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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2387 ) : TGTACAT-TCT-GT-GTT--TTTAAAG-TG----GG--T--T-----TG----CCCNCC-----------C-CCTT-------T-----AA-AAGT-GA---GG---------------------GGN-A-ACN---TGTC--C-CCTTGTCCC--A--C---G-CCCGTGAT-AT-CG-GT---ATTT------T----AT------TCCA-CG--TT-T---GC-A-TA-G-TA-C-A-A-GCAT-CAT-A--C-G--AA-TGA-GG----AAT---TA-T-----ATA-TA-A-A--CT-A--GC--T-AT---------CT-TTTTG-ATAATTTCTCA-TGTCAA-GA--TTAAAAAAAT----------AT--A----------TA-T--A---AAG-AA---CTT---A--C-A-----TTT----------TTT---A-AA------------AA----A--------TA-A-AC-TTGGG-CT-G----T-TG-A--C--CT-T-CGG-CCA---CTG--A--CA-CA---GTA----C------A--T---ATAGAT-------TT-T---TNA-T-----TCA-----------CA---CCCCCC-----CCCCCCCCCACTTTT-C---CT-------------TTTTCGCCA----T-TCCT--CCTC-CAA-CC-AATG-AT--AAAAA-TG--AACA-TA-GA--A--C-----T---A----CT-TTATC--CTA-AAAA---G---TTTGTTTT--T------C--C-C---AAAC--GCC--G-ACCA---C----CC---A--TTTAT-AA-ATCG-TTC-TGCATA-AGC----CAGTTT-CTTCTC-ACAGTG-ACA--AC-TTGCGAGATATT
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gi|8 : TGTACAT-TCT-GT-GTT--TTTA--G-TG----GG--T--G-----TG----T--GCC-----------C-C--T-------T-----AA-AAGT-GA---GG---------------------GGG-C-AC----TGTC--A-C-TTGTACT--A------G-CCCGTAAC-AT--G-G----ATTT------C----AT------TCCA-TG--T---------A-T--G-T--C-A---GCAT--AT-A--C----AA-TGA-GA----AAT---TA---------A-TA-A-----T-A--GC--T-AT---------CT-TTTTG-ATAATTTTTCA-TGTCAA-G---T--GAAAATT----------AT--A----------TA-T--AATTAAG-AA---CTTA--A--C-T-----TTT----------TTT---A-AA------------AA----A---------A-T-AC-TT-GG-CT-G----T-TG-A--C--CT-T-T-G-CCA----TG--A--CG-CA---GTA----C------A--T---ATAGAT-------TT-A---T-A-T-----T-----------------------C-----CCCCCTCCCAC------------------------TTTTTGGTA----T-TCTC--CCTC------------------AAAA-TG--AACA-TA-GA--ATTT-----T---A----CT-TTAT---ATA-AATG---G---TT--TTTT--T------C--C-C---AAA---ACC--G-A-CA---C----CT---A--TT--T-AA-ACTGTTTC-TGCAT--AGC----CAGTTT-TTACTC-A-AGTG-ACA--AC-TTGC-AGATATaat
gi|9 : TGTACATATCT-GT-GTT--TTTAAAG-TG----AG--T--TG----TG----CCCCCC-----------C-CTTT-------TTACTAAA-AAAT-AAATAGGTCCCTTTGAAGCCCTTCTCCAGGC-A-CTC---TGTC--C-C-TTGTCT---A--C---G-CCCCTGATTGT-CGCGT---ATTT------T----AT------TCCA-CG--TT-----GC-A-TA-G-TA-C-A---GCAT-CAT-A--C-C--AA-TGA-GA----AA-----A-T-----ATG-TA-A-A--CT-A--GC--T-AT---------CT-TTGAG-ATAATTTCTCA-TGTCAA-GA--TAATAAAAA---------------A----------TA-T--A---AAG-AA---CTT---A--C-A-----TTT----------TTT---T-AA------------AA----A--------TA-A-AC-TTGGG-CT-G----T-TG-A--C--CT-T-CGC-CC
gi|9 : ta-----------CG---CCCCCC-----CCCCC-----CTTT-------T-------------TTTCCG-TA----T-TCCT--CCTC-CAACCC-AATG-TT--AAAAA-TG--AACA-TA-GA--A--CCTA--T---A----CT-TTATC--CTA-AAAT---GGGTTTTGTccccccccctttttttccgtattcctcctccaacccaatgttaaaaatgaacatagaacctatactttatcctaaaatgggttttgtgagatatcaattttgatacatg
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Reference ( family-2387 ) : TGTACAT-TCT-GT-GTT--TTTAAAG-TG----GG--T--T-----TG----CCCCCC-----------C-CCTT-------T-AA-AAG---------------T-GAGG----------GGN-A-ACG---TGTC--C-CCTTGTCCC--A--C---G-CCCGTGAT-AT-CG-GT---ATTT------T----AT------TCCA-CG--TT-T---GC-A-TA-G---TA--C--A--GCAT-CAT-A--C-G--AA-TGA-GG----AAT---TA-T-----ATA-TA-A-A--CT-A--GC--T-AT---------CT-TTTTG-ATAATTTCTCA-TGTCAA-GA--TTAAAAAAAT----------AT--A----------TA-T--A---AAG-AA---CTT---A--C-A-----TTT----------TTT---A-AA------------AA----A--------TA-A-AC-TTGGG-CT-G----T-TG-A--C--CT-T-CGG-CCA---CTG--A--CA-CA---GTA----C------A--T---ATAG--------A-T-TT-C-TTA-TTCA---------CA---CCCCCCCC-------CCCCCCCAC-CTTTC---CT-------------TTTTC----G-TA-T-TCCT--CCTC-CAA-CCAATG-AT--AAAAA-TG--AACA-TA-GA--A---C-----TA----CT-TTATC--CT-A-AAAATTGG----TT-TT--T------C--C-C---AAAC--GCC--G-ACCA---C----CC---A--TTTAT-AA-ATCG-TTC-TGCATA-AGC----CAGTTT-CTTCTC-ACAGTG-ACGAC-TTGCGAGATATT
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gi|9 : TGTACATATCT-GT-GTT--TTTAAAG-TG----AG--T--TG----TG----CCCCCC-----------C-CTTTTTAC---T-AA-AAAATAAATAGGTCCCTTT-GAAGCCCTTCTCCAGGC-A-CTC---TGTC--C-C-TTGTCT---A--C---G-CCCCTGATTGT-CGCGT---ATTT------T----AT------TCCA-CG--TT-----GC-A-TA-G---TA--C--A--GCAT-CAT-A--C-C--AA-TGA-GA----AA-----A-T-----ATG-TA-A-A--CT-A--GC--T-AT---------CT-TTGAG-ATAATTTCTCA-TGTCAA-GA--TAATAAAAA---------------A----------TA-T--A---AAG-AA---CTT---A--C-A-----TTT----------TTT---T-AA------------AA----A--------TA-A-AC-TTGGG-CT-G----T-TG-A--C--CT-T-CGC-CC
gi|9 : taA---CCTTCGCC-------CCCCCCCCC-CTTT-----T-------------TTTCC----G-TA-T-TCCT--CCTC-CAACCCAATG-TT--AAAAA-TG--AACA-TA-GA--A---CCTA--TA----CT-TTATC--CT---AAAATGGG----TT-TT--ccccccccctttttttccgtattcctcctccaacccaatgttaaaaatgaacatagaacctatactttatcctaaaatgggttttgtgagatatcaattttgatacatg
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blockSeqs : . . . . . . TTG . CGCCTCTGAAAAGTGGGGGGCAGCGT C C CTAC . G A . . . . . . . . T . . . TATACA A . . AA . A . TA . . . . C . . TATTCT . A . . . CAAAGAGACATTGA . . . . . CAAATA AGGGGGCCTCCCCCCAAC . . . G . . . . . . . . . C . . . . ACATA . . T C . CATA . CTTTTTT . T . . . . C . . . . . . . CCTATACTTTATCCTAT AAA . . . . CA C . . . CC . T AA . . AAGC C AC . A .
blockSeqs : . . . . . . TT . CCCTTTAAAACTGAGGGGTAACCA C C CGC . G A . . . . . . . . T . . . TACTAG C . . G . . . AA . . . . A . . CATCT . T . . . TAACAAAATATA . . . . . CAAATA TCTAAAAAGAGAA . . . G . . . . . . . . . G . . . . CATA . . T C . CATC . TTTTCCT . C . . . . . . . . . . . . CCAATACTTTATCCT TTG . . . . CA C . . . TC . T AA . . AGCA C CC . G .
blockSeqs : . . . . . . TG . CCTAAAAGTCGTGGGGGCATGT C T CTA . G A . . . . . . . . T . . . TACTT C . . G . . . T . . . . A . . TATAT . A . . . TATTGATATATA . . . . . AAACA TTTAGAAATATA . . . G . . . . . . . . . G . . . . CATT . . T G . CATA . TTGTCTT . . . . . . . . . . . . . . CCTATACTTTATCCT CGG . . . . CC C . . . TC . G AC . . AGC G A . G .
blockSeqs : . . . . . . GT . TATAAAATGAGGGGGCCACG C C TAC . G A . . . . . . . . . . . . TACA C . . G . . . T . . . . T . . TATCT . A . . . TAAAAAAATATA . . . . . ACAA TTTTTAAAAA . . . G . . . . . . . . . C . . . . CA . . T C . CATA . TTTTCCT . . . . . . . . . . . . . . CACTTATCCTGA TGG . . . . CA C . . . TC . T AA . . TAG T C . A .
blockSeqs : . . . . . TG . TTAAAAGTGAGGGGGCACT C C CTA . C A . . . . . . . . . . . . TACA C . . G . . . A . . . . A . . TATCT . G . . . TAAATATATTCA . . . . . AACT TTTTTACAA . . . G . . . . . . . . . C . . . . CA . . T C . CACC . CCTCCGT . . . . . . . . . . . . . . TTTTACTTTATA TGG . . . . TC . . . . CT . . . . . AGC . A .
blockSeqs : TCCTATAAGGTGTGGCA A . TAC . . . . . . . . . . . . . . . TACA C . . G . . . T . . . . A . . TATCT . A . . . TAAAATATATGC . . . . . ACA TTTTAAAAA . . . G . . . . . . . . . C . . . . CA . . T T . CAC . TTTTTCT . . . . . . . . . . . . . . ATCCTA GGG . . . . CA . . . . C . . . . . AG
blockSeqs : C . AC . . . . . . . . . . . . . . . ACA C . . A . . . T . . . . A . . TATCT . A . . . TAAAAATATA . . . . . ACA TTCAAAAAA . . . G . . . . . . . . . T . . . . CA . . T C . ACA . CTTTT . . . . . . . . . . . . . . CCTA G . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . TAC T . . C . . . . . . . . A . . TAT . A . . . AATAAAAAA . . . . . ACA TTGAAAAAA . . . G . . . . . . . . . C . . . . CA . . T A . . . CT . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . AATAAA . . . . . ACA TTTTAAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATAAA . . . . . AC TTTGAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . .
blockSeqs : . . . . . AATTTC . . . . . A TTTGAAA . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TN********* CNC******** *** ****** ** ***** TACA********* C* ** T*** TATCT************* TAAAAAAATATA********************** *** TTTNAAAAA************************************** ** C*** ** CA************ CAC************* TTTTCCT***************** **** ** ** CCTTACTTTATCCT**************** ****** C** TC******* AA** AGC****** AC*
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2387 ) : TGTACAT-TCT-GT-GTT--TTTAAAG-TG----GGTN-----TG-------CCCCC---C-----------C-CCTT----T-AA-AAG---------------T-GAGG----------GGN-A-ACG---TGTC--C-CCTTGTCCN-----CG-CCCGTGAT-AT-CG-GT---ATTT------T----AT------TCCA-C-G---TT---GC-A-TA-G---TA--C--A--GCAT-CAT-A--CG--AA-TGA-GG--AA-------T---TA-T--ATA-TA-A-A--CT-A--GC--T-AT---------CT-TTTTG-ATAATTTCTCA-TGTCAA-GA--TTAAAAAAAT----------AT--A----------TA-T--A---AAG-AA---CTT---A--C-A----TTT-----------TTT---N-AA--AA----ATA-A-AC---------TTGGG-CT---G----T-TG-A--C--CT-T-CGG-CCA---CTG--A--CA-CA---GTA----C------A--T---ATAG--------A-T-TT-C-TTA-------TTC-A-----------CA-CCCCCC------CCCCCCCCAC-TTTTC---CT-------------TTTTC----G-TA-T-TCCT--CCTC-CAA-CCAATG-AT--AAAAA-TG--AACA-TA-GA--AC---C--T-TACT-TTATC--C--T--AA-AATNGG----TT-TT--T------C--C-C---AAAC--GCC--G-ACCA---C----TC---A--TTTAT-AA-ATCG-TTC-TG--CA-T-AGC-CAG------TTT-CTTCTC-ACAGTG-ACGAC-TTGCGAGATATT
gi|1 : -GT-GTT--TTTAAAGGTG----GGGG-----TGTTGCCACCCCCCTTGC-----------C-CCTC----T-AATAAG---------------T-GAAG----------GTTCA-ACGGCTCGTC--T-CCTTGTCCTAAT--CG-CCCGTAAC-AT-CG-GTGAAATTCC-----T----AT------TCCA-T-GGGTTTAGAGC-A-TA-GA--TA--C--AAAGCATTCAT-GATCG--A--TGA-GA--AA-------T---TAGT--A-A-TA-A-A--CT-A--GCAAT-AT---------CTATTTTG-ATGAATTCTCA-TGTCAA-GA--CTGAGAAAATGGATTGATAAAT--A----------TATT--A---AAGTAAGCTCTA---A--C-A----TTT-----------TTTTAAA-AA--AA----ATA-G-AC---------TTGGG-CTG--G----TGTG-A--CT-CT-T-TGG-TCGCATCTG--ACGCG-CA---GTA----C------ATTT---ATAG--------A-G-TT-A-TTAGTAAATGTCC-AAT---------CC-CCCCCC------TCTCCCCCGC-CCTCC---CTCCCCCCACCCCACTTTTCAGGAG-TATT-TCCTG-CCTC-CAA--TAATG------------G--AACA-TA-GATTACTTAT--T-TACTCTTATCCGC--T--AATAATGGG----TT-TT--TTCGCGGC--C-G---AAACG-GCC--GTACCA---CGCCTTC---A--TTGAT-AAGATCG-TTCTTG--CA-TAAGC-CAG------TTT-CTTCTC-A-AGTGAAAAACATTGCGAGATATT
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gi|17 : TA----C------A--T---ATAG--------A-T-TT-C-TTA-------TTC-A-----------CA---TACC------CCACCCCCAC-CTTTT---TT-------------GTTTT----G-TA-T-CCCT--CCTC-CAACCCAATG-AT--AAAAA-TA--AACA-TA-GA--AC---CA-A-TACT-TTATC--C--T--AA-AAT--G----TT-TT--T------C--C-C---t
gi|18 : ---G----T-TG-A--C--CT-T-CGA-CCA---CTG--A--CA-CA---GTA----C------A--T---ACAAATGTAAATA-T-TT-G-TTA-------TTC-A-----------CA-CCACCC------CACCCCCTACTTTTTC---CC-------------TTTTC----GCCA-T-TCCT--CCTC-CAA-cca
gi|19 : --CA-CA---GTA----C------A--T---ATAG--------A-T-TT-C-TTA-------TTCAA-----------CA-CCCCCC------CTCCCCTT-T-TTTTC---CT-------------TTTTC----GCCA-T-TCCT--CCTT-CAACCCAATG-AT--AAAAA-TG--AACA-TA-GA--A
gi|2 : TGTACAT-T-T-GC-GTTGTTTTAAAG-TGTGAGGGTGGT---TG-------CTCCC---CTCTCGGTCCTTC-CCTC----T-AA-C-G---------------T-GAGG----------GGG-GCACG---TGGT--C-CCTTGTCTCTACTCCG-CCCGTGAT-ATTCG-GTCT-ATTTAGTTTGTGGGGAT------TCCA-C-G---TTT--GCCA-TA-GGAACA--C--A--GCAT-CAT-A--CGGAAA-TGA-GGGGAA-------A---TA-T--A-A-TA-A-AGGCT-ATTGC--T-AT---------CT-TTTTG-ATAATTTCTCA-TGT-AA-GA--TCAAAGAGAC----------ATTGA----------TA-T--ATATAAG-AA---CTT---G--C-GATTTTTT-----------TTT---T-AG--AAATATATA-A-ACT--------TTGAGCCT---G----T-TT-A--CATCT-TGCGG-CCAC--CTGGAA--CA-CAGCCGTA----C------ATTT---TTAG--------ATT-TT-C-TTA-------TTT-------------CA-CATACC------ACTGCCCTGC-TTGTC---TT-------------CTTCT----GTTA-T-TCCTTCTCTC-CAA-CCAATGAAT--AAAAA-TG--AACA-TACGA--AC---C--TATACT-TTATC--CTAT--AG-AATGGGTTATTT-TT--T------C--C-CCCTATACGTGCCGGG-ACGG---C----AA---A--TTTAT-CA-ATGA-TTC-TG--CA-T-AGC-CAG------TTT--TTCTC-A-AGTG-ACAAT-TGGTGAac
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Unaligned ( gi|20 ): TACAATGTATATAGTATCTCACAAGTTTTCGTTTCAAATTGAGGTTTGCAGAGAGTAGACCCAACCCCG