lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555555555555555555555555555555 111111111 11111 11111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 4 55 9 7 33 555 222 0 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 2 333 2 444444444444444444444444444444 22 0 666666 999999999 2 33 3 7777 88888 5 222 11111 66 3 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 2
lowQualScore : . .. . . .. ... ... . ................................................................................... .. . ... . .............................. .. . ...... ......... . .. . .... ..... . ... ..... .. . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . .
lowQualScore : 0 55 9 0 99 000 999 6 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 88 0 555 0 444444444444444444444444444444 99 5 111111 666666666 9 22 3 1111 44444 0 555 11111 11 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 6
consensus : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TTGCCC-A-CCAAAATC------GACA--------T-TTNTN-C-T--GT---T------------T-T---TTTC-----A--A-A--TTA---AG--TGTAT--T-TTGTGCAAG---AA-TCC----CGAT-GCA-ACT---C-GA-T-TAGT--TGTTA------TTCT--------CAATTTGA--TNAAAATGAC----GT-N---AA-ATGGGATTT-----TTT--TCAC----GT-A-G-------NT------TTTCT----------TCC-----AG-------AAAA-CAT--C--G-A--G---AG-NNT---TGG-----ACAAA-CTTTATATTTAT--A-T-A---TGANAGATC-AT-C---TNTNCAGT-ACATGT--A--TG--ATA-GAAAAAAA---TTGTTT--GTCC--AAAGCTGCA----C-T----GTTT-----------CT------A-----------AT--------A---AA------TNA-----GCA------TTT--T---A--NCTAG---ATTT------ANATTG---------CATCAC---TTTCG--AT---GCTG-TGTACTCCAA-A---T-ACTGTAAAT-TAG-TA-T-CAGAGACAA-ATTATGTGAAACTGTATTGGAC---A-CG--ATC--TC---TTTTA-TGA-AATAGAA-------AG-A-AGATTTAA---TCTTT--CTTTAAA--GCTTT----AAAA-NT---T-GA----G--TTT-------AT-G-G--GGCCCC----GGAAAGG-CTGTTATCATACANAGTCCTT
Reference ( gi|3 ) : ACTAT-A--TATGGTAAGGACT--CTAT---TTGCCC-A-CCAAAATT------GACA--------T-TTTTA-C-T--AT---T------------T-T---TTTC-----A--A-A--TTA---CA--TGTAT--T-TTGTGCAAG---AA-TCC----AGAA-GCA-ACT---C-AA-T-TAGT--TGTTA------TTCT--------AAGTTTGA--TAAAAATGAC----AT-C---AA-ATGGGATTT-----TTT--TTAC----AT-A-G-------AT------TTTCT----------TTC-----AA-------GAAA-CAT--C--A-A--A---AG-AAT---TGG-----ACATA-CTTCATATTTATTTA-T-A---TCATAGATC-AT-C--ATGTACAGT-ACATGT--A--TG--ATA-GAAAAAAAAAATTGTTT--GTCT--AAAACTGCA----C-T----GTTT-----------CT------A-----------AT--------A---AA------TCA-----GCA------TTT--T---A--CCTAG---ATT-------ACATTA---------CATCAC---TTTCC-CAT---GCTG-TGTACTCCAATA---T-ATTGTAAAT-TAA-TA-T-TAGAGATAA-ACTATGAGAAACTGTATTGGAC---A-GA--ATT--TC---TTTTA-TGA-AATAGAATTAAGCAAG-A-AGACTTAA---TTTTT--CTTTTAA--GCTTT--A-AAAA-AT---T-GA----A--TTT-------AT-G-G--GGCCCT----GGTAAGG-CTGTTATTATACAAAGTCCTT
gi|2 : ACTGT-A--TAT---AAGGGCT--CTAT---CTTCCC-A-CCAAACTT------GACA--------T-TTGCC-T-T--AG---T------------T-T---CT-------A--A-A--TCA---AG--AGTAT--T-TTGTTTAAG---AA-TCC----CCAT-GTA-ACT---C-AA------C--TGTTT------TTCT--------CAATTTGA--TCAAAACGAT----GTAC---AA-ATGGAA
gi|7 : aggACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TCGTCA-A-CCATAGT-------GATG--------T-TTGTG-C-T--GT---T------------G-T---TTGA-----A--A-A--TTAAATCA--T---T--T-TTATGCAAG---AA-TC-----ATAATGCA-ACT---TTAA-A-TAGT--TGATA------TTCT--------TAATTTGA--TAAGAATGAC----cacaagcctgacactttgctgctcatatcttgacataaagtggctgtttttcacataagattttcttatagaaaatatcaattacaggttaggacaacctttatactaatctttcctgtacactgttcaagatacaagaaatgtttgtctagggctatattctatgtttacagaaaacattcataaataagaactttctaatttagttgatcaaaataaaaagatagcatactttagatgctgtgtatttcaaagtactgtacacatcagagacaaaacaggtgaaattgaattggacatgatttccttttttagtgaaatagaagagttatactttctttacagttttcaaatttggagttttactgggctctgaaggctgtccattcttatatggtattcctt
gi|5 : aagACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TCGTCA-A-CCATAGT-------GATG--------T-TTGTG-C-T--GT---T------------G-T---TTTG-----A--A-AA-TTAAATCA--T---T--T-TTATGCAAG---AA-TC-----ATAATGCA-ACT---TTAA-A-TAGT--TGATA------TTCT--------TAATTTGA--TAAGAATGAC----ttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccaggaaagatggtgtgcatgcctggacaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctatatatgaccctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaagagaacttaaaatatttaataacattttaactagatattaagttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|6 : ataaaagACTAC-A--TATAATAAGGGCT--ACAA---TTGCCC-A-ACAAA-------------------------TTA-G-A--AT---C------------T--------C-----A--------TA---GG--TATAT--T-TTGTGAAAG---AA-TCC----CAAT-GCA-ACT---C-------AGT--TACTA------TTCT--------AAATATGA--TCAAAATGAC----AT-ttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccagaaagatggtgtgcatgcctggacaaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctataatatgacctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaaagagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|4 : aggACTAT-A--CACGATAAGGGTG--GTGT---TTGCCC-AACCAAAAT---------CA--------TGCTTTC-C-T--CT---TCAGTCGTAAGTGT-T---CTTG-----ATCA-A--TTT---CA-----AT--T-TGAT-CAA----AA-T-------GA---CATACT---C-AA-C-TACT--TGTAA------C-CG--------GAATTT-----AAACATCAC----G------AACATGACGTTT-----TGTCGTTAT----TTTC-G-------ATCTGCTATTTCT----------TCT-----AG-------AAAA-TGTACC--G-A--GTGTAG-GCT---TGG-----ACTAA-ATTCATATTCG-------------------C-AT-----TGCAGAAT-ACATAT--A--TC--ATT-GAAAAATA---TTGTTT--GTCC--AAAACTACA----T-TATATGTTT-----------TTCG----A-----------AT--------G---AAAAACGTTCATACTAGCAAACAAATTT--C---A--C-TAA---ATTTGAGAA-ATAT-----------CTTC-T---TTTTA-CAT---TCTT-TGTACTCCAA-------------------A-TA-T-CAGAGA-GA-ACAATGTGAAACTGCATTGTAC---A-TG--ATC--TC---CTCTC-TAA-AATA-AAT----CAAG-A-A---TTCA---TTTTT--C-TTCAACGGCTTT--C-AAAA-TT---T-GACCCGA--GAC-------AT-G-G--GACC------AGAAAGG---GTTGTTATACAAAGTCTTTgggaactttaactaaaatttatataaacaggatacagattaggtctaatttacagttttcctccagcaagcagccttgaacatgctttattaagtgatagaaaaattttgtgtgtcctgaattatgctcgatgttttctgaccggaaaatgttcctaaaaattaagtaaaattgagacattgtgccacttttgatgctatgcactccaaatgagcataagtatcagatacaataatgtgaaactgcactgatcacaatccgtcttatctgacaatagaaatttaaaagttacaaaaattgtgagtttgatgggaacccagaaaagcatcatacagagtcc
gi|1 : aggACTATTA--GATGATAAAG-CT--CCAT---TTGCCT-A-CCAGAATC------AACA--------------A-G-C--ATGACT------------C-G---GCTT-----A--A-A--TAATT-CAG-TGTGT--T-TTGTGCAAG---AA-TCC--------------CTTTGC-AG-TGCAGT--TGTTA------TTCT--------CAATTTGATTTAAAAATGA
gi|19 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggACTGT-A--TGTGACGAGGGCTTCCTTTCAATTGCCC-A-CTGAAACTTAAATCAACAGGGGTTTCT-TTTTC-A-G--GT---T------------T-TGTATTTC-----A--A-AA-TTA---AG--TGTAT--C-TTATGCAAG---AC-TCT----TGAT-GCA-ACT---C-GA-T-TA------TTA------TTCT--------CAATTTGA--TCAAAATtgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaaatcaaagattaatatttcctgtacatgcaagtgattgagaaaaatatgttccaagctgtgcatgttttctgatagaaaacatattttgaatatgtagcaggaggggtttgctgtgtactgcaaatgtctaattttgtagccaaattatgtgaaacagtactggacatagcctcctatgaaatagaagacatattttttggcagctttgaatttgagttttatcagggctgggaggggctgttatcatacatagtcct
gi|17 : atataaacttatgataaatacatttgtaagaaaggATTAT-AATTATA-TAAGGACA--CTAT---TGGCTT-A-TTAAAGCT------GGC---------T-TTTCA-A----GC---T------------T-T---TTTC-----AG-A-A--TTT---AA--GGTAT--A-TTGTACATG---AA-TC-----ACAT-GCA-ACT---C-G----T-GT--TGTTACTAGTATTTT--------CAATTTGA--TAAAAATTATGTTAAT-CAGGAA-ATATGATTT-----TTT--TCGCCGCTGT-C-G-------GT------ATTTTGATATATATGTAC-----AATGGCTTGAAAA-CAT--CT-A-A--AGC-AG-ACT---TGG-----ATAAG-CTTTA-A---ATTCA-T-A---TCATAGACC-taagtagatcaagaatgatgacgttttgtttcctaatttggtataaag
gi|29 : ggTAT-A--AATGAAAAGGGTT--CTAT---TTGCCC-T-CAAAAATT------TACAGCAGTGT-T-TTTTT-C-T--CTC--T------------C-T---CTCC-----A--ATA--TTA---AA--TGTATAAA-TTGTGCTAA---AA-TCC----CGGT-GCA---T------A-T-CAGT--TGTTA------TTTT--------tatttttccagagcgtatacg
gi|41 : aaatgaaAT-A--TATGATAAG---T--CTGT---TTTCCCCA-CCAAGTTC------AGCA--------T-TCATG---T--GT---T------------T-G---TTTC-----A--TTG--TTA---AT--TGTAT--T-TTGTGCAAG---AA-Tccatttaaac
gi|32 : ggactaatgATGATAAGGGCT--TTAG---TTTCCT-G-CCAAAATC------GACA--------G-TCATA-CATTAAT---T------------T-TG--TTTC-----A--A-AATTTA--------GTTT--T-TTGTGCAAA---AA-TCCCTATAAAA-GCT-ATG---C-AA-C-T--T--TG-TG------TCC-----------GTTCGA--TGAAAATGA
gi|28 : AATGACA--CTAT---TTGGCC-C-CCAATATT------GACA--------A-TCGCA-C----AT---T------------TAT---TTTC-----A--A-A--TTA---AG--TG-AT--CATTGTGCAAG---AA-TGT----CGAT-ACA-ACT---T-CA-T-T-GTAATGCTA------TTTTCTCGCAACAATTTTGT--TTGAAA--AC----AT-C---AA-
gi|26 : aagaaGGCT--CTGT---TTGCCC-A-CCCAAATC------AACA--------T-CATGATC-T--GT---G------------T-T---TTTCTTTCAA--A-A--GTA---TAAGTGTAT--G-TTATGCAAG---TA-TCA----TGAT-GCA-ACT---C-AGTT-TAAC--TG---------GTCT--------CA-TTTGG--CCAAAATGGT----AT-G---AA-ATTAGAATTAAACATCA--TTAC----AA-A-T-------GT------TTTCT----------T
gi|31 : CT--CTAT---CTGGCT-C-CCAAAATC------AACA--------G-GTGTG-C-T---T---T------------T-G---TTTC-----A--A-AT-TTG---GG--TGTGT--T-TTATGCAAGTTTTA-TGC------AA-GTA-GCC---T-GA-A-GAGT--TGTTA------ATCG--------CAGTTTGG--CAAAAATGA
gi|18 : g-CTAAAATC------AAC------------TTTA-TGT--GC---T------------T-T---GTTT-----A--A-AG-TTT---GG--TGTAT--T-TTTTGCAAG---AA-TCC----AAAT-GCA-ATT---C--A-T-T--T--T-TTA------TTCT--------tctgtagggtgagaat
gi|35 : ---TTTC-----A--A-AA-TCA---AG--TGTAG--T-TTATGCAAG---AA-TCC----CAAT-GCA-AGT-----GA-T----T--TGTTA------TTCT--------CAGTTTGT--TCAAAACAGC----AT-ctcgatttcttatttatcaaagtgatgtagatttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacttttttctatagaaaatggaacgtagatttgggcaaactttgtattaattccacaga
gi|14 : TTC-----A--A-AA-TTA---AG--TGTAT--T-CTGTGCAAG---ACTTTC----AG-T-GC--ACTGTAC-AT-G-TAGC--TGTTA------TTCT--------TAATTTGA--tctcctaaccatgacatcacaaacacactattt
gi|10 : TA---AA--TGTAT--T-TTGTGCAAA---AA-TTC----CGAT-GCA-TCT---C-AA------T--TGTTA------TTGT--------CAGTTTTA--ACAAAATGAT----GT-A---GA-ATgtagactgcacacaacagaattatgatgtcataaatacaattctcaagtcttgacatgaaatgtttattattcacagattaacttctgaagcattttgtccaagccttgaacaaatatatttatactctagacatacttttcctgtaaacacatttaaaacttcgctcatatagaattgtgctctctgtttcctgacatcaaaaaaataaaaatagcaatttgacctgaatt
gi|9 : --TGTAT--T-TTATTC-AG---AA-TCA----TGAATGCC-ACT---C--A-T----T--TGTCA------TTCT--------CAGTCTGA--tatgacttcacaaacatcacactttattgtatttttgacgtaaattggccaaatttaacgtaaattttctagtccaagaagcttagaaaacttaaaattagattttttaaatttccagtacacgtttatgacaagaagattgtctttgcccaaaaagctgcaatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|12 : gttcaaaatctaataag--TGTAT--T-TTGTGCAAG---AA-T-T----AAAA------------------------TGTT-------TTTT--------CAGTTCAA--TAGAAATGAC----AT-A---AA-Aacagaaagcagagaatcggaattatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgctaatttttctcacagtttttcctctagaaagcatttagcattggctttcagaaacttcatactcatcttttcaatacatgtgtgtaataggaaaattttgtttttccagagctgatctgtttcctgaaaaaatgtttccaaaaatgagcatttaaatgaatttctgtcaaattgcatcatttttgatgctatgttctccaagtaaatgtaggaattagtggaaaattgtgtagaactgtattggaca
gi|2 : agTGAC----AT-A---AA-GTGGC-TGT-----TTT--TCAC----AT-AAG-------AT------TTTCT----------TAT-----AG-------AAAA-TAT--C--A-ATTAC--AG-GTT---AGG-----ACAAC-CTTTATACTAATCT---------------T---T-C--CTGTACA----C-TGTTCA--AG--ATA-CAAGAAA-----TGTTT--GTCT--AGGGCTATA----T-TCTATGTTT-----------AC------AGAAAACATTC-AT--------A---AA------TAA-----GAA------CTT--TCTAA--TTTAGTTGATC-------AAAATAAAAAGATAGCAT-AC---TTTAG--AT---GCTG-TGTATTTCAAAG---T-ACTGTACAC------A-T-CAGAGACAA-AACAGGTGAAATTGAATTGGAC---A-TG--ATT--TCCTTTTTTAGTGA-AAT-----------AG-A-AGAGTTAT---ACTTT--CTTTACA--GTTTT----CAAA-TT---T-GG----AGTTTT-------AC-T-G--GGCTCT----G--AAGG-CTGTccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcacacatttgtgaggtaaaaaatagtttgaccaaagctactctgttttcttcaaagaaaaatattcacaaaacaaacaaatcagcaatttaattagttttagtaaaattagaatttatgacgagtactagctcccaaggactataagtatcgcaaattatatgaaactactggaca
gi|16 : aggactgtatataagggctctatcttcccaccaaacttgacatttgccttagtttctaaatcaagagtattttgtttaagaatccccatgtaactcaactgtttttctcaatttgatcaaaacgatgtacaaatggaacacaagcctgacactttgctgctcatatctGACTT-----TGT--TCAC----AC-A-T--------T------TTTAT----------ATC-----GA-------GAAAACAT--CCAATA--A---AG-ACT---TGA-----GCAAA-CTTTATATCTAT------A---ACACAGATTTAT-CTTACG-ACAGTTACATGT--G--TGTGATA-GAAAAAAA----TGTTTTTGTAC--AAAACTGCG----T-T----GAAT-----------C-------A-----------ATATTTA---A---AA------TCA-----ATA------TTTAGT---AGGTTTAG---A---------AC-TTG---------CATCAC---TTT-T-GGT---ACAGTTGTACT-CGATA---TGACTGTGAAT-TAG-TG-T-ccattcttatatggtattcctt
gi|9 : catcataaacatcacgttttgctgccagtATTT-----TTC--TCAC----A----G-------TT------TTTCC----------TCT-----AG-------AAAG-CAT--T--T-A-------G-CAT---TGGCTTTCAGAAA-CTTCATACT---------------------C-AT-C--TTTT-CAAT-ACATGT--G--TG---TA-ATAGGAAAATTTTGTTT--TTCC--AGAGCTGAT----C-T----GTTT-----------CCTGAAAAA-----------ATGTTTCCAAA---AA------TGA-----GCA------TTT------A--AATGA---ATTTCTGTC-AAATTG---------CATCAT---TTTTG--AT---GCTA-TGTTCTCCAA----------GTAAATGTAG-GAAT-TAGTGGAAA-ATTGTGTAGAACTGTATTGGAC---A-cgaattttgttgtgaaaatgtaataaacac
gi|7 : gttcaaaatctaataagtgtattttattcagaatcatgaatgccactcatttgtcattctcagtctgaacagaaagcagagaatcggaattatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgcta-----TTT--TCAT----GT-A-G-------TT------TTTCT----------TCC-----AG-------GAAA-GAT--G--G-T--G---TG-CATGCCTGG-----ACAAA-CTTTATATTTAT--ACT-A---TGAGGGATC-ATTC--CTGTGCACC--TATAT--A--TG--ACC-CTAAAAAA-------TT--GTCC--AAAGCTGCA----C-T----GTATATAAAAGAGAACTTAA---A-----------AT--------ATTTAA------T-A-----ACA------TTT--T---A--ACTAG---AT----------ATTA---------
gi|5 : aagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgtttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtag-----TTT--TCAT----GT-A-G-------TT------TTTCT----------TCC-----A--------GAAA-GAT--G--G-T--G---TG-CATGCCTGG-----ACAAAACTTTATATTTAT--ACT-A---TGAGGGATC-AT-------TCCTGT-GCACCT--A--TA--ATATGACCTAAAAAATTGT------CC--AAAGCTGCA----C-T----GTAT-----------AT------A-----------A---------A---AA------agttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|25 : ataaaagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgttttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtag-----TTT--TGAC----AT-A-GTGAAGCCGT------TTTTC----------TTCTATAAAA-------AAAA-CTT--C--A-G--A---AGCAGTCA-TTA-----ACAAA-CTTTATATTTAT--A-CCA---TGATAGATTTAT-T---TTTCCAGT-GCTTAT--A--TG--ATA-AATAAAAAAAA----AT--GCCC--AAAGCTACA----C-gagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|13 : agaatgatggggttttgctgccattgaagtaTTATTTA-T-AGACTGAT---TC-AT-C---TTTCCAGT-TCACGT--A--TG--ACA-GAAAAAA----TTCTGT--ATCTTCAAAGCTGTAATCTT-T----ATTT-----------CT------ACAGAAACGATCATGA------A---AA------TGA-----GCA------TTT--T---A--ACTAC---ATCTTCATAAATATTA---------AATTG-----TTCAGCATAGAGTTA-TATACTCCA------T-GTT--AAATGTAAATA-TCTGCATA-AA-ATTATGGTAAACTGTACTGAAC---A-GG--A-T--TC---TTTCA---A-A--AGAAATA-------A-AAATTTGA----TCTT--CTTTAAA--GCTTT-----AAA-AT--------------TTT-------GT-G-G--GACC------AGAAAGA-CT-TTATCACACATAGTCCTT
gi|1 : tacaaaacattaagcacagactttaatagataaacttg-A---TCAAAGATT-AA-T--ATTTCCTGT-ACATGC--AAGTG--ATT-GAGAAAAATA------T--GTTC--CAAGCTGTG----CAT----GTTTT----------CT------G-----------AT--------AGA-AA------ACA------TA------TTT--T----------G---AAT-------ATGTAG---------CAGGAGGGGTTT---------GCTG-TGTACTGCAA-A---T-GTC-------TAA-TT-T-TGTAGCCAA-ATTATGTGAAACAGTACTGGAC---A-TA--GCC--TC---CT--A-TGA-AATAGAA-------------GACATAT---TTTTTGGC-----A--GCTTT--G-AAT---T---T-GA----G--TTTT------ATCA-G--GGC--T----GGGAGGGGCTGTTATCATACATAGTCCT
gi|6 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggactattagatgataaagctccatttgcctaccagaatcaacaagcatgactcggcttaaataattcagtgtgttttgtgcaagaatccctttgcagtgcagttgttattctcaatttgatttaaaaatgatgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaa-T----GTTC-----------CT------A-----------A---------A---AA------TTAA----GTA---------------------AA---ATTGAG----ACATTG---------TGCCAC---TTTTG--AT---GCTA-TGCACTCCAA-A-------TGAGCAT-AAG-TA-T-CAGATACAATA--ATGTGAAACTGCACTGATC---A-CA--ATCCGTC---TTATC-TGACAATAGAA--------------ATTTAA---------------AA--G--TT--ACAAAA-ATTG-T-GA----G--TTTG------AT-G-G--GAACCC----AGAAAAG-C----ATCATACAGAGTCC
gi|24 : aggactacatataataagggctacaattgcccaacaaattagaatctcataggtatattttgtgaaagaatcccaatgcaactcagttactattctaaatatgatcaaaatgacatgggaactttaactaaaatttatataaacaggatacagattaggtctaatttacagttttcctccagcaagcagccttgaacatgctttattaagtgatagaaaaattttgtgtgtcctgaattatgctcgatgttttctgaccggaaaaACTA---------TATCAC---TTTCG-AA----G-TG-TGTGCTACAGAAAACT-ATTATAGAT------G-T-CAGAGACAA-ATGATGTGAAACTGTATGGGAT---A-TG--ATC--TC---TTTCA-TGA-AATA----TAGG-AAG-ATAG--TGAAAAGTTTTA--CTTTAAA--GCTCT--G-AA----T---T----------TTTTGCTCTGAT-G-G--GGGCCC----AGAAAGG-CTGTTATTA
gi|22 : aatgagaa-TGCACTCCAA-A---TCATTATAACT------A-T-CAGAAACAA-ACTATGTGTAACT---TTGAGCCGGA-GATGATT--TA----TTTA-TGA-AATACAA-TGAGAATGTA-ACA---AA---TCTAT--CTTTAAT--GCTTT------CC-ATTTGT-GA----G--TGT-------AT-G-G--A--CCA----GAAAAGG-TTGTTAT
gi|27 : accaagaatggaaattatcttattattgcagtccaGTATTCCAA-A---TGACTGTAAAT-T------T-CAAAGACAA-ATTATTTGAAATTGTGTAGGAG---A-TG--ATC--CC---TTTTA-TGA-AACAA--------AAG-A-AAATTTTG---TCTTC--CTTTCAA--GCTTT-----TAA-CT---TCGA----GT-TTT-------AT-G-G--TGGTCTAGACGGAAAGG-CTagaaagata
gi|37 : tttatacGAAACTGTATTGGAC---A-CG--ATC--TT---TTTT--------TAAAAT---------A-AGATTTAG---TCTTC--CTTT-AA--GATTT--------------T-GAG---A--TGT-------AT-GTG--GGCCCA----GATAAG--CTGTTAGTTTACAAAAT
gi|15 : cAACTGTAGCGGAC---A-TG--ACT--TC---TCTCA-TAA-AAT-GA-----------A-AGTTTTCA---TCTTT---TTTAAA--ACTTTTCA-AAAATATC--T-GT----G--TTTGA-----AA-G-G--GGCCAA----GAT-AGT-CTGCTATCACACAAACTCCTTt
gi|34 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagtaacagtttgtttacccagtgctgcattcgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctGTATTGAAC---ATGA--AGT--AC---TTC-A-TGA-AAT-GAA-------AG-A-AAATTTGG---TCATT--CTCTCGA--ATTTC--T-AGAA-TT---T-GAG---A--TTT-------AC-A-GCAGGCCAA----AAAGAGG-CTGCAATCATACAAAATCCTT
gi|42 : AG---TCTTT--CTTCAAA--TCTTTTTA-AAAA-TT---T-AA----A--TTTC------AT-G-G--GGTCGT----AGAAACA-CTGTTATTATACATAGTCCTTt
18 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): AAGGACCATATACGATACAGGCTGTGTTTCATGCTCACCAAATACAGCTCATCTGGCATTCTTAATTTGTTAAAATGACTGATTCAGAATTATGTGATTAATTTAATTAAGAAGAAAATTTCTCCATTTTGGAATAAAATGACTATTTTCTACCCAGTTTTTATTCTAGAAAACATGAAGAGCAGACTTGGACAAATTTCATATATGCCATAGCTCAGTGCATGCATGGCTTAATGAAAGTTGTACTTGTTAAGTTTTTTGAAAGAAAAACATCACAAAATCCAGTTTAATCAAATGTTAAAATAGAATTGAGAAACTATATCACATTTACTTCAAAAGACTGTAATATTGGACAGAGAGTATTTGAAATGGAAATGGGCATGATCTCTTTTATAAA
Unaligned ( gi|11 ): ATTGGATTAAAAATATTGATGTGAAAGCAGAATCATGACATCATAAACCTGATGCTATGCTGCCATTTGGGATATTTTGCCACAAAATGACTACTTTTGACACCTCAGTTTTTCTGAAGAAAAAAAATTGTGCACACACTCGGACAAATTTTATATTCACAATATATATTTCTCCCTCGATCCATTACACATAATATTATATGATTGTCATTGAAGAATTTTGTTTGTCCTAAGCTGCATGCATTCTATATCTGGAATAAAATATATATATCCAACTTCTTGGTGGAAATCCGAATTGAGAAATTGTATCACGTAAATTTTGAAGTATGTACTTGAAATAACTACTAAATTTCAGACAAAAATTA
Unaligned ( gi|20 ): TAAGAATCCCAGTACATCTCGCTTGTTATTCTCAATTTTATTGAAATTAGATAGAACCTAAATTTTGACTTGAAGATGACATTTTGCTGCTTGTTTTTTATTGTTGCCTTAAAATGGCTATTTTACATGGAGTTTTTCATCTAATGATAAAGCATGGAGTGCAGGCTTTGATAATGTTATGTTTACAGCATTATAGATTTATCTTTCCAGTACACAGATGGGAAATGTT
Unaligned ( gi|21 ): TTTGGTATTTTGACATCAAATTGCTATTTTCACGCAGTTCAGTATTCCAATCTCGAAATCGTTGACCACAGGTTTGGCCAAAGATTTCATTTACGTCTCCCGACCACATGTGTGATGGACTCTTTTGTGTTCAAAGCTGCTGTTTGCATTTTTTGAATGAAAAGTATTTAAAAACAATATTGTATATGTATTACGGGGGAAATCGTGTCACTTTCAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TTTCATTAAAACTCTACCATTTCTTTCTAGAACATTTATGTGATAGAAATTTTTTTTTGTCTCAAGTTGTACATTATGTCTTCTGAATGAAAAATATTGACAAAAATGAACATTTTAATTAAGGAAAATGAAAAACTGCATCATAGTTTAATGCTAAAGTTCTGTGAATATTAGAGAAAAATTATG
Unaligned ( gi|30 ): TATGCACTCCAAATGAGCATAAGTATCAGAGACAATAATTTGAAACTGCACTGAACACAATTTGTCTTATTTAGCAATAGAAATTTAAAAGTTACAAAAATTGGGAGTTTGATGGGAACCCAGAGTCCTTTA
Unaligned ( gi|33 ): TGAGCACAATGTTGGAACAAATTTCAAATCAATGTCATGGCTATATCTCTCTGGCACATGCAAGTGACAGAAAAATATTTCCTGTCTAAAGTTGTATTTCATGTATCCTAAAAGAAA
Unaligned ( gi|36 ): AACAAACTGAACATAATCTCTTTGACGAAATAAAAATTGATTTAGTCTTTTTTCAAATTTTTATAAATGTGAGCTACACCGGAGCTCGGAAGGGCTGTCATCAT
Unaligned ( gi|38 ): ATTTTTCTAGAACACGTGTGATAGATTAATTTTGTTTATTCGATATCACAATTGCGCAATATGTTTTCTGAAAGAAACTGCTTCCAAAAATTAGCATTT
Unaligned ( gi|39 ): TAAAATTACTGTTTTTCATGCAGTTTTTCATCTACAAAGCATCATGTGGAGTTGTAGATAAACAATGTATTTCTGCATGGATTTACCTTTCCGG
Unaligned ( gi|40 ): ACGCTGCTTATTTTCCATTCTCAATTTCATCAAAATGAGAACCAGAATTACGATATCATAGACATAACATTATGTCACTATTTTCAATATTTT
Unaligned ( gi|43 ): AACAAATTTTGAGTGAATTGAGAAAATGTGTCACTTTTGTTGCTTTGTACTTACAAATGACTGTGAATACTCAGT
Unaligned ( gi|44 ): TCTCTTTTATGAAATCAAAAATTTCGTCTTCCTTTAAAGCTTTTAAGATTTAGCTTCGTGAGTGCTTAAGAAGGC
Unaligned ( gi|45 ): TAAAATGAATATTTTCTGCAGCTTTTCTGCCAGAAAATATCAAATGCAGGCTTGGACAATGTCAT
Unaligned ( gi|46 ): ATCTTGTGTGAAAATCCCGATTTATCTCAAGTTTTTATTTTCAATATAGTTCAAAATGACGTAGA
Unaligned ( gi|47 ): ATTTTAGTAGAATTGAGAAAATGTGTCACTTTGGATGCTATGTACT
Unaligned ( gi|48 ): AATTGAGAAATTGCGTCATTTTTGACGTCATGTATTCCAAATGA
Unaligned ( gi|49 ): TAAAAGCTCTTCATAAAACAGTTGTAAGTGAAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333333333333 1111111111 1111111111 2222222222 1111111 1111111111 111111111111 44444444444444444444444444 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111 111111111111111 1111111111111111 11111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11111111111111 11 33333333333333333333333 33333333333333333 111111111 11111111111111111111111111111 1
lowQualScore : 3 44 33 444 444 2 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44 3 22 1 555555 222 777 1 1 1 5555 1 222222222222222222 22 1111111111 22 666666666 555 99999999999999 666666 22 88888888 1 1 3333333333 2 9999999999 444 33 1 2 5555555 2 3 2 2222222222 1 333333333333 33 66666666666666666666666666 4444 99999 2 2 2 9999999999999999999999999999999999999999999 2 333 44444444 1 33 66 555555555555555 4444444 8888888888888888 22222222222 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 55 0 33333333333333 55555 22 666666 2 44 4 55555 2 2 2 99999999999999999999999 2 2 1 333 33 1 3 666666 2 444 2 33333333333333333 33 444444444 2 2 99999999999999999999999999999 66 3 444 1
lowQualScore : . .. .. ... ... . . ......................................................................... .. . .. . ...... ... ... . . . .... . .................. .. .......... .. ......... ... .............. ...... .. ........ . . .......... . .......... ... .. . . ....... . . . .......... . ............ .. .......................... .... ..... . . . ........................................... . ... ........ . .. .. ............... ....... ................ ........... . ..................................................................................................................................................................................... .. .. . .............. ..... .. ...... . .. . ..... . . . ....................... . . . ... .. . . ...... . ... . ................. .. ......... . . ............................. .. . ... .
lowQualScore : 3 66 44 444 444 5 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 55 6 44 7 000000 999 555 7 7 7 4444 7 222222222222222222 22 2222222222 11 222222222 444 44444444444444 222222 22 88888888 8 1 0000000000 0 2222222222 444 77 0 7 3333333 4 3 4 6666666666 0 111111111111 11 33333333333333333333333333 5555 77777 1 1 2 6666666666666666666666666666666666666666666 6 444 11111111 5 22 55 888888888888888 9999999 1111111111111111 77777777777 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 66 5 88888888888888 99999 77 888888 6 33 0 00000 1 1 1 11111111111111111111111 4 7 2 999 11 1 1 555555 5 444 5 33333333333333333 77 666666666 5 5 11111111111111111111111111111 33 8 777 0
consensus : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C--T----G-T-TT---T---T--TTCAA-AA-T--TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCCGA-TG-CA-A----C-T---C-G---AT-TAGT--T--GTTA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA------TNAAAATG-ACGT-------AA-AA-TG-G-----N-ATT---TTT--TTC-AC----GT-A-GTT-TTTCT----------TCCA-------G----AAAACA--T--C--G---AG---AGNC----T---T----GG-----A-C-AAACT-TTATATTTA--TA-T-A-TGATAGA------T-----C-A-T--C-T--TTCCAG-TACA--------TGT--A--TG----A--T----A--G---A---AAA-----------AAAT-TGTTTG-----------TC-CAAAGCTGCA------C--T----GTTT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A---AA-----------TNAGCA------TTTT-------AACTAGAT-----------T--T-------------AA-----------------A--T--TGCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA-TGTA-CT-----C-CA-A-A-T--ACTG-TA--A-ATT-G-TATCAG-AGACAAATT---ATGTGAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT--TT----AG---TCTTTCTTTAA-AGCTT-T---A-AAATT---T--GAG-TT----T--ATGG--GGNCC---CGGAAAGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
Reference ( family-2602 ) : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTN-C--T----G-T-TT---T---T--TTCAA-A--T--TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCCGA-TG-CA-A----C-T---C-G---AT-TAGT--T--GTTA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA------TNAAAATG-ACGT-------NA-AA-TG-G-----G-ATT---TTT--TTC-AC----GT-A-GNT-TTTCT----------TCCA-------G----AAAACA--T--C--G---AG---AGNN----T---T----GG-----A-C-AAACT-TTATATTTA--TA-T-A-TGANAGA------T-----C-A-T--C-T--NTNCAG-TACA--------TGT--A--TG----A--T----A--G---A---AAA-----------AAAT-TGTTTG-----------TC-CAAAGCTGCA------C--T----GTTT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A---AA-----------TNAGCA------TTTT-------ANCTAGAT-----------T--T-------------AN-----------------A--T--TGCAT--------------CAC-----TTT-CGA------TGCTG-TGTA-CT-----C-CA-A-A-T--ACTG-TA--A-ATTAG-TATCAG-AGACAAATT---ATGTGAAACTGT--ATTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT--TT----AA---TCTTTCTTTAA-AGCTT-T---A-AAANT---T--GAG-TT----T--ATGG--GGCCC---CGGAAAGGCTGTTATCATACANAGTCCTT
gi|1 : ACTATTA--GATGATAAAG-CT--CCAT---TT---GCCT-A-CCAGA--------A------TC-AACA-------AG----CATGAC--TCG--G-C-TTAAAT----------A-A--T--TCAGT-GTGT--T-TTG------TGCAA---GAATCCCTT-TG-CA-G----T-G---C---------AGT--T--GTTA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GATT----TAAAAATG-ATGT-------AGTAT-TG-G-----A-ATT---
gi|1 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggT-A-GCT-ATTTT----------TTCA-------C----AAAACA--T-----G---AGCACAGGC----T---A----GG-----A-C-AAA-------------------A-TCAAAGA------T-----T-AAT--A-T--TTCCTG-TACA--------TGC--AAGTG----A--T----T--G---A---GAA-----------AAATATGTT--------------C-CAA-GCTGTG------CA-T----GTTTT----------CT------------------------G----------A----------T--------A---GA------------AAACA------TATT--------------------------T--T-------------GA-----------------A--TA-TGTAG--------------CAG----------GAGGGGTTTGCTG-TGTA-CT-----G-CA-A-A-T--G-TC-TA--A-TTTTG-TAGC------CAAATT---ATGTGAAACAGT--ACTGGACATAGC---C--TCCT--A-T---GA-AATAGA-------A-----GAC---------A---TATTTTTTGGC-AGCTT-T---G-AA-TT---T--GAG-TT----TT-ATCA--GGGCT---GGGAGGGGCTGTTATCATACATAGTCCTgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaaatcaaagattaatatttcctgtacatgcaagtgattgagaaaaatatgttccaagctgtgcatgttttctgatagaaaacatattttgaatatgtagcaggaggggtttgctgtgtactgcaaatgtctaattttgtagccaaattatgtgaaacagtactggacatagcctcctatgaaatagaagacatattttttggcagctttgaatttgagttttatcagggctgggaggggctgttatcatacatagtcct
gi|10 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggactattagatgataaagctccatttgcctaccagaatcaacaagcatgactcggcttaaataattcagtgtgttttgtgcaagaatccctttgcagtgcagttgttattctcaatttgatttaaaaatgatgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaa--TAAAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---AAATTCCGA-TG-CA-T----C-T---C---------AAT--T--GTTA----------T--TG---------TC---AG--------------T------TT--TA------ACAAAATG-ATGT-------AG-AA-T
gi|11 : TG-CCAC-------AA-AA-TG-A-----CTACT---TTT--GAC-AC----CTCA-GTT-TTTCT----------GA-A-------G----AAAAAAAAT--T--GTGCAC---ACAC----T---C----GG-----A-C-AAATT-TTATATTCA--CA---A-T-ATATA------TTTCTCC-C-T--C-G--ATCCAT-TACACATAATATTAT--A--TG----A--TTGTCATTG---A---AGA-----------ATTT-TGTTTG-----------TC-CTAAGCTGCATGCATTC--T----ATAT-----------CTGG----------------------A----------A----------T--------A---AAATATATATAT-CCAACT------TCTTGGTGGAAATCCGAAT-----------TGAG-------------AA-----------------A--T--TGTAT--------------CACGTAAATTT-TGA------AG-TA-TGTA-CT-----T-GA-A-A-TA-ACTACTA--A-ATT-----TCAG-ACAAAAATT---Atatgacttcacaaacatcacactttattgtatttttgacgtaaattggccaaatttaacgtaaattttctagtccaagaagcttagaaaacttaaaattagattttttaaatttccagtacacgtttatgacaagaagattgtctttgcccaaaaagctgcaatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|12 : attggattaaaaatattgatgtgaaagcagaatcatgacatcataaacctgatgctatgctgccatttgggatatttAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT------TA-AA-A-------------------------T--GTT-----------T--TT---------TC---AG--------------T------TC--AA------TAGAAATG-ACAT-------AA-AA-
gi|12 : -T--CTGCA--CACA--------TTT--G--TG----A-------G--G---T---AAA-----------AAAT-AGTTTG-----------AC-CAAAGCTACT------C--T----GTTTT----------CTTCAAAGAAAAATATTCACAAAACAA----------A----------C--------A---AA-----------TCAGCA------ATTT-------AATTAGTT-----------T--T-------------AGTAAA-------------A--T--TAGA----------------AT-----TT----A------TGACG-AGTA-CTAGCTCC-CA-A-G-G--ACTA-TA--A-----G-TATCG-----CAAATT---ATATGAAAC--T--ACTGGACAccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcacacatttgtgaggtaaaaaatagtttgaccaaagctactctgttttcttcaaagaaaaatattcacaaaacaaacaaatcagcaatttaattagttttagtaaaattagaatttatgacgagtactagctcccaaggactataagtatcgcaaattatatgaaactactggaca
gi|13 : agtgtattttgtgcaagaattaaaatgttttttcagttcaatagaaatgacataaaaccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagat----AAAACA--T--T--A---AGCACAGAC----T---TTAATAG-----A-T-AAACT-TGTTATTTA--TA-G-ACTGAT---------T-----C-A-T--C-T--TTCCAG-TTCA--------CGT--A--TG----A--C----A--G---A---AAA-----------AATTCTGTATC-----------TT-CAAAGCTGTAATCT--T--T----ATTT-----------CT------------------------ACAGAAACG--A----------TCATGA---A---AA-----------TGAGCA------TTTT-------AACTACATCTTCATAAATAT--T-------------AA-----------------A--T--TGT-T--------------CAG-----CAT-AGA-------GTTA-TATA-CT-----C-CA-T-G-TTAAATG-TA--A-A-----TATCTGCATA-AAATT---ATGGTAAACTGT--ACTGAACAGGAT------TCTTTCA------A-A--AGA-------AATAAAAAT--TT----GA---TC-TTCTTTAA-AGCTT-T---A-AAAT-----------TT----T--GTGG--GA--C---CAGAAAGACT-TTATCACACATAGTCCTT
gi|14 : tac--TTCAA-AA-T--TAAGT-GTAT--T-CTG------TGCAA---GACTTTCAG-TG-C--A----C-T-----GTACATGTAGC--T--GTTA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA------
gi|15 : ----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--CA------CCGTATTT--CGT-------GA-AAATGTA-----A-ATT---TTT--GTG-AA----G----GTT-TTTCT----------TTCA-------G----AAGATA--T--C--G---AATGCAGCA----C---T----GGGTAA-A-C-AAACTGTTAgtagactgcacacaacagaattatgatgtcataaatacaattctcaagtcttgacatgaaatgtttattattcacagattaacttctgaagcattttgtccaagccttgaacaaatatatttatactctagacatacttttcctgtaaacacatttaaaacttcgctcatatagaattgtgctctctgtttcctgacatcaaaaaaataaaaatagcaatttgacctgaatt
gi|15 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagAATC---ATATCTAACTGT--AGCGGACATGAC---T--TCTCTCA-T---AA-AAT-GA-----------AAGTT--TT----CA---TCTTT-TTTAA-AACTT-TTC-A-AAAATATCT--GTG-TT----TGAAAGG--GG-CC---AAGATAGTCTGCTATCACACAAACTCCTTattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctaactgtagcggacatgacttctctcataaaatgaaagttttcatcttttttaaaacttttcaaaaatatctgtgtttgaaaggggccaagatagtctgctatcacacaaactcctt
gi|16 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagtaacagtttgtttacccagtgctgcattcgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatac-----G-ACT---TTG--TTC-AC----AC-A--TT-TTTATA---------TCGA-------G----AAAACA--T--C--C---AATAAAGAC----T---T----GA-----G-C-AAACT-TTATATCTA--TA---A-C-ACAGAT-----T-----T-A-T--C-TTACGACAGTTACATG------TGT--G--TG----A--T----A--G---A---AAA-----------AAATGTTTTTG-----------TA-CAAAACTGCG------T--T----GAAT-----------C-------------------------A----------A----------TATTTA---A---AA-----------TCAATA-------TTT-------AG-TAGGT-----------T--T-------------AG-----------------AACT--TGCAT--------------CAC-----TTT-TGG------TACAGTTGTA-CT-----C-GA-T-A-TG-ACTG-TG--A-ATTAG-TGT-------CGAATTTTGTTGTGAAAATGT--AATAAACAC
gi|17 : catcataaacatcacgttttgctgccagtATTAT-AATTAT-ATAAGGACA--CTAT---TG---GCTT-A-TTAAA--------G------CT-GGC---------T----TTTC-A--A----G-C-TT---T---T--TTCAG-AATT--TAAG--GTAT--A-TTG------TACAT---GAATCAC-A-TG-CA-A----C-T---C-G------T-GT--T--GTTACTAGTA----T--TT---------TC---AA--------------T------TT--GA------TAAAAATT-ATGTTAATCAGGA-AA-TA-T-----G-ATT---TTT--TTC-GCCGCTGT-C-GGT-ATTTTGATATATATGTACAATGGCTTG----AAAACA--T--CTAA---AGC--AGAC----T---T----GG-----A-T-AAGCT-TTAAATT----CA-T-A-TCATAGA------C-----CTA-T--T-T--TTCCAG-AGCG--------TAT--A--CG----
gi|18 : gg-CTAAA--------A------TC-AAC--------TT----TATG----T----G-C-TT---T---G--TTTAA-AG-T--TTGGT-GTAT--T-TTT------TGCAA---GAATCCAAA-TG-CA-A----T-T---C-----AT-T--T--T---TTA----------TTCTC---------TC---GA--------------TTTCTTATT--TA------TCAAAGTG-ATGT-------AG-A
gi|19 : ACTGT-A--TGTGACGAGGGCTTCCTTTCAATT---GCCC-A-CTGAA--------ACTTAAATC-AACAGGGG---TT----TCTT-T--TTCAGG-T-TT---TGTAT--TTCAA-AA-T--TAAGT-GTAT--C-TTA------TGCAA---GACTCTTGA-TG-CA-A----C-T---C-G---AT-TA--------TTA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA------TCAAAATtttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacttttttctatagaaaatggaacgtagatttgggcaaactttgtattaattccacaga
gi|2 : atataaacttatgataaatacatttgtaagaaaggACTGT-A--TAT---AAGGGCT--CTAT---CT---TCCC-A-CCAAA--------C------TT-GACA-------TT----TGCC-T--TA---G-T-TT---C---T-----AA-A--T--CAAGA-GTAT--T-TTG------TTTAA---GAATCCCCA-TG-TA-A----C-T---C---------AAC--T--GTTT----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA------TCAAAACG-ATGTA------CA-AA-TG-G-----A-Ataagtagatcaagaatgatgacgttttgtttcctaatttggtataaag
gi|2 : aggTG-ACAT-------AA-AG-TG-G-----C--TG---TTT--TTC-AC----AT-AAGAT-TTTCT----------TATA-------G----AAAATA--T--C--A---ATTACAGGT----T---A----GG-----A-C-AACCT-TTATACT-----------------A--------------A-T--C-T--TTCCTG-TACAC-------TGTTCA--AG----A--T----A--C---A---AGA-----------AA---TGTTTG-----------TC-TAGGGCTATA------T--TCTATGTTT-----------AC------------------------AGAAAACATTCA----------T--------A---AA-----------TAAGAA------CTTT---------CTA-AT-----------T--T-------------AGTTGATCAAAATAAAAAGA--T--AGCAT---------------AC-----TTT-AGA------TGCTG-TGTA-TT-----T-CA-A-AGT--ACTG-TA--C-AC-----ATCAG-AGACAAAAC---AGGTGAAATTGA--ATTGGACATGATTTCC--TTTTTTAGT---GA-AAT-----------A-GAAGAG--TT----AT---ACTTTCTTTAC-AGTTT-T---C-AAATT---TG-GAGTTT----T--ACTG--GGCTC---TG--AAGGCTGTcacaagcctgacactttgctgctcatatcttgacataaagtggctgtttttcacataagattttcttatagaaaatatcaattacaggttaggacaacctttatactaatctttcctgtacactgttcaagatacaagaaatgtttgtctagggctatattctatgtttacagaaaacattcataaataagaactttctaatttagttgatcaaaataaaaagatagcatactttagatgctgtgtatttcaaagtactgtacacatcagagacaaaacaggtgaaattgaattggacatgatttccttttttagtgaaatagaagagttatactttctttacagttttcaaatttggagttttactgggctctgaaggctgtccattcttatatggtattcctt
gi|20 : aggactgtatataagggctctatcttcccaccaaacttgacatttgccttagtttctaaatcaagagtattttgtttaagaatccccatgtaactcaactgtttttctcaatttgatcaaaacgatgtacaaatggaacacaagcctgacactttgctgctcatatctAA---GAATCCCAG-TA-CA-T----C-T---C-G---CT-T--------GTTA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--TA------TTGAAATccattcttatatggtattcctt
gi|20 : tT-------AA-AA-TG-G-----C--TA---TTT--TAC-AT----GG-A-GTT-TTTCA----------TCTA-------ATGATAAAGCA--T--G--G---AGTGCAGGC----T---T----TG-----A-T--AATG-TTATGTTTA--CAGC-A-TTATAGAT-----T-----T-A-T--C-T--TTCCAG-TACA--------CA-------G----A--T----G--G---G---AAA-----------tagatagaacctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgccttaaaatggctattttacatggagtttttcatctaatgataaagcatggagtgcaggctttgataatgttatgtttacagcattatagatttatctttccagtacacagatgggaaatgtt
gi|22 : taagaatcccagtacatctcgcttgttattctcaattttattgaaattagatagaacctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgcct-TGCA-CT-----C-CA-A-A-TC-ATTA-TA--A-CT-----ATCAG-AAACAAACT---ATGTGTAACTTTGAGCCGGAGATGAT---T--TA-TTTA-T---GA-AATACA-------AT-GAGAAT--GTAACAAA---TCTATCTTTAA-TGCTT-T---C-CATTTG--T--GAG-TG----T--ATGG--A--CC---AGAAAAGGTTGTTATtgtt
gi|24 : accaagaatggaaattatcttattattgcagtcca-------------AA-----------------A--C--TATAT--------------CAC-----TTT-CGA------AG-TG-TGTG-CT-----A-CAGA-A-A--ACTA-TT--A---TAGATGTCAG-AGACAAATG---ATGTGAAACTGT--ATGGGATATGAT---C--TCTTTCA-T---GA-AATAT--------AG-GAAGATAGTG----AAAAGTTTTACTTTAA-AGCTC-T---G-AATTT---T--TTG-CT----CTGATGG--GGGCC---CAGAAAGGCTGTTATTAagaaagata
gi|25 : aatgag-GTT-TTTCT----------TCTATAAA---A----AAAACT--T--C--A---GA---AGCAGTCAT---T----A------A-C-AAACT-TTATATTTA--TACC-A-TGATAGAT-----T-----T-A-T--T-T--TTCCAG-TGCT--------TAT--A--TGATAAA--T----A--A---A---AAA-----------AAA------TG-----------CC-CAAAGCTACA------C--
gi|26 : agaatgatggggttttgctgccattgaagtattttgacatagtgaagccGGCT--CTGT---TT---GCCC-A-CCCAA--------A------TC-AACA-------TCATGATCTG----T----G-T-TT---T---TCTTTCAA-AAGTA-TAAGT-GTAT--G-TTA------TGCAA---GTATCATGA-TG-CA-A----C-T---CAG---TT-TAAC--T--G-------------G--TC---------TC----A--------------T------TT--GG------CCAAAATG-GTAT-------GA-AA-T
gi|27 : GTA-TT-----C-CA-A-A-TG-ACTG-TA--A-ATT-----TCAA-AGACAAATT---ATTTGAAATTGT--GTAGGAGATGAT---C--CCTTTTA-T---GA-AACA-A-------AA-GAAAAT--TT----TG---TCTTCCTTTCA-AGCTT-T---T-AACTT---C--GAGTTT----T--ATGGT-GGTCTAGACGGAAAGGCTtagaattaaacatcattacaaatgttttctt
gi|28 : tttatacGAAAATGACA--CTAT---TT---GGCC-C-CCAAT--------A------TT-GACA-------AT----CGCA-C-------A-T-TTA--T---T--TTCAA-A--T--TAAGT-G-AT--CATTG------TGCAA---GAATGTCGA-TA-CA-A----C-T---T-C---AT-T-GTAAT--GCTA----------T--TT---------TC---
gi|29 : aaTAT-A--AATGAAAAGGGTT--CTAT---TT---GCCC-T-CAAAA--------A------TT-TACAGCAGTGTTT----TTTT-C--T----C-TCTC---T---C--TCCAATA--T--TAAAT-GTATAAA-TTG------TGCTA---AAATCCCGG-TG-CA--------T---------AT-CAGT--T--GTTA----------T--TT---------TC---CA--------------T------TT--AA------tcgcaacaattttgtttgaaaacatcaa
gi|3 : aaatgaaACTAT-A--TATGGTAAGGACT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TT-GACA-------TT----TTTA-C--T----A-T-TT---T---T--TTCAA-A--T--TACAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCAGA-AG-CA-A----C-T---C-A---AT-TAGT--T--GTTA----------T--TC---------TA---AG--------------T------TT--GA------TAAAAATG-ACAT-------CA-AA-TG-G-----G-ATT---TTT--TTT-AC----AT-A-GAT-TTTCT----------TTCA-------A----GAAACA--T--C--A---AA---AGAA----T---T----GG-----A-C-ATACT-TCATATTTATTTA-T-A-TCATAGA------T-----C-A-T--CAT--GTACAG-TACA--------TGT--A--TG----A--T----A--GAAAA---AAA-----------AAAT-TGTTTG-----------TC-TAAAACTGCA------C--T----GTTT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A---AA-----------TCAGCA------TTTT-------ACCTAGA------------T--T-------------AC-----------------A--T--TACAT--------------CAC-----TTTCCCA------TGCTG-TGTA-CT-----C-CA-ATA-T--ATTG-TA--A-ATTAA-TATTAG-AGATAAACT---ATGAGAAACTGT--ATTGGACAGAAT---T--TCTTTTA-T---GA-AATAGAATTAAGCAA-GAAGAC--TT----AA---TTTTTCTTTTA-AGCTT-TA--A-AAAAT---T--GAA-TT----T--ATGG--GGCCC---TGGTAAGGCTGTTATTATACAAAGTCCTTac
gi|30 : TA-TGCA-CT-----C-CA-A-A-T-----G-AG--C-ATAAG-TATCAG-AGACAA-TA---ATTTGAAACTGC--ACTGAACACAAT---T--TGTCTTA-TTTAGC-AATAGA-------A------AT--TT----A-------------AA-AGTTA-C---A-AAAAT---TGGGAG-TT----TG-ATGG--GAACC---CAGA
gi|31 : GCT--CTAT---CT---GGCT-C-CCAAA--------A------TC-AACA-------GG----TGTG-C--T------T-TT---G---T--TTCAA-AT-T--TGGGT-GTGT--T-TTA------TGCAA---G--TTTT-A-TG-CA-AGTAGC-C---T-G---AA-GAGT--T--GTTA----------A--TC---------GC---AG--------------T------TT--GG------CAAAAATG-Agtccttta
gi|32 : ATGATAAGGGCT--TTAG---TT---TCCT-G-CCAAA--------A------TC-GACA-------GT----CATA-CATT----AAT-TT---TG--T--TTCAA-AATT--TA----GTTT--T-TTG------TGCAA---AAATCCCTA-TA-AA-AG---C-TATGC-A---AC-T--T--T--GTG-------------------------TC---CG--------------T------TC--GA------TGAAAATG-Atctgtagggtgagaat
gi|33 : ---AATG----T---T----GG-----AAC-AAATT-TCAAATCAA--TG-TCA-TGGC-TA------T-------A-T--C-T--CTCTGG-CACA--------TGC--AAGTG----A--C----A--G---A---AAA-----------ATAT-TTCCTG-----------TC-TAAAGTTGTA------T--T----
gi|34 : tgagcacGT--ATTGAACATGAA---G--TACTTCA-T---GA-AAT-GA-------AA-GAAAAT--TT----GG---TCATTCTCTCG-AATTTCT---A-GAATT---T--GAGATT----T--ACAGCAGGCCA---AAAAGAGGCTGCAATCATACAAAATCCTTtcatgtatcctaaaagaaa
gi|35 : ---T--TTCAA-AA-T--CAAGT-GTAG--T-TTA------TGCAA---GAATCCCAA-TG-CA-A----G-T-----G---AT----T--T--GTTA----------T--TC---------TC---AG--------------T------TT--GT------TCAAAAt
gi|36 : --ACTGAACATAAT---C--TCTTTGA-C---GA-AATAAA-------AA-T-TGAT--TT----AG---TCTTTTTTCAA-ATTTT-T---ATAAATG---T--GAG-CTA---C--ACCG--GAGCT---CGGAAGGGCTGTCATCATcagcattctcctaaccatgacatcacaaacacactattt
gi|37 : aacaaGAAACTGT--ATTGGACACGAT---C--TTTTTT--T---AA-AAT--------------AAGAT--TT----AG---TCTTCCTTTAA-GATTT-T---G-AGA-----T--G---------T--ATGT--GGGCC---CAGATAAGCTGTTAGTTTACAAAAT
gi|39 : c---TTT--TTC-AT----GC-A-GTT-TTTCA----------TCTA-------C----AAAGCA--T--C--ATGTGG---AGTT----G---T----AG-----A-T-AAACA-ATGTATTTC--TG-C-A-TG---GAT-----T-----T-A-C--C-T--TTCCGG-t
gi|4 : taaaattactgACTAT-A--CACGATAAGGGTG--GTGT---TT---GCCC-AACCAAA--------A------TC-------------------ATG-C--T----T-T-CC---T---C--TTCAG----TCGTAAGT-GT-T--C-TTGATCAATTTCAATTTGA-TCAAAA-TGACATA----C-T---C-A---AC-TACT--T--GTAA----------C---C---------GG---AA--------------T------TT--AAACATCACGAACATG-ACGT-------TT----TG-T-----C-GTT---ATT--TTCGAT----CT---GCTATTTCT----------TCTA-------G----AAAATG--TACC--G---AGTGTAGGC----T---T----GG-----A-C-TAAAT-TCATATTCG--CA-T---TG-CAGA-----------------------------A-TACA--------TAT--A--TC----A--T----T--G---A---AAA-----------ATAT-TGTTTG-----------TC-CAAAACTACA------T--TATATGTTT-----------TTCG----------------------A----------A----------T--------G---AAAAACGTTCATACTAGCAAACAAATTTC-------A-CTAAAT-----------T--TGAG----------AA-----------------A--T--ATCTT--------------CTT-----TTT-ACA------TTCTT-TGTA-CT-----C-CA-A-A---------------------TATCAG-AGA-GAACA---ATGTGAAACTGC--ATTGTACATGAT---C--TCCTCTC-T---AA-AATAAATC-----AA-GAA-----TT----CA---TTTTTCTTCAACGGCTT-TC--A-AAATT---T--GAC-CCGAGAC--ATGG--GA--C---CAGAAAGG--GTTGTTATACAAAGTCTTT
gi|41 : aggAT-A--TATGATAAG---T--CTGT---TT---TCCCCA-CCAAG--------T------TC-AGCA-------TT----CATG----T----G-T-TT---G---T--TTCATTG--T--TAATT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT
gi|42 : ggactaatg----AG---TCTTTCTTCAA-ATCTT-TTTAA-AAATT---T--AAA-TT----TC-ATGG--GGTCG---TAGAAACACTGTTATTATACATAGTCCTT
gi|43 : A------TTTT-------GAGTGAAT-----------T--G-------------AG-----------------A--AAATGTGT--------------CAC-----TTT-TGT------TGCTT-TGTA-CT-----TACA-A-A-TG-ACTG-TG--A-ATt
gi|44 : aacaaT---C--TCTTTTA-T---GA-AATCAA-------AA-----AT--TT----CG---TCTTCCTTTAA-AGCTT-T---T-AAGAT---T--TAG-CT----T--actcagt
gi|45 : T-------AA-AA-TG-A-----ATATT---TTC--T---------GC-A-GCT-TTTCT----------GCCA-------G----AAAATA--T--C--A---AATGCAGGC----T---T----GG-----A-C-AAcgtgagtgcttaagaaggc
gi|46 : AT--C-TTG------TGTGA---AAATCCCGA-TT-TA-T----C-T---C-A-------AGT--T--TTTA----------T--TT---------TC---AA--------------TA-----TA--GT------TCAAAATG-ACGT-------AG-Atgtcat
gi|47 : A------TTTT-------AG-TAGAA-----------T--TGAG----------AA-----------------A--A--TGTGT--------------CAC-----TTT-GGA------TGCTA-TGTA-CT-----
gi|48 : -------------AA-----------------A--T--TGCGT--------------CAT-----TTT-TGA------CGTCA-TGTA-TT-----C-CA-A-A-T--
gi|5 : aattgagACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C--T----G-T-TG---T---T--TTGAA-AA-T--TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCATAA-TG-CA-A----C-T---TTA---AA-TAGT--T--GATA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA------TAAGAATG-ACTT-------GG-AA-ga
gi|5 : ataaaag---C-G---AT-TTGC--T--GCCA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA------T----ATG-AAGT-------T-----TG----------TA---GTT--TTC-AT----GT-A-GTT-TTTCT----------TCCA-------G----AAAG-A--T--G--G---TG---TGCA----TGCCT----GG-----A-CAAAACT-TTATATTTA--TACT-A-TGAGGGA------T-----C-A-T--------TCCTG-TGCA--------CCT--A--TA----A--T----AT-G---ACCTAAA-----------AAA-----TTG-----------TC-CAAAGCTGCA------C--T----GTAT-----------AT------------------------A----------AAAAGAGAACTT--------A---AAATAT-------TTAATAACAT--TTTT-------AACTAGATA----------T--T-------------AA-----------------G--T--TGAATTGAGAAATTTGCAACAA-----TTT-GAA------TGTTA-TATAGCT-----C----G-A-TG-GCT--TA--A-ATT-----TCAG-AGACAAATT---ctgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccagaaagatggtgtgcatgcctggacaaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctataatatgacctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaaagagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|6 : ataaaagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgttttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgaACTAC-A--TATAATAAGGGCT--ACAA---TT---GCCC-A-ACAAA--------T------TA-GA-A-------TC----T------------------------------CA--------TAGGT-ATAT--T-TTG------TGAAA---GAATCCCAA-TG-CA-A----C-T---C---------AGT--T--ACTA----------T--TCTAAATATGATC---AAAATGACATGGGAACT------TT--AA------CTAAAATTTATAT-------AA-AC-AG-GATACAG-ATTAGGTCTAATTT-AC-------A-G-T-TTTCC----------TCCA-------G----CAAGCA------------------GCC----T---T----GA-----A-C-ATGCT-TTAT-------TA-A-G-TGATAGAAAAATTT-----T-G-T--G-T--GTCC---TGAA--------T-T--A--TG----C--T----C--G---A----------------------TGTTT------------TC-TGA--CCGGA------AAAT----GTTC-----------CT------------------------A----------A-------------------A---AA-----------T--------------T-------AAGTAAAA-----------T--TGAG----------AC-----------------A--T--TGTGC--------------CAC-----TTT-TGA------TGCTA-TGCA-CT-----C-CA-A-A------TG-AG--C-ATAAG-TATCAG-ATAC-AATA---ATGTGAAACTGC--ACTGATCACAAT---CCGTCTTATC-T---GACAATAGA-------A------AT--TT----A-------------AA-AGTTA-C---A-AAAATTG-T--GAG-TT----TG-ATGG--GAACC---CAGAAAAGC----ATCATACAGAGTCC
gi|7 : aggACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C--T----G-T-TG---T---T--TGAAA-A--T--TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCATAA-TG-CA-A----CTT---T-A---AA-TAGT--T--GATA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA------TAAGAATG-ACTT-------GG-AA-
gi|7 : aag---C-G---AT-TTGC--T--GCCA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA------T----ATG-AAGT-------T-----TG----------TA---GTT--TTC-AT----GT-A-GTT-TTTCT----------TCCA-------G----GAAAGA--T--G--G---TG---TGCA----TGCCT----GG-----A-C-AAACT-TTATATTTA--TACT-A-TGAGGGA------T-----C-A-TTCC-T--GTGCA--CCTA--------TAT--A--TG----A--C----C--C---T---AAA-----------AAA-----TTG-----------TC-CAAAGCTGCA------C--T----GTATATAAAAGAGAACTTAA---------------------A----------A----------T--------ATTTAA-----------TAA-CA------TTTT-------AACTAGATA----------T--TAAGTTGAATTGAGAA-----------------A--T--TGCAA--------------CAA-----TTT-GAA------TGTTA-TATAGCT-----C-CG-A-T-G--GCT--TA--A-ATT-----TCAG-AGACAAATT---Actgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccaggaaagatggtgtgcatgcctggacaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctatatatgaccctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaagagaacttaaaatatttaataacattttaactagatattaagttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|8 : aagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgtttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgaACCAT-A--TACGATACAGGCT--GTGT---TTCATGCTC-A-CCAAATACAGCTCA------TCTGGCA-------TT----CTTA---------A-T-TT---G---T--T--AA-A--A--TGACT-G-AT--T-C------------A---GAATT---A-TG-T---------------G---AT-TAAT--TTAATTAAGAAGAAAATT--TC---------TC---CA--------------T------TTTGGA------ATAAAATG-AC---------------T----------ATT---TTC--T---AC----CC-A-GTT-TTTAT----------TCTA-------G----AAAACA--T--G--A---AG---AGCAGAC-T---T----GG-----A-C-AAATT-TCATAT------A-T-G-CCATAG--------------------C-T-----CAG-TGCA--------TGC--A--TG----GCTT----AATG---A---AAGTTGTACTTGTTAAGT-TTTTTGAAAGAAAAACATCACAAAA-TCCA--------------GTTT-------------------------------------A----------A----------TC-------A---AA-----------TG-----------TTA-------AAATAGAA-----------T--TGAG----------AA-----------------A--C--TATAT--------------CAC-----ATT------------------TA-CT-----T-CA-A-AAG--ACTG-TA--ATATTGG--A-CAG-AGAG----T---ATTTGAAATGGA--AATGGGCATGAT---C--TCTTTTA-T---AA-Ac
gi|9 : aagg--TAAGT-GTAT--T-TTA------TTCA----GAATCATGAATG-CC-A----C-T---C-----AT-T-----T--GTCA----------T--TC---------TC---AG--------------T------CT--GA------ACAGAA
gi|9 : gttcaaaatctaaTG-ACTT-------GA-AG-TT-GCT---A-ATT---TTT--CTC-AC-------A-GTT-TTTCC----------TCTA-------G----AAAGCA--T--T--T---AG-----CA----T---T----GGCTTTCA-G-AAACT-TCATACT------------------------------C-A-T--C-T--TTTCAA-TACA--------TGT--G--TGTA--A--T----A--G---G---AAA-----------ATTT-TGTTTT-----------TC-CAGAGCTGAT------C--T----GTTT-----------CCTGAAAA------------------A----------A----------TGTTTCCAAA---AA-----------TGAGCA------TTT--------AAATGAAT-----------T--TCTGTC--------AA-----------------A--T--TGCAT--------------CAT-----TTT-TGA------TGCTA-TGTT-CT-----C-CA-A-G-TA-AATG-TAGGA-ATTAG-T---GG-A---AAATT---GTGTAGAACTGT--ATTGGACAagcagagaatcggaattatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgctaatttttctcacagtttttcctctagaaagcatttagcattggctttcagaaacttcatactcatcttttcaatacatgtgtgtaataggaaaattttgtttttccagagctgatctgtttcctgaaaaaatgtttccaaaaatgagcatttaaatgaatttctgtcaaattgcatcatttttgatgctatgttctccaagtaaatgtaggaattagtggaaaattgtgtagaactgtattggaca
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TTTGGTATTTTGACATCAAATTGCTATTTTCACGCAGTTCAGTATTCCAATCTCGAAATCGTTGACCACAGGTTTGGCCAAAGATTTCATTTACGTCTCCCGACCACATGTGTGATGGACTCTTTTGTGTTCAAAGCTGCTGTTTGCATTTTTTGAATGAAAAGTATTTAAAAACAATATTGTATATGTATTACGGGGGAAATCGTGTCACTTTCAATTC
Unaligned ( gi|23 ): TTTCATTAAAACTCTACCATTTCTTTCTAGAACATTTATGTGATAGAAATTTTTTTTTGTCTCAAGTTGTACATTATGTCTTCTGAATGAAAAATATTGACAAAAATGAACATTTTAATTAAGGAAAATGAAAAACTGCATCATAGTTTAATGCTAAAGTTCTGTGAATATTAGAGAAAAATTATG
Unaligned ( gi|38 ): ATTTTTCTAGAACACGTGTGATAGATTAATTTTGTTTATTCGATATCACAATTGCGCAATATGTTTTCTGAAAGAAACTGCTTCCAAAAATTAGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): ACGCTGCTTATTTTCCATTCTCAATTTCATCAAAATGAGAACCAGAATTACGATATCATAGACATAACATTATGTCACTATTTTCAATATTTT
Unaligned ( gi|49 ): TAAAAGCTCTTCATAAAACAGTTGTAAGTGAAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333333333333333 11111 111111111111 333333333333 1111111111 2222222222222222222222222222 11111 111111111111 66666666666666 555555555555555555555555555555555 11111111111111111111111111111111111111111111 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4444444444444444444444444444 33333333333333333 111111 11111 1111111
lowQualScore : 3 44 33 444 444 2 2 333333333333333 444 77777777777777777777777777 00000 22 9999 6666 3 0 22 1 555555 222 666666666666 1 1 444444 222222222222 22 22 444444 6666666666 22 666666666 555 99999999999999 666666 22 5555 1 66666666666 1 6666666666 555 5555555555555555555555555555 2 22 00000 0 444444444444 0 22 11111111111111 22 1 4444 4444 1 1 4 333333333333333333333333333333333 333 22 1 2 88888888888888888888888888888888888888888888 333 2222 33 33 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 999999 77 666666 1 22 3 44444 2 2 2 6666666666666666666666666666 2 2 333 33 1 3 666666 2 444 2 44444444444444444 2 666666 1 2 2 2 2 33333 444 5 55 7 8888888 5 5 4444 2 1
lowQualScore : . .. .. ... ... . . ............... ... .......................... ..... .. .... .... . . .. . ...... ... ............ . . ...... ............ .. .. ...... .......... .. ......... ... .............. ...... .. .... . ........... . .......... ... ............................ . .. ..... . ............ . .. .............. .. . .... .... . . . ................................. ... .. . . ............................................ ... .... .. .. .. ...................................................................................................................................................................................................................................... ...... .. ...... . .. . ..... . . . ............................ . . ... .. . . ...... . ... . ................. . ...... . . . . . ..... ... . .. . ....... . . .... . .
lowQualScore : 3 66 44 444 444 5 4 444444444444444 555 11111111111111111111111111 33333 88 8888 0000 6 8 44 7 000000 999 222222222222 7 7 000000 444444444444 22 22 666666 7777777777 11 222222222 444 44444444444444 222222 22 2222 5 77777777777 7 3333333333 555 1111111111111111111111111111 2 99 33333 7 777777777777 7 88 66666666666666 88 0 0000 0000 9 9 0 111111111111111111111111111111111 777 99 9 1 66666666666666666666666666666666666666666666 999 5555 22 22 22 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777777 66 444444 3 66 8 88888 0 0 0 2222222222222222222222222222 2 0 777 11 3 1 555555 5 444 5 99999999999999999 7 222222 5 5 5 5 5 88888 444 0 99 5 5555555 0 9 6666 7 3
consensus : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTTT--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--C--G---AGCGCA--GGCTT----GG----A-C-AAACT-TTATATTTA--TA-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--TTGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A-----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A--G---AT-----------TT-------------A------A---A--T-------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--A-CTG-TAA-ATT--T----ATCAG-AGACAAATT---ATGTGAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC---CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
Reference ( family-2602 ) : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTTT--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--C--G---AG---A--GNCTT----GG----A-C-AAACT-TTATATTTA--TA-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--TTGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A-----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A--G---AT-----------TT-------------A------A---A--T-------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--A-CTG-TAA-ATT-GT----ATCAG-AGACAAATT---ATGTGAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGNCC---CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
gi|1 : ACTATTA--GATGATAAAG-CT--CCAT---TT---GCCT-A-CCAGA--------A------TC-AACA-------AG----CATGAC-TCG--GCTT-----------AAATAA-T----TCAGT-GTGT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------T--TTG-CA-G----T-GC---------AGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GATTTAAAAATG-ATGT-------A-GTAT-T-G-GA-----ATT---
gi|1 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggT-A-GCTAT--TTT-----TTCA-------C----AAAACA--T-----G---AGCACA--GGCTA----GG----A-C-AAA-------------------A-TCA-AAGA------TT-AATA-TT---TC--CTG-TACA--------TG--C--AAGTG----A--T----T--G---A----GA---AAAATATG--T--T---CC--AA-GCTGTG------CA---T----GT-TTT----------CT------------------------G-----------A----------T--------A--------GA------------AAACA----T------------ATT-----------------------------------TT-------------G------A---A--TA------T-GTAG--------------CA----------GGAGGGGTTTGCTG--TGTA-CT-----G-C-AA-A----T--GTCT----A-ATT-TT----GT----AGCCAAATT---ATGTGAAACAGT--ACTGGACATAGC---C--TCCT--A-T---GA-AATAGA-------A-----GAC-AT----A---TTTTTTGGC-AGC-T-T-T---G-AA----TT-T--GAG-TT----TT-ATCA-GGGCT---GGGAG-GGGCTGTTATCATACATAGTCCTgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaaatcaaagattaatatttcctgtacatgcaagtgattgagaaaaatatgttccaagctgtgcatgttttctgatagaaaacatattttgaatatgtagcaggaggggtttgctgtgtactgcaaatgtctaattttgtagccaaattatgtgaaacagtactggacatagcctcctatgaaatagaagacatattttttggcagctttgaatttgagttttatcagggctgggaggggctgttatcatacatagtcct
gi|10 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggactattagatgataaagctccatttgcctaccagaatcaacaagcatgactcggcttaaataattcagtgtgttttgtgcaagaatccctttgcagtgcagttgttattctcaatttgatttaaaaatgatgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaa----TAAAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---AAATTCC-------G--ATG-CA-T----C-TC---------AAT--T--GT------TA----------T--TG---------TC---AG--------------T------TT--TA--ACAAAATG-ATGT-------A-G-AA-T-
gi|10 : TG-ACGT-------A-A-AT-T-G-GCCAA--ATT---T--------------A-AC--------GT-A-AATTT--TCTAG---TCCA------------------------------AG---A--AGCTT----AG----A---AAACT-TAAAATT-A--GA-T-T-TTT-TAAA------T--------T---TC--CAG-TACA--------CGTTT--A--TG----A--C-----------A----AG---AAGAT-TGTCT--TTGCCCAAAAAGCTGCA------tatgacttcacaaacatcacactttattgtatttttgacgtaaattggccaaatttaacgtaaattttctagtccaagaagcttagaaaacttaaaattagattttttaaatttccagtacacgtttatgacaagaagattgtctttgcccaaaaagctgcaatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|11 : taaatgtattttgtgcaaaaattccgatgcatctcaattgttattgtcagttttaacaaaatgatgtagaattatgacttcacaaacatcacactttattgtattttTG-CCAC-------A-A-AA-T-G-ACT----ACT---TT--------T--GAC-AC--------CTCA-GTTTT--TCT-----GA-A-------G----AAAAAAAAT--T--GTGCAC---A--CACTC----GG----A-C-AAATT-TTATATTCA--CAAT-A-T-A-TATT------TC-T-CC-CTCGATC--CAT-TACACATAATATTA--T--A--TG----A--TTGTCATTG---A----AG---AATTT-TG--T--TTGTCC--TAAGCTGCATGCATTC----T----AT-AT-----------CTGG----------------------A-----------A----------TA-------A--------AA-----------TATATA----TA-----------TCC--AACTTCTTGGTGGA--A---ATCCGAA------TTGAG----------A------A---A--T-------T-GTAT--------------CACGTAAATTT-TGA------AG-TA--TGTA-CT-----T-G-AA-A----TA-A-CTACTAA-ATT--------TCAG-ACAAAAATT---Aatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|12 : attggattaaaaatattgatgtgaaagcagaatcatgacatcataaacctgatgctatgctgccatttgggatatttAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT--------------TA-AA-A----------------------T--GT------T-----------T--TT---------TC---AG--------------T------TC--AA--TAGAAATG-ACAT-------A-A-AA-
gi|12 : ACA--------TT--T--G--TG----A-------G--G---T----AA---AAAAT-AG--T--TTGACC--AAAGCTACT------C----T----GT-TTT----------CTTCAAAGAAAAATATTCACAAAACAA-----------A----------C--------A--------AA-----------TCAGCA----A------------TTT--AATT---------A--G---TT-----------TT-------------AGTAA--A---A--T-------T-A-G----------------AA-----TTT---A------TGACG--AGTA-CTAGCTCC-C-AA-G----G--A-CTA-TAA-----GT----ATCG-----CAAATT---ATATGAAAC--T--ACTGGACAccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcacacatttgtgaggtaaaaaatagtttgaccaaagctactctgttttcttcaaagaaaaatattcacaaaacaaacaaatcagcaatttaattagttttagtaaaattagaatttatgacgagtactagctcccaaggactataagtatcgcaaattatatgaaactactggaca
gi|13 : agtgtattttgtgcaagaattaaaatgttttttcagttcaatagaaatgacataaaaccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcac----AAAACA--T--T--A---AGCACA--GACTTTAATAG----A-T-AAACT-TGTTATTTA--TA-G-ACTGA-T---------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TTCA--------CG--T--A--TG----A--C----A--G---A----AA---AAATTCTG--T--ATCTTC--AAAGCTGTAATCT--T----T----AT-TT-----------CT------------------------ACAGAAACGATCA----------TGA------A--------AA-----------TGAGCA----T------------TTT--AACT---------A--C---ATCTTCATAAATATT-------------A------A---A--T-------T-GT-T--------------CAG-----CAT-AGA-------GTTA--TATA-CT-----C-C-AT-G----TTAA-ATG-TAA-AT--------ATCTGCATA-AAATT---ATGGTAAACTGT--ACTGAACAGGAT------TCTTTCA--------AA-AGA-------AATAAAAAT-TT----GATCTT-CTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---AT---------TT----T--GTGG-GA--C---CAGAA-AGACT-TTATCACACATAGTCCTT
gi|14 : tac--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-CTG------TGCAA---GACTTTC-------A--GTG-C--A----C-T--GTACATGTAGC--T--GT------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--GTAGACTG--CAC-------A-C-AA-C-A-GA-----ATT---
gi|15 : ----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--CA--CCGTATTT--CGTG------A-A-AA-T-GTAA-----ATT---TT--------T--GTG-AA--------G----GTTTT--TCT-----TTCA-------G----AAGATA--T--C--G---AATGCA--GCACT----GGGTAAA-C-AAACTGTTAatgatgtcataaatacaattctcaagtcttgacatgaaatgtttattattcacagattaacttctgaagcattttgtccaagccttgaacaaatatatttatactctagacatacttttcctgtaaacacatttaaaacttcgctcatatagaattgtgctctctgtttcctgacatcaaaaaaataaaaatagcaatttgacctgaatt
gi|15 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagAATC---ATATCTAACTGT--AGCGGACATGAC---T--TCTCTCA-T---AA-AAT-GA-----------AAGTT-TT----CATCTTT-TTTAA-AAC-T-T-TTC-A-AAAATATC-T--GTG-TT----TG-AAAG-GGGCC---AAGAT-AGTCTGCTATCACACAAACTCCTTattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctaactgtagcggacatgacttctctcataaaatgaaagttttcatcttttttaaaacttttcaaaaatatctgtgtttgaaaggggccaagatagtctgctatcacacaaactcctt
gi|16 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagtaacagtttgtttacccagtgctgcattcgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatac-----ACT---TT--------G--TTC-AC--------AC-A--TTTT--TATA----TCGA-------G----AAAACA--T--C--C---AATAAA--GACTT----GA----G-C-AAACT-TTATATCTA--TA---A-C-A-CAGAT-----TT-A-TC-TT---ACGACAGTTACATG------TG--T--G--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAATGTT--T--TTGTAC--AAAACTGCG------T----T----GA-AT-----------C-------------------------A-----------A----------TATTTA---A--------AA-----------TCAATA----T------------TT----AGT---------A--G---GT-----------TT-------------A------G---AACT-------T-GCAT--------------CAC-----TTT-TGG------TAC-AGTTGTA-CT-----C-G-AT-A----TG-A-CTG-TGA-ATT----------AG-TGTCGAATTTTGTTGTGAAAATGT--AATAAACAC
gi|17 : catcataaacatcacgttttgctgccagtgATTAT-AATTAT-ATAAGGACA--CTAT---TG---GCTT-A-TTAAA--------G------CT-GGCT-------TT----TCAA--------GCTT-T---T--TTCAGA--ATT----TAAG--GTAT--A-TTG------TACAT---GAATCAC----------ATG-CA-A----C-TC-G----T---GT--T--GTTACTAGTA----------T--TT---------TC---AA--------------T------TT--GA--TAAAAATT-ATGTTAATCAGG-A-AA-T-A-TG-----ATT---TT--------T--TTC-GCCGCTGTCGGT-A--TTTTGATATATATGTACAATGGCTTG----AAAACA--T--CTAA---AGC--A--GACTT----GG----A-T-AAGCT-TTAAATT----CA-T-A-TCA-TAGA------CCTA-TT-TT---TC--CAG-AGCG--------TA--T--A--CG----
gi|18 : gg-CTAAA--------A------TC-AAC--------TT----TATG---T----GCTT-T---G--TTTAAA--G-T----TTGGT-GTAT--T-TTT------TGCAA---GAATCCA-------A--ATG-CA-A----T-TC-----AT-T--T--T---T------TA----------TTCTC---------TC---GA--------------TTTCTTATT--TA--TCAAAGTG-ATGT-------A-G-A
gi|18 : TT--TTT-----TCTA-------T----AGAAAA--T--G--G---AACGTA--GATTT----GG----G-C-AAACT-TTGTATTAA--Ttttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacttttttctatagaaaatggaacgtagatttgggcaaactttgtattaattccacaga
gi|19 : ctaaaatcaactttatgtgctttgtttaaagtttggtgtattttttgcaagaatccaaatgcaattcattttttattctctcgatttcttatttatcaaagtgatgtagatttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacACTGT-A--TGTGACGAGGGCTTCCTTTCAATT---GCCC-A-CTGAA--------ACTTAAATC-AACAGGGG---TT----TCTT-T-TTCAGGTTT-TGTAT--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--C-TTA------TGCAA---GACTCTT-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TA--------T------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TCAAAATT-AAGT-------A-G-Atccacaga
gi|2 : atataaacttatgataaatacatttgtaagaaaggACTGT-A--TAT---AAGGGCT--CTAT---CT---TCCC-A-CCAAA--------C------TT-GACA-------TT----T--G-C-C-----TTA-G---T--TTCTAA--A-T----CAAGA-GTAT--T-TTG------TTTAA---GAATCCC-------C--ATG-TA-A----C-TC---------AAC--T--GT------TT----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TCAAAACG-ATGT-------ACA-AA-T-G-GA-----Atcaagaatgatgacgttttgtttcctaatttggtataaag
gi|2 : aggTG-ACAT-------A-A-AG-T-G-GC------TG---TT--------T--TTC-AC--------AT-AAGATTT--TCT-----TATA-------G----AAAATA--T--C--A---ATTACA--GGTTA----GG----A-C-AACCT-TTATACT------------------A---------A-TC-TT---TC--CTG-TACAC-------TG--TTCA--AG----A--T----A--C---A----AG---AAA---TG--T--TTGTCT--AGGGCTATA------T----TCTATGT-TT-----------AC------------------------AGAAAACATTC-A----------T--------A--------AA-----------TAAGAA----C------------TTTCTAATTT--------A--GTTGAT-----------CA-------------A------A---A--TAAAAAGATAGCAT---------------AC-----TTT-AGA------TGCTG--TGTA-TT-----T-C-AA-AG---T--A-CTG-TAC-AC--------ATCAG-AGACAAAAC---AGGTGAAATTGA--ATTGGACATGATTTCC--TTTTTTAGT---GA-AAT-----------A-GAAGAG-TT----ATACTTTCTTTAC-AGT-T-T-T---C-AA---ATT-TG-GAGTTT----T--ACTG-GGCTC---TG--A-AGGCTGTcacaagcctgacactttgctgctcatatcttgacataaagtggctgtttttcacataagattttcttatagaaaatatcaattacaggttaggacaacctttatactaatctttcctgtacactgttcaagatacaagaaatgtttgtctagggctatattctatgtttacagaaaacattcataaataagaactttctaatttagttgatcaaaataaaaagatagcatactttagatgctgtgtatttcaaagtactgtacacatcagagacaaaacaggtgaaattgaattggacatgatttccttttttagtgaaatagaagagttatactttctttacagttttcaaatttggagttttactgggctctgaaggctgtccattcttatatggtattcctt
gi|20 : aggactgtatataagggctctatcttcccaccaaacttgacatttgccttagtttctaaatcaagagtattttgtttaagaatccccatgtaactcaactgtttttctcaatttgatcaaaacgatgtacaaatggaacacaagcctgacactttgctgctcatatctAA---GAATCCC-------A--GTA-CA-T----C-TC-G---CT-T--------GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--TA--TTGAAATT-AGAT-------A-G-AA-ccattcttatatggtattcctt
gi|20 : tT-------A-A-AA-T-G-GC------TA---TT--------T--TAC-AT--------GG-A-GTTTT--TCA-----TCTA-------ATGATAAAGCA--T--G--G---AGTGCA--GGCTT----TG----A-T-AA--TGTTATGTTTA--CAGC-A-TTA-TAGA------TTTA-TC-TT---TC--CAG-TACA--------CA---------G----A--T----G--G---G----AA---Acctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgccttaaaatggctattttacatggagtttttcatctaatgataaagcatggagtgcaggctttgataatgttatgtttacagcattatagatttatctttccagtacacagatgggaaatgtt
gi|22 : taagaatcccagtacatctcgcttgttattctcaattttattgaaattagatagaacctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgcctCCA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TC-A-TTA-TAA-CT--------ATCAG-AAACAAACT---ATGTGTAACTTTGAGCCGGAGATGAT---T--TA-TTTA-T---GA-AATACA-------AT-GAGAAT-GTAACAAATCTATCTTTAA-TGC-T-T-T---C-CA---TTTGT--GAG-TG----T--AT---GGACC---AGAAA-AGGTTGTTATtgtt
gi|23 : accaagaatggaaattatcttattattgcagt-TC-TT---TC--TAG-AACA--------TT--T--A--TGTG--A--T----A--G---A----AATTT----T-TT--T--TTGTCT--CAAGTTGTA------CATTAT----GTCTT-----------CTGAATGAAA----------------A-----------A----------T--------ATTGACAAAAA-----------TGAACA----T------------TTT--AATT---------AAGG---A---------------------------A------A---A--TGAAAAACT-GCAT--------------CATA----GTT-TAA------TGCTA------------------AA-G----T--T-CTG-TGA-A----T----ATTAG-AGAAAAATT---ATGagaaagata
gi|24 : tttcattaaaactctaccatt-------------A------A---A--C-------T-ATAT--------------CAC-----TTT-CGA------AG-TG--TGTG-CT-----A-C-AG-AAAACT--A-TTA-TAG-AT--------GTCAG-AGACAAATG---ATGTGAAACTGT--ATGGGATATGAT---C--TCTTTCA-T---GA-AATAT--------AG-GAAGATAGTGAAAAGTTTTACTTTAA-AGC-T-C-T---G-AA---TTT-T--TTG-CT----CTGATGG-GGGCC---CAGAA-AGGCTGTTATTA
gi|25 : aatgag-GTTTT--TCT-----TCTATAAA---A----AAAACT--T--C--AGA-AGC--A--GTCAT----TA----A-C-AAACT-TTATATTTA--TA-CCA-TGA-TAGA------TTTA-TT-TT---TC--CAG-TGCT--------TA--T--A--TGATAAA--T----A--A---A----AA---AAAA----------TGCCC--AAAGCTACA------C----
gi|26 : agaatgatggggttttgctgccattgaagtattttgacatagtgaagccGGCT--CTGT---TT---GCCC-A-CCCAA--------A------TC-AACA-------TCATGATCTG---T----GTTT-T---TCTTTCAAA--AGTA---TAAGT-GTAT--G-TTA------TGCAA---GTATCAT-------G--ATG-CA-A----C-TCAG---TT-TAAC--T--G-------------------G--TC---------TC----A--------------T------TT--GG--CCAAAATG-GTAT-------G-A-AATT-A-GA-----ATT---
gi|27 : TA--CGTA-TT-----C-C-AA-A----TG-A-CTG-TAA-ATT--------TCAA-AGACAAATT---ATTTGAAATTGT--GTAGGAGATGAT---C--CCTTTTA-T---GA-AACA-A-------AA-GAAAAT-TT----TGTCTTCCTTTCA-AGC-T-T-T---T-AA---CTT-C--GAGTTT----T--ATGGTGGTCTAGACGGAA-AGGCTaaacatcattacaaatgttttctt
gi|28 : tttaGAAAATGACA--CTAT---TT---GGCC-C-CCAAT--------A------TT-GACA-------AT----CGCA-C------ATTTAT---T--TTCAAA----T----TAAGT-G-AT--CATTG------TGCAA---GAATGTC-------G--ATA-CA-A----C-TT-C---AT-T-GTAAT--GC------TA----------T--TT---------TC---
gi|29 : aaTAT-A--AATGAAAAGGGTT--CTAT---TT---GCCC-T-CAAAA--------A------TT-TACAGCAGTGTTT----TTTT-C-T----CTCT-C---T--CTCCAAT-A-T----TAAAT-GTATAAA-TTG------TGCTA---AAATCCC-------G--GTG-CA--------T------AT-CAGT--T--GT------TA----------T--TT---------TC---CA--------------T------TT--AA--tcgcaacaattttgtttgaaaacatcaa
gi|3 : aaatgaaACTAT-A--TATGGTAAGGACT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TT-GACA-------TT----TTTA-C-T----ATTT-T---T--TTCAAA----T----TACAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCA-------G--AAG-CA-A----C-TC-A---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TA---AG--------------T------TT--GA--TAAAAATG-ACAT-------C-A-AA-T-G-GG-----ATT---TT--------T--TTT-AC--------AT-A-GATTT--TCT-----TTCA-------A----GAAACA--T--C--A---AA---A--GAATT----GG----A-C-ATACT-TCATATTTATTTA-T-A-TCA-TAGA------TC-A-TCATG---TA--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--GAAAA----AA---AAAAT-TG--T--TTGTCT--AAAACTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A-----------A----------T--------A--------AA-----------TCAGCA----T------------TTT--ACCT---------A--G---A------------TT-------------A------C---A--T-------T-ACAT--------------CAC-----TTTCCCA------TGCTG--TGTA-CT-----C-C-AATA----T--A-TTG-TAA-ATTAAT----ATTAG-AGATAAACT---ATGAGAAACTGT--ATTGGACAGAAT---T--TCTTTTA-T---GA-AATAGAATTAAGCAA-GAAGAC-TT----AATTTTTCTTTTA-AGC-T-T-TA--A-AA---AAT-T--GAA-TT----T--ATGG-GGCCC---TGGTA-AGGCTGTTATTATACAAAGTCCTTac
gi|30 : TA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-A-GCA-TAA-----GT----ATCAG-AGACAA-TA---ATTTGAAACTGC--ACTGAACACAAT---T--TGTCTTA-TTTAGC-AATAGA-------A------AT-TT----A----------AA-AGT-T-A-C---A-AA---AAT-TGGGAG-TT----TG-ATGG-GAACC---CAGA
gi|31 : GCT--CTAT---CT---GGCT-C-CCAAA--------A------TC-AACA-------GG----TGTG-C-T-----TTT-G---T--TTCAAA--T-T----TGGGT-GTGT--T-TTA------TGCAA---G--TTTT----------ATG-CA-AGTAGC-CT-G---AA-GAGT--T--GT------TA----------A--TC---------GC---AG--------------T------TT--GG--CAAAAATG-Agtccttta
gi|32 : ATGATAAGGGCT--TTAG---TT---TCCT-G-CCAAA--------A------TC-GACA-------GT----CATA-CATTA--ATTT-TG--T--TTCAAA--A-T----TTAGT--T-T--T-TTG------TGCAA---AAATCCCTATAAAAGCTATG-CA-A----C-T------------T--T--G----------------------TG---------TC---CG--------------T------TC--GA--TGAAAATG-Atctgtagggtgagaat
gi|33 : TT----GG----AAC-AAATT-TCAAATCAA--TG-TCA-TGGCTA---------T-A-TC-TC---TC--TGG-CACA--------TG--C--AAGTG----A--C----A--G---A----AA---AATAT-TT--C--CTGTCT--AAAGTTGTA------T----T----
gi|34 : tgagcacaatgGT--ATTGAACATGAA---G--TACTTCA-T---GA-AAT-GA-------AA-GAAAAT-TT----GGTCATTCTCTCG-AAT-T-TCT---A-GA---ATT-T--GAGATT----T--ACAGCAGGCC---AAAAAGAGGCTGCAATCATACAAAATCCTTtcatgtatcctaaaagaaa
gi|35 : ---T--TTCAAA--A-T----CAAGT-GTAG--T-TTA------TGCAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----G-T--G---AT----T--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AG--------------T------TT--GT--TCAAAAt
gi|36 : --ACTGAACATAAT---C--TCTTTGA-C---GA-AATAAA-------AA-T-TGAT-TT----AGTCTTTTTTCAA-ATT-T-T-T---ATAA---ATG-T--GAG-CTA---C--ACCG-GAGCT---CGGAA-GGGCTGTCATCATcagcattctcctaaccatgacatcacaaacacactattt
gi|37 : aacaaGAAACTGT--ATTGGACACGAT---C--TTTTTT--T---AA-AAT--------------AAGAT-TT----AGTCTTCCTTTAA-GAT-T-T-T---G-AG---A---T--G---------T--ATGT-GGGCC---CAGAT-AAGCTGTTAGTTTACAAAAT
gi|39 : cT-------A-A-AA-T----T-----ACTG--TT--------T--TTC-AT--------GC-A-GTTTT--TCA-----TCTA-------C----AAAGCA--T--C--ATGTGG---A--GTTGT----AG----A-T-AAACA-ATGTATTTC--TG-C-A-TG----GAT-----TT-A-CC-TT---TC--CGG-t
gi|4 : ACTAT-A--CACGATAAGGGTG--GTGT---TT---GCCC-AACCAAA--------A------TC-------------------ATG-C-T----TTCC-T---C--TTCAGT--C-G----TAAGT-GT-T--C-TTGATCAATTTCAATTTGA-TCAA-------A--ATGACATA----C-TC-A---AC-TACT--T--GT------AA----------C---C---------GG---AA--------------T------TT-------AAACATC-ACG--------A-A-CA-T-G-AC-----GTT---TTGTCGTTATT--TTCGAT--------CT-G-CTATT--TCT-----TCTA-------G----AAAATG--TACC--G---AGTGTA--GGCTT----GG----A-C-TAAAT-TCATATTCG--CA-T---TG--CAGA-------------------------A-TACA--------TA--T--A--TC----A--T----T--G---A----AA---AATAT-TG--T--TTGTCC--AAAACTACA------T----TATATGT-TT-----------TTCG----------------------A-----------A----------T--------G--------AAAAACGTTCATACTAGCA----AACAAA-------TTT--CACT---------A--A---AT-----------TTGAG----------A------A---A--T-------A-TCTT--------------CTT-----TTT-ACA------TTCTT--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--A--------------------TCAG-AGA-GAACA---ATGTGAAACTGC--ATTGTACATGAT---C--TCCTCTC-T---AA-AATAAATC-----AA-GA--AT-TC----A-TTTTTCTTCAACGGC-T-T-TC--A-AA---ATT-T--GAC-CCGAGAC--ATGG-GA--C---CAGAA-AGG--GTTGTTATACAAAGTCTTT
gi|41 : aggAT-A--TATGATAAG---T--CTGT---TT---TCCCCA-CCAAG--------T------TC-AGCA-------TT----CATG---T----GTTT-G---T--TTCATT--G-T----TAATT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT
gi|42 : ggactaatg----AGTCTTTCTTCAA-ATC-T-T-TTTAA-AA---ATT-T--AAA-TT----TC-ATGG-GGTCG---TAGAA-ACACTGTTATTATACATAGTCCTT
gi|43 : A----T------------TTT--GAGT---------G--A---AT-----------TG-------------AGA----A---A--A-------T-GTGT--------------CAC-----TTT-TGT------TGCTT--TGTA-CT-----TAC-AA-A----TG-A-CTG-TGA-ATt
gi|44 : aacaaT---C--TCTTTTA-T---GA-AATCAA-------AA-----AT-TT----CGTCTTCCTTTAA-AGCTT-T-T---A-AG---ATT-T--AGC-TT----C--GTGA-GTGCT---TAAGA-AGGCactcagt
gi|45 : T-------A-A-AA-T-G-AAT----ATT---TT--------C--T-------------GC-A-GCTTT--TCT-----GCCA-------G----AAAATA--T--C--A---AATGCA--GGCTT----GG----A-C-AA
gi|46 : AT--C-TTG------TGTGA---AAATCCC-------G--ATT-TA-T----C-TC-A-------AGT--T--TT------TA----------T--TT---------TC---AA--------------TA-----TA--GT--TCAAAATG-ACGT-------A-G-Atgtcat
gi|47 : A----T------------TTT--AG-T---------A--G---AA-----------TTGAG----------A------A---A--A-------T-GTGT--------------CAC-----TTT-GGA------TGCTA--TGTA-CT-----
gi|48 : -------------A------A---A--T-------T-GCGT--------------CAT-----TTT-TGA------CGTCA--TGTA-TT-----C-C-AA-A----T--
gi|5 : aattgagACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C-T----GTTG-T---T--TTGAAA--A-T----TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----CTTT-A---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--TAAGAATG-ACga
gi|5 : ataaaagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA--T----ATG-AAGT--------------T-T-GT-----AGT---TT--------T----C-AT--------GT-A-GTTTT--TCT-----TCCA-------G----AAAG-A--T--G--G---TGTGCA--TGCCT----GG----A-CAAAACT-TTATATTTA--TACT-A-TGA-GGGA------TC-A-----T---TC--CTG-TGCA--------CC--T--A--TA----A--T----AT-G---ACCT-AA---AAAA---------TTGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-AT-----------AT------------------------A-----------AAAAGAGAACTT--------A--------AAATAT-------TTAATAACATT------------TTT--AACT---------A--G---ATA----------TT-------------A------A---G--T-------T-GAATTGAGAAATTTGCAACAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C----G-A----TG-G-CT--TAA-ATT--------TCAG-AGACAAATT---ttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccagaaagatggtgtgcatgcctggacaaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctataatatgacctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaaagagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|6 : ataaaagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgttttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgaACTAC-A--TATAATAAGGGCT--ACAA---TT---GCCC-A-ACAAA--------T------TA-GA-A-------TC----T-------------------------CA-----------TAGGT-ATAT--T-TTG------TGAAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----C-TC---------AGT--T--AC------TA----------T--TCTAAATATGATC---AAAATGACATGGGAACT------TT--AA--CTAAAATTTATAT-------A-A-AC-A-G-GATACAGATTAGGTC--------TAATTT-AC-----------A-GTTTT--CCT------CCA-------G----CAAGCA--------------------GCCTT----GA----A-C-ATGCT-TTAT-------TA-A-G-TGA-TAGAAAAATTTT-G-TG-TG---TC--C---TGAA--------T---T--A--TG----C--T----C--G---A---------------TG--T--TT-TCT--GA--CCGGA------AAA--T----GT-TC-----------CT------------------------A-----------A-------------------A--------AA-----------T------------------------T--AAGT---------A--A---AA-----------TT-------------G------AGACA--T-------T-GTGC--------------CAC-----TTT-TGA------TGCTA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-A-GCA-TAA-----GT----ATCAG-ATAC-AATA---ATGTGAAACTGC--ACTGATCACAAT---CCGTCTTATC-T---GACAATAGA-------A------AT-TT----A----------AA-AGT-TAC-A---A-AA---ATTGT--GAG-TT----TG-ATGG-GAACC---CAGAA-AAGC----ATCATACAGAGTCC
gi|7 : aggACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C-T----GTTG-T---T--TG-AAA--A-T----TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----CTTT-A---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--TAAGAATG-AC
gi|7 : aagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA--T----ATG-AAGT--------------T-T-GT-----AGT---TT--------T----C-AT--------GT-A-GTTTT--TCT-----TCCA-------G----GAAAGA--T--G--G---TGTGCA--TGCCT----GG----A-C-AAACT-TTATATTTA--TACT-A-TGA-GGGA------TC-A-----T---TC--CTG-TGCA--------CC--T--A--T-----A--T----AT-G---ACCCTAA---AAAA---------TTGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-ATATAAAAGAGAACTTAA---------------------A-----------A----------T--------ATTT-----AA-----------TAA-CA----T------------TTT--AACT---------A--G---ATA----------TTAAGTTGAATTGAGA------A---A--T-------T-GCAA--------------CAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C-C-GA-T----G--G-CT--TAA-ATT--------TCAG-AGACAAATT---Attggaactgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccaggaaagatggtgtgcatgcctggacaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctatatatgaccctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaagagaacttaaaatatttaataacattttaactagatattaagttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|8 : aagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgtttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgaACCAT-A--TACGATACAGGCT--GTGT---TTCATGCTC-A-CCAAATACAGCTCA------TCTGGCA-------TT----CTTA--------ATTT-G---T--T--AAA--A-T-----GACT-G-AT--T-C------------A---GAATT------------ATG-T------------G---AT-TAAT--TTAAT------TAAGAAGAAAATT--TC---------TC---CA--------------T------TTTGGA--ATAAAATG-AC---------------------T-----ATT---TT--------C--T---AC--------CC-A-GTTTT--TAT-----TCTA-------G----AAAACA--T--G--A---AGAGCA--GACTT----GG----A-C-AAATT-TCA----TA--TA-T-G-CCA-TAG-------------C-T--------CAG-TGCA--------TG--C--A--TG----GCTT----A------A----TG---AAAGT-TG--TACTTGTT----AAGT---------------------T-TT-----------TT------------------------G-----------A----------A--------A--------GA-----------AAAACA----TCACAAAATCCAGTTT--AATC---------A--A---ATG----------TT-------------AAAATAGA---A--T-------T-GAGA--------------AAC-----TAT---A------TCACA--TTTA-CT-----T-CAAA-A----G--A-CTG-TAATATT-GG----A-CAG-AG----AGT---ATTTGAAATGGA--AATGGGCATGAT---C--TCTTTTA-T---AA-Ac
gi|9 : aagg--TTCAAA--A-TCTAATAAGT-GTAT--T-TTA------TTC-A---GAATCAT-------GA-ATG-CC-A----C-TC-----AT----T--T--GT------CA----------T--TC---------TC---AG--------------T------CT--GA--ACAGAAAG--CAG-------A-G-AA-TCG-GA-----ATT---
gi|9 : gTG-ACTT-------G-A-AG-T-T-GCTA---ATT---TT--------T--CTC-AC-----------A-GTTTT--TCC-----TCTA-------G----AAAGCA--T--T--T---AGC--ATTGGCTT----TC----A-G-AAACT-TCATACT--------------------------C-A-TC-TT---TT--CAA-TACA--------TG--T--G--TGTA--A--T----A--G---G----AA---AATTT-TG--T--TTTTCC--AGAGCTGAT------C----T----GT-TT-----------CCTGAAAA------------------A-----------A----------TGTTTCCAAA--------AA-----------TGAGCA----T------------TT---AAAT---------G--A---AT-----------TTCTGTC--------A------A---A--T-------T-GCAT--------------CAT-----TTT-TGA------TGCTA--TGTT-CT-----C-C-AA-------------G-TAA-A-T-GTAGGAATTAG-TGGAAAATT---GTGTAGAACTGT--ATTGGACAatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgctaatttttctcacagtttttcctctagaaagcatttagcattggctttcagaaacttcatactcatcttttcaatacatgtgtgtaataggaaaattttgtttttccagagctgatctgtttcctgaaaaaatgtttccaaaaatgagcatttaaatgaatttctgtcaaattgcatcatttttgatgctatgttctccaagtaaatgtaggaattagtggaaaattgtgtagaactgtattggaca
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TTTGGTATTTTGACATCAAATTGCTATTTTCACGCAGTTCAGTATTCCAATCTCGAAATCGTTGACCACAGGTTTGGCCAAAGATTTCATTTACGTCTCCCGACCACATGTGTGATGGACTCTTTTGTGTTCAAAGCTGCTGTTTGCATTTTTTGAATGAAAAGTATTTAAAAACAATATTGTATATGTATTACGGGGGAAATCGTGTCACTTTCAATTC
Unaligned ( gi|38 ): ATTTTTCTAGAACACGTGTGATAGATTAATTTTGTTTATTCGATATCACAATTGCGCAATATGTTTTCTGAAAGAAACTGCTTCCAAAAATTAGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): ACGCTGCTTATTTTCCATTCTCAATTTCATCAAAATGAGAACCAGAATTACGATATCATAGACATAACATTATGTCACTATTTTCAATATTTT
Unaligned ( gi|49 ): TAAAAGCTCTTCATAAAACAGTTGTAAGTGAAT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333333333333333 11111 111111111111 333333333333 1111111111 1111111111111111111111111111 111111111111 1111111 6666666666666666666666666666666666 11111111 111111111111111111111111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333333333333333333333333 33333333333333333 111111 11111 222222222222222
lowQualScore : 3 44 33 444 444 2 2 333333333333333 444 77777777777777777777777777 00000 22 9999 6666 3 0 22 1 555555 222 666666666666 1 1 3333 1 444444444444 22 22 444444 6666666666 22 666666666 555 99999999999999 666666 22 5555 1 666666666 1 1 5555555555 444 8888888888888888888888888888 1 1 22 88888 0 555555555555 0 22 0000000 22 3333 22 333 1 1 1 4444444444444444444444444444444444 333 22 0 1 22222222 444 22 55 777777777777777777777777 333 2222 33 33 333 33 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 999999 77 666666 0 22 3 5555555 1 1 6666666666666666666666666666 2 2 2 333 2 22 1 3 555555 0 2 444 2 22222222222222222 2 666666 2 2 2 2 33333 444 5 111111111111111 2 0 55555 2 1
lowQualScore : . .. .. ... ... . . ............... ... .......................... ..... .. .... .... . . .. . ...... ... ............ . . .... . ............ .. .. ...... .......... .. ......... ... .............. ...... .. .... . ......... . . .......... ... ............................ . . .. ..... . ............ . .. ....... .. .... .. ... . . . .................................. ... .. . . ........ ... .. .. ........................ ... .... .. .. ... .. . ........................................................................................................................................................................................................................................ ...... .. ...... . .. . ....... . . ............................ . . . ... . .. . . ...... . . ... . ................. . ...... . . . . ..... ... . ............... . . ..... . .
lowQualScore : 3 66 44 444 444 5 4 444444444444444 555 11111111111111111111111111 33333 88 8888 0000 6 8 44 7 000000 999 222222222222 7 7 7777 7 000000000000 22 22 666666 7777777777 11 222222222 444 44444444444444 222222 22 2222 4 111111111 4 5 6666666666 888 2222222222222222222222222222 9 8 55 99999 4 555555555555 4 44 2222222 77 7777 44 000 7 7 8 4444444444444444444444444444444444 333 66 9 9 00000000 222 88 55 666666666666666666666666 777 5555 11 11 999 11 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555555 22 111111 7 55 6 5555555 9 9 6666666666666666666666666666 1 7 0 555 4 99 5 3 555555 2 4 111 4 66666666666666666 7 222222 5 5 5 5 88888 444 0 444444444444444 5 8 66666 7 3
consensus : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-A-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
Reference ( family-2602 ) : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-A-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
gi|1 : ACTATTA--GATGATAAAG-CT--CCAT---TT---GCCT-A-CCAGA--------A------TC-AACA-------AG----CATGAC-TCG--GCTT-----------AAATAA-T----TCAGT-GTGT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------T--TTG-CA-G----T-GC---------AGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GATTTAAAAATG-ATGT-------A-GTAT-T-G-GA-----ATT---
gi|1 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggT-A-GCTA-T--TTT-----TTCA-------C----AAAACA--T---GAGCACAG-GCTA----G--G---A-C-AAA--------------------A-TCA-AAGA------TT-AATA-TT---TC--CTG-TACA--------TG--C--AAGTG----A--T----T--G---A----GA---AAAATATG--T--T------CC--AA-GCTGTG------CA---T----GT-TTT----------CT------------------------G----------A----------T--------A--------GA------------AAACA----T------------ATT-------------------------------------TT-------------G------A---A--TA-------T-GTAG--------------CA----------GGAGGGGTTTGCTG--TGTA-CT-----G-C-AA-A----T--G-TC-TAATT--T--T----GT----AGCCAAAT-T---ATGT-GAAACAGT--ACTGGACATAGC---C--TCCT--A-T---GA-AATAGA-------A-----GAC-AT----A---TTTTTTGGC-AGC-T-T-T---G-AA----TT-T--GAG-TT----TT-ATCA-GGGCT----GGGAG-GGGCTGTTATCATACATAGTCCTgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaaatcaaagattaatatttcctgtacatgcaagtgattgagaaaaatatgttccaagctgtgcatgttttctgatagaaaacatattttgaatatgtagcaggaggggtttgctgtgtactgcaaatgtctaattttgtagccaaattatgtgaaacagtactggacatagcctcctatgaaatagaagacatattttttggcagctttgaatttgagttttatcagggctgggaggggctgttatcatacatagtcct
gi|10 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggactattagatgataaagctccatttgcctaccagaatcaacaagcatgactcggcttaaataattcagtgtgttttgtgcaagaatccctttgcagtgcagttgttattctcaatttgatttaaaaatgatgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaa----TAAAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---AAATTCC-------G--ATG-CA-T----C-TC---------AAT--T--GT------TA----------T--TG---------TC---AG--------------T------TT--TA--ACAAAATG-ATGT-------A-G-AA-T-
gi|10 : TG-ACGT-------A-A-AT-T-G-GCCAA--ATT---T--------------A-AC--------GT-A-AATT-T--TCTAG---TCCA-------A----GAA------------------GCTT----A--G---A---AAACT-TAAAATT-A--G-A-T-T-TTT-TAAA------T--------T---TC--CAG-TACA--------CGTTT--A--TG----A--C-----------A----AG---AAGAT-TGTCT--T---TGCCCAAAAAGCTGCAAT----C----C----ATATT-----------TTGTCAAAGAAG--------------A----------A----------CGTTCACGGA--------AA-----------TGAGCA----G------------TTT--AGTC---------AATGCG---AT-----------TC-------------A------A---A--TTCTAGAAAT-GCAT--------------AAT-----CTT-ATT------TGCTA---GCG-TT---------AA-A----G--A----TGAATAAT--T----ATT--------AATCT---ATTTTGAAACAGT--ATTGAATGTGAT---C--TCTTC---T---GA-AATAAA-------Atatgacttcacaaacatcacactttattgtatttttgacgtaaattggccaaatttaacgtaaattttctagtccaagaagcttagaaaacttaaaattagattttttaaatttccagtacacgtttatgacaagaagattgtctttgcccaaaaagctgcaatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|11 : taaatgtattttgtgcaaaaattccgatgcatctcaattgttattgtcagttttaacaaaatgatgtagaattatgacttcacaaacatcacactttattgtattttTG-CCAC-------A-A-AA-T-G-ACT----ACT---TT--------T--GAC-AC--------CTCA-GTTT-T--TCT-----GA-A-------G----AAAAAAAAT--TGTGCACAC-ACTC----G--G---A-C-AAATT-TTATATTCA--CAA-T-A-T-A-TATT------TC-T-CC-CTCGATC--CAT-TACACATAATATTA--T--A--TG----A--TTGTCATTG---A----AG---AATTT-TG--T--T---TGTCC--TAAGCTGCATGCATTC----T----AT-AT-----------CTGG----------------------A----------A----------TA-------A--------AA-----------TATATA----TA-----------TCC--AACTTCTTGGTGGA----A---ATCCGAA------TTGAG----------A------A---A--T--------T-GTAT--------------CACGTAAATTT-TGA------AG-TA--TGTA-CT-----T-G-AA-A----TA-ACTACTAAAT--T--------TCAG-ACAAAAAT-T---A
gi|12 : attggattaaaaatattgatgtgaaagcagaatcatgacatcataaacctgatgctatgctgccatttgggatatttAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT--------------TA-AA-A----------------------T--GT------T-----------T--TT---------TC---AG--------------T------TC--AA--TAGAAATG-ACAT-------A-A-AA-
gi|12 : TG-ACAT-------A-A-AA-T-G-G------ATA---TT--------T--TTC--T--------GT-A-G-------------------------------AAAGCA--T--TAAACACAG-GATT----G---------------------------------------TAGA------T-------TC---TG--CA--CACA--------TT--T--G--TG----A-------G--G---T----AA---AAAAT-AG--T--T---TGACC--AAAGCTACT------C----T----GT-TTT----------CTTCAAAGAAAAATATTCACAAAACAA----------A----------C--------A--------AA-----------TCAGCA----A------------TTT--AATT---------A----G---TT-----------TT-------------AGTAA--A---A--T--------T-A-G----------------AA-----TTT---A------TGACG--AGTA-CTAGCTCC-C-AA-G----G--ACTA-TAAGT----------ATCG-----CAAAT-T---ATAT-GAAAC--T--ACTGGACAccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcacacatttgtgaggtaaaaaatagtttgaccaaagctactctgttttcttcaaagaaaaatattcacaaaacaaacaaatcagcaatttaattagttttagtaaaattagaatttatgacgagtactagctcccaaggactataagtatcgcaaattatatgaaactactggaca
gi|13 : agtgtattttgtgcaagaattaaaatgttttttcagttcaatagaaatgacataaaaccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattt----AAAACA--T--TAAGCACAG-ACTTTAATA--G---A-T-AAACT-TGTTATTTA--T-A-G-ACTGA-T---------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TTCA--------CG--T--A--TG----A--C----A--G---A----AA---AAATTCTG--T--A---TCTTC--AAAGCTGTAATCT--T----T----AT-TT-----------CT------------------------ACAGAAACG--A----------TCATGA---A--------AA-----------TGAGCA----T------------TTT--AACT---------A----C---ATCTTCATAAATATT-------------A------A---A--T--------T-GT-T--------------CAG-----CAT-AGA-------GTTA--TATA-CT-----C-C-AT-G----TTAAATG-TAAA------T----ATCTGCATA-AAAT-T---ATGG-TAAACTGT--ACTGAACAGGAT------TCTTTCA------A-A--AGA-------AATAAAAAT-TT----GATC-TTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T----------------TGT-GGGAC----CAGAA-AGACT-TTATCACACATAGTCCTT
gi|14 : tac--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-CTG------TGCAA---GACTTTC-------A--GTG-C--A----C-T--GTACATGTAGC--T--GT------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--GTAGACTG--CAC-------A-C-AA-C-A-GA-----ATT---
gi|15 : ----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--CA--CCGTATTT--CGTG------A-A-AA-T-GTAA-----ATT---TT--------T--GTG-AA--------G----GTTT-T--TCT-----TTCA-------G----AAGATA--T--CGAATGCAGCACTG----G--GTAAA-C-AAACTGTTAatgatgtcataaatacaattctcaagtcttgacatgaaatgtttattattcacagattaacttctgaagcattttgtccaagccttgaacaaatatatttatactctagacatacttttcctgtaaacacatttaaaacttcgctcatatagaattgtgctctctgtttcctgacatcaaaaaaataaaaatagcaatttgacctgaatt
gi|15 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagAAT-C---ATAT-CTAACTGT--AGCGGACATGAC---T--TCTCTCA-T---AA-AAT-GA-----------AAGTT-TT----CATCTTT-TTTAA-AAC-T-T-TTC-A-AAAATATC-T--GTG-TT----TG-AAAG-GGGCC----AAGAT-AGTCTGCTATCACACAAACTCCTTattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctaactgtagcggacatgacttctctcataaaatgaaagttttcatcttttttaaaacttttcaaaaatatctgtgtttgaaaggggccaagatagtctgctatcacacaaactcctt
gi|16 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagtaacagtttgtttacccagtgctgcattcgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatac-----ACT---TT--------G--TTC-AC--------AC-A--TTT-T--TATA----TCGA-------G----AAAACA--T--CCAATAAAG-ACTT----G--A---G-C-AAACT-TTATATCTA--T-A---A-C-A-CAGAT-----TT-A-TC-TT---ACGACAGTTACATG------TG--T--G--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAATGTT--T--T---TGTAC--AAAACTGCG------T----T----GA-AT-----------C-------------------------A----------A----------TATTTA---A--------AA-----------TCAATA----T------------TT----AGT---------A----G---GT-----------TT-------------A------G---AACT--------T-GCAT--------------CAC-----TTT-TGG------TAC-AGTTGTA-CT-----C-G-AT-A----TG-ACTG-TGAAT--T----------AG-TGTCGAAT-TTTGTTGT-GAAAATGT--AATAAACAC
gi|17 : catcataaacatcacgttttgctgccagtgATTAT-AATTAT-ATAAGGACA--CTAT---TG---GCTT-A-TTAAA--------G------CT-GGCT-------TT----TCAA--------GCTT-T---T--TTCAGA--ATT----TAAG--GTAT--A-TTG------TACAT---GAATCAC----------ATG-CA-A----C-TC-G----T---GT--T--GTTACTAGTA----------T--TT---------TC---AA--------------T------TT--GA--TAAAAATT-ATGTTAATCAGG-A-AA-T-A-TG-----ATT---TT--------T--TTC-GCCGCTGTCGGT-A--TTT-TGATATATATGTACAATGGCTTG----AAAACA--T--CTAAAGCAG-ACTT----G--G---A-T-AAGCT-TTAAATT----C-A-T-A-TCA-TAGA------CCTA-TT-TT---TC--CAG-AGCG--------TA--T--A--CG----
gi|18 : gg-CTAAA--------A------TC-AAC--------TT----TATG---T----GCTT-T---G--TTTAAA--G-T----TTGGT-GTAT--T-TTT------TGCAA---GAATCCA-------A--ATG-CA-A----T-TC-----AT-T--T--T---T------TA----------TTCTC---------TC---GA--------------TTTCTTATT--TA--TCAAAGTG-ATGT-------A-G-A
gi|18 : T-T--TTT-----TCTA-------T----AGAAAA--T--GGAACGTAG-ATTT----G--G---G-C-AAACT-TTGTATTAA--T-tttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacttttttctatagaaaatggaacgtagatttgggcaaactttgtattaattccacaga
gi|19 : ctaaaatcaactttatgtgctttgtttaaagtttggtgtattttttgcaagaatccaaatgcaattcattttttattctctcgatttcttatttatcaaagtgatgtagatttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacACTGT-A--TGTGACGAGGGCTTCCTTTCAATT---GCCC-A-CTGAA--------ACTTAAATC-AACAGGGG---TT----TCTT-T-TTCAGGTTT-TGTAT--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--C-TTA------TGCAA---GACTCTT-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TA--------T------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TCAAAATT-AAGT-------A-G-Atccacaga
gi|2 : atataaacttatgataaatacatttgtaagaaaggACTGT-A--TAT---AAGGGCT--CTAT---CT---TCCC-A-CCAAA--------C------TT-GACA-------TT----T--G-C-C-----TTA-G---T--TTCTAA--A-T----CAAGA-GTAT--T-TTG------TTTAA---GAATCCC-------C--ATG-TA-A----C-TC---------AAC--T--GT------TT----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TCAAAACG-ATGT-------ACA-AA-T-G-GA-----Atcaagaatgatgacgttttgtttcctaatttggtataaag
gi|2 : aggTG-ACAT-------A-A-AG-T-G-GC------TG---TT--------T--TTC-AC--------AT-AAGATT-T--TCT-----TATA-------G----AAAATA--T--CAATTACAG-GTTA----G--G---A-C-AACCT-TTATACT-------------------A---------A-TC-TT---TC--CTG-TACAC-------TG--TTCA--AG----A--T----A--C---A----AG---AAA---TG--T--T---TGTCT--AGGGCTATA------T----TCTATGT-TT-----------AC------------------------AGAAAACATTCA----------T--------A--------AA-----------TAAGAA----C------------TTTCTAATTT--------A----GTTGAT-----------CA-------------A------A---A--TAAAAAGA-TAGCAT---------------AC-----TTT-AGA------TGCTG--TGTA-TT-----T-C-AA-AG---T--ACTG-TACAC----------ATCAG-AGACAAAA-C---AGGT-GAAATTGA--ATTGGACATGATTTCC--TTTTTTAGT---GA-AAT-----------A-GAAGAG-TT----ATACTTTCTTTAC-AGT-T-T-T---C-AA---ATT-TG-GAGTTT----T--ACTG-GGCTC----TG--A-AGGCTGTcacaagcctgacactttgctgctcatatcttgacataaagtggctgtttttcacataagattttcttatagaaaatatcaattacaggttaggacaacctttatactaatctttcctgtacactgttcaagatacaagaaatgtttgtctagggctatattctatgtttacagaaaacattcataaataagaactttctaatttagttgatcaaaataaaaagatagcatactttagatgctgtgtatttcaaagtactgtacacatcagagacaaaacaggtgaaattgaattggacatgatttccttttttagtgaaatagaagagttatactttctttacagttttcaaatttggagttttactgggctctgaaggctgtccattcttatatggtattcctt
gi|20 : aggactgtatataagggctctatcttcccaccaaacttgacatttgccttagtttctaaatcaagagtattttgtttaagaatccccatgtaactcaactgtttttctcaatttgatcaaaacgatgtacaaatggaacacaagcctgacactttgctgctcatatctAA---GAATCCC-------A--GTA-CA-T----C-TC-G---CT-T--------GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--TA--TTGAAATT-AGAT-------A-G-AA-ccattcttatatggtattcctt
gi|20 : tT-------A-A-AA-T-G-GC------TA---TT--------T--TAC-AT--------GG-A-GTTT-T--TCA-----TCTA-------ATGATAAAGCA--T--GGAGTGCAG-GCTT----T--G---A-T--AATG-TTATGTTTA--C-AGC-A-TTA-TAGAT-----TT-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------CA---------G----A--T----G--G---G----AA---Acctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgccttaaaatggctattttacatggagtttttcatctaatgataaagcatggagtgcaggctttgataatgttatgtttacagcattatagatttatctttccagtacacagatgggaaatgtt
gi|21 : taagaatcccagtacatctcgcttgttattctcaattttattgaaattagatagaacctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgcctTG-ACAT-------C-A-AA-T-T-GC-------T---AT--------T--TTC-AC--------GC-A-GTTCAG--TAT-----TCCAATCTC--G----AAATCG--T--TGACCACAG-GTTT----G--G---C-C-AAAGA-TTTCATTTA-------------------------C-G-TC-TC---CC--GAC-CACA--------TG--T--G--TG----A--T----G--G----------------AC-TC--T--TTTGTGTTC--AAAGCTG--------C----T----GT-TT-----------tgtt
gi|22 : tttggtatttCCA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TC-ATTA-TAA----C--T----ATCAG-AAACAAAC-T---ATGT-GTAACTTTGAGCCGGAGATGAT---T--TA-TTTA-T---GA-AATACA-------AT-GAGAAT-GTAACAAATCTATCTTTAA-TGC-T-T-T---C-CA---TTTGT--GAG-TG----T--AT---GGACC----AGAAA-AGGTTGTTATgcattttttgaatgaaaagtatttaaaaacaatattgtatatgtattacgggggaaatcgtgtcactttcaattc
gi|23 : accaagaatggaaattatcttattattgcagt-TC-TT---TC--TAG-AACA--------TT--T--A--TGTG--A--T----A--G---A----AATTT----T-TT--T--T---TGTCT--CAAGTTGTA------CATTAT----GTCTT-----------CTGAATGAAA----------------A----------A----------T--------ATTGACAAAAA-----------TGAACA----T------------TTT--AATT---------AAG--G---A---------------------------A------A---A--TGAAAAAC-T-GCAT--------------CATA----GTT-TAA------TGCTA------------------AA-G----T--TCTG-TGAA------T----ATTAG-AGAAAAAT-T---ATGagaaagata
gi|24 : tttcattaaaactctaccatt-------------A------A---A--C--------T-ATAT--------------CAC-----TTT-CGA------AG-TG--TGTG-CT-----A-C-AG-AAAACT--ATTA-TAGAT----------GTCAG-AGACAAAT-G---ATGT-GAAACTGT--ATGGGATATGAT---C--TCTTTCA-T---GA-AATAT--------AG-GAAGATAGTGAAAAGTTTTACTTTAA-AGC-T-C-T---G-AA---TTT-T--TTG-CT----CTGATGG-GGGCC----CAGAA-AGGCTGTTATTA
gi|25 : aatgag-GTTT-T--TCT-----TCTATAAA---A----AAAACT--T--CAGAAGCAG-TCAT----T--A---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-ACC-A-TGA-TAGAT-----TT-A-TT-TT---TC--CAG-TGCT--------TA--T--A--TGATAAA--T----A--A---A----AA---AAAA-------------TGCCC--AAAGCTACA------C----
gi|26 : agaatgatggggttttgctgccattgaagtattttgacatagtgaagccGGCT--CTGT---TT---GCCC-A-CCCAA--------A------TC-AACA-------TCATGATCTG---T----GTTT-T---TCTTTCAAA--AGTA---TAAGT-GTAT--G-TTA------TGCAA---GTATCAT-------G--ATG-CA-A----C-TCAG---TT-TAAC--T--G-------------------G--TC---------TC----A--------------T------TT--GG--CCAAAATG-GTAT-------G-A-AATT-A-GA-----ATT---
gi|27 : TA--CGTA-TT-----C-C-AA-A----TG-ACTG-TAAAT--T--T------CAA-AGACAAAT-T---ATTT-GAAATTGT--GTAGGAGATGAT---C--CCTTTTA-T---GA-AACA-A-------AA-GAAAAT-TT----TGTCTTCCTTTCA-AGC-T-T-T---T-AA---CTT-C--GAGTTT----T--ATGG-TGGTCTAGACGGAA-AGGCTaaacatcattacaaatgttttctt
gi|28 : tttaGAAAATGACA--CTAT---TT---GGCC-C-CCAAT--------A------TT-GACA-------AT----CGCA-C------ATTTAT---T--TTCAAA----T----TAAGT-G-AT--CATTG------TGCAA---GAATGTC-------G--ATA-CA-A----C-TT-C---AT-T-GTAAT--GC------TA----------T--TT---------TC---
gi|29 : aaTAT-A--AATGAAAAGGGTT--CTAT---TT---GCCC-T-CAAAA--------A------TT-TACAGCAGTGTTT----TTTT-C-T----CTCT-C---T--CTCCAAT-A-T----TAAAT-GTATAAA-TTG------TGCTA---AAATCCC-------G--GTG-CA--------T------AT-CAGT--T--GT------TA----------T--TT---------TC---CA--------------T------TT--AA--tcgcaacaattttgtttgaaaacatcaa
gi|3 : aaatgaaACTAT-A--TATGGTAAGGACT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TT-GACA-------TT----TTTA-C-T----ATTT-T---T--TTCAAA----T----TACAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCA-------G--AAG-CA-A----C-TC-A---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TA---AG--------------T------TT--GA--TAAAAATG-ACAT-------C-A-AA-T-G-GG-----ATT---TT--------T--TTT-AC--------AT-A-GATT-T--TCT-----TTCA-------A----GAAACA--T--CAAA---AG-AATT----G--G---A-C-ATACT-TCATATTTATTT-A-T-A-TCA-TAGA------TC-A-TCATG---TA--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--GAAAA----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCT--AAAACTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TCAGCA----T------------TTT--ACCT---------A----G---A------------TT-------------A------C---A--T--------T-ACAT--------------CAC-----TTTCCCA------TGCTG--TGTA-CT-----C-C-AATA----T--ATTG-TAAAT--TAAT----ATTAG-AGATAAAC-T---ATGA-GAAACTGT--ATTGGACAGAAT---T--TCTTTTA-T---GA-AATAGAATTAAGCAA-GAAGAC-TT----AATTTTTCTTTTA-AGC-T-T-TA--A-AA---AAT-T--GAA-TT----T--ATGG-GGCCC----TGGTA-AGGCTGTTATTATACAAAGTCCTTac
gi|30 : TA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-AGCA-TAAGT----------ATCAG-AGACAA-T-A---ATTT-GAAACTGC--ACTGAACACAAT---T--TGTCTTA-TTTAGC-AATAGA-------A------AT-TT----A----------AA-AGT-T-A-C---A-AA---AAT-TGGGAG-TT----TG-ATGG-GAACC----CAGA
gi|31 : GCT--CTAT---CT---GGCT-C-CCAAA--------A------TC-AACA-------GG----TGTG-C-T-----TTT-G---T--TTCAAA--T-T----TGGGT-GTGT--T-TTA------TGCAA---G--TTTT----------ATG-CA-AGTAGC-CT-G---AA-GAGT--T--GT------TA----------A--TC---------GC---AG--------------T------TT--GG--CAAAAATG-Agtccttta
gi|32 : ATGATAAGGGCT--TTAG---TT---TCCT-G-CCAAA--------A------TC-GACA-------GT----CATA-CATTA--ATTT-TG--T--TTCAAA--A-T----TTAGT--T-T--T-TTG------TGCAA---AAATCCCTATAAAAGCTATG-CA-A----C-T------------T--T--G----------------------TG---------TC---CG--------------T------TC--GA--TGAAAATG-Atctgtagggtgagaat
gi|33 : GAGCACAA-TGTT----G--G---AAC-AAATT-TCAAATCAA--T-G-TCA-TGGCTA---------T-A-TC-TC---TC--TGG-CACA--------TG--C--AAGTG----A--C----A--G---A----AA---AATAT-TT--C--C---TGTCT--AAAGTTGTA------T----T----
gi|34 : tGT--ATTGAACATGAA---G--TACTTCA-T---GA-AAT-GA-------AA-GAAAAT-TT----GGTCATTCTCTCG-AAT-T-TCT---A-GA---ATT-T--GAGATT----T--ACAGCAGGCC----AAAAAGAGGCTGCAATCATACAAAATCCTTtcatgtatcctaaaagaaa
gi|35 : ---T--TTCAAA--A-T----CAAGT-GTAG--T-TTA------TGCAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----G-T--G---AT----T--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AG--------------T------TT--GT--TCAAAAt
gi|36 : --ACTGAACATAAT---C--TCTTTGA-C---GA-AATAAA-------AA-T-TGAT-TT----AGTCTTTTTTCAA-ATT-T-T-T---ATAA---ATG-T--GAG-CTA---C--ACCG-GAGCT----CGGAA-GGGCTGTCATCATcagcattctcctaaccatgacatcacaaacacactattt
gi|37 : aacaa-GAAACTGT--ATTGGACACGAT---C--TTTTTT--T---AA-AAT--------------AAGAT-TT----AGTCTTCCTTTAA-GAT-T-T-T---G-AG---A---T--G---------T--ATGT-GGGCC----CAGAT-AAGCTGTTAGTTTACAAAAT
gi|38 : c-A-AA-T-G-CT-----AAT---TT--------T--TGG-AA--------GC-A-GTTT-----CT-----TTCA-------G----AAAACA--T--ATTGCGCAt
gi|39 : atttttctagaacacgtgtgatagattaattttgtttattcgatatcacaatT-------A-A-AA-T----T-----ACTG--TT--------T--TTC-AT--------GC-A-GTTT-T--TCA-----TCTA-------C----AAAGCA--T--CATGTGGAG---TT----GTAG---A-T-AAACA-ATGTATTTC--T-G-C-A-TG----GAT-----TT-A-CC-TT---TC--CGG-
gi|4 : ACTAT-A--CACGATAAGGGTG--GTGT---TT---GCCC-AACCAAA--------A------TC-------------------ATG-C-T----TTCC-T---C--TTCAGT--C-G----TAAGT-GT-T--C-TTGATCAATTTCAATTTGA-TCAA-------A--ATGACATA----C-TC-A---AC-TACT--T--GT------AA----------C---C---------GG---AA--------------T------TT-------AAACATC-ACG--------A-A-CA-T-G-AC-----GTT---TTGTCGTTATT--TTCGAT--------CT-G-CTAT-T--TCT-----TCTA-------G----AAAATG--TACCGAGTGTAG-GCTT----G--G---A-C-TAAAT-TCATATTCG--C-A-T---TG--CAGA-------------------------A-TACA--------TA--T--A--TC----A--T----T--G---A----AA---AATAT-TG--T--T---TGTCC--AAAACTACA------T----TATATGT-TT-----------TTCG----------------------A----------A----------T--------G--------AAAAACGTTCATACTAGCA----AACAAA-------TTT--CACT---------A----A---AT-----------TTGAG----------A------A---A--T--------A-TCTT--------------CTT-----TTT-ACA------TTCTT--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--A--------------------TCAG-AGA-GAAC-A---ATGT-GAAACTGC--ATTGTACATGAT---C--TCCTCTC-T---AA-AATAAATC-----AA-GA--AT-TC----A-TTTTTCTTCAACGGC-T-T-TC--A-AA---ATT-T--GAC-CCGAGAC--ATGG-GA--C----CAGAA-AGG--GTTGTTATACAAAGTCTTT
gi|41 : aggAT-A--TATGATAAG---T--CTGT---TT---TCCCCA-CCAAG--------T------TC-AGCA-------TT----CATG---T----GTTT-G---T--TTCATT--G-T----TAATT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT
gi|42 : ggactaatg----AGTCTTTCTTCAA-ATC-T-T-TTTAA-AA---ATT-T--AAA-TT----TC-ATGG-GGTCG----TAGAA-ACACTGTTATTATACATAGTCCTT
gi|43 : A----T------------TTT--GAGT---------G----A---AT-----------TG-------------AGA----A---A--A--------T-GTGT--------------CAC-----TTT-TGT------TGCTT--TGTA-CT-----TAC-AA-A----TG-ACTG-TGAAT--t
gi|44 : aacaaT---C--TCTTTTA-T---GA-AATCAA-------AA-----AT-TT----CGTCTTCCTTTAA-AGCTT-T-T---A-AG---ATT-T--AGC-TT----C--GTGA-GTGCT----TAAGA-AGGCactcagt
gi|45 : T-------A-A-AA-T-G-AAT----ATT---TT--------C--T-------------GC-A-GCTT-T--TCT-----GCCA-------G----AAAATA--T--CAAATGCAG-GCTT----G--G---A-C-AA
gi|46 : AT--C-TTG------TGTGA---AAATCCC-------G--ATT-TA-T----C-TC-A-------AGT--T--TT------TA----------T--TT---------TC---AA--------------TA-----TA--GT--TCAAAATG-ACGT-------A-G-Atgtcat
gi|47 : A----T------------TTT--AG-T---------A----G---AA-----------TTGAG----------A------A---A--A--------T-GTGT--------------CAC-----TTT-GGA------TGCTA--TGTA-CT-----
gi|48 : -------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAT-----TTT-TGA------CGTCA--TGTA-TT-----C-C-AA-A----T--
gi|5 : aattgagACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C-T----GTTG-T---T--TTGAAA--A-T----TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----CTTT-A---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--TAAGAATG-ACga
gi|5 : ataaaagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA--T----ATG-AAGT--------------T-T-GT-----AGT---TT--------T----C-AT--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAG-A--T--GGTGTGCAT-GCCT----G--G---A-CAAAACT-TTATATTTA--T-ACT-A-TGA-GGGA------TC-A-----T---TC--CTG-TGCA--------CC--T--A--TA----A--T----AT-G---ACCT-AA---AAAA---------T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-AT-----------AT------------------------A----------AAAAGAGAACTT--------A--------AAATAT-------TTAATAACATT------------TTT--AACT---------A----G---ATA----------TT-------------A------A---G--T--------T-GAATTGAGAAATTTGCAACAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C----G-A----TG-GCT--TAAAT--T--------TCAG-AGACAAAT-T---ttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccagaaagatggtgtgcatgcctggacaaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctataatatgacctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaaagagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|6 : ataaaagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgttttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgaACTAC-A--TATAATAAGGGCT--ACAA---TT---GCCC-A-ACAAA--------T------TA-GA-A-------TC----T-------------------------CA-----------TAGGT-ATAT--T-TTG------TGAAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----C-TC---------AGT--T--AC------TA----------T--TCTAAATATGATC---AAAATGACATGGGAACT------TT--AA--CTAAAATTTATAT-------A-A-AC-A-G-GATACAGATTAGGTC--------TAATTT-AC-----------A-GTTT-T--CCT------CCA-------G----CAA-------------GCAG-CCTT----G--A---A-C-ATGCT-TTAT-------T-A-A-G-TGA-TAGAAAAATTTT-G-TG-TG---TC--C---TGAA--------T---T--A--TG----C--T----C--G---A---------------TG--T--T---T-TCT--GA--CCGGA------AAA--T----GT-TC-----------CT------------------------A----------A-------------------A--------AA-----------T------------------------T--AAGT---------A----A---AA-----------TT-------------G------AGACA--T--------T-GTGC--------------CAC-----TTT-TGA------TGCTA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-AGCA-TAAG------T----ATCAG-ATAC-AAT-A---ATGT-GAAACTGC--ACTGATCACAAT---CCGTCTTATC-T---GACAATAGA-------A------AT-TT----A----------AA-AGT-TAC-A---A-AA---ATTGT--GAG-TT----TG-ATGG-GAACC----CAGAA-AAGC----ATCATACAGAGTCC
gi|7 : aggACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C-T----GTTG-T---T--TG-AAA--A-T----TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----C-TTTA---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--TAAGAATG-AC
gi|7 : aagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA--T----ATG-AAGT--------------T-T-GT-----AGT---TT--------T----C-AT--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----GAAAGA--T--GGTGTGCAT-GCCT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-ACT-A-TGA-GGGA------TC-A-----T---TC--CTG-TGCA--------CC--T--A--T-----A--T----AT-G---ACCCTAA---AAAA---------T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-ATATAAAAGAGAACTTAA---------------------A----------A----------T--------ATTT-----AA-----------TAA-CA----T------------TTT--AACT---------A----G---ATA----------TTAAGTTGAATTGAGA------A---A--T--------T-GCAA--------------CAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C-C-GA-T----G--GCT--TAAAT--T--------TCAG-AGACAAAT-T---Attggaactgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccaggaaagatggtgtgcatgcctggacaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctatatatgaccctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaagagaacttaaaatatttaataacattttaactagatattaagttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|8 : aagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgtttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgaACCAT-A--TACGATACAGGCT--GTGT---TTCATGCTC-A-CCAAATACAGCTCA------TCTGGCA-------TT----CTTA--------ATTT-G---T--T--AAA--A-T-----GACT-G-AT--T-C------------A---GAATT------------ATG-T------------G---AT-TAAT--TTAAT------TAAGAAGAAAATT--TC---------TC---CA--------------T------TTTGGA--ATAAAATG-AC---------------------T-----ATT---TT--------C--T---AC--------CC-A-GTTT-T--TAT-----TCTA-------G----AAAACA--T--GAAGAGCAG-ACTT----G--G---A-C-AAATT-TCA----TA--T-A-T-G-CCA-TAG-------------C-T--------CAG-TGCA--------TG--C--A--TG----GCTT----A------A----TG---AAAGT-TG--TACT---TGTT----AAGT---------------------T-TT-----------TT------------------------G----------A----------A--------A--------GA-----------AAAACA----TCACAAAATCCAGTTT--AATC---------A----A---ATG----------TT-------------AAAATAGA---A--T--------T-GAGA--------------AAC-----TAT---A------TCACA--TTTA-CT-----T-CAAA-A----G--ACTG-TAA-------T----ATTGG-ACAGAGAG-T---ATTT-GAAATGGA--AATGGGCATGAT---C--TCTTTTA-T---AA-Ac
gi|9 : aagg--TTCAAA--A-TCTAATAAGT-GTAT--T-TTA------TTC-A---GAATCAT-------GA-ATG-CC-A----C-TC-----AT----T--T--GT------CA----------T--TC---------TC---AG--------------T------CT--GA--ACAGAAAG--CAG-------A-G-AA-TCG-GA-----ATT---
gi|9 : gTG-ACTT-------G-A-AG-T-T-GCTA---ATT---TT--------T--CTC-AC-----------A-GTTT-T--TCC-----TCTA-------G----AAAGCA--T--TTAGCATTG-GCTT----T--C---A-G-AAACT-TCATACT---------------------------C-A-TC-TT---TT--CAA-TACA--------TG--T--G--TGTA--A--T----A--G---G----AA---AATTT-TG--T--T---TTTCC--AGAGCTGAT------C----T----GT-TT-----------CCTGAAAA------------------A----------A----------TGTTTCCAAA--------AA-----------TGAGCA----T------------TT---AAAT---------G----A---AT-----------TTCTGTC--------A------A---A--T--------T-GCAT--------------CAT-----TTT-TGA------TGCTA--TGTT-CT-----C-C-AA------------G-TAAAT--G--TAGGAATTAG-TGGAAAAT-T---GTGT-AGAACTGT--ATTGGACAatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgctaatttttctcacagtttttcctctagaaagcatttagcattggctttcagaaacttcatactcatcttttcaatacatgtgtgtaataggaaaattttgtttttccagagctgatctgtttcctgaaaaaatgtttccaaaaatgagcatttaaatgaatttctgtcaaattgcatcatttttgatgctatgttctccaagtaaatgtaggaattagtggaaaattgtgtagaactgtattggaca
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): ACGCTGCTTATTTTCCATTCTCAATTTCATCAAAATGAGAACCAGAATTACGATATCATAGACATAACATTATGTCACTATTTTCAATATTTT
Unaligned ( gi|49 ): TAAAAGCTCTTCATAAAACAGTTGTAAGTGAAT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111111111111111 33333333333333333333333333 11111 111111111111 333333333333 1111111111 1111111111111111111111111111 111111111111 1111111 6666666666666666666666666666666666 11111111 111111111111111111111111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333333333333333333333333 33333333333333333 111111 11111 222222222222222
lowQualScore : 3 44 33 444 444 2 2 333333333333333 444 77777777777777777777777777 00000 22 9999 6666 3 0 22 1 555555 222 666666666666 1 1 3333 1 444444444444 22 22 444444 6666666666 22 666666666 555 99999999999999 666666 22 5555 1 666666666 1 1 5555555555 444 8888888888888888888888888888 1 1 22 88888 0 555555555555 0 22 0000000 22 3333 22 333 1 1 1 4444444444444444444444444444444444 333 22 0 1 22222222 444 22 55 777777777777777777777777 333 2222 33 33 333 33 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 999999 77 666666 0 22 3 5555555 1 1 6666666666666666666666666666 2 2 2 333 2 22 1 3 555555 0 2 444 2 22222222222222222 2 666666 2 2 2 2 33333 444 5 111111111111111 2 0 55555 2 1
lowQualScore : . .. .. ... ... . . ............... ... .......................... ..... .. .... .... . . .. . ...... ... ............ . . .... . ............ .. .. ...... .......... .. ......... ... .............. ...... .. .... . ......... . . .......... ... ............................ . . .. ..... . ............ . .. ....... .. .... .. ... . . . .................................. ... .. . . ........ ... .. .. ........................ ... .... .. .. ... .. . ........................................................................................................................................................................................................................................ ...... .. ...... . .. . ....... . . ............................ . . . ... . .. . . ...... . . ... . ................. . ...... . . . . ..... ... . ............... . . ..... . .
lowQualScore : 3 66 44 444 444 5 4 444444444444444 555 11111111111111111111111111 33333 88 8888 0000 6 8 44 7 000000 999 222222222222 7 7 7777 7 000000000000 22 22 666666 7777777777 11 222222222 444 44444444444444 222222 22 2222 4 111111111 4 5 6666666666 888 2222222222222222222222222222 9 8 55 99999 4 555555555555 4 44 2222222 77 7777 44 000 7 7 8 4444444444444444444444444444444444 333 66 9 9 00000000 222 88 55 666666666666666666666666 777 5555 11 11 999 11 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555555 22 111111 7 55 6 5555555 9 9 6666666666666666666666666666 1 7 0 555 4 99 5 3 555555 2 4 111 4 66666666666666666 7 222222 5 5 5 5 88888 444 0 444444444444444 5 8 66666 7 3
consensus : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-A-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
Reference ( family-2602 ) : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-A-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
gi|1 : ACTATTA--GATGATAAAG-CT--CCAT---TT---GCCT-A-CCAGA--------A------TC-AACA-------AG----CATGAC-TCG--GCTT-----------AAATAA-T----TCAGT-GTGT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------T--TTG-CA-G----T-GC---------AGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GATTTAAAAATG-ATGT-------A-GTAT-T-G-GA-----ATT---
gi|1 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggT-A-GCTA-T--TTT-----TTCA-------C----AAAACA--T---GAGCACAG-GCTA----G--G---A-C-AAA--------------------A-TCA-AAGA------TT-AATA-TT---TC--CTG-TACA--------TG--C--AAGTG----A--T----T--G---A----GA---AAAATATG--T--T------CC--AA-GCTGTG------CA---T----GT-TTT----------CT------------------------G----------A----------T--------A--------GA------------AAACA----T------------ATT-------------------------------------TT-------------G------A---A--TA-------T-GTAG--------------CA----------GGAGGGGTTTGCTG--TGTA-CT-----G-C-AA-A----T--G-TC-TAATT--T--T----GT----AGCCAAAT-T---ATGT-GAAACAGT--ACTGGACATAGC---C--TCCT--A-T---GA-AATAGA-------A-----GAC-AT----A---TTTTTTGGC-AGC-T-T-T---G-AA----TT-T--GAG-TT----TT-ATCA-GGGCT----GGGAG-GGGCTGTTATCATACATAGTCCTgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaaatcaaagattaatatttcctgtacatgcaagtgattgagaaaaatatgttccaagctgtgcatgttttctgatagaaaacatattttgaatatgtagcaggaggggtttgctgtgtactgcaaatgtctaattttgtagccaaattatgtgaaacagtactggacatagcctcctatgaaatagaagacatattttttggcagctttgaatttgagttttatcagggctgggaggggctgttatcatacatagtcct
gi|10 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggactattagatgataaagctccatttgcctaccagaatcaacaagcatgactcggcttaaataattcagtgtgttttgtgcaagaatccctttgcagtgcagttgttattctcaatttgatttaaaaatgatgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaa----TAAAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---AAATTCC-------G--ATG-CA-T----C-TC---------AAT--T--GT------TA----------T--TG---------TC---AG--------------T------TT--TA--ACAAAATG-ATGT-------A-G-AA-T-
gi|10 : TG-ACGT-------A-A-AT-T-G-GCCAA--ATT---T--------------A-AC--------GT-A-AATT-T--TCTAG---TCCA-------A----GAA------------------GCTT----A--G---A---AAACT-TAAAATT-A--G-A-T-T-TTT-TAAA------T--------T---TC--CAG-TACA--------CGTTT--A--TG----A--C-----------A----AG---AAGAT-TGTCT--T---TGCCCAAAAAGCTGCAAT----C----C----ATATT-----------TTGTCAAAGAAG--------------A----------A----------CGTTCACGGA--------AA-----------TGAGCA----G------------TTT--AGTC---------AATGCG---AT-----------TC-------------A------A---A--TTCTAGAAAT-GCAT--------------AAT-----CTT-ATT------TGCTA---GCG-TT---------AA-A----G--A----TGAATAAT--T----ATT--------AATCT---ATTTTGAAACAGT--ATTGAATGTGAT---C--TCTTC---T---GA-AATAAA-------Atatgacttcacaaacatcacactttattgtatttttgacgtaaattggccaaatttaacgtaaattttctagtccaagaagcttagaaaacttaaaattagattttttaaatttccagtacacgtttatgacaagaagattgtctttgcccaaaaagctgcaatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|11 : taaatgtattttgtgcaaaaattccgatgcatctcaattgttattgtcagttttaacaaaatgatgtagaattatgacttcacaaacatcacactttattgtattttTG-CCAC-------A-A-AA-T-G-ACT----ACT---TT--------T--GAC-AC--------CTCA-GTTT-T--TCT-----GA-A-------G----AAAAAAAAT--TGTGCACAC-ACTC----G--G---A-C-AAATT-TTATATTCA--CAA-T-A-T-A-TATT------TC-T-CC-CTCGATC--CAT-TACACATAATATTA--T--A--TG----A--TTGTCATTG---A----AG---AATTT-TG--T--T---TGTCC--TAAGCTGCATGCATTC----T----AT-AT-----------CTGG----------------------A----------A----------TA-------A--------AA-----------TATATA----TA-----------TCC--AACTTCTTGGTGGA----A---ATCCGAA------TTGAG----------A------A---A--T--------T-GTAT--------------CACGTAAATTT-TGA------AG-TA--TGTA-CT-----T-G-AA-A----TA-ACTACTAAAT--T--------TCAG-ACAAAAAT-T---A
gi|12 : attggattaaaaatattgatgtgaaagcagaatcatgacatcataaacctgatgctatgctgccatttgggatatttAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT--------------TA-AA-A----------------------T--GT------T-----------T--TT---------TC---AG--------------T------TC--AA--TAGAAATG-ACAT-------A-A-AA-
gi|12 : TG-ACAT-------A-A-AA-T-G-G------ATA---TT--------T--TTC--T--------GT-A-G-------------------------------AAAGCA--T--TAAACACAG-GATT----G---------------------------------------TAGA------T-------TC---TG--CA--CACA--------TT--T--G--TG----A-------G--G---T----AA---AAAAT-AG--T--T---TGACC--AAAGCTACT------C----T----GT-TTT----------CTTCAAAGAAAAATATTCACAAAACAA----------A----------C--------A--------AA-----------TCAGCA----A------------TTT--AATT---------A----G---TT-----------TT-------------AGTAA--A---A--T--------T-A-G----------------AA-----TTT---A------TGACG--AGTA-CTAGCTCC-C-AA-G----G--ACTA-TAAGT----------ATCG-----CAAAT-T---ATAT-GAAAC--T--ACTGGACAccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcacacatttgtgaggtaaaaaatagtttgaccaaagctactctgttttcttcaaagaaaaatattcacaaaacaaacaaatcagcaatttaattagttttagtaaaattagaatttatgacgagtactagctcccaaggactataagtatcgcaaattatatgaaactactggaca
gi|13 : agtgtattttgtgcaagaattaaaatgttttttcagttcaatagaaatgacataaaaccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattt----AAAACA--T--TAAGCACAG-ACTTTAATA--G---A-T-AAACT-TGTTATTTA--T-A-G-ACTGA-T---------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TTCA--------CG--T--A--TG----A--C----A--G---A----AA---AAATTCTG--T--A---TCTTC--AAAGCTGTAATCT--T----T----AT-TT-----------CT------------------------ACAGAAACG--A----------TCATGA---A--------AA-----------TGAGCA----T------------TTT--AACT---------A----C---ATCTTCATAAATATT-------------A------A---A--T--------T-GT-T--------------CAG-----CAT-AGA-------GTTA--TATA-CT-----C-C-AT-G----TTAAATG-TAAA------T----ATCTGCATA-AAAT-T---ATGG-TAAACTGT--ACTGAACAGGAT------TCTTTCA------A-A--AGA-------AATAAAAAT-TT----GATC-TTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T----------------TGT-GGGAC----CAGAA-AGACT-TTATCACACATAGTCCTT
gi|14 : tac--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-CTG------TGCAA---GACTTTC-------A--GTG-C--A----C-T--GTACATGTAGC--T--GT------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--GTAGACTG--CAC-------A-C-AA-C-A-GA-----ATT---
gi|15 : ----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--CA--CCGTATTT--CGTG------A-A-AA-T-GTAA-----ATT---TT--------T--GTG-AA--------G----GTTT-T--TCT-----TTCA-------G----AAGATA--T--CGAATGCAGCACTG----G--GTAAA-C-AAACTGTTAatgatgtcataaatacaattctcaagtcttgacatgaaatgtttattattcacagattaacttctgaagcattttgtccaagccttgaacaaatatatttatactctagacatacttttcctgtaaacacatttaaaacttcgctcatatagaattgtgctctctgtttcctgacatcaaaaaaataaaaatagcaatttgacctgaatt
gi|15 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagAAT-C---ATAT-CTAACTGT--AGCGGACATGAC---T--TCTCTCA-T---AA-AAT-GA-----------AAGTT-TT----CATCTTT-TTTAA-AAC-T-T-TTC-A-AAAATATC-T--GTG-TT----TG-AAAG-GGGCC----AAGAT-AGTCTGCTATCACACAAACTCCTTattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctaactgtagcggacatgacttctctcataaaatgaaagttttcatcttttttaaaacttttcaaaaatatctgtgtttgaaaggggccaagatagtctgctatcacacaaactcctt
gi|16 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagtaacagtttgtttacccagtgctgcattcgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatac-----ACT---TT--------G--TTC-AC--------AC-A--TTT-T--TATA----TCGA-------G----AAAACA--T--CCAATAAAG-ACTT----G--A---G-C-AAACT-TTATATCTA--T-A---A-C-A-CAGAT-----TT-A-TC-TT---ACGACAGTTACATG------TG--T--G--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAATGTT--T--T---TGTAC--AAAACTGCG------T----T----GA-AT-----------C-------------------------A----------A----------TATTTA---A--------AA-----------TCAATA----T------------TT----AGT---------A----G---GT-----------TT-------------A------G---AACT--------T-GCAT--------------CAC-----TTT-TGG------TAC-AGTTGTA-CT-----C-G-AT-A----TG-ACTG-TGAAT--T----------AG-TGTCGAAT-TTTGTTGT-GAAAATGT--AATAAACAC
gi|17 : catcataaacatcacgttttgctgccagtgATTAT-AATTAT-ATAAGGACA--CTAT---TG---GCTT-A-TTAAA--------G------CT-GGCT-------TT----TCAA--------GCTT-T---T--TTCAGA--ATT----TAAG--GTAT--A-TTG------TACAT---GAATCAC----------ATG-CA-A----C-TC-G----T---GT--T--GTTACTAGTA----------T--TT---------TC---AA--------------T------TT--GA--TAAAAATT-ATGTTAATCAGG-A-AA-T-A-TG-----ATT---TT--------T--TTC-GCCGCTGTCGGT-A--TTT-TGATATATATGTACAATGGCTTG----AAAACA--T--CTAAAGCAG-ACTT----G--G---A-T-AAGCT-TTAAATT----C-A-T-A-TCA-TAGA------CCTA-TT-TT---TC--CAG-AGCG--------TA--T--A--CG----
gi|18 : gg-CTAAA--------A------TC-AAC--------TT----TATG---T----GCTT-T---G--TTTAAA--G-T----TTGGT-GTAT--T-TTT------TGCAA---GAATCCA-------A--ATG-CA-A----T-TC-----AT-T--T--T---T------TA----------TTCTC---------TC---GA--------------TTTCTTATT--TA--TCAAAGTG-ATGT-------A-G-A
gi|18 : T-T--TTT-----TCTA-------T----AGAAAA--T--GGAACGTAG-ATTT----G--G---G-C-AAACT-TTGTATTAA--T-tttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacttttttctatagaaaatggaacgtagatttgggcaaactttgtattaattccacaga
gi|19 : ctaaaatcaactttatgtgctttgtttaaagtttggtgtattttttgcaagaatccaaatgcaattcattttttattctctcgatttcttatttatcaaagtgatgtagatttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacACTGT-A--TGTGACGAGGGCTTCCTTTCAATT---GCCC-A-CTGAA--------ACTTAAATC-AACAGGGG---TT----TCTT-T-TTCAGGTTT-TGTAT--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--C-TTA------TGCAA---GACTCTT-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TA--------T------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TCAAAATT-AAGT-------A-G-Atccacaga
gi|2 : atataaacttatgataaatacatttgtaagaaaggACTGT-A--TAT---AAGGGCT--CTAT---CT---TCCC-A-CCAAA--------C------TT-GACA-------TT----T--G-C-C-----TTA-G---T--TTCTAA--A-T----CAAGA-GTAT--T-TTG------TTTAA---GAATCCC-------C--ATG-TA-A----C-TC---------AAC--T--GT------TT----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TCAAAACG-ATGT-------ACA-AA-T-G-GA-----Atcaagaatgatgacgttttgtttcctaatttggtataaag
gi|2 : aggTG-ACAT-------A-A-AG-T-G-GC------TG---TT--------T--TTC-AC--------AT-AAGATT-T--TCT-----TATA-------G----AAAATA--T--CAATTACAG-GTTA----G--G---A-C-AACCT-TTATACT-------------------A---------A-TC-TT---TC--CTG-TACAC-------TG--TTCA--AG----A--T----A--C---A----AG---AAA---TG--T--T---TGTCT--AGGGCTATA------T----TCTATGT-TT-----------AC------------------------AGAAAACATTCA----------T--------A--------AA-----------TAAGAA----C------------TTTCTAATTT--------A----GTTGAT-----------CA-------------A------A---A--TAAAAAGA-TAGCAT---------------AC-----TTT-AGA------TGCTG--TGTA-TT-----T-C-AA-AG---T--ACTG-TACAC----------ATCAG-AGACAAAA-C---AGGT-GAAATTGA--ATTGGACATGATTTCC--TTTTTTAGT---GA-AAT-----------A-GAAGAG-TT----ATACTTTCTTTAC-AGT-T-T-T---C-AA---ATT-TG-GAGTTT----T--ACTG-GGCTC----TG--A-AGGCTGTcacaagcctgacactttgctgctcatatcttgacataaagtggctgtttttcacataagattttcttatagaaaatatcaattacaggttaggacaacctttatactaatctttcctgtacactgttcaagatacaagaaatgtttgtctagggctatattctatgtttacagaaaacattcataaataagaactttctaatttagttgatcaaaataaaaagatagcatactttagatgctgtgtatttcaaagtactgtacacatcagagacaaaacaggtgaaattgaattggacatgatttccttttttagtgaaatagaagagttatactttctttacagttttcaaatttggagttttactgggctctgaaggctgtccattcttatatggtattcctt
gi|20 : aggactgtatataagggctctatcttcccaccaaacttgacatttgccttagtttctaaatcaagagtattttgtttaagaatccccatgtaactcaactgtttttctcaatttgatcaaaacgatgtacaaatggaacacaagcctgacactttgctgctcatatctAA---GAATCCC-------A--GTA-CA-T----C-TC-G---CT-T--------GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--TA--TTGAAATT-AGAT-------A-G-AA-ccattcttatatggtattcctt
gi|20 : tT-------A-A-AA-T-G-GC------TA---TT--------T--TAC-AT--------GG-A-GTTT-T--TCA-----TCTA-------ATGATAAAGCA--T--GGAGTGCAG-GCTT----T--G---A-T--AATG-TTATGTTTA--C-AGC-A-TTA-TAGAT-----TT-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------CA---------G----A--T----G--G---G----AA---Acctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgccttaaaatggctattttacatggagtttttcatctaatgataaagcatggagtgcaggctttgataatgttatgtttacagcattatagatttatctttccagtacacagatgggaaatgtt
gi|21 : taagaatcccagtacatctcgcttgttattctcaattttattgaaattagatagaacctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgcctTG-ACAT-------C-A-AA-T-T-GC-------T---AT--------T--TTC-AC--------GC-A-GTTCAG--TAT-----TCCAATCTC--G----AAATCG--T--TGACCACAG-GTTT----G--G---C-C-AAAGA-TTTCATTTA-------------------------C-G-TC-TC---CC--GAC-CACA--------TG--T--G--TG----A--T----G--G----------------AC-TC--T--TTTGTGTTC--AAAGCTG--------C----T----GT-TT-----------tgtt
gi|22 : tttggtatttCCA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TC-ATTA-TAA----C--T----ATCAG-AAACAAAC-T---ATGT-GTAACTTTGAGCCGGAGATGAT---T--TA-TTTA-T---GA-AATACA-------AT-GAGAAT-GTAACAAATCTATCTTTAA-TGC-T-T-T---C-CA---TTTGT--GAG-TG----T--AT---GGACC----AGAAA-AGGTTGTTATgcattttttgaatgaaaagtatttaaaaacaatattgtatatgtattacgggggaaatcgtgtcactttcaattc
gi|23 : accaagaatggaaattatcttattattgcagt-TC-TT---TC--TAG-AACA--------TT--T--A--TGTG--A--T----A--G---A----AATTT----T-TT--T--T---TGTCT--CAAGTTGTA------CATTAT----GTCTT-----------CTGAATGAAA----------------A----------A----------T--------ATTGACAAAAA-----------TGAACA----T------------TTT--AATT---------AAG--G---A---------------------------A------A---A--TGAAAAAC-T-GCAT--------------CATA----GTT-TAA------TGCTA------------------AA-G----T--TCTG-TGAA------T----ATTAG-AGAAAAAT-T---ATGagaaagata
gi|24 : tttcattaaaactctaccatt-------------A------A---A--C--------T-ATAT--------------CAC-----TTT-CGA------AG-TG--TGTG-CT-----A-C-AG-AAAACT--ATTA-TAGAT----------GTCAG-AGACAAAT-G---ATGT-GAAACTGT--ATGGGATATGAT---C--TCTTTCA-T---GA-AATAT--------AG-GAAGATAGTGAAAAGTTTTACTTTAA-AGC-T-C-T---G-AA---TTT-T--TTG-CT----CTGATGG-GGGCC----CAGAA-AGGCTGTTATTA
gi|25 : aatgag-GTTT-T--TCT-----TCTATAAA---A----AAAACT--T--CAGAAGCAG-TCAT----T--A---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-ACC-A-TGA-TAGAT-----TT-A-TT-TT---TC--CAG-TGCT--------TA--T--A--TGATAAA--T----A--A---A----AA---AAAA-------------TGCCC--AAAGCTACA------C----
gi|26 : agaatgatggggttttgctgccattgaagtattttgacatagtgaagccGGCT--CTGT---TT---GCCC-A-CCCAA--------A------TC-AACA-------TCATGATCTG---T----GTTT-T---TCTTTCAAA--AGTA---TAAGT-GTAT--G-TTA------TGCAA---GTATCAT-------G--ATG-CA-A----C-TCAG---TT-TAAC--T--G-------------------G--TC---------TC----A--------------T------TT--GG--CCAAAATG-GTAT-------G-A-AATT-A-GA-----ATT---
gi|27 : TA--CGTA-TT-----C-C-AA-A----TG-ACTG-TAAAT--T--T------CAA-AGACAAAT-T---ATTT-GAAATTGT--GTAGGAGATGAT---C--CCTTTTA-T---GA-AACA-A-------AA-GAAAAT-TT----TGTCTTCCTTTCA-AGC-T-T-T---T-AA---CTT-C--GAGTTT----T--ATGG-TGGTCTAGACGGAA-AGGCTaaacatcattacaaatgttttctt
gi|28 : tttaGAAAATGACA--CTAT---TT---GGCC-C-CCAAT--------A------TT-GACA-------AT----CGCA-C------ATTTAT---T--TTCAAA----T----TAAGT-G-AT--CATTG------TGCAA---GAATGTC-------G--ATA-CA-A----C-TT-C---AT-T-GTAAT--GC------TA----------T--TT---------TC---
gi|29 : aaTAT-A--AATGAAAAGGGTT--CTAT---TT---GCCC-T-CAAAA--------A------TT-TACAGCAGTGTTT----TTTT-C-T----CTCT-C---T--CTCCAAT-A-T----TAAAT-GTATAAA-TTG------TGCTA---AAATCCC-------G--GTG-CA--------T------AT-CAGT--T--GT------TA----------T--TT---------TC---CA--------------T------TT--AA--tcgcaacaattttgtttgaaaacatcaa
gi|3 : aaatgaaACTAT-A--TATGGTAAGGACT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TT-GACA-------TT----TTTA-C-T----ATTT-T---T--TTCAAA----T----TACAT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCA-------G--AAG-CA-A----C-TC-A---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TA---AG--------------T------TT--GA--TAAAAATG-ACAT-------C-A-AA-T-G-GG-----ATT---TT--------T--TTT-AC--------AT-A-GATT-T--TCT-----TTCA-------A----GAAACA--T--CAAA---AG-AATT----G--G---A-C-ATACT-TCATATTTATTT-A-T-A-TCA-TAGA------TC-A-TCATG---TA--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--GAAAA----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCT--AAAACTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TCAGCA----T------------TTT--ACCT---------A----G---A------------TT-------------A------C---A--T--------T-ACAT--------------CAC-----TTTCCCA------TGCTG--TGTA-CT-----C-C-AATA----T--ATTG-TAAAT--TAAT----ATTAG-AGATAAAC-T---ATGA-GAAACTGT--ATTGGACAGAAT---T--TCTTTTA-T---GA-AATAGAATTAAGCAA-GAAGAC-TT----AATTTTTCTTTTA-AGC-T-T-TA--A-AA---AAT-T--GAA-TT----T--ATGG-GGCCC----TGGTA-AGGCTGTTATTATACAAAGTCCTTac
gi|30 : TA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-AGCA-TAAGT----------ATCAG-AGACAA-T-A---ATTT-GAAACTGC--ACTGAACACAAT---T--TGTCTTA-TTTAGC-AATAGA-------A------AT-TT----A----------AA-AGT-T-A-C---A-AA---AAT-TGGGAG-TT----TG-ATGG-GAACC----CAGA
gi|31 : GCT--CTAT---CT---GGCT-C-CCAAA--------A------TC-AACA-------GG----TGTG-C-T-----TTT-G---T--TTCAAA--T-T----TGGGT-GTGT--T-TTA------TGCAA---G--TTTT----------ATG-CA-AGTAGC-CT-G---AA-GAGT--T--GT------TA----------A--TC---------GC---AG--------------T------TT--GG--CAAAAATG-Agtccttta
gi|32 : ATGATAAGGGCT--TTAG---TT---TCCT-G-CCAAA--------A------TC-GACA-------GT----CATA-CATTA--ATTT-TG--T--TTCAAA--A-T----TTAGT--T-T--T-TTG------TGCAA---AAATCCCTATAAAAGCTATG-CA-A----C-T------------T--T--G----------------------TG---------TC---CG--------------T------TC--GA--TGAAAATG-Atctgtagggtgagaat
gi|33 : GAGCACAA-TGTT----G--G---AAC-AAATT-TCAAATCAA--T-G-TCA-TGGCTA---------T-A-TC-TC---TC--TGG-CACA--------TG--C--AAGTG----A--C----A--G---A----AA---AATAT-TT--C--C---TGTCT--AAAGTTGTA------T----T----
gi|34 : tGT--ATTGAACATGAA---G--TACTTCA-T---GA-AAT-GA-------AA-GAAAAT-TT----GGTCATTCTCTCG-AAT-T-TCT---A-GA---ATT-T--GAGATT----T--ACAGCAGGCC----AAAAAGAGGCTGCAATCATACAAAATCCTTtcatgtatcctaaaagaaa
gi|35 : ---T--TTCAAA--A-T----CAAGT-GTAG--T-TTA------TGCAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----G-T--G---AT----T--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AG--------------T------TT--GT--TCAAAAt
gi|36 : --ACTGAACATAAT---C--TCTTTGA-C---GA-AATAAA-------AA-T-TGAT-TT----AGTCTTTTTTCAA-ATT-T-T-T---ATAA---ATG-T--GAG-CTA---C--ACCG-GAGCT----CGGAA-GGGCTGTCATCATcagcattctcctaaccatgacatcacaaacacactattt
gi|37 : aacaa-GAAACTGT--ATTGGACACGAT---C--TTTTTT--T---AA-AAT--------------AAGAT-TT----AGTCTTCCTTTAA-GAT-T-T-T---G-AG---A---T--G---------T--ATGT-GGGCC----CAGAT-AAGCTGTTAGTTTACAAAAT
gi|38 : c-A-AA-T-G-CT-----AAT---TT--------T--TGG-AA--------GC-A-GTTT-----CT-----TTCA-------G----AAAACA--T--ATTGCGCAt
gi|39 : atttttctagaacacgtgtgatagattaattttgtttattcgatatcacaatT-------A-A-AA-T----T-----ACTG--TT--------T--TTC-AT--------GC-A-GTTT-T--TCA-----TCTA-------C----AAAGCA--T--CATGTGGAG---TT----GTAG---A-T-AAACA-ATGTATTTC--T-G-C-A-TG----GAT-----TT-A-CC-TT---TC--CGG-
gi|4 : ACTAT-A--CACGATAAGGGTG--GTGT---TT---GCCC-AACCAAA--------A------TC-------------------ATG-C-T----TTCC-T---C--TTCAGT--C-G----TAAGT-GT-T--C-TTGATCAATTTCAATTTGA-TCAA-------A--ATGACATA----C-TC-A---AC-TACT--T--GT------AA----------C---C---------GG---AA--------------T------TT-------AAACATC-ACG--------A-A-CA-T-G-AC-----GTT---TTGTCGTTATT--TTCGAT--------CT-G-CTAT-T--TCT-----TCTA-------G----AAAATG--TACCGAGTGTAG-GCTT----G--G---A-C-TAAAT-TCATATTCG--C-A-T---TG--CAGA-------------------------A-TACA--------TA--T--A--TC----A--T----T--G---A----AA---AATAT-TG--T--T---TGTCC--AAAACTACA------T----TATATGT-TT-----------TTCG----------------------A----------A----------T--------G--------AAAAACGTTCATACTAGCA----AACAAA-------TTT--CACT---------A----A---AT-----------TTGAG----------A------A---A--T--------A-TCTT--------------CTT-----TTT-ACA------TTCTT--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--A--------------------TCAG-AGA-GAAC-A---ATGT-GAAACTGC--ATTGTACATGAT---C--TCCTCTC-T---AA-AATAAATC-----AA-GA--AT-TC----A-TTTTTCTTCAACGGC-T-T-TC--A-AA---ATT-T--GAC-CCGAGAC--ATGG-GA--C----CAGAA-AGG--GTTGTTATACAAAGTCTTT
gi|41 : aggAT-A--TATGATAAG---T--CTGT---TT---TCCCCA-CCAAG--------T------TC-AGCA-------TT----CATG---T----GTTT-G---T--TTCATT--G-T----TAATT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAAT
gi|42 : ggactaatg----AGTCTTTCTTCAA-ATC-T-T-TTTAA-AA---ATT-T--AAA-TT----TC-ATGG-GGTCG----TAGAA-ACACTGTTATTATACATAGTCCTT
gi|43 : A----T------------TTT--GAGT---------G----A---AT-----------TG-------------AGA----A---A--A--------T-GTGT--------------CAC-----TTT-TGT------TGCTT--TGTA-CT-----TAC-AA-A----TG-ACTG-TGAAT--t
gi|44 : aacaaT---C--TCTTTTA-T---GA-AATCAA-------AA-----AT-TT----CGTCTTCCTTTAA-AGCTT-T-T---A-AG---ATT-T--AGC-TT----C--GTGA-GTGCT----TAAGA-AGGCactcagt
gi|45 : T-------A-A-AA-T-G-AAT----ATT---TT--------C--T-------------GC-A-GCTT-T--TCT-----GCCA-------G----AAAATA--T--CAAATGCAG-GCTT----G--G---A-C-AA
gi|46 : AT--C-TTG------TGTGA---AAATCCC-------G--ATT-TA-T----C-TC-A-------AGT--T--TT------TA----------T--TT---------TC---AA--------------TA-----TA--GT--TCAAAATG-ACGT-------A-G-Atgtcat
gi|47 : A----T------------TTT--AG-T---------A----G---AA-----------TTGAG----------A------A---A--A--------T-GTGT--------------CAC-----TTT-GGA------TGCTA--TGTA-CT-----
gi|48 : -------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAT-----TTT-TGA------CGTCA--TGTA-TT-----C-C-AA-A----T--
gi|5 : aattgagACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C-T----GTTG-T---T--TTGAAA--A-T----TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----CTTT-A---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--TAAGAATG-ACga
gi|5 : ataaaagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA--T----ATG-AAGT--------------T-T-GT-----AGT---TT--------T----C-AT--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAG-A--T--GGTGTGCAT-GCCT----G--G---A-CAAAACT-TTATATTTA--T-ACT-A-TGA-GGGA------TC-A-----T---TC--CTG-TGCA--------CC--T--A--TA----A--T----AT-G---ACCT-AA---AAAA---------T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-AT-----------AT------------------------A----------AAAAGAGAACTT--------A--------AAATAT-------TTAATAACATT------------TTT--AACT---------A----G---ATA----------TT-------------A------A---G--T--------T-GAATTGAGAAATTTGCAACAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C----G-A----TG-GCT--TAAAT--T--------TCAG-AGACAAAT-T---ttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccagaaagatggtgtgcatgcctggacaaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctataatatgacctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaaagagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|6 : ataaaagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgttttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgaACTAC-A--TATAATAAGGGCT--ACAA---TT---GCCC-A-ACAAA--------T------TA-GA-A-------TC----T-------------------------CA-----------TAGGT-ATAT--T-TTG------TGAAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----C-TC---------AGT--T--AC------TA----------T--TCTAAATATGATC---AAAATGACATGGGAACT------TT--AA--CTAAAATTTATAT-------A-A-AC-A-G-GATACAGATTAGGTC--------TAATTT-AC-----------A-GTTT-T--CCT------CCA-------G----CAA-------------GCAG-CCTT----G--A---A-C-ATGCT-TTAT-------T-A-A-G-TGA-TAGAAAAATTTT-G-TG-TG---TC--C---TGAA--------T---T--A--TG----C--T----C--G---A---------------TG--T--T---T-TCT--GA--CCGGA------AAA--T----GT-TC-----------CT------------------------A----------A-------------------A--------AA-----------T------------------------T--AAGT---------A----A---AA-----------TT-------------G------AGACA--T--------T-GTGC--------------CAC-----TTT-TGA------TGCTA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-AGCA-TAAG------T----ATCAG-ATAC-AAT-A---ATGT-GAAACTGC--ACTGATCACAAT---CCGTCTTATC-T---GACAATAGA-------A------AT-TT----A----------AA-AGT-TAC-A---A-AA---ATTGT--GAG-TT----TG-ATGG-GAACC----CAGAA-AAGC----ATCATACAGAGTCC
gi|7 : aggACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATA--------G------T--GATG-------TT----TGTG-C-T----GTTG-T---T--TG-AAA--A-T----TAAATCAT-T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----C-TTTA---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TC---------TT---AA--------------T------TT--GA--TAAGAATG-AC
gi|7 : aagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TT---------TCTGTAT--------------T------TT--GA--T----ATG-AAGT--------------T-T-GT-----AGT---TT--------T----C-AT--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----GAAAGA--T--GGTGTGCAT-GCCT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-ACT-A-TGA-GGGA------TC-A-----T---TC--CTG-TGCA--------CC--T--A--T-----A--T----AT-G---ACCCTAA---AAAA---------T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-ATATAAAAGAGAACTTAA---------------------A----------A----------T--------ATTT-----AA-----------TAA-CA----T------------TTT--AACT---------A----G---ATA----------TTAAGTTGAATTGAGA------A---A--T--------T-GCAA--------------CAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C-C-GA-T----G--GCT--TAAAT--T--------TCAG-AGACAAAT-T---Attggaactgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccaggaaagatggtgtgcatgcctggacaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctatatatgaccctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaagagaacttaaaatatttaataacattttaactagatattaagttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|8 : aagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgtttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgaACCAT-A--TACGATACAGGCT--GTGT---TTCATGCTC-A-CCAAATACAGCTCA------TCTGGCA-------TT----CTTA--------ATTT-G---T--T--AAA--A-T-----GACT-G-AT--T-C------------A---GAATT------------ATG-T------------G---AT-TAAT--TTAAT------TAAGAAGAAAATT--TC---------TC---CA--------------T------TTTGGA--ATAAAATG-AC---------------------T-----ATT---TT--------C--T---AC--------CC-A-GTTT-T--TAT-----TCTA-------G----AAAACA--T--GAAGAGCAG-ACTT----G--G---A-C-AAATT-TCA----TA--T-A-T-G-CCA-TAG-------------C-T--------CAG-TGCA--------TG--C--A--TG----GCTT----A------A----TG---AAAGT-TG--TACT---TGTT----AAGT---------------------T-TT-----------TT------------------------G----------A----------A--------A--------GA-----------AAAACA----TCACAAAATCCAGTTT--AATC---------A----A---ATG----------TT-------------AAAATAGA---A--T--------T-GAGA--------------AAC-----TAT---A------TCACA--TTTA-CT-----T-CAAA-A----G--ACTG-TAA-------T----ATTGG-ACAGAGAG-T---ATTT-GAAATGGA--AATGGGCATGAT---C--TCTTTTA-T---AA-Ac
gi|9 : aagg--TTCAAA--A-TCTAATAAGT-GTAT--T-TTA------TTC-A---GAATCAT-------GA-ATG-CC-A----C-TC-----AT----T--T--GT------CA----------T--TC---------TC---AG--------------T------CT--GA--ACAGAAAG--CAG-------A-G-AA-TCG-GA-----ATT---
gi|9 : gTG-ACTT-------G-A-AG-T-T-GCTA---ATT---TT--------T--CTC-AC-----------A-GTTT-T--TCC-----TCTA-------G----AAAGCA--T--TTAGCATTG-GCTT----T--C---A-G-AAACT-TCATACT---------------------------C-A-TC-TT---TT--CAA-TACA--------TG--T--G--TGTA--A--T----A--G---G----AA---AATTT-TG--T--T---TTTCC--AGAGCTGAT------C----T----GT-TT-----------CCTGAAAA------------------A----------A----------TGTTTCCAAA--------AA-----------TGAGCA----T------------TT---AAAT---------G----A---AT-----------TTCTGTC--------A------A---A--T--------T-GCAT--------------CAT-----TTT-TGA------TGCTA--TGTT-CT-----C-C-AA------------G-TAAAT--G--TAGGAATTAG-TGGAAAAT-T---GTGT-AGAACTGT--ATTGGACAatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgctaatttttctcacagtttttcctctagaaagcatttagcattggctttcagaaacttcatactcatcttttcaatacatgtgtgtaataggaaaattttgtttttccagagctgatctgtttcctgaaaaaatgtttccaaaaatgagcatttaaatgaatttctgtcaaattgcatcatttttgatgctatgttctccaagtaaatgtaggaattagtggaaaattgtgtagaactgtattggaca
blockSeqs : . AT TC CAA CAT C A TACAGCTCA CTG GGGGTTTCTTTTTCAGG TGTA CT AT CTAA C AA A ATCAAT TTT CCTATAAAAGCT A T GTAG T GTACATGTAG AA TA TACTAG AGAAGAAAAT TC TAAATATGA TGT AATGACATGGGAAC TTCTTA TG AC T TAATCAGG . T GGATACAG AGG GTCGTTATTTTCGATCT A A GA ATATG ATGGCTTG AA ACCGAGT CA TAAT TA TAA A A G TAAGTGATAGAAAAATTTTGTG CGA GA T CATAATAT GTT TC AG ATTGTCATTGA TTT ATTC TC AC TTG AA C ATCCATATTTTGTCAAAGAAGAACGTTCACGGAAATGAGCAGTTTAGTCAATGCGATTCAAATTCTAGAAATGCAT CGTAAA CC . GT G AGCTCC A T AAACTATTATAGATG C A C TTG T GA T T TTCC G TTA C AGAATTAAGCAAGAAG A AACAAA C T A C TTAA AAT G GACCCGAGAC C TAGAC G T
blockSeqs : . . . . . . . ACTTAAA TG GCAGTGTTTTTTTCTC AT . AG A C . . . . ATGA . . . . CAGTTTAA . . . . . . TGT . A . TA . GA . . GGCCAA G TTTCGCCGCTGTCGGT . . . AG ATCTCG . TGTGC G . . . . . . TATTTATATCATAGATCATCA . . . TG A . . ATATGACCCT . AATG . . . . C CTGTATATAAAAAGAGAACTTAAAATATTTAATAACATTTTTAACTAGATATTAAGTTGAATTGAGAAATTTGCAA TA A . . G TA . . TATTGTAAATTAATA . C . . . . C G CCG . . . AGAAATAAAA . GAAAAG . . . . TCA . G GGGAGTTTG . C . A
blockSeqs : . . . . . . . G CA TCATGATCTGTG TG . TA . . . . . . CCG . . . . TTAAATAG . . . . . . . . . . GT . AC . . TGCTA . TGACACCTC . . . A ATGAT . TAAAC A . . . . . . TACAGCATTATAGATTTATC . . . C T . . ATAAATAAA . GAT . . . . C CTGTATATAAAAGAGAACTTAAAATATTTAATAACATTTTAACTAGATATTAAGTTGAATTGAGAAATTGCAA T T . . . T . . TAACTACTAAATT . C . . . . C T C . . . ACAATGAGA . GA . . . . AA . . GGAGTTTT . A . A
blockSeqs : . . . . . . . A CA GTCATACATTAA T . A . . . . . . TCA . . . . CAATTAG . . . . . . . . . . CC . A . . GACT . GTTCACAC . . . . TAAAA . TAAGC G . . . . . . TATACCATGATAGATTTATT . . . . G . . ATATGACCT . TTT . . . . T TTCTATGTTTACAGAAAACATTCATAAATAAGAACTTTCTAATTTAGTTGATCAAAATAAAAAGATAGCAT A A . . . C . . TTAAATGTAAATA . C . . . . G C T . . . AAATCAAGA . CA . . . . AT . . TTGCTCTG . T . A
blockSeqs : . . . . . . . C TG TTTTTACTA T . G . . . . . . CAA . . . . TGAAGAG . . . . . . . . . . TA . A . . GTAA . TTTCACAT . . . . A . CGAAT A . . . . . . CACAATATATATTTCTCC . . . . G . . ATAGAAAA . AAT . . . . C TGCATTCTATATCTGGAATAAAATATATATATCCAACTTCTTGGTGGAAATCCGAATTGAGAAATTGTAT G T . . . C . . TGACTGTAAATTT . C . . . . A T T . . . ATAGGAAG . AT . . . . CA . . GTGTTTG . A . A
blockSeqs : . . . . . . . A CA TTTGTGCTG G . A . . . . . . TTG . . . . CAACTAC . . . . . . . . . . TC . A . . GAAT . TTACATGG . . . . G . CCAAT A . . . . . . TATAACACAGATTTATC . . . . A . . TGATAGA . AAT . . . . T CTGTTTTCTTCAAAGAAAAATATTCACAAAACAAACAAATCAGCAATTTAATTAGTTTTAGTAAAATTAG C A . . . T . . GTAAATGTAGGAA . A . . . . T T C . . . AAAAGAAA . TG . . . . A . . GAGTTTT . C . A
blockSeqs : . . . . . . . A TG TTTGTGCTG T . A . . . . . . CCC . . . . TAAATAG . . . . . . . . . . TC . A . . CGGA . TTTCACGC . . . . G . CTAAA A . . . . . . CATATCATAGACCTATT . . . . G . . TAATAGG . TAT . . . . T ATCTTTATTTCTACAGAAACGATCATGAAAATGAGCATTTTAACTACATCTTCATAAATATTAAATTGTT C T . . . C . . GATGAATAATTA . C . . . . C T C . . . GAAAGAAA . AA . . . . C . . GAGATTT . T . T
blockSeqs : . . . . . . . A TT TTTATGTG C . T . . . . . . CCA . . . . CGATTTG . . . . . . . . . . TC . A . . AGA . TTTTACAT . . . . G . GGAAC A . . . . . . AATGTCATGGCTATATC . . . . A . . GCTTAA . TAT . . . . C CATTATGTCTTCTGAATGAAAAATATTGACAAAAATGAACATTTTAATTAAGGAAAATGAAAAACTGCAT C C . . . A . . TGACTGTGAATT . C . . . . T T T . . . AAAAATTG . GG . . . . C . . GAGCTAC . C . G
blockSeqs : . . . . . . . A TG ATCGCACA T . A . . . . . . ATG . . . . CGATTTG . . . . . . . . . . TT . A . . ATG . TTGGAAGC . . . . T . CAATT G . . . . . . TATACTATGAGGGATCA . . . . G . . ACAGA . AGT . . . . C TTATATGTTTTTCGAATGAAAAACGTTCATACTAGCAAACAAATTTCACTAAATTTGAGAAATATCTT C A . . . C . . GTACTGTACACA . T . . . . T G T . . . GAAAG . AG . . . . G . . AAATTTC . A .
blockSeqs : . . . . . . . A CA GGTGTGCT G . A . . . . . . TCG . . . . CGATTA . . . . . . . . . . CC . A . . GGA . TTTCATGC . . . . G . GGAGT G . . . . . . TATACTATGAGGGATCA . . . . T . . ATAGA . TTT . . . . T CTGTTTCCTGAAAAAATGTTTCCAAAAATGAGCATTTAAATGAATTTCTGTCAAATTGCAT T T . . . C . . TCATTATAACTA . C . . . . T C G . . . AGAAG . AG . . . . T . . GAGTTTG . C .
blockSeqs : . . . . . . . A CG TTCATGTG T . C . . . . . . CCG . . . . TCATTG . . . . . . . . . . TA . A . . GGC . TAATTTAC . . . . A . TGACC G . . . . . . TATAGACTGATTCATC . . . . A . . ATACA . AC . . . . C TTTTTGAAAGAAAAACATCACAAAATCCAGTTTAATCAAATGTTAAAATAGAATTGAGA C G . . . C . . TGAGCATAAGTA . C . . . . C T C . . . CAAAA . AG . . . . A . . GAGTGT . C .
blockSeqs : . . . . . A CA TTTCAAG G . G . . . . . . CAG . . . . GATTAA . . . . . . . . . . CA . A . . GGC . TTTCTGT . . . . G . CAGAA T . . . . . . TCTGCATGGATTTACC . . . . G . . ATGGG . AA . . . . C TTGAATCAATATTTAAAATCAATATTTAGTAGGTTTAGAACTTGCAT C T . . . C . . TGAGCATAAGTA . C . . . . T T C . . . AGAA . CG . . . . A . . GAATTT . C .
blockSeqs : . . . . . T AG TTCTTAA T . A . . . . . . CCA . . . . CGCTT . . . . . . . . . . TG . A . . TGC . TGTGAAG . . . . C . ATTGC A . . . . . . AGATTTTTTAAAT . . . . G . . ACAGA . AA . . . . G CTGTTTCTAATAAATCAGCATTTTACCTAGATTACATTACAT T G . . . C . . GACTATAAGTA . C . . . . C C C . . . AGAA . A . . . . G . . AGCTTC . T .
blockSeqs : . . . . . G C TTTGCC T . A . . . . . . AAA . . . . ATCAG . . . . . . . . . . TC . A . . AGA . TCATGT . . . . G . CATGT T . . . . . . TATATGCCATAGC . . . . A . . ATTGA . AA . . . . C AAATGTTCCTAAAAATTAAGTAAAATTGAGACATTGTGC A T . . . C . . TTCTGTGAATA . G . . . . T T C . . . AAG . A . . . . A . . GT . T .
blockSeqs : . . . . . T G ATGCTT G . A . . . . . . CCG . . . . CGTG . . . . . . . . . . TC . C . . GGG . TCATGT . . . . G . CAAAT G . . . . . . CGCATTGCAGA . . . . C . . CTCGA . A . . . . A C G . . . C . . TGGCTTAAATT . A . . . . T C C . . . A . . . . A . . . . C
blockSeqs : . G G TCT . . A . . . . . . ATA . . . . CATT . . . . . . . . . . TA . G . . GCT . CTACCC . . . . G . GGTGT G . . . . . . TACGTC . . . . C . . AGGT . T . . . . . A T . . . C . . GGCTTAAATT . . . . . . C T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CCA . . . . CAAG . . . . . . . . . . CT . C . . GAC . TCTCAC . . . . G . GGTGT G . . . . . . TAGAT . . . . G . . ATGG . . . . . . . C . . . . T . . GACTGTAATA . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . ATA . . . . CAA . . . . . . . . . . TA . A . . TGT . CTGC . . . . G . GAAGA C . . . . . . AATC . . . . G . . ACA . T . . . . C . . TA . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . AC . . . . CAA . . . . . . . . . . AT . A . . TGT . . . . . G . TTAGC G . . . . . . CATC . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . . . . GAT . . . . . . . . . . AC . A . . GG . . . . . G . CAAA A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . A . A . . T . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . T . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TTTGTGCTG***************** T**** A*** CGATTAG***** TC** TTTCACGC******************** CGAGC** TATANCATAGATTTATC***************** ** AAT* C***** ****** AAAAGAAA********* AG****
originalCons : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACA-------TT----TNTG-C-T----GTTT-T---T--TTCAAA--A-T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GA--TNAAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TT--------T--TTC-AC--------GT-A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTA--T-A-T-A-TGA-TAGA------TC-A-TC-TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAGA-------AA-GAAGAT-TT----AGTCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
finalCons : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAA--------A------TC-GACATTTGTGCTG-----------------TTTT----T--TTCAAAA---T----TAAGT-GTAT--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TCGATTAG-----T--T--GT------TA----------T--TC---------TC---AA--------------T------TT--GATC--AAAATG-ACGT-------A-A-AA-T-G-GN-----ATT---TTTTTCACGC--------------------A-GTTT-T--TCT-----TCCA-------G----AAAACA--TCGAGC--GCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTATATTTATANCATAGATTTATC-----------------TT---TC--CAG-TACA--------TG--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---C--TCTTTTA-T---GA-AATAAAAGAAA---------AT-TTAG----TCTTTCTTTAA-AGC-T-T-T---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|40 ): ACGCTGCTTATTTTCCATTCTCAATTTCATCAAAATGAGAACCAGAATTACGATATCATAGACATAACATTATGTCACTATTTTCAATATTTT
Unaligned ( gi|49 ): TAAAAGCTCTTCATAAAACAGTTGTAAGTGAAT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 333333333333333333333333333333 111111111111 333333333333 1111111111111111111111111 111111111111111111 111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333333333333333333333333 111111 11111 222222222222222
lowQualScore : 3 44 33 444 444 2 2 666666 2 999999999999999999999999999999 33 88888 99999999999 7777 6666 1 1 22 1 555555 222 666666666666 1 1 444444 222222222222 22 22 444444 6666666666 22 555 666666 22 222 666 22 1 2222222222222222222222222 1 22 8888888 1 44444 1 1 444444444444444444 44 2 88888 3333 22 22 9999999 22 3333 22 333 1 1 3 4444444 777777777777 444 555 3333 22 1 44 22 888888888888888888888888888888888888888888888888 333 2222 22 22 333 22 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 999999 77 666666 0 22 3 5555555 1 1 6666666666666666666666666666 2 2 2 333 2 22 1 3 444 0 2 99999999 77777 2 666666 2 2 2 2 33333 444 5 111111111111111 2 0 55555 2 1
lowQualScore : . .. .. ... ... . . ...... . .............................. .. ..... ........... .... .... . . .. . ...... ... ............ . . ...... ............ .. .. ...... .......... .. ... ...... .. ... ... .. . ......................... . .. ....... . ..... . . .................. .. . ..... .... .. .. ....... .. .... .. ... . . . ....... ............ ... ... .... .. . .. .. ................................................ ... .... .. .. ... .. . ........................................................................................................................................................................................................................................ ...... .. ...... . .. . ....... . . ............................ . . . ... . .. . . ... . . ........ ..... . ...... . . . . ..... ... . ............... . . ..... . .
lowQualScore : 3 66 44 444 444 5 4 888888 1 666666666666666666666666666666 22 33333 55555555555 8888 0000 8 7 44 7 000000 999 222222222222 7 7 000000 444444444444 22 22 666666 7777777777 11 444 222222 22 888 444 33 7 7777777777777777777777777 8 88 7777777 9 88888 9 9 000000000000000000 55 0 88888 9999 00 55 4444444 77 7777 44 000 7 7 6 6666666 333333333333 333 000 9999 55 5 33 66 999999999999999999999999999999999999999999999999 555 6666 99 99 777 99 8 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555555 22 111111 7 55 6 5555555 9 9 4444444444444444444444444444 1 7 0 555 4 99 5 3 111 2 4 11111111 66666 7 222222 5 5 5 5 88888 444 0 444444444444444 5 8 66666 7 3
consensus : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAAA------TCGAC--A----TT------C-GTG-C--T----GTT--T-T---TTT-----------CAAA--A-T----TAAGT-GTA-T--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TCTC---AAT------TT--GA---TC--A--AA-ATGACGT-------A-A-AA-T-G-G---N--ATT-TTTTTCA---CG-CA-GT-----T-T-TT------------------CT--TCCA-----G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTA----T--ATTTATANCAT---AGATTTATC---TT----TC--CAG--TA--CA--------T----G--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---CTCTTTTA-TGAAATAA--------AA-GAA-AAT-TT----AGTCTTTCT-TTAA-AGC-T-TT---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
Reference ( family-2602 ) : ACTAT-A--TATGATAAGGGCT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAAA------TCGAC--A----TT------T-GTG-C--T----GTT--T-T---TTT-----------CAAA--A-T----TAAGT-GTA-T--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TCTC---AAT------TT--GA---TC--A--AA-ATGACGT-------A-A-AA-T-G-G---N--ATT-TTTTTCA---CG-CA-GT-----T-T-TT------------------CT--TCCA-----G----AAAACA--T--CGAGCGCAG-GCTT----G--G---A-C-AAACT-TTA----T--ATTTATANCAT---AGATTTATC---TT----TC--CAG--TA--CA--------T----G--T--A--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TNAGCA----T------------TTT--AACT---------A----G---AT-----------TT-------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAC-----TTT-NGA------TGCTA--TGTA-CT-----C-C-AA-A----T--ACTG-TAAAT--T--T----ATCAG-AGACAAAT-T---ATGT-GAAACTGT--ACTGGACACGAT---CTCTTTTA-TGAAATAA--------AA-GAA-AAT-TT----AGTCTTTCT-TTAA-AGC-T-TT---A-AA---ATT-T--GAG-TT----T--ATGG-GGGCC----CGGAA-AGGCTGTTATCATACAAAGTCCTT
gi|1 : ACTATTA--GATGATAAAG-CT--CCAT---TT---GCCT-A-CCAGAA------TCAAC--A----AG------C-ATGAC--TCG--GCT--T--------------------AAATAA-T----TCAGT-GTG-T--T-TTG------TGCAA---GAATCCC-------T--TTG-CA-G----T-GC---------AGT--T--GT------TA----------T--TCTC---AAT------TT--GA---TTTAA--AA-ATGATGT-------A-GTAT-T-G-G---A--ATT-
gi|1 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggA-GC-----T-A-TT------------------TT--TTCA-----C----AAAACA--T---GAGCACAG-GCTA----G--G---A-C-AAA-------------------ATCAA---AGATTAATA---TT----TC--CTG--TA--CA--------T----G--C--AAGTG----A--T----T--G---A----GA---AAAATATG--T--T------CC--AA-GCTGTG------CA---T----GT-TTT----------CT------------------------G----------A----------T--------A--------GA------------AAACA----T------------ATT-------------------------------------TT-------------G------A---A--TA-------T-GTAG--------------CA----------GGAGGGGTTTGCTG--TGTA-CT-----G-C-AA-A----T--G-TC-TAATT--T--T----GT----AGCCAAAT-T---ATGT-GAAACAGT--ACTGGACATAGC---CTCCT--A-TGAAATAG--------AA-GAC-A----T----A---TTTTT-TGGC-AGC-T-TT---G-AA----TT-T--GAG-TT----TT-ATCA-GGGCT----GGGAG-GGGCTGTTATCATACATAGTCCTgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaatagctattttttcacaaaacatgagcacaggctaggacaaaatcaaagattaatatttcctgtacatgcaagtgattgagaaaaatatgttccaagctgtgcatgttttctgatagaaaacatattttgaatatgtagcaggaggggtttgctgtgtactgcaaatgtctaattttgtagccaaattatgtgaaacagtactggacatagcctcctatgaaatagaagacatattttttggcagctttgaatttgagttttatcagggctgggaggggctgttatcatacatagtcct
gi|10 : attcgatagttgcaaagcttatgctgtgcaattcactataaaggactattagatgataaagctccatttgcctaccagaatcaacaagcatgactcggcttaaataattcagtgtgttttgtgcaagaatccctttgcagtgcagttgttattctcaatttgatttaaaaatgatgtagtattggaattgcaacaacataaatatgatgttctgtcaccattttcagtattacgatgtaaaaataattgtttttcaagcaatttaatgtgagagcaggcttaaacaaactgtttatttataccatagagacgctaaat----TAAAT-GTA-T--T-TTG------TGCAA---AAATTCC-------G--ATG-CA-T----C-TC---------AAT--T--GT------TA----------T--TGTC---AGT------TT--TA---AC--A--AA-ATGATGT-------A-G-AA-T-
gi|10 : TGACGT-------A-A-AT-T-G-GCCAA--A-----TTTAA---CG-TA-AA-----T-T-TT------------------CTAGTCCA-----A----GAA------------------GCTT----A--G---A---AAACT-TAA----A--AT--------T---AGATTTTTTAAATT----TC--CAG--TA--CA--------C----GTTT--A--TG----A--C-----------A----AG---AAGAT-TGTCT--T---TGCCCAAAAAGCTGCAAT----C----C----ATATT-----------TTGTCAAAGAAG--------------A----------A----------CGTTCACGGA--------AA-----------TGAGCA----G------------TTT--AGTC---------AATGCG---AT-----------TC-------------A------A---A--TTCTAGAAAT-GCAT--------------AAT-----CTT-ATT------TGCTA---GCG-TT---------AA-A----G--A----TGAATAAT--T----ATT--------AATCT---ATTTTGAAACAGT--ATTGAATGTGAT---CTCTTC---TGAAATAA--------AA-tatgacttcacaaacatcacactttattgtatttttgacgtaaattggccaaatttaacgtaaattttctagtccaagaagcttagaaaacttaaaattagattttttaaatttccagtacacgtttatgacaagaagattgtctttgcccaaaaagctgcaatccatattttgtcaaagaagaacgttcacggaaatgagcagtttagtcaatgcgattcaaattctagaaatgcataatcttatttgctagcgttaaagatgaataattattaatctattttgaaacagtattgaatgtgatctcttctgaaataaaa
gi|11 : taaatgtattttgtgcaaaaattccgatgcatctcaattgttattgtcagttttaacaaaatgatgtagaattatgacttcacaaacatcacactttattgtattttTGCCAC-------A-A-AA-T-G-A---CT-ACT-TTTGACA---CCTCA-GT-----T-T-TT------------------CT--GA-A-----G----AAAAAAAAT--TGTGCACAC-ACTC----G--G---A-C-AAATT-TTA----T--ATTCACAATAT---ATATTTCTC---CCTCGATC--CAT--TA--CACATAATATT----A--T--A--TG----A--TTGTCATTG---A----AG---AATTT-TG--T--T---TGTCC--TAAGCTGCATGCATTC----T----AT-AT-----------CTGG----------------------A----------A----------TA-------A--------AA-----------TATATA----TA-----------TCC--AACTTCTTGGTGGA----A---ATCCGAA------TTGAG----------A------A---A--T--------T-GTAT--------------CACGTAAATTT-TGA------AG-TA--TGTA-CT-----T-G-AA-A----TA-ACTACTAAAT--T--------TCAG-ACAAAAAT-T---A
gi|12 : attggattaaaaatattgatgtgaaagcagaatcatgacatcataaacctgatgctatgctgccatttgggatatttAGT-GTA-T--T-TTG------TGCAA---GAAT--------------TA-AA-A----------------------T--GT------T-----------T--TTTC---AGT------TC--AA---TA--G--AA-ATGACAT-------A-A-AA-
gi|12 : TGACAT-------A-A-AA-T-G-G---AT-ATT-TTTCT-----------GT------------------------------------A-----G----AAAGCA--T--TAAACACAG-GATT----G------------------------------------T---AGATTC------------TG--CA---CA--CA--------T----T--T--G--TG----A-------G--G---T----AA---AAAAT-AG--T--T---TGACC--AAAGCTACT------C----T----GT-TTT----------CTTCAAAGAAAAATATTCACAAAACAA----------A----------C--------A--------AA-----------TCAGCA----A------------TTT--AATT---------A----G---TT-----------TT-------------AGTAA--A---A--T--------T-A-G----------------AA-----TTT---A------TGACG--AGTA-CTAGCTCC-C-AA-G----G--ACTA-TAAGT----------ATCG-----CAAAT-T---ATAT-GAAAC--T--ACTGGACAccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattttgacataaaatggatatttttctgtagaaagcattaaacacaggattgtagattctgcacacatttgtgaggtaaaaaatagtttgaccaaagctactctgttttcttcaaagaaaaatattcacaaaacaaacaaatcagcaatttaattagttttagtaaaattagaatttatgacgagtactagctcccaaggactataagtatcgcaaattatatgaaactactggaca
gi|13 : agtgtattttgtgcaagaattaaaatgttttttcagttcaatagaaatgacataaaaccagaattacatataaatgtgacatcttaccaccattatcagtattt----AAAACA--T--TAAGCACAG-ACTTTAATA--G---A-T-AAACT-TGT----T--ATTTATAG-AC---TGATTCATC---TT----TC--CAG--TT--CA--------C----G--T--A--TG----A--C----A--G---A----AA---AAATTCTG--T--A---TCTTC--AAAGCTGTAATCT--T----T----AT-TT-----------CT------------------------ACAGAAACG--A----------TCATGA---A--------AA-----------TGAGCA----T------------TTT--AACT---------A----C---ATCTTCATAAATATT-------------A------A---A--T--------T-GT-T--------------CAG-----CAT-AGA-------GTTA--TATA-CT-----C-C-AT-G----TTAAATG-TAAA------T----ATCTGCATA-AAAT-T---ATGG-TAAACTGT--ACTGAACAGGAT----TCTTTCA---AAAGAA--------AT-AAA-AAT-TT----GATC-TTCT-TTAA-AGC-T-TT---A-AA---ATT-T----------------TGT-GGGAC----CAGAA-AGACT-TTATCACACATAGTCCTT
gi|14 : tacTT-----------CAAA--A-T----TAAGT-GTA-T--T-CTG------TGCAA---GACTTTC-------A--GTG-C--A----C-T--GTACATGTAGC--T--GT------TA----------T--TCTT---AAT------TT--GA---GT--A--GA-CTG-CAC-------A-C-AA-C-A-G---A--ATT-
gi|15 : ATTTATC---TT----TT--CAA--TAAGCA--------TAAACA--T--T--TG----A--C----A--G---T----AA---CAGTT-TG--T--T---TACCC--AGTGCTGCA------T----T----atgatgtcataaatacaattctcaagtcttgacatgaaatgtttattattcacagattaacttctgaagcattttgtccaagccttgaacaaatatatttatactctagacatacttttcctgtaaacacatttaaaacttcgctcatatagaattgtgctctctgtttcctgacatcaaaaaaataaaaatagcaatttgacctgaatt
gi|15 : a----------T--TCTC---AAT------TT--CA---CC--G--TA-TTT-CGTG------A-A-AA-T-GTA---A--ATT-TTTGTGA---AG----GT-----T-T-TT------------------CT--TTCA-----G----AAGATA--T--CGAATGCAGCACTG----G--GTAAA-C-AAACTGTTA----cgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctaactgtagcggacatgacttctctcataaaatgaaagttttcatcttttttaaaacttttcaaaaatatctgtgtttgaaaggggccaagatagtctgctatcacacaaactcctt
gi|15 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagAAT-C---ATAT-CTAACTGT--AGCGGACATGAC---TTCTCTCA-TAAAATGA--------AA-G----TT-TT----CATCTTT-T-TTAA-AAC-T-TTTC-A-AAAATATC-T--GTG-TT----TG-AAAG-GGGCC----AAGAT-AGTCTGCTATCACACAAACTCCTTattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatacaatcatatctaactgtagcggacatgacttctctcataaaatgaaagttttcatcttttttaaaacttttcaaaaatatctgtgtttgaaaggggccaagatagtctgctatcacacaaactcctt
gi|16 : aatttatcttttcaataagcataaacatttgacagtaacagtttgtttacccagtgctgcattcgatatcttctgaaagaaaaaccttcacaaaaatttacattttcacgaaatacggtgaaattgagaaattcctttacctttgttgcgtggtcaaataatac--ACT-TTGTTCA---CA-CA--T-----T-T-TT------------------ATA-TCGA-----G----AAAACA--T--CCAATAAAG-ACTT----G--A---G-C-AAACT-TTA----T--ATCTATAACAC---AGATTTATC---TT----ACGACAGT-TA--CATG------T----G--T--G--TG----A--T----A--G---A----AA---AAAATGTT--T--T---TGTAC--AAAACTGCG------T----T----GA-AT-----------C-------------------------A----------A----------TATTTA---A--------AA-----------TCAATA----T------------TT----AGT---------A----G---GT-----------TT-------------A------G---AACT--------T-GCAT--------------CAC-----TTT-TGG------TAC-AGTTGTA-CT-----C-G-AT-A----TG-ACTG-TGAAT--T----------AG-TGTCGAAT-TTTGTTGT-GAAAATGT--AATAAACAC
gi|17 : catcataaacatcacgttttgctgccagtgATTAT-AATTAT-ATAAGGACA--CTAT---TG---GCTT-A-TTAAAG------CTGGC--T----TT------TCAAG-C--T---------T-T---TTT-----------CAGA--ATT----TAAG--GTA-T--A-TTG------TACAT---GAATCAC----------ATG-CA-A----C-TC-G----T---GT--T--GTTACTAGTA----------T--TTTC---AAT------TT--GA---TA--A--AA-ATTATGTTAATCAGG-A-AA-T-A-T---G--ATT-TTTTTCGC--CG-CT-GTCGGTAT-T-TTGATATATATGTACAATGGCT--T--------G----AAAACA--T--CTAAAGCAG-ACTT----G--G---A-T-AAGCT-TTA----A--ATTCATATCAT---AGACCTATT---TT----TC--CAG--AG--CG--------T----A--T--A--CG----
gi|18 : gg-CTAAAA------TCAAC-------TT------T-ATG----T----GCT--T-T---GTT-----------TAAA--G-T----TTGGT-GTA-T--T-TTT------TGCAA---GAATCCA-------A--ATG-CA-A----T-TC-----AT-T--T--T---T------TA----------TTCTCTC---GATTTCTTATT--TA---TC--A--AA-GTGATGT-------A-G-A
gi|18 : TTTCATTGCA-CA-CT-----T-T-TT------------------TC--TATA-----G----AAAA----T--GGAACGTAG-ATTT----G--G---G-C-AAACT-TTG----T--ATTAATTCCAC---AGAtttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaatttcattgcacacttttttctatagaaaatggaacgtagatttgggcaaactttgtattaattccacaga
gi|19 : ctaaaatcaactttatgtgctttgtttaaagtttggtgtattttttgcaagaatccaaatgcaattcattttttattctctcgatttcttatttatcaaagtgatgtagatttaaaattgtggcctctttaacatgaaattctgatttcattttaagtaatttgtaaACTGT-A--TGTGACGAGGGCTTCCTTTCAATT---GCCC-A-CTGAAACTTAAATCAAC--AGGGGTT------T-CTT-T--TTCAGGTT--T-TGTATTT-----------CAAA--A-T----TAAGT-GTA-T--C-TTA------TGCAA---GACTCTT-------G--ATG-CA-A----C-TC-G---AT-TA--------T------TA----------T--TCTC---AAT------TT--GA---TC--A--AA-ATTAAGT-------A-G-A
gi|2 : atataaacttatgataaatacatttgtaagaaaggACTGT-A--TAT---AAGGGCT--CTAT---CT---TCCC-A-CCAAAC------TTGAC--A----TT------T-GC--C--TTA--GTT--T-C---T---------------AA--A-T----CAAGA-GTA-T--T-TTG------TTTAA---GAATCCC-------C--ATG-TA-A----C-TC---------AAC--T--GT------TT----------T--TCTC---AAT------TT--GA---TC--A--AA-ACGATGT-------ACA-AA-T-G-G---A--Atcaagaatgatgacgttttgtttcctaatttggtataaag
gi|2 : aggTGACAT-------A-A-AG-T-G-G---C---TG-TTTTTCA---CA-TAAGA-----T-T-TT------------------CT--TATA-----G----AAAATA--T--CAATTACAG-GTTA----G--G---A-C-AACCT-TTA----T--ACT-------------A---ATC---TT----TC--CTG--TA--CAC-------T----G--TTCA--AG----A--T----A--C---A----AG---AAA---TG--T--T---TGTCT--AGGGCTATA------T----TCTATGT-TT-----------AC------------------------AGAAAACATTCA----------T--------A--------AA-----------TAAGAA----C------------TTTCTAATTT--------A----GTTGAT-----------CA-------------A------A---A--TAAAAAGA-TAGCAT---------------AC-----TTT-AGA------TGCTG--TGTA-TT-----T-C-AA-AG---T--ACTG-TACAC----------ATCAG-AGACAAAA-C---AGGT-GAAATTGA--ATTGGACATGATTTCCTTTTTTAGTGAAATAG--------AA-GAG-----TT----ATACTTTCT-TTAC-AGT-T-TT---C-AA---ATT-TG-GAGTTT----T--ACTG-GGCTC----TG--A-AGGCTGTcacaagcctgacactttgctgctcatatcttgacataaagtggctgtttttcacataagattttcttatagaaaatatcaattacaggttaggacaacctttatactaatctttcctgtacactgttcaagatacaagaaatgtttgtctagggctatattctatgtttacagaaaacattcataaataagaactttctaatttagttgatcaaaataaaaagatagcatactttagatgctgtgtatttcaaagtactgtacacatcagagacaaaacaggtgaaattgaattggacatgatttccttttttagtgaaatagaagagttatactttctttacagttttcaaatttggagttttactgggctctgaaggctgtccattcttatatggtattcctt
gi|20 : aggactgtatataagggctctatcttcccaccaaacttgacatttgccttagtttctaaatcaagagtattttgtttaagaatccccatgtaactcaactgtttttctcaatttgatcaaaacgatgtacaaatggaacacaagcctgacactttgctgctcatatctAA---GAATCCC-------A--GTA-CA-T----C-TC-G---CT-T--------GT------TA----------T--TCTC---AAT------TT--TA---TT--G--AA-ATTAGAT-------A-G-AA-ccattcttatatggtattcctt
gi|20 : tT-------A-A-AA-T-G-G---C---TA-TTTTACA---TG-GA-GT-----T-T-TT------------------CA--TCTA-----ATGATAAAGCA--T--GGAGTGCAG-GCTT----T--G---A-T-AA--TGTTA----T--GTTTACAGCATTATAGATTTATC---TT----TC--CAG--TA--CA--------C----A---------G----A--T----G--G---G----AA---Acctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgccttaaaatggctattttacatggagtttttcatctaatgataaagcatggagtgcaggctttgataatgttatgtttacagcattatagatttatctttccagtacacagatgggaaatgtt
gi|21 : taagaatcccagtacatctcgcttgttattctcaattttattgaaattagatagaacctaaattttgacttgaagatgacattttgctgcttgttttttattgttgcctTGACAT-------C-A-AA-T-T-G---C----T-ATTTTCA---CG-CA-GT-----T-CAGT------------------AT--TCCAATCTCG----AAATCG--T--TGACCACAG-GTTT----G--G---C-C-AA------A----G--ATTT----C-------ATTTACG---TC----TC--CCGACCA--CA--------T----G--T--G--TG----A--T----G--G----------------AC-TC--T--TTTGTGTTC--AAAGCTG--------C----T----GT-TT-----------tgtt
gi|22 : tttggtatttCCA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TC-ATTA-TAA----C--T----ATCAG-AAACAAAC-T---ATGT-GTAACTTTGAGCCGGAGATGAT---TTA-TTTA-TGAAATAC--------AATGAG-AAT-GTAACAAATCTATCT-TTAA-TGC-T-TT---C-CA---TTTGT--GAG-TG----T--AT---GGACC----AGAAA-AGGTTGTTATgcattttttgaatgaaaagtatttaaaaacaatattgtatatgtattacgggggaaatcgtgtcactttcaattc
gi|23 : accaagaatggaaattatcttattattgcagtTC---TT----TC--TAG--AA--CA--------T----T--T--A--TGTG--A--T----A--G---A----AATTT----T-TT--T--T---TGTCT--CAAGTTGTA------CATTAT----GTCTT-----------CTGAATGAAA----------------A----------A----------T--------ATTGACAAAAA-----------TGAACA----T------------TTT--AATT---------AAG--G---A---------------------------A------A---A--TGAAAAAC-T-GCAT--------------CATA----GTT-TAA------TGCTA------------------AA-G----T--TCTG-TGAA------T----ATTAG-AGAAAAAT-T---ATGagaaagata
gi|24 : tttcattaaaactctaccatt-------------A------A---A--C--------T-ATAT--------------CAC-----TTT-CGA------AG-TG--TGTG-CT-----A-C-AG-AAAACT--ATTA-TAGAT----------GTCAG-AGACAAAT-G---ATGT-GAAACTGT--ATGGGATATGAT---CTCTTTCA-TGAAATAT--------AG-GAA-GATAGTGAAAAGTTTTACT-TTAA-AGC-T-CT---G-AA---TTT-T--TTG-CT----CTGATGG-GGGCC----CAGAA-AGGCTGTTATTA
gi|25 : aatgagG-CC-GT-----T-T-TT------------------CT--TCTATAAA-A----AAAACT--T--CAGAAGCAG-TCAT----T--A---A-C-AAACT-TTA----T--ATTTATACCATGATAGATTTATT---TT----TC--CAG--TG--CT--------T----A--T--A--TGATAAA--T----A--A---A----AA---AAAA-------------TGCCC--AAAGCTACA------C----
gi|26 : agaatgatggggttttgctgccattgaagtattttgacatagtgaaGGCT--CTGT---TT---GCCC-A-CCCAAA------TCAAC--A----TCATGATCT-GTG-T--T-----TT--T-C---TTT-----------CAAA--AGTA---TAAGT-GTA-T--G-TTA------TGCAA---GTATCAT-------G--ATG-CA-A----C-TCAG---TT-TAAC--T--G-------------------G--TCTC----AT------TT--GG---CC--A--AA-ATGGTAT-------G-A-AATT-A-G---A--ATT-
gi|27 : TA--CGTA-TT-----C-C-AA-A----TG-ACTG-TAAAT--T--T------CAA-AGACAAAT-T---ATTT-GAAATTGT--GTAGGAGATGAT---CCCTTTTA-TGAAACAA--------AA-GAA-AAT-TT----TGTCTTCCT-TTCA-AGC-T-TT---T-AA---CTT-C--GAGTTT----T--ATGG-TGGTCTAGACGGAA-AGGCTaaacatcattacaaatgttttctt
gi|28 : tttaGAAAATGACA--CTAT---TT---GGCC-C-CCAATA------TTGAC--A----AT------C-GCA-C-------ATT--TAT---TTT-----------CAAA----T----TAAGT-G-A-T--CATTG------TGCAA---GAATGTC-------G--ATA-CA-A----C-TT-C---AT-T-GTAAT--GC------TA----------T--TTTC---
gi|29 : aaTAT-A--AATGAAAAGGGTT--CTAT---TT---GCCC-T-CAAAAA------TTTAC--A--------------GCA-G--T----GTT--T-T---TTTCTCTCTCTCTCCAAT--A-T----TAAAT-GTA-TAAA-TTG------TGCTA---AAATCCC-------G--GTG-CA--------T------AT-CAGT--T--GT------TA----------T--TTTC---CAT------TT--AA---tcgcaacaattttgtttgaaaacatcaa
gi|3 : aaatgaaACTAT-A--TATGGTAAGGACT--CTAT---TT---GCCC-A-CCAAAA------TTGAC--A----TT------T-TTA-C--T----ATT--T-T---TTT-----------CAAA----T----TACAT-GTA-T--T-TTG------TGCAA---GAATCCA-------G--AAG-CA-A----C-TC-A---AT-TAGT--T--GT------TA----------T--TCTA---AGT------TT--GA---TA--A--AA-ATGACAT-------C-A-AA-T-G-G---G--ATT-TTTTTTA---CA-TA-GA-----T-T-TT------------------CT--TTCA-----A----GAAACA--T--CAAA---AG-AATT----G--G---A-C-ATACT-TCATATTT--ATTTATATCAT---AGA-TCATCA--TG----TA--CAG--TA--CA--------T----G--T--A--TG----A--T----A--GAAAA----AA---AAAAT-TG--T--T---TGTCT--AAAACTGCA------C----T----GT-TT-----------CT------------------------A----------A----------T--------A--------AA-----------TCAGCA----T------------TTT--ACCT---------A----G---A------------TT-------------A------C---A--T--------T-ACAT--------------CAC-----TTTCCCA------TGCTG--TGTA-CT-----C-C-AATA----T--ATTG-TAAAT--TAAT----ATTAG-AGATAAAC-T---ATGA-GAAACTGT--ATTGGACAGAAT---TTCTTTTA-TGAAATAGAATTAAGCAA-GAA-GAC-TT----AATTTTTCT-TTTA-AGC-T-TTA--A-AA---AAT-T--GAA-TT----T--ATGG-GGCCC----TGGTA-AGGCTGTTATTATACAAAGTCCTTac
gi|30 : TA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-AGCA-TAAGT----------ATCAG-AGACAA-T-A---ATTT-GAAACTGC--ACTGAACACAAT---TTGTCTTA-TTTAGCAA--------TA-G-A-AAT-TT----A-----------AA-AGT-T-AC---A-AA---AAT-TGGGAG-TT----TG-ATGG-GAACC----CAGA
gi|31 : GCT--CTAT---CT---GGCT-C-CCAAAA------TCAAC--A----GG------T-GTG-C--T-----TT--T-G---TTT-----------CAAA--T-T----TGGGT-GTG-T--T-TTA------TGCAA---G--TTTT----------ATG-CA-AGTAGC-CT-G---AA-GAGT--T--GT------TA----------A--TCGC---AGT------TT--GG---CA--A--AA-ATGAgtccttta
gi|32 : ATGATAAGGGCT--TTAG---TT---TCCT-G-CCAAAA------TCGAC--A----GT------C-ATA-CA-TTA--ATT--T-TG--TTT-----------CAAA--A-T----TTAGT--T--T--T-TTG------TGCAA---AAATCCCTATAAAAGCTATG-CA-A----C-T------------T--T--G----------------------TGTC---CGT------TC--GA---TG--A--AA-ATGAtctgtagggtgagaat
gi|33 : GAGCACAA-TGTT----G--G---AAC-AAATT-TCA----A--ATCAATGTCAT---GGCTATATC---TC----TC--TGG--CA--CA--------T----G--C--AAGTG----A--C----A--G---A----AA---AATAT-TT--C--C---TGTCT--AAAGTTGTA------T----T----
gi|34 : tGT--ATTGAACATGAA---GTACTTCA-TGAAATGA--------AA-GAA-AAT-TT----GGTCATTCTCTCGA-ATT-T-CT---A-GA---ATT-T--GAGATT----T--ACAGCAGGCC----AAAAAGAGGCTGCAATCATACAAAATCCTTtcatgtatcctaaaagaaa
gi|35 : ---TTT-----------CAAA--A-T----CAAGT-GTA-G--T-TTA------TGCAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----G-T--G---AT----T--T--GT------TA----------T--TCTC---AGT------TT--GT---TC--A--AA-At
gi|36 : --ACTGAACATAAT---CTCTTTGA-CGAAATAA--------AA-ATT-GAT-TT----AGTCTTTTT-TCAA-ATT-T-TT---ATAA---ATG-T--GAG-CTA---C--ACCG-GAGCT----CGGAA-GGGCTGTCATCATcagcattctcctaaccatgacatcacaaacacactattt
gi|37 : aacaa-GAAACTGT--ATTGGACACGAT---CTTTTTT-------TAA--------AA-TAA-GAT-TT----AGTCTTCCT-TTAA-GAT-T-TT---G-AG---A---T--G---------T--ATGT-GGGCC----CAGAT-AAGCTGTTAGTTTACAAAAT
gi|39 : cT-------A-A-AA-T-------T--ACTGTTTTTCA---TG-CA-GT-----T-T-TT------------------CA--TCTA-----C----AAAGCA--T--CATGTGGAG---TT----GTAG---A-T-AAACA-ATG----T--ATTTCT-GCAT---GGATTTACC---TT----TC--CGG--t
gi|4 : ACTAT-A--CACGATAAGGGTG--GTGT---TT---GCCC-AACCAAAA------TCA--------------------TG-C--T----TTC--C-T---CTT-----------CAGT--C-G----TAAGT-GT--T--C-TTGATCAATTTCAATTTGA-TCAA-------A--ATGACATA----C-TC-A---AC-TACT--T--GT------AA----------C---CGG---AAT------TT--AAACATC--ACGAACATGACGT-------T-T----T-G-T---C--GTT-ATTTTCG---AT-CT-GC-----TAT-TT------------------CT--TCTA-----G----AAAATG--TACCGAGTGTAG-GCTT----G--G---A-C-TAAAT-TCA----T--ATTCGCATTGC---AGA---------------------A--TA--CA--------T----A--T--A--TC----A--T----T--G---A----AA---AATAT-TG--T--T---TGTCC--AAAACTACA------T----TATATGT-TT-----------TTCG----------------------A----------A----------T--------G--------AAAAACGTTCATACTAGCA----AACAAA-------TTT--CACT---------A----A---AT-----------TTGAG----------A------A---A--T--------A-TCTT--------------CTT-----TTT-ACA------TTCTT--TGTA-CT-----C-C-AA-A----------------------T----ATCAG-AGA-GAAC-A---ATGT-GAAACTGC--ATTGTACATGAT---CTCCTCTC-TAAAATAA--------AT-CAAGAAT-TC----A-TTTTTCT-TCAACGGC-T-TTC--A-AA---ATT-T--GAC-CCGAGAC--ATGG-GA--C----CAGAA-AGG--GTTGTTATACAAAGTCTTT
gi|41 : aggAT-A--TATGATAAG---T--CTGT---TT---TCCCCA-CCAAGT------TCAGC--A----TT------C-ATG----T----GTT--T-G---TTT-----------CATT--G-T----TAATT-GTA-T--T-TTG------TGCAA---GAAT
gi|42 : ggactaatg----AGTCTTTCT-TCAA-ATC-T-TTTTAA-AA---ATT-T--AAA-TT----TC-ATGG-GGTCG----TAGAA-ACACTGTTATTATACATAGTCCTT
gi|43 : A----T------------TTT--GAGT---------G----A---AT-----------TG-------------AGA----A---A--A--------T-GTGT--------------CAC-----TTT-TGT------TGCTT--TGTA-CT-----TAC-AA-A----TG-ACTG-TGAAT--t
gi|44 : aacaaT---CTCTTTTA-TGAAATCA--------AA-----AAT-TT----CGTCTTCCT-TTAA-AGCTT-TT---A-AG---ATT-T--AGC-TT----C--GTGA-GTGCT----TAAGA-AGGCactcagt
gi|45 : T-------A-A-AA-T-G-A---AT-ATT-TTCT-------G-CA-GC-----T-T-TT------------------CT--GCCA-----G----AAAATA--T--CAAATGCAG-GCTT----G--G---A-C-AA
gi|46 : A-T--C-TTG------TGTGA---AAATCCC-------G--ATT-TA-T----C-TC-A-------AGT--T--TT------TA----------T--TTTC---AATA-----TA--GT---TC--A--AA-ATGACGT-------A-G-Atgtcat
gi|47 : A----T------------TTT--AG-T---------A----G---AA-----------TTGAG----------A------A---A--A--------T-GTGT--------------CAC-----TTT-GGA------TGCTA--TGTA-CT-----
gi|48 : -------------A------A---A--T--------T-GCGT--------------CAT-----TTT-TGA------CGTCA--TGTA-TT-----C-C-AA-A----T--
gi|5 : aattgagACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATAG------T-GAT--G----TT------T-GTG-C--T----GTT--G-T---TTT-----------GAAA--A-T----TAAAT--CATT--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----CTTT-A---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TCTT---AAT------TT--GA---TA--A--GA-ATGACga
gi|5 : ataaaagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TTTCTGTATT------TT--GA---T---------ATGAAGT--------------T-T-G---T--AGT-TTT--CA---TG-TA-GT-----T-T-TT------------------CT--TCCA-----G----AAAG-A--T--GGTGTGCAT-GCCT----G--G---A-CAAAACT-TTA----T--ATTTATACTAT----GAGGGATC---AT----TC--CTG--TG--CA--------C----C--T--A--TA----A--T----AT-G---ACCT-AA---AAAA---------T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-AT-----------AT------------------------A----------AAAAGAGAACTT--------A--------AAATAT-------TTAATAACATT------------TTT--AACT---------A----G---ATA----------TT-------------A------A---G--T--------T-GAATTGAGAAATTTGCAACAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C----G-A----TG-GCT--TAAAT--T--------TCAG-AGACAAAT-T---ttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccagaaagatggtgtgcatgcctggacaaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctataatatgacctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaaagagaacttaaaatatttaataacatttttaactagatattaagttgaattgagaaatttgcaacaatttgaatgttatatagctcgatggcttaaatttcagagacaaatt
gi|6 : ataaaagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgttttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcatttaaaatgaACTAC-A--TATAATAAGGGCT--ACAA---TT---GCCC-A-ACAAAT------TAGA---A----TC------T--------------------------------------CA-----------TAGGT-ATA-T--T-TTG------TGAAA---GAATCCC-------A--ATG-CA-A----C-TC---------AGT--T--AC------TA----------T--TCTA---AAT------AT--GA---TC--A--AA-ATGACAT-------G--------G-G---A--ACT-TT
gi|6 : agg-CA-GT-----T-T-TC------------------CT---CCA-----G----CAA-------------GCAG-CCTT----G--A---A-C-ATGCT-TTA----TTAAGTGATAGAAA---AATTTTGTG---TG----TC--C----TG--AA--------T-------T--A--TG----C--T----C--G---A---------------TG--T--T---T-TCT--GA--CCGGA------AAA--T----GT-TC-----------CT------------------------A----------A-------------------A--------AA-----------T------------------------T--AAGT---------A----A---AA-----------TT-------------G------AGACA--T--------T-GTGC--------------CAC-----TTT-TGA------TGCTA--TGCA-CT-----C-C-AA-A----TG-AGCA-TAAG------T----ATCAG-ATAC-AAT-A---ATGT-GAAACTGC--ACTGATCACAAT---CCGTCTTA-TCTGACAA--------TA-G-A-AAT-TT----A-----------AA-AGT-TACA---A-AA---ATTGT--GAG-TT----TG-ATGG-GAACC----CAGAA-AAGC----ATCATACAGAGTCCaactaaaatttatataaacaggatacagattaggtctaatttacagttttcctccagcaagcagccttgaacatgctttattaagtgatagaaaaattttgtgtgtcctgaattatgctcgatgttttctgaccggaaaatgttcctaaaaattaagtaaaattgagacattgtgccacttttgatgctatgcactccaaatgagcataagtatcagatacaataatgtgaaactgcactgatcacaatccgtcttatctgacaatagaaatttaaaagttacaaaaattgtgagtttgatgggaacccagaaaagcatcatacagagtcc
gi|7 : aggactacatataataagggctacaattgcccaacaaattagaatctcataggtatattttgtgaaagaatcccaatgcaactcagttactattctaaatatgatcaaaatgacatgggaactttaactaaaatttatataaacaggatacagattaggtctaatttaACGAT-G--TATGATAAGTGCT--TTAT---TC---GTCA-A-CCATAG------T-GAT--G----TT------T-GTG-C--T----GTT--G-T---TTG------------AAA--A-T----TAAATCAT--T--T-TTA------TGCAA---GAATCAT-------A--ATG-CA-A----CTTT-A---AA-TAGT--T--GA------TA----------T--TCTT---AAT------TT--GA---TA--A--GA-ATGAC
gi|7 : aagC-G---AT-TTGC--T--GC------CA----------T--TTTCTGTATT------TT--GA---T---------ATGAAGT--------------T-T-G---T--AGT-TTT--CA---TG-TA-GT-----T-T-TT------------------CT--TCCA-----G----GAAAGA--T--GGTGTGCAT-GCCT----G--G---A-C-AAACT-TTA----T--ATTTATACTAT----GAGGGATC---AT----TC--CTG--TG--CA--------C----C--T--A--T-----A--T----AT-G---ACCCTAA---AAAA---------T---TGTCC--AAAGCTGCA------C----T----GT-ATATAAAAGAGAACTTAA---------------------A----------A----------T--------ATTT-----AA-----------TAA-CA----T------------TTT--AACT---------A----G---ATA----------TTAAGTTGAATTGAGA------A---A--T--------T-GCAA--------------CAA-----TTT-GAA------TGTTA--TATAGCT-----C-C-GA-T----G--GCT--TAAAT--T--------TCAG-AGACAAAT-T---Attggaactgtaatgatgacatcattaaaatgacgatttgctgccattttctgtattttgatatgaagtttgtagttttcatgtagtttttcttccaggaaagatggtgtgcatgcctggacaaactttatatttatactatgagggatcattcctgtgcacctatatatgaccctaaaaaattgtccaaagctgcactgtatataaaagagaacttaaaatatttaataacattttaactagatattaagttgaattgagaaattgcaacaatttgaatgttatatagctccgatggcttaaatttcagagacaaattac
gi|8 : aagacgatgtatgataagtgctttattcgtcaaccatagtgatgtttgtgctgttgtttgaaaattaaatcatttttatgcaagaatcataatgcaactttaaatagttgatattcttaatttgataagaatgacttggaactgtaatgatgacatcattaaaatgaACCAT-A--TACGATACAGGCT--GTGT---TTCATGCTC-A-CCAAAT------ACAGCTCA----TC------T-G-G-CATT----CTTAAT-T---TGT-----------TAAA--A-T-----GACT-G-A-T--T-C------------A---GAATT------------ATG-T------------G---AT-TAAT--TTAAT------TAAGAAGAAAATT--TCTC---CAT------TTTGGA---AT--A--AA-ATGAC------------------------T--ATT-TTCT--A---CC-CA-GT-----T-T-TT------------------AT--TCTA-----G----AAAACA--T--GAAGAGCAG-ACTT----G--G---A-C-AAATT-TCA----T--A--TATGCCAT---AG------C---T---------CAG--TG--CA--------T----G--C--A--TG----GCTT----A------A----TG---AAAGT-TG--TACT---TGTT----AAGT---------------------T-TT-----------TT------------------------G----------A----------A--------A--------GA-----------AAAACA----TCACAAAATCCAGTTT--AATC---------A----A---ATG----------TT-------------AAAATAGA---A--T--------T-GAGA--------------AAC-----TAT---A------TCACA--TTTA-CT-----T-CAAA-A----G--ACTG-TAA-------T----ATTGG-ACAGAGAG-T---ATTT-GAAATGGA--AATGGGCATGAT---CTCTTTTA-TAAAc
gi|9 : aaggTT-----------CAAA--A-TCTAATAAGT-GTA-T--T-TTA------TTC-A---GAATCAT-------GA-ATG-CC-A----C-TC-----AT----T--T--GT------CA----------T--TCTC---AGT------CT--GA---AC--A--GA-AAG-CAG-------A-G-AA-TCG-G---A--ATT-
gi|9 : gTGACTT-------G-A-AG-T-T-G---CTAATT-TTTCTCA---C---A-GT-----T-T-TT------------------CC--TCTA-----G----AAAGCA--T--TTAGCATTG-GCTT----T--C---A-G-AAACT-TCA----T--ACTCAT----------------C---TT----TT--CAA--TA--CA--------T----G--T--G--TGTA--A--T----A--G---G----AA---AATTT-TG--T--T---TTTCC--AGAGCTGAT------C----T----GT-TT-----------CCTGAAAA------------------A----------A----------TGTTTCCAAA--------AA-----------TGAGCA-----------------TTT--AAAT---------G----A---AT-----------TTCTGTC--------A------A---A--T--------T-GCAT--------------CAT-----TTT-TGA------TGCTA--TGTT-CT-----C-C-AA------------G-TAAAT--G--TAGGAATTAG-TGGAAAAT-T---GTGT-AGAACTGT--ATTGGACAatgacatcttaaacataacattttgccaccattcagtattttgacttgaagttgctaatttttctcacagtttttcctctagaaagcatttagcattggctttcagaaacttcatactcatcttttcaatacatgtgtgtaataggaaaattttgtttttccagagctgatctgtttcctgaaaaaatgtttccaaaaatgagcatttaaatgaatttctgtcaaattgcatcatttttgatgctatgttctccaagtaaatgtaggaattagtggaaaattgtgtagaactgtattggaca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|38 ): ATTTTTCTAGAACACGTGTGATAGATTAATTTTGTTTATTCGATATCACAATTGCGCAATATGTTTTCTGAAAGAAACTGCTTCCAAAAATTAGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): ACGCTGCTTATTTTCCATTCTCAATTTCATCAAAATGAGAACCAGAATTACGATATCATAGACATAACATTATGTCACTATTTTCAATATTTT
Unaligned ( gi|49 ): TAAAAGCTCTTCATAAAACAGTTGTAAGTGAAT