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Reference ( gi|2 ) : GCTTGTGT--A--G-A--AA--AAA-A-----T-A----A----AGATA-------C--------C----CC-C--TA--A---------------T-A-A-----------A---A----------T---------TT------------T-A---T--T---A----A--GG----G--------G-------TG-T-C----T--T-GA----T-TT----T---T-T--T----CT--ACACAAGTCATGTAT-T---TTTA------TT---A---G-G-G----G-----TGT-C--T----T-GA---TT---T---T--TTT-T---CTA-CACAAGCCC
gi|16 : GCTTGTGT--A--G-A--AA--AAA-AA----T-C----A----AAACA-------C--------C----CC-C--TA--G---------------T-A-A-----------A---AA---------TA--------TT------------T-A---C--T---A----G--GG----G--------G-------TG-T-T----T--T-GA----T-TT----T---T-T--T----CT--ACACAAG
gi|16 : GCTTGTGT--A--G-A--AA--AAA-A-----T-C----A----AAACA-------C--------C----CC-C--TA--G---------------T-A-A-----------AT--AT---------T---------TT------------T-A---C--T---A----G--GG----G--------G-------TG-T-T----T--T-GAT---T-TT----T---T-T--T----CT--ACACAAGc
gi|17 : gGCTTGTAT--A--G-A--AA--AAA-A-----T-C----A----AAACA-------T--------C----TC-C--TA--G---------------T-A-T--------------------------T---------TT------------T-A---C--T---A----G--GG----G--------G-------TG-T-C----T--T-GA----T-TT----T---T-T--T----CT--ACACAAGCC
gi|17 : GCTTGTGT--A--G-A--AA--AAA-A-----T-C----A----AGACA-------C--------C----CC-C--TA--G---------------T-A-A-----------A---A---------------------A------------T-A---C--T---A----G--GA----G--------A-------TG-T-T----T--T-GA----T-TT----T---T-T--T----CT--ATACAAGCCcc
gi|19 : gGCTTGTGT--A--G-A--AA--AAA-A-----T-C----A----AAACA-------C--------C----TC-C--TA--G---------------TAA-A-----------A---A----------TA--------TT------------T-A---C--T---A----G--GG----G--------G-------TG-T-T----T--T-GA----T-TT----T---T-T--T----CT--TCAc
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gi|8 : CTTGTGT--A--G-G--AA--AAA-A-----A-A----A----AGATA-------CTTACGGCAC----AC-C--TA--G---------------T-A-A-----------A---A----------TAA-------TT------------T-A---G--T---A----G--GGGGGAG--------G-------TG-T-CTGTAT--T-GA----T-TT----T---TCT--T----CT--ACACAAG
gi|8 : gcCTTGTGT--A--G-A--AG--AAA-AATCAAT-A----C----AGACA-------C--------CTCCCCC-C--TA--C---------------T-A-A-----------ATT-A----------T---------TT------------T-A---C--T---A----G--GT----GTGCCGTAAG-------TA-T-C----T--T-TT----T-TT----T---T-T--C----CT--ACACAAGgccc
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gi|9 : TGTGT--A--G-A--AA--AAA-A-----A-A----ATTCTAAACA-------C--------C----CC-TAGTA--GGCC------------T-A-A-----------A---AATAT------T---------TT------------T-A---G--T---A----G--GG----G--------G-------TG-T-T----T--T-GA----T-TTTTTTT---T-T--T----CT--ACACAAG
gi|12 : TGTGT--A--G-A--AA--AA--------T-C----A----AGACC-------C--------C----TC-C--TATGA---------------A-A-A-----------ATACA----------T---------TT------------T-C---T--T---A----G--AG----G--------GATGAGGTTG-T-C----T--T-TA----T-TT----T---T-T--T----TA--ATACAAGCCc
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gi|19 : TGA--A--G-A--AA--AAA-A-----T-C----A----AAACA-------C--------C----CC-C--TA--G---------------T-A-A-----------AT--A----------T---------TT------------TTA---C--T---A----G--GA----G--------G-------TG-T-T----T--T-GA----T-TT----T---T-T--T----CT--ACACAAGCC
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gi|1 : gg---A----------T---------TT------------T-A---C--T---A----G--GG----G--------G-------TA-T-T----T--T-GA----T-TTT---T---T-T--T----CT--AC
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gi|11 : gtgtagaaaaaaaatcaaaacaccccgtagtaaaaataCATGTAT-T---TTTA------CT---AC--G-G-G----G-----TGT-T--T----T-GA---TT---T---T--TTT-T---CTA-CACtt
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