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gi|5                          :                      atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgtaACTGTCTTCTA--AAAC--ACGTTAGAACTGAT-CACAC-TGA-TAA---CTT---TACTAATA-TT-AAC-A-GCGTC-AATC-CAA--ACATATTACC-G-TCCTCTTTTAC--A-AC---CA-G---A-G--T--A-G---TGA-TA-A--CTG-TT-ATA-AA--T----AA-A-TA-TTAACAGATGTCA-TAAT-AA--A------ACT-G--C--T--T-C----TACAC----A----G-----AGT---A--CTGA-T-A-AACTTT-----T------T-TA--T-AA-AT--A-T---AAC-A--A-T-CGTCG--A---T-C-AATACCG--T-G--C---T--CC-T-----A--C---A---CAG--A--GTT-A--CT-G-T-AA---CCTTTGT-----T----A-----T--------A--T-A----TACAA-T------G-----T--C----------AAT--CAT-A-------AC----T--G--T--C---T----C
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         C--TC-AACAGAG-TA---CTGA-CAA---ATCGT-TATAAATAATT-AACACTTGGTC-AAATGCAA--A-------CT-GCTT-TC-----CTAA-AC-A--A-CCAGA-G--C--A-C--TGGA-TATA--CTG-TT-ATA------------TA-TA-TTAAC-ACTG---GC--C-AA----------CT-G-TCC-T--C-C----TACAC----A----G-----AGT---A--CTGA-T-A-A--A-G-----TG-----T-TA--T-AA-ATC-A-T-TTAAC-A--C-T-GC--A--A---TGC-AA-AC----TCG--CCC-T--CC-T-----A--C---A---AAGA-G--C---A--CTGATT-CA---C---TGT-----T----A-----T-GA-----AT-T-A----T-----T------ctacaaaaccaactaaacagagtaaacctggtaagttatatat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                              tcctacaacaaagatactgataaatgttaaaatattaatattgtcaatccacctagtctC--TACAACAAAGATA---CTGA-TAAAT-GTTA-----AAATA-TT-AAT-ATTG-------T-CAATCC---AC--CTAG-TC-TCT----C--A-AC-A-GA-------G--T--A----CTGA-CA-AATC-G-TT-ATA-A-----------A-TAATTAAC--AC-TTGGT--C-AA--ATGCAA-ACT-GCTT--T--C-C----TAAAC----A----ACCAG-AGC---A-CTGGA-T-ATA--CTG-----T------T--A--T-AT-AT--A-T-T-AAC-A--C-T-GGCCA--A-----------C----T-GTCC---T--CC-T-----A--C---A---CAGA-G--T---A--CTGA-TAAA---G---TGT-----T----A-----T-AA-----A--TCA----T-----T------------TAAC-A---CTGC-AATG-CA--A-------AC----TC-GCCC--T---C----CT-AC-A-A-AG-A-GCA-CTGATTCAC---TGTTATGAATTA-TT-TAAC-ACT--Gtaacactgcca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcTATAAACA-TC-AACAATG--CC-AA-T-TAA--A-------CT-G-TC-AC-----C--T-AC-AACA-T---A-G--T--A-C--C-GA-TA-A--CTG-TT-ATA-A-----------A-CA-TCGAT-AATGTCAAT--C--A--A------ACT-G-TC--T--C-C----cca
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A--A---A---CT-G-TC-TC-----C--T-AC-A--A-C---A-G--A--G-TA-CTGT-TA-A--CTG-TT-ATA-A---T----ATT----------CACTGTCAAT--T-CA--A------ACT-C-TC--T--C-C----TACAGCT--G----A-----GCT---G-ACTGA-T------CTG-----T------T-TA----AA-AT--ACT-T-AAC-A--GCT-GC-CA--AGATT-C-----T----C-G--T---T--CC-T-----A--CA--A---CA-A-A--GAT-A--CTGA-T-AA---A---TGTTAAAAT----A-----T-TA-----A--T-A----T-----T------G-----T--C-A---
gi|3                          :                                                                                                                       atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgt--CT-G-TC-TC-----C--T-AC-A--A-C---A-G-----A-TTACTGA-TA-A--CTG-TT-ATA-A-----------A-TA-TTAAC-AATGTCAAT--C-AA--A-------CT-G-TC--T--C-CT---ACAAC----A----G-----AGT-----ACTAA-T-A-A--CTG------------T-TA--T-AC-AT--A-T-T-AAC-A--A-T--CTGA--A---T-C-TA-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--CA--A---TAGA-G--T---A--CTGG-T-AA---C---TGT-----T----A-----T-at
gi|5                          :                                                                                                                                     ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatacttcata--CT-G-TC-TT-----CT-A-AA-A-CA-CGTTA-G--A--A----CTGA-TC-A--C-A-CTGATA-ACTTT----ACTAATA-TTAAC-AGCGTCAAT--CCAA--ACATATTACC-G-TC--C--T-CTTTTACAACC---A----G-----AGT---A-GT-GA-T-A-A--CTG-----T------TATAAAT-AA-AT--A-T-T-AAC-AG-A-T-G-TCATAA---T-A-AA-AC----T-G--C---T--TC-T-----A--C---A---CAGA-G--T---A--CTGA-T-AAACTT---TTT-----T----A-----T-AA-----A--T-A----TAACAAT------CG----T--C----------GAT--C---A-------ATACCGT--G--C--T---C----C---T-ACACAG-A-GTTACTG--TAACCTTTGTTAT--AT---AT---AC-AAT--GT--------CAATCAT-AA--CTG-T-CT-CC-TACAaca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a--CT-G-TC-TC-----C--T-AC-AACA-C---A-G--T--A----CTGA-TA-A------TT-GT----------------TA-TTAAC--AT-----T--------A------ACT-G-TC--T--C-C----TACAAT---A----G-----AGT---A--CTGA-C-A-A--CTG-----T------T--A--T-GA-AT--A-T-C-AAC-A--A-T-G-TCA--A---T-aaaccaactaaacagagtaaacctggtaagttatatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aa-TC-TC-----TT-A-AC-A--------A-G--T--A-C--TCGA-TA-C--T-G-TT--TA-A-----------A-TA-TTAAAC--TGTCAAC--C-AA--A-------CT-G-TC--T--C-C----GTACA----T----ACCAGCAGT---A-CTT-A-T-T-T--CTG-----TTATAGAT-CA--T-GA-GT--A-TAT-ACA-A--A-T-GC-CA--ATC-T-C-AA-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--CA--A---CAG--A--G---C--CTGA-T-TAAC-T---TGT-----T----A-----TAAA-----A--T-A----T-----T------CGACTGT--C-A--------ATT--CA--A-------AC----T--G--T--TTCCT----CA-CC-AGACAGAACATC-CTGATAGAC---TGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --CTGA-TA-AA-T-G-TT-AAA-A---T----ATTAATA-TT-------GTCAAT--C-CA--C-------CTAG-TC--T--CTC----AACAG----A-----------GT---A--CTGA-C-A-A--ATC-----G------T-TA--T-AA-AT--AAT-T-AAC-A--C-TTGGTCA--AA--TGC-AA-AC----T-G--C---TTTCC-T-----AAAC---AAC-CAGA-G--C---A--CTGGATATA---C---TGT-----T----A-----T-AT-----A--T-A----T-----T------A-----A--C-A---C-T--GGC--C---A-------AC----T--G--TCCT---C----C---T-ACACAG-A-GTA-CTGATAAAG---TGTTATAAATCA-TT-TAAC-ACT--GC--AA--TGCAA--AC-----TCG-C-CC-TC-C-TACAA--A-G-AGCA-C---TG-AT-TCA--CTGTT-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcctacaacaaagata-G-CT-ATA-A-----------A-CA-TCAAC-AATGCCAAT--T-AA--A-------CT-G-TC--A--C-C----TACAA----C----AT----AGT---A--CCGA-T-A-A--CTG-----T------T--A--T-AA-AC--A-T-C-GAT-A--A-T-G-TCA--A---T-C-AA-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--TA--A---CAGatgaattatttaacactgcca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -G-TT-ATG-A--------ATTA-T--TTAAC-ACTGCCA----------A------ACT-G-TC--TCGC-T----ACCAA----A----G-----AGT---A---CGA-T-A-A--CTG------------T-TA--T-AG-ATC-A-T-T-AATAA--A-T-G-TCA--AC--T-C-AC-ACTA--T-G--C---T---C-T-----A--C---A----AGATA--GTACA--CTGA-C-TT---C---TGT-----T----A-----T--A-----A--T-A----
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actT--C-AT--A------ACT-G-TC--T--C-C----TACAA----GCTACG-----AGT-----ATTG--T-A-A---TA------------T-TG--T-AA-CT--A-T-T--AC-A--A-T---TC---A---T-CAAA-AC----T-A--CTCAT--CC-T-----A--C---A----ATA-A--A---AC-CCAA-T-AA---C---TGT----------------T-TG-----A--T-A----TA----T------A-----T--C-AGT-C-GGCAAT--T---A-------AC----G--G--T--C---TCCTACA-AC-A-CCAG-A-GTA-CTGAT-ACC---AGTTATAAATCC-AT-TGACTAAT--AT--aaacaccgtcaacctctcttaacaagtactcgatactgtttaaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--A------ACT-G-TC--T--C-CT---ACAAC----A----G-----AGT-----ACTGT-T-A-A--CTG------------T-TA--T--A-AT--A-T-T---C-A--C-T-G-TCA--AT--T-C-AA-AC----TCT--C---T--CC-T-----A--C---AG--CTGA-GCTG---A--CTGA-T------C---TGT-----T----T-----A-AA-----A--T-A----C-----TTAACAGC-----TGCC-A---A-G--ATT--C------------T----C--G--T--T---C----CT-AC-A-ACAA-AGATA-CTGAT-AAA---TGTTA-AAAT---AT-TAAT-ATT--GT--ccaatttagctcgtctcgcttacaacttaatttctttaaacttgttataaaaatttagtgtcactccaaaaaggtcatcttataacagtactgataactgttatcgcat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                  atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgt--A------ACT-G-TC--T--C-CT---ACAAC----A----C-----AGT-----ACTGA-T-A-A--TTG-----T------------------T--A-T-T-AAC-A--T-T-----------------A-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--CA--A---TAGA-G--T---A--CTGA-C-AA---C---TGT-----T----A-----T-GA-----A--T-A----T-----caat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ------ACT-G-TC--T--C-C----TACAA----C----A-----GAT---T-ACTGA-T-A-A--CTG-----T------T--A--T-AA-AT--A-T-T-AAC-A--A-T-G-TCA--A---T-C-AA-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--CA--A---CAGA-G--T---A--CTAA-T-AA---C---TGT-----T----A-----T-AC-----A--T-A----T-----T------A-----A--C-AATCT-G--AAT--CT--A-------AC----T--G--T--C---T----CCTAC-A-ATAG-A-GTA-CTGGT-AAC---TGTTATcaacaatgtcaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                    ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatacttcat------ACT-G-TC--T--T-C----TAAAA----C----A-----CGTTAGA-ACTGA-TCACA--CTGATAACT------T-TA--C-TA-AT--A-T-T-AAC-A--G-C-G-TCA--A---T-CCAA-ACATATT-A--CCG-T--CC-TCTTTTA--C---AAC-CAGA-G--T---A--GTGA-T-AA---C---TGT-----T----A-----T-AA-----A--T-AAA--T-----A------T-----T--A-A---C-A--GATGTC---ATAATAAAAC----T--G--C--T---T----C---T-ACACAG-A-GTA-CTGATAAAC---TTTTTT--ATAA-ATATAAC-AATC-GT--------CGA--TC-AATACCG-TGCT-CC-TACAC-A----G-AGTTAC---T--GT-A-A--CC-TT-TG-TTAT-----ATAT-AC-A--ATGTCA--ATC---A-------T--AACTGTC-TCCTACAA-aca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA----C----A-----AGT---A-CTCGA-T-A----CTG-----T------T-TA-----A-AT--A-T-T-AA--A--C-T-G-TCA--A---C-C-AA-AC----T-GT-C---T--CCGT-----A--C---ATACCAGC-A--GT--A--CTTA-T-TT---C---TGT-----TATAGA-----T-CATGAGTA--T-A----T-----A------C-----A--A-A---T-GCCAAT--CTCAA-------AC----T--G--T--C---T----CCTAC-A-ACAG-A-G-C-CTGATTAACT--TGTTATAAAaaccaactaaacagagtaaacctggtaagttatatat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tctctt-TA--T-AA-AC--A-T-C-AAC-A--A-T-GC-CA--A---T-T-AA-AC----T-GT-C---A--CC-T-----A--CA--A---CATA-G--T---A--CCGA-T-AA---C---TGT-----T----A-----T-AA-----A--C-A----------T------CGA---T--A-A---T-GTCAAT--CA--A-------AC----T--G--T--C---T----CCTAT-A-ACAG-atattcgactgtcaattcaaactgtttcctcaccagacagaacatcctgatagactgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gc---T-C-AT-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--C---AA--CAGA-T--T---A--CTGA-T-AA---C---TGT-----T----A-----T-AA-----A--T-A----T-----T------A-----A--CAA---T-GTCAAT--CA--A-------AC----T--G--T--C---T----CCTAC-A-ACAG-A-GTA-CTAAT-AAC---TGTTATACAT---AT-TAAC-AAT-------C--TG-AA--TCTAA--CTG-T-CT-CC-TACAA-T--A-G-AGTA-C---T--GG-TAA--CTGTT-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatactA-AC----T-GT-C---T--CC-T-----A--C---AA--CACA-G--T---A--CTGA-T-AA---T---TGT-----T----A-----T-TA-----A--C-A----T-----T-----------------------------------A-------AC----T--G--T--C---T----CCTAC-A-ATAG-A-GTA-CTGA-CAAC---TGTTATGAAT---AT-CAAC-AAT--GT--ataca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---T--CC-T-----A--C---AA--CA-A-A--G---ATACTGA-T-AA---A---TGT-----T----AAAATAT-TA-----A--T-A----T-----T------G-----T--C-A---------AT--C---C-------AC----CTAG--T--C---T----C---TCA-ACAG-A-GTA-CTGACAAAT---CGTTATAAATAA--T-TAAC-ACTTGGTCAAA--TGCAA--AC-TG--C---T-TT-CC-TAAAC-AACCAG-AGCA-C---TGGATAT-A--CTGTT---A-TAT-----ATAT-TA-A------CA--CTG---GC--CA------ACTGTCCTCCTACA----CA-GAGTACTGATAAAGTGTTATAAcaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A---C---TAT-----T----A-----C-CA-----A--T-GCCAGT-----T------C-------------------AAT--A---T-------AC----T--G--T--T---T----CCTAC-A-ACAA---GTA-CTAAT-AAC---TATTAT--ATAACAT-TAATTAAT--GT--------CAA--TC-AA--ATGAT-CT-CC-TA-AC-A--CAG-AGTA-----C--AG-T-AAACTGTT-TA--TAA--------T-C------TATCAGCAGC---ATGCCA--TGAAACTGTC-TCCTACA-----ACAAGTACTG----------ATAACTGTTAatcatttaacactgcaatgcaaactcgccctcctacaaagagcactgattcactgttatgaattatttaacactgcca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aT--C---AT------AC----T--G--T--C---T----CCTAC-A-ACAG-A--TTACTGAT-AAC---TGTTATAAATA---T-TAAC-AAT--GT--------CAA--TC-AAA-CTG-T-CT-CC-TACA--A--CAG-AGTA-C---T--AA-T-AA-CTGTT---A-TAC-----ATAT-TA-A------CA--ATCTGAAT--C---T--AACTGTC-TCCTACAA---TA-GAGTACTG----------GTAACTGTTAtgaaagcatttaatcctaccgcaacagcagtattgataacgttataaaatttgacaatatcatcctacgaaggctgtttctacatgaacagagtactgaatatattataatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatactT-A-ACAA-GTACT-C-GAT--AC---TGTT-TAAATA---T-TAA--ACT--GT--------CAA--CC-AAA-CTG-T-CT-CCGTACAT-A--C-C-AGCAGTACTT--AT-T-T--CTGTTATAGATCATGAGTATATACA-A--ATGCCA--ATC----T--CA-----AACTGTC-TCCTACAA-taca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tctctGCTATAAACA---T-CAAC-AAT--GCCAAT--TA--------AA--CTG-T-CA-CC-TACA--A--C-ATAGTACC---G--AT-A-A--CTGTT---A-TAA-----ACAT-CG-ATAATGTCA--ATC---A----------AACTGTC-TCCTATAA-cagagcctgattaacttgttataaaatattcgactgtcaattcaaactgtttcctcaccagacagaacatcctgatagactgt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgta--AT-A-A--CTGTT-TGA----------TAT-------ATATCA--GTC---GG--CAATT--AACGGTC-TCCTACAACACCA-GAGTACTG-gagctgactgatctgtttaaaatacttaacagctgccaagattctcgttcctacaacaaagatactgataaatgttaaaatattaatattgtcaat
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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|6 ): CAAAACGCTGTGCTGGAATCATTTATTTACCATTACATATAGTTACCATGGTCGGATCATCATGGTTGATCTTTTCATTCCTTCCCCATGTTTCCAGTCATGCCAATATATATGACCCTTGTACAGTCCATTCAAATCGGAACGAAAACATTTCTTATACCACCATGCTGACTTATAATACTGCGCACAACTTGAGCTATAGACGTCGTTGTCTCTATCCTTTGTTGAAAAACTCATTCCGTTTTGCATGGAAAGGCTGTCGCCTAGAATAAAAATGATACAAGTACATGTAGTGCAA
Unaligned ( gi|10 ): TACTAACAATATACATTTACTATGATGGTCGGATCATCATAGATGTTCTTTTCAATGCCTCATGCTTATTTCCCCAGGTGGGCCAGTTAAGGTATTTAGTACTANTTCAATGCCTCATGCTTATTTCCCCAGGTGGACCAGTTAAGGTATGCAGTACTGACCACAGCGGAGTTAGCATACTGTCCATTGAGGTCGGAAGTATAGCAAGCGTGATACCACCATGCTCCTTTATAACTTGTAGCACAATTCCCTCGATGTGTGTCGTTGTCC
Unaligned ( gi|11 ): TACCAGTACATGGATTTGACGTTATATGTAGGAGAATCAGAATACTCTCCGTTCAGGTTTGTGTGACCACATTTTTTGAACCACCATCCGCCATGGCGTTTTACCGCACAATTATAAGATGCCTCGTCATTATCACTGTCTGATGTAGTGAACGACATTCCGTTGAGAATTCCAAAAGAATCTCCTATAATAGAAGTAAACTGGTAACATCATAACCTTTAAAAATTA
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Reference ( family-7972 )     :                                                                                                                                                                                                                                                TCATAACTGTCTCCTACAA-ACCT---AAC-----AGA--GTA---CT-GATAAGTTAT-TATAAA-TA-TTAACAATG--TCAAT-CAAA------A-CTG-TC-TCC---NA-----CA-AC---A--GNAC-CTGATAACTGTTAT-A-AT-----A-TATATTAAC-A-AT-GTC--AATC-AAAACT-G-TCTC-CNA-C-A----N-A-GAG-TAACTGA-TAA--CTGTTTAT-AA-AT--A-TTAAC-A--A-T--G-T-CAA-T-CAA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--C---A--CAGA----G-NA--C-TG-AT-------A-AC---TGT-----TATNAA----TAT--TNTCA---CGAATC---AACTGTC-TCCTAC-----------AACAG-A-GTA---CT-GAT-AACTGTTATAAATAAATTAACAATGT-A-TGCAANCAA--CT-G-TCTCCTACAC--ACAGAGTA-CT-ATT-ACTGTT-TAA-TAAATATCAAATGTCAATCGTCATAACTGTCTCCTACAAGCTACGAGTACTGTAATGTTGTAACTGTTAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                TCATAACTGTCTCCTACAA-AACC---AACTAAACAGA--GTAAACCT-GGTAAGTTATATATAAA-TA-TTAACCATGGGTCA-T-CAAA------ATCTG-TC-TCC---AA-----CATAC---A--GCAT-CTGATAAC-GTTAT-A-AT-----ACTATATTAACCA-AT-GTC--AGTC-AAAACT-G-TCTC-CAA-A-A----A-A-AAG-TAATTGA-TAA--CTGTTTAT-AA-AT--A-TTAAC-A--A-T--GCT-CAA-T-CAA-ACT-G---C--T--CCT-A--C---A--CAGA----A-GA--C-TG-GT-------C-AC---TGT-----TATCAA----TAT--TCTCA---CGAATC---AACTGTT-TCA-AT-----------AACAG-ACGTT---CT-GATCAACTGTTATGAATAAATTAACAATGT-ATTGCAAACAA--CC-G-TCTTTTATAC--AC-GAGTAGCT-ATT-ACTGTT-TAACTAAATATTAAATATCAATCATCATAACTGTCTCCTACAAGCTACGAGTATTGTAATATTGTAACTATTAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     CTT---AAC-----A-A--GTA---CTCGATA--CTGT-T-TAAA-TA-TTAA-ACTG--TCAAC-CAAA--------CTG-TC-TCCG--TACATACCA-GC---A--GTAC-TT-ATTTCTGTTAT-AGATCATGAG-TATAT--ACAA-AT-GCC--AATCTCAAACT-G-TCTC-CTA-CAA----C-A-GAG-C--CTGATTAA--CTTGTTATAAA-AT--A-TT--C-G--ACT--G-T-CAATT-CAA-ACT-G-T-T--T--CCTCA--CCAGA--CAGA----A-CATCC-TG-AT-------AGAC---TGT-----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctACTGTTATGA-AT-------TAT-TTAAC-A-CT-GCC--AA------ACT-G-TCTCGCTACC-A----A-A-GAG-TA--CGA-TAA--CTG-TTAT-AG-ATC-A-TTAATAA--A-T--G-T-CAACT-CAC-ACT-A-T-G--C--TCT-A--C---A---AGATAGTA-CA--C-TG-AC-------T-TC---TGT-----TAT-AA----TA---AAACAC--CG--TC---AACC-TC-TCTT-------------AACA--A-GTA---CTCGAT--ACTGTT-TAAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TATAAA-CA-TCAACAATG--CCAAT-TAAA--------CTG-TC-ACC---TA-----CA-AC---ATAGTAC-C-GATAACTGTTAT-A-A---------ACATCGAT-A-AT-GTC--AATC--AAACT-G-TCTC-CTA-T-A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--C---AA-CACA----G-TA--C-TG-AT-------A-AT---TGT-----TATTAA----CAT--T----------------AACTGTC-TCCTAC-----------AATAG-A-GTA---CT-GAC-AACTGTTATGAAT--ATCAACAATGT-acag
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA------A-CTG-TC-TCC---TA-----CA-AC---A--GAGTACTGTTAACTGTTAT-A-AT-----A-T-T-----C-A-CT-GTC--AATT-CAAACT-C-TCTC-CTA-C-A----G-CTGAGCTGACTGA-T----CTGTTTA--AA-AT--ACTTAAC-A--GCT--G-C-CA-----AG-ATT-C-T-CGTT--CCT-A--CA--A--CAAA----GATA--C-TG-AT-------A-AA---TGTTAAAATATTAA----TAT--TGTCA---caat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                               atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgtACT-G-TCTC-CTA-C-A----ACA-GAT-TA-CTGA-TAA--CTGTT-AT-AA-AT--A-TTAAC-A--A-T--G-T-CAA-T-CAA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--CA--A--CAGA----G-TA--C-TA-AT-------A-AC---TGT-----TATACA----TAT--TAACAATCTGAATCT--AACTGTC-TCCTAC-----------AATAG-A-GTA---CT-GGT-AACTGTTATAat
gi|5                          :                      ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatacttcatACTGTCTTCTAAAACACGTTAGAAC-----TGATCACA---CT-GATAACTT---TACTAA-TA-TTAACAGCG--TCAATCCAAACATATTA-CCG-TC-CTCTTTTA-----CA-ACCAGA--GTA--GTGATAACTGTTATAA-AT-----A-AATATTAAC-AGAT-GTCATAAT--AAAACT-G--CTT-CTA-C-A----C-A-GAG-T-ACTGA-TAAACTTTTTTAT-AA-AT--A--TAAC-A--A-TC-G-T-CGA-T-CAATACC-G-TGC--T--CCT-A--C---A--CAGA----GTTA--C-TG--T-------A-ACCTTTGT-----TATATA----TACAATGTC------AATCAT-AACTGTC-TCCTACAAAACCAACTAAACAG-A-GTAAACCT-GGT-AA--GTTATATATca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAC-TA-TTACCAATG--CCAGT-TCAATAT---A-CTG-TT-TCC---TA-----CA-AC---AA-GTAC--TAATAACTATTAT-A--T-----A--ACATTAATTA-AT-GTC--AATC-AAA--T-GATCTC-CTAAC-A----C-A-GAG-TA-CAGT-AAA--CTGTTTAT-AATCT--A-TCAGC-AGCA-T--G-C-CA--T-GAA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--CA--A--CA-A----G-TA--C-TG-AT-------A-AC---TGT-----TATGAAAG--CAT--TT--------AATC---------C-TACCGC-----------AACAGCA-GTA---TT-GAT-AAC-GTTATAA--AATTTGACAATATCA-TCCTACGAAGGCT-G-T-TTCTACATGAACAGAGTA-CTGAAT-A-TATTATAA-TA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TCC---TA-----CA-AC---AAAGATA-CTGATAAATGTTA--A-A---------ATATTAAT-A-TT-GTC--AATC-CAC-CTAG-TCTC-TCA---A----C-A-GAG-TA-CTGA-CAA--ATCGTTAT-AA-AT--AATTAAC-A--C-TTGG-T-CAAATGCAA-ACT-GCT-T--T--CCT-AAAC---AACCAGA----G-CA--C-TGGAT-------ATAC---TGT-----TATATA----TAT--TAACA---CTGGCC---AACTGTCCTCCTAC-----------A-CAG-A-GTA---CT-GATAAAGTGTTATAAATCATTTAACACTGCAA-TGCA---AA--CTCGCCCTCCTACA---A-AGAGCA-CTGATTCACTGTT---A-TGAATt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                          CTCCTACAA----------------AGA--GCA---CT-GATTCACTGT-TATGAATTATTTAACACTG--CCAtatttaacactgcca
gi|9                          : tcctacaacaaagatactgataaatgttaaaatattaatattgtcaatccacctagtctctcaacagagtactgacaaatcgttataaataattaacacttggtcaaatgcaaactgctttcctaaacaaccagagcactggatatactgttatatatattaacactggccaactgtcctcctacacagagtactgataaagtgttataaatcatttaacactgcaatgcaaactcgccTCATAACTGTCTCCTACAA-GCT-----AC------GA--GTA---TT-G-TAA--TAT-TGTAAC-TA-TT-ACAAT---TC-AT-CAAA------A-CTACTCATCC---TA-----CA-AT---A--AAAC-CCAATAACTGTT-T-G-AT-----A-TATAT---C-A-GTCGGC--AATT---AACG-G-TCTC-CTA-C-AACACC-A-GAG-T-ACTGA-TAC--CAG-TTAT-AA-ATCCA-TTGACTA--A-T--A-TCCAA-T-TTA-GCTCG-T-C--TCGCTT-A--C---A-------------A--CTTA-ATTTCTTTAA-ACT--TGT-----TATAAAAATTTAG--TGTCA---C---TCCAAAAAGGTCATCTTAT-----------AAC---A-GTA---CT-GAT-AACTGTTAT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): ACACAGTGCACATATTTTATACACCTTTATTAACAGTCTGTATTCATTTTCGAGGACGGATCATCATGGATGTTCTTCTCAATGATTCAACCTTATTTCCAAAGTGATACCAGGAATTGTATTTGCCATCAAAGCGTGCGGAGCTAGCATACTTTCCATTTAAGTTCGAAGAAAAGCATTTAAAATACCACCATGCTCCATTATACAATGTCGCACAAGATCCTTTATATATGTCATTGTCCTGATCTTTTGTTGAAAACCTCATTCTGTTATGCTGCGATAAACTGTCGCCTAAAATGATTTTATGAAAATAAATTAAAAGGCATGTATGCAA
Unaligned ( gi|6 ): CAAAACGCTGTGCTGGAATCATTTATTTACCATTACATATAGTTACCATGGTCGGATCATCATGGTTGATCTTTTCATTCCTTCCCCATGTTTCCAGTCATGCCAATATATATGACCCTTGTACAGTCCATTCAAATCGGAACGAAAACATTTCTTATACCACCATGCTGACTTATAATACTGCGCACAACTTGAGCTATAGACGTCGTTGTCTCTATCCTTTGTTGAAAAACTCATTCCGTTTTGCATGGAAAGGCTGTCGCCTAGAATAAAAATGATACAAGTACATGTAGTGCAA
Unaligned ( gi|10 ): TACTAACAATATACATTTACTATGATGGTCGGATCATCATAGATGTTCTTTTCAATGCCTCATGCTTATTTCCCCAGGTGGGCCAGTTAAGGTATTTAGTACTANTTCAATGCCTCATGCTTATTTCCCCAGGTGGACCAGTTAAGGTATGCAGTACTGACCACAGCGGAGTTAGCATACTGTCCATTGAGGTCGGAAGTATAGCAAGCGTGATACCACCATGCTCCTTTATAACTTGTAGCACAATTCCCTCGATGTGTGTCGTTGTCC
Unaligned ( gi|11 ): TACCAGTACATGGATTTGACGTTATATGTAGGAGAATCAGAATACTCTCCGTTCAGGTTTGTGTGACCACATTTTTTGAACCACCATCCGCCATGGCGTTTTACCGCACAATTATAAGATGCCTCGTCATTATCACTGTCTGATGTAGTGAACGACATTCCGTTGAGAATTCCAAAAGAATCTCCTATAATAGAAGTAAACTGGTAACATCATAACCTTTAAAAATTA
Unaligned ( gi|13 ): ATCATTTTAGTCCCCTTTAGTGCGGAAAGTCGTCTTTTCTTCTCAGACCGTATCTTCTCACCAGACAGAGCGGACTCTGTTGTACTGCCCATTCAGGTTGAGTGGCAACAGTCCTGTACCGCCAGTCTTCGTAGGTCAGTATGACGACTGTACCGCCAGTCTCCGTTTGTGTCAGGTTGTAC
Unaligned ( gi|17 ): AGTACAATATTTCACAACCTGTTTATTTATCGACGTTAACTCTTTCGCCT






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Reference ( family-7972 )     :                                                                                                                                                                                                                       TCATAACTGTCTCCTACAAA-----C---TTA--ACAGA--GTA---CT-GATAA-CTGT-TATAAA-TA-TTAACAATG--CCAAT-CAAA------A-CTG-TC-TC-C---TA-----C--A-AC---A--GNAC-CTGATAACTGTTAT-A-AT-----A-TATATTAAC-A-AT-GTC--AA--TCAAA-CT-GTCTCCTA-C-A----CAG--AG-TA-ACTGA-TAA--CTGTTTAT-AA-AT--A-TTAAC-A--A-T--G-T-CAA-T-CAA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--C---A--CAGAG-TA--C-T-G-AT-------A-AC---TGT-----TATNAA----TAT--TGNCA---CGAATC---AACTGTC-TCCTAC-----------AACAG-A-GTA---CTGAT-AACTGTTATAAATAANTTAACAATGT-AT-GC----AAA--ACCGTCTTCTACAC--ACAGAGTA-CTGATT-ACTGTT-TAA-TAAA-TATTAAATATCAATCATCATAACTGTCTCCTACAAGCTACGAGTATTGTAATATTGTAACTATTAC
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gi|3                          :                                                                         atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgt------A-CTG-TC-TC-C---TA-----C--A-AC---A--GAT-TAC-TGATAACTGTTAT-A-A---------ATATTAAC-A-AT-GTC--AA--TCAAA-CT-GTCTCCTA-CAA----CAG--AG-T--ACTAA-TAA--CTG-TTAT-AC-AT--A-TTAAC-A--A-T--C-T-GAA-T-CTA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--CA--A--TAGAG-TA--C-T-G-GT-------A-AC---TGTT---AT--A--at
gi|5                          : ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatacttcatACTGTCTTCTA-AAA-----CACGTTAGAACTGATCACA---CT-GATAA-CT-T-TACTAA-TA-TTAACAGCG--TCAATCCAAACATATTA-CCG-TC-CT-CTTTTA-----C--A-ACCAGA--G---TA-GTGATAACTGTTATAA-AT-----A-AATATTAAC-AGAT-GTCATAA--TAAAA-CT-G-CTTCTA-C-A----CAG--AG-T--ACTGA-TAAACTTTTTTAT-AA-AT--A--TAAC-A--A-TC-G-T-CGA-T-CAATACC-G-TGC--T--CCT-A--C---A--CAGAGTTA--C-T-G--T-------A-ACCTTTGTT---AT--A--TA----TACAATGT--C-AATCAT-AACTGTC-TCCTACAAAACCAACTAAACAG-A-GTAAACCTGGT-AA--GTTATATATca
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Reference ( family-7972 )     :                                                                                                                                                                                                                           TCATAACTGTCTCCTACAAA-----C---TTA--ACAGA--GTA---CT-GATAA-CTGT-TATAAA-TA-TTAACAATG--CCAAT-CAAA------A-CTG-TC-TC-C---TA-----C--A-AC---A--G---TACCTGATAACTGTTAT-A-AT-----A-TATATTAAC-A-AT-GTC--AA--TCAAA-CT-GTCTCCTA-C-A----CAG--AG-TA-ACTGA-TAA--CTGTTTAT-AA-AT--A-TTAAC-A--A-T--G-T-CAA-T-CAA-ACT-G-T-C--T--CCT-A--C---A--CAGAG-TA--C-T-G-AT-------A-AC---TGTT---AT--A--AA----TAT--TGTCAC-AATC---AACTGTC-TCCTAC-----------AACAG-A-GTA---CTGAT-AACTGTTATAAATAATTTAACAATGT-AT-GC----AAAC--CCGTCTTCTATAC--ACAGAGTA-CTGATT-ACTGTT-TAA-TAAATTATTNAACATCAATCATCATAACTGTCTCCTACAAGCTACGAGTATTGTAATATTGTAACTATTAC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                           TCATAACTGTCTCCTACAAG-----C---T----AC-GA--GTA---TT-G-TAA--TAT-TGTAAC-TA-TT-ACAATT--C--AT-CAAA------A-CTACTCATC-C---TA-----C--A-AT---A--A---AACCCAATAACTGTT-T-G-AT-----A-TATAT---C-A-GTCGGC--AA--TT-AA-CG-GTCTCCTA-C-AACACCAG--AG-T--ACTGA-TAC--CAG-TTAT-AA-ATCCA-TTGACTA--A-T--A-TCCAA-T-TTA-GCTCG-T-C--TCGCTT-A--C---A---------A--CTT-A-ATTTCTTTAA-ACT--TGTT---AT--A--AAAATTTAG--TGTCAC---TCCAAAAAGGTCATCTTAT-----------AAC---A-GTA---CTGAT-AACTGTTATctgcca


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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              tctA-CTGT-TATGAATTATTTAACACTG--CCAA------------A-CTG-TC-TCGC-----T---ACCAA-AG---A-G---TAC--GATAACTGTT----ATA-G----ATCAT-----TA-ATAA-A-T-GTC--AACTC--ACA-CT-ATGCTCTACAA---GATAGTACA-CTGA-CTT--CTG-TTAT--A-AT--A--AAAC-A--C-C--G-T-C-AA-C-C---------T-C--T--CTT------AA-C--A-AG-TA--CTCGAT--AC---TGTT----T--A--AA----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCT----ATA-A----AC-AT-----CA-AC-A-A-T-GCC--AA-TT--AAA-CT-GTCACCTACAA---CATAGT--A-CCGA-TAA--CTG-TTAT-AA-AC--A-TCGAT-A--A-T--G-T-C-AA-T-CAA-ACT-G-T-C--T--CCT--AT--AA-C--AG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-ACT-G-T-C--T--CCT--AC--AA-C--ACAG-TA--CT-GATA-AT---TGTT---AT--T--AA----CAT--T-------------AACTGT-C-TCCTAC-----------AATAG-A-GTA---CTGAC-AACTGTTATGAATA--TCAACAATGT-
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA------A-CTG-TC-TC-C-----T---AC--A-ACAG-A-G---TA-CTGTTAACTGTT----AT--A----AT-AT-----T---C-A-C-T-GTC--AATTC--AAA-CT-CTCTCCTACAG---CTGAGCTGA-CTGA-T----CTGTTTA--AA-AT--ACTTAAC-A--GCT--G-C-C-A-----AG-ATT-C-T-CGTT--CCT--AC--AA-C--AAAGATA--CT-GATA-AA---TGTTAAAAT--ATTAA----TAT--TGTCAcaat
gi|3                          :                                                                         atcagtcattcttgtcacccttagtgcggatcgctttgatttcaagaataccggagaccgggtgagttggtgaccattcagaagcggacccggccgtactgtctcgtttcaggtttgaggtacaccagttcttgtaccaccacggctccgtgtctgtattcgcgcacagtgaatacgtacttgtccgtcattgtccctggtccctgtactgacgtcgttttcacttgcctgtatacgt------A-CTG-TC-TC-C-----T---AC--A-AC---A-GAT-TAC-TGATAACTGTT----ATA-A----AT-AT-----TA-AC-A-A-T-GTC--AA-TC--AAA-CT-GTCTCCTACAA---CAGAGT--A-CTAA-TAA--CTG-TTAT-AC-AT--A-TTAAC-A--A-T--C-T-G-AA-T-CTA-ACT-G-T-C--T--CCT--AC--AA-T--AGAG-TA--CT-GGTA-AC---TGTT---AT--A--at
gi|5                          : ttattttagtactttttagtgcttcccatttatttttccaataataccagaacgggtatttggcaccagacatagcgggcccaccgtactgtccgttgaggtttgaggcagcacagttatagtaccaccaggctccgtgcaacgataccgcacagttaccactactgtacacgtcattgtcctggtcccgtgtgctgaacttgtctccattctgatacttcatACTGTCTTCTA-AAA-----CACGTTAGAACTGATCACA---CT-GATAA-CT-T-TACTAAT-ATT-AACAGCG--TCAATCCAAACATATTA-CCG-TC-CT-C-----TTTTAC--A-ACCAGA-G---TAG-TGATAACTGTTATAAATA-A----AT-AT-----TA-AC-AGA-T-GTCATAA-TA--AAA-CT-G-CTTCTAC-A---CAGAGT--A-CTGA-TAAACTTTTTTAT-AA-AT--A--TAAC-A--A-TC-G-T-C-GA-T-CAATACC-G-TGC--T--CCT--AC---A-C--AGAGTTA--CT-G-TA-ACCTTTGTT---AT--A--TA----TACAATGT--C-AATCAT-AACTGT-C-TCCTACAAAACCAACTAAACAG-A-GTAAACCTGGT-AA--GTTATATATca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACT-ATT-ACCAATG--CCAGTT-CAATAT---A-CTG-TT-TC-C-----T---AC--A-AC---AAG---TAC-TAATAACTATT----ATATA----AC-AT-----TA-ATTA-A-T-GTC--AA-TC--AAA-TG-ATCTCCTAACA---CAGAGT--A-CAGT-AAA--CTGTTTAT-AATCT--A-TCAGC-AGCA-T--G-C-C--A-T-GAA-ACT-G-T-C--T--CCT--AC--AA-C--A-AG-TA--CT-GATA-AC---TGTT---ATGAA--AG----CAT--T----T-AATC----------C-TACCGC-----------AACAGCA-GTA---TTGAT-AAC-GTTATAA--AATTTGACAATATCAT-CCTACGAAGG--CTGT-TTCTACATGAACAGAGTA-CTGAAT-A-TATTATAA-TA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TC-C-----T---AC--A-AC---A-AAGATAC-TGATAAATGTT----A-A-A----AT-AT-----TA-AT-A-T-T-GTC--AA-TC--CAC-CTAGTCTCT--CAA---CAGAGT--A-CTGA-CAA--ATCGTTAT-AA-ATA-A-TTAAC-A--C-TTGG-T-CAAA-TGCAA-ACT-GCT-T--T--CCTAAAC--AACC--AGAG-CA--CTGGATATAC---TGTT---AT--A--TA----TAT--TAACACTGGCC---AACTGTCC-TCCTAC------------ACAG-A-GTA---CTGATAAAGTGTTATAAATCATTTAACACTGCAAT-GC----AAAC--TCGCCCTCC-TAC--AAAGAGCA-CTGATTCACTGTT---A-TGAATTATTTAACAt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                           TCATAACTGTCTCCTACAAG-----C---T----AC-GA--GTA---TT-G-TAA--TAT-TGTAACT-ATT--ACAATT--C--ATC-AAA------A-CTACTCATC-C-----T---AC--A-AT---A-A---AACCCAATAACTGTTTG--ATA-T----AT-AT---------C-A-G-TCGGC--AA-TT---AA-CG-GTCTCCTACAACACCAGAGT--A-CTGA-TAC--CAG-TTAT-AA-ATCCA-TTGACTA--A-T--A-TCC-AA-T-TTA-GCTCG-T-C--TCGCTT--AC--AA-CTTA-AT-TT--CT-TTAA-ACT--TGTT---AT--A--AAAATTTAG--TGTCAC---TCCAAAAAGGT-CATCTTAT-----------AAC---A-GTA---CTGAT-AACTGTTATctgcca
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): ACACAGTGCACATATTTTATACACCTTTATTAACAGTCTGTATTCATTTTCGAGGACGGATCATCATGGATGTTCTTCTCAATGATTCAACCTTATTTCCAAAGTGATACCAGGAATTGTATTTGCCATCAAAGCGTGCGGAGCTAGCATACTTTCCATTTAAGTTCGAAGAAAAGCATTTAAAATACCACCATGCTCCATTATACAATGTCGCACAAGATCCTTTATATATGTCATTGTCCTGATCTTTTGTTGAAAACCTCATTCTGTTATGCTGCGATAAACTGTCGCCTAAAATGATTTTATGAAAATAAATTAAAAGGCATGTATGCAA
Unaligned ( gi|6 ): CAAAACGCTGTGCTGGAATCATTTATTTACCATTACATATAGTTACCATGGTCGGATCATCATGGTTGATCTTTTCATTCCTTCCCCATGTTTCCAGTCATGCCAATATATATGACCCTTGTACAGTCCATTCAAATCGGAACGAAAACATTTCTTATACCACCATGCTGACTTATAATACTGCGCACAACTTGAGCTATAGACGTCGTTGTCTCTATCCTTTGTTGAAAAACTCATTCCGTTTTGCATGGAAAGGCTGTCGCCTAGAATAAAAATGATACAAGTACATGTAGTGCAA
Unaligned ( gi|10 ): TACTAACAATATACATTTACTATGATGGTCGGATCATCATAGATGTTCTTTTCAATGCCTCATGCTTATTTCCCCAGGTGGGCCAGTTAAGGTATTTAGTACTANTTCAATGCCTCATGCTTATTTCCCCAGGTGGACCAGTTAAGGTATGCAGTACTGACCACAGCGGAGTTAGCATACTGTCCATTGAGGTCGGAAGTATAGCAAGCGTGATACCACCATGCTCCTTTATAACTTGTAGCACAATTCCCTCGATGTGTGTCGTTGTCC
Unaligned ( gi|11 ): TACCAGTACATGGATTTGACGTTATATGTAGGAGAATCAGAATACTCTCCGTTCAGGTTTGTGTGACCACATTTTTTGAACCACCATCCGCCATGGCGTTTTACCGCACAATTATAAGATGCCTCGTCATTATCACTGTCTGATGTAGTGAACGACATTCCGTTGAGAATTCCAAAAGAATCTCCTATAATAGAAGTAAACTGGTAACATCATAACCTTTAAAAATTA
Unaligned ( gi|13 ): ATCATTTTAGTCCCCTTTAGTGCGGAAAGTCGTCTTTTCTTCTCAGACCGTATCTTCTCACCAGACAGAGCGGACTCTGTTGTACTGCCCATTCAGGTTGAGTGGCAACAGTCCTGTACCGCCAGTCTTCGTAGGTCAGTATGACGACTGTACCGCCAGTCTCCGTTTGTGTCAGGTTGTAC
Unaligned ( gi|17 ): AGTACAATATTTCACAACCTGTTTATTTATCGACGTTAACTCTTTCGCCT