lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 3333333 1 1111 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 33333333333333333333333 222222222222 22222222 222222222222222222222222222 6666666666666666666 111 33333333333 222 000000000000000000000000000000000000 111 1 11 1111 6666666666666666666666 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222 1111111 11111 3333 222222222222222 4444444444444444444444444444444444 111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 11 2222 222222222222 11 111 111 2222 3333 22222 1111111 2222222222222222 222222222 222222 333333333333 2222
lowQualScore : 4 4 8888 7 8 44 5555555 88 4 4 4 4 777 4 4 3 2222 5 6 7 8888 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 666 5 5 55 77777777777777777777777 8 444444444444 4 6 66 00000000 4 6 66 4 4 888 555555555555555555555555555 4 4 9999 55 4444444444444444444 4 4 000 33333333333 6 222 5 55 5 222222222222222222222222222222222222 333 5 9 00 5 0 66 0000 6666666666666666666666 555 4 4 55 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 3 44 7777777 0000000 555 00000 9 9999 3 444444444444444 88 55 3 7777777777777777777777777777777777 77 3 999999 666 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 33333 11 55 2222 3 888888888888 0 999999 55 3 555 66 3 888 3 3 55 999 777 4 8888 555 6666 2 2 3333 2 2 2 2 5555 33 2 2 2 2 2 2 33 2 5 8888 2 8888 2 33 2 2 2 2 2 2 44 3 3 555 66666 44 555 2 5 2 33 77777 2222222 33 2 8 8888888888888888 66 2 2 2 2 2 888888888 33 2 777 777 3 3 3 88 5 5 5 888 55 444444 66 666666666666 2222 66 5 5 5
lowQualScore : . . .... . . .. ....... .. . . . . ... . . . .... . . . .... . .................................................................................................................................. ... . . .. ....................... . ............ . . .. ........ . . .. . . ... ........................... . . .... .. ................... . . ... ........... . ... . .. . .................................... ... . . .. . . .. .... ...................... ... . . .. . ......................................................................... . . .. ....... ....... ... ..... . .... . ............... .. .. . .................................. .. . ...... ... . ............................................................................. . ..... .. .. .... . ............ . ...... .. . ... .. . ... . . .. ... ... . .... ... .... . . .... . . . . .... .. . . . . . . .. . . .... . .... . .. . . . . . . .. . . ... ..... .. ... . . . .. ..... ....... .. . . ................ .. . . . . . ......... .. . ... ... . . . .. . . . ... .. ...... .. ............ .... .. . . .
lowQualScore : 1 0 5555 0 2 99 3333333 44 0 4 0 0 000 0 2 6 0000 0 3 3 0000 6 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222 3 0 00 00000000000000000000000 0 555555555555 4 0 99 00000000 4 0 11 4 4 000 444444444444444444444444444 0 0 4444 55 5555555555555555555 0 4 333 33333333333 7 555 0 55 0 555555555555555555555555555555555555 888 0 9 11 5 4 99 8888 8888888888888888888888 555 8 0 55 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 3 66 0000000 0000000 444 88888 0 7777 3 222222222222222 55 00 3 5555555555555555555555555555555555 00 1 444444 444 7 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 66666 22 55 1111 3 555555555555 5 666666 33 3 444 55 3 222 6 6 55 000 000 0 5555 000 1111 9 9 2222 5 5 4 4 0000 22 4 5 5 5 5 5 44 5 6 8888 4 0000 9 99 9 9 9 9 9 9 22 6 3 888 88888 77 000 9 7 7 99 11111 3333333 77 7 0 5555555555555555 66 7 7 7 5 5 999999999 44 7 666 999 1 1 1 66 0 0 0 888 44 999999 99 555555555555 6666 99 0 0 0
consensus : ACAGTGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGT----TACTCGGGTT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-A-------------A--AAA------C--G--------------GTAA------------AT----------------TTA----CTG-GAAATG-TA-CACCTATTTA-A----CTGTC--NC----G--GA--CATCAGACATGCTGGAGTT-AAA-----------------------ACAGA-CAG------------TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTAT--GGATAAANT----NGGA----GA-----------TTTGT-G-GAG---GACA--A-----TCA---G-GGAGGGAGACT-GTG-ATGTACTGAGACA--TCTG-----------TTGTGTGTGGGTCTGGA--TGTCAATCA-GTCGAT-ACAGT-----T---------GTATGATAA-GTACA-TGATNATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATACACTGAT--TGA---TGAATGGT-ATG-TTGA--ATAGAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G-------GGACGT--AA---TG-C-AGGGNGAGGTAT-----------AGAG--T--A---T-----GACTCNGTGTT-A--GACAGGGNGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATGACTC-TG-TGTTA-G---------------ACAG--GGAGGGTGTG--TCTGTT-CTAGA------------GAG--------------G----ACG-AGGCGAC--GGGTGTGTGAGT---ACAGTGA----TG-GNGTGACGACTGGTGTGTA-AGT-ACAGTGA--GGA---TAA------A--T------TTN-AT--AAGGA-CA-G---AGTGCNAAAG--TACAAGAAA--GTGATGT-GTGAGATAAAGA--ATAAAGAAACATGTCA------GA-AGAC-AC---TCTGTATAG-TC-CC--TGATAG-AA-TTGT--AGAGA---GA---TGTTG-TTAC----TG---A----G-TAC-AAGAGA--GNGAT-GT-GTGAG-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AAGA----CACT-CTGTATA---GTC-CCT--G-A-T-A-GAA-TTG-T--AGAG-A-GA---TGTTGT-T--AC-TG---AG-T-AC-A--AGAG-----AGA-------G--A-TG-TGT----G--A---TAT--AA-AGAAA-CAT-G-TC-AGA-AGA---A----CAC--TC-TGT-A-T---AGTC-CC-TGAT-AGAATTG--TAGAGA-GATGTT-G-T---TAC-TGAGT----NCA--AGAGAG----AN------ATGTGTTGAGATAAA--GAAACATG-T-CAG-AAG
Reference ( gi|4 ) : ATAGTGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGT----AAATCAAGTT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAACAAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-A-------------A--------------G--------------GTAA------------CT----------------TTA----CTG-GGAATG-TA-CAC--------A----CTG----A-----G--GA--CATCAGGCATGGTGGAGTT-AAA-----------------------ACAGA-CAG------------TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAGA-CAGACC--AG-TGTGGT-GTAT--GGATAAAGT----TGGA----TA-----------TTTGT-G-GAA---GACA--A-----TAA---G-GAATACAGACT-GTG-ATGTACTGAGACG--TCTG-----------TTGTGTGGGGGTCTGGA--AGTCAATCA-GTTGAT-ACAGT-----T---------GCATGATAA-GTACAGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATATACTAAT--TGG---TGAAGGAT-ATG-TTGAACATAGAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGA---------AGACGTC-AA---TGTC-AGGGTGAGGAAT-----------AGAG--T--A---T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATAACTCTTA-TGTTA-G---------------ACAG--GGAGGGTGTG--TCTGTT-CTAGA------------GAT--------------G----ACG-AGGCGAC--GAGAGTGTGAGT---ACAGTGA----TG-GCGTGGCGACGGGTGTGCA-AGT-ACGGTGA--G-----TAA------A--T------TTG-AT--AAGGA-CA-A---AGTGCCAAAG--TACAAGAGA--CTGATGT-GTGAGATAAAGA--ATAAAGAAACATGTCA------GA-GGAC-AC---TCTGTATAT-TC-CC--AGATAG-AA-TTGT--AGAGA---GA---TGTTG-TTAC----TG---A----G-TAC-AAGAGA--CTGAT-GT-GTGAG-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AGGA----CACT-CTGTAT----GTC-CCT--G-A-T-A-GAA-TTG-T--AGAG-A-GA---TGTTG--T--AC-TG---AG-T-AC-A--AGAG-----AGA-------G--A-TG-TGT----G--A---TA---AA-AGAAA-CAT-G-TC-AGA-AGA---A----CAC--TC-TGT-A-T---AGTC-CC-TGAT-AGAATTG--TAGAGA-GATGTT-G-T---TAC-TGAGT----TCA--AGAGAG----AT------ATGTATTGAGATAAA--GAAACATG-T-CAG-AAG
gi|6 : ACAGTGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGT----TACTCAGGTT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-A-------------A--------------ATAAAATCATTCCAAGTAA------------AT----------------TTA----CTG-GAAATG-TA-CACCTATTTA-A----CTGTCTGAT----G--GA--GATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGA-CAGATCAATGTGGTGTATGG-ATGATGT--G--------GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTAT--GGATGAATT----TGAA----GA-----------TTTGT-G-GAG---GACA--A-----TCA---G-TGAGGGAGACT-GTG-ATGTACTGAGACG--TATG-----------TTGTGTGTGGGTCTGGA--TGTCAATCA-GTCAAT-ACGGT-----TTTATCCGTGGTATTATAT-GTACAATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTACACTGAT--TGA---TGATGAGT-ATG-TTGAACATAGAACA-------GAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-----------------------------GGGCGGGG---------------GCG--G--A---T-----G--TCAACGTC-A--G----GGTGAGG-------TA---TAGAAAG-----TATGGCTCT-G-TGTTA-G---------------ACAG--GGAGGGTGTG--TCTGTT-CTAGA------------GAT--------------G----ACG-AGGCGAC--GGATGTGTAAGT---ACAGTAAAGATTG-GTATGATGA-GAGTGAGGACAGTGATAGTGA--GGACAGTAAGATGGTA--T------TTC-AT--AAGTT-CA-G---TGTGCCACAG--TACAAGGAA--ATGATGT-GTGAGATAAAGAATATACAG----ATGTTAGGATAAGG-GGACGACAAGTGAGTACAG-T------AAGTGGTGA-TTTC--ATAAGTCCGA---TGTC--CCAC---------A----G-T-C-AAGGAA--ATGAT-GT-GTGAG-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T--TCAAGA-AAGA----CACT-CT-TAT----
gi|8 : ggttctctatcaACAGTGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGT----TACTCAGGTT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-A-------------AATAAAATCACTCCAG--------------GCAA------------AT----------------TGA----CTG-GAAATG-TA-CACCTATTTA-A----CTG----TCTGGTG--GA--GATCCGACATGCTGGAGTT-AAA-----------------------CCAGA-CAG------------TAGGG-ACGATGT--G--------GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTAT--GGATATATG----GGGA----GA-----------TTTGT-G-GAG---GACA--ACCAGTTGG---G-G-----AGACT-GTG-ATGTACTGAGAGA--TCTG-----------TTGTGTGGGGGTCTGGA--TGTCAATCA-GTCGAT-ACAGT-----T---------GTATAGTAA-GTACAGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTCACTGAT--TGATACTGAATGGT-ATA-CTG----TTGATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATaat
gi|9 : cacagggttctttatcaACAGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGT----TCCTCGGTTT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-A-------------A--------------A---------------TAAAATCACTCCAG-CC----------------TTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTTTTA-A----CTGTCT-G-----GTAGA--CATAACACATGCTGGAGTT-AAA-----------------------ACAGA-CAG------------TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAGA-GAGATC--AG-TGTGGT-GTAT--GGATAGAAA----AGGG----GA-----------TTTGT-G-GAG---GACA--A-----TCA---G-GGAGGGAGGCG-GTG-ATGTACTGAGACA--TCTG-----------TTGTGTGTGGGTCTGGA--TGTCAACCA-GGCCAT-ACAGT-----T---------GTATGATAA-GGACA---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATACACTGAT--TGA---TGAGTGGT-----TTG---ATAG-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
gi|2 : tttatcaACAGTGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGT----TACTCGGGTTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAACAAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACA-G-------------A--------------A--------------ATAAAATCA-------CTCCAGAGTTATTTAGGATTA----CTG-GAAATG-TATCACCTATATT-A----CTG----TCTGGTG--GA--GATCAGACATGCTGGAGTA-AAA-----------------------ACAGATCAG------------TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTA---GGATAGACTATTGTGGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTG-GTG---GACATCA-----CCA---GTGGG---AGACTTGTGGATGTACTGAGACA--TCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGG--TCTGGA--TGTCAATCA-GTCGATAACAATATCTAT---------TCATG-TGG-GTACTCTGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATACACGAGTGATGG----GAATG-T-ATG-ATCAGTATA-AACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGGGCGGTGC---GGACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG--T--AG--TGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GAC-TGGAGGAG-------TA---TATAGAGC----TAT-ACTC-TG-TGTTA-GTAGAGTTGTTGGGTAATAG--GAAAAGTATGACTCTGTTGTTAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGG----ACG-AGGCGAC--GGGTGTGTGAGT---ACAGTGA-------GAGTGG--------------AGT-A---TTA--C-----T-A------A--T------TGG-AT----GGA-CA-ATTGAATG---AAG--TACAAGCGAAGTTGA-GT-GTGAGATAAAGC--ATAACG----ATGTCC------GA-G----AT---CTTGTATAG-TC-CCTTCGATAG-AACTTGCTAAGAGGC--GA---TGTTGTTTAC----TG---A----GTTACTAAGAG----TGAGAGT-GTGAG-ATTA----AA--G-A-AATC-ATT-GTCA--G-ACAATTTTCACTCCTGTTTTA--GT--CCT--G-A-T-A-GAA-TTGAT--TGAG-A-GA---TGTTGTTT--AC--G---AG-T-AC-ATTAGAG-----AGGGGAATTTG--A-TGATGTTTGAG--A---TA---AATTTAAA-CAT-GTTC-AGA-AGA---C----CTTCGTC-TGT-ATT---AGTC-CCTTGAT-A
gi|3 : gggtctttatttcaACAGTGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATTCAGT----AC-TCATGTT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAATAAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-A-------------AATGAAACCAATCCAG--------------GTCA------------AT----------------TTG----ATG-GACATG-TT-CATCTATTTA-A----CTGTCT-A-----GTGGA--CATCAGGCATGCTGGCGTG-AAA-----------------------AGAGA-CAG------------TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTAT--GGATGAATT----TGGA----TA-----------TTTGT-G-GGG---AGCA--A-----TGA---A-GGAGGGAGACT-GCA-ATCTACTGAGACA--TTTG-----------GTGTATGTGGGTCTGGA--TGTAAATCA-GTCCAT-TCAGT-----T---------G-------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATACACTG-----GA---TGAA-TAT-TTA-TTGAAT------CATAGATC---GAGG-TTG-----ATCCT-CCTGGGCGGGCGT--AAACGTT-AA---TGAC-AGGGTGAGGTATAG---------AGAG--T--A---T-----GATTCTGCGAT-A--GACAGG--GAGGGCGTGTCTATTCTAGAGAGGACGAGACGACTGGTG-TGTAA-GT--------------ACAG--TGAGGGTAAA--TT--TT-CCAAA-----------------------------G----ACA-TAGTG-C--AAAAGTACAAGC---A-AGTGA----TGTGCG
gi|13 : gtaagaaagtgtcccttatcaACAGTAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGT----TATTCAGGTT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAACAAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACACAATCAAATCATTCTA--------------G--------------GTAA------------AG----------------TTA----CTG-GAAATG-TA-CACCTATCTA-A----CTGTC--ATGT--G--GA--CATCAGATATACTGGTGTG-AAA-----------------------ACAGA-CAG------------TAagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactgagtaaaaagagagatatgtatgagataaagaaacatgttagaatacactttgtgtagcccttgatagaattgtagagatgttacttatacttagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtacagaatgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|14 : gggttctctatcaACAGTGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGT----TACTCAGGTT-GTTGATT-CAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAACAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AACA-A-------------ATAAAATCATTCC--A--------------GTCA------------AT----------------TGA----CTG-GAAATGTTA-CAC--------tgatga
gi|7 : gggttctttatcaTAGTGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTACGGAATC----T-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAACAAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-A-------------AATAAAATACTTTTAG--------------GTGA------------AT----------------TCA----GTG-GAAATA-GA-CATCTATTTG-ATTGTCTG----AT----A--GA--TATTAGACATTCTGGAGAA-AAA-----------------------CCAAA-CAG------------TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGAA-CAGATC--AG-TATGGT-GTAT--GGATGAATT----CGGA----GA-----------TTTAT-G-GAC---GGCA--A-----TCA---G-TGAGGGAAACT-GTG-ATGTACTGAGTCA--TCTGAT---------TTGTGTGGGG--TTGAA--TGCCAATCA-GTGGAT-ACAGT-----T----------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATACACTAAT--TGA---TCA-TAATGATG-TTAA---T----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-G-----------------------A---T----AGGGGCAGGGAC-----------GGA----------T-----G--TCAATGTC-A--AA----GTGAGG-------TA---TAGCAAA-----TATGACTC--AGTGTTA-G---------------ACAG--AGAGGGTGTA--TCTGCT-CTGGA------------GAG--------------A----ACA-AGACGAC--TTGTGTGCGAGT---ACAATAA----TA-GTGctattaactgtctggtgaagatcagacat
gi|5 : agagtgttctttatcacAGTAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGT----TACTCAGGAT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAACAAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-A-------------AATAAATCTTTCCC-G--------------GTAA------------AT----------------GTA----CTA-GAAATG-TA-CA---------A----CTG----T-----T--CAATTGTCTGACATGCTGGAGTT-AGA-----------------------ACGGA-CAG------------TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAAA-CAGATC--AC-TGTGGT-GTA----------------TGGA----TA-----------------G-AGA---G-----------------G-GA------------G-ATTTACTGAGACA--TTTG-----------TTGTTTGTGGGTCTGGA--TGTCAATCA-GTTGAT-ACAAT-----T-------------------------TTATCATAAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAAACTGAT--TGA---TGAAGGG--------------AGATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGGG---------AG--------------C-GGGGGCAG------------------------A---T-----G--TCAATGTC-A--G---TG-TGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATGACTCG-G-TGTTA-G--------------------------GTGTG--TCTGTT-CTAGA------------GAG--------------A----ACA-AGGCGAC--AGGTGTGTGAAT---ACAGTAA-------GAGTGAAGATTGGTATA---------GATG---------------------T------T--------AGTA-CA-A---AGTGAAGAAG--TACAAGAAA--GCGATGT-GTGAG---------GTAAAGAAACATGTCA------GA-AGAC-AA---TCGGAATAG-TC-CC--TGAaatattcctttgaaaaaaaaagagtgaaagaatacaagaaagtgttatgcgagatcaagaaacacgtcagaagacattctgtatagtctcagatagtgttgaagggaaatgttgttacaaagaacaagagcgagatgtgttagataaagaaacatgtcagaagacact
gi|1 : cGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGT----TCCTCGGTTT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA-CAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-A-------------A--------------A---------------TAAAATACACTCCAGCC----------------TTATTC-CTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAA----CTGTTCTG-----GTAGA--CAT-AACCATGCTGGAGTT-AAA-----------------------ACAGAGCAGC-----------TAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAGA-GAAATC--AGATGTGGT-GTATCGAGATAAAAG----AGGG----GA-----------TTTGT-GAGAACCAGATC--A-----GGA---G-GAAGGGAGGCG-GTG-ATGTACTGAAACACATCTGAT---------TTGTGTGTGGGTCTGGATTGGTCA-CCATGCCAAT-ACAGT-----T---------GTATGATAAAGGACAAAAA--ATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT----TATACTAAC--TTG---TTGATGATCGTGGTTGA---TAGATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCTGG-----------GGCG-------------AGGGTGCGGA--------------------------C-----G--TCAATGTC-A--GG-GTGATG--G-------TA---TAGAGAG---------------A-GGTCATG---------------ACA----------------CTGTT-TCAGA------------G----------------------C--AGG------GAGGGTGTGTCTTTCGTAGAGA-----G-GAG-AGCGACGGATGTGTG-AGTTACAGTGA--GAAGT-TAA------A--T------ATC-AT--AATGA-CAGA---AGTGCCTGAA--TACAGGAAG--C-GATGT-GTGA----------ATCAA-AAACATATCA------GAAGGAC-AC---TCTGTA-ATGTC-CC--TGATAG--A-TTGT--AGAAAG--GA---TGTTG-TTAA----TG---A----A-TAC-AAGAGA--GAGAT-GT-GTGAATA-CA----CA--G-A-AA-C-A-TGGTCA--GTAAGA----CACT-CTGTATTGA-GTC-CCT--G-C-T-A-ATA-TAG-T--A-AG-A-GA---TGTTT--T--AC-TG---AGCT-AC-A--AGAG-----AGA-------G--A-TGTTGT----G--AGATTATC-AA-AGACA-TTT-G-TC-AGA-AGC---A----CAC---C-TGT-A-T---AGTC-CC-TGAT-AGAATTGGTTAGAGA-GATGTTGG-T---TAC-TGAGTAACATGA--AAAGAG----GT------GTGTG--AAGATAAC--GAAAAATG-T-CAGTAAGgtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|23 : gagagggttcttatttcaacagGCATTAATACT-GAACAAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-acatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|19 : -------------A--------------G--------------ATAA------------AT----------------TTA----CTG-GAAATG-TA-CACCTGTCTA-A----CTG----TCTGGTG--GA--CATCAGACCTGCTGGAGTT-AAA-----------------------ACAGA-CAG------------TAGGG-ATGA
gi|20 : catgcaggaacacaataaaatcattctG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTAT--GGAAAAGGG----GGGG----GA-----------TTTGT-G-GAG---TAAA--A-----TCATGTG-GGG---AGACT-GTA-GTGTACTGAGACA--TCTG-----------TTGTGTGTGGGTCT
gi|12 : T----TGGA----TA-----------TTTGT-G-GGA---GACA--A-----TCA---G-TGATGGAGACT-G
gi|25 : GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : gttAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGGGGGCGGGGGCGGACGTC-AA---TGT
gi|21 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaC-AGGAGGAGGTAT-----------AGAG--TGGA---T-----GACTCTGTGTT-A--GA
gi|11 : tctgtgttagaGAGGTAT-----------AGAGAGT--A---T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATaagggagacggtttctgttctagagaggaccaggcgactggt
gi|22 : gagGAGGTAT-----------AGAG-----AGCTT-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATGACTCggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : g-----------AGAG--T--A---T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGG--GAGG-------
gi|21 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagTCTGTGTT-A--GACAGGAGGAGG-------TA---TAGAGTG-----GATGACTCT-G-TGTTA-G---------------AAAG--GGAGACGGTT--TCTGTT-CTAGA------------GAG--------------G----ACC-AGGCGAC--gtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|3 : GTT-AATGACAGGGTGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATGATTCT-G-CGATA-G---------------ACAG--GGAGGGCGTG--TCTATT-CT--A------------GA----------------------G-AGG--AC--GA-------------------------------GACGACTGGTGTGTA-AGT-ACAGTGA--GGG---TAA------A--T------TTT-CC--AAAGA-CA-T---AGTGCAAAAG--TACAAGCAA--GTGATGT-GCGAGATAA---------AGAAACATGTCA------GA-AGAT-AC---TCTGTATAG-TC-CC--TGATAA-AA-TTGT--AGAGA---GA---TGTTG-TTAC----TG---A----A-CAC-GAGAGA--GAGAT-GT-GTGAA-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AAGA----CA---CTATA-----GTT-CTT--G-A-T-A-GAA-TTG-T--AGGG-A-GT---TGTTGT-T--AC-TG---AG-TAAA-A--AGAG-----AGA-------T--A-TG-TAT----G--A---GAT--AA-AGAAA-CAT-G-TT-AGA-AT----A----CAC--TT-TGT-G-T---AGCC-CT-TGAT-AGAATTG--T--AGA-GATGTT-A-CTTATAC-TTAGTAC--NNN--NNNNNN----NN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNAACATG-TACAG-AAtggt
gi|11 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacGAGGAGG-------TA---TAGAGAG-----TATTGCTC-TG-TGTTA-T---------------AAAGTAGGAGGtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|22 : GAGG-------TA---TAGAGAG-----CTTGACTC-TG-GGTTA-G---------------GCAGGAGGAGGtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gA---TAGAGAG-----TATGACTC--AGTGTTA-G---------------ACAG--GGAGGGTGTG--TCTGTT-CTAGNT-----------GGT--------------GTTAAACATAG--AACA-GAGAATGTGAGT---tatagagagtatgactc
gi|15 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgATAATT-TTG-TGTCA-G---------------ATAG--GGAGGGTA-G--TCCGCT-CTGAA------------GAG--------------G----ACG-TGGTAACTTGTATGTGTGAGT---GTATTAA----TA-GCttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|16 : accAG--GGAGGGTGTG--TCTGTT-CTAGA------------GAG--------------G----ACC-AGGCGAC--GGATGTATGAGT---ACAGTGA-------GAGTAAAGATCGGTTTG-------ATCGTGA--G-----T------------------------------A-CA-A---AATGCAAAAG--TACAAGAGA--AAGATGT-GTGAGATAAAGaaaaatgaagtggcagatagagaccaggaaaggatgatgtgttagatacagaaacaggtcagaaggttcgcattttagtctttgataattgt
gi|11 : TGTT-CTAGA------------GAG--------------G----ATG-AGGCGAC--TGGTGTGTAAGG---ACAGTGA----
gi|7 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGACGACTTGTGTGCG-AGT-ACAATAATAG-----TGA------A--TATTCCTTTG-AA--AAAAA-AA-G---AGTG--AAAGAATACAAGAAA--GTGTTAT-GCGAGATCAAGA--A-------ACACGTCA------GA-AGAC-AT---TCTGTATAG-TC-TC--AGATAG-TG-TTGA--AGGGA---AA---TGTTG-TTAC----AA---A----G-AAC-AAGAGC--GAGAT-GT-GTTAG-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AAGA----CACT-aaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|11 : agagtgttctttatcactagtgaaatgcctagtggaacacggagctgattgggttacggaatctgttgatataaatgtgtcactcctatataaagcattggttctgaacaaaccagatatattgagatatcttatacagcaacaaaataaaatacttttaggtgaattcagtggaaatagacatctatttgattgtctgatagatattagacattctggagaaaaaccaaacagtagtggtgatgtggtggtgatgaacagatcagtatggtgtatggatgaattcggagatttatggacggcaatcagtgagggaaactgtgatgtactgagtcatctgatttgtgtggggttgaatgccaatcagtggatacagttgtctgatatgagacctctgttacatacactaattgatcataatgatgttaatcacagagcggagaaggtcaggatcctgataggggcagggacggatgtcaatgtcaaagtgaggtatagcaaatatgactcagtgttagacagagagggtgtatctgctctggagagaacaaGGCGACTGGTGTGTA-AGG-ACAGTGA--AAA---CAA------ACAT------TTGTATTTAAGAAACA-G---AGTGCCAGGG--TACAAGAAA--CTGATTT-GTGAGATAAAGA--A
gi|5 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaAG--TACAAGAGA-----AAGTCGTAAGATAAAGA--A-------ATATATCA------GA-AGAC-TC---TCTGTTTAG-TC-CC--TGATAG-AA-TTGT--AGAGA---GA---TGTTG-TTAC----TG---A----G-TAC-acatctctgtttagtc
gi|18 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgAG--TACAAGAGA--GAGATGT-GTG-------GA--ATAAAGAAACATCTCA------GA-AGAC-AC---TCTGT
gi|17 : agataaagaaacatgtcagaagatactctctataatatctgatagaattgtagagatataacgttattgGGTGT-GTGAGATAACGA--A------AA-ATGTCA------GA-AGAC-AC---TCTGTGTAG-TT-CA--TGATAG-AA-TTG
gi|10 : gaATGT-GTGAGATAAA-------AAGAAACATGTCA------GA-AGA--AC---TATGTATAG-TC-CCT-ATGTAG-AA-TTGT--TAAGA---GACATTGTTG-TTAC----TGCGAA----G-TAC-AAGAGA--GAGAT-GT-GT-AG-A-TATAGAAA--G-A-AA---A-T-GTCA--G-AAGA----C--T-CTGT-TCTGAGTC-CCT--G-A-TGA-GAA-TTG-T--AGAG-A-T----TGTTGT-T--ACTTG---AG-T--C-A--AGAG-----AGA-------G--A-TGTTGT----G--A---GAT--AA-AGAAA-CAT-G-T---GA-AGA---A----CAT--TC-TGTAA-T---AGT--CC-TAAT-Acgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|18 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagaagtgtaga--ATAAAGAAACATGTCA------GA-AGAT-AC---TCTCTATAA-TA-TC--TGATAG-AA-TTGT--AGAGA---TA---TAACG-TTAT----TG---A----G-TAC-AAGAGA--GAGAT-GT-GTGGA-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-CTCA--G-AAGA----CACT-CTGTctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|24 : agCA------GA-AGGC-AC---TCTGTATAG-TC-CC--TGATAG-AT-TTGT--A
gi|5 : ---TCTGTATAG-TCACC--TGATAG-AA-TTGT--AGAGAA--GA---TGTTG-TTAC----TG---A----G-TAC-AAGAGA-----AA-GTCGTAAG-A-TA----AA--G-A-AA-T-A-T-ATCA--G-AAGA----CTCT-CTGTTTA---GTC-CCT--G-A-T-A-GAA-TTG-T--AGAG-A-GA---TGTTGT-T--AC-TG---AG-T-AC-
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctA---GA---TGTTA-GTACAAAGTG---AAGAAG-TAC-AAGAAA--GCGAT-GT-GTGAG-G-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AAGA----CAAT-CGGAATA---GTC-CCT--G-AGT-GTGAG-ATA-A--AGAC-A-CA---TGT--------C-TG---AA-G-AC-A--ATAGTTCCCGAA-------A--A-CG-TGT----C--G---CA---AG-AGAAT-GTT-G-TC-AGAGAGA---
gi|7 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatG---A----A-TAC-AAGAAA--GTGTT-AT-GCGAG-A-TC----AA--G-A-AA-C-A-C-GTCA--G-AAGA----CATT-CTGTATA---GTC-TCA--G-A-T-A-GTG-TTG-A--AGGG-A-AA---TGTTGT-T--AC-AA---AG-A-AC-A--AGAG-----CGA-------G--A-TG-TGTTA--G--A---T----AA-AGAAA-CAT-G-TC-AGA-AG----A----CAC--Tgagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|11 : agagtgttctttatcactagtgaaatgcctagtggaacacggagctgattgggttacggaatctgttgatataaatgtgtcactcctatataaagcattggttctgaacaaaccagatatattgagatatcttatacagcaacaaaataaaatacttttaggtgaattcagtggaaatagacatctatttgattgtctgatagatattagacattctggagaaaaaccaaacagtagtggtgatgtggtggtgatgaacagatcagtatggtgtatggatgaattcggagatttatggacggcaatcagtgagggaaactgtgatgtactgagtcatctgatttgtgtggggttgaatgccaatcagtggatacagttgtctgatatgagacctctgttacatacactaattgatcataatgatgttaatcacagagcggagaaggtcaggatcctgataggggcagggacggatgtcaatgtcaaagtgaggtatagcaaatatgactcagtgttagacagagagggtgtatctgctctggagagaacaagacgacttgtgtgcgagtacaataatagtgaatattcctttgaaaaaaaaagagtgaaaG---G----G-TAC-AAGAAA--CTGAT-TT-GTGAG-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-CTC
gi|2 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgcca---A----G-TAC-AAGCGAAGTTGA--GT-GTGAG-A-TA----AA--GCATAA-CGA-T-GTCC--G-AG-------ATC-TTGTATA---GTC-CCTTCG-A-T-A-GAACTTG-CTAAGAG-GCGA---TGTTG--TTTAC-TG---AG-TTACTA--AGAG-----TGA-------G--AGTG-TGA----G--A---TT---AA-AGAAATCATTG-TC-AGA-C-A---ATTTTCAC--TCCTGT-T-TT--AGTC-C--TGAT-AGAATTGA-TTGAGA-GATGTT-GTT---TAC--GAGT----ACATTAGAGAGGGGAATTTGATGATGT-TTGAGATAAATTTAAACATGTT-CAG-AAGtgtttagtc
gi|16 : gggtctttatttcaacagtgaaaatgtctttttagtggaacatggagctgactttggttactcgggtttgttgatttcaattttgtcatcattggtataatacagcattaatatttgaacaaattcaacatatagtgaaatatctcacatcaagcaacagaaataaaatcactccagagttatttaggattactggaaatgtatcacctatattactgtctggtggagatcagacatgctggagtaaaaacagatcagtagggatgatgtccggtggtgacagttcagatccaagtgtggtagtaggatagactattgtggagttatagattgggagggtttgttggtggacatcaccagtgggagacttgtggatgtactgagacatctgatctgcgtgtgttgtgtgggtctggatgtcaatcagtcgataacaatatctattcatgtgggtactctgatgataagtgttctgatgtggacctctttgttatacacgagtgatgggaatgtatgatcagtataaacatgggagaggtgagtttatcctgctgggcggtgcggacgtctaattttgtcaagggtgagggatgttattatacaagagtagtggtggggctctgtgttaagactggaggagtatatagagctatactctgtgttagtagagttgttgggtaataggaaaagtatgactctgttgttagacaggagggttgtgatctgttctatagagggacgaggcgacgggtgtgtgagtacagtgagagtggagtattactaattggatggacaattgaatga---A----G-TAC-AAGAGA--AAGAT-GT-GTGAG-A-TA----AA--G-accttcgtctgtattagtcccttgata
gi|15 : agggagggtgtgtctgttctagagaggaccaggcgacggatgtatgagtacagtgagagtaaagatcggtttgatcgtgagtacaaaatgcaaaAAAGG--ATGAT-GT-GTTAG-A-TA----CA--G-A-AA-C-A-G-GTCA--G-AAGGTT--CGCA-TTTTA-----GTC-TTT--G-A-T----AA-TTG-T--
gi|17 : accataattttgtgtcagatagggagggtagtccgctctgaagaggacgtggtaacttgtatgtgtgagtgtattaatagcaaaaatgaagtggcagatagagaccaggGGT-GT-GTGAG-A-TA----AC--G-A-AA-A-A-T-GTCA--G-AAGA----CACT-CTGTGTA---GTT-CAT--G-A-T-A-GAA-TTG-
gi|10 : gaAT-GT-GTGAG-A-TA----AAAAG-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AAGA-----ACT-ATGTATA---GTC-CCT--ATG-T-A-GAA-TTG-T--TAAG-A-GACATTGTTG--TT-AC-TGCGAAG-T-AC-A--AGAG-----AGA-------G--A-TG-TGTA---G--A---TATAGAA-AGAAA--AT-G-TC-AGA-AG----------AC--TC-TGT---TCTGAGTC-CC-TGATGAGAATTG--TAGAGA-T-TGTT-G-T---TACTTGAG-----TCA--AGAGAG----AG------ATGTTGTGAGATAAA--GAAACATG-T---G-AAGcgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|18 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagaagtgtagaAG-A-TA----AA--G-A-AA-C-A-T-GTCA--G-AAGA----TACT-CTCTATA---ATA-TCT--G-A-T-A-GAA-TTG-T--AGAG-A-TA---TAACGT-T--AT-TG---AG-T-AC-A--AGAG-----AGA-------G--A-TG-TGT----GGAA---T----AA-AGAAA-CAT-C-TC-AGA-AG----A----CAC--TC-TGT-aacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|24 : CA--G-AAGG----CACT-CTGTATA---GTC-CCT--G-A-T-A-GAT-TTG-T--A
gi|5 : T-CTGTATA---GTCACCT--G-A-T-A-GAA-TTG-T--AGAGAA-GA---TGTTGT-T--AC-TG---AG-T-AC-A--AGAG-----AAA-------G--T-CG-TAA----G--A---T----AA-AGAAA-TAT-A-TC-AGA-AG----A----CTC--TC-TGT-T-T---AGTC-CC-TGAT-AGAATTG--TAGAGA-GATGTT-G-T---TAC-TGAGT----
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnct-GA---TGTCC--C--AC------AG-T--C-A--AGGA-----AAT-------G--A-TG-TGT----G--A---GAT--AA-AGAAA-CAT---TCAAGA-AAG---A----CAC--TC-T-T-A-T---AATac
gi|7 : ggttctctatcaacagtgaaatatctagtggaacatggagctgactgggttactcaggttgttgatttcaatgtgtcagcagtatatagagcattaatcctgaacaaaccagatatagtgaaatatctcatacagcaacaaaataaaatcattccaagtaaatttactggaaatgtacacctatttaactgtctgatggagatcagacatgctggagttgaaacagacagtagggatgatgtggtgacagacagatcaatgtggtgtatggatgatgtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttgaagatttgtggaggacaatcagtgagggagactgtgatgtactgagacgtatgttgtgtgtgggtctggatgtcaatcagtcaatacggttttatccgtggtattatatgtacaatgatgataagtgtgaagcgagacctctgttgtttacactgattgatgatgagtatgttgaacatagaacagagaaggtgagtgtcctgctgggggcgggggcggatgtcaacgtcagggtgaggtatagaaagtatggctctgtgttagacagggagggtgtgtctgttctagagatgacgaggcgacggatgtgtaagtacagtaaagattggtatgatgagagtgaggacagtgatagtgaggacagtaagatggtatttcataagttcagtgtgccacagtacaaggaaatgatgtgtgagataaagaatatacagatgttaggataaggggacgacaagtgagtacagtaagtggtgatttcataagtccG---AA-T-AC-A--AGAA-----AGT-------GTTA-TG-CGA----G--A---TC---AA--GAAA-CAC-G-TC-AGA-AGA--------CAT--TC-TGT-A-T---AGTC-TC-AGAT-AGTGTTG--AAGGGA-AATGTT-G-T---TAC-AAAGA----ACA--AGAGCG----AG------ATGTGTT-AGATAAA--GAAACATG-T-CAG-AAG
gi|16 : agagtgttctttatcactagtgaaatgcctagtggaacacggagctgattgggttacggaatctgttgatataaatgtgtcactcctatataaagcattggttctgaacaaaccagatatattgagatatcttatacagcaacaaaataaaatacttttaggtgaattcagtggaaatagacatctatttgattgtctgatagatattagacattctggagaaaaaccaaacagtagtggtgatgtggtggtgatgaacagatcagtatggtgtatggatgaattcggagatttatggacggcaatcagtgagggaaactgtgatgtactgagtcatctgatttgtgtggggttgaatgccaatcagtggatacagttgtctgatatgagacctctgttacatacactaattgatcataatgatgttaatcacagagcggagaaggtcaggatcctgataggggcagggacggatgtcaatgtcaaagtgaggtatagcaaatatgactcagtgttagacagagagggtgtatctgctctggagagaacaagacgacttgtgtgcgagtacaataatagtgaatattcctttgaaaaaaaaagagtgaaa---AG-T-AC-A--AGAG-----AAA-------G--A-TG-TGTGA--G--A---TA---AA-acact
gi|15 : agggagggtgtgtctgttctagagaggaccaggcgacggatgtatgagtacagtgagagtaaagatcggtttgatcgtgagtacaaaatgcaaaC-A--GGAA-----AGGAT-----G--A-TG-TGTTA--G--A---TA---CA--GAAA-CAG-G-TC-AGA-AGGTTCG----CAT--TT-------T---AGTC-TT-TGAT---AATTG--Tg
gi|17 : accataattttgtgtcagatagggagggtagtccgctctgaagaggacgtggtaacttgtatgtgtgagtgtattaatagcaaaaatgaagtggcagatagagacGA-------G--G-TG-TGT----G--A---GAT--AA-CGAAA-AAT-G-TC-AGA-AGA--------CAC--TC-TGT-G-T---AGTT-CA-TGAT-AGAATTG--
gi|18 : ----G--A---TA---AA--GAAA-CAT-G-TC-AGA-AGA--------TAC--TC-TCT-A-T---AATA-TC-TGAT-AGAATTG--TAGAGA-TATAAC-G-T---TAT-TGAGT----ACA--AGAGAG----AG------ATGTGTGGA-ATAAA--GAAACATC-T-CAG-AAGcgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|24 : aC-AGA-AGG--------CAC--TC-TGT-A-T---AGTC-CC-TGAT-AGATTTG--TAacactctgt
gi|5 : --TC-TGT-A-T---AGTCACC-TGAT-AGAATTG--TAGAGAAGATGTT-G-T---TAC-TGAGT----ACA--AGAGAA----A---------GTCGTAAGATAAA--GAAATATA-T-CAG-AAG
gi|15 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctGAGA----CCA--GGAAAGG---ATG-----ATGTGTT-AGATACA--GAAACAGG-T-CAG-AAGactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222222222222222222 1111111111 1111111 5555555555555 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1111111 1111 1111111 222222222222222 1111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 111111 1 111 11111 11111111111 2222222222 1 1111111 111111 11 333333 11 2222222222 1 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 44 3 6 33 9999 999999999999999999999999999999 0 4444444444 9999999 555 3 3 3 3 6666666666666 44 555 8888888888888 0000000 2 3 0 1111111 3 3 66 3 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 66666 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 555555555555555555555555555555555 222 4 4 66 777 22 1 66666666666666666 2 1 3 55 4 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 2 0 6666666666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 88888 2 3 44 888 6666 9999999 2 2 333333 2 2 444 66 2 5 33 2 5 2 2 2 44 55 0 666 3 555 77 3 6 1 2 2 2 6666 2 2 44 33 2 2 6666 2 5555 77 000 3 4 4 4 9999 22 22222 55 66666666666 5555555555 3 6666666 99 6 77 5 99 333333 6 6 33 3 2 222222 33 1111111111 0 1 5 0 3 3
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . .. . . .. .... .............................. . .......... ....... ... . . . . ............. .. ... ............. ....... . . . ....... . . .. . ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ..... . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. . ................. . . . .. . .................................................................... . ....... . . .... ....... ............... . .. . . . . .......... ............................................................................. . ..... . . .. ... .... ....... . . ...... . . ... .. . . .. . . . . . .. .. . ... . ... .. . . . . . . .... . . .. .. . . .... . .... .. ... . . . . .... .. ..... .. ........... .......... . ....... .. . .. . .. ...... . . .. . . ...... .. .......... . . . . . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 66 3 2 22 6666 666666666666666666666666666666 4 6666666666 2222222 888 3 3 3 3 6666666666666 66 888 3333333333333 8888888 3 6 9 8888888 6 6 11 6 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 66666 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 444444444444444444444444444444444 222 4 4 11 888 22 9 77777777777777777 5 4 6 00 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 8 5 7777777777 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 33333 4 3 22 444 5555 2222222 9 9 999999 9 9 777 33 7 3 77 7 3 9 9 9 22 00 9 444 6 888 99 3 7 0 9 9 9 1111 9 9 77 99 9 9 1111 9 0000 44 444 5 0 0 0 4444 11 88888 11 00000000000 0000000000 3 5555555 22 7 77 7 22 777777 7 7 88 2 5 555555 88 0000000000 8 0 8 0 3 3
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA----AA--AT--A-------A-------CC-TTC-AGGTAA----------ATT-------TA---CTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGTC--TGG-------TG--G---ACAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGAGA-TTTGT-GGAGGAC--A--ATCAGNG---AGGGAGACT-GTG-ATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGAA--TA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G----G--CG----------G-C--AGGGNGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGACGAGGCGACGGGTGTGTGA--------G-TACAGTGA----TGGAGTGACGAC-G-GTGTGTA-AGT-ACAGTGA----GGA---TA-----A------A--TTTN-AT--AAGGA-CA---G-AGTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGT-CAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA--TA-GTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-TTACTG---AG--TAC-AA-GAGAGAGATGTGTGA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T-GTCA--G-AA-GA----CACT-CT--G-TA-T---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-T---TAC-TGAG-T-AC---A--AGAGAGA----------GATG-TGTGA---GAT-AAA--GAAACATG-T-CAGAAGAACAC--TCTGT-A-T--AGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TACTG--AGT-AC--AA-G-AAAGAGATGCGTTGA-GATAAAGAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA----AA--A---A-------A-------C-------GGTAA----------ATT-------TA---CTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGTC--N---------CG--G---ACAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGAGA-TTTGT-GGAGGAC--A--ATCAGGG---AGGGAGACT-GTG-ATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATNATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGAA--TA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G----GGACG--T-AA---TG-C--AGGGNGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GACTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGACGAGGCGACGGGTGTGTGA--------G-TACAGTGA----TGGNGTGACGACTG-GTGTGTA-AGT-ACAGTGA----GGA---TA-----A------A--TTTN-AT--AAGGA-CA---G-AGTGCNAAAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGT-CAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA--TA-GTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-TTACTG---AG--TAC-AA-GAGAGNGATGTGTGA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T-GTCA--G-AA-GA----CACT-CT--G-TA-T---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-T---TAC-TGAG-T-AC---A--AGAGAGA----------GATG-TGTGA---TAT-AAA--GAAACATG-T-CAGAAGAACAC--TCTGT-A-T--AGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TACTG--AGT-NC--AA-G-AGAGANATGTGTTGA-GATAAAGAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA----AA--A---T-------A-------A-------AATAC----------ACTCCAGCCTTATTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTT--C---------TG--GTAGACAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAGA-GAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGGGA-TTTGT-G-AGAACCAG--ATCAGGAGGAAGGGAGGCG-GTG-ATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--G-ATC-GTG-GTTG-A--TA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCTGGG-G-------CG---------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA-GA-GCGACGGATGTGTGA--------GTTACAGTGA-----GAAGT--------------TA-AAT-A-----------------------------------TC-AT--AATGA-CA---GAAGTGCCTGAATA-C-AG-GAAG--CG----ATGTGTGA-ATCAA--------AAACATAT-CAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA--AT-GTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-TTAATG---AA--TAC-AA-GAGAGAGATGTGTGA-ATA-CA----CAGAAA-CA-TGGTCA--GTAA-GA----CACT-CT--G-TA-TTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--T---TAC-TGAGCT-AC---A--AGAGAGA----------GATGTTGTGAGATTATCAAA--GACATTTG-T-CAGAAGCACAC---CTGT-A-T--AGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TACTG--AGTAAC--AT-GAAAAGAGGTGTGTGAA-GATAACGAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAGA-TAACGAAAAATGT-CAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGT-TA-GTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactgAAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGT-CAG-AA------GA--A-C---TATGTA--TA-GTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-TTACTGCGAAG--TAC-AA-GAGAGAGATGTGT-A-G-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GTCA--G-AA-G------ACT-CT--G-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-T---TACTTGAG-T--C---A--AGAGAGA----------GATGTTGTGA---GAT-AAA--GAAACATG-T---GAAGAACAT--TCTGTAA-T--AGT-CC-TAA-TAcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : TGTT-C-TAGAGAGGATGAGGCGACTGGTGTGTAA--------G-GACAGTGA----cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|11 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGA----TGAGG---CGACTG-GTGTGTA-AGG-ACAGTGA----AAA---CA-----A------ACATTTGTATTTAAGAAACA---G-AGTGCCAGGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTGAGATAAAGAAaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|11 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagagG---GG--TAC-AA-GAAACTGATTTGTGA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T--------------------CT-CT--G-TT-T---AGTCacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccaTTGGATA-TTTGT-GGGAGAC--A--ATCAGTG---ATGGAGACT-G
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGGG-G----Gntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACAC---AATCA---A-------A-------TCATTCTAGGTAA----------AGT-------TA---CTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTGTCATG---------TG--G---ACAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGcgggggcggacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAACAA--CCA-GATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AACA----AAT-A---A-------AATCATTCC-------AGTCA----------ATT-------GA---CTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTGTCTGG---------TG--A---AGAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGACGTGGTAACTTGTATGTG----------------------------TGA-------GTGTATT-AAT-A--GCAA----AAA---TG-----A------A--GT----------GG-CA---G-A----TAGAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGTTAGATACAGAA-------ACAGGT-CAG-AA------GGT-T-C---GCATTT--TA-GTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGACCAGGCGACGGATGTATGA--------G-TACAGTGA------GAGTAAAGATCG-GTTTG-------ATCGTGA----G-----T-----------------------------A-CA---A-AATGCAAAAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG
gi|17 : GAGGTGTGTGA-G-A-TA----ACGAAA-AA-T-GTCA--G-AA-GA----CACT-CT--G-TG-T---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : ATAAAGAAACATGT-CAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA--TA-ATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-TTATTG---AG--TAC-AA-GAGAGAGATGTGTGG-A-A-TA----AAGAAA-CA-T-CTCA--G-AA-GA----CACT-CT--G-Tcgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : agCATG-CAGG-AACACAATAA--A---A-------T-------CATTCTA-GATAA----------ATT-------TA---CTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTGTC--TGG-------TG--G---ACAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAACAAATTCAA-CATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACA----GA--A---ATAAAATCA-------CTCCAG--AGTTA----------TTTAGGAT--TA---CTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTGTC--TGG-------TG--G---AGAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACCAGTG-----GGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-T-GGGTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCAG--TATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGGGCGGTGCGGACGTCT-AATTTTG-TCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGA---------GGGT-TGTGATCTGTTCTA-TAGAGGGA----CGAGGCGACG---G-GTGTGTG-AGT-ACAGTGAGAGTGGAG--TATTACTA------A--TTGG-AT----GGA-CAATTG-AATG---AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGT-CCG--A------GAT---C---T-TGTA--TA-GTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTTTACTG---AGT-TACTAA-GAGTGAGA-GTGTGA-G-ATTA----AAGAAATCATT-GTCA--G-AC-AATTTTCACTCCT--GTTT-T---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTT---TAC--GAG-T-AC---ATTAGAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA---GAT-AAATTTAAACATGTT-CAGAAGACCTTCGTCTGT-ATT--AGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGGGA-TTTGT-GGAGTAA--A--ATCATGT---GGGGAGACT-GTA-GTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGACCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA----
gi|24 : -CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA--TA-GTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAATAAA--CGA-GATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA----AA--ATGAA-------A-------CCAATCCAGGTCA----------ATT-------TG---ATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTGTC--TAG-------TG--G---ACAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGATA-TTTGT-GGGGAGC--A--ATGAAGG---AGGGAGACT-GCA-ATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGAA--T-----CATAGATC---GAGG-TTGA-----TCCT-CCTGG----------------------G-C---GGGCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-T--AGA----GAGG--ACGAG------------------------------------ACGACTG-GTGTGTA-AGT-ACAGTGA----GGG---TA-----A------A--TTTT-CC--AAAGA-CA---T-AGTGCAAAAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCGAGATAA-------AGAAACATGT-CAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA--TA-GTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-TTACTG---AA--CAC-GA-GAGAGAGATGTGTGA-A-A-TA----AAGAAA-CA-T-GTCA--G-AA-GA----CAC--------TA-T---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-T---TAC-TGAG-TAAA---A--AGAGAGA----------TATG-TATGA---GAT-AAA--GAAACATG-T-TAGAAT-ACAC--TTTGT-G-T--AGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATACTT--AGT-ACNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaA-CGAG-AGAG--AG----ATGTGTGA-------AATAAAGAAACATGT-CAG-AA------GAC-A-C---T----A--TA-GTT-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGGG--A-GT---TGTTG-TTACTG---AG--TAA-AAAGAGAGATATGTATGA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T-GTTA--G-AA-TA----CACT-TT--G-TG-T---AGCCCTTGA-T-AGAATTG-T------AGAGATGTTA-CTTATAC-TTAG-T-ACNNNN--NNNNNNN----------NNNN-NNNNN---NNN-NNN--NNAACATG-TACAGAATGACAC--TCTGCAA-TTAAGTCCC-TGAGTAAAATTG--TAGA-AGATGTT-A----TACTGATACT-GC--AATG-GAAGGGATGCG-TGACGATGAAGAAACAtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacAACATGTACAG-AAT-----GAC-A-C---TCTGCAATTAAGTC-CCT--G-AGTAAA-A-TT-GT--AGA---A-GA---TGTTA-T-ACTG---ATACTGC-AATGGAAGGGATGCGTGACG-A-TG----AAGAAA-CA-C-CTAG--G-AACGA----CACT--TAAG-TACT---AAT-CGTGACT-GAAATTG-T----AGATATGTGTcctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactgagtaaaaagagagatatgtatgagataaagaaacatgttagaatacactttgtgtagcccttgatagaattgtagagatgttacttatacttagtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAACAAA--CGA-GATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA----AA------------------------------GGTAA----------CTT-------TA---CTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTG--------------AG--G---ACAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAGA-CAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGATA-TTTGT-GGAAGAC--A--ATAAGGA---ATACAGACT-GTG-ATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGAT-AAGTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT-GG-A----AGACG--TCAA---TGTC--AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGACGAGGCGACGAGAGTGTGA--------G-TACAGTGA----TGGCGTGGCGACGG-GTGTGCA-AGT-ACGGTGA----G-----TA-----A------A--TTTG-AT--AAGGA-CA---A-AGTGCCAAAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGT-CAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA--TA-TTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-TTACTG---AG--TAC-AA-GAGACTGATGTGTGA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T-GTCA--G-AG-GA----CACT-CT--G-TA-T----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-----TAC-TGAG-T-AC---A--AGAGAGA----------GATG-TGTGA---TA--AAA--GAAACATG-T-CAGAAGAACAC--TCTGT-A-T--AGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TACTG--AGT-TC--AA-G-AGAGATATGTATTGA-GATAAAGAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAACAAA--CCA-GATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA----AA--ATA-A-------ATCTTTCCC-------GGTAA----------ATG-------TA---CTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTGTC--T------------------------------------GACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAAA-CAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G----------------GA-T--------------------AGAG---AGGGAGATT--------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT-----------------CATAAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGGG-A----G----------------C--GGGGGCAG-----------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAACAAGGCGACAGGTGTGTGA--------A-TACAGTAA------GAGTGAAGATTG-GT-----------------------A---TA-----G------A--TGTT------AGTA-CA---A-AGTGAAGAAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTGAG-------GTAAAGAAACATGT-CAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA--TA-GTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGA-G-A-TA----AAGACA-CA-T-GTCT--G-AA-GA----CA----------A-T---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-T---CA---GAG-----------AGAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA--TA-GTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--AAGA---TGTTG-TTACTG---AG--TAC-AA-GAGAAAG-T-CGTAA-G-A-TA----AAGAAA-TA-T-ATCA--G-AA-GA----CTCT-CT--G-TT-T---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-T---TAC-TGAG-T-AC---cgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA----AA--ATAAA-------A-------TCATTCCAAGTAA----------ATT-------TA---CTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGTC--TGATGGAGATCA--G---ACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GG--------TGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAAGA-TTTGT-GGAGGAC--A--ATCAGTG---AGGGAGACT-GTG-ATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTAT-ATGTACAA-TGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--G-ATGAGTATGTT--------GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGGG-G----G--C-----------------GGGGGCGG----------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGACGAGGCGACGGATGTGTAA--------G-TACAGTAAAGATTGGTATGATGA--GAGTGAGGACAGTGATAGTGA----GGACAGTA-----AGATGGTA--TTTC-AT--AAGTT-CA---G-TGTGCCACAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATATACAG--ATGT-TAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA--CA-GTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--CCAC-----AG--T-C-AA-GGAAATGATGTGTGA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T--TCAAGA-AA-GA----CACT-CT----TA-T---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAACAAA--CCA-GATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA----AA--ATAAA-------A-------TACTTTTAGGTGA----------ATT-------CA---GTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTGTC--TGA-------TA--G---ATAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGAA-CAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGAGA-TTTAT-GGACGGC--A--ATCAGTG---AGGGAAACT-GTG-ATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-AA--T-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAGG-G-------------------G-C--AGGGACGG-----------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAACAAGACGACTTGTGTGCGA--------G-TACAATAA----T--AGTGA-------ATAT------T-CCTTTGA----AAA---AA-----A------A-------AG--AGTGA-AA---G-AATACAAGA-----AAG-------TG----TTATGCGAGATCA-------AGAAACACGT-CAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA--TA-GTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-TTACAA---AG--AAC-AA-GAGCGAGATGTGTTA-G-A-TA----AAGAAA-CA-T-GTCA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA----AA--ATAAA-------A-------TCACTCCAGGCAA----------ATT-------GA---CTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGTC--TGG-------TG--G---AGAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGATGT--GG--------TGACAGA-CAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGAGA-TTTGT-GGAGGAC--A--ACCAGTT---GGGGAGACT-GTG-ATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGT-AAGTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACA-GATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA----AA--A---T-------A-------A-------AATCACTCCAGCCTTATT-------TC---CTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTGTC--T---------GGTAG---ACAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAGA-GAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGGGA-TTTGT-GGAGGAC--A--ATCAGGG---AGGGAGGCG-GTG-ATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG-A--TA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 55555555555555555 1111111111111 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1111 1111111 222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222 111111 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 222222 222222222 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 3 44 44444444 1 3 88888888888888888 4444444444444 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 666 3 1 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 1 66666666666666666 2 1 3 55 4 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 2 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 88888 2 2 3 3 3 888 6666 0 3333333 3 111111 3 3 555 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 666 3 000 3 3 6666 3 3 33 3 44 3 3 6666 3 3 77 666 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 6 6 33 3 888888 555555555 2 4 2 2 3 3
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . . .. ........ . . ................. ............. . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ... . . . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. . ................. . . . .. . ........................................................................ . ....... . . .... ....... ............... . .. . . . . ............................................................................................ ..... . . . . . ... .... . ....... . ...... . . ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . .. . .. . . .... . . .. ... ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . ...... ......... . . . . . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 3 66 22222222 4 3 33333333333333333 0000000000000 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 444 6 0 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 9 77777777777777777 5 4 6 00 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 8 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33333 4 9 3 3 3 444 5555 4 2222222 1 999999 1 1 000 9 7 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 444 6 000 1 1 5555 1 1 99 1 22 1 1 5555 1 3 22 444 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 88 2 000000 777777777 0 3 3 3 3 3
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA--------CAGGAACAAA-AT--A----AAAT-C-C--TCC-A-G--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGAA--TA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G-C--------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGACGAGGCGACGGGTGTGTGA--------G-TACAG------------TGA-G-GAGTGACGA-C-GGTG-T-GTAAGTAC-GTGA----GGA-TA-----A-ATTTNATAAGGACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAA-G-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TACTGAGT-AC--ANG-AGAGANGTGTGTNGAGATAANGAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA--------CAGGAACAAA-AT--A----A----C-C--TTC-A-G--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGAA--TA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G-C--------------AGGGNGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGACGAGGCGACGGGTGTGTGA--------G-TACAG------------TGATG-GAGTGACGA-C-GGTG-T-GTAAGTACAGTGA----GGA-TA-----A-ATTTNATAAGGACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAA-G-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TACTGAGT-AC--AAG-AAAGAGATGCGTTGAGATAAAGAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA--CAAGATATTGTGAAATACCTAATAG-------CAGACACAAA-AT--AAAATA----CAC--TCC-A-GCCT------TA---TTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-T-GAGAACCAG--ATCAGGA-GGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--G-ATC-GTG-GTTG-A--TA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCT-GG-G--G-CG----------------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA-GA-GCGACGGATGTGTGA--------GTTACAG------------TGA-G-AAGT----------------TAAATA--------------------------TCATAATGACA---GAAGTGCCTGAATA-C-A-G-GAAG--CG----ATGTGTGA-ATCAA--------AAACATATCAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TACTGAGTAAC--ATGAAAAGAGGTGTGTGAAGATAACGAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACAT-G-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAGA-TAACGAAAAATGTCAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactAAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------GA--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : TGTT-C-TAGAGAGGATGAGGCGACTGGTGTGTAA--------G-GACAG------------TGA----A--AACAA-A-CATT-T-GTA----------------------------TTTAAGAA--ACA---G-AGTGCCAGGGTA-CAA-G-AAAC--TG----ATTTGTGAGATAAAGAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|11 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG---GG-TAC---AAGAAACTGATTTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T---------------------CT-CTG-T-TT---AGTCacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccaTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATC---A-GTGATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG--------CAGGAACACA-ATCAA----A----T-CA-TTCTA-G--G------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTG-TCATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAA-CAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA--------CAGCAACAAATAA--A----A----T-CA-TTC-C-A--G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTG-TCTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGACGTGGTAACTTGTATGTG-------------------------------------TGA-------GTG-T-ATTAATA--GCAA----AAA-TG-----A-AGT-------GGCA---G-A----TAGAGAC-CAG-G-AAAGGATG----ATGTGTTAGATACAGAA-------ACAGGTCAG-AA------GGT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGACCAGGCGACGGATGTATGA--------G-TACAG------------TGA---GAGTAAAGATC-GGTT-T-G-----ATCGTGA----G---T-------------------ACA---A-AATGCAAAAGTA-CAA-G-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : agCATG--------CAGGAACACA-AT--A----AAAT-C-A--TTCTA-G--A------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAAC-AAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAA-AT--C----A----C----TCC-A-G--AGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACC---A-GT--GGGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-T-GGGTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCAG--TATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGGGCGGTG-CG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGA---------GGGT-TGTGATCTGTTCTA-TAGAG------------GGACG-AGGCGACG----GGTG-T-GTGAGTACAGTGAGAGTGGAGTATTACTA-ATTGGAT--GGACAATTG-AATG---AAGTA-CAA-GCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------GAT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATC---ATGTG-GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGACCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA--------CAGGAACA
gi|24 : CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAAT-AAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA--------CAGGTACAAA-ATGAA----A----C-CAATCC-A-G--G------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTG-TCTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATG---A-AGGAGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGAA--T-----CATAGATC---GAGG-TTGA-----TCCT-CCTGGG---------------C---------------GGGCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-T--AGA----GAGG--ACGAG---------------------------------------------ACGA-CTGGTG-T-GTAAGTACAGTGA----GGG-TA-----A-ATTTTCCAAAGACA---T-AGTGCAAAAGTA-CAA-G-CAAG--TG----ATGTGCGAGATAA-------AGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATACTTAGT-ACNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA-AAAAG-AGAG--AT----ATGTATGAGATAA-------AGAAACATGTTAG-AA------TAC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAAC-AAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA--------CAGGAGCAAA--------------------------G--G------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTG-A-----GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATA---A-GGAATACAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGAT-AAGTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGA-A--GACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGACGAGGCGACGAGAGTGTGA--------G-TACAG------------TGATG-GCGTGGCGA-CGGGTG-T-GCAAGTACGGTGA----G---TA-----A-ATTTGATAAGGACA---A-AGTGCCAAAGTA-CAA-G-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TACTGAGT-TC--AAG-AGAGATATGTATTGAGATAAAGAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAAC-AAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA--------TAGGATCAAA-AT--A----AAT--C-T--TTC-CCG--G------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTG-TCTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT-----------------------A-GAGAGGGAGAT-T-------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGGG-A--G-CG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAACAAGGCGACAGGTGTGTGA--------A-TACAG------------TAA---GAGTGAAGATT-GGT-----------------------A-TA-----G-ATGTT---AGTACA---A-AGTGAAGAAGTA-CAA-G-AAAG--CG----ATGTGTGAG-------GTAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA--------CAGCAACAAA-AT--A----AAAT-C-A--TTCCA-A--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GG--------TGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GTGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTAT-ATGTACAA-TGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--G-ATGAGTATGTT--------GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGACGAGGCGACGGATGTGTAA--------G-TACAGTAAAGATTGGTATGATGAGAGTGAGGA-C-AGTGATAGTGAGGACAGT-A----AGA-TG-----GTATTTCATAAGTTCA---G-TGTGCCACAGTA-CAA-G-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATATACAG--ATGTTAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAAC-AAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA--------CAGCAACAAA-AT--A----AAATAC-T--TTT-A-G--G------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTG-TCTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATC---A-GTGAGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-AA--T-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAGG-------G-----G-C--------------AGGGACGG-----------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAACAAGACGACTTGTGTGCGA--------G-TACAA------------TAAT---AGTGA-------ATA-T------TCCTTTGA----AAA-AA-----A-A----AGAGTGAAA---G-AATACAA----------G-AAAG--TG----TTATGCGAG-------ATCAAGAAACACGTCAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA--------CAGCAACAAA-AT--A----AAAT-CAC--TCC-A-G--G------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACC---A-GTTGGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGT-AAGTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA--------CAGAAACAAA-AT--A----AAAT-CAC--TCC-A-G--C------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTG-TCTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GGGAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG-A--TA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 333333 111111111 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 1111 1111111 222222222222222 33333333333333333333333333 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222222 111111 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 222222222 111 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 3 44 6 33 3 111111 111111111 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 666 3 1 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 44444444444444444444 1 3 55 4 2 5 5 66 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 77777777777777777777777777 2 4 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 88888 2 3 3 3 888 6666 44444444 3 111111 3 3 555 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 666 3 000 3 3 6666 3 3 33 3 44 3 3 6666 3 3 77 666 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 77777777777777777777777777777777777 1 666666666 444 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . . .. . .. . ...... ......... . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ... . . . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. .................... . . .. . . . . .. ................................................................ . ....... . . .... ....... ............... . .. . . .......................... . . . ................................................................. ..... . . . . ... .... ........ . ...... . . ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . .. . .. . . .... . . .. ... ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ......... ... . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 3 66 2 22 1 444444 000000000 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 444 6 0 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 33333333333333333333 4 6 00 0 9 0 0 99 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 77777777777777777777777777 8 0 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33333 4 3 3 3 444 5555 00000000 1 999999 1 1 000 9 7 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 444 6 000 1 1 5555 1 1 99 1 22 1 1 5555 1 3 22 444 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 222222222 888 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC--TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAG-TACAGTGA-GGAGTG--A-GA---GGTGTGT-A-TAC-------GTGAG-A---TAA------ATTTNATAAGGACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAA-G-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-C-C--TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-C--------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACGGGTGTGTGAG-TACAGTGA-GGAGTG--ACGA-C-GGTGTGTAAGTAC-------GTGAGGA---TAA------ATTTNATAAGGACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAA-G-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ANG-AG------AGANGTGT-----GTN-GAGATAAN--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA--CAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC--TCCAGCCT------TA---TTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-T-GAGAACCAG--ATCAGGA-GGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--G-ATC-GTG-GTTG---ATA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCT-G-G-G--GCG----------------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GA-GCGACGGATGTGTGAGTTACAGTGA-GAAGT----------------------------------------TAA------ATATCATAATGACA---GAAGTGCCTGAATA-C-A-G-GAAG--CG----ATGTGTGA-ATCAA--------AAACATATCAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACAT-G-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAGA-TAACGAAAAATGTCAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------GA--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGGTGTGTAAG-GACAGTGA-AAA------CAA-A-CATTTGTA--------------------------------TTTAAGAA--ACA---G-AGTGCCAGGGTA-CAA-G-AAAC--TG----ATTTGTGAGATAAAGAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|11 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG---GG-TAC---AAGAAACTGATTTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T---------------------CT-CTG-T-TT---AGTCacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccaTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATC---A-GTGATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT--TCTAG--G------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTG-TCATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAA-CAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT--TCCA---G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTG-TCTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGT--------GTGA-----------------GTGTATTAATA--------GCAAAAA---TGA------AGT-------GGCA---G-A----TAGAGAC-CAG-G-AAAGGATG----ATGTGTTAG-------ATACAGAAACAGGTCAG-AA------GGT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGATGTATGAG-TACAGTGA--GAGTA--AAGATC-GGTTTG---AT-C-------GTGAG-----T-------------------ACA---A-AATGCAAAAGTA-CAA-G-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : agCATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT--TCTAG--A------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAAC-AAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC--TCCAG--AGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACC---A-GT--GGGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-T-GGGTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCA--GTATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGGTGTGTGAG-TACAGTGA--GAGTG----GA----GTAT-----TAC--------T----------A------ATTGGAT--GGACAATTG-AATG---AAGTA-CAA-GCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------GAT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATC---ATGTG-GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAAT-AAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAA--C-CAATCCAG--G------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTG-TCTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATG---A-AGGAGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGA--AT-----CATAGATC---GAGG-TTG-----ATCCT-CCT---G-G--GC------------------------GGGCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGGTGTGTAAG-TACAGTGA-GG------------------GTAA------------------------------ATTTTCCAAAGACA---T-AGTGCAAAAGTA-CAA-G-CAAG--TG----ATGTGCGAG-------ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA-AAAAG-AGAG--AT----ATGTATGAGATAA-------AGAAACATGTTAG-AA------TAC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAAC-AAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA-----------------G--G------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTG-A-----GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATA---A-GGAATACAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGAT-AAGTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAGTGTGAG-TACAGTGATGGCGTG--GCGA-CGGGTGTGCAAGTACG------GTGAG-----TAA------ATTTGATAAGGACA---A-AGTGCCAAAGTA-CAA-G-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAAC-AAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAATC-T-T--TCCCG--G------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTG-TCTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT-----------------------A-GAGAGGGAGAT-T-------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGGTGTGTGAA-TACAGT-A-AGAGTG--AAGATT-GGT-----------------------A---TAG------ATGTT---AGTACA---A-AGTGAAGAAGTA-CAA-G-AAAG--CG----ATGTGTGAG-------GTAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT--TCCAA--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GTGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTAT-ATGTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGA--A------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGATGTGTAAG-TACAGTAA-AGATTGGTATGA-T-GA-GAGTGAGGACAGTGATAGTGAGGACAGTAAGATGGTATTTCATAAGTTCA---G-TGTGCCACAGTA-CAA-G-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATATACAG--ATGTTAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAAC-AAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAATAC-T--TTTAG--G------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTG-TCTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATC---A-GTGAGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-A--AT-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTGTGTGCGAG-TACAAT-A-ATAGTG--A-------ATAT-----TCCT------TTGAAAA---AAA------A----AGAGTGAAA---G-AATACAAG-----------AAAG--TG----TTATGCGAG-------ATCAAGAAACACGTCAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC--TCCAG--G------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACC---A-GTTGGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGT-AAGTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC--TCCAG--C------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTG-TCTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GGGAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG---ATA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 111111111 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 1111111 222222222222222 33333333333333333333333333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222222222 111111 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 3 44 6 33 3 3 44 111111111 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 666 3 1 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 44444444444444444444 1 3 55 4 2 5 5 66 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 77777777777777777777777777 1 4 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 88888 44 3 3 888 6666 111111111 0 2 111111 333 444 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 777 4 111 3 3 7777 3 3 3 3 44 3 3 7777 3 3 66 888 0 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . . .. . .. . . .. ......... . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ... . . . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. .................... . . .. . . . . .. ................................................................. . ....... . . .... ....... ............... . .. . . .......................... . . . ........................................................................ ..... .. . . ... .... ......... . . ...... ... ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . . . .. . . .... . . .. ... . ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 3 66 2 22 1 3 22 000000000 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 444 6 0 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 33333333333333333333 4 6 00 0 9 0 0 99 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 77777777777777777777777777 0 0 6 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333 99 3 3 444 5555 222222222 3 9 111111 888 777 7 3 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 000 0 000 3 3 1111 3 3 3 3 66 3 3 1111 3 6 22 000 9 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAG-TACAGTGA-GGA--------GT-GA-GA--G--------GT----NTGTA--T-C--T-AG--TAA-ATTTNAT-AAG-GACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAG-TACAGTGA-GGA--------GT-GA-GA--G--------GT----GTGTA--TAC-GTGAGA-TAA-ATTTNAT-AAG-GACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA--CAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGCCT------TA---TTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-T-GAGAACCAG--ATCAGGA-GGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--G-ATC-GTG-GTTG---ATA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCT-G-G-G--GC------G----------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GA-GCGACGGATGTGTGAGTTACAGTGA-GAA--------GT-----------------------------------------TAA-ATATCAT-AAT-GACA---GAAGTGCCTGAATA-C-AG-GAAG--CG----ATGTGTGA-ATCAA--------AAACATATCAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAG-ATAACGAAAAATGTCAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------GA--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGGTGTGTAAG-GACAGTGA-AAA--------C---A-AA--C--------AT----TTGTA--T----------------TTAAG-AA---ACA---G-AGTGCCAGGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTGAGAT-------AAAGAAACAT--------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATC---A-GTGATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAG--G------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTG-TCATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAA-CAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA---G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTG-TCTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGT--------GTGA-------------------------------------GTGTA--T----TAATAGCAA-A---AATGAAGTGGCA---G-A----TAGAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGT----T--AG-ATACAGAAACAGGTCAG-AA------GGT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGATGTATGAG-TACAGTGA--GA--------GTAAA-GATCG--------GT----TTG-A--T-C-GTGAG--T----------------ACA---A-AATGCAAAAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAG--A------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAAC-AAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAG--AGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACC---A-GT--GGGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-T-GGGTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCA--GTATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGGTGTGTGAG-TACAGTGA--GA--------GT-G--GA-----------GT----AT-----TAC--T-------A-ATTGGAT---G-GACAATTG-AATG---AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------GAT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATC---ATGTG-GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAAT-AAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAG--G------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTG-TCTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATG---A-AGGAGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGA--AT-----CATAGATC---GAGG-TTG-----ATCCT-CCT---G-G--GC------------------------GGGCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGGTGTGTAAG-TACAGTGA-G--------------------------------------------------GG-TAA-ATTTTCC-AAA-GACA---T-AGTGCAAAAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCG------AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA--AAA-AGAG--AG----ATATGT---ATGA-G-ATAAAGAAACATGTTAG-AA------TAC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAAC-AAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA----------------G--G------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTG-A-----GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATA---A-GGAATACAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGAT-AAGTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAGTGTGAG-TACAGTGATGGC--------GT-GGCGACGG--------GT----GTGCAAGTACGGTGAG--TAA-ATTTGAT-AAG-GACA---A-AGTGCCAAAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAAC-AAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCG--G------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTG-TCTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT-----------------------A-GAGAGGGAGAT-T-------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGGTGTGTGAA-TACAGT-A-AGA--------GT-GA--A--G--------AT----TGGTA--T------AGA-T---GTT------AG-TACA---A-AGTGAAGAAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTG------AG-GTAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAA--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GTGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTAT-ATGTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGA--A------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGATGTGTAAG-TACAGTAA-AGATTGGTATGAT-GA-GA--GTGAGGACAGTGATAGTGAG--GACAGTAAGA-TGGTATTTCAT-AAG-TTCA---G-TGTGCCACAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAAC-AAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAG--G------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTG-TCTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATC---A-GTGAGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-A--AT-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTGTGTGCGAG-TACAAT-A-ATA--------GT-GA----------------------ATA--TTC------------CTTTGAA-AAA-AAAA---G-AGTGAAAGAATA-CAAG-AAAG--TG----TTATGCG------AG-ATCAAGAAACACGTCAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACC---A-GTTGGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGT-AAGTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--C------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTG-TCTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GGGAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG---ATA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 1111111 222222222222222 33333333333333333333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333333 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 44 3 6 33 3 3 44 999999 0 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 3 77777 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 3 44444444444444444444 1 3 55 4 5 5 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 77777777777777777777777777 1 4 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 777 4 44 3 3 888 6666 333333 5 2 888888 2 333 444 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 777 4 111 3 3 7777 3 3 3 3 44 3 3 7777 3 3 66 888 0 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ...... . . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. . ..... . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. . .................... . . .. . . . .. ................................................................ . ....... . . .... ....... ............... . .. . . .......................... . . . ............................................................................... ... . .. . . ... .... ...... . . ...... . ... ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . . . .. . . .... . . .. ... . ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 66 3 2 22 1 3 22 666666 6 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 6 11111 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 6 33333333333333333333 4 6 00 0 0 0 99 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 77777777777777777777777777 0 0 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000 0 99 3 3 444 5555 444444 7 9 222222 9 888 777 7 3 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 000 0 000 3 3 1111 3 3 3 3 66 3 3 1111 3 6 22 000 9 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GNG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAGT-ACAGTGA-GGA--------GT-GA-GA--G--------------GT-TGTAT---T------AGTAA------ATTTNAT-AAG-GACA---GA-GTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GNG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAGT-ACAGTGA-GGA--------GT-GA-GA--G--------------GTNTGTATC--T------AGTAA------ATTTNAT-AAG-GACA---GA-GTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGC------CTTATTC-CTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-TG-AGAACCAG--ATCA-GGAGGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTCA-CCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A-AAA-AATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--GA-TC-GTG-GTTGA---TA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCTGG-G-G---CG----------------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GAG-CGACGGATGTGTGAGTTACAGTGA-GAA--------GT-------------------------------------------TAA------ATATCAT-AAT-GACA---GAAGTGCCTGAATA-CAGG-AA-G--CG----ATGTGTGA--------ATCAA-AAACATATCAG-AA------GGAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAG-ATAACGAAAAATGTCAGTAA------G-AC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------G-A--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGGTGTGTAAGG-ACAGTGA-AAA-----------CA-AA--C--------------ATTTGTATT--T------AAGAA-------------------ACA---GA-GTGCCAGGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTG------AG-ATAAAGAAACAT---------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATCA-GTG---ATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAGG------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTGT-CATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAACAA--CCA-GATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA-G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTGT-CTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGT--------GTGA-G--------------------------------------TGTATTAAT------AGCAA------A---AATGAAGTGGCA---GA-----TAGAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGT----T--AG-ATACAGAAACAGGTCAG-AA------G-GT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGATGTATGAGT-ACAGTGA--GA--------GTAAA-GATCG--------------GTTTG-ATC----------GTGA------GT-----------ACA---AA-ATGCAAAAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAGA------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAACAAATTCAA-CATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAGAGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTGT-CTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACCA-GT-----GGGAGACTTGTGGATGTACTGAGACA--TCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-TGG-GTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCA--GTATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGGTGTGTGAGT-ACAGTGA--GA--------GT-G--GA---------------------GTAT---T------ACT-A------ATTGGAT---G-GACAATTGA-ATG---AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------G-AT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATCATGTG----GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------G-GC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAATAAA--CGA-GATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAGG------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTGT-CTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATGA-AGG---AGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAGACA--TTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGA--AT-----CATAGATC---GAGG-TTG-----ATCCT-CCT---G-G--GC------------------------GGGCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGGTGTGTAAGT-ACAGTGA-GG-----------------------------------------------------GTAA------ATTTTCC-AAA-GACA---TA-GTGCAAAAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCG------AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA--AAA-AGAG--AG----ATATGT---ATGA-G-ATAAAGAAACATGTTAG-AA------T-AC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAACAAA--CGA-GATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA----------------GG------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTGA------GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATAA-GGA---ATACAGAC-TGT-GATGTACTGAGACG--TCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGATAA-GTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAGTGTGAGT-ACAGTGATGGC--------GT-GGCGACGG--------------GTGTGCAAG--TACGGTGAGTAA------ATTTGAT-AAG-GACA---AA-GTGCCAAAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------G-AC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAACAAA--CCA-GATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCGG------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTGT-CTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT--------------------A-GAG---AGGGAGAT-T-------TACTGAGACA--TTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGGTGTGTGAAT-ACAGT-A-AGA--------GT-GA--A--G--------------ATTGGTA-------------TAG------ATGTT----AG-TACA---AA-GTGAAGAAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTG------AG-GTAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAAG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GTG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACG--TATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTATAT-GTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGA--A------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGATGTGTAAGT-ACAGTAA-AGATTGGTATGAT-GA-GA--GTGAGGACAGTGATAGTGAGGA----C------AGTAAGATGGTATTTCAT-AAG-TTCA---GT-GTGCCACAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGG-ACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAACAAA--CCA-GATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAGG------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTGT-CTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATCA-GTG---AGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAGTCA--TCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-A--AT-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTGTGTGCGAGT-ACAAT-A-ATA--------GT-GA--------------------ATAT---TC--C------------------TTTGAA-AAA-AAAA---GA-GTGAAAGAATA-CAAG-AAAG--TG----TTATGCG------AG-ATCAAGAAACACGTCAG-AA------G-AC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACCA-GTT---GGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGAGA--TCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGTAA-GTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACA-GATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGC------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTGT-CTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GGG---AGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG---ATA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 1111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 1111111 222222222222222 33333333333333333333333333 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222 111111 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 3 44 6 33 3 3 44 111111111 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 666 3 1 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 44444444444444444444 1 3 55 4 5 0000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 77777777777777777777777777 1 4 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 4444 666 88888 44 3 3 888 6666 111111111 0 2 111111 333 444 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 777 4 111 3 3 7777 3 3 3 3 44 3 3 7777 3 3 66 888 0 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . . .. . .. . . .. ......... . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ... . . . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. .................... . . .. . . .... ................................................................ . ....... . . .... ....... ............... . .. . . .......................... . . . ................................................................... . .... ... ..... .. . . ... .... ......... . . ...... ... ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . . . .. . . .... . . .. ... . ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 3 66 2 22 1 3 22 000000000 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 444 6 0 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 33333333333333333333 4 6 00 0 0 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 77777777777777777777777777 0 0 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 7777 333 33333 99 3 3 444 5555 222222222 3 9 111111 888 777 7 3 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 000 0 000 3 3 1111 3 3 3 3 66 3 3 1111 3 6 22 000 9 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAG-TACAGTGA-GGA--------GTGA-GA--G---------T---GTA-------T---T------AGTAA------ATTTNAT-AAG-GACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAG-TACAGTGA-GGA--------GTGA-GA--G--------GT-T-GTA-------T---T------AGTAA------ATTTNAT-AAG-GACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA--CAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGCCT------TA---TTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-T-GAGAACCAG--ATCAGGA-GGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--G-ATC-GTG-GTTG---ATA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCT-G-G-G--GC------G----------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GA-GCGACGGATGTGTGAGTTACAGTGA-GAA--------GT--------------------------------------------TAA------ATATCAT-AAT-GACA---GAAGTGCCTGAATA-C-AG-GAAG--CG----ATGTGTGA-ATCAA--------AAACATATCAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAG-ATAACGAAAAATGTCAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------GA--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGGTGTGTAAG-GACAGTGA-AAA----------CA-AA-----------------CA-------T---T------TGT--------ATTTAAG-AA---ACA---G-AGTGCCAGGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTG------AG-ATAAAGAAACAT--------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATC---A-GTGATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAG--G------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTG-TCATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAA-CAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA---G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTG-TCTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGT--------GTGA-G-------------------------------T-GTA-------TTAAT------AGCAA------A---AATGAAGTGGCA---G-A----TAGAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGT----T--AG-ATACAGAAACAGGTCAG-AA------GGT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGATGTATGAG-TACAGTGA--GA--------GT-A-AA--G--------AT-C-G-G-------T---T--------TGA---------TCGT-GAG-TACA---A-AATGCAAAAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAG--A------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAAC-AAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAG--AGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACC---A-GT--GGGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-T-GGGTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCA--GTATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGGTGTGTGAG-TACAGTGA--GA--------GTG--GA----------------GTA-------T---T------ACT-A------ATTGGAT---G-GACAATTG-AATG---AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------GAT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATC---ATGTG-GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAAT-AAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAG--G------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTG-TCTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATG---A-AGGAGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGA--AT-----CATAGATC---GAGG-TTGA-----TCCT-CCTGG-G-----CG-----G-------------------GCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGGTGTGTAAG-TACAGTGA-GG------------------------------------------------------GTAA------ATTTTCC-AAA-GACA---T-AGTGCAAAAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCGAGAT-------AAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA--AAA-AGAG--AG----ATATGT---ATGA-G-ATAAAGAAACATGTTAG-AA------TAC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAAC-AAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA----------------G--G------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTG-A-----GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATA---A-GGAATACAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGAT-AAGTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAGTGTGAG-TACAGTGATGGC--------GTGGCGACGG--------GTGT-GCAAGTACGGT---G------AGTAA------ATTTGAT-AAG-GACA---A-AGTGCCAAAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAAC-AAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCG--G------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTG-TCTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT-----------------------A-GAGAGGGAGAT-T-------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGGTGTGTGAA-TACAGT-A-AGA--------GTGA--A--G--------AT-TGGTA--------------------TAG------ATGTT----AG-TACA---A-AGTGAAGAAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTG------AG-GTAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAA--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GTGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTAT-ATGTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGA--A------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGATGTGTAAG-TACAGTAA-AGATTGGTATGATGA-GA--GTGAGGACAGT-G-ATA-------G---TGAGGACAGTAAGATGGTATTTCAT-AAG-TTCA---G-TGTGCCACAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAAC-AAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAG--G------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTG-TCTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATC---A-GTGAGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-A--AT-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTGTGTGCGAG-TACAAT-A-ATA--------GTGA-------------------ATA-------T---T----------C------CTTTGAA-AAA-AAAA---G-AGTGAAAGAATA-CAAG-AAAG--TG----TTATGCG------AG-ATCAAGAAACACGTCAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACC---A-GTTGGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGT-AAGTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--C------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTG-TCTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GGGAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG---ATA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 11111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 1111111 222222222222222 33333333333333333333333333 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 44 3 6 33 3 3 44 999999 0 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 3 77777 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 3 44444444444444444444 1 3 55 4 5 11111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 77777777777777777777777777 1 4 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6666666 666 777 4 44 3 3 888 6666 222222222 0 2 888888 2 333 444 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 777 4 111 3 3 7777 3 3 3 3 44 3 3 7777 3 3 66 888 0 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ...... . . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. . ..... . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. . .................... . . .. . . ..... ................................................................ . ....... . . .... ....... ............... . .. . . .......................... . . . ...................................................................... ....... ... ... . .. . . ... .... ......... . . ...... . ... ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . . . .. . . .... . . .. ... . ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 66 3 2 22 1 3 22 666666 6 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 6 11111 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 6 33333333333333333333 4 6 00 0 0 55555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 77777777777777777777777777 0 0 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0000000 333 000 0 99 3 3 444 5555 777777777 3 9 222222 9 888 777 7 3 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 000 0 000 3 3 1111 3 3 3 3 66 3 3 1111 3 6 22 000 9 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GNG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAGT-ACAGTGA-GGA--------GTGA----GAG-G----------T---------AT---T------AG--TAA------ATT--TNAT-AAG-GACA---GA-GTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GNG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTGAGT-ACAGTGA-GGA--------GTGA----GAGTG----------T---------AT---T------AG--TAA------ATT--TNAT-AAG-GACA---GA-GTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGC------CTTATTC-CTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-TG-AGAACCAG--ATCA-GGAGGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTCA-CCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A-AAA-AATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--GA-TC-GTG-GTTGA---TA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCTGG-G-G---CG----------------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GAG-CGACGGATGTGTGAGTTACAGTGA-GAA--------GT-----------------------------------------------TAA------ATA--TCAT-AAT-GACA---GAAGTGCCTGAATA-CAGG-AA-G--CG----ATGTGTGA--------ATCAA-AAACATATCAG-AA------GGAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAG-ATAACGAAAAATGTCAGTAA------G-AC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------G-A--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGGTGTGTAAGG-ACAGTGA-AAA--------C--A----AA-------------C---------AT---T------TG--TA--------TT--TAAG-AA---ACA---GA-GTGCCAGGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTGAGAT-------AAAGAAACAT---------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATCA-GTG---ATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAGG------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTGT-CATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAACAA--CCA-GATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA-G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTGT-CTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGT--GT----------------------------GAGTG----------T---------ATTAAT------AG--CAA------A-----AATGAAGTGGCA---GA-----TAGAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGT----T--AG-ATACAGAAACAGGTCAG-AA------G-GT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGATGTATGAGT-ACAGTGA--GA--------GT-A----AAG----------------------AT---C------GG--T---------TTGATCGT-GAG-TACA---AA-ATGCAAAAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAGA------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAACAAATTCAA-CATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAGAGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTGT-CTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACCA-GT-----GGGAGACTTGTGGATGTACTGAGACA--TCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-TGG-GTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCA--GTATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGGTGTGTGAGT-ACAGTGA--GA--------GTG-----GA--G----------T---------AT---T------AC--T-A------ATT--GGAT---G-GACAATTGA-ATG---AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------G-AT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATCATGTG----GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------G-GC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAATAAA--CGA-GATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAGG------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTGT-CTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATGA-AGG---AGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAGACA--TTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGA--AT-----CATAGATC---GAGG-TTGA-----TCCT-CCTGG-G-----CG-----G-------------------GCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGGTGTGTAAGT-ACAGTGA-GG-------------------------------------------------------G--TAA------ATT--TTCC-AAA-GACA---TA-GTGCAAAAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCGAGAT-------AAAGAAACATGTCAG-AA------G-AT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA--AAA-AGAG--AG----ATATGT---ATGA-G-ATAAAGAAACATGTTAG-AA------T-AC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAACAAA--CGA-GATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA----------------GG------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTGA------GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATAA-GGA---ATACAGAC-TGT-GATGTACTGAGACG--TCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGATAA-GTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAGTGTGAGT-ACAGTGATGGC--------GTGGCGACGGGTG----------TGCAAGTACGGT---G------AG--TAA------ATT--TGAT-AAG-GACA---AA-GTGCCAAAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------G-AC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAACAAA--CCA-GATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCGG------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTGT-CTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT--------------------A-GAG---AGGGAGAT-T-------TACTGAGACA--TTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGGTGTGTGAAT-ACAGT-A-AGA--------GTGA-----AG----------------------AT---T------GGTATAG------ATG--TT----AG-TACA---AA-GTGAAGAAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTG------AG-GTAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAAG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GTG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACG--TATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTATAT-GTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGA--A------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGATGTGTAAGT-ACAGTAA-AGATTGGTATGATGA----GAGTGAGGACAGTGAT---------AG---TGAGGACAG--TAAGATGGTATT--TCAT-AAG-TTCA---GT-GTGCCACAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGG-ACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAACAAA--CCA-GATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAGG------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTGT-CTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATCA-GTG---AGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAGTCA--TCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-A--AT-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTGTGTGCGAGT-ACAAT-A-ATA--------GTGA--------A----------T---------AT---T------------C------CTT--TGAA-AAA-AAAA---GA-GTGAAAGAATA-CAAG-AAAG--TG----TTATGCG------AG-ATCAAGAAACACGTCAG-AA------G-AC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACCA-GTT---GGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGAGA--TCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGTAA-GTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACA-GATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGC------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTGT-CTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GGG---AGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG---ATA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 11111 222222222222222 33333333333333333333333333 1111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 44 3 6 33 3 3 44 999999 0 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 3 77777 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 3 44444444444444444444 1 3 55 4 666666 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 9999999 1 3 0000 22222 222222222222222 3 55 3 3 77777777777777777777777777 1 55 55 3333333 55 4 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666666 666 777 4 44 3 3 888 6666 111111111111 2 888888 2 333 444 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 777 4 111 3 3 7777 3 3 3 3 44 3 3 7777 3 3 66 888 0 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . .. . . .. . . .. ...... . . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. . ..... . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. . .................... . . .. . ...... ................................................................ . ....... . . .... ..... ............... . .. . . .......................... . .. .. ....... .. . . ......................................................... ....... ... ... . .. . . ... .... ............ . ...... . ... ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . . . .. . . .... . . .. ... . ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 66 3 2 22 1 3 22 666666 6 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 6 11111 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 6 33333333333333333333 4 6 00 0 555555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 6666666 0 6 4444 77777 777777777777777 6 00 3 3 77777777777777777777777777 0 00 00 0000000 55 0 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0000000 333 000 0 99 3 3 444 5555 000000000000 9 222222 9 888 777 7 3 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 000 0 000 3 3 1111 3 3 3 3 66 3 3 1111 3 6 22 000 9 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GNG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGAA--TA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTCT-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNG--G--TGT-------GTGA--GT-ACAGTGAAGA--------GTGA--AG--------GT-A---T--------TAG--TAA------ATT--TNAT-AAG-GACA---GA-GTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-TAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GNG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGAA--TA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTCT-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNG--G--TGT-------GTGA--GT-ACAGTGAGGA--------GTGAG-AG--------GT-A---T--------TAG--TAA------ATT--TNAT-AAG-GACA---GA-GTGCNAGAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-TAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGC------CTTATTC-CTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-TG-AGAACCAG--ATCA-GGAGGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTCA-CCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A-AAA-AATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--GA-TC-GTG-GTTGA---TA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCTGGG-G----CG----------------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACACT-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GAG-CGACGG--A--TGT-------GTGA--GTTACAGTGAGAA--------GT-----------------------------------TAA------ATA--TCAT-AAT-GACA---GAAGTGCCTGAATA-CAGG-AA-G--CG----ATGTGTGA--------A-TCAA-AAACATATCAG-AA------GGAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAG-A-TAACGAAAAATGTCAGTAA------G-AC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA------AAGAAACATGTCAG-AA------G-A--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTG--G--TGT-------GTAA--GG-ACAGTGAAAA--------C-----AA--------AC-A---T--------TTG--TA--------TT--TAAG-AA---ACA---GA-GTGCCAGGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTGAGAT--------AAAGAAACAT---------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATCA-GTG---ATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTCTAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTCA-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAGG------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTGT-CATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAACAA--CCA-GATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA-G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTGT-CTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTTT-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTT--GTATGT-------GTGA--GT-GTATTAA-------------------------------------------TAG--CAA------A-----AATGAAGTGGCA---GA-----TAGAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGT----T--AG-A-TACAGAAACAGGTCAG-AA------G-GT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGG--A--TGT-------ATGA--GT-ACAGTGA-GA--------GT-AA-AG-----------A---T--------CGG--T---------TTGATCGT-GAG-TACA---AA-ATGCAAAAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : AG-A-TAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAGA------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTGT-CTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAACAAATTCAA-CATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAGAGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTGT-CTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACCA-GT-----GGGAGACTTGTGGATGTACTGAGACA--TCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-TGG-GTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCAG--TATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGGGCGGTG-CG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTCT-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGG--G--TGT-------GTGA--GT-ACAGTGA-GA--------GTG-G-A---------GT-A---T--------TAC--T-A------ATT--GGAT---G-GACAATTGA-ATG---AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCA-TAACG----ATGTCCG--A------G-AT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATCATGTG----GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTCT-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTG--G--T
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC
gi|23 : gGCATTAATACT-GAACAAA--CCA-GATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------G-GC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAATAAA--CGA-GATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAGG------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTGT-CTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATGA-AGG---AGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAGACA--TTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGAA--T-----CATAGATC---GAGG-TTGA-----TCCT-CCTGGG------CG-----G-------------------GCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTCT-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTG--G--TGT-------GTAA--GT-ACAGTGAGG-------------------------------------------G--TAA------ATT--TTCC-AAA-GACA---TA-GTGCAAAAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCGAGAT--------AAAGAAACATGTCAG-AA------G-AT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA--AAA-AGAG--AG----ATATGT---ATGA-G-A-TAAAGAAACATGTTAG-AA------T-AC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAACAAA--CGA-GATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA----------------GG------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTGA------GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATAA-GGA---ATACAGAC-TGT-GATGTACTGAGACG--TCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGATAA-GTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGA-A--GACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAG--TGTGAGTACAGTGATGGC-GTGGCGACGG--------GTGTGCAA--------GT-ACGGT--------GAG--TAA------ATT--TGAT-AAG-GACA---AA-GTGCCAAAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAG-AATAAAGAAACATGTCAG-AG------G-AC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAACAAA--CCA-GATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCGG------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTGT-CTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT--------------------A-GAG---AGGGAGAT-T-------TACTGAGACA--TTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGGG-A--G-CG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTCG-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAG--G--TGT-------GTGA--AT-ACAGT-AAGA--------GTGA--AG-----------A---T--------TGGTATAG------ATG--TT----AG-TACA---AA-GTGAAGAAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTG------AG-G-TAAAGAAACATGTCAG-AA------G-AC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAAG------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GTG---AGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGACG--TATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTATAT-GTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGAA--------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGGG-G--G-CG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTCT-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGG--A--TGT-------GTAA--GT-ACAGTAAAGATTGGTATGATGAG-AGTGAGGACAGTGA---TAGTGAGGACAG--TAAGATGGTATT--TCAT-AAG-TTCA---GT-GTGCCACAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A--ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGG-ACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAACAAA--CCA-GATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAGG------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTGT-CTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATCA-GTG---AGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAGTCA--TCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-AA--T-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAGG-G--G-CA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTCA-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTT--G--TGT-------GCGA--GT-ACAAT-AATA--------GTGA------------AT-A---T--------T------C------CTT--TGAA-AAA-AAAA---GA-GTGAAAGAATA-CAAG-AAAG--TG----TTATGCG------AG-A-TCAAGAAACACGTCAG-AA------G-AC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAACAAA--CCA-GATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTGT-CTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACCA-GTT---GGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAGAGA--TCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGTAA-GTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAA--ACA-GATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGC------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTGT-CTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATCA-GGG---AGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAGACA--TCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAA-GGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG-A--TA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777 111 11 33333333333333333333 1111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 1111111 222222222222222 33333333333333333333333333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111 111111 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 111 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 3 44 6 33 3 3 44 111111111 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 666 3 1 3 4 55 11 3333333 66 4 4 777 111111111111111111111111111111111 222 4 4 66 777 22 44444444444444444444 1 3 55 4 5 0000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 9999999 1 3 0000 0000000 222222222222222 3 55 3 3 44444444444444444444444444 1 44 3 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44 66666 7777 66666 3 3 888 6666 99999999999 2 111111 333 444 2 5 33 2 2 3 3 3 44 2222 777 4 777 777 4 111 3 3 7777 3 3 3 3 44 3 3 7777 3 3 66 888 0 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 333 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . . .. . .. . . .. ......... . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ... . . . . .. .. ....... .. . . ... ................................. ... . . .. ... .. .................... . . .. . . .... ................................................................ . ....... . . .... ....... ............... . .. . . .......................... . .. . .................................................................................... .. ..... .... ..... . . ... .... ........... . ...... ... ... . . .. . . . . . .. .... ... . ... ... . ... . . .... . . . . .. . . .... . . .. ... . ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... ... . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 3 66 2 22 1 3 22 000000000 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 444 6 0 6 0 55 00 0000000 11 4 4 888 222222222222222222222222222222222 222 4 4 11 888 22 33333333333333333333 4 6 00 0 0 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 6666666 0 6 4444 3333333 777777777777777 6 00 3 3 66666666666666666666666666 0 66 6 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 66666 7777 66666 3 3 444 5555 00000000000 9 111111 888 777 7 3 99 9 9 1 1 1 66 4444 000 0 000 000 0 000 3 3 1111 3 3 3 3 66 3 3 1111 3 6 22 000 9 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 555 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACGGG--TGTGTGAG-TACAGTGA--------------AGA-----GT--GAAG----T-A---T--------TAG--TAA------AT-T--TNAT-A-------AG-GACA---G-AGT----GCNA--GAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGG--TGTGTGAG-TACAGTGA--------------AGA-----GT--GAAG---GT-A---T--------TAG--TAA------AT-T--TNAT-A-------AG-GACA---G-AGT----GCNA--GAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA--CAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGCCT------TA---TTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-T-GAGAACCAG--ATCAGGA-GGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT---T---------GT--ATGATAAAGGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--G-ATC-GTG-GTTG---ATA-GATCATATAACAGAGAAGAGGGAG--TATCCTCGCT-G-G-G--GC------G----------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTTCAG---------------AGCAGGGAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GA-GCGACGGA--TGTGTGAGTTACAGTGA--------------GAA-----GT------------------------------TAA------AT-A--TCAT-A-------AT-GACA---GAAGT----GCCT--GAATA-C-AG-GAAG--CG----ATGTGTGA-ATCAA--------AAACATATCAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttca--GAGTAACATG-AAAA---G----AGGTGTG---TGAAG-ATAACGAAAAATGTCAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : AAG--TGTAGAATGTGTGAGATAAA-----AAGAAACATGTCAG-AA------GA--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAA-TAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGG--TGTGTAAG-GACAGTGA--------------AAA------C--AAA-----C-A---T--------TTG--TA--------T-T--TAAG-A-------A---ACA---G-AGT----GCCA--GGGTA-CAAG-AAAC--TG----ATTTGTGAGAT-------AAAGAAACAT--------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATC---A-GTGATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGTTAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgAACATAGAACAGAGAAT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAG--G------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTG-TCATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAA-CAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA---G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTG-TCTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGTCAG---------------A-TAGGGAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGTGTGAG-TGTATTAA-------------------------------------------------TAG--CAA------A------AATGA-------AGTGGCA---G-A--------TA--GAGAC-CAGG-AAAGGATG----ATGTGT----T--AG-ATACAGAAACAGGTCAG-AA------GGT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGA--TGTATGAG-TACAGTG---------------AGA-----GT--AAAG------A---T--------CGG--T---------T-TGATCGT-G-------AG-TACA---A-AAT----GCAA--AAGTA-CAAG-AGAA--AG----ATGTGTGAGATAAAG-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : AG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAG--A------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAAC-AAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAG--AGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACC---A-GT--GGGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATATCT---------ATTCATG-T-GGGTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTATGATCA--GTATAAACATGG----GAG-AG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGTTAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGGAAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGG--TGTGTGAG-TACAGTG---------------AGA-----GT--GGA----GT-A---T--------TAC--T-A------AT-T--GGAT----------G-GACAATTG-AAT----G-----AAGTA-CAAGCGAAGT-TG----A-GTGTGAGATAAAGCATAACG----ATGTCCG--A------GAT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GT-ATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATC---ATGTG-GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-AAGGGAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGG--T
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : -GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : gttACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAAT-AAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAG--G------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTG-TCTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATG---A-AGGAGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT---T---------G----------------------AATAAT---TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA-TT-TATTGA--AT-----CATAGATC---GAGG-TTGA-----TCCT-CCTGG-G-----CG-----G-------------------GCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGATAG---------------A-CAGGGAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGG--TGTGTAAG-TACAGTGA--------------GG-----------------------------------G--TAA------AT-T--TTCC-A-------AA-GACA---T-AGT----GCAA--AAGTA-CAAG-CAAG--TG----ATGTGCGAGAT-------AAAGAAACATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-G-TAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaA--------------------------CGAGA-GAGAGA--TGTGTGA-----AATAA--------------AGAAACATGTCAGAAG---AC-A---C--------TA---TAG------TTCT--TGAT-AGAATTGTAG-G------G-AGTTGTTGTTACTGAGTA--AAA-AGAG--AG----ATATGT---ATGA-G-ATAAAGAAACATGTTAG-AA------TAC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGT-ACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAAC-AAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-AA----------------G--G------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACTG-A-----GGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATA---A-GGAATACAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT---T---------GC--ATGAT-AAGTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGG-ATATGTTGAACATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAG--AGTGTGAG-TACAGTGATGGCGTGGCGACG-GGT-----GT--GCAA---GT-ACGGT--------GAG--TAA------AT-T--TGAT-A-------AG-GACA---A-AGT----GCCA--AAGTA-CAAG-AGAC--TG----ATGTGTGAGATAAAGAATAAAGAAACATGTCAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAAC-AAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCG--G------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTG-TCTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT-----------------------A-GAGAGGGAGAT-T-------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT---T---------TT--AT---------C-A-T------AAG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGG-G------------A-GATC-TA---CTGAGATA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGTTAG-------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGG--TGTGTGAA-TACAGT-A--------------AGA-----GT--GAAG------A---T--------TGGTATAG------AT-G--TT-----------AG-TACA---A-AGT----GAAG--AAGTA-CAAG-AAAG--CG----ATGTGTG------AG-GTAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAA--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GTGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT---TTTATCCGTGGT--ATTAT-ATGTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTATGTTGA--A------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGA--TGTGTAAG-TACAGTAAAGATTGGTATGATGAGA-----GT--GAGGACAGTGA---TAGTGAGGACAG--TAAGATGGTAT-T--TCAT-A-------AG-TTCA---G-TGT----GCCA--CAGTA-CAAG-GAAA--TG----ATGTGTGAGATAAAG-A-ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAAC-AAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAG--G------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTG-TCTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATC---A-GTGAGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT---T-------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---ATGTT-A--AT-----CACAGAGCGGAGAAG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGTTAG---------------A-CAGAGAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTG--TGTGCGAG-TACAAT-A--------------ATA-----GT--GAA-----T-A---T--------T------C------CT-T--TGAA-A-------AA-AAAA---G-AGT----GAAA--GAATA-CAAG-AAAG--TG----TTATGCG------AG-ATCAAGAAACACGTCAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACC---A-GTTGGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATAGT-AAGTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTG----TT-GATCATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--C------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTG-TCTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GGGAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GT---TTG---ATA-G-ACATATAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCT
blockSeqs : . A TTTT TT AT T T T TTG A T . TT T GC G . CT AGTTATT . T T . . GATCAGA GCTGGAGTTGAAA GTAGGGA G C T ATGTGGT . . CC . T CA . A GGATAGACTATTG . GTTA TTG G T . TC . T T T G . AT CGTGTGT . . A ATC TTATCCGTGGTATTATATGTACAATGATG TGT . T . TAC GG GATATGTTGAACATAGAA A . TT . A CGGT GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAGTAGTGGTGGGGC T TAATGA G . C TAGNTG TAGAGTTGTTGGGTA . AC G . GGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGA T TA . AAAGATTGGTATGATGAGAGTGAGGACAGTGATAGTGAGGACAGTAAGATGGTATTTCATA TG ATTG TGTT TTACT A C GAT TAGA AGATAAAGCAT T TAAGGG AT AAG T G TC T C C C C TA TCC CAT T TTA CGA T NNN . T ATAG T T . A AG . T TTTT C T AA CTG TG A CGCA TT TT AT TAA TT T GGAATTTGAT T C . TT T C A CGTCT AA C T C . . TTA GG AGGTGCGGATTAGGGATATCACGAGTAAGGC A AGAAT T AA A .
blockSeqs : . . . C . . T . . . . . . . G . . T G . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . GGG . . . . . . T . . . . . . . . . ATTCATGTGGGTACTCTGATG . . . . . CA GTATGATCAGTATAAA A . . . . G TCAATGTCAGGGTGAGGAATAGAGTATGGC A TAAGA A . . TT . . . . . . T . . GATGGCGTGGCGACGGGTGTGCAAGTACGGTGAGTAAATTTGATA T G . CCA . . TT . AGATAAAGAAT . . GA . . A . . . . . . . GC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G TA GT . . T T . TA . . . . . . . . T A TTAA AT C . . . . . . TAGTACNNNNNNN N . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A . . . . . . . C . . T G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . T . . . . . . . . . GCATGATAAGTACAGTGATG . . . . . . GGTATACTGTTGAT A . . . . G GGGGCAGATG T TATA G . . A . . . . . . G . . AAAGAAACATGTCAGAAGACACTATAGTTCTTGATAGAATTGT G G . CAA . . T . AGATAAAGA . . A . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . T T . TG . . . . . . . . A G TCT AC C . . . . . . GAGTTCAAGAG T . . . . .
blockSeqs : . . . T . . T . . . . . . . G . . T A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . . . G . . . . . . . . . GTATAGTAAGTACAGTGATT . . . . . . GAGTATGTTGAA T . . . . A GGGGCGGATG T TAGA G . . T . . . . . . G . . GAGAGTAAAGATCGGTTTGATCGTG G A . CAA . . T . TGAAGAT . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . T T . TA . . . . . . . . C A TTT G . . . .
blockSeqs : . . . T . . A . . . . . . . G . . C G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TTT . . . . . . G . . . . . . . . . GTATGATAAGGACAAAA . . . . . . ATTTATTGAAT A . . . . G GGGACGGATG T TAGA G . . T . . . . . . T . . GAGAGTGGAGTATTACTAATTGGAT G T . CCA . . A . AGATAAA . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . T T . TA . . . . . . . . . . TCT A . . .
blockSeqs : . . . T . . T . . . . . . . G . . A G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TTC . . . . . . A . . . . . . . . . TTATCAT . . . . . . GGTTTGATAGA G . . . . G GGCGTAAA T TAGG T . . T . . . . . . T . . AAGAGTGAAGATTGGTATAGATGTT G G . AAG . . T . ATGAGAT . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A . . . . . . . G . . T G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TGG . . . . . . T . . . . . . . . . GA . . . . . . GATGTTAAT A . . . . . A TAGA T . . T . . . . . . A . . GAAAACAAACATTTGTATTTAAGA T A . CCA . . A . TAGAT . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . T . . . . . . . G . . T G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . GGAGAT A . . . A . T . . G . . . . . . G . . AATAGTGAATATTCCTTTGAAA T A . AAA . . T . AGAT . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . G . . A . . . . . . . C . . C G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . T . . T . . . . . . A . . GAGGGTAAATTTTCCA A G . TA . . C . AGAT . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . C . . C G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . A . . . . . . G . . AATAGCAAAAATGA . G . . . . T . AGGT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . T . AGAT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : G******** ***** ** ** *** ** ** ** GTATNATAGTACATGATG*************** *** ** GAGTATGTTGAA******** TAGA*** **** G**** AGAT******* ****** A*** *** TA** **** TCT**** AN* **
originalCons : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---T---------GT--ATGAT-AAGTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTATGTTGA--ATA-GAACATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACGGG--TGTGTGAG-TACAGTGA--------------AGA-----GT--GAAG----T-A---T--------TAG--TAA------AT-T--TNAT-A-------AG-GACA---G-AGT----GCNA--GAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGATAAAG-ATAAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GT-A-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
finalCons : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAGG--------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT---TGTATNATAGTACATGATG---------------ATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATGAGTATGTTGAA--------CATAGAACAGAGAAG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTTAGA---CAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGTTAG---------------A-CAGGGAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACGGG--TGTGTGAG-TACAGTGA--------------AGA-----GT--GAAG----T-A---T--------TAG--TAA------AT-T--TNAT-A-------AG-GACAG----AGT----GCNA--GAGTA-CAAG-AAAG--TG----ATGTGTGAGAT-------AAAGAAACATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA---GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AGTA--CA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACACTCT----GTAN-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 1111111 1111111111111 1111111 1 1111111 11111 2222222222222 11 1111111 777777777777777777777777777777777777777777 11 3333333 11111111111111 1111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 22222222222222222 1111111 33333333333333333333333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 1111 111 111 1111 2222222222 1 1111 1 11 1 111 11 66666666666666666666666666666666666 22222 1 11 1 1
lowQualScore : 3 3 7777 55 0 55 3 4 3 666 3 3 3 44 6 33 3 3 44 111111111 3 3 3 3 3 0000000 8888888888888 0000000 1 3 0 1111111 3 3 66 00000 4 55 4 4 2222222222222 55 8888 666 3 3 55 55 666 3 1 3 4 55 11 3333333 66 4 4 4 666666666666666666666666666666666666666666 4 4 66 777 22 1 1111111 88888888888888 1 3 3 3 55 4 5 0000 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 9999999 1 3 9999 8888888 44 22222222222222222 0000000 44 3 3 44444444444444444444444444 2 99999 3 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 55 1 8888888 77777 33 3 3 3 33 2 66 6666 33 2 8888888 33 2 2 555 66 2 000000 3333 666 2 5 33 2 2 2 2 2 44 0 0000 666 3 666 666 3 000 3 3 6666 3 3 33 3 44 3 3 6666 3 3 77 666 555 4 0000 0 88 55 66 9999 77 5 5555555555 3 6 4444 99 6 5 5 9999999 4 6 5 5 11 0 0 0 777 33 99999999999999999999999999999999999 1 55555 0 33 0 0
lowQualScore : . . .... .. . .. . . . ... . . . .. . .. . . .. ......... . . . . . ....... ............. ....... . . . ....... . . .. ..... . .. . . ............. .. .... ... . . .. .. ... . . . . .. .. ....... .. . . . .......................................... . . .. ... .. . ....... .............. . . . . .. . . .... ................................................................ . ....... . . .... ....... .. ................. ....... .. . . .......................... . ..... . .................................................................. .. . ....... ..... .. . . . .. . .. .... .. . ....... .. . . ... .. . ...... .... ... . . .. . . . . . .. . .... ... . ... ... . ... . . .... . . .. . .. . . .... . . .. ... ... . .... . .. .. .. .... .. . .......... . . .... .. . . . ....... . . . . .. . . . ... .. ................................... . ..... . .. . .
lowQualScore : 6 6 7777 00 2 00 6 5 6 444 6 3 3 66 2 22 1 3 22 000000000 3 3 3 3 3 8888888 3333333333333 8888888 0 6 9 8888888 6 6 11 00000 0 55 0 0 0000000000000 55 5555 888 6 6 00 00 444 6 0 6 0 55 00 0000000 11 4 4 4 444444444444444444444444444444444444444444 4 4 11 888 22 0 1111111 22222222222222 4 6 6 6 00 0 0 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 6666666 0 3 6666 7777777 66 66666666666666666 8888888 66 1 1 66666666666666666666666666 7 11111 6 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 0 0000000 66666 66 1 1 1 99 9 88 1111 99 7 7777777 77 7 9 000 88 7 333333 9999 999 5 0 77 7 7 9 9 9 22 5 5555 444 6 444 444 6 000 1 1 5555 1 1 99 1 22 1 1 5555 1 3 22 444 333 4 6666 4 22 11 99 1111 99 7 0000000000 3 7 2222 22 7 2 7 5555555 0 7 7 7 00 8 8 0 555 88 00000000000000000000000000000000000 0 00000 0 88 0 0
consensus : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT-T---------GTA-TNATA--A-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATG-GTA---TGTT-------GA-A---CATAGAACA-GAGA-AG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGT--TAG---------------A-CAGG-------GAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACNGGTGTGTG-----AG-TACAG-------TGA----------A-GAGTG---A----AGT-A---T--------TAGTA--A------ATT--TNAT-AAG-GACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAA-G-A--AA-G--CG----AT--GTGTGA-G-------ATAAA--G-A-A---AC--ATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GTA-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
Reference ( family-178 ) : ACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCGGG--TT-GTTGATNTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGG-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTNA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAANTNGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GNGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT-T---------GTA-TNAT---A-GTAC-A-TGATGATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAATGAGTA---TGTT-------GA-A---CATAGAACA-GAGA-AG-GTGAG--TATCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G----------------AGGGCGAGG-----TAT------AGAG---TA-T-----GGCTCNGTGTT-A--GACAGGGNGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-T-----GTGT--TAG---------------A-CAGG-------GAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGGCGACGGGTGTGTG-----AG-TACAG-------TGA----------A-GAGTG---A----AGT-A---T--------TAGTA--A------ATT--TNAT-AAG-GACA---G-AGTGCNAGAGTA-CAA-G-A--AA-G--TG----AT--GTGTGA-G-------ATAAA--G-A-A---AC--ATGTCAG-AA------GAC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-AT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GTANTAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-A-------C--ACG-AG------AGANGTGT-----GTG-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|1 : ACAGGTGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCT-ATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAACAAAA--CAAGATATTGTGAAATACCTAATAGCAGA-CACA-AAATAAAATACAC-TCCAGCCT------TA---TTCCTGCGAAATG-AA-CATTTTTCTTAACTGTTCTGGTAGA-------CAT--------------AACCA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGAGCA-------GCTAGGGCATGATGT--AGCGTCTGCGTGACAG-AGAAATC--AGATGTGGT-GTA-------------TCGAGA----TAAAAGAGGG-GATTTG-T-GAGAACCAG--ATCAGGA-GGAAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAAACACATCTGATTTG-------TGTGTGGGTCTGGATTGGTC-ACCATGCCAAT-ACAGT-T---------GTA-TGATAA-A-GGAC-A--AAAAATAAGA--TCTGCATGTGAGATTTCTGTT--TATACTAACTTGTTGA---T--GATCGTG------GTT-------GATAGATCATATAACA-GAGA-AGAGGGAG--TATCCTCGCT-G-G-G--GC------G----------------AGGGTGCGG----------------------A-C-----G--TCAATGT-------CAGGGTGATGGTATAGAGAGAGGTCATGACAC-T-----GTTT--CAG---------------AGCAGG-------GAGGGTGTG--TCT-TT-CGTAGAGAGGA---------------------------GA-GCGACGGATGTGTG-----AGTTACAG-------TGA----------------G---A----AGT-----------------TA--A------ATA--TCAT-AAT-GACA---GAAGTGCCTGAATA-C-A-G-G--AA-G--CG----AT--GTGTGA---------ATCAA----A-A---AC--ATATCAG-AAG-----GAC-A-C---TCTGTA-ATGTC-CCT--G-A-TAG--A-TT-GT--AGAA--AGGA---TGTTG-T---TAATG---AA-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGAATA-C----ACAGAAA-CA-TGGT-CA--GTAA-GA----CACT-CTG-T-ATTG-AGTCCCTGC-T-AATATAG-T----A-AGAGATGTT--TTAC-TG--AGCT-ACA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GATTATCAAA--GACATTTG-TCAGAAGCACAC---CT--GTA-TAGTCCC-TGA-TAGAATTGGTTAGAGAGATGTTGGT---TA--CT-------GAGTAA-------C--ATGAAA------AGAGGTGT-----GTG-AAGATAAC--GAAAAATGT-CAGTAAG
gi|1 : gagagggttcttatttcaGAGTAACAT-G-A--AAAG--AG----GT--GTGTGAAG-------ATAAC--G-A-A---AA--ATGTCAGTAA------GAC-ATC---TCTGTGTTAGTTGCAT--G-ACTAGACA-TT-Gacatctctgtgttagttgcatgactagacattgcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : gagagggttcttatttcaacaggtgaagtgtctagtggaatatggagctattgggttcctcggtttgttgatatcaatctgtcagcagtatatacagcattaatactgaacaaaacaagatattgtgaaatacctaatagcagacacaaaataaaatacactccagccttattcctgcgaaatgaacatttttcttaactgttctggtagacataaccatgctggagttaaaacagagcagctagggcatgatgtagcgtctgcgtgacagagaaatcagatgtggtgtatcgagataaaagaggggatttgtgagaaccagatcaggaggaagggaggcggtgatgtactgaaacacatctgatttgtgtgtgggtctggattggtcaccatgccaatacagttgtatgataaaggacaaaaaataagatctgcatgtgagatttctgtttatactaacttgttgatgatcgtggttgatagatcatataacagagaagagggagtatcctcgctggggcgagggtgcggacgtcaatgtcagggtgatggtatagagagaggtcatgacactgtttcagagcagggagggtgtgtctttcgtagagaggagagcgacggatgtgtgagttacagtgagaagttaaatatcataatgacagaagtgcctgaatacaggaagcgatgtgtgaatcaaaaacatatcagaaggacactctgtaatgtccctgatagattgtagaaaggatgttgttaatgaatacaagagagagatgtgtgaatacacagaaacatggtcagtaagacactctgtattgagtccctgctaatatagtaagagatgttttactgagctacaagagagagatgttgtgagattatcaaagacatttgtcagaagcacacctgtatagtccctgatagaattggttagagagatgttggttactC-TGA-TAAATTTG--TAG-GATTTGTT-GT---TAGGCTAGGTGCGGATT-AGGGATATC--ACG-AGTAAGGCAGAAGTGTAGAATGTGTGAGATAAAAAGAAACATGT-CAG-AAGcgttacaatttatgataccccaacatagttctctctcgtagcgaactccacttgtgtttaatcagtg
gi|10 : --AA-G--TGTAGAAT--GTGTGA-G-------ATAAAAAG-A-A---AC--ATGTCAG-AA------GA--A-C---TATGTA-TAGTC-CCT--ATG-TAGA-A-TT-GT--TAAG--A-GACATTGTTG-T---TACTGCGAAG-TAC---AAGAGAGAGATGTGT-AG-A-TATAGAAAGAAA--A-T-GT-CA--G-AA-G------ACT-CTG-T--TCTGAGTCCCTGA-TGAGAATTG-T----AGAGAT-TGTTG-TTACTTG--AG-T--CA--A-GAGAGA----------GATGTTGTGA-GAT----AAA--GAAACATG-T--GAAGAACAT--TCT--GTAATAGT-CC-TAA-TAaactatgtatagtccctatgtagaattgttaagagacattgttgttactgcgaagtacaagagagagatgtgtagatatagaaagaaaatgtcagaagactctgttctgagtccctgatgagaattgtagagattgttgttacttgagtcaagagagagatgttgtgagataaagaaacatgtgaagaacattctgtaatagtcctaatactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : ctgataaatttgtaggatttgttgttaggctaggtgcggattagggatatcacgagtaaggcagGAGGA-GGTATAGAGAG----TATTGCTC-T-----GTGTTATAA---------------AGTAGGAGGTATAGAGAGTATG--GCCNNN-N-NNNNNNNNN--------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NN-NNNNN-------NNN----------N-NNNNN---N----NNN-N---N--------NNNNN--N------NNN--NNNN-NNN-NNNN---N-TGTTCTAGAG----AG-G-ATGAG-G--CG----ACTGGTGTG-----------TAAG--G-A------C--A-GTGAA-AA------CAA-A-CA--TTTGTA-T-------T--T-A--AGA-A--------ACAG--A-G-------TG-C---CA--G---GG-TAC---AAGAAACTGATTTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T---------------------CT-CTG-T-TT---AGTCctttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatactttaatgaatgccccacacatctctctcgttgggtctccact
gi|11 : GAGG-----TAT------AGAGAG-TA-T-----TGCTCTGTGTT-A--TAAAGTAGGA-GGTATAGAGAG----TATGGC
gi|11 : gagTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------TGAGGCGACTGGTGTGTA-----AG-GACAG-------TGA----------A-AAC-----A----AAC-A---T--------TTGTA----------TT--TAAG-AA---ACA---G-AGTGCCAGGGTA-CAA-G-A--AA-C--TG----AT--TTGTGA-G-------ATAAA--G-A-A---AC--AT--------------------C---TCTGTT-TAGTC-cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttctagagaggatgaggcgactggtgtgtaaggacagtgaaaacaaacatttgtatttaagaaacagagtgccagggtacaagaaactgatttgtgagataaagaaacatctctgtttagtc
gi|12 : gaggaggtatagagagtattgctctgtgttataaagtaggaggtatagagagtatggccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGGA-TATTTG-TGGGAGAC--A--ATC---A-GTGATGGAGAC-TG
gi|12 : GA-----TAG------AGAG---TA-T-----GACTCAGTGTT-A--GACAGGGAG--GGTGT-----G----TCTG-TTC-TAGNTGGTGT--TAA---------------A-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtATAGAGAG----TATGACTC-A-----GTGT--TAG---------------A-CAGG-------GAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGtagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|12 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtg---TGTT-------AA-A---CATAGAACA-GAGA-AT-GTGAG--TTTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGntggtgttaaacatagaacagagaatgtgagtttcctgctgggggcgggggcggacgtcaatgt
gi|13 : ttggatatttgtgggagacaatcagtgatggagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatagagagtatgactcagtgttagacagggagggtgtgtctgttctagntggACAG-TAAAA-TGTGT----AGTGGAACATTTAGCTGACTC-GGTTATTCAGG--TT-GTCAATTTTAATGT-TTCAGCA---ATATA-TTCAGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTAAATTATCTCATG-CAGG-AACA-CAATCAAAT-CAT-TCTAG--G------TAAAGTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-CTAACTG-TCATGTGGA-------CAT-------------CAGATA-------TACTGGTGTGA-AAACAGA-CA-------G-T-----ATGATGgacgtcaatgt
gi|14 : gggttctctatcaACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGAT-TCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATACT-GAAA-CAA--CCAGATATAGTGAAA-ATCTCATA-CAGC-AAC--AAATAAAAT-CAT-TCCA---G------TCAATTGACTG-GAAATGTTA-CACCTA--TTAACTG-TCTGGTGAA-------GAT-------------CAGACA-------Ta
gi|15 : gggttctttatcaATAATTT-T-----GTGT--CAG---------------A-TAGG-------GAGGGTA-G--TCCGCT-C-TGAAGAGGA--------------------------CGTGGTAACTTGTATGTG--------------------TGA--------------GTG---T----ATT-A---A--------TAGCA--A------A-----AATGAAGTGGCA---G-A----TAGAGAC-CAG-G-A--AA-GGATG----AT--GTGTTA-G-------ATACA--G-A-A---AC--AGGTCAG-AA------GGT-T-C---GCATTT-TAGTC-TTT--G-A-T--A-A-TT-GT--
gi|16 : accAGG-------GAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACGGATGTATG-----AG-TACAG-------TG-----------A-GAGTA---A----AG--A---T--------CGGT-----------TTGATCGT-GAG-TACA---A-AATGCAAAAGTA-CAA-G-A--GA-A--AG----AT--GTGTGA-G-------ATAAA--G-
gi|17 : GAGGTGTGTGAG-A-T----AACGAAA-AA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-GT---AGTTCATGA-T-AGAATTG-
gi|18 : A-G-------ATAAA--G-A-A---AC--ATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTCTA-TAATA-TCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-TA---TAACG-T---TATTG---AG-TAC---AAGAGAGAGATGTGTGGA-A-T----AAAGAAA-CA-T-CT-CA--G-AA-GA----CACT-CTG-T-cgtacaatttaatgaataccccacatatctctctcgttgcgactccacttgtgtttaatagt
gi|19 : CATG-CAGG-AACA-CAATAAAAT-CAT-TCTAG--A------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTGT-CTAACTG-TCTGGTGGA-------CAT-------------CAGACC-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGA
gi|2 : ACAG-TGAAAATGTCTTTTTAGTGGAACATGGAGCTGACTTTGGTTACTCGGG--TTTGTTGATTTCAATTTTGTCATCATTGGTATAATACAGCATTAATATTTGAAC-AAATTCAACATATAGTGAAATATCTCACATCAAGCAACAGAAATAAAAT-CAC-TCCAG--AGTTATTTAGGATTACTG-GAAATG-TATCACCTAT-ATTACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CAGACA-------TGCTGGAGTAA-AAACAGATCA-------G-TAGGG-ATGATGTCCGGTG-----GTGACAGTTCAGATCCAAG-TGTGGTAGTAGGATAGACTATTGT--GGAGTTATAGATTGGGAGGGTTTGTTGGTGGAC--ATCACC---A-GT--GGGAGACTTGTGGATGTACTGAG--ACATCTGATCTGCGTGTGTTGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGATAACAATAT---------CTATTCATGTGG-GTACTC-TGATGATAAGTGTTCTG-ATGTG-GACCTCT-TTGTTATAC--AC-GAGTGA---TGGGAAT--GTA---TGAT-------CA-G---TATA-AACATGGGAGAG-GTGAGTTTATCCT-GCTGG-GCGGTGCG-----GACGTCTAATTTTGTCAAGGGTGAGGGATGTTATTATACAAGAG---TAGTGGTGGGGCTCTGTGTTAA--GACTGGAGGA--GTATATAGAGC---TAT-ACTC-T-----GTGT--TAGTAGAGTTGTTGGGTAA-TAGG-------AAAAGTATGACTCTGTTGT-TAGACAGGAGGGTTGTGATCTGTTCTATAGAGGGACGAGGCGACGGGTGTGTG-----AG-TACAG-------TG-----------A-GAGTG---G----AGT-A---T--------TACT---A------ATT--GGAT---G-GACAATTG-AATG---AAGTA-CAA-GCG--AA-GT-TG----A---GTGTGA-G-------ATAAA--GCATA---ACG-ATGTCCG--A------GAT---C---T-TGTA-TAGTC-CCTTCG-A-TAGA-ACTT-GCTAAGAG--GCGA---TGTTGTT---TACTG---AGTTACT--AAGAGTGAGA-GTGTGAG-ATT----AAAGAAATCATT-GT-CA--G-AC-AATTTTCACTCCTGTT-TT---AGT-CCTGA-T-AGAATTGAT----TGAGAGATGTTGTTTAC--G--AG-T-ACATTA-GAGAGGGGAATTTGATGATG-TTTGA-GAT----AAATTTAAACATGTTCAGAAGACCTTCGTCT--GTATTAGTCCCTTGA-TA
gi|20 : gggtctttatttcaG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----AAAGGGGGGG-GATTTG-TGGAGTAA--A--ATC---ATGTG-GGGAGAC-TGT-AGTGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCT
gi|21 : TCTGTGTT-A--GACAGGAGGA-GGTATAGAGTG----GATGACTC-T-----GTGT--TAG---------------A-AAGG-------GAGACGGTT--TCTGTT-C-TAGAGAGGA--------------------------CCAGGCGACTGGT
gi|22 : GAGG-----TAT------AGAGAGCT--T-----GACTCTGGGTT-A--GGCAGGAGGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-
gi|23 : gGCATTAATACT-GAAC-AAA--CCAGATGTAGTGAGTTATCTCATA-CAGG-AACA-
gi|24 : CAG-AA------GGC-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAGA-T-TT-GT--A
gi|25 : GTT-------GA-A---CATAGAACA-GAGA-AG-GTGAG--TATGCT-GCTG
gi|3 : ACAG-TGAAA-TATCT----TGTGGAACATGGAGCTGAATT-CAGTACTCATG--TT-GTTGATATCGATGT-GTCAGCA---GTATA-CAGAGCATTAGTGCT-GAAT-AAA--CGAGATATAGTGAAATATCTAATA-CAGG-TACA-AAATGAAAC-CAA-TCCAG--G------TCAATTTGATG-GACATG-TT-CATCTAT-TTAACTG-TCTAGTGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGCTGGCGTGA-AAAGAGA-CA-------G-TGGTG-ATGACGT--GGTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGGA-TATTTG-TGGGGAGC--A--ATG---A-AGGAGGGAGAC-TGC-AATCTACTGAG--ACATTTG--GTG-------TATGTGGGTCTGGAT--GTAAATCA-GTCCAT-TCAGT-T---------GAA-TAAT-------------------------TCTG-ATGCGAGACCTCTGTTG-TATAC--ACTG---GA---T--GAATA--TT---TATT-------GA-AT--CATAGATC----GA-GG-TTGA-----TCCT-CCTGG-G-----CG-----G-------------------GCG----------T------AAA--------------------CGTT-AATGACAGGGTGA-GGTATAGAGAG----TATGATTC-T-----GCGA--TAG---------------A-CAGG-------GAGGGCGTG--TCTATT-C-TAGAGAGGA--------------------------CGAGACGACTGGTGTGTA-----AG-TACAG-------TGA----------G-G-------------------------------GTA--A------ATT--TTCC-AAA-GACA---T-AGTGCAAAAGTA-CAA-G-C--AA-G--TG----AT--GTGCGA-G-------ATAAA--G-A-A---AC--ATGTCAG-AA------GAT-A-C---TCTGTA-TAGTC-CCT--G-A-TAAA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AA-CAC---GAGAGAGAGATGTGTGAA-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CAC------T-AT---AGTTCTTGA-T-AGAATTG-T----AGGGAGTTGTTG-TTAC-TG--AG-TAAAA--A-GAGAGA----------TATG-TATGA-GAT----AAA--GAAACATG-TTAGAAT-ACAC--TTT--GT-GTAGCCCT-TGA-TAGAATTG--T--AGAGATGTT-ACTTATA--CT-------TAGT-A-------CNNNNN-NN------NNNNNNNN-----NNN-NNNNNNNN--NNAACATGTACAG-AA
gi|3 : gtaagaaagtgtcccttatcaGAGTA-AAAAG-A--GA-G--AT----AT--GTATGA-G-------ATAAA--G-A-A---AC--ATGTTAG-AA------TAC-A-C---TTTGTG-TAGCC-CTT--G-A-TAGA-A-TT-GT----AG--A-GA---TGTTA-CTTATACTT---AG-TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-N----NNNNNAA-CA-T-GTACA--G-AATGA----CACT-CTG-CAATTA-AGTCCCTGAGT-AAAATTG-T----AGA-AGATGTTA--TAC-TGATAC-T-GCA--ATGGAAGG----------GATG-CGTGACGAT----GAA--GAAACACC-TAGGAACGACAC--T-TAAGTACTAAT-CG-TGACTGAAATTG--TAGATATGTGTtgacactctgcaattaagtccctgagtaaaattgtagaagatgttatactgatactgcaatggaagggatgcgtgacgatgaagaaacacctaggaacgacacttaagtactaatcgtgactgaaattgtagatatgtgt
gi|4 : gtaagaaagtgtcccttatcaacagtgaaatatcttgtggaacatggagctgaattcagtactcatgttgttgatatcgatgtgtcagcagtatacagagcattagtgctgaataaacgagatatagtgaaatatctaatacaggtacaaaatgaaaccaatccaggtcaatttgatggacatgttcatctatttaactgtctagtggacatcaggcatgctggcgtgaaaagagacagtggtgatgacgtggtggtgacagacagatcagtgtggtgtatggatgaatttggatatttgtggggagcaatgaaggagggagactgcaatctactgagacatttggtgtatgtgggtctggatgtaaatcagtccattcagttgaataattctgatgcgagacctctgttgtatacactggatgaatatttattgaatcatagatcgaggttgatcctcctgggcgggcgtaaacgttaatgacagggtgaggtatagagagtatgattctgcgatagacagggagggcgtgtctattctagagaggacgagacgactggtgtgtaagtacagtgagggtaaattttccaaagacatagtgcaaaagtacaagcaagtgatgtgcgagataaagaaacatgtcagaagatactctgtatagtccctgataaaattgtagagagatgttgttactgaacacgagagagagatgtgtgaaataaagaaacatgtcagaagacactatagttcttgatagaattgtagggagttgttgttactATAG-TGAAA-TGTCT----AGAGGAACATAGAGCTGACTT-GGTAAATCAAG--TT-GTCGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAAGACT-GAAC-AAA--CGAGATATAGGGAAATATCTTATA-CAGG-AGCA-A----------------AG--G------TAACTTTACTG-GGAATG-TA-CAC--------ACT------GAGGA-------CAT-------------CAGGCA-------TGGTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATAATGT--GATG-----GTGACAG-ACAGACC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAAAGTTGGA-TATTTG-TGGAAGAC--A--ATA---A-GGAATACAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAA--GTCAATCA-GTTGAT-ACAGT-T---------GCA-TGATA--A-GTAC-AGTGATGATAAG---TCTG-ATGTGTGACCTCTGTTG-CATAT--ACTAATTGG---T--GAAGGA-TA---TGTTGAACATAGA-A---CATAGAACA-GAGA-AG-GTGAG--TATCCT-GCTGGAA-G--ACGTCAATGTC--------------AGGGTGAGG-----AAT------AGAG---TA-T-----GGCTCTGTGTT-A--GACATGATGA-GGTATAGAGAG----TATAACTCTT-----ATGT--TAG---------------A-CAGG-------GAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGAGAGTGTG-----AG-TACAG-------TGATGGCGTGGCGACGGGTGTGCA----AGT-ACGGT--------GAGTA--A------ATT--TGAT-AAG-GACA---A-AGTGCCAAAGTA-CAA-G-A--GA-C--TG----AT--GTGTGA-GATAAAGAATAAA--G-A-A---AC--ATGTCAG-AG------GAC-A-C---TCTGTA-TATTC-CCA--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAG--A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGACTGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AG-GA----CACT-CTG-T-AT----GTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG--TAC-TG--AG-T-ACA--A-GAGAGA----------GATG-TGTGA-TA-----AAA--GAAACATG-TCAGAAGAACAC--TCT--GTA-TAGTCCC-TGA-TAGAATTG--TAGAGAGATGTT-GT---TA--CT-------GAGT-T-------C--AAG-AG------AGATATGT-----ATT-GAGATAAA--GAAACATGT-CAG-AAG
gi|5 : CAG-TAAAA-TGTTT----AGTGGAACATTGACCTGACTT-GGTTACTCAGG--AT-GTTGATATCACTGT-GTCGGCA---ATATA-TACAGCATTCAAACT-GAAC-AAA--CCAGATAAAGTGAAATATCTTGTA-TAGG-ATCA-AAATAAA-T-CTT-TCCCG--G------TAAATGTACTA-GAAATG-TA-CAACTGT-TCAATTG-TCTG-------------------------------ACA-------TGCTGGAGTTA-GAACGGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAA-ACAGATC--AC-TGTGGT-GTA-------------T--G-----------------GAT-----------------------A-GAGAGGGAGAT-T-------TACTGAG--ACATTTG--TTG-------TTTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTTGAT-ACAAT-T---------TTA-TCAT---A----------------AG---TCTG-ATGTAAGACCTCTGTTG-TATAA--ACTGATTGA---T--GAAGGGAGA---TCT---------------------ACT-GAGA-TA-GTTAG--TGTACT-TCTGG-G-A--GCG-----G-----------------GGGC--------------------AG----A-T-----G--TCAATGT-------CAGTGTGA-GGTATAGAGAG----TATGACTC-G-----GTGT--TAG--------------------------------GTGTG--TCTGTT-C-TAGAGAGAA--------------------------CAAGGCGACAGGTGTGTG-----AA-TACAG-------T-A----------A-GAGTG---A----AG--A---T--------TGGTATAG------ATG--TTA----G-TACA---A-AGTGAAGAAGTA-CAA-G-A--AA-G--CG----AT--GTGTGA-G-------GTAAA--G-A-A---AC--ATGTCAG-AA------GAC-A-A---TCGGAA-TAGTC-CCT--G-A-
gi|5 : GTGTGAG-A-T----AAAGACA-CA-T-GT-CT--G-AA-GA----CA---------AT---AGTTCCCGA---AAACGTG-TCGCAAGAGA-ATGTTG-TCA---G--AG--------A-GAGAGA----------Ggtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|5 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctga---TCTGTA-TAGTCACCT--G-A-TAGA-A-TT-GT--AGAGA-A-GA---TGTTG-T---TACTG---AG-TAC---AAGAGAAAG-T-CGTAAG-A-T----AAAGAAA-TA-T-AT-CA--G-AA-GA----CTCT-CTG-T-TT---AGTCCCTGA-T-AGAATTG-T----AGAGAGATGTTG-TTAC-TG--AG-T-ACcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtatagtcacctgatagaattgtagagaagatgttgttactgagtacaagagaaagtcgtaagataaagaaatatatcagaagactctctgtttagtccctgatagaattgtagagagatgttgttactgagtac
gi|6 : cagtaaaatgtttagtggaacattgacctgacttggttactcaggatgttgatatcactgtgtcggcaatatatacagcattcaaactgaacaaaccagataaagtgaaatatcttgtataggatcaaaataaatctttcccggtaaatgtactagaaatgtacaactgttcaattgtctgacatgctggagttagaacggacagtagggatgatgtggtggtgacaaacagatcactgtggtgtatggatagagagggagatttactgagacatttgttgtttgtgggtctggatgtcaatcagttgatacaattttatcataagtctgatgtaagacctctgttgtataaactgattgatgaagggagatctactgagatagttagtgtacttctgggagcgggggcagatgtcaatgtcagtgtgaggtatagagagtatgactcggtgttaggtgtgtctgttctagagagaacaaggcgacaggtgtgtgaatacagtaagagtgaagattggtatagatgttagtacaaagtgaagaagtacaagaaagcgatgtgtgaggtaaagaaacatgtcagaagacaatcggaatagtccctgagtgtgagataaagacacatgtctgaagacaatagttcccgaaaacgtgtcgcaagagaatgttgtcagagagagagagcgaaggagaaggaagaagagacgaagagaagaagcacgagccaagaagagtagagaaagagggcgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctACAG-TGAAA-TATCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAATGT-GTCAGCA---GTATA-TAGAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAAATATCTCATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAT-TCCAA--G------TAAATTTACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGATGGAGATCAGACATGCTGGAGTTGAAACAGACAGTAGGGATGATGTGGTGACAGACAGATCAATGTGGTG-TATGG-ATGATGT--GGTG--------ACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTTGAA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GTGAGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--ACGTATG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCAAT-ACGGT-TTTATCCGTGGTA-TTAT---ATGTAC-AATGATGATAAG---TGTG-AAGCGAGACCTCTGTTG-TTTAC--ACTGATTGA---T--GA-TGAGTA---TGTT-------GA-A---CATAGAACA-GAGA-AG-GTGAG--TGTCCT-GCTGG-G-G--GCG-----G-----------------GGGCGG------------------------A-T-----G--TCAACGT-------CAGGGTGA-GGTATAGAAAG----TATGGCTC-T-----GTGT--TAG---------------A-CAGG-------GAGGGTGTG--TCTGTT-C-TAGAGATGA--------------------------CGAGGCGACGGATGTGTAAGTACAG-TAAAGATTGGTATGATG--------A-GAGTG---AGGACAGTGA---TAGTGAGGACAGTA--AGATGGTATT--TCAT-AAG-TTCA---G-TGTGCCACAGTA-CAA-G-G--AA-A--TG----AT--GTGTGA-G-------ATAAA--G-A-ATATACAGATGTTAG-GATAAGGGGACGA-CAAGTGAGTA-CAGTA-AGT--G-G-T-GA-T-TTCAT--A-AGTCC-GA---TGTC--C---CAC-----AG-T-C---AAGGAAATGATGTGTGAG-A-T----AAAGAAA-CA-T--T-CAAGA-AA-GA----CACT-CT--T-AT---AAT
gi|7 : ggttctctatcaAG-TGAAA-TGCCT----AGTGGAACACGGAGCTGATTG-GGTTAC--GGAATCT-GTTGATATAAATGT-GTCACTC---CTATA-TAAAGCATTGGTTCT-GAAC-AAA--CCAGATATATTGAGATATCTTATA-CAGC-AACA-AAATAAAAT--ACTTTTAG--G------TGAATTCAGTG-GAAATA-GA-CATCTAT-TTGATTG-TCTGATAGA-------TAT-------------TAGACA-------TTCTGGAGAAA-AACCAAA-CA-------G-TAGTG-GTGATGT--GGTG-----GTGATGA-ACAGATC--AG-TATGGT-GTA-------------T--GGA----TGAATTCGGA-GATTTA-TGGACGGC--A--ATC---A-GTGAGGGAAAC-TGT-GATGTACTGAG--TCATCTG--ATT-------TGTGTGGGGTTGAAT--GCCAATCA-GTGGAT-ACAGT-T--------------------------------------G---TCTG-ATATGAGACCTCTGTTA-CATAC--ACTAATTGA---TCATAATG---A---TGTT-------AA-T---CACAGAGCG-GAGA-AG-GTCAG--GATCCT-GATAG-G-G--GCA-----G-----------------GGACGG------------------------A-T-----G--TCAATGT-------CAAAGTGA-GGTATAGCAAA----TATGACTC-A-----GTGT--TAG---------------A-CAGA-------GAGGGTGTA--TCTGCT-C-TGGAGAGAA--------------------------CAAGACGACTTGTGTGCG-----AG-TACAA-------T-A----------A-TAGTG---A----A-T-A---T--------T------C------CTT--TGAA-AAA-AAAA---G-AGTGAAAGAATA-CAA-G-A--AA-G--TG----TT--ATGCGA-G-------ATCAA--G-A-A---AC--ACGTCAG-AA------GAC-A-T---TCTGTA-TAGTC-TCA--G-A-TAGT-G-TT-GA--AGGG--A-AA---TGTTG-T---TACAA---AG-AAC---AAGAGCGAGATGTGTTAG-A-T----AAAGAAA-CA-T-GT-CA--G-AA-GA----CACT-
gi|8 : agagtgttctttatcactACAG-TGAAA-TGTCT----AGTGGAACATGGAGCTGACTG-GGTTACTCAGG--TT-GTTGATTTCAAAGT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATCCT-GAAC-AAA--CCAGATATAGTGAATTATCTCGTA-CAGC-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--G------CAAATTGACTG-GAAATG-TA-CACCTAT-TTAACTG-TCTGGTGGA-------GAT-------------CCGACA-------TGCTGGAGTTA-AACCAGA-CA-------G-TAGGG-ACGAT-----GTG-----GTGACAG-ACAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TATATGGGGA-GATTTG-TGGAGGAC--A--ACC---A-GTTGGGGAGAC-TGT-GATGTACTGAG--AGATCTG--TTG-------TGTGGGGGTCTGGAT--GTCAATCA-GTCGAT-ACAGT-T---------GTA-TAGTA--A-GTAC-AGTGATTATAAG---TCTG-ATGTGAGACCTCTGTTG-TATTC--ACTGATTGATACT--GAATG-GTATACTGTT-------GA-T---CATAGAACA-GAGA-AG-GTGAG--TAT
gi|9 : cacagggttctttatcaACAG-TGAAG-TGTCT----AGTGGAATATGGAGCTAATTG-GGTTCCTCGGT--TT-GTTGATATCAATCT-GTCAGCA---GTATA-TACAGCATTAATACT-GAAC-AAA--ACAGATATTGTGAAATACCTAATA-CAGA-AACA-AAATAAAAT-CAC-TCCAG--C------CTTATTTCCTG-GAAATG-TA-CATTTTT-TTAACTG-TCTGGTAGA-------CAT-------------AACACA-------TGCTGGAGTTA-AAACAGA-CA-------G-TAGGG-ATGATGT--GGTG-----GTGACAG-AGAGATC--AG-TGTGGT-GTA-------------T--GGA----TAGAAAAGGG-GATTTG-TGGAGGAC--A--ATC---A-GGGAGGGAGGC-GGT-GATGTACTGAG--ACATCTG--TTG-------TGTGTGGGTCTGGAT--GTCAACCA-GGCCAT-ACAGT-T---------GTA-TGATA--A-GGAC-A---AAAATAAA---TCTG-ATGTGAGATTTCTGTTG-TATAC--ACTGATTGA---T--GAGTG-GTT---TGAT-------AG-A---CATATAACA-GAGA-AG-GTGAG--TATCCT-GCT