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Reference ( gi|1 ) : AGCAAAATT-CTTAA-CAATAT-TA-----CT-------GTTGTAAAGAATC-A----TTA-GGAGTAT----ATTC-T-CAA--A--AG--A-AAAATG--TTA---ACATC------T-TGAA---G-AT--T---T-T---TA-T--TC----TAATTTG--ATTAAC-TT-C-A--T-------T---A--A-CA-ACTGAA---T----AGAG-ATATTCTCA---A-A-CAC-------GA--TT-TGT---------T----GGTG-----T-ATTT--T-T-------TAGA--C-A-----T-TTTC------------------T------T------------------------TTTA-TGCGT----AG----TGACGTGAC--TAAA--GGTAC-TGAAA-AGA------------A-------TN---AAACAC-------GATTTGTT----GGTG-TATTTT-T-------TA-GACAC------------------CTT---TTT--TT--TAT--GCGTAG----TGACGTGACTAAAGGC-A-CTGAAAAGAACGT-TGC--GTG-G-CTT---TG-C--G--GG----C-CA-A--------ACAGTAG---A---A---T----G-AATAGAAAA---------T----G-G----A-----GAG---A------TGTTAAACATGTGA
gi|3 : AGCAAAATT-CTCA-----------------T-------CTT---AGGAATC-A----CTA-GGAGTAT----ATTC-T-CAA--A--AG--A-ATAATG--ATA---ATA----------TGAC---G-AT--T---T-T---TA-C--TC----AAATTTGCTCTCAAC-TT-C-AT-T-------T---A--A-CA-ATCGAT---T----AAAG-ATATTCTCA---A-A-CAT-------GA--TT-TGT---------T----TGTG-----T-A--T--T-T-------TAGA--C-A-----A-TTTT------------------T------C------------------------TTTA-TGGGT----AA----TGATGAGGC--TAAA--GGCAT-----A-AGA------------A-------T
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gi|41 : ttatgtacaaacataccagggAG-CAAAAT-T------CT-------GTTTTAAAGAATA-A----TTA-GGACTAT----ATTC-T-TAA--A--AG--G-AAAcc
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gi|26 : C-------GC--TT-TGT---------TTACAGGTG-----T-ATTT--T-A-------TAGA--C-A-----C-TTTT------------------T------C------------------------TTCA-TGCGT----AG----TGACGTAGC--TAAA--Gaatgttatgcagcttcgagtaaaaataaaaaaacagagagaggggggcattacacgtga
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gi|42 : tatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtagacactTT--T-A-------TAGA--C-A-----C-TTTT------------------T------C------------------------TTGA-TGCGT----AC----TGACGTAGC--TAAA--Gttaatgcgtgacgtggcttcgagggccgaacaatagaaatatcaatataaaaaggaggggggatgtaaaacatatg
gi|39 : aataaaaacaaattttaAGA--C-A-----A-TTTT------------------T------C------------------------TTTA-TGGGT----AG----TGATGAGGC--TAAA--GGCA---AAAG-AGT------------A-------CC---GAACAcgtcacgtggcttcgagggccgaacagtagaaat
gi|3 : GAT--TAAA--GATAT-TC---------------------------TC---AAACAT-------GATTTGTT----TGTG-TATTTT----------A-GACAA------------------TTT---TTC--TT--TAT--GGGTAA----TGATGAGGCTAAAGGC-A-T----AAGAA----TGT--GTG-G-CTT---CG-A--G--TA----C-CG-AACTGTGTTACAGTAG---A--------------AACAGAAAA--------------A-G----A-----GGG---AGTGGGGTGTTAAACATATGgtagaaacagaaaacagagggagtggggtgttaaacatatga
gi|18 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccagggagcaaaattctcatcttaggaatcactaggagtatattctcaaaagaataatgataatatgacgatttttactcaaatttgctctcaacttcatttaacaatcAG-AGA------------A-------TTCTCAAACAC-------AAATT-TT----G-TG-TATGTT-T-------CA-------------------------TT---TAG--GT--TAT-----T-G----TGGCGTGACTGAAGGCTATCTAA-------GT-TGT--ATGCG-ATT---CA-A--G--AGTTTCC-CG-A--------ACAGTAG---AAATA---T----G--ATAGAAAA---------C----G-A----A-----GGG---
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gi|10 : ggagcaaaattactttaaatttgtaaaaatcactaggagtatattcttaaacgaaaaaaatgttaattatatcatgaagatttttactcttatttgctgaacactcatttacacatt-------TC---GAACAC-------AATTTGTT----TGTG-TATTTT-TATA----TA-GGCAC------------------TTT---TTC--TT--TAT--ACATAC----TGACATGACTAAAGG--A-T---AAAGAATAT-TAT--GTA-G-CTT---CA-A--G--GG----C-CG-A--------ACAGTAG---AATTA---T----G-AATAGGAAA---------C----G-G----AGCTGGGAGGGAG------TGTTAAACATGTGA
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gi|27 : aaaaattctcaacaacagtaatgttgtaaaggatcacttgttaaagtatgtttaacttcatttaataactgaatagagatactcgcaacacgatttgtttgtgtattttatAACAC-------GATTTGTT----TGTG-TATTTT-A-------TA-GACAT------------------TTT---TTC--TT--CTT--GCGTAG----TGACACACCTAAAG---------------CGG-TAC--ATG-A-TTT---CGAC--GAGGG----C-CG-A--------ACAG------------------------AAAAAA---------C----GAG----G-----GAG---GG-----TGTTAAACATGCGAaggggtgtgca
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|16 : gacgtacgtaaaatttacgtagtttctgaaaaacaaaattctcagcaatattgaatttattagagtattataattctcaaaagaaaaaatttaagataataaagatttatattctaatttgcttaatttcatttacaattgaatagttatcgtctcttcaaA--A--AG--T-AAAA-TG--TTG---AT---AT-TACA-----A-A----GAT--T---T-C---TA-C-TATA--ATT
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gi|29 : agatgtatgtaaactttacgtagcctagtttgccaA-CATGATTTGTTT----GCG-TAATTTA-------T-A-GGCA-TAT---TTCTTT-C----T--GCATAGT----GATGTGGCT-----------------A-A---A-GAATG--TTA-T-------GCAGCT-T---CGA---G---------T-A--------AAAATAA---A---A--------A-AA-CAG-AGA-------G--A---G-GG-----G--G--G--C-ATT--ACA-CGTGA
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gi|3 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccaggg------T---CAAA-CATGATTTGTTT----GTG-TATTTT----------A-GACAATTT---TTCTTT-A----T--GGGTAAT----GATGAGGCT-AA----AGG-C-----ATA---A-GAATG--T-----------GTGGCT-T---CGA---GTA----C-CG-AACTGTGTTACAGTAG---A--------------AA-CAG-AAAA-----AG--A---G-GG-AGTGG--G--G--T-GTTAAACA-TATGgtgtggcttcgagtaccgaactgtgttacagtagaaacagaaaaagagggagtggggtgttaaacatatg
gi|30 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccagggagcaaaattctcatcttaggaatcactaggagtatattctcaaaagaataatgataatatgacgatttttactcaaatttgctctcaacttcatttaacaatcgattaaagatattcAA-CACGATTTGTTT----GTG-TATTTTA-------T-A-GACATTTT---TTCTTC-T----T--GCGTAGT----GACACACCT-AA----AG-------------------CG--GTA-C-------ATGATT-TCGACGA---GGG----C-CG-A--------ACA--------------------------AG-AAAAC----GG--A---G-GG-AGG-G--G--G--T-GTTAA
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gi|32 : GTAGT----GAGGTA-CT-GA----GGG-CTAT--A-A---A-GAATG--TTA-T-------GTAGCT-T---CGA---AGA----C-CG-A--------ACAGTAG--------------------------AAAC----AG--A---G-GG-AG--G--G--G--T-GTTAGACA-TGTGAcg
gi|33 : atgttgcttgctataggcataagAT----ATTCT-C-AA--A--AGAAA-AAAA-TG--TTA---GT---AT-ATTA-----A-A----GAA--T---T-TATATA-C-TCTA--CTGTG--CTTAAT-TT-C-A-----T-----------------------------------AA-ATCTTCTC--------------------TT-CA------------------------A-T-T---------GGCACCTT---TT-------------------TTC-C-CTA-T--G--------------------------CGTAC----TGACGtga
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gi|35 : ctaAACAAAATT-CT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GTTGTAAAGAATC-GTTA-GGAGAA-------------AA--T--AG--A-AAAA-TT--TTA---
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gi|40 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaaaaaatgtcaacaatattactgtgtaaagaattattaagagtatattttcaaaaaaaagattttacactaatttgtttaacttcattttatttcaattaaacagaaatatactctttccctatgcgtactgccgtttctgaaagactaaaaatgatatgcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACT----GGCGTGGCT-GA----AGG-C-----T-A---A-AAATG--TTA-T-------GTGGCT-T---CGA---CGG----C-CG-A--------TCAGTAG---AAATA----T---G-AA-TAG-AAAAC----AG--A---G-GG-A---G--G--GA-T-GTTAAACA-TGTGA
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gi|43 : aataaaaacaaattttaGCAAAGTATT-ATCA-GC-GTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAAA-TA--TTA---GT---AT-CAAA-----A-A----GAT--T---T-TTA-TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAAat
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gi|5 : gacgtcaccagacaccgtaaattttcgtagtttaatatgtaaaatgtcagggTTTA-------T-A-GGC-CTCT---TT-TCT-AAGATC--GCGTTCT----GATATGTCC-GATCACATG-C-----T-A---T-AAATG--TTATC-------GCGGCT-T----GT---GAC----C-CA-A--------ACTGAAA---T---A----T---G-A--CAG-GAAAC----GG--A---G-GG-A---G--G--G--T--TTAAACATTGTGAttataggcctcttttctaagatcgcgttctgatatgtccgatcacatgctataaatgttatcgcggcttgtgacccaaactgaaatatgacaggaaacggagggagggtttaaacattgtga
gi|50 : gacgtcaccagacaccgtaaattttcgtagtttaatatgtaaaatgtcagggagcaaaattttcagcaacgttactgtgtaaaaaacataactgtatctcaaaagaaaatgtatcataagatttttacttatttgcttaacttcatcttaacaattgaaG--TTA-C-------ATTGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ACAATAG---AAATA----T---G-AA-CAG-AAAAC----GG--A---GAGA-A---G--G--G--T-GTTAAACA-
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gi|52 : aatatgaacgttgttttctacaataaaaagtgAGCAAAATT-CT-CAA-CAGCAT-T-----------------------GAATT-ATTA-G-AGCAT----ATTAT-C-TA--A--AG--C-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----Ga
gi|53 : tcaggg-------T-A-GGCACTTT---TTCT-------------------------GTGGCT-AA----AGG-C-----T-A---A-AATTG--TTA-T-------GCATCTGTG--CAA---GGG----C-TG-A--------ACAGTA
gi|54 : tcaaT----GACGTGGCT-AA----A-------------------ATG--TTA-T-------GCGTCT-T---CAA---GGG----C-AG-A--------ACAGTAG---AAGTA----T---G-AA-TAG-AAAA
gi|55 : GGCT-----CGA---GGG----A-CG-A--------ACAGTGG---A---A----TTATG-AA-CAG-AAAAC----GG--A---G-GG-AG--G--G--G--T-GTT
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gi|57 : ATG--TTA-T-------GCGTCT-G---CAG---GGG----C-CA-A--------ACAGTAA---AAATA----T---G-AA-TAG-AAa
gi|58 : ac---T-T---TA-C-TCTG--ATTTG--CTTAAC-TT-C-AT----T-------T---A--G-CA-ATTGAA---T----AGAT-ATA
gi|6 : AGCAAAATT-CT-CAA-CAGTAT-TATAGTACT-------GTTGTGAAAAACCCATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AT--A--AG--A-AAAA-TG-------------------------A-A----GAT--T---T-T---TA-C-ACAA--A--GN--NNNNNN-NN-N-N-----N-------N---N--N-NN-NNNNNN---N----NNNN-NNNNNNNNN---N-N-NNN-------NNNN-NNN---------N--NNN-N-----NN-N-NN---N-NNNNNNNN--N---NN-------------------NNN-N-NNA-T--G--------------------------TGTAG----TGAC-CGGCTAAGGGC-----AAAAGA-------------A------T---
gi|6 : gg-A----T--GTGTAGT----GAC-CGGCT-AA----GGG-C-----A-A---AAGAATG--TTA-C-------GCGGCT-C---CAA---GGG----C-TG-A--------ACAGTAG---AAATA----T---G-AA-TAG-AAAAC----GGGAA---G-AG-G---G--G--G--T-GTTAAACA-TGTGAgttacgcggctccaagggctgaacagtagaaatatgaatagaaaacgggaagagggggtgttaaacatgtgat
gi|61 : ggagcaaaattctcaacagtattatagtactgttgtgaaaaacccattaggagtatattcttataagaaaaatgaagatttttacacaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ACAGTAG---A---A----t
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gi|8 : cagtgagcaaaattcAGCAGAATT-CT-CAA-CAATAT-T-----------------------GAAT-------------------TTCT-C-AACAAC-AA--A-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----G-T--T---T-T---CA-C-TCTA--GTTAG--CTTATC-TT-C-A-----TATACATGT---A--A-CA-ATGGAA---T----AGAACATA-TCTCA---A-A-AAC-------AATT-TG-------------TGT-A-----T--T-TT---T-ATAGGCAC--T---TT-------------------TTC-T-TTA-
gi|8 : ------T---CAAA-AACAATTTGT------GTA-T-TTTTA-------T-A-GGCACTTT---TTCTTT-A----N--NNNNNNN----NNNNNNNNN-NN----NNN-N-----N-N---N-NNNNN--NNN-NNNNNNNTGTGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ATGGTAGT--A---ATC--T---G-AA-TAG-GAAAC----GG--A---G-GGAA---G--G--G--T-GTTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtggcttcgagggccgaatggtagtaatctgaataggaaacggagggaagggtgttcaacttt
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|2 : agaagaatttattacaagtatttcaaagtaaaatgctgacgcgagcagaagaattcttactttgatttgctagactgtatgcatttaacaattcaagagatatcttctttgagtgggcAGCAAAATT-CTTCAT-CAA-----G-----C--------ATTG---AAAATT-ATTA-G-AGTAT----ATTCTTC-AA--A--AG--G-AAAA-TG--TTA---ATAC-AT-CATATTTTTA-AAAACGAT--T---T-T---TA-C-TCTC--ATTTG--C-------------------------T---A--A-CA-ATTGGAAATT----AGAA-ATTTTCTCATAGA-A-CACATATAGAGATA-TATAGAGAGAGAT--AGA-GAGAGTTA--TTTT---T-A--TAGGCCC--T---TT-------------------TTCTTTTATT--G--------------------------TG-TAATGGCGTGGCTGAAGG--CT--AAAAGA-------------A------T---gtgagtaa
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gi|20 : gagcaaaattcttcatcaagcattgaaaattattagagtatattcttcaaaaggaaaatgttaatacatcatatttttaaaaacgatttttactctcatttgctaacaattggaaattagaaattttctcatagaacacatatagagatatatagagagagatagagagagttatAGCAAATTT-CT-CAA-AAATAT-T-----------------------GAATA-ATTA-G-AGTAT----AT---------------------AA-TG--TTA---AT---AT-GATA-----A-A----GAT--T---T-A---AG-C-TCTA--ATTTG--CTTAAC-TT-C-A-----T-------T---C--A-CA-ATTTAC---C----AGAA-ATTTTCTC----------------------------------------------------T-TT---A-A--TAGCCAC--T---TT-------------------TTC-TCTA-T--G--------------------------CG-TACTGACACGGCTAAAt
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gi|28 : ctAG-CAAAAT-T------TT-------GTTGTAAAGAATC-ATTA-AGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--AG--A-AAAA-TG---TA---AT---AT-CTTG-----A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TCTG--ATTTG--CTt
gi|29 : agatgtatgtaaactttacgtagcctagtttgccaA-CATGATTTGTTT----GCG-TAA--TTT-------AT--AGGCA-TAT---TTC-TTT-C----T--GCATAGT----GATGTGGCT-----------------A-A---A-GAATG--TTA-T-------GCAGCT-T---CG--------------------AG---T-AA-A-A----ATA-AA----AAAAC----AG--A---G-AG-A---G---G--G--G-GGCATT--ACA-CGTGA
gi|3 : AGCAAAATT-CT-CA-----------------T-------CTT---AGGAATC-ACTA-GGAGTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-ATAA-TG--ATA---AT-------ATG-----A-C----GAT--T---T-T---TA-C-TCAA--ATTTGCTCTCAAC-TT-C-AT----T-------T---A--A-CA-ATCGAT---T----AAAG-ATATTCTCA---A-A-CAT-------GATT-TGT---------T--TGT-G-----TA--T-TT--------TAGACAA--T---TT-------------------TTC-TTTA-T--G--------------------------GG-TAATGATGAGGCTAAAGGCAT-----AAGA-------------A------T---
gi|3 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccaggg------T---CAAA-CATGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------A----GACAATTT---TTC-TTT-A----T--GGGTAAT----GATGAGGCT-AA----AGG-C-----ATA---A-GAATG--T-----------GTGGCT-T---CGA---GTA----C-CG-A-ACTGTGTT-AC-A-G--T-AGA-AACAG-AAAA-----AG--A---G-GG-AGTGG---G--G--T-G---TTAAACA-TATGgtgtggcttcgagtaccgaactgtgttacagtagaaacagaaaaagagggagtggggtgttaaacatatg
gi|30 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccagggagcaaaattctcatcttaggaatcactaggagtatattctcaaaagaataatgataatatgacgatttttactcaaatttgctctcaacttcatttaacaatcgattaaagatattcAA-CACGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------AT--AGACATTTT---TTC-TTC-T----T--GCGTAGT----GACACACCT-AA----AG-------------------CG--GTA-C-------ATGATT-TCGACGA---GGG----C-CG-A-ACA-----------------------AG-AAAAC----GG--A---G-GG-AGG-G---G--G--T-G---TTAA
gi|31 : ctTT-CT-CAA-CAATAC-TA-----CT-------TTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--AG--A-AAAA-TG--TTA---CT---AT-CTTA-----A-A----GAT--T---T-T---CA-C-TCTG--ATTTG--CTTAAC-TT-CAA-----T-------T---A--A-CA-ATTAAA---T----
gi|32 : GTAGT----GAGGTA-CT-GA----GGG-CTAT--A-A---A-GAATG--TTA-T-------GTAGCT-T---CGA---AGA----C-CG-A-ACAG---T-AG-------------------AAAC----AG--A---G-GG-AG--G---G--G--T-G---TTAGACA-TGTGAcg
gi|33 : atgttgcttgctataggcataagAT----ATTCT-C-AA--A--AGAAA-AAAA-TG--TTA---GT---AT-ATTA-----A-A----GAA--T---T-TATATA-C-TCTA--CTGTG--CTTAAT-TT-C-A-----T-----------------------------------AA-ATCTTCTC----------------------------------------------------T-TC---A-A--TTGGCACCTT---TT-------------------TTC-CCTA-T--G--------------------------CG-TACTGACGtga
gi|34 : AAA-CACGATTTGTTT----GTACTAT--TTTTAAAATTAT--GGCCACTTT---TTC-TTC-A----T--GCGTAGT----GACGTAGCT-AA----AAT-A-----A-A---A-GAATG--CTA-T-------GTTCCT-T---CGA---GGA----C-CA-A-ACAG---T-
gi|35 : ctaAACAAAATT-CT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GTTGTAAAGAATC-GTTA-GGAGAA-------------AA--T--AG--A-AAAA-TT--TTA---
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gi|37 : ttatgtacaaacataccaggg------T---CAAA-CACGATTTGT--------G-TAT--TTT-------ACG-AGGCACTTC---TTC-TTT-A----T--GCATTGT----GACGTGGCT-AA----AGG-C-----A-A---A-GAATT--TTA-C-------GCAGCT-T---TGA---GAG----C-CG-A-Ac
gi|38 : aaatactcTTCT-C-AA--A--AG--C-AAAA-TC--TTA----T----T-TATA-----A-A----GAT--T---T-T---TC-C-TCTT--ATTAG--CTTAAC-TT-C-AT----T-------T---A--A-CA-ATGGAA---T----AGAtg
gi|39 : ggagcaaatttctaaacaaaattgaat--AGACAATTT---TTC-TTT-A----T--GGGTAGT----GATGAGGCT-AA----AGG-C-----A-A---A-A------------------------------GA---GTA----C-CG-A-ACAG---T-AG-A-A---------ACAG-AAAAC----AG--A---G-GG-A---GTGGG--G--T-G---TTAAACA-TATGA
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gi|4 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaACTCT---TTC-CCT-A----T--GCGTACT----GCCGTTTCTGAA----AGA-C-----T-A---A-AAATG--ATA-T-------GCGtttccctatgcgtactgccgtttctgaaagactaaaaatgatatgcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggcttcgagggccgatcagtagaaaaatgaatagaaaagggaggtaggggtgttaaacatgtga
gi|4 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaaaaaatgtcaacaatattactgtgtaaagaattattaagagtatattttcaaaaaaaagattttacactaatttgtttaacttcattttatttcaattaaacagaaatat-------GCGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-TCAG---T-AGAA-A--A-ATG-AATAG-AAAAG----GG--A---G-GT-AG--G---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggcttcgagggccgatcagtagaaaaatgaatagaaaagggaggtaggggtgttaaacatgtga
gi|40 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaaaaaatgtcaacaatattactgtgtaaagaattattaagagtatattttcaaaaaaaagattttacactaatttgtttaacttcattttatttcaattaaacagaaatatactctttccctatgcgtactgccgtttctgaaagactaaaaatgatatgcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACT----GGCGTGGCT-GA----AGG-C-----T-A---A-AAATG--TTA-T-------GTGGCT-T---CGA---CGG----C-CG-A-TCAG---T-AGAA-A--T-ATG-AATAG-AAAAC----AG--A---G-GG-A---G---G--GA-T-G---TTAAACA-TGTGA
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gi|44 : gaTGTTT----CTG-TAT--TTTC------AA--AGGCACTTA---TT---TT-A----T--GTGTACT----GGCATGGAT-GA----AGA-CT----A-G---A-GAATG--TTA-T-------GTAGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACatagataaaaaaaat
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gi|47 : AG-CAAAAT-T------CT-------GTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATT-----AA--A--AG----AAAA-TGTTTTA---AT---AT-T-TG-----A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TATG--ATT
gi|48 : a-A---A-GAATG--TTA-T-------GTGCTT-T---CAA---TGA----C-CG-A-ACAA---T-AGAA-A--T-ACA-AAGAG-AAAAC----GA--A---G-GG-AGCGG---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAg
gi|49 : AATT-CT-CAA-CAATAC-TA-----CTCAGTACTGTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--t
gi|5 : AGCAAAATT-TT-CAG-CAACGT-TA-----CT-------G-TGTAAAAAA-C-AT----AACTGT----A-TCT-C-AA--A--AG----AAAA-TG---------T---AT-CAT------A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TT----ATTTG--CTTAAC-TT-C-ATC---T-------T---A--A-CA-ATTGAA---T----taatctatattttcttaaag
gi|5 : gacgtcaccagacaccgtaaattttcgtagtttaatatgtaaaatgtcaggg--TTT-------AT--AGGC-CTCT---TT--TCT-AAGATC--GCGTTCT----GATATGTCC-GATCACATG-C-----T-A---T-AAATG--TTATC-------GCGGCT-T----GT---GAC----C-CA-A-AC-----T-GA-A-A--T-ATG-A-CAG-GAAAC----GG--A---G-GG-A---G---G--G--T-----TTAAACATTGTGAttataggcctcttttctaagatcgcgttctgatatgtccgatcacatgctataaatgttatcgcggcttgtgacccaaactgaaatatgacaggaaacggagggagggtttaaacattgtga
gi|50 : gacgtcaccagacaccgtaaattttcgtagtttaatatgtaaaatgtcagggagcaaaattttcagcaacgttactgtgtaaaaaacataactgtatctcaaaagaaaatgtatcataagatttttacttatttgcttaacttcatcttaacaattgaaG--TTA-C-------ATTGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACAA---T-AGAA-A--T-ATG-AACAG-AAAAC----GG--A---GAGA-A---G---G--G--T-G---TTAAACA-
gi|51 : acatagctaacc---TTC-TCT-A----T--GCGTACT----GACGTGGTT-AA----A------------------AATG--TTA-T-------GCGCCT-T---C
gi|52 : aatatgaacgttgttttctacaataaaaagtgAGCAAAATT-CT-CAA-CAGCAT-T-----------------------GAATT-ATTA-G-AGCAT----ATTAT-C-TA--A--AG--C-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----Ga
gi|53 : tcaggg-------AT--AGGCACTTT---TTC-T-------------------------GTGGCT-AA----AGG-C-----T-A---A-AATTG--TTA-T-------GCATCTGTG--CAA---GGG----C-TG-A-ACAG---T-A
gi|54 : tcaT----GACGTGGCT-AA----A-------------------ATG--TTA-T-------GCGTCT-T---CAA---GGG----C-AG-A-ACAG---T-AG-A-AG-T-ATG-AATAG-AAAA
gi|55 : GGCT-----CGA---GGG----A-CG-A-ACAG---T-GG-A-A--TTATG-AACAG-AAAAC----GG--A---G-GG-AG--G---G--G--T-G---TT
gi|56 : G-A-ACAA---T-AG-A-AA-T-ATC-AATAG-AAAAC----GG--A---G-AG-A---GGA-G--G--T-G---TGAAACA-TGTGA
gi|57 : ATG--TTA-T-------GCGTCT-G---CAG---GGG----C-CA-A-ACAG---TAAA-A-A--T-ATG-AATAG-AAa
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|17 : aaagtaaaatgttgatattacaaagatttctactataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAT---TTATAGAGTAT----ATTTT-C-AA--A--AG--ACAAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----GAT--G---T-A---TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAAA-TT-C-A-----T-------T---T--A-CA-ATTTAA---T----ATAA-GTCTTCTC----------------------------------------------------T-TC---A-A--TATGCAC--T---TT-------------------TTC-TCTA-T--G--------------------------CG-TACTGACGTGGCTTAAAATGCT--Ataga
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gi|22 : tcataaaggattttatatctaatttgcttaatttgtattcaaagtgaaataggaatcttctcaacacaaaattatgaT--TTT-------GT--AGACACTTT---TTC-TTC-A----T--GCGTAGT----GACGTG--T-TA----ATG-C-----------------G--TGA-C-------GTGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACAA---T-AGAA-A--T-ATC-AATAT-AAAAA----GG--A---G-GG-G---G---G--A--T-G---TAAAACA-TATG
gi|23 : tatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtagacactA---GT---AT-CATG-----G-A----GAT--T---T-T---TA-C-TCTA--ATTTT--CCTAAA-TA-C-A-----T-------T---A--AACA-ATTGAA---T----AGAG-ATATTATCA---A-A-TAC-------GACT-TGT---------T--TGT-G-----TA--C-TT---T-A--TGGACAC--N---NN-------------------NNN-NNNN-N--N--------------------------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNTTA------T---CAAA-TACGACTTGTTT----GTG-TAT--TAT-------AT--GGACAC
gi|24 : AGCAAAATT-CT-CGA-AAATACATA------T-------GTTGAAAAGAATT-GTTA-G-AGTAT----ATTCT-T-AA--G--AG--A-AACA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----GAG--T---T-T---TA-C-TCTA--ATTCG--CTGAAC-TT-T-AT----T-------T---A--A-TA-ATTGAA---T----AGAA-A
gi|25 : cgtatgtaaagttagtatgtagtttttgtacaaatatgccagggGAGTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAAAATG--TTT---AT---AT-AATA-----A-A----GAT--T---T-A---TT-C-TCTATAATTTG--CTTAAA-TC-A-A-----T-------T---T--A-CA-ATTGAA---T----ATAA-ATCTTCTC---------------------T-TGA---------A--TGT-G-----T--------------------AC--T---TT-------------------TTC-TCTC-T--G--------------------------CG-TACTGcc
gi|25 : TG--TTA-T-------GCGTCA-T---CAG---GGG----C-CA-A-ACAG---TAAA-A-A--T-ATG-AATAG-AAttatgcgtcatcaggggccaaacagtaaaaatatgaatagaa
gi|26 : gagtatattctcaaaagaaaaaatgtttatataataaagatttattctctataatttgcttaaatcaatttacaattgaatataaatcttctcttgaatgtgtactttttctctctgcgtacCGCTTTGTTTACAGGTG-TAT--TTT-------AT--AGACACTTT---TTC-TTC-A----T--GCGTAGT----GACGTAGCT-AA----A-G-C-----A--------------TTA-C-------GTGGTT-C---CAA---GGG----C-CA-A-ACAA---T-AGAA-A--T-ATC-AACAG-AAAAC----GG--A---G-GG-AG--G---G--G--T-G---TTAAAC
gi|27 : AA-CACGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------AT--AGACATTTT---TTC-TTC-T----T--GCGTAGT----GACACACCT-AA----AG-------------------CG--GTA-C-------ATGATT-TCGACGA---GGG----C-CG-A-ACAG----------------------AA-AAAAC-----G--A---G-GG-A---G---G--G--T-G---TTAAACA-TGCGA
gi|28 : ctAG-CAAAAT-T------TT-------GTTGTAAAGAATC-ATTA-AGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--AG--A-AAAA-TG---TA---AT---AT-CTTG-----A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TCTG--ATTTG--CTt
gi|29 : agatgtatgtaaactttacgtagcctagtttgccaA-CATGATTTGTTT----GCG-TAA--TTT-------AT--AGGCA-TAT---TTC-TTT-C----T--GCATAGT----GATGTGGCT-----------------A-A---A-GAATG--TTA-T-------GCAGCT-T---CG--------------------AG---T-AA-A-A----ATA-AA----AAAAC----AG--A---G-AG-A---G---G--G--G-GGCATT--ACA-CGTGA
gi|3 : AGCAAAATT-CT-CA-----------------T-------CTT---AGGAATC-ACTA-GGAGTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-ATAA-TG--ATA---AT-------ATG-----A-C----GAT--T---T-T---TA-C-TCAA--ATTTGCTCTCAAC-TT-C-AT----T-------T---A--A-CA-ATCGAT---T----AAAG-ATATTCTCA---A-A-CAT-------GATT-TGT---------T--TGT-G-----TA--T-TT--------TAGACAA--T---TT-------------------TTC-TTTA-T--G--------------------------GG-TAATGATGAGGCTAAAGGCAT-----AAGA-------------A------T---
gi|3 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccaggg------T---CAAA-CATGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------A----GACAATTT---TTC-TTT-A----T--GGGTAAT----GATGAGGCT-AA----AGG-C-----ATA---A-GAATG--T-----------GTGGCT-T---CGA---GTA----C-CG-A-ACTGTGTT-AC-A-G--T-AGA-AACAG-AAAA-----AG--A---G-GG-AGTGG---G--G--T-G---TTAAACA-TATGgtgtggcttcgagtaccgaactgtgttacagtagaaacagaaaaagagggagtggggtgttaaacatatg
gi|30 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccagggagcaaaattctcatcttaggaatcactaggagtatattctcaaaagaataatgataatatgacgatttttactcaaatttgctctcaacttcatttaacaatcgattaaagatattcAA-CACGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------AT--AGACATTTT---TTC-TTC-T----T--GCGTAGT----GACACACCT-AA----AG-------------------CG--GTA-C-------ATGATT-TCGACGA---GGG----C-CG-A-ACA-----------------------AG-AAAAC----GG--A---G-GG-AGG-G---G--G--T-G---TTAA
gi|31 : ctTT-CT-CAA-CAATAC-TA-----CT-------TTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--AG--A-AAAA-TG--TTA---CT---AT-CTTA-----A-A----GAT--T---T-T---CA-C-TCTG--ATTTG--CTTAAC-TT-CAA-----T-------T---A--A-CA-ATTAAA---T----
gi|32 : GTAGT----GAGGTA-CT-GA----GGG-CTAT--A-A---A-GAATG--TTA-T-------GTAGCT-T---CGA---AGA----C-CG-A-ACAG---T-AG-------------------AAAC----AG--A---G-GG-AG--G---G--G--T-G---TTAGACA-TGTGAcg
gi|33 : atgttgcttgctataggcataagAT----ATTCT-C-AA--A--AGAAA-AAAA-TG--TTA---GT---AT-ATTA-----A-A----GAA--T---T-TATATA-C-TCTA--CTGTG--CTTAAT-TT-C-A-----T-----------------------------------AA-ATCTTCTC----------------------------------------------------T-TC---A-A--TTGGCACCTT---TT-------------------TTC-CCTA-T--G--------------------------CG-TACTGACGtga
gi|34 : AAA-CACGATTTGTTT----GTACTAT--TTTTAAAATTAT--GGCCACTTT---TTC-TTC-A----T--GCGTAGT----GACGTAGCT-AA----AAT-A-----A-A---A-GAATG--CTA-T-------GTTCCT-T---CGA---GGA----C-CA-A-ACAG---T-
gi|35 : ctaAACAAAATT-CT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GTTGTAAAGAATC-GTTA-GGAGAA-------------AA--T--AG--A-AAAA-TT--TTA---
gi|36 : cagggccgtaaactttacgtagttagtgaacaaacatgccaggcgggAG-CAATGG-TG-----TT-------GTTTTAAAGAATT-ATTA-C-AGTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAAA-TC--TTA---CT---AT-CATT-----A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TTTG--ATTTG--C
gi|37 : ttatgtacaaacataccaggg------T---CAAA-CACGATTTGT--------G-TAT--TTT-------ACG-AGGCACTTC---TTC-TTT-A----T--GCATTGT----GACGTGGCT-AA----AGG-C-----A-A---A-GAATT--TTA-C-------GCAGCT-T---TGA---GAG----C-CG-A-Ac
gi|38 : aaatactcTTCT-C-AA--A--AG--C-AAAA-TC--TTA----T----T-TATA-----A-A----GAT--T---T-T---TC-C-TCTT--ATTAG--CTTAAC-TT-C-AT----T-------T---A--A-CA-ATGGAA---T----AGAtg
gi|39 : ggagcaaatttctaaacaaaattgaat--AGACAATTT---TTC-TTT-A----T--GGGTAGT----GATGAGGCT-AA----AGG-C-----A-A---A-A------------------------------GA---GTA----C-CG-A-ACAG---T-AG-A-A---------ACAG-AAAAC----AG--A---G-GG-A---GTGGG--G--T-G---TTAAACA-TATGA
gi|4 : AAAAAT-GT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GT-GTAAAGAATT-ATTA-AGAGTAT----ATTTT-C-AA--A--AA--A-AAGA----------------------------------------T---T-T---TA-C-ACTA--ATTTG--TTTAAC-TT-C-ATT---T-------T---ATTT-CA-ATTAAA---C----AGAA-ATATACTC
gi|4 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaACTCT---TTC-CCT-A----T--GCGTACT----GCCGTTTCTGAA----AGA-C-----T-A---A-AAATG--ATA-T-------GCGtttccctatgcgtactgccgtttctgaaagactaaaaatgatatgcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggcttcgagggccgatcagtagaaaaatgaatagaaaagggaggtaggggtgttaaacatgtga
gi|4 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaaaaaatgtcaacaatattactgtgtaaagaattattaagagtatattttcaaaaaaaagattttacactaatttgtttaacttcattttatttcaattaaacagaaatat-------GCGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-TCAG---T-AGAA-A--A-ATG-AATAG-AAAAG----GG--A---G-GT-AG--G---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggcttcgagggccgatcagtagaaaaatgaatagaaaagggaggtaggggtgttaaacatgtga
gi|40 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaaaaaatgtcaacaatattactgtgtaaagaattattaagagtatattttcaaaaaaaagattttacactaatttgtttaacttcattttatttcaattaaacagaaatatactctttccctatgcgtactgccgtttctgaaagactaaaaatgatatgcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACT----GGCGTGGCT-GA----AGG-C-----T-A---A-AAATG--TTA-T-------GTGGCT-T---CGA---CGG----C-CG-A-TCAG---T-AGAA-A--T-ATG-AATAG-AAAAC----AG--A---G-GG-A---G---G--GA-T-G---TTAAACA-TGTGA
gi|41 : AG-CAAAAT-T------CT-------GTTTTAAAGAATA-ATTA-GGACTAT----ATTCT-T-AA--A--AG--G-AAA
gi|42 : cgtacgtaaactttacgtagcctagtttgtatacaaacaagcca--TTT-------AT--AGACACTTT---TTC-TTG-A----T--GCGTACT----GACGTAGCT-AA----AG-------------------CG--TCA-C-------GTGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACAG---T-AG-A-A--
gi|43 : aataaaaacaaattttaGCAAAGTATT-ATCA-GC-GTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAAA-TA--TTA---GT---AT-CAAA-----A-A----GAT--T---T-TTA-TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAAat
gi|44 : gaTGTTT----CTG-TAT--TTTC------AA--AGGCACTTA---TT---TT-A----T--GTGTACT----GGCATGGAT-GA----AGA-CT----A-G---A-GAATG--TTA-T-------GTAGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACatagataaaaaaaat
gi|45 : tg-----A-A---A-AAATG--TTA-T-------GGGGCT-T---CAA---GGG----C-TG-A-ACAG---T-AA-A-A--T-ATG-AATAG-AAAACG---GG--A---G-AG-A---G---G--G--G-G---TTAA
gi|46 : ctAGTAAAACT-CT-CAA-CAATAT-TA-------------------------------------TAT-----TTCT-C-AA--AG-AG--A-AAAA-TG--TCG---AT---AT-CATA-----A-A----TAT--T---T-T---TA-C-TCTT--ATTAG--CTTAAC-TT-C-A-----T-------ttgaaagacctgtgat
gi|47 : AG-CAAAAT-T------CT-------GTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATT-----AA--A--AG----AAAA-TGTTTTA---AT---AT-T-TG-----A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TATG--ATT
gi|48 : a-A---A-GAATG--TTA-T-------GTGCTT-T---CAA---TGA----C-CG-A-ACAA---T-AGAA-A--T-ACA-AAGAG-AAAAC----GA--A---G-GG-AGCGG---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAg
gi|49 : AATT-CT-CAA-CAATAC-TA-----CTCAGTACTGTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--t
gi|5 : AGCAAAATT-TT-CAG-CAACGT-TA-----CT-------G-TGTAAAAAA-C-AT----AACTGT----A-TCT-C-AA--A--AG----AAAA-TG---------T---AT-CAT------A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TT----ATTTG--CTTAAC-TT-C-ATC---T-------T---A--A-CA-ATTGAA---T----taatctatattttcttaaag
gi|5 : gacgtcaccagacaccgtaaattttcgtagtttaatatgtaaaatgtcaggg--TTT-------AT--AGGC-CTCT---TT--TCT-AAGATC--GCGTTCT----GATATGTCC-GATCACATG-C-----T-A---T-AAATG--TTATC-------GCGGCT-T----GT---GAC----C-CA-A-AC-----T-GA-A-A--T-ATG-A-CAG-GAAAC----GG--A---G-GG-A---G---G--G--T-----TTAAACATTGTGAttataggcctcttttctaagatcgcgttctgatatgtccgatcacatgctataaatgttatcgcggcttgtgacccaaactgaaatatgacaggaaacggagggagggtttaaacattgtga
gi|50 : gacgtcaccagacaccgtaaattttcgtagtttaatatgtaaaatgtcagggagcaaaattttcagcaacgttactgtgtaaaaaacataactgtatctcaaaagaaaatgtatcataagatttttacttatttgcttaacttcatcttaacaattgaaG--TTA-C-------ATTGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACAA---T-AGAA-A--T-ATG-AACAG-AAAAC----GG--A---GAGA-A---G---G--G--T-G---TTAAACA-
gi|51 : acatagctaacc---TTC-TCT-A----T--GCGTACT----GACGTGGTT-AA----A------------------AATG--TTA-T-------GCGCCT-T---C
gi|52 : aatatgaacgttgttttctacaataaaaagtgAGCAAAATT-CT-CAA-CAGCAT-T-----------------------GAATT-ATTA-G-AGCAT----ATTAT-C-TA--A--AG--C-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----Ga
gi|53 : tcaggg-------AT--AGGCACTTT---TTC-T-------------------------GTGGCT-AA----AGG-C-----T-A---A-AATTG--TTA-T-------GCATCTGTG--CAA---GGG----C-TG-A-ACAG---T-A
gi|54 : tcaT----GACGTGGCT-AA----A-------------------ATG--TTA-T-------GCGTCT-T---CAA---GGG----C-AG-A-ACAG---T-AG-A-AG-T-ATG-AATAG-AAAA
gi|55 : GGCT-----CGA---GGG----A-CG-A-ACAG---T-GG-A-A--TTATG-AACAG-AAAAC----GG--A---G-GG-AG--G---G--G--T-G---TT
gi|56 : G-A-ACAA---T-AG-A-AA-T-ATC-AATAG-AAAAC----GG--A---G-AG-A---GGA-G--G--T-G---TGAAACA-TGTGA
gi|57 : ATG--TTA-T-------GCGTCT-G---CAG---GGG----C-CA-A-ACAG---TAAA-A-A--T-ATG-AATAG-AAa
gi|58 : ac---T-T---TA-C-TCTG--ATTTG--CTTAAC-TT-C-AT----T-------T---A--G-CA-ATTGAA---T----AGAT-AT
gi|6 : AGCAAAATT-CT-CAA-CAGTAT-TATAGTACT-------GTTGTGAAAAACCCATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AT--A--AG--A-AAAA-TG-------------------------A-A----GAT--T---T-T---TA-C-ACAA--A--GN--NNNNNN-NN-N-N-----N-------N---N--N-NN-NNNNNN---N----NNNN-NNNNNNNNN---N-N-NNN-------NNNN-NNN---------N--NNN-N-----NN--N-NN---N-N--NNNNNNN--N---NN-------------------NNN-NNNA-T--G--------------------------TG-TAGTGAC-CGGCTAAGGGC-----AAAAGA-------------A------T---a
gi|6 : gg-A----T--GTGTAGT----GAC-CGGCT-AA----GGG-C-----A-A---AAGAATG--TTA-C-------GCGGCT-C---CAA---GGG----C-TG-A-ACAG---T-AGAA-A--T-ATG-AATAG-AAAAC----GGGAA---G-AG-G---G---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAgttacgcggctccaagggctgaacagtagaaatatgaatagaaaacgggaagagggggtgttaaacatgtgat
gi|61 : ggagcaaaattctcaacagtattatagtactgttgtgaaaaacccattaggagtatattcttataagaaaaatgaagatttttacacaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ACAG---T-AG-A-A--t
gi|7 : tAGCAAAATT-CT-CAT-CAGCAT-T-----------------------GAATT-ATTA-G-AGTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAA--TG--TTA---AT---AT-CATATTTTAA-A----AACGAT---T-T---TA-C-TCTC--ATTTG--CT----------------------------A--A-CA-ATGGAA---T----AGAA-ATTTTCTCA---A-AACAC--------ACT-TGT---------T--TGT-G-----TAT-T-TT---T-A--TAGGCCC--T---TT-------------------TTCTTTTA-T--G--------------------------TG-TAATGGCGTGGCTGAAGG--CT---AAAGA-------------A------T---ata
gi|7 : cagtgT-C-A-----T-------C---A--G-CA--TTGAA---TTATTAGAGTATATTCTCA---A-A--AG-------AAAA-TGT---------TAATATCA-----TA--T-TT---T-A--AAAACGA--T---TT-------------------TAC-TCT--------------------------------CA-T-------TTGCTAA---CAATGGAATAGA-------------AATTTTCT---CAAAACAC-ACTTGTTT----GTG-TAT--TTTT------AT--AGGCCCTTT---TTC-TTTTA----T--GTGTAAT----GGCGTGGCT-GA----AGG-CT----A-A---A-GAATG--T-A-T-------GCAGCC-T---CAA---AAG----A-TG-A-A-AA---T-GG-A-A--TTGTG-AACAG-AAAAC----AG--A---G-GG-AG--G---G--G--T-G---CTCAACA-TGTGgtatgcagcctcaaaagatgaaaatggaattgtgaacagaaaacagagggaggggtgctcaacatgtg
gi|8 : cagtgagcaaaattcAGCAGAATT-CT-CAA-CAATAT-T-----------------------GAAT-------------------TTCT-C-AACAAC-AA--A-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----G-T--T---T-T---CA-C-TCTA--GTTAG--CTTATC-TT-C-A-----TATACATGT---A--A-CA-ATGGAA---T----AGAACATA-TCTCA---A-A-AAC-------AATT-TG-------------TGT-A-----T---T-TT---T-A--TAGGCAC--T---TT-------------------TTC-TTTA-
gi|8 : ------T---CAAA-AACAATTTGT------GTA-T-T--TTT-------AT--AGGCACTTT---TTC-TTT-A----N--NNNNNNN----NNNNNNNNN-NN----NNN-N-----N-N---N-NNNNN--NNN-NNNNNNNTGTGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A-ATGG---T-AGTA-A--T-CTG-AATAG-GAAAC----GG--A---G-GGAA---G---G--G--T-G---TTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtggcttcgagggccgaatggtagtaatctgaataggaaacggagggaagggtgttcaacttt
gi|9 : agcagaattctcaacaatattgaatttctcaacaacaaaaaaatgttaatatcataaagttttcactctagttagcttatcttcatatacatgtaacaatggaatagaacatatcAAATT-CT-CAAACAATAT-TA-----TT-------GTTGTAAAAAATT-ATTA-G-----------TTCT-CCAA--A--AG--A-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CCTA-----A-A----G----TGAGT-T---TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAAC-TT-C-AT----T-------T---G--A-CA-ATTGAA---T----AGTA-ACGTT---A---A------------------TCT---------T--T---------TC--T-TT---T-A--TAGACAC--T---TT-------------------TCT-TTAA-T--GT-------------------------TGTTTTTGACATGAGTAAACGC-CT--AAAGGA-------------A------T---ttt
gi|9 : T--TTT-------AT--AGACACTTT---T-C-TTT-A-------ATGTTGTTTTTGACATGAGT-AA----ACG-CCTA--A-A---G-GAATG--TTA-T-------GCGGCC-T---CGATGTGGG----A--A-A-ACAG---T-AG-A-AA-T-GTG-AATAG-AAAAC----TG--A---G-AG-A---G---G--G--T-G---TTAAACA-gttatgcggcctcgatgtgggaaaacagtagaaatgtgaatagaaaactgagagagggtgttaaacat
blockSeqs : A T A A ACTCAGTACTGTTGT TT T G TATA T C CA CG AAA A TT ATT GCG T TTTTT C AAAC GA GAG A ATA A A TA CT A G A TGCAT ATACATG TAAA A C AAT TATT T G ATAGAACACATATAGAGATATATAGAGAGAGATAGAGAGAGTTA T TTAT TT CT TTA TCTCTTAAGCGGACTCTTT T T AG TATTTCATAGACACGATTTGTTTATG T C A CAATGG NNNNNNNNNNNTT ATTTTC TCT A ACAG C GT TAAAATT TT ATT T T AGAT AG C TTTT G TCAC GGCTATCTAA TT NNNNNNNT CGA TGT TTTC A TGT A AATTT A A AAGA GA GCT A T GTG TGG GA GC G GCA T
blockSeqs : . . . . ATAGTACTGTTGT TT . G . . . C G AC . . CTA AC . TTTTA . . . A . TA . . . . . . . TT . ATT . . . . C A AAAAGAAAATGTTAATATCATA . TA . . . . T . . T . G A TGCT . . . . . . . TAT G . . . A . G . . . GGCTATAAAG . TC CGA . . . . A AATT . . G . . . A GCG GA . A . . .
blockSeqs : . . . . ACTGCTGT CC . A . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . A . . . . . A AACACAAAATTATGATGTGTA . T . . . . . . . . . G A NNNN . . . . . . . C . . . . T . C . . . CGCCTAAAGG . T G . . . . . AAAT . . . . . . . AG . . . . . .
blockSeqs : . . . . ACTTTTGT C . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . C AAAACACACTTGTTTGTGTAT . T . . . . . . . . . C G CAT . . . . . . . T . . . . . . C . . . GGCTAAAAG . C . . . . . . AGAT . . . . . . . GG . . . . . .
blockSeqs : . . . . ACTGTTGT T . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . C GAACACAATTTGTTTGTGTA . A . . . . . . . . . C G CCT . . . . . . . . . . . . . . A . . . GGATAAAG . T . . . . . . ACAT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . GTTGTTTT T . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . A AAACACAAATTTTGTGTATG . A . . . . . . . . . C G AT . . . . . . . . . . . . . . C . . . GGCAAAAG . T . . . . . . AAAT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . ATTGTTGT A . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . C AAATACGACTTGTTTGTGTA . C . . . . . . . . . G G CT . . . . . . . . . . . . . . G . . . GGCTAAAG . C . . . . . . AAAT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . ATGTTGA T . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . T AAACATGATTTGTTTGTGTA . T . . . . . . . . . A G CT . . . . . . . . . . . . . . T . . . GGCATAAG . T . . . . . . AAAT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTGTTGT C . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . A . . . . . . . . . C A C . . . . . . . . . . . . . . A . . . GACTAGAG . T . . . . . . AAAT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . ACTGTGT C . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . C AACACGATTTGTTTGTGTA . G . . . . . . . . . G N C . . . . . . . . . . . . . . C . . . GGCAAAAG . T . . . . . . AAAT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . CTGTTTT C . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A AATGGTTTGTTTGTGTA . T . . . . . . . . . N G C . . . . . . . . . . . . . . G . . . GGCTAAAG . T . . . . . . AAAA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CTGTTGT C . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C AAAAACAATTTGTGTAT . A . . . . . . . . . C G . . . . . . . . . . . . . G . . . ATAAAAG . T . . . . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . ACTGTGT T . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A TTGAATGTGT . N . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . G . . . GGCAAAG . T . . . . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GCATTG T . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C AATCTTTTC . T . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . G . . . GGCAAAA . C . . . . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TTGT A . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . GACTAAA . T . . . . . . AAGT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TCTT T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . N . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . GGCTAAA . C . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A C . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . TGCTATA . C . . . . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . GGCTAAA . T . . . . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . T . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . .
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1563 ) : AGCAAAATT-CT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----GAT--T---T-T---TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAAC-TT-C-A-----T-------T---A--A-CA-ATTGAA---T----AGAA-ATNTTCTCA---A-A-CAC-------GATT-TGT---------T--TGT-G-----TA-T--TT---T-AT--AGGCAC--T---TT-------------------TTC-TTT-A-T--G-CG-TANTGACGTGGCT--AAA-GG--CT-AAAAGA---------------A------T---CAAA-CACGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------AT--AGGCACTTT---TTCTTT-A----T--GCGTAGT----GACGTGGCT-AA----AGG--C-T--A---AA-G-A-ATG------------------------TTA-C------GCGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ACAGTAGAA-ATAT-GAATAG-AAAAC----G-G--A---G-G-G-A---G---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGA
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gi|12 : aaaa-A-ATT------------------------TGA-T------GCGACT-T---CCA---GAA----T-CG-A--------ACA-TAGAA-ATATGGAGTA--AAAAC----GAG--A---A-GTG-A---G---G--gca
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gi|15 : gacgtacgtaaaatttacgtagtttctgaaa-------AT--AGGCACTTT---TTCTCT-A----T--GCATACT----GACGTTGCT-AA----A------------------A-ATGTT----------------------TTA-T------GCATTT-T---TAA---GGG----C-CC-A--------ACaatgttttatgcatttttaagggcccaac
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gi|17 : aaagtaaaatgttgatattacaaagatttctactataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAT---TTATAGAGTAT----ATTTT-C-AA--A--AG--ACAAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----GAT--G---T-A---TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAAA-TT-C-A-----T-------T---T--A-CA-ATTTAA---T----ATAA-GTCTTCTC---------------------------------------------------T--TC---A-AT--ATGCAC--T---TT-------------------TTC-TCT-A-T--G-CG-TACTGACGTGGCTTAAAA-TG--CT-Ataga
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gi|20 : gggT--TTA-------AT--AGCCACTTT---TTCTCT-A----T--GCGTACT----GACACGGCT-AA----A--------------------ATG------------------------TTA-T------GTGTCT-T---TAA---GGG----T-CG-A--------ACAGTAGAA-ATAT-GAATAG-AAAAC----G-G--A---G-G-G-A---G---G--G--atgttatgtgtctttaagggtcgaacagtagaaatatgaatagaaaacggagggaggg
gi|21 : gggagcaaatttctcaaaaatattgaataattagagtatataatgttaatatgataaagatttaagctctaatttgcttaacttcattcacaatttaccagaaattttctcT-CATA-----A-A----GGA--T---T-T---TA-TATCTA--ATTTG--CTTAAT-TTGT-A-----T-------T---C--A-AA-GTGAAA---T----AGGA-ATCTTCTCA---ACA-CAA-------AATTATG----------A--TGT-G-----TA-T--TT---G-GA--AGGCAC--TTTATT-------------------TTC-TTT-A-TAGG-CA-TAGTG-C-TGGC---AAA-GA---T-AAA
gi|21 : T----GTG-TAT--TTG-------GA--AGGCACTTTATTTTCTTT-A----TAGGCATAGT----G-C-TGGC--AA----AGA----T--A---AA------TG------------------------TTA-T------GTGGCT-T---TAA---GGG------CG-A--------A-AGTAGAA-ATG--AAATAG--AAAC----G-G--A---A-A-ATG---G---G--G--T-A---TTAAACA-tgttatgtggctttaagggcgaaagtagaaatgaaatagaaacggaaaatggggtattaaaca
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gi|30 : aacatatgttaaacttgcataggttgtgcacaacatgccagggagcaaaattctcatcttaggaatcactaggagtatattctcaaaagaataatgataatatgacgatttttactcaaatttgctctcaacttcatttaacaatcgattaaagatattcAA-CACGATTTGTTT----GTG-TAT--TTT-------AT--AGACATTTT---TTCTTC-T----T--GCGTAGT----GACACACCT-AA----AG--------------------CG------------------------GTA-C------ATGATT-TCGACGA---GGG----C-CG-A--------ACA----------------AG-AAAAC----G-G--A---G-G-G-AGG-G---G--G--T-G---TTAA
gi|31 : ctTT-CT-CAA-CAATAC-TA-----CT-------TTTGTAAAGAATC-ATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AA--A--AG--A-AAAA-TG--TTA---CT---AT-CTTA-----A-A----GAT--T---T-T---CA-C-TCTG--ATTTG--CTTAAC-TT-CAA-----T-------T---A--A-CA-ATTAAA---T----
gi|32 : GTAGT----GAGGTA-CT-GA----GGG--C-T--ATA-AA-G-A-ATG------------------------TTA-T------GTAGCT-T---CGA---AGA----C-CG-A--------ACAGTAG----------------AAAC----A-G--A---G-G-G-AG--G---G--G--T-G---TTAGACA-TGTGAcg
gi|33 : atgttgcttgctataggcataagAT----ATTCT-C-AA--A--AGAAA-AAAA-TG--TTA---GT---AT-ATTA-----A-A----GAA--T---T-TATATA-C-TCTA--CTGTG--CTTAAT-TT-C-A-----T-----------------------------------AA-ATCTTCTC---------------------------------------------------T--TC---A-AT--TGGCACCTT---TT-------------------TTC-CCT-A-T--G-CG-TACTGACGtga
gi|34 : AAA-CACGATTTGTTT----GTACTAT--TTTTAAAATTAT--GGCCACTTT---TTCTTC-A----T--GCGTAGT----GACGTAGCT-AA----AA-----TA-A---AA-G-A-ATG------------------------CTA-T------GTTCCT-T---CGA---GGA----C-CA-A--------ACAGT
gi|35 : ctaAACAAAATT-CT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GTTGTAAAGAATC-GTTA-GGAGAA-------------AA--T--AG--A-AAAA-TT--TTA---
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gi|37 : ttatgtacaaacataccaggg------T---CAAA-CACGATTTGT--------G-TAT--TTT-------ACG-AGGCACTTC---TTCTTT-A----T--GCATTGT----GACGTGGCT-AA----AGG--C----A---AA-G-A-ATT------------------------TTA-C------GCAGCT-T---TGA---GAG----C-CG-A--------Ac
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gi|39 : ggagcaaatttctaaacaaaattgaat--AGACAATTT---TTCTTT-A----T--GGGTAGT----GATGAGGCT-AA----AGG--C-A--A---AA-G-A-GTA-----------------------------------------------------------C-CG-A--------ACAGTAGAA-ACA-------G-AAAAC----A-G--A---G-G-G-A---GTGGG--G--T-G---TTAAACA-TATGA
gi|4 : AAAAAT-GT-CAA-CAATAT-TA-----CT-------GT-GTAAAGAATT-ATTA-AGAGTAT----ATTTT-C-AA--A--AA--A-AAGA----------------------------------------T---T-T---TA-C-ACTA--ATTTG--TTTAAC-TT-C-ATT---T-------T---ATTT-CA-ATTAAA---C----AGAA-ATATACTC
gi|4 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaACTCT---TTCCCT-A----T--GCGTACT----GCCGTTTCTGAA----AGA--C-TAAA---AATG-ATATGCGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N------GCGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------TCAGTAGAA-AAAT-GAATAG-AAAAG----G-G--A---G-G-T-AG--G---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAtttccctatgcgtactgccgtttctgaaagactaaaaatgatatgcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggcttcgagggccgatcagtagaaaaatgaatagaaaagggaggtaggggtgttaaacatgtga
gi|40 : gacacagacttacgtaagatttgcgtagtttggctaaaaaatgtcaacaatattactgtgtaaagaattattaagagtatattttcaaaaaaaagattttacactaatttgtttaacttcattttatttcaattaaacagaaatatTACT----GGCGTGGCT-GA----AGG--C-T--A---AA---A-ATG------------------------TTA-T------GTGGCT-T---CGA---CGG----C-CG-A--------TCAGTAGAA-ATAT-GAATAG-AAAAC----A-G--A---G-G-G-A---G---G--GA-T-G---TTAAACA-TGTGA
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gi|42 : cgtacgtaaactttacgtagcctagtttgtatacaaacaagcca--TTT-------AT--AGACACTTT---TTCTTG-A----T--GCGTACT----GACGTAGCT-AA----AG--------------------CG------------------------TCA-C------GTGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ACAGTAGAA-AT
gi|43 : aataaaaacaaattttaGCAAAGTATT-ATCA-GC-GTAT----ATTCT-C-AA--A--AG--A-AAAA-TA--TTA---GT---AT-CAAA-----A-A----GAT--T---T-TTA-TA-C-TCTA--ATTTG--CTTAA
gi|44 : gaTGTTT----CTG-TAT--TTTC------AA--AGGCACTTA---TT--TT-A----T--GTGTACT----GGCATGGAT-GA----AGA--C-T--A---GA-G-A-ATG------------------------TTA-T------GTAGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ACatagataaaaaaaat
gi|45 : tg--C-T--A---AA-A-A-ATG------------------------TTA-T------GGGGCT-T---CAA---GGG----C-TG-A--------ACAGTA-AA-ATAT-GAATAG-AAAACG---G-G--A---G-A-G-A---G---G--G--G-G---TTAA
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gi|53 : tcaggg-------AT--AGGCACTTT---TTCT-------------------------GTGGCT-AA----AGG--C-T--A---AA---A-TTG------------------------TTA-T------GCATCTGTG--CAA---GGG----C-TG-A--------ACAGTA
gi|54 : tcaT----GACGTGGCT-AA----A--------------------ATG------------------------TTA-T------GCGTCT-T---CAA---GGG----C-AG-A--------ACAGTAGAA-GTAT-GAATAG-AAAA
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gi|56 : G-A--------ACAATAGAA-ATAT-CAATAG-AAAAC----G-G--A---G-A-G-A---GGA-G--G--T-G---TGAAACA-TGTGA
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gi|6 : AGCAAAATT-CT-CAA-CAGTAT-TATAGTACT-------GTTGTGAAAAACCCATTA-GGAGTAT----ATTCT-T-AT--A--AG--A-AAAA-TG-------------------------A-A----GAT--T---T-T---TA-C-ACAA--A--GN--NNNNNN-NN-N-N-----N-------N---N--N-NN-NNNNNN---N----NNNN-NNNNNNNNN---N-N-NNN-------NNNN-NNN---------N--NNN-N-----NN-N--NN---N-NN--NNNNNN--N---NN-------------------NNN-NNN-A-T--G-TG-TAGTGAC-CGGCT--AAG-GG--C--AAAAGA---------------A------T---a
gi|6 : gg-A----T--GTGTAGT----GAC-CGGCT-AA----GGG--C-A--A---AA-G-A-ATG------------------------TTA-C------GCGGCT-C---CAA---GGG----C-TG-A--------ACAGTAGAA-ATAT-GAATAG-AAAAC----G-GGAA---G-A-G-G---G---G--G--T-G---TTAAACA-TGTGAgttacgcggctccaagggctgaacagtagaaatatgaatagaaaacgggaagagggggtgttaaacatgtgat
gi|61 : ggagcaaaattctcaacagtattatagtactgttgtgaaaaacccattaggagtatattcttataagaaaaatgaagatttttacacaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCT-T---CGA---GGG----C-CG-A--------ACAGTAGAA-ATAt
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gi|8 : cagtgagcaaaattcAGCAGAATT-CT-CAA-CAATAT-T-----------------------GAAT-------------------TTCT-C-AACAAC-AA--A-AAAA-TG--TTA---AT---AT-CATA-----A-A----G-T--T---T-T---CA-C-TCTA--GTTAG--CTTATC-TT-C-A-----TATACATGT---A--A-CA-ATGGAA---T----AGAACATA-TCTCA---A-A-AAC-------AATT-TG-------------TGT-A-----T--T--TT---T-AT--AGGCAC--T---TT-------------------TTC-TTT-A-
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