lowQualScore : 11 11 111 111111111 11 1111111 111111 1 111111 222 3333333333 111 1 111 111 1111111 222222222 11 11111 2 11 11 111 111 111111111 1111 1 11 555555555555555555555555 111 1 2222 11 111 111 222 111 11 2222222 33333333 11 1 22 1111 222222222 1111111 11111 222222222222 111111 222 111 3333333333333 111111 111111 11 22222222222 1111 11 11111 11 22 111 111 1 1
lowQualScore : 7 44 44 555 22 3 6 4 3 3 00 9 77777 3 3 111 1 5555 4 999 3 3 2 3 3 5 888888888 2 1 44 44 6666666 77 3 6 999 44 3 33 44 3 9 555 2 2 2 2 66 2 2 66 3 444444 55 2 0 55 33 1 8 3 2 5 33 2 55 33 444 8888 4 000000 2 33 2 44 33 111 33 33 55 5 5555 33 2 0 2 777777 55 444 55 444 2 2 2 2 33 2 2 55 55 1111111111 2 2 2 2 5555 5555 111 2 2 0 555 444 33 3 555 6666666 2 2 555555555 444 66 33 3 5 5 2 00 3 3 3 3 3 44 99 3 44 3 99999 555 4 9999 4 66 4 3 66 4 66 4 9 00 4 55 5 777 66 3 111 55 4 88888 55 8888 4 111 4 4 4 77 3 666666666 55 4 5555 0 11 8 999999999999999999999999 4 000 2 4 1111 4 4 4 55 777 222 2 5 5 5 0 777 5 5 66 5 5 888 6 66 66 5 2 5 5 66 5 5 5 3 222 22 66 66 777 4 55 1111111 4 11111111 55 99 4 1 55 8888 777 0 777 55 11 7777 4 55 4 3 7 3 8 00 9 3 3 66 2 2 2 3333 2 2 33 2 33 8 33 77 2 5 2 333333333 3 44 3 3333333 44 6 3 33 44 8 99999 44 888888888888 3 333333 66666 55 000 000 4 0 1111111111111 2 222222 4 222222 00 9999 1 4 11111111111 5 4 8 4 8888 5555 2 6 44 5 22 0 888 5 33333 55 55 444 8 8 8 111 0 3 0 0
lowQualScore : . .. .. ... .. . . . . . .. . ..... . . ... . .... . ... . . . . . . ......... . . .. .. ....... .. . . ... .. . .. .. . . ... . . . . .. . . .. . ...... .. . . .. .. . . . . . .. . .. .. ... .... . ...... . .. . .. .. ... .. .. .. . .... .. . . . ...... .. ... .. ... . . . . .. . . .. .. .......... . . . . .... .... ... . . . ... ... .. . ... ....... . . ......... ... .. .. . . . . .. . . . . . .. .. . .. . ..... ... . .... . .. . . .. . .. . . .. . .. . ... .. . ... .. . ..... .. .... . ... . . . .. . ......... .. . .... . .. . ........................ . ... . . .... . . . .. ... ... . . . . . ... . . .. . . ... . .. .. . . . . .. . . . . ... .. .. .. ... . .. ....... . ........ .. .. . . .. .... ... . ... .. .. .... . .. . . . . . .. . . . .. . . . .... . . .. . .. . .. .. . . . ......... . .. . ....... .. . . .. .. . ..... .. ............ . ...... ..... .. ... ... . . ............. . ...... . ...... .. .... . . ........... . . . . .... .... . . .. . .. . ... . ..... .. .. ... . . . ... . . . .
lowQualScore : 2 22 22 444 88 1 2 0 1 1 44 2 77777 1 1 555 2 0000 6 666 3 3 3 3 3 0 888888888 8 2 22 22 5555555 33 1 2 555 22 1 99 22 1 2 444 3 8 9 7 88 7 7 33 8 444444 33 7 7 99 44 9 1 7 6 0 44 7 66 77 777 8888 4 444444 4 22 4 00 22 222 44 44 99 0 3333 44 5 1 5 222222 22 444 99 444 5 5 5 5 44 5 5 44 99 7777777777 7 7 7 7 7777 7777 999 7 7 6 333 777 77 3 777 9999999 7 7 333333333 777 33 77 9 7 7 9 44 1 1 1 1 3 66 55 3 66 3 33333 888 4 4444 4 11 4 3 11 4 11 4 8 66 4 55 0 000 66 7 777 55 0 33333 55 5555 0 000 0 0 0 77 6 000000000 55 0 9999 5 55 6 444444444444444444444444 4 777 2 4 9999 4 4 4 00 888 555 5 0 0 0 1 444 0 0 99 0 0 666 9 99 99 0 2 0 0 99 0 0 0 2 666 66 11 11 888 0 55 0000000 0 99999999 55 55 0 4 55 5555 000 8 000 55 88 1111 0 55 0 2 5 6 2 44 2 1 1 88 9 9 9 1111 9 9 99 9 99 6 99 99 9 7 9 999999999 1 22 1 2222222 22 2 1 33 88 7 99999 66 888888888888 3 444444 00000 55 666 666 0 9 8888888888888 7 888888 4 333333 66 4444 6 4 11111111111 4 4 9 4 7777 6666 2 5 55 3 88 2 222 0 99999 88 00 000 0 0 0 888 0 2 8 0
consensus : GTATGCCCTT--AACTGTAA--CA---TTGT-ACT-GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-T-ATA---TTCT--C-TATGTTGGN--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATGAAG-ACATGAT--AAGCATT-CAATTTAAAT--CTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GCAA-AA--TACC----N-CCTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATTA-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AAGTA-----CTAC-A--CGT-ATTC-G--ATACGAA--ACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A--G---AG-GGG-TAA-CGA-AT--A-TT-CGATTTAG-AT-GATGT-CAT---T--GGG-T-GA-GG-A----A----AAC--A-CTTTATT--TTCT---T--TGTCATCGT---AA--NA-T-T-T-TG-----TA-CA---GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C-A--G-TC-A--TTTA-TTA---CGT---CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGCAAGAG---CTAACACC-GGC--ATC--CAC-A--G--TTCATT--ATG----TA-T---A-TGT-G-TTG-TGCATGTA-TTGA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-C--ATATCTTTCCTTCC-ACCCCATTA------CC-------T--------GCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-CT-GAAC-A-T-TT--GT---AAAC-C-TAGCTTAAATCATGA-GC-A-GATCACCG--AGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCA-TTAGANTT--ATT--TTCTATAT-CGCAA-T-ATT-NATG-CATACGAA-TTTA-TTNTA-TAAT-CAAACATAGTAG--AAA--T-G-TCAA-CTGAG-GAAAAA-T-----ACAA-TTTG-ATTT---T--T--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--ACAGC-TG-TA-T-AT--ATG-GTTATAAA-AAAAACAAGCATC-AAA-CACGAGG-ATAT-GANCA-T-T-GCATTC---T-TCA-GG--TTGTCAAG-TTC--CATCA--TA-ATT-CATT-G-AATC----AAC--ATTT-CCT--T-AAAT--GGTGA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAACT-A-T-AA--AAAC----ATCN----ATT-A---A--AG---TGGC--A-TAATA--AATA-AGACGTG---TGC-A-CAGCA------CCCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAATCTG-T-AT-TATGT--GTTAT----TTATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AG-TATA-NTAATTATTCTGT--AATTCAATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
Reference ( gi|3 ) : GTAAGCCCTT--AACTGTAA--CA---TTGT-CCT-GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-T-ATA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATGAAA-ATATGAT--AAGCATG-CAATTCAAAT--CTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GCAA-AA--TACC----C-CCTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTTAGTCA-T--TCA-T-TTAACA--AT---ATCCC----AACTA-----TTAC-A--CGT-ATTC-G--ATTTCAA--ACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A--G---AG-GGG-TAA-CAA-AT--A-TT-CGATTTAG-AT-AATGT-TAA---A--GGG-T-GA-GG-A----A----AAG--A-CTGTATT--GTCT---T--TGTCATCGT---AA--TA-T-T-T-TG-----GA-AA---GT--AAAAATGTAT--ATCAAGAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C-A--G-CC-A--TTTA-TTA---TCT---CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AACAAC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGGAAGAA---CTAACACA-GAC--GTC--CAC-A--G--TTCATT--ATG----TA-T---A-TGT-G-TTG-CGCATGTA-TTGA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-C--ATATATTTCCTTCA-ACCCAATTA------CC-------T--------GCAA-AAAT-G-ATCCAGCGTA-CA-GTAC-A-T-TT--GT---AAAC-C-TAGCTTAAATCATGA-GC-A-GATCACCG--AGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCA-AAAGATTT--ATT--TTCTATAT-CACAA-T-ATT-AATG-TATATGAA-TTTA-TTATA-TTAT-GAAACATAGTAG--AAA--T-G-TCAA-CTGAG-AAAAAA-T-----ACAA-TTTG-AAGT---T--T--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--ACAGA-TG-TA-T-AT--ATG-GTTATCAA-AAAAA-AAGCATT-AAA-CACGAGG-ATAT-GAATA-T-T-GCATTA---T-TCA-GG--TTGTCAAG-TTC--CATAA--TA-GTT-CATT-G-AATC----TAG--ATTT-CCT--T-AAAT--GGAGA--AT-TTGACTT-ACTT-T-GAAATCTAACT-A-C-AA--AAAC----ATCT----ATT-A---A--AG---TGGC--A-TGATA--AATA-AGACGTG---TGC-A-CAGCA------CCCAT-TT--GA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAACTTG-T-AT-TATGT--ATTAT----TTATATAGTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AG-TATA-ATACTTATTTTGT--AATTCAATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGAATGT
gi|2 : GTAAGCCTTT--AACTGTAG--AA---TTGT-CCT-GGAT--CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TAATA----TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATGAAA-ATATGAT---AGCATG-CATTTCAAAT--CTGA-AT-GTGAATA--TTCTTT-TT-C--TAACCAACGACTCT---ATGTTTGGT-ATACA-TCTGA-GCAAGAA--TA-C----T-CCTGAAA-TCT-CCAGAGAGAA--CTTA--TCTTAGTCATT--TCA-TATTAACA--AT----TCCC----AACTA-----TTACAA--CGT-ATTC-G--ATTTCAA--ACAGCT--CC--CTA-T----A--GAAGAAG-GA------TT-C---A--G---AG-GGGTTAA-CAA-AT--A-TT-CGATTTAG-AT-AATGT-TAA---A--GGG-T-GA-GG-A----A----AAG--ATCTGTATT--GTCT---T--TGTCATCGT---AA--TA-T-T-T-TG-----G--AA---GT---AAAATGTAT--ATCAAAGGT-A-T-AG-CGTTG-C-ATC-A--G--C-A--TTTA-TTA---ATC---CATC-TT-AA----TC-A-GAAAATAGC--GTTAAACAAC--A-TGATAAGAA-TTATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGGAAGAA---CTAACACA-GAC--GTC--AAC-A--G--TTCATTTAATG----TA-T---A-TGT-GTTTG-CGCATGTA-TTGGGAAATTTTTT--TTAAGTTTCATCAATTAG-CAAATATATTT-CTTCA-A-CCAA-TA-------C-------T--------GC-A-AAAT-GAATCCAGCGTA-CA-GTAC-A-T-TT--GT---AAAC-CTTAGCTTAAATC-TGA-GC-A-GAT-ACCG--AGTC-ATTAATTCCTT-TGTC-AAATGCA-AAAGATTT--A-T--TTCTATAT-CACAA-TAATT-AATG-TATATGAATTTTA-TTATATTTAT-GAAACATAGTAG--AAA--T-G-TCAAGCTGAG-AAAGAA-T-------AA-TTTG-AATT---T--TA-ATAAATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--ACAGA-TG-TA-T-AT--ATG-GTTATCAA-AAAAA-AAGCAT---AA-CACGCGG-ATAT-GAATA-T-T-GCATTA---T-TCA-GG--TTGTCAAG-TTC--CATAA--TA-GTT-CATT-G--ATC----TAG--ATTT-CCT--T-AAAT--GGAGA--AT-TTGACTTAACTT-T-GAAATCTAACT-A---AA--AAAC----ACTA----ATTAA---A--AG---TGGC--A-TGAT---AATA-AGACGTG----GC-A-CAGCA------CCCAT-TTTGAA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAACTGT-T-ATGTATGT--ATTAT----TTATATAGTTGT-ATTAGTTCC--ATAG--AC-TATA-ATACTTATTTTGTAAAATTCAATTG-GGCACT---A-TCTA-TT-TTAAATGCGAATGTAA-TTGCTCTTTCATTCAT-TTGA
gi|1 : aatgGTAAGCCCTT--A-CTGTAA--CA---T-GT-CCT-GGATAACGGAATG-ACT--AAA-TG-----G-T-ATA---TTAT----TATGTTGGA--T-TCTCAATT-AGAATAAAGAATTG-CTGAATAA-GATGAAA-ATATGAT--AAGCATGGCCATTCAA-T--CTG--AT-GTG-AT---T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCCTACATGTTTGGT-ATA-AATCCTA-GCAA-AA--TAAC----C-CCTGAAAATTC-CCAGAGAAAAA-CTTAATTCTTAGTCA-TCGTCA-T-TTAACA--TT---ATCCC----AA-TA-----TTAC-A--CGT-ATTC-G--ATTTCAA--ACGGCT--CA--CTAAT----A--GAA-AAG-GC------ATGC---A--G---AG-GGG-TAA-CAAGAT--A-TT-CGATTTTA-GT-AATGT-TAA---A--GGGAT-GA-GG-A----AGAAAAAG--A-CTGTATT--GTCCCTGT--TGTCATCGT---AA--TA-T-T-T-TG-----GA-AA----T--AAAA-TGTAT---T--AGAGT-AAT-A--CG-TG-C-A-A-G--G-CC-A--TT-A-TTT---CCT---CATCATTCAA----TCCACGAAAATAGCCCGTT-TACAAC--AATGAT--GAA-TTATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGGAAGAA---CTAACAAA-GAC---TC--CACTA--G--TT-ATT--ATG----TAAT---AATGTAG-TTG-CGCATATAATTAA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-C--ATAT-TTTC--TAACACCAAATTA------CC-------TT-------GCAA-AAAT-GTATCCAGCGTA-CA-GTAC-A-T-TT--GT---AAAC-C-TAGCTTAAAT-ATGAAGC-AAGATCACCGCGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTCAAAATGCAGAAAGATTT--ATT--TTC--TAT-TACAC-T-ATT-AATGTTATGTGAA-TTTA-ATTTA-TTAT-GAAACATAGTAG--AAA--T-G-TCAA-CTGAG-AAAAAA-T-----ACAA-TTTGAAAGT---T--T--AT-AATAG--CTAAAAAAACG---TGAT---TA--ACAGA-TGATA-T-AT---TG-GTT------AAAAA-AAGCATTAAAA-CA-GAGGAATAT-GAATA-T-T-GCATTA---T-TCA-GG--TTGTCAAG-T----CATAA--TAGGTT-CA-T-G-AATC----TAG--ATTT-CAT--T-AAAT--GGAGA--ATGTTGACTT-ACTT-T-G-AATCTTAAT-A-C-AA--AAAC----ATCT----ATT-A---A--AG---TGGA--ATTGATC--AATA-AAGAGTG---TGC-AGCAGC-------CCC-T-TT--GA--AGC-GAACA----GAAGC-AA-----------TAAACTTG-TAAT-TATGT--ATTAT----TAGTATAGTTGTAATTAGTTTCCAATAG--AGATA-A-ATA-TTATTTTGTA-AATTCAATTGGGGCACT---ATTCTATTT-TT--ATGCG-ATGTATTTGGCTCTTTCATTCATGTTGA
gi|8 : aataaagacataataacataaacaataattctatggttgatcttattagtgatcaagaattaatttatgGTATGCCCTT--AACTGTAA--CA---TTGT-ACT-GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-T-ATA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAATA-TTG-CTGAATTAAGATGAAG-ACATGAA--AAGCATT-TAATT-AAAG--CTG--AT-GTG-ATAT-T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A-TCTGA-GGAA-AA--TAAC----A-CCTGAA---CT---------AA--TCTA--TATT----A-T--TCA-T-CTAACA--TT---ATCCC----AAGTA-----CTAT-A--CGT-ATTC-G--ATACGAA--ACAGTT--CA--CTA-T----A--GGA-AAG-GC------AT-C---A--G---AG-GGG-TAA-CGA-AT--A-TT-CGATTTAG-AT-GATGT-CAT---T--GCG-T-AA-AG-A----A----AAC--A-CTTCATT---TCT---T--TGTCATGGT---AA--AA-TAT-T-TG-----TA-TA---GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGT-A-T-A--CA-TG-C-A-C-A--G-TC-A--TTTA-TTA---CGT---CATTATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-AAC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTTA--TG-ATAATC--AAGCAAGAG---CTAACACT-GTC--ATC--CAC-A--G--TTCATT--ATG----TT-T---A-TGT-G-TTG-TACATGTA-T
gi|15 : tagctaaataaagataatgcattaacaataaatcttatgcgatcttattactgatcaaggcttcattgatgGTATGCCCTT--AACTGTAA--CA---TTGT-ACT-GGATA-CGTAGTG-A-T--AAAGTG-----G-T-GTA---TTTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-TT-ATGATAAAAA-TTG-CTAAATAAAGAAAAAG-ACATAAT--CAACATT-CAATTTAA-T--CTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-G-CTCT---ATATTAATC-ATA-A-CCTGA-GCAA-AA--TACC----A-CCTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CCTA--TCTAAATTA-T--TCA-T-TTAACA--AT---ACCCA----AAGTA-----CTAC-A--TGT-ATTG-A--ATACGAA--ACAGCT--CA--ATA-T----A--G-A-AAG-GC------AC-A---A--G---AA-AGA-TAA-AAA-AT--A-TT-CGATTTAT-AT-GATGT-AAT---T--GGG-T-GA-GG-A----A----AAA--A-CTTTCTC--TTCT---T--TGTCATCGT---AA--AA-TAT-T-TG-----TA-CA---GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-
gi|10 : catatatgGTATGCCTT----ACTGTAA--C----TTGT-A-T-GGATAACGTAGTG-A-TTAAAG-TG-----G-T-GTA---TTTTTTC-T-TGTTGGGGTTATCTTA-TT--GAATGAAAA-TTGGCTAAATAAGAA--AAG-ACATAAT--AACC-TT-CAATTTAA-T--CTG--AT-GTG-ATA--T--AAT-TT-A--AAACCAA-G-CTTT---ATAGTTAAT-CTA-A-CCTGA-GCAA-AAGATACCACGAC-CCTGAAA-TCTTCCAGAGAAAAAACCTA--TCTAAATTA-T--TCAAT-TTAACA---T---ACCCCCA--AAGTA-----T-AC-A--TGT-ACTT-G--AATACGAGAACAGCT--CAAATTA-T----A--GAA---G-GC------ACAC---A--AGAAAG-AGA-TAA-CAA-ATTAA-TA-CGATTTATTATGAATGT--AC---ATTGGG-TTGA-GGGA----A----AAA--A-CTTTCTC--TTCT---T--TGTCATCGTAA-AA--TA-A-T-T-TG-----TA-CA---GT--AAAATCGTGC--ATCAAAAGTAA-T-ACGCG-TG-CAA-CAA--G-TC-A--TTTA-TAA---TGT----ATCAT
gi|22 : caaacaggtaaggaaggataaaggaatatacaattaaaatagaagtatgtgatcttattatgattaatggttttcattaatgGTATGCCCTT--AACTGT-A--CA---TTGT-ACC-GGATA-CAGAGTG-A-TA-AAA-TG-----G-T-ATA---TTTT--C-TTCGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TCG-CT---------------ATATAAT--AAGCATT-CAATT-AAAG--CTG--AT-GTG-ATC--T--ATT-TA-C--TAACCAA-GGCTCT---ACATTAGGT-ATA-A-CCTGA-GCA--------------------AAA-TCT-CCAGAGAAAG--CTTA--TATAAATCA-T--
gi|4 : gTATGCTCTT--AACTGTAA--CA---TTGT-TCT-GGATA-CGTAGTA-A-T--AAA-TG-----G-T--TA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-GAAATAAAGA-TCG-CTGAATAAAGATGAAAGACATAAT--AAGCATT-CAATTCAAAA--CTA--AT-TTG-ATA--T--TT-----C--TAAC-AC-GGCTCT---ATATTTGGTTATA-A-TCTGA-GCAA-AA--TACC----A-CTTGAAA-TCT-CCAGAGAAA---CTTA--TCTAAGTTA-T--TCA-T-CTAACA--AA---ATCCC----AAGTA-----T-AC-A--CGT-ATTG-G--ATACGAA--ACAGCT--CAA-CTT-A----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A--G---AA-GGG-TAA-CAA-AT--A-T--------AG-AT---TGT-CAT---T--GGG-T-GA-AG-A----A----AAC--A-GTTTATT--GTCT---T--TGTCATCGT---AA--AAAT-T-G-TG-----GT-AA---AT--AAAAATGTAA--TTCAAGAGT-A-T-A--CG-T--C-A-C-A--G-TC-A--TTTA-TTA---TGT---CATCATT-GA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AC--A-TGAT--GAAATGATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGGAAGAA---CTTTCACCCGGC--ATC--CAC-AAAG--T-CACT--ATG----TA-T---A-TGT-G-TTG-TGCATTTA-TTGA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-T--ATATCTTTCCTCTC-ACCCA-TTA------CCCCTCTCCT--------GCAA-AATT-G-ATCCAGGGCAACT-GAAA-A-T-TTT-GT---AAAA-C-TAGCTTGAATCATGA-GC-A-GATCCCCA--AGTC-ATT-ATTT--T-TGTC-AAATGCA-TTAGAATT--ATT--T-CTATAT-CGTAA-T-ATT-CATG-CATATGAA-TTTA-TTCTA-TAAT-CAAACATAGTAG--AAA--T-A-TCAA-CTGAG-GAAAAATT-----ACAA-TT------T---T--T--AT-ATTAG--CT----AAACG---TG-T---TA--ACAGC-TG-TA-T-AT--ATG-GTTATAAA-AAAAACAAGCATCAAAA-CACGAGG-ATAT-GAACA-T-T-CTATTA---T-TCA-GG--TTATCAAG-TTC--CATCA--TA-ATTCCATT-G-AATC----AAC--ATTT-CCT--T-AAAA--AGTTA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAACT-A-T--A--AAAC----CTTA----ATT-AT--A--A-----GGCAAA-TAATA--TATA-A
gi|9 : AAGCCCCTTAAACTGTAAGACA---TTGT-ACT-GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-T-ATAAGTTTCT--C-TATG-TGGA--TATCTCA-TTAAGAATAAATA-TTG-CT-AATTAAGATGAAAGACATGAA--AAGCATT-TAAATTAAG---CTG--ATAGTGCATATTT--TTT-TT-C--TAAACAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A--CTGAGGAAA-AA--TA-C----A-CCTGGAA--CT---------AA--TCTA--TATTATTCA-T--CC-----TAACA--TT---ATCCC----A--TA-----CTAT-A--CGT-ATTCGG--ATACGAA--ACAGTT--CA--CTA-T----AAGGAA-AAG-GC------AT-CAAAA--G---AG-GGG-TAA-CGA-AT--A-TTCCGATTTAGAAT-GATGT-C-A---T--GCG-T-AA-AG------A----AAC--A-CTTCATT--TCCT---T--TGTCATGGTAAAAA--TA---T-T-TG-----TATAA---GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGTAA-T-AC-CA-TG-C-A-C-A--GTCC-A--TTTA-TTA---CGT---CATTATT-AACAGTTC-AC-AAAATAGC--G-T-AAAAAC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTTAC-TGAATAATCAAAAGCAAGAAAGCTTAACAAATGTC--ATC--CAC-A--GTTTTCATT--ATG----TT-TA--A-TGT-G-TTGTTACATGTA-Tattattatagtagcaaaacagtaaatacagaattagccaccaaaccattcaaaggtaagggcgcctaaaaaataactggtggagtcctaaatgtaatatggggatatctagatatgattttaagttcaagaagcagtataataaatattc
gi|16 : gcgatcttattaactgatcaaggctcattgatggGCCCTC--AACTGTAA--TA---TTGT-ACT-AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-T-ATA---TTGT--C-TATGTTAGA--TATCGTA-TT-ATAATAAAGA-TTG-CTAAATAA---------------T--AAGCATT-CAATTTTA-T--CTG--AT-GTG------T--TTTATT-CACTAACCAA-GGCACT---ATATTAGAT-ATA-A-CCTGA-GCGA-AA--TTCC----A-CATGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAGCTA-T--TCA-T-CTAGCA--AT---GTCCC----AAGTA-----CTAC--------ATTT-G--ATTT
gi|28 : GCCCTT--AATTGTAA--CA---TTGT-ACC-AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-T-ATA---TTTT--C-TTTGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTAAATA---------------AT--AAGCATT-CAATATAAAagatgatgccattgggtgaggaaaacactttctctttgtcatcgtaaactatttgtacagtaaaaatgtgcatcaaaagtatgcatgcacagtcatttattatgtcatca
gi|5 : CCCTT--AA-TGTAG--CAATCTTGTACCTCGGATA-CGGA-TG-A-T--AAT-TG-----G-T-ATAA--TTCC------TGTTGG---TAT-TC---T-AGAAAAATAA-TTG-CTGAATAACGATTGAG-ACATGAA--AAG-AT--CAATT-AAAT--CTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TTTC--TAA---A-G--TCC---ATATTTGGT-GTA-A--CTGA-GGAA-AA--TATC----CACCTGAAA------------AAA---TTA--TTTCAATTA-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AAGTA-----CTAG-T--AGT-ATTC-G--ATA-CGA--ACAACTTCCC--CTACT----A--AAC-AAA-GCGGACTAAG-C---A--G---GGCGAA-TAAACGA-AT--A-TT-CGATTTAG-TT-GATGTATGA-------GA-C-GATAG-A----A----ACACCA-CTATCCT--TTCT---T--TGTTATGAT---AAA-TA-T-T-TGTA-----TA-CACCCGT--AAAA-TGTATGAATGAGAAGT-AAT-A--AG-TG-C-A-C-AAAG-TC-AATCTTACTTAAGCGCTACACATCATT-AA----TC-ACGAAA-TAGC--GTT-AA--ACTAA-TGAT--GAA-T-GTTGTTTTAAATG-ATAAT---AAGCAAGAG---CTAACA----ACTGGTCATCAC-A--T--TGCATT--ATGGTGTTA-TGTAA-TGT-G-T----GAATGTA-TTGA---------TGTTTAAGT--CATC-AT-AG-----TATTTTTCCTTCC-ACCCCATTA------CCACTTCC-T--------GCAA-AAAT-G-ATCCAG-GTA-CATGAAC-T-T-TTTTGT---AAAC---TAGCTTAAA--ATGA-GCAA-AATCACC---AGTC-ATT-ATTC--TGTGTC--AATGCA-TTATA-TT--ATT--TTCTATAT-CGTAATT-ATT-CGTG-CATACGAA-TTTA-TTCTA-TAATCAAAACATTGTAG--AAA--T-GCTCAA-CTGAG-GAAAAT-T-----ACAA-TTTG-ATTT---T--TTAAT-AATAG---T----AAACGGTATGAT---TC--TCAGC-TG-TA-TAAT--GTGAGTTATCAA-AACAC-AAGCATCAAAA-CACGACG-ATAT-GAA-A-T-T-GTATTC---T-TTA-GG--TTGTAAAG-TTC--CAT-A--TA--TT-CATC-GAAATA----AAC--ATTT-CCT--T-AAAA--AGTGA--A--GTGACTT--CTC-TAAAAATCCA----------------------CT----ATT-A---A--AA---------A-TAATC--AATA-------G---TGCAA-CAACA------GTCAA-CT--G---AG--GAAAA----------AT-----------TACATTTGTT-AT-TATAT--
gi|13 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatccCCTT--TACTGTAA---A---TTGT-ACT-GGATT-AGTAGTGTA-T--AAG-TG-----G-T-GTAC--TTTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-T--ATGATAAA---TTG-CTAAATAAAGAACAAGTACATAAT--AA--ATT-CAATTTAA-T--CTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-AGCTC----ATATT-AAT-ATA-T-ACTGA-GCAA-AAA-TACA----C-CCTGAAA-ATT-CCAG-GAAAA--CCTA--TCTAAATTAAT--TCA-T-TTAAAA--AT---A-CCCATAAAAGTA------TAC-ACTCGTAACTA-GGAATATCGA--ACAGAC--TA--ATA-TAGCAA--GAA-GAG-GC------AT-C---AACG---A--AGA-TAA-AAA-AT--ATTT-CGATTT-C-AT-ATTGA-TAATTCG--CGG-T-GA-AG-GCAACA----AAC--A-CTCTACTCCTTCT---TAATGTCATAGCTAAAA--TA-A-T-T-TAAGTACGACAA---GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-TAA--CG-TG-C-A-C-A--G-TCAA--TTTA-TTA---TGT---CCTCAT
gi|34 : atg--AACTGTAA--CA---TTGTACCT--GATA-CGGAGTG-A-TG-AAA-TGCTTAAGTT-ATA---TCTT--CTTATGT
gi|12 : TATAATGGAATTATG-GAATT-ATATAACTGGAAT-GTG-ATA--T--TTC-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GCAA-AA--TACA----A-CCTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TATAATTTA-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AAGTA-----TTGC-A--CGT-ATTG-G--ATACGAA--ACAGCT--CA--CTA-C----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A--G---AA-GGG-TAA-AGA-AT--A-TT-TTATTTAG-AT-GATGT-CAT---T--TGG-T-GA-AG-A----A----AAT--A-CTTTATT--TTCT---T--TGTCATCGT---AA--AA-T-TCT-TG-----TA-CA---G---AAAAATGTAT--ATCAAAAGT-A-T-T--CG-TG-A-A-C-A--G-TC-A--TTTA-TTA---CGT---CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AAAAAC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGCAAGAG---CTAAGACT-GGC--ATC--AAC-A--G--TTCATT--ATG----TA-T---A-TAT-G-TTG-TGCATGTA-TTGA---------T--TTAAGTTCCAGC-ATTAG-A--ACATATTTCCTTCT-ACCCCATTA------CC-------
gi|35 : aatattgctttctgaagttcAATT-AAAG--CTG--AT-GTG-AT---C--TTT-TA-C--TAACCAA-GGCTGT---ATATTAGGT-ATA-A-
gi|7 : GGT-GTA-A-TCTGA-GGAA-AA--TACC----A-CCTGAAA-T-----------------TA--TGTTAATTA-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AAGTA-----CTGT-A--CGT-ATTC-G--ATACGAA--ACAACT--CC--CTA-T----A--AAA-AAG-GG------AT-C---A--G---AG-GGG-TAA-CGA-AT--A-TT-CGATTTAG-TT-GATGT-CAT---T--GAG-C-GA-AG-A----A----AAC--A-CTTCATT---TCT---T--TGTTATGAT---AA--AA-TAT-T-TG-----TA-TA---GT--AAAAATGTAT--ATGAGAAGT-A-T-A--AG-TG-C-A-C-A--G-TA-A--TTTA-TTA---GGT---CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGCAAGAG---CTAACACT-GGC--ATC--CAC-A--A--TTCATT--ATG----TG-T---A-TGT-G-TTG-TGAATGTA-TTGA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-T--ATATCTTTCCTTCC-ACCCCATTACCACCTCC-------T--------GCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-CT-GAAC-ATT-TT--GT---AAAA-C-TAGCTTAAATCATGA-GC-A-AATCACCA--AGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCA-TTATATTT--ATT--TTCTATAT-CGTAA-T-ATT-CGTG-CATACGAA-TTTA-TTCTA-TAAT-CAAACATTGTAG--AAA--T-G-TCAA-CTGAG-GAAAAATT-----ACAA-TTTG-ATTA---T--T--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--ACAGC-TG-TA-T-AT--ATG-GTTATAAA-AAAAACAAGCATCAAAA-CACGAGG-ATAT-GAACA-T-T-GCATTC---T-TCA-GG--TTGTCAAG-TTC--CATCA--TA-ATT-CATC-G-AATC----AAC--ATTT-CCT--T-AAAA--AGTGA--AG-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAACT-ATT-AA--AAAC-----TTA----ATC-A---T--AG---TCGC--A-
gi|21 : A-A-TCTAA-GCAA-AA--TACC----C-CCTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TGTAAATTA-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCGC----ATGTA-----CTAC-A--CGT-ATTC-G--AAATGAA--ACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-ACG-GC------AT-C---A--G---AG-GGG-TAA-CGA-AA--A-TT-CGATTTAG-AT-AATGT-CAT---T--GGG-T-AA-TC-A----A----AAG--A-C--TATT--GTCT---T--TGTCATGGTG--AA--CT-T-T-T-TG-----TA-CA---GTAAAAAAATGTGT--ATCAAAAGaa
gi|23 : TGG-GCAG-AA--TATT----G-ACAGTAA-ACT-CCAGAAAAAA--CT-A------AATTA-T--TCA-C-GTGACA--AT---GCCCT----AGATG-----ATAT-G--CAT-ATTT-G--ATATGAA--ACAGGT--CA--CCA-T----A--TAA-AAA-AC------AC-A---A--G---AA-AGG-TTA-TAA-AT--A-TT-TGATTGAT-AT-GATGT-CA
gi|29 : AA--CTTA--TCTAAACTA-T--CTA-T-ATAACACTATGTAATACT----AATTAAGGTGCTAC-A--CGT-ATCC-A--ATAAGAA--ACAAGT--CA--CCT-T----A--GAA-AAATAC------AC-C---C--G---AG-AGA-TAA-TAtatgatctttctcgtcgcaaaatatctgtgtagcaaaaag
gi|6 : C----AAGTA-----CTAC-A--CGT-ATTG-G--ATACGAA--ACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-A-G-GC------AC-A---A--G---AA-AGA-TAA-CGA-AT--T-TT-CTATTGAT-GT-GATGC-CAT---T--GGG-T-GA-GG-A----A----AAC--A-CTTTCTC--TTCA---T--TGTCATGGT---AA--AA-TAT-T-TG-----TT-CT---GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TGTC-A-C-A--G-TC-A--TTTA-TTA---CGT---CATCATT-AA----TC-ATGAAAATAGC--GTT-AA-AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTTA--TG-ATAATC--AAGCAAGAG---CTAACACT-GGC--ATC--CAC-A--A--TTCATT--ATG----TA-T---A-TGT-G-TTG-TGCATGTA-TCGA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-T--ATATCTTTCCTTCC-ACCCTATTACCCCT-CC-------T--------GCAA-AAAT-A-TTCCAGGGTA-CT-G-ACAA-T-TT--GT---GAAA-C-TAGCTTAAATCATGA-TC-A-GATTACCA--AATC-ATC-ATTC--T-TGTC-AAACGCA-TTAGAATT--TTT--TTCTGTAT-CGCAA-T-ATT-AATG-TATATGAA-TGTA-TCATA-TAGT-CAAACAGAGTAG--AAA--T-A-TCAA-CTGAATACAAAT-T-----ACAA-TTTG-ATTT---T--T--AT-AATAC--AT----AAACG---TGAT---TA--ATAGC-TG-T-----------------------AAA-AAGCATT-AAG-CACGAGG-ATAT-TATCA-T-A-GCATTC---T-TCA-GG--TTGTCAAG-TTC--CATCA--TA-ATT-CATT-G-AATC----AAC--ATTT-CCT--T-CAAT--TGTGA--AT-TTCACTT-AATT-T-GAAATATATCT-A-C-AA--AAAC----ATCT----ATT-A---A--AG---TGGC--A-AAATG--AATA-AGACATG---GGCTA-AAGCA------CCCAT-TT--GA--AG--AGAAA----GTAGC-AT-----------AAAATTGG-T-AT-TATGT--GTTAT----TTATATACTTGT-TTTAGTTCCTAATGC--AG-TATA-TCAAATATTCTGT--ATTTCAATT--GACACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGta
gi|24 : C-A--CGT-ATTG-G--ATATGAA--AGAGCT--CA--CTG-C----A--GAA-A-G-GC------A--C---AT-G---AA-AGA-TAA-TGA-AT--T-TT-CTATTTAT-GT-GATGT-CAT---T--GGG-T-GA-GG-A----A----AAC--A-CATTCTC--TTCT---T--TGTCAAAAT---AA--AA-TAT-T-CG-----TA-CA---GCA-AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-
gi|16 : -AC--A-TT-TGATTTAG-AT-GATGC-CAT---T--GGG-T-GA-GG-A----A----AAC--A-CT---TT--CTCT---T--TGTCATCGT---AAACTA-T-T-T--G-----TA-CA---GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-G--CA-TG-C-A-C-A--G-TC-A--TTTA-TTA---TGT---CATCA
gi|27 : gccctcaactgtaatattgtactagatacggagtgataaaatggtatattgtctatgttagatatcgtattataataaagattgctaaataataagcattcaattttatctgatgtgttttattcactaaccaaggcactatattagatataacctgagcgaaattccacatgaaatctccagagaaaacttatctaagctattcatctagcaatgtcccaagtactATC--AAGGAAGAA---CTTTCACC-GGC--ATC--CAC-A--A--ATCACT--ATG----TA-T---A-TGT-G-TTG-TGCATTTA-TTTA---------T--TTAAGTTCCATC-ATTAG-T--ATACCTCTCCTTTC-ACCCCATTA------CC-------
gi|30 : -TTGA---------T--TTCAGTTCAAGC-ATTAGTC--A-ATCTTTCCTTCA-ACCCCACTGCCCC--CC-------C--------GCAAGAAAT---ATCCAGGGTA-CT-TAAC-A-TATT--GT---AAAcctctcctgcaa
gi|14 : TAA---------T--TTAAGTTCCAAC--TT-------TACATTGTCTTTG-ACCCCACCA------CC-------CCAAGCCACGCAA-AATT-G-ATGTAGGCTA-CT-G----A-T-CT--GTTTGAAACAC-TATCTCAGATGATTA-AC-A-GATCACCA--AATT-ATT-ATTC--C-TGTA-ACATACA------TTTTCATTATTTTTCTAT-CGCAA-A-ATC-AATG-TATCAGAA-TTTA-TTACG-TAAT-CGAGCGTCGTAG--AAAATT-A-TCAC-CTAAG-GATTTG-TTTTCCA-AA-TTTG-TA-TCTAT--T--AC-AATAAACCA----AAAAA---TGACATGTAAGACAAACTG--A-T-ATTCACA-GTAATCAATGCAAA-AACC--------CACAAGA-ATAT-GATCAGT-T-GCCTGC---TCTCA-GGTTTTGTCAAA-TGCATCA-AATTTA-ATT-CACCGG-AATCAACATAG--TTTTATCC--G-GAATGCGGACA--TT-TTAACTT-TATT-T-GAAAacaacatgcatctcaaat
gi|11 : TTCCTTTC-ACCCCATTA------CCCTCTCC-T--------GCAA-ATATTG-ATCCAGGGCA-CT-GAAA-A-T-TTT-GT---AAAC---TAGCTTAA-TCATGA-GC-A-GATC-CC---AGTCCATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCA-TTAGAATT--ATT--TTCTATATTCGTAA-T-ATTCGATG-CATATGAA-TTTATTTATA--AAT-CAAACATAGTAG--AAA--T---TCAA-CTGAG-GAAAAATT-----ACAATTTTG-ATTT---T--T--A--AATAG--CT----AAACG---TG-T---TA--ACAGC-TG----T-AT--ATG-GTTATAAA-AAAAACAAGCATC-AAA--AC-AAG-ATATGGAACA-T-TAGCATTA---T-TCA--G--TTGTCAAG-TTC--CATCA--TA-ATT-CA-T-G-AATC----AAC--ATTT-CCT--T-AAAA--GTGTA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAACT-A---AA--AAACCTGAATTC----AT------A--AG---TAGC--A-AAACAGTAATACAGAATTA---GCC-A-CA-CA------ACCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGCAAT-----------AAAAACTG-T-AT-TATGT--GATAT----C--TATAATT----TTAATT--CAAGAAGCAG-TATA-TAAATTATTatt
gi|20 : ATAGTCGCAAAA--CAG-TCAA-CTGAG-GAAAAA-TT----ACAA-TTTG-ATTA---T--T--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--ACAGC-TG-TA-T-AT--ATG-GTTATAAA-AAAAACAAGCATC-AAAACACGAGG-ATAT-GAACA-T-T-GCATTC---T-TCA-GG--TTGTCAAG-TTC--CATCA--TA-ATT-CATT-G-TATC----AAC--ATTT-CCT--T-ACAA--AGTTA--AT-TTAAGTT-ACTC-T-AAAATCCAACT-T-T-AA--AAAC----CTTA----ATT-A---T--AG---Tc
gi|17 : -G-TCAA-CTGAG-GAAAAA-TT----ACA--TTTG----T---TATT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--ACAGC-TG-TAAT-AT--ATG-GTT-TAAA-AAAAACAAGCATC-AAAACACGAGG-AT-T-GACT----T-GCATTC---T-TCAAGG--TTGTCAAG-TTC--CATA---TA-ATT-CAT-----GTA----TAAC-ATTA-TCT--A-AAGT--T---A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-ATAATC-AACT-T-TTAA--AAAC-------------TT-A---ATTAG---TAAC--G--AACA--AGTA-AAATCAGAATTGC-C-CAAAA------CC-AT-TC---A--AG--GAAGG----GGCGG-CT-----------AAAAACTG-T-AT-TATGTGGA-TAT----CTATATACTGGA-ATT--TTATTTAGAG--AG-TATA-TAAATTATTaacga
gi|32 : taatcaatagtgcaacaaca-AACAA-ACATATT-AAAATGCAAAG-A-AT-GGTTA-C-T-GTATTC---T-TCT-AG--TTGTCAAG-TTG--TATGA--TA-ATT--ATT-G-c
gi|25 : gAA-CACGAGG-ATAT-GATCA-T-T-GTATTC---T-TCA-GT--TTGTGAAG-TAG--CATCA--TA-ACT-CATT-A-AATC----AAC--ATTT-CAT--C-TAAT--GGTGA--AT-TTGACTT-GCTC-T-AAAATCCAACT-A-T-AA--AAAC----CTTA----ATT-A---T--AG---TAGta
gi|19 : A-CACGAGG-ATAT-GATCA-TCT-GTATTCTTTT-TCA-GT--TTGT-GAG-TAG--CATCA--TA-ACT-CATTAA-AATC----AAAC-ATTT-CATACT-AACT--GGTGA--ATCTTGACTT-GCTCAA-AAAATC--ACTGA-T-AA--AAAC------CT----TTT-ATGTA--AGAACCAGC--A--AATG--AGTA-ATA--------GC---CAA-A------ACCATATC--CA--AG--GCAAAGGGGGGAGC-CT-----------AAA--CTG-TAAG-TATGT--GCTATC---TCATATACTTG--ATTaaaa
gi|18 : -T-T-GCATTC---T-TTA-TG--TTGTCAAAATTG--CACGA--TA-GTT-CATT-G-AAAT----GAATTATTT-CAT--TGAAAT---GATATTAT-TGGACTT-ACTT-T-TGAATCGAAAT-A---AAGTAAAA----ATCTTTCAATT-A---T--AA---TAGC--A---AAA--AATA-AAAATAG---TAA-A-TAGCAAGAAATCCCCT-TC--AAATAGTCGAAAT----GAATA-ATTACCCCCCCTAAAAATCTG-T-A--TGTGT--GTTATAACAGTATATTACTG--ATTAATTTCCTTTAG--TA-TACA-ATGTTTTTTTTA---AATCGGATCCAGGTACTGAAA-TCTA-TTATT--Attaaatttaaaggaagataacaaatatcaaatctttctctcaa
gi|26 : aaatgatcatatcc--AATA-AGACGTG---C-T-A-AAACA------CCCAT-TT--GA--AG--AAAAA----CAAGC-AT-----------AACATTGG-T-AT-AATGT--GTTGT----TTATATACTTGT-ATTAGTTCCTAATGT--AG-TATA-TCAATTATTCTGT--ATTTCAATT--G
gi|31 : CAAAAT--AA-TATATATACATTTTCTGT--AAATCAATT--TACACT---A-T-TA-TG-TT---TGTG-ATGTAATTCACTCTGGCAGTCAT-TTCAATa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): ATAAAGGCAATATAACTAACAATGAATGTTATGTGATTCTTATTACTGATTAAGGTTTCATATTGG
Unaligned ( gi|36 ): TCTATGCGATCTTATTACTGATCAAGGTTTCATTTATG
Alignments
lowQualScore : 111 111 22 11111 11111 111111111 1111 444444444444444 1111 111 2222222 1 2222 1111 1111 111111 2222222 222222222222 3333333333333333333333333333333333333 11111111111 333333333333333333333 1111 111 11 11 22 111 1
lowQualScore : 2 33 555 33 5 2 2 99 8 77777 2 000 2 0 33 2 3 888 3 3 1 3 2 4 4 111 666 2 0 33 0 2 66 66 2 5 888 33 2 33 33 2 5 444 0 2 2 55 2 2 2 33 44 1 5555 33333 0 666 33 2 2 33 2 5 33 444 8888 55555 4 2 33 2 33 33 2 2 33 55 4 5555 33 2 2 666666 4 444 2 444 4 2 2 2 33 2 2 2 4 2 2 2 2 2 2 2 1 2 5555 5555 1 2 2 55555555 444 33 1 2 9 1 55 4 2 33 11111 444 55 33 8 2 2 99 2 2 2 2 77 3 3 44 3 44 6666 4 8888 4 55 11111 55 4 55 4 55 4 4 55 1 55 3 7 3 5 3 88 55 55 3 555 7 3 3 3 55 3 999999999 3 1111 3 0 555 44 666666666666666 4 888 4 4 2222 4 4 88 4 1 4 8 66 8 4 4 66 4 4 4 5 1 4 4 4 55 4 3 4 5 3 3 3 1 44 99 44 111 3 2222222 3 0 3 44 3 0 55 7777 666 666 55 3 3 3 7777 3 2 666 2 1111 2 2 2 2 11 2 99999 2 444 2 2 33 2 5 5555 2 2 5 5 2 2 3 1 44 3 6 3 44 6 3 3 33 0 3 3 3333 8888 1 777777 555 55 2222222 777 000000000000 4 4444444444444444444444444444444444444 4 999 55 99 0 8888 0 4 99999999999 666666666666666666666 4 8 44 8 2222 55 1 99 7 11 333 11 4 4 33 5 11 111 6 6 6 99 8 1 8
lowQualScore : . .. ... .. . . . .. . ..... . ... . . .. . . ... . . . . . . . ... ... . . .. . . .. .. . . ... .. . .. .. . . ... . . . .. . . . .. .. . .... ..... . ... .. . . .. . . .. ... .... ..... . . .. . .. .. . . .. .. . .... .. . . ...... . ... . ... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .... . . . ........ ... .. . . . . .. . . .. ..... ... .. .. . . . .. . . . . .. . . .. . .. .... . .... . .. ..... .. . .. . .. . . .. . .. . . . . . .. .. .. . ... . . . . .. . ......... . .... . . ... .. ............... . ... . . .... . . .. . . . . .. . . . .. . . . . . . . . .. . . . . . . . . .. .. .. ... . ....... . . . .. . . .. .... ... ... .. . . . .... . . ... . .... . . . . .. . ..... . ... . . .. . . .... . . . . . . . . .. . . . .. . . . .. . . . .... .... . ...... ... .. ....... ... ............ . ..................................... . ... .. .. . .... . . ........... ..................... . . .. . .... .. . .. . .. ... .. . . .. . .. ... . . . .. . . .
lowQualScore : 9 99 000 99 7 9 9 66 6 11111 9 777 9 4 99 9 6 222 1 1 4 1 9 0 2 666 333 9 1 99 9 5 77 33 7 3 777 77 7 99 77 7 3 777 7 5 5 88 5 5 5 44 44 9 3333 11111 1 111 22 4 4 22 5 0 44 444 2222 99999 1 2 11 4 11 22 4 4 22 66 7 0000 22 4 4 888888 7 111 4 111 7 4 4 4 22 4 4 4 7 4 4 4 4 4 4 4 5 4 0000 0000 2 4 4 66666666 111 22 8 4 4 0 33 7 4 22 44444 111 66 44 0 7 7 66 9 9 9 9 33 1 1 22 1 22 5555 0 5555 0 55 77777 55 0 55 0 55 0 0 00 4 00 6 3 6 5 6 66 00 00 6 777 3 6 6 6 00 6 555555555 6 3333 6 5 888 66 777777777777777 0 666 0 0 6666 0 0 33 4 1 4 9 11 2 4 4 11 4 4 4 3 9 4 4 4 44 4 4 4 3 6 6 6 3 66 22 66 555 3 7777777 3 0 3 66 3 5 00 7777 444 444 00 6 6 6 6666 6 0 444 5 5555 9 9 9 7 99 7 33333 7 777 7 7 77 7 0 7777 7 7 3 3 9 9 1 5 22 1 5 1 22 2 1 1 33 7 1 1 5555 8888 0 000000 444 55 6666666 999 555555555555 0 7777777777777777777777777777777777777 0 444 55 55 1 5555 5 0 00000000000 444444444444444444444 0 0 99 0 5555 55 0 88 4 88 333 66 0 0 66 7 44 777 7 7 7 22 0 4 0
consensus : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATA-T-T-T--GTAC----A---GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--G-AATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-A-CTGG-CATCCAC--AG--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--AT-ATCTTT---CCTTCCACCCCA--TTACC-C---CC------TGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGT-AC-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATTA-ATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAAC-N--TCAATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---NGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-AT-TATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
Reference ( family-171 ) : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGN--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCNC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AANAT--T-T-T--GTAC----A---GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--G-AATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-A-CCGG-CATCCAC--AG--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--AT-ATCTTT---CCTTCCACCCCA--TTA-------CC------TGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGT-AC-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATTN-ATG-CATACGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAAC-A--TCNATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---TGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANTA-AT-TATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
gi|1 : GTAAGCCCTTA--CTGTAA--CA---T-GTCCT--GGATAACGGAATG-ACT--AAA-TG-----G-TATA---T-TAT----TATGTTGGA--T-TCTCAATT-AGAATAAAGAATTG-CTGAATAA-GATG-AA-A-ATATGATAAGCATGGCCA--T-TCAATCTG--AT-GTG-AT---T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCCTACATGTTTGGT-ATA-AATCCTA-GC-AA-AA--TA-ACCC----CTGAAAATTC-CCAGAGAAAAA-CTTAATTCTTAGTC-A-TCGTCA-T-TTAACA--TT---ATCCC----AA------TATTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACGGCT--CA--CTAAT----A--GAA-AAG-GC------ATGC---A-G---AG-GGG-T-AACAAGAT--A-TT-CGATTT-TA-G-TAA-TGT-TAAA-G-GGAT-GAGG-A----AGAAAAAGA-CT-GTAT--T--GTCCCTGT--TGTCATCG-T-AATAT--T-T-T--GGA-----A---AT--AAAA---TGT--ATTAGA-GT-AAT-A--CG-TG-C-A-A--GGC-C-A--TT-A-TTT--CCT----CATCATTCAA----TCCACGAAAATAGCCCGTTTAC--AAC--AATGAT--G-AATTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-A-AAGA-C-TCCACT-AG--TT-ATT--AT-GTAA-TAATGTAG-TTG-CGC--ATATAATTAA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--AT-A--TTT---TCTAACACCAAA--TTA-------CCT-----TGCAA-AAAT-GTATCCAGCGT-AC-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAAT-ATGAAGCAAGATCACCGCGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTCAAAATGCAGAAAGATTTATTTTC--TAT-TACAC-T-ATTA-ATGTTATGTGAA-TTTAATTTA-TTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T-----ACAATTT-GAAAGT-TT--AT-AATAG--CTAAAAAAACG---TGAT---TA--AC-AGATG--AT-AT--ATTG-GTTA-AAA---A-----AAGCATT---AAA--ACAGAGGAATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGT--CATAA----TAGGTT-CA-T-G-AATC-TA-GATT-TCAT--T-AAATGGAG-A--ATGTTGACTT-ACTT-T--GAATCTTAA-T-A---CAAAAAC-A--TCTATT-A---AAG---TGGA--ATTG----ATC--AAT------------A-AAGA-GTG---TGC-AGCAG-------C-------C----CC-T-TT--GA--AGC-GAACA----GAAGC-AA-----------TAAA--------------CT-----TG-TAAT-TATGTAT-TAT----TA--GTATAGTTGTAATTAGTTTCCAATAG--AG-ATAAAT-AT-TATTTTGTA-AATTC-AATTGGGGCACT---ATTCTATTT-TT--ATGCG-ATGTATTTGGCTCTTTCATTCATGTTGA
gi|10 : aataaagacataataacataaacaataattctatggttgatcttattagtgatcaagaattaatttatgGTATGCCTT--A-CTGTAA--C----TTGTA-T--GGATAACGTAGTG-A-TTAAAG-TG-----G-TGTA---T-TTTTTC-T-TGTTGGGGTTATCTTA-TT--GAATGAAAA-TTGGCTAAATAAGAA---AA-G-ACATAATAACC-T--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--AAT-TT-A--AAACCAA-G-CTTT---ATAGTTAAT-CTA-A-CCTGA-GC-AA-AAGATA-CCACGACCCTGAAA-TCTTCCAGAGAAAAAACCTA--TCTAAATT-A-T--TCAAT-TTAACA---T---ACCCCCA--AA-----GTA-TAC-A--TGT-ACTT-G--AATACGAGAACAGCT--CAAATTA-T----A--GAA---G-GC------ACAC---A-AGAAAG-AGA-T-AACAA-ATTAA-TA-CGATTT-ATTA-TGAATGTACATT-G-GG-TTGAGGGA----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATAAT-T-T--GTAC----A---GT--AAAATCGTGC--ATCAAAAGTAA-T-ACGCG-TG-CAA-CA-AGT-C-A--TTTA-TAA--TGT-----ATCAT
gi|11 : caaacaggtaaggaaggataaaggaatatacaattaaaatagaagtatgtgatcttattatgattaatggttttcattaatgTT---CCTTTCACCCCA--TTA-------CCCTCTCCTGCAA-ATATTG-ATCCAGGGC-AC-TGAAA--A-T-TTTGTAAAC---TAGCTTAA-TCATG-AGC-AGATC-C--C-AGTCCATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGAATTATTTTCTATATTCGTAA-T-ATTCGATG-CATATGAA-TTTATT-TA-TAAATC-AAACATAGTAG--AA--A--T---TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACAATTTTG-ATTT-TT--A--AATAG--CT----AAACG---TG-T---TA--AC-AGCTGT-AT-AT-----G-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA--AC-AAG--ATATGGAACA-T-----TAGCATTA---T-TC-AG---TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CAT--G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAA-AGTGTA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A----AAAAAC-C--TGAATTCAT--AAG---TAGC--A-AA----ACAGTAAT------------ACAGAA-TTA---GCC-A-CA--------CA------A----CCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGCAAT-----------AAAA--------------AC-----TG-T-AT-TATGTGA-TAT----CT--ATA-ATT-----TTAATT--CAAGAAGCAGTATATAA-AT-TATTC
gi|12 : AATTATATAACTGGAAT-GTG-ATA--T--TTC-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CAAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TATAATTT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTATTGC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-C----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGG-T-AAAGA-AT--A-TT-TTATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-T-GG-T-GAAG-A----A----AATA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT--TCT-T--GTAC----A---G---AAAAATGTAT--ATCAAAAGT-A-T-T--CG-TG-A-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTTAAA--AAC--A-TGAT--G-AATTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAG-A-CTGG-CATCAAC--AG--TTCATT--AT-GT-A-T-ATAT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCAGC-ATTAG-A--AC-ATATTT---CCTTCTACCCCA--TTA-------CC------
gi|13 : aatattgctttctgaagttctataatggaattatggATGCCTTTA--CTGTAA---A---TTGTACT--GGATT-AGTAGTGTA-T--AAG-TG-----G-TGTAC--T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-T--ATGATAAA---TTG-CTAAATAAAGAAC-AA-GTACATAATAA--AT--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-AGCTC----ATA-TTAAT-ATA-T-ACTGA-GCAAA-AA--TA-CACC----CTGAAA-ATT-CCAG-GAAAA--CCTA--TCTAAATTAA-T--TCA-T-TTAAAA--AT---A-CCCATAAAA-----GTA-TAC-ACTCGTAACTA-GGAA-TATCG-AACAGAC--TA--ATA-TAGCAA--GAA-GAG-GC------AT-C---A-A---CGAAGA-T-AAAAA-AT--ATTT-CGATTTCAT-ATTGA-TA---ATTCGCGG-T-GAAG-GCAACA----AACA-CT-CTAC--TCCTTCT---TAATGTCATAGCT-AAAATAAT-T-TAAGTACGACAA---GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-TAA--CG-TG-C-A-C--AGT-CAA--TTTA-TTA--TGT----CCTCAT
gi|14 : TAA---------TTTAAGTTCCAAC-TTTA--C--ATTGTCTTTGACCCCACCACCCCAAGCCA-------C--------GCAA-AATT-G-ATGTAGGCT-AC-TGATCT-G-T-TT-G-AAACAC-TATCTCAGATGATT-AAC-AGATCAC--CAAATT-ATT-ATTC--C-TGTA-ACATACAT-TTTCATTATTTT-TCTAT-CGCAA-A-ATCA-ATG-TATCAGAA-TTTATTACG-TAA-TC-GAGCGTCGTAG--AA--AATT-A-TCAC-CTAAGGATTTG-TTTTCCA-AATTT-GTATCTATT--AC-AATAAACCA----AAAAA---TGACATGTAAGACAAACTG--AT-ATTCA-CA-GTAATCAATGCAAAAAC---C----------CAC-AAGA-ATATG-ATCAGT-----T-GCCTGC---TCTC-AGGTTTTGTC-AAA-TGCATCAAATTTA-ATT-CACCGG-AATC-AA-CAT
gi|15 : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGTAGTG-A-T--AAAGTG-----G-TGTA---T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-TT-ATGATAAAAA-TTG-CTAAATAAAGAAA-AA-G-ACATAATCAACAT--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-G-CTCT---ATATTAATC-ATA-A-CCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CCTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-TTAACA--AT---ACCCA----AA-----GTACTAC-A--TGT-ATTG-A--A-TACGA-AACAGCT--CA--ATA-T----A--G-A-AAG-GC------AC-A---A-G---AA-AGA-T-AAAAA-AT--A-TT-CGATTT-AT-A-TGA-TGT-AATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATA-T-T-T--GTAC----A---GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-agttttatccggaatgcggacattttaactttatttgaaaatt
gi|16 : catatatgGCCCTCAA-CTGTAA--TA---TTGTACT--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TATA---T-TGT--C-TATGTTAGA--TATCGTA-TT-ATAATAAAGA-TTG-CTAAATAA-----------------TAAGCAT--TCAATT-TTA-TCTG--AT-GTG------T--TTTATT-CACTAACCAA-GGCACT---ATATTAGAT-ATA-A-CCTGA-GC-GA-AA--TT-CCAC----ATGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAGCT-A-T--TCA-T-CTAGCA--AT---GTCCC----AA-----GTACTAC-A--
gi|16 : -AC--A-TT-TGATTT-AG-A-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TT-------CTCT---T--TGTCATCG-T-AAACTA-T-T-T--GTAC----A---GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-G--CA-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCAtttgatttagatgatgccattgggtgaggaaaacactttctctttgtcatcgtaaactatttgtacagtaaaaatgtgcatcaaaagtatgcatgcacagtcatttattatgtcatca
gi|17 : gccctcaactgtaatattgtactagatacggagtgataaaatggtatattgtctatgttagatatcgtattataataaagattgctaaataataagcattcaattttatctgatgtgttttattcactaaccaaggcactatattagatataacctgagcgaaattccacatgaaatctccagagaaaacttatctaagctattcatctagcaatgtcccaagtact-TAA-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACA-TTT-G--TTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGTAAT-AT--A-TG-GTT-TAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-AT-TG-AC---T-----T-GCATTC---T-TCAAGG--TTGTC-AAGTTCCAT-A----TA-ATT-CA-T-G-TAT--AA-CATTATC----T-AAA--GTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-ATAAT-CAACTT-T---TAAAAAC----TTAATT------AG---TAAC--G--A----ACA--AGT------------A-AAAT-CAGAATTGC-C-CAA--------A------A----CCAT-TC---A--AG--GAAGG----GGCGG-CT-----------AAAA--------------AC-----TG-T-AT-TATGTGGATAT----CT--ATATACTGGA-ATT--TTATTTAGAG--AGTATATAA-AT-TATTC
gi|18 : ATG-ATCA-TATCCTT-GCATTC---T-TT-ATG--TTGTCAAAATTGCACGA----TA-GTT-CATT-GAAATG-AATTATT-TCAT--TGAAATGAT--ATTAT-TGGACTT-ACTT-T-TGAATCGAAA-T-AAAGTAAAAAT-CTTTCAATT-A---TAA---TAGC--A--A----A-A--AAT------------A-AAAA-TAG---TAA-A-TAG-------CAAGAAATC----CCCT-TC--AAATAGTCGAAAT----GAATA-ATTACCCCCCCTAAAAA--------------TC-----TG-T-A--TGTGTGT-TATAACAGT--ATATTACTG--ATTAATTTCC--TTT--AGTATAC-A-ATGTTTTTTTT--AAATCGGATCCAGGTACTGAAA-TCTA-TTATT--A
gi|19 : aaA-CAC-GAGG-ATATG-ATCA-TC----T-GTATTCTTTT-TC-AGT--TTGT--GAGTAGCATCA----TA-ACT-CATTAA-AATCAAA-CATT-TCATACT-AACTGGTG-A--ATCTTGACTT-GCTCAA-AAAATC--AC-TGA---TAAAAAC-----CTTTT-ATGTAAGAACCAGC--A--A----ATG--AGT------------A-ATA---------GC---CAA--------A------A----CCATATC--CA--AG--GCAAAGGGGGGAGC-CT-----------AAA----------------C-----TG-TAAG-TATGTGC-TATC---TC--ATATACTTG--ATT
gi|2 : GTAAGCCTTTAA-CTGTAG--AA---TTGTCCT--GGAT--CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TA-A---TATCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGAT-AGCAT--GCATTT-CAAATCTGA-AT-GTGAATA--TTCTTT-TT-C--TAACCAACGACTCT---ATGTTTGGT-ATACA-TCTGA-GC-AAGAA--TA--CTC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAGAA--CTTA--TCTTAGTC-ATT--TCA-TATTAACA--AT----TCCC----AA-----CTATTACAA--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CC--CTA-T----A--GAAGAAG-GA------TT-C---A-G---AG-GGGTT-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGATCT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--T-T-T--GGA-----A---GT---AAAATGTAT--ATCAAAGGT-A-T-AG-CGTTG-C-ATC--AG--C-A--TTTA-TTA--ATC----CATC-TT-AA----TC-A-GAAAATAGC--GTT-AAACAAC--A-TGATAAG-AATTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-A-CAGA-CGTCAAC--AG--TTCATTTAAT-GT-A-T-ATGT-GTTTG-CGC--ATGT-ATTGGGAAATTTTTTTTAAGTTTCATCAATTAG-CAAAT-ATATTT----CTTCAA--CCA--ATA--------C------TGC-A-AAAT-GAATCCAGCGT-AC-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-CTTAGCTTAAATC-TG-AGC-AGAT-AC--CGAGTC-ATTAATTCCTT-TGTC-AAATGCAA-AAGATTTA-TTTCTATAT-CACAA-TAATTA-ATG-TATATGAATTTTATTATATTTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAAGCTGAGAAAGAA-T-------AATTT-GAATTT-TA--ATAAATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGATGT-AT-AT--A-TG-GTTATCAA---AAAAA-AAGCAT-----AA-CAC-GCGG-ATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G--ATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTTAACTT-T-GAAATCTAAC-T-A----AAAAAC-A--CTAATTAA---AAG---TGGC--A-TG----AT---AAT------------A-AGAC-GTG----GC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TTTGAA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA---------------C-----TGTT-ATGTATGTAT-TAT----TT--ATATAGTTGT-ATTAGTTCC--ATAG--ACTATAATA-CT-TATTTTGTAAAATTC-AATTG-GGCACT---A-TCTA-TT-TTAAATGCGAATGTAATT-GCTCTTTCATTCAT-TTGAttaaatttaaaggaagataacaaatatcaaatctttctctcaa
gi|20 : aatgATAGTCGCAAA--A--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACAATTT-G-ATTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAAACAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-TATC-AA-CATT-TCCT--T-ACAAAGTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-T---TAAAAAC-C--TTAATT-A---TAG---T
gi|21 : A-A-TCTAA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TGTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCGC----AT-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-AATGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-ACG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AA--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-CATT-G-GG-T-AATC-A----A----AAGA-C---TAT--T--GTCT---T--TGTCATGG-TGAACTT--T-T-T--GTAC----A---GTAAAAAAATGTGT--ATCAAAAGaacga
gi|22 : GTATGCCCTTAA-CTGT-A--CA---TTGTACC--GGATA-CAGAGTG-A-TA-AAA-TG-----G-TATA---T-TTT--C-TTCGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TCG-CT-----------------ATATAATAAGCAT--TCAA-T-TAAAGCTG--AT-GTG-ATC--T--ATT-TA-C--TAACCAA-GGCTCT---ACATTAGGT-ATA-A-CCTGA-GC-A--------------------AAA-TCT-CCAGAGAAAG--CTTA--TATAAATC-A-T--
gi|23 : gTGG-GC-AG-AA--TA-TTGA----CAGTAA-ACT-CCAGAAAAAA--CT-------AAATT-A-T--TCA-C-GTGACA--AT---GCCCT----AG-----ATGATAT-G--CAT-ATTT-G--A-TATGA-AACAGGT--CA--CCA-T----A--TAA-AAA-AC------AC-A---A-G---AA-AGG-T-TATAA-AT--A-TT-TGATTG-AT-A-TGA-TGT-CAT-----A-T-GA-------------------------------TCT---T--TCTCGTCG-C-AAAATA-T-C-T--GTGT----A---GC--AAAAA
gi|24 : C-A--CGT-ATTG-G--A-TATGA-AAGAGCT--CA--CTG-C----A--GAA-A-G-GC------A--C---ATG---AA-AGA-T-AATGA-AT--T-TT-CTATTT-AT-G-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CA-TTCT--C--TTCT---T--TGTCAAAA-T-AAAATA-T-T-C--GTAC----A---GCA-AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-g
gi|25 : AA-CAC-GAGG-ATATG-ATCA-T-----T-GTATTC---T-TC-AGT--TTGTG-AAGTAGCATCA----TA-ACT-CATT-A-AATC-AA-CATT-TCAT--C-TAATGGTG-A--AT-TTGACTT-GCTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAAC-C--TTAATT-A---TAG---TAG
gi|26 : --AAT------------A-AGAC-GTG---C-T-A-AAA-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--AAAAA----CAAGC-AT-----------AACA--------------TT-----GG-T-AT-AATGTGT-TGT----TT--ATATACTTGT-ATTAGTTCCTAATGT--AGTATATCA-AT-TATTCTGT--ATTTC-AATT--Gaaaa
gi|27 : ATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-A-CCGG-CATCCAC--AA--ATCACT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATTT-ATTTA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--AT-ACCTCT---CCTTTCACCCCA--TTA-------CC------a
gi|28 : GCCCTTAA-TTGTAA--CA---TTGTACC--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TATA---T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTAAATA-----------------ATAAGCAT--TCAATA-TAAAcctctcctgcaa
gi|29 : AA--CTTA--TCTAAACT-A-T--CTA-T-ATAACACTATGTAATACT----AATTAAGGTGCTAC-A--CGT-ATCC-A--A-TAAGA-AACAAGT--CA--CCT-T----A--GAA-AAATAC------AC-C---C-G---AG-AGA-T-AA
gi|3 : GTAAGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTCCT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGATAAGCAT--GCAATT-CAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTTAGTC-A-T--TCA-T-TTAACA--AT---ATCCC----AA-----CTATTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGA-CT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--T-T-T--GGAA----A---GT--AAAAATGTAT--ATCAAGAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGC-C-A--TTTA-TTA--TCT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AAC-AAC--A-TGAT--G-AATTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-A-CAGA-CGTCCAC--AG--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-CGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--AT-ATATTT---CCTTCAACCCAA--TTA-------CC------TGCAA-AAAT-G-ATCCAGCGT-AC-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAA-AAGATTTATTTTCTATAT-CACAA-T-ATTA-ATG-TATATGAA-TTTATTATA-TTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T-----ACAATTT-G-AAGT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGATGT-AT-AT--A-TG-GTTATCAA---AAAAA-AAGCATT---AAA-CAC-GAGG-ATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G-AATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTT-ACTT-T-GAAATCTAAC-T-A---CAAAAAC-A--TCTATT-A---AAG---TGGC--A-TG----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---TGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA--------------CT-----TG-T-AT-TATGTAT-TAT----TT--ATATAGTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATAATA-CT-TATTTTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGAATtata
gi|30 : TTGA---------TTTCAGTTCAAGC-ATTAGTC--A--ATCTTT---CCTTCAACCCCA--CTGCCCC---CC------CGCAAGAAAT---ATCCAGGGT-AC-TTAAC--A-TATT-GTAAAgt
gi|31 : AATAA--TATATA-TACAT-T-TTCTGT--AAATC-AATT--TACACT---A-T-TA-TG-TT---TGTG-ATGTAATTCACTCTGGCAGTCAT-TTCAATacaacatgcatctcaaat
gi|32 : tttgcaaAACAAACATATTAAAA-TGC-AAAG-A-ATG-GTTA-C-----T-GTATTC---T-TC-TAG--TTGTC-AAGTTGTATGA----TA-ATT--ATT-G-tttgcct
gi|34 : gAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--TGATA-CGGAGTG-A-TG-AAA-TGCTTAAGTTATA---T-CTT--CTTATGTta
gi|35 : T-TAAAGCTG--AT-GTG-AT---C--TTT-TA-C--TAACCAA-GGCTGT---ATATTAGGT-ATA-A-
gi|4 : aaTATGCTCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTTCT--GGATA-CGTAGTA-A-T--AAA-TG-----G-T-TA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-GAAATAAAGA-TCG-CTGAATAAAGATG-AAAG-ACATAATAAGCAT--TCAATT-CAAAACTA--AT-TTG-ATA--T--TT-----C--TAAC-AC-GGCTCT---ATATTTGGTTATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----TTGAAA-TCT-CCAGAGAAA---CTTA--TCTAAGTT-A-T--TCA-T-CTAACA--AA---ATCCC----AA-----GTA-TAC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CAA-CTT-A----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGG-T-AACAA-AT--A-T---------AG-A-T---TGT-CATT-G-GG-T-GAAG-A----A----AACA-GT-TTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-TAAAAAT--TGT-G--GTA-----A---AT--AAAAATGTAA--TTCAAGAGT-A-T-A--CG-T--C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCATT-GA----TC-ACGAAAATAGC--GTT--A--AAC--A-TGAT--GAAATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACCCGG-CATCCACAAAG---TCACT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATTT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--AT-ATCTTT---CCTCTCA-CCCA--TTACCCCTCTCC------TGCAA-AATT-G-ATCCAGGGCAAC-TGAAA--ATT-TT-GTAAAA-C-TAGCTTGAATCATG-AGC-AGATCCC--CAAGTC-ATT-ATTT--T-TGTC-AAATGCAT-TAGAATTA-TTTCTATAT-CGTAA-T-ATTC-ATG-CATATGAA-TTTATTCTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACA-------ATTT-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TG-T---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-CTATTA---T-TC-AGG--TTATC-AAGTTCCATCA----TA-ATTCCATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTT-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---T-AAAAC-C--TTAATT-AT--AA-----GGCAAA-TAATATATA--AATTATTATAGTAGCA-AAACAGTA---AAT-A-CAGAATTAGCCA------CCAAACCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGC-CT-----------AAAAAATAACTGGTGGAGTCCTAAATG-T-AA-TATGGGGATAT----CTAGATATGATTTT-A--AGTT--CAAGAAGCAGTATAATA-AA-TATTC
gi|5 : CCCTTAA--TGTAG--CAATCTTGTACCTCGGATA-CGGA-TG-A-T--AAT-TG-----G-TATAA--T-TCC------TGTTGG---TAT-TC---T-AGAAAAATAA-TTG-CTGAATAACGATT-GA-G-ACATGAAAAG-A---TCAA-T-TAAATCTG--AT-GTG-ATAT-T--TTT-TT-C--TA---AA-G--TCC---ATATTTGGT-GTA-A--CTGA-GG-AA-AA--TATCCAC----CTGAAA-----------AAA----TTA--TTTCAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTAG-T--AGT-ATTC-G--A-TACG--AACAACTTCCC--CTACT----A--AAC-AAA-GCGGACTAAG-C---A-G---GGCGAA-TAAACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT--ATG-A-GA-C-GATA-G----A----AACA-CCACTATCCT--TTCT---T--TGTTATGA-TAAATAT--T-TGT--ATAC----ACCCGT---AAAATGTATGAATGAGAAGTAA-T-A--AG-TG-C-A-CAAAGT-C-AATCTTACTTAAGCGCTACACATCATT-AA----TC-ACG-AAATAGC--GTT--A--AACTAA-TGAT--G-AATG-TTGTTTTAAA-TG-ATAAT---AAGCAAG--AGC-TAACAA-CTGGTCAT-CAC--AT--TGCATT--ATGGT-GTT-ATGT-A-ATG-TGTGAATGT-ATTGATG-------TTTAAGT--CATC-A-TAG-----T-ATTTTT---CCTTCCACCCCA--TTACCACTT-CC------TGCAA-AAAT-G-ATCCA-GGT-ACATGAACTTT-T-TT-GTAAA--C-TAGCTTAAA--ATG-AGCAAAATCAC--C-AGTC-ATT-ATTC--TGTGTC--AATGCAT-TATA-TTATTTTCTATAT-CGTAATT-ATTC-GTG-CATACGAA-TTTATTCTA-TAA-TCAAAACATTGTAG--AA--A--T-GCTCAA-CTGAGGAAAAT-T-----ACAATTT-G-ATTT-TTTAAT-AATAG---T----AAACGGTATGAT---TC--TC-AGCTGT-ATAAT--G-TGAGTTAT-CA---AAACACAAGCATCA--AAA-CAC-GACG-ATATG-AA-A-T-----T-GTATTC---T-TT-AGG--TTGTA-AAGTTCCAT-A----T--ATT-CATC-GAAATA-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--A--GTGACTT--CTC-TAAAAATCC-AC-T-AT--TAAAAATAA--TCAAT-------AG---TG
gi|5 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatccA-TAA-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----AC-ATTT-G--TTA-TT--AT-Acaacaacagtcaactgaggaaaaattacatttgttattatat
gi|6 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatcccccttaatgtagcaatcttgtacctcggatacggatgataattggtataattcctgttggtattctagaaaaataattgctgaataacgattgagacatgaaaagatcaattaaatctgatgtgatatttttttctaaagtccatatttggtgtaactgaggaaaatatccacctgaaaaaattatttcaattattcatctaacaatatctcaagtactagtagtattcgatacgaacaacttcccctactaaacaaagcggactaagcagggcgaataaacgaatattcgatttagttgatgtatgagacgatagaaacaccactatcctttctttgttatgataaatatttgtatacacccgtaaaatgtatgaatgagaagtaataagtgcacaaagtcaatcttacttaagcgctacacatcattaatcacgaaatagcgttaaactaatgatgaatgttgttttaaatgataataagcaagagctaacaactggtcatcacattgcattatggtgttatgtaatgtgtgaatgtattgatgtttaagtcatcatagtatttttccttccaccccattaccacttcctgcaaaaatgatccaggtacatgaacttttttgtaaactagcttaaaatgagcaaaatcaccagtcattattctgtgtcaatgcattatattattttctatatcgtaattattcgtgcatacgaatttattctataatcaaaacattgtagaaatgctcaactgaggaaaattacaatttgattttttaataatagtaaacggtatgattctcagctgtataatgtgagttatcaaaacacaagcatcaaaacacgacgatatgaaattgtattctttaggttgtaaagttccatatattcatcgaaataaacatttccttaaaaagtgaagtgacttctctaaaaatccactattaaaaC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-A-G-GC------AC-A---A-G---AA-AGA-T-AACGA-AT--T-TT-CTATTG-AT-G-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTCT--C--TTCA---T--TGTCATGG-T-AAAATA-T-T-T--GTTC----T---GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TGTC-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ATGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--G-AATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-A-CTGG-CATCCAC--AA--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATCGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--AT-ATCTTT---CCTTCCACCCTA--TTACCCCT--CC------TGCAA-AAAT-A-TTCCAGGGT-AC-TGACA--A-T-TT-GTGAAA-C-TAGCTTAAATCATG-ATC-AGATTAC--CAAATC-ATC-ATTC--T-TGTC-AAACGCAT-TAGAATTTTTTTCTGTAT-CGCAA-T-ATTA-ATG-TATATGAA-TGTATCATA-TAG-TC-AAACAGAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAATACAAATT-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAC--AT----AAACG---TGAT---TA--AT-AGCTGT-A----------------AA----------AAGCATT---AAG-CAC-GAGG-ATATT-ATCA-T-----A-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-CAATTGTG-A--AT-TTCACTT-AATT-T-GAAATATATC-T-A---CAAAAAC-A--TCTATT-A---AAG---TGGC--A-AA----ATG--AAT------------A-AGAC-ATG---GGCTA-AAG-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--AGAAA----GTAGC-AT-----------AAAA--------------TT-----GG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATACTTGT-TTTAGTTCCTAATGC--AGTATATCA-AA-TATTCTGT--ATTTC-AATT--GACACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGt
gi|7 : GGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-T-----------------TA--TGTTAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTGT-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAACT--CC--CTA-T----A--AAA-AAG-GG------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT-CATT-G-AG-C-GAAG-A----A----AACA-CT-TCA---T--TTCT---T--TGTTATGA-T-AAAATA-T-T-T--GTAT----A---GT--AAAAATGTAT--ATGAGAAGT-A-T-A--AG-TG-C-A-C--AGT-A-A--TTTA-TTA--GGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--G-AATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-A-CTGG-CATCCAC--AA--TTCATT--AT-GT-G-T-ATGT-G-TTG-TGA--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--AT-ATCTTT---CCTTCCACCCCA--TTACCACCT-CC------TGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGT-AC-TGAAC--ATT-TT-GTAAAA-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AAATCAC--CAAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TATATTTATTTTCTATAT-CGTAA-T-ATTC-GTG-CATACGAA-TTTATTCTA-TAA-TC-AAACATTGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACAATTT-G-ATTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATC-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--AG-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-AT--TAAAAAC----TTAATC-A---TAG---TCGC--A-
gi|8 : G-CTAAATAAAGAT--AA-T-GCAT--TAA-------CAAT---AAATCTT--AT-GCG-ATC--T--TAT-TA-C--TGATCAA-GGCTTC---ATTGATGGT-ATaa
gi|8 : taGTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAATA-TTG-CTGAATTAAGATG-AA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAATT--AAAGCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TTTC--TAACCAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-ACAC----CTGAA------------------CTAA--TCTATATT-A-T--TCA-T-CTAACA--TT---ATCCC----AA-----GTACTAT-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----A--GGA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-CG-T-AAAG-A----A----AACA-CT-TCA---T--TTCT---T--TGTCATGG-T-AAAATA-T-T-T--GTAT----A---GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGT-A-T-A--CA-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--T-AATGATTGGTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-A-CTGT-CATCCAC--AG--TTCATT--AT-GT-T-T-ATGT-G-TTG-TAC--ATGT-ATgcccttaactgtaacattgtactggatacggaatgataaattgtatattctctatgttggatatctcattagaataaatattgctgaattaagatgaagacatgaaaagcatttaattaaagctgatgtgatatttttttctaaccaagaccctatagttggtgtaatctgaggaaaataacacctgaactaatctatattattcatctaacattatcccaagtactatacgtattcgatacgaaacagttcactataggaaaggcatcagaggggtaacgaatattcgatttagatgatgtcattgcgtaaagaaaacacttcatttctttgtcatggtaaaatatttgtatagtaaaaatatatatcagaagtatacatgcacagtcatttattacgtcattattaatcacgaaaatagcgttaaaacatgattaatgattggtttatgataatcaagcaagagctaacactgtcatccacagttcattatgtttatgtgttgtacatgtat
gi|9 : tagctaaataaagataatgcattaacaataaatcttatgcgatcttattactgatcaaggcttcattgatgCCCTTAAACTGTAAGACA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TATAAGTT-TCT--C-TATG-TGGA--TATCTCA-TTAAGAATAAATA-TTG-CT-AATTAAGATGAAA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAAAT-TAAG-CTG--ATAGTGCATATTT--TTT-TT-C--TAAACAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A--CTGAGGA-AA-AA--TA--CAC----CTG---------------GAA--CTAA--TCTATATT-A-T--TCA-TCCTAACA--TT---ATCCC----A-------TACTAT-A--CGT-ATTCGG--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----AAGGAA-AAG-GC------AT-CAAAA-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TTCCGATTT-AGAA-TGA-TGT-CA-T-G-CG-T-AAAG------A----AACA-CT-TCAT--T--TCCT---T--TGTCATGG-TAAAAATA-T-T-T--GTATA---A---GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGTAA-T-AC-CA-TG-C-A-C--AGTCC-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AACAGTTC-AC-AAAATAGC--GTA-AA--AAC--A-TGAT--T-AATGATTGGTTT--ACTGAATAATCAAAAGCAAGAAAGCTTAACAA-ATGT-CATCCAC--AGTTTTCATT--AT-GT-T-TAATGT-G-TTGTTAC--ATGT-AT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): ATAAAGGCAATATAACTAACAATGAATGTTATGTGATTCTTATTACTGATTAAGGTTTCATATTGG
Unaligned ( gi|36 ): TCTATGCGATCTTATTACTGATCAAGGTTTCATTTATG
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111 111111111 1111 2222222222222222 111 2222222 1 2222 1111 111111 2222222 222222222222 3333333333333333333333333333333333333 11111111111 333333333333333333333 1111 111 11 22 111 1
lowQualScore : 2 33 555 777 5 2 2 99 8 77777 2 000 2 0 33 2 3 888 3 3 1 3 2 4 4 111 666 2 0 33 0 2 66 66 2 5 888 33 2 33 33 2 5 444 0 2 2 55 2 2 2 33 2 2 5555 33333 0 666 33 2 2 33 2 5 33 444 8888 55555 4 2 33 2 33 33 2 2 33 55 4 5555 33 2 2 666666 4 444 2 444 4 2 2 2 33 2 2 2 4 2 2 2 2 2 2 2 1 2 5555 5555 1 2 2 0 444444 444 33 1 2 2 77 2 33 2 22222 55555 55 33 8 2 2 99 2 2 2 2 77 3 3 44 3 44 6666 4 8888 4 55 8 99 55 4 55 4 55 4 4 55 1 55 3 7 44 3 3 66666 55 3 555 7 3 3 3 55 3 999999999 3 1111 3 0 555 555 8888888888888888 3 888 4 4 99 4 4 8 88 4 1 4 8 66 8 4 4 66 4 4 4 5 4 4 4 55 4 4 5 3 3 3 1 44 99 44 111 3 2222222 3 0 3 44 3 0 55 7777 666 666 55 3 3 3 7777 3 2 666 2 1111 2 2 2 2 11 2 99999 2 444 2 2 33 2 5 5555 2 2 5 5 2 2 3 1 44 3 6 3 44 6 3 3 33 0 3 3 3333 44 44 66 777777 555 55 2222222 777 000000000000 4 3333333333333333333333333333333333333 4 999 55 99 0 8888 0 4 99999999999 666666666666666666666 4 8 44 8 2222 55 1 99 7 11 333 22 4 0 33 5 11 111 6 6 6 99 8 1 8
lowQualScore : . .. ... ... . . . .. . ..... . ... . . .. . . ... . . . . . . . ... ... . . .. . . .. .. . . ... .. . .. .. . . ... . . . .. . . . .. . . .... ..... . ... .. . . .. . . .. ... .... ..... . . .. . .. .. . . .. .. . .... .. . . ...... . ... . ... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .... . . . . ...... ... .. . . . .. . .. . ..... ..... .. .. . . . .. . . . . .. . . .. . .. .... . .... . .. . .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . . ..... .. . ... . . . . .. . ......... . .... . . ... ... ................ . ... . . .. . . . .. . . . . .. . . . .. . . . . . . . .. . . . . . . . .. .. .. ... . ....... . . . .. . . .. .... ... ... .. . . . .... . . ... . .... . . . . .. . ..... . ... . . .. . . .... . . . . . . . . .. . . . .. . . . .. . . . .... .. .. .. ...... ... .. ....... ... ............ . ..................................... . ... .. .. . .... . . ........... ..................... . . .. . .... .. . .. . .. ... .. . . .. . .. ... . . . .. . . .
lowQualScore : 9 99 000 888 7 9 9 66 6 11111 9 777 9 4 99 9 6 222 1 1 4 1 9 0 2 666 333 9 1 99 9 5 77 33 7 3 777 77 7 99 77 7 3 777 7 5 5 88 5 5 5 44 5 5 3333 11111 1 111 22 4 4 22 5 0 44 444 2222 99999 1 2 11 4 11 22 4 4 22 66 7 0000 22 4 4 888888 7 111 4 111 7 4 4 4 22 4 4 4 7 4 4 4 4 4 4 4 5 4 0000 0000 2 4 4 9 222222 111 22 8 4 4 44 4 22 4 44444 99999 66 44 0 7 7 66 9 9 9 9 33 1 1 22 1 22 5555 0 5555 0 55 0 55 55 0 55 0 55 0 0 00 4 00 6 3 55 6 6 66666 00 6 777 3 6 6 6 00 6 555555555 6 3333 6 5 888 888 8888888888888888 6 666 0 0 55 0 0 0 33 4 1 4 9 11 2 4 4 11 4 4 4 3 4 4 4 11 4 4 3 6 6 6 3 66 22 66 555 3 7777777 3 0 3 66 3 5 00 7777 444 444 00 6 6 6 6666 6 0 444 5 5555 9 9 9 7 99 7 33333 7 777 7 7 77 7 0 7777 7 7 3 3 9 9 1 5 22 1 5 1 22 2 1 1 33 7 1 1 5555 22 11 55 000000 444 55 6666666 999 555555555555 0 8888888888888888888888888888888888888 0 444 55 55 1 5555 5 0 00000000000 444444444444444444444 0 0 99 0 5555 55 0 88 4 88 333 00 0 8 66 7 44 777 7 7 7 22 0 4 0
consensus : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CC---C----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATT-AATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---NGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
Reference ( family-171 ) : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CC---C----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATT-AATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---NGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
gi|1 : GTAAGCCCTTA--CTGTAA--CA---T-GTCCT--GGATAACGGAATG-ACT--AAA-TG-----G-TATA---T-TAT----TATGTTGGA--T-TCTCAATT-AGAATAAAGAATTG-CTGAATAA-GATG-AA-A-ATATGATAAGCATGGCCA--T-TCAATCTG--AT-GTG-AT---T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCCTACATGTTTGGT-ATA-AATCCTA-GC-AA-AA--TA-ACCC----CTGAAAATTC-CCAGAGAAAAA-CTTAATTCTTAGTC-A-TCGTCA-T-TTAACA--TT---ATCCC----AA------TATTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACGGCT--CA--CTAAT----A--GAA-AAG-GC------ATGC---A-G---AG-GGG-T-AACAAGAT--A-TT-CGATTT-TA-G-TAA-TGT-TAAA-G-GGAT-GAGG-A----AGAAAAAGA-CT-GTAT--T--GTCCCTGT--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GA-----A-----AT--AAAA---TGT--ATTAGA-GT-AAT-A--CG-TG-C-A-A--GGC-C-A--TT-A-TTT--CCT----CATCATTCAA----TCCACGAAAATAGCCCGTTTAC--AAC--AATGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-AAA-GA-C-TCCACTA--G--TT-ATT--AT-GTAA-TAATGTAG-TTG-CGC--ATATAATTAA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TA--TTT---TCTAACACCAAATT---A------C----C----TTGCAA-AAAT-GTATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAAT-ATGAAGCAAGATCACCGCGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTCAAAATGCAGAAAGATTTATTTTC--TAT-TACAC-T-ATT-AATGTTATGTGAA-TTTAATTTA-TTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T-----ACAATTT-GAAAGT-TT--AT-AATAG--CTAAAAAAACG---TGAT---TA--AC-AGATG--AT-AT--ATTG-GTTA-AAA---A-----AAGCATT---AAA--ACAGAGGAATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGT--CATAA----TAGGTT-CA-T-G-AATC-TA-GATT-TCAT--T-AAATGGAG-A--ATGTTGACTT-ACTT-T--GAATCTTAA-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGA--ATTG----ATC--AAT------------A-AAGA-GTG---TGC-AGCAG-------C-------C----CC-T-TT--GA--AGC-GAACA----GAAGC-AA-----------TAAA--------------CT-----TG-TAAT-TATGTAT-TAT----TA--GTATAGTTGTAATTAGTTTCCAATAG--AG-ATAAAT-ATTATTTTGTA-AATTC-AATTGGGGCACT---ATTCTATTT-TT--ATGCG-ATGTATTTGGCTCTTTCATTCATGTTGA
gi|10 : aataaagacataataacataaacaataattctatggttgatcttattagtgatcaagaattaatttatgGTATGCCTT--A-CTGTAA--C----TTGTAT---GGATAACGTAGTG-A-TTAAAG-TG-----G-TGTA---T-TTTTTC-T-TGTTGGGGTTATCTTA-TT--GAATGAAAA-TTGGCTAAATAAGAA---AA-G-ACATAATAACC-T--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--AAT-TT-A--AAACCAA-G-CTTT---ATAGTTAAT-CTA-A-CCTGA-GC-AA-AAGATA-CCACGACCCTGAAA-TCTTCCAGAGAAAAAACCTA--TCTAAATT-A-T--TCAAT-TTAACA---T---ACCCCCA--AA-----GTA-TAC-A--TGT-ACTT-G--AATACGAGAACAGCT--CAAATTA-T----A--GAA---G-GC------ACAC---A-AGAAAG-AGA-T-AACAA-ATTAA-TA-CGATTT-ATTA-TGAATGTACATT-G-GG-TTGAGGGA----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATAATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAATCGTGC--ATCAAAAGTAA-T-ACGCG-TG-CAA-CA-AGT-C-A--TTTA-TAA--TGT-----ATCAT
gi|11 : caaacaggtaaggaaggataaaggaatatacaattaaaatagaagtatgtgatcttattatgattaatggttttcattaatgTT---CCTTTCACCCCATT---A-CC---CTCT-C----CTGCAA-ATATTG-ATCCAGGGCA-C-TGAAA--A-T-TTTGTAAAC---TAGCTTAA-TCATG-AGC-AGATC-C--C-AGTCCATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGAATTATTTTCTATATTCGTAA-T-ATTCGATG-CATATGAA-TTTATT-TA-TAAATC-AAACATAGTAG--AA--A--T---TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACAATTTTG-ATTT-TT--A--AATAG--CT----AAACG---TG-T---TA--AC-AGCTGT-AT-AT-----G-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA--AC-AAG--ATATGGAACA-T-----TAGCATTA---T-TC-AG---TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CAT--G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAA-AGTGTA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A----AAAAA--C-CTGAATTCAT--AAG---TAGC--A-AA----ACAGTAAT------------ACAGAA-TTA---GCC-A-CA--------CA------A----CCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGCAAT-----------AAAA--------------AC-----TG-T-AT-TATGTGA-TAT----CT--ATA-ATT-----TTAATT--CAAGAAGCAGTATATAA-ATTATTC
gi|12 : AATTATATAACTGGAAT-GTG-ATA--T--TTC-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CAAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TATAATTT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTATTGC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-C----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGG-T-AAAGA-AT--A-TT-TTATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-T-GG-T-GAAG-A----A----AATA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-TCT-T--G-TAC----A-----G---AAAAATGTAT--ATCAAAAGT-A-T-T--CG-TG-A-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTTAAA--AAC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAG-ACT-GG-CATCAAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATAT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCAGC-ATTAG-A--A-CATATTT---CCTTCTACCCCATT---A-CC---
gi|13 : aatattgctttctgaagttctataatggaattatggATGCCTTTA--CTGTAA---A---TTGTACT--GGATT-AGTAGTGTA-T--AAG-TG-----G-TGTAC--T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-T--ATGATAAA---TTG-CTAAATAAAGAAC-AA-GTACATAATAA--AT--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-AGCTC----ATA-TTAAT-ATA-T-ACTGA-GCAAA-AA--TA-CACC----CTGAAA-ATT-CCAG-GAAAA--CCTA--TCTAAATTAA-T--TCA-T-TTAAAA--AT---A-CCCATAAAA-----GTA-TAC-ACTCGTAACTA-GGAA-TATCG-AACAGAC--TA--ATA-TAGCAA--GAA-GAG-GC------AT-C---A-A---CGAAGA-T-AAAAA-AT--ATTT-CGATTTCAT-ATTGA-TA---ATTCGCGG-T-GAAG-GCAACA----AACA-CT-CTAC--TCCTTCT---TAATGTCATAGCT-AAAATAATT-TAAG-TACGACAA-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-TAA--CG-TG-C-A-C--AGT-CAA--TTTA-TTA--TGT----CCTCAT
gi|14 : TAA---------TTTAAGTTCCAAC-TTTA--C--ATTGTCTTTGACCCCACCACCCCA-----A-GC---C----A----C-GCAA-AATT-G-ATGTAGGCTA-C-TGATCT-G-T-TT-G-AAACAC-TATCTCAGATGATT-AAC-AGATCAC--CAAATT-ATT-ATTC--C-TGTA-ACATACAT-TTTCATTATTTT-TCTAT-CGCAA-A-ATC-AATG-TATCAGAA-TTTATTACG-TAA-TC-GAGCGTCGTAG--AA--AATT-A-TCAC-CTAAGGATTTG-TTTTCCA-AATTT-GTATCTATT--AC-AATAAACCA----AAAAA---TGACATGTAAGACAAACTG--AT-ATTCA-CA-GTAATCAATGCAAAAAC---C----------CAC-AAGA-ATATG-ATCAGT-----T-GCCTGC---TCTC-AGGTTTTGTC-AAA-TGCATCAAATTTA-ATT-CACCGG-AATC-AA-CAT
gi|15 : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGTAGTG-A-T--AAAGTG-----G-TGTA---T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-TT-ATGATAAAAA-TTG-CTAAATAAAGAAA-AA-G-ACATAATCAACAT--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-G-CTCT---ATATTAATC-ATA-A-CCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CCTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-TTAACA--AT---ACCCA----AA-----GTACTAC-A--TGT-ATTG-A--A-TACGA-AACAGCT--CA--ATA-T----A--G-A-AAG-GC------AC-A---A-G---AA-AGA-T-AAAAA-AT--A-TT-CGATTT-AT-A-TGA-TGT-AATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-agttttatccggaatgcggacattttaactttatttgaaaatt
gi|16 : catatatgGCCCTCAA-CTGTAA--TA---TTGTACT--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TATA---T-TGT--C-TATGTTAGA--TATCGTA-TT-ATAATAAAGA-TTG-CTAAATAA-----------------TAAGCAT--TCAATT-TTA-TCTG--AT-GTG------T--TTTATT-CACTAACCAA-GGCACT---ATATTAGAT-ATA-A-CCTGA-GC-GA-AA--TT-CCAC----ATGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAGCT-A-T--TCA-T-CTAGCA--AT---GTCCC----AA-----GTACTAC-A--
gi|16 : -AC--A-TT-TGATTT-AG-A-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TT-------CTCT---T--TGTCATCG-T-AAACT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-G--CA-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCAtttgatttagatgatgccattgggtgaggaaaacactttctctttgtcatcgtaaactatttgtacagtaaaaatgtgcatcaaaagtatgcatgcacagtcatttattatgtcatca
gi|17 : gccctcaactgtaatattgtactagatacggagtgataaaatggtatattgtctatgttagatatcgtattataataaagattgctaaataataagcattcaattttatctgatgtgttttattcactaaccaaggcactatattagatataacctgagcgaaattccacatgaaatctccagagaaaacttatctaagctattcatctagcaatgtcccaagtact-TAA-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACA-TTT-G--TTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGTAAT-AT--A-TG-GTT-TAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-AT-TG-AC---T-----T-GCATTC---T-TCAAGG--TTGTC-AAGTTCCAT-A----TA-ATT-CA-T-G-TAT--AA-CATTATC----T-AAA--GTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-ATAAT-CAACTT-T---TAAAAA--C-TT-AATT------AG---TAAC--G--A----ACA--AGT------------A-AAAT-CAGAATTGC-C-CAA--------A------A----CCAT-TC---A--AG--GAAGG----GGCGG-CT-----------AAAA--------------AC-----TG-T-AT-TATGTGGATAT----CT--ATATACTGGA-ATT--TTATTTAGAG--AGTATATAA-ATTATTC
gi|18 : ATG-ATCA-TATCCTT-GCATTC---T-TT-ATG--TTGTCAAAATTGCACGA----TA-GTT-CATT-GAAATG-AATTATT-TCAT--TGAAATGAT--ATTAT-TGGACTT-ACTT-T-TGAATCGAAA-T-AAAGTAAAAATCT-TTCAATT-A---TAA---TAGC--A--A----A-A--AAT------------A-AAAA-TAG---TAA-A-TAG-------CAAGAAATC----CCCT-TC--AAATAGTCGAAAT----GAATA-ATTACCCCCCCTAAAAA--------------TC-----TG-T-A--TGTGTGT-TATAACAGT--ATATTACTG--ATTAATTTCC--TTT--AGTATACAATGTT-TTTTTT--AAATCGGATCCAGGTACTGAAA-TCTA-TTATT--A
gi|19 : aaA-CAC-GAGG-ATATG-ATCA-TC----T-GTATTCTTTT-TC-AGT--TTGT--GAGTAGCATCA----TA-ACT-CATTAA-AATCAAA-CATT-TCATACT-AACTGGTG-A--ATCTTGACTT-GCTCAA-AAAATC--AC-TGA---TAAAAA--C-CTT--TT-ATGTAAGAACCAGC--A--A----ATG--AGT------------A-ATA---------GC---CAA--------A------A----CCATATC--CA--AG--GCAAAGGGGGGAGC-CT-----------AAA----------------C-----TG-TAAG-TATGTGC-TATC---TC--ATATACTTG--ATT
gi|2 : GTAAGCCTTTAA-CTGTAG--AA---TTGTCCT--GGAT--CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TA-A---TATCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGAT-AGCAT--GCATTT-CAAATCTGA-AT-GTGAATA--TTCTTT-TT-C--TAACCAACGACTCT---ATGTTTGGT-ATACA-TCTGA-GC-AAGAA--TA-CT-C----CTGAAA-TCT-CCAGAGAGAA--CTTA--TCTTAGTC-ATT--TCA-TATTAACA--AT----TCCC----AA-----CTATTACAA--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CC--CTA-T----A--GAAGAAG-GA------TT-C---A-G---AG-GGGTT-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGATCT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GA-----A-----GT---AAAATGTAT--ATCAAAGGT-A-T-AG-CGTTG-C-ATC--AG--C-A--TTTA-TTA--ATC----CATC-TT-AA----TC-A-GAAAATAGC--GTT-AAACAAC--A-TGATAAGAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-ACA-GA-CGTCAAC-A--G--TTCATTTAAT-GT-A-T-ATGT-GTTTG-CGC--ATGT-ATTGGGAAATTTTTTTTAAGTTTCATCAATTAG-CAAA-TATATTT----CTTCAA--CCAAT---A----------------CTGC-A-AAAT-GAATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-CTTAGCTTAAATC-TG-AGC-AGAT-AC--CGAGTC-ATTAATTCCTT-TGTC-AAATGCAA-AAGATTTA-TTTCTATAT-CACAA-TAATT-AATG-TATATGAATTTTATTATATTTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAAGCTGAGAAAGAA-T-------AATTT-GAATTT-TA--ATAAATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGATGT-AT-AT--A-TG-GTTATCAA---AAAAA-AAGCAT-----AA-CAC-GCGG-ATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G--ATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTTAACTT-T-GAAATCTAAC-T-A----AAAAA--C-ACTAATTAA---AAG---TGGC--A-TG----AT---AAT------------A-AGAC-GTG----GC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TTTGAA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA---------------C-----TGTT-ATGTATGTAT-TAT----TT--ATATAGTTGT-ATTAGTTCC--ATAG--ACTATAATA-CTTATTTTGTAAAATTC-AATTG-GGCACT---A-TCTA-TT-TTAAATGCGAATGTAATT-GCTCTTTCATTCAT-TTGAttaaatttaaaggaagataacaaatatcaaatctttctctcaa
gi|20 : aatgATAGTCGCAAA--A--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACAATTT-G-ATTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAAACAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-TATC-AA-CATT-TCCT--T-ACAAAGTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-T---TAAAAA--C-CTTAATT-A---TAG---T
gi|21 : A-A-TCTAA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TGTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCGC----AT-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-AATGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-ACG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AA--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-CATT-G-GG-T-AATC-A----A----AAGA-C---TAT--T--GTCT---T--TGTCATGG-T-GAACT-TTT-T--G-TAC----A-----GTAAAAAAATGTGT--ATCAAAAGaacga
gi|22 : GTATGCCCTTAA-CTGT-A--CA---TTGTACC--GGATA-CAGAGTG-A-TA-AAA-TG-----G-TATA---T-TTT--C-TTCGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TCG-CT-----------------ATATAATAAGCAT--TCAA-T-TAAAGCTG--AT-GTG-ATC--T--ATT-TA-C--TAACCAA-GGCTCT---ACATTAGGT-ATA-A-CCTGA-GC-A--------------------AAA-TCT-CCAGAGAAAG--CTTA--TATAAATC-A-T--
gi|23 : gTGG-GC-AG-AA--TA-TTGA----CAGTAA-ACT-CCAGAAAAAA--CT-------AAATT-A-T--TCA-C-GTGACA--AT---GCCCT----AG-----ATGATAT-G--CAT-ATTT-G--A-TATGA-AACAGGT--CA--CCA-T----A--TAA-AAA-AC------AC-A---A-G---AA-AGG-T-TATAA-AT--A-TT-TGATTG-AT-A-TGA-TGT-CAT-----A-T-GA-------------------------------TCT---T--TCTCGTCG-C-AAAAT-ATC-T--G-TGT----A-----GC--AAAAA
gi|24 : C-A--CGT-ATTG-G--A-TATGA-AAGAGCT--CA--CTG-C----A--GAA-A-G-GC------A--C---ATG---AA-AGA-T-AATGA-AT--T-TT-CTATTT-AT-G-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CA-TTCT--C--TTCT---T--TGTCAAAA-T-AAAAT-ATT-C--G-TAC----A-----GCA-AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-g
gi|25 : AA-CAC-GAGG-ATATG-ATCA-T-----T-GTATTC---T-TC-AGT--TTGTG-AAGTAGCATCA----TA-ACT-CATT-A-AATC-AA-CATT-TCAT--C-TAATGGTG-A--AT-TTGACTT-GCTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-CTTAATT-A---TAG---TAG
gi|26 : --AAT------------A-AGAC-GTG---C-T-A-AAA-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--AAAAA----CAAGC-AT-----------AACA--------------TT-----GG-T-AT-AATGTGT-TGT----TT--ATATACTTGT-ATTAGTTCCTAATGT--AGTATATCA-ATTATTCTGT--ATTTC-AATT--Gaaaa
gi|27 : ATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACC-GG-CATCCAC-A--A--ATCACT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATTT-ATTTA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TACCTCT---CCTTTCACCCCATT---A-CC---CCTCTC----CTGCAA-a
gi|28 : GCCCTTAA-TTGTAA--CA---TTGTACC--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TATA---T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTAAATA-----------------ATAAGCAT--TCAATA-TAAA
gi|29 : AA--CTTA--TCTAAACT-A-T--CTA-T-ATAACACTATGTAATACT----AATTAAGGTGCTAC-A--CGT-ATCC-A--A-TAAGA-AACAAGT--CA--CCT-T----A--GAA-AAATAC------AC-C---C-G---AG-AGA-T-AA
gi|3 : GTAAGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTCCT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGATAAGCAT--GCAATT-CAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTTAGTC-A-T--TCA-T-TTAACA--AT---ATCCC----AA-----CTATTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGA-CT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GAA----A-----GT--AAAAATGTAT--ATCAAGAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGC-C-A--TTTA-TTA--TCT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AAC-AAC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-ACA-GA-CGTCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-CGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATATTT---CCTTCAACCCAATT---A-----------C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAA-AAGATTTATTTTCTATAT-CACAA-T-ATT-AATG-TATATGAA-TTTATTATA-TTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T-----ACAATTT-G-AAGT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGATGT-AT-AT--A-TG-GTTATCAA---AAAAA-AAGCATT---AAA-CAC-GAGG-ATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G-AATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTT-ACTT-T-GAAATCTAAC-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGC--A-TG----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---TGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA--------------CT-----TG-T-AT-TATGTAT-TAT----TT--ATATAGTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATAATA-CTTATTTTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGAATtata
gi|30 : TTGA---------TTTCAGTTCAAGC-ATTAGTC--A--ATCTTT---CCTTCAACCCCACT---GCCC---C----C----CCGCAAGAAAT---ATCCAGGGTA-C-TTAAC--A-TATT-GTAAAgt
gi|31 : AATAA--TATATATAC-ATT-TTCTGT--AAATC-AATT--TACACT---A-T-TA-TG-TT---TGTG-ATGTAATTCACTCTGGCAGTCAT-TTCAATacaacatgcatctcaaat
gi|32 : tttgcaaAACAAACATATTAAAA-TGC-AAAG-A-ATG-GTTA-C-----T-GTATTC---T-TC-TAG--TTGTC-AAGTTGTATGA----TA-ATT--ATT-G-tttgcct
gi|34 : gAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--TGATA-CGGAGTG-A-TG-AAA-TGCTTAAGTTATA---T-CTT--CTTATGTta
gi|35 : T-TAAAGCTG--AT-GTG-AT---C--TTT-TA-C--TAACCAA-GGCTGT---ATATTAGGT-ATA-A-
gi|4 : aaTATGCTCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTTCT--GGATA-CGTAGTA-A-T--AAA-TG-----G-T-TA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-GAAATAAAGA-TCG-CTGAATAAAGATG-AAAG-ACATAATAAGCAT--TCAATT-CAAAACTA--AT-TTG-ATA--T--TT-----C--TAAC-AC-GGCTCT---ATATTTGGTTATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----TTGAAA-TCT-CCAGAGAAA---CTTA--TCTAAGTT-A-T--TCA-T-CTAACA--AA---ATCCC----AA-----GTA-TAC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CAA-CTT-A----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGG-T-AACAA-AT--A-T---------AG-A-T---TGT-CATT-G-GG-T-GAAG-A----A----AACA-GT-TTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AAAA--ATTGT--GGTA-----A-----AT--AAAAATGTAA--TTCAAGAGT-A-T-A--CG-T--C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCATT-GA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--A-C--A-TGAT--GAAATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACCCGG-CATCCAC-AAAG--T-CACT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATTT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TATCTTT---CCTCTCACCC-ATT---A-CC---C----CTCTCCTGCAA-AATT-G-ATCCAGGGCAAC-TGAAA--A-T-TTTGTAAAA-C-TAGCTTGAATCATG-AGC-AGATCCC--CAAGTC-ATT-ATTT--T-TGTC-AAATGCAT-TAGAATTATTT-CTATAT-CGTAA-T-ATT-CATG-CATATGAA-TTTATTCTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACA-------ATTT-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TG-T---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-CTATTA---T-TC-AGG--TTATC-AAGTTCCATCA----TA-ATTCCATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTT-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---T-AAAA--C-CTTAATT-AT--AA-----GGCAAA-TAATATATA--AATTATTATAGTAGCA-AAACAGTA---AAT-A-CAGAATTAGCCA------CCAAACCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGC-CT-----------AAAAAATAACTGGTGGAGTCCTAAATG-T-AA-TATGGGGATAT----CTAGATATGATTTT-A--AGTT--CAAGAAGCAGTATAATA-AATATTC
gi|5 : CCCTTAA--TGTAG--CAATCTTGTACCTCGGATA-CGGA-TG-A-T--AAT-TG-----G-TATAA--T-TCC------TGTTGG---TAT-TC---T-AGAAAAATAA-TTG-CTGAATAACGATT-GA-G-ACATGAAAAG-A---TCAA-T-TAAATCTG--AT-GTG-ATAT-T--TTT-TT-C--TA---AA-G--TCC---ATATTTGGT-GTA-A--CTGA-GG-AA-AA--TATCCAC----CTGAAA-----------AAA----TTA--TTTCAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTAG-T--AGT-ATTC-G--A-TACG--AACAACTTCCC--CTACT----A--AAC-AAA-GCGGACTAAG-C---A-G---GGCGAA-TAAACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT--ATG-A-GA-C-GATA-G----A----AACA-CCACTATCCT--TTCT---T--TGTTATGA-T--AAAT-ATT-T--G-TAT----ACACCCGT---AAAATGTATGAATGAGAAGTAA-T-A--AG-TG-C-A-CAAAGT-C-AATCTTACTTAAGCGCTACACATCATT-AA----TC-ACG-AAATAGC--GTT--A--AACTAA-TGAT--GAA-TG-TTGTTTTAAA-TG-ATAAT---AAGCAAG--AGC-TAACAACT-GGTCAT-CAC-A--T--TGCATT--ATGGT-GTT-ATGT-A-ATG-TGTGAATGT-ATTGATG-------TTTAAGT--CATC-A-TAG------TATTTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CCACTT----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCA-GGTA-CATGAACTTT-T-TT-GTAAA--C-TAGCTTAAA--ATG-AGCAAAATCAC--C-AGTC-ATT-ATTC--TGTGTC--AATGCAT-TATA-TTATTTTCTATAT-CGTAATT-ATT-CGTG-CATACGAA-TTTATTCTA-TAA-TCAAAACATTGTAG--AA--A--T-GCTCAA-CTGAGGAAAAT-T-----ACAATTT-G-ATTT-TTTAAT-AATAG---T----AAACGGTATGAT---TC--TC-AGCTGT-ATAAT--G-TGAGTTAT-CA---AAACACAAGCATCA--AAA-CAC-GACG-ATATG-AA-A-T-----T-GTATTC---T-TT-AGG--TTGTA-AAGTTCCAT-A----T--ATT-CATC-GAAATA-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--A--GTGACTT--CTC-TAAAAATCC-AC-T-AT--TAAAAA--TAATCAAT-------AG---TG
gi|5 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatccA-TAA-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----AC-ATTT-G--TTA-TT--AT-Acaacaacagtcaactgaggaaaaattacatttgttattatat
gi|6 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatcccccttaatgtagcaatcttgtacctcggatacggatgataattggtataattcctgttggtattctagaaaaataattgctgaataacgattgagacatgaaaagatcaattaaatctgatgtgatatttttttctaaagtccatatttggtgtaactgaggaaaatatccacctgaaaaaattatttcaattattcatctaacaatatctcaagtactagtagtattcgatacgaacaacttcccctactaaacaaagcggactaagcagggcgaataaacgaatattcgatttagttgatgtatgagacgatagaaacaccactatcctttctttgttatgataaatatttgtatacacccgtaaaatgtatgaatgagaagtaataagtgcacaaagtcaatcttacttaagcgctacacatcattaatcacgaaatagcgttaaactaatgatgaatgttgttttaaatgataataagcaagagctaacaactggtcatcacattgcattatggtgttatgtaatgtgtgaatgtattgatgtttaagtcatcatagtatttttccttccaccccattaccacttcctgcaaaaatgatccaggtacatgaacttttttgtaaactagcttaaaatgagcaaaatcaccagtcattattctgtgtcaatgcattatattattttctatatcgtaattattcgtgcatacgaatttattctataatcaaaacattgtagaaatgctcaactgaggaaaattacaatttgattttttaataatagtaaacggtatgattctcagctgtataatgtgagttatcaaaacacaagcatcaaaacacgacgatatgaaattgtattctttaggttgtaaagttccatatattcatcgaaataaacatttccttaaaaagtgaagtgacttctctaaaaatccactattaaaaC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-A-G-GC------AC-A---A-G---AA-AGA-T-AACGA-AT--T-TT-CTATTG-AT-G-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTCT--C--TTCA---T--TGTCATGG-T-AAAAT-ATT-T--G-TTC----T-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TGTC-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ATGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--A--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATCGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TATCTTT---CCTTCCACCCTATT---A-CC---CCT--C----CTGCAA-AAAT-A-TTCCAGGGTA-C-TGACA--A-T-TT-GTGAAA-C-TAGCTTAAATCATG-ATC-AGATTAC--CAAATC-ATC-ATTC--T-TGTC-AAACGCAT-TAGAATTTTTTTCTGTAT-CGCAA-T-ATT-AATG-TATATGAA-TGTATCATA-TAG-TC-AAACAGAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAATACAAATT-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAC--AT----AAACG---TGAT---TA--AT-AGCTGT-A----------------AA----------AAGCATT---AAG-CAC-GAGG-ATATT-ATCA-T-----A-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-CAATTGTG-A--AT-TTCACTT-AATT-T-GAAATATATC-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGC--A-AA----ATG--AAT------------A-AGAC-ATG---GGCTA-AAG-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--AGAAA----GTAGC-AT-----------AAAA--------------TT-----GG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATACTTGT-TTTAGTTCCTAATGC--AGTATATCA-AATATTCTGT--ATTTC-AATT--GACACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGt
gi|7 : GGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-T-----------------TA--TGTTAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTGT-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAACT--CC--CTA-T----A--AAA-AAG-GG------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT-CATT-G-AG-C-GAAG-A----A----AACA-CT-TCAT--T--T-CT---T--TGTTATGA-T-AAAAT-ATT-T--G-TAT----A-----GT--AAAAATGTAT--ATGAGAAGT-A-T-A--AG-TG-C-A-C--AGT-A-A--TTTA-TTA--GGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--A--TTCATT--AT-GT-G-T-ATGT-G-TTG-TGA--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATTACCA-CC---T----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--ATT-TT-GTAAAA-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AAATCAC--CAAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TATATTTATTTTCTATAT-CGTAA-T-ATT-CGTG-CATACGAA-TTTATTCTA-TAA-TC-AAACATTGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACAATTT-G-ATTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATC-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--AG-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-AT--TAAAAA--C-TT-AATC-A---TAG---TCGC--A-
gi|8 : G-CTAAATAAAGAT--AA-T-GCAT--TAA-------CAAT---AAATCTT--AT-GCG-ATC--T--TAT-TA-C--TGATCAA-GGCTTC---ATTGATGGT-ATaa
gi|8 : taGTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAATA-TTG-CTGAATTAAGATG-AA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAATT--AAAGCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TTTC--TAACCAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-ACAC----CTGAA------------------CTAA--TCTATATT-A-T--TCA-T-CTAACA--TT---ATCCC----AA-----GTACTAT-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----A--GGA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-CG-T-AAAG-A----A----AACA-CT-TCAT--T--T-CT---T--TGTCATGG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAT----A-----GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGT-A-T-A--CA-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GT-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-T-T-ATGT-G-TTG-TAC--ATGT-ATgcccttaactgtaacattgtactggatacggaatgataaattgtatattctctatgttggatatctcattagaataaatattgctgaattaagatgaagacatgaaaagcatttaattaaagctgatgtgatatttttttctaaccaagaccctatagttggtgtaatctgaggaaaataacacctgaactaatctatattattcatctaacattatcccaagtactatacgtattcgatacgaaacagttcactataggaaaggcatcagaggggtaacgaatattcgatttagatgatgtcattgcgtaaagaaaacacttcatttctttgtcatggtaaaatatttgtatagtaaaaatatatatcagaagtatacatgcacagtcatttattacgtcattattaatcacgaaaatagcgttaaaacatgattaatgattggtttatgataatcaagcaagagctaacactgtcatccacagttcattatgtttatgtgttgtacatgtat
gi|9 : tagctaaataaagataatgcattaacaataaatcttatgcgatcttattactgatcaaggcttcattgatgCCCTTAAACTGTAAGACA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TATAAGTT-TCT--C-TATG-TGGA--TATCTCA-TTAAGAATAAATA-TTG-CT-AATTAAGATGAAA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAAAT-TAAG-CTG--ATAGTGCATATTT--TTT-TT-C--TAAACAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A--CTGAGGA-AA-AA--TA--CAC----CTG---------------GAA--CTAA--TCTATATT-A-T--TCA-TCCTAACA--TT---ATCCC----A-------TACTAT-A--CGT-ATTCGG--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----AAGGAA-AAG-GC------AT-CAAAA-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TTCCGATTT-AGAA-TGA-TGT-CA-T-G-CG-T-AAAG------A----AACA-CT-TCAT--T--TCCT---T--TGTCATGG-TAAAAAT-ATT-T--G-TATA---A-----GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGTAA-T-AC-CA-TG-C-A-C--AGTCC-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AACAGTTC-AC-AAAATAGC--GTA-AA--AAC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTT--ACTGAATAATCAAAAGCAAGAAAGCTTAACAAAT-GT-CATCCAC-A--GTTTTCATT--AT-GT-T-TAATGT-G-TTGTTAC--ATGT-AT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): ATAAAGGCAATATAACTAACAATGAATGTTATGTGATTCTTATTACTGATTAAGGTTTCATATTGG
Unaligned ( gi|36 ): TCTATGCGATCTTATTACTGATCAAGGTTTCATTTATG
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111 111111111 1111 2222222222222222 111 2222222 1 2222 1111 111111 2222222 222222222222 3333333333333333333333333333333333333 11111111111 333333333333333333333 1111 111 11 22 111 1
lowQualScore : 2 33 555 777 5 2 2 99 8 77777 2 000 2 0 33 2 3 888 3 3 1 3 2 4 4 111 666 2 0 33 0 2 66 66 2 5 888 33 2 33 33 2 5 444 0 2 2 55 2 2 2 33 2 2 5555 33333 0 666 33 2 2 33 2 5 33 444 8888 55555 4 2 33 2 33 33 2 2 33 55 4 5555 33 2 2 666666 4 444 2 444 4 2 2 2 33 2 2 2 4 2 2 2 2 2 2 2 1 2 5555 5555 1 2 2 0 444444 444 33 1 2 2 77 2 33 2 22222 55555 55 33 8 2 2 99 2 2 2 2 77 3 3 44 3 44 6666 4 8888 4 55 8 99 55 4 55 4 55 4 4 55 1 55 3 7 44 3 3 66666 55 3 555 7 3 3 3 55 3 999999999 3 1111 3 0 555 555 8888888888888888 3 888 4 4 99 4 4 8 88 4 1 4 8 66 8 4 4 66 4 4 4 5 4 4 4 55 4 4 5 3 3 3 1 44 99 44 111 3 2222222 3 0 3 44 3 0 55 7777 666 666 55 3 3 3 7777 3 2 666 2 1111 2 2 2 2 11 2 99999 2 444 2 2 33 2 5 5555 2 2 5 5 2 2 3 1 44 3 6 3 44 6 3 3 33 0 3 3 3333 44 44 66 777777 555 55 2222222 777 000000000000 4 3333333333333333333333333333333333333 4 999 55 99 0 8888 0 4 99999999999 666666666666666666666 4 8 44 8 2222 55 1 99 7 11 333 22 4 0 33 5 11 111 6 6 6 99 8 1 8
lowQualScore : . .. ... ... . . . .. . ..... . ... . . .. . . ... . . . . . . . ... ... . . .. . . .. .. . . ... .. . .. .. . . ... . . . .. . . . .. . . .... ..... . ... .. . . .. . . .. ... .... ..... . . .. . .. .. . . .. .. . .... .. . . ...... . ... . ... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .... . . . . ...... ... .. . . . .. . .. . ..... ..... .. .. . . . .. . . . . .. . . .. . .. .... . .... . .. . .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . . ..... .. . ... . . . . .. . ......... . .... . . ... ... ................ . ... . . .. . . . .. . . . . .. . . . .. . . . . . . . .. . . . . . . . .. .. .. ... . ....... . . . .. . . .. .... ... ... .. . . . .... . . ... . .... . . . . .. . ..... . ... . . .. . . .... . . . . . . . . .. . . . .. . . . .. . . . .... .. .. .. ...... ... .. ....... ... ............ . ..................................... . ... .. .. . .... . . ........... ..................... . . .. . .... .. . .. . .. ... .. . . .. . .. ... . . . .. . . .
lowQualScore : 9 99 000 888 7 9 9 66 6 11111 9 777 9 4 99 9 6 222 1 1 4 1 9 0 2 666 333 9 1 99 9 5 77 33 7 3 777 77 7 99 77 7 3 777 7 5 5 88 5 5 5 44 5 5 3333 11111 1 111 22 4 4 22 5 0 44 444 2222 99999 1 2 11 4 11 22 4 4 22 66 7 0000 22 4 4 888888 7 111 4 111 7 4 4 4 22 4 4 4 7 4 4 4 4 4 4 4 5 4 0000 0000 2 4 4 9 222222 111 22 8 4 4 44 4 22 4 44444 99999 66 44 0 7 7 66 9 9 9 9 33 1 1 22 1 22 5555 0 5555 0 55 0 55 55 0 55 0 55 0 0 00 4 00 6 3 55 6 6 66666 00 6 777 3 6 6 6 00 6 555555555 6 3333 6 5 888 888 8888888888888888 6 666 0 0 55 0 0 0 33 4 1 4 9 11 2 4 4 11 4 4 4 3 4 4 4 11 4 4 3 6 6 6 3 66 22 66 555 3 7777777 3 0 3 66 3 5 00 7777 444 444 00 6 6 6 6666 6 0 444 5 5555 9 9 9 7 99 7 33333 7 777 7 7 77 7 0 7777 7 7 3 3 9 9 1 5 22 1 5 1 22 2 1 1 33 7 1 1 5555 22 11 55 000000 444 55 6666666 999 555555555555 0 8888888888888888888888888888888888888 0 444 55 55 1 5555 5 0 00000000000 444444444444444444444 0 0 99 0 5555 55 0 88 4 88 333 00 0 8 66 7 44 777 7 7 7 22 0 4 0
consensus : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CC---C----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATT-AATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---NGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
Reference ( family-171 ) : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CC---C----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATT-AATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---NGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
gi|1 : GTAAGCCCTTA--CTGTAA--CA---T-GTCCT--GGATAACGGAATG-ACT--AAA-TG-----G-TATA---T-TAT----TATGTTGGA--T-TCTCAATT-AGAATAAAGAATTG-CTGAATAA-GATG-AA-A-ATATGATAAGCATGGCCA--T-TCAATCTG--AT-GTG-AT---T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCCTACATGTTTGGT-ATA-AATCCTA-GC-AA-AA--TA-ACCC----CTGAAAATTC-CCAGAGAAAAA-CTTAATTCTTAGTC-A-TCGTCA-T-TTAACA--TT---ATCCC----AA------TATTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACGGCT--CA--CTAAT----A--GAA-AAG-GC------ATGC---A-G---AG-GGG-T-AACAAGAT--A-TT-CGATTT-TA-G-TAA-TGT-TAAA-G-GGAT-GAGG-A----AGAAAAAGA-CT-GTAT--T--GTCCCTGT--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GA-----A-----AT--AAAA---TGT--ATTAGA-GT-AAT-A--CG-TG-C-A-A--GGC-C-A--TT-A-TTT--CCT----CATCATTCAA----TCCACGAAAATAGCCCGTTTAC--AAC--AATGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-AAA-GA-C-TCCACTA--G--TT-ATT--AT-GTAA-TAATGTAG-TTG-CGC--ATATAATTAA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TA--TTT---TCTAACACCAAATT---A------C----C----TTGCAA-AAAT-GTATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAAT-ATGAAGCAAGATCACCGCGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTCAAAATGCAGAAAGATTTATTTTC--TAT-TACAC-T-ATT-AATGTTATGTGAA-TTTAATTTA-TTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T-----ACAATTT-GAAAGT-TT--AT-AATAG--CTAAAAAAACG---TGAT---TA--AC-AGATG--AT-AT--ATTG-GTTA-AAA---A-----AAGCATT---AAA--ACAGAGGAATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGT--CATAA----TAGGTT-CA-T-G-AATC-TA-GATT-TCAT--T-AAATGGAG-A--ATGTTGACTT-ACTT-T--GAATCTTAA-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGA--ATTG----ATC--AAT------------A-AAGA-GTG---TGC-AGCAG-------C-------C----CC-T-TT--GA--AGC-GAACA----GAAGC-AA-----------TAAA--------------CT-----TG-TAAT-TATGTAT-TAT----TA--GTATAGTTGTAATTAGTTTCCAATAG--AG-ATAAAT-ATTATTTTGTA-AATTC-AATTGGGGCACT---ATTCTATTT-TT--ATGCG-ATGTATTTGGCTCTTTCATTCATGTTGA
gi|10 : aataaagacataataacataaacaataattctatggttgatcttattagtgatcaagaattaatttatgGTATGCCTT--A-CTGTAA--C----TTGTAT---GGATAACGTAGTG-A-TTAAAG-TG-----G-TGTA---T-TTTTTC-T-TGTTGGGGTTATCTTA-TT--GAATGAAAA-TTGGCTAAATAAGAA---AA-G-ACATAATAACC-T--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--AAT-TT-A--AAACCAA-G-CTTT---ATAGTTAAT-CTA-A-CCTGA-GC-AA-AAGATA-CCACGACCCTGAAA-TCTTCCAGAGAAAAAACCTA--TCTAAATT-A-T--TCAAT-TTAACA---T---ACCCCCA--AA-----GTA-TAC-A--TGT-ACTT-G--AATACGAGAACAGCT--CAAATTA-T----A--GAA---G-GC------ACAC---A-AGAAAG-AGA-T-AACAA-ATTAA-TA-CGATTT-ATTA-TGAATGTACATT-G-GG-TTGAGGGA----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATAATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAATCGTGC--ATCAAAAGTAA-T-ACGCG-TG-CAA-CA-AGT-C-A--TTTA-TAA--TGT-----ATCAT
gi|11 : caaacaggtaaggaaggataaaggaatatacaattaaaatagaagtatgtgatcttattatgattaatggttttcattaatgTT---CCTTTCACCCCATT---A-CC---CTCT-C----CTGCAA-ATATTG-ATCCAGGGCA-C-TGAAA--A-T-TTTGTAAAC---TAGCTTAA-TCATG-AGC-AGATC-C--C-AGTCCATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGAATTATTTTCTATATTCGTAA-T-ATTCGATG-CATATGAA-TTTATT-TA-TAAATC-AAACATAGTAG--AA--A--T---TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACAATTTTG-ATTT-TT--A--AATAG--CT----AAACG---TG-T---TA--AC-AGCTGT-AT-AT-----G-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA--AC-AAG--ATATGGAACA-T-----TAGCATTA---T-TC-AG---TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CAT--G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAA-AGTGTA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A----AAAAA--C-CTGAATTCAT--AAG---TAGC--A-AA----ACAGTAAT------------ACAGAA-TTA---GCC-A-CA--------CA------A----CCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGCAAT-----------AAAA--------------AC-----TG-T-AT-TATGTGA-TAT----CT--ATA-ATT-----TTAATT--CAAGAAGCAGTATATAA-ATTATTC
gi|12 : AATTATATAACTGGAAT-GTG-ATA--T--TTC-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CAAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TATAATTT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTATTGC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-C----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGG-T-AAAGA-AT--A-TT-TTATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-T-GG-T-GAAG-A----A----AATA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-TCT-T--G-TAC----A-----G---AAAAATGTAT--ATCAAAAGT-A-T-T--CG-TG-A-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTTAAA--AAC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAG-ACT-GG-CATCAAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATAT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCAGC-ATTAG-A--A-CATATTT---CCTTCTACCCCATT---A-CC---
gi|13 : aatattgctttctgaagttctataatggaattatggATGCCTTTA--CTGTAA---A---TTGTACT--GGATT-AGTAGTGTA-T--AAG-TG-----G-TGTAC--T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-T--ATGATAAA---TTG-CTAAATAAAGAAC-AA-GTACATAATAA--AT--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-AGCTC----ATA-TTAAT-ATA-T-ACTGA-GCAAA-AA--TA-CACC----CTGAAA-ATT-CCAG-GAAAA--CCTA--TCTAAATTAA-T--TCA-T-TTAAAA--AT---A-CCCATAAAA-----GTA-TAC-ACTCGTAACTA-GGAA-TATCG-AACAGAC--TA--ATA-TAGCAA--GAA-GAG-GC------AT-C---A-A---CGAAGA-T-AAAAA-AT--ATTT-CGATTTCAT-ATTGA-TA---ATTCGCGG-T-GAAG-GCAACA----AACA-CT-CTAC--TCCTTCT---TAATGTCATAGCT-AAAATAATT-TAAG-TACGACAA-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-TAA--CG-TG-C-A-C--AGT-CAA--TTTA-TTA--TGT----CCTCAT
gi|14 : TAA---------TTTAAGTTCCAAC-TTTA--C--ATTGTCTTTGACCCCACCACCCCA-----A-GC---C----A----C-GCAA-AATT-G-ATGTAGGCTA-C-TGATCT-G-T-TT-G-AAACAC-TATCTCAGATGATT-AAC-AGATCAC--CAAATT-ATT-ATTC--C-TGTA-ACATACAT-TTTCATTATTTT-TCTAT-CGCAA-A-ATC-AATG-TATCAGAA-TTTATTACG-TAA-TC-GAGCGTCGTAG--AA--AATT-A-TCAC-CTAAGGATTTG-TTTTCCA-AATTT-GTATCTATT--AC-AATAAACCA----AAAAA---TGACATGTAAGACAAACTG--AT-ATTCA-CA-GTAATCAATGCAAAAAC---C----------CAC-AAGA-ATATG-ATCAGT-----T-GCCTGC---TCTC-AGGTTTTGTC-AAA-TGCATCAAATTTA-ATT-CACCGG-AATC-AA-CAT
gi|15 : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGTAGTG-A-T--AAAGTG-----G-TGTA---T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-TT-ATGATAAAAA-TTG-CTAAATAAAGAAA-AA-G-ACATAATCAACAT--TCAATT-TAA-TCTG--AT-GTG-ATA--T--ATT-TA-C--AAACCAA-G-CTCT---ATATTAATC-ATA-A-CCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CCTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-TTAACA--AT---ACCCA----AA-----GTACTAC-A--TGT-ATTG-A--A-TACGA-AACAGCT--CA--ATA-T----A--G-A-AAG-GC------AC-A---A-G---AA-AGA-T-AAAAA-AT--A-TT-CGATTT-AT-A-TGA-TGT-AATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-agttttatccggaatgcggacattttaactttatttgaaaatt
gi|16 : catatatgGCCCTCAA-CTGTAA--TA---TTGTACT--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TATA---T-TGT--C-TATGTTAGA--TATCGTA-TT-ATAATAAAGA-TTG-CTAAATAA-----------------TAAGCAT--TCAATT-TTA-TCTG--AT-GTG------T--TTTATT-CACTAACCAA-GGCACT---ATATTAGAT-ATA-A-CCTGA-GC-GA-AA--TT-CCAC----ATGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAGCT-A-T--TCA-T-CTAGCA--AT---GTCCC----AA-----GTACTAC-A--
gi|16 : -AC--A-TT-TGATTT-AG-A-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TT-------CTCT---T--TGTCATCG-T-AAACT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-G--CA-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCAtttgatttagatgatgccattgggtgaggaaaacactttctctttgtcatcgtaaactatttgtacagtaaaaatgtgcatcaaaagtatgcatgcacagtcatttattatgtcatca
gi|17 : gccctcaactgtaatattgtactagatacggagtgataaaatggtatattgtctatgttagatatcgtattataataaagattgctaaataataagcattcaattttatctgatgtgttttattcactaaccaaggcactatattagatataacctgagcgaaattccacatgaaatctccagagaaaacttatctaagctattcatctagcaatgtcccaagtact-TAA-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACA-TTT-G--TTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGTAAT-AT--A-TG-GTT-TAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-AT-TG-AC---T-----T-GCATTC---T-TCAAGG--TTGTC-AAGTTCCAT-A----TA-ATT-CA-T-G-TAT--AA-CATTATC----T-AAA--GTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-ATAAT-CAACTT-T---TAAAAA--C-TT-AATT------AG---TAAC--G--A----ACA--AGT------------A-AAAT-CAGAATTGC-C-CAA--------A------A----CCAT-TC---A--AG--GAAGG----GGCGG-CT-----------AAAA--------------AC-----TG-T-AT-TATGTGGATAT----CT--ATATACTGGA-ATT--TTATTTAGAG--AGTATATAA-ATTATTC
gi|18 : ATG-ATCA-TATCCTT-GCATTC---T-TT-ATG--TTGTCAAAATTGCACGA----TA-GTT-CATT-GAAATG-AATTATT-TCAT--TGAAATGAT--ATTAT-TGGACTT-ACTT-T-TGAATCGAAA-T-AAAGTAAAAATCT-TTCAATT-A---TAA---TAGC--A--A----A-A--AAT------------A-AAAA-TAG---TAA-A-TAG-------CAAGAAATC----CCCT-TC--AAATAGTCGAAAT----GAATA-ATTACCCCCCCTAAAAA--------------TC-----TG-T-A--TGTGTGT-TATAACAGT--ATATTACTG--ATTAATTTCC--TTT--AGTATACAATGTT-TTTTTT--AAATCGGATCCAGGTACTGAAA-TCTA-TTATT--A
gi|19 : aaA-CAC-GAGG-ATATG-ATCA-TC----T-GTATTCTTTT-TC-AGT--TTGT--GAGTAGCATCA----TA-ACT-CATTAA-AATCAAA-CATT-TCATACT-AACTGGTG-A--ATCTTGACTT-GCTCAA-AAAATC--AC-TGA---TAAAAA--C-CTT--TT-ATGTAAGAACCAGC--A--A----ATG--AGT------------A-ATA---------GC---CAA--------A------A----CCATATC--CA--AG--GCAAAGGGGGGAGC-CT-----------AAA----------------C-----TG-TAAG-TATGTGC-TATC---TC--ATATACTTG--ATT
gi|2 : GTAAGCCTTTAA-CTGTAG--AA---TTGTCCT--GGAT--CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TA-A---TATCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGAT-AGCAT--GCATTT-CAAATCTGA-AT-GTGAATA--TTCTTT-TT-C--TAACCAACGACTCT---ATGTTTGGT-ATACA-TCTGA-GC-AAGAA--TA-CT-C----CTGAAA-TCT-CCAGAGAGAA--CTTA--TCTTAGTC-ATT--TCA-TATTAACA--AT----TCCC----AA-----CTATTACAA--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CC--CTA-T----A--GAAGAAG-GA------TT-C---A-G---AG-GGGTT-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGATCT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GA-----A-----GT---AAAATGTAT--ATCAAAGGT-A-T-AG-CGTTG-C-ATC--AG--C-A--TTTA-TTA--ATC----CATC-TT-AA----TC-A-GAAAATAGC--GTT-AAACAAC--A-TGATAAGAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-ACA-GA-CGTCAAC-A--G--TTCATTTAAT-GT-A-T-ATGT-GTTTG-CGC--ATGT-ATTGGGAAATTTTTTTTAAGTTTCATCAATTAG-CAAA-TATATTT----CTTCAA--CCAAT---A----------------CTGC-A-AAAT-GAATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-CTTAGCTTAAATC-TG-AGC-AGAT-AC--CGAGTC-ATTAATTCCTT-TGTC-AAATGCAA-AAGATTTA-TTTCTATAT-CACAA-TAATT-AATG-TATATGAATTTTATTATATTTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAAGCTGAGAAAGAA-T-------AATTT-GAATTT-TA--ATAAATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGATGT-AT-AT--A-TG-GTTATCAA---AAAAA-AAGCAT-----AA-CAC-GCGG-ATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G--ATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTTAACTT-T-GAAATCTAAC-T-A----AAAAA--C-ACTAATTAA---AAG---TGGC--A-TG----AT---AAT------------A-AGAC-GTG----GC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TTTGAA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA---------------C-----TGTT-ATGTATGTAT-TAT----TT--ATATAGTTGT-ATTAGTTCC--ATAG--ACTATAATA-CTTATTTTGTAAAATTC-AATTG-GGCACT---A-TCTA-TT-TTAAATGCGAATGTAATT-GCTCTTTCATTCAT-TTGAttaaatttaaaggaagataacaaatatcaaatctttctctcaa
gi|20 : aatgATAGTCGCAAA--A--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAA-TT----ACAATTT-G-ATTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAAACAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-TATC-AA-CATT-TCCT--T-ACAAAGTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-T---TAAAAA--C-CTTAATT-A---TAG---T
gi|21 : A-A-TCTAA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TGTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCGC----AT-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-AATGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-ACG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AA--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-CATT-G-GG-T-AATC-A----A----AAGA-C---TAT--T--GTCT---T--TGTCATGG-T-GAACT-TTT-T--G-TAC----A-----GTAAAAAAATGTGT--ATCAAAAGaacga
gi|22 : GTATGCCCTTAA-CTGT-A--CA---TTGTACC--GGATA-CAGAGTG-A-TA-AAA-TG-----G-TATA---T-TTT--C-TTCGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TCG-CT-----------------ATATAATAAGCAT--TCAA-T-TAAAGCTG--AT-GTG-ATC--T--ATT-TA-C--TAACCAA-GGCTCT---ACATTAGGT-ATA-A-CCTGA-GC-A--------------------AAA-TCT-CCAGAGAAAG--CTTA--TATAAATC-A-T--
gi|23 : gTGG-GC-AG-AA--TA-TTGA----CAGTAA-ACT-CCAGAAAAAA--CT-------AAATT-A-T--TCA-C-GTGACA--AT---GCCCT----AG-----ATGATAT-G--CAT-ATTT-G--A-TATGA-AACAGGT--CA--CCA-T----A--TAA-AAA-AC------AC-A---A-G---AA-AGG-T-TATAA-AT--A-TT-TGATTG-AT-A-TGA-TGT-CAT-----A-T-GA-------------------------------TCT---T--TCTCGTCG-C-AAAAT-ATC-T--G-TGT----A-----GC--AAAAA
gi|24 : C-A--CGT-ATTG-G--A-TATGA-AAGAGCT--CA--CTG-C----A--GAA-A-G-GC------A--C---ATG---AA-AGA-T-AATGA-AT--T-TT-CTATTT-AT-G-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CA-TTCT--C--TTCT---T--TGTCAAAA-T-AAAAT-ATT-C--G-TAC----A-----GCA-AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-g
gi|25 : AA-CAC-GAGG-ATATG-ATCA-T-----T-GTATTC---T-TC-AGT--TTGTG-AAGTAGCATCA----TA-ACT-CATT-A-AATC-AA-CATT-TCAT--C-TAATGGTG-A--AT-TTGACTT-GCTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-CTTAATT-A---TAG---TAG
gi|26 : --AAT------------A-AGAC-GTG---C-T-A-AAA-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--AAAAA----CAAGC-AT-----------AACA--------------TT-----GG-T-AT-AATGTGT-TGT----TT--ATATACTTGT-ATTAGTTCCTAATGT--AGTATATCA-ATTATTCTGT--ATTTC-AATT--Gaaaa
gi|27 : ATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACC-GG-CATCCAC-A--A--ATCACT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATTT-ATTTA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TACCTCT---CCTTTCACCCCATT---A-CC---CCTCTC----CTGCAA-a
gi|28 : GCCCTTAA-TTGTAA--CA---TTGTACC--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TATA---T-TTT--C-TTTGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTAAATA-----------------ATAAGCAT--TCAATA-TAAA
gi|29 : AA--CTTA--TCTAAACT-A-T--CTA-T-ATAACACTATGTAATACT----AATTAAGGTGCTAC-A--CGT-ATCC-A--A-TAAGA-AACAAGT--CA--CCT-T----A--GAA-AAATAC------AC-C---C-G---AG-AGA-T-AA
gi|3 : GTAAGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTCCT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGATAAGCAT--GCAATT-CAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GACTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTTAGTC-A-T--TCA-T-TTAACA--AT---ATCCC----AA-----CTATTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGA-CT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GAA----A-----GT--AAAAATGTAT--ATCAAGAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGC-C-A--TTTA-TTA--TCT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AAC-AAC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-ACA-GA-CGTCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-CGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATATTT---CCTTCAACCCAATT---A-----------C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAA-AAGATTTATTTTCTATAT-CACAA-T-ATT-AATG-TATATGAA-TTTATTATA-TTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T-----ACAATTT-G-AAGT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGATGT-AT-AT--A-TG-GTTATCAA---AAAAA-AAGCATT---AAA-CAC-GAGG-ATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G-AATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTT-ACTT-T-GAAATCTAAC-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGC--A-TG----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---TGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA--------------CT-----TG-T-AT-TATGTAT-TAT----TT--ATATAGTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATAATA-CTTATTTTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGAATtata
gi|30 : TTGA---------TTTCAGTTCAAGC-ATTAGTC--A--ATCTTT---CCTTCAACCCCACT---GCCC---C----C----CCGCAAGAAAT---ATCCAGGGTA-C-TTAAC--A-TATT-GTAAAgt
gi|31 : AATAA--TATATATAC-ATT-TTCTGT--AAATC-AATT--TACACT---A-T-TA-TG-TT---TGTG-ATGTAATTCACTCTGGCAGTCAT-TTCAATacaacatgcatctcaaat
gi|32 : tttgcaaAACAAACATATTAAAA-TGC-AAAG-A-ATG-GTTA-C-----T-GTATTC---T-TC-TAG--TTGTC-AAGTTGTATGA----TA-ATT--ATT-G-tttgcct
gi|34 : gAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--TGATA-CGGAGTG-A-TG-AAA-TGCTTAAGTTATA---T-CTT--CTTATGTta
gi|35 : T-TAAAGCTG--AT-GTG-AT---C--TTT-TA-C--TAACCAA-GGCTGT---ATATTAGGT-ATA-A-
gi|4 : aaTATGCTCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTTCT--GGATA-CGTAGTA-A-T--AAA-TG-----G-T-TA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-GAAATAAAGA-TCG-CTGAATAAAGATG-AAAG-ACATAATAAGCAT--TCAATT-CAAAACTA--AT-TTG-ATA--T--TT-----C--TAAC-AC-GGCTCT---ATATTTGGTTATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----TTGAAA-TCT-CCAGAGAAA---CTTA--TCTAAGTT-A-T--TCA-T-CTAACA--AA---ATCCC----AA-----GTA-TAC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CAA-CTT-A----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGG-T-AACAA-AT--A-T---------AG-A-T---TGT-CATT-G-GG-T-GAAG-A----A----AACA-GT-TTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AAAA--ATTGT--GGTA-----A-----AT--AAAAATGTAA--TTCAAGAGT-A-T-A--CG-T--C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCATT-GA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--A-C--A-TGAT--GAAATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACCCGG-CATCCAC-AAAG--T-CACT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATTT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TATCTTT---CCTCTCACCC-ATT---A-CC---C----CTCTCCTGCAA-AATT-G-ATCCAGGGCAAC-TGAAA--A-T-TTTGTAAAA-C-TAGCTTGAATCATG-AGC-AGATCCC--CAAGTC-ATT-ATTT--T-TGTC-AAATGCAT-TAGAATTATTT-CTATAT-CGTAA-T-ATT-CATG-CATATGAA-TTTATTCTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACA-------ATTT-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TG-T---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-CTATTA---T-TC-AGG--TTATC-AAGTTCCATCA----TA-ATTCCATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTT-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---T-AAAA--C-CTTAATT-AT--AA-----GGCAAA-TAATATATA--AATTATTATAGTAGCA-AAACAGTA---AAT-A-CAGAATTAGCCA------CCAAACCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGC-CT-----------AAAAAATAACTGGTGGAGTCCTAAATG-T-AA-TATGGGGATAT----CTAGATATGATTTT-A--AGTT--CAAGAAGCAGTATAATA-AATATTC
gi|5 : CCCTTAA--TGTAG--CAATCTTGTACCTCGGATA-CGGA-TG-A-T--AAT-TG-----G-TATAA--T-TCC------TGTTGG---TAT-TC---T-AGAAAAATAA-TTG-CTGAATAACGATT-GA-G-ACATGAAAAG-A---TCAA-T-TAAATCTG--AT-GTG-ATAT-T--TTT-TT-C--TA---AA-G--TCC---ATATTTGGT-GTA-A--CTGA-GG-AA-AA--TATCCAC----CTGAAA-----------AAA----TTA--TTTCAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTAG-T--AGT-ATTC-G--A-TACG--AACAACTTCCC--CTACT----A--AAC-AAA-GCGGACTAAG-C---A-G---GGCGAA-TAAACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT--ATG-A-GA-C-GATA-G----A----AACA-CCACTATCCT--TTCT---T--TGTTATGA-T--AAAT-ATT-T--G-TAT----ACACCCGT---AAAATGTATGAATGAGAAGTAA-T-A--AG-TG-C-A-CAAAGT-C-AATCTTACTTAAGCGCTACACATCATT-AA----TC-ACG-AAATAGC--GTT--A--AACTAA-TGAT--GAA-TG-TTGTTTTAAA-TG-ATAAT---AAGCAAG--AGC-TAACAACT-GGTCAT-CAC-A--T--TGCATT--ATGGT-GTT-ATGT-A-ATG-TGTGAATGT-ATTGATG-------TTTAAGT--CATC-A-TAG------TATTTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CCACTT----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCA-GGTA-CATGAACTTT-T-TT-GTAAA--C-TAGCTTAAA--ATG-AGCAAAATCAC--C-AGTC-ATT-ATTC--TGTGTC--AATGCAT-TATA-TTATTTTCTATAT-CGTAATT-ATT-CGTG-CATACGAA-TTTATTCTA-TAA-TCAAAACATTGTAG--AA--A--T-GCTCAA-CTGAGGAAAAT-T-----ACAATTT-G-ATTT-TTTAAT-AATAG---T----AAACGGTATGAT---TC--TC-AGCTGT-ATAAT--G-TGAGTTAT-CA---AAACACAAGCATCA--AAA-CAC-GACG-ATATG-AA-A-T-----T-GTATTC---T-TT-AGG--TTGTA-AAGTTCCAT-A----T--ATT-CATC-GAAATA-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--A--GTGACTT--CTC-TAAAAATCC-AC-T-AT--TAAAAA--TAATCAAT-------AG---TG
gi|5 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatccA-TAA-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----AC-ATTT-G--TTA-TT--AT-Acaacaacagtcaactgaggaaaaattacatttgttattatat
gi|6 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatcccccttaatgtagcaatcttgtacctcggatacggatgataattggtataattcctgttggtattctagaaaaataattgctgaataacgattgagacatgaaaagatcaattaaatctgatgtgatatttttttctaaagtccatatttggtgtaactgaggaaaatatccacctgaaaaaattatttcaattattcatctaacaatatctcaagtactagtagtattcgatacgaacaacttcccctactaaacaaagcggactaagcagggcgaataaacgaatattcgatttagttgatgtatgagacgatagaaacaccactatcctttctttgttatgataaatatttgtatacacccgtaaaatgtatgaatgagaagtaataagtgcacaaagtcaatcttacttaagcgctacacatcattaatcacgaaatagcgttaaactaatgatgaatgttgttttaaatgataataagcaagagctaacaactggtcatcacattgcattatggtgttatgtaatgtgtgaatgtattgatgtttaagtcatcatagtatttttccttccaccccattaccacttcctgcaaaaatgatccaggtacatgaacttttttgtaaactagcttaaaatgagcaaaatcaccagtcattattctgtgtcaatgcattatattattttctatatcgtaattattcgtgcatacgaatttattctataatcaaaacattgtagaaatgctcaactgaggaaaattacaatttgattttttaataatagtaaacggtatgattctcagctgtataatgtgagttatcaaaacacaagcatcaaaacacgacgatatgaaattgtattctttaggttgtaaagttccatatattcatcgaaataaacatttccttaaaaagtgaagtgacttctctaaaaatccactattaaaaC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-A-G-GC------AC-A---A-G---AA-AGA-T-AACGA-AT--T-TT-CTATTG-AT-G-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTCT--C--TTCA---T--TGTCATGG-T-AAAAT-ATT-T--G-TTC----T-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TGTC-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ATGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--A--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATCGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TATCTTT---CCTTCCACCCTATT---A-CC---CCT--C----CTGCAA-AAAT-A-TTCCAGGGTA-C-TGACA--A-T-TT-GTGAAA-C-TAGCTTAAATCATG-ATC-AGATTAC--CAAATC-ATC-ATTC--T-TGTC-AAACGCAT-TAGAATTTTTTTCTGTAT-CGCAA-T-ATT-AATG-TATATGAA-TGTATCATA-TAG-TC-AAACAGAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAATACAAATT-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAC--AT----AAACG---TGAT---TA--AT-AGCTGT-A----------------AA----------AAGCATT---AAG-CAC-GAGG-ATATT-ATCA-T-----A-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-CAATTGTG-A--AT-TTCACTT-AATT-T-GAAATATATC-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGC--A-AA----ATG--AAT------------A-AGAC-ATG---GGCTA-AAG-------CA------C----CCAT-TT--GA--AG--AGAAA----GTAGC-AT-----------AAAA--------------TT-----GG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATACTTGT-TTTAGTTCCTAATGC--AGTATATCA-AATATTCTGT--ATTTC-AATT--GACACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGt
gi|7 : GGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-T-----------------TA--TGTTAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTGT-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAACT--CC--CTA-T----A--AAA-AAG-GG------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT-CATT-G-AG-C-GAAG-A----A----AACA-CT-TCAT--T--T-CT---T--TGTTATGA-T-AAAAT-ATT-T--G-TAT----A-----GT--AAAAATGTAT--ATGAGAAGT-A-T-A--AG-TG-C-A-C--AGT-A-A--TTTA-TTA--GGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--A--TTCATT--AT-GT-G-T-ATGT-G-TTG-TGA--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-T--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATTACCA-CC---T----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--ATT-TT-GTAAAA-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AAATCAC--CAAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TATATTTATTTTCTATAT-CGTAA-T-ATT-CGTG-CATACGAA-TTTATTCTA-TAA-TC-AAACATTGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACAATTT-G-ATTA-TT--AT-ATTAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATC-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--AG-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-AT--TAAAAA--C-TT-AATC-A---TAG---TCGC--A-
gi|8 : G-CTAAATAAAGAT--AA-T-GCAT--TAA-------CAAT---AAATCTT--AT-GCG-ATC--T--TAT-TA-C--TGATCAA-GGCTTC---ATTGATGGT-ATaa
gi|8 : taGTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAATA-TTG-CTGAATTAAGATG-AA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAATT--AAAGCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TTTC--TAACCAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-ACAC----CTGAA------------------CTAA--TCTATATT-A-T--TCA-T-CTAACA--TT---ATCCC----AA-----GTACTAT-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----A--GGA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-CG-T-AAAG-A----A----AACA-CT-TCAT--T--T-CT---T--TGTCATGG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAT----A-----GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGT-A-T-A--CA-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GT-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-T-T-ATGT-G-TTG-TAC--ATGT-ATgcccttaactgtaacattgtactggatacggaatgataaattgtatattctctatgttggatatctcattagaataaatattgctgaattaagatgaagacatgaaaagcatttaattaaagctgatgtgatatttttttctaaccaagaccctatagttggtgtaatctgaggaaaataacacctgaactaatctatattattcatctaacattatcccaagtactatacgtattcgatacgaaacagttcactataggaaaggcatcagaggggtaacgaatattcgatttagatgatgtcattgcgtaaagaaaacacttcatttctttgtcatggtaaaatatttgtatagtaaaaatatatatcagaagtatacatgcacagtcatttattacgtcattattaatcacgaaaatagcgttaaaacatgattaatgattggtttatgataatcaagcaagagctaacactgtcatccacagttcattatgtttatgtgttgtacatgtat
gi|9 : tagctaaataaagataatgcattaacaataaatcttatgcgatcttattactgatcaaggcttcattgatgCCCTTAAACTGTAAGACA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TATAAGTT-TCT--C-TATG-TGGA--TATCTCA-TTAAGAATAAATA-TTG-CT-AATTAAGATGAAA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAAAT-TAAG-CTG--ATAGTGCATATTT--TTT-TT-C--TAAACAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A--CTGAGGA-AA-AA--TA--CAC----CTG---------------GAA--CTAA--TCTATATT-A-T--TCA-TCCTAACA--TT---ATCCC----A-------TACTAT-A--CGT-ATTCGG--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----AAGGAA-AAG-GC------AT-CAAAA-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TTCCGATTT-AGAA-TGA-TGT-CA-T-G-CG-T-AAAG------A----AACA-CT-TCAT--T--TCCT---T--TGTCATGG-TAAAAAT-ATT-T--G-TATA---A-----GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGTAA-T-AC-CA-TG-C-A-C--AGTCC-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AACAGTTC-AC-AAAATAGC--GTA-AA--AAC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTT--ACTGAATAATCAAAAGCAAGAAAGCTTAACAAAT-GT-CATCCAC-A--GTTTTCATT--AT-GT-T-TAATGT-G-TTGTTAC--ATGT-AT
blockSeqs : A GA ATC CTC A T . TA G CTTAA T AGT A TT T T GGT . A A . G A G TGA GT A . A AA GA A A ATT TC A TT AC C G . T C C G A G GA T A GACC TCTT AAA . A T . A A CT GTA ATAA TTAAG T A CT A CG GA A G TC AA C AGCA AG G T GGACTA A AAA T GAA A T A . TA T C C T T A A C C . T G G CAAC . A T A TCCT . AA C C A AA G AA G CGACA CACCC AA GA A . A CG T T A T AA C A AT C AG TACA . CAGT . . A AC TA . AA A AA C A AA C AA T A CC T . AAG TA G GT A . T T GA . GAAATTTTT A CAA T GAC ACC CCCCTCTC G TG A A TT T A T CA T C . A . A C A CT G . . A T T A CG . T A T A A A CA CA AT AG G TTTTCC T T A TA A AC . GTA ATG AG A A A TCA A A TGC C ATTA A . . G AC G ATCCT A TTT C A TT A C AATT . C G A A T A C AC G T T TT C A A AA T G AAGT TC AA GA ATGTA AAC AA TAATAT AGT TATTATAGTAGC C CAGTAAATACAGAATTAGCCACCAAA A TGA AT TC GGGG A TACCCCCCCTA AATAACTGGTGGAGTCCTAAA T A TG A AACA AG T A A CA AGC TA T AA G CA GAA . . A AA A T .
blockSeqs : . . . T . . . A A . . C . . . T T . . A . . A A AC AG A . . AT A . C AT . . T . . G . . . T . . . . . A . TCT A . . . . . C . . CA . C . . . T . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . A . . . T . . CCTT . . C . . AA . . . TA . A . A . . G . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . A T . . GTT . . A . . . . . . TG . TC . . . CCCCTCTC . GA . . T . . T C . G . . . G . . . . . . A . . . A . . A . . . G . CA . AG . TT . A . . . . . . . . . . . A . C . C CA . . . . TC . C . . . . . . C . . . A A . . . A . . T . . . . . A . . TT . C CA CATA . . AA A . . ATAGTAAATAGCAAGAAATC . A . . . . . AC . . T A C . C T T TT AGC TA . . . G . . . . . . C .
blockSeqs : . . . T . . . G A . . A . . . A T . . G . . A A AA G A . . AG . . . A . . T . . G . . . A . . . . . C . ATT A . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . CT . . A . . T . . . C . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . G . . A . . . . . . . . A . . . CCCTCTC . G . . . . . . C . C . . . G . . . . . . T . . . A . . A . . . A . . . GC . TT . . . . . . . . . . . . . A . A . C CA . . . . TC . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . T . . . . . A . . TT . T TA AAA . . TG A . . TCAGAATTGCCCAAAA . A . . . . . AC . . T . . . A T C TA G CA . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . A A . . G . . A A TG G G . . AT . . . A . . A . . A . . . C . . . . . A . TCT A . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . TT . . C . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . G . . A . . . . . . . . C . . . CCACTTC . G . . . . . . C . C . . . A . . . . . . T . . . A . . C . . . A . . . AG . TT . . . . . . . . . . . . . A . C . C CA . . . . TC . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . A . . . . . T . . T . T TA ATA . . TG G . . CATGGGCTAAAGCAC . C . . . . . TC . . G . . . C T C CA T AT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . T A . . G . . G A TG A A . . AG . . . A . . A . . G . . . C . . . . . A . TCT A . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . CT . . C . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . A . . A . . . . . . . . T . . . CCCCTC . G . . . . . . A . C . . . A . . . . . . A . . . C . . C . . . A . . . A . TT . . . . . . . . . . . . . A . A . C CA . . . . AT . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . T . . . . . A . . T . C TA AT . . AA A . . CGTGTGCACAGCAC . G . . . . . TT . . T . . . G T C CA G TC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . T T . . G . . A A TG A G . . AA . . . A . . T . . A . . . T . . . . . C . TCT A . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . G . . TG . . C . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . G . . A . . . . . . . . C . . . CCCCC . G . . . . . . A . C . . . A . . . . . . A . . . C . . A . . . A . . . G . TT . . . . . . . . . . . . . A . C . C C . . . . AC . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . T . . . . . G . . T . A CT AT . . A A . . ATTAGCCACACAA . G . . . . . CT . . T . . . C T C TA T AT . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . A T . . G . . G C TT G A . . AT . . . A . . T . . G . . . T . . . . . G . TCT A . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . TG . . G . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . T . . A . . . . . . . . T . . . GCCA . A . . . . . . A . C . . . . . . . . . . T . . . A . . C . . . A . . . G . TT . . . . . . . . . . . . . G . A . C C . . . . TC . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . A . . . . . A . . T . C TA AT . . A G . . CGTGGCACAGCAC . A . . . . . TT . . A . . . G . . C G TA .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . A A . . G . . G A TG T G . . AT . . . C . . A . . G . . . C . . . . . C . TCT G . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . CT . . C . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . A . . G . . . . . . . . T . . . CCTC . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . A . TT . . . . . . . . . . . . . A . A . C T . . . . AT . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . A . . . . . A . . C . C CA AA . . A . . . CGTGCTAAAACAC . G . . . . . C . . T . . . A . . . A AT .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . A A . . A . . G A T G G . . AG . . . A . . T . . G . . . T . . . . . A . ACT A . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . G . . TG . . A . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . A . . T . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . TT . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . T . . . . . G . . T . A CT AA . . . . GCCAAAA . . . . . . . C . . . . . . C . C TC .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . A A . . T . . A A . G G . . T . . . A . . A . . A . . . T . . . . . A . TCT A . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . TG . . C . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . A . . . . . A . . C . C A AT .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . A A . . T . . G . . . . . . T . . . C . . T . . A . . . T . . . . . A . TCT A . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . C . . CT . . C . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . . A T . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . A . . . . . . T . . . . . A . T A . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . . TT . . G . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . TT . . G . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . TT . . G . . A . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . C . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** A** *** T* TCT** A** ** ** **** *** A* C**** ** A** CCCCTTC********* G** ** TT***** **** A*** CA** A* A****** CGTNGGCCANAGCAC********************** ** T* ** **
originalCons : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GT-A-T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATT---A-CC---C----C----CTGCAA-AAAT-G-ATCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATT-AATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAA-T-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-AT--A-TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATC---AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC--A-TA----ATA--AAT------------A-AGAC-GTG---NGC-A-CAG-------CA------C----CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
finalCons : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TATA---T-TCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--AT-GTG-ATA--T--TTT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-AT-CTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAATCT--CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-A-T--TCA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTAC-A--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGG-T-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATA-TT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CG-TG-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA--AAC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GTA--T-ATGT-G-TTG-TGC--ATGT-ATTGA---------TTTAAGTTCCATC-ATTAG-C--A-TATCTTT---CCTTCCACCCCATT---ACCCCTTC---------CTGCAA-AAATG--ATCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-C-TAGCTTAAATCATG-AGC-AGATCAC--CGAGTC-ATT-ATTC--T-TGTC-AAATGCAT-TAGANTTATTTTCTATAT-CGCAA-T-ATT-AATG-CATATGAA-TTTATTNTA-TAA-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT-----ACAATTT-G-ATTT-TT--AT-AATAG--CT----AAACG---TGAT---TA--AC-AGCTGT-AT-ATA---TG-GTTATAAA---AAAAACAAGCATCA--AAA-CAC-GAGG-ATATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-TA-AAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC--AA------ATA--AAT------------A-AGACGTNGGCCANAGCAC----------------------CCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAA--------------TC-----TG-T-AT-TATGTGT-TAT----TT--ATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): ATAAAGGCAATATAACTAACAATGAATGTTATGTGATTCTTATTACTGATTAAGGTTTCATATTGG
Unaligned ( gi|36 ): TCTATGCGATCTTATTACTGATCAAGGTTTCATTTATG
Alignments
lowQualScore : 111 111 11111 111111111 2222222 111 111 1111111 1111 111111 11 333333333333333333333333 11 22222222222 1111 11 11 22 111 1
lowQualScore : 2 33 555 777 5 2 2 99 8 77777 2 2 000 0 33 2 3 888 3 3 1 3 2 4 4 111 666 2 0 33 0 2 66 33 2 2 2 2 888 33 2 33 33 2 5 444 0 2 2 55 2 2 2 33 2 2 5555 33333 0 666 33 2 33 2 2 5 33 444 8888 55555 4 55 2 33 33 2 2 33 55 4 5555 33 2 2 666666 4 444 2 444 4 4 2 33 2 2 2 4 2 2 2 2 2 2 2 1 2 5555 5555 1 2 2 0 444444 444 33 1 2 2 77 2 33 2 22222 55555 55 33 8 2 2 99 2 2 2 2 77 3 3 44 3 44 6666 4 8888 4 55 8 4 55 55 4 55 4 55 4 4 55 1 55 3 7 44 3 3 66666 55 3 7 3 3 3 3 3 55 3 999999999 3 66 5555 1 5555555 3 1 444 4 4 4 99 4 4 8 88 4 1 4 4 4 444 4 4 66 4 4 4 5 1 4 4 4 55 4 4 5 3 3 3 1 44 99 44 111 3 7777 3 0000000 44 3 44 55 7777 666 666 55 3 3 3 3 888 3 4 4 3 7777 33 2 2 11 2 99999 2 444 2 2 33 2 5 5555 2 2 5 5 2 2 3 1 44 3 6 3 44 6 3 3 33 0 3 3 3333 44 44 66 777777 555 3 3 00 66 4 0 333333333333333333333333 4 999 66 00 9999 1 4 11111111111 8 4 8 4 4 3333 1 11 3 44 888 22 4 1 33 5 11 111 6 6 6 99 8 1 8
lowQualScore : . .. ... ... . . . .. . ..... . . ... . .. . . ... . . . . . . . ... ... . . .. . . .. .. . . . . ... .. . .. .. . . ... . . . .. . . . .. . . .... ..... . ... .. . .. . . . .. ... .... ..... . .. . .. .. . . .. .. . .... .. . . ...... . ... . ... . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .... . . . . ...... ... .. . . . .. . .. . ..... ..... .. .. . . . .. . . . . .. . . .. . .. .... . .... . .. . . .. .. . .. . .. . . .. . .. . . .. . . ..... .. . . . . . . . .. . ......... . .. .... . ....... . . ... . . . .. . . . .. . . . . . ... . . .. . . . . . . . . .. . . . . . . . .. .. .. ... . .... . ....... .. . .. .. .... ... ... .. . . . . ... . . . . .... .. . . .. . ..... . ... . . .. . . .... . . . . . . . . .. . . . .. . . . .. . . . .... .. .. .. ...... ... . . .. .. . . ........................ . ... .. .. .... . . ........... . . . . . .... . .. . .. ... .. . . .. . .. ... . . . .. . . .
lowQualScore : 9 99 000 888 7 9 9 66 6 11111 9 9 777 4 99 9 6 222 1 1 4 1 9 0 2 666 333 9 1 99 9 5 77 77 7 7 7 7 777 77 7 99 77 7 3 777 7 5 5 88 5 5 5 44 5 5 3333 11111 1 111 22 4 22 5 5 0 44 444 2222 99999 1 33 4 11 22 4 4 22 66 7 0000 22 4 4 888888 7 111 4 111 7 7 4 22 4 4 4 7 4 4 4 4 4 4 4 5 4 0000 0000 2 4 4 9 222222 111 22 8 4 4 44 4 22 4 44444 99999 66 44 0 7 7 66 9 9 9 9 33 1 1 22 1 22 5555 0 5555 0 55 0 0 55 55 0 55 0 55 0 0 00 4 00 6 3 55 6 6 66666 00 6 3 6 6 6 6 6 00 3 555555555 6 33 5555 8 8888888 6 1 666 0 0 0 55 0 0 0 33 4 1 4 4 4 333 4 4 11 4 4 4 3 9 4 4 4 11 4 4 3 6 6 6 3 66 22 66 555 3 1111 3 6666666 66 3 11 00 7777 444 444 00 6 6 6 6 555 6 2 6 3 3333 99 9 7 99 7 33333 7 777 7 7 77 7 0 7777 7 7 3 3 9 9 1 5 22 1 5 1 22 2 1 1 33 7 1 1 5555 22 11 55 000000 444 2 1 44 11 0 9 111111111111111111111111 4 888 11 66 4444 7 4 11111111111 2 4 9 4 4 9999 0 99 4 22 000 00 4 9 66 7 44 777 7 7 7 22 0 4 0
consensus : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TA-TA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--A-T-GTG-A-TA--TT--TT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-AT--T-CA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTACA--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGGT-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CGT-G-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-A--AC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GTA-T-A-TGT-GTT-G-TGC--ATGTA-TTGA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-CA--T-ATCTTTCCTTCCACCCCATTACCCC----TCCTGCAA-AAAT-G-A-TCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-CT-AGCTTAAATCATGA-GC-A-GATCACCG--AGTC-ATTA-TTC--T-TGTCAAA-TGCATTA-GANTTATTTTCTATAT-CGCAA-TA-TT-AATGC-ATATGAATTT-ATTNTATA-A-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACAATTT-G-AT-TT-TT--A-TAA-TAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGCTG-T-AT-AT--ATG-GTTATAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CACGAGGA-TATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC-A--AATAA-ATAAGAC----GTGGGCCANAGCA------CCCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAANCTG-T-AT-TATGTGT-TAT----TTATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATATNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
Reference ( family-171 ) : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--GGATA-CGGAGTG-A-T--AAA-TG-----G-TA-TA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-G-ACATGATAAGCAT--TCAATT-TAAATCTG--A-T-GTG-A-TA--TT--TT-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATATTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAATT-AT--T-CA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTACTACA--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGGT-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CGT-G-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-A--AC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GTA-T-A-TGT-GTT-G-TGC--ATGTA-TTGA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-CA--T-ATCTTTCCTTCCACCCCATTACCCC--T-TCCTGCAA-AAAT-G-A-TCCAGGGTA-C-TGAAC--A-T-TT-GTAAAC-CT-AGCTTAAATCATGA-GC-A-GATCACCG--AGTC-ATTA-TTC--T-TGTCAAA-TGCATTA-GANTTATTTTCTATAT-CGCAA-TA-TT-AATGC-ATATGAATTT-ATTNTATA-A-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACAATTT-G-AT-TT-TT--A-TAA-TAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGCTG-T-AT-AT--ATG-GTTATAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CACGAGGA-TATG-ANCA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAATGGTG-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-NTCAATT-A---AAG---TGGC-A--AATAA-ATAAGAC----GTNGGCCANAGCA------CCCAT-TC--GA--AG--GAAAA----GGAGC-AT-----------AAAATCTG-T-AT-TATGTGT-TAT----TTATATANTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATANNA-ATTATTCTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTCGCTCTTTCATTCAT-TTGAAT
gi|1 : GTAAGCCCTTA--CTGTAA--CA---T-GTCCT--GGATAACGGAATG-ACT--AAA-TG-----G-TA-TA---TTAT----TATGTTGGA--T-TCTCAATT-AGAATAAAGAATTG-CTGAATAA-GATG-AA-A-ATATGATAAGCATGGCCA--T-TCAATCTG--A-T-GTG-A-T---TT--TT-TT-C--TAACCAA-GACTCCTACATGTTTGGT-ATA-AATCCTA-GC-AA-AA--TA-ACCC----CTGAAAATTC-CCAGAGAAAAA-CTTAATTCTTAGTC-ATCGT-CA-T-TTAACA--TT---ATCCC----AA------TATTACA--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACGGCT--CA--CTAAT----A--GAA-AAG-GC------ATGC---A-G---AG-GGGT-AACAAGAT--A-TT-CGATTT-TA-G-TAA-TGT-TAAA-G-GGAT-GAGG-A----AGAAAAAGA-CT-GTAT--T--GTCCCTGT--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GA-----A-----AT--AAAA---TGT--ATTAGA-GT-AAT-A--CGT-G-C-A-A--GGC-C-A--TT-A-TTT--CCT----CATCATTCAA----TCCACGAAAATAGCCCGTTTAC-A--AC--AATGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-AAA-GA-C-TCCACTA--G--TT-ATT--AT-GTAAT-AATGTAGTT-G-CGC--ATATAATTAA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-CA--T-ATTTT--CTAACACCAAATTACCT--------TGCAA-AAAT-GTA-TCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-CT-AGCTTAAAT-ATGAAGC-AAGATCACCGCGAGTC-ATTA-TTC--T-TGTCAAAATGCAGAAAGATTTATTTTCTAT---TACAC-TA-TT-AATGTTATGTGAATTT-AATTTATT-A-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAAT-----ACAATTT-G-AAAGT-TT--A-TAA-TAG--CTAAAAAAACG---TGAT---TA--AC-AGATGAT-AT-AT---TG-GTTA-----AAAA-AA-GCAT--TAAAA--CA-GAGGAATATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGT--CATAA----TAGGTT-CA-T-G-AATC-TA-GATT-TCAT--T-AAATGGAG-A--ATGTTGACTT-ACTT-T--GAATCTTAA-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGA-ATTGATCA-ATAAAGA----GTGTGC---AGCAG-----CCCCT-TT--GA--AGC-GAACA----GAAGC-AA-----------TAAACTTG-TAAT-TATGTAT-TAT----TAGTATAGTTGTAATTAGTTTCCAATAG--AG-ATAAAT-ATTATTTTGTA-AATTC-AATTGGGGCACT---ATTCTATTT-TT--ATGCG-ATGTATTTGGCTCTTTCATTCATGTTGA
gi|10 : aataaagacataataacataaacaataattctatggttgatcttattagtgatcaagaattaatttatgGTATGCCTT--A-CTGTAA--C----TTGTAT---GGATAACGTAGTG-A-TTAAAG-TG-----G-TG-TA---TTTTTTC-T-TGTTGGGGTTATCTTA-TT--GAATGAAAA-TTGGCTAAATAAGAA---AA-G-ACATAATAACC-T--TCAATT-TAA-TCTG--A-T-GTG-A-TA--TA--AT-TT-A--AAACCAA-G-CTTT---ATAGTTAAT-CTA-A-CCTGA-GC-AA-AAGATA-CCACGACCCTGAAA-TCTTCCAGAGAAAAAACCTA--TCTAAATT-AT--T-CAAT-TTAACA---T---ACCCCCA--AA-----GTA-TACA--TGT-ACTT-G--AATACGAGAACAGCT--CAAATTA-T----A--GAA---G-GC------ACAC---A-AGAAAG-AGAT-AACAA-ATTAA-TA-CGATTT-ATTA-TGAATGTACATT-G-GG-TTGAGGGA----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAATAATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAATCGTGC--ATCAAAAGTAA-T-ACGCGT-G-CAA-CA-AGT-C-A--TTTA-TAA--TGT-----ATCAT
gi|11 : caaacaggtaaggaaggataaaggaatatacaattaaaatagaagtatgtgatcttattatgattaatggttttcattaatgTTCCTTTCACCCCATTACCCT--C-TCCTGCAA-ATATTG-A-TCCAGGGCA-C-TGAAA--A-T-TTTGTAAAC--T-AGCTTAA-TCATGA-GC-A-GATC-CC---AGTCCATTA-TTC--T-TGTCAAA-TGCATTA-GAATTATTTTCTATATTCGTAA-TA-TTCGATGC-ATATGAATTT-ATT-TATA-AATC-AAACATAGTAG--AA--A--T---TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACAATTTTG-AT-TT-TT--A--AA-TAG--CTAAA----CG---TG-T---TA--AC-AGCTG-T-AT-AT----G-GTTATAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CA---AGA-TATGGAACA-T-----TAGCATTA---T-TC-AG---TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CAT--G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAA-AGTGTA--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A----AAAAA--C-CTGAATTCAT--AAG---TAGC-A--AAACA-GTAATACAGA-ATTAGCCACA-CA------ACCAT-TC--AA--AG--GTAAG----GGCGCAAT-----------AAAAACTG-T-AT-TATGTGA-TAT----CTATA-ATT-----TTAATT--CAAGAAGCAGTATATAA-ATTATTC
gi|12 : AATTATATAACTGGAA-T-GTG-A-TA--TT--TC-TT-C--TAACCAA-GGCTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CAAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TATAATTT-AT--T-CA-T-CTAACA--AT---ATCCC----AA-----GTATTGCA--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-C----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGGT-AAAGA-AT--A-TT-TTATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-T-GG-T-GAAG-A----A----AATA-CT-TTAT--T--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-TCT-T--G-TAC----A-----G---AAAAATGTAT--ATCAAAAGT-A-T-T--CGT-G-A-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTTAAA-A--AC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAG-ACT-GG-CATCAAC-A--G--TTCATT--AT-GTA-T-A-TAT-GTT-G-TGC--ATGTA-TTGA---------TTTAAGTTCCAGCA-TTAG-AA--C-ATATTTCCTTCTACCCCATTACC
gi|13 : aatattgctttctgaagttctataatggaattatggATGCCTTTA--CTGTAA---A---TTGTACT--GGATT-AGTAGTGTA-T--AAG-TG-----G-TG-TAC--TTTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-T--ATGATAAA---TTG-CTAAATAAAGAAC-AA-GTACATAATAA--AT--TCAATT-TAA-TCTG--A-T-GTG-A-TA--TA--TT-TA-C--AAACCAA-AGCTC----ATA-TTAAT-ATA-T-ACTGA-GCAAA-AA--TA-CACC----CTGAAA-ATT-CCAG-GAAAA--CCTA--TCTAAATTAAT--T-CA-T-TTAAAA--AT---A-CCCATAAAA-----GTA-TACACTCGTAACTA-GGAA-TATCG-AACAGAC--TA--ATA-TAGCAA--GAA-GAG-GC------AT-C---A-A---CGAAGAT-AAAAA-AT--ATTT-CGATTTCAT-ATTGA-TA---ATTCGCGG-T-GAAG-GCAACA----AACA-CT-CTAC--TCCTTCT---TAATGTCATAGCT-AAAATAATT-TAAG-TACGACAA-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-TAA--CGT-G-C-A-C--AGT-CAA--TTTA-TTA--TGT----CCTCAT
gi|14 : TAA---------TTTAAGTTCCAACT-TTA--CA--TTGTCTTTG-----ACCCCACCACCCCAAG-CCACGCAA-AATT-G-A-TGTAGGCTA-C-TGATCT-G-T-TT-G-AAACACT-ATCTCAGATGATTA-AC-A-GATCACCA--AATT-ATTA-TTC--C-TGTAACA-TACATTT-TCATTATTTT-TCTAT-CGCAA-AA-TC-AATGT-ATCAGAATTT-ATTACGTA-A-TC-GAGCGTCGTAG--AA--AATT-A-TCAC-CTAAGGATTTGTTTTCCA-AATTT-GTAT-CTATT--A-CAA-TAAACCAAAA----AA---TGACATGTAAGACAAACTG---AT-ATTCACA-GT--------AATCAATGCA----AAAACCCACAAGAA-TATG-ATCAGT-----T-GCCTGC---TCTC-AGGTTTTGTC-AAA-TGCATCAAATTTA-ATT-CACCGG-AATC-AA-CAT
gi|15 : GTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGTAGTG-A-T--AAAGTG-----G-TG-TA---TTTT--C-TTTGTTGGT--TATCTTA-TT-ATGATAAAAA-TTG-CTAAATAAAGAAA-AA-G-ACATAATCAACAT--TCAATT-TAA-TCTG--A-T-GTG-A-TA--TA--TT-TA-C--AAACCAA-G-CTCT---ATATTAATC-ATA-A-CCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CCTA--TCTAAATT-AT--T-CA-T-TTAACA--AT---ACCCA----AA-----GTACTACA--TGT-ATTG-A--A-TACGA-AACAGCT--CA--ATA-T----A--G-A-AAG-GC------AC-A---A-G---AA-AGAT-AAAAA-AT--A-TT-CGATTT-AT-A-TGA-TGT-AATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AAAA-CT-TTCT--C--TTCT---T--TGTCATCG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-agttttatccggaatgcggacattttaactttatttgaaaatt
gi|16 : catatatgGCCCTCAA-CTGTAA--TA---TTGTACT--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TA-TA---TTGT--C-TATGTTAGA--TATCGTA-TT-ATAATAAAGA-TTG-CTAAATAA-----------------TAAGCAT--TCAATT-TTA-TCTG--A-T-GTG-------TT--TTATT-CACTAACCAA-GGCACT---ATATTAGAT-ATA-A-CCTGA-GC-GA-AA--TT-CCAC----ATGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTAAGCT-AT--T-CA-T-CTAGCA--AT---GTCCC----AA-----GTACTACA--
gi|16 : -AC--A-TT-TGATTT-AG-A-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TT-------CTCT---T--TGTCATCG-T-AAACT-ATT-T--G-TAC----A-----GT--AAAAATGTGC--ATCAAAAGT-A-T-G--CAT-G-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCAtttgatttagatgatgccattgggtgaggaaaacactttctctttgtcatcgtaaactatttgtacagtaaaaatgtgcatcaaaagtatgcatgcacagtcatttattatgtcatca
gi|17 : gccctcaactgtaatattgtactagatacggagtgataaaatggtatattgtctatgttagatatcgtattataataaagattgctaaataataagcattcaattttatctgatgtgttttattcactaaccaaggcactatattagatataacctgagcgaaattccacatgaaatctccagagaaaacttatctaagctattcatctagcaatgtcccaagtactTA-A-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACA-TTT-G--T-TA-TT--A-TAT-TAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGCTG-TAAT-AT--ATG-GTT-TAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CACGAGGA-T-TG-AC---T-----T-GCATTC---T-TCAAGG--TTGTC-AAGTTCCAT-A----TA-ATT-CA-T-G-TAT--AA-CATTATC----T-AAA--GTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-ATAAT-CAACTT-T---TAAAAA--C-TT-AATT------AG---TAAC-G--AACAA-GTAAAATCAGAATTGCCCAAAA---------CCAT-TC---A--AG--GAAGG----GGCGG-CT-----------AAAAACTG-T-AT-TATGTGGATAT----CTATATACTGGA-ATT--TTATTTAGAG--AGTATATAA-ATTATTC
gi|18 : ATG-ATCA-TATCCTT-GCATTC---T-TT-ATG--TTGTCAAAATTGCACGA----TA-GTT-CATT-GAAATG-AATTATT-TCAT--TGAAATGAT--ATTAT-TGGACTT-ACTT-T-TGAATCGAAA-T-AAAGTAAAAATCT-TTCAATT-A---TAA---TAGC-A--AA-AA-ATAAAA-----ATAGTAAATAGCAAGAAATCCCCT-TC--AAATAGTCGAAAT----GAATA-ATTACCCCCCCTAAAAATCTG-T-A--TGTGTGT-TATAACAGTATATTACTG--ATTAATTTCC--TTT--AGTATACAATGTT-TTTTTT--AAATCGGATCCAGGTACTGAAA-TCTA-TTATT--A
gi|19 : aaA--CACGAGGA-TATG-ATCA-TC----T-GTATTCTTTT-TC-AGT--TTGT--GAGTAGCATCA----TA-ACT-CATTAA-AATCAAA-CATT-TCATACT-AACTGGTG-A--ATCTTGACTT-GCTCAA-AAAATC--AC-TGA---TAAAAA--C-CTT--TT-ATGTAAGAACCAGC-A--AATGA-GTAATA---------GCCAAAA---------CCATATC--CA--AG--GCAAAGGGGGGAGC-CT-----------AAA--CTG-TAAG-TATGTGC-TATC---TCATATACTTG--ATT
gi|2 : GTAAGCCTTTAA-CTGTAG--AA---TTGTCCT--GGAT--CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TAATA---T-CT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGATA-GCAT--GCATTT-CAAATCTG--AAT-GTG-AATA--TTCTTT-TT-C--TAACCAACGACTCT---ATGTTTGGT-ATACA-TCTGA-GC-AAGAA--TA-CT-C----CTGAAA-TCT-CCAGAGAGAA--CTTA--TCTTAGTC-AT--TTCA-TATTAACA--AT----TCCC----AA-----CTATTACAA-CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CC--CTA-T----A--GAAGAAG-GA------TT-C---A-G---AG-GGGTTAACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGATCT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GA-----A-----GT--AAAA-TGTAT--ATCAAAGGT-A-T-AG-CGTTG-C-ATC--AG--C-A--TTTA-TTA--ATC----CATC-TT-AA----TC-A-GAAAATAGC--GTT-AA-ACAAC--A-TGATAAGAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-ACA-GA-CGTCAAC-A--G--TTCATTTAAT-GTA-T-A-TGT-GTTTG-CGC--ATGTA-TTGGGAAATTTTTTTTAAGTTTCATCAATTAG-CAAAT-ATATTTC-TTCAACC--AATAC----------TGCAA-AA-T-G-AATCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-CTTAGCTTAAATC-TGA-GC-A-GAT-ACCG--AGTC-ATTAATTCCTT-TGTCAAA-TGCAAAA-GATTTATTT-CTATAT-CACAA-TAATT-AATGT-ATATGAATTTTATTATATTTA-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAAGCTGAGAAAGAAT-------AATTT-G-AA-TT-TT--AATAAATAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGATG-T-AT-AT--ATG-GTTATCAAAAAAA-AA-GCAT-----AA--CACGCGGA-TATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G--ATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTTAACTT-T-GAAATCTAAC-T-A----AAAAA--C-ACTAATTAA---AAG---TGGC-AT-GAT-A-ATAAGAC----GTGG--CACAGCA------CCCAT-TTTGAA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAA-CTGTT-ATGTATGTAT-TAT----TTATATAGTTGT-ATTAGTTCC--ATAG--ACTATAATA-CTTATTTTGTAAAATTC-AATTG-GGCACT---A-TCTA-TT-TTAAATGCGAATGTAATT-GCTCTTTCATTCAT-TTGAttaaatttaaaggaagataacaaatatcaaatctttctctcaa
gi|20 : aatgATAGTCGCAAA--A--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACAATTT-G-AT-TA-TT--A-TAT-TAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGCTG-T-AT-AT--ATG-GTTATAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CACGAGGA-TATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-TATC-AA-CATT-TCCT--T-ACAAAGTT-A--AT-TTAAGTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-T---TAAAAA--C-CTTAATT-A---TAG---TAAC-G--A
gi|21 : A-A-TCTAA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TGTAAATT-AT--T-CA-T-CTAACA--AT---ATCGC----AT-----GTACTACA--CGT-ATTC-G--A-AATGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-ACG-GC------AT-C---A-G---AG-GGGT-AACGA-AA--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-CATT-G-GG-T-AATC-A----A----AAGA-C---TAT--T--GTCT---T--TGTCATGG-T-GAACT-TTT-T--G-TAC----A-----GTAAAAAAATGTGT--ATCAAAAG
gi|22 : GTATGCCCTTAA-CTGT-A--CA---TTGTACC--GGATA-CAGAGTG-A-TA-AAA-TG-----G-TA-TA---TTTT--C-TTCGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TCG-CT-----------------ATATAATAAGCAT--TCAA-T-TAAAGCTG--A-T-GTG-A-TC--TA--TT-TA-C--TAACCAA-GGCTCT---ACATTAGGT-ATA-A-CCTGA-GC-A--------------------AAA-TCT-CCAGAGAAAG--CTTA--TATAAATC-AT--
gi|23 : gTGG-GC-AG-AA--TA-TTGA----CAGTAA-ACT-CCAGAAAAAA--CT-------AAATT-AT--T-CA-C-GTGACA--AT---GCCCT----AG-----ATGATATG--CAT-ATTT-G--A-TATGA-AACAGGT--CA--CCA-T----A--TAA-AAA-AC------AC-A---A-G---AA-AGGT-TATAA-AT--A-TT-TGATTG-AT-A-TGA-TGT-CAT-----A-T-GA-------------------------------TCT---T--TCTCGTCG-C-AAAAT-ATC-T--G-TGT----A-----GC--AAAAA
gi|24 : CA--CGT-ATTG-G--A-TATGA-AAGAGCT--CA--CTG-C----A--GAA-A-G-GC------A--C---ATG---AA-AGAT-AATGA-AT--T-TT-CTATTT-AT-G-TGA-TGT-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CA-TTCT--C--TTCT---T--TGTCAAAA-T-AAAAT-ATT-C--G-TAC----A-----GCA-AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CGT-G-C-A-g
gi|25 : AA--CACGAGGA-TATG-ATCA-T-----T-GTATTC---T-TC-AGT--TTGTG-AAGTAGCATCA----TA-ACT-CATT-A-AATC-AA-CATT-TCAT--C-TAATGGTG-A--AT-TTGACTT-GCTC-T-AAAATCCAAC-T-A---TAAAAA--C-CTTAATT-A---TAG---TAGA-A--AA
gi|26 : A-ATAAGAC----GT--GCTAAAACA------CCCAT-TT--GA--AG--AAAAA----CAAGC-AT-----------AACATTGG-T-AT-AATGTGT-TGT----TTATATACTTGT-ATTAGTTCCTAATGT--AGTATATCA-ATTATTCTGT--ATTTC-AATT--G
gi|27 : ATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACC-GG-CATCCAC-A--A--ATCACT--AT-GTA-T-A-TGT-GTT-G-TGC--ATTTA-TTTA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-TA--T-ACCTCTCCTTTCACCCCATTACCCC--TCTCCTGCAA-a
gi|28 : GCCCTTAA-TTGTAA--CA---TTGTACC--AGATA-CGGAGTG-A-T--AAAATG-----G-TA-TA---TTTT--C-TTTGTTGGT--TATCGTA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTAAATA-----------------ATAAGCAT--TCAATA-TAAA
gi|29 : AA--CTTA--TCTAAACT-AT--C-TA-T-ATAACACTATGTAATACT----AATTAAGGTGCTACA--CGT-ATCC-A--A-TAAGA-AACAAGT--CA--CCT-T----A--GAA-AAATAC------AC-C---C-G---AG-AGAT-AA
gi|3 : GTAAGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTCCT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TG-----G-TA-TA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAAGA-TTG-CTGAATAAAGATG-AA-A-ATATGATAAGCAT--GCAATT-CAAATCTG--A-T-GTG-A-TA--TT--TT-TT-C--TAACCAA-GACTCT---ATGTTTGGT-ATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCCC----CTGAAA-TCT-CCAGAGAAAA--CTTA--TCTTAGTC-AT--T-CA-T-TTAACA--AT---ATCCC----AA-----CTATTACA--CGT-ATTC-G--A-TTTCA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGGT-AACAA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TAA-TGT-TAAA-G-GG-T-GAGG-A----A----AAGA-CT-GTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AATAT--TT-T--G-GAA----A-----GT--AAAAATGTAT--ATCAAGAGT-A-T-A--CGT-G-C-A-C--AGC-C-A--TTTA-TTA--TCT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AACA--AC--A-TGAT--GAA-TTATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TAAC-ACA-GA-CGTCCAC-A--G--TTCATT--AT-GTA-T-A-TGT-GTT-G-CGC--ATGTA-TTGA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-CA--T-ATATTTCCTTCAACCCAATTA---------CCTGCAA-AAAT-G-A-TCCAGCGTA-C-AGTAC--A-T-TT-GTAAAC-CT-AGCTTAAATCATGA-GC-A-GATCACCG--AGTC-ATTA-TTC--T-TGTCAAA-TGCAAAA-GATTTATTTTCTATAT-CACAA-TA-TT-AATGT-ATATGAATTT-ATTATATT-A-TG-AAACATAGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGAAAAAA-T----ACAATTT-G-AA-GT-TT--A-TAA-TAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGATG-T-AT-AT--ATG-GTTATCAAAAAAA-AA-GCAT--T-AAA--CACGAGGA-TATG-AATA-T-----T-GCATTA---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATAA----TA-GTT-CATT-G-AATC-TA-GATT-TCCT--T-AAATGGAG-A--AT-TTGACTT-ACTT-T-GAAATCTAAC-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGC-AT-GATAA-ATAAGAC----GTGTG-CACAGCA------CCCAT-TT--GA--AG--GAAAA----GAAGC-AT-----------AAAACTTG-T-AT-TATGTAT-TAT----TTATATAGTTGT-ATTAGTTCCCAATAG--AGTATAATA-CTTATTTTGT--AATTC-AATT--GGCACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGAATtata
gi|30 : -TTGA---------TTTCAGTTCAAGCA-TTAGTCA----ATCTTTCCTTCAACCCCACTGCCCC-----CCCGCAAGAAAT---A-TCCAGGGTA-C-TTAAC--A-TATT-GTAAAgt
gi|31 : AATAA--TATATATAC-ATT-TTCTGT--AAATC-AATT--TACACT---A-T-TA-TG-TT---TGTG-ATGTAATTCACTCTGGCAGTCAT-TTCAATacaacatgcatctcaaat
gi|32 : tttgcaaAACAA-ACATATTAAAA--TGCAAAGA--ATG-GTTA-C-----T-GTATTC---T-TC-TAG--TTGTC-AAGTTGTATGA----TA-ATT--ATT-G-tttgcct
gi|34 : gAA-CTGTAA--CA---TTGTACC--TGATA-CGGAGTG-A-TG-AAA-TGCTTAAGTTA-TA---TCTT--CTTATGTta
gi|35 : T-TAAAGCTG--A-T-GTG-A-T---CT--TT-TA-C--TAACCAA-GGCTGT---ATATTAGGT-ATA-A-
gi|4 : aaTATGCTCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTTCT--GGATA-CGTAGTA-A-T--AAA-TG-----G-T--TA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-GAAATAAAGA-TCG-CTGAATAAAGATG-AAAG-ACATAATAAGCAT--TCAATT-CAAAACTA--A-T-TTG-A-TA--TT--T-----C--TAAC-AC-GGCTCT---ATATTTGGTTATA-A-TCTGA-GC-AA-AA--TA-CCAC----TTGAAA-TCT-CCAGAGAAA---CTTA--TCTAAGTT-AT--T-CA-T-CTAACA--AA---ATCCC----AA-----GTA-TACA--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CAA-CTT-A----A--GAA-AAG-GC------AT-C---A-G---AA-GGGT-AACAA-AT--A-T---------AG-A-T---TGT-CATT-G-GG-T-GAAG-A----A----AACA-GT-TTAT--T--GTCT---T--TGTCATCG-T-AAAA--ATTGT--GGTA-----A-----AT--AAAAATGTAA--TTCAAGAGT-A-T-A--CGT---C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--TGT----CATCATT-GA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-A---C--A-TGAT--GAAATGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGGAAG--AAC-TTTC-ACCCGG-CATCCAC-AAAG--T-CACT--AT-GTA-T-A-TGT-GTT-G-TGC--ATTTA-TTGA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-TA--T-ATCTTTCCTCTCACCC-ATTACCCC--TCTCCTGCAA-AATT-G-A-TCCAGGGCAAC-TGAAA--A-T-TTTGTAAAA-CT-AGCTTGAATCATGA-GC-A-GATCCCCA--AGTC-ATTA-TTT--T-TGTCAAA-TGCATTA-GAATTATTT-CTATAT-CGTAA-TA-TT-CATGC-ATATGAATTT-ATTCTATA-A-TC-AAACATAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACAATTT---------TT--A-TAT-TAG--CTAAA----CG---TG-T---TA--AC-AGCTG-T-AT-AT--ATG-GTTATAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CACGAGGA-TATG-AACA-T-----T-CTATTA---T-TC-AGG--TTATC-AAGTTCCATCA----TA-ATTCCATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTT-A--AT-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-A---T-AAAA--C-CTTAATT-AT--AA-----GGC-A--AATAATATA
gi|5 : CCCTTAA--TGTAG--CAATCTTGTACCTCGGATA-CGGA-TG-A-T--AAT-TG-----G-TA-TAA--TTCC------TGTTGG---TAT-TC---T-AGAAAAATAA-TTG-CTGAATAACGATT-GA-G-ACATGAAAAG-A---TCAA-T-TAAATCTG--A-T-GTG-A-TAT-TT--TT-TT-C--TA---AA-G--TCC---ATATTTGGT-GTA-A--CTGA-GG-AA-AA--TATCCAC----CTGAAA-----------AAA----TTA--TTTCAATT-AT--T-CA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTAGT--AGT-ATTC-G--A-TACG--AACAACTTCCC--CTACT----A--AAC-AAA-GCGGACTAAG-C---A-G---GGCGAATAAACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT--ATG-A-GA-C-GATA-G----A----AACA-CCACTATCCT--TTCT---T--TGTTATGA-T--AAAT-ATT-T--G-TAT----ACACCCGT---AAAATGTATGAATGAGAAGTAA-T-A--AGT-G-C-A-CAAAGT-C-AATCTTACTTAAGCGCTACACATCATT-AA----TC-ACG-AAATAGC--GTT--A-A--ACTAA-TGAT--GAA-TG-TTGTTTTAAA-TG-ATAAT---AAGCAAG--AGC-TAACAACT-GGTCAT-CAC-A--T--TGCATT--ATGGTGTT-A-TGT-AAT-G-TGTGAATGTA-TTGATG-------TTTAAGT--CATCA--TAG-----T-ATTTTTCCTTCCACCCCATTACCAC--T-TCCTGCAA-AAAT-G-A-TCCA-GGTA-CATGAACTTT-T-TT-GTAAA--CT-AGCTTAAA--ATGA-GCAA-AATCACC---AGTC-ATTA-TTC--TGTGTC-AA-TGCATTA-TA-TTATTTTCTATAT-CGTAATTA-TT-CGTGC-ATACGAATTT-ATTCTATA-A-TCAAAACATTGTAG--AA--A--T-GCTCAA-CTGAGG-AAAATT----ACAATTT-G-AT-TT-TTTAA-TAA-TAG---TAAA----CGGTATGAT---TC--TC-AGCTG-T-ATAAT--GTGAGTTAT-CAAAACACAA-GCAT--CAAAA--CACGACGA-TATG-AA-A-T-----T-GTATTC---T-TT-AGG--TTGTA-AAGTTCCAT-A----T--ATT-CATC-GAAATA-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--A--GTGACTT--CTC-TAAAAATCC-AC-T-AT--TAAAAA--TAATCAAT-------AG---T-GC-A--Ataaattattatagtagcaaaacagtaaatacagaattagccaccaaaccattcaaaggtaagggcgcctaaaaaataactggtggagtcctaaatgtaatatggggatatctagatatgattttaagttcaagaagcagtataataaatattc
gi|5 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatccATA-A-TC-AA---TAGTGC--AACAA--CAG-TCAA-CTGAGGAAAAATT----AC-ATTT-G--T-TA-TT--A-TAcaacagtcaactgaggaaaaattacatttgttattatat
gi|6 : tatcagatagataatactaagcataacgcattgacaataagatcttatgcgatcttattactcccgattcaaggcttcattgactacgcgtatcccccttaatgtagcaatcttgtacctcggatacggatgataattggtataattcctgttggtattctagaaaaataattgctgaataacgattgagacatgaaaagatcaattaaatctgatgtgatatttttttctaaagtccatatttggtgtaactgaggaaaatatccacctgaaaaaattatttcaattattcatctaacaatatctcaagtactagtagtattcgatacgaacaacttcccctactaaacaaagcggactaagcagggcgaataaacgaatattcgatttagttgatgtatgagacgatagaaacaccactatcctttctttgttatgataaatatttgtatacacccgtaaaatgtatgaatgagaagtaataagtgcacaaagtcaatcttacttaagcgctacacatcattaatcacgaaatagcgttaaactaatgatgaatgttgttttaaatgataataagcaagagctaacaactggtcatcacattgcattatggtgttatgtaatgtgtgaatgtattgatgtttaagtcatcatagtatttttccttccaccccattaccacttcctgcaaaaatgatccaggtacatgaacttttttgtaaactagcttaaaatgagcaaaatcaccagtcattattctgtgtcaatgcattatattattttctatatcgtaattattcgtgcatacgaatttattctataatcaaaacattgtagaaatgctcaactgaggaaaattacaatttgattttttaataatagtaaacggtatgattctcagctgtataatgtgagttatcaaaacacaagcatcaaaacacgacgatatgaaattgtattctttaggttgtaaagttccatatattcatcgaaataaacatttccttaaaaagtgaagtgacttctctaaaaatccactattaaaaC----AA-----GTACTACA--CGT-ATTG-G--A-TACGA-AACAGCT--CA--CTA-T----A--GAA-A-G-GC------AC-A---A-G---AA-AGAT-AACGA-AT--T-TT-CTATTG-AT-G-TGA-TGC-CATT-G-GG-T-GAGG-A----A----AACA-CT-TTCT--C--TTCA---T--TGTCATGG-T-AAAAT-ATT-T--G-TTC----T-----GT--AAAAATGTGT--ATCAAAAGT-A-T-A--CGT-GTC-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATCATT-AA----TC-ATGAAAATAGC--GTT-AA-A--AC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--A--TTCATT--AT-GTA-T-A-TGT-GTT-G-TGC--ATGTA-TCGA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-TA--T-ATCTTTCCTTCCACCCTATTACCCC----TCCTGCAA-AAAT-A-T-TCCAGGGTA-C-TGACA--A-T-TT-GTGAAA-CT-AGCTTAAATCATGA-TC-A-GATTACCA--AATC-ATCA-TTC--T-TGTCAAA-CGCATTA-GAATTTTTTTCTGTAT-CGCAA-TA-TT-AATGT-ATATGAATGT-ATCATATA-G-TC-AAACAGAGTAG--AA--A--T-A-TCAA-CTGAATACAAATT----ACAATTT-G-AT-TT-TT--A-TAA-TAC--ATAAA----CG---TGAT---TA--AT-AGCTG-T-A---------------AA-------AA-GCAT--T-AAG--CACGAGGA-TATT-ATCA-T-----A-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATT-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-CAATTGTG-A--AT-TTCACTT-AATT-T-GAAATATATC-T-A---CAAAAA--C-ATCTATT-A---AAG---TGGCAA--AATGA-ATAAGAC----ATGGGCTAAAGCA------CCCAT-TT--GA--AG--AGAAA----GTAGC-AT-----------AAAATTGG-T-AT-TATGTGT-TAT----TTATATACTTGT-TTTAGTTCCTAATGC--AGTATATCA-AATATTCTGT--ATTTC-AATT--GACACT---A-TCTA-TT-TT--ATGCG-ATGTAATTTGCTCTTTCATTCAT-TTGt
gi|7 : GGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-CCAC----CTGAAA-T-----------------TA--TGTTAATT-AT--T-CA-T-CTAACA--AT---ATCTC----AA-----GTACTGTA--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAACT--CC--CTA-T----A--AAA-AAG-GG------AT-C---A-G---AG-GGGT-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-T-TGA-TGT-CATT-G-AG-C-GAAG-A----A----AACA-CT-TCA---T--TTCT---T--TGTTATGA-T-AAAAT-ATT-T--G-TAT----A-----GT--AAAAATGTAT--ATGAGAAGT-A-T-A--AGT-G-C-A-C--AGT-A-A--TTTA-TTA--GGT----CATCATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-A--AC--A-TGAT--GAA-TGATTGTTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GG-CATCCAC-A--A--TTCATT--AT-GTG-T-A-TGT-GTT-G-TGA--ATGTA-TTGA---------TTTAAGTTCCATCA-TTAG-TA--T-ATCTTTCCTTCCACCCCATTACCAC--C-TCCTGCAA-AAAT-G-A-TCCAGGGTA-C-TGAAC--ATT-TT-GTAAAA-CT-AGCTTAAATCATGA-GC-A-AATCACCA--AGTC-ATTA-TTC--T-TGTCAAA-TGCATTA-TATTTATTTTCTATAT-CGTAA-TA-TT-CGTGC-ATACGAATTT-ATTCTATA-A-TC-AAACATTGTAG--AA--A--T-G-TCAA-CTGAGGAAAAATT----ACAATTT-G-AT-TA-TT--A-TAT-TAG--CTAAA----CG---TGAT---TA--AC-AGCTG-T-AT-AT--ATG-GTTATAAAAAAAACAA-GCAT--CAAAA--CACGAGGA-TATG-AACA-T-----T-GCATTC---T-TC-AGG--TTGTC-AAGTTCCATCA----TA-ATT-CATC-G-AATC-AA-CATT-TCCT--T-AAAAAGTG-A--AG-TTGACTT-ACTC-T-AAAATCCAAC-T-AT--TAAAAA--C-TT-AATC-A---TAG---TCGC-A--AA
gi|8 : G-CTAAATAAAGAT--AA-T-GCAT--TAA-------CAAT---AAATCTT--A-T-GCG-A-TC--TT--AT-TA-C--TGATCAA-GGCTTC---ATTGATGGT-AT
gi|8 : taGTATGCCCTTAA-CTGTAA--CA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TA-TA---TTCT--C-TATGTTGGA--TATCTCA-TT-AGAATAAATA-TTG-CTGAATTAAGATG-AA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAATT--AAAGCTG--A-T-GTG-A-TA--TT--TT-TTTC--TAACCAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A-TCTGA-GG-AA-AA--TA-ACAC----CTGAA------------------CTAA--TCTATATT-AT--T-CA-T-CTAACA--TT---ATCCC----AA-----GTACTATA--CGT-ATTC-G--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----A--GGA-AAG-GC------AT-C---A-G---AG-GGGT-AACGA-AT--A-TT-CGATTT-AG-A-TGA-TGT-CATT-G-CG-T-AAAG-A----A----AACA-CT-TCAT--T--T-CT---T--TGTCATGG-T-AAAAT-ATT-T--G-TAT----A-----GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGT-A-T-A--CAT-G-C-A-C--AGT-C-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AA----TC-ACGAAAATAGC--GTT-AA-A--AC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTT--A-TG-ATAATC--AAGCAAG--AGC-TAAC-ACT-GT-CATCCAC-A--G--TTCATT--AT-GTT-T-A-TGT-GTT-G-TAC--ATGTA-Tgcccttaactgtaacattgtactggatacggaatgataaattgtatattctctatgttggatatctcattagaataaatattgctgaattaagatgaagacatgaaaagcatttaattaaagctgatgtgatatttttttctaaccaagaccctatagttggtgtaatctgaggaaaataacacctgaactaatctatattattcatctaacattatcccaagtactatacgtattcgatacgaaacagttcactataggaaaggcatcagaggggtaacgaatattcgatttagatgatgtcattgcgtaaagaaaacacttcatttctttgtcatggtaaaatatttgtatagtaaaaatatatatcagaagtatacatgcacagtcatttattacgtcattattaatcacgaaaatagcgttaaaacatgattaatgattggtttatgataatcaagcaagagctaacactgtcatccacagttcattatgtttatgtgttgtacatgtat
gi|9 : tagctaaataaagataatgcattaacaataaatcttatgcgatcttattactgatcaaggcttcattgatgCCCTTAAACTGTAAGACA---TTGTACT--GGATA-CGGAATG-A-T--AAA-TT-----G-TA-TAAGTTTCT--C-TATG-TGGA--TATCTCA-TTAAGAATAAATA-TTG-CT-AATTAAGATGAAA-G-ACATGAAAAGCAT--TTAAAT-TAAG-CTG--A-TAGTGCA-TATTTT--TT-TT-C--TAAACAA-GACCCT---ATAGTTGGT-GTA-A--CTGAGGA-AA-AA--TA--CAC----CTG---------------GAA--CTAA--TCTATATT-AT--T-CA-TCCTAACA--TT---ATCCC----A-------TACTATA--CGT-ATTCGG--A-TACGA-AACAGTT--CA--CTA-T----AAGGAA-AAG-GC------AT-CAAAA-G---AG-GGGT-AACGA-AT--A-TTCCGATTT-AGAA-TGA-TGT-CA-T-G-CG-T-AAAG------A----AACA-CT-TCAT--T--TCCT---T--TGTCATGG-TAAAAAT-ATT-T--G-TATA---A-----GT--AAAAATATAT--ATCAGAAGTAA-T-AC-CAT-G-C-A-C--AGTCC-A--TTTA-TTA--CGT----CATTATT-AACAGTTC-AC-AAAATAGC--GTA-AA-A--AC--A-TGAT--TAA-TGATTGGTTT--ACTGAATAATCAAAAGCAAGAAAGCTTAACAAAT-GT-CATCCAC-A--GTTTTCATT--AT-GTT-TAA-TGT-GTT-GTTAC--ATGTA-T
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): ATAAAGGCAATATAACTAACAATGAATGTTATGTGATTCTTATTACTGATTAAGGTTTCATATTGG
Unaligned ( gi|36 ): TCTATGCGATCTTATTACTGATCAAGGTTTCATTTATG