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Reference ( family-2857 ) : TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATN--TACGTGTATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TTN-----A-GCACTG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNNTTTT---T--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-TG-G--TT--------AGAACA-TCTC--A-AA-TATAA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|15 : TTTGGA-TAA--ATCATA---AAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TGT------------T--G-AC----CATT--GGCAT--ATTTACAA-A--TT-AAGAT-ACAATATGA-TTTAAATAAA-G--ATAA-A---------A-TG-----GTA-GTGATCACTGATGTA-AG-ATATTATTTTCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACTG--------------AA-TT------------A-----A-GCAC-------TGAT--T--T--AT-TCT-AC-TTCT--T----GCAG-ATTA-T-AA----T----Ggttataaactccttacaataataa
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gi|17 : atggcagcaTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA--CATGTATATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-GGAAAAA-A---------AAAT-----AAA-GTGAT-------ATA-AG-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---T---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TTA-----A-ACACTG-accctt
gi|18 : -TGTCA--AA-G-C-TCGTTTTCC--ATGGCA-----ACAC-C--A-C-----GACTGA-AAC--AATTC-AAATC-ATACT-T-T-C-T-TC-------AGTAA---CTG--GG-TT-AC-C-TA-----A-ACA-CT-TA--C--C--A--TG-G-A-----A--A-------------TAC---A-G----ACA-TTT-TGTGAATGGGG--CCA-AAA
gi|19 : taATGTACA----GC---A-A-CAGTAACG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TATGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGC-G--A-T-----GGTTGA-G-C--AATAC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---aaaatgcccttaccatgt
gi|2 : tgtaaattacaacatgctttatccgctcctaattggaatTTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGAT--CCG-CCAATAGTATGTACACGAGATTT--A-ATTATACATTATTATGTGT----GCAAGA--TT-AAAA--ACAAT--GA-TTTAAATAAAAG--AAAA-ACAAAAACATAATTCCTAAATA-GTAA------------AG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTTTA-CT-AAT--GCGTCAGG---GCGGTCTCGTTACAGACCAT-TTCGGT-CCTA-TTCCTATAA-GCAAT-----CTGAT--TGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA-GCAA----TCGGAGATTTTT---TGATTATGGT------CAAA-ATATATAATTATTAATATAGACG--CA--A------TAT-AC--GCATCACAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-TA-CGTACAA---A-AGCT-TG-TTCCA-C--TGCAAAC--G-C--AA-TG-GTTTT--------AAAAAA-TCTC--ACAA-TATGA-----------TTTTA-G-T-AATAC-TACC-AA-ATTATATT-CG---GCCGTCCTAA-C-A-A-TGAATTCAACCCAA-GTC--GCTTACAA----------------ATCAGCCTATGGCACACATCT----------------------GTGATGT--AT--A--CAGTCA-TC--AGG-------CGAATTGCG---------TG----TT--T-AT---CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATGACAGGC--GA-GTACA----GCCAGA-G-TAGTAGCA-T---AA--------ACAA----T----CAA--T-GGTGA--AAGG-C-ATATTTCCC--ATGACA-----ACGT-GGAA-TA----ACCTGA-G-C--AA-CC-AAC---AAACA-T-TGT-TATC------CAA-AA---CCA-----GT-AT-A-TA-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TT-T-A-----G--
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gi|8 : -TACG--CACTA------C-T-AT-AACA--CCA--G---ACTC----A-GAACGCATTGAG-C--C---TAA---ATAGCTGTGTTTCCA-TCGAGC-AACCTG-C--AA-TT-G--TTTATACAAAAGAGTA-CC------AA-TATGACT---------TTTTACG-T-A--TT-TATAAAA-ATTA-A-TGCGAAAG-GG-CTC-A-C-ATA-TGAAA--C---CGA-GTC--GT---CAA----------------aacccttaccataattatatagtc
gi|8 : G-TGT--TT--A--TGCCCA-TC--GGAGGTGGCCT---TAGCGAGTGTAGTTTG----TT--T-CC---TTC-A-T-CC----ATTAAATAT-AC--GCCCGA-GTACA----G----A-A-TAGTAGCGGC---GATTGCCATTAC-A----TGCTCCAATCT-TGTGA--AA-G-T-TTACTT-CCTTATGGCAGACTCACAC-T--A-T-----TTTCGA-GCC--AATCC-AAAATTATACA-C-T-TAT-TG------TGATAA---CCC--AG-GT-AT-A-TA-----A-ACT-TTGCAACC--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TA----A-G----ACA-CTT-TTGGA-TGGGGGCCTACAAACGttttctacttagtcttgaaccattgtacatctggagtgtttatgcccatcggaggtggccttagcgagtgtagtttgtttccttcatccattaaatatacgcccgagtacagaatagtagcggcgattgccattacatgctccaatcttgtgaaagtttacttccttatggcagactcacactattttcgagccaatccaaaattatacacttattgtgataacccaggtatataaactttgcaacccattgtagataagacacttttggatgggggcctacaaacgacccttacccat
gi|9 : tacgcactactataacaccagactcagaacgcattgagcctaaatagctgtgtttccatcgagcaacctgcaattgtttatacaaaagagtaccaatatgactttttacgtatttataaaaattaatgcgaaagggctcacatatgaaaccgagtcgtcaattttctacttagtcttgaaccattgtacatctgga-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTT--CCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGA--------------AA-TTCGGG-CCTA-TTA-----A-GCACTG-------AT--A--T--AT-TCT-AG-TGTT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTTT---T--TT----TTTTC--CAAA-AT---AAA-----AATAT-TACG--CA--A------TAT-AC-AG-A--ACA--G-TAACGT----A-AA---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA-TG-G--TT--------AAAAAA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-TAA--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G--G-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------ATCCTATGGCTACATC----T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGT---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GA-GTACA----GC---A-A-TAGTAGCA-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTAA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGT-G--A-C-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CCA--GG-GA-AT-A-TA-----A-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG-T-acccttacccat
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consensus : TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATN--TACGTGTATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AGCACTG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNTTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAANA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
Reference ( family-2857 ) : TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATN--TACGTGTATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AGCACTG-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNTTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAANA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
gi|1 : TTTGGAGTAATTATCATCTTCGAT--TTCAA-------ACT-------ATAAGTT--ATATC-GAT-AATA-TGCGT-CAC------TCGA-AT-AT-CTTT--T---TATTTTTGCAA-A--TTTAAAATTACA-T--GAATTTAAATAAA-G--AAAA-------------TT-----ATAAGTCAT-------ATA-AG-AAAATTTTCCCCATA--TAA---TTAAATTTGATAAGCGT---GTGGACGA--------------AA-TTCGGAACCTA-TTTTAC-A-CGCACT--C-ACTGCT--T--TTGAT-TCT-A--TGCC--TCTCCGCAG-ACTATG-AAATGTT----GCTTTT---TT--TT----TA-----CAAATAG---AAA-----AATAT-TACAGACA--C------TAT-ACTAGCA---CATCGCTAACGTTCAGA-AT---CA-CAAT-TAAC---TAACAGA-AGTT-T--TTCCA-T--GGA-AAC--GGC--AAATGTGT--TT-----TAAA---TTTT--G-AA-TGT-------------TTTCA-A-C-AT-AC--A---AG-ATTA-A-T-CG---G-CA-CC--A-CAA-A-TGTAT--A---CAA-GTCCTGT---CAA----------------A-------------------TCACTATGGGCTAATCTG-----GTG-TGTC-TT--A--A--TCA-GC--GG--------T---TTGCGTC-------TG----TT--T-TTA--CAC-A-TGGCA---A--AAATATTTG--GC--GA-G-ACAATTGGC---ATA-AAGTAGCA-TCTAAA--------AC-ACAACT----CAAT-TCTGTGGATAA-G-TGCTAAAT-CC--AT-GTA-----ACGT-G--A-TACGTCGCTTGACG-CCTAATTCAAAA---ATAGA-TGT-T-T-TCTCCATATAGTAAC--CTA--GG-GT-AT-A-TA-----A-ACGTTT-CA--C--C--AT-TG-TCA-----G--A-------------TAA---A-GGACAATA-TTTATGGGAC--AAGGCCCA-AAA
gi|10 : GT----A-AA---C---GAT-TT-G---CAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGA-AAA--G-C--AA---TGG--CT-----G-----------------TATA------------TTTTA-A-T-A--AC-TT---GT-ATTA-T-T-AG---A-C---CT-G-C-A-T-TGAAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------TCACTAGTACTATAGCAACATCTGTA-TGG--TT--A--T--TCA-TC--GGC-------T---TTATG---------TG----AT--T-TT---CAA-A-A-TC----C--AAATATTAC--GC--AACATACA----GC---A-A-CAGTAACT-T---AA--------AT-A----T----CAA-----GTGA--AA-G-C-TTGTTT-CC--ATGCCA-----ACAC-G--A-T-----GGTTGA-A-C--AATCC-CAA---ATATA-C-A-T-T-TT------TAGTAA---CTAT-AG-GTAAT-ATTA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG---------A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTG-TCGGATT---GGTCCA-AAaacgacccttatcagtatgaatagtcctt
gi|11 : accaaatgcatacatatcaagtacaactacagtgtacaaataccatgtgcgt-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--AAAT--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGG---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AT-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----ATGCA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---G-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACGtatgaccttgt
gi|12 : tgtcatcaaatcactaaggctacatc----------------A-------------------T----------------------GTG-TGTACTT--T--T--TCA-TC--GGG-------T---TT------------TA----TTAGT-GTAGGCAT---T-GT----A--ATATAT--------------ACA----GC---A-AACAATAACG-T---GA--------AT-A----T----TA-------TAA--TA-GTC-ATTTTT-CC--AAGACA-----AAGC-A--A-T-----GATTGA-A-C--AATCT-CAA---ATATA-T-T-T-T----------AGTAA---CT---GG-GT-A--A-TACCAAGA-ACA-CT-CA--C--C--AT-GGCT-ATTTACA--A-------------GAG---A-G----ACA-TTC-T--GAGTGGGA---CA-AAAacccttacca
gi|13 : taagagtcgtcgtgtatgctacaaatcT--A--T--TCA-TC--AGG-------T---TTATT---------TG----GT--T-TT---CAA-A-T-G-----A--AAATATTAT--GC--AATGAACA----GC---A-A-CAG-AACA-T---AA---------C-A----T----CAAT-A-TGGAA--AA-G-C-TTGTTT-CC--ATGGCA-----ACAC-A--A-T-----G-TTGA-A-C--AATCC--AA---ATAAA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-ACAA-TA-----A-ACA-TT-TG--CCAC--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---ATG----GCA-TTT-TCGGATTGGGGGCCAA-gt
gi|14 : --TT--A--T--TTAAT----GA-------T---TTAAG---------TGGT--CT--T-TT---AAA-A-T--C----A--AAATATTGC--A---GACATACA----GA---A-AACAGTAACG-C---TA--------AC-A----T----CAAT-T-TGT----AA-G----TCGTC-CC--GTGTAA-----ACGCTG--A-T-----GCTTGA-G-C--AACTC-AAA----TACA-T-T-C-T-TC------TAGTAC---ATA--AGTCT-AC-A-TA-----A-GCA-TCGCA--T--C--ATGGG-T-A--------A-------------TACTCGA-G----CCG-TTT-TCGCGTTGGATGCCtgactcttaccattatatattatcagtcct
gi|15 : TTTGGA-TAA--ATCATA---AAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TGT------------T--G-AC----CATT--GGCAT--ATTTACAA-A--TT-AAGAT-ACAATATGA-TTTAAATAAA-G--ATAA-A---------A-TG-----GTA-GTGATCACTGATGTA-AG-ATATTATTTTCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACTG--------------A------------A-TT-----A-A-----G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AC-TTCT--T----GCAG-ATTA-T-AA----T----Ggttataaactccttacaataataa
gi|16 : aac-------T---TTGTG---------TG----CT--TATT---TAT-G-T-G----------GTTTTAT--GC--AACATACA----GC---A-A-CAGTAATG-T---AA--------AC-A----T----CGAT-T-TGTAA--AA-G-T-TTGTTT-CC--ATTGCA-----ACGC-A--G-T-----GGTTGA-A-C--AATCC-CGA---AGATA-T-C-T-T------------TGA---CTA--GG-GT-AA-A-TA-----A-ACA-TT-CG--C--T--TT-GG-T-A-----A--A-------------CGT---A-G----ACA-TTT-TTAGACTGGGAACCAA-AAATG
gi|17 : atggcagcaTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGGAA-------A-T-------AT--GTC--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA--CATGTATATTTGCAA-A--TT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-GGAAAAA-A---------AAAT-----AAA-GTGAT-------ATA-AG-ATA--TTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---T---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AACACTG-accctt
gi|18 : -TGTCA--AA-G-C-TCGTTTTCC--ATGGCA-----ACAC-C--A-C-----GACTGA-AAC--AATTC-AAATC-ATACT-T-T-C-T-TC-------AGTAA---CTG--GG-TT-AC-C-TA-----A-ACA-CT-TA--C--C--A--TG-G-A-----A--A-------------TAC---A-G----ACA-TTT-TGTGAATGGGG--CCA-AAA
gi|19 : taATGTACA----GC---A-A-CAGTAACG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TATGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGACA-----ACGC-G--A-T-----GGTTGA-G-C--AATAC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---aaaatgcccttaccatgt
gi|2 : tgtaaattacaacatgctttatccgctcctaattggaatTTTGGA---A--ACGATCTCTCATATCGAAT-------A-TTCGAACAAT--GTTTGAT--CCG-CCAATAGTATGTACACGAGATTT--A-ATTATACATTATTATGTGT----GCAAGA--TT-AAAA--ACAAT--GA-TTTAAATAAAAG--AAAA-ACAAAAACATAATTCCTAAATA-GTAA------------AG-ATATTAA-ACCCATAAGTAAACCTTTA-CT-AAT--GCGTCAGG---GCGGTCTCGTTACAGACCAT-TTCGGT-CCTA-TTCCTATA-AGCAAT-----CTGAT--TGGT--ATCTCTGAG-TGATGGC----GCAG-ACTA-GCAA----TCGGAGATTTT---TTGATTATGGT------CAAA-ATATATAATTATTAATATAGACG--CA--A------TAT-AC--GCATCACAAAG--AACGT----ATAA---GACAAAT-TA-CGTACAA---A-AGCT-TG-TTCCA-C--TGCAAAC--G-C--AA---TGGTTTT-----AAAAAA-TCTC--ACAA-TATGA-----------TTTTA-G-T-AATAC-TACC-AA-ATTATATT-CG---GCCGTCCTAA-C-A-A-TGAATTCAACCCAA-GTC--GCTTACAA----------------ATCAGCCTATGGCACACATCT----------------------GTGATGT--AT--A--CAGTCA-TC--AGG-------CGAATTGCG---------TG----TT--T-AT---CAC-A-T-GCAAAGA--AAATATGACAGGC--GA-GTACA----GCCAGA-G-TAGTAGCA-T---AA--------ACAA----T----CAA--T-GGTGA--AAGG-C-ATATTTCCC--ATGACA-----ACGT-GGAA-TA----ACCTGA-G-C--AA-CC-AAC---AAACA-T-TGT-TATC------CAA-AA---CCA-----GT-AT-A-TA-----A-AC--TT-TA--C--TCAAT-TT-T-A-----G--
gi|20 : GC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAAAA-TCTC--A-AA-TATCA-TTTTTAGTAATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTC-A-T-CG---G--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CTA----------------ATCACTATGGTTACATC---T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGC-------T---TTGcgtgaataga
gi|21 : GAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----A------------------------------------AA-----AATAT-TACA--CA--ATATAGGCCT-AC-AGCA--ACA--G-TAACAT----A-AT---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCTA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAA
gi|22 : ---TAA---A-AGTT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--CT-----AAAACA-TCTC--A-AA-TATAA-TTTTTAGTCATTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---A--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTT--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------
gi|23 : TTTAGA-TCA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------GT--GTT--AT--T-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACACA--------TATTTGCAA-A--TT-AAGcac
gi|24 : tacTTTGGA-TAA--AT-ATCTTTATT--TGAAAGGTTGAAA-T-------A---GTT--GT--C-T-C-A-TA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACA
gi|25 : c-CCTA-TT-----ATAA----G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TGCG--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTG---TT--
gi|26 : -G----ACA-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACG
gi|27 : A-TTT-TTGGATTGGGGGCCCA-AAACGacgcttaccatatatag
gi|3 : TTTGGA-TAG--ATTATTTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AAAA-TATGT-AAC------T--G-AT-ATACAT--------GTATGTGCAA-A--TT-AAGAA-ACAAT--GA-TTTAAATAAA-G--AAAA-C---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTTT--CCCATA--TTA---TTTA-TTTGAT--GCGT---G---ATTG--------------AA-TTCGGA-CCTA-TT-----A-AGCA------A-TGAT--T--C--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-GTTA-C-AA----T----GGTTTTTTTTT--TT----T------CAAA-AT---CAT-----TAAAT-TACA--CA--A------TTT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGC----A-AA---CGTC-ATGTA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAA-A-TC-G--A-AA-TAT-A-T---------TTTAA-G-T-A--ACTTA---AACATTA-A-T-C----G-CGTCTT-A-T-A-A-TGAAT--G---CGA-AT---GT---CAAATCACTATTGCTATATA-------------------T----------------------GTG-TGA--TT--A--T--TAA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TTA--CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---T-A-TAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----TAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGATA-----ACGC-G--A-T-----ACTTGA-G-C--GATCC-AAA---ATACA-T-T-T-C-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCAGATT-GGGGCTCA-AAACacccttaccatatatag
gi|4 : tacTTTGGA-TAA--ATCA-CTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--GGAT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AATTTCGGG-CCTA-TT-----T-AGCACTGCC-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GG-GTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGTAAC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---CGG--TT-----AGAATA-TCTC--A-AAGTATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G--G-CCT-A-C-A-ATTGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------AT--TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CACTA-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T-----AA--T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCATT-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----AC---TT-TCGGATCGGGGGGCCC-AAACGaacccttacaatata
gi|5 : TTTGGA-TAA--ATCATCTCTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--GT--C-G-C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATG--TACATGTATTTACAA-A--AT-AAGAT-ACAAT--GA-TTTAAATAAC-G--AAAA-A---------AATT-----ATA-GAAAT-------ATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGG--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----T-AGCACTG-CCACTGAT--T--T--AT-TCT-AG-TACT--T----GCAA-ATTA-G-AA----T----GGGTTT---TT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TACG--CA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-TA-C---TGA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---CGG--TT-----AGAATA-TCTC--A-AA-TATAA-T---------TTTTA-G-C-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G-CG-CCT-AAC-A-A-AGGAT--A---CGA-GTC--AT---CAA----------------A-------------------T----------------------ATG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--AGA-------T---TTGCG---------TA----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATACTAC--GC--AATGTACA----GC---A-A-TAGTAGCG-T---AA--------AG-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-TC--ATGGCA-----ACGC-A--A-T-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATGCA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATCGGGGGCCCA-AAACGacct
gi|6 : -C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA-------GTATT-GCAA-AAATT-AAGAT-AC--T--GA-TTTAAATAAA-G--AAAAAA---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATATAGCATATTTT--CCCATA--TAT---ATTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGA--------------AA-TTCGGG-CTTA-TT-----A-ATAA--G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AGTTGCT--T----GCAG-ACTA-A-TA----T----GTTTTT---TT--TT----TCCTTACCAAACAT---AAA-----AATAT-TACG--CA--AT-----TAT-AC-AGCA--ACA----TAACGT----A-AA---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTCTCCATT--GGC-AAC--G-TCAAA---TGG--TT-----AAAAGC-TCTCGAA-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-T-T-CG---G--G--CT-A-C-A-A-TG-AT--A---CGA---T--GT---CAA----------------A-------------------TC---------------------TTG-TGT--TTTAA--T--TCA-TCTAGCT-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-AGT-GC----AG-AAATATTAC--AC--GA-GTA-A----GC---A-A-TAGTAGCA-T---AA--------AC-A----T-----AAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT--C--ATGG-A-----ACGT-G--ATT-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TCA-----TAGTAA---CCA--GG-GT--T-A-TA-----C-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG---A-----GAAA-------------TAT---A-G----ACATTTT-TTGGATTGGGGG-CCA-AAACG
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gi|8 : -TACG--CACTA------C-T-AT-AACA--CCA--G---ACTC----A-GAACGCATTGAG-C--C---TAA---ATAGCTGTGTTTCCA-TCGAGC-AACCTG-C--AA---TTG--TTTATACAAAAGA-GTAC--C-AA-TATGACT---------TTTTACG-T-A--TT-TATAAAA-ATTA-A-TGCGAAAG-GG-CTC-A-C-ATA-TGAAA--C---CGA-GTC--GT---CAA----------------aacccttaccataattatatagtc
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gi|6 : -C-AATA-TATGT-CAC------T--G-AT-ATACATA-------GTATT-GCAA-AAATT-AAGAT-AC--T--GA-TTTAAATAAA-G--AAAAAA---------AATT-----ATA-GTGAT-------ATATAGCATATTTT--CCCATA--TAT---ATTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGA--------------AA-TTCGGG-CTTA-TT-----A-ATAA--G-C-ACTGAT--T--T--AT-TCT-AGTTGCT--T----GCAG-ACTA-A-TA----T----GTTTTT---TT--TT----TCCTTACCAAACAT---AAA-----AATAT-TACG--CA--AT-----TAT-AC-AGCA--ACA----TAACGT----A-AA---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTCTCCATT--GGC-AAC--G-TCAAA---TGG--TT-----AAAAGC-TCTCGAA-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-T-T-CG---G--G--CT-A-C-A-A-TG-AT--A---CGA---T--GT---CAA----------------A-------------------TC---------------------TTG-TGT--TTTAA--T--TCA-TCTAGCT-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-AGT-GC----AG-AAATATTAC--AC--GA-GTA-A----GC---A-A-TAGTAGCA-T---AA--------AC-A----T-----AAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT--C--ATGG-A-----ACGT-G--ATT-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TCA-----TAGTAA---CCA--GG-GT--T-A-TA-----C-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG---A-----GAAA-------------TAT---A-G----ACATTTT-TTGGATTGGGGG-CCA-AAACG
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gi|8 : -TACG--CACTA------C-T-AT-AACA--CCA--G---ACTC----A-GAACGCATTGAG-C--C---TAA---ATAGCTGTGTTTCCA-TCGAGC-AACCTG-C--AA---TTG--TTTATACAAAAGA-GTAC--C-AA-TATGACT---------TTTTACG-T-A--TT-TATAAAA-ATTA-A-TGCGAAAG-GG-CTC-A-C-ATA-TGAAA--C---CGA-GTC--GT---CAA----------------aacccttaccataattatatagtc
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gi|9 : tacgcactactataacaccagactcagaacgcattgagcctaaatagctgtgtttccatcgagcaacctgcaattgtttatacaaaagagtaccaatatgactttttacgtatttataaaaattaatgcgaaagggctcacatatgaaaccgagtcgtcaattttctacttagtcttgaaccattgtacatctgga-----ATA-GTGAT-------ATA-AG-ATATTT--CCCCATA--TAA---TTTA-TTTGGT--GCGT---G---ACGA--------------AA-TTCGGG-CCTA-TT-----A-AGCACTG-------AT--A--T--AT-TCT-AG-TGTT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GTTTTT---TT--TT----TTTTC--CAAA-AT---AAA-----AATAT-TACG--CA--A------TAT-AC-AG-A--ACA--G-TAACGT----A-AA---GATCAAT-TA-C---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--G-C--AA---TGG--TT-----AAAAAA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTTA-G-TAA--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG---G--G-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------ATCCTATGGCTACATC----T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TGT---TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GA-GTACA----GC---A-A-TAGTAGCA-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTAA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGT-G--A-C-----ACTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CCA--GG-GA-AT-A-TA-----A-ACT-TT-CA--C--C--AT-TG-T-acccttacccat
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blockSeqs : . . . AT . . . . . . . . . . . . GTACATG . . . A . . . . A . . . . . TC . . . . . . . . . . TAGCACTGCC . . . . . . . . . . . . . GT . . TTTTC ATC . . . CTAC . . . GT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . AA A . AATTTTAGTC . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . ATCACTATGGTTACATCT . . . . . . . C . . G . . . . . . AG . A T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . AC . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T GAAA T . . . . C .
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blockSeqs : . . . AT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . AAGCA . . . . . . . . . . . . . TT . . T AC . . . ACG . . . GT . . . G . . . . . . . . . . . . . . . GC A . GAT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . ATC . . . . . . . G . . . . . . . . . A . G C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . GA . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . T AA C . . . . T .
blockSeqs : . . . AT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAGCA . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . CCG . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . GA C . GAT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . AT . . . . . . . C . . . . . . . . . A . A T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . GG . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T AA T . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATA . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . AA A . GA . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . AT . . . . . . . C . . . . . . . . . A . A T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . AC . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T AA T . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . AT . . . . . . . A . . . . . . . . . A . A C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . AC . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T GA T . . . . C .
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blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AC . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . T A . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T .
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Reference ( family-2857 ) : TTTGGA-TAA--ATCATCTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AATA-TATGT-CACT-G-ATATA--CAT--ACGTGTAT--T-----TGCAA-A--TT-AAGAT-ACA--ATGA-TTTAAATAAA-G--A-AAA-A---------AATT-----AT-AGTGATATA-AG-ATATTTTTCCCCATA--TAA---TT-TATTTGGT--GCGT---GACGG--------------AA-TTCGG-GCCTA-T---T-----A--AGCA----T----ACTGATT--T--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-ACTA-G-AA----T----GNTTT---TTT--TT----T------CAAA-AT---CAA-----AATAT-TAC--GCA--A------CGT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGT----A-AA---CATCGAT-T-AC---TAA---A-AGCT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--TT-----AAAANA-TCTC--A-AA-TATGA-T---------TTTT---------A-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG----G--G-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTC--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------GTG-TGT--TT--A--T--TCA-TC--GGN-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TT---CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--GACGTACA----GC---A-A-CAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----CAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGGCA-----ACGC-G--A-T-----GCTTGA-G-C--AATCC-AAA---ATACA-T-T-T-T-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-TG-T-A-----G--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCGGATTGGGGGCCCA-AAACG
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gi|22 : ---TAA---A-AGTT-TGTTTCCA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--CT-----AAAACA-TCTC--A-AA-TATAA-TTTTTAGTCATTTT---------A-G-T-A--AC-TA---AA-ATTA-A-T-CG----A--A-CCT-A-C-A-A-TGAAT--A---CGA-GTT--GT---CAA----------------A-------------------T----------------------
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gi|3 : TTTGGA-TAG--ATTATTTTTGAT--TGAAA-------A-T-------AT--GTT--AT--C-G-C-AAAA-TATGT-AACT-G-ATATA--CAT------GTAT--G-----TGCAA-A--TT-AAGAA-ACA--ATGA-TTTAAATAAA-G--A-AAA-C---------AATT-----AT-AGTGATATA-AG-ATATTTT--CCCATA--TTA---TT-TATTTGAT--GCGT---GATTG--------------AA-TTCGG-ACCTA-T---T-----A--AGCA---------A-TGATT--C--AT-TCT-AG-TGCT--T----GCAG-GTTA-C-AA----T----GGTTTTTTTTT--TT----T------CAAA-AT---CAT-----TAAAT-TAC--ACA--A------TTT-AC-AGCA--ACA--G-TAACGC----A-AA---CGTC-ATGT-AC---TAA---A-AGCT-TGTTTTCA-T--GGC-AAC--GC--AA---TGG--TT-----AAAA-A-TC-G--A-AA-TAT-A-T---------TTTA---------A-G-T-A--ACTTA---AACATTA-A-T-CGC---G--T-CTT-A-T-A-A-TGAAT--G---CGA-AT---GT---CAAATCACTATTGCTATATA-------------------T----------------------GTG-TGA--TT--A--T--TAA-TC--GGC-------T---TTGCG---------TG----TT--T-TTA--CAC-A-T-GC----A--AAATATTAC--GC--AACGTACA----GC---T-A-TAGTAGCG-T---AA--------AC-A----T----TAAT-T-TGTGA--AA-G-C-TTATTT-CC--ATGATA-----ACGC-G--A-T-----ACTTGA-G-C--GATCC-AAA---ATACA-T-T-T-C-TC------TAGTAA---CTA--GG-GT-AC-A-TA-----A-ACA-TT-CA--C--C--AT-GG-T-A-----A--A-------------TAT---A-G----ACA-TTT-TCAGATT-GGGGCTCA-AAACacccttaccatatatag
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