lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 44 111 1111 11 11 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 1 1 2222222 1111 2 111111 111 111 3333333333 111 111 11111111 2222222222222 1111111111 111111 1 111111111111 11111 555555555555555555555555555555555555 44444444444444444444 11 11
lowQualScore : 99 22 77 99 111 4444 33 66 33 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 5 5 33 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 888 5 5 77 8 555 777 0 555 4 4 5 888 0 0 5 66 5 66 888 777 5 5 5 4 1 77 5 77 0000000 66 0000 4 4 3 4 000000 1 444 4 4 55 222 4 4 4 4 4 4 7777777777 0 4 55 66 4 5 5 5 999 66 777 5 777 66666666 8888888888888 0000000000 3 6 555555 0 77 888888888888 44 2 2 2 33 2 33 3 2 3 3 3 6 3 3 3 44 44 44 555 3 3 3 22222 3 3 3 8888888 000000000000000000000000000000000000 4 4 4 55555555555555555555 8 11 11 8
lowQualScore : .. .. .. .. ... .... .. .. .. . ....................................................................................................................................... . . . .. . ............................................................................. . ... . . .. . ... ... . ... . . . ... . . . .. . .. ... ... . . . . . .. . .. ....... .. .... . . . . ...... . ... . . .. ... . . . . . . .......... . . .. .. . . . . ... .. ... . ... ........ ............. .......... . . ...... . .. ............ .. . . . .. . .. . . . . . . . . . .. .. .. ... . . . ..... . . . ....... .................................... . . . .................... . .. .. .
lowQualScore : 22 55 77 22 777 2222 22 88 88 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 7 7 66 7 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 222 0 0 22 9 333 888 1 333 4 4 0 888 0 2 0 99 0 99 888 222 7 0 0 5 4 99 7 99 7777777 11 6666 4 4 9 4 222222 8 222 0 0 55 555 0 0 0 0 0 0 1111111111 8 0 55 11 4 0 0 0 666 99 111 0 888 11111111 3333333333333 7777777777 3 7 666666 0 99 222222222222 22 9 7 7 77 9 99 4 9 1 1 1 7 1 1 3 66 66 66 888 6 6 3 77777 6 6 6 2222222 444444444444444444444444444444444444 0 0 4 77777777777777777777 0 00 00 0
consensus : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--TAAC-TAGATC-TATA--CA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAAAT-CAT-GTCA--TGTTA-T-----------------ATAA--AAGGAAAATA-A-----------GGA----------T-----A----C------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTT-AAT-TA-A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCCT-GTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG----TAAAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTA---------AAATATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAA-AA---TA--------CAAAACAA---AC---AA---GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C--C--GAT-CC--GGAGGTTT---G----A---AT--GAATCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CACGA-TAA-A-TG---TTAAA-TTT-A--AA--GATTGG-ATTAC
Reference ( gi|5 ) : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--TAA--TAGATC-TATA--CA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTAAAAAT-CAT-GTCA--TGTTA-T-----------------GTAA--AA---------A-----------GGA----------T-----A----C------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATT--AAT-TA-A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCCT-GTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTATCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG----TAACAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTA---------TAATATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCACT--CTTG-T-AA-AA---TA--------CAAAACAA---AC---AA---GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C--C--GAT-CC--GGAGGTTT---G----G---AT--GAATCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CACG--TTA-A-TG---TTAAA-ATT-A--AA--GATTGG-ATTACA
gi|4 : TGCACTACTTGCATGGACAGCAAT--TAAC-TAGATC-TATA--CA---AGTCACGT----
gi|6 : TGCACAACTTGCATGGGCAGCAAT--TAAC-TAGATC-TATATACA---AGTCACTT----TTGT-TATGAAATAGGC--TG-TATgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgacaatatccatgtctattatataaaaggaaaataaagaatacagctttacccaaatatatttaatataaacacttcaaaaattattttgtgataggtaaatctggttaaagaataaacacatcgttcgtttagactcttagttcctctcgttgactattcatgtaaagctgccccagcgtttcgtccaatttatcgtgtcaaacctattaataagttgtcttccacttgtttaaaatattcctcaatataatcttcgatcgctcttgtaaaaatacaaaacaaaacataagaaaactgtctcgctcccagatcccggaggtttgaattgataattctcgctgtccatttttttacactagcatgcagacagcaacatcatactatgactctgcaaagccgtcactcatttctaaatttcagacgaggccttgacaggataaggtataagagaacaaaacacggataaatgtatttaaatttaacaagattggattcg
gi|1 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttaTGCACTACTTGCATGCGCAGCAAT--TGAACTAGCTTATATA--CA---AGTCACGTTTCCTTGT---TGAA--AGGC--TAGTATatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccgcggtacaaatcatgttatgttaatataaaaggaaaataaaggatactgtaacagactttaccaaaatattttaattacacttcaaaagtatatttgtgatagatataatcctgtcaaagaataaacacatcgttcactgtgttcaatagttttgaccttgtgtcctctctagttcat
gi|26 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaaCACTACTTGCATGGGCAGCTAT--TAAC-TAGATC-TATA--CA---AGTCACGT----TTGtatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|2 : ACTACTTGCATGGGCAGCAATATTAAC-TAGATC-TATA--TACAAAGTCACGT----TTGT-TATGAAAAAGGCTGTA-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAAAAT-CAT-GTCA--TGTTA-T-----------------ATAA--AAGGAAAATA-A-----------GGA----------TCTGTAA----C------ATAC-TTTAC---AAAAT-A-TTTT-AAT-TA-A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTTTGTGATA-GGCTAGATATATCCT-GTCAAAGAATAA-CACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTT--G-AC-CTT-GTGTCCTGTCGT--CG-C--TAGATCTAGTT--CATGAATGTAA-ACATGCCC-AGCGTTTC-TTTC----A-GTTTTT-ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGTTCT-CTCT-CAC-TG-TTA----------AA-ATTTCTTCAA-TA--T--AG-A-T-TT-TGA-TG-CGCT--CTTG-TAAA-AA---TA--------CAAAA-AA---ACGATAA---GGGC---T------ACTGTCCT-CT-C--C--GAT-CC--GGAGGTTT---G----A---AT--GAATCTCAGCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACT-AAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTC--GACGAG-----GC-T-CT-CGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CACGATTCATA-TG---TT
gi|3 : aagacaattgaagatatgatacaaatcacccttcccccgagggggtggttgtgtgtacgtgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatgtatgT--TAAC-TAGAT--TATA--CA---AGTCACG-----TTGTATATGAAATAGGC--TA-TATggattacgat
gi|6 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactGCGGTACAAAT-CAT-GTTA--TGTTAAT-----------------ATAA--AAGGAAAATAAA-----------GGA----------T-----A----CTGTAACAGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-TTTT-AAT-TA---CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTT--GTGATA-GAT---ATA-ATCCT-GTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-A-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCT--------C--TAG------TT--CATggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagacagtacaaatatgtcaatgttttatgaaaggaaataagatcagactttacgtaaaattatttaattaacacttcaagtaatattttgtgtaggttaatctgatcaaagaataaacacaagtcgttcactgtgttgatcatctagttttgacattgtgtcctctgtcgcactcgttctagtaaactgccccaagatttcgtccaattgatcgtgtaaacatttgataagctgtcgctctcctgttaaaattccttcaatatagtaacttcgatgcggcttccttggtaataatacaaaacaaacaataggctaactgtctcctactgatcccggaaggtttgactgaattcactgctctggttttaacactaaatgagacaaaatcattacatgacgtcatgcacaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggcccttgacagggataag
gi|3 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttatgcacaacttgcatgggcagcaattaactagatctatatacaagtcacttttgttatgaaataggctgtatatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccCAGTACAAAT--AT-GTCAA-TGTTT-T-----------------ATGA--AA---------G-----------GAAA---------T-----AAGATC------AGAC-TTTACGT-AAAAT-T-ATTT-AAT-TA-A-CACTTCAA-----GT-AAT-ATTTT-GTG-TA-GGT----TA-ATCTG-ATCAAAGAATAAACACAAGTCGTTCA-CTGTG--TTGATCA-TCTAGTTTTG-AC-ATT-GTGTCCTCT-GT--CG-CACTCG------TT--CTAG----TAA-AC-TGCCCCAAGATTTC-GTCC----A-ATTG---ATCGTGT--AAACAT--TT---GATAAGC-TG-TCG-CTCT-C-C-TG-TTA----------AA-ATTCCTTCAA-TA--T--AGTA-ACTT-CGA-TGCGGCTTCCTTGGT-AATAA---TA--------CAAAACAA---AC---AAT--AGGC---T----A-ACTGTCTC-CTAC--T--GAT-CCCGGAAGGTTT---G----A---CT--GAAT-TC-ACTG-CTC---T--GGT-TTTAACACTAA-ATG-AGACA--AA-ATCA-TTAC-ATGACGTCATGCACAA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-TGACAGGGATA--A----G
gi|14 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactttaactagattatacaagtcacgttgtatatgaaataggctatatggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagaCGGTACAAAT-CAT-GTCA--TGTTA-T-----------------ATAA--AA---------A-----------GGAAAATAAAGGAT-----A----C------AGAC-TTTAC-C-AATAT-A-ATTT-AAT-TA-A-CATTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCCT-GTCAAAGATCAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TA
gi|7 : TACAAAT-CATAGTCAAATGTTA-TT----------------ATAA--AA---------AAGGAAAATAAAGGA----------T-----A----C------AGAC-TTTAC-C-CAAATTA-ATTT-AAT-TA-A-CACTTCAAA-----T-A-TTATTTT-GTGATATGGT---ATACATC-T-GTCAAAGAATAAAC-CA--TGGTTCAACTGTGGTCT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GT--CCTCT-GTAACG-C--TAG------TCTCCATG----TAA-AC-TGCCC-AGCGTTTCTGTCC----C-AGTTT--GTCGCG------C-T--T-------------------CTCT--AC-TG-TTA----------AATATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGATTGCGGCT--CTTG-T-AA-AA---AA--------C-AAACAA---ACATAAA---GGGT---TATTAA-ACTGTTTC-CT-CT-C--GAT-CC---CAGGGTT---A----A---ATTGAAATCT--GCTGCCTCCA-T--TGTGTT--ACACTAG-ATGCAGG-A-C-GCATCACT-A--GTGACGTCAT-CA-AGTGAGCAGTAC--ACATCAAT--T--TA---AATGTTCATGACAAG-----GCAT-TT-CGACAGGGATA---------T-----------------A------------------AAC-AG-AAATTACG--ATA-ACTGTT-TTAAATATT-A--AGATGATTGGAATTAC
gi|1 : AAATGCAT-GTCA--TGTTA-TAGTTGTGAGAGAGAGAAGTGAGTAG---------A-----------GGA----------T-----A----C------AGACGTTTAC-CAAAAAT-A-ATTTAAGTGTAGA-CACTTCAAAGAGAGTGA-T-ATTTT-GTGATga
gi|4 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgac-CAT-GTC---TATTA-T-----------------ATAA--AAGGAAAATAAA-----------GAA----------T-----A----C------AG-C-TTTAC-C-CAAAT-ATATTT-AATATA-AACACTTCAAA---AAT---T-ATTTT-GTGATA-GGT---A-A-ATCTG-GTTAAAGAATAAACACA--TCGTTC---------------------GTTTAG-ACTCTTAGT-TCCTCTCGT--TGAC--TA-------TT--CATG----TAAAGC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTT--ATCGTGTC-AAAC-CTATT---AATAAGT-TG-T---CTTC-CACTTGTTTA---------AAATATTCC-TCAA-TA--T--A--A-TCTT-CGA-T--CGCT--CTTG-TAAA-AA---TA--------CAAAACAAAACAT---AA---GAA---------A-ACTGTCTCGCT-C--CCAGATCCC--GGAGGTTT---GAATTG---AT--AATTCTC-GCTG--TCCATT--TTT-TT--ACACTAGCATGCAGACAGCAACATCA-T-ACTATGAC-TC-TGCA-AA---GCCGT-C--ACTC--AT--TTCTA---AAT-TTCA-GACGAG-----G--C-CT-TGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TAAGA-----G-AAC-A--AAA-CACGGATAA-A-TGTATTTAAA-TTT-AACAA--GATTGG-ATTctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|8 : tgcactacttgcatggacagcaattaactagatctatacaagtcacgtgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgacaatatc--AA---------A-----------GGA----------T-----T----C------A-AC-T--AC-C-AAA-T-A-ATTT-AAT-TA-A-CACTTCAAC---A-T-A-T-AGTTT-GTGATA-GGT---ATG-ATCCTTGTTTA-GAATAAACACA--TCG--CA-CTGTG--TT---CATT-TAGTTTTGTAC-CTT-GTGTCCTCTCGT--TG-T--TA-------TT--CATG----TAA-A--------------TC-GT--------------------GTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTA---------AAATATT-CTTC-A-TA--T--AG-A-TCTT-CGA--GACGCT--CTTG-T-cg
gi|18 : ttactataaaaggaaaatTT--AAT-TA-A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-TTAATA-GGT---ATA-ATCCT-CTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-GTGTG--TT---CA-T-TAATTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCtagcccgttattgtttgttttgtatttttactgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|16 : t-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG-----AAAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--TTCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-CCG-CTCT-AAC-TG-TTA---------AAATATTCCTTCAA-TA--
gi|13 : T--CATG----TAACAC-TGCCTCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-C--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTA---------AAATATTCCTTTAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TG-CGCT--CTTG-TAAA-AA---TA--------CAAAACAA---ACAATAA---GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-CT-C--GATCCC--AGAGGTTT---G----G---AT--GAATCTC-GCTG-CTCCA-T--T
gi|20 : T--CATG----TAAAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCCGGCCA-ATTT---ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-TCCT-CAC-TG-TTA---------AAATATTCCTTCAA-TA--T--AG-
gi|1 : AC-TGCCCCAGCGTTTC-TTCC----AGATTTTTGATCGTGTCCAAAC-T--CTTAAGATAAGGGTG-TCGGCTCTGCAT-GG-GTGAGAGAGGAGTGATGTCCGTGCAAGTAATTGAAG-AGTCTTTCGA-TGCGAGT--CTTG-T-AA-AAGATTACCAAGAATCAAGACAA---A----AG---AGGC---T----A-ACTGTTTC-CT-C--CT-GAT-CC--GGAGGTTTGGAG----G---AT--GAATCTC-GATG-CTCCA----TGA-TT--ACACTAG-ATG
gi|9 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaTC--ATCGTGTC-AATT-T--CTTC-AAT--GT-TG-TCG-CTCT-CAC-C-----------------TCTCACTTCAA-TA--T--GT-A-TTTG-CTG-TGC---T--CTTG-------G---TA-----------------------------GCCC---T----T-AGTGTTTC-TT-TTAC--TAT-T----GAGGTTT---A----G---GC--TAATATC---TG-A--CA-T--AAT-GT--A---TAG-TTGCAGACA-CAACA-------C-ATG---TCATGCA-AA-GGACCGC-T--ACTCCAAT--T--TA---AAG-TACA-TACGAG-----GC-C-CA-CGACAGGGA-A--A----AGTAAAAAAAAAACCATAAAA------TA--A-----A-AAC-AG-AAA-CACG--ggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|11 : gA-AA---TA--------CAAAACAA---AC---AATAAGGGC---T----A-ACTTTCTC-CT-C--CC-GAT-CCC-GGAGGTTTT--G----A---AT--GCATCTC-GCTG-CTCCA-T--TAT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATTG-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CACGA-TAA-A-TG---TTTAA-ATTAA--AA--GATTGG-ATTACatttgttttctaagat
gi|17 : ---TA--------CAAAACAA---AC---AATAAGGGC---T----A-ACTGTCAC-CTCC--C--GATCCC--GGAGGTTT---G----AACTAT--GAATCTC-GCTA-CGC------TG--TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-Ag
gi|12 : A---GC---AA---GGCCATAT----ATACTGCCTC-CT-C--T-------C--GGAGGTTT---G----A---AT--GAATCTC-GCTG-CTCTA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CACTATAA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TAAATAAT-TTTA-GATGAG-----CC-C-CT-CGACAGGGATG--A----GGT-----------------A------TG--ATACATGCAAT-AG-AAA-CACGA-TAA-A-TG---TT----TTT-A--AA--AATTGG-ATTAC
gi|10 : -ACTGTCTC-CT-C--C-------C--GGAGATTT---G----A---GT--GAATCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCATACA-AAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGGTA--A----GG---------------------------------------------AA-CACGA-TAA-A-TG---TT----TTT-A--AA--GATTGG-AATACga
gi|8 : gatcttcggtgcgctcttgttagccctttattgtttgttatgtattttt-ACTGTC-C-CT-C--C--GAT-CC--G-AGG-------------------------C-GCTG-CTCCG-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-ACAATGACGTCAT-CG-AA-AGGCC-T-C--ACTTCAAT--T--T----ACT-CTCA-GACGAGT----GC-CTCT-CGACAGGGATAATA----GGT-----------------A------TA--A-------AAC-AGTAAA-ga
gi|21 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctcttgttagcccgttattgtttgttttgtattttt--GAATCTC-GCTG-CTCCA-TATTGT-TT--ACACTA---------------TATCA-T-AC-ATGCCGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TA---Aa
gi|24 : TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-A--CAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTAATGCA-AA-G
gi|15 : G-CTCAA-T---GT-TT--ACATTAA-TTGCAGGCA-CAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCTGA-T--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TACA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGAAA--A----GGT-----------------AAAAATGTA--A-------AAT-AG-AAA-CATG--
gi|1 : TGACGCAGTGCA-A---GGCCGT-CGTACTCCAGGGAT--TG---GAT-CTAG-GACGAGAGTTCGC-C-GTGCGACAGGGATG--AAGGAGGT-----------------A------TA--A-----G-AACGAG-Aatttgttttttaaga
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TAATATGTGATTTATTTTCTCGAGGACTATATGGTAGAAAATTATAAGATATGAATTTCATACAAATCCCCCCGGGGGTGGGTGGTGGTGTTTGGGTC
Unaligned ( gi|22 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATACGATTGAAGACAATTGAAGCTATGAATACAAA
Unaligned ( gi|23 ): TTGAACATATGGATACAAATCACCCCCTCCCCTGAAGGGTTGGTTGCGCGGTTGGGTCTAC
Unaligned ( gi|25 ): GATAATTGAAAATATGAATACAACCCCCCCCCCCCCCCGTGGGGGTGGTTGCGCGGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111 1111 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111 1 1111111111111 111 1111111 111 111 1111111111 11 11111111 2222222222 11 1 11111 444444444444444444444444444444444444 222 11
lowQualScore : 77 5 33 000 2222 88 11 11 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 666 5 11 8 4 9999 333333 777 0 4 4 7 3333333333333 4 666 4 4 4 111 777 4 4 4 4 4 777 8 4 66 4 66 777 555 5 4 4 2 8 66 5 66 6666666 55 111 7 4 2 4 8888 4 44 888 3 3 55 111 3 3 3 3 3 3 6666666666 3 55 55 4 4 4 4 22 66 3 55 33333333 555 9999999999 555 7777 2 3 6 6 11 0 77 3 7777777 44 6666 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 6 2 2 3 44 44 44 555 3 3 11111 3 3 3 44 7777 111111111111111111111111111111111111 3 3 4 4 666 000 33 5 77 77 6
lowQualScore : .. . .. ... .... .. .. .. . ....................................................................................................................................... . ... . .. . . .... ...... ... . . . . ............. . ... . . . ... ... . . . . . ... . . .. . .. ... ... . . . . . .. . .. ....... .. ... . . . . .... . .. ... . . .. ... . . . . . . .......... . .. .. . . . . .. .. . .. ........ ... .......... ... .... . . . . .. . .. . ....... .. .... . . . .. . .. . . . . . . . . .. .. .. ... . . ..... . . . .. .... .................................... . . . . ... ... .. . .. .. .
lowQualScore : 99 7 66 000 1111 88 88 00 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 222 0 99 9 4 4444 999999 888 8 4 4 8 2222222222222 4 222 4 4 0 000 000 0 0 0 0 4 888 9 4 11 4 11 888 444 0 4 4 9 8 99 0 99 9999999 55 000 2 0 5 0 5555 0 77 555 6 6 00 444 6 6 6 6 6 6 6666666666 6 00 55 0 4 4 4 33 11 6 00 22222222 888 9999999999 888 1111 9 3 7 7 22 0 99 3 9999999 22 1111 9 7 7 77 9 99 7 9 9 9 2 9 9 1 22 22 22 444 3 3 77777 3 3 3 66 1111 666666666666666666666666666666666666 6 6 0 4 555 666 11 0 99 99 7
consensus : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AAT-A-AAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CAC-GAT--AAATGT--TTAAAT-TTA--AA--GATTGG-ATTAC
Reference ( family-2504 ) : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AAT-A-A-GGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CAC-GAT--AAATG---TTAAAT-TTA--AA--GATTGG-ATTAC
gi|1 : TGCACTACTTGCATGCGCAGCAAT--TGAACTAGCTTA-TATACA---AGTCACGTTTCCTTGT---TGAA--AGGC--TAGTAT
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaaACAA-ATGC-AT-GTCA--TGTTA-T-AGTTGTGAGA--GAGAGAAGTGAGT-AGA-GGAT-----AC------AGACGTTTAC-CAAAAAT-A-ATTTAAG-TGTAGACACTTCAAAGAGAGTGA-T-ATTTT-GTGATtatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgTGTAT--GAAC-TGCCCCAGCGTTTC-TTCC----AGA-TTTTTGATCGTGTCCAAAC-T--CTTAAGATAAGGGTG-TCGGCTCTGCAT-GG-GTGAGAGAGGAGTGATGTCCGTGCAAGTAATTGAAG-AGTCTTTCGA-TGCGAGT--CTTG-TAAAAGATTACCAAGAATCAAGACAA---A-----AG----AGGC---T----A-ACTGTTTC-CT-C-CT-GAT-CC--GGAGGTTT-GG---AGGAT--GAA----TCTC-GATG-CTCCA----TGA-TT--ACACTAG-ATGctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagTGACGCAGTGCA-A---GGCCGT-CGTACTCCAGGGAT--TG---GAT-CTAG-GACGAGAGTTCGC-C-GTGCGACAGGGATG--AAGGAGGT-----------------A------TA--A-----G-AACGAG-Aggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|10 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagG-TAAAAA--TAC--------ATAACAA---ACAATAAA----GGGC---T----A-ACggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|10 : gatcttcggtgcgctctt-ACTGTCTC-CT-C-C-------C--GGAGATTT-GA---G---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCATACA-AAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGGTA--A----GG---------------------------------------------AA-CAC-GAT--AAATG---TT---T-TTA--AA--GATTGG-AATACtgtctcctcccggagatttgagtgaatctcgctgctccattgtttacattagatgcatacaaaacatcatacatgacatcatgcaaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggccctcgacaggggtaaggaacacgataaatgtttttaaagattggaatacga
gi|11 : gatcttcggtgcgctcttgttagccctttattgtttgttatgtatttttAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AATAA-GGGC---T----A-ACTTTCTC-CT-C-CC-GAT-CCC-GGAGGTTTTGA---A---T--GCA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TAT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATTG-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CAC-GAT--AAATGT--TTAAAT-TAA--AA--GATTGG-ATTACga
gi|12 : A---GC----AA----GGCCATAT----ATACTGCCTC-CT-C-T-------C--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCTA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CACTATAA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TAAATAAT-TTTA-GATGAG-----CC-C-CT-CGACAGGGATG--A----GGT-----------------A------TG--ATACATGCAAT-AG-AAA-CAC-GAT--AAATG---TT---T-TTA--AA--AATTGG-ATTACg
gi|13 : T--CATGTA---ACAC-TGCCTCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-C--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTTAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---ACAAT-AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-CTC--GATCCC--AGAGGTTT-GG---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--Tga
gi|14 : CGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAAA-G---GAA---AAT-A-AAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AATAT-A-ATTTAAT-T---AACATTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGATCAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TA
gi|15 : G-CTCAA-T---GT-TT--ACATTAA-TTGCAGGCA-CAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCTGA-T--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TACA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGAAA--A----GGT-----------------AAAAATGTA--A-------AAT-AG-AAA-CAT-GAT----TTG---TT---T-TTT--AA--GA
gi|16 : -CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG-A---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--TTCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-CCG-CTCT-AAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--
gi|17 : --TAC--------AAAACAA---AC----AATAA-GGGC---T----A-ACTGTCAC-CTCC-C--GATCCC--GGAGGTTT-GAACTA---T--GAA----TCTC-GCTA-CGC------TG--TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-A
gi|18 : TTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-TTAATA-GGT---ATA-ATCC-TCTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-GTGTG--TT---CA-T-TAATTTTG-AC-CTT-GTGTCCTC
gi|2 : ACTACTTGCATGGGCAGCAATATT-AACTAGATC--TATATACAAAGTCACGT----TTGT-TATGAAAAAGGCTGTA-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AAT-A-A-GGATCTGTAAC------ATAC-TTTAC---AAAAT-A-TTTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTTTGTGATA-GGCTAGATATATCC-TGTCAAAGAATAA-CACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTT--G-AC-CTT-GTGTCCTGTCGT--CG-C--TAGATCTAGTT--CATGAATGTAAACATGCCC-AGCGTTTC-TTTC----A-GTTTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGTTCT-CTCT-CAC-TG-TTAAA-----------ATTTCTTCAA-TA--T--AG-A-T-TT-TGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAA-AA---ACGAT-AA----GGGC---T------ACTGTCCT-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTCAGCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACT-AAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTC--GACGAG-----GC-T-CT-CGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CAC-GATTCATATG---TTGGAT-T
gi|20 : aagacaattgaagatatgatacaaatcacccttcccccgagggggtggttgtgtgtacgtgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatgtatgT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCCGGCCA-A-TTT---ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-TCCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-acgat
gi|21 : --GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-TATTGT-TT--ACACTA---------------TATCA-T-AC-ATGCCGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TA---A
gi|24 : ----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-A--CAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTAATGCA-AA-G
gi|26 : CACTACTTGCATGGGCAGCTAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTG
gi|3 : T--T-AACTAGAT---TATACA---AGTCACG-----TTGTATATGAAATAGGC--TA-TAT
gi|3 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactCAGTACAA-AT---AT-GTCAA-TGTTT-T-A----TGAAA--G---GAA---A-T-A-A-G-AT------C------AGAC-TTTACGT-AAAAT-T-ATTTAAT-T---AACACTTCAA-----GT-AAT-ATTTT-GTG-TA-GGT----TA-ATCT-GATCAAAGAATAAACACAAGTCGTTCA-CTGTG--TTGATCA-TCTAGTTTTG-AC-ATT-GTGTCCTCT-GT--CG-CACTCG------TT--CTAGTA---AA-C-TGCCCCAAGATTTC-GTCC----A-A-TTG---ATCGTGT--AAACAT--TT---GATAAGC-TG-TCG-CTCT-C-C-TG-TTAAAA---------T--TCCTTCAA-TA--T--AGTA-ACTT-CGA-TGCGGCTTCCTTGGTAATAA--TAC--------AAAACAA---AC----AAT---AGGC---T----A-ACTGTCTC-CTAC-T--GAT-CCCGGAAGGTTT-GA---C---T--GAA----T-TC-ACTG-CTC---T--GGT-TTTAACACTAA-ATG-AGACA--AA-ATCA-TTAC-ATGACGTCATGCACAA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-TGACAGGGATA--A----Gggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagacagtacaaatatgtcaatgttttatgaaaggaaataagatcagactttacgtaaaattatttaattaacacttcaagtaatattttgtgtaggttaatctgatcaaagaataaacacaagtcgttcactgtgttgatcatctagttttgacattgtgtcctctgtcgcactcgttctagtaaactgccccaagatttcgtccaattgatcgtgtaaacatttgataagctgtcgctctcctgttaaaattccttcaatatagtaacttcgatgcggcttccttggtaataatacaaaacaaacaataggctaactgtctcctactgatcccggaaggtttgactgaattcactgctctggttttaacactaaatgagacaaaatcattacatgacgtcatgcacaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggcccttgacagggataag
gi|4 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactttaactagattatacaagtcacgttgtatatgaaataggctatatggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagaTGCACTACTTGCATGGACAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----
gi|4 : ACAATAT-CCAT-GTC---TATTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAA-A-GAAT-----AC------AG-C-TTTAC-C-CAAAT-ATATTTAATATA--AACACTTCAAA---AAT---T-ATTTT-GTGATA-GGT---A-A-ATCT-GGTTAAAGAATAAACACA--TCGTTC---------------------GTTTAG-ACTCTTAGT-TCCTCTCGT--TGAC--TA-------TT--CATGTA---AAGC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A--TTT--ATCGTGTC-AAAC-CTATT---AATAAGT-TG-T---CTTC-CACTTGTTTAAAA---------TATTCC-TCAA-TA--T--A--A-TCTT-CGA-T--CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAAAACAT----AA----GAA---------A-ACTGTCTCGCT-C-CCAGATCCC--GGAGGTTT-GA---A---T--TGATAATTCTC-GCTG--TCCATT--TTT-TT--ACACTAGCATGCAGACAGCAACATCA-T-ACTATGAC-TC-TGCA-AA---GCCGT-C--ACTC--AT--TTCTA---AAT-TTCA-GACGAG-----G--C-CT-TGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TAAGA-----G-AAC-A--AAA-CACGGAT--AAATGTATTTAAAT-TTAACAA--GATTGG-ATTgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgacaatatccatgtctattatataaaaggaaaataaagaatacagctttacccaaatatatttaatataaacacttcaaaaattattttgtgataggtaaatctggttaaagaataaacacatcgttcgtttagactcttagttcctctcgttgactattcatgtaaagctgccccagcgtttcgtccaatttatcgtgtcaaacctattaataagttgtcttccacttgtttaaaatattcctcaatataatcttcgatcgctcttgtaaaaatacaaaacaaaacataagaaaactgtctcgctcccagatcccggaggtttgaattgataattctcgctgtccatttttttacactagcatgcagacagcaacatcatactatgactctgcaaagccgtcactcatttctaaatttcagacgaggccttgacaggataaggtataagagaacaaaacacggataaatgtatttaaatttaacaagattggattcg
gi|5 : tgcactacttgcatggacagcaattaactagatctatacaagtcacgtgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgTGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AA-TAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTAAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-G----TAAAA------------------A-GGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATT-AAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTATCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---ACAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTATAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCACT--CTTG-T-AAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GG---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AAA-CAC-G-T--TAATG---TTAAAA-TTA--AA--GATTGG-ATTACcg
gi|6 : TGCACAACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATCTATATACA---AGTCACTT----TTGT-TATGAAATAGGC--TG-TATa
gi|6 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttaGCGGTACAA-AT-C-AT-GTTA--TGTTAAT-A----TAAAA--G---GAA---AAT-A-AAGGAT-----ACTGTAACAGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-TTTTAAT-T---A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTT--GTGATA-GAT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-A-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCT--------C--TAG------TT--CATatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccgcggtacaaatcatgttatgttaatataaaaggaaaataaaggatactgtaacagactttaccaaaatattttaattacacttcaaaagtatatttgtgatagatataatcctgtcaaagaataaacacatcgttcactgtgttcaatagttttgaccttgtgtcctctctagttcat
gi|7 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttatgcacaacttgcatgggcagcaattaactagatctatatacaagtcacttttgttatgaaataggctgtatatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccTACAA-AT-C-ATAGTCAAATGTTA-TTA----TAAAAAAG---GAA---AAT-A-AAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-CAAATTA-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA-----T-A-TTATTTT-GTGATATGGT---ATACATC--TGTCAAAGAATAAAC-CA--TGGTTCAACTGTGGTCT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GT--CCTCT-GTAACG-C--TAG------TCTCCATGTA---AA-C-TGCCC-AGCGTTTCTGTCC----C-A-GTTT--GTCGCG------C-T--T-------------------CTCT--AC-TG-TTAAA----------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGATTGCGGCT--CTTG-TAAAAA---AC---------AAACAA---ACATA-AA----GGGT---TATTAA-ACTGTTTC-CT-CTC--GAT-CC---CAGGGTT-AA---A---TTGAAA----TCT--GCTGCCTCCA-T--TGTGTT--ACACTAG-ATGCAGG-A-C-GCATCACT-A--GTGACGTCAT-CA-AGTGAGCAGTAC--ACATCAAT--T--TA---AATGTTCATGACAAG-----GCAT-TT-CGACAGGGATA---------T-----------------A------------------AAC-AG-AAATTAC-GAT--AACTGTT-TTAAATATTA--AGATGATTGGAATTAC
gi|8 : TTACT-A----TAAAA--G---GAA---AAT-A-AAGGAT-----TC------A-AC-T--AC-C-AAA-T-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAC---A-T-A-T-AGTTT-GTGATA-GGT---ATG-ATCCTTGTT-TAGAATAAACACA--TCG--CA-CTGTG--TT---CATT-TAGTTTTGTAC-CTT-GTGTCCTCTCGT--TG-T--TA-------TT--CATGTA---AA---------------TC-G---------------------TGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATT-CTTC-A-TA--T--AG-A-TCTT-CGA--GACGCT--CTTG-Tga
gi|8 : G-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AATAACGGGC---T----A-ACtagcccgttattgtttgttttgtatttttactgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|8 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctctt-ACTGTC-C-CT-C-C--GAT-CC--G-AGG--------------------------C-GCTG-CTCCG-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-ACAATGACGTCAT-CG-AA-AGGCC-T-C--ACTTCAAT--T--T----ACT-CTCA-GACGAGT----GC-CTCT-CGACAGGGATAATA----GGT-----------------A------TA--A-------AAC-AGTAAA-tgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|9 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctcttgttagcccgttattgtttgttttgtatttttTC--ATCGTGTC-AATT-T--CTTC-AAT--GT-TG-TCG-CTCT-CAC-CT-CTCA----------------CTTCAA-TA--T-----G-TATT-TGC-TG-TGCT--CTTG-a
gi|9 : gTAG-TTGCAGACA-CAACA-------C-ATG---TCATGCA-AA-GGACCGC-T--ACTCCAAT--T--TA---AAG-TACA-TACGAG-----GC-C-CA-CGACAGGGA-A--A----AGTAAAAAAAAAACCATAAAA------TA--A-----A-AAC-AG-AAA-CAC-GAT--gtagcccttagtgtttcttttactattgaggtttaggctaatatctgacataatgtatagttgcagacacaacacatgtcatgcaaaggaccgctactccaatttaaagtacatacgaggcccacgacagggaaaagtaaaaaaaaaaccataaaataaaaacagaaacacgatttgttttctaagat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TAATATGTGATTTATTTTCTCGAGGACTATATGGTAGAAAATTATAAGATATGAATTTCATACAAATCCCCCCGGGGGTGGGTGGTGGTGTTTGGGTC
Unaligned ( gi|22 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATACGATTGAAGACAATTGAAGCTATGAATACAAA
Unaligned ( gi|23 ): TTGAACATATGGATACAAATCACCCCCTCCCCTGAAGGGTTGGTTGCGCGGTTGGGTCTAC
Unaligned ( gi|25 ): GATAATTGAAAATATGAATACAACCCCCCCCCCCCCCCGTGGGGGTGGTTGCGCGGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111 1111 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111111111111 111 1111111 111 111 1111111111 11 11111111 2222222222 11 1 11111 444444444444444444444444444444444444 111111 2222222222 11 11111
lowQualScore : 77 5 33 000 2222 88 11 11 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 666 5 11 8 4 9999 333333 777 0 1 3333333333333 4 666 4 4 4 111 777 4 4 4 4 4 777 8 4 66 4 66 777 555 5 4 4 2 8 66 5 66 6666666 55 111 7 4 2 4 8888 4 44 888 3 3 55 111 3 3 3 3 3 3 6666666666 3 55 55 4 4 4 4 22 66 3 55 33333333 555 9999999999 555 7777 2 3 6 6 11 0 77 3 7777777 44 6666 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 6 2 2 3 44 44 44 555 3 3 11111 3 3 3 44 7777 111111111111111111111111111111111111 3 3 000000 3 1111111111 55 00 11111 5 66 77 77 5 5
lowQualScore : .. . .. ... .... .. .. .. . ....................................................................................................................................... . ... . .. . . .... ...... ... . . ............. . ... . . . ... ... . . . . . ... . . .. . .. ... ... . . . . . .. . .. ....... .. ... . . . . .... . .. ... . . .. ... . . . . . . .......... . .. .. . . . . .. .. . .. ........ ... .......... ... .... . . . . .. . .. . ....... .. .... . . . .. . .. . . . . . . . . .. .. .. ... . . ..... . . . .. .... .................................... . . ...... . .......... .. .. ..... . .. .. .. . .
lowQualScore : 99 7 66 000 1111 88 88 00 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 222 0 99 9 4 4444 999999 888 8 9 2222222222222 4 222 4 4 0 000 000 0 0 0 0 4 888 9 4 11 4 11 888 444 0 4 4 9 8 99 0 99 9999999 55 000 2 0 5 0 5555 0 77 555 6 6 00 444 6 6 6 6 6 6 6666666666 6 00 55 0 4 4 4 33 11 6 00 22222222 888 9999999999 888 1111 9 3 7 7 22 0 99 3 9999999 22 1111 9 7 7 77 9 99 7 9 9 9 2 9 9 1 22 22 22 444 3 3 77777 3 3 3 66 1111 666666666666666666666666666666666666 6 6 555555 6 5555555555 55 66 44444 0 99 99 99 7 7
consensus : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
Reference ( family-2504 ) : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
gi|1 : TGCACTACTTGCATGCGCAGCAAT--TGAACTAGCTTA-TATACA---AGTCACGTTTCCTTGT---TGAA--AGGC--TAGTAT
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaaACAA-ATGC-AT-GTCA--TGTTA-T-AGTTGTGAGA--GAGAGAAGTGAGTAGAGGAT-----AC------AGACGTTTAC-CAAAAAT-A-ATTTAAG-TGTAGACACTTCAAAGAGAGTGA-T-ATTTT-GTGATtatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgTGTAT--GAAC-TGCCCCAGCGTTTC-TTCC----AGA-TTTTTGATCGTGTCCAAAC-T--CTTAAGATAAGGGTG-TCGGCTCTGCAT-GG-GTGAGAGAGGAGTGATGTCCGTGCAAGTAATTGAAG-AGTCTTTCGA-TGCGAGT--CTTG-TAAAAGATTACCAAGAATCAAGACAA---A-----AG----AGGC---T----A-ACTGTTTC-CT-C-CT-GAT-CC--GGAGGTTT-GG---AGGAT--GAA----TCTC-GATG-CTCCA----TGA-TT--ACACTAG-ATGctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagTGACGCAGTGCA-A---GGCCGT-CGTACTCCAGGGAT--TG---GAT-CTAG-GACGAGAGTTCGC-C-GTGCGACAGGGATG--AAGGAGGT-----------------A------TA--A-----G-AACGAG-AGGAGGGTA-CTCTAGTGCGAGTGAG--AAGTA--TTTAAAGT-TTG--AA--GAGGTGTGG-ATTACggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|10 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagG-TAAAAA--TAC--------ATAACAA---ACAATAAA----GGGC---T----A-ACga
gi|10 : gatcttcggtgcgctctt-ACTGTCTC-CT-C-C-------C--GGAGATTT-GA---G---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCATACA-AAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGGTA--A----GG---------------------------------------------A------A-CAC----------GAT--AAATG--TT-----T-TTA--AA--GA--T-TGG-AATACtgtctcctcccggagatttgagtgaatctcgctgctccattgtttacattagatgcatacaaaacatcatacatgacatcatgcaaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggccctcgacaggggtaaggaacacgataaatgtttttaaagattggaatacga
gi|11 : gatcttcggtgcgctcttgttagccctttattgtttgttatgtatttttAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AATAA-GGGC---T----A-ACTTTCTC-CT-C-CC-GAT-CCC-GGAGGTTTTGA---A---T--GCA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TAT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATTG-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TAA--AA--GA--T-TGG-ATTACga
gi|12 : A---GC----AA----GGCCATAT----ATACTGCCTC-CT-C-T-------C--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCTA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CACTATAA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TAAATAAT-TTTA-GATGAG-----CC-C-CT-CGACAGGGATG--A----GGT-----------------A------TG--ATACATGCAAT-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TT-----T-TTA--AA--AA--T-TGG-ATTACg
gi|13 : T--CATGTA---ACAC-TGCCTCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-C--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTTAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---ACAAT-AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-CTC--GATCCC--AGAGGTTT-GG---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--Tga
gi|14 : CGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAAA-G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AATAT-A-ATTTAAT-T---AACATTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGATCAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TA
gi|15 : G-CTCAA-T---GT-TT--ACATTAA-TTGCAGGCA-CAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCTGA-T--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TACA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGAAA--A----GGT-----------------AAAAATGTA--A-------AAT-AG-AA------A-CAT----------GAT----TTG--TTT----T-TTA--A
gi|16 : -CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG-A---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--TTCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-CCG-CTCT-AAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--ga
gi|17 : --TAC--------AAAACAA---AC----AATAA-GGGC---T----A-ACTGTCAC-CTCC-C--GATCCC--GGAGGTTT-GAACTA---T--GAA----TCTC-GCTA-CGC------TG--TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-A
gi|18 : TTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-TTAATA-GGT---ATA-ATCC-TCTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-GTGTG--TT---CA-T-TAATTTTG-AC-CTT-GTGTCCTC
gi|2 : ACTACTTGCATGGGCAGCAATATT-AACTAGATC--TATATACAAAGTCACGT----TTGT-TATGAAAAAGGCTGTA-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAA-GGATCTGTAAC------ATAC-TTTAC---AAAAT-A-TTTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTTTGTGATA-GGCTAGATATATCC-TGTCAAAGAATAA-CACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTT--G-AC-CTT-GTGTCCTGTCGT--CG-C--TAGATCTAGTT--CATGAATGTAAACATGCCC-AGCGTTTC-TTTC----A-GTTTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGTTCT-CTCT-CAC-TG-TTAAA-----------ATTTCTTCAA-TA--T--AG-A-T-TT-TGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAA-AA---ACGAT-AA----GGGC---T------ACTGTCCT-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTCAGCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACT-AAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTC--GACGAG-----GC-T-CT-CGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GATTCATATG--TT
gi|20 : aagacaattgaagatatgatacaaatcacccttcccccgagggggtggttgtgtgtacgtgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatgtatgT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCCGGCCA-A-TTT---ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-TCCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-ggattacgat
gi|21 : --GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-TATTGT-TT--ACACTA---------------TATCA-T-AC-ATGCCGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TA---A
gi|24 : ----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-A--CAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTAATGCA-AA-G
gi|26 : CACTACTTGCATGGGCAGCTAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTG
gi|3 : T--T-AACTAGAT---TATACA---AGTCACG-----TTGTATATGAAATAGGC--TA-TAT
gi|3 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactCAGTACAA-AT---AT-GTCAA-TGTTT-T-A----TGAAA--G---GAA---A-TAA--GAT------C------AGAC-TTTACGT-AAAAT-T-ATTTAAT-T---AACACTTCAA-----GT-AAT-ATTTT-GTG-TA-GGT----TA-ATCT-GATCAAAGAATAAACACAAGTCGTTCA-CTGTG--TTGATCA-TCTAGTTTTG-AC-ATT-GTGTCCTCT-GT--CG-CACTCG------TT--CTAGTA---AA-C-TGCCCCAAGATTTC-GTCC----A-A-TTG---ATCGTGT--AAACAT--TT---GATAAGC-TG-TCG-CTCT-C-C-TG-TTAAAA---------T--TCCTTCAA-TA--T--AGTA-ACTT-CGA-TGCGGCTTCCTTGGTAATAA--TAC--------AAAACAA---AC----AAT---AGGC---T----A-ACTGTCTC-CTAC-T--GAT-CCCGGAAGGTTT-GA---C---T--GAA----T-TC-ACTG-CTC---T--GGT-TTTAACACTAA-ATG-AGACA--AA-ATCA-TTAC-ATGACGTCATGCACAA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-TGACAGGGATA--A----Gggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagacagtacaaatatgtcaatgttttatgaaaggaaataagatcagactttacgtaaaattatttaattaacacttcaagtaatattttgtgtaggttaatctgatcaaagaataaacacaagtcgttcactgtgttgatcatctagttttgacattgtgtcctctgtcgcactcgttctagtaaactgccccaagatttcgtccaattgatcgtgtaaacatttgataagctgtcgctctcctgttaaaattccttcaatatagtaacttcgatgcggcttccttggtaataatacaaaacaaacaataggctaactgtctcctactgatcccggaaggtttgactgaattcactgctctggttttaacactaaatgagacaaaatcattacatgacgtcatgcacaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggcccttgacagggataag
gi|4 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactttaactagattatacaagtcacgttgtatatgaaataggctatatggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagaTGCACTACTTGCATGGACAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----
gi|4 : ACAATAT-CCAT-GTC---TATTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGAAT-----AC------AG-C-TTTAC-C-CAAAT-ATATTTAATATA--AACACTTCAAA---AAT---T-ATTTT-GTGATA-GGT---A-A-ATCT-GGTTAAAGAATAAACACA--TCGTTC---------------------GTTTAG-ACTCTTAGT-TCCTCTCGT--TGAC--TA-------TT--CATGTA---AAGC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A--TTT--ATCGTGTC-AAAC-CTATT---AATAAGT-TG-T---CTTC-CACTTGTTTAAAA---------TATTCC-TCAA-TA--T--A--A-TCTT-CGA-T--CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAAAACAT----AA----GAA---------A-ACTGTCTCGCT-C-CCAGATCCC--GGAGGTTT-GA---A---T--TGATAATTCTC-GCTG--TCCATT--TTT-TT--ACACTAGCATGCAGACAGCAACATCA-T-ACTATGAC-TC-TGCA-AA---GCCGT-C--ACTC--AT--TTCTA---AAT-TTCA-GACGAG-----G--C-CT-TGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TAAGA-----G-AAC-A--AA------A-CACG---------GAT--AAATGTATTTAAA-T-TTAACAA--GA--T-TGG-ATTgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgacaatatccatgtctattatataaaaggaaaataaagaatacagctttacccaaatatatttaatataaacacttcaaaaattattttgtgataggtaaatctggttaaagaataaacacatcgttcgtttagactcttagttcctctcgttgactattcatgtaaagctgccccagcgtttcgtccaatttatcgtgtcaaacctattaataagttgtcttccacttgtttaaaatattcctcaatataatcttcgatcgctcttgtaaaaatacaaaacaaaacataagaaaactgtctcgctcccagatcccggaggtttgaattgataattctcgctgtccatttttttacactagcatgcagacagcaacatcatactatgactctgcaaagccgtcactcatttctaaatttcagacgaggccttgacaggataaggtataagagaacaaaacacggataaatgtatttaaatttaacaagattggattcg
gi|5 : tgcactacttgcatggacagcaattaactagatctatacaagtcacgtgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgTGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AA-TAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTAAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-G----TAAAA-----------------AGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATT-AAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTATCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---ACAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTATAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCACT--CTTG-T-AAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GG---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------G-T--TAATG---TTAAA-A-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTACcg
gi|6 : TGCACAACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATCTATATACA---AGTCACTT----TTGT-TATGAAATAGGC--TG-TATa
gi|6 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttaGCGGTACAA-AT-C-AT-GTTA--TGTTAAT-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----ACTGTAACAGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-TTTTAAT-T---A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTT--GTGATA-GAT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-A-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCT--------C--TAG------TT--CATatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccgcggtacaaatcatgttatgttaatataaaaggaaaataaaggatactgtaacagactttaccaaaatattttaattacacttcaaaagtatatttgtgatagatataatcctgtcaaagaataaacacatcgttcactgtgttcaatagttttgaccttgtgtcctctctagttcat
gi|7 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttatgcacaacttgcatgggcagcaattaactagatctatatacaagtcacttttgttatgaaataggctgtatatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccTACAA-AT-C-ATAGTCAAATGTTA-TTA----TAAAAAAG---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-CAAATTA-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA-----T-A-TTATTTT-GTGATATGGT---ATACATC--TGTCAAAGAATAAAC-CA--TGGTTCAACTGTGGTCT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GT--CCTCT-GTAACG-C--TAG------TCTCCATGTA---AA-C-TGCCC-AGCGTTTCTGTCC----C-A-GTTT--GTCGCG------C-T--T-------------------CTCT--AC-TG-TTAAA----------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGATTGCGGCT--CTTG-TAAAAA---AC---------AAACAA---ACATA-AA----GGGT---TATTAA-ACTGTTTC-CT-CTC--GAT-CC---CAGGGTT-AA---A---TTGAAA----TCT--GCTGCCTCCA-T--TGTGTT--ACACTAG-ATGCAGG-A-C-GCATCACT-A--GTGACGTCAT-CA-AGTGAGCAGTAC--ACATCAAT--T--TA---AATGTTCATGACAAG-----GCAT-TT-CGACAGGGATA---------T-----------------A------------------AAC-AG-AA------ATTAC----------GAT--AACTGT-TTTAAA-TATTA--AGATGA--T-TGGAATTAC
gi|8 : TTACT-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----TC------A-AC-T--AC-C-AAA-T-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAC---A-T-A-T-AGTTT-GTGATA-GGT---ATG-ATCCTTGTT-TAGAATAAACACA--TCG--CA-CTGTG--TT---CATT-TAGTTTTGTAC-CTT-GTGTCCTCTCGT--TG-T--TA-------TT--CATGTA---AA---------------TC-G---------------------TGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATT-CTTC-A-TA--T--AG-A-TCTT-CGA--GACGCT--CTTG-Tga
gi|8 : G-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AATAACGGGC---T----A-ACtagcccgttattgtttgttttgtatttttactgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|8 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctctt-ACTGTC-C-CT-C-C--GAT-CC--G-AGG--------------------------C-GCTG-CTCCG-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-ACAATGACGTCAT-CG-AA-AGGCC-T-C--ACTTCAAT--T--T----ACT-CTCA-GACGAGT----GC-CTCT-CGACAGGGATAATA----GGT-----------------A------TA--A-------AAC-AGTAA------A-tgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|9 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctcttgttagcccgttattgtttgttttgtatttttTC--ATCGTGTC-AATT-T--CTTC-AAT--GT-TG-TCG-CTCT-CAC-CT-CTCA----------------CTTCAA-TA--T-----G-TATT-TGC-TG-TGCT--CTTG-a
gi|9 : gTAG-TTGCAGACA-CAACA-------C-ATG---TCATGCA-AA-GGACCGC-T--ACTCCAAT--T--TA---AAG-TACA-TACGAG-----GC-C-CA-CGACAGGGA-A--A----AGTAAAAAAAAAACCATAAAA------TA--A-----A-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--gtagcccttagtgtttcttttactattgaggtttaggctaatatctgacataatgtatagttgcagacacaacacatgtcatgcaaaggaccgctactccaatttaaagtacatacgaggcccacgacagggaaaagtaaaaaaaaaaccataaaataaaaacagaaacacgatttgttttctaagat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TAATATGTGATTTATTTTCTCGAGGACTATATGGTAGAAAATTATAAGATATGAATTTCATACAAATCCCCCCGGGGGTGGGTGGTGGTGTTTGGGTC
Unaligned ( gi|22 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATACGATTGAAGACAATTGAAGCTATGAATACAAA
Unaligned ( gi|23 ): TTGAACATATGGATACAAATCACCCCCTCCCCTGAAGGGTTGGTTGCGCGGTTGGGTCTAC
Unaligned ( gi|25 ): GATAATTGAAAATATGAATACAACCCCCCCCCCCCCCCGTGGGGGTGGTTGCGCGGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111 1111 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111111111111 111 1111111 111 111 1111111111 11 11111111 2222222222 11 1 11111 444444444444444444444444444444444444 111111 2222222222 11 11111
lowQualScore : 77 5 33 000 2222 88 11 11 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 666 5 11 8 4 9999 333333 777 0 1 3333333333333 4 666 4 4 4 111 777 4 4 4 4 4 777 8 4 66 4 66 777 555 5 4 4 2 8 66 5 66 6666666 55 111 7 4 2 4 8888 4 44 888 3 3 55 111 3 3 3 3 3 3 6666666666 3 55 55 4 4 4 4 22 66 3 55 33333333 555 9999999999 555 7777 2 3 6 6 11 0 77 3 7777777 44 6666 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 6 2 2 3 44 44 44 555 3 3 11111 3 3 3 44 7777 111111111111111111111111111111111111 3 3 000000 3 1111111111 55 00 11111 5 66 77 77 5 5
lowQualScore : .. . .. ... .... .. .. .. . ....................................................................................................................................... . ... . .. . . .... ...... ... . . ............. . ... . . . ... ... . . . . . ... . . .. . .. ... ... . . . . . .. . .. ....... .. ... . . . . .... . .. ... . . .. ... . . . . . . .......... . .. .. . . . . .. .. . .. ........ ... .......... ... .... . . . . .. . .. . ....... .. .... . . . .. . .. . . . . . . . . .. .. .. ... . . ..... . . . .. .... .................................... . . ...... . .......... .. .. ..... . .. .. .. . .
lowQualScore : 99 7 66 000 1111 88 88 00 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 222 0 99 9 4 4444 999999 888 8 9 2222222222222 4 222 4 4 0 000 000 0 0 0 0 4 888 9 4 11 4 11 888 444 0 4 4 9 8 99 0 99 9999999 55 000 2 0 5 0 5555 0 77 555 6 6 00 444 6 6 6 6 6 6 6666666666 6 00 55 0 4 4 4 33 11 6 00 22222222 888 9999999999 888 1111 9 3 7 7 22 0 99 3 9999999 22 1111 9 7 7 77 9 99 7 9 9 9 2 9 9 1 22 22 22 444 3 3 77777 3 3 3 66 1111 666666666666666666666666666666666666 6 6 555555 6 5555555555 55 66 44444 0 99 99 99 7 7
consensus : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
Reference ( family-2504 ) : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
gi|1 : TGCACTACTTGCATGCGCAGCAAT--TGAACTAGCTTA-TATACA---AGTCACGTTTCCTTGT---TGAA--AGGC--TAGTAT
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaaACAA-ATGC-AT-GTCA--TGTTA-T-AGTTGTGAGA--GAGAGAAGTGAGTAGAGGAT-----AC------AGACGTTTAC-CAAAAAT-A-ATTTAAG-TGTAGACACTTCAAAGAGAGTGA-T-ATTTT-GTGATtatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgTGTAT--GAAC-TGCCCCAGCGTTTC-TTCC----AGA-TTTTTGATCGTGTCCAAAC-T--CTTAAGATAAGGGTG-TCGGCTCTGCAT-GG-GTGAGAGAGGAGTGATGTCCGTGCAAGTAATTGAAG-AGTCTTTCGA-TGCGAGT--CTTG-TAAAAGATTACCAAGAATCAAGACAA---A-----AG----AGGC---T----A-ACTGTTTC-CT-C-CT-GAT-CC--GGAGGTTT-GG---AGGAT--GAA----TCTC-GATG-CTCCA----TGA-TT--ACACTAG-ATGctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagTGACGCAGTGCA-A---GGCCGT-CGTACTCCAGGGAT--TG---GAT-CTAG-GACGAGAGTTCGC-C-GTGCGACAGGGATG--AAGGAGGT-----------------A------TA--A-----G-AACGAG-AGGAGGGTA-CTCTAGTGCGAGTGAG--AAGTA--TTTAAAGT-TTG--AA--GAGGTGTGG-ATTACggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|10 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagG-TAAAAA--TAC--------ATAACAA---ACAATAAA----GGGC---T----A-ACga
gi|10 : gatcttcggtgcgctctt-ACTGTCTC-CT-C-C-------C--GGAGATTT-GA---G---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCATACA-AAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGGTA--A----GG---------------------------------------------A------A-CAC----------GAT--AAATG--TT-----T-TTA--AA--GA--T-TGG-AATACtgtctcctcccggagatttgagtgaatctcgctgctccattgtttacattagatgcatacaaaacatcatacatgacatcatgcaaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggccctcgacaggggtaaggaacacgataaatgtttttaaagattggaatacga
gi|11 : gatcttcggtgcgctcttgttagccctttattgtttgttatgtatttttAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AATAA-GGGC---T----A-ACTTTCTC-CT-C-CC-GAT-CCC-GGAGGTTTTGA---A---T--GCA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TAT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATTG-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TAA--AA--GA--T-TGG-ATTACga
gi|12 : A---GC----AA----GGCCATAT----ATACTGCCTC-CT-C-T-------C--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCTA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CACTATAA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TAAATAAT-TTTA-GATGAG-----CC-C-CT-CGACAGGGATG--A----GGT-----------------A------TG--ATACATGCAAT-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TT-----T-TTA--AA--AA--T-TGG-ATTACg
gi|13 : T--CATGTA---ACAC-TGCCTCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-C--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTTAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---ACAAT-AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-CTC--GATCCC--AGAGGTTT-GG---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--Tga
gi|14 : CGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAAA-G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AATAT-A-ATTTAAT-T---AACATTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGATCAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TA
gi|15 : G-CTCAA-T---GT-TT--ACATTAA-TTGCAGGCA-CAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCTGA-T--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TACA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGAAA--A----GGT-----------------AAAAATGTA--A-------AAT-AG-AA------A-CAT----------GAT----TTG--TTT----T-TTA--A
gi|16 : -CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG-A---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--TTCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-CCG-CTCT-AAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--ga
gi|17 : --TAC--------AAAACAA---AC----AATAA-GGGC---T----A-ACTGTCAC-CTCC-C--GATCCC--GGAGGTTT-GAACTA---T--GAA----TCTC-GCTA-CGC------TG--TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-A
gi|18 : TTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-TTAATA-GGT---ATA-ATCC-TCTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-GTGTG--TT---CA-T-TAATTTTG-AC-CTT-GTGTCCTC
gi|2 : ACTACTTGCATGGGCAGCAATATT-AACTAGATC--TATATACAAAGTCACGT----TTGT-TATGAAAAAGGCTGTA-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAA-GGATCTGTAAC------ATAC-TTTAC---AAAAT-A-TTTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTTTGTGATA-GGCTAGATATATCC-TGTCAAAGAATAA-CACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTT--G-AC-CTT-GTGTCCTGTCGT--CG-C--TAGATCTAGTT--CATGAATGTAAACATGCCC-AGCGTTTC-TTTC----A-GTTTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGTTCT-CTCT-CAC-TG-TTAAA-----------ATTTCTTCAA-TA--T--AG-A-T-TT-TGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAA-AA---ACGAT-AA----GGGC---T------ACTGTCCT-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTCAGCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACT-AAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTC--GACGAG-----GC-T-CT-CGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GATTCATATG--TT
gi|20 : aagacaattgaagatatgatacaaatcacccttcccccgagggggtggttgtgtgtacgtgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatgtatgT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCCGGCCA-A-TTT---ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-TCCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-ggattacgat
gi|21 : --GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-TATTGT-TT--ACACTA---------------TATCA-T-AC-ATGCCGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TA---A
gi|24 : ----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-A--CAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTAATGCA-AA-G
gi|26 : CACTACTTGCATGGGCAGCTAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTG
gi|3 : T--T-AACTAGAT---TATACA---AGTCACG-----TTGTATATGAAATAGGC--TA-TAT
gi|3 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactCAGTACAA-AT---AT-GTCAA-TGTTT-T-A----TGAAA--G---GAA---A-TAA--GAT------C------AGAC-TTTACGT-AAAAT-T-ATTTAAT-T---AACACTTCAA-----GT-AAT-ATTTT-GTG-TA-GGT----TA-ATCT-GATCAAAGAATAAACACAAGTCGTTCA-CTGTG--TTGATCA-TCTAGTTTTG-AC-ATT-GTGTCCTCT-GT--CG-CACTCG------TT--CTAGTA---AA-C-TGCCCCAAGATTTC-GTCC----A-A-TTG---ATCGTGT--AAACAT--TT---GATAAGC-TG-TCG-CTCT-C-C-TG-TTAAAA---------T--TCCTTCAA-TA--T--AGTA-ACTT-CGA-TGCGGCTTCCTTGGTAATAA--TAC--------AAAACAA---AC----AAT---AGGC---T----A-ACTGTCTC-CTAC-T--GAT-CCCGGAAGGTTT-GA---C---T--GAA----T-TC-ACTG-CTC---T--GGT-TTTAACACTAA-ATG-AGACA--AA-ATCA-TTAC-ATGACGTCATGCACAA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-TGACAGGGATA--A----Gggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagacagtacaaatatgtcaatgttttatgaaaggaaataagatcagactttacgtaaaattatttaattaacacttcaagtaatattttgtgtaggttaatctgatcaaagaataaacacaagtcgttcactgtgttgatcatctagttttgacattgtgtcctctgtcgcactcgttctagtaaactgccccaagatttcgtccaattgatcgtgtaaacatttgataagctgtcgctctcctgttaaaattccttcaatatagtaacttcgatgcggcttccttggtaataatacaaaacaaacaataggctaactgtctcctactgatcccggaaggtttgactgaattcactgctctggttttaacactaaatgagacaaaatcattacatgacgtcatgcacaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggcccttgacagggataag
gi|4 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactttaactagattatacaagtcacgttgtatatgaaataggctatatggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagaTGCACTACTTGCATGGACAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----
gi|4 : ACAATAT-CCAT-GTC---TATTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGAAT-----AC------AG-C-TTTAC-C-CAAAT-ATATTTAATATA--AACACTTCAAA---AAT---T-ATTTT-GTGATA-GGT---A-A-ATCT-GGTTAAAGAATAAACACA--TCGTTC---------------------GTTTAG-ACTCTTAGT-TCCTCTCGT--TGAC--TA-------TT--CATGTA---AAGC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A--TTT--ATCGTGTC-AAAC-CTATT---AATAAGT-TG-T---CTTC-CACTTGTTTAAAA---------TATTCC-TCAA-TA--T--A--A-TCTT-CGA-T--CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAAAACAT----AA----GAA---------A-ACTGTCTCGCT-C-CCAGATCCC--GGAGGTTT-GA---A---T--TGATAATTCTC-GCTG--TCCATT--TTT-TT--ACACTAGCATGCAGACAGCAACATCA-T-ACTATGAC-TC-TGCA-AA---GCCGT-C--ACTC--AT--TTCTA---AAT-TTCA-GACGAG-----G--C-CT-TGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TAAGA-----G-AAC-A--AA------A-CACG---------GAT--AAATGTATTTAAA-T-TTAACAA--GA--T-TGG-ATTgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgacaatatccatgtctattatataaaaggaaaataaagaatacagctttacccaaatatatttaatataaacacttcaaaaattattttgtgataggtaaatctggttaaagaataaacacatcgttcgtttagactcttagttcctctcgttgactattcatgtaaagctgccccagcgtttcgtccaatttatcgtgtcaaacctattaataagttgtcttccacttgtttaaaatattcctcaatataatcttcgatcgctcttgtaaaaatacaaaacaaaacataagaaaactgtctcgctcccagatcccggaggtttgaattgataattctcgctgtccatttttttacactagcatgcagacagcaacatcatactatgactctgcaaagccgtcactcatttctaaatttcagacgaggccttgacaggataaggtataagagaacaaaacacggataaatgtatttaaatttaacaagattggattcg
gi|5 : tgcactacttgcatggacagcaattaactagatctatacaagtcacgtgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgTGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AA-TAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTAAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-G----TAAAA-----------------AGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATT-AAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTATCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---ACAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTATAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCACT--CTTG-T-AAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GG---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------G-T--TAATG---TTAAA-A-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTACcg
gi|6 : TGCACAACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATCTATATACA---AGTCACTT----TTGT-TATGAAATAGGC--TG-TATa
gi|6 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttaGCGGTACAA-AT-C-AT-GTTA--TGTTAAT-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----ACTGTAACAGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-TTTTAAT-T---A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTT--GTGATA-GAT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-A-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCT--------C--TAG------TT--CATatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccgcggtacaaatcatgttatgttaatataaaaggaaaataaaggatactgtaacagactttaccaaaatattttaattacacttcaaaagtatatttgtgatagatataatcctgtcaaagaataaacacatcgttcactgtgttcaatagttttgaccttgtgtcctctctagttcat
gi|7 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttatgcacaacttgcatgggcagcaattaactagatctatatacaagtcacttttgttatgaaataggctgtatatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccTACAA-AT-C-ATAGTCAAATGTTA-TTA----TAAAAAAG---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-CAAATTA-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA-----T-A-TTATTTT-GTGATATGGT---ATACATC--TGTCAAAGAATAAAC-CA--TGGTTCAACTGTGGTCT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GT--CCTCT-GTAACG-C--TAG------TCTCCATGTA---AA-C-TGCCC-AGCGTTTCTGTCC----C-A-GTTT--GTCGCG------C-T--T-------------------CTCT--AC-TG-TTAAA----------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGATTGCGGCT--CTTG-TAAAAA---AC---------AAACAA---ACATA-AA----GGGT---TATTAA-ACTGTTTC-CT-CTC--GAT-CC---CAGGGTT-AA---A---TTGAAA----TCT--GCTGCCTCCA-T--TGTGTT--ACACTAG-ATGCAGG-A-C-GCATCACT-A--GTGACGTCAT-CA-AGTGAGCAGTAC--ACATCAAT--T--TA---AATGTTCATGACAAG-----GCAT-TT-CGACAGGGATA---------T-----------------A------------------AAC-AG-AA------ATTAC----------GAT--AACTGT-TTTAAA-TATTA--AGATGA--T-TGGAATTAC
gi|8 : TTACT-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----TC------A-AC-T--AC-C-AAA-T-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAC---A-T-A-T-AGTTT-GTGATA-GGT---ATG-ATCCTTGTT-TAGAATAAACACA--TCG--CA-CTGTG--TT---CATT-TAGTTTTGTAC-CTT-GTGTCCTCTCGT--TG-T--TA-------TT--CATGTA---AA---------------TC-G---------------------TGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATT-CTTC-A-TA--T--AG-A-TCTT-CGA--GACGCT--CTTG-Tga
gi|8 : G-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AATAACGGGC---T----A-ACtagcccgttattgtttgttttgtatttttactgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|8 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctctt-ACTGTC-C-CT-C-C--GAT-CC--G-AGG--------------------------C-GCTG-CTCCG-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-ACAATGACGTCAT-CG-AA-AGGCC-T-C--ACTTCAAT--T--T----ACT-CTCA-GACGAGT----GC-CTCT-CGACAGGGATAATA----GGT-----------------A------TA--A-------AAC-AGTAA------A-tgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|9 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctcttgttagcccgttattgtttgttttgtatttttTC--ATCGTGTC-AATT-T--CTTC-AAT--GT-TG-TCG-CTCT-CAC-CT-CTCA----------------CTTCAA-TA--T-----G-TATT-TGC-TG-TGCT--CTTG-a
gi|9 : gTAG-TTGCAGACA-CAACA-------C-ATG---TCATGCA-AA-GGACCGC-T--ACTCCAAT--T--TA---AAG-TACA-TACGAG-----GC-C-CA-CGACAGGGA-A--A----AGTAAAAAAAAAACCATAAAA------TA--A-----A-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--gtagcccttagtgtttcttttactattgaggtttaggctaatatctgacataatgtatagttgcagacacaacacatgtcatgcaaaggaccgctactccaatttaaagtacatacgaggcccacgacagggaaaagtaaaaaaaaaaccataaaataaaaacagaaacacgatttgttttctaagat
blockSeqs : AT . TA CAA . AT AA TG . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T CC A AA A T . AAG . A ACTGTAAC . GT T T A A . . A T T T TAG T T AG A GT GAT TC T T A G C AA A AC GATCTAG TC TGT A A C T GGCC . TT T . A TA TC . T . . T T A . . . T . . T CG TC G . . AAC AATAAA ATA ATTA T G C T CA C CG T ACTA TG TAAT A C T AT G TA C G C T T C T A . . TC AAT G T T A T . AT . AAAAAAAAAACCATAAAATAAA . T . T G TC TA TAAA A AC AT . . A
blockSeqs : . . . . . T AT . . . C . A C . . AG . A CTGTAAC . C . . . . . . . . . . . C . . . . . TT . . . G C . . . G . . A . C . . . T T . . . . . . . . . . A . . . . . . . CC . . . . . AATAAC . . . . A T C C C . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . ATGATACATGC . . . . . . T TAAA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T AT . . . C . . . . . G . A AC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G C . . . G . . A . C . . . T T . . . . . . . . . . A . . . . . . . CG . . . . . AATAA . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAAAATGTAA . . . . . . . TAAA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T AT . . . C . . . . . G . A AC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A C . . . G . . A . C . . . T T . . . . . . . . . . A . . . . . . . AC . . . . . AATAA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAAGAG . . . . . . . TAAA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . G . A AC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . G . . G . C . . . T T . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . AATAA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAAG . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . G . A AC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . A . C . . . T T . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . GATAA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAAG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . TC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . ATAAA . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAAG . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AAT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : ** **** T* AT C** **** G***** *** C** *** *** *** T** *** A********* ** ** ** ******** AATAA***** ** A****** ** ** ***** **** ****** ********** TAAA* **
originalCons : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---AC----AA----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GA---A---T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
finalCons : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGTT-ATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-ATC--AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAAG-----GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTACC--AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TG-TCG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--------AAAACAA---ACAATAA-----GGGC---T----A-ACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT-GAA------T--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TAATATGTGATTTATTTTCTCGAGGACTATATGGTAGAAAATTATAAGATATGAATTTCATACAAATCCCCCCGGGGGTGGGTGGTGGTGTTTGGGTC
Unaligned ( gi|22 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATACGATTGAAGACAATTGAAGCTATGAATACAAA
Unaligned ( gi|23 ): TTGAACATATGGATACAAATCACCCCCTCCCCTGAAGGGTTGGTTGCGCGGTTGGGTCTAC
Unaligned ( gi|25 ): GATAATTGAAAATATGAATACAACCCCCCCCCCCCCCCGTGGGGGTGGTTGCGCGGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111 1111 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111111111111 111 1111111 111 111 111 111111111 11 11 1 11111 444444444444444444444444444444444444 111111 2222222222 11 11111
lowQualScore : 77 5 33 000 2222 88 11 11 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 666 5 11 8 4 9999 333333 777 0 1 3333333333333 4 666 4 4 4 111 777 4 4 4 4 4 777 8 4 66 4 66 777 555 5 4 4 2 8 66 5 66 6666666 55 111 7 4 2 4 8888 4 0 222 3 3 55 111 3 3 3 3 3 3 444444444 3 3 55 55 4 4 4 4 22 66 3 55 55 3 3 3 3 7777 3 6 6 11 0 77 999 555 44 6666 2 2 2 33 2 33 2 2 2 2 6 2 2 3 44 44 44 555 3 3 11111 3 3 3 44 7777 111111111111111111111111111111111111 3 3 000000 3 1111111111 55 00 11111 5 66 77 77 5 5
lowQualScore : .. . .. ... .... .. .. .. . ....................................................................................................................................... . ... . .. . . .... ...... ... . . ............. . ... . . . ... ... . . . . . ... . . .. . .. ... ... . . . . . .. . .. ....... .. ... . . . . .... . . ... . . .. ... . . . . . . ......... . . .. .. . . . . .. .. . .. .. . . . . .... . . . .. . .. ... ... .. .... . . . .. . .. . . . . . . . . .. .. .. ... . . ..... . . . .. .... .................................... . . ...... . .......... .. .. ..... . .. .. .. . .
lowQualScore : 99 7 66 000 1111 88 88 00 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 222 0 99 9 4 4444 999999 888 8 9 2222222222222 4 222 4 4 0 000 000 0 0 0 0 4 888 9 4 11 4 11 888 444 0 4 4 9 8 99 0 99 9999999 55 000 2 0 5 0 5555 0 7 111 6 6 00 444 6 6 6 6 6 6 555555555 5 6 00 55 0 4 4 4 33 11 6 00 00 6 6 6 6 7777 3 7 7 22 0 99 222 888 22 1111 9 7 7 77 9 99 7 9 9 9 2 9 9 1 22 22 22 444 3 3 77777 3 3 3 66 1111 666666666666666666666666666666666666 6 6 555555 6 5555555555 55 66 44444 0 99 99 99 7 7
consensus : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGT-CG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--AAAA-CAA-ACAAT-AA-GGGCT----AACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT---GA---AT--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
Reference ( family-2504 ) : TGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGT-CG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--AAAA-CAA-ACAAT-AA-GGGCT----AACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT---GA---AT--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTAC
gi|1 : TGCACTACTTGCATGCGCAGCAAT--TGAACTAGCTTA-TATACA---AGTCACGTTTCCTTGT---TGAA--AGGC--TAGTAT
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaaACAA-ATGC-AT-GTCA--TGTTA-T-AGTTGTGAGA--GAGAGAAGTGAGTAGAGGAT-----AC------AGACGTTTAC-CAAAAAT-A-ATTTAAG-TGTAGACACTTCAAAGAGAGTGA-T-ATTTT-GTGATtatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgTGTAT--GAAC-TGCCCCAGCGTTTC-TTCC----AGATTTTTGATCGTGTCCAAAC-T--CTTAAGATAAGGGTGT-CGGCTCTGCAT-GG-GTGAGAGAGGAGTGATGTCCGTGCAAGTAATTGAAG-AGTCTTTCGA-TGCGAGT--CTTG-TAAAAGATTACCAAGAATCAAGACAAA-AG-AGGCT----AACTGTTTC-CT-C-CT-GAT-CC--GGAGGTTTGGAGG---AT--GAA----TCTC-GATG-CTCCA----TGA-TT--ACACTAG-ATGctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|1 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagTGACGCAGTGCA-A---GGCCGT-CGTACTCCAGGGAT--TG---GAT-CTAG-GACGAGAGTTCGC-C-GTGCGACAGGGATG--AAGGAGGT-----------------A------TA--A-----G-AACGAG-AGGAGGGTA-CTCTAGTGCGAGTGAG--AAGTA--TTTAAAGT-TTG--AA--GAGGTGTGG-ATTACggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagtgacgcagtgcaaggccgtcgtactccagggattggatctaggacgagagttcgccgtgcgacagggatgaaggaggtataagaacgagaggagggtactctagtgcgagtgagaagtatttaaagtttgaagaggtgtggattacga
gi|10 : atttgaagacaatgaagatagaatacaaatcaccccttcccgccgaagggggtgtgttggtgccggtgggtctagcatgttttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngagataacctttattcccttggaattctccctaataaaattgttataatcatgaaatgtattgatgacaatgcactacttgcatgcgcagcaattgaactagcttatatacaagtcacgtttccttgttgaaaggctagtattatgttcacagaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntggccatgagattgaacaacaacaacacaacaacaaccacaacccacaaccccccccccccgtgacaaatgcatgtcatgttatagttgtgagagagagaagtgagtagaggatacagacgtttaccaaaaataatttaagtgtagacacttcaaagagagtgatattttgtgatctgtgatacgagtatagatcccattgcatcgtgtgatgggggagttgtgtggagcgttgggtgtgcgctggctcgtgggtcggtgcgtgagtgcgagtgtatgaactgccccagcgtttcttccagatttttgatcgtgtccaaactcttaagataagggtgtcggctctgcatgggtgagagaggagtgatgtccgtgcaagtaattgaagagtctttcgatgcgagtcttgtaaaagattaccaagaatcaagacaaaagaggctaactgtttcctcctgatccggaggtttggaggatgaatctcgatgctccatgattacactagatgggctgcgaggcgaaggcgagtggcgagtaggagG-TAAAAA--TAC--ATAA-CAA-ACAATAAA-GGGCT----AACga
gi|10 : gatcttcggtgcgctcttACTGTCTC-CT-C-C-------C--GGAGATTT---GA---GT--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCATACA-AAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGGTA--A----GG---------------------------------------------A------A-CAC----------GAT--AAATG--TT-----T-TTA--AA--GA--T-TGG-AATACtgtctcctcccggagatttgagtgaatctcgctgctccattgtttacattagatgcatacaaaacatcatacatgacatcatgcaaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggccctcgacaggggtaaggaacacgataaatgtttttaaagattggaatacga
gi|11 : gatcttcggtgcgctcttgttagccctttattgtttgttatgtatttttAAA--TAC--AAAA-CAA-ACAAT-AA-GGGCT----AACTTTCTC-CT-C-CC-GAT-CCC-GGAGGTTTT--GA---AT--GCA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TAT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATTG-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TTTAAA-T-TAA--AA--GA--T-TGG-ATTACga
gi|12 : ACTGCCTC-CT-C-T-------C--GGAGGTTT---GA---AT--GAA----TCTC-GCTG-CTCTA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CACTATAA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TAAATAAT-TTTA-GATGAG-----CC-C-CT-CGACAGGGATG--A----GGT-----------------A------TG--ATACATGCAAT-AG-AA------A-CAC----------GAT--AAATG--TT-----T-TTA--AA--AA--T-TGG-ATTACg
gi|13 : agcaaggccatatatT--CATGTA---ACAC-TGCCTCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-C--CT---AATAAGT-TGT-CG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTTAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TG-CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--AAAA-CAA-ACAAT-AA-GGGCT----AACTGTCTC-CT-CTC--GATCCC--AGAGGTTT---GG---AT--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--Tga
gi|14 : CGGTACAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAAA-G---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AATAT-A-ATTTAAT-T---AACATTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGATCAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TA
gi|15 : G-CTCAA-T---GT-TT--ACATTAA-TTGCAGGCA-CAACATCA-T-AC-ATGACATCATGCA-AA-GGGCTGA-T--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TACA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGAAA--A----GGT-----------------AAAAATGTA--A-------AAT-AG-AA------A-CAT----------GAT----TTG--TTT----T-TTA--A
gi|16 : -CTT-GTGTCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATG-A---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--TTCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGC-CG-CTCT-AAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--ga
gi|17 : --TAC--AAAA-CAA-ACAAT-AA-GGGCT----AACTGTCAC-CTCC-C--GATCCC--GGAGGTTT---GAACTAT--GAA----TCTC-GCTA-CGC------TG--TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-A
gi|18 : TTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-TTAATA-GGT---ATA-ATCC-TCTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-GTGTG--TT---CA-T-TAATTTTG-AC-CTT-GTGTCCTC
gi|2 : ACTACTTGCATGGGCAGCAATATT-AACTAGATC--TATATACAAAGTCACGT----TTGT-TATGAAAAAGGCTGTA-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAA-GGATCTGTAAC------ATAC-TTTAC---AAAAT-A-TTTTAAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTTTGTGATA-GGCTAGATATATCC-TGTCAAAGAATAA-CACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTT--G-AC-CTT-GTGTCCTGTCGT--CG-C--TAGATCTAGTT--CATGAATGTAAACATGCCC-AGCGTTTC-TTTC----A-GTTTTT-ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGTTCT-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------T--TTCTTCAA-TA--T--AG-A-TTTT--GA-TGC-GCT--CTTG-TAAAAA--TAC--AAAA--AA-ACGAT-AA-GGGCT----A-CTGTCCT-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT---GA---AT--GAA----TCTCAGCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACT-AAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTC--GACGAG-----GC-T-CT-CGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------GATTCATATG--TT
gi|20 : aagacaattgaagatatgatacaaatcacccttcccccgagggggtggttgtgtgtacgtgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatgtatgT--CATGTA---AAAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCCGGCCA-ATTT---ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGT-CG-TCCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-ggattacgat
gi|21 : --GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-TATTGT-TT--ACACTA---------------TATCA-T-AC-ATGCCGTCATGCA-AA-GGGCCGC-C--ACTCCAAT--T--TA---A
gi|24 : ----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACACTAG-A--CAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTAATGCA-AA-G
gi|26 : CACTACTTGCATGGGCAGCTAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTG
gi|3 : T--T-AACTAGAT---TATACA---AGTCACG-----TTGTATATGAAATAGGC--TA-TAT
gi|3 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactCAGTACAA-AT---AT-GTCAA-TGTTT-T-A----TGAAA--G---GAA---A-TAA--GAT------C------AGAC-TTTACGT-AAAAT-T-ATTTAAT-T---AACACTTCAA-----GT-AAT-ATTTT-GTG-TA-GGT----TA-ATCT-GATCAAAGAATAAACACAAGTCGTTCA-CTGTG--TTGATCA-TCTAGTTTTG-AC-ATT-GTGTCCTCT-GT--CG-CACTCG------TT--CTAGTA---AA-C-TGCCCCAAGATTTC-GTCC----A-ATTG---ATCGTGT--AAACAT--TT---GATAAGC-TGT-CG-CTCT-C-C-TG-TTAAAA---------T--TCCTTCAA-TA--T--AGTA-ACTT-CGA-TGCGGCTTCCTTGGTAATAA--TAC--AAAA-CAA-ACAAT-A---GGCT----AACTGTCTC-CTAC-T--GAT-CCCGGAAGGTTT---GA---CT--GAA----T-TC-ACTG-CTC---T--GGT-TTTAACACTAA-ATG-AGACA--AA-ATCA-TTAC-ATGACGTCATGCACAA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GACGAG-----GC-C-CT-TGACAGGGATA--A----Gggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagacagtacaaatatgtcaatgttttatgaaaggaaataagatcagactttacgtaaaattatttaattaacacttcaagtaatattttgtgtaggttaatctgatcaaagaataaacacaagtcgttcactgtgttgatcatctagttttgacattgtgtcctctgtcgcactcgttctagtaaactgccccaagatttcgtccaattgatcgtgtaaacatttgataagctgtcgctctcctgttaaaattccttcaatatagtaacttcgatgcggcttccttggtaataatacaaaacaaacaataggctaactgtctcctactgatcccggaaggtttgactgaattcactgctctggttttaacactaaatgagacaaaatcattacatgacgtcatgcacaagggccgtcactccaatttaaatttcagacgaggcccttgacagggataag
gi|4 : ttgaagacatttgaaagatatgaatacaaatcaccccttctcccgagggggtggttgtgcggtttggggttaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacttttctccgttggaattcattcctctaataaaatatattttgacatatatgacactactttaactagattatacaagtcacgttgtatatgaaataggctatatggttcaacagaaaagtatgatgagtatggtttaataacaataatggtatattaatgagggaaattgatgtttgaaaatatcactacacggctgtatcgctataagttgagcccatagagcccacagaTGCACTACTTGCATGGACAGCAAT--T-AACTAGATC--TATACA---AGTCACGT----
gi|4 : ACAATAT-CCAT-GTC---TATTA-T-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGAAT-----AC------AG-C-TTTAC-C-CAAAT-ATATTTAATATA--AACACTTCAAA---AAT---T-ATTTT-GTGATA-GGT---A-A-ATCT-GGTTAAAGAATAAACACA--TCGTTC---------------------GTTTAG-ACTCTTAGT-TCCTCTCGT--TGAC--TA-------TT--CATGTA---AAGC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-A-TTT--ATCGTGTC-AAAC-CTATT---AATAAGT-TGT----CTTC-CACTTGTTTAAAA---------TATTCC-TCAA-TA--T--A--A-TCTT-CGA-T--CGCT--CTTG-TAAAAA--TAC--AAAA-CAA-AACAT-AA-GAA------AACTGTCTCGCT-C-CCAGATCCC--GGAGGTTT---GA---AT--TGATAATTCTC-GCTG--TCCATT--TTT-TT--ACACTAGCATGCAGACAGCAACATCA-T-ACTATGAC-TC-TGCA-AA---GCCGT-C--ACTC--AT--TTCTA---AAT-TTCA-GACGAG-----G--C-CT-TGACA-GGATA--A----GGT-----------------A------TAAGA-----G-AAC-A--AA------A-CACG---------GAT--AAATGTATTTAAA-T-TTAACAA--GA--T-TGG-ATTgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgacaatatccatgtctattatataaaaggaaaataaagaatacagctttacccaaatatatttaatataaacacttcaaaaattattttgtgataggtaaatctggttaaagaataaacacatcgttcgtttagactcttagttcctctcgttgactattcatgtaaagctgccccagcgtttcgtccaatttatcgtgtcaaacctattaataagttgtcttccacttgtttaaaatattcctcaatataatcttcgatcgctcttgtaaaaatacaaaacaaaacataagaaaactgtctcgctcccagatcccggaggtttgaattgataattctcgctgtccatttttttacactagcatgcagacagcaacatcatactatgactctgcaaagccgtcactcatttctaaatttcagacgaggccttgacaggataaggtataagagaacaaaacacggataaatgtatttaaatttaacaagattggattcg
gi|5 : tgcactacttgcatggacagcaattaactagatctatacaagtcacgtgcacgtttgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctccaccccccccccccccccccccccgtcgtgTGCACTACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AA-TAGATC--TATACA---AGTCACGT----TTGT-TATGAAATAGGC--TA-TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGTAAAA-AT-C-AT-GTCA--TGTTA-T-G----TAAAA-----------------AGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-ATT-AAT-T---AACACTTCAAA---AGT-A-T-ATTTT-GTGATA-GGT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GTATCCTCTCGT--CG-C--TAG------TT--CATGTA---ACAC-TGCCCCAGCGTTTC-GTCC----A-ATTTT--ATCGTGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGT-CG-CTCT-CAC-TG-TTATAA---------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGA-TGCCACT--CTTG-T-AAAA--TAC--AAAA-CAA-AC----AA-GGGCT----AACTGTCTC-CT-C-C--GAT-CC--GGAGGTTT---GG---AT--GAA----TCTC-GCTG-CTCCA-T--TGT-TT--ACATTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-AC-ATGACGTCATGCA-AA-GGGCCGT-C--ACTCCAAT--T--TA---AAT-TTCA-GATGAG-----GC-C-CT-CGACAGGGATA--A----GGT-----------------A------TA--A-----G-AAC-AG-AA------A-CAC----------G-T--TAATG---TTAAA-A-TTA--AA--GA--T-TGG-ATTACcg
gi|6 : TGCACAACTTGCATGGGCAGCAAT--T-AACTAGATCTATATACA---AGTCACTT----TTGT-TATGAAATAGGC--TG-TATa
gi|6 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttaGCGGTACAA-AT-C-AT-GTTA--TGTTAAT-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----ACTGTAACAGAC-TTTAC-C-AAAAT-A-TTTTAAT-T---A-CACTTCAAA---AGT-A-T-ATTT--GTGATA-GAT---ATA-ATCC-TGTCAAAGAATAAACACA--TCGTTCA-CTGTG--TT---CA-A-TAGTTTTG-AC-CTT-GTGTCCTCT--------C--TAG------TT--CATatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccgcggtacaaatcatgttatgttaatataaaaggaaaataaaggatactgtaacagactttaccaaaatattttaattacacttcaaaagtatatttgtgatagatataatcctgtcaaagaataaacacatcgttcactgtgttcaatagttttgaccttgtgtcctctctagttcat
gi|7 : taataagtgatttatttctcgaggaccatatgattgaagacaattgaagatatgaatacaaataaccccgagggggacgggtgtgtgttggttgggtctagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagttatgcacaacttgcatgggcagcaattaactagatctatatacaagtcacttttgttatgaaataggctgtatatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccccccccccTACAA-AT-C-ATAGTCAAATGTTA-TTA----TAAAAAAG---GAA---AATAAAGGAT-----AC------AGAC-TTTAC-C-CAAATTA-ATTTAAT-T---AACACTTCAAA-----T-A-TTATTTT-GTGATATGGT---ATACATC--TGTCAAAGAATAAAC-CA--TGGTTCAACTGTGGTCT---CA-T-TAGTTTTG-AC-CTT-GT--CCTCT-GTAACG-C--TAG------TCTCCATGTA---AA-C-TGCCC-AGCGTTTCTGTCC----C-AGTTT--GTCGCG------C-T--T-------------------CTCT--AC-TG-TTAAA----------TATTCCTTCAA-TA--T--AG-A-TCTT-CGATTGCGGCT--CTTG-TAAAAA---AC---AAA-CAA-ACATA-AA-GGGTTATTAAACTGTTTC-CT-CTC--GAT-CC---CAGGGTT---AA---ATTGAAA----TCT--GCTGCCTCCA-T--TGTGTT--ACACTAG-ATGCAGG-A-C-GCATCACT-A--GTGACGTCAT-CA-AGTGAGCAGTAC--ACATCAAT--T--TA---AATGTTCATGACAAG-----GCAT-TT-CGACAGGGATA---------T-----------------A------------------AAC-AG-AA------ATTAC----------GAT--AACTGT-TTTAAA-TATTA--AGATGA--T-TGGAATTAC
gi|8 : TTACT-A----TAAAA--G---GAA---AATAAAGGAT-----TC------A-AC-T--AC-C-AAA-T-A-ATTTAAT-T---AACACTTCAAC---A-T-A-T-AGTTT-GTGATA-GGT---ATG-ATCCTTGTT-TAGAATAAACACA--TCG--CA-CTGTG--TT---CATT-TAGTTTTGTAC-CTT-GTGTCCTCTCGT--TG-T--TA-------TT--CATGTA---AA---------------TC-G--------------------TGTC-AAAC-T--CT---AATAAGT-TGT-CG-CTCT-CAC-TG-TTAAAA---------TATT-CTTC-A-TA--T--AG-A-TCTT-CGA--GACGCT--CTTG-Tga
gi|8 : G-TAAAAA--TAC--AAAA-CAA-ACAAT-AACGGGCT----AACtagcccgttattgtttgttttgtatttttactgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|8 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctcttACTGTC-C-CT-C-C--GAT-CC--G-AGG-------------------------C-GCTG-CTCCG-T--TGT-TT--ACACTAG-ATGCAGACA-CAACATCA-T-ACAATGACGTCAT-CG-AA-AGGCC-T-C--ACTTCAAT--T--T----ACT-CTCA-GACGAGT----GC-CTCT-CGACAGGGATAATA----GGT-----------------A------TA--A-------AAC-AGTAA------A-tgtccctccgatccgaggcgctgctccgttgtttacactagatgcagacacaacatcatacaatgacgtcatcgaaaggcctcacttcaatttactctcagacgagtgcctctcgacagggataataggtataaaacagtaaaa
gi|9 : ttactataaaaggaaaataaaggattcaactaccaaataatttaattaacacttcaacatatagtttgtgataggtatgatccttgtttagaataaacacatcgcactgtgttcatttagttttgtaccttgtgtcctctcgttgttattcatgtaaatcgtgtcaaactctaataagttgtcgctctcactgttaaaatattcttcatatagatcttcgagacgctcttgttagcccgttattgtttgttttgtatttttTC--ATCGTGTC-AATT-T--CTTC-AAT--GT-TGT-CG-CTCT-CAC-CT-CTCA----------------CTTCAA-TA--T-----G-TATT-TGC-TG-TGCT--CTTG-a
gi|9 : gTAG-TTGCAGACA-CAACA-------C-ATG---TCATGCA-AA-GGACCGC-T--ACTCCAAT--T--TA---AAG-TACA-TACGAG-----GC-C-CA-CGACAGGGA-A--A----AGTAAAAAAAAAACCATAAAA------TA--A-----A-AAC-AG-AA------A-CAC----------GAT--gtagcccttagtgtttcttttactattgaggtttaggctaatatctgacataatgtatagttgcagacacaacacatgtcatgcaaaggaccgctactccaatttaaagtacatacgaggcccacgacagggaaaagtaaaaaaaaaaccataaaataaaaacagaaacacgatttgttttctaagat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TAATATGTGATTTATTTTCTCGAGGACTATATGGTAGAAAATTATAAGATATGAATTTCATACAAATCCCCCCGGGGGTGGGTGGTGGTGTTTGGGTC
Unaligned ( gi|22 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATACGATTGAAGACAATTGAAGCTATGAATACAAA
Unaligned ( gi|23 ): TTGAACATATGGATACAAATCACCCCCTCCCCTGAAGGGTTGGTTGCGCGGTTGGGTCTAC
Unaligned ( gi|25 ): GATAATTGAAAATATGAATACAACCCCCCCCCCCCCCCGTGGGGGTGGTTGCGCGGT
Unaligned ( gi|27 ): ATAAGTGATTTATTTTCTCGAGGACCATAT