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Reference ( gi|3 ) : GCAGTCCACCC-CAG------TGTGATG-TCA--AC-A--TTTTG---AAAAATC-A--TAG-ATT--T---AT--CTA--GAT---TTATCC---------ATGA------------T--AG--------------ATACATA-AA--T---TT-G-----AT---G-GA--------------T-----------TT---------------G---------TT-------G-----T----AAA---A----A--------AAAATC----TTGT-----TAAACAT-------GA-AATA-T----TTTAAAAGACTA---C--AAGT-TA--------TATATG----A-AT----A--ATC-A--T--TGATAT---GTTT--T-AAAACC---TTGAAT------C-CAA-GGGCA--A--T-A------GCT--CTATTT-T-A-ATTGA--T----TTCTT-----TA--G--AAGGTCCA-T--TTAA-----TA-TGT---GAT-A-GG--------T-T--C----C--TT-T-ATTTTTCC----CACACATT-----TA--GT--AT---AT-C--TTTGT-A--ATA------AAAACA-G-TTTC--A-TG-ATATT-C-----T-T--ATTAACA-CT-AT-C-----A--TA-T--CA--T-------TA-----T-AG-C-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--AT--AA--------TGCT--GC-----TT-----AAGGAAAA--GTA-G-A------ATTTCCTG-G-CGTTGA-T--A-TATA-----ATT-T-TGT-------------T-T----ATGCA----T--GTTTCACA-TCTTA-AA----AAGT--------G-T--A-AT----A-A---C--TT-A-C------ATATT--T-T--ATTT----CA---TAATTT----ATTA-CTTTT--AA--C-CC---TAGCAA-ATGG------A--A--AT-G--A---TA-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAGCT-TA-T-AATGGGAGTA
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gi|52 : taaagtagcTCCATCC-TCG------TATGGTG-TCATCAG-A--TTTTG---CAAAATC-A--ctagaaacttt
gi|5 : ttaaagtaat------TGTGATG-TCACAAG-A--CTTTG---GAAAATC-A---------------AT-------GAT---TTACAC---------ATGA------------T--AG--------------GACCATC-AA--T---TTTG-----TT---G-GAGTGT----------T-----------TTCCGATA---------G---------AT-------G-----T----CGC---A----C--------AAAATC----TTGT-----TGAACAT-------AA-AATG-T----ATCAAAAGTCCG---C----GT-TA--------GATTTA----A-AT----A--ATT-A--A--AGATAT---GCTT--C-AAAATA---TTGCAA------C-CAA-GGGCA--A--G-A------ACT--CTGTTT-C-C-ATTGA--T----T-------------------ATC----------------A-TGT---GAT-A-GG--------T-T--TT---C--TT-T-ATTTT------------------------GT--AC---AT-T--TTTGT-A--A-A------AAAAAA-G-TTTC--A-TG-AAATA-G-----T-T--ATGAATA-CA-AT-C-----A--TG-T--CA--TAA-----TA-----TCAA-C-CTGTTTT--TGTGATAA-TAT--TG--AT--AA--------AGCT--GT-----TT-----ATGGAAAA---CA-GCA------ATTCTCTG-A-CATTGA-T--A-TATG-----ATT-C-TGT-------------T-T----ATGAA----A--GTCTTACA-TCTTA-AA----GCAT--------G-T--G-ATG---A-A---C--AT-A-T------ATATT--T-T--ATTA----GA---TAATCT----ATTA-GTTTT--AA--C-TC---TGATAA-ATatgg
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gi|9 : agcagttacaatttcaGTGACG-TCAT-AC-AA-TTTTG---CAAAATC-A--CTT-ATT--T---AC--GTA--GAT---TTATGC---------ATG---------------------------------TACATACAA--T---TT-G-----TT---G-GA--------------T-----------CT---------------T---------TTCCG----A-----T----AGAT--AATGTA--------AAAATC----TTGT-----TCAGCAT-------GA-AATA-T----TTCAAAAGTCTA---T--A--T-TG--------TATTTG------AT--------TC-A--G--TGACAT---GTTT--C-AAAATA---TTGAAT------C-CAA-AAGCA--A--T-A------ACT--TTTTTT-C-A-A-TGA--T----TTTTTC----TA--T--GAAGCCCA-T-----------TA-TGT---GAT-A-GAT-------T-T--C----C--TA-T-ATTTTCCA----AACACATT-----CT--GT--GT---AT-T--TTT-------------------CA-G-TTTC--A-TG-AAGTT-G-----T-A--ATGAATA-CT-AC-T-----C--TA-T--CA--T-------TA-----A-AT-C-CAATTT----------------------T--AA--------TGCT--GT-----TT-----A----------T--G-T------ATTTCTTGCA-CTTTAACT--A-TATACATGTATT-T-TGA-------------T-TGATAATTCA----TTAGTTTCAactccccgtgtttgctgaaattcctaattatcaaatccacttttctctaattttcacagatatttttgaatcgttttgtagaagtaagtttcatgaagttgttatgaatcttattatgagataagcattaaaaaatttgatcattctgtttaaggactttctgaccttgatgttctgtgtatgtacatgtatgtctcgcatttgaaggtgtgatgaactatttttcacttgataatttattagtttttgaatttagtgaatggaaatagatatgcattctatactttgatcagatgatagtgggaatggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
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gi|7 : cactttcaacgatcatttttgataagtacatgt--------AATATC----TTGT-----TGAATAT----------AACA-T----TTCAAAAATCTAGACT--AAGT-TA--------TATAAG----A-A-----A--ATC----T--TGAAGT---CCTT--TGAAAATTG--TTGAAT------C-CC----GCA--A-----------ACT--CTGTTTAT-A-TTGGA--T----CTCCT---------------ATCTAGT--TCAT-----TA-TGT---GAC-A-TA--------T-T--C----C--TT-T-GTTTC-CC----CAGA-ATT---------GT--A----AT-T--TTT-T-A---TA------GAAACA-G-TT-C--A-AG-A-ATT-T-----T-T--TTGAATA-TTTGT-T-----A---A-T--AA--T-------T------T-AA-C-CACATTT--TGTGA-AT-AAT--TG--AT--AA--------CG-----------TT-----AAGGAAAA--TTG-C-A------ATATTCTG-A-TGCTGA-T--ATTATG-----A-T-T-TG--------------T-T----AAGTA----C---TCTTGCA-T-----------AAAT--------A-T--A-ATCAAGG-A---C--CT-A-T------A-ATT--A-C--AATT----GC---TACATT----ATTA--GTTT--AA--CTTC---TAATAA-ATGA------C--A--ATAA--A---TA-C-ATTTT------CTATACTATTA--AAAA-TA-TAAATGTGAGTAtgt
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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1992 ) : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-A-ATCANT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-----GNT-G-G-A---GT------------TT-T--------------G---------TT------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA-TN---TT---GAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT--------T--AT-A-T---G---CGAT-A----GA-T-T--C-C--TT-T-ATTTTTCA----CAGAC--A-TT------T-G----T-AT-AT--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-ATTN--TT--ATG-AATA---CT-AT-T-A---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGT-GA-AATTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------T--T-T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--A-TAC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-ATA-TATTT-T--ATTTG-A-------TAATTT----ATTAG-TTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-A-AT--A-A---TA-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-A-TNA--T-AATGCGAGTA
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gi|11 : aaattA-CCCCCCTGCGATGTCATCAG-A-TTTT--G--A---AA-A-ATCAAT---------GATT--T-TTTGTTTTT---T--GTT---TTTTAAA------GGT--ATGAT------------AGGATA--A-TG-A-----------A--T---TTT----GTT-G-G-A---AT------------CT-TTTCTGATGACT---A---------TT------G----T----AAA---A----A--------AA--TTCT-GT-TA--AACAAA-----AAA----AT-T-------A---AAAAGT--------G---T-AA-A-TTA--------TAT--AT--------------------A---A--TG---T---G-TTTCAAAA-AA---TT---GAAT------C-CA--A--GGACA--A--T-------------------T--G-TAT-CA--------------------T-G-C---A---A----TA---------T--AT-A-T---C---TTAT-A-----------------TT-T-AATTTTTA----CAGAT--A-TT------T---------T-GT--T--T---------------CA-G-TTTC--ACGA----A-ATCG--TT--ATG-AATA---CT-AT-T-T---TC-T--C-------C--T--TA-----TAAAT-CAGTTTC--TGT-GA-AATAA--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------T--T-C---AA---AGAAAAC---T-GC-C-ATT-------------T--A-TGC--------T-T------GT-------------C-T-----------CCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGTG---ATG-AC
gi|12 : aagtaattccacccca---A----G--------AAAATCTT-TT-TG--AACATA-----AA---T-AT-T-----T-T---AAATGT---CT--------------TGA--------TAT--ATT----A-ATCACAA-ATC--A---A--TAATAT---G-TATGAATG-TA---TT---GAAT------T-CA--A--GGGTT--G--TA------A-C-T--C----C--GTTTT-CTTTG-G--T----TGCT--T-T-ATC---A---AG-TCTAT------------T-A-T---G---CGAT-A----GA-T-T-------TT-C-ATTTTTCC----CA-AT--A-TTA-----T-A----T-GC-AT--T--TTTGTA-A-A-----------T-------------A-ATTG--TT--ATA-A-------------------------------------------------C-CAGTTTT--TGT-G---ATTT--TATTA---T-GA--------AGTT--G--------T--T-T---AA---GAAAAAG---T-TC-A-TATTTCTAATGTTCATT--A-TAT---GATT-C-C------GTC------------T-TAAATAATTCTATCTTATA-TCTTAAAA--------------ATTGTG---ATG-ACCTACATGT-ATA-TATGT-T--ATTTG-ATACATTGTAATTT----AAAAG-TTTT--AAA-T-C-TAATA--A-A--
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gi|14 : aT-CCA-CCCTCATATGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-A-ACCAAT---------GATT--TCATA-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATACT------------AGGAAC--A-TA-A-----------AT-T---TT-----GTT-G-A-A---GT------------CT-C------------------------TTCCAAA-T----T----AAA---ATTGTA--------AAAATCTT-AT-CA--AACACA-----AAA--TAATAT-----C-C---AAAAG-----T---G---T-CA-A-TTA--------TATACATGTATTA-ATAC--A-ATC--A---A--TCATAT---G-TGCTGAAA-TT---TT---GAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-A--C----TTAGTTTT-CA----A----------G--T-C-A-----A---AG-TCCAT------------T-A-T---G---CAAA-A----GA-TGT--T-C--TT-T-ATTTTT------CAGATTAA-TT------T-G----T-AT-AT--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-A-TTTC--ATGA----A-ATTG--TT--ATG-AATA---CT-TT-T-T---TA-T--C-------G--C--TATACATT-AAT-AAGTTTT--TGT-GAGAATTT--TG--A---T-AA--------TGCaagaaaatcaaaacgtttggaaatagtttcacaaaattcaataacaatttacaattattttt
gi|15 : gaaatTGACGTAATCAGTG-CTTTCAGATC---AA-A-TTCAA-----------ATT--T-ATA-----T---ATTGTT---TA----A------TGC--ACGAT------------AGGAAC--T-TA-A-----------AATT---TT-----GTT-G-G-----GT------------TT-TTTTTTTCAATACTTA---------TT------G----T----AAA---A----A--------AAA----T-GT-TA--A---TA-----AAAATT-GT-T-----TAC---GATAGT---ATTCAA---A-AA-GACTA--------TA---ACA----A-A-------ATC--A---T--TTA-AT---A-TTTCAAAA-TAGGATT---GAAT------G-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-TATAT-A--T----TTCT--T-T-G-CT--A---AG-TTCAT------------T-A-T---G---CGAT-A----TATT-T--C-C--TT-T-ATTGTGCA----CAGAC------------------------CT--T--TTCGTA-A-CG--AAAC----TTTTAAATGA----T-ATTG--TT--ATG-GACG---CA-AC-T-G---TA-T--C-------G--T--TA-----A-ATC-CAATTTT--TGT-GA-
gi|16 : cagcT------C-CA--AAGGGGTA--A--TC------A-G-T--C----T----------TGG-A--C----TTCT--T-C-ATC---G---AG-TTCAT--------A--AT---T---------AA-A----GA-T-TTTC-C--TT-T-ATTTT-------CAGAC--A-CT------T-GTCGTT-AA-AC--T--TTTGTGTT-AG--AAACACGCTTTC--ATGA----A-AGTG--T------------------T-T-A---CA-T-------------T--TA-----T-AAC-CAGTTTTA-TGTAAA-AATCC--TG---------A--------TGCT--T--------TTCT-T---AA---GGCAAAG---T-GC-A-ATTTGTTAACGTCAA-------AC---AATTAT-T------GT-------------T-TAT-------TGTCTCACAGTCTTAGAA--------------AATGTGAA-ATG-ACC------T-TTAGCATTTAT--ATT---A-------TG--TT----ATTGG-TTTTTCAAC-T-C-CAATAGCA-AGTTGA------AGA-ATG-A-A---TA-C-ATT-------------CTTTTATCAT-ATTCAATT-AATGCTAG
gi|17 : taaaactT-CCA-CCTTCTTTTGACTTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-A-ATCAATAGGAATATGGATT--TCATT-----T---A--G-T---CT----T------TTC---TAAT------------AGT-------TA--------------------TTGGGGGGGG-G-G-G---GT------------CT-T--------------A---------T------------T----AAA---C----A--------------------TA--AAC-------------T-AT-T-----T-C---AAA-----------A---C-AA-G-TTA--------TGT--ATG----A-AT----A-ATC--AATTA--TGATAT---G-TT---GAA-TT---CTAACAAGT------C-CATTAT-GGG----A--TA------------------T--ATTTC-CTTTT-G--T----TT-T--T-T-A-T---A---GA---CAC--------T--AT-G-TACAG---CCATGA----CA-T-T--T-T--TC-T-A-TGATCA----C---T--A--T------T-A----T-AT-AT--T--GTT------AC--AACCA-GTTTTT--GTGA----A-ATTT--TC--ATctat
gi|17 : tttgtagttaatagggactttcaagtagtTTG-A--A----TTCT--A---A-C---A---AG-TCCAT--------T--AT-------G---GGAT-A----TA-T-T--T-CCTTT-T-GTTTTTTA----TAGAC--A-CT---------------AT-GT--------------------ACA-G-C--C--ATGA----C-ATTT--TTCTATG-ATCA---CT-AT-T-A---TA-TATT-------G--T--TA-----C-AAC-CAGTTTT--TGT-GA-AATTT--TC--A---T-CA--------TGCT--catgct
gi|18 : tttgtagttaatagggactttcaagtagttccaccttcttttgacttcataagattttgcaaaatcaataggaatatggatttcatttagtcttttctaatagttattggggggggggggtcttattaaacataaactatttcaaaacaagttatgtatgaataatcaattatgatatgA-T-T--C-T--AT-T-ATTTTTCA----CAAAG--A-TT------T------T-GT-AT--------------------ACA-A-TTTC--ATAA----A-ATTA--TC--ATG-AATA---CT-AT-T-----TA-T--CATAATAAG--T--TA-----T-AAC-CAGTTTG--TGT-GA-AAATT--TA--A---T-AA--------TGCC--G--------T--T-T---AA---GGATAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACATTG------------------------------------------T-TATGCA----TGTCGCACA-TATAAGAA--------------ATTGTG---ATG-AC---------ATA-TATTT-T--ATTTG-A-------T----T----ATTAG-TTTG--AAC-T-C-CATGA--A-A--TTG------A-A-AT--A-A--------A-----------TATACTTTTATCA-----TA--T-ATTGCGA
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gi|2 : T-CCA-TCCCCATGTGAAGT-----G-A-T-------------A-A-ATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ACAATGT----------AGGTAC--A-TA-A-----------A--T---TTT----GTT-G-GGA---GT------------CT-TTTCTGACAGTGG--G---------TTAAT---G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATA-----AAA--C-AC-T-----T-T---AAAAGT---CT---C------A-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATATAGTG-TTTCAAAA-TT---TT---GAATATTGCAC-CA--AA-GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTTTCATTG-C--T----TTCT--A-T---C---A---AG-TCCA---------------------------AT---------T-T--C-C--TT-T-ATTTTTCA----CAGAC--A-TT------TTG----T-AA-AT--T--TTTGTA-A-A------CA-A-TTTA--ATGA----A-AT-A--CT--AT--AAT-----T-AT---A---TA-T--T-------G--T--AA-----T-AAC-CTGTTTT--GGT-GA-CATTT--TG--A---T-GAATCATTCATGCTCTG--------T--T-T---AA---GGAAAAT---T-GC-T-ATTTTCTGATGTTAA-TTAA-TACATGGATT-C-T------GT--------------------------GTCTCGCA-TCTT-AAA--------------AGTACA---ATG-ACC------TAATA-TATTC-T--ATTTG-A-------TAATTT----GTTAG-TTTT--AAC-T-C-CAATT--A-A--TGGATTCCAA-A-ATA-A-A---TGTC-ACATT------CTATTCTTATATCAG-G-TAA--T-AATGaatgcagct
gi|20 : TT-----A---A--GAT---CG----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-CG-A--------------------------TT-G-G-A---GT------------CT-T------------------------TT------C----C----AAT---A----G--------A---TATC-GT--A--AAAATA----------T-AT-T-----G-C---TAA--T---C----A---T-AATG-TTA--------CAT--ACG----A-G----------------A--TGACAC---G-TTTCAACA-TA---TT---GAAT------C-CA--A--AGGCA--A--GA------A-C-T-------T--GTTTA-CGTTG----T----TTTT--T-T-A-----------------------------------------TGAT-A----GA-T-T--TAC--CT-T-ATTT----------GACG-A-TT------T-A----T--T-AG--T--TTTg
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gi|21 : ttaagatcgatgcatgataggaacacgattggagtcttttccaatagatatcgtaaaaatatattgctaatcataatgttacatacgagatgacacgtttcaacatattgaatccaaaggcaagaacttgtttacgttgtttttttT-TCA-CCCTCATATGACATCATAAC-A-TGAT--GT-C---AT-A-AC--------------ATT--T--TT-----TGCAA--GATCAGTT----A------TGT--ATGGT------------AGGGAC--A--A-A-----------C--T---TT-----GTT-G-G-A---GT------------CT-TTTCCAATA------G---------TT------A----T----TGC---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATT-----GAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---T--------C-AA-G-ATA--------TAT--ATG----A-AT----T-GTC--A---A--TTA-AT---A-ATT---AA-TA---TT---GATT------T-CA--A--GGGCA--AGTTATGAAGTA-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-cgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|22 : aaggtattTG-AATA---GT-AT-T-C---TA-T--C-------T--T--TT-----A-AAC-CTGTTTT--TGT-AA-AAATTAATG------T-AA--------T--------------T--T-T--------------T---T------ATTTTCTGATGCTGA-T-----------------T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCT-TCTTAAAA--------------AGTGCA---ATG-AGC------T-CTT-AATTT-T--AGTTG-T-------TGCTTT----ATTAA-CTGT--ACC-T-C-TTATA--A-A--TTG------A-A-ATA-A-A---TA-C-GCTCT------CTATGCTTTTATCAT-A-TAA--T-AACGCGAGTAtccagatcgatagttaaagagttatgtgat
gi|23 : GTAATTCCA-CCCTCCTGTGACATCACA-----TTTT--G--C---AA-T-ATCACT---------GATT--T-GTT-----T---A--GAT---GT----A------TGC--ATGATGTATGTACATGTAGGAAG--ACTA-ATGAATATACATA--T---AT-----GTT-A-G-A---AT------------TT-T--------------T---------TTCCAATAG----T----TAATGTA----A--------AAAATCTT-GT-AA--AGCCAA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAG-----T---G---T-AA-G-TTACGTGTATGTAT--CTG----A-AT----A-ATC--A---A--TTATAT---G-TTTCATAA-AA---TT---GAAT------tagggttaaattaattcttaacatttcgactctgatttacttt
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gi|25 : gtaacatcaaattatgcatagtcttctcttgtagG-A-TTTT--G--C---AA-A-ACCGCT---------GATTAAT-ATT-----T---A--GAT---GC----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-T-----------A--TATCTT-----GCT-G-A-A---GTCCT---------TT-T--------------GCAATAGCTATT------G----T----AAA---A----A--------ATACTCT--GT-TA--AAAATA-----ACA--T-AT---------C---AAA--T---TT---A-----AA-G------------------------A-AT----A-TT-------A--T--TAT---G-----------A---TT---GATA------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C---------TTT-CATTG-G--TATAATTCT--T-T-A-
gi|26 : aaac----AAA---A----A--------ATAGTTTA-GTGTG--CATGTA-----AAA--T-AT-TACTCCT-CCCAAAAAATGACTT---T---T-AA-G-CAAA-------TAT--AC-----A-CC----A-GCC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAG-TT---TT---GAAT------C-TA--A--GGGCA--A--TA------A-T-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTTT--C-T-ATC---G---AG-TCCAT------------T-A-T---G---CGGT-ATCTTTA-C-T--A-C--TT-T-ATTTCTC
gi|27 : ---T-GC-A-ATTTTCTGACATTTA-T--G-CAC---GATT-C-T------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA----TGTCTCGCA-TCTTTGAA--------------GGTGCG---ATA-ACC------T-ATA-TATTT-T--ATTTGAA-------TTTTTT----TTTAG-TTTTTAAAT-TCC-TAAT---A-A--CGC------A-AGAG--A-A---TA-C-ACTTT-------TATAATTTTATCAG-A-TGA--T-
gi|28 : -GA-AGTTT--TC--A---A-AA--------TGCT--G--------T--T-TTAAAA---GGAAAAT---T-GA-A-ACTTTCCAATGTTGA-T------C------------------T-------------T-TATGTA----TGTCTCCCA-TCTTAAAATTGAAGTAAAAAAAAGTAC----ATG-GCC------A-AAA-TATTT-T--ATCCA-A-------TAATTC----ATTAG-TTTT--AAC-T-C-TAAAA--A-A--TGG------A-A-AT--A-g
gi|29 : T-GA-ACTTT--TG--A---T-A---------TGCT--G--------T--T-G---AA---GGAAAAT---T-GC-A-CTTGTTAGACGTTGG-T--A-TAT---GATT-C-T------GT-------------T-TATGCA----CGTCTCACA-TCTTCAAA--------------AGTGCG---Ataatttca
gi|29 : tca--AAC-T-C-TAAGA--A-A--TGA------A-A-AT--G-AATGTA-C-ACTTTAGCTCTTTATACTTTAATCCA-A-TAA--C-AATGCGAGTAactctaagaaatgaaaatgaatgtacactttagctctttatactttaatccaataacaatgcgagta
gi|3 : tcatgaacttttgatatgctgttgaaggaaaattgcacttgttagacgttggtatatgattctgtttatgcacgtctcacatcttcaaaagtgcgGCAGT-CCA-CCCCAGTGTGATGTCA--AC-A-TTTT--G--A---AA-A-ATCATA---------GATT--T-ATC-----T---A--GAT---TT----A------TCC--ATGAT------------AGATAC--A-TA-A-----------A--T---TT-----GAT-G-G-A-----------------TT-T--------------G---------TT------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATG-----AAA--T-AT-T-----T-T---AAAAGA---CT---A---C-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---T--TGATAT---G-TTTTAAAA-CC---TT---GAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------G-C-T--C----T--ATTTT-AATTG-A--T----TTCT--T-T-A-G---A---AGGTCCAT--------TTAAT-A-T---G---TGAT-A----GG-T-T--C-C--TT-T-ATTTTTCC----CACAC--A-TT------TAG----T-AT-AT--C--TTTGTA-ATAA--AAACA-G-TTTC--ATGA----T-ATTC--TT--ATT-AACA---CT-AT-C-A---TA-T--C-------A--T--TA-----T-AGC-CAGTTTT--TGT-GA-AATTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------C--T-T---AA---GGAAAAG---T-AG-A-ATTTCCTGGCGTTGA-T--A-TAT---AATT-T-T------GT-------------T-TATGCA----TGTTTCACA-TCTTAAAA--------------AGTGTA---ATA-ACT------T-ACA-TATTT-T--ATTTC-A-------TAATTT----ATTAC-TTTT--AAC-C-C-TAGCA--A-A--TGG------A-A-AT--G-A---TA-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-C-TTA--T-AATGGGAGTA
gi|30 : -AT----A-ATC--C---A--TGACAT---G-CTTCAAAA-TG---TC---GAAT------C-CA--A--GGACA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATCG-A--T----TTCG--T-C-ATC---A---TG-TCCA---------------A-T---G---CGAT-A----AATT-T--C-C--AT-T-ATTTTTCC----CAAAT--A-TT------T------T-GT-A--------TGTA-A-AG--AAGCA-A-TCTC--ATGA----A-ATTG--TT--ATG-AATG---AT-AT-C-A---
gi|31 : ct---A---T-AA-G-TTA--------TGG--ATG----A-AG----A-ATG--G---A-----------G-T-----AA-T-----T---GAAT------C-CA--A--GGGCA--C--TG------G-C-T--A----T--ATTTT-CATTT-A--T----TTCT--T-C-A-TG--A---AG-ACTGT------------T-A-T---G---TGAT-A----GATT-T--C-C--TT-T-GTT------------------TT------T-G----T-AT-A--------TGTA---------------------ATGA----A-----------------TA---CC-AT-T-A---TA-T--T-------A--T--TA-------AAC-CAGTTTT--
gi|32 : GTAATTCCA-CTTTCATGTTACGTCATATG-ATTTTT--G--C---AA-ATACCATT---------G----------------------------------A------TGC--GTGTT------------AGGAGT--A-AA-A-----------A--A---AT-----GTT-G-G-G---GTACGGTC------TT-TCCCGATA-------G---------TT------A----T----TGC---T----A--------TGATTCTT-TT-TT--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C----GAAGT---Cgttgata
gi|33 : aaaATACA-A-TTTT--G--T---AA-A-AACAAT---------TAGT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------------------------------GAAC--A-TA-T-----------A--T---TTT----GTT-G-G-A---AT------------CT-T--------------T---------CT------GATGGT----AAG---TGT--A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAG--T-AT-T-----T-C---AAAA------T---AC--T-AA-A-TTA--------TAT--GTG----A-Agaaatat
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gi|35 : GTAATTCCA-CCCTCATTTGATATCAAAAG-A-TTTT--G--C---CA-A-GTCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATAAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---CT-----TGT-G-G-AAGTGT------------TT-T--------------aaat
gi|36 : taaa-TACGTA----TGTCTTGTA-TCTTTAAA--------------A---------T--ATC------T-GTA-TATTG-T--ATT-G-AAA-----TGATTT----ATTAG-TTTA--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-A-AG--A-AA--TA-C-ATTTG------ATATACTTTTGTCAA-A-TAA--T-AATGCGAGTAccagtaatcttaagaatacaaaatacc
gi|37 : taTGATATCACAAG-A-TTTT--G--C---AA-A-TTCATT---------GAT------TT-----T---A--GAG---TT----ACCGGTGTGC--ATGAT------------AGGAACTTA-AA-A-----------A--T---TT-----ATT-G-G-A---AT------------CT-T--------------ta
gi|38 : aataacaaggatttaaacc-TT------T-G----A-AT-AT--T--TT-----A-CG--AAGCA-G-TTTC--ATGA----A-ATCA--TT--AGA-AATA---CT-AT-C-A---TA----------------------------AC-AAGGTTT--TGT-GA-AACTT--TG--T---T-TA--------TGCA--G--------T--T-T---AA---AGAAAAT---T-GTAA-ATGTTTTGGTGTTttccaatagttattggaaaaaaa
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gi|4 : TCATGTGACATCATAGG-A-TTTT--G--CAAAAA-A-ATCACT---------GATT--T-GTT-----T---A--GAT---TT----A------TTCATATGGT------------AGGAAC--A-TG-A-----------G--T---GT-----TTT-GCG-A------------------T-A--------------G---------TT------A----T----AGT---A----A--------AAAATCTT-AT---------TA-----AAA--T-GT-T-----T-A---AAAAGT---CT---C---T--C-G-TTA--------TAt
gi|4 : agcagttacaattA-G-TTA--------TA---GTA----A-AA----A-ATCTTA---T--TAAAAT---G-TTTAAAAAGTC---TC------T------C----------GTT--A--TA------A-C-T--CCCCGT--GTTTG-C--TG-AAAT----TCCTAAT-T-ATC---A---AA-TCCAC--------T----------------------------T-T--T-C--TC-T-AATTTTCA----CAGAT--A-TT------T-T----T-GA-ATCGT--TTTGTAGA-AG--TAA---G-TTTC--ATGA----A-GTTG--TT--ATG-AATC---TT-AT-T-A---T-------------G--A--GA-----T-AAG-CA----T--TA--AA-AAATT--TG--A---T-CA--------TTCT--G--------T--T-T---AA---GG---------------ACTTTCTGACCTTGA-T--G-TTC---TGTG-TAT------GT-------------A-CATGTA----TGTCTCGCA-TTT--GAA--------------GGTGTG---ATG-AAC------T-AT--T-TTT-C--ACTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTTT--GAA-T-T-TAGTG--A-A--TGG------A-A-AT--AGA---TA-T-GCATT------CTATACTTTGATCAG-A-TGA--T-AGTGGGAATactccccgtgtttgctgaaattcctaattatcaaatccacttttctctaattttcacagatatttttgaatcgttttgtagaagtaagtttcatgaagttgttatgaatcttattatgagataagcattaaaaaatttgatcattctgtttaaggactttctgaccttgatgttctgtgtatgtacatgtatgtctcgcatttgaaggtgtgatgaactatttttcacttgataatttattagtttttgaatttagtgaatggaaatagatatgcattctatactttgatcagatgatagtgggaatggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
gi|40 : agcagttacaatttcatgtgacatcataggattttgcaaaaaaatcactgatttgtttagatttattcatatggtaggaacatgagtgttttgcgatT-TCA-CCCTCCTGTGACATCATAAG-A-TTTC--G--C---AA-A-ATTAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAA---TT----A------TGC--AAGAT------------AACAAC--A-CA-A-----------C--T---TT-----GCC-----A---AT------------AT-T--------------G---------TT------G----T----AAA---ggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
gi|41 : taaagtagcA--A-A--TGG------A-A-AT--A-AA--TA-C-ACTTT------CTATACTTTCATCAA-A---A--T-AATGCAAGctagaaacttt
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gi|47 : G-TTTA--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-A-GT--A-AC--TA-C-ATTTT------CTACACTCTTATAAATG-TAG--T-AATGTGAGTAtgg
gi|48 : GTAAT-TCA-CTCTCACGTGACGTCATAAT-A-TTTT--A--C---AA-A-ATCA-----------GATT--T-ATT-----T---A--GAA---TT----A------TAC--Ata
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gi|8 : atttttttcactttcaaccatcatttttgataagtacatgt--------AATATCTT-GT-TG--AATATA-----A----C-AT-T-----T-C---AAAAAT---CT---AGACT-AA-G-TTA--------TAT--AAG----A-AT----A-AAC--T---A--TGATCT---G-TTTCAAAA-TG---TT---G-AT------C-----A--AGGCA--A--TG------A-TAT--A----T--GTTAT--ATTG-A--T----TTCT--C-T-ATC---T---AG-TTCAT------------T-A-T---G---TGAC-A----TA-T-T----C--TT-T-ATTTTCCC----CAGAA--A-TT------T-G----TAATAAT--T--TTTATA-A-AG--AAACA-G-TTTC--AAGA----A-TTTT--TT--TAG-AATAT--TT-GT-TAA---CA-T--A-------A--T--TT-----T-AAC-AA--TTT--TGT-GA-AAATA--TG--A---T-AA--------CG----------------T-T---AA---GGAAAAT---T-GC-T-A-TTTCTGATGCTGA-T--ATTAT---GATT-T-T------GT-------------T-TA-GTA----C-TCTTGCA-TATTAAAT--------------AGTACA---AGG-ACC------TAATA-TATTTATTAATTTG-C-------TAATTT----ATTAG--TTT--AACTT-C-TAATA--A-A--TGA------C-A-ATA-A-A---TA-C-ATTTT------CTATACTATTA-AAA-A-TAA--TAAATGTGAGTAtg
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Reference ( family-1992 ) : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--AA--TGATAT---G-TTTCAAAA-T-A---TTGAAT------C-CAA--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TC---------CAT---ATA-TG---CGATA----GA-T-T--C-C-TT-T-ATTTTTCA----CAGAC--A-TT------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGT--T--ATGAATA-CT-AT--TA---TA-TC-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--AT-AC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
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gi|11 : aaattA-CCCCCCTGCGATGTCATCAG-A-TTTT--G--A---AA-AATCAAT---------GATT--T-TTTGTTTTT---T--GTT---TTTTAAA------GGT--ATGAT------------AGGATA--A-TG-A-----------A--T---TTTGTT-G-G------------AAT------C-----T-TTTCTGATGACT-A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AA--TTCT-GT-TA--AACAAA-----AAA----AT-T-------A---AAAAGT--------G---T-AA-A-TTA--------TAT--AT--------------------AA--TG---T---G-TTTCAAAA-A-A---TTGAAT------C-CAA--GGACA--A--T-------------------T--G-TAT-CA--------------------T-G-C---A---A-------------TAT---ATA-TC---TTATA----------------TT-T-AATTTTTA----CAGAT--A-TT------T---------TG-T--T--T---------------CA-G-TTTC--ACGA----A-AT-CGT--T--ATGAATA-CT-AT--TT---TC-TC-------C--T--TA-----TAAAT-CAGTTTC--TGTGA-AA-TAA--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--C---AA---AGAAAAC---T-GC-C-ATT-------------T--AT-GC--------T-T------GT-------------C-T-----------CCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGTG---ATG-AC
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gi|14 : aT-CCA-CCCTCATATGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AACCAAT---------GATT--TCATA-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATACT------------AGGAAC--A-TA-A-----------AT-T---TT-GTT-G-A------------AGT------C-----T-C----------------------T--------TCCAAA-T----T----AAA---ATTGTA--------AAAATCTT-AT-CA--AACACA-----AAA--TAATAT-----C-C---AAAAG-----T---G---T-CA-A-TTA--------TATACATGTATTA-ATAC--A-ATC--AA--TCATAT---G-TGCTGAAA-T-T---TTGAAT------C-CAA--GGGCA--A--TA------A-C-A--C----TTAGTTTT-CA----A----------G--T-C-A-----A---AG-TC---------CAT----TA-TG---CAAAA----GA-TGT--T-C-TT-T-ATTTTT------CAGATTAA-TT------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-A-TTTC--ATGA----A-AT-TGT--T--ATGAATA-CT-TT--TT---TA-TC-------G--C--TATACATT-AAT-AAGTTTT--TGTGAGAA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCaagaaaatcaaaacgtttggaaatagtttcacaaaattcaataacaatttacaattattttt
gi|15 : gaaatTGACGTAATCAGTG-CTTTCAGATC---AA-ATTCAA-----------ATT--T-ATA-----T---ATTGTT---TA----A------TGC--ACGAT------------AGGAAC--T-TA-A-----------AATT---TT-GTT-G-GGTTTTTTTTTTCAATA-----C-----T-T------------A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAA----T-GT-TA--A---TA-----AAAATT-GT-T-----TAC---GATAGT---ATTCAA---A-AA-GACTA--------TA---ACA----A-A-------ATC--AT--TTA-AT---A-TTTCAAAA-T-AGGATTGAAT------G-CAA--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-TATAT-A--T----TTCT--T-T-G-CT--A---AG-TT---------CAT----TA-TG---CGATA----TATT-T--C-C-TT-T-ATTGTGCA----CAGAC-----------------------C-T--T--TTCGTA-A-CG--AAAC----TTTTAAATGA----T-AT-TGT--T--ATGGACG-CA-AC--TG---TA-TC-------G--T--TA-----A-ATC-CAATTTT--TGTGA-
gi|16 : cagcT------C-CAAAGGGGTA--A--TC------A-G-T--C----T----------TGG-A--C----TTCT--T-C-ATC---G---AG-TT---------CAT---A-A-TT-----AAA----GA-T-TTTC-C-TT-T-ATTTT-------CAGAC--A-CT------T-GTCGTTA-AA-C--T--TTTGTG-TTAG--AAACACGCTTTC--ATGA----A-AG-TGT--T-----------------TA---CA-T-----------T--TA-----T-AAC-CAGTTTTA-TGTAA-AAATCC--TG--A---T------------GCT--T--------TTCTT---AA---GGCAAAG---T-GC-A-ATTTGTTAACGTCAA-------AC---AATTAT-T------GT-------------T-TAT-------TGTCTCACAGTCTTAGAA--------------AATGTGAA-ATG-ACC------T-T-TAGCATTTA-T--A-TT---A-------TG--TT----ATTGGTTTTTCAAC-T-C-CAATAGCA-AGTTGA------AGAATG-AAT---A-C-ATT-------------CTTTTATCAT-ATTCAATT-AATGCTAG
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gi|18 : tttgtagttaatagggactttcaagtagtA-T-T--C-T-AT-T-ATTTTTCA----CAAAG--A-TT------T--T----G-TA-T--------------------ACA-A-TTTC--ATAA----A-AT-TAT--C--ATGAATA-CT-AT--T----TA-TCATAATAAG--T--TA-----T-AAC-CAGTTTG--TGTGA-AA-ATT--TA--A---T-AA--------TGCC--G--------TT--T---AA---GGATAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACATTG------------------------------------------T-TATGCA----TGTCGCACA-TATAAGAA--------------ATTGTG---ATG-AC---------A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------T----T----ATTAGTTTG--AAC-T-C-CATGA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-----------------TACTTTTATCAT-AT---A-T---TGCGA
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gi|21 : ttaagatcgatgcatgataggaacacgattggagtcttttccaatagatatcgtaaaaatatattgctaatcataatgttacatacgagatgacacgtttcaacatattgaatccaaaggcaagaacttgtttacgttgtttttttT-TCA-CCCTCATATGACATCATAAC-A-TGAT--GT-C---AT-AAC--------------ATT--T--TT-----TGCAA--GATCAGTT----A------TGT--ATGGT------------AGGGAC--A--A-A-----------C--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-TTTCCAATA----G---------T--------T------A----T----TGC---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATT-----GAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---T--------C-AA-G-ATA--------TAT--ATG----A-AT----T-GTC--AA--TTA-AT---A-ATT---AA-T-A---TTGATT------T-CAA--GGGCA--AGTTATGAAGTA-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-cgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
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consensus : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--AT-AC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
Reference ( family-1992 ) : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--AT-AC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
gi|1 : ACGCCATACG-A-TTTT--A--T---AA-AAT-AAT---------GCTT--T-ATG-----G---A--GAT---TC----G------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-C-----------A--T---TTTGTTTG-G------------GGT------C-----T-TTTCCAAGGTT--A---------T--------T------G----T----GAA---T----ATATATTTCAAAATCTT-AT-T-------TT-----ATA--T-GT-T-----T-C---AAAAGT--------A---T-AC-G-TTG--------TGT--GTG----C-AA----A-ACC--A---A--TGATAT---G-TTTTAAAA---T-A---TTGAAT------C-TG--A--GGGCATTA--CA------T-C-TAAC----T--ATTTT-CA------------TTCT--T-TAA-C---A---AG-TCCAT----------T----A---C------GCGATA----AA-TGT--C-T--TT--T-GATTTTT-A----CTGGC-------------------------A-T--T--TTTGTG-ACAG--AGACA-G--------TGA----ATAC-TACT------ACA-TT-ATGTA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGCTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-TA--------TGCT--ACATGTATTTT--T---AAAAGGAAAAAT---TAGC-A-A-TTTCTG------------------------------------------------------TA----TGTCTC-TA-TCATAGAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATCT--T--A-TTTG-G-------TCAGTT----ATTATTTTC--AAC-T-C-T-ATA--C-A--TAG--------------AT---A-C-ACATA------TTATACTTCTATCAA-AT--AA-T-AATGCTAGTA
gi|10 : T-CCA-CCCACATGTGA-----TAA-------T-----C---AATGATCCAT---------G-TA--T-ATC-----T---A--GGT---TT----C------TGT--CTGAT------------TGGAAC--A-TCTA-----------T--T---TT-GTT-G-G------------AGTATGTTACAATAGT-T------------T---------T--------T------G----TAAAAAAA---A----A--------AAAAACTT-GC-TG--AACATG-----AAA--C-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT-------T-AA-G-TTT--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTTGAAC---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--CA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTC-A--T----TTCT--T-T-A-T---C---AA-TTCAT----------------------------GATA----GATT-T--C-T--TT--T-ATTTTCC-C----CAGAT--GTT--T------T-GT----A-TA-GAATAATTTGTA-A-AG--AAACA-T-TTTC--ATGAATTCA-AA-TGTT--ATGAATT-CT-AT-TT---TA-T--C-------ATTT--TAT----T-AAC-CAGTTTT--TATGA-AA-TTT--TG--A---TAAA--------TACT--G--------TG--G---GA---AAAAAATGAAT-GC-CTATTTTCAGACATTGA-T--tggagttaccttgataagtcaattttgtagtgccgacaccactagactagattaa
gi|11 : aaattA-CCCCCCTGCGATGTCATCAG-A-TTTT--G--A---AA-AATCAAT---------GATT--T-TTTGTTTTT---T--GTT---TTTTAAA------GGT--ATGAT------------AGGATA--A-TG-A-----------A--T---TTTGTT-G-G------------AAT------C-----T-TTTCTGATGACT-A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AA--TTCT-GT-TA--AACAAA-----AAA----AT-T-------A---AAAAGT--------G---T-AA-A-TTA--------TAT--AT--------------------A---A--TG---T---G-TTTCAAAA---A-A---TTGAAT------C-CA--A--GGACA--A--T-------------------T--G-TAT-CA--------------------T-G-C---A---A----TATA---------T----A---T------CTTATA-----------------TT--T-AATTTTT-A----CAGAT--A-T--T------T---------TG-T--T--T---------------CA-G-TTTC--ACGA----A-AT-CGTT--ATGAATA-CT-AT-TT---TC-T--C-------C--T--TA-----TAAAT-CAGTTTC--TGTGA-AA-TAA--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--C---AA---AGAAAAC---T-GC-C-ATT-------------T--AT-GC--------T-T------GT-------------C-T-----------CCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGTG---ATG-AC
gi|12 : aagtaattccacccca---A----G--------AAAATCTT-TT-TG--AACATA-----AA---T-AT-T-----T-T---AAATGT---CT--------------TGA--------TAT--ATT----A-ATCACAA-ATC--A---A--TAATAT---G-TATGAATG---T-A---TTGAAT------T-CA--A--GGGTT--G--TA------A-C-T--C----C--GTTTT-CTTTG-G--T----TGCT--T-T-ATC---A---AG-TCTAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T-------TT--C-ATTTTTC-C----CA-AT--A-T--TA-----T-AT----G-CA-T--T--TTTGTA-A-A-----------T-------------A-AT-TGTT--AT----------------------------------------------AAC-CAGTTTT--TGTG---A-TTT--TATTA---T-GA--------AGTT--G--------TT--T---AA---GAAAAAG---T-TC-A-TATTTCTAATGTTCATT--AT-AT---GATT-C-C------GTC------------T-TAAATAATTCTATCTTATA-TCTTAAAA--------------ATTGTG---ATG-ACCTACATGT-A-TA-TATGT--T--A-TTTG-ATACATTGTAATTT----AAAAGTTTT--AAA-T-C-TAATA--A-A--
gi|13 : agggagccttttcgaatagccactgtGTAAT-TCAACTCTCAAGTGATGTCAAAAG-A-TTTT--A--C---AA-AATCCAT---------AATT--T-ACT-----T---A--TAT---TT----A------TGC--ATTAA------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---CT-GTT-C-A------------AAT------G-----GGT------------A---------T--------T------G----T----ACA---A----A------------TCTT-GT-TC--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A------A-G-TTAA-------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--T------------T----A---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTC-TATTC-A--T----TTCC--T-G-ATC---A---AG-TCTGTTTAATATATAT----A---T------GCACTC----GA-T-TTCC-T--TT--T-ATTTTT-------CTGAT--A-T--TG-----T-AC----A-TA-TC-T--TTTATA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CC-AT-g
gi|14 : aT-CCA-CCCTCATATGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AACCAAT---------GATT--TCATA-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATACT------------AGGAAC--A-TA-A-----------AT-T---TT-GTT-G-A------------AGT------C-----T-C----------------------T--------TCCAAA-T----T----AAA---ATTGTA--------AAAATCTT-AT-CA--AACACA-----AAA--TAATAT-----C-C---AAAAG-----T---G---T-CA-A-TTA--------TATACATGTATTA-ATAC--A-ATC--A---A--TCATAT---G-TGCTGAAA---T-T---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-A--C----TTAGTTTT-CA----A----------G--T-C-A-----A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCAAAA----GA-TGT--T-C--TT--T-ATTTTT-------CAGATTAA-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-A-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-TT-TT---TA-T--C-------G--C--TATACATT-AAT-AAGTTTT--TGTGAGAA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCaagaaaatcaaaacgtttggaaatagtttcacaaaattcaataacaatttacaattattttt
gi|15 : gaaatTGACGTAATCAGTG-CTTTCAGATC---AA-ATTCAA-----------ATT--T-ATA-----T---ATTGTT---TA----A------TGC--ACGAT------------AGGAAC--T-TA-A-----------AATT---TT-GTT-G-GGTTTTTTTTTTCAATA-----C-----T-T------------A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAA----T-GT-TA--A---TA-----AAAATT-GT-T-----TAC---GATAGT---ATTCAA---A-AA-GACTA--------TA---ACA----A-A-------ATC--A---T--TTA-AT---A-TTTCAAAA---T-AGGATTGAAT------G-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-TATAT-A--T----TTCT--T-T-G-CT--A---AG-TTCAT----------T----A---T------GCGATA----TATT-T--C-C--TT--T-ATTGTGC-A----CAGAC-------------------------C-T--T--TTCGTA-A-CG--AAAC----TTTTAAATGA----T-AT-TGTT--ATGGACG-CA-AC-TG---TA-T--C-------G--T--TA-----A-ATC-CAATTTT--TGTGA-
gi|16 : cagcT------C-CA--AAGGGGTA--A--TC------A-G-T--C----T----------TGG-A--C----TTCT--T-C-ATC---G---AG-TTCAT----------A----A---T------T--AAA----GA-T-TTTC-C--TT--T-ATTTT--------CAGAC--A-C--T------T-GTCGTTA-AA-C--T--TTTGTG-TTAG--AAACACGCTTTC--ATGA----A-AG-TGTT----------------TA---CA-T-------------T--TA-----T-AAC-CAGTTTTA-TGTAA-AAATCC--TG--A---T------------GCT--T--------TTCTT---AA---GGCAAAG---T-GC-A-ATTTGTTAACGTCAA-------AC---AATTAT-T------GT-------------T-TAT-------TGTCTCACAGTCTTAGAA--------------AATGTGAA-ATG-ACC------T-T-TAGCATTTA-T--A-TT---A-------TG--TT----ATTGGTTTTTCAAC-T-C-CAATAGCA-AGTTGA------AGAATG-AAT---A-C-ATT-------------CTTTTATCAT-ATTCAATT-AATGCTAG
gi|17 : taaaactT-CCA-CCTTCTTTTGACTTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAATAGGAATATGGATT--TCATT-----T---A--GTC---TT-----------TTC---TAAT------------AG------------------------------TT-ATT-G-G------------GG-----------------------------------------------------------------GG---G----G--------GGGGTCTT-AT-TA--AACATA-----AAC--T-AT-T-----T-C---AAA-----------A---C-AA-G-TTA--------TGT--ATG----A-AT----A-ATC--AATTA--TGATAT---G-TT---GAATTCT-A---ACAAGT------C-CATTAT-GGG----A--TA------------------T--ATTTC-CTTTT-G--T----TT-T--T-T-A-T---A---GA---CAC----------T----A---T------GT-ACA----G-------C-C--ATGAC-ATTTTTCTA----TGATC--A-CTAT------T-AT----A-TA-T--T--GTT------AC--AACCA-GTTTTT--GTGA----A-AT-TTTC--ATctat
gi|17 : tttgtagttaatagggactttcaagtagtTTG-A--A----TTCT--A---A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GGGATA----TA-T-T--T-CCTTT--T-GTTTTTT-A----TAGAC--A-C--T--------------A-TG-T--------------------ACA-G-C--C--ATGA----C-AT-TTTTCTATGATCA-CT-AT-TA---TA-TATT-------G--T--TA-----C-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TC--A---T-CA--------TGCT--catgct
gi|18 : tttgtagttaatagggactttcaagtagttccaccttcttttgacttcataagattttgcaaaatcaataggaatatggatttcatttagtcttttctaatagttattggggggggggggtcttattaaacataaactatttcaaaacaagttatgtatgaataatcaattatgatatgA-T-T--C-T--AT--T-ATTTTTC-A----CAAAG--A-T--T------T--T----G-TA-T--------------------ACA-A-TTTC--ATAA----A-AT-TATC--ATGAATA-CT-AT-T----TA-T--CATAATAAG--T--TA-----T-AAC-CAGTTTG--TGTGA-AA-ATT--TA--A---T-AA--------TGCC--G--------TT--T---AA---GGATAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACATTG------------------------------------------T-TATGCA----TGTCGCACA-TATAAGAA--------------ATTGTG---ATG-AC---------A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------T----T----ATTAGTTTG--AAC-T-C-CATGA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-----------------TACTTTTATCAT-AT---A-T---TGCGA
gi|19 : tctaagggtaatatctctgtcttcgttgaAA---A----A--------AAAATCCAAGT-TACGGGCATAGACGTAAA--T-GC-T-----T-T---AT--GT---CT---AA--TGAA-G-TTAG-------CAT--ATG----G-AC----AGATC--A---AAGTGATAT---G-TTTCAAA-----------TGAAT------TACA--A--GGGCA--A--TA------AGC-T--C----T--GTCTG-AATT-----T----TTTT--T-C-C-CCCTA---AG-TTCAT----------C----AAAAT------G-AATA----GA-T-TTTC-C--TTG-T-GTTTTTC-AGAAGCACAC--A-T--TGTTTTTT-TT----T-TA-T--T--TTTGTT-A-AGGAAAACA---TTTC--AAGA----A-AT-TGTTTAATGA-TA-CT--T-TAAAATAGT--C-------A--T--TA-----T-CACGCAGTTTTTTTGTGA-AA-TTT--TA--A---T-AA--------tgatgaacttaccataaaacacatttggta
gi|2 : T-CCA-TCCCCATGTGAAGT-----G-A-T-------------A-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ACAATGT----------AGGTAC--A-TA-A-----------A--T---TTTGTT-G-GG-----------AGT------C-----T-TTTCTGACAGTGGG---------T--------TAAT---G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATA-----AAA--C-AC-T-----T-T---AAAAGT---CT---C------A-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATATAGTG-TTTCAAAA---T-T---TTGAATATTGCAC-CA--AA-GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTTTCATTG-C--T----TTCT--A-T---C---A---AG-TCCA------------------------------AT--------T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------TTGT----A-AA-T--T--TTTGTA-A-A------CA-A-TTTA--ATGA----A-AT--ACT--AT-AAT---T-AT--A---TA-T--T-------G--T--AA-----T-AAC-CTGTTTT--GGTGA-CA-TTT--TG--A---T-GAATCATTCATGCTCTG--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-T-ATTTTCTGATGTTAA-TTAAT-ACATGGATT-C-T------GT--------------------------GTCTCGCA-TCTT-AAA--------------AGTACA---ATG-ACC------TAA-TA-TATTC--T--A-TTTG-A-------TAATTT----GTTAGTTTT--AAC-T-C-CAATT--A-A--TGGATTCCAA-AATA-AAT---GTC-ACATT------CTATTCTTATATCAG-GT--AA-T-AATGaatgcagct
gi|20 : TT-----A---A--GAT---CG----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-CG-A----------------------TT-G-G------------AGT------C-----T-T----------------------T--------T------C----C----AAT---A----G--------A---TATC-GT--A--AAAATA----------T-AT-T-----G-C---TAA--T---C----A---T-AATG-TTA--------CAT--ACG----A-G----------------A--TGACAC---G-TTTCAACA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--AGGCA--A--GA------A-C-T-------T--GTTTA-CGTTG----T----TTTT--T-T-A--------------------------------------------TGATA----GA-T-T--TAC--CT--T-ATTT-----------GACG-A-T--T------T-AT------TA-G--T--TTTg
gi|20 : ---ATG-ATA------G-A-TT-TACCT--T--A-TTTG-A-------CGATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-ATCA-AAT---A-C-GCTTT------CTATAATTaactctaataaatggaatcaaatacgctttctataattcgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|21 : ttaagatcgatgcatgataggaacacgattggagtcttttccaatagatatcgtaaaaatatattgctaatcataatgttacatacgagatgacacgtttcaacatattgaatccaaaggcaagaacttgtttacgttgtttttttT-TCA-CCCTCATATGACATCATAAC-A-TGAT--GT-C---AT-AAC--------------ATT--T--TT-----TGCAA--GATCAGTT----A------TGT--ATGGT------------AGGGAC--A--A-A-----------C--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-TTTCCAATA----G---------T--------T------A----T----TGC---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATT-----GAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---T--------C-AA-G-ATA--------TAT--ATG----A-AT----T-GTC--A---A--TTA-AT---A-ATT---AA---T-A---TTGATT------T-CA--A--GGGCA--AGTTATGAAGTA-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-cgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|22 : aaggtattTGAATA-GT-AT-TC---TA-T--C-------T--T--TT-----A-AAC-CTGTTTT--TGTAA-AA-ATTAATG------T-AA--------T--------------TT--T--------------T---T------ATTTTCTGATGCTGA-T-----------------T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCT-TCTTAAAA--------------AGTGCA---ATG-AGC------T-C-TT-AATTT--T--A-GTTG-T-------TGCTTT----ATTAACTGT--ACC-T-C-TTATA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-C-GCTCT------CTATGCTTTTATCAT-AT--AA-T-AACGCGAGTAtccagatcgatagttaaagagttatgtgat
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gi|25 : gtaacatcaaattatgcatagtcttctcG-A-TTTT--G--C---AA-AACCGCT---------GATTAAT-ATT-----T---A--GAT---GC----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-T-----------A--TATCTT-GCT-G-A------------AGT------CCTT--T-T------------GCAATAGCTAT--------T------G----T----AAA---A----A--------ATACTC-T-GT-TA--AAAATA-----ACA--T-A--------T-C---AAA--T---TT---A-----AA---------------------G----A-AT----A-TT-------A--T--TAT---G--------------A---TTGATA------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C---------TTT-CATTG-G--TATAATTCT--T-T-A-
gi|26 : aaac----AAA---A----A--------ATAGTTTA-GTGTG--CATGTA-----AAA--T-AT-TACTCCT-CCCAAAAAATGACTT---T---T-AA-G-CAAA-------TAT--AC-----A-CC----A-GCC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAG---T-T---TTGAAT------C-TA--A--GGGCA--A--TA------A-T-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTTT--C-T-ATC---G---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGGTATCTTTA-C-T--A-C--TT--T-ATTTCTC-
gi|27 : ---T-GC-A-ATTTTCTGACATTTA-T--GC-AC---GATT-C-T------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA----TGTCTCGCA-TCTTTGAA--------------GGTGCG---ATA-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTGAA-------TTTTTT----TTTAGTTTTTAAAT-TCC-TAAT---A-A--CGC------A-AGAG-AAT---A-C-ACTTT-------TATAATTTTATCAG-AT--GA-T-
gi|28 : GA-AG-TTT--TC--A---A-AA--------TGCT--G--------TT--TTAAAA---GGAAAAT---T-GA-A-ACTTTCCAATGTTGA-T------C------------------T-------------T-TATGTA----TGTCTCCCA-TCTTAAAATTGAAGTAAAAAAAAGTAC----ATG-GCC------A-A-AA-TATTT--T--A-TCCA-A-------TAATTC----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAAAA--A-A--TGG------A-AATATAAT---g
gi|29 : TGA-AC-TTT--TG--A---T-A---------TGCT--G--------TT--G---AA---GGAAAAT---T-GC-A-CTTGTTAGACGTTGG-T--AT-AT---GATT-C-T------GT-------------T-TATGCA----CGTCTCACA-TCTTCAAA--------------AGTGCG---Attca
gi|29 : tca--AAC-T-C-TAAGA--A-A--TGA------A-AATG-AATGT-A-C-ACTTTAGCTCTTTATACTTTAATCCA-AT--AA-C-AATGCGAGTAactctaagaaatgaaaatgaatgtacactttagctctttatactttaatccaataacaatgcgagta
gi|3 : tcatgaacttttgatatgctgttgaaggaaaattgcacttgttagacgttggtatatgattctgtttatgcacgtctcacatcttcaaaagtgcgGCAGT-CCA-CCCCAGTGTGATGTCA--AC-A-TTTT--G--A---AA-AATCATA---------GATT--T-ATC-----T---A--GAT---TT----A------TCC--ATGAT------------AGATAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GAT-G-G------------A--------T-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATG-----AAA--T-AT-T-----T-T---AAAAGA---CT---A---C-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---T--TGATAT---G-TTTTAAAA---C-C---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------G-C-T--C----T--ATTTT-AATTG-A--T----TTCT--T-T-A-G---A---AGGTCCAT----------TTAATA---T------GTGATA----GG-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-C----CACAC--A-T--T------TAGT----A-TA-T--C--TTTGTA-ATAA--AAACA-G-TTTC--ATGA----T-AT-TCTT--ATTAACA-CT-AT-CA---TA-T--C-------A--T--TA-----T-AGC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------CT--T---AA---GGAAAAG---T-AG-A-ATTTCCTGGCGTTGA-T--AT-AT---AATT-T-T------GT-------------T-TATGCA----TGTTTCACA-TCTTAAAA--------------AGTGTA---ATA-ACT------T-A-CA-TATTT--T--A-TTTC-A-------TAATTT----ATTACTTTT--AAC-C-C-TAGCA--A-A--TGG------A-AAT--GAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-CT--TA-T-AATGGGAGTA
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gi|31 : ct---A---T-AA-G-TTA--------TGG--ATG----A-AG----A-ATG--G---A----GTA-------------------A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--C--TG------G-C-T--A----T--ATTTT-CATTT-A--T----TTCT--T-C-A-TG--A---AG-ACTGT----------T----A---T------GTGATA----GATT-T--C-C--TT--T-GTT-------------------T--T------T-GT----A-TA---------TGTA---------------------ATGA----A---------------TA-CC-AT-TA---TA-T--T-------A--T--TA-------AAC-CAGTTTT--
gi|32 : GTAATTCCA-CTTTCATGTTACGTCATATG-ATTTTT--G--C---AA-A---------------------T-ACC-------------AT---TG----A------TGC--GTGTT------------AGGAGT--A-AA-A-----------A--A---AT-GTT-G-GGGTAC-------GGT------C-----T-TTCCCGATA----G---------T--------T------A----T----TGC---T----A--------TGATTCTT-TT-TT--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C----GAAGT---Cgttgata
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gi|36 : taaa-TACGTA----TGTCTTGTA-TCTTTAAA--------------A---------T--ATC------T-G-TA-TATTG--T--A-TT-G-AAA-----TGATTT----ATTAGTTTA--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AAGA-AAT---A-C-ATTTG------ATATACTTTTGTCAA-AT--AA-T-AATGCGAGTAttccagtaatcttaagaatacaaaatacc
gi|37 : taTGATATCACAAG-A-TTTT--G--C---AA-ATTCATT---------GAT------TT-----T---A--GAG---TT----ACCGGTGTGC--ATGAT------------AGGAACTTA-AA-A-----------A--T---TT-ATT-G-G------------AAT------C-----T-T------------ta
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gi|4 : TCATGTGACATCATAGG-A-TTTT--G--CAAAAA-AATCACT---------GATT--T-GTT-----T---A--GAT---TT----A------TTCATATGGT------------AGGAAC--A-TG-A-----------G--T---GT-TTT-GCG------------A--------------T-A------------G---------T--------T------A----T----AGT---A----A--------AAAATCTT-AT---------TA-----AAA--T-GT-T-----T-A---AAAAGT---CT---C---T--C-G-TTA--------TAt
gi|4 : agcagttacaattA-G-TTA--------TA---GTA----A-AA----A-ATCTTA---T--TAAAAT---G-TTTAAAAAG--T-C---TC---T------C----------GTT--A--TA------A-C-T--CCCCGT--GTTTG-C--TG-AAAT----TCCTAAT-T-ATC---A---AA-TCCAC----------T----------------------------T-T--T-C--TC--T-AATTTTC-A----CAGAT--A-T--T------T-TT----G-AA-TCGT--TTTGTAGA-AG--TAA---G-TTTC--ATGA----A-GT-TGTT--ATGAATC-TT-AT-TA---T-------------G--A--GA-----T-AAG-CA----T--TAAAA-AA-TTT---G--A---T-CA--------TTCT--G--------TT--T---AA---GGA---------------CTTTCTGACCTTGA-T--GT-TC---TGTG-TAT------GT-------------A-CATGTA----TGTCTCGCA-TTT--GAA--------------GGTGTG---ATG-AAC------T-A-T--T-TTT--C--A-CTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTTTGAAT-T---TAGTG--A-A--TGG------A-AATA-GAT---A-T-GCATT------CTATACTTTGATCAG-AT--GA-T-AGTGGGAATactccccgtgtttgctgaaattcctaattatcaaatccacttttctctaattttcacagatatttttgaatcgttttgtagaagtaagtttcatgaagttgttatgaatcttattatgagataagcattaaaaaatttgatcattctgtttaaggactttctgaccttgatgttctgtgtatgtacatgtatgtctcgcatttgaaggtgtgatgaactatttttcacttgataatttattagtttttgaatttagtgaatggaaatagatatgcattctatactttgatcagatgatagtgggaatggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
gi|40 : agcagttacaatttcatgtgacatcataggattttgcaaaaaaatcactgatttgtttagatttattcatatggtaggaacatgagtgttttgcgatT-TCA-CCCTCCTGTGACATCATAAG-A-TTTC--G--C---AA-AATTAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAA---TT----A------TGC--AAGAT------------AACAAC--A-CA-A-----------C--T---TT-GCC----------------AAT------A-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---ggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
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gi|42 : taaagttacc---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-TTTCTGATA----G---------T--------T------A----T----TGT---A----A--------AACATCTT-GT-TA--AATGTA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAACAT---GT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--TTG----A-AT----T-ACC--A---A--T--------------AAA-----------TGAAT------C-AA--A--GGGCA--A--TA------A-C-aatggggttacctttgattaaatattgactcatataaactccttgacctttacttt
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gi|47 : GTTTA--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AGTA-ACT---A-C-ATTTT------CTACACTCTTATAAATGT--AG-T-AATGTGAGTAtgg
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consensus : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--AT-AC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
Reference ( family-1992 ) : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--AT-AC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
gi|1 : ACGCCATACG-A-TTTT--A--T---AA-AAT-AAT---------GCTT--T-ATG-----G---A--GAT---TC----G------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-C-----------A--T---TTTGTTTG-G------------GGT------C-----T-TTTCCAAGGTT--A---------T--------T------G----T----GAA---T----ATATATTTCAAAATCTT-AT-T-------TT-----ATA--T-GT-T-----T-C---AAAAGT--------A---T-AC-G-TTG--------TGT--GTG----C-AA----A-ACC--A---A--TGATAT---G-TTTTAAAA---T-A---TTGAAT------C-TG--A--GGGCATTA--CA------T-C-TAAC----T--ATTTT-CA------------TTCT--T-TAA-C---A---AG-TCCAT----------T----A---C------GCGATA----AA-TGT--C-T--TT--T-GATTTTT-A----CTGGC-------------------------A-T--T--TTTGTG-ACAG--AGACA-G--------TGA----ATAC-TACT------ACA-TT-ATGTA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGCTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-TA--------TGCT--ACATGTATTTT--T---AAAAGGAAAAAT---TAGC-A-A-TTTCTG------------------------------------------------------TA----TGTCTC-TA-TCATAGAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATCT--T--A-TTTG-G-------TCAGTT----ATTATTTTC--AAC-T-C-T-ATA--C-A--TAG--------------AT---A-C-ACATA------TTATACTTCTATCAA-AT--AA-T-AATGCTAGTA
gi|10 : T-CCA-CCCACATGTGA-----TAA-------T-----C---AATGATCCAT---------G-TA--T-ATC-----T---A--GGT---TT----C------TGT--CTGAT------------TGGAAC--A-TCTA-----------T--T---TT-GTT-G-G------------AGTATGTTACAATAGT-T------------T---------T--------T------G----TAAAAAAA---A----A--------AAAAACTT-GC-TG--AACATG-----AAA--C-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT-------T-AA-G-TTT--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTTGAAC---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--CA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTC-A--T----TTCT--T-T-A-T---C---AA-TTCAT----------------------------GATA----GATT-T--C-T--TT--T-ATTTTCC-C----CAGAT--GTT--T------T-GT----A-TA-GAATAATTTGTA-A-AG--AAACA-T-TTTC--ATGAATTCA-AA-TGTT--ATGAATT-CT-AT-TT---TA-T--C-------ATTT--TAT----T-AAC-CAGTTTT--TATGA-AA-TTT--TG--A---TAAA--------TACT--G--------TG--G---GA---AAAAAATGAAT-GC-CTATTTTCAGACATTGA-T--tggagttaccttgataagtcaattttgtagtgccgacaccactagactagattaa
gi|11 : aaattA-CCCCCCTGCGATGTCATCAG-A-TTTT--G--A---AA-AATCAAT---------GATT--T-TTTGTTTTT---T--GTT---TTTTAAA------GGT--ATGAT------------AGGATA--A-TG-A-----------A--T---TTTGTT-G-G------------AAT------C-----T-TTTCTGATGACT-A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AA--TTCT-GT-TA--AACAAA-----AAA----AT-T-------A---AAAAGT--------G---T-AA-A-TTA--------TAT--AT--------------------A---A--TG---T---G-TTTCAAAA---A-A---TTGAAT------C-CA--A--GGACA--A--T-------------------T--G-TAT-CA--------------------T-G-C---A---A----TATA---------T----A---T------CTTATA-----------------TT--T-AATTTTT-A----CAGAT--A-T--T------T---------TG-T--T--T---------------CA-G-TTTC--ACGA----A-AT-CGTT--ATGAATA-CT-AT-TT---TC-T--C-------C--T--TA-----TAAAT-CAGTTTC--TGTGA-AA-TAA--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--C---AA---AGAAAAC---T-GC-C-ATT-------------T--AT-GC--------T-T------GT-------------C-T-----------CCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGTG---ATG-AC
gi|12 : aagtaattccacccca---A----G--------AAAATCTT-TT-TG--AACATA-----AA---T-AT-T-----T-T---AAATGT---CT--------------TGA--------TAT--ATT----A-ATCACAA-ATC--A---A--TAATAT---G-TATGAATG---T-A---TTGAAT------T-CA--A--GGGTT--G--TA------A-C-T--C----C--GTTTT-CTTTG-G--T----TGCT--T-T-ATC---A---AG-TCTAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T-------TT--C-ATTTTTC-C----CA-AT--A-T--TA-----T-AT----G-CA-T--T--TTTGTA-A-A-----------T-------------A-AT-TGTT--AT----------------------------------------------AAC-CAGTTTT--TGTG---A-TTT--TATTA---T-GA--------AGTT--G--------TT--T---AA---GAAAAAG---T-TC-A-TATTTCTAATGTTCATT--AT-AT---GATT-C-C------GTC------------T-TAAATAATTCTATCTTATA-TCTTAAAA--------------ATTGTG---ATG-ACCTACATGT-A-TA-TATGT--T--A-TTTG-ATACATTGTAATTT----AAAAGTTTT--AAA-T-C-TAATA--A-A--
gi|13 : agggagccttttcgaatagccactgtGTAAT-TCAACTCTCAAGTGATGTCAAAAG-A-TTTT--A--C---AA-AATCCAT---------AATT--T-ACT-----T---A--TAT---TT----A------TGC--ATTAA------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---CT-GTT-C-A------------AAT------G-----GGT------------A---------T--------T------G----T----ACA---A----A------------TCTT-GT-TC--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A------A-G-TTAA-------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--T------------T----A---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTC-TATTC-A--T----TTCC--T-G-ATC---A---AG-TCTGTTTAATATATAT----A---T------GCACTC----GA-T-TTCC-T--TT--T-ATTTTT-------CTGAT--A-T--TG-----T-AC----A-TA-TC-T--TTTATA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CC-AT-g
gi|14 : aT-CCA-CCCTCATATGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AACCAAT---------GATT--TCATA-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATACT------------AGGAAC--A-TA-A-----------AT-T---TT-GTT-G-A------------AGT------C-----T-C----------------------T--------TCCAAA-T----T----AAA---ATTGTA--------AAAATCTT-AT-CA--AACACA-----AAA--TAATAT-----C-C---AAAAG-----T---G---T-CA-A-TTA--------TATACATGTATTA-ATAC--A-ATC--A---A--TCATAT---G-TGCTGAAA---T-T---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-A--C----TTAGTTTT-CA----A----------G--T-C-A-----A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCAAAA----GA-TGT--T-C--TT--T-ATTTTT-------CAGATTAA-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-A-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-TT-TT---TA-T--C-------G--C--TATACATT-AAT-AAGTTTT--TGTGAGAA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCaagaaaatcaaaacgtttggaaatagtttcacaaaattcaataacaatttacaattattttt
gi|15 : gaaatTGACGTAATCAGTG-CTTTCAGATC---AA-ATTCAA-----------ATT--T-ATA-----T---ATTGTT---TA----A------TGC--ACGAT------------AGGAAC--T-TA-A-----------AATT---TT-GTT-G-GGTTTTTTTTTTCAATA-----C-----T-T------------A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAA----T-GT-TA--A---TA-----AAAATT-GT-T-----TAC---GATAGT---ATTCAA---A-AA-GACTA--------TA---ACA----A-A-------ATC--A---T--TTA-AT---A-TTTCAAAA---T-AGGATTGAAT------G-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-TATAT-A--T----TTCT--T-T-G-CT--A---AG-TTCAT----------T----A---T------GCGATA----TATT-T--C-C--TT--T-ATTGTGC-A----CAGAC-------------------------C-T--T--TTCGTA-A-CG--AAAC----TTTTAAATGA----T-AT-TGTT--ATGGACG-CA-AC-TG---TA-T--C-------G--T--TA-----A-ATC-CAATTTT--TGTGA-
gi|16 : cagcT------C-CA--AAGGGGTA--A--TC------A-G-T--C----T----------TGG-A--C----TTCT--T-C-ATC---G---AG-TTCAT----------A----A---T------T--AAA----GA-T-TTTC-C--TT--T-ATTTT--------CAGAC--A-C--T------T-GTCGTTA-AA-C--T--TTTGTG-TTAG--AAACACGCTTTC--ATGA----A-AG-TGTT----------------TA---CA-T-------------T--TA-----T-AAC-CAGTTTTA-TGTAA-AAATCC--TG--A---T------------GCT--T--------TTCTT---AA---GGCAAAG---T-GC-A-ATTTGTTAACGTCAA-------AC---AATTAT-T------GT-------------T-TAT-------TGTCTCACAGTCTTAGAA--------------AATGTGAA-ATG-ACC------T-T-TAGCATTTA-T--A-TT---A-------TG--TT----ATTGGTTTTTCAAC-T-C-CAATAGCA-AGTTGA------AGAATG-AAT---A-C-ATT-------------CTTTTATCAT-ATTCAATT-AATGCTAG
gi|17 : taaaactT-CCA-CCTTCTTTTGACTTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAATAGGAATATGGATT--TCATT-----T---A--GTC---TT-----------TTC---TAAT------------AG------------------------------TT-ATT-G-G------------GG-----------------------------------------------------------------GG---G----G--------GGGGTCTT-AT-TA--AACATA-----AAC--T-AT-T-----T-C---AAA-----------A---C-AA-G-TTA--------TGT--ATG----A-AT----A-ATC--AATTA--TGATAT---G-TT---GAATTCT-A---ACAAGT------C-CATTAT-GGG----A--TA------------------T--ATTTC-CTTTT-G--T----TT-T--T-T-A-T---A---GA---CAC----------T----A---T------GT-ACA----G-------C-C--ATGAC-ATTTTTCTA----TGATC--A-CTAT------T-AT----A-TA-T--T--GTT------AC--AACCA-GTTTTT--GTGA----A-AT-TTTC--ATctat
gi|17 : tttgtagttaatagggactttcaagtagtTTG-A--A----TTCT--A---A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GGGATA----TA-T-T--T-CCTTT--T-GTTTTTT-A----TAGAC--A-C--T--------------A-TG-T--------------------ACA-G-C--C--ATGA----C-AT-TTTTCTATGATCA-CT-AT-TA---TA-TATT-------G--T--TA-----C-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TC--A---T-CA--------TGCT--catgct
gi|18 : tttgtagttaatagggactttcaagtagttccaccttcttttgacttcataagattttgcaaaatcaataggaatatggatttcatttagtcttttctaatagttattggggggggggggtcttattaaacataaactatttcaaaacaagttatgtatgaataatcaattatgatatgA-T-T--C-T--AT--T-ATTTTTC-A----CAAAG--A-T--T------T--T----G-TA-T--------------------ACA-A-TTTC--ATAA----A-AT-TATC--ATGAATA-CT-AT-T----TA-T--CATAATAAG--T--TA-----T-AAC-CAGTTTG--TGTGA-AA-ATT--TA--A---T-AA--------TGCC--G--------TT--T---AA---GGATAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACATTG------------------------------------------T-TATGCA----TGTCGCACA-TATAAGAA--------------ATTGTG---ATG-AC---------A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------T----T----ATTAGTTTG--AAC-T-C-CATGA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-----------------TACTTTTATCAT-AT---A-T---TGCGA
gi|19 : tctaagggtaatatctctgtcttcgttgaAA---A----A--------AAAATCCAAGT-TACGGGCATAGACGTAAA--T-GC-T-----T-T---AT--GT---CT---AA--TGAA-G-TTAG-------CAT--ATG----G-AC----AGATC--A---AAGTGATAT---G-TTTCAAA-----------TGAAT------TACA--A--GGGCA--A--TA------AGC-T--C----T--GTCTG-AATT-----T----TTTT--T-C-C-CCCTA---AG-TTCAT----------C----AAAAT------G-AATA----GA-T-TTTC-C--TTG-T-GTTTTTC-AGAAGCACAC--A-T--TGTTTTTT-TT----T-TA-T--T--TTTGTT-A-AGGAAAACA---TTTC--AAGA----A-AT-TGTTTAATGA-TA-CT--T-TAAAATAGT--C-------A--T--TA-----T-CACGCAGTTTTTTTGTGA-AA-TTT--TA--A---T-AA--------tgatgaacttaccataaaacacatttggta
gi|2 : T-CCA-TCCCCATGTGAAGT-----G-A-T-------------A-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ACAATGT----------AGGTAC--A-TA-A-----------A--T---TTTGTT-G-GG-----------AGT------C-----T-TTTCTGACAGTGGG---------T--------TAAT---G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATA-----AAA--C-AC-T-----T-T---AAAAGT---CT---C------A-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATATAGTG-TTTCAAAA---T-T---TTGAATATTGCAC-CA--AA-GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTTTCATTG-C--T----TTCT--A-T---C---A---AG-TCCA------------------------------AT--------T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------TTGT----A-AA-T--T--TTTGTA-A-A------CA-A-TTTA--ATGA----A-AT--ACT--AT-AAT---T-AT--A---TA-T--T-------G--T--AA-----T-AAC-CTGTTTT--GGTGA-CA-TTT--TG--A---T-GAATCATTCATGCTCTG--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-T-ATTTTCTGATGTTAA-TTAAT-ACATGGATT-C-T------GT--------------------------GTCTCGCA-TCTT-AAA--------------AGTACA---ATG-ACC------TAA-TA-TATTC--T--A-TTTG-A-------TAATTT----GTTAGTTTT--AAC-T-C-CAATT--A-A--TGGATTCCAA-AATA-AAT---GTC-ACATT------CTATTCTTATATCAG-GT--AA-T-AATGaatgcagct
gi|20 : TT-----A---A--GAT---CG----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-CG-A----------------------TT-G-G------------AGT------C-----T-T----------------------T--------T------C----C----AAT---A----G--------A---TATC-GT--A--AAAATA----------T-AT-T-----G-C---TAA--T---C----A---T-AATG-TTA--------CAT--ACG----A-G----------------A--TGACAC---G-TTTCAACA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--AGGCA--A--GA------A-C-T-------T--GTTTA-CGTTG----T----TTTT--T-T-A--------------------------------------------TGATA----GA-T-T--TAC--CT--T-ATTT-----------GACG-A-T--T------T-AT------TA-G--T--TTTg
gi|20 : ---ATG-ATA------G-A-TT-TACCT--T--A-TTTG-A-------CGATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-ATCA-AAT---A-C-GCTTT------CTATAATTaactctaataaatggaatcaaatacgctttctataattcgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|21 : ttaagatcgatgcatgataggaacacgattggagtcttttccaatagatatcgtaaaaatatattgctaatcataatgttacatacgagatgacacgtttcaacatattgaatccaaaggcaagaacttgtttacgttgtttttttT-TCA-CCCTCATATGACATCATAAC-A-TGAT--GT-C---AT-AAC--------------ATT--T--TT-----TGCAA--GATCAGTT----A------TGT--ATGGT------------AGGGAC--A--A-A-----------C--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-TTTCCAATA----G---------T--------T------A----T----TGC---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATT-----GAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---T--------C-AA-G-ATA--------TAT--ATG----A-AT----T-GTC--A---A--TTA-AT---A-ATT---AA---T-A---TTGATT------T-CA--A--GGGCA--AGTTATGAAGTA-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-cgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|22 : aaggtattTGAATA-GT-AT-TC---TA-T--C-------T--T--TT-----A-AAC-CTGTTTT--TGTAA-AA-ATTAATG------T-AA--------T--------------TT--T--------------T---T------ATTTTCTGATGCTGA-T-----------------T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCT-TCTTAAAA--------------AGTGCA---ATG-AGC------T-C-TT-AATTT--T--A-GTTG-T-------TGCTTT----ATTAACTGT--ACC-T-C-TTATA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-C-GCTCT------CTATGCTTTTATCAT-AT--AA-T-AACGCGAGTAtccagatcgatagttaaagagttatgtgat
gi|23 : GTAATTCCA-CCCTCCTGTGACATCACA-----TTTT--G--C---AA-TATCACT---------GATT--T-GTT-----T---A--GAT---GT----A------TGC--ATGATGTATGTACATGTAGGAAG--ACTA-ATGAATATACATA--T---AT-GTT-A-G------------AAT------T-----T-T------------T---------T--------TCCAATAG----T----TAATGTA----A--------AAAATCTT-GT-AA--AGCCAA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT--------G---T-AA-G-TTACGTGTATGTAT--CTG----A-AT----A-ATC--A---A--TTATAT---G-TTTCATAA---A-A---TTGAAT------tagggttaaattaattcttaacatttcgactctgatttacttt
gi|24 : aaaTT-G-T------------AGT--------------T------------A---------T--------T------G----T----CAA---C----T--------AAA---TT-GT-TA--AAAATG-----AAA--T-AC-T-----T-C---AAA--T---CT---C---C-AA-G-T-----------AT--A-G----ACAT----T-ATC--A---C--T---AT---A-ATTCAAAA---G-A---TTCAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TT------A-C-T--C----T--GGTTT-CATTG-A--T----TTTT--T-T-T-T---ATCTGG-TGCAT----------C----A---T------GCAATG----AATT-T--C-T--TT--T-ATTTTCT-G----C-TCC--ATT--T------T-GT----G-CA-T--T--TTTGTA-A-AG--
gi|25 : gtaacatcaaattatgcatagtcttctcG-A-TTTT--G--C---AA-AACCGCT---------GATTAAT-ATT-----T---A--GAT---GC----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-T-----------A--TATCTT-GCT-G-A------------AGT------CCTT--T-T------------GCAATAGCTAT--------T------G----T----AAA---A----A--------ATACTC-T-GT-TA--AAAATA-----ACA--T-A--------T-C---AAA--T---TT---A-----AA---------------------G----A-AT----A-TT-------A--T--TAT---G--------------A---TTGATA------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C---------TTT-CATTG-G--TATAATTCT--T-T-A-
gi|26 : aaac----AAA---A----A--------ATAGTTTA-GTGTG--CATGTA-----AAA--T-AT-TACTCCT-CCCAAAAAATGACTT---T---T-AA-G-CAAA-------TAT--AC-----A-CC----A-GCC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAG---T-T---TTGAAT------C-TA--A--GGGCA--A--TA------A-T-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTTT--C-T-ATC---G---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGGTATCTTTA-C-T--A-C--TT--T-ATTTCTC-
gi|27 : ---T-GC-A-ATTTTCTGACATTTA-T--GC-AC---GATT-C-T------GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA----TGTCTCGCA-TCTTTGAA--------------GGTGCG---ATA-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTGAA-------TTTTTT----TTTAGTTTTTAAAT-TCC-TAAT---A-A--CGC------A-AGAG-AAT---A-C-ACTTT-------TATAATTTTATCAG-AT--GA-T-
gi|28 : GA-AG-TTT--TC--A---A-AA--------TGCT--G--------TT--TTAAAA---GGAAAAT---T-GA-A-ACTTTCCAATGTTGA-T------C------------------T-------------T-TATGTA----TGTCTCCCA-TCTTAAAATTGAAGTAAAAAAAAGTAC----ATG-GCC------A-A-AA-TATTT--T--A-TCCA-A-------TAATTC----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAAAA--A-A--TGG------A-AATATAAT---g
gi|29 : TGA-AC-TTT--TG--A---T-A---------TGCT--G--------TT--G---AA---GGAAAAT---T-GC-A-CTTGTTAGACGTTGG-T--AT-AT---GATT-C-T------GT-------------T-TATGCA----CGTCTCACA-TCTTCAAA--------------AGTGCG---Attca
gi|29 : tca--AAC-T-C-TAAGA--A-A--TGA------A-AATG-AATGT-A-C-ACTTTAGCTCTTTATACTTTAATCCA-AT--AA-C-AATGCGAGTAactctaagaaatgaaaatgaatgtacactttagctctttatactttaatccaataacaatgcgagta
gi|3 : tcatgaacttttgatatgctgttgaaggaaaattgcacttgttagacgttggtatatgattctgtttatgcacgtctcacatcttcaaaagtgcgGCAGT-CCA-CCCCAGTGTGATGTCA--AC-A-TTTT--G--A---AA-AATCATA---------GATT--T-ATC-----T---A--GAT---TT----A------TCC--ATGAT------------AGATAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GAT-G-G------------A--------T-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATG-----AAA--T-AT-T-----T-T---AAAAGA---CT---A---C-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---T--TGATAT---G-TTTTAAAA---C-C---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------G-C-T--C----T--ATTTT-AATTG-A--T----TTCT--T-T-A-G---A---AGGTCCAT----------TTAATA---T------GTGATA----GG-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-C----CACAC--A-T--T------TAGT----A-TA-T--C--TTTGTA-ATAA--AAACA-G-TTTC--ATGA----T-AT-TCTT--ATTAACA-CT-AT-CA---TA-T--C-------A--T--TA-----T-AGC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------CT--T---AA---GGAAAAG---T-AG-A-ATTTCCTGGCGTTGA-T--AT-AT---AATT-T-T------GT-------------T-TATGCA----TGTTTCACA-TCTTAAAA--------------AGTGTA---ATA-ACT------T-A-CA-TATTT--T--A-TTTC-A-------TAATTT----ATTACTTTT--AAC-C-C-TAGCA--A-A--TGG------A-AAT--GAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-CT--TA-T-AATGGGAGTA
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gi|31 : ct---A---T-AA-G-TTA--------TGG--ATG----A-AG----A-ATG--G---A----GTA-------------------A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--C--TG------G-C-T--A----T--ATTTT-CATTT-A--T----TTCT--T-C-A-TG--A---AG-ACTGT----------T----A---T------GTGATA----GATT-T--C-C--TT--T-GTT-------------------T--T------T-GT----A-TA---------TGTA---------------------ATGA----A---------------TA-CC-AT-TA---TA-T--T-------A--T--TA-------AAC-CAGTTTT--
gi|32 : GTAATTCCA-CTTTCATGTTACGTCATATG-ATTTTT--G--C---AA-A---------------------T-ACC-------------AT---TG----A------TGC--GTGTT------------AGGAGT--A-AA-A-----------A--A---AT-GTT-G-GGGTAC-------GGT------C-----T-TTCCCGATA----G---------T--------T------A----T----TGC---T----A--------TGATTCTT-TT-TT--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C----GAAGT---Cgttgata
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gi|35 : GTAATTCCA-CCCTCATTTGATATCAAAAG-A-TTTT--G--C---CA-AGTCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATAAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--TC--TT-GTG-G-A------------AGT------G-----T-T------------aaat
gi|36 : taaa-TACGTA----TGTCTTGTA-TCTTTAAA--------------A---------T--ATC------T-G-TA-TATTG--T--A-TT-G-AAA-----TGATTT----ATTAGTTTA--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AAGA-AAT---A-C-ATTTG------ATATACTTTTGTCAA-AT--AA-T-AATGCGAGTAttccagtaatcttaagaatacaaaatacc
gi|37 : taTGATATCACAAG-A-TTTT--G--C---AA-ATTCATT---------GAT------TT-----T---A--GAG---TT----ACCGGTGTGC--ATGAT------------AGGAACTTA-AA-A-----------A--T---TT-ATT-G-G------------AAT------C-----T-T------------ta
gi|38 : aataacaaggatttaaacc-T--T------T-GA----A-TA-T--T--TT-----A-CG--AAGCA-G-TTTC--ATGA----A-AT-CATT--AGAAATA-CT-AT-CA---TA----------------------------AC-AAGGTTT--TGTGA-AA-CTT--TG--T---T-TA--------TGCA--G--------TT--T---AA---AGAAAAT---T-GTAA-ATGTTTTGGTGTTttccaatagttattggaaaaaaa
gi|39 : ccatatcA--A--GGGCA--A--TG------G-C-T--C----T--ATTTT-CATCG-A--T----TTCT--G-T-G-CT--G---TG-TCTGA----------T----A---T------GTGATA----GA-T-T--T-C----------CTTTC--------------------------------------T--T--TTTGTA-A-AG--AA-------------------------TGTT--ATGAATA-TT-AT-GA---TA-T--T-------G--T--TA-----A-AAC-TAATTTT--T
gi|4 : TCATGTGACATCATAGG-A-TTTT--G--CAAAAA-AATCACT---------GATT--T-GTT-----T---A--GAT---TT----A------TTCATATGGT------------AGGAAC--A-TG-A-----------G--T---GT-TTT-GCG------------A--------------T-A------------G---------T--------T------A----T----AGT---A----A--------AAAATCTT-AT---------TA-----AAA--T-GT-T-----T-A---AAAAGT---CT---C---T--C-G-TTA--------TAt
gi|4 : agcagttacaattA-G-TTA--------TA---GTA----A-AA----A-ATCTTA---T--TAAAAT---G-TTTAAAAAG--T-C---TC---T------C----------GTT--A--TA------A-C-T--CCCCGT--GTTTG-C--TG-AAAT----TCCTAAT-T-ATC---A---AA-TCCAC----------T----------------------------T-T--T-C--TC--T-AATTTTC-A----CAGAT--A-T--T------T-TT----G-AA-TCGT--TTTGTAGA-AG--TAA---G-TTTC--ATGA----A-GT-TGTT--ATGAATC-TT-AT-TA---T-------------G--A--GA-----T-AAG-CA----T--TAAAA-AA-TTT---G--A---T-CA--------TTCT--G--------TT--T---AA---GGA---------------CTTTCTGACCTTGA-T--GT-TC---TGTG-TAT------GT-------------A-CATGTA----TGTCTCGCA-TTT--GAA--------------GGTGTG---ATG-AAC------T-A-T--T-TTT--C--A-CTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTTTGAAT-T---TAGTG--A-A--TGG------A-AATA-GAT---A-T-GCATT------CTATACTTTGATCAG-AT--GA-T-AGTGGGAATactccccgtgtttgctgaaattcctaattatcaaatccacttttctctaattttcacagatatttttgaatcgttttgtagaagtaagtttcatgaagttgttatgaatcttattatgagataagcattaaaaaatttgatcattctgtttaaggactttctgaccttgatgttctgtgtatgtacatgtatgtctcgcatttgaaggtgtgatgaactatttttcacttgataatttattagtttttgaatttagtgaatggaaatagatatgcattctatactttgatcagatgatagtgggaatggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
gi|40 : agcagttacaatttcatgtgacatcataggattttgcaaaaaaatcactgatttgtttagatttattcatatggtaggaacatgagtgttttgcgatT-TCA-CCCTCCTGTGACATCATAAG-A-TTTC--G--C---AA-AATTAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAA---TT----A------TGC--AAGAT------------AACAAC--A-CA-A-----------C--T---TT-GCC----------------AAT------A-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---ggggttactttacatgataagaccatgccagggcgacactaaacccagacaggcattaa
gi|41 : taaagtagcA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTCATCAA-----AA-T-AATGCAAGctagaaacttt
gi|42 : taaagttacc---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-TTTCTGATA----G---------T--------T------A----T----TGT---A----A--------AACATCTT-GT-TA--AATGTA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAACAT---GT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--TTG----A-AT----T-ACC--A---A--T--------------AAA-----------TGAAT------C-AA--A--GGGCA--A--TA------A-C-aatggggttacctttgattaaatattgactcatataaactccttgacctttacttt
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gi|5 : ttagggtagcATGTGATGTCACAAG-A-CTTT--G--G---AA-AATCAAT---------GATT--T-AC---------------------------------AC--ATGAT------------AGGACC--A-TC-A-----------A--T---TTTGTT-G-G------------AGT------G-----T-T------------T---------TCCGATAGAT------G----T----CGC---A----C--------AAAATCTT-GT-TG--AACATA-----AAA--T-GT-A-----T-C---AAAAGT---CC---G---C----G-TTA--------GAT--TTA----A-AT----A-ATT--A---A--AGATAT---G-CTTCAAAA---T-A---TTGCAA------C-CA--A--GGGCA--A--GA------A-C-T--C----T--GTTTC-CATTG-A--T----T-------------------------AT----------C----A---T------GTGATA----GG-T-T--TTC--TT--T-ATTTT-----------------------------GT----A-CA-T--T--TTTGTA-A-AA--AAAAA-G-TTTC--ATGA----A-AT-AGTT--ATGAATA-CA-AT-CA---TG-T--C-------A--TAATA-----TCAAC-CTGTTTT--TGTGATAA-TAT--TG--A---T-AA--------AGCT--G--------TT--T---AT---GGAAAAC---A-GC-A-ATTCTCTGACATTGA-T--AT-AT---GATT-C-T------GT-------------T-TATGAA----AGTCTTACA-TCTTAAAG--------------CATGTG---ATGAACA------T-A-TA-TATTT--T--A-TTAG-A-------TAATCT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TGATA--A-------------------------------------------ATACTTTTATCCA-AT--AA-T-AATGaattaagaaatta
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gi|52 : GTAATTCCA-TCCTCGTATGGTGTCATCAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------G
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blockSeqs : T . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . AT . T . . GTTTTTTTTTTCAATACTTATTGTAAAAA . . A . . . . . . . T CTAGACT . . G . . . CAG . . . A T . . G GTC . . . A . . . . . . . . . A . . . ATCA . AT . GC TAT . TTC . . . TATGATCACTATTATAT . C . A ATAA T . . . . T . . . . . CATTTTATT . . . . . . . G . . . . . . . . C ATCCAATTTTAATGCTGT . T . . . A G . C . . . A . . AA . TTG . . . . . . . . . . . . C T . . .
blockSeqs : T . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . T . T . . GGTACGGTCTTTCCCGATAGTTATTGCTA . . G . . . . . . . A CTAGACT . . A . . . TA . . . C T . . T TTG . . . . . . . . . . . . . G . . . ATCA . T . GC AAT . TA . . . CCAGATGTTTTGTAT . . . G GAAG G . . . . . . . . . . CATAATATC . . . . . . . A . . . . . . . . A TTATATGATTCCGTC . T . . . T G . A . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . C G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AGTCCTTTTGCAATAGCTATTGTAAAAA . . C . . . . . . . A CTAGACT . . . . . . TA . . . T T . . C TA . . . . . . . . . . . . . A . . . GCTA . T . GC AAT . TT . . . CAGATTAATTTGTAT . . . G AAG G . . . . . . . . . . ATTGTTAC . . . . . . . C . . . . . . . . A TGTTCTGTGTATGT . T . . . G G . C . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . C T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AATCTTTTCTGATGACTATTGTAAAAA . . A . . . . . . . A CTAATG . . . . . . TA . . . G T . . C AA . . . . . . . . . . . . . A . . . ATCG . T . GC GAT . TT . . . ACAGACATTTTGTAA . . . G AAG A . . . . . . . . . . CCTTATA . . . . . . . A . . . . . . . . A TATTATGATTTTGT . T . . . G A . C . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . A G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AATTTTTTTCCAATAGTTAATGTAA . . A . . . . . . . A CTCC . . . . . . TA . . . G C . . C TA . . . . . . . . . . . . . A . . . ATCG . A . GT TAT . C . . . CCACACATTTAGTAT . . . G AAG G . . . . . . . . . . CGTTAA . . . . . . . A . . . . . . . . T TATATGATTCTGT . T . . . G A . C . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . C . . . . AGTCTCTTCCAAATTAAAATTGTA . . A . . . . . . . A CTAC . . . . . . TT . . . G T . . C TA . . . . . . . . . . . . . A . . . ATCA . T . GG GAT . T . . . ACAGATATTTTGTAT . . . G ACG A . . . . . . . . . . CATTAT . . . . . . . G . . . . . . . . A TATATAATTTTGT . T . . . G G . T . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . C G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . A . . . . AGTCTTTTCCAATAGTTATTGCAA . . A . . . . . . . A TACT . . . . . . TA . . . G T . . C TT . . . . . . . . . . . . . G . . . ATGA . T . GC GA . C . . . CCAGAAATTTGTAAT . . . G AAG A . . . . . . . . . . TGTAAT . . . . . . . A . . . . . . . . A TATATGATATTAT . C . . . G G . C . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AGTCTTTTCTGATAGTTATTGTAA . . A . . . . . . . A CTCT . . . . . . TT . . . T T . . C TT . . . . . . . . . . . . . A . . . GCTG . C . GC GA . C . . . AAACACATTCTGTGT . . . G AAG G . . . . . . . . . . CTTTTA . . . . . . . A . . . . . . . . A TATATGATTCTGT . T . . . G A . C . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . C G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AGTGTTTTCCGATAGATGTCGCAC . . A . . . . . . . A GTAT . . . . . . TA . . . T T . . C TA . . . . . . . . . . . . . C . . . ATCA . C . GT GA . T . . . CCAATATTATATGC . . . G AAA A . . . . . . . . . . CATTAT . . . . . . . A . . . . . . . . A TATATGGTTTTGT . T . . . G G . G . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . A A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AATCTTTCTGATGGTAAGTGTA . . A . . . . . . . A CCGC . . . . . . CA . . . G C . . T TA . . . . . . . . . . . . . A . . . GTCA . T . GC GA . C . . . CTGATATTGTACAT . . . G ACG G . . . . . . . . . . AATTAT . . . . . . . A . . . . . . . . A TATTATGATTTGT . G . . . G G . A . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . A G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . A . . . . ATCTTTTCCGATAGATAATGTA . . A . . . . . . . A CTAT . . . . . . TA . . . G T . . C AA . . . . . . . . . . . . . G . . . ATCT . T . GT TA . C . . . GCTCCATTTTGTGC . . . G AAG G . . . . . . . . . . TGTTAA . . . . . . . T . . . . . . . . A TATTGTTTTTGT . T . . . A A . C . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . A . . . . AATGGGTATTGTACAAA . . A . . . . . . . A CTT . . . . . . TA . . . G A . . A GA . . . . . . . . . . . . . A . . . ATCT . T . GT GA . C . . . ACAGATATTTTTGA . . . G AAA G . . . . . . . . . . AATTTT . . . . . . . C . . . . . . . . A ACAATTATTGT . A . . . G A . C . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . C G . . .
blockSeqs : . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . G . . . . AGTCTTTTCCAATAG . . G . . . . . . . C CTA . . . . . . GA . . . A T . . C TT . . . . . . . . . . . . . A . . . ATGA . T . GT GA . A . . . CTAGAAATCTGTAT . . . G AAG G . . . . . . . . . . AATTTT . . . . . . . T . . . . . . . . T TATGCTTGT . T . . . A A . C . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . C G . . .
blockSeqs : . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . C . . . . AGTTATTGTCAACT . . A . . . . . . . A TGT . . . . . . AA . . . G T . . C CC . . . . . . . . . . . . . A . . . ATC . T . GT GG . C . . . ACAAAGATTTTGT . . . A TAG G . . . . . . . . . . CATTAA . . . . . . . G . . . . . . . . A TTGT . . . . . G T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . A . . . . ATTTGTTGTAAAAA . . T . . . . . . . A CTC . . . . . . TT . . . G A . . G TG . . . . . . . . . . . . . A . . . GCA . C . GT TA . C . . . CCAAATATTTTGT . . . A AAG G . . . . . . . . . . TATTA . . . . . . . A . . . . . . . . T TCT . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . A . . . . ATAGTTATAGTAA . . A . . . . . . . A CAT . . . . . . TA . . . G T . . C TA . . . . . . . . . . . . . A . . . ATA . C . GT GA . C . . . GGAAAACGTGTAA . . . . AA G . . . . . . . . . . GAGAT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGGGGG . . A . . . . . . . A TTA . . . . . . TA . . . G C . . C TG . . . . . . . . . . . . . A . . . ACA . T . GT GA . T . . . ACAGATATTTT . . . . AC G . . . . . . . . . . AATTT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A GT . . . . . . TA . . . G . . . . TG . . . . . . . . . . . . . C . . . AGA . T . GT GG . T . . . ATAGACACTAT . . . . AA . . . . . . . . . . . TTTCC . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . CT . . . . . . A . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . A . . . TTC . T . T TA . T . . . GACGATTTATT . . . . . . . . . . . . . . . . TTAT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . AC . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . TCT . T . G TA . C . . . CAGAATTGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . AA . . . T G . C . . . TTTGTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CA . . . . . . C . . . ACAGAC . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . GTAC . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : A** CTAT********** ** ** A*** CAGACATTTTGTAT********************** AAG**** ******** *** TATATGATTCTGT****************************
originalCons : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTC-A----CAGAC--A-T--T------T-GT----A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T--AT-AC---GATT-T-T------GT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
finalCons : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGTCTAT----------AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CATTGA---T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-C--TT--T-ATTTTTCCAGACATTTTGTAT----------------------A-T--T--TTTGTAAAG----AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-T--C-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--A---T-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGATATATGATTCTGT----------------------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|54 ): AGAGATCTTAAGTGCTGTTCCACGTAAGAATCATG
Alignments
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lowQualScore : . . . . .. .. ... . ........... .. . ..... ... .. ... .... ...... .. ............ .. . . .............. ... . . . .................................................................................................. . . . ... ..... .. . . ..... . ... . .............. . . ........ .. .... . ....... .. ... .. . . ... . . ......... ...... . .. .. .. .. ...... . . .. .... .. . . . .. .... .. . ........... . ............................ ....... . .... .. . ...................... ........ . .... .... .. . ... ... . ... .. .... . . .. . . . .... . ....................... . .. . . .. .. . ........ .. ........ .. ... ... ... . ... . . .................. ............. . . .... . . . .............. . .... . ....... . . . .. .. . ......... . .... ... . . . .. . .. ...... . . ... . . ....... .. .. . .
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consensus : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CAT-TG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-CTT--T-ATTTT----T-C-----C-A-G--A-CATT-----T--T-GT-A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-TC-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--AT-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T----AT---ATG-ATT-CTGT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
Reference ( family-1992 ) : GTAAT-CCA-CCCTCATGTGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A---T-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CAT-TG-A--T----TTCT--T-T-A-C---A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T--C-CTT--T-ATTTT----T-C-----C-A-G--A-CATT-----T--T-GT-A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-AT-TA---TA-TC-------G--T--TA-----T-AAC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--AT-AA--------TGCT--G--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACGTTGA-T----AT---ATG-ATT-CTGT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------TAATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-AATA-AAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-AT--AA-T-AATGCGAGTA
gi|1 : ACGCCATACG-A-TTTT--A--T---AA-AAT-AAT---------GCTT--T-ATG-----G---A--GAT---TC----G------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-C-----------A--T---TTTGTTTG-G------------GGT------C-----T-TTTCCAAGGTT--A---------T--------T------G----T----GAA---T----ATATATTTCAAAATCTT-AT-T-------TT-----ATA--T-GT-T-----T-C---AAAAGT--------A---T-AC-G-TTG--------TGT--GTG----C-AA----A-ACC--A---A--TGATAT---G-TTTTAAAA---T-A---TTGAAT------C-TG--A--GGGCATTA--CA------T-C-TAAC----T--ATTTT-CA-------------TTCT--T-TAA-C---A---AG-TCCAT----------T----A---C------GCGATA----AA-TGT--C-TTT--TGATTTT----T-A-----C-T-G--G-C-------------------A-T--T--TTTGTG-ACAG--AGACA-G--------TGA----ATAC-TACT------ACA-TT-ATGTA---TA-TC-------G--T--TA-----T-AAC-CAGCTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--AT-TA--------TGCT--ACATGTATTTT--T---AAAAGGAAAAAT---TAGC-A-A-TTTCTG-------------------------------------------------TA----TGTCTC-TA-TCATAGAA--------------AGTGCG---ATG-ACC------T-A-TA-TATCT--T--A-TTTG-G-------TCAGTT----ATTATTTTC--AAC-T-C-T-ATA--C-A--TAG--------------AT---A-C-ACATA------TTATACTTCTATCAA-AT--AA-T-AATGCTAGTA
gi|10 : T-CCA-CCCACATGTGA-----TAA-------T-----C---AATGATCCAT---------G-TA--T-ATC-----T---A--GGT---TT----C------TGT--CTGAT------------TGGAAC--A-TCTA-----------T--T---TT-GTT-G-G------------AGTATGTTACAATAGT-T------------T---------T--------T------G----TAAAAAAA---A----A--------AAAAACTT-GC-TG--AACATG-----AAA--C-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT-------T-AA-G-TTT--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATAT---G-TTTTGAAC---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--CA------A-C-T--C----T--GTTTT-CAT-TC-A--T----TTCT--T-T-A-T---C---AA-TTCAT----------------------------GATA----GATT-T--C-TTT--T-ATTTTC---C-C-----C-A-G--A-TGTT-----T--T-GT-A-TA-GAATAATTTGTA-A-AG--AAACA-T-TTTC--ATGAATTCA-AA-TGTT--ATGAATT-CT-AT-TT---TA-TC-------ATTT--TAT----T-AAC-CAGTTTT--TATGA-AA-TTT--TG--ATAAA--------TACT--G--------TG--G---GA---AAAAAATGAAT-GC-CTATTTTCAGACATTGA-T----tggagttaccttgataagtcaattttgtagtgccgacaccactagactagattaa
gi|11 : aaattA-CCCCCCTGCGATGTCATCAG-A-TTTT--G--A---AA-AATCAAT---------GATT--T-TTTGTTTTT---T--GTT---TTTTAAA------GGT--ATGAT------------AGGATA--A-TG-A-----------A--T---TTTGTT-G-G------------AAT------C-----T-TTTCTGATGACT-A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AA--TTCT-GT-TA--AACAAA-----AAA----AT-T-------A---AAAAGT--------G---T-AA-A-TTA--------TAT--AT--------------------A---A--TG---T---G-TTTCAAAA---A-A---TTGAAT------C-CA--A--GGACA--A--T-------------------T--G-TAT-CATGCA-A---------------T-A-T---A---TA-TC--T----------T----A---T---------AT----------------TT--A-ATTTT----T-A-----C-A-G--A-TATT-----T--T-GT------T--T------------------CA-G-TTTC--ACGA----A-AT-CGTT--ATGAATA-CT-AT-TT---TC-TC-------C--T--TA-----TAAAT-CAGTTTC--TGTGA-AA-TAA--TG--AT-AA--------TGCT--G--------TT--C---AA---AGAAAAC---T-GC-C-ATT-------------------T---ATG-CT---TGT-------------C-T-----------CCTCGCA-TCTTAAAA--------------AGTGTG---ATG-AC
gi|12 : aagtaattccacccca---A----G--------AAAATCTT-TT-TG--AACATA-----AA---T-AT-T-----T-T---AAATGT---CT--------------TGA--------TAT--ATT----A-ATCACAA-ATC--A---A--TAATAT---G-TATGAATG---T-A---TTGAAT------T-CA--A--GGGTT--G--TA------A-C-T--C----C--GTTTT-CTT-TG-G--T----TGCT--T-T-ATC---A---AG-TCTAT----------T----A---T------GCGATA----GA-T-T-----TT--C-ATTTT----T-C-----C-C-A--A-TATT-----A--T-AT-G-CA-T--T--TTTGTA-A-A-----------T-------------A-AT-TGTT--AT--------------------------------------------AAC-CAGTTTT--TGTG---A-TTT--TATTAT-GA--------AGTT--G--------TT--T---AA---GAAAAAG---T-TC-A-TATTTCTAATGTTCATT----AT---ATG-ATT-CCGTC------------T-TAAATAATTCTATCTTATA-TCTTAAAA--------------ATTGTG---ATG-ACCTACATGT-A-TA-TATGT--T--A-TTTG-ATACATTGTAATTT----AAAAGTTTT--AAA-T-C-TAATA--A-A--
gi|13 : agggagccttttcgaatagccactgtGTAAT-TCAACTCTCAAGTGATGTCAAAAG-A-TTTT--A--C---AA-AATCCAT---------AATT--T-ACT-----T---A--TAT---TT----A------TGC--ATTAA------------AGGAAC--A-TA-A-----------A--T---CT-GTT-C-A------------AAT------G-----GGT------------A---------T--------T------G----T----ACA---A----A------------TCTT-GT-TC--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---CT---A------A-G-TTAA-------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--T------------T----A---T-A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTC-TAT-TC-A--T----TTCC--T-G-ATC---A---AG-TCTGTTTAATATATAT----A---T------GCACTC----GA-T-TTCC-TTT--T-ATTTT----T-C-----T---G--A-TATT-----G--T-AC-A-TA-TC-T--TTTATA-A-AG--AAACA-G-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CC-AT-g
gi|14 : aT-CCA-CCCTCATATGACGTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AACCAAT---------GATT--TCATA-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ATACT------------AGGAAC--A-TA-A-----------AT-T---TT-GTT-G-A------------AGT------C-----T-C----------------------T--------TCCAAA-T----T----AAA---ATTGTA--------AAAATCTT-AT-CA--AACACA-----AAA--TAATAT-----C-C---AAAAG-----T---G---T-CA-A-TTA--------TATACATGTATTA-ATAC--A-ATC--A---A--TCATAT---G-TGCTGAAA---T-T---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-A--C----TTAGTTTT-CA-----A----------G--T-C-A-----A---AG-TCCAT----------T----A---T------GCAAAA----GA-TGT--T-CTT--T-ATTTT----T-------C-A-G--ATTAAT-----T--T-GT-A-TA-T--T--TTTGTA-A-AG--AAACA-A-TTTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATA-CT-TT-TT---TA-TC-------G--C--TATACATT-AAT-AAGTTTT--TGTGAGAA-TTT--TG--AT-AA--------TGCaagaaaatcaaaacgtttggaaatagtttcacaaaattcaataacaatttacaattattttt
gi|15 : gaaatTGACGTAATCAGTG-CTTTCAGATC---AA-ATTCAA-----------ATT--T-ATA-----T---ATTGTT---TA----A------TGC--ACGAT------------AGGAAC--T-TA-A-----------AATT---TT-GTT-G-GGTTTTTTTTTTCAATA-----C-----T-T------------A---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAA----T-GT-TA--A---TA-----AAAATT-GT-T-----TAC---GATAGT---ATTCAA---A-AA-GACTA--------TA---ACA----A-A-------ATC--A---T--TTA-AT---A-TTTCAAAA---T-AGGATTGAAT------G-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-TAT-AT-A--T----TTCT--T-T-G-CT--A---AG-TTCAT----------T----A---T------GCGATA----TATT-T--C-CTT--T-ATTGT----G-CA----C-A-G--A-C-------------------C-T--T--TTCGTA-A-CG--AAAC----TTTTAAATGA----T-AT-TGTT--ATGGACG-CA-AC-TG---TA-TC-------G--T--TA-----A-ATC-CAATTTT--TGTGA-
gi|16 : cagcT------C-CA--AAGGGGTA--A--TC------A-G-T--C----T----------T-GG-A--C----TTCT--T-C-ATC---G---AG-TTCAT----------A----A---T------T--AAA----GA-T-TTTC-CTT--T-ATTTT------------C-A-G--A-CACT-----TGTC-GTTA-AA-C--T--TTTGTG-TTAG--AAACACGCTTTC--ATGA----A-AG-TGTT----------------TA---CA-T-----------T--TA-----T-AAC-CAGTTTTA-TGTAA-AAATCC--TG--AT------------GCT--T--------TTCTT---AA---GGCAAAG---T-GC-A-ATTTGTTAACGTCAA-----------ACA-ATTATTGT-------------T-TAT-------TGTCTCACAGTCTTAGAA--------------AATGTGAA-ATG-ACC------T-T-TAGCATTTA-T--A-TT---A-------TG--TT----ATTGGTTTTTCAAC-T-C-CAATAGCA-AGTTGA------AGAATG-AAT---A-C-ATT-------------CTTTTATCAT-ATTCAATT-AATGCTAG
gi|17 : taaaactT-CCA-CCTTCTTTTGACTTCATAAG-A-TTTT--G--C---AA-AATCAATAGGAATATGGATT--TCATT-----T---A--GTC---TT-----------TTC---TAAT------------AG------------------------------TT-ATT-G-G------------GG-----------------------------------------------------------------GG---G----G--------GGGGTCTT-AT-TA--AACATA-----AAC--T-AT-T-----T-C---AAA-----------A---C-AA-G-TTA--------TGT--ATG----A-AT----A-ATC--AATTA--TGATAT---G-TT---GAATTCT-A---ACAAGT------C-CATTAT-GGG----A--TA------------------T--ATTTC-CTT-TT-G--T----TT-T--T-T-A-T---A---GA---CAC----------T----A---T------GT-ACA----G-------C-CATGAC-ATTTT----T-C-----T-ATG--ATCACTA----T--T-AT-A-TA-T--T--GTT------AC--AACCA-GTTTTT--GTGA----A-AT-TTTC--ATctat
gi|18 : tttgtagttaatagggactttcaagtagtA-T-T--C-TAT--T-ATTTT----T-CA----C-A-A--A-GATT-----T--T-GT-A-TA-----------------------CA-A-TTTC--ATAA----A-AT-TATC--ATGAATA-CT-AT-T----TA-TCATAATAAG--T--TA-----T-AAC-CAGTTTG--TGTGA-AA-ATT--TA--AT-AA--------TGCC--G--------TT--T---AA---GGATAAT---T-GC-A-ATTTTCTGACATTG-------------------------------------T-TATGCA----TGTCGCACA-TATAAGAA--------------ATTGTG---ATG-AC---------A-TA-TATTT--T--A-TTTG-A-------T----T----ATTAGTTTG--AAC-T-C-CATGA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-----------------TACTTTTATCAT-AT---A-T---TGCGAcatgct
gi|19 : tctaagggtaatatctctgtcttcgttgaAA---A----A--------AAAATCCAAGT-TACGGGCATAGACGTAAA--T-GC-T-----T-T---AT--GT---CT---AA--TGAA-G-TTAG-------CAT--ATG----G-AC----AGATC--A---AAGTGATAT---G-TTTCAAA-----------TGAAT------TACA--A--GGGCA--A--TA------AGC-T--C----T--GTCTG-AAT-T-----T----TTTT--T-C-C-CCCTA---AG-TTCAT----------C----AAAAT------G-AATA----GA-T-TTTC-CTTG-T-GTTTT----T-CAGAAGC-A-C--A-CATTGTTTTT--T-TT-T-TA-T--T--TTTGTT-A-AGGAAAACA---TTTC--AAGA----A-AT-TGTTTAATGA-TA-CT--T-TAAAATAGTC-------A--T--TA-----T-CACGCAGTTTTTTTGTGA-AA-TTT--TA--AT-AA--------tgatgaacttaccataaaacacatttggta
gi|2 : T-CCA-TCCCCATGTGAAGT-----G-A-T-------------A-AATCAAT---------GATT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------TGC--ACAATGT----------AGGTAC--A-TA-A-----------A--T---TTTGTT-G-GG-----------AGT------C-----T-TTTCTGACAGTGGG---------T--------TAAT---G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATA-----AAA--C-AC-T-----T-T---AAAAGT---CT---C------A-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---A--TGATATAGTG-TTTCAAAA---T-T---TTGAATATTGCAC-CA--AA-GGGCA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTTTCAT-TG-C--T----TTCT--A-T---C---A---AG-TCCA------------------------------AT--------T-T--C-CTT--T-ATTTT----T-CA----C-A-G--A-CATT-----T--T-GT-A-AA-T--T--TTTGTA-A-A------CA-A-TTTA--ATGA----A-AT--ACT--AT-AAT---T-AT--A---TA-TT-------G--T--AA-----T-AAC-CTGTTTT--GGTGA-CA-TTT--TG--AT-GAATCATTCATGCTCTG--------TT--T---AA---GGAAAAT---T-GC-T-ATTTTCTGATGTTAA-TTAATAC---ATGGATT-CTGT--------------------------GTCTCGCA-TCTT-AAA--------------AGTACA---ATG-ACC------TAA-TA-TATTC--T--A-TTTG-A-------TAATTT----GTTAGTTTT--AAC-T-C-CAATT--A-A--TGGATTCCAA-AATA-AAT---GTC-ACATT------CTATTCTTATATCAG-GT--AA-T-AATGaatgcagct
gi|20 : TT-----A---A--GAT---CG----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-CG-A----------------------TT-G-G------------AGT------C-----T-T----------------------T--------T------C----C----AAT---A----G--------A---TATC-GT--A--AAAATA----------T-AT-T-----G-C---TAA--T---C----A---T-AATG-TTA--------CAT--ACG----A-G----------------A--TGACAC---G-TTTCAACA---T-A---TTGAAT------C-CA--A--AGGCA--A--GA------A-C-T-------T--GTTTA-CGT-TG----T----TTTT--T-T-A--------------------------------------------TGATA----GA-T-T--TACCT--T-ATTT-----------------G--A-CGAT-----T--T-AT---TA-G--T--TTTg
gi|20 : ---ATG-ATA------G-A-TT-TACCT--T--A-TTTG-A-------CGATTT----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAATA--A-A--TGG------A-ATCA-AAT---A-C-GCTTT------CTATAATTaactctaataaatggaatcaaatacgctttctataattcgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|21 : ttaagatcgatgcatgataggaacacgattggagtcttttccaatagatatcgtaaaaatatattgctaatcataatgttacatacgagatgacacgtttcaacatattgaatccaaaggcaagaacttgtttacgttgtttttttT-TCA-CCCTCATATGACATCATAAC-A-TGAT--GT-C---AT-AAC--------------ATT--T--TT-----TGCAA--GATCAGTT----A------TGT--ATGGT------------AGGGAC--A--A-A-----------C--T---TT-GTT-G-G------------AGT------C-----T-TTTCCAATA----G---------T--------T------A----T----TGC---A----A--------AAAATCTT-AT-TA--AACATT-----GAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT---T--------C-AA-G-ATA--------TAT--ATG----A-AT----T-GTC--A---A--TTA-AT---A-ATT---AA---T-A---TTGATT------T-CA--A--GGGCA--AGTTATGAAGTA-C-T--C----T--GTTTT-CAT-TG-cgatttaagtattgcgcttttactgtctaccagagtgacgatttcattag
gi|22 : aaggtattTGAATA-GT-AT-TC---TA-TC-------T--T--TT-----A-AAC-CTGTTTT--TGTAA-AA-ATTAATG---T-AA--------T--------------TT--T--------------T---T------ATTTTCTGATGCTGA-T------------------TGT-------------T-TATGTA----TGTCTCGCT-TCTTAAAA--------------AGTGCA---ATG-AGC------T-C-TT-AATTT--T--A-GTTG-T-------TGCTTT----ATTAACTGT--ACC-T-C-TTATA--A-A--TTG------A-AATA-AAT---A-C-GCTCT------CTATGCTTTTATCAT-AT--AA-T-AACGCGAGTAtccagatcgatagttaaagagttatgtgat
gi|23 : GTAATTCCA-CCCTCCTGTGACATCACA-----TTTT--G--C---AA-TATCACT---------GATT--T-GTT-----T---A--GAT---GT----A------TGC--ATGATGTATGTACATGTAGGAAG--ACTA-ATGAATATACATA--T---AT-GTT-A-G------------AAT------T-----T-T------------T---------T--------TCCAATAG----T----TAATGTA----A--------AAAATCTT-GT-AA--AGCCAA-----AAA--T-AT-T-----T-C---AAAAGT--------G---T-AA-G-TTACGTGTATGTAT--CTG----A-AT----A-ATC--A---A--TTATAT---G-TTTCATAA---A-A---TTGAAT------tagggttaaattaattcttaacatttcgactctgatttacttt
gi|24 : aaaTT-G-T------------AGT--------------T------------A---------T--------T------G----T----CAA---C----T--------AAA---TT-GT-TA--AAAATG-----AAA--T-AC-T-----T-C---AAA--T---CT---C---C-AA-G-T-----------AT--A-G----ACAT----T-ATC--A---C--T---AT---A-ATTCAAAA---G-A---TTCAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TT------A-C-T--C----T--GGTTT-CAT-TG-A--T----TTTT--T-T-T-T---ATCTGG-TGCAT----------C----A---T------GCAATG----AATT-T--C-TTT--T-ATTTTCTGCT-C--------------CATT-----T--T-GT-G-CA-T--T--TTTGTA-A-AG--
gi|25 : gtaacatcaaattatgcatagtcttctcG-A-TTTT--G--C---AA-AACCGCT---------GATTAAT-ATT-----T---A--GAT---GC----A------TGC--ATGAT------------AGGAAC--A-TA-T-----------A--TATCTT-GCT-G-A------------AGT------CCTT--T-T------------GCAATAGCTAT--------T------G----T----AAA---A----A--------ATACTC-T-GT-TA--AAAATA-----ACA--T-A--------T-C---AAA--T---TT---A-----AA---------------------G----A-AT----A-TT-------A--T--TAT---G--------------A---TTGATA------C-CA--A--GGGCA--A--TA------A-C-T--C---------TTT-CAT-TG-G--TATAATTCT--T-T-A-
gi|26 : aaac----AAA---A----A--------ATAGTTTA-GTGTG--CATGTA-----AAA--T-AT-TACTCCT-CCCAAAAAATGACTT---T---T-AA-G-CAAA-------TAT--AC-----A-CC----A-GCC--A---A--TGATAT---G-TTTCAAAG---T-T---TTGAAT------C-TA--A--GGGCA--A--TA------A-T-T--C----T--GTTTT-CAT-TG-A--T----TTTT--C-T-ATC---G---AG-TCCAT----------T----A---T------GCGGTATCTTTA-C-T--A-CTT--T-ATTTC----T-C-----
gi|27 : ---T-GC-A-ATTTTCTGACATTTA-T----GC---ACG-ATT-CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA----TGTCTCGCA-TCTTTGAA--------------GGTGCG---ATA-ACC------T-A-TA-TATTT--T--A-TTTGAA-------TTTTTT----TTTAGTTTTTAAAT-TCC-TAAT---A-A--CGC------A-AGAG-AAT---A-C-ACTTT-------TATAATTTTATCAG-AT--GA-T-
gi|28 : GA-AG-TTT--TC--AA-AA--------TGCT--G--------TT--TTAAAA---GGAAAAT---T-GA-A-ACTTTCCAATGTTGA-T-----------------CT---------------T-TATGTA----TGTCTCCCA-TCTTAAAATTGAAGTAAAAAAAAGTAC----ATG-GCC------A-A-AA-TATTT--T--A-TCCA-A-------TAATTC----ATTAGTTTT--AAC-T-C-TAAAA--A-A--TGG------A-AATATAAT---g
gi|29 : TGA-AC-TTT--TG--AT-A---------TGCT--G--------TT--G---AA---GGAAAAT---T-GC-A-CTTGTTAGACGTTGG-T----AT---ATG-ATT-CTGT-------------T-TATGCA----CGTCTCACA-TCTTCAAA--------------AGTGCG---Attca
gi|29 : tca--AAC-T-C-TAAGA--A-A--TGA------A-AATG-AATGT-A-C-ACTTTAGCTCTTTATACTTTAATCCA-AT--AA-C-AATGCGAGTAactctaagaaatgaaaatgaatgtacactttagctctttatactttaatccaataacaatgcgagta
gi|3 : tcatgaacttttgatatgctgttgaaggaaaattgcacttgttagacgttggtatatgattctgtttatgcacgtctcacatcttcaaaagtgcgGCAGT-CCA-CCCCAGTGTGATGTCA--AC-A-TTTT--G--A---AA-AATCATA---------GATT--T-ATC-----T---A--GAT---TT----A------TCC--ATGAT------------AGATAC--A-TA-A-----------A--T---TT-GAT-G-G------------A--------T-----T-T------------G---------T--------T------G----T----AAA---A----A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATG-----AAA--T-AT-T-----T-T---AAAAGA---CT---A---C-AA-G-TTA--------TAT--ATG----A-AT----A-ATC--A---T--TGATAT---G-TTTTAAAA---C-C---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--A--TA------G-C-T--C----T--ATTTT-AAT-TG-A--T----TTCT--T-T-A-G---A---AGGTCCAT----------TTAATA---T------GTGATA----GG-T-T--C-CTT--T-ATTTT----T-C-----CCA-C--A-CATT-----T--A-GT-A-TA-T--C--TTTGTA-ATAA--AAACA-G-TTTC--ATGA----T-AT-TCTT--ATTAACA-CT-AT-CA---TA-TC-------A--T--TA-----T-AGC-CAGTTTT--TGTGA-AA-TTT--TG--AT-AA--------TGCT--G--------CT--T---AA---GGAAAAG---T-AG-A-ATTTCCTGGCGTTGA-T----AT---ATA-ATT-TTGT-------------T-TATGCA----TGTTTCACA-TCTTAAAA--------------AGTGTA---ATA-ACT------T-A-CA-TATTT--T--A-TTTC-A-------TAATTT----ATTACTTTT--AAC-C-C-TAGCA--A-A--TGG------A-AAT--GAT---A-C-ACTTT------CTATACTTTTATCAG-CT--TA-T-AATGGGAGTA
gi|30 : -AT----A-ATC--C---A--TGACAT---G-CTTCAAAA---T-G---TCGAAT------C-CA--A--GGACA--A--TA------A-C-T--C----T--GTTTT-CAT-CG-A--T----TTCG--T-C-ATC---A---TG-TCCA----------------A---T------GCGATA----AATT-T--C-CAT--T-ATTTT----TCC-----C-A-A--A-TATT-----T--T-GT-A------------TGTA-A-AG--AAGCA-A-TCTC--ATGA----A-AT-TGTT--ATGAATG-AT-AT-CA---
gi|31 : ct---A---T-AA-G-TTA--------TGG--ATG----A-AG----A-ATG--G---A----GTA-------------------A---TTGAAT------C-CA--A--GGGCA--C--TG------G-C-T--A----T--ATTTT-CAT-TT-A--T----TTCT--T-C-A-TG--A---AG-ACTGT----------T----A---T------GTGATA----GATT-T--C-CTT--T-GT--------------------------TT-----T--T-GT-A-TA---------TGTA---------------------ATGA----A---------------TA-CC-AT-TA---TA-TT-------A--T--TA-------AAC-CAGTTTT--
gi|32 : GTAATTCCA-CTTTCATGTTACGTCATATG-ATTTTT--G--C---AA-A---------------------T-ACC-------------AT---TG----A------TGC--GTGTT------------AGGAGT--A-AA-A-----------A--A---AT-GTT-G-GGGTAC-------GGT------C-----T-TTCCCGATA----G---------T--------T------A----T----TGC---T----A--------TGATTCTT-TT-TT--AACATA-----AAA--T-AT-T-----T-C----GAAGT---Cgttgata
gi|33 : aaaATACA-A-TTTT--G--T---AA-AAACAAT---------TAGT--T-ATT-----T---A--GAT---TT----A------------------------------GAAC--A-TA-T-----------A--T---TTTGTT-G-G------------AAT------C-----T-T------------T---------C--------T------GATGGT----AAG---TGT--A--------AAAATCTT-GT-TA--AACATA-----AAG--T-AT-T-----T-C---AAAA------T---AC--T-AA-A-TTA--------TAT--GTG----A-Agaaatat
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