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gi|2                          :    TTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGATC--CG-CCAATAGTATGTACACGAG-ATTTAATTATACAT-TATTATGTGTGCAAGA--T-TAAAA-ACAAT--GA-TTTAAATAAAAG--AAAA-ACAAAAACATA-ATTCCTA--AATAGTA-AAG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTT-TACT-AAT--GCGTCAGGGCGGTCTCGTTACAGACCATTT-CGG-TCCTA-TTCCTATAA---GCAAT----CTGAT--TGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA--GCAATCGG--AGATTTTTTGATTATGGT------CA-AA-ATATATAATTATTAATATAGAC--GCA--A------TAT-AC--G-CATCA-CAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-T-ACGTACA--A---A-AG-CT-TGTTC-C-A-C--TGCAAAC--GC--AATG-GTTTT------AA-AAA-A-TCTC--ACAA-T-ATG-A-T---------T--TT---A-G-T-A-ATACT-ACC-AA-ATTATATTCG---GCCGTCCTAACAA-T-GAATTCAA-CCCAA--GTCGCTTACAAA--TCA--------GCCTATGGCACACA----------------T------------------C-T-----------GTGAT----GT--A--TACAGTCATC-A--GGCGA-ATTG--CG--TG--TTT-AT-CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATG--ACAGG---C--G-A-GTA------CAGCCAGA-G-TAGTAGCA-----------T---AAACA-A----TC-AA--T-GGTGA--AAGGC-ATATTTCC--C--ATGACAA---CGTGGAA-TAA-----CCT--GA-G-C--AA-CC-AAC---AAA-C-A-T-TGT-------TATC------CAA-AA---CCA-----GTA-T-AT-A-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TTT-AG--aacgacccttatcagtatgaatagtcctt
gi|15                         :    TTTGGA-TAA--ATCATA---AAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT-A--T--TG-C-AATA-TGT------T-G-AC---CATTGGCAT--ATT-----TACAAAT--T-AAGAT-ACAATATGA-TTTAAATAAA-G--ATAA-A---A-TGGTA-GTGATCACTGATG-TA-A-G-ATATTATTTTCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---GACTG--------------AATT---------A---------A---GCAC------TGAT--T--T--AT-TCT-AC-TTCT--T----GCAG-ATTA--T-AAT--G--cgtgaataga
gi|23                         : aacTTTAGA-TCA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------GT--GTT-A--T--TG-C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATAC----ACA--TATT-----TGCAAAT--T-AAG
gi|24                         : tacTTTGGA-TAA--AT-ATCTTTATT--TGAAAGGTTGAAA-T-------A---GTT-G--T--CT-C-A-TA-TATGT-AACT-G-ATATACA
gi|17                         :    cTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC-A--T--CG-C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATACATACATGTATATT-----TGCAAAT--T-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-GGAAAAA-A---AAATAAA-G-----T--GATA-TA-A-G-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---TACGG--------------AATT-CGG-GCCTA-TTA-----A---ACACTG
gi|6                          :                                                                    -C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATACATA-----GTATT------GCAAAAATT-AAGAT-AC--T--GA-TTTAAATAAA-G--AAAAAA---AATTATA-G-----T--GATA-TATA-GCATATTTT--CCCATA--TAT---AT-TATTTGGT--GCGT---GACGA--------------AATT-CGG-GCTTA--TT-----A---ATA--AGCACTGAT--T--T--AT-TCT-AGTTGCT--T----GCAG-ACTA--A-TAT--G--TTTTTTTTT--------TCCTTACCA-AACAT---AAA-----AATAT-TAC--GCA--AT-----TAT-AC-AG-CA--A-CA----TAACGT----A-AA---GATCAAT-T-AC---TA--A---A-AG-CT-TGTCTCC-ATT--GGCAA-C--GTCAAATG-GTT--------AA-AAG-C-TCTCGAA-AA-T-ATG-A-T---------T--TT--TA-G-T-A-A--CT-A---AA-ATTA-TT-CG---G--G-CT--AC-A-A-TGAT---A-C--GA----T--------G--TCA--------A------------A----------------T------------------CTT-----------GTG-T----TTTAA--T----TCATCTA--G---CTTTTG--CG--TG--TTT-TT-CAC-AGT-GC----AG-AAATATT--AC--A---C--G-A-GTA-------AGC---A-A-TAGTAGCA-----------T---AAA-C-A----T--AAT-T-TGTGA--AA-GC-TTA-TT-T--C--ATGG-AA---CGT--GATT-A-----CTT--GA-G-C--AATCC-AAA---ATA-C-A-T-T-T-------T-TCA-----TAGTAA---CCA--GG-GT--T-AT-A-----C-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG--AGAAA-------------TAT---A-G----ACATTTT-T-TGGATTGGGGG-CCA-AAACG
gi|9                          :                                                                                                                                                                       ATA-G-----T--GATA-TA-A-G-ATATTT--CCCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---GACGA--------------AATT-CGG-GCCTA-TTA-----A---GCACTG------AT--A--T--AT-TCT-AG-TGTT--T----GCAG-ACTA--G-AAT--G--TTTTTTTTT--------TTTTC--CA-AA-AT---AAA-----AATAT-TAC--GCA--A------TAT-AC-AG--A--A-CA--G-TAACGT----A-AA---GATCAAT-T-AC---TA--A---A-AG-CT-TGTTTCC-A-T--GGCAA-C--GC--AATG-GTT--------AA-AAA-A-TCTC--A-AA-T-ATG-A-T---------T--TT--TA-G-TAA-A--CT-A---AA-ATTA-AT-CG---G--G-CCT-ACAA-T-GAAT---A-C--GA--GTC--------G--TCA--------A------------ATCCTATGGCTACATC-T------------------G-T-----------GTG-T----TT--A--T----TCATC-G--G---C-TTTG--CG--TGT-TTT-TT-CAC-A-T-GC----A--AAATATT--AC--G---C--G-A-GTA------CAGC---A-A-TAGTAGCA-----------T---AAA-C-A----TC-AAT-T-TGTAA--AA-GC-TTATTT-C--C--ATGGCAA---CGT--GA-C-A-----CTT--GA-G-C--AATCC-AAA---ATA-C-A-T-T-T-------T-TC------TAGTAA---CCA--GG-GAA-T-AT-A-----A-ACT-TT-CA--C--C--AT-TGT-acccttaccatatata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                       TTCTCATG--TAA---TT-TATTTGGT--GCCG---GACGG--------------AATT-CGG-GGCTA-ATT-----AA--GCA--------GATGTT--T--AT--CT-AG-TGTT--T----GCAGTATTA--G-AAT--G--TTTTTTTTT--------TT-----CA-AA-A----CAA-----AATAT-TAC--GAA--C------CGT-AC-AG-CA--A-CG--T-TAACGT----A-AA---CATCGAT-T-AC---TA--A---A-AG-TT-TGTTCAC-A-T--GGCAA-C--G-----CG-GCT--------AA-AAC-ACTCTC----AA-T-ATA-A-TTTTAGTC--T--TT--TA-GTT-A-A--CT-A---AA-ATTA-AT-CG---AA-A-CT--ACAA-T-GAAT---A-C--GAG-GTT--------G--TCA--------A------------ATCACTATGGCTACATCT------------------G-T-----------GTG-T----TT--T--T----TCATC-A--G---C-TTTGGCTGTTTT--TTT-TT-CAG-A-T-GC----A--AATTATT--AC--G---C--A-ACGTG------CAGC---A-A-T-GTAGCG-----------T---AAA-ACA----TC-AAT-T-TGTGA--AA-GT-TTATTT-C--C--ATGACAA---CGT--AA-T-A-----CTT--GA-G-C--AACTC-CAA---ATA-C-A-T-T-T-------T-TC------T--TAAAACCTAACGG-G-A-C-AT-A-----A-AC--TT-CA--C--C--TT-TTT-AG--ATTATAGGAATTTTTAT---A-G----ACA-TTT-T-TGGATTGGGGGCCCA-AAAC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCG--T----GCAG-ACTA--G-AAT------GTTTTGTT--------aacccttaccataattatatagtc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         cctattataagGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAG-ACTA--G-AAT--A--------------------------------------AA-----AATAT-TAC--ACA--ATATAGGCCT-AC-AG-CA--A-CA--G-TAACAT----A-AT---GATCAAT-T-AC---TA--A---A-AG-CT-TGTTTCT-A-T--GGCAA-C--GC--AATG-GTT--------AA-AA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --T----GTAA-ATTA--C-AAC--A--TGCTTTATCCGC-----T------CC-TA-AT---TGG-----AATAT-------------------GT-AC-AG-CA--A-CA--G-TAACGT----A-AA---CATCAAT-T-TA---TG--A---A-AG-CT-TATTTCC-A-T--GACAA-C--GC--GATG-GTTG-------AGCAAT-A----C--A-AA---ATACA-T---------T--TTTCTA-G-T-A-A--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTT--------T------CA-CA-TG---CAA-----AATAT-TAC--GCA--A------CGT-AC-AG-CA--A-CA--G-TAGCGT----A-AA---TATCAAT-T-TG---TG--A---A-AG-CT-TATTTCC-A-T--GGCAA-C--GC--AATA-CTTG-------AG-CA--A-TCCA--A-AA-T-ACA-T-T---------T--TTC-TA-G-T-A-A--CT-A---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtcatcaaatcactaaggctacatctgtgtgtttaaattcatcggctttgcgtggTCTT--------T------TA-AA-AT---CAA-----AATAT-T----GCAG-A------CAT-AC-AGAAA--A-CA--G-TAACGC----T-AA---CATCAAT-T------TG--T---A-AG--T-CG-TCCC-G-T--GTAAA-C--GCT-GATG-CTT---------G-AGC-A-ACTC--A-AA-T-ACA-T-TC--------T--TC--TA-G-T-A-gggtacataatgcattcaccattgtagatatggacattttcggattgggggcccaaaacgacccttacca
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttatttaatgatttaagtggTTT--------T------CA-AA-AT---CCA-----AATAT-TAC--GCA--A------CAT-AC-AG-CA--A-CA--G-TAACTT----A-AA---TATCA-----AG---TG--A---A-AG-CT-TGTTTCC-A-T--GCCAA-C--AC--GATG-GTT---------G-AACAA-TCCC--A-AA-T-ATACA-T---------T--TT--TA-G-T-A-A--CT-A---TA-GGTA-AT-cataagtctacataagcatcgcatcatgggtaatactcgagccgttttcgcgttggatgccgttataaactccttacaataataa
gi|13                         :                                                                                                                                                        accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgtgtaaacgatttgcaaaagcttgtttccatggaaaagcaatggctgtatattttaataacttgtattattagacctgcattgaatacgagtcatcaaatcactagtactatagcaacatctgtatggttattcatcggctttatgtgaTTT--------T------CA-AA--T---GAA-----AATAT-TAT--GCA--A------TGA-AC-AG-CA--A-CA--G--AACAT------AA---CATCAA--T-A----TGGAA---A-AG-CT-TGTTTCC-A-T--GGCAA-C--AC--AAT--GTT---------G-AAC-A-ATCC--A-AA-T-A-A-A-T---------T--TTTCTA-G-T-A-A--CT-A---attaaacattcaccatggaatatagacattgtcggattggtccaaatatgaccttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattcatcaggtttatttggT-TAT--GCA--A------CAT-AC-AG-CA--A-CA--G-TAATGT----A-AA---CATCGAT-T-TG---TA--A---A-AG-TT-TGTTTCC-A-T--TGCAA-C--GC--AGTG-GTT---------G-AACAA-TCCC--G-AA-G-AT--A-T---------C--TT--Tgggtacaataaacatttgccacatggtaaatatatggcattttcggattgggggccaaatgactcttaccattatatattatcagtcct
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atggcagcatttgtgtgcttatttatgtggtt-TAC--GCACTA------C-T-AT-AA-CA--C-CA--G---ACTC----A-GAACGCATTGAG-C--C---TA--A---ATAG-CTGTGTTTCC-A-TCGAGCAA-CCTGC--AATT-GTTTATACAAAAG-AGT-A-CC------AA-T-ATG-ACT---------T--TT--TACG-T-A-T--TT-ATAAAA-ATTA-ATGCGAAAG--G-GCTCACAT-A-TGAA---ACC--GA--GTC--------G--TCA--------A------------gactagggtaaataaacattcgctttggtaaacgtagacatttttagactgggaaccaaaaatgaccctt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AC-AG-CA--AACA--A-TAACGT----G-AA---TAT-----T-A----TA--A---T-AGTCA-TTTTTCC-A-A--GACAA-A--GC--AATG-ATT---------G-AAC-AATCTC--A-AA-T-ATA-------------T--TT--TA-G-T-A-A--CT-ttttctacttagtcttgaaccattgtacatctggagtgtttatgcccatcggaggtggccttagcgagtgtagtttgtttccttcatccattaaatatacgcccgagtacagaatagtagcggcgattgccattacatgctccaatcttgtgaaagtttacttccttatggcagactcacactattttcgagccaatccaaaattatacacttattgtgataacccaggtatataaactttgcaacccattgtagataagacacttttggatgggggcctacaaacgacccttacccat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taagagtcgtcgtgtatgctacaaatcatgtgtgtactttttcatcgggttttattagtgtaggcattgtaatataGT----A-AA---C---GAT-T------TGCAA---A-AG-CT-TGTTTCC-A-T--GGAAA-A--GC--AATG-GCT--------G-------------------T-ATA-------------T--TT--TA-A-T-A-A--CT-T---GT-ATTA-TT-AG---AC----CTG-CAT-T-GAAT---A-C--GA--GTC--------A--TCA--------A------------A----------------TCACTAGTACTATAGCAACA-T-----------CTG-TATGGTT--A--T----TCATC-G--G---C-TTTA--TG--TG--ATT-TT-CAA-A-A-TC----C--AAATATT--AC--G---C--A-ACATA------CAGC---A-A-CAGTAACT-----------T---AAA-T-A----TC-AA-----GTGA--AA-GC-TTGTTT-C--C--ATGCCAA---CAC--GA-T-G-----GTT--GA-A-C--AATCC-CAA---ATA-T-A-C-A-T-------T-TT------TAGTAA---CTAT-AG-GTAAT-ATTA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG---A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTG-T-CGGATT---GGTCCA-AAgggtaataccaagaacactcaccatggctatttacaagagagacattctgagtgggacaaaagt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgt---TA--A---A-AG-TT-TGTTTCC-A-T--GGCAA-C--GC--AATG-GCT--------AA-AAC-A-TCTC--A-AA-T-ATA-A-TTTTTAGTCAT--TT--TA-G-T-A-A--CT-A---AA-ATTA-AT-CG---A--A-CCT-ACAA-T-GAAT---A-C--GA--GTT--------G--TCA--------A------------A----------------T------------------tatgaccttgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --A---A-AG-CT-CGTTTTCCA-T--GGCAA-C--AC--CACG-ACT--------GA-AAC-A-ATTC--A-AA-TCATA-C-T---------TTCTT--CA-G-T-A-A--CT-cac
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatgtcGCAA-C--GC--AATG-GTT--------AA-AAA-A-TCTC--A-AA-T-ATC-A-TTTTTAGTAAT--TT--TA-G-T-A-A--CT-A---AA-ATTC-AT-CG---G--A-CCT-ACAA-T-GAAT---A-C--GA--GTC--------G--TCT--------A------------ATCACTATGGTTACATCT------------------G-T-----------GTG-T----TT--A--T----TCATC-A--G---C-TTTG--gggttacctaaacacttaccatggaaatacagacattttgtgaatggggccaaaaaaaatgcccttaccatgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---A-C--AA--ATC--------A--T-----------------------G----------------T------------------G-T-----------GTA-C----TT--T--T----TCATC-G--G---G-TTT-------TA--TTA-GT--GT-A-G-GC----A--TTGTAAT--A-------------TATA------CAGC---A-AACAATAACG-----------T---GAA-T-A----TT-A-------TAA--TA-G--TCATTT-TTCC--AAGACAA---AGC--AA-T-G-----ATT--GA-A-C--AATCT-CAA---ATA-T-A-T-T-T-------T----------AGTAA---CT---GG-GTA---AT-ACCAAGA-ACA-CT-CA--C--C--AT-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taagagtcgtcgtgtatgcC--------A--TC---------------------------------------T------------------G-T-----------GTG-T----TT--AAAT----TCATC-G--G---C-TTTG--CG--TGG-TTT-TT-CAC-A-T-GC----A--AAATATT--AC--G---C--A-ACGTA------CAGC---A-A-CAGTAGCG-----------T---AAA-T-A----TC-AAT-T-TGTGA--AA-GC-TTATTT-C--C--ATGGCAA---CGC--AA-T-A-----CTT--GA-G-C--AATCC-AAA---ATA-C-A-T-T-T-------T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GTA-C-AT-A-----ATGCA-TT-CA--C--C--AT-TGT-AG--A-------------TAT---G-G----ACA-TTT-T-CGGATTGGGGGCCCA-AAACGggctatttacaagagagacattctgagtgggacaaaagt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtcatcaaatcactaaggcta----TT--A--T----TTA---AT-G---A-TTTA--AG--TGGTCTT-TT-AAA-A-T--C----A--AAATATT------G---C--AGACATA------CAGA---A-AACAGTAACG-----------C---TAA-C-A----TC-AAT-T-TGT----AA-G---TCGTC-C--C--GTGTAAA---CGCT-GA-T-G-----CTT--GA-G-C--AACTC-AAA----TA-C-A-T-T-C-------T-TC------TAGTAC---ATA--AGTCTA-C-AT-A-----A-GCA-TCGCA--T--C--ATGGGT-A---A-------------TACTCGA-G----CCG-TTT-T-CGCGTTGGATGCCacccttacca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T--A--T----TCATC-A--G---G-TTTA--TT--TG--GTT-TT-CAA-A-T-G-----A--AAATATT--AT--G---C--A-ATGAA------CAGC---A-A-CAG-AACA-----------T---AAC---A----TC-AAT-A-TGGAA--AA-GC-TTGTTT-C--C--ATGGCAA---CAC--AA-T-G------TT--GA-A-C--AATCC--AA---ATA-A-A-T-T-T-------T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GTA-CAAT-A-----A-ACA-TT-TG--CCAC--AT-GGT-AA--A-------------TAT---ATG----GCA-TTT-T-CGGATTGGGGGCCAA-gttataaactccttacaataataa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-A--GC--A-TTTG--TG--TG--CTTATT-TAT-G-T-G----------GTTTT--AT--G---C--A-ACATA------CAGC---A-A-CAGTAATG-----------T---AAA-C-A----TC-GAT-T-TGTAA--AA-GT-TTGTTT-C--C--ATTGCAA---CGC--AG-T-G-----GTT--GA-A-C--AATCC-CGA---AGA-T-A-T-C-T-------T------------TGA---CTA--GG-GTA-A-AT-A-----A-ACA-TT-CG--C--T--TT-GGT-AA--A-------------CGT---A-G----ACA-TTT-T-TAGACTGGGAACCAA-AAATGtgactcttaccattatatattatcagtcct
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atggC-A-T-CC----ATTAAATA-T--AC--G---CCCG-A-GTA------CAG----A-A-TAGTAGCGGCGATTGCCATT---ACATG-C----TCCAATCT-TGTGA--AA-GT-TTACTT-C--CTTATGGCAGACTCAC--AC-T-A-----TTTTCGA-GCC--AATCC-AAAATTATA-C-A-C-T-TA------T-TG------TGATAA---CCC--AG-GTA-T-AT-A-----A-ACT-TTGCAACC--C--AT-TGT-AG--A-------------TA----A-G----ACA-CTT-T-TGGAT-GGGGGCCTACAAACGaccctt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacgcactactataacaccagactcagaacgcattgagcctaaatagctgtgtttccatcgagcaacctgcaattgtttatacaaaagagtaccaatatgactttttacgtatttataaaaattaatgcgaaagggctcacatatgaaaccgagtcgtcaattttctacttagtcttgaaccattgtacatctggagtgtttatgcccatcggaggtggccttagcgagtgtagtttgtttcctt----A--AAATATT--AC--A---C--A-ATATAGGCCTACAGC---A-A-CAGTAACA-----------T---AAT-G-A----TC-AAT-T-ACTAA--AA-GC-TTGTTT-C--T--ATGGCAA---CGC--AA-T-acccttacccat
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Reference ( family-2857 )     :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATN--TACGTGTATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TTN-----A-GCACTG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNNTTTT---T--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-TG-G--TT--------AGAACA-TCTC--A-AA-TATAA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgt-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--AAAT--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGG---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AT-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----ATGCA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---G-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACGtatgaccttgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtcatcaaatcactaaggctacatc----------------A-------------------T----------------------GTG-TGTACTT--T--T--TCA-TC--GGG-------T---TT------------TA----TTAGT-GTAGGCAT---T-GT----A--ATATAT--------------ACA----GC---A-AACAATAACG-T---GA--------AT-A----T----TA-------TAA--TA-GTC-ATTTTT-CC--AAGACA-----AAGC-A--A-T-----GATTGA-A-C--AATCT-CAA---ATATA-T-T-T-T----------AGTAA---CT---GG-GT-A--A-TACCAAGA-ACA-CT-CA--C--C--AT-GGCT-ATTTACA--A-------------GAG---A-G----ACA-TTC-T--GAGTGGGA---CA-AAAacccttacca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taagagtcgtcgtgtatgctacaaatcT--A--T--TCA-TC--AGG-------T---TTATT---------TG----GT--T-TT---CAA-A-T-G-----A--AAATATTAT--GC--AATGAACA----GC---A-A-CAG-AACA-T---AA---------C-A----T----CAAT-A-TGGAA--AA-G-C-TTGTTT-CC--ATGGCA-----ACAC-A--A-T-----G-TTGA-A-C--AATCC--AA---ATAAA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-ACAA-TA-----A-ACA-TT-TG--CCAC--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---ATG----GCA-TTT-TCGGATTGGGGGCCAA-gt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --TT--A--T--TTAAT----GA-------T---TTAAG---------TGGT--CT--T-TT---AAA-A-T--C----A--AAATATTGC--A---GACATACA----GA---A-AACAGTAACG-C---TA--------AC-A----T----CAAT-T-TGT----AA-G----TCGTC-CC--GTGTAA-----ACGCTG--A-T-----GCTTGA-G-C--AACTC-AAA----TACA-T-T-C-T-TC------TAGTAC---ATA--AGTCT-AC-A-TA-----A-GCA-TCGCA--T--C--ATGGG-T-A--------A-------------TACTCGA-G----CCG-TTT-TCGCGTTGGATGCCtgactcttaccattatatattatcagtcct
gi|15                         :                                        TTTGGA-TAA--ATCATA---AAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TGT------------T--G-AC----CATT--GGCAT--ATTTACAA-A--TT-AAGAT-ACAATATGA-TTTAAATAAA-G--ATAA-A---------A-TG-----GTA-GTGATCACTGATGTA-AG-ATATTATTTTCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACTG--------------AA-TT------------A-----A-GCAC-------TGAT--T--T--AT-TCT-AC-TTCT--T----GCAG-ATTA-T-AA----T----Ggttataaactccttacaataataa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aac-------T---TTGTG---------TG----CT--TATT---TAT-G-T-G----------GTTTTAT--GC--AACATACA----GC---A-A-CAGTAATG-T---AA--------AC-A----T----CGAT-T-TGTAA--AA-G-T-TTGTTT-CC--ATTGCA-----ACGC-A--G-T-----GGTTGA-A-C--AATCC-CGA---AGATA-T-C-T-T------------TGA---CTA--GG-GT-AA-A-TA-----A-ACA-TT-CG--C--T--TT-GG-T-A-----A--A-------------CGT---A-G----ACA-TTT-TTAGACTGGGAACCAA-AAATG
gi|17                         :                                atggcagcaTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA--CATGTATATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-GGAAAAA-A---------AAAT-----AAA-GTGAT-------ATA-AG-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---T---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TTA-----A-ACACTG-accctt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TGTCA--AA-G-C-TCGTTTTCC--ATGGCA-----ACAC-C--A-C-----GACTGA-AAC--AATTC-AAATC-ATACT-T-T-C-T-TC-------AGTAA---CTG--GG-TT-AC-C-TA-----A-ACA-CT-TA--C--C--A--TG-G-A-----A--A-------------TAC---A-G----ACA-TTT-TGTGAATGGGG--CCA-AAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taATGTACA----GC---A-A-CAGTAACG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TATGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGC-G--A-T-----GGTTGA-G-C--AATAC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---aaaatgcccttaccatgt
gi|2                          : tgtaaattacaacatgctttatccgctcctaattggaatTTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGAT--CCG-CCAATAGTATGTACACGAGATTT--A-ATTATACATTATTATGTGT----GCAAGA--TT-AAAA--ACAAT--GA-TTTAAATAAAAG--AAAA-ACAAAAACATAATTCCTAAATA-GTAA------------AG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTTTA-CT-AAT--GCGTCAGG---GCGGTCTCGTTACAGACCAT-TTCGGT-CCTA-TTCCTATAA-GCAAT-----CTGAT--TGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA-GCAA----TCGGAGATTTTT---TGATTATGGT------CAAA-ATATATAATTATTAATATAGACG--CA--A------TAT-AC--GCATCACAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-TA-CGTACAA---A-AGCT-TG-TTCCA-C--TGCAAAC--G-C--AA-TG-GTTTT--------AAAAAA-TCTC--ACAA-TATGA-----------TTTTA-G-T-AATAC-TACC-AA-ATTATATT-CG---GCCGTCCTAA-C-A-A-TGAATTCAACCCAA-GTC--GCTTACAA----------------ATCAGCCTATGGCACACATCT----------------------GTGATGT--AT--A--CAGTCA-TC--AGG-------CGAATTGCG---------TG----TT--T-AT---CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATGACAGGC--GA-GTACA----GCCAGA-G-TAGTAGCA-T---AA--------ACAA----T----CAA--T-GGTGA--AAGG-C-ATATTTCCC--ATGACA-----ACGT-GGAA-TA----ACCTGA-G-C--AA-CC-AAC---AAACA-T-TGT-TATC------CAA-AA---CCA-----GT-AT-A-TA-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TT-T-A-----G--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GC-AAC--G-C--AA-TG-G--TT--------AAAAAA-TCTC--A-AA-TATCA-TTTTTAGTAATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTC-A-T-CG---G--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CTA----------------ATCACTATGGTTACATC---T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGC-------T---TTGcgtgaataga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----A------------------------------------AA-----AATAT-TACA--CA--ATATAGGCCT-AC-AGCA--ACA--G-TAACAT----A-AT---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCTA-T--GGC-AAC--G-C--AA-TG-G--TT--------AAAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TAA---A-AGTT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-TG-G--CT--------AAAACA-TCTC--A-AA-TATAA-TTTTTAGTCATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---A--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTT--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------
gi|23                         :                                        TTTAGA-TCA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------GT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACACA--------TATTTGCAA-A--TT-AAGcac
gi|24                         :                                     tacTTTGGA-TAA--AT-ATCTTTATT--TGAAAGGTTGAAA-T-------A---GTT--GT--C-T-C-A-TA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCG--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTGT---T--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cctattataa-G----ACA-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACGacgcttaccatatatag
gi|3                          :                                        TTTGGA-TAG--ATTATTTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AAAA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACAT--------GTATGTGCAA-A--TT-AAGAA-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-C---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTT--CCCATA--TTA---TTTA-TTTGAT--GCGT---G---ATTG--------------AA-TTCGGA-CCTA-TTA-----A-GCA------A-TGAT--T--C--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-GTTA-C-AA----T----GGTTTTTTTTT--TT----T------CAAA-AT---CAT-----TAAAT-TACA--CA--A------TTT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGC----A-AA---CGTC-ATGTA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-TG-G--TT--------AAAA-A-TC-G--A-AA-TAT-A-T---------TTTAA-G-T-A--ACTTA---AACATTA-A-T-C----G-CGTCTT-A-T-A-A-TGAAT--G---CGA-AT---GT---CAAATCACTATTGCTATATA-------------------T----------------------GTG-TGA--TT--A--T--TAA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TTA--CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---T-A-TAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----TAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGATA-----ACGC-G--A-T-----ACTTGA-G-C--GATCC-AAA---ATACA-T-T-T-C-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCAGATT-GGGGCTCA-AAACacccttaccatatatag
gi|4                          :                                     tacTTTGGA-TAA--ATCA-CTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--GGAT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AATTTCGGG-CCTA-TTT-----A-GCACTGCC-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GGG-TTT---T--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGTAAC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-CG-G--TT--------AGAATA-TCTC--A-AAGTATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G--G-CCT-A-C-A-ATTGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------AT--TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CACTA-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T-----AA--T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCATT-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----AC---TT-TCGGATCGGGGGGCCC-AAACGaacccttacaatata
gi|5                          :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TTT-----A-GCACTG-CCACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GGGTTTT---T--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-CG-G--TT--------AGAATA-TCTC--A-AA-TATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-AAC-A-A-AGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------ATG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATCGGGGGCCCA-AAACGacct
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Reference ( family-2857 )     :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATN--TACGTGTATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AGCACTG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNTTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAANA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgt-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--AAAT--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGG---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AT-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----ATGCA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---G-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACGtatgaccttgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtcatcaaatcactaaggctacatc----------------A-------------------T----------------------GTG-TGTACTT--T--T--TCA-TC--GGG-------T---TT------------TA----TTAGT-GTAGGCAT---T-GT----A--ATATAT--------------ACA----GC---A-AACAATAACG-T---GA--------AT-A----T----TA-------TAA--TA-GTC-ATTTTT-CC--AAGACA-----AAGC-A--A-T-----GATTGA-A-C--AATCT-CAA---ATATA-T-T-T-T----------AGTAA---CT---GG-GT-A--A-TACCAAGA-ACA-CT-CA--C--C--AT-GGCT-ATTTACA--A-------------GAG---A-G----ACA-TTC-T--GAGTGGGA---CA-AAAacccttacca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taagagtcgtcgtgtatgctacaaatcT--A--T--TCA-TC--AGG-------T---TTATT---------TG----GT--T-TT---CAA-A-T-G-----A--AAATATTAT--GC--AATGAACA----GC---A-A-CAG-AACA-T---AA---------C-A----T----CAAT-A-TGGAA--AA-G-C-TTGTTT-CC--ATGGCA-----ACAC-A--A-T-----G-TTGA-A-C--AATCC--AA---ATAAA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-ACAA-TA-----A-ACA-TT-TG--CCAC--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---ATG----GCA-TTT-TCGGATTGGGGGCCAA-gt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TT--A--T--TTAAT----GA-------T---TTAAG---------TGGT--CT--T-TT---AAA-A-T--C----A--AAATATTGC--A---GACATACA----GA---A-AACAGTAACG-C---TA--------AC-A----T----CAAT-T-TGT----AA-G----TCGTC-CC--GTGTAA-----ACGCTG--A-T-----GCTTGA-G-C--AACTC-AAA----TACA-T-T-C-T-TC------TAGTAC---ATA--AGTCT-AC-A-TA-----A-GCA-TCGCA--T--C--ATGGG-T-A--------A-------------TACTCGA-G----CCG-TTT-TCGCGTTGGATGCCtgactcttaccattatatattatcagtcct
gi|15                         :                                        TTTGGA-TAA--ATCATA---AAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TGT------------T--G-AC----CATT--GGCAT--ATTTACAA-A--TT-AAGAT-ACAATATGA-TTTAAATAAA-G--ATAA-A---------A-TG-----GTA-GTGATCACTGATGTA-AG-ATATTATTTTCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACTG--------------A------------A-TT-----A-A-----G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AC-TTCT--T----GCAG-ATTA-T-AA----T----Ggttataaactccttacaataataa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aac-------T---TTGTG---------TG----CT--TATT---TAT-G-T-G----------GTTTTAT--GC--AACATACA----GC---A-A-CAGTAATG-T---AA--------AC-A----T----CGAT-T-TGTAA--AA-G-T-TTGTTT-CC--ATTGCA-----ACGC-A--G-T-----GGTTGA-A-C--AATCC-CGA---AGATA-T-C-T-T------------TGA---CTA--GG-GT-AA-A-TA-----A-ACA-TT-CG--C--T--TT-GG-T-A-----A--A-------------CGT---A-G----ACA-TTT-TTAGACTGGGAACCAA-AAATG
gi|17                         :                                atggcagcaTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA--CATGTATATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-GGAAAAA-A---------AAAT-----AAA-GTGAT-------ATA-AG-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---T---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AACACTG-accctt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TGTCA--AA-G-C-TCGTTTTCC--ATGGCA-----ACAC-C--A-C-----GACTGA-AAC--AATTC-AAATC-ATACT-T-T-C-T-TC-------AGTAA---CTG--GG-TT-AC-C-TA-----A-ACA-CT-TA--C--C--A--TG-G-A-----A--A-------------TAC---A-G----ACA-TTT-TGTGAATGGGG--CCA-AAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taATGTACA----GC---A-A-CAGTAACG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TATGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGC-G--A-T-----GGTTGA-G-C--AATAC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---aaaatgcccttaccatgt
gi|2                          : tgtaaattacaacatgctttatccgctcctaattggaatTTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGAT--CCG-CCAATAGTATGTACACGAGATTT--A-ATTATACATTATTATGTGT----GCAAGA--TT-AAAA--ACAAT--GA-TTTAAATAAAAG--AAAA-ACAAAAACATAATTCCTAAATA-GTAA------------AG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTTTA-CT-AAT--GCGTCAGG---GCGGTCTCGTTACAGACCAT-TTCGGT-CCTA-TTCCTATA-AGCAAT-----CTGAT--TGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA-GCAA----TCGGAGATTTT---TTGATTATGGT------CAAA-ATATATAATTATTAATATAGACG--CA--A------TAT-AC--GCATCACAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-TA-CGTACAA---A-AGCT-TG-TTCCA-C--TGCAAAC--G-C--AA---TGGTTTT-----AAAAAA-TCTC--ACAA-TATGA-----------TTTTA-G-T-AATAC-TACC-AA-ATTATATT-CG---GCCGTCCTAA-C-A-A-TGAATTCAACCCAA-GTC--GCTTACAA----------------ATCAGCCTATGGCACACATCT----------------------GTGATGT--AT--A--CAGTCA-TC--AGG-------CGAATTGCG---------TG----TT--T-AT---CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATGACAGGC--GA-GTACA----GCCAGA-G-TAGTAGCA-T---AA--------ACAA----T----CAA--T-GGTGA--AAGG-C-ATATTTCCC--ATGACA-----ACGT-GGAA-TA----ACCTGA-G-C--AA-CC-AAC---AAACA-T-TGT-TATC------CAA-AA---CCA-----GT-AT-A-TA-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TT-T-A-----G--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAAAA-TCTC--A-AA-TATCA-TTTTTAGTAATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTC-A-T-CG---G--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CTA----------------ATCACTATGGTTACATC---T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGC-------T---TTGcgtgaataga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----A------------------------------------AA-----AATAT-TACA--CA--ATATAGGCCT-AC-AGCA--ACA--G-TAACAT----A-AT---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCTA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TAA---A-AGTT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--CT-----AAAACA-TCTC--A-AA-TATAA-TTTTTAGTCATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---A--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTT--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------
gi|23                         :                                        TTTAGA-TCA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------GT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACACA--------TATTTGCAA-A--TT-AAGcac
gi|24                         :                                     tacTTTGGA-TAA--AT-ATCTTTATT--TGAAAGGTTGAAA-T-------A---GTT--GT--C-T-C-A-TA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            c-CCTA-TT-----ATAA----G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCG--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTG---TT--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -G----ACA-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|3                          :                                        TTTGGA-TAG--ATTATTTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AAAA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACAT--------GTATGTGCAA-A--TT-AAGAA-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-C---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTT--CCCATA--TTA---TTTA-TTTGAT--GCGT---G---ATTG--------------AA-TTCGGA-CCTA-TT-----A-AGCA------A-TGAT--T--C--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-GTTA-C-AA----T----GGTTTTTTTTT--TT----T------CAAA-AT---CAT-----TAAAT-TACA--CA--A------TTT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGC----A-AA---CGTC-ATGTA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAA-A-TC-G--A-AA-TAT-A-T---------TTTAA-G-T-A--ACTTA---AACATTA-A-T-C----G-CGTCTT-A-T-A-A-TGAAT--G---CGA-AT---GT---CAAATCACTATTGCTATATA-------------------T----------------------GTG-TGA--TT--A--T--TAA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TTA--CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---T-A-TAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----TAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGATA-----ACGC-G--A-T-----ACTTGA-G-C--GATCC-AAA---ATACA-T-T-T-C-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCAGATT-GGGGCTCA-AAACacccttaccatatatag
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gi|5                          :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----T-AGCACTG-CCACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GGGTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---CGG--TT-----AGAATA-TCTC--A-AA-TATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-AAC-A-A-AGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------ATG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATCGGGGGCCCA-AAACGacct
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Reference ( family-2857 )     :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATN--TACGTGTATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AGCACTG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNTTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAANA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgt-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--AAAT--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGG---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AT-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----ATGCA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---G-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACGtatgaccttgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgtcatcaaatcactaaggctacatc----------------A-------------------T----------------------GTG-TGTACTT--T--T--TCA-TC--GGG-------T---TT------------TA----TTAGT-GTAGGCAT---T-GT----A--ATATAT--------------ACA----GC---A-AACAATAACG-T---GA--------AT-A----T----TA-------TAA--TA-GTC-ATTTTT-CC--AAGACA-----AAGC-A--A-T-----GATTGA-A-C--AATCT-CAA---ATATA-T-T-T-T----------AGTAA---CT---GG-GT-A--A-TACCAAGA-ACA-CT-CA--C--C--AT-GGCT-ATTTACA--A-------------GAG---A-G----ACA-TTC-T--GAGTGGGA---CA-AAAacccttacca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taagagtcgtcgtgtatgctacaaatcT--A--T--TCA-TC--AGG-------T---TTATT---------TG----GT--T-TT---CAA-A-T-G-----A--AAATATTAT--GC--AATGAACA----GC---A-A-CAG-AACA-T---AA---------C-A----T----CAAT-A-TGGAA--AA-G-C-TTGTTT-CC--ATGGCA-----ACAC-A--A-T-----G-TTGA-A-C--AATCC--AA---ATAAA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-ACAA-TA-----A-ACA-TT-TG--CCAC--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---ATG----GCA-TTT-TCGGATTGGGGGCCAA-gt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TT--A--T--TTAAT----GA-------T---TTAAG---------TGGT--CT--T-TT---AAA-A-T--C----A--AAATATTGC--A---GACATACA----GA---A-AACAGTAACG-C---TA--------AC-A----T----CAAT-T-TGT----AA-G----TCGTC-CC--GTGTAA-----ACGCTG--A-T-----GCTTGA-G-C--AACTC-AAA----TACA-T-T-C-T-TC------TAGTAC---ATA--AGTCT-AC-A-TA-----A-GCA-TCGCA--T--C--ATGGG-T-A--------A-------------TACTCGA-G----CCG-TTT-TCGCGTTGGATGCCtgactcttaccattatatattatcagtcct
gi|15                         :                                        TTTGGA-TAA--ATCATA---AAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TGT------------T--G-AC----CATT--GGCAT--ATTTACAA-A--TT-AAGAT-ACAATATGA-TTTAAATAAA-G--ATAA-A---------A-TG-----GTA-GTGATCACTGATGTA-AG-ATATTATTTTCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACTG--------------A------------A-TT-----A-A-----G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AC-TTCT--T----GCAG-ATTA-T-AA----T----Ggttataaactccttacaataataa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aac-------T---TTGTG---------TG----CT--TATT---TAT-G-T-G----------GTTTTAT--GC--AACATACA----GC---A-A-CAGTAATG-T---AA--------AC-A----T----CGAT-T-TGTAA--AA-G-T-TTGTTT-CC--ATTGCA-----ACGC-A--G-T-----GGTTGA-A-C--AATCC-CGA---AGATA-T-C-T-T------------TGA---CTA--GG-GT-AA-A-TA-----A-ACA-TT-CG--C--T--TT-GG-T-A-----A--A-------------CGT---A-G----ACA-TTT-TTAGACTGGGAACCAA-AAATG
gi|17                         :                                atggcagcaTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA--CATGTATATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-GGAAAAA-A---------AAAT-----AAA-GTGAT-------ATA-AG-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---T---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AACACTG-accctt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TGTCA--AA-G-C-TCGTTTTCC--ATGGCA-----ACAC-C--A-C-----GACTGA-AAC--AATTC-AAATC-ATACT-T-T-C-T-TC-------AGTAA---CTG--GG-TT-AC-C-TA-----A-ACA-CT-TA--C--C--A--TG-G-A-----A--A-------------TAC---A-G----ACA-TTT-TGTGAATGGGG--CCA-AAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taATGTACA----GC---A-A-CAGTAACG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TATGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGC-G--A-T-----GGTTGA-G-C--AATAC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---aaaatgcccttaccatgt
gi|2                          : tgtaaattacaacatgctttatccgctcctaattggaatTTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGAT--CCG-CCAATAGTATGTACACGAGATTT--A-ATTATACATTATTATGTGT----GCAAGA--TT-AAAA--ACAAT--GA-TTTAAATAAAAG--AAAA-ACAAAAACATAATTCCTAAATA-GTAA------------AG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTTTA-CT-AAT--GCGTCAGG---GCGGTCTCGTTACAGACCAT-TTCGGT-CCTA-TTCCTATA-AGCAAT-----CTGAT--TGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA-GCAA----TCGGAGATTTT---TTGATTATGGT------CAAA-ATATATAATTATTAATATAGACG--CA--A------TAT-AC--GCATCACAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-TA-CGTACAA---A-AGCT-TG-TTCCA-C--TGCAAAC--G-C--AA---TGGTTTT-----AAAAAA-TCTC--ACAA-TATGA-----------TTTTA-G-T-AATAC-TACC-AA-ATTATATT-CG---GCCGTCCTAA-C-A-A-TGAATTCAACCCAA-GTC--GCTTACAA----------------ATCAGCCTATGGCACACATCT----------------------GTGATGT--AT--A--CAGTCA-TC--AGG-------CGAATTGCG---------TG----TT--T-AT---CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATGACAGGC--GA-GTACA----GCCAGA-G-TAGTAGCA-T---AA--------ACAA----T----CAA--T-GGTGA--AAGG-C-ATATTTCCC--ATGACA-----ACGT-GGAA-TA----ACCTGA-G-C--AA-CC-AAC---AAACA-T-TGT-TATC------CAA-AA---CCA-----GT-AT-A-TA-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TT-T-A-----G--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAAAA-TCTC--A-AA-TATCA-TTTTTAGTAATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTC-A-T-CG---G--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CTA----------------ATCACTATGGTTACATC---T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGC-------T---TTGcgtgaataga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----A------------------------------------AA-----AATAT-TACA--CA--ATATAGGCCT-AC-AGCA--ACA--G-TAACAT----A-AT---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCTA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TAA---A-AGTT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--CT-----AAAACA-TCTC--A-AA-TATAA-TTTTTAGTCATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---A--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTT--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------
gi|23                         :                                        TTTAGA-TCA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------GT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACACA--------TATTTGCAA-A--TT-AAGcac
gi|24                         :                                     tacTTTGGA-TAA--AT-ATCTTTATT--TGAAAGGTTGAAA-T-------A---GTT--GT--C-T-C-A-TA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            c-CCTA-TT-----ATAA----G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCG--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTG---TT--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -G----ACA-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACGacgcttaccatatatag
gi|3                          :                                        TTTGGA-TAG--ATTATTTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AAAA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACAT--------GTATGTGCAA-A--TT-AAGAA-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-C---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTT--CCCATA--TTA---TTTA-TTTGAT--GCGT---G---ATTG--------------AA-TTCGGA-CCTA-TT-----A-AGCA------A-TGAT--T--C--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-GTTA-C-AA----T----GGTTTTTTTTT--TT----T------CAAA-AT---CAT-----TAAAT-TACA--CA--A------TTT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGC----A-AA---CGTC-ATGTA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAA-A-TC-G--A-AA-TAT-A-T---------TTTAA-G-T-A--ACTTA---AACATTA-A-T-C----G-CGTCTT-A-T-A-A-TGAAT--G---CGA-AT---GT---CAAATCACTATTGCTATATA-------------------T----------------------GTG-TGA--TT--A--T--TAA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TTA--CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---T-A-TAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----TAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGATA-----ACGC-G--A-T-----ACTTGA-G-C--GATCC-AAA---ATACA-T-T-T-C-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCAGATT-GGGGCTCA-AAACacccttaccatatatag
gi|4                          :                                     tacTTTGGA-TAA--ATCA-CTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--GGAT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AATTTCGGG-CCTA-TT-----T-AGCACTGCC-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GG-GTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGTAAC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---CGG--TT-----AGAATA-TCTC--A-AAGTATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G--G-CCT-A-C-A-ATTGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------AT--TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CACTA-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T-----AA--T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCATT-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----AC---TT-TCGGATCGGGGGGCCC-AAACGaacccttacaatata
gi|5                          :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----T-AGCACTG-CCACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GGGTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---CGG--TT-----AGAATA-TCTC--A-AA-TATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-AAC-A-A-AGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------ATG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATCGGGGGCCCA-AAACGacct
gi|6                          :                                                                                                        -C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA-------GTATT-GCAA-AAATT-AAGAT-AC--T--GA-TTTAAATAAA-G--AAAAAA---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATATAGCATATTTT--CCCATA--TAT---ATTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGA--------------AA-TTCGGG-CTTA-TT-----A-ATAA--G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AGTTGCT--T----GCAG-ACTA-A-TA----T----GTTTTT---TT--TT----TCCTTACCAAACAT---AAA-----AATAT-TACG--CA--AT-----TAT-AC-AGCA--ACA----TAACGT----A-AA---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTCTCCATT--GGC-AAC--G-TCAAA---TGG--TT-----AAAAGC-TCTCGAA-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-T-T-CG---G--G--CT-A-C-A-A-TG-AT--A---CGA---T--GT---CAA----------------A-------------------TC---------------------TTG-TGT--TTTAA--T--TCA-TCTAGCT-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-AGT-GC----AG-AAATATTAC--AC--GA-GTA-A----GC---A-A-TAGTAGCA-T---AA--------AC-A----T-----AAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT--C--ATGG-A-----ACGT-G--ATT-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TCA-----TAGTAA---CCA--GG-GT--T-A-TA-----C-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG---A-----GAAA-------------TAT---A-G----ACATTTT-TTGGATTGGGGG-CCA-AAACG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                          TTCTCATG--TAA---TTTA-TTTGGT--GCCG---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-GCTAATT-----A-AGCA---------GATGTT--T--AT--CT-AG-TGTT--T----GCAGTATTA-G-AA----T----GTTTTT---TT--TT----TT-----CAAA-A----CAA-----AATAT-TACG--AA--C------CGT-AC-AGCA--ACG--T-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGTT-TGTTCACA-T--GGC-AAC--G-C--------GG--CT-----AAAACACTCTC----AA-TATAA-TTTTAGTC--TTTTA-GTT-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---A--A-ACT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGAGGTT--GT---CAA----------------ATCACTATGGCTACATC---T----------------------GTG-TGT--TT--T--T--TCA-TC--AGC-------T---TTGGC---------TGTTTTTT--T-TT---CAG-A-T-GC----A--AATTATTAC--GC--AACGTGCA----GC---A-A-T-GTAGCG-TA--AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-T-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGT-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AACTC-CAA---ATACA-T-T-T-T-TC------T--TAAAACCTAACGG-G--AC-A-TA-----A-AC--TT-CA--C--C--TT-TT-T-A-----G--ATTATAGGAATTTTTAT---A-G----ACA-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACacccttaccatatata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TACG--CACTA------C-T-AT-AACA--CCA--G---ACTC----A-GAACGCATTGAG-C--C---TAA---ATAGCTGTGTTTCCA-TCGAGC-AACCTG-C--AA---TTG--TTTATACAAAAGA-GTAC--C-AA-TATGACT---------TTTTACG-T-A--TT-TATAAAA-ATTA-A-TGCGAAAG-GG-CTC-A-C-ATA-TGAAA--C---CGA-GTC--GT---CAA----------------aacccttaccataattatatagtc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-TGT--TT--A--TGCCCA-TC--GGAGGTGGCCT---TAGCGAGTGTAGTTTG----TT--T-CC---TTC-A-T-CC----ATTAAATAT-AC--GCCCGA-GTACA----G----A-A-TAGTAGCGGC---GATTGCCATTAC-A----TGCTCCAATCT-TGTGA--AA-G-T-TTACTT-CCTTATGGCAGACTCACAC-T--A-T-----TTTCGA-GCC--AATCC-AAAATTATACA-C-T-TAT-TG------TGATAA---CCC--AG-GT-AT-A-TA-----A-ACT-TTGCAACC--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TA----A-G----ACA-CTT-TTGGA-TGGGGGCCTACAAACGttttctacttagtcttgaaccattgtacatctggagtgtttatgcccatcggaggtggccttagcgagtgtagtttgtttccttcatccattaaatatacgcccgagtacagaatagtagcggcgattgccattacatgctccaatcttgtgaaagtttacttccttatggcagactcacactattttcgagccaatccaaaattatacacttattgtgataacccaggtatataaactttgcaacccattgtagataagacacttttggatgggggcctacaaacgacccttacccat
gi|9                          :                   tacgcactactataacaccagactcagaacgcattgagcctaaatagctgtgtttccatcgagcaacctgcaattgtttatacaaaagagtaccaatatgactttttacgtatttataaaaattaatgcgaaagggctcacatatgaaaccgagtcgtcaattttctacttagtcttgaaccattgtacatctgga-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTT--CCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGA--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AGCACTG-------AT--A--T--AT-TCT-AG-TGTT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTT---TT--TT----TTTTC--CAAA-AT---AAA-----AATAT-TACG--CA--A------TAT-AC-AG-A--ACA--G-TAACGT----A-AA---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAAAA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-TAA--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G--G-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------ATCCTATGGCTACATC----T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGT---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GA-GTACA----GC---A-A-TAGTAGCA-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTAA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGT-G--A-C-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CCA--GG-GA-AT-A-TA-----A-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG-T-acccttacccat


blockSeqs                     :                                              .   .             AT     ATTCGAACA          .    TG  .  C . C    G     A   GAGATT .  G  T      TATTATGTG         G AA  .    T      AT  .          A GA    ACAAAAACAT     CCTAA   .     CACTGAT   T  C       TT      AG   ACC    .      .     CAG .      TCTCGTTACAGACC  T      .    A  CCTATAAGCAAT           GT GG .   C   G  T    GG .       T    . C  .    CGGA AT   TTT  GA  TCCTTAC        ATATAT   TTATT     A    .   ATATAGGCC   A  .    TC   AAG       .    T  ACG    G  G  . GTA   .   T    G        T CG   A   CT . CA  .     TT  TATAC    CAC    GAA   G   CATTTTTAGTAA      C T A AT  T  TAA  C    T T G  AAA CCGT   A A . T T     TC ACC   G   .   TTA   ATCACTAGTACTATAGCAACATCT                                      A   AC  TA AA AG   A  TA  AGGTGGCC GAA     AGTGTAGTT  TTTT  AG A  AGG   T G .  AAAGA           AG  CCG C     .     CAG . A        G A    TTGCCATT  A .    GCTC   TC .     .   G T .      T  TT      GACTC    GGA  T AAC        . A .      .   ATT     T . G A A  A           AAC   AC  T  A CA T  CCAAG T  A   G  AC CA CA  G  CT  GATTATAGGAATTTT         CTCG T .      T   . C              C
blockSeqs                     :                                              .   .             .      GGTTGAAAT          .    .   .  . . .    .     .   .      .  .  .      ACATGTA           . .   .    T      .   .          . .     AA             .       .     .         .  .       TC      .    .      .      .     .   .      .               .      .    .  TAGCACTGCC             .  .  .   .   .  .    .  .       .    . .  .    .    TT   .    .   ATGGT          CATA     .         .    .   ATTA        .  .    .    GT        .    .  .      A  .  . .     .   .    .        . .    .   .  . .   .     .   .        AA     AC    .   AATTTTTAGTCA      . . . .   .  CC   .    . . .  .   CGT    . . . . .     .  .     .   .   .     ATCAGCCTATGGCACACATCT                                         .   .   .  .  GC   .  .   C        .       .          GT    .  .  A     . . .  ATT             .   A   C     .     .   . A        . .    .         . .    .      T  .     .   . . .      C  .       .        TG   . GG         . C .      .   TC      . . . . .  .           .     T   .  . T  .  .     .  A   G  .  .  .   .  T   TTTACAA                 T    . .      .   . C              .
blockSeqs                     :                                              .   .             .      AT                 .    .   .  . . .    .     .   .      .  .  .      GTACATG           . .   .    A      .   .          . .     A              .       .     .         .  .       TC      .    .      .      .     .   .      .               .      .    .  TAGCACTGCC             .  .  .   .   .  .    .  .       .    . .  .    .    GT   .    .   TTTTC          ATC      .         .    .   CTAC        .  .    .    GT        .    .  .      A  .  . .     .   .    .        . .    .   .  . .   .     .   .        AA     A     .   AATTTTAGTC        . . . .   .  .    .    . . .  .   CG     . . . . .     .  .     .   .   .     ATCACTATGGTTACATCT                                            .   .   .  .  .    .  .   C        .       .          G     .  .  .     . . .  AG              .   A   T     .     .   . .        . .    .         . .    .      T  .     .   . . .      .  .       .        G    . AC         . . .      .   .       . . . . .  .           .     .   .  . C  .  .     .  A   .  .  .  .   .  T   GAAA                    T    . .      .   . C              .
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blockSeqs                     :                                              .   .             .      AT                 .    .   .  . . .    .     .   .      .  .  .      TGGCAT            . .   .    T      .   .          . .     C              .       .     .         .  .       TT      .    .      .      .     .   .      .               .      .    .  AATAAGC                .  .  .   .   .  .    .  .       .    . .  .    .    TT   .    .   T              ATC      .         .    .   ATT         .  .    .    GT        .    .  .      G  .  . .     .   .    .        . .    .   .  . .   .     .   .        TA     A     .   AAT               . . . .   .  .    .    . . .  .   C      . . . . .     .  .     .   .   .     ATCACTATGGCTACATCT                                            .   .   .  .  .    .  .   G        .       .          .     .  .  .     . . .  A               .   G   C     .     .   . .        . .    .         . .    .      T  .     .   . . .      .  .       .        A    . GC         . . .      .   .       . . . . .  .           .     .   .  . A  .  .     .  A   .  .  .  .   .  T   GA                      T    . .      .   . T              .
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Reference ( family-2857 )     :                                        TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATA--CAT--ACGTGTAT--T-----TGCAA-A--TT-AAGAT-ACA--ATGA-TTTAAATAAA-G--A-AAA-A---------AATT-----AT-AGTGATATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---GACGG--------------AA-TTCGG-GCCTA-T---T-----A--AGCA----T----ACTGATT--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNTTT---TTT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TAC--GCA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-T-AC---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--TT-----AAAANA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTT---------A-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG----G--G-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GT----A-AA---C---GAT-T-TG---CAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGA-AAA--GC--AA---TGG--CT-----G-----------------TATA------------TTTT---------A-A-T-A--AC-TT---GT-ATTA---T-TA----G--A-CCT-G-C-A-T-TGAAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------TCACTAGTACTATAGCAACATCTGTA-TGG--TT--A--T--TCA-TC--GGC-------T---TTATG---------TG----AT--T-TT---CAA-A-A-TC----C--AAATATTAC--GC--AACATACA----GC---A-A-CAGTAACT-T---AA--------AT-A----T----CAA-----GTGA--AA-G-C-TTGTTT-CC--ATGCCA-----ACAC-G--A-T-----GGTTGA-A-C--AATCC-CAA---ATATA-C-A-T-T-TT------TAGTAA---CTAT-AG-GTAAT-ATTA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG---------A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTG-TCGGATT---GGTCCA-AAaacgacccttatcagtatgaatagtcctt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgt-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--AAAT--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGG---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AT-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----ATGCA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---G-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACGtatgaccttgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtcatcaaatcactaaggctacatc----------------A-------------------T----------------------GTG-TGTACTT--T--T--TCA-TC--GGG-------T---TT------------TA----TTAGT-GTAGGCAT---T-GT----A--ATATAT--------------ACA----GC---A-AACAATAACG-T---GA--------AT-A----T----TA-------TAA--TA-GTC-ATTTTT-CC--AAGACA-----AAGC-A--A-T-----GATTGA-A-C--AATCT-CAA---ATATA-T-T-T-T----------AGTAA---CT---GG-GT-A--A-TACCAAGA-ACA-CT-CA--C--C--AT-GGCT-ATTTACA--A-------------GAG---A-G----ACA-TTC-T--GAGTGGGA---CA-AAAacccttacca
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gi|17                         :                                atggcagcaTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATA--CAT--ACATGTATATT-----TGCAA-A--TT-AAGAT-ACA--ATGA-TTTAAATAAA-GGAA-AAA-A---------AAAT-----AA-AGTGATATA-AG-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---TACGG--------------AA-TTCGG-GCCTA-T---T-----A--AACA----accctt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TGTCA--AA-G-C-TCGTTTTCC--ATGGCA-----ACAC-C--A-C-----GACTGA-AAC--AATTC-AAATC-ATACT-T-T-C-T-TC-------AGTAA---CTG--GG-TT-AC-C-TA-----A-ACA-CT-TA--C--C--A--TG-G-A-----A--A-------------TAC---A-G----ACA-TTT-TGTGAATGGGG--CCA-AAActg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taATGTACA----GC---A-A-CAGTAACG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TATGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGC-G--A-T-----GGTTGA-G-C--AATAC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---aaaatgcccttaccatgt
gi|2                          : tgtaaattacaacatgctttatccgctcctaattggaatTTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGAT--CCG-CCAATAGTATGTACACGAG-ATTTAATTAT--ACAT-TAT--TATGTGTGCAAGA--TT-AAAA--ACA--ATGA-TTTAAATAAAAG--A-AAA-ACAAAAACATAATTCCTAAAT-AGTAA-----AG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTT-TACT-AAT--GCGTCAGGGCGGTCTCGTTACAGACCAT-TTCGG-TCCTA-T---TCCTATA--AGCA----A----TCTGATTGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA-GCAA----TCGGAGATTT---TTTGATTATGGT------CAAA-ATATATAATTATTAATATAGAC--GCA--A------TAT-AC--GCATCACAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-T-ACGTACAA---A-AGCT-TG-TTCCA-C--TGCAAAC--GC--AA---TGGTTTT-----AAAAAA-TCTC--ACAA-TATGA-----------TTTT---------A-G-T-AATAC-TACC-AA-ATTATATT-CG----GCCGTCCTAA-C-A-A-TGAATTCAACCCAA-GTC--GCTTACAA----------------ATCAGCCTATGGCACACATCT----------------------GTGATGT--AT--A--CAGTCA-TC--AGG-------CGAATTGCG---------TG----TT--T-AT---CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATGACAGGC--GA-GTACA----GCCAGA-G-TAGTAGCA-T---AA--------ACAA----T----CAA--T-GGTGA--AAGG-C-ATATTTCCC--ATGACA-----ACGT-GGAA-TA----ACCTGA-G-C--AA-CC-AAC---AAACA-T-TGT-TATC------CAA-AA---CCA-----GT-AT-A-TA-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TT-T-A-----G--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GC-AAC--GC--AA---TGG--TT-----AAAAAA-TCTC--A-AA-TATCA-T---------TTTTAGTAATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTC-A-T-CG----G--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CTA----------------ATCACTATGGTTACATC---T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGC-------T---TTGcgtgaataga
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GATT--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----A------------------------------------AA-----AATAT-TAC--ACA--ATATAGGCCT-AC-AGCA--ACA--G-TAACAT----A-AT---GATCAAT-T-AC---TAA---A-AGCT-TGTTTCTA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--TT-----AAAA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---TAA---A-AGTT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--CT-----AAAACA-TCTC--A-AA-TATAA-TTTTTAGTCATTTT---------A-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG----A--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTT--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------
gi|23                         :                                        TTTAGA-TCA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------GT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATA--CAC--A----TAT--T-----TGCAA-A--TT-AAGcac
gi|24                         :                                     tacTTTGGA-TAA--AT-ATCTTTATT--TGAAAGGTTGAAA-T-------A---GTT--GT--C-T-C-A-TA-TATGT-AACT-G-ATATA--CA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cCCTA-T---T-----ATAAGCA----------CTGATT--T--AT-TCT-AG-TGCG--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTT---GTT--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -G----ACA-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACGacgcttaccatatatag
gi|3                          :                                        TTTGGA-TAG--ATTATTTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AAAA-TATGT-AACT-G-ATATA--CAT------GTAT--G-----TGCAA-A--TT-AAGAA-ACA--ATGA-TTTAAATAAA-G--A-AAA-C---------AATT-----AT-AGTGATATA-AG-ATATTTT--CCCATA--TTA---TT-TATTTGAT--GCGT---GATTG--------------AA-TTCGG-ACCTA-T---T-----A--AGCA---------A-TGATT--C--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-GTTA-C-AA----T----GGTTTTTTTTT--TT----T------CAAA-AT---CAT-----TAAAT-TAC--ACA--A------TTT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGC----A-AA---CGTC-ATGT-AC---TAA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--TT-----AAAA-A-TC-G--A-AA-TAT-A-T---------TTTA---------A-G-T-A--ACTTA---AACATTA-A-T-CGC---G--T-CTT-A-T-A-A-TGAAT--G---CGA-AT---GT---CAAATCACTATTGCTATATA-------------------T----------------------GTG-TGA--TT--A--T--TAA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TTA--CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---T-A-TAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----TAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGATA-----ACGC-G--A-T-----ACTTGA-G-C--GATCC-AAA---ATACA-T-T-T-C-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCAGATT-GGGGCTCA-AAACacccttaccatatatag
gi|4                          :                                     tacTTTGGA-TAA--ATCA-CTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CACT-GGATATA--CATGTACATGTAT--T-----TACAA-A--AT-AAGAT-ACA--ATGA-TTTAAATAAC-G--A-AAA-A---------AATT-----AT-AGAAATATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---GACGG--------------AATTTCGG-GCCTA-T---T-----T--AGCACTGCC----ACTGATT--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GG-GT---TTT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TAC--GCA--A------CGTAAC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-T-AC---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--GC--AA---CGG--TT-----AGAATA-TCTC--A-AAGTATAA-T---------TTTT---------A-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG----G--G-CCT-A-C-A-ATTGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------AT--TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CACTA-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T-----AA--T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCATT-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----AC---TT-TCGGATCGGGGGGCCC-AAACGaacccttacaatata
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