lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111 1111 111 111111 1111 2222222 111 111 1111 33333333333333333333333 33333333333333333333333333333333333333 111111111 1 111 111111 55555555555555555555555555555 11 222 1 222222 11 44444444444444 22 22222 111 222222 22222222222222222 11 11 111 11111 2222 111 4444444444444444444444444444444444444444444444 222 1111111111 22222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 222 777777777777777777777777 444 111 444444 111 111 111 55555555555555 111111 111 111 11 2 11111111 1111111 33333333333 11111 9999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 22222222 22222222222222 111111 77777777777777 222222 111 33333333 11 2222222 2222 111111111 11111 11111111 66666666666666666666666 111 1111 55555555555555555 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 11 1 111111 1111111 33333333 22222222222222 222222 11 1111 11 33333333333333 11 111 1111 3 22222 1111111 222 11111111 1111 111111 33333333333 111 22222222222 11111 22222222222222222 3333333333333333 3 2 1 1 1 5555
lowQualScore : 5 5 5 66 5 9999 555 77 4 66 66 5 0 4444 5 88888 5 5 555 555 888 66 5 111111 4444 6 7777777 222 6 99 111 6666 6 99 33333333333333333333333 6 6 77777777777777777777777777777777777777 444444444 1 555 5 999999 55555555555555555555555555555 33 111 0 555555 8 11 8 8 44444444444444 77 1 00 6 5 5 77777 777 3 333333 66 55555555555555555 9999 00 4 99999999 4 99 0 99 66 222 4 4 4 4 4 4 55 777 0 22222 55 4 6666 6666 111 4 4 0000000000000000000000000000000000000000000000 3 55 888 3 3 666 3 7777 7 5555555555 3 3 3 66666666 3 2 44 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 999999 88888 3 3 3 55 88888 7777 222 3 3 777777777777777777777777 7 5 1 6 000 3 55 3 3 3 3 999999 3 44 000 44 000000 0 3 9 3 333 7 000 3 333 3 55 55 33333333333333 55 111111 0 3 55 3 44 555 3 3 77 99 6 3 44 3 888 555 3 44 222 3 1 44 11 88888 555 3 3 3 6 3 0 44 11111111 2222222 7777 3 555 555 44444444444 0 555 6 999999 88 55 44444 7 2222222222222222222222222222222222222222222222 3 888888888 777 4 99 4 66666666 4 11111111111111 1 66 4 66 66 777777 0 1 5 5 2 0 6 88888888888888 666666 777 66666666 5 5 5 5 999 5 22 4 66 0 88 0000000 2222 5 5 222222222 5 66 66 77 33333 55555555 9 44444444444444444444444 6 111 6666 55555555555555555 3 77 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11 8 8 0 8 999999 1111111 4 00000000 5 66666666666666 555 666666 11 888 2222 22 77777777777777 44 5 000 5 4 0000 1 5 4 00000 88 66 4444444 7777 777 4 111 777 8 4 66666666 1111 555555 99 777 88888 11111111111 777 111 22222222222 3 999 7 3 44444 00000000000000000 66 4 4 9999999999999999 66 66 777 1 1 6 3 3 3 3 5555
lowQualScore : . . . .. . .... ... .. . .. .. . . .... . ..... . . ... ... ... .. . ...... .... . ....... ... . .. ... .... . .. ....................... . . ...................................... ......... . ... . ...... ............................. .. ... . ...... . .. . . .............. .. . .. . . . ..... ... . ...... .. ................. .... .. . ........ . .. . .. .. ... . . . . . . .. ... . ..... .. . .... .... ... . . .............................................. . .. ... . . ... . .... . .......... . . . ........ . . .. ................................................................................ . ...... ..... . . . .. ..... .... ... . . ........................ . . . . ... . .. . . . . ...... . .. ... .. ...... . . . . ... . ... . ... . .. .. .............. .. ...... . . .. . .. ... . . .. .. . . .. . ... ... . .. ... . . .. .. ..... ... . . . . . . .. ........ ....... .... . ... ... ........... . ... . ...... .. .. ..... . .............................................. . ......... ... . .. . ........ . .............. . .. . .. .. ...... . . . . . . . .............. ...... ... ........ . . . . ... . .. . .. . .. ....... .... . . ......... . .. .. .. ..... ........ . ....................... . ... .... ................. . .. . ........................................................................................................................... .. .. . . . . ...... ....... . ........ . .............. ... ...... .. ... .... .. .............. .. . ... . . .... . . . ..... .. .. ....... .... ... . ... ... . . ........ .... ...... .. ... ..... ........... ... ... ........... . ... . . ..... ................. .. . . ................ .. .. ... . . . . . . . ....
lowQualScore : 7 0 0 99 0 0000 666 55 4 11 99 0 1 1111 0 66666 0 0 999 666 888 99 0 444444 8888 7 0000000 777 7 22 777 0000 7 22 33333333333333333333333 7 7 99999999999999999999999999999999999999 333333333 4 777 7 222222 77777777777777777777777777777 88 000 0 222222 0 00 0 0 22222222222222 00 7 22 7 7 7 99999 333 3 444444 99 22222222222222222 9999 66 4 22222222 4 44 9 00 11 222 4 4 4 0 0 0 55 000 7 44444 55 4 9999 0000 000 0 0 3333333333333333333333333333333333333333333333 6 00 444 6 6 444 6 7777 3 9999999999 6 6 6 55555555 6 9 66 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 555555 11111 6 6 6 00 11111 4444 777 6 5 444444444444444444444444 7 5 7 7 444 3 22 3 3 3 3 666666 3 88 444 66 888888 2 6 2 6 666 3 000 6 666 6 99 00 11111111111111 00 000000 2 6 00 6 66 888 3 3 99 55 7 3 66 3 888 888 3 66 333 3 6 66 22 33333 888 3 3 3 7 3 5 66 11111111 5555555 1111 3 888 444 00000000000 3 888 7 999999 66 00 55555 3 9999999999999999999999999999999999999999999999 6 222222222 000 0 00 0 88888888 4 00000000000000 0 11 4 11 99 999999 9 4 7 7 8 2 0 55555555555555 888888 555 55555555 7 7 7 7 000 0 00 4 11 4 11 1111111 5555 0 0 666666666 0 99 11 99 77777 77777777 1 77777777777777777777777 7 777 0000 77777777777777777 3 33 7 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 00 0 0 0 0 444444 4444444 6 88888888 0 88888888888888 888 555555 11 888 2222 66 11111111111111 99 0 444 0 5 6666 0 0 4 44444 11 11 0000000 6666 888 4 888 888 9 4 11111111 4444 000000 99 888 77777 99999999999 000 000 77777777777 6 444 3 6 00000 88888888888888888 11 4 4 1111111111111111 11 11 888 7 9 7 3 3 3 7 0000
consensus : AAAG-TATTA-A-A--GA-A-T--GT---TTTCAATCCCT-GAGA--ACTG--C-TATA---NT-GA--TT-AA-GTC-AT-T-GT---A---TT--GCTT-CTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAAT------AT--ATGTGT-T--C---AAATC--T-AAAC-AAA--GCA------C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-C--------A--CAT------------TGA-----C---AAT-TT---TGA-CGC------TGACAT---GCC-AGGAAAAAA-A-----AA----AAT--AA-ACGCCGATA-GACA---C--TTTA-TCG--A-CT-GAGTCAG-GT-GACTTCAGG-CT-CTTGGAGAAGAA-TAGA-GTA-GT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG-----GAG--AC----T-TCC--------AT--T-TCCT--GAT-GAA--TTGCT-GTAAT-TGTG-AAAGGTT--TTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAG-ATG-A--T---AGAT---A-C--A-G-N-NAAAGAA-T-ATTAA---T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---A---AA---TA------TA-T--TTTTAT-TATG-CAT-T---ACGAA-AA----TT-T----------A-TC-TCT--AGA---CA-ATGT--AC-------T---TCAA----T--TA-A-T---A--T-----CAAT-G-T-AT--A------A---T--T-A----------CAT-GGCAATAT-----TG----AA-G-T-AT--T-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTCCT--CNT-AA-TCTA-TTACTGTA-TCTCCAAACGT-ATGTGTTT-TT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAGTG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GCAA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATA-C-TC-T--TGT-CA--A---T-GTGA--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-T-GAAGGTA-CAAT--A-----T-CTG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTA------TTTG---T-AGA-A--CTGTGCA--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CAG-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-A------A-TGGN---A--AA-----GGA--A-G--TGA--C---CACAAAATGTAC-C-ACAACGCGTCCATGGGGTGATCCTCNNGNGNGGGGTGG---GTAT---CAA-ACTATT-AA-AG-A-A-TNCTTT-CN-ATCCCT-GAGA--ACTGCC-ATA-N-----TGA----TCA-AGTC-AT--T-GT---A-TT--GC-CTC--TGT--T--AT---C----TCNTA-TAAAAAA-AT-NT-G----GTGT-TC---AAATC--T-AAACAAAGCACTCGATTT--TTTGTAAACATTCCT-A-ATCAC----ATT-A-CA-ACA-----CA-----TNAA-A-GACAAT---ANT-GACT--ACAT-T--GNTG-CTG--AACGTG------A-ATA--TAAAA--GTAA-ACGCCGAT-NGACA-N---TTT--ATCG--A-CT-GAGTCAG-GTG-AC-TCAG--CCNCNTGGAGAAGAAT-AGAGT-TAGTTTT----TAC--CC-ACACACGTGTCAAAAA-T-AANGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTN-ATGA---------AA--TGCTN-TAAT-TGT-G-A-AGGGTTT----CATG-AAACC-TCAGA-CTC-G---GATGATA--GAT-T---CAG-GA-AAA---G-AATNTTAA---T-CA-G--------TGT-A--AA---G--AAATAG-T---AT-A---TTTTTATTNT-GCAT-TA-CGAAAA---TT---TATC------CGTAGA-C-NATA-TAC-A-----TC---A----A--T-----TAT--CA-AT-G-T-A--T-------T-A--A--TT---TACA-TGGCAATATATTATACATCAATTT-TTATC-AATA-TATNAT---TTACATGGTGATAT
Reference ( gi|1 ) : AAAG-TATTA-A-A--GA-A-T--GT---TTCCAATCCCT-GAGA--ACTG--C-TATA---AT-GA--TT-AA-GTC-AT-T-GT---A---TT--GCTT-CTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAAT------AT--ATGTGT-T--C---AAATC--T-AAAC-AAA--GCA------C-----TTGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-C--------A--CAT------------TGA-----C---AAT-TT---TGA-TGC------TGACAT---GT-----AAAAAA-A-----AA----AAT--AA-A-GCCGATA-GACA---C--TTTA-TCG--A-CT-GAGTCAG-GTTGACTTCATG-CT-CTTGGAGAAGAAATAGA-GTA-GT-TTT-----AC-T-GACACACTTGTCAAAAAG-----GAG--AC----T-TCC--------AT--T-TCCT--GAT-GAA--TTGTT-GTAAT-TGTGGAAAGGTT--TTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAG-ATG-A--T---AGAT---A-C--A-G-T-TAAAGAA-T-ATTAA---T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---A---AA---TA------TA-T--TTTTATATATG-CAT-T---ACGAA-AA----TT-T----------A-TC-TCTA-AGA---CA-ATGT--AC-------T---TC------T--TA-A-T---A--T-----CAAT-G-T-AT--A------A---T--T-A----------CAT-GGCAATAG-----TG----AA-G-T-AT--T-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTCCTTACAT-AACTCTA-TTACTGTAGTCTTCAAGCAT-ATATGTTG-AT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-CCTC---TA--TTTGCAAGTGTATC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GCAA--C--G---TGCAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATT-C-TC-T--TGT-CT--A---T-GTGA--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-T-GAAGGTACCAAT--A-----T-TTG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTA------TTTG---T-AGA-A--CTGTGCA--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CAG-G-------CTA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTC-CTTGTAA------A-TGGG---A--AA-----GAA--A-G--TGA--C---CACAAAATGCAC-C-ATAACGTGTTCATGGGG--------GGGGGGGGGGGAG---GTAT---CAACACTAT--AA-AG-A-A-TCCGTT-CT-ATTCCT-GAGA--ACTACC-ATA-T-----TGA----TCA-AGTC-AT--T-AT---A-TT--GC-CTC--TGT--T--AT---C----TCATAGTAAGAAA-AC-TT-GCA--GTAT-TC---AAATC--T-AAACATAACTATCTATTTT-TTTGTAAGCATTCCC-A-ATCAC---CATTCA-CATACA-----CA-----TGAAGAGGACAAT---AGT-GAC---A-ATCT--GCTG-CTG--AACATG------A-ATA--TAGAAATGTAA-A-GCCTAT-CAACA-A---TTT--ATCG--A-CT-GCGTCAG-GTG-ACGTCAG--CCCCTTGGAGAAGGGTCAGAGT-TAGTTTT----TAC--CT-ACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-ATGA---------AA-ATGCTT-TAAT-TGT-A-A-AGGGTTT----CATGTAAACC-TCAGA-CTC-G---GATGGTA--GCT-T---CAG-GA-AAA---G-ACTTTTAA---T-CA-G--------TGT-A--AA---G--AAATAG-T---AT-A---TTTTTATTTTAGCCT-TATCGAAAA---TT---TATC------CGTAAA-C-AGTA-TAC-A-----TC---A----A--T-----TAT--CA-AT-G-T-A--T-------T-A--A--TT---TACAGTGGCAATATATTATACATCAA-TT-TTATC-AATA-TATGA----TTACATGGTAATAT
gi|8 : AAAC-TATTA-A-A--GA-A-TCCGT---T--CTATTCCT-GAGA--ACTA--C-CATA---TT-GA--TC-AA-GTC-AT-T-AT---A---TT--GCCT-C--TGTTAT---C--TC
gi|7 : ggtatcAAAG-TATTA-A-A--GAGA-T--GG---TTTCAATCCTT-AAGACCACTG--C-CATA---CT-GA--TC-AA-GTCAAT-C-GTAA-A---TT--GCTTGGTGCGTTatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|16 : acaaatctacttgcacagcattcaaacgaagatctatccaccttgtacatcaattttatcaatgtgaaacatacattgacaattttgaacgtatttgtcaatgaccacaatcacctgtaattactcccaaatgcagtgtgttttggatttccttgtttctttatttgcagcgatctgacttgtacaagcaaaaccgcttgtaaaaattcggtatgccacacactgtaccgtccggttccacaacatactcattgttcaatgtgtgaactggtttatcgtggtccacttgtgaagttacaatatcttaaacatggatagttttctgtaagaatggcgataaaagtctgtacagcagtgagaatttcttctatgggctaaacttcttgtgaattgagtaaaaggaagttttgaagaaaattaatccgcactggtttacgaagctttcactatttaggagattacgtgtatatcAAAG-TATTG-G-A--GA-A-T--AT---TTTCAATCCCT-AAAA--ACTG--C-CCTA---TT-GA-----AATATC-AT-G-GT---AATTTT--ACTT-GTGTGTTAT---A--TCTTACCATG-AAAAT------GTGCATGTTT-T--C---AGATT--C-AAAC-ATA--GCG------CTTTATTTGGTCG-T--AAACATT-CCTA-ATTACACTCTTCCA-C--------A--CATGATAAATCACAGTGA-----C---ATT-TC---TGG-TGC------TGACAT---Gcat
gi|24 : AAAG-TATTA-A-A--GA-A-T--GT---TTTCAATCCTT-GAGA--Ac
gi|3 : cAAG-TATTA-A-AAGGA-A-T--GTGT-TTTCAA-CCCT-GAGA---CTG--C-T-TA---AT-GA--TT-AA-GTC-AT-TTGT---A---TTAGGCTT-CTGTGTTATTCGC--TCT----ATA-AAAA-------AT--ACGTGT-TTTC---AAATC--TTAAACCAAACTGCA------C-----TCGGTT--TGTAAACATTTCCTA-ATCA---------A-C--------A--CAT------------TGA-----C---AAT-TTGATTGA-C-T------TGACATTGTGTTAAAAAAAAAA-A-----AA----AAT--AA-ACGCCGATA-GACA---CGTTTTAATCGGAA-TT-GAGTCAG-GT-GACT-CATG-CC-TTCGGAGAAGAA-TAGAAGTA-GT-TTTCGTTTACCT-GACACACTTGTCAAAAAG-----GAG--AC----T-TTC--------AT-----CCT--GAT-GTA--TTGTTTGTAAT-TGTG--AAGGGT--TTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAT-ATA-A--TTATAGAT---A-C--A-G-TATAAAGAAAT-ATTAA---T-C-AGTTGGTTTATGTAGTGT-A--AAA--C---A---GA---TA------TAAT--TTTTAT-TATGGCAT-T---ACGAA-AA----TT-TACAGTACTACA-TC-TCTA-AGAC--CA-ATGT--AC-------T---TCAATT--T--TATA-C---A--TGA---TAAT-T-T-AC--ATAGAACA---TCGT-AAACAAACCATCAT-AGCAATAG-----T------A-G-T-AT--T-C---GAT--ATG-A-CA-CCATCCT--CAT-AA--CTA--TACTGT-GTCTCC-AGCA--ATATGTTGTTT-AGGTTT-AG-GAATTTCA-CTTATCAATACTA-TGTCCCTCCG-TA--TTTGCCAGTCTGTC-G-CTATATGTGCTGC-AATTA-ACA---CCCCTGTA-TAAAAAT--GGTCTC-------T--G-AA--C--G---TGCAC-G--TC-GGA--TT---CCAC-A-A--CATT-C-TC----TGT-CC--A-----ATG---CACA-TGCGTTACA--CGCTGCGCGCG---TC-CCATCTT-G-T-GAAGG-A-CAAT--ACATTCT-TTG---ATACC----ATTA---GAT---AG-TCTA------TTTGCTAT-AGA-AATCTGTGCC--TTCAGAATGCTTCTTGT--CAAGTCAT-G-------GTA---------C--------------AATT---------GG---AGGACGAATTC-CTTGT-A------A-TGGG---ACTGG-----AAA--A-G--TGACTC---CAC-AAATGCACTC-ATAACG
gi|5 : AAGCTATTA-ACA--GA-AGT--GT---TATCAATCCCT-GGAA--TCTATCC-TATACATGT-GAATTT-AA-GTC-ATGT-GT---A---TT---TTT-CTGTGTTAT---CACTCTT---ATATAAAAA------AT--TTGTGT-T--CTATAAATC--TTAAAC-AA---GCAA-----C-----TCCGTTG-T--AAAC-CT-CCTA-ATAA--------CAAC--------AGACATC-----------TTT-----C---AATGTT---TGAATGC------TGACAT---GCCCAGGAAAAAT-A-----AATAACAAT--AA-ATGCTGATA-GACA---C--TTTA-TCG--A-CTCGAGTCAG---T-ACTTCAGGGCTGCATTAAGA-GAGATAGA-GTA-TT-TTTT----AC-T-GA-ATACATGTCAAAA-G-----GAG--AT----T-TCTTTCCAATGAT--T-TGTT--GAT-AAA--T-GTTCGTAAT-TGTGAAAAGGTT----CG--AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCA---TG-A--T---AGAT---A-C--A-G-T-TAAAGAA-T-ATTAC---TGC-AG-TG------------TCACCAA---CACGA---AA---TA------TA-T--TCTC-TATATG-CAT-T---ACGAA-AA----TA-T----------A-TCTTCTC-ACGTATCA-ATTT--GC-------TAACCC------TC-CA-A-T---AATT-----C-AT-G-T-AT--A------AG--T--T-A----------CAT-GGCAATGT-----TGTCGAGA-G-T-AT--T-C---G-T--ATG-A-CATCAGTCCT--CAT-AA--CTA--TACTG--GTC-TCAAGC-T-ATATGTTG-TC-ATGTTT-AA-G-ATGCTA-CTT-TC------A-GG---CCC---TA----TGC-AGTG-ATC--ACTAT-TGC--TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GG--------------GCAA--C--T---TGCAC-G--TC-CGG---T---CCAC-A-A--CATT-C-GT-T--GATACA--A---T-GTGC--CACTATG-GTTACA--TC--G-----G---TC-CCA-CTTGG-T-GA--GTAACAATTAA-----T-CTG---ACA-C----A-TA---GAT---A
gi|4 : AG-TATTAGA-A--GA-A-T--GT---TTTCAATTCCTTGAGA--ACTG--C-TATA---AG-CA--TT-AA-AGC-AT-T-GT---A---T---GCTT-CTGTTTTAT---C--TCTT----TA-AAAGA------AT--ATTGGT-T--C---AAATC--T-AAAC-AAA--GCA------C-----TCGGTT--TGTAAACATT-CCTAGATCA--------CA-C--------A--CAT------------TGA-----CTCCAAT-TTA--TGA-TGC------TGACAT---GC-----AAAAAA-ATAAATAA----AATTGAA-A-ACTGATATGACA---C--TTTA-TCG--A-CT-GAGTCAG-GT-GA-TTCAGG-CT-CT-GGAGAAGAA-TAGA-GTA-GTATTT-----AC---GACCAACTT-TCAGAAAG-----GAG--AC----T-TTC--------AT--T-TCCT--GAT-GAA--TTGTG-GTAAT-TGT-GAAAG--T--TTC---AT-G--A-CCTTCAGA-CTCAG-ATG-A--T---AGAT---ACC--A-GTT-TAAAGAA-T-ATTAA---T-C-AG-TG------------T-AAGAA---C---A---AA---TA------TA-T--TTTTAT-TATG-CAT-T---ACG---AA----TT-T----------A-GC-TCT--AGA---CA-ATGT--AC-------T---TCAA----TGATA-A-T---A--T-----CAATCG-T-AT--G------AAT-T--T-A----------CAT-GGCAATAGTTTTTTG----AA-GTT-AT--C-T---C-T--ATGAACCA-CAGTCCT--CAT-AA--CTA-ATACTGT-GTCTCCAAGCAT-ATATGTTG-TTAATGTTTAAG-G-ATTTCAGCTT-TC------A-TGT-CCTCAGATA---TTGC-AGTG-ATC-GACTAT-TG----GC-A---A-ACA---CCCCT-TG-AAAAATT--GGT----------T--GCAA--CT-T---TGCAC-G--TC-CGG--TTGCCCCAC-A-AT-CATT-CTTC-T--TGT-CA--A---T-GTGACCCACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TT-CCA-CTT-G-T-GAAGTAAGCAAT--A-----T-CTGGGAG-A-C----A--A---GAT---AGGTTT-------TTTG---T-AAA-A--CTTTGCGTTT--AGAA-------TGT--CAG--CA--G-------TTA---------G--------------AA-TCTCTTTAAGGG---G-GATG-ATTT-CTTGT-A------A-TGGATATA--AA-----GGA--A-A--TGA--C-----CAAAACGTAC-C-AAAA
gi|2 : TA-A-A--GA-A----GTCCTTTTCGACTTCT-GAAA--ACTA--CCTATA---CTTGA--CTCAA-GTC-AT-T-ATTATA---TT--GCCT-CTGT---AT---C--TC-----ATA-GTAATCTTAGCAT---TGTATGT--C---AAATTCTT-AAAC-TAA---CATTCTATC-----TTTTTT--T--AAGCATT-CCCA-ATCA--------CA-TTAAGTATAA--CAC------------TGAGAGGAC---AATAGT---CGA-CGCATATTCTGTCTT---GC-----GACATATA-----GA----AGT--AATA-GCCGATC-AACAAGCT--TTTA-TCG--AACT-GCGTCAGAGTATACG-CAGC-CC-CTTGGAGAAGGG-TGAA-GTATAT-TCTTA---AC-T-AACACATGTGTCAAAAATTAAATGAG--ACAACTC-TCT--------ATAGTATCCTC-AATAGAA--ATCTT--TAAT-TGCGTAAGGGTT--TCA---AT--AAA-CA-TCAGA-CTCCG-ATGTA--T---TGCT---T-C--A-G-G-AAAAGA----CTTAACTCT-C-AGGTG------------TAA--AA---G---A---AA---TAGTTAAGTA-T--TTTCAT---TG-CCTGT---ACGAA-AA----CT-T----------ACTA-TCTA-AAT---CG-GTAT--ACATCATTAT---TCTAATTGT--TA-A-T---A--T-----TTATCG-A-ATC-A------A---T--T-A----------TAC-AGCAAT
gi|18 : attagttttactcgacacagtgtcaaaaagaagactatccattttctctgatgaattgggtatgtacaacgtttcatcgataactcagaccagatgaattagtacccagtaaagaattattaaatcagtgctaaaacataaattatatttacttatgcatatcgaacaattgtatctctaatctaatgtgtacttcaatatatcctcaatgttattaactttacatggcatcagtgaagtattcgtatggacacatcctcatttaactatactgatgttctcatcatatgttatgtttagcgatttcattttcactgtcctctattgcatgatcaactattgtgctacaacaacctctttaaaaatgggtcgaatatgccacgctcactccagcgttccacaccattcctctactgtcaattgtgacacctgtacatccgggtcccacttgtcgaagtcaatatattgacattaacatatatttgtagaatactgtgcagtagaagttctgtaccagcatctacaatggagacagtcctggaatgggaaaaaagaaagcttgacacccacaagggcacccataatacgtccatgaagtgatcctcgggagaggggtgggtatcaaacaT-GAGA--ACTG--C-TATA---AT-GA--TT-AA-GTC-AT-T-GT---A---TT--GCTT-CTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAAT------AT--ATGTGT-T--C---AAATC--T-AAAC-AAA--GCA------C-----TCGGTTTGT--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-C--------A--CAT------------TGA-----C---AAT-TT---TGA-TGC------TGACAT---ttttatctaatattatcatcacttacatggattatttga
gi|7 : A--------CA-T--------A--CAT------------TGA-----C---AAT-TT---TGA-
gi|11 : acaaatctacttgcacagcattcaaacgaagatctatccaccttgtacatcaattttatcaatgtgaaA-TCG--A-CT-GGGTCAG-GT-GAAATCAAC-CA-CGTGGAGAAGATTCAAA-ATA-GT-TTT-----AC-C-CACACATGTGTCAAAAAATAAA-GAGTCAC----T---C--------AT--A-TCCT--TAT-CAA--CTGCT-GTAAT-TGTGAA----TTATTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAG-CTG-A--A---AGATTAAA-A--A-A-A-AAAAGAA-T-TTTCA---T-C-AA-TG------------T-A--AA---C---AAATAA---TA------TA-T--CTTTAT-TTTG-CAT-T---ACGAA-AA----TT-T----------G-TC-TGT--AGA---TC-ATAT--AC-------A---TCAA----T--TA-T-T---A--T-----CAAT-G-G-AT--A------A---T--TCA----------CAT-GGCAAAAT-----TG----AA-G-T-AT--T-C---G-C--CTG-A-CA-CAGTCCT--CTT-AA--CTA--TACTGTA-TCTCCAAACGT-ATGTGTTT--T-ATGTTG-TG-G-ATTTCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTacgtatttgtcaatgaccacaatcacctgtaattactcccaaatgcagtgtgttttggatttccttgtttctttatttgcagcgatctgacttgtacaagcaaaaccgcttgtaaaaattcggtatgccacacactgtaccgtccggttccacaacatactcattgttcaatgtgtgaactggtttatcgtggtccacttgtgaagttacaatatcttaaacatggatagttttctgtaagaatggcgataaaagtctgtacagcagtgagaatttcttctatgggctaaacttcttgtgaattgagtaaaaggaagttttgaagaaaattaatccgcactggtttacgaagctttcactatttaggagattacgtgtatatcaaagtattaaagagatggtttcaatccttaagaccactgccatactgatcaagtcaatcgtaaattgcttggtgcgttcat
gi|17 : ACTTC----CT-CTTTGACAACTAATAGA-TTA-GT-TTT-----AC-TCGACACA
gi|2 : cacTA-GT-TTT-----AC-TCGACACAGT-GTCAAAAAG-----AAG--AC----TATCC--------AT--T-TTCTCTGAT-GAA--TTGG--GTA---TGTACAACG--T--TTC---ATCGATA-AC-TCAGA-C-CAG-ATG-AATT---AG-T---A-CCCA-G-T--AAAGAA-TTATTAAA--T-C-AGTGC------------T-A--AAACAT---A---AA---T-------TA-T--ATTTACTTATG-CAT-A---TCGAACAA----TTGT----------A-TC-TCTA-ATC---TA-ATGTGTAC-------T---TC----------A-A-T---A--TATCCTCAAT-G-TTATT-A------ACT-T--T-A----------CAT-GGCATCAG-----TG----AA-G-T-AT--T-C---G-T--ATGGA-CA-CA-TCCTCATTT-AACTATA-CTGATGT--TCT-----CATCATATGTT-----ATGTTT-AGCG-ATTTCA-TTT-TC------ACTGT-CCTC---TA--TT-GCA--TG-ATC-AACTAT-TG---TGCTAC--A-ACAA--CCTCT-T--TAAAAAT--GGGTCGAATA---T--GCCA--C--G---CTCAC----TC-CAGCGTT---CCAC-A-C--CATT-CCTC-TACTGT-CA--A---TTGTGA--CACC-TG---TACATCCG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TCGAAG---TCAAT--A-----TATTG---A---C----A-TT---AAC---A--TATA------TTTG---T-AGA-ATACTGTGCAG-T--AGAAGT--TC-TGTACCAG--CAT---------CTA---------C--------------AA-T---------GG---A-GAC--AGTC-CTGG--A------A-TGGG---A--AAAAA--GAA--A-GCTTGA--CACCCACAAGG-GCAC-CCATAATACGTCCATGAAGTGATCCTCGGGAGAGGGGTGG---GTAT---CAA-AC-AT--AA-AG-A-AGTCCTTTTCG-ACTTCT-GAAA--ACTACCTATACT-----TGAC---TCA-AGTC-AT--T-ATTATA-TT--GC-CTC--TGT-----AT---C----TCATAGTAAT-----C-TTAGCATTGTATGTC---AAATTCTT-AAAC-TAACATTCTATCTT-TTTTTAAGCATTCCC-A-ATCAC----ATTAAGTATA-A-----CA-----CTGAGAGGACAAT---AGTCGAC---GCATAT--TCTGTCT-----TGCG------ACATA--TAGAA--GTAATA-GCCGAT-CAACA-AGCTTTT--ATCG--AACT-GCGTCAGAGTATACG-CAG--CCCCTTGGAGAAGGGTGA-AGTATA-TTCT----TAA--CTAACACATGTGTCAAAAATTAAATGAGACAACTCTCTATAGTATCCTCAATAG---------AA-AT-CTT-TAAT-TGC-GTA-AGGGTTT----CA-ATAAACA-TCAGA-CTC-C---GAT-GTATTGCT-T---CAG-GA-AAA---G-AC--TTAACTCT-CAGG--------TGTAA--AA---G--AAATAG-TTAAGT-A---TTTTCATT---GCCTGTA-CGAAAA---CTTACTATC--------TAAATC-GGTA-TAC-A-----TC--------A--T-----TATTCTA-AT---T-G--T-------T-AATA--TT---TATCG----AATCAATTATACAGCAATTT-TTATCTAATATTATCATCACTTACATGGtttttgtaaaactttgcgtagaatgtcagcagttagaatctctttaatggggatgatttcttgtaatgataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaa
gi|8 : atAAT-----GAG--AC----A-CTC--------AT--T-TCCT--CAT-GAA--ATGCT-TTAAT-TGT--AAAGGGT--TTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCGG-ATG-T--T---AGCT---T-C--A-G-G-AAAAGAC-T-TTTAA---T-C-AG-TG------------T-A--AA---G---A---AATAGTA------TA-T--TTTTAT-TTTG-CCT-T---ACGAA-AA----TT-T----------A-TC-CGT--AGA---CA-GTAT--AC-------A---TC----------A-ATT---A--T-----CAAT-GCT-ATTCA------ATTTT--T-A----------CAT-GGCAATAattatttga
gi|6 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattAAA-----GAG--AC----A-TTC--------AT--T-TCCT--GAT-GAAACCTGCT-GTAATCTATAACATGATT--TTCTGCAT-GAAAACC-TCAGAGCTCAG-GTC-A--T---AGAT---T-C--AAG----AAAGAA-T-AT-AA---T-CCAGT-G------------T-A--AA---C---A---AA---TAATA---TA-TGCTTTTCT-TA-G-AAT-T---ATGGA-AAAATGTT-T----------G--C-TGTATACT---CATAT-T--AC-------A---TCAAT---C--TA-T-T---A--T-----CAAT-G-A-A---A------T---T--T-A----------CAT-GGCAATA------TG----AA-G-T--TGGT-C---G-C--AATTA-CA-CAGTCCT--CTT-AATT--A-C-ACTGTA-TCTCCAAACGTCATGTGTTT--T-ATGTTT-TG-A-ATTTCA-CTT-TC------A-TTT-CTTC---TATGTTTGC-AGCGCACT-GAC--T-TG---TGCAA---A-ACAC--CCCCT-TG-T-AAAAT--GGGAT--------T--GCAAACC--G---TGTAC-G--TC-CGT--TT---CCAC-A-AACCATA-C-TC-T--TGT-CCAAA---T-GTGA--CAC--TG-GTTTTA--CGA-G-----G---TCTCCA-CTT-G-T-GAA-GTA-CAAT--A-----T-CTG-----G-C----A-TATTGGATGTGGGTTT--------TTTG---TAAGACA--CTGTGCA--T--AGA------CATGT--CAG--CAG-G--------TA---------CCCCAATTTAACTTTAA-T---------AG---A-G-TG-ATTTGTTTGT-A------A-TGAT---A--AA-----TGATCA-G--TGA--C---CAAAAGATGTAC-C-ACAACttatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|21 : caactgt--------AT--T-TTCT--AAT-GAA--T-GCT-GCAAT-TATG--AAGGCT--TTC---AT-GAAA-CC-CCAGA-CTCTG-AGA-A--T---AGAT---A-C--
gi|19 : t-CTCAGGATG-A--T---AGAT---T-C--A-G-G-AAAAGCG-G-ATTCA---T-C-AG-CG------------T-A--AA---C---A---AA---TATTATATTG-T--TTTTATTCTTG-AAT-T---ATGAA-AA----TTGT----------A-TC-TGT--ATA---CC-ATAT--AC-------cgaataagggtttttttttttcagtgaagataag
gi|23 : A---T-C-AGT-G------------T-A--AA---C---A---AA---TAATA---TA-T--TTTTAT-TATG-TAT-T---ACGAA-AA----TT-T----------A-TC-TCT--AGA---CA-ATGT--AC-------actcaatta
gi|7 : A---C---A---AA---TC------TA-C--TTGCACA---G-CAT-TCAAACGAA-GA----TC-T----------A-TC-C------A---CC-TTGT--AC-------A---TC----------A-A-TTTTA--T-----CAAT-G-T-GA--A------A---CA-T-A----------CATTGACAATTT-----TG----AACG-T-AT--T-T---G-TCAATGAC-CA-CAATC---AC-----CTGTAATTACT------CCCAA-------ATGCAG--T-GTGTTT-TG-G-ATTTC--CTT---------G-T-T-TCTT---TA--TTTGCA-GCG-ATCTGACT---TG---TAC-A---A-GCAAAACCGCT-TG-TAAAAATTCGG-----------TATGCCA--C--ACACTGTACCG--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATA-C-TCAT--TGT-TC--AATGT-GTGA---ACT-GG-TTTAT---CGT-G-----G---TC-C-A-CTT-G-T-GAAGTTA-CAAT--A-----TCTTA---A-A-C----A-TG---GAT---AGTTT--------TCTG---TAAGA-A--TGGCG-A--T--AAAA-G--TC-TGTA-CAG--CAGTGAGAATTTCTT---------C--------------TA-T---------GGGCTA-AAC----TT-CTTGTGA------ATTGAGTA-A--AA-----GGA--A-G--T
gi|20 : TAT--ACA------T---TCA-----T--TA-T-T---A--T-----CAAT-G-T-AT--A------AT--T--T-A----------CAT-GGtttgaagaaaattaatccgcactggtttacgaagctttcactatttaggagattacgtgtatatcaaagtattaaagagatggtttcaatccttaagaccactgccatactgatcaagtcaatcgtaaattgcttggtgcgttcat
gi|20 : atctgtataccatatacatcaattattacatgtatcaatgtataatttgcatggcaatat-T---A--T-----CAAT-G-T-AT--A------AT--T--T-G----------CAT-GGCAATAtga
gi|9 : atctgtataccatatacatcaattattacatg----------CAT-AGTAATGT-----TA----AA-A-T-AT--T-T---G-C--ATGA--CA-CATTCCT--CTT-AACT--A-T-ACTGTA-TCTCTATATGT-ATGTGTTT-TT--TGTTG-TG-G-ATTCCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTTGCA-GCG-ACT-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GCAA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATA-C-TC-T--TGT-CA--A---T-GTGA--CAC--TG-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-T-GAAGGTA-CAAT--A-----T-CTG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTA------TTTG---T-AGA-A--CAGTGCA--T--AGATTG--TC-TGT--CAG--TAG-GTAGAAT-TTATT-------T--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-A------A-TGAT---A--AT-----GGA--A-G--TGA--C---TAAAAAATGTAC-C-ACAAttatacattcattattatcaatgtataatttacatggtga
gi|10 : AT-GGTGGTAT-----TA----AA-G-T-AT--T-A---G-T--ATGA--CA-CGGTCC---CCT-GAAT-TA-T-ATTGTA-TCTCCAAACAT-ATGTGTTT--T-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTC-AGTCGAAC-TACTTT-TGT--TGC-A---ACACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GGTTTTCTATTTTT--GCAA--CGTG---TGTAC-GGTCC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATTAC-TC-T--TGT-CA--A---T-GTGA--CATC-TG-GTTACA--CG--G-----GTCCTC-CCA-CTT-GTT-GAAGGTACCAAT--A-------TTG---A-A-CACATA-CA---AAT---AGCTTTA------C------T-AGA-A--TTattttgttaaagctttcatctttagggag
gi|12 : T-GGTGGTAT-----TA----AA-G-TTAT--TAC---GGT--ATGA--CA-C-GTCC---CCTGAATTATA-TTA--GTA-TCTCCAAACAT-ATGTGTTT--T-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTC-AGTG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-A-A----CCCT-TG-TAAAAAT--GG--------------GCAA--C--G---TGTAC-G--TCTTGG--TT---CCAC-A-A--CATA-C-TC-T--TGT-CA--A---T-GTGA--CAC--TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-T-GAAGGTA-CAAT--A-----T-CTG---A-A-C----A-TA---AAT---AG-----------TTTA---T-AGA------------------AATT--TC-TTT----------------------------------------------AA-T---------GG---A-GACC-ATTT-CTTGTAATGATTTA-TCGG---A--AATGAATAAA--ACA--TTA--C---CA-AAAATGtctttatatggagaccattctgttacatgatttatcggaactatgaataaacataccaaaatgtcatctaactcatatttaggg
gi|13 : T-GGTGGTAT-----TA----AA-G-T-AT--T-TACGG-T--ATGA--CA-C-GTCC---CCT-GAAT-TA-T-ATTGTAATCTCCAAACAT-ATGTGTTT-TT-ATGTTT-AG---ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCA-GTG-ACT-GACT-T-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TGTTAAAAAT---G-----------T--GCAA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCACAA-A--CATA-C-TC-T--TGT-CA--A---T-GTGA--CACT-GG-TTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-GTT-GAAGGTA-CAAT--A-----T-CTG---A-A-C----A-TA---AAT---AGTTT------------------------------A--T--AGAAT---TC-TTT----------------------------------------------AA-TG--------GG---A-GACC-ATTT-CTTGTAA------tcgatctaacttcattattaggga
gi|14 : T-ATATGTTT--T-GTGATT-TG-G-ATTTCA-CTT-TT------A-TGT-TCTC---CA--TTTGCA-GTG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GCAA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-T--CATA-C-TC-T--TGT-CA--A---T-GTGA--CACT-GG-ATT-CA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-T-GAAGGTAC-ATT--A-----T-CTT---A-A-T----G-TG---GCT---ATTTGTAGAACAGTGCA---T-AGA-A--CAGTGCA--T--AGAACG--TC-TGT--CAG--CAG-G--------TA---------G--------------AA-T---------tgattta
gi|15 : actngtttatacggGA--TT---TCAC-TTA--CATA-C-TC-T--CGT-CA--A---T-GTGA--CACT--G-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-T-GAAGGTAC-AAT--A-----T-CTG---A-C-C----A-TG---GAT---AGGT--A------TTTG---T-AGA-A--CAGTGCA--T--AGATTG--TC-TGT--CGG--TAG-G--------TAGAATTTCGTC--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-A------A-TGAT---A--AA-----GGC--A-G--TGA--C---TAAAAAATATAC-C-ACAAAGTttctttaatgga
gi|17 : g---AGTTTT--------TTG---T-AAA-A--CTTTGCG--T--AGAATG--TC-AG---CAGT-TAG-AATCT---CTT---------T--------------AA-T---------GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-A------A-TGAT---A--AA-----GGA--A-A--TGA--C-----CAAAACGTAC-C-Attgttaaagctttcatctttaggga
gi|22 : cactgtgtcgagtaaaactaatctattagttgtcaaagaggaATGGGG--------CTGTGCGGGGTAGCGCGTATGCCCAACCCTATTTAACAGTA-A-TCCGT--CT-ATTC-T-GAGA--ACaa
gi|8 : aG---GTAT---CAA-ACTATT-AA-AG-A-A-TCCGTT-CT-ATTCCT-GAGA--ACTACC-ATA-T-----TGA----TCA-AGTC-AT--T-AT---A-TT--GC-CTC--TGT--T--AT---C----TCAT
gi|7 : TAT---CAA-AGTATT-AA-AG-AGA-TGGTTT-CA-ATCCTT-AAGACCACTGCC-ATA-C-----TGA----TCA-AGTCAATCGT-AA---A-TT--GC-TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|3 : acaaatctacttgcacagcattcaaacgaagatctatccaccttgtacatcaattttatcaatgtgaaacatacattgacaattttgaacgtatttgtcaatgaccacaatcacctgtaattactcccaaatgcagtgtgttttggatttccttgtttctttatttgcagcgatctgacttgtacaagcaaaaccgcttgtaaaaattcggtatgccacacactgtaccgtccggttccacaacatactcattgttcaatgtgtgaactggtttatcgtggtccacttgtgaagttacaatatcttaaacatggatagttttctgtaagaatggcgataaaagtctgtacagcagtgagaatttcttctatgggctaaacttcttgtgaattgagtaaaaggaagttttgaagaaaattaatccgcactggtttacgaagctttcactatttaggagattacgtgtaATTAA--AA-GG-A-A-TGTGTT-TTCAACCCT-GAGA---CTGCT--TA-A-----TGA----TTA-AGTC-AT--TTGT---A-TTAGGC-TTC--TGTGTT--ATTCGC----TC-TA-TAAAAAATAC-GT-G-----TTT-TC---AAATC--TTAAACCAAACTGC--ACTCGGTTTGTAAACATTTCCTA-ATCA--------------ACA-----CA-----TT-----GACAATTTGATT-GACTTGACAT-T--G-TG-TTA--AA----------A-AAA--AAAAAAAATAA-ACGCCGAT-AGACACG---TTTTAATCGGAA-TT-GAGTCAG-GTG-AC-TCAT--GCCTTCGGAGAAGAAT-AGAAG-TAGTTTTCGTTTAC--CTGACACACTTGTCAAAAAG-----GAGAC-TTTC---AT-----CCTG-ATGT---------AT--TGTTTGTAAT-TGT-G-A-AGGGTTT----CATG-AAACC-TCAGA-CTC-ATATAATTATA--GAT-A---CAG-TATAAA---GAAATATTAA---T-CA-GTTGGTTTATGT-A--GT---GTAAAACAGAT---ATAA---TTTTTATTATGGCAT-TA-CGAAAA---TT---T--------------A-C-AGTACTAC-A-----TCTCTA----A--------GAC--CA-AT-G-T-ACTT-------C-A--A--TTTTATACA-TGATAATTTAggtgcgttcat
gi|4 : aagtA-AG-A-A-TGTTTT-CA-ATTCCTTGAGA--ACTGCT-ATA-A-----GCA----TTA-AAGC-AT--T-GT---A-T---GC-TTC--TGT--TTTAT---C----TCTT--TAAAAGA-ATATT-G------GT-TC---AAATC--T-AAACAAAGCACTCGGTTT-----GTAAACATTCCT-AGATCAC-------------ACA-----CA-----T-----------------T-GACTCCA-ATTTATGATG-CTG--A-CATGCAAAAAA-ATAAATAAAATTG-AA-A-ACTGATATGACA-C---TTT--ATCG--A-CT-GAGTCAG-GTG-AT-TCAG--GCTC-TGGAGAAGAAT-AGAG--TAGTATT----TACGACC-A-AC---TTTCAGA-----AAGGAGAC-TTTC---AT--T-TCCTG-ATG----------AA-TTGTGG-TAAT-TGT-G-A-A-AGTTT----CATG---ACCTTCAGA-CTC-A---GATGATA--GATAC---CAGTTT-AAA---G-AATATTAA---T-CA-G--------TGT----AA---G--AACAAA-T---AT-A---TTTTTATTAT-GCAT-TA-CG--AA---TT---TAGC------TCTAGA-C-AATG-TAC-T-----TC---A----A--TGATAATAT--CA-ATCG-T-A--T-------G-A--A--TT---TACA-TGGCAATAcatagaacatcgtaaacaaaccatcatagcaatagtagtattcgatatgacaccatcctcataactatactgtgtctccagcaatatgttgtttaggtttaggaatttcacttatcaatactatgtccctccgtatttgccagtctgtcgctatatgtgctgcaattaacacccctgtataaaaatggtctctgaacgtgcacgtcggattccacaacattctctgtccaatgcacatgcgttacacgctgcgcgcgtcccatcttgtgaaggacaatacattctttgataccattagatagtctatttgctatagaaatctgtgccttcagaatgcttcttgtcaagtcatggtacaattggaggacgaattccttgtaatgggactggaaaagtgactccacaaatgcactcataacg
gi|16 : agtattag-AG-A-A-TATTTT-CA-ATCCCT-AAAA--ACTGCC-CTA-T-----TGAAATATCATGGTA-AT--T-TT---ACTT--G---TG--TGT--T--AT---A----TCTTACCATGAAA-AT-GT-GCAT-GTTT-TC---AGATT--C-AAACATAGCGCTTTATTTG-GTCGTAAACATTCCT-A-ATTA----CACTCT-TCCACA-----CA-----TGATAA--ATCAC---AGT-GAC---ATTTCT--GGTG-CTG---ACATG------gttttttgaagttatctctatgaaccacagtcctcataactaatactgtgtctccaagcatatatgttgttaatgtttaaggatttcagctttcatgtcctcagatattgcagtgatcgactattggcaaacaccccttgaaaaattggttgcaactttgcacgtccggttgccccacaatcattcttcttgtcaatgtgacccacttggttacacgggttccacttgtgaagtaagcaatatctgggagacaagataggttttttgtaaaactttgcgtttagaatgtcagcagttagaatctctttaagggggatgatttcttgtaatggatataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaaa
gi|5 : aaagtattggT-CA-ATCCCT-GGAA--TCTATC-CTA-TACATGTGAAT--TTA-AGTC-ATG-T-GT---A-TT--TTTCTG--TGT--T--AT---CACTCTTATA-TAA-AAA-AT-TT-G-----TGT-TCTATAAATC--TTAAACA-----AGCAACTCC-GTTGTAAAC-CTCCT-A-ATAAC----A---A-CAGACATCTTTCAATGTTTGAA--------T---GCT-GAC---A----T--GCC--CAGGAAAAATA------A-ATA---ACAA---TAA-ATGCTGAT-AGACA-C---TTT--ATCG--A-CTCGAGTCAG--T--ACTTCAGGGCTGCATTAAGAGAGAT-AGAGT--ATTTTT----TAC--TG-A-ATACATGTCAAAAG------GAGAT--TTC----T--T-TCC-A-ATGATTTGTTGATAA-ATGTTCGTAAT-TGTGA-A-AAGGTTC----GATG-AAACC-TCAGA-CTC------ATGATA--GAT-A---CAG-TT-AAA---G-AATATTAC---TGCA-G--------TGTCACCAACACG--AAATA--T---AT-----TCTCTATAT--GCAT-TA-CGAAAA---TA---TATCTTCTCACGT-AT-C-AATT-TGCTAACCCTCC---A----A--T-----AAT--TC-AT-G-T-A----------T-A--A--GT---TACA-TGGCAATGTc
gi|18 : aagctattaacagaagtgttaT-GAGA--ACTGCT-ATA-A-----TGA----TTA-AGTC-AT--T-GT---A-TT--GC-TTCTGTGT--T--AT---C----TCTTA-TAAAAAT-AT-AT------GTGT-TC---AAATC--T-AAACAAAGCACTCGG-----TTTGTAAACATTCCT-A-ATCACACACATTGA-CAtgtcgagagtattcgtatgacatcagtcctcataactatactggtctcaagctatatgttgtcatgtttaagatgctactttcaggccctatgcagtgatcactattgctgcaaacaccccttgaaaaatgggcaacttgcacgtccggtccacaacattcgttgatacaatgtgccactatggttacatcggtcccacttggtgagtaacaattaatctgacacatagata
gi|11 : --ATCG--A-CT-GGGTCAG-GTG-AAATCAA--CCACGTGGAGAAGATTCAAAAT--AGTTTT-----AC--CC-ACACATGTGTCAAAAAAT-AAAGAGTC-ACTC---AT--A-TCCTT-AT-C---------AA-CTGCTG-TAAT-TGT-G-A-ATTATTT----CATG-AAACC-TCAGA-CTC-A---GCTGAAA--GAT-TAAAAAA-AA-AAA---G-AATTTTCA---T-CA-A--------TGT-A--AA---C--AAATAA-T---AT-A---TCTTTATTTT-GCAT-TA-CGAAAA---TT---TGTC------TGTAGA-T-CATA-TAC-A-----TC---AATT-A--T-----TAT--CA-AT-G-G-A----------T-A--A--TT---CACA-TGGCAAAATattttgatgctgacat
gi|8 : CAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-ATGA---------AA--TGCTT-TAAT-TGT-A-A-AGGGTTT----CATG-AAACC-TCAGA-CTC-G---GATGTTA--GCT-T---CAG-GA-AAA---G-ACTTTTAA---T-CA-G--------TGT-A--AA---G--AAATAG-T---AT-A---TTTTTATTTT-GCCT-TA-CGAAAA---TT---TATC------CGTAGA-C-AGTA-TAC-A-----TC---A----A--T-----TAT--CA-AT-GCT-A--T-------TCA--ATTTT---TACA-TGGCA--ATATTATACATCAATTT-TTATC-AATA-TATGAT---TTACATGGTAATATtgaagtattcgcctgacacagtcctcttaactatactgtatctccaaacgtatgtgttttatgttgtggatttcactttcctgttctctatt
gi|6 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-AAAGAGAC-ATTC---AT--T-TCCTG-ATGA---------AACCTGCTG-TAATCTAT-A-ACATGATTTTCTGCATGAAAACC-TCAGAGCTC-A---GGTCATA--GAT-T---CAA-GA-AAG---A-A--TATAA---TCCA-G--------TGT-A--AA---C--AAATAA-T---AT-A---TGCTTTTCTTAGAAT-TATGGAAAAATGTT---TG-C------TGTATA-CTCATATTAC-A-----TC---AATCTA--T-----TAT--CA-AT-G---A------------A--A--TT---TACA-TGGCAATATt
gi|21 : caactg---AT--T-TTCTA-ATGA---------A---TGCTG-CAAT-TAT-G-A-AGGCTTT----CATG-AAACC-CCAGA-CTC-T---GAGAATA--GAT-A---CCG-AA-TAA---G-GGTTTTgaagttggtcgcaattacacagtcctcttaattacactgtatctccaaacgtcatgtgttttatgttttgaatttcactttcatttcttctatgtttgcagcgcactgacttgtgcaaaacacccccttgtaaaatgggattgcaaaccgtgtacgtccgtttccacaaaccatactcttgtccaaatgtgacactggttttacgaggtctccacttgtgaagtacaatatctggcatattggatgtgggttttttgtaagacactgtgcatagacatgtcagcaggtaccccaatttaactttaatagagtgatttgtttgtaatgataaatgatcagtgaccaaaagatgtaccacaac
gi|19 : t-CTCAG---GATGATA--GAT-T---CAG-GA-AAAGCGG-A---TTCA---T-CA-G--------CGT-A--AA---C--AAATAT-T---AT-ATTGTTTTTATTCTTGAAT-TAT-GAAAA---TTG--TATC------TGTATA-C-CATA-TAC-AC----TC---A----A--T-----TAtttttttcagtgaagataag
gi|23 : A---T-CA-G--------TGT-A--AA---C--AAATAA-T---AT-A---TTTTTATTAT-GTAT-TA-CGAAAA---TT---TATC------TCTAGA-C-AATG-TAC-
gi|7 : CGAAGA---TC---TATC------C----A-C-CTTG-TAC-A-----TC---A----ATTT-----TAT--CA-AT-G-TGA------------A--A--CA---TACATTGACAAT
gi|20 : acaaatctacttgcacagcattcaaaATC------TGTATA-C-CATA-TAC-A-----TC---A----A--T-----TAT--TACAT-G-T-A--TCAATGTAT-A--A--TT---TGCA-TGGCA--ATATTATACATTCA-TTATTATC-AATG-TATAAT---TTACATGGTGAtttgaacgtatttgtcaatgaccacaatcacctgtaattactcccaaatgcagtgtgttttggatttccttgtttctttatttgcagcgatctgacttgtacaagcaaaaccgcttgtaaaaattcggtatgccacacactgtaccgtccggttccacaacatactcattgttcaatgtgtgaactggtttatcgtggtccacttgtgaagttacaatatcttaaacatggatagttttctgtaagaatggcgataaaagtctgtacagcagtgagaatttcttctatgggctaaacttcttgtgaattgagtaaaaggaagttttgaagaaaattaatccgcactggtttacgaagctttcactatttaggagattacgtgtatatcaaagtattaaagagatggtttcaatccttaagaccactgccatactgatcaagtcaatcgtaaattgcttggtgcgttcat
Alignments
lowQualScore : 1111 11111111 111111 111 111 1 11111 33333 22222222 444444444444 111 111 11 111 22222 1 2222 1111 1 1 11 11 111 1 22222 111 1111 22222222 111 1111111 11111 111111 11111 1111 33333333333333333333 111 222 1111111111 111111111111 111111 11111 22 333333333333333333333333 111 33333333 11 22 111 111 44444444444444 111 11 11 22222 22222222222222222 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 111 2222222 1 44444444444 2222 1 1 111 11 11 1 11 1 222 11 2222 1 666666666666 2 22 44444444444 2 66666666666666666666 2 55555555555555555 2 22 33 3333 2 1 2 22222 2222 2 1 3333 1 111 1111 11 1 1 1 1 111 111 1 1 111 111 11111 1 1 222 11 1 11 333333333 11 1 1 2222
lowQualScore : 6 666 99 6 99 5 1 99 3 2222 99 6 888 22222222 555555 111 6 7 99 99 111 3 6 99 6 66666 11111 6 6 44444444 6 99 000000000000 111 6 888 00 111 88888 0 1111 4444 9 0 33 8 11 8 8 2 000 6 1 3 6 6 5 00000 777 99 2222 77 5 0 00000000 1 77 77 555 5 5 4444444 00000 5 5 5 5 222222 5 33333 9999 5 5 5 5 5 55555555555555555555 222 777 333 4 66 4 777 1 4 777 4 9999 4 9999999999 4 1 888888888888 0 66 333333 0 99999 8888 5 88 55 33 5 5 3 222222222222222222222222 88888 7777 3 3 6 66666 6 44 999 3 2 3 44 1 44 66666666 3 6 3 2 3 3 0 00 33 3 3 3 3 888888 3 3 999 44 22 6 5555 7 3 222 6 999 3 222 3 44 44 00000000000000 7777 44 999999 3 44 3 44 555 3 3 77 3 55 3 6 44 3 9 44 3 44 44 000 3 0 44 00 77777 555 3 3 3 6 0 3 00 44 77777 3 88888 3 6666 3 555 555 22222 555 3 3 88 0 00000000000000000 44 1111 6 888 44 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555 555 3 55 3 6 555 2222 777 55 55 222 0000000 1 0 4 55 4 4 0 2 0 11 33333333333 1 1 8888 0 3 5 111 1 33 1 2 33 2 0 11 0 777 2 33 7 4444 1 000000000000 6 0 77 88 55555555555 2 6 6 0 11111111111111111111 6 1 0 22222222222222222 0 6 77 11 2 77 6666 0 5 0 44444 1 1 3333 0 2 4 0 6 6666 1 3 777 4444 11 0 0 3 2 1 0 0 8 8 5 888 777 0 0 777 777 88888 9 0 0 777 6 6 8 1 8 0 33 0 22 333333333 33 1 0 2 3 3 3 0 1111 1 7 0
lowQualScore : . ... .. . .. . . .. . .... .. . ... ........ ...... ... . . .. .. ... . . .. . ..... ..... . . ........ . .. ............ ... . ... .. ... ..... . .... .... . . .. . .. . . . ... . . . . . . ..... ... .. .... .. . . ........ . .. .. ... . . ....... ..... . . . . ...... . ..... .... . . . . . .................... ... ... ... . .. . ... . . ... . .... . .......... . . ............ . .. ...... . ..... .... . .. .. .. . . . ........................ ..... .... . . . ..... . .. ... . . . .. . .. ........ . . . . . . . .. .. . . . . ...... . . ... .. .. . .... . . ... . ... . ... . .. .. .............. .... .. ...... . .. . .. ... . . .. . .. . . .. . . .. . .. .. ... . . .. .. ..... ... . . . . . . .. .. ..... . ..... . .... . ... ... ..... ... . . .. . ................. .. .... . ... .. . ................................................. ... . .. . . ... .... ... .. .. ... ....... . . . .. . . . . . .. ........... . . .... . . . ... . .. . . .. . . .. . ... . .. . .... . ............ . . .. .. ........... . . . . .................... . . . ................. . . .. .. . .. .... . . . ..... . . .... . . . . . .... . . ... .... .. . . . . . . . . . . ... ... . . ... ... ..... . . . ... . . . . . . .. . .. ......... .. . . . . . . . .... . . .
lowQualScore : 7 888 22 7 22 7 7 22 2 7777 22 7 333 00000000 000000 777 7 8 22 22 777 3 7 22 7 77777 88888 7 7 22222222 7 22 888888888888 777 7 333 00 777 22222 0 2222 8888 0 0 88 0 00 0 0 5 222 7 7 3 7 7 7 00000 333 66 1111 99 7 4 77777777 7 99 99 666 7 7 0000000 77777 7 7 7 7 666666 7 99999 0000 7 7 0 0 0 11111111111111111111 222 888 333 4 11 4 000 9 4 888 4 4444 4 4444444444 4 1 000000000000 1 11 222222 1 22222 9999 0 44 44 88 0 0 3 111111111111111111111111 33333 1111 3 3 7 66666 7 66 333 3 4 3 66 0 66 22222222 3 7 3 5 1 1 4 33 99 1 1 1 1 888888 1 1 666 22 00 7 5555 7 3 555 7 222 3 555 3 77 66 88888888888888 1111 66 222222 3 66 3 22 444 1 1 33 1 77 1 2 22 1 2 22 1 22 22 000 1 8 22 44 77777 444 1 1 1 2 8 1 44 22 77777 1 66666 1 5555 1 444 000 11111 444 1 1 55 7 00000000000000000 66 5555 7 333 66 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222 888 3 11 3 7 888 4444 000 55 55 555 7777777 6 4 0 55 0 0 9 0 7 33 33333333333 0 0 3333 0 2 5 000 0 00 0 0 88 0 0 00 0 555 0 88 3 0000 5 000000000000 0 0 55 00 55555555555 5 0 0 0 55555555555555555555 0 0 0 55555555555555555 0 0 55 55 5 00 0000 0 0 0 00000 0 0 0000 0 5 0 5 0 0000 0 3 555 8888 00 0 0 2 5 0 0 0 0 0 4 000 555 0 0 555 555 88888 0 0 0 555 4 4 0 0 0 8 88 0 55 555555555 88 2 0 5 2 2 2 0 2222 0 0 7
consensus : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATAA---TGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN-AAAAAAAAAA-AA----AA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACT-----TCAAT--TANTATC---AAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG------------------------CGATA-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAGCG-ACC-G--ACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AAT---GG---TAAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--TC-CT-GGGAGGGGG----GTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCC-NTTCNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--ATTAT--ATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAGNAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACNNAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAANAGCCNATCAACAAGCNTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGNCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAA-TT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-NAT-G-AAATGCTTTAATTGTG-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAAGANTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
Reference ( family-2240 ) : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATAN---TGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-CGCTGACAT---GCC-AGGAAAAAAA-AA----AA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCAGG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-NN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACT-----TCAAT--TAATATC---AAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG------------------------CAATA-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAGTG-ACC-G--ACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AAT---GG---NAAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAATG-TA--C-C-ACAACGCGTCCATGGGGTGATC-CTCNNGNGNGGG----GTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TNC-TTTCNATCCCTGAGA--ACTGCC-ATA-NTGA-TCAAGTC---ATTGT--ATTGCCTCTGTTATCTCNTA-TAAAAA----AATNTG--GTGT-TCAAAT--CTAAACAAAGCACTCGA-T-TTTTTGTAAACATTCCTAATCA-CAT----T-ACA-ACACATNA--AAGACAATANT-GAC-TACATTGNTG-CTGAACGTGA-ATATAAAA--GTAAACGCCGATNGACA---NTTTATCG-ACTGAGTCAG-GTG-AC-TCAGCCNCNTGGAGAAGAAT-AGAGT-TAGTTTTTACCCACACACGTGTCAAAAA-T--AANGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-NAT-G-AAATGCTNTAATTGTG-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGATTCAGGAAAAGAATNTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-NT-GCAT-TA-CGAAAATT---TATCCGTAGA-CNATATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATNATTTACATGGTGATAT
gi|1 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTCCAATCCCT-GAGAACTG--CTATAA---TGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TTGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GT-----AAAAAAA-AA----AA-T--AAA-GCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGGTTGACTTCATG-CT-CTTGGAGAAGAAAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTT-GTAAT-TGTGGAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-TATATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCTAAGA---C--A-ATGT--ACT-----TC--T--TAATATC---AAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG------------------------CAATA-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CTTACAT--AACTC-TATTACTG-TAGT-CTTCAAGCAT-A-TATGTTGAT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-CCTC---TA--TTTGCAAGTGTATC-G--ACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGCAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC-T--TG-T-C--TAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-AC-CAAT--A-----TT-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-GC-------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTC-CTTGTAAAT---GG---GAAA---GA--A--AG---TGA--C---CACAAAATG-CA--C-C-ATAACGTGTTCATGGGG---------GGGGGGGGG----GGAGGTATCAACACTA-TAAAGA-A-TCC-GTTCTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---ATTAT--ATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAA----AACTTGCAGTAT-TCAAAT--CTAAACATAACTATCTATT-TTTTTGTAAGCATTCCCAATCACCAT----TCACATACACATGAAGAGGACAATAGT-GAC-AAT-CTGCTG-CTGAACATGA-ATATAGAAATGTAAA-GCCTATCAACA---ATTTATCG-ACTGCGTCAG-GTG-ACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCAGAGT-TAGTTTTTACCTACACATGTGTCAAAAATT--AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-CAT-GAAAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATGTAAACCTCAGACTC-GGATG-GTAGCTTCAGGAAAAGACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TTAGCCT-TATCGAAAATT---TATCCGTAAA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACAGTGGCAATATATTATACATCAA-TTTTATC-AATAT----ATGA-TTACATGGTAATAT
gi|10 : AT-GG------------------------TGGTA-----TTA----AA-G-T-ATT-A---G-T--ATGA--CA-CGGTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCAGTCG-AAC-T--ACTTT-TGT--TGC-A---ACACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GGTTTTCTATTTTT--GC----AA--CGTG---TGTAC-GGTCC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATT-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CATC-TG-GTTACA--CG--G-----GTCCTC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-AC-CAAT--A-----T--TG---A-A-CACATA-CA---AAT---AGCTTTAC------T-AGA-A--TT
gi|11 : A-TCG--ACT-GGGTCAGG-TGAAATCAAC-CA-CGTGGAGAAG-ATTCAAA-ATAGT-TTT-----AC-C-CACACATGTGTCAAAAAATAAAGAGTCACT---C--------ATATCCT--TATCAA--CTGCT-GTAAT-TGT-GAATTA----TTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGCTGA--A---AG-ATTAAA-AAA-AA-AAAGAA-T-TTTCA-T-C-AAT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--C-TTTA-T-TTTG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------GTC-TGT-AGA---T--C-ATAT--ACA-----TCAAT--TATTATC---AAT-GG-AT-AA--T-TCACAT-GG------------------------CAAAA-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-C--CTG-A-CA-CAGTC-CT--CTT--AA--C-TA-TACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTG-TTTT-ATGTTG-TG-G-ATTTCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTtctttatatggagaccattctgttacatgatttatcggaactatgaataaacataccaaaatgtcatctaactcatatttaggg
gi|12 : T-GG------------------------TGGTA-----TTA----AA-G-TTATTAC---GGT--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-TTATATTA--G-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTC-AGTG-ACT-G--ACTTT-TG---TGC-A---A-A-A----CCCT-TG-TAAAAAT--GG--------------GC----AA--C--G---TGTAC-G--TCTTGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AG-----TTTA---T-AGA-------------------------------AATT--TC-TTT-----------------------------------------------AA-T---------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AAT---GATT-TATC---GG--A--AA---TGA-------ATAAAACATTA--C-C-AAAA
gi|13 : T-GG------------------------TGGTA-----TTA----AA-G-T-ATT-TACGG-T--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TAAT-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG---ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCA-GTG-ACT-G--ACT-T-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TGTTAAAAAT---G-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCACAA-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-TTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AGTTT-------------------------------------A--T--AGAAT---TC-TTT-----------------------------------------------AA-TG--------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AAT---Gatgtcgatctaacttcattattaggga
gi|14 : GT-A-TATGTTTT--GTGATT-TG-G-ATTTCA-CTT-TT------A-TGT-TCTC---CA--TTTGCA-GTG-ACT-G--ACTTT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-T--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-ATT-CA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CATT--A-----TC-TT---A-A-T----G-TG---G---------CTATTTG---T-AGA-A--CAGTGCATAGAACAGTGC-A--T--AGAACG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA--------------------------------------G---A------ATTT-CTT-T-AAT---GG---attta
gi|15 : actngtttatacgGA--TT---TCAC-TTA--CA-T-AC-TC-T--CG-T-C--AAT-GTG--A--CACT--G-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CGG--TA-G-G--------TAGAATTTCGTC--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AAT---GA---TAAA---GG--C--AG---TGA--C---TAAAAAATA-TA--C-C-ACAAa
gi|16 : gAAAG-TATTG-G-A--GAA-TAT--TTTCAATCCCT-AAAAACTG--CCCTAT---TGA----AATATCAT-G-GTAATTTT--ACTTGTGTGTTAT---A--TCTTACCATG-AAAATGTGCATGTTTT--C---AGATTC-AAAC-ATA--GCG-CTTTATTTGGTCG-T--AAACATT-CCTA-ATTACACTCTTCCA-CA--CATGATAAATCACAGTGAC---ATT-TC---TGG-TGCTGACAT---GCagtttgttaaagctttcatctttaggga
gi|17 : ACTTC----CT-CTTTGACAACTAAT-AGA-TTAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTG
gi|17 : ---AGTTTT--TTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-G--T--AGAATG--TC-------AG--CA-G-T--------TAGAATCTCTTT--------------AA-T---------GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AAT---GA---TAAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-Atttttgtaaaactttgcgtagaatgtcagcagttagaatctctttaatggggatgatttcttgtaatgataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaa
gi|18 : cactgtgtcgagtaaaactaatctattagttgtcaaagaggaT-GAGAACTG--CTATAA---TGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTTTGT--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---aa
gi|19 : CTCAGGATG-ATAGATTCAGGAAAAGCGGATTCA---TCA-GCGT-AAACAAATATT---ATATTGTTTTTATTCTT-GAAT-TA-TGAAAATTG--TATCTGTATA-CCATATACACTCAATTA
gi|2 : TAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTGTCAAAAAG----AAG--ACTATCC--------ATTTTCTCTGATGAA--TTGG--GTA---TGT-ACA--A-CGTTT-C---ATCGATA-AC-TCAGA-C-CAGATGAATT---AGTAC---C-CAG-T--AAAGAA-TTATTAAAT-C-AGTGC------------T-A--AAACAT---AAAT----TA-T--A-TTTACT-TATG-CATA---TCGAACAA----TTGT----------ATC-TCT-AAT---CT-A-ATGTGTACT-----TCAAT----ATATCCTCAAT-GTTATTAACTT-T-ACAT-GG------------------------CATCA-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGGA-CA-CA-TC-CT--CATTTAA--C-TAT-ACTGATG-TTCTC--ATCAT-A-TGT-----T-ATGTTT-AGCG-ATTTCA-TTT-TC------ACTGT-CCTC---TA--TT-GCA--TG-ATC-A--ACTAT-TG---TGCTAC--A-ACAA--CCTCT-T--TAAAAAT--GGGTCGAATA---T--GC----CA--C--G---CTCAC----TC-CAGCGTT---CCAC-A-C--CA-TTCC-TC-TACTG-T-C--AATTGTG--A--CACC-TG---TACATCCG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TCGAAGT----CAAT--A-----TA-TT---G-A-C----A-TT---AAC---A--TATATTTG---T-AGA-ATACTGTG------------C-AG-T--AGAAGT--TC-TGTACCAG--CA-T-C--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACA-GT---CCTGG-AAT---GG---GAAAAAAGA--A--AGCT-TGA--CACCCACAAGG-G-CA--C-CCATAATACGTCCATGAAGTGATC-CTCGGGAGAGGG----GTGGGTATCAA-AC-A-TAAAGA-AGTCCTTTTCGACTTCTGAAA--ACTACCTATACTTGACTCAAGTCATTATTAT--ATTGCCTCTG-TATCTC--A-TAGTAATCTTAGCATT--GTATGTCAAATTCTTAAACTAA-CATTCTA-TCTTTTTTTAAGCATTCCCAATCA-CATTAAGT-ATA-ACAC-TGAG-AGGACAATAGTCGACGCATATT-CTGTCT---TGCGACATATAGAA--GTAATAGCCGATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTATAC-GCAGCCCCTTGGAGAAGGGT-GAAGTATATTCTTAACTAACACATGTGTCAAAAA-TTAAATGAGACAACTCTCTATAGTATCCTCAATAG-AAAT-CTTTAATTGCGTAAGGGTTTCAAT-AAACATCAGACTC-CGATGTATTGCTTCAGGAAAAGA--CTTAACTCTCAGGTGTAAAAGAAATAGTTAAGTA---TTTTCAT---T-GCCTGTA-CGAAAACTTACTATC--TAAATCGGTATACA-TC-ATTATTCTA-AT--TGT-------T-AA--TATTTA-TCG-AATCAATTATACAGCAATTTTTATCTAATATTATCATCACTTACATGG
gi|20 : atATCTGTATA-CCATATACA-TCAATTAT--TACATG-TATCAATGTAT-AA--TTTGCA-TGGCAATAT--TATACATTCATTATTATC-AATGT----ATAATTTACATGGTGAattatttga
gi|21 : ---AT--T-TTCT-AAT-G-AA-TGCTGCAATTATG-AAGGCTTTCATG-AAACCCCAGACTC-TGAGA-ATAGATACCGAATAAGGGTTTT
gi|23 : tA-T-C-AGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--T-TTTA-T-TATG-TATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACtttttttcagtgaagataag
gi|24 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCTT-GAGAA
gi|3 : cAAG-TATTA-A-AAGGAA-TGTGTTTTCAA-CCCT-GAGA-CTG--CT-TAA---TGA--TTAA-GTCAT-TTGTA---TTAGGCTTCTGTGTTATTCGC--TCT----ATA-AAAA-AT--ACGTGTTTTC---AAATCTTAAACCAAACTGCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATTTCCTA-ATCA---------A-CA--CAT------------TGAC---AAT-TTGATTGA-C-TTGACATTGTGTT-AAAAAAAAAA-AA----AAAT--AAACGCCGATA-GACACGTTTTAATCGGAATT-GAGTCAGG-TGACT-CATG-CC-TTCGGAGAAG-AAT-AGAAGTAGT-TTTCGTTTACCT-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TTC--------AT--CCT--GATGTA--TTGTTTGTAAT-TGT-GAA--G-GGTTT-C---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCATATAA--TTATAG-AT---A-CAG-TATAAAGAAAT-ATTAA-T-C-AGTTGGTTTATGTAGTGT-A--AAA--C---AGATA---TAAT--T-TTTA-T-TATGGCATT---ACGAA-AA----TT-TACAGTACTACATC-TCTAAGAC--C--A-ATGT--ACT-----TCAAT--T-TTATA---CAT-G--AT-AAT-T-T-ACAT-AGAACATCGTAAACAAACCATCATAGCAATA-----GT------A-G-T-ATT-C---GAT--ATG-A-CA-CCATC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG-TG-T-CTCCAGCAAT-A-TGT-TGTTT-AGGTTT-AG-GAATTTCA-CTTATCAATACTA-TGTCCCTCCG-TA--TTTGCCAGT---CT-GTCGCTATATGTGCTGC-AATTA-ACA---CCCCTGTA-TAAAAAT--GG-----------T---CTCTGAA--C--G---TGCAC-G--TC-GGA--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC----TG-TCC--AAT-G-------CACA-TGCGTTACA--CGCTGCGCGCG---TC-CCATCTT-G-TGAAGG--A--CAAT--ACATTCTT-TG---ATACC----ATTA---GAT---AG-TCTATTTGCTAT-AGA-AATCTGTG------------C-C--TTCAGAATGCTTCTTGT--CAAGTCATG-G--------TA---------C--------------AATT---------GG---AGGACGAATTC-CTTGT-AAT---GG---GACT---GGAAA--AG---TGACTC---CAC-AAATG-CA--CTC-ATAACG
gi|4 : AG-TATTAGA-A--GAA-TGT--TTTCAATTCCTTGAGAACTG--CTATAA---GCA--TTAA-AGCAT-T-GTA---T---GCTTCTGTTTTAT---C--TCTT----TA-AAAGAAT--ATTGGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATT-CCTAGATCA--------CA-CA--CAT------------TGACTCCAAT-TTA--TGA-TGCTGACAT---GCA-AAAAAATAAATAA----AA-TTGAAA-ACTGATATGACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGA-TTCAGG-CT-CT-GGAGAAG-AAT-AGA-GTAGTATTT-----AC---GACCAACTT-TCAGAAAG----GAG--ACT-TTC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTG-GTAAT-TGT-GAA--A-G--TTTC---AT-G--A-CCTTCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---ACCAGTTT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AG-TG------------T-AAGAA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACG---AA----TT-T----------AGC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACT-----TCAATGATAATATC---AATCGT-AT-GAATT-T-ACAT-GG------------------------CAATAGTTTTTTG----AA-GTT-ATC-T---C-T--ATGAACCA-CAGTC-CT--CAT--AA--C-TAATACTG-TG-T-CTCCAAGCAT-A-TATGTTGTTAATGTTTAAG-G-ATTTCAGCTT-TC------A-TGT-CCTCAGATA---TTGC-AGTG-ATC-G--ACTAT-TG----GC-A---A-ACA---CCCCT-TG-AAAAATT--GGT----------T--GC----AA--CT-T---TGCAC-G--TC-CGG--TTGCCCCAC-A-AT-CA-T-TCTTC-T--TG-T-C--AAT-GTG--ACCCACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TT-CCA-CTT-G-TGAA-GT-AAGCAAT--A-----TC-TGGGAG-A-C----A--A---GAT---AGGTTT-TTTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-GTTT--AGAA-------TGT--CAG--CA-G-T--------TA---------G--------------AA-TCTCTTTAAGGG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AAT---GGATATAAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-AAAA
gi|5 : AAGCTATTA-ACA--GAAGTGT--TATCAATCCCT-GGAATCTATCCTATACATGTGAATTTAA-GTCATGT-GTA---TT---TTTCTGTGTTAT---CACTCTT---ATATAAAAAAT--TTGTGTT--CTATAAATCTTAAAC-AA---GCAAC-----TCCGTTG-T--AAAC-CT-CCTA-ATAA--------CAACAGACATC-----------TTTC---AATGTT---TGAATGCTGACAT---GCCCAGGAAAAATA-AATAACAA-T--AAATGCTGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACTCGAGTCAG--T-ACTTCAGGGCTGCATTAAGAGA-GAT-AGA-GTATT-TTTT----AC-T-GA-ATACATGTCAAAA-G----GAG--ATT-TCTTTCCAATGATTTGTT--GATAAA--T-GTTCGTAAT-TGT-GAA--A-AGGTTCG---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTC--ATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAC-TGC-AG-TG------------TCACCAA---CACGAAATA---TA-T--TCTCTA---TATG-CATT---ACGAA-AA----TA-T----------ATCTTCTCACGTATC--A-ATTT--GCTAACCCTCCAA--TAAT-TC----AT-GT-AT-AAG-T-T-ACAT-GG------------------------CAATG-----TTGTCGAGA-G-T-ATT-C---G-T--ATG-A-CATCAGTC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG--G-T-CT-CAAGC-T-A-TATGTTGTC-ATGTTT-AA-G-ATGCTA-CTT-TC------A-GG---CCC---TA----TGC-AGTG-ATC----ACTAT-TGC--TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GG--------------GC----AA--C--T---TGCAC-G--TC-CGG---T---CCAC-A-A--CA-T----TCGT--TGATAC--AAT-GTG--C--CACTATG-GTTACA--TC--G-----G---TC-CCA-CTTGG-TGA--GTAA--CAATTAA-----TC-TG---ACA-C----A-TA---GAT---A
gi|6 : AAA----GAG--ACA-TTC--------ATTTCCT--GATGAAACCTGCT-GTAATCTAT-AAC--ATGATTTTCTGCAT-GAAAACC-TCAGAGCTCAGGTCA--T---AG-AT---T-CA--AG-AAAGAA-T-AT-AA-T-CCAGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-TGCT-TTTC-T-TA-G-AATT---ATGGA-AAAATGTT-T----------G-C-TGT-ATA---CTCATAT-T--ACA-----TCAATC-TATTATC---AAT-GA-A--AT--T-T-ACAT-GG------------------------CAATA-----T-G----AA-G-TTGGT-C---G-C--AATTA-CA-CAGTC-CT--CTT--AA-T--TAC-ACTG-TA-T-CTCCAAACGTCA-TGTG-TTTT-ATGTTT-TG-A-ATTTCA-CTT-TC------A-TTT-CTTC---TATGTTTGC-AGCGCACT-G--AC--T-TG---TGCAA---A-ACAC--CCCCT-TG-T-AAAAT--GGGAT--------T--GC----AAACC--G---TGTAC-G--TC-CGT--TT---CCAC-A-AACCA-T-AC-TC-T--TG-T-CCAAAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CGA-G-----G---TCTCCA-CTT-G-TGAA-GT-A--CAAT--A-----TC-TG-----G-C----A-TATTGGATGTGGGTTT--TTTG---TAAGACA--CTGTG------------C-A--T--AGA------CATGT--CAG--CA-G-G--------TA---------CCCCAATTTAACTTTAA-T---------AG---A-G-TG-ATTTGTTTGT-AAT---GA---TAAA---TG--ATCAG---TGA--C---CAAAAGATG-TA--C-C-ACAAC
gi|7 : caactgtA---C---AAATC---TA-C--T-TGCA-C--A-G-CATTCAAACGAA-GA----TC-T----------ATC-C-----A---C--C-TTGT--ACA-----TCAAT--TT-TATC---AAT-GT-GA-AA--CAT-ACATTGA------------------------CAATT-----TTG----AACG-T-ATT-T---G-TCAATGAC-CA-CAATCACC--TGT--AA-T-----TACT--------CCCAAATGC-AGTGTGTTTT----------G-G-ATTTC--CTT---------G-T-T-TCTT---TA--TTTGCA-GCG-ATCTG--ACT---TG---TAC-A---A-GCAAAACCGCT-TG-TAAAAATTCGG-----------TATGC----CA--C--ACACTGTACCG--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TCAT--TG-TTC--AAT-GTGTGA---ACT-GG-TTTAT---CGT-G-----G---TC-C-A-CTT-G-TGAAGTT-A--CAAT--A-----TCTTA---A-A-C----A-TG---GAT---AGTTT--TCTG---T-AAG-A--ATG-G------------CGA--T--AAAA-G--TC-TGTA-CAG--CA-GTGAGAATTTCTT---------C--------------TA-T---------GGGCTA-AAC----TT-CTTGTGAATTGAGT---AAAA---GG--A--AGTTTTGA-------AGAAAAT--TAATC-C-GCACTG-GTTTACGAAGCTTTCACTATTTAGGAGATTACGTGTATATCAA-AGTATTAAAGAGA-TGG-TTTCAATCCTTAAGACCACTGCC-ATA-CTGA-TCAAGTCA--ATCGTAAATTGCTT
gi|8 : GGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCC-GTTCTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---ATTAT--ATTGCCTCTGTTATCTCATggtgcgttcat
gi|8 : CAAAAA-TT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-CAT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-TTAGCTTCAGGAAAAGACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTAGA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATGCTAT-------TCAATTTTTACA-TGGCA--ATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|9 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAT-AG------------------------TAATG-----TTA----AA-A-T-ATT-T---G-C--ATGA--CA-CATTC-CT--CTT--AA--C-TAT-ACTG-TA-T-CTCTATATGT-A-TGTGTTTTT--TGTTG-TG-G-ATTCCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTTGCA-GCG-ACT-G--ACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CAG--TA-G-G--------TAGAATTTATTT--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AAT---GA---TAAT---GG--A--AG---TGA--C---TAAAAAATG-TA--C-C-ACAAt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AATGGGGCTGTGCGGGGTAGCGCGTATGCCCAACCCTATTTAACAGTAATCCGTCTATTCTGAGAAC
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111111 111 111 1 11111 33333 22222222 444444444444 111 111 111 33333 111 1111 1 1 11 11 1 22222 111 1111 11111111 11 1111111 11111 1111 33333333333333333333 111 222 1111111111 111111111111 111111 11 22 22222222222222222222222222222222 111 33333333 11 22 111 111 44444444444444 111 11 11 22222 22222222222222222 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 111 2222222 1 999999999999999 11 1 111 1 11 1 1 1 222 11 44444444 111 1 11 22 33 1 333333 1 1 1 1 11 1111 1 222 1 11 2 222 1 1 1 2 1 1 1 1 222222222 11 111 11 1 1 11 111 111 1 1 111 111 111 1 1 1 222 11 1 11 333333333 11 1 1 2222
lowQualScore : 6 666 99 6 99 5 1 99 3 111 99 6 888 22222222 555555 111 6 7 99 99 111 3 6 99 6 66666 11111 6 6 44444444 6 99 000000000000 111 6 888 6 111 22222 111 4444 9 0 33 8 11 8 8 2 888 6 1 3 6 6 5 00000 777 99 2222 77 5 0 88888888 0 66 66 3 00 5 5 5555555 5 888 5 5 5 5 0 999999 5 11111 9999 5 5 5 5 5 55555555555555555555 222 777 333 4 66 4 777 1 4 777 4 9999 4 9999999999 4 1 888888888888 0 66 333333 0 66 44 0 0 5 88 55 33 5 5 3 55555555555555555555555555555555 7777 3 3 6 66666 6 44 999 3 2 3 44 1 44 66666666 3 6 3 2 3 3 0 00 33 3 3 3 3 888888 3 3 999 44 22 3 6 0 3 7 3 222 6 999 3 222 3 44 44 00000000000000 7777 44 999999 3 44 3 44 555 3 3 77 3 55 3 6 44 3 9 44 3 44 44 000 3 0 44 00 77777 555 3 3 3 6 0 3 00 44 77777 3 88888 3 6666 3 555 555 22222 555 3 3 88 0 00000000000000000 44 1111 6 888 44 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555 555 3 55 3 3 44 2222222 777 55 55 222 0000000 1 666 55 4 4 0 2 0 222222222222222 44 0 3 66 111 1 0 1 33 0 0 0 999 33 7 99999999 1 999 5 88 11 22 00 1 5 000000 5 5 5 5 66 9999 5 111 5 88 0 1 555 5 5 5 0 5 5 1 1 1 3 3 888888888 44 666 6 44 3 0 11 333 777 0 0 777 777 000 0 0 0 777 6 1 8 1 8 0 33 0 22 333333333 33 1 0 2 3 3 3 0 1111 0 7
lowQualScore : . ... .. . .. . . .. . ... .. . ... ........ ...... ... . . .. .. ... . . .. . ..... ..... . . ........ . .. ............ ... . ... . ... ..... ... .... . . .. . .. . . . ... . . . . . . ..... ... .. .... .. . . ........ . .. .. . .. . . ....... . ... . . . . . ...... . ..... .... . . . . . .................... ... ... ... . .. . ... . . ... . .... . .......... . . ............ . .. ...... . .. .. . . . .. .. .. . . . ................................ .... . . . ..... . .. ... . . . .. . .. ........ . . . . . . . .. .. . . . . ...... . . ... .. .. . . . . . . ... . ... . ... . .. .. .............. .... .. ...... . .. . .. ... . . .. . .. . . .. . . .. . .. .. ... . . .. .. ..... ... . . . . . . .. .. ..... . ..... . .... . ... ... ..... ... . . .. . ................. .. .... . ... .. . ................................................. ... . .. . . .. ....... ... .. .. ... ....... . ... .. . . . . . ............... .. . . .. ... . . . .. . . . ... .. . ........ . ... . .. .. .. .. . . ...... . . . . .. .... . ... . .. . . ... . . . . . . . . . . . ......... .. ... . .. . . .. ... ... . . ... ... ... . . . ... . . . . . . .. . .. ......... .. . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 7 888 22 7 22 7 7 22 2 777 22 7 333 00000000 000000 777 7 8 22 22 777 3 7 22 7 77777 88888 7 7 22222222 7 22 888888888888 777 7 333 7 777 00000 000 8888 0 0 88 0 00 0 0 5 333 7 7 3 7 7 7 00000 333 66 1111 99 7 4 11111111 4 99 99 2 11 0 0 5555555 1 888 0 0 0 0 4 999999 0 00000 7777 7 7 0 0 0 11111111111111111111 222 888 333 4 11 4 000 9 4 888 4 4444 4 4444444444 4 1 000000000000 1 11 222222 1 99 22 1 1 0 44 44 88 0 0 3 11111111111111111111111111111111 1111 3 3 7 66666 7 66 333 3 4 3 66 0 66 22222222 3 7 3 5 1 1 4 33 99 1 1 1 1 888888 1 1 666 22 00 3 7 1 3 7 3 555 7 222 3 555 3 77 66 88888888888888 1111 66 222222 3 66 3 22 444 1 1 33 1 77 1 2 22 1 2 22 1 22 22 000 1 8 22 44 77777 444 1 1 1 2 8 1 44 22 77777 1 66666 1 5555 1 444 000 11111 444 1 1 55 7 00000000000000000 66 5555 7 333 66 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222 888 3 11 3 3 66 9999999 000 55 55 555 7777777 6 888 55 0 0 9 0 7 333333333333333 00 0 2 55 000 0 0 0 88 0 0 0 222 88 3 00000000 0 000 0 00 55 00 55 0 0 000000 5 5 0 0 00 5555 5 000 0 55 5 0 555 5 5 5 5 0 5 0 0 0 3 3 000000000 33 777 7 00 3 0 22 888 555 0 0 555 555 222 0 0 0 555 4 0 0 0 0 8 88 0 55 555555555 88 2 0 5 2 2 2 0 2222 2 0
consensus : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACT-----TCAAT--TATTATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACNTAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-CAT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAAGACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
Reference ( family-2240 ) : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACT-----TCAAT--TANTATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGG-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAGNAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACNNAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAANAGCCNATCAACAAGCNTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGNCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-NAT-G-AAATGCTTTAATTGTG-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAAGANTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
gi|1 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTCCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TTGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GT--------AAAAAA-A-AAAA-T--AAA-GCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGGTTGACTTCATG-CT-CTTGGAGAAGAAAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTT-GTAAT-TGTGGAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-TATATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCTAAGA---C--A-ATGT--ACT-----TC--T--TAATATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CTTACAT--AACTC-TATTACTG-TAGT-CTTCAAGCAT-A-TATGTTGAT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-CCTC---TA--TTTGCAAG-TGTATC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGCAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC-T--TG-T-C--TAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-AC-CAAT--A-----TT-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-GC-------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTC-CTTGTAAA--TG-G---G-AAA---GA--A--AG---TGA--C---CACAAAATG-CA--C-C-ATAACGTGTTCATGGGG---------------GGGGGG-GGGGGAGGTATCAACACTA-TAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAA----AACTTGCAGTAT-TCAAAT--CTAAACATAACTATCTATT-TTTTTGTAAGCATTCCCAATCACCAT----TCACATACACATGAAGAGGACAATAGT-GAC-AAT-CTGCTG-CTGAACATGA-ATATAGAAATGTAA-AGCCTATCAACAA---TTTATCG-ACTGCGTCAG-GTG-ACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCAGAGT-TAGTTTTTACCTACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-CAT-GAAAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATGTAAACCTCAGACTC-GGATG-GTAGCTTCAGGAAAAGACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TTAGCCT-TATCGAAAATT---TATCCGTAAA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACAGTGGCAATATATTATACATCAA-TTTTATC-AATAT----ATGA-TTACATGGTAATAT
gi|10 : AT-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-A---G-T--ATGA--CA-CGGTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCAGT-CG-AAC-TACTTT-TGT--TGC-A---ACACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GGTTTTCTATTTTT--GC----AA--CGTG---TGTAC-GGTCC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATT-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CATC-TG-GTTACA--CG--G-----GTCCTC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-AC-CAAT--A-----T--TG---A-A-CACATA-CA---AAT---AGCTTTAC------T-AGA-A--TT
gi|11 : A-TCG--ACT-GGGTCAGG-TGAAATCAAC-CA-CGTGGAGAAG-ATTCAAA-ATAGT-TTT-----AC-C-CACACATGTGTCAAAAAATAAAGAGTCACT---C--------ATATCCT--TATCAA--CTGCT-GTAAT-TGT-GAATTA----TTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGCTGA--A---AG-ATTAAA-AAA-AA-AAAGAA-T-TTTCA-T-C-AAT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--C-TTTA-T-TTTG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------GTC-TGT-AGA---T--C-ATAT--ACA-----TCAAT--TATTATCAAT-GG-AT-AA--T-TCACAT-GG-----CA----------AA-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-C--CTG-A-CA-CAGTC-CT--CTT--AA--C-TA-TACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTG-TTTT-ATGTTG-TG-G-ATTTCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTtctttatatggagaccattctgttacatgatttatcggaactatgaataaacataccaaaatgtcatctaactcatatttaggg
gi|12 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-TTATTAC---GGT--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-TTATATTA--G-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTC-AG-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-A-A----CCCT-TG-TAAAAAT--GG--------------GC----AA--C--G---TGTAC-G--TCTTGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AG-----TTTA---T-AGA-------------------------------AATT--TC-TTT-----------------------------------------------AA-T---------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-ATT-T-ATC---GG--A--AA---TGA-------ATAAAACATTA--C-C-AAAA
gi|13 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-TACGG-T--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TAAT-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG---ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCA-G-TG-ACT-GACT-T-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TGTTAAAAAT---G-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCACAA-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-TTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AGTTT-------------------------------------A--T--AGAAT---TC-TTT-----------------------------------------------AA-TG--------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---T-atgtcgatctaacttcattattaggga
gi|14 : GT-A-TATGTTTT--GTGATT-TG-G-ATTTCA-CTT-TT------A-TGT-TCTC---CA--TTTGCA-G-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-T--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-ATT-CA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CATT--A-----TC-TT---A-A-T----G-TG---G---------CTATTTG---T-AGA-A--CAGTGCATAGAACAGTGC-A--T--AGAACG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA--------------------------------------G---A------ATTT-CTT-T-AA--TG-G---tta
gi|15 : actngtttatacgGA--TT---TCAC-TTA--CA-T-AC-TC-T--CG-T-C--AAT-GTG--A--CACT--G-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CGG--TA-G-G--------TAGAATTTCGTC--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---T-AAA---GG--C--AG---TGA--C---TAAAAAATA-TA--C-C-ACAAa
gi|16 : gAAAG-TATTG-G-A--GAA-TAT--TTTCAATCCCT-AAAAACTG--CCCTA---TTGA----AATATCAT-G-GTAATTTT--ACTTGTGTGTTAT---A--TCTTACCATG-AAAATGTGCATGTTTT--C---AGATTC-AAAC-ATA--GCG-CTTTATTTGGTCG-T--AAACATT-CCTA-ATTACACTCTTCCA-CA--CATGATAAATCACAGTGAC---ATT-TC---TGG-TGCTGACAT---GCagtttgttaaagctttcatctttaggga
gi|17 : ACTTC----CT-CTTTGACAACTAAT-AGA-TTAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTG
gi|17 : ---AGTTTT--TTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-G--T--AGAATG--TC-------AG--CA-G-T--------TAGAATCTCTTT--------------AA-T---------GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---T-AAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-Atttttgtaaaactttgcgtagaatgtcagcagttagaatctctttaatggggatgatttcttgtaatgataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaa
gi|18 : cactgtgtcgagtaaaactaatctattagttgtcaaagaggaT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTTTGT--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---aa
gi|19 : CTCAGGATG-ATAGATTCAGGAAAAGCGGATTCA---TCA-GCGT-AAACAAATATT---ATATTGTTTTTATTCTT-GAAT-TA-TGAAAATTG--TATCTGTATA-CCATATACACTCAATTA
gi|2 : TAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTGTCAAAAAG----AAG--ACTATCC--------ATTTTCTCTGATGAA--TTGG--GTA---TGT-ACA--A-CGTTT-C---ATCGATA-AC-TCAGA-C-CAGATGAATT---AGTAC---C-CAG-T--AAAGAA-TTATTAAAT-C-AGTGC------------T-A--AAACAT---AAAT----TA-T--A-TTTACT-TATG-CATA---TCGAACAA----TTGT----------ATC-TCT-AAT---CT-A-ATGTGTACT-----TCAATA-TATCCTCAAT-GTTATTAACTT-T-ACAT-GG-----CA----------TC-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGGA-CA-CA-TC-CT--CATTTAA--C-TAT-ACTGATG-TTCTC--ATCAT-A-TGT-----T-ATGTTT-AGCG-ATTTCA-TTT-TC------ACTGT-CCTC---TA--TT-GCA---TG-ATC-AACTAT-TG---TGCTAC--A-ACAA--CCTCT-T--TAAAAAT--GGGTCGAATA---T--GC----CA--C--G---CTCAC----TC-CAGCGTT---CCAC-A-C--CA-TTCC-TC-TACTG-T-C--AATTGTG--A--CACC-TG---TACATCCG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TCGAAGT----CAAT--A-----TA-TT---G-A-C----A-TT---AAC---A--TATATTTG---T-AGA-ATACTGTG------------C-AG-T--AGAAGT--TC-TGTACCAG--CA-T-C--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACA-GT---CCTGG-AA--TG-G---G-AAAAAAGA--A--AGCT-TGA--CACCCACAAGG-G-CA--C-CCATAATACGTCCATGAAGTGAT-------CCTCGGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-AC-AT-AAAGA-AGTCCTTTTCGACTTCTGAAA--ACTACCTATACTTGACTCAAGTCATTAT--TATATTGCCTCTGT-ATCTCATAGTA---ATCTTAGCATT--GTATGTCAAATTCTTAAACT-AACATTCTAT-CTTTTTTTAAGCATTCCCAATCAC-ATTAAGT-ATA-ACAC-TGAG-AGGACAATAGTCGACGCATATT-CTGTCT---TGCGACATATAGAA--GTAATAGCCGATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTATACG-CAGCCCCTTGGAGAAGGGT-GAAGTATATTCTTAACTAACACATGTGTCAAAAATTAAATGAGACAACTCTCTATAGTATCCTCAATAG-AAAT-CTTTAATTGCGTAAGGGTTTCAAT-AAACATCAGACTC-CGATGTATTGCTTCAGGAAAAGAC--TTAACTCTCAGGTGTAAAAGAAATAGTTAAGTA---TTTTCA---TT-GCCTGTA-CGAAAACTTACTATC--TAAATCGGTATACA-TC-ATTATTCTA-AT--TGT-------T-AA--TATTTA-TCG-AATCAATTATACAGCAATTTTTATCTAATATTATCATCACTTACATGG
gi|20 : atATCTGTATA-CCATATACA-TCAATTAT--TACATG-TATCAATGTAT-AA--TTTGCA-TGGCAATAT--TATACATTCATTATTATC-AATGT----ATAATTTACATGGTGAattatttga
gi|21 : --------ATTTTCT--AATGAA--T-GCT-GCAAT-TAT-GAA----GGCTTTC---AT-GAAA-CC-CCAGA-CTCTGAGAA--T---AG-AT---A-C
gi|23 : tA-T-C-AGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--T-TTTA-T-TATG-TATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACcgaataagggtttttttttttcagtgaagataag
gi|24 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCTT-GAGAA
gi|3 : cAAG-TATTA-A-AAGGAA-TGTGTTTTCAA-CCCT-GAGA-CTG--CT-TA---ATGA--TTAA-GTCAT-TTGTA---TTAGGCTTCTGTGTTATTCGC--TCT----ATA-AAAA-AT--ACGTGTTTTC---AAATCTTAAACCAAACTGCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATTTCCTA-ATCA---------A-CA--CAT------------TGAC---AAT-TTGATTGA-C-TTGACATTGTGTT----AAAAAAAAA-A-AAAAAT--AAACGCCGATA-GACACGTTTTAATCGGAATT-GAGTCAGG-TGACT-CATG-CC-TTCGGAGAAG-AAT-AGAAGTAGT-TTTCGTTTACCT-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TTC--------AT--CCT--GATGTA--TTGTTTGTAAT-TGT-GAA--G-GGTTT-C---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCATATAA--TTATAG-AT---A-CAG-TATAAAGAAAT-ATTAA-T-C-AGTTGGTTTATGTAGTGT-A--AAA--C---AGATA---TAAT--T-TTTA-T-TATGGCATT---ACGAA-AA----TT-TACAGTACTACATC-TCTAAGAC--C--A-ATGT--ACT-----TCAAT--T-TTATACAT-G--AT-AAT-T-T-ACAT-AGAACATCGTAAACAAACCATCATAGCAA-----TAG----TA-G-T-ATT-C---GAT--ATG-A-CA-CCATC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG-TG-T-CTCCAGCAAT-A-TGT-TGTTT-AGGTTT-AG-GAATTTCA-CTTATCAATACTA-TGTCCCTCCG-TA--TTTGCCAGTCT-GTC-G-CTATATGTGCTGC-AATTA-ACA---CCCCTGTA-TAAAAAT--GG-----------T---CTCTGAA--C--G---TGCAC-G--TC-GGA--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC----TG-TCC--AAT-G-------CACA-TGCGTTACA--CGCTGCGCGCG---TC-CCATCTT-G-TGAAGG--A--CAAT--ACATTCTT-TG---ATACC----ATTA---GAT---AG-TCTATTTGCTAT-AGA-AATCTGTG------------C-C--TTCAGAATGCTTCTTGT--CAAGTCATG-G--------TA---------C--------------AATT---------GG---AGGACGAATTC-CTTGT-AA--TG-G---G-ACT---GGAAA--AG---TGACTC---CAC-AAATG-CA--CTC-ATAACG
gi|4 : AG-TATTAGA-A--GAA-TGT--TTTCAATTCCTTGAGAACTG--CTATA---AGCA--TTAA-AGCAT-T-GTA---T---GCTTCTGTTTTAT---C--TCTT----TA-AAAGAAT--ATTGGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATT-CCTAGATCA--------CA-CA--CAT------------TGACTCCAAT-TTA--TGA-TGCTGACAT---GCA----AAAAAATAA-ATAAAA-TTGAAA-ACTGATATGACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGA-TTCAGG-CT-CT-GGAGAAG-AAT-AGA-GTAGTATTT-----AC---GACCAACTT-TCAGAAAG----GAG--ACT-TTC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTG-GTAAT-TGT-GAA--A-G--TTTC---AT-G--A-CCTTCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---ACCAGTTT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AG-TG------------T-AAGAA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACG---AA----TT-T----------AGC-TCT-AGA---C--A-ATGT--ACT-----TCAATGATAATATCAATCGT-AT-GAATT-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------AGTTTTTTG----AA-GTT-ATC-T---C-T--ATGAACCA-CAGTC-CT--CAT--AA--C-TAATACTG-TG-T-CTCCAAGCAT-A-TATGTTGTTAATGTTTAAG-G-ATTTCAGCTT-TC------A-TGT-CCTCAGATA---TTGC-AG-TG-ATC-GACTAT-TG----GC-A---A-ACA---CCCCT-TG-AAAAATT--GGT----------T--GC----AA--CT-T---TGCAC-G--TC-CGG--TTGCCCCAC-A-AT-CA-T-TCTTC-T--TG-T-C--AAT-GTG--ACCCACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TT-CCA-CTT-G-TGAA-GT-AAGCAAT--A-----TC-TGGGAG-A-C----A--A---GAT---AGGTTT-TTTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-GTTT--AGAA-------TGT--CAG--CA-G-T--------TA---------G--------------AA-TCTCTTTAAGGG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-GATAT-AAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-AAAA
gi|5 : AAGCTATTA-ACA--GAAGTGT--TATCAATCCCT-GGAATCTATCCTATACATGTGAATTTAA-GTCATGT-GTA---TT---TTTCTGTGTTAT---CACTCTT---ATATAAAAAAT--TTGTGTT--CTATAAATCTTAAAC-AA---GCAAC-----TCCGTTG-T--AAAC-CT-CCTA-ATAA--------CAACAGACATC-----------TTTC---AATGTT---TGAATGCTGACAT---GCCCAGGAAAAATAAATA-ACAA-T--AAATGCTGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACTCGAGTCAG--T-ACTTCAGGGCTGCATTAAGAGA-GAT-AGA-GTATT-TTTT----AC-T-GA-ATACATGTCAAAA-G----GAG--ATT-TCTTTCCAATGATTTGTT--GATAAA--T-GTTCGTAAT-TGT-GAA--A-AGGTTCG---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTC--ATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAC-TGC-AG-TG------------TCACCAA---CACGAAATA---TA-T--TCTCTA---TATG-CATT---ACGAA-AA----TA-T----------ATCTTCTCACGTATC--A-ATTT--GCTAACCCTCCAA--TAAT-TC-AT-GT-AT-AAG-T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------G-----TTGTCGAGA-G-T-ATT-C---G-T--ATG-A-CATCAGTC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG--G-T-CT-CAAGC-T-A-TATGTTGTC-ATGTTT-AA-G-ATGCTA-CTT-TC------A-GG---CCC---TA----TGC-AG-TG-ATC--ACTAT-TGC--TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GG--------------GC----AA--C--T---TGCAC-G--TC-CGG---T---CCAC-A-A--CA-T----TCGT--TGATAC--AAT-GTG--C--CACTATG-GTTACA--TC--G-----G---TC-CCA-CTTGG-TGA--GTAA--CAATTAA-----TC-TG---ACA-C----A-TA---GAT---A
gi|6 : AAA----GAG--ACA-TTC--------ATTTCCT--GATGAAACCTGCT-GTAATCTAT-AAC--ATGATTTTCTGCAT-GAAAACC-TCAGAGCTCAGGTCA--T---AG-AT---T-CAA--G-AAAGAA-T-AT-AA-T-CCAGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-TGCT-TTTC-T-TA-G-AATT---ATGGA-AAAATGTT-T----------G-C-TGT-ATA---CTCATAT-T--ACA-----TCAATC-TATTATCAAT-GA-A--AT--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----T-G----AA-G-TTGGT-C---G-C--AATTA-CA-CAGTC-CT--CTT--AA-T--TAC-ACTG-TA-T-CTCCAAACGTCA-TGTG-TTTT-ATGTTT-TG-A-ATTTCA-CTT-TC------A-TTT-CTTC---TATGTTTGC-AG-CGCACT-GAC--T-TG---TGCAA---A-ACAC--CCCCT-TG-T-AAAAT--GGGAT--------T--GC----AAACC--G---TGTAC-G--TC-CGT--TT---CCAC-A-AACCA-T-AC-TC-T--TG-T-CCAAAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CGA-G-----G---TCTCCA-CTT-G-TGAA-GT-A--CAAT--A-----TC-TG-----G-C----A-TATTGGATGTGGGTTT--TTTG---TAAGACA--CTGTG------------C-A--T--AGA------CATGT--CAG--CA-G-G--------TA---------CCCCAATTTAACTTTAA-T---------AG---A-G-TG-ATTTGTTTGT-AA--TG-A---T-AAA---TG--ATCAG---TGA--C---CAAAAGATG-TA--C-C-ACAAC
gi|7 : caactgtA---C---AAATC---TA-C--T-TGCA-C--A-G-CATTCAAACGAA-GA----TC-T----------ATC-C-----A---C--C-TTGT--ACA-----TCAAT--T-TTATCAAT-GT-GA-AA--CAT-ACATTGA-----CA----------AT-------T-----TTG----AACG-T-ATT-T---G-TCAATGAC-CA-CAATCACC--TGT--AA-T-----TACT--------CCCAAATGC-AGTGTGTTTT----------G-G-ATTTC--CTT---------G-T-T-TCTT---TA--TTTGCA-G-CG-ATCTGACT---TG---TAC-A---A-GCAAAACCGCT-TG-TAAAAATTCGG-----------TATGC----CA--C--ACACTGTACCG--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TCAT--TG-TTC--AAT-GTGTGA---ACT-GG-TTTAT---CGT-G-----G---TC-C-A-CTT-G-TGAAGTT-A--CAAT--A-----TCTTA---A-A-C----A-TG---GAT---AGTTT--TCTG---T-AAG-A--ATG-G------------CGA--T--AAAA-G--TC-TGTA-CAG--CA-GTGAGAATTTCTT---------C--------------TA-T---------GGGCTA-AAC----TT-CTTGT-GAATTGAG---TAAAA---GG--A--AGTTTTGA-------AGAAAAT--TAATC-C-GCACTG-GTTTACGAAGC--TTTCACTATTT-AGGAGATTACGTGTATATCAA-AGTATTAAAGAGA-TGGTTT-CAATCCTTAAGACCACTGCC-ATA-CTGA-TCAAGTCA--ATCGTAAATTGCTT
gi|8 : GGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATggtgcgttcat
gi|8 : CAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCT-CAT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-TTAGCTTCAGGAAAAGACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTAGA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATGCTAT-------TCAATTTTTACA-TGGCA--ATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|9 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAT-AG-----TA----------AT-------G-----TTA----AA-A-T-ATT-T---G-C--ATGA--CA-CATTC-CT--CTT--AA--C-TAT-ACTG-TA-T-CTCTATATGT-A-TGTGTTTTT--TGTTG-TG-G-ATTCCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTTGCA-G-CG-ACT-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CAG--TA-G-G--------TAGAATTTATTT--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---T-AAT---GG--A--AG---TGA--C---TAAAAAATG-TA--C-C-ACAAt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AATGGGGCTGTGCGGGGTAGCGCGTATGCCCAACCCTATTTAACAGTAATCCGTCTATTCTGAGAAC
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111111 111 111 1 11111 33333 22222222 444444444444 111 111 111 33333 111 1111 1 1 11 11 1 22222 111 1111 11111111 111 1111111 11111 1111 33333333333333333333 111 222 1111111111 1111111111 3333333333333333333 22 22222222222222222222222222222222 111 33333333 11 22 111 111 44444444444444 111 11 11 22222 22222222222222222 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 111 2222222 1 999999999999999 1 1 111 1 11 1 1 1 222 11 4444444 111 1 11 2 33 1 333333 1 1 1 1 11 1111 1 222 1 11 1 222 1 1 1 1 1 1 1 1 222222222 1 111 1 1 1 11 111 111 111 1 1 111 111 111 1 1 1 222 11 1 11 333333333 11 1 1 2222
lowQualScore : 6 666 99 6 99 5 1 99 3 111 99 6 888 22222222 555555 111 6 7 99 99 111 3 6 99 6 66666 11111 6 6 44444444 6 99 000000000000 111 6 888 6 111 22222 111 4444 9 0 33 8 11 8 8 2 888 6 1 3 6 6 5 00000 777 99 2222 77 5 0 88888888 0 66 66 3 111 5 5 5555555 5 888 5 5 5 5 0 999999 5 11111 9999 5 5 5 5 5 55555555555555555555 222 777 333 4 66 4 777 1 4 777 4 9999 4 9999999999 4 1 7777777777 66 3 5555555555555555555 5 88 55 33 5 5 3 55555555555555555555555555555555 7777 3 3 6 66666 6 44 999 3 2 3 44 1 44 66666666 3 6 3 2 3 3 0 00 33 3 3 3 3 888888 3 3 999 44 22 3 6 0 3 7 3 222 6 999 3 222 3 44 44 00000000000000 7777 44 999999 3 44 3 44 555 3 3 77 3 55 3 6 44 3 9 44 3 44 44 000 3 0 44 00 77777 555 3 3 3 6 0 3 00 44 77777 3 88888 3 6666 3 555 555 22222 555 3 3 88 0 00000000000000000 44 1111 6 888 44 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555 555 3 55 3 3 44 2222222 777 55 55 222 0000000 1 666 55 4 4 0 2 0 222222222222222 3 0 3 66 111 1 0 1 33 0 0 0 999 33 7 5555555 1 999 5 88 0 22 00 1 5 000000 5 5 5 5 66 9999 5 111 5 88 5 1 000 5 5 5 5 5 5 1 1 1 3 3 888888888 3 666 6 3 3 0 11 777 444 777 0 0 777 777 000 0 0 0 777 6 1 8 1 8 0 33 0 22 333333333 33 1 0 2 3 3 3 0 1111 0 7
lowQualScore : . ... .. . .. . . .. . ... .. . ... ........ ...... ... . . .. .. ... . . .. . ..... ..... . . ........ . .. ............ ... . ... . ... ..... ... .... . . .. . .. . . . ... . . . . . . ..... ... .. .... .. . . ........ . .. .. . ... . . ....... . ... . . . . . ...... . ..... .... . . . . . .................... ... ... ... . .. . ... . . ... . .... . .......... . . .......... .. . ................... . .. .. .. . . . ................................ .... . . . ..... . .. ... . . . .. . .. ........ . . . . . . . .. .. . . . . ...... . . ... .. .. . . . . . . ... . ... . ... . .. .. .............. .... .. ...... . .. . .. ... . . .. . .. . . .. . . .. . .. .. ... . . .. .. ..... ... . . . . . . .. .. ..... . ..... . .... . ... ... ..... ... . . .. . ................. .. .... . ... .. . ................................................. ... . .. . . .. ....... ... .. .. ... ....... . ... .. . . . . . ............... . . . .. ... . . . .. . . . ... .. . ....... . ... . .. . .. .. . . ...... . . . . .. .... . ... . .. . . ... . . . . . . . . . . . ......... . ... . . . . .. ... ... ... . . ... ... ... . . . ... . . . . . . .. . .. ......... .. . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 7 888 22 7 22 7 7 22 2 777 22 7 333 00000000 000000 777 7 8 22 22 777 3 7 22 7 77777 88888 7 7 22222222 7 22 888888888888 777 7 333 7 777 00000 000 8888 0 0 88 0 00 0 0 5 333 7 7 3 7 7 7 00000 333 66 1111 99 7 4 11111111 4 99 99 2 222 0 0 5555555 1 888 0 0 0 0 4 999999 0 00000 7777 7 7 0 0 0 11111111111111111111 222 888 333 4 11 4 000 9 4 888 4 4444 4 4444444444 4 1 7777777777 11 8 9999999999999999999 0 44 44 88 0 0 3 11111111111111111111111111111111 1111 3 3 7 66666 7 66 333 3 4 3 66 0 66 22222222 3 7 3 5 1 1 4 33 99 1 1 1 1 888888 1 1 666 22 00 3 7 1 3 7 3 555 7 222 3 555 3 77 66 88888888888888 1111 66 222222 3 66 3 22 444 1 1 33 1 77 1 2 22 1 2 22 1 22 22 000 1 8 22 44 77777 444 1 1 1 2 8 1 44 22 77777 1 66666 1 5555 1 444 000 11111 444 1 1 55 7 00000000000000000 66 5555 7 333 66 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222 888 3 11 3 3 66 9999999 000 55 55 555 7777777 6 888 55 0 0 9 0 7 333333333333333 3 0 2 55 000 0 0 0 88 0 0 0 222 88 3 0000000 0 000 0 00 5 00 55 0 0 000000 5 5 0 0 00 5555 5 000 0 55 5 0 555 5 5 5 5 0 5 0 0 0 3 3 000000000 3 777 7 3 3 0 22 555 888 555 0 0 555 555 222 0 0 0 555 4 0 0 0 0 8 88 0 55 555555555 88 2 0 5 2 2 2 0 2222 2 0
consensus : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACNTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
Reference ( family-2240 ) : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACTTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACNTAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
gi|1 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTCCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TTGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GT--------AAAAAA-A-AAAA-T--AAA-GCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGGTTGACTTCATG-CT-CTTGGAGAAGAAAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTT-GTAAT-TGTGGAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-TATATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCTAAGA-C--A-ATGT--ACTTC--T-T-------------AA--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CTTACAT--AACTC-TATTACTG-TAGT-CTTCAAGCAT-A-TATGTTGAT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-CCTC---TA--TTTGCAAG-TGTATC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGCAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC-T--TG-T-C--TAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-AC-CAAT--A-----TT-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-GC-------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTC-CTTGTAAA--TG-G---G-AAA---GA--A--AG---TGA--C---CACAAAATG-CA--C-C-ATAACGTGTTCATGGGG---------------GGGGGG-GGGGGAGGTATCAACACTA-TAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAA----AACTTGCAGTAT-TCAAAT--CTAAACATAACTATCTATT-TTTTTGTAAGCATTCCCAATCACCAT----TCACATACACATGAAGAGGACAATAGT-GAC-AAT-CTGCTG-CTGAACATGA-ATATAGAAATGTAA-AGCCTATCAACAA---TTTATCG-ACTGCGTCAG-GTG-ACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCAGAGT-TAGTTTTTACCTACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-GAAAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATGTAAACCTCAGACTC-GGATG-GTAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TTAGCCT-TATCGAAAATT---TATCCGTAAA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACAGTGGCAATATATTATACATCAA-TTTTATC-AATAT----ATGA-TTACATGGTAATAT
gi|10 : AT-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-A---G-T--ATGA--CA-CGGTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCAGT-CG-AAC-TACTTT-TGT--TGC-A---ACACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GGTTTTCTATTTTT--GC----AA--CGTG---TGTAC-GGTCC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATT-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CATC-TG-GTTACA--CG--G-----GTCCTC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-AC-CAAT--A-----T--TG---A-A-CACATA-CA---AAT---AGCTTTAC------T-AGA-A--TT
gi|11 : A-TCG--ACT-GGGTCAGG-TGAAATCAAC-CA-CGTGGAGAAG-ATTCAAA-ATAGT-TTT-----AC-C-CACACATGTGTCAAAAAATAAAGAGTCACT---C--------ATATCCT--TATCAA--CTGCT-GTAAT-TGT-GAATTA----TTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGCTGA--A---AG-ATTAAA-AAA-AA-AAAGAA-T-TTTCA-T-C-AAT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--C-TTTA-T-TTTG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------GTC-TGT-AGA-T--C-ATAT--ACATCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GG-AT-AA--T-TCACAT-GG-----CA----------AA-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-C--CTG-A-CA-CAGTC-CT--CTT--AA--C-TA-TACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTG-TTTT-ATGTTG-TG-G-ATTTCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTtctttatatggagaccattctgttacatgatttatcggaactatgaataaacataccaaaatgtcatctaactcatatttaggg
gi|12 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-TTATTAC---GGT--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-TTATATTA--G-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTC-AG-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-A-A----CCCT-TG-TAAAAAT--GG--------------GC----AA--C--G---TGTAC-G--TCTTGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AG-----TTTA---T-AGA-------------------------------AATT--TC-TTT-----------------------------------------------AA-T---------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-ATT-T-ATC---GG--A--AA---TGA-------ATAAAACATTA--C-C-AAAA
gi|13 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-TACGG-T--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TAAT-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG---ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCA-G-TG-ACT-GACT-T-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TGTTAAAAAT---G-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCACAA-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-TTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AGTTT-------------------------------------A--T--AGAAT---TC-TTT-----------------------------------------------AA-TG--------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---T-atgtcgatctaacttcattattaggga
gi|14 : GT-A-TATGTTTT--GTGATT-TG-G-ATTTCA-CTT-TT------A-TGT-TCTC---CA--TTTGCA-G-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-T--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-ATT-CA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CATT--A-----TC-TT---A-A-T----G-TG---G---------CTATTTG---T-AGA-A--CAGTGCATAGAACAGTGC-A--T--AGAACG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA--------------------------------------G---A------ATTT-CTT-T-AA--TG-G---tta
gi|15 : actngtttatacgGA--TT---TCAC-TTA--CA-T-AC-TC-T--CG-T-C--AAT-GTG--A--CACT--G-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CGG--TA-G-G--------TAGAATTTCGTC--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---T-AAA---GG--C--AG---TGA--C---TAAAAAATA-TA--C-C-ACAAa
gi|16 : gAAAG-TATTG-G-A--GAA-TAT--TTTCAATCCCT-AAAAACTG--CCCTA---TTGA----AATATCAT-G-GTAATTTT--ACTTGTGTGTTAT---A--TCTTACCATG-AAAATGTGCATGTTTT--C---AGATTC-AAAC-ATA--GCG-CTTTATTTGGTCG-T--AAACATT-CCTA-ATTACACTCTTCCA-CA--CATGATAAATCACAGTGAC---ATT-TC---TGG-TGCTGACAT---GCagtttgttaaagctttcatctttaggga
gi|17 : ACTTC----CT-CTTTGACAACTAAT-AGA-TTAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTG
gi|17 : ---AGTTTT--TTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-G--T--AGAATG--TC-------AG--CA-G-T--------TAGAATCTCTTT--------------AA-T---------GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---T-AAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-Atttttgtaaaactttgcgtagaatgtcagcagttagaatctctttaatggggatgatttcttgtaatgataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaa
gi|18 : cactgtgtcgagtaaaactaatctattagttgtcaaagaggaT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTTTGT--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---aa
gi|19 : CTCAGGATG-ATAGATTCAGGAAAAGCGGA---TTCA---TCA-GCGT-AAACAAATATT---ATATTGTTTTTATTCTT-GAAT-TA-TGAAAATTG--TATCTGTATA-CCATATACACTCAATTA
gi|2 : TAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTGTCAAAAAG----AAG--ACTATCC--------ATTTTCTCTGATGAA--TTGG--GTA---TGT-ACA--A-CGTTT-C---ATCGATA-AC-TCAGA-C-CAGATGAATT---AGTAC---C-CAG-T--AAAGAA-TTATTAAAT-C-AGTGC------------T-A--AAACAT---AAAT----TA-T--A-TTTACT-TATG-CATA---TCGAACAA----TTGT----------ATC-TCT-AAT-CT-A-ATGTGTACTTCAATAT-------------AT--CCTCAAT-GTTATTAACTT-T-ACAT-GG-----CA----------TC-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGGA-CA-CA-TC-CT--CATTTAA--C-TAT-ACTGATG-TTCTC--ATCAT-A-TGT-----T-ATGTTT-AGCG-ATTTCA-TTT-TC------ACTGT-CCTC---TA--TT-GCA---TG-ATC-AACTAT-TG---TGCTAC--A-ACAA--CCTCT-T--TAAAAAT--GGGTCGAATA---T--GC----CA--C--G---CTCAC----TC-CAGCGTT---CCAC-A-C--CA-TTCC-TC-TACTG-T-C--AATTGTG--A--CACC-TG---TACATCCG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TCGAAGT----CAAT--A-----TA-TT---G-A-C----A-TT---AAC---A--TATATTTG---T-AGA-ATACTGTG------------C-AG-T--AGAAGT--TC-TGTACCAG--CA-T-C--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACA-GT---CCTGG-AA--TG-G---G-AAAAAAGA--A--AGCT-TGA--CACCCACAAGG-G-CA--C-CCATAATACGTCCATGAAGTGAT-------CCTCGGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-AC-AT-AAAGA-AGTCCTTTTCGACTTCTGAAA--ACTACCTATACTTGACTCAAGTCATTAT--TATATTGCCTCTGT-ATCTCATAGTAA---TCTTAGCATT--GTATGTCAAATTCTTAAAC-TAACATTCTAT-CTTTTTTTAAGCATTCCCAATCAC-ATTAAGT-ATA-ACAC-TGAG-AGGACAATAGTCGACGCATATT-CTGTCT---TGCGACATATAGAA--GTAATAGCCGATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTATACG-CAGCCCCTTGGAGAAGGGT-GAAGTATATTCTTAACTAACACATGTGTCAAAAATTAAATGAGACAACTCTCTATAGTATCCTCAATAG-AAAT-CTTTAATTGCGTAAGGGTTTCAAT-AAACATCAGACTC-CGATGTATTGCTTCAGGAAAA---GAC--TTAACTCTCAGGTGTAAAAGAAATAGTTAAGTA---TTTTCA---TT-GCCTGTA-CGAAAACTTACTATC--TAAATCGGTATACA-TC-ATTATTCTA-AT--TGT-------T-AA--TATTTA-TCG-AATCAATTATACAGCAATTTTTATCTAATATTATCATCACTTACATGG
gi|20 : atATCTGTATA-CCATATACA-TCAATTAT--TACATG-TATCAATGTAT-AA--TTTGCA-TGGCAATAT--TATACATTCATTATTATC-AATGT----ATAATTTACATGGTGAattatttga
gi|21 : --------ATTTTCT--AATGAA--T-GCT-GCAAT-TAT-GAA----GGCTTTC---AT-GAAA-CC-CCAGA-CTCTGAGAA--T---AG-AT---A-C
gi|23 : tA-T-C-AGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--T-TTTA-T-TATG-TATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACcgaataagggtttttttttttcagtgaagataag
gi|24 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCTT-GAGAA
gi|3 : cAAG-TATTA-A-AAGGAA-TGTGTTTTCAA-CCCT-GAGA-CTG--CT-TA---ATGA--TTAA-GTCAT-TTGTA---TTAGGCTTCTGTGTTATTCGC--TCT----ATA-AAAA-AT--ACGTGTTTTC---AAATCTTAAACCAAACTGCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATTTCCTA-ATCA---------A-CA--CAT------------TGAC---AAT-TTGATTGA-C-TTGACATTGTGTT----AAAAAAAAA-A-AAAAAT--AAACGCCGATA-GACACGTTTTAATCGGAATT-GAGTCAGG-TGACT-CATG-CC-TTCGGAGAAG-AAT-AGAAGTAGT-TTTCGTTTACCT-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TTC--------AT--CCT--GATGTA--TTGTTTGTAAT-TGT-GAA--G-GGTTT-C---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCATATAA--TTATAG-AT---A-CAG-TATAAAGAAAT-ATTAA-T-C-AGTTGGTTTATGTAGTGT-A--AAA--C---AGATA---TAAT--T-TTTA-T-TATGGCATT---ACGAA-AA----TT-TACAGTACTACATC-TCTAAGACC--A-ATGT--ACTTCAAT-T--------------T--TATACAT-G--AT-AAT-T-T-ACAT-AGAACATCGTAAACAAACCATCATAGCAA-----TAG----TA-G-T-ATT-C---GAT--ATG-A-CA-CCATC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG-TG-T-CTCCAGCAAT-A-TGT-TGTTT-AGGTTT-AG-GAATTTCA-CTTATCAATACTA-TGTCCCTCCG-TA--TTTGCCAGTCT-GTC-G-CTATATGTGCTGC-AATTA-ACA---CCCCTGTA-TAAAAAT--GG-----------T---CTCTGAA--C--G---TGCAC-G--TC-GGA--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC----TG-TCC--AAT-G-------CACA-TGCGTTACA--CGCTGCGCGCG---TC-CCATCTT-G-TGAAGG--A--CAAT--ACATTCTT-TG---ATACC----ATTA---GAT---AG-TCTATTTGCTAT-AGA-AATCTGTG------------C-C--TTCAGAATGCTTCTTGT--CAAGTCATG-G--------TA---------C--------------AATT---------GG---AGGACGAATTC-CTTGT-AA--TG-G---G-ACT---GGAAA--AG---TGACTC---CAC-AAATG-CA--CTC-ATAACG
gi|4 : AG-TATTAGA-A--GAA-TGT--TTTCAATTCCTTGAGAACTG--CTATA---AGCA--TTAA-AGCAT-T-GTA---T---GCTTCTGTTTTAT---C--TCTT----TA-AAAGAAT--ATTGGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATT-CCTAGATCA--------CA-CA--CAT------------TGACTCCAAT-TTA--TGA-TGCTGACAT---GCA----AAAAAATAA-ATAAAA-TTGAAA-ACTGATATGACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGA-TTCAGG-CT-CT-GGAGAAG-AAT-AGA-GTAGTATTT-----AC---GACCAACTT-TCAGAAAG----GAG--ACT-TTC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTG-GTAAT-TGT-GAA--A-G--TTTC---AT-G--A-CCTTCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---ACCAGTTT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AG-TG------------T-AAGAA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACG---AA----TT-T----------AGC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACTTCAAT-G-------------ATAATATCAATCGT-AT-GAATT-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------AGTTTTTTG----AA-GTT-ATC-T---C-T--ATGAACCA-CAGTC-CT--CAT--AA--C-TAATACTG-TG-T-CTCCAAGCAT-A-TATGTTGTTAATGTTTAAG-G-ATTTCAGCTT-TC------A-TGT-CCTCAGATA---TTGC-AG-TG-ATC-GACTAT-TG----GC-A---A-ACA---CCCCT-TG-AAAAATT--GGT----------T--GC----AA--CT-T---TGCAC-G--TC-CGG--TTGCCCCAC-A-AT-CA-T-TCTTC-T--TG-T-C--AAT-GTG--ACCCACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TT-CCA-CTT-G-TGAA-GT-AAGCAAT--A-----TC-TGGGAG-A-C----A--A---GAT---AGGTTT-TTTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-GTTT--AGAA-------TGT--CAG--CA-G-T--------TA---------G--------------AA-TCTCTTTAAGGG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-GATAT-AAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-AAAA
gi|5 : AAGCTATTA-ACA--GAAGTGT--TATCAATCCCT-GGAATCTATCCTATACATGTGAATTTAA-GTCATGT-GTA---TT---TTTCTGTGTTAT---CACTCTT---ATATAAAAAAT--TTGTGTT--CTATAAATCTTAAAC-AA---GCAAC-----TCCGTTG-T--AAAC-CT-CCTA-ATAA--------CAACAGACATC-----------TTTC---AATGTT---TGAATGCTGACAT---GCCCAGGAAAAATAAATA-ACAA-T--AAATGCTGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACTCGAGTCAG--T-ACTTCAGGGCTGCATTAAGAGA-GAT-AGA-GTATT-TTTT----AC-T-GA-ATACATGTCAAAA-G----GAG--ATT-TCTTTCCAATGATTTGTT--GATAAA--T-GTTCGTAAT-TGT-GAA--A-AGGTTCG---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTC--ATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAC-TGC-AG-TG------------TCACCAA---CACGAAATA---TA-T--TCTCTA---TATG-CATT---ACGAA-AA----TA-T----------ATCTTCT-----C----ACGT--A--TCAAT-TTGCTAACCCTCCAAT--AATTCAT-GT-AT-AAG-T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------G-----TTGTCGAGA-G-T-ATT-C---G-T--ATG-A-CATCAGTC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG--G-T-CT-CAAGC-T-A-TATGTTGTC-ATGTTT-AA-G-ATGCTA-CTT-TC------A-GG---CCC---TA----TGC-AG-TG-ATC--ACTAT-TGC--TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GG--------------GC----AA--C--T---TGCAC-G--TC-CGG---T---CCAC-A-A--CA-T----TCGT--TGATAC--AAT-GTG--C--CACTATG-GTTACA--TC--G-----G---TC-CCA-CTTGG-TGA--GTAA--CAATTAA-----TC-TG---ACA-C----A-TA---GAT---A
gi|6 : AAA----GAG--ACA-TTC--------ATTTCCT--GATGAAACCTGCT-GTAATCTAT-AAC--ATGATTTTCTGCAT-GAAAACC-TCAGAGCTCAGGTCA--T---AG-AT---T-CAA--G-AAAGAA-T-AT-AA-T-CCAGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-TGCT-TTTC-T-TA-G-AATT---ATGGA-AAAATGTT-T----------G-C-TGT-ATA-CTCATAT-T--ACATCAATCT-------------AT--TATCAAT-GA-A--AT--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----T-G----AA-G-TTGGT-C---G-C--AATTA-CA-CAGTC-CT--CTT--AA-T--TAC-ACTG-TA-T-CTCCAAACGTCA-TGTG-TTTT-ATGTTT-TG-A-ATTTCA-CTT-TC------A-TTT-CTTC---TATGTTTGC-AG-CGCACT-GAC--T-TG---TGCAA---A-ACAC--CCCCT-TG-T-AAAAT--GGGAT--------T--GC----AAACC--G---TGTAC-G--TC-CGT--TT---CCAC-A-AACCA-T-AC-TC-T--TG-T-CCAAAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CGA-G-----G---TCTCCA-CTT-G-TGAA-GT-A--CAAT--A-----TC-TG-----G-C----A-TATTGGATGTGGGTTT--TTTG---TAAGACA--CTGTG------------C-A--T--AGA------CATGT--CAG--CA-G-G--------TA---------CCCCAATTTAACTTTAA-T---------AG---A-G-TG-ATTTGTTTGT-AA--TG-A---T-AAA---TG--ATCAG---TGA--C---CAAAAGATG-TA--C-C-ACAAC
gi|7 : caactgtA---C---AAATC---TA-C--T-TGCA-C--A-G-CATTCAAACGAA-GA----TC-T----------ATC-C-----A-C--C-TTGT--ACATCAAT-T--------------T--TATCAAT-GT-GA-AA--CAT-ACATTGA-----CA----------AT-------T-----TTG----AACG-T-ATT-T---G-TCAATGAC-CA-CAATCACC--TGT--AA-T-----TACT--------CCCAAATGC-AGTGTGTTTT----------G-G-ATTTC--CTT---------G-T-T-TCTT---TA--TTTGCA-G-CG-ATCTGACT---TG---TAC-A---A-GCAAAACCGCT-TG-TAAAAATTCGG-----------TATGC----CA--C--ACACTGTACCG--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TCAT--TG-TTC--AAT-GTGTGA---ACT-GG-TTTAT---CGT-G-----G---TC-C-A-CTT-G-TGAAGTT-A--CAAT--A-----TCTTA---A-A-C----A-TG---GAT---AGTTT--TCTG---T-AAG-A--ATG-G------------CGA--T--AAAA-G--TC-TGTA-CAG--CA-GTGAGAATTTCTT---------C--------------TA-T---------GGGCTA-AAC----TT-CTTGT-GAATTGAG---TAAAA---GG--A--AGTTTTGA-------AGAAAAT--TAATC-C-GCACTG-GTTTACGAAGC--TTTCACTATTT-AGGAGATTACGTGTATATCAA-AGTATTAAAGAGA-TGGTTT-CAATCCTTAAGACCACTGCC-ATA-CTGA-TCAAGTCA--ATCGTAAATTGCTT
gi|8 : GGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATggtgcgttcat
gi|8 : CAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-TTAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTAGA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATGCTAT-------TCAATTTTTACA-TGGCA--ATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|9 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAT-AG-----TA----------AT-------G-----TTA----AA-A-T-ATT-T---G-C--ATGA--CA-CATTC-CT--CTT--AA--C-TAT-ACTG-TA-T-CTCTATATGT-A-TGTGTTTTT--TGTTG-TG-G-ATTCCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTTGCA-G-CG-ACT-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CAG--TA-G-G--------TAGAATTTATTT--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---T-AAT---GG--A--AG---TGA--C---TAAAAAATG-TA--C-C-ACAAt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AATGGGGCTGTGCGGGGTAGCGCGTATGCCCAACCCTATTTAACAGTAATCCGTCTATTCTGAGAAC
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111111 111 111 1 11111 33333 22222222 444444444444 111 111 111 33333 111 1111 1 1 11 11 1 22222 111 1111 11111111 111 1111111 11111 1111 33333333333333333333 111 222 1111111111 1111111111 3333333333333333333 22 22222222222222222222222222222222 111 33333333 11 22 111 111 44444444444444 111 11 11 22222 22222222222222222 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 111 2222222 1 999999999999999 1 1 111 1 11 1 1 1 222 11 4444444 111 1 11 1 33 1 333333 1 1 1 1 11 1111 1 222 1 11 1 222 1 1 1 1 1 1 1 1 222222222 1 111 1 1 1 11 111 111 111 1 1 111 111 111 1 1 1 222 11 1 11 333333333 11 1 1 2222
lowQualScore : 6 666 99 6 99 5 1 99 3 111 99 6 888 22222222 555555 111 6 7 99 99 111 3 6 99 6 66666 11111 6 6 44444444 6 99 000000000000 111 6 888 6 111 22222 111 4444 9 0 33 8 11 8 8 2 888 6 1 3 6 6 5 00000 777 99 2222 77 5 0 88888888 0 66 66 3 111 5 5 5555555 5 888 5 5 5 5 0 999999 5 11111 9999 5 5 5 5 5 55555555555555555555 222 777 333 4 66 4 777 1 4 777 4 9999 4 9999999999 4 1 7777777777 66 2 5555555555555555555 5 88 55 33 5 5 3 55555555555555555555555555555555 7777 3 3 6 66666 6 44 999 3 2 3 44 1 44 66666666 3 6 3 2 3 3 0 00 33 3 3 3 3 888888 3 3 999 44 22 3 6 0 3 7 3 222 6 999 3 222 3 44 44 00000000000000 7777 44 999999 3 44 3 44 555 3 3 77 3 55 3 6 44 3 9 44 3 44 44 000 3 0 44 00 77777 555 3 3 3 6 0 3 00 44 77777 3 88888 3 6666 3 555 555 22222 555 3 3 88 0 00000000000000000 44 1111 6 888 44 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555 555 3 55 3 3 44 2222222 777 55 55 222 0000000 1 666 55 4 4 0 2 0 222222222222222 3 0 3 66 111 1 0 1 33 0 0 0 999 33 7 5555555 1 999 5 88 5 22 00 1 5 000000 5 5 5 5 66 9999 5 111 5 88 5 1 000 5 5 5 5 5 5 1 1 1 3 3 888888888 3 666 6 3 3 0 11 777 444 777 0 0 777 777 000 0 0 0 777 6 1 8 1 8 0 33 0 22 333333333 33 1 0 2 3 3 3 0 1111 0 7
lowQualScore : . ... .. . .. . . .. . ... .. . ... ........ ...... ... . . .. .. ... . . .. . ..... ..... . . ........ . .. ............ ... . ... . ... ..... ... .... . . .. . .. . . . ... . . . . . . ..... ... .. .... .. . . ........ . .. .. . ... . . ....... . ... . . . . . ...... . ..... .... . . . . . .................... ... ... ... . .. . ... . . ... . .... . .......... . . .......... .. . ................... . .. .. .. . . . ................................ .... . . . ..... . .. ... . . . .. . .. ........ . . . . . . . .. .. . . . . ...... . . ... .. .. . . . . . . ... . ... . ... . .. .. .............. .... .. ...... . .. . .. ... . . .. . .. . . .. . . .. . .. .. ... . . .. .. ..... ... . . . . . . .. .. ..... . ..... . .... . ... ... ..... ... . . .. . ................. .. .... . ... .. . ................................................. ... . .. . . .. ....... ... .. .. ... ....... . ... .. . . . . . ............... . . . .. ... . . . .. . . . ... .. . ....... . ... . .. . .. .. . . ...... . . . . .. .... . ... . .. . . ... . . . . . . . . . . . ......... . ... . . . . .. ... ... ... . . ... ... ... . . . ... . . . . . . .. . .. ......... .. . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 7 888 22 7 22 7 7 22 2 777 22 7 333 00000000 000000 777 7 8 22 22 777 3 7 22 7 77777 88888 7 7 22222222 7 22 888888888888 777 7 333 7 777 00000 000 8888 0 0 88 0 00 0 0 5 333 7 7 3 7 7 7 00000 333 66 1111 99 7 4 11111111 4 99 99 2 222 0 0 5555555 1 888 0 0 0 0 4 999999 0 00000 7777 7 7 0 0 0 11111111111111111111 222 888 333 4 11 4 000 9 4 888 4 4444 4 4444444444 4 1 7777777777 11 8 9999999999999999999 0 44 44 88 0 0 3 11111111111111111111111111111111 1111 3 3 7 66666 7 66 333 3 4 3 66 0 66 22222222 3 7 3 5 1 1 4 33 99 1 1 1 1 888888 1 1 666 22 00 3 7 1 3 7 3 555 7 222 3 555 3 77 66 88888888888888 1111 66 222222 3 66 3 22 444 1 1 33 1 77 1 2 22 1 2 22 1 22 22 000 1 8 22 44 77777 444 1 1 1 2 8 1 44 22 77777 1 66666 1 5555 1 444 000 11111 444 1 1 55 7 00000000000000000 66 5555 7 333 66 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222 888 3 11 3 3 66 9999999 000 55 55 555 7777777 6 888 55 0 0 9 0 7 333333333333333 3 0 2 55 000 0 0 0 88 0 0 0 222 88 3 0000000 0 000 0 00 5 00 55 0 0 000000 5 5 0 0 00 5555 5 000 0 55 5 0 555 5 5 5 5 0 5 0 0 0 3 3 000000000 3 777 7 3 3 0 22 555 888 555 0 0 555 555 222 0 0 0 555 4 0 0 0 0 8 88 0 55 555555555 88 2 0 5 2 2 2 0 2222 2 0
consensus : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACNTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
Reference ( family-2240 ) : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACNTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
gi|1 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTCCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TTGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GT--------AAAAAA-A-AAAA-T--AAA-GCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGGTTGACTTCATG-CT-CTTGGAGAAGAAAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTT-GTAAT-TGTGGAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-TATATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCTAAGA-C--A-ATGT--ACTTC--T-T-------------AA--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CTTACAT--AACTC-TATTACTG-TAGT-CTTCAAGCAT-A-TATGTTGAT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-CCTC---TA--TTTGCAAG-TGTATC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGCAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC-T--TG-T-C--TAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-AC-CAAT--A-----TT-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-GC-------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTC-CTTGTAAA--TG-G---G-AAA---GA--A--AG---TGA--C---CACAAAATG-CA--C-C-ATAACGTGTTCATGGGG---------------GGGGGG-GGGGGAGGTATCAACACTA-TAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAA----AACTTGCAGTAT-TCAAAT--CTAAACATAACTATCTATT-TTTTTGTAAGCATTCCCAATCACCAT----TCACATACACATGAAGAGGACAATAGT-GAC-AAT-CTGCTG-CTGAACATGA-ATATAGAAATGTAA-AGCCTATCAACAA---TTTATCG-ACTGCGTCAG-GTG-ACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCAGAGT-TAGTTTTTACCTACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-GAAAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATGTAAACCTCAGACTC-GGATG-GTAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TTAGCCT-TATCGAAAATT---TATCCGTAAA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACAGTGGCAATATATTATACATCAA-TTTTATC-AATAT----ATGA-TTACATGGTAATAT
gi|10 : AT-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-A---G-T--ATGA--CA-CGGTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCAGT-CG-AAC-TACTTT-TGT--TGC-A---ACACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GGTTTTCTATTTTT--GC----AA--CGTG---TGTAC-GGTCC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATT-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CATC-TG-GTTACA--CG--G-----GTCCTC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-AC-CAAT--A-----T--TG---A-A-CACATA-CA---AAT---AGCTTTAC------T-AGA-A--TT
gi|11 : A-TCG--ACT-GGGTCAGG-TGAAATCAAC-CA-CGTGGAGAAG-ATTCAAA-ATAGT-TTT-----AC-C-CACACATGTGTCAAAAAATAAAGAGTCACT---C--------ATATCCT--TATCAA--CTGCT-GTAAT-TGT-GAATTA----TTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGCTGA--A---AG-ATTAAA-AAA-AA-AAAGAA-T-TTTCA-T-C-AAT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--C-TTTA-T-TTTG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------GTC-TGT-AGA-T--C-ATAT--ACATCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GG-AT-AA--T-TCACAT-GG-----CA----------AA-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-C--CTG-A-CA-CAGTC-CT--CTT--AA--C-TA-TACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTG-TTTT-ATGTTG-TG-G-ATTTCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTtctttatatggagaccattctgttacatgatttatcggaactatgaataaacataccaaaatgtcatctaactcatatttaggg
gi|12 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-TTATTAC---GGT--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-TTATATTA--G-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTC-AG-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-A-A----CCCT-TG-TAAAAAT--GG--------------GC----AA--C--G---TGTAC-G--TCTTGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AG-----TTTA---T-AGA-------------------------------AATT--TC-TTT-----------------------------------------------AA-T---------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-ATT-T-ATC---GG--A--AA---TGA-------ATAAAACATTA--C-C-AAAA
gi|13 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-TACGG-T--ATGA--CA-C-GTC-CC--CTG--AA-T--TAT-ATTG-TAAT-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG---ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTTCA-G-TG-ACT-GACT-T-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TGTTAAAAAT---G-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCACAA-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-TTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---AAT---AGTTT-------------------------------------A--T--AGAAT---TC-TTT-----------------------------------------------AA-TG--------GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---T-atgtcgatctaacttcattattaggga
gi|14 : GT-A-TATGTTTT--GTGATT-TG-G-ATTTCA-CTT-TT------A-TGT-TCTC---CA--TTTGCA-G-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-T--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-ATT-CA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CATT--A-----TC-TT---A-A-T----G-TG---G---------CTATTTG---T-AGA-A--CAGTGCATAGAACAGTGC-A--T--AGAACG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA--------------------------------------G---A------ATTT-CTT-T-AA--TG-G---tta
gi|15 : actngtttatacgGA--TT---TCAC-TTA--CA-T-AC-TC-T--CG-T-C--AAT-GTG--A--CACT--G-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CGG--TA-G-G--------TAGAATTTCGTC--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---T-AAA---GG--C--AG---TGA--C---TAAAAAATA-TA--C-C-ACAAa
gi|16 : gAAAG-TATTG-G-A--GAA-TAT--TTTCAATCCCT-AAAAACTG--CCCTA---TTGA----AATATCAT-G-GTAATTTT--ACTTGTGTGTTAT---A--TCTTACCATG-AAAATGTGCATGTTTT--C---AGATTC-AAAC-ATA--GCG-CTTTATTTGGTCG-T--AAACATT-CCTA-ATTACACTCTTCCA-CA--CATGATAAATCACAGTGAC---ATT-TC---TGG-TGCTGACAT---GCagtttgttaaagctttcatctttaggga
gi|17 : ACTTC----CT-CTTTGACAACTAAT-AGA-TTAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTG
gi|17 : ---AGTTTT--TTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-G--T--AGAATG--TC-------AG--CA-G-T--------TAGAATCTCTTT--------------AA-T---------GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---T-AAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-Atttttgtaaaactttgcgtagaatgtcagcagttagaatctctttaatggggatgatttcttgtaatgataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaa
gi|18 : cactgtgtcgagtaaaactaatctattagttgtcaaagaggaT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTTTGT--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---aa
gi|19 : CTCAGGATG-ATAGATTCAGGAAAAGCGGA---TTCA---TCA-GCGT-AAACAAATATT---ATATTGTTTTTATTCTT-GAAT-TA-TGAAAATTG--TATCTGTATA-CCATATACACTCAATTA
gi|2 : TAGT-TTT-----AC-TCGACACA-GTGTCAAAAAG----AAG--ACTATCC--------ATTTTCTCTGATGAA--TTGG--GTA---TGT-ACA--A-CGTTT-C---ATCGATA-AC-TCAGA-C-CAGATGAATT---AGTAC---C-CAG-T--AAAGAA-TTATTAAAT-C-AGTGC------------T-A--AAACAT---AAAT----TA-T--A-TTTACT-TATG-CATA---TCGAACAA----TTGT----------ATC-TCT-AAT-CT-A-ATGTGTACTTCAATAT-------------AT--CCTCAAT-GTTATTAACTT-T-ACAT-GG-----CA----------TC-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGGA-CA-CA-TC-CT--CATTTAA--C-TAT-ACTGATG-TTCTC--ATCAT-A-TGT-----T-ATGTTT-AGCG-ATTTCA-TTT-TC------ACTGT-CCTC---TA--TT-GCA---TG-ATC-AACTAT-TG---TGCTAC--A-ACAA--CCTCT-T--TAAAAAT--GGGTCGAATA---T--GC----CA--C--G---CTCAC----TC-CAGCGTT---CCAC-A-C--CA-TTCC-TC-TACTG-T-C--AATTGTG--A--CACC-TG---TACATCCG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TCGAAGT----CAAT--A-----TA-TT---G-A-C----A-TT---AAC---A--TATATTTG---T-AGA-ATACTGTG------------C-AG-T--AGAAGT--TC-TGTACCAG--CA-T-C--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACA-GT---CCTGG-AA--TG-G---G-AAAAAAGA--A--AGCT-TGA--CACCCACAAGG-G-CA--C-CCATAATACGTCCATGAAGTGAT-------CCTCGGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-AC-AT-AAAGA-AGTCCTTTTCGACTTCTGAAA--ACTACCTATACTTGACTCAAGTCATTAT--TATATTGCCTCTGT-ATCTCATAGTAA---TCTTAGCATT--GTATGTCAAATTCTTAAAC-TAACATTCTAT-CTTTTTTTAAGCATTCCCAATCAC-ATTAAGT-ATA-ACAC-TGAG-AGGACAATAGTCGACGCATATT-CTGTCT---TGCGACATATAGAA--GTAATAGCCGATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTATACG-CAGCCCCTTGGAGAAGGGT-GAAGTATATTCTTAACTAACACATGTGTCAAAAATTAAATGAGACAACTCTCTATAGTATCCTCAATAG-AAAT-CTTTAATTGCGTAAGGGTTTCAAT-AAACATCAGACTC-CGATGTATTGCTTCAGGAAAA---GAC--TTAACTCTCAGGTGTAAAAGAAATAGTTAAGTA---TTTTCA---TT-GCCTGTA-CGAAAACTTACTATC--TAAATCGGTATACA-TC-ATTATTCTA-AT--TGT-------T-AA--TATTTA-TCG-AATCAATTATACAGCAATTTTTATCTAATATTATCATCACTTACATGG
gi|20 : atATCTGTATA-CCATATACA-TCAATTAT--TACATG-TATCAATGTAT-AA--TTTGCA-TGGCAATAT--TATACATTCATTATTATC-AATGT----ATAATTTACATGGTGAattatttga
gi|21 : --------ATTTTCT--AATGAA--T-GCT-GCAAT-TAT-GAA----GGCTTTC---AT-GAAA-CC-CCAGA-CTCTGAGAA--T---AG-AT---A-C
gi|23 : tA-T-C-AGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-T--T-TTTA-T-TATG-TATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACcgaataagggtttttttttttcagtgaagataag
gi|24 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCTT-GAGAA
gi|3 : cAAG-TATTA-A-AAGGAA-TGTGTTTTCAA-CCCT-GAGA-CTG--CT-TA---ATGA--TTAA-GTCAT-TTGTA---TTAGGCTTCTGTGTTATTCGC--TCT----ATA-AAAA-AT--ACGTGTTTTC---AAATCTTAAACCAAACTGCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATTTCCTA-ATCA---------A-CA--CAT------------TGAC---AAT-TTGATTGA-C-TTGACATTGTGTT----AAAAAAAAA-A-AAAAAT--AAACGCCGATA-GACACGTTTTAATCGGAATT-GAGTCAGG-TGACT-CATG-CC-TTCGGAGAAG-AAT-AGAAGTAGT-TTTCGTTTACCT-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TTC--------AT--CCT--GATGTA--TTGTTTGTAAT-TGT-GAA--G-GGTTT-C---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCATATAA--TTATAG-AT---A-CAG-TATAAAGAAAT-ATTAA-T-C-AGTTGGTTTATGTAGTGT-A--AAA--C---AGATA---TAAT--T-TTTA-T-TATGGCATT---ACGAA-AA----TT-TACAGTACTACATC-TCTAAGACC--A-ATGT--ACTTCAAT-T--------------T--TATACAT-G--AT-AAT-T-T-ACAT-AGAACATCGTAAACAAACCATCATAGCAA-----TAG----TA-G-T-ATT-C---GAT--ATG-A-CA-CCATC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG-TG-T-CTCCAGCAAT-A-TGT-TGTTT-AGGTTT-AG-GAATTTCA-CTTATCAATACTA-TGTCCCTCCG-TA--TTTGCCAGTCT-GTC-G-CTATATGTGCTGC-AATTA-ACA---CCCCTGTA-TAAAAAT--GG-----------T---CTCTGAA--C--G---TGCAC-G--TC-GGA--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC----TG-TCC--AAT-G-------CACA-TGCGTTACA--CGCTGCGCGCG---TC-CCATCTT-G-TGAAGG--A--CAAT--ACATTCTT-TG---ATACC----ATTA---GAT---AG-TCTATTTGCTAT-AGA-AATCTGTG------------C-C--TTCAGAATGCTTCTTGT--CAAGTCATG-G--------TA---------C--------------AATT---------GG---AGGACGAATTC-CTTGT-AA--TG-G---G-ACT---GGAAA--AG---TGACTC---CAC-AAATG-CA--CTC-ATAACG
gi|4 : AG-TATTAGA-A--GAA-TGT--TTTCAATTCCTTGAGAACTG--CTATA---AGCA--TTAA-AGCAT-T-GTA---T---GCTTCTGTTTTAT---C--TCTT----TA-AAAGAAT--ATTGGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--TGTAAACATT-CCTAGATCA--------CA-CA--CAT------------TGACTCCAAT-TTA--TGA-TGCTGACAT---GCA----AAAAAATAA-ATAAAA-TTGAAA-ACTGATATGACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGA-TTCAGG-CT-CT-GGAGAAG-AAT-AGA-GTAGTATTT-----AC---GACCAACTT-TCAGAAAG----GAG--ACT-TTC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGTG-GTAAT-TGT-GAA--A-G--TTTC---AT-G--A-CCTTCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---ACCAGTTT-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AG-TG------------T-AAGAA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACG---AA----TT-T----------AGC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACTTCAAT-G-------------ATAATATCAATCGT-AT-GAATT-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------AGTTTTTTG----AA-GTT-ATC-T---C-T--ATGAACCA-CAGTC-CT--CAT--AA--C-TAATACTG-TG-T-CTCCAAGCAT-A-TATGTTGTTAATGTTTAAG-G-ATTTCAGCTT-TC------A-TGT-CCTCAGATA---TTGC-AG-TG-ATC-GACTAT-TG----GC-A---A-ACA---CCCCT-TG-AAAAATT--GGT----------T--GC----AA--CT-T---TGCAC-G--TC-CGG--TTGCCCCAC-A-AT-CA-T-TCTTC-T--TG-T-C--AAT-GTG--ACCCACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TT-CCA-CTT-G-TGAA-GT-AAGCAAT--A-----TC-TGGGAG-A-C----A--A---GAT---AGGTTT-TTTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-GTTT--AGAA-------TGT--CAG--CA-G-T--------TA---------G--------------AA-TCTCTTTAAGGG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-GATAT-AAA---GG--A--AA---TGA--C-----CAAAACG-TA--C-C-AAAA
gi|5 : AAGCTATTA-ACA--GAAGTGT--TATCAATCCCT-GGAATCTATCCTATACATGTGAATTTAA-GTCATGT-GTA---TT---TTTCTGTGTTAT---CACTCTT---ATATAAAAAAT--TTGTGTT--CTATAAATCTTAAAC-AA---GCAAC-----TCCGTTG-T--AAAC-CT-CCTA-ATAA--------CAACAGACATC-----------TTTC---AATGTT---TGAATGCTGACAT---GCCCAGGAAAAATAAATA-ACAA-T--AAATGCTGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACTCGAGTCAG--T-ACTTCAGGGCTGCATTAAGAGA-GAT-AGA-GTATT-TTTT----AC-T-GA-ATACATGTCAAAA-G----GAG--ATT-TCTTTCCAATGATTTGTT--GATAAA--T-GTTCGTAAT-TGT-GAA--A-AGGTTCG---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTC--ATGA--T---AG-AT---A-CAG-TT-AAAGAA-T-ATTAC-TGC-AG-TG------------TCACCAA---CACGAAATA---TA-T--TCTCTA---TATG-CATT---ACGAA-AA----TA-T----------ATCTTCT-----C----ACGT--A--TCAAT-TTGCTAACCCTCCAAT--AATTCAT-GT-AT-AAG-T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------G-----TTGTCGAGA-G-T-ATT-C---G-T--ATG-A-CATCAGTC-CT--CAT--AA--C-TA-TACTG--G-T-CT-CAAGC-T-A-TATGTTGTC-ATGTTT-AA-G-ATGCTA-CTT-TC------A-GG---CCC---TA----TGC-AG-TG-ATC--ACTAT-TGC--TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GG--------------GC----AA--C--T---TGCAC-G--TC-CGG---T---CCAC-A-A--CA-T----TCGT--TGATAC--AAT-GTG--C--CACTATG-GTTACA--TC--G-----G---TC-CCA-CTTGG-TGA--GTAA--CAATTAA-----TC-TG---ACA-C----A-TA---GAT---A
gi|6 : AAA----GAG--ACA-TTC--------ATTTCCT--GATGAAACCTGCT-GTAATCTAT-AAC--ATGATTTTCTGCAT-GAAAACC-TCAGAGCTCAGGTCA--T---AG-AT---T-CAA--G-AAAGAA-T-AT-AA-T-CCAGT-G------------T-A--AA---C---AAATAATATA-TGCT-TTTC-T-TA-G-AATT---ATGGA-AAAATGTT-T----------G-C-TGT-ATA-CTCATAT-T--ACATCAATCT-------------AT--TATCAAT-GA-A--AT--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----T-G----AA-G-TTGGT-C---G-C--AATTA-CA-CAGTC-CT--CTT--AA-T--TAC-ACTG-TA-T-CTCCAAACGTCA-TGTG-TTTT-ATGTTT-TG-A-ATTTCA-CTT-TC------A-TTT-CTTC---TATGTTTGC-AG-CGCACT-GAC--T-TG---TGCAA---A-ACAC--CCCCT-TG-T-AAAAT--GGGAT--------T--GC----AAACC--G---TGTAC-G--TC-CGT--TT---CCAC-A-AACCA-T-AC-TC-T--TG-T-CCAAAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CGA-G-----G---TCTCCA-CTT-G-TGAA-GT-A--CAAT--A-----TC-TG-----G-C----A-TATTGGATGTGGGTTT--TTTG---TAAGACA--CTGTG------------C-A--T--AGA------CATGT--CAG--CA-G-G--------TA---------CCCCAATTTAACTTTAA-T---------AG---A-G-TG-ATTTGTTTGT-AA--TG-A---T-AAA---TG--ATCAG---TGA--C---CAAAAGATG-TA--C-C-ACAAC
gi|7 : caactgtA---C---AAATC---TA-C--T-TGCA-C--A-G-CATTCAAACGAA-GA----TC-T----------ATC-C-----A-C--C-TTGT--ACATCAAT-T--------------T--TATCAAT-GT-GA-AA--CAT-ACATTGA-----CA----------AT-------T-----TTG----AACG-T-ATT-T---G-TCAATGAC-CA-CAATCACC--TGT--AA-T-----TACT--------CCCAAATGC-AGTGTGTTTT----------G-G-ATTTC--CTT---------G-T-T-TCTT---TA--TTTGCA-G-CG-ATCTGACT---TG---TAC-A---A-GCAAAACCGCT-TG-TAAAAATTCGG-----------TATGC----CA--C--ACACTGTACCG--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TCAT--TG-TTC--AAT-GTGTGA---ACT-GG-TTTAT---CGT-G-----G---TC-C-A-CTT-G-TGAAGTT-A--CAAT--A-----TCTTA---A-A-C----A-TG---GAT---AGTTT--TCTG---T-AAG-A--ATG-G------------CGA--T--AAAA-G--TC-TGTA-CAG--CA-GTGAGAATTTCTT---------C--------------TA-T---------GGGCTA-AAC----TT-CTTGT-GAATTGAG---TAAAA---GG--A--AGTTTTGA-------AGAAAAT--TAATC-C-GCACTG-GTTTACGAAGC--TTTCACTATTT-AGGAGATTACGTGTATATCAA-AGTATTAAAGAGA-TGGTTT-CAATCCTTAAGACCACTGCC-ATA-CTGA-TCAAGTCA--ATCGTAAATTGCTT
gi|8 : GGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATggtgcgttcat
gi|8 : CAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-TTAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTAGA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATGCTAT-------TCAATTTTTACA-TGGCA--ATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|9 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAT-AG-----TA----------AT-------G-----TTA----AA-A-T-ATT-T---G-C--ATGA--CA-CATTC-CT--CTT--AA--C-TAT-ACTG-TA-T-CTCTATATGT-A-TGTGTTTTT--TGTTG-TG-G-ATTCCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTTGCA-G-CG-ACT-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-C-C----A-TG---GAT---AG--GTATTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CAG--TA-G-G--------TAGAATTTATTT--------------AA-T---------GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---T-AAT---GG--A--AG---TGA--C---TAAAAAATG-TA--C-C-ACAAt
blockSeqs : C GA AG G GT T A TC C CAT AT T TT ATTTTA TCGC ACC T T GC TT TAT T C CT A TTTAT TGT T G CACTCTTC A GA GATAAATCACAG TCC G GAT A TGT CCAGG AT TTG C T GT A GA C . A GGG G T T C A A CGTTT TC TG TAAA TC A TTCCAATG CT AC T TTT C . ATGAT T TGC C A T G TTAT T TAAA TAT A T A G C TTGGTTTATGTAGTGTA ACA ACG ATA A GC C CT T G CAA C AATG G ACAGTACTAC T G ATACTCAT GT A TTGCTAACCCTCCAAT C TT TT CT A C T AACATCGTAAACAAACCATCATAGCAA TCGA C T T TACG G CA AAC T G A . T TT TTATATT A A T A C G TA AA C A G A AATACT C C AGA TG AG T C T T A TGC T ATT C AAA G TT TC TTTTCTATTTTT TCTG AC ACAC C GT T CG GCC A T AC T TC T G AC A C CA T TG CC TAT C TC CT CGCGC TCC T T G T A AG TA CATTC T GGAG C ACAT T TTG GTG CTTTA CTA A C TA CATAGAACAGTGCA TC TGCT T ACC GT T GTACCCCAATTTAACTTTAAT GCT G GA G . AT GATAT AAA AA TC TTT CACCC T CAT AT T C C CTTTCACTATTT T . T TT AG T T G CC T C C ATT CG T TCTT A T G TC . AT C T . TAAGT . . . C GC ATT T . C . T G GCT A A T . . A T A A A A TCTATAGTA A AG G T . A TA GCG CTT CTC G A TAA TTG TTC . G . TAC T T T C C TC C GC CAATGTAT TT T . C A A T T TATC C
blockSeqs : . AC . . . . A . A . . . GT TTAGG CAC . . T . . . T . . . . TGT . . . . . C . . A . . T TA AT T . . . . . . C AC . T . . . . T TC CT . . . . . . T TTC . . ACGT T . . . . . ATT . AC TTT . . . . . TGTCACC A . ATA . . . T T . . . . . . . C AAGACCA . T GATAA . G T AT . . . CAATAGTTTT . . . T AC A . GA . A . . T . CTAAT . . . G . . T A . . . . . . . CG . CA . . . T . T A C . A . T . GTCGAATAT . . GTG . . . . . . . T . A . A . . A . . . . CT . . A . . . . . T . C . . . AT . . . . . TTTT . . . AT CGTT . TT A AC . . GTAGAATTTCGTCAAT . . C . . . ATTT . . . CT CTCC A TA . . . . TGATCCTC . . T TT GA T . A . . . . A . . . . ATT . G . . . . A . C . . . . . TT . . . G T A . G . . . G TC . G . C A A T . . T
blockSeqs : . G . . . . A . A . . . G TTG A . . A . . . . . . . . TGT . . . . . . . . . . . A A T . . . . . . . C TG . C . . . . . CT CT . . . . . . T CT . . GGGT T . . . . . A . C AA . . . . . TGTAAG . . ATA . . . T T . . . . . . . C AATCTA . T ATAT . T T T . . . TGGTA . . . . A . . TA . A . . T . TTAT . . . A . . T T . . . . . . . . . A . . . T . C . . . C . T . GATT . . TT . . . . . . . . . A . . . . T . . . . TG . . T . . . . . . . . . . . AC . . . . . TATA . . . . CAG . CG . C . . TTAGAATCTCTTTAAT . . C . . . AGTA . . . . CT C CG . . . . . T A G . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C T . C . . . . T . A . . . . T . . T
blockSeqs : . A . . . . A . A . . . T TG C . . A . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . C GG . T . . . . . C CA . . . . . . T CT . . AAGG C . . . . . T . A TT . . . . . TGCTA . . . . . . T T . . . . . . . C AGATC . T CTAT . T T G . . . CAAAA . . . . C . . AC . C . . T . CTAT . . . A . . T A . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . T . TAT . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TCTA . . . . CGA . TG . C . . TTAGAATCTCTTTAAG . . G . . . AT . . . . CC C TG . . . . G . A .
blockSeqs : . A . . . . T . . . . . T TT C . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . T TG . . TTA T . . . . . T . A T . . . . . TGTA . . . . . . T T . . . . . . . C AGACA . A TAT . A T . . . . TGGTA . . . . C . . A . A . . A . TTAT . . . G . . T A . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . T . TT . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GTTT . . . . CA . TG . C . . TGAGAATTTCTTCTAT . . G . . . AT . . . . CT C CG . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . CT . . GGC . . . . . . T . A G . . . . . TGTA . . . . . . T T . . . . . . . C AGACA . A TT . T A . . . . TGGTA . . . . C . . A . A . . A . CTAT . . . A . . C T . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . A . T . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TTT . . . . CG . GT . C . . GTAGAATTTATTTAAT . . A . . . AT . . . . C C TG . . .
blockSeqs : . . . . G . . AG . . . . . . T . T . . . TGTA . . . . . . C . . . . . . . . G ACC . . TT . . . . . . . CATCA . . . . T . . A . A . . A . CTAT . . . A . . T A . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . T . T . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . CTA . . . . CC . TG . C . . GTACAATT . . G . . . GG . . . . C A TG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . . CAATG . . . . C . . A . A . . A . CTAT . . . A . . T A . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . T . T . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GTA . . . . CA . T . C . . CTACAAT . . G . . . GG . . . . . G G . . .
blockSeqs : . CAATA . . . . C . . A . A . . T . TTAC . . . G . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . T . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TTT . . . . CA . G . . . . AATG . . G . . . AT . . . . . A T . . .
blockSeqs : . CAATT . . . . T . . A . . . . G . CTAT . . . G . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TTT . . . . A . . . . . . AAT . . . . . . AT
blockSeqs : . TAATG . . . . T . . A . . . . T . TT . . . G . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GTA . . . . . . . . . . . GTA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : TTG***** TGT** TC* TT** TGTA**************** T** AGACA***** TAT**************** A** ** CTAT**** A* ** TTT** NTAGAATTCTTCAAT**********************************
originalCons : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTT--T--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----AC-T-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAG-TN-AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTTG------------T-A--AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTA-T-TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACNTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGAA-CA-CAGTC-CT--CNT--AA-TC-TATTACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCAAG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-G-G--------TA---------C--------------AA-T---------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
finalCons : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTATTG-----CTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-C-----TCGGTTTGT--AAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGAC---AAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAAAAAAAA-A-AAAA-T--AAACGCCGATA-GACAC--TTTA-TCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AGA-GTAGT-TTT-----ACTC-GACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTGCT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCAGATGA--T---AG-AT---A-CAGTT--AAAGAA-T-ATTAA-T-C-AGTGTA----------------AA---C---AAATA---TA-T--T-TTTAT--TATG-CATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCTAGACA-----ATGT--ACNTCAATTAT----------------TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--ATGA--CA-CAGTC-CT--CNT--AACTAT----ACTG-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTGCA-G-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TC-TG---A-A-C----A-TA---GAT---AGTTT--TTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-GNTAGAATTCTTCAAT----------------------------------GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---T-AAA---GG--A--AG---TGA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--T-------CCT-GGGAGA-GGGGTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AATGGGGCTGTGCGGGGTAGCGCGTATGCCCAACCCTATTTAACAGTAATCCGTCTATTCTGAGAAC
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111111 111 111 1 22222 22222222 444444444444 111 111 111 333333333 1 2 1 1 1 11 11 1 22222 11 1111 11111111 1111 2222222 11111 1111 444444444444444 222 1111111111 1111111111 3333333333333333333 22 22222222222222222222222222222222 111 111 44444444444444 111 11 11 11111111111111111 11111 222222222222222222 11111 111 2222222 1 999999999999999 1 1 111 1 11 1 1 1 222 11 4444444 111 1 11 1 33 1 333333 1 1 1 1 11 1111 1 222 1 11 1 222 1 1 1 1 1 1 1 1 222222222 1 111 1 1 1 11 111 111 111 1 1 111 111 111 1 1 1 222 11 1 11 333333333 11 1 1 2222
lowQualScore : 6 666 99 6 99 5 1 99 3 111 99 6 888 22222222 555555 111 6 7 99 99 111 3 6 99 6 11111 6 6 44444444 6 99 000000000000 111 6 888 6 111 333333333 0 0 2 0 0 11 11 8 8 66 888 6 7 3 6 6 00000 5 6 33 2222 77 5 0 88888888 66 66 3 1111 5 5 1111111 888 5 5 5 5 9999 66 5 11111 5 8888 5 5 5 5 5 5 66 222222222222222 777 66 333 4 66 4 777 66 777 4 9999 4 9999999999 4 1 7777777777 66 2 5555555555555555555 5 88 55 33 5 5 3 55555555555555555555555555555555 7777 3 3 6 66666 6 44 3 6 44 3 3 2 3 44 1 44 44 3 3 3 3 6 3 2 3 3 4 66 33 3 3 3 3 888888 3 3 999 44 3 3 6 6 0 3 7 3 222 6 999 3 222 3 44 44 00000000000000 7777 44 999999 3 44 3 44 555 3 3 77 3 55 3 6 44 3 9 44 3 44 44 000 3 0 44 00 77777 555 3 3 3 6 0 3 00 44 77777 3 88888 3 6666 3 44 555 555 333 888 555 3 3 88 99999999999999999 55 22222 7 88 55 444444444444444444 3 1 3 555 3 44 3 3 55 33333 111 55 55 55 777 0000000 1 666 55 4 4 0 2 0 222222222222222 3 0 3 66 111 1 0 1 33 0 0 0 999 33 7 5555555 1 999 5 88 5 22 00 1 5 000000 5 5 5 5 66 9999 5 111 5 88 5 1 000 5 5 5 5 5 5 1 1 1 3 3 888888888 3 666 6 3 3 0 11 777 444 777 0 0 777 777 000 0 0 0 777 6 1 8 1 8 0 33 0 22 333333333 33 1 0 2 3 3 3 0 1111 0 7
lowQualScore : . ... .. . .. . . .. . ... .. . ... ........ ...... ... . . .. .. ... . . .. . ..... . . ........ . .. ............ ... . ... . ... ......... . . . . . .. .. . . .. ... . . . . . ..... . . .. .... .. . . ........ .. .. . .... . . ....... ... . . . . .... .. . ..... . .... . . . . . . .. ............... ... .. ... . .. . ... .. ... . .... . .......... . . .......... .. . ................... . .. .. .. . . . ................................ .... . . . ..... . .. . . .. . . . . .. . .. .. . . . . . . . . . . .. .. . . . . ...... . . ... .. . . . . . . . . ... . ... . ... . .. .. .............. .... .. ...... . .. . .. ... . . .. . .. . . .. . . .. . .. .. ... . . .. .. ..... ... . . . . . . .. .. ..... . ..... . .... . .. ... ... ... ... ... . . .. ................. .. ..... . .. .. .................. . . . ... . .. . . .. ..... ... .. .. .. ... ....... . ... .. . . . . . ............... . . . .. ... . . . .. . . . ... .. . ....... . ... . .. . .. .. . . ...... . . . . .. .... . ... . .. . . ... . . . . . . . . . . . ......... . ... . . . . .. ... ... ... . . ... ... ... . . . ... . . . . . . .. . .. ......... .. . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 7 888 22 7 22 7 7 22 2 777 22 7 333 00000000 000000 777 7 8 22 22 777 3 7 22 7 55555 7 7 22222222 7 22 888888888888 777 7 333 7 777 000000000 0 0 8 0 0 00 00 0 0 00 333 7 5 3 7 7 00000 7 6 11 1111 99 7 4 11111111 99 99 2 2222 0 0 6666666 888 0 0 0 0 1111 99 0 00000 7 3333 7 7 0 0 0 0 99 222222222222222 888 11 333 4 11 4 000 33 888 4 4444 4 4444444444 4 1 7777777777 11 8 9999999999999999999 0 44 44 88 0 0 3 11111111111111111111111111111111 1111 3 3 7 66666 7 66 3 7 66 3 3 4 3 66 0 66 66 3 3 3 3 7 3 5 1 1 2 55 99 1 1 1 1 888888 1 1 666 22 3 3 7 7 1 3 7 3 555 7 222 3 555 3 77 66 88888888888888 1111 66 222222 3 66 3 22 444 1 1 33 1 77 1 2 22 1 2 22 1 22 22 000 1 8 22 44 77777 444 1 1 1 2 8 1 44 22 77777 1 66666 1 5555 1 22 444 000 999 000 444 1 1 55 11111111111111111 00 22222 3 66 00 999999999999999999 3 4 3 888 3 22 6 6 00 77777 000 55 55 55 000 7777777 6 888 55 0 0 9 0 7 333333333333333 3 0 2 55 000 0 0 0 88 0 0 0 222 88 3 0000000 0 000 0 00 5 00 55 0 0 000000 5 5 0 0 00 5555 5 000 0 55 5 0 555 5 5 5 5 0 5 0 0 0 3 3 000000000 3 777 7 3 3 0 22 555 888 555 0 0 555 555 222 0 0 0 555 4 0 0 0 0 8 88 0 55 555555555 88 2 0 5 2 2 2 0 2222 2 0
consensus : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-CTCGGTTT----GTAAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGA---CAAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAA-AAA-AAATAAAAATAAACGCCGATA-GACAC-TTT--ATCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AG-AGTAGT-----TTT-ACTCGACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTG-CT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCA---GATGA--TAG-AT---A-CA-G-T-TAAAG-AAT-ATTAA-T-C-AG-T--GT------------A--AAC---A--AATA---T-AT--T-TTTA-T-TAT-GCATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACNTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--A-TG-A--C-A-CAGTC-CT--CNT--AA--CT-A-TACT-G-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTG-C-AG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TCT-G---A-A-C----A-T--A---GAT---A-GTTT--TTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-GGTA---GAA-T-T---C-TTTAAT-GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---TAAA---GG--A--AG--T---GA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--TCC-------T-GGGAGAGGG-GTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
Reference ( family-2240 ) : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-CTCGGTTT----GTAAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGA---CAAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GCN----AAA-AAA-AAA-AAAAATAAACGCCGATA-GACAC-TTT--ATCG--ACT-GAGTCAGG-TGACTTCANG-CT-CTTGGAGAAG-AAT-AG-AGTAGT-----TTT-ACTCGACACACGTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTG-CT-GTAAT-TGT-GAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCA---GATGA--TAG-AT---A-CA-G-T-TAAAG-AAT-ATTAA-T-C-AG-T--GT------------A--AAC---A--AATA---T-AT--T-TTTA-T-TAT-GCATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACNTCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CG----------AT-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--A-TG-A--C-A-CAGTC-CT--CNT--AA--CT-A-TACT-G-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTG-C-AG-CG-ACC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TCT-G---A-A-C----A-T--A---GAT---A-GTTT--TTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-GNTA---GAA-T-T---C-TTCAAT-GG---A-GACG-ATTT-CTTGT-AA--TG-G---TAAA---GG--A--AG--T---GA--C---CACAAAACG-TA--C-C-ACAACGCGTTCACGAAGC--TCC-------T-GGGAGAGGG-GTGGGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCNTT-CNATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTCA--AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAATCTTAGCNTNCAGTATGTCAAATTCCTAAACATAACNNTCTATTCTTTTTNTAAGCATTCCCAATCACCATTAAGTCACATACACATGAGGAGGACAATAGTCGACGNATACTGCTGTCTGAACGCGACATATAGAAATGTAATAGCCNATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTGTACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCGGAGTATANTCTTNACCNACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-ATAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTANA-CNGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACA-TGGCAATATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATAT
gi|1 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTCCAATCCCT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-CTTGGTT------TAAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGA---CAAT-TT---TGA-TGCTGACAT---GT---------AAA-AAA-AAAAATAAA-GCCGATA-GACAC-TTT--ATCG--ACT-GAGTCAGGTTGACTTCATG-CT-CTTGGAGAAGAAAT-AG-AGTAGT-----TTT-ACT-GACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TCC--------ATTTCCT--GATGAA--TTG-TT-GTAAT-TGTGGAA--A-GGTTTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCA---GATGA--TAG-AT---A-CA-G-T-TAAAG-AAT-ATTAA-T-C-AGTT--GT------------A--AAC---A--AATA---T-AT--T-TTTA-TATAT-GCATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCTAAGA-C--A-ATGT--ACTTC--T-T-------------AA--TATCAAT-GT-AT-AA--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--A-TGAA--C-A-CAGTC-CTTACAT--AACTCT-ATTACT-G-TAGT-CTTCAAGCAT-A-TATGTTGAT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-CCTC---TA--TTTG-CAAG-TGTATC-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGCAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC-T--TG-T-C--TAT-GTG--A--CACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-AC-CAAT--A-----TTT-G---A-A-C----A-T--A---GAT---A-GTTTTATTTG---T-AGA-A--CTGTG------------C-A--T--AGAATG--TC-TGT--CAG--CA-GG---------------C-TACAAT-GG---A-GACG-ATTC-CTTGTAAA--TG-G---GAAA---GA--A--AG--T---GA--C---CACAAAATG-CA--C-C-ATAACGTGTTCATGGGG---------------GGGGGGGGG-GGAGGTATCAACACTA-TAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATAGTAAGAA----AACTTGCAGTAT-TCAAAT--CTAAACATAACTATCTATT-TTTTTGTAAGCATTCCCAATCACCAT----TCACATACACATGAAGAGGACAATAGT-GAC-AAT-CTGCTG-CTGAACATGA-ATATAGAAATGTAA-AGCCTATCAACAA---TTTATCG-ACTGCGTCAG-GTG-ACGTCAGCCCCTTGGAGAAGGGTCAGAGT-TAGTTTTTACCTACACATGTGTCAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-GAAAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATGTAAACCTCAGACTC-GGATG-GTAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TTAGCCT-TATCGAAAATT---TATCCGTAAA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATG-TAT-------T-AA--TTTACAGTGGCAATATATTATACATCAA-TTTTATC-AATAT----ATGA-TTACATGGTAATAT
gi|10 : AT-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-A---G-T--A-TG-A--C-A-CGGTC-CC--CTG--AA--TT-A-TATT-G-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTG-TTTT-ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTT-C-AGTCG-AAC-TACTTT-TGT--TGC-A---ACACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GGTTTTCTATTTTT--GC----AA--CGTG---TGTAC-GGTCC-CGG--TT---CCAC-A-A--CATT-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CATC-TG-GTTACA--CG--G-----GTCCTC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-AC-CAAT--A-----T-T-G---A-A-CACATA-C--A---AAT---A-GCTT--TAC----T-AGA-A--TT
gi|11 : --ATCG--ACT-GGGTCAGG-TGAAATCAAC-CA-CGTGGAGAAG-ATTCAA-AATAGT-----TTT-ACCC-ACACATGTGTCAAAAAATAAAGAGTCACT---C--------ATATCCT--TATCAA--CTG-CT-GTAAT-TGT-GAATTA----TTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCA---GCTGA--AAG-ATTAAA-AA-A-A-AAAAG-AAT-TTTCA-T-C-AA-T--GT------------A--AAC---A--AATAATAT-AT--C-TTTA-T-TTT-GCATT---ACGAA-AA----TT-T----------GTC-TGT-AGA-T--C-ATAT--ACATCAAT-T-------------AT--TATCAAT-GG-AT-AA--T-TCACAT-GG-----CA----------AA-------A-----TTG----AA-G-T-ATT-C---G-C--C-TG-A--C-A-CAGTC-CT--CTT--AA--CT-A-TACT-G-TA-T-CTCCAAACGT-A-TGTG-TTTT-ATGTTG-TG-G-ATTTCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTtctttatatggagaccattctgttacatgatttatcggaactatgaataaacataccaaaatgtcatctaactcatatttaggg
gi|12 : T-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-TTATTAC---GGT--A-TG-A--C-A-C-GTC-CC--CTG--AA--TT-A-TATTAG-TA-T-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTT--ATGTTT-AG-G-ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTT-C-AG-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-A-A----CCCT-TG-TAAAAAT--GG--------------GC----AA--C--G---TGTAC-G--TCTTGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TCT-G---A-A-C----A-T--A---AAT---A-G-----TTTA---T-AGA-A--
gi|12 : -T-T---C-TTTAAT-GG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-ATT-TATC---GG--A--AA--T---GA-------ATAAAACATTA--C-C-AAAAatttctttaatggagaccatttcttgtaatgatttatcggaaatgaataaaacattaccaaaaatgtcgatctaacttcattattaggga
gi|13 : tggtggtattaaagttattacggtatgacacgtcccctgaattatattagtatctccaaacatatgtgttttatgtttaggatttcactttcatgttctctattttcagtgactgacttttgtgcaaaacccttgtaaaaatgggcaacgtgtacgtcttggttccacaacatactcttgtcaatgtgacactggttacacgggtcccacttgtgaaggtacaatatctgaacataaatagtttatagaaatT-GG-----TG----------GT-------A-----TTA----AA-G-T-ATT-TACGG-T--A-TG-A--C-A-C-GTC-CC--CTG--AA--TT-A-TATT-G-TAAT-CTCCAAACAT-A-TGTGTTTTT-ATGTTT-AG---ATTTCA-CTT-TC------A-TGT-TCTC---TA--TTTT-C-AG-TG-ACT-GACT-T-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TGTTAAAAAT---G-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCACAA-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-TTTACA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-GTTGAAGGT-A--CAAT--A-----TCT-G---A-A-C----A-T--A---AAT---A-GTTT-------------------------------------A--T--AGAAT---TC-T--------------------------------TTAATGGG---A-GACC-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---Tatgtcgatctaacttcattattaggga
gi|14 : GT-A-TATGTTTT--GTGATT-TG-G-ATTTCA-CTT-TT------A-TGT-TCTC---CA--TTTG-C-AG-TG-ACT-GACTTT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-T--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CACT-GG-ATT-CA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CATT--A-----TCT-T---A-A-T----G-T--G---GCT---A-------TTTG---T-AGA-A--CAGTGCATAGAACAGTGC-A--T--AGAACG--TC-TGT--CAG--CA-GGTA---GAATT-T---C-TTTAAT-GG---A-tta
gi|15 : actngtttatacgGA--TT---TCAC-TTA--CA-T-AC-TC-T--CG-T-C--AAT-GTG--A--CACT--G-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TCT-G---A-C-C----A-T--G---GAT---A-GGTA--TTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CGG--TA-GGTA---GAATT-T---C-GTCAAT-GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---TAAA---GG--C--AG--T---GA--C---TAAAAAATA-TA--C-C-ACAA
gi|16 : gAAAG-TATTG-G-A--GAA-TAT--TTTCAATCCCT-AAAAACTG--CCCTA---TTGA----AATATCAT-G-GTAATTTT--ACTTGTGTGTTAT---A--TCTTACCATG-AAAATGTGCATGTTTT--C---AGATTC-AAAC-ATA--GCG-CTTTATTTGGTCGTAAACATT-CCTA-ATTACACTCTTCCA-CA--CATGATAAATCACAGTGA---CATT-TC---TGG-TGCTGACAT---GCagtttgttaaagctttcatctttaggga
gi|17 : ACTTC----CT-CTTTGACAACTAAT-AG-ATTAGT-----TTT-ACTCGACACA-GTG
gi|17 : ---A-GTTT--TTTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-G--T--AGAATG--TC-------AG--CA-GTTA---GAA-TCT---C-TTTAAT-GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-A---TAAA---GG--A--AA--T---GA--C-----CAAAACG-TA--C-C-Atttttgtaaaactttgcgtagaatgtcagcagttagaatctctttaatggggatgatttcttgtaatgataaaggaaatgaccaaaacgtaccaaa
gi|18 : cactgtgtcgagtaaaactaatctattagttgtcaaagaggaT-GAGAACTG--CTATA---ATGA--TTAA-GTCAT-T-GTA---TT--GCTTCTGTGTTAT---C--TCTT---ATA-AAAATAT--ATGTGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-CTCGGTTT----GTAAACATT-CCTA-ATCA--------CA-CA--CAT------------TGA---CAAT-TT---TGA-TGCTGACAT---aa
gi|19 : CTCAGGATG-ATAGATTCAGGAAAAGCGGA---TTCA---TCA-GCGT-AAACAAATATT---ATATTGTTTTTATTCTT-GAAT-TA-TGAAAATTG--TATCTGTATA-CCATATACACTCAATTA
gi|2 : TAGT-----TTT-ACTCGACACA-GTGTCAAAAAG----AAG--ACTATCC--------ATTTTCTCTGATGAA--TTG-G--GTA---TGT-ACA--A-CGTTT-C---ATCGATA-AC-TCAGA-C-CA---GATGAATTAGTAC---C-CA-G-T--AAAG-AATTATTAAAT-C-AG-T--GCTA----------A--AAC---ATAAAT----T-AT--A-TTTACT-TAT-GCATA---TCGAACAA----TTGT----------ATC-TCT-AAT-CT-A-ATGTGTACTTCAATAT-------------AT--CCTCAAT-GTTATTAACTT-T-ACAT-GG-----CA----------TC-------A-----GTG----AA-G-T-ATT-C---G-T--A-TGGA--C-A-CA-TC-CT--CATTTAA--CT-A-TACT-GATG-TTCTC--ATCAT-A-TGT-----T-ATGTTT-AGCG-ATTTCA-TTT-TC------ACTGT-CCTC---TA--TT-G-C-A--TG-ATC-AACTAT-TG---TGCTAC--A-ACAA--CCTCT-T--TAAAAAT--GGGTCGAATA---T--GC----CA--C--G---CTCAC----TC-CAGCGTT---CCAC-A-C--CA-TTCC-TC-TACTG-T-C--AATTGTG--A--CACC-TG---TACATCCG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TCGAAGT----CAAT--A-----TAT-T---G-A-C----A-TTAA---CAT---A---TA--TTTG---T-AGA-ATACTGTG------------C-AG-T--AGAAGT--TC-TGTACCAG--CA--------------T---C-TACAAT-GG---A-GACA-GT---CCTGG-AA--TG-G---GAAAAAAGA--A--AGCTT---GA--CACCCACAAGG-G-CA--C-CCATAATACGTCCATGAAGTGATCC-------TCGGGAGAGGG-GTGGGTATCAA-AC-AT-AAAGA-AGTCCTTTTCGACTTCTGAAA--ACTACCTATACTTGACTCAAGTCATTAT--TATATTGCCTCTGT-ATCTCATAGTAA---TCTTAGCATT--GTATGTCAAATTCTTAAAC-TAACATTCTAT-CTTTTTTTAAGCATTCCCAATCAC-ATTAAGT-ATA-ACAC-TGAG-AGGACAATAGTCGACGCATATT-CTGTCT---TGCGACATATAGAA--GTAATAGCCGATCAACAAGCTTTTATCGAACTGCGTCAGAGTATACG-CAGCCCCTTGGAGAAGGGT-GAAGTATATTCTTAACTAACACATGTGTCAAAAATTAAATGAGACAACTCTCTATAGTATCCTCAATAG-AAAT-CTTTAATTGCGTAAGGGTTTCAAT-AAACATCAGACTC-CGATGTATTGCTTCAGGAAAA---GAC--TTAACTCTCAGGTGTAAAAGAAATAGTTAAGTA---TTTTCA---TT-GCCTGTA-CGAAAACTTACTATC--TAAATCGGTATACA-TC-ATTATTCTA-AT--TGT-------T-AA--TATTTA-TCG-AATCAATTATACAGCAATTTTTATCTAATATTATCATCACTTACATGG
gi|20 : atATCTGTATA-CCATATACA-TCAATTAT--TACATG-TATCAATGTAT-AA--TTTGCA-TGGCAATAT--TATACATTCATTATTATC-AATGT----ATAATTTACATGGTGAattatttga
gi|21 : --------ATTTTCT--AATGAA--T-G-CT-GCAAT-TAT-GAA----GGCTTTC---AT-GAAA-CC-CCAGA-CTCT---GAGAA--TAG-AT---A-C
gi|23 : tA-T-C-AG-T--GT------------A--AAC---A--AATAATAT-AT--T-TTTA-T-TAT-GTATT---ACGAA-AA----TT-T----------ATC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACcgaataagggtttttttttttcagtgaagataag
gi|24 : AAAG-TATTA-A-A--GAA-TGT--TTTCAATCCTT-GAGAA
gi|3 : cAAG-TATTA-A-AAGGAA-TGTGTTTTCAA-CCCT-GAGA-CTG--CT-TA---ATGA--TTAA-GTCAT-TTGTA---TTAGGCTTCTGTGTTATTCGC--TCT----ATA-AAAA-AT--ACGTGTTTTC---AAATCTTAAACCAAACTGCA-CTCGGTTT----GTAAACATTTCCTA-ATCA---------A-CA--CAT------------TGA---CAAT-TTGATTGA-C-TTGACATTGTGTT----AAAAAAA-AAA-AAAAATAAACGCCGATA-GACACGTTTTAATCGGAATT-GAGTCAGG-TGAC-TCATG-CC-TTCGGAGAAG-AAT-AGAAGTAGTTTTCGTTT-ACCTGACACACTTGTCAAAAAG----GAG--ACT-TTC--------A--TCCT--GATGTA--TTGTTT-GTAAT-TGT-GAA--G-GG-TTTC---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTCATATAATTA--TAG-AT---A-CA-G-TATAAAGAAAT-ATTAA-T-C-AG-TTGGTTTATGTAGTGTAA--AAC---A--GATA---TAAT--T-TTTA-T-TATGGCATT---ACGAA-AA----TT-TACAGTACTACATC-TCTAAGACC--A-ATGT--ACTTCAAT-T--------------T--TATACAT-G--AT-AAT-T-T-ACAT-AGAACATCGTAAACAAACCATCATAGCAA-----TAG----TA-G-T-ATT-C---GAT--A-TG-A--C-A-CCATC-CT--CAT--AA--CT-A-TACT-G-TG-T-CTCCAGCAAT-A-TGT-TGTTT-AGGTTT-AG-GAATTTCA-CTTATCAATACTA-TGTCCCTCCG-TA--TTTGCC-AGTCT-GTC-G-CTATATGTGCTGC-AATTA-ACA---CCCCTGTA-TAAAAAT--GG-----------T---CTCTGAA--C--G---TGCAC-G--TC-GGA--TT---CCAC-A-A--CA-T-TC-TC----TG-TCC--AAT-G-------CACA-TGCGTTACA--CGCTGCGCGCG---TC-CCATCTT-G-TGAAGG--A--CAAT--ACATTCTTT-G---ATACC----ATT--A---GAT---A-GTCTA-TTTGCTAT-AGA-AATCTGTG------------C-C--TTCAGAATGCTTCTTGT--CAAGTCATGGTA---CAA-T------------T-GG---AGGACGAATTC-CTTGT-AA--TG-G---GACT---GGAAA--AG--T---GACTC---CAC-AAATG-CA--CTC-ATAACG
gi|4 : AG-TATTAGA-A--GAA-TGT--TTTCAATTCCTTGAGAACTG--CTATA---AGCA--TTAA-AGCAT-T-GTA---T---GCTTCTGTTTTAT---C--TCTT----TA-AAAGAAT--ATTGGTT--C---AAATCT-AAAC-AAA--GCA-CTCGGTTT----GTAAACATT-CCTAGATCA--------CA-CA--CAT------------TGACTCCAAT-TTA--TGA-TGCTGACAT---GCA----AAA-AAATAAATAAAATTGAAAACTGATATGACAC-TTT--ATCG--ACT-GAGTCAGG-TGA-TTCAGG-CT-C-TGGAGAAG-AAT-AG-AGTAGTA----TTT-A--CGAC-CAACTTTCAGAAAG----GAG--ACT-TTC--------ATTTCCT--GATGAA--TTG-TG-GTAAT-TGT-GAA--A-G--TTTC---AT-G--A-CCTTCAGA-CTCA---GATGA--TAG-AT---ACCA-GTT-TAAAG-AAT-ATTAA-T-C-AG-T--GT------------AAGAAC---A--AATA---T-AT--T-TTTA-T-TAT-GCATT---ACG---AA----TT-T----------AGC-TCT-AGA-C--A-ATGT--ACTTCAAT-G-------------ATAATATCAATCGT-AT-GAATT-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------AGTTTTTTG----AA-GTT-ATC-T---C-T--A-TG-AACC-A-CAGTC-CT--CAT--AA--CTAA-TACT-G-TG-T-CTCCAAGCAT-A-TATGTTGTTAATGTTTAAG-G-ATTTCAGCTT-TC------A-TGT-CCTCAGATA---TTG-C-AG-TG-ATC-GACTAT-TG----GC-A---A-ACA---CCCCT-TG-AAAAATT--GGT----------T--GC----AA--CT-T---TGCAC-G--TC-CGG--TTGCCCCAC-A-AT-CA-T-TCTTC-T--TG-T-C--AAT-GTG--ACCCACT-TG-GTTACA--CG--G-----G---TT-CCA-CTT-G-TGAA-GT-AAGCAAT--A-----TCT-GGGAG-A-C----A----A---GAT---AGGTTT--TTTG---T-AAA-A--CTTTG------------C-GTTT--AGAA-------TGT--CAG--CA-GTTA---GAA-TCT---C-TTTAAG-GG---G-GATG-ATTT-CTTGT-AA--TG-GATATAAA---GG--A--AA--T---GA--C-----CAAAACG-TA--C-C-AAAA
gi|5 : AAGCTATTA-ACA--GAAGTGT--TATCAATCCCT-GGAATCTATCCTATACATGTGAATTTAA-GTCATGT-GTA---TT---TTTCTGTGTTAT---CACTCTT---ATATAAAAAAT--TTGTGTT--CTATAAATCTTAAAC-AA---GCAACTCCGTT-----GTAAAC-CT-CCTA-ATAA--------CAACAGACATC-----------TTT---CAATGTT---TGAATGCTGACAT---GCCCAGGAAA-AAT-AAATAACAATAAATGCTGATA-GACAC-TTT--ATCG--ACTCGAGTCAG--T-ACTTCAGGGCTGCATTAAGAGA-GAT-AG-AGTATT-----TTTTACT-GA-ATACATGTCAAAA-G----GAG--ATT-TCTTTCCAATGATTTGTT--GATAAA--T-G-TTCGTAAT-TGT-GAA--A-AGGTTCG---AT-GAAA-CC-TCAGA-CTC-----ATGA--TAG-AT---A-CA-G-T-TAAAG-AAT-ATTAC-TGC-AG-T--GTC-----------ACCAACACGA--AATA---T-AT--TCTCTA---TAT-GCATT---ACGAA-AA----TA-T----------ATCTTCT-----C----ACGT--A--TCAAT-TTGCTAACCCTCCAAT--AATTCAT-GT-AT-AAG-T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------G-----TTGTCGAGA-G-T-ATT-C---G-T--A-TG-A--C-ATCAGTC-CT--CAT--AA--CT-A-TACT-G--G-T-CT-CAAGC-T-A-TATGTTGTC-ATGTTT-AA-G-ATGCTA-CTT-TC------A-GG---CCC---TA----TG-C-AG-TG-ATC--ACTAT-TGC--TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG--AAAAAT--GG--------------GC----AA--C--T---TGCAC-G--TC-CGG---T---CCAC-A-A--CA-T----TCGT--TGATAC--AAT-GTG--C--CACTATG-GTTACA--TC--G-----G---TC-CCA-CTTGG-TGA--GTAA--CAATTAA-----TCT-G---ACA-C----A-T--A---GAT---A-
gi|6 : AAA----GAG--ACA-TTC--------ATTTCCT--GATGAAACCTG-CT-GTAATCTAT-AAC--ATGATTTTCTGCAT-GAAAACC-TCAGAGCTCA---GGTCA--TAG-AT---T-CAAG----AAAG-AAT-AT-AA-T-CCAG-T--GT------------A--AAC---A--AATAATAT-ATGCT-TTTC-T-TA--GAATT---ATGGA-AAAATGTT-T----------G-C-TGT-ATA-CTCATAT-T--ACATCAATCT-------------AT--TATCAAT-GA-A--AT--T-T-ACAT-GG-----CA----------AT-------A-----T-G----AA-G-TTGGT-C---G-C--AATT-A--C-A-CAGTC-CT--CTT--AA--TT-A-CACT-G-TA-T-CTCCAAACGTCA-TGTG-TTTT-ATGTTT-TG-A-ATTTCA-CTT-TC------A-TTT-CTTC---TATGTTTG-C-AG-CGCACT-GAC--T-TG---TGCAA---A-ACAC--CCCCT-TG-T-AAAAT--GGGAT--------T--GC----AAACC--G---TGTAC-G--TC-CGT--TT---CCAC-A-AACCA-T-AC-TC-T--TG-T-CCAAAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CGA-G-----G---TCTCCA-CTT-G-TGAA-GT-A--CAAT--A-----TCT-G-----G-C----A-T--ATTGGATGTGG-GTTT--TTTG---TAAGACA--CTGTG------------C-A--T--AGA------CATGT--CAG--CA-GGTACCCCAA-T-TTAAC-TTTAAT-AG---A-G-TG-ATTTGTTTGT-AA--TG-A---TAAA---TG--ATCAG--T---GA--C---CAAAAGATG-TA--C-C-ACAAC
gi|7 : caactgtAC---A--AATC---T-AC--T-TGCA-C--A--GCATTCAAACGAA-GA----TC-T----------ATC-C-----A-C--C-TTGT--ACATCAAT-T--------------T--TATCAAT-GT-GA-AA--CAT-ACATTGA-----CA----------AT-------T-----TTG----AACG-T-ATT-T---G-TCAA-TG-A--CCA-CAATCACC--TGT--AA--TT-A-C---------T-C-CCAAATGC-AGTGTGTTTT----------G-G-ATTTC--CTT---------G-T-T-TCTT---TA--TTTG-C-AG-CG-ATCTGACT---TG---TAC-A---A-GCAAAACCGCT-TG-TAAAAATTCGG-----------TATGC----CA--C--ACACTGTACCG--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TCAT--TG-TTC--AAT-GTGTGA---ACT-GG-TTTAT---CGT-G-----G---TC-C-A-CTT-G-TGAAGTT-A--CAAT--A-----TCTTA---A-A-C----A-T--G---GAT---A-GTTT--TCTG---T-AAG-A--ATG-G------------CGA--T--AAAA-G--TC-TGTA-CAG--CA-GTGA---GAA-T-TT--C-TTCTAT-GGGCTA-AAC----TT-CTTGT-GAATTGAG---TAAAA--GG--A--AG--TTTTGA-------AGAAAAT--TAATC-C-GCACTG-GTTTACGAAGC--TTTCACTATTT-AGGAGATTACGTGTATATCAA-AGTATTAAAGAGA-TGGTTT-CAATCCTTAAGACCACTGCC-ATA-CTGA-TCAAGTCA--ATCGTAAATTGCTT
gi|8 : GGTATCAA-ACTATTAAAGA-A-TCCGTT-CTATTCCTGAGA--ACTACC-ATA-TTGA-TCAAGTC---AT--TATATTGCCTCTGTTATCTCATggtgcgttcat
gi|8 : CAAAAATT-AATGAGAC-ACTC---AT--T-TCCTC-AT-G-AAATGCTTTAATTGTA-AAGGGTTTCATG-AAACCTCAGACTC-GGATG-TTAGCTTCAGGAAAA---GACTTTTAA---TCA-GTGT-AAAGAAATAGT---ATA---TTTTTATT-TT-GCCT-TA-CGAAAATT---TATCCGTAGA-CAGTATACA-TCAATTAT--CA-ATGCTAT-------TCAATTTTTACA-TGGCA--ATATTATACATCAATTTTTATC-AATAT----ATGATTTACATGGTAATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaaattaatgagacactcatttcctcatgaaatgctttaattgtaaagggtttcatgaaacctcagactcggatgttagcttcaggaaaagacttttaatcagtgtaaagaaatagtatatttttattttgccttacgaaaatttatccgtagacagtatacatcaattatcaatgctattcaatttttacatggcaatattatacatcaatttttatcaatatatgatttacatggtaatatt
gi|9 : ggtatcaaactattaaagaatccgttctattcctgagaactaccatattgatcaagtcattatattgcctctgttatctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAT-AG-----TA----------AT-------G-----TTA----AA-A-T-ATT-T---G-C--A-TG-A--C-A-CATTC-CT--CTT--AA--CT-A-TACT-G-TA-T-CTCTATATGT-A-TGTGTTTTT--TGTTG-TG-G-ATTCCA-CTT-TC------C-TGT-TCTC---TA--TTTG-C-AG-CG-ACT-GACTAT-TG---TGC-A---A-ACA---CCCCT-TG-TAAAAAT--GG-----------T--GC----AA--C--G---TGTAC-G--TC-CGG--TT---CCAC-A-A--CA-T-AC-TC-T--TG-T-C--AAT-GTG--A--CAC--TG-GTTTTA--CG--G-----G---TC-CCA-CTT-G-TGAAGGT-A--CAAT--A-----TCT-G---A-C-C----A-T--G---GAT---A-GGTA--TTTG---T-AGA-A--CAGTG------------C-A--T--AGATTG--TC-TGT--CAG--TA-GGTA---GAA-T-T---TATTTAAT-GG---A-GATG-ATTC-CTTTT-AA--TG-A---TAAT---GG--A--AG--T---GA--C---TAAAAAATG-TA--C-C-ACAAt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AATGGGGCTGTGCGGGGTAGCGCGTATGCCCAACCCTATTTAACAGTAATCCGTCTATTCTGAGAAC