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gi|2 : TTCCTT-G---A-AGC-T-AAA-----GT-TTTA----TT---G-GCTTCTCATGTATGTGTATCT---AA-TTG-T--T-GGT-A-AAT--T-A-CACTT------AAA--ATC-AG-CACCG-GAA-G--T-T---GTTGCT-A-CTGG--GT-T--AT--TAT-AT-GA-T--T-TTGG--AC----GAACA-TCAACGTTGTTT---GACAGT-GGTAAagtt
gi|20 : caaagtAA-G--T-T---G----T-A-TTGG--GT-T--AT--T-T-AT-TG-T--A-T--G--AC-T--GGACA-TCACCA-----T---GACAGT-GGTAAa
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gi|27 : --G--AC-G--GAACA-TCACCA-----T---GACAGT-GGTAAaa
gi|4 : AGTTCATT-G---A-AGN-N-NNN---N-NN-NNNN----NN---N-N-----------NNNNNNNNN---NN-NNN-N--N-NNN-N-NN---N-N-NNNNNN----NNNN--NNN-NN-NN-NN-NNN-N--N-N---N----N-N-NNNN--NN-N--NN--N-N-NNNTG-T--A-C--G--AC-G--GAACA-TCACCG-----T---GACAGT-GGTAAaat
gi|5 : GTTCATTTG---A-AGT-TTAAA---T-GC-TTTT----T----G-G-----------TGTGTATCT---AAATTG-T--T-GGT-A-A----T-A-CAGTCTTATAAAAA--AAC-CG-CAACG-TAA-GGAT-T---G----T-A-CTGG--GT-T--AT--T-T-GT-TG-T--A-T--G--AC-G----ACA-TCACCG-----T---GACAGT-GGTaat
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): CAAGTTCATTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACGGAACATCACCGTGACAGTGGTAAAAT
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Reference ( family-2203 ) : AGTTCATT-G---A-AGT-T-AAA---T-GC-TTTT----TT---G-G-----------TGTGTATCT---AA-TTG-T--T-GGT-A-AA---T-A-CACTTT----AAAA--AAC-AG-CA-CG-TAA-G--T-T---G----T-A-CTGG--GT-T--AT--T-T-AT-TG-T--A-T--G--AC-G--GAACA-TCACCG-----T---GACAGT-GGTAA
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gi|20 : caaagtAA-G--T-T---G----T-A-TTGG--GT-T--AT--T-T-AT-TG-T--A-T--G--AC-T--GGACA-TCACCA-----T---GACAGT-GGTAAa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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