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Reference ( gi|9 ) : TGCCCCTCCAAT-CTT-CTAGGGG-G---CG---T--GG-CT---TC--TG-C-ACGAAA-TG-CT------TCTC-GC-A-CGGAACG-----------------CT-TTG-------AATGG------------------TT---T--GCAC------G--------AAATGC---T---GAA-CAGT-T-T--GCA----TGAA-ACGTTG-AA-----------C--AAT-C--T--GCACGG-AA--------CGAT---------GAA-------CG--------ATTT--GCACAG---AA-CAA-TG--AAC-GA--TTTG-CACGAAACG-AAACC---AAACG----C-TTTGGAG-GG--G----TA--G--TAG--CACGCTTTAGGGTC
gi|5 : TGTCCCTTCAGGGTTT-CTAAGGG-CTACCGAAAT--G--CT---CT--CG-C-ACGAA--CG-AT------TCTC-GC-AGTGGAACG-----------------CT-TTG-------AACGG------------------TT---T--TGGC------C--------AAACGAG--T---GAA-CCGC-TCT--GTT----GGAA-GCGCTATGA-----------C--GAT-C--T--GCACAA-AAATGAGGGTCGCT---------GAA-------CG--------ATCT--GGCCCG---AATCGA--G--AACTAA--TTTG--ACGAA-CGTAAACG---AAACG----C-TTTGGAA-GGTAG----TA--G--TAG--CACGCTTTAGGGTC
gi|11 : gaacaaattgtctccTGCCCCTCTAAG-TTA-GTAGGGG-----CA---T--GG-CT---T----G-A-ACGA-------T------TCGT-GC-A-CGGAACG-----------------AT-TC--------------------------------T---T--GCA----------------AAA-----------AA-CACT-T-T--GCA----TAAA-GCGCTG-AA-----------C--AGT-T--T--GCACGA-AA--------t
gi|1 : gactgtacaattaacggtaaattgaattctactgtgaaaaacaaatatatgcaaatgatgtctaGCCCCTTCAAG-TTT-CTAGGGG-----CG---TTAAA-CTCACTCCTTG-C-ATGAAA-CG-CT------TCTC-GT-A-TGGAA--------------------------------AGTGA------------------TTCTAT--GAAC------A--------AAA-GCATTT---ACA-CGGT-T-T--GCA------AA-GCAGTA-AA-----------C--AATGC--TTGGCACGG-AA--------CGTT---------AAACTAGGTCCG--------ATCG--ACACGG---AA-CGCTTG--AAC-GA--TTTACCAAGGAACGAAAACG---AAACG----C--ACGGAGAGG--G----TA--A--TAG--CACGGCTTAGG
gi|2 : tttctcagctccattctgtaattagaaaaccaattatatcgaatatacaagtttattctgatcacaaggaatagtcatgtaggatttcttcgtgtcctcattttgttttaaactgggtcttaatctattgataacaaaaagtgccgtggccttgttaatatccagaaaggtttatttgctgaccattatataataacccattaattaattcaacaattacattaaacagaaaaattgaaattttgaaaattggccaaCCCGTCAAG-TTT-CTAGGGG-----CG---T--GG-CT---TC--TG-C-ACGAAAACG-CT------TCTC-GC-A-CGGAACGATTCCGCAACTTGAACGCT-TTG-------AACGGGTGCACAAACGGCTAACGTT---T--GTAC------G--------GA-CGC---T---GAAACTGT-T-T--GCA----CGAA--CGATG-AA-----------C--G-T-C--T--GCCCG--AA--------CGCT---------GAA-------CG---------CTT--GAACGA---AT-CGA-TG--AA--GA--TTTG-CACGAAACG-AAAC----GAACG----A-CTTGGAG-G--------TA--G--TAG--CACGCTTTAGGGtct
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaaatggaaaatgaaacaaaatcaaaatttttctatCCCTTCAAT-TTTTCTAGGGG-----CG---T--GGGCT---TC--TG-CTACGAAC-GGTCT------TCTT-GC-A-CGGAACG------------------------------AATT-------------------CT---C--GCAC------------------------T---GAA-CG---T-T--GCA----CGAATACGCTG-AA-----------ATGAAT-C--T--GCGCGG-AA--------AGCT---------GA--------CG--------CTTG--GAACGG---AA-CGA-TG--AAC-GA--TTTG-CACGAAACA-AAACG---AAACG----A-TTTG--T-GG--A----TA--G--TAG--CACGC-TTAGGGTCct
gi|3 : aaaatttgaaaattgtctattCCCTTCAAG-TTT-CTAGGGT-G-----------GG-CT---T---TG---ACGAAA-CG-CTC-----TCCT-GC-A-CG-AACG-----------------AT-TC--------------------------------T---C--GCAT------G--------GAACGC---TTTGAAA-CGGT-T-T--GCC----CGAA-ATGCTG-AA-----------C--GAC-T--T--GC-CGG-A---------CGCT---------GAA-------CG--------CTTG--ACAC-G---AA-CGCCTG--AAC--A--TTTG-CATGAAACG-AAAC----GAACG----A-TTTGA---GG--G----TA--G--TAGAACACGCTTTAGGGTCt
gi|6 : ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtaactgaacaataattaaaaatggaaaatgaaaacaaaatttgaaaattttctctgAT-TTT-CTAGGGG-G---CG---T--GG-CT---TC--TGCC-ACGAAA-CG-CC------TCTC-GC-A-CGGAACtg
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gi|8 : tTT-CTAGGGG-----CG---T--GG-CT---TC--TG-C-GCGAAA-CG-CT------TCTC-GC-A-CGaacgctctggaggcgtaatagaatgctataaggtctgt
gi|16 : TT-CTAGGGGGG---CG---T--GG-CT---TT--TG-C-ATGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaccaaacgctttggaggggtagtagcacgctttagggtctg
gi|14 : aaaaatgaaaaatgaacagaattaaaaaaattttctatgtcctttagaag---TT--TG-C-ACGAAA-CG-CTGAATTATCT--GC-C-CGGAACG-----------------C---TG-------GACGC------------------TT---G--GAAC------G--------GAACGA---T---GAA-CGAT-T-T--GCA----CGAG-AC
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gi|4 : tta------TCTCTGCTA-CGTAACG-----------------CT-TTG-------AACGG------------------TT---T--GCACCCGATAG--------AAGGAC---TC--GAA-CGGTCT-T--GTAACGGTGAA-GCGCTG-AAGCCCGGGTTGTC--AAT-C--G--GAACGATAA--------CGGTCTCGCCG--GAA-------CGCGAAGTACGCTTGGGAACGG---AA-CGC-TGAAAACAGACTTTTG-CACGAACTG-AAAACGGAAAACGAGCAT-TTTGGAA-GA--GCGGTTAATG--TAG---ACGCTTTAcacagaacataaacgctttgcat
gi|15 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatctgcccgttatttcaaatatctcttgggtggagctgaggcttcattgcaccgaaacgctcaatacctcggcatcggacctcgtata-GC-A-CG-AACG-----------------CT-TTATGCAAGCAATGA------------------TTCT-T--TAAC------G--------AAGCAA---T---GAG-CGTT-T-T--ACA----TGAA-ATGTTG-AA-----------A--GCT-A--T--ACATGG-AA--------CGAT---------GGG-------CG--------CTTT--ACAaaatgtgcgtctgta
gi|13 : tga-------AACGA------------------TC---T--GCAT------G--------AAA-GC---T---GAA-CAAT-T-T--GCA----CAGA-ACACTG-Aat
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gi|14 : tttctacggggcg---T---GAA-CGGT-T-T--GCA----CGAA-ACGCTG-AA-----------T--TAT-C--T--GCCCGG-AA--------CGCT---------GGA-------CG--------CTTG--GAACGG---AA-CGA-TG--AAC-GA--TTTG-CACGAGACA-AAACG---AAACG----A-TTTGG-T-GA--A----TA--G--TAG--CACGCTTTAGGGTCtgt
gi|13 : A-CAGT-T-T--GCAA---TGAA-AGGTGA-AA-----------C--GAT-C--T--GCATGA-AA---------GCT---------GAA-------CA--------ATTT--GCACAG---AA-CAC-TG---AC-GG--TTTT-GATGAAACA-AAACA---AAATG----CTTTTGGGA-GA--G----TA--AGTTAGC-CACGCTTTAGGGT
gi|18 : A-ACGATG-AA-----------C--GAT-T--T--GCACGG-AA--------GGA-----------AA-------CG--------A
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gi|18 : gactgtacaattaacggtaaattgaattctactgtgaaaaacaaatatatgcaaatgatgtctatgcccctctaagttagtaggggcatggcG-AA--------CGAT---------GAA-------CG--------ATTT--GCAC
gi|17 : ACAGTTAAA-CAC-TG--TTC-GA--TTTG-CATGGATCA-AAACA---AAATG----C-TTTGGAG-GA--G----TA--G--TAG--CATGCTTTAGGGTCggaaggaaacgaaacgctttggaggggtagtagcacgctttaggggctg
gi|18 : G---AA-CGA-TG--AAC-GA--TTTG-CACGGAAGG-AAACG---AAACG----C-TTTGGAG-GG--G----TA--G--TAG--CACGCTTTAGGGtg
gi|6 : A--TTTG-CTCGAA-CA-AAACG---AAACG----C-TTTGGAG-GG--G----TA--G--TTG--CACGCTTTAGGGTCgctg
gi|8 : attttctagggggcgtggcttctgccacgaaacgcctctcgcacggaactattctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AAACC---AAACG----C-TTTGGAG-GG--G----TA--G--TAG--CACGCTTTAGGGTCt
gi|19 : ttctaggggcgtggcttctgcgcgaaacgcttctcgcacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGAG-GG--G----TA--G--TAG--CACGCTTT-GGGTCtg
Alignments
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Reference ( family-8752 ) : TGCCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TG-C-AC-G-AAACG--CT-----TCTC-GCA-CGG---AACGCT--------T--TG-------AA---CGAT--T---TG-C-A--CG--------AAA-C-GC--T---GA-ACGGTT-T-GCA-C------GAA-ACGCT-G-AA---CGA-T-C-T---GC-ACGG---AA--------CGCTG--AA---C--G---NTTTG-----C----A--CG--GAACG-NT-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACG-AAA-CGAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTC
gi|1 : GCCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-G-----CG---TTA-AA-CTCACTCCTTG-C-AT-G-AAACG--CT-----TCTC-GTA-TGG---AA------------------------AG---TGAT--TCTATG-A-A--CA--------AAAGC-AT--T---TACACGGTT-T-GCA---------AA-GCAGT-A-AA---CAA-TGC-TTG-GC-ACGG---AA--------CGTTA--AA---CTAG---GTCCGATCGAC----A--CG--GAACG-CTTGAAC-GA-----------T-TTACCAAGGAACG-AAAACGAA--ACGC-AC-GGAGAGG--G----TA--A--TAG--C-ACGGCTTAGG
gi|10 : tttctcagctccattctgtaattagaaaaccaattatatcgaatatacaagtttattctgatcacaaggaatagtcatgtaggatttcttcgtgtcctcattttgttttaaactgggtcttaatctattgataacaaaaagtgccgtggccttgttaatatccagaaaggtttatttgctgaccattatataataacccattaattaattcaacaattacattaaacagaaaaattgaaattttgaaaattggccaa-AAACG--CT-----TCTT-GCA-CAG----ACGTTC-------T--TG-------AA---TGAT--T---TT-T-A--CGCTTTGCAAGAA-C-GC--T---G--ACGG-T-T-GCA-T------GAA-TAG-T-G-AA---TGA-C-C-C---GT-ACGG----A--------CACTG--AA---C--G---CTTTG----------A--CA--GAAAC-AT-AAAC-G--------------CTGC-ACG----G-ATA-CT-A--ACGCTTT-tct
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gi|12 : gactgtacaattaacggtaaattgaattctactgtgaaaaacaaatatatgcaaatgatgtcta-T--TT-CTACGG-G-G---CG---T---GG-TT---TC--TG-C-AC-A-AAACG--GT-----TCTC-GCA-CGG---AATGCT-------------------------------------------------------------------GA-ACGATC-T-GCA-C------GAA-AC---------------T-C-T---TT-ACAG---------------------------------TTGG-----C----A--CG--GAGCG-AT-GAAC-TA-----------T-TTCC-ATGAAAAG-AAA-CAAA--ACGCTCT-GGAG-GC--G----TA--A--TAG--A-ATGCTATAAGGTC
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gi|15 : -GCA-CG----AACGCT--------T--TATGCAAGCAA---TGATTCT---TT-A-A--CG--------AAG-C-AA--T---GA-GCGTTT-T-ACA-T------GAA-ATGTT-G-AA---AGC-T-A-T---AC-ATGG---AA--------CGATG--GG---C--G---CTTTA-----C----A--
gi|16 : tgaTGTCC----TTTAGAA-G--TT-CTAGGG-GGG---CG---T---GG-CT---TT--TG-C-AT-G-Aat
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gi|3 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaaatggaaaatgaaacaaaatcaaaatttttctatCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-T-G------------GG-CT---T---TG---AC-G-AAACG--CTC----TCCT-GCA-C-----------------------G-------AA---CGATTCT---CG-C-A--TG--------GAA-C-GC--TTTGAA-ACGGTT-T-GCC-C------GAA-ATGCT-G-AA---CGA-C-T-T---GC--CGG----A--------CGCTG--AA---C--G---CTTGA-----C----A--C---GAACGCCT-GAAC--A-----------T-TTGC-ATGAAACG-AAA-CG-A--ACGATTT-G--A-GG--G----TA--G--TAGAAC-ACGCTTTAGGGTCct
gi|4 : ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtaactgaacaataattaaaaatggaaaatgaaaacaaaatttgaaaattttctctgTGCCCGTTATTTCAAA-TATCT-CTTGGGTG-G---AG---CTGAGG-CT---TCATTG-C-ACCG-AAACG--CTCAATACCTCGGCATCGG---ACCTCG--------T--AT-------AT---C--T--C---TG-CTA--CG--------TAA-C-GCTTT---GA-ACGGTT-T-GCA-CCCGATAGAA-GGACTCG-AA---CGG-T-CTT---GTAACGGTGAAG--------CGCTG--AAGCCC--G---GGTTGT----C----AATCG--GAACG-AT--AAC-GG-----------TCTCGC--CGGAACG-----CGAAGTACGCTTG-GGAtg
gi|4 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatc-----TCTT-GTAACGGTGAAGCGCT------------G-------AAGCCCGGG--T---TGTC-AATCG--------GAA-C-GA--T----A-ACGGTC-TCGC--C------GGA-ACGC--G-AAGTACG----C-TTGGGA-ACGG---AA--------CGCTGAAAA---C--AGACTTTTG-----C----A--C---GAAC---T-GAA---A------------------ACGGA----AAA-CG-A--GCATTTT-GGAA-GA--GCGGTTAATG--TAG----ACGCTTTAacggaacgctgaaaacagacttttgcacgaactgaaaacggaaaacgagcattttggaagagcggttaatgtagacgctttaaaatgtgcgtctgta
gi|5 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatctgcccgttatttcaaatatctcttgggtggagctgaggcttcattgcaccgaaacgctcaatacctcggcatcggacctcgtatatctctgctacgtaacgctttgaacggtttgcacccgatagaaggactcgaacggTGTCC----CTTCAGGGT--TT-CTAAGG-G-CTACCGAAAT---G--CT---CT--CG-C-AC-G-AA-CG--AT-----TCTC-GCAGTGG---AACGCT--------T--TG-------AA---CGGT--T---TT-G-G--CC--------AAA-C-GAG-T---GA-ACCGCTCT-GTT-G------GAA-GCGCT-ATGA---CGA-T-C-T---GC-ACAA---AAATGAGGGTCGCTG--AA---C--G---ATCTGG----C----C--CG--AATCG-A--GAACTAA-----------T-TTG--ACGAA-CGTAAA-CGAA--ACGCTTT-GGAA-GGTAG----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCaaatgtgcgtctgta
gi|6 : gaacaaattgtctcc-T--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TGCC-AC-G-AAACG--CC-----TCTC-GCA-CGG---AACt
gi|6 : atA-----------T-TTGC-TCGAA-CA-AAA-CGAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TTG--C-ACGCTTTAGGGTCtattctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgctcgaacaaaacgaaacgctttggaggggtagttgcacgctttagggtct
gi|7 : attttctagggggcgtggcttctgccacgaaacgcctctcgcacggaactattctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCC----CTTCAAT-T--TTTCTAGGG-G-----CG---T---GGGCT---TC--TG-CTAC-G-AA-CGGTCT-----TCTT-GCA-CGG---AACG----------------------------AAT--T------C-T--CG------------C-AC--T---GA-ACG--T-T-GCA-C------GAATACGCT-G-AAA--TGAAT-C-T---GC-GCGG---AA--------AGCTG--A----C--G---CTTGG-----A----A--CG--GAACG-AT-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACA-AAA-CGAA--ACGATTT-G--T-GG--A----TA--G--TAG--C-ACGC-TTAGGGTCt
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gi|8 : -AAA-CCAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaccaaacgctttggaggggtagtagcacgctttagggtctg
gi|9 : ttctaggggcgtggcttctgcgcgaaacgcttctcgcacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCC----CTCCAAT-C--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TG-C-AC-G-AAATG--CT-----TCTC-GCA-CGG---AACGCT--------T--TG-------AA---TGGT--T---TG-C-A--CG--------AAA-T-GC--T---GA-ACAGTT-T-GCA-T------GAA-ACGTT-G-AA---CAA-T-C-T---GC-ACGG---AA--------CGATG--AA---C--G---ATTTG-----C----A--CA--GAACA-AT-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACG-AAA-CCAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCtg
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gi|4 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatc-----TCTT-GTAACGGTGAAGCGCT------------G-------AAGCCCGGG--T---TGTC-AATCG--------GAA-C-GA--T----A-ACGGTC-TCGC--C------GGA-ACGC--G-AAGTACG----C-TTGGGA-ACGG---AA--------CGCTGAA---A--ACAGACTTTTG-----C----A--C---GAAC----T-GAA---A------------------ACGGA----AAA-CG-A--GCATTTT-GGAA-GA--GCGGTTAATG--TAG----ACGCTTTAacggaacgctgaaaacagacttttgcacgaactgaaaacggaaaacgagcattttggaagagcggttaatgtagacgctttaaaatgtgcgtctgta
gi|5 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatctgcccgttatttcaaatatctcttgggtggagctgaggcttcattgcaccgaaacgctcaatacctcggcatcggacctcgtatatctctgctacgtaacgctttgaacggtttgcacccgatagaaggactcgaacggTGTCC----CTTCAGGGT--TT-CTAAGG-G-CTACCGAAAT---G--CT---CT--CG-C-AC-G-AA-CG--AT-----TCTC-GCAGTGG---AACGCT--------T--TG-------AA---CGGT--T---TT-G-G--CC--------AAA-C-GAG-T---GA-ACCGCTCT-GTT-G------GAA-GCGCT-ATGA---CGA-T-C-T---GC-ACAA---AAATGAGGGTCGCTGAA---C--GA-----TCTGG----C----C--CG--AATCG-A---GAACTAA-----------T-TTG--ACGAA-CGTAAA-CGAA--ACGCTTT-GGAA-GGTAG----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCaaatgtgcgtctgta
gi|6 : gaacaaattgtctcc-T--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TGCC-AC-G-AAACG--CC-----TCTC-GCA-CGG---AACt
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Alignments
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gi|2 : acgtttgttagCC----CGTCAAG-T--TT-CTAGGG-G-----CG---T---GG-CT---TC--TG-C-AC-GAAAACG--CT-----TCTC-GCA-CGG---AACGATTCCGCAACT--TG-------AA---CGCT--T---TG-A-A--CGGGTGCAC-AAA-CGGC--T----A-AC-GTT-T-GTA-C------G-G-ACGCT-GAAA---CTG-T-T-T---GC-AC-G---AA--------CGATGAA---C--G------TCTG-----CCCGAA--CGCTGAACG-CTT-GAAC-GAATCGATGAAGAT-TTGC-ACGAAACG-AAA-CG-A--ACGACTT-GGA---G--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGtgtaaa
gi|3 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaaatggaaaatgaaacaaaatcaaaatttttctatCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-T-G------------GG-CT---T---TG---AC-G-AAACG--CTC----TCCT-GCA-C-----------------------G-------AA---CGATTCT---CG-C-A--TG--------GAA-C-GC--TTTGAA-ACGGTT-T-GCC-C------GAA-ATGCT-G-AA---CGA-C-T-T---GC--CGG----A--------CGCTGAA---C--GC-----TTGA-----C----A--C---GAACGCC-T-GAAC--A-----------T-TTGC-ATGAAACG-AAA-CG-A--ACGATTT-G--A-GG--G----TA--G--TAGAAC-ACGCTTTAGGGTCct
gi|4 : ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtaactgaacaataattaaaaatggaaaatgaaaacaaaatttgaaaattttctctgTGCCCGTTATTTCAAA-TATCT-CTTGGGTG-G---AG---CTGAGG-CT---TCATTG-C-ACCG-AAACG--CTCAATACCTCGGCATCGG---ACCTCG--------T--AT-------AT---C--T--C---TG-CTA--CG--------TAA-C-GCTTT---GA-ACGGTT-T-GCA-CCCGATAGAA-GGACTCG-AA---CGG-T-CTT---GTAACGGTGAAG--------CGCTGAAGCCC--GG-----GTTGT----C----AATCG--GAACG-A-T--AAC-GG-----------TCTCGC--CGGAACG-----CGAAGTACGCTTG-GGAtg
gi|4 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatc-----TCTT-GTAACGGTGAAGCGCT------------G-------AAGCCCGGG--T---TGTC-AATCG--------GAA-C-GA--T----A-ACGGTC-TCGC--C------GGA-ACGC--G-AAGTACG----C-TTGGGA-ACGG---AA--------CGCTGAA---A--ACAGACTTTTG-----C----A--C---GAAC----T-GAA---A------------------ACGGA----AAA-CG-A--GCATTTT-GGAA-GA--GCGGTTAATG--TAG----ACGCTTTAacggaacgctgaaaacagacttttgcacgaactgaaaacggaaaacgagcattttggaagagcggttaatgtagacgctttaaaatgtgcgtctgta
gi|5 : aagtggaaatgaaaaccataatttgcaaaattttataatttaatctgcccgttatttcaaatatctcttgggtggagctgaggcttcattgcaccgaaacgctcaatacctcggcatcggacctcgtatatctctgctacgtaacgctttgaacggtttgcacccgatagaaggactcgaacggTGTCC----CTTCAGGGT--TT-CTAAGG-G-CTACCGAAAT---G--CT---CT--CG-C-AC-G-AA-CG--AT-----TCTC-GCAGTGG---AACGCT--------T--TG-------AA---CGGT--T---TT-G-G--CC--------AAA-C-GAG-T---GA-ACCGCTCT-GTT-G------GAA-GCGCT-ATGA---CGA-T-C-T---GC-ACAA---AAATGAGGGTCGCTGAA---C--GA-----TCTGG----C----C--CG--AATCG-A---GAACTAA-----------T-TTG--ACGAA-CGTAAA-CGAA--ACGCTTT-GGAA-GGTAG----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCaaatgtgcgtctgta
gi|6 : gaacaaattgtctcc-T--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TGCC-AC-G-AAACG--CC-----TCTC-GCA-CGG---AACt
gi|6 : atA-----------T-TTGC-TCGAA-CA-AAA-CGAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TTG--C-ACGCTTTAGGGTCtattctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttgctcgaacaaaacgaaacgctttggaggggtagttgcacgctttagggtct
gi|7 : attttctagggggcgtggcttctgccacgaaacgcctctcgcacggaactattctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCC----CTTCAAT-T--TTTCTAGGG-G-----CG---T---GGGCT---TC--TG-CTAC-G-AA-CGGTCT-----TCTT-GCA-CGG---AACG----------------------------AAT--T------C-T--CG------------C-AC--T---GA-ACG--T-T-GCA-C------GAATACGCT-G-AAA--TGAAT-C-T---GC-GCGG---AA--------AGCTGA----C--GC-----TTGG-----A----A--CG--GAACG-A-T-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACA-AAA-CGAA--ACGATTT-G--T-GG--A----TA--G--TAG--C-ACGC-TTAGGGTCt
gi|8 : aaaatttgaaaattgtctatt--TT-CTAGGG-G-----CG---T---GG-CT---TC--TG-C-GC-G-AAACG--CT-----TCTC-GCA-CGt
gi|8 : -AAA-CCAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaccaaacgctttggaggggtagtagcacgctttagggtctg
gi|9 : ttctaggggcgtggcttctgcgcgaaacgcttctcgcacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGCCC----CTCCAAT-C--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TG-C-AC-G-AAATG--CT-----TCTC-GCA-CGG---AACGCT--------T--TG-------AA---TGGT--T---TG-C-A--CG--------AAA-T-GC--T---GA-ACAGTT-T-GCA-T------GAA-ACGTT-G-AA---CAA-T-C-T---GC-ACGG---AA--------CGATGAA---C--GA-----TTTG-----C----A--CA--GAACA-A-T-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACG-AAA-CCAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCtg
blockSeqs : GTTA G AT T T CTACCGAAAT G . CAT C T C A GT CAATA G T TGA ATTCCGCAACTTGAACGCTTTGAACGGGTGCACA . G CTT TTGA . C C CCCGATA T GA GTA AA . T TGG A AAATGAGGGT C GCC . CAGACT CCCGA AT GCT CT . T ATCGATGAAGA C . A T . A GT T G TA CGGT AT GT AA C
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blockSeqs : . . . . . GCGT . . C . . . . . . . . . ATTCTTGCAAAAAACACTTTGCATAA . . C G . . . C . G . A . . . . AA A . . A C . A A . . . . . T . . A . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GCGT . . T . . . . . . . . . CTGAAGCCCGGGTTGTCAATCGG . . A G . . . C . A . A . . . . AA A . . C C . G C . . . . . A . . A . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GCGT . . C . . . . . . . . . CTTTGAACGGTTTTGGCCA . . C G . . . C . G . C . . . . AA C . . C C . G A . . . . . A . . A . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CAT . . C . . . . . . . . . CTTTGAATGGTTTGCACGA . . C G . . . C . G . G . . . . AA C . . C A . G A . . . . . A . . A . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGT . . C . . . . . . . . . CGTATATCTCTGCTACGT . . A G . . . T . G . A . . . . AA C . . G C . G A . . . . . A . . A . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . CGT . . C . . . . . . . . . GAACGATTCTCGCATGG . . C G . . . C . G . G . . . . AA C . . A C . A A . . . . . A . . A . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . CGT . . . . . . . . . . . . CTTTGACAGA . . C G . . . C . G . A . . . . AA C . . C C . . A . . . . . A . . A . . G . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . CT . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
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blockSeqs : .
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finalCons : TGCCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-GGCGT----------GG-CT---TC--TG-C-AC-G-AAACG--CT-----TCTC-GCA-CGG---AACGCT--------T--TG-------AA---CGAT--T---TG-C-A--CG--------AAA-C-GC--T---GA-ACGGTT-T-GCAC-------GAA-ACGCT-G-AA---CGA-T-C-T---GC-ACGG---AA--------CGCTGAA---C--GC-----TTTGC---------A--CG--GAACG-A-T-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACG-AAA-CGAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTC
Alignments
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Reference ( family-8752 ) : TGCCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-G-G---CG---T---GG-CT---TC--TG-C-AC-G-AAACG--CT-----TCTC-GCA-CGG---AACGCT--------T--TG-------AA---CGAT--T---TG-C-A--CG--------AAA-C-GC--T---GA-ACGGTT-T-GCA-C------GAA-ACGCT-G-AA---CGA-T-C-T---GC-ACGG---AA--------CGCTGAA---C--GC-----TTTG-----C----A--CG--GAACG-A-T-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACG-AAA-CGAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTC
gi|1 : GCCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-G-----CG---TTA-AA-CTCACTCCTTG-C-AT-G-AAACG--CT-----TCTC-GTA-TGG---AA------------------------AG---TGAT--TCTATG-A-A--CA--------AAAGC-AT--T---TACACGGTT-T-GCA---------AA-GCAGT-A-AA---CAA-TGC-TTG-GC-ACGG---AA--------CGTTAAA---CTAGG-----TCCGATCGAC----A--CG--GAACG-C-TTGAAC-GA-----------T-TTACCAAGGAACG-AAAACGAA--ACGC-AC-GGAGAGG--G----TA--A--TAG--C-ACGGCTTAGG
gi|10 : tttctcagctccattctgtaattagaaaaccaattatatcgaatatacaagtttattctgatcacaaggaatagtcatgtaggatttcttcgtgtcctcattttgttttaaactgggtcttaatctattgataacaaaaagtgccgtggccttgttaatatccagaaaggtttatttgctgaccattatataataacccattaattaattcaacaattacattaaacagaaaaattgaaattttgaaaattggccaa-AAACG--CT-----TCTT-GCA-CAG----ACGTTC-------T--TG-------AA---TGAT--T---TT-T-A--CGCTTTGCAAGAA-C-GC--T---G--ACGG-T-T-GCA-T------GAA-TAG-T-G-AA---TGA-C-C-C---GT-ACGG----A--------CACTGAA---C--GC-----TTTG----------A--CA--GAAAC-A-T-AAAC-G--------------CTGC-ACG----G-ATA-CT-A--ACGCTTT-tct
gi|10 : ttaCA-CTG---AACGCT--------T--TG-------A-----------------C-A---G--------AAA-C-A---T---AA-ACG--C-T-GCA-C------G-G-ATACT---AA---CGC-T-T-T----C-ACAG---AA--------CA-TAAA---C--GC-----TTTG-----C----A--cacagaacataaacgctttgcat
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gi|12 : gactgtacaattaacggtaaattgaattctactgtgaaaaacaaatatatgcaaatgatgtcta-T--TT-CTACGG-G-G---CG---T---GG-TT---TC--TG-C-AC-A-AAACG--GT-----TCTC-GCA-CGG---AATGCT-------------------------------------------------------------------GA-ACGATC-T-GCA-C------GAA-AC---------------T-C-T---TT-ACAG---------------------------------TTGG-----C----A--CG--GAGCG-A-T-GAAC-TA-----------T-TTCC-ATGAAAAG-AAA-CAAA--ACGCTCT-GGAG-GC--G----TA--A--TAG--A-ATGCTATAAGGTC
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gi|16 : tgaTGTCC----TTTAGAA-G--TT-CTAGGG-GGG---CG---T---GG-CT---TT--TG-C-AT-G-Aat
gi|17 : aaaaatgaaaaatgaacagaattaaaaaaattttctaC-GA-----------T-TTGC-ATGGATCA-AAA-CAAA--ATGCTTT-GGAG-GA--G----TA--G--TAG--C-ATGCTTTAGGGTC
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gi|3 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaaatggaaaatgaaacaaaatcaaaatttttctatCC----CTTCAAG-T--TT-CTAGGG-T-G------------GG-CT---T---TG---AC-G-AAACG--CTC----TCCT-GCA-C-----------------------G-------AA---CGATTCT---CG-C-A--TG--------GAA-C-GC--TTTGAA-ACGGTT-T-GCC-C------GAA-ATGCT-G-AA---CGA-C-T-T---GC--CGG----A--------CGCTGAA---C--GC-----TTGA-----C----A--C---GAACGCC-T-GAAC--A-----------T-TTGC-ATGAAACG-AAA-CG-A--ACGATTT-G--A-GG--G----TA--G--TAGAAC-ACGCTTTAGGGTCct
gi|4 : ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtaactgaacaataattaaaaatggaaaatgaaaacaaaatttgaaaattttctctgTGCCCGTTATTTCAAA-TATCT-CTTGGGTG-G---AG---CTGAGG-CT---TCATTG-C-ACCG-AAACG--CTCAATACCTCGGCATCGG---ACCTCG--------T--AT-------AT---C--T--C---TG-CTA--CG--------TAA-C-GCTTT---GA-ACGGTT-T-GCA-CCCGATAGAA-GGACTCG-AA---CGG-T-CTT---GTAACGGTGAAG--------CGCTGAAGCCC--GG-----GTTGT----C----AATCG--GAACG-A-T--AAC-GG-----------TCTCGC--CGGAACG-----CGAAGTACGCTTG-GGAtg
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gi|7 : attttctagggggcgtggcttctgccacgaaacgcctctcgcacggaactattctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCC----CTTCAAT-T--TTTCTAGGG-G-----CG---T---GGGCT---TC--TG-CTAC-G-AA-CGGTCT-----TCTT-GCA-CGG---AACG----------------------------AAT--T------C-T--CG------------C-AC--T---GA-ACG--T-T-GCA-C------GAATACGCT-G-AAA--TGAAT-C-T---GC-GCGG---AA--------AGCTGA----C--GC-----TTGG-----A----A--CG--GAACG-A-T-GAAC-GA-----------T-TTGC-ACGAAACA-AAA-CGAA--ACGATTT-G--T-GG--A----TA--G--TAG--C-ACGC-TTAGGGTCt
gi|8 : aaaatttgaaaattgtctatt--TT-CTAGGG-G-----CG---T---GG-CT---TC--TG-C-GC-G-AAACG--CT-----TCTC-GCA-CGt
gi|8 : -AAA-CCAA--ACGCTTT-GGAG-GG--G----TA--G--TAG--C-ACGCTTTAGGGTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaccaaacgctttggaggggtagtagcacgctttagggtctg
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