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Unaligned ( gi|6 ): TATGCAGATTTAGAAGGGGGAGGGCAGAGGGCACGGATCCCCTTATTCGTGAACAAAATGTTTATTGATATA
Unaligned ( gi|10 ): ATAGGCAGATTTAGAGGAAGCAGGGGGCAGGGGTCCTCTTTTCAATATGAAGATTATCATCATGTGTA
Unaligned ( gi|28 ): CAGCTTTTAAGTTCTCGAGCCCCCCCCCCCCTTTTTTTTTTTTGCAAGATGA
Unaligned ( gi|29 ): ATAGCAATGTGGTGTATTAGACCCCCCCCCCCCCCCCCCCTATAATTTTCTT
Alignments
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lowQualScore : . ..... .. . ........................................................................... . ..... ...... . ... .. ....
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consensus : TCATA-GGCGGATTT-----AG--AG-GGG---------G-----C------GC---CC------C---C----C----CCCC-C----------T-----C--TT-TT-----T----G-GTG-ACCA---AA--ATTA----TCAT
Reference ( family-259 ) : TCATA-GGCGGATTT-----AG--AG-GGG---------G-----C------GC---CC------C---C----C----CCCC-C----------T-----C--TT-TT-----T----G-GTG-ACCA---AA--ATTA----TCAT
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gi|12 : ATA-GGCGGATTGA----AG--GG-AGG---------G-----CCA----GC---CC------C---C----C----CCCC-C----------T-----T--TT-TTTTTTGT----G-GTG-ACC-----A--ATTA----ttaattatt
gi|13 : CATA-GGCGGATTC-----CG--AG-GGG---------GGA---CA-----GC---CT------C---C----C----GCCC-C--------------------T-TT-----T----C-GTG-ACCC---AA--ATTttta
gi|14 : ATA-GGCGGATTT-----AG--AT-GGG---------G-----CA-----GC---CC------CTGAC----C----CACC-C----------C-----C--TG-TT-----C------GCG-ACCA---AA--ATTA----TCATttacattat
gi|15 : CATAAGGCGGATTT-----AGAAAG-GGG---------G-----C------GT---TA------C---C----C----CGCC-C----------C-----C-----TT-----T----G-GTGTACCA---GA--ACTg
gi|16 : -----AG--GG-GGG---------G-----CAGGGG-GT---CC------G---CGGG-C----CCCC-C----------T--------TT-AT-----T----G-GTG-ACAAATTAG--ATTA----TCATtaaatt
gi|17 : gaTCATA-GGCGGATTT-----AG--AG-GGG---------G-----C------GT---CC------C---C----T----CTCC-C----------T-----C--TCATT-----T----G-GTG-ACCA---AA--ATTA----TCATgta
gi|18 : TA-GGTGGATTT-----AG--AG-GGG---------G-----CCA----GC---TC------C---CACTTC----CCCC-T----------T-----T--TT-TT-----T----C-GTG-ACCA---AA--ATTA----
gi|19 : ATA-AGCAGATTT-----AG--AG-GGG---------G-----T------GT---CC-------------------------------------------------T-----T----C-GTG-ACCA---CA--ATTA----TCAT
gi|2 : caataataCATA-GGCGGATTTT----AA--AG-GGGTGGGGTTACA-----C------GA---CC------C---C----GTTA-CCCC-G----------T-----CCATT-CT-----C----G-CTG-ACCA---AA--ATTAATTATCATtatgtat
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gi|24 : TA-GGCGGATTT-----TA--AT-TGA---------G-----C-------C---CC------C---C----C----CCCC-CTTTTT-----T-----T--TT-TT-----T----G-GT--ACCA---AA--ATatta
gi|25 : ATT-GGCGGATGT-----AG--AG-GA------------------------C---CC------C---C----C----TCCCGC----------C-----C--TT-TT-----T----G-GTG-ACCA---AA--CTTga
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gi|31 : gtttttaaatgCATA-GGCGGATTT-----AC--AA-------------------C------AC---CC------C---C----T----CCCC-C----------T------------T-----T----G-GTG-ACCA---AA--ATTA----
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gi|33 : cATA-GGCGGACTTCTA--AG--A----------------------------C---CC------C---C----C----CCCC-C----------T-----T--TT-TT-----TTTT-G-GTG-ACCA---
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): ATAGGCAGATTTAGAGGAAGCAGGGGGCAGGGGTCCTCTTTTCAATATGAAGATTATCATCATGTGTA
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