lowQualScore : 11 33333 11
lowQualScore : 5 00 5 33 2 5 4 2 4 8888 555555 22222 1 44 55555 1 5 44 1 888888 22 444 1 3 1 1 00000 1 3 3 4 3 1 1 22 1 1 1 1 1 44 66
lowQualScore : . .. . .. . . . . . .... ...... ..... . .. ..... . . .. . ...... .. ... . . . . ..... . . . . . . . .. . . . . . .. ..
lowQualScore : 3 00 3 77 7 3 0 4 7 5555 222222 55555 7 11 77777 7 0 66 7 111111 22 444 6 2 6 7 77777 6 2 2 8 2 6 6 22 6 6 6 6 7 66 99
consensus : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCA-GA-TG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-NN-TT-CA-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTATG
Reference ( gi|9 ) : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTCCA-GA-TG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-AT-TT-CA-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AATA-TTTTATG
gi|11 : TACTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCG-GA-TG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAC-A-TT-TTC-TA-TT-CA-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AA
gi|8 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AA-TTTCA-GA-TG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-----C-TC-TT--TC-A------GCAT--G---T-TAA-A-TC-TTC-TA-TT-CA-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAG-T--AA-ATA-T-A-A--ATCC-TTTTATGcctc
gi|14 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAC--T-AT-AAATTTCA-GA-TG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---A-TAA-T-TT-TTC-TA-TT-CA-TAAAG-TTGCA-C-AC-TCAG-T--AATA-A-T-g
gi|15 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AA-TTCCA-GA-T-----------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TCT-A--TT-CA-TAAAG-T---A-C-AA-T--------A-A-A-T---A--AATC-TTTTATGtc
gi|6 : TATTGT-ATGATTTA-AA-CAGA--C-AT-AAAT--CATAA-TG---A------AA--A--TG-ATAGT-CTT-G---C--C-TT--TC-AAGGTCGACAT--G---TCTAA-A-TT-TTC-TA-TT-CA-AAAAG-TTGCATC-ACGTCAG-T---A-A-A-T-A-A--g
gi|13 : ctTATTGT-ATGATT----A-CA----C-AT-TAA-------A-TG---A------AA--A--TG--TAG--CTTTA---C-TA-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTT-A--TT-CA-TAAAGTTTACA---AA-GCAG-T--AA-A-A-T-ATA--AACA-TTGTATGttctttta
gi|12 : tATTGT-ATGATT---AA-CAAA--C-AT------TCA-GA-TG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TA-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-CA-TAAAG-TTACA-C-AC-GCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AACA-TTGTATGga
gi|5 : TTGT-ATGATTTTTAA-CAAA--CCATTAAATTC-A-GA-TG---AAAATGAAA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC--T--TC-A------GCAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-GTATT-CATTAAAG--TACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-T-A-A-A--AATC-TTTTATG
gi|4 : TTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAAATTTCA-GA-TG---A------AAACA--TGTACGA--CTT-G---C-TCTTT--TC-A------ACAT--GT--T-TAA-A-TT-TCT-A--TT-CA-TAAAGTTTATA-C-AC-TAAG-T--AA-A-A-T-A-A--ATTCTTTTTATGg
gi|2 : tatTTGTCATGATTT--AAACAAA--C-AT-ACATTTCA-GAATGTAAA------AA--G--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGTC-AG-----ACAT--G---T-TAAGA-TT-TTC--C-TT-CA-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-AACAGTC-TTTTATGg
gi|1 : TTGTCATGATTT--AAACAAA--C-AT-ACATTTCA-GAATGTAAA------AA--G--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGTC-AG-----ACAT--G---T-TAAGA-TT-TTC--C-TT-CA-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-AACAGTC-TTTTATGga
gi|16 : TGT-ACGATTT--TA-CAAG--C-AT-AAATTTCA-GA-T----A------AA--A--TC-A------TT-A---C-TC-TT--TC-A------ATAT--A---T-T-C-G-TT-TTT-TT-TT-TA-TAATA-CTACA-C-GC-TCAG-T--AA-A-A---A-A--AAT--TTTga
gi|10 : T-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCA-GA-TG---A------AA-----TG-AT-G--CTT-G---A-TC-TT--TCCA------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTT-CTATT-CA-T-AAG-TTACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTATGg
gi|7 : tacaT-ATGATTTTAAA-CAAAGAC-AT-AAATTC-A-GA-TG---A------AA--AAATG-ATAG--CAT-G---CCTC-TT--TC-A------ACATCGG---T-TAA-AATTGTTCTAT-TT-CA-TAAAG-TTACA-T-AC-TCAA-TCAAA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTATg
gi|18 : T-ACGAT----AA-CAAA--C-TT-AAATTTCA-GA-TA---A------AA--------ATAGCTCTT-A---C-TC-T-----------------------T-CAA-A-CT-TTCAAT-TT-CATTAAAG-CTA-A-C-AC-TTGG-T--AA-A-G-T-A-G--A
gi|23 : tCA-GA-T----A------AA--A--TG-AAAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ATAT--G---T-TTA-------T---T-TT-CA-TAAAG-CTACA-C-AC-TCTG-T--GA-A-A-T-A-T--AATC-TTtcttgt
gi|24 : -GA-TA---A------AA--A--TT-ATAG--GTT-C---C-TC-TT--TA-A------AATT--G---A-TAA-A-TT---C-A-----CG-TA--G-CTGCA-G-AC-TCAG-T--AG-A-A-T-A-A--AAgtc
gi|26 : ---A------AA--T--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-cttgt
gi|19 : gagttggcatgatataat------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---A-TAA-A-TT-TT--ATATT-CA-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTGTATGaattt
gi|22 : tgcattaaat------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TCT-A--TT-CA--AAAA-TTACA-C-AC-TCAG-T---A-A-A-T-A-A--AAT
gi|20 : tttgcattataat------AA--A--TG-ATAG--CTT-GTAAC-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTG-A----------AAG-TCACA-C-AC-TCGG-T--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTGTATG
gi|17 : tttacattataat------AA--A--TG-A-AG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------CGAT--GGATC-TAA-A-TT-TTTTAT-TCGTA-TAAAA-TTACA-CCAC-TCAG-T--TA-A-A-T-A-A--Ag
gi|21 : tgagctttgacatctataat--A--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------GCAT--G---T-TAA-A-TT-TC-------------------AC--C-AC-T-AG-T--AA-A-A-TAA-A--AATA-TTGTATGctct
gi|25 : tgagtttgcattataatacC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-CA-T-AAG-TCACA-C-AC-TCAG-T--AA-A-A-T-A-A--AAga
gi|27 : --G---T-TAA-A-TT-TCT-AT-T--CA-TA--G-TTACA-C-AC-CCAGTT--AA-A-A-T-A-A--AATCTTTTTATGccgtgtatg
gi|3 : -TT-CA-TAAA--TTCCA-CCAC-TCAG-T--AA-A-AAT-A-A--AATC-TTTTATG
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 5 99 5 33 2 2 0 2 4 7777 555555 22 22 1 44 55555 1 4 44 1 777777 22 222 1 3 3 1 222 1 22 3 3 4 3 1 33 1 1 1 1 1 44 3
lowQualScore : . .. . .. . . . . . .... ...... .. .. . .. ..... . . .. . ...... .. ... . . . . ... . .. . . . . . .. . . . . . .. .
lowQualScore : 0 44 0 44 5 5 1 2 4 5555 000000 33 33 7 00 00000 7 8 44 6 888888 11 777 5 1 1 6 333 5 11 1 1 6 1 5 77 5 5 5 5 6 44 3
consensus : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCA-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TATT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTATG
Reference ( family-2141 ) : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCA-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-NNTT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTATG
gi|1 : TTGTCATGATTT--AAACAAA--C-AT-ACATTTCA-GAATGTAAA------AA--G--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGTC-AG-----ACAT--G---T-TAAGA-TT-TTC--CTT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|10 : T-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCA-G-ATG---A------AA-----TG-AT-G--CTT-G---A-TC-TT--TCCA------ACAT--G---T-TAA-ATTT-TTC-TATT-C--A-T-AAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTATGga
gi|11 : tacaTACTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTTCG-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAC-A-TT-TTC-TATT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AACC-g
gi|12 : ATTGT-ATGATT---AA-CAAA--C-AT------TCA-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TA-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TATT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-GCAGT--AA-A-A-T-A-A--AACA-TTGTATGc
gi|13 : TATTGT-ATGATT---------A--C-AC-A----TTA-A-ATG---A------AA--A--TG--TAG--CTTTA---C-TA-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TT--TATT-C--A-TAAAGTTTACA---AA-GCAGT--AA-A-A-T-ATA--AACA-TTGTATG
gi|14 : tTATTGT-ATGATTT--AA-CAAC--T-AT-AAATTTCA-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---A-TAA-T-TT-TTC-TATT-C--A-TAAAG-TTGCA-C-AC-TCAGT--AATA-A-T-ga
gi|15 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AA-TTCCA-G-AT-----------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TATT-C--A-TAAAG-T---A-C-AA-T-------A-A-A-T---A--AATC-TTTTATGtc
gi|16 : TGT-ACGATTT--TA-CAAG--C-AT-AAATTTCA-G-AT----A------AA--A--TC-A------TT-A---C-TC-TT--TC-A------ATAT--A---T-T-C-G-TT-TTT-TTTT-T--A-TAATA-CTACA-C-GC-TCAGT--AA-A-A---A-A--AATT-TTg
gi|17 : ------AA--A--TG-A-AG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------CGAT--GGATC-TAA-A-TT-TTT-TATT-CGTA-TAAAA-TTACA-CCAC-TCAGT--TA-A-A-T-A-A--ACTC-g
gi|18 : tgagctttgacatctataatT-ACGAT----AA-CAAA--C-TT-AAATTTCA-G-ATA---A------AA--------ATAGCTCTT-A---C-TC-T-----------------------T-CAA-A-CT-TTCAATTT-C--ATTAAAG-CTA-A-C-AC-TTGGT--AA-A-G-T---A--GATC-TT
gi|19 : t------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---A-TAA-A-TT-TTA-TATT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTGTATGgt
gi|2 : tgcattaaatTTGTCATGATTT--AAACAAA--C-AT-ACATTTCA-GAATGTAAA------AA--G--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGTC-AG-----ACAT--G---T-TAAGA-TT-TTC--CTT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|20 : ------AA--A--TG-ATAG--CTT-GTAAC-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTG------------AAAG-TCACA-C-AC-TCGGT--AA-A-A-T-A-A--AATC-TTGTATGga
gi|21 : tttacattataat--A--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------GCAT--G---T-TAA-A-T--------TT-C--A-C-----------C-AC-T-AGT--AA-A-A-TAA-A--AATA-TTGTATGg
gi|22 : tgagtttgcattataatac------AA--A--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TATT-C--A--AAAA-TTACA-C-AC-TCAGT---A-A-A-T-A-A--AATga
gi|23 : tttgcattataatCA-G-AT----A------AA--A--TG-AAAG--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ATAT--G---T-T---------TA-TTTT-C--A-TAAAG-CTACA-C-AC-TCTGT--GA-A-A-T-A-T--AATC-TT
gi|24 : -G-ATA---A------AA--A--TT-ATAG--GTT-C---C-TC-TT--TA-A------AATT--G---A-TAA-A-TT----------C--A-CGTAG-CTGCA-G-AC-TCAGT--AG-A-A-T-A-A--AA-C-TTgtc
gi|25 : C-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TATT-C--A-TAA-G-TCACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AACC-GTGTATGgt
gi|26 : ---A------AA--T--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-
gi|27 : gagttggcatgatataat--G---T-TAA-A-TT-T-C-TATT-C--A-TA--G-TTACA-C-AC-CCAGTT-AA-A-A-T-A-A--AATCTTTTTATGaattt
gi|3 : TC-TATT-C--A-TAAA--TTCCA-CCAC-TCAGT--AA-A-AAT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|4 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAAATTTCA-G-ATG---A------AAACA--TGTACGA--CTT-G---C-TCTTT--TC-A------ACAT--G---T-TTA-A-AT-TTC-TATT-C--A-TAAAGTTTATA-C-AC-TAAGT--AA-A-A-T-A-A--ATTCTTTTTATGga
gi|5 : tatTTGT-ATGATTTTTAA-CAAA--CCAT-TAAATTCA-G-ATG---AAAATGAAA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC--T--TC-A------GCAT--G---T-TAA-A-TT-TTCGTATT-C--ATTAAAG--TACA-C-AC-TCAGT--AA-A-T-A-A-A--AATC-TTTTATGg
gi|6 : TATTGT-ATGATTTA-AA-CAGA--C-AT-AAA--TCATA-ATG---A------AA--A--TG-ATAGT-CTT-G---C--C-TT--TC-AAGGTCGACAT--G---TCTAA-A-TT-TTC-TATT-C--A-AAAAG-TTGCATC-ACGTCAGT---A-A-A-T---A--ATTC-TTTTAg
gi|7 : ctT-ATGATTTTAAA-CAAAGAC-AT-AAATT-CA-G-ATG---A------AA--AAATG-ATAG--CAT-G---CCTC-TT--TC-A------ACATCGG---T-TAA-AATTGTTC-TATTTC--A-TAAAG-TTACA-T-AC-TCAATCAAA-A-A-T-A-A--AATC-TTTTAT
gi|8 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AA-TTTCA-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-----C-TC-TT--TC-A------GCAT--G---T-TAA-A-TC-TTC-TATT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-ATA-T-A-A--ATCC-TTTTATG
gi|9 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-AT-AAATTCCA-G-ATG---A------AA--A--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--TC-A------ACAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-ATTT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-A-T-A-A--AATA-TTTTATGg
Alignments
lowQualScore : 5 66 7 33 2 22 2 4 7777 555555 44 1 44 55555 1 3 44 1 1 3 444444 22 222 1 3 3 1 2222 1 22 3 3 6 1 1 55 1 1 1 1 44 3
lowQualScore : . .. . .. . .. . . .... ...... .. . .. ..... . . .. . . . ...... .. ... . . . . .... . .. . . . . . .. . . . . .. .
lowQualScore : 0 99 5 44 5 66 2 4 5555 000000 66 7 00 00000 7 2 44 6 6 2 666666 11 777 5 1 1 6 3333 5 11 1 1 2 5 5 22 5 5 5 6 44 3
consensus : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
Reference ( family-2141 ) : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|1 : TTGTCATGATTT--AAACAAA--C-ATACA-TTTCA-GAATGTAAA------AAG--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGT-C-AGA------CAT--G---T-TAAGA-TT-TTC-C--TT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|10 : T-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AA---TG-AT-G--CTT-G---A-TC-TT--T-CCA-A------CAT--G---T-TAA-ATTT-TTC-TA-TT-C--A-T-AAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATGga
gi|11 : tacaTACTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCG-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAC-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AACC-g
gi|12 : ATTGT-ATGATT---AA-CAAA--C-AT------TCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TA-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-GCAGT--AA-A-AT-A-A--AACA-TTGTATGc
gi|13 : TATTGT-ATGATT---------A--C-ACA-----TTA-A-ATG---A------AAA--TG--TAG--CTTTA---C-TA-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TT--TA-TT-C--A-TAAAGTTTACA---AA-GCAGT--AA-A-AT-ATA--AACA-TTGTATG
gi|14 : tTATTGT-ATGATTT--AA-CAAC--T-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---A-TAA-T-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTGCA-C-AC-TCAGT--AATA-AT-ga
gi|15 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAA--TTCCA-G-AT-----------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-T---A-C-AA-T-------A-A-AT---A--AATC-TTTTATGtc
gi|16 : TGT-ACGATTT--TA-CAAG--C-ATAAA-TTTCA-G-AT----A------AAA--TC-A------TT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------TAT--A---T-T-C-G-TT-TTT-TT-TT-T--A-TAATA-CTACA-C-GC-TCAGT--AA-A-A--A-A--AATT-TTg
gi|17 : ------AAA--TG-A-AG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-C------GAT--GGATC-TAA-A-TT-TTT-TA-TT-CGTA-TAAAA-TTACA-CCAC-TCAGT--TA-A-AT-A-A--ACTC-g
gi|18 : tgagctttgacatctataatT-ACGAT----AA-CAAA--C-TTAAA-TTTCA-G-ATA---A------AA------ATAGCTCTT-A---C-TC-T-------------------------T-CAA-A-CT-TTC-AATTT-C--ATTAAAG-CTA-A-C-AC-TTGGT--AA-A-GT---A--GATC-TT
gi|19 : t------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---A-TAA-A-TT-TTA-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTGTATGgt
gi|2 : tgcattaaatTTGTCATGATTT--AAACAAA--C-ATACA-TTTCA-GAATGTAAA------AAG--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGT-C-AGA------CAT--G---T-TAAGA-TT-TTC-C--TT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|20 : ------AAA--TG-ATAG--CTT-GTAAC-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTG-------------AAAG-TCACA-C-AC-TCGGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTGTATGga
gi|21 : tttacattataatA--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-T---------TT-C--A-C-----------C-AC-T-AGT--AA-A-ATAA-A--AATA-TTGTATGg
gi|22 : tgagtttgcattataatac------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TA-TT-C--A--AAAA-TTACA-C-AC-TCAGT---A-A-AT-A-A--AATga
gi|23 : tttgcattataatCA-G-AT----A------AAA--TG-AAAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------TAT--G---T-TTA------TT-----TT-C--A-TAAAG-CTACA-C-AC-TCTGT--GA-A-AT-A-T--AATC-TT
gi|24 : -G-ATA---A------AAA--TT-ATAG--GTT-C---C-TC-TT--T-A-A-A------ATT--G---A-TAA-A-TT-----------C--A-CGTAG-CTGCA-G-AC-TCAGT--AG-A-AT-A-A--AA-C-TTgtc
gi|25 : C-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-T-AAG-TCACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AACC-GTGTATGgt
gi|26 : ---A------AAT--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-
gi|27 : gagttggcatgatataat--G---T-TAA-A-TT-T-C-TA-TT-C--A-TA--G-TTACA-C-AC-CCAGTT-AA-A-AT-A-A--AATCTTTTTATGaattt
gi|3 : TC-TA-TT-C--A-TAAA--TTCCACC-AC-TCAGTA-AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|4 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAAATTTCA-G-ATG---A------AAACATGTACGA--CTT-G---C-TC-TT--TTC-A-A------CAT--G---T-TTA-A-AT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAGTTTATA-C-AC-TAAGT--AA-A-AT-A-A--ATTCTTTTTATGga
gi|5 : tatTTGT-ATGATTTTTAA-CAAA--CCATTAA-ATTCA-G-ATG---AAAATGAAAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC--T--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTCGTA-TT-C--ATTAAAG--TACA-C-AC-TCAGT--AA-A-TA-A-A--AATC-TTTTATGg
gi|6 : TATTGT-ATGATTT--AAACAGA--C-ATAAA-T--CATA-ATG---A------AAA--TG-ATAGT-CTT-G---C--C-TT--T-C-A-AGGTCGACAT--G---TCTAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-AAAAG-TTGCATC-ACGTCAGT---A-A-AT---A--ATTC-TTTTAg
gi|7 : ctT-ATGATTTTAAA-CAAAGAC-ATAAA-TT-CA-G-ATG---A------AAAAATG-ATAG--CAT-G---CCTC-TT--T-C-A-A------CATCGG---T-TAA-AATTGTTC-TA-TTTC--A-TAAAG-TTACA-T-AC-TCAATCAAA-A-AT-A-A--AATC-TTTTAT
gi|8 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAA--TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-----C-TC-TT--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-TC-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-ATAT-A-A--ATCC-TTTTATG
gi|9 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTCCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-AT-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATA-TTTTATGg
Alignments
lowQualScore : 5 66 7 33 2 22 2 4 7777 555555 44 1 44 55555 1 3 44 1 1 3 444444 22 222 1 3 3 1 2222 1 22 3 3 6 1 1 55 1 1 1 1 44 3
lowQualScore : . .. . .. . .. . . .... ...... .. . .. ..... . . .. . . . ...... .. ... . . . . .... . .. . . . . . .. . . . . .. .
lowQualScore : 0 99 5 44 5 66 2 4 5555 000000 66 7 00 00000 7 2 44 6 6 2 666666 11 777 5 1 1 6 3333 5 11 1 1 2 5 5 22 5 5 5 6 44 3
consensus : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
Reference ( family-2141 ) : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|1 : TTGTCATGATTT--AAACAAA--C-ATACA-TTTCA-GAATGTAAA------AAG--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGT-C-AGA------CAT--G---T-TAAGA-TT-TTC-C--TT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|10 : T-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AA---TG-AT-G--CTT-G---A-TC-TT--T-CCA-A------CAT--G---T-TAA-ATTT-TTC-TA-TT-C--A-T-AAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATGga
gi|11 : tacaTACTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCG-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAC-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AACC-g
gi|12 : ATTGT-ATGATT---AA-CAAA--C-AT------TCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TA-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-GCAGT--AA-A-AT-A-A--AACA-TTGTATGc
gi|13 : TATTGT-ATGATT---------A--C-ACA-----TTA-A-ATG---A------AAA--TG--TAG--CTTTA---C-TA-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TT--TA-TT-C--A-TAAAGTTTACA---AA-GCAGT--AA-A-AT-ATA--AACA-TTGTATG
gi|14 : tTATTGT-ATGATTT--AA-CAAC--T-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---A-TAA-T-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTGCA-C-AC-TCAGT--AATA-AT-ga
gi|15 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAA--TTCCA-G-AT-----------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-T---A-C-AA-T-------A-A-AT---A--AATC-TTTTATGtc
gi|16 : TGT-ACGATTT--TA-CAAG--C-ATAAA-TTTCA-G-AT----A------AAA--TC-A------TT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------TAT--A---T-T-C-G-TT-TTT-TT-TT-T--A-TAATA-CTACA-C-GC-TCAGT--AA-A-A--A-A--AATT-TTg
gi|17 : ------AAA--TG-A-AG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-C------GAT--GGATC-TAA-A-TT-TTT-TA-TT-CGTA-TAAAA-TTACA-CCAC-TCAGT--TA-A-AT-A-A--ACTC-g
gi|18 : tgagctttgacatctataatT-ACGAT----AA-CAAA--C-TTAAA-TTTCA-G-ATA---A------AA------ATAGCTCTT-A---C-TC-T-------------------------T-CAA-A-CT-TTC-AATTT-C--ATTAAAG-CTA-A-C-AC-TTGGT--AA-A-GT---A--GATC-TT
gi|19 : t------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---A-TAA-A-TT-TTA-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTGTATGgt
gi|2 : tgcattaaatTTGTCATGATTT--AAACAAA--C-ATACA-TTTCA-GAATGTAAA------AAG--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGT-C-AGA------CAT--G---T-TAAGA-TT-TTC-C--TT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|20 : ------AAA--TG-ATAG--CTT-GTAAC-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTG-------------AAAG-TCACA-C-AC-TCGGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTGTATGga
gi|21 : tttacattataatA--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-T---------TT-C--A-C-----------C-AC-T-AGT--AA-A-ATAA-A--AATA-TTGTATGg
gi|22 : tgagtttgcattataatac------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TA-TT-C--A--AAAA-TTACA-C-AC-TCAGT---A-A-AT-A-A--AATga
gi|23 : tttgcattataatCA-G-AT----A------AAA--TG-AAAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------TAT--G---T-TTA------TT-----TT-C--A-TAAAG-CTACA-C-AC-TCTGT--GA-A-AT-A-T--AATC-TT
gi|24 : -G-ATA---A------AAA--TT-ATAG--GTT-C---C-TC-TT--T-A-A-A------ATT--G---A-TAA-A-TT-----------C--A-CGTAG-CTGCA-G-AC-TCAGT--AG-A-AT-A-A--AA-C-TTgtc
gi|25 : C-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-T-AAG-TCACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AACC-GTGTATGgt
gi|26 : ---A------AAT--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-
gi|27 : gagttggcatgatataat--G---T-TAA-A-TT-T-C-TA-TT-C--A-TA--G-TTACA-C-AC-CCAGTT-AA-A-AT-A-A--AATCTTTTTATGaattt
gi|3 : TC-TA-TT-C--A-TAAA--TTCCACC-AC-TCAGTA-AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|4 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAAATTTCA-G-ATG---A------AAACATGTACGA--CTT-G---C-TC-TT--TTC-A-A------CAT--G---T-TTA-A-AT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAGTTTATA-C-AC-TAAGT--AA-A-AT-A-A--ATTCTTTTTATGga
gi|5 : tatTTGT-ATGATTTTTAA-CAAA--CCATTAA-ATTCA-G-ATG---AAAATGAAAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC--T--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTCGTA-TT-C--ATTAAAG--TACA-C-AC-TCAGT--AA-A-TA-A-A--AATC-TTTTATGg
gi|6 : TATTGT-ATGATTT--AAACAGA--C-ATAAA-T--CATA-ATG---A------AAA--TG-ATAGT-CTT-G---C--C-TT--T-C-A-AGGTCGACAT--G---TCTAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-AAAAG-TTGCATC-ACGTCAGT---A-A-AT---A--ATTC-TTTTAg
gi|7 : ctT-ATGATTTTAAA-CAAAGAC-ATAAA-TT-CA-G-ATG---A------AAAAATG-ATAG--CAT-G---CCTC-TT--T-C-A-A------CATCGG---T-TAA-AATTGTTC-TA-TTTC--A-TAAAG-TTACA-T-AC-TCAATCAAA-A-AT-A-A--AATC-TTTTAT
gi|8 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAA--TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-----C-TC-TT--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-TC-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-ATAT-A-A--ATCC-TTTTATG
gi|9 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTCCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-AT-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATA-TTTTATGg
blockSeqs : C TT A GA C AA T A GTAA AAATGA CA T CT GTAA C A GG T C G GGTCGA CG GAT C G T G AAT T GT T T G C G CA T T A T AC T
blockSeqs : . TA A . . A . . G . AA . T TA . . . . . . . . . . . A . GTA . . T T C . . T . . . . . T
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : G*** ** TA** **
originalCons : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
finalCons : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTCTA--TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
Alignments
lowQualScore : 5 66 7 33 2 22 2 4 7777 555555 44 1 44 55555 1 3 44 1 1 3 444444 22 222 1 3 3 1 2222 1 22 3 3 6 1 1 55 1 1 1 1 44 3
lowQualScore : . .. . .. . .. . . .... ...... .. . .. ..... . . .. . . . ...... .. ... . . . . .... . .. . . . . . .. . . . . .. .
lowQualScore : 0 99 5 44 5 66 2 4 5555 000000 66 7 00 00000 7 2 44 6 6 2 666666 11 777 5 1 1 6 3333 5 11 1 1 2 5 5 22 5 5 5 6 44 3
consensus : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
Reference ( family-2141 ) : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|1 : TTGTCATGATTT--AAACAAA--C-ATACA-TTTCA-GAATGTAAA------AAG--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGT-C-AGA------CAT--G---T-TAAGA-TT-TTC-C--TT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|10 : T-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AA---TG-AT-G--CTT-G---A-TC-TT--T-CCA-A------CAT--G---T-TAA-ATTT-TTC-TA-TT-C--A-T-AAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATGga
gi|11 : tacaTACTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTTCG-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAC-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AACC-g
gi|12 : ATTGT-ATGATT---AA-CAAA--C-AT------TCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TA-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-GCAGT--AA-A-AT-A-A--AACA-TTGTATGc
gi|13 : TATTGT-ATGATT---------A--C-ACA-----TTA-A-ATG---A------AAA--TG--TAG--CTTTA---C-TA-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TT--TA-TT-C--A-TAAAGTTTACA---AA-GCAGT--AA-A-AT-ATA--AACA-TTGTATG
gi|14 : tTATTGT-ATGATTT--AA-CAAC--T-ATAAA-TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---A-TAA-T-TT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTGCA-C-AC-TCAGT--AATA-AT-ga
gi|15 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAA--TTCCA-G-AT-----------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-T---A-C-AA-T-------A-A-AT---A--AATC-TTTTATGtc
gi|16 : TGT-ACGATTT--TA-CAAG--C-ATAAA-TTTCA-G-AT----A------AAA--TC-A------TT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------TAT--A---T-T-C-G-TT-TTT-TT-TT-T--A-TAATA-CTACA-C-GC-TCAGT--AA-A-A--A-A--AATT-TTg
gi|17 : ------AAA--TG-A-AG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-C------GAT--GGATC-TAA-A-TT-TTT-TA-TT-CGTA-TAAAA-TTACA-CCAC-TCAGT--TA-A-AT-A-A--ACTC-g
gi|18 : tgagctttgacatctataatT-ACGAT----AA-CAAA--C-TTAAA-TTTCA-G-ATA---A------AA------ATAGCTCTT-A---C-TC-T-------------------------T-CAA-A-CT-TTC-AATTT-C--ATTAAAG-CTA-A-C-AC-TTGGT--AA-A-GT---A--GATC-TT
gi|19 : t------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---A-TAA-A-TT-TTA-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTGTATGgt
gi|2 : tgcattaaatTTGTCATGATTT--AAACAAA--C-ATACA-TTTCA-GAATGTAAA------AAG--TG-ATAG---TT-G---C-TCATTGGT-C-AGA------CAT--G---T-TAAGA-TT-TTC-C--TT-C--A-TGAAA-GTACAGT-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-AACAGTC-TTTTATG
gi|20 : ------AAA--TG-ATAG--CTT-GTAAC-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTG-------------AAAG-TCACA-C-AC-TCGGT--AA-A-AT-A-A--AATC-TTGTATGga
gi|21 : tttacattataatA--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-T---------TT-C--A-C-----------C-AC-T-AGT--AA-A-ATAA-A--AATA-TTGTATGg
gi|22 : tgagtttgcattataatac------AAA--TG-ATAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A--T-TTC-TA-TT-C--A--AAAA-TTACA-C-AC-TCAGT---A-A-AT-A-A--AATga
gi|23 : tttgcattataatCA-G-AT----A------AAA--TG-AAAG--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------TAT--G---T-TTA------TT-----TT-C--A-TAAAG-CTACA-C-AC-TCTGT--GA-A-AT-A-T--AATC-TT
gi|24 : -G-ATA---A------AAA--TT-ATAG--GTT-C---C-TC-TT--T-A-A-A------ATT--G---A-TAA-A-TT-----------C--A-CGTAG-CTGCA-G-AC-TCAGT--AG-A-AT-A-A--AA-C-TTgtc
gi|25 : C-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-T-AAG-TCACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AACC-GTGTATGgt
gi|26 : ---A------AAT--TG-AT-G--CTT-A---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-
gi|27 : gagttggcatgatataat--G---T-TAA-A-TT-T-C-TA-TT-C--A-TA--G-TTACA-C-AC-CCAGTT-AA-A-AT-A-A--AATCTTTTTATGaattt
gi|3 : TC-TA-TT-C--A-TAAA--TTCCACC-AC-TCAGTA-AA-A-AT-A-A--AATC-TTTTATG
gi|4 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAAATTTCA-G-ATG---A------AAACATGTACGA--CTT-G---C-TC-TT--TTC-A-A------CAT--G---T-TTA-A-AT-TTC-TA-TT-C--A-TAAAGTTTATA-C-AC-TAAGT--AA-A-AT-A-A--ATTCTTTTTATGga
gi|5 : tatTTGT-ATGATTTTTAA-CAAA--CCATTAA-ATTCA-G-ATG---AAAATGAAAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC--T--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTCGTA-TT-C--ATTAAAG--TACA-C-AC-TCAGT--AA-A-TA-A-A--AATC-TTTTATGg
gi|6 : TATTGT-ATGATTT--AAACAGA--C-ATAAA-T--CATA-ATG---A------AAA--TG-ATAGT-CTT-G---C--C-TT--T-C-A-AGGTCGACAT--G---TCTAA-A-TT-TTC-TA-TT-C--A-AAAAG-TTGCATC-ACGTCAGT---A-A-AT---A--ATTC-TTTTAg
gi|7 : ctT-ATGATTTTAAA-CAAAGAC-ATAAA-TT-CA-G-ATG---A------AAAAATG-ATAG--CAT-G---CCTC-TT--T-C-A-A------CATCGG---T-TAA-AATTGTTC-TA-TTTC--A-TAAAG-TTACA-T-AC-TCAATCAAA-A-AT-A-A--AATC-TTTTAT
gi|8 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAA--TTTCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-----C-TC-TT--T-C-A-G------CAT--G---T-TAA-A-TC-TTC-TA-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-ATAT-A-A--ATCC-TTTTATG
gi|9 : TATTGT-ATGATTT--AA-CAAA--C-ATAAA-TTCCA-G-ATG---A------AAA--TG-ATAG--CTT-G---C-TC-TT--T-C-A-A------CAT--G---T-TAA-A-TT-TTC-AT-TT-C--A-TAAAG-TTACA-C-AC-TCAGT--AA-A-AT-A-A--AATA-TTTTATGg