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Reference ( gi|1 )            : GTTACTCAA-CCGGCGGGT--GTCAGCTGATCTAGAGCGCCGCTGAGCATGT-TTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCCTT-AAAACAACATGCCAACG---TTTGTTGTTTGTAGTTATAGGTAGAAATCAACAA-TTAGACAAAATCGACTCTCTTTT-TT-TTAACTT---CATATGACATACCG-CGGGAAACGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAACAAGTCGCGCACACAGAAGACTTCGTTTTTTATTTTTAATTCTAGTGTTTTATTTG--GTAT---TCTT-TCGTACCTTTGT-CACATTGCGTTAAAGAG-ATAAAATAAAAATGAAAAGTTGACAAGCCTTACAAAAATAGCGAACTTAGAATTACCGAAATTCTTTAT-GTCGACAATTTT--AGATTTTCAAAGGGAAT-TACGATCCATGTA-TGAATCAATTGCAACAACTACATGTATAGATATAT--ATATAATGAAGATTTTGGAAGTGGAT-ACAATTTT-ATGTCTCTAGTATGATTTT----------TTTTATTTTTACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGT--TTTTTAGAAAGTGTTTTGTTTTTTTTTAATTGAGTTTTTATCTATAA-CAAATATAATTAACACCAATGGTATATAGATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCCATTATGAAAAGTATCTTTGATTGAATTAGATCTAATTGAATGAATTAAATTGTTTGTTAAAGACG-CCTTTTTTATTTCATACTTTAAACCATCGATTGGTG--AATTCTAATAA---AATTACACGCACATTGCAATT-CAGAAAAAGTGGTATAACTTTCATA--GTTCAAGTGACTTGGTATTATAAACACCAA-TTCTCAC--------TTAACAAAAATAAATGTCTC-TAATTTTAAGATTTGTTTATT------TCGTGTTCA----GAG-----AAATCGCAATATATGCTGCATACGGTAAGTGTAAATGTGGAGTGTGAATATTCATAATT-ATGTA-AACATGTAATTATCTTTTCCTGCGTTTCTT--TTACTTATTCTTGTTAAAACACC-TTATATAACGTTCCAATGTACGAAAAATTACACTGG-TTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTCGGCAGTTTCAAAGTGAACTGGGACACTGATGAGGAGTAGCGGAGTACCTTAAAGTTGGAAGCAAAGATAAAAACAGCTTGAGGTAATCAAACAATTAAATTACTCGCTACAAAATGCCGATGATGGA-TAATTATACTACGC-------------------GATGCTACACTGCCCACCGACCCC--TAG--C-----TTG-----T-----CTATAAT---TCTCTATTTCACACTTAATCATAATAGTGATA-ATTCACGGATTCCAAACTCTGGATTTTCACAGCTTTTGAAAATTAAATGACAGACACGAAGT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAAATTTTCATATAGTTCAATTGACTTGG-------------AG-TTATCAC--------GTAAT-----TGGATGTCTC-TAATTTTGAGATTTATTTATTATAGATTTATTTTGAATATGAGTTAACAAATCGCGAGGTATTCTATAT---GTAATTG--AATGTAAAGCGTGAATATTCAC-ATT---------CATGTAATGATCCTTTATTGCGTTTC-T--CAACTAATTCTCGTTGAAACA-------ATAATATTCCAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -----AAAGCTCGATGTATACTGCATA-----ATTGTGAATGTGAAGAATGAATATTCAC--TT-ACATCTACCGGGTAATTATCTTTTATTTTGTTTCCTAAATAC---TTCTTGCTGGACCATCATTATActatatagtggagtaccctaaagttcaaagcaaagataacagggggggggggggtccaaagaattgaatctatgcagatgctacactaaaaaccaagctaatacactccctaacaacccctagttcgtttcttctctaatcaatatctattttacatcaaatcatattgaggacagatccacgggacccaaactcgagattttcacggtttttgaaaattaaactacacacaccaagtttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGCTTTTGTTTGGTTGAGTATTTTTATT-GATAGTTTCAAGGTGATATGAGGCTCTGACGCGGAGTAATGGACTACCCTAAATTTTGACGAAAAGAT---AACAGCCTGGGGGAATCATACATTTAAATCAAT-GCTAC-AAATGCAGGTGATTGG-CCATTATACTACGCCAGACGATATTCAAGTCAAGATAATACACCCCCTGCCAACTCC--TAGATCCTAGATTGTTTCTT-----CTATGAT-----TATATTTTACATCAAATCATATTGGTGATATATCAACTGAATCCATA--CTGGATTTTCAAAACTTTTGAAATTTAAATGACAGACAGGGAGTc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAGTGGAGTACCCTAAAGTTCAAAGCAAAGATAACAGGGGGGGGGGGGGTCCAAAGAATTGAAT------CTA-----TGCAGATGCTACACTAA--AAACCAAGC---------------------TAATACACTCCCTAACAACCCC--TAG--T-----TCG-----TTTCTTCTCTAATCAATATCTATTTTACATCAAATCATATTGAGGACAGATCCACGGGACCCAAACTCGAGATTTTCACGGTTTTTGAAAATTAAACTACACACACCAAGTttggactttttgcatcggttcaattatggttgagttattttttgcatttgcaatccttttatatgctagttgtcactgtcctaagattttctgtgtattacggtgtttatatgtgtatatcctatttacttcaaaatcattgctgctacgtttcttttggatttgcattttgatcaaaacaataacatgtatgatatgagggacgagtcgtctcaagaaagggggcgagctttcccgaagaggacaagttgtcttggagtcgagtacgttgtccttatgatggggcgagttgttttgaggacgatttatctggggaacgagttgtcctggtaccgttagaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaaattttcatatagttcaattgacttggagttatcacgtaattggatgtctctaattttgagatttatttattatagatttattttgaatatgagttaacaaatcgcgaggtattctatatgtaattgaatgtaaagcgtgaatattcacattcatgtaatgatcctttattgcgtttctcaactaattctcgttgaaacaataatattccaactataAATTGGACGCAAAGATAAA----GGTTAAGAAAATCAAACAATTAAATT--T-------AAATGCCGATGATTGA-TAATTATAATAttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gAACGCCGATGAT-----AATTATCCTACGCTC-----------------GA--CTACTCTGCCTGCCAATCTTGTTAC--C-----T-------------CTATAAT---TATATATTTCACACTTAATCAT-----------ATT----GATTCCAACCTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAA
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TCTTTTTTTAAAATTAATATATATCTTACATGAAATAGTATTTGTGATAAATTCACGGAACAAGCTTTTGAAAATTTAACTCAAGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGTGGAATTTTCGCATCCGTCCAATCATGGCTGACTTGTGTTTGCATTTGCAA
Unaligned ( gi|8 ): TCCTTTTACTAGTATATACAAGGATGTTATCATTGTAATTTTTCTGTGTATTGCAGTGTTTATGTATACTTTACTTACCATAAGATTATTGTCGCTACTTTTCTCTTGGATTTAGATCAAAATAACAT
Unaligned ( gi|9 ): TGTGTATACTTTATGTTTATGTGTATACTTTATCTTCAATAAATTTATTGTCACTAATATGTTTCTCTTGGATTTAGACAAAAAGTAACGATTACACATAAACATTCATGCTATGAAGG
Unaligned ( gi|11 ): TCAATTATCATTGTCCTAAGTTTTTCTATGTATTACGGTGTTTTTGTGTATATACTATTTACAAAAAATTATATTCCCTACGTTTCTCTTGGAATTTGGACAAAAATAATAA
Unaligned ( gi|12 ): TTCAATCATGACTGAGTTATGTTTAGCCTTCAGTTGTCACTGTCCTAGGTTTTTTTGTGTATTACGGTGTTATAATAATTATGTAGATATTACTTAC
Unaligned ( gi|13 ): TAAACATTATCTTCAATAAATTTAATGTCACTAATACATTTCTCTTGGATTTTTACCAAAAGCATTTATACTATGAGGGG
Unaligned ( gi|15 ): ACACGAAGTTTGGAACTTTGCATCAATTCAACCATGGCTGAGTTATGCTGCATTTGTAAT
Unaligned ( gi|16 ): GCAAGTTGTTCAGGAAGGGGCACAGTTGTTCCTGAAGAGGGGACGAGCTAGTTGTCTT
Unaligned ( gi|17 ): TGTTTATGTGGTATATCATCTACAACTAAATTATTGTCGCTAATATTTTTCTCTTG
Unaligned ( gi|19 ): TAATTGTAAAACCAGAATAGCTCATAGAAGTTAAAA






Alignments
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACTTTACACAA----ATAGTG--ATTTCTAATAA---AATTACACACACATTGCATTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAAAA-TTGACAAGCCTTACAAAA-TAGCGAACTTAGAATTACCGAATATCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGA-TCAATTGCAAAAACTACATGTAAGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGA-GTGGATTACAACTTTCATGTCTTTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTGACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAA-------TGTGTTTTTTTAATTGAGTATATATCTATAAACAAGTA--ATTA-CAC-------ATATA--TTTTTCCAGTAATCGAAATTTCTATCATGAAAAGTAACTTTGATTGAATTAGATGTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCTTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTGCAGATCCTAA-AATTTATTTACATACAAATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTAT-ACAATC--ATAGTTC------------A-TTATAAATACCGACTTTCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTAT------TTTGTGTTCA----GAG-----AAATCGCAATA---------------TAAGTGTAAATGTGGAATGTGAATATTCATAATTAATGTA-AAAT---GTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTCATT-T-A-TTCTTGTTAAAAC-------------TTCCAATGTACGAATAATAACAACGG-TTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTC-GCGATTTC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCC-TTGAAACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGGCTTTTGTTTGGTTGAGTATTTTTATT-GATAGTTTCAAGGTGATATGAGGCTCTGACGCGGAGTAATGGACTACCCTAAATTTTGACGAAAAGAT-A-AC--AGCCTGGGGGAATC-ATACATTTAAAT--CAATGC----TACAAATGCAGGTGATTGG-CCATTATACTACGC-CAGACGATATTCAAGTCAAGATAATACACCCCCTGCCAACTCCTAGATCCTAGATTGTTT-CTT-----CTATGAT-----TATATTTTACATCAAATCATATTG-GTGATATA-TC-AACTGA-A-TCCATA--CTGGATTTTCAAAACTTTTGAAATTTAAATGACAGACAGGGAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTAAAATTTTCATATAGTTCAATTGACTTGG-AGTTAT--------------CACGTAATTGG-------------ATGTCTCT-AATTTTGAGATTTATTTATTATAGATTTATTTTGAATATGAGTTAACAAATCGCGAGGTATT-CTATATG---TAAT--TGAATGTAAAGCGTGAATATTCAC-ATT--------CAT---GTAATGATCCTTTATTGCGTTTC-TCAA-C-TAA-TTCTCGTTGAAACA------ATAATATTCCAAttggactttttgcatcggttcaattatggttgagttattttttgcatttgcaatccttttatatgctagttgtcactgtcctaagattttctgtgtattacggtgtttatatgtgtatatcctatttacttcaaaatcattgctgctacgtttcttttggatttgcattttgatcaaaacaataacatgtatgatatgagggacgagtcgtctcaagaaagggggcgagctttcccgaagaggacaagttgtcttggagtcgagtacgttgtccttatgatggggcgagttgttttgaggacgatttatctggggaacgagttgtcctggtaccgttagaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAGTGGAGTACCCTAAAGTTCAAAGCAAAGATAACAG--GGGGGGGGGGGGTCCAAAGAATTGAAT--C--T-----------ATGCAGATGCTACACTAA--AAACCAAGC----------------------TAATACACTCCCTAACAACCCCTAG------------TT-CGTTTCTTCTCTAATCAATATCTATTTTACATCAAATCATATTGAG-GACAGA-TCCA--CGGGA-CCCAAACTCGAGATTTTCACGGTTTTTGAAAATTAAACTACACACACCAAGTctatatagtggagtaccctaaagttcaaagcaaagataacagggggggggggggtccaaagaattgaatctatgcagatgctacactaaaaaccaagctaatacactccctaacaacccctagttcgtttcttctctaatcaatatctattttacatcaaatcatattgaggacagatccacgggacccaaactcgagattttcacggtttttgaaaattaaactacacacaccaagtttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|5                          : taaaattttcatatagttcaattgacttggagttatcacgtaattggatgtctctaattttgagatttatttattatagatttattttgaatatgagttaacaaatcgcgaggtattctatatgtaattgaatgtaaagcgtgaatattcacattcatgtaatgatcctttattgcgtttctcaactaattctcgttgaaacaataatattccaactataTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTTGAGCGCCGCTGAGTATGTCTTTATACCCCATCTGCGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTT---TGTAATTATAGGT-GAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTTTTTTGTTATTAACTTGCATATATGACATAACGGCGGGAA-CGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAAAAAGTCGCGCGCACAGAAGACT-CGTTTTT-ATTTTTA-TTC-A----TTTATTTATTGTACATATCTTCTAATACCTTTGT-ACAATTG-GT-AAAGAGAATAAAATAAttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaAACGCCGATGAT-----AATTATCCTACGCTC------------------GAC--TACTCTGCCTGCCAATC--TTG------------TTACCT-----CTATAAT---TATATATTTCACACTTAATCATATTG--------A-T-----------TCCAACCTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TCTTTTTTTAAAATTAATATATATCTTACATGAAATAGTATTTGTGATAAATTCACGGAACAAGCTTTTGAAAATTTAACTCAAGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGTGGAATTTTCGCATCCGTCCAATCATGGCTGACTTGTGTTTGCATTTGCAA
Unaligned ( gi|8 ): TCCTTTTACTAGTATATACAAGGATGTTATCATTGTAATTTTTCTGTGTATTGCAGTGTTTATGTATACTTTACTTACCATAAGATTATTGTCGCTACTTTTCTCTTGGATTTAGATCAAAATAACAT
Unaligned ( gi|9 ): TGTGTATACTTTATGTTTATGTGTATACTTTATCTTCAATAAATTTATTGTCACTAATATGTTTCTCTTGGATTTAGACAAAAAGTAACGATTACACATAAACATTCATGCTATGAAGG
Unaligned ( gi|11 ): TCAATTATCATTGTCCTAAGTTTTTCTATGTATTACGGTGTTTTTGTGTATATACTATTTACAAAAAATTATATTCCCTACGTTTCTCTTGGAATTTGGACAAAAATAATAA
Unaligned ( gi|12 ): TTCAATCATGACTGAGTTATGTTTAGCCTTCAGTTGTCACTGTCCTAGGTTTTTTTGTGTATTACGGTGTTATAATAATTATGTAGATATTACTTAC
Unaligned ( gi|13 ): TAAACATTATCTTCAATAAATTTAATGTCACTAATACATTTCTCTTGGATTTTTACCAAAAGCATTTATACTATGAGGGG
Unaligned ( gi|15 ): ACACGAAGTTTGGAACTTTGCATCAATTCAACCATGGCTGAGTTATGCTGCATTTGTAAT
Unaligned ( gi|16 ): GCAAGTTGTTCAGGAAGGGGCACAGTTGTTCCTGAAGAGGGGACGAGCTAGTTGTCTT
Unaligned ( gi|17 ): TGTTTATGTGGTATATCATCTACAACTAAATTATTGTCGCTAATATTTTTCTCTTG
Unaligned ( gi|19 ): TAATTGTAAAACCAGAATAGCTCATAGAAGTTAAAA






Alignments
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACTTTACACAA---AT-AGTG-ATTTCTAATAAAA-----TTACACACACATTGCATTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAAAA-TTGACAAGCCTTACAAAA-TAGCGAACTTAGAATTACCGAATATCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGA-TCAATTGCAAAAACTACATGTAAGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGA-GTGGATTACAACTTTCATGTCTTTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTGACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAA-------TGTGTTTTTTTAATTGAGTATATATCTATAAACAAG--TAATT-ACAC-------ATAT--ATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCTATCATGAAAAGTAACTTTGATTGAATTAGATGTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCTTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTGCAGATCC--TAAAATTTATTTACATACAAATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTAT-ACAATCATA--GTTC-------------A-TTATAAATACCGACTTTCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TTGTGTTCA----GAG-----AAATCGCA-----------AT---ATAAGTGTAAATGTGGAATGTGAATATTCATAATTAATGT--AAAATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTCATT-T-A-TTCTTGTTAAAAC-------------TTCCAATGTACGAATAATAACAACGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTC-GCGATTTC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCC-TTGAAACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTTTTGTTTGGTTGAGTATTTTTATT-GATAGTTTCAAGGTGATATGAGGCTCTGACGCGGAGTAATGGACTACCCTAAATTTTGACGAAAAGAT-A-AC--AGCCTGGGGGAATC-ATACATTTAAAT--CAATGC----TACAAATGCAGGTGATTGG-CCATTATACTACGC-CAGACGATATTCAAGTCAAGATAATACACCCCCTGCCAACTCCTAGATCCTAGATTGTTT-CTT-----CTATGAT---TA--TATTTTACATCAAATCATATTGGTGATATA-TC-AACTGA-A-TCCATA--CTGGATTTTCAAAACTTTTGAAATTTAAATGACAGACAGGGAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggcTAAAATTTTCATATAGTTCAA-TTGACTTGG-AGTTAT--------------CACGTAATTGG-------------ATGTCTCT-AATTTTGAGATTTATTTATTATAGATTTATTTTGAATATGAGTTAACAAATCGCGAGGTATTCTATAT---GTAATTG--AATGTAAAGCGTGAATATTCAC-ATT---------CATGTAATGATCCTTTATTGCGTTTC-TCAA-C-TAA-TTCTCGTTGAAACA------ATAATATTCCAAttggactttttgcatcggttcaattatggttgagttattttttgcatttgcaatccttttatatgctagttgtcactgtcctaagattttctgtgtattacggtgtttatatgtgtatatcctatttacttcaaaatcattgctgctacgtttcttttggatttgcattttgatcaaaacaataacatgtatgatatgagggacgagtcgtctcaagaaagggggcgagctttcccgaagaggacaagttgtcttggagtcgagtacgttgtccttatgatggggcgagttgttttgaggacgatttatctggggaacgagttgtcctggtaccgttagaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGTGGAGTACCCTAAAGTTCAAAGCAAAGATAACAG--GGGGGGGGGGGGTCCAAAGAATTGAAT--C--T-----------ATGCAGATGCTACACTAA--AAACCAAGC----------------------TAATACACTCCCTAACAACCCCTAG------------TT-CGTTTCTTCTCTAATCAATATCTATTTTACATCAAATCATATTGAGGACAGA-TCCA--CGGGA-CCCAAACTCGAGATTTTCACGGTTTTTGAAAATTAAACTACACACACCAAGTctatatagtggagtaccctaaagttcaaagcaaagataacagggggggggggggtccaaagaattgaatctatgcagatgctacactaaaaaccaagctaatacactccctaacaacccctagttcgtttcttctctaatcaatatctattttacatcaaatcatattgaggacagatccacgggacccaaactcgagattttcacggtttttgaaaattaaactacacacaccaagtttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|5                          : taaaattttcatatagttcaattgacttggagttatcacgtaattggatgtctctaattttgagatttatttattatagatttattttgaatatgagttaacaaatcgcgaggtattctatatgtaattgaatgtaaagcgtgaatattcacattcatgtaatgatcctttattgcgtttctcaactaattctcgttgaaacaataatattccaactataTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTTGAGCGCCGCTGAGTATGTCTTTATACCCCATCTGCGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTT---TGTAATTATAGGT-GAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTTTTTTGTTATTAACTTGCATATATGACATAACGGCGGGAA-CGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAAAAAGTCGCGCGCACAGAAGAC-TCG-TTTTTATTTTT-ATTC-A----TTTATTTATTGTACATATCTTCTAATACCTTTGT-ACAATTG-G-TAAAGAGAATAAAATAAttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaAACGCCGATGAT-----AATTATCCTACGCTC------------------GAC--TACTCTGCCTGCCAATC--TTG------------TTACCT-----CTATAAT---TATATATTTCACACTTAATCATATTGAT-------------------TCCAACCTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TCTTTTTTTAAAATTAATATATATCTTACATGAAATAGTATTTGTGATAAATTCACGGAACAAGCTTTTGAAAATTTAACTCAAGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGTGGAATTTTCGCATCCGTCCAATCATGGCTGACTTGTGTTTGCATTTGCAA
Unaligned ( gi|8 ): TCCTTTTACTAGTATATACAAGGATGTTATCATTGTAATTTTTCTGTGTATTGCAGTGTTTATGTATACTTTACTTACCATAAGATTATTGTCGCTACTTTTCTCTTGGATTTAGATCAAAATAACAT
Unaligned ( gi|9 ): TGTGTATACTTTATGTTTATGTGTATACTTTATCTTCAATAAATTTATTGTCACTAATATGTTTCTCTTGGATTTAGACAAAAAGTAACGATTACACATAAACATTCATGCTATGAAGG
Unaligned ( gi|11 ): TCAATTATCATTGTCCTAAGTTTTTCTATGTATTACGGTGTTTTTGTGTATATACTATTTACAAAAAATTATATTCCCTACGTTTCTCTTGGAATTTGGACAAAAATAATAA
Unaligned ( gi|12 ): TTCAATCATGACTGAGTTATGTTTAGCCTTCAGTTGTCACTGTCCTAGGTTTTTTTGTGTATTACGGTGTTATAATAATTATGTAGATATTACTTAC
Unaligned ( gi|13 ): TAAACATTATCTTCAATAAATTTAATGTCACTAATACATTTCTCTTGGATTTTTACCAAAAGCATTTATACTATGAGGGG
Unaligned ( gi|15 ): ACACGAAGTTTGGAACTTTGCATCAATTCAACCATGGCTGAGTTATGCTGCATTTGTAAT
Unaligned ( gi|16 ): GCAAGTTGTTCAGGAAGGGGCACAGTTGTTCCTGAAGAGGGGACGAGCTAGTTGTCTT
Unaligned ( gi|17 ): TGTTTATGTGGTATATCATCTACAACTAAATTATTGTCGCTAATATTTTTCTCTTG
Unaligned ( gi|19 ): TAATTGTAAAACCAGAATAGCTCATAGAAGTTAAAA






Alignments
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Reference ( family-2438 )     :                                                                                                                                                                                                                            NTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTNGAGCGCCGCTGAGCATGTCTTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTTGTTTGTAGTTATAGGTAGAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTCTTTTGTTATTAACTTGCACATATGACATANCGGCGGGAAACGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAANAAGTCGCGCGCACAGAAGACTTCGTTTTTTATTTTTAATTCTAGTGTTTTATTTGTTGTACATATCTTCTCGTACCTTTGTCACAATTGCGTTAAAGAGAATAAAATAAAAATGAAAAGTTGACAAGCCTTACAAAAATAGCGAACTTAGAATTACCGAANNTCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGAATCAATTGCAANAACTACATGTANGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGAAGTGGATTACAACTTTCATGTCTCTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTNACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAAAGTGTTTTGTNTTTTTTTAATTGAGTNTNTATCTATAAACAAGTATAATTAACACCAATGGTATATAGATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCCATCATGAAAAGTANCTTTGATTGAATTAGATNTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCCTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTG--ANTTCTAATAA---AATTACACGCACATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTATAACTTTCATA--GTTCAA-T-GACTTGG-A-TTATAAACACCGA-TTCCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TCGTGTTCA----GAG-----AAATCGCGATGTATNCTGCAT---GTAANTGTAAATGTGGAGCGTGAATATTCACAATT-ACG--T-AACATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTNA-C-T-A-TTCTTGTTGAAACA------ATAACGTTCCAATGTACGAANAATNACANCGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTCGGCGGTTTCAAGGTGANNTGGGGCNCTGACGNGGAGTAGCGGAGTACCCTAAAGTTNGANGCAAAGATAA-AG--GGCTTGGGGGAATC-AAACAATTAAAT--C--T-C----CA-AAATGCCGATGATNGA-TAATTATACTACGC-C------------------GATAATACACTNCCTGCCAACCCCTAG------------TT-CGT-----CTATAAT---TATCTATTTCACACCNAATCATATTGGTGATA-A-TC-A--CGG-A-TCCAAACTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAACGACAGACACGAAGT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACTTTACACAA---AT-AGTG--ATTTCTAATAA---AATTACACACACATTGCATTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAAAA-TTGACAAGCCTTACAAAA-TAGCGAACTTAGAATTACCGAATATCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGA-TCAATTGCAAAAACTACATGTAAGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGA-GTGGATTACAACTTTCATGTCTTTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTGACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAA-------TGTGTTTTTTTAATTGAGTATATATCTATAAACAAG--TAATT-ACAC-------ATAT--ATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCTATCATGAAAAGTAACTTTGATTGAATTAGATGTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCTTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTGCAGATCCTAA-AATTTATTTACATACAAATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTAT-ACAATCATA--GTTC-------------A-TTATAAATACCGACTTTCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TTGTGTTCA----GAG-----AAATCGCA-----------AT---ATAAGTGTAAATGTGGAATGTGAATATTCATAATTAATG--T-AAAATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTCATT-T-A-TTCTTGTTAAAAC-------------TTCCAATGTACGAATAATAACAACGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTC-GCGATTTC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCC-TTGAAACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTTTTGTTTGGTTGAGTATTTTTATT-GATAGTTTCAAGGTGATATGAGGCTCTGACGCGGAGTAATGGACTACCCTAAATTTTGACGAAAAGAT-A-AC--AGCCTGGGGGAATC-ATACATTTAAAT--CAATGC----TACAAATGCAGGTGATTGG-CCATTATACTACGC-CAGACGATATTCAAGTCAAGATAATACACCCCCTGCCAACTCCTAGATCCTAGATTGTTT-CTT-----CTATGAT---TA--TATTTTACATCAAATCATATTGGTGATATA-TC-AACTGA-A-TCCATA--CTGGATTTTCAAAACTTTTGAAATTTAAATGACAGACAGGGAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggcTAAAATTTTCATATAGTTCAA-TTGACTTGG-AGTTAT--------------CACGTAATTGG-------------ATGTCTCT-AATTTTGAGATTTATTTATTATAGATTTATTTTGAATATGAGTTAACAAATCGCGAGGTATTCTATAT---GTAATTG--AATGTAAAGCGTGAATATTCACA-TT----------CATGTAATGATCCTTTATTGCGTTTC-TCAA-C-TAA-TTCTCGTTGAAACA------ATAATATTCCAAttggactttttgcatcggttcaattatggttgagttattttttgcatttgcaatccttttatatgctagttgtcactgtcctaagattttctgtgtattacggtgtttatatgtgtatatcctatttacttcaaaatcattgctgctacgtttcttttggatttgcattttgatcaaaacaataacatgtatgatatgagggacgagtcgtctcaagaaagggggcgagctttcccgaagaggacaagttgtcttggagtcgagtacgttgtccttatgatggggcgagttgttttgaggacgatttatctggggaacgagttgtcctggtaccgttagaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGTGGAGTACCCTAAAGTTCAAAGCAAAGATAACAG--GGGGGGGGGGGGTCCAAAGAATTGAAT--C--T-----------ATGCAGATGCTACACTAA--AAACCAAGC----------------------TAATACACTCCCTAACAACCCCTAG------------TT-CGTTTCTTCTCTAATCAATATCTATTTTACATCAAATCATATTGAGGACAGA-TCCA--CGGGA-CCCAAACTCGAGATTTTCACGGTTTTTGAAAATTAAACTACACACACCAAGTctatatagtggagtaccctaaagttcaaagcaaagataacagggggggggggggtccaaagaattgaatctatgcagatgctacactaaaaaccaagctaatacactccctaacaacccctagttcgtttcttctctaatcaatatctattttacatcaaatcatattgaggacagatccacgggacccaaactcgagattttcacggtttttgaaaattaaactacacacaccaagtttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|5                          : taaaattttcatatagttcaattgacttggagttatcacgtaattggatgtctctaattttgagatttatttattatagatttattttgaatatgagttaacaaatcgcgaggtattctatatgtaattgaatgtaaagcgtgaatattcacattcatgtaatgatcctttattgcgtttctcaactaattctcgttgaaacaataatattccaactataTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTTGAGCGCCGCTGAGTATGTCTTTATACCCCATCTGCGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTT---TGTAATTATAGGT-GAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTTTTTTGTTATTAACTTGCATATATGACATAACGGCGGGAA-CGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAAAAAGTCGCGCGCACAGAAGAC-TCG-TTTTTATTTTT-ATTC-A----TTTATTTATTGTACATATCTTCTAATACCTTTGT-ACAATTG-G-TAAAGAGAATAAAATAAttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaAACGCCGATGAT-----AATTATCCTACGCTC------------------GAC--TACTCTGCCTGCCAATC--TTG------------TTACCT-----CTATAAT---TATATATTTCACACTTAATCATATTGAT-------------------TCCAACCTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TCTTTTTTTAAAATTAATATATATCTTACATGAAATAGTATTTGTGATAAATTCACGGAACAAGCTTTTGAAAATTTAACTCAAGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGTGGAATTTTCGCATCCGTCCAATCATGGCTGACTTGTGTTTGCATTTGCAA
Unaligned ( gi|8 ): TCCTTTTACTAGTATATACAAGGATGTTATCATTGTAATTTTTCTGTGTATTGCAGTGTTTATGTATACTTTACTTACCATAAGATTATTGTCGCTACTTTTCTCTTGGATTTAGATCAAAATAACAT
Unaligned ( gi|9 ): TGTGTATACTTTATGTTTATGTGTATACTTTATCTTCAATAAATTTATTGTCACTAATATGTTTCTCTTGGATTTAGACAAAAAGTAACGATTACACATAAACATTCATGCTATGAAGG
Unaligned ( gi|11 ): TCAATTATCATTGTCCTAAGTTTTTCTATGTATTACGGTGTTTTTGTGTATATACTATTTACAAAAAATTATATTCCCTACGTTTCTCTTGGAATTTGGACAAAAATAATAA
Unaligned ( gi|12 ): TTCAATCATGACTGAGTTATGTTTAGCCTTCAGTTGTCACTGTCCTAGGTTTTTTTGTGTATTACGGTGTTATAATAATTATGTAGATATTACTTAC
Unaligned ( gi|13 ): TAAACATTATCTTCAATAAATTTAATGTCACTAATACATTTCTCTTGGATTTTTACCAAAAGCATTTATACTATGAGGGG
Unaligned ( gi|15 ): ACACGAAGTTTGGAACTTTGCATCAATTCAACCATGGCTGAGTTATGCTGCATTTGTAAT
Unaligned ( gi|16 ): GCAAGTTGTTCAGGAAGGGGCACAGTTGTTCCTGAAGAGGGGACGAGCTAGTTGTCTT
Unaligned ( gi|17 ): TGTTTATGTGGTATATCATCTACAACTAAATTATTGTCGCTAATATTTTTCTCTTG
Unaligned ( gi|19 ): TAATTGTAAAACCAGAATAGCTCATAGAAGTTAAAA






Alignments
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Reference ( family-2438 )     :                                                                                                                                                                                                                            NTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTNGAGCGCCGCTGAGCATGTCTTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTTGTTTGTAGTTATAGGTAGAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTCTTTTGTTATTAACTTGCACATATGACATANCGGCGGGAAACGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAANAAGTCGCGCGCACAGAAGACTTCGTTTTTTATTTTTAATTCTAGTGTTTTATTTGTTGTACATATCTTCTCGTACCTTTGTCACAATTGCGTTAAAGAGAATAAAATAAAAATGAAAAGTTGACAAGCCTTACAAAAATAGCGAACTTAGAATTACCGAANNTCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGAATCAATTGCAANAACTACATGTANGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGAAGTGGATTACAACTTTCATGTCTCTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTNACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAAAGTGTTTTGTNTTTTTTTAATTGAGTNTNTATCTATAAACAAGTATAATTAACACCAATGGTATATAGATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCCATCATGAAAAGTANCTTTGATTGAATTAGATNTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCCTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTG--AATTCTAATAA---AATTACACGCACATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTATAACTTTCATA--GTTCAA-T-GACTTGG-A-TTATAAACACCGA-TTCCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TCGTGTTCA----GAG-----AAATCGCGATGTATNCTGCAT---GTAANTGTAAATGTGGAGCGTGAATATTCACAATT-ACG--T-AACATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTNA-C-T-A-TTCTTGTTGAAACA------ATAACGTTCCAATGTACGAANAATNACANCGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTCGGCGGTTTCAAGGTGANNTGGGGCNCTGACGNGGAGTAGCGGAGTACCCTAAAGTTNGANGCAAAGATAA-AG--GGCTTGGGGGAATC-AAACAATTAAAT--C--T-C----CA-AAATGCCGATGATNGA-TAATTATACTACGC-C------------------GATAATACACTNCCTGCCAACCCCTAG------------TT-CGT-----CTATAAT---TATCTATTTCACACCNAATCATATTGGTGATA-A-TC-A--CGG-A-TCCAAACTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAACGACAGACACGAAGT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACTTTACACAA---AT-AGTG--ATTTCTAATAA---AATTACACACACATTGCATTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAAAA-TTGACAAGCCTTACAAAA-TAGCGAACTTAGAATTACCGAATATCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGA-TCAATTGCAAAAACTACATGTAAGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGA-GTGGATTACAACTTTCATGTCTTTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTGACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAA-------TGTGTTTTTTTAATTGAGTATATATCTATAAACAAG--TAATT-ACAC-------ATAT--ATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCTATCATGAAAAGTAACTTTGATTGAATTAGATGTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCTTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTGCAGATCCTAA-AATTTATTTACATACAAATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTAT-ACAATCATA--GTTC-------------A-TTATAAATACCGACTTTCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TTGTGTTCA----GAG-----AAATCGCA-----------AT---ATAAGTGTAAATGTGGAATGTGAATATTCATAATTAATG--T-AAAATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTCATT-T-A-TTCTTGTTAAAAC-------------TTCCAATGTACGAATAATAACAACGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTC-GCGATTTC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCC-TTGAAACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTTTTGTTTGGTTGAGTATTTTTATT-GATAGTTTCAAGGTGATATGAGGCTCTGACGCGGAGTAATGGACTACCCTAAATTTTGACGAAAAGAT-A-AC--AGCCTGGGGGAATC-ATACATTTAAAT--CAATGC----TACAAATGCAGGTGATTGG-CCATTATACTACGC-CAGACGATATTCAAGTCAAGATAATACACCCCCTGCCAACTCCTAGATCCTAGATTGTTT-CTT-----CTATGAT---TA--TATTTTACATCAAATCATATTGGTGATATA-TC-AACTGA-A-TCCATA--CTGGATTTTCAAAACTTTTGAAATTTAAATGACAGACAGGGAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggcTAAAATTTTCATATAGTTCAA-TTGACTTGG-AGTTAT--------------CACGTAATTGG-------------ATGTCTCT-AATTTTGAGATTTATTTATTATAGATTTATTTTGAATATGAGTTAACAAATCGCGAGGTATTCTATAT---GTAATTG--AATGTAAAGCGTGAATATTCACA-TT----------CATGTAATGATCCTTTATTGCGTTTC-TCAA-C-TAA-TTCTCGTTGAAACA------ATAATATTCCAAttggactttttgcatcggttcaattatggttgagttattttttgcatttgcaatccttttatatgctagttgtcactgtcctaagattttctgtgtattacggtgtttatatgtgtatatcctatttacttcaaaatcattgctgctacgtttcttttggatttgcattttgatcaaaacaataacatgtatgatatgagggacgagtcgtctcaagaaagggggcgagctttcccgaagaggacaagttgtcttggagtcgagtacgttgtccttatgatggggcgagttgttttgaggacgatttatctggggaacgagttgtcctggtaccgttagaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGTGGAGTACCCTAAAGTTCAAAGCAAAGATAACAG--GGGGGGGGGGGGTCCAAAGAATTGAAT--C--T-----------ATGCAGATGCTACACTAA--AAACCAAGC----------------------TAATACACTCCCTAACAACCCCTAG------------TT-CGTTTCTTCTCTAATCAATATCTATTTTACATCAAATCATATTGAGGACAGA-TCCA--CGGGA-CCCAAACTCGAGATTTTCACGGTTTTTGAAAATTAAACTACACACACCAAGTctatatagtggagtaccctaaagttcaaagcaaagataacagggggggggggggtccaaagaattgaatctatgcagatgctacactaaaaaccaagctaatacactccctaacaacccctagttcgtttcttctctaatcaatatctattttacatcaaatcatattgaggacagatccacgggacccaaactcgagattttcacggtttttgaaaattaaactacacacaccaagtttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|5                          : taaaattttcatatagttcaattgacttggagttatcacgtaattggatgtctctaattttgagatttatttattatagatttattttgaatatgagttaacaaatcgcgaggtattctatatgtaattgaatgtaaagcgtgaatattcacattcatgtaatgatcctttattgcgtttctcaactaattctcgttgaaacaataatattccaactataTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTTGAGCGCCGCTGAGTATGTCTTTATACCCCATCTGCGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTT---TGTAATTATAGGT-GAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTTTTTTGTTATTAACTTGCATATATGACATAACGGCGGGAA-CGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAAAAAGTCGCGCGCACAGAAGAC-TCG-TTTTTATTTTT-ATTC-A----TTTATTTATTGTACATATCTTCTAATACCTTTGT-ACAATTG-G-TAAAGAGAATAAAATAAttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaAACGCCGATGAT-----AATTATCCTACGCTC------------------GAC--TACTCTGCCTGCCAATC--TTG------------TTACCT-----CTATAAT---TATATATTTCACACTTAATCATATTGAT-------------------TCCAACCTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAA


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Reference ( family-2438 )     :                                                                                                                                                                                                                            NTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTNGAGCGCCGCTGAGCATGTCTTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTTGTTTGTAGTTATAGGTAGAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTCTTTTGTTATTAACTTGCACATATGACATANCGGCGGGAAACGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAANAAGTCGCGCGCACAGAAGACTTCGTTTTTTATTTTTAATTCTAGTGTTTTATTTGTTGTACATATCTTCTCGTACCTTTGTCACAATTGCGTTAAAGAGAATAAAATAAAAATGAAAAGTTGACAAGCCTTACAAAAATAGCGAACTTAGAATTACCGAANNTCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGAATCAATTGCAANAACTACATGTANGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGAAGTGGATTACAACTTTCATGTCTCTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTNACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAAAGTGTTTTGTNTTTTTTTAATTGAGTNTNTATCTATAAACAAGTATAATTAACACCAATGGTATATAGATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCCATCATGAAAAGTANCTTTGATTGAATTAGATNTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCCTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTG--AATTCTAATAA---AATTACACGCACATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTATAACTTTCATA--GTTCAA-T-GACTTGG-A-TTATAAACACCGA-TTCCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TCGTGTTCA----GAG-----AAATCGCGATGTATNCTGCAT---GTAANTGTAAATGTGGAGCGTGAATATTCACAATT-ACG--T-AACATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTNA-C-T-A-TTCTTGTTGAAACA------ATAACGTTCCAATGTACGAANAATNACANCGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTCGGCGGTTTCAAGGTGANNTGGGGCNCTGACGNGGAGTAGCGGAGTACCCTAAAGTTNGANGCAAAGATAA-AG--GGCTTGGGGGAATC-AAACAATTAAAT--C--T-C----CA-AAATGCCGATGATNGA-TAATTATACTACGC-C------------------GATAATACACTNCCTGCCAACCCCTAG------------TT-CGT-----CTATAAT---TATCTATTTCACACCNAATCATATTGGTGATA-A-TC-A--CGG-A-TCCAAACTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAACGACAGACACGAAGT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACTTTACACAA---AT-AGTG--ATTTCTAATAA---AATTACACACACATTGCATTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGAAAA-TTGACAAGCCTTACAAAA-TAGCGAACTTAGAATTACCGAATATCTTTATAGTCGACAATTTTGTAGATTTTCAAAGGGAATATACGATCCATGTAATGA-TCAATTGCAAAAACTACATGTAAGGATATATGAATATAATGAAGATTTTGGA-GTGGATTACAACTTTCATGTCTTTAGTATGATTTTATATTTTTTTTTTTACTTTGACGACACATATTGATTGAAGAGCAGCAAACATTAAGAAAACGAACAACAAAGTATTTTTTAGAA-------TGTGTTTTTTTAATTGAGTATATATCTATAAACAAG--TAATT-ACAC-------ATAT--ATTTTTCCAGTAATCGAAATTTCTATCATGAAAAGTAACTTTGATTGAATTAGATGTAATTGAATGAATTAGATTGTTTGTTAAAGACGTCTTTTTTTATTTCATACTTTAAACGATCGATTGGTGCAGATCCTAA-AATTTATTTACATACAAATTGCATTTCCAGAAAAAGTGGTAT-ACAATCATA--GTTC-------------A-TTATAAATACCGACTTTCCACGTAATTGGTTAACAGAAAT-AATGTCTCTTAATTTTAAGATTTGTTTATT------TTGTGTTCA----GAG-----AAATCGCA-----------AT---ATAAGTGTAAATGTGGAATGTGAATATTCATAATTAATG--T-AAAATGTAATTATCTTTTATTGCGTTTC-TTCATT-T-A-TTCTTGTTAAAAC-------------TTCCAATGTACGAATAATAACAACGGTTTTGTTTGATTGAGTACTTGTACTC-GCGATTTC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAC-CCCCATT--CGCGTGCCC-TTGAAACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tTTTTGTTTGGTTGAGTATTTTTATT-GATAGTTTCAAGGTGATATGAGGCTCTGACGCGGAGTAATGGACTACCCTAAATTTTGACGAAAAGAT-A-AC--AGCCTGGGGGAATC-ATACATTTAAAT--CAATGC----TACAAATGCAGGTGATTGG-CCATTATACTACGC-CAGACGATATTCAAGTCAAGATAATACACCCCCTGCCAACTCCTAGATCCTAGATTGTTT-CTT-----CTATGAT---TA--TATTTTACATCAAATCATATTGGTGATATA-TC-AACTGA-A-TCCATA--CTGGATTTTCAAAACTTTTGAAATTTAAATGACAGACAGGGAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggcTAAAATTTTCATATAGTTCAA-TTGACTTGG-AGTTAT--------------CACGTAATTGG-------------ATGTCTCT-AATTTTGAGATTTATTTATTATAGATTTATTTTGAATATGAGTTAACAAATCGCGAGGTATTCTATAT---GTAATTG--AATGTAAAGCGTGAATATTCACA-TT----------CATGTAATGATCCTTTATTGCGTTTC-TCAA-C-TAA-TTCTCGTTGAAACA------ATAATATTCCAAttggactttttgcatcggttcaattatggttgagttattttttgcatttgcaatccttttatatgctagttgtcactgtcctaagattttctgtgtattacggtgtttatatgtgtatatcctatttacttcaaaatcattgctgctacgtttcttttggatttgcattttgatcaaaacaataacatgtatgatatgagggacgagtcgtctcaagaaagggggcgagctttcccgaagaggacaagttgtcttggagtcgagtacgttgtccttatgatggggcgagttgttttgaggacgatttatctggggaacgagttgtcctggtaccgttagaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGTGGAGTACCCTAAAGTTCAAAGCAAAGATAACAG--GGGGGGGGGGGGTCCAAAGAATTGAAT--C--T-----------ATGCAGATGCTACACTAA--AAACCAAGC----------------------TAATACACTCCCTAACAACCCCTAG------------TT-CGTTTCTTCTCTAATCAATATCTATTTTACATCAAATCATATTGAGGACAGA-TCCA--CGGGA-CCCAAACTCGAGATTTTCACGGTTTTTGAAAATTAAACTACACACACCAAGTctatatagtggagtaccctaaagttcaaagcaaagataacagggggggggggggtccaaagaattgaatctatgcagatgctacactaaaaaccaagctaatacactccctaacaacccctagttcgtttcttctctaatcaatatctattttacatcaaatcatattgaggacagatccacgggacccaaactcgagattttcacggtttttgaaaattaaactacacacaccaagtttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|5                          : taaaattttcatatagttcaattgacttggagttatcacgtaattggatgtctctaattttgagatttatttattatagatttattttgaatatgagttaacaaatcgcgaggtattctatatgtaattgaatgtaaagcgtgaatattcacattcatgtaatgatcctttattgcgtttctcaactaattctcgttgaaacaataatattccaactataTTACTCAAACCGGCGGGTCTGTCAGCTGATCTTGAGCGCCGCTGAGTATGTCTTTATACCCCATCTGCGCGTGCCCTTTGAAACAACATGCCAACGAGATTTGTT---TGTAATTATAGGT-GAAATCAACAAATTAGACAAAATCGACTCTTTTTTGTTATTAACTTGCATATATGACATAACGGCGGGAA-CGAGTCGCATAAACAGACTTCATAAGATTTAGGTACCGCGGGAAAAAAGTCGCGCGCACAGAAGAC-TCG-TTTTTATTTTT-ATTC-A----TTTATTTATTGTACATATCTTCTAATACCTTTGT-ACAATTG-G-TAAAGAGAATAAAATAAttatacttctgcatcagttcaatcatgacattggctgaatttattttgcatttgcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaAACGCCGATGAT-----AATTATCCTACGCTC------------------GAC--TACTCTGCCTGCCAATC--TTG------------TTACCT-----CTATAAT---TATATATTTCACACTTAATCATATTGAT-------------------TCCAACCTCTGGATTTTCACGGCTTTTGAAAATTAAA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TCTTTTTTTAAAATTAATATATATCTTACATGAAATAGTATTTGTGATAAATTCACGGAACAAGCTTTTGAAAATTTAACTCAAGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACGGTGGAATTTTCGCATCCGTCCAATCATGGCTGACTTGTGTTTGCATTTGCAA
Unaligned ( gi|8 ): TCCTTTTACTAGTATATACAAGGATGTTATCATTGTAATTTTTCTGTGTATTGCAGTGTTTATGTATACTTTACTTACCATAAGATTATTGTCGCTACTTTTCTCTTGGATTTAGATCAAAATAACAT
Unaligned ( gi|9 ): TGTGTATACTTTATGTTTATGTGTATACTTTATCTTCAATAAATTTATTGTCACTAATATGTTTCTCTTGGATTTAGACAAAAAGTAACGATTACACATAAACATTCATGCTATGAAGG
Unaligned ( gi|11 ): TCAATTATCATTGTCCTAAGTTTTTCTATGTATTACGGTGTTTTTGTGTATATACTATTTACAAAAAATTATATTCCCTACGTTTCTCTTGGAATTTGGACAAAAATAATAA
Unaligned ( gi|12 ): TTCAATCATGACTGAGTTATGTTTAGCCTTCAGTTGTCACTGTCCTAGGTTTTTTTGTGTATTACGGTGTTATAATAATTATGTAGATATTACTTAC
Unaligned ( gi|13 ): TAAACATTATCTTCAATAAATTTAATGTCACTAATACATTTCTCTTGGATTTTTACCAAAAGCATTTATACTATGAGGGG
Unaligned ( gi|15 ): ACACGAAGTTTGGAACTTTGCATCAATTCAACCATGGCTGAGTTATGCTGCATTTGTAAT
Unaligned ( gi|16 ): GCAAGTTGTTCAGGAAGGGGCACAGTTGTTCCTGAAGAGGGGACGAGCTAGTTGTCTT
Unaligned ( gi|17 ): TGTTTATGTGGTATATCATCTACAACTAAATTATTGTCGCTAATATTTTTCTCTTG
Unaligned ( gi|19 ): TAATTGTAAAACCAGAATAGCTCATAGAAGTTAAAA