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Reference ( gi|3 )            :       TTTGTTTCTCAA-----GTTAT---ACAATTT--TT--GA-ATGGAGT------CTCTATTCAG-TTT-GATACTTAAA-AAGGGCA--TTTGA-----GATCTAA-CATTT-TGTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAAT-TGTCA--AAAGAA-C--------A---T----A-GAGCCATTTTTCCTCTAA--A--AAG-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGT-CTTTGATT---GCTAC----TACA----GTAC--TGAA-TATATTGCACAGG--TGTACTT
gi|8                          :       TTTGCTTTTCAA-----ATTATGGTATACTCT--TT--AATATGATAT------TTCT--TCAG-TTT-GATAATTAAC-AAGGCCATCTTTGA-----AG--TAA-CACTT-TAATGATACTCTCTGATATTGGAGGAAA-TATCA--AAAG
gi|6                          :      atTTGCTTCTCAA-----ATTGT---AC--TTTA-TTA-GA-GTGAAATAATT--TTTTTTTCAA-TTT-GATATTTAAC-AAA---A--CTTAATCTCTAAACTAA-CATTT-TATCAACACTCTTCAATAATGGA-AAGT-T-TTG--GAAGGA-C--------A---------------ATGT-----CAAATCA--AAG-GATGTTTTAT-TTGGATATTAATCCTTT-CTTTGATT---ATTGC----TTCA----TAAC--AGAA-TATATTGTGCAGG--gttgatgtatatgtataaatagatgttt
gi|15                         :        TTGCTTCTCAA-----GTTAT------ATTTCATTA-GA-GTGAAAT------ATTTCTTCAC-TTT-GATATTCAA
gi|5                          : taatgatgTGTTTCTCAA-----GTTAT---AAAATTT--T---GA-ATGGAGT------CTCTATTCAG-TTTTGATACTTAAA-AAGGGCA--TTTGA-----GATCTAA-CATT---GTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAAT-TGTCA--AAAGAA-C--------A---T----A-GAGCCATTTTTCCTCTAA--A--AAG-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGT-CTTTGATT---GCTAC----TACA----GTAC--TGAA--ATATTGCACAGG--TGTAca
gi|4                          :         TGCTCCTCAATGTATGTTAT---ATTTTTT--TTT-GA-GTGAAGT------CT---TTCA--TTT---CAC------AAAGATA--TCTTA-----GAACTAA-CATTTATG--AATACTCAC-AATACTAG-GAAATATG-CAGAAAAAAA-C--------A---CTGACA-AAGCCATT----AACTGACCA--ATG-AATGGTTAAT-TTGGATGTTAA-TCTAT--TTTGATG---ACGAC----TGTA----ATTT--TTAA-TGTATAGGGCAGGCATGT-CTT
gi|2                          :          GTTTCTCAA-----GTTAT---AAAATTT--TT--GA-ATGGAGT------CTCTATTCAGTTTT-GATACTTAAA-AAGGGCA--TTTGA------ATCTAAGCATTT-TGTTAATGCTTT-TGATATTGGAGAAAT-TGTCA--AAAGAA-C--------A---T----A-GAGCCATTTTTCCTCTAA--A--AAG-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGT-CTTTGATT---GCTAC----TACA----GTAC--GAAA-TATA-TGCACAGG--TGTACTTgtg
gi|10                         :            TTCTGTA-----GTTGC---AC---TT--TT--G---TAGAGTAAAAAATTTTCCTCGC-TTT-GGTATTTGAC-AAAATCA--TCATA-----GAGCTAA-CATTT-TATCAGTACTCTTCAATATCAGAGAAAtgtactttttatgccccctttgaaaaagaggg
gi|1                          :                        acTAT---AC--TTT--GTAAGA-GTGATAT------CTTTTCTCAA-TAT-GAT-TTTAAACAAAGCCA--CCTGA-----GATCTAA-CATTT-CATTGAT------------CAGAGAAAG-TGTTG--AA-GAA-CCACCACTGG---C----A-GAG--ATTTTTTTTTTTA--ATCAAGTAATGATTT-T-TT---------TTCTTT-CTTGGATT---AATAC----TGCG----TTAC--TGAA-TATATTGCGTGAG--TGTATTTatattgggagaca
gi|7                          :                                                                                                              TAA-CATTC-TAGTGAGACTCCTGGATATTAGAAAAAG-TG-CA--AAACAAGC--------AATGT----AAGAGTCTTTTTTTTTTTAACCA--AAG-ACTGGTTTATATTAGATGTTAATCATTT-CTTTGATT---G----------CA----TTAC--TGAGTTATATTGCAtgcagcgtgagcattgatcttggttttgtaaagggattaatacatttttaatttgatgtattcctcagaag
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AGTTTTGCAGTGTAAGATTTTCAGCTGTTGTTTCTGATACTCAAGAAACAAACCCATCGTTTTGGTGCATTCTTTATGAAG
Unaligned ( gi|14 ): GAGTGATAATCCTTTCATTGATAAATACTGCTACGGAATATACTGGATGGGCATATTTTTGCAGCGT
Unaligned ( gi|17 ): TTTTATGCCCCCTTTGAAAAAGAGGG






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Reference ( family-11400 )    :               TTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AC--T-T--T-T-T---GA-GTGAAG--T----CTCTNTTCAGTTT-GATACTTAANAAGGNC--ATCTGAGANCTAA-CATTTTATTAATACTCTCCGATATTGGAGAAAT-TGTCGAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA-C-AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATCCTTTCTTTGATTACTACTGC-------ANT-A--C--TGAA-TATATTGCGCGGGTGTATTT
gi|1                          :                                  TAT-----AC--T-T--T-G-TAA-GA-GTGATA--T----CTTTTCTCAATAT-GATTTTAAACAAAGCC--ACCTGAGATCTAA-CATTTCATTGAT------------CAGAGAAAG-TGTTGAA-GAA---CCACCACTGG---CA-GAGAT-TTTTTTTTTTAA-T-CAA-GTAATGATTT-T-TT---------TTCTTTCTTGGATTAATACTGC-------GTT-A--C--TGAA-TATATTGCGTGAGTGTATTT
gi|10                         :                   CTTCTGTA-----GTTGC-----AC--T-T--T-TGTA--GA-GTAAAAAAT----TT-TCCTCGCTTT-GGTATTTGACAAAATC--ATCATAGAGCTAA-CATTTTATCAGTACTCTTCAATATCAGAGAAAA-TATTGGGAGAtgcagcgtgagcattgatcttggttttgtaaagggattaatacatttttaatttgatgtattcctcagaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                        aTTTGT---AGATGCTTTTCTTTTCTTTGATTGCTACAGC-------GTTCAGTC--TAGA-AATATTGGGCAGGTGTATTTca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                      agcaa-C-AAA-G-AATGATTTAT-TTGGATGTTAACTTATCCTTTGATTACGACTGC-------ATT-T--CGATGGG-CATATTtgcagcgggagcgtgctcacgcttttata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                   cTGATAATCCTTTCATTGATAAATACTGC---------T-A--C--GGAA-TATACTGGATGGGCATATTTttgtag
gi|15                         :             gagTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AT--T-TCAT-T-A---GA-GTGAAA--T----ATTTCTTCACTTT-GATATTCAACAttgcagcgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                     taatgatgT-TTGGATGTTAGTCCCTTCTTTGATTACTATTGC-------ATT-A--C--TAGA-AATATTAC
gi|2                          :                  GTTTCTCAA-----GTTAT-----AAAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGA-ATCTAAGCATTTTGTTAATGCTTTT-GATATTGGAGAAAT-TGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--GAAA-TATA-TGCACAGGTGTACTTttactacagttg
gi|3                          :               TTTGTTTCTCAA-----GTTAT-----ACAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTT-GATACTTAAAAAGGGC--ATTTGAGATCTAA-CATTTTGTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAAT-TGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--TGAA-TATATTGCACAGGTGTACTTtgtactttttatgccccctttgaaaaagaggg
gi|4                          :                 TGCTCCTCAATGTATGTTAT-----AT--T-T--T-T-TTTTGA-GTGAAG--T----CT---TTCATTTC---------ACAAAGAT--ATCTTAGAACTAA-CATTT-ATGAATACTC-ACAATACTAG-GAAATATGCAGAAAAAAACACTG------A---CA-AAGCCATT----AACTGA-C-CAATG-AATGGTTAAT-TTGGATGTTAATC--TATTTTGATGACGACTGT-------AAT-T--T--TTAA-TGTATAGGGCAGGCATGTCT
gi|5                          :                 TGTTTCTCAA-----GTTAT-----AA--AAT--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGAGATCTAA-CATT--GTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAAT-TGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--TGAA--ATATTGCACAGGTGTAtgtg
gi|6                          :                TTGCTTCTCAA-----ATTGT-----AC--T-T--TAT-TA--GA-GTGAAA--TAATTTTTTTTTCAATTT-GATATTTAACAAAACTTAATCTCTAAACTAA-CATTTTATCAACACTCTTCAATAATGGA-AAGT-T-TTGGAAGGA---C--------A-----------AT-----GTCAAATC-AAA-G-GATGTTTTAT-TTGGATATTAATCCTTTCTTTGATTATTGCTTC-------ATA-A--C--AGAA-TATATTGTGCAGG
gi|7                          :                                                                                                                     TAA-CATTCTAGTGAGACTCCTGGATATTAGAAAAAG-TG-CAAAACAAG--C--------AATGTAAGAGTCTTTTTTTTTTTAA-CCAAA-G-ACTGGTTTATATTAGATGTTAATCATTTCTTTGAT------TGC-------ATT-A--C--TGAGTTATATTGC
gi|8                          : ttttaattcttaagTTTGCTTTTCAA-----ATTATGGTATAC--T-C--T-T-T---AATATGA----T----ATTTCTTCAGTTT-GATAATTAACAAGGCC--ATCTTTGAAGTAA-CACTTTAATGATACTCTCTGATATTGGAGGAAA-TATCAAAAGagcataagcattggtcttgttataccccct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                              atTGAACGTTAATCCTTTCTTTGGTTTATACTGCTACATTTAAT-A--A--TGAA-TATCTTGGATGGGTGTATTTgttgatgtatatgtataaatagatgttt
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consensus                     :               TTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AC--T-T--T-T-T---GA-GTGAAG--T----CTCTNTTCAGTTT-GATACTTAACAAGGNC--ATCTNAGANCTAA-CATTTTATTAATACTCTCCGATATTGGAGAAANTGTCGAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA-C-AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATCCTTTCTTTGATTACTACTGC-------ANT-A--C--TGAA-TATATTGCGCGGGCGTATTT
Reference ( family-11400 )    :               TTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AC--T-T--T-T-T---GA-GTGAAG--T----CTCTNTTCAGTTT-GATACTTAACAAGGNC--ATCTNAGANCTAA-CATTTTATTAATACTCTCCGATATTGGAGAAANTGTCGAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA-C-AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATCCTTTCTTTGATTACTACTGC-------ANT-A--C--TGAA-TATATTGCGCGGGCGTATTT
gi|1                          :                                  TAT-----AC--T-T--T-G-TAA-GA-GTGATA--T----CTTTTCTCAATAT-GATTTTAAACAAAGCC--ACCTGAGATCTAA-CATTTCATTGAT------------CAGAGAAAGTGTTGAA-GAA---CCACCACTGG---CA-GAGAT-TTTTTTTTTTAA-T-CAA-GTAATGATTT-T-TT---------TTCTTTCTTGGATTAATACTGC-------GTT-A--C--TGAA-TATATTGCGTGAGTGTATTT
gi|10                         :                   CTTCTGTA-----GTTGC-----AC--T-T--T-TGTA--GA-GTAAAAAAT----TT-TCCTCGCTTT-GGTATTTGACAAAATC--ATCATAGAGCTAA-CATTTTATCAGTACTCTTCAATATCAGAGAAAATATTGGGAGAtgcagcgtgagcattgatcttggttttgtaaagggattaatacatttttaatttgatgtattcctcagaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                       aTTTGT---AGATGCTTTTCTTTTCTTTGATTGCTACAGC-------GTTCAGTC--TAGA-AATATTGGGCAGGTGTATTTca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                     agcaa-C-AAA-G-AATGATTTAT-TTGGATGTTAACTTATCCTTTGATTACGACTGC-------ATT-T--CGATGGG-CATATTtgcagcgggagcgtgctcacgcttttata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                  cTGATAATCCTTTCATTGATAAATACTGC---------T-A--C--GGAA-TATACTGGATGGGCATATTTttgtag
gi|15                         :             gagTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AT--T-TCAT-T-A---GA-GTGAAA--T----ATTTCTTCACTTT-GATATTCAACAttgcagcgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                    taatgatgT-TTGGATGTTAGTCCCTTCTTTGATTACTATTGC-------ATT-A--C--TAGA-AATATTAC
gi|2                          :                  GTTTCTCAA-----GTTAT-----AAAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGA-ATCTAAGCATTTTGTTAATGCTTTT-GATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--GAAA-TATA-TGCACAGGTGTACTTttactacagttg
gi|3                          :               TTTGTTTCTCAA-----GTTAT-----ACAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTT-GATACTTAAAAAGGGC--ATTTGAGATCTAA-CATTTTGTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--TGAA-TATATTGCACAGGTGTACTTtgtactttttatgccccctttgaaaaagaggg
gi|4                          :                 TGCTCCTCAATGTATGTTAT-----AT--T-T--T-T-TTTTGA-GTGAAG--T----CT---TTCATTTC---------ACAAAGAT--ATCTTAGAACTAA-CATTT-ATGAATACTC-ACAATACTAGGAAATATGCAGAAAAAAACACTG------A---CA-AAGCCATT----AACTGA-C-CAATG-AATGGTTAAT-TTGGATGTTAATC--TATTTTGATGACGACTGT-------AAT-T--T--TTAA-TGTATAGGGCAGGCATGTCT
gi|5                          :                 TGTTTCTCAA-----GTTAT-----AA--AAT--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGAGATCTAA-CATT--GTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--TGAA--ATATTGCACAGGTGTAtgtg
gi|6                          :                TTGCTTCTCAA-----ATTGT-----AC--T-T--TAT-TA--GA-GTGAAA--TAATTTTTTTTTCAATTT-GATATTTAACAAAACTTAATCTCTAAACTAA-CATTTTATCAACACTCTTCAATAATG--GAAAGTTTTGGAAGGA---C--------A-----------AT-----GTCAAATC-AAA-G-GATGTTTTAT-TTGGATATTAATCCTTTCTTTGATTATTGCTTC-------ATA-A--C--AGAA-TATATTGTGCAGG
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gi|8                          : ttttaattcttaagTTTGCTTTTCAA-----ATTATGGTATAC--T-C--T-T-T---AATATGA----T----ATTTCTTCAGTTT-GATAATTAACAAGGCC--ATCTTTGAAGTAA-CACTTTAATGATACTCTCTGATATTGGAGGAAATATCAAAAGagcataagcattggtcttgttataccccct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                             atTGAACGTTAATCCTTTCTTTGGTTTATACTGCTACATTTAAT-A--A--TGAA-TATCTTGGATGGGTGTATTTgttgatgtatatgtataaatagatgttt
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lowQualScore                  :                           55555     444444444 4 11 4 4 888  4      11 4444  2 6    9   9    7         0 99    0   0    4     8      4   999             0           9999999999999999999     7  4  44     888   0 0        7 0                         2       8888888 2 3 66 66    00      5  7  0      
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Reference ( family-11400 )    :               TTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AC--T-T--T-T-T---GA-GTGAAG--T----CTCTNTTCAGTTT-GATACTTAACAAGGNC--ATCTNAGANCTAA-CATTTTATTAATACTCTCCGATATTGGAGAAANTGTCGAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA-C-AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATCCTTTCTTTGATTACTACTGC-------ANT-A--C--TGAA-TATATTGCGCGGGCGTATTT
gi|1                          :                                  TAT-----AC--T-T--T-G-TAA-GA-GTGATA--T----CTTTTCTCAATAT-GATTTTAAACAAAGCC--ACCTGAGATCTAA-CATTTCATTGAT------------CAGAGAAAGTGTTGAA-GAA---CCACCACTGG---CA-GAGAT-TTTTTTTTTTAA-T-CAA-GTAATGATTT-T-TT---------TTCTTTCTTGGATTAATACTGC-------GTT-A--C--TGAA-TATATTGCGTGAGTGTATTT
gi|10                         :                   CTTCTGTA-----GTTGC-----AC--T-T--T-TGTA--GA-GTAAAAAAT----TT-TCCTCGCTTT-GGTATTTGACAAAATC--ATCATAGAGCTAA-CATTTTATCAGTACTCTTCAATATCAGAGAAAATATTGGGAGAtgcagcgtgagcattgatcttggttttgtaaagggattaatacatttttaatttgatgtattcctcagaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                       aTTTGT---AGATGCTTTTCTTTTCTTTGATTGCTACAGC-------GTTCAGTC--TAGA-AATATTGGGCAGGTGTATTTca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                     agcaa-C-AAA-G-AATGATTTAT-TTGGATGTTAACTTATCCTTTGATTACGACTGC-------ATT-T--CGATGGG-CATATTtgcagcgggagcgtgctcacgcttttata
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gi|15                         :             gagTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AT--T-TCAT-T-A---GA-GTGAAA--T----ATTTCTTCACTTT-GATATTCAACAttgcagcgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                    taatgatgT-TTGGATGTTAGTCCCTTCTTTGATTACTATTGC-------ATT-A--C--TAGA-AATATTAC
gi|2                          :                  GTTTCTCAA-----GTTAT-----AAAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGA-ATCTAAGCATTTTGTTAATGCTTTT-GATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--GAAA-TATA-TGCACAGGTGTACTTttactacagttg
gi|3                          :               TTTGTTTCTCAA-----GTTAT-----ACAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTT-GATACTTAAAAAGGGC--ATTTGAGATCTAA-CATTTTGTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--TGAA-TATATTGCACAGGTGTACTTtgtactttttatgccccctttgaaaaagaggg
gi|4                          :                 TGCTCCTCAATGTATGTTAT-----AT--T-T--T-T-TTTTGA-GTGAAG--T----CT---TTCATTTC---------ACAAAGAT--ATCTTAGAACTAA-CATTT-ATGAATACTC-ACAATACTAGGAAATATGCAGAAAAAAACACTG------A---CA-AAGCCATT----AACTGA-C-CAATG-AATGGTTAAT-TTGGATGTTAATC--TATTTTGATGACGACTGT-------AAT-T--T--TTAA-TGTATAGGGCAGGCATGTCT
gi|5                          :                 TGTTTCTCAA-----GTTAT-----AA--AAT--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGAGATCTAA-CATT--GTTAATGCTTTCTGATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--TGAA--ATATTGCACAGGTGTAtgtg
gi|6                          :                TTGCTTCTCAA-----ATTGT-----AC--T-T--TAT-TA--GA-GTGAAA--TAATTTTTTTTTCAATTT-GATATTTAACAAAACTTAATCTCTAAACTAA-CATTTTATCAACACTCTTCAATAATG--GAAAGTTTTGGAAGGA---C--------A-----------AT-----GTCAAATC-AAA-G-GATGTTTTAT-TTGGATATTAATCCTTTCTTTGATTATTGCTTC-------ATA-A--C--AGAA-TATATTGTGCAGG
gi|7                          :                                                                                                                     TAA-CATTCTAGTGAGACTCCTGGATATTAGAAAAAGTG-CAAAACAAG--C--------AATGTAAGAGTCTTTTTTTTTTTAA-CCAAA-G-ACTGGTTTATATTAGATGTTAATCATTTCTTTGAT------TGC-------ATT-A--C--TGAGTTATATTGC
gi|8                          : ttttaattcttaagTTTGCTTTTCAA-----ATTATGGTATAC--T-C--T-T-T---AATATGA----T----ATTTCTTCAGTTT-GATAATTAACAAGGCC--ATCTTTGAAGTAA-CACTTTAATGATACTCTCTGATATTGGAGGAAATATCAAAAGagcataagcattggtcttgttataccccct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                             atTGAACGTTAATCCTTTCTTTGGTTTATACTGCTACATTTAAT-A--A--TGAA-TATCTTGGATGGGTGTATTTgttgatgtatatgtataaatagatgttt


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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|17 ): TTTTATGCCCCCTTTGAAAAAGAGGG






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Reference ( family-11400 )    :               TTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AC--T-T--T-T-T---GA-GTGAAG--T----CTCTNTTCAGTTT-GATACTTAACAAGGNC--ATCTNAGANCTAA-CATTTTATTAATACTCTCTGATATTGGAGAAANTGTCGAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA-C-AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATCCTTTCTTTGATTACTACTGC-------ANT-A--C--TGAA-TATATTGCGCGGGCGTATTT
gi|1                          :                                  TAT-----AC--T-T--T-G-TAA-GA-GTGATA--T----CTTTTCTCAATAT-GATTTTAAACAAAGCC--ACCTGAGATCTAA-CATTTCATTGAT------------CAGAGAAAGTGTTGAA-GAA---CCACCACTGG---CA-GAGAT-TTTTTTTTTTAA-T-CAA-GTAATGATTT-T-TT---------TTCTTTCTTGGATTAATACTGC-------GTT-A--C--TGAA-TATATTGCGTGAGTGTATTT
gi|10                         :                   CTTCTGTA-----GTTGC-----AC--T-T--T-TGTA--GA-GTAAAAAAT----TT-TCCTCGCTTT-GGTATTTGACAAAATC--ATCATAGAGCTAA-CATTTTATCAGTACTCTTCAATATCAGAGAAAATATTGGGAGAtgcagcgtgagcattgatcttggttttgtaaagggattaatacatttttaatttgatgtattcctcagaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                       aTTTGT---AGATGCTTTTCTTTTCTTTGATTGCTACAGC-------GTTCAGTC--TAGA-AATATTGGGCAGGTGTATTTca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                     agcaa-C-AAA-G-AATGATTTAT-TTGGATGTTAACTTATCCTTTGATTACGACTGC-------ATT-T--CGATGGG-CATATTtgcagcgggagcgtgctcacgcttttata
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gi|15                         :             gagTTGCTTCTCAA-----GTTAT-----AT--T-TCAT-T-A---GA-GTGAAA--T----ATTTCTTCACTTT-GATATTCAACAttgcagcgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                    taatgatgT-TTGGATGTTAGTCCCTTCTTTGATTACTATTGC-------ATT-A--C--TAGA-AATATTAC
gi|2                          :                  GTTTCTCAA-----GTTAT-----AAAAT-T--T-T-T---GA-ATGGAG--T----CTCTATTCAGTTTTGATACTTAAAAAGGGC--ATTTGA-ATCTAAGCATTTTGTTAATGCTTT-TGATATTGGAGAAATTGTCAAAAGAA---C--------A---TA-GAGCCATTTTTCCTCTAA---AAA-G-AATGGTTTGT-TTGGATGTTAATTCTGTCTTTGATTGCTACTAC-------AGT-A--C--GAAA-TATA-TGCACAGGTGTACTTttactacagttg
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gi|6                          :                TTGCTTCTCAA-----ATTGT-----AC--T-T--TAT-TA--GA-GTGAAA--TAATTTTTTTTTCAATTT-GATATTTAACAAAACTTAATCTCTAAACTAA-CATTTTATCAACACTCTTCAATAATG--GAAAGTTTTGGAAGGA---C--------A-----------AT-----GTCAAATC-AAA-G-GATGTTTTAT-TTGGATATTAATCCTTTCTTTGATTATTGCTTC-------ATA-A--C--AGAA-TATATTGTGCAGG
gi|7                          :                                                                                                                     TAA-CATTCTAGTGAGACTCCTGGATATTAGAAAAAGTG-CAAAACAAG--C--------AATGTAAGAGTCTTTTTTTTTTTAA-CCAAA-G-ACTGGTTTATATTAGATGTTAATCATTTCTTTGAT------TGC-------ATT-A--C--TGAGTTATATTGC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                             atTGAACGTTAATCCTTTCTTTGGTTTATACTGCTACATTTAAT-A--A--TGAA-TATCTTGGATGGGTGTATTTgttgatgtatatgtataaatagatgttt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AGTTTTGCAGTGTAAGATTTTCAGCTGTTGTTTCTGATACTCAAGAAACAAACCCATCGTTTTGGTGCATTCTTTATGAAG
Unaligned ( gi|17 ): TTTTATGCCCCCTTTGAAAAAGAGGG