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gi|17 : cggtattgtttttcttttttttaattaaaaaggtgtgttaagtacgggtaatccttatactcaaatactgaacttttcaactgtctgTATTTAATGTACGTAC-TGCAA--C-TATTAA-TTTTCA-CCCGAGTTTTGGA-A--GTGCATTGTACA-TGT-G-GTTACAGGCAAATCA-CACGTAGAACCACGCCAT--------
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gi|6 : cactatccaacctgttttgtagaatttaaattaatcataagtatctttatgagaaagcgaacggtattcgtttttctttttcaattaaagaaaagtgccgagtacacggcggtaatcctatactgaacttttcaactgtctgccacccccccccccttccgtaacaaagatgacttttattattataaactgatatgttacgtactggaactattaattttcaccctgaattttggcaagtgaatgtgaacatgtcggtagaggcaaatcacacgtagaaccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctggccttttaaagtCTGT-TATTTAC---AC-GTG-ATAT-TTA-CACTTTGGATTGACG-AT-AT-CCGCCCACTATC----G----TAA---TTGT---GATCA-------TGACT---GTAGCATTGGAAATA-AAG--TTTATAA-T------CTACT-AACGCCGTACGCGTCCAA-GCTAC-GGG----TT-TTCGCGC--TGT----------T----ATC--C--A---GCTTTCA-T---TTGGT-ACGAC-----------TTCAATG-CACCAAAGA----GTTTCCA-C---T-ACG-----ACTTA-CGA-CAA-GCA---ACAGTTA--CGTAC--CTAAC--GA-TA-CG---ATA-G--GTTTTGTACAAACGATCCTACGA-TAATGTCGCCTAAAG---TTCT--TCAAA-TT-TACGAACTCTACGAT--TT--AAGA-C--TA---CGACC-T
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Reference ( family-2429 ) : CCCCCCCCCCCCTTC-CGTAACAA--GGATTGA-TT-----TTATTATTATAAGCTGTATTTAATGT-ACGTAC-TGCAA--C-TATTAATTTTTCACC-TGAATTTT-GG-AAGTGCAT-----ATGTG-G-TACAGGCATGTCA-CACGTAGAACCACGCCAT--------GGACATGTAGACCAGCCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGATCGATCGGATGCGATCGACCCTTTTTTATTTAATTATATGGACATTTTCTG------T----TATTTNC-----AC-ATGTAT-T-TTA-CGCATTGGA-TGACAGAT-AT-CCACCCACTATA----A----TAT---TTTT--AGATGAA-TGAATGACT---GTAACATT-GAA-AT-A-AG--TTTATAAAT------CT-CT-GCG-CG-T---CGT-CAAAGCGTCGGG-T------TTTG-GC--CGC------G----T-AT--C-----C-NNG-TTCAT--------TT-G-CA--CGA-CTTC--ATG-CACCAAAGA----G-TTCCA-C---TAC--GAC---TTA-CGA-CAAGACA---AC-GTT-A--CG-ACCT-AC--GATTA-CG---ATG-G--GTTTTGTA-AAACGGTCCTACGA-T-ATGTCGT---AAG---TTCT--TCAATTCTACG-ACT-TACGAT--TT--AAGAC-TTA---CGACT-TTTTGT-AAAACGC
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blockSeqs : . . T A . . T . T . T . . . C AATAT . A . . . . . . . . T . A G C . . T . T G . . C . A . . . . . . . . G . G A . . . . . AG . C . . . . . T . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . T . T G C . . T . T G . . T . A . . . . . . . . A . G A . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-2429 ) : CCCCCCCCCCCCTTC-CGTAACAA--GNATTGA-TT-----TTATTATTATAAGCTGTATTTAATGT-ACGTAC-TGCAA--C-TATTAATTTTTCACC-TGAATTTT-GG-AAGTGCAT------TGTG-G-TACAGGCATGT-A-CACGTAGAACCACGCCAT--------GGACACGTAGACCAGCCACGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGATCGATCGGATGCGATCGACCCTTTTTTATTTAATTATATGGACATTTTCTG------T----TATTTNC-----AC-ATGTAT-T-TTA-CGCATTGGA-TGACAGAT-AT-CCAC----CCACTATA----A----TAN-TTTT--AGATGAA-TGAATGACT---GTAGCATT-GAA-AT-AAG--TTTATAAAT------CT-CT-GCG-CG-T---CGT-CAAAGCGTCGGG-T------TTC--G---CG-C-G-----------TATC-----CA-CG-TTCAT--------TT-G-CA--CGA-CTTC--ATG-CACCAAAGA----G-TTCCA-C---TAC--GAC---TTA-CGA-CAAGACA---AC-GTT-A--CG-ACCT-AC--GATTA-CG---ATG-G--GTTTTGTA-AAACGGTCCTACGA-T-ATGTCGT---AAG---TTCT--TCAATTCTACG-ACT-TACGAT--TT--AAGAC-TTA---CGACT-TTTTGT-AAAACGC
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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