lowQualScore                  :                                                                                                                                                                          11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
lowQualScore                  :                                           3             1         22                                    44444444444444444444444444444444444        2222222222222         00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                                         222222222                                   11               11   111           33333333            111    111    33333333333333333333       55555    11    22                               11   11     1       333333333333    222222222222  11                   777777777777777777777          2222222222         333333333333                1     1111                                        444444444444444444444444    111111111111111111111111        111  3333333333                      22     111111      4444444444444444444444444444     222222222222222            1111111               2222222                            44444444444444444           22222222       2222                                 2222222222222222222   111                                        1111        11            333333                222                11                 22        22                                     2222222222222222                             111      22222    22222222222        111111   11111  555555555     22222222222222      2222222             22222         555555555555555555555555555555555555555555555555            3                                1      11       222222222                                      111  222  1            333         1     2 1              333333          1  1                4     2       1             55555555555      44      2     333333         2   333333   11                                   11               111      333    222222222       2       4444      1   2    22       
lowQualScore                  :                       4   66 8      3     3             6     3 3 11 3   555 3    555 3    6   3 3 3    33333333333333333333333333333333333   55 3 0000000000000   4   0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111  5  66          9999  4      66   4 8  8        4     4 999999999    3  3     555      3     3 7    33    3  444  6  00   666  3  3  3  11111111  7 3   3 3 888  7 000    33333333333333333333     4 33333    33    44     4  4 8   4  4  777   777  00   00     2  4    111111111111    444444444444  00     66 4   66     111111111111111111111    5  5  9999999999       5 444444444444     5   3    5 1  5  2222        555   66   5     5 66   55 777  444444444444444444444444    999999999999999999999999 0 5    000  2222222222      5   5  5     5  33   5 666666   5  6666666666666666666666666666     000000000000000  5  55  0  4444444 66      55 5  5555555 3  777 0   4    8  66  4   88888888888888888  4 4      22222222  66   9999  3 55 7 55 3    33     888888   3333333333333333333   666 88  55 3      3 1  555 2   88    6 99  0000   4  1 00 4  8   99  111111    4    4 4  5 111 4  4 4     55  55 4  4       4 4  99  4   8 00    888  8888      4 4  66  4 99   4 7777777777777777     2 777  3  4  4 66  8    222   5  11111    22222222222   66   111111   22222  111111111   5 88888888888888  5   6666666   9999999   88888      1  888888888888888888888888888888888888888888888888         5  5     77     77     888   1      5    6 33  99 6 000000000  7777   55     8  8  0     3    3    333  999  0 3    55    000         5     7 0     3        999999  3  2  3 0  5     2          0     0       5          2  44444444444      22      0     777777   4   2 0   999999   88  6        4               6       88 1     4  6    666      111    999999999 4     0       5555      5   3    77       
lowQualScore                  :                       .   .. .      .     .             .     . . .. .   ... .    ... .    .   . . .    ...................................   .. . .............   .   . ....................................................................  .  ..          ....  .      ..   . .  .        .     . .........    .  .     ...      .     . .    ..    .  ...  .  ..   ...  .  .  .  ........  . .   . . ...  . ...    ....................     . .....    ..    ..     .  . .   .  .  ...   ...  ..   ..     .  .    ............    ............  ..     .. .   ..     .....................    .  .  ..........       . ............     .   .    . .  .  ....        ...   ..   .     . ..   .. ...  ........................    ........................ . .    ...  ..........      .   .  .     .  ..   . ......   .  ............................     ...............  .  ..  .  ....... ..      .. .  ....... .  ... .   .    .  ..  .   .................  . .      ........  ..   ....  . .. . .. .    ..     ......   ...................   ... ..  .. .      . .  ... .   ..    . ..  ....   .  . .. .  .   ..  ......    .    . .  . ... .  . .     ..  .. .  .       . .  ..  .   . ..    ...  ....      . .  ..  . ..   . ................     . ...  .  .  . ..  .    ...   .  .....    ...........   ..   ......   .....  .........   . ..............  .   .......   .......   .....      .  ................................................         .  .     ..     ..     ...   .      .    . ..  .. . .........  ....   ..     .  .  .     .    .    ...  ...  . .    ..    ...         .     . .     .        ......  .  .  . .  .     .          .     .       .          .  ...........      ..      .     ......   .   . .   ......   ..  .        .               .       .. .     .  .    ...      ...    ......... .     .       ....      .   .    ..       
lowQualScore                  :                       0   11 0      6     8             1     3 3 22 3   888 3    888 3    7   3 3 3    77777777777777777777777777777777777   00 6 0000000000000   0   7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  0  99          4444  4      11   4 9  9        0     0 999999999    6  6     555      6     6 3    99    6  111  5  11   222  6  6  6  00000000  3 6   6 6 000  3 000    88888888888888888888     0 55555    55    77     0  0 0   4  4  888   888  88   66     0  0    444444444444    222222222222  66     11 4   11     777777777777777777777    0  0  2222222222       0 222222222222     7   0    7 4  7  1111        333   99   0     0 99   11 222  666666666666666666666666    111111111111111111111111 5 0    888  8888888888      0   0  0     0  88   0 000000   0  3333333333333333333333333333     444444444444444  0  44  4  8888888 99      11 0  7777777 1  888 9   4    9  11  4   77777777777777777  4 4      22222222  11   7777  6 00 3 00 6    55     000000   3333333333333333333   444 66  00 6      3 3  888 3   11    7 22  4444   4  1 88 4  9   11  333333    4    4 4  0 000 0  0 0     55  33 0  0       0 0  55  0   0 77    111  5555      0 0  77  0 55   4 7777777777777777     6 222  7  4  4 11  9    222   0  22222    11111111111   99   000000   55555  999999999   0 99999999999999  0   2222222   7777777   77777      4  666666666666666666666666666666666666666666666666         7  1     99     99     333   0      0    7 33  22 7 000000000  5555   88     0  0  8     2    2    222  222  0 2    88    888         0     8 0     2        888888  2  5  2 0  5     5          0     0       5          5  55555555555      55      0     000000   0   5 0   555555   33  7        7               7       33 0     7  7    777      000    333333333 0     0       5555      5   0    55       
consensus                     :             NNNNNATGATNGAT--A-GATTTA-TTTAT-TCCAAATAGGGGCCCTCTT-G-GG-C-ATA---A-TACA---T-ACAT-GAT-T-G-CTGAT-------TAAT--NAATA------TG-TC-AA--TAG--T-T-------------TTA-CAACA-N----------------G--------------TT---------TACAA----------T--------AA-AA--AAAAAAAAAA----AA-AAAAAT--CCA-G-AA-AGTACTGT-GGTTA-TCC-AATGNNACAT-TA-CATGA-GGCATGTT-GATAA-A-CATTGGAAAA-TG-T-GCAAAA-CATA--TT-TT-AC-AAG---G---AT-T-ATA-C-AGAAGT-A---TACA-------TT-----A-T---AAAAA-T-----AGTA--TCTAA-GCTTA-TA-G-ATA-AA-GA---ACA---TAA-CAT--GAGAC-AT-TTTT----------A-ACAT--A-T-------AT--ACTTG--A-ATG--TATTT-T---TA-TGTAATGT-ACC-ACCG-TG-TAT--CAT--A-TGCAAAA-CAGTA---A-AAATTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGCAAA-A-GAT--ACC-ACGGG-A--CGGT-G-CTATCG--GTA-CT--A---C--T----CAATA-TGN--CA-T-G-T--T------ATT-AAAGGA-TGT--A---A--TGTGCA-AAC-AT-AGTCT-TAC-AAG-G-TTA--ATA-CAA-----C----CAAAA--C-C-------AATAG-TA----T--AA---TA-AGA-TATAAT------G--TACATA-AC-AT---G-AGACAT---TCTTT-AACA-TA--AT-ATACCAGTC--TTG--A---TG-T-ATTTTATGT-TG--GT--ACCA-C-CG-T--G-T--A-TCCTAATGCAAG-A-C-AGT--AAA--G---AT--GNT-TAT---T-ACT--T-CACTGT-ATTG---CAAAAA-GATA-C--AC----GGG-ACGGT-G-CT-ATT-GGT--AC--TACT-TCAA-T-AT-GC--C-AT-G-TTGAT--AAG-A-TT-GCAAATG-T-GCA-AA-CAT-AGTTTTTAC-AA----GGTTCA-T-ACC-GA-G--TAC-A---T------------TATAANA-C-TAGTA-GT-A--TA-AGCT---TAG-AT-----AAAA---A-------AAA--AAA--A---AAA-----CA---------TAA-T--A-A---------CT-TGAT---TTATTATAGTTT-GTAGGTA-CCACCGTGT-ATCATAA-TGC--AANAA-AA--CA--AA----A--A---A------TGCTTCACT-GT-AGTGC--AAAAG--ATACC-A-CGGGACGGTG-CTAT-T-GGT--A-C--C-A-A-TTC-AA-CAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATGTC-CACAATTCT-GTCATATGGTTC--ATATTGCCTCTTTTAT-C-AAATTACAAAGGGC-TGCG-AGTATGTCAG-TATTTTCGNAATTGAGTAG-CCATATTCAATTTATTCATGTTATNAGGAC-TAGAAAAAATGTCC-AAAGTGCTTGTTATTATAATANTTTNATTACAANAGTCCT--GTCTAAGTGAGNAATAATTCGGACATTCAAATATT--AGATGAANTTCATCA-C-CAATTTCA-CCAG---A-AG-AANCAATTGGTGCAAAACCTCTTAAATGTCCAGGGTAATTCCCA
Reference ( gi|2 )            :             ACAGTATGATAGAT--A-GATTTA-TTTATGTCCAAATAGGGGCTCTCTT-G-G--C-ATA---A-TACA---T-ACAT-GAT-T-G-CTGAT-------TAAT--CAATA------TG-TC-A---TAG--T-T-------------TTA-CAACA-G----------------C--------------TT---------TACGA----------T--------AA-AA--AAAAAAAAAA----AA-AAAAAT--CCA-G-AA-AGTACTGT-GGTTA-TCC-AAT-TAACAT-TA-CATGA-GGCATGTT-GATAA-A-CATTGGAAAA-TG-T-GCAAAA-CATA--TT-TT-AC-AA----G---AT-T-ATA-C-AGAAGT-A---TACA-------TG-----A-T---AAAAA-TCG---AGTA--TCTAAGGCTTA-TA-G-ATA-AA-GA---ACA---TAA-CAT--GAGAC-AT-TTTT----------A-ACAT--A-T-------AT--ACTTG--A-ATG--TATTT-T---TA-TGTAATGT-ACCTACCG-TG-TA---CAT--A-TGCAAAA-C-GTA---A-AATTTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGCAAA-A-GAT--ACC-ACGGG-A--CGGT-G-CTATTG--GTA-CT--A---C--T----CAATA-TGC--CA-T-G-T--T------ATT-AAAGGA-TGT--A---A--TGTGCA-AAC-AT-AGTCT-TACCAAG-G-TTA--ATA-CAA-----C----CAAAA--C-C-------AATAG-TA----T--AA---TA-AGA-TATAAT------G--TACATA-AC-AT---G-A-ATAT---TCTTT-AACA-TA--AT-ATACCATTC--TT---A---TG-T-ATTTTA-GT-TG--GT--ACCA-CACG-T--G-T--A-TCCTAATGCAAG-A-C-AGT--AAA--G---AT--GCT-TAT---T-ACT--T-CACTGT-ATTG---CAAAAA-GATA-C--AC----GGG-ACGGT-G-CT-ATT-GGT-GAC--TACT-TCAA-T-AT-GC--C-AT-G-TTGAT--AAG-A-TT-GCAAATG-T-GC--AA-CAT-AGTTTTTCC-AA----GGTTCA-T-ACT-GA-G--TAC-A---T------------TATAATA-C-TAGTA-GT-A--TA-AGCT---TAG-AT-----AAAA---A-------AAA--AAA--A---AAA-----CA---------TAA-T--A-A---------CT-TGAT---TT-TTATAGTTT-GTAGGTACCCACCGTGTGATCAATA-TGC--AACAA-AA--CA--AA----A--A---A------TGCTTCACT-GTCAGTGC--AAAAG--ATACC-A-CGGGACGGTGCCTAT-T-GGT--A-C--C-A-A-TTC-AA-CAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATGTT-CACACTCCT-GTCATATGGTTC--ATATTGCCTCGTTTATAC-AAATTACAAAGGGC-T-CA-AGTATGTCAG-TATTTTCACAATTGAGTAGCCCATA-TCAATTTATTCATGTTATCAA-ACATAG-AAAAATGTTCAAAAGTG-TTGTT-TT---ATAATTTCA-TAC-AT-GTTCT--GTCTAAGTGAGTAATAATTTGGACATTCAAATATT--AAATGAATTTCATCA-C-CAATTT-A-CCAG---A-AG-AAACAATT-GTGCAAA--C-CTTAAATGTCTAGGG--ATTCCCA
gi|13                         :                  ATGATTGAT--ATGATTTA-TTT---TCCAAATAGGGGCCCTCTT-G-GG-C-ATA---A-TACA---T-ACAT-GAT-T-G-CTGAA-------TAAT--
gi|19                         : atacaaaacaaatacatatgATAGATTTA-GATTTA-TTTAT-TCCAAATAGGGGCCCTCataaagtttaattaaaataattcaaaatgctttaa
gi|4                          :                       tGAT--A-GATTTA-TTTAT--TCAAATAGGGGCCCTCTG-G-GG-C-ATA---AGTACA---T-A-AT-GAT-TTG-CTGATAA-----TAA----AATA------TGGTC-AA--TAG--T-T-------------TTA-CAACA---------------------------------TG---------TA-AA----------T--------AA-AA--AAAAAAAAAA----ATTAAAAATTTCCA-GGAA-AGTACTGG-TGTT--TTC-AAT-GTACATGTA--ATGA-GGCATGTTTGATAA-A-CATTTGAAAA-TG-T-GCAAA--CATA--TT-TTTAC-AA----GGG-AT-T-ATA-C-AAGAGTTA---TACA-------TT-----A-TT--AAAAA-T-----AGTA--T-TA--GCTTA-TAAG-ACA-AA--A---ACA---TA--CATT-GAGACCAT-TTT-------------ACAT--A-A-------TT--ACTTGGGA-ATG---ATTT-TA--TA-TGTAA------CCACCG-TG-TA---TGCTAA-TGCCAAA-CAGTA---AGAAATTATA-TAT-TTTC-AACT-GT----AGGGCAAA-AAGAT--ACC-ACGGGGA--CAGG-G-C-ATTG--GTAACT--AA--T--T----CAATA-TTG--CA-T---T--T------ATT-AAAG-A-TGT--A---AA-TGTGCA-A-C-AT-AGTCT-TAC-AAG-G-TTG--A-A-TGA-----C----ACAAA--C-C-------AATAG-T-----T--AA---TA-AAT-TA-AAT------G--TACATA-AC-AT---G-AGATAT---TCTTTTAACA-TA--AT-ATACCAGTC--TTG--A---TG-TTATTTTATGT-TG--GTTTACCA-C-CG-T--G-T--A-TCCTAATGCAAG-AAC-AGT--AAA--A---AT--GGC-TAT---TTACT--T-CACTGT-ATTG---CAAAAA-TAC--C--AC----GGGGACGGT-G-CTGATT-GGT--AC--TACT-TCAAAT-ATTGC--C-ATAG-TTGAT--AAG-A-TTTGCAAATG-TTGC--AAACATTAGTTTT-CC-AA----GGTTCA-TTACT-GA-G--TACCA---T------------TATAATA-C-T-GTA-GT-A--TA-AGCT---TAG-AT-----AAAA---A-------AAA--AAA--A---AAAAAAAACA---------TAA-TTAA-A---------CT-TGAT---TTATTA-AGTT--GTAG-TACCACCCGTGT-ATCATAA-TGC--CAAAA-AA--CA--AATAAAA--A---A------TGCTTCACTTGT-AGTGC--AAAAAGAATACCCA-CGG-ACGGTGCTAAT-T-G-T--A-C--C-A-A-CTC-AAACAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATATTCCACAAT-CT-G-CATATGGTTTCAATATTGCCTCTTTTAT-C-AAATTACAAAGGGC-T-TGCAG--TGTCAG-TA
gi|8                          :                        GAT--A-GATTTA-TT-----CCAA-TAGGGGCCCTCTTTG-G--C-ATA---A-TACA---T------GAT-G-G-CTGAT--------AAT--AAATA------TG-TC-AATATAAGTT-T-------------TTA-CAACA-T----------------G--------------TT---------TACAA----------TTTAGTTTTAA-AATGAATAAAAAAA----AA-AAAAAT--CCA-G-AA-G--ACTGT-GGTTA-TC--AATGTACAAT-AA-CATGA-GGCATGTT-GATAA---CATTG-AAAA-TG-TTGTAAA--CATA--TT-TT-AT-AAAAAGG---AT-TGATA---ACAAGT-A---TACA-------TT-----A-T---AAAAAAT-----AGTA--TCTA--GCTTAATA-G-ATA-AA-GA---ACA---TAA-C-T--GAGAC-AT-TTTT----------ACACTA--A-T-------AT--ACTTA--A-ATG--TATTT-T---TG-T---ATGT-AC--ACCG-TG-TAT--CAT--AATGCAAAA-CAGTAC--A-GAATTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AATGCAAA-A-GAT--ACA-CCGGG-A--CGGT-G-CTATT---GTA-CT--ATACT--T----CAATaacgcataatgtaaagtgtgaatggctataattttcgttat
gi|17                         :                        GAT--ATGATTTA-TTTA--TTCAAATAGAGACCCTCTT-G-GGTC-ATA---A-TACA---T-AGAT-GAT-T-G-CTGA--------TAAT--T--TA------TG--------TAG--T-T-------------T
gi|14                         :                       gtAT--A-AATATA-TTTAT-TCCAAATAGGGGC--------------ATA---A-TACAACAT-GCAT-GAT-T-G-CTAA--------TAAT--AAA-A------AG-TC-AACTCAG--T-T-------------CTA-CAACA-gaagaacaaactc
gi|5                          :                           --A-GATTTA-TTTAT-TCCAAATAGGGGC-CTCTG-G-G--C-ATA---A-TACA---T-ACATTGATAT-GTCTGAT-------TAAC--TAA-AGT----TG-TC-AA--TAG--T-T-------------CTA-CAACA-T----------------G--------------TT---------AACAA----------T--------AA-AA--AATAAAAAAA----TA-AAAAAT--CCA-GTAA-AGTACTGT-GTTTA-TC--AATGTAA--T-TA-CAT-A-GGCAT--T-GATAA-AACATTG-AAAA-TGCT-GCAAAA-CATT--TT-TT-AC-AG----ATGTAT-T-ATA-C-AGA-GT-A---TACA-------TT-----A-T---TAAA--T-----AGTAA-TCTA--GCTTA-TA-G-ATATAA-GA---ACA---TAAGCAT--GAGAC-AT-TT--------------ACAT--AAT-------AT--ACTTG--A-ATG--TATTT-T---TG-T---ATGT-ACC-ACCG-TG-TAT--CAT--A-TGCAAAA-CAGTG---A-AGAATATACTATTTTTC-AGCT-GT----AGTGCAAA---GAT--ACC-ACGGG-A--CGGT-G-CTAATT--GTA-C---A---CCTT----CAAT--TAT--CA-TTA-T--T------AT--AAAGGA-TGTTAA---A--TGTGCACAAC-AT-AGTCT-TACAAAG-G-TTACTATA-CAA-----C------AAA--CAC-------AAT-G-TA----T--AA---TA-AGA-TATAAT------G--TACATA-AC-AT---GAA-ATATGTCTCTTA-AACA-TAATAT-ATACCAGTC--TT---A---TGTT-ATTTTATGT-TG--GT--ACC--CCCG-T--G-T--ATTCCTAATGCAAG-A-C-AGTAAAAA--G---AT--GCT-TAT---T-ACTAAT-CACTGT-ATTG---CAAAA---GTA-C--AC----GGG-ACGGT-G-CT-ATT-GGT--AC--TACT-TCAA-T-AT-G---C-AT-G-TTGAT--AA--A-TT--CAAATG-T-GCA-AA-CAT-ATATTTTCC-AA----GGTTCA-T-ACT-GA-G---AC-ATCTT------------TATAATA-C-TACTA-GT-A--TA-GAGT---TAG-ATAAAAAAAAA---A-------AAA--AAA--A---AAA-----CA---------TAA-TA-A-A---------CT-TGAT---TTATTATAGTTTAGTAGGTA-CCACCGTGTATTCATAA-TG-----CAA-AA--CAATAA----A--A---A------TGCTTCACT-GT-AGTGC--AAAAG--ATACC-A-CGGAACGGTGCCTAT-T--GT--A-CATC-A-G-AAC-AA-CAA--AGCATGGC-TA-TTTCGTACATATGTC-TCCACATCT-GTCATATGGTTCATATATTGCCTCTTTTATACAAAATTACAAAGGGC-TGCAGAGTAT-TCAG-TAttgtgtttgttatatatgttgaaagtacatttagaaaa
gi|3                          :                           --A-GATTTA-TTTAT-TCCAAATAGGGGCTCT--T-G-G----ATA---G--ATA---T-ACATAGAT-T-G-CTGATAATATAATAATGTCAATAGAGTTTTA-CA-A---CAA--TGT-------------TTA-CAATA-G----------------TAGTAATAAAATAATTTAAAAAAAAATAAAA----------T--------AAAAA--AAAAAAAAAA----AA-AAAAAT--CCA-G-GA-AG-A-TGTGGGTTA-T----AT-GTACAT-TA--ATGA--GCATGTT-GATAA-A-C-TTGAAAAA-TG-T-GC--AA-CATAATTT-TT-AC-AAG---G---AT-T-ATA-C-AG-AGT-A---TACA-------TT-----ATT---AAAAA-T-----AGTA--TCTAA-GCTTA-TA-G-ATA-AA-GA---A-A---TAA-CAT--GAGACGAT-TTTT----------A-ACATA-A-T-------AT--ACTTG--A-ATG--TAGTT-TAGGTA-TGT----T-AC--ACCG-TG-TATGTCAT--A-T-CAAAA-CAGTA---G-AATTAATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGCAAAGA-GAT--GAC-ACGGG-A--CGGT-G-CTATTG--G-A-CT--A---T--TC---CAATT-GGC--AA-T-G-T--T------AGT-AAAGGATTGCA-A---A--TGTGCA-AAC-A--AGTCT-TAC--AA-G-TTA--ATT-AAA-----------AAGA--C-C-------AATAG-------T--AA---T--AGA-T-TAAT------G--T-CATA-AC-AT---G-A-G-AT---TTTTT-AACA-TA--AT--TA-CAGTC--TTG--A---TG-T-ATTTTATGT-TG--GT--ACC----CG-T--G-CTAA-TCCTAATGCAAG-A---AGTA-AAA--G---AT--GCT-TAT---T-ACT--TCCACTGT-AGTG---C-AAAA-GATACC--AC----GGG-AC--T-A-CTCATT-GGT--AC--TACT-TCAA-T-AT-G---C-AT-T-TTGAT--AAG-A-TT-GCAAATG-T-GCA-AA-CAT-AG--TTTGC-AG----GGTTCATT-ACT-GA-G--TAC-A---T------------TATAAT--C-TAATA-GT-G--TATAGCT---TAG-AT-----AAAA---ATAACAACAAAACAAA--A---AAA-----CAAAAAC----TAATT--A-A---------C--TGAT---GT-TTATAGTTG-GTAGGTA-CCACCG-GT-ATCATAA-TGC--AA-AA-AA--T---AA----A--A---A------TGCTTCAC---TTAGTG----AAAG--ATACC-A-CGGGACGGTGGCTAT-T-GGT--ACC--C-A-G-TTC-AA-CAAT-AACAT-GCTTGTTTTCGTAAAT-TGTC-CACAGTTCTGGTCATAT-GTTC---TATTGCCTCTTTTAT-C-AAATT-TAAAGGGC-TGCA-AGTATGTC-G-TATTTTCGAAATTGAGTAG-CCATATTCAATTTATTCATGTTATAAG-AC-TAG----AATGTC--AAAGTG-TTGTT-TT---ATATTTTAA-TACAAT-G-TCT--GT-TAAGTGAGAGATAATTCGGACATT-AAATATT--AATTGAACTT-ATCATC-CAATGT-ACCCAG---ATAGCAAGCAATaaacgcattacatgtaaagtgtgaatggtatttatttttcctggttt
gi|6                          :                           --A-GATTTA-TTTAT-TCCAAATAGG--CCCTCTT-G-GG-C-ATA---A-TACA---T-ACAT-GAT-T-G--TGAT--------AAT--AAATA------TG-TC-AA--TAG--T-T-------------TAA-CAA---G----------------CG-------------TT---------TACAAATAGTAGTAAT--------AA-AA--TAAAAAAAAATATTAA-AAAAAT--CCA-G-AA-AGTACT-T-GGTTA-TTCGAAT-GTACAG-TA-CATGA-GGCATGGT-GATAA-AACAT-GAAAAA-TG-T-GCAAAC-GATA--TTATT-AC-AA----GG--AA-T-ATA-C-A--AGT-AA--TACA-------TT-----A-T---AAAAA-T-----AGTA--TC--AAGCTTA-TA-G-ATA-AAAGA---ACA---TA--CAT--GA-AC-AT-TTAT----------T-ACAT--A-T-------ATT-ACTTG--ACATG--TATTT------A-TGTA-TGTTACC-ACCGATG-TAT--CAT--AATGCAAAAACAGTA---A-GAATTATA-TATATTTC-A-CT-GT----AGTGCAAA-A-GAT--ACC-ACGAA-A--CGG--G-C-ATTG---TA-CT--A---C--TT---CAATAATGC--CAAT-GGT--T------ATT-AAAGAG-TA---A---A--TGTGCA-AAC-ATCAGTCT-TAC-AAG-G-T-A--ATA-CA------C----CAAAAAAC-C-------AATAGGTA----T--AA---TA-AGA-TATAAT------G--TACATA-AC-ATT--G-AGATAT---TCTTT-AACA-----AT-ATACCAGTC--TTG--A---TG-T-ATTTTA----TGATGT--ACCA-CCTG---------A-TCCTAATGCAAGGA-C-AGT--AAA--A---GTAAGCT-TAT---T-ACT--T-CACTGT-AGTG---CAAAAAAGATA-CCAGC----GGG-ACGGTTG-CT-ATTCGGTTGAC--TACTCTCAA-T-AT-GC--C-AT-GTTTGAT---AG-A-TT-GCAAATG-T-GCAAAA-CAT-AGTTTTCC---A----GGTTCA-T-ACT-GA-G--TAC-A---T------------TATAATA-CGTA-TA-GT-A--TA-AGCT---TAG-ATAAA--AAAA---A-------AAA--AAA--A---AAA-----CAAT-------TAA-TA-A-A---------CT-TGAT---TTATTAT
gi|1                          :                              -GATTTAGTTTAT-TCCAAAAATAGGC-CTCTT-G-G--C-ATAGAAA-TA-A---C-AC-T-GAT-T-G-CTGAT-------TAA----AATT------AG-TC-A---TAG--G-T-------------TTAACAACATG----------------T--------------CC---------TACAA----------T--------AA-AA--AAAACAAAAA----AT-AAAAAT--CCA-G-AACAGTCTCGT-GGT-A-TC--AATCTAGCAT-T--CATGA-G--ATGTT--ATAA-A-CATTG-AAAA-TT-C-ACAACATCATT--CT-TT-ACCAA----G---GA-T-ATAAC-AGA-GT-A---TACA-------TT-----A-TGAAAAAAA-T-----AGTAG-TCTAAG-CTAA-TC-G-ATA-A--GA---AAA---TAA-CAT--G-GAC-ATCTTTT----------T-ACATTAA-T-------AT--ACCTG--A-AGG--TATTT-T----A--GTA-TGT-ACC-AC-G-TGATA---CATTAA-TGCAAAA-C-ATA---A-AGATTATA-T-TGTTTCCA-CTCGCTACGATTGGAAA-A-GATCTACC-ACGGG-AGTCGGT-G-TGAT-G--GT--CTTGA---C--TTTTCCAATA-AGC---A-T-G-TAAT------ATTGAAAGGA-TGT--AGAAA--TG-GCA-AAC-AT-AGACC-TAACAACTG-TTAG-ATA-CAC-----A----CGAAA--C-C-------A-TAG-TA----T--AA---TA-AG--TATAATTAAATAGACTACATATACCATAGAG-AGATAT---TCTTT-AACAATA--AT-ATACCAGCCATTT---A----G-T-ATTTTATGT-TGT-AC--ACCA-C-CG-TTAG-T--A-TCCTAATGCAAG-A-CGAGT--AAAAGG---AT--GCT-TAT---T-ACT--T-CACTGT-ATTGGTGCAAAAA-GATA-CCAAC----GGG-ACGG----CT-ATT-GGT--AC--TACT-TCAA-T-AT-GC--C-AT-G-TTGAT--AA--A-TT-GCAAATG-T-CA--AA-CAT-AGTTGTCGCGAA----GGTTCA-T-ACTAGA-GC-TAC-AA--T------------TATAATAAC-TAGTA-GTTA--TA-AGCT----AG-AT-----AAAA------------AA--AAA--A---AAC-----CA---------TAA-T--A-A---------ATCTGAT---TTATTATAGTTT-GTAGGTATCCACCGTGT-ATCATAA-TGC--AAAAC-AATTTA--AA----A--A---A------TGCTTCACT-GT-AGTGC--AAAAG--ATACC-A-CGGGACGGTG-CTATAT-GGT--A-C--CAA-A-TTCAAA-CAATCAACAT-GC-TATTTTCG-ACATATGTT-C-CAAT-CT-GTCTTG-GGTCC--ATATTGCCTCTGTTAT-C-AAATTACAAAGGGCATGCA-AGTATGTCAGATA-TTTCACAATTGAGTAG-CCATA-TCAATTT-TTCATGTTATCAAGAC-TAGAAAAAATGTTC-AAAGTGCTTGTTATTATAATAATTTCATTAC-AGAGTCCTGGGTCTAAGTGAGTAATAATTTGGACATTCAAATATTTAAGATGAAATTCATCA-CGCAATTTCA-CCAGAGCA-AG-AACAAATT-GTGCAAAACT-CTTAAA-GTC-AGGGTAATTCCC
gi|9                          :                                 tTTA-TTTAT-TCCAAACAGGGGC-CTCTT-GTG--CCATA---A-TA-----T-ACAT-GAT-T-G-CTGAT--------AAT--AAATA------TG-TC-AA--TAG--T-TTTACAACATGCTTTTA-CAATA-GTAGTAATNNNNNNNNNN--------------NN---------NNNNN----------N--------NN-NN--NNNNNNNNNN----NN-NNNNNN--CCATG-AATAGTACTGT-G--TA-GTC-AATGT--CAT-TA-CATGA-G-CATGTT-GATAA-A-ATTTGGAAA---G-T-CCAAAA-TA-----T-TT-AC-AAG---G---AT-T-ATA-C-AGA--T-A---TA-A-------TT-----A-T---AAAAA-T-----AGTA--TCTAAG--TTA-TA-GAATA-AA-GAAAGAC----TAACCATTGAAGAC-AT-TTTT-------------TAT----T-------AT----------------TATCT-T---TA-TAAAATAT----------TT-CA---CAT--A-TGAACAA-C-ACAACTA-AATTT
gi|15                         :                                        TAT-TCCAAATAGGGGCCCTATT-G-GG-C-ATA---A-TACA---T-ACAT-GAC-T-G-CTGATAA-----TAA---CAATA------TG-CCAA---TAG--T-T-------------TTA-CAAGA-T----------------G--------------TT---------TACAA----------T--------Agcac
gi|11                         :                                                            CTT-G-GG-C-ACA---G-TACA---TTACAC-GAT-T-G-TTGAT--------GAT--ACATA------TG----A---TAG--T-T-------------TTA-CAACA-T----------------G--------------TT---------TATAA----------T--------AG-TA--ATACTTAACA----AA-AATCGT--CCA-G-AA-TGTACTGT-GTTTA-AAC-AAG-GAACAT-AA-CATGA-GACATgtaataataatgataa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                             AA----GA-AAATAT--ACA-G-AA-GGTACTGT-AGTTA-TC--AAT-GTACAT-AA-CATGA-GGCATGTT-GATAA-A-CATT-GCAGA-TG-T-GC-AAA-CATAT-TT-TT-AC-AAG---G---AT-T-ATA-C-AG-AGT-A---Tt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           acgatattaataataatttt-GGTTAATCA-GATGTACCAT-TAACATGAAGGCATGTT-GATAA-A-CATTGAAAAATTG-T-GTAAAC-TATT--TT-TA-AC-AA----G---ATGT-ATA-CGAGGCGT-ATCTTATA-------AGAAAAAA-A---AAAAA-T-----AGTACTTCTAA-GCTTA-TA-GAATA-AA-GA---ACATTTTAA-CAT--GAGATAAT-TTTTCCTATCGATGA-ATAT--A-TTGTCCCAATGGACTTG--A-ATGGCTATCTAT---TACTGGTATGT-ACC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAT-TA-CACGA-T---TGTT-GATGATA-CAT------A-TG-----------ATAG-TT-TT-AC-AA----C---ATGT-TTA-T-AATAGTAA---TACT-------TA-----A-C---AAAAA-TCGTCCAGAA--TGTACTGTGTT-TA-A-ACA-AG-GA---ACA---TAA-CAT--GAGAC-AT-Tacaataatcaattactaattgattatagcgcaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cttgggcacagtATGTT-GATAA-A-CATT-GCAAA-TG-T-GC-AAA-CTTAT-TT-TT-AC-AAG---G---AT-T-ATA-C-A-AAGT-A---TATACAATTATTGAAT--A-T---AAAAC-TAGT--AGTA--TCTAA-GCTTA-TA-G-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tGAC-AT-TTTT----------A-ACAT--AAT-------AT--ACTTG--A-ATG--TA----------------------CCACCG-TG-TAT--CCT--AGTGCAA------------------ATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AATGCAAA-A-GA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-A-AAT---CC-AGAAG-A--CTGT-GGTTATCAATGTA-CA--A---T--------AACA-TGAGGCA-T-G-T--TGATAACATT-GAAA-A-TGT-----------TGTA-AAC-AT-ATTTTATAAAAAG-GATTG--ATAACAAGTATACATTATAAAA------------AATAG-TA----TCTAGCT-TA-ATA-GATAAA------G--AACATA-AC--T---G-AGACAT---TTTT---ACACTA--AT-ATAC-------TT---AAA-TG-T-ATTTTT-GT-AT--GT--AC-A-C-CG-T--G-T--A-TCATAATGCAAA-A-C-AGT--ACA--G---A----AT-TATATAT-GTT--T-CACTGT-AATG---CAAAA--GATA-C--ACC---GGG-ACGGT-G-CT-ATT--GT--ACTATACT-TCAA-T-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatagatttattccaataggggccctctttggcataatacatgatggctgataataaatatgtcaatataagtttttacaacatgtttacaatttagttttaaaatgaataaaaaaaaAAA-A-TAT--ACAGAAGGT-A--CTGTAG-TTATCA--ATG--T--A---C--A----TAACA-TGAGGCA-T-G-T--T------GAT-AAACAT-TGC--AG--A--TGTGCA-AAC-AT-ATTTT-TA-CAAG-G-ATT--ATA-CA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acgatattaataataattttaag--CA-T-G-G--T------GAT-AAAACA-TGA--A---AAATGTGCA-AACGAT-ATTAT-TAC-AAG-G-AAT--ATA-CAA-----G----TAATA--C-ATTATAAAAATAG-TA----TC-AAGCTTATAGA-TAAAA-------G--AACATA--C-AT---G-A-ACAT---TTATT-A-CA-TA---T-AT----TAC--TTGACA---TG-T-ATTTAT-GTATG--TT--ACCA-C-CGAT--G-T--A-TCATAATGCAAA-AAC-AGT--AAG--A---AT------TATATAT-ATT--T-CACTGT-AGTG---C-AAAA-GATACC--AC----GAA-ACGG--G-C--ATT--GT--AC--TACT-TCAA-TAAT-GC--CAAT-G-GTTATTAAAG-A----GTAAATG-T-GCA-AA-CATCAG-TCTTAC-AA----GGT-----------A-A--TAC-A---C------------CAAAAAA-C-CAATAGGT-A--TA-A--T---AAG-AT-----ATAATGTA-------CAT--AAC--ATTGAGA-----TATTCTT----TAA-C--A-ATATACCAGTCT-TGATGTATT-TTATGA--T-GTA-----CCACC---TGATCCTAA-TGC--AAGGACAG--TA--AA----AGTA---AGCTTATTACTTCACT-GT-AGTGCAAAAAAG--ATACC-AGCGGGACGGTTGCTAT-TCGGTTGA-C--T---A-CTC-------TCAATAT-GC-CATGTTTGgagtat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agatttatttattccaaataggccctcttgggcataatacatacatgattgtgataataaatatgtcaatagtttaacaagcgtttacaaatagtagtaataaaataaaaaaaaatattaaaaaaatccagaaagtacttggttattcgaatgtacagtacatgaggATAG-TAACCTT--TG---TA-AGACTATGTT------G--TGCA----C-AT---TTA-ACAT---CCTTT-ATAA-TA--ATGATA--ATTG-------AAGGTG-T-AC---A-AT-TA--GC--ACCGTCCCG-T--GGT--A-TCTT--TGCACT-A-C-AGCTGAAA--A---AT--AGTATAT---T--CT--T-CACTGT-TTTG---C-ATAT-GATA-C--AC----GGatagattgcaaatgtgcaaaacatagttttccaggttcatactgagtacattataatacgtatagtataagcttagataaaaaaaaaaaaaaaaaacaattaataaacttgatttattat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agatttatttattccaaataggggcctctgggcataatacatacattgatatgtctgattaactaaagttgtcaatagttctacaacatgttaacaataaaaaataaaaaaataaaaaatccagtaaagtactgtgtttatcaatgtaattacataggcattgataaaacattgaaaatgctgcaaaacattttttacagatgtattatacagagtatacattattaaatagtaatctagcttatagatataagaacataagcatgagacatttacataatatacttgaatgtatttttgtatgtacca-ACAT---T-TTT-AACA-TA--AT-ATAC-----------------------TTGA-AT-----GT--ACCA-C-CG-T--G-T--A-TCCTAGTGCAAA---------------------------TATA--T-GTT--T-CACTGT-AATG---CAAAAacaacaaacacaatgtataataagatataatgtacataacatgaaatatgtctcttaaacataatatataccagtcttatgttattttatgttggtacccccgtgtattcctaatgcaagacagtaaaaagatgcttattactaatcactgtattgcaaaagtacacgggacggtgctattggtactacttcaatatgcatgttgataaattcaaatgtgcaaacatatattttccaaggttcatactgagacatctttataatactactagtatagagttagataaaaaaaaaaaaaaaaaaaacataataaacttgatttattatagtttagtaggtaccaccgtgtattcataatgcaaaacaataaaaatgcttcactgtagtgcaaaagataccacggaacggtgcctattgtacatcagaacaacaaagcatggctatttcgtacatatgtctccacatctgtcatatggttcatatattgcctcttttatacaaaattacaaagggctgcagagtattcagtaaaacgcattacatgtaaagtgtgaatggtatttatttttcctggttt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gCG-T--GGT--A-TTTT--TGCAAT-A-C-AGT--GAA--GTAAAT--AGC-CAT---T---T--T-TACTGTTCTTG---CATTAG-GATA-C--AC----GGga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gatagatttatttattcaaataggggccctctggggcataagtacataatgatttgctgataataaaatatggtcaatagttttacaacatgtaaataaaaaaaaaaaaaaattaaaaatttccaggaaagtactggtgttttcaatgtacatgtaatgaggcatgtttgataaacatttgaaaatgtgcaaacatatttttacaagggattatacaagagttatacattattaaaaatagtattagcttataagacaaaaacatacattgagaccattttacataattacttgggaatgattttatatgtaaccaccgtgtatgctaatgccaaacagtaagaaattatatattttcaactgtagggcaaaaagataccacggggacagggcattggtaactaattcaatattgcatttattaaagatgtaaatgtgcaacatagtcttacaaggttgaatgacacaaaccaatagttaataaattaaatgtacataacatgagatattcttttaacataatataccagtcttgatgttattttatgttggtttaccaG-T--G-T--A-TCTTT-TGCATT-A-C-AGTG-AAA--C---AT--ATA-TAA---T-TCT--G-TACTGT-TTTG---CATTAT-GATA-C--AC----GGgggacggtgctgattggtactacttcaaatattgccatagttgataagatttgcaaatgttgcaaacattagttttccaaggttcattactgagtaccattataatactgtagtataagcttagataaaaaaaaaaaaaaaaaaaacataattaaacttgatttattaagttgtagtaccacccgtgtatcataatgccaaaaaacaaataaaaaatgcttcacttgtagtgcaaaaagaatacccacggacggtgctaattgtaccaactcaaacaatcaacatgctattttcgtacatatattccacaatctgcatatggtttcaatattgcctcttttatcaaattacaaagggcttgcagtgtcagtaaacgcataatgtaaagtgtgaatggctataattttcgttat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gatagatttattccaataggggccctctttggcataatacatgatggctgataataaatatgtcaatataagtttttacaacatgtttacaatttagttttaaaatgaataaaaaaaaaaaaaatccagaagactgtggttatcaatgtacaataacatgaggcatgttgataacattgaaaatgttgtaaacatattttataaaaaggattgataacaagtatacattataaaaaatagtatctagcttaatagataaagaacataactgagacatttttacactaatatacttaaatgtatttttgtatgtaca-ATTT---TAAGAA-AATA-T--ACAGAAGGT-ACTGTAG-TT-ATC-AAT-G----TACA-T-AA-C-AT-GAGGC-AT-G-TTGAT--AAACA-TT-GCAGATG-T-GCA-AA-CAT-A-TTTTTAC-AA----GGATTA-T-ACA-GA-G--TAcgggacggtgctattgtactatacttcaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acgatattaataataAAAAA-AATC-C--AG----AAG-ACTGT-GGTT-ATC-AAT-G----TACA-ATAA-C-AT-GAGGC-AT-G-TTGAT--AAC-A-TT-GAAAATGTT-GTA-AA-CAT-A--TTTTAT-AAAAAGGATTGA-T-AAC-AA-GTATAC-A---T------------TATAAAA----AATA-GT-A--TCTAGCTTAATAG-AT-----AAAG---A-------ACA--TAACTG---AGA-----CATTTTTACACTAA-T--ATA---------CT-TAA----AT-GTAT-TTTT-GTATGTA--CACCGTGT-ATCATAA-TGCAAAACAG-TA--CA--GA----ATTATATA------TGTTTCACT-GT-AATGC--AAAAG--ATACA-C-CGGGACGGTG-CTAT-T--GT--A-C--T-ATACTTC-AA-t
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gatagatttattccaataggggccctctttggcataatacatgatggctgataataaatatgtcaatataagtttttacaacatgtttacaatttagttttaaaatgaataaaaaaa--C-AT-G-TTGAT--AAA-ATTT-GGAAA-G-T-CC--AA-AAT-A---TTTAC-AA----GGATTA-T-ACA-GATA--TA--A---T------------TATAAAA-A-TAGTA--T-C--TA-AGTTA--TAGAAT-----AAAG---A-------AAG--At
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttatttattccaaacaggggcctcttgtgccataatatacatgattgctgataataaatatgtcaatagttttacaacatgcttttacaatagtagtaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccatgaatagtactgtgtagtcaatgtcattacatgag-AT-G-TTGAT--AAACA-TT-GCAAATG-T-GCA-AA-CTT-A-TTTTTAC-AA----GGATTA-T-ACA-AA-G--TAT-A---TACAATTATTGAATATAAAA-C-TAGTA-GT-ATCTA-AGCT---TActaaccattgaagacattttttattattatctttataaaatatttcacatatgaacaacacaactaaatttgcac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tAA-----CA---------TAA-T--ATA---------CT-TGA-----------A---T-GTA-----CCACCGTGT-ATCC-TAGTGC--AA------------AT----A--T---A------TGTTTCACT-GT-AATGC--AAAAG--Ataga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacatttttCT--GTCTGAGTGAGCAATAATTTGGACATTCAAATATT--AGATGAATTTCATCA-C-CAATTTCA-CCAG---A-AG--AACAATTGGTGCAAA--CTCTTAAATGTCCAGGG--ATTTCCA

lowQualScore                  :                                                                                                            222222    11111     11111111111111                   2222222222222             33333333333333333333333333333333     2222222222222222222                1111111                                  111    11                                   1                    111          111            111          1111111111    2222222222                11                                                           222222222222    222222222222                       33333333333                  111   1111               11                 1       1111                                     11111   22222222222222     11     11111111              2222222                                  11     1111                              111111               111    1  111                             1                 1111             111              1          11                              111     111   2222               1       11                                                             22          1   11           111                               22222    444444444444444              22222     22                                                            33333333                           11                                 11       1                                11      22                222               1                1   11             1                1     2                    2   1   2        222      2     2     4444     1   3333  1  11                                   11               1 1            11111  1  1     2       44                 33       
lowQualScore                  :                          1   55 7      3     3      44        1       3 3   888 3 555    3    3   3 3 3    000000  3 11111  3  99999999999999  99999  555  555  1111111111111  44 3 3     77777777777777777777777777777777  0  4444444444444444444    66          0000000     444    8 4  8          3   3 777    99    3  3     3 5    3        7     0    3  3 3  4  55   888  3    3  555    7 3     222 3  3     7777777777  4 8888888888   777  4 55    33  0 0 4    4 4  8   4  4  777   777   8  4 66    4 8  4    777777777777    000000000000  99    55  4   666    44444444444   4   4    4  4  000   4444       4  3  4 00        5   1    0 5  5  0000     5   5    77     5    77   1  8  22222   88888888888888 5   44  7  88888888    6       6 0000000 6      6     6       6 6  777    55     3333   99 6      6         3      999999 99      6  6  888  1 1  111  6       6       99      6  0   6 6           6666      6   99 000  6           3  6   6   88   99 1   6     99 6          111     000   1111  6        6   3   6   55      6  6    6      6   6     6 6         6      6  6   3   00 6        3   22   6  6  6 111     666 6  5    6   6         88888    666666666666666   99         55555   6 22    6      7      0  8       8  8 8   0  8 8           8 0  88888888             8   8         11    8            8 8 8   8 5   8 11 8     6     55     8  8  0     0    0  99   0  44   8 0    0     222               6 8     0        6   77  0     0 0  3    11          3     3       7          1 8   3   3        000      3     3     0000   1 6   6666  2  33  2        1       2       2       33       1  2    0 0      8     88888  0  0     3       77        7  6     00       
lowQualScore                  :                          .   .. .      .     .      ..        .       . .   ... . ...    .    .   . . .    ......  . .....  .  ..............  .....  ...  ...  .............  .. . .     ................................  .  ...................    ..          .......     ...    . .  .          .   . ...    ..    .  .     . .    .        .     .    .  . .  .  ..   ...  .    .  ...    . .     ... .  .     ..........  . ..........   ...  . ..    ..  . . .    . .  .   .  .  ...   ...   .  . ..    . .  .    ............    ............  ..    ..  .   ...    ...........   .   .    .  .  ...   ....       .  .  . ..        .   .    . .  .  ....     .   .    ..     .    ..   .  .  .....   .............. .   ..  .  ........    .       . ....... .      .     .       . .  ...    ..     ....   .. .      .         .      ...... ..      .  .  ...  . .  ...  .       .       ..      .  .   . .           ....      .   .. ...  .           .  .   .   ..   .. .   .     .. .          ...     ...   ....  .        .   .   .   ..      .  .    .      .   .     . .         .      .  .   .   .. .        .   ..   .  .  . ...     ... .  .    .   .         .....    ...............   ..         .....   . ..    .      .      .  .       .  . .   .  . .           . .  ........             .   .         ..    .            . . .   . .   . .. .     .     ..     .  .  .     .    .  ..   .  ..   . .    .     ...               . .     .        .   ..  .     . .  .    ..          .     .       .          . .   .   .        ...      .     .     ....   . .   ....  .  ..  .        .       .       .       ..       .  .    . .      .     .....  .  .     .       ..        .  .     ..       
lowQualScore                  :                          0   55 3      3     1      22        5       1 1   555 1 444    1    1   1 1 1    777777  1 00000  3  66666666666666  66666  888  888  7777777777777  66 6 6     44444444444444444444444444444444  2  0000000000000000000    11          1111111     111    0 0  0          6   6 555    77    6  6     6 1    6        3     3    6  6 6  4  66   555  6    6  000    3 6     000 6  6     5555555555  0 5555555555   000  0 55    55  8 8 0    0 0  0   4  4  888   888   9  4 11    0 0  0    444444444444    000000000000  55    55  0   333    11111111111   0   0    4  4  777   9999       4  9  4 66        0   4    0 0  0  6666     0   0    99     7    99   4  4  44444   11111111111111 7   00  5  88888888    7       7 2222222 7      7     7       7 7  555    88     8888   22 7      7         5      222222 22      7  7  333  0 7  777  7       7       22      7  8   7 7           8888      7   22 888  7           3  7   7   33   22 0   7     22 7          777     888   7777  7        7   3   7   88      7  7    7      7   7     7 7         7      7  7   5   33 7        3   77   7  7  7 777     888 7  2    7   7         33333    555555555555555   22         88888   7 55    7      3      8  0       0  0 0   8  0 0           8 6  22222222             0   0         00    0            0 0 0   0 0   0 00 0     0     88     0  0  8     8    8  00   8  00   0 8    8     888               0 0     8        0   66  8     8 8  3    77          3     7       3          0 7   3   7        777      3     7     0000   0 0   3333  0  88  5        0       0       5       88       0  5    0 0      8     55555  0  8     3       00        3  7     77       
consensus                     :                NNNNNATGATAGAT--A-GATTTA-TTTAT-TCCAAA--TAGGGGCCCTCTTGGG-C-ATA---A-T---ACAT-ACAT-GAT-T-G-CTGAT----TAA-T--A--AA-TA--------------TG-T---CAA--TA---GT-------------TT--T-A-CAACA---T--GT--------------T---------TACAA----------T--------AAAA--AAAAAAAAAA----A--AAAAA-A-TCCA-G-AA-AGTACTGTGG-TTA-TCC-AATGTAACAT-TA-CATGA-GGCATG-TTGATAAA-CATTGGAAAA-TG-T-GCAAAA-CATA--TT-TTAC-AA---GGAT-T-ATACAGAAG-TA-TACAT----------TA-T----------AAA---AA-T--AGTA--TCTAAG-CTTA-T-AG-ATA-AA-GA---ACA---TAA-CA-T--GAGA-C-AT-TTTT----------A-ACAT--A-T-------AT--ACTT--GA-ATG--TATTT-T-TA-TGTAATGT-ACC-ACCG-TG-TAT--CAT--A-TGCAAAA-CAGTA-A--AAATTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGC-AAA-AGAT--ACCAC-GGGA--CGGTGCTATTGGT-ACT--A---C--T----C-AATA-TGNCA-T-G-T--TATT-AAAGGAT-GT--A---A-TGTGCA-AACAT-AGTCTTA-C-AA-G-GTTA--ATACAACCAAAA--C-CAATAG-TATAATAAGATATAAT------G--TACATA-AC-AT---GAGATAT---TC-TTTAACA-TAATATA--CCAGTC-TTGATG-T-ATTTTATGTTG-G--TACCAC-CGT--GT--AT-CCTAATGCAAG-AC-AGT-AAA--GAT--GCTTA-TTACT--T-CACTGTATTG---CAAAAA-GATA-C--AC-GGGACGGT-GCT-ATT-GGT--ACTACT-TC-AATA-TGCCAT-GTT-GATAAGA-TTGCAAATG-TGCAAA-CA-TAGTTTTT-C-AAGGTTCA-TACT-GAG-TA-CA-T---TATAATA-C-TAGTAGT-ATA-AGCTTAGAT-----AAAA-------A-------AAA--AAAAAAACA-----TAA-T--AACT-TGATTTATTATAGTTT-GTAGGTA-CC-A-CCGTGT-A-TCATAATGCAAAAAAA--T----AAAAAATGCTTCAC-TGT-AGTGCAAAA--GATA-CCACGGGACGGT-G-C-TAT-TGGTA-C--C-AATTCAAACAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATGT-TCCACAATTCT-GTCATATGGTTC--ATATTGCCTCTTTTATAC-AAATTACAAAGGGC-TGC-AAGTATGTCAGTAT-TTTCGCAATTGAGTAG-CCATA-TCAATTTATTCATGTTATCA-GAC-TAG-AAAAATGTTC-AAAGTG-TTGTT-TTATAA---TTTCA-TACAA--GTCCT--GTCTAAGTGAGTAATAATTTGGACATTCAAATATT--AGATGAATTTCATCA-C-CAATTTCACCAG---A-AG-AANCAATT-GTGCAAA--CTCTTAAATGTCCAGGG--ATTCCCA
Reference ( family-1527 )     :                NNNNNATGATNGAT--A-GATTTA-TTTAT-TCCAAA--TAGGGGCCCTCTTGGG-C-ATA---A-T---ACAT-ACAT-GAT-T-G-CTGAT----TAA-T--N--AA-TA--------------TG-T---CAA--TA---GT-------------TT--T-A-CAACA---N--GT--------------T---------TACAA----------T--------AAAA--AAAAAAAAAA----A--AAAAA-A-TCCA-G-AA-AGTACTGTGG-TTA-TCC-AATGNNACAT-TA-CATGA-GGCATG-TTGATAAA-CATTGGAAAA-TG-T-GCAAAA-CATA--TT-TTAC-AA---GGAT-T-ATACAGAAG-TA-TACAT----------TA-T----------AAA---AA-T--AGTA--TCTAAG-CTTA-T-AG-ATA-AA-GA---ACA---TAA-CA-T--GAGA-C-AT-TTTT----------A-ACAT--A-T-------AT--ACTT--GA-ATG--TATTT-T-TA-TGTAATGT-ACC-ACCG-TG-TAT--CAT--A-TGCAAAA-CAGTA-A--AAATTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGC-AAA-AGAT--ACCAC-GGGA--CGGTGCTATCGGT-ACT--A---C--T----C-AATA-TGNCA-T-G-T--TATT-AAAGGAT-GT--A---A-TGTGCA-AACAT-AGTCTTA-C-AA-G-GTTA--ATACAACCAAAA--C-CAATAG-TATAATAAGATATAAT------G--TACATA-AC-AT---GAGACAT---TC-TTTAACA-TAATATA--CCAGTC-TTGATG-T-ATTTTATGTTG-G--TACCAC-CGT--GT--AT-CCTAATGCAAG-AC-AGT-AAA--GAT--GNTTA-TTACT--T-CACTGTATTG---CAAAAA-GATA-C--AC-GGGACGGT-GCT-ATT-GGT--ACTACT-TC-AATA-TGCCAT-GTT-GATAAGA-TTGCAAATG-TGCAAA-CA-TAGTTTTTAC-AAGGTTCA-TACC-GAG-TA-CA-T---TATAANA-C-TAGTAGT-ATA-AGCTTAGAT-----AAAA-------A-------AAA--AAAAAAACA-----TAA-T--AACT-TGATTTATTATAGTTT-GTAGGTA-CC-A-CCGTGT-A-TCATAATGCAANAAAA--C----AAAAAATGCTTCAC-TGT-AGTGCAAAA--GATA-CCACGGGACGGT-G-C-TAT-TGGTA-C--C-AATTC-AACAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATG--TCCACAATTCT-GTCATATGGTTC--ATATTGCCTCTTTTAT-C-AAATTACAAAGGGC-TGC-GAGTATGTCAGTAT-TTTCGNAATTGAGTAG-CCATATTCAATTTATTCATGTTATNAGGAC-TAGAAAAAATGTCC-AAAGTGCTTGTTATTATAATANTTTNATTACAANAGTCCT--GTCTAAGTGAGNAATAATTCGGACATTCAAATATT--AGATGAANTTCATCA-C-CAATTTCACCAG---A-AG-AANCAATTGGTGCAAAACCTCTTAAATGTCCAGGGTAATTCCCA
gi|1                          :                                 -GATTTAGTTTAT-TCCAAAAATAGG---CCTCTTGG--C-ATAGAAA-T---A-AC-AC-T-GAT-T-G-CTGAT----TAA-------AA-TT--------------AG-T---CA---TA---GG-------------TT--T-AACAACA---T--GT--------------CC--------TACAA----------T--------AAAA--AAAACAAAAA----A--TAAAA-A-TCCA-G-AACAGTCTCGTGG-T-A-TC--AATCTAGCAT-T--CATGA-G--ATG-TT-ATAAA-CATTG-AAAA-TT-C-ACAACATCATT--CT-TTACCAA---GGATAT-A-ACAGA-G-TA-TACAT----------TA-TGAA-------AAA---AA-T--AGTAG-TCTAAG-CTAA-T-CG-ATA-A--GA---AAA---TAA-CA-T--G-GA-C-ATCTTTT----------T-ACATTAA-T-------AT--ACCT--GA-AGG--TATTT-T--A--GTA-TGT-ACC-AC-G-TGATA---CATTAA-TGCAAAA-CA-TA-A--AGATTATA-T-TGTTTCCA-CTCGCTACGATTGG-AAA-AGATCTACCAC-GGGAGTCGGTGTGAT-GGT--CTTGA---C--TTTTCC-AATA-AG-CA-T-G-TAATATTGAAAGGAT-GT--AGAAA-TG-GCA-AACAT-AGACCTAAC-AA-CTGTTAG-ATACACACGAAA--C-CA-TAG-TATAATAAG-TATAATTAAATAGACTACATATACCATAGAGAGATAT---TC-TTTAACAATAATATA--CCAGCCATTTA-G-T-ATTTTATGTTGTA--CACCAC-CGTTAGT--AT-CCTAATGCAAG-ACGAGT-AAAAGGAT--GCTTA-TTACT--T-CACTGTATTGGTGCAAAAA-GATA-CCAAC-GGGACGG---CT-ATT-GGT--ACTACT-TC-AATA-TGCCAT-GTT-GATAA-A-TTGCAAATG-T-CAAA-CA-TAGTTGTCGCGAAGGTTCA-TACTAGAGCTA-CAAT---TATAATAAC-TAGTAGTTATA-AGCT-AGAT-----AAAA----------------AA--AAAAAACCA-----TAA-T--AAATCTGATTTATTATAGTTT-GTAGGTATCC-A-CCGTGT-A-TCATAATGCAAAACAATTT----AAAAAATGCTTCAC-TGT-AGTGCAAAA--GATA-CCACGGGACGGT-G-C-TATATGGTA-C--CAAATTCAAACAATCAACAT-GC-TATTTTCG-ACATATG--TTC-CAA-TCT-GTCTTG-GGTCC--ATATTGCCTCTGTTAT-C-AAATTACAAAGGGCATGC-AAGTATGTCAG-ATATTTCACAATTGAGTAG-CCATA-TCAATTT-TTCATGTTATCAAGAC-TAGAAAAAATGTTC-AAAGTGCTTGTTATTATAATAATTTCATTAC-AGAGTCCTGGGTCTAAGTGAGTAATAATTTGGACATTCAAATATTTAAGATGAAATTCATCA-CGCAATTTCACCAGAGCA-AG-AACAAATT-GTGCAAAA-CTCTTAAA-GT-CAGGGTAATTCCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tGG-TTAATCA-GATGTACCAT-TAACATGAAGGCATG-TTGATAAA-CATTGAAAAATTG-T-GTAAAC-TATT--TT-TAAC-AA----GATGT-ATAC-GAGG-CG-TATCT----------TA-TAAGAAAAAAAAAA---AA-T--AGTACTTCTAAG-CTTA-T-AGAATA-AA-GA---ACATTTTAA-CA-T--GAGA-TAAT-TTTTCCTATCGATGA-ATAT--A-TTGTCCCAATGGACTT--GA-ATGGCTATCTAT-TACTGGTATGT-ACC-AC
gi|11                         :                                                                 CTTGGG-C-ACA---G-T---ACATTACAC-GAT-T-G-TTGAT-----GA-T--A--CA-TA--------------TG-------A--TA---GT-------------TT--T-A-CAACA---T--GT--------------T---------TATAA----------T--------AGTA--ATACTTAACA----A--AAATC-G-TCCA-G-AA-TGTACTGTGT-TTA-AAC-AA-GGAACAT-AA-CATGA-GACATaataatcaattactaattgattatagcgcaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 AA----G--AAAAT-A-TACA-G-AA-GGTACTGTAG-TTA-TC--AATGT-ACAT-AA-CATGA-GGCATG-TTGATAAA-CATT-GCAGA-TG-T-GC-AAA-CATAT-TT-TTAC-AA---GGAT-T-ATACAG-AG-TA-Tt
gi|13                         : acgatattaataataattttATGATTGAT--ATGATTTA-TTT---TCCAAA--TAGGGGCCCTCTTGGG-C-ATA---A-T---ACAT-ACAT-GAT-T-G-CTGAA----TAA-T--
gi|14                         :        atacaaaacaaatacatatgAT--A-AATATA-TTTAT-TCCAAA--TAG----------GGG-C-ATA---A-TACAACAT-GCAT-GAT-T-G-CTAA-----TAA-T--A--AA--A--------------AG-T---CAACTCA---GT-------------TC--T-A-CAACATTGT--GT--------------T---------Tataaagtttaattaaaataattcaaaatgctttaa
gi|15                         :                                           TAT-TCCAAA--TAGGGGCCCTATTGGG-C-ATA---A-T---ACAT-ACAT-GAC-T-G-CTGA-----TAA-TAAC--AA-TA--------------TG-C---CAA--TA---GT-------------TT--T-A-CAAGA---T--GT--------------T---------TACAA----------T--------Agttatatatgttgaaagtacatttagaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATG-TTGATAAA-CATTGCAAA--TG-T-GC-AAA-CTTAT-TT-TTAC-AA---GGAT-T-ATACA-AAG-TA-TATACAATTATTGAATA-T----------AAAACTAG-T--AGTA--TCTAAG-CTTA-T-AG-Agtaataataatgataa
gi|17                         :                          tGAT--ATGATTTA-TTTAT-T-CAAA--TAGAGACCCTCTTGGGTC-ATA---A-T---ACAT-AGAT-GAT-T-G-CTGA-----TAA-T--T-----TA--------------TG----------TA---GT-------------TT--
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtGA-C-AT-TTTT----------A-ACAT--AAT-------AT--ACTT--GA-ATG--------------------T-ACC-ACCG-TG-TAT--CCT--AGTGCAA-----------------ATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AATGC-AAA-AGAgaagaacaaactc
gi|19                         :                        ATAGATTTA-GATTTA-TTTAT-TCCAAA--TAGGGGCCCTC
gi|2                          :                    tATGATAGAT--A-GATTTA-TTTATGTCCAAA--TAGGGGCTCTCTTGG--C-ATA---A-T---ACAT-ACAT-GAT-T-G-CTGAT----TAA-T--C--AA-TA--------------TG-T---CA---TA---GT-------------TT--T-A-CAACA---G--CT--------------T---------TACGA----------T--------AAAA--AAAAAAAAAA----A--AAAAA-A-TCCA-G-AA-AGTACTGTGG-TTA-TCC-AAT-TAACAT-TA-CATGA-GGCATG-TTGATAAA-CATTGGAAAA-TG-T-GCAAAA-CATA--TT-TTAC-AA---G-AT-T-ATACAGAAG-TA-TACAT----------GA-T----------AAA---AA-TCGAGTA--TCTAAGGCTTA-T-AG-ATA-AA-GA---ACA---TAA-CA-T--GAGA-C-AT-TTTT----------A-ACAT--A-T-------AT--ACTT--GA-ATG--TATTT-T-TA-TGTAATGT-ACCTACCG-TG-TA---CAT--A-TGCAAAA-C-GTA-A--AATTTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGC-AAA-AGAT--ACCAC-GGGA--CGGTGCTATTGGT-ACT--A---C--T----C-AATA-TGCCA-T-G-T--TATT-AAAGGAT-GT--A---A-TGTGCA-AACAT-AGTCTTA-CCAA-G-GTTA--ATACAACCAAAA--C-CAATAG-TATAATAAGATATAAT------G--TACATA-AC-AT---GA-ATAT---TC-TTTAACA-TAATATA--CCATTC-TT-ATG-T-ATTTTA-GTTG-G--TACCACACGT--GT--AT-CCTAATGCAAG-AC-AGT-AAA--GAT--GCTTA-TTACT--T-CACTGTATTG---CAAAAA-GATA-C--AC-GGGACGGT-GCT-ATT-GGTG-ACTACT-TC-AATA-TGCCAT-GTT-GATAAGA-TTGCAAATG-TGCAA--CA-TAGTTTTTCC-AAGGTTCA-TACT-GAG-TA-CA-T---TATAATA-C-TAGTAGT-ATA-AGCTTAGAT-----AAAA-------A-------AAA--AAAAAAACA-----TAA-T--AACT-TGATTT-TTATAGTTT-GTAGGTA-CCCA-CCGTGTGA-TCAATATGCAACAAAA--C----AAAAAATGCTTCAC-TGTCAGTGCAAAA--GATA-CCACGGGACGGT-G-CCTAT-TGGTA-C--C-AATTC-AACAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATG--TTCACACTCCT-GTCATATGGTTC--ATATTGCCTCGTTTATAC-AAATTACAAAGGGC-T-C-AAGTATGTCAGTAT-TTTCACAATTGAGTAGCCCATA-TCAATTTATTCATGTTATCA-AACATAG-AAAAATGTTCAAAAGTG-TTGTT-TTATAA---TTTCA-TACA--TGTTCT--GTCTAAGTGAGTAATAATTTGGACATTCAAATATT--AAATGAATTTCATCA-C-CAATTT-ACCAG---A-AG-AAACAATT-GTGCAAA---CCTTAAATGTCTAGGG--ATTCCCA
gi|3                          :                         acagt--A-GATTTA-TTTAT-TCCAAA--TAGGGGC--TCTTGGA-T-AGAT--A-T---ACAT-AGAT-TGC-T-G-ATAATATAATAA-T--GTCAA-TAGAGTTTTACAACAATG-TTTACAA--TA---GTA------------GTAAT-A-AAATA---A--TT--------------TAAAAAAAAATAAAA----------T--------AAAA--AAAAAAAAAA----A--AAAAA-AATCCA-G-GA-AG-A-TGTGGGTTA-T----ATGT-ACAT-TA--ATGA-G-CATG-TTGATAAA-C-TTGAAAAA-TG-T-GCAA---CATAATTT-TTAC-AA---GGAT-T-ATACAGA-G-TA-TACAT----------TA-TT---------AAA---AA-T--AGTA--TCTAAG-CTTA-T-AG-ATA-AA-GA---A-A---TAA-CA-T--GAGA-CGAT-TTTT----------A-ACAT--AAT-------AT--ACTT--GA-ATG--TAGTT-T--A-GGTA-TGT-TAC-ACCG-TG-TATGTCAT--A-T-CAAAA-CAGTA-G--AATTAATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AGTGC-AAAGAGAT--GACAC-GGGA--CGGTGCTATTGG--ACT--A---T--T----CCAAT--TGGCAAT-G-T--TAGT-AAAGGATTGC--A---AATGTGCA-AACA--AGTCTTA-C-AA-G--TTA--ATTAAA--AAGA--C-CAATAG-TA--ATA-GAT-TAAT------G--T-CATA-AC-AT---GAGA--T---TT-TTTAACA-TAAT-TA--C-AGTC-TTGATG-T-ATTTTATGTTG-G--TAC--C-CGT--GCTAAT-CCTAATGCAAG-A--AGTAAAA--GAT--GCTTA-TTACT--TCCACTGTAGTG---C-AAAA-GATACC--AC-GGGAC--T-ACTCATT-GGT--ACTACT-TC-AATA-TG-CAT-TTT-GATAAGA-TTGCAAATG-TGCAAA-CA-TAG--TTTGC-AGGGTTCATTACT-GAG-TA-CA-T---TATAAT--C-TAATAGT-GTATAGCTTAGAT-----AAAA-------ATAACAACAAAACAAAAAAACAAAAACTAATT--AAC--TGATGT-TTATAGTTG-GTAGGTA-CC-A-CCG-GT-A-TCATAATGCAA-AAAA--T-----AAAAATGCTTCAC-T-T-AGTG--AAA--GATA-CCACGGGACGGTGG-C-TAT-TGGTACC--C-AGTTC-AACAAT-AACAT-GCTTGTTTTCGTAAAT-TG--TCCACAGTTCTGGTCATAT-GTTC---TATTGCCTCTTTTAT-C-AAATT-TAAAGGGC-TGC-AAGTATGTC-GTAT-TTTCGAAATTGAGTAG-CCATATTCAATTTATTCATGTTATAA-GAC-TAG----AATGT-C-AAAGTG-TTGTT-TTATA----TTTTAATACAAT-GT-CT--GT-TAAGTGAGAGATAATTCGGACATT-AAATATT--AATTGAACTT-ATCATC-CAATGTACCCAG---ATAGCAAGCAAT
gi|4                          :                           GAT--A-GATTTA-TTTAT-TC-AAA--TAGGGGCCCTCTGGGG-C-ATA---AGT---ACAT-A-AT-GAT-TTG-CTGAT-----AA-T--A--AAATA--------------TGGT---CAA--TA---GT-------------TT--T-A-CAACA---T--G-------------------------TA-AA----------T--------AAAA--AAAAAAAAAA----ATTAAAAATT-TCCAGG-AA-AGTACTGGTG-TT--TTC-AATG-TACATGTA--ATGA-GGCATGTTTGATAAA-CATTTGAAAA-TG-T-GC-AAA-CATAT-TT-TTAC-AAG--GGAT-T-ATACAAGAGTTA-TACAT----------TATT----------AAA---AA-T--AGTA--TT--AG-CTTA-TAAG-ACA-AA--A---ACA---T-A-CATT--GAGACC-AT-TTT-------------ACAT--A-A-------TT--ACTTGGGA-ATG---ATTT-TATA-TGTA-----ACC-ACCG-TG-TAT--GCTA-A-TGCCAAA-CAGTA-AG-AAATTATA-TAT-TTTCAA-CT-GT----AGGGCAAAA-AGAT--ACCACGGGGA--CAGGGC-ATTGGTAACTA-A---T--T----C-AATA-TTGCA-T---T--TATT-AAA-GAT-GTA-A---A-TGTGC--AACAT-AGTCTTA-C-AA-G-GTTG--A-ATGACACAAA--C-CAATAG-T-TAATAAATTA-AAT------G--TACATA-AC-AT---GAGATAT---TCTTTTAACA-TAATATA--CCAGTC-TTGATGTT-ATTTTATGTTG-GTTTACCAC-CGT--GT--AT-CCTAATGCAAGAAC-AGT-AAA--AAT--GGCTATTTACT--T-CACTGTATTG---CAAAA---ATACC--ACGGGGACGGT-GCTGATT-GGT--ACTACT-TCAAATATTGCCATAGTT-GATAAGATTTGCAAATGTTGCAAA-CATTAGTTTTC-C-AAGGTTCATTACT-GAG-TACCA-T---TATAATA-C-T-GTAGT-ATA-AGCTTAGATAAAAAAAAA-------A-------AAA--AAAAAAACA-----TAA-TTAAACT-TGATTTATTA-AG-TT-GTA-GTA-CC-ACCCGTGT-A-TCATAATGCCAAAAAA--CAAATAAAAAATGCTTCACTTGT-AGTGCAAAAAGAATACCCAC-GGACGGT-G-C-TAA-TTGTA-C--C-AACTCAAACAATCAACAT-GC-TATTTTCGTACATATAT-TCCACAA-TCT-G-CATATGGTTTCAATATTGCCTCTTTTAT-C-AAATTACAAAGGGCTTGC--AG--TGTCAGTA
gi|5                          :                              --A-GATTTA-TTTAT-TCCAAA--TAGGGGCC-TCT-GGG-C-ATA---A-T---ACAT-ACATTGATAT-GTCTGAT----TAACT--A--AA-GT--------------TG-T---CAA--TA---GT-------------TC--T-A-CAACA---T--GT--------------T---------AACAA----------T--------AAAA--AATAAAAAAA----T--AAAAA-A-TCCA-GTAA-AGTACTGTGT-TTA-TC--AATGTAA--T-TA-CAT-A-GGCAT---TGATAAAACATTG-AAAA-TGCT-GCAAAA-CATT--TT-TTAC-AGAT-GTAT-T-ATACAGA-G-TA-TACAT----------TA-T----------TAA---A--T--AGTAA-TCTA-G-CTTA-T-AG-ATATAA-GA---ACA---TAAGCA-T--GAGA-C-AT-TT--------------ACAT--AAT-------AT--ACTT--GA-ATG--TATTT-T-TG-T---ATGT-ACC-ACCG-TG-TAT--CAT--A-TGCAAAA-CAGTG-A--AGAATATACTATTTTTC-AGCT-GT----AGTGC-AAA--GAT--ACCAC-GGGA--CGGTGCTAATTGT-AC---A---CCTT----C-AAT--TATCA-TTA-T--TAT--AAAGGAT-GTTAA---A-TGTGCACAACAT-AGTCTTA-C-AAAG-GTTACTATACAAC--AAA--CACAAT-G-TATAATAAGATATAAT------G--TACATA-AC-AT---GAAATATGTCTC-TTAAACA-TAATATATACCAGTC-TT-ATG-TTATTTTATGTTG-G--TACCCC-CGT--GT--ATTCCTAATGCAAG-AC-AGT-AAAAAGAT--GCTTA-TTACTAAT-CACTGTATTG---CAAAAG---TA-C--AC-GGGACGGT-GCT-ATT-GGT--ACTACT-TC-AATA-TGC-AT-GTT-GATAA-A-TT-CAAATG-TGCAAA-CA-TATATTTTCC-AAGGTTCA-TACT-GAG--A-CA-TCTTTATAATA-C-TACTAGT-ATA-GAGTTAGAT-----AAAAAAAAAAA---------AA--AAAAAAACA-----TAA-TA-AACT-TGATTTATTATAGTTTAGTAGGTA-CC-A-CCGTGT-ATTCATAATGCAAAACAA--T-----AAAAATGCTTCAC-TGT-AGTGCAAAA--GATA-CCACGGAACGGT-GCC-TAT-T-GTA-CATC-AGAAC-AACAA--AGCATGGC-TA-TTTCGTACATATGTCTCCACA--TCT-GTCATATGGTTCATATATTGCCTCTTTTATACAAAATTACAAAGGGC-TGCAGAGTAT-TCAGTAaacgcataatgtaaagtgtgaatggctataattttcgttat
gi|6                          :                              --A-GATTTA-TTTAT-TCCAAA--TAGG--CCCTCTTGGG-C-ATA---A-T---ACAT-ACAT-GAT-T-G--TGAT-----AA-T--A--AA-TA--------------TG-T---CAA--TA---GT-------------TT--A-A-CAA-G---C--GT--------------T---------TACAAATAGTAGTAAT--------AAAA--TAAAAAAAAATATTA--AAAAA-A-TCCA-G-AA-AGTACT-TGG-TTA-TTCGAATGT-ACAG-TA-CATGA-GGCATG-GTGATAAAACAT-GAAAAA-TG-T-GCAAAC-GATA--TTATTAC-AA---GGAA-T-ATACA--AG-TAATACAT----------TA-T----------AAA---AA-T--AGTA--TC-AAG-CTTA-T-AG-ATA-AAAGA---ACA---TA--CA-T--GA-A-C-AT-TTAT----------T-ACAT--A-T-------ATT-ACTT--GACATG--TATTT----A-TGTA-TGTTACC-ACCGATG-TAT--CAT--AATGCAAAAACAGTA-A--GAATTATA-TATATTTC-A-CT-GT----AGTGC-AAA-AGAT--ACCAC-GAAA--CGG-GC-ATTG-T-ACT--A---C--TT---C-AATAATGCCAAT-GGT--TATT-AAAGAGT-A---A---A-TGTGCA-AACATCAGTCTTA-C-AA-G-GT-A--ATACA-CCAAAAAAC-CAATAGGTATAATAAGATATAAT------G--TACATA-AC-ATT--GAGATAT---TC-TTTAACA---ATATA--CCAGTC-TTGATG-T-ATTTTATGATG----TACCAC-C-T--G---AT-CCTAATGCAAGGAC-AGT-AAA--AGTAAGCTTA-TTACT--T-CACTGTAGTG---CAAAAAAGATA-CCAGC-GGGACGGTTGCT-ATTCGGTTGACTACTCTC-AATA-TGCCAT-GTTTGATA-GA-TTGCAAATG-TGCAAAACA-TAGTTTT--C-CAGGTTCA-TACT-GAG-TA-CA-T---TATAATA-CGTA-TAGT-ATA-AGCTTAGATAAA--AAAA-------A-------AAA--AAAAAAACAAT---TAA-TA-AACT-TGATTTATTATaaacgcattacatgtaaagtgtgaatggtatttatttttcctggttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CT--GTCTGAGTGAGCAATAATTTGGACATTCAAATATT--AGATGAATTTCATCA-C-CAATTTCACCAG---A-AG-AA-CAATTGGTGCAAA--CTCTTAAATGTCCAGGG--ATTTCCA
gi|8                          :                           GAT--A-GATTTA-TT-----CCAA---TAGGGGCCCTCTTTGG-C-ATA---A-T---ACAT------GAT-G-G-CTGAT-----AA-T--A--AA-TA--------------TG-T---CAA--TATAAGT-------------TT--TTA-CAACA---T--GT--------------T---------TACAA----------TTTAGTTTTAAAATGAATAAAAAAA----A--AAAAA-A-TCCA-G-AA-G--ACTGTGG-TTA-TC--AATGTACAAT-AA-CATGA-GGCATG-TTGATAA--CATTG-AAAA-TG-TTGTAAA--CATA--TT-TTAT-AAAAAGGAT-TGATA-ACAAG-TA-TACAT----------TA-T----------AAA---AAAT--AGTA--TCTA-G-CTTAAT-AG-ATA-AA-GA---ACA---TAA-C--T--GAGA-C-AT-TTTT----------ACACTA--A-T-------AT--ACTT--AA-ATG--TATTT-T-TG-T---ATGT-AC--ACCG-TG-TAT--CAT--AATGCAAAA-CAGTACA--GAATTATA-TATGTTTC-A-CT-GT----AATGC-AAA-AGAT--ACACC-GGGA--CGGTGCTATT-GT-ACT--ATACT--T----C-AATtataacgacctcgtttctattgcaaggttgtgagctgatgtacgtaatcttgtaagtatttttaacgttgtgccaggtggtaaagtgtcgaagtagttttcaataacaaagtttagatttaatttaatcataattttcaagttttcatatttgtaaacttactgatattgccccattctttcaaactagtgggtgtataacacatttcttgcatcttttacttaaaatgatacattattaattgtaataaggttgttttctattccaataattccaaatactttttgtacaacactataccacgactgtgattttaatgtacacggcattaagtt
gi|9                          :                                     TTA-TTTAT-TCCAAA--CAGGGGCC-TCTTGTG-CCATA---A-T---A--T-ACAT-GAT-T-G-CTGAT-----AA-T--A--AA-TA--------------TG-T---CAA--TA---GTTTTACAACATGCTTT--T-A-CAATA---GTAGTAATNNNNNNNNNNNN---------NNNNN----------N--------NNNN--NNNNNNNNNN----N--NNNNN-N-NCCATG-AATAGTACTGTG---TA-GTC-AATGT--CAT-TA-CATGA-G-CATG-TTGATAAA-ATTTGGAAA---G-T-CCAAAA-TAT------TTAC-AA---GGAT-T-ATACAGA---TA-TA-AT----------TA-T----------AAA---AA-T--AGTA--TCTAAG--TTA-T-AGAATA-AA-GAAAGAC----TAACCA-TTGAAGA-C-AT-TTTT-------------TAT----T-------AT----------------TATCT-T-TA-TAAAATAT-TTC-A------------CAT--A-TGAACAA-CA-CA-ACTAAATT