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gi|37 : tacaatagattttaatttaccgttaatcatacgccttgtgaacatcgagcaaggtttagttttatggatctttgcaaatgtgatcgacaaacagaaaacaaaagttttaatggcacaagcggcagatcaccagataataaatggatgctgtataagcgtttgatttagttgacacgctcggtaatataatgagcatgtttatcgtaacagttaagcaagttaggattgcagatacacaacattgtttatacttggtacctgtatcagtaatacatgcgcgtgtatatatatatattttttatttttaagtgatctcaaacagcgaaaattaatcaacatgaaatcgtgttaactCGTATTT-A--ATTTCGT-GTT-GGATNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNNNNNNNN--NN--NNNNN----NNNN--NNNNNNNNN--NNN-NNNN-NNNN-NNNN--AT-T---TA---CAG--AAACTC--TTT--ATTTT----AATGTTA-GA-A-GTCCGTGTCTC-TATT-ATTCGT-AGT-CCATGTAAActt
gi|52 : gaCGTATTT-A--ATTTCGT-GTT-GGATTAAATTTC--GTTATGTT--CGTGTCTGG--AA--GTAAA----CAAC--GAAAg
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gi|36 : --T-CCAT-ATGTAGC-CA-T-TAACTCGACACAGGTGCCA-A-G-TT-----AAAATGGTTCG-------A-TG--ATTAG-AATGATTACTATCAAAAta
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gi|28 : atacatgtacaaatATTAAGAATGATGACTGTCAAAACAGG-AC-AG-TTCA--TA-T----ATAGACGC--------TAA-CTCG--AC------CCGGG-----------------------------------------------TG-CAAGTTA-GAAA----G-GGT-----TG-A-TG-Ttttaaacatcctgttgacttttgttaaacactcaggcgtatatacgtaaccgattgatgattgtattaatattggcactcttgaatcttcatacataggtaaaaatgtcgagtatatcgtaatagttagctacgcaagttagaattgcagaaaagaacatttttttatacttggtacgctagtgcatacatatatgtattttcaagtcttgtcaaacaccgaaaattaatccatacatcttcccaacgatatcaaatacgtttg
gi|44 : gaattttattttcagaaaatctgtatttcaaaattagataatatgtgtctctgttattcgtagtccatgtttagtaaacatatttcgccaatactgtaatcaactgtacccgcattttgttgtATTAAGAATGATTGCTGTCAAAGCAGG-AC-AG-TTCA--TA-T----ATAGACAC--------TAA-CTCG--ACA-----CGGG------------------------------------------------TG-CAAGTTA-AAAA----G-GGT-----TG-A-TG-Taattaagaatgattact
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gi|35 : TC------------------AC----------A--TA-------------TT--GTA--------T---TG--TAC-------GGC-T------------G------G-----------AC-------GTGCT------------------AAAT-ATT----------GTTC---------------AT-------------T-------AGTTC---TT-TTGTA-GACGGT-TAT-AAGGAA-----------AC-----------GT--------GAT-------CTAT-GAACATCGAGCACCGAGCA-GGGT-------GT-G--A-------GC-A--T-C-AAC----C-CTAATTCAACGG-agccaacgcagatcaccggataataattg
gi|49 : atttcaattcactgttaaccatacggTC------------------AC----------A--TT-------------TT--CTT--------T---TG--TAC-------GAG-T------------G------G-----------GT-------GTGTT------------------AGAT-ATT----------GT-----------------g
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gi|17 : tacaatagattttaatttaccgttaatcata--------GCC-------CTAT-GAACAT-------CAAGCA-GGGT-------GT-GA---------GC-A--T-C-AAC----C-CTGGTTCAACAG-G----T-C-TT-T-GCGAATTTTATA-GA--CAAATGGAATA-CA------------AA------TTAATCT------T-A-C---------A----T------TTCAA---TG-ACA--C-AAGCAAAC----A----CA--G-ATCACTA--G---G-----TAAT---TAA-----------GTGCT----A------------CTT---TAA---T-TGACA-----TGCTTA-AT-------A-----A---TA----------------T--------------A-------T-TG---GGTGA--G-T--GTATCGT-------------AA-CG----GTATA-------T-ACA--T-GC--ATAACA-Actt
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gi|55 : gac-GGGC-------AT-GA---------GC-A--T-C-AAC----C-CTGGTTCAACAG-G----T-C-TT-agtga
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|13 : tggtaat--TT----TC---ATCTGG---TGA-TACGAC-TC--CTGGGCCGCA-TAC-C-----GCACT--ATG--AA-T----TT--GT--------------------TTTTAAAAATAAAT----TT-C----AACTTACCGCTAACCA-----TA------GG------TC-------------------AT-------------------------A--TG-------------TT--CTA--------T---TG--T-----------T-T------------A------A--------------------------TGTAA---------------AGAC---AAAGA-T--------------A--A---------------TC-------A---------TT-TTGTA-GAAAGT-TAT-AAGGAA-----------AC-----------GT--------ACT-------TTAT-GAACAT-------CAAG-CAGGA--------------------------------------TTC-A---ATAG-GTCTT-T-TT-GAATTTTA-TC---A----CA--A----------T-A-------------------------------AT------C----T--AA------C---------A----T------T--TT------G-ACA--C-GAG----CGA----A----CT--GA-TCACG-A---G---G---GAAT-----------TAAGAGC------------T----AGTTTAGTTG-ACA-----CGTTTG-------AT---G-A---TA--T--------------AAAG--G--GCG-A-G-TGTATTGT-------------AA-CG------GTATA-------TAatcataatgagttgttttaacaatatattccaatctactgttaacaggacagtcactaggttgatgttattttcggtttgtttctaattattaattttgtatcatttaaggatatacttgtcctaatgacccctttttacatcaaatagggcatgtgtatgttaaagcaggt
gi|13 : ----------CAA-CA-TT---GTTTA-------AAC-C-GGGTA----CC----CA--TA-------CTCGT-A-ATATTT--------A---C---------ATG--TATTT---TT--TTT-----TA---TTTT-tgtatgtgatgattgcaaataatcaacattgtttaaaccgggtacccatactcgtaatatttacatgtatttttttttatttttatgt
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gi|27 : tttgacacgcttgataatgtatagagcgagtgcatcgtaacggtacatatatatgcatgtaatcaagctaggactatagataag----------CAA-CA-TT---GTTTA-------TTC-T-TCACA----AT-----G--TA-------TCCGT-A-CTACAT--------A---T---GTGTATATT--T-TTT---TT--TTT-----CA---TTTTTAAGTTA--T-CT-CAAGCAATG--AT---GA-TTAA--------TCCA-CA-C---AAA--A--TCA-TGTT--CACT--AC---AAAAACAA--CAAA--AT--TTTTT-----CC-AGACAAAATTAA---A--TACGTtta
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gi|30 : tgtaga----------C------C---GC---T--TT----TC---TTCAAGTTATGA-TA-GAC-TCTGTTGATCCGCA-TAA-T------CACC--ATG--AAGG----TT--GA--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------ttacag
gi|31 : actctgaagttcCAT--------A---T----------TG--T-TTT---GT--TTT-----T----TTTT-AAGTGT--C-CT-AAACCAACA--AA---AA-TTAAATTAAAGTTCCA-AC-C---GCA--A--CCA-TGTTCATATT--AC---AAAAACAA--TAGA--AT--TTTTTTTTACCCACAACGAAATTAAATTA--TACGTcaatattgaaattttaccgtttaatcgtatggtcacacgcaatgtaacatgtaactgatttttctttagtagtgtgttaaatatattggtatataatgtaataactgttttgtggc
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gi|35 : --AA-T----TC--AC--------------------T------------G----TT-A----A------------CCA-----TA------CG------GTC------------------AC-------------------------A--TA-------------TT--GTA--------T---TG--TAC-------GGC-T------------G------G-----------AC-----G-------TGCTA---------------A-AT---ATTGT-TC-------------A-T----------------T--------AGTTC-----TT-TTGTA-GACGGT-TAT-AAGGAA-----------AC-----------GT--------GAT-------CTAT-GAACATCGAGCACCGAG-CAGGG--------TG------TG---AG-CATC-AACC-CTAATTC-A---ACGG-Gtttacaca
gi|36 : atttcAAACG-G-AAA-GTTCCATAT-GTAGCCA-TT-AACTCGACACAGGTGCCA-A-G-------TT--AAAATGGTTCG-------A-TG--ATT-AGAATGATTACTATCAAAAAATAGTAC----------------AAGAC------------------ACAA--AG-TCGG-------------G-G--------------------
gi|37 : CGTATTT-A--ATTTCGTGTT-GGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN--NNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNN--ATTTA---CAG--AAACTCTTT--ATTTTAATGTTAGA-A-GTCCGTGTCTC-TAT-TATT--CGTAGT-CCATGTAAAtagaaatcgtagtgcagctgacagctcaatgctaacagcgcct
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Reference ( family-842 ) : CGTATTT-A--ATTTCGTGTT-GGATTAAATTTCGTTATTTTCGTGTCTGGACGAAAA----CAAC--GAAATTAAATCCAACN-CGAA-TTTT--ATTTA---AAG--AAACTTTTT-TATTTCAATGTTAGA-A-GTCCGTGTCTC-TGTTATT--CNTAGT-CCATGTAAAAANAA-CATATTTCGCAAGTTCCGTAC-T-AA-TGTACCC-C-ATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAG--AT-GTACGCGCGCTTT--G----------AATGATTACTAT-C-AAAACA-T-ACA-GTTC-ATAT-TTAGACG-CT-AACTCGACACGGGTGCAA--A--G-------TT--AAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATGATTACTATC--AAAACAGTNCGG-GTCAATT-T----AAGATAC--------T-AACTCGACAAAG--TCGG-------------G-------------G--------------------A------------------------CA--------TG-CATA-----CAGCGCGTT-----TGA-TA-TGC--CG-CTG----AGA-A-GAAAC-CC--GT----CCGTG-CA----A----AG-------------T-----------------TT---A--T------G-ACACCCGTGG----ATTCAC-------ATG-------T------T---A---GTA----------C------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TC--CTGAGCCGCA-TAC-C-----GCACC--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GGT-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT---------T--------A-TA---------------T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGG--------CG------TG--CAG-CATC-AACC-CTGGTTC-A---ACAG-GTC-TT-TNC-GAATTTTA-TC-G-A----CA--AAC---GGAN-T-AC------AAANNAA---------CC---T-G-A------CA----T-T--TT-------------AA---TG-ACA--CAAG----C------A----CG--GA-TCACC-G---GG---TAAT-----------TAGGTGC------------TAATTCANTTG-ACANGCTTG-------AT---A-AT--A--T--------------AAAG--G--GCG-G-G-TGTATCGT-A----------CAA-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------A---T---G---A-ATGT-TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--C--G--AT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TACGT
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gi|13 : tggtaat--TT----TC---ATCTGG---TGA-TACGAC-TC--CTGGGCCGCA-TAC-C-----GCACT--ATG--AA-T----TT--GT--------------------TTTTAAAAATAAAT----TT-C----AACTTACCGCTAACCA-----TA------GG------TC-------------------AT-------------------------A--TG-------------TT--CTA--------T---TG--T-----------T-T------------A------A--------------------------TGTAA---------------AGAC---AAAGA---------T--------A--A---------------TC-------A---------TT-TTGTA-GAAAGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GT--------ACT-------TTAT-GAACAT-------CAAG-CAGGA--------------------------------------TTC-A---ATAG-GTC-TT-TTT-GAATTTTA-TC-------------------------AC------AA--TAA---------TC---T-A-A------CA----T-T--TT-------------------G-ACA--CGAG----CGA----A----CT--GA-TCACG-A---GG---GAAT-----------TAAGAGC------------TAGTTTAGTTG-ACACGTTTG-------AT---G-AT--A--T--------------AAAG--G--GCG-A-G-TGTATTGT-------------AA-CG------GTATA-------TAatcataatgagttgttttaacaatatattccaatctactgttaacaggacagtcactaggttgatgttattttcggtttgtttctaattattaattttgtatcatttaaggatatacttgtcctaatgacccctttttacatcaaatagggcatgtgtatgttaaagcaggt
gi|13 : ----------CAA-CA-TT---GTTTA-------AAC-C-GG--GTA----C---------C----CA--TA--------------CTCGT-A-ATATTT--------A---C---------ATGTATT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-tgtatgtgatgattgcaaataatcaacattgtttaaaccgggtacccatactcgtaatatttacatgtatttttttttatttttatgt
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gi|21 : TATTT-A--ATTTCGTGTT-GGATTAATTTTCGTTATTTTCGTGTCTTGAAGAAAA----CAAC--AAAATTAAATCCAACA-CGAA-TTTT--ATTTACTTAAA--A----TATG-TATTTCAAAGTTAGA-A-ATATGTATCAC-TGTTATT--CGAAAT-CCATGTATATATAA-CAGA--TCG---------------------ACAC-C-ACTGTATTC-CTGAG-GAGTAG--AT-GTAGCCGCACTTT--GTTGTGTTAGCAATGATTGCTAT-C-AAAACAGT-ACAGGGTC-ATAT-TTACACA-CT-ATCTCGACAGGGGTGT-A--A--G-------TT--ATATCGGTTTC-------A-TGTAATT
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gi|25 : --G--GTG-A-C-TGTATCGT-AACTGTATAAGCAA-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GG--GCA----C---------A----CA--TA--------------T-----------AT--------A---T---G-------GT-TT-------T---TT--T---TT-----AAAATTTTT-AAGTGA--T-CT-TAAACAACG--AT---AA-TAAAG-------TCCA-CA-T---GAA--A--TCG-TGTT-C--ATT--AC---AAAAACAA--C--GA-AT--TTTTT----TCC-CAACGAAta
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gi|30 : tgtaga----------C------C---GC---T--TT----TC---TTCAAGTTATGA-TA-GAC-TCTGTTGATCCGCA-TAA-T------CACC--ATG--AAGG----TT--GA--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------ttacag
gi|31 : actctgaagttcCAT--------A---T----------TGT-TT-------T---GT--T---TT-----T----TTTT-AAGTGT--C-CT-AAACCAACA--AA---AA-TTAAATTAAAGTTCCA-AC-C---GCA--A--CCA-TGTT-CATATT--AC---AAAAACAA--TAGA--AT--TTTTTTTTACCCACAACGAAATTAAATTA--TACGTcaatattgaaattttaccgtttaatcgtatggtcacacgcaatgtaacatgtaactgatttttctttagtagtgtgttaaatatattggtatataatgtaataactgttttgtggc
gi|33 : atatcgttgattttcttttcctactacatcagtttaaatcagtgtat--------TG-CAGT-----CAGTTCATT-----GTA-TG-TGT--CG-CTG----AGGCA-GAACC-CA--GT----CCGTG-CA----A----AATTGTATGTGGTT-T-----------------TT---A--T------G-ACGCCCGTGG----ATTCAC-------ACG-------ttacagta
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gi|12 : ----------AATGATTAGTAT-C-AAAACAGT-TCT-TTTT-ATAT-CAAAGCAACT-AACTCGACACA--TGCAA--A--TATTTTTTTT--AGA-----TTA-------A-TGTAAAGAAGAATTATCAATATG--AAAACAGTACTG-GTCAAAT-T----AAGATAG----------AACTCGACAAAGAG-TAGG-------------GAG--------------------ATTGGATTACAGACAACTGCT----CATG-CATA-----CAGTGTCTT-----TGA-TA-TGC--CA-CTG----GCA-G-TAAAC-CT--AT----CAGTT-AA----A----CA-------------T-----------------TTTTCA--G------A-ATGTCTGTAG----ATTGAT-------ATG-------TATCATGT---AC--GTA----------T------T---CA---T--GT----TCGTTTTCAGG---TGA-TACGAC-gttt
gi|13 : tggtaat--TT----TC---ATCTGG---TGA-TACGAC-TC--CTGGGCCGCA-TAC-C-----GCACT--ATG--AA-T----TT--GT--------------------TTTTAAAAATAAAT----TT-C----AACTTACCGCTAACCA-----TA------GG------TC-------------------AT-------------------------A--TG-------------TT--CTA--------T---TG--T-----------T-T------------A------A--------------------------TGTAA---------------AGAC---AAAGA---------T--------A--A---------------TC-------A---------TT-TTGTA-GAAAGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GT--------ACT-------TTAT-GAACAT-------CAAG-CAGGA--------------------------------------TTC-A---ATAG-GTC-TT-TT-TGAATTTTA-TC-------------------------AC------AA--TAA---------TC---T-AA------C----AT-T--TT-------------------G-ACA--CGA--G----CGA----A----CT--GA-TCAC-GA---GG---GAAT-----------TAAGAGC------------TAGTTTAGTTG-ACACGTTTG-------A-T---G-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-A-G-T--GTATTGT-------------A------A-CG------GTATA-------TAatcataatgagttgttttaacaatatattccaatctactgttaacaggacagtcactaggttgatgttattttcggtttgtttctaattattaattttgtatcatttaaggatatacttgtcctaatgacccctttttacatcaaatagggcatgtgtatgttaaagcaggt
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gi|21 : TATTT-A--ATTTCGTG-TT-GGATTAATTTTCGTTATTTTCGTGTCTTGAAGAAAA----CAAC--AAAATTAAATCCAAC-ACGAA-TTTT--ATTTACTTAAA--A----TATG-TATTTCAAAGTT-AGA-A-ATATGTATCAC-TGTTA-TT-CGA-AA-TCCATGTATATATAA-CAGA--TCG---------------------A-CAC-CACTGTATTC-CTGAG-GAGTAG--AT-GTAGCCGCACTTT--GTTGTGTTAGCAATGATTGCTAT-C-AAAACAGT-ACAGGGTC-ATAT-TTACACA-CT-ATCTCGACAGGGGTGT-A--A--G-------TT--ATATCGGTTTC-------A-TGTAATT
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gi|25 : --G--GTG-A-C-T--GTATCGT-AACTGTATAAGCA------A-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GG--GCA----C---------A----CA--TA--------------T-----------AT--------A---T---G-------GT-TT-------T---TT--T---TT-----AAAATTTTT-AAGTGA--T-CT-TAAACAACG--AT---AA-TAAAG-------TCCA-CA-T---GAA--A--TCG-TGTT-C--ATT--AC---AAAAACAA--C--GA-AT--TTTTT----TCC-CAACGAAta
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gi|27 : tATTTAGTTG-ACACACTTG-------AGC---A-AGTGTA--TCGTA----------AAACAATTTA--A--GCA-A-G-TTAGGATTGC-A----------CATACGCAA-CA-TT---GTTTA-------TTC-T-TC--ACA----A---------T-----G--TA--------------TCCGT-A-CTACAT--------A---T---GTGTATATTT-TT-------T---TT--T---TT-----CA---TTTTTAAGTTA--T-CT-CAAGCAATG--AT---GA-TTAA--------TCCA-CA-C---AAA--A--TCA-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--CAAA--AT--TTTTT-----CC-AGACAAAATTAA---A--TACGTtta
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gi|30 : tgtaga----------C------C---GC---T--TT----TC---TTCAAGTTATGA-TA-GAC-TCTGTTGATCCGCA-TAA-T------CACC--ATG--AAGG----TT--GA--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------ttacag
gi|31 : actctgaagttcCAT--------A---T----------TGT-TT-------T---GT--T---TT-----T----TTTT-AAGTGT--C-CT-AAACCAACA--AA---AA-TTAAATTAAAGTTCCA-AC-C---GCA--A--CCA-TGTT-CATATT--AC---AAAAACAA--TAGA--AT--TTTTTTTTACCCACAACGAAATTAAATTA--TACGTcaatattgaaattttaccgtttaatcgtatggtcacacgcaatgtaacatgtaactgatttttctttagtagtgtgttaaatatattggtatataatgtaataactgttttgtggc
gi|33 : atatcgttgattttcttttcctactacatcagtttaaatcagtgtatTG-CAGT-----CAGTTCATT-----GTA-TG-TGT--CG-CTG----AGGCA-GAACC-CA--GT----CCGTG-CA----A----AATTGTATGTGGTT-T-----------------TT---A--T------G-ACGCCCGTGG----ATTCAC-------ACG-------ttacagta
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gi|36 : atttcAAACG-G-AAA-GTTCCATAT-GTAGCCA-TT-AACTCGACACAGGTGCCA--A--G-------TT--AAAATGGTTCG-------A-TG--ATT-AGAATGATTACTATCAAAAAATAGTAC----------------AAGAC------------------ACAA--AG-TCGG-------------G-G--------------------
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gi|11 : attccagggtgctatttggtaataccataagacaaaatcagggaagatcggattacatgtagacagcacatttgatatgccactgagacacaacctgtaaaacctaatgtcattttttttaagacacccgtggattcacatgcacactgtaagtatccacgcttttcttcaggtgatacgacttctcagccgcataccacaccatgagtatgtttatcccaccatgagtatgtttttcacaatagatttcaatttaaccgtacagtcacatgcatataactgatgttctgttgtacggctaggggtgtcaaatattgtttccatataacatttattttgtagcagattaaggaaatgtaccatactggctatgaacattgagcagggtgtaggcatctgggtctttgggaattttatcaacaggatacaaaattatttaaacattttagtgacaagcgaacacagatcacggggtaattaagtgctaatttagttgacaatataaggggcgagtgtatcgtaacagtatctaagcaagttaggattgcatatagC--CG-CTT----AGA-A-GAAAC-CC--GT----CCGTG-CA----A----AT-------------T-----------------TC---A--T------G-ACACCCGTGA-------CAC-------ATG-------T------A---A---GTA----------T------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TT--CTGAGCCGCA-TAC-C-----GCATT--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TG------AA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GAC-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT---------TCA------A-TAGTTATATATAGT---T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GTC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGG--------CG------TGT-CAG-TATC-AACC-CTGGTTC-A---ACAG-GTC-TT-TC-CGAACTTCA-TC-G-A----CA--AAC---GG-----------G-TT-AC------AAAATAA---------TC-------T-GA------C---------AT--T--TC-------------AA---TG-ACA--CAA--GCGAAC------A----CG--GA-TCAC-CG---G---G---TAAT-----------TAAGTGC------------TAATT-CATT------TG-ACA-GGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-G-G-T--GTATCGT-A----------CA------A-TT-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACTT--------A---T---G---G-A-AT-TT-------------------------------TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-A--ACT--AC---AAAAACAA--C--GAAAT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TA
gi|12 : ----------AATGATTAGTAT-C-AAAACAGT-TCT-TTTT-ATAT-CAAAGCAACT-AACTCGACACA--TGCAA--A--TATTTTTTTT--AGA-----TTA-------A-TGTAAAGAAGAATTATCAATATG--AAAACAGTACTG-GTCAAAT-T----AAGATAG----------AACTCGACAAAGAG-TAGG-------------GAG--------------------ATTGGATTACAGACAACTGCT----CATG-CATA-----CAGTGTCTT-----TGA-TA-TGC--CA-CTG----GCA-G-TAAAC-CT--AT----CAGTT-AA----A----CA-------------T-----------------TTTTCA--G------A-ATGTCTGTAG----ATTGAT-------ATG-------TATCATGT---AC--GTA----------T------T---CA---T--GT----TCGTTTTCAGG---TGA-TACGAC-gttt
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gi|16 : gacacatcaagcagggcatgagcatcaacctgttcaacaggtctttgccgaatttcactagaccaaagaactcacaaattaatctctacaatttcaatgacacaagcaaacacagagtcactaggctaattaattgctactttaattgaacatgcttataatatattgggctgattatcgtaacgcgtatatacagcactaagcataGTT-----TGA-TG-TCC--TG-CGG----AGG-C-AAAAC-CC--GT----CCGTG-TA----A----AA-------------T-----------------T----A--T------G-ACAACCGTGG----GTTCAC-------A--------------------A---GCA----------C------C---AA---G--TA----TA---TTTAGG---TGA-TACGAC-TC--CAGAACTGCA-TAC--------CATCTAATG--GA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAATACACTA------GA------TTT-------------------C-------------------------AATTGA------------TT--TTCGA------T---CG--TAC-------TGT-CTCAT--------GCATATTA-----------GA-----A-------TGTTA---------------G-AT---ATTATTGGTGCCGGT--------A-TATAATAGC--------T--------A---------TT-TTGTA-GAA----TATT-AAGGAA-----------AT-----------GT--------GTC-------TAGT-GAACAT-------CGAG-AAAGG--------TA------TG--GA--CATC-TACC-CTAGTTC-T---ACAG-GTC-TT-TA-CGAATTTTA-TC-G-A----CA--AAC---GG-----------A-AT-AC------AAAA-----------------------GA----------------AT--T--TT-------------AA---AG-GCA--CAA--G----CGA----A----CGCAGA-CCAC-AG---G---A---TAAT-----------AAGagtga
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gi|19 : tgagcatcaaccctgttcaacaggtctttgcgaatttatagacaaatgaatacaaattaatcttacatttcaatgacacaagcaaacacagatcactaggtaattaattgctactttaattgacatgcttgaataatatattgggtgagtgtatcgtaacggtatatacatgcataagcaagtgagtattgcaataag-TTGTA-GAAAGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------------------T-------CTATAGAACAT-------CAAG-CAAGGATTCATTACG------TT--C---CATT---CC-ATTGCAC-T---TCAG-ATGATT-TG---AATTTTA-TT-G-AACTTCACTGACTCAGG-----------AGAT-AC--------AATGA---------CCAT-----T-AA------CAATA-----AT--C--CT-------------AACTTTG-ACA--CGATCG----A------A----CT--GA-TCACGAG---G---G---GAAT-----------TAAGAGC------------TAGTT-T-GT------TG-ACA-CGTT-TG-------A-TG--G-A---TA--T--------------AAA------G--G--GGA-G-C-T--GTATTGT-------------A------A-CG------GTATA-------TAagtgaga
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gi|2 : ttgtagaaagttataaggaaactctatagaacatcaagcaaggattcattacgttccattccattgcacttcagatgatttgaattttattgaacttcactgactcaggagatacaatgaccattaacaataatcctaactttgacacgatcgaactgatcacgaggggaattaagagctagtttgttgacacgtttgatggatataaaggggagctgtattgtaacggtatatatgtatgtgatgattgcaaataatGTATTTTA--ATTTCGTG-TTTGGATTAAATTTCGTTATTGTCGTGTCTG-ACGAAAAA---TAACCGAAAATTAAATCCAAC-TCGAA-TTTT--ATTTA---AAGTAAAACTTTTT-ATTTTCAATG-T-AAA-A-GTTCA-GTCTC-T-TTATTTCCTT-AGTTCCATGTAAAAAAAA-CATATTTCACAAGTTCCGTAC---AA-TGTACCCC-CATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAGAAAT-GTACG-GCGCTTTG-G----------AATGA-GACTATCC-AAAACA-T-ATA---TC-ATAA-TTAGACG--T-AACTCCATACGGGTAAAC--A--G-------TTTAAGAAAGGTTCG-------A-TGCAATTAGGAATGA-TACTATC--AAAACA-TTCGGAGTTAATTGT----AAGATAC--------TAAACTCGACAA--AG-TC-A-------------G-G--------------------A------------------------CATG-CATA-----CAAAACGTT-----TGA--A-TGC--CG-CTT----AGA-ATGAAGC-CC--GT----CGCTG-AA----A----AG-------------T-----------------TT---AG-T------GAAAATCCGTGG-------CA--------ATG-------T------T---A---GTA----------C------C---GA------TT----TC---TTCAGGT--TGA-TACGAC-TT--CTGAGCCGCATTACTT-----GCA-T--ATGGAAA-T----CT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TG------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------T----TC--------T---TG--TAC--------GT-C------------G------G------------------G-------TGTT----------------A-AT---ATTG----------T--------A-TA---------------T--------A---------TT-TCGTATGACGTT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACA--------CGAGCCAGGG--------TG-------A--CAGCCATC-AA-C-CTGG-TC-A---ACAGAATC-TT-TC-CGAATTTCA-TTAA-A----CA--AAC---GG-----------A-TT-AC-------AAAT-A---------CC-------G-GAT-----C---------ATA-T--TT-------------AA---TT-ACAC-CAA--A----C------A----CG--GG--CA--CG---G---G---TAAT-----------TAGGTCC------------TAATT-CATT------TG-ACA-GGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--CAGTG-T-T--GTATCGG-A----------CA------A-TGTTT---GTTTAT------TACTT-GC--GTA----C---------C----AA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------AT--T---G---A-ATG--TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTAA--T-CT-AAAACAACG--AA---TA-TAAA--------TCCA-CA-CAGAAAA--A--TCG-TGTT-A--ACT--AC---AAAAACAA--C--GA-AT--TTTTC----CCC-CAACGAAATTAA---AATTACGTgta
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gi|24 : TTC-AAAT-TTCGACA-CT-TACTCGCCACAGGTACAT-----G-------CT--GAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATTATTACT----------------G-ACCGCTT-T----AAGATAC--------T-AACTCAACAA--AA-TCGG-------------G-G--------------------AAGATCGCATCACAGCTAACGGCT-CATG-CAGT-----CAGCGCGTT-----TGA-TG-TGCCGCG-CTG----AGG-T-AAAAT-CC--GT----CCGTG-CA----A----AATGTGTAGTGATTTT-----------------TT---A--T------G-ACATCCATGG----ATTCCC-------CT-----------------------GCA----------C------C---AA---G--TA----TC---TTCAGT---CGA-TACGAA-TC--TCGAGCCGCA-TAaattg
gi|25 : --G--GTG-A-C-T--GTATCGT-AACTGTATAAGCA------A-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GG--GCA----C---------A----CA--TA--------------T-----------AT--------A---T---G-------GT-TT-------T---TT--T---TT-----AAAATTTTT-AAGTGA--T-CT-TAAACAACG--AT---AA-TAAAG-------TCCA-CA-T---GAA--A--TCG-TGTT-C--ATT--AC---AAAAACAA--C--GA-AT--TTTTT----TCC-CAACGAAta
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gi|27 : tATT-TAGT------TG-ACA-CACT-TG-------AGC---A-AGTGTA--TCGTA----------AAACAATTTA--A--GCA-A-G-TTAGGATTGC-A----------CATACGCAA-CA-TT---GTTTA-------TTC-T-TC--ACA----A---------T-----G--TA--------------TCCGT-A-CTACAT--------A---T---GTGTATATTT-TT-------T---TT--T---TT-----CA---TTTTTAAGTTA--T-CT-CAAGCAATG--AT---GA-TTAA--------TCCA-CA-C---AAA--A--TCA-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--CAAA--AT--TTTTT-----CC-AGACAAAATTAA---A--TACGTtta
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gi|30 : tgtaga----------C------C---GC---T--TT----TC---TTCAAGTTATGA-TA-GAC-TCTGTTGATCCGCA-TAA-T------CACC--ATG--AAGG----TT--GA--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------ttacag
gi|31 : actctgaagttcCAT--------A---T----------TGT-TT-------T---GT--T---TT-----T----TTTT-AAGTGT--C-CT-AAACCAACA--AA---AA-TTAAATTAAAGTTCCA-AC-C---GCA--A--CCA-TGTT-CATATT--AC---AAAAACAA--TAGA--AT--TTTTTTTTACCCACAACGAAATTAAATTA--TACGTcaatattgaaattttaccgtttaatcgtatggtcacacgcaatgtaacatgtaactgatttttctttagtagtgtgttaaatatattggtatataatgtaataactgttttgtggc
gi|33 : atatcgttgattttcttttcctactacatcagtttaaatcagtgtatTG-CAGT-----CAGTTCATT-----GTA-TG-TGT--CG-CTG----AGGCA-GAACC-CA--GT----CCGTG-CA----A----AATTGTATGTGGTT-T-----------------TT---A--T------G-ACGCCCGTGG----ATTCAC-------ACG-------ttacagta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : attccagggtgctatttggtaataccataagacaaaatcagggaagatcggattacatgtagacagcacatttgatatgccactgagacacaacctgtaaaacctaatgtcattttttttaagacacccgtggattcacatgcacactgtaagtatccacgcttttcttcaggtgatacgacttctcagccgcataccacaccatgagtatgtttatcccaccatgagtatgtttttcacaatagatttcaatttaaccgtacagtcacatgcatataactgatgttctgttgtacggctaggggtgtcaaatattgtttccatataacatttattttgtagcagattaaggaaatgtaccatactggctatgaacattgagcagggtgtaggcatctgggtctttgggaattttatcaacaggatacaaaattatttaaacattttagtgacaagcgaacacagatcacggggtaattaagtgctaatttagttgacaatataaggggcgagtgtatcgtaacagtatctaagcaagttaggattgcatatagC--CG-CTT----AGA-A-GAAAC-CC--GT----CCGTG-CA----A----AT-------------T-----------------TC---A--T------G-ACACCCGTGA-------CAC-------ATG-------T------A---A---GTA----------T------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TT--CTGAGCCGCA-TAC-C-----GCATT--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TG------AA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GAC-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT---------TCA------A-TAGTTATATATAGT---T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GTC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGG--------CG------TGT-CAG-TATC-AACC-CTGGTTC-A---ACAG-GTC-TT-TC-CGAACTTCA-TC-G-A----CA--AAC---GGG-----------TT-AC------AAAATAA---------TC-------T-GA------C---------AT--T--TC-------------AA---TG-ACA--CAA--GCGAAC------A----CG--GA-TCAC-CG---G---G---TAAT-----------TAAGTGC------------TAATT-CATT------TG-ACA-GGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-G-G-T--GTATCGT-A----------CA------A-TT-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACTT--------A---T---G---G-A-AT-TT-------------------------------TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-A--ACT--AC---AAAAACAA--C--GAAAT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TA
gi|12 : ----------AATGATTAGTAT-C-AAAACAGT-TCT-TTTT-ATAT-CAAAGCAACT-AACTCGACACA--TGCAA--A--TATTTTTTTT--AGA-----TTA-------A-TGTAAAGAAGAATTATCAATATG--AAAACAGTACTG-GTCAAAT-T----AAGATAG----------AACTCGACAAAGAG-TAGG-------------GAG--------------------ATTGGATTACAGACAACTGCT----CATG-CATA-----CAGTGTCTT-----TGA-TA-TGC--CA-CTG----GCA-G-TAAAC-CT--AT----CAGTT-AA----A----CA-------------T-----------------TTTTCA--G------A-ATGTCTGTAG----ATTGAT-------ATG-------TATCATGT---AC--GTA----------T------T---CA---T--GT----TCGTTTTCAGG---TGA-TACGAC-gttt
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gi|16 : gacacatcaagcagggcatgagcatcaacctgttcaacaggtctttgccgaatttcactagaccaaagaactcacaaattaatctctacaatttcaatgacacaagcaaacacagagtcactaggctaattaattgctactttaattgaacatgcttataatatattgggctgattatcgtaacgcgtatatacagcactaagcataGTT-----TGA-TG-TCC--TG-CGG----AGG-C-AAAAC-CC--GT----CCGTG-TA----A----AA-------------T-----------------T----A--T------G-ACAACCGTGG----GTTCAC-------A--------------------A---GCA----------C------C---AA---G--TA----TA---TTTAGG---TGA-TACGAC-TC--CAGAACTGCA-TAC--------CATCTAATG--GA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAATACACTA------GA------TTT-------------------C-------------------------AATTGA------------TT--TTCGA------T---CG--TAC-------TGT-CTCAT--------GCATATTA-----------GA-----A-------TGTTA---------------G-AT---ATTATTGGTGCCGGT--------A-TATAATAGC--------T--------A---------TT-TTGTA-GAA----TATT-AAGGAA-----------AT-----------GT--------GTC-------TAGT-GAACAT-------CGAG-AAAGG--------TA------TG--GA--CATC-TACC-CTAGTTC-T---ACAG-GTC-TT-TA-CGAATTTTA-TC-G-A----CA--AAC---GGA-----------AT-AC------AAAA-----------------------GA----------------AT--T--TT-------------AA---AG-GCA--CAA--G----CGA----A----CGCAGA-CCAC-AG---G---A---TAAT-----------AAGagtga
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gi|19 : tgagcatcaaccctgttcaacaggtctttgcgaatttatagacaaatgaatacaaattaatcttacatttcaatgacacaagcaaacacagatcactaggtaattaattgctactttaattgacatgcttgaataatatattgggtgagtgtatcgtaacggtatatacatgcataagcaagtgagtattgcaataag-TTGTA-GAAAGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------------------T-------CTATAGAACAT-------CAAG-CAAGGATTCATTACG------TT--C---CATT---CC-ATTGCAC-T---TCAG-ATGATT-TG---AATTTTA-TT-G-AACTTCACTGACTCAGGAG----------AT-AC--------AATGA---------CCAT-----T-AA------CAATA-----AT--C--CT-------------AACTTTG-ACA--CGATCG----A------A----CT--GA-TCACGAG---G---G---GAAT-----------TAAGAGC------------TAGTT-T-GT------TG-ACA-CGTT-TG-------A-TG--G-A---TA--T--------------AAA------G--G--GGA-G-C-T--GTATTGT-------------A------A-CG------GTATA-------TAagtgaga
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gi|2 : ttgtagaaagttataaggaaactctatagaacatcaagcaaggattcattacgttccattccattgcacttcagatgatttgaattttattgaacttcactgactcaggagatacaatgaccattaacaataatcctaactttgacacgatcgaactgatcacgaggggaattaagagctagtttgttgacacgtttgatggatataaaggggagctgtattgtaacggtatatatgtatgtgatgattgcaaataatGTATTTTA--ATTTCGTG-TTTGGATTAAATTTCGTTATTGTCGTGTCTG-ACGAAAAA---TAACCGAAAATTAAATCCAAC-TCGAA-TTTT--ATTTA---AAGTAAAACTTTTT-ATTTTCAATG-T-AAA-A-GTTCA-GTCTC-T-TTATTTCCTT-AGTTCCATGTAAAAAAAA-CATATTTCACAAGTTCCGTAC---AA-TGTACCCC-CATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAGAAAT-GTACG-GCGCTTTG-G----------AATGA-GACTATCC-AAAACA-T-ATA---TC-ATAA-TTAGACG--T-AACTCCATACGGGTAAAC--A--G-------TTTAAGAAAGGTTCG-------A-TGCAATTAGGAATGA-TACTATC--AAAACA-TTCGGAGTTAATTGT----AAGATAC--------TAAACTCGACAA--AG-TC-A-------------G-G--------------------A------------------------CATG-CATA-----CAAAACGTT-----TGA--A-TGC--CG-CTT----AGA-ATGAAGC-CC--GT----CGCTG-AA----A----AG-------------T-----------------TT---AG-T------GAAAATCCGTGG-------CA--------ATG-------T------T---A---GTA----------C------C---GA------TT----TC---TTCAGGT--TGA-TACGAC-TT--CTGAGCCGCATTACTT-----GCA-T--ATGGAAA-T----CT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TG------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------T----TC--------T---TG--TAC--------GT-C------------G------G------------------G-------TGTT----------------A-AT---ATTG----------T--------A-TA---------------T--------A---------TT-TCGTATGACGTT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACA--------CGAGCCAGGG--------TG-------A--CAGCCATC-AA-C-CTGG-TC-A---ACAGAATC-TT-TC-CGAATTTCA-TTAA-A----CA--AAC---GGA-----------TT-AC-------AAAT-A---------CC-------G-GAT-----C---------ATA-T--TT-------------AA---TT-ACAC-CAA--A----C------A----CG--GG--CA--CG---G---G---TAAT-----------TAGGTCC------------TAATT-CATT------TG-ACA-GGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--CAGTG-T-T--GTATCGG-A----------CA------A-TGTTT---GTTTAT------TACTT-GC--GTA----C---------C----AA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------AT--T---G---A-ATG--TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTAA--T-CT-AAAACAACG--AA---TA-TAAA--------TCCA-CA-CAGAAAA--A--TCG-TGTT-A--ACT--AC---AAAAACAA--C--GA-AT--TTTTC----CCC-CAACGAAATTAA---AATTACGTgta
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gi|24 : TTC-AAAT-TTCGACA-CT-TACTCGCCACAGGTACAT-----G-------CT--GAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATTATTACT----------------G-ACCGCTT-T----AAGATAC--------T-AACTCAACAA--AA-TCGG-------------G-G--------------------AAGATCGCATCACAGCTAACGGCT-CATG-CAGT-----CAGCGCGTT-----TGA-TG-TGCCGCG-CTG----AGG-T-AAAAT-CC--GT----CCGTG-CA----A----AATGTGTAGTGATTTT-----------------TT---A--T------G-ACATCCATGG----ATTCCC-------CT-----------------------GCA----------C------C---AA---G--TA----TC---TTCAGT---CGA-TACGAA-TC--TCGAGCCGCA-TAaattg
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gi|27 : tATT-TAGT------TG-ACA-CACT-TG-------AGC---A-AGTGTA--TCGTA----------AAACAATTTA--A--GCA-A-G-TTAGGATTGC-A----------CATACGCAA-CA-TT---GTTTA-------TTC-T-TC--ACA----A---------T-----G--TA--------------TCCGT-A-CTACAT--------A---T---GTGTATATTT-TT-------T---TT--T---TT-----CA---TTTTTAAGTTA--T-CT-CAAGCAATG--AT---GA-TTAA--------TCCA-CA-C---AAA--A--TCA-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--CAAA--AT--TTTTT-----CC-AGACAAAATTAA---A--TACGTtta
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gi|30 : tgtaga----------C------C---GC---T--TT----TC---TTCAAGTTATGA-TA-GAC-TCTGTTGATCCGCA-TAA-T------CACC--ATG--AAGG----TT--GA--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------ttacag
gi|31 : actctgaagttcCAT--------A---T----------TGT-TT-------T---GT--T---TT-----T----TTTT-AAGTGT--C-CT-AAACCAACA--AA---AA-TTAAATTAAAGTTCCA-AC-C---GCA--A--CCA-TGTT-CATATT--AC---AAAAACAA--TAGA--AT--TTTTTTTTACCCACAACGAAATTAAATTA--TACGTcaatattgaaattttaccgtttaatcgtatggtcacacgcaatgtaacatgtaactgatttttctttagtagtgtgttaaatatattggtatataatgtaataactgttttgtggc
gi|33 : atatcgttgattttcttttcctactacatcagtttaaatcagtgtatTG-CAGT-----CAGTTCATT-----GTA-TG-TGT--CG-CTG----AGGCA-GAACC-CA--GT----CCGTG-CA----A----AATTGTATGTGGTT-T-----------------TT---A--T------G-ACGCCCGTGG----ATTCAC-------ACG-------ttacagta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : attccagggtgctatttggtaataccataagacaaaatcagggaagatcggattacatgtagacagcacatttgatatgccactgagacacaacctgtaaaacctaatgtcattttttttaagacacccgtggattcacatgcacactgtaagtatccacgcttttcttcaggtgatacgacttctcagccgcataccacaccatgagtatgtttatcccaccatgagtatgtttttcacaatagatttcaatttaaccgtacagtcacatgcatataactgatgttctgttgtacggctaggggtgtcaaatattgtttccatataacatttattttgtagcagattaaggaaatgtaccatactggctatgaacattgagcagggtgtaggcatctgggtctttgggaattttatcaacaggatacaaaattatttaaacattttagtgacaagcgaacacagatcacggggtaattaagtgctaatttagttgacaatataaggggcgagtgtatcgtaacagtatctaagcaagttaggattgcatatagC--CG-CTT----AGA-A-GAAAC-CC--GT----CCGTG-CA----A----AT-------------T-----------------TC---A--T------G-ACACCCGTGA-------CAC-------ATG-------T------A---A---GTA----------T------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TT--CTGAGCCGCA-TAC-C-----GCATT--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TG------AA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GAC-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT---------TCA------A-TAGTTATATATAGT---T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GTC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGG--------CG------TGT-CAG-TATC-AACC-CTGGTTC-A---ACAG-GTC-TT-TC-CGAACTTCA-TC-G-A----CA--AAC---GGG-----------TT-AC------AAAATAA---------TC-------T-GA------C---------AT--T--TC-------------AA---TG-ACA--CAA--GCGAAC------A----CG--GA-TCAC-CG---G---G---TAAT-----------TAAGTGC------------TAATT-CATT------TG-ACA-GGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-G-G-T--GTATCGT-A----------CA------A-TT-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACTT--------A---T---G---G-A-AT-TT-------------------------------TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-A--ACT--AC---AAAAACAA--C--GAAAT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TA
gi|12 : ----------AATGATTAGTAT-C-AAAACAGT-TCT-TTTT-ATAT-CAAAGCAACT-AACTCGACACA--TGCAA--A--TATTTTTTTT--AGA-----TTA-------A-TGTAAAGAAGAATTATCAATATG--AAAACAGTACTG-GTCAAAT-T----AAGATAG----------AACTCGACAAAGAG-TAGG-------------GAG--------------------ATTGGATTACAGACAACTGCT----CATG-CATA-----CAGTGTCTT-----TGA-TA-TGC--CA-CTG----GCA-G-TAAAC-CT--AT----CAGTT-AA----A----CA-------------T-----------------TTTTCA--G------A-ATGTCTGTAG----ATTGAT-------ATG-------TATCATGT---AC--GTA----------T------T---CA---T--GT----TCGTTTTCAGG---TGA-TACGAC-gttt
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gi|16 : gacacatcaagcagggcatgagcatcaacctgttcaacaggtctttgccgaatttcactagaccaaagaactcacaaattaatctctacaatttcaatgacacaagcaaacacagagtcactaggctaattaattgctactttaattgaacatgcttataatatattgggctgattatcgtaacgcgtatatacagcactaagcataGTT-----TGA-TG-TCC--TG-CGG----AGG-C-AAAAC-CC--GT----CCGTG-TA----A----AA-------------T-----------------T----A--T------G-ACAACCGTGG----GTTCAC-------A--------------------A---GCA----------C------C---AA---G--TA----TA---TTTAGG---TGA-TACGAC-TC--CAGAACTGCA-TAC--------CATCTAATG--GA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAATACACTA------GA------TTT-------------------C-------------------------AATTGA------------TT--TTCGA------T---CG--TAC-------TGT-CTCAT--------GCATATTA-----------GA-----A-------TGTTA---------------G-AT---ATTATTGGTGCCGGT--------A-TATAATAGC--------T--------A---------TT-TTGTA-GAA----TATT-AAGGAA-----------AT-----------GT--------GTC-------TAGT-GAACAT-------CGAG-AAAGG--------TA------TG--GA--CATC-TACC-CTAGTTC-T---ACAG-GTC-TT-TA-CGAATTTTA-TC-G-A----CA--AAC---GGA-----------AT-AC------AAAA-----------------------GA----------------AT--T--TT-------------AA---AG-GCA--CAA--G----CGA----A----CGCAGA-CCAC-AG---G---A---TAAT-----------AAGagtga
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gi|19 : tgagcatcaaccctgttcaacaggtctttgcgaatttatagacaaatgaatacaaattaatcttacatttcaatgacacaagcaaacacagatcactaggtaattaattgctactttaattgacatgcttgaataatatattgggtgagtgtatcgtaacggtatatacatgcataagcaagtgagtattgcaataag-TTGTA-GAAAGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------------------T-------CTATAGAACAT-------CAAG-CAAGGATTCATTACG------TT--C---CATT---CC-ATTGCAC-T---TCAG-ATGATT-TG---AATTTTA-TT-G-AACTTCACTGACTCAGGAG----------AT-AC--------AATGA---------CCAT-----T-AA------CAATA-----AT--C--CT-------------AACTTTG-ACA--CGATCG----A------A----CT--GA-TCACGAG---G---G---GAAT-----------TAAGAGC------------TAGTT-T-GT------TG-ACA-CGTT-TG-------A-TG--G-A---TA--T--------------AAA------G--G--GGA-G-C-T--GTATTGT-------------A------A-CG------GTATA-------TAagtgaga
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gi|2 : ttgtagaaagttataaggaaactctatagaacatcaagcaaggattcattacgttccattccattgcacttcagatgatttgaattttattgaacttcactgactcaggagatacaatgaccattaacaataatcctaactttgacacgatcgaactgatcacgaggggaattaagagctagtttgttgacacgtttgatggatataaaggggagctgtattgtaacggtatatatgtatgtgatgattgcaaataatGTATTTTA--ATTTCGTG-TTTGGATTAAATTTCGTTATTGTCGTGTCTG-ACGAAAAA---TAACCGAAAATTAAATCCAAC-TCGAA-TTTT--ATTTA---AAGTAAAACTTTTT-ATTTTCAATG-T-AAA-A-GTTCA-GTCTC-T-TTATTTCCTT-AGTTCCATGTAAAAAAAA-CATATTTCACAAGTTCCGTAC---AA-TGTACCCC-CATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAGAAAT-GTACG-GCGCTTTG-G----------AATGA-GACTATCC-AAAACA-T-ATA---TC-ATAA-TTAGACG--T-AACTCCATACGGGTAAAC--A--G-------TTTAAGAAAGGTTCG-------A-TGCAATTAGGAATGA-TACTATC--AAAACA-TTCGGAGTTAATTGT----AAGATAC--------TAAACTCGACAA--AG-TC-A-------------G-G--------------------A------------------------CATG-CATA-----CAAAACGTT-----TGA--A-TGC--CG-CTT----AGA-ATGAAGC-CC--GT----CGCTG-AA----A----AG-------------T-----------------TT---AG-T------GAAAATCCGTGG-------CA--------ATG-------T------T---A---GTA----------C------C---GA------TT----TC---TTCAGGT--TGA-TACGAC-TT--CTGAGCCGCATTACTT-----GCA-T--ATGGAAA-T----CT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TG------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------T----TC--------T---TG--TAC--------GT-C------------G------G------------------G-------TGTT----------------A-AT---ATTG----------T--------A-TA---------------T--------A---------TT-TCGTATGACGTT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACA--------CGAGCCAGGG--------TG-------A--CAGCCATC-AA-C-CTGG-TC-A---ACAGAATC-TT-TC-CGAATTTCA-TTAA-A----CA--AAC---GGA-----------TT-AC-------AAAT-A---------CC-------G-GAT-----C---------ATA-T--TT-------------AA---TT-ACAC-CAA--A----C------A----CG--GG--CA--CG---G---G---TAAT-----------TAGGTCC------------TAATT-CATT------TG-ACA-GGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--CAGTG-T-T--GTATCGG-A----------CA------A-TGTTT---GTTTAT------TACTT-GC--GTA----C---------C----AA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------AT--T---G---A-ATG--TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTAA--T-CT-AAAACAACG--AA---TA-TAAA--------TCCA-CA-CAGAAAA--A--TCG-TGTT-A--ACT--AC---AAAAACAA--C--GA-AT--TTTTC----CCC-CAACGAAATTAA---AATTACGTgta
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gi|24 : TTC-AAAT-TTCGACA-CT-TACTCGCCACAGGTACAT-----G-------CT--GAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATTATTACT----------------G-ACCGCTT-T----AAGATAC--------T-AACTCAACAA--AA-TCGG-------------G-G--------------------AAGATCGCATCACAGCTAACGGCT-CATG-CAGT-----CAGCGCGTT-----TGA-TG-TGCCGCG-CTG----AGG-T-AAAAT-CC--GT----CCGTG-CA----A----AATGTGTAGTGATTTT-----------------TT---A--T------G-ACATCCATGG----ATTCCC-------CT-----------------------GCA----------C------C---AA---G--TA----TC---TTCAGT---CGA-TACGAA-TC--TCGAGCCGCA-TAaattg
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gi|27 : tATT-TAGT------TG-ACA-CACT-TG-------AGC---A-AGTGTA--TCGTA----------AAACAATTTA--A--GCA-A-G-TTAGGATTGC-A----------CATACGCAA-CA-TT---GTTTA-------TTC-T-TC--ACA----A---------T-----G--TA--------------TCCGT-A-CTACAT--------A---T---GTGTATATTT-TT-------T---TT--T---TT-----CA---TTTTTAAGTTA--T-CT-CAAGCAATG--AT---GA-TTAA--------TCCA-CA-C---AAA--A--TCA-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--CAAA--AT--TTTTT-----CC-AGACAAAATTAA---A--TACGTtta
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gi|30 : tgtaga----------C------C---GC---T--TT----TC---TTCAAGTTATGA-TA-GAC-TCTGTTGATCCGCA-TAA-T------CACC--ATG--AAGG----TT--GA--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------ttacag
gi|31 : actctgaagttcCAT--------A---T----------TGT-TT-------T---GT--T---TT-----T----TTTT-AAGTGT--C-CT-AAACCAACA--AA---AA-TTAAATTAAAGTTCCA-AC-C---GCA--A--CCA-TGTT-CATATT--AC---AAAAACAA--TAGA--AT--TTTTTTTTACCCACAACGAAATTAAATTA--TACGTcaatattgaaattttaccgtttaatcgtatggtcacacgcaatgtaacatgtaactgatttttctttagtagtgtgttaaatatattggtatataatgtaataactgttttgtggc
gi|33 : atatcgttgattttcttttcctactacatcagtttaaatcagtgtatTG-CAGT-----CAGTTCATT-----GTA-TG-TGT--CG-CTG----AGGCA-GAACC-CA--GT----CCGTG-CA----A----AATTGTATGTGGTT-T-----------------TT---A--T------G-ACGCCCGTGG----ATTCAC-------ACG-------ttacagta
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gi|7 : -TT---TTTTA-------TAC-T-TG--GTA----C---------G----C---TA-----------------GT-GCATACAT--------A---T---------ATGT------------------------------A---TTTTCAAGTCT--T-GT-CAAACACCG--AA---AA-TTAA--------TCCA-TA-C---atagttagctacgcaagttagaattgcagaaaagaacatttttttatacttggtacgctagtgcatacatatatgtattttcaagtcttgtcaaacaccgaaaattaatccatacatcttcccaacgatatcaaatacgtttg
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blockSeqs : . . . . T G G N . . N . . . . CT T . . . T T . T T C . . A . CA AAT . . C . . . . CG A AAG TG . . GG G . T A . CA AAG . . . . T GA C T T . . GGGAGATTGGATTACAGACAACTGCT . A . C . . . . . . AG . T . A . AATTGTATGTGGTTT . A . GT . TATCATGT . TCCACGTT . . G . . . . CA . . . . . T . . . . AAAATTA . AAGATTACCCCAATTGTACACGGTCACGCGGATAATGTGTTATATGGAATGGAGAAAAACATTCTTGTGTGAATTACTA . . ACGTT . . . GC . . . . CGTGTC . T . GG T . . . T . G . . C T . . TA TTTAAACAAATC . . . . . . . CAAAC . T . C . . . . G . . G . . C . . . . . . . . . . . G . . GA . . TT . A . G . . . . . A . . . . TGGA A . T . . TA T . . . . . . . . . . . . . A . . . AAA . . . . .
blockSeqs : . . . . C C G C . . T . . . . CG T . . . C T . T T G . . T . GT TAA . . C . . . . AG T GG TT . . GG G . T G . CC AG . . . . A GG T T T . . GGAATACAGCTAACAGCT . G . C . . . . . . GT . C . T . TGTCATTTTTT . T . AC . GCCTTGTA . TGTATGC . . G . . . . CG . . . . . T . . . . TAC . ACCGTTAATTGTACAGTCAAATGTCTGATGTTCTTTTGTACAACTTGGTGTGAGTGTGCTAAATATTGTCTGTATA . . ACGTT . . . GT . . . . TGTGAC . A . TG A . . . G . G . . A A . . TA TCTCTACA . . . . . . . CGAAC . A . C . . . . A . . A . . T . . . . . . . . . . . A . . A . . TT . A . G . . . . . T . . . . GCA A . A . . TA C . . . . . . . . . . . . . C . . . AAA . . . . .
blockSeqs : . . . . T G G A . . A . . . . C T . . . C . . . . C . . . . . . . . T . . . . GC A GG TT . . GT G . T G . AA AG . . . . T AG C T T . . AGGGAAGATCGGATTA . T . A . . . . . . CA . C . A . AATG . G . AT . CACCAT . TCGAT . . G . . . . CG . . . . . T . . . . TA . CAATTGATTTTCGATCGTACTGTCTCATGCATATTAGAATGTTAGATATTATTGGTGCCGGTATATAATAGCTA . . CAGGT . . . GT . . . . CGTGTC . A . GG T . . . A . G . . C C . . TA TTTAAAC . . . . . . . CGAAC . A . C . . . . G . . A . . T . . . . . . . . . . . T . . A . . TT . . . C . . . . . C . . . . GTA T . A . . AT . . . . . . . . . . . . . . C . . . AGA . . . . .
blockSeqs : . . . . T G A T . . A . . . . . . . . . C . . . . G . . . . . . . CC A G TT . . AG A . A A . AA AG . . . . T CG C G T . . AGGGA . G . T . . . . . . GG . C . C . ATT . T . AT . TA . TTCAT . . G . . . . AA . . . . . T . . . . TG . ACCATTAATCGTACGGTCACACGCATATTTGTATGGCAAGGGGTGTTTAGTATTGTTGGTATAGAATAGCCA . . ACGGT . . . GC . . . . TATGG . A . TG A . . . G . G . . T A . . TG CCGGATC . . . . . . . TGTTG . A . C . . . . A . . A . . T . . . . . . . . . . . G . . A . . TC . . . T . . . . . C . . . . AT T . T . . AT . . . . . . . . . . . . . . A . . . AA . . . . .
blockSeqs : . . . . N N N N . . N . . . . . . . . . G TC . . T G . T G . TA AG . . . . A TG C T A . . AGAGG . T . A . . . . . . TA . C . C . CAT . T . AT . TT . CCAAG . . C . . . . CA . . . . . T . . . . TA . ACATGTTCTCTTGTACGACCGGGCGTGTTAAATATTGTTCAATAGTTATATATAGTTA . . ACGGT . . . GT . . . . TGTA . A . GG A . . . G . G . . T A . . TA CCGGATC . . . . . . . CGAAC . A . C . . . . A . . G . . C . . . . . . . . . . . G . . A . . CT . . . C . . . . . C . . . . GG T . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . A . . . GA . . . . .
blockSeqs : . . . T G G A . . A . . . C TT . . T G . A A . CA AG . . . . A G . . A . . AGAAA . T . T . . . . . . AG . C . A . AAT . T . AT . TT . CCAAG . . T . . . . TG . . . . . T . . . . TG . ACATATTGTATTGTACGGCTGGACGTGCTAAATATTGTTCATTAGTTC . . ACAGT . . . GC . . . . CATG . A . TT T . . . G . G . . C A . . TG TTCAAAT . . . . . . . CGA . T . C . . . . A . . T . . G . . . . . . . . . . . A . . A . . TC . . . G . . . . . T . . . . AT T . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . C . . . GA . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . G . . G . . T A . CA G . . . . A . . . . . . AGGA . G . A . . . . . . AG . A . C . AGT . T . AT . TT . CCGAT . . G . . . . CG . . . . . T . . . . TA . ACATGTTCTCTTGTACGGTCGGGCGTGTTCAATATTGTATATA . . CAGGT . . . GT . . . . TGTG . A . AA A . . . C . A . . T T . . AA TTTAAAC . . . . . . . CGA . G . T . . . . G . . T . . G . . . . . . . . . . . A . . A . . TT . . . C . . . . . C . . . . GA T . T . . CA . . . . . . . . . . . . . . C . . . GA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . T . . A A . T G . . . . . . . . . . . AGGA . T . C . . . . . . AG . C . A . AGT . T . . . TA . CCGCT . . T . . . . GA . . . . . T . . . . TA . ATATGTTCTATTGTTTAATGTAAAGACAAAGATAATCA . . CAGA . . . GT . . . . TGAC . A . GG T . . . G . G . . C A . . TA TCTGAC . . . . . . . CG . G . C . . . . G . . G . . C . . . . . . . . . . . G . . A . . GT . . . G . . . . . C . . . . GC T . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . C . . . GA . . . . .
blockSeqs : T . . T . . C G . . . . . . C . C . . . . . . CA . A . C . AGT . T . . . TA . CCGAT . . G . . . . CA . . . . . T . . . . TA . ACATGTTCTTGTACGTCGGGTGTTAATATTGTATATA . . CAGA . . . GC . . . . TGAC . A . GT A . . . C . A . . C T . . TA TCTAAC . . . . . . . C . G . T . . . . G . . T . . C . . . . . . . . . . . A . . A . . TT . . . C . . . . . T . . . . GA T . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . .
blockSeqs : . T . . A A . . . . . . C . . . . . . TG . G . C . AAT . T . . . . . TCCAT . . A . . . . AA . . . . . T . . . . TA . ACATGTTCTCTGTACGTCGGGGTGTTAAATTGTTATA . . CAG . . . AC . . . . TGTG . A . CG A . . . G . G . . C A . . TA TCTTAC . . . . . . . C . G . C . . . . G . . T . . G . . . . . . . . . . . A . . A . . TT . . . G . . . . . C . . . . GG T . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . .
blockSeqs : C G . . . . C . . . . . . AG . A . C . AT . T . . . . . CCGA . . A . . . . C . . . . . T . . . . TG . . . AA . . . GT . . . . CATG . A . GG A . . . C . G . . C T . . TA TCTTAC . . . . . . . A . G . G . . . . A . . C . . G . . . . . . . . . . . A . . A . . TT . . . C . . . . . C . . . . GC T . T . . TA . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AC . T . T . TT . A . . . TCCT . . G . . . . T . . . . . T . . . . TA . . . CA . . . GT . . . . CGTG . A . GG C . . . A . G . . C T . . AA CCGGAC . . . . . . . C . A . C . . . . A . . G . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . GT . . . C . . . . . T . . . . G T . C . . TA . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . TT . . . AT . . . . . . . . CATG . . . GT A . . . C . A . . C T . . TA CATGAC . . . . . . . C . G . T . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . AT . . . C . . . . . G . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . TT . . . . . CGTG . . . GG A . . . G . G . . T A . . T TCTGAC . . . . . . . C . C . C . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . TT . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . T . . . . T . . . G A . . . G . G . . A A . . T CTTGC . . . . . . . C . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . GT . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G T . . . G . . . . . A . . . GCC . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . .
blockSeqs : . . . . G T . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
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originalCons : CGTATTT-A--ATTTCGTG-TT-GGATTAAATTTCGTTATTTTCGTGTCTGGACGAAAA----CAAC--GAAATTAAATCCAAC-NCGAA-TTTT--ATTTA---AAG--AAACTTTTT-TATTTCAATGTT-AGA-A-GTCCGTGTCTC-TGTTATTT-CNT-AG-TCCATGTAAAAANAA-CATATTTCGCAAGTTCCGTAC-T-AA-TGTA-CCC-CATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAG--AT-GTACGCGCGCTTT--G----------AATGATTACTAT-C-AAAACA-T-ACA-GTTC-ATAT-TTAGACG-CT-AACTCGACACGGGTGCAA--A--G-------TT--AAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATGATTACTATC--AAAACAGTNCGG-GTCAATT-T----AAGATAC--------T-AACTCGACAA--AG-TCGG-------------G-G--------------------A------------------------CATG-CATA-----CAGCGCGTT-----TGA-TA-TGC--CG-CTG----AGA-A-GAAAC-CC--GT----CCGTG-CA----A----AG-------------T-----------------TT---A--T------G-ACACCCGTGG----ATTCAC-------ATG-------T------T---A---GTA----------C------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TC--CTGAGCCGCA-TAC-C-----GCACC--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GGT-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT---------T--------A-TA---------------T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGG--------CG------TG--CAG-CATC-AACC-CTGGTTC-A---ACAG-GTC-TT-TG-CGAATTTTA-TC-G-A----CA--AAC---GGA-----------AT-AC------AAAATAA---------CC-------T-GA------C---------AT--T--TT-------------AA---TG-ACA--CAA--G----C------A----CG--GA-TCAC-CG---G---G---TAAT-----------TAGGTGC------------TAATT-TANT------TG-ACA-CGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-G-G-T--GTATCGT-A----------CA------A-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------A---T---G---A-ATGT-TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--C--G--AT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TACGT
finalCons : CGTATTT-A--ATTTCGTG-TT-GGATTAAATTTCGTTATTTTCGTGTCTGGACGAAAA----CAAC--GAAATTAAATCCAAC-NCGAA-TTTT--ATTTA---AAG--AAACTTTTTT-ATTTCAATGTT-AGA-A-GTCCGTGTCTC-TGTTATTT-CNT-AG-TCCATGTAAAAANAA-CATATTTCGCAAGTTCCGTACTAAT---GTA-CCC-CATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAG--AT-GTACGCGCGCTTTGAG----------AATGATTACTAT-C-AAAACAGG-ACAG-TTC-ATAT-TTAGACG-CT-AACTCGACACGGGTGCAAAG-----------TT--AAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATGATTACTATC--AAAACAGTNCGG-GTCAATT-T----AAGATAC--------T-AACTCGACAA--AG-TCGG-------------G-G--------------------A------------------------CATG-CATA-----CAGCGCGTT-----TGA-TA-TGC--CG-CTG----AGANG--AAAC-CC--GT----CCGTG-CA----A----AG-------------T-----------------TT---AT--------G-ACACCCGTGGAT----TCAC-------ATGTA----------------A---GTA----------C------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TC--CTGAGCCGCA-TACCG------CACC--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GGT-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT---------T--------A-TA---------------T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TA-T-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGGCGTG-----------------AG-CATC-AACC-CTGGTTC-A---ACAG-GTC-TT-TG-CGAATTTTA-TCG--A----CA--AAC---GGA-----------AT-AC------AAAATAA---------CC-------T-GA------C---------AT--T--TT-------------AA---TG-ACA--CAA--G----C------A----CG--GA-TCAC-CG---G---G---TAAT-----------TAGGTGC------------TAATT-TANT------TG-ACA-CGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-G-G-T--GTATCGTA-----------CA------A-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------A---T---G---A-ATGT-TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--C--G--AT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TACGT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTACCCAAGCTTACACAGATCACATAATTCTTTGTGAATAGTTGTTAACGATGACATACTTCATCAAGCAAATGGCATAAATTTACATGATGTGTGTATCACAAAAGTATATACACAAGTCAGGACTGCAGATAAAGCAACATTATTTATACTTCAGATGCATAATTGCCATAATAT
Unaligned ( gi|53 ): TATTTCTTATGAGTAGATGTACTTGTATTTTGTTGTGTTAATATATAGTTAATCAACACATTACA
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Reference ( family-842 ) : CGTATTT-A--ATTTCGTG-TT-GGATTAAATTTCGTTATTTTCGTGTCTGGACG-AAAA----CAAC--GAAATTAAATCCAAC-NCGAA-TTTT--ATTTA---AAG--AAACTTTTT-TATTTCAATGTT-AGA-AGTCCGTGTCTC-TGTTATTT-CNTAG-TCCATGTAAAAA-NAACATATTTCGCAAGTTCCGTAC-T-AA-TGTA-CCC-CATTCTCTCC-CTTAT-GAGTAG--A-TGTACGCGCGCTTTG--------AG-AATGATTACTAT-CAAAACAGGACA-GTTC-AT-ATTTAGACG-C-TAACTCGACACGGGTGCAA--A-G-------TT--AAAAAGGTTCG-------A-TGTAATTAAGAATGATTACTATC--AAAACAGTNCGG-GTCAATT-T----AAGATAC--------T-AACTCGACAAAG--TCGG-------------G-------------G--------------------A------------------------CA--------TG-CATA-----CAGCGCGTT-----TGA-TA-TGC--CG-CTG----AG-ANGAAAC-CC-GT----CCGTG-CA----A----AG-------------T-----------------TT---A--T------G-ACACCCGTGGATTCA-----------C-------A------T-------G-------TAAGTA----------C------C---GA---T--TT----TC---TTCAGG---TGA-TACGAC-TC--CTGAGCCGCA-TAC-C-----GCACC--ATG--AA-T----TT--GT--------------------T------------T----TT-C----A------------CAA-----TA------GA------TTT------------------AC-------------------------A--TG-------------TT--CTC--------T---TG--TAC-------GGT-C------------G------G-----------GC-----G-------TGTTA---------------A-AT---ATTGT-T--------------A-TA---------------T--------A---------TT-TTGTA-GACGGT-TAT-AAGGAA-----------AC-----------GC--------GCC-------CTAT-GAACAT-------CGAG-CAGGGCGTG--A--G-C-A---T-C-AAC----C--CTGGTTC-A---A--CAG-GTC-TT-TG-CGAATTTTA-TC-G-A----CA--AAC---GGA-----------AT-AC------AAAATAA---------CC-------T-GA------C---------AT--T--TT-------------AA---TG-ACA--CAA--G----C------A----CG--GA-TCAC-CG---G---G---TAAT-----------TAGGTGC------------TAATT-TANT------TG-ACA-CGCT-TG-------A-T---A-A---TA--T--------------AAA------G--G--GCG-G-G-T--GTATCGT-A----------CA------A-CG-TT---GTTTA-------TAC-T-GC--GTA----C---------C----CA--TA--------------TTCGT-A-ATACAT--------A---T---G---A-ATGT-TT-------T---TT--T---TT-----TA---TTTT-AAGTGA--T-CT-AAAACAACG--AA---AA-TTAA--------TCCA-CA-C---GAA--A--TCG-TGTT-C--ACT--AC---AAAAACAA--C--G--AT--TTTTT----CCC-CAACGAAATTAA---A--TACGT
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