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Reference ( gi|11 ) : TTTGA-C-TAT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C---AT-T-A-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--C-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----T--GC--------AT------G-------T-A----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AA------T--A-TCTT----------------T-GC--TA-TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T---TG---------T--T-T--CA-AAT-CGT-A---A-C-GT---GTGTTT-GACT
gi|15 : TTTGA-C-TAT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C---AT-T-A-A-A---G-G-C---T-T---TT--T-----CAT--T-CA-A--C-TG-C----A--TA--T-AC-A-T-----A----T--GC--------AT------G-------C-A----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AA------T--A-TCTT----------------A-GC--TA-TC---T-C--A-A-A-T-G--C-G------T---TG---------T--T-T--CA-AAT-CGT-A---A-C-GT---ATGTTT-GAC
gi|22 : TTTGA-C-TAT-A-T--AAT-T-TCCT-AGATT--T--T-G-A---T---AC-----AC-T-A-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CA----C-TG-C----A--TA--A-AC---T-----A----T--GC--------AT------G-------TAA----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AA------T--A-TCTT----------------A-GC--TA-TC---T-C--A-A-A-T-GA-C-A------T---TG---------T--T-T--C--AAT-CGT-A---A-C-GT---
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gi|6 : gTTGA---TATTA-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-AC--T---AC-C---ACAT-ATA-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CACGTC-CA-A--C-TG-C----A--TA--C-ACTACT-----A----T--GC--------AT------G-------T------T-AC--A-A-T-TG--TA-T-T--AT---T--G---GAAA------T--A-TCTT----------------A-GC---A-TT---C-C--A-A-----G--C-A------A---TGA--------G--T-T--CA-AATACGT-A---A-C-GT---ac
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gi|24 : TGA-C-TAT-A-T--A---T-T----AG-TT--T--T-GAA---T---AC------T-T-A-A-A---GTT-C---T-T---TT--T-----CGC--T-CA-A--C-TG-CA---A--TA--A-AC-A-A-----T----T--GC--------CT------G-------T-A----T-A---A-A-T-TGA-AA-TAT--AT---T--G---G-GAAGGAACT--A-TCAT----------------G-ACAGTA--C---T-C--A-A-ACT-G--C-A------T---TG---------T--T-CTACA-CAT-CG
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gi|35 : T--T--T-G-A---TT--AC-C---AC-T-T-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CACA--C-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----AA---T--GC--------TT------G-------T-A----T-A---A-T-A-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AA------A--T-TCTT----------------A-GC--TA-TC---T-C--GGA-A-TAG--C------------TG---------T--T-T--CA-AAT-CGTAA---A-C-GT----TGTTT-GA
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gi|44 : -C----A--TA--A-AC-A-T-----A----T--GC--------AA------G-------T-G----T-A---C-A-T-TGA-T----T--AT---T--A---G-AC------T--A-TCTT----------------A-GC--TA-TC---T-C--A-A-A-T-G-----------------------------------------CGT-A---A-C-GT---ATGTTT-GACc
gi|45 : -T-----A----T--GC--------AT------G-------T-A----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AAT-----T--A-TCCTA---------------TAGC--TA-TC---T-C--A-A-A-T-G--C-G------T---TG---------T--T-C--C
gi|43 : ------G-------C-A----T-A---A-A-T-TG--TA-C-T--ATC--T--A---G-AA------TT-A-TCTT----------------G-GC--TA-TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T---TG---------T--G-T--CA-AAT-CGT-A---A-C-GT---AAGTTT-GAC
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gi|47 : catagattctgtgtttgaatgaatatagcctacattcacatgtaagtaggcaatgagagtgtcaaa--AT---T--A---G-AA------T--A-TCTT----------------A-GC--TT-TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T---TG---------A--T-T--GA-AAT-AGT-A---A-A--------GTTT-GACT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|39 : taa---TT--T-----AGC--T-CA-A--A-TA-C----A--TATAA-AC-A-T-----ACATGTG--T--------AA------G-------T-A----C-A---A-G-T-TGA-TA-C-T--GT---T--A---G-AA------T--A-C-C-T--T-----T-GC--TA-----------TA---T--------A-T-G--T-A------CGATA---------T--C-T--CA-AAT-TGtga
gi|4 : TTGA-T-C-AA-A-G--A---T-T--C-AG-TT--G--G-A-A---T---A-------AT-C-G-A-A-----T-A---T-C---AT--T-----AAC--T-CA-A--A-AA-C----A--TA--A-AA-A-T-----A----TG-----------A-----------------A----T-A---A-A-CATAA-TA-G-T--TT---T--A---T-AA------A--A-T-C-T--T-----A-GC--TACGTATGCTA--TC---T-C--A-G-A-T-G--C-ATTGCAGT--TG---------T--T-T--TA-AAT-CGTAA---A-C-GTA---TGCTT-c
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gi|3 : TGA-C-T-A--A-T--A---T-T--T-A--TTAAT--T-G-A---TC--GC-T----AT-TTA-A-A---G-C-TACAT-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--C-TG-CCATTA--T---A-AC-A-T-----A----T---C--------AC------GGTTGGTTT-A----T-AGCTA-A-T-TGA-TA-T-T--AA---T--G---G--A------T--A-T-C-T--C-----A-GC--TAT----------TC---T-C--A-A-A-T-G--T-A------G--TG---------TAGT-T--CA-AAT-CGTAA---A-C-GTG---TGTTTCGACT
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gi|31 : catagattctgtgtttgaatgaatatagcctacattcacatgtaagtaggcaatgagagtgtcaaaTTTGA-C-T-AT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C----AT-T---A-T---G-T-C---T-T---TT--T-----CAT--T-C--A--C-TG-C----A--T---A-AC-A-T-----A----TG--C--------AT------G-------C-A----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-T--AT---T------G-AA------T--A-T---T--T-----A-GC--TA------------C---T----A-A-A-T-G----G------T--TG---------T--T-T--CA-AAT-CGT-A---A---GTA----GTTT-GAC
gi|32 : ---T-T--T-AG-TT--T--T-T-A---T---AC-C----AT-TTA-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--A-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----GG--C--------AA------G-------T-A----T-A---A-A-T-TTG-TA---T--AT---T--A---G-AA------T--A-T-C-T--T-----A-GC--TA-----------TC---T-TG-A-A-A-A-G--C-A------T--TGT--------T--T-T--CA-AAT-CGT-A---A-C-GTA---AGTTT-GAC
gi|33 : TTTA-C-T-AG-A-T--A---T-TGAT-AG-TT--TC-T-G-A---T---AG-C----ATAT-A-A-A---G-T-C---T-T---TT--------CAC--T-CA-A--C-GG-C----A--TG--A-AC-A-T-----A----TG--C----------------G-------T-A----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-A--TT---T--G---G-AA------T--A-T-C-T--T-----A-GCT-TA-----------TC---T-C----A-A-T-G--C-A------T--TG---------T--C---------------------C-GTA---TGTTT-GAC
gi|34 : gTTTGA-C-T------T------T-T--T-AG-TC--TGTT-G-A---TTT-AC-------T-T-A-A-T---A-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-TA-AT-C-TG-C-------TA--A-AT-A-T----------TG-----------GT------G-------T-A----T-A---A-T-T-TGA-T----T--AT---T--G---G-AA------T--A-T-T-T--T-----A-GC--TA-----------TT---C-T--ATA-T-T-G--C-A------T--TG---------T--T-T--CA-AAT-------------GTA---TGTT
gi|35 : T--T--T-G-A---TT--AC-C----AC-T-T-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CACA--C-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----AA---TG--C--------TT------G-------T-A----T-A---A-T-A-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AA------A--T-T-C-T--T-----A-GC--TA-----------TC---T-C--GGA-A-TAG--C-----------TG---------T--T-T--CA-AAT-CGTAA---A-C-GT----TGTTT-GAatgtt
gi|36 : agTTGAAC-T-AT-AAT--A---T-A--T-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-CT---AT-T-A-A-A---G-T-------T---TT--T-----CAC--T-CA-A--C-TG-C----A--TA--A-ACAA-T-----A----TG--CTTAGATAGAT------G-------T-ATATCT-A---G-A-T-TGAGCA-T-T--AT---T------G-AA------T--A-T-T-G--T-------GC--TA-----------
gi|37 : TGA-C-T-A--A-TC-A---T-T--T-AG-TG--T--T-G-A---T---AC-C----AC-T-ATA-A---G-TAC---T-T---TT--T-----CAC--T-AA-A--C-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----TG--C--------AT------GT------T-A----T-AC--A-A-T-TGA-TA-T-T--ATCTGT--G---A-CA------T--A-T-C-T--A-----A-GC--TA-----------TC---c
gi|38 : ta------G-------T-A----G-A---A-A-T-TGA-TA-G-T--GT---T--A---G-AA------T--A-T-C-T--TGAGTTA-GT--TACACGTATGATATT---T-C--A-A-A-T-G--T-AGTT---TG-TG---------T--T-T--CA-AGC-TGT-A---A-C-CTA---T-TTT-atc
gi|39 : taa---TT--T-----AGC--T-CA-A--A-TA-C----A--TATAA-AC-A-T-----ACATGTG--T--------AA------G-------T-A----C-A---A-G-T-TGA-TA-C-T--GT---T--A---G-AA------T--A-C-C-T--T-----T-GC--TA-----------TA---T--------A-T-G--T-A------CGATA---------T--C-T--CA-AAT-TGtga
gi|4 : TTGA-T-C-AA-A-G--A---T-T--C-AG-TT--G--G-A-A---T---A-------AT-C-G-A-A-----T-A---T-C---AT--T-----AAC--T-CA-A--A-AA-C----A--TA--A-AA-A-T-----A----TG-----------A-----------------A----T-A---A-A-CATAA-TA-G-T--TT---T--A---T-AA------A--A-T-C-T--T-----A-GC--TACGTATGCTA--TC---T-C--A-G-A-T-G--C-ATTGCAGT--TG---------T--T-T--TA-AAT-CGTAA---A-C-GTA---TGCTT-c
gi|40 : TTTCA-C-T-AT-A-T--A---T-T--C-AG-TT--T--A-G-G---T---AT-CATTAAT-T-A-A-A---G---C---C-T---AT--T-----CAC--T------------------------A-AT-A-T-----A----AG--T---------T------G----------------A---A-A-T-TGA-TA-G-T--GTA--C--A---T-AA------C--A-T-C-T--T-----A-GC--
gi|42 : atTTTGA-C-T-AT-A-T--A---T-T--TTAG-TT--T--T-G-A---T---AC-A----TT-T-A-A-A---G-G-C---T-T---TT--C-----CAT--T-CACA--G-TGAG----A--TA--A-AC-
gi|43 : tg------G-------C-A----T-A---A-A-T-TG--TA-C-T--ATC--T--A---G-AA------TT-A-T-C-T--T-----G-GC--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------T--G-T--CA-AAT-CGT-A---A-C-GTA---AGTTT-GACcattcaataat
gi|44 : -C----A--TA--A-AC-A-T-----A----TG--C--------AA------G-------T-G----T-A---C-A-T-TGA-T----T--AT---T--A---G-AC------T--A-T-C-T--T-----A-GC--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G----------------------------------------CGT-A---A-C-GTA---TGTTT-GAC
gi|45 : -T-----A----TG--C--------AT------G-------T-A----T-A---A-A-T-TGA-TA-T-T--AT---T--G---G-AAT-----T--A-T-C-CTAT-----A-GC--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-G------T--TG---------T--T-C--C
gi|46 : A-C-T-CT-G-T--A---T-T--C-AG-TT--T----G-A---T---AC-C----AT-T-A-A-A---G-T-AA--T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--C-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----TG--C--------
gi|47 : --AT---T--A---G-AA------T--A-T-C-T--T-----A-GC--TT-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------A--T-T--GA-AAT-AGT-A---A-----A----GTTT-GACT
gi|48 : GA-C-C-AT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C----AT-T-A-A-A---G-T-A---T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--A-TG-C----
gi|5 : TTTGA-C-TTAT-A----A---T-T--T-AT-GT--T--T-G-A---T---AC-------T-C-A-A-ATAGG-T-C---C-T---TT--TGT---CGC--T-CA-AAAC-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----TG--CCTC-----AT------G-------T-A----C-A---A-A-T-TGA-TATT-T--AT---T--G---G-AA------T--T-T-C-T--T-----A--C--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-C------A--TG---------T--TGT--CA-AAT-CGT-A---A---GTA----G-TT-GAC
gi|6 : TTGA---T-ATTA-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-AC--T---AC-C----ACAT-ATA-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CACGTC-CA-A--C-TG-C----A--TA--C-ACTACT-----A----TG--C--------AT------G-------T------T-AC--A-A-T-TG--TA-T-T--AT---T--G---GAAA------T--A-T-C-T--T-----A-GC---A-----------TT---C-C--A-A-----G--C-A------A--TGA--------G--T-T--CA-AATACGT-A---A-C-GTA---GGT
gi|7 : tgtc-T-AT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---GC-C----AT-T-A-A-A---A-T-T---TAT---TT--TTTCCACAC--T-CA-A--TATG-C----A--TA--T-AC-A-G-----A----TC--C--------A-------A-------A-G----T-G---A-A-T-TGA-TA-G-TA-AT---T--A---G-AA------T--A-T-CTT--T-----A-GCT-TA-----------TC---TAA--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------T--T-T--AA-AATGGGT-A---A-CGGTG---TGTTT-GAat
gi|8 : g-A-T--A---T-T--T-A--TT--T--T-G-A---T---AC-CCA--GT-T-A-ATA---G-T-A---T-T---TT--------CAC--T-CA-A--A-TG-C----A--TA--A-ACAA-T-----A----TA--C--------ATCAA---G-------T-A------G---A-A-TATGAGTA-G-T--ATAG-A--G---A-AA------TA-A-T-C-T--T-----ATGC--GA-----------TCGTGT-T--A-A-A-TCG--C-A------T--TG---------T--T-T--CA-AA--CGT-AC--A-C-GTG---TGTTT-
gi|9 : cTTGA-C-C-AT-A-T--A---T-T--A-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C----AT-T-A-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--A-TG-C----A--TT--A-AC-A-T-----A----TG--C--------TTTGCCAAG-------T-A----T-A---A-A-T-TTA-TA-T-T--GT---T--A---A-AA------T--C-T-C-T--T-----A-GC--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------T--T-T--CA-TAT-CGT-A---A-C-GTA---TGTTT-GACtga
blockSeqs : A C T T A CT CAT A CC T A AA GT . A CAT TTT CATTA A T T T TAG T A ACA A ATG CA TTCCA GT T C AAC CATT . TA A TA CATG AA TTAGATAGAT GTTGGTT A TATC G GCT A G TA AA CTG TTA AGGAAC T G T TA GAGTT AG CGCGAATGATA GTG CG T C A A TTGCAG GA CAGTTCGTA AG TA T A A GTT C G ACG C
blockSeqs : . . . . . C AT A GA . . . A . C C TT CCA A T T . . . . A . . . GT . T C CC A . . T . AT . TTTGCCAA T A . T C A G TT A AG TG T T . T . GAGTT T CACGTATGATA . TA G C C C GTT G T . . . G A C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . C . . . C AC . . . . . . . . . . . G . . . TC A . . A . A . ATATAA . . . . C . . T . A G . A . . . A T CACGTATGATA . AA . . . . GTT G A . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T CA . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . CTCAT . . . . . . . T . C A . . . . . . . CGTATGCTA . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . ATCAA . . . . . . . C . . G . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AAA . . . . . . . T . . A . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AT . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AA . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AA . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . TT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AA . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . AT . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . TT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AA . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CT . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AC . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AA . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . GT . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . TT . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AA . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . AA . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AT . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . AT . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATAGTGTTATAAAAGCCGCATTAGCTTAGCTACATATGGTATCTCAGATGCATTGTAGCTCGTATTTCAATTGTA
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gi|46 : A-C-T-CT-G-T--A---T-T--C-AG-TT--T----G-A---T---AC-C----AT-T-A-A-A---G-T-AA--T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--C-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----TG--C--------
gi|47 : --AT---T--A---G-AA------T--A-T-C-T--T-----A-GC--TT-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------A--T-T--GA-AAT-AGT-A---A-----A----GTTT-GACT
gi|48 : GA-C-C-AT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C----AT-T-A-A-A---G-T-A---T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--A-TG-C----
gi|5 : TTTGA-C-TTAT-A----A---T-T--T-AT-GT--T--T-G-A---T---AC-------T-C-A-A-ATAGG-T-C---C-T---TT--TGT---CGC--T-CA-AAAC-TG-C----A--TA--A-AC-A-T-----A----TG--CCTC-----AT------G-------T-A----C-A---A-A-T-TGA-TATT-T--AT---T--G---G-AA------T--T-T-C-T--T-----A--C--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-C------A--TG---------T--TGT--CA-AAT-CGT-A---A---GTA----G-TT-GAC
gi|6 : TTGA---T-ATTA-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-AC--T---AC-C----ACAT-ATA-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CACGTC-CA-A--C-TG-C----A--TA--C-ACTACT-----A----TG--C--------AT------G-------T------T-AC--A-A-T-TG--TA-T-T--AT---T--G---GAAA------T--A-T-C-T--T-----A-GC---A-----------TT---C-C--A-A-----G--C-A------A--TGA--------G--T-T--CA-AATACGT-A---A-C-GTA---GGT
gi|7 : tgtc-T-AT-A-T--A---T-T--T-AG-TT--T--T-G-A---T---GC-C----AT-T-A-A-A---A-T-T---TAT---TT--TTTCCACAC--T-CA-A--TATG-C----A--TA--T-AC-A-G-----A----TC--C--------A-------A-------A-G----T-G---A-A-T-TGA-TA-G-TA-AT---T--A---G-AA------T--A-T-CTT--T-----A-GCT-TA-----------TC---TAA--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------T--T-T--AA-AATGGGT-A---A-CGGTG---TGTTT-GAat
gi|8 : g-A-T--A---T-T--T-A--TT--T--T-G-A---T---AC-CCA--GT-T-A-ATA---G-T-A---T-T---TT--------CAC--T-CA-A--A-TG-C----A--TA--A-ACAA-T-----A----TA--C--------ATCAA---G-------T-A------G---A-A-TATGAGTA-G-T--ATAG-A--G---A-AA------TA-A-T-C-T--T-----ATGC--GA-----------TCGTGT-T--A-A-A-TCG--C-A------T--TG---------T--T-T--CA-AA--CGT-AC--A-C-GTG---TGTTT-
gi|9 : cTTGA-C-C-AT-A-T--A---T-T--A-AG-TT--T--T-G-A---T---AC-C----AT-T-A-A-A---G-T-C---T-T---TT--T-----CAC--T-CA-A--A-TG-C----A--TT--A-AC-A-T-----A----TG--C--------TTTGCCAAG-------T-A----T-A---A-A-T-TTA-TA-T-T--GT---T--A---A-AA------T--C-T-C-T--T-----A-GC--TA-----------TC---T-C--A-A-A-T-G--C-A------T--TG---------T--T-T--CA-TAT-CGT-A---A-C-GTA---TGTTT-GACtga
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|41 ): ATAGTGTTATAAAAGCCGCATTAGCTTAGCTACATATGGTATCTCAGATGCATTGTAGCTCGTATTTCAATTGTA