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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTGCAACCATCTTACTGA-TTCTCATCCAGTCTACCTTTACTGATTATTATTGCTATCTTGGACTT-C-AA-TG-A--TATGAC-GAT-CTAAGAA---TGAT---AACAATATTTTATCAATGCTTGTAATA-----CTGATTTTCA--ACGCCGATAAT--TC---TTACTC---AATAAATAGACAAGCGC--CTTATCC-TCGAGTTTTCGTAATTGTATCA-CAAGGATAACTACCTCAATTCCTCAATAATCACAGTATACAATGTAAACTAGTACGAATTTA---TACTTACAGTGTTTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGT--GATCCAAAT----TACT-AAACAATAA--AAATAACGAATATTACGATAATGTT-CTGGATATTG-A-TATAGTGATCGA-AAATCTAGTTT---TT-CCTT----------G--TGGTACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAA-----ACAACTT------TT---A-CTTTCTCTCCTATTAGCAGACATTGCATAATAAAGTTATCACTCAGACATCTTTCAT--CGTAGTTGTTTTCAATGCGCTTCTCTCTAGCCTAGAAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAGCACAATAATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTGATACTTTCCTATCACTTTCATATTAATA------TTAGTATACCTTCTTAAATTTACGACAACAATAGTAAATATCACGAAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAGCAATGCTTCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATACGTGAATTCCTCCTCCTAAATTCTC-ACTTCATATTTTGTTTTT-AA---AT--AGTAGAAATTCTGCAATATCTGA--------------TACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGAATCCCAATACCGCCTA-TTACTA-TTG-AATA-TG-AATT-CGAATAAC------ACTG---------ATCCCA--AT--T-TGCCAC-----AATGCTAGC--GAT-GCTGATTCCCA--------ATGCTG-CCAAT--TCCTACTG----AATAAAT-AAGCAA-CAATTTATCTATTACTGTTTGCTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTC------TAC--TATC------CATAATGTAA-CAAT--TACTGATTTAAAATACTTACAGT-CCTCGTACGTTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTTTATTCTGGTTATAATATTCCCAGAT--AAGTCACT--AA--A--A-TGA-ATAACTAAT-AAACA-TTAAGATAAC-TTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAA-CTCT-G-TTTGAGTCACCTAG-TGATA-C-AGCTACTCA-AATA--AACTACAA-C-CAGTGTA----AGA--AATCTTC--------ACAAC--TTAGTC-------TTTTTCTCCAATTACCAGATA-TTAAT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcctccttctaaatcgacttcatattttgttttaaaaaagtagaaattctacaatatctgatacct-A--TATGA---ATGCTAATAACACTGAT---CCCAATATGTTA-CAATGCCAGGAATG-----CTG------------CC---AAT--TC---CTATTG---CATAAATTAGCAA-CAA--CTTATCT-ATTAGTGTTTGTTATTGTATGA-CAAGAATATCTCCCACAACTTTTCTACTATC-CACTATCTAACAAATACTGATTCAAA---A---TACTTACAGTTCTTGTAATCTTGTCAaatgttcagaccatctatattac
gi|9                          : atcgtgataccagaacttaaaacaacttcaaacacagtatgatacaaaacaacttttactttctctccaattaacagacattgcataatgaagttatcactcagacttcattcatcgtagttgttttcaatatgcttccctctagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactga-A--TATGA---ATGTTAATAACACTGAT---CACAAT-TTGTGACAATGCTAGCAATG-----CTGATTCCCATTCCGCCAATGCT--GCCAGTTACTCGTGAATAAATAAGTAA-CTA--CTTATCT-GTTAGTGTTTGTTATTGTATGA-CAAGAATATCTCCCACAACTTCTC------TACTGTCCAAAATGTAA-CAAATACTGATTAA---TACTTACAGTTTTTGTAAGCTTGTCAAGGCAACAAATGTTTCT-TTTTCTATAC-TGGTTATGCTATTCCAAGAT--AAGT----AACT-AAA-AATGAATAAATAATAAACATTAAGATAACTTA-CAGGAAATCG---TCTA-----CAACAAATGTAAATT---CT-GCTTGAGACACCCAG--TGATACCGGTACTCAGATCAACTACAACCACTGTA----AGAAATCCTCACAACTTAGTCTCTT---ATTTTTTTCTCCAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgatgtgaatgctgacaatactgattcccaataccgccaattactattgaTAACAC---TGAT---CCCAAT-TTGTGACAATCCTAGCAATG-----CTGATTTCCA--ATGCTGACAAT--TC---CTACTG---AATAGATAAGCAA-CAA--CTTATCTATC-AGTGTTTGTAATTGTATGA-CAAGAATATCGCCCACAACTTCTCTACTATC------CACAATGTAA-CAAATACTATTTTAAAATACTTACAGTCCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCT-TTCTCTATAC-TGGTTATATTATT------CCCAGATAAGGAACT-GAAATTTAT--AAATAATAAACATTACGATAA-GTTACAGGAAATCGTC-TACAACAAATGA-AAATTCTGTTT---
gi|10                         :                                                                                                                                                             gttttcaatacacgtctctctagcctaggatattagcttgtctcttgagcagaacacaataatttaaccttcactatgcacattgaagctgattaatgctttcctatcactttcatattaatattaatagtccttcttaaattgacgacagcaatagtaaatatcacggagacttaccatttgcgatattggtaatcaatcaatgagagtaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaacatagaatatgcaaattcctcttcctaaattctgacgtcatattttgatttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgacacctttggtgttctgttttcctaatctacttatgattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctacagaatataattgctaaATATTT-ATCAATGCTTGTAATA-----CTGATGTTCA--ACGCCGACAGTAATC---TTACTC---AATAAATAAACAAGCGC--CTTAACC-TCGAGTTTTCGTAATTGTATCC-CAAGGATAGTTATCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTA---TACTTAAAGTATCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTGAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGT--CATCCAATT----TACT-AAACAATAA--AAATAACGAACATTAAGATAATGTT-ATGGATATTG-A-TACATTTATTGA-AAATCTAGTTT---CC-TCTT----------AATTGATACTAGAACTCAAAACAACTTTAAACATTCTTTGATGCAAA-----ACAACTT------TT---A-CTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCAGAATAAAGTTATCACTCAGACATCATTCAT--CGTAGTTgagtc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTACAGTATACAATGTAAACTCATGCGGATTTA---TACTCTCAGT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A---TACTTACAGCCCTTCTAGGTTTACCAAAGTGGCAAA-ACTCCCATTCTCTA-ACGTTGCAATTTGATTGC--CCTCCAAAT----TTCT-GAATAAGAA--AGATAa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggagTC----------G--TGATACCAGAACTTAAAACAACTTCAAACACAGTATGATACAAA-----ACAACTT------TT---A-CTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACTTCATTCAT--CGTAGTTGTTTTCAATATGCTTCCCTCTAGCttgtg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTT------TT---A-CTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactgaatatgaatgctaataacactgatcccaatatgttacaatgccaggaatgctgccaattcctattgcataaattagcaacaacttatctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttttctactatccactatctaacaaatactgattcaaaatacttacagttcttgtaatcttgtca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTTTCAATACACGTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAACACAATAATTTAACCTTCAC-TATGCACATTGAAGCTGATTAATGCTTTCCTATCACTTTCATATTAATA------TTAATAGTCCTTCTTAAATTGACGACAGCAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGAGTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAACATAGAATATGCAAATTCCTCTTCCTAAATTCTG-ACGTCATATTTTGATTTA-AA---AA--AGTAGAAATTCTGCAATATCTGA--------------CACCTTTGGTGTTCT-GTTTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAA-TTCCTA-CAG-AATA-T--AATTGCTAATAAC------ACTG---------ATCCCA--AT--T-TGTGAC-----AATCCTAGC--AAT-GCTGATTTCCA--------ATGCTG-ACAAT--TCCTACTG----AATAGAT-AAGCAA-CAACTTATCTATCAGTGTTTGTAATTGTATGACAAGAATATCGCCCACAACTTCTC------TAC--TATC------CACAATGTAA-CAAA--TACTATTTTAAAATACTTACAGT-CCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGAT--AAGGAACT--GA--A--A-TTT-ATAAATAAT-AAACA-TTACGATAAG-TTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAA-TTCT-G-TTTGAGTCcaatagtaaatatcacggatacttaccatttgcaatattggtaatcaatcaatgagattagaaaagtaatcaacaacgctatttttcttgttaattaatataaaatatgtgaattcctcttcctaacttctgacttcatattttaaaataagtagaaattctgcagtatctgatagcattcttattaagtattcctaatatac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTTAACATTTACCTATGCACACTGGAACTGA-TAATACTTTCC-ATCAC-TTCATATTTATC------ATAGTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttagcttcctactgagatctattaggagtacagaacacaccttaatacaattggttA------CTAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACACTAGTAAATATCACGGAGACTTATCATTTGCGATATTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCAAATTCCTCTTCTTAAATTCTG-ACTTCATACTTTGTTTTTAAA---AA--AGTAGAAATTCTGCAATATCTGA--------------TACCTTTGTTATTTC-GTCTCC-CTAATCTACTTATCATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAA-TTCCTA-CTG-AATA-TG-AATG-CTAATAAC------ACTG---------ATCCCA--AT--A-TGTTAC-----AATGCCAG---G-------------A--------ATGCTG-CCAAT--TCCTATTG----CATAAAT-TAGCAA-CAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTTTC------TAC--TATC------CACTATCTAA-CAAA--TACTGATTCAAAATACTTACAGT-TCTTGTAATCTTGTCAataat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atcgtgataccagaacttaaaacaacttcaaacacagtatgatacaaaacaacttttactttctctccaattaacagacattgcataatgaagttatcactcagacttcattcatcgtagttgttttcaatatgcttccctctagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACAATAGTAAATATCACGGATACTTACCATTTGCAATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAACAACGCTATTTTTCTTGTTAATTAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAACTTCTG-ACTTCATATTTTA------AA---ATA-AGTAGAAATTCTGCAGTATCTGA--------------TAGCATTCTTATTAA-GTATTC-CTAATATAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttactttctctccaattatcagtcattgcataatgaagttAACGCTCTTTCACTTGTTAATGAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTC-ACTTCATATTTTGTTTTT-AA---AA--AGTAGAAATTCTGCAATATCTGA--------------TATCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGCTTGATGT-GAATGTTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTCTCTTGTTAATCAATATGAAATATATAAATTCCTCTTCCTAACTTCTG-ACTTCATATCTTA------AA---ATAAAGTTGAAATTCTGCAATATCTAA--------------TAGCTTTGTTATCAA-GTTTTC-CT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCCTCCTTCTAAAT---CGACTTCATATTTTGTTTTA-AA---AA--AGTAGAAATTCTACAATATCTGA--------------TACCTTTGTTATTTCAGTCTTCTCTAATCTACTTATGATTGATGTGGAATGCTAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGATTCCAAATACTGTCAA-TTCCTA-CTG-AATA-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTT-AAGATAT--ATTACATATTTTGCAACTTCTGACTTCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGCTTT--TATTG-CTAATTGATTTACAAATGATAT-GAATGCTAAGAATG-------------------------ATGA----CAACAATATTTA-TCAATGCTTGTAATACTG-ATTT-T---CAAC------GCCG---------A---CA--AT--T-Taataagcaacaacttctctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttctctactatccacaatgtaacaaatactgattaatacttacagtcttagtaagcttgtcaaggctgaaaatgtttctttctctatactggttatattgttcccagataagtcactaaaaaaatataaataataaacttcaaaataacttacaggaaatcggctacaacaaatgcaaattctgtttgagtcacctagtgataccgctactcagataaactacaaccactgtatgaaaccctcacaacttagtcttctaattttttctccaattacgagagattaatgttcagaccatctatattac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TT-AACATAT--ATTACATATTTTGCAACTTCTGA-----------------CTTT------TC-GTCC-----AGTCTACCTTTG-TTGGTTT-TATTGC---CAAT---------------------------TGAATTACAA--------A-TGA-TA-T-G-AATA-CT-AA----GAATGA---------TG---------ATAACAGTAT--T-TATCA-------ATAGTTGT--AAA-ACTGATTTTCA--------ACGCCG-ACAAT--TCTTACGC----AATAAATAAAGAAG-CACATTATCCTTGAGTTTTCGTAATTGTACACCAAGGATAACTttaatatataaacaagcgccttaacctcgagtttttgtaattgtatccccaggatagctacgtcaatccctcaataattacagtatacaaagtaaactaatacggatttatacttacagtatctctaggttttccaatccagtaaatgcttctttctcaatacttgttatatcattgtgatccaatctactaaacaataaaaataacgaacattaagataatattctggatattgatacagtgattgaaaatctcgtttatccttctgataccagaactcataacaacttcaaacactgtatgatacaaaacaacttttactttctctccaattaacagctattgcataatgaagttatcactcagacatcattaatatcagttgc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTTTGCAACTTCTGA------------------------ATTT---TCATC-C-AATCTACCTTTG-TTGGTTT-TATTGCTAAT------------------------------TGAATTTCAA---------------A-T---GATA-TG-GATG-CTAAGAAT------GATG---------AAAACA--ATATT-TATCA-------ACGCTTGT--AAT-TTTAATTTTCA--------ACGCCG-A-AAT--TCTTACTC----AATAAAT-AAACAAGCACATTATCTGCGAGTTTTCGTAAATGTATCACAAGGATAACTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTAT--------ACAATGTAA--ACTGATAGGGATTTA---TACTTACAGTAGCTC-TAGGTTTGCCAATCTAGTAAATGCTTCTTTCTCAATACTTGTTATATCATTGT--GATCCAATTTACT--AAACA--A-TAA-A-AA-TAAC-GAACA-TTAAGATAAT-GTTCTGGATATTG-ATACAGTGATT-GAAAA--TCTAG-TTT---TT-CCTCA-TGATGCC-AGA-ACT---AATAACAACTTCAA-A-CACTGTATAATACA--AA-------------ACAAC--TTTTAC-------TTTCTCTCCAATTATCAGTCA-TTatctcagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taacatatataacatTTGATGT-GAATGCTGACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAA-TTACTA-TTG-AATA-TG-AATG-TTAATAAC------ACTG---------ATCACA--AT--T-TGTGAC-----AATGCTAGC--AAT-GCTGATTCCCATTCCGCCAATGCTG-CCAGT--TACTCGTG----AATAAAT-AAGTAA-CTACTTATCTGTTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTC------TAC--TGTC------CAAAATGTAA-CAAA--TACTGATT---AATACTTACAGT-TTTTGTAAGCTTGTCAAGGCAACAAATGTTTCTTTTTCTATACTGGTTATGCTATTCCAAGAT--AAGTAACT--AA--A--AATGA-ATAAATAAT-AAACA-TTAAGATAAC-TTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GTAAA-TTCT-G-CTTGAGACACCCAG-TGATA-C-CGGTACTCA-GATC--AACTACAA-C-CACTGTA----AGA--AATCCTC--------ACAAC--TTAGTCTCTTATTTTTTTCTCCAATgcataatgaagtta
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atttaagatatattacatatgttgcaacgtctgacttctcatcaagtctacctttgttggttttattgctaattga-TTACAA-ATG-A-TA-TG-AATG-CTAAGAAT------GATG---------ACAACA--ATATT-TATCA-------ATGCTTGT--AAT-ACTGATTTTCA--------ACGCCG-ACAAT--TTTTAATA----TATAAAC-AAGCGC-C--TTAACCT-CGAGTTTTTGTAATTGTATCCCCAGGATAGCTACGTCAATCCCTCAATAATTACAGTATA------CAAAGTA-AA-CTAA--TACGGATTTA---TACTTACAGTATCTC-TAGGTTTTCCAATCCAGTAAATGCTTCTTTCTCAATACTTGTTATATCATTGT--GATCCAATCTACT--AAACA--A-TAA-A-AA-TAAC-GAACA-TTAAGATAAT-ATTCTGGATATTG-ATACAGTGATT-GAAAATCTC--G-TTT--AT--CCTTC-TGATACC-AGA-ACTCATAAC---AACTTCAA-A-CACTGTATGATACA--AA-------------ACAAC--TTTTAC-------TTTCTCTCCAATTAACAGCTA-TTgcataataaagttttcactcagacatcattcatcgtagttgttttcaatacgtttctctctagcctaggataatacatgtagctcgtctcttgagtagaacacattaatttaacattcacaatgcacactgaaattgattaatactttcctatcactttcatattaatactaatattcattcttaaatctacgacaacaatagtaaataccacagagacttaacatttgcgatcttgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctctttttaatgaatataaaacatgtgaattcctcttcctaaattctgactatagtttttaaaaagtagaaattacgtaatatctgatacctttgttatttcgtcttcctaatctacttatgattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaatactgccaatttctactgaataaataagtgtaacgggatagctgtttctcgctatcccacttctgacaccaaaaaatgtaacgggatagctgtttctatctatcccacttctgatgccaaaaaaaattagtaaaattgatctatagattatattgg
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacgctctttcacttgttaatgaatataaaatatgtgaattcctcttcctaaattctcacttcatattttgtttttaaaaagtagaaattctgcaatatctgatatctttgttatttcgtcttcctaatctacttatgcttgatgtgAGATACTTACAGC-CCTTCTAGGTTTACCAAAGTGGCAAAACTCCCATTCTCTAc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggG-TGATA-CCAGA-ACTTA-AAAC--AACTTCAAACACAGTATG----ATACAAA-------------ACAAC--TTTTAC-------TTTCTCTCCAATTAACAGACA-TTacgttgcaatttgattgccctccaaatttctgaataagaaagatattgtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atcTGTA----TGA--AGTCCTC--------ACAAT--TTAGTC-------TTTTTTTCCAATTAACAGAGACTTAATgcataatgaagttatcactcagacttcattcatcgtagttgttttcaatatgcttccctctagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactgaatatgaatgctaataacactgatcccaatatgttacaatgccaggaatgctgccaattcctattgcataaattagcaacaacttatctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttttctactatccactatctaacaaatactgattcaaaatacttacagttcttgtaatcttgtca
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACACCAAAAATGTAACGGGAATAGGCTGTTCGCCTAGGCCTATCCCACTTCTAGGGGCTTCTAGACACCAAAAAAAAACCTAGTAAAAATTGATGCTAGTAGATTATACTGGGTTAAAAACCTACAACCCTGGTTATA
Unaligned ( gi|16 ): ATCCCAATTCTGACACCAAAAATGTAACGGGATAGCTGTTTCTAGCTATCCCACTTCAAGCTTCTGACACCAAAAAAATAGTAAAATTGGTCTATAGATTATACTGGTTAAAACCACAACCCTTGT
Unaligned ( gi|20 ): CTATCCCAACTCTGACACCGTAAACTTATGTAGCGAGATAGCAGTTTCTAGCTACCCCACTTTCACTTCTGACACCA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATAGTAAAATTGATCCATAGATTATATTGGTTAAAACCACAACCCTT
Unaligned ( gi|23 ): TATTTCACTAGTAATTTGCTCTCAAAATCTAGCCCAATACAAGTA






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Reference ( family-840 )      :                                                                                             NTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTNCAAATGATATGA--ATGCTAAGAA---TGAT---AACAATATTTTATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTATCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCA-CAAGGATANCTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTNNCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCNATAC-TTGTTATATCATTGCGATCCAANTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATCGATACAGCGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCANAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACGTTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATACTAATATT------CCTNCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACGGAGACTTANCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTACTATTGAAT--ATG-AAT--GCTAATAACGCTGATCACAATTTGTCACAATGCTNGCAATGCTGATTC--------CCAACGCCGNCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACANCTTATCTNCGAGTNTTCGTAATTGTATNACAAGGATANCTCCCNCAACCCCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACTGATTT--AAATACTTACAGTATCTCGTAGGCTTGCCAANGCAGCAAATGCTTCTTTCTCNATACTNGTTATATCATTNCCAGATCCAANTNACTAAACAATAAATAAATAA-CGAACA-TTAAGATAACTTACNGGANATCGTNTACAGCGANT-GAAAATTCTAGTTTGAGTCACCTAGTGATACCAGA-ACTCAAANCAACTNCAACCACTGTATATANAAATCCTCACAACT---TNTNC-------TTTCTCTCCAATTAACAGACA-TTAAT
gi|1                          :                                                                                              TTGCAACCATCTTACTGATTCTCATCCAGTCTACCTTTACTGATTATTATTGCTATCTTGGACTTCAA-TGATATGACGAT-CTAAGAA---TGAT---AACAATATTTTATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGATAAT--TCTTACTCAATAAATAGACAAGCGC--CTTATCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCA-CAAGGATAACTACCTCAATTCCTCAATAATCACAGTATACAATGTAAACTAGTACGAATTTATACTTACAGTGTTTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAAATTACTAAACAATAAAAATAACGAATATTACGATAATGTTCTGGATATTGATATAGTGATCGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGGTACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCTATTAGCAGACATTGCATAATAAAGTTATCACTCAGACATCTTTCATCGTAGTTGTTTTCAATGCGCTTCTCTCTAGCCTAGAAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAGCACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTGATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATATTAGTATA------CCTTCTTAAATTTACGACAACAATAGTAAATATCACGAAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAGCAATGCTTCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATACGTGAATTCCTCCTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-TA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGAATCCCAATACCGCCTATTACTATTGAAT--ATG-AAT--TCGAATAACACTGATCCCAATTTGCCACAATGCTAGCGATGCTGATTC--------CCAATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAATTTATCTATTACTGTTTGCTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCATAATGTAACAATTACTGATTTA-AAATACTTACAGT-CCTCGTACGTTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTTTATTCTGGTTATAATATTCCCAGAT--AAGTCACTAA--AATGAATAACTAA-TAAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAACTCT-GTTTGAGTCACCTAGTGATA-CAGCTACTCAAATAAACTACAACCAGTGTA---AGAAATCTTCACAACT---TAGTC-------TTTTTCTCCAATTACCAGATA-TTAAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                    cATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATGTTCAACGCCGACAGTAATCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCC-CAAGGATAGTTATCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTAAAGTATCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTGAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATGGATATTGATACATTTATTGAAAATCTAGTTTCCTCTTAATTGATACTAGAACTCAAAACAACTTTAAACATTCTTTGATGCAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCAGAATAAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAATAGTAAATATCACGGATACTTACCATTTGCAATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAACAACGCTATTTTTCTTGTTAATTAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATTTTA-----AA--ATAA-GTAGAAATTCTGCAGTATCTGATAGCATTCTTATTAA-GTATTC-CTAATATACcaatagtaaatatcacggatacttaccatttgcaatattggtaatcaatcaatgagattagaaaagtaatcaacaacgctatttttcttgttaattaatataaaatatgtgaattcctcttcctaacttctgacttcatattttaaaataagtagaaattctgcagtatctgatagcattcttattaagtattcctaatatac
gi|12                         :                                                    ttttactttctctccaattatcagtcattgcataatgaagttTTGCAACT-TCTGACT---TTTCGTCCAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCCA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAA---TGATGATAACAGTATTT-ATCAATAGTTGTAAAACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACGCAATAAATAAAGAAGCAC--ATTATCCTTGAGTTTTCGTAATTGTA-CACCAAGGATAACTATCTCAGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacatatattacatattAACGCTCTTTCACTTGTTAATGAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATATCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGCTTGATGT-GAATGTTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGAACACACCTTAATACAATTGGTTATTTAACATTTACCTATGCACACTGGAACTGA-TAATACTTTCC-ATCAC-TTCATATTTATCATAGTAATA
gi|17                         :                                                                ttagcttcctactgagatctattaggagtaTTGCAATT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTCTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCTAATGATATGA--ATGCTAAGAA---TGAT---AACAATA-TTTATCAATGCTTGTAATat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagatatatattTTTCTCTTGTTAATCAATATGAAATATATAAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATCTTA-----AAATA-AA-GTTGAAATTCTGCAATATCTAATAGCTTTGTTATCAA-GTTTTC-CT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tATACTTACAGCCCTTCTAGGTTTACCAAAGTGGCAAA-ACTCCCATTCTCTA-ACGTTGCAATTTGATTGCCCTCCAAATTTCTGAATAAGAAAGATA
gi|2                          :                                                                                          ggagTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGCATACCTATGTTGGTT-TTATTGCTA-ACTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAA---TGAT---TACAATATT--ATCAATGCTTCTAATATTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGCGCCTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCC-CACGGATAACTACCTCAATCCCTCACTAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTATAGTCGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTCACTAAACAATAAAA-TAACGAACATTAAGATAATGTTATAGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTG----------------------CATAAT-----GTAGATGTTTTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------TTTTAACGTTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCGTA-TTA--ATACTAATATTAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACAGGGACTTAACATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAGCAACGCTCCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATTTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATT-------------------------TTGATTCTCAATACCGCCAATTACTATTGAAT--ATG-AAT--GTTAATAACACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTC--------CAAATGCTGCTAAATCCTATTGAATAAATAAGCAACATCTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATTACAATCATATCTCCCGCAACCTCTCTACTATCCACAATCTGACAAATATTGATT----AATACTTACAGT-TCTCGTAAGCTTGTCAAGGAAGCAAATGTTTTTTTCTCTATACTAGATATATTATTCCCAGAT--AAGTAACTAAAAAATGAATACATAATCAAACATTTAATATAACTTACA-GAAATCGTCTACAACAAATAAAAAATTCTGTTTTGAGTCACCCAATttgtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttacatattTGTAT---GAAGTCCTCACAATT---TAGTC-------TTTTTTTCCAATTAACAGAGACTTAATta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTACAGTATACAATGTAAACTCATGCGGATTTATACTCTCAGTattcataagatcttta
gi|3                          :                                                                                              TTGCAACG-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAAAGATGAT---AACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAATTAAACAAGCGC--CTTACCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCC-CAAGGATAGCTACCTTAATCCCTCAATAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTTTCAATAT-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTTGATATTGATACAGTGGTTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCAAAGCAACTTTAAACACTGTATGATACAAAATAACGTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATAAAGTTTTCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGTTTCTCTCTAGCCTAGGATAATACATGTAGCTCGTCTCTTGAGTAGAACACA-----TTA---------ATTTAACATTCAC-AATGCACACTGAAATTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATACTAATATT------CATTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATACCACAGAGACTTAACATTTGCGATCTTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTTTTAATGAATATAAAACATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACT--ATA----GTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTACGTAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACTGCCAATTTCTACTGAATAAATA-AGT--G----TAACGa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttaagatatattacatatgGTTTTCAATACACGTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACCTTCAC-TATGCACATTGAAGCTGATTAATGCTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATATTAATAGT------CCTTCTTAAATTGACGACAGCAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGAGTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAACATAGAATATGCAAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACGTCATATTTTGATTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGACACCTTTGGTGTTCT-GTTTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACAGAAT--ATA-ATT--GCTAATAACACTGATCCCAATTTGTGACAATCCTAGCAATGCTGATTT--------CCAATGCTGACAATTCCTACTGAATAGATAAGCAACAACTTATCTATCAGTGTTTGTAATTGTATGACAAGAATATCGCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACT-ATTTTAAAATACTTACAGT-CCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGAT--AAGGAACTGA--AATTTATAAATAA-TAAACA-TTACGATAAGTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCT-GTTTGAGTCggatagctgtttctcgctatcccacttctgacaccaaaaaatgtaacgggatagctgtttctatctatcccacttctgatgccaaaaaaaattagtaaaattgatctatagattatattgg
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aACTAATATT------CCTGCTTAAATCTACGACAACACTAGTAAATATCACGGAGACTTATCATTTGCGATATTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCAAATTCCTCTTCTTAAATTCTGACTTCATACTTTGTTTTTAA--A-AAAGTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTCC-CTAATCTACTTATCATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACTGAAT--ATG-AAT--GCTAATAACACTGATCCCAATATGTTACAATGCCAGGAATGCTG---------------------CCAATTCCTATTGCATAAATTAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTTTCTACTATCCACTATCTAACAAATACTGATTCA-AAATACTTACAGT-TCTTGTAATCTTGTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactgaatatgaatgctaataacactgatcccaatatgttacaatgccaggaatgctgccaattcctattgcataaattagcaacaacttatctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttttctactatccactatctaacaaatactgattcaaaatacttacagttcttgtaatcttgtca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atcgtgataccagaacttaaaacaacttcaaacacagtatgatacaaaacaacttttactttctctccaattaacagacattgcataatgaagttatcactcagacttcattcatcgtagttgttttcaatatgcttccctctagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCTCCTTCTAAATC--GACTTCATATTTTGTTTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTACAATATCTGATACCTTTGTTATTTCAGTCTTCTCTAATCTACTTATGATTGATGTGGAATGCTAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGATTCCAAATACTGTCAATTCCTACTGAAT--A---AATAAGC-AACAAC
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gi|7                          : tcctccttctaaatcgacttcatattttgttttaaaaaagtagaaattctacaatatctgatacctttgttatttcagtcttctctaatctacTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGCTT-TTATTGCTA-ATTGATTTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAA---TGATGACAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TTTTA----ATATATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTTGTAATTGTATCC-CCAGGATAGCTACGTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAAAGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTATCTCTAGGTTTTCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAATCTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATATTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTCGTTTATCCTTC--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGCTATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTAATATCAGTTGgttcagaccatctatattac
gi|8                          :                                                                          tttaagatatattacatattTTGCAACT-TCTGAAT---TTTCATCCAATCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCAAATGATATGG--ATGCTAAGAA---TGATGAAAACAATATTT-ATCAACGCTTGTAATTTTAATTTTCAACGCCGA-AAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCAC--ATTATCTGCGAGTTTTCGTAAATGTATCA-CAAGGATAACTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTGATAGGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCTAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCA--TGATGCCAGAACTAATAACAACTTCAAACACTGTATAATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTAc
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-840 )      :                                                                                                           NTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTNCAAATGATATGA--ATGCTAAGAATGATG-A-AACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTANCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGCTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTANCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCANAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAC------TAATATTCCTTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTNCTACTGAATATGAATGCTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTCCCA--------ATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACTGATTT--AAATACTTACAGTTCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGATAAGTAACTAAAAAATGA-ATAAATAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCTG-TTTGAGTCACCCAGTGATACCGGTACTCAGATAAACTACAACCACTGTATAGAAATCCTCACAACTTAGTC-----T-----TTTTTTCTCCAATTACCAGAGA-TTAAT
gi|1                          :                                                                                                            TTGCAACCATCTTACTGATTCTCATCCAGTCTACCTTTACTGATTATTATTGCTATCTTGGACTTCAA-TGATATGACGAT-CTAAGAATGAT----AACAATATTTTATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGATAAT--TCTTACTCAATAAATAGACAAGCGC--CTTATCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCACAAGGATAACTACCTCAATTCCTCAATAATCACAGTATACAATGTAAACTAGTACGAATTTATACTTACAGTGTTTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAAATTACTAAACAATAAAAATAACGAATATTACGATAATGTTCTGGATATTGATATAGTGATCGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGGTACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCTATTAGCAGACATTGCATAATAAAGTTATCACTCAGACATCTTTCATCGTAGTTGTTTTCAATGCGCTTCTCTCTAGCCTAGAAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAGCACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTGATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAT------TAGTATACCTTCTTAAATTTACGACAACAATAGTAAATATCACGAAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAGCAATGCTTCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATACGTGAATTCCTCCTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-TA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGAATCCCAATACCGCCTATTACTATTGAATATGAATTCGAATAAC-ACTGATCCCAATTTGCCACAATGCTAGCGATGCTGATTCCCA--------ATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAATTTATCTATTACTGTTTGCTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCATAATGTAACAATTACTGATTTA-AAATACTTACAGTCCTCGTACGTTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTTTATTCTGGTTATAATATTCCCAGATAAGTCACT--AAAATGA-ATAACTAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAACTCTG-TTTGAGTCACCTAGTGATACAGCTACTCAAATAAACTACAACCAGTGTA-AGAAATCTTCACAACTTAGTC------------TTTTTCTCCAATTACCAGATA-TTAAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                cATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATGTTCAACGCCGACAGTAATCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGTTATCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTAAAGTATCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTGAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATGGATATTGATACATTTATTGAAAATCTAGTTTCCTCTTAATTGATACTAGAACTCAAAACAACTTTAAACATTCTTTGATGCAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCAGAATAAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAATAGTAAATATCACGGATACTTACCATTTGCAATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAACAACGCTATTTTTCTTGTTAATTAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATTTTA-----AA--ATAA-GTAGAAATTCTGCAGTATCTGATAGCATTCTTATTAA-GTATTC-CTAATATACcaatagtaaatatcacggatacttaccatttgcaatattggtaatcaatcaatgagattagaaaagtaatcaacaacgctatttttcttgttaattaatataaaatatgtgaattcctcttcctaacttctgacttcatattttaaaataagtagaaattctgcagtatctgatagcattcttattaagtattcctaatatac
gi|12                         :                                                                  ttttactttctctccaattatcagtcattgcataatgaagttTTGCAACT-TCTGACT---TTTCGTCCAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCCA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAATGATG-ATAACAGTATTT-ATCAATAGTTGTAAAACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACGCAATAAATAAAGAAGCAC--ATTATCCTTGAGTTTTCGTAATTGTACACCAAGGATAACTATCTCAGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaacatatattacatattAACGCTCTTTCACTTGTTAATGAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATATCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGCTTGATGT-GAATGTTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGAACACACCTTAATACAATTGGTTATTTAACATTTACCTATGCACACTGGAACTGA-TAATACTTTCC-ATCAC-TTCATATTTATCATAG------TAATA
gi|17                         :                                                                              ttagcttcctactgagatctattaggagtaTTGCAATT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTCTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCTAATGATATGA--ATGCTAAGAATGAT----AACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aagatatatattTTTCTCTTGTTAATCAATATGAAATATATAAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATCTTA-----AAATA-AA-GTTGAAATTCTGCAATATCTAATAGCTTTGTTATCAA-GTTTTC-CT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tATACTTACAGCCCTTCTAGGTTTACCAAAGTGGCAAA-ACTCCCATTCTCTA-ACGTTGCAATTTGATTGCCCTCCAAATTTCTGAATAAGAAAGATA
gi|2                          :                                                                                                        ggagTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGCATACCTATGTTGGTT-TTATTGCTA-ACTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAATGATT-A---CAATATT--ATCAATGCTTCTAATATTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGCGCCTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCACGGATAACTACCTCAATCCCTCACTAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTATAGTCGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTCACTAAACAAT-AAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATAGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGTAG--AT----------------------GTT---TTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------TTTTAACGTTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCGTA-TTA--ATACTAATATTAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACAGGGACTTAACATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAGCAACGCTCCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATTTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATT-------------------------TTGATTCTCAATACCGCCAATTACTATTGAATATGAATGTTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTCCAA--------ATGCTGCTAAATCCTATTGAATAAATAAGCAACATCTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATTACAATCATATCTCCCGCAACCTCTCTACTATCCACAATCTGACAAATATTGATT----AATACTTACAGTTCTCGTAAGCTTGTCAAGGAAGCAAATGTTTTTTTCTCTATACTAGATATATTATTCCCAGATAAGTAACTAAAAAATGA-ATACATAATCAAACATTTAATATAACTTACA-GAAATCGTCTACAACAAATAAAAAATTCTGTTTTGAGTCACCCAATttgtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttacatattTGTAT-GAAGTCCTCACAATTTAGTC-----T-----TTTTT--TCCAATTAACAGAGACTTAATta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTACAGTATACAATGTAAACTCATGCGGATTTATACTCTCAGTAattcataagatcttta
gi|3                          :                                                                                                            TTGCAACG-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAAAGATG-ATAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAATTAAACAAGCGC--CTTACCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGCTACCTTAATCCCTCAATAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTTTCAATAT-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTTGATATTGATACAGTGGTTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCAAAGCAACTTTAAACACTGTATGATACAAAATAACGTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATAAAGTTTTCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGTTTCTCTCTAGCCTAGGATAATACATGTAGCTCGTCTCTTGAGTAGAACACA-----TTA---------ATTTAACATTCAC-AATGCACACTGAAATTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAC------TAATATTCATTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATACCACAGAGACTTAACATTTGCGATCTTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTTTTAATGAATATAAAACATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACT--ATA----GTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTACGTAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACTGCCAATTTCTACTGAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atttaagatatattacatatgGTTTTCAATACACGTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACCTTCAC-TATGCACATTGAAGCTGATTAATGCTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAT------TAATAGTCCTTCTTAAATTGACGACAGCAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGAGTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAACATAGAATATGCAAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACGTCATATTTTGATTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGACACCTTTGGTGTTCT-GTTTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACAGAATATAATTGCTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATCCTAGCAATGCTGATTTCCA--------ATGCTGACAATTCCTACTGAATAGATAAGCAACAACTTATCTATCAGTGTTTGTAATTGTATGACAAGAATATCGCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACT-ATTTTAAAATACTTACAGTCCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGATAAGGAACT--GAAATTT-ATAAATAAT-AAACA-TTACGATAAGTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCTG-TTTGAGTCaataagtgtaacgggatagctgtttctcgctatcccacttctgacaccaaaaaatgtaacgggatagctgtttctatctatcccacttctgatgccaaaaaaaattagtaaaattgatctatagattatattgg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCG--TGATACCAGAACTTAAAACAACTTCAAACACAGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACTTCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATATGCTTCCCTCTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAC------TAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACACTAGTAAATATCACGGAGACTTATCATTTGCGATATTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCAAATTCCTCTTCTTAAATTCTGACTTCATACTTTGTTTTTAA--A-AAAGTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTCC-CTAATCTACTTATCATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACTGAATATGAATGCTAATAAC-ACTGATCCCAATATGTTACAATGCCAG-------GA--------------ATGCTGCCAATTCCTATTGCATAAATTAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTTTCTACTATCCACTATCTAACAAATACTGATTCA-AAATACTTACAGTTCTTGTAATCTTGTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactgaatatgaatgctaataacactgatcccaatatgttacaatgccaggaatgctgccaattcctattgcataaattagcaacaacttatctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttttctactatccactatctaacaaatactgattcaaaatacttacagttcttgtaatcttgtca
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Reference ( family-840 )      :                                                                                                           NTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTNCAAATGATATGA--ATGCTAAGAATGATG-A-AACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTANCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGCTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTANCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCANAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAC------TAATATTCCTTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTNCTACTGAATATGAATGCTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTCCCA--------ATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACTGATTT--AAATACTTACAGTCCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGATAAGTAACTAAAAAATGA-ATAAATAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCTG-TTTGAGTCACCCAGTGATACCGCTACTCAGATAAACTACAACCACTGTATAGAAATCCTCACAACTTAGTC-----T-----TTTTTTCTCCAATTACCAGAGA-TTAAT
gi|1                          :                                                                                                            TTGCAACCATCTTACTGATTCTCATCCAGTCTACCTTTACTGATTATTATTGCTATCTTGGACTTCAA-TGATATGACGAT-CTAAGAATGAT----AACAATATTTTATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGATAAT--TCTTACTCAATAAATAGACAAGCGC--CTTATCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCACAAGGATAACTACCTCAATTCCTCAATAATCACAGTATACAATGTAAACTAGTACGAATTTATACTTACAGTGTTTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAAATTACTAAACAATAAAAATAACGAATATTACGATAATGTTCTGGATATTGATATAGTGATCGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGGTACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCTATTAGCAGACATTGCATAATAAAGTTATCACTCAGACATCTTTCATCGTAGTTGTTTTCAATGCGCTTCTCTCTAGCCTAGAAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAGCACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTGATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAT------TAGTATACCTTCTTAAATTTACGACAACAATAGTAAATATCACGAAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAGCAATGCTTCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATACGTGAATTCCTCCTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-TA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGAATCCCAATACCGCCTATTACTATTGAATATGAATTCGAATAAC-ACTGATCCCAATTTGCCACAATGCTAGCGATGCTGATTCCCA--------ATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAATTTATCTATTACTGTTTGCTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCATAATGTAACAATTACTGATTTA-AAATACTTACAGTCCTCGTACGTTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTTTATTCTGGTTATAATATTCCCAGATAAGTCACT--AAAATGA-ATAACTAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAACTCTG-TTTGAGTCACCTAGTGATACAGCTACTCAAATAAACTACAACCAGTGTA-AGAAATCTTCACAACTTAGTC------------TTTTTCTCCAATTACCAGATA-TTAAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                cATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATGTTCAACGCCGACAGTAATCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGTTATCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTAAAGTATCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTGAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATGGATATTGATACATTTATTGAAAATCTAGTTTCCTCTTAATTGATACTAGAACTCAAAACAACTTTAAACATTCTTTGATGCAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCAGAATAAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAATAGTAAATATCACGGATACTTACCATTTGCAATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAACAACGCTATTTTTCTTGTTAATTAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATTTTA-----AA--ATAA-GTAGAAATTCTGCAGTATCTGATAGCATTCTTATTAA-GTATTC-CTAATATACcaatagtaaatatcacggatacttaccatttgcaatattggtaatcaatcaatgagattagaaaagtaatcaacaacgctatttttcttgttaattaatataaaatatgtgaattcctcttcctaacttctgacttcatattttaaaataagtagaaattctgcagtatctgatagcattcttattaagtattcctaatatac
gi|12                         :                                                                  ttttactttctctccaattatcagtcattgcataatgaagttTTGCAACT-TCTGACT---TTTCGTCCAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCCA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAATGATG-ATAACAGTATTT-ATCAATAGTTGTAAAACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACGCAATAAATAAAGAAGCAC--ATTATCCTTGAGTTTTCGTAATTGTACACCAAGGATAACTATCTCAGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttaacatatattacatattAACGCTCTTTCACTTGTTAATGAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATATCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGCTTGATGT-GAATGTTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGAACACACCTTAATACAATTGGTTATTTAACATTTACCTATGCACACTGGAACTGA-TAATACTTTCC-ATCAC-TTCATATTTATCATAG------TAATA
gi|17                         :                                                                              ttagcttcctactgagatctattaggagtaTTGCAATT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTCTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCTAATGATATGA--ATGCTAAGAATGAT----AACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aagatatatattTTTCTCTTGTTAATCAATATGAAATATATAAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATCTTA-----AAATA-AA-GTTGAAATTCTGCAATATCTAATAGCTTTGTTATCAA-GTTTTC-CT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tATACTTACAGCCCTTCTAGGTTTACCAAAGTGGCAAA-ACTCCCATTCTCTA-ACGTTGCAATTTGATTGCCCTCCAAATTTCTGAATAAGAAAGATA
gi|2                          :                                                                                                        ggagTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGCATACCTATGTTGGTT-TTATTGCTA-ACTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAATGATT-A---CAATATT--ATCAATGCTTCTAATATTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGCGCCTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCACGGATAACTACCTCAATCCCTCACTAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTATAGTCGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTCACTAAACAAT-AAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATAGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGTAG--AT----------------------GTT---TTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------TTTTAACGTTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCGTA-TTA--ATACTAATATTAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACAGGGACTTAACATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAGCAACGCTCCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATTTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATT-------------------------TTGATTCTCAATACCGCCAATTACTATTGAATATGAATGTTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTCCAA--------ATGCTGCTAAATCCTATTGAATAAATAAGCAACATCTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATTACAATCATATCTCCCGCAACCTCTCTACTATCCACAATCTGACAAATATTGATT----AATACTTACAGTTCTCGTAAGCTTGTCAAGGAAGCAAATGTTTTTTTCTCTATACTAGATATATTATTCCCAGATAAGTAACTAAAAAATGA-ATACATAATCAAACATTTAATATAACTTACA-GAAATCGTCTACAACAAATAAAAAATTCTGTTTTGAGTCACCCAATttgtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttacatattTGTAT-GAAGTCCTCACAATTTAGTC-----T-----TTTTT--TCCAATTAACAGAGACTTAATta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTACAGTATACAATGTAAACTCATGCGGATTTATACTCTCAGTAattcataagatcttta
gi|3                          :                                                                                                            TTGCAACG-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAAAGATG-ATAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAATTAAACAAGCGC--CTTACCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGCTACCTTAATCCCTCAATAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTTTCAATAT-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTTGATATTGATACAGTGGTTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCAAAGCAACTTTAAACACTGTATGATACAAAATAACGTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATAAAGTTTTCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGTTTCTCTCTAGCCTAGGATAATACATGTAGCTCGTCTCTTGAGTAGAACACA-----TTA---------ATTTAACATTCAC-AATGCACACTGAAATTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAC------TAATATTCATTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATACCACAGAGACTTAACATTTGCGATCTTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTTTTAATGAATATAAAACATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACT--ATA----GTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTACGTAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACTGCCAATTTCTACTGAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atttaagatatattacatatgGTTTTCAATACACGTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACCTTCAC-TATGCACATTGAAGCTGATTAATGCTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAT------TAATAGTCCTTCTTAAATTGACGACAGCAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGAGTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAACATAGAATATGCAAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACGTCATATTTTGATTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGACACCTTTGGTGTTCT-GTTTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACAGAATATAATTGCTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATCCTAGCAATGCTGATTTCCA--------ATGCTGACAATTCCTACTGAATAGATAAGCAACAACTTATCTATCAGTGTTTGTAATTGTATGACAAGAATATCGCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACT-ATTTTAAAATACTTACAGTCCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGATAAGGAACT--GAAATTT-ATAAATAAT-AAACA-TTACGATAAGTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCTG-TTTGAGTCaataagtgtaacgggatagctgtttctcgctatcccacttctgacaccaaaaaatgtaacgggatagctgtttctatctatcccacttctgatgccaaaaaaaattagtaaaattgatctatagattatattgg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCG--TGATACCAGAACTTAAAACAACTTCAAACACAGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACTTCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATATGCTTCCCTCTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAC------TAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACACTAGTAAATATCACGGAGACTTATCATTTGCGATATTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCAAATTCCTCTTCTTAAATTCTGACTTCATACTTTGTTTTTAA--A-AAAGTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTCC-CTAATCTACTTATCATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACTGAATATGAATGCTAATAAC-ACTGATCCCAATATGTTACAATGCCAG-------GA--------------ATGCTGCCAATTCCTATTGCATAAATTAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTTTCTACTATCCACTATCTAACAAATACTGATTCA-AAATACTTACAGTTCTTGTAATCTTGTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactgaatatgaatgctaataacactgatcccaatatgttacaatgccaggaatgctgccaattcctattgcataaattagcaacaacttatctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttttctactatccactatctaacaaatactgattcaaaatacttacagttcttgtaatcttgtca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcgtgataccagaacttaaaacaacttcaaacacagtatgatacaaaacaacttttactttctctccaattaacagacattgcataatgaagttatcactcagacttcattcatcgtagttgttttcaatatgcttccctctagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCTCCTTCTAAATC--GACTTCATATTTTGTTTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTACAATATCTGATACCTTTGTTATTTCAGTCTTCTCTAATCTACTTATGATTGATGTGGAATGCTAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGATTCCAAATACTGTCAATTCCTACTGAATA--AATA--AGCAACAACT--TCTCTATTAGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATGCTAACAA-------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGATTCCAA--------ATACTGTCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAACTTCTCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACTGATT----AATACTTACAGTCTTAGTAAGCTTGTCAAGGCTGAAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTGTTCCCAGATAAGTCACTAAAAAA--ATATAAATAAT-AAACT-TCAAAATAACTTACAGGAAATCGGCTACAACAAAT-GCAAATTCTG-TTTGAGTCACCTAGTGATACCGCTACTCAGATAAACTACAACCACTGTAT-GAAACCCTCACAACTTAGTC-----TTCTAATTTTTTCTCCAATTACGAGAGA-TTAATtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttctctactatccacaatgtaacaaatactgattaatacttacagtcttagtaagcttgtcaaggctgaaaatgtttctttctctatactggttatattgttcccagataagtcactaaaaaaatataaataataaacttcaaaataacttacaggaaatcggctacaacaaatgcaaattctgtttgagtcacctagtgataccgctactcagataaactacaaccactgtatgaaaccctcacaacttagtcttctaattttttctccaattacgagagattaatgttcagaccatctatattac
gi|7                          : tcctccttctaaatcgacttcatattttgttttaaaaaagtagaaattctacaatatctgatacctttgttatttcagtcttctctaatctacttatgattgatgtgTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGCTT-TTATTGCTA-ATTGATTTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAATGATG-ACAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TTTTA----ATATATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTTGTAATTGTATCCCCAGGATAGCTACGTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAAAGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTATCTCTAGGTTTTCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAATCTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATATTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTCGTTTATCCTTC--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGCTATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTAATATCAGTTGgttcagaccatctatattac
gi|8                          :                                                                                        tttaagatatattacatattTTGCAACT-TCTGAAT---TTTCATCCAATCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCAAATGATATGG--ATGCTAAGAATGATGAA-AACAATATTT-ATCAACGCTTGTAATTTTAATTTTCAACGCCGA-AAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCAC--ATTATCTGCGAGTTTTCGTAAATGTATCACAAGGATAACTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTGATAGGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCTAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCA--TGATGCCAGAACTAATAACAACTTCAAACACTGTATAATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTAc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taacatatataacatattTTGATGT-GAATGCTGACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTACTATTGAATATGAATGTTAATAAC-ACTGATCACAATTTGTGACAATGCTAGCAATGCTGATTCCCATTCCGCCAATGCTGCCAGTTACTCGTGAATAAATAAGTAACTACTTATCTGTTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTGTCCAAAATGTAACAAATACTGATT----AATACTTACAGTTTTTGTAAGCTTGTCAAGGCAACAAATGTTTCTTTTTCTATACTGGTTATGCTATTCCAAGATAAGTAACTAAAA-ATGA-ATAAATAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GTAAATTCTG-CTTGAGACACCCAGTGATACCGGTACTCAGATCAACTACAACCACTGTA-AGAAATCCTCACAACTTAGTCTCTTAT-----TTTTTTCTCCAAT


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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): ATCCCAATTCTGACACCAAAAATGTAACGGGATAGCTGTTTCTAGCTATCCCACTTCAAGCTTCTGACACCAAAAAAATAGTAAAATTGGTCTATAGATTATACTGGTTAAAACCACAACCCTTGT
Unaligned ( gi|20 ): CTATCCCAACTCTGACACCGTAAACTTATGTAGCGAGATAGCAGTTTCTAGCTACCCCACTTTCACTTCTGACACCA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATAGTAAAATTGATCCATAGATTATATTGGTTAAAACCACAACCCTT
Unaligned ( gi|23 ): TATTTCACTAGTAATTTGCTCTCAAAATCTAGCCCAATACAAGTA






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Reference ( family-840 )      :                                                                                                           NTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTNCAAATGATATGA--ATGCTAAGAATGATGATAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTANCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGCTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTANCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCANAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAC------TAATATTCCTTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTNCTACTGAATATGAATGCTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTCCCA--------ATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACTGATT----AATACTTACAGTCCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGATAAGTAACTAAAAAATGA-ATAAATAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCTG-TTTGAGTCACCCAGTGATACCGCTACTCAGATAAACTACAACCACTGTATAGAAATCCTCACAACTTAGTC-----T-----TTTTTTCTCCAATTACCAGAGA-TTAAT
gi|1                          :                                                                                                            TTGCAACCATCTTACTGATTCTCATCCAGTCTACCTTTACTGATTATTATTGCTATCTTGGACTTCAA-TGATATGACGAT-CTAAGAATGAT---AACAATATTTTATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGATAAT--TCTTACTCAATAAATAGACAAGCGC--CTTATCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCACAAGGATAACTACCTCAATTCCTCAATAATCACAGTATACAATGTAAACTAGTACGAATTTATACTTACAGTGTTTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAAATTACTAAACAATAAAAATAACGAATATTACGATAATGTTCTGGATATTGATATAGTGATCGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGGTACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCTATTAGCAGACATTGCATAATAAAGTTATCACTCAGACATCTTTCATCGTAGTTGTTTTCAATGCGCTTCTCTCTAGCCTAGAAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAGCACA-----ATA---------ATTTAACATTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTGATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAT------TAGTATACCTTCTTAAATTTACGACAACAATAGTAAATATCACGAAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAGCAATGCTTCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATACGTGAATTCCTCCTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-TA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGAATCCCAATACCGCCTATTACTATTGAATATGAATTCGAATAAC-ACTGATCCCAATTTGCCACAATGCTAGCGATGCTGATTCCCA--------ATGCTGCCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAATTTATCTATTACTGTTTGCTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCATAATGTAACAATTACTGATTTAA-AATACTTACAGTCCTCGTACGTTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTTTATTCTGGTTATAATATTCCCAGATAAGTCACT--AAAATGA-ATAACTAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAACTCTG-TTTGAGTCACCTAGTGATACAGCTACTCAAATAAACTACAACCAGTGTA-AGAAATCTTCACAACTTAGTC------------TTTTTCTCCAATTACCAGATA-TTAAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                               cATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATGTTCAACGCCGACAGTAATCTTACTCAATAAATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGTTATCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTAAAGTATCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTGAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATGGATATTGATACATTTATTGAAAATCTAGTTTCCTCTTAATTGATACTAGAACTCAAAACAACTTTAAACATTCTTTGATGCAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCAGAATAAAGTTATCACTCAGACATCATTCATCGTAGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACAATAGTAAATATCACGGATACTTACCATTTGCAATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGAAAAGTAATCAACAACGCTATTTTTCTTGTTAATTAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATTTTA-----AA--ATAA-GTAGAAATTCTGCAGTATCTGATAGCATTCTTATTAA-GTATTC-CTAATATACcaatagtaaatatcacggatacttaccatttgcaatattggtaatcaatcaatgagattagaaaagtaatcaacaacgctatttttcttgttaattaatataaaatatgtgaattcctcttcctaacttctgacttcatattttaaaataagtagaaattctgcagtatctgatagcattcttattaagtattcctaatatac
gi|12                         :                                                                  ttttactttctctccaattatcagtcattgcataatgaagttTTGCAACT-TCTGACT---TTTCGTCCAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCCA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAATGATGATAACAGTATTT-ATCAATAGTTGTAAAACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACGCAATAAATAAAGAAGCAC--ATTATCCTTGAGTTTTCGTAATTGTACACCAAGGATAACTATCTCAGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttaacatatattacatattAACGCTCTTTCACTTGTTAATGAATATAAAATATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATATCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGCTTGATGT-GAATGTTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAGAACACACCTTAATACAATTGGTTATTTAACATTTACCTATGCACACTGGAACTGA-TAATACTTTCC-ATCAC-TTCATATTTATCATAG------TAATA
gi|17                         :                                                                              ttagcttcctactgagatctattaggagtaTTGCAATT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTCTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCTAATGATATGA--ATGCTAAGA---ATGATAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aagatatatattTTTCTCTTGTTAATCAATATGAAATATATAAATTCCTCTTCCTAACTTCTGACTTCATATCTTA-----AAATA-AA-GTTGAAATTCTGCAATATCTAATAGCTTTGTTATCAA-GTTTTC-CT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tATACTTACAGCCCTTCTAGGTTTACCAAAGTGGCAAA-ACTCCCATTCTCTA-ACGTTGCAATTTGATTGCCCTCCAAATTTCTGAATAAGAAAGATA
gi|2                          :                                                                                                        ggagTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGCATACCTATGTTGGTT-TTATTGCTA-ACTGAATTACAAATGATATGA--ATACTAAGAATGAT--TA-CAATATT--ATCAATGCTTCTAATATTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCGCGCCTTAACCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCACGGATAACTACCTCAATCCCTCACTAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTATAGTCGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTCATCCAATTCACTAAACAAT-AAAATAACGAACATTAAGATAATGTTATAGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTTG--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGTAG--AT----------------------GTT---TTCAATACGCTTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTCGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------TTTTAACGTTCAC-TATGCACACTGAAACTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCGTA-TTA--ATACTAATATTAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATATCACAGGGACTTAACATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAGCAACGCTCCTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCGAATTCCTCTTCCTAAATTCTCACTTCATATTTTGTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATTTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATT-------------------------TTGATTCTCAATACCGCCAATTACTATTGAATATGAATGTTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATGCTAGCGATGCTGATTCCAA--------ATGCTGCTAAATCCTATTGAATAAATAAGCAACATCTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATTACAATCATATCTCCCGCAACCTCTCTACTATCCACAATCTGACAAATATTGATT----AATACTTACAGTTCTCGTAAGCTTGTCAAGGAAGCAAATGTTTTTTTCTCTATACTAGATATATTATTCCCAGATAAGTAACTAAAAAATGA-ATACATAATCAAACATTTAATATAACTTACA-GAAATCGTCTACAACAAATAAAAAATTCTGTTTTGAGTCACCCAATttgtg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttacatattTGTAT-GAAGTCCTCACAATTTAGTC-----T-----TTTTT--TCCAATTAACAGAGACTTAATta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTACAGTATACAATGTAAACTCATGCGGATTTATACTCTCAGTAattcataagatcttta
gi|3                          :                                                                                                            TTGCAACG-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAAAGATGATAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TCTTACTCAATAATTAAACAAGCGC--CTTACCCTCGAGTTTTCGTAATTGTATCCCAAGGATAGCTACCTTAATCCCTCAATAATTACAGAATACAATGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTTTCAATAT-TTGTTATATCATTGCGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTTGATATTGATACAGTGGTTGAAAATCTAGTTTTTCCTCG--TGATACCAGAACTCAAAGCAACTTTAAACACTGTATGATACAAAATAACGTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATAAAGTTTTCACTCAGACATCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATACGTTTCTCTCTAGCCTAGGATAATACATGTAGCTCGTCTCTTGAGTAGAACACA-----TTA---------ATTTAACATTCAC-AATGCACACTGAAATTGATTAATACTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAC------TAATATTCATTCTTAAATCTACGACAACAATAGTAAATACCACAGAGACTTAACATTTGCGATCTTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTTTTAATGAATATAAAACATGTGAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACT--ATA----GTTTTTAA--A-AA-GTAGAAATTACGTAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACTGCCAATTTCTACTGAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttaagatatattacatatgGTTTTCAATACACGTCTCTCTAGCCTAGGAT-AT-----TAGCTTGTCTCTTGAGCAGAACACA-----ATA---------ATTTAACCTTCAC-TATGCACATTGAAGCTGATTAATGCTTTCCTATCACTTTCATA-TTA--ATAT------TAATAGTCCTTCTTAAATTGACGACAGCAATAGTAAATATCACGGAGACTTACCATTTGCGATATTGGTAATCAATCAATGAGAGTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAACATAGAATATGCAAATTCCTCTTCCTAAATTCTGACGTCATATTTTGATTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTGCAATATCTGACACCTTTGGTGTTCT-GTTTTC-CTAATCTACTTATGATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACAGAATATAATTGCTAATAAC-ACTGATCCCAATTTGTGACAATCCTAGCAATGCTGATTTCCA--------ATGCTGACAATTCCTACTGAATAGATAAGCAACAACTTATCTATCAGTGTTTGTAATTGTATGACAAGAATATCGCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACT-ATTTTAAAATACTTACAGTCCTCGTAAGCTTGTCAAGGCAGCAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTATTCCCAGATAAGGAACT--GAAATTT-ATAAATAAT-AAACA-TTACGATAAGTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GAAAATTCTG-TTTGAGTCaataagtgtaacgggatagctgtttctcgctatcccacttctgacaccaaaaaatgtaacgggatagctgtttctatctatcccacttctgatgccaaaaaaaattagtaaaattgatctatagattatattgg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCG--TGATACCAGAACTTAAAACAACTTCAAACACAGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGACATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACTTCATTCATCGTAGTTGTTTTCAATATGCTTCCCTCTAGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAC------TAATATTCCTGCTTAAATCTACGACAACACTAGTAAATATCACGGAGACTTATCATTTGCGATATTGCTAATCAATCAATGAGATTAGGAAAGTAATCAACAACGCTCTTTCTCTTGTTAATGAATATAAAATATGCAAATTCCTCTTCTTAAATTCTGACTTCATACTTTGTTTTTAA--A-AAAGTAGAAATTCTGCAATATCTGATACCTTTGTTATTTC-GTCTCC-CTAATCTACTTATCATTGATGT-GAATGCTAACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTCCTACTGAATATGAATGCTAATAAC-ACTGATCCCAATATGTTACAATGCCAG-------GA--------------ATGCTGCCAATTCCTATTGCATAAATTAGCAACAACTTATCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTTTCTACTATCCACTATCTAACAAATACTGATTCAA-AATACTTACAGTTCTTGTAATCTTGTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaatattcctgcttaaatctacgacaacactagtaaatatcacggagacttatcatttgcgatattgctaatcaatcaatgagattaggaaagtaatcaacaacgctctttctcttgttaatgaatataaaatatgcaaattcctcttcttaaattctgacttcatactttgtttttaaaaaagtagaaattctgcaatatctgatacctttgttatttcgtctccctaatctacttatcattgatgtgaatgctaacaatactgattcccaataccgccaattcctactgaatatgaatgctaataacactgatcccaatatgttacaatgccaggaatgctgccaattcctattgcataaattagcaacaacttatctattagtgtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttttctactatccactatctaacaaatactgattcaaaatacttacagttcttgtaatcttgtca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atcgtgataccagaacttaaaacaacttcaaacacagtatgatacaaaacaacttttactttctctccaattaacagacattgcataatgaagttatcactcagacttcattcatcgtagttgttttcaatatgcttccctctagctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCCTCCTTCTAAATC--GACTTCATATTTTGTTTTAAA--A-AA-GTAGAAATTCTACAATATCTGATACCTTTGTTATTTCAGTCTTCTCTAATCTACTTATGATTGATGTGGAATGCTAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGATTCCAAATACTGTCAATTCCTACTGAATA--AATA--AGCAACAACT--TCTCTATTAGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAATGCTAACAA-------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTGATTCCAA--------ATACTGTCAATTCCTACTGAATAAATAAGCAACAACTTCTCTATTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTATCCACAATGTAACAAATACTGATT----AATACTTACAGTCTTAGTAAGCTTGTCAAGGCTGAAAATGTTTCTTTCTCTATACTGGTTATATTGTTCCCAGATAAGTCACTAAAAAA--ATATAAATAAT-AAACT-TCAAAATAACTTACAGGAAATCGGCTACAACAAAT-GCAAATTCTG-TTTGAGTCACCTAGTGATACCGCTACTCAGATAAACTACAACCACTGTAT-GAAACCCTCACAACTTAGTC-----TTCTAATTTTTTCTCCAATTACGAGAGA-TTAATtttgttattgtatgacaagaatatctcccacaacttctctactatccacaatgtaacaaatactgattaatacttacagtcttagtaagcttgtcaaggctgaaaatgtttctttctctatactggttatattgttcccagataagtcactaaaaaaatataaataataaacttcaaaataacttacaggaaatcggctacaacaaatgcaaattctgtttgagtcacctagtgataccgctactcagataaactacaaccactgtatgaaaccctcacaacttagtcttctaattttttctccaattacgagagattaatgttcagaccatctatattac
gi|7                          : tcctccttctaaatcgacttcatattttgttttaaaaaagtagaaattctacaatatctgatacctttgttatttcagtcttctctaatctacttatgattgatgtgTTGCAACT-TCTGACT---TCTCATCAAGTCTACCTTTGTTGCTT-TTATTGCTA-ATTGATTTACAAATGATATGA--ATGCTAAGAATGATGACAACAATATTT-ATCAATGCTTGTAATACTGATTTTCAACGCCGACAAT--TTTTA----ATATATAAACAAGCGC--CTTAACCTCGAGTTTTTGTAATTGTATCCCCAGGATAGCTACGTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAAAGTAAACTAATACGGATTTATACTTACAGTATCTCTAGGTTTTCCAATCCAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAATCTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATATTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTCGTTTATCCTTC--TGATACCAGAACTCATAACAACTTCAAACACTGTATGATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTAACAGCTATTGCATAATGAAGTTATCACTCAGACATCATTAATATCAGTTGgttcagaccatctatattac
gi|8                          :                                                                                        tttaagatatattacatattTTGCAACT-TCTGAAT---TTTCATCCAATCTACCTTTGTTGGTT-TTATTGCTA-ATTGAATTTCAAATGATATGG--ATGCTAAGAATGATGAAAACAATATTT-ATCAACGCTTGTAATTTTAATTTTCAACGCCGA-AAT--TCTTACTCAATAAATAAACAAGCAC--ATTATCTGCGAGTTTTCGTAAATGTATCACAAGGATAACTACCTCAATCCCTCAATAATTACAGTATACAATGTAAACTGATAGGGATTTATACTTACAGTAGCTCTAGGTTTGCCAATCTAGTAAATGCTTCT-TTCTCAATAC-TTGTTATATCATTGTGATCCAATTTACTAAACAATAAAAATAACGAACATTAAGATAATGTTCTGGATATTGATACAGTGATTGAAAATCTAGTTTTTCCTCA--TGATGCCAGAACTAATAACAACTTCAAACACTGTATAATACAAAACAACTTTTACTTTCTCTCCAATTATCAGTCATTGCATAATGAAGTTAc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taacatatataacatattTTGATGT-GAATGCTGACAATA-------------------------CTGATTCCCAATACCGCCAATTACTATTGAATATGAATGTTAATAAC-ACTGATCACAATTTGTGACAATGCTAGCAATGCTGATTCCCATTCCGCCAATGCTGCCAGTTACTCGTGAATAAATAAGTAACTACTTATCTGTTAGTGTTTGTTATTGTATGACAAGAATATCTCCCACAACTTCTCTACTGTCCAAAATGTAACAAATACTGATT----AATACTTACAGTTTTTGTAAGCTTGTCAAGGCAACAAATGTTTCTTTTTCTATACTGGTTATGCTATTCCAAGATAAGTAACT-AAAAATGA-ATAAATAAT-AAACA-TTAAGATAACTTACAGGAAATCGTCTACAACAAAT-GTAAATTCTG-CTTGAGACACCCAGTGATACCGGTACTCAGATCAACTACAACCACTGTA-AGAAATCCTCACAACTTAGTCTCTTAT-----TTTTTTCTCCAAT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACACCAAAAATGTAACGGGAATAGGCTGTTCGCCTAGGCCTATCCCACTTCTAGGGGCTTCTAGACACCAAAAAAAAACCTAGTAAAAATTGATGCTAGTAGATTATACTGGGTTAAAAACCTACAACCCTGGTTATA
Unaligned ( gi|16 ): ATCCCAATTCTGACACCAAAAATGTAACGGGATAGCTGTTTCTAGCTATCCCACTTCAAGCTTCTGACACCAAAAAAATAGTAAAATTGGTCTATAGATTATACTGGTTAAAACCACAACCCTTGT
Unaligned ( gi|20 ): CTATCCCAACTCTGACACCGTAAACTTATGTAGCGAGATAGCAGTTTCTAGCTACCCCACTTTCACTTCTGACACCA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATAGTAAAATTGATCCATAGATTATATTGGTTAAAACCACAACCCTT
Unaligned ( gi|23 ): TATTTCACTAGTAATTTGCTCTCAAAATCTAGCCCAATACAAGTA