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lowQualScore                  :                                        22   4 4   00 3 8    222222  6  3 99999   1  2  44444444   2  4  0   888888 555   5     4  5  222222222222   9  111111   444 0000000000000        7         2 
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lowQualScore                  :                                        00   2 7   33 7 0    222222  7  3 44444   7  6  99999999   5  1  9   111111 000   3     1  1  333333333333   7  333333   777 5555555555555        0         0 
consensus                     :                                   CTATTTCGCAATNTTGNCCNT-TCCAC----GCC-TT-C-G-T-ACAGTCACA---C--GTATAAGANCCNTCA--T---T---GTTNATACAGGTNCC---GTTGTTTTCACANGG--NG--AAT---TN---TCA------CATTCATTNACATCTACAAA
Reference ( gi|12 )           :                                   CTATTTGGCAATTTTGTCCCT-TCCAC----GCC-TT-C-G-T-ACAGTTGCA---G--ATATAAGATCCTTCA--T---T---ATTGATACAGGTACC---GTTGTGTTTACATGG--GG--AAT---TG---TCA------CATTCATTCACATCTACAGA
gi|8                          :                                   CTATTCTGCA-TCTTGGGCCTGTCCAA----CCC-TT-G-G-G-ACACTTACA---C--ATGTAAGACCC--CAG-TG--T---GTTTGTACATACACC---ATTGTTCTCACAGGG--AA--AAC---TG---TTA------CATTCAATCACATCTACAA
gi|9                          :                                  acTATTTCACAATTATGTCCCT-GCCA-----GCC-TT-C-GGT-ACAATTGCA---C--CCATAAGAACCACCA--T---T---GTTGATACAGGTACC---GCTATTCTGACAGGG--GG--AAT---TC---TCA------CATTCATTTACATCTagaa
gi|13                         :                                    TATT--GCAGTTATGGTCAC-TCCA-----GCC-CG-CTG-T-ACAGTCACA---G--AAATATGACCCCTCA--G---T---GTTAGAACAGGTGCC---ATTGTTTCCACAGGG--TG--AAT---CC---GAA------CACTCATTTATATCTAgtaatattca
gi|3                          :                               ataccttTTTTGCAGTCTGGATTTT-TCCAT-----CC-AT-C-GGT-ACAATCACA---A--GTGTAAGAGCCGACA--G---T---ATTAATACAGGTGCC---ATTGTTCTCACACGG--GGCCAGC---T-----TA------CACTCATTCACATCT
gi|1                          :                                    taccagGCAATATTG--CTTGTCCAT----CCG-TC-C-G-T-ACAATCACA---ATAATATGAG--CCATCA--T---T---GTTGATGCAGGTGCC---ACCATTTTGGCAAGG--GG--AGT---TA---TCA------CATTCGTTGACATCTgaaagaggtattacaatg
gi|14                         : tatcacatcatctcattacaaaaatacctgtttcgcagtctGCAATATTTTCCAC-TCCAT-----CC-TTGT-G-T-ACAAGAACACTGG--A---AAGATC---CA--TACGT---ATTTATACAAGTAGC---GCCATTTTTGCAAGG--TG--AATATATT---TGG------CATTCGTTAACGTCgta
gi|10                         :                                           agtatcTGTCCAT-TCTAC-----------C-G-T-ACACTGGCA---T--GTATAAGATCCTTCA--T---T---GTTTATGCAAGTTCC---ATTATGTTCACAAGG--CA--GAT---TGTTCTCG------CATTCATTGAAGTCTA
gi|15                         :                                        cgcagtcatgaccCTT-TCCAT----CCC-TT-T-T-C-ACAGTCACA---G--ACGAAAGACCCTTCG--T---T---GTTTATGCAAGTTCC---GTTATTTTCACAAGG--AG--AAT---CA---TCATCG---CATTCATTCAAATCTaaatgcaaaga
gi|5                          :                                                      CT-GCCAC----CCC-TC-T-G-T-GCAGTTACA---C--ATATAGGACCC--CA--TAG-T---ATTGATGCATGTTCC---ATTGTTTTGACAAGG--CA--AAC---GT---TTG------CATTCGTCGTCATCTgtaagagattaagga
gi|20                         :                                  taccatctctacagtctttatt-TCCACTGTAGCCGTT-C-T-G-ACATTTGCA---G--GTGTA---TCCGTTA--T---TTTTATCAATACA-----C---GT-GTGTC--CATGGCAAG--GGT---TGCTTTCA------CATTCATTTACATCTgaaaatagaaaa
gi|2                          :                                                          CCA-----GCCATT-C-T-G-ACATTTACA---T--TGATAGGAACCCTGG--G---T---GTTTGTACAGGACCC---ATTGA---CACATGG--GT--TGT---TA---TTA------CACTCGTTGATATCTACAAgt
gi|7                          :                  atatcacatttactgaaaatcacatacttaaatcgcaatcgattcctgaCC-TT-C-C-TGACAGTTACA---C--GTATAGGATCCTTCA--G---T---GTTGACACATATTCC---G-------AACCCGG--AGC-ACT---TC---TCATGTTCGCATTCATTTATATCTagttcaa
gi|16                         :                                                      atttcacaagattttcctgagtga-ACAGTTACA---G--GTGTAT--TTGTTCACGT---G---ATCAATACAGGTACC---GT---GAATACATGG--CG--AAC---TC---GCA------CACTCATCTATATCTGTAGtggtcacatttcaaa
gi|11                         :                                                    cagtttgttccagtgtagccaggctc-ACAGTCACA---C--ACATAGGAGCCATCT--G---C---ATTCACACACTGACCCCCATTG-GT--ACAGGG--AT--ACT---TC---GCA------CATTCATTAATATCTACAA
gi|23                         :                                                                                                             acctgtactgcacagtgagtctgtccacccggtgagTACAGGG--AG--AAC---TG---GCA------CATTCATCAATATCag
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): TCACACGATTCCCCAGACATCCTGCAGAACATTCACATTGAAAAGATCCGTTTGTGTTCTTACAAATTCAATCATTGGCACATGGTTGACTGATTTCGCATTCATCTATGTTTACAAAGTATAGTATCATAAATAT
Unaligned ( gi|6 ): CCTTGTTCACAAACAGTTCCATTGTATCTTTCGGTGCAATCACATTCAAATCGATTCACCAAATTATTGCAATTTCCTCCGTTTTGACATGGCGAATTTTGGCATTCATCTATGTCTGAAATTGAGAATG
Unaligned ( gi|17 ): ATATAACAGTTCTGACAAATTCTGCTTACCATCCTGACAGTCATGATTCTGCCATCCTTCCATGCACTCACACAGATAGGAACCCGGAGTGTTAATACAGGTCCCATT
Unaligned ( gi|18 ): CTCCAGTGAAACCATGGTGACAGGAACATACAAATCCATTGACGTCATCTGTACAGTTTCCATGGATGCAAGGAGAACTTGCACACTCATTTGTATCTAA
Unaligned ( gi|19 ): TGGCCAGTGTATCCTGCTTGACAGGAACAAGTGAATCTGTTGATGAAGTCATTACACGTCCCGTGCACACAAGGTGAGCTTGCACACTCGCCAATATCTT
Unaligned ( gi|21 ): CTCCAGTGTATCCAGCTTCACATTCACACACGTATCCATTGACTTGGTCGGTGCAGTTACCATGGACACAAGGAGAGCCAACACAATCGTCAATGTCTG
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Unaligned ( gi|24 ): GTTCATGCAAGTCCCGCCATTTTCACAAGTCAGAATGTTTAGTTCGCATTCATTCAC






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lowQualScore                  :                                            6   3 666  444  888   000 1111111  3  7 999 1   1     9999 2 8888  0  1   11111  88  5555     111 0 7  5     000 777  0 1 00000000000000000000   777777        0           
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Reference ( family-1587 )     :                                     CTATTTC-GCAAT--NTTGN-CCNT-TCC---AC----G-CC-TT-C-G-T-ACAGTCACAC-GTATAA---GANCCNTCA---T-TG--TTN---ATACA--GG-TNCCGTTGTTTTCA---CANG-GN-G--AA---T---T----NTCA------CATTCATTNACATCTACAAA
gi|1                          :                                            -GCAAT--ATTG---CTTGTCC---AT----C-CG-TC-C-G-T-ACAATCACA----ATAATATGAGCCATCA---T-TG--TTG---ATGCA--GG-TGCCACCATTTTGG---CAAG-GG-G--AG---T---T----ATCA------CATTCGTTGACATCT
gi|10                         :  tatcacatcatctcattacaaaaatacctgtttcgcagtctC-GCAGT--CATGA-CCTG-TCC---AT----T-CT-AC-C-G-T-ACACTGGCAT-GTATAA---GATCCTTCA---T-TG--TTT---ATGCA--AG-TTCCATTATGTTCA---CAAG-GC-A--GATTGT---T----CTCG------CATTCATTGAAGTCTAAAAgta
gi|11                         :                                                                                        -ACAGTCACAC-ACATAG---GAGCCATC------TGCATTC---ACACACTGACCCCCATTGGT---A---CAGG-GA-T--AC---T---T----CGCA------CATTCATTAATATCTACAAAtgcaaaga
gi|12                         : acctgtactgcacagtgagtctgtccacccggtgagCTATTTG-GCAAT--TTTGT-CCCT-TCC---AC----G-CC-TT-C-G-T-ACAGTTGCAG-ATATAA---GATCCTTCA---T-TA--TTG---ATACA--GG-TACCGTTGTGTTTA---CATG-GG-G--AA---T---T----GTCA------CATTCATTCACATCTACAGAag
gi|13                         :                                      TATT---GCAGT--TATGG-TCAC-TCC---A-----G-CC-CG-CTG-T-ACAGTCACAG-AAATAT---GACCCCTCA---G-TG--TTA---GAACA--GG-TGCCATTGTTTCCA---CAGG-GT-G--AA---T---C----CGAA------CACTCATTTATATCTA
gi|14                         :                                   ataccttTC-GCAAT--ATTTT-CCAC-TCC---AT------CC-TTGT-G-T-ACAAGAACACTGGA-AA---GATCCATAC---G-TA--TTT---ATACA--AG-TAGCGCCATTTTTG---CAAG-GT-G--AA---TATAT----TTGG------CATTCGTTAACGTC
gi|15                         :                                                       agtaCTT-TCC---AT----C-CC-TT-T-T-C-ACAGTCACAG-ACGAAA---GACCCTTCG---T-TG--TTT---ATGCA--AG-TTCCGTTATTTTCA---CAAG-GA-G--AA---T---C----ATCATCG---CATTCATTCAAATCTGTAA
gi|16                         :                                                                                        -ACAGTTACAG-GTGTAT-----TTGTTCA---CGTGA-TCA---ATACA--GG-TACCGTGAAT---A---CATG-GC-G--AA---C---T----CGCA------CACTCATCTATATCTgagattaagga
gi|17                         :                    cagtttgttccagtgtagccaggctcCAGT--CATGA-TTCT-GCC---AT----C-CT-TC-C-A-T-GCACTCACAC-AGATAG---GAACCCGGA---G-TG--TTA---ATACA--GG-TCCCATTgtag
gi|2                          :     atataacagttctgacaaattctgcttaccatcctgaTC-GCAATCGATT---CCTG-ACC---A-----G-CCATT-C-T-G-ACATTTACAT-TGATAG---GAACCCTGG---G-TG--TTT---GTACA--GG-ACCCATTG---ACA---CATG-GG-T--TG---T---T----ATTA------CACTCGTTGATATCTACAAA
gi|20                         :                              atatcacatttactgaaaatcacatacttaaa-TCC---ACTGTAG-CCGTT-C-T-G-ACATTTGCAG-GTGTA------TCCGTTA---T-TT--TTATCAATACA--------CGT-GTGTCCATGGCAAG-GG-T--TG---C---T----TTCA------CATTCATTTACATCTagttcaa
gi|22                         :                                                                                      -T-ACAGACACAC-G---AA---ACCCCACCGAGTT-CG--TTA---AAACA--CG-TA---TTATTTCCA---CAAG-GG-T--GT---T---C----ATCA------CACTCGTTTGTATCgt
gi|24                         :                                                                                                           ccctctgtatccagggtG--TTC---ATGCA--AG-TCCCGCCATTTTCA---CAAGTCA-G--AA---TG--TTTAGTTCG------CATTCATTCAC
gi|3                          :                                        TTTT-GCAGT--CTGGA-TTTT-TCC---AT------CC-AT-C-GGT-ACAATCACAA-GTGTAA---GAGCCGACA---G-TA--TTA---ATACA--GG-TGCCATTGTTCTCA---CACG-GG-GCCAG------------CTTA------CACTCATTCACATCT
gi|4                          :                                                                                  taccag-ACATTCACAT-TGAAAA---GATCCGTTT---G-TG--TTC---TTACA--AA-TTCAATCATTGGCA---CATG-GTTG--AC---TGA-T----TTCG------CATTCATCTATGTTTACAAAgaaagaggtattacaatg
gi|5                          :         tcacacgattccccagacatcctgcagaCCATCTCTACAGT--CTTTA-TTCT-GCC---AC----C-CC-TC-T-G-T-GCAGTTACAC-ATATAG---GACCCCATA---G-TA--TTG---ATGCA--TG-TTCCATTGTTTTGA---CAAG-GC-A--AA---C---G----TTTG------CATTCGTCGTCATCTGAAAAgtatagtatcataaatat
gi|6                          :                                                                          ta-CT-TT-C-GGT-GCAATCACAT-TCA-AATC-GATTCACCAAA-T-TA--TTG------CA--AT-TTCCTCCGTTTTGA---CATG-GC-G--AA---T---T----TTGG------CATTCATCTATGTCTtagaaaa
gi|7                          :            ccttgttcacaaacagttccattgtatATTTC-ACAAG--ATT------T-TCCTGAGT----GACC-TT-C-C-TGACAGTTACAC-GTATAG---GATCCTTCA---G-TG--TTG---ACACA--TA-TTCCG-------AA---CCCG-GA-GC-AC---T---T----CTCATGTTCGCATTCATTTATATCTgaaattgagaatg
gi|8                          :                                     CTATTCT-GCA-T--CTTGGGCCTG-TCC---AA----C-CC-TT-G-G-G-ACACTTACAC-ATGTAA---GACCC--CAG--TGTG--TTT---GTACA--TA-CACCATTGTTCTCA---CAGG-GA-A--AA---C---T----GTTA------CATTCAATCACATCTACAAAtggtcacatttcaaa
gi|9                          :                                    acTATTTC-ACAAT--TATGT-CCCT-GCC---A-----G-CC-TT-C-GGT-ACAATTGCAC-CCATAA---GAACCACCA---T-TG--TTG---ATACA--GG-TACCGCTATTCTGA---CAGG-GG-G--AA---T---T----CTCA------CATTCATTTACATCTGTAAagaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CTCCAGTGAAACCATGGTGACAGGAACATACAAATCCATTGACGTCATCTGTACAGTTTCCATGGATGCAAGGAGAACTTGCACACTCATTTGTATCTAA
Unaligned ( gi|19 ): TGGCCAGTGTATCCTGCTTGACAGGAACAAGTGAATCTGTTGATGAAGTCATTACACGTCCCGTGCACACAAGGTGAGCTTGCACACTCGCCAATATCTT
Unaligned ( gi|21 ): CTCCAGTGTATCCAGCTTCACATTCACACACGTATCCATTGACTTGGTCGGTGCAGTTACCATGGACACAAGGAGAGCCAACACAATCGTCAATGTCTG
Unaligned ( gi|23 ): CAGACACATATATAGCTGTTGATTCTATCCTCTATACAATCGTTTCCATACATACAGGGAGAACTGGCACATTCATCAATATC






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lowQualScore                  :                                            .   .  .............  ..    ......      . .   .    .. ......   .  .  .   ..  . .. .     ..   .  ...   ...   . . .. .. ....................           .           
lowQualScore                  :                                            0   4  4444444444444  00    888888      7 4   1    22 222222   9  0  3   44  2 11 0     11   0  888   999   0 4 44 22 11111111111111111111           0           
consensus                     :                                     CTATTTC-GCAGTC--T------TGN-CCTTTCCATC----CCTCCG-T-ACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTCAG-TG-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
Reference ( family-1587 )     :                                     CTATTTC-GCAGTC--T------TGN-CCTTTCCATN----CCTTCG-T-ACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTCAN-TG-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
gi|1                          :                                     CTGTTTC-GCAGTC--TGCAATATTG-CTTGTCCATC----CGTCCG-T-ACAATCAC--A--A-TAATATGAGCCATCAT-TG-T--TGATGCA--GGTGCCACCATTTTGGCAAG-GG-G--A---G---T---T-------ATCACATTCGTTGACATCT
gi|10                         :                tatcacatcatctcattacaaaaatacC-GCAGTC--A------TGA-CCTGTCCATT----CTACCG-T-ACACTGGC--A--T-GTATAAGATCCTTCAT-TG-T--TTATGCA--AGTTCCATTATGTTCACAAG-GC-A--G---ATTGT---T-------CTCGCATTCATTGAAGTCTAAAAgta
gi|11                         :                                                                                      -ACAGTCAC--A--C-ACATAGGAGCCATCTG-CA-T--TCACACACTGACCCC--CATTGGTACAGG-GA-T--A---C---T---T-------CGCACATTCATTAATATCTACAAAtgcaaaga
gi|12                         : acctgtactgcacagtgagtctgtccacccggtgagCTATTTG-GCAATT--T------TGT-CCCTTCCACG----CCTTCG-T-ACAGTTGC--A--G-ATATAAGATCCTTCAT-TA-T--TGATACA--GGTACCGTTGTGTTTACATG-GG-G--A---A---T---T-------GTCACATTCATTCACATCTACAGAag
gi|13                         :                                      TATT---GCAGTT--A------TGG-TCACTCCAGC----CCGCTG-T-ACAGTCAC--A--G-AAATATGACCCCTCAG-TG-T--TAGAACA--GGTGCCATTGTTTCCACAGG-GT-G--A---A---T---C-------CGAACACTCATTTATATCTA
gi|14                         :                                   ataccttTC-GCAATA--T------TTT-CCACTCCATC----CTTGTG-T-ACAAGAAC--A--CTGGA-AAGATCCATACG-TA-T--TTATACA--AGTAGCGCCATTTTTGCAAG-GT-G--A---A---TATAT-------TTGGCATTCGTTAACGTC
gi|15                         :                                                             agtaCTTTCCATC----CCTTTT-C-ACAGTCACAGA--C-GA--AAGACCCTTCGT-TG-T--TTATGCA--AGTTCCGTTATTTTCACAAG-GA-G--AATCA---T---C-------ATCGCATTCATTCAAATCTGTAA
gi|16                         :                                                                                      -ACAGTTAC--A--G-GTGTAT--TTGTTCACGTGAT--CAATACA--GGTACCGTGAAT---ACATG-GC-G--A---A---C---T-------CGCACACTCATCTATATCTgagattaagga
gi|17                         :                    cagtttgttccagtgtagccaggctcCAGTC--A------TGA-TTCTGCCATC----CTTCCA-T-GCACTCAC--A--C-AGATAGGAACCCGGAG-TG-T--TAATACA--GGTCCCATgtag
gi|2                          :     atataacagttctgacaaattctgcttaccatcctgaTC-GCAATCGAT------T---CCTGACCAGC----CATTCT-G-ACATTTAC--A--T-TGATAGGAACCCTGGG-TG-T--TTGTACA--GGACCCATTG---ACACATG-GG-T--T---G---T---T-------ATTACACTCGTTGATATCTACAAAt
gi|24                         :                                                                                        atatcacatttactgaaaatcacatacttaaaG-T--TCATGCA--AGTCCCGCCATTTTCACAAGTCA-G--A---A---TG--TTTAG---TTCGCATTCATTCACagttcaa
gi|3                          :                                        TTTT-GCAGTC--T------GGA-TTTTTCCATC----CATCGG-T-ACAATCAC--A--A-GTGTAAGAGCCGACAG-TA-T--TAATACA--GGTGCCATTGTTCTCACACG-GG-GCCA---G---------------CTTACACTCATTCACATCT
gi|4                          :                                                                                taccag-ACATTCAC--A--T-TGAAAAGATCCGTTTG-TG-T--TCTTACA--AATTCAATCATTGGCACATG-GTTG--A---C---TGA-T-------TTCGCATTCATCTATGTTTACAAAgaaagaggtattacaatg
gi|5                          :         tcacacgattccccagacatcctgcagaCCATCTCTACAGTC--T------TTA-TTCTGCCACC----CCTCTG-T-GCAGTTAC--A--C-ATATAGGACCCCATAG-TA-T--TGATGCA--TGTTCCATTGTTTTGACAAG-GC-A--A---A---C---G-------TTTGCATTCGTCGTCATCTGAAAAgtatagtatcataaatat
gi|6                          :                                                                 taTTCCATTGTATCTTTCGGT-GCAATCAC--ATTC-AAATC-GATTCACCAA--A-T--TATTGCA--ATTTCCTCCGTTTTGACATG-GC-G--A---A---T---T-------TTGGCATTCATCTATGTCTtagaaaa
gi|7                          :                                                          ccttgttcacaaacag----CCTTCC-TGACAGTTAC--A--C-GTATAGGATCCTTCAG-TG-T--TGACACA--TATTCCG-------AACCCG-GA-G--C---A---C---TTCTCATGTTCGCATTCATTTATATCTgaaattgagaatg
gi|8                          :             atttcacaagattttcctgagtgaCTATTCT-GCA-TC--T------TGGGCCTGTCCAAC----CCTTGG-G-ACACTTAC--A--C-ATGTAAGACCC--CAG-TG-TGTTTGTACA--TACACCATTGTTCTCACAGG-GA-A--A---A---C---T-------GTTACATTCAATCACATCTACAAAtggtcacatttcaaa
gi|9                          :                                    acTATTTC-ACAATT--A------TGT-CCCTGCCA-G----CCTTCGGT-ACAATTGC--A--C-CCATAAGAACCACCAT-TG-T--TGATACA--GGTACCGCTATTCTGACAGG-GG-G--A---A---T---T-------CTCACATTCATTTACATCTGTAAagaa
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CTCCAGTGAAACCATGGTGACAGGAACATACAAATCCATTGACGTCATCTGTACAGTTTCCATGGATGCAAGGAGAACTTGCACACTCATTTGTATCTAA
Unaligned ( gi|19 ): TGGCCAGTGTATCCTGCTTGACAGGAACAAGTGAATCTGTTGATGAAGTCATTACACGTCCCGTGCACACAAGGTGAGCTTGCACACTCGCCAATATCTT
Unaligned ( gi|20 ): TCCACTGTAGCCGTTCTGACATTTGCAGGTGTATCCGTTATTTTTATCAATACACGTGTGTCCATGGCAAGGGTTGCTTTCACATTCATTTACATCTGT
Unaligned ( gi|21 ): CTCCAGTGTATCCAGCTTCACATTCACACACGTATCCATTGACTTGGTCGGTGCAGTTACCATGGACACAAGGAGAGCCAACACAATCGTCAATGTCTG
Unaligned ( gi|22 ): CCCTCTGTATCCAGGGTTACAGACACACGAAACCCCACCGAGTTCGTTAAAACACGTATTATTTCCACAAGGGTGTTCATCACACTCGTTTGTATC
Unaligned ( gi|23 ): CAGACACATATATAGCTGTTGATTCTATCCTCTATACAATCGTTTCCATACATACAGGGAGAACTGGCACATTCATCAATATC






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lowQualScore                  :                                                      0   4  4444444444444  88    1  5  6     4    11 888888   2  0  2  2 2  99 1 99 0     88   0  888   555   0 1 11 99 11111111111111111111           0 2         
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Reference ( family-1587 )     :                                               CTATTTC-GCAGTC--T------TGN-CCTTTCCATCCCTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
gi|1                          :                                               CTGTTTC-GCAGTC--TGCAATATTG-CTTGTCCATCCGTCCGTACAATCAC--A--A-TAATATGAGCCATC-A-TT--G-T--TGATGCA--GGTGCCACCATTTTGGCAAG-GG-G--A---G---T---T-------ATCACATTCGTTGACATCT
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gi|12                         :           acctgtactgcacagtgagtctgtccacccggtgagCTATTTG-GCAATT--T------TGT-CCCTTCCACGCCTTCGTACAGTTGC--A--G-ATATAAGATCCTTC-A-TT--A-T--TGATACA--GGTACCGTTGTGTTTACATG-GG-G--A---A---T---T-------GTCACATTCATTCACATCTACAGAag
gi|13                         :                                                TATT---GCAGTT--A------TGG-TCACTCCAGCCCGCTGTACAGTCAC--A--G-AAATATGACCCCTC-A-GT--G-T--TAGAACA--GGTGCCATTGTTTCCACAGG-GT-G--A---A---T---C-------CGAACACTCATTTATATCTA
gi|14                         :                                             ataccttTC-GCAATA--T------TTT-CCACTCCATCCTTGTGTACAAGAAC--A--CTGGA-AAGATCCATA-C-GT--A-T--TTATACA--AGTAGCGCCATTTTTGCAAG-GT-G--A---A---TATAT-------TTGGCATTCGTTAACGTC
gi|15                         :                                                                       agtaCTTTCCATCCCTTTTCACAGTCACAGA--C-GA--AAGACCCTTC-G-TT--G-T--TTATGCA--AGTTCCGTTATTTTCACAAG-GA-G--AATCA---T---C-------ATCGCATTCATTCAAATCTGTAA
gi|16                         :                                                                                           ACAGTTAC--A--G-GTGTAT--TTGTTC-ACGT--GAT--CAATACA--GGTACCGTGAAT---ACATG-GC-G--A---A---C---T-------CGCACACTCATCTATATCTgagattaagga
gi|17                         :                              cagtttgttccagtgtagccaggctcCAGTC--A------TGA-TTCTGCCATCCTTCCATGCACTCAC--A--C-AGATAGGAACCCGG-A-GT--G-T--TAATACA--GGTCCCATgtag
gi|18                         :                                                                                                  atataacagttctgacaaattctgcttaccatcctgaTACA--GTTTCCATGGAT---GCAAG-GA-G--A---A---C---T-------TGCACACTCATTTGTATCTAt
gi|2                          : ctccagtgaaaccatggtgacaggaacatacaaatccattgacgtcatctgTC-GCAATCGAT------T---CCTGACCAGCCATTCTGACATTTAC--A--T-TGATAGGAACCCTG-G-GT--G-T--TTGTACA--GGACCCATTGA---CACATG-GG-T--T---G---T---T-------ATTACACTCGTTGATATCTACAAAa
gi|22                         :                                                          atatcacatttactgaaaatcacatacttaaaTACAGACAC--A--C-G---AAACCCCACCGA-GTTCG-T--TAAAACA--CGTA---TTATTTCCACAAG-GG-T--G---T---T---C-------ATCACACTCGTTTGTATCagttcaa
gi|24                         :                                                                                                            ccctctgtatccagggt--G-T--TCATGCA--AGTCCCGCCATTTTCACAAGTCA-G--A---A---TG--TTTAG---TTCGCATTCATTCAC
gi|3                          :                                                  TTTT-GCAGTC--T------GGA-TTTTTCCATCCATCGGTACAATCAC--A--A-GTGTAAGAGCCGAC-A-GT--A-T--TAATACA--GGTGCCATTGTTCTCACACG-GG-GCCA---G---------------CTTACACTCATTCACATCT
gi|4                          :                                                                          taccagCATCCTGCAGAACATTCAC--A--T-TGAAAAGATCCGTT-T-GT--G-T--TCTTACA--AATTCAATCATTGGCACATG-GTTG--A---C---TGA-T-------TTCGCATTCATCTATGTTTACAAAgaaagaggtattacaatg
gi|5                          :                              tcacacgattccccagaCCATCTCTACAGTC--T------TTA-TTCTGCCACCCCTCTGTGCAGTTAC--A--C-ATATAGGACCCCAT-A-GT--A-T--TGATGCA--TGTTCCATTGTTTTGACAAG-GC-A--A---A---C---G-------TTTGCATTCGTCGTCATCTGAAAAgtatagtatcataaatat
gi|6                          :                                                                               taATCTTTCGGTGCAATCAC--ATTC-AAATC-GATTCACC-A-A---A-T--TATTGCA--ATTTCCTCCGTTTTGACATG-GC-G--A---A---T---T-------TTGGCATTCATCTATGTCTtagaaaa
gi|7                          :                                                          ccttgttcacaaacagttccattgtCCTTCCTGACAGTTAC--A--C-GTATAGGATCCTTC-A-GT--G-T--TGACACA--TATTCCG-------AACCCG-GA-G--C---A---C---TTCTCATGTTCGCATTCATTTATATCTgaaattgagaatg
gi|8                          :                       atttcacaagattttcctgagtgaCTATTCT-GCA-TC--T------TGGGCCTGTCCAACCCTTGGGACACTTAC--A--C-ATGTAAGACCC--C-A-GT--G-TGTTTGTACA--TACACCATTGTTCTCACAGG-GA-A--A---A---C---T-------GTTACATTCAATCACATCTACAAAtggtcacatttcaaa
gi|9                          :                                              acTATTTC-ACAATT--A------TGT-CCCTGCCAGCCTTCGGTACAATTGC--A--C-CCATAAGAACCACC-A-TT--G-T--TGATACA--GGTACCGCTATTCTGACAGG-GG-G--A---A---T---T-------CTCACATTCATTTACATCTGTAAagaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGGCCAGTGTATCCTGCTTGACAGGAACAAGTGAATCTGTTGATGAAGTCATTACACGTCCCGTGCACACAAGGTGAGCTTGCACACTCGCCAATATCTT
Unaligned ( gi|20 ): TCCACTGTAGCCGTTCTGACATTTGCAGGTGTATCCGTTATTTTTATCAATACACGTGTGTCCATGGCAAGGGTTGCTTTCACATTCATTTACATCTGT
Unaligned ( gi|21 ): CTCCAGTGTATCCAGCTTCACATTCACACACGTATCCATTGACTTGGTCGGTGCAGTTACCATGGACACAAGGAGAGCCAACACAATCGTCAATGTCTG
Unaligned ( gi|23 ): CAGACACATATATAGCTGTTGATTCTATCCTCTATACAATCGTTTCCATACATACAGGGAGAACTGGCACATTCATCAATATC






Alignments
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lowQualScore                  :                                                      0   4  4444444444444  88    1  5  6     4    11 888888   2  0  2  2 2  99 1 99 0     88   0  888   555   0 1 11 99 11111111111111111111           0 2         
consensus                     :                                               CTATTTC-GCAGTC--T------TGN-CCTTTCCATCCCTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
Reference ( family-1587 )     :                                               CTATTTC-GCAGTC--T------TGN-CCTTTCCATCCCTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
gi|1                          :                                               CTGTTTC-GCAGTC--TGCAATATTG-CTTGTCCATCCGTCCGTACAATCAC--A--A-TAATATGAGCCATC-A-TT--G-T--TGATGCA--GGTGCCACCATTTTGGCAAG-GG-G--A---G---T---T-------ATCACATTCGTTGACATCT
gi|10                         :                          tatcacatcatctcattacaaaaatacC-GCAGTC--A------TGA-CCTGTCCATTCTACCGTACACTGGC--A--T-GTATAAGATCCTTC-A-TT--G-T--TTATGCA--AGTTCCATTATGTTCACAAG-GC-A--G---ATTGT---T-------CTCGCATTCATTGAAGTCTAAAAgta
gi|11                         :                                                                                           ACAGTCAC--A--C-ACATAGGAGCCATC-T-GC--A-T--TCACACACTGACCCC--CATTGGTACAGG-GA-T--A---C---T---T-------CGCACATTCATTAATATCTACAAAtgcaaaga
gi|12                         :           acctgtactgcacagtgagtctgtccacccggtgagCTATTTG-GCAATT--T------TGT-CCCTTCCACGCCTTCGTACAGTTGC--A--G-ATATAAGATCCTTC-A-TT--A-T--TGATACA--GGTACCGTTGTGTTTACATG-GG-G--A---A---T---T-------GTCACATTCATTCACATCTACAGAag
gi|13                         :                                                TATT---GCAGTT--A------TGG-TCACTCCAGCCCGCTGTACAGTCAC--A--G-AAATATGACCCCTC-A-GT--G-T--TAGAACA--GGTGCCATTGTTTCCACAGG-GT-G--A---A---T---C-------CGAACACTCATTTATATCTA
gi|14                         :                                             ataccttTC-GCAATA--T------TTT-CCACTCCATCCTTGTGTACAAGAAC--A--CTGGA-AAGATCCATA-C-GT--A-T--TTATACA--AGTAGCGCCATTTTTGCAAG-GT-G--A---A---TATAT-------TTGGCATTCGTTAACGTC
gi|15                         :                                                                       agtaCTTTCCATCCCTTTTCACAGTCACAGA--C-GA--AAGACCCTTC-G-TT--G-T--TTATGCA--AGTTCCGTTATTTTCACAAG-GA-G--AATCA---T---C-------ATCGCATTCATTCAAATCTGTAA
gi|16                         :                                                                                           ACAGTTAC--A--G-GTGTAT--TTGTTC-ACGT--GAT--CAATACA--GGTACCGTGAAT---ACATG-GC-G--A---A---C---T-------CGCACACTCATCTATATCTgagattaagga
gi|17                         :                              cagtttgttccagtgtagccaggctcCAGTC--A------TGA-TTCTGCCATCCTTCCATGCACTCAC--A--C-AGATAGGAACCCGG-A-GT--G-T--TAATACA--GGTCCCATgtag
gi|18                         :                                                                                                  atataacagttctgacaaattctgcttaccatcctgaTACA--GTTTCCATGGAT---GCAAG-GA-G--A---A---C---T-------TGCACACTCATTTGTATCTAt
gi|2                          : ctccagtgaaaccatggtgacaggaacatacaaatccattgacgtcatctgTC-GCAATCGAT------T---CCTGACCAGCCATTCTGACATTTAC--A--T-TGATAGGAACCCTG-G-GT--G-T--TTGTACA--GGACCCATTGA---CACATG-GG-T--T---G---T---T-------ATTACACTCGTTGATATCTACAAAa
gi|22                         :                                                          atatcacatttactgaaaatcacatacttaaaTACAGACAC--A--C-G---AAACCCCACCGA-GTTCG-T--TAAAACA--CGTA---TTATTTCCACAAG-GG-T--G---T---T---C-------ATCACACTCGTTTGTATCagttcaa
gi|24                         :                                                                                                            ccctctgtatccagggt--G-T--TCATGCA--AGTCCCGCCATTTTCACAAGTCA-G--A---A---TG--TTTAG---TTCGCATTCATTCAC
gi|3                          :                                                  TTTT-GCAGTC--T------GGA-TTTTTCCATCCATCGGTACAATCAC--A--A-GTGTAAGAGCCGAC-A-GT--A-T--TAATACA--GGTGCCATTGTTCTCACACG-GG-GCCA---G---------------CTTACACTCATTCACATCT
gi|4                          :                                                                          taccagCATCCTGCAGAACATTCAC--A--T-TGAAAAGATCCGTT-T-GT--G-T--TCTTACA--AATTCAATCATTGGCACATG-GTTG--A---C---TGA-T-------TTCGCATTCATCTATGTTTACAAAgaaagaggtattacaatg
gi|5                          :                              tcacacgattccccagaCCATCTCTACAGTC--T------TTA-TTCTGCCACCCCTCTGTGCAGTTAC--A--C-ATATAGGACCCCAT-A-GT--A-T--TGATGCA--TGTTCCATTGTTTTGACAAG-GC-A--A---A---C---G-------TTTGCATTCGTCGTCATCTGAAAAgtatagtatcataaatat
gi|6                          :                                                                               taATCTTTCGGTGCAATCAC--ATTC-AAATC-GATTCACC-A-A---A-T--TATTGCA--ATTTCCTCCGTTTTGACATG-GC-G--A---A---T---T-------TTGGCATTCATCTATGTCTtagaaaa
gi|7                          :                                                          ccttgttcacaaacagttccattgtCCTTCCTGACAGTTAC--A--C-GTATAGGATCCTTC-A-GT--G-T--TGACACA--TATTCCG-------AACCCG-GA-G--C---A---C---TTCTCATGTTCGCATTCATTTATATCTgaaattgagaatg
gi|8                          :                       atttcacaagattttcctgagtgaCTATTCT-GCA-TC--T------TGGGCCTGTCCAACCCTTGGGACACTTAC--A--C-ATGTAAGACCC--C-A-GT--G-TGTTTGTACA--TACACCATTGTTCTCACAGG-GA-A--A---A---C---T-------GTTACATTCAATCACATCTACAAAtggtcacatttcaaa
gi|9                          :                                              acTATTTC-ACAATT--A------TGT-CCCTGCCAGCCTTCGGTACAATTGC--A--C-CCATAAGAACCACC-A-TT--G-T--TGATACA--GGTACCGCTATTCTGACAGG-GG-G--A---A---T---T-------CTCACATTCATTTACATCTGTAAagaa


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blockSeqs                     :                                                      .      ATGA           CT       C  C     G    .  CTGG     G  G  A  . .  .  . .  C     .    C  GTT   GGT   G . C  .  ATGTTTAGT                      A
blockSeqs                     :                                                      .      TTGT           AC       C  T     G    .  TGT      A  T  T  . .  .  . .  G     .    A  ATT   TTT   T . A  .  ATTGTTC                        C
blockSeqs                     :                                                      .      ATGG           AC       T  T     G    .  CAC      T  C  C  . .  .  . .  A     .    G  GCC   TCC   G . G  .  ATATATT                        T
blockSeqs                     :                                                      .      TTTT           TT       C  T     A    .  GAT      A  T  A  . .  .  . .  T     .    A  GTT   TTT   A . T  .  ATCATCA                        A
blockSeqs                     :                                                      .      ATGA           CT       T  C     G    .  GAA      A  C  T  . .  .  . .  T     .    T  GTG   TTC   A . T  .  CTGATT                         C
blockSeqs                     :                                                      .      GATT           TG       A  C     G    .  CGA      T  T  T  . .  .  . .  A     .    A  ATG   TCC   T . A  .  CTTC                           T
blockSeqs                     :                                                      .      TGGA           TT       A  G     C    .  GGT      G  A  C  . .  .  . .  A     .    C  ATT   TTC   A . C  .  ATTG                           T
blockSeqs                     :                                                      .      TTTA           CT       T  A     T    .  CAG      G  A  C  . .  .  . .  T     .    T  GCC   CTC   T . A  .  ATCC                           G
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blockSeqs                     :                                                                            CT       T  G     A    .  AGT      A  G  G  . .  .  . .  C     .    A  ATC   TTG   A . G  .  ACTT                           C
blockSeqs                     :                                                                                     T  C     T    .  TTG      A  T  G  . .  .  . .  A     .    C  ATT   TTG   C . A  .  GTTA                           C
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blockSeqs                     :                                                                                     T  G     A    .  CGT      G  T  A  . .  .  . .  G     .    T  ATT   CTG   A . C  .  ACGT                           G
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blockSeqs                     :                                                                                              A    .  CG       .  A  .  . .  .  . .  T     .    T  C     .     G . A  .  ATTC                           C
blockSeqs                     :                                                                                                                             .  . .  G     .    A  G     .     G . G  .  GC                             T
blockSeqs                     :                                                                                                                                           .    A                                                        


blockSeqCons                  :                                                             NTGN*********
originalCons                  :                                               CTATTTC-GCAGTC--T------TGN-CCTTTCCATCCCTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
finalCons                     :                                               CTATTTC-GCAGTCNTGN---------CCTTTCCATCCCTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGGCCAGTGTATCCTGCTTGACAGGAACAAGTGAATCTGTTGATGAAGTCATTACACGTCCCGTGCACACAAGGTGAGCTTGCACACTCGCCAATATCTT
Unaligned ( gi|20 ): TCCACTGTAGCCGTTCTGACATTTGCAGGTGTATCCGTTATTTTTATCAATACACGTGTGTCCATGGCAAGGGTTGCTTTCACATTCATTTACATCTGT
Unaligned ( gi|21 ): CTCCAGTGTATCCAGCTTCACATTCACACACGTATCCATTGACTTGGTCGGTGCAGTTACCATGGACACAAGGAGAGCCAACACAATCGTCAATGTCTG
Unaligned ( gi|23 ): CAGACACATATATAGCTGTTGATTCTATCCTCTATACAATCGTTTCCATACATACAGGGAGAACTGGCACATTCATCAATATC






Alignments
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lowQualScore                  :                                               4  5555555  00   5       4  4     1    22 666666   0  0  3  4 4  11 2 11 0     11   0  2222  333   0 4 44 22 22222222222222222222           0 5         
consensus                     :                                     CTATTTCGCAGTCN------TGN-CCTNTCCATCCTTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
Reference ( family-1587 )     :                                     CTATTTCGCAGTCN------TGN-CCTTTCCATCCCTCCGTACAGTCAC--A--C-GNATAAGANCCNTC-A-GT--G-T--TNATACA--GGTNCCGTCGTTTTCACANG-GN-G--A---A---T---T-------NTCGCATTCATTNACATCTACAAA
gi|1                          :                                     CTGTTTCGCAGTCTGCAATATTG-CTTGTCCATCCGTCCGTACAATCAC--A--A-TAATATGAGCCATC-A-TT--G-T--TGATGCA--GGTGCCACCATTTTGGCAAG-GG-G--A---G---T---T-------ATCACATTCGTTGACATCT
gi|10                         :                tatcacatcatctcattacaaaaatacCGCAGTCA------TGA-CCTGTCCATTCTACCGTACACTGGC--A--T-GTATAAGATCCTTC-A-TT--G-T--TTATGCA--AGTTCCATTATGTTCACAAG-GC-A--G---ATTGT---T-------CTCGCATTCATTGAAGTCTAAAAgta
gi|11                         :                                                                              ACAGTCAC--A--C-ACATAGGAGCCATC-T-GC--A-T--TCACACACTGACCCC--CATTGGTACAGG-GA-T--A---C---T---T-------CGCACATTCATTAATATCTACAAAtgcaaaga
gi|12                         : acctgtactgcacagtgagtctgtccacccggtgagCTATTTGGCAATTT------TGT-CCCTTCCACGCCTTCGTACAGTTGC--A--G-ATATAAGATCCTTC-A-TT--A-T--TGATACA--GGTACCGTTGTGTTTACATG-GG-G--A---A---T---T-------GTCACATTCATTCACATCTACAGAag
gi|13                         :                                      TATT--GCAGTTA------TGG-TCACTCCAGCCCGCTGTACAGTCAC--A--G-AAATATGACCCCTC-A-GT--G-T--TAGAACA--GGTGCCATTGTTTCCACAGG-GT-G--A---A---T---C-------CGAACACTCATTTATATCTA
gi|14                         :                                   ataccttTCGCAATAT------TTT-CCACTCCATCCTTGTGTACAAGAAC--A--CTGGA-AAGATCCATA-C-GT--A-T--TTATACA--AGTAGCGCCATTTTTGCAAG-GT-G--A---A---TATAT-------TTGGCATTCGTTAACGTC
gi|15                         :                                                          agtaCTTTCCATCCCTTTTCACAGTCACAGA--C-GA--AAGACCCTTC-G-TT--G-T--TTATGCA--AGTTCCGTTATTTTCACAAG-GA-G--AATCA---T---C-------ATCGCATTCATTCAAATCTGTAA
gi|16                         :                                                                              ACAGTTAC--A--G-GTGTAT--TTGTTC-ACGT--GAT--CAATACA--GGTACCGTGAAT---ACATG-GC-G--A---A---C---T-------CGCACACTCATCTATATCTgagattaagga
gi|17                         :                   cagtttgttccagtgtagccaggctcCAGTCA------TGA-TTCTGCCATCCTTCCATGCACTCAC--A--C-AGATAGGAACCCGG-A-GT--G-T--TAATACA--GGTCCCATgtag
gi|2                          :     atataacagttctgacaaattctgcttaccatcctgaTCGCAATCG------ATT-CCTGACCAGCCATTCTGACATTTAC--A--T-TGATAGGAACCCTG-G-GT--G-T--TTGTACA--GGACCCATTG---ACACATG-GG-T--T---G---T---T-------ATTACACTCGTTGATATCTACAAAt
gi|22                         :                                             atatcacatttactgaaaatcacatacttaaaTACAGACAC--A--C-G---AAACCCCACCGA-GTTCG-T--TAAAACA--CGTA---TTATTTCCACAAG-GG-T--G---T---T---C-------ATCACACTCGTTTGTATCagttcaa
gi|24                         :                                                                                               ccctctgtatccagggt--G-T--TCATGCA--AGTCCCGCCATTTTCACAAGTCA-G--A---A---TG--TTTAG---TTCGCATTCATTCAC
gi|3                          :                                        TTTTGCAGTCT------GGA-TTTTTCCATCCATCGGTACAATCAC--A--A-GTGTAAGAGCCGAC-A-GT--A-T--TAATACA--GGTGCCATTGTTCTCACACG-GG-GCCA---G---------------CTTACACTCATTCACATCT
gi|4                          :                                                             taccagCATCCTGCAGAACATTCAC--A--T-TGAAAAGATCCGTT-T-GT--G-T--TCTTACA--AATTCAATCATTGGCACATG-GTTG--A---C---TGA-T-------TTCGCATTCATCTATGTTTACAAAgaaagaggtattacaatg
gi|6                          :                                                   tcacacgattccccagaATCTTTCGGTGCAATCAC--ATTC-AAATC-GATTCACC-A-A---A-T--TATTGCA--ATTTCCTCCGTTTTGACATG-GC-G--A---A---T---T-------TTGGCATTCATCTATGTCTgtatagtatcataaatat
gi|7                          :                                             ccttgttcacaaacagttccattgtCCTTCCTGACAGTTAC--A--C-GTATAGGATCCTTC-A-GT--G-T--TGACACA--TATTCCG-------AACCCG-GA-G--C---A---C---TTCTCATGTTCGCATTCATTTATATCTgaaattgagaatg
gi|8                          :             atttcacaagattttcctgagtgaCTATTCTGCA-TCT------TGGGCCTGTCCAACCCTTGGGACACTTAC--A--C-ATGTAAGACCC--C-A-GT--G-TGTTTGTACA--TACACCATTGTTCTCACAGG-GA-A--A---A---C---T-------GTTACATTCAATCACATCTACAAAtggtcacatttcaaa
gi|9                          :                                    acTATTTCACAATTA------TGT-CCCTGCCAGCCTTCGGTACAATTGC--A--C-CCATAAGAACCACC-A-TT--G-T--TGATACA--GGTACCGCTATTCTGACAGG-GG-G--A---A---T---T-------CTCACATTCATTTACATCTGTAAagaa
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TACCATCTCTACAGTCTTTATTCTGCCACCCCTCTGTGCAGTTACACATATAGGACCCCATAGTATTGATGCATGTTCCATTGTTTTGACAAGGCAAACGTTTGCATTCGTCGTCATCTGAAAATAGAAAA
Unaligned ( gi|18 ): CTCCAGTGAAACCATGGTGACAGGAACATACAAATCCATTGACGTCATCTGTACAGTTTCCATGGATGCAAGGAGAACTTGCACACTCATTTGTATCTAA
Unaligned ( gi|19 ): TGGCCAGTGTATCCTGCTTGACAGGAACAAGTGAATCTGTTGATGAAGTCATTACACGTCCCGTGCACACAAGGTGAGCTTGCACACTCGCCAATATCTT
Unaligned ( gi|20 ): TCCACTGTAGCCGTTCTGACATTTGCAGGTGTATCCGTTATTTTTATCAATACACGTGTGTCCATGGCAAGGGTTGCTTTCACATTCATTTACATCTGT
Unaligned ( gi|21 ): CTCCAGTGTATCCAGCTTCACATTCACACACGTATCCATTGACTTGGTCGGTGCAGTTACCATGGACACAAGGAGAGCCAACACAATCGTCAATGTCTG
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