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Reference ( gi|5 )            :       GTGTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG--T--AT-T-GAGCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A-A--GC----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAA---TTA--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CTTG--TATTGTG-CATCTGC-GC---AT-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTCA-CTTTG-CGAATTCAAAGAGAG-CA-GACGT----A-AAA--AT-TTT-GAT-AATTGTA-TCG-AACACCACTCT-------GTCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-A-TAAGTACATGT--ATGTT--GCG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--CAAA-GGCCA--AGAGCCCATATTATAGGGAAAAAAACTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACCAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GA-CCACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-A-----------------A-GTC-T-TGC-A-G-AAACCTGAGGATA--TTCG--AATT---ACAGTACAC--ACCCGC-T-GTTGC-C-ACA-CCAAT----------CC----C-TTGGCGATTC-AA--T-CGACACAT-CG-CTCGT-----CAA--GT-ACA-TG-T--A----GTT---AT----ATATCCTCATTTTCATGT-AA-CCCTTT-GGGAGA-A--TGCCGAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTG-ATC-CTATTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA----AT-CATGAAGGATC--AGT-ATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGT-CA----TT--------CAGGTCAAA-G-C--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC--AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTTGGGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACA-AGTATATATATATGGCTTT-AAA-TAAA-----GGAGG-GGT-GC-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGC-TC---AAAA----TCAT---GGGATTCGGA-TCATTCCACTT-GAGTTGGGCTA-C-AGTAG--ATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT--------------TAT------------------C-CCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCAGG
gi|2                          :       GTTTATCCAACTTATGGAAT---AAACCTAG--TTTAT-T-TAGCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-TTTTAATTA-A--GC----CCCCCTAAA-A-TTAGGTTAAGAAAAA--TTAA-CTAGTCGGG-TTCAACTTT-CT-G--TGTTGTG-CATCTGC-GC---ATTGTCCAGAATCAATC-TTC-CCTTCA-CTTTAACGAATTCAAAGAGAG-CA-GACGT----ACAAA--AT-TTT-GAT-AATGGAAATCG-A-CACCA-TCT-------GTCGTCATCGGTCCAATTTTAATATTTGAAAAAAT-AATAAA-----GTTAATGTT--ACG--T-GCTAG-CATAGGA-CTC--TAAA-GGCGC--AGCGCC-ATATTATAGGGGAAAAA-CTTC-A--TCAAGGGCGGA-T-TTCG-A-CA-GTGTTCTTCTTTGTCACAC------------------------AACTT-GCCAGCTCCGAACCC-AAGCGA-CTACGTGGGG---------------CGACGC--AACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-A-----------------A-GTC-T-TGCCA-G-AAACCTGAGGATA--TTCG--AATT---ACA---C-C--ACCCGCCT-GTTGC-CGACA-GAAGT----------CC----C-CTGGCGATTCTAG--T-CGACACAT-CG-TTCGT-----CAG--GTGACA-TG-T--T----GTTTATATTGTTATATCCTTCCTTTTATGT-GATCCCTTT-GGGGGA-AAATGCCTAACTCCTTTATTCAGCT-CTCGTA-ACC-CTATTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATATAA-TAGGGAAG-AAA----AT-CATGAATGATC--AGT-ATGTT--AATTTAG-TTCAA-CATTTGCATCATGACCCCAC-TACAAACTCC-T-ATTAA-CACCAAACATTGTACTTGGAAG-A--TGGGGT-CA----TT--------CAGGTCAAAGG-C--AAGCACCGAGATC--GT-AAAATAATC-GCAAA--T-TC-TCGGCAAAATGGATTGATGCATTTATTATTATATATTT-GCAATCGGTCTAGCTT-TGGAAAGCATTTC------ATCTCAAGCCATTCCTTTGGTTTACGTACA-TGTA-------ATGGC-TT-AAT-TAAAGGGGGGGGGG-GGG-GT-TG-AAAAATTAAA-GGCCAAA-TGG---C--TTGA--A---ATACT--GTCCAACTT---TTGGC-TCACAAAAA----TCAT---GG-----------ATTCCACTT-GAG-TGGGCTATC-AGTAG--ATGC-----AGAATCT---GTGG-TTGATTTATAGTGCAAACCTCTAT------------------C-CCCCTCAATTT--CATCAGCTCCGCGTCG-GT-AGGCAGG
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gi|12                         :      gGTTTATCCA--CTATGTA-T---AAACCTGG--TT-AT-T-TAGCGCAAACTAATTT--ATTTT--C--T-T-----T-A-ATAGC----TCT----AATA-TTAGGGAAGGAAAA---TTG--C--GTCGGG-TTCCACCTT-TATG--TATTGTG-CATCTGC-GC---AT-GTCAAGgcaatctcttggtccccgaaaagtgttatgatta
gi|6                          : tttataaggTATCGA--CTATGGA-T---AAACCTGG--TT-AT-TTAAGCGCAAATTAACCG--ATTTTTTA--T-T----TT-AGA--GCGCAAT------AA-AATTAGGTTAGGAAAAA--TTA--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TGCTGTGGCATCTGC-GC---ATTGTCCAGA-TCAGTC-TTC-CTTTCAACTTTG-CGAATTCAAAGAGAGGCA-GACGTT---ACAGA--ATCTTT-AAT-AATTGTA-TCG-AGCACCATCCT-------GTCG-CATCGG-C-AATTTTA-TATT-GAAAAAAC-T-TAA-TACGT-------TT--GCG--TCGCAAG-CA--GGA-CAT--CAAAAGGCCA--AGAGCCCATATTATAGGG--AAAAACTTC-AC-TCAAGGGCG-A-TGTTTAGA-CC-GT----TTCTTTGTC-CAC----------------T------CAACTT-GCCAGCTC-GACCGC-AGG-GA-CAACGTGGGG---------------AGG-ACTGCACGG---------CAGTGT--A--------------TGTTC-A-----------------ATGTC-T-CGC-A-G-GAACCTGAGGATAC-TTCG--GATT---A----ACACCAACCCGA-T-GTTGC-C-ACA-CAAGT----------CCCCTGC-TTGGCG-TTC-AG--TCCGACACAT-CGCCTCGTCCGTACAAT-GT-A-A-TG-T--AATGTGTT----T----ATACTCCCATTTTCACGTGAA-CCCTTT-GGG-GA-A--TGC----C-CCTTTAT-CAGCT-T-CGTG-ACCACCATTAGCG-GTTTCCTTT---GCCCC--AAGATAT-A-TAGGG-AA-AAA----AT-ATTGAAAGATC--AGT-ATGTTG-ATTTTGGTTTC-ACCTTTTGCATAATGA
gi|1                          :     ggtttTATCCA--TT---GA-TTTTAAACCTAG--TCTAT-T-TAGCGCAAAT--ACT---ATTTC--A--T-T----ATTA-G--GT----T------AA-G-TTAGGTTTTGAAAAATCTGAGCC--GTCGGGGTTCG-TCTT-CAAGCTTATTGTG--ATCTGC-GCTAAAT-GTCAAGA-ACAATCCTTC-CTT----CTCTA-CAACTCCAACGAGAG-CA-GACGTTTAAA-AAA--ATGTTT-GA--GAT--CA-TCA-AGTTGCA-TC--------GTAGTCATCGG-CCAA--TTA-T-TT-GACAAA------GAACACAACT--ATGTTGAGCGGCT-GCCAG-TA--GAT-CATGCCAAG-GGCAAATAGAGCCC-TA-TATA-GGCAAAAACCTTCTAATTTTAGGGCG-ATT-TTCA-A-CC-GC----TTC-----C-TACAAACTCGTCACGCGT-T------AATCT---CAAGC-C-GAACC---AG-GAGACACGTGGGGCCGACGCAACAAGCCAGA-TC--CACAC---------GAGTGT-AG--------------AGTTC-AATCGCAGGAAACCTGTCA-GTC-T-TGC-ATGTGAACCTTCAGATA--TT-GTTAATTTCCAC----CAC---CCCGC-TGGCTGC-T-TCATTCAGTCC--------CC----C-TTGACAACTG-AAGCC-CCCCTCGT-CG-CTCG------CGA--GT-ACATTT-T--C----GTT---AC----A-AACCCCATTTTCATTT-GA-CCCTTTGGGGAAG-A--TACCTAAC-CCTCTAT-AAGTT-CTCGTT--TC-TCCTTAGCGTT-TTCATTCTTAGCTC-------TTT-AGTGAAA-GG-AAAAGAGAT-CGTCACATATCAAAAT-ATATTTGATTTTAG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCGCC-TGC-AACTTCATAAT----AATC--ACATTGTGTTT-GAAG-AACTGAATTCCAGTGCTTTGAAAAGACAGG---AA-G-C--ACACACAAAGACCAAG-AAAAAAAATAGGCAAA-AT-TCTTC-GCATAAT-AATTGATGCATTTAC-----TATATTTGGC-ATCAGTCTA-TT--GTGGAAACA-TTCAGGATTATCTCAAGCGATTTCTAT-GTTTAGGTA------------ACATGGCTTTGAAA-TAAA------AAGG-GGC-GA-TGAAAAAAATAAT-GG-CCAATTGGACCC--TTGAT-T---ATG-TACGTTCAA-CTACACCGGC-TA---AAAAAAACTCGTTCGGGGATTCG----CCTT-TA-TT-GAGTTGGGCTT-CTTGTAG--ACACACACGAAAA-ATTGGGTGGCTTGATTTA-------------TATGGCAACCTACACACCCCCC-CCCTTCAATCTTGCATC-GAT-CGGCTC-AATAAG
gi|16                         :          TATCCA--CTATGGAAT---AAACCTGGGTT--AT-T-TAGCGCAAATTAATTT--ATTTT--ATTT-T----AT-A-A--AC----TA-----AA-A-TTA-GTAAGGAAAA---TTAAGC--GTCGtcgtcgggcatctcttggtctcgaaagtggtatattacaattcccagggcattgtagcatatttcatactatgcatcaatgcatgacttctcacccttcgtgcattgttcagactggctccaattccaaaaaaaagaaaatcctgttgactcctcatatgttaaaaattacagtgctcaaaaaggttcagacttaaattggacatccaagatatatgattgtctaatttcttattggtttatccaattatgctattcaagtttcagtagctcttttttcggtatgcttctattagcataagatgaacgaatgtgccttacggtgttgatcaacttgtgaccatttcagacaaaattacatatacggtatctaatacagcatccaaaactgacatctgggtttgggagcagttgtcaagtcaagcgtcaatattcgtatcgagtatatattcttattgtcaaattctg
gi|4                          :    attaagattCCA--CTATGGA-T---AAACCTGT--T--ATAT-GA-CGCAA-TTGAATT--ATTTT--A--T-T----AT-A-A--GC----T------AA-A-TTTAGTTAGGAAA----TTA--C--GTCGGG-T-CGACCTTTCTTG--TATTGTG-CATCTGCCGC----T-GTCCAGA-TCGATC-TGC-CTTTCA-CTTTG-CGAATTTCAAGAGAG-CACGACGT----A-AAACAAT-TTT-GAT-AATTGTA-TCGTAACACCAATCTTTTTCTGGTCGTCATCG--CCAAATTTA-TATT-GAAAAAATTA-TAAGTAC-TGT--ATGTT--GCG--T-GCCAGGCA--GGAACAT--CAAA-GGC----AAAGCCCTAATTATAGG---AAAAACTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CCCGT----TTCTTTGTC-CACCAA-T---------T-T------GAACTTTGCCA-CTC-GAACCCCAAG-GA-CCACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTTTA-----------------A-GTCCT-TGC-A-G-AA-CCTGAGGATAATTCCG--AATT---ACAGTACACC-ACCCGC-T-GTTGC-C-ACA-CCAAT----------CC----C-TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATCCG-CTCGT-----CAA--GT-ACA-TG----A----GTT---ATA---ATAT-CTCATTTTCATGT-AA-CCCTTT-GGGAGA-A--TGCCGAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTG-ATC-CTATTAGCG-G-TTCATTT---G-CCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA----ATCCATGAAGGATC--AGT-ATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACA-TGTGCTT-G-AG-A--T-GGGT-CAT---TT--------CAGGTCAAA-GCC--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC--AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACA-AGTATATATATATGGCTTT-AAATTAAA-----GGAGGTGGTGGC-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---CTTTTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGCTTC---AAAA----TCAT---GGGATTCGGATTCATTCCACTTGGAGTTGGGCTA-C-AGTAGTAATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT--------------TATC-----------------C-CCCTTCATTTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGaagtt
gi|10                         :                             atcACCTGA--TT-AT-T-AAGCGCAAATTAATTT--ATTTC--A--TCT----AT-A-A--GC----TA-----AA-A-TTAGATAAGGAAAA---TTG--T--GTTGGG-TTCAACca
gi|10                         :                                                                                                                                                                                              cgATC-TGCGCTTTCA-CTTAG-CGAATTCGAAGAGAG-GA-GACGT----T-AAC--AT-TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgcatctgcgctttcacttagcgaattcgaagagaggagacgttaacattt
gi|19                         :                                                     cgacctgattattaagcgcaaattaatttatttcatctataagctaaaattagataaggaaaattgtgttgggttcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgc-CTTTCA-CTTAG-CGAATTCGAAGAGAG-GA-GACGT----T-AAC--AT-TTT--AT-ACTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAGCCC-GAACCC-AGG-GA-CCACGTGGGG---------------AGA-CG--GACAG---------CAGTCCCA---------------TGTC-------------------------------------------AAGATA--CTGT--AATT---CC---AC-C--ACCCGC-T-GCTGC-A-ACA-TCAGTC---------CC----C-TTGGCAACT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caaacgctcctacaaactcgtcagccggaatct-G-GAACCTGAGGATA--TTCG--GATT---ACA---C-C--ACC-GC-T-GTTGC-C-ACA-CCACTGACACCAGTCCC----C-TTGGCGATTC-AG--T-CGACATAT-CG-CTCCT-----CAG--GT-ACA-GG-TACA----GT-----T----ACATCCCCATTTTCATGT-CA---------------------------CTTTTAT-CAGCT-C-TGTG-ACC-ACATTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATGT-A-TAAGG-GGAAAA----AT-CAGGAATGATC--ATTCATG----GCTTTAA-Tg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CGACTCAT-CG-CTCGC-----CAG--GT-ACA-TGCT--C----GTT----T----ACAACCCCATTTTTATTT-GA-CCCTTT-GGGGGACA--TACCTAAC-CC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGG-CAAATA-T--AGGCATAAAGACC----AAAAAT--T--GCCAA-TTGTC-CC-G----ATGGCTTGATGC-TTTA-------ATATTT-TC-ATCAGTGTA-CTTAGTTT-ACCA-CCC------ATCTCAAATCATCCCATT-GCTCAGATACACGGCAC-TA-AT-----TTT-AAA-AAAG-----GGGGG-GGG-GCGTG-AATAATTAAA-GG-TAA-------------------------C--ATTCAA-TT---TCGTC-TC---AAGA----AC---------TT---A-CTTTTACA-TT-AAGTAGAACTG-G-AGTCG--ATGC-----AAAG-TT---GTGA-CTGAT-T--------------TAT------------------
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtggtatgttgacaggattggaagGGGAAGCA-TTC------GTCTTAAGCCAATCCTTT-GTTTACGTA-------------TATGGCTTT-AAT-TAAAAAGGGGGGGG-GGG-GCCTGAAAAAATTAAA-GG-C-------------TTGA--A---ATA-T--GTCCAA-TT---TCGG----------A----TCAT---GGGATatgcagtcatcaaacatgcccctatcttatcaaccatctgcatatctgtcgaggcatcatcttggtcctcgcaagtgttgattt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGGCTTT-AA--TAAG-----GGGGG-GGG-GC-TGAAAAAATTAAA-GT-CAAT-TGG---C--TTGA--ATATATGAT--GTCCAA-TT---TCGGC-TC---AAAA----
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T--GTCCAA-TT---TCGGC-TC---AAAAAA--TCAT---GGGGTTC-----CACT----TT-GAGTTGGGTTT-C-AGTAG--ATGC-----AGAG-CT---GTAA-TTGATTTATATGCAAACCTC-TAC------------------CTCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCAAATAAGGCAGGa
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TTCCAGGGCATTTGCAGTTAAATCTGTCTGCAATTATTCTCATAGTGCATCAAATGCAATGCCTCTCACCTTCGGCAATTGTTCAAAGACTGGCTCTAATTCCATAGAAAAATCCTGTTGACTCCTTCATTGTTACAGGCAAAAAAGTCTAATGTATCCCAGGATATACATTGTGTTATTGTCTAGATTTCTTATTGTACCACATCTATGCTATTCAAGTTTTAAAGTAGCTCTTTTTCGGTCTGCATTCACATTAGCATTTTAAAGTGAGCGAAGTAGTGGCTTAGGTGTTGATCATGTGACCATTTCAGACAATTCCATATCGGTTCTTATAAAAGCATCCAAAACTGACCAACTGGGTTTGGAGCAGTTGTCCAAGTCAATCGTTCACATGATGCATCACTGCTATTTCAGTCACTCGAGTATTATAGTCTTATGTTGTCAATTCCTA
Unaligned ( gi|15 ): CGGGACAATTGCGGAAACCCAATTTATTCCCATACCTGCCTCAAATGCAATATTCCTTACCCTTTAGCTAGTGGTTTTATGAACAGTCATAATTCCATCGCAGATAAA
Unaligned ( gi|20 ): CACCATGACCCCGCTGCAACTCATAAGAATCAC






Alignments
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Reference ( family-1791 )     :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAAATT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCNAGA-TCAATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCGAAGAGA-GCA-GACGT----N-AAA--AT-TTT-GAT-AATTGNA-TCG-AGCGCCA-------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-A-TAAGTACGNGT--ATGTT--GCG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCGA--AGAGCCCATATTATAGGGCAAAAAACTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACAAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GA-CCACGTGGGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTC-AA-------------GTC----T-TGC-A-G-GAACCTGAGGATA--T--TCGAATTACA--ACAC--ACCCGC-T-GCTGC-C-ACA-CCA---------GT--CC----C-TTGGCGACTC-AG--T-CGACACATC-G-CTCGTCGG--GT-AC-A-TG-T---------C-GTT---AT----ACANCCCCATTTTCATGTG-A-CCCTTTGGGGGA-A--TGCCTAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTGACC-CCA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA----AT-CGTGAANGATC--AGTATGTT--ATTTTAG-TTC-G-CTTTTGCATCATGACCCCGC-TGC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGT-CA----TTC---AGGTCA--AA-G-C--AAGCACAAAGACC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC-A-AATGGATTGATGCATTTAC-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTCCTTT-GTTTACGTAC-A--GTA-----ATATGGCTTT-AA--A-TAAA-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAATTAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCGT---GGGATTCG---TCATT-CA---TT--GAGTTGGGCT-NC-AGTAG--ATGC-----AGAA-NT---GTGG-TTGAT-TTA-------------TAT------------------CCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCGGG
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caaacgctcctacaaactcgtcagccggaatctGGGAAGCA-TTC------GTCTTAAGCCAATCCTTT-GTTTACGT--------------ATATGGCTTT-AATTA-AAAA-----GGGGG-GG-GGGGGCC-TGAAAAAATTAAA----------GG---C--TTGA--A---ATA-T--GTCCAA-TT---TCGG----------A--TCAT---GGGATg
gi|16                         :     TTTATCCA--CTATGGAAT---AAACCTGGGT-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--ATTT-T----AT-A--AA--C----TA-----AA-A-TTAG--TAAGGAAAATT--AAGC--GTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            attaagaATGGCTTT-AA----TAAG-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAATTAAA-GT-CAAT-TGG---C--TTGA--ATATATGAT--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAaagtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CGACTCATC-G-CTCGCCAG--GT-AC-A-TGCT---------C-GTT----T----ACAACCCCATTTTTATTTG-A-CCCTTTGGGGGACA--TACCTAAC-CC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                     -CTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT----T-AAC--AT-TTT--AT-ACTT
gi|2                          :    GTTTATCCAACTTATGGAAT---AAACCTAG-T-TTATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-TTTTAATTA--AG--C----CCCCCTAAA-A-TTAGGTTAAGAAAAATT--AA-CTAGTCGGG-TTCAACTTT-C-TG--TGTTGT-GCATCTGC-GC---A-TTGTCCAGAATCAATC-TTC-CCTTC-ACTTTAACGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT----ACAAA--AT-TTT-GAT-AATGGAAATCG-A-CACCA-------T-CTG-TCGTCATCGGTCCAATTTTAATATTTGAAAAAAT-AATAA-----AGTTAATGTT--ACG--T-GCTAG-CATAGGA-CTC--T-AAAGGCGC--AGCGCC-ATATTATAGGG-GAAAAACTTC-A--TCAAGGGCGGA-T-TTCG-A-CA-GTGTTCTTCTTTGTCACACAA------------------------CTT-GCCAGCTCCGAACCC-AAGCGA-CTACGTGGGG---------------CGACGC--AACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-------------GTC----T-TGCCA-G-AAACCTGAGGATA--T--TCGAATTACA---C-C--ACCCGCCT-GTTGC-CGACA-GAA---------GT--CC----C-CTGGCGATTCTAG--T-CGACACATC-G-TTCGTCAG--GTGAC-A-TG-T---------T-GTTTATATTGTTATATCCTTCCTTTTATGTG-ATCCCTTTGGGGGA-AAATGCCTAACTCCTTTATTCAGCT-CTCGTAACC-CTA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATATAA-TAGGGAAG-AAA----AT-CATGAATGATC--AGTATGTT--AATTTAG-TTCAA-CATTTGCATCATGACCCCAC-TACAAACTCC-T-ATTAA-CACCAAACATTGTACTTGGAAG-A--TGGGGT-CA----TTC---AGGTCA--AAGG-C--AAGCACCGAGATC--GT-AAAATAATC-GCAAA--T-TC-TCGGCAA-AATGGATTGATGCATTTATTATTATATATTT-GCAATCGGTCTAGCTT-TGGAAAGCATTTC------ATCTCAAGCCATTCCTTTGGTTTACGTAC-AT-GTA-------ATGGC-TT-AA--T-TAAAGGGGGGGGGG-GG-GG----T-TG-AAAAATTAAA-GGCCAAA-TGG---C--TTGA--A---ATACT--GTCCAACTT---TTGGC-TCACAAAAA--TCAT----GGATTC-----CAC-------TT--GAG-TGGGCTATC-AGTAG--ATGC-----AGAATCT---GTGG-TTGAT-TTATAGTGCAAACCTCTAT------------------CCCCCTCAATTT--CATCAGCTCCGCGTCG-GT-AGGCAGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gCACCATGACCCCGC-TGC-AACTC---A--TAAGAATC--AC
gi|3                          :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTAG-T-T-ATTTA-GCGCAAAT-AATTTTGAGTCA--T--T-T----AT-A--GG--T----T------AA-AGTTAGGTTTGGAAAA-TT--G--C--GTCGGG-TTCGGTCTT-CAAG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGA-ACAATC-TCC-TTTTC---TTTA-CAAACTCCAAGAGA-GCA-GACGT----T-AAA--AT-TTTTGATTAATCGAA-TCA-AGTGCCA-------T-CCG-TAGTCATCGG-CCAATT--A-TTTT-GACAAAA------AGAACAAAT--ATGTT--GCG--T-GCCAT-C------------C-A--GGCAA--AGAGCCC-TATTATAGGGCAAAAA--CTC-A--TCTAGGGCG-A-T-TTCA-AACC-GC----TCCT-------ACAAACT---------TGTCAGGCGGAATCT---CGGCCC-GAACCC-CAG-GA-CCACGTGGGG---------------AGA-G----ACGGACAGAGTCCCAGTGTCAGAGTTATGCGAAACCTGTCC-AA-------------GTT----TCTGC-T-G-GAACCTCAAGATA--T--TGTAAT--CC--AC-C--GCCCGC-T-GCTGCAC-ACA-CCA---------GT--CC----CCTTGGCAACTG-AG--C-C----CA-C-G-CTCGTCGCCCGT-AC-A-TG-TT--------C-GTT----T----ACAACCCCATTTTCAT-TG-A-CCCTTTGGGGGACA--TACCTAAC-CCCTTTT-AAGTTTC-CGTTTCT-CCAATTAGCG-G-TTCACTT---GCCTCTAA--GTGT---TAAAG-GA-AAAG---AT-CGTCAATGATC--AGTATATTG-ATTTTGG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCCGCCTGC-AACTC----AT-AAGAATC--ACATTGT-TTT-GAAGTG--TGGTGT-CA----TTC---AGGTGA--AA-G-CCAAAACACAAAGAC------AAAA-AGTA-GCAAAATT-TC-GC-GC-A-G-TGGATTGATGCATTTAC-----TATATTT-GC-ATCAGTCTA-CTT-GGGGAAACA-TTT------ATCTCAAGCGGTTCCTTT-GTTTAGGTAC--------------ATGGCTTT--G--A-TAAA------AAGG-GG-GG----C-TGAAAAA--TAAATGG-CAAT-TGG---C--TTGATTAT--ATGAC--GTTCAA-TT---CTGGC-TAA-AAAAA--TCGT---GG-----------ATT-CAGCTTT--GAGTTGGGCT-TC-TGTAG--ATAC-----AGAA--T---GT-G-TTGAT-GTA-------------TATGCAACCCTCACC------CCCCTTCAATTT--CATCAGTC-GGCTTTAAATAAGTCGGG
gi|4                          :         gCCA--CTATGGA-T---AAACCTG--T-T-ATATG-ACGCAA-TTGAATT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTTAGTTAGGAAA--TT--A--C--GTCGGG-T-CGACCTTTCTTG--TATTGT-GCATCTGCCGC-----T-GTCCAGA-TCGATC-TGC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTTCAAGAGA-GCACGACGT----A-AAACAAT-TTT-GAT-AATTGTA-TCGTAACACCAATCTTTTT-CTGGTCGTCATCG--CCAAATTTA-TATT-GAAAAAATTA-TAAGTAC-TGT--ATGTT--GCG--T-GCCAGGCA--GGAACAT--C-AAAGGCAA--AG--CCCTAATTATAGG---AAAAACTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CCCGT----TTCTTTGTC-CACCAA-T---------T-T------GAACTTTGCCA-CTC-GAACCCCAAG-GA-CCACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTTTAA-------------GTCC---T-TGC-A-G--AACCTGAGGATAATT--CCGAATTACAGTACACC-ACCCGC-T-GTTGC-C-ACA-CCA---------AT--CC----C-TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATCCG-CTCGTCAA--GT-AC-A-TG-----------A-GTT---AT----AATATCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAGA-A--TGCCGAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCG-G-TTCATTT---G-CCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA----ATCCATGAAGGATC--AGTATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACA-TGTGCTT-G-AG-A--T-GGGT-CAT---TTC---AGGTCA--AA-GCC--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC---AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAA--GTATATATATATGGCTTT-AA--ATTAAA-----GGAGGTGGTGG----C-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---CTTTTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGCTTC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGATTCATTCCA---CTTGGAGTTGGGCT-AC-AGTAGTAATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCTTA-------------T-C------------------CCCCTTCATTTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGgcaatctcttggtccccgaaaagtgttatgatta
gi|5                          : atcGTGTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T---ATTGA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAA-TT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CTTG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT----A-AAA--AT-TTT-GAT-AATTGTA-TCG-AACACCAC------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-A-TAAGTACATGT--ATGTT--GCG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCCA--AGAGCCCATATTATAGGGAAAAAAACTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACCAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GA-CCACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-------------GTC----T-TGC-A-G-AAACCTGAGGATA--T--TCGAATTACAGTACAC--ACCCGC-T-GTTGC-C-ACA-CCA---------AT--CC----C-TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATC-G-CTCGTCAA--GT-AC-A-TG-T---------A-GTT---AT----ATATCCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAGA-A--TGCCGAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA----AT-CATGAAGGATC--AGTATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGT-CA----TTC---AGGTCA--AA-G-C--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC---AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTTGGGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAA--GTATATATATATGGCTTT-AA--A-TAAA-----GGAGG-GG-TG----C-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGC-TC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGA-TCATTCCAC--TT--GAGTTGGGCT-AC-AGTAG--ATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGAT-CT--------------TAT------------------CCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCAGGca
gi|6                          :     TTTATCGA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTAAGCGCAAATTAACCG--ATTTTTTA--T-T----TT-AG-AG--CGCAAT------AA-AATTAGGTTAGGAAAAATT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TGCTGTGGCATCTGC-GC---ATT-GTCCAGA-TCAGTC-TTC-CTTTCAACTTTG-CGAATTCAAAGAGAGGCA-GACGTTA--C-AGA--ATCTTT-AAT-AATTGTA-TCG-AGCACCA-------TCCTG-TCG-CATCGG--CAATTTTA-TATT-GAAAAAAC-T-TAA-TACGT-------TT--GCG--TCGCAAG-CA--GGA-CAT--CAAAAGGCCA--AGAGCCCATATTATAGGG--AAAAACTTC-AC-TCAAGGGCG-A-TGTTTAGA-CC-GT----TTCTTTGTC-CAC----------------T------CAACTT-GCCAGCTC-GACCGC-AGG-GA-CAACGTGGGG---------------AGG-ACTGCACGG---------CAGTGT--A--------------TGTTC-AAT------------GTC----T-CGC-A-G-GAACCTGAGGATAC-T--TCGGATT--A--ACACCAACCCGA-T-GTTGC-C-ACA-CAA---------GT--CCCCTGC-TTGGCG-TTC-AG--TCCGACACATC-GCCTCGTC-C--GT-ACAA-TG-TAATGTAATGT-GTT----T----ATACTCCCATTTTCACGTGAA-CCCTTT-GGGGA-A--TGC----C-CCTTTAT-CAGCT-T-CGTGACCACCA-TTAGCG-GTTTCCTTT---GCCCC--AAGATAT-A-TAGGG-AA-AAA----AT-ATTGAAAGATC--AGTATGTTG-ATTTTGGTTTC-ACCTTTTGCATAATGA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgacctgattattaagcgcaaattaatttatttcatctataagctaaaattagataaggaaaattgtgttgggttcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgc-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGGTTC-----CACT------TT--GAGTTGGGTT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAG-CT---GTAA-TTGATTTATA-TGCAAACC----TCTAC-----C---TCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCAAATAAGGCAGG
gi|12                         :    GTTTATCCA--CTATGTA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAACTAATTT--ATTTT--C--T-T-----T-AATAGCTC----T------AATA-TTAGGGAAGG-AAAATT--G--C--GTCGGG-TTCCACCTT-TATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGgcaatctcttggtccccgtaagtgttatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttataaggCAGCCC-GAACCC-AGG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-CG--GACAG---------CAGTCCCA---------------TG-TC-AA----------------------------------------GATA--CT--GTAATT-CC--AC-C--ACCCGC-TG-CTGC-A-ACAT-CA---------GTCCC----C--TTGGCAACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caaacgctcctacaaactcgtcagccggaatctGGGAAGCA-TTCG------TCTTAAGCCAATCCTTT-GTTTACGT--------------ATATGGCTTT-AATTA-AAAA-----GGGGG-GG-GGGGGCC-TGAAAAAATTAAA----------GG---C--TTGA--A---ATA-T--GTCCAA-TT---TCGG----------A--TCAT---GGGATg
gi|16                         :     TTTATCCA--CTATGGAAT---AAACCTGGGT-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--ATTT-T----AT-A--AA--C----TA-----AA-A-TTAG--TAAGGAAAATT--AAGC--GTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attaagaATGGCTTT-AA----TAAG-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAATTAAA-GT-CAAT-TGG---C--TTGA--ATATATGAT--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAaagtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -CGACTCAT-CG-CTCGCCAG--GT-AC-ATGCT---------C-GTT----T----ACAACCCCATTTTTATTTG-A-CCCTTTGGGGGACA--TACCTAAC-CC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                     -CTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT--T----AAC--AT-TTT--AT-ACTT
gi|2                          :    GTTTATCCAACTTATGGAAT---AAACCTAG-T-TTATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-TTTTAATTA--AG--C----CCCCCTAAA-A-TTAGGTTAAGAAAAATT--AA-CTAGTCGGG-TTCAACTTT-C-TG--TGTTGT-GCATCTGC-GC---A-TTGTCCAGAATCAATC-TTC-CCTTC-ACTTTAACGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT--AC---AAA--AT-TTT-GAT-AATGGAAATCG-A-CACCA-------T-CTG-TCGTCATCGGTCCAATTTTAATATTTGAAAAAAT-A---ATA-AAGTTAATGTTA--CG--T-GCTAG-CATAGGA-CTC--T-AAAGGCGCA--GCGCC-ATATTATAGGGGAAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCGGAT-TT-CG-A-CA-GTGTTCTTCTTTGTCACACAA------------------------CTT-GCCAGCTCCGAACCC-AAGCGAC-TACGTGGGG---------------CGACGC--AACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-----------------GTC-T-TGCCA-G-AAACCTGAGGATA--TT--CGAATTACA---C-C--ACCCGCCTG-TTGC-CGACAG-AA---------GT-CC----C--CTGGCGATTCTAG--T-CGACACAT-CG-TTCGTCAG--GTGAC-ATG-T---------T-GTTTATATTGTTATATCCTTCCTTTTATGTG-ATCCCTTTGGGGGA-AAATGCCTAACTCCTTTATTCAGCT-CTCGTAACC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATATAA-TAGGGAAG-AAA-A----T-CATGAATGATCAG--TATGTT--AATTTAG-TTCAA-CATTTGCATCATGACCCCAC-TACAAACTCC-T-ATTAA-CACCAAACATTGTACTTGGAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAAGG-C--AAGCACCGAGATC--GT-AAAATAATCG-CAAA--T-TCT-CGGCAA-AATGGATTGATGCATTTATTATTATATATTTG-CAATCGGTCTAGCTT-TGGAAAGCATTTCA------TCTCAAGCCATTCCTTTGGTTTACGTAC-AT-GTA-------ATGGC-TT-AA--T-TAAAGGGGGGGGGG-GG-GG----T-TG-AAAAATTAAA-GGCCAAA-TGG---C--TTGA--A---ATACT--GTCCAACTT---TTGGC-TCACAAAAA--TCAT----GGATTC-----CAC-------TT--GAG-TGGGCTATC-AGTAG--ATGC-----AGAATCT---GTGG-TTGATTTATAGTGCAAACC----T---------CTATCCCCCTCAATTT--CATCAGCTCCGCGTCG-GT-AGGCAGG
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gi|3                          :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTAG-T-T-ATTTA-GCGCAAAT-AATTTTGAGTCA--T--T-T----AT-A--GG--T----T------AA-AGTTAGGTTTGGAAAA-TT--G--C--GTCGGG-TTCGGTCTT-CAAG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGA-ACAATC-TCC-TTTTC---TTTA-CAAACTCCAAGAGA-GCA-GACGT--T----AAA--AT-TTTTGATTAATCGAA-TCA-AGTGCCA-------T-CCG-TAGTCATCGG-CCAATT--A-TTTT-GACAAAA-----AGAACAAAT--ATGTTG--CG--T-GCCAT-C------------C-A--GGCAAA--GAGCCC-TATTATAGGGCAAAAA-CT-C--A-TCT-AGGGCG-AT-TT-CA-AACC-GC----TCCT-------ACAAACT---------TGTCAGGCGGAATCT---CGGCCC-GAACCC-CAG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-G----ACGGACAGAGTCCCAGTGTCAGAGTTATGCGAAACCTGTCC-AA-----------------GTT-TCTGC-T-G-GAACCTCAAGATA--TT--GTAAT--CC--AC-C--GCCCGC-TG-CTGCAC-ACAC-CA---------GT-CC----CC-TTGGCAACTG-AG--C-C----CA--CG-CTCGTCGCCCGT-AC-ATG-TT--------C-GTT----T----ACAACCCCATTTTCAT-TG-A-CCCTTTGGGGGACA--TACCTAAC-CCCTTTT-AAGTTTC-CGTTTCT-CCAATTAGCGG-TT-CACTT---GCCTCTAA--GTGT---TAAAG-GA-AAAGA----T-CGTCAATGATCAG--TATATTG-ATTTTGG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCCGCCTGC-AACTC----AT-AAGAATC--ACATTGT-TTT-GAAGTG--TGGTGTC-A-----TT-------CAGGTGAAA-G-CCAAAACACAAAGAC------AAAA-AGTAG-CAAAATT-TCG-C-GC-A-G-TGGATTGATGCATTTAC-----TATATTTG-C-ATCAGTCTA-CTT-GGGGAAACA-TTTA------TCTCAAGCGGTTCCTTT-GTTTAGGTAC--------------ATGGCTTT--G--A-TAAA------AAGG-GG-GG----C-TGAAAAA--TAAATGG-CAAT-TGG---C--TTGATTAT--ATGAC--GTTCAA-TT---CTGGC-TAA-AAAAA--TCGT---GG-----------ATT-CAGCTTT--GAGTTGGGCT-TC-TGTAG--ATAC-----AGAA--T---GT-G-TTGATGTATA-TGCA-ACCCTCAC---------C---CCCCTTCAATTT--CATCAGTC-GGCTTTAAATAAGTCGGG
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Reference ( family-1791 )     :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAAATT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCGAAGAGA-GCA-GACGT--N----AAA--AT-TTT-GAT-AATTGNA-TCG-AGCGCCA-------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-ATAAGTACAAGT--ATGTTG--CG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCAAA--GAGCCCATATTATAGGGAAAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCG-AT-TT-CA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACAAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTC-AA-----------------GTC-T-TGC-A-G-GAACCTGAGGATA--TT--CGAATTACA--ACAC--ACCCG-CTG-TTGC-C-ACAC---------CAGTCCC---C-TTGGCGATTC-AG--T-CGACACAT-CG-CTCGTCGG--GT-AC-ATG-T---------C-G-TTA------TACANCCCCATTTTCATGTG-A-CCCTTTGGGGG--A-ATGCCTAAC-CCTTTA-TCAGCT-C-CGTGACC-CCA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA-A----T-CGTGAANGATCAG--TATGTT--ATTTTAG-TTC-G-CTTTTGCATCATGACCCCGC-TGC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAA-G-C--AAGCACAAAGACC--GTAAAAATAATAG-CAAA-TT-TCT-C-GC-A-AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTTG-C-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTCG------TCTCAAGCCATTCCTTT-GTTTACGTAC-A--GTA-----ATATGGCTTT-AA--A-TAAA-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAANTAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGATTCG---TCATT-CA---TT--GAGTTGGGCT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAA-NT---GTGG-TTGATTTATA-TG-------CAAACCT---------C---CCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCGGG
gi|1                          :       TATCCA--TT---GA-TTTTAAACCTAG-TCT-ATTTA-GCGCAAAT--ACT---ATTTC--A--T-T----ATTA--GG--T----T------AA-G-TTAGGTTTTGAAAAATCTGAGCC--GTCGGGGTTCG-TCTT-CAAGCTTATTGT-G-ATCTGC-GCTAAA-T-GTCAAGA-ACAATCCTTC-CTT----CTCTA-CAACTCCAACGAGA-GCA-GACGT--TTAAAAAA--ATGTTT-GA--GAT--CA-TCA-AGTTGCA-------T-C-G-TAGTCATCGG-CCAATT--A-T-TT-GACAAAG-----AACACAACT--ATGTTGAGCGGCT-GCCAG-TA--GAT-CATGCC-AAGGGCAAATAGAGCCC-TAT-ATAGGCAAAAAC-CTTCTAA-TTTTAGGGCG-AT-TTTCA-A-CC-GC----TTC-----C-TACAAACTCGTCACGCGT-T------AATCT---CAAGC-C-GAACC---AG-GAGACACGTGGGGCCGACGCAACAAGCCAGA-TC--CACAC---------GAGTGT-AG--------------AGTTC-AATCGCAGGAAACCTGTCAGTC-T-TGC-ATGTGAACCTTCAGATA--TTGTTAATTTCCA--CCAC---CCCG-CTGGCTGC-T-TCATT--------CAGTCCC---CCTTGACAACTG-AAGCC-CCCCTCGT-CG-CTCG-CGA--GT-AC-ATT-TT--------C-G-TTA------CA-AACCCCATTTTCATTTG-A-CCCTTTGGGGA--AGATACCTAAC-CCTCTA-TAAGTT-CTCGTTTCT-CC--TTAGCGT-TTTCATTCTTAGCTC-------TTT-AGTGAAA-GG-AAA-AGAGAT-CGTCACATATCAAAATATATTTGATTTTAG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCGCC-TGC-AACTTCATAAT----AATC--ACATTGTGTTT-GAAG-AACTGAATTCCAGTGCTTTGAAAAGACAGG---AA-G-C--ACACACAAAGACCAAGAAAAAA-AATAGGCAAA-AT-TCTTC-GC-ATAATA-ATTGATGCATTTAC-----TATATTTGGC-ATCAGTCTA--TT-GTGGAAACA-TTCAGGATTATCTCAAGCGATTTCTAT-GTTTA------G--GTA-----ACATGGCTTTGAA--A-TAAA-----AAGGG-GC-GA------TGAAAAAAATAAT-GG-CCAATTGGACCC--TTGAT-T---ATG-TACGTTCAA-CTACACCGGC-TAA-AAAAAACTCGTTCGGGGATTCG---CC-TT-TA---TT--GAGTTGGGCT-TCTTGTAG--ACACACACGAAAA-ATTGGGTGGCTTGATTTATA-TG-------GCAACCTACACACCCCC---CCCCTTCAATCTTGCATC-GAT-CGGCTC-AATAAGTCG
gi|10                         :                             ACCTGA-T-T-ATTAA-GCGCAAATTAATTT--ATTTC--A--TCT----AT-A--AG--C----TA-----AA-A-TTAGATAAGG-AAAATT--G--T--GTTGGG-TTCAACtcgggcatctcttggtctcgaaagtggtatattacaattcccagggcattgtagcatatttcatactatgcatcaatgcatgacttctcacccttcgtgcattgttcagactggctccaattccaaaaaaaagaaaatcctgttgactcctcatatgttaaaaattacagtgctcaaaaaggttcagacttaaattggacatccaagatatatgattgtctaatttcttattggtttatccaattatgctattcaagtttcagtagctcttttttcggtatgcttctattagcataagatgaacgaatgtgccttacggtgttgatcaacttgtgaccatttcagacaaaattacatatacggtatctaatacagcatccaaaactgacatctgggtttgggagcagttgtcaagtcaagcgtcaatattcgtatcgagtatatattcttattgtcaaattctg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                            cgATC-TGCGCTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT--T----AAC--AT-TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgcatctgcgctttcacttagcgaattcgaagagaggagacgttaacattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cgacctgattattaagcgcaaattaatttatttcatctataagctaaaattagataaggaaaattgtgttgggttcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgc-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGGTTC-----CACT------TT--GAGTTGGGTT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAG-CT---GTAA-TTGATTTATA-TG-------CAAACCTCTAC-----C---TCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCAAATAAGGCAGG
gi|12                         :    GTTTATCCA--CTATGTA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAACTAATTT--ATTTT--C--T-T-----T-AATAGCTC----T------AATA-TTAGGGAAGG-AAAATT--G--C--GTCGGG-TTCCACCTT-TATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGgcaatctcttggtccccgtaagtgttatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttataaggCAGCCC-GAACCC-AGG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-CG--GACAG---------CAGTCCCA---------------TG-TC-AA----------------------------------------GATA--CT--GTAATT-CC--AC-C--ACCCG-CTG-CTGC-A-ACAT---------CAGTCCC---C-TTGGCAACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caaacgctcctacaaactcgtcagccggaatctGGGAAGCA-TTCG------TCTTAAGCCAATCCTTT-GTTTACGT--------------ATATGGCTTT-AATTA-AAAA-----GGGGG-GG-GGGGGCC-TGAAAAAATTAAA----------GG---C--TTGA--A---ATA-T--GTCCAA-TT---TCGG----------A--TCAT---GGGATg
gi|16                         :     TTTATCCA--CTATGGAAT---AAACCTGGGT-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--ATTT-T----AT-A--AA--C----TA-----AA-A-TTAG--TAAGGAAAATT--AAGC--GTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attaagaATGGCTTT-AA----TAAG-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAATTAAA-GT-CAAT-TGG---C--TTGA--ATATATGAT--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAaagtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CGACTCAT-CG-CTCGCCAG--GT-AC-ATGCT---------C-G-TT-------TACAACCCCATTTTTATTTG-A-CCCTTTGGGGG--ACATACCTAAC-CC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                     -CTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT--T----AAC--AT-TTT--AT-ACTT
gi|2                          :    GTTTATCCAACTTATGGAAT---AAACCTAG-T-TTATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-TTTTAATTA--AG--C----CCCCCTAAA-A-TTAGGTTAAGAAAAATT--AA-CTAGTCGGG-TTCAACTTT-C-TG--TGTTGT-GCATCTGC-GC---A-TTGTCCAGAATCAATC-TTC-CCTTC-ACTTTAACGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT--AC---AAA--AT-TTT-GAT-AATGGAAATCG-A-CACCA-------T-CTG-TCGTCATCGGTCCAATTTTAATATTTGAAAAAAT-A---ATA-AAGTTAATGTTA--CG--T-GCTAG-CATAGGA-CTC--T-AAAGGCGCA--GCGCC-ATATTATAGGGGAAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCGGAT-TT-CG-A-CA-GTGTTCTTCTTTGTCACACAA------------------------CTT-GCCAGCTCCGAACCC-AAGCGAC-TACGTGGGG---------------CGACGC--AACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-----------------GTC-T-TGCCA-G-AAACCTGAGGATA--TT--CGAATTAC---AC-C--ACCCGCCTG-TTGC-CGACAG---------AAGTCCC---C--TGGCGATTCTAG--T-CGACACAT-CG-TTCGTCAG--GTGAC-ATG-T---------T-GTTTATATTGTTATATCCTTCCTTTTATGTG-ATCCCTTTGGGGGAAA-ATGCCTAACTCCTTTATTCAGCT-CTCGTAACC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATATAA-TAGGGAAG-AAA-A----T-CATGAATGATCAG--TATGTT--AATTTAG-TTCAA-CATTTGCATCATGACCCCAC-TACAAACTCC-T-ATTAA-CACCAAACATTGTACTTGGAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAAGG-C--AAGCACCGAGATC--GT-AAAATAATCG-CAAA--T-TCT-CGGCAA-AATGGATTGATGCATTTATTATTATATATTTG-CAATCGGTCTAGCTT-TGGAAAGCATTTCA------TCTCAAGCCATTCCTTTGGTTTACGTAC-AT-GTA-------ATGGC-TT-AA--T-TAAAGGGGGGGGGG-GG-GG----T-TG-AAAAATTAAA-GGCCAAA-TGG---C--TTGA--A---ATACT--GTCCAACTT---TTGGC-TCACAAAAA--TCAT----GGATTC-----CAC-------TT--GAG-TGGGCTATC-AGTAG--ATGC-----AGAATCT---GTGG-TTGATTTATAGTG-------CAAACCT---------CTATCCCCCTCAATTT--CATCAGCTCCGCGTCG-GT-AGGCAGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gCACCATGACCCCGC-TGC-AACTC---A--TAAGAATC--AC
gi|3                          :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTAG-T-T-ATTTA-GCGCAAAT-AATTTTGAGTCA--T--T-T----AT-A--GG--T----T------AA-AGTTAGGTTTGGAAAA-TT--G--C--GTCGGG-TTCGGTCTT-CAAG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGA-ACAATC-TCC-TTTTC---TTTA-CAAACTCCAAGAGA-GCA-GACGT--T----AAA--AT-TTTTGATTAATCGAA-TCA-AGTGCCA-------T-CCG-TAGTCATCGG-CCAATT--A-TTTT-GACAAAA-----AGAACAAAT--ATGTTG--CG--T-GCCAT-C------------C-A--GGCAAA--GAGCCC-TATTATAGGGCAAAAA-CT-C--A-TCT-AGGGCG-AT-TT-CA-AACC-GC----TCCT-------ACAAACT---------TGTCAGGCGGAATCT---CGGCCC-GAACCC-CAG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-G----ACGGACAGAGTCCCAGTGTCAGAGTTATGCGAAACCTGTCC-AA-----------------GTT-TCTGC-T-G-GAACCTCAAGATA--TT--GTAAT--CC--AC-C--GCCCG-CTG-CTGCAC-ACAC---------CAGTCCC---C-TTGGCAACTG-AG--C-C----CA--CG-CTCGTCGCCCGT-AC-ATG-TT--------C-G-TT-------TACAACCCCATTTTCAT-TG-A-CCCTTTGGGGG--ACATACCTAAC-CCCTTT-TAAGTTTC-CGTTTCT-CCAATTAGCGG-TT-CACTT---GCCTCTAA--GTGT---TAAAG-GA-AAAGA----T-CGTCAATGATCAG--TATATTG-ATTTTGG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCCGCCTGC-AACTC----AT-AAGAATC--ACATTGT-TTT-GAAGTG--TGGTGTC-A-----TT-------CAGGTGAAA-G-CCAAAACACAAAGAC------AAAA-AGTAG-CAAAATT-TCG-C-GC-A-G-TGGATTGATGCATTTAC-----TATATTTG-C-ATCAGTCTA-CTT-GGGGAAACA-TTTA------TCTCAAGCGGTTCCTTT-GTTTAGGTAC--------------ATGGCTTT--G--A-TAAA------AAGG-GG-GG----C-TGAAAAA--TAAATGG-CAAT-TGG---C--TTGATTAT--ATGAC--GTTCAA-TT---CTGGC-TAA-AAAAA--TCGT---GG-----------ATT-CAGCTTT--GAGTTGGGCT-TC-TGTAG--ATAC-----AGAA--T---GT-G-TTGATGTATA-TG-------CAACCCTCAC------C---CCCCTTCAATTT--CATCAGTC-GGCTTTAAATAAGTCGGG
gi|4                          :         gCCA--CTATGGA-T---AAACCTG--T-T-ATATG-ACGCAA-TTGAATT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTTAGTTAGGAAA--TT--A--C--GTCGGG-T-CGACCTTTCTTG--TATTGT-GCATCTGCCGC-----T-GTCCAGA-TCGATC-TGC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTTCAAGAGA-GCACGACGT--A----AAACAAT-TTT-GAT-AATTGTA-TCGTAACACCAATCTTTTT-CTGGTCGTCATCG--CCAAATTTA-TATT-GAAAAAATTATAAGTACT-GT--ATGTTG--CG--T-GCCAGGCA--GGAACAT--C-AAAGGCAAA--G--CCCTAATTATAGG--AAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCG-AT-TT-CA-A-CCCGT----TTCTTTGTC-CACCAA-T---------T-T------GAACTTTGCCA-CTC-GAACCCCAAG-GAC-CACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTTTAA-----------------GTCCT-TGC-A-G--AACCTGAGGATAATTC--CGAATTACAGTACACC-ACCCG-CTG-TTGC-C-ACAC---------CAATCCC-----TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATCCG-CTCGTCAA--GT-AC-ATG-----------A-G-TTA------TAATATCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAG--A-ATGCCGAAC-CCTTTA-TCAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---G-CCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA-A----TCCATGAAGGATCAG--TATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACA-TGTGCTT-G-AG-A--T-GGGTC-AT----TT-------CAGGTCAAA-GCC--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATAG-CAAA-TT-TCT-C-GC---AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTTG-C-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTCG------TCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAA--GTATATATATATGGCTTT-AA--ATTAAA-----GGAGGTGGTGG----C-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---CTTTTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGCTTC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGATTCATTCCA---CTTGGAGTTGGGCT-AC-AGTAGTAATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT-TA----------------T---------C---CCCCTTCATTTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGgcaatctcttggtccccgaaaagtgttatgatta
gi|5                          : atcGTGTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T---ATTGA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAA-TT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CTTG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT--A----AAA--AT-TTT-GAT-AATTGTA-TCG-AACACCAC------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-ATAAGTACATGT--ATGTTG--CG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCCAA--GAGCCCATATTATAGGGAAAAAAACTTC--A-TCA-AGGGCG-AT-TT-CA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACCAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GAC-CACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-----------------GTC-T-TGC-A-G-AAACCTGAGGATA--TT--CGAATTACAGTACAC--ACCCG-CTG-TTGC-C-ACAC---------CAATCCC-----TTGGCGATTC-AA--T-CGACACAT-CG-CTCGTCAA--GT-AC-ATG-T---------A-G-TTA------TATATCCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAG--A-ATGCCGAAC-CCTTTA-TCAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA-A----T-CATGAAGGATCAG--TATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAA-G-C--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATAG-CAAA-TT-TCT-C-GC---AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTTG-C-ATCGGTCTA-CTTGGGGGAAGCA-TTCG------TCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAA--GTATATATATATGGCTTT-AA--A-TAAA-----GGAGG-GG-TG----C-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGC-TC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGA-TCATTCCAC--TT--GAGTTGGGCT-AC-AGTAG--ATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT-TA-T----------------------------CCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCAGGca
gi|6                          :     TTTATCGA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTAAGCGCAAATTAACCG--ATTTTTTA--T-T----TT-AG-AG--CGCAAT------AA-AATTAGGTTAGGAAAAATT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TGCTGTGGCATCTGC-GC---ATT-GTCCAGA-TCAGTC-TTC-CTTTCAACTTTG-CGAATTCAAAGAGAGGCA-GACGTTAC----AGA--ATCTTT-AAT-AATTGTA-TCG-AGCACCA-------TCCTG-TCG-CATCGG--CAATTTTA-TATT-GAAAAAAC-TTAA-TAC--GT-----TTG--CG--TCGCAAG-CA--GGA-CAT--CAAAAGGCCAA--GAGCCCATATTATAGGG-AAAAA-CTTC--ACTCA-AGGGCG-ATGTT-TAGA-CC-GT----TTCTTTGTC-CAC----------------T------CAACTT-GCCAGCTC-GACCGC-AGG-GAC-AACGTGGGG---------------AGG-ACTGCACGG---------CAGTGT--A--------------TGTTC-AAT----------------GTC-T-CGC-A-G-GAACCTGAGGATAC-TT--CGGATT--A--ACACCAACCCG-ATG-TTGC-C-ACAC---------AAGTCCCCTGC-TTGGCG-TTC-AG--TCCGACACAT-CGCCTCGTC-C--GT-ACAATG-TAATGTAATGT-G-TT-------TATACTCCCATTTTCACGTGAA-CCCTTT-GGGG--A-ATGC----C-CCTTTA-TCAGCT-T-CGTGACCACCA-TTAGCGGTTT-CCTTT---GCCCC--AAGATAT-A-TAGGG-AA-AAA-A----T-ATTGAAAGATCAG--TATGTTG-ATTTTGGTTTC-ACCTTTTGCATAATGA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggtAGG-CAAATA-T--AGGCATAAAGACC----AAAAAT--T-G-CCAA-TTGTCC-C-G-----ATGGCTTGATGC-TTTA-------ATATTTT-C-ATCAGTGTA-CTT-AGTTTACCA-CCCA------TCTCAAATCATCCCATT-GCTCAGATAC-ACGGCA-----CTA--ATTTT-AA--A-AAAG-----GGGGG-GG-GG----CGTG-AATAATTAAA-GG-TAA-------------------------C--ATTCAA-TT---TCGTC-TCA-AGAAC--TTAC-------TT-----TTA---CA---TT--AAGTAGAACT-GG-AGTCG--ATGC-----AAAG-TT---GTGA-CTGATTTATA-TGCAGTCATCAAACAT---------G---CCCCT---ATCT--TATCAAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtggtatgttgacaggattggaag-G-GAACCTGAGGATA--TT--CGGATTACA--CCAC-----CG-CTG-TTGC-C-ACACCACTGACACCAGTCCC---C-TTGGCGATTC-AG--T-CGACATAT-CG-CTCCTCAG--GT-AC-AGG-TA--------CAG-T--------TACATCCCCATTTTCATGTC-A--------------------------CTTTTA-TCAGCT-C-TGTGACC-ACA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATGT-A-TAAGG-GGAAAA-A----T-CAGGAATGATCAcatctgcatatctgtcgaggcatcatcttggtcctcgcaagtgttgattt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TTCCAGGGCATTTGCAGTTAAATCTGTCTGCAATTATTCTCATAGTGCATCAAATGCAATGCCTCTCACCTTCGGCAATTGTTCAAAGACTGGCTCTAATTCCATAGAAAAATCCTGTTGACTCCTTCATTGTTACAGGCAAAAAAGTCTAATGTATCCCAGGATATACATTGTGTTATTGTCTAGATTTCTTATTGTACCACATCTATGCTATTCAAGTTTTAAAGTAGCTCTTTTTCGGTCTGCATTCACATTAGCATTTTAAAGTGAGCGAAGTAGTGGCTTAGGTGTTGATCATGTGACCATTTCAGACAATTCCATATCGGTTCTTATAAAAGCATCCAAAACTGACCAACTGGGTTTGGAGCAGTTGTCCAAGTCAATCGTTCACATGATGCATCACTGCTATTTCAGTCACTCGAGTATTATAGTCTTATGTTGTCAATTCCTA
Unaligned ( gi|15 ): CGGGACAATTGCGGAAACCCAATTTATTCCCATACCTGCCTCAAATGCAATATTCCTTACCCTTTAGCTAGTGGTTTTATGAACAGTCATAATTCCATCGCAGATAAA






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Reference ( family-1791 )     :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAAATT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCGAAGAGA-GCA-GACGT--N----AAA--AT-TTT-GAT-AATTGNA-TCG-AGCGCCA-------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-ATAAGTACAAGT--ATGTTG--CG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCAAA--GAGCCCATATTATAGGGAAAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCG-AT-TT-CA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACAAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTC-AA-----------------GTC-T-TGC-A-G-GAACCTGAGGATA--TT--CGAATTACA--ACAC--ACCCG-CTG-TTGC-C-ACAC---------CAGTCCC---C-TTGGCGATTC-AG--T-CGACACAT-CG-CTCGTCGG--GT-AC-ATG-T---------C-G-TTA------TACANCCCCATTTTCATGTG-A-CCCTTTGGGGG--A-ATGCCTAAC-CCTTTA-TCAGCT-C-CGTGACC-CCA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA-A----T-CGTGAANGATCAG--TATGTT--ATTTTAG-TTC-G-CTTTTGCATCATGACCCCGC-TGC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAA-G-C--AAGCACAAAGACC--GTAAAAATAATAG-CAAA-TT-TCT-C-GC-A-AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTTG-C-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTCG------TCTCAAGCCATTCCTTT-GTTTACGTAC-A--GTA-----ATATGGCTTT-AA--A-TAAA-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAANTAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGATTCG---TCATT-CA---TT--GAGTTGGGCT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAA-NT---GTGG-TTGATTTATA-TG-------CAAACCT---------C---CCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCGGG
gi|1                          :       TATCCA--TT---GA-TTTTAAACCTAG-TCT-ATTTA-GCGCAAAT--ACT---ATTTC--A--T-T----ATTA--GG--T----T------AA-G-TTAGGTTTTGAAAAATCTGAGCC--GTCGGGGTTCG-TCTT-CAAGCTTATTGT-G-ATCTGC-GCTAAA-T-GTCAAGA-ACAATCCTTC-CTT----CTCTA-CAACTCCAACGAGA-GCA-GACGT--TTAAAAAA--ATGTTT-GA--GAT--CA-TCA-AGTTGCA-------T-C-G-TAGTCATCGG-CCAATT--A-T-TT-GACAAAG-----AACACAACT--ATGTTGAGCGGCT-GCCAG-TA--GAT-CATGCC-AAGGGCAAATAGAGCCC-TAT-ATAGGCAAAAAC-CTTCTAA-TTTTAGGGCG-AT-TTTCA-A-CC-GC----TTC-----C-TACAAACTCGTCACGCGT-T------AATCT---CAAGC-C-GAACC---AG-GAGACACGTGGGGCCGACGCAACAAGCCAGA-TC--CACAC---------GAGTGT-AG--------------AGTTC-AATCGCAGGAAACCTGTCAGTC-T-TGC-ATGTGAACCTTCAGATA--TTGTTAATTTCCA--CCAC---CCCG-CTGGCTGC-T-TCATT--------CAGTCCC---CCTTGACAACTG-AAGCC-CCCCTCGT-CG-CTCG-CGA--GT-AC-ATT-TT--------C-G-TTA------CA-AACCCCATTTTCATTTG-A-CCCTTTGGGGA--AGATACCTAAC-CCTCTA-TAAGTT-CTCGTTTCT-CC--TTAGCGT-TTTCATTCTTAGCTC-------TTT-AGTGAAA-GG-AAA-AGAGAT-CGTCACATATCAAAATATATTTGATTTTAG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCGCC-TGC-AACTTCATAAT----AATC--ACATTGTGTTT-GAAG-AACTGAATTCCAGTGCTTTGAAAAGACAGG---AA-G-C--ACACACAAAGACCAAGAAAAAA-AATAGGCAAA-AT-TCTTC-GC-ATAATA-ATTGATGCATTTAC-----TATATTTGGC-ATCAGTCTA--TT-GTGGAAACA-TTCAGGATTATCTCAAGCGATTTCTAT-GTTTA------G--GTA-----ACATGGCTTTGAA--A-TAAA-----AAGGG-GC-GA------TGAAAAAAATAAT-GG-CCAATTGGACCC--TTGAT-T---ATG-TACGTTCAA-CTACACCGGC-TAA-AAAAAACTCGTTCGGGGATTCG---CC-TT-TA---TT--GAGTTGGGCT-TCTTGTAG--ACACACACGAAAA-ATTGGGTGGCTTGATTTATA-TG-------GCAACCTACACACCCCC---CCCCTTCAATCTTGCATC-GAT-CGGCTC-AATAAGTCG
gi|10                         :                             ACCTGA-T-T-ATTAA-GCGCAAATTAATTT--ATTTC--A--TCT----AT-A--AG--C----TA-----AA-A-TTAGATAAGG-AAAATT--G--T--GTTGGG-TTCAACtcgggcatctcttggtctcgaaagtggtatattacaattcccagggcattgtagcatatttcatactatgcatcaatgcatgacttctcacccttcgtgcattgttcagactggctccaattccaaaaaaaagaaaatcctgttgactcctcatatgttaaaaattacagtgctcaaaaaggttcagacttaaattggacatccaagatatatgattgtctaatttcttattggtttatccaattatgctattcaagtttcagtagctcttttttcggtatgcttctattagcataagatgaacgaatgtgccttacggtgttgatcaacttgtgaccatttcagacaaaattacatatacggtatctaatacagcatccaaaactgacatctgggtttgggagcagttgtcaagtcaagcgtcaatattcgtatcgagtatatattcttattgtcaaattctg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                            cgATC-TGCGCTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT--T----AAC--AT-TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgcatctgcgctttcacttagcgaattcgaagagaggagacgttaacattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cgacctgattattaagcgcaaattaatttatttcatctataagctaaaattagataaggaaaattgtgttgggttcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgc-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGGTTC-----CACT------TT--GAGTTGGGTT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAG-CT---GTAA-TTGATTTATA-TG-------CAAACCTCTAC-----C---TCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCAAATAAGGCAGG
gi|12                         :    GTTTATCCA--CTATGTA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAACTAATTT--ATTTT--C--T-T-----T-AATAGCTC----T------AATA-TTAGGGAAGG-AAAATT--G--C--GTCGGG-TTCCACCTT-TATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGgcaatctcttggtccccgtaagtgttatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttataaggCAGCCC-GAACCC-AGG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-CG--GACAG---------CAGTCCCA---------------TG-TC-AA----------------------------------------GATA--CT--GTAATT-CC--AC-C--ACCCG-CTG-CTGC-A-ACAT---------CAGTCCC---C-TTGGCAACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caaacgctcctacaaactcgtcagccggaatctGGGAAGCA-TTCG------TCTTAAGCCAATCCTTT-GTTTACGT--------------ATATGGCTTT-AATTA-AAAA-----GGGGG-GG-GGGGGCC-TGAAAAAATTAAA----------GG---C--TTGA--A---ATA-T--GTCCAA-TT---TCGG----------A--TCAT---GGGATg
gi|16                         :     TTTATCCA--CTATGGAAT---AAACCTGGGT-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--ATTT-T----AT-A--AA--C----TA-----AA-A-TTAG--TAAGGAAAATT--AAGC--GTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              attaagaATGGCTTT-AA----TAAG-----GGGGG-GG-GG----C-TGAAAAAATTAAA-GT-CAAT-TGG---C--TTGA--ATATATGAT--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAaagtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CGACTCAT-CG-CTCGCCAG--GT-AC-ATGCT---------C-G-TT-------TACAACCCCATTTTTATTTG-A-CCCTTTGGGGG--ACATACCTAAC-CC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                     -CTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT--T----AAC--AT-TTT--AT-ACTT
gi|2                          :    GTTTATCCAACTTATGGAAT---AAACCTAG-T-TTATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-TTTTAATTA--AG--C----CCCCCTAAA-A-TTAGGTTAAGAAAAATT--AA-CTAGTCGGG-TTCAACTTT-C-TG--TGTTGT-GCATCTGC-GC---A-TTGTCCAGAATCAATC-TTC-CCTTC-ACTTTAACGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT--AC---AAA--AT-TTT-GAT-AATGGAAATCG-A-CACCA-------T-CTG-TCGTCATCGGTCCAATTTTAATATTTGAAAAAAT-A---ATA-AAGTTAATGTTA--CG--T-GCTAG-CATAGGA-CTC--T-AAAGGCGCA--GCGCC-ATATTATAGGGGAAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCGGAT-TT-CG-A-CA-GTGTTCTTCTTTGTCACACAA------------------------CTT-GCCAGCTCCGAACCC-AAGCGAC-TACGTGGGG---------------CGACGC--AACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-----------------GTC-T-TGCCA-G-AAACCTGAGGATA--TT--CGAATTAC---AC-C--ACCCGCCTG-TTGC-CGACAG---------AAGTCCC---C--TGGCGATTCTAG--T-CGACACAT-CG-TTCGTCAG--GTGAC-ATG-T---------T-GTTTATATTGTTATATCCTTCCTTTTATGTG-ATCCCTTTGGGGGAAA-ATGCCTAACTCCTTTATTCAGCT-CTCGTAACC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATATAA-TAGGGAAG-AAA-A----T-CATGAATGATCAG--TATGTT--AATTTAG-TTCAA-CATTTGCATCATGACCCCAC-TACAAACTCC-T-ATTAA-CACCAAACATTGTACTTGGAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAAGG-C--AAGCACCGAGATC--GT-AAAATAATCG-CAAA--T-TCT-CGGCAA-AATGGATTGATGCATTTATTATTATATATTTG-CAATCGGTCTAGCTT-TGGAAAGCATTTCA------TCTCAAGCCATTCCTTTGGTTTACGTAC-AT-GTA-------ATGGC-TT-AA--T-TAAAGGGGGGGGGG-GG-GG----T-TG-AAAAATTAAA-GGCCAAA-TGG---C--TTGA--A---ATACT--GTCCAACTT---TTGGC-TCACAAAAA--TCAT----GGATTC-----CAC-------TT--GAG-TGGGCTATC-AGTAG--ATGC-----AGAATCT---GTGG-TTGATTTATAGTG-------CAAACCT---------CTATCCCCCTCAATTT--CATCAGCTCCGCGTCG-GT-AGGCAGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gCACCATGACCCCGC-TGC-AACTC---A--TAAGAATC--AC
gi|3                          :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTAG-T-T-ATTTA-GCGCAAAT-AATTTTGAGTCA--T--T-T----AT-A--GG--T----T------AA-AGTTAGGTTTGGAAAA-TT--G--C--GTCGGG-TTCGGTCTT-CAAG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGA-ACAATC-TCC-TTTTC---TTTA-CAAACTCCAAGAGA-GCA-GACGT--T----AAA--AT-TTTTGATTAATCGAA-TCA-AGTGCCA-------T-CCG-TAGTCATCGG-CCAATT--A-TTTT-GACAAAA-----AGAACAAAT--ATGTTG--CG--T-GCCAT-C------------C-A--GGCAAA--GAGCCC-TATTATAGGGCAAAAA-CT-C--A-TCT-AGGGCG-AT-TT-CA-AACC-GC----TCCT-------ACAAACT---------TGTCAGGCGGAATCT---CGGCCC-GAACCC-CAG-GAC-CACGTGGGG---------------AGA-G----ACGGACAGAGTCCCAGTGTCAGAGTTATGCGAAACCTGTCC-AA-----------------GTT-TCTGC-T-G-GAACCTCAAGATA--TT--GTAAT--CC--AC-C--GCCCG-CTG-CTGCAC-ACAC---------CAGTCCC---C-TTGGCAACTG-AG--C-C----CA--CG-CTCGTCGCCCGT-AC-ATG-TT--------C-G-TT-------TACAACCCCATTTTCAT-TG-A-CCCTTTGGGGG--ACATACCTAAC-CCCTTT-TAAGTTTC-CGTTTCT-CCAATTAGCGG-TT-CACTT---GCCTCTAA--GTGT---TAAAG-GA-AAAGA----T-CGTCAATGATCAG--TATATTG-ATTTTGG-GTC-G-CTCTTGCATCATGACCCCGCCTGC-AACTC----AT-AAGAATC--ACATTGT-TTT-GAAGTG--TGGTGTC-A-----TT-------CAGGTGAAA-G-CCAAAACACAAAGAC------AAAA-AGTAG-CAAAATT-TCG-C-GC-A-G-TGGATTGATGCATTTAC-----TATATTTG-C-ATCAGTCTA-CTT-GGGGAAACA-TTTA------TCTCAAGCGGTTCCTTT-GTTTAGGTAC--------------ATGGCTTT--G--A-TAAA------AAGG-GG-GG----C-TGAAAAA--TAAATGG-CAAT-TGG---C--TTGATTAT--ATGAC--GTTCAA-TT---CTGGC-TAA-AAAAA--TCGT---GG-----------ATT-CAGCTTT--GAGTTGGGCT-TC-TGTAG--ATAC-----AGAA--T---GT-G-TTGATGTATA-TG-------CAACCCTCAC------C---CCCCTTCAATTT--CATCAGTC-GGCTTTAAATAAGTCGGG
gi|4                          :         gCCA--CTATGGA-T---AAACCTG--T-T-ATATG-ACGCAA-TTGAATT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTTAGTTAGGAAA--TT--A--C--GTCGGG-T-CGACCTTTCTTG--TATTGT-GCATCTGCCGC-----T-GTCCAGA-TCGATC-TGC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTTCAAGAGA-GCACGACGT--A----AAACAAT-TTT-GAT-AATTGTA-TCGTAACACCAATCTTTTT-CTGGTCGTCATCG--CCAAATTTA-TATT-GAAAAAATTATAAGTACT-GT--ATGTTG--CG--T-GCCAGGCA--GGAACAT--C-AAAGGCAAA--G--CCCTAATTATAGG--AAAAA-CTTC--A-TCA-AGGGCG-AT-TT-CA-A-CCCGT----TTCTTTGTC-CACCAA-T---------T-T------GAACTTTGCCA-CTC-GAACCCCAAG-GAC-CACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTTTAA-----------------GTCCT-TGC-A-G--AACCTGAGGATAATTC--CGAATTACAGTACACC-ACCCG-CTG-TTGC-C-ACAC---------CAATCCC-----TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATCCG-CTCGTCAA--GT-AC-ATG-----------A-G-TTA------TAATATCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAG--A-ATGCCGAAC-CCTTTA-TCAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---G-CCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA-A----TCCATGAAGGATCAG--TATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACA-TGTGCTT-G-AG-A--T-GGGTC-AT----TT-------CAGGTCAAA-GCC--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATAG-CAAA-TT-TCT-C-GC---AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTTG-C-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTCG------TCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAA--GTATATATATATGGCTTT-AA--ATTAAA-----GGAGGTGGTGG----C-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---CTTTTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGCTTC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGATTCATTCCA---CTTGGAGTTGGGCT-AC-AGTAGTAATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT-TA----------------T---------C---CCCCTTCATTTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGgcaatctcttggtccccgaaaagtgttatgatta
gi|5                          : atcGTGTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T---ATTGA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAA-TT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CTTG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT--A----AAA--AT-TTT-GAT-AATTGTA-TCG-AACACCAC------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-ATAAGTACATGT--ATGTTG--CG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCCAA--GAGCCCATATTATAGGGAAAAAAACTTC--A-TCA-AGGGCG-AT-TT-CA-A-CC-GT----TTCTTTGTC-CACCAACT---------T-T------GAACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GAC-CACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-----------------GTC-T-TGC-A-G-AAACCTGAGGATA--TT--CGAATTACAGTACAC--ACCCG-CTG-TTGC-C-ACAC---------CAATCCC-----TTGGCGATTC-AA--T-CGACACAT-CG-CTCGTCAA--GT-AC-ATG-T---------A-G-TTA------TATATCCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAG--A-ATGCCGAAC-CCTTTA-TCAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATAT-A-TAAGG-GG-AAA-A----T-CATGAAGGATCAG--TATGTT--ACTTTAG-TTC-A-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TAC-AACTCC-TAATTAAGAACC--ACATTGTGCTT-GAAG-A--TGGGGTC-A-----TT-------CAGGTCAAA-G-C--AAGCACAAAGATC--GTAAAAATAATAG-CAAA-TT-TCT-C-GC---AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTTG-C-ATCGGTCTA-CTTGGGGGAAGCA-TTCG------TCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAA--GTATATATATATGGCTTT-AA--A-TAAA-----GGAGG-GG-TG----C-TGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGC-TC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGA-TCATTCCAC--TT--GAGTTGGGCT-AC-AGTAG--ATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT-TA-T----------------------------CCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCAGGca
gi|6                          :     TTTATCGA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTAAGCGCAAATTAACCG--ATTTTTTA--T-T----TT-AG-AG--CGCAAT------AA-AATTAGGTTAGGAAAAATT--A--C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TGCTGTGGCATCTGC-GC---ATT-GTCCAGA-TCAGTC-TTC-CTTTCAACTTTG-CGAATTCAAAGAGAGGCA-GACGTTAC----AGA--ATCTTT-AAT-AATTGTA-TCG-AGCACCA-------TCCTG-TCG-CATCGG--CAATTTTA-TATT-GAAAAAAC-TTAA-TAC--GT-----TTG--CG--TCGCAAG-CA--GGA-CAT--CAAAAGGCCAA--GAGCCCATATTATAGGG-AAAAA-CTTC--ACTCA-AGGGCG-ATGTT-TAGA-CC-GT----TTCTTTGTC-CAC----------------T------CAACTT-GCCAGCTC-GACCGC-AGG-GAC-AACGTGGGG---------------AGG-ACTGCACGG---------CAGTGT--A--------------TGTTC-AAT----------------GTC-T-CGC-A-G-GAACCTGAGGATAC-TT--CGGATT--A--ACACCAACCCG-ATG-TTGC-C-ACAC---------AAGTCCCCTGC-TTGGCG-TTC-AG--TCCGACACAT-CGCCTCGTC-C--GT-ACAATG-TAATGTAATGT-G-TT-------TATACTCCCATTTTCACGTGAA-CCCTTT-GGGG--A-ATGC----C-CCTTTA-TCAGCT-T-CGTGACCACCA-TTAGCGGTTT-CCTTT---GCCCC--AAGATAT-A-TAGGG-AA-AAA-A----T-ATTGAAAGATCAG--TATGTTG-ATTTTGGTTTC-ACCTTTTGCATAATGA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggtAGG-CAAATA-T--AGGCATAAAGACC----AAAAAT--T-G-CCAA-TTGTCC-C-G-----ATGGCTTGATGC-TTTA-------ATATTTT-C-ATCAGTGTA-CTT-AGTTTACCA-CCCA------TCTCAAATCATCCCATT-GCTCAGATAC-ACGGCA-----CTA--ATTTT-AA--A-AAAG-----GGGGG-GG-GG----CGTG-AATAATTAAA-GG-TAA-------------------------C--ATTCAA-TT---TCGTC-TCA-AGAAC--TTAC-------TT-----TTA---CA---TT--AAGTAGAACT-GG-AGTCG--ATGC-----AAAG-TT---GTGA-CTGATTTATA-TGCAGTCATCAAACAT---------G---CCCCT---ATCT--TATCAAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtggtatgttgacaggattggaag-G-GAACCTGAGGATA--TT--CGGATTACA--CCAC-----CG-CTG-TTGC-C-ACACCACTGACACCAGTCCC---C-TTGGCGATTC-AG--T-CGACATAT-CG-CTCCTCAG--GT-AC-AGG-TA--------CAG-T--------TACATCCCCATTTTCATGTC-A--------------------------CTTTTA-TCAGCT-C-TGTGACC-ACA-TTAGCGG-TT-CATTT---GCCCC--A--ATGT-A-TAAGG-GGAAAA-A----T-CAGGAATGATCAcatctgcatatctgtcgaggcatcatcttggtcctcgcaagtgttgattt


blockSeqs                     :             AC       A .          G TT      A        T     TG     ATT   C TTTA  T AT  CT CCCCCTA      T G          G   A  AAG   TA      .         T A  .       G        C  AT    T       A      .   G     AA     A       G      G   C     TAC       CA  C   T   T   T A A   T G A   ATCTTTT C T G          T      T  A A  T       TTATA A   AA  TA      .   .  C     G  TA   A   .  A      G  .  C    A         GG     A    .  C   .      G  G  .  G A  C  GTTC    T    A   AAACTTGTCAGGCGG              TG     C C      C   C   .         .                 ACTGC     ACAGAGTCC      C  AGTTATGCGAAACC     T  T                   TC    CAGA              AT  .       ACAGTACACCA     C   .    CG     CACTGACAC       CTGC           T  TC          C  C      GCCC  G  A   TAATGTAATGTGTT            C A            T  A T           AAA      T   T      T      T T       A   A       T  .     .       TAA      AA      A  A   G .    C A    T      .       G        T   AA                   A C   A     CTAATT   G    AA       A   G    TG         . TTT               T    GCCA               GTA      T   C .    AT G   . G  AA                   TTATTA        . A         G   G         T    .                      G     C  A AAGTATATATA           .  TTA     GGGGG     T  T  GGGCC   A     T    T  C   T    .   TT    ATAT     AT        C  .       T  AC     .     G        CGGATTCATTCCA     TG          AT .     TA    .        TCT       .       A  TGCAGTCATCAAACATG                         .         C      A
blockSeqs                     :             .        A .          . T       .        T     .      TTA   . .     . G   .  GCAAT        . A          A   A  AA    .       .         . A  .       .        .  A     .       .      .   .     A      .       G      .   .     AC        .   .   .   .   G A .   . A G   C       . C .          .      T  . T  .       TATA  G   AA  .       .   .  .     .  .    .   .  .      A  .  A    T         GC     .    .  .   .      .  .  .  . .  .  .       T    .   CAACTTTG                     G      T .      .   .   .         .                 CGCA      .              C  .                  .  .                   CT    TGG               C   .       ACAGTACACA      .   .    AC     .               C              .  T           .  .      AG    .  .   TTGTTTATATTGT             T T            G  . .           AC       T   .      .      . .       .   .       .  .     .       AAG      A       .  .   . .    . G    T      .       G        .   AC                   G .   .     CTAATT   G    .        G   .    A          . TT                T    GGC                GTA      T   A .    T  .   . .  A                    C             . .         .   .         .    .                      .     C  A AAGTATATATA           .  AT      .         .  .  CG      A     T    .  .   A    .   .     TTAT     CT        .  .       .  A      .     G        CGGATCATTCCAC     .           T  .     .     .        CT        .       A  TGCAAACCTCTACC                            .         .      G
blockSeqs                     :             .        . .          . T       .        T     .      A     . .     . .   .  TA           . .          A   A  G     .       .         . T  .       .        .  A     .       .      .   .     A      .       A      .   .     T         .   .   .   .   C T .   . A A   .       . T .          .      T  . A  .       CTTA  G   AT  .       .   .  .     .  .    .   .  .      A  .  A    A         GA     .    .  .   .      .  .  .  . .  .  .       T    .   CAATTTG                      G      C .      .   .   .         .                 CGG       .              C  .                  .  .                   T     AGA               .   .       AACACCAA        .   .    A      .               C              .  C           .  .      AG    .  .   CTCGTT                    C A            G  . .           AC       T   .      .      . .       .   .       .  .     .       A        A       .  .   . .    . A    G      .       .        .   G                    G .   .     CTATT    G    .        G   .    A          . TT                T    GCC                GT       T   A .    T  .   . .  .                    T             . .         .   .         .    .                      .     G  A ACGGCAC               .  T       .         .  .  C       A     T    .  .   T    .   .     A        AC        .  .       .  A      .     G        ATTCAGCT          .           T  .     .     .        AT        .       A  GTGCAAACCTCTAT                            .         .      A
blockSeqs                     :             .        . .          . T       .        T     .      C     . .     . .   .  TA           . .          A   A  G     .       .         . T  .       .        .  A     .       .      .   .     A      .       C      .   .     T         .   .   .   .   T T .   . G A   .       . T .          .      T  . A  .       TA    G   T   .       .   .  .     .  .    .   .  .      C  .  A    A         G      .    .  .   .      .  .  .  . .  .  .       T    .   AA                           G      T .      .   .   .         .                 GCC       .              C  .                  .  .                   T     AGG               .   .       ACACCAC         .   .    C      .               C              .  T           .  .      AA    .  .   TTCGTT                    A A            G  . .           A        G   .      .      . .       .   .       .  .     .       A        A       .  .   . .    . A    G      .       .        .   A                    A .   .     AT       G    .        .   .    A          . TT                T    TAT                A        T   A .    T  .   . .  .                    T             . .         .   .         .    .                      .     C  A ATGTA                 .  A       .         .  .  T       A     A    .  .   A    .   .     A        T         .  .       .  A      .     G        CCACT             .           A  .     .     .        AT        .       A  TGCAACCCTCACC                             .         .      G
blockSeqs                     :             .        . .          . T       .        T     .      A     . .     . .   .  T            . .          A   A  G     .       .         . A  .       .        .  A     .       .      .   .     A      .       C      .   .     T         .   .   .   .   T T .   . . A   .       . T .          .      .  . A  .       .     .   .   .       .   .  .     .  .    .   .  .      C  .  .    .         .      .    .  .   .      .  .  .  . .  .  .       .    .   TC                           .      T .      .   .   .         .                 GCC       .              C  .                  .  .                   T     AG                .   .       CCACCA          .   .    C      .               C              .  T           .  .      AA    .  .   TAGTTA                    T T            G  . .           A        G   .      .      . .       .   .       .  .     .       A        A       .  .   . .    . T    A      .       .        .   A                    A .   .     AT       .    .                                                .    GC                 .        .   . .    .  .   . .  .                    .             . .         .   .         .    .                      .     C  A A                     .  A       .         .  .  C       A     A    .  .   A    .   .     A        T         .  .       .  A      .     G        TTACA             .           A  .     .     .        TT        .       .  TC                                        .         .      G
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Reference ( family-1791 )     :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAAAT-T--G---C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCGAAGAGA-GCA-GACGT-T----AAA--AT-TTT-GAT-AATTGNA-TCG-AGCGCCA-------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAAT-TA--AGTACAAGT--ATGTT--GCG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCAA--AGAGCCCATATTATAGGGAAAAAA-CTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CC-GT----TTC-------TTTGTC-CAC-AA-CTT-G--------AACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GA-CCACGTGGGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTC-AA-------------GTC----T-TGC-A-G-GAACCTGAGGATA--T--TCGAATT-ACA-----C-C-A-CCCGC-T-GTTGC-C-ACA-C---------CAGT-CCC---CTTGGCGATTC-AG--T-CGACACATC-G-CTCGTCGG--GT-AC-ATG--------TNCGTT-TAC-AN--------C--CCCATTTTCATGTG-A-CCCTTTGGGGGA-A--TGCCTAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTGACC-CCA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATATA-TAAGGG-G-AAA----ATC-GTGAANGATC--AGTATGTT--ATTTTAG-TTCG-CTTTTGCATCATGACCCCGC-TGCAA-CTCC-TAATTAAGAACCA--CATTGTGCTTG-AAG-A--TGGGGTCATT-CAGGT-C-----AAAGNCAAG-------CACAAAGACC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC--AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTCCTTT-GTTTACGTACAGAT-----TAT-ATGGC------TTT-AA--A-TAAA-----GGGGG--GG-GG----CTGAAAAAANTAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGATTC-----CATTCCACTT-GAGTTGGGCT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAA-NT---GTGG-TTGATTTATA-T-GC-AA-CC-T-C--A------C---C-CCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCGGG
gi|1                          :       TATCCA--TT---GA-TTTTAAACCTAG-TCT-ATTTA-GCGCAAAT--ACT---ATTTC--A--T-T----ATTA--GG--T----T------AA-G-TTAGGTTTTGAAAAATCT--GAGCC--GTCGGGGTTCG-TCTT-CAAGCTTATTGT-G-ATCTGC-GCTAAA-T-GTCAAGA-ACAATCCTTC-CTT----CTCTA-CAACTCCAACGAGA-GCA-GACGT-TTAAAAAA--ATGTTT-GA--GAT--CA-TCA-AGTTGCA-------T-C-G-TAGTCATCGG-CCAA--TTA-T-TT-GACAAA----G--AACACAACT--ATGTTGAGCGGCT-GCCAG-TA--GAT-CATGCC-AAGGGCAAATAGAGCCC-TA-TATAGGCAAAAAC-CTTCTAATTTTAGGGCG-ATT-TTCA-A-CC-GC----TTCCTACAAACTCGT--CAC-GC-GTT-A--------ATCT---CAAGC-C-GAACC---AG-GAGACACGTGGGGCCGACGCAACAAGCCAGA-TC--CACAC---------GAGTGT-AG--------------AGTTC-AATCGCAGGAAACCTGTCAGTCT-TGC-ATGTGAACCTTCAGATA--TTGTTAATTT-CCA-----C-C-ACCCCGC-TGGCTGC-T-TCATT---------CAGTCCCC---CTTGACAACTG-AAGCC-CCCCTCGTC-G-CTCG-CGA--GT-AC-ATT--------TTCG-T-TACAAA--------C--CCCATTTTCATTTG-A-CCCTTTGGGGAAGA--TACCTAAC-CCTCTAT-AAGTT-CTCGTTTCT-CC--TTAGCGTT-TTCATTCTTAGCTC-------TTTAGTGAAAG-G-AAAAGAGATC-GTCACATATCAAAATATATTTGATTTTAG-GTCG-CTCTTGCATCATGACCCGCC-TGCAA-CTTCATAAT----AATCA--CATTGTGTTTG-AAG-AACTGA----ATT-CCAGTGCTTTGAAAAGACAGGAAGCACACACAAAGACCAAG-AAAAAAAATAGGCAAA-AT-TCTTC-GCATAAT-AATTGATGCATTTAC-----TATATTTGGC-ATCAGTCTA--TT-GTGGAAACA-TTCAGGATTATCTCAAGCGATTTCTAT-GTTTAGGTA-----------AC-ATGGC------TTTGAA--A-TAAA-----AAGGG--GC-GA-----TGAAAAAAATAAT-GG-CCAATTGGACCC--TTGAT-T---ATG-TACGTTCAA-CTACACCGGC-TAA-AAAAAACTCGTTCGGGGATTC-----GCCTTTA-TT-GAGTTGGGCT-TCTTGTAG--ACACACACGAAAA-ATTGGGTGGCTTGATTTATA-TGGC-AA-CC-TAC--ACACCCCC---C-CCCTTCAATCTTGCATC-GAT-CGGCTC-AATAAGTCG
gi|10                         :                             ACCTGA-T-T-ATTAA-GCGCAAATTAATTT--ATTTC--A--TCT----AT-A--AG--C----TA-----AA-A-TTAGATAAGG-AAAAT-T--G---T--GTTGGG-TTCAACtcgggcatctcttggtctcgaaagtggtatattacaattcccagggcattgtagcatatttcatactatgcatcaatgcatgacttctcacccttcgtgcattgttcagactggctccaattccaaaaaaaagaaaatcctgttgactcctcatatgttaaaaattacagtgctcaaaaaggttcagacttaaattggacatccaagatatatgattgtctaatttcttattggtttatccaattatgctattcaagtttcagtagctcttttttcggtatgcttctattagcataagatgaacgaatgtgccttacggtgttgatcaacttgtgaccatttcagacaaaattacatatacggtatctaatacagcatccaaaactgacatctgggtttgggagcagttgtcaagtcaagcgtcaatattcgtatcgagtatatattcttattgtcaaattctg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                              cgATC-TGCGCTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT-T----AAC--AT-TTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgcatctgcgctttcacttagcgaattcgaagagaggagacgttaacattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgacctgattattaagcgcaaattaatttatttcatctataagctaaaattagataaggaaaattgtgttgggttcaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgctgtgc-T--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAA--TCAT---GGGGTTC-----CACT----TT-GAGTTGGGTT-TC-AGTAG--ATGC-----AGAG-CT---GTAA-TTGATTTATA-T-GCAAA-CC-T-CT-A------C---CTCCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCAAATAAGGCAGG
gi|12                         :    GTTTATCCA--CTATGTA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTA-GCGCAAACTAATTT--ATTTT--C--T-T-----T-AATAGCTC----T------AATA-TTAGGGAAGG-AAAAT-T--G---C--GTCGGG-TTCCACCTT-TATG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGgcaatctcttggtccccgtaagtgttatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttataaggCAGCCC-GAACCC-AGG-GA-CCACGTGGGG---------------AGA-CG--GACAG---------CAGTCCCA---------------TGT-C-AA-------------G--------------------------ATA--C--TGTAATT-CCA-----C-C-A-CCCGC-T-GCTGC-A-ACA-T---------CAGT-CCC---CTTGGCAACT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caaacgctcctacaaactcgtcagccggaatctGGGAAGCA-TTC------GTCTTAAGCCAATCCTTT-GTTTACG------------TAT-ATGGC------TTT-AATTA-AAAA-----GGGGG--GG-GGGGGCCTGAAAAAATTAAA----------GG---C--TTGA--A---ATA-T--GTCCAA-TT---TCGG----------A--TCAT---GGGATg
gi|16                         :     TTTATCCA--CTATGGAAT---AAACCTGGGT-T-ATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--ATTT-T----AT-A--AA--C----TA-----AA-A-TTAG--TAAGGAAAAT-TAAG---C--GTCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            attaaga-ATGGC------TTT-AA----TAAG-----GGGGG--GG-GG----CTGAAAAAATTAAA-GT-CAAT-TGG---C--TTGA--ATATATGAT--GTCCAA-TT---TCGGC-TCA-AAAAaagtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CGACTCATC-G-CTCGCCAG--GT-AC-ATG--------CTCGTT-TAC-AA--------C--CCCATTTTTATTTG-A-CCCTTTGGGGGACA--TACCTAAC-CC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                       -CTTTC-ACTTAG-CGAATTCGAAGAGA-GGA-GACGT-T----AAC--AT-TTT--AT-ACTT
gi|2                          :    GTTTATCCAACTTATGGAAT---AAACCTAG-T-TTATTTA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-TTTTAATTA--AG--C----CCCCCTAAA-A-TTAGGTTAAGAAAAAT-T--AA--CTAGTCGGG-TTCAACTTT-C-TG--TGTTGT-GCATCTGC-GC---A-TTGTCCAGAATCAATC-TTC-CCTTC-ACTTTAACGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGTAC----AAA--AT-TTT-GAT-AATGGAAATCG-A-CACCA-------T-CTG-TCGTCATCGGTCCAATTTTAATATTTGAAAAAAT-----AATA-AAGTTAATGTT--ACG--T-GCTAG-CATAGGA-CTC--T-AAAGGCGC--AGCGCC-ATATTATAGGGGAAAAA-CTTC-A--TCAAGGGCGGA-T-TTCG-A-CA-GTGTTCTTC-------TTTGTCACAC-AA-CTT-G---------------CCAGCTCCGAACCC-AAGCGA-CTACGTGGGG---------------CGACGC--AACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-------------GTC----T-TGCCA-G-AAACCTGAGGATA--T--TCGAATT-ACA-----C-C-A-CCCGCCT-GTTGC-CGACA-G---------AAGT-CCC---CT-GGCGATTCTAG--T-CGACACATC-G-TTCGTCAG--GTGAC-ATG--------TT-GTT-TAT-ATTGTTATATC--CTTCCTTTTATGTG-ATCCCTTTGGGGGA-AAATGCCTAACTCCTTTATTCAGCT-CTCGTAACC-CTA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATATAATAGGGAAG-AAA----ATC-ATGAATGATC--AGTATGTT--AATTTAG-TTCAACATTTGCATCATGACCCCAC-TACAAACTCC-TA-TTAACA-CCAAACATTGTACTTGGAAG-A--TGGGGTCATT-CAGGT-C-----AAAGGCAAG-------CACCGAGATC--GT-AAAATAATC-GCAAA--T-TC-TCGGCAAAATGGATTGATGCATTTATTATTATATATTT-GCAATCGGTCTAGCTT-TGGAAAGCATTTC------ATCTCAAGCCATTCCTTTGGTTTACGTACA--------TGTAATGGC-------TT-AA--T-TAAAGGGGGGGGGG--GG-GG----TTG-AAAAATTAAA-GGCCAAA-TGG---C--TTGA--A---ATACT--GTCCAACTT---TTGGC-TCACAAAAA--TCAT---GG-----------ATTCCACTT-GAG-TGGGCTATC-AGTAG--ATGC-----AGAATCT---GTGG-TTGATTTATAGT-GCAAA-CC-T-CT-A------T---C-CCCCTCAATTT--CATCAGCTCCGCGTCG-GT-AGGCAGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gCACCATGACCCCGC-TGCAA-CTC---A--TAAGAATCA--C
gi|3                          :    GTTTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTAG-T-T-ATTTA-GCGCAAAT-AATTTTGAGTCA--T--T-T----AT-A--GG--T----T------AA-AGTTAGGTTTGGAAAA-T-T--G---C--GTCGGG-TTCGGTCTT-CAAG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCAAGA-ACAATC-TCC-TTTTC---TTTA-CAAACTCCAAGAGA-GCA-GACGT-T----AAA--AT-TTTTGATTAATCGAA-TCA-AGTGCCA-------T-CCG-TAGTCATCGG-CCAATT--A-TTTT-GACAAAA------AGAACAAAT--ATGTT--GCG--T-GCCAT-C------------C-A--GGCAA--AGAGCCC-TATTATAGGGCAAAAA-CT-C-A--TCTAGGGCG-A-T-TTCA-AACC-GC----TCC-------T-------AC-AAACTT-GTCAGGCGGAATCT---CGGCCC-GAACCC-CAG-GA-CCACGTGGGG---------------AGA-G----ACGGACAGAGTCCCAGTGTCAGAGTTATGCGAAACCTGTCC-AA-------------GTT----TCTGC-T-G-GAACCTCAAGATA--T--TGTAATC--CA-----C-C-G-CCCGC-T-GCTGCAC-ACA-C---------CAGT-CCC---CTTGGCAACTG-AG--C-C----CA-C-G-CTCGTCGCCCGT-AC-ATG--------TTCGTT-TAC-AA--------C--CCCATTTTCAT-TG-A-CCCTTTGGGGGACA--TACCTAAC-CCCTTTT-AAGTTTC-CGTTTCT-CCAATTAGCG-G-TTCACTT---GCCTCTAA--GTGT--TAAAGG-A-AAAG---ATC-GTCAATGATC--AGTATATTG-ATTTTGG-GTCG-CTCTTGCATCATGACCCCGCCTGCAA-CTC----AT-AAGAATCA--CATTGT-TTTG-AAGTG--TGGTGTCATT-CAGGT-G-----AAAGCCAAAA------CACAAAGAC------AAAA-AGTA-GCAAAATT-TC-GC-GC--AGTGGATTGATGCATTTAC-----TATATTT-GC-ATCAGTCTA-CTT-GGGGAAACA-TTT------ATCTCAAGCGGTTCCTTT-GTTTAGGTAC-------------ATGGC------TTT--G--A-TAAA------AAGG--GG-GG----CTGAAAAA--TAAATGG-CAAT-TGG---C--TTGATTAT--ATGAC--GTTCAA-TT---CTGGC-TAA-AAAAA--TCGT----GGATTC-----AGCT----TT-GAGTTGGGCT-TC-TGTAG--ATAC-----AGAA--T---GT-G-TTGATGTATA-T-GC-AACCC-T-C--AC-----C---C-CCCTTCAATTT--CATCAGTC-GGCTTTAAATAAGTCGGG
gi|4                          :         gCCA--CTATGGA-T---AAACCTG--T-T-ATATG-ACGCAA-TTGAATT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTTAGTTAGGAAA--T-T--A---C--GTCGGG-T-CGACCTTTCTTG--TATTGT-GCATCTGCCGC-----T-GTCCAGA-TCGATC-TGC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTTCAAGAGA-GCACGACGT-A----AAACAAT-TTT-GAT-AATTGTA-TCGTAACACCAATCTTTTT-CTGGTCGTCATCG--CCAAATTTA-TATT-GAAAAAAT-TATAAGTACT-GT--ATGTT--GCG--T-GCCAGGCA--GGAACAT--C-AAAGGCAA--AG--CCCTAATTATAGG--AAAAA-CTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CCCGT----TTC-------TTTGTC-CACCAA-TTT-G--------AACTTTGCCA-CTC-GAACCCCAAG-GA-CCACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTTTAA-------------GTCC---T-TGC-A-G--AACCTGAGGATAATT--CCGAATT-ACAGTACAC-C-A-CCCGC-T-GTTGC-C-ACA-C---------CAAT-CCC----TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATCCG-CTCGTCAA--GT-AC-ATG--------AG---T-TAT-AA--------TATCTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAGA-A--TGCCGAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCC---A--ATATA-TAAGGG-G-AAA----ATCCATGAAGGATC--AGTATGTT--ACTTTAG-TTCA-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TACAA-CTCC-TAATTAAGAACCA--CAT-GTGCTTG-A-G-A--TGGG-TCATTTCAGGT-C-----AAAGCCAAG-------CACAAAGATC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC--AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTT-GGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAAGTATATATAT-ATGGC------TTT-AA--ATTAAA-----GGAGGT-GGTGG----CTGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---CTTTTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGCTTC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGATTCATTCCACTTGGAGTTGGGCT-AC-AGTAGTAATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGATCT-TA-T----------------------C---C-CCCTTCATTTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGgcaatctcttggtccccgaaaagtgttatgatta
gi|5                          : atcGTGTATCCA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T---ATTGA-GCGCAAATTAATTT--ATTTT--A--T-T----AT-A--AG--C----T------AA-A-TTAGGTTAGGAAAA-T-T--A---C--GTCGGG-TTCGACCTT-CTTG--TATTGT-GCATCTGC-GC---A-T-GTCCAGA-TCGATC-TTC-CTTTC-ACTTTG-CGAATTCAAAGAGA-GCA-GACGT-A----AAA--AT-TTT-GAT-AATTGTA-TCG-AACACCAC------T-CTG-TCGTCATCGG-CCAATTTTA-TATT-GAAAAAATATA--AGTACATGT--ATGTT--GCG--T-GCCAG-CA--GGA-CAT--C-AAAGGCCA--AGAGCCCATATTATAGGGAAAAAAACTTC-A--TCAAGGGCG-A-T-TTCA-A-CC-GT----TTC-------TTTGTC-CACCAA-CTTTG--------AACTT-GCCAGCTC-GAACCC-AAG-GA-CCACGTGAGG---------------AGA-GC--CACGG---------CAGTGTCAG--------------TGTTT-AA-------------GTC----T-TGC-A-G-AAACCTGAGGATA--T--TCGAATT-ACAGTA--CAC-A-CCCGC-T-GTTGC-C-ACA-C---------CAAT-CCC----TTGGCGATTC-AA--T-CGACACATC-G-CTCGTCAA--GT-AC-ATG--------TA-GTTATAT-AT--------C--CTCATTTTCATGTA-A-CCCTTTGGGAGA-A--TGCCGAAC-CCTTTAT-CAGCT-C-CGTGATC-CTA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATATA-TAAGGG-G-AAA----ATC-ATGAAGGATC--AGTATGTT--ACTTTAG-TTCA-CTTTTGCATCATGACCCCAC-TACAA-CTCC-TAATTAAGAACCA--CATTGTGCTTG-AAG-A--TGGGGTCATT-CAGGT-C-----AAAG-CAAG-------CACAAAGATC--GTAAAAATAATA-GCAAA-TT-TC-TC-GC--AATGGATTGATGCATTTAT-----TATATTT-GC-ATCGGTCTA-CTTGGGGGAAGCA-TTC------GTCTCAAGCCATTTCTTT-GTTTACGTACAAGTATATATAT-ATGGC------TTT-AA--A-TAAA-----GGAGG--GG-TG----CTGAAAAAAATAAA-GG-CAAA-TGG---C--TTGA--A---ATG-T--GTCCAA-TT---TTGGC-TC---AAAA--TCAT---GGGATTCGGAT-CATTCCACTT-GAGTTGGGCT-AC-AGTAG--ATGC-----AGAA-AT---GTGG-TTGAT---------------C-T-T--A------T---C-CCCTTCAATTT--CATCAGCT-CGCTTCGAATAAGGCAGGca
gi|6                          :     TTTATCGA--CTATGGA-T---AAACCTGG-T-T-ATTTAAGCGCAAATTAACCG--ATTTTTTA--T-T----TT-AG-AG--CGCAAT------AA-AATTAGGTTAGGAAAAAT-T--A---C--GTCGGG-TTCGACCTT-CATG--TGCTGTGGCATCTGC-GC---ATT-GTCCAGA-TCAGTC-TTC-CTTTCAACTTTG-CGAATTCAAAGAGAGGCA-GACGT-TAC--AGA--ATCTTT-AAT-AATTGTA-TCG-AGCACCA-------TCCTG-TCG-CATCGG--CAATTTTA-TATT-GAAAAAAC-TT--AATAC--GT-----TT--GCG--TCGCAAG-CA--GGA-CAT--CAAAAGGCCA--AGAGCCCATATTATAGGG-AAAAA-CTTC-AC-TCAAGGGCG-A-TGTTTAGA-CC-GT----TTC-------TTTGTC-CAC------T-C--------AACTT-GCCAGCTC-GACCGC-AGG-GA-CAACGTGGGG---------------AGG-ACTGCACGG---------CAGTGT--A--------------TGTTC-AAT------------GTC----T-CGC-A-G-GAACCTGAGGATAC-T--TCGGATTAACA-----C-CAA-CCCGA-T-GTTGC-C-ACA-C---------AAGT-CCCCTGCTTGGCG-TTC-AG--TCCGACACATC-GCCTCGTC-C--GT-ACAATGTAATGTAATGTGTT-TAT-AC--------T--CCCATTTTCACGTGAA-CCCTTT-GGGGA-A--TGC----C-CCTTTAT-CAGCT-T-CGTGACCACCA-TTAGCG-GTTTCCTTT---GCCCC--AAGATATA-TAGGGA-A-AAA----ATA-TTGAAAGATC--AGTATGTTG-ATTTTGGTTTCACCTTTTGCATAATGA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggtAGG--C-----AAATATAGG-------CATAAAGACC----AAAAAT--T--GCCAA-TTGTC-CC-G----ATGGCTTGATGC-TTTA-------ATATTT-TC-ATCAGTGTA-CTT-AGTTTACCA-CCC------ATCTCAAATCATCCCATT-GCT------CAGAT------AC-ACGGCACTAATTTT-AA--A--AAA-----GGGGGGGGG-GC----GTG-AATAATTAAA-GG-TAA-------------------------C--ATTCAA-TT---TCGTC-TCA-AGAAC--TTAC-------TT--------TTACA-TT-AAGTAGAACT-GG-AGTCG--ATGC-----AAAG-TT---GTGA-CTGATTTATA-T-GC-AG-TCAT-CAAA------CATGC-CCCT---ATCT--TATCAAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtggtatgttgacaggattggaag-G-GAACCTGAGGATA--T--TCGGATT-ACA-----C-C-A-CC-GC-T-GTTGC-C-ACA-CCACTGACACCAGT-CCC---CTTGGCGATTC-AG--T-CGACATATC-G-CTCCTCAG--GT-AC-AGG--------TACAGT-TAC-AT--------C--CCCATTTTCATGTC-A--------------------------CTTTTAT-CAGCT-C-TGTGACC-ACA-TTAGCG-G-TTCATTT---GCCCC--A--ATGTA-TAAGGG-GAAAA----ATC-AGGAATGATC--Acatctgcatatctgtcgaggcatcatcttggtcctcgcaagtgttgattt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): TTCCAGGGCATTTGCAGTTAAATCTGTCTGCAATTATTCTCATAGTGCATCAAATGCAATGCCTCTCACCTTCGGCAATTGTTCAAAGACTGGCTCTAATTCCATAGAAAAATCCTGTTGACTCCTTCATTGTTACAGGCAAAAAAGTCTAATGTATCCCAGGATATACATTGTGTTATTGTCTAGATTTCTTATTGTACCACATCTATGCTATTCAAGTTTTAAAGTAGCTCTTTTTCGGTCTGCATTCACATTAGCATTTTAAAGTGAGCGAAGTAGTGGCTTAGGTGTTGATCATGTGACCATTTCAGACAATTCCATATCGGTTCTTATAAAAGCATCCAAAACTGACCAACTGGGTTTGGAGCAGTTGTCCAAGTCAATCGTTCACATGATGCATCACTGCTATTTCAGTCACTCGAGTATTATAGTCTTATGTTGTCAATTCCTA
Unaligned ( gi|15 ): CGGGACAATTGCGGAAACCCAATTTATTCCCATACCTGCCTCAAATGCAATATTCCTTACCCTTTAGCTAGTGGTTTTATGAACAGTCATAATTCCATCGCAGATAAA