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gi|3                          :           TTCTTCCTGTGT---AAAGTGCAGGA--TTTCCAGGG-AGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGAT--GAGTAC-C-G-CTAAA-----AACCTT-TCCGCA--AATGTACAGTTAAATTATGGAT-A-AAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CT-----TGG-GCATATTGTCTGGGTGGAAGTCAGCA-------GCATG-CGAGAGGGCTTG-ATGGAACTAGCCA--CCCTCACTGAAGATG-GTAGT-TTGTTCCAGTCGCG--GATTGTGCGTGGGA---AGGAGTTG-TCATTCAGTTCCTTGCCAGT--AATGAG----TTGGA-GATACTTCTGTGCTTCTCTTTTTCTGTTGTTCCCTGGTGTTAGATTAGTAAG-AGCATGTATGTGGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCC-TGT-AGATT-ATGATG-AGCC-TAGATGTTCT-ACG-GC-GGT--CAA-CAAGGTACCTCATTGCAACTGATGGATCATGTGCATC-ATGCTGCCCGGT----GAGCGATCCCTGAAG--TTACCGGTG-AC-AATCTGGCTGT-TCCCT-TTGGGCAC-CTTC-ACGATCTTTT-TCAGATTTGTG------------TGGTATGTTCCT--AAACG-GAAA-T----GCATATTCCAATGA-TAGGCGACCAT-TGTCTTATA-TGTCATGG-ATCGAAT-TGG---TTTGCA-ATATTTATAGAGTTCCT-CTTGATA-AATCCAAGGGGT-TTTGTGG-TTTTTGGTCTT-TGTGT-GGAGAT-----TTGCAAA-----AAGCTTGTTGTGG-AAG-GTAACTCATAGATAT-----TTG------CAC--TGCTGA-TTCTTCGA-GG---GT--ATGG-CC-Aa
gi|8                          :           TTCTTCCTGTAC---AA-ATGCAGAA--CTCCCAGGAGAGTGTAAATA------TGGACTG----ACG-CATGCT--AGGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATCTACAGTTAAAATAAGGATAA-AAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CT-----GGA-GCATGCTGTCTGGGTGGAAG-------TCAGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCATTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGCA--GATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATA
gi|17                         :           TTCTTCCTGTGC---AA-GTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----A
gi|15                         : ttcttcttaaaTCTTCCTTCACTTCGA-GTGCAGGA--TTCTTATAG-AGTGTAAGTA------TGCACTGGTGTACG-GATTCTCAAAG-AC-A-G-ATAAA-----ATCC-T-TAGGCAGTATTTTACAATTAAAACA--GAT-A-Attatacccaggtcttgaaaatattcctattaaagatggataacaaactct
gi|5                          :              tccttttac---AA-GTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGAT-ACAAACACTTCG-TCT-GTGTCTCACTGA-CT-----GGA-GCACGCTGCCTGGGTGGAAG-------TCAGCAGCATG-CGGAAGGTCTCG-ATGGGACATGCCA--TCCTCACTGA--AC--GTAGA-TTACTCCCGTCGCG--GTGTGTGCATGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCGGA--GAG----TTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCACCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCAAA-ATCT-TGT-AGAGC-ATGAT-GAGCC-TAGATGTTCT-ACG-G-CGGT--CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGGTGAATCATGTGCGTC-ATGCTGACCGGT----GAGCGATCCCTGTTG--TTACCAGT-GACGAATTTAGCTGCTCTTCT-TTGGACAC-CTTCCAAGAT-CTTTATCAGGTTTTGG------------TGGTAT---TCCCAAACGG-AACT-T----GCATATTCCAA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                    ttgtcaCCA--TTCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATACTTCCTTGCCAGCGGA--GAG----TTGGA-GATACTTCCGGACTCCTCTTGTTCTGTTGTCTCCAGGTGTTAGATAAGTGGG-AATATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCT-T
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttaG-ATCT-CGT-AGAGC-ATGATGACTTTAT-----TCCTGACCCTCCTGTGCTGC-AAGGGC-TCCCATGCCAGCTGATGTAAC----------ATGCTG----GTAACACAACG------GTAG--TTTCCAGTGG-CGAATCTGGCTGC-CTGGCGTTG--TACTTGCTCAAG------T-TCAGTTGTTGGATTTGCTGTAGATGGTAAGGGTCC--CAT----ACTGTTGAGGCATATT-CAAGGA-CAGG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   nnTCCATT-TCAAGGTC-TTGTGA-ATG-TTAATTCCAAGGTAC-T---TTGCTGAGTCA--------ACCACGTCAAGGGTGTGTCCATGGATC-ATGTA--TG--T------AT--ATTCAATTA-C---------ACTTCCTCTT-GTGGTGA-CATGCAGA----ACTTGGCACT--TCTT--GGG-AT--GGAAC-TC--CATCAACCA-GTCATCCT-CCCACGCTT--GCAATGATTCCAGGTCTT--GTTGGAGTTTGATG--GCATCCTGTTTCTGTTCTGAT-GTTACGATACAGAATA-CAG-----TCATCCGCAAAGAGGCGc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggtaacatggttgagtggtggtCTTTCAAGG---GT--GTGA-CC-ATGGAGATGGTA------ATCCACT---TTGACTGGTATTT-------TCTT-CCTG-GT-GATGTGGATG--GTGGTACATT--CTTC--TGG-GT--GGA---ATGACATCTGCCAGCC--TTTT-CCCCATaaccgttgatcccatccgatacacaattaggaaggtcattaatatataggaaggaaacgcaacggtccgagcacacttccctgagggacaccggactgggctgggctgccgatgatgtaacgccttccagtataacttgttgtgtccgacctgcaaggaagtcctttatccaccctagatgactgcttctgatcccgtaagtgatgtagttttatacaggagacgcctatgggggactttatcgaacgccttttgaaaaatccagtaggatgacatccgtttggcccttcaagtcgata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gatctcgtagagcatgatgactttattcctgaccctcctgtgctgcaagggctcccatgccagctgatgtaacatgctggtaacacaacggtagtttccagtggcgaatctggctgcctggcgttgtacttgctcaagttcagttgttggatttgctgtagatggtaagggtcccatactgttgaggcatattcaaggacaggtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaaca--ATGT-CC-GTGTA-ATG--AGTACTGAT--ATT---TTA-AA--CGTTT--TTGTTTTTTCGT---GA-GATGGTGAGT--ACCTGGCACTAATCTGGATGG-ATTCGGA---CC--AATTT-CCAAG---TTAT-CCCAgtctctcaagtgc
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCCAACTCTTGGAGACTGTTTAGGTGTCATTGTGGCGCTGCTGTGTCATCTGGACTGTTAACATTTCGATACAGCAGGCAAAGAGACGGGCTATTGATTTCATTTGTGCAAGTAGATCGTTAATGTACACAAGGAATAGCAAGGGTCCTAGCACAGTCCCCTACGGTACTCCGAAGGTTACTGGCGCTGATTCTGACATCATTCTTTCCACGACAACACGTTGGGTTCTGTTATTAAGGAATGGTTCTATCCAA
Unaligned ( gi|10 ): TGCCTTGTATATGGTCTGTTGATTATATGTCACGCCATGACAGATCCTGACTATGATCACGCCTATCAGTACTTTCCGTTCCTGGAACACTTTTCAAAGTATTGGCCTGGTATTTGGGTAATCCACTTCTTGATTGGTTCTTTTCTCTCTAGGTATATGCGATGGTGGGTTACTATTTTTTTCTGGTGTGGTGACTTATGACCATCTGCCTAGTCTTTTTTATCCCGTATGTTCTCAAATGCT
Unaligned ( gi|12 ): TCGATGACTCTCCATCCACTAGTACTACGACTTGTTGACTATGATTGGCAAGGAAGCTCCCAATCCACTTCAACGTGTACCCCCTCACGCCATAATGGTGCAGTTTCATGGCTAGCCGGTGATGAGCGACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCCAGTGTGATGGCGTCTATCTGCTATTTGTTGTCGTTCAGG
Unaligned ( gi|13 ): GTTGCAACCATATCAACCGATGGAGCATGTTGGTCACACAGCTGGGTTCTCAGGAGCAGAAGTCGCCTGTGGCAAATACCGGTATATATGGCAGCTCGACTTTGGATGTTGGATCCGATGCTGGTTGTAACGGTCCCATACT
Unaligned ( gi|14 ): CAAAGAAACGGGCTTTGGACTTTACTTGTGCAGGTAGGTCCCCCGAGGCACTCTGGAGGTTACTGGTACTGATTTTGACATCATTCCTTCCACGACAACACGTTGGTTTCTATTGCTAAGGAATGATTCTATCCAAGA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTTACCTCTTTCCATAGTTGATGTAGTTTGGGGCTGACGGCTATGGCAAACCTTTGTCAAAGGCTTTACTGAAGTCTATTATTGGCAGATTTCTGTTA
Unaligned ( gi|22 ): ATTTATGCCCAGGTACTTTGCTGAATTGATGTGTTCAAGCAAATGTCCATGTAATGTGTAATGAAATTTCGACGTGTTTTTTCGTGA






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gi|20                         :              TCTTCTCCCTGTGA-AAGTGCAGGA--TTT-----GGAGTGTAAATA------TGCATTG----ATG-CATGCT--AAGCAC-A-GCCTAGAAATCTAACCTT-TCGGCAT-AATTCATActtg
gi|21                         :              TCTTCTTCCTGTCA-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TC--TA--AATTtaca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCC--AGGTAC-T---TTGCTG-AAT-TGAT-G--T-GT--TCAAGCA---A---ATGT-CCATGTA-ATG--
gi|23                         :      atttatgTTCTTCTTCCTGTAC-AGGTACAGGA--CTCCCGGGGGAGTGTAAATA------TTCATTtgtaatgaaatttcgacgtgttttttcgtga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cGATC-TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-ATC-GGAACTT---GCATATTCCAATAATGGGC-tcaaatcttgagtatccta
gi|25                         :           nnTTCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACT
gi|26                         :            cTTCTTCTTCCTGTGC-TCGTGCAGGA--CTCTCAGGGGAGTGTAAATA------Tcaggatt
gi|27                         :             TCCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        tcCCA--TTCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCC
gi|3                          :                TTCTTCCTGTGTAAAGTGCAGGA--TTTCCA-GGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGAT--GAGTAC-C-G-CTAAA-----AACCTT-TCCGCA--AATGTACAGTTAAATTATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTTGGG--CATAT-TGTCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGAGAGGGCTTG-ATGGAACTAGCCA--CCCTCACTGAAGATG-GTAGT-TTGTTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGG---GAAGGAGTTG-TCATTCAGTTCCTTGCCAGTA-ATGA--GTTGGA-GATACTTCTGTGCTTCTCTTTTTCTGTTGTTCCCTGGTGTTAGATTAGTAAG-AGCATGTATGTGGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCC-TGT-AGATT-ATGAT-GAGCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAA-GGTACCTCATTGCAACTGATGGATCATGTGCAT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGAAG--TTACCGGT-GAC-AATCTGGCTGTTC-CCT-TTGGGCAC-CTT--CACGATCTTTT-TCAGATTT--G---TGTGGTAT-GTTCCTA-AAC-G-GAAAT---GCATATTCCAATGATAGGC-GACCAT-TGTCTTAT-ATGTCAT-GGATCGAATT----GGTTTGCAAT-ATTTATAGAGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGGG-TTTTGTGGT-TTTTGGTCTT-TGTG-TGGAGAT-TTGCAAA---------AAGCTTGTTGTGG-AAG-GTAACTCATAGATAT-T-------TG-CAC-TGCTGAT-T-CT--TCGA-GG---GT--ATGG-CCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCATT-TCAAGGTC-TTGTGA-ATG-TTAATTCCAAGGTAC-T---TTGCTG--AG-T-CA-AC-CACG--TCAAGGGTGTGTCCATGGATCATGTA--TG--TAT--A-T------TC-A--AT--TAC---ACTTCCTCTTGTGGTG-ACATGCAGA----ACTTGGCACTTCTTGGG-ATGGAAC-T-----C--CATCAACCAGT-CATCCTCCCACGCTTG--CAATGATTCCAGGTCT--TGTTGGAGTTTGATG--GCATCCTGTTTCTGTTCTGA-TGTTACGATACAGAATA-CAG-----TCATCCGCAAAGAGGCG
gi|5                          :    ttggtaacatggttgagtggtggt-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATACAAA-CACTTCG-TCTG-TGTCTCACTGA-CTGGAG--CACGC-TGCCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGTCTCG-ATGGGACATGCCA--TCCTCACTGA--ACG--TAGA-TTACTCCCGTCGC--GGTGTGTGCATGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCACCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCAAA-ATCT-TGT-AGAGC-ATGAT-GAGCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGGTGAATCATGTGCGT-CATGCTGACCGGTGA-GCGATCCCTGTTG--TTACCAGT-GACGAATTTAGCTGCTCTTCT-TTGGACAC-CTTC-CAAGAT-CTTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-AACGG-AACTT---GCATATTCCAAaaccgttgatcccatccgatacacaattaggaaggtcattaatatataggaaggaaacgcaacggtccgagcacacttccctgagggacaccggactgggctgggctgccgatgatgtaacgccttccagtataacttgttgtgtccgacctgcaaggaagtcctttatccaccctagatgactgcttctgatcccgtaagtgatgtagttttatacaggagacgcctatgggggactttatcgaacgccttttgaaaaatccagtaggatgacatccgtttggcccttcaagtcgata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtcaG-ATCT-CGT-AGAGC-ATGATGACTTTAT-----TCCTGACCC-TCCTGTGCTGCAAGGGC-TCCCATGCCAGCTGATGTA--A--------CATGCTG----GTAACACAA---CGGTAG--TTTCCAGTGG-CGAATCTGGCTGC-CTGGCGTTG--TAC-TTGCTCAAGTTCAGTTGTTGGATTTGCTGTAGATGGTAAGGGTCCCATACT-G----TTGAGGCATATT-CAAGGACAGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AC-A-CT--TTCAAGG---GT--GTGA-CCATGGAGATGGTAATCCACT------TTGA--CTGGTATTT-------TCTTCCTG-G-TGATGTGGATG--GTGGTACATTCTTCTGG-GTGGA---A-----TGACATCTGCCAGC-C-TTTTCCCCATtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaacactttcaagggtgtgaccatggagatggtaatccactttgactggtattttcttcctggtgatgtggatggtggtacattcttctgggtggaatgacatctgccagccttttccccatgtctctcaagtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatctcgtagagcatgatgactttattcctgaccctcctgtgctgcaagggctcccatgccagctgatgtaacatgctggtaacacaacggtagtttccagtggcgaatctggctgcctggcgttgtacttgctcaagttcagttgttggatttgctgtagatggtaagggtcccatactgttgaggcatattcaaggacaggtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccagga--AAGTAC-T---TTGCTG-AAT-TG---AC-T-TTGTTCA--GC---AC--ATGT-CCGTGTA-ATG--AGT--ACTGATATTTT-AAACG--TTTTT-GTT--TTTTCGT---G-AGATGGTGAGT--ACCTGGCACTAATCTGG-ATGGA---TTCGGAC--CAATTTCCAAG---TTATCCCAgtctctcaagtgc
gi|8                          : gttatatttatgcctTTCTTCCTGTAC-AAATGCAGAA--CTCCCAGGAGAGTGTAAATA------TGGACTG----ACG-CATGCT--AGGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATCTACAGTTAAAATAAGGATA-AAAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCATTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--AGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATAcagctggctagcttatgcaggtcgtcctgtagaacttgatcgtctgcttcagatgtgatggctaagtatgctatcgtgtcgtcagcaaataaacgcactgttgattcaatgccaagagacatgtcgttgatgtaaaataagaacagcatggtcctaagaccgatccctacggcacaccggactatag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCCAACTCTTGGAGACTGTTTAGGTGTCATTGTGGCGCTGCTGTGTCATCTGGACTGTTAACATTTCGATACAGCAGGCAAAGAGACGGGCTATTGATTTCATTTGTGCAAGTAGATCGTTAATGTACACAAGGAATAGCAAGGGTCCTAGCACAGTCCCCTACGGTACTCCGAAGGTTACTGGCGCTGATTCTGACATCATTCTTTCCACGACAACACGTTGGGTTCTGTTATTAAGGAATGGTTCTATCCAA
Unaligned ( gi|10 ): TGCCTTGTATATGGTCTGTTGATTATATGTCACGCCATGACAGATCCTGACTATGATCACGCCTATCAGTACTTTCCGTTCCTGGAACACTTTTCAAAGTATTGGCCTGGTATTTGGGTAATCCACTTCTTGATTGGTTCTTTTCTCTCTAGGTATATGCGATGGTGGGTTACTATTTTTTTCTGGTGTGGTGACTTATGACCATCTGCCTAGTCTTTTTTATCCCGTATGTTCTCAAATGCT
Unaligned ( gi|12 ): TCGATGACTCTCCATCCACTAGTACTACGACTTGTTGACTATGATTGGCAAGGAAGCTCCCAATCCACTTCAACGTGTACCCCCTCACGCCATAATGGTGCAGTTTCATGGCTAGCCGGTGATGAGCGACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCCAGTGTGATGGCGTCTATCTGCTATTTGTTGTCGTTCAGG
Unaligned ( gi|13 ): GTTGCAACCATATCAACCGATGGAGCATGTTGGTCACACAGCTGGGTTCTCAGGAGCAGAAGTCGCCTGTGGCAAATACCGGTATATATGGCAGCTCGACTTTGGATGTTGGATCCGATGCTGGTTGTAACGGTCCCATACT
Unaligned ( gi|14 ): CAAAGAAACGGGCTTTGGACTTTACTTGTGCAGGTAGGTCCCCCGAGGCACTCTGGAGGTTACTGGTACTGATTTTGACATCATTCCTTCCACGACAACACGTTGGTTTCTATTGCTAAGGAATGATTCTATCCAAGA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTTACCTCTTTCCATAGTTGATGTAGTTTGGGGCTGACGGCTATGGCAAACCTTTGTCAAAGGCTTTACTGAAGTCTATTATTGGCAGATTTCTGTTA






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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCC--AGGTAC-T---TTGCTG-AAT-TGAT-G--T-GT--TCAAGCA-A-----ATGT-CCATGTA-ATG--
gi|23                         :      atttatgTTCTTCTTCCTGTAC-AGGTACAGGA--CTCCCGGGGGAGTGTAAATA------TTCATTtgtaatgaaatttcgacgtgttttttcgtga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-ATC-GGAACTT---GCATATTCCAATAATGGGC-tcaaatcttgagtatccta
gi|25                         :           nnTTCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACT
gi|26                         :            cTTCTTCTTCCTGTGC-TCGTGCAGGA--CTCTCAGGGGAGTGTAAATA------Tcaggatt
gi|27                         :             TCCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        tcCCA--TTCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCC
gi|3                          :                TTCTTCCTGTGTAAAGTGCAGGA--TTTCCA-GGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGAT--GAGTAC-C-G-CTAAA-----AACCTT-TCCGCA--AATGTACAGTTAAATTATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTTGGG--CATAT-TGTCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGAGAGGGCTTG-ATGGAACTAGCCA--CCCTCACTGAAGATG-GTAGT-TTGTTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGG---GAAGGAGTTG-TCATTCAGTTCCTTGCCAGTA-ATGA--GTTGGA-GATACTTCTGTGCTTCTCTTTTTCTGTTGTTCCCTGGTGTTAGATTAGTAAG-AGCATGTATGTGGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCC-TGT-AGATTATGAT-GA-GCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAA-GGTACCTCATTGCAACTGATGGATCATGTGCAT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGAAG--TTACCGGT-GAC-AATCTGGCTGTTC-CCT-TTGGGCAC-CTT--CACGATCT-TTT-TCAGATTT--G---TGTGGTAT-GTTCCTA-AAC-G-GAAAT---GCATATTCCAATGATAGGC-GACCAT-TGTCTTAT-ATGTCAT-GGATCGAATT----GGTTTGCAAT-ATTTATAGAGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGG-GTTTTGTGGTTTTTGGTCTT-TGTG-TGGAGAT-TTGCAAA---------AAGCTTGTTGTGG-AAG-GTAACTCATAGATAT-T-------TG-CAC-TGCTGAT-T-CT--TCGA-GG-GT----ATGG-CCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCATT-TCAAGGTC-TTGTGA-ATG-TTAATTCCAAGGTAC-T---TTGCTG--AG-T-CA-AC-CACG--TCAAGGGTGTGTCCATGGATCATGT--ATG--TAT--A-T------TC-A--AT--TA--C-ACTTCCTCTTGTGGTG-ACATGCAGA----ACTTGGCACTTCTTGGG-ATGGAAC-T-----C--CATCAACCAGT-CATCCTCCCACGCTTGCAATGATTCCAGGTCT--TGTTGGAGTTTGATG--GCATCCTGTTTCTGTTCTGATGTTACGATACAGAATA-CAG------TCATCCGCAAAGAGGCG
gi|5                          :    ttggtaacatggttgagtggtggt-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATACAAA-CACTTCG-TCTG-TGTCTCACTGA-CTGGAG--CACGC-TGCCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGTCTCG-ATGGGACATGCCA--TCCTCACTGA--ACG--TAGA-TTACTCCCGTCGC--GGTGTGTGCATGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCACCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCAAA-ATCT-TGT-AGAGCATGAT-GA-GCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGGTGAATCATGTGCGT-CATGCTGACCGGTGA-GCGATCCCTGTTG--TTACCAGT-GACGAATTTAGCTGCTCTTCT-TTGGACAC-CTTC-CAAGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-AACGG-AACTT---GCATATTCCAAaaccgttgatcccatccgatacacaattaggaaggtcattaatatataggaaggaaacgcaacggtccgagcacacttccctgagggacaccggactgggctgggctgccgatgatgtaacgccttccagtataacttgttgtgtccgacctgcaaggaagtcctttatccaccctagatgactgcttctgatcccgtaagtgatgtagttttatacaggagacgcctatgggggactttatcgaacgccttttgaaaaatccagtaggatgacatccgtttggcccttcaagtcgata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtcaG-ATCT-CGT-AGAGCATGATGAC-TTTAT-----TCCTGACCC-TCCTGTGCTGCAAGGGC-TCCCATGCCAGCTGATGTA--A--------CATGCTG----GTAACACAA---CGGTAG--TTTCCAGTGG-CGAATCTGGCTGC-CTGGCGTTG--TAC-TTGCTCAAGTTCAGTTG-TTGGATTTGCTGTAGATGGTAAGGGTCCCATACT-G----TTGAGGCATATT-CAAGGACAGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AC-A-CT--TTCAAGG-GT----GTGA-CCATGGAGATGGTAATCCACT------TTGA--CTGGTATTT-------TCTTCCTG-G-TGATGTGGATG--GTGGTACATTCTTCTGG-GTGGA---A-----TGACATCTGCCAGC-C-TTTTCCCCATtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaacactttcaagggtgtgaccatggagatggtaatccactttgactggtattttcttcctggtgatgtggatggtggtacattcttctgggtggaatgacatctgccagccttttccccatgtctctcaagtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatctcgtagagcatgatgactttattcctgaccctcctgtgctgcaagggctcccatgccagctgatgtaacatgctggtaacacaacggtagtttccagtggcgaatctggctgcctggcgttgtacttgctcaagttcagttgttggatttgctgtagatggtaagggtcccatactgttgaggcatattcaaggacaggtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccagga--AAGTAC-T---TTGCTG-AAT-TG---AC-T-TTGTTCA--GC-AC----ATGT-CCGTGTA-ATG--AGT--ACTGATATTTT-AAACG--TTTTT-GTT--TTTTCGT---G-AGATGGTGAGT--ACCTGGCACTAATCTGG-ATGGA---TTCGGAC--CAATTTCCAAG---TTATCCCAgtctctcaagtgc
gi|8                          : gttatatttatgcctTTCTTCCTGTAC-AAATGCAGAA--CTCCCAGGAGAGTGTAAATA------TGGACTG----ACG-CATGCT--AGGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATCTACAGTTAAAATAAGGATA-AAAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCATTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--AGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATAcagctggctagcttatgcaggtcgtcctgtagaacttgatcgtctgcttcagatgtgatggctaagtatgctatcgtgtcgtcagcaaataaacgcactgttgattcaatgccaagagacatgtcgttgatgtaaaataagaacagcatggtcctaagaccgatccctacggcacaccggactatag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCCAACTCTTGGAGACTGTTTAGGTGTCATTGTGGCGCTGCTGTGTCATCTGGACTGTTAACATTTCGATACAGCAGGCAAAGAGACGGGCTATTGATTTCATTTGTGCAAGTAGATCGTTAATGTACACAAGGAATAGCAAGGGTCCTAGCACAGTCCCCTACGGTACTCCGAAGGTTACTGGCGCTGATTCTGACATCATTCTTTCCACGACAACACGTTGGGTTCTGTTATTAAGGAATGGTTCTATCCAA
Unaligned ( gi|10 ): TGCCTTGTATATGGTCTGTTGATTATATGTCACGCCATGACAGATCCTGACTATGATCACGCCTATCAGTACTTTCCGTTCCTGGAACACTTTTCAAAGTATTGGCCTGGTATTTGGGTAATCCACTTCTTGATTGGTTCTTTTCTCTCTAGGTATATGCGATGGTGGGTTACTATTTTTTTCTGGTGTGGTGACTTATGACCATCTGCCTAGTCTTTTTTATCCCGTATGTTCTCAAATGCT
Unaligned ( gi|12 ): TCGATGACTCTCCATCCACTAGTACTACGACTTGTTGACTATGATTGGCAAGGAAGCTCCCAATCCACTTCAACGTGTACCCCCTCACGCCATAATGGTGCAGTTTCATGGCTAGCCGGTGATGAGCGACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCCAGTGTGATGGCGTCTATCTGCTATTTGTTGTCGTTCAGG
Unaligned ( gi|13 ): GTTGCAACCATATCAACCGATGGAGCATGTTGGTCACACAGCTGGGTTCTCAGGAGCAGAAGTCGCCTGTGGCAAATACCGGTATATATGGCAGCTCGACTTTGGATGTTGGATCCGATGCTGGTTGTAACGGTCCCATACT
Unaligned ( gi|14 ): CAAAGAAACGGGCTTTGGACTTTACTTGTGCAGGTAGGTCCCCCGAGGCACTCTGGAGGTTACTGGTACTGATTTTGACATCATTCCTTCCACGACAACACGTTGGTTTCTATTGCTAAGGAATGATTCTATCCAAGA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTTACCTCTTTCCATAGTTGATGTAGTTTGGGGCTGACGGCTATGGCAAACCTTTGTCAAAGGCTTTACTGAAGTCTATTATTGGCAGATTTCTGTTA






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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCC--AGGTAC-T---TTGCTG-AAT-TGAT-G--T-GT--TCAAGCA-A-----ATGT-CCATGTA-ATG--
gi|23                         :      atttatgTTCTTCTTCCTGTAC-AGGTACAGGA--CTCCCGGGGGAGTGTAAATA------TTCATTtgtaatgaaatttcgacgtgttttttcgtga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-ATC-GGAACTT---GCATATTCCAATAATGGGC-tcaaatcttgagtatccta
gi|25                         :           nnTTCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACT
gi|26                         :            cTTCTTCTTCCTGTGC-TCGTGCAGGA--CTCTCAGGGGAGTGTAAATA------Tcaggatt
gi|27                         :             TCCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        tcCCA--TTCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCC
gi|3                          :                TTCTTCCTGTGTAAAGTGCAGGA--TTTCCA-GGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGAT--GAGTAC-C-G-CTAAA-----AACCTT-TCCGCA--AATGTACAGTTAAATTATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTTGGG--CATAT-TGTCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGAGAGGGCTTG-ATGGAACTAGCCA--CCCTCACTGAAGATG-GTAGT-TTGTTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGG---GAAGGAGTTG-TCATTCAGTTCCTTGCCAGTA-ATGA--GTTGGA-GATACTTCTGTGCTTCTCTTTTTCTGTTGTTCCCTGGTGTTAGATTAGTAAG-AGCATGTATGTGGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCC-TGT-AGATTATGAT-GA-GCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAA-GGTACCTCATTGCAACTGATGGATCATGTGCAT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGAAG--TTACCGGT-GAC-AATCTGGCTGTTC-CCT-TTGGGCAC-CTT--CACGATCT-TTT-TCAGATTT--G---TGTGGTAT-GTTCCTA-AAC-G-GAAAT---GCATATTCCAATGATAGGC-GACCAT-TGTCTTAT-ATGTCAT-GGATCGAATT----GGTTTGCAAT-ATTTATAGAGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGG-GTTTTGTGGTTTTTGGTCTT-TGTG-TGGAGAT-TTGCAAA---------AAGCTTGTTGTGG-AAG-GTAACTCATAGATAT-T-------TG-CAC-TGCTGAT-T-CT--TCGA-GG-GT----ATGG-CCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCATT-TCAAGGTC-TTGTGA-ATG-TTAATTCCAAGGTAC-T---TTGCTG--AG-T-CA-AC-CACG--TCAAGGGTGTGTCCATGGATCATGT--ATG--TAT--A-T----TC----AAT--TA--C-ACTTCCTCTTGTGGTG-ACATGCAGA----ACTTGGCACTTCTTGGG-ATGGAAC-T-----C--CATCAACCAGT-CATCCTCCCACGCTTGCAATGATTCCAGGTCT--TGTTGGAGTTTGATG--GCATCCTGTTTCTGTTCTGATGTTACGATACAGAATA-CAG------TCATCCGCAAAGAGGCG
gi|5                          :    ttggtaacatggttgagtggtggt-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATACAAA-CACTTCG-TCTG-TGTCTCACTGA-CTGGAG--CACGC-TGCCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGTCTCG-ATGGGACATGCCA--TCCTCACTGA--ACG--TAGA-TTACTCCCGTCGC--GGTGTGTGCATGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCACCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCAAA-ATCT-TGT-AGAGCATGAT-GA-GCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGGTGAATCATGTGCGT-CATGCTGACCGGTGA-GCGATCCCTGTTG--TTACCAGT-GACGAATTTAGCTGCTCTTCT-TTGGACAC-CTTC-CAAGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-AACGG-AACTT---GCATATTCCAAaaccgttgatcccatccgatacacaattaggaaggtcattaatatataggaaggaaacgcaacggtccgagcacacttccctgagggacaccggactgggctgggctgccgatgatgtaacgccttccagtataacttgttgtgtccgacctgcaaggaagtcctttatccaccctagatgactgcttctgatcccgtaagtgatgtagttttatacaggagacgcctatgggggactttatcgaacgccttttgaaaaatccagtaggatgacatccgtttggcccttcaagtcgata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtcaG-ATCT-CGT-AGAGCATGATGAC-TTTAT-----TCCTGACCC-TCCTGTGCTGCAAGGGC-TCCCATGCCAGCTGATGTA--A--------CATGCTG----GTAACACAA---CGGTAG--TTTCCAGTGG-CGAATCTGGCTGC-CTGGCGTTG--TAC-TTGCTCAAGTTCAGTTG-TTGGATTTGCTGTAGATGGTAAGGGTCCCATACT-G----TTGAGGCATATT-CAAGGACAGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AC-A-CT--TTCAAGG-GT----GTGA-CCATGGAGATGGTAATCCACT----TTG---ACTGGTATTT-------TCTTCCTG-G-TGATGTGGATG--GTGGTACATTCTTCTGG-GTGGA---A-----TGACATCTGCCAGC-C-TTTTCCCCATtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaacactttcaagggtgtgaccatggagatggtaatccactttgactggtattttcttcctggtgatgtggatggtggtacattcttctgggtggaatgacatctgccagccttttccccatgtctctcaagtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatctcgtagagcatgatgactttattcctgaccctcctgtgctgcaagggctcccatgccagctgatgtaacatgctggtaacacaacggtagtttccagtggcgaatctggctgcctggcgttgtacttgctcaagttcagttgttggatttgctgtagatggtaagggtcccatactgttgaggcatattcaaggacaggtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccagga--AAGTAC-T---TTGCTG-AAT-TG---AC-T-TTGTTCA--GC-AC----ATGT-CCGTGTA-ATG--AGT--ACTGATATTTTAAACG--TTTTT-GTT--TTTTCGT---G-AGATGGTGAGT--ACCTGGCACTAATCTGG-ATGGA---TTCGGAC--CAATTTCCAAG---TTATCCCAgtctctcaagtgc
gi|8                          : gttatatttatgcctTTCTTCCTGTAC-AAATGCAGAA--CTCCCAGGAGAGTGTAAATA------TGGACTG----ACG-CATGCT--AGGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATCTACAGTTAAAATAAGGATA-AAAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCATTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--AGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATAcagctggctagcttatgcaggtcgtcctgtagaacttgatcgtctgcttcagatgtgatggctaagtatgctatcgtgtcgtcagcaaataaacgcactgttgattcaatgccaagagacatgtcgttgatgtaaaataagaacagcatggtcctaagaccgatccctacggcacaccggactatag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCCAACTCTTGGAGACTGTTTAGGTGTCATTGTGGCGCTGCTGTGTCATCTGGACTGTTAACATTTCGATACAGCAGGCAAAGAGACGGGCTATTGATTTCATTTGTGCAAGTAGATCGTTAATGTACACAAGGAATAGCAAGGGTCCTAGCACAGTCCCCTACGGTACTCCGAAGGTTACTGGCGCTGATTCTGACATCATTCTTTCCACGACAACACGTTGGGTTCTGTTATTAAGGAATGGTTCTATCCAA
Unaligned ( gi|10 ): TGCCTTGTATATGGTCTGTTGATTATATGTCACGCCATGACAGATCCTGACTATGATCACGCCTATCAGTACTTTCCGTTCCTGGAACACTTTTCAAAGTATTGGCCTGGTATTTGGGTAATCCACTTCTTGATTGGTTCTTTTCTCTCTAGGTATATGCGATGGTGGGTTACTATTTTTTTCTGGTGTGGTGACTTATGACCATCTGCCTAGTCTTTTTTATCCCGTATGTTCTCAAATGCT
Unaligned ( gi|12 ): TCGATGACTCTCCATCCACTAGTACTACGACTTGTTGACTATGATTGGCAAGGAAGCTCCCAATCCACTTCAACGTGTACCCCCTCACGCCATAATGGTGCAGTTTCATGGCTAGCCGGTGATGAGCGACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCCAGTGTGATGGCGTCTATCTGCTATTTGTTGTCGTTCAGG
Unaligned ( gi|13 ): GTTGCAACCATATCAACCGATGGAGCATGTTGGTCACACAGCTGGGTTCTCAGGAGCAGAAGTCGCCTGTGGCAAATACCGGTATATATGGCAGCTCGACTTTGGATGTTGGATCCGATGCTGGTTGTAACGGTCCCATACT
Unaligned ( gi|14 ): CAAAGAAACGGGCTTTGGACTTTACTTGTGCAGGTAGGTCCCCCGAGGCACTCTGGAGGTTACTGGTACTGATTTTGACATCATTCCTTCCACGACAACACGTTGGTTTCTATTGCTAAGGAATGATTCTATCCAAGA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTTACCTCTTTCCATAGTTGATGTAGTTTGGGGCTGACGGCTATGGCAAACCTTTGTCAAAGGCTTTACTGAAGTCTATTATTGGCAGATTTCTGTTA






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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCC--AGGTAC-T---TTGCTG-AAT-TGAT-G--T-GT--TCAAGCA-A-----ATGT-CCATGTA-ATG--
gi|23                         :      atttatgTTCTTCTTCCTGTAC-AGGTACAGGA--CTCCCGGGGGAGTGTAAATA------TTCATTtgtaatgaaatttcgacgtgttttttcgtga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-ATC-GGAACTT---GCATATTCCAATAATGGGC-tcaaatcttgagtatccta
gi|25                         :           nnTTCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACT
gi|26                         :            cTTCTTCTTCCTGTGC-TCGTGCAGGA--CTCTCAGGGGAGTGTAAATA------Tcaggatt
gi|27                         :             TCCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        tcCCA--TTCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCC
gi|3                          :                TTCTTCCTGTGTAAAGTGCAGGA--TTTCCA-GGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGAT--GAGTAC-C-G-CTAAA-----AACCTT-TCCGCA--AATGTACAGTTAAATTATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTTGGG--CATAT-TGTCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGAGAGGGCTTG-ATGGAACTAGCCA--CCCTCACTGAAGATG-GTAGT-TTGTTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGG---GAAGGAGTTG-TCATTCAGTTCCTTGCCAGTA-ATGA--GTTGGA-GATACTTCTGTGCTTCTCTTTTTCTGTTGTTCCCTGGTGTTAGATTAGTAAG-AGCATGTATGTGGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCC-TGT-AGATTATGAT-GA-GCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAA-GGTACCTCATTGCAACTGATGGATCATGTGCAT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGAAG--TTACCGGT-GAC-AATCTGGCTGTTC-CCT-TTGGGCAC-CTT--CACGATCT-TTT-TCAGATTT--G---TGTGGTAT-GTTCCTA-AAC-G-GAAAT---GCATATTCCAATGATAGGC-GACCAT-TGTCTTAT-ATGTCAT-GGATCGAATT----GGTTTGCAAT-ATTTATAGAGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGG-GTTTTGTGGTTTTTGGTCTT-TGTG-TGGAGAT-TTGCAAA---------AAGCTTGTTGTGG-AAG-GTAACTCATAGATAT-T-------TG-CAC-TGCTGAT-T-CT--TCGA-GG-GT----ATGG-CCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCATT-TCAAGGTC-TTGTGA-ATG-TTAATTCCAAGGTAC-T---TTGCTG--AG-T-CA-AC-CACG--TCAAGGGTGTGTCCATGGATCATGT--ATG--TAT--A-T----TC----AAT--TA--C-ACTTCCTCTTGTGGTG-ACATGCAGA----ACTTGGCACTTCTTGGG-ATGGAAC-T-----C--CATCAACCAGT-CATCCTCCCACGCTTGCAATGATTCCAGGTCT--TGTTGGAGTTTGATG--GCATCCTGTTTCTGTTCTGATGTTACGATACAGAATA-CAG------TCATCCGCAAAGAGGCG
gi|5                          :    ttggtaacatggttgagtggtggt-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATACAAA-CACTTCG-TCTG-TGTCTCACTGA-CTGGAG--CACGC-TGCCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGTCTCG-ATGGGACATGCCA--TCCTCACTGA--ACG--TAGA-TTACTCCCGTCGC--GGTGTGTGCATGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCACCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCAAA-ATCT-TGT-AGAGCATGAT-GA-GCC-TAGATGTTCTA--CG-G-CGGT-CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGGTGAATCATGTGCGT-CATGCTGACCGGTGA-GCGATCCCTGTTG--TTACCAGT-GACGAATTTAGCTGCTCTTCT-TTGGACAC-CTTC-CAAGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-AACGG-AACTT---GCATATTCCAAaaccgttgatcccatccgatacacaattaggaaggtcattaatatataggaaggaaacgcaacggtccgagcacacttccctgagggacaccggactgggctgggctgccgatgatgtaacgccttccagtataacttgttgtgtccgacctgcaaggaagtcctttatccaccctagatgactgcttctgatcccgtaagtgatgtagttttatacaggagacgcctatgggggactttatcgaacgccttttgaaaaatccagtaggatgacatccgtttggcccttcaagtcgata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtcaG-ATCT-CGT-AGAGCATGATGAC-TTTAT-----TCCTGACCC-TCCTGTGCTGCAAGGGC-TCCCATGCCAGCTGATGTA--A--------CATGCTG----GTAACACAA---CGGTAG--TTTCCAGTGG-CGAATCTGGCTGC-CTGGCGTTG--TAC-TTGCTCAAGTTCAGTTG-TTGGATTTGCTGTAGATGGTAAGGGTCCCATACT-G----TTGAGGCATATT-CAAGGACAGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AC-A-CT--TTCAAGG-GT----GTGA-CCATGGAGATGGTAATCCACT----TTG---ACTGGTATTT-------TCTTCCTG-G-TGATGTGGATG--GTGGTACATTCTTCTGG-GTGGA---A-----TGACATCTGCCAGC-C-TTTTCCCCATtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaacactttcaagggtgtgaccatggagatggtaatccactttgactggtattttcttcctggtgatgtggatggtggtacattcttctgggtggaatgacatctgccagccttttccccatgtctctcaagtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gatctcgtagagcatgatgactttattcctgaccctcctgtgctgcaagggctcccatgccagctgatgtaacatgctggtaacacaacggtagtttccagtggcgaatctggctgcctggcgttgtacttgctcaagttcagttgttggatttgctgtagatggtaagggtcccatactgttgaggcatattcaaggacaggtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccagga--AAGTAC-T---TTGCTG-AAT-TG---AC-T-TTGTTCA--GC-AC----ATGT-CCGTGTA-ATG--AGT--ACTGATATTTTAAACG--TTTTT-GTT--TTTTCGT---G-AGATGGTGAGT--ACCTGGCACTAATCTGG-ATGGA---TTCGGAC--CAATTTCCAAG---TTATCCCAgtctctcaagtgc
gi|8                          : gttatatttatgcctTTCTTCCTGTAC-AAATGCAGAA--CTCCCAGGAGAGTGTAAATA------TGGACTG----ACG-CATGCT--AGGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATCTACAGTTAAAATAAGGATA-AAAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-GT-----C--AGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCATTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--AGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATAcagctggctagcttatgcaggtcgtcctgtagaacttgatcgtctgcttcagatgtgatggctaagtatgctatcgtgtcgtcagcaaataaacgcactgttgattcaatgccaagagacatgtcgttgatgtaaaataagaacagcatggtcctaagaccgatccctacggcacaccggactatag


blockSeqs                     :                          A A          TA                    CATGTA       GTGT   G      CA      T T C     AATCT      A      GT                       C   A       G                T      GA     A             A TC                G            T             AT          A    T     C             AC  C          A            A                    GA    TG      A                                                    C                 A    T       G    G   T          GAAT   C           AC  GC     G                              TCAT      C       C       C             GT     G  G               T    CGT       .    T       AG   A        GCTGTA        GGG     T A G GA    GAG              T    G  C   .   C    A  GT   .          T          A  C    A  G      .        C       G  T         TTT  G     C    T G     AT    CTCCATTCT       TG      C   A       AT      . T     C  C   .  CTGATT    GT    GGGTGTGTCC    C       G   GT   CC C GATATTTTAA   GG     GCTG       G GGT A     T   TTCA             G   C     TTCGGAC              CGAG   T           C               TG    G  GT      CT      T  TTCT      AT        T       G   GAAT          A
blockSeqs                     :                          T .          .                     .            .      .      .       . . .     .          .      G                        .   .       .                .      .      .             . TC                .            .             .           C    .     .             .   A          G            .                    G     .       .                                                    .                 .    .       .    .   .          GAC    A           .   TC     .                              TCAT      .       C       .             .      A  .               T    TT        .    .       T    A        T             GGG     . T . A     .                T    .  C   .   .    .  G    .          .          A  A    .  .      .        .       .  .         TC   G     .    . .     T     AA              G       .   .       CA      . T     C  A   .  CAACCA    .     AGGGT         A       .   .    .  C TTG          .      ACTT       C TG  .     C   TG               T   .     CATTC                GTCA   C           .               T     G  .       .       .  G         .         A       .   .             .
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blockSeqs                     :                            .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                TC*******                                                                                                                          G*                                                                                                                    GA**                   G**                                   TAT*                                                                   CT*                                                                                                                                                                                                                                                          **        T***     N*     TGACT***        GGGT******                                              GT***                                                 ATTC********         GCG**
originalCons                  :             TTCTTCTTCCTGTGC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-GT-----CTCAGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCCCCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCT-TGT-AGAGCATGATGGA-GCCATAGATGTTCTA--CG-GCCGGT-CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGATGGATCATGTGCGT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGTAG--TTACCGGTGGACGAATCTGGCTGCTCTCCTGTTGGACAC-CTTC-CAAGATC--TTT-TCAGGTTT--T---GGTGGTATGGGTCCCA-ANC-G-AACTT---GCATATTCCAATGATGGGC-GACCAT-TGTCTGAT-ATGCCAT-GGATCGGATTTGGAGGTTTGCAATCATTT-TA-AGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGGTCTTTTGTGGTCTTTGGTCTT-TATGTTGGAGATATTGCTCGTCCATT-T-AAGCTCGTTGTGG-ATG-GTAACTC--AGGTAC-T---TTGCTG-CAC-TGCT-AC-T-CT--TCGAGGG-GT----ATGG-CCATGTA-ATG--AAT--ACT----TT----ACT--TATTT-GCTGCCTCTTGTTG-G-AGATGCGGATT--ACCGTGCATTTCTNTGG-ATGGA---T-----C--CATCTGCCANG-C-TTNTCCCAATCCTG-AACGATGTTAGGTCTTGTGTTGGA--TTGCTGCCGCGTCC-GT---CGTTTTG--GTTATTTTNCGGAATAGCAGG-A--ATCATCCGCGAACAGCCG
finalCons                     :             TTCTTCTTCCTGTGC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-GTC-------AGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCCCCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCT-TGT-AGAGCATGATGA--GCCATAGATGTTCTA--CGG--CGGT-CAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGATGGATAT-GTGCGT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGTAG--TTACCGGTGGACGAATCTGGCTGCTCTCCCT-TGGACAC-CTTC-CAAGATC--TTT-TCAGGTTT--T---GGTGGTATGGGTCCCA-ANC-G-AACTT---GCATATTCCAATGATGGGC-GACCAT-TGTCTGAT-ATGCCAT-GGATCGGATTTGGAGGTTTGCAATCATTT-TA-AGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGGTCTTTTGTGGTCTTTGGTCTT-TATGTTGGAGATATTGCTCGTCCATT-T-AAGCTCGTTGTGG-ATG-GTAACTC--AGGTAC-TT---TGCTGN-AC-TGTGACT---CT--TCGAGGGT------ATGG-CCATGTA-ATG--AAT--ACT----TT----ACT--TATTTGT---CCTCTTGTTG-G-AGATGCGGATT--ACCGTGCATTTCTNTGG-ATGGAATTC--------CATCTGCCAGCG--TTNTCCCAATCCTG-AACGATGTTAGGTCTTGTGTTGGA--TTGCTGCCGCGTCC-GT---CGTTTTG--GTTATTTTNCGGAATAGCAGG-A--ATCATCCGCGAACAGCCG
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCCAACTCTTGGAGACTGTTTAGGTGTCATTGTGGCGCTGCTGTGTCATCTGGACTGTTAACATTTCGATACAGCAGGCAAAGAGACGGGCTATTGATTTCATTTGTGCAAGTAGATCGTTAATGTACACAAGGAATAGCAAGGGTCCTAGCACAGTCCCCTACGGTACTCCGAAGGTTACTGGCGCTGATTCTGACATCATTCTTTCCACGACAACACGTTGGGTTCTGTTATTAAGGAATGGTTCTATCCAA
Unaligned ( gi|10 ): TGCCTTGTATATGGTCTGTTGATTATATGTCACGCCATGACAGATCCTGACTATGATCACGCCTATCAGTACTTTCCGTTCCTGGAACACTTTTCAAAGTATTGGCCTGGTATTTGGGTAATCCACTTCTTGATTGGTTCTTTTCTCTCTAGGTATATGCGATGGTGGGTTACTATTTTTTTCTGGTGTGGTGACTTATGACCATCTGCCTAGTCTTTTTTATCCCGTATGTTCTCAAATGCT
Unaligned ( gi|12 ): TCGATGACTCTCCATCCACTAGTACTACGACTTGTTGACTATGATTGGCAAGGAAGCTCCCAATCCACTTCAACGTGTACCCCCTCACGCCATAATGGTGCAGTTTCATGGCTAGCCGGTGATGAGCGACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCCAGTGTGATGGCGTCTATCTGCTATTTGTTGTCGTTCAGG
Unaligned ( gi|13 ): GTTGCAACCATATCAACCGATGGAGCATGTTGGTCACACAGCTGGGTTCTCAGGAGCAGAAGTCGCCTGTGGCAAATACCGGTATATATGGCAGCTCGACTTTGGATGTTGGATCCGATGCTGGTTGTAACGGTCCCATACT
Unaligned ( gi|14 ): CAAAGAAACGGGCTTTGGACTTTACTTGTGCAGGTAGGTCCCCCGAGGCACTCTGGAGGTTACTGGTACTGATTTTGACATCATTCCTTCCACGACAACACGTTGGTTTCTATTGCTAAGGAATGATTCTATCCAAGA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTTACCTCTTTCCATAGTTGATGTAGTTTGGGGCTGACGGCTATGGCAAACCTTTGTCAAAGGCTTTACTGAAGTCTATTATTGGCAGATTTCTGTTA






Alignments
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CCC--AGGTAC-T---TTGCTG-AAT-TGATG-----TGT--TCAA-GCAAATGT-CCATGTA------ATG--
gi|23                         :      atttatgTTCTTCTTCCTGTAC-AGGTACAGGA--CTCCCGGGGGAGTGTAAATA------TTCATTtgtaatgaaatttcgacgtgttttttcgtga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-ATC-GGAACTT---GCATATTCCAATAATGGGC-tcaaatcttgagtatccta
gi|25                         :           nnTTCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACT
gi|26                         :            cTTCTTCTTCCTGTGC-TCGTGCAGGA--CTCTCAGGGGAGTGTAAATA------Tcaggatt
gi|27                         :             TCCTTCTTCCTGTAC-AAGTGCAGGA--CTCCCAG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                        tcCCA--TTCTCACTGACGATG-GTAGA-TTATTCC
gi|3                          :                TTCTTCCTGTGTAAAGTGCAGGA--TTTCCA-GGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGAT--GAGTAC-C-G-CTAAA-----AACCTT-TCCGCA--AATGTACAGTTAAATTATGGATA-AAA-CACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTTGGG--CATAT-TGTCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGAGAGGGCTTG-ATGGAACTAGCCA--CCCTCACTGAAGATG-GTAGT-TTGTTCCAGTCGC--GGATTGTGCGTGG---GAAGGAGTTG-TCATTCAGTTCCTTGCCAGTA-ATGA--GTTGGA-GATACTTCTGTGCTTCTCTTTTTCTGTTGTTCCCTGGTGTTAGATTAGTAAG-AGCATGTATGTGGACTT-GATC-ATGCGAG-ATCC-TGT-AGATT-ATGA-T-GAGCC-TA-----GATGTTCTACG-G-CGGTCAACAA-GGTACCTCATTGCAACTGATGGATCATGTGCAT-CATGCTGCCCGGTGA-GCGATCCCTGAAG--TTACCGGT-GAC-AATCTGGCTGTTC-CCT-TTGGGCAC-CTT--CACGATCT-TTT-TCAGATTT--G---TGTGGTAT-GTTCCTA-AAC-G-GAAAT---GCATATTCCAATGATAGGC-GACCAT-TGTCTTAT-ATGTCAT-GGATCGAATT----GGTTTGCAAT-ATTTATAGAGTTCC-TCTTGATA-AATCCAAGGG-GTTTTGTGGTTTTTGGTCTT-TGTG-TGGAGAT-TTGCAAA---------AAGCTTGTTGTGG-AAG-GTAACTCATAGATA--T---TTGC----AC-TGCTGA--T-TCT--TCGA-GGGTATGG-CCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCCATT-TCAAGGTC-TTGTGA-ATG-TTAATTCCAAGGTAC-T---TTGCTG-A----G-TCAACC-ACG--TCAA-GGGTGTGT-CCATGGATCATGTATG--TAT--A-T----TC----AAT--TACACT--T--CCTCTTGTGGTG-ACATGCAGA----ACTTGGCACTTCTTGGG-ATGGA-ACT----CCATCAACCA-GTCATCCTCCCACGCTTGCAATGATTCCAGGTCT--TGTTGGAGTTTGATG--GCATCCTGTTTCTGTTCTGATGTTACGATACAGAATA-CAG------TCATCCGCAAAGAGGCG
gi|5                          :    ttggtaacatggttgagtggtggt-AAGTGCAGGA--CTCCCAGGGGAGTGTAAATA------TGCACTG----ACG-CATGCT--AAGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATTTACAGTTAAAATATGGATACAAA-CACTTCG-TCTG-TGTCTCACTGA-CTGGAG--CACGC-TGCCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGGAAGGTCTCG-ATGGGACATGCCA--TCCTCACTGA--ACG--TAGA-TTACTCCCGTCGC--GGTGTGTGCATGGGAAGAAGGAGTTG-TCATACACTTCCTTGCCAGCG-GAGA--GTTGGA-GATACTTCCGGGCTCCTCTTGTTCTGTTGTCACCTGGTGTTAGATAAGTGGG-AGCATGTATGTCGACTT-GATC-ATGCAAA-ATCT-TGT-AGAGC-ATGA-T-GAGCC-TA-----GATGTTCTACG-G-CGGTCAACAAGGGTATCCCATTGCAACTGGTGAATCATGTGCGT-CATGCTGACCGGTGA-GCGATCCCTGTTG--TTACCAGT-GACGAATTTAGCTGCTCTTCT-TTGGACAC-CTTC-CAAGATC--TTTATCAGGTTT--T---GGTGGTAT---TCCCA-AACGG-AACTT---GCATATTCCAAaaccgttgatcccatccgatacacaattaggaaggtcattaatatataggaaggaaacgcaacggtccgagcacacttccctgagggacaccggactgggctgggctgccgatgatgtaacgccttccagtataacttgttgtgtccgacctgcaaggaagtcctttatccaccctagatgactgcttctgatcccgtaagtgatgtagttttatacaggagacgcctatgggggactttatcgaacgccttttgaaaaatccagtaggatgacatccgtttggcccttcaagtcgata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtcaG-ATCT-CGT-AGAGC-ATGA-T-GA-CTTTATTCCTGACCCTC--CT-G-TGCT--GCAAGGGC-TCCCATGCCAGCTGATGTA--A--------CATGCTG----GTAACACAA---CGGTAG--TTTCCAGTGG-CGAATCTGGCTGCCTGGCG-TTG--TAC-TTGCTCAAGTTCAGTTG-TTGGATTTGCTGTAGATGGTAAGGGTCCCATACT-G----TTGAGGCATATT-CAAGGACAGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A--C-T-T--TCAA-GGGTGTGA-CCATGGAG-----ATGGTAATCCACT----TTG---ACTGGTATTT--------TCTTCCTG-G-TGATGTGGATG--GTGGTACATTCTTCTGG-GTGGA-ATG----ACATCTGCCA-G-CCTTTTCCCCATtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaacactttcaagggtgtgaccatggagatggtaatccactttgactggtattttcttcctggtgatgtggatggtggtacattcttctgggtggaatgacatctgccagccttttccccatgtctctcaagtgc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gatctcgtagagcatgatgactttattcctgaccctcctgtgctgcaagggctcccatgccagctgatgtaacatgctggtaacacaacggtagtttccagtggcgaatctggctgcctggcgttgtacttgctcaagttcagttgttggatttgctgtagatggtaagggtcccatactgttgaggcatattcaaggacaggtcggtctagagttgtgtaagcctgtgccttgaaatcttgtgggcagctccttagattgcgacgcaagaagtttggcttggatgtggtctggttgatatggtcacgccatgacagatcctgagatatgtacacgctttgcccccaggaac--AAGTAC-T---TTGCTG-AAT-TG---A--C-TTTGTTC-A-GCACATGT-CCGTGTA------ATG--AGT--ACTGATATTTTAAACG--TTTTTG--T--TTTTTCGT---G-AGATGGTGAGT--ACCTGGCACTAATCTGG-ATGG--ATTCGGACCAATTTCCA-A--GTTATCCCAgtctctcaagtgc
gi|8                          : gttatatttatgcctTTCTTCCTGTAC-AAATGCAGAA--CTCCCAGGAGAGTGTAAATA------TGGACTG----ACG-CATGCT--AGGTAC-G-G-CTAAA-----AACCTT-TCGGCA--AATCTACAGTTAAAATAAGGATA-AAAACACTTCG-TCTGGTGTCTCACTGA-CTGGAG--CATGC-TGTCTGGGTGGAA-G-------TCAGCAGCATG-CGGAAGGCCTCG-ATGGAACTAGCCA--TCCTCATTGACGATG-GTAGA-TTATTCCAGTCGC--AGATTGTGCGTGGGAAGAAGGAGTTG-TCATAcagctggctagcttatgcaggtcgtcctgtagaacttgatcgtctgcttcagatgtgatggctaagtatgctatcgtgtcgtcagcaaataaacgcactgttgattcaatgccaagagacatgtcgttgatgtaaaataagaacagcatggtcctaagaccgatccctacggcacaccggactatag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTCCAACTCTTGGAGACTGTTTAGGTGTCATTGTGGCGCTGCTGTGTCATCTGGACTGTTAACATTTCGATACAGCAGGCAAAGAGACGGGCTATTGATTTCATTTGTGCAAGTAGATCGTTAATGTACACAAGGAATAGCAAGGGTCCTAGCACAGTCCCCTACGGTACTCCGAAGGTTACTGGCGCTGATTCTGACATCATTCTTTCCACGACAACACGTTGGGTTCTGTTATTAAGGAATGGTTCTATCCAA
Unaligned ( gi|10 ): TGCCTTGTATATGGTCTGTTGATTATATGTCACGCCATGACAGATCCTGACTATGATCACGCCTATCAGTACTTTCCGTTCCTGGAACACTTTTCAAAGTATTGGCCTGGTATTTGGGTAATCCACTTCTTGATTGGTTCTTTTCTCTCTAGGTATATGCGATGGTGGGTTACTATTTTTTTCTGGTGTGGTGACTTATGACCATCTGCCTAGTCTTTTTTATCCCGTATGTTCTCAAATGCT
Unaligned ( gi|12 ): TCGATGACTCTCCATCCACTAGTACTACGACTTGTTGACTATGATTGGCAAGGAAGCTCCCAATCCACTTCAACGTGTACCCCCTCACGCCATAATGGTGCAGTTTCATGGCTAGCCGGTGATGAGCGACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCCAGTGTGATGGCGTCTATCTGCTATTTGTTGTCGTTCAGG
Unaligned ( gi|13 ): GTTGCAACCATATCAACCGATGGAGCATGTTGGTCACACAGCTGGGTTCTCAGGAGCAGAAGTCGCCTGTGGCAAATACCGGTATATATGGCAGCTCGACTTTGGATGTTGGATCCGATGCTGGTTGTAACGGTCCCATACT
Unaligned ( gi|14 ): CAAAGAAACGGGCTTTGGACTTTACTTGTGCAGGTAGGTCCCCCGAGGCACTCTGGAGGTTACTGGTACTGATTTTGACATCATTCCTTCCACGACAACACGTTGGTTTCTATTGCTAAGGAATGATTCTATCCAAGA
Unaligned ( gi|19 ): GTGTTACCTCTTTCCATAGTTGATGTAGTTTGGGGCTGACGGCTATGGCAAACCTTTGTCAAAGGCTTTACTGAAGTCTATTATTGGCAGATTTCTGTTA