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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                            GAATATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA---CA---G--------T-TA---------T-----AAAGT-----GATA-TG----AA--AA--C-AC--CA-ATGA-AT-TG----T-----A-CGCTTT-GAT--AAAGTTC-ATTG-TTA--C-ATCA----TAA-TG-T----A--A-C-G--T---T-GG--A-AAATAAT-A--T----G-G--GAAAA-T------TT----AC-TTT---T-TACAT--A-AA-A-TGG-G------A-A-CT--T-------ATA------T--CTG--A-T-TT-A-A--CATTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-T-T-CT-G-TA-------GAATTT-GTTAATTTGAAAAAAAAAAAC-CAATA-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--AT--TGAG-AATCCTTG-TCAC-A-AA-----TG-A------GATG--A-A--TTGAA-GGTCA--CG-TAAT-GTCTCTGTAG---A-TTT---C-TTGATTT-----T--AAAA-A----C-GA-T-AAAAG------T---CG--A--T-TTT-----ACG--CTCATTGAG-AA-TCCTTGT-TC---AAA---T-----G-A-----GATG-CAG-CTGAAGGACGCGC-A-TCATAAAAGT---TG----TCG-T---GC-AACAGTGTGT---CTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TT-A--TG-ATG----T-ATTGATA--TGAT-ATTTAATTATGA-TTTA-ATTTTT--GGATAGT--TTTTTCTTTGGTT-TAACG--AAATTTGCGTTCAGTCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--AACGGTCATG-CGGATGATATAAT-------G-T-TGAAGGAT------AAGCGAT-AGT------TTAACCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GCAC-C-ACTATTATGACTAA-TTAA-A-A--CT--ATG-GGCA--T-------A-GAGTGG-TT-ATA---TTTTTGAAT-AA-ATAG--TTTT-C-TTTG--GTTT--C-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTCATT-TA-G-GAAATTTA-AT--------AAAATGG-AAAAACCGG--AAAATTTGG-ATA
gi|2                          :                                                                                                                            GAACATTGC--TAG-ATTA--CA-CAAATTACA---CA---G--------C-TA---------TTTTC-AAAGT-----GATA-TG----AA--AA--G-CG--CA-ATGA-AT-TGGT--T-----A-CGCTTT-GAT--AACGTTC-ATTG-TTA--C-GTCA----TAA-TG-T----A--A-C-A--T---T-GGG-A-AAATAAT-A--C----G-G--GAAAA-T------TA----AC-ATT---T--ACAA--A-AA-A-CGG-G------A-A-CT--T-------ATA------T--CTG--A-T-TT-TTA--CATTC-TAT--TTCTA-----------------------------------------------------AATGTGAAAAAAAA-----CAATA-AA--A-----T-CG-GA---TT--TTT--A---C----TCTCAT--TGAG-AATCCTTG-TCCC-A-AA-----TG-A------GATG--A-AGTTTGAA-CGGCA--CA-AAAT-GTCT--GTAG---AATTT---A-TTAATTT-----TG-AAAA-A----C-GA-T-AAAAG------T---AG--GATT-TTT-----ACG--CTCATTGAG-AA-TCCTTGT-CC---AAA---T-----G-A-----GATG-GAG-TTGAAGGGCGCGCAA-TCATAGAAGT---TA----ACG-T---GC-AACAA---GTCAACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA--TG-ATGT---T-ATTGATGATTGAT-ATTTAATTATGA-TTTATATTTTT--GGATAG---TTTTTCTTTGGTT-ANNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGACTGTCCATGAA--AACGGTCATG-C-GATGATATAAT-------G-TGCGAAGGAT------CAGCGAT-CGT------TTA--CTTTAGACCTAA---------TAGAGTG-GCAA-CCGT-AT-CT-GAAC-C-ACTATAAT-------TTAA-T-ATTTT--ATG-TGCA--TTTA----A-GAGTGGTTT-ATA---TTTTTGAAT-AA-ATAGTTTTTT-C-TTTG--G-TT--C-A-CG----TTTTTCTG-TTGTGTC-TT-TA-T-GAAATTTATTT--------AAAATGG-AAAAACGGT--AAAATGTG
gi|14                         :                                                                                                                          atGAATATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA---CA---G--------C-TA---------TTTC--AAAGT-----GATA-TG----AA--AAG-C-GC--CA-ATGA-AT-TG----TT----A-CGCTTT-GAT--AAAGTTC-ATTG-TTA--C-GTCA----TAA-TG-T----A--A-C-G--C---T-GGT-A-AAATAAT-A--C----G-G--GAAAT-T------TT----AC-ATT---T--ACAT--A-AA-------------------------------TA------T--CTG--A-T-TT-A-A--CATTC-TATATTTGTGT------------------T-GTA-T---CT-G-TA-------GAATTT-ATTAATTTGGGGAAAAAAAAC-CAATA-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---
gi|21                         :                                                                                                                            GAACATTGG--TAG-GTTA--CA-CAAAT-AAA---CA---G--------C-TACTCGTATTTT-----AAAGT-----AATA-TGAAAAAA--AA--C-GC--CA-ATGA-AT-TGT---T-----A-CGCTTT-GAT--AAAGTTC-AT---TTA--T-GTCG----TAA-TG-T----A--A-C-GT-T---T-GG--A-AAATAAT-A--C----G-G-----AA-T------TT----A
gi|31                         :                                                                                                                            GAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA---CA---G--------C-TA---------TTTC--AAAGT-----GATA-TG----AA--AAG-C-GC--CA-ATGA-AT-TGT---T-----A-CGCTTT-GAT--AAAGTTC-
gi|13                         :                                                                                                                          atGAACATTGC--TAG-G--A--TA-AAAAT-ACA---CA---G--------CCTAGGGT-----C-----AAAGTTGCTAGAT--TA----AA--AG--C-GC--CAGATGATATATG----TTA---A-CGCTTGAGAT--AAAGTT--ATTG-TTA--C-G-CA----TAAATG-T----A--AAC-G--C---TCGGTCA-AAATACT-A--C----G-GAGGAATA-T------TT----AC-ATT---T--ACAT--A-AA-AACGG-G------A-A-CT--T-------ATA------T--CTGTAA-TGTT-A-AATCAGTG-TA---TCCTG---------------------------T-CT-T-TG-------AAGTTT-TTTTTTTTTAAAGAAAA
gi|41                         :                                                                                                                          atGAAGATGGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACG---CA---G--------C-TA---------T-----ca
gi|35                         :                                                                                                                         aatGAACGTTGC--GAG-GTTG--CA-CAAGT-ACAGAGCG---G--------T-TT---------C-----AAAGT-----GATA-TG----
gi|30                         :                                                                                                                         aatGAACATTGCATTAG-GTTAA-CAACAAAT-ACA---CA---
gi|6                          :                                                                       tatatatatgaaggcgctatacatagtttctaacaaatattcaaggagtataatAACATTGC--TAT-GTTA--CA-CAAAT-ACG---CATCGA--------T-TT---------C-----AAAGT-----GATA-AG----AA--AAAGC-GT--CA-ATAA-AT-AG----TT----A-CGCTTT-TAT--AAAGTCC-ATTA-TTA--T-GTCA----TAA-TG-T----A--A-C-A--T---TGGG--A-AAATAAT-A--C----G-G--GGAAA-TAAAACGTT-------TTT---T-TGT------AA-A-TGC-G------AGA-CT--TTCTTTGAATAGCTTTCT--CTAATA-T-TT-A-A--CGGTC-TAT--TTATGT------------------T-GT--T-T------TA-------AAATTT-ATTAATTCAAAAA---------CGGTA-AA--A-----TTCG-AA---TT--TTT--ATT-T----TC--AT--TTAG-AACTCTTG-TCCC-A-AA-----TG-A------GATG--A-AG-TTGAA-GGGCA--CG-CAAT-agcta
gi|22                         :                                                                                                                            aAACATCGA--TAA-GTTT--CA-CTTAT-ACA---TT---G--------T--G---------C-----ACAGT-----G-TA-TC----AA--AA--C-GCGCCG-ATGA-AT-TG--------------CTAT-AAT--AT-GCTT-ATTA-TTT--C-GTCG----TAA-T-------A--A-T-GG-TGCAT-GGT-A-AGATAAC-A--T----T-G--GAAAA-T------TT----Acatcgaagttgctgtcatgcaacagttgaattttatatatttgtgaaacattaatcgtattattaatgtggttattttatcatgatttatattttggatagtttcttttagggttctaagagt
gi|7                          :                                                                                                                          aattACATTGC--TAGTGTTA--CA-CAAAT-ACA---CA---GCCTTTAATT-TG---------C-----CAAGT-----GATAATG----AA--AAA-CGAC--CA--TGA-AT-TG----TT----A-CGCTTT-GAT--AAAAGTC-ATTG-TTA--CCATCAATGTTAT-TGGT----ACGA-C-G--T---G-GT--ATAAATAAT-A--G----G-G--AGAAA-T------TTGTATAC-TTT---T--ACAT--A-AA-A-CAGCG------A-A-CT----------ATA------T--CTG--A-T-TTTA-A--CATTC-TAT--TTCTGT------------------TTGTG-T-TTCT-G-TA-------GAATTT--TTAATTTGAAAAAAAAA--C-CAATA-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTTT-A---CGCGTTC--AT--TGAG-AATTCCTG-TCGCCATAA-----TG-A------GATG--A-AG-TTGAACGGGCA--CGATAATAGTCTCTGTAA---A-ATT---A-TT-ATTT-----TGAAAAA-A----C-GA-T-AAAAG------T---CG--A--T-TTT-----TCG--CTCATTGAG-AATTCCTTGTCCC---AAATTTT-----G-A-----GA-------CTGAAAGta
gi|24                         :                                                                                                                            tgACATTGC--TAG-GTTAACCA-CAA-T-ACA---CA------------C-TA---------TTTC--AAAGT-----GATA-TG----GA--AG--C-GC--CA-ATGA-AT-TGT---T-----A-CGCTTT-GAT--AAAG-TC-ATTA-TTA--C-GTCA----T-A-TG-T----T--A-A-G--T---T-TG--G-AAATAAT-A---------G--GAAAA-T------ttgaacggca
gi|33                         :                                                                                                                               gATTGC--TAG-GTTA--CA-CATGT-GCA---CA---G--------C-TA---------TTTC--GAAGT-----GATA-TG----AA--AAG-C-TC--CA-ATGA-AT-TGT---T-----A-CGCTTT-gtt
gi|8                          :                                                                                                                             ataagcGC--TAG-GGTT--CA-CAAAT-ACA---CA---G--------C-TA---------TTTC--AAAG------GATA-TG----AA--AAG-C-GC--CA-ATGA-AT-TG----TTACTCG-CCCTTT-GATTAAAAGTTCTATTGGTTA--C--TCA----TAA-TG-T----G--A-CCG--C---T-GGT-A-AAATAAT-AA-C----G-G--GAATA-TGATTT-TT----AC-ATT---T-TAATT--A-AA-A-AGG-G------A-AACTC-T-------ATA------T---TG--A-T-TT-A-A--CATTC--AT--TTTTGT------------------G-TTG-TAT-CT-G-TA-------GAATTT-ATTAATTT---AAAAAAAAAC-CAATATAA--A-----TTCGCGATTTTT--TTT--AACTC----TC--AT--TGAGAAATCCTT--TC-C-A-AA-----TG-A------GATGATA-G--TTGAACGGCAA--CATTAAT-GTCTCTGTAGA--A-TTT---A-TTA--TT-----T--GGAA-A----C-G
gi|15                         :                                                                                                                                     ttgAG-GTTA--CA-CAAAG-ACA---CAACAG--------C-TA---------TTTTC-AAAGT-----GATA-TG----GG--AA-------------------------------A-CGCTTTTGATT-AAGGTTC-ATTA-TTA--C-GTCA----TAA-TG-T----G--A---G--T---T-AG--G-GAAAAAT-A--TTACCG-A--GAAAA-G------TT----GA-CTT---T-TACAC--A-AATA-C-G-G------A-A-TTTAT-------ATA------T--CTGA-A-T-TT-A-G--CATTCTTAT--TTCTGT------------------T-GTT-C-T-CT-GCTA-------GAATTT-ATTAATT------AAAAAAACGC--TA-AC--A-----TTTC-GA---TT--TGT--A---C----TC--
gi|27                         :                                                                                                                                                        T-ACAA--CA---G--------C-TA---------TTCGTCAAATT-----GATA-TG----AACCAG--C-GT--CA-ATGA-ATCTGACTTT-----A-C-CTTT-GAT--AACGTTC-ATTGATTAACT-GTCA----TAA--G-TACTAA--A-C-GTCT---T-GG--A-TAATAAT-G--T----ta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                           c-----AAAGT-----GATA-TG----AA--AAG-C-GC--CA-ATGA-AT-TT----T-----ATCGTTTT-
gi|43                         : cagccgttcatctgtacaacccagcaatgctgtttcggggtggtgtggagggggaggggcgtcagtgagttgttgctctttgatgaagttcattgttgcgtcataatgttgcataaaaacgggaacttgtatatctgatttgacattctatttctgttgtgtctctgtagaatttgttaatttaaaa-----AAAGT-----GATA-TG----AA--AAG-C-GC--CA-ATGA-Agaaatag
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                              tttc----AA--AG--C-GT--CA-ACGA-AT-TG----TTA---ATCGCTTT-GAT--AAAACTC-ATTA-TTA--C-GACA----TG----------A--A-C-C--A---T-GG--A-GGACAAT-G--C----G-G--GAACATT------TT----AC-TTT---TATATAT--A-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                 a--CA-GTGA-GT-TG----TT----G-CTCTTT-GAT--GAAGTTC-ATTG-TTG--C-GTCA----TAA-TG-T----T--G-C-A--T---------A-AAA-----A--C----G-G--GA-----------------AC-T---------------------TG-----------------T-------ATA------T--CTG--A-T-TT-G-A--CATTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-TCT-CT-G-TA-------GAATTT-GTTAATTTAAAAAAAA------CGATA-AA--A-----TTCtaccagaagttaatttgaatagttcttctct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                cagccgttcatctgtacaacccagcaatgctgtttcggggtggtgtggagggggaggggcgtGCTTT-GAT--AAAACTC-ATTA-TTA--C-GACA----TG----------A--A-C-C--A---T-GG--A-GGACAAT-G--C----G-G--GAACATT------TT----AC-TTT---TATATAT--A-attggcgcttttcatatcactttgaaatag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   -GAT--AAAGTTC-ATTA-TTG--C-ATTA----TAA-TG-T----A--A-C-G--T---TGGG--A-AAATAAT-A--CA---G-G--GAAGA-T------TT----AC--TT---T-TACATAAA-AA-A-CAG-G------A-A-CT--T-------ATATG----T--CTG--A-T-TT-A-A--CATTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-TCT-CT-G-TA-------TATTTT-ATTAATTTGAAAAA--------CGATA-AA--A-----TTCG-CA---TT--TTT--ACT-C----TC--AT--TGAG-AATCTTTC-TCCC-A-AA-----TG-A------GATT--ATG--TTGAA-GAGCA--CG-TAAT-ATTTTTGTAGA--A-TTT---A-TTAATTT-----G--AAAA-A----T-GA-T-ACAAT------T---CG--GATT-TTT-----ACT--TTCATTAAG-AA-TCCTTGTCCC---AAA---T-----G-A-----AATG-TAA-TTAAATGAtaccagaagttaatttgaatagttcttcttt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      T--AAAGTCC-ATAA-TTA--T-GTCA----TAA-TA-T----T--A-C-A--T---T-GGT-G-AAATATT-A--C----G-G--GAAAA-T------aagtaaaaatccgaattttatcgt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         --C-GTCA----TAA-TG-T----A--A-C-G--T---TGGG--A-AAATAAT-A--C----G-ggcgcttttatata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               tttgtatacgtccgtTCA----TAA-TG-T----A--A-C-G--T---T-GGGAA-AAATAATCA--C----G-G--GAAAA-T------TT----AC-GTT---T-TACAT--A-AA-A-CGG-G------A-A-CT--T-------ATA------T--CTG--ATT-TT-A-A--CATTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTA---T-CT-GTTA-------GATTTT-ATTAATTTGTAATAAAA-----CAATA-AAATA-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cacgc-AAA-AAT-ACCT----GAG--GAAAA-T------TTT---ACATTTACAT-TACA---A-AA-A-CAG-G------A-A-CT----------ATA------T--CTG--A-T-T--A-G--CAATT-T-T--TTCCGTACACTTACTAAGATATAGT-ATGATAT-CT-G-TAAGAAAAAGAAATT-ATTAATTTGAAAAAAAAAAAA-ACATA-AA--AAAAATTTTG-GA---TT--TTT--G---C----TC---TCATGAG-AATCCTTGGTCCC-A-AAATTGGTG-GATCTATGATG--A-AGTTTGAA-GGAAAACCA-TGAT-A-CTCTGTAGAAAA-TTTAAAA-ATAATTGAAACAA--AAAA-A----C-GATT-AAAAG------T---CGA-A--TATTT-----ACGAACTCATT-AG-AA-TCCTTGTCCC---AAA---T-----G-A-----cat
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aat-A--C----G-G--GAAAA-T------TT----AC--TT---T-TACATA-A-AA-A-CGG-G------A-A-CT--T-------A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-T------TT----GC-CTT---T-TACAT--ATAA-A-TGC-GCGAAGTA-A-TT--TTGA----ATAGCTTC-T--CTGTGG-T-TT-A-A--CTTTC-TAT--ATCTTT------------------T-GTG-TCT-CT-G-TA-------GAATTT-ATCAATTTGAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcactgttcgttatT----AT-TTT---C-TA-AT--A-AA-T-TG-------------TT--T-------TTC------T--TTG--G-T-TT-C-A--CGTTC-TTT--TTCTGT------------------T-GTG-T---CT-T-TAT------GAAGTT---TAA----AAAAAAAAAAAA-CGGTA-AA--A-----TTTG-GA---T
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgtagagtggcagacgtaatctgaaccactctaataatttaatatttatgtggcaattaagagtggttta--A-AA-A-AGG-G------A-A-CT--T-------ATA------TATCGA--A-T-TT-A-A--AATTA-TAT--TTCTGC------------------T-GTG-TAT-CT-A-TA-------GAATTG-ATTG-CTTGAAAAA--------CGATA-AA--A-----TTCG-GA---TG--TTT--A---C----TCTCAT--TGAT-AATCCTGG-TCCC-A-AA-----TG-A------GATA--A-AG-TTGAC-GGACA--CG-TCTT-CTATTTGTAG---AATCT---A-TTAATTT-----G--AAAA-A----AAGA-T-AAAAT------T---CGGAA--T-TGT-----ATT--TACATTGAT-AA-TCATTAC-CCC--AAA---T-----G-A-----TATG-ATG-TTAAAGGGCACGC-AATCGTTGAAGT---TGCTG-TCG-C---GC-AACATT-TGA---CTTT-ATATCAATG-T---GAGAAA--AT-AA-TG-ATG----TTATTAATA--TGGA-ATTTAATTATGATTTTT-ATTTTT--GGGTAG---TTTTTCTTTCGTT-TANNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAGGTCATGATGAACGGCCA--TGCGGT---------TGATATGAT-------GAG-CGAAGGAT------GAGTGAT-A-T------CTAACCTAAAGACCTAACG-------TAGa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a------T--TTG--G-T-TA-A-A--CACGC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-TCT-CT-A-TG-------GAATTTAATTTTTTTTAAAAA--------TAGTA-AA--A-----TTCG-GA---T
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatggtttatattttttttgagtagtttttc-T-TT-A-A--CGTTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-T-C-CCCA-TA-------GAA-----TCA------------------CGGTT-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTTG-TCCC-A-AA-----TG-A------TATG--A-AG-TTGAA-GGACA--CG-CAAT-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TT-A-A--CGTTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-T-C-CC-A-TA-------GAA-----TCA------------------CGGTT-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTTG-TCCC-A-AA-----TG-A------TATG--A-AG-TTGAA-GGACA--CG-CAAT-catagaagttgctgttgtgcaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-A-A--CGTTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-T-C-CCCA-TA-------GAA-----TCA------------------CGGTT-AG--A-----TTCG-GA---AT--CTTCCA---C----TC--AT--TAAG-AACCCTTG-TCCC-A-AA-----TG-A------TATG--A-AG-TTGAA-GGACA--CG-CAAT-catagaagttgctgtttggcaaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A-A--AATTC-TAT--TTCTGT------------------T-GTG-TCT-CT-G-TA-------GATTTT-ATTAATTTGAAAAAcatagaagtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AT--TTCTGT------------------T-GTG-T-C-CC-C-TA-------GAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctaAATTT-ATTAATTTGAAAAA--------CGATA-AA--A-----ATAG-GA---TTATTTC--G---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT--CCAC-A-AA-----TG-A------GATA--A-G--TTTAA-CGGCA--C--TAAT-GTCTCTGTAGCGAA-TTT---A-TTAATTG--------AAAA-A----C-GA---AAAAG------T---AG--A--T-TTTT----ACG--CT-ATTGAG-AA-TCCTTGT-CC---AAA---T-----G-A-----GATG---A-TTGAA-GCCGCGCAA-TCATAAA------TG----TCG-T---GCAAACAGT-CGA---CTT---TATAAATG-TAAAGAGAAG--TTGA--TG-ATGATATT-ATTGATT--TG---ATTTAATTATGA-TTTATATTTTT--TGATAGT--TTTTTC--TGGTT-TAACG---AATTCGCGTTGAATCAAATATAAGTAAGTTACACATAAAAGTGAGATGTATGAACACACAGCAGATTGACTCTCTGACCTAATGTGTGACGTTCATGATAACAAC-GTCATGCCGGATGATATAAT-------G-T-CGAAGGAT------CAGCGAT-AGT------TTAA-CTTTAGAC--AACG-------TAGAGT--GC-G-ACGTAATATT-GAAC-C-A--ACCATAA-TAATTTAATA-T--TT--ATGTGGCA--TTTA----A-GAGTGGTTT-ATA---TTTT---ATAAA-ATAGT-TTTT-C-TTTG--GTTT--C-A-CG-TTCTTcacggttagaattcggaattttctactcattagaacccttgtcccaaatgcatatgaagttgaaggacacgcaatcatagaagttgctgtttgtgcaaacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -CGATA-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---CTT--TC--AT--Tgtgctt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                           gataaagttcattattgcattataatgtaacgttgggaaaataatacagggaagatttacttttacataaaaaacaggaacttatatgtctgatttaacattctatttctgttgtgtctctgtatattttattaatttgaaaaacgataaaattcgcatttttactctcattgagaatctttctcccaaatgagattatgttgaagagcacgtaatatttttgtagaatttattaatttgaaaaatgatacaattcggatttttactttcattaagaatccttgtcccaaatgaaatgtaattaTA-GA--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--T-AG-AACCCTTG-TCCC-A-AA-----TGCA------TATG--A-AG-TTGAA-GGACA--CG-CAAT-t
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctaatttctgttgtgtcccctagaacacggtT-GTATCTGTAG---AATTT---A-TTAATTT-----A--AAAA-AAAACC-AA-T-ATAAA------TTCGCG--A--T-TTTTTTTAACT--CTCATTGAGAAA-TCCTT-T-CC---AAA---T-----G-A-----GATGATAG-TTGA---ACG-GC-A-ACATTAA------TG----TCcatagaagttgctgtttgtgcaaacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttggctagggttcacaaatacacagctatttcaaaggatatgaaaagcgccaatgaattgttactcgccctttgattaaaagttctattggttactcataatgtgaccgctggtaaaataataacgggaatatgatttttacattttaattaaaaagggaaactctatattgatttaacattcatttttgtgtT-GTCTCTGTAGA--A-TTT---G-TTAATTTAA---A--AAAA-A----C-GA-T-AAAAT------T---C---A--T-Ttctgtagaatttattatttggaaacg
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cagccgttcatctgtacaacccagcaatgctgtttcggggtggtgtggagggggaggggcgtcagtgagttgttgctctttgatgaagttcattgttgcgtcataatgttgcataaaaacgggaacttgtatatctgatttgacattctatttctgttgT-GTCTCTGTAG---A-TTT---TATTAATTT-----G--AAAA-A----ggcgcttttcatatcactttgaaatag
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaattctatttctgttgAA---A-TTT---A-TTAATTC--------AAAA-A----C-GG-T-AAAAT------T---CG--AATT-TTT-----ATT--TTCATTTAG-AA-CTCTTGT-CCC--AAA---T-----G-A-----GATG-AAG-TTGAAGGGCACGC-AATCATCGAAGT---TGCTG-TCA-T---GC-AACAGT-TGA---ATTTTATATATTTG-T---GAAACA--TT-AATCGTAT-----T-ATTAATG--TGGTTATTTTATCATGA-TTTA-TATTTT--GGATAGT--TTCTTTTAGGGTTCTAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaacattgctatgttacacaaatacgcatcgatttcaaagtgataagaaaaagcgtcaataaatagttacgcttttataaagtccattattatgtcataatgtaacattgggaaaataatacggggaaataaaacgtttttttgtaaatgcgagactttctttgaatagctttctctaatatttaacggtctatttatgttgtttta-----T--AGAACA----C-GG-TTAGAAT------T---CGGAA--T-TTT-----CTA--CTCATT-AG-AA-CCCTTGT-CCC--AAA---T-----GCA-----TATG-AAG-TTGAAGGACACGCAA-TCATAGAAGT---TGCTGTTTG-T---GC-AAgagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctaatttctgttgtgtcccc--AAAA-A----C--A-T-AAAAAAAATTTT---GG--A--T-TTTT----GCT--CTCAT-GAG-AA-TCCTTGG-TCCCAAAA---TTGGTGG-ATCTATGATG-AAGTTTGAAGGAacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aataaaaatacctgaggaaaattttacatttacattacaaaaacaggaactatatctgattagcaattttttccgtacacttactaagatatagtatgatatctgtaagaaaaagaaattattaatttgaaaaaaaa-A----C-GG-T-TAGAT------T---CGGAA--T-TTT-----CTA--CTCATTAAG-AA-CCCTTGT-CCC--AAA---T-----G-A-----TATG-AAG-TTGAAGGACACGCAA-TCATAGAAGT---TG----CTG-TTTGGC-AAaaaccatgatactctgtagaaaatttaaaaataattgaaacaaaaaaacgattaaaagtcgaatatttacgaactcattagaatccttgtcccaaatga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaacgttctatttctgttgtgtcccatagaatc-A----C-GG-T-TAGAT------T---CGGAA--T-TTT-----CTA--CTCATTAAG-AA-CCCTTGT-CCC--AAA---T-----G-A-----TATG-AAG-TTGAAGGACACGCAA-TCATAGAAGTTGCTG----TTG-T---GC-AACAacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatc-A----C-GG-T-TAGAT------T---CGGAA--T-CTT-----CCA--CTCATTAAG-AA-CCCTTGT-CCC--AAA---T-----G-A-----TATG-AAG-TTGAAGGACACGCAA-TCATAGAAGT---Taaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taacgttctatttctgttgtgtccccatagaatc---T-----G-A-----GATG-AAG-TTGAAGGGCGCGCAA-TCATA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAGAAAT---TGCG--TTGCT---GC-AACAGATTGA---CTTGCA-ATAA-TGAT---GAGAAGGTTT-AAGTG-ATG----TTATTAATA--TGGT-ATTTAATTATGA-TTTATATTTTTTACGATA-TAATTTTTCTTTTGTT-TAACGATAAA---GCGTAGAATCAAATTATAAAGATGTTACAAGATAAGGAGAAAGTATTGAAAACAATAGCAGTTACTTTGACTACACGTACATGTATGTGTGGATA-----GTTCATG-T--ATGA-ACAGTACATGCGG-T-TGAATGATCGTGCAAAG-GATCGGTTATTAATTAACCTATAGACCTAACGTACATGTTAGAGTGCGCTA-ACGTAAT-CTAGAACTC-ACT-TAATAATT-T-TTAA-GTA--TTC-ATA-TGCT--TTTA----A-GAGTGGTTT-ATATTTTTTTTGAA--AA-ATAGC-TTTT-T-TTTG--GTTT--CTA-CG-TTCTTTTGCTG-TTGTGTCTTT-TATT-GAAATTT--AT--------AA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCATG-CGGATGATATAAT-------G-TGCGAAGGAT------CAGCGAT-AGT------TTAACCTTTAGACCTAACGC------TAGAGTG-GCAGAACGTAAT-CT-GAAT-CAACTATTA--A-TAA-TTTA-A-T--TTTAGTG-GGCA--TTATAAGAA-GAGTGGTTT-ATA---TTTTTCAAT-AACATGT--TTTT-CTTTTG--GTTT--C-ACCGTTTCTTTTTCTGTTTGTGTCCTT-TG-GTGGAATTT--AT--------AAAATGG---AAACCGGTTAAAATTTGGTATA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAAT-------G-T-TACAAGAN------AAGC-------------------TTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GTAG-ATGTAAT-CT-GAAC-C-ACTATAAT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgaattaatatataagCG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTCTAATAATT----TAA-T-A--TTT-ATGTGGCAATT-------AAGAGTGG-TTTATA---TTTTCTAAT-AA-ATTG--TTTTTC-TTTG--GTTT--C-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TT-TA-T-GAAGTTTA-AA--------AAAA--A-AAAAAACGGT-AAAATTTGG-ATA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGG-TTTATA---TTTTTTT-T-GA-GTAG--TTTTTC-TTTG--GTTAAAC-A-CG---CTATTTCTG-TTGTGTC-TC-TA-T-GGAATTTA-ATTTTTTTTAAAAATAGTAAAATTCGG--A
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAGG-G-G---CGTCA-GTGA-GT-TG---TTG--CT--CTTT-GAT--GAAGT-----------------TCAT----TGT---------TG-CG--T---C-----------ATAAT-G----------------------------------T----TGCAT-A-AA-AA-CGG-G------AACT--TGT-----ATA------T--CTG--A-TTTG-ACATTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAA-TTTGTTAATTT---------AAAAAAAA----CGATA-AA--A-----TTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                  cagccgttcatctgtacaacccagcaatgctgtttcggggtggtgtggaggggC-T----A-------T--TTC--A--AAGT-GATA--TGAAA-A-G---CGCCA-ATGA-AT-T----TTAT-CG--TTTT-attggcgcttttcatatcactttgaaatag
gi|13                         :                   cagccgttcatctgtacaacccagcaatgctgtttcggggtggtgtggagggggaggggcgtcagtgagttgttgctctttgatgaagttcattgttgcgtcataatgttgcataaaaacgggaacttgtatatctgatttgacattctatttctgttgtgtctctgtagaatttgttaatttaaaaGAACATTGC--TAG-G--A--TA-AAAAT-ACA-C-A---GCCT----A-------GGGTC---A--AAGTTGCTAGATTAAA-A-G---CGCCAGATGATATATG---TTAA-CG--CTTGAGAT--AAAGTT--ATT-G-TTA--CG--CAT-AAATGT---------AAACG--C---TC--GGTCA-AAATACT-A-C---GGAGGAATA-----T-T----T-AC-ATTT-----ACAT-A-AA-AA-CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG------TA-ATGTTA--AA--TCAG--------------------TGTA-T-CCT-G-TCTTT----GAAGTTTTTTTTTTT---T-----AAAGAAAA----C
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                            atGAATATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A-------T--TTC--A--AAGT-GATA--TGAAA-A-G---CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--C---T---GGT-A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAT-----T-T----T-AC-A-TT----TACAT-A-A------------------------------ATA------T--CTG--A-TTTA-ACATTCTATATTTGTG-T------------------TGTA---TCT-G-TA-------GAA-TTTATTAATTTGGGG-----AAAAAAAAC---CAATA-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---a
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                          AG-GTTA--CA-CAAAG-ACA-C-AACAGC-T----A-------T--TTTC-A--AAGT-GATA--TGGGA-A-A---CGCT-------------------------TTT-GATT-AAGGTTC-ATT-A-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------GA--G--T---TAGGGA--A-AAATATT-ACC---GA--GAAAA-----G-T----T-GA-CTTT----TACAC-A-AATA--C-G-G------AATTTAT-------ATA------T--CTGA-A-TTTA-GCATTCT-TATTTCTG-T------------------TGTT-C-TCT-GCTA-------GAA-TTTATTAATT-----------AAAAAAA----CGCTA-AC--A-----TTTC-GA---TT--TGT--A---C----TC--
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTTA-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCCCA-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGTT-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TGA---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-ta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AC-GG-T-TAGATTCGGAAT-TTT-CTA--CTCATTAAGAA-CCCTTGTCCCAAA---TG-ATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTG-T--TG-TGCAA-C-Acatagaagttgctgttgtgcaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatc-TGATGATCA--TGA-TA-TCTATGT-GGCATA-T---AAATGTGGTTTATA---TT---T--Taaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgaaggacacgcaatcatagaagttgctgttgtgcaacTTA-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-A-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGTT-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TGA---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctaatttctgttgtgtcccc-TAATGATCA--TGA-TA-TCTATGT-GGCATA-T---AAATGTGCTTTATA---TTTTGT--TTGCACAA-ACAG--CAACTT-C-TATGATT--GC-G-TG-TCCTacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atA--CGCTCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GGGAA-AAATAATCA-C---GG--GAAAA-----T-T----T-AC-GTTT----TACAT-A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--ATTTTA-ACATTC--TATTTCTG-T------------------TGTA---TCT-GTTA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----TAATAAAA----CAATA-AAATA-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--gtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                             cGAACATTGG--TAG-GTTA--CA-CAAAT-AAA-C-A---GC-T----ACTCGTATT--TT---A--AAGT-AATA--TGAAA-A-AAAACGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-AT----TTA--TG-TCGT-AA-TGT---------AA-CGT-T---T---GG--A-AAATAAT-A-C---GG-----AA-----T-T----T-Acat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                               AACATCGA--TAA-GTTT--CA-CTTAT-ACA-T--------T----G-------T--GC---A--CAGT-G-TA--TCAAA-ACG---CGCCG-ATGA-AT-TG---CTA---------T-AAT--AT-GCTT-ATT-A-TTT--CG-TCGT-AA-T-----------AA-TGG-TGCAT---GGT-A-AGATAAC-A-T---TG--GAAAA-----T-T----T-A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          aattAAA-A-G---CGTCA-ACGA-AT-TG---TTAATCG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-AC--TTT----TATAT-ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-ta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                ACATTGC--TAG-GTTAACCA-C-AAT-ACA-C-A----C-T----A-------T--TTC--A--AAGT-GATA--TG-GA-A-G---CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAG-TC-ATT-A-TTA--CG-TCAT--A-TGT---------TA-AG--T---T---TG--G-AAATAAT-A------G--GAAAA-----T-atagttcttctct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTA-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCCCA-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGTT-AG--A-----TTCG-GA---AT--CTTCCA---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TGA---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-gtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----T-T----T-GC-CTTT----TACAT-ATAA-A--TGC-GCGAAGTAATT--TTGA----ATAGCTTC-T--CTGTGG-TTTA-ACTTTC--TATATCTT-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAA-TTTATCAATTT---G-----AAcatagaagtt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                            tcactgttcgttatT-ACAAC-A---GC-T----A-------T--TCGTCA--AATT-GATA--TGAACCA-G---CGTCA-ATGA-ATCTGACTTTA--C---CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-GATTAACTG-TCAT-AA--GTACTA-----AA-CGTCT---T---GG--A-TAATAAT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cTGGTTTATA---TT---T--TTT-TTGA-GTAGT-T--TTT-C-TTTGGTTAAAC-A-CG---CTATTTCTG-TTGTGTC-TCT--A-TGGAATTTA-ATTTTTTTTAAAAATA-G-TAAAATTCGG-ATgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-AC--TTT----TATAT-ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA-TTTATTAATTT---G-----AAAAA-------CGATA-AA--A-----ATAG-GA---TTATTTC--G---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT---C-CACA-AA--TGA---------GAT-A-AG-TT-TAA-CGGC-AC--TAAT-G-T-CTCTGTAGCGAA-TTT---ATTAATT------G-AAAAAC-GA---AAAAGTAGAT-T-TTT-ACG--CT-ATTGAGAA-TCCTTGTCC-AAA---TG-AGA-TG-A--TTGAAGC-CGCGCAATCATAAA---TG----T--CG-TGCAAAC-AG-T-CGACTTT---ATAAATG-TAAAGAGAAG--TTGA-TGATGATATTATTGATT--TG---ATTTAATTATGATTTATATTTTT--TGATAGT--TTTTTCT--GGTT-TAACG--AA-TTCGCGTTGAATCAAATATAAGTAAGTTACACATAAAAGTGAGATGTATGAACACACAGCAGATTGACTCTCTGACC--------TAATGTGTGAC--GTTC--ATGATAACAACG-T-CATGCCGGATGATATAAT-G-T-CGAAGGATCAGCGATAGTTTAAC-TTTAGAC--AACG-------TAGAGTG--C-G-ACGTAATATT-GAAC-C-AACCA-TAATAATT---TAA-TA-TTTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TATA--AA-ATAGT-T--TTT-C-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTatagttcttcttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGCATTAG-GTTAA-CAACAAAT-ACA-CAA---GC-T----A-------tgtgctt
gi|31                         :                                                                                                                                                        tatatatatgaaggcgctatacatagtttctaacaaatattcaaggagtataatGAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A-------T--TTC--A--AAGT-GATA--TGAAA-A-G---CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atAAGCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GTAG-ATGTAAT-CT-GAAC-C-A-CTA-TAAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                ttgaattaatatataagtaatgttacaaganAGCATTGC--TAG-GTTA--CA-CATGT-GCA-C-A---GC-T----A-------T--TTC--G--AAGT-GATA--TGAAA-A-G---CTCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataT--AAAGTCC-ATA-A-TTA--TG-TCAT-AA-TAT---------TA-CA--T---T---GGT-G-AAATATT-A-C---GG--GAAAA-----T-G----G-CG-CTTT----TATAT-A-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                              GAACGTTGC--GAG-GTTG--CA-CAAGT-ACA-G-A---GC-G----G-------T--TTC--A--AAGT-GATA--TG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----AAAAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaa--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttgtatacgtccgt-A-AA-A--AGG-G------AACT--T-------ATA------TATCGA--A-TTTA-AAATTA--TATTTCTG-C------------------TGTG-TATCT-A-TA-------GAA-TTGATTG-CTT---G-----AAAAA-------CGATA-AA--A-----TTCG-GA---TG--TTT--A---C----TCTCAT--TGAT-AATCCTG-GTC-C-CA-AA--TGA---------GATAA-AG-TT-GAC-GGAC-ACG-TCTT-C-T-ATTTGTAG---AATCT---ATTAATTT-----G-AAAAAAAGA-T-AAAATTCGGAAT-TGT-ATT--TACATTGATAA-TCATTACCCCAAA---TG-ATA-TG-ATGTTAAAGGGCACGCAATCGTTGAAGTTGC---TGTCG-CGCAA-C-AT-T-TGACTTT-ATATCAATG-T---GAGAAA--ATAA-TGATG---TTATTAATA--TGG-AATTTAATTATGATTTTTATTTTT--GGGTAG---TTTTTCTTTCGTT-TANNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--------GAAGGTC--AT----------GATGA--ACGGC-CATGC-GGTTGATATGAT-GAG-CGAAGGATGAGTGATA-TCTAACCTAAAGACCTAACG-------TAG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-AC--TTT----TACATAA-AA-A--CGG-G------AACT--T-------A
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                              GAAGATGGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---GC-T----A-------T--
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aat---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                               -------T--TC---A--AAGT-GATA--TGAAA-A-G---CGCCA-ATGA-A
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Reference ( family-1572 )     :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-TCT-G-TA-------GAA-TTTATTAATTT---G-----AAAAAAAA----CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--AT--TGAG-AATCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-G-T-CTCTGTAG---A-TTTATTAAT--TT-G------AAAAAC-GA-T-AAAANTCGGA-T-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTGCTG-TCG-TGCAA-C-AG-T-CGACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTTG--GATAGT--TTTTTCTTTGGTT-TAACGA--AATTCGCGTTGAATCAAATNNNAGNGANNTNNNNANANAAGNGGGANGTATNGANANNNANCGNANTNACTCTNNNNNC--------GAATGTNT-GACT-GTTCGTG-ATA--AACGGT-CATG-CGGATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATAGTTTAACCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAATGA-TCATTAA-TA-TCTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTNAATAA-ATAG--T--TTT-C-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTA-ATAAAATGGAAAAACCGG-TAAAATTTGG-ATA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-A-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctaAACAC-GG-TTAGAATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATT-AGAA-CCCTTGTCCCAAA---TGCATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTGTTTG-TGCAA-catagaagttgctgtttgtgcaaacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctaatttctgttgtgtcccctag-TAATGA-TCAT-GA-TA-TCTATGT-GGCATA-T---AAATGTGCTTTATA---TTTTGT--TTGCACAA-ACAG--CAACTT-C-TATGATT--GC-G-TG-TCCTTacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctaatttctgttgtgtcccctagaacacggttagaattcggaattttctactcattagaacccttgtcccaaatgcatatgaagttgCG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTC-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCAAT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TCTAATAA-ATTG--T--TTTTC-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAGTTTA-AAAAAA--AAAAAAACGG-TAAAATTTGG-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-ATTA--CA-CAAATTACA-C-A---GC-T----A------TT--TTCAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGC-A-ATGA-AT-TGG--TTA--CG--CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---T---GGG-A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----A-A---C-ATTT-ACAA----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-TTACATTC--TATTTCTA----------------------------------------------------AATGT---G-----AAAAAAAA----CAAT-A-AA--A-----T-CG-GA---TT--TTT--A---C----TCTCAT--TGAG-AATCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TTTGAA-CGGC-ACA-AAAT-G-T-CT--GTAG---AATTTATTAAT--TTTG------AAAAAC-GA-T-AAAAGTAGGATT-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGT-CCAAA---TG-AGA-TG-GAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTAA----CG-TGCAA-CAAG-T-CAACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATGATTGA-TATTTAATTATGATTTATATTTTTG--GATAG---TTTTTCTTTGG-T-TANNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNTGGACT-GTCCATG-A-A--AACGGT-CATG-C-GATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATCGTTTA--CTTTAGACCTAA---------TAGAGTG-GCAA-CCGT-AT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT------TTAA-TATTTTATGT--GCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTGAATAA-ATAGTTT--TTT-C-TTTGG-T--TC-A-CG----TTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTATTTAAAATGGAAAAA-CGG-TAAAATGTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atA--CGCTCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GGGAA-AAATAATCA-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---CGTTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTTTA-ACATTC--TATTTCTG-T------------------TGTA---TCT-GTTA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----TAATAAAA----CAAT-A-AAATA-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                               AACATCGA--TAA-GTTT--CA-CTTAT-ACA-T-T---G---------------T--G-CACAGT-G-TA--TCAAA-ACG-------CGCCG-ATGA-AT-TG---CTA---------T-AAT--AT-GCTT-ATT-A-TTT--CG-TCGT-AA-T-----------AA-TGG-TGCAT---GGT-A-AGATAAC-A-T---TG--GAAAA-----T-T----T-A---
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      aattAAA-A-G-------CGTCA-ACGA-AT-TG---TTAATCG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-A---C-TTTT-ATAT----ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-ta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                ACATTGC--TAG-GTTAACCA-CAA-T-ACA-C-A----C-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGGAA---G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAG-TC-ATT-A-TTA--CG-TCAT--A-TGT---------TA-AG--T---T---TG--G-AAATAAT-A------G--GAAAA-----T-atagttcttctct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCCCA-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GA---AT--CTTCCA---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-gtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----T-T----T-G---CCTTTT-ACAT----ATAA-A--TGC-GCGAAGTAATT--TTGA----ATAGCTTC-T--CTGTGG-TTT-A-ACTTTC--TATATCTT-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAA-TTTATCAATTT---G-----AAcatagaagtt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                            tcactgttcgttatT-ACAAC-A---GC-T----A------TTCGT-CAAATT-GATA--TGAACCA-G-------CGTCA-ATGA-ATCTGACTTTA--C---CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-GATTAACTG-TCAT-AA--GTACTA-----AA-CGTCT---T---GG--A-TAATAAT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cTGGTTTATA---TT---T--TTT-TTGA-GTAGT-T--TTT-C-TTTGGTTAAAC-A-CG---CTATTTCTG-TTGTGTC-TCT--A-TGGAATTTA-ATTTTTTTTAAAAA-TAG-TAAAATTCGG-ATgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-A---C-TTTT-ATAT----ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA-TTTATTAATTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----ATAG-GA---TTATTTC--G---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT---C-CACA-AA--TG-A---------GAT-A-AG-TT-TAA-CGGC-AC--TAAT-G-T-CTCTGTAGCGAA-TTTATTAAT--T--G------AAAAAC-GA---AAAAGTAGAT-T-TTTACG--CT-ATTGAGAA-TCCTTGTCC-AAA---TG-AGA-TG-A--TTGAAGC-CGCGCAATCATAAA------TG-TCG-TGCAAAC-AG-T-CGACTTT---ATAAATG-TAAAGAGAAG--TTGA-TGATGATATTATTGATT--TG---ATTTAATTATGATTTATATTTTTT--GATAGT--TTTTTCT--GGTT-TAACGA--A-TTCGCGTTGAATCAAATATAAGTAAGTTACACATAAAAGTGAGATGTATGAACACACAGCAGATTGACTCTCTGACC--------TAATGTGT-GAC--GTTCATG-ATAACAAC-GT-CATGCCGGATGATATAAT-GT-CGAAGGATCAGCGATAGTTTAA-CTTTAGAC--AACG-------TAGAGT--GC-G-ACGTAATATT-GAAC-CAACCA-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TATA--AA-ATAGT-T--TTT-C-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTatagttcttcttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGCATTAG-GTTAA-CAACAAAT-ACA-CAA---GC-T----A------gtgctt
gi|31                         :                                                                                                                                                        tatatatatgaaggcgctatacatagtttctaacaaatattcaaggagtataatGAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atAAGCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GTAG-ATGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                ttgaattaatatataagtaatgttacaaganAGCATTGC--TAG-GTTA--CA-CATGT-GCA-C-A---GC-T----A------TT--T-CGAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CTCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataT--AAAGTCC-ATA-A-TTA--TG-TCAT-AA-TAT---------TA-CA--T---T---GGT-G-AAATATT-A-C---GG--GAAAA-----TGG----C-G---C-TTTT-ATAT----A-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                              GAACGTTGC--GAG-GTTG--CA-CAAGT-ACA-G-A---GC-G----G------TT--T-CAAAGT-GATA--TG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----AAAAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaa--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttgtatacgtccgt----A-AA-A--AGG-G------AACT--T-------ATA------TATCGA--A-TTT-A-AAATTA--TATTTCTG-C------------------TGTG-TATCT-A-TA-------GAA-TTGATTG-CTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TG--TTT--A---C----TCTCAT--TGAT-AATCCTG-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATAA-AG-TT-GAC-GGAC-ACG-TCTT-C-T-ATTTGTAG---AATCTATTAAT--TT-G------AAAAAAAGA-T-AAAATTCGGAAT-TGTATT--TACATTGATAA-TCATTACCCCAAA---TG-ATA-TG-ATGTTAAAGGGCACGCAATCGTTGAAGTTGCTG-TCG-CGCAA-C-AT-T-TGACTTT-ATATCAATG-T---GAGAAA--ATAA-TGATG---TTATTAATA--TGG-AATTTAATTATGATTTTTATTTTTG--GGTAG---TTTTTCTTTCGTT-TANNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--------GAA-----------GGTCATG-ATG--AACGGC-CATG-CGGTTGATATGAT-GAGCGAAGGATGAGTGATA-TCTAACCTAAAGACCTAACG-------TAG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACATA---A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------A
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                              GAAGATGGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---GC-T----A------T
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aat---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                               ------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGAAATTGC-G-TTGCTGCAA-C-AGAT-TGACTTGCA-ATAA-TGAT---GAGAAGGTTTAAGTGATG---TTATTAATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTTTACGATA-TAATTTTTCTTTTGTT-TAACGATAAA---GCGTAGAATCAAATTATAAAGATGTTACAAGATAAGGAGAAAGTATTGAAAACAATAGCAGTTACTTTGACTACACGTACATGTATGTGT-GGATAGTTCATGTATG--AACAGTACATG-CGGTTGA-ATGATCGTGCAAAGGATCGGTTATTAATTAACCTATAGACCTAACGTACATGTTAGAGTGCGCTA-ACGTAAT-CTAGAACTC-ACT--TAATAA-TTTTTAAGTA-TTCATAT--GCTTT-T---AAGAGTGGTTTATATTTTT---T--TTGAA-AA-ATAGC-T--TTT-T-TTTGGTT--TCTA-CG-TTCTTTTGCTG-TTGTGTCTTTT--ATTGAAATTT--ATAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                               AACATTGC--TAT-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---TC-G----A------TT--T-CAAAGT-GATA--AGAAA-AAG-------CGTCA-ATAA-AT-AG---TTA--CG--CTTT-TAT--AAAGTCC-ATT-A-TTA--TG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GGAAA-----T-A----A-AACGT-TTTT-TTGT----A-AATG--CGA-G-------ACT--TTCTTTGAATAGCTTTCT--CTAATA-TTT-A-ACGGTC--TATTTATG-T------------------TGT--T-T-----TA-------AAA-TTTATTAATTC------------AAAAA----CGGT-A-AA--A-----TTCG-AA---TT--TTT--ATT-T----TC--AT--TTAG-AACTCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAA---A-TTTATTAAT--TC--------AAAAAC-GG-T-AAAATTCGAATT-TTTATT--TTCATTTAGAA-CTCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCACGCAATCATCGAAGTTGCTG-TCA-TGCAA-C-AG-T-TGAATTTTATATATTTG-T---GAAACA--TTAA-TCGTA---TTATTAATG--TGGTTATTTTATCATGATTTATA-TTTTG--GATAGT--TTCTTTTAGGGTTCTAAcatcgaagttgctgtcatgcaacagttgaattttatatatttgtgaaacattaatcgtattattaatgtggttattttatcatgatttatattttggatagtttcttttagggttctaagagt
gi|7                          : aaacattgctatgttacacaaatacgcatcgatttcaaagtgataagaaaaagcgtcaataaatagttacgcttttataaagtccattattatgtcataatgtaacattgggaaaataatacggggaaataaaacgtttttttgtaaatgcgagactttctttgaatagctttctctaatatttaacggtctatttatgttgttttaACATTGC--TAGTGTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-CTTTAA------TT--TGCCAAGT-GATAA-TGAAA-A-A-------CGACC-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAAGTC-ATT-G-TTA--C---CATCAA-TGTTATTGGTACGA-CG--T---G---GT--ATAAATAAT-A-G---GG--AGAAA-----T-TTGTAT-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CAGCG------AAC---T-------ATA------T--CTG--ATTTT-A-ACATTC--TATTTCTGTT------------------TGTGTT-TCT-G-TA-------GAA-TTT-TTAATTT---G-----AAAAAAAAAC--CAAT-A-AA--A-----TTCG-GAT--TT--TTT--A---CGCGTTC--AT--TGAG-AATTCCT-GTCGC-CATAA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAACGGGC-ACGATAATAG-T-CTCTGTAA---A-ATTATTATT--TT-GA-----AAAAAC-GA-T-AAAAGTC-GA-T-TTTTCG--CTCATTGAGAATTCCTTGTCCCAAATTTTG-AGACTGAAAGTTGAACGGCgagt
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Reference ( family-1572 )     :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-TCT-G-TA-------GAA-TTTATTAATTT---G-----AAAAAAAA----CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-G-T-CTCTGTAG---A-TTTATTAAT--TT-G------AAAAAC-GA-T-AAAATTCGGA-T-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTGCTG-TCG-TGCAA-C-AG-T-CGACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTT--GGATAGT--TTTTTCTTTGGTT-TAACG--AAATTCGCGTTGAATCAAATNNNAGNGANNTNNNNANANAAGNGGGANGTATNGANANNNANCGNANTNACTCTNNNNNC--------GAATGTGTGACT-GTTCATG-ATA--AACGGT-CATG-CGGATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATAGTTTAACCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAATGA-TCATTAA-TA-TCTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTNAATAA-ATAG--T--TTT-C-TTTGGTT--TC-G-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTA-ATAAAATGGAAAAACCGG-TAAAATTTGG-ATA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AC-GG-T-TAGATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATTAAGAA-CCCTTGTCCCAAA---TG-ATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTG-TTG-TGCAA-C-Acatagaagttgctgttgtgcaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-A-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AC-GG-T-TAGATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATTAAGAA-CCCTTGTCCCAAA---TG-ATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTG-TTT-GGCAA-catagaagttgctgtttggcaaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaacgttctatttctgttgtgtcccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-C-TA-------GAA-C--------------------------A----CGGTTA-GA--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--T-AG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TGCA---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctaAACAC-GG-TTAGAATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATT-AGAA-CCCTTGTCCCAAA---TGCATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTGTTTG-TGCAA-catagaagttgctgtttgtgcaaacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctaatttctgttgtgtcccctag-TAATGA-TCAT-GA-TA-TCTATGT-GGCATA-T---AAATGTGCTTTATA---TTTTGT--TTGCACAA-ACAG--CAACTT-C-TATGATT--GC-G-TG-TCCTTacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctaatttctgttgtgtcccctagaacacggttagaattcggaattttctactcattagaacccttgtcccaaatgcatatgaagttgCG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTC-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCAAT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TCTAATAA-ATTG--T--TTTTC-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAGTTTA-AAAAAA--AAAAAAACGG-TAAAATTTGG-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-ATTA--CA-CAAATTACA-C-A---GC-T----A------TT--TTCAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGC-A-ATGA-AT-TGG--TTA--CG--CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---T---GGG-A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----A-A---C-ATTT-ACAA----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-TTACATTC--TATTTCTA----------------------------------------------------AATGT---G-----AAAAAAAA----CAAT-A-AA--A-----T-CG-GA---TT--TTT--A---C----TCTCAT--TGAG-AATCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TTTGAA-CGGC-ACA-AAAT-G-T-CT--GTAG---AATTTATTAAT--TTTG------AAAAAC-GA-T-AAAAGTAGGATT-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGT-CCAAA---TG-AGA-TG-GAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTAA----CG-TGCAA-CAAG-T-CAACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATGATTGA-TATTTAATTATGATTTATATTTTT--GGATAG---TTTTTCTTTGGTTANNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNTG-GACT-GTCCATG-A-A--AACGGT-CATG-C-GATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATCGTTTA--CTTTAGACCTAA---------TAGAGTG-GCAA-CCGT-AT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT------TTAA-TATTTTATGT--GCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTGAATAA-ATAGTTT--TTT-C-TTTGG-T--TC-A-CG----TTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTATTTAAAATGGAAAAA-CGG-TAAAATGTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atA--CGCTCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GGGAA-AAATAATCA-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---CGTTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTTTA-ACATTC--TATTTCTG-T------------------TGTA---TCT-GTTA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----TAATAAAA----CAAT-A-AAATA-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                               AACATCGA--TAA-GTTT--CA-CTTAT-ACA-T-T---G---------------T--G-CACAGT-G-TA--TCAAA-ACG-------CGCCG-ATGA-AT-TG---CTA---------T-AAT--AT-GCTT-ATT-A-TTT--CG-TCGT-AA-T-----------AA-TGG-TGCAT---GGT-A-AGATAAC-A-T---TG--GAAAA-----T-T----T-A---
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                ACATTGC--TAG-GTTAACCA-CAA-T-ACA-C-A----C-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGGAA---G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAG-TC-ATT-A-TTA--CG-TCAT--A-TGT---------TA-AG--T---T---TG--G-AAATAAT-A------G--GAAAA-----T-atagttcttctct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCCCA-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GA---AT--CTTCCA---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-gtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----T-T----T-G---CCTTTT-ACAT----ATAA-A--TGC-GCGAAGTAATT--TTGA----ATAGCTTC-T--CTGTGG-TTT-A-ACTTTC--TATATCTT-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAA-TTTATCAATTT---G-----AAcatagaagtt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                            tcactgttcgttatT-ACAAC-A---GC-T----A------TTCGT-CAAATT-GATA--TGAACCA-G-------CGTCA-ATGA-ATCTGACTTTA--C---CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-GATTAACTG-TCAT-AA--GTACTA-----AA-CGTCT---T---GG--A-TAATAAT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cTGGTTTATA---TT---T--TTT-TTGA-GTAGT-T--TTT-C-TTTGGTTAAAC-A-CG---CTATTTCTG-TTGTGTC-TCT--A-TGGAATTTA-ATTTTTTTTAAAAA-TAG-TAAAATTCGG-ATgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-A---C-TTTT-ATAT----ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA-TTTATTAATTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----ATAG-GA---TTATTTC--G---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT---C-CACA-AA--TG-A---------GAT-A-AG-TT-TAA-CGGC-AC--TAAT-G-T-CTCTGTAGCGAA-TTTATTAAT--T--G------AAAAAC-GA---AAAAGTAGAT-T-TTTACG--CT-ATTGAGAA-TCCTTGTCC-AAA---TG-AGA-TG-A--TTGAAGC-CGCGCAATCATAAA------TG-TCG-TGCAAAC-AG-T-CGACTTT---ATAAATG-TAAAGAGAAG--TTGA-TGATGATATTATTGATT--TG---ATTTAATTATGATTTATATTTTT--TGATAGT--TTTTTCT--GGTT-TAACG--AA-TTCGCGTTGAATCAAATATAAGTAAGTTACACATAAAAGTGAGATGTATGAACACACAGCAGATTGACTCTCTGACC--------TAATGTGTGAC--GTTCATG-ATAACAAC-GT-CATGCCGGATGATATAAT-GT-CGAAGGATCAGCGATAGTTTAA-CTTTAGAC--AACG-------TAGAGT--GC-G-ACGTAATATT-GAAC-CAACCA-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TATA--AA-ATAGT-T--TTT-C-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTatagttcttcttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGCATTAG-GTTAA-CAACAAAT-ACA-CAA---GC-T----A------gtgctt
gi|31                         :                                                                                                                                                        tatatatatgaaggcgctatacatagtttctaacaaatattcaaggagtataatGAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atAAGCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GTAG-ATGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                ttgaattaatatataagtaatgttacaaganAGCATTGC--TAG-GTTA--CA-CATGT-GCA-C-A---GC-T----A------TT--T-CGAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CTCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataT--AAAGTCC-ATA-A-TTA--TG-TCAT-AA-TAT---------TA-CA--T---T---GGT-G-AAATATT-A-C---GG--GAAAA-----TGG----C-G---C-TTTT-ATAT----A-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                              GAACGTTGC--GAG-GTTG--CA-CAAGT-ACA-G-A---GC-G----G------TT--T-CAAAGT-GATA--TG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----AAAAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaa--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttgtatacgtccgt----A-AA-A--AGG-G------AACT--T-------ATA------TATCGA--A-TTT-A-AAATTA--TATTTCTG-C------------------TGTG-TATCT-A-TA-------GAA-TTGATTG-CTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TG--TTT--A---C----TCTCAT--TGAT-AATCCTG-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATAA-AG-TT-GAC-GGAC-ACG-TCTT-C-T-ATTTGTAG---AATCTATTAAT--TT-G------AAAAAAAGA-T-AAAATTCGGAAT-TGTATT--TACATTGATAA-TCATTACCCCAAA---TG-ATA-TG-ATGTTAAAGGGCACGCAATCGTTGAAGTTGCTG-TCG-CGCAA-C-AT-T-TGACTTT-ATATCAATG-T---GAGAAA--ATAA-TGATG---TTATTAATA--TGG-AATTTAATTATGATTTTTATTTTT--GGGTAG---TTTTTCTTTCGTT-TANNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--------GAA----------GGTCATG-ATG--AACGGC-CATG-CGGTTGATATGAT-GAGCGAAGGATGAGTGATA-TCTAACCTAAAGACCTAACG-------TAG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACATA---A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------A
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                              GAAGATGGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---GC-T----A------T
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aat---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                               ------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGAAATTGC-G-TTGCTGCAA-C-AGAT-TGACTTGCA-ATAA-TGAT---GAGAAGGTTTAAGTGATG---TTATTAATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTTTACGATA-TAATTTTTCTTTTGTT-TAACGATAAA---GCGTAGAATCAAATTATAAAGATGTTACAAGATAAGGAGAAAGTATTGAAAACAATAGCAGTTACTTTGACTACACGTACATGTATGTGTGGATAGTTCATGTATG--AACAGTACATG-CGGTTGA-ATGATCGTGCAAAGGATCGGTTATTAATTAACCTATAGACCTAACGTACATGTTAGAGTGCGCTA-ACGTAAT-CTAGAACTC-ACT--TAATAA-TTTTTAAGTA-TTCATAT--GCTTT-T---AAGAGTGGTTTATATTTTT---T--TTGAA-AA-ATAGC-T--TTT-T-TTTGGTT--TCTA-CG-TTCTTTTGCTG-TTGTGTCTTTT--ATTGAAATTT--ATAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                               AACATTGC--TAT-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---TC-G----A------TT--T-CAAAGT-GATA--AGAAA-AAG-------CGTCA-ATAA-AT-AG---TTA--CG--CTTT-TAT--AAAGTCC-ATT-A-TTA--TG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GGAAA-----T-A----A-AACGT-TTTT-TTGT----A-AATG--CGA-G-------ACT--TTCTTTGAATAGCTTTCT--CTAATA-TTT-A-ACGGTC--TATTTATG-T------------------TGT--T-T-----TA-------AAA-TTTATTAATTC------------AAAAA----CGGT-A-AA--A-----TTCG-AA---TT--TTT--ATT-T----TC--AT--TTAG-AACTCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAA---A-TTTATTAAT--TC--------AAAAAC-GG-T-AAAATTCGAATT-TTTATT--TTCATTTAGAA-CTCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCACGCAATCATCGAAGTTGCTG-TCA-TGCAA-C-AG-T-TGAATTTTATATATTTG-T---GAAACA--TTAA-TCGTA---TTATTAATG--TGGTTATTTTATCATGATTTATA-TTTT--GGATAGT--TTCTTTTAGGGTTCTAAcatcgaagttgctgtcatgcaacagttgaattttatatatttgtgaaacattaatcgtattattaatgtggttattttatcatgatttatattttggatagtttcttttagggttctaagagt
gi|7                          : aaacattgctatgttacacaaatacgcatcgatttcaaagtgataagaaaaagcgtcaataaatagttacgcttttataaagtccattattatgtcataatgtaacattgggaaaataatacggggaaataaaacgtttttttgtaaatgcgagactttctttgaatagctttctctaatatttaacggtctatttatgttgttttaACATTGC--TAGTGTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-CTTTAA------TT--TGCCAAGT-GATAA-TGAAA-A-A-------CGACC-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAAGTC-ATT-G-TTA--C---CATCAA-TGTTATTGGTACGA-CG--T---G---GT--ATAAATAAT-A-G---GG--AGAAA-----T-TTGTAT-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CAGCG------AAC---T-------ATA------T--CTG--ATTTT-A-ACATTC--TATTTCTGTT------------------TGTGTT-TCT-G-TA-------GAA-TTT-TTAATTT---G-----AAAAAAAAAC--CAAT-A-AA--A-----TTCG-GAT--TT--TTT--A---CGCGTTC--AT--TGAG-AATTCCT-GTCGC-CATAA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAACGGGC-ACGATAATAG-T-CTCTGTAA---A-ATTATTATT--TT-GA-----AAAAAC-GA-T-AAAAGTC-GA-T-TTTTCG--CTCATTGAGAATTCCTTGTCCCAAATTTTG-AGACTGAAAGTTGAACGGCgagt
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Reference ( family-1572 )     :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-TCT-G-TA-------GAA-TTTATTAATTT---G-----AAAAAAAA----CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-G-T-CTCTGTAG---A-TTTATTAAT--TT-G------AAAAAC-GA-T-AAAATTCGGA-T-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTGCTG-TCG-TGCAA-C-AG-T-CGACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTT--GGATAGT--TTTTTCTTTGGTT-TAACG--AAATTCGCGTTGAATCAAATNNNAGNGANNTNNNNANANAAGNGGGANGTATNGANANNNANCGNANTNACTCTNNNNNC--------GAATGTGTGACT-GTTCATG-ATA--AACGGT-CATG-CGGATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATAGTTTAACCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAATGA-TCATTAA-TA-TCTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTNAATAA-ATAG--T--TTT-C-TTTGGTT--TC-G-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTA-ATAAAATGGAAAAACCGG-TAAAATTTGG-ATA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AC-GG-T-TAGATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATTAAGAA-CCCTTGTCCCAAA---TG-ATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTG-TTG-TGCAA-C-Acatagaagttgctgttgtgcaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-A-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AC-GG-T-TAGATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATTAAGAA-CCCTTGTCCCAAA---TG-ATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTG-TTT-GGCAA-catagaagttgctgtttggcaaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttaacgttctatttctgttgtgtcccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-C-TA-------GAA-C--------------------------A----CGGTTA-GA--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--T-AG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TGCA---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctaAACAC-GG-TTAGAATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATT-AGAA-CCCTTGTCCCAAA---TGCATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTGTTTG-TGCAA-catagaagttgctgtttgtgcaaacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctaatttctgttgtgtcccctag-TAATGA-TCAT-GA-TA-TCTATGT-GGCATA-T---AAATGTGCTTTATA---TTTTGT--TTGCACAA-ACAG--CAACTT-C-TATGATT--GC-G-TG-TCCTTacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctaatttctgttgtgtcccctagaacacggttagaattcggaattttctactcattagaacccttgtcccaaatgcatatgaagttgCG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTC-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCAAT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TCTAATAA-ATTG--T--TTTTC-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAGTTTA-AAAAAA--AAAAAAACGG-TAAAATTTGG-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-ATTA--CA-CAAATTACA-C-A---GC-T----A------TT--TTCAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGC-A-ATGA-AT-TGG--TTA--CG--CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---T---GGG-A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----A-A---C-ATTT-ACAA----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-TTACATTC--TATTTCTA----------------------------------------------------AATGT---G-----AAAAAAAA----CAAT-A-AA--A-----T-CG-GA---TT--TTT--A---C----TCTCAT--TGAG-AATCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TTTGAA-CGGC-ACA-AAAT-G-T-CT--GTAG---AATTTATTAAT--TTTG------AAAAAC-GA-T-AAAAGTAGGATT-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGT-CCAAA---TG-AGA-TG-GAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTAA----CG-TGCAA-CAAG-T-CAACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATGATTGA-TATTTAATTATGATTTATATTTTT--GGATAG---TTTTTCTTTGGTTANNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNTG-GACT-GTCCATG-A-A--AACGGT-CATG-C-GATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATCGTTTA--CTTTAGACCTAA---------TAGAGTG-GCAA-CCGT-AT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT------TTAA-TATTTTATGT--GCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTGAATAA-ATAGTTT--TTT-C-TTTGG-T--TC-A-CG----TTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTATTTAAAATGGAAAAA-CGG-TAAAATGTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atA--CGCTCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GGGAA-AAATAATCA-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---CGTTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTTTA-ACATTC--TATTTCTG-T------------------TGTA---TCT-GTTA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----TAATAAAA----CAAT-A-AAATA-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                               AACATCGA--TAA-GTTT--CA-CTTAT-ACA-T-T---G---------------T--G-CACAGT-G-TA--TCAAA-ACG-------CGCCG-ATGA-AT-TG---CTA---------T-AAT--AT-GCTT-ATT-A-TTT--CG-TCGT-AA-T-----------AA-TGG-TGCAT---GGT-A-AGATAAC-A-T---TG--GAAAA-----T-T----T-A---
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                ACATTGC--TAG-GTTAACCA-CAA-T-ACA-C-A----C-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGGAA---G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAG-TC-ATT-A-TTA--CG-TCAT--A-TGT---------TA-AG--T---T---TG--G-AAATAAT-A------G--GAAAA-----T-atagttcttctct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCCCA-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GA---AT--CTTCCA---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-gtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----T-T----T-G---CCTTTT-ACAT----ATAA-A--TGC-GCGAAGTAATT--TTGA----ATAGCTTC-T--CTGTGG-TTT-A-ACTTTC--TATATCTT-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAA-TTTATCAATTT---G-----AAcatagaagtt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                            tcactgttcgttatT-ACAAC-A---GC-T----A------TTCGT-CAAATT-GATA--TGAACCA-G-------CGTCA-ATGA-ATCTGACTTTA--C---CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-GATTAACTG-TCAT-AA--GTACTA-----AA-CGTCT---T---GG--A-TAATAAT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cTGGTTTATA---TT---T--TTT-TTGA-GTAGT-T--TTT-C-TTTGGTTAAAC-A-CG---CTATTTCTG-TTGTGTC-TCT--A-TGGAATTTA-ATTTTTTTTAAAAA-TAG-TAAAATTCGG-ATgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-A---C-TTTT-ATAT----ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA-TTTATTAATTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----ATAG-GA---TTATTTC--G---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT---C-CACA-AA--TG-A---------GAT-A-AG-TT-TAA-CGGC-AC--TAAT-G-T-CTCTGTAGCGAA-TTTATTAAT--T--G------AAAAAC-GA---AAAAGTAGAT-T-TTTACG--CT-ATTGAGAA-TCCTTGTCC-AAA---TG-AGA-TG-A--TTGAAGC-CGCGCAATCATAAA------TG-TCG-TGCAAAC-AG-T-CGACTTT---ATAAATG-TAAAGAGAAG--TTGA-TGATGATATTATTGATT--TG---ATTTAATTATGATTTATATTTTT--TGATAGT--TTTTTCT--GGTT-TAACG--AA-TTCGCGTTGAATCAAATATAAGTAAGTTACACATAAAAGTGAGATGTATGAACACACAGCAGATTGACTCTCTGACC--------TAATGTGTGAC--GTTCATG-ATAACAAC-GT-CATGCCGGATGATATAAT-GT-CGAAGGATCAGCGATAGTTTAA-CTTTAGAC--AACG-------TAGAGT--GC-G-ACGTAATATT-GAAC-CAACCA-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCATT-T---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TATA--AA-ATAGT-T--TTT-C-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTatagttcttcttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGCATTAG-GTTAA-CAACAAAT-ACA-CAA---GC-T----A------gtgctt
gi|31                         :                                                                                                                                                        tatatatatgaaggcgctatacatagtttctaacaaatattcaaggagtataatGAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atAAGCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GTAG-ATGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                ttgaattaatatataagtaatgttacaaganAGCATTGC--TAG-GTTA--CA-CATGT-GCA-C-A---GC-T----A------TT--T-CGAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CTCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataT--AAAGTCC-ATA-A-TTA--TG-TCAT-AA-TAT---------TA-CA--T---T---GGT-G-AAATATT-A-C---GG--GAAAA-----TGG----C-G---C-TTTT-ATAT----A-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                              GAACGTTGC--GAG-GTTG--CA-CAAGT-ACA-G-A---GC-G----G------TT--T-CAAAGT-GATA--TG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----AAAAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaa--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttgtatacgtccgt----A-AA-A--AGG-G------AACT--T-------ATA------TATCGA--A-TTT-A-AAATTA--TATTTCTG-C------------------TGTG-TATCT-A-TA-------GAA-TTGATTG-CTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TG--TTT--A---C----TCTCAT--TGAT-AATCCTG-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATAA-AG-TT-GAC-GGAC-ACG-TCTT-C-T-ATTTGTAG---AATCTATTAAT--TT-G------AAAAAAAGA-T-AAAATTCGGAAT-TGTATT--TACATTGATAA-TCATTACCCCAAA---TG-ATA-TG-ATGTTAAAGGGCACGCAATCGTTGAAGTTGCTG-TCG-CGCAA-C-AT-T-TGACTTT-ATATCAATG-T---GAGAAA--ATAA-TGATG---TTATTAATA--TGG-AATTTAATTATGATTTTTATTTTT--GGGTAG---TTTTTCTTTCGTT-TANNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--------GAA----------GGTCATG-ATG--AACGGC-CATG-CGGTTGATATGAT-GAGCGAAGGATGAGTGATA-TCTAACCTAAAGACCTAACG-------TAG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACATA---A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------A
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                              GAAGATGGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---GC-T----A------T
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aat---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                               ------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGAAATTGC-G-TTGCTGCAA-C-AGAT-TGACTTGCA-ATAA-TGAT---GAGAAGGTTTAAGTGATG---TTATTAATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTTTACGATA-TAATTTTTCTTTTGTT-TAACGATAAA---GCGTAGAATCAAATTATAAAGATGTTACAAGATAAGGAGAAAGTATTGAAAACAATAGCAGTTACTTTGACTACACGTACATGTATGTGTGGATAGTTCATGTATG--AACAGTACATG-CGGTTGA-ATGATCGTGCAAAGGATCGGTTATTAATTAACCTATAGACCTAACGTACATGTTAGAGTGCGCTA-ACGTAAT-CTAGAACTC-ACT--TAATAA-TTTTTAAGTA-TTCATAT--GCTTT-T---AAGAGTGGTTTATATTTTT---T--TTGAA-AA-ATAGC-T--TTT-T-TTTGGTT--TCTA-CG-TTCTTTTGCTG-TTGTGTCTTTT--ATTGAAATTT--ATAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                               AACATTGC--TAT-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---TC-G----A------TT--T-CAAAGT-GATA--AGAAA-AAG-------CGTCA-ATAA-AT-AG---TTA--CG--CTTT-TAT--AAAGTCC-ATT-A-TTA--TG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GGAAA-----T-A----A-AACGT-TTTT-TTGT----A-AATG--CGA-G-------ACT--TTCTTTGAATAGCTTTCT--CTAATA-TTT-A-ACGGTC--TATTTATG-T------------------TGT--T-T-----TA-------AAA-TTTATTAATTC------------AAAAA----CGGT-A-AA--A-----TTCG-AA---TT--TTT--ATT-T----TC--AT--TTAG-AACTCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAA---A-TTTATTAAT--TC--------AAAAAC-GG-T-AAAATTCGAATT-TTTATT--TTCATTTAGAA-CTCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCACGCAATCATCGAAGTTGCTG-TCA-TGCAA-C-AG-T-TGAATTTTATATATTTG-T---GAAACA--TTAA-TCGTA---TTATTAATG--TGGTTATTTTATCATGATTTATA-TTTT--GGATAGT--TTCTTTTAGGGTTCTAAcatcgaagttgctgtcatgcaacagttgaattttatatatttgtgaaacattaatcgtattattaatgtggttattttatcatgatttatattttggatagtttcttttagggttctaagagt
gi|7                          : aaacattgctatgttacacaaatacgcatcgatttcaaagtgataagaaaaagcgtcaataaatagttacgcttttataaagtccattattatgtcataatgtaacattgggaaaataatacggggaaataaaacgtttttttgtaaatgcgagactttctttgaatagctttctctaatatttaacggtctatttatgttgttttaACATTGC--TAGTGTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-CTTTAA------TT--TGCCAAGT-GATAA-TGAAA-A-A-------CGACC-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAAGTC-ATT-G-TTA--C---CATCAA-TGTTATTGGTACGA-CG--T---G---GT--ATAAATAAT-A-G---GG--AGAAA-----T-TTGTAT-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CAGCG------AAC---T-------ATA------T--CTG--ATTTT-A-ACATTC--TATTTCTGTT------------------TGTGTT-TCT-G-TA-------GAA-TTT-TTAATTT---G-----AAAAAAAAAC--CAAT-A-AA--A-----TTCG-GAT--TT--TTT--A---CGCGTTC--AT--TGAG-AATTCCT-GTCGC-CATAA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAACGGGC-ACGATAATAG-T-CTCTGTAA---A-ATTATTATT--TT-GA-----AAAAAC-GA-T-AAAAGTC-GA-T-TTTTCG--CTCATTGAGAATTCCTTGTCCCAAATTTTG-AGACTGAAAGTTGAACGGCgagt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                   tgGC--TAG-GGTT--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAG--GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTACTCGCCCTTT-GATTAAAAGTTCTATTGG-TTA--C--TCAT-AA-TGT---------GACCG--C---T---GGT-A-AAATAATAA-C---GG--GAATATGATTT-T----T-A---CATTTT-AATT----A-AA-A--AGG-GA-----AACTC-T-------ATA------T---TG--A-TTT-A-ACATTC---ATTTTTG-T------------------GTTG-TATCT-G-TA-------GAA-TTTATTAATTT---A-----AAAAAAAAC---CAAT-ATAA--A-----TTCGCGATTTTT--TTT--AACTC----TC--AT--TGAGAAATCCT---TT-C-CA-AA--TG-A---------GATGATAG-TT-GAA-CGGCAACATTAAT-G-T-CTCTGTAGA--A-TTTATT-AT--TT-G------GAAAa
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Reference ( family-1572 )     :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-TCT-G-TA-------GAA-TTTATTAATTT---G-----AAAAAAAA----CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-G-T-CTCTGTAG---A-TTTATTAAT--TT-G------AAAAAC-GA-T-AAAATTCGGA-T-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTGCTG-TCG-TGCAA-C-AG-T-TGACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTT--GGATAGT--TTTTTCTTTGGTT-TAACG--AAATTCGCGTTGAATCAAATNNNAGNGANNTNNNNANANAAGNGGGANGTATNGANANNNANCGNANTNACTCT--CTA-ACGTA-----ATGTGTGA--A--GTTCATG-ATA--AACGGT-CATG-CGGATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATAGTTTAACCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAATGA-TCATTAA-TA-TCTATGT-GGCA-TNT---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTNAATAA-ATAG-C-TTTTC-TTTGGTT--TC-G-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTA-ATAAAATGGAAAAACCGG-TAAAATTTGG-ATA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatc-TGATGA-TCAT-GA-TA-TCTATGT-GGCA-TAT---AAATGTGGTTTATA---TT---TTGTTGCAC-A-ACAG-CAACTTC-TATGATT--GC-G-TG-TCCTTaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttaacgttctatttctgttgtgtccccatagaatcacggttagattcggaattttctactcattaagaacccttgtcccaaatgatatgaagttgTT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCC-A-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GAAT-TT--TCT--A---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AC-GG-T-TAGATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATTAAGAA-CCCTTGTCCCAAA---TG-ATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTG-TTT-GGCAA-catagaagttgctgtttggcaaacaaaatataaaccacatttatatgccacatagatatcatgatcatca
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctaAACAC-GG-TTAGAATTCGGAAT-TTTCTA--CTCATT-AGAA-CCCTTGTCCCAAA---TGCATA-TG-AAGTTGAAGGACACGCAATCATAGAAGTTGCTGTTTG-TGCAA-catagaagttgctgtttgtgcaaacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctaatttctgttgtgtcccctag-TAATGA-TCAT-GA-TA-TCTATGT-GGCA-TAT---AAATGTGCTTTATA---TTTTGT--TTGCACAA-ACAG-CAACTTC-TATGATT--GC-G-TG-TCCTTacaaaatataaagcacatttatatgccacatagatatcatgatcatta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctaatttctgttgtgtcccctagaacacggttagaattcggaattttctactcattagaacccttgtcccaaatgcatatgaagttgCG-------TAGAGTG-GCAG-ACGTAAT-CT-GAAC-C-ACTC-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCA-ATT---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TCTAATAA-ATTG-T-TTTTC-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAGTTTA-AAAAAA--AAAAAAACGG-TAAAATTTGG-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGC--TAG-ATTA--CA-CAAATTACA-C-A---GC-T----A------TT--TTCAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGC-A-ATGA-AT-TGG--TTA--CG--CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-G-TTA--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---T---GGG-A-AAATAAT-A-C---GG--GAAAA-----T-T----A-A---C-ATTT-ACAA----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTT-TTACATTC--TATTTCTA----------------------------------------------------AATGT---G-----AAAAAAAA----CAAT-A-AA--A-----T-CG-GA---TT--TTT--A---C----TCTCAT--TGAG-AATCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TTTGAA-CGGC-ACA-AAAT-G-T-CT--GTAG---AATTTATTAAT--TTTG------AAAAAC-GA-T-AAAAGTAGGATT-TTTACG--CTCATTGAGAA-TCCTTGT-CCAAA---TG-AGA-TG-GAGTTGAAGGGCGCGCAATCATAGAAGTTAA----CG-TGCAA-CAAG-T-CAACTTTTATATAAATG-T---GAGAAG--TTAA-TGATG---TTATTGATGATTGA-TATTTAATTATGATTTATATTTTT--GGATAG---TTTTTCTTTGG-T-TANNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNNNN-----NNNNNTGG--ACTGTCCATG-A-A--AACGGT-CATG-C-GATGATATAAT-GTGCGAAGGATCAGCGATCGTTTA--CTTTAGACCTAA---------TAGAGTG-GCAA-CCGT-AT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT------TTAA-TATTTTATGT--GCA-TTT---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TTGAATAA-ATAGTT-TTTTC-TTTGG-T--TC-A-CG----TTTTTCTG-TTGTGTC-TTT--A-TGAAATTTATTTAAAATGGAAAAA-CGG-TAAAATGTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atA--CGCTCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---T---GGGAA-AAATAATCA-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---CGTTTT-ACAT----A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------ATA------T--CTG--A-TTTTA-ACATTC--TATTTCTG-T------------------TGTA---TCT-GTTA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----TAATAAAA----CAAT-A-AAATA-----TTCG-GA---TT--TTT--A---C----TC--
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                               AACATCGA--TAA-GTTT--CA-CTTAT-ACA-T-T---G---------------T--G-CACAGT-G-TA--TCAAA-ACG-------CGCCG-ATGA-AT-TG---CTA---------T-AAT--AT-GCTT-ATT-A-TTT--CG-TCGT-AA-T-----------AA-TGG-TGCAT---GGT-A-AGATAAC-A-T---TG--GAAAA-----T-T----T-A---
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gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                ACATTGC--TAG-GTTAACCA-CAA-T-ACA-C-A----C-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGGAA---G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAG-TC-ATT-A-TTA--CG-TCAT--A-TGT---------TA-AG--T---T---TG--G-AAATAAT-A------G--GAAAA-----T-atagttcttctct
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-A-ACGTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-T-CCCCA-TA-------GAA-TC-------------------------A----CGGT-T-AG--A-----TTCG-GA---AT--CTTCCA---C----TC--AT--TAAG-AACCCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------TATGA-AG-TT-GAA-GGAC-ACG-CAAT-gtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----T-T----T-G---CCTTTT-ACAT----ATAA-A--TGC-GCGAAGTAATT--TTGA----ATAGCTTC-T--CTGTGG-TTT-A-ACTTTC--TATATCTT-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAA-TTTATCAATTT---G-----AAcatagaagtt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                            tcactgttcgttatT-ACAAC-A---GC-T----A------TTCGT-CAAATT-GATA--TGAACCA-G-------CGTCA-ATGA-ATCTGACTTTA--C---CTTT-GAT--AACGTTC-ATT-GATTAACTG-TCAT-AA--GTACTA-----AA-CGTCT---T---GG--A-TAATAAT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cTGGTTTATA---TT---T--TTTT-TGA-GTAG-T-TTTTC-TTTGGTTAAAC-A-CG---CTATTTCTG-TTGTGTC-TCT--A-TGGAATTTA-ATTTTTTTTAAAAA-TAG-TAAAATTCGG-ATgt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taG--CTTT-GAT--AAAACTC-ATT-A-TTA--CG-ACAT-G--------------AA-CC--A---T---GG--A-GGACAAT-G-C---GG--GAACAT----T-T----T-A---C-TTTT-ATAT----ATAT-A--CCA-G------AAGT--T-------A-A------T--TTG--A-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AA-TTTATTAATTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----ATAG-GA---TTATTTC--G---C----TC--AT--TGAG-AACCCTT---C-CACA-AA--TG-A---------GAT-A-AG-TT-TAA-CGGC-AC--TAAT-G-T-CTCTGTAGCGAA-TTTATTAAT--T--G------AAAAAC-GA---AAAAGTAGAT-T-TTTACG--CT-ATTGAGAA-TCCTTGTCC-AAA---TG-AGA-TG-A--TTGAAGC-CGCGCAATCATAAA------TG-TCG-TGCAAAC-AG-T-CGACTTT---ATAAATG-TAAAGAGAAG--TTGA-TGATGATATTATTGATT--TG---ATTTAATTATGATTTATATTTTT--TGATAGT--TTTTTCT--GGTT-TAACG--AA-TTCGCGTTGAATCAAATATAAGTAAGTTACACATAAAAGTGAGATGTATGAACACACAGCAGATTGACTCT--CTG-ACCTA-----ATGTGTGA--C--GTTCATG-ATAACAAC-GT-CATGCCGGATGATATAAT-GT-CGAAGGATCAGCGATAGTTTAA-CTTTAGAC--AACG-------TAGAGT--GC-G-ACGTAATATT-GAAC-CAACCA-TAATAA-T--TTAA-TA-TTTATGT-GGCA-TTT---AAGAGTGGTTTATA---TT---T--TATA--AA-ATAG-T-TTTTC-TTTGGTT--TC-A-CG-TTCTTatagttcttcttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                              GAACATTGCATTAG-GTTAA-CAACAAAT-ACA-CAA---GC-T----A------gtgctt
gi|31                         :                                                                                                                                                        tatatatatgaaggcgctatacatagtttctaacaaatattcaaggagtataatGAACATTGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-T----A------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAGTTC-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atAAGCTTTAGACCTAACG-------TAGAGTG-GTAG-ATGTAAT-CT-GAAC-C-ACTA-TAAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                ttgaattaatatataagtaatgttacaaganAGCATTGC--TAG-GTTA--CA-CATGT-GCA-C-A---GC-T----A------TT--T-CGAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CTCCA-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataT--AAAGTCC-ATA-A-TTA--TG-TCAT-AA-TAT---------TA-CA--T---T---GGT-G-AAATATT-A-C---GG--GAAAA-----TGG----C-G---C-TTTT-ATAT----A-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                              GAACGTTGC--GAG-GTTG--CA-CAAGT-ACA-G-A---GC-G----G------TT--T-CAAAGT-GATA--TG
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatTTC--TATTTCTG-T------------------TGTG-TCTCT-G-TA-------GAT-TTTATTAATTT---G-----AAAAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaa--CG-TCAT-AA-TGT---------AA-CG--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttgtatacgtccgt----A-AA-A--AGG-G------AACT--T-------ATA------TATCGA--A-TTT-A-AAATTA--TATTTCTG-C------------------TGTG-TATCT-A-TA-------GAA-TTGATTG-CTT---G-----AAAAA-------CGAT-A-AA--A-----TTCG-GA---TG--TTT--A---C----TCTCAT--TGAT-AATCCTG-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATAA-AG-TT-GAC-GGAC-ACG-TCTT-C-T-ATTTGTAG---AATCTATTAAT--TT-G------AAAAAAAGA-T-AAAATTCGGAAT-TGTATT--TACATTGATAA-TCATTACCCCAAA---TG-ATA-TG-ATGTTAAAGGGCACGCAATCGTTGAAGTTGCTG-TCG-CGCAA-C-AT-T-TGACTTT-ATATCAATG-T---GAGAAA--ATAA-TGATG---TTATTAATA--TGG-AATTTAATTATGATTTTTATTTTT--GGGTAG---TTTTTCTTTCGTT-TA----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNNNN-----NNNNNTGA--A--GGTCATG-ATG--AACGGC-CATG-CGGTTGATATGAT-GAGCGAAGGATGAGTGATA-TCTAACCTAAAGACCTAACG-------TAG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a-A-C---GG--GAAAA-----T-T----T-A---C-TTTT-ACATA---A-AA-A--CGG-G------AACT--T-------A
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                              GAAGATGGC--TAG-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---GC-T----A------T
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aat---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCGCGCAATCATA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                               ------TT--T-CAAAGT-GATA--TGAAA-A-G-------CGCCA-ATGA-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGAAATTGC-G-TTGCTGCAA-C-AGAT-TGACTTGCA-ATAA-TGAT---GAGAAGGTTTAAGTGATG---TTATTAATA--TGG-TATTTAATTATGATTTATATTTTTTACGATA-TAATTTTTCTTTTGTT-TAACGATAAA---GCGTAGAATCAAATTATAAAGATGTTACAAGATAAGGAGAAAGTATTGAAAACAATAGCAGTTACTTTGACTACACGTACATGTATGTGTGGATA--GTTCATGTATG--AACAGTACATG-CGGTTGA-ATGATCGTGCAAAGGATCGGTTATTAATTAACCTATAGACCTAACGTACATGTTAGAGTGCGCTA-ACGTAAT-CTAGAACTC-ACT--TAATAA-TTTTTAAGTA-TTCATAT--GCT-TTT---AAGAGTGGTTTATATTTTT---T--TTGAA-AA-ATAG-C-TTTTT-TTTGGTT--TCTA-CG-TTCTTTTGCTG-TTGTGTCTTTT--ATTGAAATTT--ATAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                               AACATTGC--TAT-GTTA--CA-CAAAT-ACG-C-A---TC-G----A------TT--T-CAAAGT-GATA--AGAAA-AAG-------CGTCA-ATAA-AT-AG---TTA--CG--CTTT-TAT--AAAGTCC-ATT-A-TTA--TG-TCAT-AA-TGT---------AA-CA--T---TG--GG--A-AAATAAT-A-C---GG--GGAAA-----T-A----A-AACGT-TTTT-TTGT----A-AATG--CGA-G-------ACT--TTCTTTGAATAGCTTTCT--CTAATA-TTT-A-ACGGTC--TATTTATG-T------------------TGT--T-T-----TA-------AAA-TTTATTAATTC------------AAAAA----CGGT-A-AA--A-----TTCG-AA---TT--TTT--ATT-T----TC--AT--TTAG-AACTCTT-GTC-C-CA-AA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAA-GGGC-ACG-CAAT-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAA---A-TTTATTAAT--TC--------AAAAAC-GG-T-AAAATTCGAATT-TTTATT--TTCATTTAGAA-CTCTTGTCCCAAA---TG-AGA-TG-AAGTTGAAGGGCACGCAATCATCGAAGTTGCTG-TCA-TGCAA-C-AG-T-TGAATTTTATATATTTG-T---GAAACA--TTAA-TCGTA---TTATTAATG--TGGTTATTTTATCATGATTTATA-TTTT--GGATAGT--TTCTTTTAGGGTTCTAAcatcgaagttgctgtcatgcaacagttgaattttatatatttgtgaaacattaatcgtattattaatgtggttattttatcatgatttatattttggatagtttcttttagggttctaagagt
gi|7                          : aaacattgctatgttacacaaatacgcatcgatttcaaagtgataagaaaaagcgtcaataaatagttacgcttttataaagtccattattatgtcataatgtaacattgggaaaataatacggggaaataaaacgtttttttgtaaatgcgagactttctttgaatagctttctctaatatttaacggtctatttatgttgttttaACATTGC--TAGTGTTA--CA-CAAAT-ACA-C-A---GC-CTTTAA------TT--TGCCAAGT-GATAA-TGAAA-A-A-------CGACC-ATGA-AT-TG---TTA--CG--CTTT-GAT--AAAAGTC-ATT-G-TTA--C---CATCAA-TGTTATTGGTACGA-CG--T---G---GT--ATAAATAAT-A-G---GG--AGAAA-----T-TTGTAT-A---C-TTTT-ACAT----A-AA-A--CAGCG------AAC---T-------ATA------T--CTG--ATTTT-A-ACATTC--TATTTCTGTT------------------TGTGTT-TCT-G-TA-------GAA-TTT-TTAATTT---G-----AAAAAAAAAC--CAAT-A-AA--A-----TTCG-GAT--TT--TTT--A---CGCGTTC--AT--TGAG-AATTCCT-GTCGC-CATAA--TG-A---------GATGA-AG-TT-GAACGGGC-ACGATAATAG-T-CTCTGTAA---A-ATTATTATT--TT-GA-----AAAAAC-GA-T-AAAAGTC-GA-T-TTTTCG--CTCATTGAGAATTCCTTGTCCCAAATTTTG-AGACTGAAAGTTGAACGGCgagt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|38 ): GAAAAGTATGTACACACAGCAATTGACTCCTGACCTATGTGTG
Unaligned ( gi|39 ): TATTATATAGTCGCCAAGTTTCTACAATTCTTCAGAAGTAT