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Reference ( gi|1 ) : GTCACACATCATCGAAAA--C-ATGGTCG--GT---TGCATTTCTTT--------TGGGATACAACA------ACA---T---TTTT--GCTGGAAGG--TGT--C--T--T--G-GCTTCTT--AT-TGTGATTGG---TTGCAATACCATT-CCGTATTGCA--A-TATTCA-ACCA---A--T--G-AA-AA-GCC--------C--C-TT---AT---CAAAGTGTTCAG-------GAGCATAGAAAACAAT--AC-TTTCG-AAGTA-AGGACTTTGACT------GT-----TTAAGTT-GA-ACT----AGT---TACAAAGCTTAGCAAGATG-C-TTAATCTGCG--TA-AT-TG----AAA--C--AGAG----GGATGTGT----TT----------GTGT---TTATACATA-AAG---ACA-GG-G-GAGGAA-A-AAGCCTAT-G-----CTA-CCAAGC-AT--TTACTAC------------------T--GTGTAC-GAGTCTATG-TAC----TCA---C---TAC--TGCT----C------TA----TGT-GT-C---TCACCACCATTT------AT-----------CCATCATACA----GGACCATTTCAATCTTTTGAAAAAACTTGG-TA------ATTCA------TCTGC--TTATG---AA-------GGTATGTTAAGCTAATCACAAGAACCCGTAATT--TTGTCTG----T-GATAACCAT-AGTA---------------------GT-------------GG--------CA-----C------CACCACTACT-----G---GT--G----TT-T-G-AGTTCCGGGAGTACTTT-CAGTGATT-CCCATCAGTCCTCGACAGGTC--------CCAT--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATG------TG--TTA---------TG---CAAAAATAT--TGGTGTTGTGTCCCATGGGAGGTAAAA-----GA----A--AC--CAACTA---TGGATTTCTG
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gi|22 : actaaagtgaacaatatatgc--------TGGGACACAAGG------ACGAAGC---CTTT--GCTGGAAGG--TGT--cgact
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gi|19 : -----TTAAGTT-GAGACA----AGT---TACAAAGCTTAGTGAGATG-C-TTTAACTGCA--TT-AT-TG----AAG--C--GG
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gi|18 : C-GAGTCTATG-TACAAGTTCA---TG--TTC--AGCA----C------TC----CGA-GT-C---TCGCCACTTTTT------AT-----------CCCTCATACA----GTAACACTTTAATTATTT
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gi|17 : ataatcatggtatatattttcata-------------GG--------CG-----C------CGCCATTACT-----G---CT--GGCGTTT-T-G-ACGTCCGGGAATACCTA-CAGCGATT-CCTTCCGGTCCTCGATAGa
gi|16 : tcctg------CATTACTACT-----G---AC--A----TTCT-T-AGTTCTGGAAATACGAA-CGACGATC-CCCATTGGTCCTCAGCAGGTC------------------------------------ACT----CAT--TTTAATG------ttgtgtgataatatcggtgtttttttccacggg
gi|10 : tacaacacgcatagttttgcgggcgccgaACAACT-----G---AC--G----TT-TTG-AATTCCGGAAATACGAA-CGACGATT-TCCATTGGTCCGCAAAAGGTC--------AAGA--------------AA----GGTCATa
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gi|11 : attaaggtagtactctacaccacatatcgttgAAATATA-CGGTGTTGTGTCTCATGGGAGGTAAAA-----AAGTACA--AC--CGATCG---TGGGTTCCttgaaggagtatcacggctgcgtaatgcgattgattacaatgcattgccgtatagcgatattcaaccaatgcaaaagtccctttttaaaatgttcaggaacagagaaaacattactttcgaagcaaggactttgatttatacagttaaagtttatgctccaaagttacaaagctttgcgaggtgctttatctgcattgttgagatggagggatgtttgcatagttcgggtgaggaaaacatatgctatcaagcgtttagcactgcgcacgagcctgtgtacaggtttacgtgtaattttcaacacttgtagtctcgccactttttattcatcatacaggtttgaacaggcttggcactttatattggtctgcaataatcaaagtatatacactctgtactctaatgctgaggttcctagtttcgaaatacgtatggcgattcctattggtgctcgacagttcacgtaaggtcatgcattttaatgagttatgcgaaaatatcgatgctgtgtcccactggaggtaaaagaagtgcaaattatcgtgggtttcc
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Reference ( family-2232 ) : NNCACACATCGTCGGAAAC-CACGGTCG--C-GTACTTGTTTTACCTCCCGT---GGGACAC---A---AC---G------ATA--T-TTTCGCTGGAAGG--TGT--CT--C--G-GCTTCTTAATGTGATTGATCGCAATACCATT-CCGTATTGC-GATATTCA-ACCA---AT--G-AAAA-G-----CCC-CNTTTTAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACANT--AC-TTTCG-AAGC-GAGGACTTTGA-CT-----AG-TTTAAG-TT-G-GACT----AGT---TACAAAGCT--TAGCGAGATG-CTTTATCTGC-ATT-AT---TG------AAGCGGAG----GGATGTG-TTT-T---------GTCTG--CAT----A---AAG---AC-G-GG-GGAGGAA-AAAGCCTAT-G-----CTA-CCAAGCGTTTACTAC------------------T--GCGTAC-GAGTCTACGT-AC----TCA---C--T---AC--TGC-----CTA-----C----GTA--GTCTCGCCA----CT---------TTTTAT----CCATCATACA----GGAGNANTTTAATTTTTTGAACGGACTTGG-TATTTCATCGGCTTATGTA-------GGTATGTT--AAGC-TTACC-AC--AAGAACCGGTAATT--TTGTCTGTA-ATAATC----ATAGTATATA-----A----T---ACT------GGCGCCG--CCA-T-ACTACTG---AC---GTTCTGAGTTCCGGAAAT-ACNTACGGCGATT-CCCATTGGTCCTCGACAGGTC--ACG-----T--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----AATAT--CGGTGTTGTGTCCCACGGGAGGTAAAA-----GA-----AACCGACCGTGGGTTTC
gi|1 : CACACATCATCGAAAAC--ATGGTCG----------GTTGCATTTCTTTT---GGGATAC---A---AC---A------ACA--T-TTTTGCTGGAAGG--TGT--CT--T--G-GCTTCTTATTGTGATTGGTTGCAATACCATT-CCGTATTGC-AATATTCA-ACCA---AT--G-AAAA-G-----CCC-CTTATCAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACAAT--AC-TTTCG-AAGT-AAGGACTTTGA-CT------G-TTTAAG-TT-G-AACT----AGT---TACAAAGCT--TAGCAAGATG-CTTAATCTGC-GTA-AT---TG------AAACAGAG----GGATGTG-TTTGT---------GTTTATACAT----A---AAG---AC-A-GG-GGAGGAA-AAAGCCTAT-G-----CTA-CCAAGCATTTACTAC------------------T--GTGTAC-GAGTCTATGT-AC----TCA---C--T---AC--TGCT----CTA-----T----GT---GTCTCACCA----CC---------ATTTAT----CCATCATACA----GGACCATTTCAATCTTTTGAAAAAACTTGG-TAATTCATCTGCTTATGAA-------GGTATGTT--AAGC-TAATC-AC--AAGAACCCGTAATT--TTGTCTGTG-ATAACC----ATAG----------------T---AGT------GGCACCA--CC----ACTACTG---GT---GTT-TGAGTTCCGGGAGT-ACTTTCAGTGATT-CCCATCAGTCCTCGACAGGTC--CCA-----T--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGT------G--TT-ATGC------AAA-----AATAT--TGGTGTTGTGTCCCATGGGAGGTAAAA-----GA-----AACCAACTATGGATTTC
gi|10 : gtC---G------ATA--T-TTTCTCTGGAAGG--TGT--GT--CTAG-GCTTCTTAATGTGATTAGTCGCAATTCCATT-CCGTATTGC-GATATTCA-ACCA---AT--A-AAAA-T-----CCC-CCTTTTAA-AGTG--TTCAGGACTTTTGAGAATAGATAACAACTGACGTTTTG-AAtg
gi|10 : -ACAACTG---AC---GTTTTGAATTCCGGAAAT-ACGAACGACGATT-TCCATTGGTCCGCAAAAGGTC--AAG-----A--------------AA----GGTCATttccggaaatacgaacgacgatttccattggtccgcaaaaggtcaagaaaggtcatttta
gi|11 : cgatattttctctggaaggtgtgtctaggcttcttaatgtgattagtcgcaattccattccgtattgcgatattcaaccaataaaaatcccccttttaaagtgttcaggacttttgagaatagataCACAT--TCGGAACC-CACGATCGGTT-GTACTT-TTTTACCTCCCAT---GAGACAC---A---AC---ACC----GTA--TATTTCGCTGGAAGG--TGTGTTT--C--GCGCTTCTTAATGTGATTGGTAGCAATACGATT-CCGTA------ATGT----------------------------CCC-C--TTTAT-AGTG--TACAG-------GAGCATAGGAAG-ATT--AC-TTTTG-AAGC-GAttta
gi|12 : actaaagtgaacaatatatgc-ATAATC----ATGGTATATATTTTCA----T---A--------GGCGCTG--CCA-T---TACTGCGTAC---GTTCTGAATTTCA-AAAT-ACGTAAAGCGATT-CCCATTGGTCCTTGGCAGGTC--ATG-----G--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGATCACATGATTT-ATGT------GAA-----AATAT--AGGTGTTGTATCCCAAGGGAGATAAAAGT---GC-----AGCCAACATTGGGTTTct
gi|13 : C---G------ATA--C-TTCCGATTGAAGG--TGT--GTATT--G-CCTTCTTAATGCGGTTGATCGCAATACCATT-ACGTGTTGC-GATACTCA-ACCA---AT--GAAAAA-G-----CTT-CATTTT-C-ATTG--TTCGG-------GAGCACAGAAAACAGG--AC-TTTa
gi|14 : agccTGAGTTCCAGGAAT-ACTTACGGCAAGT-CCCATTGGTCCTCGA-AGGTC--ACG-----TTNNNNNNNNNNNNNNN----NNTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----AATAT--TGGCGTTGTGTCCCACGGTAGGTAAAA-----G-------AC------TGGGTTTCaataataataatatcctttat
gi|15 : tCATT--AC-CTTCG-AAGC-GAAGACTTTGA-CT-----A---------------------------------AGCT--TAGCGAGATG-CCTTTTCTGC-GTT-AT---TG------CAGCGGAG----GGGTGTGTTTT-T---------GTCTG----T----A---AAG---ACAG-GG-GGAGAAA-CAAACCTAT-A-----ATA-TCAAGCGTTTACTcga
gi|16 : C----ATAGTTT-------------T---GCG------GGCGCCG--ACA-TTACTACTG---AC---ATTCTTAGTTCTGGAAAT-ACGAACGACGATC-CCCATTGGTCCTCAGCAGGTC--AC------T-------------------------------CAT--TTTAATGA------
gi|17 : tacaacacg------GGCGCCG--CCA-TTACTGCTG---GC---GTTTTGACGTCCGGGAAT-ACCTACAGCGATT-CCTTCCGGTCCTCGATAG
gi|17 : tcctgA------G--TT-GTGT------GAT-----AATAT--CGGTGTTTTTTTCCACGGGttgtgtgataatatcggtgtttttttccacggg
gi|18 : tcctgggcgccgccattactgctggcgttttgacgtccgggaatacctacagcgattccttccggtcctcgatC-GAGTCTATGT-ACAAGTTCA---TG-T---TC--AGCA----CTC-----C----G-A--GTCTCGCCA----CT---------TTTTAT----CCCTCATACA----GTAACACTTTAATTATTT
gi|19 : TTAAG-TT-GAGACA----AGT---TACAAAGCT--TAGTGAGATG-CTTTAACTGC-ATT-AT---TG------AAGCGGcattgtcatagtaggagtatata
gi|2 : aaccataatttacaattcgaaaattttataatgaaatcaaagCACATATCGTTGGAAATTCACAGTCA--CAGTACTTGTTTTACCTTCCGT---GGGTCAC---A---ACACCG------ATA--T-TTTCGCTTGAAGGAGTAT--CA--C--G-GCTGCGTAATGCGATTGATTACAATGC-ATTGCCGTATAGC-GATATTCA-ACCA---AT--GCAAAA-G-----TCC-CTTTTTAA-AATG--TTCAG-------GAACAGAGAAAACATT--AC-TTTCG-AAGC-AAGGACTTTGA-TTTATACAG-TTAAAGTTT-A-TGCTCCAAAGT---TACAAAGCT--TTGCGAGGTG-CTTTATCTGC-ATT-GT---TG------AGATGGAG----GGA---------T---------GTTTG--CAT---------AGT--TC-G-GG-TGAGGAA-AA--CATAT-G-----CTA-TCAAGCGTTTAGCAC------------------T--GCGCAC-GAGCCTGTGT-ACAGGTTTA---CG-TGTAAT--TTT-----CAA-----CACTTGTA--GTCTCGCCA----CT---------TTTTAT----TCATCATACA----GG-------------TTTGAACAGGCTTGG-CACTTTAT
gi|2 : attaaggtagtactctacacT--TGGTCTGCA-ATAATC----AAAGTATATA----------C---ACT----------CTGTACTC-T-AATGCTG---AG---GTTCCTAGTTTCG-AAAT-ACGTATGGCGATT-CCTATTGGTGCTCGACAGTTC--ACG-----T--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----AATAT--CGATGCTGTGTCCCACTGGAGGTAAAA-----GAAGTGCAAATTATCGTGGGTTTCattggtctgcaataatcaaagtatatacactctgtactctaatgctgaggttcctagtttcgaaatacgtatggcgattcctattggtgctcgacagttcacgtaaggtcatgcattttaatgagttatgcgaaaatatcgatgctgtgtcccactggaggtaaaagaagtgcaaattatcgtgggtttcc
gi|20 : attaaggtagtactctacaccacatatcgttggaaattcacagtcacagtacttgttttaccttccgtgggtcacaacaccgatattttcgcttgaaggagtatcacggctgcgtaatgcgattgattacaatgcattgccgtatagcgatattcaaccaatgcaaaagtccctttttaaaatgttcaggaacagagaaaacattactttcgaagcaaggactttgatttatacagttaaagtttatgctccaaagttacaaagctttgcgaggtgctttatctgcattgttgagatggagggatgtttgcatagttcgggtgaggaaaacatatgctatcaagcgtttagcactgcgcacgagcctgtgtacaggtttacgtgtaattttcaacacttgtagtctcgccactttttattcatcatacaggtttgaacaggcttggcactttataGTGTCCCACTGGAGGTAAGAGAAGCGA-----AACCGATCGTAGGTTTCc
gi|21 : gtcatgcatatttatgaTTTTGAACGGACTTGG-TATTTCATCGGCTTCTAT----------T--------AGC--GATC-AC--AAGAACCAGT-ATT--TT
gi|22 : TACCTCCCAT---GGGACAC---AAGGAC---G------AAG--C-CTTTGCTGGAAGG--TGT--
gi|3 : cGGACAC---A---AT---ACCCTGAATA--T-TTTCACTGGAAGG--TAT--CTAAC--A-GCTTTCTAATTTGATTGAT-ACAATACAGTT-TCGTATTGC-AATACTCA-ATCA---GT--A-AAAA-A-----TACACAGT--AA-AGTG--TTCAA-------GAGCA-AATAAACATT--AC-TTTCA-AAGC-AAAAACTTTTATCA-----AA-ATTAAG-TT-T-GACT----AGT---TACAAAGCT--TAGCAAGATT-CTTTATCTGC-ATTTAC---TT------AAACGGAC----G-ATGGG-TTT-TT--------GTCTG--CA---------AAG---AC-CTGG-GGAGGAA-ATA--CAATAG-----CTA-CCAAGC--TCGC-AC------------------T--GCA----------------------CA---C--T---A------------------------GTA--GTCTAGCCA----CT---------TGTTAT----CCATCTTACA----GGAGCATTTTAATTTTT-GAACGGATTTGG-TATTTCATCGGCTTATATA-------GGTATGTT--AAGC-TTACC-AC--AAGAATTGGTAATT--TGGTCTGAA-TTAATC----ACACTATATA-----C----TTTCACG------GGCGTCG--CCAAT-ACTACTG---AA---GTTCTGAGTTTCG-AAAT-GCTTACGGCGATT-CCCATTGGTCTTCGAAAGGTC--GCA-----T--------------GA----GGTCAAT----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----CATAT--CGGTGTTTTGTCCCACCGGAGGTAAAA-----GAAGTGTAACCGACCGTAAGTgt
gi|4 : AC---A---CC---G------ATG--C-CTTCACTGGAAGG--TGTGTCT--C--G-GCTGTTTAGTGTGATTGTTTGCAATACTATT-CCGCATTGC-GATATTCA-ACCA---AT--G-AAAAAG-----CAG-CTTCCTAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACAAT--AC-TTTCG-AAGC-GATAACTTTGA-CT-----A------AG-TT-----CA----AGT---TGCA---CTAATAACAAAA---CTT--------------------------AGCGA-------GATGC---TT-T---------ATCTG--CATTATTG---AAG----C-G-GG-GGATGT-----GTTT-T-G-----CTG-CGTA-CGATTACGAT------------------TTTATGTAC-AAGCCCACAT-GT----TCA---G--T---AC--T-C-----CTA---------------GTCTCGCCG----AT---------TTTTAT----CCATCATATA----GGAGCAATTTAATTTGATGAACGGACTTGG-TATTTCATCGGCTTATGTA-------GGTATGTT--AAAC-TTAGC-AC--AATAGCCGGTAATT--TTGTCTGTA-ATAATC----ATAATACATAC----A----T---ACTTCCATGGGCGCCG--CCATT-ACTACTG---AG---GTTTTGAATTCCAGAAAT-ACTTACGGCGATT-CCCATTGGTCCTCAACAGGTC--ACG-----T--------------AACCTTGGTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------AAA-----AAGAT--CGATGTTGTGT
gi|5 : GACAC---A---ACACTG------ATA--T-TTTTGCTTGAAGG--TGTATCT--T--G-ATATCTTAATGTAATTGATCGT-----CATT-CCGTATTGC-AATATTCA-ACCA---AT--G-AAAA-AAAAAAC-----TTTTAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACATT--GC-TTTTG-AAGC-GAGGACTTTGC-CT-----AGGTTTAAG-TT-G-GACT----AGT---TACAATGCT--TAGTGAGATG-TTTTATCTGC-ATT-AT---TG------AAGTGGAG----ATCTGTG-TTCAT---------GTCTG----T----A---AAG---AT-G-GGAGGAGGGA-AAAGC--AT-G-----GTA-CCAAGCGTTTAATAT------------------T--GCATAC-GAGTCTATGT-ACAGG-TC-------T---ACA-TGT-----TCAGCACTC----ATA--ATCTCACTA----CA---------TTTTAT----CGATAATTTA----GGGAGAATTTAATTTTTTTAATGGACTTGA-TATTTCATTGGTTTATGTATACGTCTAATATGCT--AAGC-TTACC-AC--AAAAAGCGGTAATT--TTGTCTGTA-ATAATC----ATAGTATACATGTATA----T---ACTTTCATGGGTGCCA--CCATT-ACTACTG---AG---GTTTTGAGTTCCg
gi|6 : -TTG-T---------GTTTG----T----A---AAA---AC-GTGG-AGGAGAA-AAAACCTGTCA-----CTAGCCAAACATTTACTAC------------------T--GTGCACGGAGTGTATGT-AC----AAAGGTC--T---ACAATGTTTCGGCTA-----G----GTACCACTTCGCTAGCATCTTCAACCATATTTTCTAGTACCATCATACA----GGAAGAAATTAAATTTTTGAACAGACATGACTAATATATGGAAGTCTGCA--------TTATGTCTAAAACTTTACCTATCAAAAAAACAGTAAATGGTTGTCCGTAGATAATCCTGAGTAGTGGAGA-----GCTTTC---AAT------GG-GCCGGTGCACT-ATTACTG---ACAGTGTTGTG-GTTTGGGAAATGATTTACAA-AATTGTCCATTGGTCCACGGTAGGTCGAGCGGCGCCT--------------AA----GGTCAAGTAAACACTATTTAACAG------G--TTAAAGCTAAACTGAAATAAGAATATTATGGTGTTGTGTCCC
gi|7 : ttaatatagaagtgtgcgtgagaG--TGT--CT--C--G-GCTTCTTGATGTG---GAATATAATGCCATT-CTGTACTGC-GAC---CA-ATCACACATTCA-AAAA-G-----CCC-CATTTCAA-AGTG--GCCAG-------GAGCATAAAAAA------AC----------C-GACCACTTTAA-CTTA---AG-TTTAAG-TT-G-AACT----AGT---TACAAAGCT--TACTGAGGTG-CTTTATCTGC-ATT-AC---TGGTATAGACGCGGAGCCCCGGATGTG---------------GACTG--CA------------------A-GG-GGAGGAA-AC-TCCTAC-A-----CTA-CAAAGC--TTA--------------------------------GAGTCGATGTTCC----TCA---C--T-----------------------C----GTA--GTCTCGCCA----CT---------CTTTGT----CCATCATGCA----GGAGAATTTTAATTTTTTTAACGAACCTGG-CATTTCA-------ACGTG-------GGTATGT
gi|8 : TTTTACCTCCCGTGGGGGGACACCATA---AT---GTGGA--ATATTT-TTTCACTG--CGG--TGTCCCT--C--T-GCCTC-TAATGT-ATT--CTGTAAAGCAATA-ACGTAGTGCAAATTTTCATCCCA---AT--G-AAAACG-----TCT-CTTTTTAACAATGTTTTCAG-------GAGCATAG--AACA-T--AC-TTTCGAAAGCAGAGGAGTCTA---------AG-CTTAAG-TTGG-GGCT----AGTCTATATATAGTT--TAGCGA-ATGCCTTTAT-TGCAATT-ATATCTG------AAGCGAA------GAT-TG---T-T---------GTTTG--CAT----ATGTAAGCGAAC-T-TG-GGAGGAAGAAAATCTAC-GTATTTCTACCCAAGCGATT
gi|9 : TTTATCTGC-ATT-AT---TG------AAGCGGAG----GGATGTG-CCC-CCCCCCCCCAGTCTT----T----A---CAG---AC-----------AA-AAAGTCTAT-G-----CTA-CCAAGCATTTGCTATGTACTATACTCATGAGTTT--ATGTAC-AAGTCTACAT-GT----TCA---CAGT---TC--AGCA----CT------T----GTA--TTCTTACCA----CT---------TTTTAT----CCATCATACATTTAGGAGGAATTAAATTTTTGGAACGGACTTGG-TATTTCATCAGCTTA--TA-------AGTATCTT--ACGC-TTACC-AC--AAGAACCGGTAATT--TTGTCTGT---TCATG----ATAATATAT
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blockSeqs : . C CA . G . . . GTGGA . . . GTTTC . A G . . . . GA AG C . A . . . TT . . . A TAAGT . GAGACA . A . . . . . . G TTGTTTGCATATGTAAGCGAACT . . AG AG C GT GC TTT C T . T ACAAAGGTCTACAATGTTTCGGCTAG . . . . . GC T . G . . . . . A . CATACTTCCATG GT TT ACAGT C G . G . C . GCGCCTAA . . . . . . . . GAAGCGA TT CG
blockSeqs : A . . . ACCG . . . GTATT . C C . . . . GC CG T . T . . . GG . . . A AGGT . GGGGCT . A . . . . . . G TTTATCTGCATTATTGAAGCG . . AA CA . GA CG T T T . C ACAGGTCTACATGTTCAGCACTC . . . . . GC A . G . . . . . A . GCTTTCAAT . AT AC C G . T . C . TAACCTT . . . . . . . . GAAGTGT CG CG
blockSeqs : G . . . ACTG . . . CTAAC . T A . . . . A T C . A . . . TT . . . A AAA . TGACT . A . . . . . . C TTTTTGTCTGTAAAGACAG . . AA A . GT AT T C C . T ACAAGTTCATGTTCAGCACTCC . . . . . AG A . G . . . . . A . TTTTCATA . TT AC T G . G . T . AAA . . . . . . . . GTGC CG CG
blockSeqs : . . ACC . . . GTCTC . T T . . . . A G A . T . . . TT . . . C AGC . GGACT . A . . . . . . G TTTTTGTCTGCAAAGACCT . . AG G . AT CT T T T . T GTTCACAGTTCAGCACTT . . . . . AG A . A . . . . . A . CTTTCACG . TT GC C G . C . C . GAA . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . G . . . ATCTT . C C . . . . G G A . A . . . TT . . . A A . GAACT . T . . . . . . G TTCATGTCTGTAAAGATG . . A G . GA CT T T . . T GTTCAGTACTCCTA . . . . . GA T . . . . . . . . . TGCG . CT AG C G . G . A . TAA . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . CCCTC . T C . . . . G A C . T . . . AT . . . . A . CA . . . . . . . . . TTGTGTTTGTAAAAACGT . . G G . AT C . . . . C TCCTCACTC . . . . . GG A . . . . CACT . T AA T . . T . C . TGA . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . CAC . T A . . . . G G C . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . TGTTTGCATAGTTCG . . T A . . . . . CACTA . . . . . . . . . . T AG T . . T . T . T .
blockSeqs : G . . . CTC . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . GACTGCAA . . . G . . AG G . . T . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : GTCTC**** AGT****** TTTTTGTCTGTAAAGACCN************************* ACAGTTTACATGTTCAGCACTC*********************** TT* GAAGCGN*****
originalCons : NNCACACATCGTCGGAAAC-CACGGTCG--C-GTACTTGTTTTACCTCCCGT---GGGACAC---A---AC---G------ATA--T-TTTCGCTGGAAGG--TGT--CT--C--G-GCTTCTTAATGTGATTGATCGCAATACCATT-CCGTATTGC-GATATTCA-ACCA---AT--G-AAAA-G-----CCC-CNTTTTAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACANT--AC-TTTCG-AAGC-GAGGACTTTGA-CT-----AG-TTTAAG-TT-G-GACT----AGT---TACAAAGCT--TAGCGAGATG-CTTTATCTGC-ATT-AT---TG------AAGCGGAG----GGATGTG-TTT-T---------GTCTG--CAT----A---AAG---AC-G-GG-GGAGGAA-AAAGCCTAT-G-----CTA-CCAAGCGTTTACTAC------------------T--GCGTAC-GAGTCTACGT-AC----TCA---C--T---AC--TGC-----CTA-----C----GTA--GTCTCGCCA----CT---------TTTTAT----CCATCATACA----GGAGNANTTTAATTTTTTGAACGGACTTGG-TATTTCATCGGCTTATGTA-------GGTATGTT--AAGC-TTACC-AC--AAGAACCGGTAATT--TTGTCTGTA-ATAATC----ATAGTATATA-----A----T---ACT------GGCGCCG--CCA-T-ACTACTG---AC---GTTCTGAGTTCCGGAAAT-ACNTACGGCGATT-CCCATTGGTCCTCGACAGGTC--ACG-----T--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----AATAT--CGGTGTTGTGTCCCACGGGAGGTAAAA-----GA-----AACCGACCGTGGGTTTC
finalCons : NNCACACATCGTCGGAAAC-CACGGTCG--C-GTACTTGTTTTACCTCCCGT---GGGACAC---A---AC---G------ATA--T-TTTCGCTGGAAGG--TGTGTCTC----G-GCTTCTTAATGTGATTGATCGCAATACCATT-CCGTATTGC-GATATTCA-ACCA---AT--G-AAAA-G-----CCC-CNTTTTAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACANT--AC-TTTCG-AAGC-GAGGACTTTGA-CTAGT------TTAAG-TT-G-GACT----AGT---TACAAAGCT--TAGCGAGATG-CTTTATCTGC-ATT-AT---TG------AAGCGGAG----GGATGTGTTTTTGTCTGTAAAGACCN-------------------------GG-GGAGGAA-AAAGCCTAT-G-----CTA-CCAAGCGTTTACTAC------------------T--GCGTAC-GAGTCTACGTACAGTTTACATGTTCAGCACTC-----------------------GTA--GTCTCGCCA----CT---------TTTTAT----CCATCATACA----GGAGNANTTTAATTTTTTGAACGGACTTGG-TATTTCATCGGCTTATGTA-------GGTATGTT--AAGC-TTACC-AC--AAGAACCGGTAATT--TTGTCTGTA-ATAATC----ATAGTATATA-----A----T---ACT------GGCGCCG--CCATT-ACTACTG---AC---GTTCTGAGTTCCGGAAAT-ACNTACGGCGATT-CCCATTGGTCCTCGACAGGTC--ACG-----T--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----AATAT--CGGTGTTGTGTCCCACGGGAGGTAAAAGAAGCGN-----AACCGACCGTGGGTTTC
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Reference ( family-2232 ) : NNCACACATCGTCGGAAAC-CACGGTCG--C-GTACTTGTTTTACCTCCCGT---GGGACAC---A---AC---G------ATA--T-TTTCGCTGGAAGGTGTGTCTCG-GCTTCTTAATGTGATTGATCGCAATACCATT-CCGTATTGC-GATATTCA-ACCA---AT--G-AAAA-G-----C-CCCNTTTTAA-AGTG--TTCAG-------GAGCATAGAAAACANT--AC-TTTCG-AAGC-GAGGACTTTGA-CT-----AG-TTTAAG-TT-G-GACT----AGT---TACAAAGCTTAGCGAGATG-CTTTATCTGC-A-TTAT---T------GAAGCGGAG----GGATGTGTT-TTT--------G--TCTGTA----AA-GACCNGGGGAGGAA-AAAGCCTAT-G-----CTA-CCAAGCGTTTACTAC------TGCGTACG-A----G--TCTACGTACA---GTTTACA-TG-----TT-CA-------GC--------ACT-CG-TAG--TCTC--GCCACTTTTTAT----CCATCATACA----GGAGNANTTTAATTTTTTGAACGGACTTGG-TATTTCATCGGCTTATGTA-------GGTATGTT--AAGC-TTACC-AC--AAGAACCGGTAATT--TTGTCTGTA-ATAATC----ATAGTATATA-----A----T---ACT------GGCGCCG--C-CATTACTACTGAC---GTTCTGAGTTCCGGAAAT-ACNTACGGCGATT-CCCATTGGTCCTCGACAGGTC--ACG-----T--------------AA----GGTCATG----CAT--TTTAATGA------G--TT-ATGC------GAA-----AATAT--CGGTGTTGTGTCCCACGGGAGGTAAAAGAAGCGNAACCGACCGTGGGTTTC
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