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lowQualScore                  :        7    5     5 66   3   66 3    6  2             2 8888 2  0 33  66666       2   2 6  33 777777    00000000000000000000  999  333  33333333333   55555    9999  66  66  4444444        2 2 2 4     2  22  7777   22  2 4       22   2     4   5555555 333 4    2  22    2 2  2        2          
lowQualScore                  :        .    .     . ..   .   .. .    .  .             . .... .  . ..  .....       .   . .  .. ......    ....................  ...  ...  ...........   .....    ....  ..  ..  .......        . . . .     .  ..  ....   ..  . .       ..   .     .   ....... ... .    .  ..    . .  .        .          
lowQualScore                  :        4    0     0 99   6   44 6    2  9             7 0000 5  6 44  22222       5   5 0  44 222222    77777777777777777777  222  999  00000000000   66666    4444  11  11  6666666        1 1 1 2     1  99  2222   99  0 0       88   0     0   1111111 777 2    1  99    2 2  4        7          
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Reference ( gi|5 )            : AAGTGAAACAAGGATACACA--TTT-GCAT-G-ATCACTT-TAATTTTGAAACA-CA-A-T-GTTA--AT-----TCGATGG-GAT-GCTT--A------TAGA-----------T--------AT---AA---AA----AGT-C--GAA-----AATG----TT--TG--TC--T----GAAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---CATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTATA-AGAG-----GC---G-ACAA-CG--GGTT-G-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
gi|8                          : AAATGAAGCAAGCATACAAA--TTT-GCAC-A-ATCAGTT-TAATTTTGAAACA-CA-T-T-GTGA--AT-----TCCATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT---AA---AA----AA--C--GAA-----AATG----TT--TG--TCTGT----GAAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---TATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTAAA-AGAG-----AC---G-ACAA-CG--GTTT-G-TT-GTTTAT
gi|4                          : AAGTGAATCAAGCATTCAAA--TTT-CCAC-A-ATGACTT--AATTTGGAAACA-CA-T-T-GTTA--AT-----TCGATGG-TAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ATAA-AA---AA----AAC-A--AAA-----AATG----TT--TG--TCTTT----GAAATTTT-A-T-A-TTATT-AA--TT---TATA--AA-C-TTGTATT--GGA-CTATATAGA-----------G-ACAA-TG--GGTT-G-TA-GTTTATAATTGTAAAACCC
gi|23                         : AAGTGAAGCAAGCATACAAAAATTT-GCAG-G-GTCATTT-TAATTTTGAAACA-
gi|3                          :  AGTGAAGCAAGCATACAAA--TTT-GCAC-G-ACCATTT-TAATTTTGAAACA-CA-T-G-GTGA--AT-----GTGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ATAAAAA---AA----AAA-C--CAA-----AATG----TT--TG--TCTTT----GACATTCT-A-T-A-ATATT-AA--TC---TATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTATA-AGAG-----AC---G-ACAA-CG--GGTT-GTTT-GTTTATAA-TGTAAAA
gi|7                          :  AGTGAAGCAAGCATACAAA--TTT-GCAC-A-ATCATTT-TAATTTTGAAACA-CA-T-T-GTTA--AT-----TCAATAG-GAT-GTTT--A------CAGA-----------T--------ATA--AA---AA----AAC-C--GAA-----AA-G----TT--TG--TCTTT----GAAAT-----------TATT-AA--TT---TATC--AA-C-TTGTATT--T-A-CTATA-AGAG-----AC---G-ACAA-CG--GGTT-G-TT-GTTTGTAA-TGTAAAACCCttc
gi|9                          :  AATGAAGCGAGTATATGGA--TTTTGGAT-G-ATCATCT-TAATTTTGAAACA-CATA-TTGTGA--AT-----TCAATGA-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT---AATGAAA----AA-----GAA-----AATG----TT--TG--TC--TTT--GAAATTAC-A-C-A-ATATT-AA--TT---TATC--AA-C-TTGCATT--GAA-CTATA-AGAG-----AC---A-ATAG-CA--GGTT-G-Ta
gi|6                          :  AGTGAAGCAAGCATACAAA--TTT-GCATTG-ATCATTT-TAATTTTGAAACA-CC-ATT-GTGA--AT-----TTGATGATGAT-GTGT--A------TAGA-----------TTATAAAAAAC---AA---AA----AAC-C--GAA-----AAAA----TT--TG--TCTTT----GAAATTTT-A-TAA-ATATT-AA--TT---T-TC--AA----TGTATT--GAA-C-ATA-AGA------------------------------T-GTTTATAA-TGTAAACCC
gi|20                         :  AGTGAAGCAATCATACAAA--TTT-GAAC-G-ATTATTT-TCATTTT-AAATG-CA-T-T-GTGA--AT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ata
gi|13                         :                        TT-GCAC-GGATCGATTATAATTTTGAACCA-T----T-GTGA--AT-----TC-ATGG-GAA-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT---AA---AAC---AAA-C--G-A-----AATG----TT--TG--TC--TTTGAAAAATTCC-A-T-ATATATTAAA--TTTAATATCCAAA-C-TTATATT--GAA-CTATAGAGAG-----TA---G-ACGA-CA--GG
gi|2                          :                         T-GCAT-G-ATCATGT-TAATTTTGAAATATC----T-GTGA--AT-----TCAATGG-GAT-GTTT--A------TAGATATG-------T--------AT---GA---AA----AAT-A--GAAAAAATAATA----TT--TT--CC--TC---GAA--TCA-A-C-A-ATATT-AA--TT---CAAC---A-C-TTGCATT--TAA-CTATA-AGAG-----AC---GAACGA-CG--GGTT-G-CT-GTTTATAA-CGTAAA
gi|10                         :       gaagtgagcatatggaacg-GCAC-A-GTCATTT-TAATTTTCAAACA-CA-T-T-ATGA--AT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AG---AA---AA----AAC-CC-GAA-----AACG----TT--TG--TCATT----GAAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TA---TATC--AA-C-GTGTATT--GAA-CTATA-AGAG-----AC---G-ACAA-CG--GCTT-G-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCCctccat
gi|11                         :                                     ATTT-TAATTTTGAAAAA-CA-T-T-GTGA--AT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT---AA---AA----AAAAC--GAA-----AATG----TTATTC--TT--T----GAAATTCC-T-T-A-ATATT-AA--TT---CATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTATA-AGAG-----AC---G-ACAA-CG--AATT-G-TT-GTTTATAT-TGTAAAACCa
gi|12                         :                                     ATTT-TAATTTTGAAACA-CA-C-T-GTGA--AT-----TCAACGG-GAT-GTTT--A------TGGG-----------T--------AT---AA---AA----AAC-T--GAA-----AATA----TT--TG--TC--TTT--GAAATTCC-A-C-A-ATATT-AA--TT---TATC--AA-C-TTGCATT--GAA-CTATA-AGAG-----TCTCAA-ACAA-CT--GGTT---T---TTTATAA-TGTAAA
gi|14                         :                                         -TAATTTTGAAACA-CA-T-T-GTGA--TT-----TCGATTG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT---AA---AA----A-------AA-----ACCGATTTTT--TT--TC--TTC--GAAATTCC-A-T-A-ATA----A--TT---TATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTATA-AGAA-----AC---G-ACAA-TG--GGTT-G-TT-GTTTATAA-TGTAAATCCCt
gi|1                          :                                            ATTTTAAAAAA-CC-A-C-GTTAGGATCACGATCGATGT-GAT-GTTTTAG------TAAACTACCTATTTGT--------AT---AA---AA----AA--C--GAA-----AATG----TT--TGACTT--T----GAAATTCC-A-C-ATATATT-AAATCT---CATG--AA-CGTCGCATT---AA-CTGGA-AAAA-----Gat
gi|15                         :              taaatgaaatgtgagccgattatacagaatttgttacgcatattgg-T-GTGA--AT-----TCAATGG-TATTGTTT--A------TAGA-----------TTAAT----AT---AA---AAGAAAAG-----GAA-----AACAAAGATT--TG--TG--TTG--GAAATTCC-AGC-A-ATA-T-AA--TT---TATC--AA-CGTTGCATT--TAAGCTATA-AGAAC----TC---G-ATAG-CG--GGTT-G-TTGGTTTATAA-actgggtaaatccggctggttcttt
gi|16                         :                                                              -GTAA--AT-----TCGATGG-GAT-GTTT--ATACATGTAGA-----------T--------AT---AA---AA------------AA-----AACG----TTAATG--TT--T---------------T-G-A-----AA--TT---TATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTA-------------C---A-ACAA-CG--TGTT-G-TT-ATTTATAA-TGTAAAACCCa
gi|17                         :                                                                                                        A-----------T--------AA---AA---AA----AAT----GAA-----AATG----TT--TG--TC--TTT--GAAATTCC-A-T-A-TTATT-AA--TT---TATC--AA-C-TTGTATT--GAA-CTAGA-AGAA-----AC---G-ACAA-CG--GGTT-G-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCCat
gi|19                         :                                                                                                                              t---AA---AG----AAA-C--GAA-----AATG----TT--TG--TC--TTT--GAAATTTC-A-T-A-GTATT-AA--TT---TATC--AA-C-TTGTATT--TAA-CTATA-AGAG-----AC---G-ACAA-CG--GGTT-G-TT-GCTTAT-A-TGTTAAACCCata
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                       taaA-C-TTGTACT--GAA-CTAT---GAG-----AC---GAACAA-CGAAAAAT-G-TT-GTTTATAA-T-TAAAACC





Alignments
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lowQualScore                  :                   7  55   3  3 3  3   2  2             444  2   33       55555       2   2    33 666666    99999999999999999999  9999  333  55  5555555   55555    4444  22  2  7777777 2       2 2 2 4     2  22  333    44   3       22   1    1 3  44444   1 333 4  2    22  2   2  2        2          
lowQualScore                  :                   .  ..   .  . .  .   .  .             ...  .   ..       .....       .   .    .. ......    ....................  ....  ...  ..  .......   .....    ....  ..  .  ....... .       . . . .     .  ..  ...    ..   .       ..   .    . .  .....   . ... .  .    ..  .   .  .        .          
lowQualScore                  :                   3  00   1  1 1  1   7  7             444  5   44       99999       4   4    22 888888    11111111111111111111  5555  777  00  7777777   33333    5555  99  1  2222222 1       0 0 0 0     0  66  333    55   8       66   9    9 8  88888   9 333 0  0    88  0   1  2        5          
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Reference ( family-964 )      : AAGTGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CG-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----AA---AA--AA--C-C--GAA-----AATG----TT--TG-TC-T-T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
gi|1                          :   GTGAGCCGATTATACAGAA--TTT-GTTA-CG---C-ATATTGGATTTTAAAAAACCA-CGT--TA-GGATCACGATCGATGT-GAT-GTTTTAG------TAAACTACCTATTTGT--------AT----AA---AA--AA--C----GAA-----AATG----TT--TG-ACTT-T---G-AAATTCC-A-C-ATATATT-AAATCT---CATG--AACGTCGCATT---AA-CTGGAA-AA-----AGA-C---
gi|10                         :                 taaatgaaat-GC-A-CA-GTC-AT-TTTAATTTTCAAA---CA-CAT--TATGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AG----AA---AA--AA--C-CC-GAA-----AACG----TT--TG-TCAT-T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TA---TATC--AAC-GTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GC-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCCtgggtaaatccggctggttcttt
gi|11                         :                                       -AT-TTTAATTTTGAAA---AA-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----AA---AA--AA--AAC--GAA-----AATG----TT--AT-TC-T-TT--G-AAATTCC-T-T-A-ATATT-AA--TT---CATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--AA-TTG-TT-GTTTATAT-TGTAAAACCa
gi|12                         :                                       -AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAC--TGTGAAT-----TCAACGG-GAT-GTTT--A------TGGG-----------T--------AT----AA---AA--AA--C-T--GAA-----AATA----TT--TG-TCTT-T---G-AAATTCC-A-C-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGCATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGT-CTCAA-AC-AACT--GG-TT--T---TTTATAA-TGTAAA
gi|13                         :                         TT-GC-A-CGGATCGAT-TATAATTTTGAA----C--CAT--TGTGAAT-----TC-ATGG-GAA-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----AA---AAC-AA--A-C--G-A-----AATG----TT--TG-TC-T-TTGAA-AAATTCC-A-T-ATATATTAAA--TTTAATATCCAAAC-TTATATT--GAA-CTAT-AGAG-----AGT-A---G-AC-GACA--GG-t
gi|14                         :                                             TAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGATT-----TCGATTG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----AA---AA--AAAAC-C--GAT-------TT----TT--TT-TC-T-TC--G-AAATTCC-A-T-A-ATA----A--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AAA-C---G-AC-AATG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAATCCC
gi|15                         :                                                                 --TGTGAAT-----TCAATGG-TATTGTTT--A------TAGA-----------TTAAT----AT----AA---AAGAAA--A-G--GAA-----AACAAAGATT--TG-TG-T-T---GGAAATTCC-AGC-A-ATAT--AA--TT---TATC--AACGTTGCATT--TAAGCTAT-A-AG-----AACTC---G-AT-AGCG--GG-TTG-TTGGTTTATAA-at
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gi|18                         :                                                                                                                                 t----AA---AA--AA--C-CTGGAA-----CATT----TT--TGGTC-C-T---C-AAATTCCCA-C-A-ATGTT-AA--TT---TATCA-AAC-TTGCATTCGAAA-CTAT-A-AGAACCTAAA-C---G-ACAAACG--GGTTTG-TT-GTTTATAata
gi|19                         :                                                                                                                                aa----AA---AG--AA--A-C--GAA-----AATG----TT--TG-TC-T-TT--G-AAATTTC-A-T-A-GTATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--TAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GCTTAT-A-TGTTAAACCC
gi|2                          :     GAAGTGAGCATATGGAA--CGT-GC-A-TG-ATC-AT-GTTAATTTTGAAA---TA-T-C--TGTGAAT-----TCAATGG-GAT-GTTT--A------TAGATATG-------T--------AT----GA---AA--AA--T-A--GAAAAAATAATA----TT--TT-CC-T-C---G-AA--TCA-A-C-A-ATATT-AA--TT---CAAC---AC-TTGCATT--TAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---GAAC-GACG--GG-TTG-CT-GTTTATAA-CGTAAAata
gi|20                         :  AGTGAAGCAATCATACA-AA--TTT-GA-A-CG-ATT-AT-TTTCATTTT-AAA---TG-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ctccat
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gi|23                         : AAGTGAAGCAAGCATACA-AAAATTT-GC-A-GG-GTC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-aata
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gi|4                          : AAGTGAATCAAGCATTCA-AA--TTT-CC-A-CA-ATG-AC-TT-AATTTGGAAA---CA-CAT--TGTTAAT-----TCGATGG-TAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ATAA--AA---AA--AA--C-A--AAA-----AATG----TT--TG-TCTT-T---G-AAATTTT-A-T-A-TTATT-AA--TT---TATA--AAC-TTGTATT--GGA-CTAT-ATAG-----A-------G-AC-AATG--GG-TTG-TA-GTTTATAATTGTAAAACCCttc
gi|5                          : AAGTGAAACAAGGATACA-CA--TTT-GC-A-TG-ATC-AC-TTTAATTTTGAAA---CA-CAA--TGTTAAT-----TCGATGG-GAT-GCTT--A------TAGA-----------T--------AT----AA---AA--AG--T-C--GAA-----AATG----TT--TG-TC---T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---CATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGG-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
gi|6                          :  AGTGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-ATTG-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CACCAT--TGTGAAT-----TTGATGATGAT-GTGT--A------TAGA-----------TTATAAAAAAC----AA---AA--AA--C-C--GAA-----AAAA----TT--TG-TCTT-T---G-AAATTTT-A-TAA-ATATT-AA--TT---T-TC--AA---TGTATT--GAA-C-AT-A-AG-----A--------------------------T-GTTTATAA-TGTAAACCC
gi|7                          :  AGTGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CA-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTTAAT-----TCAATAG-GAT-GTTT--A------CAGA-----------T--------ATA---AA---AA--AA--C-C--GAA-----AA-G----TT--TG-TCTT-T---G-AAAT-----------TATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--T-A-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTGTAA-TGTAAAACCCata
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Reference ( family-964 )      : AAGTGAAGCGAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CG-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AA--C-C--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
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gi|14                         :                                             TAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGATT-----TCGATTG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AAAAC-C--GAT-------TT----TT--TT-TC-T-TC--G-AAATTCC-A-T-A-ATA----A--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AAA-C---G-AC-AATG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAATCCC
gi|15                         :                                                                 --TGTGAAT-----TCAATGG-TATTGTTT--A------TAGA-----------TTAAT----AT----A----A---AAGAAA--A-G--GAAAA-----CAAAGATT--TG-TG-T-T---GGAAATTCC-AGC-A-ATAT--AA--TT---TATC--AACGTTGCATT--TAAGCTAT-A-AG-----AACTC---G-AT-AGCG--GG-TTG-TTGGTTTATAA-at
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gi|17                         :                                                                                                           A-----------T--------A-----A----A---AA--AA--A-T--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-TT--G-AAATTCC-A-T-A-TTATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAG-A-AG-----AAA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCCat
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gi|2                          :     GAAGTGAGCATATGGAA--CGT-GC-A-TG-ATC-AT-GTTAATTTTGAAA---TA-T-C--TGTGAAT-----TCAATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----GTATGA---AA--AA--T-A--GAAAAAATAATA----TT--TT-CC-T-C---G-AA--TCA-A-C-A-ATATT-AA--TT---CAAC--A-C-TTGCATT--TAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---GAAC-GACG--GG-TTG-CT-GTTTATAA-CGTAAAata
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Reference ( family-964 )      : AAGTGAAGCGAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CG-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AA--C-C--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
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blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         TTAAT                 AA   .    .    C   CCTG        .      .     .   .  ATT     .       . . . .     .  .   .      A    .       .    .    . T  .       . .   A  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     A    .    .    .   CCC         .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   AAC         .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   CT          .      .     .   .  TTC     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   AC          .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   AG          .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   AT          .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          A        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   AC          .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :          G        .  .    .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   TA          .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :                           .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   CC          .      .     .   .  TTT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :                           .  . .  .   .  .             .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   CA          .      .     .   .  TGT     .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
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blockSeqs                     :                                                        .    .   .        .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   CC          .      .     .   .  TT      .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .        .
blockSeqs                     :                                                                          .           .   .    .  .         T                     .    .    .    .   C           .      .     .   .  CT      .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .         
blockSeqs                     :                                                                                                            T                     .    .    .    .   .           .      .     .   .  TC      .       . . . .     .  .   .      .    .       .    .    . .  .       . .   .  .    .   .   .  .         
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                    .   .      .    .       .    .    . .  .       . .                                


blockSeqCons                  :                                                        ***               *****                **           T*******************                     CC*****                                                        **
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Reference ( family-964 )      : AAGTGAAGCGAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CG-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AA--C-C--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
gi|1                          :   GTGAGCCGATTATACAGAA--TTT-GTTA-CG---C-ATATTGGATTTTAAAAAACCA-CGT--TA-GGATCACGATCGATGT-GAT-GTTTTAG------TAAACTACCTATTTGT--------AT----A----A---AA--AA--C----GAAAA-----TG----TT--TG-ACTT-T---G-AAATTCC-A-C-ATATATT-AAATCT---CATG--AACGTCGCATT---AA-CTGGAA-AA-----AGA-C---
gi|10                         :                 taaatgaaat-GC-A-CA-GTC-AT-TTTAATTTTCAAA---CA-CAT--TATGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AG----A----A---AA--AA--C-CC-GAAAA-----CG----TT--TG-TCAT-T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TA---TATC--AAC-GTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GC-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCCtgggtaaatccggctggttcttt
gi|11                         :                                       -AT-TTTAATTTTGAAA---AA-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AA--AAC--GAAAA-----TG----TT--AT-TC-T-TT--G-AAATTCC-T-T-A-ATATT-AA--TT---CATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--AA-TTG-TT-GTTTATAT-TGTAAAACCa
gi|12                         :                                       -AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAC--TGTGAAT-----TCAACGG-GAT-GTTT--A------TGGG-----------T--------AT----A----A---AA--AA--C-T--GAAAA-----TA----TT--TG-TCTT-T---G-AAATTCC-A-C-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGCATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGT-CTCAA-AC-AACT--GG-TT--T---TTTATAA-TGTAAA
gi|13                         :                         TT-GC-A-CGGATCGAT-TATAATTTTGAA----C--CAT--TGTGAAT-----TC-ATGG-GAA-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AAC-AA--A-C--G-AAA-----TG----TT--TG-TC-T-TTGAA-AAATTCC-A-T-ATATATTAAA--TTTAATATCCAAAC-TTATATT--GAA-CTAT-AGAG-----AGT-A---G-AC-GACA--GG-t
gi|14                         :                                             TAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGATT-----TCGATTG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AAAAC-C--GAT-------TT----TT--TT-TC-T-TC--G-AAATTCC-A-T-A-ATA----A--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AAA-C---G-AC-AATG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAATCCC
gi|15                         :                                                                 --TGTGAAT-----TCAATGG-TATTGTTT--A------TAGA-----------TTAAT----AT----A----A---AAGAAA--A-G--GAAAA-----CAAAGATT--TG-TG-T-T---GGAAATTCC-AGC-A-ATAT--AA--TT---TATC--AACGTTGCATT--TAAGCTAT-A-AG-----AACTC---G-AT-AGCG--GG-TTG-TTGGTTTATAA-at
gi|16                         :                                                                    GTAAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--ATACATGTAGA-----------T--------AT----A----A---AA------------AAAA-----CG----TTAATG-TT-T-T---G-A-------------------AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CT--------------A-C---A-AC-AACG--TG-TTG-TT-ATTTATAA-TGTAAAACCCa
gi|17                         :                                                                                                           A-----------T--------A-----A----A---AA--AA--A-T--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-TT--G-AAATTCC-A-T-A-TTATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAG-A-AG-----AAA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCCat
gi|18                         :                                                                                                                                 t----A----A---AA--AA--C-CTGGAACA-----TT----TT--TGGTC-C-T---C-AAATTCCCA-C-A-ATGTT-AA--TT---TATCA-AAC-TTGCATTCGAAA-CTAT-A-AGAACCTAAA-C---G-ACAAACG--GGTTTG-TT-GTTTATAata
gi|19                         :                                                                                                                                aa----A----A---AG--AA--A-C--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-TT--G-AAATTTC-A-T-A-GTATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--TAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GCTTAT-A-TGTTAAACCC
gi|2                          :     GAAGTGAGCATATGGAA--CGT-GC-A-TG-ATC-AT-GTTAATTTTGAAA---TA-T-C--TGTGAAT-----TCAATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----GTATGA---AA--AA--T-A--GAAAAAATAATA----TT--TT-CC-T-C---G-AA--TCA-A-C-A-ATATT-AA--TT---CAAC--A-C-TTGCATT--TAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---GAAC-GACG--GG-TTG-CT-GTTTATAA-CGTAAAata
gi|20                         :  AGTGAAGCAATCATACA-AA--TTT-GA-A-CG-ATT-AT-TTTCATTTT-AAA---TG-CAT--TGTGAAT-----TCGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ctccat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                     -A-T-A-A-ATT-----TT---TATC--AAC-TTGTACT--GAA-CTAT----G-----AGA-C---G-AC-AACG--GA-ATG-TT-GTTTATAA-TATAAAACCC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                 taa--TT---TAT----AC-TTGTACT--GAA-CTAT----G-----AGA-C---GAAC-AACGAAAA-ATG-TT-GTTTATAA-T-TAAAACC
gi|23                         : AAGTGAAGCAAGCATACA-AAAATTT-GC-A-GG-GTC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-aata
gi|3                          :  AGTGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CG-ACC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--GGTGAAT-----GTGATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ATAAAAA----A---AA--AA--C-C---AAAA-----TG----TT--TG-TCTT-T---G-ACATTCT-A-T-A-ATATT-AA--TC---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTGTTT-GTTTATAA-TGTAAAA
gi|4                          : AAGTGAATCAAGCATTCA-AA--TTT-CC-A-CA-ATG-AC-TT-AATTTGGAAA---CA-CAT--TGTTAAT-----TCGATGG-TAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------ATAA--A----A---AA--AA--C-A--AAAAA-----TG----TT--TG-TCTT-T---G-AAATTTT-A-T-A-TTATT-AA--TT---TATA--AAC-TTGTATT--GGA-CTAT-ATAG-----A-------G-AC-AATG--GG-TTG-TA-GTTTATAATTGTAAAACCCttc
gi|5                          : AAGTGAAACAAGGATACA-CA--TTT-GC-A-TG-ATC-AC-TTTAATTTTGAAA---CA-CAA--TGTTAAT-----TCGATGG-GAT-GCTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AG--T-C--GAAAA-----TG----TT--TG-TC---T---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---CATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGG-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTATAA-TGTAAAACCC
gi|6                          :  AGTGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-ATTG-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CACCAT--TGTGAAT-----TTGATGATGAT-GTGT--A------TAGA-----------TTATAAAAAAC----A----A---AA--AA--C-C--GAAAA-----AA----TT--TG-TCTT-T---G-AAATTTT-A-TAA-ATATT-AA--TT---T-TC--AA---TGTATT--GAA-C-AT-A-AG-----A--------------------------T-GTTTATAA-TGTAAACCC
gi|7                          :  AGTGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CA-ATC-AT-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTTAAT-----TCAATAG-GAT-GTTT--A------CAGA-----------T--------ATA---A----A---AA--AA--C-C--GAAAA------G----TT--TG-TCTT-T---G-AAAT-----------TATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--T-A-CTAT-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GG-TTG-TT-GTTTGTAA-TGTAAAACCCata
gi|8                          : AAATGAAGCAAGCATACA-AA--TTT-GC-A-CA-ATC-AG-TTTAATTTTGAAA---CA-CAT--TGTGAAT-----TCCATGG-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----A---AA--AA----C--GAAAA-----TG----TT--TG-TC-TGT---G-AAATTCC-A-T-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGTATT--GAA-CTAA-A-AG-----AGA-C---G-AC-AACG--GT-TTG-TT-GTTTATa
gi|9                          :  AATGAAGCGAGTATATG-GA--TTTTGG-A-TG-ATC-AT-CTTAATTTTGAAA---CA-CATATTGTGAAT-----TCAATGA-GAT-GTTT--A------TAGA-----------T--------AT----A----ATGAAA--AA-------GAAAA-----TG----TT--TG-TC-T-TT--G-AAATTAC-A-C-A-ATATT-AA--TT---TATC--AAC-TTGCATT--GAA-CTAT-A-AG-----AGA-C---A-AT-AGCA--GG-TTG-T