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Reference ( gi|7 ) : ATTTATCGGAT-AGCCTTTAA-TTTTTTTAA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TACATA-C-A-AA--ATT-GACGAATGT------------A-------------A---------T------------T-AA-TCC-CTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A------T-A-------A---T-A-------CTA----TT--T-TAT----------CAC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----A----T-GGTCT-----TAATA-TA----G--G--GAA-------CA-------T-----T-TGG---------T-------C-TTGT---G-A-G-------AAAATG-------TATGT-----ACT-T------GG------AA----TA-----G-------G---G-TA-----C-T-A---TGC----T--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----C-T-AT-T--TTG-AC----AC----AAATC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------G--G--T-------T-CAACTTT-ATTC-TTTAAAG-TTG--TTGATAA--AGA---C-A----------------------GT-AAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
gi|4 : ACTTATCGAAT-AGCCTTTAA-TTGTTTGAA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TACATA-C-T-AAT-ATT-GACGATTGT------------A-------------T---------T------------T-GC-TCC-CTTCT-T-TGTG---CG-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATTCATGGGCCC-TGATTCGGT-A--A------C-A-------A---T-A-------CTA----TT--C-TAA----------CAC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----A----C-AGTGT-----TAATA-TA----G--A--GAA-------CAGTGGTT-T-----T-TGG---------T-------C-TTGT---GAA-G-------AAAATG-------TATGT-----ATT-T------GG------AA----TA-----G-------G---G-TA-----C-T-G----------------TGTAA----G-GA-T-AT----C-T-AT-T--TTG-AC----AC----ATTTT-AAATACCGGTATGAGAT----A----AA-AGACTGA-GA----T--------A--A--A-------T-CAACTTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCCAA--AGAAGGC-ATT--------------------GTCAAGC------T----TTT-TT---AGAAA-GCTA--TTCT
gi|3 : ACTTATCGGAT-AGCCTTTAATTTTTTTTAA-CTG----A-GTACTAA----GTC--TACATA-C-T-AA--ATT-GAC-AATGT------------ATTT----------ACTCGAAGATT------------T-AC-TCC-CTTAA-T-TGTG---CA-TGT------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--ATACATGT-A-------A---T-A-------CTA----TT--A-TAA----------CACGGTATGAGT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----A----C-AGTGT-----TAA------------------------------------------------------T-------C-TTAT---GAA-A-------AAAATA-------TATGT-----ACT-T------GG------AA----TA-----G-------G---G-TA-----C-T-G---TGC----C--TTTTGTAA----G-GA-T-CT----C-T-ATGT--TTG-GC----AC----ATTTC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----TAATTGAACG--G--T-------T-CAAATTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GC-AAGC------T----TTT-TT---ACAAA-GC
gi|19 : gACTTATCGGAT-AGCCTTTAA-TTTTTTGAA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TACATA-CTA-AA--ATT-GACGAATGTATTTGCTGGAAGA-------------A---------T------------T-AA-TCC-CTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------TTACATGTACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--AT-----T-A-------A---C-A-------C-A----T-------------------GC------AAT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----A----C-AGTGT-----TAATA-TA----G--A--TAA-------CAGTTGT--T-----T-TGG---------T-------C-TTGT---GAA-G-------AAAATctaccactt
gi|12 : TTT-TCGGAG-AGCCTTTA--TTTTTTTAA-TCA----AAGT-TTGAT---GTC--TACATAAT-A-AA--ATT-GACGAATGT------------A-------------A---------T------------T--A-TCCACTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACT--------------------------------TGATTCGGT-A--A------T-A-------A---T-A-------CTA----------AAA----------CAC------AGT-------------TTGA---CAA-----------------------------GTCT--------TG-TG----G--A--GAA-----------------------------------------------TGT-----------------------------ATGT-----ACT-TC-----GG------AA----TA-------------G---G-TG-----C-T-C---TGTG---T--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----C-T-AT-T--TTG-AC----AC-----AATCAAAA-A-----ATGAAATATAAA----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------TCCAACTTC-ACTC-TTTGAAG-TTG--TTGCTTA--AGA---CGG----------------------GT-AAGC------T----TTT-TTTTAAAAAA-GCTA--TACTTG
gi|1 : cTTT-TCGGAT-AGCCTTTAA-CTTTTTGAA-CCG----A-GTACTCAT---GTC--TACATA-CTA-AAATATT-GACGAATGT------------A-------------A---------T------------T-AA-TCC-CTTCA-T-TGT----CA-TTG------TGTCATT----------C------TTCTTG-TTT-ATGAACCAAA--ATTACCGAGCCCATGATC--GT-A--A------TAA-------A---T-A-------CTA----TCAAC-AAA----------CAC------A---------------TGTA---C-A---G-----TTAG--C-----A----C-GGTCT-----TGGT--CA----G--GCAGAA-------TA-------T-----A-TA---------------------TGT---A-T-A-------TACATGA------CATGTAA---ATT-T------GG------AACTATCA-----G-------G---T-CG-----C-T-C---TGCGTAAT--TTTTG-AAGAGGG-GATT-ATCGAAC-TAAT-T--TTG-AC----AC------ATC-AAA-A-----A-GAAAC----AATACAA-A----GA-GA----T--------A--A--TAA-----T-CAAC-TC-ACTC-TTTAAAG-TGG--TT
gi|23 : cTTT-TCGAAT-AGCCTTTAA-TTTTTTAAA-CTG----A-ATGCTGAT---GTC--TATCTA-C-TTAA--ATT-GACGAATGT------------ATTACCTCGAAGA-A---------C------------T-GC-TCT-CTTCA-TGTGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ACT---GGGCTT-TGATTCGGT-A--A------C-G-------A---T-A-------CTtgcacaccggaatctgaacggtcaagccggtttcaaacaaaagctactaatcttt
gi|5 : TTATCGGAT-AGCCTTTAG-TTTTTTTAAACTG----A-GTACAGAT---GTC--TACATA-CTA-AA--ATT-GACGAATGT------------A-------------A---------TAACTCGAAGAATT-AC-TCT-CGTCA-T-TGTG---CA-TTG------T-------------------------------TT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TAATTCGGT-A--A------T-A-------A---T-A-------CTA----TT--C-TATTCTAA-----CAC------AGT-------------TGTA---CAATAGGC----TT-T--A-----A----TCAGTTT-----TGATA-TATA--G--G--GAA-------CAGTGGTT-T-----T-TGA---------T-------C-TTGT---G-AAG-------AAAATG-------TATGT-----ACT-G------GG------AA----TA-----G-------A---G-TA-----C-T-A---TAC----G--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----C-T-AT-G--TTG-GC----ACATTTAAA---AAA-A-----AT--AAT----A----AA-A----GA-GA----T--------C--A--T-------T-CAACTTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GT-AAGC------T----TTT-TT---
gi|8 : cTTATCGGAT-AGCCTTTAA-TATTTTAAA-CTGCATGA-GTACTGAT---GCC--TACATA-CTA-AA--ATT-GACGAATGT------------ATCAACTCGAAG--A---------A------------T-AACTCT-CTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGACCC-TGATTTGGT-A--A------T-A-------A---T-A-------CTA----TT--T-TAA----------CAC------AGT-------------TGCA---TAA---G-----AT-G--CTTTTAA----TCAGTGT-----TAATA-TA----G--G--GGA-------CAGTGGTTTT-----T-TGA---------T-------C-TTGT---GAA-G-------AAAATG-------TA-GT-----TCT-T------GA------AA----TA-----G-------G---G-CA-----C-T-A---TGT----TCGTTTAGTAA----G-GA-T-AT----C-T-AT-T--TTG-GC----AC----ATTTC-CAA-A-----TTGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------T-CAACTTC-CCTC-TTTAAAG-TTG--TTG
gi|9 : cTTATCGGAA-ATCCTTTAA-TTTTTAAAA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TACATA-CTA-AA--ATT-GACGAATGT------------ATTAACTCGGAAGAA---------T------------T-AC-TCT-CTTCA-T-TGCT---CA-TTG------T----CT------------------ACTTG-TTT-ATG-GCC--A--ATG---GGACCT-TGATTCGGT-T--A------T-A-------A---T-A-------------------------------------------AT-------------TGCA---CAA---GAAGC-TT-T--A-----A----TCAATGT-----TAATA-TA----G--G--GAA-------CAGTGGTT-T-----T-TGG---------T-------T-TTGT---G-AAG-------AAAATG-------TATGT-----ACT-T------GGGAAGCGAA----TA-----G-------T---G-TA-----T-T-G---TGC----G--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----C-T-AT-A--TTG-GCCGGCAC----ATTTC-AAG-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------T-CAACTTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------G
gi|10 : TTATCGGAT-AGC---------TTTTTGA-T------------TGAT---GTC--TACATA-T-A-AA--ATT-GACGACTGT------------ATTAAATCGAAGA-A---------T------------T-AC-TCT-TTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-------------------------GCCC-TGATTCGGT-A--A------T-A-------T---T-A-------CTA----TT--T-TAA----------CAC------AGT-------------TGTA---CAA---GAGGCTTT-AATC-----A----T-G---T-----TAATA-TA----G--G--GAA-------CAGTGGTT-T-----T-TGA---------T-------C-TTGT---G----------------------------T-----ACT-T------GG------AA----TA-----G-------GTACG-TA-----C-T-G---TGCG---T--TTTTATAA----G-GA-T-AT----T-T--T-T--TTG-GC----AC----AT-TC-AAA-A-----ATGAAAA----T----AA-A----GACTA----C--------A--A--T-------T--ACCTTC-ATTC-TTTAAAG-TTGNNNNNNNNN--NNN---N-N----------------------NN-NNNN------N----NNN-NT---AAAAA-AC
gi|2 : cTATCGGATCAGCCTTTA-----TTTTA--CCG----A-GTACTGACATGGTC--TACATA-CTA-AA--ATT-GACGAATGT------------ATTCCGAAAGA---A---------T------------TTAA-TCC-CTTCAAT-TGTG---CAATTG------T----CT----------T-------ACTTA-TT--ATG-ACC--A--ATT---GGGCC--TGATTCGGT-A--AAT----T-A-------A---C-A-------C-------------AT-----------GC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----ACACGT-CGTCT-------ATA-TA----A--GAAGAAAAGATTGTA-------TC----T-TGG---------T---------TTGTCGAA-A-G-------AAAATGATA----CATGT-----ACT-TAATATTGG------AA----AT-----G-------G---G-TA-----CGT-A---CAC----TGGTTTTGTAA----GAGA-C-AT----C-T-AT-T--TTG-AC----AC----AAATC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AAGA----GA-TA----T--------A--A--T-------T-CAACTTCCACTC-TT-AAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GC-AAGC------T----TTT-TA---AAAAAGGTTA--TACTacat
gi|6 : A-TTTTTATAAACTG----A-GTACTGAT---GTC--TACACA-C-T-AA--ATTTGACTAATGT------------ATAACTCGAAGA--A---------T------------T-AC-TCT-CTTCA-T-TGTG---CA-TTGCAATTGT----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--GTT---CGGCCC-TGATTCGGT-A--A------T-ATAAAGCTA---T-A-------CTA----TT--C-TAA----------CAC------AGC-------------TGTA---CAA---G-----AG-G--CTTTA-A----TCAGTGT-----TAATA-TATATAG--G--GAG-------CA-------G-----T--GG---------T-------T-TTGT---T---------------CG-------TATGC-----ACT-T------GG------AA----TATAATAG-------G---G-CT-----C-T-G---TGC----G--TTTTGTAA----G-GG-T-AT----C-T-AT-T--TTG-GC----AC----AGTTC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------T-CAACTTC-ACTC-TTTGACG-TTG--TTGTTAA--AGA---C-
gi|43 : acttattttatatgactt-TTTTTTGAA-CCG----A-GTACTGAT---GTCTATACATA-CTA-AA--CTT-GACGAATGT------------g
gi|47 : AA-CCG----A-GTACTGAT---GCCTATACATA-CTA-AA--GTT-GACGAATGT------------
gi|11 : -------------A---------T------------T-GG-CCC-CTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTGGTTT-ACG-ACC--A--ATT---TGGCCC-T-ATTC----------------------------------------------------------------TAC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----TT----------------------------AATA-TA----G--A--AAA-------AGAGTTGTTT-----T-TGG---------T-------C-TTGT---G-AAG-------AAAATG-------TATGTTGGCTACT-T------GG------AA----TA-----GCATAATGG---G-TAGATATC-T-ACTCTGC----G--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----A-T-AT-T--TTG-AC----AC----AAATC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------T-TTACTTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCTCA--AGA---C-G----------------------GC-AAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TACTT
gi|32 : ttgacccttgagtgtatttgccccggg------------T-AA-TCC-CTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TATCTG-TTT-ATG-ACC--AATATT---GGGCAA-TGATTCGGT-AATA------T-A-------A---T-T-------CTA----TA--T-TAA----------CAC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----
gi|13 : -TCC-CTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TATTTG-TTTTATG-ACA--G--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A------T-A-------AAAAT-A-------CTA----TT--T-TAA----------CAC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----A----C-AGTGT-----T-ATA-AG----G--G--GAA-------CAGTTGTT-T-----T-TGG---------T-------CTTTGT---G-A-A-------GAAATGTAATACCTATGT-----ACTGT------GG-------A----TA-------------G---G-CA-----C-TCC---TTC----A--TTTTGTAA----G-GA-TAAT----C-T-AT-TTCTTGAAC----AC----AAATC-AAA-A-----ATAAAAT----A----AA-A----GAGGA----T--------AATA--T-------T-CAAATTC-ACTCTTTTAAAGTTTG--TTGCTAA--AGA---C------------------------GT-AAGC------T----TCT-TT---TAAAA-GC-A--TACTT
gi|29 : TCA-T-TGTGGACCA-TTT------T----CTGAGGTGGTAAT------TACATG-TTT-ATG-CCC--A--TTT---GGGCCC-TGATTTGGTAA--A------TAA-------A---T-A-------CTA----CT--
gi|15 : -T-NGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ACT---AGGCCC-TGATTCGGT-A--A------T-G-------A---T-A-------CTA----TT--CATATTCTATTCTAACAC------AGT-------------TGTA---AAA---GAGGCTTT-G--------A----TCAGTGT-----TAATA-TA----G--G--GAA-------CAGTGGTT-T-----T-TTA---------T-------C-TTGT---G-AGG-------AAAATGTA-----TATGT-----ACT-G------GG------AT----CA-----G-------G---G-TA-----C-T-G---TAC----G--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----A-T-AC-T--TTG-GC----TT----ATTTC-AAA-A-----ATGGAAT----A----AA-A----GA-GA----TA-------A--A--T-------T-CAACTTC-ACTC-ATTAAAG-TTG--TTACTAA--AGA---C-G----------------------GT-AAGA---------------TT---AAAAA-actaatgtagatatacacaatcagtgtcggtata
gi|42 : TG-TTT-ATG-GCC--A--ATG---GGGCCC-TGATTCGGT-A--G-------------------------------TA----TT--C-TAA----------CAC------ATT-------------TGTT---CAaaactag
gi|45 : TG-TTT-ATG-CCC--A--TTT---GGGCCC-TGCTTTGATAA--A------TAA-------A---T-A-------CTA----g
gi|14 : caTT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A------T-A-------A---T-ACTAAATTCTAACAGTT--T-TACAAGTTG----CAC------AGTGTTAATACATAAACGTAAAGCAA---AGGGT-TT-G--CTTT--A----T-G-TCTATGGATAATA-TA----G--G--GAA-------CAGTTGTT-T-----T-TGG---------T-------C-TTGT---G-AAG-------AAAATG-------TATGT-----ACT-T------GG------AA----TA-----G-------A---G-TA-----C-T-C---TAC----G--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----A-T-AT-T--TTG-AC----AC----AAATC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------T-CAACTTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GC-AAGC------T----TTT-TTA--AAAAA-GCTA--TACTTG
gi|40 : C-TCATTCGGT-A--A------T-A-----------------------------------------------TAC------AGT-------------TGCA---CAA---G-----TT-G--C-----A----C-AG-----------TA-CA----GTTG------------TT-------T-----T-TGG---------T-------C-TTGT---GAA-G-------AAAATG-------T
gi|16 : a-A-------A---TCA-------CTT----CC--T-TAA----------CAC------AGT-------------TGTA---CAA---G-----TT-G--C-----A----C-AGTGT-----TAATA-TA----G--G--GAA-------CAGTTGTT-T-----T-TGG---------T-------C-TTGT---G-AAG-------AAAATG-------TATGT-----ACT-T------GG------AA----TA-----G-------G---G-TA-----C-T-C---TGT----G--TTTTGTAA----G-GA-C-AT----A-T-AT-T--TTG-AC----AC----AAATC-AAA-A-----ATGAAAT----A----AA-A----GA-GA----T--------A--A--T-------T-CAACTTC-ACTC-TTTAAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GC-AAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TAC
gi|48 : atacatttacgacactttcaactgaccaaaactgccaggccactaatttttcaataccctcgc-A-------A---T-A-------CTA----TT--T-TAA----------CAC------AGT-------------TGTAC--CAA---G-----TT-A--C-----A----C-CGTGT-----TA
gi|26 : --T-TAA----------CAC------AGC-------------TGTA---CGA---G-----TT-G--C-----A----C-AATGT-----TAAT--T-----------GAA-------CG-------TGTTTTT-TGA---------T-------T-TTG----G-A-G-------AAAATG-------TAT-T-----AC--T------GG------AA----T------G-------G---G-TA-------T-G---TGC----C--TTTTGTAA------CA-T-AT-------------------------------------AG-A-----ATAAAA-----G----AA-A----GA-GAG---T--------A--A--T-------T-CAACT
gi|20 : GT-------------TTTA---CAA---GGGC--TT-T--A-----A----T-CGTGT-----TAAAAATA----G--A--GAA-------TAGTGGGTTT-----T-TGA---------C-------C-TTGT---G-AAG-------AAAATA-------TATGT-----ACT-T------GG------AA----TA-----A-------A---G-TA-----C-T-G---TGCG---T--TTTTGTAA----G-GA-T-AT----CTT-AT-T--TTG-GC----AC----ATA------------------------A----AA-A----GA-G-----T-----------A--T-------T-CAATTTTCACTT-TT---AG-TTT--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GT-AAAC------T----TTTATTCC-AAAAA-GCTA--TACTTc
gi|17 : tGTGT-----TAATA-TG----A--T--GAA-------CAGTGGTT-T-----T-TGA---------T-------C-TTGT---G-A-AGCCTTGAAAAATC-------TGTGT-----AAT-G------AG------AT----CG-----G-------G---A-TA-----C-T------GC----T--TTC-GTAA----G-GGCT-AT----C-T-AT-T--TCA-GC----AC----ATTTC-AAT-G-----ACGAAAC----T----AA-A----GA-GT----T--------G--A--T-------T-AAACTTC-ACTC-TATAAAG-TTG--TTGCTAA--AGA---C-G----------------------GC-AAGT------T----TTT-TT---tgtg
gi|18 : tgctttgtttcattattcatcaaacactggaaatcttttctctgttttgacacagaggctttaatcaGTGT-----TAATA-TG----A--G--GAA-------CAAC-----T-----TATGGCTTTCTTTAT-------C-TTGT---G-AAG-------AAAATG-------TATGC-----AAT-G------GG------AT----CA-----A-------A---G-TA-----C---A----GC-------TTTTGTAtttttttttttggttttttttaataaaagctatactt
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10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-847 ) : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TN-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTAT---T--------A-------GAATT-ANTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-G---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-A-G-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACANNTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
gi|1 : CTTTTCGGAT-A-GCCTTTAACTTTT-TG-AA-CCG----A-GTACTCAT---GTC--TA--CATACTAAAATATTGAC----GAATGT-----------------------AATT-AATCCCTTCA-T-TGT----CA-TTG------TGTCATT----------C------TTCTTG-TTT-ATGAACCAAA--ATTACCGAGCCCATGATC--GT-A--A--TAA-------A---TACT--ATCAAC-----------AA-----ACAC------A--TGTA-C--A---G-----T----TAGC----A--CG-GT-CTT-GGT--CA----GG-----CA----G---A-A---T-ATA-TA-----TGT---A-T-A-------TACA-TGA------CAT--GTAA---ATT-T------G------G------AACTATCA-----G-------G---T-CG--------CT-CTG--C----G-TAATTT-TTGAA-GAGGGGATT-ATCGAAC-TAAT-T--TT----G-ACACA--TCAAA-A-----A-GAAACAATACAA-A----GA-GA----T-A--A---TAA---TC-AA-C---------T-CACTC-TT--TAAAG-TGG--TT
gi|10 : CTTATCGGAT-A-GC-------TTTT-TG-A--------------TTGAT---GTC--TA--CATA-TAAA--ATTGAC----GACTGTAT---T--------AAATCGAAGAATT-ACTCTTTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-------------------------GCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------T---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----A----G-GCTTTAA--TC-AT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TGATC-TTGT---G-------------------------------T-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------GTACG-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTTTATAAG-GA------T-AT----T-T--T-T--TT----G-GCACAT-TCAAA-A-----ATGAAAAT----AA-A----GACTA----C-A--A---T-----T--AC-C--------TT-CATTC-TT--TAAAG-TTGNNNNNNNNN--NNNN----------------------NN------NNNNN------N----NNN-NT---AAAAA-ACtgcacaccggaatctgaacggtcaagccggtttcaaacaaaagctactaatcttt
gi|11 : TTGACCCTTGAGTGTAT---TTGCCCC--G-------GGATT-GGCCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTGGTTT-ACG-ACC--A--ATT---TGGCCC-T-----------------------------------ATT--C-----------TA--------C------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T--------------------AATA-TA----GA--AAA-A----GAGTT-G---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-AAG-------AAAA-TG-------TAT--GTTGGCTACT-T------G------G------AA----TA-----GCATAATGG---G-TAGATATCTACT-CTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TT-TA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTCA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TACTTacat
gi|12 : CTTTTCGGAG-A-GCCTTTA-TTTTT-TT-AA-TCA----AAGT-TTGAT---GTC--TA--CATAATAAA--ATTGAC----GAATGT-----------------------AATT-ATCCACTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACT--------------------------------TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--A----------------AA-----ACAC------AGTTTGA-CA-A---G-----TCTTGT-GG----A--GA-AT-GT---ATG-TACTT-CG--GAATAG---G---T-G---C-TCTGTGTTT-TTGT---A-A-G-------GATA-TC-------TAT--
gi|12 : GTC-TTGT---G---G-------AGAA-TG-------TAT--GT-----ACT-TC-----G------G------AA----TA-----G-------G-----TG--------CT-CTG--T----G-T--TTTTGTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-ACACAATCAAAA-A-----ATGAAATATAAAAA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TCCAA-C--------TT-CACTC-TT--TGAAG-TTG--TTGCTTA--AGACG---------------------GG------TAAGC------T----TTT-TTTTAAAAAA-GCTA--TACTTGtttgacacaatcaaaaaatgaaatataaaaaagagataattccaacttcactctttgaagttgttgcttaagacgggtaagcttttttttaaaaaagctatacttg
gi|13 : cttttcggagagcctttatttttttaatcaaagtttgatgtctacataataaaattgacgaatgtaattatccacttcattgtgcattgtctttacttgattcggtaataatactaaaacacagtttgacaaTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TATTTG-TTTTATG-ACA--G--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------AAAATACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT--ATA-AG----GG--GAACA----GT--T-G---T-TTT-TGGTCTTTGT---G-A-A-------GAAA-TGTAATACCTAT--GT-----ACTGT------G------G-------A----TA-------------G---G-CA--------CTCCTT--C----A-T--TTT-GTAAG-GA------TAAT----C-T-AT-TTCTT----GAACACAAATCAAA-A-----ATAAAATA----AA-A----GAGGA----T-AATA---T-----TC-AA-A--------TT-CACTCTTT--TAAAGTTTG--TTGCTAA--AGAC-----------------------G------TAAGC------T----TCT-TT---TAAAA-GC-A--TACTT
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gi|14 : T-AATA-TA----GG--GAACA----G---TTG---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-AAG-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------A---G-TA--------CT-CTA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TTA--AAAAA-GCTA--TACTTGtaaacgtaaagcaaagggtttgctttatgtctatggataatatagggaacagttgtttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtacttggaatagagtactctacgttttgtaaggatatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagcttttttaaaaaagctatacttg
gi|15 : ttgggccctgattcggtaataatactaaattctaacagttttacaagttgcacagtgttaatacataaacgtaaagcaaagggtttgctttatgtctatgga-T-NGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ACT---AGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-G-------A---TACT--ATT--CATATTCTATTCTA-----ACAC------AGTTGTA-AA-A---GAGGCTT----T-GA----T--CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TTATC-TTGT---G-A-GG------AAAA-TG-------TATATGT-----ACT-G------G------G------AT----CA-----G-------G---G-TA--------CT-GTA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AC-T--TT----G-GCTTATTTCAAA-A-----ATGGAATA----AA-A----GA-GA----TAA--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-AT--TAAAG-TTG--TTACTAA--AGAC----------------------GG------TAAGA---------------TT---AAAAA-
gi|16 : -----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---TTG---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-AAG-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------G---G-TA--------CT-CTG--T----G-T--TTT-GTAAG-GA------C-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TACaaactag
gi|17 : atacatttacgacactttcaactgaccaaaactgccaggccactaatttttcaataccctcgcaatcacttcctCT--GTT--T-----------TG-----ACAC------AG-------A-G---G-----C----T-TT----AATCA-GT-GTT-AATA-TG----AT--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TGATC-TTGT---G-A-AGCCTTGAAAAA-TC-------TGT--GT-----AAT-G------A------G------AT----CG-----G-------G---A-TA--------CT-GC----------T--TTC-GTAAG-GGC-----T-AT----C-T-AT-T--TC----A-GCACATTTCAAT-G-----ACGAAACT----AA-A----GA-GT----T-G--A---T-----TA-AA-C--------TT-CACTC-TA--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGT------T----TTT-TT---
gi|18 : tgctttgtttcattattcatcaaacactggaaatcttttct--CA-GT-GTT-AATA-TG----AG--GAACAACTTA---T-GGCTT-TCT-TTATC-TTGT---GAA-G-------AAAA-TG-------TAT--GC-----AAT-G------G------G------AT----CA-----A-------A---G-TA--------CA-GC----------T--TTT-GTAtttttttttttggttttttttaataaaagctatactt
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gi|26 : gtaaagaggctttaatcggtgt-----------TA-----ACAC------AGCTGTA-CG-A---G-----T----T-GC----A--CA-AT-GTT-AAT--T---------GAAC-----G---T-GT--T-TTT-TGATT-TTG----G-A-G-------AAAA-TG-------TAT---T-----AC--T------G------G------AA----T------G-------G---G-TA---------T-GTG--C----C-T--TTT-GTA---------------------------------------ACATAT--AG-A-----ATAAAA-G----AA-A----GA-GAG---T-A--A---T-----TC-AA-C--------T
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gi|27 : -A-----AGGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--AAA-T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------TAAGCTTTTTTT----TTT-TT---TAAAA-GCTA--TACTTGTaaaagagataaaattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagctttttttttttttaaaagctatacttgt
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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|1 : CTTTTCGGAT-A-GCCTTTAACTTTT-TG-AA-CCG----A-GTACTCAT---GTC--TA--CATACTAAAATATTGAC----GAATGT----------------------------AA---TT-AATCCCTTCA-T-TGT----CA-TTG------TGTCATT----------C------TTCTTG-TTT-ATGAACCAAA--ATTACCGAGCCCATGATC--GT-A--A--TAA-------A---TACT--ATCAAC-----------AA-----ACAC------A--TGTA-C--A---G-----T----TAGC----A--CG-GT-CTT-GGT--CA----GG-----CA----G---A-A---T-ATA-TA-----TGT---A-T-A-------TACA-TGA------CAT--GTAA---ATT-T------G------G------AACTATCA-----G-------G---T-CG--------CT-CTG--C----G-TAATTT-TTGAA-GAGGGGATT-ATCGAAC-TAAT-T--TT----G-ACACA--TCAAA-A-----A-GAAACAATACAA-A----GA-GA----T-A--A---TAA---TC-AA-C---------T-CACTC-TT--TAAAG-TGG--TT
gi|10 : CTTATCGGAT-A-GC-------TTTT-TG-A--------------TTGAT---GTC--TA--CATA-TAAA--ATTGAC----GACTGTA----T----TAAAT-CGA----A---GAA---TT-ACTCTTTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-------------------------GCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------T---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----A----G-GCTTTAA--TC-AT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TGATC-TTGT---G-------------------------------T-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------GTACG-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTTTATAAG-GA------T-AT----T-T--T-T--TT----G-GCACATT-CAAA-A-----ATGAAAAT----AA-A----GACTA----C-A--A---T-----T--AC-C--------TT-CATTC-TT--TAAAG-TTGNNNNNNNNN--NNNN----------------------NN------NNNNN------N----NNN-NT---AAAAA-ACtgcacaccggaatctgaacggtcaagccggtttcaaacaaaagctactaatcttt
gi|11 : TTGACCCTTGAGTGTA----T----TTGCCCC------G---GGA---TT-GGCCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTGGTTT-ACG-ACC--A--ATT---TGGCCC-T-----------------------------------ATT--C-----------TA--------C------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T--------------------AATA-TA----GA--AAA-A----GAGTT-G---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-AAG-------AAAA-TG-------TAT--GTTGGCTACT-T------G------G------AA----TA-----GCATAATGG---G-TAGATATCTACT-CTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TT-TA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTCA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TACTTacat
gi|12 : CTTTTCGGAG-A-GCCTTTA-TTTTT-TT-AA-TCA----AAGT-TTGAT---GTC--TA--CATAATAAA--ATTGAC----GAATGT----------------------------AA---TT-ATCCACTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACT--------------------------------TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--A----------------AA-----ACAC------AGTTTGA-CA-A---G-----TCTTGT-GG----A--GA-AT-GT---ATG-TACTT-CG--GAATAG---G---T-G---C-TCTGTGTTT-TTGT---A-A-G-------GATA-TC-------TAT--
gi|12 : GTC-TTGT---G---G-------AGAA-TG-------TAT--GT-----ACT-TC-----G------G------AA----TA-----G-------G-----TG--------CT-CTG--T----G-T--TTTTGTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-ACACAATCAAAA-A-----ATGAAATATAAAAA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TCCAA-C--------TT-CACTC-TT--TGAAG-TTG--TTGCTTA--AGACG---------------------GG------TAAGC------T----TTT-TTTTAAAAAA-GCTA--TACTTGtttgacacaatcaaaaaatgaaatataaaaaagagataattccaacttcactctttgaagttgttgcttaagacgggtaagcttttttttaaaaaagctatacttg
gi|13 : cttttcggagagcctttatttttttaatcaaagtttgatgtctacataataaaattgacgaatgtaattatccacttcattgtgcattgtctttacttgattcggtaataatactaaaacacagtttgacaaTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TATTTG-TTTTATG-ACA--G--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------AAAATACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT--ATA-AG----GG--GAACA----GT--T-G---T-TTT-TGGTCTTTGT---G-A-A-------GAAA-TGTAATACCTAT--GT-----ACTGT------G------G-------A----TA-------------G---G-CA--------CTCCTT--C----A-T--TTT-GTAAG-GA------TAAT----C-T-AT-TTCTT----GAACACAAATCAAA-A-----ATAAAATA----AA-A----GAGGA----T-AATA---T-----TC-AA-A--------TT-CACTCTTT--TAAAGTTTG--TTGCTAA--AGAC-----------------------G------TAAGC------T----TCT-TT---TAAAA-GC-A--TACTT
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gi|15 : ttgggccctgattcggtaataatactaaattctaacagttttacaagttgcacagtgttaatacataaacgtaaagcaaagggtttgctttatgtctatgga-T-NGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ACT---AGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-G-------A---TACT--ATT--CATATTCTATTCTA-----ACAC------AGTTGTA-AA-A---GAGGCTT----T-GA----T--CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TTATC-TTGT---G-A-GG------AAAA-TG-------TATATGT-----ACT-G------G------G------AT----CA-----G-------G---G-TA--------CT-GTA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AC-T--TT----G-GCTTATTTCAAA-A-----ATGGAATA----AA-A----GA-GA----TAA--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-AT--TAAAG-TTG--TTACTAA--AGAC----------------------GG------TAAGA---------------TT---AAAAA-
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gi|19 : tacttttacaagaataattttatgaaattttgagaaaagagaaaattcaaacctgtttgctttgtttcattattagtctaaaaggaaaatggaattttattaaacactgaaaatctccgtttctgtgttttaatatagaggccttaatACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TG-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTA----T----T----T---GCTGGAA-GAATT-AATCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------TTACATGTACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--AT-T-A-------A---CAC---------------------------ATGC------AATTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-AATA-TA----GA--TAACA----G---T-T---G-TTT-TGGTC-TTGT---GAA-G-------AAAA-Tttttg
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Reference ( family-847 ) : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TN-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTA----T----T----C---G-----A-GAATT-ACTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-G---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-A-G-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
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gi|10 : CTTATCGGAT-A-GC-------TTTT-TG-A--------------TTGAT---GTC--TA--CATA-TAAA--ATTGAC----GACTGTA----T----TAAATC---G-----AAGAATT-ACTCTTTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-------------------------GCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------T---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----A----G-GCTTTAA--TC-AT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TGATC-TTGT---G-------------------------------T-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------GTACG-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTTTATAAG-GA------T-AT----T-T--T-T--TT----G-GCACATT-CAAA-A-----ATGAAAAT----AA-A----GACTA----C-A--A---T-----T--AC-C--------TT-CATTC-TT--TAAAG-TTGNNNNNNNNN--NNNN----------------------NN------NNNNN------N----NNN-NT---AAAAA-ACtgcacaccggaatctgaacggtcaagccggtttcaaacaaaagctactaatcttt
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gi|48 : -A-------A---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTACCA-A---G-----T----T-AC----A--CC-GT-GTT-A
gi|5 : CTTATCGGAT-A-GCCTTTAGTTTTT-TT-AAACTG----A-GTACAGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTAATAAC----T----C---G-----AAGAATT-ACTCTCGTCA-T-TGTG---CA-TTG------T-------------------------------TT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TAATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TATTCTAACAC------AGTTGTA-CA-ATAGG-----C----T-TT----AATCA-GT-TTT-GATA-TATA--GG--GAACA----G---T-GG--T-TTT-TGATC-TTGT---G-AAG-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-G------G------G------AA----TA-----G-------A---G-TA--------CT-ATA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-G--TT----G-GCACATTTAAAA-A-----AAATAATA----AA-A----GA-GA----T-C--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------TAAGC------T----TTT-TT---
gi|6 : ACTTATTTTAT-ATGACTT--ATTTTTATA-AA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CACACTAAA--TTTGAC----TAATGTA----TAAC-T----C---G-----AAGAATT-ACTCTCTTCA-T-TGTG---CA-TTGCAATTGT----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--GTT---CGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-ATAAAGCTA---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGCTGTA-CA-A---GAGGCTT----T-AA----T--CA-GT-GTT-AATA-TATATAGG--GAGCA----G---T-G---G-TTT-TGTTC--------------------------G-------TAT--GC-----ACT-T------G------G------AA----TATAATAG-------G---G-CT--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GG------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACAGTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TGACG-TTG--TTGTTAA--AGAC----------------------G
gi|7 : ATTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TT-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATAC-AAA--ATTGAC----GAATGTA----------------------------ATT-AATCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--T-----------TA-----TCAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--TG-GT-CTT-AATA-TA----GG--GAACA-----------------TT-TGGTC-TTGT---G-A-G-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------G---G-TA--------CT-ATG--C----T-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-G--G---T-----TC-AA-C--------TT-TATTC-TT--TAAAG-TTG--TTGATAA--AGAC----------------------AG------TAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
gi|8 : CTTATCGGAT-A-GCCTTTAATATTT-TA-AA-CTGCATGA-GTACTGAT---GCC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTA----TCAACT----C---G-----AAGAATA-ACTCTCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGACCC-TGATTTGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGCA-TA-A---G-----A----T-GCTTTTAATCA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GGACA----G---T-GGT-T-TTT-TGATC-TTGT---GAA-G-------AAAA-TG-------TA---GT-----TCT-T------G------A------AA----TA-----G-------G---G-CA--------CT-ATGTTC----G-T--TTA-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCCAA-A-----TTGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CCCTC-TT--TAAAG-TTG--TTG
gi|9 : TTATCGGAA-A-TCCTTTAATTTTT-AA-AA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTA----TTAACT----C---GGA---A-GAATT-ACTCTCTTCA-T-TGCT---CA-TTG------T----C------------------TACTTG-TTT-ATG-GCC--A--ATG---GGACCT-TGATTCGGT-T--A--T-A-------A---TA----ATT---------------------GCAC------A-----A-GA-A---G-----C----T-TT----AATCA-AT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---TGG---T-TTT-TGGTT-TTGT---GAA-G-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------GGGAAGCG------AA----TA-----G-------T---G-TA--------TT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-A--TTGGCCG-GCACATTTCAAG-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------
blockSeqs : C T A A TT A CATG A ATG TA TA . CCTT TTAACTCGGAA T C A G GAC A CAATTG . GAGGTGGTAAT G T . . AT CAT . A AT AT A TAAAGCT AAA AA CATATTCTATTC TTCTA GGTATG C C TAG ATGCTTTTAAT C C T A TATA AA ACTTATGGCT A G A T CGA AAGCCTTGA A TAATACC AT TGGCT G AATATT GGAAGC GAAGCG . TAATA CATAATG TAC A GATATCTA C GTT ACTG T . T A C A . T . G TC GGCC A TT T CCGGT TAAA G GACT C TAAT A AT ATT CAACA C T GGTTCAAA C T AA T NN TT AAAGTTGTTGCTATTAAAAGAT CATTGT TTTTTT TTGG A TTA G AT
blockSeqs : . . A . G . . . . . . . . TTAAATCGAA . G . . . . . . TTACATG . . . . . . . A . T A CATGTA . . AC . . . . . AGGCTTTGAT . . . . CTT . GAGTTG . . G . . AAG . ATA . . . C . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . . . AA . . . . . G G . . AA . . . . . . . . . . G . . . . AAA . .
blockSeqs : . . A . T . . . . . . . . TTTGCTGGAA . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AGGCTTTAAT . . . . TA . GATTG . . T . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . .
blockSeqs : . . A . G . . . . . . . . TTACCTCGAA . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . AGGCTTTAA . . . . . . GTGGG . . G . . AGG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . G . A . . . . . . . . TTTACTCGAA . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TCTTGTGGA . . . . . . GTGGT . . G . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . G . . . . . . . . ATAACTCGAA . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . GGCTTTAA . . . . . . GTGG . . G . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . G . . . . . . . . TCAACTCGAA . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . CTTTAAT . . . . . . GGTG . . A . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . T . . . . . . . . TTTGCCCCG . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . CTTTAAT . . . . . . GTTG . . G . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . A . . . . . . . . TAACTCGAA . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . CTTTAAT . . . . . . GTTG . . A . . AGG . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . TTCCGAAA . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTGCA . . . . . . GTGG . . A . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . TTTG . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTGCA . . . . . . GTTG . . G . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTGCA . . . . . . GTGG . . G . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTGCA . . . . . . GTGT . . A . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . TTGCA . . . . . . GTGG . . A . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTGCA . . . . . . GTTG . . G . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTGCA . . . . . . GTGG . . G . . AG . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGCA . . . . . . GTGG . . A . . AA . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTGCA . . . . . . GTT . . T . . AG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTACA . . . . . . GTA . . G . . AG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TTGCA . . . . . . GTG . . A . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . G . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ** TTNACTCGAA**************** **** ** *** C************* TTGCA**************** GTGG********** AAG******** ******* ***** **** ** ****** **** TT **** *****
originalCons : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TN-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTA----T----T----C---G-----A-GAATT-ACTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACA----G---T-G---T-TTT-TGGTC-TTGT---G-A-G-------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
finalCons : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TN-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATTNACTCGAA----------------GAATT-ACTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATTC-------------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---GTTGCA----------------CA-GT-GTT-AATA-TA----GG--GAACAGTGG----------T-TTT-TGGTC-TTGT---GAAG--------AAAA-TG-------TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TA-----G-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A---T-----TC-AA-C--------TT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): CTACTTGTGAAAGAATAACTTTATGAAAATGTTAGCAATTCAAAACTGTTTGTTTAATTTCATTATTAGTCTAAAAATAAAATAAAATTGGATTAAACACTTAAAAATCTCCTTTTCTTTATTTTGATATAGAGGCTTTAATCGCTGTACTCACATGACAATATACAGTG
Unaligned ( gi|30 ): CGTTACAGACACTTTCAACTACAAAATATGTAAAAATCAAAACAATCCAATGCCCATAATGCATTAATTTTTCAATACCCACGCAATCACGTC
Unaligned ( gi|33 ): CGTTACAGACACTTCCAACCACAAAATGTGTAAAAATAAAAAAAAAATATTCAAAGGGCCATGATTTTTTCAATACCCACGCAATCGCTTCC
Unaligned ( gi|34 ): CGTTACAGACACTTTCAACTACAAAATATGTAAACTTAAAAAATATTCAATGGGCCAATCATTTTTCAATACCCACGCAATCACTTCCT
Unaligned ( gi|35 ): ACGTTACAGACACTTTCAACTACAAAATATGCAAAATCAAAAAAATTCAATTGGCCATTAATTTTTCAATACCCACGCAATCAAATTC
Unaligned ( gi|36 ): CGTTACCGACGCTTTCAACTACAAAATATGTAAAAATAAAAAAAAATCAATGGGCCATTAATTTTTCAATACCCACGCAATCACTTCC
Unaligned ( gi|37 ): TTCAGACACTTTCAACCACAAAATATGCAAAAAATAAAAAAAAATCAATAAGCCTTAATTTTTCAATACCCTCGCAATCACTGC
Unaligned ( gi|44 ): AAAAAAATAAAAAATCTTTAATTTTTCAATATCCTCGCAACCACTAC
Unaligned ( gi|46 ): CAAATGGGCCTATAATTTTTCAATACCCACGCAATCACTTCCT
Unaligned ( gi|49 ): GATTTATGAGGTGAGATTGATCACTGTTCGA
Alignments
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consensus : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TN-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATTAACTC-GAA-GAATT-ACTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AT---T---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAG-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
Reference ( family-847 ) : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TN-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATTNACTC-GAA-GAATT-ACTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AT---T---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAG-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TACTTGT
gi|1 : CTTTTCGGAT-A-GCCTTTAACTTTT-TG-AA-CCG----A-GTACTCAT---GTC--TA--CATACTAAAATATTGAC----GAATGT--------------AATT-AATCCCTTCA-T-TGT----CA-TTG------TGTCATT----------C------TTCTTG-TTT-ATGAACCAAA--AT---TACCGAGCCCATGATC--GT-A--A--TAA-------A---TACT--ATCAAC-----------AA-----ACAC------A--TGTA-C--A---G-----T----TAGC----A--CG-GT-CTT-G----GT--C--A---GGCAGAAT-A----------T-ATA--TG----TATAT--ACAT------GA----CATG---TA----A-----ATT-T------G------G------AACTATCAG-------G---T-CG--------CT-CTG--C----G-TAATTT-TTGAA-GAGGGGATT-ATCGAAC-TAAT-T--TT----G-ACACA--TCAAA-A-----A-GAAACAATACAA-A----GA-GA----T-A--A--------TAA---TC-AA-C-T-CACTC-TT--TAAAG-TGG--TT
gi|10 : CTTATCGGAT-A-GC-------TTTT-TG-A--------------TTGAT---GTC--TA--CATA-TAAA--ATTGAC----GACTGTATTAAATC-GAA-GAATT-ACTCTTTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG----------------------------GCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------T---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---GAGGC-T----T-TA----A--TC-AT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGATC-T-TG----------------------------T--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAG-------GTACG-TA--------CT-GTG--C----GTT--TTT-ATAAG-GA------T-AT----T-T--T-T--TT----G-GCACA-TTCAAA-A-----ATGAAAAT----AA-A----GACTA----C-A--A--------T-----T--AC-CTT-CATTC-TT--TAAAG-TTGNNNNNNNNN--NNNN----------------------NN------NNNNN------N----NNN-NT---AAAAA-ACtgcacaccggaatctgaacggtcaagccggtttcaaacaaaagctactaatcttt
gi|11 : TTGACCCTTGAGTGTATTTGCCCCG---GGATT-GGCCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTGGTTT-ACG-ACC--A--AT---T---TGGCCC-T-----------------------------------ATT--C-----------TA--------C------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T--------------------A----ATA-T--A---GA--AAAAGA-G----TTG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GTTGGCTACT-T------G------G------AA----TAGCATAATGG---G-TAGATATCTACT-CTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TT-TA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTCA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TACTTacat
gi|12 : CTTTTCGGAG-A-GCCTTTA-TTTTT-TT-AA-TCA----AAGT-TTGAT---GTC--TA--CATAATAAA--ATTGAC----GAATGT--------------AATT-ATCCACTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACT-----------------------------------TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--A----------------AA-----ACAC------AGTTTGA-CA-A---G-----TCTTGT-GG----A--GA-AT-GT-------ATG-T--ACTTCG--GAAT-AGG----TGC-T-CTG--TGTTT-T-TGT---AAG------GA----TATC---TAT--
gi|12 : GTC-T-TGT--GGAG------AA------TG---TAT--GT-----ACT-TC-----G------G------AA----TAG-------G-----TG--------CT-CTG--T----G-T--TTTTGTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-ACACAATCAAAA-A-----ATGAAATATAAAAA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TCCAA-CTT-CACTC-TT--TGAAG-TTG--TTGCTTA--AGACG---------------------GG------TAAGC------T----TTT-TTTTAAAAAA-GCTA--TACTTGtttgacacaatcaaaaaatgaaatataaaaaagagataattccaacttcactctttgaagttgttgcttaagacgggtaagcttttttttaaaaaagctatacttg
gi|13 : cttttcggagagcctttatttttttaatcaaagtttgatgtctacataataaaattgacgaatgtaattatccacttcattgtgcattgtctttacttgattcggtaataatactaaaacacagtttgacaaTCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TATTTG-TTTTATG-ACA--G--AT---T---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------AAAATACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT------ATA-A--G---GG--GAAC-A-G----TTG-T-TTT--TGGTCTT-TGT--GAAG------AAATGTAATACC-TAT--GT-----ACTGT------G------G-------A----TA--------G---G-CA--------CTCCTT--C----A-T--TTT-GTAAG-GA------TAAT----C-T-AT-TTCTT----GAACACAAATCAAA-A-----ATAAAATA----AA-A----GAGGA----T-AATA--------T-----TC-AA-ATT-CACTCTTT--TAAAGTTTG--TTGCTAA--AGAC-----------------------G------TAAGC------T----TCT-TT---TAAAA-GC-A--TACTT
gi|14 : T---T---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACTAAATT--C-----------TA-------AC------AGTTTTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----ATA-C--A---
gi|14 : T-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TTG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAG-------A---G-TA--------CT-CTA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TTA--AAAAA-GCTA--TACTTGtaaacgtaaagcaaagggtttgctttatgtctatggataatatagggaacagttgtttttggtcttgtgaagaaaatgtatgtacttggaatagagtactctacgttttgtaaggatatatattttgacacaaatcaaaaatgaaataaaagagataattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggcaagcttttttaaaaaagctatacttg
gi|15 : ttgggccctgattcggtaataatactaaattctaacagttttacaagttgcacagtgttaatacataaacgtaaagcaaagggtttgctttatgtctatgga-T-NGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AC---T---AGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-G-------A---TACT--ATT--CATATTCTATTCTA-----ACAC------AGTTGTA-AA-A---GAGGCTT----T-GA----T--CA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TTATC-T-TGT--GAGG------AA----AATG---TATATGT-----ACT-G------G------G------AT----CAG-------G---G-TA--------CT-GTA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----A-T-AC-T--TT----G-GCTTATTTCAAA-A-----ATGGAATA----AA-A----GA-GA----TAA--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-AT--TAAAG-TTG--TTACTAA--AGAC----------------------GG------TAAGA---------------TT---AAAAA-
gi|16 : -----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TTG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAG-------G---G-TA--------CT-CTG--T----G-T--TTT-GTAAG-GA------C-AT----A-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTA--TACaaactag
gi|17 : atacatttacgacactttcaactgaccaaaactgccaggccactaatttttcaataccctcgcaatcacttcctCT--GTT--T-----------TG-----ACAC------AG-------A-G---G-----C----T-TT----AATCA-GT-GTT-A----ATA-T--G---AT--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGATC-T-TGT--GAAGCCTTGAAA----AATC---TGT--GT-----AAT-G------A------G------AT----CGG-------G---A-TA--------CT-GC----------T--TTC-GTAAG-GGC-----T-AT----C-T-AT-T--TC----A-GCACATTTCAAT-G-----ACGAAACT----AA-A----GA-GT----T-G--A--------T-----TA-AA-CTT-CACTC-TA--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGT------T----TTT-TT---
gi|18 : tgctttgtttcattattcatcaaacactggaaatcttttct--CA-GT-GTT-A----ATA-T--G---AG--GAAC-A-ACTTATGG-C-TTTCTTTATC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GC-----AAT-G------G------G------AT----CAA-------A---G-TA--------CA-GC----------T--TTT-GTAtttttttttttggttttttttaataaaagctatactt
gi|19 : tacttttacaagaataattttatgaaattttgagaaaagagaaaattcaaacctgtttgctttgtttcattattagtctaaaaggaaaatggaattttattaaacactgaaaatctccgtttctgtgttttaatatagaggccttaatACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TG-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATTTGCTG-GAA-GAATT-AATCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------TTACATGTACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AT---T---GGGCCC-TGATTCGGT-A--AT-T-A-------A---CAC---------------------------ATGC------AATTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GA--TAAC-A-G----TTG---TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATttttg
gi|2 : TATCGGATCA-GCCTTTA---TTT-T---A-CCG----A-GTACTGACATGGTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATTC---C-GAAAGAATTTAATCCCTTCAAT-TGTG---CAATTG------T----CT----------T-------ACTTA-TT--ATG-ACC--A--AT---T---GGGCC--TGATTCGGT-A--AATT-A-------A---CAC---------------------------ATGC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CACGTCGTC-T----ATA-T--A---AGAAGAAA-A-GA---TTG-TATCT--TGGT--T-TGTCGAAAG------AA----AATGATACAT--GT-----ACT-TAATATTG------G------AA----ATG-------G---G-TA--------C--GTA--CACTGG-T--TTT-GTAAGAGA------C-AT----C-T-AT-T--TT----G-ACACAAATCAAA-A-----ATGAAATA----AAGA----GA-TA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTTCCACTC--T--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAAGGTTA--TACT
gi|20 : GTTTTA-CA-A---GGGC--T----T-TA----A--TC-GT-GTT-A----AAAAT--A---GA--GAAT-A-G----TGGGT-TTT--TGACC-T-TGT--GAAG------AA----AATA---TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAA-------A---G-TA--------CT-GTG--C----GTT--TTT-GTAAG-GA------T-AT----CTT-AT-T--TT----G-GCACAT---A----------------A----AA-A----GA-G-----T----A--------T-----TC-AATTTT-CACTT-TT-----AG-TTT--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------TAAAC------T----TTTATTCC-AAAAA-GCTA--TACTT
gi|22 : t--CA-GT-ATTTA----ACA-T--A---GG--GAAC-------------------------C-TGT--GAGG------AA----AATC---TAT----------------------------------AA----TCG-------G---GATA--------CT-GC----------T--TTT-GTTAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GTACATTTCAAT-A-----ATGAAACC----AA-A----GA-GATAATT-A--A--------T-----TC-AG-CTC-CACTC-TT--GAAAG-TTT--TTGCTAA--AGAT----------------------GG------CATGC------T----TTtgtg
gi|23 : aggctttaaataatTTTTCGAAT-A-GCCTTTAATTTTT-TA-AA-CTG----A-ATGCTGAT---GTC--TA--TCTACTTAA--ATTGAC----GAATGTATTACCTC-GAA-GAACT-GCTCTCTTCA-TGTGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AC---T---GGGCTT-TGATTCGGT-A--A--C-G-------A---TACT--
gi|24 : T-CAGCC-TT--TAAAG-TTG--TTGCAAA--AGAC----------------------TG------TAAGC------T----TTT-TT---AAAAA-GCTA--TAATTGT
gi|25 : atttcggcaaaatacgttacaataacatataaatcatttttaaatcattgG-------G---G-TA--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-AACTT-TT--TGAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAACA-Gtaaattatcagtggtcaacattgaaaacagtgcgat
gi|26 : gtaaagaggctttaatcggtgt-----------TA-----ACAC------AGCTGTA-CG-A---G-----T----T-GC----A--CA-AT-GTT-A----AT--T----------GAAC---G----TGT-T-TTT--TGATT-T---T--GGAG------AA----AATG---TAT---T-----AC--T------G------G------AA----T-G-------G---G-TA---------T-GTG--C----C-T--TTT-GTAA-------------------------------------CATAT----AG-A-----ATAAAA-G----AA-A----GA-GAG---T-A--A--------T-----TC-AA-CT
gi|27 : tT-----ACT-T------G------GGAAGCGAA----TAG-------T---G-TA--------TT-CTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------A-AT----c
gi|27 : -A-----AGGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--AAA------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------TAAGCTTTTTTT----TTT-TT---TAAAA-GCTA--TACTTGTaaaagagataaaattcaacttcactctttaaagttgttgctaaagacggtaagctttttttttttttaaaagctatacttgt
gi|28 : tacttgggaagcgaatagtgtattctgcgttttgtAAA-A-----ATGAAA-A----AA-A----GA-GA----T-A--AATT-----TCAACATC-AA-CTT-CACGC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGACAAAGTTGTTGCTATTAAAAGATGG------TAAGC------T----TTT-TTAAAAAAAA-GCTA--TACTTG
gi|29 : TCA-T-TGTGGACCA-TTT------T----CTGAGGTGGTAAT------TACATG-TTT-ATG-CCC--A--TT---T---GGGCCC-TGATTTGGTAA--A--TAA-------A---TACT--ACTA-C-----------TA-----ATGT------AGATATA-CACA---A-----T---------------CA-GT-GTC-G----GTA-T--A---
gi|3 : ACTTATCGGAT-A-GCCTTTAATTTTT-TTTAA-CTG----A-GTACTAA----GTC--TA--CATACTAAA---TTGAC-----AATGTATTTACTC-GAA-GATTT-ACTCCCTTAA-T-TGTG---CA-TGT------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AT---T---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-ACATGTA-A---TACT--ATT--A-----------TA-----ACACGGTATGAGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----AT----------------------------------------C-T-TAT--GAAA------AA----AATA---TAT--GT-----ACT-T------G------G------AA----TAG-------G---G-TA--------CT-GTG--C----C-T--TTT-GTAAG-GA------T-CT----C-T-ATGT--TT----G-GCACATTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--ATTGAACGGT-----TC-AA-ATT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TT---ACAAA-GC
gi|31 : g----TGG-T-ATT--TTTTC-T-TTT--AAAG------AA----AATG---TCT--AT-----ATT-G------G------G------AA----TAG-------G---G-TG--------CT-GAA--C----G-T--TCT-GCAAG-GA------T-AT----T-T-AT-T--TT----T-GCACATTTctaccactt
gi|32 : gttgagtattT-AATCCCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TATCTG-TTT-ATG-ACC--AATAT---T---GGGCAA-TGATTCGGT-AATA--T-A-------A---TTCT--ATA--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----
gi|38 : A-A----GA-AA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTA-TT--TAGAG-TTA--TTGCTAATTAGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---TAAAA-GCTA--TAC
gi|39 : ATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CG-----------AA-TTC--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------CAAGC------T----TTT-TA---AAAAA-GCTAATTACTTGTattac
gi|4 : ACTTATCGAAT-A-GCCTTTAATTGTT-TG-AA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAT--ATTGAC----GATTGTATT--------------T-GCTCCCTTCT-T-TGTG---CG-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--ATTCAT---GGGCCC-TGATTCGGT-A--A--C-A-------A---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGTTGTA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GA--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ATT-T------G------G------AA----TAG-------G---G-TA--------CT-G----------------T-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-ACACATTTTAAATACCGGTATGAGATA----AA-AGACTGA-GA----T-A--A--------A-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCCAA--AGAA----------------------GGCATTGTCAAGC------T----TTT-TT---AGAAA-GCTA--TTCT
gi|40 : C-TCATTCGGT-A--A--T-A------------------------------------------TAC------AGTTGCA-CA-A---G-----T----T-GC----A--CA-GT---------------------------AC-A-G----TTG-T-TTT--TGGTC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---T
gi|41 : aT-CACTC-TAAATAAAG-TTG--CTGCTAA--AGAC----------------------GG------TAAGC------TTTGGTTT-TT---TTAAA-GCTA--TACT
gi|42 : TG-TTT-ATG-GCC--A--AT---G---GGGCCC-TGATTCGGT-A--G-------------------T--ATT--C-----------TA-----ACAC------ATTTGTT-CA-
gi|43 : TTTTT-TG-AA-CCG----A-GTACTGAT---GTCTATA--CATACTAAA--CTTGAC----GAATGTg
gi|45 : TG-TTT-ATG-CCC--A--TT---T---GGGCCC-TGCTTTGATAA--A--TAA-------A---TACT--A
gi|47 : ca-AA-CCG----A-GTACTGAT---GCC--TATACATACTAAA--GTTGAC----GAATGT
gi|48 : -A-------A---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGTACCA-A---G-----T----T-AC----A--CC-GT-GTT-A----
gi|5 : CTTATCGGAT-A-GCCTTTAGTTTTT-TT-AAACTG----A-GTACAGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTAATAACTC-GAA-GAATT-ACTCTCGTCA-T-TGTG---CA-TTG------T-------------------------------TT-ATG-ACC--A--AT---T---GGGCCC-TAATTCGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--C-----------TATTCTAACAC------AGTTGTA-CA-ATAGG-----C----T-TT----AATCA-GT-TTT-G----ATA-TATA---GG--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGATC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ACT-G------G------G------AA----TAG-------A---G-TA--------CT-ATA--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-G--TT----G-GCACATTTAAAA-A-----AAATAATA----AA-A----GA-GA----T-C--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------TAAGC------T----TTT-TT---
gi|6 : ACTTATTTTAT-ATGACTT--ATTTTTATA-AA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CACACTAAA--TTTGAC----TAATGTAT-AACTC-GAA-GAATT-ACTCTCTTCA-T-TGTG---CA-TTGCAATTGT----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--GT---T---CGGCCC-TGATTCGGT-A--A--T-ATAAAGCTA---TACT--ATT--C-----------TA-----ACAC------AGCTGTA-CA-A---GAGGCTT----T-AA----T--CA-GT-GTT-AATATATA-T--A---GG--GAGC-A-G----TGG---TTT--TGTTC---------------------------G---TAT--GC-----ACT-T------G------GAATAT-AA----TAG-------G---G-CT--------CT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GG------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACAGTTCAAA-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TGACG-TTG--TTGTTAA--AGAC----------------------G
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gi|8 : CTTATCGGAT-A-GCCTTTAATATTT-TA-AA-CTGCATGA-GTACTGAT---GCC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATCAACTC-GAA-GAATA-ACTCTCTTCA-T-TGTG---CA-TTG------T----CT----------T------TACTTG-TTT-ATG-ACC--A--AT---T---GGACCC-TGATTTGGT-A--A--T-A-------A---TACT--ATT--T-----------TA-----ACAC------AGTTGCA-TA-A---G-----A----T-GCTTTTAATCA-GT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GGAC-A-G----TGGTT-TTT--TGATC-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TA---GT-----TCT-T------G------A------AA----TAG-------G---G-CA--------CT-ATGTTC----G-T--TTA-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-T--TT----G-GCACATTTCCAA-A-----TTGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CCCTC-TT--TAAAG-TTG--TTG
gi|9 : TTATCGGAA-A-TCCTTTAATTTTT-AA-AA-CTG----A-GTACTGAT---GTC--TA--CATACTAAA--ATTGAC----GAATGTATTAACTCGGAA-GAATT-ACTCTCTTCA-T-TGCT---CA-TTG------T----C------------------TACTTG-TTT-ATG-GCC--A--AT---G---GGACCT-TGATTCGGT-T--A--T-A-------A---TA----ATT---------------------GCAC------A-----A-GA-A---G-----C----T-TT----AATCA-AT-GTT-A----ATA-T--A---GG--GAAC-A-G----TGG-T-TTT--TGGTT-T-TGT--GAAG------AA----AATG---TAT--GT-----ACT-T------GGGAAGCG------AA----TAG-------T---G-TA--------TT-GTG--C----G-T--TTT-GTAAG-GA------T-AT----C-T-AT-A--TTGGCCG-GCACATTTCAAG-A-----ATGAAATA----AA-A----GA-GA----T-A--A--------T-----TC-AA-CTT-CACTC-TT--TAAAG-TTG--TTGCTAA--AGAC----------------------GG------
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