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gi|2                          :   gacattagtgattacacaaacacatattggtttcAATCTGGACATTA--CAATTT--G--ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATA---TA--TTTT----TTGA-CTTT-GC-GA--TTACA--TGTTTG------T-AAAGATG--ATAAT-ATGGTA---G--CA-TG-T-ACC-AAGCAAT---TGGA-TTTATTCCTTTTAATGTGTCGGATCTAGTATTATCT----TT-TTAACATG--G-CT---T---CA-GAAGCATT---GCAG-----AC-AT-T-ATATTT--AGT-TTGAGTAA---T-GTTATTC-CACCATC-CA-AC-------AT-------GCATCC-A-----------AC---CTACTATTCAGT--TGAT-GTACCA---AAT--ACCGCT-----------GA-CAAAG--AG-ATATGT--G-ATTT--ATTT---GTTTT--AT-TTTATCGTCTGTACCAGAAGAAT-AACAT--AAC-T--AGTAT--------C-----A--TGTTGTTTATTC---TCTT-AGTCTTGC-TTTCATTTCAAT-ACAAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--AC----TA--TACG-TTAT-G-TTCTTTTACTTTCA--TG-AGAT-TGGC-A--TC-TA-TAAATT-TAC-TATTTTG-ATTAC--AT---AAAGCTT----CTAC-ACACACAA-AAGAATTG-TG-GT---TTTA--TTGCCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-ACTCT-------G-TA--------CATG-TACTTGAGCCAA--AACTAGC--C-G-TCTATTCT-TA--TA---AACAC---TT-CCGT-AACATGT-------GCTGAGGTCTGTC-TCACACAGTTTATCGTCCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTTTGTAACTTAAGACTGAAATATT-TAAAAAATTTCAAATACTAT----TTAAAAGTGT
gi|14                         :    ggcattaatgttcacaaaatcacatatgttttcAGTCTGGG-AT-A--CAGTTT--AC-ATAAACA-CC-------T-TA-TT--CTTTGACTTGCAA--TGATGGTA----TT---ATCA-GC-AA--TTGGA--TTTT-ATTTCCTT-TTG-ATG--GTGATGATATTAT-TT--TA-TG-T-Aaacaactcccgacgtttcgcgatcttgttcagtatacgtgctccgtggtatataacggatcatgcttcggcgtagcgatgcgtacaatttttcaccgaccggtcatttggtatttttcaaagtcgtgaacaaatgaggcagagtttggtgtagtcttttagaccatttatcaagacatattaaggcctacaaactcgacccgtaaacagatagacgaatactacaagccacataagtacatttgccttcaagactaaattcgtactttttccaaagcaaagttcaaatcggaaagggctaccttgaatttaatgctttgtctacttatacagaaaaaatgtactctgtttcaaggtttgttatctgacttttgtttattagaactctttcttgcgtacaaaatagatccttctaaatatgggcaaaataacaaaactctcaaaattaggtaccatccattagccgaccaccacctatgctccgtggcatcaggatccctccgcggcgaggtacggatcgggatacacggtgtg
gi|1                          :         ttagtgtttcccaaacacatctagtttcAATCTGTG-GT-GATCAGTTTTCGC-ATAAATA-CT-------TGTA-TTTAC----AGTTATAG--TATTTTTTAAT-TTGA--CTA-GCAGAATTTCCAGTTTTT-G------TTAAA-ATTCAGTTATGATGGGATATAACCA-CGGT-ACCCA-GCAATGGATT---TTT-------------------------TACT-TTCACTTTT-TTAA--TG--GATG---TAACTA-GA-----TTTCG-TC-----ACTATGC-TTATGCGAA-TGTTAGGTAAACAT-CGGTTTTA-AC----ATAT----------T---T-----------------T-TATAT---TGATTGTC---T-----------CA---ACT--AC-TCTGGGGGGT--GAAAACAG-GGCAG-AT--GTTTG-ATTTTCATTT-TTGTTTT--ATATTTAT-GTTTCT-TCAGAAAAGA-AA-----AAA-TCTAGTAT--------C-----T---GTTGTCT-TTCGCATCTT--GTTTGACGTTTGATTC--AT-A-AA-GTTTA-ATAGTCCAGAT--TAC--AA----TG--A-CA----------CTTTTA-TT-CAAATGGAG-T-TG-C----TCATGGTAAATTAGACGTATTGTGAATTAC--AT---AA-GCTTAATACTACCACAAGCAC-A-GATGTG-CATGTCCTTTCACTTT-TCAACTTATA-TACAA-G-AAGAAG-A---T-------GCTAGAAATGTTCATG-TA---GGGCCAA--CA-T-GCGGC-GGTCTATTTC-TAATTAG--AAC-C---TTTCCGT-AA-ATGTCCGACTGGCTGAGGTCGTTC-TCACACAtttatgtaaaatcttttttacacatcatatgctctggtgatacatgaagcatgcagggttatatatgtactttatttgttgttcaatacacctcttgaaagcaggtaaatgtgatttatttttgttttttatatgttttcataaaaaaaaactagtatcagtatctgatatttttctcttattttattttcattcataaaagtttatacagtaaattacactagttatcgttatct
gi|5                          :    ggacattagtgcttcgcaacacgtacttcgttttcTCTGGT-GT-A--CAGTTTAGGTGATAAATAACTATAACGGT-TAGTT--C----ATCTATAGCTTAATTTTTCCATTCGAGACTAAGC-GA--TTA-A--TGTTTG------T-AAA-ATT--GTAATGAT-GTA--TA--CA-TG-T--CC-A--CAAT---TTTGATTT-------------------------TA-T-TCC----TT-GTAA--TG--T-TGGGTT---CC-AA-----C---A-ATATCAAACTCT-CTTTAT-T--A-TCTTATGTAAA-ATCCTTCTCTACA-CATTATA----------AT---TGAAGCA-GCTCA--CGAC-TATAT---T-ATTATT---TAAT-TT-GT-TCAAAGATTACACCTCT------TCGAAAA-CAAGATCAG-AC-TGT--G-ATTT--ATTTCTTGTTTTAAAT-TTCAT-GTTTTA-TCA-AAGAAATAATCAATAAACT--AGTATGAACTATCC-----C--TATTTGTT-TTC---TCTTGAGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTATTGCAGT--AAAT--GATCAAA----TA--T-CG-TTATCGTTTCTGGTA--GTCA--TG-AT-TCTG-C-ATCTC-TG-TAAATT-TAC-TA-TTAGCATTAC--ATCAAAAGGTTT----C-ACAACAAACAACAAGACATA-TGTG-----GTA--AT-TCA---TCTAGT-CAA-GAAATAAGCA---T-------G-AG--------CATGTTA---AGGCCAAAGAGCT-GCA-C-G-TCTATATCTTA--TAGAAAAC-CATATC-CTAT-AA----T-------TCTGA--TCGTTCTTCACACAG--TATCATTCTT-TTACGTAGTA-ATCATATCTTCAAA-TTTTGTAAACTAAGACTGAGATATATTAAAACATTTCAAATACTAT----cagtagtcgcttcaagacttataagctcatttttaacgtggtaacgctccgcgttctttccggatacttgtttagtattaaacgtactccgtgagatataacggagtcatgcgtcagtgggattagcgggaccgttatattccatggtcatttgtatttttcaaacgtgtgaccaagacatgacggcagagttgtggtgtaagtctgggtacagaaggcatttatcacaaatgccactatattaaggcttaccaaaaaaactgctgtacacagaatcagttaacggaatactacacagctcattaattttacatttggccttcaaagccgtaaccatcaatcgtctactttttccaagcaaagttcacagaccttggcaagggcactttggaataactggctttgttccttacagaaaaatgttactactaatgttcaagccctattgtttattctgaccttgtctgctacacttatgttattggtacatataaccttccttttactctgacaacctaacacaacttcaaatagagttacccatcaggttagccaccctcaccacccttcgctgctcgggggtgggggcatcgagatccgctcgcgctggcagaatacac
gi|4                          : gggccgcattagtgatcacaaagcacatattgtgttcccacGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TT-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----T--G-ACTA-GC-GA--TTACA--TGTTTG------T-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--CA-TG-TGACC-A-GCAA--------------------------------------AT--------------AA--TG--G-TG---T---CA-GA-----T---G-AT-----ACTAT-C-TTATGT--A-T-TTAGGTAAA-AT-CTTTTTTACAC-ATCATATAC-------AT----GAAGCATGC-AG--GGATATATAT---T--TTATT---T---GTT-GT-TCA---ATT-TACCTCT------T--GAAAACAGAGGCAG-A--AGT--G-ATTT--ATTT-TGTTTTT--AT-TTTAT-GTTT---TCAGAAGAAA-AA-----AAC-T--AGTAT--------C-----T---GTGGTTT-C------CTT-AGTTT-GC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTT-ATACAGT--AAAT--GAC--AC----TA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTCA--TG-AG-T-TG-C-A--TC-TG-TAAATT--AC-TATTT-GCATTAC--AT---AAAGTTT----CTAC-ACAAACAA-AAGAAATG--GTGT---TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GCG-C-G-TCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TT-CCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTC-TTC-TCACACAG--TATCATTCTT-TT---TACTATATCAGATC-TC-AA-TTTTGTAAACTAAGAC
gi|14                         :                                                                                                                                                               TT--GCAATGATGGTAT-TA--T---------C-A-GCAAT---TGGA-TTT-------------------------TATT-TCC----TT-TTGA--TG--G-TG-----------A-----T---G-AT-----ATTAT-T-TTATGT--A-T-TTATGTAAA-AT-CTTTTTTACA-CATCATATGCTCTGGTGATACATGAAGCATGC-AG--GG-T-TATATATGTACTTTAT---T--TGTT-GT-TCA---ATA-CACCTCT------T--GAAAGC--AGGTAA-AT--GT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT---T-TATAT-GTTT---TCATAA-AAA-AA-----AAC-T--AGTAT--------CAGTATC--TGATATTT-TTC---TCTT-A-TTTTAT-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--TAC--ACTAGTTA--T-CG-TTAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgtatttttcaaagtgtggacaaatgaggcagagttcggtgtagtctttttataccaattatcaaagacatattgggctacaaactgccgtaaacagagtacgaatactacaagccacataagtacatttggccttcaaagcgtaaatatcgtactttttccaagcaaagttcaagatcggtaagggctacttgaataatactggctattatacagaaaaatgtactctgttcaagctttgtttatctgacttttgttctgtacaatttttttggtacaaatgatcctttaaatatgcaaataacaaacttcaaataggtaccatcattagccgcctaccacttatgtctccgtggcatccggatccctccgcggcgtacggatcgggatacacggtgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttagtgtttcccaaacacatctagtttcagtctgggatacagtttacataaacaccttattctttgacTGAATTAC--AT---AAAGTTT----CTAC-ACACACAA-A-----TG-TGTGT---TTTA--TT-TCA---TCTA-A-CAA-G-AATAAG-A---TGCTAGATG-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--CACT-GCG-C-G-TCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TT-CCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTCGTTC-TCACACAG--TATCGTTct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-GCG-C-G-TCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TT-CCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTCGTTC-TCACAGAG--TATAGTTCTT-TT----ACTTTATCAGATCTTC-AA-TTT-GTAAACTA-GATTGAGATATT-TAATCA-TTTCACATACTAA----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-T--TTGT-A--TTTTTC---ATA--GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-GTCA---TT--T-A-----G-AGC--C-ATTTATC---A---AAGA----C--ATAGTGG-GCTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AT---A--G-A---GT--A--C-GAA-TACTACA---A-G---C---C--ACA-TAA-G-T---ACT-ATTGGC-C--C-T-CAA-A-GC-GTG-AATA----TCGT--AC--TTTT-TT-------------C-G-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAA-GGACT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GCT----------TT-GT-CTA-T-TAT-ACAA-AAAA-AT-G-C-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A---T-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TT---ATA--TATG--TAT--C--AT-CA--TTAG-----C--CGCC--T-----AC-CA--TCT--ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCCGATCC-CTC-CGT-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATA-CACGGCG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GACTGAAATATT-TAAAA-ATTTCAAATACTGTACTATTTAAAGTGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aGGTCAT--TTGGTA--TTTTTC---A-AA-GTCGT-G-AA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-GTCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC-------AAGA----C--ATATTAAGGCCTAC-----AA----A-CTCGACC--CG-T----A-A-AC---AGAT-A---G---A--C-G-AATACTACA---A-G---C---C--ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGC-C--T-T-CAA-G-AC--TA-A--AT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------CAA-AGC-----AAA-GTT--C-A-A--AT-C--G-GAAA-GGGCT-ACCT---T--GAATTTAA-T--GCT----------TT-GT-CTACT-TAT-ACAGAAAAA-AT-G-T-A-CT-C---TGTT-TCAAGG-T---T-TG-T-TA-TC-TGACTT----TTG-TTTAT-TAG--A---ACTCT-TTCTTGCG---------------TA-CAAA-A-TAGA---TCCTTCTA-AATATGGG--CA--AAATAACAA---A--A-CTCTC---AAAATTAGG--TAC--C--ATCCA--TTAG-----C--CGAC--C-----AC-CA--CCT--ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCAGGATCC-CTC-CGC-GGCGAGGTA-CGG-ATCGGGATA-CACGGTGTGaacgctcc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggcattaatgttcacaaaatcacatatgttttcaatctggacattacaatttgataaatactttattcatttatatattttttgactttgcgattacatgtttgtaaagatgataatatggtagcatgtaccaagcaattggatttattccttttaatgtgtcggatctagtattatctttttaacatggcttcagaagcattgcagacattatatttagtttgagtaatgttattccaccatccaacatgcatccaacctactattcagttgatgtaccaaataccgctgacaaagagatatgtgatttatttgttttattttatcgtctgtaccagaagaataacataactagtatcatgttgtttattctcttagtcttgctttcatttcaatacaaagtttatacagtaaatgacactatacgttatgttcttttactttcatgagattggcatctataaatttactattttgattacataaagcttctacacacacaaaagaattgtggttttattgccatctatcaagaataagactctgtacatgtacttgagccaaaactagccgtctattcttataaacacttccgtaacatgtgctgaggtctgtctcacacagtttatcgtcctttttactatatcagatcttcaatttttgtaacttaagactgaaatatttaaaaaatttcaaatactatttaaaagtgtaacaactcccgacgtttcgcgatcttgttcagtatacgtgctccgtggtatataacggatcatgcttcggcgtagcgatgcgtacaatttttcaccgaccGGTCCT--GCGTTAATTCTTTC---A-AAAGT-GTTGCGATTCAA---ATGAAGGCA---GA---GTT-T-GAT-GAAAGCCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A---AAGA----C--ATATTGG-GCT-AC-----AA----A-CT----C--CG-T----A-A-AC---A-AG------T--A--C-GCA-TACTACA---A-G---C---C--ACAATAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-C-TCA-A-GC-GTG-AATAA---TCGT--AC--TTTT-TCGGTTCTGGTTGTCC-A-AGC-----AAA-GCT--C-A-ACGAT-C--G-GAAA-GGGCTGA-CTTTCT--GAT--GAA-T--GCGTCGTCCTTGTTT-GT-CTA-T-TAT-ACAG--AAA-AT-G-C-A-CG-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TATTC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--ATT-T--TT-TTTTTG-G---------------T----AA-A-T-AA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--ACCT-TC---AAA--TTAG--TACCCC--AT-CAT-TTAG-----CCGCGCC--T-----AC-CA--CCT--ATG-CTC-----------CGTG--GGC---ATCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATA-C-CGGCGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaccggtaacctccttGGCCATGTCTGCTA--TTGTTCTCAA-A--GT-GT-G--A--CAA---ATGT-AATG---GACGTGTT-T-GGT-TGA-GCCT---TT----A-----G-AGC--C-ATTTATC---A---AAGA----C--A-ATTGGGTCTAAC-----AA----A-C--G--C--CG-T----ACA-AC---A-GGGA---GT--AA-C-GAA-TACTACATTAA-G---C---CTAACA-TAA-G-T---AC--A---------C-T-CAATA-GA-GTG-AATAT----CGT--AC--TTTTGTC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--CGA-A-GAT-C--G-AAA--GGGCT-A-CT---T--GAAC-TAAGT--GC-----------T--GT-C-A-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-CCA-CT-C---TG-TGTCAAGCAT---G-TGTT-TA-CT-CGACTT----T-G-T-CTG-TAA--A---T--TT-TTTTTA-G---------------TAGC-AA-AAT-AA---CGCTTGTATAATAT--GTTCC--AAATAAC-A---ATGA-CT-TCCCAAAA--TAGG--TA---CC-AG-CA--TTAG-----C---ACC--T-----AC-TA--CTT--AT--CGC-----------CGT---GGTCAGATCCGGATCC-CAT-CGCCGGC---GTG-CGG-ATCGGGATA-CACGGCGT
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggacattagtgcttcgcaacacgtacttcgttttcaatctgtggtgatcagttttcgcataaatacttgtatttacagttatagtattttttaatttgactagcagaatttccagtttttgttaaaattcagttatgatgggatataaccacggtacccagcaatggattttttactttcacttttttaatggatgtaactagatttcgtcactatgcttatgcgaatgttaggtaaacatcggttttaacatatttttatattgattgtctcaactactctggggggtgaaaacagggcagatgtttgattttcatttttgttttatatttatgtttcttcagaaaagaaaaaatctagtatctgttgtctttcgcatcttgtttgacgtttgattcataaagtttaatagtccagattacaatgacacttttattcaaatggagttgctcatggtaaattagacgtattgtgaattacataagcttaatactaccacaagcacagatgtgcatgtcctttcacttttcaacttatatacaagaagaagatgctagaaatgttcatgtagggccaacatgcggcggtctatttctaattagaacctttccgtaaatgtccgactggctgaggtcgttctcacacacagtagtcgcttcaagacttataagctcatttttaacgtggtaacgctccgcgttctttccggatacttgtttagtattaaacgtactccgtgagatataacggagtcatgcgtcagtgggattagcgggaccgttatattccatGGTCAT--TGGT-A--TTTTTC---A-AA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GAT-GTA-GCCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTGTC---A---AAGA----C--ATATTGG-GC-TAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A--C-G-GATACTACA---A-G---C---C--ACA-Tagaatacac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgctccgtggttagcggaccgttaattttctcaccGTCAT--TT--TG--TATTTC---A-AA-GT-GT-G--A--CAA---A-GA-GGCA---GAA--GTT-CCGGTTGTA-GTCT---TTGGT-A-----ATA-C--CCAATTATTTCAA---AAGA----C--ATATTGG-GCT-AC-----AA----AACT-G--C--CG-TTCAGA-A-ATCAGA-AG-A---GT--AA-C-GGAATATTA-AC--AAG---C---C--ACA-TAA-GGT---AC--ATT-GG-C--C-TTCAA-A-GC-GTA-AATAG---TCGT--AC--TTTT-TC-----------------AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGCGT-A-CT------GAA--TAA-TC-GC-----------TTTGT-CTA-T-TAT-ACA--AAAA-AT-G-A-ATCT-C---TGGT-TCAAGC-T---T-TGTT-TACTC-TGACTT----TTG-ATCTG-TACTGA---A--TT-TTTT-G-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCTTT-AA-AATAT--G---A--AAATAAC-A---ATAA-CT-TC---AAAA-TAGG--TA---C-----CA--TCAGTGCGCC--CGCC--T-----AC-CA--CT---ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC----TA-CGGAATCGGGATA-CACGGTGTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgtatacgttgctgtcgtggtataacagatcatgcttcgtggttagcggacgtaaatttttccacttTCAT--TTGT-A--TTTTCA---A-A--GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-G--A---GA---GTT-A-GGT-GTA-GTCT---TT--T-A-----T-A-A--C-AATTATC---A---AAGA----C--ATATTGG-GCTTAC-----AA------CT-G--C---G-T----A-A-AC---A--G-A---GT--A-----GAATACTACA---A-G---C---C--ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-CA-T-T-CAA-A-G--GTA-A-TAT----CGT--AC--TTT---C-------------C-A-AGC-----AA--GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGG-TT-A--T---T--AAA--GAA-T--GC-----------TTTGTTCTA-T-TAT-ACCG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-T---GC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTATG-TAC------A--TT-TTTTT--G---------------TA-C-AA-A-T--A---TCTTT----AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-AC-TT---AAA--TAGG--TAC--C--AT-CA--TTAG-----C--CGCT--T-----ACACA---GT--ATG--TC-----------CGT---GGC---ATCC-CATCC---T-CGC-GGC---GTATCGG-ATCGGGAT----CAGTGTG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taacgctccgcgttcttacgatcattgttagtatacgtgtccgtggtataaagggatatgctccgtggtagcggacgtaaattgtcacggcTCAT--TTTATA--TTTGTC---A-AA-GT-GTAG-GA--CAA---ATA---GCAATCGA---GT----GTT-ATA--TCT---GC--T-ACCAAAA-A-C--C-AATTCTC---ACACAAAA----A--CCACTCGCGCT-AC-----CATATGA-CG-G--CTTCG-T----A-ATAC---A--G-A---GT--AAGC-GGTATGATACAC--A-AAGTCTTAC--ACA-TAA-G-T---ACGAATTTGT-CTTC-T-CAACATAC-GAA-ACTATC--TCGC--ACCATTTT-CC-------------C-ACAGC-----AAATGTTACC-A-A-GATAT--GTGAAGAGGGCT-A-CC---T--GAA--TAA-T--GC------------T-GT-CTA-TGTATAACAG-AAAATATCG-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---TATGTTGTA-TCTTGACTCTTTATTGTTTCCGCTAC--A---A--TTATTTTTGTGGTTGCCCCCCCCTCCTA-C-AACA-T-CA---TCC-T-TA-AATAT--GC-CACTAAATAAC-ACGCA--A-CC-CT---A-----CCG--TA---CCAAT-CA---TAG-----CCACGCC--TCCCTCAC-CA--CT----TC-CTC-----------C-T----GC---ATCCCGATCC-CTC-C-C--GC---GTA-C-A-ATCGGTATA-CACGCTGTG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gggatacagtttgcataaatacttttttcatttatagtaattttttgactagcgattacatgtttgtaaaattgtaatgatggtattacatgtgaccagcaaataatggtgtcagatgatactatcttatgtatttaggtaaaatcttttttacacatcatatacatgaagcatgcagggatatatattttatttgttgttcaatttacctcttgaaaacagaggcagaagtgatttattttgtttttattttatgttttcagaagaaaaaaactagtatctgtggtttccttagtttgctttcattcataaaagttatacagtaaatgacactatcgttatgttcttttatttcatgagttgcatctgtaaattactatttgcattacataaagtttctacacaaacaaaagaaatggtgttttatttcatctatcaagaataagatgtacatgtaaggccaaaactgcgcgtctatttctatagaaccttccgtaaatgtgctgaggtcttctcacacagtatcattctttttactatatcagatctcaattttgtaaactaagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTA--TTTTTC---A-AT-GT-AT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---TTT-T-TGTTGTA-GTCG---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATCC--A---AAGA----C--ATAGTGG-GCT-AC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A--G-A---GT--A--C-GAA-TACTACA---A-G---C---C--ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--CCT-CAA-A-GCTGTG-AATAT----CGT--AC--TTTT-TT-------------C-G-AGC-----AAA-GT---C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGG-CT-A-CT---T--GAA--TAA-T---C-----------TT-GT-CTA-T--AT-ACA--ATAA-AT-G-C-G-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TATT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTGT-T---------------TA-C-AA-A-T-GA---ACCTT-TA-GATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C--AT-CA--TTAT-----C--CGCC--T-----AC-CA--TCT---TG-CTC-----------CGT---GGC---ACCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-AT-GGGATA-CACGGCGTG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atC-----------CGT---G-T---ATCCCGATCC-GTA-CGC-CAC---GGA-GGG-ATCGGGATGCCACGG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgcgcgtctatttctatagaaccttccgtaaatgtgctgaggtcgttctcacagagtatagttcttttactttatcagatcttcaatttgtaaactagattgagatatttaatcatttcacatactaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgtatttttcatagtgtggacaaatgaggcagagtttggtgtagtcatttagagccatttatcaaagacatagtgggcttacaaactgccgtaaatagagtacgaatactacaagccacataagtactattggccctcaaagcgtgaatatcgtacttttttcgagcaaagttcaagatcggaaaggactacttgaataatgctttgtctattatacaaaaaaatgcactctgttcaagctttgtttatctgacttttgttctgtacaattttttggtacaaatgatcctttaaatatgcaaaataacaaactttatatatgtatcatcattagccgcctaccatctatgct---GGC---ATCCGGCTCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATcg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATA-CACGG
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Reference ( family-2041 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTGA-ACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTTTGT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GA-TTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-CATATAC-------AT---TGAAGCATGC--AG--GGAT-T-----ATAT---T-A--TTATTT--TG-TT-GT-TCAA---TT-CACCTCT------T-GAAAACAGAGGCAG-A-T-GT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTTC-T--CAGAA--GAA-A------A-A---AANTAGTAT--------C-----T--TGTTGTTT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----NTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTC--AT-G-AG-T-TG-C-A--TC-T-GTAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTA-C-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTG---T-TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GC-GC-GTCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TTCCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCGTTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTAAGACTGAGATAT-TTAAAAAATTTCAAATACTAT----TTNAAAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTCAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A-AG-A---GT--A--C-GAAATACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-AATAT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-G-TCTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-C-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGCGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggacattagtgcttcgcaacacgtacttcgttttcaatctgtggtgatcagttttcgcataaatacttgtatttacagttatagtattttttaatttgactagcagaatttccagtttttgttaaaattcagttatgatgggatataaccacggtacccagcaatggattttttactttcacttttttaatggatgtaactagatttcgtcactatgcttatgcgaatgttaggtaaacatcggttttaacatatttttatattgattgtctcaactactctggggggtgaaaacagggcagatgtttgattttcatttttgttttatatttatgtttcttcagaaaagaaaaaatctagtatctgttgtctttcgcatcttgtttgacgtttgattcataaagtttaatagtccagattacaatgacacttttattcaaatggagttgctcatggtaaattagacgtattgtgaattacataagcttaatactaccacaagcacagatgtgcatgtcctttcacttttcaacttatatacaagaagaagatgctagaaatgttcatgtagggccaacatgcggcggtctatttctaattagaacctttccgtaaatgtccgactggctgaggtcgttctcacacacagtagtcgcttcaagacttataagctcatttttaacgtggtaacgctccgcgttctttccggatacttgtttagtattaaacgtactccgtgagatataacggagtcatgcgtcagtgggattagcgggaccgttatattccatGTCAT--TT--TG--TA--TTTCAAA-GT-GT-G--A--CAA---A-GA-GGCA---GAA--GTT-CCGGTTGTA-G-TCT---TTGGT-A-----ATA-C--CCAATTATTTCAA----AAGAC------ATATT-G-G-G-CT-AC-----AA----AACT-G--C--CG-TTCAGA-A-ATCAGA-AG-A---GT--AA-C-GGAATATTAACA---AGCC----ACA-TAA-GGT---AC--ATT-GG-C--C-TTCAA-A-GC-GTA-AATAG---TCGT--AC--TTTT-TC-----------------AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGCGT-A-CT------GAA--TAA-TC-GC-----------TTTG-TCTA-T-TAT-ACA--AAAA-AT-G-A-ATCT-C---TGGT-TCAAGC-T---T-TGTT-TACTC-TGACTT----TTG-ATCTG-TACTGA---A--TT-TTTT-G-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCTTT-AA-AATAT--G---A--AAATAAC-A---ATAA-CT-TC---AAAA-TAGG--TA--CC-AT-CA--GTGCGC--CCGCC--T-----ACCAC--T----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC----TA-CGGAATCGGGATACACGGTGTGagaatacac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aacgctccgcgttgtgcttgtcggatttgttagtaatacgtgtccgggtgtaaccggatcatgctccgtggttgagcggaccgtaaattttatcaccgtTCAT--TTGT-A--TT--TT-CAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-G--A---GA---GTT-A-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----T-A-A--C-AATTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CTTAC------A----A-CT-G-----CG-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A-----GAATACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-CA-T-T-CAA-A-G--GT--AATA----TCGT--AC----TT-TC-------------C-A-AGC------AA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAA-GGGTT-A--T---T--AAA--GAA-T--GCT----------TT-GTTCTA-T-TAT-ACCG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-T---GC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTATG-TAC------A--TT-TTTTT--G---------------TA-C-AA-A-T--A---TCTTT----AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-AC-TT---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCT--T-----A-CACAGT----ATG--TC-----------CGT---GGC---ATCC-CATCC---T-CGC-GGC---GTATCGG-ATCGGGAT---CAGTGTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taacgctccgcgttcttacgatcattgttagtatacgtgtccgtggtataaagggatatgctccgtggtagcggacgtaaattgtcacggcGGTCCT--GCGTTAATTC--TTTCAAAAGT-GTTGCGATTCAA---ATGAAGGCA---GA---GTT-T-GAT-GAAAG-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT----C--CG-T----A-A-AC---A-AG------T--A--C-GCA-TACTA-CA---AGCC----ACAATAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-C-TCA-A-GC-GTG-AATAA---TCGT--AC--TTTT-TCGGTTCTGGTTGTCC-A-AGC-----AAA-GCT--C-A-ACGAT-C--G-GAAA-GGGCTGA-CTTTCT--GAT--GAA-T--GCGTCGTCCTTGTTT-G-TCTA-T-TAT-ACAG--AAA-AT-G-C-A-CG-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TATTC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--ATT-T--TT-TTTTTG-G---------------T----AA-A-T-AA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--ACCT-TC---AAA--TTAG--TACCCC-AT-CAT-TTA-GCCGC-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGTG--GGC---ATCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATAC-CGGCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaccggtaacctccttTA--TT--TTTCAAT-GT-AT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---TTT-T-TGTTGTA-G-TCG---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATCC--A----AAGAC------ATAGT-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A--G-A---GT--A--C-GAA-TACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--CCT-CAA-A-GCTGTG-AATAT----CGT--AC--TTTT-TT-------------C-G-AGC-----AAA-GT---C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGG-CT-A-CT---T--GAA--TAA-T---C-----------TT-G-TCTA-T--AT-ACA--ATAA-AT-G-C-G-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TATT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTGT-T---------------TA-C-AA-A-T-GA---ACCTT-TA-GATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-TC--C-GCC--T-----ACCAT-CT-----TG-CTC-----------CGT---GGC---ACCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-AT-GGGATACACGGCGTG
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgtatacgttgctgtcgtggtataacagatcatgcttcgtggttagcggacgtaaatttttccacttA--CAA---ATGA-AGCA---GA---GTT---GGT-GTA-GCTCT---TGG-T-A-----G-C-A--C-ATTTATC---A----AAGCC------ATATT-A-C-G----AC-----AA----A-CT-G--C--CGTT----A-A-AC-----AG-A---TT--A--CAGAAGTACCA-T----AGCC----ACA-TAACG-T---AC--ATTTGGCC--C-T-CAA-A----GTAGAATA----TCTT--AC--TTTT-T--------------C-A-AGCTGTTTCAG-ATA--C-A-AGGAT-C--T-GAAA-GGGCT-A-CTC--T--GA
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggcattaatgttcacaaaatcacatatgttttcaatctggacattacaatttgataaatactttattcatttatatattttttgactttgcgattacatgtttgtaaagatgataatatggtagcatgtaccaagcaattggatttattccttttaatgtgtcggatctagtattatctttttaacatggcttcagaagcattgcagacattatatttagtttgagtaatgttattccaccatccaacatgcatccaacctactattcagttgatgtaccaaataccgctgacaaagagatatgtgatttatttgttttattttatcgtctgtaccagaagaataacataactagtatcatgttgtttattctcttagtcttgctttcatttcaatacaaagtttatacagtaaatgacactatacgttatgttcttttactttcatgagattggcatctataaatttactattttgattacataaagcttctacacacacaaaagaattgtggttttattgccatctatcaagaataagactctgtacatgtacttgagccaaaactagccgtctattcttataaacacttccgtaacatgtgctgaggtctgtctcacacagtttatcgtcctttttactatatcagatcttcaatttttgtaacttaagactgaaatatttaaaaaatttcaaatactatttaaaagtgtaacaactcccgacgtttcgcgatcttgttcagtatacgtgctccgtggtatataacggatcatgcttcggcgtagcgatgcgtacaatttttcaccgacc---TT--T-A-----T-A-C--C-ATTTTCC---T----CAGAC------ATATT---G-G-CCTAC-----GA----A-CT-G--C--TG-T----A-A-AG---A-A--A---TC--A--C--AAATACCA-CA---TGCG----ATA-TAA-G-T---GC--ATCTGGTC--C-T-CAC-A-AC-AT
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C--C-GCC--T-----ACCAT-CT----ATG-CTCCGTGGCAGCTCCGT---GGC---AGCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCGT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atAGACTGAAATAT-TTA-AAAATTTCAAATACTGTACTATTTAAAGTGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---A----AAGA-----------T-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT-G--C--CA-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A--C-Gaacgctcc
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---GGC---ATCCGGCTCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-AT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTGA-ACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTT-GT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GAGTTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-TATATAC-------AT---TGAAGCATGC--AG--GGAT-T-----ATAT---TAA--TTATTT--TG-CT-GT-TCAA---TT-TACCTCT------T-G-AAACAGAGGCAG-A-TCGT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT--T--CAGAA--GAA-A------A-A---AAATAGTAT--------C-----T--TGTTGTTT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----CTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTC--AT-G-AG-T-TG-C-A--TC-T-GTAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTA-C-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTG---T-TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GC-GC-GTCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TTCCGT-AA-ATGT-------GCTGAAGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCATTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTATGACTGAGATAT-ATAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTATAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTC-AA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAA------ATATT-G-GCG-CTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A-AG-A---GT--A--C-GAAATACTA-CAC--AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-AATAT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-G-TCTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-TT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
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Reference ( family-2041 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTGA-ACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTTTGT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GA-TTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-CATATAC-------AT---TGAAGCATGC--AG--GGAT-T-----ATAT---TA--TTATTT--TG-TT-GT-TCAA---TT-CACCTCT------T-GAAAACAGAGGCAG-A-T-GT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT---T--CAGAA--GAA-A------A-A---AACTAGTAT--------C-----T--TGTTGTTT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----NTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTC--AT-G-AG-T-TG-C-A--TC-T-GTAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTA-C-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTG---T-TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GC-GC-GTCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TTCCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCGTTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTAAGACTGAGATAT-TTAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTAAAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTCAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A-AG-A---GT--A--C-GAAATACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-AATAT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-G-TCTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGCGTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aacgctccgcgttgtgcttgtcggatttgttagtaatacgtgtccgggtgtaaccggatcatgctccgtggttgagcggaccgtaaattttatcaccgtTCAT--TTGT-A--TT--TT-CAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-G--A---GA---GTT-A-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----T-A-A--C-AATTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CTTAC------A----A-CT-G-----CG-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A-----GAATACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-CA-T-T-CAA-A-G--GT--AATA----TCGT--AC----TT-TC-------------C-A-AGC------AA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAA-GGGTT-A--T---T--AAA--GAA-T--GCT----------TT-GTTCTA-T-TAT-ACCG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-T---GC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTATG-TAC------A--TT-TTTTT--G---------------TA-C-AA-A-T--A---TCTTT----AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-AC-TT---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCT--T-----A-CACAGT----ATG--TC-----------CGT---GGC---ATCC-CATCC---T-CGC-GGC---GTATCGG-ATCGGGAT---CAGTGTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taacgctccgcgttcttacgatcattgttagtatacgtgtccgtggtataaagggatatgctccgtggtagcggacgtaaattgtcacggcGGTCCT--GCGTTAATTC--TTTCAAAAGT-GTTGCGATTCAA---ATGAAGGCA---GA---GTT-T-GAT-GAAAG-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT----C--CG-T----A-A-AC---A-AG------T--A--C-GCA-TACTA-CA---AGCC----ACAATAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-C-TCA-A-GC-GTG-AATAA---TCGT--AC--TTTT-TCGGTTCTGGTTGTCC-A-AGC-----AAA-GCT--C-A-ACGAT-C--G-GAAA-GGGCTGA-CTTTCT--GAT--GAA-T--GCGTCGTCCTTGTTT-G-TCTA-T-TAT-ACAG--AAA-AT-G-C-A-CG-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TATTC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--ATT-T--TT-TTTTTG-G---------------T----AA-A-T-AA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--ACCT-TC---AAA--TTAG--TACCCC-AT-CAT-TTA-GCCGC-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGTG--GGC---ATCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATAC-CGGCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaccggtaacctccttTA--TT--TTTCAAT-GT-AT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---TTT-T-TGTTGTA-G-TCG---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATCC--A----AAGAC------ATAGT-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A--G-A---GT--A--C-GAA-TACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--CCT-CAA-A-GCTGTG-AATAT----CGT--AC--TTTT-TT-------------C-G-AGC-----AAA-GT---C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGG-CT-A-CT---T--GAA--TAA-T---C-----------TT-G-TCTA-T--AT-ACA--ATAA-AT-G-C-G-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TATT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTGT-T---------------TA-C-AA-A-T-GA---ACCTT-TA-GATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-TC--C-GCC--T-----ACCAT-CT-----TG-CTC-----------CGT---GGC---ACCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-AT-GGGATACACGGCGTG
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgtatacgttgctgtcgtggtataacagatcatgcttcgtggttagcggacgtaaatttttccacttA--CAA---ATGA-AGCA---GA---GTT---GGT-GTA-GCTCT---TGG-T-A-----G-C-A--C-ATTTATC---A----AAGCC------ATATT-A-C-G----AC-----AA----A-CT-G--C--CGTT----A-A-AC-----AG-A---TT--A--CAGAAGTACCA-T----AGCC----ACA-TAACG-T---AC--ATTTGGCC--C-T-CAA-A----GTAGAATA----TCTT--AC--TTTT-T--------------C-A-AGCTGTTTCAG-ATA--C-A-AGGAT-C--T-GAAA-GGGCT-A-CTC--T--GA
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C--C-GCC--T-----ACCAT-CT----ATG-CTCCGTGGCAGCTCCGT---GGC---AGCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCGT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atAGACTGAAATAT-TTA-AAAATTTCAAATACTGTACTATTTAAAGTGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---A----AAGA-----------T-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT-G--C--CA-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A--C-Gaacgctcc
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---GGC---ATCCGGCTCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-AT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTGA-ACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTT-GT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GAGTTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-TATATAC-------AT---TGAAGCATGC--AG--GGAT-T-----ATAT---TAA-TTATTT--TG-CT-GT-TCAA---TT-TACCTCT------T-GAAA-CAGAGGCAG-A-TCGT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT---T--CAGAA--GAA-A------A-A---AAATAGTAT--------C-----T--TGTTGTTT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----CTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTC--AT-G-AG-T-TG-C-A--TC-T-GTAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTA-C-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTG---T-TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GC-GC-GTCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TTCCGT-AA-ATGT-------GCTGAAGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCATTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTATGACTGAGATAT-ATAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTATAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTC-AA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAA------ATATT-G-GCG-CTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A-AG-A---GT--A--C-GAAATACTA-CAC--AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-AATAT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-G-TCTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-TT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
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Reference ( family-2041 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTGA-ACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTTTGT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GA-TTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-CATATAC-------AT---TGAAGCATGC--AG--GGAT-T-----ATAT---TA--TTATTT--TG-TT-GT-TCAA---TT-CACCTCT------T-GAAAACAGAGGCAG-A-T-GT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT---T--CAGAA--GAA-A------A-A---AACTAGTAT--------C-----T--TGTTGTTT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----NTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTC--AT-G-AG-T-TG-C-A--TC-T-GTAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTA-C-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTG---T-TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GC-GC-GTCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TTCCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCGTTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTAAGACTGAGATAT-TTAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTAAAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTCAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A-AG-A---GT--A--C-GAAATACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-AATAT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-G-TCTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGCGTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aacgctccgcgttgtgcttgtcggatttgttagtaatacgtgtccgggtgtaaccggatcatgctccgtggttgagcggaccgtaaattttatcaccgtTCAT--TTGT-A--TT--TT-CAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-G--A---GA---GTT-A-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----T-A-A--C-AATTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CTTAC------A----A-CT-G-----CG-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A-----GAATACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-CA-T-T-CAA-A-G--GT--AATA----TCGT--AC----TT-TC-------------C-A-AGC------AA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAA-GGGTT-A--T---T--AAA--GAA-T--GCT----------TT-GTTCTA-T-TAT-ACCG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-T---GC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTATG-TAC------A--TT-TTTTT--G---------------TA-C-AA-A-T--A---TCTTT----AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-AC-TT---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCT--T-----A-CACAGT----ATG--TC-----------CGT---GGC---ATCC-CATCC---T-CGC-GGC---GTATCGG-ATCGGGAT---CAGTGTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taacgctccgcgttcttacgatcattgttagtatacgtgtccgtggtataaagggatatgctccgtggtagcggacgtaaattgtcacggcGGTCCT--GCGTTAATTC--TTTCAAAAGT-GTTGCGATTCAA---ATGAAGGCA---GA---GTT-T-GAT-GAAAG-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT----C--CG-T----A-A-AC---A-AG------T--A--C-GCA-TACTA-CA---AGCC----ACAATAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-C-TCA-A-GC-GTG-AATAA---TCGT--AC--TTTT-TCGGTTCTGGTTGTCC-A-AGC-----AAA-GCT--C-A-ACGAT-C--G-GAAA-GGGCTGA-CTTTCT--GAT--GAA-T--GCGTCGTCCTTGTTT-G-TCTA-T-TAT-ACAG--AAA-AT-G-C-A-CG-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TATTC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--ATT-T--TT-TTTTTG-G---------------T----AA-A-T-AA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--ACCT-TC---AAA--TTAG--TACCCC-AT-CAT-TTA-GCCGC-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGTG--GGC---ATCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATAC-CGGCGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaccggtaacctccttTA--TT--TTTCAAT-GT-AT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---TTT-T-TGTTGTA-G-TCG---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATCC--A----AAGAC------ATAGT-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A--G-A---GT--A--C-GAA-TACTA-CA---AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--CCT-CAA-A-GCTGTG-AATAT----CGT--AC--TTTT-TT-------------C-G-AGC-----AAA-GT---C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGG-CT-A-CT---T--GAA--TAA-T---C-----------TT-G-TCTA-T--AT-ACA--ATAA-AT-G-C-G-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TATT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTGT-T---------------TA-C-AA-A-T-GA---ACCTT-TA-GATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-TC--C-GCC--T-----ACCAT-CT-----TG-CTC-----------CGT---GGC---ACCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-AT-GGGATACACGGCGTG
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgtatacgttgctgtcgtggtataacagatcatgcttcgtggttagcggacgtaaatttttccacttA--CAA---ATGA-AGCA---GA---GTT---GGT-GTA-GCTCT---TGG-T-A-----G-C-A--C-ATTTATC---A----AAGCC------ATATT-A-C-G----AC-----AA----A-CT-G--C--CGTT----A-A-AC-----AG-A---TT--A--CAGAAGTACCA-T----AGCC----ACA-TAACG-T---AC--ATTTGGCC--C-T-CAA-A----GTAGAATA----TCTT--AC--TTTT-T--------------C-A-AGCTGTTTCAG-ATA--C-A-AGGAT-C--T-GAAA-GGGCT-A-CTC--T--GA
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C--C-GCC--T-----ACCAT-CT----ATG-CTCCGTGGCAGCTCCGT---GGC---AGCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCGT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atAGACTGAAATAT-TTA-AAAATTTCAAATACTGTACTATTTAAAGTGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---A----AAGA-----------T-G-G-G-CT-AC-----AA----A-CT-G--C--CA-T----A-A-AC-----AG-A---GT--A--C-Gaacgctcc
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---GGC---ATCCGGCTCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-AT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTGA-ACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTT-GT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GAGTTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-TATATAC-------AT---TGAAGCATGC--AG--GGAT-T-----ATAT---TAA-TTATTT--TG-CT-GT-TCAA---TT-TACCTCT------T-GAAA-CAGAGGCAG-A-TCGT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT---T--CAGAA--GAA-A------A-A---AAATAGTAT--------C-----T--TGTTGTTT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----CTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTC--AT-G-AG-T-TG-C-A--TC-T-GTAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTA-C-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTG---T-TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GC-GC-GTCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TTCCGT-AA-ATGT-------GCTGAAGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCATTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTATGACTGAGATAT-ATAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTATAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTC-AA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAA------ATATT-G-GCG-CTTAC-----AA----A-CT-G--C--CG-T----A-A-AC---A-AG-A---GT--A--C-GAAATACTA-CAC--AGCC----ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-AATAT---TCGT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-G-TCTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-TT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
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Reference ( family-2041 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTG-GACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTTTGT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GA-TTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-CAT-----------ATAC--AT-G--AAGCATGC--A--G--G----GAC-TATAT---TA--TTATTT--TG-TT-GT-TCAA---TT-CACCTCT------T-GAAAACAGAGGCAG-A-T-GT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT---T--CAGAA--GAA-A------A-A---AACTAGTAT--------C-----CTGTTGT--TT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----NTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTCA--TG-AG-T-TG-C-A--TC-TG-TAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTAC-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTGT---TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GCG-C-G-TCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TT-CCGT-AA-ATGT-------GCTGAGGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCGTTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTAAGACTGAGATAT-TTAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTAAAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTCAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT--G-G-G-C-T-A-C-----AA----A-CT-G--C--CGT----A-A-AC----AG--AGT------A--C-G-A----A-TACTA-CA---AG--C---C--ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-A--AT--A-TC--GT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-GT-CTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGCGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggacattagtgcttcgcaacacgtacttcgttttcaatctgtggtgatcagttttcgcataaatacttgtatttacagttatagtattttttaatttgactagcagaatttccagtttttgttaaaattcagttatgatgggatataaccacggtacccagcaatggattttttactttcacttttttaatggatgtaactagatttcgtcactatgcttatgcgaatgttaggtaaacatcggttttaacatatttttatattgattgtctcaactactctggggggtgaaaacagggcagatgtttgattttcatttttgttttatatttatgtttcttcagaaaagaaaaaatctagtatctgttgtctttcgcatcttgtttgacgtttgattcataaagtttaatagtccagattacaatgacacttttattcaaatggagttgctcatggtaaattagacgtattgtgaattacataagcttaatactaccacaagcacagatgtgcatgtcctttcacttttcaacttatatacaagaagaagatgctagaaatgttcatgtagggccaacatgcggcggtctatttctaattagaacctttccgtaaatgtccgactggctgaggtcgttctcacacacagtagtcgcttcaagacttataagctcatttttaacgtggtaacgctccgcgttctttccggatacttgtttagtattaaacgtactccgtgagatataacggagtcatgcgtcagtgggattagcgggaccgttatattccatGTCAT--TT--TG--TA--TTTCAAA-GT-GT-G--A--CAA---A-GA-GGCA---GAA--GTT-CCGGTTGTA-G-TCT---TTGGT-A-----ATA-C--CCAATTATTTCAA----AAGAC------ATATT--G-G-G-C-T-A-C-----AA----AACT-G--C--CGTTCAGA-A-ATCAGAAG--AGT------AA-C-GGA----A-TATTAACA---AG--C---C--ACA-TAA-GGT---AC--ATT-GG-C--C-TTCAA-A-GC-GTA-A--AT--AGTC--GT--AC--TTTT-TC-----------------AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGCGT-A-CT------GAA--TAA-TC-GC-----------TTTGT-CTA-T-TAT-ACA--AAAA-AT-G-A-ATCT-C---TGGT-TCAAGC-T---T-TGTT-TACTC-TGACTT----TTG-ATCTG-TACTGA---A--TT-TTTT-G-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCTTT-AA-AATAT--G---A--AAATAAC-A---ATAA-CT-TC---AAAA-TAGG--TA--CC-AT-CA--GTGCGC--CCGCC--T-----ACCAC--T----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC----TA-CGGAATCGGGATACACGGTGTGagaatacac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aacgctccgcgttgtgcttgtcggatttgttagtaatacgtgtccgggtgtaaccggatcatgctccgtggttgagcggaccgtaaattttatcaccgtTCAT--TTGT-A--TT--TT-CAAA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-G--A---GA---GTT-A-GGT-GTA-G-TCT---TT--T-A-----T-A-A--C-AATTATC---A----AAGAC------ATATT--G-G-G-C-TTA-C-----AA------CT-G--C---GT----A-A-AC----AG--AGT------A----G-A----A-TACTA-CA---AG--C---C--ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-CA-T-T-CAA-A-G--GTA-A---T--A-TC--GT--AC--TTT---C-------------C-A-AGC-----AA--GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGG-TT-A--T---T--AAA--GAA-T--GC-----------TTTGTTCTA-T-TAT-ACCG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-T---GC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTATG-TAC--A------TT-TTTTTG-----------------TA-C-AA-A-T--A---TCTTT----AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-AC-TT---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-GC--C-GCT--T-----A-CACAGT----ATG--TC-----------CGT---GGC---ATCC-CATCC---T-CGC-GGC---GTATCGG-ATCGGGAT---CAGTGTG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taacgctccgcgttcttacgatcattgttagtatacgtgtccgtggtataaagggatatgctccgtggtagcggacgtaaattgtcacggcGGTCCT--GCGTTAATTC--TTTCAAAAGT-GTTGCGATTCAA---ATGAAGGCA---GA---GTT-T-GAT-GAAAG-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAC------ATATT--G-G-G-C-T-A-C-----AA----A-CT----C--CGT----A-A-AC----A---AGT------A--C-G-C----A-TACTA-CA---AG--C---C--ACAATAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-C-TCA-A-GC-GTG-A--AT--AATC--GT--AC--TTTT-TCGGTTCTGGTTGTCC-A-AGC-----AAA-GCT--C-A-ACGAT-C--G-GAAA-GGGCTGA-CTTTCT--GAT--GAA-T--GCGTCGTCCTTGTTT-GT-CTA-T-TAT-ACAG--AAA-AT-G-C-A-CG-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TATTC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--ATT-T--TT-TTTTTG-G---------------T----AA-A-T-AA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--ACCT-TC---AAA--TTAG--TACCCC-AT-CAT-TTA-GCCGC-GCC--T-----ACCAC-CT----ATG-CTC-----------CGTG--GGC---ATCCGGAT-C-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATAC-CGGCGT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ataaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttgtatacgttgctgtcgtggtataacagatcatgcttcgtggttagcggacgtaaatttttccacttA--CAA---ATGA-AGCA---GA---GTT---GGT-GTA-GCTCT---TGG-T-A-----G-C-A--C-ATTTATC---A----AAGCC------ATATT--A-C-G-----A-C-----AA----A-CT-G--C--CGTT---A-A-AC----AG--ATT------A--CAG-A----AGTACCA-TA----G--C---C--ACA-TAACG-T---AC--ATTTGGCC--C-T-CAA-A----GTAGA--AT--A-TC--TT--AC--TTTT-T--------------C-A-AGCTGTTTCAG-ATA--C-A-AGGAT-C--T-GAAA-GGGCT-A-CTC--T--GA
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggcattaatgttcacaaaatcacatatgttttcaatctggacattacaatttgataaatactttattcatttatatattttttgactttgcgattacatgtttgtaaagatgataatatggtagcatgtaccaagcaattggatttattccttttaatgtgtcggatctagtattatctttttaacatggcttcagaagcattgcagacattatatttagtttgagtaatgttattccaccatccaacatgcatccaacctactattcagttgatgtaccaaataccgctgacaaagagatatgtgatttatttgttttattttatcgtctgtaccagaagaataacataactagtatcatgttgtttattctcttagtcttgctttcatttcaatacaaagtttatacagtaaatgacactatacgttatgttcttttactttcatgagattggcatctataaatttactattttgattacataaagcttctacacacacaaaagaattgtggttttattgccatctatcaagaataagactctgtacatgtacttgagccaaaactagccgtctattcttataaacacttccgtaacatgtgctgaggtctgtctcacacagtttatcgtcctttttactatatcagatcttcaatttttgtaacttaagactgaaatatttaaaaaatttcaaatactatttaaaagtgtaacaactcccgacgtttcgcgatcttgttcagtatacgtgctccgtggtatataacggatcatgcttcggcgtagcgatgcgtacaatttttcaccgacc---TT--T-A-----T-A-C--C-ATTTTCC---T----CAGAC------ATATT--G-G-C-C-T-A-C-----GA----A-CT-G--C--TGT----A-A-AG----AA--ATC------A--C-A-A----A-TACCA-CA---TG--C---G--ATA-TAA-G-T---GC--ATCTGGTC--C-T-CAC-A-AC-AT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gagatcctataC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA--CC-AT-CA--TTA-TC--C-ATC--T-----ACCGT-CC----AAT-CTT-----------CGT---GGT---ATCCGGGTCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATGCACGGCGg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C--C-GCC--T-----ACCAT-CT----ATG-CTCCGTGGCAGCTCCGT---GGC---AGCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCGT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atAGACTGAAATAT-TTA-AAAATTTCAAATACTGTACTATTTAAAGTGT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---A----AAGA-----------T--G-G-G-C-T-A-C-----AA----A-CT-G--C--CAT----A-A-AC----AG--AGT------A--C-G-aacgctcc
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CTC-CGC-GGC---GTT-CGG-ATCGGGATACACGGCAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---GGC---ATCCGGCTCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-AT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATCTGGG-AT-A--CAGTTT--GC-ATAAATA-CT-------T-TA-TT--C----ATTTATAG--TAATTTTT----TTG-AACTA-GC-GA--TTACA-T---------GTT-GT-AAA-ATT--GTAATGATGGTAT-TA--C-ATG-T-ACC-A-GCAATTT-GAGTTT-------------------------TATT-TCCTT-TTAA--TGGTG---TC-AGA-----TG-ATA-----CTATCTT-A-TGTA-T-TTAGGTAAAATCTTTTT-TACACCAT-TAT-----------ATAC--ATTG--AAGCATGC--A--G--G----GAT-TATAT---TAA-TTATTT--TG-CT-GT-TCAA---TT-TACCTCT------T-GAAA-CAGAGGCAG-A-TCGT--G-ATTT--ATTT-TTGTTTT-A--T-TTTAT-GTTT---T--CAGAA--GAA-A------A-A---AAATAGTAT--------C-----TTGTTGT--TT-TTC---TCTT-AGTTTTGC-TTTCATTC--AT-A-AAAGTTTATACAGT--AAAT--GAC--A----CTA--T-CG-TTAT-G-TTCTTTTA-TTTCA--TG-AG-T-TG-C-A--TC-TG-TAAATT-TAC-TATTTTGCATTAC--AT---AAAGTTT----CTAC-ACAAACAA-AAGAAATG-TGTGT---TTTA--TT-TCA---TCTA-T-CAA-G-AATAAG-A---T-------G-TA--------CATG-TA---AGGCCAA--AACT-GCG-C-G-TCTATTTC-TA--TAG--AAC-C---TT-CCGT-AA-ATGT-------GCTGAAGTCGTTC-T--CACACAGT--A-TCATTCTT-TT---TACTATATCAGATCTTC-AATTTT-GTAAACTATGACTGAGATAT-ATAAAAAATTTCAAATACTAT----TTTATAGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTCAT--TTGTTA--TT--TTTC-AA-GT-GT-G-GA--CAA---ATGA-GGCA---GA---GTT-T-GGT-GTA-G-CCT---TT--T-A-----G-A-C--C-ATTTATC---A----AAGAA------ATATT--G-GCG-CTT-A-C-----AA----A-CT-G--C--CGT----A-A-ACA---AG--AGT------A--C-GAA----A-TACTA-CAC--AG--C---C--ACA-TAA-G-T---AC--ATTTGG-C--C-T-CAA-A-GC-GTA-A--AT--ATTC--GT--AC--TTTT-TC-------------C-A-AGC-----AAA-GTT--C-A-A-GAT-C--G-GAAAGGGGCT-A-CT---T--GAA--TAA-T--GC-----------TT-GT-CTA-T-TAT-ACAG-AAAA-AT-G-T-A-CT-C---TG-T-TCAAGC-T---T-TGTT-TA-TC-TGACTT----TTG-TTCTG-TAC--A---A--TT-TTTTTG-G---------------TA-C-AA-A-T-GA---TCCTT-TA-AATAT--G--CA--AAATAAC-A---A--A-CT-TC---AAA--TAGG--TA---C-AT-CA--TTA-GC--C-GCC--T-----ACCAC-TT----ATG-CTC-----------CGT---GGC---ATCCGGATCC-CTC-CGC-GGC---GTA-CGG-ATCGGGATACACGGTGTG
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