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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-888 ) : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-C--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GN------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGN-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAC
gi|1 : TGCCG-TTTC-G-A-C-C--G--------A----GG--CGTTCC-CAT------C------TCAA---A------GAAA-CTGGA---A-C-C--G----AC-TAAC----CCCG--AAC---CCA--TA--TCT-AAGAC---G-GGAAAAACCC-T-TTGTGCC-CACTTCTG---------------------T-T--TT-T--T------C-TT-T--C-TG-G----TTGGGGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--CTACA-T-A-CC-T----------TG--------T------TTTA--------CCC--CGA--GG-GAGT-CCC
gi|10 : acaGATATTGCCG-TTTC-G-C-C-C--G--------G----GA--C------T-TTCCCTTC------T------A------GATA-C--GA---T-C-CA-G----AT-TG-C----CCTG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GG------CA-C-TTGTGCC-C-----CT---------------------T-T--GC-T--C------T-TC-T----TGAG----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--T-----T-A-AC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCA--CGG--AG-AAGT-GTCACcactgacgcact
gi|11 : GAGCTTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------A----TA--C------C-T------C------T------G------GAAA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-C---AC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTACC-A-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-TTGGTTTTG--TGG-------T------TTTG--------CCC--CGA--AG-TAGT-GCCAtggcat
gi|12 : gGAGATTGCTG-TTTC-G-A-C-A--G--------G----CA--T------T-T------C------C------GCTTCAAAACA-C--AA---T-C-CT-G----AC-TA-C----CCCG--A-C---CC---CA--TCT-AGA-C---G-GA------CA-C-TTGTACC-C-----TT---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGT-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TAG------AGT-GCCACacggc
gi|13 : gGAGATTGTCG-TTTC-G-C-C-C--G--------G----GA--C------T-T------CCCCTTTT------G------GACA-C--GA---T-A-CA-A----AC-TA-C----CTCG--A-C---CC---TA--TTT-AGG-C---A-GA------CA-C-TTGTTTC-T-----TA---------------------T-T---------------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCCCGCGG--AG-GAGT-GCCACtggcact
gi|14 : GAGATTGCTG-TTTC-G-C-C-A--G--------G----GA--C------T-T------CCCCTTGT------G------GACA-C--GA---T-A-AA-G----AC-TA-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-T---G-AA------CA-C-TTGTACC-C-----AG---------------------T-------T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---C-CT-T-GC--C-----C-A-TC-T----------TGT-------T------TTTA--------ACC--ACG--AT-GAGT-GCCACtggcat
gi|15 : gGATATTGCTG-TTTC-G-C-C-C--A--------G----GA--C------T-T------CCCCTTAT------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-A---CC---TA--TCT-AGA-C---G-GG------TA-T-TTGTTCC--------G---------------------T-T--GC-T--T------T-TT-T--A-TG-G----T---AGGC-TT-CGG---T-CT-T-GT--CTA---T-A-CC-T----------TGT-------T------TTCG--------CCC--CAG--AA-GAGT-GCCACtggcac
gi|16 : GATATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------TACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-T-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-TG-GC-T--T------T-TT-T--G-TA-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCtgg
gi|17 : gGATTGC-G-TT-C-GAC-T-CATG--------G----GA--C------C-T------C--------------------GGCA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-ATGTGCC-C-----CG---------------------T-T--GCAT--T------T-TC-TGAG-TG-G----T---GGGC-TT-CGAAGTT-CC-TCGCCGC-----TAA-CC-T----------TGG-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCactggtactc
gi|18 : gGATATTGCCA-TT-C-G-C-C-T--GATACACATG----TA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-T----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AAG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GT-T--T------T-TC-T--G-TA-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--T-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG--------T---------GG-TATT-GCCACact
gi|19 : tgGAGATTGCCA-TT-C-C-C-C-T--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-TGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGTC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CAG---T-CC-T-GC--A-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--TGG--AG-TAGT-GCCACtggc
gi|2 : gA--C------T-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TA-C----CCCG--A-T---CC---AA--ATT-CGG-C---G-GA------TT-T-TTGTGCC-C-----TGGGTTTTTTTTTTTTTTTGGTTT-T--GT-T--TTGGGTTT-TT-T--GTTG-G----T---TGGT-TT-TTG---C-CC-T-GC--C-----T-A-CT-T----------TGT-------A------TTTA--------CCCT-CAG--AA-TATT-GCCAtggtac
gi|20 : cctgggagttccGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------G----AG--C------C-T------C------T------G------ATCA-C--GA---T-TTCA-GC---ATGTG-C----GCC---A-C---CA---T---TCT-AGG-C---G-GT------CA-CATTGTGCC-C-----TG---------------------T-A--GC-T--T------T-TC----G-TG-G----T---GG-C-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCACttggcac
gi|21 : gGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------A----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-T--C----CCC---A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGAC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG--------TCC--CGG--AG-TAGT-GCCACtggtac
gi|22 : gCG-TT-C-G-C------G--------A----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---TGC-CA-G----AC-TG-CAAACCCCA--A-C---TC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-CCTTGT-CT-C-----TG---------------------TAT--GC-T--T------T-TC-T----TG------T---GGCT-TT-GGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-TTGGTTTTG--TGG-------T------TTTG--------CCC--CGGCAAA-TAG--GCCACtggcact
gi|23 : AGATTGTGG-TT-C-G-C-A-T--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GC---T-C-CA-G----AC-TG-T----CCCA--A-C---TC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGTC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG---------CC--TGG--AG-TAGT-GCCACtgg
gi|24 : GATATTGCCGAGT-C-G-T-C-T--G--------G-----A--C------C--------C------T------G------GACAGC--GA---T-T-CA------AC--G-C----GCCA--A-C---C----TA--TCT-AGG-A---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC----T------T-TC-T--G--G-G----T---GGGC-TT-CGAT--T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------C------TTTG---------CC--CGA--AG-TAGTCGCCACtggtac
gi|25 : tgAGAATGTCG-TT-C-G-C-C-A--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--AA---T-C-CA-G----AC-TG-C----TCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CT-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TG--------T------TTTG---------CC--CGG--AG-TAGT-GCCAtggta
gi|26 : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--A--------G----AA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GT--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCACatggta
gi|27 : GAGATTACCG-TTTC-G-C-C-T--G--------G----AA--C------T-T------CCCCTTTT------G------GACA-C--GA---T-T-AA-G----AC-TG-T----CCAG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GG------CA-C-TTGTGCC-C-----TA---------------------T-T--CC-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGAC-TT-AAG---T-CC-T-GT--T-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-
gi|28 : GAGAT-GCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------G----GA--C------C-T------A------T------G------GACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTG-C-C-----TG---------------------T-T--GT-T--T------T-TC-T--G-TG-G--------GGGC-TT-CGG---T-CCTT-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGA--AC-TAGT-ga
gi|29 : CCA-TT-CCA-C-C-C--G--------G----AA--C------T-T------CCTTTC-T------T------TACA-C--GA---T-C-CG-G----TC-T-------------A-C---TC---TA--ACT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------C-T--GC-T--T------T-TT-T--G----G----T---GAGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------A------TTTA--------CTC--CGG--AG-GAGT-GCCACtactg
gi|3 : ttACA-C--AAA--T-C-CT-G----AC-TA-C----CCCGCGA-C---CCCCATA--ACC-TGA-C---G-GA------CA-C-TTGTACC-C-----TG---------------------T-CTGGT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGT-TTTCGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CCTT----------TGT-------T------TTTA--------CCC--T----AG-GAGT-GCCACtggca
gi|30 : gacttgcttgtttcgacaggcatttccgccttcaaaaTGCCG-TT-C-A-A-C-T--G--------C----GA--C------C-T------CC-----T------G------GACA-C--GA---T---CA-G----ACTTG-C----GCCA--G-C---CC---TA--TCT-CAG-C---G-GT------CA-C-ATG-GCTGC-----TG-----------------------T--GC-T--T------T-TCTT--G-TG-GGCACTG--GGGC-TT-CGA---T-CC-T--C--C-----T-ATTC-T----------TG---------------TTTA--------CCC--CGG--Agggtggcact
gi|31 : gaCG-TT-C-G-CGC-T--G--------A----GATTC------T-C------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CATG----AC-T--C----CCTC--A-C---CC---TAC-TCTAAGG-CTCTG-GA------TA-C--TATTCC-C-----TG---------------------T-T--GC-TTCT------T-TC-T--C-T--G----T-----GC-TTCCGGT--T-CC-T-GC--tatcca
gi|32 : gtggattatta-C-C--G--------G----GA--CGTC---C-C------C------TTCA---A------GACA-C--GA---T-T-CT-G----AC-TA-C----CTCG--A-C---CC---TA--TCT-AGA-T---G-GA------CA-C-TTGTGCC-G-----TT---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-G--T-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CC-T-TC--C-----T-A-CC-T----------tcaatcctaccc
gi|33 : a-TT-C-A-C-T-C--G--------G----GA--C------T-TTTT---C------T------G------GATA-T--GA---T-T-CG-G----AC-TA-C----CCCG--A-C---TC---TA--TAT-CGG-C---G-AG------CA-C-TTGTGCT-C-----TG---------------------C-T--GC-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGG-TT-TGG---C-CC-T-GT--C-----T-A-CT-T----------TGaaggtattcccttaccccag
gi|34 : ctgtTTGCCA-TTTC-G-C-C-C--A--------G----TA--C------T-T------CCCCTTTT------G------GACA-C--GA---T-C-CA-A----AA-TG-C----CCCG--A-C---CG---TA--TCT-AGG-C---G-TG------CA-C-TTAAGCC-C-----TG---------------------T-T--AC-T--T------T-TC-T--T-TG-G---------------------------T-GC--C-----T-A-TC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCtatt
gi|35 : ----CCCG--A-C---CC---CA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------C-T--GC-T--T------T-CC-T--T-TGAG----T----GAC-TT-CGG---C-CC-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TG
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gi|37 : ------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TT-C----TCCA--A-C---CG---TA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCT-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------TATC-T----T--G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----
gi|38 : ----CCCG--A-C---CT---AA--CCT-AGG-C--------------------------------TG---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-T--C-TG-G----T---GGGT-TT----------C-T-GC--C-----A-A-TT-T----------TAT-------TA-----TTTA--------CTC--CAG--AC-GAGT-GTCAC
gi|39 : -T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGAC-TT-CGG---T-CG-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GACACtg
gi|4 : TGCCG-CT-C-G-C-A-T--A--------GAGAGGG--C------A-TA-----C------T------G------GACAAC--GAAATT-C-TA-GG---AC-TG-C----CCCA--A-TTAGCG---TAATTCT-AGG-C---GCGT------CA-C-TTTAGCT-C------G---------------------T----GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CCTT-GC--C-----T-A-CC-CTTGGTTTTTGTGG-------T------TTTG--------CCC--CGG--AGTTAGT-GCCACtggcact
gi|40 : GAGATTGCTG-TT-C-G-C-A-T--G--------A----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-GACGTAC-TG-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---tggca
gi|41 : tgC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGAC-TT-CGG---T-CG-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GACAC
gi|42 : -TG-A----T---GGGCCTT-CAA---C-CC-T-GC--C-----T-A-CA-T----------TGT-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCACtggcac
gi|43 : atGGT-TT-CAG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTGTGATTTTTCCC--CAG--AG-TAAT-GCCACtgacact
gi|44 : C-TT-CGG---TGCC-TCGC--C-----T-AACC-T----------TGGGTTGTGGT------TTTA--------CCC---GG--AG-TAGT-GCCACtggcact
gi|45 : GAGATTGCCG-TT-T-C-CAC-C--G--------G----GA--C------G-T------C------CATTTCAA------GACA-C--GA---T-tggact
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gi|6 : gAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------A----GA--C------C-TT-----C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-C---TC---TAAATCT-AGG-C---G-GT------CAAC-TTGGTCT-C-----TGA--------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CC-T-GC--C-----TAA-CC-T----------TGG-------TTTTGTGTTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAttggacac
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gi|8 : GAGATTGCCG-TTTC-A-A-C-C--G--------G----GA--CGT----CAT------C------TTCA---A------GACA-C--GA---T-T-CG-G----AC-TA-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGA-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TT---------------------T-G--GT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CAG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TGG--AG-GAGT-GCCACtggcact
gi|9 : ATCGCCT-TTTC-G-A-C-C--G--------G----GA--CATCCCCT-T------C------C------A------GACA-C--AA---T-C-CG-G----AC-TA-C----TCCG--A-A---GC---TA--TCT-AGA-C---A-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TT---------------------C-T--GC-T--T------T-TC-C--T-TG-A----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TAG--AA-AAGT-GCCACtggcac
Alignments
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consensus : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-C--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GN------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGN-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAC
Reference ( family-888 ) : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-C--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GN------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGN-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAC
gi|1 : TGCCG-TTTC-G-A-C-C--G--------A----GG--CGTTCC-CAT------C------TCAA---A------GAAA-CTGGA---A-C-C--G----AC-TAAC----CCCG--AAC---CCA--TA--TCT-AAGAC---G-GGAAAAACCC-T-TTGTGCC-CACTTCTG---------------------T-T--TT-T--T------C-TT-T--C-TG-G----TTGGGGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--CTACA-T-A-CC-T----------TG--------T------TTTA--------CCC--CGA--GG-GAGT-CCC
gi|10 : acaGATATTGCCG-TTTC-G-C-C-C--G--------G----GA--C------T-TTCCCTTC------T------A------GATA-C--GA---T-C-CA-G----AT-TG-C----CCTG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GG------CA-C-TTGTGCC-C-----CT---------------------T-T--GC-T--C------T-TC-T----TGAG----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--T-----T-A-AC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCA--CGG--AG-AAGT-GTCACcactgacgcact
gi|11 : GAGCTTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------A----TA--C------C-T------C------T------G------GAAA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-C---AC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTACC-A-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-TTGGTTTTG--TGG-------T------TTTG--------CCC--CGA--AG-TAGT-GCCAtggcat
gi|12 : gGAGATTGCTG-TTTC-G-A-C-A--G--------G----CA--T------T-T------C------C------GCTTCAAAACA-C--AA---T-C-CT-G----AC-TA-C----CCCG--A-C---CC---CA--TCT-AGA-C---G-GA------CA-C-TTGTACC-C-----TT---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGT-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TAG------AGT-GCCACacggc
gi|13 : gGAGATTGTCG-TTTC-G-C-C-C--G--------G----GA--C------T-T------CCCCTTTT------G------GACA-C--GA---T-A-CA-A----AC-TA-C----CTCG--A-C---CC---TA--TTT-AGG-C---A-GA------CA-C-TTGTTTC-T-----TA---------------------T-T---------------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCCCGCGG--AG-GAGT-GCCACtggcact
gi|14 : GAGATTGCTG-TTTC-G-C-C-A--G--------G----GA--C------T-T------CCCCTTGT------G------GACA-C--GA---T-A-AA-G----AC-TA-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-T---G-AA------CA-C-TTGTACC-C-----AG---------------------T-------T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---C-CT-T-GC--C-----C-A-TC-T----------TGT-------T------TTTA--------ACC--ACG--AT-GAGT-GCCACtggcat
gi|15 : gGATATTGCTG-TTTC-G-C-C-C--A--------G----GA--C------T-T------CCCCTTAT------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-A---CC---TA--TCT-AGA-C---G-GG------TA-T-TTGTTCC--------G---------------------T-T--GC-T--T------T-TT-T--A-TG-G----T---AGGC-TT-CGG---T-CT-T-GT--CTA---T-A-CC-T----------TGT-------T------TTCG--------CCC--CAG--AA-GAGT-GCCACtggcac
gi|16 : GATATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------TACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-T-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-TG-GC-T--T------T-TT-T--G-TA-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCtgg
gi|17 : gGATTGC-G-TT-C-GAC-T-CATG--------G----GA--C------C-T------C--------------------GGCA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-ATGTGCC-C-----CG---------------------T-T--GCAT--T------T-TC-TGAG-TG-G----T---GGGC-TT-CGAAGTT-CC-TCGCCGC-----TAA-CC-T----------TGG-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCactggtactc
gi|18 : gGATATTGCCA-TT-C-G-C-C-T--GATACACATG----TA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-T----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AAG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GT-T--T------T-TC-T--G-TA-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--T-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG--------T---------GG-TATT-GCCACact
gi|19 : tgGAGATTGCCA-TT-C-C-C-C-T--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-TGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGTC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CAG---T-CC-T-GC--A-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--TGG--AG-TAGT-GCCACtggc
gi|2 : gA--C------T-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TA-C----CCCG--A-T---CC---AA--ATT-CGG-C---G-GA------TT-T-TTGTGCC-C-----TGGGTTTTTTTTTTTTTTTGGTTT-T--GT-T--TTGGGTTT-TT-T--GTTG-G----T---TGGT-TT-TTG---C-CC-T-GC--C-----T-A-CT-T----------TGT-------A------TTTA--------CCCT-CAG--AA-TATT-GCCAtggtac
gi|20 : cctgggagttccGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------G----AG--C------C-T------C------T------G------ATCA-C--GA---T-TTCA-GC---ATGTG-C----GCC---A-C---CA---T---TCT-AGG-C---G-GT------CA-CATTGTGCC-C-----TG---------------------T-A--GC-T--T------T-TC----G-TG-G----T---GG-C-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCACttggcac
gi|21 : gGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------A----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-T--C----CCC---A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGAC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG--------TCC--CGG--AG-TAGT-GCCACtggtac
gi|22 : gCG-TT-C-G-C------G--------A----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---TGC-CA-G----AC-TG-CAAACCCCA--A-C---TC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-CCTTGT-CT-C-----TG---------------------TAT--GC-T--T------T-TC-T----TG------T---GGCT-TT-GGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-TTGGTTTTG--TGG-------T------TTTG--------CCC--CGGCAAA-TAG--GCCACtggcact
gi|23 : AGATTGTGG-TT-C-G-C-A-T--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GC---T-C-CA-G----AC-TG-T----CCCA--A-C---TC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGTC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG---------CC--TGG--AG-TAGT-GCCACtgg
gi|24 : GATATTGCCGAGT-C-G-T-C-T--G--------G-----A--C------C--------C------T------G------GACAGC--GA---T-T-CA------AC--G-C----GCCA--A-C---C----TA--TCT-AGG-A---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC----T------T-TC-T--G--G-G----T---GGGC-TT-CGAT--T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------C------TTTG---------CC--CGA--AG-TAGTCGCCACtggtac
gi|25 : tgAGAATGTCG-TT-C-G-C-C-A--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--AA---T-C-CA-G----AC-TG-C----TCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CT-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TG--------T------TTTG---------CC--CGG--AG-TAGT-GCCAtggta
gi|26 : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--A--------G----AA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GT--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCACatggta
gi|27 : GAGATTACCG-TTTC-G-C-C-T--G--------G----AA--C------T-T------CCCCTTTT------G------GACA-C--GA---T-T-AA-G----AC-TG-T----CCAG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GG------CA-C-TTGTGCC-C-----TA---------------------T-T--CC-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGAC-TT-AAG---T-CC-T-GT--T-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-
gi|28 : GAGAT-GCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------G----GA--C------C-T------A------T------G------GACA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----GCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTG-C-C-----TG---------------------T-T--GT-T--T------T-TC-T--G-TG-G--------GGGC-TT-CGG---T-CCTT-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGA--AC-TAGT-ga
gi|29 : CCA-TT-CCA-C-C-C--G--------G----AA--C------T-T------CCTTTC-T------T------TACA-C--GA---T-C-CG-G----TC-T-------------A-C---TC---TA--ACT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------C-T--GC-T--T------T-TT-T--G----G----T---GAGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------A------TTTA--------CTC--CGG--AG-GAGT-GCCACtactg
gi|3 : ttACA-C--AAA--T-C-CT-G----AC-TA-C----CCCGCGA-C---CCCCATA--ACC-TGA-C---G-GA------CA-C-TTGTACC-C-----TG---------------------T-CTGGT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGT-TTTCGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CCTT----------TGT-------T------TTTA--------CCC--T----AG-GAGT-GCCACtggca
gi|30 : gacttgcttgtttcgacaggcatttccgccttcaaaaTGCCG-TT-C-A-A-C-T--G--------C----GA--C------C-T------CC-----T------G------GACA-C--GA---T---CA-G----ACTTG-C----GCCA--G-C---CC---TA--TCT-CAG-C---G-GT------CA-C-ATG-GCTGC-----TG-----------------------T--GC-T--T------T-TCTT--G-TG-GGCACTG--GGGC-TT-CGA---T-CC-T--C--C-----T-ATTC-T----------TG---------------TTTA--------CCC--CGG--Agggtggcact
gi|31 : gaCG-TT-C-G-CGC-T--G--------A----GATTC------T-C------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CATG----AC-T--C----CCTC--A-C---CC---TAC-TCTAAGG-CTCTG-GA------TA-C--TATTCC-C-----TG---------------------T-T--GC-TTCT------T-TC-T--C-T--G----T-----GC-TTCCGGT--T-CC-T-GC--tatcca
gi|32 : gtggattatta-C-C--G--------G----GA--CGTC---C-C------C------TTCA---A------GACA-C--GA---T-T-CT-G----AC-TA-C----CTCG--A-C---CC---TA--TCT-AGA-T---G-GA------CA-C-TTGTGCC-G-----TT---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-G--T-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CC-T-TC--C-----T-A-CC-T----------tcaatcctaccc
gi|33 : a-TT-C-A-C-T-C--G--------G----GA--C------T-TTTT---C------T------G------GATA-T--GA---T-T-CG-G----AC-TA-C----CCCG--A-C---TC---TA--TAT-CGG-C---G-AG------CA-C-TTGTGCT-C-----TG---------------------C-T--GC-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGG-TT-TGG---C-CC-T-GT--C-----T-A-CT-T----------TGaaggtattcccttaccccag
gi|34 : ctgtTTGCCA-TTTC-G-C-C-C--A--------G----TA--C------T-T------CCCCTTTT------G------GACA-C--GA---T-C-CA-A----AA-TG-C----CCCG--A-C---CG---TA--TCT-AGG-C---G-TG------CA-C-TTAAGCC-C-----TG---------------------T-T--AC-T--T------T-TC-T--T-TG-G---------------------------T-GC--C-----T-A-TC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCtatt
gi|35 : ----CCCG--A-C---CC---CA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------C-T--GC-T--T------T-CC-T--T-TGAG----T----GAC-TT-CGG---C-CC-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TG
gi|36 : AGTGATTGCCG-TTTC-G-C-T-T--G--------G----GA--C------T-TTTCCTTC------T------G------GACA-C--GA---T-C-CG-G----AC-TA-C----CCCG--A-T---CC---TT--TGT-AGT-C---G-GG------CG-C-TTGTGCC-C-----taggtgccactggcact
gi|37 : ------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TT-C----TCCA--A-C---CG---TA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCT-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------TATC-T----T--G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----
gi|38 : ----CCCG--A-C---CT---AA--CCT-AGG-C--------------------------------TG---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-T--C-TG-G----T---GGGT-TT----------C-T-GC--C-----A-A-TT-T----------TAT-------TA-----TTTA--------CTC--CAG--AC-GAGT-GTCAC
gi|39 : -T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGAC-TT-CGG---T-CG-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GACACtg
gi|4 : TGCCG-CT-C-G-C-A-T--A--------GAGAGGG--C------A-TA-----C------T------G------GACAAC--GAAATT-C-TA-GG---AC-TG-C----CCCA--A-TTAGCG---TAATTCT-AGG-C---GCGT------CA-C-TTTAGCT-C------G---------------------T----GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CCTT-GC--C-----T-A-CC-CTTGGTTTTTGTGG-------T------TTTG--------CCC--CGG--AGTTAGT-GCCACtggcact
gi|40 : GAGATTGCTG-TT-C-G-C-A-T--G--------A----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-GACGTAC-TG-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---tggca
gi|41 : tgC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGAC-TT-CGG---T-CG-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GACAC
gi|42 : -TG-A----T---GGGCCTT-CAA---C-CC-T-GC--C-----T-A-CA-T----------TGT-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCACtggcac
gi|43 : atGGT-TT-CAG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTGTGATTTTTCCC--CAG--AG-TAAT-GCCACtgacact
gi|44 : C-TT-CGG---TGCC-TCGC--C-----T-AACC-T----------TGGGTTGTGGT------TTTA--------CCC---GG--AG-TAGT-GCCACtggcact
gi|45 : GAGATTGCCG-TT-T-C-CAC-C--G--------G----GA--C------G-T------C------CATTTCAA------GACA-C--GA---T-tggact
gi|5 : tgGAAGCTGCCG-TTTC-G-A-CAC--G--------A----GG--C------G-T------C------CCATTCAA------GAAA-C--G----T-C-CG-G----AC-TA-C----CCCG--A-C---CT---AA--TCT-AGA-C---G-GA------AA-C-TTGTGCA-C-----TT---------------------C-T--GT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--TACATGT-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCA
gi|6 : gAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--G--------A----GA--C------C-TT-----C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCA--A-C---TC---TAAATCT-AGG-C---G-GT------CAAC-TTGGTCT-C-----TGA--------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CC-T-GC--C-----TAA-CC-T----------TGG-------TTTTGTGTTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAttggacac
gi|7 : GAGATTGCCG-TT-TTG-C-C-C--G--------G----GA--C------T-T------CCCCTTCT------G------AATA-C--GA---T-T-CA-G----AC-TG-C----CCCG--A-C---CA---TA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--T-TG-A----T---GGGT-TT-CGT---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCACactggcac
gi|8 : GAGATTGCCG-TTTC-A-A-C-C--G--------G----GA--CGT----CAT------C------TTCA---A------GACA-C--GA---T-T-CG-G----AC-TA-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGA-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TT---------------------T-G--GT-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CAG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TGG--AG-GAGT-GCCACtggcact
gi|9 : ATCGCCT-TTTC-G-A-C-C--G--------G----GA--CATCCCCT-T------C------C------A------GACA-C--AA---T-C-CG-G----AC-TA-C----TCCG--A-A---GC---TA--TCT-AGA-C---A-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TT---------------------C-T--GC-T--T------T-TC-C--T-TG-A----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TAG--AA-AAGT-GCCACtggcac
blockSeqs : A T C A G CAT ATACACAT AGAG TT TTTCCCTTCT CTTCAA G . AAT G T T ACGT G . AAAC GCG . TAG CCA AT A . TCT C G A A G . GGTTTTTTTTTTTTTTTGGTT A TG A TC TGGGTT A T GAG A GCAC G T AGT T C CG ACATG A T T TTGGTTTTTG GGTTGTGG TTTGTG TGATTTTT CG CA TT C
blockSeqs : . T T . A AC . . . TTCCCCTTTT . A . A . . . C T . . G . . . AA . . . . T . C . . A . G . . . . . GT A . . C T T C . TA A A . TGGTTTTG T A . T . A .
blockSeqs : . T . . . C . . . TTCCCCTTGT . . . . . . . G . . . A . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . TGGTTTTG G . . . . T .
blockSeqs : . T . . . T . . . TTCCCCTTAT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . T . . . A . . . TTCCCCTTTT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . T . . . C . . . GTCCCCTTCA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . T . . . A . . . TTCCCCTTTT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . . T .
blockSeqs : . T . . . C . . . TTTTCCTTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . T .
blockSeqs : . T . . . T . . . GTCCATTTCA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . T . . . T . . . GTCCCATTCA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . T . . . T . . . TTCCCCTTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . GTCATCTTCA . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . ATCCCCTTCC . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . TTCCTTTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . TTTTTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . A . . . CTCCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . ATACT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . T .
blockSeqs : . . . . . C . . . TTCC . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . G .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . . . . . C . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . T .
blockSeqs : . . . . . C . . . TTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . T .
blockSeqs : . . . . . C . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . G .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . . . . . C . . . CTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . T .
blockSeqs : . . . . . T . . . CTCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . G .
blockSeqs : . . . . . C . . . CTAT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . G .
blockSeqs : . . . . . C . . . TCCT . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . A .
blockSeqs : . . . . . C . . . CTCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CTC . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . CCT . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : CTCCTTCT********************* ** *** N****** ***** *** ***** N*******
originalCons : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-C--G--------G----GA--C------C-T------C------T------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GN------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGN-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAC
finalCons : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-C--G--------G----GA--CCTCCTTCT---------------------G------GACA-C--GA---T-C-CA-G----AC-TG-C----CCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GN------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GC-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGN-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAC
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Reference ( family-888 ) : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-C--GG-GAC--C---T--C--C--TT-CT---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TG-C----CCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GN------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGN-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAC
gi|1 : TGCCG-TTTC-G-A-C-C--GA-GGC--G---TTCC--C--AT-CTCAAAGAAA-CTGGA---A-C-C--G-AC----TAAC----CCCG--AAC---CCA--TA--TCT-AAGAC---G-GGAAAAACCC-T-TTGTGCC-CACTTCTG---------------------T-T--T-T-T--T------C-TT-T--C-TG-G----TTGGGGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--CTACA-T-A-CC-T----------TG--------T------TTTA--------CCC--CGA--GG-GAGT-CCC
gi|10 : acaGATATTGCCG-TTTC-G-C-C-C--GG-GAC--T---TTCC--C--TT-CT---AGATA-C--GA---T-C-CA-G-AT----TG-C----CCTG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GG------CA-C-TTGTGCC-C-----CT---------------------T-T--G-C-T--C------T-TC-T----TGAG----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--T-----T-A-AC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCA--CGG--AG-AAGT-GTCACcactgacgcact
gi|11 : GAGCTTGCCG-TT-C-G-C-C-T--GA-TAC--C---T--C---------T---GGAAA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TG-C----CCCA--A-C---AC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTACC-A-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-TTGGTTTTG--TGG-------T------TTTG--------CCC--CGA--AG-TAGT-GCCAtggcat
gi|12 : gGAGATTGCTG-TTTC-G-A-C-A--GG-CAT--T---T--C--CGCTT-CA---AAACA-C--AA---T-C-CT-G-AC----TA-C----CCCG--A-C---CC---CA--TCT-AGA-C---G-GA------CA-C-TTGTACC-C-----TT---------------------C-T--G-T-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGT-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TAG------AGT-GCCACacggc
gi|13 : gGAGATTGTCG-TTTC-G-C-C-C--GG-GACTTC---C--C--C--TT-TT---GGACA-C--GA---T-A-CA-A-AC----TA-C----CTCG--A-C---CC---TA--TTT-AGG-C---A-GA------CA-C-TTGTTTC-T-----TA---------------------T-T----------------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCCCGCGG--AG-GAGT-GCCACtggcact
gi|14 : GAGATTGCTG-TTTC-G-C-C-A--GG-GACTTC---C--C--C--TT-GT---GGACA-C--GA---T-A-AA-G-AC----TA-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-T---G-AA------CA-C-TTGTACC-C-----AG---------------------T--------T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---C-CT-T-GC--C-----C-A-TC-T----------TGT-------T------TTTA--------ACC--ACG--AT-GAGT-GCCACtggcat
gi|15 : gGATATTGCTG-TTTC-G-C-C-C--AG-GACTTC---C--C--C--TT-AT---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TG-C----CCCA--A-A---CC---TA--TCT-AGA-C---G-GG------TA-T-TTGTTCC--------G---------------------T-T--G-C-T--T------T-TT-T--A-TG-G----T---AGGC-TT-CGG---T-CT-T-GT--CTA---T-A-CC-T----------TGT-------T------TTCG--------CCC--CAG--AA-GAGT-GCCACtggcac
gi|16 : GATATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--GG-GAC--C---T--C---------T---GTACA-C--GA---T-T-CA-G-AC----TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-T-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--GGC-T--T------T-TT-T--G-TA-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCtgg
gi|17 : gGATTGC-G-TT-C-GAC-T-CATGG-GAC--C---T--C--------------GGCA-C--GA---T-T-CA-G-AC----TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-ATGTGCC-C-----CG---------------------T-T--G-CAT--T------T-TC-TGAG-TG-G----T---GGGC-TT-CGAAGTT-CC-TCGCCGC-----TAA-CC-T----------TGG-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCactggtactc
gi|18 : gGATATTGCCA-TT-C-G-C-C-T--GA-TACA-CATGT--A--C--CT-CT---GGACA-C--GA---T-T-CA-G-AC----TG-T----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AAG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-T-T--T------T-TC-T--G-TA-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--T-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG--------T---------GG-TATT-GCCACact
gi|19 : tgGAGATTGCCA-TT-C-C-C-C-T--GG-GAC--C---T--C---------T---GGACA-C--GA---T-T-CA-G-AC----TG-C----GCCA--A-C---CC---TA--TCT-TGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGTC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CAG---T-CC-T-GC--A-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--TGG--AG-TAGT-GCCACtggc
gi|2 : g-C-C-T--GG-GAG--T---T--C--CACTT-CT---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TA-C----CCCG--A-T---CC---AA--ATT-CGG-C---G-GA------TT-T-TTGTGCC-C-----TGGGTTTTTTTTTTTTTTTGGTTT-T--G-T-T--TTGGGTTT-TT-T--GTTG-G----T---TGGT-TT-TTG---C-CC-T-GC--C-----T-A-CT-T----------TGT-------A------TTTA--------CCCT-CAG--AA-TATT-GCCAtggtac
gi|20 : GAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--GG-AGC--C---T--C---------T---GATCA-C--GA---T-TTCA-GCATG---TG-C----GCC---A-C---CA---T---TCT-AGG-C---G-GT------CA-CATTGTGCC-C-----TG---------------------T-A--G-C-T--T------T-TC----G-TG-G----T---GG-C-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCACttggcac
gi|21 : gGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--GA-GAC--C---T--C---------T---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----T--C----CCC---A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGAC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG--------TCC--CGG--AG-TAGT-GCCACtggtac
gi|22 : gCG-TT-C-G-C------GA-GAC--C---T--C---------T---GGACA-C--GA---TGC-CA-G-AC----TG-CAAACCCCA--A-C---TC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-CCTTGT-CT-C-----TG---------------------TAT--G-C-T--T------T-TC-T----TG------T---GGCT-TT-GGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-TTGGTTTTG--TGG-------T------TTTG--------CCC--CGGCAAA-TAG--GCCACtggcact
gi|23 : AGATTGTGG-TT-C-G-C-A-T--GG-GAC--C---T--C---------T---GGACA-C--GC---T-C-CA-G-AC----TG-T----CCCA--A-C---TC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGTC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTG---------CC--TGG--AG-TAGT-GCCACtgg
gi|24 : GATATTGCCGAGT-C-G-T-C-T--GG--AC--C---------------CT---GGACAGC--GA---T-T-CA---AC-----G-C----GCCA--A-C---C----TA--TCT-AGG-A---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-C----T------T-TC-T--G--G-G----T---GGGC-TT-CGAT--T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------C------TTTG---------CC--CGA--AG-TAGTCGCCACtggtac
gi|25 : tgAGAATGTCG-TT-C-G-C-C-A--GG-GAC--C---T--C---------T---GGACA-C--AA---T-C-CA-G-AC----TG-C----TCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CT-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TG--------T------TTTG---------CC--CGG--AG-TAGT-GCCAtggta
gi|26 : AGAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--AG-AAC--C---T--C---------T---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TG-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GT--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCACatggta
gi|27 : GAGATTACCG-TTTC-G-C-C-T--GG-AACTTC---C--C--C--TT-TT---GGACA-C--GA---T-T-AA-G-AC----TG-T----CCAG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GG------CA-C-TTGTGCC-C-----TA---------------------T-T--C-C-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGAC-TT-AAG---T-CC-T-GT--T-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-
gi|28 : GAGAT-GCCG-TT-C-G-C-C-T--GG-GAC--C---T--A---------T---GGACA-C--GA---T-T-CA-G-AC----TG-C----GCCG--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---G-GT------CA-C-TTGTG-C-C-----TG---------------------T-T--G-T-T--T------T-TC-T--G-TG-G--------GGGC-TT-CGG---T-CCTT-GC--C-----T-A-CC-T----------TGA-------T------TTTG--------CCC--CGA--AC-TAGT-ga
gi|29 : CCA-TT-CCA-C-C-C--GG-AAC--T---T--C--C--TTTCT---TTACA-C--GA---T-C-CG-G-TC----T-------------A-C---TC---TA--ACT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------C-T--G-C-T--T------T-TT-T--G----G----T---GAGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------A------TTTA--------CTC--CGG--AG-GAGT-GCCACtactg
gi|3 : ttACA-C--AAA--T-C-CT-G-AC----TA-C----CCCGCGA-C---CCCCATA--ACC-TGA-C---G-GA------CA-C-TTGTACC-C-----TG---------------------T-CTGG-T-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGT-TTTCGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CCTT----------TGT-------T------TTTA--------CCC--T----AG-GAGT-GCCACtggca
gi|30 : gacttgcttgtttcgacaggcatttccgccttcaaaaTGCCG-TT-C-A-A-C-T--GC-GAC--C---T--C--C--T-------GGACA-C--GA---T---CA-G-ACT---TG-C----GCCA--G-C---CC---TA--TCT-CAG-C---G-GT------CA-C-ATG-GCTGC-----TG-----------------------T--G-C-T--T------T-TCTT--G-TG-GGCACTG--GGGC-TT-CGA---T-CC-T--C--C-----T-ATTC-T----------TG---------------TTTA--------CCC--CGG--Agggtggcact
gi|31 : gaCG-TT-C-G-CGC-T--GA-GA-------T--T--C--TC-CT---GGACA-C--GA---T-C-CATG-AC----T--C----CCTC--A-C---CC---TAC-TCTAAGG-CTCTG-GA------TA-C--TATTCC-C-----TG---------------------T-T--G-C-TTCT------T-TC-T--C-T--G----T-----GC-TTCCGGT--T-CC-T-GC--tatcca
gi|32 : gtggattatta-C-C--GG-GACGTC---C--C--C--TT-CA---AGACA-C--GA---T-T-CT-G-AC----TA-C----CTCG--A-C---CC---TA--TCT-AGA-T---G-GA------CA-C-TTGTGCC-G-----TT---------------------C-T--G-T-T--T------T-TC-G--T-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CC-T-TC--C-----T-A-CC-T----------tcaatcctaccc
gi|33 : a-TT-C-A-C-T-C--GG-GAC--T---T--T-----TT-CT---GGATA-T--GA---T-T-CG-G-AC----TA-C----CCCG--A-C---TC---TA--TAT-CGG-C---G-AG------CA-C-TTGTGCT-C-----TG---------------------C-T--G-C-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGG-TT-TGG---C-CC-T-GT--C-----T-A-CT-T----------TGaaggtattcccttaccccag
gi|34 : ctgtTTGCCA-TTTC-G-C-C-C--AG-TACTTC---C--C--C--TT-TT---GGACA-C--GA---T-C-CA-A-AA----TG-C----CCCG--A-C---CG---TA--TCT-AGG-C---G-TG------CA-C-TTAAGCC-C-----TG---------------------T-T--A-C-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---G---------------------C--C-----T-A-TC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCtatt
gi|35 : ----CCCG--A-C---CC---CA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------C-T--G-C-T--T------T-CC-T--T-TGAG----T----GAC-TT-CGG---C-CC-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TG
gi|36 : AGTGATTGCCG-TTTC-G-C-T-T--GG-GAC--T---TTTC--C--TT-CT---GGACA-C--GA---T-C-CG-G-AC----TA-C----CCCG--A-T---CC---TT--TGT-AGT-C---G-GG------CG-C-TTGTGCC-C-----taggtgccactggcact
gi|37 : -CT---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TT-C----TCCA--A-C---CG---TA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCT-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------TATC-T----T--G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----
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gi|4 : TGCCG-CT-C-G-C-A-T--AGAGAG--G---G--C--A--TA-CT---GGACAAC--GAAATT-C-TA-GGAC----TG-C----CCCA--A-TTAGCG---TAATTCT-AGG-C---GCGT------CA-C-TTTAGCT-C------G---------------------T----G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CCTT-GC--C-----T-A-CC-CTTGGTTTTTGTGG-------T------TTTG--------CCC--CGG--AGTTAGT-GCCACtggcact
gi|40 : GAGATTGCTG-TT-C-G-C-A-T--GA-GAC--C---T--C---------T---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-ACGTACTG-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGG-C---tggca
gi|41 : tg-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGAC-TT-CGG---T-CG-T-AC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-TAGT-GACAC
gi|42 : -TG-A----T---GGGCCTT-CAA---C-CC-T-GC--C-----T-A-CA-T----------TGT-------A------TTTA--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCACtggcac
gi|43 : atGGT-TT-CAG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGG-------T------TTTGTGATTTTTCCC--CAG--AG-TAAT-GCCACtgacact
gi|44 : C-TT-CGG---TGCC-TCGC--C-----T-AACC-T----------TGGGTTGTGGT------TTTA--------CCC---GG--AG-TAGT-GCCACtggcact
gi|45 : GAGATTGCCG-TT-T-C-CAC-C--GG-GAC--G---T--C--CATTT-CA---AGACA-C--GA---T-tggact
gi|5 : tgGAAGCTGCCG-TTTC-G-A-CAC--GA-GGC--G---T--C--CCATT-CA---AGAAA-C--G----T-C-CG-G-AC----TA-C----CCCG--A-C---CT---AA--TCT-AGA-C---G-GA------AA-C-TTGTGCA-C-----TT---------------------C-T--G-T-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--TACATGT-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCA
gi|6 : gAGATTGCCG-TT-C-G-C-C-T--GA-GAC--C---T---------T-CT---GGACA-C--GA---T-C-CA-G-AC----TG-C----CCCA--A-C---TC---TAAATCT-AGG-C---G-GT------CAAC-TTGGTCT-C-----TGA--------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--G-TG-G----T---GGGC-TT-TGG---T-CC-T-GC--C-----TAA-CC-T----------TGG-------TTTTGTGTTTG--------CCC--CGG--AG-TAGT-GCCAttggacac
gi|7 : GAGATTGCCG-TT-TTG-C-C-C--GG-GACTTC---C--C--C--TT-CT---GAATA-C--GA---T-T-CA-G-AC----TG-C----CCCG--A-C---CA---TA--TCT-AGG-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TG---------------------T-T--G-C-T--T------T-TC-T--T-TG-A----T---GGGT-TT-CGT---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTG--------CCC--CGG--AG-GAGT-GCCACactggcac
gi|8 : GAGATTGCCG-TTTC-A-A-C-C--GG-GAC--G---T--CATC--TT-CA---AGACA-C--GA---T-T-CG-G-AC----TA-C----CCCA--A-C---CC---TA--TCT-AGA-C---G-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TT---------------------T-G--G-T-T--T------T-TC-T--T-TG-G----T---GGGC-TT-CAG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TGG--AG-GAGT-GCCACtggcact
gi|9 : ATCGCCT-TTTC-G-A-C-C--GG-GACATC---C--C--C--TT-CC---AGACA-C--AA---T-C-CG-G-AC----TA-C----TCCG--A-A---GC---TA--TCT-AGA-C---A-GA------CA-C-TTGTGCC-C-----TT---------------------C-T--G-C-T--T------T-TC-C--T-TG-A----T---GGGC-TT-CGG---T-CC-T-GC--C-----T-A-CC-T----------TGT-------T------TTTA--------CCC--TAG--AA-AAGT-GCCACtggcac