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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTCGG--AAC--A-C-GAG---A-A-TG-TCT-----CGC-GCA---TCGACgcgcactcgacatgtgcacactcgacatg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cACTCGG--AACT-G-CTCGC---A-A-TG-TCT-----CGA-GCA-C-TCGACATt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCGG--AAC--A-CCGAG---A-A-TG-TCG-----AGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TA-CGGA--G-G-CCACCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTTGTTTTGTTATTT-TTTTTTTAA-A------C------AGC-GAT-ACAGCAATAACTGAAGTGA--AGA-G-GATACGTCTTGTTT-AC-ATAATTCTT-ACGA---TGTA----AATAG-TAT-AAACA-ATGGGATCTC---TT--GAA-AAGAAG------------TGG--ACTATATGAA------------GTATTGATACTTTGTTA-CCC--GGTCG---ATATT--A---TTACG---CCGACC----TATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-A--TCCACTCAT---GGCGG-C-C--TCCG-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCAG--AAC--A-CCGAG---A-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TA-CGGA--G-G-CCGCCTTGAGTGGATTTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG---------TTTTTG-TAAT----TTT----T----TTTA------TAAAA------C------TGC-GAT-AAAATAACAACTGAAGTG--AAGA-GAAA-ACGTCTTGTTT-A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCGGTAAGCT-A-CTGAG---ATA-TGGTCT-----CG--GCA-CATCGACATTGACCTCTG-GAGTGTAA-TA-CGGA--G-G-CCG-CATGAGTGGATTTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTCG---AAC--T-CCGAG---A-AATA-TCT-----CGCAGCA-C-TCGACATTGATCTC---GA-TGTAA-TA-atcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGG--AAC--T-CCGAT---A-A-TG-TCT-----CGttgg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 caccgagaatgtctcgcactcgacattgacctTCGG--AAC--T-CCTCG---C-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGG--AACTCA-TCGA------A-TA-TCT-----CCC-GTG-C-CCAGCAAAGGTCTC-A-GA-TGTAA-TA-CG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgcatcatattcattcctggaaaacatTCGG--AAC--T-CCTCG---C-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-Ttt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacgtcgagtactCGG--AAC--T-CCGAG---A-A-TA-TCT-----CGT-GCA-A-TCGACATT---CTC-G-G--TGTg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AC--ATCCGAGGTCA-A-TG-TCG-----AGT-GCG-C-TCGACATT---CTC-G-G--TGT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcggaC--A-CCGAG---A-A-TG-TCT-----CGC---A-C-TCGACATTGACCTC-GAGA-CATTA-T--CGGA--G-aatacggaggccaccatgagtggatttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtttttcctgatgtggtttgttttgttattttttttttaaacagcgatacagcaataactgaagtgaagaggatacgtcttgtttacataattcttacgatgtaaatagtataaacaatgggatctcttgaaaagaagtggactatatgaagtattgatactttgttacccggtcgatattattacgccgacctattaacataatgcaccaaatccactcatggcggcctccg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TG-TCT-----CAC-GCA-C-TCGA-A-TAACCTCGG-GA-T-TAA-TAGCGTA--G-GTCCG-CATGAATGGATTttccga
gi|5                          : cattcggaacaccgagaatgtctcgcgcattcgacattgacctcggatgtaatacggaggccgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactggttttctgatgtggttttgtgatttaaaaaaaaccctgcgatactgaagtgaagaggaaacgtcttgtttacataattcttacgatgtaaatagtataaacaaaatgatctcttcaaaagaagtggactatatggagtattgacacatgtattgacactttgtaccggtcgagatttttacgactgacgattcaccaaaatcccCCTC-G-GA-TGTAA-CA-CGGA--G-G-CTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGA---ATTTTAA-AA-A------CAAAAAATGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGA--AGA-GGAA-ACGTCTGGTTT-AC-ATAATTCTT-ACGA---TGTA----AATAG-AAT-AAACA-ATATGATCTC---TT--GAA-AA--GA------------ACTGGACTATATGGA------------GTATTGACACTTTGTTA-CCC--AGTCG---ATATT--A---TTACG---CGGACC----GATT-AA---CAT----AAAGCA-------CCAA-A--TCCACTCAT---GGCGG-C-C--TCCG-T
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA-TA-CGGG--G-G-TCACCATGGGTGGATTTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataaacaatgtgatctctaaaataagtagactatattttatatcgacaagaggttacgccgaccgattaacatacA-CGGA--G-G-CCGCCATGAGTGGATTTG
gi|4                          :                                                cctcggatgtaacacggaggctgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtttttctgatgtggttttgtgaattttaaaaacaaaaaatgcgatacaattacaactgaagtgaagaggaaacgtctggtttacataattcttacgatgtaaatagaataaacaatatgatctcttgaaaagaactggactatatggagtattgacactttgttacccagtcgatattattacgcggaccgattaacataaagcac-CGGA--G-G-CCGCCATGAGTGGATTTG
gi|7                          :                     ttcggaacaccgagaatgtcgagcgcactcgacattgacctcggatgtaatacggaggccaccatgagtggatttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtttttcctgatgtggtttgttttgttattttttttttaaacagcgatacagcaataactgaagtgaagaggatacgtcttgtttacataattcttacgatgtaaatagtataaacaatgggatctcttgaaaagaagtggactatatgaagtattgatactttgttacccggtcgatattattacgccgacctattaacataatgcacA--G-G-CCGCCATGAGTGGATTTG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acaactgaagtgaagaggaaacgtcttgttaacataattcttaagatgtaagtagtataaacaatatgatatcttaaaaagaagtgaactatatggaatattgtcactttgttgcccgatcgagattattacgccgaccgattcacaaaatgcacCTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT------TTAA-AAAAA--C------TGT-GTT-ACAATAATTACTGAAGTGA--AGA-GGAA-ATGTCTTGTTT-AC-ATAATTCTT-ACGA---TGTA----AAac
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA-A------C------TGTAGATTACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGG-AA-GCA-CTTGTTTGACAATAATTCTTAACAATGTTGTATTTTAACAGTAATCACACATATATGATCTCTAATT--AAAGAA--AGATAGTGGACTGATCT--A-TGTATAGATAAAAT------TTACTGACACTTTGTTA-CCCAAAGTTGGGAGGATT--ATGGTTACG---CGGACCCCGAGGTG-AAAACCATGGAGGATGCAAAATTCTTCAATA--TCCACTCATGAAGACGG-C-C--T
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attcggaacaccgagaatgtctcgctccgcgcacctcgacattgacctcggatgtaattacggaccgcgccgccatgagggaaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaACAACTGAAGTGA--AGA-GGAA-ACGTCTTGTTA-AC-ATAATTCTT-AAGA---TGTA----AGTAG-TAT-AAACA-ATATGATATC---TT--AAA-AAGAAG------------TGA--ACTATATGGA------------ATATTGTCACTTTGTTG-CCC--GATCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-CA---CAA----AATGCA-------CCAA-A--TCCACTCAT---GGCGG-C-C--Tt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT-AAACA-ATGTGATCTC---TA--AAA-TA--AG------------TAG--ACTATAT-------------------------TTTAT-A-TC----GACA---AGAG---G---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----A------------CCAA-A--TCCACCCAT---GGTGA-C-C--CCCG-TA-TTac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTAACCC--GATCG---A-ATTTCA---TTA-GAGACCG-CC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-A--TCC---TAT---GGCGG-C-C--TC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtcggTGCA-------TCAT-A--TTCATTCCT---GGAAA-A-C--ATCG-TA-TTACA-T-C-T-GAGACCTTTGC-TGG-GC------A-C-----G--GGAGAT-A-TTCGATGAGTTCCGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCA-------TCAA-CCTTCC-CTCAT---GGCGG-CGCGGTCCG-TAATTACA-T-C-C-GAGGTCAATGT-CGAGGT------G-CGCGGAG--CGAGAC-A-TTCTCGGTGTTCCGAATtt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-------TCAA-A--TCCACTCAT---G-CGG-C-C--TCCG-TA-TTACACT-C-CAGAGGTCAATGT-CGATGT------G-C--------CGAGAC-ttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaaaactgtagattacaataattactgaagtgaagaggaagcacttgtttgacaataattcttaacaatgttgtattttaacagtaatcacacatatatgatctctaattaaagaaagatagtggactgatctatgtatagataaaatttactgacactttgttacccaaagttgggaggattatggttacgcggaccccgaggtgaaaaccatggaggatgcaaaattcttcaatatccactcatgaagacggcctt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcggtaagctactgagatatg-------CCAA-A--TCCACTCAT---GGTGG-C-C--TCCG-TA-TTACA-T-C-C-GAGGTCAATGT-CGA-GT------G-C-----G--CTCGAC-A-TTCTCGGTGTTCCGAcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caccgagaa-TA-TTACA-T-C---GAGATCAATGT-CGA-GT------G-CT----G--CGAGAT-ATTTCTCGGAGTTCttccga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttc-TA-TTA-A-T-C-C-CAGGTCTATGTTCGA-GT------GTC-----GGTTTGGACGATTGCGAGGAGTTCTGAGTttgg
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lowQualScore                  :            ..   .       .   .   .....      ...              . .  .     .      .. .           .       .......................................................................................      .           ....     ...........   .............   .   .     .  .          . .                 .   .         .      ........       ..      .           ......     ........        .......       ......      ............        . .   ..     ... .   ......     ...      ....    .  ...   ....      .......    .          ...     .      .       .. .   ....           .        .  . ..  .         
lowQualScore                  :            99   4       4   4   11111      222              0 0  0     0      99 0           9       666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666      8           2222     22222222222   0000000000000   7   7     9  5          0 8                 0   7         7      11111111       99      7           666666     99999999        6666666       444444      333333333333        1 0   99     888 5   999999     888      6666    0  888   6666      4444444    4          888     4      7       88 2   8888           0        9  0 66  0         
consensus                     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGCGCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTGA-A-GAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---T--AAAAAGAA-----GTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAGATCNATGTCGAGTGC-GCGAGACA-TT-CGAGGAGTTCCGAGT
Reference ( family-2175 )     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGCGCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTGA-AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---T--AAAAA--A-----GTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAGGTCAATGTCGAGTGC-GCGAGACA-TT-CTCGGNGTTCCGAGT
gi|1                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCTCGCTCCGCGCACC-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAATTACGGACCGCGCCGCCATGAG-GGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                   AAA------C------TGTAGATTACAATAATTACTGAAGTGA-A-GAGGAAGCA-CTTGTTTGACAATAATTCTTAACAATGTTGTATTTTAACAGTAATCACACATATATGATCTCTAATT--AAAGA--AAGATAGTGGACTGATCTATGTATAGATAAAATTTACTGA------------CACTTTGTTA-CCCAAAGTTGGGAGGATT--ATGGTTACG---CGGACCCCGAGGTG-AAAACCATGGAGGATGCAAAATTCTTCAATATCCACTCATGAAGACGG-CCTaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaaaactgtagattacaataattactgaagtgaagaggaagcacttgtttgacaataattcttaacaatgttgtattttaacagtaatcacacatatatgatctctaattaaagaaagatagtggactgatctatgtatagataaaatttactgacactttgttacccaaagttgggaggattatggttacgcggaccccgaggtgaaaaccatggaggatgcaaaattcttcaatatccactcatgaagacggcctt
gi|10                         :                                                                                                      attcggaacaccgagaatgtctcgctccgcgcacctcgacattgacctcggatgtaattacggaccgcgccgccatgagggaaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaA--TAAACA-ATGTGATCTCT---A--AAATA--A-----GTAGACTA-------TATTTTA------TATCGA------------CA-------A----------G---AGGTT--A------CG---CCGACC----GATT-AA---CAT----A------------CCAA-ATCCACCCAT---GGTGA-CCCCCG-TATTt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGCA-------TCAT-ATTCATTCCT---GGAAA-ACATCG-TATTACAT-CTGAGACCTTTGCTGGGCAC-GGGAGATA-TT-CGATGAGTTCCGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTAACCC--GATCG---A-ATTTCA---TTA-GAGACCG-CC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCC---TAT---GGCGG-CCTCtt
gi|13                         : gtcggATTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGCGCA-C-TCGACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TATTACAT-C-GAGATCAATGTCGAGTGCTGCGAGATATTT-CTCGGAGTTCgcgcactcgacatgtgcacactcgacatg
gi|16                         :             ttcC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGC--A-C-TCGACATTGACCTC-GAGA-CATTA-T-CGGA--G-ttgg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGAGACA-TT-ATCGGAGTTCCGAttccga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caccgagaatgtctcgcactcgacattgacctAGTGC-GCGAGACA-TG-CGAGGAGTTCCGAG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacgtcgagtactACA--CCGAG---AATGTCGATTGC-ACGAGATA-TT-CTCGGAGTTCCG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGTCGAGTGC-TCGAGACA-TTGCGAGCAGTTCCGAGT
gi|2                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGCGCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGTCATGAGTGGATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTATTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTTTTTAAA------C------TGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGATAAGA-GAAACGTCTTGTTT-ATA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---T--AAAAA--A-----GTTTACTA-------TATGGGG------TATTGA------------CGCTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCATTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGATATCTATGTCGAGTGC-GCAAGACAGTG-CGAGGAGTTCCGAGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGTCGAGTGC-GCGAGACA-TG-CGAGGAGTTCCGA
gi|21                         :      ATTCGG--AAC-AC-GAGA-ATG-TCT-----CGCGCA---TCGAC
gi|3                          :     cATTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGCGCA-T-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT----------TTTCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-------AAAAAAACCC------TGC-GAT-AC---------TGAAGTGA-A-GAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-AAATGATCTCT---TCAAAAGA--A-----GTGGACTA-------TATGGAG------TATTGACACATGTATTGACACTTTGT-A-CC---GGTCG---AGATT--T---TTACGA--CTGA-C----GATTCAC---CAA----AAT----------CCCA-ATCCATTCAT----GCGGACCTACGCTATTA-ATCCCGAGGTT-AT-TCGAGTGC-GTGAGACA-t
gi|4                          :      cTTCGG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCG-----AGCGCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCACCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG---------TTTTTCCTGATGTGGTTTGTTTTGTTATTTTTTTT-TTAAA------C------AGC-GAT-ACAGCAATAACTGAAGTGA-A-GAGGATACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATGGGATCTCT---T--GAAAAGAA-----GTGGACTA-------TATGAAG------TATTGA------------TACTTTGTTA-CCC--GGTCG---ATATT--A---TTACG---CCGACC----TATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-
gi|5                          :                                                         CCTC-G-GA-TGTAA-CACGGA--G-GCTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGA---ATTTT-AAAAA------CAAAAAATGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGA-A-GAGGAAACGTCTGGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---T--GAAAAGAA-----CTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--AGTCG---ATATT--A---TTACG---CGGACC----GATT-AA---CAT----AAAGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-T
gi|6                          :       TTCAG--AAC-ACCGAGA-ATG-TCT-----CGCGCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCTTGAGTGGATTTG------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNGTTTT------TGTAATTT----T--------TTTTATAAAA------C------TGC-GAT-AAAATAACAACTGAAGTG--AAGAGAAAACGTCTTGTTT-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAACTGAAGTGA-A-GAGGAAACGTCTTGTTA-ACA-TAATTCTTA-AGATGT---A----AGTAGTA--TAAACA-ATATGATATCT---T--AAAAAGAA-----GTGAACTA-------TATGGAA------TATTGT------------CACTTTGTTG-CCC--GATCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-CA---CAA----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCT
gi|8                          :       TTCGGTAAGCTACTGAGATATGGTCT-----CG-GCA-CATCGACATTGACCTCTG-GAGTGTAA-TACGGA--G-GCCG-CATGAGTGGATTTGac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                          CTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT------TTAAAAAAA--C------TGT-GTT-ACAATAATTACTGAAGTGA-A-GAGGAAATGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AAatcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta
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Unaligned ( gi|14 ): ATATTAATCCCAGGTCTATGTTCGAGTGTCGGTTTGGACGATTGCGAGGAGTTCTGAGTG






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consensus                     :           ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-TTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAGGTCTATGT-CGAGTGCGCGA----GAC-A-TN-CGAGGAGTTCCGAGT
Reference ( family-2175 )     :           ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-TTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAGATCNATGT-CGAGTGCGCGA----GAC-A-TT-CGAGGAGTTCCGAGT
gi|1                          :           ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCTCGCTCCGC-GCACC-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAATTACGGACCGCGCCGCCATGAG-GGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                           AAA------C------TGTAGATTACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGGAAGCA-CTTGTTTGACAATAATTCTTAACAATGTTGTATTTTAACAGTAATCACACATATATGATCTCTAATTAAAGAAAGATAGTGGACTGATCTATGTATAGATAAAATTTACTGA------------CACTTTGTTA-CCCAAAGTTGGGAGGATT--ATGGTTACG---CGGACCCCGAGGTG-AAAACCATGGAGGATGCAAAATTCTTCAATATCCACTCATGAAGACGG-CCTaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaaaactgtagattacaataattactgaagtgaagaggaagcacttgtttgacaataattcttaacaatgttgtattttaacagtaatcacacatatatgatctctaattaaagaaagatagtggactgatctatgtatagataaaatttactgacactttgttacccaaagttgggaggattatggttacgcggaccccgaggtgaaaaccatggaggatgcaaaattcttcaatatccactcatgaagacggcctt
gi|10                         :                                                                                                              attcggaacaccgagaatgtctcgctccgcgcacctcgacattgacctcggatgtaattacggaccgcgccgccatgagggaaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaA--TAAACA-ATGTGATCTCT-----AA--AATA-AGTAGACTA-------TATTTTA------TATCGA------------CA-------A----------G---AGGTT--A------CG---CCGACC----GATT-AA---CAT----A------------CCAA-ATCCACCCAT---GGTGA-CCCCCG-TATTt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGCA-------TCAT-ATTCATTCCT---GGAAA-ACATCG-TATTACAT-CTGAGACCTTTGC-TGGGCACGGGA----GAT-A-TT-CGATGAGTTCCGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTAACCC--GATCG---A-ATTTCA---TTA-GAGACCG-CC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCC---TAT---GGCGG-CCTCtt
gi|13                         :      gtcggATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TATTA-AT-CCCAGGTCTATGTTCGAGTGT-CGGTTTGGACGA-TTGCGAGGAGTTCTGAGTgcgcactcgacatgtgcacactcgacatg
gi|15                         :           aTTCG---AAC-TCCGAGA-AATA-TCT-----CGCAGCA-C-TCGACATTGATCTC---GA-TGTAA-TAg
gi|16                         :                     C-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC---A-C-TCGACATTGACCTC-GAGA-CATTA-T-CGGA--G-ttgg
gi|16                         :             TCGG--AAC-TCCGATA-A-TG-TCT-----CGttccga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caccgagaatgtctcgcactcgacattgacctAGTGCGCGA----GAC-A-TG-CGAGGAGTTCCGAG
gi|18                         : tacgtcgagtactCGG--AAC-TCCGAGA-A-TA-TCT-----CGT-GCA-A-TCGACATT---CTC-G-G--TGT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGT-CGAGTGCTCGA----GAC-A-TTGCGAGCAGTTCCGAGT
gi|2                          :           ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGTCATGAGTGGATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTATTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGATAAGA-GAAACGTCTTGTTT-ATA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--A--A-AGTTTACTA-------TATGGGG------TATTGA------------CGCTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCATTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGATATCTATGT-CGAGTGCGCAA----GAC-AGTG-CGAGGAGTTCCGAGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGT-CGAGTGCGCGA----GAC-A-TG-CGAGGAGTTCCGA
gi|21                         :           ATTCGG--AAC-AC-GAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA---TCGAC
gi|3                          :          cATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-T-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT----------TTTCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA--------AAAAAAACCC------TGC-GAT-AC---------TGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-AAATGATCTCT---TCAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGACACATGTATTGACACTTTGT-A-CC---GGTCG---AGATT--T---TTACGA--CTGA-C----GATTCAC---CAA----AAT----------CCCA-ATCCATTCAT----GCGGACCTACGCTATTA-ATCCCGAGGT-TAT-T-CGAGTGCGTGA----GAC-A-t
gi|4                          :           cTTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCG-----AGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCACCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG---------TTTTTCCTGATGTGGTTTGTTTTGTTATTTT-TTTT-TTAAA------C------AGC-GAT-ACAGCAATAACTGAAGTG--AAGAGGATACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATGGGATCTCT---TGAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGAAG------TATTGA------------TACTTTGTTA-CCC--GGTCG---ATATT--A---TTACG---CCGACC----TATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-
gi|5                          :                                                                CCTC-G-GA-TGTAA-CACGGA--G-GCTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGA---A-TTTT-AAAAA------CAAAAAATGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTGGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TGAA--AAGA-ACTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--AGTCG---ATATT--A---TTACG---CGGACC----GATT-AA---CAT----AAAGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-T
gi|6                          :            TTCAG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCTTGAGTGGATTTG------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNGTTTT------TGTAATTT----T---------TTTTATAAAA------C------TGC-GAT-AAAATAACAACTGAAGTG--AAGAGAAAACGTCTTGTTT-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                         ACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTA-ACA-TAATTCTTA-AGATGT---A----AGTAGTA--TAAACA-ATATGATATCT---TAAA--AAGA-AGTGAACTA-------TATGGAA------TATTGT------------CACTTTGTTG-CCC--GATCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-CA---CAA----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCT
gi|8                          :            TTCGGTAAGCTACTGAGATA-TGGTCT-----CG--GCA-CATCGACATTGACCTCTG-GAGTGTAA-TACGGA--G-GCCG-CATGAGTGGATTTGac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                 CTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT-------TTAAAAAAA--C------TGT-GTT-ACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGGAAATGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AAatcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta





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lowQualScore                  :            ..   .       . .  .   .....   .   ...              . .  .     .      .. .           .       .......................................................................................      .           ....     ............   .............   .   .     .  .         ..                   .   .         .      ........       ..      .           .....  ..    .         .......       ......      ............        . .   ..     ... .   ......     ...      ....    .  ...   ....      .......    .          ...     .      .     .  .     .  .     .     ......      ....    .. .               
lowQualScore                  :            00   3       3 3  3   33333   6   555              0 0  0     4      99 0           9       666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666      8           2222     222222222222   0000000000000   7   7     9  5         99                   0   7         7      11111111       99      7           11111  99    7         6666666       444444      333333333333        1 0   99     888 5   999999     888      6666    0  888   6666      4444444    4          888     4      7     0  0     0  0     0     444444      6666    99 0               
consensus                     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-TTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAG-GTCTATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAGT
Reference ( family-2175 )     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-TTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAG-GTCTATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TNCGAGGAGTTCCGAGT
gi|1                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCTCGCTCCGC-GCACC-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAATTACGGACCGCGCCGCCATGAG-GGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                      AAA------C------TGTAGATTACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGGAAGCA-CTTGTTTGACAATAATTCTTAACAATGTTGTATTTTAACAGTAATCACACATATATGATCTCTAATTAAAGAAAGATAGTGGACTGATCTATGTATAGATAAAATTTACTGA------------CACTTTGTTA-CCCAAAGTTGGGAGGATT--ATGGTTACG---CGGACCCCGAGGTG-AAAACCATGGAGGATGCAAAATTCTTCAATATCCACTCATGAAGACGG-CCTaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaaaactgtagattacaataattactgaagtgaagaggaagcacttgtttgacaataattcttaacaatgttgtattttaacagtaatcacacatatatgatctctaattaaagaaagatagtggactgatctatgtatagataaaatttactgacactttgttacccaaagttgggaggattatggttacgcggaccccgaggtgaaaaccatggaggatgcaaaattcttcaatatccactcatgaagacggcctt
gi|10                         :                                                                                                         attcggaacaccgagaatgtctcgctccgcgcacctcgacattgacctcggatgtaattacggaccgcgccgccatgagggaaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaA--TAAACA-ATGTGATCTCT-----AA--AATA-AGTAGACTA-------TATTTTA------TATCGA------------CA-------A----------G---AGGTT--A------CG---CCGACC----GATT-AA---CAT----A------------CCAA-ATCCACCCAT---GGTGA-CCCCCG-TATTt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGCA-------TCAT-ATTCATTCCT---GGAAA-ACATCG-TATTACAT-CTGAG-ACCTTTGC-TGGGC------ACGGGA----GATA--TTCGATGAGTTCCGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTAACCC--GATCG---A-ATTTCA---TTA-GAGACCG-CC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCC---TAT---GGCGG-CCTCtt
gi|13                         : gtcggATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACATGTCGAGTGCGCATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TTCTCGGTGTTCCGAATgcgcactcgacatgtgcacactcgacatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TATTA-AT-CCCAG-GTCTATGTTCGAGT------GT-CGGTTTGGACGATTGCGAGGAGTTCTGAGTgcacactcgacatg
gi|15                         :      aTTCG---AAC-TCCGAGA-AATA-TCT-----CGCAGCA-C-TCGACATTGATCTC---GA-TGTAA-TAg
gi|16                         :                C-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC---A-C-TCGACATTGACCTC-GAGA-CATTA-T-CGGA--G-ttgg
gi|16                         :        TCGG--AAC-TCCGATA-A-TG-TCT-----CGttccga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caccgagaatgtctcgcactcgacattgacctTACGT-CGAGTACTAGTGCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAG
gi|18                         :         CGG--AAC-TCCGAGA-A-TA-TCT-----CGT-GCA-A-TCGACATT---CTC-G-G--TGT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGT-CGAGT------GCTCGA----GACAT-TGCGAGCAGTTCCGAGT
gi|2                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGTCATGAGTGGATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTATTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGATAAGA-GAAACGTCTTGTTT-ATA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--A--A-AGTTTACTA-------TATGGGG------TATTGA------------CGCTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCATTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAT-ATCTATGT-CGAGT------GCGCAA----GACAG-TGCGAGGAGTTCCGAGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGA
gi|21                         :      ATTCGG--AAC-AC-GAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA---TCGAC
gi|3                          :     cATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-T-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT----------TTTCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA--------AAAAAAACCC------TGC-GAT-AC---------TGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-AAATGATCTCT---TCAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGACACATGTATTGACACTTTGT-A-CC---GGTCG---AGATT--T---TTACGA--CTGA-C----GATTCAC---CAA----AAT----------CCCA-ATCCATTCAT----GCGGACCTACGCTATTA-ATCCCGAG-GT-TAT-T-CGAGT------GCGTGA----GACA--t
gi|4                          :      cTTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCG-----AGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCACCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG---------TTTTTCCTGATGTGGTTTGTTTTGTTATTTT-TTTT-TTAAA------C------AGC-GAT-ACAGCAATAACTGAAGTG--AAGAGGATACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATGGGATCTCT---TGAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGAAG------TATTGA------------TACTTTGTTA-CCC--GGTCG---ATATT--A---TTACG---CCGACC----TATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-
gi|5                          :                                                           CCTC-G-GA-TGTAA-CACGGA--G-GCTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGA---A-TTTT-AAAAA------CAAAAAATGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTGGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TGAA--AAGA-ACTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--AGTCG---ATATT--A---TTACG---CGGACC----GATT-AA---CAT----AAAGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-T
gi|6                          :       TTCAG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCTTGAGTGGATTTG------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNGTTTT------TGTAATTT----T---------TTTTATAAAA------C------TGC-GAT-AAAATAACAACTGAAGTG--AAGAGAAAACGTCTTGTTT-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTA-ACA-TAATTCTTA-AGATGT---A----AGTAGTA--TAAACA-ATATGATATCT---TAAA--AAGA-AGTGAACTA-------TATGGAA------TATTGT------------CACTTTGTTG-CCC--GATCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-CA---CAA----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCT
gi|8                          :       TTCGGTAAGCTACTGAGATA-TGGTCT-----CG--GCA-CATCGACATTGACCTCTG-GAGTGTAA-TACGGA--G-GCCG-CATGAGTGGATTTGac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                            CTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT-------TTAAAAAAA--C------TGT-GTT-ACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGGAAATGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AAatcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta





Alignments
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consensus                     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-TTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAG-GTCTATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAGT
Reference ( family-2175 )     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA-TTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAG-GTCTATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAGT
gi|1                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCTCGCTCCGC-GCACC-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAATTACGGACCGCGCCGCCATGAG-GGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                      AAA------C------TGTAGATTACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGGAAGCA-CTTGTTTGACAATAATTCTTAACAATGTTGTATTTTAACAGTAATCACACATATATGATCTCTAATTAAAGAAAGATAGTGGACTGATCTATGTATAGATAAAATTTACTGA------------CACTTTGTTA-CCCAAAGTTGGGAGGATT--ATGGTTACG---CGGACCCCGAGGTG-AAAACCATGGAGGATGCAAAATTCTTCAATATCCACTCATGAAGACGG-CCTaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaaaactgtagattacaataattactgaagtgaagaggaagcacttgtttgacaataattcttaacaatgttgtattttaacagtaatcacacatatatgatctctaattaaagaaagatagtggactgatctatgtatagataaaatttactgacactttgttacccaaagttgggaggattatggttacgcggaccccgaggtgaaaaccatggaggatgcaaaattcttcaatatccactcatgaagacggcctt
gi|10                         :                                                                                                         attcggaacaccgagaatgtctcgctccgcgcacctcgacattgacctcggatgtaattacggaccgcgccgccatgagggaaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaA--TAAACA-ATGTGATCTCT-----AA--AATA-AGTAGACTA-------TATTTTA------TATCGA------------CA-------A----------G---AGGTT--A------CG---CCGACC----GATT-AA---CAT----A------------CCAA-ATCCACCCAT---GGTGA-CCCCCG-TATTt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGCA-------TCAT-ATTCATTCCT---GGAAA-ACATCG-TATTACAT-CTGAG-ACCTTTGC-TGGGC------ACGGGA----GATA--TTCGATGAGTTCCGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTAACCC--GATCG---A-ATTTCA---TTA-GAGACCG-CC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCC---TAT---GGCGG-CCTCtt
gi|13                         : gtcggATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACATGTCGAGTGCGCATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TTCTCGGTGTTCCGAATgcgcactcgacatgtgcacactcgacatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TATTA-AT-CCCAG-GTCTATGTTCGAGT------GT-CGGTTTGGACGATTGCGAGGAGTTCTGAGTgcacactcgacatg
gi|15                         :      aTTCG---AAC-TCCGAGA-AATA-TCT-----CGCAGCA-C-TCGACATTGATCTC---GA-TGTAA-TAg
gi|16                         :                C-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC---A-C-TCGACATTGACCTC-GAGA-CATTA-T-CGGA--G-ttgg
gi|16                         :        TCGG--AAC-TCCGATA-A-TG-TCT-----CGttccga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caccgagaatgtctcgcactcgacattgacctTACGT-CGAGTACTAGTGCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAG
gi|18                         :         CGG--AAC-TCCGAGA-A-TA-TCT-----CGT-GCA-A-TCGACATT---CTC-G-G--TGT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGT-CGAGT------GCTCGA----GACAT-TGCGAGCAGTTCCGAGT
gi|2                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGTCATGAGTGGATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTATTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTTT-TTAAA------C------TGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGATAAGA-GAAACGTCTTGTTT-ATA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--A--A-AGTTTACTA-------TATGGGG------TATTGA------------CGCTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCATTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAT-ATCTATGT-CGAGT------GCGCAA----GACAG-TGCGAGGAGTTCCGAGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGA
gi|21                         :      ATTCGG--AAC-AC-GAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA---TCGAC
gi|3                          :     cATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-T-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT----------TTTCTGATGTGGTTT----TGTGATTTA--------AAAAAAACCC------TGC-GAT-AC---------TGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-AAATGATCTCT---TCAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGACACATGTATTGACACTTTGT-A-CC---GGTCG---AGATT--T---TTACGA--CTGA-C----GATTCAC---CAA----AAT----------CCCA-ATCCATTCAT----GCGGACCTACGCTATTA-ATCCCGAG-GT-TAT-T-CGAGT------GCGTGA----GACA--t
gi|4                          :      cTTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCG-----AGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCACCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG---------TTTTTCCTGATGTGGTTTGTTTTGTTATTTT-TTTT-TTAAA------C------AGC-GAT-ACAGCAATAACTGAAGTG--AAGAGGATACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATGGGATCTCT---TGAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGAAG------TATTGA------------TACTTTGTTA-CCC--GGTCG---ATATT--A---TTACG---CCGACC----TATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-
gi|5                          :                                                           CCTC-G-GA-TGTAA-CACGGA--G-GCTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGTTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGA---A-TTTT-AAAAA------CAAAAAATGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTGGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TGAA--AAGA-ACTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--AGTCG---ATATT--A---TTACG---CGGACC----GATT-AA---CAT----AAAGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-T
gi|6                          :       TTCAG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCTTGAGTGGATTTG------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNGTTTT------TGTAATTT----T---------TTTTATAAAA------C------TGC-GAT-AAAATAACAACTGAAGTG--AAGAGAAAACGTCTTGTTT-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAACTGAAGTG--AAGAGGAAACGTCTTGTTA-ACA-TAATTCTTA-AGATGT---A----AGTAGTA--TAAACA-ATATGATATCT---TAAA--AAGA-AGTGAACTA-------TATGGAA------TATTGT------------CACTTTGTTG-CCC--GATCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-CA---CAA----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCT
gi|8                          :       TTCGGTAAGCTACTGAGATA-TGGTCT-----CG--GCA-CATCGACATTGACCTCTG-GAGTGTAA-TACGGA--G-GCCG-CATGAGTGGATTTGac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                            CTGTTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT-------TTAAAAAAA--C------TGT-GTT-ACAATAATTACTGAAGTG--AAGAGGAAATGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AAatcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta


blockSeqs                     :            TA   T       T A  G   .       A   CA               T A  G     .      .  .                   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG      C           GTTT     TTTTTTTTTT     AAAACCC         .   .     T            AT                   .   .         .      A              .       .           TA     .     .         .             .           CACATGTATTGA          A   .      .   G   TCA        AGA      .       C  .     .         .          .          .       A      C     C  G     T  G     T     ACTAGT      TTTG    AT
blockSeqs                     :            .    .       . .  .   .       .   C                . .  .     .      .  .                   NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT             C           .        ATTTTAA        CAAAAAA         .   .     A            .                    .   .         .      A              .       .           TC     .     .         .             .           .                     .   .      .   G   A          A        .       .  .     .         .          .          .       .      .     C  C     .  C     .     .           .       T 
blockSeqs                     :            .    .       . .  .   .       .   C                . .  .     .      .  .                   GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG               C           .        TTTTATA        AAAAC           .   .     T            .                    .   .         .      A              .       .           TG     .     .         .             .           .                     .   .      .   G   A          .        .       .  .     .         .          .          .       .      .     .  .     .  C     .     .           .       G 
blockSeqs                     :            .    .       . .  .   .       .   C                . .  .     .      .  .                   ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG               .           .        TTTTT          C               .   .     A            .                    .   .         .      A              .       .           TG     .     .         .             .           .                     .   .      .   T   T          .        .       .  .     .         .          .          .       .      .     .  .     .  .     .     .           .       . 
blockSeqs                     :            .    .       . .  .   .       .   A                . .  .     .      .  .                                                                                                                .           .        TTTA           C               .   .     A            .                    .   .         .      A              .       .           TA     .     .         .             .           .                     .   .      .   T   A          .        .       .  .     .         .          .          .       .      .                       .     .           .       . 
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Reference ( family-2175 )     :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCATGAGTGGATTTGGNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT---ACTG--TTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT-----T-TA----AAA------C------TGC-GAT-ACAATAACAACTGAAGTGA--AGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATATGATCTCT---TGAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAG-GTCTATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAGT
gi|1                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCTCGCTCCGC-GCACC-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAATTACGGACCGCGCCGCCATGAG-GGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                       T---ACTAGATTTTTCCT--TG-GATCT----TA-GATTA-----T-TA----AAAAAAAAAC------TGTAGATTACAATAATTACTGAAGTGA--AGAGGAAGCA-CTTGTTTGACAATAATTCTTAACAATGTTGTATTTTAACAGTAATCACACATATATGATCTCTAATTAAAGAAAGATAGTGGACTGATCTATGTATAGATAAAATTTACTGA------------CACTTTGTTA-CCCAAAGTTGGGAGGATT--ATGGTTACG---CGGACCCCGAGGTG-AAAACCATGGAGGATGCAAAATTCTTCAATATCCACTCATGAAGACGG-CCTaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcattactagatttttccttggatcttagattattaaaaaaaaaactgtagattacaataattactgaagtgaagaggaagcacttgtttgacaataattcttaacaatgttgtattttaacagtaatcacacatatatgatctctaattaaagaaagatagtggactgatctatgtatagataaaatttactgacactttgttacccaaagttgggaggattatggttacgcggaccccgaggtgaaaaccatggaggatgcaaaattcttcaatatccactcatgaagacggcctt
gi|10                         :                                                                                                                                                     attcggaacaccgagaatgtctcgctccgcgcacctcgacattgacctcggatgtaattacggaccgcgccgccatgagggaaggttgatgcttgcacgactgactgcgcaccccgtcagagtctatgacaattaccgttactggattgcgttatactgtcatagttagcataggtagacatcatA--TAAACA-ATGTGATCTCT-----AA--AATA-AGTAGACTA-------TATTTTA------TATCGA------------CA-------A----------G---AGGTT--A------CG---CCGACC----GATT-AA---CAT----A------------CCAA-ATCCACCCAT---GGTGA-CCCCCG-TATTt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGCA-------TCAT-ATTCATTCCT---GGAAA-ACATCG-TATTACAT-CTGAG-ACCTTTGC-TGGGC------ACGGGA----GATA--TTCGATGAGTTCCGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTAACCC--GATCG---A-ATTTCA---TTA-GAGACCG-CC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCC---TAT---GGCGG-CCTCtt
gi|13                         : gtcggATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATGTCGAGTGCGCATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TTCTCGGTGTTCCGAATgcgcactcgacatgtgcacactcgacatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TATTA-AT-CCCAG-GTCTATGTTCGAGT------GT-CGGTTTGGACGATTGCGAGGAGTTCTGAGTgcacactcgacatg
gi|15                         :      aTTCG---AAC-TCCGAGA-AATA-TCT-----CGCAGCA-C-TCGACATTGATCTC---GA-TGTAA-TAg
gi|16                         :                C-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC---A-C-TCGACATTGACCTC-GAGA-CATTA-T-CGGA--G-ttgg
gi|16                         :        TCGG--AAC-TCCGATA-A-TG-TCT-----CGttccga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caccgagaatgtctcgcactcgacattgacctTACGT-CGAGTACTAGTGCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGAG
gi|18                         :         CGG--AAC-TCCGAGA-A-TA-TCT-----CGT-GCA-A-TCGACATT---CTC-G-G--TGT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGT-CGAGT------GCTCGA----GACAT-TGCGAGCAGTTCCGAGT
gi|2                          :      ATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGTCATGAGTGGATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTA--TTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGATTTATTTTT-TT----AAA------C------TGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGATAAGAG-AAACGTCTTGTTT-ATA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TAAA--AA---AGTTTACTA-------TATGGGG------TATTGA------------CGCTTTGTTA-CCC--GGTCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCATTCAT---GGCGG-CCTCCG-TATTACAT-CCGAT-ATCTATGT-CGAGT------GCGCAA----GACAG-TGCGAGGAGTTCCGAGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGT-CGAGT------GCGCGA----GACA--TGCGAGGAGTTCCGA
gi|21                         :      ATTCGG--AAC-AC-GAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA---TCGAC
gi|3                          :     cATTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-T-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTGGT------------TTTCTGATGTGGTTT----TGTGATTT-----A-AA----AAAAACC--C------TGC-GAT-AC---------TGAAGTGA--AGAGGAAACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-AAATGATCTCT---TCAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGGAG------TATTGACACATGTATTGACACTTTGT-A-CC---GGTCG---AGATT--T---TTACGA--CTGA-C----GATTCAC---CAA----AAT----------CCCA-ATCCATTCAT----GCGGACCTACGCTATTA-ATCCCGAG-GT-TAT-T-CGAGT------GCGTGA----GACA--t
gi|4                          :      cTTCGG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCG-----AGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCACCATGAGTGGATTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG-----------TTTTTCCTGATGTGGTTTGTTTTGTTATTT-----T-TTTTTTAAA------C------AGC-GAT-ACAGCAATAACTGAAGTGA--AGAGGATACGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGTA--TAAACA-ATGGGATCTCT---TGAA--AAGA-AGTGGACTA-------TATGAAG------TATTGA------------TACTTTGTTA-CCC--GGTCG---ATATT--A---TTACG---CCGACC----TATT-AA---CAT----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-
gi|5                          :                                                           CCTC-G-GA-TGTAA-CACGGA--G-GCTGCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTG--TTTTTC-TGATGTGGTTT----TGTGAATT-----T-TA----AAAA-----CAAAAAATGC-GAT-ACAATTACAACTGAAGTGA--AGAGGAAACGTCTGGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AATAGAA--TAAACA-ATATGATCTCT---TGAA--AAGA-ACTGGACTA-------TATGGAG------TATTGA------------CACTTTGTTA-CCC--AGTCG---ATATT--A---TTACG---CGGACC----GATT-AA---CAT----AAAGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCTCCG-T
gi|6                          :       TTCAG--AAC-ACCGAGA-A-TG-TCT-----CGC-GCA-C-TCGACATTGACCTC-G-GA-TGTAA-TACGGA--G-GCCGCCTTGAGTGGATTTG------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNG--TTTT------TGTAATTT----T----TTT-----TATA----AAA------C------TGC-GAT-AAAATAACAACTGAAGTGA--AGAGAAAACGTCTTGTTT-A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAACTGAAGTGA--AGAGGAAACGTCTTGTTA-ACA-TAATTCTTA-AGATGT---A----AGTAGTA--TAAACA-ATATGATATCT---TAAA--AAGA-AGTGAACTA-------TATGGAA------TATTGT------------CACTTTGTTG-CCC--GATCG---AGATT--A---TTACG---CCGACC----GATT-CA---CAA----AATGCA-------CCAA-ATCCACTCAT---GGCGG-CCT
gi|8                          :       TTCGGTAAGCTACTGAGATA-TGGTCT-----CG--GCA-CATCGACATTGACCTCTG-GAGTGTAA-TACGGA--G-GCCG-CATGAGTGGATTTGac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                            CTG--TTTTTCCTGATGTGGTTT----TGTGATTT-----T-TA----AAAAAA---C------TGT-GTT-ACAATAATTACTGAAGTGA--AGAGGAAATGTCTTGTTT-ACA-TAATTCTTA-CGATGT---A----AAatcgctggctgcaaactatgaaagtcagagtctattgattacgattacgtta