lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                    11111111    1111111                                                                                                                                                                                                                           11111                                                99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999                                                                  111                             111                 9999999999999999999999999999999999                                  22222222                                                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                    22222222    4444444    9999999999  4 6666       2  2  333        8888   22 4      2     888     2  2 2   22   2 2 2 2    2      2  2   7   1       77 2 3333    0 33  5555 77     444   2 2  2  2  2   6666  2 2 2 2     6 2     1 2  2  2    77777  444              2 2   33 2   6666 33 2  333  00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2   7777777 2 5555 2 2   7   7   777777 2 5   33  3333  33    33 777 33   5  2 2  2 2 2  55  33  777   99999999   2  1111111111111111111111111111111111    33  2   2 33   2 2   33  2    55555555  55      2 2  77    33 2 2      2 999    2   2  6666  2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                    ........    .......    ..........  . ....       .  .  ...        ....   .. .      .     ...     .  . .   ..   . . . .    .      .  .   .   .       .. . ....    . ..  .... ..     ...   . .  .  .  .   ....  . . . .     . .     . .  .  .    .....  ...              . .   .. .   .... .. .  ...  .................................................................... .   ....... . .... . .   .   .   ...... . .   ..  ....  ..    .. ... ..   .  . .  . . .  ..  ..  ...   ........   .  ..................................    ..  .   . ..   . .   ..  .    ........  ..      . .  ..    .. . .      . ...    .   .  ....  .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                    66666666    4444444    7777777777  4 9999       4  4  999        6666   99 2      1     555     1  1 1   99   2 2 1 1    4      5  5   5   9       99 4 8888    6 11  1111 99     111   4 4  4  4  4   6666  4 4 2 2     7 2     1 4  4  4    33333  111              4 4   11 2   9999 11 2  999  44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2   6666666 4 0000 4 4   1   5   777777 7 6   99  9999  77    77 444 77   3  7 5  5 5 5  99  44  222   11111111   5  4444444444444444444444444444444444    22  4   4 22   4 4   22  4    66666666  66      4 4  99    22 4 5      5 111    5   5  1111  7     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                        GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATT----CTCG-T-TCGGTT-CGGTT-C-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-TC-AATG-A--TAT---TCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGC-TAG-A--AA--TTGC--A-T-G--GAT-AT-G-GA-T-G-CA--GG--AT-N-GGA--------ATT-TT-A--CA-----ATTTT-ATAAGAA---AAAGTGGAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGCT-A------TC--GCAATC-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GC--GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
Reference ( gi|5 )            :                                                                                                                                                                                                                                        GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATT----CTCG-T-TCGGTT-CGGTT-C-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-TC-AATG-G--CAT---TCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CATGC-TAG-A--AA--TTGC--A-G-G--GAT-AT-G-GA-T-G-CA--GG--AT-T-GGA--------ATT-TT-G--CA-----ATTTC-ATAAGAATTCAAAGTGAAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGCT-T------TC--ACAATC-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GT--GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                        GCTGT-ACGGTTTAAACCGAAACC-------GAAA----------AAAT----CGGTTAA-CC-GCTTTGGTGAATT----CTCGATGTCGGTT-CGGTT-C-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A--TTC-GGTTCG-GT-TTTGGTTTAC-----------------CAT--TTGGC-T--TTTTT---CGCTT-AC-ACGGT-GTTGC--TGAA-T-TGGGTTCGG-ATATTTAGTA-TC-AATGTGATTAT---TCCAACC-ATGGAA-TATCC--A-TAT----ATTA-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----ATA-CGG-AGCTGA----------ACGCTTAG-ATTAT--TTGC--G-GTGCCGAT-AG-G-GA-T-GACA--GG--AT-T-GGA--------A-T-TT-A--CAGAT--ATTTA-TTAAG-----AAAGTGGAAGT--CA-AAG-GATTTT-T-AATGGAA-AGCC-TA-----TC--ACAATC-T-GC--AAAT--A-T-TCAAG--GC--GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                        GCTGTCACGGTT--------AACCGAAACC-GAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATtatgatcggcgggtagcttctgtggttcaatgttcgcttcgtacctgaaggtgtgtgttctagttcccactcaaacttgaggacaccatgatctgattgcttcccgaacgctcggcattcagaactagtgagttgcgcgaatccttaaaatcgaggtcacacatcacggacagactaacgaccgtaagcgctattatgtattagttcgaattttcttagtattcaccaa
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                       gGCTGTCATGGTT--------AACCGAAAACCGAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTAAAT
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                       gGCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CGG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                      gaGCTGTCACGGTT-----------C--------AAA----------CA-TTTTTCGGTTCA-GT-TC---AGGAAACTGAACCTCG-G-TTTTTT-CGGTT-C-GGTTT--T-A-TTT--TGT-G-T-A-TT
gi|12                         :                                         atctaaattaaaactgttttaaaagcttttgattattgttgtatgtacactatgtcattcttgccatgaatattacatatgttatattatattgctgaatagaatttattaaacttagatgtgtgcatttgtacacccattttacgtctagggtcctcaagataccttgattcatgaaatttattttatttGCTGTCACGGTTCAA-----GATC-------TAAATTTTTCGGTGGT-T----CGGTTCA-CC-G-------AAACTGAA-C-CG-T--CGGTTTCGGTT-T-GGTTT-TT-A-TTT--Tcc
gi|7                          : agcctatagtcggttaagggactggtcttttaaagctggatagctacgttctttgttggactgttgttctctaaccataatgtcttatccttgcatgaaggttatacatatgttatattgcttgtgaataaatttttttatatttagtgtgcatttgatacacccattttacttcctgggtcctcaaagattcctgggatttcatggaaagattattttggatttattacacCTGTCACGGTT--------AACC-------CGAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATT----CTAG-T-TCGGTT-CGGTT---------GC-A-TTT--TCC-G-G-AATTTC-GGTTCA-GT-TTT-GTT-ACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT--TTC--TTTTT---CAC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-TC-ATTT-A--TAT---TCCAACCAATGGAA-T--CC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATATCATTGTTGGTAAA-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGC-TAG-A--A---TTGCGCA-T-G--GAT-AT-G-GA-T-G-CA--GG--ATATAGGA--------ATT-TT-----A-----A---C-A----AATTTA--------GT--CA-AAG-A--TTT-TTAAT--AA-AGCT-A------TC--GCAGTC-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGT-GTGCGAGT-TTA-AGT---Tc
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                         CTGTCACGGTT--------AACC-------GAAA----------AA-T----TGGTTAA-CT-GT---GGTAAATA----CTC-------ATT-CAGTT-C-AGTTT-GC-A-TTT--TCT-G-A-A-TTTC-GGTTCT-GT-TTT-GTTTACATTTT--ACA-ATGTTCCAT--TT--T-cctgca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                           GTAACGGTT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATT----CTCG-T-TCGGTT-CGGTT-C-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTT-GTTCACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-TC-ATTG-A--TGT---TCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------GTAATAACCTGTTTGTT--------------A---------------A-AAC-------A-T----A-A-CAT-GGC-GAC------A--GTGC-TAG-A--AATGTTGC--ATG-G--GAT-AT-G-GA-T-G-CA--GAGTAT-TAGGA--------ATC-T-------------TTTA-ACAAAAATTT--------AGT--CA-AAGAA--TTT-T-AAT--AA-AAGT-TCATAACTCT-GCAGTC-TAGC--AAATTGA-T-TC-AGC-GC--GAGTGTTG-AATGTGTA-TGAAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                           GTCACG-TT--------AACA-------GAAA----------A--T----CGGTTTA-AC-G----GGTA--TT----TTCG-T---AGGT-CGGTTTC-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-ATT--CTAC-T--TT--T-T--TTTTT---CGT-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-G-GGTCC-G--TGATTA-TA-T---GT--G--CATGAATCGAACCAATGGAA-T-TCCATA-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------T-AGCCTGTGGTA-AAAGCA-A-CATGGGC-GAC------AGCGTGC-AAA-T--AA--TTGC--A-T-G--GAT-AT-G-GAGT-G-CAC-GG--ATAG-GGA--------ATTGTT-AACCA-----ATATC--TAAG---TCA-------------A-AAG-A--TTTGT-AAT--AAGAGCT-A------TCGAACAGTC-T-GCAAAAAT--A-TCTCAAGC-GC--AAGT-TTA-AGT---TA-t
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                           GTCACAATT--------ATCC-------AAAA----------AA-T----CGGTTAA-TC-GC---GGTAAATA----CACA-T-TCGGTT-CTGTT-A-AGTTT-GT-T-CTT--TCA-G-G-A-TTTC-GGgtgtcaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                          tcTCA-GGTT--------AACC-------AAAA----------AAAT----CG-------T-GC---GGTAAATT----CT-----TCGGT--CGGTT-C-GGTTT-GC-A-TTTATTCC-G-G-A-TTTC-AAGTCG--T-TTT-GTT-ACTTTTTT-A-A-A--CTACAT--TT--T-C--TTTTTTGTCGC-TTAC-AC-GC-TTT-C--TT-T-A-T-GGTTC-G-ATATTTA-TAATC-AATG-A--T-T---TCCAACCAATGGAAAT-TCC--A-TAT----A--AACA---TCT-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-ATCATCGGC-GAC------A-CGTGC-TGG-A--AA--TTGC--A-T-G--GAT-AT-G-AA---G-TA--GG--AT-T-GGG--------ATT-TT-A--CA-----ATTTTTATAAGAA------GTGAAAG----------A--TTT-T-AAT--AA-AGCA-TGA----TC--ACAATCCT-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GC--GAGT-TGA-AGT---TA-TGCAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                             CACGGTT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---AGTAAATT----CTCG-T-TCGGTT-CGGTT------TT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-TGGTCGTGT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-TAT-GGTTC-G--TATTTA-TA-TC-ATTG-A--TAT---TCCAACCAATGGAA-T-TTC--A-TGT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATAACATGTTGGTA--A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGC-TAG-A--AA--TTGC--A-T-G--GAT-AT-G-GA-T-G-CACAGG--ATATAGGA--------ATT-TT-A--CA-----A-----------ATTCA--------GT--CA-AAG----TTT-T-AAT--AA-AGCT-A------TC--GCAGTC-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GCA-AAGT-TTA-AGT---TATTGCAAta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                             CACGGGT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CG-TTAA-CCCGC---GGTAAATT----CTC--T-T---TT-CGGTTTC-GGTTTTGC-A-TTT--TTCTG-G-A-TTTC-GGT-CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A----CTACACACTT--T-CCTTTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-CTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-A-TA-TC-AATG-A--TAT---TCCAACCAATAGAA---TCC--ACTAT----A--A-CA---TCGGTATACATGTTA-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CA--GGCGGAC------A-CGTGC-TAG-----A--T---------G--GA--AT-G-GA-T-G-CA--GA--AT-A-GGG--------ATT-TT-A--TATTTTTATTTC--TAAG-----AAAG-GAAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGTTAT------GC--GCAATC-T-GC---AAT--A-T-TCAAGC-GT--GAGT-TTA-AGT---TA-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                GATT--------AACC-------GAAA----------AG-C----TGATTAA-CT-GT---GATAAATA----CTCA-A-TAGGTT-CGATT-C-AGTC--GC-A-TTT--TCT-G-G-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTT-GTTTACATTGT--A-C-A--CTACCC--TA--T-T--ATGTA---TGC-T-AC-A---T-GTT-CTATG-A-T-T-GGT--------------------ATG-A--TAT---TCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TGT----A--A-CA---TCACGAAA--------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----G-A-CAT-G----------------TGC---------A--TTGT--G-G-G--AAT---------------------AC-T-ATA--------ATT-TT------------TTTA-AGAAGG----GGGGGGGGGGTTCCAGAAG-A--TTT-T-AAC--AA-AGCA-A------TC--AC--TA-T-GCA-AAAT--A-T-TCAAGC-CT--GAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtgc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                            tggtaaaT--------AACC-------GAAA----------AA-T----CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATT----CTCG-T-TCG-------TT-A-CATTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TT---GGTTCG-GT-T---GTTTACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT----C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-TTC-T--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-CC-AATG-A--TAT---TCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATACATGTAGGT----A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGC-TAG-A--AA--TTGC--A-T-G--GGT-ATGG-GA-T-G-CA--GG--AT-A-GGG--------ATT-TT-A--CA-----AATTT-ATAAG-----AAAGTGGAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGTT-A------TC--GCAATC-T-GC--AAAT--A-T-TGAAGT-GC--GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAAta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                    --------AACC-------GAAA----------AA-TT---CGGTTAAACC-GC---GGTAAATT----CTCG-TGTCG-TT-CG-TT-A-CATTT-GC-AATTT--TCC-GAG-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A-A--CTACAT--TT--T-C--TTTTT---CG--T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T---GGTTCTG-ATATT-A-TA-CCGAATG-A--TAT---TCCAACCAATG-AA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TCTCGGTATACATGTAG------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CATTGGC-GAC------A-CGTGC-TAG-A--AA--TTGC--A-T-G--GGT-AT-G-GA-T-G-CA--GG--AT-A-GGG--------ATT-TTAA--CA-----AATTT-ATAAG-----AAAGTGGAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT---A-AGTT-A------TC--GCAATC-T-GC--AAAT--A-T-TGAAGT-GC--GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA----------AA-T----CGATTAT-CC-AC---GGTAAATA----CTCA-T-TCGGTT-CGATT-T-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-A-G-A-TTTC-AGTTTG-GT-TTT-GTATACTTTTT--A-A-A--CTACTC--TA--C-C--TTATT---TGC-T-AT-AT-GC-ACT-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-TC-AATA-A--TAT---TCAAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-TA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C---GGTAAATT----CTCA-T-TCGGCT-CGATT-C-GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-GGTTCG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A-A--CTATCT--TT--T-C--CTGTT---TGC-A-AC-AC-GC-GCT-A--TG-T-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-TA-TC-AATG-A--TAT---TCTAGCCAATGGAT-T-TCC--A-TAT----A--A-CC---CC--------------GGTAAAAG---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGC-AAG-A--AA--TTGC--A-T-G--GAT-GT-G-AA-T-C-CA--GG--AT-A-GGA--------ATT-TT-A--TT-----ATTTT-ATAAG-----AAAGTGGGAGT--CC-AAG-A--ATT-T-ggtaa
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTAAATT----CTCA-T-TCGGTT-CGATT-C-GATTT-GCTT-TTT--TTC-G-G-A-TTccta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAAATT----CTCG-T-TCAGTT-C-------GGTTT-GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTTCG-GT-TTT-GCTTACTTCTTTAA-A-A--CTA-AT--TT--T-CT-TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTCC-GAATATTTA-TA-TC-AATG-A--TAT---TCCAATCAATGGAA-T-TCC--A--ATC---A--A-CAATTCC--------------G------G---------------TATACGCTGTTGGGAA---------------A-AAC-------ACA----A-C-CAT-TGC-GAC------A-CGTGC-AAGAA--AA--TGGC--A-T-G--GATAAT-GCGA-T-G-CA--GG--AT-A-AGA--------ATT-TT-A--CA----------------AATT--------AAGT--CA-AAG-A--TTT-C-AAT--AA-AGCT-A------TC--ACAGTC-T-GA--AAAT--A-T-TCAAGC-GC--GAGT-TTA-AGT---TA-TGC
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCG-T-TCGGTT-CGGTT-CCGGTTT-GC-A-GTT--TCC-G-GTA-TTTCCGGTTCG-GT-TTT-GTT------------------TACAT--TT--T-CT-TTTTT---CGC-T-ACAAC-GCGGTT-C--TG-ATT-T-GGTTC-G-ATATT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A-TTTC---TTCG-TCATTT-GT--ACTTTTTT-A-A-A--CTACAT--TT--TGC--TTT-----CG--T-A--AC-GC-GTT-TCTTG-A-T---GGTT--G-ATATT-A-TA--C-AATG-A--TAT----CCAACCA-TGGAA-T-TCC--A--------A--A--A---T---------------G------A---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGCAGACCGTGTCA-CGTGT-TAG-A--AA--TTGC--A-T-G--TAT-AT-G-GA-TTG-C---GG--AT-T-GAA--------ATT-TT----------------------AAT--AAAGTGAATTC--CA-AA-----CTA-T-AA----A-AGCT-A------TC--ACAATC-T-TG--AAAT--AAT-TCAAACCGC--GAGT-TTA-AGT---TA-TGTAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTACTTTC-------A--GTAC-T--TT--G-A--TTGTT---TGC-T-AC-AC-AC-GCC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATTTA-CA-TC-AATG-A--TAT---TTTAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TATATTAA--A-CA---TCGCTAA---------G------G---------------T--------------G---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GCC-GAT------A-CGTGC-AAG-A--AA--TTTC--ATA-T--GATGAT-G-GT-T-G-CA--GG--AT-A-GGAATTTAATTATT-TT-A--CA-----ATTTT-ATAAG-----AAAGTGGGAGT--CA-AAT-A--ATT-T-AAT--AA-AGCT-A------TC--ACAATC-T-GC--AAAT--A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAT--TT--C-C--TTT------GC-T-----T-GC-GTC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ACATTTT-TA-TC-AATG-----AT------GACCAGTGGAG-T-TCT--A-CGT----A--A--A---TT--------------G------T---------------T--------------A---------------ATAGT-------A-A----A-A-AAT-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatcc-T-GGTTCAG-ATATTTA-TA-TC-AATG-A--TAT---TCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------GG--------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-G-C-GAC------A-CGTGC-TAG-A--AA--TTGC--A-T-G--GAT-A--G-GA-T-A-CA--GG--AT-T-GGA--------ATT-TT-A--CA-----ATTTT-ATAAGGA----AAGTGGAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGCT-A------TC--ACAATC-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GC--GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAAtg
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C--A-TAT----A--A-CA---TT--------------G------G---------------T--------------ATACCTGTTGGTA---A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-G
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GA-T-A-CA--GG--AT-T-GGA--------ATT-TT-A--CA-----ATTTT-ATAAGAA
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGCT-A------TC--GTAATA-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GC--AAGT-TTA-AG----TA-TGCAA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccaatatagtgcgtccAAAGT--CA-AAG-A--TTT-T-AAT--AA-AGCT-A------TC--GTAATA-T-GC--AAAT--A-T-TCAAGC-GC--AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtag
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccaatatagtgcgtcc--AA-AGCA-A------TC--ACAATC-T-GCT-AAAT--A-T-TCAAGC-GC--GGG---TAGAGG---TA-TGCtag
31 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): GATCGCCGAATTGAACAGCTAAGCAAATTGGCAAGGTTAGCTCAGTGGGGCATTGTAGTTGATGTGGATCAGCTTCGTGAACCGGAAAAATGTGTGTGTTCGAGTCCTCCACTCAAGACTTGTAGACGGTTTGACTTCCCAAAGATTACGCACTGCATATCACTAGACTGGAGAGACTGCGGATCATTAGGTTATGACCTTAAAATTGGAAGGGTCCACATATCACGACAGGGCCGGTTGTTATGGATCTATCAGTTCTAAAGAAAATCCTTCCTGATCTACAGACCGTAAGCGCCTATGGATATAGTCTAAATTTTCGAAGTACCTCACCAAGAACGACCGGTAATATTAGTCAGATTAAGACGTACTTATGTTATAAAGCTTCTTGTTGATCTGATTTGTATATGCTACATCAATGTCATCCTTGATGTAATATTACCATATATGTTATTATGTGAATAAATTTAGTAAACTTGTGATGTGTGCATTTGTACACCCAGGGTTTTACGTTCTAGGCGTCCTCAAAAACCTTGATTGGCATGAAATTTTTATTTATTTAAGGTTACAACCAAAAAGTACAACTTATCCGGAATTTTAGCCAAGAATAAAAAACTGCCAAAACCGGACGTTTCAATTTCCGTGAAACCTGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|15 ): TATAGTCGATTAGAGCTGCTTTTAAAGTTTTGCTGATGTTGTATTGTACAATTAATGTATCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCATTTGTACACCCATTGTACTTCTAGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTCATTTTATTTAATACACAAAATAAAACGAACCGAAAAAAAACGAAACCGAAAAAACCGAAAACTGAGGTTCAATTTCCTGAAGACCGAACTGAAAATGTCTGACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|16 ): GCCCTATAGTCGATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTGATTGTGTATTTGCACAATTAATGTCATCCTTGCATGAATTTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCCTTTGTACACCCATTTTTACTTCCATGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAATTAATTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAATCCGAAAACCGAGTTCAGTTTCCTGAACCGAACAAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|17 ): AGCCTATAGTCGGTTAAGACTGCTTTTCTTAAGTCTTTTGTTGACTGTTGTATTGTACATAATGTCATCCTTGCATGAATTATACATATGTTATATTGCTGAATAAATTTTTTATACTTTAATTGTGTGCATTGTACACCCATTTTACTTCCTGGGTCCTCAAGATTCCTGGATTCATGAAAATTAATTTTATTTATTACACAAAATAAAAACCAAACCGAAACCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATTATCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|18 ): GCCTTATAGTCTATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTTTTTTAATTGTTGATTGTACCATAATGTCATCCTTGCATGAATATTACATGGTATATTGCTTGATAGAATTTATTAAACCATTGGTCGTGTTGCCTTTGTCACCCCATTTTACTTTCAAATGGTCCTCAAGATACCTGGATTTCATGAAATTAATTTATTTTATTACACAAAATAAAAACCGAACTGAAAAAAACGAAACGAGTTCAGTTTCCTGAACCGGAACCGAACGATGTCGAACCGCTGA
Unaligned ( gi|19 ): ACGTGCTTGTTTAAAGCTTTGTTGGGTTGTTGTATTGTACATATGTGTCATCCTTGCCTGGATATTACATATGTTATATTGCTAAATATGAATTTATTAAACTGTTGGTGGTGCATTTTGTACATACCCATTTTACCTTCAGGGTCTCAAGATTTACCTGGATTCGATGAAAATATTTTAATTAATACACAAATAATAACGAACCGAGAACCGAAAACCGATGTTCAGTTCCTGAACGGAGACGGAACGAAAATGTTCTGAACCGGTGACAGACC
Unaligned ( gi|20 ): TACAGTTGGTTAAGCTTTTGTTGCTTGTTGCATTGTACCCCGCATTGTACATAATGTCATCCTTGCATAAATATTTCTTATGGTATGTTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTTTGCATTTGCACATCAATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACTTGGATTCAAGAAATTATTTTAATTTATTATTCAAAACAAAACCGAACTGAAATAACCGAAAACCGAGGTTCAGTTTTCTGAACCGAACAGAAAAATGTCTGAACCGTGACAG
Unaligned ( gi|21 ): AATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATACACAAAAATAAAACCGAAAACCAATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAACCGAAAATGTCTGAACCGAGAC
Unaligned ( gi|22 ): ATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAAAACCGATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGAGACATCC
Unaligned ( gi|26 ): GAGCCTGTAGTACTGTAAGATGCTTTTTAGCTTTGTTGCTTTGATGTAATAATAGATCACTCTGCATGATATTAATATTTATGGCTGAATAGAATTTATTATATCTACATGTGTCGTATACTTCCAGGACGCTCAATACTGATCATGAAATAATTTATCATATACAAAAACTAAAACCGATACCGAAAAAAATGAAAACGATTCATTCCTGATCGACCGAACCAGAAAATGTCTAACGTGAAGCTG
Unaligned ( gi|28 ): GATCGGTTTGGTAAGCTCAGTTGTGAATTTTCGTTTCATGACGGAAGGTTGTGTTTCTAGTCCACTCAAAATTGAGCCATGACTGCTTTCCCAAACGTCGACTTCAGATTGATGCGCGATCAGTAGATAGACTTAAAAATTGAGAGCACATATCTCGACAGACGTTGTAAGTTTAAGAAACTTCTACTCACCTGCTAGCGCTATGTAATGTCAAATTTTCAACCTCA
Unaligned ( gi|30 ): TTAAATGAATACTACTTATCTAATATTGCTGAATAAAATTTCTTAGAAATTGGACATTTCCATTGTTACTGATATATACAGCTTTAGGGTATTCATTATTCTTCAAATCTTGGATTCAAGAAATTGTTCTATTTTAACACACAATATAAAACCAAACCAAAAATACCCGAAATGAGGTTTTGTTTCCTGAACCAT
Unaligned ( gi|31 ): ATAATAAACATTAATGTTTGCATTTGTACAGCAATTTTACTTCTAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAAGTAATATTTTAATTTATCACACAAAATAAAACTGAACCAAAAAAAACACCCAAAAACCAGGGTTTTGTTTCTTGAACCGAACATAACCAAAATATGTCTAAACCGTGACAGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CTGAATAGAATTTATTATACTTTATTGTGTGCATTTGTACACCTATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTTTAATGAAATTAATTTTATTTATAACACAAAATGAAACCGAACCGAAAAAACCGAAAACCGAGGTTCAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|34 ): ATTAGGAGTATAACCTTAATAATCGGAGGTACATTATCCACGACAGGCTTGGCAGTTTAAAAATCCTTCCTACTTTAACGACCGTAAGACGCTACTGTATAGTCTAAATTACTCATGTACCACCCAAGC
Unaligned ( gi|35 ): GATCGCGGTTAGCCTAAACAGTGTTTTAAGTCGGCTTCGTAACGGAAATGATTGATGTGTCCCCTTCTAGTCACCACTCAAAATCTTGAGGGACCACATGACTGCTCTTTCCCAACACGCTCGGCAT
Unaligned ( gi|36 ): ATTAATTTATCACACAAAATAAAACTGCAAAAAGGAAATACACCCCCCCCCCTAAATAAAATTTCAAAATCCGACGCTTTGTTTCCTGAATTGAACCGAAAAATGGTTGACCCATAACAGCTTC
Unaligned ( gi|37 ): GAGTTTAAGTATGCAATAGGATCGCGGTACAGTACCTCAGTGGTAGCTAGAATGTTCGCTTCGTGACCGAAAGATCGTGTGTTCTATAGTTCCTCTCAAACCTGAGACACATGAC
Unaligned ( gi|38 ): GCTTCGTGACCGGAAGGTTGTGTGTTCTAGCTAGTCCTATTCAAACTTGAGACACGTGACTGCTTTTCCCAAACGCTTGGCATTAAGACTTGAGAGCCGCGGATCATTAGGATA
Unaligned ( gi|40 ): TGTCTATTAAGACTGCTTTTTGAAAAGCTGTTTTGATGTGTCTGTATTGTCATGATGTCATCTTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGAACATTTTAAACT
Unaligned ( gi|47 ): TAGTCAGTTAAGACTGCTTTTGAAAACTTTGTTACTTGTTGTATTGTACAGTATGTTATCCTTGCAAGAA
Unaligned ( gi|48 ): TACACAAAATAAAACCGAACTGAAAAAAACCGAAAGCCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCG
Unaligned ( gi|49 ): AGGCGTTGTCATATTTAGGAACCTTTACTACCAAGACCGAAACCATCAAGTTATGTCTAATTATG
Unaligned ( gi|50 ): CGAAAACCGAGGTTAAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTATGAACCATGACAGCCC
Unaligned ( gi|51 ): AGCCTATAGTCAGAGACTGATTTTTTAAGCTTTTGTTGATTGTTGTATTGTACATA
Unaligned ( gi|52 ): CTACGACCGTAAGTGCTATAGTATGAATAGGTCTAATTTTCAGTACCTCATCCAG
Unaligned ( gi|54 ): GGATCGCGGTAGCTCAGTGGATTAGAAAAATGTAACCTTCGTCACGAA
Unaligned ( gi|59 ): TGTATAGTTCTAAATAGGTAGTACCTCACCTG
Unaligned ( gi|60 ): CGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCGC
Unaligned ( gi|61 ): GCGGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCCTA
Unaligned ( gi|62 ): CCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCCTAC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                   1111111                                                                                                                                                                                                                                                                   88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                                                                             1111                               333333333333333333333                                                                                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       99999999    5555555      4 2       2  2  333           888888           444   333  44  1 1   22   1 1 1 1    1    22  2  2   6   0       77 2 55 33    0   4444 77     333   2 2  2  2  2   2 66  2 2 2 2     6 2     22 2  2  2  33   2                 2 2   22 2   6666 22 2  333  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2   7777777 2 4444 2 2   6   7   777777 2        2 33  33    55  2 55   5  2 2  4  2  55    0000   88888888   2  2 77  2 777   777777777777777777777   333  55    2 22   2 2   77  2  2 2 4  77777  33    2  2  77    55  2    33 2   2    2   2  5555  2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       ........    .......      . .       .  .  ...           ......           ...   ...  ..  . .   ..   . . . .    .    ..  .  .   .   .       .. . .. ..    .   .... ..     ...   . .  .  .  .   . ..  . . . .     . .     .. .  .  .  ..   .                 . .   .. .   .... .. .  ...  .................................................................... .   ....... . .... . .   .   .   ...... .        . ..  ..    ..  . ..   .  . .  .  .  ..    ....   ........   .  . ..  . ...   .....................   ...  ..    . ..   . .   ..  .  . . .  .....  ..    .  .  ..    ..  .    .. .   .    .   .  ....  .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       11111111    3333333      7 2       4  4  999           444444           111   333  55  9 9   66   9 9 8 8    9    88  0  0   0   6       55 2 33 11    1   3333 55     999   2 2  2  2  2   2 11  2 2 1 1     3 1     66 2  2  2  11   2                 2 2   99 1   6666 99 1  777  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1   2222222 2 7777 2 2   7   1   222222 5        5 44  44    99  5 99   0  5 4  7  4  66    6666   11111111   2  2 55  2 111   000000000000000000000   777  00    1 99   1 1   55  2  2 2 4  88888  11    2  2  55    33  4    22 4   4    4   4  2222  5     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GA-TG-CA--GGAT-A--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAG-A---AAAGTGGAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
Reference ( family-706 )      :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GA-TG-CA--GGAT-N--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAGAA---AAAGTGGAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                               TCA-GGTT--------AACC-------AAAAAAAT-CG-------T-GC---GGTAAATTCT-------TCGGT-CGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTTATTCC-G-G-A-TTTC-AAGT--CG--T-TTT-GTT-ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTTTGTCGC-TTAC-AC-GC-TTT-C--TT-T-A-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TAATC-AA--TGA-T-TTCCAACCAATGGAAAT-TCC--A-TAT----A--AACA---TCT-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-ATCATCGGC-GAC------A-CGTGCTGG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-AA--G-TA--GGAT-T--GGG--------ATT-TT-A--CA-ATT-TTTA----TAAG------AAGTG-----------AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-CATGAT-----CA--CAATCCT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TGA-AGT---TA-TGCAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                      T--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCG------TT-A-CAT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TT---GGTT--CG-GT-T---GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT----C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-TTC-T--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-CC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATACATGTAGGT----A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATGG-GA-TG-CA--GGAT-A--GGG--------ATT-TT-A--CA-A-A-TTTA----TAAG-----AAAGTGGAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAAta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTCTCG-T---TCAGTTC-------GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GCTTACTTCTTTAA-A--A--CTA-ATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTCC-GAATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAATCAATGGAA-T-TCC--A--ATC---A--A-CAATTCC--------------G------G---------------TATACGCTGTTGGGAA---------------A-AAC-------ACA----A-C-CAT-TGC-GAC------A-CGTGCAAGAA--AA--TGGC--AT-G--GATAAT-GCGA-TG-CA--GGAT-A--AGA--------ATT-TT-A--CA-A-A-TT----------------------AAG---TC--AAAG-A--TTT-C-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAGT-CT-GA--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                   GATT--------AACC-------GAAAAG-C-TGATTAA-CT-GT---GATAAATACTCA-A---TAGGTTCGATT-C-AGT---C---GC-A-TTT--TCT-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACATTGT--A-C--A--CTACCCTA--T-T--ATGTA---TGC-T-AC-A---T-GTT-CTATG-A-T-T-GGT---------------------A--TGA-TATTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TGT----A--A-CA---TCACGAAA--------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----G-A-CAT-G-------------------------------TGC--AT------T-GT-G-G------------------GA--------ATA-CT-A--TA-ATT-TTTT----TAAGAA---GGGGGGGGGGGGTTCCAGAAG-A--TTT-T-AAC--AA-AG-C-A-AT-----CA--C--T-AT-GCA-AAAT--AT-TCAA--G-CCT-GAGT-TTA-AG----TA-TGCAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                           tggtaaa-CGGTTCA---------GATAATTTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-AGGAAACT--GA-A-CCT----C-G-G---TTTC-GGTT--TG-GT-T----TTTATTTTta
gi|2                          : agcctatagtcggttaagactgcttttcttaagtcttttgttgactgttgtattgtacataatgtcatccttgcatgaattatacatatgttatattgctgaataaattttttatactttaattgtgtgcattgtacacccattttacttcctgggtcctcaagattcctggattcatgaaaattaattttatttattacacGCTGT-ACGGTTTAAACCGAAACC-------GAAAAAAT-CGGTTAA-CC-GCTTTGGTGAATTCTCGATG--TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A--TTC-GGTT--CG-GT-TTTGGTTTAC------------------CATTTGGC-T--TTTTT---CGCTT-AC-ACGGT-GTTGC--TGAA-T-TGGGTTCGG-ATATT-TAGTA-TC-AATGTGATTATTCCAACC-ATGGAA-TATCC--A-TAT----ATTA-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----ATA-CGG-AGCTGA-------A-CGC-TTAG-ATTAT--TTGCG-GT-GCCGAT-AG-G-GA-TGACA--GGAT-T--GGA--------A-T-TT-A--CAGA-TATTTAT---TAAG-----AAAGTGGAAG---TC--AAAG-GATTTT-T-AATGGAA-AGCC-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G--GC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAAtgacagccc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TCAGGA-A-A-----CT-G-A-A-TT---GGTTTTCG-GT-TTT-ATTTtatgatcggcgggtagcttctgtggttcaatgttcgcttcgtacctgaaggtgtgtgttctagttcccactcaaacttgaggacaccatgatctgattgcttcccgaacgctcggcattcagaactagtgagttgcgcgaatccttaaaatcgaggtcacacatcacggacagactaacgaccgtaagcgctattatgtattagttcgaattttcttagtattcaccaa
gi|21                         :                                                                             aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaTCGGTT-C-AG--------AC-A-TTT--TC--G-G----TTC-GGTT--CG-GT-TCG-GTTCAgtctgaaccgagac
gi|24                         :                      aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaaaataaaaccgaaaaccaattcagtttccC---GGTAAATTCTCA-T---TCGGCTCGATT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTATCTTT--T-C--CTGTT---TGC-A-AC-AC-GC-GCT-A--TG-T-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCTAGCCAATGGAT-T-TCC--A-TAT----A--A-CC---CC--------------GGTAAAAG---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCAAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-GT-G-AA-TC-CA--GGAT-A--GGA--------ATT-TT-A--TT-A-T-TTTA----TAAG-----AAAGTGGGAG---TC--CAAG-A--ATT-T-gac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-TTTC---TT--CG-TCATTT-GT--ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--TGC--TTT-----CG--T-A--AC-GC-GTT-TCTTG-A-T---GGTT--G-ATATT--A-TA--C-AA--TGA-TAT-CCAACCA-TGGAA-T-TCC--A--------A--A--A---T---------------G------A---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGCAGACCGTGTCA-CGTGTTAG-A--AA--TTGC--AT-G--TAT-AT-G-GATTG-C---GGAT-T--GAA--------ATT-TT-----A-A-T------------------AAAGT-GAAT---TC--CAA--A--CTA-T-A----AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-TG--AAATA-AT-TCAA--ACCGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGTAAccta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTACTTTC--------A--GTAC-TTT--G-A--TTGTT---TGC-T-AC-AC-AC-GCC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-CA-TC-AA--TGA-TATTTTAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TATATTAA--A-CA---TCGCTAA---------G------G---------------T--------------G---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GCC-GAT------A-CGTGCAAG-A--AA--TTTC--AT-AT-GATGAT-G-GT-TG-CA--GGAT-A--GGAATTTAATTATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAG-----AAAGTGGGAG---TC--AAAT-A--ATT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--At
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-GGTTCAG-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------GG--------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-G-C-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-A--G-GA-TA-CA--GGAT-T--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAGGA---AA-GTGGAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              GTAACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTCACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TGTTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------GTAATAACCTGTTTGTT--------------A---------------A-AAC-------A-T----A-A-CAT-GGC-GAC------A--GTGCTAG-A--AATGTTGC--ATGG--GAT-AT-G-GA-TG-CA--GAGT-A-----------------TT-AG-GA-A-T-CTTT----TAACAA---AAATTT--AG---TC--AAAGAA--TTT-T-AATA-AA-AG-T-TCATAACTCTG--CAGT-CTAGC--AAATTGAT-TC-A--G-CGC-GAGTGTTG-AATGTGTA-TGAAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                           AAAAA-T-CGATTAT-CC-AC---GGTAAATACTCA-T---TCGGTTCGATT-T-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-A-G-A-TTTC-AGTT--TG-GT-TTT-GTATACTTTTT--A-A--A--CTACTCTA--C-C--TTATT---TGC-T-AT-AT-GC-ACT-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TAA-TATTCAAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-TA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-At
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                            CTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-TGGTTAA-CT-GT---GGTAAATACTC---------ATTCAGTT-C-AGT---TT--GC-A-TTT--TCT-G-A-A-TTTC-GGTT--CT-GT-TTT-GTTTACATTTT--ACA--ATGTTCCATTT--T-ggtaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                              GTCACG-TT--------AACA-------GAAAA--T-CGGTTTA-AC-G----GGTA--TTTTCG-TAGGTCGGTT----T-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-AT-T--CTAC-TTT--T-T--TTTTT---CGT-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-G-GGTCC-G-TGATTATA-TG-TG-CA--TGA--A-TCGAACCAATGGAA-T-TCCATA-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------T-AGCCTGTGGTA-AAAGCA-A-CATGGGC-GAC------AGCGTGCAAA-T--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GAGTG-CAC-GGATAG--GGA--------ATTGTT-AACCA-A-TATCT---------------------AAG---TCA-AAAG-A--TTTGT-AAT--AAGAG-C-T-AT-----CGAACAGT-CT-GCAAAAAT--ATCTCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AGT---TA-
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            TCG-T---TCGGTTCGGTT-CCGGT---TT--GC-A-GTT--TCC-G-GTA-TTTCCGGTT--CG-GT-TTT-GTT-------------------TACATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-ACAAC-GCGGTT-C--TG-ATT-T-GGTTC-G-ATATT-gtgtcaat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTT--C-C--TTT------GC-T-----T-GC-GTC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ACATT-TT-TA-TC-AA--TGA-T-----GACCAGTGGAG-T-TCT--A-CGT----A--A--A---TT--------------G------T---------------T--------------A---------------ATAGT-------A-A----A-A-AAT-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatccAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccaatatagtgcgtccaAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtag
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccaatatagtgcgtcca--------ATT-CC-G--CA-A-T-TGT-----TAACAA---AAGG--GGTG---TC--AGAG-G--------AGTC-AA-AG-C-A-AT-----CA--CAAT-CT-GCT-AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GGG---TAGAGG---TA-TGCtag
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                              GTCACAATT--------ATCC-------AAAAAA-T-CGGTTAA-TC-GC---GGTAAATACACA-T---TCGGTTCTGTT-A-AGT---TT--GT-T-CTT--TCA-G-G-A-TTTC-GG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                         tcGCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGG-CATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CATGCTAG-A--AA--TTGC--AG-G--GAT-AT-G-GA-TG-CA--GGAT-T--GGA--------ATT-TT-G--CA-A-T-TTCA----TAAGAATTCAAAGTGAAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-TT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCATGGTT--------AACCGAAAACCGAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAAT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                          gGCTGTCACGGTT--------AACCGAAACC-GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAAT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gGTAAATTCTCA-T---TCGGTTCGATT-C-GAT---TT--GCTT-TTT--TTC-G-G-A-TT
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--A-TAT----A--A-CA---TT--------------G------G---------------T--------------ATACCTGTTGGTA---A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-G
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GA-TA-CA--GGAT-T--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAGAA---
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                       --------AACC-------GAAAAA-TTCGGTTAAACC-GC---GGTAAATTCTCG-TG--TCG-TTCG-TT-A-CAT---TT--GC-AATTT--TCC-GAG-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CG--T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T---GGTTCTG-ATATT--A-TA-CCGAA--TGA-TATTCCAACCAATG-AA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TCTCGGTATACATGTAG------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CATTGGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-AT-G-GA-TG-CA--GGAT-A--GGG--------ATT-TTAA--CA-A-A-TTTA----TAAG-----AAAGTGGAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT---A-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAA
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                          gaCTGTCACGGTT--------AACC-------CGAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTAG-T---TCGGTTCGGTT-------------GC-A-TTT--TCC-G-G-AATTTC-GGTT--CA-GT-TTT-GTT-ACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--TTC--TTTTT---CAC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TTA-TATTCCAACCAATGGAA-T--CC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATATCATTGTTGGTAAA-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--A---TTGCGCAT-G--GAT-AT-G-GA-TG-CA--GGAT-ATAGGA--------ATT-TT-AA-CA-A-A-TTTA----------------------G---TC--AAAG-A--TTT-TTAAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAAGTG-TGC-GAGT-TTA-AGT---T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGGT--------AACC-------GAAAAA-T-CG-TTAA-CCCGC---GGTAAATTCTC--T---T---TTCGGTTTC-GGT---TTT-GC-A-TTT--TTCTG-G-A-TTTC-GGT---CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-ACTA--C-ACACTT--T-CCTTTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-CTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT--A-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATAGAA---TCC--ACTAT----A--A-CA---TCGGTATACATGTTA-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CA--GGCGGAC------A-CGTGCTAG--------------AT-G--GA--AT-G-GA-TG-CA--GAAT-A--GGG--------ATT-TT-A--TA-T-T-TTTATTTCTAAGAA---AG---GAAAG---TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-ATG----CG--CAAT-CT-GC---AAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-cctgca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---AGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT---------TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-TGGT--CGTGT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-TAT-GGTTC-G--TATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TTC--A-TGT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATAACATGTTGGTA--A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GA-TG-CACAGGAT-ATAGGA--------ATT-TT-A--CA-A-A-TTCA----------------------G---TC--AAAG----TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGCAAAGT-TTA-AGT---TATTGCAAtgc
31 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): GATCGCCGAATTGAACAGCTAAGCAAATTGGCAAGGTTAGCTCAGTGGGGCATTGTAGTTGATGTGGATCAGCTTCGTGAACCGGAAAAATGTGTGTGTTCGAGTCCTCCACTCAAGACTTGTAGACGGTTTGACTTCCCAAAGATTACGCACTGCATATCACTAGACTGGAGAGACTGCGGATCATTAGGTTATGACCTTAAAATTGGAAGGGTCCACATATCACGACAGGGCCGGTTGTTATGGATCTATCAGTTCTAAAGAAAATCCTTCCTGATCTACAGACCGTAAGCGCCTATGGATATAGTCTAAATTTTCGAAGTACCTCACCAAGAACGACCGGTAATATTAGTCAGATTAAGACGTACTTATGTTATAAAGCTTCTTGTTGATCTGATTTGTATATGCTACATCAATGTCATCCTTGATGTAATATTACCATATATGTTATTATGTGAATAAATTTAGTAAACTTGTGATGTGTGCATTTGTACACCCAGGGTTTTACGTTCTAGGCGTCCTCAAAAACCTTGATTGGCATGAAATTTTTATTTATTTAAGGTTACAACCAAAAAGTACAACTTATCCGGAATTTTAGCCAAGAATAAAAAACTGCCAAAACCGGACGTTTCAATTTCCGTGAAACCTGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|12 ): AGCCTATAGTCGGTTAAGGGACTGGTCTTTTAAAGCTGGATAGCTACGTTCTTTGTTGGACTGTTGTTCTCTAACCATAATGTCTTATCCTTGCATGAAGGTTATACATATGTTATATTGCTTGTGAATAAATTTTTTTATATTTAGTGTGCATTTGATACACCCATTTTACTTCCTGGGTCCTCAAAGATTCCTGGGATTTCATGGAAAGATTATTTTGGATTTATTACACAAAATAAAAACCAAACCGAAACCGACGGTTCAGTTTCGGTGAACCGAACCACCGAAAAATTTAGATCTTGAACCGTGACAGCC
Unaligned ( gi|15 ): TATAGTCGATTAGAGCTGCTTTTAAAGTTTTGCTGATGTTGTATTGTACAATTAATGTATCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCATTTGTACACCCATTGTACTTCTAGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTCATTTTATTTAATACACAAAATAAAACGAACCGAAAAAAAACGAAACCGAAAAAACCGAAAACTGAGGTTCAATTTCCTGAAGACCGAACTGAAAATGTCTGACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|16 ): GCCCTATAGTCGATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTGATTGTGTATTTGCACAATTAATGTCATCCTTGCATGAATTTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCCTTTGTACACCCATTTTTACTTCCATGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAATTAATTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAATCCGAAAACCGAGTTCAGTTTCCTGAACCGAACAAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|18 ): GCCTTATAGTCTATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTTTTTTAATTGTTGATTGTACCATAATGTCATCCTTGCATGAATATTACATGGTATATTGCTTGATAGAATTTATTAAACCATTGGTCGTGTTGCCTTTGTCACCCCATTTTACTTTCAAATGGTCCTCAAGATACCTGGATTTCATGAAATTAATTTATTTTATTACACAAAATAAAAACCGAACTGAAAAAAACGAAACGAGTTCAGTTTCCTGAACCGGAACCGAACGATGTCGAACCGCTGA
Unaligned ( gi|19 ): ACGTGCTTGTTTAAAGCTTTGTTGGGTTGTTGTATTGTACATATGTGTCATCCTTGCCTGGATATTACATATGTTATATTGCTAAATATGAATTTATTAAACTGTTGGTGGTGCATTTTGTACATACCCATTTTACCTTCAGGGTCTCAAGATTTACCTGGATTCGATGAAAATATTTTAATTAATACACAAATAATAACGAACCGAGAACCGAAAACCGATGTTCAGTTCCTGAACGGAGACGGAACGAAAATGTTCTGAACCGGTGACAGACC
Unaligned ( gi|20 ): TACAGTTGGTTAAGCTTTTGTTGCTTGTTGCATTGTACCCCGCATTGTACATAATGTCATCCTTGCATAAATATTTCTTATGGTATGTTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTTTGCATTTGCACATCAATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACTTGGATTCAAGAAATTATTTTAATTTATTATTCAAAACAAAACCGAACTGAAATAACCGAAAACCGAGGTTCAGTTTTCTGAACCGAACAGAAAAATGTCTGAACCGTGACAG
Unaligned ( gi|22 ): ATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAAAACCGATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGAGACATCC
Unaligned ( gi|23 ): ATCTAAATTAAAACTGTTTTAAAAGCTTTTGATTATTGTTGTATGTACACTATGTCATTCTTGCCATGAATATTACATATGTTATATTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTAGATGTGTGCATTTGTACACCCATTTTACGTCTAGGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTTATTTTATTTAATACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAACCGAGGTTCAGTTTCCTGAACTGAACCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|26 ): GAGCCTGTAGTACTGTAAGATGCTTTTTAGCTTTGTTGCTTTGATGTAATAATAGATCACTCTGCATGATATTAATATTTATGGCTGAATAGAATTTATTATATCTACATGTGTCGTATACTTCCAGGACGCTCAATACTGATCATGAAATAATTTATCATATACAAAAACTAAAACCGATACCGAAAAAAATGAAAACGATTCATTCCTGATCGACCGAACCAGAAAATGTCTAACGTGAAGCTG
Unaligned ( gi|28 ): GATCGGTTTGGTAAGCTCAGTTGTGAATTTTCGTTTCATGACGGAAGGTTGTGTTTCTAGTCCACTCAAAATTGAGCCATGACTGCTTTCCCAAACGTCGACTTCAGATTGATGCGCGATCAGTAGATAGACTTAAAAATTGAGAGCACATATCTCGACAGACGTTGTAAGTTTAAGAAACTTCTACTCACCTGCTAGCGCTATGTAATGTCAAATTTTCAACCTCA
Unaligned ( gi|30 ): TTAAATGAATACTACTTATCTAATATTGCTGAATAAAATTTCTTAGAAATTGGACATTTCCATTGTTACTGATATATACAGCTTTAGGGTATTCATTATTCTTCAAATCTTGGATTCAAGAAATTGTTCTATTTTAACACACAATATAAAACCAAACCAAAAATACCCGAAATGAGGTTTTGTTTCCTGAACCAT
Unaligned ( gi|31 ): ATAATAAACATTAATGTTTGCATTTGTACAGCAATTTTACTTCTAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAAGTAATATTTTAATTTATCACACAAAATAAAACTGAACCAAAAAAAACACCCAAAAACCAGGGTTTTGTTTCTTGAACCGAACATAACCAAAATATGTCTAAACCGTGACAGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CTGAATAGAATTTATTATACTTTATTGTGTGCATTTGTACACCTATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTTTAATGAAATTAATTTTATTTATAACACAAAATGAAACCGAACCGAAAAAACCGAAAACCGAGGTTCAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|34 ): ATTAGGAGTATAACCTTAATAATCGGAGGTACATTATCCACGACAGGCTTGGCAGTTTAAAAATCCTTCCTACTTTAACGACCGTAAGACGCTACTGTATAGTCTAAATTACTCATGTACCACCCAAGC
Unaligned ( gi|35 ): GATCGCGGTTAGCCTAAACAGTGTTTTAAGTCGGCTTCGTAACGGAAATGATTGATGTGTCCCCTTCTAGTCACCACTCAAAATCTTGAGGGACCACATGACTGCTCTTTCCCAACACGCTCGGCAT
Unaligned ( gi|36 ): ATTAATTTATCACACAAAATAAAACTGCAAAAAGGAAATACACCCCCCCCCCTAAATAAAATTTCAAAATCCGACGCTTTGTTTCCTGAATTGAACCGAAAAATGGTTGACCCATAACAGCTTC
Unaligned ( gi|37 ): GAGTTTAAGTATGCAATAGGATCGCGGTACAGTACCTCAGTGGTAGCTAGAATGTTCGCTTCGTGACCGAAAGATCGTGTGTTCTATAGTTCCTCTCAAACCTGAGACACATGAC
Unaligned ( gi|38 ): GCTTCGTGACCGGAAGGTTGTGTGTTCTAGCTAGTCCTATTCAAACTTGAGACACGTGACTGCTTTTCCCAAACGCTTGGCATTAAGACTTGAGAGCCGCGGATCATTAGGATA
Unaligned ( gi|40 ): TGTCTATTAAGACTGCTTTTTGAAAAGCTGTTTTGATGTGTCTGTATTGTCATGATGTCATCTTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGAACATTTTAAACT
Unaligned ( gi|47 ): TAGTCAGTTAAGACTGCTTTTGAAAACTTTGTTACTTGTTGTATTGTACAGTATGTTATCCTTGCAAGAA
Unaligned ( gi|48 ): TACACAAAATAAAACCGAACTGAAAAAAACCGAAAGCCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCG
Unaligned ( gi|49 ): AGGCGTTGTCATATTTAGGAACCTTTACTACCAAGACCGAAACCATCAAGTTATGTCTAATTATG
Unaligned ( gi|50 ): CGAAAACCGAGGTTAAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTATGAACCATGACAGCCC
Unaligned ( gi|51 ): AGCCTATAGTCAGAGACTGATTTTTTAAGCTTTTGTTGATTGTTGTATTGTACATA
Unaligned ( gi|52 ): CTACGACCGTAAGTGCTATAGTATGAATAGGTCTAATTTTCAGTACCTCATCCAG
Unaligned ( gi|54 ): GGATCGCGGTAGCTCAGTGGATTAGAAAAATGTAACCTTCGTCACGAA
Unaligned ( gi|59 ): TGTATAGTTCTAAATAGGTAGTACCTCACCTG
Unaligned ( gi|60 ): CGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCGC
Unaligned ( gi|61 ): GCGGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCCTA
Unaligned ( gi|62 ): CCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCCTAC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                   1111111                                                                                                                                                                                                                                                                   88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                                                                                                                 22222222222222                                                                                                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       99999999    5555555      4 2       2  2  333           888888           444   333  44  1 1   22   1 1 1 1    1    22  2  2   6   0       77 2 55 33    0   4444 77     333   2 2  2  2  2   2 66  2 2 2 2     6 2     22 2  2  2  33   2                 2 2   22 2   6666 22 2  333  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2   7777777 2 4444 2 2   6   7   777777 2        2 33  33    55  2 55   5  2 2  4  55  2  33  777   88888888   2  2 77  2 777   33333333333333    5555  4444  55    2 22   2 2   77  2  2 2 4  77777  33    2  2  77    55  2    33 2   2    2   2  5555  2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       ........    .......      . .       .  .  ...           ......           ...   ...  ..  . .   ..   . . . .    .    ..  .  .   .   .       .. . .. ..    .   .... ..     ...   . .  .  .  .   . ..  . . . .     . .     .. .  .  .  ..   .                 . .   .. .   .... .. .  ...  .................................................................... .   ....... . .... . .   .   .   ...... .        . ..  ..    ..  . ..   .  . .  .  ..  .  ..  ...   ........   .  . ..  . ...   ..............    ....  ....  ..    . ..   . .   ..  .  . . .  .....  ..    .  .  ..    ..  .    .. .   .    .   .  ....  .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       11111111    3333333      7 2       4  4  999           444444           111   333  55  9 9   66   9 9 8 8    9    88  0  0   0   6       55 2 33 11    1   3333 55     999   2 2  2  2  2   2 11  2 2 1 1     3 1     66 2  2  2  11   2                 2 2   99 1   6666 99 1  777  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1   2222222 2 7777 2 2   7   1   222222 5        5 44  44    99  5 99   0  5 4  7  66  4  22  222   11111111   2  2 55  2 111   66666666666666    3333  5555  00    1 99   1 1   55  2  2 2 4  88888  11    2  2  55    33  4    22 4   4    4   4  2222  5     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GA-TG--CA-GG--ATA--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAG-----AAAGTGGAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
Reference ( family-706 )      :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GA-TG--CA-GG--ATA--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAGA----AAAGTGGAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                               TCA-GGTT--------AACC-------AAAAAAAT-CG-------T-GC---GGTAAATTCT-------TCGGT-CGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTTATTCC-G-G-A-TTTC-AAGT--CG--T-TTT-GTT-ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTTTGTCGC-TTAC-AC-GC-TTT-C--TT-T-A-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TAATC-AA--TGA-T-TTCCAACCAATGGAAAT-TCC--A-TAT----A--AACA---TCT-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-ATCATCGGC-GAC------A-CGTGCTGG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-AA--G--TA-GG--ATT--GGG--------ATT-TT-A--CA-ATT-TTTA----TAAG------AAGTG------------AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-CATGAT-----CA--CAATCCT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TGA-AGT---TA-TGCAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                      T--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCG------TT-A-CAT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TT---GGTT--CG-GT-T---GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT----C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-TTC-T--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-CC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATACATGTAGGT----A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATGG-GA-TG--CA-GG--ATA--GGG--------ATT-TT-A--CA-A-A-TTTA----TAAG-----AAAGTGGAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAAta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTCTCG-T---TCAGTTC-------GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GCTTACTTCTTTAA-A--A--CTA-ATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTCC-GAATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAATCAATGGAA-T-TCC--A--ATC---A--A-CAATTCC--------------G------G---------------TATACGCTGTTGGGAA---------------A-AAC-------ACA----A-C-CAT-TGC-GAC------A-CGTGCAAGAA--AA--TGGC--AT-G--GATAAT-GCGA-TG--CA-GG--ATA--AGA--------ATT-TT-A--CA-A-A-TT----------------------AAG----TC--AAAG-A--TTT-C-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAGT-CT-GA--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                   GATT--------AACC-------GAAAAG-C-TGATTAA-CT-GT---GATAAATACTCA-A---TAGGTTCGATT-C-AGT---C---GC-A-TTT--TCT-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACATTGT--A-C--A--CTACCCTA--T-T--ATGTA---TGC-T-AC-A---T-GTT-CTATG-A-T-T-GGT---------------------A--TGA-TATTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TGT----A--A-CA---TCACGAAA--------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----G-A-CAT-G-------------------------------TGC--AT------T-GT-G-G-------------------GA--------ATA-CT-A--TA-ATT-TTTT----TAAGA----AGGGGGGGGGGGGTTCCAGAAG-A--TTT-T-AAC--AA-AG-C-A-AT-----CA--C--T-AT-GCA-AAAT--AT-TCAA--G-CCT-GAGT-TTA-AG----TA-TGCAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                           tggtaaa-CGGTTCA---------GATAATTTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-AGGAAACT--GA-A-CCT----C-G-G---TTTC-GGTT--TG-GT-T----TTTATTTTta
gi|2                          : agcctatagtcggttaagactgcttttcttaagtcttttgttgactgttgtattgtacataatgtcatccttgcatgaattatacatatgttatattgctgaataaattttttatactttaattgtgtgcattgtacacccattttacttcctgggtcctcaagattcctggattcatgaaaattaattttatttattacacGCTGT-ACGGTTTAAACCGAAACC-------GAAAAAAT-CGGTTAA-CC-GCTTTGGTGAATTCTCGATG--TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A--TTC-GGTT--CG-GT-TTTGGTTTAC------------------CATTTGGC-T--TTTTT---CGCTT-AC-ACGGT-GTTGC--TGAA-T-TGGGTTCGG-ATATT-TAGTA-TC-AATGTGATTATTCCAACC-ATGGAA-TATCC--A-TAT----ATTA-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----ATA-CGG-AGCTGA-------A-CGC-TTAG-ATTAT--TTGCG-GT-GCCGAT-AG-G-GA-TGA-CA-GG--ATT--GGA--------A-T-TT-A--CAGA-TATTTA----TTAAG----AAAGTGGAAG----TC--AAAG-GATTTT-T-AATGGAA-AGCC-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G--GC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAAtgacagccc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TCAGGA-A-A-----CT-G-A-A-TT---GGTTTTCG-GT-TTT-ATTTtatgatcggcgggtagcttctgtggttcaatgttcgcttcgtacctgaaggtgtgtgttctagttcccactcaaacttgaggacaccatgatctgattgcttcccgaacgctcggcattcagaactagtgagttgcgcgaatccttaaaatcgaggtcacacatcacggacagactaacgaccgtaagcgctattatgtattagttcgaattttcttagtattcaccaa
gi|21                         :                                                                             aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaTCGGTT-C-AG--------AC-A-TTT--TC--G-G----TTC-GGTT--CG-GT-TCG-GTTCAgtctgaaccgagac
gi|24                         :                      aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaaaataaaaccgaaaaccaattcagtttccC---GGTAAATTCTCA-T---TCGGCTCGATT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTATCTTT--T-C--CTGTT---TGC-A-AC-AC-GC-GCT-A--TG-T-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCTAGCCAATGGAT-T-TCC--A-TAT----A--A-CC---CC--------------GGTAAAAG---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCAAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-GT-G-AA-TC--CA-GG--ATA--GGA--------ATT-TT-A--TT-A-T-TTTA----TAAG-----AAAGTGGGAG----TC--CAAG-A--ATT-T-gac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-TTTC---TT--CG-TCATTT-GT--ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--TGC--TTT-----CG--T-A--AC-GC-GTT-TCTTG-A-T---GGTT--G-ATATT--A-TA--C-AA--TGA-TAT-CCAACCA-TGGAA-T-TCC--A--------A--A--A---T---------------G------A---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGCAGACCGTGTCA-CGTGTTAG-A--AA--TTGC--AT-G--TAT-AT-G-GATTG--C--GG--ATT--GAA--------ATT-TT-----A-A-T------------------AAAGT-GAAT----TC--CAA--A--CTA-T-A----AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-TG--AAATA-AT-TCAA--ACCGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGTAAccta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTACTTTC--------A--GTAC-TTT--G-A--TTGTT---TGC-T-AC-AC-AC-GCC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-CA-TC-AA--TGA-TATTTTAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TATATTAA--A-CA---TCGCTAA---------G------G---------------T--------------G---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GCC-GAT------A-CGTGCAAG-A--AA--TTTC--AT-AT-GATGAT-G-GT-TG--CA-GG--ATA--GGAATTTAATTATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAG-----AAAGTGGGAG----TC--AAAT-A--ATT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--At
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-GGTTCAG-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------GG--------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-G-C-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-A--G-GA-TA--CA-GG--ATT--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAGG----AAAGTGGAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              GTAACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTCACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TGTTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------GTAATAACCTGTTTGTT--------------A---------------A-AAC-------A-T----A-A-CAT-GGC-GAC------A--GTGCTAG-A--AATGTTGC--ATGG--GAT-AT-G-GA-TG--CA-GA--GTA-----------------TT-AG-GA-A-T-CTTT----TAACA----AAAATTT-AG----TC--AAAGAA--TTT-T-AATA-AA-AG-T-TCATAACTCTG--CAGT-CTAGC--AAATTGAT-TC-A--G-CGC-GAGTGTTG-AATGTGTA-TGAAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                           AAAAA-T-CGATTAT-CC-AC---GGTAAATACTCA-T---TCGGTTCGATT-T-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-A-G-A-TTTC-AGTT--TG-GT-TTT-GTATACTTTTT--A-A--A--CTACTCTA--C-C--TTATT---TGC-T-AT-AT-GC-ACT-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TAA-TATTCAAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-TA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-At
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                            CTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-TGGTTAA-CT-GT---GGTAAATACTC---------ATTCAGTT-C-AGT---TT--GC-A-TTT--TCT-G-A-A-TTTC-GGTT--CT-GT-TTT-GTTTACATTTT--ACA--ATGTTCCATTT--T-ggtaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                              GTCACG-TT--------AACA-------GAAAA--T-CGGTTTA-AC-G----GGTA--TTTTCG-TAGGTCGGTT----T-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-AT-T--CTAC-TTT--T-T--TTTTT---CGT-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-G-GGTCC-G-TGATTATA-TG-TG-CA--TGA--A-TCGAACCAATGGAA-T-TCCATA-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------T-AGCCTGTGGTA-AAAGCA-A-CATGGGC-GAC------AGCGTGCAAA-T--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GAGTG--CACGG--ATAG-GGA--------ATTGTT-AACCA-A-TATCT---------------------AAG----TCA-AAAG-A--TTTGT-AAT--AAGAG-C-T-AT-----CGAACAGT-CT-GCAAAAAT--ATCTCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AGT---TA-
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            TCG-T---TCGGTTCGGTT-CCGGT---TT--GC-A-GTT--TCC-G-GTA-TTTCCGGTT--CG-GT-TTT-GTT-------------------TACATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-ACAAC-GCGGTT-C--TG-ATT-T-GGTTC-G-ATATT-gtgtcaat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTT--C-C--TTT------GC-T-----T-GC-GTC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ACATT-TT-TA-TC-AA--TGA-T-----GACCAGTGGAG-T-TCT--A-CGT----A--A--A---TT--------------G------T---------------T--------------A---------------ATAGT-------A-A----A-A-AAT-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatccAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccaatatagtgcgtccaAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtag
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ccaatatagtgcgtcca--------ATT-CC-G--CA-A-T-TGT-----TAACA----AAAG-GGGTG----TC--AGAG-G--------AGTC-AA-AG-C-A-AT-----CA--CAAT-CT-GCT-AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GGG---TAGAGG---TA-TGCtag
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                              GTCACAATT--------ATCC-------AAAAAA-T-CGGTTAA-TC-GC---GGTAAATACACA-T---TCGGTTCTGTT-A-AGT---TT--GT-T-CTT--TCA-G-G-A-TTTC-GG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                         tcGCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGG-CATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CATGCTAG-A--AA--TTGC--AG-G--GAT-AT-G-GA-TG--CA-GG--ATT--GGA--------ATT-TT-G--CA-A-T-TTCA----TAAGAATTCAAAGTGAAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-TT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCATGGTT--------AACCGAAAACCGAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAAT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                          gGCTGTCACGGTT--------AACCGAAACC-GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAAT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gGTAAATTCTCA-T---TCGGTTCGATT-C-GAT---TT--GCTT-TTT--TTC-G-G-A-TT
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--A-TAT----A--A-CA---TT--------------G------G---------------T--------------ATACCTGTTGGTA---A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-G
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GA-TA--CA-GG--ATT--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-T-TTTA----TAAGA----A
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                       --------AACC-------GAAAAA-TTCGGTTAAACC-GC---GGTAAATTCTCG-TG--TCG-TTCG-TT-A-CAT---TT--GC-AATTT--TCC-GAG-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CG--T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T---GGTTCTG-ATATT--A-TA-CCGAA--TGA-TATTCCAACCAATG-AA-T-TCC--A-TAT----A--A-CA---TCTCGGTATACATGTAG------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CATTGGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-AT-G-GA-TG--CA-GG--ATA--GGG--------ATT-TTAA--CA-A-A-TTTA----TAAG-----AAAGTGGAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT---A-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAA
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                          gaCTGTCACGGTT--------AACC-------CGAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTAG-T---TCGGTTCGGTT-------------GC-A-TTT--TCC-G-G-AATTTC-GGTT--CA-GT-TTT-GTT-ACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--TTC--TTTTT---CAC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TTA-TATTCCAACCAATGGAA-T--CC--A-TAT----A--A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATATCATTGTTGGTAAA-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--A---TTGCGCAT-G--GAT-AT-G-GA-TG--CA-GG--ATATAGGA--------ATT-TT-AA-CA-A-A-TTTA----------------------G----TC--AAAG-A--TTT-TTAAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAAGTG-TGC-GAGT-TTA-AGT---T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGGT--------AACC-------GAAAAA-T-CG-TTAA-CCCGC---GGTAAATTCTC--T---T---TTCGGTTTC-GGT---TTT-GC-A-TTT--TTCTG-G-A-TTTC-GGT---CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-ACTA--C-ACACTT--T-CCTTTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-CTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT--A-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATAGAA---TCC--ACTAT----A--A-CA---TCGGTATACATGTTA-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CA--GGCGGAC------A-CGTGCTAG--------------AT-G--GA--AT-G-GA-TG--CA-GA--ATA--GGG--------ATT-TT-A--TA-T-T-TTTATTTCTAAGA----AAG--GAAAG----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-ATG----CG--CAAT-CT-GC---AAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-cctgca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---AGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT---------TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-TGGT--CGTGT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-TAT-GGTTC-G--TATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TTC--A-TGT----A--A-CA---TCGGTATAACATGTT-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-AT-G-GA-TGCACA-GGATATA--GGA--------ATT-TT-A--CA-A-A-TTC----------------------AG----TC--AAAG----TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGCAAAGT-TTA-AGT---TATTGCAAtgc
31 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): GATCGCCGAATTGAACAGCTAAGCAAATTGGCAAGGTTAGCTCAGTGGGGCATTGTAGTTGATGTGGATCAGCTTCGTGAACCGGAAAAATGTGTGTGTTCGAGTCCTCCACTCAAGACTTGTAGACGGTTTGACTTCCCAAAGATTACGCACTGCATATCACTAGACTGGAGAGACTGCGGATCATTAGGTTATGACCTTAAAATTGGAAGGGTCCACATATCACGACAGGGCCGGTTGTTATGGATCTATCAGTTCTAAAGAAAATCCTTCCTGATCTACAGACCGTAAGCGCCTATGGATATAGTCTAAATTTTCGAAGTACCTCACCAAGAACGACCGGTAATATTAGTCAGATTAAGACGTACTTATGTTATAAAGCTTCTTGTTGATCTGATTTGTATATGCTACATCAATGTCATCCTTGATGTAATATTACCATATATGTTATTATGTGAATAAATTTAGTAAACTTGTGATGTGTGCATTTGTACACCCAGGGTTTTACGTTCTAGGCGTCCTCAAAAACCTTGATTGGCATGAAATTTTTATTTATTTAAGGTTACAACCAAAAAGTACAACTTATCCGGAATTTTAGCCAAGAATAAAAAACTGCCAAAACCGGACGTTTCAATTTCCGTGAAACCTGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|12 ): AGCCTATAGTCGGTTAAGGGACTGGTCTTTTAAAGCTGGATAGCTACGTTCTTTGTTGGACTGTTGTTCTCTAACCATAATGTCTTATCCTTGCATGAAGGTTATACATATGTTATATTGCTTGTGAATAAATTTTTTTATATTTAGTGTGCATTTGATACACCCATTTTACTTCCTGGGTCCTCAAAGATTCCTGGGATTTCATGGAAAGATTATTTTGGATTTATTACACAAAATAAAAACCAAACCGAAACCGACGGTTCAGTTTCGGTGAACCGAACCACCGAAAAATTTAGATCTTGAACCGTGACAGCC
Unaligned ( gi|15 ): TATAGTCGATTAGAGCTGCTTTTAAAGTTTTGCTGATGTTGTATTGTACAATTAATGTATCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCATTTGTACACCCATTGTACTTCTAGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTCATTTTATTTAATACACAAAATAAAACGAACCGAAAAAAAACGAAACCGAAAAAACCGAAAACTGAGGTTCAATTTCCTGAAGACCGAACTGAAAATGTCTGACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|16 ): GCCCTATAGTCGATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTGATTGTGTATTTGCACAATTAATGTCATCCTTGCATGAATTTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCCTTTGTACACCCATTTTTACTTCCATGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAATTAATTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAATCCGAAAACCGAGTTCAGTTTCCTGAACCGAACAAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|18 ): GCCTTATAGTCTATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTTTTTTAATTGTTGATTGTACCATAATGTCATCCTTGCATGAATATTACATGGTATATTGCTTGATAGAATTTATTAAACCATTGGTCGTGTTGCCTTTGTCACCCCATTTTACTTTCAAATGGTCCTCAAGATACCTGGATTTCATGAAATTAATTTATTTTATTACACAAAATAAAAACCGAACTGAAAAAAACGAAACGAGTTCAGTTTCCTGAACCGGAACCGAACGATGTCGAACCGCTGA
Unaligned ( gi|19 ): ACGTGCTTGTTTAAAGCTTTGTTGGGTTGTTGTATTGTACATATGTGTCATCCTTGCCTGGATATTACATATGTTATATTGCTAAATATGAATTTATTAAACTGTTGGTGGTGCATTTTGTACATACCCATTTTACCTTCAGGGTCTCAAGATTTACCTGGATTCGATGAAAATATTTTAATTAATACACAAATAATAACGAACCGAGAACCGAAAACCGATGTTCAGTTCCTGAACGGAGACGGAACGAAAATGTTCTGAACCGGTGACAGACC
Unaligned ( gi|20 ): TACAGTTGGTTAAGCTTTTGTTGCTTGTTGCATTGTACCCCGCATTGTACATAATGTCATCCTTGCATAAATATTTCTTATGGTATGTTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTTTGCATTTGCACATCAATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACTTGGATTCAAGAAATTATTTTAATTTATTATTCAAAACAAAACCGAACTGAAATAACCGAAAACCGAGGTTCAGTTTTCTGAACCGAACAGAAAAATGTCTGAACCGTGACAG
Unaligned ( gi|22 ): ATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAAAACCGATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGAGACATCC
Unaligned ( gi|23 ): ATCTAAATTAAAACTGTTTTAAAAGCTTTTGATTATTGTTGTATGTACACTATGTCATTCTTGCCATGAATATTACATATGTTATATTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTAGATGTGTGCATTTGTACACCCATTTTACGTCTAGGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTTATTTTATTTAATACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAACCGAGGTTCAGTTTCCTGAACTGAACCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|26 ): GAGCCTGTAGTACTGTAAGATGCTTTTTAGCTTTGTTGCTTTGATGTAATAATAGATCACTCTGCATGATATTAATATTTATGGCTGAATAGAATTTATTATATCTACATGTGTCGTATACTTCCAGGACGCTCAATACTGATCATGAAATAATTTATCATATACAAAAACTAAAACCGATACCGAAAAAAATGAAAACGATTCATTCCTGATCGACCGAACCAGAAAATGTCTAACGTGAAGCTG
Unaligned ( gi|28 ): GATCGGTTTGGTAAGCTCAGTTGTGAATTTTCGTTTCATGACGGAAGGTTGTGTTTCTAGTCCACTCAAAATTGAGCCATGACTGCTTTCCCAAACGTCGACTTCAGATTGATGCGCGATCAGTAGATAGACTTAAAAATTGAGAGCACATATCTCGACAGACGTTGTAAGTTTAAGAAACTTCTACTCACCTGCTAGCGCTATGTAATGTCAAATTTTCAACCTCA
Unaligned ( gi|30 ): TTAAATGAATACTACTTATCTAATATTGCTGAATAAAATTTCTTAGAAATTGGACATTTCCATTGTTACTGATATATACAGCTTTAGGGTATTCATTATTCTTCAAATCTTGGATTCAAGAAATTGTTCTATTTTAACACACAATATAAAACCAAACCAAAAATACCCGAAATGAGGTTTTGTTTCCTGAACCAT
Unaligned ( gi|31 ): ATAATAAACATTAATGTTTGCATTTGTACAGCAATTTTACTTCTAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAAGTAATATTTTAATTTATCACACAAAATAAAACTGAACCAAAAAAAACACCCAAAAACCAGGGTTTTGTTTCTTGAACCGAACATAACCAAAATATGTCTAAACCGTGACAGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CTGAATAGAATTTATTATACTTTATTGTGTGCATTTGTACACCTATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTTTAATGAAATTAATTTTATTTATAACACAAAATGAAACCGAACCGAAAAAACCGAAAACCGAGGTTCAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|34 ): ATTAGGAGTATAACCTTAATAATCGGAGGTACATTATCCACGACAGGCTTGGCAGTTTAAAAATCCTTCCTACTTTAACGACCGTAAGACGCTACTGTATAGTCTAAATTACTCATGTACCACCCAAGC
Unaligned ( gi|35 ): GATCGCGGTTAGCCTAAACAGTGTTTTAAGTCGGCTTCGTAACGGAAATGATTGATGTGTCCCCTTCTAGTCACCACTCAAAATCTTGAGGGACCACATGACTGCTCTTTCCCAACACGCTCGGCAT
Unaligned ( gi|36 ): ATTAATTTATCACACAAAATAAAACTGCAAAAAGGAAATACACCCCCCCCCCTAAATAAAATTTCAAAATCCGACGCTTTGTTTCCTGAATTGAACCGAAAAATGGTTGACCCATAACAGCTTC
Unaligned ( gi|37 ): GAGTTTAAGTATGCAATAGGATCGCGGTACAGTACCTCAGTGGTAGCTAGAATGTTCGCTTCGTGACCGAAAGATCGTGTGTTCTATAGTTCCTCTCAAACCTGAGACACATGAC
Unaligned ( gi|38 ): GCTTCGTGACCGGAAGGTTGTGTGTTCTAGCTAGTCCTATTCAAACTTGAGACACGTGACTGCTTTTCCCAAACGCTTGGCATTAAGACTTGAGAGCCGCGGATCATTAGGATA
Unaligned ( gi|40 ): TGTCTATTAAGACTGCTTTTTGAAAAGCTGTTTTGATGTGTCTGTATTGTCATGATGTCATCTTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGAACATTTTAAACT
Unaligned ( gi|47 ): TAGTCAGTTAAGACTGCTTTTGAAAACTTTGTTACTTGTTGTATTGTACAGTATGTTATCCTTGCAAGAA
Unaligned ( gi|48 ): TACACAAAATAAAACCGAACTGAAAAAAACCGAAAGCCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCG
Unaligned ( gi|49 ): AGGCGTTGTCATATTTAGGAACCTTTACTACCAAGACCGAAACCATCAAGTTATGTCTAATTATG
Unaligned ( gi|50 ): CGAAAACCGAGGTTAAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTATGAACCATGACAGCCC
Unaligned ( gi|51 ): AGCCTATAGTCAGAGACTGATTTTTTAAGCTTTTGTTGATTGTTGTATTGTACATA
Unaligned ( gi|52 ): CTACGACCGTAAGTGCTATAGTATGAATAGGTCTAATTTTCAGTACCTCATCCAG
Unaligned ( gi|54 ): GGATCGCGGTAGCTCAGTGGATTAGAAAAATGTAACCTTCGTCACGAA
Unaligned ( gi|59 ): TGTATAGTTCTAAATAGGTAGTACCTCACCTG
Unaligned ( gi|60 ): CGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCGC
Unaligned ( gi|61 ): GCGGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCCTA
Unaligned ( gi|62 ): CCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCCTAC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                   1111111                                                                                                                                                                                                                                                                  88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                                                                                                                    111111111111111                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       99999999    5555555      4 2       2  2  333           888888           444   333  44  1 1   22   1 1 1 1    1    22  2  2   6   0       77 2 55 33    0   4444 77     333   2 2  2  2  2   2 66  2 2 2 2     6 2     22 2  2  2  33   2                 2 2   22 2   2 7777 2  333  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2   7777777 2 4444 2 2   6   7   777777 2        2 33  33    55  2 55   5   2 2 4  55  2  33 444 777      2 88888888 2 55  2 777   222222222222222    666   55555  55    2 22   2 2   77  2  2 2 4  77777  33    2  2  77    55  2    33 2   2    2   2  5555  2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       ........    .......      . .       .  .  ...           ......           ...   ...  ..  . .   ..   . . . .    .    ..  .  .   .   .       .. . .. ..    .   .... ..     ...   . .  .  .  .   . ..  . . . .     . .     .. .  .  .  ..   .                 . .   .. .   . .... .  ...  .................................................................... .   ....... . .... . .   .   .   ...... .        . ..  ..    ..  . ..   .   . . .  ..  .  .. ... ...      . ........ . ..  . ...   ...............    ...   .....  ..    . ..   . .   ..  .  . . .  .....  ..    .  .  ..    ..  .    .. .   .    .   .  ....  .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       11111111    3333333      7 2       4  4  999           444444           111   333  55  9 9   66   9 9 8 8    9    88  0  0   0   6       55 2 33 11    1   3333 55     999   2 2  2  2  2   2 11  2 2 1 1     3 1     66 2  2  2  11   2                 2 2   99 1   1 4444 1  777  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1   2222222 2 7777 2 2   7   1   222222 5        5 44  44    99  5 99   0   4 4 7  66  4  22 111 222      2 11111111 2 33  2 111   444444444444444    333   33333  00    1 99   1 1   55  2  2 2 4  88888  11    2  2  55    33  4    22 4   4    4   4  2222  5     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
Reference ( family-706 )      :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                               TCA-GGTT--------AACC-------AAAAAAAT-CG-------T-GC---GGTAAATTCT-------TCGGT-CGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTTATTCC-G-G-A-TTTC-AAGT--CG--T-TTT-GTT-ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTTTGTCGC-TTAC-AC-GC-TTT-C--TT-T-A-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TAATC-AA--TGA-T-TTCCAACCAATGGAAAT-TCC--A-TAT-A----AACA---TCT-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-ATCATCGGC-GAC------A-CGTGCTGG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-A-A--G--TA-GG--A---TT--GGGATT-T--------T-A--CA-ATT-TTTA----TAA-G------AAGTG-------------AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-CATGAT-----CA--CAATCCT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TGA-AGT---TA-TGCAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                      T--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCG------TT-A-CAT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TT---GGTT--CG-GT-T---GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT----C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-TTC-T--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-CC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATACATGTAGGT----A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATG-GGA-TG--CA-GG--A---TA--GGGATT-T--------T-A--CA-A-A-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAAta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTCTCG-T---TCAGTTC-------GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GCTTACTTCTTTAA-A--A--CTA-ATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTCC-GAATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAATCAATGGAA-T-TCC--A--ATCA----A-CAATTCC--------------G------G---------------TATACGCTGTTGGGAA---------------A-AAC-------ACA----A-C-CAT-TGC-GAC------A-CGTGCAAGAA--AA--TGGC--AT-G--GATAATGCG-A-TG--CA-GG--A---TA--AGAATT-T--------T-A--CA-A-A-TT-----------------------AAG-----TC--AAAG-A--TTT-C-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAGT-CT-GA--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                   GATT--------AACC-------GAAAAG-C-TGATTAA-CT-GT---GATAAATACTCA-A---TAGGTTCGATT-C-AGT---C---GC-A-TTT--TCT-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACATTGT--A-C--A--CTACCCTA--T-T--ATGTA---TGC-T-AC-A---T-GTT-CTATG-A-T-T-GGT---------------------A--TGA-TATTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TGT-A----A-CA---TCACGAAA--------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----G-A-CAT-G-------------------------------TGC--AT------T-GTG-G-----------------------GAATA-C--------T-A--TA-ATT-TTTT----TAA-G-----AAGGGGGGGGGGGGTTCCAGAAG-A--TTT-T-AAC--AA-AG-C-A-AT-----CA--C--T-AT-GCA-AAAT--AT-TCAA--G-CCT-GAGT-TTA-AG----TA-TGCAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                           tggtaaa-CGGTTCA---------GATAATTTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-AGGAAACT--GA-A-CCT----C-G-G---TTTC-GGTT--TG-GT-T----TTTATTTTta
gi|2                          : agcctatagtcggttaagactgcttttcttaagtcttttgttgactgttgtattgtacataatgtcatccttgcatgaattatacatatgttatattgctgaataaattttttatactttaattgtgtgcattgtacacccattttacttcctgggtcctcaagattcctggattcatgaaaattaattttatttattacacGCTGT-ACGGTTTAAACCGAAACC-------GAAAAAAT-CGGTTAA-CC-GCTTTGGTGAATTCTCGATG--TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A--TTC-GGTT--CG-GT-TTTGGTTTAC------------------CATTTGGC-T--TTTTT---CGCTT-AC-ACGGT-GTTGC--TGAA-T-TGGGTTCGG-ATATT-TAGTA-TC-AATGTGATTATTCCAACC-ATGGAA-TATCC--A-TAT-ATT--A-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----ATA-CGG-AGCTGA-------A-CGC-TTAG-ATTAT--TTGCG-GT-GCCGAT-AGG-G-A-TGA-CA-GG--A---TT--GGAA-T-T--------T-A--CAGA-TATTTAT---TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-GATTTT-T-AATGGAA-AGCC-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G--GC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAAtgacagccc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TCAGGA-A-A-----CT-G-A-A-TT---GGTTTTCG-GT-TTT-ATTTtatgatcggcgggtagcttctgtggttcaatgttcgcttcgtacctgaaggtgtgtgttctagttcccactcaaacttgaggacaccatgatctgattgcttcccgaacgctcggcattcagaactagtgagttgcgcgaatccttaaaatcgaggtcacacatcacggacagactaacgaccgtaagcgctattatgtattagttcgaattttcttagtattcaccaa
gi|21                         :                                                                             aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaTCGGTT-C-AG--------AC-A-TTT--TC--G-G----TTC-GGTT--CG-GT-TCG-GTTCAgtctgaaccgagac
gi|24                         :                      aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaaaataaaaccgaaaaccaattcagtttccC---GGTAAATTCTCA-T---TCGGCTCGATT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTATCTTT--T-C--CTGTT---TGC-A-AC-AC-GC-GCT-A--TG-T-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCTAGCCAATGGAT-T-TCC--A-TAT-A----A-CC---CC--------------GGTAAAAG---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCAAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-GTG-A-A-TC--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--TT-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGGAG-----TC--CAAG-A--ATT-T-gac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-TTTC---TT--CG-TCATTT-GT--ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--TGC--TTT-----CG--T-A--AC-GC-GTT-TCTTG-A-T---GGTT--G-ATATT--A-TA--C-AA--TGA-TAT-CCAACCA-TGGAA-T-TCC--A-----A----A--A---T---------------G------A---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGCAGACCGTGTCA-CGTGTTAG-A--AA--TTGC--AT-G--TAT-ATG-G-ATTG--C--GG--A---TT--GAAATT-T--------T-----A-A-T-------------------AAAGT-GAAT-----TC--CAA--A--CTA-T-A----AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-TG--AAATA-AT-TCAA--ACCGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGTAAccta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTACTTTC--------A--GTAC-TTT--G-A--TTGTT---TGC-T-AC-AC-AC-GCC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-CA-TC-AA--TGA-TATTTTAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-ATTAAA-CA---TC--------------GCTAAG-G---------------T--------------G---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GCC-GAT------A-CGTGCAAG-A--AA--TTTC--AT-AT-GATGATG-G-T-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-TAATTATTTT-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGGAG-----TC--AAAT-A--ATT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--At
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-GGTTCAG-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT--GC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-A-G-G-A-TA--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAAGG-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              GTAACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTCACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TGTTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------GTAATAACCTGTTTGTT--------------A---------------A-AAC-------A-T----A-A-CAT-GGC-GAC------A--GTGCTAG-A--AATGTTGC--ATGG--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GA--GTATTA--GGAATC-T------------------T-TTAA----CAA-A-----AATTT---AG-----TC--AAAGAA--TTT-T-AATA-AA-AG-T-TCATAACTCTG--CAGT-CTAGC--AAATTGAT-TC-A--G-CGC-GAGTGTTG-AATGTGTA-TGAAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                           AAAAA-T-CGATTAT-CC-AC---GGTAAATACTCA-T---TCGGTTCGATT-T-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-A-G-A-TTTC-AGTT--TG-GT-TTT-GTATACTTTTT--A-A--A--CTACTCTA--C-C--TTATT---TGC-T-AT-AT-GC-ACT-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TAA-TATTCAAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-TA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-At
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                            CTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-TGGTTAA-CT-GT---GGTAAATACTC---------ATTCAGTT-C-AGT---TT--GC-A-TTT--TCT-G-A-A-TTTC-GGTT--CT-GT-TTT-GTTTACATTTT--ACA--ATGTTCCATTT--T-ggtaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                              GTCACG-TT--------AACA-------GAAAA--T-CGGTTTA-AC-G----GGTA--TTTTCG-TAGGTCGGTT----T-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-AT-T--CTAC-TTT--T-T--TTTTT---CGT-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-G-GGTCC-G-TGATTATA-TG-TG-CA--TGA--A-TCGAACCAATGGAA-T-TCCATA-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------T-AGCCTGTGGTA-AAAGCA-A-CATGGGC-GAC------AGCGTGCAAA-T--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-AGTG--CACGG--A---TAG-GGAATTGT--------T-AACCA-A-TATCT----------------------AAG-----TCA-AAAG-A--TTTGT-AAT--AAGAG-C-T-AT-----CGAACAGT-CT-GCAAAAAT--ATCTCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AGT---TA-
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            TCG-T---TCGGTTCGGTT-CCGGT---TT--GC-A-GTT--TCC-G-GTA-TTTCCGGTT--CG-GT-TTT-GTT-------------------TACATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-ACAAC-GCGGTT-C--TG-ATT-T-GGTTC-G-ATATT-gtgtcaat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTT--C-C--TTT------GC-T-----T-GC-GTC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ACATT-TT-TA-TC-AA--TGA-T-----GACCAGTGGAG-T-TCT--A-CGT-A----A--A---TT--------------G------T---------------T--------------A---------------ATAGT-------A-A----A-A-AAT-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatccAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccaatatagtgcgtccaAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtag
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccaatatagtgcgtccaATT-C--------C-G--CA-A-T-TGT-----TAA-C-----AAAAGGGGTG-----TC--AGAG-G--------AGTC-AA-AG-C-A-AT-----CA--CAAT-CT-GCT-AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GGG---TAGAGG---TA-TGCtag
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                              GTCACAATT--------ATCC-------AAAAAA-T-CGGTTAA-TC-GC---GGTAAATACACA-T---TCGGTTCTGTT-A-AGT---TT--GT-T-CTT--TCA-G-G-A-TTTC-GG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                         tcGCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGG-CATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CATGCTAG-A--AA--TTGC--AG-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-G--CA-A-T-TTCA----TAA-GAATTCAAAGTGAAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-TT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCATGGTT--------AACCGAAAACCGAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAAT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                          gGCTGTCACGGTT--------AACCGAAACC-GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAAT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gGTAAATTCTCA-T---TCGGTTCGATT-C-GAT---TT--GCTT-TTT--TTC-G-G-A-TT
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--A-TAT-A----A-CA---TT--------------G------G---------------T--------------ATACCTGTTGGTA---A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-G
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-A-TA--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                       --------AACC-------GAAAAA-TTCGGTTAAACC-GC---GGTAAATTCTCG-TG--TCG-TTCG-TT-A-CAT---TT--GC-AATTT--TCC-GAG-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CG--T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T---GGTTCTG-ATATT--A-TA-CCGAA--TGA-TATTCCAACCAATG-AA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TCTCGGTATACATGTAG------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CATTGGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGGATT-T--------TAA--CA-A-A-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT---A-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAA
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                          gaCTGTCACGGTT--------AACC-------CGAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTAG-T---TCGGTTCGGTT-------------GC-A-TTT--TCC-G-G-AATTTC-GGTT--CA-GT-TTT-GTT-ACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--TTC--TTTTT---CAC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TTA-TATTCCAACCAATGGAA-T--CC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATATCATTGTTGGTAAA-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--A---TTGCGCAT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TATAGGAATT-T--------T-AA-CA-A-A-TTTA-----------------------G-----TC--AAAG-A--TTT-TTAAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAAGTG-TGC-GAGT-TTA-AGT---T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGGT--------AACC-------GAAAAA-T-CG-TTAA-CCCGC---GGTAAATTCTC--T---T---TTCGGTTTC-GGT---TTT-GC-A-TTT--TTCTG-G-A-TTTC-GGT---CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-ACTA--C-ACACTT--T-CCTTTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-CTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT--A-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATAGAA---TCC--ACTAT-A----A-CA---TCGGTATACATGTTA-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CA--GGCGGAC------A-CGTGCTAG--------------AT-G--GA--ATG-G-A-TG--CA-GA--A---TA--GGGATT-T--------T-A--TA-T-T-TTTATTTCTAA-G-----AAAG-GAAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-ATG----CG--CAAT-CT-GC---AAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-cctgca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---AGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT---------TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-TGGT--CGTGT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-TAT-GGTTC-G--TATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TTC--A-TGT-A----A-CA---TCGGTATAACATGTT-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TGCACA-GGATA---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-A-TTC-----------------------AG-----TC--AAAG----TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGCAAAGT-TTA-AGT---TATTGCAAtgc
31 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): GATCGCCGAATTGAACAGCTAAGCAAATTGGCAAGGTTAGCTCAGTGGGGCATTGTAGTTGATGTGGATCAGCTTCGTGAACCGGAAAAATGTGTGTGTTCGAGTCCTCCACTCAAGACTTGTAGACGGTTTGACTTCCCAAAGATTACGCACTGCATATCACTAGACTGGAGAGACTGCGGATCATTAGGTTATGACCTTAAAATTGGAAGGGTCCACATATCACGACAGGGCCGGTTGTTATGGATCTATCAGTTCTAAAGAAAATCCTTCCTGATCTACAGACCGTAAGCGCCTATGGATATAGTCTAAATTTTCGAAGTACCTCACCAAGAACGACCGGTAATATTAGTCAGATTAAGACGTACTTATGTTATAAAGCTTCTTGTTGATCTGATTTGTATATGCTACATCAATGTCATCCTTGATGTAATATTACCATATATGTTATTATGTGAATAAATTTAGTAAACTTGTGATGTGTGCATTTGTACACCCAGGGTTTTACGTTCTAGGCGTCCTCAAAAACCTTGATTGGCATGAAATTTTTATTTATTTAAGGTTACAACCAAAAAGTACAACTTATCCGGAATTTTAGCCAAGAATAAAAAACTGCCAAAACCGGACGTTTCAATTTCCGTGAAACCTGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|12 ): AGCCTATAGTCGGTTAAGGGACTGGTCTTTTAAAGCTGGATAGCTACGTTCTTTGTTGGACTGTTGTTCTCTAACCATAATGTCTTATCCTTGCATGAAGGTTATACATATGTTATATTGCTTGTGAATAAATTTTTTTATATTTAGTGTGCATTTGATACACCCATTTTACTTCCTGGGTCCTCAAAGATTCCTGGGATTTCATGGAAAGATTATTTTGGATTTATTACACAAAATAAAAACCAAACCGAAACCGACGGTTCAGTTTCGGTGAACCGAACCACCGAAAAATTTAGATCTTGAACCGTGACAGCC
Unaligned ( gi|15 ): TATAGTCGATTAGAGCTGCTTTTAAAGTTTTGCTGATGTTGTATTGTACAATTAATGTATCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCATTTGTACACCCATTGTACTTCTAGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTCATTTTATTTAATACACAAAATAAAACGAACCGAAAAAAAACGAAACCGAAAAAACCGAAAACTGAGGTTCAATTTCCTGAAGACCGAACTGAAAATGTCTGACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|16 ): GCCCTATAGTCGATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTGATTGTGTATTTGCACAATTAATGTCATCCTTGCATGAATTTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCCTTTGTACACCCATTTTTACTTCCATGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAATTAATTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAATCCGAAAACCGAGTTCAGTTTCCTGAACCGAACAAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|18 ): GCCTTATAGTCTATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTTTTTTAATTGTTGATTGTACCATAATGTCATCCTTGCATGAATATTACATGGTATATTGCTTGATAGAATTTATTAAACCATTGGTCGTGTTGCCTTTGTCACCCCATTTTACTTTCAAATGGTCCTCAAGATACCTGGATTTCATGAAATTAATTTATTTTATTACACAAAATAAAAACCGAACTGAAAAAAACGAAACGAGTTCAGTTTCCTGAACCGGAACCGAACGATGTCGAACCGCTGA
Unaligned ( gi|19 ): ACGTGCTTGTTTAAAGCTTTGTTGGGTTGTTGTATTGTACATATGTGTCATCCTTGCCTGGATATTACATATGTTATATTGCTAAATATGAATTTATTAAACTGTTGGTGGTGCATTTTGTACATACCCATTTTACCTTCAGGGTCTCAAGATTTACCTGGATTCGATGAAAATATTTTAATTAATACACAAATAATAACGAACCGAGAACCGAAAACCGATGTTCAGTTCCTGAACGGAGACGGAACGAAAATGTTCTGAACCGGTGACAGACC
Unaligned ( gi|20 ): TACAGTTGGTTAAGCTTTTGTTGCTTGTTGCATTGTACCCCGCATTGTACATAATGTCATCCTTGCATAAATATTTCTTATGGTATGTTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTTTGCATTTGCACATCAATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACTTGGATTCAAGAAATTATTTTAATTTATTATTCAAAACAAAACCGAACTGAAATAACCGAAAACCGAGGTTCAGTTTTCTGAACCGAACAGAAAAATGTCTGAACCGTGACAG
Unaligned ( gi|22 ): ATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAAAACCGATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGAGACATCC
Unaligned ( gi|23 ): ATCTAAATTAAAACTGTTTTAAAAGCTTTTGATTATTGTTGTATGTACACTATGTCATTCTTGCCATGAATATTACATATGTTATATTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTAGATGTGTGCATTTGTACACCCATTTTACGTCTAGGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTTATTTTATTTAATACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAACCGAGGTTCAGTTTCCTGAACTGAACCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|26 ): GAGCCTGTAGTACTGTAAGATGCTTTTTAGCTTTGTTGCTTTGATGTAATAATAGATCACTCTGCATGATATTAATATTTATGGCTGAATAGAATTTATTATATCTACATGTGTCGTATACTTCCAGGACGCTCAATACTGATCATGAAATAATTTATCATATACAAAAACTAAAACCGATACCGAAAAAAATGAAAACGATTCATTCCTGATCGACCGAACCAGAAAATGTCTAACGTGAAGCTG
Unaligned ( gi|28 ): GATCGGTTTGGTAAGCTCAGTTGTGAATTTTCGTTTCATGACGGAAGGTTGTGTTTCTAGTCCACTCAAAATTGAGCCATGACTGCTTTCCCAAACGTCGACTTCAGATTGATGCGCGATCAGTAGATAGACTTAAAAATTGAGAGCACATATCTCGACAGACGTTGTAAGTTTAAGAAACTTCTACTCACCTGCTAGCGCTATGTAATGTCAAATTTTCAACCTCA
Unaligned ( gi|30 ): TTAAATGAATACTACTTATCTAATATTGCTGAATAAAATTTCTTAGAAATTGGACATTTCCATTGTTACTGATATATACAGCTTTAGGGTATTCATTATTCTTCAAATCTTGGATTCAAGAAATTGTTCTATTTTAACACACAATATAAAACCAAACCAAAAATACCCGAAATGAGGTTTTGTTTCCTGAACCAT
Unaligned ( gi|31 ): ATAATAAACATTAATGTTTGCATTTGTACAGCAATTTTACTTCTAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAAGTAATATTTTAATTTATCACACAAAATAAAACTGAACCAAAAAAAACACCCAAAAACCAGGGTTTTGTTTCTTGAACCGAACATAACCAAAATATGTCTAAACCGTGACAGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CTGAATAGAATTTATTATACTTTATTGTGTGCATTTGTACACCTATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTTTAATGAAATTAATTTTATTTATAACACAAAATGAAACCGAACCGAAAAAACCGAAAACCGAGGTTCAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|34 ): ATTAGGAGTATAACCTTAATAATCGGAGGTACATTATCCACGACAGGCTTGGCAGTTTAAAAATCCTTCCTACTTTAACGACCGTAAGACGCTACTGTATAGTCTAAATTACTCATGTACCACCCAAGC
Unaligned ( gi|35 ): GATCGCGGTTAGCCTAAACAGTGTTTTAAGTCGGCTTCGTAACGGAAATGATTGATGTGTCCCCTTCTAGTCACCACTCAAAATCTTGAGGGACCACATGACTGCTCTTTCCCAACACGCTCGGCAT
Unaligned ( gi|36 ): ATTAATTTATCACACAAAATAAAACTGCAAAAAGGAAATACACCCCCCCCCCTAAATAAAATTTCAAAATCCGACGCTTTGTTTCCTGAATTGAACCGAAAAATGGTTGACCCATAACAGCTTC
Unaligned ( gi|37 ): GAGTTTAAGTATGCAATAGGATCGCGGTACAGTACCTCAGTGGTAGCTAGAATGTTCGCTTCGTGACCGAAAGATCGTGTGTTCTATAGTTCCTCTCAAACCTGAGACACATGAC
Unaligned ( gi|38 ): GCTTCGTGACCGGAAGGTTGTGTGTTCTAGCTAGTCCTATTCAAACTTGAGACACGTGACTGCTTTTCCCAAACGCTTGGCATTAAGACTTGAGAGCCGCGGATCATTAGGATA
Unaligned ( gi|40 ): TGTCTATTAAGACTGCTTTTTGAAAAGCTGTTTTGATGTGTCTGTATTGTCATGATGTCATCTTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGAACATTTTAAACT
Unaligned ( gi|47 ): TAGTCAGTTAAGACTGCTTTTGAAAACTTTGTTACTTGTTGTATTGTACAGTATGTTATCCTTGCAAGAA
Unaligned ( gi|48 ): TACACAAAATAAAACCGAACTGAAAAAAACCGAAAGCCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCG
Unaligned ( gi|49 ): AGGCGTTGTCATATTTAGGAACCTTTACTACCAAGACCGAAACCATCAAGTTATGTCTAATTATG
Unaligned ( gi|50 ): CGAAAACCGAGGTTAAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTATGAACCATGACAGCCC
Unaligned ( gi|51 ): AGCCTATAGTCAGAGACTGATTTTTTAAGCTTTTGTTGATTGTTGTATTGTACATA
Unaligned ( gi|52 ): CTACGACCGTAAGTGCTATAGTATGAATAGGTCTAATTTTCAGTACCTCATCCAG
Unaligned ( gi|54 ): GGATCGCGGTAGCTCAGTGGATTAGAAAAATGTAACCTTCGTCACGAA
Unaligned ( gi|59 ): TGTATAGTTCTAAATAGGTAGTACCTCACCTG
Unaligned ( gi|60 ): CGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCGC
Unaligned ( gi|61 ): GCGGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCCTA
Unaligned ( gi|62 ): CCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCCTAC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                   1111111                                                                                                                                                                                                                                                                  88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                                                                                                                    111111111111111                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       99999999    5555555      4 2       2  2  333           888888           444   333  44  1 1   22   1 1 1 1    1    22  2  2   6   0       77 2 55 33    0   4444 77     333   2 2  2  2  2   2 66  2 2 2 2     6 2     22 2  2  2  33   2                 2 2   22 2   2 7777 2  333  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2   7777777 2 4444 2 2   6   7   777777 2        2 33  33    55  2 55   5   2 2 4  55  2  33 444 777      2 88888888 2 55  2 777   222222222222222    666   55555  55    2 22   2 2   77  2  2 2 4  77777  33    2  2  77    55  2    33 2   2    2   2  5555  2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       ........    .......      . .       .  .  ...           ......           ...   ...  ..  . .   ..   . . . .    .    ..  .  .   .   .       .. . .. ..    .   .... ..     ...   . .  .  .  .   . ..  . . . .     . .     .. .  .  .  ..   .                 . .   .. .   . .... .  ...  .................................................................... .   ....... . .... . .   .   .   ...... .        . ..  ..    ..  . ..   .   . . .  ..  .  .. ... ...      . ........ . ..  . ...   ...............    ...   .....  ..    . ..   . .   ..  .  . . .  .....  ..    .  .  ..    ..  .    .. .   .    .   .  ....  .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       11111111    3333333      7 2       4  4  999           444444           111   333  55  9 9   66   9 9 8 8    9    88  0  0   0   6       55 2 33 11    1   3333 55     999   2 2  2  2  2   2 11  2 2 1 1     3 1     66 2  2  2  11   2                 2 2   99 1   1 4444 1  777  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1   2222222 2 7777 2 2   7   1   222222 5        5 44  44    99  5 99   0   4 4 7  66  4  22 111 222      2 11111111 2 33  2 111   444444444444444    333   33333  00    1 99   1 1   55  2  2 2 4  88888  11    2  2  55    33  4    22 4   4    4   4  2222  5     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
Reference ( family-706 )      :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                               TCA-GGTT--------AACC-------AAAAAAAT-CG-------T-GC---GGTAAATTCT-------TCGGT-CGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTTATTCC-G-G-A-TTTC-AAGT--CG--T-TTT-GTT-ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTTTGTCGC-TTAC-AC-GC-TTT-C--TT-T-A-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TAATC-AA--TGA-T-TTCCAACCAATGGAAAT-TCC--A-TAT-A----AACA---TCT-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-ATCATCGGC-GAC------A-CGTGCTGG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-A-A--G--TA-GG--A---TT--GGGATT-T--------T-A--CA-ATT-TTTA----TAA-G------AAGTG-------------AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-CATGAT-----CA--CAATCCT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TGA-AGT---TA-TGCAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                      T--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCG------TT-A-CAT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TT---GGTT--CG-GT-T---GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT----C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-TTC-T--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-CC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATACATGTAGGT----A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATG-GGA-TG--CA-GG--A---TA--GGGATT-T--------T-A--CA-A-A-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAAta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTCTCG-T---TCAGTTC-------GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GCTTACTTCTTTAA-A--A--CTA-ATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTCC-GAATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAATCAATGGAA-T-TCC--A--ATCA----A-CAATTCC--------------G------G---------------TATACGCTGTTGGGAA---------------A-AAC-------ACA----A-C-CAT-TGC-GAC------A-CGTGCAAGAA--AA--TGGC--AT-G--GATAATGCG-A-TG--CA-GG--A---TA--AGAATT-T--------T-A--CA-A-A-TT-----------------------AAG-----TC--AAAG-A--TTT-C-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAGT-CT-GA--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                   GATT--------AACC-------GAAAAG-C-TGATTAA-CT-GT---GATAAATACTCA-A---TAGGTTCGATT-C-AGT---C---GC-A-TTT--TCT-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACATTGT--A-C--A--CTACCCTA--T-T--ATGTA---TGC-T-AC-A---T-GTT-CTATG-A-T-T-GGT---------------------A--TGA-TATTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TGT-A----A-CA---TCACGAAA--------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----G-A-CAT-G-------------------------------TGC--AT------T-GTG-G-----------------------GAATA-C--------T-A--TA-ATT-TTTT----TAA-G-----AAGGGGGGGGGGGGTTCCAGAAG-A--TTT-T-AAC--AA-AG-C-A-AT-----CA--C--T-AT-GCA-AAAT--AT-TCAA--G-CCT-GAGT-TTA-AG----TA-TGCAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                           tggtaaa-CGGTTCA---------GATAATTTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-AGGAAACT--GA-A-CCT----C-G-G---TTTC-GGTT--TG-GT-T----TTTATTTTta
gi|2                          : agcctatagtcggttaagactgcttttcttaagtcttttgttgactgttgtattgtacataatgtcatccttgcatgaattatacatatgttatattgctgaataaattttttatactttaattgtgtgcattgtacacccattttacttcctgggtcctcaagattcctggattcatgaaaattaattttatttattacacGCTGT-ACGGTTTAAACCGAAACC-------GAAAAAAT-CGGTTAA-CC-GCTTTGGTGAATTCTCGATG--TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A--TTC-GGTT--CG-GT-TTTGGTTTAC------------------CATTTGGC-T--TTTTT---CGCTT-AC-ACGGT-GTTGC--TGAA-T-TGGGTTCGG-ATATT-TAGTA-TC-AATGTGATTATTCCAACC-ATGGAA-TATCC--A-TAT-ATT--A-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----ATA-CGG-AGCTGA-------A-CGC-TTAG-ATTAT--TTGCG-GT-GCCGAT-AGG-G-A-TGA-CA-GG--A---TT--GGAA-T-T--------T-A--CAGA-TATTTAT---TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-GATTTT-T-AATGGAA-AGCC-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G--GC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAAtgacagccc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TCAGGA-A-A-----CT-G-A-A-TT---GGTTTTCG-GT-TTT-ATTTtatgatcggcgggtagcttctgtggttcaatgttcgcttcgtacctgaaggtgtgtgttctagttcccactcaaacttgaggacaccatgatctgattgcttcccgaacgctcggcattcagaactagtgagttgcgcgaatccttaaaatcgaggtcacacatcacggacagactaacgaccgtaagcgctattatgtattagttcgaattttcttagtattcaccaa
gi|21                         :                                                                             aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaTCGGTT-C-AG--------AC-A-TTT--TC--G-G----TTC-GGTT--CG-GT-TCG-GTTCAgtctgaaccgagac
gi|24                         :                      aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaaaataaaaccgaaaaccaattcagtttccC---GGTAAATTCTCA-T---TCGGCTCGATT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTATCTTT--T-C--CTGTT---TGC-A-AC-AC-GC-GCT-A--TG-T-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCTAGCCAATGGAT-T-TCC--A-TAT-A----A-CC---CC--------------GGTAAAAG---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCAAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-GTG-A-A-TC--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--TT-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGGAG-----TC--CAAG-A--ATT-T-gac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-TTTC---TT--CG-TCATTT-GT--ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--TGC--TTT-----CG--T-A--AC-GC-GTT-TCTTG-A-T---GGTT--G-ATATT--A-TA--C-AA--TGA-TAT-CCAACCA-TGGAA-T-TCC--A-----A----A--A---T---------------G------A---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGCAGACCGTGTCA-CGTGTTAG-A--AA--TTGC--AT-G--TAT-ATG-G-ATTG--C--GG--A---TT--GAAATT-T--------T-----A-A-T-------------------AAAGT-GAAT-----TC--CAA--A--CTA-T-A----AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-TG--AAATA-AT-TCAA--ACCGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGTAAccta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTACTTTC--------A--GTAC-TTT--G-A--TTGTT---TGC-T-AC-AC-AC-GCC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-CA-TC-AA--TGA-TATTTTAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-ATTAAA-CA---TC--------------GCTAAG-G---------------T--------------G---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GCC-GAT------A-CGTGCAAG-A--AA--TTTC--AT-AT-GATGATG-G-T-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-TAATTATTTT-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGGAG-----TC--AAAT-A--ATT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--At
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-GGTTCAG-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT--GC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-A-G-G-A-TA--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAAGG-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              GTAACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTCACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TGTTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------GTAATAACCTGTTTGTT--------------A---------------A-AAC-------A-T----A-A-CAT-GGC-GAC------A--GTGCTAG-A--AATGTTGC--ATGG--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GA--GTATTA--GGAATC-T------------------T-TTAA----CAA-A-----AATTT---AG-----TC--AAAGAA--TTT-T-AATA-AA-AG-T-TCATAACTCTG--CAGT-CTAGC--AAATTGAT-TC-A--G-CGC-GAGTGTTG-AATGTGTA-TGAAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                           AAAAA-T-CGATTAT-CC-AC---GGTAAATACTCA-T---TCGGTTCGATT-T-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-A-G-A-TTTC-AGTT--TG-GT-TTT-GTATACTTTTT--A-A--A--CTACTCTA--C-C--TTATT---TGC-T-AT-AT-GC-ACT-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TAA-TATTCAAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-TA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-At
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                            CTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-TGGTTAA-CT-GT---GGTAAATACTC---------ATTCAGTT-C-AGT---TT--GC-A-TTT--TCT-G-A-A-TTTC-GGTT--CT-GT-TTT-GTTTACATTTT--ACA--ATGTTCCATTT--T-ggtaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                              GTCACG-TT--------AACA-------GAAAA--T-CGGTTTA-AC-G----GGTA--TTTTCG-TAGGTCGGTT----T-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-AT-T--CTAC-TTT--T-T--TTTTT---CGT-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-G-GGTCC-G-TGATTATA-TG-TG-CA--TGA--A-TCGAACCAATGGAA-T-TCCATA-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------T-AGCCTGTGGTA-AAAGCA-A-CATGGGC-GAC------AGCGTGCAAA-T--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-AGTG--CACGG--A---TAG-GGAATTGT--------T-AACCA-A-TATCT----------------------AAG-----TCA-AAAG-A--TTTGT-AAT--AAGAG-C-T-AT-----CGAACAGT-CT-GCAAAAAT--ATCTCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AGT---TA-
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            TCG-T---TCGGTTCGGTT-CCGGT---TT--GC-A-GTT--TCC-G-GTA-TTTCCGGTT--CG-GT-TTT-GTT-------------------TACATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-ACAAC-GCGGTT-C--TG-ATT-T-GGTTC-G-ATATT-gtgtcaat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTT--C-C--TTT------GC-T-----T-GC-GTC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ACATT-TT-TA-TC-AA--TGA-T-----GACCAGTGGAG-T-TCT--A-CGT-A----A--A---TT--------------G------T---------------T--------------A---------------ATAGT-------A-A----A-A-AAT-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatccAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccaatatagtgcgtccaAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtag
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccaatatagtgcgtccaATT-C--------C-G--CA-A-T-TGT-----TAA-C-----AAAAGGGGTG-----TC--AGAG-G--------AGTC-AA-AG-C-A-AT-----CA--CAAT-CT-GCT-AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GGG---TAGAGG---TA-TGCtag
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                              GTCACAATT--------ATCC-------AAAAAA-T-CGGTTAA-TC-GC---GGTAAATACACA-T---TCGGTTCTGTT-A-AGT---TT--GT-T-CTT--TCA-G-G-A-TTTC-GG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                         tcGCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGG-CATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CATGCTAG-A--AA--TTGC--AG-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-G--CA-A-T-TTCA----TAA-GAATTCAAAGTGAAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-TT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCATGGTT--------AACCGAAAACCGAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAAT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                          gGCTGTCACGGTT--------AACCGAAACC-GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAAT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gGTAAATTCTCA-T---TCGGTTCGATT-C-GAT---TT--GCTT-TTT--TTC-G-G-A-TT
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--A-TAT-A----A-CA---TT--------------G------G---------------T--------------ATACCTGTTGGTA---A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-G
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-A-TA--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                       --------AACC-------GAAAAA-TTCGGTTAAACC-GC---GGTAAATTCTCG-TG--TCG-TTCG-TT-A-CAT---TT--GC-AATTT--TCC-GAG-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CG--T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T---GGTTCTG-ATATT--A-TA-CCGAA--TGA-TATTCCAACCAATG-AA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TCTCGGTATACATGTAG------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CATTGGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGGATT-T--------TAA--CA-A-A-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT---A-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAA
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                          gaCTGTCACGGTT--------AACC-------CGAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTAG-T---TCGGTTCGGTT-------------GC-A-TTT--TCC-G-G-AATTTC-GGTT--CA-GT-TTT-GTT-ACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--TTC--TTTTT---CAC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TTA-TATTCCAACCAATGGAA-T--CC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATATCATTGTTGGTAAA-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--A---TTGCGCAT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TATAGGAATT-T--------T-AA-CA-A-A-TTTA-----------------------G-----TC--AAAG-A--TTT-TTAAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAAGTG-TGC-GAGT-TTA-AGT---T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGGT--------AACC-------GAAAAA-T-CG-TTAA-CCCGC---GGTAAATTCTC--T---T---TTCGGTTTC-GGT---TTT-GC-A-TTT--TTCTG-G-A-TTTC-GGT---CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-ACTA--C-ACACTT--T-CCTTTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-CTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT--A-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATAGAA---TCC--ACTAT-A----A-CA---TCGGTATACATGTTA-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CA--GGCGGAC------A-CGTGCTAG--------------AT-G--GA--ATG-G-A-TG--CA-GA--A---TA--GGGATT-T--------T-A--TA-T-T-TTTATTTCTAA-G-----AAAG-GAAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-ATG----CG--CAAT-CT-GC---AAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-cctgca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---AGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT---------TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-TGGT--CGTGT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-TAT-GGTTC-G--TATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TTC--A-TGT-A----A-CA---TCGGTATAACATGTT-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TGCACA-GGATA---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-A-TTC-----------------------AG-----TC--AAAG----TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGCAAAGT-TTA-AGT---TATTGCAAtgc


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       TAAACCGA    GAAAACC      A T       A  C  TTT           GTAGG            CC    AAA  AG  T A   .    T A T A    C    TT  T  A   G           TA C CT TG        GGC  CT     .     T .  A  G  G   G TA  A T A G     G A     AT G  .  G  TG   T                 . A   AT C   C TTAA .  ATT  GGTAATAACCTGTTTGTTA                                                  T   CTGTGGT C AAGC T .   G   T   CGTGTC G        A TT  TG    GC  G CC   A   C G T  CA  C  AT TAT ATA      G AATTATTT A AC  G TT    ATAAGAATTC         TGG   GGGGT  CA    A AT   G T   GG  G  C . C  AACTC  AA    .  A  AA    TG  C    GT C   A    G   G  TGTG  T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           GAAACC       . .       .  .  .             GATG             TC    .    T   . .   .    . . . .    .    .   .  .   T           T  . T  .         TG   T      .     . .  .  .  .   . CT  . . . .     A .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . TT   .  .    GGTATATCATTGTTGGTAA                                                  .   .       . .    . .   T   A   .      .        . .   .     G   . T    G   . . G  A   .  .  .   AG       . .        . A   . TA    ATTTCTAAG          GGG   .      A     . .    . .   A   .  . . .  G      .     .  .  A     A   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GGT              A     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   T           .  . .  .         TT   T      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     T .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTATACGCTGTTGGGAA                                                   .   .       . .    . .   .   G   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . TA    ATTAAG             TGG   .      .     . .    . .   C   .  . . .  .      .     .  .  T     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GGT              C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    TCGGTATACATGTAGGTA                                                   .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . A     ATAAGG             TGG   .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GTG              C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTATACATGTTAGGTA                                                    .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   T        . .        . .   . A     ATAAG              TGG   .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTATAACATGTTGGTA                                                    .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . T     TTAAG              TGG   .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         G    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTATACCTGTTGGTA                                                     .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   T        . .        . .   . T     ATAAG              GGG   .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             AA               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTATACATGTAGGT                                                      .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . T     ATAAG              TGA   .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  G     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             AT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         C    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    ACGAAAGGTA                                                           .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   T        . .        . .   . T     ACAAA              TGG   .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTAAAAGTA                                                           .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . T     ATAAG              TG    .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             AT               T     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GCTAAGGTG                                                            .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   T        . .        . .   . T     ATAAG              GA    .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGGTA                                                                .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   T        . .        . .   . T     TAAC               T     .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             AT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         C    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     T  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGGTA                                                                .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . T     A                  .     .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  T     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             GT               A     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     .  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GATA                                                                 .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . A     .                  .     .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .           .            . .       .  .  .             AT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     .  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTA                                                                 .   .       . .    . .   .   .   .      .        . .   .     .   . .    .   . . .  .   .  .  .   A        . .        . .   . A     .                  .     .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                . .       .  .  .             GT               C     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     .  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GGTA                                                                 .   .       . .    . .   .   .                                              . . .  .   .  .  .   .        . .        . .   . T     .                  .     .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .   .    .  .   .    .   .  .      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                  .             .             GT               A     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .           .  . .  .         T    .      .     . .  .  .  .   . .   . . . .     . .     .  .  .  .  .    .                 . .   .  .   . .    .  .    GTTA                                                                 .   .       . .    . .   .                                                                                . .        . .   . A     .                        .      .     . .    . .   .   .  . . .  .      .     .  .  .     .                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                              T                .     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .                             .                                          . .     . .                                              .  .   . .    .  .    GGTA                                                                 .                                                                                                                                                           .      .     . .    . .                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                              .                .     .    .   . .   .    . . . .    .    .   .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                               .     .    .   . .   .    . . . .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                              GT****                                **                                          **                            ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T**                      TGG
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCGT----TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-AT--TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
31 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): GATCGCCGAATTGAACAGCTAAGCAAATTGGCAAGGTTAGCTCAGTGGGGCATTGTAGTTGATGTGGATCAGCTTCGTGAACCGGAAAAATGTGTGTGTTCGAGTCCTCCACTCAAGACTTGTAGACGGTTTGACTTCCCAAAGATTACGCACTGCATATCACTAGACTGGAGAGACTGCGGATCATTAGGTTATGACCTTAAAATTGGAAGGGTCCACATATCACGACAGGGCCGGTTGTTATGGATCTATCAGTTCTAAAGAAAATCCTTCCTGATCTACAGACCGTAAGCGCCTATGGATATAGTCTAAATTTTCGAAGTACCTCACCAAGAACGACCGGTAATATTAGTCAGATTAAGACGTACTTATGTTATAAAGCTTCTTGTTGATCTGATTTGTATATGCTACATCAATGTCATCCTTGATGTAATATTACCATATATGTTATTATGTGAATAAATTTAGTAAACTTGTGATGTGTGCATTTGTACACCCAGGGTTTTACGTTCTAGGCGTCCTCAAAAACCTTGATTGGCATGAAATTTTTATTTATTTAAGGTTACAACCAAAAAGTACAACTTATCCGGAATTTTAGCCAAGAATAAAAAACTGCCAAAACCGGACGTTTCAATTTCCGTGAAACCTGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|12 ): AGCCTATAGTCGGTTAAGGGACTGGTCTTTTAAAGCTGGATAGCTACGTTCTTTGTTGGACTGTTGTTCTCTAACCATAATGTCTTATCCTTGCATGAAGGTTATACATATGTTATATTGCTTGTGAATAAATTTTTTTATATTTAGTGTGCATTTGATACACCCATTTTACTTCCTGGGTCCTCAAAGATTCCTGGGATTTCATGGAAAGATTATTTTGGATTTATTACACAAAATAAAAACCAAACCGAAACCGACGGTTCAGTTTCGGTGAACCGAACCACCGAAAAATTTAGATCTTGAACCGTGACAGCC
Unaligned ( gi|15 ): TATAGTCGATTAGAGCTGCTTTTAAAGTTTTGCTGATGTTGTATTGTACAATTAATGTATCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCATTTGTACACCCATTGTACTTCTAGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTCATTTTATTTAATACACAAAATAAAACGAACCGAAAAAAAACGAAACCGAAAAAACCGAAAACTGAGGTTCAATTTCCTGAAGACCGAACTGAAAATGTCTGACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|16 ): GCCCTATAGTCGATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTGATTGTGTATTTGCACAATTAATGTCATCCTTGCATGAATTTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCCTTTGTACACCCATTTTTACTTCCATGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAATTAATTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAATCCGAAAACCGAGTTCAGTTTCCTGAACCGAACAAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|18 ): GCCTTATAGTCTATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTTTTTTAATTGTTGATTGTACCATAATGTCATCCTTGCATGAATATTACATGGTATATTGCTTGATAGAATTTATTAAACCATTGGTCGTGTTGCCTTTGTCACCCCATTTTACTTTCAAATGGTCCTCAAGATACCTGGATTTCATGAAATTAATTTATTTTATTACACAAAATAAAAACCGAACTGAAAAAAACGAAACGAGTTCAGTTTCCTGAACCGGAACCGAACGATGTCGAACCGCTGA
Unaligned ( gi|19 ): ACGTGCTTGTTTAAAGCTTTGTTGGGTTGTTGTATTGTACATATGTGTCATCCTTGCCTGGATATTACATATGTTATATTGCTAAATATGAATTTATTAAACTGTTGGTGGTGCATTTTGTACATACCCATTTTACCTTCAGGGTCTCAAGATTTACCTGGATTCGATGAAAATATTTTAATTAATACACAAATAATAACGAACCGAGAACCGAAAACCGATGTTCAGTTCCTGAACGGAGACGGAACGAAAATGTTCTGAACCGGTGACAGACC
Unaligned ( gi|20 ): TACAGTTGGTTAAGCTTTTGTTGCTTGTTGCATTGTACCCCGCATTGTACATAATGTCATCCTTGCATAAATATTTCTTATGGTATGTTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTTTGCATTTGCACATCAATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACTTGGATTCAAGAAATTATTTTAATTTATTATTCAAAACAAAACCGAACTGAAATAACCGAAAACCGAGGTTCAGTTTTCTGAACCGAACAGAAAAATGTCTGAACCGTGACAG
Unaligned ( gi|22 ): ATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAAAACCGATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGAGACATCC
Unaligned ( gi|23 ): ATCTAAATTAAAACTGTTTTAAAAGCTTTTGATTATTGTTGTATGTACACTATGTCATTCTTGCCATGAATATTACATATGTTATATTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTAGATGTGTGCATTTGTACACCCATTTTACGTCTAGGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTTATTTTATTTAATACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAACCGAGGTTCAGTTTCCTGAACTGAACCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|26 ): GAGCCTGTAGTACTGTAAGATGCTTTTTAGCTTTGTTGCTTTGATGTAATAATAGATCACTCTGCATGATATTAATATTTATGGCTGAATAGAATTTATTATATCTACATGTGTCGTATACTTCCAGGACGCTCAATACTGATCATGAAATAATTTATCATATACAAAAACTAAAACCGATACCGAAAAAAATGAAAACGATTCATTCCTGATCGACCGAACCAGAAAATGTCTAACGTGAAGCTG
Unaligned ( gi|28 ): GATCGGTTTGGTAAGCTCAGTTGTGAATTTTCGTTTCATGACGGAAGGTTGTGTTTCTAGTCCACTCAAAATTGAGCCATGACTGCTTTCCCAAACGTCGACTTCAGATTGATGCGCGATCAGTAGATAGACTTAAAAATTGAGAGCACATATCTCGACAGACGTTGTAAGTTTAAGAAACTTCTACTCACCTGCTAGCGCTATGTAATGTCAAATTTTCAACCTCA
Unaligned ( gi|30 ): TTAAATGAATACTACTTATCTAATATTGCTGAATAAAATTTCTTAGAAATTGGACATTTCCATTGTTACTGATATATACAGCTTTAGGGTATTCATTATTCTTCAAATCTTGGATTCAAGAAATTGTTCTATTTTAACACACAATATAAAACCAAACCAAAAATACCCGAAATGAGGTTTTGTTTCCTGAACCAT
Unaligned ( gi|31 ): ATAATAAACATTAATGTTTGCATTTGTACAGCAATTTTACTTCTAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAAGTAATATTTTAATTTATCACACAAAATAAAACTGAACCAAAAAAAACACCCAAAAACCAGGGTTTTGTTTCTTGAACCGAACATAACCAAAATATGTCTAAACCGTGACAGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CTGAATAGAATTTATTATACTTTATTGTGTGCATTTGTACACCTATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTTTAATGAAATTAATTTTATTTATAACACAAAATGAAACCGAACCGAAAAAACCGAAAACCGAGGTTCAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|34 ): ATTAGGAGTATAACCTTAATAATCGGAGGTACATTATCCACGACAGGCTTGGCAGTTTAAAAATCCTTCCTACTTTAACGACCGTAAGACGCTACTGTATAGTCTAAATTACTCATGTACCACCCAAGC
Unaligned ( gi|35 ): GATCGCGGTTAGCCTAAACAGTGTTTTAAGTCGGCTTCGTAACGGAAATGATTGATGTGTCCCCTTCTAGTCACCACTCAAAATCTTGAGGGACCACATGACTGCTCTTTCCCAACACGCTCGGCAT
Unaligned ( gi|36 ): ATTAATTTATCACACAAAATAAAACTGCAAAAAGGAAATACACCCCCCCCCCTAAATAAAATTTCAAAATCCGACGCTTTGTTTCCTGAATTGAACCGAAAAATGGTTGACCCATAACAGCTTC
Unaligned ( gi|37 ): GAGTTTAAGTATGCAATAGGATCGCGGTACAGTACCTCAGTGGTAGCTAGAATGTTCGCTTCGTGACCGAAAGATCGTGTGTTCTATAGTTCCTCTCAAACCTGAGACACATGAC
Unaligned ( gi|38 ): GCTTCGTGACCGGAAGGTTGTGTGTTCTAGCTAGTCCTATTCAAACTTGAGACACGTGACTGCTTTTCCCAAACGCTTGGCATTAAGACTTGAGAGCCGCGGATCATTAGGATA
Unaligned ( gi|40 ): TGTCTATTAAGACTGCTTTTTGAAAAGCTGTTTTGATGTGTCTGTATTGTCATGATGTCATCTTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGAACATTTTAAACT
Unaligned ( gi|47 ): TAGTCAGTTAAGACTGCTTTTGAAAACTTTGTTACTTGTTGTATTGTACAGTATGTTATCCTTGCAAGAA
Unaligned ( gi|48 ): TACACAAAATAAAACCGAACTGAAAAAAACCGAAAGCCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCG
Unaligned ( gi|49 ): AGGCGTTGTCATATTTAGGAACCTTTACTACCAAGACCGAAACCATCAAGTTATGTCTAATTATG
Unaligned ( gi|50 ): CGAAAACCGAGGTTAAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTATGAACCATGACAGCCC
Unaligned ( gi|51 ): AGCCTATAGTCAGAGACTGATTTTTTAAGCTTTTGTTGATTGTTGTATTGTACATA
Unaligned ( gi|52 ): CTACGACCGTAAGTGCTATAGTATGAATAGGTCTAATTTTCAGTACCTCATCCAG
Unaligned ( gi|54 ): GGATCGCGGTAGCTCAGTGGATTAGAAAAATGTAACCTTCGTCACGAA
Unaligned ( gi|59 ): TGTATAGTTCTAAATAGGTAGTACCTCACCTG
Unaligned ( gi|60 ): CGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCGC
Unaligned ( gi|61 ): GCGGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCCTA
Unaligned ( gi|62 ): CCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCCTAC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                   1111111                                                                                                                                                                                                                                                                  88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                                                                                                                    111111111111111                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       99999999    5555555      4 2       2  2  333           888888           444   333  44  1 1   22   1 1 1 1    1    22  2  2   6   0       77 2 55 33    0   4444 77     333   2 2  2  2  2   2 66  2 2 2 2     6 2     22 2  2  2  33   2                 2 2   22 2   2 7777 2  333  33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2   7777777 2 4444 2 2   6   7   777777 2        2 33  33    55  2 55   5   2 2 4  55  2  33 444 777      2 88888888 2 55  2 777   222222222222222    666   55555  55    2 22   2 2   77  2  2 2 4  77777  33    2  2  77    55  2    33 2   2    2   2  5555  2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       ........    .......      . .       .  .  ...           ......           ...   ...  ..  . .   ..   . . . .    .    ..  .  .   .   .       .. . .. ..    .   .... ..     ...   . .  .  .  .   . ..  . . . .     . .     .. .  .  .  ..   .                 . .   .. .   . .... .  ...  .................................................................... .   ....... . .... . .   .   .   ...... .        . ..  ..    ..  . ..   .   . . .  ..  .  .. ... ...      . ........ . ..  . ...   ...............    ...   .....  ..    . ..   . .   ..  .  . . .  .....  ..    .  .  ..    ..  .    .. .   .    .   .  ....  .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                       11111111    3333333      7 2       4  4  999           444444           111   333  55  9 9   66   9 9 8 8    9    88  0  0   0   6       55 2 33 11    1   3333 55     999   2 2  2  2  2   2 11  2 2 1 1     3 1     66 2  2  2  11   2                 2 2   99 1   1 4444 1  777  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1   2222222 2 7777 2 2   7   1   222222 5        5 44  44    99  5 99   0   4 4 7  66  4  22 111 222      2 11111111 2 33  2 111   444444444444444    333   33333  00    1 99   1 1   55  2  2 2 4  88888  11    2  2  55    33  4    22 4   4    4   4  2222  5     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
Reference ( family-706 )      :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                               TCA-GGTT--------AACC-------AAAAAAAT-CG-------T-GC---GGTAAATTCT-------TCGGT-CGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTTATTCC-G-G-A-TTTC-AAGT--CG--T-TTT-GTT-ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTTTGTCGC-TTAC-AC-GC-TTT-C--TT-T-A-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TAATC-AA--TGA-T-TTCCAACCAATGGAAAT-TCC--A-TAT-A----AACA---TCT-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-ATCATCGGC-GAC------A-CGTGCTGG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-A-A--G--TA-GG--A---TT--GGGATT-T--------T-A--CA-ATT-TTTA----TAA-G------AAGTG-------------AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-CATGAT-----CA--CAATCCT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TGA-AGT---TA-TGCAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                      T--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCG------TT-A-CAT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TT---GGTT--CG-GT-T---GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT----C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-TTC-T--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-CC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATACATGTAGGT----A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATG-GGA-TG--CA-GG--A---TA--GGGATT-T--------T-A--CA-A-A-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAAta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTCTCG-T---TCAGTTC-------GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GCTTACTTCTTTAA-A--A--CTA-ATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTCC-GAATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAATCAATGGAA-T-TCC--A--ATCA----A-CAATTCC--------------G------G---------------TATACGCTGTTGGGAA---------------A-AAC-------ACA----A-C-CAT-TGC-GAC------A-CGTGCAAGAA--AA--TGGC--AT-G--GATAATGCG-A-TG--CA-GG--A---TA--AGAATT-T--------T-A--CA-A-A-TT-----------------------AAG-----TC--AAAG-A--TTT-C-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAGT-CT-GA--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                   GATT--------AACC-------GAAAAG-C-TGATTAA-CT-GT---GATAAATACTCA-A---TAGGTTCGATT-C-AGT---C---GC-A-TTT--TCT-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACATTGT--A-C--A--CTACCCTA--T-T--ATGTA---TGC-T-AC-A---T-GTT-CTATG-A-T-T-GGT---------------------A--TGA-TATTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TGT-A----A-CA---TCACGAAA--------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----G-A-CAT-G-------------------------------TGC--AT------T-GTG-G-----------------------GAATA-C--------T-A--TA-ATT-TTTT----TAA-G-----AAGGGGGGGGGGGGTTCCAGAAG-A--TTT-T-AAC--AA-AG-C-A-AT-----CA--C--T-AT-GCA-AAAT--AT-TCAA--G-CCT-GAGT-TTA-AG----TA-TGCAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                           tggtaaa-CGGTTCA---------GATAATTTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-AGGAAACT--GA-A-CCT----C-G-G---TTTC-GGTT--TG-GT-T----TTTATTTTta
gi|2                          : agcctatagtcggttaagactgcttttcttaagtcttttgttgactgttgtattgtacataatgtcatccttgcatgaattatacatatgttatattgctgaataaattttttatactttaattgtgtgcattgtacacccattttacttcctgggtcctcaagattcctggattcatgaaaattaattttatttattacacGCTGT-ACGGTTTAAACCGAAACC-------GAAAAAAT-CGGTTAA-CC-GCTTTGGTGAATTCTCGATG--TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A--TTC-GGTT--CG-GT-TTTGGTTTAC------------------CATTTGGC-T--TTTTT---CGCTT-AC-ACGGT-GTTGC--TGAA-T-TGGGTTCGG-ATATT-TAGTA-TC-AATGTGATTATTCCAACC-ATGGAA-TATCC--A-TAT-ATT--A-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----ATA-CGG-AGCTGA-------A-CGC-TTAG-ATTAT--TTGCG-GT-GCCGAT-AGG-G-A-TGA-CA-GG--A---TT--GGAA-T-T--------T-A--CAGA-TATTTAT---TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-GATTTT-T-AATGGAA-AGCC-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G--GC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAAtgacagccc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTTCGGT---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TCAGGA-A-A-----CT-G-A-A-TT---GGTTTTCG-GT-TTT-ATTTtatgatcggcgggtagcttctgtggttcaatgttcgcttcgtacctgaaggtgtgtgttctagttcccactcaaacttgaggacaccatgatctgattgcttcccgaacgctcggcattcagaactagtgagttgcgcgaatccttaaaatcgaggtcacacatcacggacagactaacgaccgtaagcgctattatgtattagttcgaattttcttagtattcaccaa
gi|21                         :                                                                             aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaTCGGTT-C-AG--------AC-A-TTT--TC--G-G----TTC-GGTT--CG-GT-TCG-GTTCAgtctgaaccgagac
gi|24                         :                      aatatcggttaaactgctttttaaagcttttgttaattgttgtattgtacataatgtcacccttgcatgaatattacatatgttatattgctgaatagaatttattaagctttgatgtgtgcatctgtacacccaatttacttccaggatcaagatacctagattcatgaaagtaattttatttcgggttttatttatacacaaaaataaaaccgaaaaccaattcagtttccC---GGTAAATTCTCA-T---TCGGCTCGATT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTATCTTT--T-C--CTGTT---TGC-A-AC-AC-GC-GCT-A--TG-T-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCTAGCCAATGGAT-T-TCC--A-TAT-A----A-CC---CC--------------GGTAAAAG---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCAAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-GTG-A-A-TC--CA-GG--A---TA--GGAATT-T--------T-A--TT-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGGAG-----TC--CAAG-A--ATT-T-gac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -A-TTTC---TT--CG-TCATTT-GT--ACTTTTTT-A-A--A--CTACATTT--TGC--TTT-----CG--T-A--AC-GC-GTT-TCTTG-A-T---GGTT--G-ATATT--A-TA--C-AA--TGA-TAT-CCAACCA-TGGAA-T-TCC--A-----A----A--A---T---------------G------A---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGCAGACCGTGTCA-CGTGTTAG-A--AA--TTGC--AT-G--TAT-ATG-G-ATTG--C--GG--A---TT--GAAATT-T--------T-----A-A-T-------------------AAAGT-GAAT-----TC--CAA--A--CTA-T-A----AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-TG--AAATA-AT-TCAA--ACCGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGTAAccta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTACTTTC--------A--GTAC-TTT--G-A--TTGTT---TGC-T-AC-AC-AC-GCC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-CA-TC-AA--TGA-TATTTTAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-ATTAAA-CA---TC--------------GCTAAG-G---------------T--------------G---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GCC-GAT------A-CGTGCAAG-A--AA--TTTC--AT-AT-GATGATG-G-T-TG--CA-GG--A---TA--GGAATT-TAATTATTTT-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGGAG-----TC--AAAT-A--ATT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--At
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-GGTTCAG-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TCG-------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT--GC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-A-G-G-A-TA--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAAGG-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              GTAACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTCACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TGTTCTAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------GTAATAACCTGTTTGTT--------------A---------------A-AAC-------A-T----A-A-CAT-GGC-GAC------A--GTGCTAG-A--AATGTTGC--ATGG--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GA--GTATTA--GGAATC-T------------------T-TTAA----CAA-A-----AATTT---AG-----TC--AAAGAA--TTT-T-AATA-AA-AG-T-TCATAACTCTG--CAGT-CTAGC--AAATTGAT-TC-A--G-CGC-GAGTGTTG-AATGTGTA-TGAAA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                           AAAAA-T-CGATTAT-CC-AC---GGTAAATACTCA-T---TCGGTTCGATT-T-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-A-G-A-TTTC-AGTT--TG-GT-TTT-GTATACTTTTT--A-A--A--CTACTCTA--C-C--TTATT---TGC-T-AT-AT-GC-ACT-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TAA-TATTCAAGCCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-TA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-At
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                            CTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-TGGTTAA-CT-GT---GGTAAATACTC---------ATTCAGTT-C-AGT---TT--GC-A-TTT--TCT-G-A-A-TTTC-GGTT--CT-GT-TTT-GTTTACATTTT--ACA--ATGTTCCATTT--T-ggtaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                              GTCACG-TT--------AACA-------GAAAA--T-CGGTTTA-AC-G----GGTA--TTTTCG-TAGGTCGGTT----T-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-AT-T--CTAC-TTT--T-T--TTTTT---CGT-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-G-GGTCC-G-TGATTATA-TG-TG-CA--TGA--A-TCGAACCAATGGAA-T-TCCATA-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------T-AGCCTGTGGTA-AAAGCA-A-CATGGGC-GAC------AGCGTGCAAA-T--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-AGTG--CACGG--A---TAG-GGAATTGT--------T-AACCA-A-TATCT----------------------AAG-----TCA-AAAG-A--TTTGT-AAT--AAGAG-C-T-AT-----CGAACAGT-CT-GCAAAAAT--ATCTCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AGT---TA-
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            TCG-T---TCGGTTCGGTT-CCGGT---TT--GC-A-GTT--TCC-G-GTA-TTTCCGGTT--CG-GT-TTT-GTT-------------------TACATTT--T-CT-TTTTT---CGC-T-ACAAC-GCGGTT-C--TG-ATT-T-GGTTC-G-ATATT-gtgtcaat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTT--C-C--TTT------GC-T-----T-GC-GTC-A--TG-A-T-T-GGTTC-G-ACATT-TT-TA-TC-AA--TGA-T-----GACCAGTGGAG-T-TCT--A-CGT-A----A--A---TT--------------G------T---------------T--------------A---------------ATAGT-------A-A----A-A-AAT-
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatccAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccaatatagtgcgtccaAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--TAAT-AT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGC-AAGT-TTA-AG----TA-TGCAAtag
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ccaatatagtgcgtccaATT-C--------C-G--CA-A-T-TGT-----TAA-C-----AAAAGGGGTG-----TC--AGAG-G--------AGTC-AA-AG-C-A-AT-----CA--CAAT-CT-GCT-AAAT--AT-TCAA--G-CGC-GGG---TAGAGG---TA-TGCtag
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                              GTCACAATT--------ATCC-------AAAAAA-T-CGGTTAA-TC-GC---GGTAAATACACA-T---TCGGTTCTGTT-A-AGT---TT--GT-T-CTT--TCA-G-G-A-TTTC-GG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                         tcGCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT-C-GGT---TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AA--TGG-CATTCCAACCAATGGAA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CATGCTAG-A--AA--TTGC--AG-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-G--CA-A-T-TTCA----TAA-GAATTCAAAGTGAAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-TT-----CA--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-TGCAA
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCATGGTT--------AACCGAAAACCGAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAAT
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                          gGCTGTCACGGTT--------AACCGAAACC-GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTGAAT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gGTAAATTCTCA-T---TCGGTTCGATT-C-GAT---TT--GCTT-TTT--TTC-G-G-A-TT
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--A-TAT-A----A-CA---TT--------------G------G---------------T--------------ATACCTGTTGGTA---A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-G
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-A-TA--CA-GG--A---TT--GGAATT-T--------T-A--CA-A-T-TTTA----TAA-G-----AA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                       --------AACC-------GAAAAA-TTCGGTTAAACC-GC---GGTAAATTCTCG-TG--TCG-TTCG-TT-A-CAT---TT--GC-AATTT--TCC-GAG-A-TTTC-GGTT--CG-GT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CG--T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T---GGTTCTG-ATATT--A-TA-CCGAA--TGA-TATTCCAACCAATG-AA-T-TCC--A-TAT-A----A-CA---TCTCGGTATACATGTAG------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CATTGGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GGT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TA--GGGATT-T--------TAA--CA-A-A-TTTA----TAA-G-----AAAGTGGAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT---A-AG-T-T-AT-----CG--CAAT-CT-GC--AAAT--AT-TGAA--G-TGC-GAGT-TTA-AGT---TA-GGCAA
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                           GCTGTCACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                          gaCTGTCACGGTT--------AACC-------CGAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---GGTAAATTCTAG-T---TCGGTTCGGTT-------------GC-A-TTT--TCC-G-G-AATTTC-GGTT--CA-GT-TTT-GTT-ACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--TTC--TTTTT---CAC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT-TA-TA-TC-AT--TTA-TATTCCAACCAATGGAA-T--CC--A-TAT-A----A-CA---TC--------------G------G---------------T--------------ATATCATTGTTGGTAAA-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--A---TTGCGCAT-G--GAT-ATG-G-A-TG--CA-GG--A---TATAGGAATT-T--------T-AA-CA-A-A-TTTA-----------------------G-----TC--AAAG-A--TTT-TTAAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAAGTG-TGC-GAGT-TTA-AGT---T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGGT--------AACC-------GAAAAA-T-CG-TTAA-CCCGC---GGTAAATTCTC--T---T---TTCGGTTTC-GGT---TTT-GC-A-TTT--TTCTG-G-A-TTTC-GGT---CG-GT-TTT-GTTTACTTTTT--A-ACTA--C-ACACTT--T-CCTTTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-CTT-C--TG-A-T-T-GGTTC-G-ATATT--A-TA-TC-AA--TGA-TATTCCAACCAATAGAA---TCC--ACTAT-A----A-CA---TCGGTATACATGTTA-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CA--GGCGGAC------A-CGTGCTAG--------------AT-G--GA--ATG-G-A-TG--CA-GA--A---TA--GGGATT-T--------T-A--TA-T-T-TTTATTTCTAA-G-----AAAG-GAAAG-----TC--AAAG-A--TTT-T-AAT--AA-AG-T-T-ATG----CG--CAAT-CT-GC---AAT--AT-TCAA--G-CGT-GAGT-TTA-AGT---TA-cctgca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                CACGGTT--------AACC-------GAAAAA-T-CGGTTAA-CC-GC---AGTAAATTCTCG-T---TCGGTTCGGTT---------TT--GC-A-TTT--TCC-G-G-A-TTTT-TGGT--CGTGT-TTTTGTTTACTTTTT--A-A--A--CTACATTT--T-C--TTTTT---CGC-T-AC-AC-GC-GTT-C--TG-A-TAT-GGTTC-G--TATT-TA-TA-TC-AT--TGA-TATTCCAACCAATGGAA-T-TTC--A-TGT-A----A-CA---TCGGTATAACATGTT-G------G---------------T--------------A---------------A-AAC-------A-A----A-A-CAT-GGC-GAC------A-CGTGCTAG-A--AA--TTGC--AT-G--GAT-ATG-G-A-TGCACA-GGATA---TA--GGAATT-T--------T-A--CA-A-A-TTC-----------------------AG-----TC--AAAG----TTT-T-AAT--AA-AG-C-T-AT-----CG--CAGT-CT-GC--AAAT--AT-TCAA--G-CGCAAAGT-TTA-AGT---TATTGCAAtgc
31 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): GATCGCCGAATTGAACAGCTAAGCAAATTGGCAAGGTTAGCTCAGTGGGGCATTGTAGTTGATGTGGATCAGCTTCGTGAACCGGAAAAATGTGTGTGTTCGAGTCCTCCACTCAAGACTTGTAGACGGTTTGACTTCCCAAAGATTACGCACTGCATATCACTAGACTGGAGAGACTGCGGATCATTAGGTTATGACCTTAAAATTGGAAGGGTCCACATATCACGACAGGGCCGGTTGTTATGGATCTATCAGTTCTAAAGAAAATCCTTCCTGATCTACAGACCGTAAGCGCCTATGGATATAGTCTAAATTTTCGAAGTACCTCACCAAGAACGACCGGTAATATTAGTCAGATTAAGACGTACTTATGTTATAAAGCTTCTTGTTGATCTGATTTGTATATGCTACATCAATGTCATCCTTGATGTAATATTACCATATATGTTATTATGTGAATAAATTTAGTAAACTTGTGATGTGTGCATTTGTACACCCAGGGTTTTACGTTCTAGGCGTCCTCAAAAACCTTGATTGGCATGAAATTTTTATTTATTTAAGGTTACAACCAAAAAGTACAACTTATCCGGAATTTTAGCCAAGAATAAAAAACTGCCAAAACCGGACGTTTCAATTTCCGTGAAACCTGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|12 ): AGCCTATAGTCGGTTAAGGGACTGGTCTTTTAAAGCTGGATAGCTACGTTCTTTGTTGGACTGTTGTTCTCTAACCATAATGTCTTATCCTTGCATGAAGGTTATACATATGTTATATTGCTTGTGAATAAATTTTTTTATATTTAGTGTGCATTTGATACACCCATTTTACTTCCTGGGTCCTCAAAGATTCCTGGGATTTCATGGAAAGATTATTTTGGATTTATTACACAAAATAAAAACCAAACCGAAACCGACGGTTCAGTTTCGGTGAACCGAACCACCGAAAAATTTAGATCTTGAACCGTGACAGCC
Unaligned ( gi|15 ): TATAGTCGATTAGAGCTGCTTTTAAAGTTTTGCTGATGTTGTATTGTACAATTAATGTATCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCATTTGTACACCCATTGTACTTCTAGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTCATTTTATTTAATACACAAAATAAAACGAACCGAAAAAAAACGAAACCGAAAAAACCGAAAACTGAGGTTCAATTTCCTGAAGACCGAACTGAAAATGTCTGACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|16 ): GCCCTATAGTCGATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTGATTGTGTATTTGCACAATTAATGTCATCCTTGCATGAATTTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTGTGCCTTTGTACACCCATTTTTACTTCCATGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAATTAATTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAATCCGAAAACCGAGTTCAGTTTCCTGAACCGAACAAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|18 ): GCCTTATAGTCTATTAAGACTGCTTTTTAAAGCTTTTTTTTTAATTGTTGATTGTACCATAATGTCATCCTTGCATGAATATTACATGGTATATTGCTTGATAGAATTTATTAAACCATTGGTCGTGTTGCCTTTGTCACCCCATTTTACTTTCAAATGGTCCTCAAGATACCTGGATTTCATGAAATTAATTTATTTTATTACACAAAATAAAAACCGAACTGAAAAAAACGAAACGAGTTCAGTTTCCTGAACCGGAACCGAACGATGTCGAACCGCTGA
Unaligned ( gi|19 ): ACGTGCTTGTTTAAAGCTTTGTTGGGTTGTTGTATTGTACATATGTGTCATCCTTGCCTGGATATTACATATGTTATATTGCTAAATATGAATTTATTAAACTGTTGGTGGTGCATTTTGTACATACCCATTTTACCTTCAGGGTCTCAAGATTTACCTGGATTCGATGAAAATATTTTAATTAATACACAAATAATAACGAACCGAGAACCGAAAACCGATGTTCAGTTCCTGAACGGAGACGGAACGAAAATGTTCTGAACCGGTGACAGACC
Unaligned ( gi|20 ): TACAGTTGGTTAAGCTTTTGTTGCTTGTTGCATTGTACCCCGCATTGTACATAATGTCATCCTTGCATAAATATTTCTTATGGTATGTTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTTGATGTTTGCATTTGCACATCAATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACTTGGATTCAAGAAATTATTTTAATTTATTATTCAAAACAAAACCGAACTGAAATAACCGAAAACCGAGGTTCAGTTTTCTGAACCGAACAGAAAAATGTCTGAACCGTGACAG
Unaligned ( gi|22 ): ATATCGGTTAAACTGCTTTTTAAAGCTTTTGTTAATTGTTGTATTGTACATAATGTCACCCTTGCATGAATATTACATATGTTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAGCTTTGGATGTGTGCATCTGTACACCCAATTTACTTCCAGGATCAAGATACCTAGATTCATGAAAGTAATTTTATTTCGGGTTTTATTTATTACACAAAATAAAACCGAAAACCGATTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGAGACATCC
Unaligned ( gi|23 ): ATCTAAATTAAAACTGTTTTAAAAGCTTTTGATTATTGTTGTATGTACACTATGTCATTCTTGCCATGAATATTACATATGTTATATTATATTGCTGAATAGAATTTATTAAACTTAGATGTGTGCATTTGTACACCCATTTTACGTCTAGGGTCCTCAAGATACCTTGATTCATGAAATTTATTTTATTTAATACACAAAATAAAACCGAACCGAAAAAACCGAGGTTCAGTTTCCTGAACTGAACCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|26 ): GAGCCTGTAGTACTGTAAGATGCTTTTTAGCTTTGTTGCTTTGATGTAATAATAGATCACTCTGCATGATATTAATATTTATGGCTGAATAGAATTTATTATATCTACATGTGTCGTATACTTCCAGGACGCTCAATACTGATCATGAAATAATTTATCATATACAAAAACTAAAACCGATACCGAAAAAAATGAAAACGATTCATTCCTGATCGACCGAACCAGAAAATGTCTAACGTGAAGCTG
Unaligned ( gi|28 ): GATCGGTTTGGTAAGCTCAGTTGTGAATTTTCGTTTCATGACGGAAGGTTGTGTTTCTAGTCCACTCAAAATTGAGCCATGACTGCTTTCCCAAACGTCGACTTCAGATTGATGCGCGATCAGTAGATAGACTTAAAAATTGAGAGCACATATCTCGACAGACGTTGTAAGTTTAAGAAACTTCTACTCACCTGCTAGCGCTATGTAATGTCAAATTTTCAACCTCA
Unaligned ( gi|30 ): TTAAATGAATACTACTTATCTAATATTGCTGAATAAAATTTCTTAGAAATTGGACATTTCCATTGTTACTGATATATACAGCTTTAGGGTATTCATTATTCTTCAAATCTTGGATTCAAGAAATTGTTCTATTTTAACACACAATATAAAACCAAACCAAAAATACCCGAAATGAGGTTTTGTTTCCTGAACCAT
Unaligned ( gi|31 ): ATAATAAACATTAATGTTTGCATTTGTACAGCAATTTTACTTCTAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTCATGAAAGTAATATTTTAATTTATCACACAAAATAAAACTGAACCAAAAAAAACACCCAAAAACCAGGGTTTTGTTTCTTGAACCGAACATAACCAAAATATGTCTAAACCGTGACAGCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CTGAATAGAATTTATTATACTTTATTGTGTGCATTTGTACACCTATTTTACTTCCAGGGTCCTCAAGATACCTGGATTTTAATGAAATTAATTTTATTTATAACACAAAATGAAACCGAACCGAAAAAACCGAAAACCGAGGTTCAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCC
Unaligned ( gi|34 ): ATTAGGAGTATAACCTTAATAATCGGAGGTACATTATCCACGACAGGCTTGGCAGTTTAAAAATCCTTCCTACTTTAACGACCGTAAGACGCTACTGTATAGTCTAAATTACTCATGTACCACCCAAGC
Unaligned ( gi|35 ): GATCGCGGTTAGCCTAAACAGTGTTTTAAGTCGGCTTCGTAACGGAAATGATTGATGTGTCCCCTTCTAGTCACCACTCAAAATCTTGAGGGACCACATGACTGCTCTTTCCCAACACGCTCGGCAT
Unaligned ( gi|36 ): ATTAATTTATCACACAAAATAAAACTGCAAAAAGGAAATACACCCCCCCCCCTAAATAAAATTTCAAAATCCGACGCTTTGTTTCCTGAATTGAACCGAAAAATGGTTGACCCATAACAGCTTC
Unaligned ( gi|37 ): GAGTTTAAGTATGCAATAGGATCGCGGTACAGTACCTCAGTGGTAGCTAGAATGTTCGCTTCGTGACCGAAAGATCGTGTGTTCTATAGTTCCTCTCAAACCTGAGACACATGAC
Unaligned ( gi|38 ): GCTTCGTGACCGGAAGGTTGTGTGTTCTAGCTAGTCCTATTCAAACTTGAGACACGTGACTGCTTTTCCCAAACGCTTGGCATTAAGACTTGAGAGCCGCGGATCATTAGGATA
Unaligned ( gi|40 ): TGTCTATTAAGACTGCTTTTTGAAAAGCTGTTTTGATGTGTCTGTATTGTCATGATGTCATCTTGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGAACATTTTAAACT
Unaligned ( gi|47 ): TAGTCAGTTAAGACTGCTTTTGAAAACTTTGTTACTTGTTGTATTGTACAGTATGTTATCCTTGCAAGAA
Unaligned ( gi|48 ): TACACAAAATAAAACCGAACTGAAAAAAACCGAAAGCCGAGGTTCAGTTTCCTGAACCGAACCGAACCG
Unaligned ( gi|49 ): AGGCGTTGTCATATTTAGGAACCTTTACTACCAAGACCGAAACCATCAAGTTATGTCTAATTATG
Unaligned ( gi|50 ): CGAAAACCGAGGTTAAATTTCCTGAACCGAACCGAAAAATGTATGAACCATGACAGCCC
Unaligned ( gi|51 ): AGCCTATAGTCAGAGACTGATTTTTTAAGCTTTTGTTGATTGTTGTATTGTACATA
Unaligned ( gi|52 ): CTACGACCGTAAGTGCTATAGTATGAATAGGTCTAATTTTCAGTACCTCATCCAG
Unaligned ( gi|54 ): GGATCGCGGTAGCTCAGTGGATTAGAAAAATGTAACCTTCGTCACGAA
Unaligned ( gi|59 ): TGTATAGTTCTAAATAGGTAGTACCTCACCTG
Unaligned ( gi|60 ): CGAACCGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCGC
Unaligned ( gi|61 ): GCGGAAAAATGTCTGAACCGTGACAGCCCTA
Unaligned ( gi|62 ): CCGAAAAATGTTTGAACCGTGACAGCCCTAC