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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                          AACTTGCTCGATTTT-C------GTCCATCGCTATAATGTT---TATTATACCACTTTT--TGA-GTACAATTATCGTGACATA----TTCATTTTCAAATGTGCTTTTTTTCTCAAAACAGAT-GATAATTGTCTTTGATTT---TGAGT-----------AATTCTT--------------AA-TC-T----AATTCATCTCGC-TTT-GATTAAAAGTACTGGGGA----A-----TGA-ACTATTTTATCT-CACAATAATTTCTT-T-CGAAACCATG--TAATATG-----TTCATAACGCCATT-AAA-TTGTC--TA-GCTC----CAAACTGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGCATTTCTA-T--CGTGTCAGTATCCAATCCATTAC-TGTTGAAGATACGTGAAATTT--GTCCCG-----ATTTATG-CACAA-AGAAAATAAACGTGAAC---CATA---------ACAA------ATGC------AC--CTATACGCATATTTTTTAAGTAGCCTTTCATTTAATA-TTCTACC-AATGC--TT---TTTAACGTGATTGTTTTTTCG---TTTGAGGTAGGTT--GTAGGAGACATTC------ATATTTGATTGATATTTACAAATCATGTCATACACTT---TTACCCATGTGTA-ATGTAAATT------AAA------ATGACTGTAAT--AGATAGAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          AACTTGATCGATTTT-A------TTTCTTTGTGATTATGTTGACCATAATACCACTATT--T
gi|6                          :                                                     tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaAACTTGATCGATTTT-A------G-----CG-TATAAT--C---AATTACACAGATTTTCCTGGTGTATATGTATTGTGACATAAACATTCATTTTCAAATA----TTCTTTCTCAAAACAGAC-GAAAATAGTCATGCATTT---CAAA------------AATTCTT--------------GA-TC-T----TACT----TTGC---G-GATAAAAAGTATTGAGTA----A-----tacttatataataatttatagattttcctgatgtatatgtattgttacatattttaaaacattcattttcaaatattcattttctcaaaacagatgataatagtctttgatttagaataatgcttttcaaaaattctcaaatctagtttctcttactttgataaaaagtattgaggaat
gi|7                          : aaataaaggaaaatgttcatgtttaactgtagaattaagaactacccataattcgtcaaacacaaagaaagagatttatcatccatgcgtttacttcagctgggaatattatttactcattctgctttaaaatggatttcactcaacaaatcaaccttttctccagctgcccctaccccttctgagaaacaatgcaaagtttatatatcgtacggagttgaatgaatacggggacattttcaacgtttcattatttctagcgaaaAACTTGATCGATTTTAT------TTCCTTTGTGATTATGTTGACCATAATACCACTATT--T
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gi|7                          :                     tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaaacttgatcgattttatttctttgtgattatgttgaccataataccactattttacttatataataatttatagattttcctgatgtatatgtattgtTACA--TATTTTAAAACA----TTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTCA-------------AA-TCTT----AGTTTCTCTTACTTTT-GATAAAAAGTATTGAGAA----
gi|8                          :                                                                                                ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatggaacttgatcgattttatttcctttgtgattatgttgaccataataccactattttactatataatatttaatagattttcctgatgatatatgtatttTATTTTAAAACA----TTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGAT-GATAATAGTCTTTGATTT---AGAAT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT-GATAAAAAGTATTGAGGA----ATACAGTAA-ATTATTTGATTT-TATCATAATTTCTG-TACAAAACCAT---T-----------TTCAT------ATT-AAG---GT---TA-G-------TAAAAT-----------ATCTA-CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAAT-----ATCCATTAC-TGCCGAAGATGTGTGAATTTT--GGCACG-----GTTTATG-CACAA-AGAAATTAAACATGAGC---AATT---------ACAA------ATAT------TG--CTGT--GCATATt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaTATTTTAAAACA----TTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTC--------------AAATC-TT---AGTTTCTCTTAC-TTTTGATAAAAAGTATTGAGAATACAG-----TAATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAACCAT--------T------TTCATA------TT-AAG---GT---TA-GT-------AAA---TA-T------ATCTA-CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA-----TTAC-TGC-GAAGATGTGTGAA-TAT--GGCACG-----GTT-ATG-CACAA-AGAAATTAAACATGAGC---AATT---------ACAATATCTGGTGCGATATAACTGCTATAC---TATTTTCT-------CTTCAATTTAATA-TTCCATC-AATTCTTTT---TTTAA-ATAATTG-TTTTTCG---TTTGAaactgctatactattttctatattcatcatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acaTTTCTCAAAACAGAC-GAAAATAGTCAT-GCTTT---TCAAA-----------AATTCTT--------------GA-TC-TTACAAATGTACTTTGC-G---GATAAAAAGTATTGAGTA----A-----TGA-AATATTTTATTT-CATAACAGTGTCTG-T-TGAAACCATG--TAATATT-----TTCACAAGGTCAGTAAAA-CTGTCTATA-GCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT--------------AA-TC-T----AATTACTCTTAC-CTT-GATGAGAAATTGTGAGTA----A-----TAA-AATATTTCATTTTCAAAATAATTTCTG-T-TGAAACAATA--TA-TATAACAATTTTATAGGGTCGGT-AAT-ATGTC--TA-GCTC----CAAGCTATA-CG-----GTGGA-CTAGGAGGTATTTCTA-T--CGTGTCAGT------------------TGAAGATGTATGCATTTT--GGGTCG-----ATTTCTG-CACAA-AGAAAATAAACACTAGC---GATT---------ACTA------ATGT------AC--CTATACGCATATATCTGCAACAGCATTTCATTTAATA-TTCCATC-AATTC--TT---TTTAAAATTATTG-TTTTTCG---TTTAATGTATGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCCATGTTTATAAACCATGTTATACGCTT---TTACCCATATGTA-ATATAAATT------AAA------AGGAATGTGACTGAGATAAttatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcaaggatactAATTATTTTTTGT-CGAAACAATG--TAATATT-----TTCATGAAGTCAGT-GAA-ATCTT--TA-CCTC----CAAACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTGtatatagtgtctgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaGAAAACATAAATAATATT-----TTCATAAAGTCAGT-AAAACTGTC--TA-GCTC----TGAACTGTA-CG-----ATTAG-CCATGATGTATTTGTA-A--CGTGTCATT-----ATCCATTAC-TGCCGAAAACGTGTGCTTTTTTAGGTCCG-----ATTTATG-CACAA-ATAAAATAAACGTGAGC---TATT---------ACAA------ATGT------AC--CTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgtcatttgataaatgacagttttcgacaaacccatttctatgttgccttcatggaaattatgaAA-CTGTC--TAAGC------CAAG-TGTAACGGATATATTAAGCCTTGATGTGGTTGTAGTAACGTGTCGGTACCCG---CATTACACGCCAGAAACGTGTGAA--TT--GTTTTGGGACAATCTATGGCACAGCAGAAAATAAATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgagataattgtcacagaagttggtagTTATG-CACAA-AGAAAATAAATGTCATG---TATT---------ACGA------ATGT------AC--CTA--CGCATATTTCTGCAGTAGTCTTTCATTTAACAATTCCTTC-AATTC--TTAATTTTAAAATAATCGTTCTT-CG---TTTGATGTGCGTT--GCACGAGTCTTCC------ATATTTGATTTATGTTTACAAATC---TC--------------CCCATGTGTA-ATATACATTAAAGGGAAA------GTGACTG------AGATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattca-CACAA-AGAAAATAAACCTGAACTTACATATGTAATATTACAG------ATGT------CC--CCATACGCATATTTTTGCAATATGCTTTCATTTAATA-TTCTATC-AATAC--TT---TTTAAAATGATTGCTTTTT-G---TTTGGTGTAAGCT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATTGATATTTACA-------------ACTT---TTACCCATGTATT-AGATATATT------AAATGGAATGTGACAGGAAC--AGATAtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tccaTTCATTTAATA-TTCCATCAAATTC--TT---TTTTAAATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAtataattataatgtctgtttccatc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaatacagtaatattatttgattttatcataatttcctgtacaaaaccattttcatattaaggttagtaaatatatctaccatgatgtattcttatggtgtcaatatccattactgcgaagatgtgtgaatatggcacggttatgcacaaagaaattaaacatgagcaattacaatatctggtgcgatataactgctatactattttctcttcaatttaatattccatcaattctttttttaaataattgtttttcgtttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcAATA-TTCCATC-AATAG--TTA--TTTAAAATGATTGCTTTT-CG---TTTGATGTTGGTT--GCACGAGTCTTTC------ATGTTTGATTGATATTTAAAACTCATGTCATACACTT---T
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATTGTTTTCTCGCGTTCTGATGTACGTTTGACACGGGTCTTTCCA----GTATTTGATCGATGTT-----ATTAAATCATACGCTTTTGTTACCCAC-TCTACATGTAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttgggacaatctatggcacagcagaaaataaatgtgattctgtttaaaaatatcggtacaaatgtatgctctggtacctcatattcttgagttggagagaattaatcacTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAt
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): AACTACCCATAATTCGTCAAACACAAAGAAAAAGATTTATCATCCATGTGTTTACTTCAGCTGGGAATATTATTTACTCAATCTGCTTTGAAATGGATTTCACTCAACAAATCAACCTTT
Unaligned ( gi|16 ): AAATAAAGGAACATGTCGTCTGCTTCCAACTGTGGAATCAAACCTAAAACACTACTTCGTCAAATATAAAAATGACTTCATCATCAGTGCAACCAACTCTCAACTGGGA
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Reference ( family-1207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACTTGATCGATTTTNN------TTC-TTTGCG-ATNATGTTGACCATNATACCGCT-NTT--TGNTNTAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-CGATAATAGTCTTTGATTT---N---AAAT-----------AATTCTT--------------AA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGNA----ATA-----A-ANTATTTNATTT-CATAATAATTTCTGGTACGAAAC----CATG--TAATATTTTCATA---AGGTCAGTA-AA-CTGTCTA--GCTCCAA----GCTGTA-CG-----ATTAA-CCATGATGTATTTNTA-T--CGTGTCAGTATCCGATCCATTAC-TGC-CGAAGACGTGTGAA---TTTT--GGCNCGATTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAACGTGAG-CN------------ATTACAAATGTACCTA-TACGCATATTTCTGCAATAGN-C---TTTC------AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATNATTGCTTTTTCG---TTTGATGTACGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCGATGTTTACAAATCATGTCATACGCTT---TTACCCATGTGTAATATANATT------AAA------GTGACTG-G-ACAGATAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttgtcatttgataaatgacagttttcgacaaacccatttctatgttgccttcatggaaattatgaTTT--GGGACAATCTAT-GGCACAGCAGAAAATAAATGTGATTCT------------GTT-TAAAAATATCGG-TAC--AAATGTATGC----------------------T-CTGGTA-CCTCAT---ATTC-TTGAGTTGGAGAGAATTAATCACTAATTGTTTTCTCGCGTTCTGATGTACGTTTGACACGGGTCTTTCCA----GTATTTGATCGATGTT-----ATTAAATCATACGCTTTTGTTACCCA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTGTCACAG--AAGTTGGTAGAA-CTGTCTAA-GC--CAA----G-TGTAACGGATATATTAAGCCTTGATGTGGTTGTAGTAACGTGTCGGTACCCG---CATTACACGC-CAGAAACGTGTGAATTGTTTT--GGGACAATCTATGG-CACAGCAGAAAATAAATGTGActctacatgtaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgagataAACTTGATCGATTCTTAGACTAGTTC-ATTGCG-ATAATGTT---TATTATATCTCT-TTT--TGCT-TACAA--TAATTTA------
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgtattcaatattttctgaccagattgtggattattgaaAATA-TTCCATC-AATAG-TTA---T--------TTAA--AATGATTGC-TTTTCG---TTTGATGTTGGTT--GCACGAGTCTTTC------ATGTTTGATTGATATTTAAAACTCATGTCATACACTT---Ttagattttcctgatgtatttatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATTATTTTTTGT-CGAAAC----AATG--TAATATTTTCATG---AAGTCAGTG-AA-ATCTTTA--CCTCCAA----ACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTT---AGATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTC--------------AAATC-TT---AGTTTCTCTTAC-TTTT--G---ATAAAAAGTATTGAGAATACAGTA-----ATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGTA-AA----TATA--TCT--------------------------A-CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCC-----ATTAC-TGC--GAAGATGTGTGAA---TAT---GGCACGGTT-AT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAA---TATCTGGTGCG-ATATAACTGCTATACTAT---TTTCTCTTCAAT-TTAATA-TTCCATC-AATTCTTT----T--------TTTA--AATAATTG-TTTTTCG---TTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTC------AT-TTAATA-TTCCATCAAATTC-TT----T--------TTTA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaatacagtaatattatttgattttatcataatttcctgtacaaaaccattttcatattaaggttagtaaatatatctaccatgatgtattcttatggtgtcaatatccattactgcgaagatgtgtgaatatggcacggttatgcacaaagaaattaaacatgagcaattacaatatctggtgcgatataactgctatactattttctcttcaatttaatattccatcaattctttttttaaataattgtttttcgtttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctc--GCATGGTTCTTCC------ATATTTGATCGATGTTTCCAAATCATGTCATACTATT---TCACTCGTGTGGAATATA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCAT-GCTTT---T---CAAA-----------AATTCTT--------------GA-TC-TTACAAATGT-----AC-TTT---GCGGATAAAAAGTATTGAGTA----ATG-----A-AATATTTTATTT-CATAACAGTGTCTGTT--GAAAC----CATG--TAATATTTTCACA---AGGTCAGTA-AAACTGTCTATAGCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGT-----ATCCATTA--TGCACAAAGA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccaTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-GT------------ATTACGAATGTACCTA---CGCATATTTCTGCAGTAGT-C---TTTC------AT-TTAACAATTCCTTC-AATTC-TTAAT-T--------TTAA--AATAATCG-TTCTTCG---TTTGATGTGCGTT--GCACGAGTCTTCC------ATATTTGATTTATGTTTACAAATC---TC--------------CCCATGTGTAATATACATTAAAGGGAAA------GTGACTG-----AGATAattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
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gi|8                          :                                                                                                                                             ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatggaacttgatcgattttatttcctttgtgattatgttgaccataataccactattttactatataatatttaatagattttcctgAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTT---A---GAAT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATACAGTAA-ATTATTTGATTT-TATCATAATTTCTG-TACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGTA-AA-ATATCTA---------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCC-----ATTAC-TGC-CGAAGATGTGTGAA---TTTT--GGCACGGTTTAT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAAATATTGCTG-T--GCATATAACTGCTATACT-A---TTT--------T-CT-ATA-TT-CATC-At
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttgtcatttgataaatgacagttttcgacaaacccatttctatgttgccttcatggaaattatgaTTT--GGGACAATCTAT-GGCACAGCAGAAAATAAATGTGATTCT------------GTT-TAAAAATATCGG-TACAAAT------------GTATGC---T-CT----------GGTA-CCTCAT---ATTC-TTGAGTTGGAGAGAATTAATCACTAATTGTTTTCTCGCGTTCTGATGTACGTTTGACACGGGTCTTTCCA----GTATTTGATCGATGTT-----ATTAAATCATACGCTTTTGTTACCCA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTGTCACAG--AAGTTGGT-AGAAC-TGTC--TAAGC------CAAG-TGTAACGGATATATTAAGCCTTGATGTGGTTGTAGTAACGTGTCGGTACCCG---CATTACACGCCAGAAACGTGTGAATTGTTTT--GGGACAATCTATGG-CACAGCAGAAAATAAATGTGActctacatgtaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgagataAACTTGATCGATTCTTAGACTAGTTCATT-GCG-ATAATGTT---TATTATATCTCT-TTT--TG-CT-TACAA--TAATTTA------
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgtattcaatattttctgaccagattgtggattattgaaAATA-TTCCATC-AATAG-TTA---T--------TTAA--AATGATTGC-TTTTCG---TTTGATGTTGGTT--GCACGAGTCTTTC------ATGTTTGATTGATATTTAAAACTCATGTCATACACTT---Ttagattttcctgatgtatttatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTTTT-TGT-CGAAAC----AATG--TAATATTTTCATG---AAGTCAGT-G-AAA-TCTT--TA-CCTC----CAAACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaatAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAG---ATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTC--------------AAATC-TT---AGTTTCTCTTAC-TTTT--G---ATAAAAAGTATTGAGAATACAGTA-----ATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AATATATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA-T----TAC-TGC-GAAGATGTGTGAA---TAT---GGCACGGTT-AT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAA---TATCTGGTGCG-ATATAACTGCTATACTATTT---T-CTCTTCAAT-TTAATA-TTCCATC-AATTCTTT----T--------TTTA--AATAATTG-TTTTTCG---TTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTC----AT-TTAATA-TTCCATCAAATTC-TT----T--------TTTA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaatacagtaatattatttgattttatcataatttcctgtacaaaaccattttcatattaaggttagtaaatatatctaccatgatgtattcttatggtgtcaatatccattactgcgaagatgtgtgaatatggcacggttatgcacaaagaaattaaacatgagcaattacaatatctggtgcgatataactgctatactattttctcttcaatttaatattccatcaattctttttttaaataattgtttttcgtttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctc--GCATGGTTCTTCC------ATATTTGATCGATGTTTCCAAATCATGTCATACTATT---TCACTCGTGTGGAATATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCAT-GCTTTTC---A---AA-----------AATTCTT--------------GA-TC-TTACAAATGT-----AC-TTT---GCGGATAAAAAGTATTGAGTA----ATG-----A-AATATTTTATTT-CATAACAGTGTC-TGT-TGAAAC----CATG--TAATATTTTCACA---AGGTCAGTAA-AAC-TGTCTATA-GCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATCCA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-TT------------ATTACAAATGTACC---TACGCATATTTCTGC---NGTGTACTTGT-TTC----ATGTCAGTA-TTCtatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccaTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-GT------------ATTACGAATGTACCTA---CGCATATTTCTGC---AGTAGTC---T-TTC----AT-TTAACAATTCCTTC-AATTC-TTAAT-T--------TTAA--AATAATCG-TTCTTCG---TTTGATGTGCGTT--GCACGAGTCTTCC------ATATTTGATTTATGTTTACAAATC---TC--------------CCCATGTGTAATATACATT-AAAGGGAAAGTGACTG-----AGATAattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|4                          : tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcaAACTTGATCGATTTT------ATTTCTTT-GTG-ATTATGTTGACCATAATACCACTATTT--TACTTATATAA--TAATTTA------tg
gi|4                          :                                                                                                                                                           tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaTAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATtagattttcctgatgtatatgtattgttacatattttaaaacattcattttcaaatattcattttctcaaaacagatgataatagtctttgatttagaataatgcttttcaaaaattctcaaatctagtttctcttactttgataaaaagtattgaggaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                    tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaaacttgatcgattttatttctttgtgattatgttgaccataataccactattttacttatataataatttatagattttcctgatgtatatgtattgtTT--------------AA-TC-T----AATTACTCTTAC-CTT---G---ATGAGAAATTGTGAGTA----ATA-----A-AATATTTCATTTTCAAAATAATTTC-TGT-TGAAACAATATATA--TAACAATTTTATA---GGGTCGGT-A-ATA-TGTC--TA-GCTC----CAAGCTATA-CG-----GTGGA-CTAGGAGGTATTTCTA-T--CGTGTCAGT------------------TGAAGATGTATGCA---TTTT--GGGTCGATTTCT-G-CACAA-AGAAAATAAACACTAG-CG------------ATTACTAATGTACCTA-TACGCATATATCTGC---AACAGCA---T-TTC----AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTAATGTATGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCCATGTTTATAAACCATGTTATACGCTT---TTACCCATATGTAATATAAATTAAAA-GGAATGTGACTGAG-ATAAATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcaaggatactAACTTGATCGATTTT------A--------GCGTATAAT-----CAATTACACAGAT-TTTCCTG-GTGTAT-A--TGTATTGTGACATAAACATTCATTTTCAAATAT--TC--TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCATGCATTTCA---A---A------------AATTCTT--------------GA---------------TCTTAC-TTTGCGG---ATAAAAAGTATTGAGTA----Atatagtgtctgttt
gi|7                          :                                  aaataaaggaaaatgttcatgtttaactgtagaattaagaactacccataattcgtcaaacacaaagaaagagatttatcatccatgcgtttacttcagctgggaatattatttactcattctgctttaaaatggatttcactcaacaaatcaaccttttctccagctgcccctaccccttctgagaaacaatgcaaagtttatatatcgtacggagttgaatgaatacggggacattttcaacgtttcattatttctagcgaaaAACTTGATCGATTTT------ATTTCCTTTGTG-ATTATGTTGACCATAATACCACTATTT--TA-CTATATAA--TATTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                        ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatgg--TA-TTTTAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATA---TCATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATAA---ATGCTTTTTCAAAAATTCTCA-------------AA-TCTT----AGTTTCTCTTACTTTT---G---ATAAAAAGTATTGAGAA----aatagattttcctgatgatatatgtattttacatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaat
gi|8                          :                                                                                                                                    ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatggaacttgatcgattttatttcctttgtgattatgttgaccataataccactattttactatataatatttaatagattttcctgatgatatatgAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATACAGTAA-ATTATTTGATTT-TATCATAATTTC-TGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AAA-TATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCC-----ATTAC-TGCCGAAGATGTGTGAA---TTTT--GGCACGGTTTAT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAAATATTGCTG-T--GCATATAACTGC-----TATAC---TATT------T-TCTATA-TT-CATC-At
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAATAAAGGACAATTTTGCTTACCATACTTTTAACCGTGGAATTAAAGAAGCAAACCAATATTTTCAAACAAAGAAAACGATTCAATTATCAGTTGCATCTATTCCAGTTAGAATTATCATGTCTTATTATATTATTTTTTTGAGAGGTACAGTGTGTTTCCTCCAACGTGCCATTCTCTTCTCCAGCTTCCCCCCACCACCTTCGAAAGCACCCCTCCCCAATTCAAAGTCCTTGTCTCGTATCTGGATGTTATGTAT
Unaligned ( gi|15 ): AACTACCCATAATTCGTCAAACACAAAGAAAAAGATTTATCATCCATGTGTTTACTTCAGCTGGGAATATTATTTACTCAATCTGCTTTGAAATGGATTTCACTCAACAAATCAACCTTT
Unaligned ( gi|16 ): AAATAAAGGAACATGTCGTCTGCTTCCAACTGTGGAATCAAACCTAAAACACTACTTCGTCAAATATAAAAATGACTTCATCATCAGTGCAACCAACTCTCAACTGGGA
Unaligned ( gi|19 ): CATTCGTCATTTAATAAATGACAGTTTTTGACTAACTCATTTCTCACGTTGTCTTTATGGAACTTTTGAGGAGACATAAAAGAAAATACTAGTTTCA






Alignments
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Reference ( family-1207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACTTGATCGATTTT------ANTTCNTT-GCG-ATAATGTTG--------A--------CCATTAT---ACC-AC----T-----------------ATTT------------T---GNTG------------TA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-CGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATTCTT--------------AA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGNA----ATA-----A-ANTATTTNATTT-CATAATAATTTC-TGT-CGAAAC----CATG--TAATATTTTCATA---AGGTCAGT-A-AAN-TGTC--TA-GCTC----CAAGCTGTA-CG-----ATTAA-CCATGATGTATTTNTA-T--CGTGTCAGTATCCA---TATTAC-TGC-CGAAGACGTGTGAA---TTTT--GGNACGATTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAACGTGAG-CT------------ATTACAAATGTACCTA-TACGCATATNTCTGC---AGTATNC---T-TTC----AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATGATTGCTTTTTCG---TTTGATGTANGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCGATGTTTACAAATCATGTCATACGCTT---TTACCCATGTGTAATATANATT-AAA-GGAATGTGACTG-G-ATAGATAGA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTTTT-TGT-CGAAAC----AATG--TAATATTTTCATG---AAGTCAGT-G-AAA-TCTT--TA-CCTC----CAAACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaatA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAG---ATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTC--------------AAATC-TT---AGTTTCTCTTAC-TTTT--G---ATAAAAAGTATTGAGAATACAGTA-----ATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AATATATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA---T--TAC-TGC--GAAGATGTGTGAA---TAT---GGCACGGTT-AT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAA---TATCTGGTGCG-ATATAACTGCTATACTATTT---T-CTCTTCAAT-TTAATA-TTCCATC-AATTCTTT----T--------TTTA--AATAATTG-TTTTTCG---TTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTC----AT-TTAATA-TTCCATCAAATTC-TT----T--------TTTA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaatacagtaatattatttgattttatcataatttcctgtacaaaaccattttcatattaaggttagtaaatatatctaccatgatgtattcttatggtgtcaatatccattactgcgaagatgtgtgaatatggcacggttatgcacaaagaaattaaacatgagcaattacaatatctggtgcgatataactgctatactattttctcttcaatttaatattccatcaattctttttttaaataattgtttttcgtttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctc--GCATGGTTCTTCC------ATATTTGATCGATGTTTCCAAATCATGTCATACTATT---TCACTCGTGTGGAATATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCAT-GCTTTTC---A---AA-----------AATTCTT--------------GA-TC-TTACAAATGT-----AC-TTT---GCGGATAAAAAGTATTGAGTA----ATG-----A-AATATTTTATTT-CATAACAGTGTC-TGT-TGAAAC----CATG--TAATATTTTCACA---AGGTCAGTAA-AAC-TGTCTATA-GCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATCC-----ATTA--TGCACAAAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-TT------------ATTACAAATGTACC---TACGCATATTTCTGC---NGTGTACTTGT-TTC----ATGTCAGTA-TTCaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccaTGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATTC-----ATTA--TGCACAAAGAattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTGTCACAG--AAGTTGGT-AGAAC-TGTC--TAAGC------CAAG-TGTAACGGATATATTAAGCCTTGATGTGGTTGTAGTAACGTGTCGGTACCCG---CATTACACGC-CAGAAACGTGTGAATTGTTTT--GGGACAATCTATGG-CACAGCAGAAAATAAATGTGActctacatgtaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgagataAACTTGATCGATTCTTAGACTAGTTCATT-GCG-ATAATGTT-----------T-----------ATTATATC-TC----T------------------TTT------------T---GCT-------------TA------------CAA--TAATTTA------
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atgtattcaatattttctgaccagattgtggattattgaaAATA-TTCCATC-AATAG-TTA---T--------TTAA--AATGATTGC-TTTTCG---TTTGATGTTGGTT--GCACGAGTCTTTC------ATGTTTGATTGATATTTAAAACTCATGTCATACACTT---Ttagattttcctgatgtatttatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTTTT-TGT-CGAAAC----AATG--TAATATTTTCATG---AAGTCAGT-G-AAA-TCTT--TA-CCTC----CAAACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaatA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAG---ATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTC--------------AAATC-TT---AGTTTCTCTTAC-TTTT--G---ATAAAAAGTATTGAGAATACAGTA-----ATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AATATATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA---T--TAC-TGC--GAAGATGTGTGAA---TAT---GGCACGGTT-AT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAA---TATCTGGTGCG-ATATAACTGCTATACTATTT---T-CTCTTCAAT-TTAATA-TTCCATC-AATTCTTT----T--------TTTA--AATAATTG-TTTTTCG---TTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTC----AT-TTAATA-TTCCATCAAATTC-TT----T--------TTTA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaatacagtaatattatttgattttatcataatttcctgtacaaaaccattttcatattaaggttagtaaatatatctaccatgatgtattcttatggtgtcaatatccattactgcgaagatgtgtgaatatggcacggttatgcacaaagaaattaaacatgagcaattacaatatctggtgcgatataactgctatactattttctcttcaatttaatattccatcaattctttttttaaataattgtttttcgtttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctc--GCATGGTTCTTCC------ATATTTGATCGATGTTTCCAAATCATGTCATACTATT---TCACTCGTGTGGAATATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCAT-GCTTTTC---A---AA-----------AATTCTT--------------GA-TC-TTACAAATGT-----AC-TTT---GCGGATAAAAAGTATTGAGTA----ATG-----A-AATATTTTATTT-CATAACAGTGTC-TGT-TGAAAC----CATG--TAATATTTTCACA---AGGTCAGTAA-AAC-TGTCTATA-GCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATCC-----ATTA--TGCACAAAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-TT------------ATTACAAATGTACC---TACGCATATTTCTGC---NGTGTACTTGT-TTC----ATGTCAGTA-TTCaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccaTGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATTC-----ATTA--TGCACAAAGAattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-GT------------ATTACGAATGTACCTA---CGCATATTTCTGC---AGTAGTC---T-TTC----AT-TTAACAATTCCTTC-AATTC-TTAAT-T--------TTAA--AATAATCG-TTCTTCG---TTTGATGTGCGTT--GCACGAGTCTTCC------ATATTTGATTTATGTTTACAAATC---TC--------------CCCATGTGTAATATACATT-AAAGGGAAAGTGACTGAGATAaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|4                          : tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcaAACTTGATCGATTTT------ATTTCTTT-GTG-ATTATGTTGACCATAATACC-----------ACTATTTT-AC----TTATATAATAATTTATAGATTT------------TCCTGATG------------TATATGTATTGTTAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATtg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaAG---G---AT-----------ACTT--T--------------AA-TC-T----AATTACTCTTAC-CTT---G---ATGAGAAATTGTGAGTA----ATA-----A-AATATTTCATTTTCAAAATAATTTC-TGT-TGAAACAATATATA--TAACAATTTTATA---GGGTCGGT-A-ATA-TGTC--TA-GCTC----CAAGCTATA-CG-----GTGGA-CTAGGAGGTATTTCTA-T--CGTGTCAGT-------------------TGAAGATGTATGCA---TTTT--GGGTCGATTTCT-G-CACAA-AGAAAATAAACACTAG-CG------------ATTACTAATGTACCTA-TACGCATATATCTGC---AACAGCA---T-TTC----AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTAATGTATGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCCATGTTTATAAACCATGTTATACGCTT---TTACCCATATGTAATATAAATTAAAA-GGAATGTGACTGAGATAAATA
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gi|7                          :                                  aaataaaggaaaatgttcatgtttaactgtagaattaagaactacccataattcgtcaaacacaaagaaagagatttatcatccatgcgtttacttcagctgggaatattatttactcattctgctttaaaatggatttcactcaacaaatcaaccttttctccagctgcccctaccccttctgagaaacaatgcaaagtttatatatcgtacggagttgaatgaatacggggacattttcaacgtttcattatttctagcgaaaAACTTGATCGATTTT------ATTTCCTTTGTG-ATTATGTTGA--------CCATAATACCACTATTTTACT-ATATAAT-----------------ATTTAATAGATTTTCCT---GATGATATATGTATTTTA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATA---TCATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATAA---ATGCTTTTTCAAAAATTCTCA-------------AA-TCTT----AGTTTCTCTTACTTTT---G---ATAAAAAGTATTGAGAA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatggA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATACAGTAA-ATTATTTGATTT-TATCATAATTTC-TGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AAA-TATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA---T--TAC-TGC-CGAAGATGTGTGAA---TTTT--GGCACGGTTTAT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAAATATTGCTG-T--GCATATAACTGC-----TATAC---TATT------T-TCTATA-TT-CATC-At
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTTTT-TGT-CGAAAC----AATG--TAATATTTTCATG---AAGTCAGT-G-AAA-TCTT--TA-CCTC----CAAACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaatA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT---CATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAG---ATAAATGCTTTTTCAAAAATTCTC--------------AAATC-TT---AGTTTCTCTTAC-TTTT--G---ATAAAAAGTATTGAGAATACAGTA-----ATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AATATATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA---T--TAC-TGC--GAAGATGTGTGAA---TAT---GGCACGGTT-AT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAA---TATCTGGTGCG-ATATAACTGCTATACTATTT---T-CTCTTCAAT-TTAATA-TTCCATC-AATTCTTT----T--------TTTA--AATAATTG-TTTTTCG---TTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTC----AT-TTAATA-TTCCATCAAATTC-TT----T--------TTTA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatattttaaaacattcattttcaaatatcattttctcaaaacagatcaataatagtctttgatttagataaatgctttttcaaaaattctcaaatcttagtttctcttacttttgataaaaagtattgagaatacagtaatattatttgattttatcataatttcctgtacaaaaccattttcatattaaggttagtaaatatatctaccatgatgtattcttatggtgtcaatatccattactgcgaagatgtgtgaatatggcacggttatgcacaaagaaattaaacatgagcaattacaatatctggtgcgatataactgctatactattttctcttcaatttaatattccatcaattctttttttaaataattgtttttcgtttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctc--GCATGGTTCTTCC------ATATTTGATCGATGTTTCCAAATCATGTCATACTATT---TCACTCGTGTGGAATATA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCAT-GCTTTTC---A---AA-----------AATTCTT--------------GA-TC-TTACAAATGT-----AC-TTT---GCGGATAAAAAGTATTGAGTA----ATG-----A-AATATTTTATTT-CATAACAGTGTC-TGT-TGAAAC----CATG--TAATATTTTCACA---AGGTCAGTAA-AAC-TGTCTATA-GCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATCC-----ATTA--TGCACAAAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-TT------------ATTACAAATGTACC---TACGCATATTTCTGC---NGTGTACTTGT-TTC----ATGTCAGTA-TTCaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccaTGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATTC-----ATTA--TGCACAAAGAattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-GT------------ATTACGAATGTACCTA---CGCATATTTCTGC---AGTAGTC---T-TTC----AT-TTAACAATTCCTTC-AATTC-TTAAT-T--------TTAA--AATAATCG-TTCTTCG---TTTGATGTGCGTT--GCACGAGTCTTCC------ATATTTGATTTATGTTTACAAATC---TC--------------CCCATGTGTAATATACATT-AAAGGGAAAGTGACTGAGATAaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|4                          : tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcaAACTTGATCGATTTT------ATTTCTTT-GTG-ATTATGTTGACCATAATACC-----------ACTATTTT-AC----TTATATAATAATTTATAGATTT------------TCCTGATG------------TATATGTATTGTTAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATtg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaAG---G---AT-----------ACTT--T--------------AA-TC-T----AATTACTCTTAC-CTT---G---ATGAGAAATTGTGAGTA----ATA-----A-AATATTTCATTTTCAAAATAATTTC-TGT-TGAAACAATATATA--TAACAATTTTATA---GGGTCGGT-A-ATA-TGTC--TA-GCTC----CAAGCTATA-CG-----GTGGA-CTAGGAGGTATTTCTA-T--CGTGTCAGT-------------------TGAAGATGTATGCA---TTTT--GGGTCGATTTCT-G-CACAA-AGAAAATAAACACTAG-CG------------ATTACTAATGTACCTA-TACGCATATATCTGC---AACAGCA---T-TTC----AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTAATGTATGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCCATGTTTATAAACCATGTTATACGCTT---TTACCCATATGTAATATAAATTAAAA-GGAATGTGACTGAGATAAATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcaAACTTGATCGATTTT------A--------GCGTATAAT-------------CA-----------ATTACACAGAT----T-----------------TTCC------------T---GGTG------------TA------------T-A--TGTATTGTGACATAAACATTCATTTTCAAATAT--TC--TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTCATGCATTTCA---A---A------------AATTCTT--------------GA---------------TCTTAC-TTTGCGG---ATAAAAAGTATTGAGTA----Atatagtgtctgttt
gi|7                          :                                  aaataaaggaaaatgttcatgtttaactgtagaattaagaactacccataattcgtcaaacacaaagaaagagatttatcatccatgcgtttacttcagctgggaatattatttactcattctgctttaaaatggatttcactcaacaaatcaaccttttctccagctgcccctaccccttctgagaaacaatgcaaagtttatatatcgtacggagttgaatgaatacggggacattttcaacgtttcattatttctagcgaaaAACTTGATCGATTTT------ATTTCCTTTGTG-ATTATGTTGA--------CCATAATACCACTATTTTACT-ATATAAT-----------------ATTTAATAGATTTTCCT---GATGATATATGTATTTTA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATA---TCATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATAA---ATGCTTTTTCAAAAATTCTCA-------------AA-TCTT----AGTTTCTCTTACTTTT---G---ATAAAAAGTATTGAGAA----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatggA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAG---A---AT-----------AATGCTTTTCAAAAATTCTCAAA-TC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAGGA----ATACAGTAA-ATTATTTGATTT-TATCATAATTTC-TGTACAAAAC----CAT---------TTTCATATTAAGGTTAGT-A-AAA-TATC--TA--------------------------------CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCCA---T--TAC-TGC-CGAAGATGTGTGAA---TTTT--GGCACGGTTTAT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAAATATTGCTG-T--GCATATAACTGC-----TATAC---TATT------T-TCTATA-TT-CATC-At


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Reference ( family-1207 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACTTGATCGATTTT------ANTTCNTT-GCG-ATAATGTTGA--------CC-----------ATTATACC-AC----T-----------------ATTT------------T---GATG------------TA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-CGATAATAGTCTTTGATTTAGA-A-AATGC-TTTTCAAAAATTCTC-AATC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAG----NAA-----TAA-ANTATTTNATTT-CATAATAATTT-CTGT-CGAAAC----CATG--TAATATTTTCA---TA-AGGTCAGT-A-AA-N-TGTC--TA-GCTC----CAAGCTGTA-CG-----ATTAA-CCATGATGTATTTNTA-T--CGTGTCAGTATCC-----ATTAC-TGC-CGAAGACGTGTGAA---TTTT--GGNACGATTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAACGTGAG-CT------------ATTACAAATGTACCT-ATACGCATATNTCTGC---AGTATNC---T-TTC----AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATGATTGCTTTTTCG---TTTGATGTANGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCGATGTTTACAAATCATGTCATACGCTT---TTACCCATGTGTAATATANATT-AAA-GGAATGTGACTGAGATAGATAGA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTTT-TTGT-CGAAAC----AATG--TAATATTTTCA---TG-AAGTCAGT-G-AA-A-TCTT--TA-CCTC----CAAACAGTA-CG-----ATTAA-CAATGATGTTTTTCTG-T--CGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaatA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATA---TCATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATA-AATGCTTTTTCAAAAATTCTCAAATCTT----AGTTTCTCTTACTTTT---G---ATAAAAAGTATTGAGAATACAG-----TAATATTATTTGATTT-TATCATAATTTCCTGTACAAAAC----C---------ATTTTCATATTA-AGGTTAGT-A-AATA-TATC--T-------------------------------A-CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCC-----ATTAC-TG--CGAAGATGTGTGAA----TAT--GGCACGG-TTAT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAA---TATCTGGTGCG-ATATAACTGCTATACTATTT---T-CTCTTCAAT-TTAATA-TTCCATC-AATTCTTT----T--------TTTA--AATAATTG-TTTTTCG---TTTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TTC----AT-TTAATA-TTCCATCAAATTC-TT----T--------TTTA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcttcatttaatattccatcaaattcttttttaaattattgtttttcgtttgatgtattttgcacgagcctttcgtagtgatatttgatggatgattacaa
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCG---TTTGATGTATTTT--GCACGAGCCTTTCGTAGTGATATTTGATGGATGATTACAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTC---------------ATGC-TTTTCAAAAATTCTT-GATC-TTACAAATGT-----AC-TTT---GCGGATAAAAAGTATTGAG----TAA-----TGA-AATATTTTATTT-CATAACAGTGT-CTGT-TGAAAC----CATG--TAATATTTTCA---CA-AGGTCAGTAA-AA-C-TGTCTATA-GCTCTAATTAAGCTGTA-CA-----ATTAA-CCATGATGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATCC-----ATTA--TGCACAAAGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-TT------------ATTACAAATGTACC---TACGCATATTTCTGC---NGTGTACTTGT-TTC----ATGTCAGTA-TTCaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccaTGTACTTGTT-T--CATGTCAGTATTC-----ATTA--TGCACAAAGAattatgcacaaagaaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngTTAT-G-CACAA-AGAAAATAAATGTCAT-GT------------ATTACGAATGTACCT-A--CGCATATTTCTGC---AGTAGTC---T-TTC----AT-TTAACAATTCCTTC-AATTC-TTAAT-T--------TTAA--AATAATCG-TTCTTCG---TTTGATGTGCGTT--GCACGAGTCTTCC------ATATTTGATTTATGTTTACAAATC---TC--------------CCCATGTGTAATATACATT-AAAGGGAAAGTGACTGAGATAaaataaatgtcatgtattacgaatgtacctacgcatatttctgcagtagtctttcatttaacaattccttcaattcttaattttaaaataatcgttcttcgtttgatgtgcgttgcacgagtcttccatatttgatttatgtttacaaatctccccatgtgtaatatacattaaagggaaagtgactgagatatg
gi|4                          : tttctcaaaacagacgaaaatagtcatgcttttcaaaaattcttgatcttacaaatgtactttgcggataaaaagtattgagtaatgaaatattttatttcataacagtgtctgttgaaaccatgtaatattttcacaaggtcagtaaaactgtctatagctctaattaagctgtacaattaaccatgatgtacttgtttcatgtcagtatccattatgcacaaagaaaataaatgtcatttattacaaatgtacctacgcatatttctgcngtgtacttgtttcatgtcagtattcaAACTTGATCGATTTT------ATTTCTTT-GTG-ATTATGTTGACCATAATACC-----------ACTATTTT-AC----TTATATAATAATTTATAGATTT------------TCCTGATG------------TATATGTATTGTTAC-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAGA-ATAATGC-TTTTCAAAAATTCTCAAATC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAG----GAA-----Ttg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgttttaaagtacaaataaacatttaaccgcccacccctggtctactccagctgggactatcattttattcaacaagtcagcttcctctccagctgcccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacattttcaatgtttcgatatttctatcgaagtttcagtcatggaaTCAAGGATACTTTAATC-T----AATTACTCTTAC-CTT---G---ATGAGAAATTGTGAG----TAA-----TAA-AATATTTCATTTTCAAAATAATTT-CTGT-TGAAACAATATATA--TAACAATTTTA---TA-GGGTCGGT-A-AT-A-TGTC--TA-GCTC----CAAGCTATA-CG-----GTGGA-CTAGGAGGTATTTCTA-T--CGTGTCAGT-------------------TGAAGATGTATGCA---TTTT--GGGTCGATTTCT-G-CACAA-AGAAAATAAACACTAG-CG------------ATTACTAATGTACCT-ATACGCATATATCTGC---AACAGCA---T-TTC----AT-TTAATA-TTCCATC-AATTC-TT----T--------TTAA--AATTATTG-TTTTTCG---TTTAATGTATGTT--GCACGAGTCTTTC------ATATTTGATCCATGTTTATAAACCATGTTATACGCTT---TTACCCATATGTAATATAAATTAAAA-GGAATGTGACTGAGATAAATA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACTTGATCGATTTT------A--------GCGTATAAT-------------CA-----------ATTACACAGAT----T-----------------TTCC------------T---GGTG------------TA------------T-A--TGTATTGTGACATAAACATTCATTTTCAAATAT--TC--TTTCTCAAAACAGA-CGAAAATAGTC---------------ATGC-ATTTCAAAAATTCTT-GA--------------TCTTAC-TTTGCGG---ATAAAAAGTATTGAG----TAA-----tatagtgtctgttt
gi|7                          :                                  aaataaaggaaaatgttcatgtttaactgtagaattaagaactacccataattcgtcaaacacaaagaaagagatttatcatccatgcgtttacttcagctgggaatattatttactcattctgctttaaaatggatttcactcaacaaatcaaccttttctccagctgcccctaccccttctgagaaacaatgcaaagtttatatatcgtacggagttgaatgaatacggggacattttcaacgtttcattatttctagcgaaaAACTTGATCGATTTT------ATTTCCTTTGTG-ATTATGTTGA--------CCATAATACCACTATTTTACT-ATATAAT-----------------ATTTAATAGATTTTCCT---GATGATATATGTATTTTA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATA---TCATTTTCTCAAAACAGATCAATAATAGTCTTTGATTTAGATA-AATGCTTTTTCAAAAATTCTCAAATCTT----AGTTTCTCTTACTTTT---G---ATAAAAAGTATTGAG----AA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttttattcaacaagtcagcttcctctccagctgccccaccctttatgaaaaacaatgtaaattccttgtatcgtacgtatatagagttgaatgagtacgaaaacatttcaatgtttcgatatttccttcgaatttcagtcatggA------------C-A--TATTTTA------AAACATTCATTTTCAAATAT--TCATTTTCTCAAAACAGA-TGATAATAGTCTTTGATTTAGA-ATAATGC-TTTTCAAAAATTCTCAAATC-T----AGTTTCTCTTAC-TTT---G---ATAAAAAGTATTGAG----GAATACAGTAA-ATTATTTGATTT-TATCATAATTT-CTGTACAAAAC----C---------ATTTTCATATTA-AGGTTAGT-A-AA-A-TATC--T-------------------------------A-CCATGATGTATTCTTA-T--GGTGTCAATATCC-----ATTAC-TGC-CGAAGATGTGTGAA---TTTT--GGCACGGTTTAT-G-CACAA-AGAAATTAAACATGAG-CA------------ATTACAAATATTGCT-GT--GCATATAACTGC-----TATAC---TATT------T-TCTATA-TT-CATC-At
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): AAATAAAGGACAATTTTGCTTACCATACTTTTAACCGTGGAATTAAAGAAGCAAACCAATATTTTCAAACAAAGAAAACGATTCAATTATCAGTTGCATCTATTCCAGTTAGAATTATCATGTCTTATTATATTATTTTTTTGAGAGGTACAGTGTGTTTCCTCCAACGTGCCATTCTCTTCTCCAGCTTCCCCCCACCACCTTCGAAAGCACCCCTCCCCAATTCAAAGTCCTTGTCTCGTATCTGGATGTTATGTAT
Unaligned ( gi|15 ): AACTACCCATAATTCGTCAAACACAAAGAAAAAGATTTATCATCCATGTGTTTACTTCAGCTGGGAATATTATTTACTCAATCTGCTTTGAAATGGATTTCACTCAACAAATCAACCTTT
Unaligned ( gi|16 ): AAATAAAGGAACATGTCGTCTGCTTCCAACTGTGGAATCAAACCTAAAACACTACTTCGTCAAATATAAAAATGACTTCATCATCAGTGCAACCAACTCTCAACTGGGA
Unaligned ( gi|19 ): CATTCGTCATTTAATAAATGACAGTTTTTGACTAACTCATTTCTCACGTTGTCTTTATGGAACTTTTGAGGAGACATAAAAGAAAATACTAGTTTCA