lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 22222 2 111 11111111 22222222222222 333333 1111111 11 555555555555 2222 1111111 222222222222222222 11 111 222 22 666666666666666666666666666666666666 111 3333333333333333333333333 4444444444444 11111111 1 111111 11111111111 1111 111 222222222 222222222 1111 111 1111111111 222222222 111 333333333333 11 11111 1 111111 111111 444444444444444444444 11111 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222 333333333333333333333333333 111111111 11111111 11111 3333333333333333333333 111111 111 2222222222222 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000 55555555555555555555555555555555555555555 11 111111111 11111 1111 111111 1111 333333333333 111 11111111111111 11111 11111 111111 111 222222222222 1111111 222222222 222222 333333333333 1111 11111 1111 22222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2222222222 11 11 55555555555555555555555 3333333333333333333333333 1111111111 555555555555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 1111 1111 11111 1111 111 11 1 1 11 2222 1 1 1 2 2222 1111111 1111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111111111 2222222222222 1 222 11 1 111 111111 11111 111111111 7777777777777777
lowQualScore : 4 4 4 999 55 4 55555 4 4 2 4 44 000 4 3 3 3 3 33333333 3 33333333333333 4 0 4 99 4 4 99 4 99 4 888888 4 8 4 4 0 4 99 4 3333333 4 55 4 22 11 555555555555 66 3 0000 5 0 8888888 66 55 111111111111111111 33 0 55 5 333 66 000 5 5 66 0 5 33 5 777777777777777777777777777777777777 4 111 4 55 2222222222222222222222222 0000000000000 777777 4 55 777 44444444 0 4 4 5 777777 8 77777777777 99999 5555 2 5 66 5 000 66 5 222222222 9999 5 5 000000000 0000 111 5 3333333333 5 5 444444444 5 888 111 8888 5 555555555555 5 66 5 11 5 5 0 55555 5 5 0 222222 4 4 66 4 4 666666 777 66 777 4 4 66 4 8 66 555555555555555555555 8 4 4 4 4 00000 666 4 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 5 5 66 2 4444 777777777777777777777777777 4 4 0 777777777 0 55 4 777 66666 4 88888888 00000 2 0000000000000000000000 4 4 1 4 0 55 99 4 9999 4 8888 4 4 666666 88 8888 5 555 5 1111111111111 333 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888 0 33333333333333333333333333333333333333333 44 33 8 222222222 4 55 2 55 4 55 4 99 4 44 11111 55 4 3 3 88 7 44 44 3 3333 3 3 3 555 555 111111 44 3 44 555 3 1111 44 3 666666666666 8888 2 77777 2 2 000 77777 5 2 22 2 33 77777777777777 5 888 66666 5 00000 3 555 3 4 777 777777 55 4 4 11111 888888 4 333 66 888888888888 777 4444444 8 8 66 555555555 4 2 4 4 000000 3 5 66 222222222222 3333 00000 66 5555 8 0 4 66 11111 66 777 777 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 3333333333 33 3 11 4 4 22222222222222222222222 777 3 3 33 999 3 44 1 44 3 3 88 44 3 3 7777777777777777777777777 7777 2222222222 0 3 6 8888 66 222222222222 55 55 8 777 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 5 5 5 5 0000 5 55 888 2222 2222 5 55555 5 0000 777 222 11 888 5 8 5 5 0 3 66 5 0000 0 5 5 0 5 55 0 66 0 9999 6666666 5 1111 5 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 3 66 3 44 3 3 6 33333333 5555555555 77 66 7777777777777 0 333 55 888 5 999 11 0 66 0 5 888 5 555 5 555555 00000 777777777 5 2 888 0000000000000000 5 5 99
lowQualScore : . . . ... .. . ..... . . . . .. ... . . . . . ........ . .............. . . . .. . . .. . .. . ...... . . . . . . .. . ....... . .. . .. .. ............ .. . .... . . ....... .. .. .................. .. . .. . ... .. ... . . .. . . .. . .................................... . ... . .. ......................... ............. ...... . .. ... ........ . . . . ...... . ........... ..... .... . . .. . ... .. . ......... .... . . ......... .... ... . .......... . . ......... . ... ... .... . ............ . .. . .. . . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. ..................... . . . . . ..... ... . . ........................................................................................................................................ . . . .. . .... ........................... . . . ......... . .. . ... ..... . ........ ..... . ...................... . . . . . .. .. . .... . .... . . ...... .. .... . ... . ............. ... . ................................................. . ......................................... .. .. . ......... . .. . .. . .. . .. . .. ..... .. . . . .. . .. .. . .... . . . ... ... ...... .. . .. ... . .... .. . ............ .... . ..... . . ... ..... . . .. . .. .............. . ... ..... . ..... . ... . . ... ...... .. . . ..... ...... . ... .. ............ ... ....... . . .. ......... . . . . ...... . . .. ............ .... ..... .. .... . . . .. ..... .. ... ... . ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ . .......... .. . .. . . ....................... ... . . .. ... . .. . .. . . .. .. . . ......................... .... .......... . . . .... .. ............ .. .. . ... ..................................................... . . . . . .... . .. ... .... .... . ..... . .... ... ... .. ... . . . . . . .. . .... . . . . . .. . .. . .... ....... . .... . . ............................................................................................................ . . .. . .. . . . ........ .......... .. .. ............. . ... .. ... . ... .. . .. . . ... . ... . ...... ..... ......... . . ... ................ . . ..
lowQualScore : 4 0 0 000 55 0 33333 0 3 3 0 88 222 0 6 6 6 6 22222222 6 66666666666666 0 8 0 55 0 0 55 0 55 4 666666 4 9 0 0 8 0 55 0 0000000 0 55 0 88 99 999999999999 99 2 0000 7 1 1111111 99 88 666666666666666666 88 4 11 0 888 44 111 0 0 99 1 0 88 0 222222222222222222222222222222222222 0 000 0 55 7777777777777777777777777 5555555555555 666666 0 55 000 55555555 0 0 0 5 222222 9 77777777777 77777 6666 7 0 99 0 222 99 0 555555555 2222 0 0 000000000 6666 444 0 5555555555 0 0 555555555 0 888 444 1111 0 111111111111 0 99 0 99 0 0 5 99999 0 0 0 888888 4 4 11 4 4 333333 888 11 888 4 4 11 4 9 11 111111111111111111111 0 0 0 0 0 00000 555 0 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 0 99 5 4444 111111111111111111111111111 4 4 8 777777777 8 55 0 000 00000 0 55555555 00000 9 2222222222222222222222 4 4 8 4 6 55 55 4 4444 4 9999 4 4 555555 66 1111 0 666 0 2222222222222 888 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888 4 33333333333333333333333333333333333333333 77 55 0 000000000 0 55 5 55 0 55 0 55 0 88 88888 55 0 6 6 66 3 22 22 1 1111 1 1 1 444 444 999999 22 1 22 444 1 9999 22 1 888888888888 9999 9 11111 9 9 666 11111 7 9 99 9 99 44444444444444 7 999 44444 7 00000 4 000 1 0 000 555555 66 0 0 66666 555555 4 999 11 999999999999 888 7777777 9 9 11 777777777 4 0 2 4 333333 2 0 99 555555555555 1111 66666 11 6666 9 1 4 11 11111 11 888 000 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 6666666666 55 6 33 0 0 77777777777777777777777 000 6 6 88 222 3 66 0 66 3 3 66 66 3 3 3333333333333333333333333 1111 6666666666 4 6 5 5555 88 555555555555 55 55 9 888 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 0 0 0 0 6666 0 11 888 9999 0000 0 99999 0 6666 111 111 99 888 0 1 0 0 0 4 99 0 1111 0 6 0 0 0 44 0 99 0 2222 2222222 0 1111 0 4 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 3 77 2 66 3 3 7 44444444 1111111111 22 99 5555555555555 0 222 11 222 0 000 99 4 99 0 0 888 0 666 0 000000 22222 666666666 0 5 888 8888888888888888 0 0 66
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AA-TTC-A--AACAT-AG-GTGGCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCG-GTGT--------GTATA-AGA-TA---G-------A-GTG-A--G-GGT-GGT--AATTT-T--CA-AT-----TGCGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGCGGGGG----G-------TTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGG-AAC-A-GCGA--AAACGAGCG-CTTT-G-AAA-TTCT-----GGAC-A-CT--AC--CACCC-CGGGAC-CACAC---C-CA--CG-------C---------AT-TG---TATT--------TG---GTTG--AG--G-AA--ACT---A--------TTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-C----T------TAGTTT--GG-AA----CTTTCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGA--TT-TTAGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----ATTTN---A-TA--TT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--TC--A----T--AT--AA-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG-G-----C----------ACAGTACTCCC----G---------------AA--AT-A--TAT-T-CA-AGAT--------ATTATT-TT-AAG-A-----TATAT-TTAA--A--GTT--TNA---CA-CNC-A-TAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCC-CCCCC-------------CC---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGT--A--AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCCTAAAAT-TTGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A-TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----AT-G-C---A-T-GTA-TGTACA--T--ACACGTT-C-CTTTCGTT-AT-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC-TGGA---A-TC--TTCA-T-TA-C--AT-TTG--ACA--TT-AA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--A-AA--T---T-G--T-C--AA-ACTT-T-----A--T-TA----ATTT-A-----A-A-C-A-AAGT-----TTG-C-AT-TA-TC--AT----G-G-A-----TA-TTTTG---TT----AA-A-----TGTC---A-TGTT-G---AT--C---AACGG-A-C-CCAT--G--AAA------G-TA---CA--GT------------CCA---AA-A-----CACCAA-CAC-C--AAA------GA-AAT-GATTATACTTC-GCC----TATTT-GT--AGAA-CTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAAA----A------------T-------------------T--------------A------TTA---------T-T-C---A--A-TC-------------C--AATT--TT--AT--C--------A--AA--------A-TCAA--------ATGC----AAT--AT----T---T-A-------TT--AAGCT--G-T---AA--AT-------TT------AT-C-AAA-T-----G-A-A----------------A-TN---G-----------------A--AAAAAA--A--------------A---------AC----CAA-AAAAAAAA--ACCTT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT----------GTGTT-AAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-A-TTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATT--GT-TG----TTGT------TGT-TTTTTCT-TNAC----AA-TCCA-AT-------CT--G--AAC-AAGA---A-----------A-A----GT-A-----T----A----------C--TA-T---TT-TG-TTGA-GTATT-GAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT-GA----A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-T-T-GCTTG-GG-CTTCC--T-TTGT-ACGGC-TA-TG-AT-TG-G--TGAAATGT--TTTTA-------CTTCGTA-AAT--T-C-TGAGTGCAGGTC--TTCT-NNG-A-A-CA-TGC-A-------------------------GC-------------A----------------------AC---T---G--------G-ATC-CA-TAGTT--AC-TGC-A-C------A-TTC--A-C-----ACT-G--ACATTC-------------TGCTA-TGCACCCAT--CA-ACA-TC-T-A-CA--CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GC-CGGGGG---GGGGGGG---GG-----------T-C-GTGAC-CAAAAT
Reference ( gi|4 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AA-TT--A--AACAT-AGTGTGGCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCG-GTGT--------ATATA-AGA-GA---G-------A-GTG-A--G-GGT-GGT--AATTT-T--CA-AT-----AGCGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGCGGGGG----G------TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGG-A-C-A-GCGA--AAACGAGCG-CTT--G-AAA-T-AT-----GGAC-A-CT--AC--CACCC-CG---C-CACAC---C-CA--CG-------C---------AT-TG---TATT--------TG---GTTG--AG--G-AA--ACT---A--------TTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-C----T------TAGTTT--GG-AA----TTTTCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAA--TT-TTAGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----ATTTC---A-TA--TT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--CC--A----T--AT--A--TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG-G-----C----------ACA------------A---------------AA--AT-A--TAT-T-CA-AGAT--------ATTATT-TT-ACG-A-----TATAT-TTAA--A--GTT--TTA---CA-CTCTAGTAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCC-CTCCC-------------CC---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGT--A--AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCCTGAAAT-TTGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A-TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----AT-G-C---A-T-GTA-TGTACA--TTAACACATT-C-CTTTCGTT-AT-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC-TGGA---A-TC--TTCA-T-TA-C--AT-TTG--ACA--TT-AA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--A-AA--T---T-G--T-C--AA-ACTT-T-----A--T-TA----ATTT-A-----A-A-C-A-AAGT-----TTG-C-AT-TA-TC--AT----G-G-A-----TA-TTTTG---TT----AA-A-----TGCC---A-TGTT-G---AT--C---AACGG-A-C-CCAT--G--AAA------G-TA---CA--GT------------CCA---AA-A-----CACCAA-CAC-C--AAA------TA-AAT-GATTACACTTC-GCC----TATTT-GT--AGAA-CTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAAA----A------------T-------------------T--------------A------TTA---------T-T-C---A--A-TC-------------C--AATT--TT--AT--C--------A--AA--------A-TCAA--------ATGC----AAT--AT----T---T-A-------TT--AAGCT--G-T---AA--AT-------TC------AT-C-AAA-T-----G-A-A----------------A-TG---G-----------------A--AAAAAA--A--------------A---------AC----CAA-AAAAAAAACCACCTT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT----------GTGTT-TAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-A-CTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATT--GTGTG----TTGT------TGT-TTTTTCT-TAAC----AA-CC---AT-------CT--G--AAC-AAGA---A-----------A-A----GT-A-----T----A----------C--TA-T---TT-TG-TTGA-GTATT-GAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT-GA----A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCC-T-T-GCTT--GG-CTTCC--T-TTGT-ACGGC-TA-TG-AT-TG-G--TG-AATGT--TTTTA-------CTTCGTA-AAT--T-C-TAAGTGCA------TTCT-AAG-A-A-CA-TGC-A-------------------------GC-------------A----------------------AC---T---G--------G-ATC-CA-TAGTT--AC-TGC-A-C------A-TTC--A-C-----ACT-G--ACATTC-------------TGCTA-TGCACCCAC--CA-ACA-TC-T-A-CA--CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GC-CGGGGG---GGGGGGG---G------------T-C-GTGAT-CAAAAT
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AA-TTC-A--AACAT-AGT-TGGCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCG-GTGT--------GTATA-AAA-TA---G-------A-GTG-A--G-GGTCGGT--AATTT-T--CA-AT-----TGCGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GCGGAGGA---G---------AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGG-AAC-A-GCGA--AAACGAGCG-CTTT-G-AAA-TTCT-----GGAC---CT--ACTACACCC-CGGGAC-CACAC---C-CA--CG-------C---------AT-TG---TATT--------AG---GTTG--AG--G-AA--AAT---A--------TTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-C----T------TAGTTT--GGAAA----CTTTAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGA--TT-TTAGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----ATTT----A-TA--TT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCATTCA--A----T--ATA-A--TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGCC-----C----------ACAGTACTTCTC---A---------------CA--ATAA--TAT-T-CA-AGAT--------TTTATT-TT-A-G-ATTAATTAT-T-TTAA--A--GTT--TAA---AA-C---AACAGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A---------CC-------------CC---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGT--A--AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCCTAGAA--TTGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A-TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----AT-G-T--------TA-TGTAC------ACAT-TT-C-CTTTCGTT--T-A--T------T-------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAAC-TAGA---ATTC--TTCA-TGTA-C--AT-TTG--ACA--TT-AA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G----AA--T---T-G--T-C---A-ACTTAT-----A--TATA----ATTT-A-----A-A-CAA-AAGT-----TTG-CAAT-TA-TC--AT----G-G-A-----TA-TTTTG---TT----AA-A-----TGCC---A-TGTT-G---AT--C---AACGG-A-C-CCATTGA--AAA------G-TA---CA--GT------------CCA---AA-A-----CACCAA-CAC-C--AAA------GA-AAT-GATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GG--AGGA-TT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCAATC--A------------T-------------------CTTCCTTA-------A------TCA---------T-T-G---A--T-TC-------------C--AATT--TT--AT--C--------A--AA--------T-GCA------------C----AAT--AT----T---TAA-------TT--AAGCT--GTT---AA--TT-------TT------ATCC-AAATT-----G-A-A----------------A-TA---GGNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN--N--------------N---------NN----NNN-NNNNNNNNNNNNNNN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGTT-AAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-CC-AT------------TGT----------TG----TTGT------TG--TTTTTCT-TTAC----AA-TCCA-AT-------CT--G--AAC-AAGA---A-----------T-A----TTAA-----T----ATTGAAAAGATT--TA-T---TT-TG-TTGA-GCATT-GAATAATC-C----ATCTTTATT---GAAATT--TTCAACG--GGA-CGT--T-GT-GA----A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATT-GCC-T-TGGTTT--GG-CTTCCTTT-TTGT-ACCG--TA-TG-AT-TG-GATTGAAATG---GCTTA-------CTTCGT--AAT--T-C-TGAGTGCAGGTCCTCTCT-GTA-A-T-CA-TGC-ATTAT---------------------GC-------------ACAATTTTTTCTTTATGCAGCAAAC---T---G--------G-ATC-CA-TAG-T--AC-TGC-A-C------ATTTC--A-C-----ACT-G--CCATTT-------------TACTA-TGCACCCATAACA-ACA-TCTT-ACCA--CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGC-CGGGGA---GGGGGGG---GGT----------T-C-GTGAC-CAAAA
gi|5 : gtcgATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AA-TTCAA--AAC-T-AG-GTGCAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCG-GTGT--------GTATA-AGA-TG---G-------T-G-G-A--G-GGT-G-T--AATTT-T--CA-AA-----TGCGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGCGGAG-------------TAAAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGG-AAC-A-GCGA--AAACGAGCG-CTT--G-AAA-T-CT-----G-AC-A-CT--AC---ACCC-CG---GACACACA--C-CG--CT-------C---------AT--G---TATT---------A---GTTA------G-AA--A-T---A--------TTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-C----T------TAGTTT--GG-AA----CTT-CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG----TT-TTAGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----ATT-A---A-TA--TT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--TC--AA---T--AT--A--ACTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G-G-----C----------ACAGTATTCTCAC--A---------------AA--A--A--TAT-T-CA-AGAT--------TTTATT-T--AAG-A-----TA-AT-TTAA-----GTT--AAA---CA-CT-----AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCC-CCCTT-------------TT---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGA---------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGT--A--AGTTACGATACTG-AAC-TGTA-G----A-CAG---GAA-AC-ATTCCAGAA---TTGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A-T-G----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT------------TA-TGTACA--------CATT-C-CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA--G-TAA--A-A--TG-AC--AG-AC-TGGA-----TC--TTCA-T-TA-C--AT-TTG--ACA--TT-AA----TC-AAAA-T-ATCGG---A---TT-----G--A-AA--T---T-G--T-C--AA---CT-T-----A--TATA----ATTT-A-----A-A-C-A-AAGT-----T-G-C-AT-TA-TC--AT----G-G-------TA-TTT-G---TT----AA-A-----T--C---A-TGTTTG---AT-------ACGG-A-C-CCAT--G--AAA------G-TA---CA--GT------------C-A---AA-A-----CACCAAACAC-C--AAA-------G-AAT-GATTATACTTC-GT-----TATTT-GT--AGAA-CTAGA------GGA------------------------------TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAAA----A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------TTA---------TAT-C---ATCA-TC-------------T--GCTT--TA--AT--C--------ATGAATCCAATTTA-TCAA--------ATGC----AAT--AT----T------------------AGC---G-T----G--AT-------TT------AC-C-AAA-TGAATAG-A-A----------------A-AA---G-----------------A--AAAAAA--AAAAAAAGAAAAACGA---------AC----CAA-AAAAAAAA--A--TT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT----------GTGTT-AAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-A-TTG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT-----------------------TGTG----TTGT------TGT-TTTTTCT-TTAC----AA-TCCA-AT-------CA--G--AAA-CAGATTTA-----------A-------T-A-----TAAGAA----------T--TA-TACATT-TG-TTT--GCATT-G-ATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-C--GGA-CA---T--T-GA----A-T-TT---AGC--ATGA---TAA-ATATT-GCC-TGT-G-TG--GG-CTTCC----TTGT-ACCGC-TA-TG-A--TG-G--TG-AAAG---GTTTA-------CTTCGTA-AAT--T-C-TGAGTGCAGTC---TTCT-CGT-A-T-CA-TGC-ATTATT--------------------GCACAATTTCTTAAGA----------------------ACA--T---GCAGCAACTG-ATC-CA-TAGTT--AC-TGC-A-C------A-TTC--A-------ACA-T--ACATTA-------------TACTA-TG--CCCAT--C--ACA--C-T---CA--CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GC-C---GG---GGGGGGG---G------------T-C-GTGACACAAAATatt
gi|23 : ggtcgATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AA-TTC-A--AACAT-AG-GTGGCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCG-GTGT--------GTATA-AGA-TA---G-------A-GTG-A--G-GGT-GGT--AATTT-T--
gi|20 : ggtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AA-TTC-A--AACAT-AGCG-GGCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C--T-CCGCGTGT--------A-GTA-AGA-TG---G-------A--T-----A-GGT-GGT--AA-TT-T--CA-AT-----TGCGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GC
gi|10 : gtcgATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATC--ATCAACACGAGTG-AGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCG-GTGTTGTAGCGAATAGG-AGT-GA---G-------ATGTGTA--GTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC---GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGCTAGAGTAAAA------TTTA-GCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGA-A-CTA-GCGACCAAACTAGCG-CTTTTGTAAA-G-ATTTCTGGAAC-A-CCTCACAGCACTCGCGGTAC-CTCAC---C-CC--TG-------CGA-------AT-TGG--TATT--------TA---GGTG--AATTG-AA--ACT---A--------TTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-C----T------TAGTTTTGGA-AA----CTCTCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGA--CGATTAGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATATTTTAAAA-TA--TT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--TCCAA----T--TT--A--TCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG-G-----C----------ctcaaa
gi|1 : gtcgTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAA-TT--A--AACAT-AG-GTGGCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCG-GTGT--------GTATA-AGA-TATATGT------A-GTG-AA-G-GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCGCAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGCGGGGG----G------GTTAAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGG-AAC-AAGCGA--AA-CGAGCAACTT--G-AAA---ATTCTT-GGAC-ATCT--TTG-CATCC-CGGGAC-TACACACCC-CA--CG-------C---------AT-TG---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--ACT---A--------TTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCAC----T------TAGTTT--GGTAACTTCTTTCTT-GCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGA--TT-TTAGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---A-GAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAATC--AAGAGT--ATTAA--TTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA----G-----C----------ACA------------GTAACTTTCTCAATCTAATGAT-A--TAT-TTCA-AGAT--------ATTATT-TT-AAG-A-----TATAT-TTAATTA--GTT--TTAAAACA-CT-----AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCC-CCCCCGT-----------CC---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGT--AG-AGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCCTAAAAT-T-GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AATTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----ATTG-TCAAA-T-GTA-TGTACA------CATTTT-CTCTTTCGTT-AT-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TC--TTCA-T-TAAC--AT-TTT--ACAATTT-AA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--A-AA--T---TCG--T-C--AATACTT-------A--TGTA----ATTT-C-----A-A-C-A-AAGT-----TTG-C-ATGTA-TC--ATAT--G-G-A-----TA-TTTTG---TT----AA-A-----AGCC---AATGTT-G---AT--C---AACAT-A-C-CCATA-G--AAAAGTATTG-TA---CA--GT------------CCA---AA-AAATCTCACCAAACAC-CGTAAA------GA-AGT-GATTATACTTC-AC-----TATTT-GT--AGAA-CTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAAA----A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------TTA---------T-TTC---AC-A-TC-------------C--AATT--TTT-AT--C--------A--AA--------AATCAA--------ATGC----AAT--AT----T---T-A-------T---AAGCT--G-TTATAA--AT-------TTTT----AT-CCAAA-T-----GGA-A----------------A-TT---A-----------------A--AAAAAA--A--------------A---------A------AA-AAAAAACAACACCTTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT----------GTGTT-AAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-A-TTG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATT--GT-TG----TTGT------TGT-TTTCT-T-TAAC----AA-TCCA-AT-------CT--AGAAAC-AAGA---A-----------A-AA---GT-A-----T----A----------C--TA-T---TA-TG-TTGA-GTATT-GAATAATTAC----ATC-TTA-T---GAAT-TA-TTCAA-G--GGA-CA---T-TG-GA----ATT-TT-ATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCC-T-T-GCTTGAGG-CTTCC--T-TTGTAACGGC-TATTG-AT-TG-G--TG-AAAGTG-TTTTA-------CTTCGTA-AAT--T-C-TGAGTG
gi|30 : taaaAGTT-CTT-TCCAC---T--AA-TTC-A--AACGT-AG-GTGGCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTG-GTGT--------ATGTA-Agcaggtctttctctgtaatcatgcatttaattaggcacaaatttcttaagatacaatgcagcaactgcgccactggatccatagttttactgccacattccagcactgacattctgctaatgcacccattcaacatctacactagcattactttcaaacacaccaatcgctactaaacataggcgcgggggttcgggaggggaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|21 : tggaAGTT-CTT-TCC-CC--T--AT-TT-------CAT-AA-GTGGCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTG-GTGA--------ACATA-AAA-CA---GTGATTTTA-TTG-AGTG-GGT--GT--AATTT-T--T---T-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAAt
gi|11 : GTT-TAT-TCT-CG--T--AA-TT--A-----------GCGGCGC-AAG--CTC-------CA------CTTGA-C-TT-TCG-GTGT--------ATGTACAGA-TA---G-------A-GTG-A--G-GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-AT-----TGCGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGCGGGGG------------TTAAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT---------------------CGAGCG-CTTTTG-AAAGT-CT-----GGAC-A--T--A----ATCC-CGAGAC-CACAC---C-CA--CG-------A---------GG-TGCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTACTTATA--------TTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-C----T------TAGCTT--GG-AAGC--TGTCCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAA--TT-TCAGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A-TA--TTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TTT--CA--A----T--TT--AA-TCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG-G-----CCAGTACTTCTACA------------G---------------AA--AT-A--TAT-T-CA-AGAT--------TTTTAT-TT-AAG-A-----TAT-T-TTAA--A--G-T--TTA---CA-AACC--TAGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACCCTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|3 : TT-CCC-C---T--AA-TT--C--AACAT-AG-GTGGCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCG-TTGT--------GTATA-AGATAA---G-------A-G-G-A--G-GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGCGGGGG------------TTAAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGG-AAC-A-GCGA--AAACGAGCG-CTTT-G-AAA-TTCT-----GGACGA-CT--AC---ACCC-CGGGAC-CACAC---CGCAAACG-------C---------AT-TG---TATT--------TT---GTTG--AG--G-AA--ACT---A--------TTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-C----TG-----TAGTTT--GG-AA----CTTTCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T----T----TTAAGATTT-TTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----TATTA---A-TA--TT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--TC--AA---T--AT--AAATCT-CA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTG-GAG---C----------ACAGTACTTCTCCACA---------------AT--AT-A--TAT-A-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA-----TATAT-TTAA--A--AGT--TAA---AA-CC--ACTAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCC-CCCCC-------------CCATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGT--C--AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCTT---AG-TTGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A-TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----AT-GCC---A-TGGTA-TGT--------ACACATT-C-CTTTCGTT-AT-A--TGACAAATTTAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-AC-TGGA---A-TC--TTCATT-TA-C--AT-TTG---CA--TT-AA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAA-AA--T---T-G--T-TCAAA-ACTT-A-----A--TGTA----ATTT-A-----A-A-C-A-AAGT-----TTG-C-AT-TA-TC--AT----G-G-A-----TATTTTTG---TTGTTGAA-A-----TGCC---A-TGTT-G---AT--C---AAGCT-A-C-CCAT--G--AAGTAT---GTTA---CA--GTCC----------CCA---AA-A-----CACCAA-CAC-C--GAA------GA-AGT-GATTATACTTC-A-C----TATTTGGT--AGAA-C--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAAA----ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------TTA---------T-T-C---A--A-TC-------------C--AATT--TT--AT--CA-------A--AA--------A-ACAA--------ATGC----AAT--AT----T---T-A-------TT--AAGCTTGG-T---AA--AT-------TT------ATCC-AAA-T-----G-A-A----------------A-TT---T-----------------A--AAAAAA--A--------------G---------A------AA-AAAAAAGACCACCTT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT----------GTGTT-AAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-A-TTG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTC-TT---TGTT----TTGT------TGTGTTTCTCT-TTAC----AA-TCCA-AT-------CTAGG--AACAAAGA---A-----------A-A----GT-A-----TG---A----------C--TA-T---TTCTG-TTGA-GTATT-GAATAATC-C----ATC-TT--T---GAAA-T--TTCAA-GGCGGA-CA---T-GT-GA----A-TGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCC-T-T-GCTTG-GG-CTTCC--T-TTGT-ACGGC-TG-TG-AT-TGTG--TGAAATG----TTTA-------CTTCGTA-ATT--A-C-TGAG-GCAGGTCT-CTCT-GTA-A-T-CA-TGC-ATTATTGC------------------AC-------------A----------------------AT---T---------------TC-TT-TAAGA--ACATGC-AGCATATGGA-TCC--A-CTAGTTACT-GGCACATTCATCACTGACATTCTGCTA-TGCGCCCAT--CA-A----T-T-A-CA--C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GC-CGGGGG---GGGGGGG---GGGGGATTT----T-T-GTGAC-CAAAAT
gi|24 : tA-C-TT-CCG-GTGT--------GTATA-AGA-TA---G-------A-GTG-A--G-GGC-GGT--AATTT-T--CA-AT-----TGCGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGCGGAGG----G-------TTAAGCTTC--CAGAAATATGAtattatgt
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGG----GAGGGGGGGTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAA-C-A-GCGA--AAACAAGCG-CTT--C-AAATT-CT-----GGA-----T--TC--CG--T-GG---C-CACAC---C-CA--CG-------CAGTGCCAGTAT-TG---TGTT--------T----GTTG--AG--G-AA--ACT---A--------TTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CTTAAT------TAATTT--TG-AA----TTTTCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGA--TT-TTAGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TTC---A-TG-----GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--TAT--CA--A----T--ATA-A--TCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|25 : tgagccttcggctcaggcgagct-C-A-GCGA--AAACGAGCG-CTT--G-AAA-TTCT-----GGAC-C-CT--AC---ACCC-CGGGAC-CACAC---C-CA--CAGTACCGTC---------ACATG---TGTT--------TG----TTG--AC--G-AA--ACT---A--------TTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTTat
gi|22 : -----GGAC-A-CT--AC---ACCC-CGGGAC-CACAT---C-CA--CG-------C---------GG-TGCGGTATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACT---ACTTAATTATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-C----TATGTACTAGTGT------A----TTTTC
gi|6 : GAC-A-CA--AC--C-CGA-CG---A-CCCAC---C-T---CG-------C---------AT--A---TATT--------T------TG--AA--GTGA--ACT---A--------TT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGC----T------TA--TT--GA-AA----TTTAAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGA--TT-T--AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----AT--C---AATA--TT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--T------------T--C--TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TGCGTATCTC----------ACAT-----------A---------------AA--AA-A--T-----CATAGAT--------AT-ATT-TT-A-G-A-----CAT-T-TGAAT-A--GATCATGA---CA-C-CTA--AGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCC-C-------------------------CCTTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGT--A--AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CA-----GA-AC-A-TCTTGAATT-GTCTTTA-TATT--G-A-GTTTAG-A-TTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----AT-G-C---G-T-G-A-TA-ACAGTTCTACACATTAC-CTTTCGTTAAT-A--T-AC--ATTCA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA---GTAA--A-A--TGCAC---G-AG-TGGA------C--ATCA-G-TA-CT-ATATTG--ACA--TC-AAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--A-AACTT---T-G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAA--T-AA----ATTTCAATTATA-A-C-A-AA-T-----TTG-C-A--TA-TCCTAT----G-G-AGAAACTA-TTTTG---TT----AACA-----TG-C---A-GATT-G---TT--CCAGACCGGTA-C-CAAT--GAAAAA------A-TACT-CA--GT------------CCATATAACA-----CACCAA-CACAC--AA--------G-AAT-GA-GATACTTC-GCC----TA--T-GT--AGAA--TAGA------GGA-GA-TT----TATC--T----CA-CA-GA-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTA------------TAAAATAA------------T--------------A------TAG---------T-T-T---A--A-TCATATCCATT----C--AATA--AT--AT--CTAGTACCGA--AATTT-----A-TCAAACTCAACGATGC----AAT--AT----TTTAT-A-------TT--AA-CT--G-T---TA--TTA------TC------CC-C-A---------G-A-A----------------A-TT------------------------AAAAAA--A--------------A---------AC----ATA-AAAAAAAA--------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT----------GCA---TA-------GTG-TCT-T------T-C----T---------TCT---TAG-GCTA-TTA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATT--GTTTGCGAATTAT--------T-TTTTTCT-TGAC-----A-CCTCGATA------CT--G--AACAAAGC---A-----------T-AGGTTGT-A-----T----A----------CAATA-G---AT-CG---GA-AT-TT-GAACTAT--T----ATA-TTC-T-----AA-T--TCAAA-A--GGATCA-----GTAGAAGAGA-T-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCTGT-T-ATTG--GG-CTTCC--TGTTGC----GC-TA-TGTAT-TA-C--TT-TACGTAATTCTGATAGCATCTCTCTACAATCAT-C-TTATTGCACCAT--TTCT-TAA-A-A-CA-TGCTA-------------------------GC-------------T----------------------A----T---G--------A-GTCACATTAGTT--AC-TGC-A-C------A-TT-----C-----ACC-G--AC--TC-------------CGCTA--GCA-CCAT--CACAC--TC-T-G-TAG-CTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CC-CGGGAG---CGGGGAGCATG------------T-C-Gatgattgtg
gi|7 : gagccatttaaactttccCGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--TC--A----TTTAT--AA-TCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG-G-----C----------ACAGTACTCTC----A---------------CA--AT-GATTAT-A-CA-A-AT--------ATTATT-TTTAAG-AGTA--TATATATTAG--ATGGTTG-TTA---AAACACTA----CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTA-TTCCC-------------CC---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGT--A--AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACATTGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA-TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTAT-G-C---AGT-GTAGTGTACA-----ACA-GTT-T-CTTTCGAT-A--A--TGAC-AATTTA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-AC-TGGA---A-TC--TTCA-T-T--T--AT-TCAGTACG--TG-AGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--A-AA--T---T-GGATAC--AA-ACTT-T-----A--C-TAGTAAATTT-A-----ACA-C-G-AAGTACTTTCTG-T-GT-GAATC--AT----GAG-A-----TA-TTTTGAT-TT----AA-AA----TGCC---A-TGTT-GTATAT--C---AACGT-A-CGCCAT--G--AAA------G-TA----A--GTTGATCTGAGATTCCA---AA-------CACCAA-CAA-C--AAAGAGAAGTA-GACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GT--AGAAACTA--------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAAA----A------------G-------------------T--------------A------TAT---------T-T-C---A--A-TC-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTA-----A--AA--------A-TCAATT------TTGCTATAGAT--ATTCGGT---T-A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATAT-------TCTTATTAAC-C-AAG-C-----C-A-A----------------ACTG--------------------------AACC--A--------------A---------ACTCTTCAA-ACAAAAAACAACCTT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT----------GCGGT-TTG-TTATTGTcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|12 : --A----T--AT--AA-TCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG-G-----C----------ACA------------G--------------------T-A--CTTCT-CAGAAAT--------AT-ATT-TT-AAG-A-----TATAT-TTTA--A--ATT--TTA---CA-AAC-ACTAGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCC--TCCC-------------CC---G--TCAT-T--------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGT--A--AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCCTATAAT-TTGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A-TTG----TG--A----TAA---T-TTT------------T-T-T-----T-TTA-TATACA--TTA----------CTTTCGTT-GTTG--T-AA-AATTAA--AATC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AA-TGGA---A-TC--TTTA-T-TA-C--AG-TTG--ACA--TT-AA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--A-AA--T---T-G--T-C--GA-ACTTAT-----A----TA----ATTT-A-----A-A-C-A-AAGT-----CTG-C-AT-TA-GC--AT----G-G-T-----TA-TTTTG---TT----TA-A-----TGTC---A-TGTT-G---AT--C---AACGA-A-C-CCAT--G--GAA------G-TA---CA--AT------------CCA---AA-A-----CACCAA-CAG-C--AAA------GA-AAT-ACAAATACCTC-GCC----TAtaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|29 : gCC-------------CC---C--CCCC-CCC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGT--A--ATTTat
gi|8 : AG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGT--A--AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCCTAGGAT-TTGTTTT-CGAT----A-GTGC---A-TTG----TA--A---TTAA---T-TTT----------------------------TG---A--TTA----------CTTTCGTT-GT-TGTT-GA-AATTAA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-AC-TGGA---A-TA--TTCA-T-TA-C--AT-TTG--ACA--TT-AA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--A-TA--T---T-G--T-C--AA-ACTT-------A--T--A----ATTT-A-----A-G-C-T-AAGT-----TTG-C-AT-TA-TC--AT----G-G-C-----TA-TTTTG---TT----TA-A-----AGTC---A-TATT-T---AT--C---AACGG-A-C-CCAT--G--GGC------G-TA---CA--GT------------CCA---AA-A-----TACTAA-CAC-C--AAA------GG-AAT-G--CACACCTC-GCC----TATTT-GT--GGAA-GGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAAA----A------------T-------------------C--------------A------TTAATCATTTTCC-T-C---A--ATTC-------------T--TATT--TT--AT--C--------A--AA--------A-TTAA--------ATGC----AGT--A---------C-A-------TT--AAGCT--G-T---AA--AT-------TT------ATCC-AAA-T-----G-A-A----------------A-TA---A-----------------A--TACATATTA--------------ATGATATTTCACTATTCAATAAAGAAAA----CTT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT----------GTGTT-AAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-C-CTG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATT--GT-CG----TTGT------TGT-TTTTCTT-TA
gi|3 : TGTCCCTGTCTATCAGTTACAGTATCGTAAC-T----G----A-CA----GGA-AC-Acagtccaa
gi|14 : tttcccctaattcaacataggtggcgccaagactcgtttacgtccttcttgacttgccgttgtgtataagataagaggagggtggtaatttgtcaattggcgaataccgtctattgtgtggccgagattgctcacgccgcgggggttaagcttccagaatatgaatcatgaaaaataacacagtggattatgcctattaagcggaacagcgaaaacgagcgctttgaaattctggacgactacaccccgggaccacaccgcaaacgcattgtattttgttgaggaaactatttacgggggttggaattttatcctgtagtttggaactttctgcgattaaatggttattttaagatttttagttattcttcaatgttcttacatctcatattaatattgctgcgaatttatctcaggcccgcgtggattttaagatctactttgtaacatgtacgtcatcaatataaatctcatggggaagtgtttgaacgaattactggagcacagtacttctccacaatatatatacaagatttttttttattattattatttatatatttaaaagttaaaaccactagctgttcctgacagcagccaaccccccccccccattccttttcccgctccttcagtgtgacgacgtgtttaattcaaaaggcaacgtttgtaagaccat-AATTTA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGT-A--A-A--TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-CAGAT-TTG--ACA--TTAAA----TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--A-AA--TCCGC-G--C-A--AG-ACTTAT-----A--T-T-----ATTT-A-----A-A-C---AAGT-----TTG-C-AT-TA--C--ATTGGAG-G-A-----TA-TTTTGTGTTT----AA-ATTTTTTGCCTCAA-TGTT-G---ATCCC---AACGT-AGC-CCAT-----AAA------G-TATGTCATGGT------------CCA---A---------ACGAG-CTCTC----G------TAGAGT-GATTATACTTC-AGC----CA-TT-GTAGAGAA-CT--A------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAAA----AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------TTA---------T-T-C---A--A-TC-------------C--AATT--TTAAAT--CG-------A--AA--------A-TC-A--------TTGC----AAT---T----A---T-AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AA--AT-------TC------AT-ttcttagttgtttatgatgagtgtattgtgttgattaatgtttgaaacatgccatggtatgtacacattcctttcgttatatgacaaatttaagattgtagttccattttaaattcaggtaaagattgacagactggaatcttcatttacatttgcattaatcaaaatctgcgatggaaaattgttcaaaacttaatgtaatttaaacaaagtttgcattatcatggatatttttgttgttgaaatgccatgttgatcaagctacccatgaagtatgttacagtccccaaaacaccaacaccgaagaagtgattatacttcactatttggtagaacaaggagattgatctcaccaggatccagatattttttttttattaaaattttaataaagtttattattcaatccaattttatcaaaaaacaaatgcaatatttattaagcttggtaaatttatccaaatgaaatttaaaaaaaagaaaaaaaaagaccaccttaaattgtattttgtgtgttaaattagtgtgtcattccttttttaggcattgagcctcttgaaattgtcaataaaaaaccatgcatgcatgttctttgttttgttgtgtttctctttacaatccaatctaggaacaaagaaaagtatgactatttctgttgagtattgaataatccatctttgaaatttcaaggcggacatgtgaatgttaagcaatgatgaatttttgccttgcttgggcttcctttgtacggctgtgattgtgtgaaatgtttacttcgtaattactgaggcaggtctctctgtaatcatgcattattgcacaatttctttaagaacatgcagcatatggatccactagttactggcacattcatcactgacattctgctatgcgcccatcaattacacagcattcttcacacacaatgcaacaacatagccgggggggggggggggggatttttgtgaccaaaattattatgt
gi|19 : ccgttattagccaaTTA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TA--TTGA-A-TG-T--ATATTG--ACA--TC-AG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--A-AA--T---T-G--C-C---A-ACTC-T--------T-TAC---A----A-----A-A-T-G-AAAT-----TGG-C-AT-TG-TC--AT----G-T-C-----TA-CT------TT----AATA-----TGTC---A----T-A---AT--C---AAC-G-A-C----T--G--AAA------gcat
gi|8 : -TA-A--AT-ATG--ACT--TT-AA----AC-AAAA-T-A-GCC---A---T------G--A-TA--A---T-G----C--AA-AC------------T-TA----GCTT-A-----A-ATT-ATAAGT-----TTGAC-AA-TA-TC--ATC---G-C-A-----TATTTTTG---AT----TA-A-----TGTC---A-cccaggagacaatgcagatacaaga
gi|2 : agtgggacgatgcgattctaacttaaaagggaacggttgtaaggacactgttcctgtaagttacgatattgtaaccataagacagggaatattcctaggatttgttttcgatagtgcattgtaattaatttttgattactttcgttgttgttgaaattaaaattgtgtttcatttaaacttcagtgaaaatgacagactggaatattcattacattTG--GCA--TT-TA----AC-AAAA-T-ATCC----A---T------G--ATAA--T---T-G----C--AA-ACTT-T-----TGTT-TA----AATT-A-----T-A-T-ATAAGT-----TGA-C-AA-T--TC--AT----C-GCA-----TA-TTTTG---AT----TA-A-----TGTC---A-tcaacggacccatgggcgtacagtccaaaatactaacaccaaaggaatgcacacctcgcctatttgtggaaggaaacaagggggaaaattcatctcacagaataaagttggtttttttttattttgaaataaaaatcattaatcattttcctcaattcttattttatcaaaattaaatgcagtacattaagctgtaaatttatccaaatgaaataaatacatattaatgatatttcactattcaataaagaaaacttaaatatttggatttaatttctgtgtgttaaattagtgtgttatttataaatgcgcattttaggccctgaccctcttgaaaatgtaataaaaatcatacagttcattgtcgttgttgtttttctttacagtccaa
gi|12 : gtcgatatttttcagattcttccctaattcaaacatagttggcgcaaggactcgttttacgtccttcttgactccggtgtgtataaaatagagtgagggtcggtaattttcaattgcgaatgccgtcttatgtgtgccgagatgcttgaccgcggaggagaagcttccagaatatgaatcaatgggaaaaaataatacagtggattattgccattaagcggaacagcgaaaacgagcgctttgaaattctggacctactacaccccgggaccacacccacgcattgtattaggttgaggaaaatatttacggtgggttgaaattatttccttagtttggaaactttatgcataaatggttaaatgtttagattttagttatttttgccaatgcaggtcacccaatgctcttacacatccatccaatttatattgactcgaattttcctcagcccgcgtgattttaagatacttactgctttacatgtactgtcattcaatataatcttcatggggaagtgttgaacgaattatgcccacagtacttctcacaataatattcaagattttattttagattaattattttaaagtttaaaacaacagctgttcctgacatcaaaccccccctttcccgcatcctttcagtgggacaagtgattctaatcaaaagggaacggttgtaaatgacactgttcctgtaagttacgaactgtaacttgtaagacaggaaacaattcctagaattgttcatgatgtatgtgtattgttcagttttaatttttgataacatgttatgtacacatttcctttcgtttattttgtgttccattttaaattttcaggtaaaatgacagaactagaattcttcatgtacattTG--ACA--TT-AA----AC-AAAA-T-A-ACC---A---T------G--C-TA--A---T-G----C--AG-ACTT-T-----GT-T-TA----AATT-A-----T-A-T---AAGT-----TCGAC-AA-TT-TC--ATC---G-C-A-----TA-TTTTG---AT----TA-A-----TGTC---A-tgttgatcaacggacccattgaaaagtacagtccaaaacaccaacaccaaagaaatgattatacttcggtctatatttggaggattcaggatttttgattttttgtattaaaattgaaataaaagtaattgttttattattcaatcatcttccttaatcattgattccaattttatcaaatgcacaatatttaattaagctgttaattttatccaaattgaaataggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatttaacaccttaaatttgtaatttgttgtgtgttaaattagtgtcatttttttttaaagatctgacctcttgaaaatatatttaaaaaaccattgttgttgttgtttttctttacaatccaatctgaacaagaatattaatattgaaaagatttattttgttgagcattgaataatccatctttattgaaattttcaacgggacgttgtgaatttaagcatgatgaatattgccttggtttggcttcctttttgtaccgtatgattggattgaaatggcttacttcgtaattctgagtgcaggtcctctctgtaatcatgcattatgcacaattttttctttatgcagcaaactggatccatagtactgcacatttcacactgccattttactatgcacccataacaacatcttaccactaacattctacacaccaattcacacaaaaacaacgccggggagggggggggttcgtgaccaaaaatt
gi|36 : gatataatcttcatgggaagtgtgtatgagcggattatggcacagtacttctcagaaatatattttaagatatattttaaattttacaaacactagctattcctgacagcagcaccccctcccccgtcattagtggacgacgcaattctaattcaaaagggaaggttgtaatgacaaagttcctgtaagttacgatactgtaactataaggcagggaacattcctataatttgtttttaatgagagcattgtgataattttttttttatatacattactttcgttgttgtaaaattaaaatcgtgttgcatttaaacttcaggggaaatgacagaatggaatctttattacagt-TA----ATTT-A-----A-A-C-A-AAGT-----TTG-C-AT-AA-CA--AT----G-G-T-----TA-TTTTG---TT----AT-A-----TGTC---tgttgatcaacgaacccatggaagtacaatccaaaacaccaacagcaaagaaatacaaatacctcgcctaat
gi|17 : ------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGAA----A------------T-------------------T--------------AATTTCATTA---------T-T-C---A--A-TCATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C--------A--AA--------A-TTAA--------ATGT----AAT--------T---C-A-------TT--AAGCT--G-T---AA--AT-------TT------AT-CCAAA-T-----G-A-ATTAAATACATATTTCAA-TATTTG-----------------ATTAAAAAA--A--------------A---------AC----TTA-AATA--------TTT-G-A----------AT-----T---------C----A----ATTT-TGT----------GTGTT-AAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-A-CTGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATT--GT-TT----TTGT------TG--TTTTTCT-TTAC----AT-TCCA-AT-------AT--G--AAT-AAGA---A-----------
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCAA-----------------T-------------------C--------------A------TT----------T-T-CCTTA--A-TT-------------C--TTTT--TT--ATATC--------A--AA--------A-TTAA--------ATGC----TGTGAAT----T---T-A-------TT--TAAAT--G-----AA--ATATATATTTC------AT-T-ATT-T-----G-ATA----------------A-T---------------------------------A--------------A---------AC----TTA-AATACAAGTAAATAT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT----------GTGTT-AAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-A-CTG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|9 : atttagaaataaagAAAAA--A--------------T---------AT----CAA-ACATTAA--CAC-TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT------GTGTCATAA-ATA-TGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-A-TTG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G-----TG----TT--GTATG----TGGT------T
gi|26 : aacacctatatagaacaatgatataagtctttcgtctatttgtaggataataagagagatccagatgttgtgttatttttctttattattttttttgcgttaattcaaaatttgagaatataaagcaacttgttgtattatactcgatatcgactgttaaattatgtggaatattccaattgtttatcacaccatttgcgataagttgagtttatgtgaatcgcctgttaatgatatagcgcaaatgataattaggaaaatagaatactaaaaacatcgattatgaaaaagtacgtgaaccaaaagaggcttaaagt-G------T----A----ATTTGTGT----------GTGTT-AAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-A-TTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-CC-AT-------------------------TG----TTG-----------TTTTTCT-TTAC----AA-TCCA-AT-------CT--G--tcgttacaatgcatagatgccatgaacaccacgaaatagttattaatatgagagaggtaacttacatgaaacttatgtttttggagcatgtgacagttatatttgaaccatgcttataaaattcaacgggacagtgaaatgttctaacatgagaatcctttgggcctttttggggatccaccgtcgtacagcgcctactgatgg
gi|15 : G-GC-A-TTG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATT--GTA--------GT------TGT-TTTT-CT-TTAC----AA-TCCA-AT-------CT--G--AAC-AAGA---ATATAATATGAAA-A----GT-A-----T----A----------C--TG-T---TT-TG-TTGA-GTATT-GAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT-GA----A----T-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-T-T-GGTT--GG-GCTCC----TTGT-AC-AC-T--TG-AT-TG-G--TGAAATG---TTTTA-------CTTCGTA-AAT--T-C-TGAGTGCAGGTC--TTCT-CTGTA-ATCA-TGC-ATTATTGCACAATTTCTTAAGAACATGC-------------A----------------------GCAACT---G--------G-ATC-CA-CAGTT--AC-TGC-A-C------A-TTC--A-C-----ACT-G--ACATTT-------------TGCTA-TGCACCCAT--CA-ACA-TC-T-A-CA--CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GC-C--GGG---AGGGATT---T------------T-C-GTGAC-CAAAA
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATAT-CATCTCGTGTG----GGGT------GAG-TTTCGAT-TAGC----AATCC---ATA------CT--G--AAC-AAGG---A-----------AGA----GT-GATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G---GAAATT--TTCAATG--GGA-CATGTT-GT-GA----A-T-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATATTG--C-T-C-TCTTG-GG-CTTCC--T-TTGTAACGCT-TATTG-AT-TGCG--TGAAATGT--CTTAA-------CTTCGTA-AAT--TGCATGAGTG
gi|13 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT-----TG----TTGTAGAATCTGT-TTTTCTTGTAACTCGCAA-TCT--ATACACCCACT--G--AAC-AAGA---A-----------A-AA---GT-A-----T----A----------C--AA-GA--GT-TA-TTGA-GTATT-GAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAA-TGTTTCAA-G--GGA-CA---TTGT-GA----A-T-TTTA-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCC-T-TTGCTT--GGGCTTCCG-T-TTGT-ACGGCGTA-TG-AAATG-G--TG-AATGT--TATAA-------CTTCGTA-AAT--TCC-TGAGTGgcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|1 : ------TTCTTAAG-ATA-CAATGC-A-------------------------GC-------------A----------------------AC---T---GCGCCACTGG-ATC-CA-TAGTTTTAC-TGCCA-C------A-TTCCAG-C-----ACT-G--ACATTC-------------TGCTAATGCACCCATT-CA-ACA-TC-T-A-CA--CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--AG-GCGCGGGGGTTCGGGAGGG---GAATTTTT-----T-CTGTGAT-CTAAATgcaggtctctctgtaagatcattagcttattattgcgcacaatgtcttcagaacatgcagcatactggtatccatagtttatgcacttcaacacgacattctgcatgcatcccaacagtcttacactaatgcgattcttcacatcaccaatgctccgcacaaacatagagccggggggggggggaggggggattttcttgtgaccaaaatcattatgt
gi|7 : taaattgtcagttctttcccctgaattaaacataggtggcgcaagactcgttacgtccctcttgaacttccggtgtgtataagatatatgtagtgaagggtggtaattttcccatttgtccgcaaatgccgtcttatgtgtgccgtagatgctctcccgcgggggggttaagcttccagaaatatgaaattcaatgaaaaaaaataacaagtggatcttatttgccattaaccggaacaagcgaaacgagcaacttgaaaattcttggacatctttgcatcccgggactacacaccccacgcattgtattgttgaggaaactatttacggtggttggaaattttatcacttagtttggtaacttctttcttgcataacatgtgttatgtttagattttagttatctgttcaatgcagtctacaaatgttctgtacaatccatcaaatttagaaattgaatttctgaattttctcagctccgcgtgattttaagattcttactgtacagtcgtacatcaaatcaagagtattaattttcatgggaagtggtttgaaacgaattagcacagtaactttctcaatctaatgatatatttcaagatattattttaagatatatttaattagttttaaaacactagctgttcctgacagcagcaccccccccccgtcccttcctttcccgcatcctgtcagtgggacggcccgtgattctaattcaaaaggcaaaggctcgttgtaatgacattgtatctgtagagttacgatctgtaactgtaagaacagggaacattcctaaaattgtttatgatgagtgtaattgtgagttagtttgaaacattgtcaaatgtatgtacacattttctctttcgttatatacaatttaattgtgtgaccatttaaacttcaggtaaaatgacagacgatcttcattaacattttacaatttaatcaaaatatgcgatgaaattcgtcaatacttatgtaatttcaacaaagtttgcatgtatcatatggatattttgttaaaagccaatgttgatcaacatacccatagaaaagtattgtacagtccaaaaaatctcaccaaacaccgtaaagaagtgattatacttcactatttgtagaactaaggaggatttggagatctcacaggatccagatattttttttttttattaaaattttaaataaaggtttattatttcacatccaatttttatcaaaaatcaaatgcaatatttataagctgttataaatttttatccaaatggaaattaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaacacctttaaattttgtaattgtgtgtgttaaaattattgtgtcgtttcttatttagacattgctcttgaaattgataaaaaaataaccttcatttgcatgttcattgttgttgttgttttctttaacaatccaatctagaaacaagaaaaagtatactattatgttgagtattgaataattacatcttatgaattattcaagggacattggaattttatagcatgaggaatatttgccttgcttgaggcttcctttgtaacggctattgattggtgaaagtgttttacttcgtaaattctgagtggcaggtctttctctgtaatcatgcatttaattaggcacaaat------TTCT-TAA-A-A-CA--GC-A-------------------------GC---------------------------------------------G--------G-AT------AG-----C-TGC-AAC------A-TTC--A-C-----ACTTG--ACATTC-------------TGCTACTGCACCCA------ACA-GC-T-A-CATACTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GC-TGGGGG---AGGGATA---G------------TAC-G-GAC-CAAAATtattaatgtataga
gi|13 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatAG-A-A-CA-TGC-A-------------------------GC-------------AT---------------------AC---T---G--------GTATC-CA-TAGTT--TA-TGC-A-C--------TTC--AAC-----AC--G--ACATTC-------------TGC-A-TGCATCC----CA-ACAGTC-TTA-CA--CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GC-CGGGGG---GGGGGGG---AGGGGGGATTTTCT-T-GTGAC-CAAAATattatat
gi|3 : aaattcatgcatatgtcatgttcatttgttgtagaatctgtttttcttgtaactcgcaatctatacacccactgaacaagaaaaagtatacaagagttattgagtattgaataatcccactatattatccaaaaatgtttcaagggacattgtgaattttaagcatgaaactgaatatttgcctttgcttgggcttccgtttgtacggcgtatgaaatggtgaatgttataacttcgtaaattcctgagtggcaggtctctctgtaagatcattagcttattattgcgcacaatgtcttcG-A-A-TG-TGCCA-------------------------GT-------------A----------------------AC---TAGTG--------G-ATC-CA-TA--T--GC-TGC-A-T------G-TTC--cattatgt
gi|15 : tttcccctaattcaacataggtggcgccaagactcgtttacgtccttcttgacttgccgttgtgtataagataagaggagggtggtaatttgtcaattggcgaataccgtctattgtgtggccgagattgctcacgccgcgggggttaagcttccagaatatgaatcatgaaaaataacacagtggattatgcctattaagcggaacagcgaaaacgagcgctttgaaattctggacgactacaccccgggaccacaccgcaaacgcattgtattttgttgaggaaactatttacgggggttggaattttatcctgtagtttggaactttctgcgattaaatggttattttaagatttttagttattcttcaatgttcttacatctcatattaatattgctgcgaatttatctcaggcccgcgtggattttaagatctactttgtaacatgtacgtcatcaatataaatctcatggggaagtgtttgaacgaattactggagcacagtacttctccacaatatatatacaagatttttttttattattattatttatatatttaaaagttaaaaccactagctgttcctgacagcagccaaccccccccccccattccttttcccgctccttcagtgtgacgacgtgtttaattcaaaaggcaacgtttgtaagaccattgttcctgtcagttacgatactgtaactgatagacagggacattcttagttgtttatgatgagtgtattgtgttgattaatgtttgaaacatgccatggtatgtacacattcctttcgttatatgacaaatttaagattgtagttccattttaaattcaggtaaagattgacagactggaatcttcatttacatttgcattaatcaaaatctgcgatggaaaattgttcaaaacttaatgtaatttaaacaaagtttgcattatcatggatatttttgttgttgaaatgccatgttgatcaagctacccatgaagtatgttacagtccccaaaacaccaacaccgaagaagtgattatacttcactatttggtagaacaaggagattgatctcaccaggatccagatattttttttttattaaaattttaataaagtttattattcaatccaattttatcaaaaaacaaatgcaatatttattaagcttggtaaatttatccaaatgaaatttaaaaaaaagaaaaaaaaagaccaccttaaattgtattttgtgtgttaaattagtgtgtcattccttttttaggcattgagcctcttgaaattgtcaataaaaaaccatgcatgcatgttctttgttttgttgtgtttctctttacaatccaatctaggaacaaagaaaagtatgactatttctgttgagtattgaataatccatctttgaaatttcaaggcggacatgtgaatgttaagcaatgatgaatttttgccttgcttgggcttcctttgtacggctgtgattgtgtgaaatgtttacttcgtaattactgaggcaggtctctctgtaatcatgcattattgcacaatttctttaaG-A-A-TG-TGC-A-------------------------GT-------------A----------------------AC---T---GTG------G-ATC-C---AGTT--GC-TGC-A-T------G-TTC--atcactgacattctgctatgcgcccatcaattacacagcattcttcacacacaatgcaacaacatagccgggggggggggggggggatttttgtgaccaaaattattatgt
gi|41 : ggcattgacctctaaaatgtaataaaaaaccatgcatgcatgttcattgtagttgtttttctttacaatccaatctgaacaagaatataatatgaaaagtatactgttttgttgagtattgaataatccatcttatgaaatttcaagggacatgtgaataagcatgatgaatatttgccttggttgggctccttgtacacttgattggtgaaatgttttacttcgtaaattctgagtgcaggtcttctctgtaatcatgcattattgcacaatttcttaaA-TGC-A-------------------------GC-------------A----------------------AC---T---G--------G-ATC-CA-TAGTT--AC-TGC-A-C------acactgacattttgctatgcacccatcaacatctacactagcattctttacaccacaatcgcacaaacatagccgggagggattttcgtgaccaaaa
gi|41 : -TGC-A-------------------------GT-------------A----------------------AC---TAT-G--------G-ATC-C---AGTT--GC-TGC-A-
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|37 ): ACACTACACCACGGGACCACACCCACGCATTATTGTCACATG
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 333333333333 222222222222222222222222222222 33333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 33333333333333 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 11 333333 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 5555555555555555555555555555555555555555555 22222222222222222222222222222222222 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 1111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 444444444444444444444444444444444444444444 111 111 111 11 1111 444444444444444444444444444444444444444444444 111111 11111 111 11111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 11111 2222222222222 11 1111111 111111 44444444444444444444444 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 3 333333333333 3 3 999 3 44 000000000000000000000000000000 33333333333333 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 11111111111111 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 22 5 1 4 000000 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 3 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 8888888888888888888888888888888888888888888 555 88888888888888888888888888888888888 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 1111111 2 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 77777 1 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 66 666 4 9999 4 666 9999 4 555 999 00 777 4 7 55 0 4 3333 555 3 4 4 4 8 444444444444444444444444444444444444444444444 9999 4 222222 66 22222 8 111 8 55555555555 99 4 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 8 888888 4 4 777 8 4 111111 4 777 66 11111 4 66 8888888888888 66 8 1 00 1 9999999 4 4 66 777777 1 4 4 9999 33333333333333333333333 4 222222 777 4 999999 66 6 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . . ............ . . ... . .. .............................. .............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... .. . . . ...... . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . ........................................... ... ................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . ....... . ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... . ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . .. ... . .... . ... .... . ... ... .. ... . . .. . . .... ... . . . . . ............................................. .... . ...... .. ..... . ... . ........... .. . ........................................................................ . . ...... . . ... . . ...... . ... .. ..... . .. ............. .. . . .. . ....... . . .. ...... . . . .... ....................... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 3 444444444444 3 3 222 3 66 777777777777777777777777777777 44444444444444 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 66666666666666 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 22 3 1 4 333333 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 9 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 2222222222222222222222222222222222222222222 222 99999999999999999999999999999999999 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 1111111 6 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 77777 0 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 11 777 4 6666 4 777 4444 4 333 888 66 888 4 3 22 1 4 1111 333 9 4 4 4 9 999999999999999999999999999999999999999999999 4444 4 888888 11 99999 9 888 9 66666666666 55 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 0 555555 0 0 000 0 0 555555 4 888 11 11111 4 11 9999999999999 11 9 1 66 9 0000000 4 4 11 222222 0 4 4 7777 66666666666666666666666 4 222222 000 4 444444 11 7 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA-C-A-CT--AC---ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CG-------C--A---------T-T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--TNACA-CAC----TAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----AT-G-C---A-TGTA-TGTACA----T--ACACATT-C-CTTTCGTTA-T-AT-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--T-----TTACAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG------G--T----G-----------AAAT------------GTTTTTA----CTTCGTA-A------AT--T-C---TGAGT-GCA--GGTCT-TC--TNNG-A-A-CA--TGC-ATTATT--------------------GC----------------------A--A----C---TG--------GATC-CA-TAGT---T--A-C-T---GC-A-C------A-T---TC--AC-----AC-TG--ACATTC-------------TG--CTA-TGCACCCAT--CAACA------TC-TA-C--A------CTAGC-ATT-CTTC---ACAC-------------------A--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA-C-A-CT--AC--CACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CG-------C--A---------T-T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---N-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--TNACA-CNC--A-TAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----AT-G-C---A-TGTA-TGTACA----T--ACACGTT-C-CTTTCGTTA-T-AT-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--T-----TNACAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG------G--T----G-----------AAAT------------GTTTTTA----CTTCGTA-A------AT--T-C---TGAGT-GCA--GGTCT-TC--TNNG-A-A-CA--TGC-A-------------------------GC----------------------A--A----C---TG--------GATC-CA-TAGT---T--A-C-T---GC-A-C------A-T---TC--AC-----AC-TG--ACATTC-------------TG--CTA-TGCACCCAT--CAACA------TC-TA-C--A------CTAGC-ATT-CTTC---ACAC-------------------A--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA-C-ATCT--TTG-CATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--CG-------C--A---------T-T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--TTAAAACAC----TAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----ATTG-TCAAA-TGTA-TGTACA--------CATTTT-CTCTTTCGTTA-T-AT-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TCT---T-----TAACAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T--GAAT---TATTCAA-G--GGA-CA---TTG----GA-A-T-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCC-TTGCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTG-ATTGGTGAAAG--T----GTTTTACTTCGTAAATTCTGAGTGGCAGGTCTTT-----CTCTGTA-ATCATGCAT--T-TAATTAGGC-ACA--AATTT-CT--TAAG-ATA-CAA-TGC-A-------------------------GC----------------------A--A----C---TGCGCCACTGGATC-CA-TAGT---TTTA-C-T---GCCA-C------A-T---TCCAGC-----AC-TG--ACATTC-------------TG--CTAATGCACCCATT-CAACA------TC-TA-C--A------CTAGC-ATTACTTTCAAACAC-------------------A--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAAC-A-CCTCACAGCACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--TG-------CGAA---------T-T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA-C-A--T--A----ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--CG-------A--G---------G-T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA--------T---T-ATATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--T-ACA-AAC--C-TAGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--TTACA-AAC--ACTAGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT----------------------TTT--TTTATA----T--ACA--TT-A-CTTTCGTTG-TTGT-AA-AATTAA--AATC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAATGT-TTCAA-G--GGA-CAT--TGT----GA-ATT-TT-A-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG------G--T----G------------AAT------------GTTATAA----CTTCGTA-A------AT--TCC---TGAGTGGCA--GGTCTCTCTGTAAG-A-T-CA--T-T-A-------------------------GCTT--------------------ATTA----T---TG-----------CGCA-CAAT---G--T-C-TTCAGA-A-C------A-TGCAGC--AT-----AC-TG--GTATCCA------------TAGTTTA-TGCACT--T--CAACACGACATTC-TG-C--ATGCATCCCAAC-AGT-CTT----ACACTAATGCGATTCTTCACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATTTA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--T-----TTACAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A----T-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGGTTG-GGCT--C--C-TTGT-A-C-AC-T--T-G-ATTG------G--T----G-----------AAAT------------G-TTTTA----CTTCGTA-A------AT--T-C---TGAGT-GCA--GGTCT-TC--TCTGTA-ATCA--TGC-ATTATTGCACAATTTCTTAAGAACATGC----------------------A--G----CAACTG--------GATC-CA-CAGT---T--A-C-T---GC-A-C------A-T---TC--AC-----AC-TG--ACATTT-------------TG--CTA-TGCACCCAT--CAACA------TC-TA-C--A------CTAGC-ATT-CTTT---ACAC-------------------C--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC---GGGA---GGGATTT-----------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA-T--------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--CG-------C--AGTGCCAGTAT-T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--T-----TTACATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagTTA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA-C---CT--ACTACACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CG-------C--A---------T-T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--TAAAA-CA---A-CAGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----AT-G-T-------TA-TGTACA----C--AT---TT-C-CTTTCGTT--T-AT------T-------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--T-----TTACAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT--GAAAT--T-TTCAACG--GGA-CGT--TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCC-TTGGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-G-ATTG------GATT----G-----------AAAT------------G-GCTTA----CTTCGT--A------AT--T-C---TGAGT-GCA--GGTCC-TC--TCTGTA-ATCA--TGC-ATTAT---------------------GCACAATTTTTTCTTTATGCAGCAA--A----C---TG--------GATC-CA-TAG----T--A-C-T---GC-A-C------ATT---TC--AC-----AC-TG--CCATTT-------------TA--CTA-TGCACCCATAACAACA------TCTTACC--A------CTAAC-ATT-CT-----ACAC-------------------A--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA-C-A-CT--AC---ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--CG-------C--G---------G-TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA-C-C-CT--AC---ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGTACCGTC--A---------CAT---G---TGTT------TG------TTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--T-----TTACAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA-CGA-CT--AC---ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAACG-------C--A---------T-T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--TAAAA-CCA--C-TAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----AT-GCC---A-TG----GTATG----T--ACACATT-C-CTTTCGTTA-T-ATGACAAATTTAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--T-----TTACAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T--GAAA---T-TTCAA-GGCGGA-CA---TGT----GA-A-TGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-G-ATTGT-----G--T----G-----------AAAT------------G--TTTA----CTTCGTA-A------TT--A-C---TGAG--GCA--GGTCTCTC--TGTA-A-T-CA--TGC-ATTATTGC------------------AC----------------------A--A----T---T-----------TC-TT-TAAG---A--A-CAT---GC-AGCATATGGA-T---CC--ACTAGTTAC-TGGCACATTCATCACTGACATTCTG--CTA-TGCGCCCAT--CAA---------T-TA-C--A------C-AGC-ATT-CTTC---ACAC-------------------A---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A-C-A-CT--AC---ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--CG-------C--A---------T-T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA-C-A-CT--AC--CACCC-CG----CCACAC---C-CA--CG-------C--A---------T-T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--TTACA-CTCTAG-TAGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----AT-G-C---A-TGTA-TGTACA----TTAACACATT-C-CTTTCGTTA-T-AT-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--T-----TAACAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCC-TTGCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG------G--T----G------------AAT------------GTTTTTA----CTTCGTA-A------AT--T-C---TAAGT-GCA------T-TC--TAAG-A-A-CA--TGC-A-------------------------GC----------------------A--A----C---TG--------GATC-CA-TAGT---T--A-C-T---GC-A-C------A-T---TC--AC-----AC-TG--ACATTC-------------TG--CTA-TGCACCCAC--CAACA------TC-TA-C--A------CTAGC-ATT-CTTC---ACAC-------------------A--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : A--TGC-A-------------------------GC----------------------A--A----C---TG--------GATC-CA-TAGT---T--A-C-T---GC-A-C------
gi|5 : ATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A-C-A-CT--AC---ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--CT-------C--A---------T-----G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT--AAACA-C------TAGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT-----------TA-TG--------T--ACACATT-C-CTTTCG---------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A--------TC---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--T-----TTACAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-C--GGA-CA---T-T----GA-A-T-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC--TGTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-G-A-TG------G--T----G-----------AAAG------------G--TTTA----CTTCGTA-A------AT--T-C---TGAGT-GCA---GTCT-TC--TCGT-A-T-CA--TGC-ATTATT--------------------GCACAATTTCTTAAG---------A--A----CA--TGCAGCAACTGATC-CA-TAGT---T--A-C-T---GC-A-C------A-T---TC--A------AC-AT--ACATTA-------------TA--CTA-TG--CCCAT--C-ACA-------C-T--C--A------CAAAC-ATT-CTTC---A--------------------------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA-C-A-C--------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---CG-------C--A---------T-----A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GATCATGACA-CCT--A--AGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----AT-G-C---G-TG-A-TA-ACAGTTCT--ACACATTAC-CTTTCGTTAAT-AT-AC-A-TTCA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----G-C---A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--T-----TGACACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T----AA---T-TCAAA-A--GGATCA----GTAGAAGAGA-T-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCT-GTTATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-GTATTA------C--TTTACG-----------TAAT------------TCTGATAGCATCTCTCTACA------ATCAT-C---TTATT-GCA--CCATT-TC--TTAA-A-A-CA--TGCTA-------------------------GC----------------------T--A--------TG--------AGTCACATTAGT---T--A-C-T---GC-A-C------A-T---T----C-----AC-CG--AC--TC-------------CG--CTA--GCA-CCAT--C-ACAC-----TC-TG-T--AG-----CTGG---GT-CTCC---GCCT-------------------A----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTTAAAA-CAC----TA-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTAT-G-C---AGTGTAGTGTACA-------ACA-GTT-T-CTTTCGATA---ATGAC-AATTTA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGAT-----TAGCAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G--GAAAT--T-TTCAATG--GGA-CATGTTGT----GA-A-T-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCT-CT-CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-G-ATTGC-----G--T----G-----------AAAT------------GTCTTAA----CTTCGTA-A------AT--TGCA--TGAGTGGCAGTGGTCT-TCT-TCTT-A-A-CATTTGC-ACTGTTTTGC----------------AC----------------------A--AATTTC---TT--------AAAA-CAGCAGCGGAT--AGC-T---GCAA-C------A-T---TC--AC-----ACTTG--ACATTC-------------TG--CTACTGCACC-----CAACA------GC-TA-CATA------CTAGCTATT-CTTC---ACAC-------------------AATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT----------------------TG-A-T---------T--AC---TT-T-CGTT-GTTG-T--T-GA-AATTAA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--T-----TTACAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--G-----TTACAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 22222222222222 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 111111111111111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 6666666666666666666666666666666666666 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 111 111 11 1111 222 1 111 1 2222222222 111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 11111111 111111 22222222222222 1111 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 33333333333333 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 777777777777777 4 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 7777777777777777777777777777777777777 1 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 66 666 4 9999 4 666 9999 4 555 999 00 777 4 7 55 0 4 3333 555 3 4 4 4 4 2 8 66 4 1 000 66 1 8 4 3 222 4 3 2222222222 777777 55 55 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 8 555 2 4 4 22222222 4 777777 55 66 66666666666666 4 4 8888 1 1111 4 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 6 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ............... . . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . ..................................... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . .. ... . .... . ... .... . ... ... .. ... . . .. . . .... ... . . . . . . . .. . . ... .. . . . . ... . . .......... ...... .. .. .................................................................................. . . ... . . . ........ . ...... .. .. .............. . . .... . .... . .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 88888888888888 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 999999999999999 4 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 8888888888888888888888888888888888888 1 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 11 777 4 6666 4 777 4444 4 333 888 66 888 4 3 22 1 4 1111 333 9 4 4 4 4 0 9 11 6 8 666 11 9 9 4 3 888 4 3 9999999999 000000 55 55 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 000 3 0 0 44444444 4 222222 44 11 11111111111111 4 4 6666 9 3333 4 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 7 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--TNAAA--C---A-CTA-GCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATG-C--TGT---A-TGTACG----T--ACACATT-C---CTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-T-TC--TCTG-AN-CA------T--GC--ATT--A--T-----------------T--GCACAA-TT-TT-A-----------AACA----------T-----G--------G-ATC-CA---TAGTTACT-GC-AC------A-TTC-A------CAC-TG--ACATT--------------CTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--TNACA--C---A-CTA-GCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATG-CA-TGT---A-TGTACA----T--ACACATT-C---CTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-T-TC--TNNG-AA-CA------T--GC--ATT--A--T-----------------T--GC-----------------------AAC-----------T-----G--------G-ATC-CA---TAGTTACT-GC-AC------A-TTC-A------CAC-TG--ACATT--------------CTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--TTAAAA-C---A-CTA-GCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----AT-----TGTCAAA-TGTATG----T--ACACATT-TTCTCTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T--GAAT---TATTCAA-G--GGA-CA---TTG----GA-A-T-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCC-TTGCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTG-ATTG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGGCA--GGTCTT-TC--TCTGTAATCA------T--GC--ATTTAA--T-----------------TAGGCACA--------------------AAT-----------TTCTTAA--------G-ATA-CAATGCAGCAACT-GC-GCCACTGGA-TCC-ATAGTTTTAC-TGCCACATTCCAGCACTGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--T-ACA--A---ACCTA-GCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--TTACAAAC---A-CTA-GCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT--------------------T---T-TTT-TA----T--ATACATT-A---CTTTCGTTG-TTG--T-AA-AATTAA--AATC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAATGT-TTCAA-G--GGA-CAT--TGT----GA-ATT-TT-A-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TG-AATGT-TATAACTT--CGTAAATTCC-TGAGTGGCA--GGTC-TCTCTGTAAG-AT-CA------TTAGCTTATT--A--T-----------------T--GCGCACAATGTCTTCAG--------AACATGCAGCATACT-----G--------GTATC-CA---TAGTTTAT-GC-AC--------TTCAA------CAC--G--ACATT--------------CTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTCTTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATTTA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A----T-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGGTTG-GGCT--C--C-TTGT-A-C-AC-T--T-G-ATTG-G--TGAAATG--TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-T-TC--TCTGTAATCA------T--GC--ATT--A--T-----------------T--GCACAATTTCTTAAGAACATGCAGCAAC-----------T-----G--------G-ATC-CA---CAGTTACT-GC-AC------A-TTC-A------CAC-TG--ACATT--------------TTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC---GGGA---GGGATTT-----------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagTTA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--TAAAA--C---A-ACA-GCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----ATG-T----T---A-TGTACA----C--AT---TT-C---CTTTCGTT--T-A--T------T-------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT--GAAAT--T-TTCAACG--GGA-CGT--TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCC-TTGGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-G-ATTG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-C-TC--TCTGTAATCA------T--GC--ATT--A--TGCACAATTTTTTCTTTAT--GCAGCA-------------------AAC-----------T-----G--------G-ATC-CA---TAG-TACT-GC-AC------ATTTC-A------CAC-TG--CCATT--------------TTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTTACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--TAAAAC-C---A-CTA-GCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----ATGCCA-TG-------GTATG----T--ACACATT-C---CTTTCGTTA-T-A--TGACAAATTTAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T--GAAA---T-TTCAA-GGCGGA-CA---TGT----GA-A-TGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-G-ATTGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--GCA--GGTC-TCTC--TGTA-AT-CA------T--GC--ATT--A--T-----------------T--GCACAATTTCTTTAAG---------AACATGCAGCATA-T-----G--------G-ATC-CAC--TAGTTACTGGC-AC------A-TTC-AT-----CAC-TG--ACATT--------------CTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-TA-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--TTACA--CTCTA-GTA-GCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATG-CA-TGT---A-TGTACA----TTAACACATT-C---CTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCC-TTGCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-GCA-------T-TC--TAAG-AA-CA------T--GC--A----------------------------GC-----------------------AAC-----------T-----G--------G-ATC-CA---TAGTTACT-GC-AC------A-TTC-A------CAC-TG--ACATT--------------CTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : A------T--GC--A----------------------------GC-----------------------AAC-----------T-----G--------G-ATC-CA---TAGTTACT-GC-AC------
gi|5 : ATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT----AAA--C---A-CTA-GCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT-------T---A-TG--------T--ACACATT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-C--GGA-CA---T-T----GA-A-T-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC--TGTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-G-A-TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA---GTC-T-TC--TCGT-AT-CA------T--GC--ATT--A--T-----------------T--GCACAATTTCTTAAG----------AACA----------T-----GCAGCAACTG-ATC-CA---TAGTTACT-GC-AC------A-TTC-A-------AC-AT--ACATT--------------ATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T--C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GATCATGACA--C-----CTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----ATG-CG-TG----A-TA-ACAGTTCT--ACACATTAC---CTTTCGTTAAT-A--T-AC-A-TTCA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T----AA---T-TCAAA-A--GGATCA----GTAGAAGAGA-T-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCT-GTTATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGT-AATT-C-TGATA-GCA----TC-TCTC--TACA-AT-CATCTTATT--GC--ACC--A--T-----------------T--TCTTAA-------------------AACATGCTAGCTA-T-----G--------A-GTCACAT--TAGTTACT-GC-AC------A-TT---------CAC-CG--AC--T--------------CCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-TG-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTTAAAA--C---A-CTA--CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTATG-CAGTGT---AGTGTACA-------ACA-GTT-T---CTTTCGATA---A--TGAC-AATTTA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G--GAAAT--T-TTCAATG--GGA-CATGTTGT----GA-A-T-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCT-CT-CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-G-ATTGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGGCAGTGGTC-T-TCT-TCTT-AA-CATT----T--GC--ACT--GTTT-----------------T--GCACAAATTTCTTAA----------AAC-----------A-----G--------C-AGCGGA---TAG---CT-GCAAC------A-TTC-A------CACTTG--ACATT--------------CTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-TA-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT--------------------------TG---------------ATT-A---CTTTCGTTG-T-TGTT-GA-AATTAA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 22222222222222 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 11111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 777777777777777777777777777777777777 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 11 11111111111 111 11 1111 111 111 3333333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 1111 11 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 33333333333333 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 11111 66 8 777 66 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 888888888888888888888888888888888888 4 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 777 8 00 9999 4 44444444444 4 4 444 00 777 4 7 0 4 0 4 4444 555 0 4 4 4 66 8 66 1 555 2 66 1 4 8 8 4 222 88 4 7777777 1 66 66 66 77777 66 66 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 4 111 666 4 4 4 4 0000 55 4 4 8888 1 00 4 777 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 1 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ..... .. . ... .. . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . .................................... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . ... . .. .... . ........... . . ... .. ... . . . . . . .... ... . . . . .. . .. . ... . .. . . . . . ... .. . ....... . .. .. .. ..... .. .. ........................................................................... . . ... ... . . . . .... .. . . .... . .. . ... .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 88888888888888 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 22222 11 9 888 11 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 000000000000000000000000000000000000 4 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 888 9 66 6666 4 66666666666 4 4 222 66 888 4 3 8 4 1 4 1111 333 1 4 4 4 44 9 11 8 111 2 11 9 4 9 9 4 888 00 4 3333333 0 11 11 11 66666 11 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 000 333 0 0 0 4 3333 44 4 4 6666 9 77 4 000 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 1 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTC-TCT--GTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T-------------A--A-----------ACA------------------TGC---------G-ATC-CA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTC-TCT--G----ANCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T-------------A--A-----------ACA------------------TG----------G-ATC-CA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--T-TA--AAAC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----AT----TGTCAAA-T----GTATGT--ACACA-TT-TTCTCTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T---GAAT-TA-TTCAA-G--GGA-CA---T-TG----GA-AT-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCCTT-GCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTGAT-TG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGG-CA--GGTCTTTC-TCT--GTA--ATCA--T--GC--ATTTAA--TTAGGC--ACAAATTT---C--T--T-------------A--AGAT--------ACAATGCAGCAACTGCGCCACTG----------G-ATC-CA---TAGTTTTACT-GCC-ACA-TTCCAG-CAC-TGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--TACA--AA-C----CT--AGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--T-TACAAA-C---ACT--AGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT------------TTT--TTT---A-----------T--ATACA-TT-A---CTTTCGTTGTTG--T-AA-AATTAAA--A-TC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAA-TGTTTCAA-G--GGA-CA---TTGT----GA-AT-TTTA-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TGAA-TGT-TATAACTT--CGTAAATT-CCTGAGT-GGCA--GGTC-T-C-TCT--GTAAGATCA--TTAGCTTATT--A--TT--GCGCACAA---TGTCT--T--C-------------AG-A-----------ACA------------------TGCAGCATACTGGTATC-CA---TAG--TTTAT-G-C-AC--TTC--AACAC--GACATTCTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTC-TTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATT-TA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT----A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GGTTG-GGCTCC-----TTGT-A-CA-C-T--T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTT-ACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTC-TCT--GTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--TCTT-------------A--AGA---------ACA------------------TGCAGCAACTG-G-ATC-CA---CAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTTTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGAGGG---ATTT--------------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagT-TA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--T-AA--AA-C---AAC--AGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----ATGT----------------TATGT--ACACATTT-C---CTTTCGTT--TA--T------T--------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT---GAAATT--TTCAACG--GGA-CGT--T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCCTT-GGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-GAT-TG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-CTC-TCT--GTA--ATCA--T--GC--ATT--A---T--GC--ACAA---T---T--T--TTTCTTTATGCAGCA--A-----------AC-------------------TG----------G-ATC-CA---TAG---TACT-G-C-ACATTTC--A-CAC-TGCCATTTTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTT-ACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--T-AA--AACC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----ATGC--CAT---G------GTATGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--TGACAAATT-TAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T---GAAA-T--TTCAA-GGCGGA-CA---T-GT----GA-ATGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-GAT-TGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--G-CA--GGTC--TC-TCT--GTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---TTTCT--T--T-------------A--AGAACATGCAGCATA------------------TG----------G-ATC-CAC--TAG--TTACTGG-C-ACA-TTC--ATCAC-TGACATTCTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-T-A-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-TA--CA-CTCTAGT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGCA-TGT---A-T----GTACATTAACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCCTT-GCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-G-CA-------TTC-TAA--G----AACA--T--GC--A-----------GC------------------------------------A-----------AC-------------------TG----------G-ATC-CA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : --A-----------AC-------------------TG----------G-ATC-CA---TAG--TTACT-G-C-AC
gi|5 : atgcagcATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT-----A--AA-C---ACT--AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT------------------TATGT--ACACA-TT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-C--GGA-CA---T--T----GA-AT-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC-T-GTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-GA--TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA---GTC-TTC-TCG--T----ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---TTCT--T-------------AAGA-----------ACA------------------TGCAGCAACT--G-ATC-CA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A--AC-ATACATTATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T---C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GAT--C-AT--GA-C---ACCTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----ATGCG-TG----A-TAACAGTTC-T--ACACA-TTAC---CTTTCGTTAATA--T-AC-A-TT-CA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T-----AA-T--TCAAA-A--GGATCA-----GTAGAAGAGAT-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCTGT-TATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGT-AATT-C-TGATA-G-CA----TC--TC-TCTACA----ATCA--T---C---TT--A--TT--GC--ACCA---T---T--T--CTTA----------A--A-----------ACA------------------TGCTAGCTAT--G-AGT-CACATTAG--TTACT-G-C-ACA-TT-----CAC-CGAC--TCCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-T-G-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTT-AA--AA-C---ACT--A-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTATGCAGTGT---AGT----GTACA---ACA-G-TT-T---CTTTCGATA--A--TGAC-AATT-TA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G---GAAATT--TTCAATG--GGA-CATGTT-GT----GA-AT-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCTCT--CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-GAT-TGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGG-CAGTGGTC-TTCTTCT--T----AACATTT--GC--ACT--GTTTT--GC--ACAA---A---T--T--TCTTA---------A--A-----------ACA-------------------G----------C-AGCGGA---TAG-----CT-G-CAACA-TTC--A-CACTTGACATTCTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-T-A-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT-------------------------T----G-----------A-TT-A---CTTTCGTTG-TTGTT-GA-AATT-AA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 22222222222222 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 11111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 777777777777777777777777777777777777 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 111 111 11 1111 111 1 111 11 111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 11 1111 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 33333333333333 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 11111 66 8 777 66 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 888888888888888888888888888888888888 4 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 66 666 4 9999 4 666 9999 4 4 4 999 00 777 4 7 55 0 4 4444 555 0 4 4 4 4 2 8 66 4 1 555 2 66 1 8 4 3 222 33 1 66 1 66 66 66 222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 666 4 4 4 4 00 4 55 4 4 8888 1 1111 4 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 1 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ..... .. . ... .. . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . .................................... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . .. ... . .... . ... .... . . . ... .. ... . . .. . . .... ... . . . . . . . .. . . ... . .. . . . . ... .. . .. . .. .. .. ......... .................................................................... ... ... . . . . .. . .. . . .... . .... . .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 88888888888888 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 22222 11 9 888 11 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 000000000000000000000000000000000000 4 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 11 777 4 6666 4 777 4444 4 4 4 888 66 888 4 3 22 1 4 1111 333 1 4 4 4 4 0 9 11 6 8 111 2 11 9 9 4 3 888 44 0 11 9 11 11 11 666666666 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 333 0 0 0 4 66 4 44 4 4 6666 9 3333 4 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 1 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-TTCTCTGTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GCACAA---T---T--T--T-------------A--A---AC-ATGCAGCA--T---------G----------ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-TTCTCTGTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GCACAA---T---T--T--T-------------A--A---AC-ATGC----------------G----------ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--T-TA--AAAC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----AT----TGTCAAA-T----GTATGT--ACACA-TT-TTCTCTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T--GAAT---TATTCAA-G--GGA-CA---TTG----GA-A-T-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCC-TTGCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTG-ATTG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGGCA--GGTCTTTCTCTGTA--ATCA--T--GC--ATTTAA--TTAGGCACAAATTT---C--T--T-------------A--AGATACAATGCAGCAACTGCGCCACTGG----------ATCCA---TAGTTTTACT-GCC-ACA-TTCCAG-CAC-TGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--TACA--AA-C----CT--AGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--T-TACAAA-C---ACT--AGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT------------TTT--TTT---A-----------T--ATACA-TT-A---CTTTCGTTGTTG--T-AA-AATTAAA--A-TC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAATGT-TTCAA-G--GGA-CAT--TGT----GA-ATT-TT-A-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TG-AATGT-TATAACTT--CGTAAATTCC-TGAGTGGCA--GGTC--TCTCTGTAAGATCA--TTAGCTTATT--A--TTGCGCACAA---TGTCT--T--C-------------AG-A---AC-ATGC----------------AGCATACTGGTATCCA---TAG--TTTAT-G-C-AC--TTCA-A-CAC--GACATTCTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTCTTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATT-TA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T----A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCC-TTGGTTG-GGCTCC-----TTGT-A-CA-C-T--T-G-ATTG-G--TGAAATGT-TTT-ACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-TTCTCTGTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GCACAA---T---T--TCTT-------------A--AGA-AC-ATGCAGCAACTG--------G----------ATCCA---CAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTTTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGAGGG---ATTT--------------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagT-TA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--T-AA--AA-C---AAC--AGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----ATGT----------------TATGT--ACACATTT-C---CTTTCGTT--TA--T------T--------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT--GAAAT--T-TTCAACG--GGA-CGT--TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCC-TTGGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-G-ATTG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-GCA--GGTC-CTCTCTGTA--ATCA--T--GC--ATT--A---T--GCACAA---T---T--T--TTTCTTTATGCAGCA--A---AC--TG-----------------G----------ATCCA---TAG---TACT-G-C-ACATTTC--A-CAC-TGCCATTTTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTTACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--T-AA--AACC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----ATGC--CAT---G------GTATGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--TGACAAATT-TAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T--GAAA---T-TTCAA-GGCGGA-CA---TGT----GA-A-TGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCC-TTGCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-G-ATTGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--GCA--GGTC--TCTCTGTA--ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GCACAA---TTTCT--T--T-------------AAGA---AC-ATGCAGCATATG--------G----------ATCCAC--TAG--TTACTGG-C-ACA-TTC--ATCAC-TGACATTCTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-TA-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-TA--CA-CTCTAGT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGCA-TGT---A-T----GTACATTAACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-G--GGA-CA---TGT----GA-A-T-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCC-TTGCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-G-ATTG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-GCA-------TTCTAAG-A--A-CA--T--GC--A-----------GC----------------------------------A---AC--TG-----------------G----------ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : ----------------G----------ATCCA---TAG--TTACT-G-C-AC
gi|5 : atgcagcaactgATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT-----A--AA-C---ACT--AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT------------------TATGT--ACACA-TT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T--GAAA---T-TTCAA-C--GGA-CA---T-T----GA-A-T-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC--TGTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-G-A-TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-GCA---GTC-TTCTC-GT---ATCA--T--GC--ATT--A--TT--GCACAA---T---TTCT--T-------------AAGA---AC-ATGCAGCAACT---------G----------ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A--AC-ATACATTATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T--C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GAT--C-AT--GA-C---ACCTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----ATGCG-TG----A-TAACAGTTC-T--ACACA-TTAC---CTTTCGTTAATA--T-AC-A-TT-CA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T----AA---T-TCAAA-A--GGATCA----GTAGAAGAGA-T-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCT-GTTATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGT-AATT-C-TGATA-GCA----TC--TCTCTACA--ATCA--T---C---TT--A--TT--GCACCA---T---T--T--CTTA----------A--A---AC-ATGCTAGCTAT---------G----------AGTCACATTAG--TTACT-G-C-ACA-TT-----CAC-CGAC--TCCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-TG-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTT-AA--AA-C---ACT--A-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTATGCAGTGT---AGT----GTACA---ACA-G-TT-T---CTTTCGATA--A--TGAC-AATT-TA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G--GAAAT--T-TTCAATG--GGA-CATGTTGT----GA-A-T-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCT-CT-CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-G-ATTGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGGCAGTGGTC-TTCTTCTTA--A-CATTT--GC--ACT--GTTTT--GCACAA---A---T--T--TCTTA---------A--A---AC-A-GC----------------A----------GCGGA---TAG-----CT-G-CAACA-TTC--A-CACTTGACATTCTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-TA-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT-------------------------T----G-----------A-TT-A---CTTTCGTTG-TTGTT-GA-AATT-AA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 22222222222222 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 11111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 777777777777777777777777777777777777 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 11 11111111111 111 11 1111 111 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 1111 11 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 33333333333333 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 11111 66 8 777 66 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 888888888888888888888888888888888888 4 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 777 8 00 9999 4 44444444444 4 4 444 00 777 4 7 0 4 0 4 4444 555 0 4 4 4 66 8 66 1 555 2 66 4 8 8 4 222 4 1 1 888 66 66 66 77777 66 66 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 666 4 4 4 4 0000 55 4 4 8888 1 00 4 777 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 1 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ..... .. . ... .. . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . .................................... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . ... . .. .... . ........... . . ... .. ... . . . . . . .... ... . . . . .. . .. . ... . .. . . . . ... . . . ... .. .. .. ..... .. .. ........................................................... ... ... . . . . .... .. . . .... . .. . ... .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 88888888888888 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 22222 11 9 888 11 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 000000000000000000000000000000000000 4 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 888 9 66 6666 4 66666666666 4 4 222 66 888 4 3 8 4 1 4 1111 333 1 4 4 4 44 9 11 8 111 2 11 4 9 9 4 888 4 9 0 000 11 11 11 66666 11 11 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000 333 0 0 0 4 3333 44 4 4 6666 9 77 4 000 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 1 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T----A--A---AC---ATGC-AGC-AAC-T---------G-----ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T----A--A---AC---ATGC-AGC-A---T---------G-----ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--T-TA--AAAC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----AT----TGTCAAA-T----GTATGT--ACACA-TT-TTCTCTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T---GAAT-TA-TTCAA-G--GGA-CA---T-TG----GA-AT-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCCTT-GCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTGAT-TG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGG-CA--GGTCTTTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATTTAA--TTAGGC--ACAAATTT---C--T--T----A--AGATACA--ATGC-AGC-AAC-TGCGCCACTGG-----ATCCA---TAGTTTTACT-GCC-ACA-TTCCAG-CAC-TGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--TACA--AA-C----CT--AGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--T-TACAAA-C---ACT--AGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT------------TTT--TTT---A-----------T--ATACA-TT-A---CTTTCGTTGTTG--T-AA-AATTAAA--A-TC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAA-TGTTTCAA-G--GGA-CA---TTGT----GA-AT-TTTA-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TGAA-TGT-TATAACTT--CGTAAATT-CCTGAGT-GGCA--GGTC-T-CTCTGTAAGATCA--TTAGCTTATT--A--TT--GCGCACAA---TGTCT--T--C----AG-A---AC---ATGC-AGC-A---T---------ACTGGTATCCA---TAG--TTTAT-G-C-AC--TTC--AACAC--GACATTCTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTC-TTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATT-TA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT----A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GGTTG-GGCTCC-----TTGT-A-CA-C-T--T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTT-ACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--TCTT----A--AGA-AC---ATGC-AGC-AAC-T---------GG----ATCCA---CAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTTTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGAGGG---ATTT--------------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagT-TA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--T-AA--AA-C---AAC--AGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----ATGT----------------TATGT--ACACATTT-C---CTTTCGTT--TA--T------T--------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT---GAAATT--TTCAACG--GGA-CGT--T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCCTT-GGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-GAT-TG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-CTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A---T--GC--ACAA---T---T--T--T-------T---TCTTTATGC-AGC-AAACTG--------G-----ATCCA---TAG---TACT-G-C-ACATTTC--A-CAC-TGCCATTTTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTT-ACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--T-AA--AACC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----ATGC--CAT---G------GTATGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--TGACAAATT-TAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T---GAAA-T--TTCAA-GGCGGA-CA---T-GT----GA-ATGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-GAT-TGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--G-CA--GGTC--TCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---TTTCT--T--T----AAGA---AC---ATGC-AGC-A---TATG------G-----ATCCAC--TAG--TTACTGG-C-ACA-TTC--ATCAC-TGACATTCTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-T-A-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-TA--CA-CTCTAGT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGCA-TGT---A-T----GTACATTAACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCCTT-GCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-G-CA-------TTCTAAG-AA---CA--T--GC--A-----------GC---------------------------A---AC----TG--------------------G-----ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : ---ATGC-AGC-AAC-T---------GG----ATCCA---TAG--TTACT-G-C-AC
gi|5 : ATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT-----A--AA-C---ACT--AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT------------------TATGT--ACACA-TT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-C--GGA-CA---T--T----GA-AT-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC-T-GTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-GA--TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA---GTC-TTCTC-GT-A--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---TTCT--T----AAGA---AC---ATGC-AGC-AAC-T---------G-----ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A--AC-ATACATTATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T---C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GAT--C-AT--GA-C---ACCTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----ATGCG-TG----A-TAACAGTTC-T--ACACA-TTAC---CTTTCGTTAATA--T-AC-A-TT-CA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T-----AA-T--TCAAA-A--GGATCA-----GTAGAAGAGAT-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCTGT-TATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGTAA-TT-C-TGATA-G-CA----TC-T-CTCTACAA--TCA--T---C---TT--A--TT--GC--ACCA---T---T--T--CTTA-A--A---AC---ATGCTAGCTA---T---------G-----AGTCACATTAG--TTACT-G-C-ACA-TT-----CAC-CGAC--TCCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-T-G-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTT-AA--AA-C---ACT--A-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTATGCAGTGT---AGT----GTACA---ACA-G-TT-T---CTTTCGATA--A--TGAC-AATT-TA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G---GAAATT--TTCAATG--GGA-CATGTT-GT----GA-AT-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCTCT--CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-GAT-TGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGG-CAGTGGTC-TTCTTCTTAA---CATTT--GC--ACT--GTTTT--GC--ACAA---A---T--T--TCTTAA--A---AC---A-GC-AGC-G-------------G---------A---TAG-----CT-G-CAACA-TTC--A-CACTTGACATTCTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-T-A-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT-------------------------T----G-----------A-TT-A---CTTTCGTTG-TTGTT-GA-AATT-AA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 22222222222222 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 11111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 777777777777777777777777777777777777 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 11 11111111111 111 11 1111 111 111 66666666666666666666666666666 222222222222 111 1111 11 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 33333333333333 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 11111 66 8 777 66 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 888888888888888888888888888888888888 4 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 777 8 00 9999 4 44444444444 4 4 444 00 777 4 7 0 4 0 4 4444 555 0 4 4 4 66 8 66 1 555 2 66 4 8 8 4 222 4 1 1 888 66 66 888 77777 66 66 44444444444444444444444444444 4 4 8 777777777777 111 666 4 4 4 4 0000 55 4 4 8888 1 00 4 777 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 1 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ..... .. . ... .. . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . .................................... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . ... . .. .... . ........... . . ... .. ... . . . . . . .... ... . . . . .. . .. . ... . .. . . . . ... . . . ... .. .. ... ..... .. .. ............................. . . . ............ ... ... . . . . .... .. . . .... . .. . ... .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 88888888888888 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 22222 11 9 888 11 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 000000000000000000000000000000000000 4 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 888 9 66 6666 4 66666666666 4 4 222 66 888 4 3 8 4 1 4 1111 333 1 4 4 4 44 9 11 8 111 2 11 4 9 9 4 888 4 9 0 000 11 11 000 66666 11 11 66666666666666666666666666666 0 0 0 555555555555 000 333 0 0 0 4 3333 44 4 4 6666 9 77 4 000 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 1 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T---A--A---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T---A--A---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--T-TA--AAAC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----AT----TGTCAAA-T----GTATGT--ACACA-TT-TTCTCTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T---GAAT-TA-TTCAA-G--GGA-CA---T-TG----GA-AT-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCCTT-GCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTGAT-TG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGG-CA--GGTCTTTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATTTAA--TTAGGC--ACAAATTT---C--T--T---A--AGATACA--ATGC-AGC-A-ACTGCGCCACTGG--ATCCA---TAGTTTTACT-GCC-ACA-TTCCAG-CAC-TGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--TACA--AA-C----CT--AGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--T-TACAAA-C---ACT--AGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT------------TTT--TTT---A-----------T--ATACA-TT-A---CTTTCGTTGTTG--T-AA-AATTAAA--A-TC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAA-TGTTTCAA-G--GGA-CA---TTGT----GA-AT-TTTA-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TGAA-TGT-TATAACTT--CGTAAATT-CCTGAGT-GGCA--GGTC-T-CTCTGTAAGATCA--TTAGCTTATT--A--TT--GCGCACAA---TGTCT--T--C---AG-A---AC---ATGC-AGC-ATACT---------GGTATCCA---TAG--TTTAT-G-C-AC--TTC--AACAC--GACATTCTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTC-TTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATT-TA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT----A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GGTTG-GGCTCC-----TTGT-A-CA-C-T--T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTT-ACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--TCTT---A--AGA-AC---ATGC-AGC-A-ACT---------GG-ATCCA---CAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTTTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGAGGG---ATTT--------------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagT-TA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--T-AA--AA-C---AAC--AGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----ATGT----------------TATGT--ACACATTT-C---CTTTCGTT--TA--T------T--------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT---GAAATT--TTCAACG--GGA-CGT--T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCCTT-GGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-GAT-TG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-CTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A---T--GC--ACAA---T---T--T--T------T---TCTTTATGC-AGCAA-ACTG--------G--ATCCA---TAG---TACT-G-C-ACATTTC--A-CAC-TGCCATTTTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTT-ACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--T-AA--AACC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----ATGC--CAT---G------GTATGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--TGACAAATT-TAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T---GAAA-T--TTCAA-GGCGGA-CA---T-GT----GA-ATGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-GAT-TGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--G-CA--GGTC--TCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---TTTCT--T--T---AAGA---AC---ATGC-AGC-ATATG---------G--ATCCAC--TAG--TTACTGG-C-ACA-TTC--ATCAC-TGACATTCTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-T-A-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-TA--CA-CTCTAGT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGCA-TGT---A-T----GTACATTAACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCCTT-GCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-G-CA-------TTCTAAG-AA---CA--T--GC--------------------------------------------------------AGC-A-ACTG--------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : ---ATGC-AGC-A-ACT---------GG-ATCCA---TAG--TTACT-G-C-AC
gi|5 : ATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT-----A--AA-C---ACT--AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT------------------TATGT--ACACA-TT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-C--GGA-CA---T--T----GA-AT-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC-T-GTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-GA--TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA---GTC-TTCTC-GT-A--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---TTCT--T---AAGA---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A--AC-ATACATTATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T---C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GAT--C-AT--GA-C---ACCTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----ATGCG-TG----A-TAACAGTTC-T--ACACA-TTAC---CTTTCGTTAATA--T-AC-A-TT-CA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T-----AA-T--TCAAA-A--GGATCA-----GTAGAAGAGAT-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCTGT-TATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGTAA-TT-C-TGATA-G-CA----TC-T-CTCTACAA--TCA--T---C---TT--A--TT--GC--ACCA---T---T--T--CTTAA--A---AC---ATGCTAGC-T-A-T---------G--AGTCACATTAG--TTACT-G-C-ACA-TT-----CAC-CGAC--TCCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-T-G-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTT-AA--AA-C---ACT--A-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTATGCAGTGT---AGT----GTACA---ACA-G-TT-T---CTTTCGATA--A--TGAC-AATT-TA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G---GAAATT--TTCAATG--GGA-CATGTT-GT----GA-AT-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCTCT--CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-GAT-TGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGG-CAGTGGTC-TTCTTCTTAA---CATTT--GC--ACT--GTTTT--GC--ACAAATTT---C--T--T---A--A---A------AC-AGC-A-GCG---------G------A---TAG-----CT-G-CAACA-TTC--A-CACTTGACATTCTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-T-A-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT-------------------------T----G-----------A-TT-A---CTTTCGTTG-TTGTT-GA-AATT-AA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 1111111 222222222 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 22222222222222 11 11111 111111 111111 2222222 111 4444444444444444444444 11111111 11111 11111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 777777777777777777777777777777777777 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 11 11111111111 111 11 1111 111 111 66666666666666666666666666666 222222222222 111 1111 11 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 4444444 444444444 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 99 4 66 4 33333333333333 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 55 4 7777777 55 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 3333333333333333333333 66 4 66 66 4 66666666 2 4 4 88 777 88888 4 33333 11111 66 8 777 66 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 888888888888888888888888888888888888 4 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 777 8 00 9999 4 44444444444 4 4 444 00 777 4 7 0 4 0 4 4444 555 0 4 4 4 66 8 66 1 555 2 66 4 8 8 4 222 4 1 1 888 66 66 888 77777 66 66 44444444444444444444444444444 4 4 8 777777777777 111 666 4 4 4 4 0000 55 4 4 8888 1 00 4 777 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 1 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ....... ......... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... .. . .. . .............. . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .. . ....... .. . . . . . . ..... ... . . .. ...................... .. . .. .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ..... .. . ... .. . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . .................................... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . ... . .. .... . ........... . . ... .. ... . . . . . . .... ... . . . . .. . .. . ... . .. . . . . ... . . . ... .. .. ... ..... .. .. ............................. . . . ............ ... ... . . . . .... .. . . .... . .. . ... .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 4444444 111111111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 00 4 11 4 88888888888888 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 55 0 7777777 00 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 7777777777777777777777 11 4 11 77 4 11111111 3 4 4 11 888 99999 4 11111 22222 11 9 888 11 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 000000000000000000000000000000000000 4 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 888 9 66 6666 4 66666666666 4 4 222 66 888 4 3 8 4 1 4 1111 333 1 4 4 4 44 9 11 8 111 2 11 4 9 9 4 888 4 9 0 000 11 11 000 66666 11 11 66666666666666666666666666666 0 0 0 555555555555 000 333 0 0 0 4 3333 44 4 4 6666 9 77 4 000 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 1 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T---A--A---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T---A--A---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC-------GGGGG----GGTT-AAGCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT---AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-C--AAGAGT--ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTC-TCAAT----C---T-AATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--T-TA--AAAC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-A-AC----AT----TGTCAAA-T----GTATGT--ACACA-TT-TTCTCTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T---GAAT-TA-TTCAA-G--GGA-CA---T-TG----GA-AT-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCCTT-GCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTGAT-TG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGG-CA--GGTCTTTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATTTAA--TTAGGC--ACAAATTT---C--T--T---A--AGATACA--ATGC-AGC-A-ACTGCGCCACTGG--ATCCA---TAGTTTTACT-GCC-ACA-TTCCAG-CAC-TGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC-------TAGAGTAAAA-TT-TAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA-TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--T-CCAA----T---T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC-------GGGGG------TT-AAGCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT---A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-C--AA---T--TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA-----C-TT--C----TACAG-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--TACA--AA-C----CT--AGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctcca--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA-----C-TT--C----TCA-G-AA--AT-A--TATT-----------------------TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--T-TACAAA-C---ACT--AGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT------------TTT--TTT---A-----------T--ATACA-TT-A---CTTTCGTTGTTG--T-AA-AATTAAA--A-TC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAA-TGTTTCAA-G--GGA-CA---TTGT----GA-AT-TTTA-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TGAA-TGT-TATAACTT--CGTAAATT-CCTGAGT-GGCA--GGTC-T-CTCTGTAAGATCA--TTAGCTTATT--A--TT--GCGCACAA---TGTCT--T--C---AG-A---AC---ATGC-AGC-ATACT---------GGTATCCA---TAG--TTTAT-G-C-AC--TTC--AACAC--GACATTCTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTC-TTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATT-TA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT----A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GGTTG-GGCTCC-----TTGT-A-CA-C-T--T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTT-ACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--TCTT---A--AGA-AC---ATGC-AGC-A-ACT---------GG-ATCCA---CAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTTTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGAGGG---ATTT--------------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A-TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CA-A----T--AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagT-TA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC-------GGAGGA---G----AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A-TTT-----ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCA--T-TCAA----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA-----CTTC--T----C---A-CA--ATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--T-AA--AA-C---AAC--AGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATA-AC----ATGT----------------TATGT--ACACATTT-C---CTTTCGTT--TA--T------T--------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT---GAAATT--TTCAACG--GGA-CGT--T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCCTT-GGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-GAT-TG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-CTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A---T--GC--ACAA---T---T--T--T------T---TCTTTATGC-AGCAA-ACTG--------G--ATCCA---TAG---TACT-G-C-ACATTTC--A-CAC-TGCCATTTTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTT-ACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC-------GGAGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGGGG----G-GT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC-------GGGGG------TT-AAGCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA--TC-----T-CA----T-ATT---A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA-----C-TT--CTCCAC---A-AT--AT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--T-AA--AACC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-A-AC----ATGC--CAT---G------GTATGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--TGACAAATT-TAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T---GAAA-T--TTCAA-GGCGGA-CA---T-GT----GA-ATGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-GAT-TGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--G-CA--GGTC--TCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---TTTCT--T--T---AAGA---AC---ATGC-AGC-ATATG---------G--ATCCAC--TAG--TTACTGG-C-ACA-TTC--ATCAC-TGACATTCTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-T-A-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TTTAAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-C--A----T--AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAA------------------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-TA--CA-CTCTAGT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGCA-TGT---A-T----GTACATTAACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCCTT-GCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-G-CA-------TTCTAAG-AA---CA--T--GC--------------------------------------------------------AGC-A-ACTG--------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : ---ATGC-AGC-A-ACT---------GG-ATCCA---TAG--TTACT-G-C-AC
gi|5 : ATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC-------GGAG-------TA-AAGCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A-TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-C--AA---T--AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA-----T-TC--T----C---ACAA--AA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT-----A--AA-C---ACT--AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGA-T-AC----AT------------------TATGT--ACACA-TT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-C--GGA-CA---T--T----GA-AT-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC-T-GTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-GA--TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA---GTC-TTCTC-GT-A--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---TTCT--T---AAGA---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A--AC-ATACATTATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T---C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A-TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC---------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTAT----C-TC--A----C---A-TA--AA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GAT--C-AT--GA-C---ACCTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAA-C-AA----ATGCG-TG----A-TAACAGTTC-T--ACACA-TTAC---CTTTCGTTAATA--T-AC-A-TT-CA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T-----AA-T--TCAAA-A--GGATCA-----GTAGAAGAGAT-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCTGT-TATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGTAA-TT-C-TGATA-G-CA----TC-T-CTCTACAA--TCA--T---C---TT--A--TT--GC--ACCA---T---T--T--CTTAA--A---AC---ATGCTAGC-T-A-T---------G--AGTCACATTAG--TTACT-G-C-ACA-TT-----CAC-CGAC--TCCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-T-G-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-C--A----TTTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA-----C-TC--T----C---A-CA--AT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTT-AA--AA-C---ACT--A-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGA-ATACTTTTATGCAGTGT---AGT----GTACA---ACA-G-TT-T---CTTTCGATA--A--TGAC-AATT-TA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G---GAAATT--TTCAATG--GGA-CATGTT-GT----GA-AT-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCTCT--CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-GAT-TGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGG-CAGTGGTC-TTCTTCTTAA---CATTT--GC--ACT--GTTTT--GC--ACAAATTT---C--T--T---A--A---A------AC-AGC-A-GCG---------G------A---TAG-----CT-G-CAACA-TTC--A-CACTTGACATTCTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-T-A-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT-------------------------T----G-----------A-TT-A---CTTTCGTTG-TTGTT-GA-AATT-AA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
blockSeqs : T G A CCC . C TC T A C G TT C . A G T G C A TGATTTT GATGTGTAGT C TC G GA . CGT T T T C T AG G GTGTGTG . AT T C GC GGGGGGA TAAAATT TC A AAGT G GGGAA TT A TTTATATAG . A G GG . G TAT T C . CC TTGT GAT . ACACCT CTAC C G C A G AA A GA GTGCCAGTATTG ATCACATGTGTCT AATT T CT TACTTAAT TAT G T G T GATATT G G AATT TG A G G T C AT . GG AA A TGCGTATCG A T G TTATCACTT TTAT AGC T G TT . CC C C TTGAGTTG . TGA CA A CA C TCATATTTTAAA C A G . TTCG T G G CAGACC C G GC A A ACAC TAG TT CTT A T . T T TT . T CAA TT . G T C T . AGCAA TAA . C GA CTTCTCCACA . A AT T T TTTTTTTT T A T TT GTA ATTAT A ATG GTTA CA C TCT TA A T A AT C GGGG . TNNNNNNNNNNNNNNN AT A CCTTCATG AG C GGA T . G TAACCAAA CAGCC G ACTGGTCCTGTTCATGCG A G C . T A TGTA . TAT C A C T G AA TG T T GAT GA AGGATAAG CGC G G ATACTTTTATGCAGTGTAGTGTACA T AC AATGACAATTTAGTTATATGTGGGGCAT C A . GT C TAAAAT AA A AA G TT GAT C CC A T GAT T GT T G . T GA A GT . GAAG T A T GGT CTGAGTA GA CT CGC GA A CAA . GTTCAAAAT GTAA CAATT T C A ACTTT A . A CT TGGA A AGAAAC T AT GTT GTTG T A TTTTT TCA . T TAT CC GAC GT G G TG TATGT AGTTGATCTG TG AT CC TAT CA A . T . AAGTAGAC G CTCCGG G A GA AAACAAGGG GG G . CA TTTG T G AG AAAAG AA TTG CCC ATTAAATTTTATAAAATAATATAGTTTAATCATATCCATTCAATAATATCTAGTACCG GG AA AT GTA T . CAATTTATCAA TATA TATAAAAATACTT TG T . ATTC . TAACC T . AGAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACGAACCAAAAAAAAAAATTAAAAAATAACTAATTTA G AATTTGTT TG CA . A G TTATAAATGCGCA ATA T T C AA G AG TT . C TA . A CGATG ATGTCATGT G TGCGA A AGAATCTGT GAG GA ACTCG TAC A CAC AG . A A TTT TATAATATGAAAAGTATA AA A ACA C A A T . CACT T T CCA T GT GGC T GTAGAA G G TA GG AAC G T T . TTT AA G T . AA T AT T TT A TA G C G G GTG . T T GAT TT TA TTA GTT . GC TTTCTTTAAGAAC T A T GGT CAT T G . A T AA TT . C TAA A GT T TA AT G AT G . . T ATC T GCTCC AG . TCCT AC G . GGGGGATTTTC A
blockSeqs : . . . C . C . . . . . CT . . . . . . . . G GTG . T . T . GG . G . . . C . . . . . T G . GTTT . A . . AAA . . . . . A . . . T . A . . TTG . . . GAC . . . . . . . . CCGTCACATG TA CAAT . . . . G . . G A . . . . . . . C . . . A . . TGAT . . . . . G . . . . A . . AT . . A . . . TATTA . . . . TC . . . . . . . . . ACT . . . . . . . C . . . CAA . . G . . . . . TG . . C CTTCTACAG . . . T . . T . . A . TA . TA TAC . . . . . . . . C AA . CATTC N . CTTG . . . . . . G . G CGG . . . . . A . . . . . . T . T . . . . . TTCAGTT T . G AACATGCATGTATGTACATTA . A ATATGACAAATTTAAGATT . A . A C . T . . G . TA . T . . . . . . . . . . A . . AGGT . . . . CACT . . . . . G . ATATA C . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . A . . . AAA TGTC . . . . A . . . . A . TCTA . . . AAA AA . . . CC C . . GGT . . . TTTTTTTTTTGTATAAAATTTGAAATAAAGCAATGTGTTATTATATCATCATCT . G . G . . AACG . ATTCGGTTATTGA . . . . . CCCC . . AGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATTTAACACCTTA C TGTT . . . . . TCTAAATGCGCA . . . . AG . . . . . A . . CATG GCATGT . . . TGTG . . . . . . . . . G . TATTAATATTGAAAAGAT . . A . . . . . . . . . T . CG . TGTTGT . . AA A . . T . . GT A . . . T C . T TT T . . A . . G . T T T . . A A . . TGTCTTCAGAAC . . T GG C T . . . . AT T . . T A CT . AC . . . T . . . C . CT A . TAG . G . GGGATTT .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . C . . GTT . A . . GG . . . . . A . . . . . A . . TG . . . AC . . . . . . . . GTGCGG TG AG . . . . G . . G . . . . . . . . T . . . T . . ATG . . . . . G . . . . T . . T . . A . . . ATTTC . . . . AT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . G . . . CTTCTCAG . . . T . . A . . A . TA . A TT . . . . . . . . C CA . GT T . CTT . . . . . . . . G CAG . . . . . T . . . . . . T . A . . . . . TGTTGA . . G CAAATGCGTGATAACAGTTCT . C GTTGTTGAAATTAAAATT . . . T . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . TT . . . . . A . TATA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . G CTC . . . . A . . . . A . CC . . . AGA TT . . . . . . . A . . . AATTATAAATTTAAAAATAAGAAGACTTATTATTCAATCC . . . A . . AATT . ATTTTATATT . . . . . CC . . AAATACATATTAATGATATTTCACTATTCAATAAAGAAAACTTAAATATTTGGATTTA . . . . . . . TTATTATTTT . . . . AC . . . . . . . . CATG GCATGT . . . TGT . . . . . . . . . . . GAGTGATTAGTA . . . . . . . . . . . . . . TG . TTGT . . A . . . T . . TG A . . . T . . T TT T . . . . . G . T T T . . A A . . TTTCTTAAGAAC . . . GG . T . . . . A T . . T A T . A . . . . . . . A . C A . T . G . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . GGT . A . . A . . . . . A . . . . . A . . TG . . . AC . . . . . . . . GTGCGG AG AG . . . . G . . T . . . . . . . . T . . . T . . GT . . . . . T . . . . T . . T . . A . . . ATTT . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . CTTCTCA . . . A . . A . . G . TA . A TA . . . . . . . . C . . CC T . ATG . . . . . . . . C CGT . . . . . A . . . . . . A . A . . . . . TGAG . . G AACATGCCATGGTATGT . C GTTGTAAAATTAAAATC . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . ATAT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . G C . . . . A . . . . G . GC . . . CA GG . . . . . . . T . . . TTGAAATTAATTTCATTATTCAATCATTTCGTTAATTTT . . . . . . AA . ATTTAATT . . . . . TT . . TAAATACATATTTCAATATTTGATTAAAAAAAAACTTAAATATTTGAATTCA . . . . . . . TTGTAA . . . . A . . . . . . . . CATG GCATGT . . . TGT . . . . . . . . . . . TAGGTTGTATA . . . . . . . . . . . . . . G . TTGT . . A . . . T . . T A . . . T . . T TC T . . . . . G . T T T . . A A . . TTTCTTAAGAAC . . . GG . T . . . . A T . . C A T . A . . . . . . . C . C A . C . G . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . TT . A . . G . . . . . . . . . . . A . . TA . . . CC . . . . . . . . TTGG TT AG . . . . G . . G . . . . . . . . T . . . G . . GT . . . . . G . . . . T . . T . . A . . . ATTA . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . TTCTCAC . . . T . . T . . C . TA . A TA . . . . . . . . C . . CC T . CTG . . . . . . . . G CGG . . . . . A . . . . . . T . A . . . . . TCAG . . A TAACATGTTATGT . C ATATACAATTTAATT . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . AATG . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . G C . . . . A . . . . A . CC . . . AA GG . . . . . . . A . . . TATGAAATCTTTTTAAATTAAAAGTATATTTCAATCCTA . . . . . . AA . ATTTATT . . . . . CC . . ATATATTTCATTATTTGATAATAAACTTAAATACAAGTAAATATGGATTTGA . . . . . . . TCCTT . . . . A . . . . . . . . CATG GCATGT . . . GGG . . . . . . . . . . . ATATAAGAA . . . . . . . . . . . . . . G . TGT . . A . . . T . . T A . . . T . . T G T . . . . . G . T A T . . A A . . TTTCTTAAAAC . . . GG . T . . . . A T . . T A T . A . . . . . . . C . C A . T . G . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . C . . AG . A . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . AC . . . . . . . . TTG TG AC . . . . G . . T . . . . . . . . T . . . G . . TT . . . . . G . . . . T . . T . . . . . . ATCA . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . TCTCACA . . . T . . A . . A . T . A TT . . . . . . . . C . . CC C . TGA . . . . . . . . G CGG . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . TGAT . . G TACATTATGT . C AATATACATTCAATG . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . TATA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . G C . . . . A . . . . A . CC . . . AG AA . . . . . . . A . . . TTGAAATAAAAATCATTAATCATTTTCCTCAATTCT . . . . . . AA . ATTTATT . . . . . CC . . TGAACCAAACTCTTCAAACAAAAAACAACCTTATAATTGGGGTTGTTCTCA . . . . . . . TTTAT . . . . A . . . . . . . . CATG GAAGT . . . TG . . . . . . . . . . . AAAGTATA . . . . . . . . . . . . . . G . TGT . . A . . . . . . T A . . . T . . G T T . . . . . . . T T T . . A A . . TTTTTTCTTT . . . G . T . . . . A A . . T A G . G . . . . . . . . . C A . T . G . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . C . . TT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . AC . . . . . . . . TTG T AG . . . . G . . T . . . . . . . . A . . . G . . GT . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CTCTCA . . . A . . A . . A . A . A CA . . . . . . . . . . . TT T . CT . . . . . . . . A CGG . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . TGA . . . TTTTTTAT . T TATTTT . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . TAT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . G C . . . . A . . . . A . CC . . . A G . . . . . . . T . . . ATTAAAATTTTAATAAAGTTTATTATTCAATCC . . . . . . AA . TCATT . . . . . CC . . GGAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAACCACCTTAAATTTGTA . . . . . . . TTTT . . . . A . . . . . . . . CATA GCATA . . . TG . . . . . . . . . . . AAGTATGA . . . . . . . . . . . . . . C . TGT . . A . . . . . . . A . . . . . . T . A . . . . . . . . C . . . . A . . ATTTCTTAAA . . . G . T . . . . A C . . . . . . A . . . . . . . . . . G . A . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . G . . . AC . . . . . . . . TTA A AG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . CT . . TG . . . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . TG . A . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . TAC . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . G C . . . . . . . . . . . C . . . A G . . . . . . . G . . . ATTCAATCATCTTCCTTAATCATTGATTCC . . . . . . AA . ACATT . . . . . C . . TTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGACCACCTTAAATTGT . . . . . . . TCTT . . . . A . . . . . . . . AACT GT . . . TG . . . . . . . . . . . AAGTATA . . . . . . . . . . . . . . A . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . AC . . . . . . . . TTG T AA . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . G C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . ATTCAATCATTTTCCTTAATTC . . . . . . A . ATT . . . . . C . . TAAAAAAAAACATAAAAAAAAAAAATTTGA . . . . . . . TCTT . . . . A . . . . . . . . CAT G . . . GG . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . ATTAAAATTATTATTCAATCC . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** T** *** ******* G*********** G****** TT******* **** ** ** TG** *** AC***** *** TG*********** T*** G** ATTA********** ** C***** ** ** AA***** CTTCTCA*************** ** T* A**** ** CC******************* ** CGG******************* ** TAACATGCTATGT*********************** C**** ** *** TAT******* **** ** G******** A****** ** CC**** **** ** ATTTATT**************** *** ** TCTT******************* A** ** CATG* GCATGT***** TGT******* ***** ** AAGTATA*********************************** ** A** A** TT* A**** ** TTTCTTAAGAAC***************** GG********** T** A*** T*** *** A** ***
originalCons : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGG----G-TT-AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A-TTT---A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-C--A----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA-----C-TC--C----C---G-AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-A-AC----ATGC--TGT---A-T----GTACGT--ACACA-TT-C---CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--ACAA---T---T--T--T---A--A---AC---ATGC-AGC-A-ACT---------G--ATCCA---TAG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
finalCons : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTTT--ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGAG-----------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATTG------CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC-------GGGGGTT-------AAGCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTTG--AAA---TTCT-GGA------CAC-----TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATTTG-----------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-TT---CT-GCA--TAA-ATGG--TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CAATTA----------ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TC-----TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-CAA-----T--AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTACTTCTCA---------------AA--AT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAAA----GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--CCC-------------------CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAACGG-------------------TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGATAACATGCTATGT-----------------------ACACA-TTC----CTTTCGTTA-TA--T-AC-AATT-TA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTTTAT-------TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAAG--------TA-------C--A--G--T--CCA---AAA------CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATATTTATT----------------AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTCTT-------------------TTT---TAG-GC-AT-TGA--CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CCATG-CATGCATGT-----TCATTGT-T-----GT-TGTTGT-------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---AAAGTATA-----------------------------------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TTA--AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGTA--CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGTT-TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATTA----TT--GC--ACAATTTCTTAAGAAC-----------------ATGC-AGC-A-ACTGG----------ATCCA---TAGT--TACT-G-C-ACA-TTCA---CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCAT---CAACA-TC-T-A-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GCA--C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 111 1111111 111111111111 1111111 1111111 11 11111111 11 11111 1111 1111111 111111111 1 11 111 1111 111 2222222222222222222222222 3333333333333 11111111 111111 111111111 111111111 222222222 1111111111 222222 11 11111 111111 111111 1111 111 111 22222222 11111111 11111 11111 2222 333333333333333333333 111111111 11111111 2222222222222222222222 11 111111111111 111 77777777777777777777777777777 111111 11111 3333333333333333333333333333333333333 11 111111 1111 1111111111 111 2222222222 1111 1111 111111 111111111 2222222222 1111111 11111111 111111 222222222 1111 11111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 111 1111111111111 22222222222222222222222 22222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 44444444444444444444444 11111111111 2222222222 11111 444444444444444444444444444444444444444444 111 11 11111111111 111 11 1111 111 111 222222222222 11 1111 111 111111 44444444444
lowQualScore : 4 4 4 111 55 1 55 4 4 4 4 777 4 3 3 3 3 3 3 000 9999999 444444444444 3 88 3 88 4 7777777 4 8 3 3 3 88 3 1111111 3 55 3 1 00 66666666 4 22 11111 66 1 7777 5 4444444 66 4 777777777 66 4 4 22 4 4 222 5 3 4 66 5555 111 0 3 999999 8888888 3 3 3 999 3 44 3 44 7777777777777777777777777 5555555555555 555555 3 55 33333333 666 8 3 3 4 555555 8 4 9999 66 8 4 4 8888 8 66 4 888 66 4 555555555 4 4 4 777777777 9999 999 4 4 66 4 99 4 4 000000000 4 777 777 4 66 4444444444 000000 4 00 4 4 33333 4 4 8 111111 4 4 55 4 4 333333 777 55 777 4 4 55 4 8 55 0000 666 3 3 7 3 3 3 3 99999 555 3 4 99 888 222 22222222 88888 99 4 66666666 1 4 4 88 777 88888 4 33333 11111 66 8 777 66 4 4 4 66 1 1111 55 222222222222222222222 44 4 333333333 55 3 666 3 55 0 3 66666666 99999 1 4444444444444444444444 4 4 0 4 0 4 4 1 9999 4 777 4 4 4 7 4 66 66 4 4 777 00 444444444444 222 4 2 88888888888888888888888888888 777777 8 11111 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 22 7 000000 88 3 55 1 55 5555 3 88 3 3 666 3 55 3 3 3 3 55 7 55 55 9999 3 3 3 666 2222222222 55 55 000 55 3 666 3 6666666666 0000 88888 3 3 3 88888 3 3 3 44 1111 3 111111 3 44 555 7777 6 3 88888 555 3 3 666 55 666 44 3 3 88 777777777 1111111111 55 55 55 777 4444444 4 4 4 55 66666666 4 666666 4 4 66 0 555555555 66 4 8888 55 4444 8 4 55 88888 55 777 666 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 22 55 333 3 3 5555555555555 7777 55555555555555555555555 55 3 666 7777 55 99999999 4 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 99999999 44 55 3 3 3 00000000000000000000000 666 3 3 3 777 3 44 0 44 3 3 77 44 3 99999 77777777777 3 77777 3 1111111111 555 44 00000 555 3 666 55 55 4 8 777 222222222222222222222222222222222222222222 66 4 222 4 4 4 4 4 9999 4 4 777 8 00 9999 4 44444444444 4 4 444 00 777 4 7 0 4 0 4 4444 555 0 4 4 4 66 8 66 1 555 2 66 4 8 8 4 222 4 1 1 888 66 66 66 77777 66 66 8 777 4 1 777 4 4 666666666666 4 4 4 4 666 4 4 4 4 00 4 55 4 4 8888 1 1111 4 66 4 66 8 4 777 4 222 4 222222 777 4 999999 66 1 777 55555555555 5
lowQualScore : . . . ... .. . .. . . . . ... . . . . . . . ... ....... ............ . .. . .. . ....... . . . . . .. . ....... . .. . . .. ........ . .. ..... .. . .... . ....... .. . ......... .. . . .. . . ... . . . .. .... ... . . ...... ....... . . . ... . .. . .. ......................... ............. ...... . .. ........ ... . . . . ...... . . .... .. . . . .... . .. . ... .. . ......... . . . ......... .... ... . . .. . .. . . ......... . ... ... . .. .......... ...... . .. . . ..... . . . ...... . . .. . . ...... ... .. ... . . .. . . .. .... ... . . . . . . . ..... ... . . .. ... ... ........ ..... .. . ........ . . . .. ... ..... . ..... ..... .. . ... .. . . . .. . .... .. ..................... .. . ......... .. . ... . .. . . ........ ..... . ...................... . . . . . . . . .... . ... . . . . . .. .. . . ... .. ............ ... . . ............................. ...... . ..... ..................................... . . . .. . ...... .. . .. . .. .... . .. . . ... . .. . . . . .. . .. .. .... . . . ... .......... .. .. ... .. . ... . .......... .... ..... . . . ..... . . . .. .... . ...... . .. ... .... . . ..... ... . . ... .. ... .. . . .. ......... .......... .. .. .. ... ....... . . . .. ........ . ...... . . .. . ......... .. . .... .. .... . . .. ..... .. ... ... . .................................................................................................................................................................................. .. .. .. ... . . ............. .... ....................... .. . ... .... .. ........ . . ........................................................................................................................................................ . ........ .. .. . . . ....................... ... . . . ... . .. . .. . . .. .. . ..... ........... . ..... . .......... ... .. ..... ... . ... .. .. . . ... .......................................... .. . ... . . . . . .... . . ... . .. .... . ........... . . ... .. ... . . . . . . .... ... . . . . .. . .. . ... . .. . . . . ... . . . ... .. .. .. ..... .. .. . ... . . ... . . ............ . . . . ... . . . . .. . .. . . .... . .... . .. . .. . . ... . ... . ...... ... . ...... .. . ... ........... .
lowQualScore : 4 0 0 000 55 6 55 0 0 0 0 888 0 3 3 3 3 3 3 000 1111111 666666666666 6 66 6 66 0 0000000 0 0 6 6 6 66 6 8888888 6 00 6 4 66 11111111 4 22 11111 11 9 5555 0 8888888 11 4 888888888 11 4 4 22 4 4 222 0 1 4 11 8888 000 8 6 666666 4444444 3 3 3 222 3 66 3 66 2222222222222222222222222 1111111111111 222222 6 00 22222222 444 2 6 6 2 555555 0 0 4444 11 9 4 4 8888 9 11 4 000 11 4 111111111 4 4 4 888888888 4444 000 4 4 11 4 88 4 4 888888888 4 888 222 4 11 6666666666 333333 4 66 4 4 11111 4 4 9 555555 0 0 55 0 0 777777 000 55 000 0 0 55 0 0 55 0000 444 6 6 3 6 6 6 6 11111 000 6 0 55 000 222 66666666 11111 33 4 11111111 9 4 4 11 888 99999 4 11111 22222 11 9 888 11 4 4 4 11 1 7777 55 111111111111111111111 88 0 000000000 00 6 444 6 00 2 6 88888888 11111 6 2222222222222222222222 0 0 7 0 5 0 4 0 4444 4 888 4 4 4 4 4 77 11 4 4 888 66 666666666666 222 4 9 88888888888888888888888888888 222222 9 33333 5555555555555555555555555555555555555 6 3 6 33 3 555555 66 6 00 4 00 5555 6 66 6 6 444 6 00 6 6 6 6 00 3 00 00 1111 6 6 6 444 8888888888 00 00 000 00 6 333 6 8888888888 4444 33333 3 3 3 33333 3 3 3 66 7777 3 888888 3 66 888 1111 7 3 33333 888 6 6 444 00 444 22 6 6 66 999999999 0000000000 55 55 55 000 8888888 0 0 0 55 88888888 0 333333 4 4 11 1 777777777 44 0 5555 55 0000 0 0 55 11111 55 000 444 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 33 00 666 6 6 5555555555555 7777 11111111111111111111111 00 6 444 7777 00 22222222 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222 66 00 6 6 6 11111111111111111111111 444 3 3 3 888 1 22 2 22 1 1 99 22 1 22222 33333333333 1 77777 1 5555555555 444 22 88888 444 6 444 00 00 0 0 000 333333333333333333333333333333333333333333 11 4 222 4 4 4 4 4 4444 4 4 888 9 66 6666 4 66666666666 4 4 222 66 888 4 3 8 4 1 4 1111 333 1 4 4 4 44 9 11 8 111 2 11 4 9 9 4 888 4 9 0 000 11 11 11 66666 11 11 9 888 4 8 444 0 0 888888888888 0 0 0 0 333 0 0 0 4 66 4 44 4 4 6666 9 3333 4 11 4 11 9 4 888 4 888 4 222222 000 4 444444 11 1 888 00000000000 7
consensus : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC--------GG-GGG--TTAA-----GCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A--TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-CAA---T-AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA--CTTCT---CA-A------AAT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-AA---C----AT-GC------TA-----TGTACA------CA-TT-C---CTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--AC-AA---TTTC-TTAAGA-AC-ATGC-AGC-A--------ACTGG-ATC-CA-T-AG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
Reference ( family-245 ) : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC--------GG-GGG--TTAA-----GCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A--TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--T-CAA---T-AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACAGTA--CTTCT---CA-A------AAT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-NA--AA-C---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TAGAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGATAA---C----AT-GC------TA-----TGTACA------CA-TT-C---CTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----C---AAA-TG-AAATNG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------A--ACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--AC-AA---TTTC-TTAAGA-AC-ATGC-AGC-A--------ACTGG-ATC-CA-T-AG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAC-CAAAAT
gi|1 : TTGTCAGTT-CTT-TCC-C---CTGAATT-A--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT---ACGTCCC-TCTTGAAC-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATATATGT------AGTGAA-G---------GGT-GGT--AATTT-T--CCCATTTGTCCG-CAA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CGTAGA--T-GCTCT-C--CCGC--------GG-GGGGGTTAA-----GCTTC--CAGAAATATGAAAT--T-CAAT--G----AA--AA-AA---------AATAA-CAAGTGGATCTTATTTGC-C---ATTAA-CCGGAACAAGCGA--AA-CGAGCAACTT-G-AAAA--TTCTTGGA------C--ATCTTTGC-ATCC-CGG-GACTACACACCC-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT-------------GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGG-TTGGA-AA-TTTTA------TCACT-TAGTT----T--GGTAA-CT-TCTTTCTTGCA--TAACATGTG-TT--A-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------AT-C----TGT--TCA-ATGCA-GT--CTA-CAA-A-TGT-T-------CTGT---ACA-ATC-C--AT-CA----AATTT----AGAAATT-GAATTT-CTGAATTT-T---CTC-AG-CTCCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---TCTTA---CT--G---TA-C-AGTCGT-AC-A--TCAAAT-CAAGAGT-ATTAATTTTCA-T-GGG--AA-GTGGT-----TTG---AAACGAATTA-----GCACAGTAACTTTCT---CA-ATCTAATGAT-A--TATTTCA-AGA--------TATTATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTAATTA--GTT--T-TA--AAAC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCCCCCGTC--------------C---CTTCCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-GCCCGTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------AG-GCTCGTTGT-A-ATGA-CATTGTATCTGTAGAGTTACGAT-CTGTAAC-TGTAAG----AACAG---GGA-AC-ATTCC-TAAAATT--GTTTA-TGAT--G-A-GTGT---AA-TTG----TG--AG--TTAG---T-TT-GA-AA---C----ATTGTCAAATGTA-----TGTACA------CA-TT-TTCTCTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTGACCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-AC----G---A-TCT--TCA-T-TAAC-A--T-TTT--ACAATTTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TTC--G--T-C--AATACTT-------ATGTA----ATTT-----C-A-AC-AAAGT-----TTGC-ATGTA-TC--ATAT--G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-A-----GCC---AATG-TTG---ATC--AA---CAT-A-C-CCATA-GAAAAGTATTG--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-AAATCTCACC-AAACAC-CGTAAAGAAG-------TGATTATACTTC-AC-----TATTT-GTAG-A--ACTAA-------GGAGGA-TTTGGAGATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTTTTT---------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------TTTAAATAAAGGTTTA------T---TA---------T-TTC---AC-A-T-----------C-------------C--AATT--TTT-AT--C---A-AAAATC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------T---AAGCT--G-TTATAAAT----TTTTAT----CC--AAA-TGGAAATTA-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AA----AAA---------AAAACAA---------C--ACC-----------TTTA-A----------AT-----TTTG------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAAATTATTGTG-TCG-T------TTCT---T---------ATT---TAG-AC-AT-TG----C-TC--TTGAAA--TTGAT-AAA--AAAATAA-CC--TTCATTTG---CATGTTCATTGT-T-----GT-TGT------TGT-TT---T--C--TTTAA----CAATCCA---AT-C---T--AGAAAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--T-AT---TA-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATTAC----ATC-TTA-T---GAAT-TA-TTCAA-G--GGA-CA---T-TG----GA-AT-TTTATAGC--ATGA---GGA-ATATTTGCCTT-GCTTGAGGCTTCC--T-TTGT-AACGGC-TA-TTGAT-TG-G--TGAAA-GTGTTTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGTGG-CA--GGTCTTTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATTTAA--TTAGGC--ACAAA---TTTC-TTAAGATACAATGC-AGC-AACTGCGCCACTGG-ATC-CA-T-AGTTTTACT-GCC-ACA-TTCCAG-CAC-TGACATTCTGCTAA-TGCACCCATT--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATTACTTTCAAACA-CA--CCAA-T----C-GCTA-CTAAACA---T--A--GGCGCGGGGGTTCGGGAGGG-----------
gi|10 : taaaATATGTCAGTT-TTGGTCC-C---T--AAATCATCAACACGA-GTGAGCGA-GAG-ACTCTCG-T-ACGTCCTCTATGGA-GAGG-CCGGTGTTGTA-GC-GAATA---GG------AGTGA--GATGTGTAGTGGT-GGTTCAATCT-TGACA-ATCC----GTCGATATTGTCGACTT-A-TTG-TAGGCG-C-------AA-AGAATT-GCT-GGC--CCGC--------TA-GAG--TAAAATTTAGCTTCTCCAGAAACATGAAAAGTTGCAAT--A----GATTAA-TATTTATATAGAC--A-GAGGTTGAGGGTATT-CCGC---ATTGATGCGAACTA-GCGACCAAACTAGCGCTTTTGTAAAGATTTCT-GGAACACCTC--AC---AGC-ACTCGCGG-TACCTCAC---C-CC--T-GCGAA---------T-------T---GG--TATT------TA-----GGTG--AATTG-AA--AC--------T---ATTTAC-GT-AGTTGGA-AAGTTCTAGATATTTC-CT-TAGTT----TTGGA-AA-CT-C---TCT-GTA--T-A-ATG-A-AT--A-TTGCGTATCGTTAGACGATT-AGTGT---------ATTCTTATTTG--TCA-ACGCA-AA--C-G-ACACA-TAT-TTGAGTTGCT-CTGAACG-ATCAC--AT-CGTCATA--TTTTAAA-ATATT-GA--C--C-GATTTT-TTCGTTC-AG-CGCCGC------GTCG-AGCCT-TTAGAT-T---C--TATAGCT--G---TA-C-A--TGT-AC-GTTTCA--TCCAA---T--T-TATCTTCAGT-GGG-GAG-GGG-TAGCAATGG---AG-AGAA-TA-TG--GCgaattttttctgtgatctaaattattaatgtataga
gi|11 : gtcgCTTGA-C-TT-TCGGTGT-ATG-TACAGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-AGTT-AATTT-TT-CA-ATT-----G-CGA--T-GTCGTCTT-A-TTG-TC-GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGACGCCCGC--------GG-GGG--TTAA-----GCT-C--CAGAAATATGTA----T-CAAT--G----AA--AA-AT---------AC--A-CA-GTGA----TATT-GC-CTATATTAT-------------------CGAGCGCTTTTG-AAA---GTCT-GGA------C--A----TA--ATCC-CGA-GACCACAC---C-CA--C-GA--G---------G-------T---GCGGTATT-------------ATCACAAT--G-GACTAC--------TTATATTTACG-TGG-TTA-A-AA-TTTGAA-----TC-CT-TAGCT----T--GG-AAGCTGT---CCTCGTA--TAA-ATG-T-TT--AAT---ATG---TTAAATT-TC-AGT-TTTATCACTTATTC----TTG--TTATATGCA-GT--C-A-TCG-ACTGC---------CT-T---A-A-A-C-C--AT-CA-------TT----A--TATTCGA--TT-T----TTT-T---TTCTAG-C-TTG--------T-G-A--TT-TTAAGAAT---C--TA---CT--G---TA----------AC-G--TT---T-CAA---T-TT-AATCTTCA-TTGGG-GAA-GTG-T-----TTGG--AA-CGAATTA-TG--GC-CAGTA--CTTCTA--CAGA------AAT-A--TATT-CA-AGA--------TTTTTAT-TT-A-AGA---TA--T--T-TTAA--A--GTT--TACA--AA-C----CT--AGCTGT-TT-CTGAACA--GCAGCAA--ACCCCCACACC--CTNNNNNNNNNNNNNN---N--NNNN-NNN-NNNACCCCTTCAT-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GCGAT-T--------C-------ATGCAA
gi|12 : gtttattctcgtaattagcggcgcaagctccaA---T-AT-AATCTTCA-T-GGG-AAGTGTG-T-----ATG---AG-CGGATTA-TG--GCACAGTA--CTTCT---CA-G------AA---------------A--------TAT-ATT-TT-A-AGA---TA--TA-T-TTTA--A--ATT--T-TACAAA-C---ACT--AGCTAT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCTCCCC--C--------------G---T--CATT----------------------AG--TG-G-A---CG-AC--GCAAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA---------------G-G----TTGT-A-ATGA-CAAAGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TATAAG----G-CAG---GGA-AC-ATTCC-TATAATT-TGTTTT-TAAT--G-A-GAGC---A--TTG----TG--A----TAA---T-TTT--------------T-TT------TT-----TATATA------CA-TT-A---CTTTCGTTG-TTG--T-AA-AATTAA--AATC-------------G-T-GTT-GCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGGGA--A-A--TG-AC--AG-AAT-GGA---A-TCT--TTA-T-TA-C-A--G-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--GA-AC-T--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----CTGC-AT-TA-GC--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-T-----GTC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGA-A-C-CCAT--GGAA------G--TA-------C--A--A--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAG-C--AAAGAAA-------TACAAATACCTC-GCC----TA
gi|13 : gAAA--T-TC-ATGCAT--ATGTCATGTTCATT---T-----GT-TGTAGAATCTGT-TT---TTCT--TGTAACTCGCAATCTATACAC-CCACT--G--AAC-AA-GA---A-----------AAAG----T-----AT----A----------C--A-AGA--GT-TA-TTG-AGTA-TTGAATAATC-CCACTATA-TTA-TCCAAAAA-TGTTTCAA-G--GGA-CA---TTGT----GA-AT-TTTA-AGC--ATGAAACTGA-ATATTTGCCTTTGCTTG-GGCTTCCG-T-TTGT-A-CGGCGTA-T-GAAATG-G--TGAA-TGT-TATAACTT--CGTAAATT-CCTGAGT-GGCA--GGTC-T-CTCTGTAAGATCA--TTAGCTTATT--A--TT--GCGCAC-AA---TGTC-TTCAGA-AC-ATGC-AGC-AT-------ACTGGTATC-CA-T-AG--TTTAT-G-C-AC--TTCA-A-CAC--GACATTCTGC--A-TGCATCC-----CAACAGTCTTA-C--A-CTAATGCGATT-CTTC---ACATCA--CCAA-TGCTCC-GC-A-C-AAACA---TAGA--GCCGGGGGGG---GGGGGAGGGGGGATTTTCTTGTGAC-CAAAATat
gi|14 : -AATTTA--AATT-------------G-GAGTT-CCAA-TT-TAA------AAACT-TCA--GGTAA--A----TG-ACT-AG-ACTTGGAGATA-TCTGTTCA-T-TA-C-AGAT-TTG--ACA--TTAAA---TCTAAAA-T-ATGCG---ACACT------G--AAA--TCCGCG--C-A--AG-ACTTA-T----AT-TA-----TTT-----A-A-AC-AA-GT-----TTGC-AT-TA--C--ATTGGAG-GA-----TA-TTTTG--TGTTT----AA-A-TTTTTTGCCTCAA-TG-TTG---ATCCCAA---CGT-AGC-CCAT---AAA------G--TATGT----C--ATGG--T--CCA---AA---------CG-AG-CTCTC--GTAGAG--------TGATTATACTTC-AGC----CATT--GTAG-AGAACTA--------GGAGGAGTT----GATTCAT----CA-CAGGA-TCC--ATA-A----T--T---TTT---TATATT----------------AATTATAAATT-----------TAA----------------------A--AATAAGAAGAC--T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TTAAAT--CG--A-AAA-TC----------A--TTGC----AAT-T----AT---AAAAATACTT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----cattatgt
gi|15 : ccgttattagccaaG-GC-AT-TG-A-CC-TC--T--AAA--ATG-T-AAT--AAAA--AACC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGT-A-----GT-TGT------T--------TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---ATATAATATGAAAA-G----T-----AT----A----------C--T-GT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT----A-AGC--ATGA---TGA-ATATTTGCCTT-GGTTG-GGCTCC-----TTGT-A-CA-C-T--T-GAT-TG-G--TGAAATGT-TTT-ACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-TTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--AC-AA---TTTC-TTAAGA-AC-ATGC-AGC-A--------ACTGG-ATC-CA-C-AG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTTTGCT-A-TGCACCCA-T--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTT---ACA-CC--ACAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCCGGGAGGG---ATTT--------------TCGTGAC-CAAAAgcat
gi|16 : ----AA--AA-AA---------AC--AACCAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACAAGCGCTTC---AAA---TTCT-GGA------T-------------TC-CGT-GGCCACAC---C-CA--C-GC--AGTGCCAGTAT-------T---G---TGTT------TG------TTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTGA------TC-CT-TAATTAATTT--TG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-T-TT--A-C---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTT--TTA-ATGTA-GT--C-A-TCA-G-TGC-T-------CT-T---ACA-AGC-C--AT-CG----A--TT-------CATG-GA--CT-C-GAATTT-T---TTC-AG-C-CCTT------GC-G-A--TT-TTAAGA-T---G--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AT-A--T-A--T-CAA---T-AT-AATCTTCA-T--CG-GAA-GTG-T-----ATG---AA-CGGAT
gi|17 : tgagccttcggctcaggcgagct------GGAAAA-TT----CATC--T----CG-CAGGA-TAA--AGATT----T--T---TTTCCCTTAATT--------------------------T-----------TGA----------------------A--A------------T-------------------T--------------AATTTCAT---TA---------T-T-C---A--A-T-----------CATTTCGTTAATTTT--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGT----AAT------TC---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--AT----CC--AAA-TG-AA-TTA-------------------A-------------ATACAT------AT---------TT----CAATATTTGATTAAAAAAA---------A--AC------------TT-A-A----------ATAT---TT-GAATT--C----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTGATCT-T------T-CTAAATGCGCA----GTT---TAG-GC-AC-TGAA-CC-TC--TTAAAA--ATG-A-AAT--AAAA--G-C-----CAT--G---CATGTTCATTGT-T-----TT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CATTCCA---AT-A---T--G--AAT-AA-GA---A-----------at
gi|18 : aacaaggg---TTCATT----------------A---------T-----------TCA----------------------A---------------T-------------------C--------------A------T---T----------T-T-CCTTA--A-T-----------T-------------C--TTTT--TT--ATATC---A-AAA-TT---------AA--ATGC----------------------------------T--G-T---GAAT----TT--AT----TT--AAA-TG-AAATAT-------------------ATATTTCATTATTTGATAAT------AA---------AC----TTA---------AATACAAGT-------A--AAT-----------AT-G-G----------AT-----TT-G-----------A----TTTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTGGTGTG-TTA-T------T-TG---TAA-------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CCGTC--ATAAAA--ATG-T-cactaata
gi|19 : atttagaaataaagTTA--A-AT-------------GCT-GTT-GCA--TTCTCA------A--CT-TCA--G--AA--A-A--AG-CC--AC-CC--------A-TAT--TGA-A-TG-T-A--TATTG--ACA--TCAG----TT-GAAG-T-ATGAA---A---T------G--AAA--TT---G--C-C---A-ACTC--T-----T-TAC---A--------A-A-AT-GAAAT-----TGGC-AT-TG-TC--AT----G-TC-----TA-CT-----T---T----AATA-T-----GTC---A-----TA---ATC--AA---C-G-A-C----T--GAAA------
gi|2 : ATATTTTTCAGAT-TCT-TCC-C---T--AATTCA--AACATAG-TTG-GCGC-AAGGACTCGTT-TTACGTCCT-TCTTGA-C-T--CCGGTGT-GTA-TA-AAATA---G-------AGTGA--G---------GGTCGGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-T-G-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--C-GC--------GG-AGG--AGAA-----GCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CAAT--GGGAAAA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CCTAC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------AG-----GTTG--AG--G-AA--AA--------T---ATTTACGGTGGGTT-GA-AA-TTATT------TC-CT-TAGTT----T--GGAAA-CT-T---TAT-GCA--TAA-ATG-G-TTAAA-T---GT----TTAGATT-TT-AGT-T---------ATTT----TTG--CCA-ATGCAGGT--C-ACCCA-A-TGC-T-------CT-T---ACACATC-C--ATCCA----A--TT----T-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-TC--CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-TAC-T--TA---CT--GCTTTA-C-A--TGT-ACTG--TCAT-T-CAA---T-AT-AATCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-------TTG---AA-CGAATTA-TGC-CCACAGTA--CTTCT---CA-C------AATAA--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-TT-A-GAT---TAATTATT-TTAA--A--GTT--T-AA--AA-C---AAC--AGCTGT-TC-CTG-ACA--TCAA-----A--------CC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-TTCAG--TG-GGA---CA-A---GTGAT-T--------CTA-----A-TCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGTAA-ATGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGA-ACTGTAACTTGTAAG----A-CAG---GAA-ACAATTCC-TAGAA-T-TGTTCA-TGAT--GTATGTGT---A--TTGT---TC--AGTTTTAAT--T-TTTGATAA---C----AT-GT------TA-----TGTACA------CATTT-C---CTTTCGTT--T-A--T------T-------TT-------------G-T-GTT-CCAT-TT-TAA------AT-TT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AGAACT-AGA---ATTCT--TCA-TGTA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G---AA--TT---G--T-C---A-ACTTA-T----ATATA----ATTT-----A-A-ACAAAAGT-----TTGCAAT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCATTGAAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAAGAAA-------TGATTATACTTCGGTCTA--TATTT-GGAG-G--ATT-CA------GGATTT-TT----GATT--TTTTGTATTAAAA-TTG--AAATAAAAGTAAT---TGT---TTTATT----------------A---------T-----------TCA----------------------ATCA------------T-------------------CTTCCTTA-------A------T---CA---------T-T-G---A--T-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAT-GC---------A------C----AATAT----TTA--A-------TT--AAGCT--GTT---AATT----TT--ATC---C---AAATTG-AAATAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------------NNNNNN------NN---------NN----NNN---------NNNNNNN---------N--NNN-----------NN-A-A----------AT-----TT-AACACCTT----A----AATT-TGTAATTTGTTGTGTGT--TAAA-TTA--GTG-TCA-T------T-TT---T---------TTT---TAA-AG-ATCTG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-ATTTAAAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------TA-T----TA----AT----ATTGAAAAGATT--T-AT---TT-TG-TTG-AGCA-TTGAATAATC-C----ATCTTTATT---GAAATT--TTCAACG--GGA-CGT--T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATA-TTGCCTT-GGTTT-GGCTTCCTTT-TTGT-A-CCG--TA-T-GAT-TG-GATTGAAATG--GCTTACTT--CGT-AATT-C-TGAGT-G-CA--GGTC-CTCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A---T--GC--AC-AATTTTTTC-TT------T-ATGC-AGCAA--------ACTGG-ATC-CA-T-AG---TACT-G-C-ACATTTC--A-CAC-TGCCATTTTACT-A-TGCACCCA-TAACAACA-TCTTACC--A-CTA--AC-ATT-CT-----ACA-CA--CCAATT----C-AC-A-C-AAAAA---C--AACGCCGGGGAGG---GGGGGGGT----------TCGTGAC-CAAAAcccaggagacaatgcagatacaaga
gi|20 : gtcgATATTCGTCAGTC-TTT-CCC-C---T--AATTCA--AACATAG-CGG-GCG--AAG--CTCGTT-G-ACGTTCC-TC-TGA-C-TC-C--GCGT-GTAGTA-AGATG---G-------A-T----A---------GGT-GGT--AA-TT-T--CA-ATT-----G-CGA-ATGGCCGTCTT-ACTTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCatt
gi|21 : gtcgAGTT-CTT-TCC-C---C--TATTT-----CATAA-GTG-GCGC-ATG-ATTCGAT-C-ACATTCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGA-ACA-TA-AAACA---GTGATTTTATTGAGTG---------GGT--GT--AATTT-T------TT-------C---AT-GCAGTCTT-G-TTGTT--GTG-TGTGTGTGTG-AAA--T-GCTCAActcaaa
gi|22 : -GGA------C--AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAT---C-CA--C-GC--G---------G-------TGCGG---TATTATCACATGTGTCTGTTG--AG--G-GA--ACTACTTAATT---ATTTACGGTGGGTTAGA-AC-TTTGA------TC-CT-
gi|23 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-CC--T--AATTCA--AACATAG-GTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--atgtactagtgtattttcatgattgtg
gi|24 : ggtcgA-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATA---G-------AGTGA--G---------GGC-GGT--AATTT-T--CA-ATT-----G-CGA-AT-GCCGTC-----TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAA--CCGC--------GGAGGG--TTAA-----GCTTC--CAGAAATATGA
gi|25 : CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---TTCT-GGA------C--CC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---C-CA--CAGT--A---------CCGTCACAT---G---TGTT------T------GTTG--AC--G-AA--AC--------T---ATTTGCGGTGGGTTGGA-AA-TTTT
gi|26 : -G------T----A----ATTTGTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCG-T------T----------------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATA-T-AAT--AAAA--A-C--------------------CATTGT-T-----G---------------TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---T--G--
gi|27 : T-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTTGAC--CCGCGGGGGGAGGG-GGG--GTAA-----GCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAGTAAA----AA--AA-TA---------AC--A-C-AGTGGAT--TTTT-GC-C---ATTA
gi|29 : CCCCC--C--------------C---C--CC----CC-CGCATCA-----T-GTCAG--TG-GGA---CG------CAAT-T--------CTA-----ATTCATTAGGGAA--------------CA-G----TTGT-A-ATGA-CACTGTTCCTGTA-ATTT
gi|3 : TT-CCC-C---T--AATTCA--A-CATAG-GTG-GCGCCAAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TTGCCGTTGT-GTA-TA-AGATAA--G-------AG-GA--G---------GGT-GGT--AATTTGT--CA-ATT-----GGCGA-AT-ACCGTCT--A-TTG-T--GTGGC-------CG-AGA--TTGCTC-ACG-CCGC--------GG-GGG--TTAA-----GCTTC--CAGAA-TATGAA----T-CA-T--G----AA--AAATA---------AC--A-CA-GTGGAT--TAT--GC-CT--ATTAA-GCGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTTT-G-AAA---TTCT-GGA------CG-AC---TAC-ACCC-CGG-GACCACAC---CGCAAAC-GC--A---------T-------T---G---TATT------TT-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGG-GGGTTGGA-A--TTTTA------TC-CTGTAGTT----T--GG-AA-CT-T---TCT-GCGATTAA-ATG-G-TT--A-T---TT----TAAGATT-TTTAGT-T---------ATTC----TT----------------------CA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-TCT-C--AT-------A--TT----A-ATATT-G---CTGC-GAATTTAT---CTC-AGGC-CCGC------GT-GGA--TT-TTAAGA-T---C--TA---CTTTG---TAAC-A--TGT-AC-G--TCA--T-CAA---T-AT-AAATCTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTACTGGAGCACAGTA--CTTCTCCACA-A------TAT-A--TATA-CA-AGATTTTTTTTTATTATTATT-ATTTA---TA--TA-T-TTAA--A--AGT--T-AA--AACC---ACT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGCCA--ACCCCCCCCCC--C--------------CATTC--CTTT-TCC-CGC-TCC-----T--TCAG--TG-TGA---CG-AC--GTG---T--------TTA-----ATTCAAAAGGCAA--------------CG-T----TTGT-A-A-GACCATTGTTCCTGTC-AGTTACGATACTGTAAC-TGATAG----A-CAG---GG--AC-ATTCT-TAG---T-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TGTTGA--TTAA---TGTTTGA-AA---C----AT-GCCATGG-TA-----TGTACA------CA-TT-C---CTTTCGTTA-T-A--TGACAAATTTAAGA-TT-------------G-TAGTT-CCA--TT-TTA------A--AT-TCA--GGTAA--A-GATTG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCATT-TA-C-A--T-TTG---CA--TTAA----TC-AAAA-T-CTGCG---A---T------GGAAAA--TT---G--T-TCAAA-ACTT--A----ATGTA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TATTTTTG--T---TGTTGAA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---GCT-A-C-CCAT--GAAGTAT---GT-TA-------C--A--G--TCCCCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--GAAGAAG-------TGATTATACTTC-A-C----TATTTGGTAG-A--AC--AA------GGA-GA-TT----GATC--T----CACCAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTT-TT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--ATTTTAATAAAGTT-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--CA--A-AAA-AC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCTTGG-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATTT-------------------A-------------AAAAAA------AG---------A------AA---------AAAAAAG---------ACCACC-----------TT-A-A----------A------TT-G------T---------ATTT-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-T------TCCT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-AGCC-TC--TTGAAA--TTG-TCAATA-AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCTTTGT-T------T-TGT------TGTGTT---TCTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---TAGG--AACAAA-GA---A-----------AA-G----T-----ATG---A----------C--T-AT---TTCTG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TT--T---GAAA-T--TTCAA-GGCGGA-CA---T-GT----GA-ATGTT-A-AGCA-ATGA---TGA-ATTTTTGCCTT-GCTTG-GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TG-T-GAT-TGTG--TGAAATG---TTTACTT--CGTAATTA-C-TGAG--G-CA--GGTC--TCTCTGTAA--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--AC-AA---TTTCTTTAAGA-AC-ATGC-AGC-A--------TATGG-ATC-CACT-AG--TTACTGG-C-ACA-TTC--ATCAC-TGACATTCTGCT-A-TGCGCCCA-T--CAA----T-TA-C--A-C-A--GC-ATT-CTTC---ACA-CA---CAA-T------GC-A-A-CAACA---T--A--GCCGGGGGGG---GGGGGGGGGGATTT----TTGTGAC-CAAAAT
gi|30 : tAGTT-CTT-TCCAC---T--AATTCA--AACGTAG-GTG-GCGC-GAT-AATTGTG-T-ACGCCCT-TGTTGA-C-TT-CTGGTGT-ATG-TA-Atattatgt
gi|36 : tgga-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-AA-CA--AT----G-GT-----TA-TTTTG--T---T----AT-A-T-----GTC---t
gi|37 : A------C--AC---TAC-ACCA-CGG-GACCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---A---T
gi|4 : ATATTTGTCAGTT-CTT-TCC-C---T--AATT-A--AACATAGTGTG-GCGC-AAG-ACTCGTT-T-ACGTCCT-TCTTGA-C-TT-CCGGTGT-ATA-TA-AGAGA---G-------AGTGA--G---------GGT-GGT--AATTT-T--CA-ATA-----G-CGA-AT-GCCGTCTT-A-TTG-T--GTG-C-------CG-AGA--T-GCTCGAC--CCGC--------GG-GGGGTTTAA-----GCTTC--CAGAAATATGAA----T-CAAT--G----AA--AA-TA---------AC--A-CAAGTGGAT--TATT-GC-C---ATTAA-GCGGA-CA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-AT-GGA------C--AC---TACCACCC-CG----CCACAC---C-CA--C-GC--A---------T-------T---G---TATT------TG-----GTTG--AG--G-AA--AC--------T---ATTTACGGTGGGTTGGA-AA-TTTTA------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-TT-T---TCT-GCA--TAA-ATG-G-TT--A-T---GT----TTAAATT-TT-AGT-T---------ATTC----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A-TCA-A-TGT-T-------CT-T---ACA-ATC-C--AT-CA----A--TTT---C-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-T---CTC-AG-C-CCGC------GT-G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT-AC-G--TCA--C-CA----T-AT-A-TCTTCA-T-GGG-GAA-GTG-T-----TTG---AA-CGAATTA-TG--GCACA--------------A-A------AAT-A--TATT-CA-AGA--------TATTATT-TT-A-CGA---TA--TA-T-TTAA--A--GTT--T-TA--CA-CTCTAGT--AGCTGT-TC-CTG-ACA--GCAGC----ACCCCCCTCCC--C--------------C---C--CCTT-TCC-CGCATCC-----T-GTCAG--TG-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-ATGA-CATTGTTCCTGTA-AGTTACGATACTGTAAC-TGTAAG----A-CAG---GGA-AC-ATTCC-TGAAATT-TGTTTA-TGAT--G-A-GTGT---A--TTG----TG--AG--TTAA---T-TTTGA-AA---C----AT-GCATG---TA-----TGTACATTAACACA-TT-C---CTTTCGTTA-T-A--T-AC-AATTTA--A-TT-------------G-T-GTT-CCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GGTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATGCG---A---T------G--AAA--TT---G--T-C--AA-ACTT--T----AT-TA----ATTT-----A-A-AC-AAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GA-----TA-TTTTG--T---T----AA-A-T-----GCC---A-TG-TTG---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----CACC-AA-CAC-C--AAATAAA-------TGATTACACTTC-GCC----TATTT-GTAG-A--ACTAAA------GGAGGA-TT----GATC--T----CA-CAGGA-TCC--AGATA----T--T---TTT---TTTATT----------------A---------T-----------TAA----------------------A--A------------T-------------------T--------------A------T---TA---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------C--AATT--TT--AT--C---A-AAA-TC---------AA--ATGC----AATAT----TT---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TC--AT----C---AAA-TG-AAATGG-------------------A-------------AAAAAA------AA---------AC----CAA---------AAAAAAA---------ACCACC-----------TT-A-A----------AT-----TT-G------T----A----ATTT-TGT--------GTG--T--TTAA-TTGGTGTG-TCA-T------T-CT---T---------TTT---TAG-GC-AC-TG-A-CC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-CC-ATGCAT--G---CATGTTCATTGTGT-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTAA-----CAACC-----AT-C---T--G--AAC-AA-GA---A-----------AA-G----T-----AT----A----------C--T-AT---TT-TG-TTG-AGTA-TTGAATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-G--GGA-CA---T-GT----GA-AT-TT-A-AGC--ATGA---TGA-ATATTGGCCTT-GCTT--GGCTTCC--T-TTGT-A-CGGC-TA-T-GAT-TG-G--TG-AATGT-TTTTACTT--CGTAAATT-C-TAAGT-G-CA-------TTCTAAG-AA---CA--T--GC--A----------------------------------------GC-AAC------------TGG-ATC-CA-T-AG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A-CAC-TGACATTCTGCT-A-TGCACCCA-C--CAACA-TC-TA-C--A-CTA--GC-ATT-CTTC---ACA-CA--CCAA-T----C-GC-A-C-AAACA---T--A--GCC-GGGGGG---GGGGGGG-----------TCGTGAT-CAAAATtgtcacatg
gi|41 : -ATGC-AGC-A--------ACTGG-ATC-CA-T-AG--TTACT-G-C-AC
gi|5 : ATATTTGTCAGTTTCTT-TCC-CCCCT--AATTCA--AAACTAG-GTG-CAGC-AAG-ACTCGTTCT-ACGTC---TCT--G-C-TT-CCGGTGT-GTA-TA-AGATG---G-------TG-GA--G---------GGT-G-T--AATTT-T--CA-AAT-----G-CGA-AT-GCCGTCTTTA-TTG-T--GTG-C----------GGA--T-GCTTGAC--CCGC--------GG-AG---TAAA-----GCTCC----GAAATATGAA----T-CAAT--GG---AA--AA-TA---------AT--A-CA-GTGGAT--T-----C-C---ATT---GTGGAACA-GCGA--AAACGAGCGCTT--G-AAA---T-CT-G-A------C--AC---TAC-ACCC-CGG-A--CACACA--C-CG--C-TC--A---------T-----------G---TATT-------A-----GTTA------G-AA--A---------T---ATTTACGGTGG-TTGAATAA-TT--A------TC-CT-TAGTT----T--GG-AA-CT-T----CT-GCA--TAA-ATG-GGTT--A-T---GT----TTG--TT-TT-AGT-T---------ATT-----TTG--TCA-ATGCA-GT--C-A--CA-A-TGT---------CT-T---ACA--TC-C--AT--A----A--TT----A-ATATT-GA--CT-C-GAATTT-----CTC-AG-C-CCGC------G--G-A--TT-TTAAGA-T---C--TA---CT--G---TA-C-A--TGT--C-G--TCA--T-CAA---T-AT-AA-CTTCA-T-GGG-GAA-GCG-T-----ATG---AA-ACAATT---G--GCACAGTA---TTCT---CACA------AAA-A--TATT-CA-AGA--------TTTTATT-T--A-AGA---TA---A-T-TTAA-----GTT-----A--AA-C---ACT--AGCTGT-TCTCTG-ACA--G-A------ACCCCCCCCTT--T--------------T---T--TTTC-CCC-CGCATC------T-GTC-----G-GGA---CG-AC--GTGAT-T--------CTA-----ATTCAAAAGGG-A--------------CG-G----AT-T-A-ATGA-CACT-TTCCTGTA-AGTTACGATACTG-AAC-TGT-AG----A-CAG---GAA-AC-ATTCC--AGAA-T-TGTTT--TGAT--G-A-GTGT---A---TG----TC--AG--TTAA---T-TTTGAT-A---C----AT---------TA-----TGTACA------CA-TT-C---CTTTCG-----------------------------------------------------T-TAA------A--TT-TCA---GTAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GG----A-TCT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAA-T-ATCGG---AT--T------G--AAA--TT---G--T-C--AA---CT--T----ATATA----ATTT-----A-A-AC-AAAG------TTGC-AT-TA-TC--AT----G-G------TA--TTTG--T---T----AA-A-T-------C---A-TGTTTG---AT----A---CGG-A-C-CCAT--GAAA------G--TA-------C--A--G--T---CA---AA-A-----CACCAAA-CAC-C--AAAG-AA-------TGATTATACTTC-G-T----TATTT-GTAG-A--ACTAG-----------------------------------AGGA-TCC--AGATT----T--T---TTT---TTTTTT----------------T---------TTTTTTTTTGTATAA----------------------A--A------------TTTGAAATAAAGCAATGTGTT--------------A------T---TA---------TAT-C---ATCA-T-----------C-------------T--GCTT--TA--AT--C---ATGAA-TCCAATTTATCAA--ATGC----AATAT----T-----------------AGC---G-T----GAT----TT--AC----C---AAA-TG--AATAG-------------------A-------------AAAAGA------AA---------A------AA---------AAAAAAAAGAAAAACGA--ACCAAAAAAAAAAATT-A-AAAAATAACTAAT-----T---------T----A----ATTG-TGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TCA-TTTATTAT-TT---T---------TTT---TAG-GC-AT-TG-A-CC-TC--TTGAAA--AT--T-AAT--AAAA--A-CC-AT---T--G----------------T-----GT-TGT------TGT-TT---TTTC--TTTA-----CAATCCA---AT-C---A--G--AAA-CA-GATTTA-----------A-------T-----ATAAGAA----------T--T-ATACATT-TG-TTT--GCA-TTG-ATAATC-C----ATC-TTA-T---GAAA-T--TTCAA-C--GGA-CA---T--T----GA-AT-TT---AGC--ATGA---TAA-ATA-TTGCC-T-GTGTG-GGCTTCC----TTGT-A-CCGC-TA-T-GA--TG-G--TGAAAGG---TTTACTT--CGTAAATT-C-TGAGT-G-CA---GTC-TTCTC-GT-A--TCA--T--GC--ATT--A--TT--GC--AC-AA---TTTC-TTAAGA-AC-ATGC-AGC-A--------ACT-G-ATC-CA-T-AG--TTACT-G-C-ACA-TTC--A--AC-ATACATTATACT-A-TG--CCCA-T--C-ACA--C-T--C--A-CAA--AC-ATT-CTTC---A--------------------C-G-C-AAACA---A--C--GCC----GGG---GGGGGGG-----------TCGTGACACAAAAT
gi|6 : ggtcgGAGCCATTT-A-AAC---TTTC-CGA------C--AC-------AACC-CGACGACC-CAC---C-T---C-GC--A---------T-----------A---TATT------T--------TG--AA--GTGA--AC--------T---ATT-ACGGTGG--TGGA-AA-TCT-A------TCGCT-TA--T----T--GA-AA-TT-T---AAT--CA--TAA-ATG-A-TT--A-TTG-AT----TTAGATT-T---AT-T-----------TC----TTAGCTCA-ATGCA-TTTTC-A-TCA-A-TTTAT-------CT-T---AC---TC-CCAAT-CA----A--TC----A-ATATT-GAA-CT-C-AATTTC-T---CCT-GC-C-CCGCCAGACCGT---A--TCATTAAGG-TACAC--CC---CT--T---AA-CTA--TGTTAC-G--TCA--TTC------------TCTTCA-T-TAGCGAA-TAG-T-----TTATAAAA-CGAATTA-TG-----C-GTA--TCTCA---CA-T------AAA-A--AAT--CATAGA--------TAT-ATT-TT-A--GA---CA--T--T-TGAAT-A--GAT--C-AT--GA-C---ACCTAAGCTGT-CT-CTG-ACGATGCAGC----ACCCCCCCC----------------------------TTATCCACGAGTCT-----G-ATC-G--TGCGAA---CGTAC---TGAT-TTAACCAAACTACAGCCGTTCAAAAGG--A--------------CG-------TAT-A-AT---CATTATTCCTGTA-AG--ACGATAACGCAA--TGTAAG----A-CAG-----A-AC-AT--C-TTGAATTGTCTTTA-TATT--G-A-GTTT---AGATTGAGGATA--AG----AA---T-TTTAACAAATGC----GT-GA------TAACAGTTCTACA------CA-TTAC---CTTTCGTTAAT-A--T-AC-A-TTCA--A-TG-------------A-T--TC-TCA--TTCTAA------A--AT-TCA--G-TAA--A-A--TGCAC---G-AGT-GGA------CA--TCA-G-TA-CTA--TATTG--ACA--TCAAGAAGTC-ACTA-T-AT-TG---A---CTGAGTAG--AAACTTT---G--T-C--AA-ACTTGTTCAAAAT-AA----ATTTCAATTATA-AC-AAA-T-----TTGC-AT--A-TCCTAT----G-GAGAAACTA-TTTTG--T---T----AACA-T-----GC----A-GA-TTG---TTC--CAGACCGGTA-C-CAAT--GAAA------AAATA-------CTCA--G--T--CCATATAACA-----CACC-AA-CAC-A--CAAGAA--------TGAG-ATACTTC-GCC----TAT---GTAG-A--A-TAGA------GGAG-A-TT----TATC--T----CA-CAG-A-TCC--AGAT-----T--T---TTG---TTTATC----------------A---------T-----------TAAATTTTATAAAATAATATAGTTTA--A------------T-------------------C--------------A------TATCCA---------T-T-C---A--A-TAATATCTAGTAC-------------CG-AAAT--TT--AT--C---A-AAC-TC---------AACGATGC----AATAT----TTTATA-------TT--AA-CT--G-T---TA------TT--AT----CCCCA----G-AAATTA-------------------A-------------AAAAAA------A----------------CAT---------AAAAAAA---------A--A----------------A-A----------AT-----TT-G-----------A----GTAC-CAT--------GCA--T---------AGTGTC-T---T------T-CT---T---------CTT----AG-GCTAT-TA----C-TC--T--AAGTTGTG-T-AAA--AAAT--A-TC-ATGCAT--G---AA-GTTCATTGT-TTGCGAAT-TAT------T---TT---TTTC--TTGA-----CACCTCG---ATAC---T--G--AAC-AAAGC---A-----------TA-GGTTGT-----AT----A----------CAAT-AG---AT-CG---G-AAT--TTGAACTATT------ATA-TTC-T-----AA-T--TCAAA-A--GGATCA-----GTAGAAGAGAT-TT-A-AGC--AT-A---TGA-A-ATTTGCTGT-TATTG-GGCTTCC--TGTTGC-----GC-TA-T-G------------------TATTACTTTACGTAA-TT-C-TGATA-G-CA----TC-T-CTCTACAA--TCA--T---C---TT--A--TT--GC--AC-CA---TTTC-TTAA-A-AC-ATGCTAGC-T--------A-TGA-GTCACA-TTAG--TTACT-G-C-ACA-TT-----CAC-CGAC--TCCGCT-A--GCA-CCA-T--C-ACACTC-TG-T--AGCTG--G---GT-CTCC---GCC-TA----AA-T----C-AC------AACATCCT--A--CCCGGGAGCG---GGGAG
gi|7 : CGC------GT-G-A--TT-TAGAGT-C---C--TA---CT--G---AA-C-A--TGT-ACCG--TCA--T-CAT---TTAT-AATCTTCAGT-ATG-GGA-GTT-T-----TTGTG-AA-CGAAT-A-TG--GCACAGTA--CT-CT---CA-C------AAT-GATTATA-CA-A-A--------TATTATT-TTTA-AGAGTATA--TA-TATTAG--ATGGTTGTT-AA--AA-C---ACT--A-CTGTATC-CTG-AGA--G--GCGGGGAAGCTATTCCC--C--------------C---T--CCTT-TCC-CGCATCC-----TTGTCAGAGTG-GGAGGACG-AC--GTGATGTG-------CTA-----ATTCAAAAGGAAAACTGGTCCTGTTCATGCG----TTGT-AGAGGA-CATTGTTC-TGTA-AGTGACGATACTTTA-C-TGTGAATGTAA-CAGTATGGACAT-GTTCCCTAGACAT-TGTTTAAGGATTGG-A-GTGTGATA--TTG----TG--AT--TTAGCGCT-TTTGAATA---CTTTTAT-GCAGTG--TAG----TGTACAA-----CAGTT-T---CTTTCGATA---A--TGAC-AATTTA--G-TTATATGTGGGGCATG-T-GTG-CCAGTTT-TGATAAAATA--CTATCAAAGGTAATTATA--TG-ACCCAG-ACT-GGA---A-TCT--TCA-T-T--T-A--T-TCAGTACG--TGAGAGGTTC-AAAG-TTATGCGGGTA---T------G--AAA--TT---GGATAC--AA-ACTT--T----AC-TAGTAAATTT-----A-ACAC-GAAGTACTTTCTGT-GT-GAATC--AT----GAGA-----TA-TTTTGATT---T----AA-AAT-----GCC---A-TG-TTGTATATC--AA---CGT-A-CGCCAT--GAAA------G--TAAGTTGATCTGA--GATT--CCA---AA-------CACC-AA-CAA-C--AAAGAGAAGTAGACCGATTATACTTG-GCTCCGGTATTT-GTAGAA--ACT--A------GGAGGA-TT----GATC--TCC--CA-CAGGAGTCCAGAGATG----T--TTTGTTT---TTTACTTATGAAATCTTTTTAAA---------T-----------TAA----------------------A--A------------G-------------------T--------------A------T---AT---------T-T-C---A--A-T-----------C-------------CTAAATTGGTTG-AT--CGTAA-AAA-TC---------AATTTTGCTATAGATATTCGGTT---A-------TTGAAGGCT--G-T---AAATATTCTT--ATTAACC---AAG-CC-AAACTG-------------------A-------------ACCAAACTCTTCAA---------AC----------------AAAAAAC---------A--ACC-----------TT-ATA----------ATTGGGGTT-G------TTCTCA----ATCT-TGT--------GCG--catgtcgcttgcgtgtttgtgtcctgaaccaaactcttattgatgtagag
gi|7 : -A-CC-TC--TT-AAA--TTG-T-AAT--AAAA--A-CCGATGCAT--G---CATA-TCATC-T-C-----G--TGT------GGG-GTGAGTTTCGATTAG-----CAATCCA---TA-C---T--G--AAC-AAGGA---A-----------GA-G----TGATTAGT----A----------C--TAAT---TT-TGATTGAAGTATTTGAA-AAGC-C----ATC-TTA-G---GAAATT--TTCAATG--GGA-CATGTT-GT----GA-AT-CTAA-AGCGGATGA---TGAGATA-TTGCTCT--CTTG-GGCTTCC--T-TTGTAA-CGCT-TATT-GAT-TGCG--TGAAATGT-CTTAACTT--CGTAAATTGCATGAGTGG-CAGTGGTC-TTCTTCTTAA---CATTT--GC--ACT--GTTTT--GC--ACAAA---TTTC-TTAA-A-AC-A-GC-AGC-------------GG------A-T-AG-----CT-G-CAACA-TTC--A-CACTTGACATTCTGCT-ACTGCACC------CAACA-GC-TA-CATA-CTA--GCTATT-CTTC---ACA-CAATCCAA-T----CTGC-AGC-AAACA---T--A--GCTGGGGGAG---GGATAGT-----------ACG-GAC-CAAAATgtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatacctcttaaattgtaataaaaaccgatgcatgcatatcatctcgtgtggggtgagtttcgattagcaatccatactgaacaaggaagagtgattagtactaattttgattgaagtatttgaaaagccatcttaggaaattttcaatgggacatgttgtgaatctaaagcggatgatgagatattgctctcttgggcttcctttgtaacgcttattgattgcgtgaaatgtcttaacttcgtaaattgcatgagtggcagtggtcttcttcttaacatttgcactgttttgcacaaatttcttaaaacagcagcggatagctgcaacattcacacttgacattctgctactgcacccaacagctacatactagctattcttcacacaatccaatctgcagcaaacatagctgggggagggatagtacggaccaaaatattatat
gi|8 : cgcgtgatttagagtcctactgaacatgtaccgtcatcatttataatcttcagtatgggagtttttgtgaacgaatatggcacagtactctcacaatgattatacaaatattatttttaagagtatatatattagatggttgttaaaacactactgtatcctgagaggcggggaagctattccccctcctttcccgcatccttgtcagagtgggaggacgacgtgatgtgctaattcaaaaggaaaactggtcctgttcatgcgttgtagaggacattgttctgtaagtgacgatactttactgtgaatgtaacagtatggacatgttccctagacattgtttaaggattggagtgtgatattgtgatttagcgcttttgaatacttttatgcagtgtagtgtacaacagtttctttcgataatgacaatttagttatatgtggggcatgtgtgccagttttgataaaatactatcaaaggtaattatatgacccagactggaatcttcatttattcagtacgtgagaggttcaaagttatgcgggtatgaaattggatacaaactttactagtaaatttaacacgaagtactttctgtgtgaatcatgagatattttgatttaaaatgccatgttgtatatcaacgtacgccatgaaagtaagttgatctgagattccaaacaccaacaacaaagagaagtagaccgattatacttggctccggtatttgtagaaactaggaggattgatctcccacaggagtccagagatgttttgttttttacttatgaaatctttttaaattaaaagtatatttcaatcctaaattggttgatcgtaaaaatcaattttgctatagatattcggttattgaaggctgtaaatattcttattaaccaagccaaactgaaccaaactcttcaaacaaaaaacaaccttataattggggttgttctcaatcttgtgcggtttgttattgttaaggtacagggtctagtaaactgacgtcgattttattcttgctttataattatgcgtgcgtatAG--TG-GGA---CG-AT--GCGAT-T--------CTA-----ACTTAAAAGGGAA--------------CG-G----TTGT-A-AGGA-CACTGTTCCTGTA-AGTTACGATATTGTAAC-CATAAG----A-CAG---GGA-AT-ATTCC-TAGGATT-TGTTTT-CGAT----A-GTGC---A--TTG----TA--A---TTAA---T-TTT-------------------------------TG-----------A-TT-A---CTTTCGTTG-T-TGTT-GA-AATTAA--AATT-------------G-T-GTT-TCA--TT-TAA------A--CT-TCA--GTGAA--A-A--TG-AC--AG-ACT-GGA---A-TAT--TCA-T-TA-C-A--T-TTG--ACA--TTAA----TC-AAAAAT-ATGCG---A---T------G--ATA--TT---G--T-C--AA-ACTT-------AT--A----ATTT-----A-A-GC-TAAGT-----TTGC-AT-TA-TC--AT----G-GC-----TA-TTTTG--T---T----TA-A-A-----GTC---A-TA-TTT---ATC--AA---CGG-A-C-CCAT--GGGC------G--TA-------C--A--G--T--CCA---AA-A-----TACT-AA-CAC-C--AAAGGAA-------TG--CACACCTC-GCC----TATTT-GTGG-A--AGGAAACAAGGGGGAAAA-TT----CATC--T----CA-CAGAA-TAA--AGTTGGT--T--T---TTT---TTTATTTTGAA-----------A---------T-----------AAA----------------------A--A------------T-------------------C--------------A------T---TAATCATTTTCC-T-C---A--ATT-----------C-------------T--TATT--TT--AT--C---A-AAA-TT---------AA--ATGC----AGTA------C---A-------TT--AAGCT--G-T---AAAT----TT--ATC---C---AAA-TG-AAATAA-------------------A-------------TACATATT----AATGATATTTCACTATTCAA---------TAAAGAA---------A--A-C-----------TT-A-AAT--------AT-----TT-GGATT--T----A----ATTTCTGT--------GTG--T--TAAA-TTAGTGTG-TTA-T------T-TA---TAAATGCGCATTT---TAG-GC-CC-TG-ACCC-TC--TTGAAA--ATG-T-AAT--AAAA--A-TC-ATACA----------GTTCATTGT-C-----GT-TGT------TG--TT---TTTC--TTTA-----CAGTCCA---Aattatat
gi|9 : AAAAA------AT---------AT----CAA---------ACATTAA---------C--AC------------TT-A-A----------AT-----AT-A------T----GTTTCATTT-TGTTGTT----GTG--TCATAAA-T--ATGTG-TCAGT------T-TTA--T---------TTTATATAGTGC-AT-TG-A-C--TCAGTTGAAA--ATG-T-TAT--TAGA--A-TA-ACTCAT--G------------TGT-T-----GTATGT------GG-------TTTC--GTTA-----CAATGCA---
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CATTCTGCCAACAATCAATATTATAGGTGGAGATAGAGTGGGGGGGGGGTGCTTTCTTGACCCAAAATTATTATTATGTATAG
Unaligned ( gi|31 ): AATGTCTCCCCACCATAGGGCCCCCGGGGGGGGGGGGACATAATTTTGCACTTGTGATCATAAATATCATGAAAT
Unaligned ( gi|32 ): AACAATATCCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTCTGTAACTAAAGATATTACGTAC
Unaligned ( gi|33 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAAAACTATCATATCGGAGTTATCCTCATAA
Unaligned ( gi|34 ): CTTGAGCCTTCGGCTCAGGGGAGCTAAAAACTGTAATTATTTAAATAGA
Unaligned ( gi|35 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAACCTAATAAGTGAATTGTTTTT
Unaligned ( gi|38 ): CTTGAGCCTTCGGCTTAGGTGAGCTAATAAAGTAATCAG
Unaligned ( gi|39 ): GCCTTCGGCTCAGGTGAGCTAAAAATAAAACAATAT
Unaligned ( gi|40 ): CCTTCGGCTCAGGTGAGCTAATAAAAACTTTATTT