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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|23 : atcgTCTTGGCTTGGTATTTCAAATTACATATATGTAGTAAATCAT-ACA--A-----TTTTTTTTTATACAAAA--CAATT-GATA-CC--T-TGTG-AGAA----------TTCAAT-GA-TTATGACTCTGGAAG--atta
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gi|7 : TTTTTTATAT--ATAA--AA--TCGATA-TC--TAAGTG-AGAA----------TTCAAT-GA-TTATGACTCTGGAAGA-AATAATTTGT-GATTTTAAAT-AATACATTACAAAG-GGTC-GCACAAACGAATTTGATCGGGATTGA-GAC-TACA-A-AAATTAACGAACTGGC-GAGAGCAA--T-GAG--TTTTTCTTCA----------AT-AAAGT-GA---AT-AATA--TG---G--TAT-AATGCAT-GAAATTG-------TTTAGTTTAATT--TATACATGCACT-GCTATTAATAATCCATGCA-GTTAAAAGAGT--T-CAAACACTTGTAAT-A-ATTAAAAATCCCCAGGGTTCTctagggttttttagagttctctgtttagt
gi|8 : TA-AAGAACT-A-T--------CTA-----AG-AACTCCTGGAG--AT----ATAAACTTAATT-TT-ACAA-G-GTGT-GTGGAC-TCTTT-----C-A--CCCACGTTGAATTA-TTTAA--TCAAA-A-TGC------AAATAT-AT--G-AAT-TA----A-AATAAA----AC-ATTGT----TATGCA-TT-TAT-AA-----C--CCA-TAATTTATTTC--AC--TTT-AT--TGAA-A-----A-------A--AACG-ATA-TTA-CC-C-TCGCAG--TT-CGTT-AG----TTT-TTGTT------ATCT-C-GA--T-CC---CG--A-T-C---AATT-A-TGCA--AA--AAACTCC--------G---TG--GGAATAAT---TT-TA--C----Cctaggttttttagagttctctgtttagt
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blockSeqs : TCCG . CTAGATAACCCTA T T AC GAGGT AAAC . A GTGTGGACTGCT AAATTTA CA G AA G T GT A TA ATATAT AA G TGA A GTTA T C AAG A TA CCGGCC . A T TACGGC . AT T TC GG G CGAATAGCAT AACAAAC CC A TAT T G C TC T . ATAT G TTT C C TT T TCA AA A C GC T TT TG T TAAGT ATG TG T AAC C AA GTAA CAT T T . T TAAATAAGAAA A A A CTAGT CAACCG A . G A CATATATGTAG C A ATTTTTT T AC AA ATT G TT . ATAATCTTTC . T A GCA A . T AG A . . G GC C G . G TGTAGTCT TGAATTATTGATA G TAT A AAT AAC G AATTGTTTAGTTTAATT T . . T G CTT C . G C
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blockSeqs : . . GCTACCA . . . T . . . TTTTGGAACGCT AA A A AA . . . A A . . . A . . . T . A A TA . . . A . . . . . . TGAAAA . . . TA . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . . A AAGT . . T . . . . . A C . . A . . . T . . . G A CG C . AT T . . TC . . . . . . A T A . A A . . . . A C . . G TGAGT AT N . . N . N AATTGTT C . . . C T C . . A
blockSeqs : . . ATCTA . . . T . . . TTTGGACGCT TA G A AA . . . C A . . . A . . . C . A A CC . . . C . . . . . . TTGGAG . . . A . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . A AAGT . . A . . . . . A T . . A . . . T . . . . . G T . . A . . T . . . . . . A C A . A T . . . . A C . . . TGAG AT . . . A . . TAATT T . . . C C C . . T
blockSeqs : . . CTCA . . . T . . . TGTGGAATCT CA G G AA . . . A A . . . G . . . T . A A GT . . . C . . . . . . TGAAG . . . A . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . T . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . GCT AT . . . . . . . T . . . G C C . . A
blockSeqs : . . CTAG . . . T . . . TTTGGACGCT TA A A GA . . . A A . . . A . . . C . A A CC . . . C . . . . . . TGAAG . . . T . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . N . . . G T C . . A
blockSeqs : . . CTA . . . G . . . AGTAGACTGT TA G A GA . . . A A . . . G . . . C . A A TG . . . C . . . . . . TGAAG . . . T . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G T . . . A
blockSeqs : . CTA . . . G . . . TGTAAAATAC GA G A AA . . . A G . . . A . . . C . A A TC . . . C . . . . . . AGAAG . . . A . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CTA . . . T . . . TTTGAACAC TA A G A . . . T A . . . A . . . C . A A TC . . . C . . . . . . TGAAG . . . A . . . . . . . . TA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . ATA . . . A . . . TGT CA G G A . . . A A . . . T . . . C . A A TT . . . C . . . . . . TGAAA . . . A . . . . . . . . CA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TA . . . A . . . TTG TA C . A . . . . . . . . A . . . C . T A TC . . . C . . . . . . GAAG . . . A . . . . . . . . CA . . . . . . . . .
blockSeqs : . CA . . . T . . . . T . . A . . . . . . . . T . . . A . . . TC . . . . . . . . . . AGG . . . A . . . . . . . . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . CA . . . T . . . . T . . A . . . . . . . . A . . . C . . . GT . . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . CA . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
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originalCons : CTAAACAGAGAAC----CCTA-GAGAACT-C-TA-------CTA----GAG-AAC-CCTGGGG--AT----TT----TTAATTATT-ACAA-GTGTTT-G-GGAC-GCTTT-----T-A--CT-GCGTTGAATTA-TT-GA--TAAAA-A-TGC------A--TAT-AT--A-AAT-TA----A-ACTAAA---CAA-ATTTC----CATGCA-TT-TAT-AA-----C--CAA-TA--TTATT-C--AC--TTT-AT--TGAA-AG---AA-------A--AACG-A-A-TTG-CC-C-TCGCAG--TT-CGTT-AA----TTT-TTGTT-----AATCT-C-GA--T-CC---CG--A-T-CA--AATT-AGTGCA--AA--GAACTCC-AAGT--TG---TG--GGAATTAT---TT-TA--T----CAATATA---ATTAAATTC--GTGTATTATTT--------AAACT-CTTT-CTTTCA-TGCT---TTCTTGAGAATG------AGAC-GAAAATGACAAAAATTGCTGCATTCGA---CTTTGATGTAAATCTTGGCTTGGTATTTCAAATTA-------GT--TAAATCATAACA--A-----TTTTTTTTTAT--AAAA--CA--T-GATA-CC--TAAGTG-AGAA----------TTCAAT-GATTTATGACTCTGGAAG--NATAATTTGT-GATTTTAATA-AATACATTACGAAG-GGTC-GCACAAACGAATTTGATCGGGATTGA-GAT-TACA-A-AAATTAACGAACT-GC-GAGGGCAA--T-TAG-CTTTTTCTTCAT---------ATAAAAGTGGA---ATAAATA--TG---GGTTATAAATGCATGGAAATTG-------TTTA-TTT-ATT--TATACATGCACT-GTTATTAATAATCCATGCA-G-TAAAAGAGT--T-CAAACACTTGTAAT-A-ATTAAAAATCCCCAGGGTTCT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|29 ): GATTGAAATTCTTTCTGAAAATATTTGTATCAATCAGTTTGTTTGTCTTTGTACCTCAGTGGAATAGGGG
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Reference ( family-2034 ) : CTAAACAGAGAACCCTA-GAGAA-CT----------C-T------AG-----AG--AAC-CCTGGGG-A--T----TT----TTAATTATT-ACAA-G-TGTT-T--GG-AC-GCT-----TTT-A--CT-GCGTTGAATTA-TT-GA--TAAAA-A-TGC------A--TAT-AT--A-AAT-TA----A-ACTAAA---CAA-ATTTC----CATGCA-TT-TAT-AA-----C--CAA-TA--TTATT-C--AC--TTT-A-T--TGA--A-G---AA--------A--AACG-A-A-TTG-CC-C-T-CGCAG--TT-CGTT-AA----TTT-TTGT------AATCT-C-GA--T-CC---CG--A-T-CA--AATT-AGTGCA--AA--GAACTCC-AAGTTG---TG--GGAATTAT---TT-TA--T----CAATATA---ATTAAATTCG--TGTATTATTT----------ACT-CTTT-CTTTCA-TGCT---TTCTTGAGAATG------AGAC-GAAAATGACAAAAATTGCTGCATTCGA---CTTTGATGTAAATCTTGGCTTGGTATTTCAAATTA-------GT--TAAATCATAACA------T---TTTTTTTTAT--AAAACAATTGATA-CC--TAAGTGA-GAA----------TTCAAT-GATTTATGACTCTGGAAG--NATAATTTGT-GATTTTAATA-AATACATTACGAAG-GGTC-GCACAAACGAATTTGATCGGGATTGA-GAT-TACA-A-AAATT--AACGA----ACT-GC-GAGGGCAA--TG-AG-TT--TTTCT---TCAAT-AAAGTGGAATAAATATG-------------GGTTATAAATGCATGGAAATTG-------TTTAGTTTA--T---TATACATGCACT-GTTATTAATAATCCATGCA-G-TAAAAGAGT--T-CAAACACTTGTAAT-A-ATTAAAAATCCCCAGGGTTCT
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gi|16 : taT---TTCTTGGTAATT------AAAC-GAAAATGACAAAAATTGCTGTGTTCGA---CTTTGATGTAGATCTTGGCTTGTTATATCAA---A-------AT--TCATTCATACCA-----------------CAT--AAATTAATTG--A-CC--AAAGTTA-GAAATAATCTTTCTTCAAC-AA-TTATAACTTTTGGTG--TATAATGAGT-GTTTTTAGCA-AATCCAT
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gi|2 : acaaaacC------A--T-T-AT--A-AAT-TA----A--CTAAA---CAA---TTC----CATGTA-TTATA--AA-----C--CAA-T----TATT-C--AC--TTT-ACT--TGG--A-G---AA--------A--AAAG-A-A-TTGGTC-C-T-CG-AG--TTTCGTT-AA----TTT-T-GC------AATCT-T-GA--T-CC---CG--AAT-TA--AATT-AGTGCA--A---GA--TCC-AAGTTGATGTG--GGAAT-AT---TT-TA--T----CAATATA---AGTTAATTCG--TGTAC-ATTT----------ACT-CTTT-CTTTCA-TGTT---TTCTTGAGGATG------AGAC-GAAAATGAAAAAAATTGCTGCATTCGA---CTGTGAT-TAAATCTTGGCTTGGTATTTCAAATTA-------CG--TAAATCAT-ACAATTTTTT---TTTTTTTTAT--AAAACA--TGATAGCCTTTAAGTGA-GGA----------GACAAT-GATTT-TGACTCTGGAAGGCAAT-ATTTGT-G-TTTTAAT--AATATATTACGAAGAAGTC-ACACAAACGAAATTGATT-GGAGTGA-GATGTACA-GCAAATT--AA-GA----CCT-GC-GA-GGCAA--TGTAG-TCTGTTTCT---TCAAT--AAGTGAAAT-AAT-TG-------------GGTTATAAATGCATGGA--------------TAAT-----T---TGTACATGCA-T-GTTATTAATAATCCATGCA-G-TAAAAGAGT--TCCAAACACTAGTAAT-AGATTAAAGATCCCCAGGGTT
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