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Alignments
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Reference ( family-885 ) : AACGAATGTGTA-CAGCT-ATA-ATGAATTT-AGATCTTAATCTAAACTCAACGTNTA-C-CTAGCAA-GTTATTAACG-GTT-TTG---TTT-GA--TTTTT---TTAA--TTCTT-CGTGCG-TTG-----TAT--------T-TA-G-ATAAGTATTATA---ACAGCA----TG-C-ATCAGTT------ACAT--------AAATTCTTTTT----G--TA-TATT-T---T-GTGCATGCATGTGTGTGT--TTGTTCTCT---ATAAGA-CTCCT---TAGCAGTAATATTTCAGAGG--GTATGCCA-CGT-ACATATCAG--------------------T-A-CAC--T--ATT-ATACTCAAAATGCTTCTTTTTC--AA-TGAGCAAAGATGTATA----TACATAA-TATA-CCGAAATCAA-TTCCTAGT-AGT-TTA-TTGAAA-TGTGCATTATAATGAAAT-ACATCATGATCGA--TTTCCTTAACTCTTCCTT-GCGGTG-AATTGTCATTTGTTAATATT--AATGCAATTAAAAA--T-GGGATTTT-CTTAATTTCAATTCACA--CCAAATATG-CCC-TTA--TAA--------TAT--------GTA-TT--TGCTT-----A-A-TA-ACC-ATG-A---G--T----GT--GGGCTT--ATTTA---TCAA-ATAC-ATTA-CAT---TTGGAAGTA---T-ATTTCG-TT-TA-----TT-TCTC-GGC-------------AAATT-AGTTCA-TAAT--TA-TTTTCTTAAAACCACA-TTG--------ATC-CAC---CTCGA--T-GTTTT-AAAA--TAGTC-TC-AAA--C-C--AAAATCA-T----A-TAGGT-ATT-GCGCA-T-GCTC-AAAGTCTG-GA----CTA-AACTCG-CGAG----TTTA-CGCCCAG-CG-A---T-A-CGCTCTTTTGT--GAAACGCGATTTA-----GGCCGGT------CTAGATTT--TGGCGTA-ACTTAGTT-AGTCGGCC-TAAGTTACGCCC--TGAATTT-ACACC-TTTTTGTG
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gi|20 : ataatgtacatatatgcatgctttcttttcaagcaatatgtacaataaattatagcttgatatttaatttattcatgctaaagtaacgaatgtgtaacagctataatgaattttagatcttaatataaactcaatgtttacttagcataaataccaccaaaaatgtttaagcatgaataccggagatgaaacgtaacaTTCCTTA-CTCTCCCTT-GCGGTG-AATTGTC-TTCG-----ATT--GGTGCAATTAAAAA--T-GGGATTT
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Reference ( family-885 ) : AACGAATGTGTA-CAGCT-ATA-ATGAATTT-AGATCTTAATCTAAACTCAACGTNTA-C-CTAGCAA-GTTATTAACG-GTT-TTG----TTTGA---TT---TTT----TAA--TTCTT-CGTGCG-TTG-----TAT--------T-TA-G-ATAAGTATTATA---ACAGCA----TGN-ATCAGTT------ACAT--------AAATTCTTTTT----G--TA-TATT-T---T-GTGCATGCATGTGTGTGT--TTGTTCTCT---ATAAGA-CTCCT---TAGCAGTAATATTTCAGAGG--GTATGCCA-CGTA-CATATCAG--------------------T-A-CACAAGTTTAT--ACTCAAAATGCTTCTTTTT-CAAATGAGCAAAGATGTATA----TACATAA-TATACC-GAAATCAA-TTCCTAGT-AGT-TTA-TTGAAA-TGTGCATTATAATGAAAT-ACATCATGATCGA--TTTCCTTAACTCTTCCTT-GCGGTG-AATTGTCATTTGTTAATATT--AATGCAATTAAAAA--T-GGGATTTT-CTTAATTTCAATTCACA--CCAAATATG-CCC-TTA--TAA--------TAT--------GTA-TT--TGCTT-----A-A-TA-ACC-ATGNG-TT---G-T--GGGCTT--ATTTA---TCAA-ATAC-ATTA-CAT---TTGGAAGTA---T-ATTTCG-TT-TA-----TT-TCTCGG-C-------------AAATT-AGTTCA-TAAT--TATTTT-CTTAAAACCACA-TTG--------ATC-CAC---CTCGA--T-GTTTT-AAAA--TAGTC-TC-AAA--C-C--AAAATCA-T----A-TAGGT-ATT-GCGCA-T-GCTC-AAAGTCTG-GA----CTA-AACTCG-CGAG----TTTA-CGCCCAG-CG-A---T-A-CGCTCTTTTGT--GAAACGCGATTTA-----GGCCGGT------CTAGATTT--TGGCGTA-ACTTAGTT-AGTCGGCC-TAAGTTACGCCC--TGAATTT-ACACC-TTTTTGTG
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