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Reference ( family-920 ) : NGTGATTTTT--TTC--GG-G--CC-AA--AA-T-GCCACCG-A-TANT--GGGC-GGTT-TC-CC---CT----CCC--A-------------------AAAA----T-T------GG------G--TA-----TTTT------TT-CC----C----------AA-T-C-ATACA-T---CTA--TTT-TTT--CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAGA-A-G-AAATT-GTA-------AACA--------AAAG-T-CACCG-T----ATATNA-ATT---AA-TTAATT----TT-T---CT-G-ACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------T----------------------CCGG-------------------T--TT-TATT-CT--CC--A-AACCC-CTGCACAT-GCAAAAGGTTTTGTG--ATG-----A-ATG----GGTAATA-CAAT-GGAG----GT--ATC--GATT-ATT---TTATGC-A----TTTTT----T---A-TCATTCTA--A-TGTA---C-TGCAA---AT--GATGATTTT--T----CCC--AA-T--T-TGAGG---A--A----AA-----------TGT-C--G-CTAAT---TTT-TCCNNNTNC-------------GAG-G--GGGGT--GGTG-GT-T----TAAAAA-ACAAAAAAAAT
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gi|12 : ccactgatattcggctgtttcccctcccaaaaattgggtatttattcccaatcatatatctatttttcccaatttgactgaggaattcaataaaagtaattctaagaaaataaataatagttatctatttgttaaaaaatatttatttcatgatttcaaatcagatataaatgaacctcaaacaaaaacacttgttgttcttgttccttataatttGATTTTT--TTC--GG-G--CC-AA--AA-TTGCCACCG-A--AAT--GGGT-GGTT-TC-CC---CT----CAC--A-------------------AAAA----T--------GT------G--TA-----TTTT------T--CC----C----------AA-T-C-ATA-A-T---CTA--TTT-TTC--CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAGA-A-GAAAATT-GTA-------AAAC--------AAAG-T-CATTG-T-----TAT---ATT---AA-TTAATT----TT-T---CT-G-ACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------TACGAGTTTTTTTTCA-------CCAG-------------------T--TA-TATT-CT--CC--A-AACCC-CTGAACAT-GCAAAAGGTTAGGTG--ATG-----A-GTG----GGTAATA-CAAT-GGCG----GG--ATC--GATT-AAT---GTATGC-A----TTTAT----T---A-TCATTCTA--A-TGCA---C-T
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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blockSeqs : . . . . C . . T C . . . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : NGTGATTTTT--TTC--GG-G--CC-AA--AA-T-GCCACCG-A-TANT--GGGC-GGTT-TC-CC---CT----CCC--A-------------------AAAA----T-T------GG------G--TA-----TTTT------TT-CC----C----------AA-T-C-ATACA-T---CTA--TTT-TTT--CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAGA-A-G-AAATT-GTA-------AACA--------AAAG-T-CACCG-T----ATATNA-ATT---AA-TTAATT----TT-T---CT-G-ACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------T----------------------CCGG-------------------T--TT-TATT-CT--CC--A-AACCC-CTGCACAT-GCAAAAGGTTTTGTG--ATG-----A-ATG----GGTAATA-CAAT-GGAG----GT--ATC--GATT-ATT---TTATGC-A----TTTTT----T---A-TCATTCTA--A-TGTA---C-T---ACAAAT--G-ATGATTTT--T----CCC--AA-T--T-TGAGGA--A----AA-----------TGT-C--G-CTAAT---TT--TT---C---C--AAA--TTCA-----AAG---GGGG--T-GGT--G---GT-T----TAAAAA-ACAAAAAAAAT
finalCons : NGTGATTTTT--TTC--GG-G--CC-AA--AA-T-GCCACCG-A-TANT--GGGC-GGTT-TC-CCCT-------CCC--A-------------------AAAA----T-T------GGG--------TA-----TTTT------TT-CC----C----------AA-T-C-ATACA-T---CTA--TTT-TTT--CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAGAA--G-AAATT-GTA-------AACA--------AAAG-T-CACCG-TAT----ATNA-ATTAAT----TAATT----TT-T---CT-G-ACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------T----------------------CCGG-------------------T--TT-TATT-CT--CC--A-AACCC-CTGCACAT-GCAAAAGGTTTTGTG--ATG-----A-ATG----GGTAATA-CAAT-GGAG----GT--ATC--GATT-ATT---TTATGC-A----TTTTT----T---A-TCATTCTA--A-TGTA---C-T---ACAAAT--G-ATGATTTT--T----CCC--AA-T--T-TGAGGA--A----AA-----------TGT-C--G-CTAAT---TT--TT---C---C--AAA--TTCA-----AAG---GGGGN---GGT--G---GT-T----TAAAAA-ACAAAAAAAAT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-920 ) : NGTGATTTTT--TTC--GG-G--CC-AA--AA-T-GCCACCG-A-TANT--GGGC-GGTT-TC-CC---CT----CCC--A-------------------AAAA----T-T------GG------G--TA-----TTTT------TT-CC----C----------AA-T-C-ATACA-T---CTA--TTT-TTT--CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAGA-A-G-AAATT-GTA-------AACA--------AAAG-T-CACCG-T----ATATNA-ATT---AA-TTAATT----TT-T---CT-G-ACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------T----------------------CCGG-------------------T--TT-TATT-CT--CC--A-AACCC-CTGCACAT-GCAAAAGGTTTTGTG--ATG-----A-ATG----GGTAATA-CAAT-GGAG----GT--ATC--GATT-ATT---TTATGC-A----TTTTT----T---A-TCATTCTA--A-TGTA---C-T---ACAAAT--G-ATGATTTT--T----CCC--AA-T--T-TGAGG---A--A----AA-----------TGT-C--G-CTAAT---TT--TT---C---C--AAA--TTCA-----AAG---GGGG-NGGT--G---GT-T----TAAAAA-ACAAAAAAAAT
gi|1 : TGATTTTGAACTC--GG-G--CC-AA--AA-T-GTCACCG-A-TAAT--GGGT-GGTG-TT-CC---CTGCTGCCT--A-------------------AAAA----TAT------GGCAGTATG--TG-----TTTTCTTATTTT-CC----C----------AA-T-CGAT-CA-TTCACTACGTTTATTC--CCCC-AAT----TTC-AA-ACTTG-TAGACA-G-AAATTCGCA-------AACA--------AAAG-TTCATCG-T----A-ATTA-ATT------TCATTT----TT-TGTTCT-GGACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------TAGCGGCTTTGTTTTTTTTTCAGCCAG-------------------TATTT-TATT-CT--TCGCA-AACCTGCTGCACAT-GTAAAAGTTTTTGTGTGATG-----A-AGG----GGTAATA-CAAT-GGAG----GT--ATCCGGATTCACTTCGTTATGC-A----TTTTTATCCT---A-TCATTCTA--A-TGGAATTC-T---ACAAAT--G--CGTTCTTG-T----CCC--AAGT--T-TGAGG---A--AGCAGAT-----------TGG-C--G-CTAAT---GT--TTGTACACAC--AAATGTTCAATAGGAAG---GGGGTGGGT--A---ATGT----TAAAAAGACAACAGAA
gi|10 : --GG-G--GC-AA--AA-T-CCCACAA-A-TATT--CGGC-TGTT-TC-CC----T----CCA--A-------------------CAAA----T-T------GG------G--TA-----TTTT------CC-CC----A----------AA-----AAACA-T---CTA--TTT-TTT--CCCC-AGT----TTC-AA-A--TG-AAG----G-AAATC-GTA-------AACA--------AAAGTT-CACCA-TGAGAAAATGA-A-T---AA-TTCAGT----TT-T---C--A-ATAAAT---ATAA------------------A-------------A-------------------
gi|11 : gataaaatctgtttttaaacagatgatagttttaacatcattgtaaggttgaaatgcactagtattgatttatatttcagtgattgggggCCACTG-A-TATT--CGGC-TGTT-TC-CC---CT----CCC--A-------------------AAAA----T-T------GG------G--TA-----TTTA------TT-CC----C----------AA-T-C-ATATA-T---CTA--TTT-TT----CCC-AAT----TT--GA-C--TG------A-G-GAAT---TC-------AATA--------AAAG-T-aaaattatatatataagttcttgattcaaatcagatataaaatgaatagccaaagtggttgtgtgtgtttctcgctgtcgtgtaatt
gi|11 : ATT-ATT---TTATGC-A----TTTTT----T---A-TCACTCTA--A-TTTA---C-T---GCAAAT--GNNNNNNNNN--N----NNN--NN-N--N-NNNNN---N--N----NN-----------NNN-N--N-NNNNN---NN--NN---N---N--NNN--NNNN-----NAG---GGGG-TGGaattctaagaaaataaataatagttatctatttgttaaaaaatatttatttcatgatttcaaatcagatataaatgaacctcaaacaaaaacacttgttgttcttgttccttataatttattattttatgcattttttatcactctaatttactgcaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagggggtgg
gi|12 : ccactgatattcggctgtttcccctcccaaaaattgggtatttattcccaatcatatatctatttttcccaatttgactgaggaattcaataaaagtaattctaagaaaataaataatagttatctatttgttaaaaaatatttatttcatgatttcaaatcagatataaatgaacctcaaacaaaaacacttgttgttcttgttccttataatttGATTTTT--TTC--GG-G--CC-AA--AA-TTGCCACCG-A--AAT--GGGT-GGTT-TC-CC---CT----CAC--A-------------------AAAA----T--------GT------G--TA-----TTTT------T--CC----C----------AA-T-C-ATA-A-T---CTA--TTT-TTC--CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAGA-A-GAAAATT-GTA-------AAAC--------AAAG-T-CATTG-T-----TAT---ATT---AA-TTAATT----TT-T---CT-G-ACAAAG---AGAA------------------A-------------A-------------------TACGAGTTTTTTTTCA-------CCAG-------------------T--TA-TATT-CT--CC--A-AACCC-CTGAACAT-GCAAAAGGTTAGGTG--ATG-----A-GTG----GGTAATA-CAAT-GGCG----GG--ATC--GATT-AAT---GTATGC-A----TTTAT----T---A-TCATTCTA--A-TGCA---C-T---
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gi|14 : C--GG-G--CC-AAGAAA-T-GCCAACT-A-TAAT--GGTG-GGTTATC-CCTC-CT----CTC--A-------------------AAAA----T-T------TT------G--TAGTATCTTTT------TT-CC----C----------AA-T-C-ATACATT---CTT--ATT-TGT--CCCC-AAT----ATCAAA-A--TG-TAGA-----AAATT-GTA-------AACA--------AAAG-T-CATCA-T----ATATTA-ATC---AA------T----TT-T---CT-G-ACAAAG---AAAAAATACAATTCTTTTTTTCA-------------A-------------------T----------------------CCAG-------------------T--TT-TATT-TT--CC--A-AACCC-CTGCACAT-GCAAAAAGTTTTGTG--ATG------------------------AT-GGAG----GT--ATC--GATT-ATT---ATATGC-A----TTTTT----T---A-GCATTCTA--A-TGcta
gi|15 : tccttataGATTTTT--TTC--GG-G--TCTAA--AA-T-GCCACCG-A-TAAT--GG-T-GGTT-TC-CC----T----CCC--A-------------------AAA-----T-T------GG---------TA-----TTTT------TT-CC----C----------AA-T-C-ATACA-C---CTA--TTT-T----CCCC-AAT----TTC-AA-A--TG-TAAA-AAG-AAATT-----------AACA--------AAAG-T-CACCAAT----ATATAA-AT-----A-TT--TT----TTAC---CT-G-ACAACACT-AGAA------------------A-------------A-------------------TGA--------------------CCGGGTT----------------T--TT-TAGT-CTGCCT--A-AACCC-CTGCACAT-GCAAAAGGTTAAGTG--ATG-----A-ATGCATGGGTAATA-CAAT-GGAG----GT--ATC--GATT-ATT---TTATGC-AT---TTTTT----T---A-TCATTCTA--A-TGg
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gi|30 : A-T---CTA--TTT-TTT--CCCCCAAT----TTC-AA-A--TG-TAGT-G-G-AAATT-GTc
gi|4 : TGATA-TAAC-GA-------T--ATC----TT--TT---GTATGC-AATCATTTTG----T---A-TCATTCTA--A-TTTA---C-C---GCAATT--T-A-GATTTT--TTTGCCCC--AA-T--T-TGAGG---ACGA----AA-----------TGTAT--GTCTAATATATT--TT---C---CTAAAA--TTCA-----AAGT--GGAG-AGG
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