lowQualScore                  :          11  3333333    5555555555555555555555555555555           1       2      111       2222222222222                                             6666666               11           111111                                                                        222222                         1          111111              1111                          11111111           2222222222      22                                 888888888            1             111111         111111111    11111                         1111                                        33333333333333333333   11111                                      4444444444444    2222222222222222        11111111                                                               2222222      111111        111111  222222                 44444444444444444                        333     11     11                       11   
lowQualScore                  :       9  33  0000000    5555555555555555555555555555555  66 99  2 5       6 1    888  2  2 8888888888888 5555      2  4  33  33    2  22    0   2 2  5555555  33   33 22   44   33    2 999999  2 2  7 9999 33   5      333  4 55555       33  2 2       2     33   2 555555     888888888           8   2  3   444444       77 33  6666     999   555  0   555   88888888     2 33  8888888888 2    44  2  33   2    2   55555         000000000     1      8  3      3   555555      44 444444444 3  22222  4  4 3     55     3    7777 2      777   3       5 2  88    88  4  66666666666666666666 0 00000    1      2         3      9     3   0000000000000    8888888888888888        99999999  666       7   9        555 3                  3  999999      8888888      000000  1     000000  000000 55  2 4     7   22222222222222222       66           7   666     11   1 77     3    5            55   
lowQualScore                  :       .  ..  .......    ...............................  .. ..  . .       . .    ...  .  . ............. ....      .  .  ..  ..    .  ..    .   . .  .......  ..   .. ..   ..   ..    . ......  . .  . .... ..   .      ...  . .....       ..  . .       .     ..   . ......     .........           .   .  .   ......       .. ..  ....     ...   ...  .   ...   ........     . ..  .......... .    ..  .  ..   .    .   .....         .........     .      .  .      .   ......      .. ......... .  .....  .  . .     ..     .    .... .      ...   .       . .  ..    ..  .  .................... . .....    .      .         .      .     .   .............    ................        ........  ...       .   .        ... .                  .  ......      .......      ......  .     ......  ...... ..  . .     .   .................       ..           .   ...     ..   . ..     .    .            ..   
lowQualScore                  :       0  88  5555555    7777777777777777777777777777777  55 77  4 0       9 2    111  4  4 5555555555555 0000      1  2  11  11    1  99    2   0 2  8888888  11   11 55   33   77    5 555555  5 5  5 9999 44   2      777  2 33333       11  2 2       5     22   4 000000     666666666           1   5  9   444444       99 22  1111     888   000  7   000   00000000     9 77  7777777777 7    77  7  77   7    1   44444         666666666     4      2  1      1   777777      22 555555555 6  66666  0  0 0     00     6    8888 8      000   3       1 5  66    44  9  99999999999999999999 3 00000    1      7         6      9     6   0000000000000    1111111111111111        33333333  444       8   7        222 3                  5  666666      2222222      555555  9     555555  000000 55  0 7     2   66666666666666666       99           6   333     77   7 44     9    7            55   
consensus                     :   AAAAAAA--ATGGGNAAAAAAACCATCAGACAAAAA-A---C---GN------GC--G--TA-AGAGTGGAA-GGAAACT--TT-CT-T-----A-TTATATT----AGGAAT-TT-GA--TT--GTGA-AA--TATATTTAAT-GTCA-G--AGG--ATT--A-TCAA-CAGT-GAAAT-TT-----CC-G-CA-T---AG--CGTTAGAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTAAG--ATG-TT--AACGACTT-A-------TCAAGAGGCGAGATA-TACAAA--G---TACATGT--A--AT---TAAGAT--CAAA---TTCAAT---TAT-G------AAAAA-T-GCA-TTACA--A-T-ATTGCCCC-TA--AAA-CTTAGAAAG-AT-TTTCATAAAATT---ATTCTGAACCCCGAAAAT-CACCTT-CCATAAATATTATCA--T---------A-TT--A--TG-TG-ACTTAAT--TTTAT-ACAA--C-TTAATTTC---TCC-CTCACCCGTTTT--TGAAN-TAGAAGA-AAATAAGACCATAA---TCA-----AATTGATTTAACGAAGAATTT-ACGCCAACATCT-ATGAACGAG-AA-AA-TTTGCAAATA-AAT--GT-GTTTAGAGT--N-----CA---CTACCTAATTTGAAGCGTTTA--T-CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTCT------TAATAC------GTTTGTTG------TA------T--ATGCCTCCCGTATA--TGCC-TN-TT-AA--ATATTTT--ACACACATGTTCAAAAC-TTGCTG-TGTAAT-CGGGCCTTTA-TACCGTTTAGGTGCGTA
Reference ( gi|1 )            :   AAAAGAA--ATGGACAACAAAACCATCACACAAAAA-A---C---AA------GT--G--TA-ACAGTGGAAAGGAAACG--TT-CT-T-----A-CTATCCT----AGGAAT-TT-GA--TT--GTGA-AA--TATATTTAAT-GTTACGGTAGG--ATT--A-TCAA-AAGT-GAAAT-TA-----CC-G-CA-T---GG--CGTCAAAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTAAG--ATG-TA--AAGGACTT-A-------TCAAGAGGCGACATA-TATAAA--A---TACATGT--A--AT---GAAGAT--CAAA---TTCAAT---TAT-A------AAAAA-T-ACA-TTATG--A-T-ATTGTACC-TA--AAA-CTTAGAAAG-AT-TTTCATAAAATTTTGATTCTGAACCCCGAACAT-CACCTT-CCACAAACATTATCA--T---------A-TT--A--TG-TG-ACTTAAT--TTTAT-ACAA--T-TCAATTTC---TCC-CTCACCCCTCTT--TGAAT-TAAAATA-AGATAGGATTACAC---TTA-----AATTGATTTAATGAAGAATTT-ACGCCAGCATCT-ATGGACACG-AA-AA-TTTGTATATA-AAT--GT-CTTTAGAGT--A-----CA---CTACCTAGTTTAAAGCGTTTG--T-CTCTCATAAATAATGCAACTA------TTTTTCT------TAATAC------GTTTGTTG------TA------T--ATACTTCCCGCATA--GGTA-TA-TT-GA--ATATTTT--ACACACATGTTTAAATA-TTGCTA-TGTAAA-CGGGCTTTTA-TACCGTTTAGGTAAGTA
gi|12                         :   AAAACAA--ACAGGAAAAAAAACC--CACGC----------------------GT--GCATA-AGATTGGAA-GGAACTT--TT-CT-G-----A-TCA-AAT----AGGTAC-TT-GA--TTCAATCA-AA--TATATTTA-T-GTCA------G--ATT--AATCAA-CAGC-AAATT-TT-----CC-G-CA-T---AA--CGTTATAAAC---AA-G-----GTTCAAA--AT-T-AATTTAT-GTAAC--ATA-TT--AATGACTT-A-------ACAAGAGGCGAGATA-TACAAA--G---TATATGT--A--AT---TAAGAT--TAAA---TTAAAC---TATGA------AAAAA-T-GTA-TTGCA--A-T-ATTGCCCC-TA--CAG-CTTA
gi|32                         : atAAAAAAA--AT---TAAAAAAACC------CAAAAACA---C---AC------GTACG--TA-AGAGTGGAA-TGAAACT--TT-CT-T-----A-TTATGTA----AGGCAT-TT-GA--TT--GTGA-AA--AATA-TTAAT-GT-----CAGG--ATT--A-CCAA-CAGT-GAAAT-TT-----CC-G-CA-T---agga
gi|43                         :   AAAAAAATGATGGGGAAAAAAACCA-------AAAA-A---C---TC------GTATG--TA-AAAGTGGAA-GGAAACT--TT-CT-T-----A-TTATATTTAATAGGAAT-TT-GA--TT--GTGA-AA--tgtgc
gi|6                          :      gaaA--ATGG-CGGAAAAA--ATAAGATAAAAA-A---C---GT------GT--GCGTA-AGAGTGGAA-GGAAACT--TC-CA-T-----A-TTAGATT----ACGAAT-TT-GA--AA--GTGA-AA--TATATTTAAT-GT--CGG---G--ATT--A-TCAA-CAGT-GAAAT-TA-----CC-G-CA-T---AG--CGATAGAAAC---AA-G-----GTCCCAA--AC---GATTTTT-TAAAG--GTG-TT--AACGACTT-A-------TCAAAGGGCGAGATA-CACAAA--G---CACATGT--A--AT---TAAGAT--CAAA---TTCAAT---TAT-G------AAAAA-T-ACA-TTAAA--A-T-ATTGCTCC-TA--AAA-CTTAGAAAG-AT-TTTCATAAA------ATTCTGAATCCCAAAAAT-CACCTT-TCATAAATTTTATCA--
gi|47                         :             aagacaatAAAA--ATCAGA-AGAAA-A---T---AAAGCGT-GC--G--TA-AGAGTG-AAAGGAAATT--TT-CT-T-----G-TCATATT----AGGAAT-TT-
gi|25                         :                             CAAACAAAAA-A---C---CC------GT--GCGTA-AAGGTGGAA-GGAAATT--TT-AT-T-----A-TCATATT----AGGAAT-TT-GA--TC--GTGA-AA--TATATTTAAT-GCCA-----GG--GTT--A-TCAA-CAGC-GAATT-TT-----CC-G-CA-T---AA--CGTTATAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AAATTAT-TTAAG--ATG-Tca
gi|24                         :                               aaCAAAAA-ATCCC---GT------GT--G--TATAGAGTGGAACG--AACT--TT-CT-T-----ATCTA-CAT----AGGAAT-TTTGA--TT--GTGA-AG--TTT-TTTAAT-GTCA-----GG--ATT--A---AT-AGGT--AGAT-GT-----CC-G-CAAT---AG--CTT--AGAAC---AA-A-----GTTCCAA--AC-TAAATTTt
gi|5                          :            ctacaatacaaaaagggtaaggAAAAA-A---G---AA------AC--G--TA-G-AATGGAA-GGAAAT---TT-CT-TTT---A-GCATATT----AGGAAT-TTTGA--TT--GTGA-AA--TATATTTAAT-AT--CGG---G--ATT--A-TCAA-CAGC-GAATT-TT-----CC-G-CA-G---AG--CATTAGAAAT---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TGAAG--ATG-TT--AACGACCT-A-------TCAAGAGGCAAGATA-TAAAAA--G---GACATGT--A--AT---TAAGAT--TAAA---TTCAAT---TAT-G------AAAAA-T-GCA-TTACA--A-T-ATTGCCCC-TA--AAA-TTTAGTAAG-AT-TTTCAT-AAAT-----TTCTGAACCCCGAAAAT-CACCTT-CTA-AA----TATCA--T---------ATTT--T--TG-TG-ACTT-AT--TTTAT-ACAA--C-T
gi|7                          :                 aaaaaaaaaaatgaaagAAAAA-A---G---AACGCAT-GT--G--TA-AGAATGGTA-GGAAACT--TT-AT-TTTATAA-TTAAATT----AGGAAT-TT-GA--TT--GTAA-AA--TATATTTATT-GTCA-AGT------TT--T-CCGA-TAGT-GCAAT-TT-----TC-G-CA-T---AG--CATTAAAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-CTTAG--ATG-TT--AAAGA-TT-A-------TTAAGAGGCGAGATA-TACAAA--G---TACATGT--A--AT---TAAGAA--CAAC---T----T---TAT-G------AAAAA-T-AC-------------ATTGCCCT-TA--AAA-TTTA-CACT-TT-TTTCATAAA------ATTCTGAACCCCAAAAAT-CACCTT-CCATACATATTATCA--T---------A-TT--t
gi|2                          :                    aagacaaaattggaAAAAA-A---C---GAAC----GT--G--TG--CGTTAAGTAGTGAACG--TTTCT-T-----A--TA-CTT----ATAA---TT-GACTTT--GTGA-AAACTATACTTAAT-----CGG---A--ATT--A-TCAA-CAGT-AACAT-TT-----CC-G--A-T---TAATCGCTAGAAAC---AATG-----GTTCCAACAAC----ATTTAT-TTAAG--AT------------TT-A-------TCAAGAG----CA-A-TATAAA--AATTTGCAT----A--AT---TAATATT-CAAA---TTCAAT---TA-----------------------------------------TA--AAA-TTTAAAAAA-AA-T--CATAAAATT------CTGAATCCCGAA-AT-CACCTT-C-GTAA---TTTCTA--T---------A-AT-----TG-TG-A--TACA--TTTAT-ACAAACT-TCA-TTTC---TCC-CT--CTCCTCTTAATGAAT-TAAAGAA-AAATA-----ACACCAATCA-----AATT-ATTTAACGAAGA--------CCAAGATCTCATA---ACG-AGCAA-CTTGT-TA-A-AAC--TT-GTTTAGAGTTGACTTCTCA---TTACTTAATTT-AAGCG-TTG--T-CTC-CA-AAAAAATGCAACT-------TTCTTCTAAATTCTAATAC------G-TTGTTG------CA------C--ATCCTCCCTACAT
gi|20                         :                        gaccaaaatgAAAAA-A---G---AATGCGT-GC--G--TA-AGAGTGAAAAT-AAACT--TT-CT-T-----A-GTATATT----AGGAAT-TT-GA--TC--GTGA-AA--TACAA--AAT-GTCA-----GG--ATT--A-TCAG-CGGT-GAAAT-TT-----CC-T-CA-T---AG--CGTTCAAAAC---AAAG-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT----AT--ATT-TA-------TTTCA-------TCAAGAGGTGAGATA-TACAAA--G---TACATGC--A--TT---TAAGAT--Cgtcagaaaacgtgctgtatatatcggcctttatac
gi|13                         :                          caaaaatgAAAAA-A---T---GAACGCGTGT--G--TA-AAAGTGGAA-GAAAACT--TT-TT-T-----A-TTATATT----AGGAAT-TT-GA--AT--GTGA-AA--TATATTTAAT-CGTCCGGGAG----TTAAA-TCAATGAGT-TAATT-TAATTTTCT-G-CA-TATCAT--CGTCTAGAAA---AA-A-----GTCCCAA--AC-T-AAT---T-TTAAATCAGG-T---AACGACTT-A-------TTGAGAGGCGTGATA-TACAAA--G---TGCATGT--A--AT---AA
gi|30                         :                      cgaaaaaaaatgAAAAA-A---C---GC------GC--G--TA-AGAGTACAA--GCAACT--TT-CT-T-----ATCTATATT----AGGAATCTT-GA--TT--GGGA-AA--TATATTTAAT-GTCA-----GG--ATT--A-TCAA-CAAT-GCAAT-TT-----CC-T-CA-T---AG--CGTTAGAAAA---AA-G-----CTTCCAtatga
gi|11                         :                 caaaaatatagagagagAAAGA-A---CCGCGA------GC--G--TA-AGAATGGAA-GGAAACACTTT-CTAT-----A-ATAT--T----AGGAAT-T--GA--T---GTGA-AA--TACAAATA-T-GTTGTG-TAGGGAATT--A--CAA-CAGT-TATAT-AG-----CC---CG-T---AG--AATTAAACACTTTAA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTGT-TTAAG--ATGTTG--ACGCACTCGA-------TCAAGAGGCGA-AGA-TATACACTG---TACAAGT--ACGAT---G----T-----A---TTCCAA---TAC-A------AAGAGCT-ACA-CAATT--T-T-GTT-TACC--A--AGA-CCTAg
gi|39                         :             gaggcaaaaattgaaaaaaaaaaAAA-G---C---GC------GA--G--TA-AGGGTGGAA-GGAAATA--TT-CC-T-----T-TTATGTT----AGAAAT-TT-GA--TC--CTGA-GA--TACA---AAT-----TGTCAGG--GTT--A-TCAA-CAGT-TAAA
gi|40                         :                       aaaatgagaaatgAAA-G---C---GC------GA--G--TA-AGGGTGGA--GGAAATA--TT-CC-T-----T-TTATGTT----AGAAAT-TT-GA--TC--CTGAGAA--CAAAT----T-GT-----CAGG--GTT--A-TCAA-CAGT-TAAA
gi|23                         :                                     aaaatgaaaaatg------GT--G--TA-AGAGTGGAACG-AAAC---TT-CT-T-----A-TCA-CAT----AGGAAT-TT-GA--TT--GTTG-AG--TATATTTACT-CTCA----GGG--ATT--A-TCAA-CAGT-GAAGTCTGT----CC-GCCATT---AG--CTTTAGAAAC---AA-A-----TTTCCAA--ACTT-AATTT
gi|42                         :                                                                                   agggataaaggagaaaaaaaattccggtGGAAT-TT-GA--TT--GTGA-AA--TATATTTAAT-GTTACGGTAGG--ATT--A-TCAA-AAGT-GAAAT-TA-----CC-G-CA-T---GG--CGTCAAAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTA
gi|9                          :                                                                                                               GGAAT-TT-GA--TT--GTAA-AA---ATATTTATTTGTCA----AGT--GTT--T-CCGA-TAGTTGCAAT-TT-----TTTG-CAAT---AG--C--TAAAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T--ATTTATCTTAAG--ATG-TA--A--GA-TT-A-------TTAAGAGGCGAGATA-TAC-AA--A---TACATGTA-A--AT---TAAGATA-CAAC---TT---T---TAT-G------AAAAA-----A-T--------C-ATTGC-CT-TA--AAA-TTT--ACAC-TT-TTTCATAAAA---TG--TCTGAACCCCAAA-ATAAACCTT-CTAACCATATTATCA--
gi|44                         :                                                                            aacaacagaaacgcatgtagaatggtgtagaactttatttttataattaaattagA-AA--TATATTTAAT-GTCA-----GG--ATT------------------T-TT-----CC-A-CA-T---AG--CGTTAGAAAC---AA-G-----ATTTCAA--AT-T-TATTTAT-TTAAG--ATG-TT--AACGACTT-A-------TCAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                            a--CGTTAGAAAC---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-TATTTAT-TTAAT--ATG-TT--AACGACTT-A-------TCAAGAGGCGAGATA-TACAAA--G---TACATGT--A--AT---TAGGAT--CAAA---TTCAATTTATAT-G------AAAAA-T-ACA-T
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                              atatCAAAAA--------------TTCCGA--AC-T-AATTTAT-TCA-----TG-TT--AAGGACTT-A-------TCAACAGGCGAGATC-TACAAA--G---TACATGT--A--TT---TACCAT--CAAA---TT-AAT---TGA-G------AAAAA-T-ACA-TGAAG--A-T-ATTG--CC-TATAAAA-CTTTGAAAG-AT-TTTCATAAAATT------CTGAATCCCGAAAAT-TACCTT-CCATGAATATTATTA--T---------A-TT--G--TG-TG-CTTTGAG--TTTTT-ACAA--C-TTAATTTC---TCA-TCCAGCCTTTCT--TGAAT-TAGAAGA-AA-----------------A-----AATTCAGTTAACGAAGAATTT-ACGCCAACATTT-ATG---ACGAAA-AA-TTTGCAAATA-AAT--GT-GTTTAGAGT--G-----CA---TTACCTAATTTGAAGCGTTTG--T-CTTTGATAAACAATGCAACTA------TTTTTC-------TATTAC------GTGTGTTG------CA------T--ATA--TC---------------------------TTTT--ACACACATGTTaaattctgcttcgtatgaatataaagat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                    AAATC---AA-GACTCCGCCCCAA--AC-T-ATAGTAT-T-AAA--ATG-TGTTACCGACTTTA-------TCAAGAGGCGG-ATACTATAAA--GG--TACATAT--A---T---TAAGAT--TAAA---TTCAAT---CGT-ATGCAAGAGAGA-T-GCA-TTACACAA-T-ATTGC-CC-TA--AAA-ATTAGAAAC-A--TTTCATAAAATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                               ttatgcagaccaatcccaagaccacccgcacattctttagAC---AA-A-----GTTCCAA--AC-T-GATTTAT-TTTAG--ATG-TT--AATGACTT-ACATTGTATTAAGAGGCGAGATA-TACAAA--G---TACATGT--A--ATTTAAAAGATAATAAA---TTCAAT---TAT-G------AAAAA-T-GCA-TTACA--A-T-GTTGCCCC-TA--AAA-CT-AAAAAG-AT-TTGCATAAAATT------CTGAACCCCGAAAAT-CACCTT-CCATAAATATTATCA--T---------A-TT--A--TG-TG-ACTTAAT--TTTAT-ACAA--C-TTAATTTC---TCC-CTCACCAGTTTT--TGAAT-TAGAAGA-AAATAAGACCATAA---TCA-----AATTGATTTAACAAAGAATTT-ACGCCAACATCT-ATGAACGAG--A-AA-TTTG----CA-AAT--GTGTTTTAGAGT--C-----CA---CTACCTAATTTTAAGTGTTTA--T-CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTC-------TAATAC------GTTTGTTG------TA------T--ATGCCTCCCGCATA--TGCC-TA-TT-AA--ATATTTT--ACACACATGTACAAAAC-TTGCTG-TGTAAT-CGGGCTTTTA-TAACATTTAAGTGAGTc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                               G--ATG-TT--AGCGACTT---------TCAAGAAGCAA-ACA-TACAAA--G---TACAGCTTAA--AT---TAAGAT--TATA---TTCAAT---GAT-G------AAAAA-T-GCAATCACA--ACT-ATTGCCCG-TA--AAA-CTTAGAA-G-AT-TTTCATAAA------ATTCTGAA-CCCGAAAAT-CACC-T-CCATGAATGTTAT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                               G--ATG-TT--AACGACTT-A-------TTAAGATGCGAGACA-TACAAA--G---TACATGT--A--
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               CTA-A-------TCAAGAGGCAAAACA-TACAAA--G---TACAGCTA-A--AT---TAAGAT--TAAATATTCCAAT---GAC-C------CAAGA-TCACA------------ATTGCCCCTTA--AAA-CTTG----------TTC-TAA-------ATTCTGAA--CCGAATAT--ACCTT-CCATGATGTTTATCA--T---------A-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgttagcgactATGT--A--AT---AAACAT--TAAA---TTCAAT---TATTG------AAAAA-T-GCA-TTACA--A-TTATTGCCCC-TA--AAA-CTTGGAAAGAAC-TTTCTTAA-------ATTCTGAACCCTGAAAAT-CACCTTGCCATTAG-ATTATCATCT---------A-TTCCA--TGTTG-ATCAAATTATCTAT-ACAAC-T-TTAATTTCAGATCCTCTCA-CCCTATA--TGAAC-TAAAAAA-AGATAGG--TAAAA---TTA-----Ac
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gA-TCAAG--A-T-ATTGCCCC-TG--AAA-CTAAGAAAT-AT-GTTCATAAAATT------CTGAACCCCGGAAAT-CACTTT-CCATAAATAGTATTA--T---------A-TA--A--TG-TGAACTTAAT--TTTAT-ATACT-T-TCAATTCT---TCC-gaacacgaataatcaaaattttgatgtgtagaaacatagagagcatatttaacatcaatcgttaaattttatgaaacgagtaagttgatatattgag
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                a-ATTGCCCC-TA--AAAACTTAGAAAG-AAATTTCATAAA-------TTCTGAACCCCGAAAAT-CACCT--CCATAAATGTTATCA--TGTATATAATA-TT--A--TG-TG-ATTTAAT--TTTATTGCAA--CCTTAATTTC---TCC-CTCACCCGTTTTG-TGAAAATAGAAGA-AAATAAGACCATAA---TTA-----AATTGAATTAACAAAGCATTT-ACGCCATCATCT-ATGtgcgtc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -TTTCATAGAATT------CTGAACCCCGAAAAT-TACCTC-CCATAAATATTATCA--T---------A-TT--A--TG-TT-ATTTGAT--TTTAT-ACAA--C-TTAATTTC---TTC-ATCATCCGTTTT--a
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aa--T---------A-TT--AAATG-TG-ATTTAAT--TTTAT-ACAA--C-TTAATTTC---TCC-CAAACTCGTTTT--TGAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcgaaaagtaaccagtccaaaatgcc-TG-ACTTAAT--GCTAT-ATGA--C-TTAATTTC---TCC-CTCGTCCCTCTT--TGAAT-TAGAA----AATAAAACTATAC---TTA-----AAC--ATTTAATGAAGAATTT-ACGCCAACATCT-ATGAACGAG-AA-A--TTGGCAAATA-AAT--TT-GTTTAGAGT--G-----CA---CTACCTAATTGTAAGCGTTGG--T-CTCTCATAAATAATGCAACTA------TTGTAC-------TAATAC------GTTTGTTA------T
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT--TTTAT-ACAA--C-TTAATTTC---TCC-CTAACCCATTTT--TCAAA-TATAAGA-AAATAAGACCATAA---TCA-----AATTGATTTAACAAAGCATTT-ACGCCAACATC---------------AA-TTTGCGAATA-AAT--GT-GTTTAGAGT--C-----CAGCTCTACCTAATTTGAAGCGTTTA--T-CTCTCATAAATAATGCAATTAAAATTATTTTTCT-------AATAC------GTGTGTTT------TA------T--ATGCCTCTTGTATA--TGCC-TA-TT-AA--GTATTTT--ACACACATGTTCAAAAC-TTGCTG-TGT-AA-TGGGCCTTTA-CACCGTTTAGGTcccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CC-CTCACCTGTTTT--TGAAA-TAGAAGA-AAAAAAGAAAATAA---TCA-----AATTGATTGAACAAAGAATTT-ACGCCAACATTT-ATGAATGAG-AA-A--TTAGCAAATA-A-T--GT-GTTTAGAGT--C-----CA---CTACCTAGTTTGAAGTGTTTA--T-CTCTCATAAATAATGAAATTA------TTTTTC-------TAATAT------GTGTGTTG------TA------T--AT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CC-CCCCCCCCTCTT--CGAAG-T---ATCTAGAGAAAATTATGG---CTATGAGTAATTGAACTTACAAATAATCT-ACGCCGACTTCT-ATGA--GCG-AGCAA-TTTG----------------TTTAGAGT--G-----CA---CTAC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----AATTGATTTATTGAAGAATTT-ACGCCAACATCT-ATG--CA-G-AG-AATTTTGCAAATA-AAT--GT-GATTAGAGT--G-----TT---CTACCGA----AAA--GTTTGTCT-CTCTCGTGAATAATGCAAATA------TGTCTC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tAAGAATTT-ATTCCAACATCC-ATGAACGAG-AA-A--TTTGCAATTA-AAT--GG--TTTAGAGA--A-----CA---CTACCAAATTTGAAGCGTTTA--T-CTCTCATGA-CAATGC---TA------TTTTTTT------TAATACATGTACGTTTGTTG------TACATTTAT--ATACT--CCGTATA--TGCC-TT-TT-AA--ATATTTT--ACACACATGTTCAAAAC-TTGCTG-TGTAAT-C--GCCTTTA-TACT-TTTAGGTGCGTAagtc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAAGAATTTAATTCCA-CATCT-ATGAACGAG-AA-A---TTGCAT-TAGAATTGGG-TTTTAGAGA--A-----CA---CTAGCAAATTTGAAGCGTTTA--TCCTCTCAATGATAATGC-ATTA------TTTT--T------TAATAC------GTTTGTTG------TACAAT--T--ATATGCTCCGTATA--TGCC-T--TT-AA--ATATTATACACACACATGTCAAAAC--TTGCTGTTGTAAGTCGGGCCTTTA-TACCGTTTAGGTa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-AA-TTTGCAAATC-AAT--GT-GTTTAGAGT--C-----CA---CTACCTGATTTGAAGCGTTTA--T-CTTTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTC-------TGATAT------GTTTGTTGTACATTTA------T--ATGCCTCCCA-ATA--TGCC-TT-TTAAA--ATATTTT--ACACACATGTTCAAAAC-TTGCTG-TGTTAT-CGGGCCTTTA-TATCGTTTACGTGCGTAgcgt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aggTGAAGCTTTCA--T-CTCTTATAATTAATGCAATTA------TTTTTCT-------AATAC------GTGT-TTG------TA------T--ATGCCTCCCGTGTA--TGCC-TA-TT-AA--ATATTTT--ACACACATGTTCAACAC-TTGCTG-TGTAAT-CGGGCCTTTA-TACCGTTCAGaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTC-------TAATCC------GTGTGTTG------TA------TACATGCCTCCCGTATACTGGTAGTGCTT-AATCATATTTT--ACACACACGTTCAAAAACTTGCCG-TGTAAT-CGGGCCTTTATTATCGTTTAGATGTGTAtgctt

Unaligned ( gi|16 ): TCCGTGCGCTCTGCGTGAGTTAATTGTGCTCTCTGCTTGCGCTCACCGTTCACAATTTTGCGTTCACCGTTCACAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAAATGGGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAAAAGAAATGTGTGTGTAAGAGTGGAAGGAAATTT
Unaligned ( gi|35 ): GACAAAATGAACAAGGAATGTATGCGCAAGAGTGGAGAGGAACTTTCATGTAACAGATCACACAAGATGTATGCTTTTGAACTACAAATCATTTGGATTGTCAACAGTGAAAATTC
Unaligned ( gi|37 ): AAGACAAAATAATGAAAATGGACGCAAGACTGGAAGGAAACTTTCATATTACATCAGAGATATGATTTTGAACTAAAAAGTATTTAGATTATTAGCTGTGAAAAT
Unaligned ( gi|38 ): AAAATTAGAAATGAAAAGCGCGAGTAAGGGGTGGAAGGAAACTATTCCTTTTATGTAGAAATTTGATCCTGAGATACAAATTGTCCAGGGTTATCAACAGGTTA
Unaligned ( gi|46 ): AATGACAATAGCAACAACAAAAAAAGAAAGAAGGAAAAAAAACCATGTGCGTAAGAGTGGAAGGAAATTT
Unaligned ( gi|48 ): TGTTCAGTGTTTGCTGTTCTGTTCACAATTTTGCGTTCACCGTTCGCGAA
Unaligned ( gi|50 ): GCGCTCTGCTTGCACTCACCGTTCACAGTTTTGTGTTCACCGTTT

lowQualScore                  :                 1111111       555555555                   1111                                              1111111                                                                   3333333                                                                                                                                                                                                                                                                                33333333                                             111111111                                                                                       1111111111                                                              11                             11111111                                                             2222222                    111111                       1111111                                                                                  
lowQualScore                  :             66  9999999       000000000 22 1  5555555 333 1111 6666 555 22    1    1    22 1      44 1 1    0000000  3    555555 44444   1  1 1  1  22  22    1  22  88888  1   44 3  1111111     2222     1   1   333 22  33   2 2 2 4 22  2 1 4444      2 555  2 55555       22  2 2       2       22  22   1 2    8888888888          2     2    666666   2 2  2    77    444     99      2   888 555  2 8888 555     2 2  0 888888 2       33     2    1   77777         88888888      0        2 2    2  2      33   2       777777777   88888   3 3 1      44    3    3 3  3      666   3       5    3    55  777   0    4  7777777777      999999   2   666                               3        44  7      3   3      3        11111111  555           1          3                     888888      5555555      999999  1     999999  7777 55  3 1     1   3333333    99  4  55                 4  4           4    4 4  1        4         1       
lowQualScore                  :             ..  .......       ......... .. .  ....... ... .... .... ... ..    .    .    .. .      .. . .    .......  .    ...... .....   .  . .  .  ..  ..    .  ..  .....  .   .. .  .......     ....     .   .   ... ..  ..   . . . . ..  . . ....      . ...  . .....       ..  . .       .       ..  ..   . .    ..........          .     .    ......   . .  .    ..    ...     ..      .   ... ...  . .... ...     . .  . ...... .       ..     .    .   .....         ........      .        . .    .  .      ..   .       .........   .....   . . .      ..    .    . .  .      ...   .       .    .    ..  ...   .    .  ..........      ......   .   ...                               .        ..  .      .   .      .        ........  ...           .          .                     ......      .......      ......  .     ......  .... ..  . .     .   .......    ..  .  ..                 .  .           .    . .  .        .         .       
lowQualScore                  :             11  0000000       111111111 66 7  7777777 000 5555 1111 888 44    7    7    44 7      11 7 7    5555555  6    222222 66666   7  7 7  7  55  55    7  44  44444  8   33 6  0000000     8888     8   9   333 66  11   2 2 1 2 99  2 9 7777      1 555  0 00000       99  1 1       4       99  99   0 2    4444444444          4     4    888888   4 4  2    55    777     00      5   999 000  9 9999 000     9 9  8 000000 7       11     7    9   00000         00000000      6        7 7    7  7      77   7       999999999   00000   6 6 8      66    3    3 3  3      444   1       9    3    00  000   7    0  5555555555      888888   3   444                               3        55  4      3   2      3        88888888  888           8          1                     888888      1111111      666666  0     222222  7777 00  2 6     3   0000000    88  0  55                 0  4           4    4 4  1        4         4       
consensus                     :      AAAAAAA--ATG--G-GAAAAAAAACC-T-AGACA--A-AA-------A---A----C----GC--G--CGTA-AGAG-TGGA--A-GGAAAC--T-T-TCTT-------AT-TATA------T----TAGG-AA-T-TT-GA--TT--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GT--C-G-AGGATT--A-TCAAC-AGT-GAA---A--TT--TCC-G-C-A-T--AG-CGT----TAGAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTAAGAT--GT--TAACG-ACTT--A-------TCAAGAGGCG-AGATA-TACA------AAG-T-AC-ATGT--AATT---AAGAT--CAAATTCAAT---T---AT-G----A---AAAATGC-ATTACA--A-T-ATTGCCCC-TAAAA-CTTAGAAAGA-T-TTTCATAAAATT----TTCTGAACCCCGAAAA-T-CACC-TT-CCATAA--ATA-TTATCAT---------ATT--A--TGT-G-ACTTAATT--TTAT-ACAA-C-TT-AATTTC---TCC-CTCACCCGTTTT-TGAAN-TA---GAAGAAAA-TA----------AGACCA----T-AATCAAA---TTGATTTAACGAAGAATTTACGCCAACATCT-ATGAACGAGAAAATTTGCA-AATAAATGTG-TTTAGAGT-------NCA---CTACCTAATTTGAAGCGTTTAT-CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTCT------TAATAC------GTTTGTTG------TA----T--ATGCCTCCCGTATA-------TGCCTATT-AA--ATATTTTACACACATGT-TC-AAAACTTGCTG-TGTA-A-TCGGGCCTTTA-TACCGTTTAGGTGCGTA
Reference ( family-930 )      :      AAAAAAA--ATG--G-GNAAAAAAACCATCAGACA--A-AA-------A---A----C----GN--G--CGTA-AGAG-TGGA--A-GGAAAC--T-T-TCTT-------AT-TATA------T----TAGG-AA-T-TT-GA--TT--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GT--CAG-AGGATT--A-TCAAC-AGT-GAA---A--TT--TCC-G-C-A-T--AG-CGT----TAGAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTAAGAT--GT--TAACG-ACTT--A-------TCAAGAGGCG-AGATA-TACA------AAG-T-AC-ATGT--AATT---AAGAT--CAAATTCAAT---T---AT-G----A---AAAATGC-ATTACA--A-T-ATTGCCCC-TAAAA-CTTAGAAAGA-T-TTTCATAAAATT---ATTCTGAACCCCGAAAA-T-CACC-TT-CCATAA--ATA-TTATCAT---------ATT--A--TGT-G-ACTTAATT--TTAT-ACAA-C-TT-AATTTC---TCC-CTCACCCGTTTT-TGAAN-TA---GAAGAAAA-TA----------AGACCA----T-AATCAAA---TTGATTTAACGAAGAATTTACGCCAACATCT-ATGAACGAGAAAATTTGCA-AATAAATGTG-TTTAGAGT-------NCA---CTACCTAATTTGAAGCGTTTAT-CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTCT------TAATAC------GTTTGTTG------TA----T--ATGCCTCCCGTATA-------TGCCTNTT-AA--ATATTTTACACACATGT-TC-AAAACTTGCTG-TGTA-A-TCGGGCCTTTA-TACCGTTTAGGTGCGTA
gi|1                          :      AAAAGAA--ATG--G-ACAACAAAACCATCACACA--A-AA-------A---A----C----AA--G--TGTA-ACAG-TGGA--AAGGAAAC--G-T-TCTT-------AC-TATC------C----TAGG-AA-T-TT-GA--TT--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GTTACGGTAGGATT--A-TCAAA-AGT-GAA---A--TT--ACC-G-C-A-T--GG-CGT----CAAAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTAAGAT--GT--AAAGG-ACTT--A-------TCAAGAGGCG-ACATA-TATA------AAA-T-AC-ATGT--AATG---AAGAT--CAAATTCAAT---T---AT-A----A---AAAATAC-ATTATG--A-T-ATTGTACC-TAAAA-CTTAGAAAGA-T-TTTCATAAAATTTTGATTCTGAACCCCGAACA-T-CACC-TT-CCACAA--ACA-TTATCAT---------ATT--A--TGT-G-ACTTAATT--TTAT-ACAA-T-TC-AATTTC---TCC-CTCACCCCTCTT-TGAAT-TA---AAATAAGA-TA----------GGATTA----C-ACTTAAA---TTGATTTAATGAAGAATTTACGCCAGCATCT-ATGGACACGAAAATTTGTA-TATAAATGTC-TTTAGAGT-------ACA---CTACCTAGTTTAAAGCGTTTGT-CTCTCATAAATAATGCAACTA------TTTTTCT------TAATAC------GTTTGTTG------TA----T--ATACTTCCCGCATA-------GGTATATT-GA--ATATTTTACACACATGT-TT-AAATATTGCTA-TGTA-A-ACGGGCTTTTA-TACCGTTTAGGTAAGTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATT--TTAT-ACAA-C-TT-AATTTC---TCC-CTAACCCATTTT-TCAAA-TA---TAAGAAAA-TA----------AGACCA----T-AATCAAA---TTGATTTAACAAAGCATTTACGCCAACATC-------------AATTTGCG-AATAAATGTG-TTTAGAGT-------CCAGCTCTACCTAATTTGAAGCGTTTAT-CTCTCATAAATAATGCAATTAAAATTATTTTTCT-------AATAC------GTGTGTTT------TA----T--ATGCCTCTTGTATA-------TGCCTATT-AA--GTATTTTACACACATGT-TC-AAAACTTGCTG-TGTA-A-T-GGGCCTTTA-CACCGTTTAGGT
gi|11                         :         AAAA--ATT--G-AAAAAAAAA---------A--A-AA-------G---AACCGC----GA--G--CGTA-AGAA-TGGA--A-GGAAACACT-T-TCT--------AT-AATA------T----TAGG-AA-T-T--GA--T---GTGA-AA--TACAAA-TATGTTG-T-GT---AG-GGAATT--A--CAAC-AGT-TAT---A--TA--GCC---C-G-T--AG-AAT----TAAACA-CTTTAA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTGT-TTAAGAT--GT--TGACGCACTCG-A-------TCAAGAGGCGAAGATA-TACACTGTACAAG-T-ACGATGT--A
gi|12                         : gaggcAAAACAA--ACA--G-GAAAAAAAACC--CA--CG----------------------C----GT--G--CATA-AGAT-TGGA--A-GGAACT--T-T-TCTG-------AT-CAAA------T-----AGG-TA-C-TT-GA--TTCAATCA-AA--TA-----TATTTA--T-GT--CAG-A---TT--AATCAAC-AGC-AAA---T--TT--TCC-G-C-A-T--AA-CGT----TATAAA-C---AA-G-----GTTCAAA--AT-T-AATTTAT-GTAACAT--AT--TAATG-ACTT--A-------ACAAGAGGCG-AGATA-TACA------AAG-T-AT-ATGT--AATT---AAGAT--TAAATTAAAC---T---AT-GA---A---AAAATGT-ATTGCA--A-T-ATTGCCCC-TACAG-CTTAttccaatacaaagagctacacaattttgtttaccaagaccta
gi|13                         :    atAAAAAAA--ATG-------AAAAAAT-----------G-AA-------C---G----C----GT--G--TGTA-AAAG-TGGA--A-GAAAAC--T-T-TTTT-------AT-TATA------T----TAGG-AA-T-TT-GA--AT--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-TCGT--CCG-GGAGTTAAA-TCAATGAGT-TAATTTAATTT--TCT-G-C-A-T--AT-CATCGTCTAGAAA-----AA-A-----GTCCCAA--AC-T-AAT---T-TTAA-ATCAGG--TAACG-ACTT--A-------TTGAGAGGCG-TGATA-TACA------AAG-T-GC-ATGT--AATagga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgAAGAATTTAATTCCACATCT-ATGAACGAGAAA--TTGCATTAGAATTGGGTTTTAGAGA-------ACA---CTAGCAAATTTGAAGCGTTTATCCTCTCAATGATAATGC-ATTA------TTTT--T------TAATAC------GTTTGTTGTACAATTA----T--ATGC--TCCGTATA-------TGCCT-TT-AA--ATATTATACACACACATGTC-AAAACTTGCTGTTGTA-AGTCGGGCCTTTA-TACCGTTTAGGTGCGTaatatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aAAGAATTTATTCCAACATCC-ATGAACGAGAAA-TTTGCA-ATTAAATG-G-TTTAGAGA-------ACA---CTACCAAATTTGAAGCGTTTAT-CTCTCATGA-CAATGC---TA------TTTTTTT------TAATACATGTACGTTTGTTG------TACATTT--ATATACTCCGTATA-------TGCCTTTT-AA--ATATTTTACACACATGT-TC-AAAACTTGCTG-TGTA-A-TC--GCCTTTA-TACT-TTTAGGTGCGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aT-G-ACTTAATG--CTAT-ATGA-C-TT-AATTTC---TCC-CTCGTCCCTCTT-TGAAT-TA---GAA---AA-TA----------AAACTA----T-ACTTAAA---C--ATTTAATGAAGAATTTACGCCAACATCT-ATGAACGAGAAA-TTGGCA-AATAAATTTG-TTTAGAGT-------GCA---CTACCTAATTGTAAGCGTTGGT-CTCTCATAAATAATGCAACTA------TTGTAC-------TAATAC------GTTTGTTA------Ta
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                               CC-G-C-A-C--ATTCTT----TAGAAATC---AA-GACTCCGCCCCAA--AC-T-ATAGTAT-T-AAAAT--GTGTTACCG-ACTTT-A-------TCAAGAGGCG--GATACTATA------AAGGT-AC-ATAT--A-TT---AAGAT--TAAATTCAATCG-T---AT-GCAAGA---GAGATGC-ATTACACAA-T-ATTGCCC--TAAAA-ATTAGAAACA---TTTCATAAAATT---cccc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttatgcagaccaatcccaagaccac-ATTGCCCC-TAAAAACTTAGAAAGA-AATTTCATAAA-------TTCTGAACCCCGAAAA-T-CACC-T--CCATAA--ATG-TTATCATGTATATAATATT--A--TGT-G-ATTTAATT--TTATTGCAA-CCTT-AATTTC---TCC-CTCACCCGTTTTGTGAAAATA---GAAGAAAA-TA----------AGACCA----T-AATTAAA---TTGAATTAACAAAGCATTTACGCCATCATCT-ATGAc
gi|2                          :                                        A--A-AA-------A---A----C----GA--A--CGTG-TGCG-TTAAGTA-GTGAACG-T-T-TCTT-------AT--AC-------T----TATA-A----TT-GACTTT--GTGA-AAACTA-----TACTTAA-T-----CGG-A--ATT--A-TCAAC-AGT-AAC---A--TT--TCC-G---A-TTAAT-CGC----TAGAAA-C---AATG-----GTTCCAACAAC----ATTTAT-TTAAGAT--------------TT--A-------TCAAGAG-CA-A--TA-TAAA------AAT-TTGC-AT----AATT---AATATT-CAAATTCAAT---T---AT----------AAAAT----TTA------------------AAAA------AAA-------TCATAAAATT------CTGAATCCCGAAA--T-CACC-TT-C-GTAA--TTT-CTATAAT-----------------TGT-G-A--TACAT--TTAT-ACAAAC-TT-CATTTC---TCC-CTCTCCTCTTAA-TGAAT-TA---AAGAAAAA-TA----------ACACC-------AATCAAA---TT-ATTTAACGAAGA-------CCAAGATCTCAT-AACGAG-CAACTTGTT-A--AAACTTG-TTTAGAGTTGACTTCTCA---TTACTTAATTT-AAGCG-TTGT-CTC-CA-AAAAAATGCAACT-------TTCTTCTAAATTCTAATAC------G-TTGTTG------CA----C--AT-CCTCCC-TACA-------TGTC-----AG--A---------------------AAACGTGCTG-TATATA-TC-GGCCTTTA-TAC
gi|20                         :                              gaccaaaatgA--A-AG-------A---ATG--C----GT--G--CGTA-AGAG-TGAA--A-ATAAAC--T-T-TCTT-------AG-TATA------T----TAGG-AA-T-TT-GA--TC--GTGA-AA--TA-----CA--AAA-T-GT--C---AGGATT--A-TCAGC-GGT-GAA---A--TT--TCC-T-C-A-T--AG-CGT----TCAAAA-CA--AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT------AT--AT--TTAT---TTC--A-------TCAAGAGGTG-AGATA-TACA------AAG-T-AC-ATGC--ATTT---AAGAT--C
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caaaaatgaaaAATTTGCA-AATCAATGTG-TTTAGAGT-------CCA---CTACCTGATTTGAAGCGTTTAT-CTTTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTC-------TGATAT------GTTTGTTGTACATTTA----T--ATGCCTCCCA-ATA-------TGCCTTTTAAA--ATATTTTACACACATGT-TC-AAAACTTGCTG-TGTT-A-TCGGGCCTTTA-TATCGTTTACGTGCGTA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aggCC-CTCACCTGTTTT-TGAAA-TA---GAAGAAAA-AA----------AGAAAA----T-AATCAAA---TTGATTGAACAAAGAATTTACGCCAACATTT-ATGAATGAG-AAATTAGCA-AAT-AATGTG-TTTAGAGT-------CCA---CTACCTAGTTTGAAGTGTTTAT-CTCTCATAAATAATGAAATTA------TTTTTC-------TAATAT------GTGTGTTG------TA----T--ATaa
gi|23                         :                                    AGAAA--A-AA-------A---A----TTCCGGT--G--TGTA-AGAG-TGGA--A-CGAAAC--T-T--CTT-------AT-CACA------T-----AGG-AA-T-TT-GA--TT--GTTG-AG--TA-----TATTTAC-T-CT--CAG--GGATT--A-TCAAC-AGT-GAA---G--TCTGTCC-GCC-ATT--AG-CTT----TAGAAA-C---AA-A-----TTTCCAA--ACTT-AATTT
gi|24                         :               agggataaaggAAAAAGGGTAAGGCA--A-AA-------A---ATCC-C----GT--G--TGTATAGAG-TGGA--A-CGAA-C--T-T-TCTT-------ATCTACA------T-----AGG-AA-T-TTTGA--TT--GTGA-AG--T------TTTTTAA-T-GT--C---AGGATT------AAT-AGG-TAG---A--TG--TCC-G-CAA-T--AG-C-T----TAG-AA-C---AA-A-----GTTCCAA--AC-TAAATTT
gi|25                         :                          ctacaatacCAAACA--A-AA-------A---A----CCC--GT--G--CGTA-AAGG-TGGA--A-GGAAAT--T-T-TATT-------AT-CATA------T----TAGG-AA-T-TT-GA--TC--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GC--C---AGGGTT--A-TCAAC-AGC-GAA---T--TT--TCC-G-C-A-T--AA-CGT----TATAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AAATTAT-TTAAGAT--GT--T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaGAT--GT--TAGCG-ACTT----------TCAAGAAGCA-A-ACA-TACA------AAG-T-AC-AGCTTAAATT---AAGAT--TATATTCAAT---G---AT-G----A---AAAATGCAATCACA--ACT-ATTGCCCG-TAAAA-CTTAG-AAGA-T-TTTCATAAA------ATTCTGAA-CCCGAAAA-T-CACC--T-CCATGA--ATG-TTAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                     -A-T--AT-CGT----TAGAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-TATTTAT-TTAATAT--GT--TAACG-ACTT--A-------TCAAGAGGCG-AGATA-TACA------AAG-T-AC-ATGT--AATT---AGGAT--CAAATTCAATTTAT---AT-G----A---AAAATAC-AT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTC-------TAATCC------GTGTGTTG------TA----TACATGCCTCCCGTATACTGGTAGTGC---TT-AATCATATTTTACACACACGT-TCAAAAACTTGCCG-TGTA-A-TCGGGCCTTTATTATCGTTTAGATGTGTAaaattctgcttcgtatgaatataaagat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T--GT--TAGCG-ACTCTAA-------TCAAGAGGCA-AAACA-TACA------AAG-T-AC-AGCTA-AATT---AAGAT--TAAAT---AT---TCCAAT-G----ACCCAAG-----ATCACA------ATTGCCCCTTAAAA-CTTG----------TTC-TAA-------ATTCTGAA--CCGAATA-T--ACC-TT-CCAT-G--ATGTTTATCAT---------Aaag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                          A-C---AA-A-----GTTCCAA--AC-T-GATTTAT-TTTAGAT--GT--TAATG-ACTT--ACATTGTATTAAGAGGCG-AGATA-TACA------AAG-T-AC-ATGT--AATTTAAAAGATAATAAATTCAAT---T---AT-G----A---AAAATGC-ATTACA--A-T-GTTGCCCC-TAAAA-CT-AAAAAGA-T-TTGCATAAAATT------CTGAACCCCGAAAA-T-CACC-TT-CCATAA--ATA-TTATCAT---------ATT--A--TGT-G-ACTTAATT--TTAT-ACAA-C-TT-AATTTC---TCC-CTCACCAGTTTT-TGAAT-TA---GAAGAAAA-TA----------AGACCA----T-AATCAAA---TTGATTTAACAAAGAATTTACGCCAACATCT-ATGAACGAG-AAATTTGCA-AAT--GTGT--TTTAGAGT-------CCA---CTACCTAATTTTAAGTGTTTAT-CTCTCATAAATAATGCAATTA------TTTTTC-------TAATAC------GTTTGTTG------TA----T--ATGCCTCCCGCATA-------TGCCTATT-AA--ATATTTTACACACATGT-AC-AAAACTTGCTG-TGTA-A-TCGGGCTTTTA-TAACATTTAAGTGAGTc
gi|30                         :                                    AGAGA--A-AA-------A---A----C----GC--G--CGTA-AGAG-TACA--A-GCAA-C--T-T-TCTT-------ATCTATA------T----TAGG-AA-TCTT-GA--TT--GGGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GT--C---AGGATT--A-TCAAC-AAT-GCA---A--TT--TCC-T-C-A-T--AG-CGT----TAGAAA-A---AA-G-----CTTCCA
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaaaatatagagTGAAGCTTTCAT-CTCTTATAATTAATGCAATTA------TTTTTCT-------AATAC------GTGT-TTG------TA----T--ATGCCTCCCGTGTA-------TGCCTATT-AA--ATATTTTACACACATGT-TC-AACACTTGCTG-TGTA-A-TCGGGCCTTTA-TACCGTTCA-GTGCg
gi|32                         :      AAAAAAA--AT------TAAAAAAACC------CA--A-AA-------ACACA----C----GT--A--CGTA-AGAG-TGGA--A-TGAAAC--T-T-TCTT-------AT-TATG------T----AAGG-CA-T-TT-GA--TT--GTGA-AA--AA-----TA-TTAA-T-GT--C---AGGATT--A-CCAAC-AGT-GAA---A--TT--TCC-G-C-A-T--tt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --A-T-ATTGCCCC-TGAAA-CTAAGAAATA-T-GTTCATAAAATT------CTGAACCCCGGAAA-T-CACT-TT-CCATAA--ATA-GTATTAT---------ATA--A--TGT-GAACTTAATT--TTAT-ATAC-T-TT-CAATTC---TTC-CTtgtgc
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatcaagAA---TTGATTTATTGAAGAATTTACGCCAACATCT-ATGCA-GAG-AATTTTGCA-AATAAATGTG-ATTAGAGT-------GTT---CTACCGAA----AAGTTTGTCT-CTCTCGTGAATAATGCAAATA------TGTCTCgcgtc
gi|35                         :                                     tACA--A-GG-------A---A----T----GTATG--CGCA-AGAG-TGGA--G-AGGAAC--T-T-TCATGTAACAGAT-CACA------C----AAGA-TG-T-AT-GC--TT--TTGA-AC--TA-----CAAATCA-T-TT-------GGATT--G-TCAAC-AGT-GAA---A--AT--TCagtc
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gacaaaatgaCC-CCCCCCCCTCTT-CGAAG-TATCTAGAGAAAATTA----------TGGCTA----TGAGT--AA---TTGAACTTACAAATAATCTACGCCGACTTCT-ATGAGCGA--------GC------AATTTG-TTTAGAGT-------GCA---CTAC
gi|37                         :                                    AGACA--A-AATAATGAAA---A----T----GG--A--CGCA-AGAC-TGGA--A-GGAAAC--T-T-TCAT-------AT-TACA------T----CAGA-GA-T-AT-GA--TT--TTGA-AC--TAAAAAGTATTTA--------------GATT--A-TTAGC-TGT-GAA---A--
gi|38                         :                                aATTAGAAATGA-AA-------A---G----C----GC--G--AGTA-AGGGGTGGA--A-GGAAAC--TAT-TCCT-------TT-TATG-----------TAGA-AA-T-TT-GA--TC--CTGA-GA--TA-----CA---AATT-GT--C-C-AGGGTT--A-TCAAC-AGat
gi|39                         :                                         aaa-AA-------A---G----C----GC--G--AGTA-AGGG-TGGA--A-GGAAAT--A-T-TCCT-------TT-TATG------T----TAGA-AA-T-TT-GA--TC--CTGA-GA--TA-----CA---AATT-GT--C---AGGGTT--A-TCAAC-AGT-TAA---A--gtta
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                aaaatgagaaatg---AA-A-----ATTCCGA--AC-T-AATTTAT-TCA---T--GT--TAAGG-ACTT--A-------TCAACAGGCG-AGATC-TACA------AAG-T-AC-ATGT--ATTT---ACCAT--CAAATT-AAT---T---GA-G----A---AAAATAC-ATGAAG--A-T-ATTGCCTA-TAAAA-CTTTGAAAGA-T-TTTCATAAAATT------CTGAATCCCGAAAA-T-TACC-TT-CCATGA--ATA-TTATTAT---------ATT--G--TGT-G-CTTTGAGT--TTTT-ACAA-C-TT-AATTTC---TCA-TCCAGCCTTTCT-TGAAT-TA---GAAGAAAA------------------------------AA---TTCAGTTAACGAAGAATTTACGCCAACATTT-ATGA-CGA-AAAATTTGCA-AATAAATGTG-TTTAGAGT-------GCA---TTACCTAATTTGAAGCGTTTGT-CTTTGATAAACAATGCAACTA------TTTTTC-------TATTAC------GTGTGTTG------CA----T--AT--------------------------------ATCTTTTACACACATGT-T
gi|40                         :                                          ca-AA-------A---G----C----GC--G--AGTA-AGGG-TGGA----GGAAAT--A-T-TCCT-------TT-TATG------T----TAGA-AA-T-TT-GA--TC--CTGAGAA--CA-----AAT-----T-GT--C---AGGGTT--A-TCAAC-AGT-TAA---A--
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaatgaaaaatg-TTTCATAGAATT------CTGAACCCCGAAAA-T-TACC-TC-CCATAA--ATA-TTATCAT---------ATT--A--TGT-T-ATTTGATT--TTAT-ACAA-C-TT-AATTTC---TTC-ATCATCCGTTTT-
gi|42                         :                                                                                                                                      aaGG-AA-T-TT-GA--TT--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GTTACGGTAGGATT--A-TCAAA-AGT-GAA---A--TT--ACC-G-C-A-T--GG-CGT----CAAAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TTA
gi|43                         :      AAAAAAATGATG--G-GGAAAAAAAC-------CA--A-AA-------A---ACT--C----GT--A--TGTA-AAAG-TGGA--A-GGAAAC--T-T-TCTT-------AT-TATA------TTTAATAGG-AA-T-TT-GA--TT--GTGA-AA--
gi|44                         :                                                                                                                                                           gaaA-AA--TA-----TATTTAA-T-GT--CAG---GATT-----------------------TT--TCC-A-C-A-T--AG-CGT----TAGAAA-C---AA-G-----ATTTCAA--AT-T-TATTTAT-TTAAGAT--GT--TAACG-ACTT--A-------TCAA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aCGAAAAGT-AACCAGT-CCA-AA--ATG-----CCT---------ATT--AAATGT-G-ATTTAATT--TTAT-ACAA-C-TT-AATTTC---TCC-CAAACTCGTTTT-TGAA
gi|46                         :     tAAAAAGA--AAGAAG-GAAAAAAAACCAT---------------------------------GT--G--CGTA-AGAG-TGGA--A-GGAAAT--T-T-
gi|47                         :      aatgacaatagcaacaacaaAAAAATCAGAAGAAA--ATAA-------A---G----C----GT--G--CGTA-AGAG-TGAA--A-GGAAAT--T-T-TCTT-------GT-CATA------T----TAGG-AA-T-TT-
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAT--GT--TAACG-ACTT--A-------TTAAGATGCG-AGACA-TACA------AAG-T-AC-ATGT--Aca
gi|5                          :      AAAAAAA--AT-----GAAAGAAAA---------A--A-GA-------A---A----C----GT----------AGAA-TGGA--A-GGAAAT--T-TCTTTT-------AG-CATA------T----TAGG-AATT-TT-GA--TT--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-AT--C---GGGATT--A-TCAAC-AGC-GAA---T--TT--TCC-G-C-A-G--AG-CAT----TAGAAA-T---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-TGAAGAT--GT--TAACG-ACCT--A-------TCAAGAGGCA-AGATA-TAAA------AAG-G-AC-ATGT--AATT---AAGAT--TAAATTCAAT---T---AT-G----A---AAAATGC-ATTACA--A-T-ATTGCCCC-TAAAA-TTTAGTAAGA-T-TTTCAT-AAAT-----TTCTGAACCCCGAAAA-T-CACC-TT-C--TAA--ATA-TCAT-AT----------TT--T--TGT-G-ACTT-ATT--TTAT-ACAA-C-TT-
gi|6                          :      aaaAATA--ATG--GCGGAAAAAA----TAAGATA--A-AA-------A---A----C----GT--GTGCGTA-AGAG-TGGA--A-GGAAAC--T-T-CCAT-------AT-TAGA------T----TACG-AA-T-TT-GA--AA--GTGA-AA--TA-----TATTTAA-T-GT--CGG---GATT--A-TCAAC-AGT-GAA---A--TT--ACC-G-C-A-T--AG-CGA----TAGAAA-C---AA-G-----GTCCCAA--AC---GATTTTT-TAAAGGT--GT--TAACG-ACTT--A-------TCAAAGGGCG-AGATA-CACA------AAG-C-AC-ATGT--AATT---AAGAT--CAAATTCAAT---T---AT-G----A---AAAATAC-ATTAAA--A-T-ATTGCTCC-TAAAA-CTTAGAAAGA-T-TTTCATAAA------ATTCTGAATCCCAAAAA-T-CACC-TT-TCATAA--ATT-TTATCA
gi|7                          :                                   aagacA--A-AG-------A---A----C----GCATG--TGTA-AGAA-TGGT--A-GGAAAC--T-T-TATTTTATA--AT-TAAA------T----TAGG-AA-T-TT-GA--TT--GTAA-AA--TA-----TATTTAT-T-GT--CAA---GTTT--T-CCGAT-AGT-GCA---A--TT--TTC-G-C-A-T--AG-CAT----TAAAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-AATTTAT-CTTAGAT--GT--TAAAG-A-TT--A-------TTAAGAGGCG-AGATA-TACA------AAG-T-AC-ATGT--AATT---AAGAA--CAACT----T---T---AT-G----A---AAAATAC-------------ATTGCCCT-TAAAA-TTTA-CACTT-T-TTTCATAAA------ATTCTGAACCCCAAAAA-T-CACC-TT-CCATAC--ATA-TTATCAT---------ATT--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagacaaaattggaaaa-ATGT--AATA---AACAT--TAAATTCAAT---T---ATTG----A---AAAATGC-ATTACA--A-TTATTGCCCC-TAAAA-CTTGGAAAGAAC-TTTCTTAAA-------TTCTGAACCCTGAAAA-T-CACC-TTGCCATTA--G-A-TTATCATCT-------ATTCCA--TGTTG-ATCAAATTATCTAT-ACAA-C-TTTAATTTCAGATCCTCTCACCC-TATA-TGAAC-TA---AAAAAAGA-TAGGTAAAATTAAGAACACGAAT-AATCAAAATTTTGAT
gi|9                          :                                        g--A-GA-------A---A----C----GC--A--TGTA--GAA-TGGT--G-TAGAAC--T-T-TATT-------TT-TATAATTAAAT----TAGGGAA-T-TT-GA--TT--GTAA-AA---A-----TATTTAT-TTGT--CA--AGTGTT--T-CCGAT-AGTTGCA---A--TT--TTTTG-C-AAT--AG-C------TAAAAA-C---AA-G-----GTTCCAA--AC-T-A-TTTATCTTAAGAT--GT---AA-G-A-TT--A-------TTAAGAGGCG-AGATA-TACA------AA--T-AC-ATGTA-AATT---AAGATA-CAACTT---T---T---AT-G----A---AAAA----AT--------C-ATTG-CCT-TAAAA-TTT--ACACT-T-TTTCATAAAAT-----GTCTGAACCCC-AAAA-TAAACC-TT-C--TAACCATA-TTATCAgtgtagaaacatagagagcatatttaacatcaatcgttaaattttatgaaacgagtaagttgatatattgag