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gi|6 : TCTC-GTCC---GTGT-AATT---ATCCT--TGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GTGAA----T---TGTTTGTT--AAT-T--C-CATACA---------GTAAA-GCG-TTA-CCATAGT-CCA--GCCTCGA-----TGTAACG-A-G--AG-AA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AAC-GG-TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--AACAT---GAT---CTT-GC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTG-TTTTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGAT-TTTTCACACTT-TC--GGTAgtg
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Reference ( family-848 ) : TAANTAATAATA-ATNANAAT-A-A-TAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG---C--A---A----A-ACGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTTTCCAGA----GT--TGT--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACCGTA--AGGTCTTA--GTTC-TGACTGATGG-TACAGTTA-GT-A-GA-TTT-GCG-GTTTCTGA---ACGC-AGGGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGCT---T---GT---------------------GGAG------A------CT---TTTTAAA----CACATA---TAG-GA---GAA-TTTTGTAC-TGG-ATACG-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAAC-AGGTG-T-G-AT-ATGATCA-TGTTTTCTCG-TCC---GTGTTAATT---ATCCT-ATGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GT-GAAT---T----TTG-TT--AA-T-T--C-CATACA---------GT-AAAGCG-TTACCATAGT-CCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AAC-G--TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--AACATA-T-----GATC-TTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACACTT-TC--GGTATCAC-A-AAT-GAT--G-T-TTCCATCGA-A--------AGT-T-ATG-TT-NAAGGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
gi|1 : AACTAAC--TA-ACTTCAAT-A-A---AAATACACTTATA-TAGC------GACCTTATC-A-----AAA-ACT-CT-C-TA-AAGCGCCTGT-A-CTCA-AC----AT-A--CCTAAAA--TT--AC-AATTATAAAT-A-C--TT-T--AAAG--AAAACCATTA-G----------AATACAAA---A-CCGAAA--AGAT-A-C-TTCTTT------ACACT--TTTCAATAGCCA-T---GA-AGT-GCACAA-CA-T---A------GTT--AT--A-AT-A-GGAA--TAAAAAAAGTA-C-A------ATAACTCATATCTATATGTATTACA---AGTT-GCATC--A-T-AAATA-T---TG-A--TGCA-G----C--ATTAA----ATACGTCCCATAAAT-ATCATGGAACCAAAACA-AT---TTATTTGTAATCTAA-----AA-----CACC-A--ACCGTGCCCGAAGTGTTTC--GGTTAAATTGTA-AACACGTA--GC--TATTTTAATGGTGTATA-----GCAGGT-TTAA--CAGCAAAGGAA-TGAGAGTTTTTATACAAT--GA-CTGTTTAAGAAA-CAATTTCTAATATGAGATTTTTGGCGTTTCTGAGGACTGGCTAGACAAG-ATCATCTGTTTCCAGA----GTAGTGT--GCTATTGCATGGTCAGC-TGTG-TTCGACTCCTGCGATCCACT-CACC-TATTAGGACATGATGTTCGTG-CTTAGGA-TATAAT-A-GT-A-GA-TTTTGCGAGTTTCTGA---ACGCCAGGGCTCTAGCTTTACTTAT----CGGGTTGT---G-GAATAATGAGT--------------CCGTT---AGA-TATC-TGGA-GCACAGGCCAAGTCAAGT---------------------GGAGGGGTTAA------CT---TT--AAAGATACACATAGTATAG-GACATGAA-CTTTATACGTGGTATACGTCTGGAGGGTTGTGAGGTGTTAAA-TAAATTAATACGGGGAAGCCAATGAGGATTGATCAATGACAC-AGGTGATAG-ATTATGATCAATGTTTTCTCG-TTCATCGTGCTAATTTTAATCTT-GCTCAGACGGTGGTTTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTTTGATGT-GAATGTAT----TTGATT--AAGTGT--C-CATACACCAGGTTTGGTGAAAGCGGTTACCATAGTTCCAAGGCCTCGAAAT-GATG-A-ACGGATAAGAA---TGCACCAGAATTTTTACAAGGCGCGAGATCG-TTACAG-TAA-CATTTAAC-G--TCGA-AAATTGGCTGCCTATTCCG-TAGTCAACAAG-ATGATGGCATGTTTAATTTA-CTAGTAGACA-TTGC-AAACGTGAGA-CTGCAATTGTT-TTTCTCCATTCGTA-GGGATTTGTTCCGATAACTACATTTTACACTCATAGAATTTTTCACACTT-AC--GGTATCAC-ATAAT-GATTAG-TCCTCCATCGA-A--------AGTAT-ATGTTT-GAAGGTAT-GTTACCCTCGTATATTGT
gi|10 : ataTAATAATA-A--ACAAA-A-A-TTAA-CGCACTTATAATACT------G-CCTTATCTA-----CAACATA-CT-CGTA-AAA-GC-CATTA-C--T-AC----ATTA--C-TAAAA--TTT-ACCAATTA---ATTA-CCTTT-C--AAAG--AAA-CCAT-A-G----------AATACAAA---AAC-GAAA--AA-T-A-C-CT---T------ACACAGTTTTAAA-A--CA-T---GATA-TCGCA--AACAAT--TA-TATGAGTC--ATCAG-AT-A-G--GACTAAAAA--GTA-T-ATCACTCA--------AT-AA---G----CCATTCATTT-AAAGTTAA-T-AAA-AATA--TG-A--TGCACGG---C--A---ATAAAA-ACGTCC--AAAAT-AT-G-GAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATTTAA-----AAACAACCACA-A--AC-GTGTCCAA--TGTT-C--GGT-AAAT---A-A-CA-GGAAAGC---ATTT-AATGGT-TATA-----G--G-T-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA---A-C-GTT
gi|11 : A-ATAATAATCA-A-TAAA-TACACTATTA-T-GC------G-C-TTATTAA-----AAA-AAA-CT-T-GA-AAGCGC-TGT-AAC--A-ACCATTAT----C-TAAAAACTTT-AC-AATTA---AT-AAC--TT-C--AAATT-AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---G-C-GAAACAG--T-AGC-CT---TCTCGTTACACAA-TTTAAC-A--CA-T---GA-A-T-GCAT-A-CA-T--TAAT----GTCGAAT--ACAT-ACG--A--TAAAAA--GTAAC-G------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-TAAAA-A-TAACTGCA--TGCA-GG---CATA---A----A-ACGTCC--TAAATAATAATGAAA----AACACAT-AAGAAT----AATCTAA-----AA-----CACACAATAC-GTG-CCAA--TGTT-C---GT-AAATT-TACA-CA-GTA--GCCTTCTAT-AATGGT-TATATGTAGG--GAT-TCATCCCATGAAAG--ACTGAG--gtagggcgtt
gi|12 : TA-----AAA-TTA-C--C-TA-A-GCGC-TGT-A-C--A--C----AT-A--C-TAAA---TTT-AC-AATGAG--AT-A-T--TT-C--AA-G--AA---CAT-C-G----------A-TACAAA-----C-GAG------TGA-CGCT---T------ACACC--TTTTAA-C--CA-T---GA-A-T-GCA--A-C--C--TA-T----GTC--AT--A-CT-A-G--A--TAAGAG--TTA-A-C------A--------ATCAG---------CA---ATTT-AAAGT--AGT-G-----TA--TG-AATTGCA-GC---C--T---A----A-A-GTCT--TGAG--A--ATGAAA----A-CA--T-A-GTT-----AATTTAA-----AC-----GACA-A--AC-GTGCCCAA---GTT-CCAGG--AAAT---G-A-TACGT---GT--TATTT-AATGAT-TTTA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AGGATTTTTGGCGTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTT
gi|13 : AATAATAATA-ATNNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNN------N-NNNNNNNNN-----NNN-NNN-NN-N-NN-NNNNNN-NNN-N-N--N-NN----NN-N--N-NNAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG---CATA---A----A-ACGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TA
gi|14 : atAATG-ATAAAAAT-A-A-TAAAATCCACTTATA-TAGA------G-CCTTTACTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-A-GCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-ATAC-TAAAA--TTT-AC-AATTA----T-A-C--TT-TTTAAGA--AAAACCAT-A-GTCTATATTAGAATACAAA---A-C-TAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-GAA-A-TAT-TG-A--TGCA-GG---CATA---A----A-ACGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----A
gi|15 : aAATAA-AATG-ATAAAAAT-A-A-TAAAAT-CACTTATA-TAGA------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-A-GCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-ATAC-TAAAA--TTT-AC-AATTA----T-A-C--TT-T--TAGA--AAAACCAT-A-GTCTATATTAGAATACAAA---A-C-TAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--T--T----GT---AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-GAA-A-TAT-TG-A--TGCA-GG---CATA---A----A-ACGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----
gi|16 : TA-ATAAAAAT-A-T-AAAAACAAAATTATA--AGC------G-CCTTATC-------AAA-ATAGCT-C----AAGCGC-TGT-A-C--AGAC----AT-T--A-TAAAA--TTT-AT-AATTA---AT-A-T--TT----AAAG--AAAAC-AT-A-G----------AATACAAA-----C-GAAA--A--T-A-C-CG---T------ACACA--TTAATA-A--CA-T---AA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-A----TTC--AT--A-ATAA-G--A--TAAAAA--ATA-C-A------A--------ATCA---------ACC---ATTT--AAGT--A-T-AAA-
gi|17 : A-ATAATAAT-A-A-TCAAATACACTAGTA-TAGC------G-CCCTA-CTA-----AAA-ATA-CTAC-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-ACA---AT-A--G-T--AA--TTT-AC-CAATA---AA-A-C--TT-C--AAAAGTAAAGCCAT-AGG----------AATACAAATGTA-C---AA--A--C-A-C------T------A-------TCAAA-A--CAGT---GA-A-A-GCA--A-CA-TAGCA-A----AAC--AT--A-AT-T-T--A--AAAAAA--GTA-C-A-----------------CAA---A----GCA---A
gi|18 : ataAT-ACA-TAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-G--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--TAA-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--G
gi|19 : ATC-TTGT-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACATTT-TT--GGTATCAC-A-AAT-GAT--G-T-TTCCATCGA-A--------AGT-T-ATG-TT-TAAAGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
gi|2 : ATAATA-ATAA--AT-A-A-TAAAATACATTTATA-TAACTATCACG-CCTTATCTT-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TCT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAA----TT-AC-AATTA----T-A-C--TTTC--AAAG--AAA-CCAT-A-G----------A-TACAAA-----C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA----CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA---A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--AAT-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG---C--AT--A----A-CCGTCC----AA--AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A---C-GTGCCAAA---GTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTTTAATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CGGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AAACA--T-C------AAGATTT--GGCGTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTT--CA-A----GG--TGT--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CAAATC-TGCG-----T--CACCGTA---GGTCTTA--GTTC-TGACT-ATGG-TACAGTTA-GTTA-GA-TTT-GCG-GTTTCTGA---ACGC-AGGGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GA-TAATGGGT---------------CGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGCT---T---GTGGAGACTTTTAAACACATATAGGAG------AATTGTACTGACTTTTAAA----CACATA---TAG-GA---GAA-TTTTGTAC-TGG-ATACG-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGAT-GATCA--GAA-C-AGGTG-TTG-AT-AT-ATCA-TGTTTTCTCGGTCC---GTGT-AATT---ATCTTCATGCAG-TG-T---TTTTGAAT-CGCTGGAGTTTGTTT----GT-GAAT---TGTTTTTG-TT--AA-T-T--C-CATACA---------GT-AAAGCG-TTACCATAGT-CCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAAA--TTCACCAGAATATT-ACAAG---C---ATC--TT-CAACTTA-TA---AAC-GC-TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CTG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--AACATA-T--------C-TTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGCTCTTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACACTT-TC--GGTATCACAA-AAT-GAT--G-T-TTCCATCGA-AAGTAAATTAGT-T-ATG-TT-GAAGCTATGGTTA---TCGTAT-TTGT
gi|20 : ATG-ATAATACT-A-A-TGAAATACATTTATA-TAGT------G-CCTTATCTAGATAGAAA-ATT-CT-T-AA-AGGCGC-TTT-A-C--G-AT----AT-A--C-TAAAA---AT-AC-AAGTA---
gi|21 : G-TCT---TTGT-AACC---ATGCT-A-GCTG-CAGTA--TTTTGGACTCTTTGCAGTTTGTCT----GTAAAATA--T----TTC-TT--GA-T-C--C-CAAACA---------AC-AATGCA-TTTCCATAAT-CAA--G----------AGCA-A-G-------------TTAACGAAAGTTTT-ACATG--------TCAATT-CAG-Tgcaaatcctccatataatagataaatctaaaacagcgtcacaaaa
gi|22 : AA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAGCCAT-A-G----------AATACACA---A-C-GAAA--A--A-C-C-CT---T------ACACA--TATAAA-A--CA-T---GA-A-T-ACA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTTAAAAGT--A-T-AAA-A-Tc
gi|23 : CTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TAT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---CT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AACACACA---A-CTAAAA--A--T---C-CT---T------ACACA--TATAAA-
gi|24 : ACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACGCA--TTTAAA-A--CA-TTTAAA-A-T-ATG--T-C--T--TG-T----GCA--AT--A-AA-G-A--A--TAAAGA--AT
gi|25 : -TTTTGTAC-TGG-ATACT-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAACCAATGAAGATTGATCA---AAAC-AGGTG-T-G-AT-ATGATCG-TGt
gi|26 : ATAATATATAATA-T-A-A-TAAAATACACTTACA-T------------CTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-
gi|27 : tat--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACC------------------C-TGACTGATGG-T
gi|28 : TTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGA--TTTGGCGTTT
gi|3 : TAATTAACAATA-ATTACATT-A-ACTAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TG--A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--T--C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-CGA------A--------ATCAA---G----ACA---A-TT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG---C--A---A----A-ACGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAG--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTTCGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTTTCCAGA----GT--TGT--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACCGTA--AGGTCTTA--GTTC-TGACTGATGG-TACAGTTA-GT-ATGA-TTT-GCA-GTTTCTGA---ACGC-A-GGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGC----T---GT---------------------GGAG------A------CT---TTTTAAA----CACATA---TAGCGAT--GAA-TTTTGTAC-TGG-ATACG-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAAC-AGTTG-T-G-AT-ATGATCA-GTTTTTCTCG-TCC---GTGTTAATT---ATCCT-ATGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAG---GTTT----GT-GAAT---T----TTG-TTTAAA-T-T--C-CATACA---------GTAAAAGCG-TTA-CATAGT-CCA--GCCTCGAT-T-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AAC-G--TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--GACATACT-----GATCTTTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA--TTTTCACACTT-TC--GGTATCAC-A-AAT-GAT--GTT-TTCCATCGACA--------AGT-T-TTG-TTGAAAGGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
gi|4 : ATACTTATA-TAGC------A-CCTTATCTA-----CAA-ATA-CT-C-TATAAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTTTAC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-G-TAGGA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAAC-GTA-C-A------A--------CTCAA---G----ACA---TTTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--CG-A--TGCA-GG---CATA---A----A-ACGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGT------AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--AGTT-C---GT-AAA-T-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAGC-TTTTTA---AAA--GA-A-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCTTTTTTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TG-TTCCAGA----G---TGT--G-----A-ATG--CAGC-CTTGTT-CGAATC-TACG-----TTCCACCGTA--A-GTCTTA--GTTC-TGATTGATGGTTACAGTTA-GT-A-GATTTT-GCG-GTTTCTGA---ACGC-AGGGCTCT---------TG-----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGCT---T---GT---------------------GAAG------A------C----TTTTAAA----CACATA---TAG-GA---GAATTTTTGTAC-T-G-ATACG-----------------------A-TAA-TCGAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAACAAGGTG-T-G-AT-ATGATCA-TGTTTTCTCG-T-C---GTG-TAATT---ATCCT--TGCAG-CGGTG---TTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GT-GAATTGCT----TTG-TT--AA-T-TCGC-CATACA---------GT-AAAGCG-TTACCATAATCCCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-ATA-T----AAC-GGTTCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATA----CATGT--tc
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gi|17 : A-ATAATAAT-A-A-TCAAATACACTAGTA-TAGC------G-CCCTA-CTA-----AAA-ATA-CTAC-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-ACA---AT-A--G-T--AA--TTT-AC-CAATA---AA-A-C--TT-C--AAAAGTAAAGCCAT-AGG----------AATACAAATGTA-C---AA--A--C-A-C------T------A-------TCAAA-A--CAGT---GA-A-A-GCA--A-CA-TAGCA-A----AAC--AT--A-AT-T-T--A--AAAAAA--GTA-C-A-----------------CAA---A----GCA---A
gi|18 : ataAT-ACA-TAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-G--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--TAA-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--G
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gi|27 : tat--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACC------------------C-TGACTGATGG-T
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gi|8 : tttataatcagattagaattcaatggacccaattgtgttcggcagagcttaaatattggagacactgtagctactttaatggtaggtctataaattaagccttcttcaccaatggaggtTCTTA--GTTC-TGACTGATGGCTACAGTTAGGT-A-GA-TTT-GCA-GTTTCTGAGAGGCGCTAGGG-TCT---------TATGATCCGAGTTGTATTGTGAATAATGAATGATTATACCTTGCACCATTTTCAGA-TATCCTGGAGGCA--AGCT---tatatgaatttacaaatgtgaagtctcttcccgtgatattaaccagacacatggtattttttcttagttctgactgatggctacagttaggtagatttgcagtttctgagaggcgctagggtcttatgatccgagttgtattgtgaataatgaatgattataccttgcaccattttcagatatcctggaggcaagctatcaa
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Reference ( family-848 ) : TAAATAATAATA-ATAANAAT-A-A-TAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG-CA-T-AAA-A-CGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTTTCCAGA----GT--TGT--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACCGTA--AGGTCTTA--GTTC-TGACTGATGG-TACAGTTA-GT-A-GA-TTT-GCG-GTTTCTGA---ACGC-AGGGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGCT---T---GT---------------------GGAG------A------CT---TTTTAAA----CACATA---TAG-GA---GAA-TTTTGTAC-TGG-ATACG-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAAC-AGGTG-T-G-AT-ATGATCA-TGTTTTCTCG-TCC---GTGTTAATT---ATCCT-ATGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GTGAAT-TG-TTT--G-TT--AA-T-T--C-CATACA---------GT-AAAGCG-TTACCATAGT-CCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AAC-G--TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--AACATA-T-----GATC-TTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACACTT-TC--GGTATCAC-A-AAT-GAT--G-T-TTCCATCGA-A--------AGT-T-ATG-TTG-AAGGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
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gi|24 : ACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACGCA--TTTAAA-A--CA-TTTAAA-A-T-ATG--T-C--T--TG-T----GCA--AT--A-AA-G-A--A--TAAAGA--AT
gi|25 : -TTTTGTAC-TGG-ATACT-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAACCAATGAAGATTGATCA---AAAC-AGGTG-T-G-AT-ATGATCG-TGt
gi|26 : ATAATATATAATA-T-A-A-TAAAATACACTTACA-T------------CTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-
gi|27 : tat--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACC------------------C-TGACTGATGG-T
gi|28 : TTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGA--TTTGGCGTTT
gi|3 : TAATTAACAATA-ATTACATT-A-ACTAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TG--A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--T--C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-CGA------A--------ATCAA---G----ACA---ATT--AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG-CA----AA-A-CGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAG--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTTCGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTTTCCAGA----GT--TGT--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACCGTA--AGGTCTTA--GTTC-TGACTGATGG-TACAGTTA-GT-ATGA-TTT-GCA-GTTTCTGA---ACGC-A-GGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGC----T---GT---------------------GGAG------A------CT---TTTTAAA----CACATA---TAGCGAT--GAA-TTTTGTAC-TGG-ATACG-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAAC-AGTTG-T-G-AT-ATGATCA-GTTTTTCTCG-TCC---GTGTTAATT---ATCCT-ATGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAG---GTTT----GTGAAT----TTT--G-TTTAAA-T-T--C-CATACA---------GTAAAAGCG-TTA-CATAGT-CCA--GCCTCGAT-T-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AAC-G--TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--GACATACT-----GATCTTTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA--TTTTCACACTT-TC--GGTATCAC-A-AAT-GAT--GTT-TTCCATCGACA--------AGT-T-TTG-TTGAAAGGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
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gi|5 : agataCAA---G----ACA---TTTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--CG-A--TGCA-GGGCA-T-AAA-A-CGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----A-TCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--AGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A--GAG--TTTTTA---AAAAAGA-A-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCTTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTT-CCAGA----GT---GT--G-----A-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TACG-----TT-CACCGTA--AG-TCTTA--GTTC-TGATTGATGG-TACAGTTA-GT-A-GA-TTT--CG-GTTTCTGA---ACGC-AGGGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGAATATCCTGGA-GCA--AGCT---T---GT---------------------GAAG------A------CT---TTT--AA----CACATA---TAGAGA---GAA-TTTTGTAC--GG-ATACG-----------------------AATAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAAC-AGG-G-T-GTAT-ATGATCA-TGTTTTCTCG-TCC---GTGTAAATT---ATCCT--TGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GTGAAT-TG-TTT--G-TT--AA-T-T--CGCATACA---------GT-AAAGCG-TTAC-ATAAT-CCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-ATA-TA---AAC-GG-TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATA----CATGT--AA--TA-T-----GATC-TTGC-AA-GG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGAGATTTGT--CGAGG--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACACTC-TC--GGTATCAC-A-AAT-GAT--G-T-TTCCATCGA-A--------AGT-T-ATG-TTG-AAGGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
gi|6 : TTC-TGACTGATGG-TACAGTTA-GT-A-GA-TTA-GCA-GT
gi|6 : atTCTCG-TCC---GTGT-AATT---ATCCT--TGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GTGAAT-TG-TTT--G-TT--AA-T-T--C-CATACA---------GT-AAAGCG-TTACCATAGT-CCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AACGG--TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--AAC--A-T-----GATC-TTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACACTT-TC--GGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcgtccgtgtaattatccttgcagcggtgttttgaattcgctggagtttgtttgtgaattgtttgttaattccatacagtaaagcgttaccatagtccagcctcgatgtaacgagagaattcaccagaattttacaagcatcttcagttataaacggtcgaatgctgcctatccgacgtagatgcatgtaacatgatcttgcaacggaactgcattgtttttccatcgtaagggatttgtcgagatacattccaagatttttcacactttcggta
gi|7 : atttctgactgatggtacagttagtagattagcagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----GTGAAT-TG-TTT--G-TT--AA-T-T--C-CATACA---------GT-AAATCA-TTACCATAGT-CCA--GCCTCGATGTCAACGTACG------AGGAATTTTCACCAGATTTTTGACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTATTA---AAC-GT-TCTATA---TG--TGCCTAT-CCGAACGT-----AGTATG----CATGT--AA-AGA-T------ATCATTGCAAA-CG-GA-ACCTGCA-TTG-T-TTTC--CAT-CGGAAGGGATTTG---CGAGA--TACATTCCA-------AAA--TTTTCACACCTGTCGGGGTATCAC-A-AATGGAT--G---TTCCATCGA-A--------ACT-TAATG-TT--AAGGTAT-GTTA---TCGTAT-
gi|8 : -----G--GATATCA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GAAC-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTCTGAA--GTGGCTAGGCA-GAAT----TGTTTCCAGATATGAT--TGTTGA-----G-ATG--CAGCACTTgattctttttatgatacaaacacacatttaattcttgttttgtacttgatttagttttagacaagttagactacacattccatcttacgtaatatctgagagacgactgtgttaacctattcacataacaaatcatcccaagttttggacgcaggttcgactacaatatagatctg
gi|8 : tttataatcagattagaattcaatggacccaattgtgttcggcagagcttaaatattggagacactgtagctactttaatggtaggtctataaattaagccttcttcaccaatggaggtTCTTA--GTTC-TGACTGATGGCTACAGTTAGGT-A-GA-TTT-GCA-GTTTCTGAGAGGCGCTAGGG-TCT---------TATGATCCGAGTTGTATTGTGAATAATGAATGATTATACCTTGCACCATTTTCAGA-TATCCTGGAGGCA--AGCT---tatatgaatttacaaatgtgaagtctcttcccgtgatattaaccagacacatggtattttttcttagttctgactgatggctacagttaggtagatttgcagtttctgagaggcgctagggtcttatgatccgagttgtattgtgaataatgaatgattataccttgcaccattttcagatatcctggaggcaagctatcaa
gi|9 : tttataatcagattagaattcaatggacccaattgtgttcggcagagcttaaatattggagacactgtagctactttaatggtaggtctataaattaagccttcttcaccaatggaggtggatatcacagaaaagatgagtttttaaaagaacgtttaaaacattcaagatttttggcgtttctgaagtggctaggcagaattgtttccagatatgattgttgagatgcagcactttatatgaatttacaaatgtgaagtctcttcccgtgatattaaccagacacatggtatttttTAAAAAT-A-A-TAAAA--CACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--ATAT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG-CA-T-AAA-A-CGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-ATAAAGTA-----AATCTAAAACCTAA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATAGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GA-CTGTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TG-TTCCAGA----GT--atcaa
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blockSeqs : T . N . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . TA . . . . A . . . . . T . . TCTATATTAG AA . . . A . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . A G . . . A . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T GG GG . . . . . . . G GG . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . TT GGAGACT TT . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . C . . . . . . C . . . . . . . . . CATAT A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . T G . .
blockSeqs : T . A . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T GT GG . . . . . . . G AG . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . TT GAAGACT TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . TATG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . G G . .
blockSeqs : C . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T GT GG . . . . . . . G AG . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T GAAGAC T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . CATG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . G G . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GT GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . AGAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GA . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqCons : ** A*** ** *** ** ** ** ** A************** G******* A** ** **** ***** T** T* ** *** ** ** *** ** ** ****** ** **** GT****** GG******** ** ***** AG*** ** ********* T************* ** TT****** GGAGACT************************************ TT **** *** *** *********************** *** ** *** T* *** T** ** **** ********* ** ****** C****** ** *** ** *** ***** **** ** NATG******** ** ** ** ******* T* ** T** ***
originalCons : TAAATAATAATA-ATAANAAT-A-A-TAAAATACACTTATA-TAGC------G-CCTTATCTA-----AAA-ATA-CT-C-TA-AAGCGC-TGT-A-C--A-AC----AT-A--C-TAAAA--TTT-AC-AATTA---AT-A-C--TT-C--AAAG--AAAACCAT-A-G----------AATACAAA---A-C-GAAA--A--T-A-C-CT---T------ACACA--TTTAAA-A--CA-T---GA-A-T-GCA--A-CA-T--TA-T----GTC--AT--A-AT-A-G--A--TAAAAA--GTA-C-A------A--------ATCAA---G----ACA---ATTT-AAAGT--A-T-AAA-A-TA--TG-A--TGCA-GG-CA-T-AAA-A-CGTCC--TAAAT-AT-ATGAAA----AACA-AT-AAGTA-----AATCTAA-----AA-----CACA-A--AC-GTGCCCAA--TGTT-C--GGT-AAATT-TA-A-CA-GTA--GC--TATTT-AATGGT-TATA-----G--GAT-TTA---CAGAAAAG--A-TGAG--TTTTTA---AAA--GA-C-GTTTAA--AA-CA--TTC------AAGATTTTTGGCGTTTCTGAG--CTGGCTAGGCA-G-AT----TGTTTCCAGA----GT--TGT--G-----G-ATG--CAGC-CTTG-T-CGAATC-TGCG-----TT-CACCGTA--AGGTCTTA--GTTC-TGACTGATGG-TACAGTTA-GT-A-GA-TTT-GCG-GTTTCTGA---ACGC-AGGGCTCT---------TGT----CGGGTTGTA-TG-GAATAATGAGT--T-----------CCGTT---AGA-TATCCTGGA-GCA--AGCT---T---GT---------------------GGAG------A------CT---TTTTAAA----CACATA---TAG-GA---GAA-TTTTGTAC-TGG-ATACG-----------------------A-TAA-TCAAC---GGGAAGCCAATGAAGATTGATCA--GAAAC-AGGTG-T-G-AT-ATGATCA-TGTTTTCTCG-TCC---GTGTTAATT---ATCCT-ATGCAG-CGGTG--TTTTGAATTCGCTGGAGTTTGTTT----GTGAAT-TG-TTT--G-TT--AA-T-T--C-CATACA---------GT-AAAGCG-TTACCATAGT-CCA--GCCTCGATGT-AACG-A-G------AGAA---TTCACCAGAATTTT-ACAAG---C---ATC--TT-CAG-TTA-TA---AAC-G--TCGA-A---TG-CTGCCTAT-CCG-ACGT-----AG-ATG----CATGT--AACATA-T-----GATC-TTGC-AA-CG-GA-A-CTGCA-TTGTT-TTTC--CAT-CGTAAGGGATTTGT--CGAGA--TACATTCCA-------AGA-TTTTTCACACTT-TC--GGTATCAC-A-AAT-GAT--G-T-TTCCATCGA-A--------AGT-T-ATG-TTG-AAGGTATGGTTA---TCGTAT-TTGTT
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