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Reference ( gi|3 ) : TAATCAGGTTATATCTTGATTAAATC--CACTGGCTACCTATTT-ATGTG-TGTTATG--CCAAATCCAT---G-TA----A-T--T-GC----TC-A---T------TTT--ATGTAA---T---AG-GC----A---A--AA----------T---T----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------G--C-------A--A----A------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAAT--AGG-C---A---A--AA-C------T---------CC---TG-C-T--GA--TT-TCA--T-GA-------AATT-T--GC--AA-A----C---A--G--A-T--C--TTG-TC----CAG------T---AC--ATG-AAAT--AGG-CAA---A----C-TG------TAA-ATT---CTC----AG--T-TC---A---A-CT---C--T------A--AA--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGCCT--ATTT-CATG-AAATCAGC--A-A--G-A-ATTTA-------TTTA--C--A------T--TTTCCCTC-CACC--TCTCT
gi|9 : TGAT--AATT--CACATTTTGCCTATTT--CATG-TACTGGG--CAAGATC--T---G-T-------T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGAAA---T---CG-GC----A---G--GAG---------T---T----------------T---TG------CCC-ATTT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-ATTT----------------------G--C----------------------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAATT--AGG-C---A---A--AA--------G---------CC---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AAT
gi|4 : tatgttacgcctaatccatgcaattacctAATCTACACTG-CGGCCTATTTCACGTACTG----G--GCAAGTTC-T---G-TG---------T-GC----CT-A---T------TTT--ATGAAA---T---CG-GC----A---G--GAGT--------T---T----------------T---TG------CCT-CTTT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------T--T-------T--A----C------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAATT--CTG-C---A---A--AT-A------T----------C---TG-C-C--TA--TT-TCA--T--A-------AATT-gttcaactctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatctgcaagaattgattaacatattctctccctcaatctct
gi|2 : tgaaacaaatatgttgttattttgttttgatctattagttacatgtagtatatatgtgtgtgtgccacatattcaagtggtcatgcaaccggtgtaacaatacgtcacgcctC--CACT--TTGCCTATTT--CATG-TACTGGG--CAAGATC--T---G-T-------T--T-GC----CT-A---T------TTC---TAGAA---TCGAAG-G---------A--GT----------T---T----------------T---TG------CCC-ATTT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------T-------------------------------TT--------G---CTT-GCTTTCA--TGAATT--CTG-C---A---A--AG--------T---------CT---GG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATctcagttcaactctaaatatgca
gi|13 : tcatggtaatggcct--CACT--TTGCCTATTT--CATG-TACTAGG--CAAGATC--T---G-T-------T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGAAA---T---CG-GC----A---GG-AA----------T---T----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---AG--G--ACA-ATTTGCTTGCCTATTTCATGAATTCTG--C-------A--A----AAGT---------CT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAATT--GGG-C---A---A--tacaaatttctcagttcaattctgaatatgcactttgtctatttcatgaaatcagcaatgtatgtaatgaattttacagggttattttcctccctctctttctctcactttgcctatttcatgaaatcagcaagagattaatttactctctctcaagcttt
gi|8 : ctaatccatataa--CACT--TTGCCTATTT--CATG-TACTGGG--CAAGACC--T---G-T-------T--T-AC----CT-A---T------TTC--ATGAAA---T---CG-GC----A---A--GAG---------T---T----------------T---TG------CCT-ATTT----C--G---------TGAA----A---AC--G--GCA-ACTTGCTTGCCTTTTTCTTGAATTCTG--C-------A--A----AATT---------CT--------G---TCA-A-TTTCA--TGAATT--GGG-C---A---taaattctcagttcagctctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatcagcaatgattaatttacattttatccacctttctcta
gi|4 : tatgttacgcctaattcatgtaacGCCACATATTC-AAGTG--GTCATG--C--AACCGGT---G-TA----A-CAAT-ACG---TC-A---CGCCTAATTT--ATGAAA---T---AG-GC----A---G--AT----------A---T----------------T---TG------CAG-AATT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------G--T-------A--A----A------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAAAG--AGG-CA--A---A--AA-C------T---------CC---TG-C-C--GA--TT-TCA--T-AA-------AATA-G--GC--AC-A----C---A--G--A-A--C--TTG-CC----CAG------T---AC--GTG-AAAT--AGGCCGC---A----G-TG------TAG-ATT---CTC----AG--T-TC---A---A-CT---C--T------A--AA--T---AT-GC---A----taaattctcagtttaactctaaatatgcactttgcctagatttcatgaaatctgcaagaattaatttacattttctccccctttccctgt
gi|7 : tgaaacaaatatgttgttattttgttttgatctattagttacatgtagtatatatgtgtgtgtTGCCTATTTCATGT----CTAGG--CAAGATC--T---G-T-------T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGAAA---T---CG-GA----G---G--AG----------T---T----------------T---TG------CCCCATTT----C--A---------CGAA--------AA--G--GCC-A-------------------------A--A-------A--A----ATTTTTTTGGGGCTT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAATT--CGG-C---A---A--G-------------------TA---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--GC--AA-
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gi|7 : -ATATA-TGGTATGGGCC---TACAT---G-TA----A-T--T-GC----CG-A---T------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---T--A---------------C----------------T---TG------CCG-AATT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------G--CCCCAAAAA--A----A------------TTTTTTG---G---CCT---TTTCG--TGAAAT--GGGGC---A---A--AA-C------T---------CC---T--C-C--GA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AA-A----C---A--G--A-T--C--TTG-CC----TAG----------AC--ATG-AAAT--AGG-CAA---A----G-CA------TAA-ATT---CTC----AA--T-TC---A---A-CT---C--T------A--AA--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGCCT--ATTT-CATG-AAATCTTG--A-A--G-A-ATTAA-------TTAA--C--A------T--TTTCTCCC-Cgaattaatttacattttctcccctttctccatctctt
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gi|8 : TA-TGTTACG--CCTAATTCAT---G-TA----A-C--T-GC----CC-A---A------TTC--ATGAAA---T---TG-AC----A---G--AA----------T---T----------------T---TG------CAG-AATT----C--A---------AGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------G--C-------A--A----G------------TT--------G---CCG-T-TTTCA--CGAAAT--AGG-C---A---A--AA-C------T---------CT---TG-C-C--GA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GT--AA-A----C---A--G--G-T--C--TTG-CC----CAG------T---AC--ATG-AAAT--AGG-CAA---A----G-TG------TAA-ATT---CTC----AG--T-TT---A---A-CT---C--T------A--AA--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGCCTAGATTT-CATG-AAATCTGC--A-A--G-A-ATTAA-------TTTA--C--A------T--TTT--CTC-CCCC--TTTC
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gi|6 : ctagcataaaagaaatgttggttcatatgttacactaaatttctgaaattacctgttttgtgaaacgagcaaaaaaaaaaaTA-TGTTACA--CTAAATTTCT---G-AA----A-T--T-AC----CT-G---T------TTT--GTGAAA---C---GA-GC----A---A--AA----------------------------------------------------------------------AA----A---AA--A----A-A------------------------------------A--A----A------------TT--------G---CTT-G-TTTTA--TGAAAT--AGG-G---AGGTA--AA-C------T----------T---TGCC-T--GA--TT-T-A--C-GA-------AA-------A--AG-G----C---A--GGTG-T--G--TTG-CC----TGT------T---TC--ATG-AAAT--AAG-CAA---tgcattacgaaagtttcatgag
gi|10 : ctagcataaaagaaatgttggttca-TGTTACG--CCTAATCCAT---G-TT----A-T--T-GC----CC-A---A------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---G--AC----------T---T----------------T---TG------CAG-AATT----C--A---------TGAA----A---TA--G--GCA-A-------------------------G--C-------A--A----A------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAAAT--AGG-C---A---A--AA-C------T---------CC---TG-C-C--GA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AA-A----C---A--G--A-T--C--TTG-CC----CAG------T---AC--ATG-AAAT--AGG-CTA---A----G-TG------TAA-ATT---CTC----AG--T-TC---A---A-CT---C--T------A--AT--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGCCT--ATTT-CATG-AAATCAGC--A-A--T-A-AGTAA-------TTTA--C--A------T--TTTCTCCC-CCTT--TCTCTcggcattgaaacgagcaattttttgctcgtttcacgaaacagtcaatttcagaaatttagtgtaaaacatgcattacgaaagtttcatgag
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gi|11 : GTTATA--CTAAATTACT---G-AA----A-T--T-GC----TT-G---T------TTC--GTGAAA---T---GA-AC----A---A--AA----------G---T----------------T---TG------CTT-GTTT----C--A---------TGAA----------------CTTA-------------------------G--C-------A--ATACCG------------TT--------GGTTTTT-T-TTTCA--TGAAAC--ATG-C---A---A--CA-C------A---------CC---TG-C-T--TG--TT-TCG--T-G--------AAT------C--GG-G----C---A--A--A-T--T--TTA-TCGGCTCAT------T---TC--ATG-AAAC--TGG-CAA---C----C-GA------TTA---T---TTG----AG--CACC---A---A-CC---C--T------ATGAATGT---AT-G-------------T-------------T-CGCCT--GTTT-CATGTAAA
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gi|13 : tcatggtaatggcctAATCCAT---A-TA----A-T--T-GC----CC-A---A------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---G--AC----------T---T----------------T---TG------CAG-AATT----C--A---------TGAA----A---TA--G--GCA-A-------------------------G--C-------A--A----A------------TT--------G---TCC-T-TTTCA--TGAAAT--AGG-C---A---A--AA-T------T---------CC---TG-C-C--GA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AA-A----C---A--G--A-T--C--TTG-CC----TAG------T---AC--ATG-AAAT--AGG-CAA---A----G-TG------TAA-ATT---CTC----AG--T-TC---A---G-CT---C--T------A--AA--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGCCT--ATTT-CATG-AAATCAGC--A-A--T-G-ATTAA-------TTTA--C--A------T--TTT--ATC-CACC--TTTCTtacagggttattttcctccctctctttctctcactttgcctatttcatgaaatcagcaagagattaatttactctctctcaagcttt
gi|2 : ctCAT---GGTA----A-T--G-GC----CT-A---T------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----C---A--GA----------C---T----------------T---TG------CAG-AATT----C--A---------TGAA----A----------GCA-A-------------------------G--C-------A--A----A------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAAAT--GGG-C---A---A--AAAC------T---------CC---TT-C----GA--TT-CTA----GA-------AATA-G--GC--AA-A----C---A--G--A-T--C--TTG-CC----CAG------T---AC--ATG-AAAT--AGG-CAA---A----G-TGGTA---CAA-ATTT--CTC----AG--T-TC---A---A-TT---C--T------G--AA--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGTCT--ATTT-CATG-AAATCAGC--A-AT-G-T-ATGTAATGAAT-TTTA--C--AGGG---TTATTTTCCTC---CC--TCTCTcta
gi|16 : t---G-TT----A-T--T-GCCAA-TCGA---T------TTC--ATGTAA---T---GA-GC----A---A--AG----------T---TAAGAGGTTCAACATTTT---TA------CGT-GTTT----T--A---------AGCA----A---AA--T--G-------------------------------------------------------------TT--------G---CTC-A-TTTCG--TGTACT--TGG-C---A---G--CA-C------T---------T----TG-C-C--GA--CT-TCG--T-GA-------AATT-G--GC--AACA----C---G----------C--TTG-CC----AAA------T---AC--GT--AAAC--AAA-AAA---A----C-ttctctcactttgcctatttcatgaaatcagcaagagattaatttactctctctcaagcttt
gi|7 : tatatgtcgtgccgaattcgtgaaattgcggggtt-TA----A-T--T-CT----TC-AAGAT------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---A--AG----------T-------------------------G------CAT-ATTT----A--GAGT------TGAATTGAG---AA--T--TTA-T-------------------------G--C-------T--------------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGTC-T--AGG-C---A---A--GATC------TG--------TT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--G----A-G----G---A--G----T--T--TTGCCC----CAT------T---TC--ACG-AAA---AGGCCAA---A---------------AA-ATT---TTTTTGGGG--C-TT---G---C-CT---T--TTTCATGA--AT--T---CG-GC---A----A---G-------------TATGCCT--ATTT-CATG-AAATCGGC--A-A--gcgtaaaacgcaactgatt
gi|6 : atatatggtatgggcctacatgtaaA----A-T--T-GC----TT-G---T------TTT--ATGAAA---T---AG-GG----AGGTA--AA----------C---T----------------T---TG------CCT-GATT----T--A---------CGAA----A---AA--G--GCA-G-------------------------G--T-------G--T----G------------TT--------G---CCT-G-TTTCA--TGAAAT--AAG-C---A---A--attaacattttctcccctca
gi|10 : ctagcataaaagaaatgttggttcatatgttacactaaatttctgaaattacctgttttgtgaaacgagcaaaaaaaaaaaaa----A-T--T-GC----TG-A---T------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---A--AG----------T-------------------------G------CAT-AATT-------------------------A---GA--G--TTG-A-------------------------A--CTGA----G--A----A------------TTTACACTTAG---CCT-A-TTTCA--TGTACT--GGG-C---A---A--GATC------TG--------TT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--GC--AG-G--------A--G----T--T--TTG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAA--AGG-CAA---T----T-TG------C----TTG--CCT----AT--T-TC---ATGAA-TT---C--TGC----A--AA--------------A----G---T-------------C-TGCCT--ATTT-CATG-AATTGGGC--A-A--T-A-Acggcattgaaacgagcaattttttgctcgtttcacgaaacagtcaatttcagaaatttagtgtaaaacatgcattacgaaagtttcatgag
gi|13 : atgttacgcctaatccatg----A-T--T-GC----TG-A---T------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---A--AG-----------------------------------TG------CAT-ATTTAGAGC------------TGAA----CT--GA--G----A-ATTT----------------------A--C-------A--C----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGTACT--AGG-C---A---A--GATC------TG--------TT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--GC--AG----------G--A--A-T--T--TTG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAA--GGA-CAA---T----T-TG------C----TTG--CCT----AT--T-TCATGA---A-TT---C--TGC----A--AA--------------A----G---T-------------C-TGCCT--ATTT-CATG-AATTGGGC--A-A--aagtaatttacattttctccccctttctct
gi|9 : ctaatccatataa-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T---GG-GC----A---A--GA----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-G-------------------------G--A-------G--T----T------------TT--------G---CCC-A-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---A--TT-T------G---------CT---TG-C-C--TT--TT-TCA--T-GA-------ATTA-G--GC--AA-A--------A--G-------C--CTG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAT--AGG-TAA---gattaatttacattttatccacctttctcta
gi|9 : tatgttacgcctaatccatgcaa-T--T-GC----AG-A---T------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---A--AG-----------------------------------TG------CAT-ATTT-------AGAGT-----TGAACTG-AT--AA--T--TCA------------------------------C-------A--T----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGTACT--GGG-C---A---A--GATC------TG--------TT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--GC--AG-G--------A--G----T--T--TTG-CC----CAT------T---TC--ATG-AAAA--AGG-CAA---T----T-TG------C----TTGC-CTT-----T--T-TC---A-------------T------G--AAT-T---AG-GC---AAAAGC-----------------C-TGCCT--ATTT-CATG-AAATAGGT--A-A--aatgtgaattatcagttcaactctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatctgcaagaattgattaacatattctctccctcaatctct
gi|13 : tatgttacgcctaatccatgcaa-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T---AG-GC----A---A--GA----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-G-------------------------G--A-------A--T----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAA---AGG-----A---C--AA-T------TTG-------CT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------ATTC-T--GC--AA-A--------A--G----T--C---TG-CC----TAT------T---TC--ATG-AATT--GGG-CAA---gaattgattaacatattctctccctcaatctct
gi|8 : ctaatccatataa-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T---GG-GC----A---A--GA----------CCTGT----------------T---TA------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-A-------------------------G--A-------G--T----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCG--TGAAAA--CGG-C----------AA-C------TTG-------CT---TG-C-C--TT--TT-TCT--T-GA-------ATTC-T--GC--AA-A--------------A-T--T--CTG-TC----AAT------T---TC--ATG-AATT--GGG-CAagtgtaaattctcagttcagctctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatcagcaatgattaatttacattttatccacctttctcta
gi|5 : tatgttacgcctaattcatgtaac-T--T-GC----AT-A---T------TTC--ATGTAC---T---AG-GC----A---T--A-----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----ATC-AA------CA-G-------------------------G--G-------G--T----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---A--TT-T------T---------CT---TT-C-C--TT--TT-TCT--T-GA-------ATTC-T--GC--AA----------A--A--A-T--C---TG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAT--AGG-CAA---agtgtaaattctcagtttaactctaaatatgcactttgcctagatttcatgaaatctgcaagaattaatttacattttctccccctttccctgt
gi|17 : gttacgcctaatccatgtaa-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T---GG-GC----A---A--GA----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-G-------------------------G--A-------G--T----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---A--agtgtaaattctcagttcaactcttgaatatgcactttgcctattatgaaatcagcaaataatgtaaatgaattttacaggttttttttccctcacctctct
gi|17 : tgtatatgttacatctaattcatgcaaa-T--T-GC----TG-A---T------TTC--ATGAAA---T---AG-GC----A---A--AG----------T-------------------------G------CAT-ATTT----A--GAGT------TGAA----CT--GA--G----A-ATTT----------------------A--C-------A--C----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGTACT--GGG-C---A---A--GATC------TG--------TT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--GC--AG-G--------A--G----T--T--TTG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAA--AGG-CAA---T----T-TGCA----TGA-ATT---agtgtaaattctcagttcaactctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatcagcaagaattaatttacattttctcccctttctccatctctt
gi|7 : tgtatatgttacatct-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTC----T---AG-GC----A---A--GA----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----ATCGGA--G--G---A-------------------------G--T-------T--------------------TT--------G---CCCCA-TTTCA--CGAAA---AGG-CCAAA---A--AA-T------TTTTTTGGGGCT---TG-C-C--TT--TT-TCA--T-GA-------ATTC-G--GC--AA-G----T---A--------------TG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAT--CGG-CAATT-A----CATG------TAgaattaatttacattttctcccctttctccatctctt
gi|2 : atatatggtatgggcc-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T---GG-GC----A---A--GA----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--T---------AGAATC--G---AA--G--G---A-------------------------G--T-------T--T-----------------TT--------G---CCC-A-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---A----------------------TT---TG-C-TT-GC--TT-TCA--T-GA-------ATTC-T--GC--AA-A--------------G-T--C--TGG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAT--AGG-Cagcataaattctcaattcaactctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatcttgaagaattaattaacattttctcccctca
gi|19 : tcatggtaatg-T--T-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T----G-GC----A---A--A-----------TCTGT----------------T---TG------GCT-ATTT----TCGA---------TGAA----A---TC--G---CA-G-------------------------G--A-------G--T----T------------TT--------G---CCT-A-TT-CA--TGAAA---AGG-C---A---------T------TTG-------CT---TG-C-C--TT--TT-TCA--T-GA-------AATTCT--GC--AA-agtggtacaaatttctcagttcaattctgaatatgcactttgtctatttcatgaaatcagcaatgtatgtaatgaattttacagggttattttcctccctctctttctctcactttgcctatttcatgaaatcagcaagagattaatttactctctctcaagcttt
gi|14 : ttacgcctaatccatgtaa-T--T-GC-----C-T---T------TTC--ATGTAC---T---AG--C----A---ACTGA----------T---T----------------C---TGTTTTGGCCT-ATTT----C--A---------TGAA----AT--CA--G------A-------------------------G--G-------G--A----G------------TT--------G---CCT-A--TTCA--TGGAAC--AG--------------A-T------T---------TG---TG-C-T--TGCCTT-TCA--T-GG-------ATTC-T--GC--AA-A----aatataaattctcagttcaactctaaatatgcacttgcctatttccatgaatc
gi|11 : atgttacgctaatccatgtaatgctcatttcagaaaaaatagagcaga-T--T-GC----CA-G---T------TTC--ATGAAA---T---GA-GCCGATA---A--AA----------T---T----------------T----G------CCC-GATT----C--A---------CGAA----A---CA--A--GCA-G-------------------------G--T-------G--T----G------------TT--------G---CAT-G-TTTCA--TGAAAA--A-------A---A--AA-CCAACGGT---------AT---TG-C-T--AA--GT-TCA--T-GA-------AACA-A--GC--AA-A----C-----------T--T--TTG-TT----CAT------T---TC--ACG-AAAC--AAG-CAA---agtgaaattctagtcaactctgaatattgcacttgcctatttcatgaaatctgcaa
gi|10 : gttatactaaattactgaaa-GC----CT-A---T------TTC--ATGTAC---T---GG-GC----A---A--GA----------TCTGT----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-G-------------------------G--A-------G--T----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---A--TT-T------G---------CT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------ATTC-T--GC--AA-A--------A--G----T--C---TG-CC----TAT------T---TC--ATG-AATT--GGG-CAA---ccgattatttgagcaccaaccctatgaatgtatgttcgcctgtttcatgtaaactataatgaaaaagaaataactggtatttgttctca
gi|4 : atgttacgcctaatccatgtta-GC----CT-A---T------TTC--ACGTAC---T---GG-GC----A---A--GT----------T---C----------------TGTGTG------CCT-ATTT----T--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-G-------------------------G-------------A----G------------TTTTT-----G---CCT-C-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---ATTTA-C------T--------------TG-C-C--TT--TT-TCA--T-GA-------ATTC-T--GC--AA-A----T---------A-T--C---TG-CC----TAT------T---TC--ATA-AATT--AGG-Ctaagtgtaaattctcagttcaactctaattatgcactttgcctatttcatgaaatcagcaataagtaatttacattttctccccctttctct
gi|21 : tgaaacaaatatgttgttattttgttttgatctattagttacatgtagtatatatgtgtgtgtgccacatattcaagtggtcatgcaaccggtgtaacaatacgtcac-A---T------TTC--ATGAAA---T---CG-GC----A---G--GAG---------T---T----------------T---TG------CAC-ATTT----C--A---------TGAA----A---AA--G--GCA-A-------------------------G--T-------T--G----C------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAATT--CGG-C---A---A--AA-G------T----------C---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AA-cgcagtgtagattctcagttcaactctaaatatgca
gi|20 : atgttacgcctaatccatgtaa------TTC--ATGGAA---CGA-AG-GC----A---A--AA----------A---T----------------T---TA------T-T-GTTT----C--G---------TGAA----A---TT--A--GCA-ATG-----------------------G--C-------C--G-----------------TT--------G---CTT-T-TTTCAAACGAA-C--ATG-C---A---A--CA-C------A---------CC---TG-C-T--G---TT-TCG--T-GA-------ATTG-G--GC--AA----------A--G--T-TTGC--CTG-CT----CAT------TCTGACTGATG-AAAC--AGA-CAag
gi|20 : ---AG-GC----A------AA----------C---T----------------T---TG------CCC-AATT----C--A---------CGAA----A---CA-----GCA-G-------------------------G--T-------G--T----G------------TT--------G---CAT-G--TTCGTTTGAAAA--AAG-C---A---AC-GG-C------C---------AT---TG-C-T--AA--TT-TCA--C-GA-------AAccggaaaatttccgaaatttagc
gi|17 : tgtctgtttcatcagtcagaatgagcA----------C---T----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGTA----C---TG--G--GCA-A-------------------------GATC-------T--G----T------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAAT--CGG-C---A---G--GA-G------T---------TT---TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GAAAAAGGCAATT-T--GC--Acaataaatttttgccttcgttccatgaaccggaaaatttccgaaatttagc
gi|1 : tgtatatgttacatctaattcaA----------C---T----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---gtaaattctcagttcaactctaaatatgcactttgcctatttcatgaaatcagcaagaattaatttacattttctcccctttctccatctctt
gi|21 : atatgc----------------T---TG------CCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TA--G--GCA-G-------------------------A--C-------T--T-----------------TT--------G---CCG-A-ATTCA--TGAAAA--AGG-C---A---AGCAA-C------T--------------TG-C-C--TT--TT-TCA--T-GA-------AATG-T--GC--AA-AA---C-----------T--C--CTG-CC----GAT------T---TC--ATG-AAAT--AGtcagtaatatatgtaatgaattttacagggtttttttcctcacatctctttttctcatacttcaaccgtttgggaactcttcattcatatatttctaattctaattaattattctaatctaattcctaaagtcaagtaaggacaactgttgtttcacacccaacgtcgtcagtttgattttcatgacgccgttaacgttagctctttccgcagacaccagcaactaagcgagagacattatctgttgggaggattcaagctctctagcactaggtatggacaaattcacacacagagagagagagaagagagaga
gi|11 : atgttacgcctaatccatgtaa----------------T---TG------CCA-GTTT----C--A---------TGAA----AT--GA--G--CCG-A-------------------------T--A-------A--A----A------------TTT-------G---CCC-G-ATTCA--CGAAAC--AAG-C---A---G--GT-G------T---------GT---TG-CAT--G---TT-TCA--T-GA-------AA----------AA-AAAACC---AACG--G-T--A--TTG-CT----AAG------T---TC--ATG-AAAC--AAG-CAA---A----C-TT------T----TG---TTC----AT--T-TC---A----------C--G------A--AA--C---AA-GC---A----A---T-------------T-T
gi|21 : gttatactaaattactgCT-ATTT----C--A---------TGAA----A---TC--G--GCA-G-------------------------G--A-------G--T----T------------TT--------G---CAC-A-TTTCA--TGAAAA--AGG-C---A---A--GT-T------G---------CT---TG-C-C--TT--TT-TCA--T-GA-------ATTC-G--GC--AA-A--------A--G----T--C---TG-CC----TAT------T---TC--ATG-AAAT--AGG-CAA---ccgattatttgagcaccaaccctatgaatgtatgttcgcctgtttcatgtaaactataatgaaaaagaaataactggtatttgttctca
gi|17 : atgttacgcctaatccatgtaaCA-T-------------------------G--C-------A--A----A------------TT--------G---CCT-T-TTTCA--TGAAAT--AGG-C---A---A--AA-C------T---------CC---TG-C-C--GA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AA-A----C---A--G--A-T--C--TTG-CC----CAG------T---AC--ATG-AAAT--AGG-CAA---A----G-TG------TAA-ATT---CTC----AG--T-TC---A---A-CT---C--T------A--AA--T---AT-GC---A----C---T-------------T-TGCCT--ATTT-CATG-AAATCAGC--A-A--G-A-ATTAA-------TTTA--C--A------T--TTT--CTC-C-CC--TTTCT
gi|6 : tgtatatgttacatctaatt-------A--A----A------------TT--------A---CCT-G-TTTTG--TGAAAC--GAG-C---A---A--AA---------------------------------------------AA-------AA----------AA-A----A---A--A--A-TTGC--TTG-T--------------T---TT--ATG-AAAT--AGG-GAG-----------G------TAA-ACT---TT------G--C-CT---G---A-TTTA-C--G------A--AA--A---AG-GC---AGGTGT---G-------------T-TGCCT--GTTT-CATG-AAATAAGC--A-A--ccatctctt
gi|1 : ctagcataaaagaaatgttggttcatatgttacactaaatttctg----A------------TT--------A---CTG-A-TTTCA--TGAAAT--AGG-C---A---A--Acggcattgaaacgagcaattttttgctcgtttcacgaaacagtcaatttcagaaatttagtgtaaaacatgcattacgaaagtttcatgag
gi|8 : atatgcac------------TT--------G---CAG-A-TTTCA--TGAAATCTAGG-C---A---A--AG-T------G---------CA---TA-T-TTAGA--GT-TAAACT-GAG------AATT-T--AC--A-------------------C--T--TTG-CC----TAT------T---TC--ATG-TACT--GGG-CAA---GAC--C-TG------T----TTA--CCT----AT--T-TC---A-------------TG-----A--AA--T---CG-GC---AAGAGT---T-------------T-TGCCT--ATTT-CGTG-AAAACGGC---------A-ACTTG-------CTTG--C--C------T--TTTTCTTatatgtaatgaattttacagggtttttttcctcacatctctttttctcatacttcaaccgtttgggaactcttcattcatatatttctaattctaattaattattctaatctaattcctaaagtcaagtaaggacaactgttgtttcacacccaacgtcgtcagtttgattttcatgacgccgttaacgttagctctttccgcagacaccagcaactaagcgagagacattatctgttgggaggattcaagctctctagcactaggtatggacaaattcacacacagagagagagagaagagagaga
gi|26 : tatgttacgcctaattcatgtaactgcccaattcatgaaattgacagaattttgcagaattc------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGTACT--GGG-C---G---A--AA-gaattaatttacattttctccccctttccctgt
gi|1 : aga------------TT--------G---CCT-A-TTTCA--TGAAAT--CAG-T---A---A--agtgtaaattctcggttcaactctaaatatgcactttg
gi|19 : atatgcact--------G---CCT-A-ATCCA--TGTAAT---TG-C---A---G--AA-----------------------------------TT-TCA--T-GA-------AAAA-G--GC--AA-G----C---A--A--A-TGCC--TTT-T-------------------C--ATG--AAT--AGG-CAA---AACTCC-TG------CGA---T---TTC----A-----TC---G---A----------------A--AA--T---A--GCCAAA----CAGAT-------------T-TGCC---AGTA-CATG-AAATAGGC--A-A--A-A----TA---------TA--A--A------T--TCTCAGTT-CAAC--TCTtatatgtaatgaattttacagggtttttttcctcacatctctttttctcatacttcaaccgtttgggaactcttcattcatatatttctaattctaattaattattctaatctaattcctaaagtcaagtaaggacaactgttgtttcacacccaacgtcgtcagtttgattttcatgacgccgttaacgttagctctttccgcagacaccagcaactaagcgagagacattatctgttgggaggattcaagctctctagcactaggtatggacaaattcacacacagagagagagagaagagagaga
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gi|21 : tgaaacaaatatgttgttattttgttttgatctattagttacatgtagtatatatgtgtgtgtgccacatattcaagtggtcatgcaaccggtgtaacaatacgtcacgc--------G---CCT-A-ATCCA--TGTAAT------------------------------------------TG-C-C--TA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AG-A----C-----------T--T--TTG-CC----GAA------T---TC--ATG-AAAA--AGG-CAA-----------G------CAA-CTTGC-CTT-----T--T-TC---A----------T--G------A--AA--T---GT-GCAAAA----C---TC------------C-TGCCG--ATTT-CATG-AAATcgcagtgtagattctcagttcaactctaaatatgca
gi|8 : atgttac--AA-T------T---------CT---TG-C-A--GA--TT-TCA--T-GA-------AATC-TAGGC--AA-A------------------------G-TG----CA-------T---AT--TTA-GAGT------TAA---A----C-TG------AGA-ATT---TAC----AC--T-TT---G---C-CT-----------------A--TTTCAT-GT---A----C---TGGGCAAGACCTGTT-TACCT--ATTT-CATG-AAATCGGC--A-A--G-A-GTTTag
gi|17 : tatgttacgcctaattcatgtaactgcccaattcatgaaattgacagaattttgcagaattcaagaaaaaggcaagcaagttgccgttttcacgaaataggca--AA-T------T---------CT---TG-C-T--GA--TT-TCA--T-GA-------AATA-G--GC--AA-AGTG-C---A--T--A-T--T--TAG--------AG------T--------TG-AACT--GAG---A---A----T-T-------TAC-ACTTTGCCT----AT--T-TC---ATGTA-CTGGGC--A------A--GA--T---CT-G-------------T-------------T-TGCCT--ATTT-CATG-AAATCGGC--A-G--G-A-GTTTaatttacattttctccccctttccctgt
gi|16 : tgtatatgttacatctaattcatgcaaattgcctttttcatgaaataggca--GA--TT-TCA--T-GT-------AATG-A--GC--AA-A----GTTAA--G--A-G-------G-TT----CAACATTTTT---AC--GTG-TTTT--AAG-CAA---A----A-TG------T----TG---CTC----AT--T-TC---GTGTA-CT---T--G------G--CA---------GC---A----C---T-------------T-TGCCG--ACTT-CGTG-AAATTGGC--A-A--aatttacattttctcccctttctccatctctt
gi|21 : tatatgtcgtgccgaattcgtgaaattgcggggttgtttttttgtttacgtatttggcaagcgtgA--TT-TCA--T-GA-------AATC-G--GC--AG-G--------A--G----T--T--TTG-CA----CAT------T---TC--ATG-AAAA--AGG-CAA---G----T-TGCTTGCCT----TT---TTC----A-----TG---A---A-TT---CGGC------A--AA--------------A----G---T-------------C-TGCCT--ATTT-CATG-AAATAGGC--A-A--gattggcaataacgcgtaaaacgcaactgatt
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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1956 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNTGATTAAATCCACTGGCTGCCACATNTTTACGTGTGTTACGCCTAATCCATG-TAAT---------TGCCCGTTTCATGAAA---T--AG-GCAGA---A---------TTT---TGCCG------AATTCATGAAANAGGCAA----GC-------A--AAT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAATAGG-C-A---AA---------A-C------T--CCT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--C--TT----GCCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGCAA-----G-----A-AT-TAA------TTTACA------T--TTTCCCTC-CACC--TCTCT
gi|1 : ATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGTAATATATGT----A-AT-GAAT-----TTTACAGGGTT-T--TTTTCCTCACATC--TCTTT
gi|10 : TGTTACGCCTAATCCATG-TTAT---------TGCCCAATTCATGAAA---T--AG-GCAGA---C---------TTT---TGCAG------AATTCATGAAATAGGCAA----GC-------A--AAT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAATAGG-C-A---AA---------A-C------T--CCT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--C--TT----GCCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CTA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TCAA-CTC-TAATTA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGCAA-----T-----A-AG-TAA------TTTACA------T--TTTCTCCC-CCTT--TCTCTttctcatacttcaaccgtttgggaactcttcattcatatatttctaattctaattaattattctaatctaattcctaaagtcaagtaaggacaactgttgtttcacacccaacgtcgtcagtttgattttcatgacgccgttaacgttagctctttccgcagacaccagcaactaagcgagagacattatctgttgggaggattcaagctctctagcactaggtatggacaaattcacacacagagagagagagaagagagaga
gi|11 : aGTTATACTAAATTACTG-AAAT---------TGCTTGTTTCGTGAAA---T--GA-ACAAA---A---------GTT---TGCTT------GTTTCATGAACTTAGCAATACCGT-------T--GGT--T------TTTTTTTC--ATGAAACATG-C-A---AC---------A-C------A--CCT--GCT-TGTTTCGT--GAATCGGGC--AA-----AT--T--TTATCGGCTCATT---TC--ATGAAACTGG-CAACCGATT------------A-TT-T-GAG-----------CACCAA-CCC-TATGAA-TGTATGTTCGCCT--GTTT-CATGTAAACTATAATGAAAAA-----G-----A-AA-TAA------CTGGTA------T--TTGTTCTC-
gi|11 : T---------TGCCAGTTTCATGAAA---T--GA-GCCGATAAA---------ATT---TGCCC------GATTCACGAAACAAGCAG----GT-------G--TGT--T-----GCATGTTTC--ATGAAAAA-----A---AA---------A-CCAACGGT--ATT--GCT-AAGTTCAT--GAAACAAGC--AAAC----T--T--TT----GTTCATT---TC--ACGAAACAAG-CAA---a
gi|12 : gttatactaaattactgaaaAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATT---ATG-A------AATCAGCAA-----AT----A-ATGTAAATGAATTTTACAGGTTTTT--TTTCCCT--CACC--TCTCTccgattatttgagcaccaaccctatgaatgtatgttcgcctgtttcatgtaaactataatgaaaaagaaataactggtatttgttctca
gi|13 : CTAATCCATA-TAAT---------TGCCCAATTCATGAAA---T--AG-GCAGA---C---------TTT---TGCAG------AATTCATGAAATAGGCAA----GC-------A--AAT--T-----GTCCTTTTC--ATGAAATAGG-C-A---AA---------A-T------T--CCT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--C--TT----GCCTAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TCAG-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGCAA-----T-----G-AT-TAA------TTTACA------T--TTT--ATC-CACC--TTTCTttctctctcatacttcaaaccgtttgggaactcttcattcatttatttcctaattctaattaattattctaatctaattcctaaagtcccataaggacaattgttatttcttcaccatgccatcaagtttgattttcaagacgacctagctctttcctccgccagatctgcaac
gi|14 : TGTTACGC-TAATCCATG-TAAT----------GCTCATTTCA-GAAAAAAT--AGAGCAGA--------------TT---TGCAG------AATCCATGAAA--GGCAA----GC-------ACAAAT----------CTGTTCC--ATGAA-TAGG-C-A---A------------C------T--CCC--TCT-GATTTCAT--GAAATAGGCCAAAACAGAAT--CAGTT----G-CTAGT---AC--ATGAAA-AGG-CAA---AGT--G----AA---A-TTCT--AG-------------TCAA-CTC-TGAATATTGCAC--TTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCTGCAA-----cta
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gi|16 : tatatgtcgGGCAA----GC-------G--TGT--T-----GCCAATTTC--ACGAAGTCGG-C-A---AA---------G--------T--GCT--GCC-AAGTACAC--GAAATGAGC---AAC---AT--T--TT----GCT------------TAAAACACG-TAA-------------AA---A-T------G-----------T-TGAACCTC-T---TA----AC-TTTGCTC--ATTA-CATG-A------AATCtgaacctcttaactttgctcattacatgaaatcgattggcaataacgcgtaaaacgcaactgatt
gi|17 : tatatgtcgtgccgaattcgtgaaattgcggggttgtttttttgtttacgtatttCAT----GC-------A--AAT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAATAGG-C-A---AA---------A-C------T--CCT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--C--TT----GCCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGCAA-----G-----A-AT-TAA------TTTACA------T--TTT--CTC-C-CC--TTTCTgattggcaataacgcgtaaaacgcaactgatt
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gi|2 : tAAT---------TGCCTTTTTCATGAAA---T--GG-GCAAA---AAC-------TCC---T-TCG------A-TTCTAGAAATAGGCAA----AC-------A--GATCTT-----GCCCAGTAC--ATGAAATAGG-C-A---AAGTGGTACAAA-T------T--TCTCAGTT-CAATTC-T--GAA-TATGC--A-------C--T--TT----GTCTATT---TC--ATGAAATCAG-CAA---TGTATG---TAATGAA-TTTTACAGGGTTATTTTCCT-CCCT-CTC-TTTCTC-T-CAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGCAA-----G-----AGAT-TAA------TTTAC----------TCTCTCTC-AAGC--TTTttctctcactttgcctatttcatgaaatcagcaagagattaatttactctctctcaagcttt
gi|20 : tcatggtaatggcctatttcatgaaataggccagactttgcagaattcatgaaagcaagcaAAT---------TTTCCGGTTCATGGAA---CGAAG-GCAAA---A---------ATT---TATTG------T-TTCGTGAAATTAGCAATG--GC-------C--G-T--T-----GCTTTTTTCAAACG-AACATG-C-A---AC---------A-C------A--CCT--GCT-G-TTTCGT--GAATTGGGC--AA--AG-TTTGC--CT----GCTCATTCTGACTGATGAAACAGA-CA
gi|21 : TGTTACGCCTAATCCATG-TAAT---------TGCCTATTTCATGAAA---T--AG-GCAGA---C---------TTT---TGCCG------AATTCATGAAAAAGGCAA----GC-------A--ACT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAATGTG-C-A---AA---------A-C------T--CCT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGtccgaaatttagc
gi|23 : aACATTTATACCTGTTTTAAGC--AA---A-G-TG-T---------TGCTCAGTTCGTGTAC---T--TG-ACAGT---T---------CTT---TGCCG------ACTACGTGAAATTGGCAA----
gi|26 : gtgAG-AT--T--TC----GCCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CGG-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGtgaacttcttgagtttgctcattac
gi|3 : TGATTAAATCCACTGGCTACC---TATTTATGTGTGTTATGCCAAATCCATG-TAAT---------TGCTCATTTTATGTAA---T--AG-GCAAA---A---------TTT---TGCCT------ATTTCATGAAAAAGGCAA----GC-------A--AAT--T-----GCCTATTTC--ATGAAATAGG-C-A---AA---------A-C------T--CCT--GCT-GATTTCAT--GAAATTTGC--AAACAG-AT--C--TT----GTCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---ACT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCAGCAA-----G-----A-AT-TTA------TTTACA------T--TTTCCCTC-CACC--TCTCT
gi|4 : taatcaggttatatctTGCCACATATTCAAGTG-GTCATGC--AACCGGTG-TAACAATACGTCACGCCTAATTTATGAAA---T--AG-GCAGA---T---------ATT---TGCAG------AATTCATGAAAAAGGCAA----GT-------A--AAT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAAGAGG-CAA---AA---------A-C------T--CCT--GCC-GATTTCAT--AAAATAGGC--ACACAG-AA--C--TT----GCCCAGT---AC--GTGAAATAGGCCGC---AGT--G---TAG---A-TTCT-CAG-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCA
gi|5 : tgaaacaaatatgttgttattttgttttgatctattagttacatgtagtatatatgtgtgtgGTTACGCCTAATCCATG-TAAT---------TGCCTATTTCATGAAA---T--AG-GCAGA---T---------TTT---TGCAG------AATTCAAGAAAAAGGAAA----GA-------A--AAT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAATAGG-C-A---AA---------A-C------C--CCT--GTT-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--A---T----GCCTAGT---AC--ATGAAATATG-CAA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TCAA-CTCTTGAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATT---ATG-A------AATCAGCAA-----AT----A-ATGTAAATGAATTTTACAGGTTTTT--TTTCCCT--CACC--TCTCT
gi|6 : CATATGTTACACTAAATTTCTG-AAAT---------TACCTGTTTTGTGAAA---C--GA-GCAAA---A----------------------------------AAAAAA--AA-------------A--AAT--T-----GCTTGTTTT--ATGAAATAGG-G-AGGTAA---------A-C------T---TT--GCCTGATTT-AC--GAAAAAGGC--AGGT---GT--G--TT----GCCTGTT---TC--ATGAAATAAG-CAA---
gi|6 : ctagcataaaagaaatgttggttTGCATGTTTTACACTAAATTTCTG-AAAT---------TGACTGTTTCGTGAAA---C--GA-GCAAA---AAATTGCTCGTTTCAATGCCGTTGCTTATTTCATGAAACAGGCAA-----C-------A--CACC-T-----GCCTTTTTC--GTAAATCAGG-C-A---AA---------G-T------TTACCT--CCC-TATTTCAT--AAAACAAGC--AAcggcattgaaacgagcaattttttgctcgtttcacgaaacagtcaatttcagaaatttagtgtaaaacatgcattacgaaagtttcatgag
gi|7 : ctagcataaaagaaatgttggttcatatgttacactaaatttctgaaattacctgttttgtgaaacgagcaaaaaaaaaaaaaaaGCCTA---CATG-TAAT---------TGCCGATTTCATGAAA---T--AG-GCATA--------------CT---TGCCG------AATTCATGAAAAAGGCAA----GCCCCAAAAA--AAT--TTTTTGGCCTTTT-C--GTGAAATGGGGC-A---AA---------A-C------T--CCT---CC-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--C--TT----GCCTAG----AC--ATGAAATAGG-CAA---AGC--A---TAA---A-TTCT-CAA-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCTTGAA-----G-----A-AT-TAA------TTAACA------T--TTTCTCCC-Cttacgaaagtttcatgag
gi|8 : atatatggtatggTATGTTACGCCTAATTCATG-TAAC---------TGCCCAATTCATGAAA---T--TG-ACAGA---A---------TTT---TGCAG------AATTCAAGAAAAAGGCAA----GC-------A--AGT--T-----GCCGTTTTC--ACGAAATAGG-C-A---AA---------A-C------T--CTT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGGT--AAACAG-GT--C--TT----GCCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---AGT--G---TAA---A-TTCT-CAG-----------T-TTAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCTAGATTT-CATG-A------AATCTGCAA-----G-----A-AT-TAA------TTTACA------T--TTT--CTC-CCCC--TTTCtca
gi|9 : TATGTTACGCCTAATCCATG-CAAT---------TACCTATTTCATGAAA---T--AG-GCAGG---C---------TTT---TGCCT------AATTCATGAAAAAGGCAA----GC-------A--AAT--T-----GCCTTTTTC--ATGAAATGGG-C-A---AA---------A-C------T--CCT--GCC-GATTTCAT--GAAATAGGC--AAACAG-AT--C--TT----GCCCAGT---AC--ATGAAATAGG-CAA---AAT--G---TGA---A-TTAT-CAG-----------T-TCAA-CTC-TAAATA-TGCAC-TTTGCCT--ATTT-CATG-A------AATCTGCAA-----G-----A-AT-TGA------TTAACA------T--ATTCTCTC-CCTCAATCTCTcctgt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ACATATAATATGTCTCCGTGCCGAAATTCGCTGAAATTGCTTCGTTTTACGTGTATTTGGCAAAGCGTGTTCGTCAACCTTCAGCAAAGACGCTGCTGCAAGTACGAACGCAAATGACGCAACACTTTGCTTAAGAACTCGTAGAAATGTCTGACTTGCTGTACTTCATTGCGTGAAATTAACTCGCCCGAATTACGCGTAAAACGCAACCGATT
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Unaligned ( gi|24 ): TGTGTTGTAAAAAATTCGTGAAATTGCTTTTTTTTCGCGTATTTGGCTAGCGTGTTGCCAAGTTCACGTAGTCGGCAAAGAGCGGCCAAGTACACGAAAC
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