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lowQualScore                  :               .  ...    .   ..... .   ...  ..             .....   . .  .    .  .    .......   .   ..      .    .     ......  .   .    ........   .        . ..    ..          .  ...................    .....        .     .   .  ..  ......           ............. .   ..            ..        .  . .   ...............    ... ..       
lowQualScore                  :               2  444    1   22222 7   777  11             55555   7 9  7    7  7    4444444   7   66      7    9     888888  8   8    33333333   6        0 88    99          9  9999999999999999999    00000        0     2   2  11  555555           5555555555555 7   66            55        9  3 9   444444444444444    444 88       
consensus                     :          NNAGGTGG---TTTTTTTC-----GCGGG--GTG--ATAAATTTGGCTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AG-ATAC-------CTT-TCC-GCCAAAA-TTTCACTCGCC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGAGAG------AT--AA------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAA-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--G-CATA-C-TTTG-AGCCAGCAAATC--GCCAAATT-TCAG-ACCCGC-GG------A--AAAAA--C--CCGCTAT
Reference ( gi|4 )            :          AGAGGTGG---TTTTCTTT-----GTGGG--ATG--ATAAATTTGGCTT-C---TTT-TGGC-GGTT-AG-ATAC-------CTT-TCC-ACCAAAA-TTTCCCTCGCT-----AA-ATA-TGCA------C-CCACTTGCGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGAGAG------GT--AA------CACTT-----CCTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--CA--G-AATA-C-TTTA-AGCCAGCAAATC--GCCAAATT-TCTG-ACCTGT-GT------A--AAAAG--C--CCGCTAT
gi|5                          :            AGGTTT---TTTTTTTTTG---GCAGG--GTT--ATAAATTTAGCTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AA-ATAC-------CCT-TTC-GCCATAA-TTTCATTTGCC-----AA-ATA-TGCA-----------------ATA-T--CAGT--ATTTGCAAGGGAG------AT--GA------CACTT-----CCTTGTCCGCAAAA-A-A-TA--TT----CTGATAAAATTAA--TA--G-CATACC-TTTA-AGACAGTAAATC--GCCAAATT-TCAG-ACCCAC-GG------A--AAAAA--C--CC
gi|14                         : taacgggtagcAGG-GG---TTTT-TCC-----GTGGG--GTG--ATAAATTTGG-TG-C---ATT-T-------T-AG------------CTC-TCT-GTCAAAA-TTTCCCTCGCC-----AG-ATA-TGCA------A-TGAATTGCGACT-T--CAGT--AATCACAAGA-AG------AA--AA------CACTT-----CCTTGTCCCCCAGA-ATT-TA--TT----CCGCCAAAATTAT--TA--G----------CA-AACC----AATC--ACCAAATT-TCAG-ACCCTC-GG------A--AAAAcc
gi|25                         :       gtatagcGTGGGGTTTTTCCCT------TGGG---TG--ATAAATTTAGCTA-A---ATT-TATC-GGTT-AG-ATAC-------CTT-TTC-GCCAAAG-TTaact
gi|10                         :          gtataTGG---TTTTTTTT-----GTGGGGAATG--ATAAATTTGGC----------------AGTT-AG-ATAA-------CTT-TCT-GCCAAAA-TTTCACTCTCC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCAATT-T--CAGT--GTTAACAAGA------------------------TT-------TAGTCTGCCAAA-ATT-TA--TA----TAACTAAATTTAC--TT--A-CATACC-TTTG-AGCCAGCAAAGT--GCCAAATT-TCAG-CCCCAC-GG------A--AAAA---C--CAACTATa
gi|7                          :          tttattGG---TTTTTTTCCC---GCAGG---TG--ATAAATTTAGGTT-A---TTT-TAGC-AGTT-AG-ACAC-------CTT-TTC-GCCAAAA-TTTTAGCCGCC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGAAAG------AT--AA------CACTT-----CCTGGTCCGACAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATCAT--TA--G-CATA-CTTTTG-AGCCAGCAAATC--GTCAAATT-TCAG-ATTTG
gi|2                          :       cgtacagcaGG---TTTTTTTTCC---ACAGG--GTG--ATAAATTCGGCTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AA-ATAC-------CTT-TCC-ACCAAAA-TTTCAGTCCCC-----AA-ATA-TGCA------T-CCAGTTGCGAGT-T--CAGT--ATTTGC-ATATAT------TTTCAA-------ACTT-----TGTTGTCCCCTAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--TA--G-TATA-C-TTTG-AGCCAGCATATC--ACCAAATT-TCAG-ACCCAA-AG------A--AAAAA--C--CCACTa
gi|6                          :       cgtatagtgGG---TTTTTATCCC---GCGGG--ATG--ATAAATTTAGCTT-A---CTT-TAGC-GGTG-AG-ATAC-------CTT-TAC-GCCAAAA-TTGCACTCGTC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGATT-T--CAGT--ATTTGTAGTGGAG------AT--AA------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAT-ATT-TA--TT----TCGCCAAATTTAA--TA--G-CATATT-TTTA-AGCCAACAATTC--GCCAAAAT-TCAG-ACCCGC-AG------AC-AAAAC--C--CCGCtta
gi|9                          :              cgGG---TTTTTTTT-----TTGGC--AGGGTATAAATTTAGCTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AA-ATAC-------CCT-TTC-GCCATAA-TTTATTT-GCC-----AA-ATA-TGCA-----------------ATA-T--CAGT--ATT-GCAAGGGAG------AT--GA------CACTT-----CCTTGTCCGCTAAA-AAT--A--TT----CTGATAAAATTAA--TA--G-CATA-CCTTTA-AGACAGTAAATC--GCCAAATT-TCAG-ACCCAC-GG------A--AAAAC--C--CCGC
gi|8                          :              caGG---TTATTTCT-----GCAGG--------TAAATTTGGCTT-AATATTT-TAGC-AGTT-TG-ATAG-------CTT-TCC-ACCAAGA-TTTCACTTGCC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGACT-T--CAGT--ATTCACAAGA-AG------AA--AA------CATTT-----CCTTGTCCGCC-AA-ATT-TA--TT--------------------A--G-CATACC-TTTG-AGCCAGCAAATC--ACCAAATT-TCAG-ACCCAT-GGGGGGAAA--AAAAA--C--CCACTaa
gi|13                         :            agcaGG---TTTTTTCT-----GCACG--GTG--ATAAACTTGGCTT-A---CTT-TAGT-GGTT-AG-ATAC-------C----------AAAA-TTTCACTTTCC-----AA-ATA-CGCA------C-CCAGTTGCGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGAGAA------AT--AA------TACTT-----CCTTGTCCt
gi|17                         :      ccgtatagcgGG---TTTTTTCT-----GCACG--GTG--ATAAACTTGGCTTAC---TTTGTGGC---TT-AG-ATA------------------CAAAA-TTTCACTT-CC-----AA-ATA-CGCA------C-CCAGTTGCGATTGT--CAG---ATTTGCAAG-GAA------AT--AA------TACTT-----CCTTGTCCtagtgggcaaattgtcaaatttcagactcaccggggaaaaaaaaccacggccagatgtcagta
gi|22                         :       cgtatagcgGG---TTTTTTTCC----GCAGG--GTG--ATAAATATGTCTT-A---TGT-TAGC-GGTG-TG-ATAC-------CTT-TCC-GCCAAAA-TTCCGCTCGCC-----AA-ATA-TGCA------T-TCAGTAGCGATT-T--CAGtagtgggcaattgtcaaatttcaggactcaccggcggaaaaaaaaaccacaccatgca
gi|23                         :        tataacagGG---TTCTTTTTTACCCGCGGG--ATG--ATGAATCTGGCTT-A---TTT-TAAC-GTTT-CGAATAC-------TTTGTCG-AC----A-TTTTTTTCAATCACCAAA-ATATTGCA------C-
gi|3                          :           tatagcg---TTTTTTTC-----GTGGG--GTG--ATAAATTTAGCTT-A---ATT-AAGT-GGTT-AC-ATAC--------TT-TCC-ACTAAAAATTTCCCTCACA-----AAGATA-TGAA------C-CAA-TTGCGATT-TTTCAGT--GTTTGCAAGAGAG------GT--GA------TACTT-----CCTTGTCTGCCAAATTTT-TATTTT----CTCCTAAAATTATACTA--G--ACC-T-TTTG-AG-CAGCAAATC--ACC--ATT-TCAGAACCCAG-GG------A--AAAA---C--CCACTt
gi|20                         :        atagcaattt---TTTTTTCC-----GCGGT--GTG--ATAAATTTAACTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AT-ATTCA------TTT-TCC-GCCAAAA--------------------ATA-TGCA------T-TCAATTGCGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGAGGG------AT--AAAACTAGTACTT-----CCTTATCCGCCAA
gi|24                         :        tatagcgggc---TTTTTTTC-----GCGGG--GTG--ATAAATTTGGTTT-A---TTT-TAGC-GGTC-GG-ATAC-------CTT-TCT-GCCAAAA-TTTCACTTGCC-----GA-ATA-TGCA------
gi|11                         :             gtatagcgggtttTTT-----TTGGG---TG--ATAAATTTAGCTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AG-ATAC-------CTT-TCT-GCCAAAA-TTTCATTTGCC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGAGAG------AT--CA------CACTT-----CTTTGTCCACCAAA-ATT-CA--TT----TCGTTGAAATTAT--TA--GCAAAC-C-TTTG-AGCAAG-GAATC--ACCAAATT-TGAG-ACCCGC-Gt
gi|12                         :                                         tTG--ATAAATTTAGCTT-G---TTT-TAAT-ATTT-AG-ATAC-------CTC-TCT-GCCAACA-TTTCACTCACC-----AA-AT-----------------TTTGCAGCT-T--CAGT--ATTTGCTAGAGAG------AT--A--------ACTTAATGACTTTGTCCACTACA-ATT-TA--TTCCGGCCGTTACAATTGT--TACCG-TATA-C-CTTAGAGCCGGAATATC--ACCTAATT-TCAG-ACCAGT-GA------G--AAAAgggaaa
gi|16                         :                                          caaagTAAGTTTGGCTT-A---TTT-TAGC-GGTT-AG-GTTC-------CTT-TCC-ACCAAAA-TATCAAACGCC-----AA-ATA-TGCA------C-CAACTTGTGATT-T--CCGT--ATTTGCAAGAGAC------G----A------TACTT------------------A-ATT-TA--AC----CCGGCACATGTAT---------AT--C-TTTG-AGACAGCTAACC--AACAAATG-TCAT-ACCCGC-GG------A--AAAAGATCCACCGCTATa
gi|1                          :                                        tttgtttTAAATTTA-----C---TTT-TAATAGGTTCAG-ATACATGTTACCTT-TCCCACCAAAA-TTTCACTTGCC-----AA-AT--TGCA------CTCCAATTGCGCT------AGT--A-TTGCAAGCGAG------AG--AA------GGCTT-----C--TGTCGGCAAAA-ATTGTA--TT----CGGCT-AAATTA----A--G-CATA-C-CTTC-AGCCAGCAAAT---GGTAAATT-TCAG-ACgtggt
gi|18                         :              tttttttctgaggggtctaaattggcttagaagtAAATTTAGCTT-A---TTT-TAGC-GGTA-AA-ATAC-------CTT-TTC-GCCAAAA-ATTCACTCGTC-----AA-ATA-TGCAAAGAATT-GCAATTGCGATT-T--CAGT--ATTTGCAAGGAAG------AT--AC------CACTT-----CTTTGTCCGCTAAT-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--G-CATA-CTTTTA-TGCTAGCACTTT--GCCAAATT-TCAG-ACCtcgcaggggagaaaaaaactact
gi|15                         :                                                         TT-G---TTT-TTGT-GGTT-AG-ATAC-------ATT-TAC-GCCAAAA-TTTCACTCACC-----AG-ATA-TGCA------C-CCAATTACAACT-T--CAGC--ATTTGCAAGTGAGGTACTAGT--AA------CACTT-----ACCTATCCGCTAAA-ATT-TA--TT----CCGTTAAAATTCT--TA--G-CGTACC-TTTG-AGCCAGCGAATC--GCCATATT-TCAG-ACCCGTGGT------A--AAAAA--G--CCGCTc
gi|19                         :                                                         TT-A---TTT-TGGT-GTTT-AA-ATAC-------CTT-TCC-GTCAAAT-TCTCACTGGCC-----AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGATA-T--CAGTAGATATGCAAGAGAGAAAA--GT--TA-------ACTT-----CCTTGTTTGCAAAA-A------------------AAAACTAT--TA--G-CATACC-TTTG-AGCCTGCAGATC--ACCGAATtta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                       TT-----CTTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CCACTAAAATTAT--TA--A-AATACC-TTTA-AACCAGCAAATT--GCTAAATT-TTAG-TTCTGC-AG------A--TAAAG--C--CTGCTA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                               tttgtaatgaaAA-ATA-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TT--G---TA-T-T-----------AAATC--GCCAAATTGTAT--ATCCAC-GG------A--AAAAC--C--CCGCTcatgg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                             GCTAAAATTAT--TT--G-CACATC-TTTG-AGCCAACAAGTT--GCCAAATT-TTAG-A---GA-G-------A--AAAAA--CA-CCGCTATg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    -C-TTTT-AGCCAGCAAATT--GCCAAATT-TCAG-ACCCGatgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   acc-TCTA-AGCCA-CAAAGTAAGCCAAGTT-TATC-ACC-GT-GC------AGAAAAAA--C--CCGCTATcagaataaatcacaataca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgt--GCCAAGTT-TATC-ACC-GT-GC------AGAAAAAA--C--CCGCTATtacaaaatttcacttccaaatacgcacccagttgcgattgtcagatttgcaaggaaataatacttccttgtcctagtgggcaattgtcaaatttcaggactcaccggcggaaaaaaaaaccacaccatgca
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): CGTATAGCGGTTTTTATCCACAGGGTAATGACTTTTAGCTTATTTTAGCTGTTAGATAC
Unaligned ( gi|30 ): GAGCGGATTTTTTTCCCGCGAGGTGATCAATTTGGTTTAATTTAGCGGCGG






Alignments
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lowQualScore                  :                                                                                                                                                  9  99999999   8   55          7      77777777777777       5  5  6  6    8888888      7   7    5555           7  7   7    77777777          66  9     88         55 0 888888   0000000000000    88888              1   1  99  5555 3           88  88     0 9   9  9                       55555  333    555  888888      99 88       
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Reference ( family-8170 )     :                                                                                                                                     NNAGGTGGTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTTCACTCGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-G------ATA-----A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAA-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATA-C-TTT-GA-GCCAGCAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---GG------AAAAAA--C--CCGCTAT
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtataGCTAAAATTAT--TT--GCACATC-TTT-GA-GCCAACAAGTTGCCAAATTTTAG-----A------G----AG------AAAAAA--CA-CCGCTATa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-ATA-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TT--GTAT----------------TAAATCGCCAAATTGTAT-----AT---CCAC---GG------AAAAAC--C--CCGCTatgt
gi|28                         :                                                                                                                                         GCGGTTTTTATC-----C--ACA-GGG--TAATGACTTTTAGCTTA--------------TTTTAGC-TG-TT-AG-ATAC-------g
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgtata-C-TTT-TA-GCCAGCAAATTGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---AG------AATAAA--T--
gi|3                          :                                                                                                                                          accTTTTT-TT-----C--GTG-GGG--TGATAAATTT-AGCTTA--------------ATTAAGT-GG-TT-AC-ATA--------CTTTCC-ACTAAAAA----TTTCCCTCACA-AAGATA-TG-A------A-CCAATTGCGATTTT-TCAGT--GTTTGCAAGAGA-G------GTG-----A------TACTT-----CCTTGTCTGCCAAATTTT-TATTTT----CTCCTAAAATTATACTA--G-ACC-T-TTT-GA-G-CAGCAAATCACC--ATTTCAG-----AA---CCCA---GG------GAAAAA--C--CCACTacaataca
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gi|4                          :                                                                                                                                  gagcgAGGTGGTTTTC-TT-----T--GTG-GGA--TGATAAATTT-GGCTTC--------------TTTTGGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCCCTCGCT-AA-ATA-TGCA------C-CCACTTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-G------GTA-----A------CACTT-----CCTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--CA--GAATA-C-TTT-AA-GCCAGCAAATCGCCAAATTTCTG-----AC---CTGT---GT------AAAAAG--C--CCGCTATcgg
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Reference ( family-8170 )     :                                                                                                                                     NNAGGTGGTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTTCACTCGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GATA------A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAA-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCAGCAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---GG------AAAAAA--C--CCGCTAT
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gi|11                         :                                                                                                                                        tttattTTTT-TT------------GGG--TGATAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCT-GCC-AAAA----TTTCATTTGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GATC------A------CACTT-----CTTTGTCCACCAAA-ATT-CA--TT----TCGTTGAAATTAT--TA--GCAAACC-TTTGAGCAAG-GAATCACCAAATTTGAG-----AC---CCGC---GG------GGAAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                   G--TGATAAATTT-AGCTTG--------------TTTTAAT-AT-TT-AG-ATAC-------CTCTCT-GCC-AACA----TTTCACTCACC-AA-AT--T---------------TTGCAG--CT-TCAGT--ATTTGCTAGAGA-GATA--------------ACTTAATGACTTTGTCCACTACA-ATT-TA--TTCCGGCCGTTACAATTGT--TACCGTATACC-TTAGAGCCGGAATATCACCTAATTTCAG-----AC---CAGT---GA------GAAAAA--
gi|13                         :                                                                                                                                       caaaGGTTTTT-TC-----T--GCA-CGG--TGATAAACTT-GGCTTA--------------CTTTAGT-GG-TT-AG-ATAC-------C----------AAAA----TTTCACTTTCC-AA-ATA-CGCA------C-CCAGTTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-AATA------A------TACTT-----CCTTGTCC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccgtatagcgGCAAATTGTCAAATTTCAG-----ACTCACCGG---GG------AAAAAA--tagtgggcaaattgtcaaatttcagactcaccggggaaaaaaaaccacggccagatgtcagta
gi|14                         : ccgtatagcgggttttttctgcacggtgataaacttggcttactttagtggttagataccaaaatttcactttccaaatacgcacccagttgcgatttcagtatttgcaagagaaataatacttccttgtcctagtggGGGTTTT-TC-----C--GTG-GGG--TGATAAATTT-GGTGCA--------------TTTTAGC----------------------TCTCT-GTC-AAAA----TTTCCCTCGCC-AG-ATA-TGCA------A-TGAATTGCGA--CT-TCAGT--AATCACAAGA-A-GAAA------A------CACTT-----CCTTGTCCCCCAGA-ATT-TA--TT----CCGCCAAAATTAT--TA--GCAAACC-------------AATCACCAAATTTCAG-----AC---CCTC---GG------AAAAAA--aaccacggccagatgtcagta
gi|15                         :                                                                                                                                                                           gtatagcagTTG--------------TTTTTGT-GG-TT-AG-ATAC-------ATTTAC-GCC-AAAA----TTTCACTCACC-AG-ATA-TGCA------C-CCAATTACAA--CT-TCAGC--ATTTGCAAGTGA-GGTACTAGTAA------CACTT-----ACCTATCCGCTAAA-ATT-TA--TT----CCGTTAAAATTCT--TA--GCGTACC-TTTGAGCCAGCGAATCGCCATATTTCAG-----AC---CCGT---GGT-----AAAAAA--G--CCGCTact
gi|16                         :                                                                                                                                                                         TAAGTTT-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-GTTC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TATCAAACGCC-AA-ATA-TGCA------C-CAACTTGTGA--TT-TCCGT--ATTTGCAAGAGACGAT---------------ACTT------------------A-ATT-TA--AC----CCGGCA----CAT------GTATATC-TTTGAGACAGCTAACCAACAAATGTCAT-----AC---CCGC---GG------AAAAAGATCCACCGCTATtta
gi|17                         :                                                                                                                                    tttgtttGGTTTTT-TC-----T--GCA-CGG--TGATAAACTT-GGCTTA--------------CTTT-GT-GGCTT-AG-ATA-----------------C-AAAA----TTTCACTT-CC-AA-ATA-CGCA------C-CCAGTTGCGA--TTGTCAG---ATTTGCAAG-GA-AATA------A------TACTT-----CCTTGTCCgtggt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgtatagcgAATTGTCAAATTTCAGGACTCAC---CGGC---GG------AAAAAA--tagtgggcaattgtcaaatttcaggactcaccggcggaaaaaaaaaccacaccatgca
gi|18                         :                                  cgtatagcgggttttttctgcacggtgataaacttggcttactttgtggcttagatacaaaatttcacttccaaatacgcacccagttgcgattgtcagatttgcaaggaaataatacttccttgtcctagtgggcAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TA-AA-ATAC-------CTTTTC-GCC-AAAA----ATTCACTCGTC-AA-ATA-TGCAAAGAATT-GCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGGAA-GATA------C------CACTT-----CTTTGTCCGCTAAT-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATACT-TTTATGCTAGCACTTTGCCAAATTTCAG-----AC---CCaaaccacaccatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                    TTA--------------TTTTGGT-GT-TT-AA-ATAC-------CTTTCC-GTC-AAAT----TCTCACTGGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TA-TCAGTAGATATGCAAGAGA-GAAA------AGTT---AACTT-----CCTTGTTTGCAAAA-A------------------AAAACTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCTGCAGATCACCGAAT
gi|2                          :                                                                                                                                           GGTTTTT-TTTC---C--ACA-GGG--TGATAAATTC-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCAGTCCCC-AA-ATA-TGCA------T-CCAGTTGCGA--GT-TCAGT--ATTTGCA------TATATTTTC-A------AACTT-----TGTTGTCCCCTAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--TA--GTATAC--TTTGAGCCAGCATATCACCAAATTTCAG-----AC---CCAA---AG------AAAAAA--C--CCACT
gi|20                         :                                                                                                                                  cgtatagtgGGCTTTT-TTC----C--GCG-GTG--TGATAAATTT-AACTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AT-ATTCA------TTTTCC-GCC-AA------------------AA-ATA-TGCA------T-TCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGG-GATA------AAACTAGTACTT-----CCTTATCCGCCAAtta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatagcgTT-----CTTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CCACTAAAATTAT--TA--AAATACC-TTTAAACCAGCAAATTGCTAAATTTTAG-----TT---CTGC---AG------ATAAAG--C--CTGCTA
gi|22                         :                                                                                                                                tttgtaatgaaGGTTTTT-TT-----CC-GCA-GGG--TGATAAATAT-GTCTTA--------------TGTTAGC-GG-TG-TG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTCCGCTCGCC-AA-ATA-TGCA------T-TCAGTAGCGA--TT-TCAGcatgg
gi|23                         :                                                                                                                                   tataacagGGTTCTT-TTTTACCC--GCG-GGA--TGATGAATCT-GGCTTA--------------TTTTAAC-GT-TT-CGAATAC-------TTT----GTC-GACATTTTTTTCAATCACCAAA-ATATTGCA------C-
gi|24                         :                                                                                                                                      tatagcgTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGTTTA--------------TTTTAGC-GG-TC-GG-ATAC-------CTTTCT-GCC-AAAA----TTTCACTTGCC-GA-ATA-TGCA------t
gi|25                         :                                                                                                                            gtatagcgggtttGTGGGGTTT-TT-----C--CCTTGGG--TGATAAATTT-AGCTAA--------------ATTTATC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTTC-GCC-AAAG----TTt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtataGCTAAAATTAT--TT--GCACATC-TTTGAGCCAACAAGTTGCCAAATTTTAG-----A------G----AG------AAAAAA--CA-CCGCTATa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA-ATA-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TT--GTAT--------------TAAATCGCCAAATTGTAT-----AT---CCAC---GG------AAAAAC--C--CCGCTatgt
gi|28                         :                                                                                                                                         GCGGTTTTTATC-----C--ACA-GGG--TAATGACTTTTAGCTTA--------------TTTTAGC-TG-TT-AG-ATAC-------g
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgtataCC-TTTTAGCCAGCAAATTGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---AG------AATAAA--T--
gi|3                          :                                                                                                                                           acTTTTT-TT-----C--GTG-GGG--TGATAAATTT-AGCTTA--------------ATTAAGT-GG-TT-AC-ATA--------CTTTCC-ACTAAAAA----TTTCCCTCACA-AAGATA-TG-A------A-CCAATTGCGATTTT-TCAGT--GTTTGCAAGAGA-GGTG------A------TACTT-----CCTTGTCTGCCAAATTTT-TATTTT----CTCCTAAAATTATACTA--G---ACCTTTTGAG-CAGCAAATCACC--ATTTCAG-----AA---CCCA---GG------GAAAAA--C--CCACTacaataca
gi|30                         :                                                                                                                                 atagcaatttGATTTTT-TT-----CCCGCG-AGG--TGATCAATTT-GGTTTA--------------ATTTAGC-GG-
gi|4                          :                                                                                                                                  gagcgAGGTGGTTTTC-TT-----T--GTG-GGA--TGATAAATTT-GGCTTC--------------TTTTGGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCCCTCGCT-AA-ATA-TGCA------C-CCACTTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GGTA------A------CACTT-----CCTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--CA--GAATA-C-TTTAAGCCAGCAAATCGCCAAATTTCTG-----AC---CTGT---GT------AAAAAG--C--CCGCTATcgg
gi|5                          :                                                                                                                                           agTTTTT-TT-----G--GCA-GGG--TTATAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CCTTTC-GCC-ATAA----TTTCATTTGCC-AA-ATA-TGCA-----------------A--TA-TCAGT--ATTTGCAAGGGA-GATG------A------CACTT-----CCTTGTCCGCAAAA-A-A-TA--TT----CTGATAAAATTAA--TA--GCATACC-TTTAAGACAGTAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCAC---GG------AAAAAA--C--CC
gi|6                          :                                                                                                                        taacgggtagcaggtttttGGTTTTT-AT-----CCCGCG-GGA--TGATAAATTT-AGCTTA--------------CTTTAGC-GG-TG-AG-ATAC-------CTTTAC-GCC-AAAA----TTGCACTCGTC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TT-TCAGT--ATTTGTAGTGGA-GATA------A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAT-ATT-TA--TT----TCGCCAAATTTAA--TA--GCATATT-TTTAAGCCAACAATTCGCCAAAATTCAG-----AC---CCGC---AG------ACAAAA--C--CCcc
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Reference ( family-8170 )     :                                                                                                                                     NNAGGTGGTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTTCACTCGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GATA------A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAA-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCAGCAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---GG------AAAAAA--C--CCGCTAT
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gi|18                         :                                  cgtatagcgggttttttctgcacggtgataaacttggcttactttgtggcttagatacaaaatttcacttccaaatacgcacccagttgcgattgtcagatttgcaaggaaataatacttccttgtcctagtgggcAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TA-AA-ATAC-------CTTTTC-GCC-AAAA----ATTCACTCGTC-AA-ATA-TGCAAAGAATT-GCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGGAA-GATA------C------CACTT-----CTTTGTCCGCTAAT-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATACT-TTTATGCTAGCACTTTGCCAAATTTCAG-----AC---CCaaaccacaccatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                    TTA--------------TTTTGGT-GT-TT-AA-ATAC-------CTTTCC-GTC-AAAT----TCTCACTGGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TA-TCAGTAGATATGCAAGAGA-GAAA------AGTT---AACTT-----CCTTGTTTGCAAAA-A------------------AAAACTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCTGCAGATCACCGAAT
gi|2                          :                                                                                                                                           GGTTTTT-TTTC---C--ACA-GGG--TGATAAATTC-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCAGTCCCC-AA-ATA-TGCA------T-CCAGTTGCGA--GT-TCAGT--ATTTGCA------TATATTTTC-A------AACTT-----TGTTGTCCCCTAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--TA--GTATAC--TTTGAGCCAGCATATCACCAAATTTCAG-----AC---CCAA---AG------AAAAAA--C--CCACT
gi|20                         :                                                                                                                                  cgtatagtgGGCTTTT-TTC----C--GCG-GTG--TGATAAATTT-AACTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AT-ATTCA------TTTTCC-GCC-AA------------------AA-ATA-TGCA------T-TCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGG-GATA------AAACTAGTACTT-----CCTTATCCGCCAAtta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatagcgTT-----CTTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CCACTAAAATTAT--TA--AAATACC-TTTAAACCAGCAAATTGCTAAATTTTAG-----TT---CTGC---AG------ATAAAG--C--CTGCTA
gi|22                         :                                                                                                                                tttgtaatgaaGGTTTTT-TT-----CC-GCA-GGG--TGATAAATAT-GTCTTA--------------TGTTAGC-GG-TG-TG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTCCGCTCGCC-AA-ATA-TGCA------T-TCAGTAGCGA--TT-TCAGcatgg
gi|23                         :                                                                                                                                   tataacagGGTTCTT-TTTTACCC--GCG-GGA--TGATGAATCT-GGCTTA--------------TTTTAAC-GT-TT-CGAATAC-------TTT----GTC-GACATTTTTTTCAATCACCAAA-ATATTGCA------C-
gi|24                         :                                                                                                                                      tatagcgTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGTTTA--------------TTTTAGC-GG-TC-GG-ATAC-------CTTTCT-GCC-AAAA----TTTCACTTGCC-GA-ATA-TGCA------t
gi|25                         :                                                                                                                            gtatagcgggtttGTGGGGTTT-TT-----C--CCTTGGG--TGATAAATTT-AGCTAA--------------ATTTATC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTTC-GCC-AAAG----TTt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtataGCTAAAATTAT--TT--GCACATC-TTTGAGCCAACAAGTTGCCAAATTTTAG-----A------G----AG------AAAAAA--CA-CCGCTATa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA-ATA-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TT--GTAT--------------TAAATCGCCAAATTGTAT-----AT---CCAC---GG------AAAAAC--C--CCGCTatgt
gi|28                         :                                                                                                                                         GCGGTTTTTATC-----C--ACA-GGG--TAATGACTTTTAGCTTA--------------TTTTAGC-TG-TT-AG-ATAC-------g
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgtataCC-TTTTAGCCAGCAAATTGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---AG------AATAAA--T--
gi|3                          :                                                                                                                                           acTTTTT-TT-----C--GTG-GGG--TGATAAATTT-AGCTTA--------------ATTAAGT-GG-TT-AC-ATA--------CTTTCC-ACTAAAAA----TTTCCCTCACA-AAGATA-TG-A------A-CCAATTGCGATTTT-TCAGT--GTTTGCAAGAGA-GGTG------A------TACTT-----CCTTGTCTGCCAAATTTT-TATTTT----CTCCTAAAATTATACTA--G---ACCTTTTGAG-CAGCAAATCACC--ATTTCAG-----AA---CCCA---GG------GAAAAA--C--CCACTacaataca
gi|30                         :                                                                                                                                 atagcaatttGATTTTT-TT-----CCCGCG-AGG--TGATCAATTT-GGTTTA--------------ATTTAGC-GG-
gi|4                          :                                                                                                                                  gagcgAGGTGGTTTTC-TT-----T--GTG-GGA--TGATAAATTT-GGCTTC--------------TTTTGGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCCCTCGCT-AA-ATA-TGCA------C-CCACTTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GGTA------A------CACTT-----CCTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--CA--GAATA-C-TTTAAGCCAGCAAATCGCCAAATTTCTG-----AC---CTGT---GT------AAAAAG--C--CCGCTATcgg
gi|5                          :                                                                                                                                           agTTTTT-TT-----G--GCA-GGG--TTATAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CCTTTC-GCC-ATAA----TTTCATTTGCC-AA-ATA-TGCA-----------------A--TA-TCAGT--ATTTGCAAGGGA-GATG------A------CACTT-----CCTTGTCCGCAAAA-A-A-TA--TT----CTGATAAAATTAA--TA--GCATACC-TTTAAGACAGTAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCAC---GG------AAAAAA--C--CC
gi|6                          :                                                                                                                        taacgggtagcaggtttttGGTTTTT-AT-----CCCGCG-GGA--TGATAAATTT-AGCTTA--------------CTTTAGC-GG-TG-AG-ATAC-------CTTTAC-GCC-AAAA----TTGCACTCGTC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TT-TCAGT--ATTTGTAGTGGA-GATA------A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAT-ATT-TA--TT----TCGCCAAATTTAA--TA--GCATATT-TTTAAGCCAACAATTCGCCAAAATTCAG-----AC---CCGC---AG------ACAAAA--C--CCcc
gi|7                          :                                                                                                                                         cgGGTTTTT-TT-----C--CCGCAGG--TGATAAATTT-AGGTTA--------------TTTTAGC-AG-TT-AG-ACAC-------CTTTTC-GCC-AAAA----TTTTAGCCGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAAA-GATA------A------CACTT-----CCTGGTCCGACAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATCAT--TA--GCATACT-TTTGAGCCAGCAAATCGTCAAATTTCAG-----Acgc
gi|8                          :                                                                                                                                  cgtacagcaGGTTATT-TC-----T--GCA-GG------TAAATTT-GGCTTAATA-----------TTTTAGC-AG-TT-TG-ATAG-------CTTTCC-ACC-AAGA----TTTCACTTGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGA--CT-TCAGT--ATTCACAAGA-A-GAAA------A------CATTT-----CCTTGTCCGCC-AA-AT---------------------TTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCAGCAAATCACCAAATTTCAG-----AC---CCAT---GGGGGGAAAAAAAA--C--CCACTtttga
gi|9                          :                                                                                                                                   agcaAGGTTTTTTTT-TT-----G--GCA-GGG--T-ATAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CCTTTC-GCC-ATAA----TTT-ATTTGCC-AA-ATA-TGCA-----------------A--TA-TCAGT--A-TTGCAAGGGA-GATG------A------CACTT-----CCTTGTCCGCTAAA-A-A-TA--TT----CTGATAAAATTAA--TA--GCATACC-TTTAAGACAGTAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCAC---GG------AAAAAC--C--CCGCt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                  A  TTACCC     T   AA          T      ATA                  .  C  .  A    A            .   A    TTTT           A  G   T    AAGAATT           TT  G     AG            C    CTAGTAAC          AATGA              T   .  TT  CCGG             AC  CC       T                            GACTC  TCA    .    GGGGAA      AT CA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  TCC        C   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AAACTAGT          .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    T           .  A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  CCC        .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    TTTTCAA           .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  CCC        .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AGTTA             .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  CC         .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    A                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  CC         .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AT                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  T          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  T          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AT                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  C          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    CC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  T          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    T                 .   .     .             .    AT                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  C          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    T                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  C          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    T                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  C          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  C          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    A                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  T          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  G          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    AC                .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  C          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    .                 .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  .  T          .   .           .      .                    .  .  .  .    .            .   .    .              .  .   .    C                 .   .     .             .    .                 .                  .   .  .   .                .   .        .                            .      .      .    .           .    
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Reference ( family-8170 )     :                                                                                                                                     NNAGGTGGTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTTCACTCGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GATA------A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAA-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCAGCAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---GG------AAAAAA--C--CCGCTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                   G--TGATAAATTT-AGCTTG--------------TTTTAAT-AT-TT-AG-ATAC-------CTCTCT-GCC-AACA----TTTCACTCACC-AA-AT--T---------------TTGCAG--CT-TCAGT--ATTTGCTAGAGA-GATA--------------ACTTAATGACTTTGTCCACTACA-ATT-TA--TTCCGGCCGTTACAATTGT--TACCGTATACC-TTAGAGCCGGAATATCACCTAATTTCAG-----AC---CAGT---GA------GAAAAA--
gi|13                         :                                                                                                                                       caaaGGTTTTT-TC-----T--GCA-CGG--TGATAAACTT-GGCTTA--------------CTTTAGT-GG-TT-AG-ATAC-------C----------AAAA----TTTCACTTTCC-AA-ATA-CGCA------C-CCAGTTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-AATA------A------TACTT-----CCTTGTCC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ccgtatagcgGCAAATTGTCAAATTTCAG-----ACTCACCGG---GG------AAAAAA--tagtgggcaaattgtcaaatttcagactcaccggggaaaaaaaaccacggccagatgtcagta
gi|14                         : ccgtatagcgggttttttctgcacggtgataaacttggcttactttagtggttagataccaaaatttcactttccaaatacgcacccagttgcgatttcagtatttgcaagagaaataatacttccttgtcctagtggGGGTTTT-TC-----C--GTG-GGG--TGATAAATTT-GGTGCA--------------TTTTAGC----------------------TCTCT-GTC-AAAA----TTTCCCTCGCC-AG-ATA-TGCA------A-TGAATTGCGA--CT-TCAGT--AATCACAAGA-A-GAAA------A------CACTT-----CCTTGTCCCCCAGA-ATT-TA--TT----CCGCCAAAATTAT--TA--GCAAACC-------------AATCACCAAATTTCAG-----AC---CCTC---GG------AAAAAA--aaccacggccagatgtcagta
gi|15                         :                                                                                                                                                                           gtatagcagTTG--------------TTTTTGT-GG-TT-AG-ATAC-------ATTTAC-GCC-AAAA----TTTCACTCACC-AG-ATA-TGCA------C-CCAATTACAA--CT-TCAGC--ATTTGCAAGTGA-GGTACTAGTAA------CACTT-----ACCTATCCGCTAAA-ATT-TA--TT----CCGTTAAAATTCT--TA--GCGTACC-TTTGAGCCAGCGAATCGCCATATTTCAG-----AC---CCGT---GGT-----AAAAAA--G--CCGCTact
gi|16                         :                                                                                                                                                                         TAAGTTT-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AG-GTTC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TATCAAACGCC-AA-ATA-TGCA------C-CAACTTGTGA--TT-TCCGT--ATTTGCAAGAGACGAT---------------ACTT------------------A-ATT-TA--AC----CCGGCA----CAT------GTATATC-TTTGAGACAGCTAACCAACAAATGTCAT-----AC---CCGC---GG------AAAAAGATCCACCGCTATtta
gi|17                         :                                                                                                                                    tttgtttGGTTTTT-TC-----T--GCA-CGG--TGATAAACTT-GGCTTA--------------CTTT-GT-GGCTT-AG-ATA-----------------C-AAAA----TTTCACTT-CC-AA-ATA-CGCA------C-CCAGTTGCGA--TTGTCAG---ATTTGCAAG-GA-AATA------A------TACTT-----CCTTGTCCgtggt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgtatagcgAATTGTCAAATTTCAGGACTCAC---CGGC---GG------AAAAAA--tagtgggcaattgtcaaatttcaggactcaccggcggaaaaaaaaaccacaccatgca
gi|18                         :                                  cgtatagcgggttttttctgcacggtgataaacttggcttactttgtggcttagatacaaaatttcacttccaaatacgcacccagttgcgattgtcagatttgcaaggaaataatacttccttgtcctagtgggcAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TA-AA-ATAC-------CTTTTC-GCC-AAAA----ATTCACTCGTC-AA-ATA-TGCAAAGAATT-GCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGGAA-GATA------C------CACTT-----CTTTGTCCGCTAAT-ATT-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TA--GCATACT-TTTATGCTAGCACTTTGCCAAATTTCAG-----AC---CCaaaccacaccatgca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                    TTA--------------TTTTGGT-GT-TT-AA-ATAC-------CTTTCC-GTC-AAAT----TCTCACTGGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TA-TCAGTAGATATGCAAGAGA-GAAA------AGTT---AACTT-----CCTTGTTTGCAAAA-A------------------AAAACTAT--TA--GCATACC-TTTGAGCCTGCAGATCACCGAAT
gi|2                          :                                                                                                                                           GGTTTTT-TTTC---C--ACA-GGG--TGATAAATTC-GGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCAGTCCCC-AA-ATA-TGCA------T-CCAGTTGCGA--GT-TCAGT--ATTTGCA------TATATTTTC-A------AACTT-----TGTTGTCCCCTAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--TA--GTATAC--TTTGAGCCAGCATATCACCAAATTTCAG-----AC---CCAA---AG------AAAAAA--C--CCACT
gi|20                         :                                                                                                                                  cgtatagtgGGCTTTT-TTC----C--GCG-GTG--TGATAAATTT-AACTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AT-ATTCA------TTTTCC-GCC-AA------------------AA-ATA-TGCA------T-TCAATTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGG-GATA------AAACTAGTACTT-----CCTTATCCGCCAAtta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatagcgTT-----CTTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CCACTAAAATTAT--TA--AAATACC-TTTAAACCAGCAAATTGCTAAATTTTAG-----TT---CTGC---AG------ATAAAG--C--CTGCTA
gi|22                         :                                                                                                                                tttgtaatgaaGGTTTTT-TT-----CC-GCA-GGG--TGATAAATAT-GTCTTA--------------TGTTAGC-GG-TG-TG-ATAC-------CTTTCC-GCC-AAAA----TTCCGCTCGCC-AA-ATA-TGCA------T-TCAGTAGCGA--TT-TCAGcatgg
gi|23                         :                                                                                                                                   tataacagGGTTCTT-TTTTACCC--GCG-GGA--TGATGAATCT-GGCTTA--------------TTTTAAC-GT-TT-CGAATAC-------TTT----GTC-GACATTTTTTTCAATCACCAAA-ATATTGCA------C-
gi|24                         :                                                                                                                                      tatagcgTTTTT-TT-----C--GCG-GGG--TGATAAATTT-GGTTTA--------------TTTTAGC-GG-TC-GG-ATAC-------CTTTCT-GCC-AAAA----TTTCACTTGCC-GA-ATA-TGCA------t
gi|25                         :                                                                                                                            gtatagcgggtttGTGGGGTTT-TT-----C--CCTTGGG--TGATAAATTT-AGCTAA--------------ATTTATC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTTC-GCC-AAAG----TTt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtataGCTAAAATTAT--TT--GCACATC-TTTGAGCCAACAAGTTGCCAAATTTTAG-----A------G----AG------AAAAAA--CA-CCGCTATa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA-ATA-TA--TT----CCGCTAAAATTAT--TT--GTAT--------------TAAATCGCCAAATTGTAT-----AT---CCAC---GG------AAAAAC--C--CCGCTatgt
gi|28                         :                                                                                                                                         GCGGTTTTTATC-----C--ACA-GGG--TAATGACTTTTAGCTTA--------------TTTTAGC-TG-TT-AG-ATAC-------g
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgtataCC-TTTTAGCCAGCAAATTGCCAAATTTCAG-----AC---CCGC---AG------AATAAA--T--
gi|3                          :                                                                                                                                           acTTTTT-TT-----C--GTG-GGG--TGATAAATTT-AGCTTA--------------ATTAAGT-GG-TT-AC-ATA--------CTTTCC-ACTAAAAA----TTTCCCTCACA-AAGATA-TG-A------A-CCAATTGCGATTTT-TCAGT--GTTTGCAAGAGA-GGTG------A------TACTT-----CCTTGTCTGCCAAATTTT-TATTTT----CTCCTAAAATTATACTA--G---ACCTTTTGAG-CAGCAAATCACC--ATTTCAG-----AA---CCCA---GG------GAAAAA--C--CCACTacaataca
gi|30                         :                                                                                                                                 atagcaatttGATTTTT-TT-----CCCGCG-AGG--TGATCAATTT-GGTTTA--------------ATTTAGC-GG-
gi|4                          :                                                                                                                                  gagcgAGGTGGTTTTC-TT-----T--GTG-GGA--TGATAAATTT-GGCTTC--------------TTTTGGC-GG-TT-AG-ATAC-------CTTTCC-ACC-AAAA----TTTCCCTCGCT-AA-ATA-TGCA------C-CCACTTGCGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAGA-GGTA------A------CACTT-----CCTTGTCCACCAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATTAT--CA--GAATA-C-TTTAAGCCAGCAAATCGCCAAATTTCTG-----AC---CTGT---GT------AAAAAG--C--CCGCTATcgg
gi|5                          :                                                                                                                                           agTTTTT-TT-----G--GCA-GGG--TTATAAATTT-AGCTTA--------------TTTTAGC-GG-TT-AA-ATAC-------CCTTTC-GCC-ATAA----TTTCATTTGCC-AA-ATA-TGCA-----------------A--TA-TCAGT--ATTTGCAAGGGA-GATG------A------CACTT-----CCTTGTCCGCAAAA-A-A-TA--TT----CTGATAAAATTAA--TA--GCATACC-TTTAAGACAGTAAATCGCCAAATTTCAG-----AC---CCAC---GG------AAAAAA--C--CC
gi|6                          :                                                                                                                        taacgggtagcaggtttttGGTTTTT-AT-----CCCGCG-GGA--TGATAAATTT-AGCTTA--------------CTTTAGC-GG-TG-AG-ATAC-------CTTTAC-GCC-AAAA----TTGCACTCGTC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TT-TCAGT--ATTTGTAGTGGA-GATA------A------CACTT-----CCTTGTCCGCCAAT-ATT-TA--TT----TCGCCAAATTTAA--TA--GCATATT-TTTAAGCCAACAATTCGCCAAAATTCAG-----AC---CCGC---AG------ACAAAA--C--CCcc
gi|7                          :                                                                                                                                         cgGGTTTTT-TT-----C--CCGCAGG--TGATAAATTT-AGGTTA--------------TTTTAGC-AG-TT-AG-ACAC-------CTTTTC-GCC-AAAA----TTTTAGCCGCC-AA-ATA-TGCA------C-CCAATTGTGA--TT-TCAGT--ATTTGCAAGAAA-GATA------A------CACTT-----CCTGGTCCGACAAA-ATT-TA--TT----CTGCTAAAATCAT--TA--GCATACT-TTTGAGCCAGCAAATCGTCAAATTTCAG-----Acgc
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