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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGCAAT--ACAC-------CTT-CAT----------ATGTAA--TA----AC--T---TG-ATC-ATG-AGA----AAATTGATA--TA----CAT------CT--CACTTGC--AC-----TTC-ATGTTTT---GCT--AA-TACA-----A----T--AACA---A-AGTC-AATGA--CTGAT-A-ATTCAATTCTATAGT-C-AT----A-------A-A--AA-----T-T--------T-A-T-----A--AA-A--------G---------AAA-C--AAAT-A--T-ATA----A---C---AA--------GAC-TTG---------AAG--A-AT-------T---TTGT---CT---TT--TCAT---G--A-T-CAAT-------AC--T------C--------A-T-----G----GT---AAA--C--AA---T-GT--------G---------GGTGATGC----A----TA-A--ACAA-G-----T-T--A-CCC-TCTTCCA---CA-TAT----ATGTAG---TT-T-C-T-TGGATT--G-TGT-A-TTC-----A-A---G--CA-G-------T--G-CATT----C--------------A---AT-----TCAT--CAATT--------TCAAATTAA------A--T----GCC-T--GA---------A-----------A-----------AA---------ATGGATCT----A----G--T--A---T--GCCCTACCATCTCA-----T-TGA---TT-TTT--GTCA-GCAAA-A-A---AC--GT--A----TC---CCTA----GT-CA---GTTTCAGAAACTT-CC-ATGATGTTACAAAATT-ACCT--AATT---C--ATAGCTG--A-AT-GA-TAAATGACAGGCTATATATTTCTGAAC-TGTAGTAGAAC--ATATTGTGG-ATGATGCAGGATAGC-TTCCTTTGACTTC-AAATGTTGTTTCGATATATAAAA---TCCATAACTAATGCCTCAGCTTTTTTAGTATTTCAA---A--A----CA---TTTCCCAACCTCAGAAGT-TACCCTGCATC-ATCGAC--GAAAATGCAAACTTTATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGCAAT--ATACACTGTACCTT-CAT----------ATGTAA--TT----AC--T----A-ATT-ATGGAGA----AAATT-ATG--TATCTCCAG------CT--CATTTGC--GC-----TTT-GTGTTTT---GCT--AA-TAT------A----T--CATT---A-AGTCGGGTAA--CTGAT-T-ATTCAATTTTAGA-T-CAAT----G-------A-A--AG-----T-----------------------AA-A--------T---------ATA-C--ATGT-ACTT-GTATTTTG---C---AAAT------GAC--AG---------AAG--A-ATA------T---TTGT---CA---TT--CAATATAA--A-T-CAATCTGC---AT--T------CCAAGGCCTA-TACACAA----GT---AAA--CA-AA---C-AT------------------AGCAATGC----A----CA-G--ACAA-G-----T-TTAA-TCC-TCTTCCA---CT-TAA----ATGTAG---AT-T-T-T-T---------------TTC-----A-A----------------------CATC----A--------------A---A-------CATGAAAACT--------TGAAAT---------A--T----TTT-T--CA---------A-----------A-----------AT---------ATT--TCA----A----G--T--A---T--ACCCTATCATC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tggttatgcaaaggcattataCTGCGAT--GTAT-------ATT-CAT----------AGGT-------------------G-ATT-ACG-AGA----ACATTGATA--T---------------------TTGC--AC-----------ATTTC---GCCTGGA-TATAC----A----T--TCTA---A-AGTC-AACAA--CTGAT-C-ATTCAAATTTATAAT-C-AT----A-------A-A--TA-----T-T--------gtaattcaata
gi|51                         :                                                                   aatgacttacagtaaacagtgatggtctgttttcctgatgttctgttatacaacggacttgtggctctgcaataacatgccctattgttgtacttcctgtttgctctcactgtcaacgcagactgggttcctgcattggtcactccagtggttagtgtgtcatctccacatacccagctccacgtgatggaagggttaccgagggtggacaaggtacaacgtaagctaatgaactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgtcagttgtggggcggcaaggggtgcgtctattgaatcaacatttataagcagtaatcactatgtacatgtacttgacaatgtattctactaagattattgtagagatcaaaggaatgcattattCTGTGAT--ATAC-------CTT-CAT----------ACGTAA--TA----AC------TG-ATG-ATG-AAA----Acgctattacataatg
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatcccaaagaccaaaggaataccacggtcaatattCCGCGAT--ATAC-------TTC-CAT----------ATGTAA--T---------T---TATGTCTAGG-AGA----AAATAAATT--CC----TAT------CT--CGCATGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCT--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggaatgccgcggtatctattTGCAGTCAATAC-------CTT-CAT----------ATGTAA--AA----AC--T----G-ATT-ATG-AGA----AAATTGATA--CA----CAT------CT--CACTTGC--TC-----TTC-GTGTTTT---GCT--AA-TACAACTGTA----C--AATA---A-AGTC-AGTAA--CTTAT-A-ATTCAATTTCACAAT-C-AT----G-------A-A--AA-----CAT--------T-----------------------------------AA-T--CATT-A--T-GTGCT--G---C---AA--------A----TG---------AA------------------TTGTCAGCA---TT--CCGA---G--A-T-CAAC-------AC--A------G--------ACT-----G----GT---ATG--T--GA---T-GT--------AAGCAAACATGGTGATGT----A----CA-G--ACAA-G-----T-TA-A-CCC-TCATCCA---TT-CGT----GCTTAGT--TT-T-C-T-AAGACT--G-TGT-A-TTCA----A-A---G--TAGG-------T--G--ATA----T--------------A---AT-----CAGT--CAAAA--------TCAAATTAG------A--T----ATT-T--GA---------AATATTTTTC--A-----------AA---------ATAGATCT----ATACGG--T--A---T--ACCCAACTATCCCC-----T-T-----TT-TTT--GTCA-GCAAA-A-AAT-AT--GT--A----TG---CCAA----GT-CT---GTTTC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agaaaaaaagactagcacaaacatgataatattacaaagcaatttgacaatagtcattttatcagttattgcaaagaacaaaggaatgtTGCACT--GTAC-------ATT-CAT----------ACGTGA--TG----A----------ATG-AGG-AAA----AAATTGATAATTA----CAC------CTATCACCTGC--AC-----TTT-GTGTTTT---GCA--AA-TACC-----A----C--AATA---A-AGTC-GATCA--CTGAt
gi|56                         : gttcaggaaatgtacttacagtatacagtgataacctgtgttcctgacgtcttgttatacgaaaatgacggtcttggactcatggctctacattgacacgttctctggttgtactttctgtctgttgtcaagttctttactgactgggtccccgtattggtcactccagtggtcagtgtgtcatctccacagacccagctccacgtgatggcagggttacccagcgtagacaaggtacatcgtaatgtaatggactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgttagttgtggggcggcagggggggcatctgtttaatcaaaattcagtatttttctgggtaatcccaatgcttttctaaaatgggaaatttgttagaaaactacgaacacctagacaaagtattctaccatggctactctataaaaatgcagcagtcattattctgcaatgTGTGAT--ATAC-------CTT-CAT----------ACGTAA--TA----AA--TG--TG-ATT-GTG-AAA----AAGTTGATA--CA----ggggaatctatttttttctaaatatttcccattata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgGCAAT--ATAC-------AAT-CAT----------ACGTGA--TATTTTAC--T----G-ATT-ATG-AGA----AGATTGACA--------CAT------GT--C-CTTAA--CC-----TTC-GTGTTTC---GAT--AA-TACA-----A----C--ATTA---A--GTC-GGTAA--AGGAG-A-ATTCACTTTTATAAT-C-AT----A-------A-A--AA-----T-A--------C-ATT-----A--AT-ATCTATTGCA---------AAA-C--AAAT-C--TCATA----A---T---G-------------CTG---------AA---A-ATA------T---TTGT---CA---TT--CAATATAA--A-T-CAATCGTCTACAT--T------CCGAG----A-T-----------T---ACA--C---A---T---------------------AGCGATGC----A----CA-G--ACAA-GGTCAAT-C--A-CTT-TGTTCCA---CG-TTT----GTGTAGT--TT-T-C-T-TGGACT--G-C-T---TTG-----A-ATGTG--TA-G-------T--T-GATA----T--------------A---AT-----CCGT--CAAAT--------TTTTATT--------------------------------------------------------------------------TTT----A----------A---T--ACCCTACAATCTCA-----C-T-----TT-TTT--GTCA-GCAAA-A-G---GCATGT--A----GG---CCTA----AT-CC---GTTTCAGACA----TC-ATGACGTCAC---GTCGACGC--AATT---C--GTAGCTG--T-AT-Gt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtatatatattacatattctgccattatcattgtcattgcaaaggtcaaaggaatgtcttggtccttatttgAT--ACAC-------CTT-CAT----------ACGTAA--TA----AC--T----G-ATT-ATA-GGA----AAAT----------------------CT--CATTAGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCT--AA-TG-------A----T--A-TA---A-A--C-AATAA----AGT-AGAT---ACTTTATAAT-C-AT----A-------A-G--AA-----A-T--------A-A-T-----C--AA-A--------ATATGTGAC-AAATC--AAAT-C--T-ATA----A------------------AT-TTGTCATTGAATAAG--A-TT-------TAA-TCGT---CAGCATT--GCGA---G--A-T-TGAT-------AC--C------C--------A-T-----G-----T---AAA--C--AAA--C-AT--------G---------G-CGATGTCTAGA----CA-ATTACAA-G-----T-T--AACCC-TATTCCA---CG-AAT----GTGTGG---TT-T-C-CCTCGACA--A-TAT-A-TTC-----A-AA--G--CA-G-------T--T-GATA----T--------------A---GT-----CCAT--CAACA--------TCAAACTAA------G--T----AT--T--CA---------A-----------A-----------AC---------ATAG--CT----A----G--T--A---T--ACCCTACCATCTCA-----C-CT----TT-TTC--TTCA-GCAAA-A-ATC-AT--GT--A----GG---CCTA----TT-CC---GTTTCGGAAACTT-TC-ATGACGCTAC--GATTGACCT--TATT---G--GTAGCTG--T-ATAGG-TAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attattgcatagatcaagggattatcacggtcattatcctgctatatAT--A-AC-------CTTTCAT----------ACGCAA--AA----AA--C---GG-ATT-ATG-AGGG---AAATTTATCC-TA----CAC------CT--C-CTTACTGGC-----TTC-TTGCTTTAATGCT--AAATACA-----A----C--AACAT--A-AG-C-GATAA--CT--T-A-AT---ATTC-ATAAT-T-AT----A---------------------T--------C-A-T-----A--AT-T--------G---------AAA----AAAT-A--
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttatAT--ATGC-------CTT-TAT----------ATGTAA--TT----AC--T----G-ATT-ATG-AGA----AAACT------TA----CAC------TT--CAGTCGC---------------GTTTT---GCT--GA-TACA-----A----C--AATA---A-A----AGT-----TGAC-A-ATT------TATCAT-C-AT----A-------ACA--AA-----T-C--------TAA-T-----ATCAA-ATGTGCT--G---------AAAGC--AAA--A--TCATA----A-------AC--------GA---TG---------AAA--AGATG------T---TTGTCA-CT---TT--Tatcagtttactctgcaatgaagggtttcaataaaggtgactgaaaaagggaactggccgaagctactatacattacatgtacacatgtaaacaagcatgggaatacacagccaagttaatcctcttctacgtagtgtaattttcttggaatgtgtatccaaagcacattgaagcagttgatacaatccgtggagaccaaactaaacacttgaaatatttttgtcaaaataaatcgcgctcacctttttcttcggcaaaaacgcgtgtatccctattacatccgctgcggtaactaccatgacgtcacggtaacctaatacgcaactgtataagta
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T--ATAC-------CTT-CATTCGTACAATTATGTAC--AA----AC--T----G-ATA-ATA-AGA----AAATTGATA---------------------CACTTGC--TC-----TTC-GAGGTAT---GCT--AA-TA------------T--AACA-------CC-GATAA--CTG-----ATT--GTTCAAGAAT-C-A---------------A--CA-----T-T--------T-A----------------------A---------AAA-T--GATTGA--T--TA----A---C---A-----------------------------------------T---TTG--------------CA-------A-TTCAAT-------A---------------------------------T---AAAT-C--AAG--T-GT--------C---------GGCGTTGC----GCATGTA-A--ATAA-A-----T-------CC-CATTCCA---CG-GAT----GGGTAG---TT-T-C-C-TTAATTAAG-TGT-A-ATC-----A-AT--G--CA-G-------TTAA-CAT--------------------A---AT-----CCGT--CAACA--------TCAAACTAA------A--T----ACT-TATGA---------A-----------ACACGTTTTTCAAA---------ATAGATCT----A----G--T--A---T--ACCCTACCATCTCAC----C-T-----TT-TTC--GTGG-GCAAATA-A---AC--GT--A----TC---aaaaatgttaatttaaatgtatcgtctgctgtaccgacatcgatgcacatgtccgaactgtaacaaacatgacgatgcacaaagttgaccctttttcacatatgcgtagtgttgatacaatcgtacaacatcaaactaaatatttgattttttttcttcaaattaaaactcttgcctttttcgtcagcaaaagacatgcatgtagg
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaaaaaaaaaaacacacacacaaaaaaaaaaccggaagctcaaacgttttagtaaataattctaccacgtctattgcaaagttcgaaggaataccgcggtgggttgtttttttcctggT--ACA---------TT-CAT----------GTGTAA--TA----AC--TGTCTG-ATT-ACG-AGA----AATTTGATA--CA----TAggatactgacatgacgtcataaagtcttaggttgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattaaaaaaaaaactgactaggattttatatttcaaaacaacatttctcaacctcggactttcatgaaaacgcgaacattatttctg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atggccctagcatagatgaaaggaattccacagtcattactccgtgattAC-------CCT-CAA----------ATGTAAATTA----A---T---TG-ATT-ATG-AGAGAGAAAA--AATA--CA----CAC------CT--CAACAGC--AC-----TTT-CTGTTTT---GTT--GA-TA-A-----A----T--AAAA---C-ACTC-GATTA--CTGAT-A-ATTC--TTTTATgagttatgtttataacacggataataggtgtttgaccctcaaaaggataatcatatttgaca
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttgcaaacatcaatggaatgccgcactcagtC-------CTC-CAT----------ACGTAA--TAG---ACGAT---TG-A---AAA-AGA----AAATCGGTA--CA----CAT------CT--CGCTTAT--CCTTGAGTTC-GTATTTT---GCA--AA-TGCA-----G----C----CG---T-AGTC-AAAAA--CTttgacaat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       g-------CTC-TAT----------GTGTAC--TA----AC--T----G-ATT-ATA-AGA----AAATTGAGA--CA-----AG------CT--CACTTGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GGT--AA-TATT-----A----TACAACAAGCA-ATTC-GATAA--CTAAta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattactgcaaagttcaaaagaaagccactgtcgttattctgtgctTAA--TA----AC--T----G-AT---TG-AGA----AA-TTGATAC-TA----CATATTATGCT--CACT-GC--AC-----TTC-ATGTTTT---GCT--AA-TCCA-----A----C----CA---ATAATT-GATAA--ATGAT-A-ATT--GTT-TATAAT-C-AT----T-------G-G--AT-----G-T--------T-G-T-----A--AA-A--------G---------AAA-T----------C-ATA----A-------AT--------GAC-------------AGG--A-AT-------A---TTGT---AC---AT--TCAT---GTAA-A-CAAT-------CC--T------C----------T-----G----ATC--AAA--C---A---T---------------------GGTGATGC----A----CA-G--ACAA-A-----A-A--A-----TCTT-CA---CA-TAT----ACCTA----TT-T-C-T-TGAATT--GTTAT-A-TCA-----A-A---G--CC-A-------CCAA-CATT----G--------------A---AC-----TGA---AAACT-----------AATTAA------A--TTTTCTCC----------------------------------------A---------GTAGATCT----A----G--T--A---T--ACCCTACAATC-CA-----T-C-----TTGTCT--GTC--GCAAA-A-A---CA--GT--AACATTA---CCTA----AT-TATCTGTTTCAG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtgatgtataaattgtataaaaatcctcattctccaagttattgcaagtcaaaggatgccatgtcttatcggaaaGATT--CA----CAA------CT--TACTTGC--AT-----TTCCGTGTTTT---GCT--AA-TACA-----A----C--AATG---A-AGTC-GATAG--ATAGT-A-GTTTAATTATATAAT-C-ATTTTAA-------A-A--AA-----T-C--------A-A-TC----A--AA-ATATGTAGCA---------AAA-C--AAAT-C--T-ATAT---A---T---AT--------AAT-CT----------AGG--A-ATA------T---TTG----CT---AT--TCAT---tacgcttgacactcatggtgactaatcttgctgt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aa--AC-----TTC-AAATTTT---GCT--AA-TACA-----ATAATT--AACA---A-AATC-GATAG--CTGTT-A-ATTTTATTTCACGATGC-AT----ATACTATTA-ATCAATATATT-T--------T-A-T-----A--AA-GT-------G---------TTA-C--AAAT-T--C-ATA----AATGCCTGAAGGATATTTGACATTG---------AAGAAA-ATAGCA---A---TCGT---CT---GT--T-AC---GAAA-T-CGAT-------AC--TTTTGTCC--------A-C-----GGTCTGT---AAA--T--AA---C-CA--------A---------GGCGATGC----A----AA-G--ACAAGG-----T-G--A-ACC-TCCTTCA---C---GT----GTGTAG---TT-T-tctaaagtcatacgccggtttcgaga
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aa-----TTC-GTGTTTT---GGT--GA-TACA-----A----C--AATA---A-AGTC-AACAA--CTGAC-A-ATTCAACTTCATAAT-C-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caatatatcacattctaccaaagttattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTTT---GCT--AA-TACA-----A----C--AATA---A-----------------T-A-ATTTAATTTTGTAAT-C-AT----A-------A-A--AA-----G-TAATCA---T-A-T-----A--TG-ATGC-----A---------AAA-C--AATT----T-ATA----A-------AT--------GAC-T-G---------TAG--A-ACA------T---TTAC---CG---TTCATTAT---A--AGT-CAAT-------CG--T------C--------C-T-----C----TT---TC---C--GA---G-GT--------G---------G---ATAC----A----CA-T--GCAA-G---------------------CA---AA-TATGTCGATGCACATTTT-T-C-T-TGGGCT--G-TGT-A-TTA-----A-AA--G--CA-G-------T--T-GATA----A--------------A---AT-----CAGT--CAACA--------TCAAACTAA------A--T----ACT-T--GA---------A-----------ATACTTGTTTAAAA---------ATAGATTT----A----A--T--A---T--GCCATACCATCACA---------A---CT-TT----TC--------------AT--TT--A----GG---CTTT----GT-CC---GTTTCGCAAACTG-TC-ATGATGTCAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgTTT---ACT--AC-TACA-----A----C--AATA---A-AGTC-TATAT--CTAAT-T-ATTCAATTTTATACT-C-TT----A-------A-A--AA-----T-T--------A-A-T-----C--AATATGTGTT--G---------AA-----AAAT-A--T-GT---------------------------TTG---------AAG--A-ATA------T---TTGT---CA---TT--CAATATAA--A-T-CAAT-------CA--T------C--------A-A-----A----ATTCCAAGATC--GA---T-ATCA------A---------GGCGATGC----A----CA-G--AGAA-G-----T-T--A-ACC--CTTTCA----------------------TT-T-C-A-TGGACT--G-TGTGG-TTCA----A-A---G--CA-T-------T--T-GATA----T--------------A---AT-----CTGT--CAACA--------TCAAACTAAGAACATA--T----G------GA---------ATATTTTTC---A-----------AA---------ACAAATCT----C----G--C--A---T--ACCCCATCACCTCA-----T---A---TT-TTTC-GTCA-ACAAA-ATC---AT--GC--A----GG---CTTA----GT-CC---GT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtaaTTT---GCC--AA-TACA-----A----C--TATA---G-AGTC-GATAAAGCTGAT-A-ATTCAGTTTTATGGT-A-AT----A-------A-A--AA-----T-T--------A-A-T-----A--TT-T--------GTTGCA----AAA-T--AAAT-T--T-ATA----A-------AT--------GAC-T-G---------AGG--A-ACACATAAGTCAATCGT---CTACATT--CTAA---G--A-T-TGAT-------GC--A------C--------A-T-----A-----T---AAA--C--AAACAT-GT--------A---------G---ATGC----A----CA-G--ATGA-G-----T-T--A-ACC-T--TCCA---C-----------GAAG---TTAT-C-T-TGAATT--G-TGT-T-TTCA----A-A---G--CA-G-------TTAA-TATA----CTAGT----------A---AT-----CCGT--CAAAC--------CCAAATTTA------A--T-------------------------------------------------------------ATAT----A----G--TTCA---A--CCCCCCCCCCCCCAAATTCC-TGC---CT-TTTACGTCA-GCAAA-A-A---AT--GT--A------------G----GT-C-----------AAGCTG-TC-GTGACGT--CATGGTG-ACCT--AATT---C--ATAACTA--G-A--GG-TAAAgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TACA-----A----A--AATA---A-CGTC-AATAA--CTGATCA-ATT-AATTTAATAAT-C-AT----A-------A-A--AA-----T-T--------A-A-T-----C--AA-T--------GTATGTTGCAAAA-CA-AAAT-C--T-ATA----A-------AT--------GG--TTG---------AAG--A-A-----------------------------CAT---G---------------------T------C--------A-G-----G----GT---AAAC-C--AA---TCGTCTACATTCA---------GG-GATAG----A----TA-C--ACAT-G-----CAT--G-CCT-AGATGCA---CA-CA-------GT-----TT-T-C-T-TGAAC-----TGT-A-TTCA----A-A---G--CA-T-------T--T-GATA----T--------------A---ATCAG--TCAT--CA-----------TCAAACTAA------A--T----ACT-T--GATTGTTTTTT------------------------------------TGGTTGT----A----GATT--ACAGT--ACCCTA-CATTTCA-----T-C-C---TT-GTC--GTCT-GCAAA-A-A---A-------A-----C---CCTGT---GTACAT--GT-----AAACTG-AC-ATGACATCACA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AT-A-A--CAACTTTATAAT-A-AT----G-------A-A--AA-----T-TAATCAATAT-A-TGTTGCA--AA-A--------C---------AAA-TTGAAAT-C--T-TTG----G---C---AA--------TA---TA---------AATC-A-GTCA-----T---CTGTG--CA---TT--CCAA---G--A-T-CGAT-------AC--A------C----------T-----T----GT---AAA--C--AAA--T-AT--------G---------G-CGGT------------------TAA-G-----T--------C-TCTTCTA---CA-TAT----GCATAG---TT-TTC-T-TGGACT--G-TAT-A-TTCA----A-A---G--CA-A-------T--T-GATG----T--------------A---AT-----CTGT--CAACA--------TCAAAgcgcgcgacctattcgtaatggtatagg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttgtgttttgcaaatT---TT--TGA----G--A-T-CAAT-------ATAAT------T--------A-TT----G----GC---AAA--CCAAA---T-G---------G---------CGAGGTCC----A----TATA--AC---------T-T--A-ACT-CTTTCCG---CG-CAT-------TGG---TT-T-G-A-TGGGCT--G-C---A-TTCGCCACA-G---G--TA-A-------G--GTCATT----CTGTTTCATTGATGTA---CT-----CCAT--CAACA--------GCAAATTAA------A--A----GTA-T--AA---------A-----------A-----------TA---------A-GTTTCTAATGA----G--T--A---T--AGACTATAATGT-------T-TCT---TT-TTTA-GCCA-ACAAA-A-A-------GT--A----AT---ACTA----TT-CC---GTTCCGGAAACTG-TT-ATGGTATTACTAAGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaT-------AC--A------C--------A-T-----G-----T---AAA--C--AAG--C-AT--------G---------GG-AATAC----A----CA-G--CCAA-G-----T-T--AATCC-TCTTCTA---CG-TA-----GTGTAA---TT-TTC-T-TGGAAT--G-TGT-A-TCC-----A-A-------A-G-------C--A-CATTGAAGC--------------A---GT-----TGATA-CAATCCGTGGAGACCAAACTAA------A--C----ACT-T--GA---------AATATTTTTGTCA-----------AA---------ATAAATC-----------------------GCGCT--CACCT---------------TT-TTC--TTCG-GCAAA-A-ACGCGT--GT--A----TC---CCTATTACAT-CC---GCTGCGGTAACTA-CC-ATGACGTCAC--GGTA-ACCT--AATA---C--GCAACTG--T-AT-AA-ga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttatataacctttcatacgcaaaaaacggattatgagggaaatttatcctacacctccttactggcttcttgctttaatgctaaatacaacaacataagcgataacttaatattcataattatatcataattgaaaaaataatcagtttactctgcaatgaagggtttcaataaaggtgactgaaaaagggaactggccgaagctactatacattacatgT---AAA-----AA---C-AT--------G---------G-TGATAC----A----CG-A--ACAA-A-----T-T--A-ACCATCTTCAA---CAATAT----GTGTA----TT-T-C-T-TGGACT--G-TGT-ACTTCA----A-A---G--CT-G-------T--C-AATG----A--------------A---AT-----TCGT--CCA-----------CA---------------------CT-T--GA---------A-------------------------------------CATCT----A------------------CCCTACCATTTCG-----TCT-----TT-TTC--GTCACGCAAA---------------------C---CC--------------GTTTC-GGAACTTACC-ATGACGTCA-AGAGGT-GCCCCGAATT---CCGGTAGCTG--T-AT-GAGTAACCTATGGGCTGTgta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcgtctgttccgagattgatacacagaaacaattgataaaaaGTGATGC----A----CA-G--GCAA-G-----T-----------CGACCAGGGC--TGT----GTGTGA---TT-T-TGT-TGGACT--A-TGT-A-TT---------------CA-G-------T--G-CATTG---C--------------A---AA-----TAAT--CTACT--------TC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atacgtgtaagcaagcattGATGC----A----CA-A--A----G-----T-TG-A-CCC-TTTTTCA---CA-TAT----GCGTAG---Tgcaaacatttcaatatttgcctaagtaattgacatacatgtatctctcaaaatagtacgctttacagtaccccgtttaggaaaataacatgacatcacaaggtgatttacttcgtatttgt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatgcctttatatgtaattactgattatgagaaaacttacacttcagtcgcgttttgctgatacaacaataaaagttgacaatttatcatcataacaaatctaatatcaaatgtgctgaaagcaaaatcataaacgatgaaaagatgtttgtcacttttaaaaatgttaatttaaatgtatcgtctgctgtaccgacatcgatgcacatgtccgaactgtaacaaacatgacATGC----A----TA-G--ACAA-C-----T-TG-A-TCC-TAT---A---CA-CGT----GCATAG---TT-----------TT--GTTGT-A-TTC-----AGA---G--CA-GATCAAATT--G--ATT----C--------------ATTGATATAAACCGT--CAACA--------TCAAACCAA------A--T----ACCGT--CA---------A-----------A----------------------------CT----A----G--T--A---TAGACCCTAGC-TATTAT----T-TGACCTTT-TTC--GTCA-ACTAA-A-gttgatacaatcgtacaacatcaaactaaatatttgattttttttcttcaaattaaaactcttgcctttttcgtcagcaaaagacatgcatgtagg
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -T-TGGACT--G-CGT-AATCC-----A-A---G--TG-G-------T--T-GATA----T--------------A---AT-----TCGT--CAATA--------TCAAACTAA------A--T----ATT-T--GA---------A-----------A-----------GATTTTTAAAGATAGATCT----A----GAAT--A---T--ACC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -T-TGGACT--G-TGT-A-TTC-----AGA---A--CA-GCGT----C--G-CATTGATGT--------------A---CT-----TCAT--CAACA--------TCAAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tca-A-TTC-----A-A---ATACA-T-------C--G-CATT----C--------------AT--ATAGC--CCAT--AAACA--------TCAAACTAA------AAAT----ATG-T--GA---------A-----------A-----------AA----------------T----A----G--A--A---C--ATC--ACC-------------------TT-TTT--GTCA-GCAAA-T-ATT-AT--GT--A----CA---TGCA----TT-CC---GTTTTGGAAGCTG-TC-ATGACGcagaatctcaacttttttgccagaaaaaaaaaacaacaccacatattctgtctcggaagttatgacgtca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggactgtgcatggaaaattaacATCT----G----G--T--A--------CCT-TCATCTCA-----C-CTC---TT-TTC--ATTA--CAAA-A-A---AC--AT--G----TA---ACTA----GT-CC---ATT--GGATAATG-CCGATGAT-TCACA---TG-ACCT--AATC-------TAGCTT--ATAT-GGGTAAATGATCAGCTATATGTTT--GAACACGTAATAGAAT--GAAGTTTGA-ATG---CAAG-TA---TTC--TTG--TTC-AAATGTTGT---GAAATATAAAAGTTTGTATTACT--TGC---------TTTA-CATTTCAA---AATA----CA---ATTGTCAACCATTGAA-T-TA-TCTGCAAC-ATGCAA--GAAAAGGCAAACT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatctgagaaataccttcatactaatttatgaattatggattgcatacacaacattgcttattgtgtttttaacataaaatatgcaaatgaacatattcatttttatcataaaaaatcatatttgcaaacaaacttaaaaaaaataattaatcatttcaaagtaataaccatctgctccaagatcaatacacattttaaccaacaagggaatgcacagacatgtgaacctttccccatatgtatacatcaaactaaaccgggggtattctatta-GCAAA-A-A---AC--ATGAA----TAAGACCTA----GT-CT---GTTTCGGGAATTG-TC-ATGACGTCAC--GGTA-ACCC---CTT---T--ATA-----------GG-TAAAT-------------TTTCTGGGC-CGTAATAG------T-TTCT---ATAGTACAGGATGACATTCC--CGATCTCGAAA---TGTTTTGAAATATGAAA---GCC
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -A-A---AC--AT--C----TTG--CCT------T-CA---ATTTTAGAAGCTG-TC-ATGGCGTAAAGAGCTT-AGA---AGTTAGCC--ATAGATGTGG-A--GA-AAAACGATTTACTGCATATTTCTGACC-TGTAGTAGTATGGAAATAGAGGAATGATTCAAGATTTC-CTCCTTGGTCTCT-AAGTGTAGTTTAAA-ATATCAAA---ACCTCGCCTAAAGCCAGGGCTTTT---ATGTTGC-----A--A----CA---TTTCTCATCCTttt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGG-ATGATGCTGAATAAC-CTC----GACTTG-A----TTTTTTTAAAATATAAAA---GTCTCGGCTAACGCTTCGGCTTTT---GCA------------A----CA---TTTCTAGACCTCAGAGGT-TATCATGCAAC-ATCAAC--GAAAATGTGAATTATGTT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AAATGTTGTTTTGAAATATAAAA---TCC-TAG--------TCAGTTTTTTTtc
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaaaaaaaaaaacacacacacaaaaaaaaaaccggaagctcaaacgttttagtaaataattctaccacgtctattgcaaagttcgaaggaataccgcggtgggttgtttttttcctggtataccttcattcgtacaattatgtacaaactgataataagaaaattgatacacttgctcttcgaggtatgctaatataacaccgataactgattgttcaagaatcaacatttaaaaatgattgattaacatttgcaattcaatataaatcaagtgtcggcgttgcgcatgtaaataaatcccattccacggatgggtagtttccttaattaagtgtaatcaatgcagttaacataatccgtcaacatcaaactaaatacttatgaaacacgtttttcaaaatagatctagtataccctaccatctcacctttttcgtgggcaaataaacgtatcggatactgacatgacgtcataaagtcttaggttgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattaaaTATATAAG-----CCCTGGTTAATGTTTCGGCTTCT-----ATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACCTCTGAGGT-ctcaacctcggactttcatgaaaacgcgaacattatttctg
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaatAATTAACGCCGCGGGTTT----ATATTTCAA---A--AACAACA---ATTGTCAACCTTATAGAT-TATTCTGCTAA-ATCCAC--GAAAGTGCAAACTTTATT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCCTCTG--TTTTTA-TATTTCAA---A--A----TA---TTTCTCGATCTCTGAGTT-TATTCTGCAAT-ATACAC--GAAAACGCAACCCTTCTTtctt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTA-TATTTCAA---A--A----CAACATTTCTCAACCTCGGA-------CTT---TC-AT------GAAAACGCGAACATTATTtctt
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaaaaaaaaaaaacacacacacaaaaaaaaaaccggaagctcaaacgttttagtaaataattctaccacgtctattgcaaagttcgaaggaataccgcggtgggttgtttttttcctggtataccttcattcgtacaattatgtacaaactgataataagaaaattgatacacttgctcttcgaggtatgctaatataacaccgataactgattgttcaagaatcaacatttaaaaatgattgattaacatttgcaattcaatataaatcaagtgtcggcgttgcgcatgtaaataaatcccattccacggatgggtagtttccttaattaagtgtaatcaatgcagttaacataatccgtcaacatcaaactaaatacttatgaaacacgtttttcaaaatagatctagtataccctaccatctcacctttttcgtgggcaaataaacgtatcggatactgacatgacgtcataaagtcttaggttgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattaaaaaaaaaactgactaggaTTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACCTTGGGGGT-TAtctg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCAA---A--A----TA---TTTC----------AAGTATACCCT--ATC-ATCAAC--AAAA--GCAAagaaaacgcgaacctctga
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taattgtttttgcggaattctatcacagctgcaaatatataatggaaagatcaaaggaatgccagggtccgtattctgcaatatacactgtaccttcatatgtaattactaattatggagaaaattatgtatctccagctcatttgcgctttgtgttttgctaatatatcattaagtcgggtaactgattattcaattttagatcaatgaaagtaaatatacatgtacttgtattttgcaaatgacagaagaatatttgtcattcaatataaatcaatctgcattccaaggcctatacacaagtaaacaaacatagcaatgcacagacaagtttaatcctcttccacttaaatgtagatttttttcaacatcaaacatgaaaacttgaaatattA---A--A----CA---TTTCCTGACCTCAGAGGT-TA--CTGCAACTATCCAT--GAAAATGTAAACTTTATTtcctgaggtctagttcattttggaacatacatgtatatatcttaggtagcaccttttcatatgtaa
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---TTTCTCAACTTCGGAAGT-TATCCTGCAAT-ATGTACAAGAAAACGCAATCTTTATTtcttgaattgaagtcaaattttaa
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGTACTTACAGTATACAGTGACGGTCTGTGTTGCTGACGTCCTGTTATACGACAATGACGGTCTTGGACTCGTGGCTCTACAATGACACGTTTTCTGGTTGTACTTTCTGTCTGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGGGTCCCCGTATTGGTCACTCCAGTGGTCAGTGTGTCATCCCCACAGACCCAGCTCCAGTTGATGACAGGGTTACCCAGTGAAGACAAGGTACATCGTAATATAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATTCACCAGCTGTCAGTTGTGGGGTGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|16 ): ACTTACAGTATACAGTGATGGTTTGTGTTGCTGACACCCTGTTATACGACAATGACTGTCTTGGACTCGTGGCTCTACACTGACAGGTTCTCTGGTTGTACTTTCTGTATGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGTGTCCCTGTATTGGTCACTCCATCGGTCAGTGTGTCATCTCCACAGACCCAGCTCCACGTGATGGCAGGGTTACCCAGCGTAGACAAGGTACATTGTAATGTAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|21 ): GATTTCGTCTGCAACATGAGTAAATTAATAATGAATCGTGAATAAATTAACATGGAAACAAACAGGCAAGTAAAGTCTCTTCCGCGTTTGGCATCGTGTGGTTTTATTGGACTGTGCATGCAGATATATTTACATTGCACTGATAAAATCTGTCAACATAAAACTAAACACTTGAGGTATCTTTCAAAAAATCTTCTTTTCATCAGGGAAAATCATTCATTCCGTTTCGGAAGCTGTCATGACG
Unaligned ( gi|26 ): AATCAGGCAAACAAAATAAACATATATACCACATTATTATAAACATAAAAATTACTAAATACATGTATATGTTGGAAAACAATTTTATAAATGACTGAAAAATAGTTGGCATTCAATATAAATCAATCATCTGCATTGTGAGAGTAATACAGGTACGGTTGGCGATGCACAAACAAGTTAACCTTCTTTCATGTCCGTATAGTTTTC
Unaligned ( gi|37 ): ACAGTTAAAATTCACAGACAAATTTATAAATGGCTGAAGCATATCTGACATTCATCTAAAAGATCAGTGGTCTGAATTCCGAGATCAATACATGTAAACAAACACTCTGACAAGTTGACTCTCTCCCACGA
Unaligned ( gi|39 ): AGAAATTGATACATATATATCTGTTACACCTCGTCTTTTGCTAAACCTTAAGTCAGTGTTATATTTATAAACATTGAATGTTGCAAAACAATTTATAAATGACTTGAAGAGTATTTGTGTAATTC
Unaligned ( gi|40 ): GTATGTTGAGCATCAATACTCTAGAAAAATATTTGTCATTCAAATTCAAAGATCGATACACATGTAAAGAAACAGTGCGATGCAAAGATACTTTACACGTAATCCTCTTTCATGTACATGTA
Unaligned ( gi|42 ): AGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGCTGGGGGTGCGTCTATTGAATCAACATTCATTAACAGCAAACCCTAACTACTAGACAATGTATTTCACTAGGTTATTGTAGAAAAC
Unaligned ( gi|43 ): ATACATACATATGCACATACACACAGTTTGCTCGTATACATGCATACAAACATTTGCATAAATTTGATCAATCTTATACAATCTGGATAATTCTGGTTTGTTTTTCAGGTTG
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Reference ( family-2 )        :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC--T---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATAA--CT-GA---T-AATT----CA--AT-T---TTATAA-T-C-A-------T----A-------AA--A----A-------T-----T-----TA---T-AAA---------AT-------G------AA--------A-C-A---------A-ATNT-A-------T--A-A------------C--A-N--G--AC-TT-GAAG-AA--T-AT---------T----------T----GT---C---N---TTC--CAT-------G-------A-TCG---AT----A-C----T------C--------A--------T------G--------G-T----AA-A---C-A-----A---CG---T--G--GGCGATGC----ACAG-------ACAA-G-----TT--AN-C-C-TC-TTCCACG--T-----AT-GC--GTAG-TT-T-C-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------A-A-------------G--CA---------G--------------TNNAT------NCA-----AT---C-----CGT-CAACAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GA-----------A-----------A---------AA----ATAGATCT------A----G--TAT--ACCCTACC----A-----T--CTC---A--T-T------TTT-T-C-GTCA-GCAAA-A-A---A---C--GT--A----TN---CC---T---A----GT---CCGTTTCGGAAACTGTC-ATGACGT--------C-AC-AG---GTNACCC-AATTC--GTAGCT-GTAT-G-G-TAAA-CGATCGGCTGTATGTTTCTGANC-CGTAATAG-ATG--A-ATTNTGGA-TGATNCAGGATAAC-TTCCTTTGACTTC-AAATGTTGTTTTGAAATATAAAAGCC-C-GGCTAACGCCTCGGCTTTTTTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCGGAGGTTATCCTGCAAC-ATNCAC--GAAAACGCAAACTTTATT
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gi|10                         : aaaaaaaaaaaaacacacacacaaaaaaaaaaccggaagctcaaacgttttagtaaataattctaccacgtctattgcaaagttcgaaggaataccgcggtgggttgtttttttcctggtataccttcattcgtacaattatgtacaaactgataataagaaaattgatacacttgctcttcgaggtatgctaatataacaccgataactgattgttcaagaatcaacatttaaaaatgattgattaacatttgcaattcaatataaatcaagtgtcggcgttgcgcatgtaaataaatcccattccacggatgggtagtttccttaattaagtgtaatcaatgcagttaacataatccgtcaacatcaaactaaatacttatgaaacacgtttttcaaaatagatctagtataccctaccatctcacctttttcgtgggcaaataaacgtatcggatactgacatgacgtcataaagtcttaggttgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattaaaaaaaaaactgactaggaATACA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC--T----G---ATTATA-GGA----AAAT--------------------------CTCAT-T--AGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-TGATATAAAC-----AAT----A---AA-GTA-GATA--------------------------C-T---TTATAA-T-C-A-------T----A-------AG--A----A-------A-----T-----AA---TCAAA---------AT-------ATGTGACAA--------ATC-A---------A-ATCT-A-------T--A-A---------------A-TTTG--TCATT-GAAT-AA--G-AT---------T----------TAATCGT---C---AGCATTG--CGA-------G-------A-TTG---AT----A-C----C------C--------A--------T------G----------T----AA-A---C-A-----AA--CA---T--G--G-CGATGTCTAGACAATT-----ACAA-G-----TT--AA-C-CCTA-TTCCACG--A-----AT-GT--GTGG-TT-T-C-CCTCGACA--AT-ATA-T-TC---------A-AA------------G--CA---------G--------------TTGAT------ATA-----GT---C-----CAT-CAACAT-CAAACT--AA----G--T----A-T--T--------CA-----------A-----------A---------AC----ATAG--CT------A----G--TAT--ACCCTACC----A-----T--CTC---AC-C-T------TTT-T-C-TTCA-GCAAA-A-ATC-A---T--GT--A----GG---CC---T---A----TT---CCGTTTCGGAAACTTTC-ATGACGC--------T-AC-GA---TTGACCT-TATTG--GTAGCT-GTATAG-G-TAAtctg
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtgatgtataaattgtataaaaatcctcattctccaagttattgcaagtcaaaggatgccatgtcttatcggaaaATATG--C-------CTTTATATGTA---------A--TT----AC--T----G---ATTATG-AGA----AAACT---TA----C-A----C--------TTCA------G-----------TC-GCGTTTT---GCTG-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AAAGTT-GACAA--TT-TA---T-CATCATAACA--AA-T---CTAATA-T-C-AAATGTGCT----G-------AA--AGCAAA-------A-----T-----CA---T-AAACG-------AT-------G------AA--------A---A---------G-ATGT-T-------T--G-T------------C--A-C------T-TT-TAAA-AA--T-GT---------TAATTTAAATGT----AT---C---G---TCT--GCT-------GTACCGACA-TCG---AT----G-C----A------C--------A--------T------GTCCGAACTG-T----AA-C---A-A-----A---CA---T--G--A-CGATGC----ACA----------AA-G-----TTG-AC-C-C-TT-TTTCACA--T-----AT-GC--GTAG-T------------------------------------------------------------------G--------------TTGAT------ACA-----AT---C------GTACAACAT-CAAACT--AA----A--T----ATT--T--------GATTTTTTTTCTTC-----------A---------AA----TTAAAACT---------------------CTTGCC------------------------T------TTT-T-C-GTCA-GCAAA-A-G---A---C--AT--tacgcttgacactcatggtgactaatcttgctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---GCCA-----A-T---ACAA-C-----TAT----A---GA-GTC-GATAAAGCT-GA---T-AATT----CA--GT-T---TTATGG-T-A-A-------T----A-------AA--A----A-------T-----TAA---TA---T-TTG---------TT-------GCA----AA--------A-T-A---------A-ATTT-A-------T--A-A---------------A-T--G--AC--T-GAGG-AA--C-ACATAAGTCAAT----------C----GTCTAC---A---TTC--TAA-------G-------A-TTG---AT----G-C----A------C--------A--------T---------------A-T----AA-A---CAA-----A---CA---T--G--TA-GATGC----ACAG-------ATGA-G-----TT--AA-C----C-TTCCACG--------A--------AG-TTAT-C-T-TGAATT--GT-GTT-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------G--------------TTAATATACTAGTA-----AT---C-----CGT-CAAACC-CAAATT--TA----A--T----AT-----------------------------------------------------ATAGTTC-------A------------ACCCCCCC----C-----C--CCCCAAA--T-TCCTGCCTTT-TAC-GTCA-GCAAA-A-A---A---T--GT--A------------------G----GT---C--------AAGCTGTC-GTGACGT--------C-AT--G---GTGACCT-AATTC--ATAACT-AGA--G-G-TAAA-gcatgtagg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----A-T---ACAA-A-----AAT----A---AC-GTC-AATAA--CT-GA---TCAATT-----A--AT-T---TAATAA-T-C-A-------T----A-------AA--A----A-------T-----T-----AA---T-CAATGT------AT-------GTTGCA-AA--------A-CAA---------A-ATCT-A-------T--A-A---------------A-T--G--G--TT-GAAG-AA--C-AT---------G----------TCAGGGT---A---A---ACC--AAT-------C-------G-TCT---AC----A-T----T------C--------A--------G------G--------GAT----AG-A---T-AC----A---CA---T------GC-ATGC----CTAG-------A-------------------------TGCACA--C-----A------GT---TT-T-C-T-TGAAC----T-GTA-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------T--------------TTGAT------ATA-----AT---C-----AGT-CATCAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GATTGTTTTTTT-G-----------G---------TT----GTAGAT-T------A----C--AGT--ACCCTA-C----A-----T--TTC---A--T-C------CTTGT-C-GTCT-GCAAA-A-A---A----------A-----C---CC---T---GT---GT---ACAT---GTAAACTGAC-ATGACAT--------C-AC-AGCGCGCGACCT--ATTC--GTAATG-GTAT-A-G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---ACTA-----C-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-TATAT--CT-AA---T-TATT----CA--AT-T---TTATAC-T-C-T-------T----A-------AA--A----A-------T-----T-----AA---T-CAAT--------AT-------GTGTT--GA--------A---A---------A-ATAT-G-------T-------------------------------TT-GAAG-AA--T-AT---------T----------T----GT---C---A---TTC--AAT-------ATAA----A-TCA---AT----C-A----T------C--------A-------------------------------AA-ATTCC-A-----AGATCGATATCAA--GGCGATGC----ACAG-------AGAA-G-----TT--AA-C-C--C-TTTCA----------------------TT-T-C-A-TGGACT--GT-GTGGT-TC---------A-AA------------G--CA---------T--------------TTGAT------ATA-----AT---C-----TGT-CAACAT-CAAACT--AAGAACA--T----A-T--G--------GA-----------ATATTTTTC---A---------AA----ACAAATCT------C----G--CAT--ACCCCATC----A-----C--CTC---A--TAT------TTT-T-C-GTCA-ACAAA-ATC---A---T--GC--A----GG---CT---T---A----GT---CCGTg
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatcaggcaaacaaaataaacatatataccacCTGCAATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA--------C---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----TATATA---TTCTG-T--TAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A-----AC----------------------------------CT------T-AAGT----CA--GTGT---TTATAATT-T-A-------T----A-------AA--C----A-------T-----T-----GA---T-GTT---------GC-------A------AA--------A-C-----------A-ATTT-A-------T--A-A---------------A-T--G--AC-TT-GAAG-AG--T-AT---------T----------T----GT---tc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tggttatgcaaaggcattataG-ATT----C-A----CAA------CTTAC-T--TGC--AT-----TTCCGTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----G---AA-GTC-GATAG--AT-AG---T-AGTT----TA--AT-T---ATATAA-T-C-A-------TTTTAA-------AA--A----A-------T-----C-----AA---TCAAA---------ATATGTAGCA------AA--------A-C-A---------A-ATCT-A-------T--ATA------------T--A-T--A--AT-CT--AGG-AA--T-AT---------T----------T----GC---T---A---TTC--gtaattcaata
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aa-----TTC-GTGTTTT---GGTG-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-AACAA--CT-GA---C-AATT----CA--AC-T---TCATAA-T-C-attctaaagtcatacgccggtttcgaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caatatatcacattctaccaaagttattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCACTGTA--C-------ATTCATACGTG---------A--TG----A------------ATGAGG-AAA----AAATTG-ATAATTAC-A----CCT------ATCAC-C--TGC--AC-----TTT-GTGTTTT---GCAA-----A-T---ACCA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATCA--CT-GAGGGG-AA-T----CT--AT-T---TTTT---T-C---------T----A-------AA--T----A-------T-----T-----T
gi|30                         :                                                                                                                                                      gttcaggaaatgtacttacagtatacagtgataacctgtgttcctgacgtcttgttatacgaaaatgacggtcttggactcatggctctacattgacacgttctctggttgtactttctgtctgttgtcaagttctttactgactgggtccccgtattggtcactccagtggtcagtgtgtcatctccacagacccagctccacgtgatggcagggttacccagcgtagacaaggtacatcgtaatgtaatggactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgttagttgtggggcggcagggggggcatctgtttaatcaaaattcagtatttttctgggtaatcccaatgcttttctaaaatgggaaatttgttagaaaactacgaacacctagacaaagtattctaccatggctactctataaaaatgcagcagtcattattctgcaatgCCGTGATTTA--C-------ATTCATGTGTA---------A--TA----AC--TGTCTG---ATTACG-AGA----AATTTG-ATA----C-A----TAcccattata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atggccctagcatagatgaaaggaattccacagtcattactATGC----ATAG-------ACAA-C-----TTG-AT-C-C-TA-T-ACACG--T--------GC--ATAG-TT-T----------T--GTTGTA-T-TC---------AGA-------------G--CA---------GATCAAA--------TTGAT------TCATTGATATAAAC-----CGT-CAACAT-CAAACC--AA----A--T----ACCG-T--------CA-----------A-----------A---------------------CT------A----G--TATAGACCCTAGCTATTA-----T--TTG---AC-C-T------TTT-T-C-GTCA-ACTAA-A-gagttatgtttataacacggataataggtgtttgaccctcaaaaggataatcatatttgaca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGA-TGATGCTGAATAAC-CTC----GACTTG-A----TTTTTTTAAAATATAAAAGTCTC-GGCTAACGCTTCGGCTTTTGCA---------------A----CA---TTTCTAGACC-TCAGAGGTTATCATGCAAC-ATCAAC--GAAAATGTGAATTATGTT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -GCAAA-A-A---A---C--ATGAA----TAAGACC---T---A----GT---CTGTTTCGGGAATTGTC-ATGACGT--------C-AC--G---GTAACCC------------CT-TTATAG-G-TAAA-T-------------TTTCTGGGC-CGTAATAG--T------TTCT--A-TAGTACAGGATGACATTCC--CGATCTCGAAA---TGTTTTGAAATATGAAAGCC-tcgtaatttgaacccagtttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA--C-------CCTCAAATGTA---------AATTA----A---T---TG---ATTATG-AGAGAGAAAA--A-ATA----C-A----CAC------CTCAA-C--AGC--AC-----TTT-CTGTTTT---GTTG-----A-T---A-AA-T-----AAA----A---CA-CTC-GATTA--CT-GA---T-AATT----C----T-T---TTATttt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttgcaaacatcaatggaatgccgcactcag-------------G--CA------------------------TTCAT------ATA-----GC---C-----CAT-AAACAT-CAAACT--AA----AAAT----ATG--T--------GA-----------A-----------A---------AA-----TAGA------------------AC--A---------------------TC---A--C-C------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-T-ATT-A---T--GT--A----CA---TG---C---A----TT---CCGTTTTGGAAGCTGTC-ATGACGttgacaat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggactgtgcatggaaaattaacattcaaatacatc-------CTCTATGTGTA---------C--TA----AC--T----G---ATTATA-AGA----AAATTG-AGA----C-A-----AG------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GGTAATATTA-T---ACAA-C-----AAG----C---AA-TTC-GATAA--CT-AA---
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattactgcaaagttcaaaagaaagccactgtcgttattctgtgctA--A----A-------T-----T-----TA---T-AAATGG------CT-------G------AA--------G-C-------------ATAT-C-------T--G-A------------C--ATT--C--AT-CT-AAAA-GA--TCAG---------T----------G----GT---CTGAA---TTC--CGA-------G-------A-TCA---AT----A-------------C--------A--------T---------------G-T----AA-A---C-A-----A------------------ACAC----TCTG-------ACAA-G-----TT--GA-CTC-TC-TCCCACG--
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acagttaaaattcacagac-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------AGA-------------A--CA---------GCGTCGCA-------TTGAT------GTA-----CT---T-----CAT-CAACAT-CAAACA--GA----A--TCTCAACT--TTTTTGCCAGA-----------A-----------A---------AA----Aa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tca----A-----T--CTC---AA-C-T------TTT-T-T-GCCA-GAAAA-A-A---AAAAC--A---A----CA---CCACAT---A----TT---CTGTCTCGGAA---GTT-ATGACGT--------C-Aaaaacaacaccacatattctgtctcggaagttatgacgtca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcattggactgtgtattcagaacagcgtcgcattgatgtacttcatcaacatcaaacaga----AAATTG-ATA----C-A----TAT------ATATC-TGTTAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A--------A-C------------------------------CT------T-AAGT----CA--GT-G---TTATAT-T-T-A-------T----A-------AA--C----A-------T-----T-------------GA---------AT-------GTTGCA-AA--------A-C-A---------A--TTT-A-------T--A-A---------------A-T--G--AC-TT-GAAG-AG--T-AT---------T----------T----GT---
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agCTGAGAAATA--C-------CTTCATAC---------------TA----AT--T---TATGAATTATG-G--------ATTGCATA----C-A----CA----------ACAT--TGC--TT-----ATT-GTGTTTT-----TA-----A-C---ATAA-------AAT----ATGCAA-AT--GA--A--C---A---T-A-TT----CA--TT-T---TTAT-----C-A-------T----A-------AA--A----A-------A-----T-----CA---T-ATT----------T-------GC-----AA--------A-C-A---------A-ACTT-AAAAAAAAT--A-A------------TTAA-T--C--AT-TTCAAAGTAA--T-AA---------C----------C----AT---C---TG--CTC--CAA-------G-------A-TCA---AT----A-C----A------C--------A--------T------T--------T-T----AA-C---C-A-----A---CA---A--G--GG-AATGC----ACAG-------ACAT-G-----TG--AA-C-C-T--TTCCCCA--T-----AT-GT--ATAgtaattc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatACAT-CAAACT--AA----A--------CC--G--------GG-----------G-----------G---------TATTCTATTAATCT------G----G--TA-----CCT-TC----A-----T--CTC---ACCT-C------TTT-T-C-ATTA--CAAA-A-A---A---C--AT--G----TA---AC---T---A----GT---CCATT--GGATAATGCCGATGAT-T--------C-AC-A-----TGACCT-AATC----TAGCTTATAT-G-GGTAAA-TGATCAGCTATATGTT--TGAACACGTAATAGAATG--A-AGTTTGAA-TG---CAAG-TA---TTC--TTG--TTC-AAATGTTG---TGAAATATAAAAGTT-T-G--TATTACTT--GC---TTTA-CATTTCAA---AATA----CA---ATTGTCAACCATTGAA--TTAT-CTGCAAC-ATGCAA--GAAAAGGCAAACTcatcaaactaaaccgggggtattctattaatctggtaccttcatctcacctcttttcattacaaaaaacatgtaactagtccattggataatgccgatgattcacatgacctaatctagcttatatgggtaaatgatcagctatatgtttgaacacgtaatagaatgaagtttgaatgcaagtattcttgttcaaatgttgtgaaatataaaagtttgtattacttgctttacatttcaaaatacaattgtcaaccattgaattatctgcaacatgcaagaaaaggcaaact
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatctgagaaataccttcatactaatttatgaattatggattgcatacacaacattgcttattgtgtttttaacataaaatatgcaaatgaacatattcatttttatcataaaaaatcatatttgcaaacaaacttaaaaaaaataattaatcatttcaaagtaataaccatctgctccaagatcaatacacattttaaccaacaagggaatgcacagacatgtgaacctttccccatatgtatC-TA-GAAA-AA--T-AT---------T----------T----GT---C---A---TTCA-AATTCAAA--G-------A-TCG---AT----A-C----A------C--------A--------T---------------G-T----AA-AG--A-A-----A---CA------G--TGCGATGC----AAAGATACTTTACAC-G-----TA--AT-C-C-TC-TTTCATG--T-----AC-AT--GTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtatgttgagcatcaatact-TTTCTCT--CTCC-AAATGTTGTTTAG-AATATTAAAGCA-C-TGCGGA-----------TTTTA-TATTTCAAAGCA--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGATGTTAT--TGCAAC-ATAAAA--GAAAACACATGCTTCATT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----ACAG-------ACAA-G-----CTA-AC-C-C-TT-TTCAATG--------AT-GCGTGTAG-TT-T-TGT-TTGA-T--AT-AGA-A-GC---------AGA-------------G--CA---------GATAGATGTATTACATTTAT------ATA-----AG---C-----CAT-CAACAT-CAAtc
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --C-------CTCCATACGTA---------A--TAG---ACGAT---TG---A--AAA-AGA----AAATCG-GTA----C-A----CAT------CTCGC-T--TAT--CCTTGAGTTC-GTATTTT---GCAA-----A-T---GCAG-C-----CGT---------A-GTC-AAAAA--CT-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gCCGCGATATA--C-------TTCCATATGTA---------A--T------T--TA--TG---TCTAGG-AGA----AAATAA-ATT----C-C----TAT------CTCGC-A--TGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggaatgccgcggtatctattTAACGCCGCGGGTTT---A-TATTTCAA---A--AACAACA---ATTGTCAACC-TTATAGATTATTCTGCTAA-ATCCAC--GAAAGTGCAAACTTTATT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aat-T-TGGACT--GC-GTAAT-CC---------A-A-------------G--TG---------G--------------TTGAT------ATA-----AT---T-----CGT-CAATAT-CAAACT--AA----A--T----ATT--T--------GAAAGATTTTT--A-----------A---------AG----ATAGATCT------A----GAATAT--ACCtctt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCCTCTG--TTTTTA-TATTTCAA---A--A----TA---TTTCTCGATC-TCTGAGTTTATTCTGCAAT-ATACAC--GAAAACGCAACCCTTCTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATATAACC-------TTTCATACGCA---------A--AA----AA--C---GG---ATTATG-AGGG---AAATTT-ATC----CTA----CAC------CTC-C-T--TACTGGC-----TTC-TTGCTTTAATGCTA-----AAT---ACAA-C-----AAC----AT--AA-G-C-GATAA--CTTAA---T-A-TT----CATAAT-TATATCATAA-T-T-G-------A----A-------AA--A----ATAATCAGT-----T-----TACTCT-GCA---------AT-------G------AAGGGTTTCAA-T-A---------A-AGGT-GAC-----TGAA-A------------A--A-G--GGAAC-TG-GCCG-AAGCT-AC---------TA---------T----A----C---A---TTA--CAT-------G----------------T----A-C----A------C--------A--------T------G----------T----AA-A---C-A-----AG--CA---T--G--GG-AATAC----ACAG-------CCAA-G-----TT--AATC-C-TC-TTCTACG--T-----A--GT--GTAA-TT-TTC-T-TGGAAT--GT-GTA-T-CC---------A-AAGCACATTGAA--G--CA---------G--------------TTGAT------ACA-----AT---C-----CGT-GGAGAC-CAAACT--AA----A--C----ACT--T--------GA-----------AATATTTTTGTCA---------AA----ATAAATC--------------------GCGCT--C----A-----C--C----------T------TTT-T-C-TTCG-GCAAA-A-ACGCG---T--GT--A----TC---CC---T---ATTACAT---CCGCTGCGGTAACTACC-ATGACGT--------C-AC--G---GTAACCT-AATAC--GCAACT-GTAT-tctt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttA---A--A----CA---TTTCCTGACC-TCAGAGGTTA--CTGCAACTATCCAT--GAAAATGTAAACTTTATTaagta
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC------TG---ATGATG-AAA----Atcttgaattgaagtcaaattttaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatcccaaagaccaaaggaataccacggtcaatattGAATTATATAAGCC-CTGGTTAATGTTTCGGCTTCT-----ATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCTGAGGT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---TTTCTCAACT-TCGGAAGTTATCCTGCAAT-ATGTACAAGAAAACGCAATCTTTATT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGGGGTTAtcta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AA--TG--TG---ATTGTG-AAA----AAGTTG-ATA----C-A----agaaaacgcgaacctctga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgCTGCGATGTA--T-------ATTCATAGGT----------------------------G---ATTACG-AGA----ACATTG-ATATTTGC-A----CAT------TTCGC-C--TGG--AT----------------------------A-T---ACATTC-------T----A---AA-GTC-AACAA--CT-GA---T-CATT----CA--AA-T---TTATAA-T-C-A-------T----A-------AA--T----A-------T-----T-----t
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                         aatgacttacagtaaacagtgatggtctgttttcctgatgttctgttatacaacggacttgtggctctgcaataacatgccctattgttgtacttcctgtttgctctcactgtcaacgcagactgggttcctgcattggtcactccagtggttagtgtgtcatctccacatacccagctccacgtgatggaagggttaccgagggtggacaaggtacaacgtaagctaatgaactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgtcagttgtggggcggcaaggggtgcgtctattgaatcaacatttataagcagtaatcactatgtacatgtacttgacaatgtattctactaagattattgtagagatcaaaggaatgcattattCTGCAATATA--CACTGTACCTTCATATGTA---------A--TT----AC--T----A---ATTATGGAGA----AAATT--ATG----T-ATCTCCAG------CTCAT-T--TGC--GC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ATAT-C------AT----T---AA-GTCGGGTAA--CT-GA---T-TATT----CA--AT-T---TTA-GA-T-CAA-------T----G-------AA--A----G-------T-------------------AA---------AT--------------AT--------A-C-ATGTACTTGTA-TTTT-G-------C--A-A---------------A-T--G--AC--A-GAAG-AA--T-AT---------T----------T----GT---C---A---TTC--AATATA----A-------A-TCA---ATCTGCA-T----T------CCAAGGCCTA--------TACACA-A--------G-T----AA-A---CAA-----A---CA---T-----AGCAATGC----ACAG-------ACAA-G-----TTTAAT-C-C-TC-TTCCACT--T-----AA-AT--GTAG-AT-T-T-T-T--------------T-TC---------A-A----------------CA-----------------------------------TCA---------------------AACATGAAAACTTGAA----A--T----ATT--T--------TT-----------C-----------A---------AA----ATATTTCA------A----G--TAT--ACCCTATC----A-----T--Ccgctattacataatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taattgtttttgcggaattctatcacagctgcaaatatataatggaaagatcaaaggaatgccagggtccgtattATA--C-------CTTCATATGTA---------A--AA----AC--T----G---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--TC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-CTGTACAAT----A---AA-GTC-AGTAA--CT-TA---T-AATT----CA--AT-T---TCACAA-T-C-A-------T----G-------AA--A----A-------C------------------------------AT-------T------AA--------T-C-A---------TTATGT-G-------C--T-G------------C--A-A--A------T-GAA-------------------T----------T----GT---C---AGCATTC--CGA-------G-------A-TCA---AC----A-CAGACTGG----T--------A--------T------GTGAT----G-T----AA-G---C-A-----AA--CA---T--G--G-TGATGT----ACAG-------ACAA-G-----TT--AA-C-CCTC-ATCCATT--C-----GT-GC--TTAG-TT-TTC-T-AAGACT--GT-GTA-T-TC---------A-AA------------G--TA---------G--------------GTGAT------ATA-----AT---C-----AGT-CAAAAT-CAAATT--AG----A--T----ATT--T--------GA-----------A-----------ATATTTTTCAAA----ATAGATCT------ATACGG--TAT--ACCCAACT----A-----T--CCC---C--T-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A-AAT-A---T--GT--A----TG---CC---A---A----GT---CTGTTTCaacaaaagcaatcctgaggtctagttcattttggaacatacatgtatatatcttaggtagcaccttttcatatgtaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaaaaaaagactagcacaaacatgataatattacaaagcaatttgacaatagtcattttatcagttattgcaaagaacaaaggaatgttgcagtcaGCAATATA--C-------AATCATACGTG---------A--TATTTTAC--T----G---ATTATG-AGA----AGATTG-A------C-A----CAT------GTC-C-T--TAA--CC-----TTC-GTGTTTC---GATA-----A-T---ACAA-C-----ATT----A---A--GTC-GGTAA--AG-GA---G-AATT----CA--CT-T---TTATAA-T-C-A-------T----A-------AA--A----A-------T-----A-----CAT--T-AAT---------ATCTATTGCA------AA--------A-C-A---------A-ATCTCA-------T--A-A------------T--G-C---------T-GAA--AA--T-AT---------T----------T----GT---C---A---TTC--AATATAAATCA-------A-TCGTCTAC----A-T----T------CCGAG----A--------T-----------------T----AC-A---C-A--------------T-----AGCGATGC----ACAG-------ACAA-GGTCAATC--AC-T-T-TG-TTCCACG--T-----TT-GT--GTAGTTT-T-C-T-TGGACT--GC--T--T-TG---------A-ATGT----------G--TA---------G--------------TTGAT------ATA-----AT---C-----CGT-CAA-AT------------------------TT--T--------------------------------------------------TATTTTT------A--------AT--ACCCTACA----A-----T--CTC---A--C-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A-G---G---CATGT--A----GG---CC---T---A----AT---CCGTTTCAGACA---TC-ATGACGT--------C-AC--G---TCGACGC-AATTC--GTAGCT-GTAT-G-t
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGTACTTACAGTATACAGTGACGGTCTGTGTTGCTGACGTCCTGTTATACGACAATGACGGTCTTGGACTCGTGGCTCTACAATGACACGTTTTCTGGTTGTACTTTCTGTCTGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGGGTCCCCGTATTGGTCACTCCAGTGGTCAGTGTGTCATCCCCACAGACCCAGCTCCAGTTGATGACAGGGTTACCCAGTGAAGACAAGGTACATCGTAATATAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATTCACCAGCTGTCAGTTGTGGGGTGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|16 ): ACTTACAGTATACAGTGATGGTTTGTGTTGCTGACACCCTGTTATACGACAATGACTGTCTTGGACTCGTGGCTCTACACTGACAGGTTCTCTGGTTGTACTTTCTGTATGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGTGTCCCTGTATTGGTCACTCCATCGGTCAGTGTGTCATCTCCACAGACCCAGCTCCACGTGATGGCAGGGTTACCCAGCGTAGACAAGGTACATTGTAATGTAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|42 ): AGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGCTGGGGGTGCGTCTATTGAATCAACATTCATTAACAGCAAACCCTAACTACTAGACAATGTATTTCACTAGGTTATTGTAGAAAAC
Unaligned ( gi|43 ): ATACATACATATGCACATACACACAGTTTGCTCGTATACATGCATACAAACATTTGCATAAATTTGATCAATCTTATACAATCTGGATAATTCTGGTTTGTTTTTCAGGTTG
Unaligned ( gi|52 ): TATTGTAAGGATCAAGGAATACCATTGTCATTATTCTGTTACATATACTTTTAAATACGTAAGAACCGTTAAT
Unaligned ( gi|57 ): TAATTCTACCACGGCTATTGCAAAGATCAAAGAAACCCCGC






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Reference ( family-2 )        :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC--T---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATAA--CT-GAT-AATT----CA--AT-T-TTATAA-T-C-A-------T----A-------AA--A----AT-----TNA-T-A--A-----------A---------AT-------G------AAA----------C---AAAT-TT--A-------T-------AA---A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--CAT------------G---A-TCGAT----A--C----T------C--------A--------T------G--------G-T----AA----A---C-A-----A-CA-T--------G--GGCGATGC----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-C----TC-TTCCACG--T-----AT-GC--GTAG-TT-T-C-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------A-A-------------G--CA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AACAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GA-----------A-----------A-------AA----ATAGATCT------A----G--TAT--ACCCTACC----A-----T--CTC---A--T-T------TTT-T-C-GTCA-GCAAA-A--A---A---C--GT-----A----CGCC---T---A----GT---CCGTTTCGG-AAACTGTC-ATGACG-TC-AC-AG---GTGACCT----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-G-TAAA-CGATNGGCTGTATATTTCTGAAC-CGTAGTAG-A-TG--A-ATTNTGG-ATGATGCAGGATAAC-TTCCTTTGACTTC-AAATGTTGTTTTGAAATATAAAAGCC-C-GGCTAACGCCTCGGCTTTTTTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCGGAGGTTATCCTGCAAC-ATNCAC--GAAAACGCAAACTTTATT
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gi|10                         : aaaaaaaaaaaaacacacacacaaaaaaaaaaccggaagctcaaacgttttagtaaataattctaccacgtctattgcaaagttcgaaggaataccgcggtgggttgtttttttcctggtataccttcattcgtacaattatgtacaaactgataataagaaaattgatacacttgctcttcgaggtatgctaatataacaccgataactgattgttcaagaatcaacatttaaaaatgattgattaacatttgcaattcaatataaatcaagtgtcggcgttgcgcatgtaaataaatcccattccacggatgggtagtttccttaattaagtgtaatcaatgcagttaacataatccgtcaacatcaaactaaatacttatgaaacacgtttttcaaaatagatctagtataccctaccatctcacctttttcgtgggcaaataaacgtatcggatactgacatgacgtcataaagtcttaggttgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattaaaaaaaaaactgactaggaATACA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC--T----G---ATTATA-GGA----AAAT--------------------------CTCAT-T--AGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-TGATATAAAC-----AAT----A---AA-GTA-GATA-----------------------C-T-TTATAA-T-C-A-------T----A-------AG--A----AA-----TAA-TCA--A-----------A---------AT-------ATGTGACAAAT---------C---AAAT-CT--A-------T-------AA---A--TTTG---TCATT--G-AA---T-AA----------------G-----AT---------T-TAATCGT---C-AGCATT-----------G--CGA------------G---A-TTGAT----A--C----C------C--------A--------T------G----------T----AA----A---C-A-----AACA-T--------G--G-CGATGTCTAGACA----ATT-----ACAA-G-TTAA-C-CC---TA-TTCCACG--A-----AT-GT--GTGG-TT-T-C-CCTCGACA--AT-ATA-T-TC---------A-AA------------G--CA---------G--------------TTG-ATA------TAGTC-----CAT-C-AACAT-CAAACT--AA----G--T----A-T--T--------CA-----------A-----------A-------AC----ATAG--CT------A----G--TAT--ACCCTACC----A-----T--CTC---AC-C-T------TTT-T-C-TTCA-GCAAA-A--ATC-A---T--GT-----A----GGCC---T---A----TT---CCGTTTCGG-AAACTTTC-ATGACG-CT-AC-GA---TTGACCT----TATT---G--GTAGCT-GTATAG-G-TAAtctg
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---GCCA-----A-T---ACAA-C-----TAT----A---GA-GTC-GATAAAGCT-GAT-AATT----CA--GT-T-TTATGG-T-A-A-------T----A-------AA--A----AT-----TAA-T-ATTT-----------G---------TT-------GCA----AAA----------T---AAAT-TT--A-------T-------AA---A--T--G---AC--T--G-AG---G-AA----------------C-----ACATAAGTCAAT-C----GTCTAC-A---TT-----------C--TAA------------G---A-TTGAT----G--C----A------C--------A--------T---------------A-T----AA----A---CAA-----A-CA-T--------G--TA-GATGC----ACA----G-------ATGA-G-TTAA-C-------C-TTCCACG--------A--------AG-TTAT-C-T-TGAATT--GT-GTT-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------G--------------TTA-ATATACTAGTAATC-----CGT-C-AAACC-CAAATT--TA----A--T----AT---------------------------------------------------ATAGTTC-------A------------ACCCCCCC----C-----C--CCCCAAA--T-TCCTGCCTTT-TAC-GTCA-GCAAA-A--A---A---T--GT-----A---------------G----GT---C---------AAGCTGTC-GTGACG-TC-AT--G---GTGACCT----AATT---C--ATAACT-AGA--G-G-TAAA-g
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----A-T---ACAA-A-----AAT----A---AC-GTC-AATAA--CT-GATCAATT-----A--AT-T-TAATAA-T-C-A-------T----A-------AA--A----AT-----TAA-T-C--A-----------ATGT------AT-------GTTGCA-AAA----------CA--AAAT-CT--A-------T-------AA---A--T--G---G--TT--G-AA---G-AA----------------C-----AT---------G-TCAGGGT---A-A---AC-----------C--AAT------------C---G-TCTAC----A--T----T------C--------A--------G------G--------GAT----AG----A---T-AC----A-CA-T------------GC-ATGC----CTA----G-------A----------------------TGCACA--C-----A------GT---TT-T-C-T-TGAAC----T-GTA-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----AGT-C-ATCAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GATTGTTTTTTT-G-----------G-------TT----GTAGAT-T------A----C--AGT--ACCCTA-C----A-----T--TTC---A--T-C------CTTGT-C-GTCT-GCAAA-A--A---A-------------A----C-CC---T---GT---GT---ACAT---GT-AAACTGAC-ATGACA-TC-AC-AGCGCGCGACCT-----ATT---C--GTAATG-GTAT-A-G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---ACTA-----C-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-TATAT--CT-AAT-TATT----CA--AT-T-TTATAC-T-C-T-------T----A-------AA--A----AT-----TAA-T-C--A-----------AT--------AT-------GTGTT--GAA--------------AAAT--------------------------A--T--G----T-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AAT------------ATAAA-TCAAT----C--A----T------C--------A-------------------------------AA----ATTCC-A-----A-GA-TCGATATCAA--GGCGATGC----ACA----G-------AGAA-G-TTAA-C-C-----C-TTTCA----------------------TT-T-C-A-TGGACT--GT-GTGGT-TC---------A-AA------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----TGT-C-AACAT-CAAACT--AAGAACA--T----A-T--G--------GA-----------ATATTTTTC---A-------AA----ACAAATCT------C----G--CAT--ACCCCATC----A-----C--CTC---A--TAT------TTT-T-C-GTCA-ACAAA-AT-C---A---T--GC-----A----GGCT---T---A----GT---CCGTg
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatcaggcaaacaaaataaacatatataccacCTGCAATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA--------C---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----TATATA---TTCTG-T--TAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A-----AC----------------------------------CT---T-AAGT----CA--GTGT-TTATAATT-T-A-------T----A-------AA--C----AT-----TGA-T-G--T-----------T---------GC-------A------AAA----------C----AAT-TT--A-------T-------AA---A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---tc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tggttatgcaaaggcattataG-ATT----C-A----CAA------CTTAC-T--TGC--AT-----TTCCGTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----G---AA-GTC-GATAG--AT-AGT-AGTT----TA--AT-T-ATATAA-T-C-A-------TTTTAA-------AA--A----AT-----CAA-TCA--A-----------A---------ATATGTAGCA------AAA----------C---AAAT-CT--A-------T-------AT---A--T--AT--AA-TC--T-AG---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GC---T-A---TT-----------C--gtaattcaata
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aa-----TTC-GTGTTTT---GGTG-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAC-AATT----CA--AC-T-TCATAA-T-C-attctaaagtcatacgccggtttcgaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caatatatcacattctaccaaagttattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCACTGTA--C-------ATTCATACGTG---------A--TG----A------------ATGAGG-AAA----AAATTG-ATAATTAC-A----CCT------ATCAC-C--TGC--AC-----TTT-GTGTTTT---GCAA-----A-T---ACCA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATCA--CT-GA
gi|30                         :                                                                                                                                                      gttcaggaaatgtacttacagtatacagtgataacctgtgttcctgacgtcttgttatacgaaaatgacggtcttggactcatggctctacattgacacgttctctggttgtactttctgtctgttgtcaagttctttactgactgggtccccgtattggtcactccagtggtcagtgtgtcatctccacagacccagctccacgtgatggcagggttacccagcgtagacaaggtacatcgtaatgtaatggactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgttagttgtggggcggcagggggggcatctgtttaatcaaaattcagtatttttctgggtaatcccaatgcttttctaaaatgggaaatttgttagaaaactacgaacacctagacaaagtattctaccatggctactctataaaaatgcagcagtcattattctgcaatgCCGTGATTTA--C-------ATTCATGTGTA---------A--TA----AC--TGTCTG---ATTACG-AGA----AATTTG-ATA----C-A----TAggggaatctatttttttctaaatatttcccattata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atggccctagcatagatgaaaggaattccacagtcattactATGC----ATA----G-------ACAA-C-TTGA-T-C----CT-ATACACG--T--------GC--ATAG-TT-T----------T--GTTGTA-T-TC---------AGA-------------G--CA---------GATCAAATTGATTCATTG-ATA------TAAAC-----CGT-C-AACAT-CAAACC--AA----A--T----ACCG-T--------CA-----------A-----------A-------------------CT------A----G--TATAGACCCTAGCTATTA-----T--TTG---AC-C-T------TTT-T-C-GTCA-ACTAA-A--gagttatgtttataacacggataataggtgtttgaccctcaaaaggataatcatatttgaca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-ATGATGCTGAATAAC-CTC----GACTTG-A----TTTTTTTAAAATATAAAAGTCTC-GGCTAACGCTTCGGCTTTTGCA---------------A----CA---TTTCTAGACC-TCAGAGGTTATCATGCAAC-ATCAAC--GAAAATGTGAATTATGTT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GCAAA-A--A---A---C--ATGAATAA----GACC---T---A----GT---CTGTTTCGG-GAATTGTC-ATGACG-TC-AC--G---GTAACCC------------------CT-TTATAG-G-TAAA-T-------------TTTCTGGGC-CGTAATAG---T------TTCT---ATAGTACAGGATGACATTCC--CGATCTCGAAA---TGTTTTGAAATATGAAAGCC-tcgtaatttgaacccagtttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA--C-------CCTCAAATGTA---------AATTA----A---T---TG---ATTATG-AGAGAGAAAA--A-ATA----C-A----CAC------CTCAA-C--AGC--AC-----TTT-CTGTTTT---GTTG-----A-T---A-AA-T-----AAA----A---CA-CTC-GATTA--CT-GAT-AATT----C----T-T-TTATttt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgcaaacatcaatggaatgccgcactcag-------------G--CA------------------------TTC-ATA------TAGCC-----CAT-A-AACAT-CAAACT--AA----AAAT----ATG--T--------GA-----------A-----------A-------AA-----TAGA------------------AC--A---------------------TC---A--C-C------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-T--ATT-A---T--GT-----A----CATG---C---A----TT---CCGTTTTGG-AAGCTGTC-ATGACG-ttgacaat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggactgtgcatggaaaattaacattcaaatacatc-------CTCTATGTGTA---------C--TA----AC--T----G---ATTATA-AGA----AAATTG-AGA----C-A-----AG------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GGTAATATTA-T---ACAA-C-----AAG----C---AA-TTC-GATAA--CT-AA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattactgcaaagttcaaaagaaagccactgtcgttattctgtgct-------AA--A----AT-----TCA-C-A--G-----------A--------------------------------------C---AAAT-TT--A-------T-------AA---A--T--G---GC--T--G-AA---G-CA----------------T-----AT---------C-T----GA---C-A---TT--------------CATCTAAAA------G---A-TCAGT----G--G----T------CTGA-----A--------TTCCGA-G--------A-T----CA----A---T-------A-CA-T--------GTAAACAA-------ACACTCTG-------ACAA-G-TTGA-CTC----TC-TCCCACG--
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acagtt-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------AGA-------------A--CA---------GCGTCGCA-------TTG-ATG------TACTT-----CAT-C-AACAT-CAAACA--GA----A--TCTCAACT--TTTTTGCCAGA-----------A-----------A-------AA----Aa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tca----A-----T--CTC---AA-C-T------TTT-T-T-GCCA-GAAAA-A--A---AAAAC--A------A----CACCACAT---A----TT---CTGTCTCGG-AA---GTT-ATGACG-TC-Aaaaacaacaccacatattctgtctcggaagttatgacgtca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcattggactgtgtattcagaacagcgtcgcattgatgtacttcatcaacatcaaacaga----AAATTG-ATA----C-A----TAT------ATATC-TGTTAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A--------A-C------------------------------CT---T-AAGT----CA--GT-G-TTATAT-T-T-A-------T----A-------AA--C----AT-----TGA----------------------------AT-------GTTGCA-AAA----------C---AA-T-TT--A-------T-------AA---A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agCTGAGAAATA--C-------CTTCATAC---------------TA----AT--T---TATGAATTATG-G--------ATTGCATA----C-A----CA----------ACAT--TGC--TT-----ATT-GTGTTTT-----TA-----A-C---ATAA-------AAT----ATGCAA-AT--GA--A--C---AT-A-TT----CA--TT-T-TTAT-----C-A-------T----A-------AA--A----AA-----TCA-T-A--T-----------T----------T-------GC-----AAA----------C---AAAC-TT--AAAAAAAAT-------AATTAA--T--C---AT-TTC-A-AA---GTAA----------------T-----AA---------C-C----AT---CTG---CT-----------C--CAA------------G---A-TCAAT----A--C----A------C--------A--------T------T--------T-T----AA----C---C-A-----A-CA-A--------G--GG-AATGC----ACA----G-------ACAT-G-TGAA-C-C----T--TTCCCCA--T-----AT-GT--ATAgtaattc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatACAT-CAAACT--AA----A--------CC--G--------GG-----------G-----------G-------TATTCTATTAATCT------G----G--TA-----CCT-TC----A-----T--CTC---ACCT-C------TTT-T-C-ATTA--CAAA-A--A---A---C--AT-----G----TAAC---T---A----GT---CCATT--GG-ATAATGCCGATGAT--TC-AC-A-----TGACCT----AATC-------TAGCTTATAT-G-GGTAAA-TGATCAGCTATATGTTT--GAACACGTAATAG-AATG--A-AGTTTGA-ATG---CAAG-TA---TTC--TTG--TTC-AAATGTTGT---GAAATATAAAAGTT-T-G--TATTACTT--GC---TTTA-CATTTCAA---AATA----CA---ATTGTCAACCATTGAA--TTAT-CTGCAAC-ATGCAA--GAAAAGGCAAACTcatcaaactaaaccgggggtattctattaatctggtaccttcatctcacctcttttcattacaaaaaacatgtaactagtccattggataatgccgatgattcacatgacctaatctagcttatatgggtaaatgatcagctatatgtttgaacacgtaatagaatgaagtttgaatgcaagtattcttgttcaaatgttgtgaaatataaaagtttgtattacttgctttacatttcaaaatacaattgtcaaccattgaattatctgcaacatgcaagaaaaggcaaact
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatctgagaaataccttcatactaatttatgaattatggattgcatacacaacattgcttattgtgtttttaacataaaatatgcaaatgaacatattcatttttatcataaaaaatcatatttgcaaacaaacttaaaaaaaataattaatcatttcaaagtaataaccatctgctccaagatcaatacacattttaaccaacaagggaatgcacagacatgtgaacctttccccatatgtatC-TA--G-AA---A-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------CA-AATTCAAA-------G---A-TCGAT----A--C----A------C--------A--------T---------------G-T----AA----AG--A-A-----A-CA----------G--TGCGATGC----AAA----GATACTTTACAC-G-TAAT-C-C----TC-TTTCATG--T-----AC-AT--GTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtatgttgagcatcaatact-TTTCTCT--CTCC-AAATGTTGTTTAG-AATATTAAAGCA-C-TGCGGA-----------TTTTA-TATTTCAAAGCA--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGATGTTAT--TGCAAC-ATAAAA--GAAAACACATGCTTCATT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----ACA----G-------ACAA-G-CTAACC-C----TT-TTCAATG--------AT-GCGTGTAG-TT-T-TGT-TTGA-T--AT-AGA-A-GC---------AGA-------------G--CA---------GATAGATGTATTACATTT-ATA------TAAGC-----CAT-C-AACAT-CAAtc
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --C-------CTCCATACGTA---------A--TAG---ACGAT---TG---A--AAA-AGA----AAATCG-GTA----C-A----CAT------CTCGC-T--TAT--CCTTGAGTTC-GTATTTT---GCAA-----A-T---GCAG-C-----CGT---------A-GTC-AAAAA--CT-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gCCGCGATATA--C-------TTCCATATGTA---------A--T------T--TA--TG---TCTAGG-AGA----AAATAA-ATT----C-C----TAT------CTCGC-A--TGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggaatgccgcggtatctattTAACGCCGCGGGTTT---A-TATTTCAA---A--AACAACA---ATTGTCAACC-TTATAGATTATTCTGCTAA-ATCCAC--GAAAGTGCAAACTTTATT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aat-T-TGGACT--GC-GTAAT-CC---------A-A-------------G--TG---------G--------------TTG-ATA------TAATT-----CGT-C-AATAT-CAAACT--AA----A--T----ATT--T--------GAAAGATTTTT--A-----------A-------AG----ATAGATCT------A----GAATAT--ACCtctt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCCTCTG--TTTTTA-TATTTCAA---A--A----TA---TTTCTCGATC-TCTGAGTTTATTCTGCAAT-ATACAC--GAAAACGCAACCCTTCTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATATAACC-------TTTCATACGCA---------A--AA----AA--C---GG---ATTATG-AGGG---AAATTT-ATC----CTA----CAC------CTC-C-T--TACTGGC-----TTC-TTGCTTTAATGCTA-----AAT---ACAA-C-----AAC----AT--AA-G-C-GATAA--CTTAAT-A-TT----CATAAT-T-ATATCA-T-A-A-------TTG--A-------AA--A----AA-----TAA-T-C--AGTTTACTCTGCA---------AT-------G------AAG---------------GGT-TTCAA-------T-------AA---AGGT--G---AC-T---G-AA---A-AAGGGAACTGGCCGAAGCT-----AC---------TAT----A----C-A---TT-----------A--CAT------------G---------T----A--C----A------C--------A--------T------G----------T----AA----A---C-A-----AGCA-T--------G--GG-AATAC----ACA----G-------CCAA-G-TTAATC-C----TC-TTCTACG--T-----A--GT--GTAA-TT-TTC-T-TGGAAT--GT-GTA-T-CC---------A-AAGCACATTGAA--G--CA---------G--------------TTG-ATA------CAATC-----CGT-G-GAGAC-CAAACT--AA----A--C----ACT--T--------GA-----------AATATTTTTGTCA-------AA----ATAAATC--------------------GCGCT--C----A-----C--C----------T------TTT-T-C-TTCG-GCAAA-A--ACGCG---T--GT-----A----TCCC---T---ATTACAT---CCGCTGCGG-TAACTACC-ATGACG-TC-AC--G---GTAACCT----AATA---C--GCAACT-GTAT-tctt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttA---A--A----CA---TTTCCTGACC-TCAGAGGTTA--CTGCAACTATCCAT--GAAAATGTAAACTTTATTaagta
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC------TG---ATGATG-AAA----Atcttgaattgaagtcaaattttaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatcccaaagaccaaaggaataccacggtcaatattGAATTATATAAGCC-CTGGTTAATGTTTCGGCTTCT-----ATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCTGAGGT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---TTTCTCAACT-TCGGAAGTTATCCTGCAAT-ATGTACAAGAAAACGCAATCTTTATT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGGGGTTAtcta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AA--TG--TG---ATTGTG-AAA----AAGTTG-ATA----C-A----agaaaacgcgaacctctga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgCTGCGATGTA--T-------ATTCATAGGT----------------------------G---ATTACG-AGA----ACATTG-ATATTTGC-A----CAT------TTCGC-C--TGG--AT----------------------------A-T---ACATTC-------T----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAT-CATT----CA--AA-T-TTATAA-T-C-A-------T----A-------AA--T----AT-----Tt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                         aatgacttacagtaaacagtgatggtctgttttcctgatgttctgttatacaacggacttgtggctctgcaataacatgccctattgttgtacttcctgtttgctctcactgtcaacgcagactgggttcctgcattggtcactccagtggttagtgtgtcatctccacatacccagctccacgtgatggaagggttaccgagggtggacaaggtacaacgtaagctaatgaactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgtcagttgtggggcggcaaggggtgcgtctattgaatcaacatttataagcagtaatcactatgtacatgtacttgacaatgtattctactaagattattgtagagatcaaaggaatgcattattCTGCAATATA--CACTGTACCTTCATATGTA---------A--TT----AC--T----A---ATTATGGAGA----AAATT--ATG----T-ATCTCCAG------CTCAT-T--TGC--GC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ATAT-C------AT----T---AA-GTCGGGTAA--CT-GAT-TATT----CA--AT-T-TTA-GA-T-CAA-------T----G-------AA--A----GT-----AAA-T-AT-A-----------C---------AT-------G-------TA----------CTTGTATT-TT--G-------C-------AA---A--T--G---AC--A--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAATCTGCA--T----T------CCAAGGCCTA--------TACACA-A--------G-T----AA----A---CAA-----A-CA-T-----------AGCAATGC----ACA----G-------ACAA-GTTTAATC-C----TC-TTCCACT--T-----AA-AT--GTAG-AT-T-T-T-T--------------T-TC---------A-A-----------------------------------------------------------------CAT-CAAACATGAAAACTTGAA----A--T----ATT--T--------TT-----------C-----------A-------AA----ATATTTCA------A----G--TAT--ACCCTA-------------------------------------T-C-ATCA-ACAAA-AGCA---AT--C--CTG----A----GGTC---T---A----GT---TCATTTTGG-AAcgctattacataatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taattgtttttgcggaattctatcacagctgcaaatatataatggaaagatcaaaggaatgccagggtccgtattATA--C-------CTTCATATGTA---------A--AA----AC--T----G---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--TC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-CTGTACAAT----A---AA-GTC-AGTAA--CT-TAT-AATT----CA--AT-T-TCACAA-T-C-A-------T----G-------AA--A----AC------------------------------------AT-------T------AAT----------C---A----TT--A-------TGTGCTGCAA---A--T--G---AA-TT--G-------------------------------------------T-C----AG---C-A---TT-----------C--CGA------------G---A-TCAAC----A--CAGACTGG----T--------A--------T------GTGAT----G-T----AA----G---C-A-----AACA-T--------G--G-TGATGT----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-CC---TC-ATCCATT--C-----GT-GC--TTAG-TT-TTC-T-AAGACT--GT-GTA-T-TC---------A-AA------------G--TA---------G--------------GTG-ATA------TAATC-----AGT-C-AAAAT-CAAATT--AG----A--T----ATT--T--------GA-----------AATATTTTTC--A-------AA----ATAGATCT------ATACGG--TAT--ACCCAACT----A-----T--CCC---C--T-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A--AAT-A---T--GT-----A----TGCC---A---A----GT---CTGTTTCcatacatgtatatatcttaggtagcaccttttcatatgtaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaaaaaaagactagcacaaacatgataatattacaaagcaatttgacaatagtcattttatcagttattgcaaagaacaaaggaatgttgcagtcaGCAATATA--C-------AATCATACGTG---------A--TATTTTAC--T----G---ATTATG-AGA----AGATTG-A------C-A----CAT------GTC-C-T--TAA--CC-----TTC-GTGTTTC---GATA-----A-T---ACAA-C-----ATT----A---A--GTC-GGTAA--AG-GAG-AATT----CA--CT-T-TTATAA-T-C-A-------T----A-------AA--A----AT-----ACATT-A--A-----------T---------ATCTATTGCA------AAA----------C---AAATCTC--A-------T--------A---A--T--G------CT--G-AA-----AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAAT----CGTC----TA-----C--------A--------T------T--------C-C----GAGATTA---C-------A-CA-T-----------AGCGATGC----ACA----G-------ACAAGG-TCAA-T-CACTTTG-TTCCACG--T-----TT-GT--GTAGTTT-T-C-T-TGGACT--GC--T--T-TG---------A-ATGT----------G--TA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AA-AT------------------------TT--T------------------------------------------------TATTTTT------A--------AT--ACCCTACA----A-----T--CTC---A--C-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A--G---G---CATGT-----A----GGCC---T---A----AT---CCGTTTCAG-ACA---TC-ATGACG-TC-AC--G---TCGACGC----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-t
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGTACTTACAGTATACAGTGACGGTCTGTGTTGCTGACGTCCTGTTATACGACAATGACGGTCTTGGACTCGTGGCTCTACAATGACACGTTTTCTGGTTGTACTTTCTGTCTGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGGGTCCCCGTATTGGTCACTCCAGTGGTCAGTGTGTCATCCCCACAGACCCAGCTCCAGTTGATGACAGGGTTACCCAGTGAAGACAAGGTACATCGTAATATAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATTCACCAGCTGTCAGTTGTGGGGTGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|16 ): ACTTACAGTATACAGTGATGGTTTGTGTTGCTGACACCCTGTTATACGACAATGACTGTCTTGGACTCGTGGCTCTACACTGACAGGTTCTCTGGTTGTACTTTCTGTATGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGTGTCCCTGTATTGGTCACTCCATCGGTCAGTGTGTCATCTCCACAGACCCAGCTCCACGTGATGGCAGGGTTACCCAGCGTAGACAAGGTACATTGTAATGTAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|42 ): AGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGCTGGGGGTGCGTCTATTGAATCAACATTCATTAACAGCAAACCCTAACTACTAGACAATGTATTTCACTAGGTTATTGTAGAAAAC
Unaligned ( gi|43 ): ATACATACATATGCACATACACACAGTTTGCTCGTATACATGCATACAAACATTTGCATAAATTTGATCAATCTTATACAATCTGGATAATTCTGGTTTGTTTTTCAGGTTG
Unaligned ( gi|52 ): TATTGTAAGGATCAAGGAATACCATTGTCATTATTCTGTTACATATACTTTTAAATACGTAAGAACCGTTAAT
Unaligned ( gi|57 ): TAATTCTACCACGGCTATTGCAAAGATCAAAGAAACCCCGC






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Reference ( family-2 )        :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC--T---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATAA--CT-GAT-AATT----CA--AT-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-A--A-----------A---------AT-------G------AA-----A----------C---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--CAT------------G---A-TCGAT----A--C----T------C--------A--------T------G--------G-TAA----A---C-A-----A-C-AT--------G--GGCGATGC----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-C----TC-TTCCACG--T-----AT-GC--GTAG-TT-T-C-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------A-A-------------G--CA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AACAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GA-----------A-----------A-------AA----ATAGATCT------A----G--TAT--ACCCTACC----A-----T--CTC---A--T-T------TTT-T-C-GTCA-GCAAA-A--A---A---C--GT-----A----CGCC---T---A----GT---CCGTTTCGG-AAACTGTC-ATGACG-TC-AC-AG---GTGACCT----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-G-TAAA-CGATNGGCTGTATATTTCTGAAC-CGTAGTAG-A-TG--A-ATTNTGG-ATGATGCAGGATAAC-TTCCTTTGACTTC-AAATGTTGTTTTGAAATATAAAAGCC-C-GGCTAACGCCTCGGCTTTTTTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCGGAGGTTATCCTGCAAC-ATNCAC--GAAAACGCAAACTTTATT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---GCCA-----A-T---ACAA-C-----TAT----A---GA-GTC-GATAAAGCT-GAT-AATT----CA--GT-T-TTATGG-T-A-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-ATTT-----------G---------TT-------GCA----AA-----A----------T---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---AC--T--G-AG---G-AA----------------C-----ACATAAGTCAAT-C----GTCTAC-A---TT-----------C--TAA------------G---A-TTGAT----G--C----A------C--------A--------T---------------A-TAA----A---CAA-----A-C-AT--------G--TA-GATGC----ACA----G-------ATGA-G-TTAA-C-------C-TTCCACG--------A--------AG-TTAT-C-T-TGAATT--GT-GTT-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------G--------------TTA-ATATACTAGTAATC-----CGT-C-AAACC-CAAATT--TA----A--T----AT---------------------------------------------------ATAGTTC-------A------------ACCCCCCC----C-----C--CCCCAAA--T-TCCTGCCTTT-TAC-GTCA-GCAAA-A--A---A---T--GT-----A---------------G----GT---C---------AAGCTGTC-GTGACG-TC-AT--G---GTGACCT----AATT---C--ATAACT-AGA--G-G-TAAA-g
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----A-T---ACAA-A-----AAT----A---AC-GTC-AATAA--CT-GATCAATT-----A--AT-T-TAATAA-T-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-C--A-----------ATGT------AT-------GTTGCA-AA-----A----------CA--AAAT-CT--ATAA-A--T--G---G--TT--G-AA---G-AA----------------C-----AT---------G-TCAGGGT---A-A---AC-----------C--AAT------------C---G-TCTAC----A--T----T------C--------A--------G------G--------GATAG----A---T-AC----A-C-AT------------GC-ATGC----CTA----G-------A----------------------TGCACA--C-----A------GT---TT-T-C-T-TGAAC----T-GTA-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----AGT-C-ATCAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GATTGTTTTTTT-G-----------G-------TT----GTAGAT-T------A----C--AGT--ACCCTA-C----A-----T--TTC---A--T-C------CTTGT-C-GTCT-GCAAA-A--A---A-------------A----C-CC---T---GT---GT---ACAT---GT-AAACTGAC-ATGACA-TC-AC-AGCGCGCGACCT-----ATT---C--GTAATG-GTAT-A-G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---ACTA-----C-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-TATAT--CT-AAT-TATT----CA--AT-T-TTATAC-T-C-T-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-C--A-----------AT--------AT-------GTGTT--GA-----A--------------AAAT----------A--T--G----T-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AAT------------ATAAA-TCAAT----C--A----T------C--------A---------------------------AA----ATTCC-A-----A-G-ATCGATATCAA--GGCGATGC----ACA----G-------AGAA-G-TTAA-C-C-----C-TTTCA----------------------TT-T-C-A-TGGACT--GT-GTGGT-TC---------A-AA------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----TGT-C-AACAT-CAAACT--AAGAACA--T----A-T--G--------GA-----------ATATTTTTC---A-------AA----ACAAATCT------C----G--CAT--ACCCCATC----A-----C--CTC---A--TAT------TTT-T-C-GTCA-ACAAA-AT-C---A---T--GC-----A----GGCT---T---A----GT---CCGTg
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatcaggcaaacaaaataaacatatataccacCTGCAATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA--------C---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----TATATA---TTCTG-T--TAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A-----AC----------------------------------CT---T-AAGT----CA--GTGT-TTATAATT-T-A-T----A------------AA-----C----A-------TT---GAT-G--T-----------T---------GC-------A------AA-----A----------C----AAT-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---tc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tggttatgcaaaggcattataG-ATT----C-A----CAA------CTTAC-T--TGC--AT-----TTCCGTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----G---AA-GTC-GATAG--AT-AGT-AGTT----TA--AT-T-ATATAA-T-C-A-TTTTAA------------AA-----A----A-------TC---AATCA--A-----------A---------ATATGTAGCA------AA-----A----------C---AAAT-CT--ATAT-A--T--AT--AA-TC--T-AG---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GC---T-A---TT-----------C--gtaattcaata
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aa-----TTC-GTGTTTT---GGTG-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAC-AATT----CA--AC-T-TCATAA-T-C-attctaaagtcatacgccggtttcgaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caatatatcacattctaccaaagttattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCACTGTA--C-------ATTCATACGTG---------A--TG----A------------ATGAGG-AAA----AAATTG-ATAATTAC-A----CCT------ATCAC-C--TGC--AC-----TTT-GTGTTTT---GCAA-----A-T---ACCA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATCA--CT-GA
gi|30                         :                                                                                                                                                      gttcaggaaatgtacttacagtatacagtgataacctgtgttcctgacgtcttgttatacgaaaatgacggtcttggactcatggctctacattgacacgttctctggttgtactttctgtctgttgtcaagttctttactgactgggtccccgtattggtcactccagtggtcagtgtgtcatctccacagacccagctccacgtgatggcagggttacccagcgtagacaaggtacatcgtaatgtaatggactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgttagttgtggggcggcagggggggcatctgtttaatcaaaattcagtatttttctgggtaatcccaatgcttttctaaaatgggaaatttgttagaaaactacgaacacctagacaaagtattctaccatggctactctataaaaatgcagcagtcattattctgcaatgCCGTGATTTA--C-------ATTCATGTGTA---------A--TA----AC--TGTCTG---ATTACG-AGA----AATTTG-ATA----C-A----TAggggaatctatttttttctaaatatttcccattata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atggccctagcatagatgaaaggaattccacagtcattactATGC----ATA----G-------ACAA-C-TTGA-T-C----CT-ATACACG--T--------GC--ATAG-TT-T----------T--GTTGTA-T-TC---------AGA-------------G--CA---------GATCAAATTGATTCATTG-ATA------TAAAC-----CGT-C-AACAT-CAAACC--AA----A--T----ACCG-T--------CA-----------A-----------A-------------------CT------A----G--TATAGACCCTAGCTATTA-----T--TTG---AC-C-T------TTT-T-C-GTCA-ACTAA-A--gagttatgtttataacacggataataggtgtttgaccctcaaaaggataatcatatttgaca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGG-ATGATGCTGAATAAC-CTC----GACTTG-A----TTTTTTTAAAATATAAAAGTCTC-GGCTAACGCTTCGGCTTTTGCA---------------A----CA---TTTCTAGACC-TCAGAGGTTATCATGCAAC-ATCAAC--GAAAATGTGAATTATGTT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GCAAA-A--A---A---C--ATGAATAA----GACC---T---A----GT---CTGTTTCGG-GAATTGTC-ATGACG-TC-AC--G---GTAACCC------------------CT-TTATAG-G-TAAA-T-------------TTTCTGGGC-CGTAATAG---T------TTCT---ATAGTACAGGATGACATTCC--CGATCTCGAAA---TGTTTTGAAATATGAAAGCC-tcgtaatttgaacccagtttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA--C-------CCTCAAATGTA---------AATTA----A---T---TG---ATTATG-AGAGAGAAAA--A-ATA----C-A----CAC------CTCAA-C--AGC--AC-----TTT-CTGTTTT---GTTG-----A-T---A-AA-T-----AAA----A---CA-CTC-GATTA--CT-GAT-AATT----C----T-T-TTATttt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgcaaacatcaatggaatgccgcactcag-------------G--CA------------------------TTC-ATA------TAGCC-----CAT-A-AACAT-CAAACT--AA----AAAT----ATG--T--------GA-----------A-----------A-------AA-----TAGA------------------AC--A---------------------TC---A--C-C------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-T--ATT-A---T--GT-----A----CATG---C---A----TT---CCGTTTTGG-AAGCTGTC-ATGACG-ttgacaat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggactgtgcatggaaaattaacattcaaatacatc-------CTCTATGTGTA---------C--TA----AC--T----G---ATTATA-AGA----AAATTG-AGA----C-A-----AG------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GGTAATATTA-T---ACAA-C-----AAG----C---AA-TTC-GATAA--CT-AA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattactgcaaagttcaaaagaaagccactgtcgttattctgtgctT-A--A-----------A---------AT-------TCAC---AG-----A----------C---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---GC--T--G-AA---G-CA----------------T-----AT---------C-T----GA---C-A---TT--------------CATCTAAAA------G---A-TCAGT----G--G----T------CTGA-----A--------TTCCGA-G--------A-TCA----A---T-------A-C-AT--------GTAAACAA-------ACACTCTG-------ACAA-G-TTGA-CTC----TC-TCCCACG--
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acagt-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------AGA-------------A--CA---------GCGTCGCA-------TTG-ATG------TACTT-----CAT-C-AACAT-CAAACA--GA----A--TCTCAACT--TTTTTGCCAGA-----------A-----------A-------AA----Aa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tca----A-----T--CTC---AA-C-T------TTT-T-T-GCCA-GAAAA-A--A---AAAAC--A------A----CACCACAT---A----TT---CTGTCTCGG-AA---GTT-ATGACG-TC-Aaaaacaacaccacatattctgtctcggaagttatgacgtca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcattggactgtgtattcagaacagcgtcgcattgatgtacttcatcaacatcaaacaga----AAATTG-ATA----C-A----TAT------ATATC-TGTTAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A--------A-C------------------------------CT---T-AAGT----CA--GT-G-TTATAT-T-T-A-T----A------------AA-----C----A-------TT---GA---------------------------AT-------GTTGCA-AA-----A----------C---AA-T-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agCTGAGAAATA--C-------CTTCATAC---------------TA----AT--T---TATGAATTATG-G--------ATTGCATA----C-A----CA----------ACAT--TGC--TT-----ATT-GTGTTTT-----TA-----A-C---ATAA-------AAT----ATGCAA-AT--GA--A--C---AT-A-TT----CA--TT-T-TTAT-----C-A-T----A------------AA-----A----AATCATATTTGCAAAC-A--A-----------A---------CT-------T------AA-----A----------A---AAAA-TA--ATTA-A--T--C---AT-TTC-A-AA---GTAA----------------T-----AA---------C-C----AT---CTG---CT-----------C--CAA------------G---A-TCAAT----A--C----A------C--------A--------T------T--------T-TAA----C---C-A-----A-C-AA--------G--GG-AATGC----ACA----G-------ACAT-G-TGAA-C-C----T--TTCCCCA--T-----AT-GT--ATAgtaattc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatACAT-CAAACT--AA----A--------CC--G--------GG-----------G-----------G-------TATTCTATTAATCT------G----G--TA-----CCT-TC----A-----T--CTC---ACCT-C------TTT-T-C-ATTA--CAAA-A--A---A---C--AT-----G----TAAC---T---A----GT---CCATT--GG-ATAATGCCGATGAT--TC-AC-A-----TGACCT----AATC-------TAGCTTATAT-G-GGTAAA-TGATCAGCTATATGTTT--GAACACGTAATAG-AATG--A-AGTTTGA-ATG---CAAG-TA---TTC--TTG--TTC-AAATGTTGT---GAAATATAAAAGTT-T-G--TATTACTT--GC---TTTA-CATTTCAA---AATA----CA---ATTGTCAACCATTGAA--TTAT-CTGCAAC-ATGCAA--GAAAAGGCAAACTcatcaaactaaaccgggggtattctattaatctggtaccttcatctcacctcttttcattacaaaaaacatgtaactagtccattggataatgccgatgattcacatgacctaatctagcttatatgggtaaatgatcagctatatgtttgaacacgtaatagaatgaagtttgaatgcaagtattcttgttcaaatgttgtgaaatataaaagtttgtattacttgctttacatttcaaaatacaattgtcaaccattgaattatctgcaacatgcaagaaaaggcaaact
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatctgagaaataccttcatactaatttatgaattatggattgcatacacaacattgcttattgtgtttttaacataaaatatgcaaatgaacatattcatttttatcataaaaaatcatatttgcaaacaaacttaaaaaaaataattaatcatttcaaagtaataaccatctgctccaagatcaatacacattttaaccaacaagggaatgcacagacatgtgaacctttccccatatgtatC-TA--G-AA---A-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------CA-AATTCAAA-------G---A-TCGAT----A--C----A------C--------A--------T---------------G-TAA----AG--A-A-----A-C-A---------G--TGCGATGC----AAA----GATACTTTACAC-G-TAAT-C-C----TC-TTTCATG--T-----AC-AT--GTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtatgttgagcatcaatact-TTTCTCT--CTCC-AAATGTTGTTTAG-AATATTAAAGCA-C-TGCGGA-----------TTTTA-TATTTCAAAGCA--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGATGTTAT--TGCAAC-ATAAAA--GAAAACACATGCTTCATT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----ACA----G-------ACAA-G-CTAACC-C----TT-TTCAATG--------AT-GCGTGTAG-TT-T-TGT-TTGA-T--AT-AGA-A-GC---------AGA-------------G--CA---------GATAGATGTATTACATTT-ATA------TAAGC-----CAT-C-AACAT-CAAtc
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --C-------CTCCATACGTA---------A--TAG---ACGAT---TG---A--AAA-AGA----AAATCG-GTA----C-A----CAT------CTCGC-T--TAT--CCTTGAGTTC-GTATTTT---GCAA-----A-T---GCAG-C-----CGT---------A-GTC-AAAAA--CT-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gCCGCGATATA--C-------TTCCATATGTA---------A--T------T--TA--TG---TCTAGG-AGA----AAATAA-ATT----C-C----TAT------CTCGC-A--TGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggaatgccgcggtatctattTAACGCCGCGGGTTT---A-TATTTCAA---A--AACAACA---ATTGTCAACC-TTATAGATTATTCTGCTAA-ATCCAC--GAAAGTGCAAACTTTATT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aat-T-TGGACT--GC-GTAAT-CC---------A-A-------------G--TG---------G--------------TTG-ATA------TAATT-----CGT-C-AATAT-CAAACT--AA----A--T----ATT--T--------GAAAGATTTTT--A-----------A-------AG----ATAGATCT------A----GAATAT--ACCtctt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCTCTG--TTTTTA-TATTTCAA---A--A----TA---TTTCTCGATC-TCTGAGTTTATTCTGCAAT-ATACAC--GAAAACGCAACCCTTCTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATATAACC-------TTTCATACGCA---------A--AA----AA--C---GG---ATTATG-AGGG---AAATTT-ATC----CTA----CAC------CTC-C-T--TACTGGC-----TTC-TTGCTTTAATGCTA-----AAT---ACAA-C-----AAC----AT--AA-G-C-GATAA--CTTAAT-A-TT----CATAAT-T-ATATCA-T-A-A-TTG--A------------AA-----A----A-------AT---AAT-C--AGTTTACTCTGCA---------AT-------G------AA-----G---------------GGT-TTCAATAA-AGGT--G---AC-T---G-AA---A-AAGGGAACTGGCCGAAGCT-----AC---------TAT----A----C-A---TT-----------A--CAT------------G---------T----A--C----A------C--------A--------T------G----------TAA----A---C-A-----AGC-AT--------G--GG-AATAC----ACA----G-------CCAA-G-TTAATC-C----TC-TTCTACG--T-----A--GT--GTAA-TT-TTC-T-TGGAAT--GT-GTA-T-CC---------A-AAGCACATTGAA--G--CA---------G--------------TTG-ATA------CAATC-----CGT-G-GAGAC-CAAACT--AA----A--C----ACT--T--------GA-----------AATATTTTTGTCA-------AA----ATAAATC--------------------GCGCT--C----A-----C--C----------T------TTT-T-C-TTCG-GCAAA-A--ACGCG---T--GT-----A----TCCC---T---ATTACAT---CCGCTGCGG-TAACTACC-ATGACG-TC-AC--G---GTAACCT----AATA---C--GCAACT-GTAT-tctt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttA---A--A----CA---TTTCCTGACC-TCAGAGGTTA--CTGCAACTATCCAT--GAAAATGTAAACTTTATTaagta
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC------TG---ATGATG-AAA----Atcttgaattgaagtcaaattttaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatcccaaagaccaaaggaataccacggtcaatattGAATTATATAAGCC-CTGGTTAATGTTTCGGCTTCT-----ATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCTGAGGT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---TTTCTCAACT-TCGGAAGTTATCCTGCAAT-ATGTACAAGAAAACGCAATCTTTATT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGGGGTTAtcta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AA--TG--TG---ATTGTG-AAA----AAGTTG-ATA----C-A----agaaaacgcgaacctctga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgCTGCGATGTA--T-------ATTCATAGGT----------------------------G---ATTACG-AGA----ACATTG-ATATTTGC-A----CAT------TTCGC-C--TGG--AT----------------------------A-T---ACATTC-------T----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAT-CATT----CA--AA-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----T----A-------TT---t
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                         aatgacttacagtaaacagtgatggtctgttttcctgatgttctgttatacaacggacttgtggctctgcaataacatgccctattgttgtacttcctgtttgctctcactgtcaacgcagactgggttcctgcattggtcactccagtggttagtgtgtcatctccacatacccagctccacgtgatggaagggttaccgagggtggacaaggtacaacgtaagctaatgaactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgtcagttgtggggcggcaaggggtgcgtctattgaatcaacatttataagcagtaatcactatgtacatgtacttgacaatgtattctactaagattattgtagagatcaaaggaatgcattattCTGCAATATA--CACTGTACCTTCATATGTA---------A--TT----AC--T----A---ATTATGGAGA----AAATT--ATG----T-ATCTCCAG------CTCAT-T--TGC--GC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ATAT-C------AT----T---AA-GTCGGGTAA--CT-GAT-TATT----CA--AT-T-TTA-GA-T-CAA-T----G------------AA-----A----G-------TA---AAT-AT-A-----------C---------AT-------G-------T-----A----------CTTGTATT-TT--GCAA-A--T--G---AC--A--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAATCTGCA--T----T------CCAAGGCCTA--------TACACA-A--------G-TAA----A---CAA-----A-C-AT-----------AGCAATGC----ACA----G-------ACAA-GTTTAATC-C----TC-TTCCACT--T-----AA-AT--GTAG-AT-T-T-T-T--------------T-TC---------A-A-----------------------------------------------------------------CAT-CAAACATGAAAACTTGAA----A--T----ATT--T--------TT-----------C-----------A-------AA----ATATTTCA------A----G--TAT--ACCCTA-------------------------------------T-C-ATCA-ACAAA-AGCA---AT--C--CTG----A----GGTC---T---A----GT---TCATTTTGG-AAcgctattacataatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taattgtttttgcggaattctatcacagctgcaaatatataatggaaagatcaaaggaatgccagggtccgtattATA--C-------CTTCATATGTA---------A--AA----AC--T----G---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--TC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-CTGTACAAT----A---AA-GTC-AGTAA--CT-TAT-AATT----CA--AT-T-TCACAA-T-C-A-T----G------------AA-----A----ACA-----TT---AAT-C--A-----------TT--------AT-------G-------------------------------TGCT--GCAA-A--T--G---AA-TT--G-------------------------------------------T-C----AG---C-A---TT-----------C--CGA------------G---A-TCAAC----A--CAGACTGG----T--------A--------T------GTGAT----G-TAA----G---C-A-----AAC-AT--------G--G-TGATGT----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-CC---TC-ATCCATT--C-----GT-GC--TTAG-TT-TTC-T-AAGACT--GT-GTA-T-TC---------A-AA------------G--TA---------G--------------GTG-ATA------TAATC-----AGT-C-AAAAT-CAAATT--AG----A--T----ATT--T--------GA-----------AATATTTTTC--A-------AA----ATAGATCT------ATACGG--TAT--ACCCAACT----A-----T--CCC---C--T-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A--AAT-A---T--GT-----A----TGCC---A---A----GT---CTGTTTCcatacatgtatatatcttaggtagcaccttttcatatgtaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaaaaaaagactagcacaaacatgataatattacaaagcaatttgacaatagtcattttatcagttattgcaaagaacaaaggaatgttgcagtcaGCAATATA--C-------AATCATACGTG---------A--TATTTTAC--T----G---ATTATG-AGA----AGATTG-A------C-A----CAT------GTC-C-T--TAA--CC-----TTC-GTGTTTC---GATA-----A-T---ACAA-C-----ATT----A---A--GTC-GGTAA--AG-GAG-AATT----CA--CT-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----AATACA-------TT---AAT-ATCT-----------A---------TT-------GCA----AA-----A----------C---AAATCTC--AT-A-A--T--G------CT--G-AA-----AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAAT----CGTC----TA-----C--------A--------T------T--------C-CGAGATTA---C-------A-C-AT-----------AGCGATGC----ACA----G-------ACAAGG-TCAA-T-CACTTTG-TTCCACG--T-----TT-GT--GTAGTTT-T-C-T-TGGACT--GC--T--T-TG---------A-ATGT----------G--TA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AA-AT------------------------TT--T------------------------------------------------TATTTTT------A--------AT--ACCCTACA----A-----T--CTC---A--C-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A--G---G---CATGT-----A----GGCC---T---A----AT---CCGTTTCAG-ACA---TC-ATGACG-TC-AC--G---TCGACGC----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-t
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGTACTTACAGTATACAGTGACGGTCTGTGTTGCTGACGTCCTGTTATACGACAATGACGGTCTTGGACTCGTGGCTCTACAATGACACGTTTTCTGGTTGTACTTTCTGTCTGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGGGTCCCCGTATTGGTCACTCCAGTGGTCAGTGTGTCATCCCCACAGACCCAGCTCCAGTTGATGACAGGGTTACCCAGTGAAGACAAGGTACATCGTAATATAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATTCACCAGCTGTCAGTTGTGGGGTGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|16 ): ACTTACAGTATACAGTGATGGTTTGTGTTGCTGACACCCTGTTATACGACAATGACTGTCTTGGACTCGTGGCTCTACACTGACAGGTTCTCTGGTTGTACTTTCTGTATGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGTGTCCCTGTATTGGTCACTCCATCGGTCAGTGTGTCATCTCCACAGACCCAGCTCCACGTGATGGCAGGGTTACCCAGCGTAGACAAGGTACATTGTAATGTAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|42 ): AGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGCTGGGGGTGCGTCTATTGAATCAACATTCATTAACAGCAAACCCTAACTACTAGACAATGTATTTCACTAGGTTATTGTAGAAAAC
Unaligned ( gi|43 ): ATACATACATATGCACATACACACAGTTTGCTCGTATACATGCATACAAACATTTGCATAAATTTGATCAATCTTATACAATCTGGATAATTCTGGTTTGTTTTTCAGGTTG
Unaligned ( gi|52 ): TATTGTAAGGATCAAGGAATACCATTGTCATTATTCTGTTACATATACTTTTAAATACGTAAGAACCGTTAAT
Unaligned ( gi|57 ): TAATTCTACCACGGCTATTGCAAAGATCAAAGAAACCCCGC






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Reference ( family-2 )        :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC--T---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATAA--CT-GAT-AATT----CA--AT-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-A--A-----------A---------AT-------G------AA-----A----------C---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--CAT------------G---A-TCGAT----A--C----T------C--------A--------T------G--------G-TAA----A---C-A-----A-C-AT--------G--GGCGATGC----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-C----TC-TTCCACG--T-----AT-GC--GTAG-TT-T-C-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------A-A-------------G--CA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AACAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GA-----------A-----------A-------AA----ATAGATCT------A----G--TAT--ACCCTACC----A-----T--CTC---A--T-T------TTT-T-C-GTCA-GCAAA-A--A---A---C--GT-----A----CGCC---T---A----GT---CCGTTTCGG-AAACTGTC-ATGACG-TC-AC-AG---GTGACCT----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-G-TAAA-CGATNGGCTGTATATTTCTGAAC-CGTAGTAG-A-TG--A-ATTNTGG-ATGATGCAGGATAAC-TTCCTTTGACTTC-AAATGTTGTTTTGAAATATAAAAGCC-C-GGCTAACGCCTCGGCTTTTTTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCGGAGGTTATCCTGCAAC-ATNCAC--GAAAACGCAAACTTTATT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---GCCA-----A-T---ACAA-C-----TAT----A---GA-GTC-GATAAAGCT-GAT-AATT----CA--GT-T-TTATGG-T-A-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-ATTT-----------G---------TT-------GCA----AA-----A----------T---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---AC--T--G-AG---G-AA----------------C-----ACATAAGTCAAT-C----GTCTAC-A---TT-----------C--TAA------------G---A-TTGAT----G--C----A------C--------A--------T---------------A-TAA----A---CAA-----A-C-AT--------G--TA-GATGC----ACA----G-------ATGA-G-TTAA-C-------C-TTCCACG--------A--------AG-TTAT-C-T-TGAATT--GT-GTT-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------G--------------TTA-ATATACTAGTAATC-----CGT-C-AAACC-CAAATT--TA----A--T----AT---------------------------------------------------ATAGTTC-------A------------ACCCCCCC----C-----C--CCCCAAA--T-TCCTGCCTTT-TAC-GTCA-GCAAA-A--A---A---T--GT-----A---------------G----GT---C---------AAGCTGTC-GTGACG-TC-AT--G---GTGACCT----AATT---C--ATAACT-AGA--G-G-TAAA-g
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----A-T---ACAA-A-----AAT----A---AC-GTC-AATAA--CT-GATCAATT-----A--AT-T-TAATAA-T-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-C--A-----------ATGT------AT-------GTTGCA-AA-----A----------CA--AAAT-CT--ATAA-A--T--G---G--TT--G-AA---G-AA----------------C-----AT---------G-TCAGGGT---A-A---AC-----------C--AAT------------C---G-TCTAC----A--T----T------C--------A--------G------G--------GATAG----A---T-AC----A-C-AT------------GC-ATGC----CTA----G-------A----------------------TGCACA--C-----A------GT---TT-T-C-T-TGAAC----T-GTA-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----AGT-C-ATCAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GATTGTTTTTTT-G-----------G-------TT----GTAGAT-T------A----C--AGT--ACCCTA-C----A-----T--TTC---A--T-C------CTTGT-C-GTCT-GCAAA-A--A---A-------------A----C-CC---T---GT---GT---ACAT---GT-AAACTGAC-ATGACA-TC-AC-AGCGCGCGACCT-----ATT---C--GTAATG-GTAT-A-G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTT---ACTA-----C-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-TATAT--CT-AAT-TATT----CA--AT-T-TTATAC-T-C-T-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-C--A-----------AT--------AT-------GTGTT--GA-----A--------------AAAT----------A--T--G----T-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AAT------------ATAAA-TCAAT----C--A----T------C--------A---------------------------AA----ATTCC-A-----A-G-ATCGATATCAA--GGCGATGC----ACA----G-------AGAA-G-TTAA-C-C-----C-TTTCA----------------------TT-T-C-A-TGGACT--GT-GTGGT-TC---------A-AA------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----TGT-C-AACAT-CAAACT--AAGAACA--T----A-T--G--------GA-----------ATATTTTTC---A-------AA----ACAAATCT------C----G--CAT--ACCCCATC----A-----C--CTC---A--TAT------TTT-T-C-GTCA-ACAAA-AT-C---A---T--GC-----A----GGCT---T---A----GT---CCGTg
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatcaggcaaacaaaataaacatatataccacCTGCAATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA--------C---TG---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----TATATA---TTCTG-T--TAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A-----AC----------------------------------CT---T-AAGT----CA--GTGT-TTATAATT-T-A-T----A------------AA-----C----A-------TT---GAT-G--T-----------T---------GC-------A------AA-----A----------C----AAT-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---tc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tggttatgcaaaggcattataG-ATT----C-A----CAA------CTTAC-T--TGC--AT-----TTCCGTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----G---AA-GTC-GATAG--AT-AGT-AGTT----TA--AT-T-ATATAA-T-C-A-TTTTAA------------AA-----A----A-------TC---AATCA--A-----------A---------ATATGTAGCA------AA-----A----------C---AAAT-CT--ATAT-A--T--AT--AA-TC--T-AG---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GC---T-A---TT-----------C--gtaattcaata
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aa-----TTC-GTGTTTT---GGTG-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAC-AATT----CA--AC-T-TCATAA-T-C-attctaaagtcatacgccggtttcgaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caatatatcacattctaccaaagttattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCACTGTA--C-------ATTCATACGTG---------A--TG----A------------ATGAGG-AAA----AAATTG-ATAATTAC-A----CCT------ATCAC-C--TGC--AC-----TTT-GTGTTTT---GCAA-----A-T---ACCA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATCA--CT-GA
gi|30                         :                                                                                                                                                      gttcaggaaatgtacttacagtatacagtgataacctgtgttcctgacgtcttgttatacgaaaatgacggtcttggactcatggctctacattgacacgttctctggttgtactttctgtctgttgtcaagttctttactgactgggtccccgtattggtcactccagtggtcagtgtgtcatctccacagacccagctccacgtgatggcagggttacccagcgtagacaaggtacatcgtaatgtaatggactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgttagttgtggggcggcagggggggcatctgtttaatcaaaattcagtatttttctgggtaatcccaatgcttttctaaaatgggaaatttgttagaaaactacgaacacctagacaaagtattctaccatggctactctataaaaatgcagcagtcattattctgcaatgCCGTGATTTA--C-------ATTCATGTGTA---------A--TA----AC--TGTCTG---ATTACG-AGA----AATTTG-ATA----C-A----TAggggaatctatttttttctaaatatttcccattata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atggccctagcatagatgaaaggaattccacagtcattactATGC----ATA----G-------ACAA-C-TTGA-T-C----CT-ATACACG--T--------GC--ATAG-TT-T----------T--GTTGTA-T-TC---------AGA-------------G--CA---------GATCAAATTGATTCATTG-ATA------TAAAC-----CGT-C-AACAT-CAAACC--AA----A--T----ACCG-T--------CA-----------A-----------A-------------------CT------A----G--TATAGACCCTAGCTATTA-----T--TTG---AC-C-T------TTT-T-C-GTCA-ACTAA-A--gagttatgtttataacacggataataggtgtttgaccctcaaaaggataatcatatttgaca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGG-ATGATGCTGAATAAC-CTC----GACTTG-A----TTTTTTTAAAATATAAAAGTCTC-GGCTAACGCTTCGGCTTTTGCA---------------A----CA---TTTCTAGACC-TCAGAGGTTATCATGCAAC-ATCAAC--GAAAATGTGAATTATGTT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GCAAA-A--A---A---C--ATGAATAA----GACC---T---A----GT---CTGTTTCGG-GAATTGTC-ATGACG-TC-AC--G---GTAACCC------------------CT-TTATAG-G-TAAA-T-------------TTTCTGGGC-CGTAATAG---T------TTCT---ATAGTACAGGATGACATTCC--CGATCTCGAAA---TGTTTTGAAATATGAAAGCC-tcgtaatttgaacccagtttaaa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA--C-------CCTCAAATGTA---------AATTA----A---T---TG---ATTATG-AGAGAGAAAA--A-ATA----C-A----CAC------CTCAA-C--AGC--AC-----TTT-CTGTTTT---GTTG-----A-T---A-AA-T-----AAA----A---CA-CTC-GATTA--CT-GAT-AATT----C----T-T-TTATttt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgcaaacatcaatggaatgccgcactcag-------------G--CA------------------------TTC-ATA------TAGCC-----CAT-A-AACAT-CAAACT--AA----AAAT----ATG--T--------GA-----------A-----------A-------AA-----TAGA------------------AC--A---------------------TC---A--C-C------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-T--ATT-A---T--GT-----A----CATG---C---A----TT---CCGTTTTGG-AAGCTGTC-ATGACG-ttgacaat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggactgtgcatggaaaattaacattcaaatacatc-------CTCTATGTGTA---------C--TA----AC--T----G---ATTATA-AGA----AAATTG-AGA----C-A-----AG------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GGTAATATTA-T---ACAA-C-----AAG----C---AA-TTC-GATAA--CT-AA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattactgcaaagttcaaaagaaagccactgtcgttattctgtgctT-A--A-----------A---------AT-------TCAC---AG-----A----------C---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---GC--T--G-AA---G-CA----------------T-----AT---------C-T----GA---C-A---TT--------------CATCTAAAA------G---A-TCAGT----G--G----T------CTGA-----A--------TTCCGA-G--------A-TCA----A---T-------A-C-AT--------GTAAACAA-------ACACTCTG-------ACAA-G-TTGA-CTC----TC-TCCCACG--
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acagt-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------AGA-------------A--CA---------GCGTCGCA-------TTG-ATG------TACTT-----CAT-C-AACAT-CAAACA--GA----A--TCTCAACT--TTTTTGCCAGA-----------A-----------A-------AA----Aa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tca----A-----T--CTC---AA-C-T------TTT-T-T-GCCA-GAAAA-A--A---AAAAC--A------A----CACCACAT---A----TT---CTGTCTCGG-AA---GTT-ATGACG-TC-Aaaaacaacaccacatattctgtctcggaagttatgacgtca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcattggactgtgtattcagaacagcgtcgcattgatgtacttcatcaacatcaaacaga----AAATTG-ATA----C-A----TAT------ATATC-TGTTAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A--------A-C------------------------------CT---T-AAGT----CA--GT-G-TTATAT-T-T-A-T----A------------AA-----C----A-------TT---GA---------------------------AT-------GTTGCA-AA-----A----------C---AA-T-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agCTGAGAAATA--C-------CTTCATAC---------------TA----AT--T---TATGAATTATG-G--------ATTGCATA----C-A----CA----------ACAT--TGC--TT-----ATT-GTGTTTT-----TA-----A-C---ATAA-------AAT----ATGCAA-AT--GA--A--C---AT-A-TT----CA--TT-T-TTAT-----C-A-T----A------------AA-----A----AATCATATTTGCAAAC-A--A-----------A---------CT-------T------AA-----A----------A---AAAA-TA--ATTA-A--T--C---AT-TTC-A-AA---GTAA----------------T-----AA---------C-C----AT---CTG---CT-----------C--CAA------------G---A-TCAAT----A--C----A------C--------A--------T------T--------T-TAA----C---C-A-----A-C-AA--------G--GG-AATGC----ACA----G-------ACAT-G-TGAA-C-C----T--TTCCCCA--T-----AT-GT--ATAgtaattc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatACAT-CAAACT--AA----A--------CC--G--------GG-----------G-----------G-------TATTCTATTAATCT------G----G--TA-----CCT-TC----A-----T--CTC---ACCT-C------TTT-T-C-ATTA--CAAA-A--A---A---C--AT-----G----TAAC---T---A----GT---CCATT--GG-ATAATGCCGATGAT--TC-AC-A-----TGACCT----AATC-------TAGCTTATAT-G-GGTAAA-TGATCAGCTATATGTTT--GAACACGTAATAG-AATG--A-AGTTTGA-ATG---CAAG-TA---TTC--TTG--TTC-AAATGTTGT---GAAATATAAAAGTT-T-G--TATTACTT--GC---TTTA-CATTTCAA---AATA----CA---ATTGTCAACCATTGAA--TTAT-CTGCAAC-ATGCAA--GAAAAGGCAAACTcatcaaactaaaccgggggtattctattaatctggtaccttcatctcacctcttttcattacaaaaaacatgtaactagtccattggataatgccgatgattcacatgacctaatctagcttatatgggtaaatgatcagctatatgtttgaacacgtaatagaatgaagtttgaatgcaagtattcttgttcaaatgttgtgaaatataaaagtttgtattacttgctttacatttcaaaatacaattgtcaaccattgaattatctgcaacatgcaagaaaaggcaaact
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatctgagaaataccttcatactaatttatgaattatggattgcatacacaacattgcttattgtgtttttaacataaaatatgcaaatgaacatattcatttttatcataaaaaatcatatttgcaaacaaacttaaaaaaaataattaatcatttcaaagtaataaccatctgctccaagatcaatacacattttaaccaacaagggaatgcacagacatgtgaacctttccccatatgtatC-TA--G-AA---A-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------CA-AATTCAAA-------G---A-TCGAT----A--C----A------C--------A--------T---------------G-TAA----AG--A-A-----A-C-A---------G--TGCGATGC----AAA----GATACTTTACAC-G-TAAT-C-C----TC-TTTCATG--T-----AC-AT--GTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtatgttgagcatcaatact-TTTCTCT--CTCC-AAATGTTGTTTAG-AATATTAAAGCA-C-TGCGGA-----------TTTTA-TATTTCAAAGCA--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGATGTTAT--TGCAAC-ATAAAA--GAAAACACATGCTTCATT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----ACA----G-------ACAA-G-CTAACC-C----TT-TTCAATG--------AT-GCGTGTAG-TT-T-TGT-TTGA-T--AT-AGA-A-GC---------AGA-------------G--CA---------GATAGATGTATTACATTT-ATA------TAAGC-----CAT-C-AACAT-CAAtc
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --C-------CTCCATACGTA---------A--TAG---ACGAT---TG---A--AAA-AGA----AAATCG-GTA----C-A----CAT------CTCGC-T--TAT--CCTTGAGTTC-GTATTTT---GCAA-----A-T---GCAG-C-----CGT---------A-GTC-AAAAA--CT-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gCCGCGATATA--C-------TTCCATATGTA---------A--T------T--TA--TG---TCTAGG-AGA----AAATAA-ATT----C-C----TAT------CTCGC-A--TGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggaatgccgcggtatctattTAACGCCGCGGGTTT---A-TATTTCAA---A--AACAACA---ATTGTCAACC-TTATAGATTATTCTGCTAA-ATCCAC--GAAAGTGCAAACTTTATT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aat-T-TGGACT--GC-GTAAT-CC---------A-A-------------G--TG---------G--------------TTG-ATA------TAATT-----CGT-C-AATAT-CAAACT--AA----A--T----ATT--T--------GAAAGATTTTT--A-----------A-------AG----ATAGATCT------A----GAATAT--ACCtctt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCTCTG--TTTTTA-TATTTCAA---A--A----TA---TTTCTCGATC-TCTGAGTTTATTCTGCAAT-ATACAC--GAAAACGCAACCCTTCTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATATAACC-------TTTCATACGCA---------A--AA----AA--C---GG---ATTATG-AGGG---AAATTT-ATC----CTA----CAC------CTC-C-T--TACTGGC-----TTC-TTGCTTTAATGCTA-----AAT---ACAA-C-----AAC----AT--AA-G-C-GATAA--CTTAAT-A-TT----CATAAT-T-ATATCA-T-A-A-TTG--A------------AA-----A----A-------AT---AAT-C--AGTTTACTCTGCA---------AT-------G------AA-----G---------------GGT-TTCAATAA-AGGT--G---AC-T---G-AA---A-AAGGGAACTGGCCGAAGCT-----AC---------TAT----A----C-A---TT-----------A--CAT------------G---------T----A--C----A------C--------A--------T------G----------TAA----A---C-A-----AGC-AT--------G--GG-AATAC----ACA----G-------CCAA-G-TTAATC-C----TC-TTCTACG--T-----A--GT--GTAA-TT-TTC-T-TGGAAT--GT-GTA-T-CC---------A-AAGCACATTGAA--G--CA---------G--------------TTG-ATA------CAATC-----CGT-G-GAGAC-CAAACT--AA----A--C----ACT--T--------GA-----------AATATTTTTGTCA-------AA----ATAAATC--------------------GCGCT--C----A-----C--C----------T------TTT-T-C-TTCG-GCAAA-A--ACGCG---T--GT-----A----TCCC---T---ATTACAT---CCGCTGCGG-TAACTACC-ATGACG-TC-AC--G---GTAACCT----AATA---C--GCAACT-GTAT-tctt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttA---A--A----CA---TTTCCTGACC-TCAGAGGTTA--CTGCAACTATCCAT--GAAAATGTAAACTTTATTaagta
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AC------TG---ATGATG-AAA----Atcttgaattgaagtcaaattttaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatcccaaagaccaaaggaataccacggtcaatattGAATTATATAAGCC-CTGGTTAATGTTTCGGCTTCT-----ATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TCTGAGGT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---TTTCTCAACT-TCGGAAGTTATCCTGCAAT-ATGTACAAGAAAACGCAATCTTTATT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATTTCAA---A--A----CA---TTTCTCGACC-TTGGGGGTTAtcta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGATATA--C-------CTTCATACGTA---------A--TA----AA--TG--TG---ATTGTG-AAA----AAGTTG-ATA----C-A----agaaaacgcgaacctctga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgCTGCGATGTA--T-------ATTCATAGGT----------------------------G---ATTACG-AGA----ACATTG-ATATTTGC-A----CAT------TTCGC-C--TGG--AT----------------------------A-T---ACATTC-------T----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAT-CATT----CA--AA-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----T----A-------TT---t
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                         aatgacttacagtaaacagtgatggtctgttttcctgatgttctgttatacaacggacttgtggctctgcaataacatgccctattgttgtacttcctgtttgctctcactgtcaacgcagactgggttcctgcattggtcactccagtggttagtgtgtcatctccacatacccagctccacgtgatggaagggttaccgagggtggacaaggtacaacgtaagctaatgaactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgtcagttgtggggcggcaaggggtgcgtctattgaatcaacatttataagcagtaatcactatgtacatgtacttgacaatgtattctactaagattattgtagagatcaaaggaatgcattattCTGCAATATA--CACTGTACCTTCATATGTA---------A--TT----AC--T----A---ATTATGGAGA----AAATT--ATG----T-ATCTCCAG------CTCAT-T--TGC--GC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ATAT-C------AT----T---AA-GTCGGGTAA--CT-GAT-TATT----CA--AT-T-TTA-GA-T-CAA-T----G------------AA-----A----G-------TA---AAT-AT-A-----------C---------AT-------G-------T-----A----------CTTGTATT-TT--GCAA-A--T--G---AC--A--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAATCTGCA--T----T------CCAAGGCCTA--------TACACA-A--------G-TAA----A---CAA-----A-C-AT-----------AGCAATGC----ACA----G-------ACAA-GTTTAATC-C----TC-TTCCACT--T-----AA-AT--GTAG-AT-T-T-T-T--------------T-TC---------A-A-----------------------------------------------------------------CAT-CAAACATGAAAACTTGAA----A--T----ATT--T--------TT-----------C-----------A-------AA----ATATTTCA------A----G--TAT--ACCCTA-------------------------------------T-C-ATCA-ACAAA-AGCA---AT--C--CTG----A----GGTC---T---A----GT---TCATTTTGG-AAcgctattacataatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taattgtttttgcggaattctatcacagctgcaaatatataatggaaagatcaaaggaatgccagggtccgtattATA--C-------CTTCATATGTA---------A--AA----AC--T----G---ATTATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--TC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-CTGTACAAT----A---AA-GTC-AGTAA--CT-TAT-AATT----CA--AT-T-TCACAA-T-C-A-T----G------------AA-----A----ACA-----TT---AAT-C--A-----------TT--------AT-------G-------------------------------TGCT--GCAA-A--T--G---AA-TT--G-------------------------------------------T-C----AG---C-A---TT-----------C--CGA------------G---A-TCAAC----A--CAGACTGG----T--------A--------T------GTGAT----G-TAA----G---C-A-----AAC-AT--------G--G-TGATGT----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-CC---TC-ATCCATT--C-----GT-GC--TTAG-TT-TTC-T-AAGACT--GT-GTA-T-TC---------A-AA------------G--TA---------G--------------GTG-ATA------TAATC-----AGT-C-AAAAT-CAAATT--AG----A--T----ATT--T--------GA-----------AATATTTTTC--A-------AA----ATAGATCT------ATACGG--TAT--ACCCAACT----A-----T--CCC---C--T-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A--AAT-A---T--GT-----A----TGCC---A---A----GT---CTGTTTCcatacatgtatatatcttaggtagcaccttttcatatgtaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaaaaaaagactagcacaaacatgataatattacaaagcaatttgacaatagtcattttatcagttattgcaaagaacaaaggaatgttgcagtcaGCAATATA--C-------AATCATACGTG---------A--TATTTTAC--T----G---ATTATG-AGA----AGATTG-A------C-A----CAT------GTC-C-T--TAA--CC-----TTC-GTGTTTC---GATA-----A-T---ACAA-C-----ATT----A---A--GTC-GGTAA--AG-GAG-AATT----CA--CT-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----AATACA-------TT---AAT-ATCT-----------A---------TT-------GCA----AA-----A----------C---AAATCTC--AT-A-A--T--G------CT--G-AA-----AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAAT----CGTC----TA-----C--------A--------T------T--------C-CGAGATTA---C-------A-C-AT-----------AGCGATGC----ACA----G-------ACAAGG-TCAA-T-CACTTTG-TTCCACG--T-----TT-GT--GTAGTTT-T-C-T-TGGACT--GC--T--T-TG---------A-ATGT----------G--TA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AA-AT------------------------TT--T------------------------------------------------TATTTTT------A--------AT--ACCCTACA----A-----T--CTC---A--C-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAA-A--G---G---CATGT-----A----GGCC---T---A----AT---CCGTTTCAG-ACA---TC-ATGACG-TC-AC--G---TCGACGC----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-t


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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGTACTTACAGTATACAGTGACGGTCTGTGTTGCTGACGTCCTGTTATACGACAATGACGGTCTTGGACTCGTGGCTCTACAATGACACGTTTTCTGGTTGTACTTTCTGTCTGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGGGTCCCCGTATTGGTCACTCCAGTGGTCAGTGTGTCATCCCCACAGACCCAGCTCCAGTTGATGACAGGGTTACCCAGTGAAGACAAGGTACATCGTAATATAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATTCACCAGCTGTCAGTTGTGGGGTGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|16 ): ACTTACAGTATACAGTGATGGTTTGTGTTGCTGACACCCTGTTATACGACAATGACTGTCTTGGACTCGTGGCTCTACACTGACAGGTTCTCTGGTTGTACTTTCTGTATGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGTGTCCCTGTATTGGTCACTCCATCGGTCAGTGTGTCATCTCCACAGACCCAGCTCCACGTGATGGCAGGGTTACCCAGCGTAGACAAGGTACATTGTAATGTAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|42 ): AGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGCTGGGGGTGCGTCTATTGAATCAACATTCATTAACAGCAAACCCTAACTACTAGACAATGTATTTCACTAGGTTATTGTAGAAAAC
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Reference ( family-2 )        :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGCGATATA--C-------CTTCATACGTA-----A--T-----A----A--CT-G----A-TT--ATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--AC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATAA--CT-GAT-AATT----CA--AT-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-A--A-----------A---------AT-------G------AA-----A----------C---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--CAT------------G---A-TCGAT----A--C----T------C--------A--------T------G--------G-TAA----A---C-A-----A-C-AT--------G--GGCGATGC----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-C----TC-TTCCACG--T-----AT-GC--GTAG-TT-T-C-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------A-A-------------G--CA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AACAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GA-----------A-----------A-------AA----ATAGATCT------A----G--TAT--ACCCTAC-C----A-----T--CTC---A--T-T------TTT-T-C-GTCA-GC-AAAA-A----C-A----TG--TA----NG-CC---T---A----GT---CCGTTTCGG-AAACTGTC-ATGACG-TCA--C--G----G-TGACCT----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-G-TAAA-CGATNGGCTGTATATTTCTGAAC-CGTAGTAG-A-TG--A-ATTNTGGA-TGATGCAGGATAAC-TTCCT--G-T--CTTCAAATGTTGTTTTGAAATATAAAAGCCTCGGCTAACGCCTCGGCTTTTTTA-TATTTCAAA---A----CA---TTTCTCGACC-TCGGAGGTTATCCTGCAAC-ATNCAC--GAAAACGCAAACTTTATT
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gi|10                         : aaaaaaaaaaaaacacacacacaaaaaaaaaaccggaagctcaaacgttttagtaaataattctaccacgtctattgcaaagttcgaaggaataccgcggtgggttgtttttttcctggtataccttcattcgtacaattatgtacaaactgataataagaaaattgatacacttgctcttcgaggtatgctaatataacaccgataactgattgttcaagaatcaacatttaaaaatgattgattaacatttgcaattcaatataaatcaagtgtcggcgttgcgcatgtaaataaatcccattccacggatgggtagtttccttaattaagtgtaatcaatgcagttaacataatccgtcaacatcaaactaaatacttatgaaacacgtttttcaaaatagatctagtataccctaccatctcacctttttcgtgggcaaataaacgtatcggatactgacatgacgtcataaagtcttaggttgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattaaaaaaaaaactgactaggaATACA--C-------CTTCATACGTA-----A--T-----A----A--CT-G----A-TT--ATA-GGA----AAAT--------------------------CTCAT-T--AGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-TGATATAAAC-----AAT----A---AA-GTA-GATA-----------------------C-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AG-----A----A-------AT---AATCA--A-----------A---------AT-------ATGTGACAA-----AT---------C---AAAT-CT--ATAA-A--TTTG---TCATT--G-AA---T-AA----------------G-----AT---------T-TAATCGT---C-AGCATT-----------G--CGA------------G---A-TTGAT----A--C----C------C--------A--------T------G----------TAA----A---C-A-----AAC-AT--------G--G-CGATGTCTAGACA----ATT-----ACAA-G-TTAA-C-CC---TA-TTCCACG--A-----AT-GT--GTGG-TT-T-C-CCTCGACA--AT-ATA-T-TC---------A-AA------------G--CA---------G--------------TTG-ATA------TAGTC-----CAT-C-AACAT-CAAACT--AA----G--T----A-T--T--------CA-----------A-----------A-------AC----ATAG--CT------A----G--TAT--ACCCTAC-C----A-----T--CTC---A--CCT------TTT-T-C-TTCA-GC-AAAA-AT---C-A----TG--TA----GG-CC---T---A----TT---CCGTTTCGG-AAACTTTC-ATGACG-CTA--C--G----ATTGACCT----TATT---G--GTAGCT-GTATAG-G-TAAtctg
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTT---GCCA-----A-T---ACAA-C-----TAT----A---GA-GTC-GATAAAGCT-GAT-AATT----CA--GT-T-TTATGG-T-A-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-ATTT-----------G---------TT-------GCA----AA-----A----------T---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---AC--T--G-AG---G-AA----------------C-----ACATAAGTCAAT-C----GTCTAC-A---TT-----------C--TAA------------G---A-TTGAT----G--C----A------C--------A--------T---------------A-TAA----A---CAA-----A-C-AT--------G--TA-GATGC----ACA----G-------ATGA-G-TTAA-C-------C-TTCCACG--------A--------AG-TTAT-C-T-TGAATT--GT-GTT-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------G--------------TTA-ATATACTAGTAATC-----CGT-C-AAACC-CAAATT--TA----A--T----AT---------------------------------------------------ATAGTTC-------A------------ACCCCCC-C----C-----C--CCCCAAA--T-TCCTGCCTTT-TAC-GTCA-GC-AAAA-A------A----TG--TA----GG-TC---------------------------AAGCTGTC-GTGACG-TCA--T--G----G-TGACCT----AATT---C--ATAACT-AGA--G-G-TAAA-tagg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----A-T---ACAA-A-----AAT----A---AC-GTC-AATAA--CT-GATCAATT-----A--AT-T-TAATAA-T-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-C--A-----------ATGT------AT-------GTTGCA-AA-----A----------CA--AAAT-CT--ATAA-A--T--G---G--TT--G-AA---G-AA----------------C-----AT---------G-TCAGGGT---A-A---AC-----------C--AAT------------C---G-TCTAC----A--T----T------C--------A--------G------G--------GATAG----A---T-AC----A-C-AT------------GC-ATGC----CTA----G-------A----------------------TGCACA--C-----A------GT---TT-T-C-T-TGAAC----T-GTA-T-TCA--------A-A-------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----AGT-C-ATCAT-CAAACT--AA----A--T----ACT--T--------GATTGTTTTTTT-G-----------G-------TT----GTAGAT-T------A----C--AGT--ACCCTA--C----A-----T--TTC---A--T-C------CTTGT-C-GTCT-GC-AAAA-A----------------A----AC-CC---T---GT---GT---ACAT---GT-AAACTGAC-ATGACA-TCA--C--AGCGCG-CGACCT-----ATT---C--GTAATG-GTAT-A-G-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTT---ACTA-----C-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-TATAT--CT-AAT-TATT----CA--AT-T-TTATAC-T-C-T-T----A------------AA-----A----A-------TT---AAT-C--A-----------AT--------AT-------GTGTT--GA-----A--------------AAAT----------A--T--G----T-TT--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AAT------------ATAAA-TCAAT----C--A----T------C--------A---------------------------AA----ATTCC-A-----A-G-ATCGATATCAA--GGCGATGC----ACA----G-------AGAA-G-TTAA-C-C-----C-TTTCA----------------------TT-T-C-A-TGGACT--GT-GTGGT-TC---------A-AA------------G--CA---------T--------------TTG-ATA------TAATC-----TGT-C-AACAT-CAAACT--AAGAACA--T----A-T--G--------GA-----------ATATTTTTC---A-------AA----ACAAATCT------C----G--CAT--ACCCCAT-C----A-----C--CTC---A--TAT------TTT-T-C-GTCA-AC-AAAA-T----C-A----TG--CA----GG-CT---T---A----GT---CCGTg
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgtgttttgcaaat--AT-TATTATAA-A-C-A-T----A------------AA-----A----A-------TT---ACT-A--A-----------ATACATGTATAT-------GTTGGA-AA-----A----------C---AATT-TT--ATAA-A--T--G---AC--T--G-AA---A-AA----------------T-----AG---------T-T----GG---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAATC---AT-C----TG-----C--------A--------TTGTGAGA--------G-TAAT---A---C-AGGT--A-CGGT--------T--GGCGATGC----ACA----A-------ACAA-G-TTAA-C-CT---TC-TTTCATG--T-----CC-GT--ATAG-TT-T-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatcaggcaaacaaaataaacatatataccacCTGCAATATA--C-------CTTCATACGTA-----A--T-----A-------CT-G----A-TT--ATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----TATATA---TTCTG-T--TAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A-----AC----------------------------------CT---T-AAGT----CA--GTGT-TTATAATT-T-A-T----A------------AA-----C----A-------TT---GAT-G--T-----------T---------GC-------A------AA-----A----------C----AAT-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---tc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tggttatgcaaaggcattataG-ATT----C-A----CAA------CTTAC-T--TGC--AT-----TTCCGTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-C-----AAT----G---AA-GTC-GATAG--AT-AGT-AGTT----TA--AT-T-ATATAA-T-C-A-TTTTAA------------AA-----A----A-------TC---AATCA--A-----------A---------ATATGTAGCA------AA-----A----------C---AAAT-CT--ATAT-A--T--AT--AA-TC--T-AG---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GC---T-A---TT-----------C--gtaattcaata
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aa-----TTC-GTGTTTT---GGTG-----A-T---ACAA-C-----AAT----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAC-AATT----CA--AC-T-TCATAA-T-C-attctaaagtcatacgccggtttcgaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caatatatcacattctaccaaagttattgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCACTGTA--C-------ATTCATACGTG-----A--T-----G----A--AT-G----A-G-----G-AAA----AAATTG-ATAATTAC-A----CCT------ATCAC-C--TGC--AC-----TTT-GTGTTTT---GCAA-----A-T---ACCA-C-----AAT----A---AA-GTC-GATCA--CT-GA
gi|30                         :                                                                                                                                                      gttcaggaaatgtacttacagtatacagtgataacctgtgttcctgacgtcttgttatacgaaaatgacggtcttggactcatggctctacattgacacgttctctggttgtactttctgtctgttgtcaagttctttactgactgggtccccgtattggtcactccagtggtcagtgtgtcatctccacagacccagctccacgtgatggcagggttacccagcgtagacaaggtacatcgtaatgtaatggactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgttagttgtggggcggcagggggggcatctgtttaatcaaaattcagtatttttctgggtaatcccaatgcttttctaaaatgggaaatttgttagaaaactacgaacacctagacaaagtattctaccatggctactctataaaaatgcagcagtcattattctgcaatgCCGTGATTTA--C-------ATTCATGTGTA-----A--T-----A----A--CT-GTCTGA-TT--ACG-AGA----AATTTG-ATA----C-A----TAggggaatctatttttttctaaatatttcccattata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atggccctagcatagatgaaaggaattccacagtcattactATGC----ATA----G-------ACAA-C-TTGA-T-C----CT-ATACACG--T--------GC--ATAG-TT-T----------T--GTTGTA-T-TC---------AGA-------------G--CA---------GATCAAATTGATTCATTG-ATA------TAAAC-----CGT-C-AACAT-CAAACC--AA----A--T----ACCG-T--------CA-----------A-----------A-------------------CT------A----G--TATAGACCCTAG-CTATTA-----T--TTG---AC-C-T------TTT-T-C-GTCA-AC-TAAA-gagttatgtttataacacggataataggtgtttgaccctcaaaaggataatcatatttgaca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGA-TGATGCTGAATAAC-CTC----G-A--CTTGA----TTTTTTTAAAATATAAAAGTCTCGGCTAACGCTTCGGCTTTT----------GCA---A----CA---TTTCTAGACC-TCAGAGGTTATCATGCAAC-ATCAAC--GAAAATGTGAATTATGTT
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tattactgcaaagttcaaaagaaagccactgtcgttattctgtgctT-A--A-----------A---------AT-------TCAC---AG-----A----------C---AAAT-TT--ATAA-A--T--G---GC--T--G-AA---G-CA----------------T-----AT---------C-T----GA---C-A---TT--------------CATCTAAAA------G---A-TCAGT----G--G----T------CTGA-----A--------TTCCGA-G--------A-TCA----A---T-------A-C-AT--------GTAAACAA-------ACACTCTG-------ACAA-G-TTGA-CTC----TC-TCCCACG--
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acagt-T-TGGACT--GT-GTA-T-TC---------AGA-------------A--CA---------GCGTCGCA-------TTG-ATG------TACTT-----CAT-C-AACAT-CAAACA--GA----A--TCTCAACT--TTTTTGCCAGA-----------A-----------A-------AA----Aa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tca----A-----T--CTC---AA-C-T------TTT-T-T-GCCA-GA-AAAA-AAAAAC-A---------A----CA-CCACAT---A----TT---CTGTCTCGG-AA---GTT-ATGACG-TCA--aaaacaacaccacatattctgtctcggaagttatgacgtca
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcattggactgtgtattcagaacagcgtcgcattgatgtacttcatcaacatcaaacaga----AAATTG-ATA----C-A----TAT------ATATC-TGTTAC--AC-----CTC-GTCTTTT---GCTA-----A--------A-C------------------------------CT---T-AAGT----CA--GT-G-TTATAT-T-T-A-T----A------------AA-----C----A-------TT---GA---------------------------AT-------GTTGCA-AA-----A----------C---AA-T-TT--ATAA-A--T--G---AC-TT--G-AA---G-AG----------------T-----AT---------T-T----GT---
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agCTGAGAAATA--C-------CTTCATAC-TA-----A--T-----T----T--AT-G----AATT--ATG-G--------ATTGCATA----C-A----CA----------ACAT--TGC--TT-----ATT-GTGTTTT-----TA-----A-C---ATAA-------AAT----ATGCAA-AT--GA--A--C---AT-A-TT----CA--TT-T-TTAT-----C-A-T----A------------AA-----A----AATCATATTTGCAAAC-A--A-----------A---------CT-------T------AA-----A----------A---AAAA-TA--ATTA-A--T--C---AT-TTC-A-AA---GTAA----------------T-----AA---------C-C----AT---CTG---CT-----------C--CAA------------G---A-TCAAT----A--C----A------C--------A--------T------T--------T-TAA----C---C-A-----A-C-AA--------G--GG-AATGC----ACA----G-------ACAT-G-TGAA-C-C----T--TTCCCCA--T-----AT-GT--ATAgtaattc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatACAT-CAAACT--AA----A--------CC--G--------GG-----------G-----------G-------TATTCTATTAATCT------G----G--TA-----CCT-T-C----A-----T--CTC---ACCT-C------TTT-T-C-ATTA-CA-AAAA-A----C-A----TG--TA----A---C---T---A----GT---CCATT--GG-ATAATGCCGATGAT--TCA--C--A------TGACCT----AATC-------TAGCTTATAT-G-GGTAAA-TGATCAGCTATATGTTT--GAACACGTAATAG-AATG--A-AGTTTGAA-TG---CAAG-TA---TTCTT--G-T----TCAAATGTTGT---GAAATATAAAAGTTTGTATTA----CTTG----CTTTA-CATTTCAAAAT-A----CA---ATTGTCAACCATTGAA--TTAT-CTGCAAC-ATGCAA--GAAAAGGCAAACTcatcaaactaaaccgggggtattctattaatctggtaccttcatctcacctcttttcattacaaaaaacatgtaactagtccattggataatgccgatgattcacatgacctaatctagcttatatgggtaaatgatcagctatatgtttgaacacgtaatagaatgaagtttgaatgcaagtattcttgttcaaatgttgtgaaatataaaagtttgtattacttgctttacatttcaaaatacaattgtcaaccattgaattatctgcaacatgcaagaaaaggcaaact
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattgcaaagataaaaaaaagctgcgtccatatctgagaaataccttcatactaatttatgaattatggattgcatacacaacattgcttattgtgtttttaacataaaatatgcaaatgaacatattcatttttatcataaaaaatcatatttgcaaacaaacttaaaaaaaataattaatcatttcaaagtaataaccatctgctccaagatcaatacacattttaaccaacaagggaatgcacagacatgtgaacctttccccatatgtatC-TA--G-AA---A-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------CA-AATTCAAA-------G---A-TCGAT----A--C----A------C--------A--------T---------------G-TAA----AG--A-A-----A-C-A---------G--TGCGATGC----AAA----GATACTTTACAC-G-TAAT-C-C----TC-TTTCATG--T-----AC-AT--GTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtatgttgagcatcaatact-TTTCT--C-T--CTCCAAATGTTGTTTAGAA-TATTAAAGC----ACTG------CGGATTTT--A-TATTTCAAAGCAA----CA---TTTCTCGACC-TTGGATGTTAT--TGCAAC-ATAAAA--GAAAACACATGCTTCATT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----ACA----G-------ACAA-G-CTAACC-C----TT-TTCAATG--------AT-GCGTGTAG-TT-T-TGT-TTGA-T--AT-AGA-A-GC---------AGA-------------G--CA---------GATAGATGTATTACATTT-ATA------TAAGC-----CAT-C-AACAT-CAAtc
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --C-------CTCCATACGTA-----A--T-----A----G--AC-G----A-TTGAAAA-AGA----AAATCG-GTA----C-A----CAT------CTCGC-T--TAT--CCTTGAGTTC-GTATTTT---GCAA-----A-T---GCAG-C-----CGT---------A-GTC-AAAAA--CT-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gCCGCGATATA--C-------TTCCATATGTA-----A--T-----T----T--AT-G----T-CT--AGG-AGA----AAATAA-ATT----C-C----TAT------CTCGC-A--TGA--AC-----TTT-GTGTTTT---GCTta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggaatgccgcggtatctattTAACGCCGCGGGTTT---A-TATTTCAAA---AACAACA---ATTGTCAACC-TTATAGATTATTCTGCTAA-ATCCAC--GAAAGTGCAAACTTTATT
gi|48                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat-T-TGGACT--GC-GTAAT-CC---------A-A-------------G--TG---------G--------------TTG-ATA------TAATT-----CGT-C-AATAT-CAAACT--AA----A--T----ATT--T--------GAAAGATTTTT--A-----------A-------AG----ATAGATCT------A----GAATAT--ACCtctt
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCCTCTG--TTTTTA-TATTTCAAA---A----TA---TTTCTCGATC-TCTGAGTTTATTCTGCAAT-ATACAC--GAAAACGCAACCCTTCTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATATAACC-------TTTCATACGCA-----A--A-----A----AA-CG-G----A-TT--ATG-AGGG---AAATTT-ATC----CTA----CAC------CTC-C-T--TACTGGC-----TTC-TTGCTTTAATGCTA-----AAT---ACAA-C-----AAC----AT--AA-G-C-GATAA--CTTAAT-A-TT----CATAAT-T-ATATCA-T-A-A-TTG--A------------AA-----A----A-------AT---AAT-C--AGTTTACTCTGCA---------AT-------G------AA-----G---------------GGT-TTCAATAA-AGGT--G---AC-T---G-AA---A-AAGGGAACTGGCCGAAGCT-----AC---------TAT----A----C-A---TT-----------A--CAT------------G---------T----A--C----A------C--------A--------T------G----------TAA----A---C-A-----AGC-AT--------G--GG-AATAC----ACA----G-------CCAA-G-TTAATC-C----TC-TTCTACG--T-----A--GT--GTAA-TT-TTC-T-TGGAAT--GT-GTA-T-CC---------A-AAGCACATTGAA--G--CA---------G--------------TTG-ATA------CAATC-----CGT-G-GAGAC-CAAACT--AA----A--C----ACT--T--------GA-----------AATATTTTTGTCA-------AA----ATAAATC--------------------GCGCT---C----A-----C--C----------T------TTT-T-C-TTCG-GC-AAAA-ACG--C-G----TG--TA----TC-CC---T---ATTACAT---CCGCTGCGG-TAACTACC-ATGACG-TCA--C--G----G-TAACCT----AATA---C--GCAACT-GTAT-tctt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catgattattgcaaaaatgatcaagaatagaaaaatgccgcggccattagatttttgcaagtattttAA---A----CA---TTTCCTGACC-TCAGAGGTTA--CTGCAACTATCCAT--GAAAATGTAAACTTTATTaagta
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTGTGATATA--C-------CTTCATACGTA-----A--T-----A----A--CT-G----A-TG--ATG-AAA----Atcttgaattgaagtcaaattttaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatcccaaagaccaaaggaataccacggtcaatattGAATTATATAAGCCCTGGTTAATGTTTCGGCTTCT-----ATTTCAAA---A----CA---TTTCTCGACC-TCTGAGGT
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---TTTCTCAACT-TCGGAAGTTATCCTGCAAT-ATGTACAAGAAAACGCAATCTTTATT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTA-TATTTCAAA---A----CA---TTTCTCGACC-TTGGGGGTTAtcta
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTGATATA--C-------CTTCATACGTA-----A--T-----A----AATGT-G----A-TT--GTG-AAA----AAGTTG-ATA----C-A----agaaaacgcgaacctctga
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgCTGCGATGTA--T-------ATTCATAGGT--------------------------G----A-TT--ACG-AGA----ACATTG-ATATTTGC-A----CAT------TTCGC-C--TGG--AT----------------------------A-T---ACATTC-------T----A---AA-GTC-AACAA--CT-GAT-CATT----CA--AA-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----T----A-------TT---t
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                         aatgacttacagtaaacagtgatggtctgttttcctgatgttctgttatacaacggacttgtggctctgcaataacatgccctattgttgtacttcctgtttgctctcactgtcaacgcagactgggttcctgcattggtcactccagtggttagtgtgtcatctccacatacccagctccacgtgatggaagggttaccgagggtggacaaggtacaacgtaagctaatgaactgtccttcatccactgacgtagatccatcagctgtcagttgtggggcggcaaggggtgcgtctattgaatcaacatttataagcagtaatcactatgtacatgtacttgacaatgtattctactaagattattgtagagatcaaaggaatgcattattCTGCAATATA--CACTGTACCTTCATATGTA-----A--T-----T----A--CT-A----A-TT--ATGGAGA----AAATT--ATG----T-ATCTCCAG------CTCAT-T--TGC--GC-----TTT-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ATAT-C------AT----T---AA-GTCGGGTAA--CT-GAT-TATT----CA--AT-T-TTA-GA-T-CAA-T----G------------AA-----A----G-------TA---AAT-AT-A-----------C---------AT-------G-------T-----A----------CTTGTATT-TT--GCAA-A--T--G---AC--A--G-AA---G-AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAATCTGCA--T----T------CCAAGGCCTA--------TACACA-A--------G-TAA----A---CAA-----A-C-AT-----------AGCAATGC----ACA----G-------ACAA-GTTTAATC-C----TC-TTCCACT--T-----AA-AT--GTAG-AT-T-T-T-T--------------T-TC---------A-A-----------------------------------------------------------------CAT-CAAACATGAAAACTTGAA----A--T----ATT--T--------TT-----------C-----------A-------AA----ATATTTCA------A----G--TAT--ACCCTA--------------------------------------T-C-ATCA-AC-AAAA-G----C-AATCCTG---A----GG-TC---T---A----GT---TCATTTTGG-AAcgctattacataatg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taattgtttttgcggaattctatcacagctgcaaatatataatggaaagatcaaaggaatgccagggtccgtattATA--C-------CTTCATATGTA-----A--A-----A----A--CT-G----A-TT--ATG-AGA----AAATTG-ATA----C-A----CAT------CTCAC-T--TGC--TC-----TTC-GTGTTTT---GCTA-----A-T---ACAA-CTGTACAAT----A---AA-GTC-AGTAA--CT-TAT-AATT----CA--AT-T-TCACAA-T-C-A-T----G------------AA-----A----ACA-----TT---AAT-C--A-----------TT--------AT-------G-------------------------------TGCT--GCAA-A--T--G---AA-TT--G-------------------------------------------T-C----AG---C-A---TT-----------C--CGA------------G---A-TCAAC----A--CAGACTGG----T--------A--------T------GTGAT----G-TAA----G---C-A-----AAC-AT--------G--G-TGATGT----ACA----G-------ACAA-G-TTAA-C-CC---TC-ATCCATT--C-----GT-GC--TTAG-TT-TTC-T-AAGACT--GT-GTA-T-TC---------A-AA------------G--TA---------G--------------GTG-ATA------TAATC-----AGT-C-AAAAT-CAAATT--AG----A--T----ATT--T--------GA-----------AATATTTTTC--A-------AA----ATAGATCT------ATACGG--TAT--ACCCAAC-T----A-----T--CCC---C--T-T------TTT-T-T-GTCA-GCAAAAA-A----T-A----TG--TA----TG-CC---A---A----GT---CTGTTTCcatacatgtatatatcttaggtagcaccttttcatatgtaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaaaaaaagactagcacaaacatgataatattacaaagcaatttgacaatagtcattttatcagttattgcaaagaacaaaggaatgttgcagtcaGCAATATA--C-------AATCATACGTG-----A--T-----ATTTTA--CT-G----A-TT--ATG-AGA----AGATTG-A------C-A----CAT------GTC-C-T--TAA--CC-----TTC-GTGTTTC---GATA-----A-T---ACAA-C-----ATT----A---A--GTC-GGTAA--AG-GAG-AATT----CA--CT-T-TTATAA-T-C-A-T----A------------AA-----AATACA-------TT---AAT-ATCT-----------A---------TT-------GCA----AA-----A----------C---AAATCTC--AT-A-A--T--G------CT--G-AA-----AA----------------T-----AT---------T-T----GT---C-A---TT-----------C--AATATA---------A---A-TCAAT----CGTC----TA-----C--------A--------T------T--------C-CGAGATTA---C-------A-C-AT-----------AGCGATGC----ACA----G-------ACAAGG-TCAA-T-CACTTTG-TTCCACG--T-----TT-GT--GTAGTTT-T-C-T-TGGACT--GC--T--T-TG---------A-ATGT----------G--TA---------G--------------TTG-ATA------TAATC-----CGT-C-AA-AT------------------------TT--T------------------------------------------------TATTTTT------A--------AT--ACCCTAC-A----A-----T--CTC---A--C-T------TTT-T-T-GTCA-GC-AAAAGG----C-A----TG--TA----GG-CC---T---A----AT---CCGTTTCAG-ACA---TC-ATGACG-TCA--C--G----T-CGACGC----AATT---C--GTAGCT-GTAT-G-t
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATGTACTTACAGTATACAGTGACGGTCTGTGTTGCTGACGTCCTGTTATACGACAATGACGGTCTTGGACTCGTGGCTCTACAATGACACGTTTTCTGGTTGTACTTTCTGTCTGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGGGTCCCCGTATTGGTCACTCCAGTGGTCAGTGTGTCATCCCCACAGACCCAGCTCCAGTTGATGACAGGGTTACCCAGTGAAGACAAGGTACATCGTAATATAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATTCACCAGCTGTCAGTTGTGGGGTGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|16 ): ACTTACAGTATACAGTGATGGTTTGTGTTGCTGACACCCTGTTATACGACAATGACTGTCTTGGACTCGTGGCTCTACACTGACAGGTTCTCTGGTTGTACTTTCTGTATGTTGTCAAGGTCAGCACTGACTGTGTCCCTGTATTGGTCACTCCATCGGTCAGTGTGTCATCTCCACAGACCCAGCTCCACGTGATGGCAGGGTTACCCAGCGTAGACAAGGTACATTGTAATGTAATGGACTGTCCTTCATCCACTGACGTTACAGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGTAAGGGGGGCATCTGTTTGATTGAAAAGTTATAAG
Unaligned ( gi|42 ): AGATCCATCAGCTGTCAGTTGTGGGGCGGCTGGGGGTGCGTCTATTGAATCAACATTCATTAACAGCAAACCCTAACTACTAGACAATGTATTTCACTAGGTTATTGTAGAAAAC
Unaligned ( gi|43 ): ATACATACATATGCACATACACACAGTTTGCTCGTATACATGCATACAAACATTTGCATAAATTTGATCAATCTTATACAATCTGGATAATTCTGGTTTGTTTTTCAGGTTG
Unaligned ( gi|52 ): TATTGTAAGGATCAAGGAATACCATTGTCATTATTCTGTTACATATACTTTTAAATACGTAAGAACCGTTAAT
Unaligned ( gi|57 ): TAATTCTACCACGGCTATTGCAAAGATCAAAGAAACCCCGC