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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGGCATATCATCCATCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCACAGAACTCC--TCAAGT--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CT------TTA-----GG-------CTA-CAGTCA-TCT-TC---TGGCTCCTC--------ACGA--T-CCACACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGTGAA--TCCT-CCC-G-----------TCC---------CCTGTAC-CAA--CTTTG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAA--CA-TGCCTGAAACA-CATGACTTATCCATGG--AGAAAGCCTGAAATTTAT-CCT-CCTC-CATCGGATG---ATGTAGTCTGTT-----ATTACT-CCT---TTT---G-TGCAT-CCTGGATTCCC-GATTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATATA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTCCCCACA----TTTTCTTG----ATTAC-ACATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATCAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCAC----TATCCGCTCCCGAGGG--GCAAGCGTCTCGTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGTTTCG-TCG--TTGACC-CTTCGTTT--ATGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAAC-CACCACGACGGTT-----------TCTGTT------------GTGAT-TAGGGGTGCATAT-GGGGAAGGATCTGTCCCTGCA--GTTTTAAT-TCTT--TCTCCAGTTTC-TCAAT-TATCTGA--CA--------G-------TGTATCCCTCTCTAATG--------------------CCGCTATTCACATCGAGTGCTGGATCCGTTCTTTGACTACCTCCACTAC-TTCCTTCAT-GAGCTTAAATTG-CTTGTTATA----CGGAAGGTTCTATCATTCCAAG-A-GGATC-CTT-GTGC-CTAGG------------CAA----------------GCCCATTAT----ACTATA----TGG--CTACAGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCATTGGAGTTATTCCCTTGGA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGGTATGTAATCTGTCCTCTC-CTCTGC-ATGGCCACAAACCATC--TCCAGC--TTACT-TTTCTTCTC---AGACTGAGAAACGTCCT------GCATCGTTGC-------CTC-CAGTCA-TTTATC---AGGTTATT------------A--T-CCAAACCTT-T-TTCCT-GA-A-CAG--------------------------------------------GCGAG--TCCT-CTT-GA----------TCC---------CTTGCAT-CAAACCCTTGCAGCTCTTGCACTGCAATATC--ATCA--GGGAAA--TT-GAA--CC-TGCCGGGAACA-CATGACCCACCCATGG--AGAAGGCCTAAAACCTGT-CCT---GT-CACCTTATG---ATGTACATAGTTCCCAAATTCCT-CCT---CCTCTGG-TGTTT-CCTGGAATC
gi|1                          : catggacaccgtattactgaagcagctggaacttgaactgtctaaatcacagagatttgggcctcttgtttctcccaagagcgccacgggaacctcaacgagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacactgtattctatattcccacgagaccgatgatattcccccatctttcttgcggtctcgccagcctgcacaaggatgacatgttgctgtattggcggatcggagtaaagctcttcatagatcctgttggacaaaacactaatctcggcacttgtgtccaccactgcttgcagttacactccctggacagtcatttctacatgtaccattaatctggtggttaggcataattgcccgatgagaacagacaagtctcgacagggttttaaagcgtgccagtGGCATATCATCCATCTCCCCGTTCTACTTTGGCAGCAGAACCTCTTTCAAGCTATCAGTGGT-CTTCTTCCAAAACTGA--------CT------TTT-----GG-------CTACCAGTCATTCT-TC---AGGCTGCTCTTCCGTCGACCA--TACCA-ACCCC-T-T-CCTCGACG-CAGATCTTCCGTGTTTAGTT------------A----------CC--GTAAAGTTCTT-CTC-GACCAGGTGAATTCCTCCCGTCCCCTTGTACACAA--CTTTG--------ACACT-CATTATTCAAGTATCGGGGATTCTTCGAATCCATTGCCTGGAACGCCATGAC--AGCC-TGAGTAGAAAG--TA----TCATGCCTACCTCGCATC-GATGCAAATGT-GTCCTCT-----ATTACTACCTATCTCT---GATGCATACCTGGATTCCC-GA-TCAGCGCTTTGATCTTTCTTGTCAGTAGATAAACAATTTGCAGACAGCGTACACGGTTCTTTCCCACAATGTTTTCCTTGACTTATTACTTCATTACAATGAGCTCTTCGACATGCACTTTATCTCTCAGTGTCCAATAATTAATTTCAGAGAGTCCT-CGATGTCTATGCCTCCATCGA--ATGAACCTCTCTTT-GTCACCGTGTGGACATATTCTGTCACTTAGTACCTGCCCCCGAGGGTTGCAAGCGTCTCGTGGTTTTGCTACCCGATATATTCTCTCT-CAAGCTCCGTTCAGTTTGACCTCCTTATTTTCGTGTGCGTCTGCCTTTTCGGACAGTCCTTATAT-TCGAAAT-GTC-AGAG-CCCACTACTTGAACGTGCCATGACGGTTTCTGTTATTCCTCTGTT------------GTGATATAGGGGTGCATCTGGGGGAAGGATATGTCCTTGCAGCGTTTTAGTGTCTTTCTCTCCAGTTCCTTCAATATATCTGAGTTA--------GTCCTAGTTGTATTCCTTGCTCATGCTGTTTTTTCTGGGCCCCCCCCGCTGTT-ACATCGAATGCTGAACTCGTTCCTTACTTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTCTTGTATTACCGCAAGG---TGT-----CAAGTA-AGATCTCTTCGTGCTTTAGG------------CGACGTTTCCACCTCCAATGTCCATTATTCACATTGTACTTCTGG--CTACTGTGAAGGGGGTTAGATATG-AATCATTGGAATTATTTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aC--------GCGACTT-CCACACCCTCT-T-TCT-GA------------------TA----------------------------AGGCGAA--TCAT-CCT-GATGA-------CTC---------CTTG----CAG--CTCTG--------GCACTGTA--A------------------TTCAAA--CC-TGCCTGGAACT-CACGACTCATACCTGG---GAAAGTCgctgcagtag
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atcggcacaagggtgacgtgtcttgcttcatatgggcggcttgaggtcgagttcctaatagatactaatggacagaccactgactttacgcctgtgtccaccattgcttgctactggcactccctggattgccatttataccatatatccagtgatcgggcattataccccaataaccacgggcaagtctccgcgtgacccagaaacatgacggcttgatatgtcatctgttgacttggctacgtccacatttttactgcgctgggaattttcctacgtcactgcctccgagaatttctagggcaaaaCACACCCT-TCT-CCT-GA-A-CAG-----------TTACCGTAAGTTCTTCTGA----------TCAGGTGAA--TCCTACCC-G-----------TCC---------CCTGTAC-CAA--CTTTA--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -CATGACTCATCCATGG--AGAAAGCCCGAAATTTTC-CCT-CCTC-CATCCGATG---ATGTAGTCTGCT-----ATGCCT-CTT---TTT---G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GTg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-CAATGAACTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TCCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACTTCTCATTGGACAACG-GTGGACATAT--CGTCGC----TCTCCGC-CCCGAAGG--GCAAGCTTCTATTGG-TTGGCAA--CAAAAG----TCTCC-CAACCTTCG-TTG--TTGATC-CTTCGTTT--TTGGGTGTC--TCCTTCTGGACAGTC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATATATCTCTCTTTGGCTAACT-TTGGAAATAT--CGTCGC----TCTTCGCCCCCGAGGC--AAAAGCGTCTGTTGG-TGGGTCA--CGAAAT----TCTTCACAAACTTCG-TCG--CTGACC-CTTGGTTT---TGAGTGT---ATCTTCCCAACAGTCCC----TATCAAAATGGTCAAGAACCCCAT-ACTT-----CA----GACTGTT-----------CCTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATAGTCAGGAGCCCCAC-ACTTGAAG-TGCCATGACGGTC-----------TCTGTTTATGCCCTTGTTGTGAT-TAGGGGTGCATCT-GGGAAATGATCCATCCTTGCA--GTTTTAGT-TCCT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTTA--CATTAGTCCCG-------TGTATCCTTCTCCTATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACTGCCACGAC-TTCCTTCAT-AGGCTTAAATAG-CTTGCTATA----CCAAAGGTTCTATCATTCCAAG-ACAGATC-CTT-GTGC-CTAGGCACGTTTCTACCCAA----------------GTCCATTGC----ACTATC----TGA--CTACTGGAAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AA----------------ACCAATTGC----ATTATC----TGGGGC-ACTGGGAAGGG-----GTCTTGCGAT-ACTGGGGTTATTCTCTggcagaatgcccaggtaatggcgtatgcgtgtctgcttcacctgatagggtccaaaagtaacgtactccactcagtggtgcctggttatttatccagaaaaacaaaaagaaaaaagtgaaagagcaaaatctccagctgctaatcggggacggtcatctcagcagagtggggcatttgtgt
14 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GGGAAACCTGGGCCTCCTGTTTCTTCCCGAGGCGCCCAAACGTCATTGGGACGGTTTCCTCACCCGTGGTCAGTTTGCTTTGCCCAAGGTTCAGCCGGGTTTACTGGCGGTACAGAAATTACATTCACAACAGCATCTGGTCCTGCAATGGGGCTACGTACAGTTCCATGTCGAGCTCCGTACCTCCCAGACGAATTATGAATCCGATCATGCGGGCAGGGTAACATGCTGCTTGATGGGAGGCGTGAGGTCGAGCTCCTCGTAGACTCGAGTCGACGATGCATAACTTCCGCCCCCGTGTCCACGACAGCCTGAAACTCCACGCCCTGCACTATCATGTTAACGGTAAAGATTGTAGTCGGTCGGATCTGTCCGAAAGGGGATACACCCGGGGTCCTCCCACATGCCTACAGGACATGTCCTGTGAATCTAACTCCGCTTGGCTTTGACCACTTCCAGTCCACTCTCCTCCTTGGGCTGCAACTGCTGCACAGGTTCCAC
Unaligned ( gi|8 ): AGACGGTCTCCTCACCCATGGTAAGTGTGCCTTGCCCAAGATCCAGCCGAGCTTACTGGGGGTACAGAAATTCCATCCCTACTGACCTAGCAGCATCTGGTCCTGCAACCGGGTTCCGTACTTCCCAGGTGAATCCTCACGGGGCAAATTATGGATCCGCTAATACGGGCATTCTCCCCCACATGTGTATGGGTAACATGCTGGTTGATGGCAGCTTGGTTTCCAGCTCCTCTTAGACTCGAGTCGACTATGCATGAACGTCCACCGCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCCCCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGG
Unaligned ( gi|9 ): TTCTAGTTTTTGGCAGTCACTGGGCACTGAGTCCGAGCCTGCCTCCTCCTCTTAAGCAGGCCAATCGCCCTCATCCACCAAGTCGTCAGGATCGTCACGGGAATCCTCCGTTCTCCTGGTTCCCGGCACTAGGTAATGGCACCACATCCTTAGAAAATCTAAATCTACCCGGGACACATGGTTCATCCTTTGGAGTGGGGTCGTACCTATCTTCTTCCTACCCAGTGACCAAGTCCTCAGATTCCTAGTCCTACTCCCTTGGTGCCTCCTGGAACCGAAT
Unaligned ( gi|10 ): TTCTACCCATTGTGTATTCCCTCGAACAAGAGTACTGGAGGATTAGGAAAAGAGTGATGGATACTGGGGCTAGCTTCTGGGTGAAATGCTCAGAGAATGGCATTTTTCTGGTTCACCTAACTGGGGCCGAACGTGGGCGACTCTACCCAGTGATGCCAGAGTGTTACTGAAAATGAGCAGAAGATTCCTTCTGCTGATAGGGGAAGGTCAAGGCAAAAGGGTGTGACATATGTATGCTAGCATAGCCACCAATCATGGGGATACCATGGGTTGGGCATA
Unaligned ( gi|11 ): GCTGCTTGATGGGCGGCTTAGGGTTGAGATTCTTGTAGACTCGAGTCGACGATACACTAACTTCTGCCCCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCGCCATGCCCTAGCTGTACTACCATGTTAACGGTAAAACCTTTATATTATTCGGGCGAATCTGTTCGATAGGCGCCGGATACACCCGGGGTTCTCACACCAATGTAGGGTATGTCCTCCTCTGACTCTACCTCCGCTTGGCTGTT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACTCCATGCCCAAGAGCATCTGATCCTGCAGTGGGGCCACATATAGGTCCATGTCTTTCTGGGTGTCGCCCAGGCGGACGTTCACCGGTCCCACTATGAACCCCTTCATACGGGCGTTCTCACCCGCCTGGATGAGGGTGACCCGTCGCTTAATGGGCGGTTTGGGATCCAACCCC
Unaligned ( gi|16 ): TAGGCTCGAGTCGGACCAAACGACTCACGCTTCTGATCTCCCGTATCCACCACTGCCTGGAGCTCCATCCCCCCATGCAACCACATAATCCACCAGTAAACCCGGTGAATTGACTGGCCGGGACTTGGCCGGAGAGGCGGGACAAGGGACACCCGGGTTTCTCCTGCAGGC
Unaligned ( gi|17 ): GAAACCTGGAACTCCTAATTCTTCCTGGGGGCCCCAAACGTCATTGGGACGGTCTCCTTGCCCAAGATCCAGTCGAGCGGTACAGACATTCCATTCCTAGCTCAGCATCTGGTCCCCTGCAACGGGGCTACGTACGGTTCCATGTC
Unaligned ( gi|18 ): TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTATACGACCATCTAGCTGCACGAGCCATTTCGAACTTCCTGGCCCTATGTCCATAGTTGGTTTAGTCAGTCGCACTCC
Unaligned ( gi|21 ): CCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGGCTATTGAACACTTCCTGCCCACTCTCCTCCTTGAGCTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|22 ): AAAGCCAAGACCCCACATTTGGAGTATCCCAAAGATTATTGTTCATGCCCCTGCTGTGAGTGCCTGGGGCGCATCTCATGGGAA
Unaligned ( gi|23 ): GCTTGGCTATTGACCACTTTCAGCCCACTCTCCACCATGGGTTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|24 ): TTCTAAAACAGCCTCTTGTGCCTAGGCACATTTCTACCCAAATGCATTGGGTTATCTGGCGACT
Unaligned ( gi|25 ): ACAGGACATAGGGCCACTAACAGCCGCCGGATTTGAACAGTCTCAGT






Alignments
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Reference ( family-7702 )     : NAGGGCATATNATCCGTCTTCTC-CTCTNCTT-GGCCGCAAAACNTCT--CCAGCT--CACTG-T-CTTCTC---AAACTGA--------CT------TCG--GG-------CTA-CAGTCATT-T-TCAGGCTNCT----CG-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGCGAA--TCCT-CCC--------GA--ATCCC----------TTGTAC-CAA--CTTTG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAAC---NTGCCTGGAACG-CACGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCGT-CCT-CCTC-CACCCGATG---ATGTA-----NTCCGC-TATTCCT---CCT---TCT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACNT--GTCTTCCTTGTNAGTAGATGNACAATTTNNAGACAGCGCACACGGTTCTTTCCCACAATGTTCTNCTTGACTTATTACTTCATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TCCAGAGAGNNCTCCGATGTCTATGCCTCCATCGAAGATANACCTCTCTTTGGNCAACG-GTGGACATAT--CGTCGCTC----TCCGCCCCCGAGGG--GCAAGCGTCTNTTGG-TTGGCNA--CGAAAT----TCTCC-CAANCTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTT---TGNGCGTC--NCCTTCCGGACAGTCCCTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-C--G----CCATGACGGTTTCTGTTTATGCCCTTGTTGTGATATA---GGGGTGCATCT-GGGGGAANGATNCGTCCTTGCAGCGTTTTAGTGTCCTTCTCTCCAGTTCCTTCAATATATCTNAGTCATTAGTCCCGTCCTAGTTGTATCCCTCGCCCATGCTGTTTTTTCTGGGCCCCCCCCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGNCTACCGCCACNACTTTCCTTCATGGGGCTTAAATAGCCTTNCTGTATTACCNNAAGGTTCTGTCATTCCAAGTACAGATCTCTTCGTGCTCTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCGA-GTCC-----------ATT----GCATTA----TCTGG--CTACTGGGAAGGG-----GNTNTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|1                          :    GGCATATCATCCATCTCCCCGTTCTACTTTGGCAGCAGAACCTCTTTCAAGCTATCAGTGGT-CTTCTTCCAAAACTGA--------CT------TTT--GG-------CTACCAGTCATTCT-TCAGGCTGCTCTTCCGTCGA--CCATACCAACCCC-T-T-CCTCGACG-CAGATCTTCCGTGTTTAGTT------------A----------CC--GTAAAGTTCTT-CTCGACCAGGTGA--ATTCCTCCCGTCCCCTTGTACACAA--CTTTG--------ACACT-CATTATTCAAGTATCGGGGATTCTTCGAATCCATTGCCTGGAACGCCATGA--CAGCC-T-GAGTAGAAAG--------TA----TCATGCCTACCTCGCA-TCGATGCAAATGT------GTCCTC-TATTACTA--CCTATCTCT------GATGCATACCTGGATTCCC-GA-TCAGCGCTTTGATCTTTCTTGTCAGTAGATAAACAATTTGCAGACAGCGTACACGGTTCTTTCCCACAATGTTTTCCTTGACTTATTACTTCATTACAATGAGCTCTTCGACATGCACTTTATCTCTCAGTGTCCAATAATTAATTTCAGAGAGTCCT-CGATGTCTATGCCTCCATCGA--ATGAACCTCTCTTT-GTCACCGTGTGGACATATTCTGTCACTTAGTACCTGCCCCCGAGGGTTGCAAGCGTCTCGTGGTTTTGCTACCCGATATATTCTCTCT-CAAGCTCCGTTCAGTTTGACCTCCTTA-TTTTCGTGTGCGTCTGCCTTTTCGGACAGTCCTTATAT-TCGAAAT-GTC-AGAG-CCCACTACTTGAA-CGTG----CCATGACGGTTTCTG-TTATTCCTCTGTTGTGATATA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATATGTCCTTGCAGCGTTTTAGTGTCTTTCTCTCCAGTTCCTTCAATATATCTGAGTTA--------GTCCTAGTTGTATTCCTTGCTCATGCTGTTTTTTCTGGGCCCCCCCCGCTGTT-ACATCGAATGCTGAACTCGTTCCTTACTTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTCTTGTATTACCGCAAGG---TGT-----CAAGTA-AGATCTCTTCGTGCTTTAGGCGACGTTTCCA-CCTCCAATGTCC-----------ATTATTCACATTGTACTTCTGG--CTACTGTGAAGGGGGTTAGATATG-AATCATTGGAATTATTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aT-CAATGAACTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TCCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACTTCTCATTGGACAACG-GTGGACATAT--CGTCGCTC----TCCG-CCCCGAAGG--GCAAGCTTCTATTGG-TTGGCAA--CAAAAG----TCTCC-CAACCTTCG-TTG--TTGATC-CTTCGTTTT---TGGGTGTC--TCCTTCTGGACAGTCgctgcagtag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTGGC-GAGTTTCTGTC--CCGA-GTTCTGTTTAAACCAATT----GCATTA----TCTGGGGC-ACTGGGAAGGG-----GTCTTGCGAT-ACTGGGGTTATTCTCT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATATATCTCTCTTTGGCTAACT-TTGGAAATAT--CGTCGCTC----TTCGCCCCCGAGGC--AAAAGCGTCTGTTGG-TGGGTCA--CGAAAT----TCTTCACAAACTTCG-TCG--CTGACC-CTTGG-TTT---TGAGTGT---ATCTTCCCAACAGTCCC----TATCAAAATGGTCAAGAACCCCAT-ACTT-------------CA-GACTGTTCCTGggcggaatgcccagaaatgtatatctggttcacctaaatgggactctactcagtggtgtcagggaatttgcatgtagaataaaagagcagaaagttc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -CATGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCCGAAATTTTC-CCT-CCTC-CATCCGATG---ATGTA-----GTCTGC-TATGCCT---CTT---TTT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GT
gi|2                          :  AGGGCATATCATCCATCTCCTC-CTCTACTT-GGCCACAGAACTCCT--CAAGTT--CACTG-T-CTTCTC---AAACTGA--------CT------TTA--GG-------CTA-CAGTCATC-T-TCTGGCTCCT----CA-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGTGAA--TCCT-CCC--------G----TCCC----------CTGTAC-CAA--CTTTG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAAC---ATGCCTGAAACA-CATGACTTATCCAT-GG--AGAAAG------CCTGAAATTTAT-CCT-CCTC-CATCGGATG---ATGTA-----GTCTGT-TATTACT---CCT---TTT------G-TGCAT-CCTGGATTCCC-GATTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATATA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTCCCCACA----TTTTCTTGA----TTACA-CATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATCAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCACTA----TCCGCTCCCGAGGG--GCAAGCGTCTCGTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGTTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTTA--TGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-CC-A----CCACGACGGTTTCTGTT------------GTGAT-TA---GGGGTGCATAT--GGGGAAGGATCTGTCCCTGCA--GTTTTAAT-TC--TTTCTCCAGTTTC-TCAAT-TATCTGA-----CAG------------TGTATCCCTCTCTAATG--------------------CCGCTATTCACATCGAGTGCTGGATCCGTTCTTTGACTACCTCCACTAC-TTCCTTCAT-GAGCTTAAATTG-CTTGTTATA----CGGAAGGTTCTATCATTCCAAG-A-GGATC-CTT-GTGC-CTAGGC-A---------------A-GCCC-----------ATT----ATACTA----TATGG--CTACAGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCATTGGAGTTATTCCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                       a-CAC--ACCCT-TCT-CCT-GA-A-CAG-----------TTACCGTAAGTTCTTCTGA----------TCAGGTGAA--TCCTACCC--------G----TCCC----------CTGTAC-CAA--CTTTA--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGtgga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCCAAGA-CCCCAC-ATTTGGA----GTATCCCA--AAGATTATTGTTCATGCCCCTGCTGTGA-GTGCCTGGGGCGCATCTCATGGGAAg
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gi|3                          :   GGGTATGTAATCTGTCCTCTC-CTCTGCAT-GGCCACAAACCATCT--CCAGCT--TACTT-TTCTTCTC---AGACTGAGAAACGTCCTGCA---TCGTTGC-------CTC-CAGTCATT-TATCAGGTTATT---------A--TC-CAA--ACCTT-T-TTCCT-GA-A-CAG--------------------------------------------GCGAG--TCCT-CTT--------GA---TCCC----------TTGCAT-CAAACCCTTGCAGCTCTTGCACTGCAATATC--ATCA--GGGAAA--TT-GAAC---CTGCCGGGAACA-CATGACCCACCCAT-GG--AGAAGG------CCTAAAACCTGT-CCT---GT-CACCTTATG---ATGTACATAGTTCCCA-AATTCCT---CCT---CCTCTG---G-TGTTT-CCTGGAATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          catggacaccgtattactgaagcagctggaacttgaactgtctaaatcacagagatttgggcctcttgtttctcccaagagcgccacgggaacctcaacgagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacactgtattctatattcccacgagaccgatgatattcccccatctttcttgcggtctcgccagcctgcacaaggatgacatgttgctgtattggcggatcggagtaaagctcttcatagatcctgttggacaaaacactaatctcggcacttgtgtccaccactgcttgcagttacactccctggacagtcatttctacatgtaccattaatctggtggttaggcataattgcccgatgagaacagacaagtctcgacagggttttaaagcgtgccagtAAATAGTCAGGAGCCCCAC-ACTTGAAGT--G----CCATGACGGTCTCTGTTTATGCCCTTGTTGTGAT-TA---GGGGTGCATCT-GGGA-AATGATCCATCCTTGCAG--TTTTAGT-TCCTTCTC--CAGTTCCT-CAAT-TATCTTA--CATTAGTCCCGT-------GTATCCTTCTCCTATGC--------------------CGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACTGCCACGACTT-CCTTCATAGG-CTTAAATAGC-TTGCTATA----CCAAAGGTTCTATCATTCCAAG-ACAGATC-CTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCACTA----TCTGA--CTACTGGAAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|6                          :  AAGACATATTATCCATCTTTTC-CTCTTCTT-AACCTTAAAACTCCT--CCAGTT--CACTG-T-CTTCTC---CAACTGA--------CTAATTTATTG--GGTTGTAACCTA-CAGTCATT-T-TCACATGTCT----CG-CGA--TC-CAT--ACCCT-T-C-TCT-TA-GACAG-----------TTA---------------AGTCATCCTGACCAGGTGAA--TCCT-CCCC-------G----TCCC----------CTGTAC-CAA--CTTTG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGAAGAT--TTCGAAC---ATGCCTCGAAGA-CTCGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCAT-CCT-GCTC-CACCCGATG---ATGTA-----TTCTGA-TATTCCT---CCT---TTA------G-TGCAT-CCTGGAACCCCTAAGTCGGAACAT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATGCA----TTCAAGA-AG-GCACATG----TTTTTCACA----TCTGCTTG---------TTCATT-CAATGTGCTTTTC-AC-TGCA--TTG----TCAGTGTCCAGT-ATGAA-ggcagaatgcccaggtaatggcgtatgcgtgtctgcttcacctgatagggtccaaaagtaacgtactccactcagtggtgcctggttatttatccagaaaaacaaaaagaaaaaagtgaaagagcaaaatctccagctgctaatcggggacggtcatctcagcagagtggggcatttgtgt
gi|7                          :                                                                                                                                          ----CG-CGACTTC-CAC--ACCCTCT-T-TCT-GA------------------TA---------------A-------------GGCGAA--TCAT-CCT--------GATGACTCC----------TTG----CAG--CTCTG--------GCACTGTA--A------------------TTCAAAC---CTGCCTGGAACT-CACGACTCATACCT-GG---GAAAG------TC
gi|9                          :                atcggcacaagggtgacgtgtcttgcttcatatgggcggcttgaggtcgagttcctaatagatactaatggacagaccactgactttacgcctgtgtccaccattgcttgctactggcactccctggattgccatttataccatatatccagtgatcgggcattataccccaataaccacgggcaagtctccgcgtgacccagaaacatgacggcttgatatgtcatctgttgacttggctacgtccacatttttactgcgctgggaattttcctacgtcactgcctccgagaatttctagggcaaaaAAT---CTACCCGGGACA-CATGGTTCATCCTTTGG--AGTGGGGTCGTACCTA----TCTT-CTT-CCT---ACCCAGTG---ACCAA-----GTCCTCAGATTCCTAGTCCT---ACTCCCTTGG-TGCCT-CCTGGAACC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|8 ): AGACGGTCTCCTCACCCATGGTAAGTGTGCCTTGCCCAAGATCCAGCCGAGCTTACTGGGGGTACAGAAATTCCATCCCTACTGACCTAGCAGCATCTGGTCCTGCAACCGGGTTCCGTACTTCCCAGGTGAATCCTCACGGGGCAAATTATGGATCCGCTAATACGGGCATTCTCCCCCACATGTGTATGGGTAACATGCTGGTTGATGGCAGCTTGGTTTCCAGCTCCTCTTAGACTCGAGTCGACTATGCATGAACGTCCACCGCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCCCCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGG
Unaligned ( gi|10 ): TTCTACCCATTGTGTATTCCCTCGAACAAGAGTACTGGAGGATTAGGAAAAGAGTGATGGATACTGGGGCTAGCTTCTGGGTGAAATGCTCAGAGAATGGCATTTTTCTGGTTCACCTAACTGGGGCCGAACGTGGGCGACTCTACCCAGTGATGCCAGAGTGTTACTGAAAATGAGCAGAAGATTCCTTCTGCTGATAGGGGAAGGTCAAGGCAAAAGGGTGTGACATATGTATGCTAGCATAGCCACCAATCATGGGGATACCATGGGTTGGGCATA
Unaligned ( gi|11 ): GCTGCTTGATGGGCGGCTTAGGGTTGAGATTCTTGTAGACTCGAGTCGACGATACACTAACTTCTGCCCCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCGCCATGCCCTAGCTGTACTACCATGTTAACGGTAAAACCTTTATATTATTCGGGCGAATCTGTTCGATAGGCGCCGGATACACCCGGGGTTCTCACACCAATGTAGGGTATGTCCTCCTCTGACTCTACCTCCGCTTGGCTGTT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACTCCATGCCCAAGAGCATCTGATCCTGCAGTGGGGCCACATATAGGTCCATGTCTTTCTGGGTGTCGCCCAGGCGGACGTTCACCGGTCCCACTATGAACCCCTTCATACGGGCGTTCTCACCCGCCTGGATGAGGGTGACCCGTCGCTTAATGGGCGGTTTGGGATCCAACCCC
Unaligned ( gi|16 ): TAGGCTCGAGTCGGACCAAACGACTCACGCTTCTGATCTCCCGTATCCACCACTGCCTGGAGCTCCATCCCCCCATGCAACCACATAATCCACCAGTAAACCCGGTGAATTGACTGGCCGGGACTTGGCCGGAGAGGCGGGACAAGGGACACCCGGGTTTCTCCTGCAGGC
Unaligned ( gi|17 ): GAAACCTGGAACTCCTAATTCTTCCTGGGGGCCCCAAACGTCATTGGGACGGTCTCCTTGCCCAAGATCCAGTCGAGCGGTACAGACATTCCATTCCTAGCTCAGCATCTGGTCCCCTGCAACGGGGCTACGTACGGTTCCATGTC
Unaligned ( gi|18 ): TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTATACGACCATCTAGCTGCACGAGCCATTTCGAACTTCCTGGCCCTATGTCCATAGTTGGTTTAGTCAGTCGCACTCC
Unaligned ( gi|21 ): CCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGGCTATTGAACACTTCCTGCCCACTCTCCTCCTTGAGCTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|23 ): GCTTGGCTATTGACCACTTTCAGCCCACTCTCCACCATGGGTTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CTTGGC-GAGTTTCTGTC--CCGA-GTTCTGTTTAAACCAATT----GCATTA----TCTGGGGC-ACTGGGAAGGG-----GTCTTGCGAT-ACTGGGGTTATTCTCT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATATCTCTCTTTGGCTAACT-TTGGAAATAT--CGTCGCTC----TTCGCCCCCGAGGC--AAAAGCGTCTGTTGG-TGGGTCA--CGAAAT----TCTTCACAAACTTCG-TCG--CTGACC-CTTGG-TTT---TGAGTGT---ATCTTCCCAACAGTCCC----TATCAAAATGGTCAAGAACCCCAT-ACTT---------CA-GACTGTTCCTGggcggaatgcccagaaatgtatatctggttcacctaaatgggactctactcagtggtgtcagggaatttgcatgtagaataaaagagcagaaagttc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCCGAAATTTTC-CCT-CCTC-CATCCGATG---ATG----TAGTCTGC-TATGCCT---CTT---TTT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GT
gi|2                          :                                                                                  AGGGCATATCATCCATCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCACAGAACTCC--TCAAGT--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CT------TTA--GG-------CTA-CAGTCATC-T-TCTGGCTCCT----CA-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGTGAA--TCCT-CCCG-T---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAACA---TGCCTGAAACA-CATGACTTATCCAT-GG--AGAAAG------CCTGAAATTTAT-CCT-CCTC-CATCGGATG---ATG----TAGTCTGT-TATTACT---CCT---TTT------G-TGCAT-CCTGGATTCCC-GATTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATATA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTCCCCACA----TTTTCTTG----ATTACA-CATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATCAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCACTA----TCCGCTCCCGAGGG--GCAAGCGTCTCGTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGTTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTTA--TGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-CC-ACCACGACGGTTTCTGTT------------GTGAT-TA---GGGGTGCATAT-GGGG-AAGGATCTGTCCCTGCAG--TTTTAAT-TCTTTCTC--CAGTTTCT-CAAT-TATCTGACA--------GT-----GTATCCCTCTCTAATG-------------------CC-GCTATTCACATCGAGTGCTGGATCCGTTCTTTGACTACCTCCACTAC-TTCCTTCAT-GAGCTTAAATTG-CTTGTTATA----CGGAAGGTTCTATCATTCCAAGA-GGATC-CTT-GTGC-CTAGG----------------CAA-GCCC-----------ATT----ATACTA----TATGG--CTACAGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCATTGGAGTTATTCCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                       a-CAC--ACCCT-TCT-CCT-GA-A-CAG-----------TTACCGTAAGTTCTTCTGA----------TCAGGTGAA--TCCTACCCG-T---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TA--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGtgga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCCAAGA-CCCCAC-ATTTGGAGT--ATCCCAAAGATTATTGTTCATGCCCCTGCTGTGA-GTGCCTGGGGCGCATCTCATGGGAAg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaTTCTAAAACAG-CCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACATTTCTA-C--CCAA-ATGC-----------ATT----GGGTTA----TCTGG--CGACT
gi|3                          :                                                                                   GGGTATGTAATCTGTCCTCTC-CTCTGC-ATGGCCACAAACCATC--TCCAGC--TTACT-TTTCTTCTC---AGACTGAGAAACGTCCTGCA---TCGTTGC-------CTC-CAGTCATT-TATCAGGTTATT---------A--TC-CAA--ACCTT-T-TTCCT-GA-A-CAG--------------------------------------------GCGAG--TCCT-CTTGAT---C------------CCT-------TGCAT-CAAACCCT-TGCAGCTCTTGCACTGCAATATC--ATCA--GGGAAA--TT-GAACC---TGCCGGGAACA-CATGACCCACCCAT-GG--AGAAGG------CCTAAAACCTGT-CCT---GT-CACCTTATG---ATGTACATAGTTCCCAAATTCCT---CCT---CCTCTG---G-TGTTT-CCTGGAATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catggacaccgtattactgaagcagctggaacttgaactgtctaaatcacagagatttgggcctcttgtttctcccaagagcgccacgggaacctcaacgagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacactgtattctatattcccacgagaccgatgatattcccccatctttcttgcggtctcgccagcctgcacaaggatgacatgttgctgtattggcggatcggagtaaagctcttcatagatcctgttggacaaaacactaatctcggcacttgtgtccaccactgcttgcagttacactccctggacagtcatttctacatgtaccattaatctggtggttaggcataattgcccgatgagaacagacaagtctcgacagggttttaaagcgtgccagtAAATAGTCAGGAGCCCCAC-ACTTGAAGT--GCCATGACGGTCTCTGTTTATGCCCTTGTTGTGAT-TA---GGGGTGCATCT-GGGA-AATGATCCATCCTTGCAG--TTTTAGT-TCCTTCTC--CAGTTCCT-CAAT-TATCTTACATTA-----GTCCCGTGTATCCTTCTCCTATG-------------------CC-GCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACTGCCACGACTT-CCTTCATAG-GCTTAAATAGC-TTGCTATA----CCAAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATC-CTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCACTA----TCTGA--CTACTGGAAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|6                          :                                                                                  AAGACATATTATCCATCTTTTC-CTCTTC-TTAACCTTAAAACTCC--TCCAGT--TCACT-GT-CTTCTC---CAACTGA--------CTAATTTATTG--GGTTGTAACCTA-CAGTCATT-T-TCACATGTCT----CG-CGA--TC-CAT--ACCCT-T-C-TCT-TA-GACAG-----------TTA---------------AGTCATCCTGACCAGGTGAA--TCCT-CCCCGT---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGAAGAT--TTCGAACA---TGCCTCGAAGA-CTCGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCAT-CCT-GCTC-CACCCGATG---ATG----TATTCTGA-TATTCCT---CCT---TTA------G-TGCAT-CCTGGAACCCCTAAGTCGGAACAT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATGCA----TTCAAGA-AG-GCACATG--TTTTT--CACA----TCTGCTTG---------TTCATT-CAATGTGCTTTTC-AC-TGCA--TTG----TCAGTGTCCAGT-ATGAA-ggcagaatgcccaggtaatggcgtatgcgtgtctgcttcacctgatagggtccaaaagtaacgtactccactcagtggtgcctggttatttatccagaaaaacaaaaagaaaaaagtgaaagagcaaaatctccagctgctaatcggggacggtcatctcagcagagtggggcatttgtgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                          ----CG-CGACTTC-CAC--ACCCTCT-T-TCT-GA------------------TA---------------A-------------GGCGAA--TCAT-CCTGATGACT------------CCT-------TG----CAG--CTC-TG--------GCACTGTA-----------------AT--T-CAAACC---TGCCTGGAACT-CACGACTCATACCT-GG---GAAAG------TC
gi|9                          : atcggcacaagggtgacgtgtcttgcttcatatgggcggcttgaggtcgagttcctaatagatactaatggacagaccactgactttacgcctgtgtccaccattgcttgctactggcactccctggattgccatttataccatatatccagtgatcgggcattataccccaataaccacgggcaagtctccgcgtgacccagaaacatgacggcttgatatgtcatctgttgacttggctacgtccacatttttactgcgctgggaattttcctacgtcactgcctccgagaatttctagggcaaaa--TTCT-CCTGGT---T------------CCC-------GGCAC-TAG--GTAATG--------GCACCACAT---C--CTTA--GAAAAT--CT-AAATC---TACCCGGGACA-CATGGTTCATCCTTTGG--AGTGGGGTCGTACCTA----TCTT-CTT-CCT---ACCCAGTG---ACC----AAGTCCTCAGATTCCTAGTCCT---ACTCCCTTGG-TGCCT-CCTGGAACC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|8 ): AGACGGTCTCCTCACCCATGGTAAGTGTGCCTTGCCCAAGATCCAGCCGAGCTTACTGGGGGTACAGAAATTCCATCCCTACTGACCTAGCAGCATCTGGTCCTGCAACCGGGTTCCGTACTTCCCAGGTGAATCCTCACGGGGCAAATTATGGATCCGCTAATACGGGCATTCTCCCCCACATGTGTATGGGTAACATGCTGGTTGATGGCAGCTTGGTTTCCAGCTCCTCTTAGACTCGAGTCGACTATGCATGAACGTCCACCGCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCCCCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGG
Unaligned ( gi|10 ): TTCTACCCATTGTGTATTCCCTCGAACAAGAGTACTGGAGGATTAGGAAAAGAGTGATGGATACTGGGGCTAGCTTCTGGGTGAAATGCTCAGAGAATGGCATTTTTCTGGTTCACCTAACTGGGGCCGAACGTGGGCGACTCTACCCAGTGATGCCAGAGTGTTACTGAAAATGAGCAGAAGATTCCTTCTGCTGATAGGGGAAGGTCAAGGCAAAAGGGTGTGACATATGTATGCTAGCATAGCCACCAATCATGGGGATACCATGGGTTGGGCATA
Unaligned ( gi|11 ): GCTGCTTGATGGGCGGCTTAGGGTTGAGATTCTTGTAGACTCGAGTCGACGATACACTAACTTCTGCCCCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCGCCATGCCCTAGCTGTACTACCATGTTAACGGTAAAACCTTTATATTATTCGGGCGAATCTGTTCGATAGGCGCCGGATACACCCGGGGTTCTCACACCAATGTAGGGTATGTCCTCCTCTGACTCTACCTCCGCTTGGCTGTT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACTCCATGCCCAAGAGCATCTGATCCTGCAGTGGGGCCACATATAGGTCCATGTCTTTCTGGGTGTCGCCCAGGCGGACGTTCACCGGTCCCACTATGAACCCCTTCATACGGGCGTTCTCACCCGCCTGGATGAGGGTGACCCGTCGCTTAATGGGCGGTTTGGGATCCAACCCC
Unaligned ( gi|16 ): TAGGCTCGAGTCGGACCAAACGACTCACGCTTCTGATCTCCCGTATCCACCACTGCCTGGAGCTCCATCCCCCCATGCAACCACATAATCCACCAGTAAACCCGGTGAATTGACTGGCCGGGACTTGGCCGGAGAGGCGGGACAAGGGACACCCGGGTTTCTCCTGCAGGC
Unaligned ( gi|17 ): GAAACCTGGAACTCCTAATTCTTCCTGGGGGCCCCAAACGTCATTGGGACGGTCTCCTTGCCCAAGATCCAGTCGAGCGGTACAGACATTCCATTCCTAGCTCAGCATCTGGTCCCCTGCAACGGGGCTACGTACGGTTCCATGTC
Unaligned ( gi|18 ): TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTATACGACCATCTAGCTGCACGAGCCATTTCGAACTTCCTGGCCCTATGTCCATAGTTGGTTTAGTCAGTCGCACTCC
Unaligned ( gi|21 ): CCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGGCTATTGAACACTTCCTGCCCACTCTCCTCCTTGAGCTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|23 ): GCTTGGCTATTGACCACTTTCAGCCCACTCTCCACCATGGGTTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|25 ): ACAGGACATAGGGCCACTAACAGCCGCCGGATTTGAACAGTCTCAGT






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Reference ( family-7702 )     :                                                                                 NAGGGCATATCATCCGTCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCGCAGAACTCC--TCNAGC--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CTG-----TTG--GG-------CTA-CAGTCATT-T-TCAGGCTNCT----CG-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGCGAA--TCCT-CCCGAT---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------GCACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAACC---TGCCTGGAACA-CACGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCGT-CCT-CCTC-CACCCGATG---ATG----TAGTCCGC-TATTCCT---CCT---TCT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATANA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTTCCCACA----TTTNCTTG----ATTACTTCATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCGCTC----TCCGCCCCCGAGGG--GCAAGCGTCTNNTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGCTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTT---TGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-GCGCCACGACGGTTTCTGTTTATGCCCCTGTTGTGATGTA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATCCGTCCTTGCA--GTTTTAGT-TCTT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTGA------CAT-GGT----TGTATCCCTCTCTNATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTGTTATA----CGNAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCATTA----TCTGG--CTACTGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|1                          :                                                                                    GGCATATCATCCATCTCCCCGTTCTACTTTGGCAGCAGAACCTCTTTCAAGCTATCAGTGGT-CTTCTTCCAAAACTGA--------CT------TTT--GG-------CTACCAGTCATTCT-TCAGGCTGCTCTTCCGTCGA--CCATACCAACCCC-T-T-CCTCGACG-CAGATCTTCCGTGTTTAGTT------------A----------CC--GTAAAGTTCTT-CTCGAC---CAGGTGAATTCCTCCCGTCCCCTTGTACACAA--CTT-TG--------ACACT-CATTATTCAAGTATCGGGGATTCTTCGAATCCATTGCCTGGAACGCCATGA--CAGCC-T-GAGTAGAAAG--------TA----TCATGCCTACCTCGCA-TCGATGCAAATG----T-GTCCTC-TATTACTA--CCTATCTCT------GATGCATACCTGGATTCCC-GA-TCAGCGCTTTGATCTTTCTTGTCAGTAGATAAACAATTTGCAGACAGCGTACACGGTTCTTTCCCACAATGTTTTCCTTGACTTATTACTTCATTACAATGAGCTCTTCGACATGCACTTTATCTCTCAGTGTCCAATAATTAATTTCAGAGAGTCCT-CGATGTCTATGCCTCCATCGA--ATGAACCTCTCTTT-GTCACCGTGTGGACATATTCTGTCACTTAGTACCTGCCCCCGAGGGTTGCAAGCGTCTCGTGGTTTTGCTACCCGATATATTCTCTCT-CAAGCTCCGTTCAGTTTGACCTCCTTA-TTTTCGTGTGCGTCTGCCTTTTCGGACAGTCCTTATAT-TCGAAAT-GTC-AGAG-CCCACTACTTGAACGTGCCATGACGGTTTCTG-TTATTCCTCTGTTGTGATATA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATATGTCCTTGCAGCGTTTTAGTGTCTTTCTCTCCAGTTCCTTCAATATATCTGAGTTAGTCCT-AGT----TGTATTCCTTGCTCATGCTGTTTTTTCTGGGCCCCCCCCGCTGTT-ACATCGAATGCTGAACTCGTTCCTTACTTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTCTTGTATTACCGCAAGG---TGT-----CAAGTAAGATCTCTTCGTGCTTTAGGCGACGTTTCCA-CCTCCAATGTCC-----------ATTATTCACATTGTACTTCTGG--CTACTGTGAAGGGGGTTAGATATG-AATCATTGGAATTATTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aT-CAATGAACTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TCCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACTTCTCATTGGACAACG-GTGGACATAT--CGTCGCTC----TCCG-CCCCGAAGG--GCAAGCTTCTATTGG-TTGGCAA--CAAAAG----TCTCC-CAACCTTCG-TTG--TTGATC-CTTCGTTTT---TGGGTGTC--TCCTTCTGGACAGTCgctgcagtag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CTTGGC-GAGTTTCTGTC--CCGA-GTTCTGTTTAAACCAATT----GCATTA----TCTGGGGC-ACTGGGAAGGG-----GTCTTGCGAT-ACTGGGGTTATTCTCT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATATCTCTCTTTGGCTAACT-TTGGAAATAT--CGTCGCTC----TTCGCCCCCGAGGC--AAAAGCGTCTGTTGG-TGGGTCA--CGAAAT----TCTTCACAAACTTCG-TCG--CTGACC-CTTGG-TTT---TGAGTGT---ATCTTCCCAACAGTCCC----TATCAAAATGGTCAAGAACCCCAT-ACTT--------CA-GACTGTTCCTGggcggaatgcccagaaatgtatatctggttcacctaaatgggactctactcagtggtgtcagggaatttgcatgtagaataaaagagcagaaagttc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCCGAAATTTTC-CCT-CCTC-CATCCGATG---ATG----TAGTCTGC-TATGCCT---CTT---TTT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GT
gi|2                          :                                                                                  AGGGCATATCATCCATCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCACAGAACTCC--TCAAGT--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CT------TTA--GG-------CTA-CAGTCATC-T-TCTGGCTCCT----CA-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGTGAA--TCCT-CCCG-T---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAACA---TGCCTGAAACA-CATGACTTATCCAT-GG--AGAAAG------CCTGAAATTTAT-CCT-CCTC-CATCGGATG---ATG----TAGTCTGT-TATTACT---CCT---TTT------G-TGCAT-CCTGGATTCCC-GATTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATATA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTCCCCACA----TTTTCTTG----ATTACA-CATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATCAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCACTA----TCCGCTCCCGAGGG--GCAAGCGTCTCGTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGTTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTTA--TGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-CCACCACGACGGTTTCTGTT------------GTGAT-TA---GGGGTGCATAT-GGGG-AAGGATCTGTCCCTGCA--GTTTTAAT-TCTT--TCTCCAGTTTC-TCAAT-TATCTGA------CA---GT-----GTATCCCTCTCTAATG--------------------CCGCTATTCACATCGAGTGCTGGATCCGTTCTTTGACTACCTCCACTAC-TTCCTTCAT-GAGCTTAAATTG-CTTGTTATA----CGGAAGGTTCTATCATTCCAAGA-GGATC-CTT-GTGC-CTAGG----------------CAA-GCCC-----------ATT----ATACTA----TATGG--CTACAGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCATTGGAGTTATTCCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                       a-CAC--ACCCT-TCT-CCT-GA-A-CAG-----------TTACCGTAAGTTCTTCTGA----------TCAGGTGAA--TCCTACCCG-T---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TA--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGtgga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCCAAGA-CCCCAC-ATTTGGA-GTATCCCAAAGATTATTGTTCATGCCCCTGCTGTGA-GTGCCTGGGGCGCATCTCATGGGAAg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaTTCTAAAACAG-CCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACATTTCTA-C--CCAA-ATGC-----------ATT----GGGTTA----TCTGG--CGACT
gi|3                          :                                                                                   GGGTATGTAATCTGTCCTCTC-CTCTGC-ATGGCCACAAACCATC--TCCAGC--TTACT-TTTCTTCTC---AGACTGAGAAACGTCCTGCA---TCGTTGC-------CTC-CAGTCATT-TATCAGGTTATT---------A--TC-CAA--ACCTT-T-TTCCT-GA-A-CAG--------------------------------------------GCGAG--TCCT-CTTGAT---C------------CCT-------TGCAT-CAAACCCT-TGCAGCTCTTGCACTGCAATATC--ATCA--GGGAAA--TT-GAACC---TGCCGGGAACA-CATGACCCACCCAT-GG--AGAAGG------CCTAAAACCTGT-CCT---GT-CACCTTATG---ATGTACATAGTTCCCAAATTCCT---CCT---CCTCTG---G-TGTTT-CCTGGAATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catggacaccgtattactgaagcagctggaacttgaactgtctaaatcacagagatttgggcctcttgtttctcccaagagcgccacgggaacctcaacgagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacactgtattctatattcccacgagaccgatgatattcccccatctttcttgcggtctcgccagcctgcacaaggatgacatgttgctgtattggcggatcggagtaaagctcttcatagatcctgttggacaaaacactaatctcggcacttgtgtccaccactgcttgcagttacactccctggacagtcatttctacatgtaccattaatctggtggttaggcataattgcccgatgagaacagacaagtctcgacagggttttaaagcgtgccagtAAATAGTCAGGAGCCCCAC-ACTTGAA-GTGCCATGACGGTCTCTGTTTATGCCCTTGTTGTGAT-TA---GGGGTGCATCT-GGGA-AATGATCCATCCTTGCA--GTTTTAGT-TCCT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTTA------CATTAGTCCCGTGTATCCTTCTCCTATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACTGCCACGACTT-CCTTCATAG-GCTTAAATAGC-TTGCTATA----CCAAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATC-CTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCACTA----TCTGA--CTACTGGAAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|6                          :                                                                                  AAGACATATTATCCATCTTTTC-CTCTTC-TTAACCTTAAAACTCC--TCCAGT--TCACT-GT-CTTCTC---CAACTGA--------CTAATTTATTG--GGTTGTAACCTA-CAGTCATT-T-TCACATGTCT----CG-CGA--TC-CAT--ACCCT-T-C-TCT-TA-GACAG-----------TTA---------------AGTCATCCTGACCAGGTGAA--TCCT-CCCCGT---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGAAGAT--TTCGAACA---TGCCTCGAAGA-CTCGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCAT-CCT-GCTC-CACCCGATG---ATG----TATTCTGA-TATTCCT---CCT---TTA------G-TGCAT-CCTGGAACCCCTAAGTCGGAACAT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATGCA----TTCAAGA-AG-GCACATG--TTTTT--CACA----TCTGCTTG---------TTCATT-CAATGTGCTTTTC-AC-TGCA--TTG----TCAGTGTCCAGT-ATGAA-ggcagaatgcccaggtaatggcgtatgcgtgtctgcttcacctgatagggtccaaaagtaacgtactccactcagtggtgcctggttatttatccagaaaaacaaaaagaaaaaagtgaaagagcaaaatctccagctgctaatcggggacggtcatctcagcagagtggggcatttgtgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                          ----CG-CGACTTC-CAC--ACCCTCT-T-TCT-GA------------------TA---------------A-------------GGCGAA--TCAT-CCTGATGACT------------CCT-------TG----CAG--CTC-TG--------GCACTGTA-----------------AT--T-CAAACC---TGCCTGGAACT-CACGACTCATACCT-GG---GAAAG------TC
gi|9                          : atcggcacaagggtgacgtgtcttgcttcatatgggcggcttgaggtcgagttcctaatagatactaatggacagaccactgactttacgcctgtgtccaccattgcttgctactggcactccctggattgccatttataccatatatccagtgatcgggcattataccccaataaccacgggcaagtctccgcgtgacccagaaacatgacggcttgatatgtcatctgttgacttggctacgtccacatttttactgcgctgggaattttcctacgtcactgcctccgagaatttctagggcaaaa--TTCT-CCTGGT---T------------CCC-------GGCAC-TAG--GTAATG--------GCACCACAT---C--CTTA--GAAAAT--CT-AAATC---TACCCGGGACA-CATGGTTCATCCTTTGG--AGTGGGGTCGTACCTA----TCTT-CTT-CCT---ACCCAGTG---ACC----AAGTCCTCAGATTCCTAGTCCT---ACTCCCTTGG-TGCCT-CCTGGAACC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|8 ): AGACGGTCTCCTCACCCATGGTAAGTGTGCCTTGCCCAAGATCCAGCCGAGCTTACTGGGGGTACAGAAATTCCATCCCTACTGACCTAGCAGCATCTGGTCCTGCAACCGGGTTCCGTACTTCCCAGGTGAATCCTCACGGGGCAAATTATGGATCCGCTAATACGGGCATTCTCCCCCACATGTGTATGGGTAACATGCTGGTTGATGGCAGCTTGGTTTCCAGCTCCTCTTAGACTCGAGTCGACTATGCATGAACGTCCACCGCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCCCCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGG
Unaligned ( gi|10 ): TTCTACCCATTGTGTATTCCCTCGAACAAGAGTACTGGAGGATTAGGAAAAGAGTGATGGATACTGGGGCTAGCTTCTGGGTGAAATGCTCAGAGAATGGCATTTTTCTGGTTCACCTAACTGGGGCCGAACGTGGGCGACTCTACCCAGTGATGCCAGAGTGTTACTGAAAATGAGCAGAAGATTCCTTCTGCTGATAGGGGAAGGTCAAGGCAAAAGGGTGTGACATATGTATGCTAGCATAGCCACCAATCATGGGGATACCATGGGTTGGGCATA
Unaligned ( gi|11 ): GCTGCTTGATGGGCGGCTTAGGGTTGAGATTCTTGTAGACTCGAGTCGACGATACACTAACTTCTGCCCCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCGCCATGCCCTAGCTGTACTACCATGTTAACGGTAAAACCTTTATATTATTCGGGCGAATCTGTTCGATAGGCGCCGGATACACCCGGGGTTCTCACACCAATGTAGGGTATGTCCTCCTCTGACTCTACCTCCGCTTGGCTGTT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACTCCATGCCCAAGAGCATCTGATCCTGCAGTGGGGCCACATATAGGTCCATGTCTTTCTGGGTGTCGCCCAGGCGGACGTTCACCGGTCCCACTATGAACCCCTTCATACGGGCGTTCTCACCCGCCTGGATGAGGGTGACCCGTCGCTTAATGGGCGGTTTGGGATCCAACCCC
Unaligned ( gi|16 ): TAGGCTCGAGTCGGACCAAACGACTCACGCTTCTGATCTCCCGTATCCACCACTGCCTGGAGCTCCATCCCCCCATGCAACCACATAATCCACCAGTAAACCCGGTGAATTGACTGGCCGGGACTTGGCCGGAGAGGCGGGACAAGGGACACCCGGGTTTCTCCTGCAGGC
Unaligned ( gi|17 ): GAAACCTGGAACTCCTAATTCTTCCTGGGGGCCCCAAACGTCATTGGGACGGTCTCCTTGCCCAAGATCCAGTCGAGCGGTACAGACATTCCATTCCTAGCTCAGCATCTGGTCCCCTGCAACGGGGCTACGTACGGTTCCATGTC
Unaligned ( gi|18 ): TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTATACGACCATCTAGCTGCACGAGCCATTTCGAACTTCCTGGCCCTATGTCCATAGTTGGTTTAGTCAGTCGCACTCC
Unaligned ( gi|21 ): CCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGGCTATTGAACACTTCCTGCCCACTCTCCTCCTTGAGCTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|23 ): GCTTGGCTATTGACCACTTTCAGCCCACTCTCCACCATGGGTTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|25 ): ACAGGACATAGGGCCACTAACAGCCGCCGGATTTGAACAGTCTCAGT






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Reference ( family-7702 )     :                                                                                 NAGGGCATATCATCCGTCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCGCAGAACTCC--TCNAGC--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CTG-----TTG--GG-------CTA-CAGTCATT-T-TCAGGCTNCT----CG-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGCGAA--TCCT-CCCGAT---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------GCACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAACC---TGCCTGGAACA-CACGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCGT-CCT-CCTC-CACCCGATG---ATG----TAGTCCGC-TATTCCT---CCT---TCT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATANA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTTCCCACA----TTTNCTTG----ATTACTTCATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCGCTC----TCCGCCCCCGAGGG--GCAAGCGTCTNNTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGCTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTT---TGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-GTGCCACGACGGTTTCTGTTTATGCCCCTGTTGTGATGTA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATCCGTCCTTGCA--GTTTTAGT-TCTT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTGA------CAT-AGT----TGTATCCCTCTCTNATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTGTTATA----CGNAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCATTA----TCTGG--CTACTGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|1                          :                                                                                    GGCATATCATCCATCTCCCCGTTCTACTTTGGCAGCAGAACCTCTTTCAAGCTATCAGTGGT-CTTCTTCCAAAACTGA--------CT------TTT--GG-------CTACCAGTCATTCT-TCAGGCTGCTCTTCCGTCGA--CCATACCAACCCC-T-T-CCTCGACG-CAGATCTTCCGTGTTTAGTT------------A----------CC--GTAAAGTTCTT-CTCGAC---CAGGTGAATTCCTCCCGTCCCCTTGTACACAA--CTT-TG--------ACACT-CATTATTCAAGTATCGGGGATTCTTCGAATCCATTGCCTGGAACGCCATGA--CAGCC-T-GAGTAGAAAG--------TA----TCATGCCTACCTCGCA-TCGATGCAAATG----T-GTCCTC-TATTACTA--CCTATCTCT------GATGCATACCTGGATTCCC-GA-TCAGCGCTTTGATCTTTCTTGTCAGTAGATAAACAATTTGCAGACAGCGTACACGGTTCTTTCCCACAATGTTTTCCTTGACTTATTACTTCATTACAATGAGCTCTTCGACATGCACTTTATCTCTCAGTGTCCAATAATTAATTTCAGAGAGTCCT-CGATGTCTATGCCTCCATCGA--ATGAACCTCTCTTT-GTCACCGTGTGGACATATTCTGTCACTTAGTACCTGCCCCCGAGGGTTGCAAGCGTCTCGTGGTTTTGCTACCCGATATATTCTCTCT-CAAGCTCCGTTCAGTTTGACCTCCTTA-TTTTCGTGTGCGTCTGCCTTTTCGGACAGTCCTTATAT-TCGAAAT-GTC-AGAG-CCCACTACTTGAACGTGCCATGACGGTTTCTG-TTATTCCTCTGTTGTGATATA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATATGTCCTTGCAGCGTTTTAGTGTCTTTCTCTCCAGTTCCTTCAATATATCTGAGTTAGTCCT-AGT----TGTATTCCTTGCTCATGCTGTTTTTTCTGGGCCCCCCCCGCTGTT-ACATCGAATGCTGAACTCGTTCCTTACTTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTCTTGTATTACCGCAAGG---TGT-----CAAGTAAGATCTCTTCGTGCTTTAGGCGACGTTTCCA-CCTCCAATGTCC-----------ATTATTCACATTGTACTTCTGG--CTACTGTGAAGGGGGTTAGATATG-AATCATTGGAATTATTTC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aT-CAATGAACTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATTAA-TCCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACTTCTCATTGGACAACG-GTGGACATAT--CGTCGCTC----TCCG-CCCCGAAGG--GCAAGCTTCTATTGG-TTGGCAA--CAAAAG----TCTCC-CAACCTTCG-TTG--TTGATC-CTTCGTTTT---TGGGTGTC--TCCTTCTGGACAGTCgctgcagtag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CTTGGC-GAGTTTCTGTC--CCGA-GTTCTGTTTAAACCAATT----GCATTA----TCTGGGGC-ACTGGGAAGGG-----GTCTTGCGAT-ACTGGGGTTATTCTCT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATATCTCTCTTTGGCTAACT-TTGGAAATAT--CGTCGCTC----TTCGCCCCCGAGGC--AAAAGCGTCTGTTGG-TGGGTCA--CGAAAT----TCTTCACAAACTTCG-TCG--CTGACC-CTTGG-TTT---TGAGTGT---ATCTTCCCAACAGTCCC----TATCAAAATGGTCAAGAACCCCAT-ACTT--------CA-GACTGTTCCTGggcggaatgcccagaaatgtatatctggttcacctaaatgggactctactcagtggtgtcagggaatttgcatgtagaataaaagagcagaaagttc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCCGAAATTTTC-CCT-CCTC-CATCCGATG---ATG----TAGTCTGC-TATGCCT---CTT---TTT------G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GT
gi|2                          :                                                                                  AGGGCATATCATCCATCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCACAGAACTCC--TCAAGT--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CT------TTA--GG-------CTA-CAGTCATC-T-TCTGGCTCCT----CA-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCT-GA-G-CAG-----------TTA---------------A----------CCAGGTGAA--TCCT-CCCG-T---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGAACA---TGCCTGAAACA-CATGACTTATCCAT-GG--AGAAAG------CCTGAAATTTAT-CCT-CCTC-CATCGGATG---ATG----TAGTCTGT-TATTACT---CCT---TTT------G-TGCAT-CCTGGATTCCC-GATTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATATA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTCCCCACA----TTTTCTTG----ATTACA-CATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTA----TCAGTGTCCAAT-ATCAA-TTCAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATAT--CGTCACTA----TCCGCTCCCGAGGG--GCAAGCGTCTCGTGG-TTGGCTA--CGAAAT----TCTCC-CAAGTTTCG-TCG--TTGACC-CTTCG-TTTA--TGGGTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-CCACCACGACGGTTTCTGTT------------GTGAT-TA---GGGGTGCATAT-GGGG-AAGGATCTGTCCCTGCA--GTTTTAAT-TCTT--TCTCCAGTTTC-TCAAT-TATCTGA------CA---GT-----GTATCCCTCTCTAATG--------------------CCGCTATTCACATCGAGTGCTGGATCCGTTCTTTGACTACCTCCACTAC-TTCCTTCAT-GAGCTTAAATTG-CTTGTTATA----CGGAAGGTTCTATCATTCCAAGA-GGATC-CTT-GTGC-CTAGG----------------CAA-GCCC-----------ATT----ATACTA----TATGG--CTACAGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCATTGGAGTTATTCCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                       a-CAC--ACCCT-TCT-CCT-GA-A-CAG-----------TTACCGTAAGTTCTTCTGA----------TCAGGTGAA--TCCTACCCG-T---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TA--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGAT--TTCGtgga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCCAAGA-CCCCAC-ATTTGGA-GTATCCCAAAGATTATTGTTCATGCCCCTGCTGTGA-GTGCCTGGGGCGCATCTCATGGGAAg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaTTCTAAAACAG-CCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACATTTCTA-C--CCAA-ATGC-----------ATT----GGGTTA----TCTGG--CGACT
gi|3                          :                                                                                   GGGTATGTAATCTGTCCTCTC-CTCTGC-ATGGCCACAAACCATC--TCCAGC--TTACT-TTTCTTCTC---AGACTGAGAAACGTCCTGCA---TCGTTGC-------CTC-CAGTCATT-TATCAGGTTATT---------A--TC-CAA--ACCTT-T-TTCCT-GA-A-CAG--------------------------------------------GCGAG--TCCT-CTTGAT---C------------CCT-------TGCAT-CAAACCCT-TGCAGCTCTTGCACTGCAATATC--ATCA--GGGAAA--TT-GAACC---TGCCGGGAACA-CATGACCCACCCAT-GG--AGAAGG------CCTAAAACCTGT-CCT---GT-CACCTTATG---ATGTACATAGTTCCCAAATTCCT---CCT---CCTCTG---G-TGTTT-CCTGGAATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catggacaccgtattactgaagcagctggaacttgaactgtctaaatcacagagatttgggcctcttgtttctcccaagagcgccacgggaacctcaacgagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacactgtattctatattcccacgagaccgatgatattcccccatctttcttgcggtctcgccagcctgcacaaggatgacatgttgctgtattggcggatcggagtaaagctcttcatagatcctgttggacaaaacactaatctcggcacttgtgtccaccactgcttgcagttacactccctggacagtcatttctacatgtaccattaatctggtggttaggcataattgcccgatgagaacagacaagtctcgacagggttttaaagcgtgccagtAAATAGTCAGGAGCCCCAC-ACTTGAA-GTGCCATGACGGTCTCTGTTTATGCCCTTGTTGTGAT-TA---GGGGTGCATCT-GGGA-AATGATCCATCCTTGCA--GTTTTAGT-TCCT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTTA------CATTAGTCCCGTGTATCCTTCTCCTATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACTGCCACGACTT-CCTTCATAG-GCTTAAATAGC-TTGCTATA----CCAAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATC-CTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCACTA----TCTGA--CTACTGGAAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|6                          :                                                                                  AAGACATATTATCCATCTTTTC-CTCTTC-TTAACCTTAAAACTCC--TCCAGT--TCACT-GT-CTTCTC---CAACTGA--------CTAATTTATTG--GGTTGTAACCTA-CAGTCATT-T-TCACATGTCT----CG-CGA--TC-CAT--ACCCT-T-C-TCT-TA-GACAG-----------TTA---------------AGTCATCCTGACCAGGTGAA--TCCT-CCCCGT---C------------CCC-------TGTAC-CAA--CTT-TG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGAAGAT--TTCGAACA---TGCCTCGAAGA-CTCGACTCATCCAT-GG--AGAAAG------CCTAAAATTCAT-CCT-GCTC-CACCCGATG---ATG----TATTCTGA-TATTCCT---CCT---TTA------G-TGCAT-CCTGGAACCCCTAAGTCGGAACAT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATGCA----TTCAAGA-AG-GCACATG--TTTTT--CACA----TCTGCTTG---------TTCATT-CAATGTGCTTTTC-AC-TGCA--TTG----TCAGTGTCCAGT-ATGAA-ggcagaatgcccaggtaatggcgtatgcgtgtctgcttcacctgatagggtccaaaagtaacgtactccactcagtggtgcctggttatttatccagaaaaacaaaaagaaaaaagtgaaagagcaaaatctccagctgctaatcggggacggtcatctcagcagagtggggcatttgtgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                          ----CG-CGACTTC-CAC--ACCCTCT-T-TCT-GA------------------TA---------------A-------------GGCGAA--TCAT-CCTGATGACT------------CCT-------TG----CAG--CTC-TG--------GCACTGTA-----------------AT--T-CAAACC---TGCCTGGAACT-CACGACTCATACCT-GG---GAAAG------TC
gi|9                          : atcggcacaagggtgacgtgtcttgcttcatatgggcggcttgaggtcgagttcctaatagatactaatggacagaccactgactttacgcctgtgtccaccattgcttgctactggcactccctggattgccatttataccatatatccagtgatcgggcattataccccaataaccacgggcaagtctccgcgtgacccagaaacatgacggcttgatatgtcatctgttgacttggctacgtccacatttttactgcgctgggaattttcctacgtcactgcctccgagaatttctagggcaaaa--TTCT-CCTGGT---T------------CCC-------GGCAC-TAG--GTAATG--------GCACCACAT---C--CTTA--GAAAAT--CT-AAATC---TACCCGGGACA-CATGGTTCATCCTTTGG--AGTGGGGTCGTACCTA----TCTT-CTT-CCT---ACCCAGTG---ACC----AAGTCCTCAGATTCCTAGTCCT---ACTCCCTTGG-TGCCT-CCTGGAACC


blockSeqs                     :                                                                                                A       .    A .      A      T  .   A   .      .  T      .         GAAACGTCCTGCATCGTTGC             .        TA        C  CA        CT  .   .      C CT    .  ACAGTTACCGTAAGTTCTTCTGATCA                             .     A    ATGACT               .        T  .   AC   A  CAGCTCTT        TT   .     TC      .   C     .             .  T         A T  .       GTCGTA    A  T  T .   C   C   T      .     TACA      G A       AGT   ACTCCCTTG    .     .           T  G         .          .    .     T .          .  .       .      C     .      T    ATTACA         .             .  .    .    .               .     .             C       .        .    A               G       .          .        C        C         .           AT   .     A .       .        A         .   .       .     T   A         CT                  T    A       G       A      .       CCA    C           T C  G            GTGCCT            C    G                 .         .    .            .     .       CATTAGTCCCGT                  A   .                           C                                        T T       A A          C         .     G    T     C         C  A  T   .    .      .         TC      .    TGTTTAAACCA   .         .        GG T           .          C   C
blockSeqs                     :                                                                                                G       .    G .      A      A  .   C   .      .  .      .         CTAATTTATTGGGTTGTAAC             .        T         A  CG        .   .   .      . TT    .  GACAGTTAAGTCATCCTGACCA                                 .     .    ATC                  .        T  .   .    .  .               TT   .     TC      .   C     .             .  T         A .  .       .         A  T  A .   C   C   T      .     .         G A       .     CCTCTG       .     .           .  T         .          .    .     C .          .  .       .      .     .      G    TT             .             .  .    .    .               .     .             C       .        .    A               G       .          .        C        C         .           GT   .     C .       .        .         .   .       .     .   .         CC                  .    A       G       G      .       GTA    C           T T  G            TTA               .    .                 .         .    .            .     .       CAGT                          T   .                           C                                        . .       . .          C         .     A    T     C         C  A  .   .    .      .         C       .    .             .         .        .  G           .          .   C
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Unaligned ( gi|11 ): GCTGCTTGATGGGCGGCTTAGGGTTGAGATTCTTGTAGACTCGAGTCGACGATACACTAACTTCTGCCCCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCGCCATGCCCTAGCTGTACTACCATGTTAACGGTAAAACCTTTATATTATTCGGGCGAATCTGTTCGATAGGCGCCGGATACACCCGGGGTTCTCACACCAATGTAGGGTATGTCCTCCTCTGACTCTACCTCCGCTTGGCTGTT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACTCCATGCCCAAGAGCATCTGATCCTGCAGTGGGGCCACATATAGGTCCATGTCTTTCTGGGTGTCGCCCAGGCGGACGTTCACCGGTCCCACTATGAACCCCTTCATACGGGCGTTCTCACCCGCCTGGATGAGGGTGACCCGTCGCTTAATGGGCGGTTTGGGATCCAACCCC
Unaligned ( gi|16 ): TAGGCTCGAGTCGGACCAAACGACTCACGCTTCTGATCTCCCGTATCCACCACTGCCTGGAGCTCCATCCCCCCATGCAACCACATAATCCACCAGTAAACCCGGTGAATTGACTGGCCGGGACTTGGCCGGAGAGGCGGGACAAGGGACACCCGGGTTTCTCCTGCAGGC
Unaligned ( gi|17 ): GAAACCTGGAACTCCTAATTCTTCCTGGGGGCCCCAAACGTCATTGGGACGGTCTCCTTGCCCAAGATCCAGTCGAGCGGTACAGACATTCCATTCCTAGCTCAGCATCTGGTCCCCTGCAACGGGGCTACGTACGGTTCCATGTC
Unaligned ( gi|18 ): TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTATACGACCATCTAGCTGCACGAGCCATTTCGAACTTCCTGGCCCTATGTCCATAGTTGGTTTAGTCAGTCGCACTCC
Unaligned ( gi|21 ): CCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGGCTATTGAACACTTCCTGCCCACTCTCCTCCTTGAGCTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|23 ): GCTTGGCTATTGACCACTTTCAGCCCACTCTCCACCATGGGTTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|25 ): ACAGGACATAGGGCCACTAACAGCCGCCGGATTTGAACAGTCTCAGT






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Reference ( family-7702 )     :                                                                                                  NAGGGCATATCATCCGTCTCCTC-CTCTAC-TTGGCCGCAGAACTCC--TCNAGC--TCACT-GT-CTTCTC---AAACTGA--------CTG-----TTG--GG-------CTA-CAGTCATT-T-TCAGGCTNCT----CG-CGA--TC-CAC--ACCCT-T-T-CCTGAACAGTTA---------------A----------CCAGGCGAAT-CC-------TCCCGGT---CCCCTGTAC-CAA--CT-TTG--------GCACTGCATTATC--ATTATCGGGGATT--TCGAACC---TGCCTGGAACAC-ACGACTCATCC-ATGG--AGAAAG------CCTAAAATTCGT-CCT-CCTC-CACCCGATG---ATG----TAGTCC---G----C-TATTC---CT-CCT---TTT---G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATANA----TTCAAGA-AG-GTACACG--TTTTTCCCACA----TTTNCTTGA----TTACTTCATT-CAATGAGCTCTTC-AC-TGCA--TTATC----AGTGTCCAATA-TTAATT-CAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACCTCTCTTTGGCCAACG-GTGGACATATC--GTCGCTC----TCCGCCCCCGAGGG--GCAAGCGTCTNNTGGTTG-GCTAC--GAAAT----TCTCC-CAAGCTTCGTC--GTT-GACC-CTTCG-TTT-TGG---GTGTC--CCCTTCCGGACAGTCCTTATATATCGAAATGGTCAAGAGCCCCAC-ACTTGAA-GTACCACGACGGTTTCTGTTTATGCCCCTGTTGTGATGTA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATCCGTCCTTGCA--GTTTTAGT-TCTT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTGA------CAT-AGT----TGTATCCCTCTCTNATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTGTTATA----CGNAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCATTA----TCTGG--CTACTGGGAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    a---------------A----------CCAGGTGAATTCC-------TCCCGTC---CCCTTGTACACAA--CT-TTG--------ACACT-CATTATTCAAGTATCGGGGATTCTTCGAATCCATTGCCTGGAACGCCATGAC--AGCC--TGAGTAGAAAG--------TA----TCATGCCTACCTCGCATC-GATGCAAATG----T-GTCC---T----C-TATTA---CTACCTATCTCT---GATGCATACCTGGATTCCC-GA-TCAGCGCTTTGATCTTTCTTGTCAGTAGATAAACAATTTGCAGACAGCGTACACGGTTCTTTCCCACAATGTTTTCCTTGACTTATTACTTCATTACAATGAGCTCTTCGACATGCACTTTATCTCTCAGTGTCCAATAATTAATTTCAGAGAGTCCTC-GATGTCTATGCCTCCATCGAA--TGAACCTCTCTTTG-TCACCGTGTGGACATATTCTGTCACTTAGTACCTGCCCCCGAGGGTTGCAAGCGTCTCGTGGTTTTGCTACCCGATATATTCTCTCT-CAAGCTCCGTTCAGTTTGACCTCCTTA-TTT-TCGTGTGCGTCTGCCTTTTCGGACAGTCCTTATAT-TCGAAATG-TCA-GAGCCC-ACTACTTGAACGTGCCATGACGGTTTCTGTT-ATTCCTCTGTTGTGATATA---GGGGTGCATCT-GGGGGAAGGATATGTCCTTGCAGCGTTTTAGTGTCTTTCTCTCCAGTTCCTTCAATATATCTGAGTTAGTCCT-AGT----TGTATTCCTTGCTCATGCTGTTTTTTCTGGGCCCCCCCCGCTGTT-ACATCGAATGCTGAACTCGTTCCTTACTTACCTCCACTACTTTCCTTCATGGAGCTTAAATAGCCTTCTTGTATTACCGCAAGG---TGT-----CAAGTAAGATCTCTTCGTGCTTTAGGCGACGTTTCCA-CCTCCAATGTCC-----------ATTATTCACATTGTACTTCTGG--CTACTGTGAAGGGGGTTAGATATG-AATCATTGGAATTATTTCcgacgcagatcttccgtgtttagttaccgtaaagttcttctcgaccaggtgaattcctcccgtccccttgtacacaactttgacactcattattcaagtatcggggattcttcgaatccattgcctggaacgccatgacagcctgagtagaaagtatcatgcctacctcgcatcgatgcaaatgtgtcctctattactacctatctctgatgcatacctggattcccgatcagcgctttgatctttcttgtcagtagataaacaatttgcagacagcgtacacggttctttcccacaatgttttccttgacttattacttcattacaatgagctcttcgacatgcactttatctctcagtgtccaataattaatttcagagagtcctcgatgtctatgcctccatcgaatgaacctctctttgtcaccgtgtggacatattctgtcacttagtacctgcccccgagggttgcaagcgtctcgtggttttgctacccgatatattctctctcaagctccgttcagtttgacctccttattttcgtgtgcgtctgccttttcggacagtccttatattcgaaatgtcagagcccactacttgaacgtgccatgacggtttctgttattcctctgttgtgatataggggtgcatctgggggaaggatatgtccttgcagcgttttagtgtctttctctccagttccttcaatatatctgagttagtcctagttgtattccttgctcatgctgttttttctgggccccccccgctgttacatcgaatgctgaactcgttccttacttacctccactactttccttcatggagcttaaatagccttcttgtattaccgcaaggtgtcaagtaagatctcttcgtgctttaggcgacgtttccacctccaatgtccattattcacattgtacttctggctactgtgaagggggttagatatgaatcattggaattatttcgctgcagtag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggcatatcatccatctccccgttctactttggcagcagaacctctttcaagctatcagtggtcttcttccaaaactgacttttggctaccagtcattcttcaggctgctcttccgtcgaccataccaaccccttcctcgacgcagatcttccgtgtttagttaccgtaaagttcttctcgT-CAATGAACTCTTC-AC-TGCA--TTATC----AGTGTCCAATA-TTAATC-CAGAGAGAGCTCCGATGTC-ATGCCTCC-TCGAAGATAGACTTCTCATTGGACAACG-GTGGACATATC--GTCGCTC----TCCG-CCCCGAAGG--GCAAGCTTCTATTGGTTG-GCAAC--AAAAG----TCTCC-CAACCTTCGTT--GTT-GATC-CTTCGTTTT-TGG---GTGTC--TCCTTCTGGACAGTCgctgcagtag
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-ATGACTCATCC-ATGG--AGAAAG------CCCGAAATTTTC-CCT-CCTC-CATCCGATG---ATG----TAGTCT---G----C-TATGC---CT-CTT---TTT---G-TGCAT-CCTGGAACCCC-GAGTCGGAACCT--GT
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                        a-CAC--ACCCT-TCT-CCTGAACAGTTACCGTAAGTTCTTCTGA----------TCAGGTGAAT-CC-------TACCCGT---CCCCTGTAC-CAA--CT-TTA--------ACACTGCATTATC--ATTATCGGGGATT--TCGtgga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCCAAGA-CCCCAC-ATTTGGA-GTATCCCAAAGATTATTGTTCATGCCCCTGCTGTGA-GTGCCTGGGGCGCATCTCATGGGAAg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaTTCTAAAACAG-CCTCTT-GTGC-CTAGGC-ACATTTCTA-C--CCAA-ATGC-----------ATT----GGGTTA----TCTGG--CGACT
gi|3                          :                                                                                                    GGGTATGTAATCTGTCCTCTC-CTCTGC-ATGGCCACAAACCATC--TCCAGC--TTACT-TTTCTTCTC---AGACTGAGAAACGTCCTGCA---TCGTTGC-------CTC-CAGTCATT-TATCAGGTTATT---------A--TC-CAA--ACCTT-T-TTCCTGAACAG---------------------------------GCGAGT-CC-------TCTTGAT---CCCTTGCAT-CAAACCC-TTGCAGCTCTTGCACTGCAATATC--ATCA--GGGAAAT--T-GAACC---TGCCGGGAACAC-ATGACCCACCC-ATGG--AGAAGG------CCTAAAACCTGT-CCT---GT-CACCTTATG---ATGTACATAGTTC---C----CAAATTC---CT-CCT---CCTCTGG-TGTTT-CCTGGAATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catggacaccgtattactgaagcagctggaacttgaactgtctaaatcacagagatttgggcctcttgtttctcccaagagcgccacgggaacctcaacgagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacactgtattctatattcccacgagaccgatgatattcccccatctttcttgcggtctcgccagcctgcacaaggatgacatgttgctgtattggcggatcggagtaaagctcttcatagatcctgttggacaaaacactaatctcggcacttgtgtccaccactgcttgcagttacactccctggacagtcatttctacatgtaccattaatctggtggttaggcataattgcccgatgagaacagacaagtctcgacagggttttaaagcgtgccagtAAATAGTCAGGAGCCCCAC-ACTTGAA-GTGCCATGACGGTCTCTGTTTATGCCCTTGTTGTGAT-TA---GGGGTGCATCT-GGGA-AATGATCCATCCTTGCA--GTTTTAGT-TCCT--TCTCCAGTTCC-TCAAT-TATCTTA------CATTAGTCCCGTGTATCCTTCTCCTATG--------------------CCGCTGTTCACATCGAGTGCTGGACCCGTTCCTTGACTACTGCCACGACTT-CCTTCATAG-GCTTAAATAGC-TTGCTATA----CCAAAGGTTCTATCATTCCAAGACAGATC-CTT-GTGC-CTAGGC-ACGTTTCTA-C--CCAA-GTCC-----------ATT----GCACTA----TCTGA--CTACTGGAAAGGG-----GCTGTG-GATCACTGGAGTTATTCCCT
gi|6                          :                                                                                                   AAGACATATTATCCATCTTTTC-CTCTTC-TTAACCTTAAAACTCC--TCCAGT--TCACT-GT-CTTCTC---CAACTGA--------CTAATTTATTG--GGTTGTAACCTA-CAGTCATT-T-TCACATGTCT----CG-CGA--TC-CAT--ACCCT-TCT-CTTAGACAGTTA---------------AGTCATCCTGACCAGGTGAAT-CC-------TCCCCGT---CCCCTGTAC-CAA--CT-TTG--------ACACTGCATTATC--ATTATCGAAGATT--TCGAACA---TGCCTCGAAGAC-TCGACTCATCC-ATGG--AGAAAG------CCTAAAATTCAT-CCT-GCTC-CACCCGATG---ATG----TATTCT---G----A-TATTC---CT-CCT---TTA---G-TGCAT-CCTGGAACCCCTAAGTCGGAACAT--GTCTTCCTT-TGAG-AGATGCA----TTCAAGA-AG-GCACATG--TTTTT--CACA----TCTGCTTG---------TTCATT-CAATGTGCTTTTC-AC-TGCA--TTGTC----AGTGTCCAGTA-TGAAggcagaatgcccaggtaatggcgtatgcgtgtctgcttcacctgatagggtccaaaagtaacgtactccactcagtggtgcctggttatttatccagaaaaacaaaaagaaaaaagtgaaagagcaaaatctccagctgctaatcggggacggtcatctcagcagagtggggcatttgtgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                           ----CG-CGACTTC-CAC--ACCCTCT-T-TCTGA-----TA---------------A-------------GGCGAAT-CA-------TCCTGATGACTCCTTG----CAG--CT-CTG--------GCACTGTA-----------------ATT---CAAACC---TGCCTGGAACTC-ACGACTCATAC-CTGG---GAAAG------TC
gi|9                          : atcggcacaagggtgacgtgtcttgcttcatatgggcggcttgaggtcgagttcctaatagatactaatggacagaccactgactttacgcctgtgtccaccattgcttgctactggcactccctggattgccatttataccatatatccagtgatcgggcattataccccaataaccacgggcaagtctccgcgtgacccagaaacatgacggcttgatatgtcatctgttgacttggctacgtccacatttttactgcgctgggaattttcctacgtcactgcctccgagaatttctagggcaaaaGAAT-CCTCCGTTCTCCTGGT---TCCCGGCAC-TAG--GTAATG--------GCACCAC---ATC--CTTA--GAAAATC--T-AAATC---TACCCGGGACAC-ATGGTTCATCCTTTGG--AGTGGGGTCGTACCTA----TCTT-CTT-CCT---ACCCAGTG---ACC----AAGTCCTCAGATTCC-TAGTCCTACT-CCC---TTG---G-TGCCT-CCTGGAACC
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GGGAAACCTGGGCCTCCTGTTTCTTCCCGAGGCGCCCAAACGTCATTGGGACGGTTTCCTCACCCGTGGTCAGTTTGCTTTGCCCAAGGTTCAGCCGGGTTTACTGGCGGTACAGAAATTACATTCACAACAGCATCTGGTCCTGCAATGGGGCTACGTACAGTTCCATGTCGAGCTCCGTACCTCCCAGACGAATTATGAATCCGATCATGCGGGCAGGGTAACATGCTGCTTGATGGGAGGCGTGAGGTCGAGCTCCTCGTAGACTCGAGTCGACGATGCATAACTTCCGCCCCCGTGTCCACGACAGCCTGAAACTCCACGCCCTGCACTATCATGTTAACGGTAAAGATTGTAGTCGGTCGGATCTGTCCGAAAGGGGATACACCCGGGGTCCTCCCACATGCCTACAGGACATGTCCTGTGAATCTAACTCCGCTTGGCTTTGACCACTTCCAGTCCACTCTCCTCCTTGGGCTGCAACTGCTGCACAGGTTCCAC
Unaligned ( gi|8 ): AGACGGTCTCCTCACCCATGGTAAGTGTGCCTTGCCCAAGATCCAGCCGAGCTTACTGGGGGTACAGAAATTCCATCCCTACTGACCTAGCAGCATCTGGTCCTGCAACCGGGTTCCGTACTTCCCAGGTGAATCCTCACGGGGCAAATTATGGATCCGCTAATACGGGCATTCTCCCCCACATGTGTATGGGTAACATGCTGGTTGATGGCAGCTTGGTTTCCAGCTCCTCTTAGACTCGAGTCGACTATGCATGAACGTCCACCGCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCCCCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGG
Unaligned ( gi|10 ): TTCTACCCATTGTGTATTCCCTCGAACAAGAGTACTGGAGGATTAGGAAAAGAGTGATGGATACTGGGGCTAGCTTCTGGGTGAAATGCTCAGAGAATGGCATTTTTCTGGTTCACCTAACTGGGGCCGAACGTGGGCGACTCTACCCAGTGATGCCAGAGTGTTACTGAAAATGAGCAGAAGATTCCTTCTGCTGATAGGGGAAGGTCAAGGCAAAAGGGTGTGACATATGTATGCTAGCATAGCCACCAATCATGGGGATACCATGGGTTGGGCATA
Unaligned ( gi|11 ): GCTGCTTGATGGGCGGCTTAGGGTTGAGATTCTTGTAGACTCGAGTCGACGATACACTAACTTCTGCCCCTGTGTCCACAACAGCCTGAAGCGCCATGCCCTAGCTGTACTACCATGTTAACGGTAAAACCTTTATATTATTCGGGCGAATCTGTTCGATAGGCGCCGGATACACCCGGGGTTCTCACACCAATGTAGGGTATGTCCTCCTCTGACTCTACCTCCGCTTGGCTGTT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACTCCATGCCCAAGAGCATCTGATCCTGCAGTGGGGCCACATATAGGTCCATGTCTTTCTGGGTGTCGCCCAGGCGGACGTTCACCGGTCCCACTATGAACCCCTTCATACGGGCGTTCTCACCCGCCTGGATGAGGGTGACCCGTCGCTTAATGGGCGGTTTGGGATCCAACCCC
Unaligned ( gi|16 ): TAGGCTCGAGTCGGACCAAACGACTCACGCTTCTGATCTCCCGTATCCACCACTGCCTGGAGCTCCATCCCCCCATGCAACCACATAATCCACCAGTAAACCCGGTGAATTGACTGGCCGGGACTTGGCCGGAGAGGCGGGACAAGGGACACCCGGGTTTCTCCTGCAGGC
Unaligned ( gi|17 ): GAAACCTGGAACTCCTAATTCTTCCTGGGGGCCCCAAACGTCATTGGGACGGTCTCCTTGCCCAAGATCCAGTCGAGCGGTACAGACATTCCATTCCTAGCTCAGCATCTGGTCCCCTGCAACGGGGCTACGTACGGTTCCATGTC
Unaligned ( gi|18 ): TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTATACGACCATCTAGCTGCACGAGCCATTTCGAACTTCCTGGCCCTATGTCCATAGTTGGTTTAGTCAGTCGCACTCC
Unaligned ( gi|21 ): CCACACCCAGTACTACCATGTGACTCTACCTCCGCCTGGCTATTGAACACTTCCTGCCCACTCTCCTCCTTGAGCTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|23 ): GCTTGGCTATTGACCACTTTCAGCCCACTCTCCACCATGGGTTGCAATGCTGCACAGGTTCCACT
Unaligned ( gi|25 ): ACAGGACATAGGGCCACTAACAGCCGCCGGATTTGAACAGTCTCAGT