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gi|2 : ttaccaaagtaaattgttgagcaataatcgccgcgatatttggggcaacattgcaagcacaattTTCT-G-G-CAG----T--A------------------T-------T------G--C----CAGAA--------TG---TT----------GA---ACTCAGA--T--GTTGGTTGGCA-GCTAG-----TGG-CAA-TATTC-----ACTC------------T-T--G------------------CTG----GC--AGT--A------------------TT-GCCAGAA------TGTT--ACC-----GA-G-----ATAAGTTGTTT-----G----CAG-C-----TAG--TGC-A-ATT-A--------AT-TT--Caaatttctggcaacatcctatgtgatagcatatcagcatcgtacagtttgtaatttgccactcagcttgcaacaaatttttggtaaattctggaataaaatgatcgggcttcgtatgtaatataaggtcgcggttcggcgcctgggcctatgcattctgggaagacaattaggcgcgataagacgaacgccatcttttatgagctgtcaaaaggcattcatgatcatcgtaaagaaagtccacggtttctacagataacgaagattggtaagaagcaacccaagtgcacagcgacaatgaaaattcgatgccgatgaaactgtgagtggtttattacgtcagttttattttttatatagttcgaatgaattggtagtgttcacaaacggttgtgtacataatcgtaatgacttaatactgttgaatcagctatttttacgctataaggcttatatgtacgacgatcgtttatagcaaatttcaacataagctattcaccgactgtttgtgagataatgttaaattaagttccggtgatacgtaaaatcgtaattctcataggagaggtttggca
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2085 ) : CTTTACCAAACGTAAAATTGTTGCCAGCAATA-TCGCCGCGAT--ATT-GCGGCAACATTGCAGCAACACA-ATTTTT-GTTGC---CAGAAACCAG-ATTTT-GA---GACAAGTG-AAATAT---TGCCACTAG-----C-TGCAA-CAACTT-CTGG---CA-ACATTCC-G-GC-AA-TAC------------T-G--CCAGAA-A--AGANT-----------GA---AAT--ATTGCC-ACTAGCT---GCAA-CAACTT-TCT--GTAACATTC-TG----GCAAT--ACTGCCAGAAAGAGTGAA-ATATT----GCCGCTAGCTGC-AAC-A--------AC-TT--CTG-GT--A-AC-ATTCTGGCAA-T-A--C-------TGCCAG-AA--AATTTT----CTNGC-AACAT--CCTA--TGTGATC----AG-C-T-ATC-GGCAT---ACAG---TT-TGT--A---A-TATTGCCACT--AGCT-GCAAC-AAATTTT-GGTAACATTCTGGCAAATAA-AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATGTA-ATATA-AAG-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-GGGC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CAA-TTAGG--CGC---GATA---TA---CG-----AA--CGCC-A--TCTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AG-CAT-C-AC-G-ATC-G---TCG--TAAA--ACA---G--TCCCACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--GA-GAGGAT---CGATAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCG-CACA--CGA---CAATGAAG-ATTCGATGCC--GATGAA-A-TG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TCATTTT-C-ATACTA--G-TTCGGA-AT-G--AAT-TGG-TA-GTGTTG--------CACAA-C-NGT---C-GTGTA---CATATATCG-TAATGA-CTTAA-TCACTGTTGAN-CAGCTAT-TTCGCACGACCG-TTTTGTACGCTATA--------GGCCTA-TATG--TACG--ACGT---NTCGTTTATAGTAATA-TT---TCAACA-AANC-TATTCAC-CGACCGTTCG-T-A----------GA-TA-ATGT---------------TGAAAA--TT--AGG-TCTC-CGGT-AGTG-ATACGTAAAATCGGTAAAT---TCT-ATA-----NAGCCAGGTTTGGGCAAGCA
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|7 : aatgatcgggttcgtatactaaagccatcgggtttccatgatcaaggctattgcattatgggtagttaatatttgagcgcattaacaaacggggtaaacgccattttgtctacaaacagctTG--------CACAA-C-AGT---C-ATGTA---CA---------------CTTAAATTACTGTTGAA-CAGCTA--TTCG-ATGACCG-TCGTGT-CATAATATTTCAACTGGTCTA-TATG--CATG--ACG----GTCATATATGTTAATATTT---TCAGCA-A
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gi|9 : cTC-G---TCG--CAAA-------------CCACGG-TT-----TTGAGTC----T-ACATACATTCCCTCAAATGATGATGA-GAGAAT---CGATAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCA-C
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2085 ) : CCTTACCAAAGTAAAATTGTTGC-AGCAATA-TCGCNGCGAT--ATT-GCGGCAACATCGCAGCAA-CACAATTTTTT--G-TTG-C---CAGAAACCAG-ATTTT-GA---GACAAGTG-AAATAT---TGCCACTAG-----C-TGCAA-CAACTT-CTGG---CA-ACATTCC-G-GC-AA-TAC------------T-G--CCAGAA-A--AGANT-----------GA---AAT--ATTGCC-ACTAGCT---GCAA-CAACTT-TCT--GTAACATTC-TG----GCAAT--ACTGCCAGAAAGAGCGAA-GTATT----GCCACTAGCTGC-AAC-A-CA-------CTT--CTN-GT--A-AC-ATTCTGGCAAT-TACT-------GCCAG-AA--AATTTTC----TNGC-AACAT--CCTAT--GTGATC----AG-C-TA-TCA-GCAT---ACAG-TT---TGT--A---A-TATTGCCACT--AGCT-GCAAC-AAATTTT-GGTAACATTCTGGCAAATAA-AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATGTA-ATATA-AAG-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-GGGC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CAA-TTAGG--CGC---GATA---TA---CG-----AA--CGCC-A--TTTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AG-CAT-C-AC-G-ATC-G---TCG--CAAA--ACA---G--TCCCACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--GA-GAGGAT---CGGTAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCG-CACA--CGA---CAATGAAA-ATTCGATGCC--GATGAA-A-TG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TCATTTT-T-A-TACTAG-TTCGGA-AT-G--AAT-TGG-TA-GTGTTG--------CACAA-C-NGT---C-GTGTA---CATATATCG-TAATGA-CTTAA-TCACTGTTGAA-CAGCTAT-TTCGCACGACCG-TTTTGTACGCTATA--------GGCCTA-TATG--TACG--ACGT---NTCGTTTATAGTAATA-TT---TCAACA-AANC-TATTCACTCGACCGTTCG-T-A----------GA-TA-ATGT---------------TGAAAA--TT--AGG-TCTC-CGGTAAGTG-ATACGTAAAATTGGTAAAT---TCT-ATA-----NAG-CAGGTTTGGGCAAGCA
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gi|3 : ctttaccaaacgttaataatctgtttgcagcaattaatcCCTTACCAAAGTAAAATTGTTGC-AGCAATA-TCGCCGCGAT--ATT-ACGGCAACATTGCAGCAA-CACAATTTTT---G-TTA-C---CAGAAACCAG-ATTTT-GA---GACAAGTG-AAATAT---TGCCACTAG-----C-TGCAA-CAACTT-CTGG---TA-ACATTCC-G-GC-AA-TAC------------T-G--CCAGAA-A--AGATT-----------GA---AAT--ATCGCC-ACTAGCT---GCAA-CAACTT-TCT--GTAACATTC-TG----GCAAT--ACTGCCAGAAAGAGTGAA-ATATC----GCCACTAGCTGC-AAC-A--A-------CTT--CTG-GT--A-AC-ATTCTGGCAA--TACT-------GCCAGAAA--AATTTTC----TTGC-AACAT--CCTAT--GTGATC----AG-C-TA-TCA-GCAT---ACAG-TT---TGT--A---A-TATTGCCACT--AGCT-GCAAC-AAATTTT-GGT-ACATTCTGGCAAATAA-AAT-GATC-G-G-T-TCA--TATGTA-ATATA-AAG-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-GGGC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CAA-TTAGG--CGC---GATA---TA---CG-----AA--CGCC-A--TGTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AG-CAT-C-AC-G-ATC-A---TCG--T-AA--ACA---G--TCCCACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--GA-GAAGAT---CGGTAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCG-CACA--CGA---CAATG-AA-ATTTGATGCC--GATGAA-A-TG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TCATTTT-T-A----TAG-TTCGAATAT-G--AAT-TGG-TA-GTGTTG--------TACAA-C-TGT---T-GTGTA---CACATATCG-TAATGA-C-TAA-TCACTGTTGAT-CAGCTATATTCGTACGACCG-TTTTGTACGATATA--------GGCCTA-TATG--TACG--ACGT----TCGTTTAT-GTAATA-TT---TCAACA-AAAC-TATTCACTCGACCGCT-G-T------------GA-TA-ATGT---------------TGAAAA--TT--A-G-TCTC-CGGTAAGTG-ATACGTAAATTT--TAAAT---TCT-ATA-----GAG--AGGTTT-GGCAAACAa
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gi|6 : -AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATAC-----TA-AAGCCA-TCG-GG---TTTCCAT-GATCAAGGC-TA--TT-GCATTATGGG-TAGTTAA--TAT-TTGAG--CGCATTAACA---AA---CGGGGTAAA--CGCC-A--TTTTacata
gi|6 : A---------------GATT--GG-AAGGA----CGATAAA--AAG-A-CCC-T--GCGG-TCAACACA--CGA---TAATGAAG-AGTTGATGCC--AA-GAA-A-GG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----TTAC-GTCAG-GT-----TTTT-T-A-Tgtctacaaacagctagattggaaggacgataaaaagaccctgcggtcaacacacgataatgaagagttgatgccaagaaaggtgagtggtttatttacgtcaggttttttat
gi|7 : aatgatcgggttcgtatactaaagccatcgggtttccatgatcaaggctattgcattatgggtagttaatatttgagcgcattaacaaacggggtaaacgccattttgtctacaaacagctTG--------CACAA-C-AGT---C-ATGTA---CA---------------CTTAAATTACTGTTGAA-CAGCTA--TTCG-ATGACCG-TCGTGT-CATAATATTTCAACTGGTCTA-TATG--CATG--ACG----GTCATATATGTTAATATTT---TCAGCA-A
gi|8 : ataAATAA-AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATGTA--TATA-A-G-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-AGAC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CCA-TTAGG--CGC---GATA---caatt
gi|9 : cTC-G---TCG--CAAA-------------CCACGG-TT-----TTGAGTC----T-ACATACATTCCCTCAAATGATGATGA-GAGAAT---CGATAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCA-C
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): CATACACTCCCTTAAATGATGGGAGAGAATTCATAAGGAGCACTGGTCGGTCAACG
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Reference ( family-2085 ) : CCTTACCAAAGTAAAATTGTTGC-AGCAATA-TCGCNGCGAT--ATT-GCGGCAACATCGCAGCAA-CACAATCTTTT--G-TTG-C---CAGAAACCAG-ATTTT-GA---GACAAGTG-AAATAT---TGCCACTAG-----C-TGCAA-CAACTT-CTGG---CA-ACATTCC-G-GC-AA-TAC------------T-G--CCAGAA-A--AGANT-----------GA---AAT--ATTGCC-ACTAGCT---GCAA-CAACTT-TCT--GTAACATTC-TG----GCAAT--ACTGCCAGAAAGAGCGAA-GTATT----GCCACTAGCTGC-AAC-A-CA-------CTT--CTN-GT--A-AC-ATTCTGGCAAT-TACT-------GCCAG-AA--AATTTTC----TNGC-AACAT--CCTAT--GTGATC----AG-C-TA-TCA-GCAT---ACAG-TT---TGT--A---A-TATTGCCACT--AGCT-GCAAC-AAATTTT-GGTAACATTCTGGCAAATAA-AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATGTA-ATATA-AAG-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-GGGC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CAA-TTAGG--CGC---GATA---TA---CG-----AA--CGCC-A--TTTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AG-CAT-C-AC-G-ATC-G---TCG--CAAA--ACA---G--TCCCACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--GA-GAGGAT---CGGTAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCG-CACA--CGA---CAATGAAA-ATTCGATGCC--GATGAA-A-TG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TCATTTT-T-A-TACTAG-TTCGGA-AT-G--AAT-TGG-TA-GTGTTG--------CACAA-C-NGT---C-GTGTA---CATATATCG-TAATGA-CTTAA-TCACTGTTGAA-CAGCTAT-TTCGCACGACCG-TTTTGTACGCTATA--------GGCCTA-TATG--TACG--ACGT---NTCGTTTATAGTAATA-TT---TCAACA-AANC-TATTCACTCGACCGTTCG-T-A----------GA-TA-ATGT---------------TGAAAA--TT--AGG-TCTC-CGGTAAGTG-ATACGTAAAATTGGTAAAT---TCT-ATAT-T---NAG-NAGGTTTGGGCAAGCA
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gi|3 : ctttaccaaacgttaataatctgtttgcagcaattaatcCCTTACCAAAGTAAAATTGTTGC-AGCAATA-TCGCCGCGAT--ATT-ACGGCAACATTGCAGCAA-CACAAT-TTTT--G-TTA-C---CAGAAACCAG-ATTTT-GA---GACAAGTG-AAATAT---TGCCACTAG-----C-TGCAA-CAACTT-CTGG---TA-ACATTCC-G-GC-AA-TAC------------T-G--CCAGAA-A--AGATT-----------GA---AAT--ATCGCC-ACTAGCT---GCAA-CAACTT-TCT--GTAACATTC-TG----GCAAT--ACTGCCAGAAAGAGTGAA-ATATC----GCCACTAGCTGC-AAC-A--A-------CTT--CTG-GT--A-AC-ATTCTGGCAA--TACT-------GCCAGAAA--AATTTTC----TTGC-AACAT--CCTAT--GTGATC----AG-C-TA-TCA-GCAT---ACAG-TT---TGT--A---A-TATTGCCACT--AGCT-GCAAC-AAATTTT-GGT-ACATTCTGGCAAATAA-AAT-GATC-G-G-T-TCA--TATGTA-ATATA-AAG-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-GGGC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CAA-TTAGG--CGC---GATA---TA---CG-----AA--CGCC-A--TGTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AG-CAT-C-AC-G-ATC-A---TCG--T-AA--ACA---G--TCCCACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--GA-GAAGAT---CGGTAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCG-CACA--CGA---CAATG-AA-ATTTGATGCC--GATGAA-A-TG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TCATTTT-T-A----TAG-TTCGAATAT-G--AAT-TGG-TA-GTGTTG--------TACAA-C-TGT---T-GTGTA---CACATATCG-TAATGA-C-TAA-TCACTGTTGAT-CAGCTATATTCGTACGACCG-TTTTGTACGATATA--------GGCCTA-TATG--TACG--ACGT----TCGTTTAT-GTAATA-TT---TCAACA-AAAC-TATTCACTCGACCGCT-G-T------------GA-TA-ATGT---------------TGAAAA--TT--A-G-TCTC-CGGTAAGTG-ATACGTAAATTT--TAAAT---TCT-ATA------GAG--AGGTTT-GGCAAACAa
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gi|6 : -AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATAC-----TA-AAGCCA-TCG-GG---TTTCCAT-GATCAAGGC-TA--TT-GCATTATGGG-TAGTTAA--TAT-TTGAG--CGCATTAACA---AA---CGGGGTAAA--CGCC-A--TTTTacata
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gi|7 : aatgatcgggttcgtatactaaagccatcgggtttccatgatcaaggctattgcattatgggtagttaatatttgagcgcattaacaaacggggtaaacgccattttgtctacaaacagctTG--------CACAA-C-AGT---C-ATGTA---CA---------------CTTAAATTACTGTTGAA-CAGCTA--TTCG-ATGACCG-TCGTGT-CATAATATTTCAACTGGTCTA-TATG--CATG--ACG----GTCATATATGTTAATATTT---TCAGCA-A
gi|8 : ataAATAA-AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATGTA--TATA-A-G-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-AGAC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CCA-TTAGG--CGC---GATA---caatt
gi|9 : cTC-G---TCG--CAAA-------------CCACGG-TT-----TTGAGTC----T-ACATACATTCCCTCAAATGATGATGA-GAGAAT---CGATAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCA-C
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GTCGCCGCAAACCACGGTTTTGAGTCCACATGTACGCTTCTTCAATCGCCTGTGGGTC
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|3 : ctttaccaaacgttaataatctgtttgcagcaattaatcgccgcgatattaccggcaacattgcatgcaacacatttttgatgattgccagaacaccagattttgagacaagcCCTTACCAAA-GT-AA-AAT-TGTT-GCAGCAAT--A-TCGCCGCGATATT-AC-GGCAACATTGCA-GCAA-CACAAT-TTTT--G----TTA-C---CAGAA-ACCAG-ATTTT-GA---GACAAGTG-AAAT--AT---TGCCA-----CTAGC-TGC-AA-CAACT--T-CT-GG---TA-ACAT--TCC-GGC-AA-TACT-G--CCAGAA-AAGA-TTGA---AAT--ATCGCC-ACTAGCTG-CAA-CA-ACTTTCT----G----TAACATTCTG----G-CAATACTGCCAGAAAG-----A-GTGAA-ATAT---C----G----CCA-CTAGCTGC-A-AC-A--A-------C---TTCT---GGTA-AC-ATTCTGGCAAT-A--CT-------GCCAGAA--AAATTTTC----TTGC-AACAT--CCTAT--GTGATC----AG-C--T--A-TCA-GCAT---ACAG-TT---TGT--A---A-TATTGCCACT--AGCT-GCAAC-AAATTTT-GGTA-CATTCTGGCAAATAA-AAT-GATC-G-G-T-TCA--TATGTAA-TATA---AAG-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-GGGC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CAA-TTAGG--CGC---GATA---TA---CG-----AA--CGCC-A--TGTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AG-CAT-C-AC-G-ATC-A---TCG--T-AA--AC-A---GT-CCCACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--GA-GAAGAT---CGGTAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCG-CACA--CGA---CAATG-AA-ATTTGATGCC--GATGAA-A-TG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TCATTTT-T-A----TAG-TTCGAATAT-G--AAT-TGG-TA-GTGTTG--------TACAA-C-TGT---TGTGT-A---CACATATCG-TAATGA-C-T-AATCACTGTTGAT-CAGCTATATTCGTACGACCG-TTTTGTACGATATA--------GGCCTA-TATG--TACG--ACG----TTCGTTTAT-GTAATA-TT---TCAACA-AAAC-TATTCACTCGACCGCT-G-T------------GA-TA-ATGT---------------TGAAAA--TT--A-G-TCTC-CGGTAAGTG-ATACGTAAATTT--TAAAT---TCT-ATA------GAG--AGGTTT-GGCAAACAa
gi|4 : TTACCAAA-GT-AA-A-T-TGTT-G-AGCAAT--AATCGCCGCGATATTTGG-GGCAACATTGCA---AG-CACAATTTTTT--A----TTG-C---CAGAG-ACCAG-ATTTT-GA---GACA-GTG-CAAT--AT---TGCCA------TAGC-TGC-AA-CA-CT--T-CT-GG---TA-ACAT--TCCTGGCCAA-TACTCG--CCA--A-AAGAGT-GA---AATG-ATTGCCTACTAGCTG-CAA-CA-ACTTT-G----G----TAA-ATTCTG----G-CAAT--CGCCAGACAA-----A-GAGAACGTAT---T----G----CCA-CTAGCTGC-A--C-A--A-------C---TTTC---TGTA--C-ATTCTGGCAATTA--CT-------GCAGAAA--AA-ATTTC----TGGC-AACAT--CCTAT--GTGAT-----AG-CA-T--A-TCA-GCATCGTACAG-TT---TGT--A---A-T-TTGCCACTC-AGCTTGCAAC-AAATTTTTGGTAA-ATTCTGG--AATAA-AAT-GATCGG-GCT-TCG--TATGT-AATATA---AGG----TCGCGG---TT--CGGCGCCT-GGGCCTA--T--GCATTCTGGG-AAG--AC---AA-TTAGG--CGC---GATAA--GA---CG-----AA--CGCC-A--TCTTTTATG-AGCTGTCAA-A---AGGCATTC-AT-G-ATC-A---TCG--TAAAG-AA-A---GT-CC-ACGG-TT-----T-----C----T-ACA---------------GATA--AC-GAAGAT---TGGTAAG--AAGCAACCCA-----AG-T-G-CACAG-CGA---CAATGAAA-ATTCGATGCC--GATGAA-ACTG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----T-AC-GTCAG-TT--TTATTTT-TTA-TA-TAG-TTCG-A-AT-G--AAT-TGG-TA-GTGTT---------CACAAAC-GGT---TGTGT-A---CATA-ATCG-TAATGA-CTT-AAT-ACTGTTGAATCAGCTAT-TTT---------------TACGCTATAA-------GGCTTA-TATG--TACG--ACG----ATCGTTTATAGCAA-A-TT---TCAACATAAGC-TATTCAC-CGACTGTTTG-TGA----------GA-TA-ATGT---------------T--AAA--TT--AAG-T-TC-CG----GTG-ATACGTAAAATC-GT-AAT---TCTCATA------GGA-GAGGTTTG
gi|5 : GCAGCAATATT-GC-GGCAACATCGCA-GCAA-CATATACTTAA--A----TTG-CATGCAGAA-ACCAG-A-TTT-GA---GACAAGTA-AAAT--GT---TGCCACTAGTCTAGC-TGC-AA-CAATT--T-CT-GG---CA-ATATAGTCT-GGC-AA-TATT----C-------------------AC--GTT-----CTG---G-CAA-CATGCATT-T-------------ATCCCG----ATCAA--CTGTCAGCAAT-----A-CCATA-GTAT---T----G----CCA-TTAGCCGC-A-AC-ACCATGACCACC---TTCT---TATA-AC-ATTCTGGCAAT-ACGCT-------GCCAGGAATAA-TTTTC----TAGT-AATAca
gi|6 : -AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATAC-----TA---AAGCCA-TCG-GG---TTTCCAT-GATCAAGGC-TA--TT-GCATTATGGG-TAGTTAA--TAT-TTGAG--CGCATTAACA---AA---CGGGGTAAA--CGCC-A--TTTTacata
gi|6 : A---------------GATT--GG-AAGGA----CGATAAA--AAG-A-CCC-T--GCGG-TCAACACA--CGA---TAATGAAG-AGTTGATGCC--AA-GAA-A-GG-T-G-AGT-----GG-TTTAT----TTAC-GTCAG-GT-----TTTT-T-A-Tgtctacaaacagctagattggaaggacgataaaaagaccctgcggtcaacacacgataatgaagagttgatgccaagaaaggtgagtggtttatttacgtcaggttttttat
gi|7 : aatgatcgggttcgtatactaaagccatcgggtttccatgatcaaggctattgcattatgggtagttaatatttgagcgcattaacaaacggggtaaacgccattttgtctacaaacagctTG--------CACAA-C-AGT---CATGT-A---C--------------A-CTTAAATTACTGTTGAA-CAGCTA--TTCG-ATGACCG-TCGTGT-CATAATATTTCAACTGGTCTA-TATG--CATG--ACG----GTCATATATGTTAATATTT---TCAGCA-A
gi|8 : ataAATAA-AAT-GATCGG-G-T-TCG--TATGT-A-TATA---A-G-CG-TCG-GG---TT--CGG-GCTC-AGAC-TA--TT-GCATTCTGGG-AAG--AC--CCA-TTAGG--CGC---GATA---caatt
gi|9 : cTC-G---TCG--CAAA-------------CCACGG-TT-----TTGAGTC----T-ACATACATTCCCTCAAATGATGATGA-GAGAAT---CGATAAG--AAGCA-CCCGT--G-GG-TCA-C
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GTCGCCGCAAACCACGGTTTTGAGTCCACATGTACGCTTCTTCAATCGCCTGTGGGTC
Unaligned ( gi|15 ): CATACACTCCCTTAAATGATGGGAGAGAATTCATAAGGAGCACTGGTCGGTCAACG
Unaligned ( gi|18 ): TCGTCGCAAACCACCGTTTTGAGTCTACATGCGTTCTCT
Unaligned ( gi|19 ): CATCGTCACAAACCACGGTTTTGAGTCCACA