lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 111 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222 11111 111 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555555555555555555555555555555555555555555555 111111 222222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 5555555555555555 111111 2222222222222222222 22222222 3333333333333333333333 22222222222222 22222222222222222 222222 1111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22
lowQualScore : 6 5 7 2222 222 0 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 66 88888 3 444 2 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 888888 2 5 4 2 6 6 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222 33 88888 4 2 444 66 666 5 77 2 555 33 222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 88 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 7777 1 6666666666666666666666666666666666666666666666 9 222222 888888888888888 55555 5 77 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 3 888 7777777777777777 3 666666 0 2 7 66 4444444444444444444 55 6 777 1 11111111 0 44 555 1 6666666666666666666666 44 55555555555555 33 88888888888888888 0 22 2 2 333 333333 88 2 33 7777777 333 5555 33 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11
lowQualScore : . . . .... ... . . ............................................................................................. .. ..... . ... . . ..................................................................................... . ...... . . . . . . . .......................................................................................... .......... .. ..... . . ... .. ... . .. . ... .. ... ............................................................. . .. ..................................................................................... . .... . .............................................. . ...... ............... ..... . .. .................................................................................... . . ... ................ . ...... . . . .. ................... .. . ... . ........ . .. ... . ...................... .. .............. .. ................. . .. . . ... ...... .. . .. ....... ... .... .. . ...................................................................... ..
lowQualScore : 0 0 0 7777 222 0 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 66 66666 1 666 9 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 222222 7 3 7 7 8 1 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0000000000 99 66666 9 7 777 33 111 3 66 7 000 99 000 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 88 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 1111 7 7777777777777777777777777777777777777777777777 5 555555 111111111111111 00000 7 88 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 0 888 2222222222222222 7 444444 7 5 3 11 1111111111111111111 55 8 000 1 77777777 8 66 888 8 0000000000000000000000 00 33333333333333 77 55555555555555555 8 88 5 5 999 222222 88 4 22 6666666 999 3333 44 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00
consensus : TTTGACCTTGAACAT-AAAA-CTGGTAT-AACTTTAGAAAGAGAAT-------NG-TNGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGAAN----AG-AAAATTG-GTATTACT-TCAGAACCAGGTCTG-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTNGCC-TT------TGACCT-T-GAACATAAAAA-CTGGTATAACTTTAGAAAGAGAATTG-AAAANTCNNGNGATGTTTGCAGAAGGGTGATAAAGAGGATAACAGACCTATAAACTTAAGGTCAAGGTCNNCGANTNACCTT-------GACCTCTGA-----CC--TTGG----AANAG-A---AAA--T--GG-T-ATTACT-TC---AGAAC--CAG--GTCTC-G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCACTTTGACCTTGATCATAGAAA-GTTGT----------A------NT-AC-----T--TA-A------A--------CC---A-------------ATCNT--TAG-A----GTGATAGAAGAA--T-GCGA---CCTACA----A----N-G---------TAGTATATCC---A--GTGACCTTNA----CCTTTGACCTTG--A--TTNAT-A-T-AA-CTT-G-TATAA-CTTTAGAACCGGGAT----------C---NNNNNNNNNCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTACTGAAGGAAAC-AGGGA-A------TTT-TT--TGGAAATTTTCAAA------ATCTTTGCGATNAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGA--TNTA---GAATTTC----TAAATGAACTTAAA--A---TTGGCAT------------GGCATGGA--TT-ATGTGC----AA--------GGG--AG----------G--A--ATACAGTAGTA-TT-CAGA-AAAAG-CC-C----ACTTT-GT-A--CAGCCAGTACTTCGTTTGGGAG---A-CTTTATAA---TC----GGCAG--ATTATAATC-ATATC--GTTT---CTNATTCTNA---------TTTCGCNTTGTATAAAATCTCAATCACCTAC-------TT-ACAATATACACT
Reference ( gi|1 ) : TTTAAACTTTAAAAT-AAAA-CCGGTAT-AACTTTAGAAAGAGGGT-------AG-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGAAA----AG-AAAATTT-TTATTACT-TCAGAACCAGGTTTG-----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-TT------TGACCT-T-GAACATAAAAA-CTAGTACAACTTTAGAAAGAGAATTG-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC-------GACCT-TGA-----AC--TTGC----AAAAG-A---AAA--T--GG-T-GTTACT-TC---AGAAC--CAG--TTCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCACTTTGACCTTGATCATAGAAT-GTTGT----------A------AT-AC-----T--TA-A------A--------CT---A-------------ATCTT--TAG-AT---GTGATAGAAGAA--T-GCAA---CCTATA----A----T-G---------TAGTATATCT---T--GTGATCTTCA----CCTTTGACCTTG--A--TTGAT-A-T-AA-CTT-G-TATAA-TTTTAGAACTGGGAT----------C---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTACGGAAAGAAAC-AGGGA-A------TTT-TTCCTGGAAATTCTCAAA------ATCTTTGCGATCAAGTGATACCAGGTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAA--TTTA---GAATTTT----TGGATGAACTTAAA--A---TTGGCAT------------GGCATGTA--TT-ATGTGC----CA--------GGG--AT----------G--A--ATACAGTAGTA-TT-CAGA-AAAAG-CC-G----ACTTT-GT-A--CAGCCAGTACTTCGTTTGGGAA---A-TTTTATAA---TC----GGCAG--ATTATAATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA---------TTTCATTTTAT-TGGAAT-TCAATCAACGACAAAGTAATTGACAATGGACACTA
gi|7 : TTTGACCTTGAACAC-AAAAACTGATAT-AACTGTAGAAAGAGAATTGNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTGGACCTCTGACCTTGGAAA----AG-AAAATTG-GTA----T-TCAGAAC
gi|31 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacTTTGACCTTGAACATTAAAA-CTGGTTT-AACTCTAGAAAGAGACT-------TGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATA----AGAAAAATAG-GTATTACT-
gi|3 : cttcaccTGAATT-AAAA-ACTGCATTAACTTTAGAAAGAGAAT-------GA-TTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGAAA----AG--AAATTT-ATATTACT-TCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGACTTTTGACCT-T-GAACATAAAAA-CTGGTATCATGTAGGAAAGA-AATTG-ATACAACATGGGATGTTTGCAGAAGGGTGATAAAGAGGATAACAGACCTATAAACTTAAGGTCAAGGTCAATGAATCCAGT--------GACCT-TGACCCTGACCTTTGTTGAAAAAAG-A---CAA--T--CG-T-ATTACT-TC---AGAACGACAAGCTTTTC----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCACTTTGATCTTGAACATTTAAA-GTTGT----------A------AT-AC-----T--TA-AGCCAATA--------CTA--A-------------ATCTT--TAG-A----GTGATAGAAGAA--TCGTAA---ACTACA----A----A-A---------TGATATATCC-------TGA-CTTTA----CCTTTGACCTTG--A--TTAAT-A-T-AA-CTT-G-TATAA-GTTTAGA
gi|6 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccaggacc-AAAA-TTGGTAA-AACTTTAGAAACAGGAT------------TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACTTCTGATCTTGGAAAAGAGAG-AAAATTG-GTATTAC--TAAGAACCAAGTCTG-----c
gi|45 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtg--CCTTGACTTCTGGCCTTGGAAC----AG-AAAATTG-GTACTTCT-TCATAAACAGGTCTG-----gtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|10 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgacaaagccaagtcactacagagaCTTGATATTTGACCTTGAATA----TT-AAAACTT-ATA-TACCATTAGAACTAGAATTG-----
gi|22 : CTTGACCTCTGACCTTGGAAC----AT-AAAATTG-GTATTTTT-TCAGAACCAGGTCTG---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-CT------TGACCT-C------TAAAAA-CTGATATAACTCTAGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgtggaaattctcaaaatatctgtgatttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|8 : TTGACCTCTGGTTTTGGAGC----AG-AAAATTTAGTATTACT-TCAGAACCAGGTtggtgatagagacgtgttctatagagataaaaagaggatgcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|24 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcttgacatctgatcatgaacataaaaactggtaaaatttaaaactaggatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCTGACCTTGAAAA----AG-ACAATTG-TTATTACT-TCAGAACCATGTCTGN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-TT------TGACCT-T-GAACATATAAA-TTGGTATAACTTTTGGAAGAGAATTG-c
gi|17 : cTTTGACCTTGGAAC----AT-AAAATTG-CTATTACT-TCAGAACCAGGCCTG-----atagcaacattgaatcttcagaaatgataa
gi|34 : ttaccTTTGACCTTGGAAC----AT-AAAATTG-CTATTACT-TCAGAACCAGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaccttgacctctgactttggaatacaaaattcttataacttaagagccagcttagatagagagatgtgatgaatggataaaggg
gi|2 : tgacttgtgactacgaacaaaaaaaaactggtttagctttaaaacttggaatgagagcaacataagattctaagagatgatggggatgacggtaagggacttcagtggattttaccTCTGACTTTG--AA----CG-AACACTG-GCATTAAT-TCAGAACCAGGTCTc
gi|4 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccactgaccatgaactttaaacctggtgcaactttagaactgggactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttaccTGACCTCGGAAC----AT-AAAATTG-GTATTACT-TCAGAACCAGGTCTG-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTGACTTT------TGACCT-T-GATCATGAAAA-tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|9 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctTATTACT-TCAGAACCAGGTCTG-----aattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|7 : gagattggC-TT------TGACCT-T-GAACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAAAGAGAATTG-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTGGACCTCTGA-----CC--TTGG----AAAAG-A---AAA--T-----T-GGTA-T-TC---AGAAC--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacactgatcttgattatagaaatttgtactacatgtacttaaaaaccaatagtgatagagacatgaaatcttaagatttgataaaaaaatagtgtatccagttactttgacctttgaacttggttataataacatgtataattttagaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactgaaggaatgggattttttggaaattttcaaaatcttcacgatatagaatttttaaatgaacttaagatttgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
gi|31 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaaC-TT------TGACCT-T-GAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTAGAAAGAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTT-------GACCTCTGA-----CC--TTGG----ATAAGAA---AAA--TA-GG-T-ATTACT-
gi|17 : cttcacC-TT------TGACCT-TGGAACAT-AAAA-TTGCTATTACTTCAGAA
gi|34 : ttacC-TT------TGACCT-TGGAACAT-AAAA-TTGCTATTACTTCAGAAccaggcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaccttgacctctgactttggaatacaaaattcttataacttaagagccagcttagatagagagatgtgatgaatggataaaggg
gi|2 : tgacttgtgactacgaacaaaaaaaaactggtttagctttaaaacttggaatgagagcaacataagattctaagagatgatggggatgacggtaagggacttcagtggattttacC-TC------TGACCT-T-GAACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAccaggc
gi|10 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccactgaccatgaactttaaacctggtgcaactttagaactgggactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaac-TT------TGACCT-T-GAATATTAAAA-CTTATATACCATTAGAACTAGAATTG------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCCACTAACCTT-------GACCT-------------TTAC----CATAG-A---AAG--T--TG-T-ATTACT-TTTAAAGAAC--CAG--TACTcttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|8 : cttgata-TC------TGATCA-T-GAACATAAAAA-CTGGT--------------AAAATTT-AAAACTAGGATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT-------GACCTCTGG-----TT--TTGG----AGCAG-A---AAA--TTTAG-T-ATTACT-TC---AGAAC--CAG--GTCgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgtggaaattctcaaaatatctgtgatttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|4 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcttgacaT------TGACCTCT-GACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA
gi|16 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT------TGACCT-T-TAACATAAAAAACTGGTATAACTTTAAAAataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|2 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna------TGACCA-T-GAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTAGAACTGGGACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCTT-------AACCTCTGA-----CC--TTGA----ACAAA-A---AAC--T--GG-T-ATAACC-TA---AGAAC--
gi|6 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCT-T-GAACGTGAAAA-TTGGTAAAACTTTAGAAACAGGATTG-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTT-------GACTTCTGA-----TC--TTGG----AAAAG-AGAGAAAATT--GG-T-ATTAC--TA---AGAAC--CAA--GTCTttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|12 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-------GACCT-TGA-----TC--GT---------AG-A---AAA--T--TG-T-ATTACTAGT---AGAAC--CAG--Tggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|22 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactTT-------GACCTCTGA-----CC--TTGG----AACAT-A---AAA--TT-GG-T-ATTTTT-TC---AGAAC--CAG--GTCTaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaaggggggttggaaattttcaaaatctttgtgatttagaaattaaaattggcttagcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|45 : cTT-------GACTTCTGG-----CC--TTGG----AACAG-A---AAAT-T--GG-T-ACTTCT-TC---ATAAA--CAG--GTCTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctaaaaactgatataactctagaatggtgatagagacgtgttctatagagataaaaagaggatgcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|17 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgacaaagccaagtcactacagagaccCTT-TGA-----CC--TTGG----AACAT-A---AAA--T--TGCT-ATTACT-TC---AGAAC--CAG--g
gi|34 : ttacCTT-TGA-----CC--TTGG----AACAT-A---AAA--T--TGCT-ATTACT-TC---AGAAC--CAG--gcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaccttgacctctgactttggaatacaaaattcttataacttaagagccagcttagatagagagatgtgatgaatggataaaggg
gi|4 : tgacttgtgactacgaacaaaaaaaaactggtttagctttaaaacttggaatgagagcaacataagattctaagagatgatggggatgacggtaagggacttcagtggattttacCT-TGA-----CC--TCGG----AACAT-A---AAA--TT-GG-T-ATTACT-TC---AGAAC--CAG--GTCTgc
gi|24 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGA-----CC--TTGA----AAAAG-A---CAA--T--TG-TTATTACT-TC---AGAAC--CAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|9 : ctcG-A---GAT--T--GG-T-ATTACT-TC---AGAAC--CAG--GTCT--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACACTGATCTTGATTATAGAAA-TTTGT----------ACTACATGT-AC-----T--TA-A------A-------------A-------------ACCAA--TAG-------TGATAGAGACA--T-GAAA---TCT-TA----AGATTT-GATAAAAAAATAGTGTATCC---A--GTTACTTTGA----CCTTTGAACTTG--G--TT-AT-AAT-AA-CAT-G-TATAA-TTTTAGAACTtgtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaccttgaacatataaattggtataacttttggaagagaattgatagcaacattgaatcttcagaaatgataa
gi|12 : ACTTTGACCTTGATCGTAGAAA-ATTGT----------A------TT-AC-----TAGTAGA------A--------CC---A-------------GTAAT--T-----------ATAGAA-------ACAAAATCTTTTG----A----T-G---------TGAT-TAT-TGAAT--GTGACCTACAAAGGACTTTGACCTTG--A--TTAAG-A-T-AA-C------------TTTAAAACTGGAAC----------CGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTACTGAAGGAAAC-AGGGA-AGGGGGGT-------TGGAAATTTTCAAA------ATCTTTGTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactgaaggaatgggattttttggaaattttcaaaatcttcacgatatagaatttttaaatgaacttaagatttgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
gi|10 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgACCTTGACCTTTACCATAGAAA-GTTGT----------A------TT-ACTT---T--TA-A------A---------G---A-------------ACC-----AGTAC----TGATAG-AGAA--T-GTAA---CCTACAGAGCA----TAG---------TAATATATCC---A--GTGGT-----------TTTGACCGTG-----TTTATAA-T-AG-CTT-G-TATAA-CTTTATAACTGGGAT----------ttagaaattaaaattggcttagcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|2 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaACTTTGACCTTGATCGT-GAATAGCTGT----------T------ATGAC-----T--AG-A------A--------CC---A-------------tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgtggaaattctcaaaatatctgtgatttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|5 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccactgaccatgaactttaaacctggtgcaactttagaactgggactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaTTTGATCTTCATCATAGAAA-GTTGC----------A------TT-AC-----A--TA-A------AAACTAGCACT---AGTAGATACATGAAATCTT--CAG-AT---GTGATAAAAGGT--T-ATGA---CATGCA----A----A-G---------TAGTATATCC---A--TTGGCCTTCA----CCATAAACCTTG--A--TTG------------T-G--ATAA-ATTTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTACTGAAAGAAAA-AAG----------TTTGTTTTTGTAAATATTCAAA------ATCTTTGTGATAAAGtaactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|11 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggaTTTTACCTTGATCATAAAAA-GTTCTCTATCAATTTA------GT-ACAAGGAT--TG-ATAGAG-A--------CTTTAA-------------ATTTG--TAC-AT---GTGATAAAAGAA--T-GTGA---C--------------------------TGATATCTCT---A--GTGACCTTGA----CCTATGACCTTG--A--TTG-T-A-T-A-----------AA-TTTTGGAACTGAGAaaattctaaagatattaaaattggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|43 : TGACCTTGACTACAGGAA-GTTGT----------A------TT-AC-----TA-TAGA------A--------CC---A-------------GCACTGATAG-AGACAGTGATAAAAGAA--A-GTGA---CCTTCA----A----A-C---------TACTACATCC---A--GTGA-----------CTTTGACCAT---A--TTTATGA-T-AA-CTT-G-TATctataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggatattttttgaaaaatttcaaagttaaggtctttttgatcttgattctgtaaatgaatttaaaattggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|15 : -AC-----T--TG-A------A---------------------------ATCCT--TAG-AT---GTAATA-AAGAA--T-GCGA---CATACA----A----A-C---------TAG--TATCT---TCAATGACCTTGA----TGTTTGACGATG--ATGTTCAT-A-A-AATCTT-G-TGTAA-CTTTAGAACCGAGA------------------------CTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAAACAAGGGA-A------TCT-T---TGAAAAATTTCAAT------ATCta
gi|35 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagA-A------A--------TT---A-------------AT--T--CAG-AA---GTGATAAAAGGACCT-ACAA---ACTACA----A----T-C---------T-------CC---A--GTGACCTT-G----CCTTTGACCTTG--A---TGAT-C-T-AA-aagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|2 : ctgacctttgaacatttgacataaaactcgtatcatttagaatcggaaacagtgacatg--GTGACCTTGA----CCACTGACCATG--AACTT--T-A-A-AC-CTG-G-TGCAA-CTTTAGAACTGGGAaaaactcaaatattactttag
gi|34 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcaGATTTT-A----CCTTTGACCTTG--G----AAC-A-TAAA-ATT-GCTATTA-CTTCAGAACCAGGctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|31 : tgacttgtgactacgaacaaaaaaaaactggtttagctttaaaacttggaatgagagcaacataagattctaagagatgatggggatgacggtaagggacttcagtgCTTCA----CCTTTGACCTTG--A--ACATT-A-A-AA-CTG-G-TTTAA-CTCTAGAAc
gi|6 : CTTTA----CCTCTGACCTTGGAA--T--AT-A-A-AA-TTG-G-TATTA-CTTCAGAACagagacttgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggataagaaaaataggtattact
gi|17 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA----CCTTTGACCTTG--G----AAC-A-TAAA-ATT-GCTATTA-CTTCAGAACCAGGcaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|24 : ----CCTTTGACCTTG--A--AC-AT-A-T-AA-ATTGG-TATAACTTTTGGAAcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaccttgacctctgactttggaatacaaaattcttataacttaagagccagcttagatagagagatgtgatgaatggataaaggg
gi|11 : ctctgaccttgaaaaagacaattgttattacttcagaaccatgtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTACTTGAGGCAAC-AGGGATA------TTT-TT--TGAAAAATTTCAAAGTTAAGGTCTTTTTGATCgagaattgatagcaacattgaatcttcagaaatgataa
gi|9 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagcTACTGAAGGAA----TGGG-A------TTT-TT--TGGAAATTTTCAAA------ATCTTCACGATttgattctgtaaatgaatttaaaattggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|23 : gagattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacactgatcttgattatagaaatttgtactacatgtacttaaaaaccaatagtgatagagacatgaaatcttaagatttgataaaaaaatagtgtatccagttactttgacctttgaacttggttataataacatgtataattttagaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGGG-A------TTT-TAA--AGAAATTTTCAAA------ATATTTGCGATatagaatttttaaatgaacttaagatttgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
gi|10 : TGGAAATTCTCAAA------ATATCTGTGATatagaatttctagatgaacataaactattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|10 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgTTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGA--TTTA---TAATATC----TGAATGAACTAAAA--A---ACTACAT------------GACATGAT--TT-ATGTGC----AAAGGGAGGGGGG--AT----------T--G--TTACAGTAATGTTT-CAGA-AAAAG-CC-C----AATTT-GT-A--CAACttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|5 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGA--TAAA---GAAATTC----TAAA-GATATTAAA--A---TTGGCAT------------GGCATGGA--TT-ATGTGC----AA--------GGG---------------------TACAGTACTA-TT-CAGA-AAA-G-CA-C----ACTTT-AT-A--CATCCAGTAGTTCGCTTGGGTG---A-CTTTATAA---TT----GACAG--TTTATAATC-ATAT
gi|18 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttactgaaagaaaaaagTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGA--TGTA---GATTTTC----TAAATAGAATTAAA--A---TTGGCATAAATTTGTGCAAGGGATTTA--CTGATGTG------G--------GGG--AT----------G--GCGATACTTT--TA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C----AATTT--T-A--CAGCCAGTACTTTG------------------TAA---TT----GGCAG--ATTATAATC-ATATA-----T---CTTATcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|9 : tttaccaaatgagaaaaaggTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGA--TATA---GAATTTT----TAAATGAACTTAAG--A---TTTGCTT------------GGCATGGG--TT-ATGTGC----AA--------GGG--AG----------G--A--ATACAGAAGTA-TT-CAGA-AAAAG-CC-C----ACTTT-GT-A--CAGCCAGTACTTCGTTTGGGAG---A-CTTTATAA---TT----GGCAG--ATTATAATagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|11 : gagattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacactgatcttgattatagaaatttgtactacatgtacttaaaaaccaatagtgatagagacatgaaatcttaagatttgataaaaaaatagtgtatccagttactttgacctttgaacttggttataataacatgtataattttagaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactgaaggaatgggaTTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGA--TCTT---GATTCTG----TAAATGAATTTAAA--A---TTGGCTT------------GG-----A--TT-TTATGC----AT--------GAG--AG----------A--A--AAATAGCAATA-TT-CAGG-TAAAG-CCCA----ATTTT-AT-G--CAGCCCATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTATCA---TT----GGCAG--ATTACAATC-ATAT
gi|28 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggataTTTTTTGG--AAATTTTTAAAA-----------------GCAAGGTTTATGTGAAAC-------AGATTA-TTTA--------TTGGCAT------------CGCTT-----TT-GTGTGG----TG--------GGGTTATCAAAGTTGGGG--A--ATTTAGTAATG-TT-CAGA-AAA-G-CC-C----ATTTT-AT-A--CAGCTAGTACTTTGTATGGAAG---T-CTTTACAA---AC----GGTAG--ATTATAGTC-ATAct
gi|15 : agttttattgaaacgagcgtaTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGA--TCTG---GATTTTTGAAATGCATGAACTTAAA--A---TTTGCAT------------GG-----A--GT-TTGTGC----AA--------GGG--A---------------------------------AGA-AAAA--------------T--T-A--CAGCTAGCACTTCGTTTGGATG---A-CTTTATAA---TC----AGCAG--AT
gi|12 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGA--TTTA---GAA-----------A-----TTAAA--A---TTGGCTT------------AGCATGGA--TT-ATGTAC----AA--------GGG--AG----------G--A--ATACAGTATTA-TT-CAGA-GAAAG-TC-C----TCTGT-GT-A--CAGCCAGTACTTCGTTTGGGAatc
gi|23 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaaggggggtG--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGA--TATA---GAATTTC----TAGATGAACATAAACTA---TT--CAT------------GGCTTCGA--GT-ATGTAC----AA--------GTG--A-----------GAAA--ATAGAGTAGCA--T-AATATAAGAG-CC-C----ACTTT-TT-G---AGCAAGTTCTTCGTTTAAAAG---A-GT-----A---CC----GACAG--ATTATAATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT---------TTTTCTTTTGTATAAAATCTCAg
gi|26 : ggggattttaaaTCTTCAAAAT------T------TTTT--A--TATA---GAATTTT-----AAATGAACTTAAA--AAAATTGGCAT------------GAAATGGT--TT-ATGTGC----AA--------GGG--AG----------G--A--ATTCAGTAGTA-TTTCAGA-AAA-G-CC-ACAAAACTTT-GTTA--CAGCCAGTACTTCG-TTGGGAG---ACCTTTATAA---TC----GGCAGTTTTTATAATC-TTAT
gi|38 : AACTTAGA--A---TTAGCGT------------A-CAT-----TT--TGTGC----AA--------GAG--AG----------G--A--AAATAGTAGTA-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--CAGCTAGTACTTCGTTTTGGAG---A-CATTGTAA---TC----GGC-----TTATAAcctttttgcatgcgtcggttggtataac
gi|47 : --A---TTGGTAT--------------CGTGTAGATT-ATGTGAAAGATA--------GGG--ATA---------G--C--ATACAGTATTA-TT-CAGA-AAAAG-GT-AC---ACTTG-GT-A--CAG-CAGTACCTTGTTTGGGAG---A-CTTTACAA---atctacatcgtaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|41 : TGTGT----TT--------GGG--AG----------G--A--AAATAGTAGTA-CT-CAGA-AAACG-AC-C----ACTTTTAT-A--CAGCAAGTACTTTGTCTGGGAG---A-CTTTATTA---TT----GGCAT--ATTATATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA---------
gi|33 : acacgaaatccttgttTGC----AA--------GGG--AG----------A--A--ATACATTGGTA-TT-AAGA-AAAAAACC-T----GCTT-------------AGCACTTCGTTTGGGAG---A-CTTTATAA---TC----GGCAG--GTTATAATC-ATA-------T---CTTGCTCTTAAACATCACGTTTCGCATTAT-T----T-TCAATCACCTAC-------TT-ACAATATACACTataaata
gi|36 : A--------GGG--AG----------G--A--AAATGGTAGTA-CT-CAGA-AAAAG-CC-C----ACTTT--T-AAACAGCCAGTATTTCGTTGGAGAG---A-TATTAAAA---TC----GGCAG--ATTATAATC-ATATgcatttgtaacaaaaca
gi|46 : gcgaggagtaatccaGTA-CA-CAGA-AAAAT-CC-C----ATTTT-AT-A--CAGACAGTACTTGGTTTAGGAG---G-GTTTTTGA---TT----AGCAG--ATTATAACC-ATcctgtttaatatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|62 : atatagtgcaagggagttattaattggggggt----ACTTT-GT-A--CAGCCAGTACTTCGTCTGGGA--------TTATAA---T
gi|59 : cAGCCAGTGCTCTGCTTTGGAG---A-CTTTATAATATTC----AGCAG--ATTATGAT
gi|56 : CCAATACTTCGTTTGGGAG---A-CTTTATAA---TCATATGACAA--ATCATAATC-ATt
gi|54 : TTTGGAG---A-CTTTATAA---TT----GGCAA--ATTATAATC-ATATtc
28 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTAGGGGAAAGCAAGGGGAATTGGTTCGGAAAAATTCGGAAATCAAGGTCTTTGTATCTAGATATTTTTTTAATGAATAAATTGTGCAAGGGAGGAAAATTAGCAGTATTAGAAAAGGCCTACTTTTATAAGCCAGGTGCTTCATTTGGAGCTTTATTAGATCGTGATCTT
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|48 ): TCAAGGTCACGTGATACTACAGTAACCTAGCTTGACATTGGACCTAGATCATCTTCAGAACATGAACTGATAGAGACATTGGGGTATTC
Unaligned ( gi|49 ): AACAGTTTTACTGAAGGAAACAAGGGCATTTTTTATATTTCAAAATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTTTTAAATGAACTTATAATTG
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111 1111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111111111111111 1111111111111 2222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 11 222222222222222222222 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 111 6666666666666666666666666 1 4444444 111
lowQualScore : 88 1 6 8 8 9 88 8 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 77 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 33 33 2 2 33 2 0 33 222222 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 22222222 3 1 444 555 88888888 3 44 0000 4 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7777 4 3 0 0 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666 5555 1 9999999999999999999999999 44 6666666666666 33 1 4 888888 2 2 8888888888888888 2 5555 9999 0 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 777 11 66 66 4 77 111111111111111111111 4 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 111 5 555 1 111 1 1111111111111111111111111 0 7 3 3333333 777
lowQualScore : .. . . . . . .. . . ................................................................................. . .. . ..................................................................................... ...... .. .. . . .. . . .. ...... ............................................................................................................ . ........ . . ... ... ........ . .. .... . .............................................................. .... . . . . ............................................................................................ .... .... . ......................... .. ............. .. . . ...... . . ................ . .... .... . ................................................................................... . ... .. .. .. . .. ..................... . .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... . ... . ... . ......................... . . . ....... ...
lowQualScore : 88 4 0 0 0 0 66 4 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 22 8 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 999999 77 77 7 7 77 7 1 66 111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 66666666 3 0 444 444 00000000 1 66 2222 0 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 2 1 7 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8888 1111 2 0000000000000000000000000 22 0000000000000 99 9 0 222222 9 9 6666666666666666 9 6666 6666 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 888 44 11 11 4 66 000000000000000000000 0 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 0 777 0 777 0 0000000000000000000000000 5 3 7 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTATAACTTTAGAAA-GAGACTGG-TNGATTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGAACAN-AAAATTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----CCNTGA-CCTT------TGACC--TTGAACAT--AAA-A-A--CTGGT-ATAACT-TTAGAAAG----AGAATTG-------A---GA--AA-T-CGCGNGATNTT--TGCAG--AAGGGTGATAAAGAGGATGACA-G-ACCTACAAACTTAAG--TCANGGTCNNCG-----AGTG-----ACCTTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTACT-TCAGAAC--CAGG--T-C-T-NGTAGACACGNGANNTCCNNGGATGNNGTGANNNNNNNNGNCNTGNNAAGTAGTATNC---CCACT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------A------NTAC-----T--T-----A-A-----A--------CC-------A-------------ATCTT--TAGA-G----TGATAGAAG---AAT-GCGACCT------------A-CA-A-----ANT--AGTAT------------ATCCA--GTGACCTTGAC------CTTTGACC-TT-GA--T--TNAT-AT----AA-CTT--G-TATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CANNNNNNNNCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTACTGAAGGAAAC-AGG---GG-ATTTT--T--TGGAAAT-TTTCAAAATCTTTGCGATATAGNGNTNCCAGGTNNACNTANGATTTTTTTTT-TGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GT-TT---CTAA---TTCTGATTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACAT-AAAA-CTG-GTATAACTTTAGAAA-GAGAATNG-TNGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGAANAG-AAAATTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----CCGTNG-CCTT------TGACC--TTGAACAT--AAA-A-A--CTGGT-ATAACT-TTAGAAAG----AGAATTG-------A---AA--AN-T-CNNGNGATGTT--TGCAG--AAGGGTGATAAAGAGGATAACA-G-ACCTATAAACTTAAG-GTCAAGGTCNNCG-----ANTN-----ACCTTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTACT-TCAGAAC--CAGG--T-C-T-CGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---CCACT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------A------NTAC-----T--T-----A-A-----A--------CC-------A-------------ATCNT--TAGA-G----TGATAGAAG---AAT-GCGACCT------------A-CA-A-----NGT--AGTAT------------ATCCA--GTGACCTTNAC------CTTTGACC-TT-GA--T--TNAT-AT----AA-CTT--G-TATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CNNNNNNNNNCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTACTGAAGGAAAC-AGG---GA-ATTTT--T--TGGAAAT-TTTCAAAATCTTTGCGATNAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTT-TGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GT-TT---CTNA---TTCTNATTT--------CG----CNTTGTATAAAATCTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCG-GTATAACTTTAGAAA-GAGGGTAG-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGAAAAG-AAAATTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNN-NCTT------TGACC--TTGAACAT--AAA-A-A--CTAGT-ACAACT-TTAGAAAG----AGAATTG-------N---NN--NN-N-NNNNNNNNNNN--NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-----NNNN-----NNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----A-AAA--GA---AA-A--T---GGTGTTACT-TCAGAAC--CAGT--T-C-T-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCACT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------A------ATAC-----T--T-----A-A-----A--------CT-------A-------------ATCTT--TAGATG----TGATAGAAG---AAT-GCAACCT------------A-TA-A-----TGT--AGTAT------------ATCTT--GTGATCTTCAC------CTTTGACC-TT-GA--T--TGAT-AT----AA-CTT--G-TATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTACGGAAAGAAAC-AGG---GA-ATTTT--TCCTGGAAAT-TCTCAAAATCTTTGCGATCAAGTGATACCAGGTTTATATATGATTTTT-TTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GT-TT---CTTA---TTCTGATTT--------CA----TTTTAT-TGGAAT-TCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : CTTGATATTTGACCTTG--------A-ATATTAA---AA-C--T---TATAT-ACCATTAGAAC--TAGAATTGN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC---CCACTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------A------TTAC-----T--TTTAAAG-A-----A--------CC-------A-------------GT--------A-C----TGATAG-AG---AAT-GTAACCT------------A-CA-GAGCATAGT--AATAT------------ATCCA--GTGG-------------TTTTGACC-GT-G---T--TTATAAT----AG-CTT--G-TATAACT----TTATAACTGGGAT----------a
gi|10 : TTTATCTTG-TGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgtggaaattctcaaaatatctgtgatttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTA------GTACAAGGAT--T-----G-ATAGAGA--------CTTTA----A-------------ATTTG--TACATG----TGATAAAAG---AAT-GTGAC---------------------------T--GATAT------------CTCTA--GTGACCTTGAC------CTATGACC-TT-GA--T--TG-T-AT----AA-ATT--T-TGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTACTTGAGGCAAC-AGG---GATATTTT--T--TGAAAAA-TTTCAAAGT
gi|11 : TTTTT-TGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--taaggtctttttgatcttgattctgtaaatgaatttaaaattggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggataT-GCGACCT------------A-CATA-----ACT--AGGAT------------CTCCA--CTGACTTTGAC------CT-TGATC-GTAGA----------------AA-ATT--G-TATTACTA---GTAGAACCAGt
gi|12 : aaagggatttACT----TTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------A------TTAC-----TAGT-----AGA-----A--------CC-------A-------------GTAAT--TA-----------TAGAAACAAAAT-----CTT------------T-TG-A-----TGT--GAT-T------------ATTGAATGTGACCT--ACAAAGGACTTTGACC-TT-GA--T--TAAG-AT----AA-CTT----TAAAACT------GGAACCGNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---G--TTTACTGAAGGAAAC-AGG---GA-AGGGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAAATCTTTGTGATTTAGtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaaggggggttggaaattttcaaaatctttgtgatttagaaattaaaattggcttagcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|12 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgT-TGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Gaaattaaaattggcttagcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaaggggggAC-----T--T-----G-A-----A-------------------------------ATCCT--TAGATG----TAATA-AAG---AAT-GCGACAT------------A-CA-A-----ACT--AGTAT------------CTTCA--ATGACCTTGAT------GTTTGACG-AT-GA--TGTTCAT-AA----AATCTT--G-TGTAACT----TTAGAACCGAGA---------------------CTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNAAGGAAAC-AAG---GG-AATCT--T--TGAAAAA-TTTCAATATC
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTT-TGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaT------TGACC--TTTAACAT--AAA-AAA--CTGGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGAACAT-AAAATTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTG
gi|17 : tt--CCTTGACCTCTGACTTTGGAATAC-AAAATTCTTATAACTTAAGAGCCAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaccttgacctctgactttggaatacaaaattcttataacttaagagccagcttagatagagagatgtgatgaatggataaaggg
gi|18 : ttacctttgaccttggaacataaaattgctattacttcagaaccaggcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTTTTTTT-TGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATcttagatagagagatgtgatgaatggataaaggg
gi|2 : tttaccaaatgagaaaaagg--TTGAACAG--ATA-A-A--TT----AAAACCATGACAAAT----AGAATAG-------A---AA--AAGT-CCAAGGCTCTT--TGGAAGCAAGGGT-------AGAATGACA-GTGCCTTCAAACT--AGTATCATGGTCAATG-----AATTCAGTGACCTTGACCACTGACCATG--A-----A-CTT--TA---AACC--T---GGTGCAACT-TTAGAAC--TGGG--A-C-T-atcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--TAGA-A----TGACAG--------T-GC---CT------------T-CA-A-----ACT--AGTATCATGGTCAATGAATTCA--GTGACCTTGAC------CACTGACC-AT-GAACT--TTA--------AA-CCT--GGTGCAACT----TTAGAACTGGGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTG-GTGCAACTTTAGAACTGGGACTGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTT-GAACAA-AAAACTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----CCTTGA-ACTT------TGACC--TTGATCGT--GAATA-G--CTGTT-ATGAC---TAGAACC----ATAACTG-------G---GA--AG-GACATGGAAT-TT--T-CAG--AA----GATCAA----ACGAC----ACCAAT-GACTTA-----------CCTC--------TG-----ACTTTGA------AC------G-----A-AC---------A-C--T---GGCATTAAT-TCAGAAC--CAGG--T-CTT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------G------TAAC-----TG-TA----A-A-----A--------CC-------A-------------Actgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGAACAT-AAAATTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNN-NCCT------TGACC--TC-----T--AAA-A-A--CTGAT-ATAACT-CTAGAATG----GTGATAG-------A---GA-------CGTGT----TC--TATAG--A--GATAA-AAAGAGGATgattg
gi|23 : GG---GG-ATTTT--A--AAGAAAT-TTTCAAAATATTTGCGATATAGgcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGT-TTA--CCAA---TTCTCTTTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCAaatttctagatgaacataaactattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAAAAAG-ACAATTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNCCTT------TGACC--TTGAACAT--ATA-A-A--TTGGT-ATAACT-TTTGGAAG----AGAATTG-------A---
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CT-TT---TTtagcaacattgaatcttcagaaatgataa
gi|28 : GAAACGAGC---GT-ATTTT--T--TGGAAAT-TTTTAAAAgcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTT-TGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAATTA-AAAA-CTGCAT-TAACTTTAGAAA-GAGAATGA-TTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGAAAAG-AAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA-CCTTGACTTTTGACC--TTGAACAT--AAA-A-A--CTGGT-ATCATG-TAGGAAAG----A-AATTG-------A---TA--CA-A-CATGGGATGTT--TGCAG--AAGGGTGATAAAGAGGATAACA-G-ACCTATAAACTTAAG-GTCAAGGTCAATGAATCCAGTG-----ACCTTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAA-AAA--GA---CA-A--T---CGTATTACT-TCAGAACGACAAGCTT-T-T-C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---CCACT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------A------ATAC-----T--T-----A-A-----G--------CCAATACTAA-------------ATCTT--TAGA-G----TGATAGAAG---AATCGTAAACT------------A-CA-A-----AAT--GATAT------------ATCC----TGA-CTTTAC------CTTTGACC-TT-GA--T--TAAT-AT----AA-CTT--G-TATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTT-CGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTTTAACTCTAGAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAGAAAAATAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATC--TTGCT---CTTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : CTTG-----TGACT--ACGAACAA--AAA-A-AAACTGGT-TTAGCT-TTAAAACT----TGGAATG-------A---GAGCAA---CATAAGAT-TC--TA-AG--A--GATGAT---GGGGATGACG-G------------TAAG------GGACTTC------AGTG-----GATTTTACCTTTGACCTTG--G-----A-ACA--TA---AA-AT-T---GCTATTACT-TCAGAAC--CAGG--gcatttgtaacaaaaca
gi|34 : tgaTTTACCTTTGACCTTGGAACAT-AAAATTGCTATTACTTCAGAACCAGGc
gi|35 : tgacttgtgactacgaacaaaaaaaaactggtttagctttaaaacttggaatgagagcaacataagattctaagagatgatggggatgacggtaagggacttcagtggatTGA-CCTT------TGAACATTTGA-CAT--A-A-A-A--CTCGT-ATCATT-T-----------AGAATCG-------G---AAACAG-T-GACATGAAATTAATTCAG--AA--GTGATAAA-AG--------G-ACCTACAAAC-TA-----CAA--TCTCC------AGTG-----ACCTTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AA-A--CTCAAATATTACT-TTAGc
gi|35 : c-----A-A-----A--------TT-------A-------------AT--T--CAGAAG----TGATAAAAG---------GACCT------------A-CA-A-----ACT--ACAAT------------CTCCA--GTGACCTTG-C------CTTTGACC-TT-GA-----TGAT-CTAAAAAA-CTCAAA-TATTACT----TTAG
gi|36 : ctgacctttgaacatttgacataaaactcgtatcatttagaatcggaaacagtgacatg----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CT-GT---TTAA---T
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GT-atacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCAT-AAAAATTG-GTATAACTTTA------ATACCGG---GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGAACAT-AAAATTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NCATTGACTTT------TGACC--TTGATCATGAAAA-A-A--TTCGTGAT-ATT-TTACAAaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------G------ATAT-----T--T-----T-A---------------C-------A-------------ACCAT----GA-C----CGATAGAAA---CAT-GGAACTT------------T-CA-ccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GT-TTTGCCTAA---TTTTGAgaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------A------TTAC-----TA-T-----AGA-----A--------CC-------A-------------GCACTGATAGA-GACAGTGATAAAAG---AAA-GTGACCT------------T-CA-A-----ACT--ACTAC------------ATCCA--GTGA-------------CTTTGACC-AT--A--T--TTATGAT----AA-CTT--G-TATataaata
gi|45 : --CCTTGACTTCTGGCCTTGGAACAG-AAAATTGGTACTTCTTCATAAACAGGTCTGta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgacaaagccaagtcactacagagaTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|49 : --TTTACTGAAGGAAACAAGG---GC-ATTTT--T--T----ATATTTCAAAAT
gi|5 : aacagtA--GTGACCTTGAT------ATTTGACC-TT-AA--A--CC-T-AA----AA-CTC--A-TATAAAG----TTAGAAtaaggatttatgattgcagattttttaaatgaacttataattg
gi|5 : TT------TGACC--TTAAACCT---AA-A-A--CTCAT-ATAAAG-TTAGAAAATTCTGGAATTG-------ATGGAA--A----CATGAGATCTT----CAG--GAATGT--TAAA-CGAATTATATG-ACCTA-----CTAA---TTATGATCCCC------ACTG-----GATTTGATCT-TCATC-------------ATA--GA---AA-G--T---TGCATTACA-TAAAAAC--TAGC--A-C-T-AGTAGATACATGAAATCTTCAGATGTGATAAAAGGTTATGACATGCAAAGTAGTATAT---CCA------TTGGCCTTCACCAT-AAAaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttactgaaagaaaaaagtttgtttttgtaaatattcaaaatctttgtgataaagaaattctaaagatattaaaattggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|5 : agtgaccttgataT----TTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------A------TTAC-----A--T-----A-A-----AAACTAGCACT-------AGTAGATACATGAAATCTT--CAGATG----TGATAAAAG---GTT-ATGACAT------------G-CA-A-----AGT--AGTAT------------ATCCA--TTGGCCTTCAC------CATAAACC-TT-GA--T--TG--------------T--G--ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTACTGAAAGAAAA-AAGTTTG----TTT--T--TGTAAAT-ATTCAAAATCTTTGTGATAAAGccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttactgaaagaaaaaagtttgtttttgtaaatattcaaaatctttgtgataaagaaattctaaagatattaaaattggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|5 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggaTTTGTTTT-TGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---T-TG---TTAA---CTTTGAATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATaaattctaaagatattaaaattggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttactgaaagaaaaaagTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : TGA-CCTC------TAACC--ATGAATAT--GAA-A-A--CTGGT-CTAACt
gi|6 : tCTTTACCTCTGACCTTGGAATAT-AAAATTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTTACCTCTGACCTTG--G-----A-ATA--TA---AA-A--TT--GGTATTACT-TCAGAAC--CAAG--T-C-T-TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------A------AAAC-----T--TTAG--A-A-----A--------Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAACGT--GAA-A-A--TTGGT-AAAACT-TTAGAAAC----AGGATTG-------N---NN--NN-N-NNNNNNNNNNN--NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-----N---------CCTTGACTTCTGATCTTG--G-----A-AAA--GAGAGAA-AATT---GGTATTAC--TAAGAAC--CAAG--T-C-T-GGTAGACATGGGATCTTCAGGAATGATGTGACTCCAGTGACCTTGAC-----------------CT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------------TAC-----T--G-----A-A---------------------------------------CTT--CAGA----------AAAGA---AAT-TCG---T------------ATCA-A-----GGTCAAGTGA------------CTCCA--GTGCCCTTGAT------ATTTGACCTTT-GA------AAT-AA----AG-CTC--A-T-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---Ttgatagagacatgggatcttcaga
gi|7 : CTT------TGACC--TTGAACAC--AAA-A-A--CTGAT-ATAACT-GTAGAAAG----AGAATTGNNNNNNNN---NN--NN-N-NNNNNNNNNNN--NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-----NNNN-----NCCTGGACCTCTGACCTTG--G-----A-AAA--GA---AA-AT-T---GGTA----T-TCAGAAC--
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaaTC------TGATC--ATGAACAT--AAA-A-A--CTGGT-A-------------------AAATTT-------A---AA--AC-T-AGGATANNNNN--NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN-----NNNN-----NNNTTGACCTCTGGTTTTG--G-----A-GCA--GA---AA-A--TTT-AGTATTACT-TCAGAAC--CAGG--T-C-
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcttgaca--GA---GA-T--T---GGTATTACT-TCAGAAC--CAGG--T-C-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NCACA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTAC-----T--TAA---A-A-----A--------CC-------A-------------AT--------A-G----TGATAGAGA---CAT-GAAATCTTAAGATTTGATAA-AA-A-----AAT--AGTGT------------ATCCA--GTTACTTTGAC------CTTTGAAC-TT-GG--T--T-ATAAT----AA-CAT--G-TATAATT----TTAGAAC
gi|9 : TACTGAAGGAA----TG---GG-ATTTT--T--TGGAAAT-TTTCAAAATCTTCACGATATAGAATTTTTAAATGAACTTAAGATTTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactgaaggaatgggattttttggaaattttcaaaatcttcacgatatagaatttttaaatgaacttaagatttgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
gi|9 : gagattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacactgatcttgattatagaaatttgtactacatgtacttaaaaaccaatagtgatagagacatgaaatcttaagatttgataaaaaaatagtgtatccagttactttgacctttgaacttggttataataacatgtataattttagaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTT-TGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|48 ): TCAAGGTCACGTGATACTACAGTAACCTAGCTTGACATTGGACCTAGATCATCTTCAGAACATGAACTGATAGAGACATTGGGGTATTC
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111111111111 1111111111111 11111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 11111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 8 8 9 88 8 999 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 4 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 3 33 0 33 2 2 2 33 2 0 2 5555555 44 3 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 0 11111111 2 1 777 333 999999999 1 2 2 33 777777 2 66666666 7777777 22 22 444444444444444444444444444444444444444444444444 5 3 1 2 3333333333 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 3 5 555 0 88888888888888 77777 2 4444 7777777777777 0 2 1 6666 33 99999999999999 33 777 7777 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 777 6666 66 4 44444 6 44 666 1 2 2 22 1 1 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . . .. . ... . ........................................................................ . . . .................................................................................... .. . .. . .. . . . .. . . . ....... .. . ............................................................................................................ . . ........ . . ... ... ......... . . . .. ...... . ........ ....... .. .. ................................................ . . . . .......... . ..................................................................................... . . . ... . .............. ..... . .... ............. . . . .... .. .............. .. ... .... . .................................................................................... . ... .... .. . ..... . .. ... . . . .. . . .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 0 0 0 66 0 000 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 1 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 00 1 44 3 44 5 5 5 44 4 5 5 2222222 66 6 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 1 66666666 4 0 222 999 000000000 6 1 1 11 333333 7 22222222 4444444 00 00 777777777777777777777777777777777777777777777777 7 1 4 3 5555555555 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 1 1 444 8 88888888888888 77777 1 5555 8888888888888 5 8 5 5555 66 99999999999999 88 555 1111 6 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 888 9999 11 4 33333 7 00 888 0 8 0 00 0 0 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTATAACTTTAGAAA-GAGAC-TGGTNGATTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACANAAAATTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAACAT--A-AA-A-A--CTGGT-ATAACT-TTAGAA--AN---AGG-ATTG--------A---GA--AA---CATGNGATCTTTGCAG--AAGGG-TGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTCTNCG-----A-----GTGACCTT-GACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-TGG------TAGA--NACGNGANNTCCNNGGATGNNA--TGAANNANNTNGACNTACNAACTANNATCC---C-CACT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--------CC-----------------A-------------A---TCTT--TAGA-G----TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-AT----AA-CTT--GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------NATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTACTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAAATC-----TTTGCGA-TNNAGAANTTCTAGATGAACNTATGATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTATAACTTTAGAAA-GAGAC-TGGTNGATTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACANAAAATTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-NTGA-CCTTTGACC--TTGAACAT--A-AA-A-A--CTGGT-ATAACT-TTAGAA--AG---AGA-ATTG--------A---GA--AA-T-CGCGNGATNTTTGCAG--AAGGG-TGATAAAGAGGATGACAG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTCNNCG-----A-----GTGACCTT-GACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-TNG------TAGA--CACGNGANNTCCNNGGATGNNG--TGANNNNNNNNGNCNTGNNAAGTAGTATNC---C-CACT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--------CC-----------------A-------------A---TCTT--TAGA-G----TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----ANT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-AT----AA-CTT--GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CANNNNNNNNCTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTACTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAAATC-----TTTGCGA-TATAGNGNTNCCAGGTNNACNTANGATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCG-GTATAACTTTAGAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAAGAAAATTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TTGAACAT--A-AA-A-A--CTAGT-ACAACT-TTAGAA--AG---AGA-ATTG--------N---NN--NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNNN-----N-----NNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----A-AAA--GA---AA-A--T---GGTGTTA-CT-TCAGAAC--CAG----T-TC-TCN------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTC-CACT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--------CT-----------------A-------------A---TCTT--TAGATG----TGATAGAAGAAT-GCAA---CCT------------A-TAA-----TGT--AGTAT------------ATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-AT----AA-CTT--GTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTACGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAAATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATACCAGGTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : CTT-GATATTTGACCTTG--------A-ATATTAA---AA-C--T---TATAT-A-CCATTAGAAC--TAGAATTG-NN-NNN------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-C---C-CACTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--------CC-----------------A-------------G---T--------A-C----TGATAG-AGAAT-GTAA---CCT------------A-CAGAGCATAGT--AATAT------------ATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAAT----AG-CTT--GTATAACT----TTATAACTGGGAT----------a
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgtggaaattctcaaaatatctgtgatttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--------CTTTA--------------A-------------A---TTTG--TACATG----TGATAAAAGAAT-GTGA---C--------------------------T--GATAT------------CTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-AT----AA-ATT--TTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTACTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--taaggtctttttgatcttgattctgtaaatgaatttaaaattggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggataAACTAGGATCT---C-CACTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--------CCAGTAATTATAGAAACAAA-------------A---TCTT--TTGATG----TGATTATTGAAT-GTGA---CCT------------A-CAA-----AG---------------------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-AT----AA-CTT---TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTACTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAAATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATt
gi|12 : aaagggattttgcgacctacatTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Gtaaaattggcttagcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GACATTA-CT-TTAAAAC--CAG----T-AT-TGA------TAGA--GACTTGAAATCCTTAGATGTAA--T-AAAGAATGCGACATACAAACTAGTATCT---T-CAA------TGACCTTGAT
gi|15 : cctTGAC-ATTACT-TTAAAA--CC---AGT-ATTG--------ATA-GA--GA---CTTGAAATCCTT--AG--A--TG-TAATAAAGA--ATG-C-G-ACATACAAACT--A-GT-------ATCTTCA-----A------TGACCTT-GATGTTTGACGATGATG-----T-TCA--TA---AA-ATCT---TGTGTAA-CT-TTAGAAC--Cgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A-----------------------------------------A---TCCT--TAGATG----TAATA-AAGAAT-GCGA---CAT------------A-CAA-----ACT--AGTAT------------CTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-AA----AATCTT--GTGTAACT----TTAGAACCGAGA---------------------CTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAATATC-----gagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TTTAACAT--A-AA-AAA--CTGGT-ATAACT-TTAAAA--atc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACATAAAATTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC-------CA---------------GAT----ACT-TTAGAG--AC---GGG-AT----------A---GN--NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNNG-----A---------CCTT-GACCTCTGACTTTG--G-----A-ATA--CA---AA-AT-T---CTTATAA-CT-TAAGAGC--CAG-------C-T--------TAGA--TA-GAGAGAT
gi|17 : tt-----------CC-TTGA-CCTCTGACT--TTGGA-AT--ACAA-A-A--TTCTT-ATAACT-TAAGAGCCAGCTTAG--ATAG--------A---GA--GA-T----GTGAT-------G--AATG---GATAAAGGGgtgatgaatggataaaggg
gi|18 : ttacctttgaccttggaacataaaattgctattacttcagaaccaggcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacccagatactttagagacgggatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATAT
gi|2 : tttaccaaatgagaaaaagg--TTGAACAG--A-TA-A-A--TT----AAAACCATGACAA--AT---AGA-ATAG--------A---AA--AAGT-CCAAGGCTCTTTGGAAGCAAGGG-T-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATG-----AATTCAGTGACCTT-GACCACTGACCATG--A-----A-CTT--TA---AACC--T---GGTGCAA-CT-TTAGAAC--TGG----G-AC-Tatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--------CC-----------------A-------------AGGCTCTT--TGGAAG----CAAGGGTAGAAT-GACAGTGCCT------------T-CAA-----ACT--AGTATCATGGTCAATGAATTCAGTGACCTTGAC----CACTGACC-ATGAACTTTA--------AA-CCTG-GTGCAACT----TTAGAACTGGGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTG-GTGCAACTTTAGAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTT-GA-ACAAAAAACTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TTGATCGT--G-AATA-G--CTGTT-ATGAC---TAGAA--CC---ATA-ACTG--------G---GA--AG-GACATGGAATTTT--CAG--AA-----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA-------------CCTC-------------TGACTTT-GA------AC------G-----A-AC---------A-C--T---GGCATTA-AT-TCAGAAC--CAG----G-TCTTNN------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N-NNNN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--------CC-----------------A-------------A---ctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACATAAAATTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC-----T--A-AA-A-A--CTGAT-ATAACT-CTAGAA--TG---GTG-ATAG--------A---GA---------CGTG--TTCTATAG--A--GA-TAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAAATA-----TTTGCGA-TATAGAATTTCTAGATGAACATAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCAaactattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAAGACAATTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TTGAACAT--A-TA-A-A--TTGGT-ATAACT-TTTGGA--AG---AGA-ATTGAT------A---GC--AA---CATTGAATCTT--CAG--AA--A-TGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAAAgcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCAT-TAACTTTAGAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-AAGAAATTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TTGAACAT--A-AA-A-A--CTGGT-ATCATG-TAGGAA--AG---A-A-ATTG--------A---TA--CA-A-CATGGGATGTTTGCAG--AAGGG-TGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCA-----GTGACCTT-GACC-CTGACCTTT--GTTGAAA-AAA--GA---CA-A--T---CGTATTA-CT-TCAGAACGACAA----GCTT-TTC------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---C-CACT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--------CCAATACTA----------A-------------A---TCTT--TAGA-G----TGATAGAAGAATCGTAA---ACT------------A-CAA-----AAT--GATAT------------ATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-AT----AA-CTT--GTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTTTAACTCTAGAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAGAAAAATAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--ACGAACAA--A-AA-A-AAACTGGT-TTAGCT-TTAAAA--CT---TGG-AATG--------A---GAGCAA---CATAAGATTCT-------AAGAGATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GACTTC------A-----GTGGATTT-TACCTTTGACCTTG--G-----A-ACA--TA---AA-AT-T---GCTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTTGA-CAT--A-AA-A----CTCGT-ATCA-T-TTAGAATCGG---AAACAGTG--------ACATGA--AA-T-----TAATT----CAG--AAG---TGATAAA-AGGA--------CCTACAAACT---------ACA-ATCTCC------A-----GTGACCTT-G-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AA-A--CTCAAATATTA-CT-TTAGc
gi|35 : c-----A-A-----A--------TT-----------------A-------------A---T--T--CAGAAG----TGATAAAAG------GA---CCT------------A-CAA-----ACT--ACAAT------------CTCCAGTGACCTTG-C----CTTTGACC-TTGA---TGAT-CTAAAAAA-CTCAAATATTACT----TTAG
gi|36 : ctgacctttgaacatttgacataaaactcgtatcatttagaatcggaaacagtgacatg----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTG-GTATAACTTTA------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACATAAAATTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TTGATCATGAA-AA-A-A--TTCGTGAT-ATT-TTACAA--aacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------------C-----------------A-------------A---CCAT----GA-C----CGATAGAAACAT-GGAA---CTT------------T-CAG-----AAT-------------------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT----T----AC-CTC--GGACAACT----TCAGCACCTGGccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--------CC-----------------A-------------G---CACTGATAGA-GACAGTGATAAAAGAAA-GTGA---CCT------------T-CAA-----ACT--ACTAC------------ATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGAT----AA-CTT--GTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----CTAC------A-----GAGACCTT-GACTTCTGGCCTTG--G-----A-ACA--GA---AA-AT-T---GGTACTT-CT-TCATAAA--CAG----G-TC-Tta
gi|45 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgA--CCTTGACTTCTGGCCTTGGA-ACAGAAAATTGGTACTTCTTCATAAACAGGTCTGg
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgacaaagccaagtcactacagagTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|49 : --TTTACTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAAATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTTTTAAATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagt-----A-----GTGACCTT-GATATTTGACCTTA--A-----A-CCT--AA---AA-C--T---CATATAA-AG-TTAGAA----AA----T-TC-TGGAATTGATGGAAACATGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACTAATTATGATCC---C-CACTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--T-----A-A-----AAACTAGCACT-----------------AGTAGATACATGAAA---TCTT--CAGATG----TGATAAAAGGTT-ATGA---CAT------------G-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG--------------T--G-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTACTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAAATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATTCTAg
gi|5 : TTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATaagatattaaaattggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttactgaaagaaaaaagTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : TT-GACCTCTAACCATG--------A-ATAT-GA---AA-AC-T---GGT-----CT-----AAC--NNN----N-NN-NNN------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTAC---C----T----CTGACCTTGG-AAT-ATAAAATTGGT----------ATTAC------T--TCA---G-A-----A--------CC-----------------A-------------AG--TCTT--t
gi|6 : TGA-CCTCTAACC--ATGAATAT--G-AA-A-A--CTGGT-CTAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : tCTTTACCTCTGACCTTGGA-ATATAAAATTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTT-TACCTCTGACCTTG--G-----A-ATA--TA---AA-A--TT--GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAA----G-TC-TTN------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N-NNNN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--------Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAACGT--G-AA-A-A--TTGGT-AAAACT-TTAGAA--AC---AGG-ATTG--------N---NN--NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNNN-----N-----N---CCTT-GACTTCTGATCTTG--G-----A-AAA--GAGAGAA-AATT---GGTATTA-C--TAAGAAC--CAA----G-TC-TGG------TAGA--CATGGGATCTTCAGGAATGATG--TGACTCCAGTGACCTTGAC------------------CT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A----------------------------------------------------CTT--CAGA----------AAAGAAAT-TCG------T------------ATCAA-----GGTCAAGTGA------------CTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-AA----AG-CTC--AT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGACTCC------A-----GTGCCCTT-GATATTTGACCTTT--G-----A-AAT--AA---AG-C--T-----CATTATCT-TTAAAAC--TGG----A-AT-TGA------TAGA--GACATGGGATCTTCAGAtgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : C-TTGA-ACTTTGACC--TTGAACAC--A-AA-A-A--CTGAT-ATAACT-GTAGAA--AG---AGA-ATTGNNNNNNNNN---NN--NN-N-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNNN-----N-----NNNNCCTG-GACCTCTGACCTTG--G-----A-AAA--GA---AA-AT-T---GGTA-----T-TCAGAAC--
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-TTGA-CATCTGATC--ATGAACAT--A-AA-A-A--CTGGT-A-AAAT-TTAAAA--CT---AGG-AT---------------------------ANNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNNNNNN-----N-----NNNNNNTT-GACCTCTGGTTTTG--G-----A-GCA--GA---AA-A--TTT-AGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GA-T--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-TGN------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNCACA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAA------CC-----------------A-------------A---T--------A-G----TGATAGAGACAT-GAAA---TCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGT------------ATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--T---T-AT----A---------ATAACA----T--------GTAT----------AATTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TACTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAAATC-----TTCACGA-TATAGAATTTTTAAATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|48 ): TCAAGGTCACGTGATACTACAGTAACCTAGCTTGACATTGGACCTAGATCATCTTCAGAACATGAACTGATAGAGACATTGGGGTATTC
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 11111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222 111111111111111111111111111 111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 22222222222222222222 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 6 6 8 111 6 33 777 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 4 1 4 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 2 55 2 1 33 2 66666 333 22 0 2 66 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 0 99999999 6666666 5555 888888888 0 2 2 33 6666666 2 77777777777 1 444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 3 0 0 4444444444 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 3 4 555 1 11111111111111 999999999999999999999999999 1 33 2 7777 44 99 555555 3 3 0 7777 1 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 4 777 6666 55 55 4 11111111111111111111 4 8 22 22 3 5 1 6 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . . ... . .. ... .......................................................................... . . . . .................................................................................... . . .. . . .. . ..... ... .. . . .. ......................................................................................................... .. . ........ ....... .... ......... . . . .. ....... . ........... . ... .............................................................. . . . . .......... . ..................................................................................... . . . ... . .............. ........................... . .. . .... .. .. ...... . . . .... . . ...................................................................................... . . ... .... .. .. . .................... . . .. .. . . . . .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 5 777 7 33 222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 1 0 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 9 33 2 4 11 2 55555 777 22 9 2 44 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44 7 88888888 3333333 0000 666666666 8 2 2 22 8888888 7 44444444444 0 222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 3 2 0 6666666666 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 3 2 888 8 22222222222222 222222222222222222222222222 2 33 5 1111 77 22 666666 3 3 5 7777 6 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 4 000 7777 55 55 0 66666666666666666666 4 9 00 33 1 7 0 6 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGGTNGATTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACANAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAACCGGGATTG---------A--GA--A--A---CATGGGATCTTT-CAG--AAGGG-TGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCC-AGTGACC--TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA----AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGANACGNGAGATC--CNNGGATGTNA--TGAATNATGTCGACCTACN-AACTAGGATCTC-C--ACT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--------CC-----------------A-------------A---TCTT--TAGATG----TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAAAG-----T--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTACTGAAGGA-AAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGG--AAAT-TTTCAAA------A------TC-----TTTGCGA-TNTAGAANTTCTAAAT-GAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTATAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGGTNGATTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACANAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAAANAGGATTG---------A--GA--A--A---CATGNGATCTTTGCAG--AAGGG-TGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TNCGAGTGACC--TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA----AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGANACGNGANNTC--CNNGGATGNNA--TGAANNANNTNGACNTACN-AACTANNATCCC-C--ACT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--------CC-----------------A-------------A---TCTT--TAGA-G----TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAAAG-----T--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------NATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTACTGAAGGA-AAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGG--AAAT-TTTCAAA------A------TC-----TTTGCGA-TNNAGAANTTCTAGAT-GAACNTATGATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCG-GTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAAGAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG---------N--NN--N--N---NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----A-AAA--GA----AA-A--T---GGTGTTA-CT-TCAGAAC--CAG----T-TC-TCNNNN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNTC-C--ACT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--------CT-----------------A-------------A---TCTT--TAGATG----TGATAGAAGAAT-GCAA---CCT------------A-TAATG-----T--AGTAT------------ATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTT-GTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTACGGAAAGA-AAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGG--AAAT-TCTCAAA------A------TC-----TTTGCGA-TCAAGTGATACCAGGT-TTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C--TTGATATTTGACCTTG--------A-ATATTAA----AA-C--T---TATAT-A-CCATTAGAAC--TAGAATTG-NN-N---NN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNTCCCACTAACC----TTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--------CC-----------------A-------------G---T--------A-C----TGATAGA-GAAT-GTAA---CCT------------A-CAGAGCATAGT--AATAT------------ATCCAGTGGT-----------TTTGACC-GTG---TTTAT-AATAG-CTT-GTATAACT----TTATAACTGGGAT----------a
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatcttgtggaaattctcaaaatatctgtgatttataatatctgaatgaactaaaaaactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--------CTTTA--------------A-------------A---TTTG--TACATG----TGATAAAAGAAT-GTGA---C--------------------------T--GATAT------------CTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATT-TTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTACTTGAGGC-AAC-AGG---G--ATATTTTT--TGA--AAAA-TTTCAAAGTTAAGG------TC-----TTTTTGA-TCTTGATTCTGTAAAT-GAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggataGACCTACATAACTAGGATCTC-C--ACTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--------CCAGTAATTATAGAAACAAA-------------A---TCTT--TTGATG----TGATTATTGAAT-GTGA---CCT------------A-CAAAG--------------------------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT--TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTACTGAAGGA-AAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGG--AAAT-TTTCAAA------A------TC-----TTTGTGA-TTTAGAAATTt
gi|12 : aaagggattttgcTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Gaaaattggcttagcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GACATTA-CT-TTAAAAC--CAG----T-AT-T---GA------TAGAGACTTGAAATC--CTTAGATGTAA--TAAAGAATG-CGACATACA-AACTAGTATCTT-C--AA------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG---------ATAGA--G--A---CTTGAAATCCTT--AG--A--TG-TAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAA-TGACC--TTGATGTTTGACGATGATG-----T-TCA--TA----AA-ATCT---TGTGTAA-CT-TTAGAAC--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A-----------------------------------------A---TCCT--TAGATG----TAATA-AAGAAT-GCGA---CAT------------A-CAAAC-----T--AGTAT------------CTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTT-GTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNAAGGA-AAC-AAG---G--G-AATCTT--TGA--AAAA-TTTCAAT------A------TCAAGA-TCTG-GATTTTTGAAATGC---AT-GAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TT-TAACAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACATAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT------------------A--G---NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNGACC--TTGACCTCTGACTTTG--G-----A-ATA--CA----AA-AT-T---CTTATAA-CT-TAAGAGC--CAG-------C-T-----------TAGATA-GAGA----------GATGTGA--TGAA
gi|18 : tt--TTTACCAAATGAGAAA-AAG---G--T-TTTTTT--TGGGTAAAT-TTTCTAA------ATCGAGGTC-----TTTGTGA-TGTAGATTTTCTAAATAGAAtggataaaggg
gi|18 : TTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATttaaaattggcataaatttgtgcaagggatttactgatgtgggggatggcgatacttttactcaaataaaacccaattttacagccagtactttgtaattggcagattataatcatatatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : tttaccaaatgagaaaaagg--TT-GAACAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG---------A--AA--A--AGTCCAAG-GCTCTTTGGAAGCAAGGG-T-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTC-AGTGACC--TTGACCACTGACCATG--A-----A-CTT--TA----AACC--T---GGTGCAA-CT-TTAGAAC--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--------CC-----------------A-------------AGGCTCTT--TGGAAG----CAAGGGTAGAAT-GACAGTGCCT------------T-CAAAC-----T--AGTATCATGGTCAATGAATTCAGTGACCTTGAC----CACTGACC-ATGAACTTTA-----AA-CCTGGTGCAACT----TTAGAACTGGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTG-GTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTT-GA-ACAAAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TT-GATCGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG---------G--GA--AGGA---CATGGAATTTT--CAG--AA-----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA-------------C------CTC---TGACT--TTGA------AC------G-----A-AC----------A-C--T---GGCATTA-AT-TCAGAAC--CAG----G-TCTT---NN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N--NNN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--------CC-----------------A-------------A---ctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACATAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-----------A--GA--G--A---CGTGT----TCTATAG--A--GA-TAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAG--AAAT-TTTCAAA------A------TA-----TTTGCGA-TATAGAATTTCTAGAT-GAACATAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCAaactattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAAGACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TT-GAACAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT-------A--GC--A--A---CATTGAATCTT--CAG--AA--A-TGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GA-AACGAGC---G--T-ATTTTT--TGG--AAAT-TTTTAAA------A------gcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCAT-TAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-AAGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG---------A--TAC-A--A---CATGGGATGTTTGCAG--AAGGG-TGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCC-AGTGACC--TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAA-AAA--GA----CA-A--T---CGTATTA-CT-TCAGAACGACAA----GCTT-T---TC------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNC-C--ACT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--------CCAATACTA----------A-------------A---TCTT--TAGA-G----TGATAGAAGAATCGTAA---ACT------------A-CAAAA-----T--GATAT------------ATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTT-GTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTG-GTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAGAAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--AC-GAACAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG---------A--GAGCA--A---CATAAGATTCT-------AAGAGATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTC-AGTGGAT--TTTACCTTTGACCTTG--G-----A-ACA--TA----AA-AT-T---GCTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTT-GA-CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC----------A--GT--G--A---CATGAAATTAATTCAG--AAG---TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCC-AGTGACC--TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA----AA-A--CTCAAATATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTG-GTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACATAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TT-GATCATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT-------A--GA--A--A---CATG-GAACTTT-CAG--AA--T-TGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------------C-----------------A-------------A---CCAT----GA-C----CGATAGAAACAT-GGAA---CTT------------T-CAGAA-----T-------------------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTC-GGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TT-GACCAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG---------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--------CC-----------------A-------------G---CACTGATAGA-GACAGTGATAAAAGAAA-GTGA---CCT------------T-CAAAC-----T--ACTAC------------ATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTT-GTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TAC-AGAGACC--TTGACTTCTGGCCTTG--G-----A-ACA--GA----AA-AT-T---GGTACTT-CT-TCATAAA--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|49 : --TTTACTGAAGGA-AAC-AAG---G--GCATTTTT--T------ATATTTCAAA------A------TTAAGGATTTATGATTGCAGATTTTTTAAAT-GAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC--TTGATATTTGACCTTA--A-----A-CCT--AA----AA-C--T---CATATAA-AG-TTAGAA----AA----T-TC-T---GGAATTGATGGAAACATGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTATGATCCC-C--ACTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--T-----A-A-----AAACTAGCACT-----------------AGTAGATACATGAAA---TCTT--CAGATG----TGATAAAAGGTT-ATGA---CAT------------G-CAAAG-----T--AGTAT------------ATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------T-G-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTACTGAAAGA-AAA-AAGTTTG------TTTT--TGT--AAAT-ATTCAAA------A------TC-----TTTGTGA-TAAAGAAATTCTAAAg
gi|5 : TTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATgatattaaaattggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttactgaaagaaaaaagTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--AT-GAATAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATATAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTTACCTCTGACCTTG--G-----A-ATA--TA----AA-A--TT--GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAA----G-TC-T---TN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN-N--NNN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--------Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TT-GAACGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG---------N--NN--N--N---NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNN--CC--TTGACTTCTGATCTTG--G-----A-AAA--GAGAGAAA-A--TT--GGTATTA-CT--AAGAAC--CAA----G-TC-T---GG------TAGACATGGGATCTT--CAGGAATGATG--TGACTCCAGT-GACCT--T-GAC--------------CT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A----------------------------------------------------CTT--CAGA----------AAAGAAAT-TCG------T------------ATCAAGG-----TCAAGTGA------------CTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTC-AT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCC-AGTGCCC--TTGATATTTGACCTTT--G-----A-AAT--AA----AG-C--T-----CATTATCT-TTAAAAC--TGG----A-AT-T---GA------TAGAGACATGGGATC--TTCAGAtgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-----------CC-TTGA-TATTTGACCT-TT-GAA-AT---AA-A--G--CT---CAT--TATCT-TTAAAACTGGAATTGAT-------A--GA--G--A---CATGGGATCTT--CAG--A
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgc-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : C-TTGA-ACTTTGACC--TT-GAACAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNCC--TGGACCTCTGACCTTG--G-----A-AAA--GA----AA-AT-T---GGTA-----T-TCAGAAC--
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTG-ATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACATAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--AT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT-----------------------------ANNNNNNNNNNN--NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNN--TTGACCTCTGGTTTTG--G-----A-GCA--GA----AA-A--TTT-AGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA----GA-T--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNC--ACA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAA------CC-----------------A-------------A---T--------A-G----TGATAGAGACAT-GAAA---TCTTAAGATTTGATAA-AAAAA-----T--AGTGT------------ATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CAT-GTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TACTGAAGGA-A----TG---G--G-ATTTTT--TGG--AAAT-TTTCAAA------A------TC-----TTCACGA-TATAGAATTTTTAAAT-GAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|48 ): TCAAGGTCACGTGATACTACAGTAACCTAGCTTGACATTGGACCTAGATCATCTTCAGAACATGAACTGATAGAGACATTGGGGTATTC
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 22222222222222222222222222222222 2222 1 1111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222222222222 1111111111111 111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 555 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 3 2 44 3 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 2 33 4 1 33 2 88888 333 22 0 2 555 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 0 99999999 6666666 444 999999999 0 2 2 33 6666666 2 22222222222222222222222222222222 1 666 1 99 777777 4 1 4 4 1111 3 3 0 0 4444444444 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 4 555 1 11111111111111 88888 2 44 0 8888888888888 1 44 2 7777 44 99 555555 3 3 0 7777 1 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 22 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. . . .. . ..... ... .. . . ... ......................................................................................................... .... . ........ ....... ... ......... . . . .. ....... . ................................ . ... . .. ...... . . . . .... . . . . .......... . ..................................................................... . . . ... . .............. ..... . .. . ............. . .. . .... .. .. ...... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . .. . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 999 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 6 8 66 6 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 9 11 4 4 11 2 44444 777 22 9 2 111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333 7 88888888 3333333 111 444444444 8 2 2 22 8888888 7 00000000000000000000000000000000 0 444 0 77 555555 0 4 0 0 2222 1 3 2 0 6666666666 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 3 2 888 8 22222222222222 33333 3 66 2 1111111111111 2 11 5 1111 77 22 666666 3 3 5 7777 6 2 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 33 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAACCGGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGGATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGANACATGAGATC--CTNAGATGTNA--NGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTTCTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGGTNGATTNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAACCGGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGGATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGANACGNGAGATC--CNNGGATGTNA--TGAATNATGTCGACCTACN-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAANTTCTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----A-AAA--GA---AA-A--T---GGTGTTA-CT-TCAGAAC--CAG----T-TC-TCNNNN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAA---CCT------------A-TAA-----TGT--AGTAT------------ATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTT-GTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATACCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------A-ATATTAA---AA-C--T---TATAT-A-CCATTAGAAC--TAGAATTG-NN-N---NN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-CTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AG---T--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAA---CCT------------A-CAGAGCATAGT--AATAT------------ATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTT-GTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATATCTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AA---TTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGA---C--------------------------T--GATAT------------CTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATT-TTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCTGTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggataCGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-CTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AA---TCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGA---CCT------------A-CAA-----AG---------------------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT--TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATTA-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aaagggattttgTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GACATTA-CT-TTAAAAC--CAG----T-AT-T---GA------TAGAGACTTGAAATC--CTTAGATGTAA--TAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----T-TCA--TA---AA-ATCT---TGTGTAA-CT-TTAGAAC--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------A---TCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGA---CAT------------A-CAA-----ACT--AGTAT------------CTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTT-GTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTTTGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TT-TAACAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----A-ATA--CA---AA-AT-T---CTTATAA-CT-TAAGAGC--CAG-------C-T-----------TAGATA---GAGA--------GATGTGA--TGAAT
gi|18 : ttCCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATggataaaggg
gi|2 : ttta--TT-GAACAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCA-AGGCTCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCATG--A-----A-CTT--TA---AACC--T---GGTGCAA-CT-TTAGAAC--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--CC-------------------AAGGCTCTT--TGGAA---G--CAAGGGTAGAAT-GACAGTGCCT------------T-CAA-----ACT--AGTATCATGGTCAATGAATTCAGTGACCTTGAC----CACTGACC-ATGAACTTTA-----AA-CCTGGTGCAACT----TTAGAACTGGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TT-GATCGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----A-AC---------A-C--T---GGCATTA-AT-TCAGAAC--CAG----G-TCTT---NN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AA---ctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTTCTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TT-GAACAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAA-AAA--GA---CA-A--T---CGTATTA-CT-TCAGAACGACAA----GCTT-T---TC------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-CT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AA---TCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAA---ACT------------A-CAA-----AAT--GATAT------------ATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTT-GTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--AC-GAACAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----A-ACA--TA---AA-AT-T---GCTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTT-GA-CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AA-A--CTCAAATATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TT-GATCATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AA---CC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAA---CTT------------T-CAG-----AAT-------------------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTC-GGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TT-GACCAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AG---CACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGA---CCT------------T-CAA-----ACT--ACTAC------------ATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTT-GTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----A-ACA--GA---AA-AT-T---GGTACTT-CT-TCATAAA--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|49 : --TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTTTTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----A-CCT--AA---AA-C--T---CATATAA-AG-TTAGAA----AA----T-TC-T---GGAATTGATGGAAACATGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAA---TCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGA---CAT------------G-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------T-G-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATTCTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : CTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--AT-GAATAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----A-ATA--TA---AA-A--TT--GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAA----G-TC-T---TN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TT-GAACGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----A-AAA--GAGAGAA-AATT---GGTATTA-C--TAAGAAC--CAA----G-TC-T---GG------TAGACA--TGGGATC--T-------TCA--GGAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACCT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A-----------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG------T------------ATCAA-----GGTCAAGTGA------------CTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTC-AT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----A-AAT--AA---AG-C--T-----CATTATCT-TTAAAAC--TGG----A-AT-T---GA------TAGAGACATGGGATC--TTCAGAtgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-----------CC-TTGA-TATTTGACC--TTTGAA-AT--AAA-G-----CT---CAT--TATCT-TTAAAACTGGAATTG-----------ATAGA--G--A---CATGGGATC---TT-C--AG-A
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgc-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TT-GAACAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----A-AAA--GA---AA-AT-T---GGTA-----T-TCAGAAC--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--AT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----A-GCA--GA---AA-A--TTT-AGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GA-T--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GN------NNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-CA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AA---T--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAA---TCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGT------------ATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CAT-GTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTTTTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|48 ): TCAAGGTCACGTGATACTACAGTAACCTAGCTTGACATTGGACCTAGATCATCTTCAGAACATGAACTGATAGAGACATTGGGGTATTC
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111 11111111111 11111111111 11 222222222 1 1111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222222222222 1111111111111 111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 2 44 3 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 33 2 2 33 2 66666 333 2 1 2 666 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 0 99999999 6666666 444 999999999 0 2 2 33 6666666 2 77777777777 33 11 0 333 22222222222 1 33 777777 4 1 4 4 000000000 3 3 0 0 4444444444 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 4 555 1 11111111111111 88888 2 44 0 8888888888888 1 44 2 7777 44 99 555555 3 3 0 7777 1 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 1 7 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. . . .. . ..... ... . . . ... ......................................................................................................... .... . ........ ....... ... ......... . . . .. ....... . ........... .. .. . ... ........... . .. ...... . . . . ......... . . . . .......... . ..................................................................... . . . ... . .............. ..... . .. . ............. . .. . .... .. .. ...... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . . . . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 444 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 6 8 66 6 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 22 4 1 22 4 55555 999 2 4 4 333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 7 88888888 3333333 111 444444444 8 2 2 22 8888888 7 44444444444 22 55 9 555 66666666666 0 44 111111 0 4 0 0 222222222 1 3 2 0 6666666666 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 3 2 888 8 22222222222222 33333 3 66 2 1111111111111 2 11 5 1111 77 22 666666 3 3 5 7777 6 2 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 3 3 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGAGACATGAGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-C----T----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAACCGGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGGATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-ANA--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGANACATGAGATCCTNAG--ATGT--NANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-C----T----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----A-AAA--GA---AA-A--T---GGTGTTA-CT-TCAGAAC--CAG----T-TC-TCNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-C----T----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAA---CCT------------A-TAA-----TGT--AGTAT------------ATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTT-GTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATA-CCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------A-ATATTAA---AA-C--T---TATAT-A-CCATTAGAAC--TAGAATTG-NN-N---NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-C----TAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AG---T--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAA---CCT------------A-CAGAGCATAGT--AATAT------------ATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTT-GTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATAT-CTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----T----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AA---TTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGA---C--------------------------T--GATAT------------CTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATT-TTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCT-GTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggataAGGGATTTTG-CGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-C----TGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AA---TCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGA---CCT------------A-CAA-----AG---------------------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT--TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATT-A-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aaTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GACATTA-CT-TTAAAAC--CAG----T-AT-T---GA------TAGAGACTTGAAATCCTTAG--ATGT--AATAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A----------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----T-TCA--TA---AA-ATCT---TGTGTAA-CT-TTAGAAC--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------A---TCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGA---CAT------------A-CAA-----ACT--AGTAT------------CTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTT-GTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTT-TGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TT-TAACAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----A-ATA--CA---AA-AT-T---CTTATAA-CT-TAAGAGC--CAG-------C-T-----------TAGATA---GAG------AG--ATGT--GATGAAT
gi|18 : ttTTTACCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATggataaaggg
gi|2 : --TT-GAACAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCA-AGGCTCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCATG--A-----A-CTT--TA---AACC--T---GGTGCAA-CT-TTAGAAC--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--CC-------------------AAGGCTCTT--TGGAA---G--CAAGGGTAGAAT-GACAGTGCCT------------T-CAA-----ACT--AGTATCATGGTCAATGAATTCAGTGACCTTGAC----CACTGACC-ATGAACTTTA-----AA-CCTGGTGCAACT----TTAGAACTGGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TT-GATCGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----A-AC---------A-C--T---GGCATTA-AT-TCAGAAC--CAG----G-TCTT---NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-N----N----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AA---ctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTT-CTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TT-GAACAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAA-AAA--GA---CA-A--T---CGTATTA-CT-TCAGAACGACAA----GCTT-T---TC------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-C----T----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AA---TCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAA---ACT------------A-CAA-----AAT--GATAT------------ATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTT-GTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--AC-GAACAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----A-ACA--TA---AA-AT-T---GCTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTT-GA-CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AA-A--CTCAAATATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TT-GATCATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc----T----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AA---CC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAA---CTT------------T-CAG-----AAT-------------------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTC-GGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TT-GACCAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AG---CACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGA---CCT------------T-CAA-----ACT--ACTAC------------ATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTT-GTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----A-ACA--GA---AA-AT-T---GGTACTT-CT-TCATAAA--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|49 : --TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTT-TTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----A-CCT--AA---AA-C--T---CATATAA-AG-TTAGAA----AA----T-TC-T---GGAATTGATGGAAACATGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGAT----TTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAA---TCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGA---CAT------------G-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------T-G-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATT-CTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : TTTACTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--AT-GAATAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----A-ATA--TA---AA-A--TT--GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAA----G-TC-T---TN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-N----N----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TT-GAACGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----A-AAA--GAGAGAA-AATT---GGTATTA-C--TAAGAAC--CAA----G-TC-T---GG------TAG--ACATGGGATCTTCAG-----------GAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACC----T----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A-----------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG------T------------ATCAA-----GGTCAAGTGA------------CTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTC-AT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----A-AAT--AA---AG-C--T-----CATTATCT-TTAAAAC--TGG----A-AT-T---GA------TAGAGACATGGGATCTTCAG--Atgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TT-GAACAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----A-AAA--GA---AA-AT-T---GGTA-----T-TCAGAAC--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--AT-GAACAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----A-GCA--GA---AA-A--TTT-AGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GA-T--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-C----A----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AA---T--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAA---TCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGT------------ATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CAT-GTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTT-TTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
26 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|48 ): TCAAGGTCACGTGATACTACAGTAACCTAGCTTGACATTGGACCTAGATCATCTTCAGAACATGAACTGATAGAGACATTGGGGTATTC
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 11111111111 111111111111111111111 2222 1 1111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222222222222 1111111111111 111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 2 44 3 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 33 33 33 2 66666 333 2 1 2 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 5555 3 99999999999999999 333 999999999 1 2 2 33 555555 2 11111111111 1 3 1 777777777777777777777 777777 4 1 4 4 1111 3 3 0 0 4444444444 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 4 555 1 11111111111111 88888 2 44 0 8888888888888 1 44 2 7777 44 99 555555 3 3 0 7777 1 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 1 7 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. .. .. . ..... ... . . . .. ......................................................................................................... . .... . ................. ... ......... . . . .. ...... . ........... . . . ..................... ...... . . . . .... . . . . .......... . ..................................................................... . . . ... . .............. ..... . .. . ............. . .. . .... .. .. ...... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . . . . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 444 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 6 8 66 6 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 22 55 22 4 55555 999 2 4 4 88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 0000 0 44444444444444444 999 555555555 6 1 1 11 111111 5 88888888888 3 3 9 222222222222222222222 111111 0 4 0 0 2222 1 3 2 0 6666666666 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 3 2 888 8 22222222222222 33333 3 66 2 1111111111111 2 11 5 1111 77 22 666666 3 3 5 7777 6 2 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 3 3 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-AC-A--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GA------TAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----A-AN-A--GA---AA-A--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GG------TAGAGACA-TGAGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----A-AA-A--GA---AA-A--T---GGTGTTA-CT-TCAGAAC--CAG----T-TC-TCNNNN------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAA---CCT------------A-TAA-----TGT--AGTAT------------ATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTT-GTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATA-CCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------A-AT-ATTAA---AA-C--T---TATAT-A-CCATTAGAAC--TAGAATTG-NN-N---NN------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-CTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AG---T--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAA---CCT------------A-CAGAGCATAGT--AATAT------------ATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTT-GTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATAT-CTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AA---TTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGA---C--------------------------T--GATAT------------CTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATT-TTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCT-GTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggata--AAGGGATTTTG-CGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-CTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AA---TCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGA---CCT------------A-CAA-----AG---------------------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT--TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATT-A-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GACATTA-CT-TTAAAAC--CAG----T-AT-T---GA------TAGAGACT-TGAAATCCTTAG--ATGT--AATAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----T-TC-A--TA---AA-ATCT---TGTGTAA-CT-TTAGAAC--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------A---TCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGA---CAT------------A-CAA-----ACT--AGTAT------------CTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTT-GTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTT-TGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TTTAA-CAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----A-AT-A--CA---AA-AT-T---CTTATAA-CT-TAAGAGC--CAG----C-TT-A---GA------TAGAGAGA-TGTGAT
gi|18 : ttTTTACCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATgaatggataaaggg
gi|2 : --TTGAA-CAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCAAGGC-TCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCATG--A-----A-CT-T--TA---AACC--T---GGTGCAA-CT-TTAGAAC--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--CC-------------------AAGGCTCTT--TGGAA---G--CAAGGGTAGAAT-GACAGTGCCT------------T-CAA-----ACT--AGTATCATGGTCAATGAATTCAGTGACCTTGAC----CACTGACC-ATGAACTTTA-----AA-CCTGGTGCAACT----TTAGAACTGGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAT-CGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----A-AC----------A-C--T---GGCATTA-AT-TCAGAAC--CAG----G-TCTT---NN------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AA---ctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTT-CTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TTGAA-CAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAA-AA-A--GA---CA-A--T---CGTATTA-CT-TCAGAACGACAA----GCTT-T---TC------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-CT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AA---TCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAA---ACT------------A-CAA-----AAT--GATAT------------ATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTT-GTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--ACGAA-CAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----A-AC-A--TA---AA-AT-T---GCTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTTGA--CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCT-A--AA---AA-A--CTCAAATATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TTGAT-CATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AA---CC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAA---CTT------------T-CAG-----AAT-------------------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTC-GGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TTGAC-CAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AG---CACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGA---CCT------------T-CAA-----ACT--ACTAC------------ATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTT-GTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----A-AC-A--GA---AA-AT-T---GGTACTT-CT-TCATAAA--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|48 : C------TACAGTAACC----T--AGCT-TGACATTG--G-----A-CCTA--GA---TC-A--T-----------CT-TCAGAAC--ATG----A-AC-T---GA------TAGAGACATTGGGGTATTC
gi|49 : tcaaggtcacgtgata--TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTT-TTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----A-CC-T--AA---AA-C--T---CATATAA-AG-TTAGAA----AA----T-TC-T---GGAATTGATGGAAACA-TGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAA---TCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGA---CAT------------G-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------T-G-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATT-CTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : TTTACTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--ATGAA-TAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----A-AT-A--TA---AA-A--TT--GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAA----G-TC-T---TN------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAA-CGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----A-AA-A--GAGAGAA-AATT---GGTATTA-C--TAAGAAC--CAA----G-TC-T---GG------T--AGACA-TGGGATCTTCAG-----------GAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACCT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A-----------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG------T------------ATCAA-----GGTCAAGTGA------------CTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTC-AT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----A-AA-T--AA---AG-C--T-----CATTATCT-TTAAAAC--TGG----A-AT-T---GA------TAGAGACA-TGGGATCTTCAG--Atgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAA-CAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----A-AA-A--GA---AA-AT-T---GGTA-----T-TCAGAAC--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--ATGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----A-GC-A--GA---AA-A--TTT-AGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GA-T--T---GGTATTA-CT-TCAGAAC--CAG----G-TC-T---GN------NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-CA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AA---T--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAA---TCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGT------------ATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CAT-GTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTT-TTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
25 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 111111111111111111111 2222 1 1111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222222222222 1111111111111 111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 2 44 3 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 33 33 33 2 66666 333 2 1 2 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 5555 3 77777777 888888 333 9999999 2 1 2 2 4444 33 6666666 2 444 1 3 0 777777777777777777777 777777 4 1 4 4 1111 3 3 0 0 4444444444 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 4 555 1 11111111111111 88888 2 44 0 8888888888888 1 44 2 7777 44 99 555555 3 3 0 7777 1 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 1 7 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. .. .. . ..... ... . . . .. ......................................................................................................... . .... . ........ ...... ... ....... . . . . .... .. ....... . ... . . . ..................... ...... . . . . .... . . . . .......... . ..................................................................... . . . ... . .............. ..... . .. . ............. . .. . .... .. .. ...... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . . . . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 444 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 6 8 66 6 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 22 55 22 4 55555 999 2 4 4 88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 0000 0 77777777 777777 999 7777777 1 6 1 1 7777 11 0000000 5 777 3 3 2 222222222222222222222 111111 0 4 0 0 2222 1 3 2 0 6666666666 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 8 3 2 888 8 22222222222222 33333 3 66 2 1111111111111 2 11 5 1111 77 22 666666 3 3 5 7777 6 2 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 3 3 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGA---CCT------------A-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTT-GTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----AAA-A--GA---AAA--T---GGT-GTTA-CT-TCAGAA----C--CAG----T-TC-TCNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AA---TCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAA---CCT------------A-TAA-----TGT--AGTAT------------ATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTT-GTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATA-CCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------AAT-ATTAA---AAC--T---TAT-AT-A-CCATTAGAA----C--TAGAATTG-NN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-CTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AG---T--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAA---CCT------------A-CAGAGCATAGT--AATAT------------ATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTT-GTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATAT-CTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AA---TTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGA---C--------------------------T--GATAT------------CTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATT-TTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCT-GTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggata--AAGGGATTTTG-CGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-CTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AA---TCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGA---CCT------------A-CAA-----AG---------------------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT--TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATT-A-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GAC-ATTA-CT-TTAAAA----C--CAG----T-AT-T---GATAGAGACT-TGAAATCCTTAG--ATGT--AATAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----TTC-A--TA---AAATCT---TGT-GTAA-CT-TTAGAA----C--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------A---TCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGA---CAT------------A-CAA-----ACT--AGTAT------------CTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTT-GTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTT-TGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TTTAA-CAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----AAT-A--CA---AAAT-T---CTT-ATAA-CT-TAAGAG----C--CAG----C-TT-A---GATAGAGAGA-TGTGAT
gi|18 : ttTTTACCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATgaatggataaaggg
gi|2 : --TTGAA-CAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCAAGGC-TCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCAT---G-----AAC-T--TT---AAACCT---GGT-GCAA-CT-TTAGAA----C--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaat--CC-------------------AAGGCTCTT--TGGAA---G--CAAGGGTAGAAT-GACAGTGCCT------------T-CAA-----ACT--AGTATCATGGTCAATGAATTCAGTGACCTTGAC----CACTGACC-ATGAACTTTA-----AA-CCTGGTGCAACT----TTAGAACTGGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAT-CGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----AAC----------AC--T---GGC-ATTA-AT-TCAGAA----C--CAG----G-TCTT---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AA---ctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTT-CTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TTGAA-CAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAAAA-A--GA---CAA--T---CGT-ATTA-CT-TCAGAA----CGACAA----GCTT-T---TCNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-CT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AA---TCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAA---ACT------------A-CAA-----AAT--GATAT------------ATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTT-GTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--ACGAA-CAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----AAC-A--TA---AAAT-T---GCT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTTGA--CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AAA--CTCAAAT-ATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TTGAT-CATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AA---CC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAA---CTT------------T-CAG-----AAT-------------------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTC-GGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TTGAC-CAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AG---CACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGA---CCT------------T-CAA-----ACT--ACTAC------------ATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTT-GTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----AAC-A--GA---AAAT-T---GGT-ACTT-CT-TCATAA----A--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|48 : C------TACAGTAACC----T--AGCT-TGACATTG--G-----ACCTA--GA---TCA--T------------CT-TCAGAA----C--ATG----A-AC-T---GATAGAGACATTGGGGTATTC
gi|49 : tcaaggtcacgtgata--TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTT-TTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----ACC-T--AA---AAC--T---CAT-ATAA-AG-TTAGAAAATTC--TGG----A-AT-T---GATGGAAACA-TGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAA---TCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGA---CAT------------G-CAA-----AGT--AGTAT------------ATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------T-G-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATT-CTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : TTTACTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--ATGAA-TAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----AAT-A--TA---AAA--TT--GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAA----G-TC-T---TNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAA-CGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----AAA-A--GAGAGAAAATT---GGT-ATTA-C--TAAGAA----C--CAA----G-TC-T---GGT--AGACA-TGGGATCTTCAG-----------GAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACCT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A-----------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG------T------------ATCAA-----GGTCAAGTGA------------CTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTC-AT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----AA--A--TA---AA-------GCTCATTATCT-TTAAAA----C--TGG----A-AT-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--Atgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAA-CAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----AAA-A--GA---AAAT-T---GGT-A-----T-TCAGAA----C--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--ATGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----AGC-A--GA---AAA--TTT-AGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GAT--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-T---GNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-CA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AA---T--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAA---TCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGT------------ATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CAT-GTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTT-TTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
25 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 111111111111111111111 2222 1 1111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222 1111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 2 44 3 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 33 33 33 2 66666 333 2 1 2 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 5555 3 77777777 888888 333 00 6666 2 1 2 2 4444 33 2 6666666 2 444 1 3 0 777777777777777777777 777777 4 1 4 4 1111 3 3 0 0 4444444444 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 3 3 2 11111111111111 999999999999 1 22 66 3 7777 3 55 3333 3 3 1 8888 1 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 1 7 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. .. .. . ..... ... . . . .. ......................................................................................................... . .... . ........ ...... ... .. .... . . . . .... .. . ....... . ... . . . ..................... ...... . . . . .... . . . . .......... . .................................................................. . . . . .............. ............ . .. .. . .... . .. .... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . . . . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 444 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 6 8 66 6 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 22 55 22 4 55555 999 2 4 4 88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 0000 0 77777777 777777 999 00 7777 1 6 1 1 7777 11 8 0000000 5 777 3 3 2 222222222222222222222 111111 0 4 0 0 2222 1 3 2 0 6666666666 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 6 3 8 55555555555555 222222222222 9 77 33 6 7777 6 00 7777 6 6 6 5555 1 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 3 3 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----AAA-A--GA---AAA--T---GGT-GTTA-CT-TCAGAA----C--CAG----T-TC-TCNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAACCT------------A-TAA-----TGT--AGTATATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTTGTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATA-CCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------AAT-ATTAA---AAC--T---TAT-AT-A-CCATTAGAA----C--TAGAATTG-NN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-CTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AGT--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAACCT------------A-CAGAGCATAGT--AATATATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTTGTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATAT-CTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AATTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGAC--------------------------T--GATATCTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATTTTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCT-GTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggata--AAGGGATTTTG-CGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-CTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AATCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGACCT------------A-CAA-----AG---------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT-TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATT-A-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GAC-ATTA-CT-TTAAAA----C--CAG----T-AT-T---GATAGAGACT-TGAAATCCTTAG--ATGT--AATAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----TTC-A--TA---AAATCT---TGT-GTAA-CT-TTAGAA----C--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------ATCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGACAT------------A-CAA-----ACT--AGTATCTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTTGTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTT-TGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TTTAA-CAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----AAT-A--CA---AAAT-T---CTT-ATAA-CT-TAAGAG----C--CAG----C-TT-A---GATAGAGAGA-TGTGAT
gi|18 : ttTTTACCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATgaatggataaaggg
gi|2 : --TTGAA-CAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCAAGGC-TCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCAT---G-----AAC-T--TT---AAACCT---GGT-GCAA-CT-TTAGAA----C--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAT-CGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----AAC----------AC--T---GGC-ATTA-AT-TCAGAA----C--CAG----G-TCTT---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTT-CTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TTGAA-CAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAAAA-A--GA---CAA--T---CGT-ATTA-CT-TCAGAA----CGACAA----GCTT-T---TCNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-CT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AATCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAAACT------------A-CAA-----AAT--GATATATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTTGTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--ACGAA-CAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----AAC-A--TA---AAAT-T---GCT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTTGA--CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AAA--CTCAAAT-ATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TTGAT-CATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AACC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAACTT------------T-CAG-----AAT-------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTCGGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TTGAC-CAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AGCACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGACCT------------T-CAA-----ACT--ACTACATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTTGTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----AAC-A--GA---AAAT-T---GGT-ACTT-CT-TCATAA----A--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|48 : C------TACAGTAACC----T--AGCT-TGACATTG--G-----ACCTA--GA---TCA--T------------CT-TCAGAA----C--ATG----A-AC-T---GATAGAGACATTGGGGTATTC
gi|49 : tcaaggtcacgtgata--TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTT-TTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----ACC-T--AA---AAC--T---CAT-ATAA-AG-TTAGAAAATTC--TGG----A-AT-T---GATGGAAACA-TGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAATCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGACAT------------G-CAA-----AGT--AGTATATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------TG-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATT-CTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : TTTACTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--ATGAA-TAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----AAT-A--TA---AAA--TT--GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAA----G-TC-T---TNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAA-CGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----AAA-A--GAGAGAAAATT---GGT-ATTA-C--TAAGAA----C--CAA----G-TC-T---GGT--AGACA-TGGGATCTTCAG-----------GAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACCT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A--------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG---T------------ATCAA-----GGTCAAGTGACTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTCAT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----AA--A--TA---AA-------GCTCATTATCT-TTAAAA----C--TGG----A-AT-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--Atgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAA-CAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----AAA-A--GA---AAAT-T---GGT-A-----T-TCAGAA----C--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--ATGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----AGC-A--GA---AAATTT---AGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GAT--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-T---GNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-CA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AAT--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAATCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGTATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CATGTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTT-TTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
25 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 111111111111111111111 2222 1 1111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222 1111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 2 44 3 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 33 33 33 2 66666 333 2 1 2 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 5555 3 77777777 888888 333 00 6666 2 1 2 2 4444 33 2 6666666 2 444 1 3 0 777777777777777777777 777777 4 1 4 4 1111 3 3 0 0 4444444444 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 3 3 2 11111111111111 999999999999 1 22 66 3 7777 3 55 3333 3 3 1 8888 1 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 1 7 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. .. .. . ..... ... . . . .. ......................................................................................................... . .... . ........ ...... ... .. .... . . . . .... .. . ....... . ... . . . ..................... ...... . . . . .... . . . . .......... . .................................................................. . . . . .............. ............ . .. .. . .... . .. .... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . . . . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 444 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 6 8 66 6 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 22 55 22 4 55555 999 2 4 4 88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 0000 0 77777777 777777 999 00 7777 1 6 1 1 7777 11 8 0000000 5 777 3 3 2 222222222222222222222 111111 0 4 0 0 2222 1 3 2 0 6666666666 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 6 3 8 55555555555555 222222222222 9 77 33 6 7777 6 00 7777 6 6 6 5555 1 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 3 3 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----AAA-A--GA---AAA--T---GGT-GTTA-CT-TCAGAA----C--CAG----T-TC-TCNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAACCT------------A-TAA-----TGT--AGTATATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTTGTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATA-CCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------AAT-ATTAA---AAC--T---TAT-AT-A-CCATTAGAA----C--TAGAATTG-NN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-CTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AGT--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAACCT------------A-CAGAGCATAGT--AATATATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTTGTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATAT-CTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AATTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGAC--------------------------T--GATATCTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATTTTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCT-GTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggata--AAGGGATTTTG-CGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-CTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AATCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGACCT------------A-CAA-----AG---------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT-TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATT-A-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GAC-ATTA-CT-TTAAAA----C--CAG----T-AT-T---GATAGAGACT-TGAAATCCTTAG--ATGT--AATAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----TTC-A--TA---AAATCT---TGT-GTAA-CT-TTAGAA----C--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------ATCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGACAT------------A-CAA-----ACT--AGTATCTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTTGTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTT-TGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TTTAA-CAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----AAT-A--CA---AAAT-T---CTT-ATAA-CT-TAAGAG----C--CAG----C-TT-A---GATAGAGAGA-TGTGAT
gi|18 : ttTTTACCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATgaatggataaaggg
gi|2 : --TTGAA-CAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCAAGGC-TCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCAT---G-----AAC-T--TT---AAACCT---GGT-GCAA-CT-TTAGAA----C--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAT-CGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----AAC----------AC--T---GGC-ATTA-AT-TCAGAA----C--CAG----G-TCTT---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTT-CTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TTGAA-CAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAAAA-A--GA---CAA--T---CGT-ATTA-CT-TCAGAA----CGACAA----GCTT-T---TCNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-CT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AATCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAAACT------------A-CAA-----AAT--GATATATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTTGTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--ACGAA-CAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----AAC-A--TA---AAAT-T---GCT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTTGA--CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AAA--CTCAAAT-ATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TTGAT-CATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AACC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAACTT------------T-CAG-----AAT-------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTCGGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TTGAC-CAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AGCACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGACCT------------T-CAA-----ACT--ACTACATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTTGTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----AAC-A--GA---AAAT-T---GGT-ACTT-CT-TCATAA----A--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|48 : C------TACAGTAACC----T--AGCT-TGACATTG--G-----ACCTA--GA---TCA--T------------CT-TCAGAA----C--ATG----A-AC-T---GATAGAGACATTGGGGTATTC
gi|49 : tcaaggtcacgtgata--TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTT-TTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----ACC-T--AA---AAC--T---CAT-ATAA-AG-TTAGAAAATTC--TGG----A-AT-T---GATGGAAACA-TGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAATCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGACAT------------G-CAA-----AGT--AGTATATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------TG-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATT-CTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : TTTACTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--ATGAA-TAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----AAT-A--TA---AAA--TT--GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAA----G-TC-T---TNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAA-CGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----AAA-A--GAGAGAAAATT---GGT-ATTA-C--TAAGAA----C--CAA----G-TC-T---GGT--AGACA-TGGGATCTTCAG-----------GAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACCT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A--------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG---T------------ATCAA-----GGTCAAGTGACTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTCAT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----AA--A--TA---AA-------GCTCATTATCT-TTAAAA----C--TGG----A-AT-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--Atgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAA-CAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----AAA-A--GA---AAAT-T---GGT-A-----T-TCAGAA----C--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--ATGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----AGC-A--GA---AAATTT---AGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GAT--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-T---GNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-CA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AAT--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAATCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGTATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CATGTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTT-TTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
blockSeqs : CT CT T A G ATTG T GACT NNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T C CA A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA A N AT AG GA T AAA TTA G T A CC TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . T GTTGAA TATTA GAG TC TCAA C T T A AATT GA A AATTGN T . N T GAATGTTAAACGAATTATAT CTACAT T T N C AACC C G G CTATCAATTT T ATAAAAACTAGCACTAGTAGATACATGAAATCTTCAGATG G C T C TAAGATTTGATAA AGCATAGTAA A AG CC G AGGA T TG TATA A T C GAGA T G ATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T CG TTT AAG . A GTTAAG AAGGAT T T T A A ATGC CT GT TAAGGTC GT T T C T CATG C CT AAA T A GACA GAT A A GTGGGGTTAT A TT TTTACTGATGTGGGGGATGG TTT T T T A A A AAA TA T AA A G GCT C TA TAT ATAT TT A T TTG TGC C CG GATAACAACGTGAA ATAAAAT T C . AT
blockSeqs : T CA T . T G . GAC ATT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA . C T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . A . . TCA . . A . AC TGATACAACATGGGATGTTTGCAGAAGGGTGATAAAGAGGATAACAGACCTATAAACTTAAGGTCAAGGTCAATGAA . T ATG CTAA . CC TG . A . . . . A GCT . . A . NNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNN . T . . GACT T . C . G TAGTAGAACCAGTAATTATAGAAACAAAATCTTTTGATG A . T C AT GGTCAAG C AG CC G . . . TATG . . C . N N ATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . C . AT . . . T T . C T A . TT . CGAGGTC TT C . G . . T . . G T AGCA GGA T . . . . GGGGGGATTGTTA . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . T TTG A A . TC ATCAT . T . A
blockSeqs : T CA T . T G . GAA CTA TCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . C A . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . A . . AA . . A . AT AGAAAAAGTCCAAGGCTCTTTGGAAGCAAGGGTAGAATGACAGTGCCTTCAAACTAGTATCATGGTCAATGAA . C ATG CTAG . AT T . A . . . . G TA . . A . NNNNNNNNNNNNNNNNN ATACA . N . . GGAT T . G . T AAGGATTGATAGAGACTTTAAATTTGTACATG A . T A A ACTAG C AA CT G . . . AAG . . C . C A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGC . C . GC . . . T T . T A . . CT . CAAGG GT T . T . . C . . G A GGCT GGA A . . . . GTTATTAATTGGG . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . C . T . CG T
blockSeqs : . . A . A G . TAC ATA TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . A T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . T . . A . . G . CC TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . C G CAT . TT G . A . . . . A GA . . N . NNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNN . N . . . T . . . T TATAGAACCAGCACTGATAGAGACAG G . C C A AATGA A AG CT G . . . CAT . . C . C G NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG . C . G . . . T A . C T . . CT . A AA C . C . . A . . G A GAAA GGA T . . . . GGGATAGCATA . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . C . T .
blockSeqs : . G T . TA ATN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA . A G . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . A . . G . . A . TG AGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . C G TAC . T T . T . . . . G CT . . N . NNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNN . C . . . A . . . A TTAAGCCAATACTAAATCTTTAGAG G . T T A ACTAC A AT CC C . . . AAT . . G . C G TTTTAGAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . C . G . . . T C . A A . . CA . C GT G . C . . C . . G A CGCT CGA A . . . . GAAAATA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . G . . . G GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . C A . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . A . . A . . A . AG ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . T G CTT . T C . T . . . . A GA . . A . NNNNNNNNNNNNNNNNN CTACT . N . . . A . . . A ATGTACTTAAAAACCAATAG A . G C A AGTAG A AG CC G . . . AAT . . C . T G ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . A . T . . . T T . G T . . CT . C GC A . T . . C . . G A CGTG GGT A . . . . GGAAAAT . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . T A . ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . A . . A . . C . AA TGATAGAGACTTGAAATCCTTAGATGTAATAAAGAATGCGACATACAAACTAGTATC . T G AAG . T G . T . . . . A GT . . G . ATGTAATAAAGAATGC NNNNN . T . . . T . . . T TTTTAAAGAACCAGTAC A . T A T AATAG C AG CT G . . . GT . . A . T . . . . G . . . . T . A A . . AT . A GT A . C . . T . . G G GGCA AGA G . . . . GAAAAA . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C T . . . . T . . A . . A . CT CAGTGACATGAAATTAATTCAGAAGTGATAAAAGGACCTACAAACTACAATC . C G CAT . T G . T . . . . A GT . . N . GAATGATGT NNNNN . N . . . C . . . T TTGAAATCCTTAGATG A . T C T TGA A . . . . . . AT . . C . . . . . . . . . . C . A A . . CT . T GT G . T . . T . . A A GGCA GGA A . . . . GGAATA . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C T . . . . C . . A . . C . TC TGGGAAGGACATGGAATTTTCAGAAGATCAAACGACACCAATGACTTACC . T G CAG . . C . T . . . . A AA . . A . T . . . . . T . . . A TTTACAACCATGAC G . C . G AAT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . C AC C . . . . C . . G A GCA GGG A . . . . GGAATT . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . A . . A . CC TGAGAGCAACATAAGATTCTAAGAGATGATGGGGATGACGGTAAGGGAC . C A CTA . . G . A . . . . T AA . . N . . A . . . C TGAACTTCAGA . . A . . AG . . . . . . . G . . . . . . C T A . . . . A . . G T ACA A A . . . . GGAATT . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . A . . A . CC . C G TAT . . G . T . . . . G GT . . . . . T . . . . C . A . . . . C . . T . AA . A . . . . GAAATA . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . A . . A . AC . T G AAG . . C . T . . . . A GT . . . . . . . . . . . . . . . . GGAAAA . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . T . . A . AG . C G AAG . . G . T . . . . A AA . . . . . . . . . . . . . GGAAAA . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . CC . C G CAG . . G . T . . . . G GT . . . . . . . GGAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . CT . . G AT . . G . T . . . . A GT . . . . GGAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . . A . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : **** *** **
originalCons : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
finalCons : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
25 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 1111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 111111111111111111111 2222 1 1111111111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222 1111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 111111 111111 2222222222222 1111111111 111111111111111111111111111111111111111 111 111 11 55555555555555 3333333 4444444 111
lowQualScore : 88 66 6 5 1 0000 5 4444 333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 2 44 3 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 3 33 33 33 2 66666 333 2 1 2 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 5555 3 77777777 888888 333 00 6666 2 1 2 2 4444 33 2 6666666 2 444 1 3 0 777777777777777777777 777777 4 1 4 4 1111 3 3 0 0 4444444444 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 3 3 2 11111111111111 999999999999 1 22 66 3 7777 3 55 3333 3 3 1 8888 1 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 55 777 6666 0 55 4 111111 333333 1 4 1 1 7 0 7777 44 55 1111111111111 77 1 3 0 5 3 6666 1 33 555 1 2 7777 444 3 2 0000000000 2 33 999999999999999999999999999999999999999 333 2 2 2 2 4 2 333 88 2 22 2 2 333 2 22 333 4444 33 2 5 444 555 1 11 11111111111111 5555555 7 1 3333333 777
lowQualScore : .. .. . . . .... . .... ... ........................................................................... . . . .. . . .................................................................................... . . .. .. .. . ..... ... . . . .. ......................................................................................................... . .... . ........ ...... ... .. .... . . . . .... .. . ....... . ... . . . ..................... ...... . . . . .... . . . . .......... . .................................................................. . . . . .............. ............ . .. .. . .... . .. .... . . . .... . . ...................................................................................... . .. ... .... . .. . ...... ...... . . . . . . .... .. .. ............. .. . . . . . .... . .. ... . . .... ... . . .......... . .. ....................................... ... . . . . . . ... .. . .. . . ... . .. ... .... .. . . ... ... . .. .............. ....... . . ....... ...
lowQualScore : 88 00 0 7 7 7777 7 4444 444 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 6 8 66 6 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 1 22 55 22 4 55555 999 2 4 4 88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 9 0000 0 77777777 777777 999 00 7777 1 6 1 1 7777 11 8 0000000 5 777 3 3 2 222222222222222222222 111111 0 4 0 0 2222 1 3 2 0 6666666666 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 6 3 8 55555555555555 222222222222 9 77 33 6 7777 6 00 7777 6 6 6 5555 1 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 66 000 7777 8 55 0 555555 000000 7 4 0 3 3 4 7777 44 00 8888888888888 33 0 3 5 8 3 5555 4 99 000 9 7 5555 666 6 7 3333333333 4 11 888888888888888888888888888888888888888 999 2 2 2 2 2 1 777 22 1 99 0 0 333 0 88 555 7777 22 5 7 777 777 4 00 88888888888888 0000000 3 0 3333333 777
consensus : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
Reference ( family-721 ) : TTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTGTAACTTTA---GAAA-GAGAC-TGATAGATTNTNGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--CCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-NAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGCNNNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-CCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATAACT-TTAGAANCAGGATTG-----------A--GA--A--A---CATGGAATCT--TT-C--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATGACGG-ACCTACAAACTTAA-GT--CANG-GTC------TCCAGTGACC----TTGACCTCTGACCTTG--G-----AAC-A--GA---AAA--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CGG----G-TC-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--ATGT--AANGAATNATGTCGACCTACA-AACTAG-GATCTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAAAGTT-GT----------ANTAC------T--T-----A-A-----A--CC-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCGACCT------------A-CAA-----AGT--AGTATATCCAGTGACCTTGAC----CTTTGACC-TTGA--TTNAT-A-TAA-CTTGTATAACT----TTAGAACCGGGAT----------CATTTTAGAACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCA--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TNTAGAATTT-CTAA----ATGAACTTAAAATTTTTTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCGATNTAGA-ATTTCTA-AATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--GTTT---CTAATTCTGA--TTT--------CG----CTTTATATGGAATTTCAATCANCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|1 : TTTAAACT-TTAAAAT-AAAA-CCGGTATAACTTTA---GAAA-GAGGG-TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATATCTGACCTTGGA-AAA-GAAAA-TTTTTATTACTTCAGAACCAGGTTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---AGT-ACAACT-TTAGAAAGAGAATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNTCGACCT-TGAACTTG--C-----AAA-A--GA---AAA--T---GGT-GTTA-CT-TCAGAA----C--CAG----T-TC-TCNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNTC-CA-CT----TTGACCTTGATCAT-AGAATGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----A--CT-------------------AATCTT--TAGAT---G--TGATAGAAGAAT-GCAACCT------------A-TAA-----TGT--AGTATATCTTGTGATCTTCAC----CTTTGACC-TTGA--TTGAT-A-TAA-CTTGTATAATT----TTAGAACTGGGAT----------CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TTTA-CGGAAAGAAAC-AGG---G--A-ATTTTTCCTGGAAAT-TCTCAAA------ATC-----TTTGCGA-TCAAGTGATA-CCAG----GTTTATATATGATTTTTTTTCTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGCAATTTAGA-ATTTTTG-GATG----AACTTAAA--A---TTGGCATGGCATGTATTAT-GTG----------C-CAGG--GA-------------T-G----AA-------T---A-----CAGTAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-G-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---AA-TTTTAT--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATA--GTTT---CTTATTCTGA--TTT--------CA----TTTTAT-TGGAA-TTCAATCAACGACAAAGTAATTGA-CAATGGACACT
gi|10 : C----TTGATATTTGACCTTG--------AAT-ATTAA---AAC--T---TAT-AT-A-CCATTAGAA----C--TAGAATTG-NN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNTC-C-CA-CTAACCTTGACCTTTACCAT-AGAAAGTT-GT----------ATTAC------T--TTTAAAG-A-----A--CC-------------------AGT--------AC------TGATAG-AGAAT-GTAACCT------------A-CAGAGCATAGT--AATATATCCAGTGG-----------TTTTGACC-GTG---TTTATAA-TAG-CTTGTATAACT----TTATAACTGGGATTG--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTATCTTGTGGAAA----------------TTC--TCAAAAT--------------ATC-------TGTGA-TTTATAATAT-CTGA----ATGAACTAAAAAa
gi|10 : TTTATCTTGTGG--AAATTCTCAAAAT------A------TCTGTGATTTATA-ATATCTG-AATG----AACTAAAA--A---ACTACATGACATGATTTAT-GTG----------CAAAGG--GA-------------G-G----GGGGATTGTT---A-----CAGTAAT---GTTT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---ATTT-GT-A--C-AACactacatgacatgatttatgtgcaaagggaggggggattgttacagtaatgtttcagaaaaagcccaatttgtacaac
gi|11 : cttgatatttgaccttgaatattaaaacttatataccattagaactagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcccactaaccttgacctttaccatagaaagttgtattacttttaaagaaccagtactgatagagaatgtaacctacagagcatagtaatatatccagtggttttgaccgtgtttataatagcttgtataactttataactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT----TTTACCTTGATCAT-AAAAAGTT-CTCTATCAATTTAGTACAAGGA-T--T-----G-ATAGAGA--CTTTA----------------AATTTG--TACAT---G--TGATAAAAGAAT-GTGAC--------------------------T--GATATCTCTAGTGACCTTGAC----CTATGACC-TTGA--TTG-T-A-TAA-ATTTTGGAACTGAGACTATAANNNNNNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCAGCTTTA-CTTGAGGCAAC-AGG---G--ATATTTTT--TGAAAAA-TTTCAAAGTTAAGGTC-----TTTTTGA-TCTTGATTCT-GTAA----ATGAATTTAAAATT
gi|11 : TTTTTTGA--AAAATTTCAAAGTTAAGGTC------TTTTTGATCTTGA-TTCTGTA-AATG----AATTTAAA--A---TTGGC-T----TGGATTTT-ATG----------C-ATGA--GA-------------G-A----AA-------A---A-----TAGCAAT---A-TT-CAGG-TAAAG-CC-CAA---TTTT-AT-G--C-AGCCC-ATATATGATTTGGGAGCTGA-CTTTAT--CA---TT----GGCAG--ATTAC-AATC-ATATC--ggcttggattttatgcatgagagaaaaatagcaatattcaggtaaagcccaattttatgcagcccatatatgatttgggagctgactttatcattggcagattacaatcatatct
gi|12 : ttttaccttgatcataaaaagttctctatcaatttagtacaaggattgatagagactttaaatttgtacatgtgataaaagaatgtgactgatatctctagtgaccttgacctatgaccttgattgtataaattttggaactgagactataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcagctttacttgaggcaacagggata--AAGGGATTTTG-CGACCTACATAACTAG-GATCTC-CA-CTGACTTTGACCTTGATCGT-AGAAAATT-GT----------ATTAC------TAGT-----AGA-----A--CCAGTAATTATAGAAACAA--AATCTT--TTGAT---G--TGATTATTGAAT-GTGACCT------------A-CAA-----AG---------------GA-----------CTTTGACC-TTGA--TTAAG-A-TAA-CTT-TAAAAC------TGGAACCG---N----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTA-CTGAAGGAAAC-AGG---GAAG-GGGGGT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TTTAGAAATT-A-AA----ATTGGCTTAt
gi|12 : aTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTTGTGATTTAGA-A----------------A-TTAAA--A---TTGGCTTAGCATGGATTAT-GTA----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGTATT---A-TT-CAGA-GAAAG-TC-C-T---CTGT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---Ggcatggattatgtacaagggaggaatacagtattattcagagaaagtcctctgtgtacagccagtacttcgtttgggag
gi|15 : aaagggattttgcgacctacataactaggatctccactgactttgaccttgatcgtagaaaattgtattactagtagaaccagtaattatagaaacaaaatcttttgatgtgattattgaatgtgacctacaaaggactttgaccttgattaagataactttaaaactggaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacagggaagggggg--T---GAC-ATTA-CT-TTAAAA----C--CAG----T-AT-T---GATAGAGACT-TGAAATCCTTAG--ATGT--AATAAAGAATG-CGACATACA-AACTAG-TATCTT-CA-A------TGACCTTGAT
gi|15 : cctT---GAC-ATTACT-TTAAAACCAGTATTG-----------ATAGA--G--A---CTTGAAATCC--TT----AG-A--TGTAATAAAGA--ATG-CG--ACATACAAACT--A-GT-------ATC------TTCAATGACC----TTGATGTTTGACGATGATG-----TTC-A--TA---AAATCT---TGT-GTAA-CT-TTAGAA----C--CGA----G-AC-T---Ggtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : cctAC------T--T-----G-A-----A------------------------ATCCT--TAGAT---G--TAATA-AAGAAT-GCGACAT------------A-CAA-----ACT--AGTATCTTCAATGACCTTGAT----GTTTGACG-ATGATGTTCAT-A-AAATCTTGTGTAACT----TTAGAACCGAG---------------------ACTGNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-NNNAAGGAAAC-AAG---G--G-AATCTT--TGAAAAA-TTTCAAT------ATC--------AAGA-TCTGGATTTT-TGAAATGCATGAACTTAAAATTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaatctttgaaaaatttcaatatcaagatctggatttttgaaatgcatgaacttaaaatttgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|15 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagTCTTTGA--AAAATTTCAATAT------C---------AAGATCTGGA-TTTTTGA-AATGCATGAACTTAAA--A---TT----T-GCATGGAGTTT-GTG----------C-AAGG--GA-------------------------------------------------------AGA-AAAA------------T----T-A--C-AGCTA-GCACTTCGTTTGGAT---GA-CTTTAT--AA---TC----AGCAG--ATgcatggagtttgtgcaagggaagaaaaattacagctagcacttcgtttggatgactttataatcagcagatatc
gi|16 : ccttgacattactttaaaaccagtattgatagagacttgaaatccttagatgtaataaagaatgcgacatacaaactagtatcttcaatgaccttgatgtttgacgatgatgttcataaaatcttgtgtaactttagaaccgagactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggaaacaagggaaTTGACC--TTTAA-CAT--AAA-AA-A--CT---GGT-ATAACT-TTAAAAatc
gi|17 : cgcctctttctcgtgccttaaactgtccgacacttttctccgtaacctgttgatgaaaatcttagatattctaggacatgatagaccaatgtatgtagatgtgcagaatgtttttgttttcagattgtggggattagcgtacattctgtggggatggggtttaacatatacatgtaactctatggggaaaataaattccaaaattcaaaagatgtaacttcattaatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACCTTTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGCTATTACTTCAGAACCAGGCCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--------CA------------------GAT----ACT-TTAGAGACGGGAT-------------A--G---N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNGACC----TTGACCTCTGACTTTG--G-----AAT-A--CA---AAAT-T---CTT-ATAA-CT-TAAGAG----C--CAG----C-TT-A---GATAGAGAGA-TGTGAT
gi|18 : ttTTTACCAA----ATGAGA--AAAAGGTTTTTTTTGGGTAAATTTTCTAAAT------CGAGGTCTTTGTGATGTAGA-TTTTCTA-AATA----GAATTAAA--A---TTGGCATAA-----ATT-T-GTG----------C-AAGG--GATTTACTGATGTGGG-G----GA-------T---GG----CGATACTTTTA-CT-CAAA-TAAAA-CC-C-A---ATTT--T-A--C-AGCCA-GTACTTTG------------------T--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATgaatggataaaggg
gi|2 : --TTGAA-CAG--ATA-A--A--TT-------AAAACCATGACAAATAGAATAG-----------A--AA--A--AGTCCAAGGC-TCT--TT-GGAAGCAAGGGT-------AGAATGACAGTGCCTTCAAACT--A-GTATCATG-GTCAATGAATTCAGTGACC----TTGACCACTGACCAT---G-----AAC-T--TT---AAACCT---GGT-GCAA-CT-TTAGAA----C--TGG----G-AC-T---Gatcttatagttttcttcaattacaagtaaatatacttaaagcatatataccttgaaa
gi|2 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatTGACCA-TGAACTTTAAAC-CTGGTGCAACTTTA---GAACTGGGAC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA--TCTTAACCTCTGACCTTG-A-ACA-AAAAA-CTGGTATAACCTAAGAAC----TTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAT-CGT--GAATA--G--CT---GTT-ATGAC---TAGAACCATAACTG-----------G--GA--AGGA---CATGGAAT-T--TT-C--AG-AA----GATCAA----ACGAC---ACCAAT-GACTTA------------CC------TC---TGACT----TTGA------AC------G-----AAC----------AC--T---GGC-ATTA-AT-TCAGAA----C--CAG----G-TCTT---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNCCTTGAATAT-A-AAAGTTGGT----------GTAAC------TG-TA----A-A-----A--CC-------------------AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcttaacctctgaccttgaacaaaaaactggtataacctaagaacttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaactttgaccttgatcgtgaatagctgttatgactagaaccataactgggaaggacatggaattttcagaagatcaaacgacaccaatgacttacctctgactttgaacgaacactggcattaattcagaaccaggtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaatataaaagttggtgtaactgtaaaaccaagattg
gi|22 : cttccacttcttgttcatctttttctttcttatacttaaaatggccagcagccattctctgtaatccatggatgaaagtattagatacttaaggatatgataggccaatatatataggaatgaatggggtttgggtacatttttgggagatcagattgggatggggtgtcacatagaagtctgggaaaatattaagtgcaaatttgaacagataaattaaaaccatgacaaatagaatagaaaaagtccaaggctctttggaagcaagggtagaatgacagtgccttcaaactagtatcatggtcaatgaattcagtgaccttgaccacCTTGACCTCTGACCTTGGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTTTTTCAGAACCAGGTCTG----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNN-NCCTTGACC--TC------T--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-CTAGAATGGTGAT-------------A--GA--G--A---CGTG-----T--TC-T--AT-AGAGATAA-AAAGAGGATGgattg
gi|23 : GG---G--G-ATTTTA--AAGAAAT-TTTCAAA------ATA-----TTTGCGA-TATAGAATTT-CTAG----ATGAACATAAAcaagctagtgtcagggccaaacgat
gi|23 : G--AAATTTTCAAAAT------A------TTTGCGATATAGA-ATTTCTA-GATG----AACATAAACTA---TT--CATGGCTTCGAGTAT-GTA----------C-AAGT--GA-------------GAA----AA-------T---A-----GAGTAGC---A--T-AATATAAGAG-CC-C-A---CTTT-TT-G----AGCAA-GTTCTTCGTTTAAAA---GA-GT-------A---CC----GACAG--ATTAT-AATC-ATATCTTGTTTA--CCAATTCTCT--TTT--------TC----TTTTGTATAAAATCTCActattcatggcttcgagtatgtacaagtgagaaaatagagtagcataatataagagcccactttttgagcaagttcttcgtttaaaagagtaccgacagattataatcatatcttgtttaccaattctctttttcttttgtataaaatctca
gi|24 : ggggattttaaaCTCTGACCTTGAA-AAA-GACAA-TTGTTATTACTTCAGAACCATGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-NNNNNCCTTTGACC--TTGAA-CAT--ATA-A--A--TT---GGT-ATAACT-TTTGGAAGAGAATTGAT---------A--GC--A--A---CATTGAATC---TT-C--AG-AA--ATGATAA
gi|26 : TCTTCAAAAT------T------TTTT--ATATAGA-ATTT-TA-AATG----AACTTAAA--AAAATTGGCATGAAATGGTTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---T-----CAGTAGT---A-TTTCAGA-AAA-G-CCAC-AAAACTTT-GTTA--C-AGCCA-GTACTTCG-TTGGGA---GACCTTTAT--AA---TC----GGCAGTTTTTAT-AATC-TTATC--CTTT---TT
gi|28 : GAAACGAGC---G--T-ATTTTT--TGGAAAT-TTTTAAA------Agcatgcgtcggttggtataac
gi|28 : agttttattTTTTTTGG--AAATTTTTAAAAG------CAAGG--TTT---ATGTGAA-AC----A-GATT----A-TTTA--------TTGGCATCGCTT---TTGT-GTGGTGGGGTTATC-AAAGTTGG-------------G-G----AA-------T---T-----TAGTAAT---G-TT-CAG--AAAAG-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGCTA-GTACTTTGTATGGAA---GT-CTTTAC--AA---AC----GGTAG--ATTAT-AGTC-ATAgcaaggtttatgtgaaacagattatttattggcatcgcttttgtgtggtggggttatcaaagttggggaatttagtaatgttcagaaaagcccattttatacagctagtactttgtatggaagtctttacaaacggtagattatagtcata
gi|3 : agttttattgaaacgagcgtaGACCT--GAA--TTAAAAACTGCATTAACTTTA---GAAA-GAGAA-TGATTGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTGAC-TTGGA-A-A-AGAAA-TTTATATTACTTCAGAACCAGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGACC-TTGA-CTTTTGACC--TTGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-ATCA-T-GTAGGAAAGAAATTG-----------A--TAC-A--A---CATGGGATGT--TTGC--AG-AAGGGTGATAAAGAGGATAACAG-ACCTATAAACTTAAGGT--CAAG-GTCAATGAATCCAGTGACC----TTGACC-CTGACCTTT--GTTGAAAAA-A--GA---CAA--T---CGT-ATTA-CT-TCAGAA----CGACAA----GCTT-T---TCNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNC-CA-CT----TTGATCTTGAACAT-TTAAAGTT-GT----------AATAC------T--T-----A-A-----G--CCAATACTA------------AATCTT--TAGA----G--TGATAGAAGAATCGTAAACT------------A-CAA-----AAT--GATATATCC--TGACTTT-AC----CTTTGACC-TTGA--TTAAT-A-TAA-CTTGTATAAGT----TTAGA
gi|30 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccccaaaattcaacagagtgacttacaataattatgaagaggatagagtatggggtgttcagaaagaaaggggggatgggccaaggtcaagtactccagTTCGG--AAAT---CAAGGT------C------TTTGT-ATCTAGATATTTTTTTAATG----AAT---AA--A---TTG------------------TG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---AT----TAGCAGT---A-TT--AGA-AAAGG-CC-T-A---CTTT--T-A--TAAGCCAGGTGCTTCATTT-GGA---G--CTTTATTAGA---TC----Gc
gi|31 : gttttacttaggggaaagcaaggggaattggttcggaaaaaTTTGACCT-TGAACATTAAAA-CTGGTTTAACTCTA---GAAA-GAGACTTGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTCTGACCTTGGATAAG-AAAAA-TAGGTATTACTtgatctt
gi|33 : cttcaccTG----------C-AAGG--GA-------------G-A----AA-------T---A-----CATTGGT---A-TT-AAGA-AAAAAACC-T-G---CTT--------------A-GCACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TC----GGCAG--GTTAT-AATC-ATATCTTGCTC---TTAAACATCACGTTT--------CG----CATTAT------TTTCAATCACCTAC-------TT-A-CAATATACACT
gi|34 : TGA-CTTGTGACT--ACGAA-CAA--AAA-A--AAACT---GGT-TTAGCT-TTAAAACTTGGAATG-----------A--GAGCA--A---CATAAGAT-T--CT-A--AG-A--GATGAT---GGGGATGACGG------------TAA-G------G-GAC------TTCAGTGGAT----TTTACCTTTGACCTTG--G-----AAC-A--TA---AAAT-T---GCT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-gcatttgtaacaaaaca
gi|35 : TGA-CCTTTGAACATTTGA--CAT--AAA-A-----CT---CGT-ATCA-T-TTAGAATCGGAAAC------------A--GT--G--A---CATGAAAT-TAATT-C--AG-AAG--TGATAAAA--------GG-ACCTACAAACT---------ACA-ATC------TCCAGTGACC----TTG-CCTTTGACCTTGATG-----ATCTA--AA---AAA--CTCAAAT-ATTA-CT-TTAGc
gi|36 : c----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TGGTAGT---A-CT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT--T-AAAC-AGCCA-GTATTTCGTTGGAGA---GA-TATTAA--AA---TC----GGCAG--ATTAT-AATC-ATATC--CTGT---TTAAT
gi|38 : gcgaggagtaatc----AACTTAGA--A---TTAGCGTA-CAT---TT-T-GTG----------C-AAGA--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AA--------------CTT-GT-A--C-AGCTA-GTACTTCGTTTTGGA---GA-CATTGT--AA---TC----GGC-----TTATAAATCTACATC--GTatacagaccacataaaaagtgcatacatagttacaat
gi|4 : TTGACCTCTGACCATAAAAA-TTGGTATAACTTTA---------ATAC-CGG--GACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGACCTC-------GGA-ACA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NCATTGA-CTTTTGACC--TTGAT-CATGAAAA-A--A--TT---CGTGAT-ATT-TTACAACCATGACCGAT---------A--GA--A--A---CATGGAA-CT--TT-C--AG-AA--TTGAT-GACAGGATaacacctccactattccaaccatatacccac
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncT----TTGACCTTGATCATGAAAAAATTCGT----------GATAT------T--T-----T-A---------C-------------------AACC-------AT---GACCGATAGAAACAT-GGAACTT------------T-CAG-----AAT-------------TGA---TGACAGGATTTTG-----TGA--TTT-----TAC-CTCGGACAACT----TCAGCACCTGGtttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|4 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgactCC--TTGAC-CAT--AAA-ATCA--TTTTAGGC-CTAACT-TTAGAACCAAGACTG-----------tttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccataaaatcattttaggcctaactttagaaccaagactg
gi|41 : tccttgcgcctataaaaacggccgcagccattctccgtaacccatcgatgaaagaagcagacattcaaggataagataggccaatgtatctacacgtacgtagttgtgcagaaatgttttgttttcggaatgaagggcataaattgtaatttgtttccgaaattcaacagatatatctagtcaaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctctgaccataaaaattggtataactttaataccgggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgacctcggaacataaaattggtattacttcagaaccaggtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattgacttttgaccttgatcatgaaaaaattcgtgatattttacaaccatgaccgatagaaacatggaactttcagaattgatgacaggattttgtgattttacctcggacaacttcagcacctggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGG--GA-------------G-G----AA-------A---A-----TAGTAGT---A-CT-CAGA-AAACG-AC-C-A---CTTTTAT-A--C-AGCAA-GTACTTTGTCTGGGA---GA-CTTTAT--TA---TT----GGCAT--ATTAT-ATTCTATTTT--GTTTTGCCTAATTTTGA--
gi|43 : acacgaaatccttgtttgtgtttTGACCTTGACTAC-AGGAAGTT-GT----------ATTAC------TA-T-----AGA-----A--CC-------------------AGCACTGATAGAGACAG--TGATAAAAGAAA-GTGACCT------------T-CAA-----ACT--ACTACATCCAGTGACTTTGAC----CAT---------A--TTTATGA-TAA-CTTGTATataaata
gi|45 : ACAAAGCCAA-GT--CA-----C------TACAGAGACC----TTGACTTCTGGCCTTG--G-----AAC-A--GA---AAAT-T---GGT-ACTT-CT-TCATAA----A--CAG----G-TC-T---Gta
gi|46 : atcagggcaatataggacgtacaaggtattgTATAGTG----------C-AAGG--GA-------------G-TTATTAA-------TTGGG-----GGGT-GT---A-CA-CAGA-AAAAT-CC-C-A---TTTT-AT-A--C-AGACA-GTACTTGGTTTAGGA---GG-GTTTTT--GA---TT----AGCAG--ATTAT-AACC-AT
gi|47 : a--A---TTGGTATCGTGTAGATTAT-GTG----------A-AAGA--TA-------------G-G----GA-------T---AGCATACAGTATT---A-TT-CAGA-AAAAG-GTAC-A---CTTG-GT-A--C-AGC-A-GTACCTTGTTTGGGA---GA-CTTTAC--AA---
gi|48 : C------TACAGTAACC----T--AGCT-TGACATTG--G-----ACCTA--GA---TCA--T------------CT-TCAGAA----C--ATG----A-AC-T---GATAGAGACATTGGGGTATTC
gi|49 : tcaaggtcacgtgata--TTTA-CTGAAGGAAAC-AAG---G--GCATTTTT--T----ATATTTCAAA------ATTAAGGATTTATGATTGCAGATTTT-TTAA----ATGAACTTATAATT
gi|5 : aacagtAGTGACC----TTGATATTTGACCTTA--A-----ACC-T--AA---AAC--T---CAT-ATAA-AG-TTAGAAAATTC--TGG----A-AT-T---GATGGAAACA-TGAGATCTTCAGGAATGTTAAACGAATTATAT-GACCTACT-AATTAT-GATCCC-CA-CTGGATTTGATCTTCATCAT-AGAAAGTT-GC----------ATTAC------A--TAA---A-A-----A--CTAGCACTAGTAGATACATGAAATCTT--CAGAT---G--TGATAAAAGGTT-ATGACAT------------G-CAA-----AGT--AGTATATCCATTGGCCTTCAC----CATAAACC-TTGA--TTG-----------TG-ATAAAT----TTAGAACTGGGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTA-CTGAAAGAAAA-AAGTTTG------TTTT--TGTAAAT-ATTCAAA------ATC-----TTTGTGA-TAAAGAAATT-CTAA----A-GATATTAAAATTg
gi|5 : TTTACTGA----AAGAA---AAAAGTTTGTTTTTGT--AAATATTCAAAAT------C------TTTGTGATAAAGA-AATTCTA-AA-G----ATATTAAA--A---TTGGCATGGCATGGATTAT-GTG----------C-AAGG--G------------------------------T---A-----CAGTACT---A-TT-CAGA-AAA-G-CA-C-A---CTTT-AT-A--C-ATCCA-GTAGTTCGCTTGGGT---GA-CTTTAT--AA---TT----GACAG--TTTAT-AATC-ATATC---TTG---TTAACTTTGA--ATTGATAACAACGTGAACTTTATAT--CATTTCAA--ATGTAC-------TT-ATCAATATggcatggcatggattatgtgcaagggtacagtactattcagaaaagcacactttatacatccagtagttcgcttgggtgactttataattgacagtttataatcatatcttgttaactttgaattgataacaacgtgaactttatatcatttcaaatgtacttatcaatatttaaacttgtcaaaat
gi|54 : agtgaccttgatatttgaccttaaacctaaaactcatataaagttagaaaattctggaattgatggaaacatgagatcttcaggaatgttaaacgaattatatgacctactaattatgatccccactggatttgatcttcatcatagaaagttgcattacataaaaactagcactagtagatacatgaaatcttcagatgtgataaaaggttatgacatgcaaagtagtatatccattggccttcaccataaaccttgattgtgataaatttagaactgggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAA--ATTAT-AATC-ATATttaaacttgtcaaaat
gi|56 : aagccagtatttgcaaattgggagacCCA-ATACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TCATATGACAA--ATCAT-AATC-AT
gi|59 : -AGCCA-GTGCTCTGCTTTGGA---GA-CTTTAT--AATATTC----AGCAG--ATTAT-GATtc
gi|6 : -TTGA-CCTCTAACC--ATGAA-TAT--GAA-A--A--CT---GGT-CTAACt
gi|6 : CTTTACCTCTGACCTTGGA-ATA-TAAAA-TTGGTATTACTTCAGAACCAAGTCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC----TTTACCTCTGACCTTG--G-----AAT-A--TA---AAA--TT--GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAA----G-TC-T---TNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNN-NN-NN----NNNNNCTTGAACGT--GAAAATTGGT----------AAAAC------T--TTAG--A-A-----A--Ctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--TTGAA-CGT--GAA-A--A--TT---GGT-AAAACT-TTAGAAACAGGATTG-----------N--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TTGACTTCTGATCTTG--G-----AAA-A--GAGAGAAAATT---GGT-ATTA-C--TAAGAA----C--CAA----G-TC-T---GGT--AGACA-TGGGATCTTCAG-----------GAATGATGT-GACT-------CCAGTGACCTT-GACCT----CTAACATTGA-AAT-AAAAAATT-GT------------TAC------T--G-----A-A--------------------------------CTT--CAGA-----------AAAGAAAT-TCG---T------------ATCAA-----GGTCAAGTGACTCCAGTGCCCTTGAT----ATTTGACCTTTGA----AAT-A-AAG-CTCAT-TATCT----TTAAAACTGGAAT----------aggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatcaaggtcaagtgactccagtgcccttgatatttgacctttgaaataaagctcattatctttaaaactggaattgatagagacatgggatcttcaga
gi|6 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAG-GT--CAAGTGAC------TCCAGTGCCC----TTGATATTTGACCTTT--G-----AA--A--TA---AA-------GCTCATTATCT-TTAAAA----C--TGG----A-AT-T---GATAGAGACA-TGGGATCTTCAG--Atgatagagacatgggatcttcaga
gi|62 : ttgacctctaaccatgaatatgaaaactggtctaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttacctctgaccttggaatataaaattggtattacttcagaaccaagtcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgaacgtgaaaattggtaaaactttagaaacaggattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgatcttggaaaagagagaaaattggtattactaagaaccaagtctggtagacatgggatcttcaggaatgatgtgactccagtgaccttgacctctaacattgaaataaaaaattgttactgaacttcagaaaagaaattcgtatca-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTCTGGGA--------TTAT--AA---T
gi|7 : AA-TTGATGTAACTTGA---TAAA-CA----TGATAGAT----GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NCTTGAACTTTGACCTT-GA-ACACAAAAA-CTGATATAACTGTAGAA
gi|7 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcC-TTGA-ACTTTGACC--TTGAA-CAC--AAA-A--A--CT---GAT-ATAACT-GTAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNN--NN--N--N---NNNNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNCC----TGGACCTCTGACCTTG--G-----AAA-A--GA---AAAT-T---GGT-A-----T-TCAGAA----C--agagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctggacctctgaccttggaaaagaaaattggtattcagaac
gi|8 : ttggagtgaagtttacttaccacaaacttgataattaagtctccctaactaagtttggagacttattgtttgtgctcagttccacttcttccttctccaatttttgggcttaaaactgtccaacacttttctccttaacctgttaatgaaagtcttagagataagccaatgtatgtagatgtgcagaaatgtgtttattttcatattgaaatgggttatggtacattctggggagatcaaatgggggtggggtttaacatagaactctatgggaaaaaatttaattccaaaattcaattgatgtaacttgataaacatgatagatgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CTGATGTAACTTTAATTGATA-AATA--TGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--TCTTGACATCTGATCATG-A-ACA-TAAAAACTGGTAA-AATTTAAAACTAGG--------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------NN-TTGA-CCTCTGGTT--TTGGAGCAG--AAA-A--T--TT---AGT-ATTACT-TCAGAACCAGG
gi|8 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccC-TTGA-CATCTGATC--ATGAA-CAT--AAA-A--A--CT---GGT-A-AAAT-TTAAAACTAGGAT----------------------------ANNNNNNNN--NN-N--NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN-NN--NNNN-NNN------NNNNNNNNN-----TTGACCTCTGGTTTTG--G-----AGC-A--GA---AAATTT---AGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-tc
gi|9 : tccaaacgaagtttggagactgagtgttttttgttcggttcctctttttcttcttccgacttttctcgtactgtccaactcttgtctccgtaacctgttgaaagtcttcgatattctaggatatgataggtcaatgtatgtagatatgcagaaatatttttgttttgagattgaagggggttagggtacattttggacggaccaaatgggggtggggtttaacatagaatccatgggggaaaataattccaaaacccaactgatgtaactttaattgataaatatgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnat--GA---GAT--T---GGT-ATTA-CT-TCAGAA----C--CAG----G-TC-T---GNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNN--NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNCA-CA----CTGATCTTGATTAT-AGAAATTT-GT----------ACTACATGTACT--T-----A-A-----AAACC-------------------AAT--------A----G--TGATAGAGACAT-GAAATCTTAAGATTTGATAA-AAA-----AAT--AGTGTATCCAGTTACTTTGAC----CTTTGAAC-TTGG--TT-AT-AATAA-CATGTATAA-------------------------------TTTTAGAACTNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----TA-CTGAAGGAA----TG---G--G-ATTTTT--TGGAAAT-TTTCAAA------ATC-----TTCACGA-TATAGAATTT-TTAA----ATGAACTTAAGATTT
gi|9 : TTTTTTGG--AAATTTTCAAAAT------C------TTCACGATATAGA-ATTTTTA-AATG----AACTTAAG--A---TTTGCTTGGCATGGGTTAT-GTG----------C-AAGG--GA-------------G-G----AA-------T---A-----CAGAAGT---A-TT-CAGA-AAAAG-CC-C-A---CTTT-GT-A--C-AGCCA-GTACTTCGTTTGGGA---GA-CTTTAT--AA---TT----GGCAG--ATTAT-AATgcttggcatgggttatgtgcaagggaggaatacagaagtattcagaaaaagcccactttgtacagccagtacttcgtttgggagactttataattggcagattataat
25 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): GACTTGTTGTTTGGCTTGGATTTATATCTTCTGCTTCTTCGGTTCTTTCCGTTCTTGTTTTGTGCTAGAAAGCTATTGCAGTCATTTGCTCTGCATATGTTGACTGGAAAGTGTTGAGATGTTCACGGACATGATGCCACCGTAATTTAGATCGCTGGGCAGAAAGTCGAGTATTTGTTTTCAGGATTGAAGGGGTTAGGTAGGTAATTTGGGGGAAATTAAATGGGAGTGGGGTGTTAACGTGTAGGAGGTCGTATGTGGGGGGAAAAAAATAATCGTAGCAAAATCAATGACAAATATGTAATAAAAGTAGAGTCCTGGGGTCTTCCTGAAGTGAGAGAAATGATGGGGCTCAAAACAGTGTCAAGACAAGTGAGTTCCAGT
Unaligned ( gi|14 ): ACTATAGGCTGGCTTTCAAACCAATGGGTGTTGATGTTATATATTTATGTCTCACAGTCGAAATTTTGAGATGTACTTCTTGCTTAGTTAAATCTTCCGCTTCTTGTTTTTCTTGCACCTTAAAATGTTCGCAGTCGTTCTCCATAACCTTCTGATGAGAGTATTAGATGCTAAGGGATATAATATCAAGAAAGTTTTTGGTTTTAAACTGACGGGTGTTAGTGTACATTGTGCGGGGTTAAATGGTATGGAGTGTAACATGACCCCCTATGGAGATAATCAATTTAAAAAATCAAAAGATAATAATAATAGTTCTATTATATTCGGAAATGAGAAGAAAATGACATGATCTACAAACTCTA
Unaligned ( gi|19 ): TCCCAAATGAAATGTTAAGATTTATTGTTTTCACTCAGTTCCTATTCTTCTGCTTTTTCATTTGCTTCTTTCTTGCACCTAAAAATGTCTGTCATTGTTTGATAACTATCTGGTTGTGCGGGAATGTTTTAGTTTTTCAGATTGAAAGGGATTTAGGTACCTTTTTGGGAGGATCAAATGGGAGTGGTGTCTTACATAGAACCTTATGGGAAAAAGCTTAATTTCATCAGATTTACTTGATAAATATCATA
Unaligned ( gi|20 ): GTCTCCCAAACAAATTTTGAAGACTTTAAATGCTTATTGTTTTTGCTCAGTTCTTATTTCTCTTTCTTTAGAACTTGCAGTCGTCCTATTAACCAATCTATGAAATTATTAGATATTGAAGGATCTAAAAGGCTAATGTATATAGTTGTGTAGAAATGTTTTTGTTTTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTC
Unaligned ( gi|21 ): AAGTCTCCAAAATAAAGACTGGAGACATGGTTTTTAATCATGTCTTATATATCCCAAAGTACATGATGTTTTTGCTCGGTTCTAACAATTTTTTGGCTTCTTGCTGTTTGTCATTCTTGGGCCTTGAAATGACTGCAGCTGTTCTCTGTAACCTGCCAATGAAAATATTAGATATTCAAAGATATGTTAGGCCAGTGTATGAAGTGGTGCAGAAATATTGTTTTGACTGGA
Unaligned ( gi|25 ): CTCTCAAATGAAGTTTGAAGACTGATTGTCTTTGCTTGTCTTTGCTCAGTTTTTATTATTCTTCAGATTCTTACAGCTTTCTTTCTTGCACCTAAAACCATGCAGTCTTTCTCTGTAACTTGTTGATAAAAATATTAGATATTCCAAGTTATGATAGGCCAATGTATTTAGATGTGCAGAAAATTGAAAAGAGAGTTAGG
Unaligned ( gi|27 ): AGAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTTCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTAGATGTGCAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGGGGGGGTAAATTTAAAGGGAATAAAATGGGGGTAGGGTTTAACACGGGAC
Unaligned ( gi|29 ): AATTCTTCCCGGTTCTCATCCACCAGTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCCGACACTTTTCTTTTGATGAAAGTCTTAGATATTCTAGGATATGATAAGCCAATGGATGTAGATGTGCAGAAATGTTTGAAGGGAATTAGAGTACATTCAGGGGGGAGGGGGTCAAAAATTAAAATAATTCCAAAATTAAA
Unaligned ( gi|32 ): TGTGTCTTTTTTCTCATGCCTAAAACTGACCAACGCCGTTCTCCGTCACCTATTGATCAAAGTGTTACATATCCAATCTCAGATTAAAGGGGTTAGGGTACAAATAGGGGGCGTGGTTAAACATGGAACTCTATGGAGTAAAATTATTTTCAAAATTCAACAGCTAT
Unaligned ( gi|37 ): ATAGGTCAATGTATGTAGATGTGCAGAAATGTTTTGTTAGGGGGTTAGGATACATTCTGTGAGAGATCAAATGGGGATGGGTTTTAACATAGAACTCTTATGGGGAAAAAATTAATTCTAATATTCAACACATATGATAGATAGAG
Unaligned ( gi|39 ): AATGTATGTAGCTGTACAGAAATGTTTATATTTTTAAATTATAAGAGAGTTTAGGGTGCATGGGACAAGCAGGGGTGTCATAAGGGTTGAAATCTAAACATAGAACTTTCAATTTGGTGAAAATAGTCCAAAATTGAACAGAT
Unaligned ( gi|40 ): AAAGGTAATTTATGTACTAAAGATGTGATAGTTCAGTATCTAGTCATGTGCAGTTTTGGGATAGAAGGGGTCTAGGTACTTTCGAGGGATCAGATGGAGATGGGATGTACGCATAGAACATCTACTGGGGAAAATTTAATT
Unaligned ( gi|42 ): ACCAAACGAAGCTAGGACAGTTATTGTTTTGGCTCGGTTCTTCTGCTCGTGCTTAAACTTTTCTCCGTAACCTATTGATAAACTCTTAAATAATCTAGGATATGATAGGCTAATGTATTTATGTGTTCCGAATTGT
Unaligned ( gi|44 ): CGCTTCTTCCGCCTCTTTTCGTGCCTAAAACTGTCCGGACACCTTTCTCCGTAACCTGAAATGAAATAATGAAAATTCAAGAACGATATGATCAGCAATGTATGCAGAT
Unaligned ( gi|50 ): CCCAAACGAAGTTTGGAGATTATTGTGTTTGCTCACTCGTGCCTAAAACTGTCCGAAACTTTTCTCCTTAACCTGTTGATGAAAGTC
Unaligned ( gi|51 ): TGTGTTTTCAGATTGAAGGGTTCTAGGTAAGGTAGCAATGGGGATGGGGTCTTACAATAAAACTCTGTGAGAAAAAATGGC
Unaligned ( gi|52 ): TTTCAGATTGAAGATGGGGAGAGTGGGTCACTGGAGGGGGGATAACATAGAACTCTAGGGGGGAAATGAACTCCAAA
Unaligned ( gi|53 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTTTCGAGCTTAAATAGAAAGTTTCCATGTTACTT
Unaligned ( gi|55 ): TAAGACATTCTACATGATAGGCCAATATGTATGTAAATGTGCAGAAATATTTTTA
Unaligned ( gi|57 ): ACTAAGTCTCGCAAACAAAGTTTGGAGACTTATTGATTTTGTGCTTTTC
Unaligned ( gi|58 ): TGAAATGTTAAGATTTNTTTCCCCCGAGTTTGACGGTTCCTGTAGTTAA
Unaligned ( gi|60 ): ATGACAGTGTCTACAAACTAGTGTCATGGCCAAGGGGCTCTAGTGAC
Unaligned ( gi|61 ): ATGAAGTCTCCCATGCGAAGTTTGGAGATTATTGTTTTTGAC
Unaligned ( gi|63 ): TGTCTATGCTTTCCTTAAATATCTGTGATTT
Unaligned ( gi|64 ): ATACAAGTGAATTCCTGATATCTCAGCAAAA