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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus : GAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--GAAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------T--TNNANN-CNCGNN-GANNNNNNGNNNNNNNNNCNAGNCGACGGNGNAA-CGNA-----T-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--GAAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------T--TNNNNN-CNCGNN-GNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNACGNNNNNA-CGNN-----T-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
gi|1 : GAATAT---CTGT-GTT-TGG----CGAG---T--GACGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATTCTTTC--CA-A------T--TTTCAA-CACCTG-GAAATGAGGAGGGGAGGGCTAGTCC----CAAAA-CGAA-----T-----TTA-T--CC----GC---T-G----A--AA------CT------T----T-A-GGAAA----TATT-A----A--T-CA-AAT-TTTCTA-ATCTCTA-CA-TTC-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----TAT-TA-ATG----AATATT-G--AA-CACC---A---T--AATA-G----G----------C----AAGTCCATGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TT----------G---------AA-CA-T---------AAC-TA---------------------AT--AA---AC---A---AT-----------------------------AA---------GA-TC--AAA---ATTTGA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----ACAACA--CT-G-----------AT--CT---CA---A-A---A--T--A-----AT-----C--------TA-CAAGTTAA----A-A--GCA---TGCAA--TA---G-GT-T-GAA-G-------------------------AACTAAAAC-A-TTCTATGCA-TCTGGA---A-GATGGG-TGT-A-TGAGAT
gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CCGT-ACT-GAG----CGAG--GC--GAAGC-CG----A--G-----TTCCAAT--AC-GGATC---T---CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----N-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-CG-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A---T----AT---G---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-TT---------AT--A-----T-GT--AAT-CATAAAA--TACAAATGTATAA----CAAT-AAA--A----TA---------AA-T----AA---A-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--A--CT-G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-AG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----CGA-G------T--------C--------AGACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
gi|11 : gAA-AT---C-AT-ACT-GGG----CGAG--GC--AAAGC-TG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----C-----ATA-T--CC---TGC---T-T----G--GG-AC---CT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----C--T-CA-GAT-TTC--A-G--CA-A-CA-T-C-ATT--G-A-T-AGATATCAGTTGATA--T-C----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ATT-G--AA-GACC---A---T--A-TA-----------------C----A------TGT---AT-T-ACATT----GA---G---C--AT--C-----------A---------TA-TA-T---------AAT-TA---------TC--A-----C-AT-------GT---A--TATGGA-----GACCTCATA--GTT--A----AA---------GA-TA--CAA---A-C-AA--C----A----------------------A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-C---G--T-AA-------------------------A--TTAA----A-A--GCA-----------------------AA-A------TAC-GTA--AGTT-----GGACCAAAAC-A--CCC-TGCA-C---
gi|12 : aGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--GAAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----N-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------AT-T-T----C-TT----CAA-TT-ATG-----A-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAG--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--TA---A--A--TG-TT-TGTTTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA-----GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTA
gi|13 : GAA-ATTAACC-T-ATT-GAG----C-AG--GC--GAAAC--G----A--G-------CCAA---AC-A-ATT---TC---A-A------T--TCAACA-CCTGAT-GATCTGTAGAAGCCCAAACA-----ACGGTA--A-CGAA-----T-----TTAAT--CG---CACA--T-G----A--A--AC---CT------T----T-A-GGAAA----A-TT-AA---G--T-CC-AAT-T-A--A-ATCCT-G-CA-TTC-TTT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----CAA--T-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC-------T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT---A---T----GT---G---C--A---------------G---------AA-CT-T---------AAT-CA---------TT--A-------AT--AAC-CAC---A---ATTAA-----AA----CAA--AA--------------------T-TC--CAA---A-C-AA--T----A--G--TG-TTGGG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---CA---A-A---A--T-AA-----A------C--------TA-CA--TT-A----A-A--GCA---T---A--TA---G-AT-T---A-G------TAT-ATA--A--------AGAC-AAGAA-A-CCCC-TGCA-A---CG---A-GAT-
gi|14 : gGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAT--GC--G
gi|14 : -----TTA-T--CC---CAC---T-T----A--AG-AC---CT------T----T-A-AGAAA----T-TT-G----T--T-CA-GAA-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-T-------A-TT-ATA----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----GTCTA------C----A------TAT---AT-C-A---A----GT---G---C--GT--TG----------A---------A--CA-T---------A--------------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATTAA-----CC----AAT--AAA--ATT--AA----------A-T----AA---A-CTTG--T----C--A--GG-TT-TG-TTG-----A-A--A--AT-A-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----GT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----TAA-G------C--------C--------AGACCAAAGC-A-TCCC-TGCA-T---GT---A-GAT-GG-TGG-ATTGAAATTtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaattatcccacttaagacctttaagaaatttgttcagaattcagtagcatcttttataaattatattataaaattgaacaccatataggtctacatatatcaagtgcgttgaacatattatataatcacaatattaaccaataaaattaaataaacttgtcaggtttgttgaaaataaatgcagaaataggtctacattgaaagcatatacgtaagccagaccaaagcatccctgcatgtagatggtggattgaaattccatagcct
gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgcgtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaa---T-G----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
gi|16 : GAA-AT---CCGT-ATT-GGG----C-AG--GC--GAAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----N-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC----ATCTA-G-CA-TAC-TTT--T-A-T-AA------------A----T----A-TT----CAA-TT-AT-----AA-ATT-G--AACCACCA--A---T--A-TA------G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA--A-T---------AAT-TA----------T--A-----TAAT--AAT-C-C---A---AT---------A----AAC--AAA--T----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TGTTT-TG-TTG-----A-A--A--AC-A-----------AA--TT---CA--GA-A---A--T-AA-----AC-----CA-------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-cacaaa
gi|17 : gGAA-AT---CCGT-ATA-GGA----CAGGTTGCATGAAGC-CG----A--G-----TCCCAAC--AT-GGATT---TC--CA-TATCACGT--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----N-----TTA-T--CC---TAT---T-G----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--GAAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA--------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----N-----TTA-T---C---CGC---T-G----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CCGT-AAT-GGG----CGAG--GC--CAAGT-GG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-------------TTA-T--C----------T-G----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : GAA-AT---CTGTTATT-GGG----CGAG--GC--GAAAC-CG----A--G-----TCC-AATGAAC-GGGAT---TC--CA-A------TGTNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNG-----T-----TTA-----CGAGCGC---T-G----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CCGT-ATT-GGGGGGGCGAG--GC--GAGGCGCG----A--G-----T-CCAAT--AC-GGATTTG-TC--CA-T------T--CACACG-CT-GGA-TTTGACTCGTAGTCGCCGCAAGACGACTGTGTAA-CGAA-----T-----TTA-CTGCG---CGC---T-G----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CTGT-ATT-GGG----CAAA--GC--AAAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-----NNNNNNTTA-T--CT---CGC---T-G----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--GAAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CCGT-ATT-GA-----C-AG--GC--AAA-C-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGATT---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNT-----T-----AT--T--CC---CGC---T-G----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : g-----T-----TT--T--CC---CG------G----A--AG-AC----T------T----T-A-GGAT-----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T-C--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : gatttccattcacacctgagatactggtattactcccaaactgactgtgttga--G-----TTCCAAT--ACTGGATT----C--CA-T------T--TACACA-CCTGAT-GACTCACAGTTTATGTCCCCAAACGACGGGA--A-C-CA-----T-----TTA-T--CC---CGC---T-G----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-G
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctcA-CGAA-----T-----TTA-T--CC---TGC---T-GTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : taA-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
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gi|14 : gGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAT--GC--G-
gi|14 : GGAATA-ATGAA-A-----TTA-T--CC---CAC---TT----A--AG-AC---CT------T----T-A-AGAAA----T-TT-G----T--T-CA-GAA-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-T-------A-TT-ATA----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----GTCTA------C----A------TAT---AT-C-A---A----GT---G---C--GT--TG----------A---------A--CA-T---------A--------------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATTAA-----CC----AAT--AAA--ATT--AA----------A-T----AA---A-CTTG--T----C--A--GG-TT-TG-TTG-----A-A--A--AT-A-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----GT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----TAA-G------C--------C--------AGACCAAAGC-A-TCCC-TGCA-T---GT---A-GAT-GG-TGG-ATTGAAATTtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaattatcccacttaagacctttaagaaatttgttcagaattcagtagcatcttttataaattatattataaaattgaacaccatataggtctacatatatcaagtgcgttgaacatattatataatcacaatattaaccaataaaattaaataaacttgtcaggtttgttgaaaataaatgcagaaataggtctacattgaaagcatatacgtaagccagaccaaagcatccctgcatgtagatggtggattgaaattccatagcct
gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgcgtattatgtccccaactgacctt---TG----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
gi|16 : GAA-AT---CCGT-ATT-GGG----C-AG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC----ATCTA-G-CA-TAC-TTT--T-A-T-AA------------A----T----A-TT----CAA-TT-AT-----AA-ATT-G--AACCACCA--A---T--A-TA------G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA--A-T---------AAT-TA----------T--A-----TAAT--AAT-C-C---A---AT---------A----AAC--AAA--T----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TGTTT-TG-TTG-----A-A--A--AC-A-----------AA--TT---CA--GA-A---A--T-AA-----AC-----CA-------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-cacaaa
gi|17 : gGAA-AT---CCGT-ATA-GGA----CAGGTTGCATG-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAC--AT-GGAT-T---TC--CA-TATCACGT--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---TAT---TG----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA--------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNN-N-----TTA-T---C---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CCGT-AAT-GGG----CGAG--GC--C-AAGT-GG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNN---------TTA-T--C----------TG----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : GAA-AT---CTGTTATT-GGG----CGAG--GC--G-AAAC-CG----A--G-----TCC-AATGAAC-GGGA-T---TC--CA-A------TGTNNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNG-T-----TTA-----CGAGCGC---TG----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CCGT-ATT-GGGGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----T-CCAAT--AC-GGAT-TTG-TC--CA-T------T--CACACG-C---TG--GATTTGACTCGTAGTCGCCGCA----A-GAC-GACTGTGTA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CTGT-ATT-GGG----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CCGT-ATT-GA-----C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gGAT-T---TC--CA-T------T--CACACC------T--GA--GATACTGGTATTACTCCC----A-AACTGACTGTGT----TGA-T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-AC----T------T----T-A-GGAT-----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T-C--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : --G-----TTCCAAT--ACTGGAT-T----C--CA-T------T--TACACA-CCTGAT--GA--CTCACAGTTTATGTCCCC----A-AAC-GACGGG--A-AC-CA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-G
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctcA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : tA-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tatt-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-TG-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : GAT-T---TC--CA-T------T--TCAAAT-CC---------------TGGATGACTCCCA----A-GCT-AACGGTGTA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-CA-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaaAA---A-CAAA--T----C--A--TG-TA-CG-TTG-----A-A-----CT-G-----------AA--CG---CA--------------AC-----AT--------------TA-CA--CTGA----AGA--GCA---A---A--T------GC-A-CAA-G------TC----------------AGACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CCAT-ATT-GGG----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCCCAA---AC-TGAC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : gCA----A-ACT-GACTGTGTA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-TA-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgttatatccG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---------------------------------------TGA----A-A--ACA---T---A--TT---G-GTGT-TAG-GTAGGCCTAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG-----CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC-AAT--AC-GGAC-T---TCT-CA-G------T--TTCAGCACCCGGATGGA--CGTCGAGTATAAGTGTCCCAAAACGTT-GAAAATGTAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TACA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA---T----GT---G---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-TA----------T--A-------AT--AATCCAC---A--TATAAA-----AT----TAT--AA--------------------G-TC--AAA---ATTTAA--T----A--A--TG-TT-GA-GTGC----A-A--A--CT-------------AA--TG---C----A-A---A--T--A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GCA---T---A--TA---GCGTGT-TAG-C------TAT-ATA--A--------AGTCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CCAT-ATT-GGG----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCCCAA---AC-TGAC-T---ccaaact
gi|41 : g-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GCA---T---A--CA---T-G----TAA-G------T----CA--A----------ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTgtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-T------T--Tcggagcctccg
gi|43 : ttattagttaccacagtcagtgttgtggcgagatcggtcgatatcatgcggtgtgCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-T------T--Tcgggt
gi|44 : ttattagttaccacagtcagtgttgtggcgagatcggtcgatatcatgcggtgtg-GACTGTGTA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-CA-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : aactGAA-AT---CTGT-ATT-GGA----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatgA---------GA-T----AA---A-CAAA--T----C--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-TG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---
gi|5 : tGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TC--CA-N------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAAG-A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTt
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CTGTTATT-GGG----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC-AATGAAC-GGGA-T---TC--CA-A------G--TACACC-CT-GAA--GA--CTCCGTATATATGTCCCA----A--CT-GACG-TGTA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C-----T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TT---------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATAAA-----AA----CAATGAAATTA----AA---------AA-CT--AAA---TTCCAA--T----C--A--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-AA-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GCA---TAC-A--TA---C-AT-G-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACTAACAC-A-TCCC-TGC
gi|7 : gGAA-AT---CCGT-ATTTGGG----CGAGA-GC--G-AAGC-CG----T--G-----TCCCAAT--AG-GGTT-T---TTGANN-N------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-ACACA-T-----TTA-T--CC---CGT---TG----A--AG-AC---CT------T------A-GGAAA----T-TT-AA---G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----ATTT----CAGTTT-ATG----AA-ATT-GAAAA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---ATCC-AT--T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-C--T---------AA--TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT--------AA----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---ACCTAA--T----A--A--T--TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---TA--GACA---A--TAAA-----AT-----C--------TATCA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GT-------G------T----TA--G--------A-ACTAAAACAA-TCCC-T-CA-C---G
gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-TG-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A---T----AT---A------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-T---------CAC-AA---------TT--AAAGGGT-AT--GAA-CAT---A--AATAAT-----AA----AAT--GAA--A----CATGTACATCCGA-TC--------A-TTAA-------A--A---G----TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-AA-----AT-----C-----------------GA----A-A--GCAATTT---A--TA---C-A----TAA-GC-----TAT-ACG--ATAGCTGTCAGACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CCGT-ATT-GGG----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--AC-GGAT-T---TT--CANN------N--NNNNNN-NNNNNN--NN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-NNN-NNNNNNNNN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-CA-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA-CATA---AT--T--A-TA-T----A----------A----A------CGC---A----A---T----ATAAAA---C--AA--TG----------A---------GA-TC-T---------AA---A---------CT--A-------AT--AAT--GT---T--TGTTGA-----AA----ATA--AAA--A----AT---------GG--C--GAA---G-TAAA--C----A--A--TG----TG-TCA-----A--------T-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGAATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : . ... . . . ... .... . .. .. . . .... .. ..... .. . . . . ... .. ............................................................... .. . .... ... . . ... . . .. ..... . .. ... ... .... .. . ... ...... .... . . .... . ......... . . . .. . . . . . . . .. . . . ............ .. . .... . .... . . .... . . .. . ... ... .. . ................. .... ...... ... . . ... .... ... ... .. .. .................... . . ......... . ..................... .. . .................................................. . .... ... . .. .... .. .. . . . ..... . .. .. . ........... .. ... .. . ... .. . ..... .............. . .. .... . .. ....... .. ....................................... . . . . ..... ... . . . .
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consensus : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TTNCA-CACC-C--GAN--GANNT--NNNG--------TA----TNN-------GT--CCCAAANC-G---ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TTNCA-CNCC-C--GNN--GANNT--NNNG--------NA----NNN-------GT--CCCNAGNC-G---ACNGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
gi|1 : A-AT---CC-GT-ATT-GG---GA---CTCG--GC--GTCACT-CG--------------CCAAAC--A-C-AG-ATAT---TC--CA-T------TTTTA-CACC-CTGGAA--GGACT--CTCG--------TA----TTA--------T--CCCAAAACTG---ACTGT-
gi|1 : ttattaggtaagGAATAT---CT-GT-GTT-TG---G----CGAG---T--G-ACGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-TCTTTC--CAAT------TTTCAACACC-T--G----GAAAT--GAGG--------AG----GGGAGGGCTAGT--CCCAA-------------------A-ACGAA-T-----TTA-T--CC----GC---TG----A--AA------CT------T----T-A-GGAAA----TATT-A----A--T-CA-AAT-TTTCTA-ATCTCTA-CA-TTC-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----TAT-TA-ATG----AATATT-G--AA-CACC---A---T--AATA-G----G----------C----AAGTCCATGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TT----------G---------AA-CA-T---------AAC-TA---------------------AT--AA---AC---A---AT-----------------------------AA---------GA-TC--AAA---ATTTGA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----ACAACA--CT-G-----------AT--CT---CA---A-A---A--T--A-----AT-----C--------TA-CAAGTTAA----A-A--GCA---TGCAA--TA---G-GT-T-GAA-G-------------------------AACTAAAAC-A-TTCTATGCA-TCTGGA---A-GATGGG-TGT-A-TGAGATctttccaattttcaacacctggaaatgaggaggggagggctagtcccaaaacgaatttatccgctgaaactttaggaaatattaatcaaattttctaatctctacattcttttataaattatttattaatgaatattgaacaccataataggcaagtccatgtatcatgtgcatttgaacataactaataaacaataagatcaaaatttgataatgtttgttgacaacactgatctcaaaataatctacaagttaaaagcatgcaataggttgaagaactaaaacattctatgcatctggaagatgggtgtatgagatattcacaagcctttgtt
gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CC-GT-ACT-GA---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TTCCAAT--A-C-GG-AT-C---T---CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-CG-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A---T----AT---G---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-TT---------AT--A-----T-GT--AAT-CATAAAA--TACAAATGTATAA----CAAT-AAA--A----TA---------AA-T----AA---A-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--A--CT-G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-AG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----CGA-G------T--------C--------AGACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
gi|11 : gAA-AT---C--AT-ACT-GG---G----CGAG--GC--A-AAGC-TG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-C-----ATA-T--CC---TGC---TT----G--GG-AC---CT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----C--T-CA-GAT-TTC--A-G--CA-A-CA-T-C-ATT--G-A-T-AGATATCAGTTGATA--T-C----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ATT-G--AA-GACC---A---T--A-TA-----------------C----A------TGT---AT-T-ACATT----GA---G---C--AT--C-----------A---------TA-TA-T---------AAT-TA---------TC--A-----C-AT-------GT---A--TATGGA-----GACCTCATA--GTT--A----AA---------GA-TA--CAA---A-C-AA--C----A----------------------A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-C---G--T-AA-------------------------A--TTAA----A-A--GCA-----------------------AA-A------TAC-GTA--AGTT-----GGACCAAAAC-A--CCC-TGCA-C---
gi|12 : aGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------AT-T-T----C-TT----CAA-TT-ATG-----A-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAG--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--TA---A--A--TG-TT-TGTTTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA-----GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTA
gi|13 : GAA-ATTAACC--T-ATT-GA---G----C-AG--GC--G-AAAC--G----A--G-------CCAA---A-C-A--AT-T---TC--AA-T------TCA-A-CACC-T--GAT--GATCT--GTAG--------AA----G--------------CCCAAAC-A---ACGGT------A-ACGAA-T-----TTAAT--CG---CACA--TG----A--A--AC---CT------T----T-A-GGAAA----A-TT-AA---G--T-CC-AAT-T-A--A-ATCCT-G-CA-TTC-TTT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----CAA--T-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC-------T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT---A---T----GT---G---C--A---------------G---------AA-CT-T---------AAT-CA---------TT--A-------AT--AAC-CAC---A---ATTAA-----AA----CAA--AA--------------------T-TC--CAA---A-C-AA--T----A--G--TG-TTGGG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---CA---A-A---A--T-AA-----A------C--------TA-CA--TT-A----A-A--GCA---T---A--TA---G-AT-T---A-G------TAT-ATA--A--------AGAC-AAGAA-A-CCCC-TGCA-A---CG---A-GAT-
gi|14 : gGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAT--GC--G-
gi|14 : -------GT--CCCCAACT-G---ACCTT-GGAATA-ATGAA-A-----TTA-T--CC---CAC---TT----A--AG-AC---CT------T----T-A-AGAAA----T-TT-G----T--T-CA-GAA-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-T-------A-TT-ATA----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----GTCTA------C----A------TAT---AT-C-A---A----GT---G---C--GT--TG----------A---------A--CA-T---------A--------------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATTAA-----CC----AAT--AAA--ATT--AA----------A-T----AA---A-CTTG--T----C--A--GG-TT-TG-TTG-----A-A--A--AT-A-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----GT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----TAA-G------C--------C--------AGACCAAAGC-A-TCCC-TGCA-T---GT---A-GAT-GG-TGG-ATTGAAATTtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaattatcccacttaagacctttaagaaatttgttcagaattcagtagcatcttttataaattatattataaaattgaacaccatataggtctacatatatcaagtgcgttgaacatattatataatcacaatattaaccaataaaattaaataaacttgtcaggtttgttgaaaataaatgcagaaataggtctacattgaaagcatatacgtaagccagaccaaagcatccctgcatgtagatggtggattgaaattccatagcct
gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgcgtattat---TG----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
gi|16 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----C-AG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC----ATCTA-G-CA-TAC-TTT--T-A-T-AA------------A----T----A-TT----CAA-TT-AT-----AA-ATT-G--AACCACCA--A---T--A-TA------G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA--A-T---------AAT-TA----------T--A-----TAAT--AAT-C-C---A---AT---------A----AAC--AAA--T----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TGTTT-TG-TTG-----A-A--A--AC-A-----------AA--TT---CA--GA-A---A--T-AA-----AC-----CA-------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-cacaaa
gi|17 : gGAA-AT---CC-GT-ATA-GG---A----CAGGTTGCATG-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAC--A-T-GG-AT-T---TC--CA-TATCACGTNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---TAT---TG----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA--------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T---C---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CC-GT-AAT-GG---G----CGAG--GC--C-AAGT-GG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNN---------TTA-T--C----------TG----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : CCCAAT--AAC-AG-AT-T---TC--CA-T------TT-CA-CACCGCTGGAT--GGACT--CCA---------TATTACTTT-------AT--CCCAAACTGG---ACTGT-G---TA-ACAA
gi|2 : aacattaGAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAAC-CG----A--G-----TCC-AATGAA-C-GGGAT-T---CC--AA-TG-----TNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNG-T-----TTA-----CGAGCGC---TG----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-cgaggcgaaaccgagtccaatgaacgggattccaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttacgagcgctgacaagacctttaggaaattcaatcaagattttttaggcatatttttagtgaaattattcagttattaagtgaaccatactacgatatgaatcatgtgcatgaacataatttaaaataatcgcaaatataaacaatgaaattaaaactaattccaatcatgttgttttgaaactgaatgcagaaatacatgttcaagtaaagcatacatacattacgtgttagttagacaacatcatccctgcatggaagat
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---GGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----T-CCAAT--A-C-GG-AT-TTG-TC--CA-T------TCACA-CGC------TG--GATTTGACTCG--------TA----GTC-------GC--CGCAAGAC-G---ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---G----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GA--------C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gG-AT-T---TC--CA-T------T--CA-CACC-T--GA---GATA---CTGG--------TA----TTA-------CT--CCCAAACT-G---ACTGT-G---T---TGA--T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-AC----T------T----T-A-GGAT-----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T-C--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : GGA-AT---CCAGT-ATT-GGAACG----AGAG--GC--G-AAGC-TG----A--A-----T----------------T-T---GT--CA-TA-----TATCATCACC-C--ATT--GGTAT--GAAGCTCCTTTATA----TAA-------GT--CCCCAACT-G---ACTGT-G---TA-ACTAA-T-----
gi|3 : gtatt--G-----TTCCAAT--A-CTGG-AT-T----C--CA-T------TTACA-CACC-T--GAT--GACTC--ACAG--------TT----TAT-------GT--CCCCAAAC-G---ACGG--G----A-ACCA--T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-Gatttacacacctgatgactcacagtttatgtccccaaacgacgggaaccatttatcccgctgaagaccttaatggaaatttgagctcagatcttcaatctagcgtttttataaatatattcaatttatgaaatttgaaccattaatatgcatgtattcaagtgcatattgaacataaaatattcatttattacaagtataaagcaatacgatcaaaactaataatgtttgttgaaactgaatgcagaaataaatgtacattgaaaacataaagactggaacatccttgcacggagatg
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctc---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : A-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tatt-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-TG-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : G-AT-T---TC--CA-T------TTC-----------------AAAT--CCTG--------GA----TGA-------CT--CCCAAGCT-A---ACGGT-G---TA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-CA-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaaAA---A-CAAA--T----C--A--TG-TA-CG-TTG-----A-A-----CT-G-----------AA--CG---CA--------------AC-----AT--------------TA-CA--CTGA----AGA--GCA---A---A--T------GC-A-CAA-G------TC----------------AGACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCCCAA---A-C-TG-AC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : gT--CCCAAACT-G---ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-TA-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgttataG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---------------------------------------TGA----A-A--ACA---T---A--TT---G-GTGT-TAG-GTAGGCCTAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG--------CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC-AAT--A-C-GG-AC-T---TCT-CA-G------TTTCAGCACC-C--GGATGGACGT--CGAG--------TA----TAA-------GTGTCCCAAAAC-GTTGAAAAT-G---TAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TACA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA---T----GT---G---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-TA----------T--A-------AT--AATCCAC---A--TATAAA-----AT----TAT--AA--------------------G-TC--AAA---ATTTAA--T----A--A--TG-TT-GA-GTGC----A-A--A--CT-------------AA--TG---C----A-A---A--T--A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GCA---T---A--TA---GCGTGT-TAG-C------TAT-ATA--A--------AGTCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCCCAA---A-C-TG-AC-T---ccaaact
gi|40 : g-------GT--CCCAAACT-G---ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--gtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|41 : ggaaatccatattgggtcaggcgaagctgtgttat-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GCA---T---A--CA---T-G----TAA-G------T----CA--A----------ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TT-CA-CACC-G--CAT--GATATCGACCG--------AT----CTC-------GC--CACAACACTG---ACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cggagcctccg
gi|43 : ttCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TT-CA-CACC-G--CAT--GATATCGACCG--------AT----CTC-------GC--CACAACACTG---ACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cgggt
gi|44 : tt-G---ACTGT-G---TA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-CA-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : aactGAA-AT---CT-GT-ATT-GG---A----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatgA---------GA-T----AA---A-CAAA--T----C--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-TG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---
gi|5 : tGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAAG-A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTt
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC-AATGAA-C-GG-GA-T---TC--CA-A------GTACA-C-CC-T--GAA--GACTC--CGTA--------TA----TAT-------GT--CCCAA-CT-G---AC-GT-G---TA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C-----T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TT---------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATAAA-----AA----CAATGAAATTA----AA---------AA-CT--AAA---TTCCAA--T----C--A--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-AA-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GCA---TAC-A--TA---C-AT-G-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACTAACAC-A-TCCC-TGC
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gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-TG-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A---T----AT---A------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-T---------CAC-AA---------TT--AAAGGGT-AT--GAA-CAT---A--AATAAT-----AA----AAT--GAA--A----CATGTACATCCGA-TC--------A-TTAA-------A--A---G----TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-AA-----AT-----C-----------------GA----A-A--GCAATTT---A--TA---C-A----TAA-GC-----TAT-ACG--ATAGCTGTCAGACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCCCAAT--A-C-GG-AT-T---TT--CANN------NNNNN-NNNN-N--NNN--NNNNN--NNNN--------NN----NNN-------NN--NNNNNNNN-N---NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-CA-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA-CATA---AT--T--A-TA-T----A----------A----A------CGC---A----A---T----ATAAAA---C--AA--TG----------A---------GA-TC-T---------AA---A---------CT--A-------AT--AAT--GT---T--TGTTGA-----AA----ATA--AAA--A----AT---------GG--C--GAA---G-TAAA--C----A--A--TG----TG-TCA-----A--------T-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGAATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : . ... . . . ... .... . .. .. . . .... .. ..... .. . .. . . . . ... .. .. ............................................................ ..... . . ...... ... . . . ..... . .. ... ... .... .. . ... ...... .... . . .... . ......... . . . .. . . . . . . . .. . . . ............ .. . .... . .... . . .... . . .. . ... ... .. . ................. .... ...... ... . . ... .... ... ... .. .. .................... . . ......... . ..................... .. . .................................................. . .... ... . .. .... .. .. . . . ..... . .. .. . ........... .. ... .. . ... .. . ..... .............. . .. .... . .. ....... .. ....................................... . . . . ..... ... . . . .
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consensus : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCCAA-ACC-G-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCCAA-ANC-G-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
gi|1 : A-AT---CC-GT-ATT-GG---GA---CTCG--GC--GTCACT-CG--------------CC--AA-AC--A-C-AG-ATAT---T--C--CA-T------TTTTA-CACC-CTGG------AA--GGACT--CTC--GTAT-TA-----T--CCCAA-AACTG-ACTG----T-
gi|1 : ttattaggtaagGAATAT---CT-GT-GTT-TG---G----CGAG---T--G-ACGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-TCTTT--C--CAAT------TTTCAACACC-T--GGAAATGAG--GAGGG--GAG--G-GC-TA----GT--CCCAA-A----------------------ACGAA-T-----TTA-T--CC----GC---TG----A--AA------CT------T----T-A-GGAAA----TATT-A----A--T-CA-AAT-TTTCTA-ATCTCTA-CA-TTC-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----TAT-TA-ATG----AATATT-G--AA-CACC---A---T--AATA-G----G----------C----AAGTCCATGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TT----------G---------AA-CA-T---------AAC-TA---------------------AT--AA---AC---A---AT-----------------------------AA---------GA-TC--AAA---ATTTGA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----ACAACA--CT-G-----------AT--CT---CA---A-A---A--T--A-----AT-----C--------TA-CAAGTTAA----A-A--GCA---TGCAA--TA---G-GT-T-GAA-G-------------------------AACTAAAAC-A-TTCTATGCA-TCTGGA---A-GATGGG-TGT-A-TGAGATctttccaattttcaacacctggaaatgaggaggggagggctagtcccaaaacgaatttatccgctgaaactttaggaaatattaatcaaattttctaatctctacattcttttataaattatttattaatgaatattgaacaccataataggcaagtccatgtatcatgtgcatttgaacataactaataaacaataagatcaaaatttgataatgtttgttgacaacactgatctcaaaataatctacaagttaaaagcatgcaataggttgaagaactaaaacattctatgcatctggaagatgggtgtatgagatattcacaagcctttgtt
gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CC-GT-ACT-GA---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TTC--CA-AT--A-C-GG-AT-C---T-----CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-CG-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A---T----AT---G---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-TT---------AT--A-----T-GT--AAT-CATAAAA--TACAAATGTATAA----CAAT-AAA--A----TA---------AA-T----AA---A-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--A--CT-G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-AG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----CGA-G------T--------C--------AGACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
gi|11 : gAA-AT---C--AT-ACT-GG---G----CGAG--GC--A-AAGC-TG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-C-----ATA-T--CC---TGC---TT----G--GG-AC---CT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----C--T-CA-GAT-TTC--A-G--CA-A-CA-T-C-ATT--G-A-T-AGATATCAGTTGATA--T-C----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ATT-G--AA-GACC---A---T--A-TA-----------------C----A------TGT---AT-T-ACATT----GA---G---C--AT--C-----------A---------TA-TA-T---------AAT-TA---------TC--A-----C-AT-------GT---A--TATGGA-----GACCTCATA--GTT--A----AA---------GA-TA--CAA---A-C-AA--C----A----------------------A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-C---G--T-AA-------------------------A--TTAA----A-A--GCA-----------------------AA-A------TAC-GTA--AGTT-----GGACCAAAAC-A--CCC-TGCA-C---
gi|12 : aGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------AT-T-T----C-TT----CAA-TT-ATG-----A-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAG--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--TA---A--A--TG-TT-TGTTTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA-----GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTA
gi|13 : GAA-ATTAACC--T-ATT-GA---G----C-AG--GC--G-AAAC--G----A--G-------C--CA-A---A-C-A--AT-T---T--C--AA-T------TCA-A-CACC-T--G------AT--GATCT-------GTAG-AA----G---CCCAA-A-C-A-AC-G------G---TA-ACGAA-T-----TTAAT--CG---CACA--TG----A--A--AC---CT------T----T-A-GGAAA----A-TT-AA---G--T-CC-AAT-T-A--A-ATCCT-G-CA-TTC-TTT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----CAA--T-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC-------T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT---A---T----GT---G---C--A---------------G---------AA-CT-T---------AAT-CA---------TT--A-------AT--AAC-CAC---A---ATTAA-----AA----CAA--AA--------------------T-TC--CAA---A-C-AA--T----A--G--TG-TTGGG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---CA---A-A---A--T-AA-----A------C--------TA-CA--TT-A----A-A--GCA---T---A--TA---G-AT-T---A-G------TAT-ATA--A--------AGAC-AAGAA-A-CCCC-TGCA-A---CG---A-GAT-
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gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgc---TG----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
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gi|17 : gGAA-AT---CC-GT-ATA-GG---A----CAGGTTGCATG-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AC--A-T-GG-AT-T---T--C--CA-TATCACGTNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---TAT---TG----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA--------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T---C---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CC-GT-AAT-GG---G----CGAG--GC--C-AAGT-GG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNN---------TTA-T--C----------TG----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : CC--CA-AT--AAC-AG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACCGCTGG------AT--GGACT--CCA---TAT-TACTTTAT--CCCAA-ACT-GGACTG----T-G---TA-ACAA
gi|2 : aacattaGAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAAC-CG----A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GGGAT-T---C--C--AA-TG-----TNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNG-T-----TTA-----CGAGCGC---TG----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-cgaggcgaaaccgagtccaatgaacgggattccaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttacgagcgctgacaagacctttaggaaattcaatcaagattttttaggcatatttttagtgaaattattcagttattaagtgaaccatactacgatatgaatcatgtgcatgaacataatttaaaataatcgcaaatataaacaatgaaattaaaactaattccaatcatgttgttttgaaactgaatgcagaaatacatgttcaagtaaagcatacatacattacgtgttagttagacaacatcatccctgcatggaagat
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---GGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----TCC---A-AT--A-C-GG-AT-T---TGTC--CA-T------TCACA-CGCT------------G--GATTT--GACTCGTAG-TC----GC--CGCAA-GAC-G-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---G----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GA--------C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gG-AT-T---T--C--CA-T------T--CA-CACC-T--G------A---GATA---CTG--GTAT-TA----CT--CCCAA-ACT-G-ACTG----T-G---T---TG-A-T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-A----CT------T----T-A-GG-AT----T-TT-A----G--T-CA-GA--TTC--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : GGA-AT---CCAGT-ATT-GGAACG----AGAG--GC--G-AAGC-TG----A--A-----TTTGTCATAT--ATC----AT-CA--C--C--CA-T------TGGTA-T-------G------AA--GCTCC--TTT--ATAT-AA----GT--CCCCA-ACT-G-ACTG----T-G---TA-ACTAA-T-----
gi|3 : gtatt--G-----TTC--CA-AT--A-CTGG-AT-T------C--CA-T------TTACA-CACC-T--G------AT--GACTC--ACA--GTTT-AT----GT--CCCCA-AAC-G-ACGG------G----A-ACCA--T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-Gatttacacacctgatgactcacagtttatgtccccaaacgacgggaaccatttatcccgctgaagaccttaatggaaatttgagctcagatcttcaatctagcgtttttataaatatattcaatttatgaaatttgaaccattaatatgcatgtattcaagtgcatattgaacataaaatattcatttattacaagtataaagcaatacgatcaaaactaataatgtttgttgaaactgaatgcagaaataaatgtacattgaaaacataaagactggaacatccttgcacggagatg
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctc---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : A-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tatt-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-TG-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : G-AT-T---T--C--CA-T------TTC-----------------------AAAT--CCT--GGAT-GA----CT--CCCAA-GCT-A-ACGG----T-G---TA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-CA-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaaAA---A-CAAA--T----C--A--TG-TA-CG-TTG-----A-A-----CT-G-----------AA--CG---CA--------------AC-----AT--------------TA-CA--CTGA----AGA--GCA---A---A--T------GC-A-CAA-G------TC----------------AGACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : gT-AT----AT--CCCAA-ACT-G-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-TA-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgtG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---------------------------------------TGA----A-A--ACA---T---A--TT---G-GTGT-TAG-GTAGGCCTAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG--------CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC---A-AT--A-C-GG-AC-T---T--CT-CA-G------TTTCAGCACC-C--G------GATGGACGT--CGA--GTAT-AA----GTGTCCCAA-AAC-G--TTGAAAAT-G---TAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TACA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA---T----GT---G---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-TA----------T--A-------AT--AATCCAC---A--TATAAA-----AT----TAT--AA--------------------G-TC--AAA---ATTTAA--T----A--A--TG-TT-GA-GTGC----A-A--A--CT-------------AA--TG---C----A-A---A--T--A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GCA---T---A--TA---GCGTGT-TAG-C------TAT-ATA--A--------AGTCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---ccaaact
gi|40 : g--G------GC--GAAGC--TGT--GT-T-AT----GT--CCCAA-ACT-G-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--gtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|41 : ggaaatccatattgggtca-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GCA---T---A--CA---T-G----TAA-G------T----CA--A----------ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CACAACACT-G-ACTG----TGG---TA-ACTAA-T-----cggagcctccg
gi|43 : ttCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CACAACACT-G-ACTG----TGG---TA-ACTAA-T-----cgggt
gi|44 : ttA-ACT-G-ACTG----T-G---TA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-CA-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---A----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatgA---------GA-T----AA---A-CAAA--T----C--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-TG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---
gi|5 : tGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAAG-A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTt
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GG-GA-T---T--C--CA-A------GTACA-C-CC-T--G------AA--GACTC--CGT--ATAT-AT----GT--CCCAA--CT-G-AC-G----T-G---TA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C-----T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TT---------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATAAA-----AA----CAATGAAATTA----AA---------AA-CT--AAA---TTCCAA--T----C--A--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-AA-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GCA---TAC-A--TA---C-AT-G-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACTAACAC-A-TCCC-TGC
gi|7 : gGAA-AT---CC-GT-ATTTGG---G----CGAGA-GC--G-AAGC-CG----T--G-----TCC--CA-AT--A-G-GG-TT-T---T--TGANN-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-ACACA-T-----TTA-T--CC---CGT---TG----A--AG-AC---CT------T------A-GGAAA----T-TT-AA---G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----ATTT----CAGTTT-ATG----AA-ATT-GAAAA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---ATCC-AT--T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-C--T---------AA--TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT--------AA----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---ACCTAA--T----A--A--T--TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---TA--GACA---A--TAAA-----AT-----C--------TATCA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GT-------G------T----TA--G--------A-ACTAAAACAA-TCCC-T-CA-C---G
gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-TG-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A---T----AT---A------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-T---------CAC-AA---------TT--AAAGGGT-AT--GAA-CAT---A--AATAAT-----AA----AAT--GAA--A----CATGTACATCCGA-TC--------A-TTAA-------A--A---G----TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-AA-----AT-----C-----------------GA----A-A--GCAATTT---A--TA---C-A----TAA-GC-----TAT-ACG--ATAGCTGTCAGACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--T--CANN------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNNNN-NNN-N-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-CA-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA-CATA---AT--T--A-TA-T----A----------A----A------CGC---A----A---T----ATAAAA---C--AA--TG----------A---------GA-TC-T---------AA---A---------CT--A-------AT--AAT--GT---T--TGTTGA-----AA----ATA--AAA--A----AT---------GG--C--GAA---G-TAAA--C----A--A--TG----TG-TCA-----A--------T-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGAATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : . ... . . . ... .... . .. .. . . .... .. ..... .. . .. . . . . ... .. .. ............................................................ . . . . . ...... ... . . . ..... . .. ... ... .... .. . ... ...... .... . . .... . ......... . . . .. . . . . . . . .. . . . ............ .. . .... . .... . . .... . . .. . ... ... .. . ................. .... ...... ... . . ... .... ... ... .. .. .................... . . ......... . ..................... .. . .................................................. . .... ... . .. .... .. .. . . . ..... . .. .. . ........... .. ... .. . ... .. . ..... .............. . .. .... . .. ....... .. ....................................... . . . . ..... ... . . . .
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consensus : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-ACTG-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-ACCG-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
gi|1 : A-AT---CC-GT-ATT-GG---GA---CTCG--GC--GTCACT-CG--------------CC--AA-AC--A-C-AG-ATAT---T--C--CA-T------TTTTA-CACC-CTGG------AA--GGACT--CTC--GTAT-TA-----T--CCCAAA-ACTG-ACTG----T-
gi|1 : ttattaggtaagGAATAT---CT-GT-GTT-TG---G----CGAG---T--G-ACGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-TCTTT--C--CAAT------TTTCAACACC-T--GGAAATGAG--GAGGG--GAG--G-GC-TA----GT--CCC-AA-A---------------------ACGAA-T-----TTA-T--CC----GC---TG----A--AA------CT------T----T-A-GGAAA----TATT-A----A--T-CA-AAT-TTTCTA-ATCTCTA-CA-TTC-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----TAT-TA-ATG----AATATT-G--AA-CACC---A---T--AATA-G----G----------C----AAGTCCATGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TT----------G---------AA-CA-T---------AAC-TA---------------------AT--AA---AC---A---AT-----------------------------AA---------GA-TC--AAA---ATTTGA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----ACAACA--CT-G-----------AT--CT---CA---A-A---A--T--A-----AT-----C--------TA-CAAGTTAA----A-A--GCA---TGCAA--TA---G-GT-T-GAA-G-------------------------AACTAAAAC-A-TTCTATGCA-TCTGGA---A-GATGGG-TGT-A-TGAGATctttccaattttcaacacctggaaatgaggaggggagggctagtcccaaaacgaatttatccgctgaaactttaggaaatattaatcaaattttctaatctctacattcttttataaattatttattaatgaatattgaacaccataataggcaagtccatgtatcatgtgcatttgaacataactaataaacaataagatcaaaatttgataatgtttgttgacaacactgatctcaaaataatctacaagttaaaagcatgcaataggttgaagaactaaaacattctatgcatctggaagatgggtgtatgagatattcacaagcctttgtt
gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CC-GT-ACT-GA---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TTC--CA-AT--A-C-GG-AT-C---T-----CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-CG-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A---T----AT---G---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-TT---------AT--A-----T-GT--AAT-CATAAAA--TACAAATGTATAA----CAAT-AAA--A----TA---------AA-T----AA---A-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--A--CT-G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-AG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----CGA-G------T--------C--------AGACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
gi|11 : gAA-AT---C--AT-ACT-GG---G----CGAG--GC--A-AAGC-TG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-C-----ATA-T--CC---TGC---TT----G--GG-AC---CT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----C--T-CA-GAT-TTC--A-G--CA-A-CA-T-C-ATT--G-A-T-AGATATCAGTTGATA--T-C----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ATT-G--AA-GACC---A---T--A-TA-----------------C----A------TGT---AT-T-ACATT----GA---G---C--AT--C-----------A---------TA-TA-T---------AAT-TA---------TC--A-----C-AT-------GT---A--TATGGA-----GACCTCATA--GTT--A----AA---------GA-TA--CAA---A-C-AA--C----A----------------------A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-C---G--T-AA-------------------------A--TTAA----A-A--GCA-----------------------AA-A------TAC-GTA--AGTT-----GGACCAAAAC-A--CCC-TGCA-C---
gi|12 : aGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------AT-T-T----C-TT----CAA-TT-ATG-----A-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAG--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--TA---A--A--TG-TT-TGTTTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA-----GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTA
gi|13 : GAA-ATTAACC--T-ATT-GA---G----C-AG--GC--G-AAAC--G----A--G-------C--CA-A---A-C-A--AT-T---T--C--AA-T------TCA-A-CACC-T--G------AT--GATCT-------GTAG-AA----G---CCC-AA-AC-A-AC-G------G---TA-ACGAA-T-----TTAAT--CG---CACA--TG----A--A--AC---CT------T----T-A-GGAAA----A-TT-AA---G--T-CC-AAT-T-A--A-ATCCT-G-CA-TTC-TTT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----CAA--T-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC-------T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT---A---T----GT---G---C--A---------------G---------AA-CT-T---------AAT-CA---------TT--A-------AT--AAC-CAC---A---ATTAA-----AA----CAA--AA--------------------T-TC--CAA---A-C-AA--T----A--G--TG-TTGGG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---CA---A-A---A--T-AA-----A------C--------TA-CA--TT-A----A-A--GCA---T---A--TA---G-AT-T---A-G------TAT-ATA--A--------AGAC-AAGAA-A-CCCC-TGCA-A---CG---A-GAT-
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gi|14 : --GTAT-TAT---GT--CCC-CA-ACTG-ACCT----T-GGAATA-ATGAA-A-----TTA-T--CC---CAC---TT----A--AG-AC---CT------T----T-A-AGAAA----T-TT-G----T--T-CA-GAA-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-T-------A-TT-ATA----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----GTCTA------C----A------TAT---AT-C-A---A----GT---G---C--GT--TG----------A---------A--CA-T---------A--------------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATTAA-----CC----AAT--AAA--ATT--AA----------A-T----AA---A-CTTG--T----C--A--GG-TT-TG-TTG-----A-A--A--AT-A-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----GT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----TAA-G------C--------C--------AGACCAAAGC-A-TCCC-TGCA-T---GT---A-GAT-GG-TGG-ATTGAAATTtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaattatcccacttaagacctttaagaaatttgttcagaattcagtagcatcttttataaattatattataaaattgaacaccatataggtctacatatatcaagtgcgttgaacatattatataatcacaatattaaccaataaaattaaataaacttgtcaggtttgttgaaaataaatgcagaaataggtctacattgaaagcatatacgtaagccagaccaaagcatccctgcatgtagatggtggattgaaattccatagcct
gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgc---TG----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
gi|16 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----C-AG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC----ATCTA-G-CA-TAC-TTT--T-A-T-AA------------A----T----A-TT----CAA-TT-AT-----AA-ATT-G--AACCACCA--A---T--A-TA------G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA--A-T---------AAT-TA----------T--A-----TAAT--AAT-C-C---A---AT---------A----AAC--AAA--T----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TGTTT-TG-TTG-----A-A--A--AC-A-----------AA--TT---CA--GA-A---A--T-AA-----AC-----CA-------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-cacaaa
gi|17 : gGAA-AT---CC-GT-ATA-GG---A----CAGGTTGCATG-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AC--A-T-GG-AT-T---T--C--CA-TATCACGTNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---TAT---TG----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA--------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T---C---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CC-GT-AAT-GG---G----CGAG--GC--C-AAGT-GG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNN---------TTA-T--C----------TG----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : CC--CA-AT--AAC-AG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACCGCTGG------AT--GGACT--CCA---TAT-TACTTTAT--CCC-AA-ACTGGACTG----T-G---TA-ACAA
gi|2 : aacattaGAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAAC-CG----A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GGGAT-T---C--C--AA-TG-----TNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNG-T-----TTA-----CGAGCGC---TG----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-cgaggcgaaaccgagtccaatgaacgggattccaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttacgagcgctgacaagacctttaggaaattcaatcaagattttttaggcatatttttagtgaaattattcagttattaagtgaaccatactacgatatgaatcatgtgcatgaacataatttaaaataatcgcaaatataaacaatgaaattaaaactaattccaatcatgttgttttgaaactgaatgcagaaatacatgttcaagtaaagcatacatacattacgtgttagttagacaacatcatccctgcatggaagat
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---GGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----TCC---A-AT--A-C-GG-AT-T---TGTC--CA-T------TCACA-CGCT------------G--GATTT--GACTCGTAG-TC----GC--CGC-AA-GACG-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---G----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GA--------C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gG-AT-T---T--C--CA-T------T--CA-CACC-T--G------A---GATA---CTG--GTAT-TA----CT--CCC-AA-ACTG-ACTG----T-G---T---TG-A-T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-A----CT------T----T-A-GG-AT----T-TT-A----G--T-CA-GA--TTC--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : GGA-AT---CCAGT-ATT-GGAACG----AGAG--GC--G-AAGC-TG----A--A-----TTTGTCATAT--ATC----AT-CA--C--C--CA-T------TGGTA-T-------G------AA--GCTCC--TTT--ATAT-AA----GT--CCC-CA-ACTG-ACTG----T-G---TA-ACTAA-T-----
gi|3 : gtatt--G-----TTC--CA-AT--A-CTGG-AT-T------C--CA-T------TTACA-CACC-T--G------AT--GACTC--ACA--GTTT-AT----GT--CCC-CA-AACG-ACGG------G----A-ACCA--T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-Gatttacacacctgatgactcacagtttatgtccccaaacgacgggaaccatttatcccgctgaagaccttaatggaaatttgagctcagatcttcaatctagcgtttttataaatatattcaatttatgaaatttgaaccattaatatgcatgtattcaagtgcatattgaacataaaatattcatttattacaagtataaagcaatacgatcaaaactaataatgtttgttgaaactgaatgcagaaataaatgtacattgaaaacataaagactggaacatccttgcacggagatg
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctc---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : A-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tatt-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-TG-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : G-AT-T---T--C--CA-T------TTC-----------------------AAAT--CCT--GGAT-GA----CT--CCC-AA-GCTA-ACGG----T-G---TA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-CA-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaaAA---A-CAAA--T----C--A--TG-TA-CG-TTG-----A-A-----CT-G-----------AA--CG---CA--------------AC-----AT--------------TA-CA--CTGA----AGA--GCA---A---A--T------GC-A-CAA-G------TC----------------AGACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : gT-AT----AT--CCC-AA-ACTG-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-TA-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgtG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---------------------------------------TGA----A-A--ACA---T---A--TT---G-GTGT-TAG-GTAGGCCTAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG--------CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC---A-AT--A-C-GG-AC-T---T--CT-CA-G------TTTCAGCACC-C--G------GATGGACGT--CGA--GTAT-AA----GTGTCCC-AA-AACG--TTGAAAAT-G---TAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TACA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA---T----GT---G---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-TA----------T--A-------AT--AATCCAC---A--TATAAA-----AT----TAT--AA--------------------G-TC--AAA---ATTTAA--T----A--A--TG-TT-GA-GTGC----A-A--A--CT-------------AA--TG---C----A-A---A--T--A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GCA---T---A--TA---GCGTGT-TAG-C------TAT-ATA--A--------AGTCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---ccaaact
gi|40 : g--G------GC--GAAGC--TGT--GT-T-AT----GT--CCC-AA-ACTG-ACTG----T-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--gtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|41 : ggaaatccatattgggtca-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GCA---T---A--CA---T-G----TAA-G------T----CA--A----------ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CAC-AACACTG-ACTG----TGG---TA-ACTAA-T-----cggagcctccg
gi|43 : ttCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CAC-AACACTG-ACTG----TGG---TA-ACTAA-T-----cgggt
gi|44 : ttA-ACTG-ACTG----T-G---TA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-CA-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---A----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatgA---------GA-T----AA---A-CAAA--T----C--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-TG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---
gi|5 : tGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAAG-A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTt
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GG-GA-T---T--C--CA-A------GTACA-C-CC-T--G------AA--GACTC--CGT--ATAT-AT----GT--CCC-AA--CTG-AC-G----T-G---TA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C-----T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TT---------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATAAA-----AA----CAATGAAATTA----AA---------AA-CT--AAA---TTCCAA--T----C--A--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-AA-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GCA---TAC-A--TA---C-AT-G-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACTAACAC-A-TCCC-TGC
gi|7 : gGAA-AT---CC-GT-ATTTGG---G----CGAGA-GC--G-AAGC-CG----T--G-----TCC--CA-AT--A-G-GG-TT-T---T--TGANN-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-ACACA-T-----TTA-T--CC---CGT---TG----A--AG-AC---CT------T------A-GGAAA----T-TT-AA---G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----ATTT----CAGTTT-ATG----AA-ATT-GAAAA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---ATCC-AT--T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-C--T---------AA--TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT--------AA----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---ACCTAA--T----A--A--T--TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---TA--GACA---A--TAAA-----AT-----C--------TATCA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GT-------G------T----TA--G--------A-ACTAAAACAA-TCCC-T-CA-C---G
gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-TG-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A---T----AT---A------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-T---------CAC-AA---------TT--AAAGGGT-AT--GAA-CAT---A--AATAAT-----AA----AAT--GAA--A----CATGTACATCCGA-TC--------A-TTAA-------A--A---G----TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-AA-----AT-----C-----------------GA----A-A--GCAATTT---A--TA---C-A----TAA-GC-----TAT-ACG--ATAGCTGTCAGACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--T--CANN------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-NNNN-NNNN----N-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-CA-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA-CATA---AT--T--A-TA-T----A----------A----A------CGC---A----A---T----ATAAAA---C--AA--TG----------A---------GA-TC-T---------AA---A---------CT--A-------AT--AAT--GT---T--TGTTGA-----AA----ATA--AAA--A----AT---------GG--C--GAA---G-TAAA--C----A--A--TG----TG-TCA-----A--------T-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGAATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : . ... . . . ... .... . .. .. . . .... .. ..... .. . .. . . . . ... .. .. ........................................................ .. . ..... . . . ... . . . ..... . .. ... ... .... .. . ... ...... .... . . .... . ......... . . . .. . . . . . . . .. . . . ............ .. . .... . .... . . .... . . .. . ... ... .. . ................. .... ...... ... . . ... .... ... ... .. .. .................... . . ......... . ..................... .. . .................................................. . .... ... . .. .... .. .. . . . ..... . .. .. . ........... .. ... .. . ... .. . ..... .............. . .. .... . .. ....... .. ....................................... . . . . ..... ... . . . .
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consensus : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
gi|1 : A-AT---CC-GT-ATT-GG---GA---CTCG--GC--GTCACT-CG--------------CC--AA-AC--A-C-AG-ATAT---T--C--CA-T------TTTTA-CACC-CTGG------AA--GGACT--CTC--GTAT-TA-----T--CCC-AA-AA--CTG-ACTGT-
gi|1 : ttattaggtaagGAATAT---CT-GT-GTT-TG---G----CGAG---T--G-ACGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-TCTTT--C--CAAT------TTTCAACACC-T--GGAAATGAG--GAGGG--GAG--G-GC-TA----GT--CCC-AA-A--------------------ACGAA-T-----TTA-T--CC----GC---TG----A--AA------CT------T----T-A-GGAAA----TATT-A----A--T-CA-AAT-TTTCTA-ATCTCTA-CA-TTC-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----TAT-TA-ATG----AATATT-G--AA-CACC---A---T--AATA-G----G----------C----AAGTCCATGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TT----------G---------AA-CA-T---------AAC-TA---------------------AT--AA---AC---A---AT-----------------------------AA---------GA-TC--AAA---ATTTGA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----ACAACA--CT-G-----------AT--CT---CA---A-A---A--T--A-----AT-----C--------TA-CAAGTTAA----A-A--GCA---TGCAA--TA---G-GT-T-GAA-G-------------------------AACTAAAAC-A-TTCTATGCA-TCTGGA---A-GATGGG-TGT-A-TGAGATctttccaattttcaacacctggaaatgaggaggggagggctagtcccaaaacgaatttatccgctgaaactttaggaaatattaatcaaattttctaatctctacattcttttataaattatttattaatgaatattgaacaccataataggcaagtccatgtatcatgtgcatttgaacataactaataaacaataagatcaaaatttgataatgtttgttgacaacactgatctcaaaataatctacaagttaaaagcatgcaataggttgaagaactaaaacattctatgcatctggaagatgggtgtatgagatattcacaagcctttgtt
gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CC-GT-ACT-GA---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TTC--CA-AT--A-C-GG-AT-C---T-----CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-CG-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A---T----AT---G---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-TT---------AT--A-----T-GT--AAT-CATAAAA--TACAAATGTATAA----CAAT-AAA--A----TA---------AA-T----AA---A-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--A--CT-G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-AG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----CGA-G------T--------C--------AGACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
gi|11 : gAA-AT---C--AT-ACT-GG---G----CGAG--GC--A-AAGC-TG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-C-----ATA-T--CC---TGC---TT----G--GG-AC---CT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----C--T-CA-GAT-TTC--A-G--CA-A-CA-T-C-ATT--G-A-T-AGATATCAGTTGATA--T-C----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ATT-G--AA-GACC---A---T--A-TA-----------------C----A------TGT---AT-T-ACATT----GA---G---C--AT--C-----------A---------TA-TA-T---------AAT-TA---------TC--A-----C-AT-------GT---A--TATGGA-----GACCTCATA--GTT--A----AA---------GA-TA--CAA---A-C-AA--C----A----------------------A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-C---G--T-AA-------------------------A--TTAA----A-A--GCA-----------------------AA-A------TAC-GTA--AGTT-----GGACCAAAAC-A--CCC-TGCA-C---
gi|12 : aGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------AT-T-T----C-TT----CAA-TT-ATG-----A-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAG--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--TA---A--A--TG-TT-TGTTTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA-----GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTA
gi|13 : GAA-ATTAACC--T-ATT-GA---G----C-AG--GC--G-AAAC--G----A--G-------C--CA-A---A-C-A--AT-T---T--C--AA-T------TCA-A-CACC-T--G------AT--GATCT-------GTAG-AA----G---CCC-AA-A---C-A-AC-G--G---TA-ACGAA-T-----TTAAT--CG---CACA--TG----A--A--AC---CT------T----T-A-GGAAA----A-TT-AA---G--T-CC-AAT-T-A--A-ATCCT-G-CA-TTC-TTT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----CAA--T-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC-------T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT---A---T----GT---G---C--A---------------G---------AA-CT-T---------AAT-CA---------TT--A-------AT--AAC-CAC---A---ATTAA-----AA----CAA--AA--------------------T-TC--CAA---A-C-AA--T----A--G--TG-TTGGG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---CA---A-A---A--T-AA-----A------C--------TA-CA--TT-A----A-A--GCA---T---A--TA---G-AT-T---A-G------TAT-ATA--A--------AGAC-AAGAA-A-CCCC-TGCA-A---CG---A-GAT-
gi|14 : gGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAT--GC--G-
gi|14 : --GTAT-TAT---GT--CCC-CA-A---CTG-ACCTT-GGAATA-ATGAA-A-----TTA-T--CC---CAC---TT----A--AG-AC---CT------T----T-A-AGAAA----T-TT-G----T--T-CA-GAA-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-T-------A-TT-ATA----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----GTCTA------C----A------TAT---AT-C-A---A----GT---G---C--GT--TG----------A---------A--CA-T---------A--------------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATTAA-----CC----AAT--AAA--ATT--AA----------A-T----AA---A-CTTG--T----C--A--GG-TT-TG-TTG-----A-A--A--AT-A-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----GT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----TAA-G------C--------C--------AGACCAAAGC-A-TCCC-TGCA-T---GT---A-GAT-GG-TGG-ATTGAAATTtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaattatcccacttaagacctttaagaaatttgttcagaattcagtagcatcttttataaattatattataaaattgaacaccatataggtctacatatatcaagtgcgttgaacatattatataatcacaatattaaccaataaaattaaataaacttgtcaggtttgttgaaaataaatgcagaaataggtctacattgaaagcatatacgtaagccagaccaaagcatccctgcatgtagatggtggattgaaattccatagcct
gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgc---TG----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
gi|16 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----C-AG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC----ATCTA-G-CA-TAC-TTT--T-A-T-AA------------A----T----A-TT----CAA-TT-AT-----AA-ATT-G--AACCACCA--A---T--A-TA------G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA--A-T---------AAT-TA----------T--A-----TAAT--AAT-C-C---A---AT---------A----AAC--AAA--T----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TGTTT-TG-TTG-----A-A--A--AC-A-----------AA--TT---CA--GA-A---A--T-AA-----AC-----CA-------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-cacaaa
gi|17 : gGAA-AT---CC-GT-ATA-GG---A----CAGGTTGCATG-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AC--A-T-GG-AT-T---T--C--CA-TATCACGTNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---TAT---TG----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA--------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T---C---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CC-GT-AAT-GG---G----CGAG--GC--C-AAGT-GG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNN---------TTA-T--C----------TG----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : CC--CA-AT--AAC-AG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACCGCTGG------AT--GGACT--CCA---TAT-TACTTTAT--CCC-AA-A---CTGGACTGT-G---TA-ACAA
gi|2 : aacattaGAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAAC-CG----A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GGGAT-T---C--C--AA-TG-----TNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNG-T-----TTA-----CGAGCGC---TG----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-cgaggcgaaaccgagtccaatgaacgggattccaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttacgagcgctgacaagacctttaggaaattcaatcaagattttttaggcatatttttagtgaaattattcagttattaagtgaaccatactacgatatgaatcatgtgcatgaacataatttaaaataatcgcaaatataaacaatgaaattaaaactaattccaatcatgttgttttgaaactgaatgcagaaatacatgttcaagtaaagcatacatacattacgtgttagttagacaacatcatccctgcatggaagat
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---GGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----TCC---A-AT--A-C-GG-AT-T---TGTC--CA-T------TCACA-CGCT------------G--GATTT--GACTCGTAG-TC----GC--CGC-AA-G---ACG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---G----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GA--------C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gG-AT-T---T--C--CA-T------T--CA-CACC-T--G------A---GATA---CTG--GTAT-TA----CT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---T---TG-A-T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-A----CT------T----T-A-GG-AT----T-TT-A----G--T-CA-GA--TTC--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : GGA-AT---CCAGT-ATT-GGAACG----AGAG--GC--G-AAGC-TG----A--A-----TTTGTCATAT--ATC----AT-CA--C--C--CA-T------TGGTA-T-------G------AA--GCTCC--TTT--ATAT-AA----GT--CCC-CA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACTAA-T-----
gi|3 : gtatt--G-----TTC--CA-AT--A-CTGG-AT-T------C--CA-T------TTACA-CACC-T--G------AT--GACTC--ACA--GTTT-AT----GT--CCCCAA-A---C-G-ACGG--G----A-ACCA--T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-Gatttacacacctgatgactcacagtttatgtccccaaacgacgggaaccatttatcccgctgaagaccttaatggaaatttgagctcagatcttcaatctagcgtttttataaatatattcaatttatgaaatttgaaccattaatatgcatgtattcaagtgcatattgaacataaaatattcatttattacaagtataaagcaatacgatcaaaactaataatgtttgttgaaactgaatgcagaaataaatgtacattgaaaacataaagactggaacatccttgcacggagatg
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctc---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : A-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tatt-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-TG-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : G-AT-T---T--C--CA-T------TTC-----------------------AAAT--CCT--GGAT-GA----CT--CCC-AA-G---CTA-ACGGT-G---TA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-CA-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaaAA---A-CAAA--T----C--A--TG-TA-CG-TTG-----A-A-----CT-G-----------AA--CG---CA--------------AC-----AT--------------TA-CA--CTGA----AGA--GCA---A---A--T------GC-A-CAA-G------TC----------------AGACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : gT-AT----AT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-TA-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgtG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---------------------------------------TGA----A-A--ACA---T---A--TT---G-GTGT-TAG-GTAGGCCTAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG--------CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC---A-AT--A-C-GG-AC-T---T--CT-CA-G------TTTCAGCACC-C--G------GATGGACGT--CGA--GTAT-AA----GTGTCCC-AA-AACGTTG-AAAAT-G---TAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TACA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA---T----GT---G---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-TA----------T--A-------AT--AATCCAC---A--TATAAA-----AT----TAT--AA--------------------G-TC--AAA---ATTTAA--T----A--A--TG-TT-GA-GTGC----A-A--A--CT-------------AA--TG---C----A-A---A--T--A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GCA---T---A--TA---GCGTGT-TAG-C------TAT-ATA--A--------AGTCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---ccaaact
gi|40 : g--G------GC--GAAGC--TGT--GT-T-AT----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--gtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|41 : ggaaatccatattgggtca-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GCA---T---A--CA---T-G----TAA-G------T----CA--A----------ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CAC-AACA---CTG-ACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cggagcctccg
gi|43 : ttCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CAC-AACA---CTG-ACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cgggt
gi|44 : ttA-A---CTG-ACTGT-G---TA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-CA-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---A----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatgA---------GA-T----AA---A-CAAA--T----C--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-TG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---
gi|47 : t----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGC-G---TA-t
gi|5 : aaataatgtatgtaaattgtatacagctgtaGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAAG-A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTcagggtgtga
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GG-GA-T---T--C--CA-A------GTACA-C-CC-T--G------AA--GACTC--CGT--ATAT-AT----GT--CCC-AA-----CTG-AC-GT-G---TA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C-----T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TT---------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATAAA-----AA----CAATGAAATTA----AA---------AA-CT--AAA---TTCCAA--T----C--A--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-AA-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GCA---TAC-A--TA---C-AT-G-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACTAACAC-A-TCCC-TGC
gi|7 : gGAA-AT---CC-GT-ATTTGG---G----CGAGA-GC--G-AAGC-CG----T--G-----TCC--CA-AT--A-G-GG-TT-T---T--TGANN-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-ACACA-T-----TTA-T--CC---CGT---TG----A--AG-AC---CT------T------A-GGAAA----T-TT-AA---G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----ATTT----CAGTTT-ATG----AA-ATT-GAAAA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---ATCC-AT--T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-C--T---------AA--TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT--------AA----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---ACCTAA--T----A--A--T--TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---TA--GACA---A--TAAA-----AT-----C--------TATCA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GT-------G------T----TA--G--------A-ACTAAAACAA-TCCC-T-CA-C---G
gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-TG-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A---T----AT---A------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-T---------CAC-AA---------TT--AAAGGGT-AT--GAA-CAT---A--AATAAT-----AA----AAT--GAA--A----CATGTACATCCGA-TC--------A-TTAA-------A--A---G----TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-AA-----AT-----C-----------------GA----A-A--GCAATTT---A--TA---C-A----TAA-GC-----TAT-ACG--ATAGCTGTCAGACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--T--CANN------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-CA-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA-CATA---AT--T--A-TA-T----A----------A----A------CGC---A----A---T----ATAAAA---C--AA--TG----------A---------GA-TC-T---------AA---A---------CT--A-------AT--AAT--GT---T--TGTTGA-----AA----ATA--AAA--A----AT---------GG--C--GAA---G-TAAA--C----A--A--TG----TG-TCA-----A--------T-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGAATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : . ... . . . ... .... . .. .. . . .... .. ..... .. . .. . . . . ... .. .. ........................................................ .. . ..... . . . ... . . . ..... . .. ... ... .... .. . ... ...... .... . . .... . ......... . . . .. . . . . . . . .. . . . ............ .. . .... . .... . . .... . . .. . ... ... .. . ................. .... ...... ... . . ... .... ... ... .. .. .................... . . ......... . ..................... .. . .................................................. . .... ... . .. .... .. .. . . . ..... . .. .. . ........... .. ... .. . ... .. . ..... .............. . .. .... . .. ....... .. ....................................... . . . . ..... ... . . . .
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consensus : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
gi|1 : A-AT---CC-GT-ATT-GG---GA---CTCG--GC--GTCACT-CG--------------CC--AA-AC--A-C-AG-ATAT---T--C--CA-T------TTTTA-CACC-CTGG------AA--GGACT--CTC--GTAT-TA-----T--CCC-AA-AA--CTG-ACTGT-
gi|1 : ttattaggtaagGAATAT---CT-GT-GTT-TG---G----CGAG---T--G-ACGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-TCTTT--C--CAAT------TTTCAACACC-T--GGAAATGAG--GAGGG--GAG--G-GC-TA----GT--CCC-AA-A--------------------ACGAA-T-----TTA-T--CC----GC---TG----A--AA------CT------T----T-A-GGAAA----TATT-A----A--T-CA-AAT-TTTCTA-ATCTCTA-CA-TTC-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----TAT-TA-ATG----AATATT-G--AA-CACC---A---T--AATA-G----G----------C----AAGTCCATGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TT----------G---------AA-CA-T---------AAC-TA---------------------AT--AA---AC---A---AT-----------------------------AA---------GA-TC--AAA---ATTTGA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----ACAACA--CT-G-----------AT--CT---CA---A-A---A--T--A-----AT-----C--------TA-CAAGTTAA----A-A--GCA---TGCAA--TA---G-GT-T-GAA-G-------------------------AACTAAAAC-A-TTCTATGCA-TCTGGA---A-GATGGG-TGT-A-TGAGATctttccaattttcaacacctggaaatgaggaggggagggctagtcccaaaacgaatttatccgctgaaactttaggaaatattaatcaaattttctaatctctacattcttttataaattatttattaatgaatattgaacaccataataggcaagtccatgtatcatgtgcatttgaacataactaataaacaataagatcaaaatttgataatgtttgttgacaacactgatctcaaaataatctacaagttaaaagcatgcaataggttgaagaactaaaacattctatgcatctggaagatgggtgtatgagatattcacaagcctttgtt
gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CC-GT-ACT-GA---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TTC--CA-AT--A-C-GG-AT-C---T-----CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-CG-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A---T----AT---G---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-TT---------AT--A-----T-GT--AAT-CATAAAA--TACAAATGTATAA----CAAT-AAA--A----TA---------AA-T----AA---A-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--A--CT-G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-AG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----CGA-G------T--------C--------AGACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
gi|11 : gAA-AT---C--AT-ACT-GG---G----CGAG--GC--A-AAGC-TG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-C-----ATA-T--CC---TGC---TT----G--GG-AC---CT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----C--T-CA-GAT-TTC--A-G--CA-A-CA-T-C-ATT--G-A-T-AGATATCAGTTGATA--T-C----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ATT-G--AA-GACC---A---T--A-TA-----------------C----A------TGT---AT-T-ACATT----GA---G---C--AT--C-----------A---------TA-TA-T---------AAT-TA---------TC--A-----C-AT-------GT---A--TATGGA-----GACCTCATA--GTT--A----AA---------GA-TA--CAA---A-C-AA--C----A----------------------A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-C---G--T-AA-------------------------A--TTAA----A-A--GCA-----------------------AA-A------TAC-GTA--AGTT-----GGACCAAAAC-A--CCC-TGCA-C---
gi|12 : aGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------AT-T-T----C-TT----CAA-TT-ATG-----A-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAG--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--TA---A--A--TG-TT-TGTTTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA-----GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTA
gi|13 : GAA-ATTAACC--T-ATT-GA---G----C-AG--GC--G-AAAC--G----A--G-------C--CA-A---A-C-A--AT-T---T--C--AA-T------TCA-A-CACC-T--G------AT--GATCT-------GTAG-AA----G---CCC-AA-A---C-A-AC-G--G---TA-ACGAA-T-----TTAAT--CG---CACA--TG----A--A--AC---CT------T----T-A-GGAAA----A-TT-AA---G--T-CC-AAT-T-A--A-ATCCT-G-CA-TTC-TTT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----CAA--T-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC-------T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT---A---T----GT---G---C--A---------------G---------AA-CT-T---------AAT-CA---------TT--A-------AT--AAC-CAC---A---ATTAA-----AA----CAA--AA--------------------T-TC--CAA---A-C-AA--T----A--G--TG-TTGGG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---CA---A-A---A--T-AA-----A------C--------TA-CA--TT-A----A-A--GCA---T---A--TA---G-AT-T---A-G------TAT-ATA--A--------AGAC-AAGAA-A-CCCC-TGCA-A---CG---A-GAT-
gi|14 : gGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAT--GC--G-
gi|14 : --GTAT-TAT---GT--CCC-CA-A---CTG-ACCTT-GGAATA-ATGAA-A-----TTA-T--CC---CAC---TT----A--AG-AC---CT------T----T-A-AGAAA----T-TT-G----T--T-CA-GAA-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-T-------A-TT-ATA----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----GTCTA------C----A------TAT---AT-C-A---A----GT---G---C--GT--TG----------A---------A--CA-T---------A--------------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATTAA-----CC----AAT--AAA--ATT--AA----------A-T----AA---A-CTTG--T----C--A--GG-TT-TG-TTG-----A-A--A--AT-A-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----GT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---C-G----TAA-G------C--------C--------AGACCAAAGC-A-TCCC-TGCA-T---GT---A-GAT-GG-TGG-ATTGAAATTtattatgtccccaactgaccttggaataatgaaattatcccacttaagacctttaagaaatttgttcagaattcagtagcatcttttataaattatattataaaattgaacaccatataggtctacatatatcaagtgcgttgaacatattatataatcacaatattaaccaataaaattaaataaacttgtcaggtttgttgaaaataaatgcagaaataggtctacattgaaagcatatacgtaagccagaccaaagcatccctgcatgtagatggtggattgaaattccatagcct
gi|15 : gaaatccgtattgggcgatgc---TG----A--AGTAT---CT------T----TTA-AGACA----C-TC-AAACTG--T-CA-GAT-TTTCGA-GTCCA-G-CAAT-C-TTT--T-A---AA------------A--T-TCTCAA-TTTTAACAA-TT-ATA----GA-GTT-G--AA-CACCCCAA---T--A-TACG----GC---------C----A------TGCAAAAT-A-C---T----GT---GGAAT--AT--TG----------T---------CA-C-------------AT-TA----------T--A-----T-ATTGAAT-CACA--A--CATAAG-----AA----GCC--ATG--G----AA---------AA-TTAAAAA---A-CTAATTT----A--ATCTG-TT-TGTTTA-----A-A--A--CTCG-----------AA--TG---TAG-GA-A---A--T-AACTAATAT-----T--------TA-CA--TTGATTTTA-AGGGCAAC-T---A--TACTCG----T-TAG-T------TTT-GT--------------ACTAAAAC-ATTTCT-TTCA-C---GGAAAA-GAT-GGTTGT--TTGAAATTTccatagcct
gi|16 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----C-AG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC----ATCTA-G-CA-TAC-TTT--T-A-T-AA------------A----T----A-TT----CAA-TT-AT-----AA-ATT-G--AACCACCA--A---T--A-TA------G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA--A-T---------AAT-TA----------T--A-----TAAT--AAT-C-C---A---AT---------A----AAC--AAA--T----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TGTTT-TG-TTG-----A-A--A--AC-A-----------AA--TT---CA--GA-A---A--T-AA-----AC-----CA-------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-cacaaa
gi|17 : gGAA-AT---CC-GT-ATA-GG---A----CAGGTTGCATG-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AC--A-T-GG-AT-T---T--C--CA-TATCACGTNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---TAT---TG----G--AG-GC---TTA-----T----T-T-CAAAA----T-TT-G----A--T-TAAGAT-TTC--A-AT--A-A-CA-T-C-ATT--A-A-T-GA------------ACAT-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AC-ATT-G--AA-TACT---A---T--A-T-------T----------T----A------TGC---AT-C-A------------------------TG----------A---------AATCA-C---------AA--TA---------TC--A-------A---AAT-AAG---A--TAT--------------------AT--A----AA---------TA-TT--TAA---A-TTAA-------A--A--T--CA-TG--TG-----A-ATCAGTCT-G-----------AA--TT---CA--GA-C---A--T--------AT-----C--------CG-TA--TAGA----A-A--GCA---A---A--TA---A-G
gi|18 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA--------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T---C---CGC---TG----A--AG-AC---C-------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AG------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATGAAAAAA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--AT--T---------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TAT-------------------------------------------------A---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-------A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--T
gi|19 : GAA-AT---CC-GT-AAT-GG---G----CGAG--GC--C-AAGT-GG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNN---------TTA-T--C----------TG----A--AG-AC---CT------T----T---GGAAG----T--------------------------------A-A-CA-T-C-TTTGAT-G-T-AT------------A--T-T----A-TT----CAA-TA-ATG----AA-ACT-A--AA-CACC---A---T--A-TA-----------------C----G------TGT---GT-C-A-----------------C--AT--T-----------A---------AA-CA-T---------CAT-T-----------------------T--AAT-AAC---A--AATGAA-----AC----ATA--TGA--ACATTAA---------AA-TT--AAATTAA-CTAA--T----C--A--TG-TT-TA-TTG-----A-A--G--CT-G-----------AA--TG---CA--G------A--T-A----------------------TA-CA--CTGA----A-A--TC----------------------------------------------------AGACCAAAAC-A-TCCC-TGC
gi|2 : CC--CA-AT--AAC-AG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACCGCTGG------AT--GGACT--CCA---TAT-TACTTTAT--CCC-AA-A---CTGGACTGT-G---TA-ACAA
gi|2 : aacattaGAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAAC-CG----A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GGGAT-T---C--C--AA-TG-----TNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNG-T-----TTA-----CGAGCGC---TG----ACAAG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGTGAA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AA-C--C---A---T--ACTACG----A----------T----A------TGA---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--------------G---------AA-CA-T---------AAT-T----------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATATA-----AA----CAA--TGA--A----A-------------TT--AAA---A-CTAA--TTCCAATCA--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AC-----AT-----G--------TT-CA--AGTA----A-A--GCA---T---A--CA---T-ACAT-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACAACATC-A-TCCC-TGCA-T---GGA--A-GAT-cgaggcgaaaccgagtccaatgaacgggattccaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttacgagcgctgacaagacctttaggaaattcaatcaagattttttaggcatatttttagtgaaattattcagttattaagtgaaccatactacgatatgaatcatgtgcatgaacataatttaaaataatcgcaaatataaacaatgaaattaaaactaattccaatcatgttgttttgaaactgaatgcagaaatacatgttcaagtaaagcatacatacattacgtgttagttagacaacatcatccctgcatggaagat
gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---GGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----TCC---A-AT--A-C-GG-AT-T---TGTC--CA-T------TCACA-CGCT------------G--GATTT--GACTCGTAG-TC----GC--CGC-AA-G---ACG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-TA---------TTTCA-----T-AT--AATGCACT--A--TATAAA-----CA----ATA--A--------------------GA-TC--AAG-----------T----G--A--TA-TT-TG-TTG-----ACA--A--CT-G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-AA-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GTGT-TAA-G------T-T-ATACTG--------AGACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---AT-TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------GACTC--AAA---A--TAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GG-T-TAATT------TATAATA--A--------AGACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---G----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-CC-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A---T----GT---G---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------TA---------TC--A-----C-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----A
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TA---------T-----------AT--AAA-CGC---A--TATAAA-----AC----ATG--A--------------------GA-TC--TAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTGAAAAAA-A--A--AT-GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-AA-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGA--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAc
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT---------A----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GTGT-T----------------------------AGACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-TA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--------T-AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-TATAAACTCTGTT--A-----C-A---AAT-CACA--A--CATAAA-----AA----ATATGGAT--A----AA---------AA-T----AA---C-CTAC--T----C--A--TT-TT-TA-TTG-----G-A--A--TT-G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-AC-----AT-----
gi|27 : ATC---A---C--A-T-------G----------T----A------TGC---AT-C-A---T----AT----------AT--TA----------A---------AT-CA-C---------AAT--A---------TG--A-----A-AA--CAT-CAC---A--GTTAAA-----GA----TAT--GAA--C----AA-------------T--AAA---A-TTAA----------A--TG-TT-TG---------A-A--C--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-GC-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GTA---A---A--T------GT-G-AAA-G-----------TC--A--------GGGC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GA--------C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gG-AT-T---T--C--CA-T------T--CA-CACC-T--G------A---GATA---CTG--GTAT-TA----CT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---T---TG-A-T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-A----CT------T----T-A-GG-AT----T-TT-A----G--T-CA-GA--TTC--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C---TAGTGGT---G---C--AT--
gi|3 : GGA-AT---CCAGT-ATT-GGAACG----AGAG--GC--G-AAGC-TG----A--A-----TTTGTCATAT--ATC----AT-CA--C--C--CA-T------TGGTA-T-------G------AA--GCTCC--TTT--ATAT-AA----GT--CCC-CA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACTAA-T-----
gi|3 : gtatt--G-----TTC--CA-AT--A-CTGG-AT-T------C--CA-T------TTACA-CACC-T--G------AT--GACTC--ACA--GTTT-AT----GT--CCCCAA-A---C-G-ACGG--G----A-ACCA--T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-CA-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A---A----GT---G---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAATA---------TTC-A-----T-TT--A-T-TAC---AAGTATAAA-----GC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--------------------------------------ATA--A--------AGACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-Gatttacacacctgatgactcacagtttatgtccccaaacgacgggaaccatttatcccgctgaagaccttaatggaaatttgagctcagatcttcaatctagcgtttttataaatatattcaatttatgaaatttgaaccattaatatgcatgtattcaagtgcatattgaacataaaatattcatttattacaagtataaagcaatacgatcaaaactaataatgtttgttgaaactgaatgcagaaataaatgtacattgaaaacataaagactggaacatccttgcacggagatg
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctc---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACA--A--TATAAA-----AC----AAA--
gi|31 : A-CT-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CACG--A--TATAAA-----AC----AAA-----------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-G------TAT-A----------------------C-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAA
gi|32 : gcacgttac-AT--AAT-CAC---AA-TATAAA-----AC----AAT--AC-------------------GA-TC--AAA---A-CTAA--C----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AG-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GCATAGT---A--TA---C-GTGT-TAG-G------TAT-ATA--A--------AG-------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--A-----T-AC--AAT-CAC---AA-TATTAA-----AA----CAA--TAA------------------GA-TT--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--ACA---T---A--TA---G-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tA----AAA--CAA--G----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAC--T----A--A----------------------------T-G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-AA-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---ATGTA---C-GTGT-TAG-T------TAT-ATA--A--------AGACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tatt-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-TG-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : G-AT-T---T--C--CA-T------TTC-----------------------AAAT--CCT--GGAT-GA----CT--CCC-AA-G---CTA-ACGGT-G---TA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-CA-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaaAA---A-CAAA--T----C--A--TG-TA-CG-TTG-----A-A-----CT-G-----------AA--CG---CA--------------AC-----AT--------------TA-CA--CTGA----AGA--GCA---A---A--T------GC-A-CAA-G------TC----------------AGACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : gT-AT----AT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-TA-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgtG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---------------------------------------TGA----A-A--ACA---T---A--TT---G-GTGT-TAG-GTAGGCCTAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG--------CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC---A-AT--A-C-GG-AC-T---T--CT-CA-G------TTTCAGCACC-C--G------GATGGACGT--CGA--GTAT-AA----GTGTCCC-AA-AACGTTG-AAAAT-G---TAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TACA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA---T----GT---G---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-TA----------T--A-------AT--AATCCAC---A--TATAAA-----AT----TAT--AA--------------------G-TC--AAA---ATTTAA--T----A--A--TG-TT-GA-GTGC----A-A--A--CT-------------AA--TG---C----A-A---A--T--A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GCA---T---A--TA---GCGTGT-TAG-C------TAT-ATA--A--------AGTCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---ccaaact
gi|40 : g--G------GC--GAAGC--TGT--GT-T-AT----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--gtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|41 : ggaaatccatattgggtca-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GCA---T---A--CA---T-G----TAA-G------T----CA--A----------ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CAC-AACA---CTG-ACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cggagcctccg
gi|43 : ttCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACC--G-ATCTC----GC--CAC-AACA---CTG-ACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cgggt
gi|44 : ttA-A---CTG-ACTGT-G---TA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-CA-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---A----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatgA---------GA-T----AA---A-CAAA--T----C--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-TG-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---
gi|47 : t----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGC-G---TA-t
gi|5 : aaataatgtatgtaaattgtatacagctgtaGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-AA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC------TATAAA-----AA----AAA--AAAG-A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGTCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTcagggtgtga
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GG-GA-T---T--C--CA-A------GTACA-C-CC-T--G------AA--GACTC--CGT--ATAT-AT----GT--CCC-AA-----CTG-AC-GT-G---TA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAAGAT-TT------TTTA-GGCA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-GT--G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C-----T----GT---G---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-TT---------TA--A-----A-AT--AAT-CGC---A--AATAAA-----AA----CAATGAAATTA----AA---------AA-CT--AAA---TTCCAA--T----C--A--TG-TTGTT-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-AA-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GCA---TAC-A--TA---C-AT-G-TAC-G------TGT--TA--GTT------AGACTAACAC-A-TCCC-TGC
gi|7 : gGAA-AT---CC-GT-ATTTGG---G----CGAGA-GC--G-AAGC-CG----T--G-----TCC--CA-AT--A-G-GG-TT-T---T--TGANN-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-ACACA-T-----TTA-T--CC---CGT---TG----A--AG-AC---CT------T------A-GGAAA----T-TT-AA---G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----ATTT----CAGTTT-ATG----AA-ATT-GAAAA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---ATCC-AT--T----GT---G---C--AT--TG--------------------AA-C--T---------AA--TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CATA--A--TAT--------AA----AAA--CAA--T----AA---------TA-TC--AAA---ACCTAA--T----A--A--T--TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-GA----------AA--TG---TA--GACA---A--TAAA-----AT-----C--------TATCA--TT-A----A-A--TTA---T---A--TA---G-GT-------G------T----TA--G--------A-ACTAAAACAA-TCCC-T-CA-C---G
gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-TG-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A---T----AT---A------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-T---------CAC-AA---------TT--AAAGGGT-AT--GAA-CAT---A--AATAAT-----AA----AAT--GAA--A----CATGTACATCCGA-TC--------A-TTAA-------A--A---G----TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-AA-----AT-----C-----------------GA----A-A--GCAATTT---A--TA---C-A----TAA-GC-----TAT-ACG--ATAGCTGTCAGACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--T--CANN------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNN--NNNN-NN----NN--NNN-NN-N---NNN-NNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-CA-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA-CATA---AT--T--A-TA-T----A----------A----A------CGC---A----A---T----ATAAAA---C--AA--TG----------A---------GA-TC-T---------AA---A---------CT--A-------AT--AAT--GT---T--TGTTGA-----AA----ATA--AAA--A----AT---------GG--C--GAA---G-TAAA--C----A--A--TG----TG-TCA-----A--------T-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TAT--A-GT-TGTCA-GT-----TAT-ATA--A--------AGAATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
blockSeqs : T TAA A T T AAC GGGG TT AT . G TGTT AA TTATA GT T GA A T G . CTT GT GA ATTTTCAACACCTGGAAATGAGGAGGGGAGGGCTA GT C AACG G N G GAA G N G NNNNN A TG GAG GAT TTCA CA T GCG AAGATA AACA T T TTTT . AAACTG A A C CG G C . G A T G GA T G G ATATCAGTTGAT CA A CTCA T TTAA T T AAAA . T AA C CCA TAT TA C AGATTGCATGTA CTAT . AAA T A CAT AGTG AAA GAA AA AT TCATAATACCA G C TTCGATGCA A TAAACTCTGTTAC TG G AAAATACAAATGTATAACAATAAAATAA C TAAA TTA T TT TCCA TC TC T G T AAAAA C TC GT C GCGAAGTAAAC AT TGT AT C TGC GG A CTAAT CTAGTAATT G G TTTT G GG TAGT TG GGTGTTAGGTAGGCCTATATAA C A T . GC AAA T . T C
blockSeqs : . . . T . . . A . . . CT T . . . GA T . . . A . T TATCACGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . CA . N G . . N . . . T . A G T . . A . . . G . GAGC . A . . . C . G . A G . . G . . T . . . . . . T . . . . A C . C GACCTA . . . C . T . . . . . AGCATATCAT T . . . TTAAAGGGT . C AAATAATAAAATGAAACATGTACATCCG . AC . T . A . . . G T C . . . . A . . G . . . . . TAAATC T . . . . ATTT . CATAAGCTATACGATAGCTGTC C . . . C A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCACACCGCTGGATGGACTCCATATTACTTT . . CA . N . . . N . . . . . T C . . . . . . . . . AAG . A . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GGTCTA . . . . . . . . . . . AT . . . . TTTCAT . . ATATGGAGACCTCATAGTTAAAG . CA . C . . . . . G . . . . . . A . . . . . . . . CA . . . . . ACT . TAGTTGTCAGTTATATAA T . . . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTTCAGCACCCGGATGGACGTCGAGTATAA . . A . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGCCTA . . . . . . . . . . . A . . . . TTCAT . . AAATGAAACATATGAACATTAAA . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . TAC . TAGTTGTCAGTTATATAA C . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . N . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGGC . . . . . . . . . . . A . . . . ATAT . . AAATAAAAACAATGAAATTAAAA . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . TACATTACGTGTTAGTT T . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCACACCGCATGATATCGACCGATCTC . . N . N . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGA . . . . . . . . . . . G . . . . TCAC . . AACATAAAAAATATGGATAAAA . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GGTGTTAAGTTATACTG C . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCACACCGCATGATATCGACCGATCTC . . N . N . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGG . . . . . . . . . . . A . . . . TTAT . . AATATTAACCAATAAAATTAA . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GGGTTAATTTATAATAA A . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . A . N . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . T . . . . TTAT . . AACATAAGAAGCCATGGAAA . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GCGTGTTAGCTATATAA T . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . A . T . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TATA . . TATAAAAAAAAAAAGAAAG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . CGTGTTAGGTATATAA T . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . N . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TTAT . . TTGTTGAAAATAAAAAATG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . GGTGTTAGTTATATAA T . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . T . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TAAA . . TATAAAAAAAAAAGAAAG . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . CGTGTTAGTTATATAA T . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . N . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . G . . . . TTAT . . AGTTAAAGATATGAACAA . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . CATGTACGTGTTAGTT T . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . N . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . A . . . . TCAC . . AAATATAAACAATGAAA . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GGTTTAAGTATATAA T . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . A . T . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TTAT . . AAGTATAAAGCAATACG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GTTTAAGTATATAA A . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . A . . . . TGAA . . AATATTAAAACAATAAG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . CTCGTTAGTTTTGT T . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTACACACCTGATGACTCACAGTTTAT . . G . G . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TTAT . . AATATAAAAACAATAAT . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . AAATACGTAAGTT T . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . G . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . G . . . . TTAT . . ATTATAAAACAATAAG . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . GATTAGTATATAA C . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . N . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TTAT . . AATATAAAACAATAAT . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . GGTGTTAGGTATA T . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . A . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . A . . . . TTAT . . AATATAAAACAATACG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GTGAAAGTCA T . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCACACGCTGGATTTGACTCGTAGTC . . A . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . A . . . . TAAA . . TATATAAACAATAAG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . TGTAAGTCAA T . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGTACACCCTGAAGACTCCGTATATAT . . A . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . TTAT . . AATAAACAAATAAG . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . GCACAAGTC C . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCAACACCTGATGATCTGTAGAA . . G . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . ATATAAAACATGAG . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . CGCGAGTC T . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCACACCTGAGATACTGGTATTA . . A . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . GATATAAAACAAAG . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . CGTAAGCC . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGGTATGAAGCTCCTTTATATAA . . A . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TCA . . ATATAAAATTATAA . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . GGTGTTAG . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TTTCAAATCCTGGATGA . . A . N . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TTT . . AATTAAAACAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . GGTGTT . . . .
blockSeqs : . . . . . A . N . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . ATATATAAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . ATAA . . . .
blockSeqs : . . . . . N . N . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . AATAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . .
blockSeqs : . . N . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : **** A**** ** ****** TTAT***************** AATATAAAACAATAAG********************************** ** ** T****** GGTGTTAGTTATATAA*********************** C****
originalCons : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AA-A---CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TA---------TT--A-----T-AT--AAT-CAC---A--TATAAA-----AA----AAA--AAA--A----AA---------GA-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCA---T---A--TA---G-GT-T-TAA-G------TAT-ATA--A--------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
finalCons : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---T--C--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNN--GTAT-NN----GT--CCC-AAA----CTG-ACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-CA-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A---T----GT---G---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-TATTAT-----------------AT--AAT-CACAATATAAAACAATAAG----------------------------------A-TC--AAA---A-CTAA--T----A--A--TG-TT-TG-TTG-----A-A--A--CT-G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-AA-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GCAT------A--TAGGTGTTAGTTATATAA-----------------------AGACTAAAAC-A-TCCC-TGCAC----GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): GGAAGACCTACAACTTTGTGAATCGTGATGAGAGAGAATATAGAAAG
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Unaligned ( gi|51 ): AAAGATTTGAACCTGAATGAAATATGCAGGTCATT
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Reference ( family-911 ) : GAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TTNCA-CACC-C--G------AN--GANNT--NNNGTA----T-NN-GT--CCC-AA-A---CT-GACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-C-A-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAC--A---A-TAT-A--A------A------A------C-A-----A---T--A-AGA-TC--A--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GC--A-----------------------T---A--------T--AG-GTGTT-AG------TTAT-ATAA--------AG-ACTAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTT
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gi|10 : ttattaggtaagacagtcagttttgggataatacgagagtccttccagggtgtaaaaatgGAA-AT---CC-GT-ACT-GA---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TTC--CA-AT--A-C-GG-AT-C---T---CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNNNNN----N-NN-NN--NNN-NN-N---NN-NNNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-------T-------------------A----T-TT-G----T--T-C-G-GAT-TTC--A-A--TA-G-CA-T-T-TTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-GACCTA----------C----A------TGT---AT-C-A-T----ATG---C--AT--TG----------A---------AAGCGCC---------AAT-T--T---------AT--AT----GT--A---AT-CATAAA---A-TAC-A--AATGTATA------A------C-A-----A---T--A-AAA-TA--AATAA---A--------CTAA--T----C--A--TG-TT---TA-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------GA--TG---CA--GA-G---A--T-A---G-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GC--A-----------------------T---A--------T--AC-GCG---AG------TC---------------AG-ACCGAAAT-A-TCCC-TGCA-attcacaagcctttgtt
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gi|20 : aacattattgttacacagtccagtttgggataaagtaatatggagtccatccagcggtgtgaaatgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---GGGGGCGAG--GC--G-AGGCGCG----A--G-----T-C--CA-AT--A-C-GG-AT-TTG-TC--CA-T------TCACA-CGCT------------G--GATTTGACTCGTA----G-TC-GC--CGC-AA-G---AC-GACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-CTGCG---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-
gi|20 : g--AT--TG----------AT--------AG-CA-A---------AAT-T--A---------TTTCAT----AT--A---ATGCAC--T---A-TAT-A--A------A-------------C-A-----A---T--A-AGA-TC--A--AG------------------T----G--A--TA-TT---TG-TT-G-----ACA--A--CT---G-----------AAATTG---CA--GA-A------T-A---A-----AT-----C--------TG-AA--TTGA----A-A--GC--A-----------------------T---A--------T--AG-GTGTTAAG------TTAT-ACTG--------AG-ACTAGAGC-A-TCCC-TGAAGC---GGA--A-GAT-GG-Tttgatagcaaaattatttcatataatgcactatataaacaataagatcaagtgatatttgttgacaactgaaattgcagaataaatctgaattgaaagcatataggtgttaagttatactgagactagagcatccctgaagcggaagatggt
gi|21 : ggaaatccgtattgggggggcgaggcgaggcgcgagtccaatacggatttgtccattcacacgctggatttgactcgtagtcgccgcaagacgactgtgtaacgaatttactgcgcgctgaagacctttTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CA------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-C-A-GAT-TTC--A-ATCAG-G-TA-T-C-TTT--TTA-T-AA------------T--T-T----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------AGT---GT-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAC--A---T-TAT-A--A------A------A------C-A-----A---T--A-AGACTC--A--AA---A---------TAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-A---A-----ATC----C--------TAGCA--TCAA----A-A--GC--A-----------------------T---A--------T--AG-G-GTT-AAT-----TTATAATAA--------AG-ACT-AAAC-A-TTCC-CGCA-T---GG---A-GAT-
gi|22 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---G----CAAA--GC--A-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNNNNN----N-NN-NN--NNN-NN-N---NN-NNNNNN-N---NN-NNNNN-NNNNNNTTA-T--CT---CGC---TG----A--AG-TC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-G----T--T-C-C-AAT-TTC--A-GT--A-G-CA-T-C-TTT--------AA------------A--T-T----A-TT----CAA-TT-ATA----AA-ATT-G--AC-CACC---A---T--A-TA-G----G----------CCTATA------TGT---AT-T-A-T----GTG---C--CT--TG--------------------AA-CA---------------T--A---------TC--AC----AT--A---AT-CAC--A---A-TAT-A--A------A------A------C-
gi|23 : -AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT-ATG----AA-AT--G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----G---------------A------GAT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-T--A---------T---------AT--A---AA-CGC--A-----TAT-A--A------A------A------C-A---------T--G-AGA-TC--T--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-GAAAAAA-A--A--AT---GGCGAAGTAAACAA--TGTGTCAATGA-ATGCA--G-A---A-----ATTAAATC--------TA-CA--TTGA----A-A--GCATA-----------------------T---A--------T--AG-TTGTC-AG------TTAT-ATAA--------AG-A--AAAAC-A-T-CC-TGCA-C---GA---A-GAT-GG-TGT-ATTGAA
gi|24 : -A-GGAAA----T-TT-A----G--T-C-A-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----A-TT----CAG-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------A---------A--CA-T---------AAT-T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAT--A---A-TAT-A--A------A------A------C-A-----A---T--A-ATA-TC--A--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---TA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----C--------TA-CA--TT-A----A-A--TT--A-----------------------T---A--------T--AG-GTGTT--------------------------AG-ACTAAAAA-A-TCCC-TGCA-C---GG---A-ttccgaatcc
gi|25 : tgGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAG
gi|25 : g-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-T-A-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-A-AA------------A--T-T----G-TT----CTT-TT-TTT----AA-ATT-G--AA-CATC---A---T--A-TA-G----T----------C----A------TGT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-T--A---------TT---T----AT--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcccgctgaagacctttaggaaatttagttagatttcaatctagcatcttttaaaaattgttctttttttaaattgaacatcatatagtcatgtatcatgtgcattgaacataattatttat
gi|26 : ggaaatccgtattgggcgaggcgaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T-A-T-AT------------A--T-T----A-TA----CAA-TT-ATA----AT-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TA-A----GATTGCATGTAC----A------TGT---AC-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------AGCATATCATAA-CA-TTTCGATGCAAAT-T--ATAAACTCTGTT--AC----A---A---AT-CAC--A---A-CAT-A--A------A------A--------A-----A---T--ATGGA-TA--A--AA---ATAAC----CTAC--T----C--A--TT-TT---TA-TT-G-----G-A--A--TT---G-----------AA--TG---AA--GA-C---A--T-A---C-----AT-----
gi|27 : ---AT-C-A-C----ATG---T--AT---G----------C---------AT-CA-T---------A---T--A---------TT--A---------A---AT-CAC--A---A-TAT-G--A------A------AACATCAC-A-----G---TTAA-AGA-TA--T--GA---A--------C-AA--T----A--A--AA-TTAAATG-TTTG-----A-A--C--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-T---A--T-G---C-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--GT--A-----------------------A---A--------T-----GTGAA-AG------TC------A--------GG-GC-AATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GAT-GG--GT-ATTGACATTTgt
gi|28 : GAA-AT---CC-GT-ATT-GA--------C-AG--GC--A-AA-C-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNNNNN----N-NN-NN--NNN-NN-N---NN-NNNNNN-N---NN-NNNN--------TTA-TT-CC---CGC---TG----A---G-AC---CT------T----T-A-G----------TT-A----G--T-C-A-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-C-TTT--T-T-T---------------A--T-T----A-Tcaggccctc
gi|29 : gG-AT-T---TC--CA-T------T--CA-CACC-T--G------A---GATA---CTGGTA----T-TA-CT--CCC-AA-A---CT-GACTGT-G---T---TG-A-T-----TT--T--CC---CG-----G----A--AG-A----CT------T----T-A-GG-AT----T-TT-A----G--T-C-A-GA--TTC--A-ATCTA---TA-G-T-TTT--T-A-T------------------T-T----C-TT----CAC-TG-ATG----AG---T-G--AA-CACC---A---T--A-TA-G----G----------C-----------TGT---AT-C-C-TAGTGGTG---C--AT--
gi|3 : GGA-AT---CCAGT-ATT-GGAACG----AGAG--GC--G-AAGC-TG----A--A-----TTTGTCATAT--ATC----AT-CA--CC--CA-T------TGGTA-T-------G------AA--GCTCC--TTTATA----T-AA-GT--CCC-CA-A---CT-GACTGT-G---TA-ACTAA-T-----
gi|3 : gtatt--G-----TTC--CA-AT--A-CTGG-AT-T----C--CA-T------TTACA-CACC-T--G------AT--GACTC--ACAGTT----T-AT-GT--CCCCAA-A---C--GACGG--G----A-ACCA--T-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----A-ATGGAAA----T-TTGA----GC-T-C-A-GATCTTC--A-ATCTA-G-CG-T---TTT--T-A-T-AA------------A--TAT----A-TT----CAA-TTTATG----AA-ATTTG--AA-C--C---A---TTAA-TA-T----G----------C----A------TGT---ATTC-A-A----GTG---C--ATATTG----------A---------A--CA-T---------AAAAT--A---------TTC-AT----TT--A----T-TAC--A---AGTAT-A--A------A------G------C-A-----A---T--A-CGA-TC--A--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----G--------TA-CA--TTGA----A-A--AC----------------------------------------------------------------ATAA--------AG-ACTGGAAC-A-TCCT-TGCA-C---GG---A-GAT-Gatttacacacctgatgactcacagtttatgtccccaaacgacgggaaccatttatcccgctgaagaccttaatggaaatttgagctcagatcttcaatctagcgtttttataaatatattcaatttatgaaatttgaaccattaatatgcatgtattcaagtgcatattgaacataaaatattcatttattacaagtataaagcaatacgatcaaaactaataatgtttgttgaaactgaatgcagaaataaatgtacattgaaaacataaagactggaacatccttgcacggagatg
gi|30 : gtattattagttacacagtcagttggggacttatataaaggagcttcataccaatgggtgatgatatatgacaaattcagcttcgcctctc---TA-ACGAA-T-----TTA-T--CC---TGC---TGTTCAA--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----A--T-C-A-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A-T-A--------------------------------AA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A------A-TA-G----G----------C----A------TGT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAC--A---A-TAT-A--A------A------A------C-A-----A---
gi|31 : A-CT-T---------AAT-T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAC--G---A-TAT-A--A------A------A------C-A-----A--------AGA-TC--A--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---T-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--AC--A-----------------------T---A--------T--AG-GTGTT-AG------GTAT----------------------AC-A-TCCC-AGCA-A---GG---A-GAT----TGT-ACTGAAAa
gi|32 : gcacgttac----AT--A---AT-CAC--A---A-TAT-A--A------A------A------C-A-----A---T--A-CGA-TC--A--AA---A--------CTAA--C----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-A---G-----AT-----G--------TA-CT--TTGA----A-G--GC--ATAG--------------------T---A--------T--AC-GTGTT-AG------GTAT-ATAA--------AG--------------------A-C---GG---A-GAT-GG-TGT-ACTGAA
gi|33 : g---------TT--AT----AC--A---AT-CAC--A---A-TATTA--A------A------A------C-A-----A---T--A-AGA-TT--A--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----C--------TA-TA--TTAA----A-A--AC--A-----------------------T---A--------T--AG-GTGTT-AG------TTAT-ATAA--------AG-ACTAAAAC-A-TCCC-TGCg
gi|34 : tT-A--A------A------A------C-A-----A---G--A-AGA-TC--A--AA---A--------CTAC--T----A--A-------------------------------T---G-----------AA--TG---AA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----CTAGTAATTTA-CA--TTGA----A-A--GC--A-----------------------T---ATG------T--AC-GTGTT-AG------TTAT-ATAA--------AG-ACTATAAC-A-TCCC-TGCA-C---AG---A-GAT-GG-TGT-
gi|35 : tat-T-----TTA-T--CC---CTC---TGG---A--AG-AC---CG------T----T-A-T-AAA----T-TT-T----T--T-T-G-CAT-T-C--A-AT--A-G-CA-T-C-TGT--T-A-T-GA------------A--T-T----A-TT----TAG-TT-TTG----AA-ATT-G--AA-CACC---ATATT--A-TA-G----GCCTA------C----A------TGT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------A---------A
gi|36 : G-AT-T---TC--CA-T------TTC-----------------------AAAT--CCTGGA----T-GA-CT--CCC-AA-G---CT-AACGGT-G---TA-ACACA-T-----GTG-T--CC---CGC---TG----A--AC-AC---CT------T----T-G-GGAAA----T-TT-A----T--T-C-A-GAT-TTC--
gi|37 : agtcagtttgggcgggtcgaa--AA---A--------CAAA--T----C--A--TG-TA---CG-TT-G-----A-A-----CT---G-----------AA--CG---CA---A-C---A--T---------------------------TA-CA--CTGA----AGA--GC--A-----------------------A---A--------T-----GCACA-AG------TC---------------AG-ACAAATAC-A-TCCC-TGTA-C---AG---A-GA
gi|38 : aacGAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----CGAA--AC--A-AAGC-TG----T--GTTATATCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---atttggggggttgtgtgattc
gi|38 : g----T-AT-AT--CCC-AA-A---CT-GACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTG-T--AC-------------------G-TC---GT------T----T-A-GAAAA----T-TT-G----T--T-T-A-GAT-TTC--A-GTgtgtaacgaatttgtacgtcgtttagaaaatttgtttagatttcagt
gi|39 : ggaaatccatattgggcgaaacaaagctgtgtG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-A------------------------------------------TGA----A-A--AC--A-----------------------T---A--------T--TG-GTGTT-AGGTAGGCCTAT-ATAA--------AG-TCTAAAAC-A-TTCC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-
gi|4 : -ATT-GG--------CGAG--GC--G-A-GC-CG----AAAG-----TCC---A-AT--A-C-GG-AC-T---TCT-CA-G------TTTCAGCACC-C--G------GATGGACGT--CGAGTA----T-AA-GTGTCCC-AA-AACGTT-GAAAAT-G---TAGAC-AA-T-----TTA-T--CT---CGCGATTG----AT-AG-ATGCGCTAAGATATAACAT-A-GGAAA----T-CT-A----G--TAC-A-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-----T--T-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CCAC---A---T--A-TA------G----------C----A------TG----AT-CAA-T----GTG---CAAAT--TG----------G---------AA-CA-T---------AAT-T--A----------T--A-----AT--A---AT-C-C--AC--A-TAT-A--A------A------A------T-T-----A---T--A-AG--TC--A--AA---AT-------TTAA--T----A--A--TG-TT---GA-GT-GC----A-A--A--CT---------------AA--TG---C----A-A---A--T-----A-----AT-----C--------T--CAG-TTG-------A--GC--A-----------------------T---A--------T--AGCGTGTT-AG------CTAT-ATAA--------AG-TCTAACAC---TCCC-TGCA-A---GT---A-GAT--G-TGT-ATTGAAATT
gi|40 : GAA-AT---CC-AT-ATT-GG---G----TCAG--GC--G-AAGC-TGTGTTAT-G-----TCC--CA-A---A-C-TG-AC-T---ccaaact
gi|40 : g--G------GC--GAAGC--TGTGT-----T-AT-GT--CCC-AA-A---CT-GACTGT-G---TA-ACGAA-T-----TTA-T--gtgtaacgaatttatacgtccttttaaaaagt
gi|41 : ggaaatccatattgggtca-----AT-----C--------TA-TA--TTGA----A-A--GC--A-----------------------T---A--------C--A---TGTA-AG------TC---------------AA-ACCGAAAC-A-TTCC-TGAA-T---GG---A-TAT-CG-TCT-GCAGAAATTTacgtccttttaaaaagt
gi|42 : tCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACCG-A----TCTC-GC--CAC-AACA---CT-GACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cggagcctccg
gi|43 : ttCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-T------TT-CA-CACC-G--C------AT--GATATCGACCG-A----TCTC-GC--CAC-AACA---CT-GACTGTGG---TA-ACTAA-T-----cgggt
gi|44 : ttA-A---CT-GACTGT-G---TA-CCTAA-T-----TTA-T--CC---CACT--TG----A--AG-AC---CT------T----T-A---AAATTTTT-TT-T----T--T-C-A-GAT-TTC--AGA---A-A-CA-T-C-TTT--G-A-T-cgggt
gi|45 : GAA-AT---CT-GT-ATT-GG---A----CAAG--GC--G-AA
gi|46 : ggatattattagttgcatagagttatccatcttgtgaaatg-AGA-T------AA---A--------CAAA--T----C--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---TA--GA-C---A--T-T---G-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--GC--A-----------------------T---A--------T--A
gi|47 : t-GT--CCC-AA-A---CT-GACTGC-G---TA-t
gi|5 : aaataatgtatgtaaattgtatacagctgtaGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TC--CA-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNNNNN----N-NN-NN--NNN-NN-N---NN-NNNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-A-A-GAT-TTC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--G-A-T-AA------------A--T-T----C-TT----CAA-TT-ATG----AA-ATT-G--AA-CACC---A---T--A-TATG----G----------C----A------TCT---AT-C-A-T----GTG---C--AT--TG----------A---------AA-CA-T---------AAT-T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAC--T---A-TAA-A--A------A------A------A-A-----AAAGA--A-AGA-TC--A--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TA---CA--GA-A---A--T-A---A-----AT-----C--------TA-CA--TTGA----A-A--TC--A-----------------------T---A--------T--AG-GT-TT-AA------GTAT-ATAA--------AG-TCTAAAAC-A-TATC-TGCA-A---GG---A-GAT-GG-TGT-ATTGAAATTTcagggtgtga
gi|50 : TA-C--CC---TGC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAA----T-TT-A----G--T-C-A-GAT-T
gi|6 : GAA-AT---CT-GTTATT-GG---G----CCAG--GC--G-AAAC-CGCT--A--G-----TCC---A-ATGAA-C-GG-GA-T---TC--CA-A------GTACA-C-CC-T--G------AA--GACTC--CGTATA----T-AT-GT--CCC-AA-----CT-GAC-GT-G---TA-ACGAAGT-----TTA-T--CG---CGC---TGC---A--AG-AC---CT------T----T-A-GGAAAG---T-TC-A----A--T-CAA-GAT-TT------TTTAGG-CA-TAT-TTT--T-AGT-GA------------A--A-T----A-TT----CAG-TT-ATT----AA-G-T-G--AC-CACC---AC--T--ACTA-G----A----------T----A-------GA---AT-C---T----GTG---C--AT--TG--------------------AA-CA-T---------AAT-T--T---------TA--AA----AT--A---AT-CGC--A---A--ATAA--A------A------A------C-A-----A---T--G-AAA-TT--A--AA---AACTAAATTCCAA--T----C--A--TG-TTG--TT-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA--TG---CA--GA-A---AGGT-A---A-----TG-----G--------TT-CA--ATAA----A-A--GC--A-----------------------T---ACATACATGT--AC-GTGTT-AG------TT---------------AG-ACTAACAC-A-TCCC-TGC
gi|7 : gGAA-AT---CC-GT-ATTTGG---G----CGAGA-GC--G-AAGC-CG----T--G-----TCC--CA-AT--A-G-GG-TT-T---TTGANN-N------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNNNNN----N-NN-NN--NNN-NN-N---NN-NNNNNN-N---NN-ACACA-T-----TTA-T--CC---CGT---TG----A--AG-AC---CT------T------A-GGAAA----T-TT-AA---G--T-C-A-GAT-TTC--A-ATCTG-G-CA-T-CGTTT--T-A-T-AA------------A--T-T----ATTT----CAGTTT-ATG----AA-ATT-GAAAA-AACC---A---T--A-TA-G----G----------C----A------GGT---ATCC-ATT----GTG---C--AT--TG--------------------AA-C--T---------AA--T--A---------TT--AT----AT--A---AT-CAT--A---A-TATAA--A------A------A------C-A-----A---T--A-ATA-TC--A--AA---AC-------CTAA--T----A--A--T--TT---TG-TT-G-----A-A--A--CT---GA----------AA--TG---TA--GACA---A--TAA---A-----AT-----C--------TATCA--TT-A----A-A--TT--A-----------------------T---A--------T--AG-GTGTT-AG------------------------A-ACTAAAACAA-TCCC-T-CA-C---G
gi|8 : g-----TTA-T--CC---CAC---TG----A--AG-AC---CT------T----T-T-GAAAA----A-TT------GTTT-T-G-GAT-TTC--A-G--TA-A-CA-T-C-TTT--G-A-T----------------------------------AG-TT-ATG-----A-ATT-G--A---ACC---A---T--A-TA-----------------C----A------ATT---GT-C-A-T----ATA------AT--TGTCATAATACCA---------AA-CA-TCAC------AAT-T--AAAGG-----GT--ATGAACATA-A---AT-AAT--A---A-AAT-G--A------A------A------C-ATGTACA---T--C-CGA-TC----------A--------TTAA-------A--A---G------TG-TT-G-----A-A--A--CT---G-----------AA---G---CA--GA-C---A--T-A---A-----AT-----C-----------------GA----A-A--GC--AATT--------------------T---A--------T--AC-ATA---AG------CTAT-ACGATAGCTGTCAG-ACCAATAC-A-CCCT-T--A-C---GG---ATGAC-GG-TGTCCTCGAAATTT
gi|9 : acagatttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-AT---CC-GT-ATT-GG---G----CGAG--GC--G-AAGC-CG----A--G-----TCC--CA-AT--A-C-GG-AT-T---TT--CANN------NNNNN-NNNN-N--N------NN--NNNNN--NNNNNN----N-NN-NN--NNN-NN-N---NN-NNNNNN-N---NN-NNNNN-N-----TTA-T--CC---CGC---TG-------AG-AC---CT------T----T-A-GGGAA----T-TT------G--T-C-A-GAT-ATC--A-ATCTA-G-CA-T-C-TTT--T-A---AA------------A--T-C----A-TT----CAA-TT--TGT---GC-ATT-G--AA----C---A---T--A--------------------------------------AT-T-A-T----AT-----------------------A---------AA-CG-C---------AA----------------T--AT----A----------------------------A------A------A------C-A-----A---T--G-AGA-TC--T--AA---A--------CTAA--T----A--A--TG-TT---TG-TT-G-----A-A--A--ATAAAA-----------AA--TG---GC--GA-A---G--T-AAACA-----AT-----G--------TGTCA--ATGA----A-T--GC--AGAAATAAATCTACATTGAAAGCAT---A--------TATAG-TTGTC-AG------TTAT-ATAA--------AG-AATAAAAC-A-TCCC-TGCA-C---GA---A-Gaagggccg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): GGAAGACCTACAACTTTGTGAATCGTGATGAGAGAGAATATAGAAAG
Unaligned ( gi|49 ): ACTATTAGTTACACAGTGAGTTTGTCATCCGAGGTGTGAAAT
Unaligned ( gi|51 ): AAAGATTTGAACCTGAATGAAATATGCAGGTCATT