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lowQualScore                  :        ...          . .        ..    . .  .   .  .. .. . .   .. .    . .. . .     ..        .   .      ...  .  .  ..  ........ . . . ..   ..  ..........   .   .. . . . .     .. . .  .. . ..... .   ... . ... .  .   ...............  . . .  .... . ... ..  ......   ....     .....   .   ..  ..   . .. .  . .... .     .  .   ...     ..  .   ....  . .. .. . ...........     .        .... .  . .      .   ...............  .  .   ..               .............................................................................. ..      .  ...  .  .         ..   .   ...      .   
lowQualScore                  :        777          3 7        99    7 7  9   9  33 99 9 9   88 7    7 22 1 2     00        9   9      000  1  1  22  22222222 1 1 1 22   22  9999999999   2   22 1 3 3 7     66 1 1  33 1 77777 1   888 1 888 2  6   333333333333333  1 2 1  1111 3 222 66  222222   1111     33333   3   44  22   2 99 1  1 6666 5     1  1   888     11  3   1111  3 66 99 3 66666666666     6        7777 6  3 3      3   333333333333333  6  6   00               777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11      4  000  6  0         11   0   000      7   
consensus                     :   AAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GGTT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CCGC-A--C-G-CGCTG-CTTTTCTGG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-A--TCT--TT---------TACG-TAA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GAG-C-T-----C-TAG---T-C-T-G-AATAGT----CG-TATA--C-CT-T-T-GT----A-C---A--TC---C--GTT----ACGCT-----GTG-TTT--AC--AAC-TC-C-AA-T---ATTAGCTA-TG-ACA---TCACAG-CCTAAG-T--GC-T--A--C-G-T-C--T----TCAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATG----ACG-T-CA--CAA-TT-GAC--AGAGCGCGGTAAATA-A-----------TA--AAG-CGAAT------------TT-----------AC----------A--------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
Reference ( gi|7 )            :   AAGGT--AGAGACGGATA-GATATCACGT--GGTT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CCGC-A--C-G-CGCTG-TTTTTCTGA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-A--TCT--TT---------GACG-TAA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GAA-C-T-----C-TAG---T-C-T-G-AATAGT----TC-TAT---C-CT-T-T-GT----A-C---A--TC---G--GTT----ACGCT-----GTG-TTT--AC--AAC-TC-C-AA-T---ATTAGCTA-TG-ACA---TCACAG-CCTAAG-A--GC-T--A--C-G-T-C--T----TCAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATG----GTG-T-CA--TAA-TT-GAC--AGAGCGCGGTAAATA-A--TA-----ATTA--AAG-CGAAT------------TT-----------AC----------A--------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATA-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
gi|2                          :   AAGGT---GAGACGGATACGTTATCACGT--GATT-GGCA-TAATTT--C--G-T-GAA--T-CCGC-GATC-G-CGCTG-CTTTCCTAG-CTT-CATTAA---AGTCT-ACCTCG--------A-T-C-A--TCT--TT---------TACG-TAAACA-T-C-CGTACAG--T-C-GAGTC-T-----CTTAG---T-C-T-G-AATAGT----TG-TAT---A-CC-T-T-GTGTCAA-CA--A--TC---C--GTT----ACGCT-----ATG-TTTAAAC--AAC-C-----A-T---ATTAGCTA-TG-A-------ATAG----AAG-T--GC-T--A--CAG------T----TAATA-A--TAACG----T-AC-T-G-CAGCAATG----ACG-TACAC-CAA-TT-G-C--AG-GCG-GGTAAATA-A-----------TA--AAGCCAAAT------------AT-----------AA----------A--------------AGTTTTACA-GC-----TTTTGTA--CAATA-TTT-CAA--GC-CAAA-
gi|15                         : ttAAGAT--AACGATGGATA-GTTATCACGT--GGAT-GGTA-TAT-TG--C--G-T-GAA--T-CCGC-A--C-A-CGCTG-CTTTTCCGG-CTT-TACCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-A--TTT--TT----------ATG-TAA--A-C-C-G-TACAG--T-C-GAT-C-T-----C-TAG---T-C-A-G-CTTAGT----CG-TATA--C-CT-T-T-ttttaaggcaatttcttagttttttaatgtgcattttgcgtattagtttatggttttgttcggttcattgattgtcgaagcattaggttatcggttt
gi|10                         : ttAAGGTTAGGAGACG-ATAAGTTATCACGTTGGGTTCGGCA-TTA-TTTTC--GCT-GAAA-TACCGCTA--C-GGCGCTG-CTTTT--AA-----TATTAC---AC-CT--C--GG--------A-TTC-A--TCC--TTCTATCATCCGAAC-TAA--A-T-C-C-TT--G--T-C-TGA-C-TGCTCCC-TAGGTCT-C-T-GTAATGGTCTGTTA-TAG---C-CTAT-T-GT----AGC---AAGTC---GCCGTT----ACGTTTCGTTGTG-TTTT-AC--AAC-TC-CAAA-T---ATTAGCTATTG-ACA----CA-AGTCCTAAGTAT-GC-T--A--C-G-taac
gi|21                         :   AAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACTT--GGTT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CCGC-attct
gi|4                          : tttAAGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GGTT-GGCA-TAA-TT--C--G-TGGAA--T-CCGCAA--C-G-CGCTG-CTTTTCTGG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-ATTTTT--TT---------TACGTTAA--A-T---C-GACAG--T-C-G-A-C-T-----C-AGG---T-T-TGG-AATAGT----CG-TAT-------------T----A-C---------------TT----A----------TT-TTT--A---AAC-T--C-AA-T---ATTAGGTA-TG-ACATTGTCACAG-CCCACC-ATTGC-T--A--C-GTT-C--T----TCAAACATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATT----ACGTT-CA--CAA-TT-GAC--AGAACGCGCT---T-------------TTA------CACATTTG---------TT-----------ACA---------A--------------A--TTCAAA-GC--AAAAATCTTACGCAATA-TTTCCAG---CTCAAATGTG
gi|19                         :     GGTG-AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GGTTTGGCAATAA-TT--CCCG-T-GA---T-CTGC-A--CCG-CGCTG-CTTCTCTGA-CTT-TATCAA---Accatttatacggaaagtttatcggttttgttgggttatccatgactgtccaagcattgattatcg
gi|23                         :      GT--AGAGACGTATA-GTTATCACGT--GATT-GGCA--AA-T
gi|6                          :           GAGACGGATA-GTTATCA-GT--GGTT-G-CA-TGT-TT--C--A-T-GAACAT-CCGC-A--C-GGTGCTGCTTTTTCTGG-CTT--ATCAA---AG-CTTAC------------A-T-CGA--TCT--TT---------TACG-TAA--A-T-CGT-TACAGATT-C-GAG-C-T-----C-TAGG--T-C-T-G-AAAAGT----CA-TATA--C-CT-TCT-GT----A-C---A--TC---A--GTA----ACGCT-----ATG-TTT--AC--AACTTC-T-AATT---ATTAGCTA-TG---------ACAG-CCT-AG-T--GC-TACA--C-G-T-A--T----TC--A-ATCTAACG----T-ACTT-GACAGC-AGG----AT--T-CA--C-A-TT-GAC--AGAACGCGGTAAATA-A--TAATGCGATTA--CAG-C---T------------TTTGTTTTGTTCAAC----------T--------------A--TTCAAA-GC--AAA-TTTTTATGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAT-GTG
gi|8                          :           GAGACGGATA-G------------GTT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CCGC-A--C-G-CGCGG-CGTTTCTGA--TT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-A--TCT--TT---------TAGG-TAA--A-T-C-C-TACA---T-C-GAT-C-T-----C-TAG---T-C-T-G-AATAGT----CC-TATAA-C-CT-T-T-GT----A-C---A--TC---CC-GTT----GCGCT-----GTG-TTTT-AC--AAC-TC-C-AT-T----TAAGCCA-T--ACA---TCA-AG-CCTTAA-AT-GC-T--A--C-GCT-C--C----TTAAA--CCTAACG----TGAC-T-GACAGC-ATG----A-----------------GC--AGAGCGCGGTAAATA-A-----------TA--AAG-CGAAT------------TT-----------ACTGCTTTTGTTACAAT----------A--TTCAAA-GC--AAAcattgtgggcgtaacatttcatcaattt
gi|5                          :                 GATA-GTTATCACGT--GGAT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CTGC-A--C-G-CGCTG-CTTTTCTGA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-A--TCA--TT---------TACG-TAA--A-T-C-C-TACAG----C-GAG-C-T-----C-TAG---T-C----------------C-TATA--C-CT-TGT-GT----A-C---A--AC---C--GTT----ACGCT-----GTG-TTT--AC--AAC-TC-C-A-------------A-TG-ACA---TC-CA---------A--GC-------------C--T----TCAAA-ATCTAACG----T-AC-TGGACAGC-ATG----ACG-T-CA--CAA--T-GACAAAAAACGCGGTAAATA-A-----------TA--AAG-CGAATTTTCAGCTTTCGTT-----------AC----------AAT------------A--TTCAAA-GC--AAAATTTTTACGCAATCTTTT-CAAGTTCTCAAA-GTGat
gi|3                          :                aGATC-GAT-TCACGT--GGTT-G--A-TAA-TTT-C--G-T-GAA--T-CCGC-A--C-G-CGCTT-GTTTTCTGATCTT-TATCAA---AA-GT-AC--CG--------A-T-C-T--CTT--TT---------AACG-TAA--A-T-C-C-TACAG--TTC-GAG-C-T-----C-TAG---TTC-T-GTAATAGT-----C-AAT---A-CA-T-TAGT----A-----A--TC---CT-GTT----ATGCT-----GTG-TTT--AC--AAT-TC-C-AA-T---AT-AGCTA-TG--CA---TCACAT-CCTAAG-T--GC-T--A--C-G-T-CGTT----TCAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGAC--GTG-C-C----AA-TT-GAC--AGAGGCCGGTAAATA-------------TA--AAG-CGAAT------------TT-----------AC----------A--------------G--CT---A-GC-----TTTTTTcattgtgcgctaacagtttatcggttttgttgggttccaattgattgtcaagcattagataatttagattatcg
gi|14                         :                        TATCAC-T--GGTT-G-CA--AA-TT--C--G-T-GAA--TTCCGC-A--C---CG--G-GCTTTCTGG-CTTCTATCAA---AG-CT-AT--CG--------ACT-C-A--TCTATTT---------ACCG-TAA--AAT-C-G-TACAA--T-C-GAG-C-T-----C-TAG---T-C-T-G-AA-AGTCG--TCATAC---C-TT-T-A-GT----A-C---A--TT-------CC----ACA------------TT--AC----C-TT-C-AA-T----TTAGCTA-CG-ttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcggcaattttcagtctcaaagtgcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|9                          :                         tTCACGT--GGTT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CCGC-A--C-G-CGCTG-CTTTTCTGA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-C-A--TCT--TT---------CACG-TAA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GAA-C-T-----C-TAG---T-C-T-G-AATAGT----TG-TATA--C-CT-T-T-GT----A-C---A--TC---C--ATT----ACACT-----GTG-TTT--AC--------------------TAGCTA-TG-ACA---TCACAA-CCTAAG-T--GC-T--A--C-G-T-C--T----TCAAA-ATCTAACT----T-AC-T-GACAGC-ATG----ACG-T-CA--CAA-TT-GAC--AGAACGCGGCAAGTA-A-----------TA--AAG-CGAAT------------TT-----------AC----------A--------------
gi|13                         :                        ttTCACGT--GGTT-GGCA-TAA-TT--C--G-T-GAA--T-CCGC-G--A-G-CGCTG-CTTTTCGGA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CA--------A-T-C-A--TTT--TT---------TACG-TAA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GAG-C-T-----C-TAG---T-C---G-TATA---------------C-CT-T-T-GT----A-C---A--TC---C--GTT----ACGCT-----GTG-TTT--AC--AAC-TC-C-AA-T---ATCACCTA-TG-ACA---TCACAG-CCTAAG-T--AC-T--A--T-G-T-C--T----TCAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATG----gcttttgtt
gi|1                          :                                                     --G-T-GTA--T-CTGC-A--C-G-CGCGC-TTTTTCTGA-CTT-TATCAATTGAG-TA-AC--CGGAGTCCAAA-T-A-C--TCT--TT---------TACGTTAA--A-TAC-CATACAG--T-CAGAG-CAT-----C-TAGAGTT-CATAG-AATAGTAAA-CC-TATATACACT-T-T-GT----A-CACAA--TCACAG--ATTTTCGACGCT-----GTGTTTT--ACTAAACTTC-C-AA-TTTAATTAGCTA-TGAACA---TCACAG-CC-AAG-AT-GCTT--ACTC-G-TAC--TTTTCTCAAA-ATCTAATAGCTTT-A--T-GACAAT-ATGAACAGTT-T-CGACCAATTT-GAC--AGAACACGGTATATACATTTA-----ACTGATAAG-CGAAT------------CT-----------TC----------A--------------
gi|22                         :                                                                                CTG-CATTTCTGG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-T-A-A--TCT--TT---------TACG-TAA--A-gactgattaagttacaaaatgatgctcatagcataattatattatatttaacagcaattctttttagtcttcgaaagtgccgcggttgtgccttcgttaacagtttatcgttttgtttgggttactcaattggattgtcaagcattagataata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                  -C-GAG-C-T-----C-TAG---T-C-T-G-AAAAGT----CG-TATA--C-CT-T-T-GT----A-C---A--TC---C--GTT----GCACT-----ATG-TTT--AC--AAC-TC-C-AA-T---ATTAGC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          TT--AC--AAC-TCAC-AA-T---AT-AGCTA-T--ACA---TCACA--CCTAAG-T--GC-T--TT-C-G-TTC--A----TCAAA-CTTTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATG----ACG-T-CA--CAA-TTTGA---AGAACGCGGTAAATA-A--T--------TA--AAG-TGAAT------------TT-----------AC----------AGTTTTGTTACAT--A--TTCAAAAGCCAAAATTT---ACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAaaccggtcgcggtggcacagttggt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-TG-ACA---TCACAG-CCTAAG-T--AT-T--A--C-G-T-C--T----TCAAA-ATCTATCG----T-AC-A-GA---C-ATG----ATG-T-TA--CAG-TT-GAC--AAAGCGCGGTAAATA-A-----------TA--AAG-CGATT------------TT-----------AC----------AGCCTTTGTTACAATA--TTCAAA-AC--AATTTGTTTACGCAGTC-GTT-CAA--TCTCAAA-ATGtggcattaatagttggttccattgactgtcaagcattgata
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C-T-GACGGC-ATG----ACG-T-CA--CAG-TT-GTA--AAAGTGCGGTAAAT-----TA-----A--A--AAG-TG-AT------------TT-----------tattgtgcgtaataatttattggttttgttgcgttccattgattgtcaaccatta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agat--TCCAAA-GC--AAATTTGTCACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tGCAAT--TTT-CAG--TCTCAAA-GTGcattgtgagtaatagtttatcggttttgttgggttccattgatgtgtcaagcattagattatcgtt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GATGAAATCAACAACCTTCCAAGTAAACACCCTTCAATAATTTCCAATATAGATAAAAATGTGAAGCTTAAGATTTGATTTTTGTGTCATTATTGTTCAGTTAAAGTAGAGACGGATAGTTAT






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Reference ( family-704 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAATT-GAC--AGAGCGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-TG-TA--T-CTGC-A--CG-CGC-GCTTTTT---------CT-GA-CTT-TATCAATTGAG-TA-AC--CGGAGTCCAAA-TA-C--TCT-TTTA-C-G---TTAA--A-TAC-CATACAG--T-CAGA--G-CATC--TA-GAGTT-CATAG-AATAGTAAACCT-AT-ATA-CACT-T-T-GT--A-C-ACAATCACAGATTTT--C-G--ACGCT-----GTGTTTT-ACTAAAC-TTC-C-AA-TTTAATTAGCTA-TGAACA---TCACAG-CCA-A--GA--TGCTT-A-CTCG-TAC--TTTTCTCAAA-ATCTAATAGCTTT-A--T-GACAAT-ATGAACAGTTTCG-A-C--CAATTTGAC--AGAACACG---GTATATACATTTAACTGA----T--AAG-CGAAT------------CTTC----------A-------------------
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGTTAGGAGACG-ATAAGTTATCACGTTGGG-TTCGGC-ATTA-TTTTCGCTG-AAA-TACCGCTA--CGGCGCTGCTTTTAATATTACACCTCGG-ATT-CATC--------CT--T--CT--------A-TC-A--TC-------C-GAACT-AA--A-T-C-C-TT--G--T-CTGACTG-C-TCCCTA-GGTCT-C-T-GTAATGGT-----CTGTTATAGC-CTAT-T-GT--AGC-AAG----------TCGCC-GTTACGTTTCGTTGTGTTTT-AC--AAC-T-C-CAAA-T---ATTAGCTATTGA-CA----CA-AGTCCT-A--AGTATGCT--A-C--G-gactgattaagttacaaaatgatgctcatagcataattatattatatttaacagcaattctttttagtcttcgaaagtgccgcggttgtgccttcgttaacagtttatcgttttgtttgggttactcaattggattgtcaagcattagataata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--AC--AAC-T-CAC-AA-T---AT-AGCTA-T-A-CA---TCACA--CCT-A--AG--TGCT--TTC--G-TTC--AT----CAAA-CTTTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAATTTGA---AGAACGCG---GTAAATA----------A----TTAAAG-TGAAT------------TTAC----------AGTTTTGTTACAT-------A--TTCAAAAGCCAAAATTT---ACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAattct
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--TATT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTATCG----T-AC-A-GA---C-ATGA-------TG-T-TA-CAGTT-GAC--AAAGCGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGATT------------TTAC----------AGCCTTTGTTACAAT-----A--TTCAAA-AC--AATTTGTTTACGCAGTC-GTT-CAA--TCTCAAA-ATGtggcattaatagttggttccattgactgtcaagcattgata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-G--AG-CGCTGCTTTT----------CG-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CA--------A-TC-A--TTT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--G-C-TC--TA-G---T------------------C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATCACCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--TACT--A-T--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGtattgtgcgtaataatttattggttttgttgcgttccattgattgtcaaccatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATCAC-T--GG-TT-G-C-A-AA-TT--CG-TG-AA--TTCCGC-A--C--CG--GGCTTT----------CT-GG-CTTCTATCAA---AG-CT-AT--CG--------ACTC-A--TCTATTTA-CCG---T-AA--AAT-C-G-TACAA--T-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AA-AGT-----C-GTCATA-C-CT-T-TAGT--A-C-A------------TT--C---CACA-----------TT--AC----C-T-T-C-AA-T----TTAGCTA-CG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGAT--AACGATGGATA-GTTATCACGT--GG-AT-GGT-ATAT-TG--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CA-CGCTGCTTTT----------CC-GG-CTT-TACCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--T-T-TTTA-T-G---T-AA--A-C-C-G-TACAG--T-C-GA--T-C-TC--TA-G---T-C-A-G-CTTAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttAAAGT--AGAGACGGATA-GTTATtaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatgaaatcaacaaccttccaagtaaacacccttcaataatttccaatatagataaaaatgtgaagcttaagatttgatttttgtgtcattattgttcagtt--TCCAAA-GC--AAATTTGTCACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    t-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AAAAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTGCACT-----ATGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCcattgtgagtaatagtttatcggttttgttgggttccattgatgtgtcaagcattagattatcgtt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGTG-AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GGTTT-GGCAATAA-TTCCCG-TG--A--T-CTGC-AC-CG-CGCTGCTTCT----------CT-GA-CTT-TATCAA---Aaaccggtcgcggtggcacagttggt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT---GAGACGGATACGTTATCACGT--GA-TT-GGC-ATAATTT--CG-TG-AA--T-CCGC-GATCG-CGCTGCTTTC----------CT-AG-CTT-CATTAA---AGTCT-ACCTCG--------A-TC-A--TCT-TTTA-C-G---T-AAACA-T-C-CGTACAG--T-C-GA--GTC-TCT-TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-GT-ATA-C-CT-TGT-GTCAA-CAA------------TC--C-GTTACGCT-----ATGTTTAAAC--AAC-C------A-T---ATTAGCTA-TGA--------ATAG-----A--AG--TGCT--A-CA-G------TT----AATA-A--TAACG----T-AC-T-G-CAGCAATGA-------CG-TACACCAATT-G-C--AG-GCG-G---GTAAATA----------A----T-AAAGCCAAAT------------ATAA----------A-------------------AGTTTTACA-GC-----TTTTGTA--CAATA-TTT-CAA--GC-CAAA-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttC-T-GACGGC-ATGA-------CG-T-CA-CAGTT-GTA--AAAGTGCG---GTAAATT----------A----A-AAAG-TG-AT------------TTttttaaggcaatttcttagttttttaatgtgcattttgcgtattagtttatggttttgttcggttcattgattgtcgaagcattaggttatcggttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agatAAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACTT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttCTGCATTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TA-A--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GT--AGAGACGTATA-GTTATCACGT--GA-TT-GGC-A-AA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-G---ATAA-TTT-CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTTGTTTT----------CT-GATCTT-TATCAA---AA-GT-AC--CG--------A-TC----TCT-TTTAAC-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--TTC-GA--G-C-TC--TA-G---TTC-T-GTAATAGT-----C-A--ATA-C-AT-T-A-GT--A---A------------TC--CTGTTATGCT-----GTGTTT--AC--AAT-T-C-C-AA-T---A-TAGCTA-TG--CA---TCACAT-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-CGTTT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-GC-CAATT-GAC--AGAGGCCG---GTAAAT-----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------G--CT---A-GC-----TTTTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatcgatGCAAT--TTT-CAG--TCTCAAA-GTGttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcggcaattttcagtctcaaagtgcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|4                          : gatcgattcacgtggttgataatttcgtgaatccgcacgcgcttgttttctgatctttatcaaaagtaccgatctcttttaacgtaaatcctacagttcgagctctagttctgtaatagtcaatacattagtaatcctgttatgctgtgtttacaattccaatatagctatgcatcacatcctaagtgctacgtcgtttcaaaatctaacgtactgacagcatgacgtgccaattgacagaggccggtaaatataaagcgaatttacagctagcttttttttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcgAAGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TGGAA--T-CCGC-AA-CG-CGCTGCTTTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-ATTTTT-TTTA-C-GT--T-AA--A-T---C-GACAG--T-C-GA----C-TC--AG-G---T-T-TGG-AATAGT-----C-GT-AT------------T--A-C---------------------TTA----------TTTTT--A---AAC-T---C-AA-T---ATTAGGTA-TGA-CATTGTCACAG-CCC-ACCAT--TGCT--A-C--GTT-C--TT----CAAACATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATTA-------CGTT-CA-CAATT-GAC--AGAACGCGCTTTTACACA----------T----T------TG---------------TTACA---------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAAAATCTTACGCAATA-TTTCCAG---CTCAAATGTGcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATA-GTTATCACGT--GG-AT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CTGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCA-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG----C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-C-----------------T-ATA-C-CT-TGT-GT--A-C-A------------AC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-A-------------A-TGA-CA---TCCAAG-C-------------------------C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-TGGACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAA-T-GACAAAAAACGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGAATTTTCAGCTTTCGTTAC----------AAT-----------------A--TTCAAA-GC--AAAATTTTTACGCAATCTTTT-CAAGTTCTCAAA-GTGccatttatacggaaagtttatcggttttgttgggttatccatgactgtccaagcattgattatcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aGAGACGGATA-GTTATCA-GT--GG-TT-G-C-ATGT-TT--CA-TG-AACAT-CCGC-A--CGGTGCTGCTTTTT---------CT-GG-CTT--ATCAA---AG-CTTAC------------A-TCGA--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-CGT-TACAGATT-C-GA--G-C-TC--TAGG---T-C-T-G-AAAAGT-----C-AT-ATA-C-CT-TCT-GT--A-C-A------------TC--A-GTAACGCT-----ATGTTT--AC--AACTT-C-T-AATT---ATTAGCTA-TG---------ACAG-CCT----AG--TGCTACA-C--G-T-A--TT----C--A-ATCTAACG----T-ACTT-GACAGC-AGGA-------T--T-CA-C-ATT-GAC--AGAACGCG---GTAAATA----------A----T-AATG-CGA--------------TTAC----------AGCTTTTGTTTTGTTCAACTA--TTCAAA-GC--AAA-TTTTTATGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAT-GTGcattgtgcgctaacagtttatcggttttgttgggttccaattgattgtcaagcattagataatttagattatcg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT--AGAGACGGATA-GATATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGTTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTGA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--A-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-CT-AT--C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--G-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--AGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGG-------TG-T-CA-TAATT-GAC--AGAGCGCG---GTAAATA----------ATAATT-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATA-TTT-CAG--TCTCAAA-GTGcattgtgggcgtaacatttcatcaattt
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Reference ( family-704 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAATT-GAC--AGAGCGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGTTAGGAGACG-ATAAGTTATCACGTTGGG-TTCGGC-ATTA-TTTTCGCTG-AAA-TACCGCTA--CGGCGCTGCTTTTAATATTACACCTCGG-ATT-CATC--------CT--T--CT--------A-TC-A--TC-------C-GAACT-AA--A-T-C-C-TT--G--T-CTGACTG-C-TCCCTA-GGTCT-C-T-GTAATGGT-----CTGTTATAGC-CTAT-T-GT--AGC-AAG----------TCGCC-GTTACGTTTCGTTGTGTTTT-AC--AAC-T-C-CAAA-T---ATTAGCTATTGA-CA----CA-AGTCCT-A--AGTATGCT--A-C--G-gactgattaagttacaaaatgatgctcatagcataattatattatatttaacagcaattctttttagtcttcgaaagtgccgcggttgtgccttcgttaacagtttatcgttttgtttgggttactcaattggattgtcaagcattagataata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--AC--AAC-T-CAC-AA-T---AT-AGCTA-T-A-CA---TCACA--CCT-A--AG--TGCT--TTC--G-TTC--AT----CAAA-CTTTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAATTTGA---AGAACGCG---GTAAATA----------A----TTAAAG-TGAAT------------TTAC----------AGTTTTGTTACAT-------A--TTCAAAAGCCAAAATTT---ACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAattct
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--TATT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTATCG----T-AC-A-GA---C-ATGA-------TG-T-TA-CAGTT-GAC--AAAGCGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGATT------------TTAC----------AGCCTTTGTTACAAT-----A--TTCAAA-AC--AATTTGTTTACGCAGTC-GTT-CAA--TCTCAAA-ATGtggcattaatagttggttccattgactgtcaagcattgata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-G--AG-CGCTGCTTTT----------CG-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CA--------A-TC-A--TTT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--G-C-TC--TA-G---T------------------C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATCACCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--TACT--A-T--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGtattgtgcgtaataatttattggttttgttgcgttccattgattgtcaaccatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATCAC-T--GG-TT-G-C-A-AA-TT--CG-TG-AA--TTCCGC-A--C--CG--GGCTTT----------CT-GG-CTTCTATCAA---AG-CT-AT--CG--------ACTC-A--TCTATTTA-CCG---T-AA--AAT-C-G-TACAA--T-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AA-AGT-----C-GTCATA-C-CT-T-TAGT--A-C-A------------TT--C---CACA-----------TT--AC----C-T-T-C-AA-T----TTAGCTA-CG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGAT--AACGATGGATA-GTTATCACGT--GG-AT-GGT-ATAT-TG--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CA-CGCTGCTTTT----------CC-GG-CTT-TACCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--T-T-TTTA-T-G---T-AA--A-C-C-G-TACAG--T-C-GA--T-C-TC--TA-G---T-C-A-G-CTTAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttAAAGT--AGAGACGGATA-GTTATtaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatgaaatcaacaaccttccaagtaaacacccttcaataatttccaatatagataaaaatgtgaagcttaagatttgatttttgtgtcattattgttcagtt--TCCAAA-GC--AAATTTGTCACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    t-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AAAAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTGCACT-----ATGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCcattgtgagtaatagtttatcggttttgttgggttccattgatgtgtcaagcattagattatcgtt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGTG-AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GGTTT-GGCAATAA-TTCCCG-TG--A--T-CTGC-AC-CG-CGCTGCTTCT----------CT-GA-CTT-TATCAA---Aaaccggtcgcggtggcacagttggt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT---GAGACGGATACGTTATCACGT--GA-TT-GGC-ATAATTT--CG-TG-AA--T-CCGC-GATCG-CGCTGCTTTC----------CT-AG-CTT-CATTAA---AGTCT-ACCTCG--------A-TC-A--TCT-TTTA-C-G---T-AAACA-T-C-CGTACAG--T-C-GA--GTC-TCT-TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-GT-ATA-C-CT-TGT-GTCAA-CAA------------TC--C-GTTACGCT-----ATGTTTAAAC--AAC-C------A-T---ATTAGCTA-TGA--------ATAG-----A--AG--TGCT--A-CA-G------TT----AATA-A--TAACG----T-AC-T-G-CAGCAATGA-------CG-TACACCAATT-G-C--AG-GCG-G---GTAAATA----------A----T-AAAGCCAAAT------------ATAA----------A-------------------AGTTTTACA-GC-----TTTTGTA--CAATA-TTT-CAA--GC-CAAA-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttC-T-GACGGC-ATGA-------CG-T-CA-CAGTT-GTA--AAAGTGCG---GTAAATT----------A----A-AAAG-TG-AT------------TTttttaaggcaatttcttagttttttaatgtgcattttgcgtattagtttatggttttgttcggttcattgattgtcgaagcattaggttatcggttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agatAAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACTT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttCTGCATTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TA-A--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GT--AGAGACGTATA-GTTATCACGT--GA-TT-GGC-A-AA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-G---ATAA-TTT-CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTTGTTTT----------CT-GATCTT-TATCAA---AA-GT-AC--CG--------A-TC----TCT-TTTAAC-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--TTC-GA--G-C-TC--TA-G---TTC-T-GTAATAGT-----C-A--ATA-C-AT-T-A-GT--A---A------------TC--CTGTTATGCT-----GTGTTT--AC--AAT-T-C-C-AA-T---A-TAGCTA-TG--CA---TCACAT-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-CGTTT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-GC-CAATT-GAC--AGAGGCCG---GTAAAT-----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------G--CT---A-GC-----TTTTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatcgatGCAAT--TTT-CAG--TCTCAAA-GTGttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcggcaattttcagtctcaaagtgcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|4                          : gatcgattcacgtggttgataatttcgtgaatccgcacgcgcttgttttctgatctttatcaaaagtaccgatctcttttaacgtaaatcctacagttcgagctctagttctgtaatagtcaatacattagtaatcctgttatgctgtgtttacaattccaatatagctatgcatcacatcctaagtgctacgtcgtttcaaaatctaacgtactgacagcatgacgtgccaattgacagaggccggtaaatataaagcgaatttacagctagcttttttttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcgAAGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TGGAA--T-CCGC-AA-CG-CGCTGCTTTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-ATTTTT-TTTA-C-GT--T-AA--A-T---C-GACAG--T-C-GA----C-TC--AG-G---T-T-TGG-AATAGT-----C-GT-AT------------T--A-C---------------------TTA----------TTTTT--A---AAC-T---C-AA-T---ATTAGGTA-TGA-CATTGTCACAG-CCC-ACCAT--TGCT--A-C--GTT-C--TT----CAAACATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATTA-------CGTT-CA-CAATT-GAC--AGAACGCGCTTTTACACA----------T----T------TG---------------TTACA---------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAAAATCTTACGCAATA-TTTCCAG---CTCAAATGTGcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATA-GTTATCACGT--GG-AT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CTGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCA-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG----C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-C-----------------T-ATA-C-CT-TGT-GT--A-C-A------------AC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-A-------------A-TGA-CA---TCCAAG-C-------------------------C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-TGGACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAA-T-GACAAAAAACGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGAATTTTCAGCTTTCGTTAC----------AAT-----------------A--TTCAAA-GC--AAAATTTTTACGCAATCTTTT-CAAGTTCTCAAA-GTGccatttatacggaaagtttatcggttttgttgggttatccatgactgtccaagcattgattatcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aGAGACGGATA-GTTATCA-GT--GG-TT-G-C-ATGT-TT--CA-TG-AACAT-CCGC-A--CGGTGCTGCTTTTT---------CT-GG-CTT--ATCAA---AG-CTTAC------------A-TCGA--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-CGT-TACAGATT-C-GA--G-C-TC--TAGG---T-C-T-G-AAAAGT-----C-AT-ATA-C-CT-TCT-GT--A-C-A------------TC--A-GTAACGCT-----ATGTTT--AC--AACTT-C-T-AATT---ATTAGCTA-TG---------ACAG-CCT----AG--TGCTACA-C--G-T-A--TT----C--A-ATCTAACG----T-ACTT-GACAGC-AGGA-------T--T-CA-C-ATT-GAC--AGAACGCG---GTAAATA----------A----T-AATG-CGA--------------TTAC----------AGCTTTTGTTTTGTTCAACTA--TTCAAA-GC--AAA-TTTTTATGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAT-GTGcattgtgcgctaacagtttatcggttttgttgggttccaattgattgtcaagcattagataatttagattatcg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT--AGAGACGGATA-GATATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGTTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTGA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--A-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-CT-AT--C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--G-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--AGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGG-------TG-T-CA-TAATT-GAC--AGAGCGCG---GTAAATA----------ATAATT-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATA-TTT-CAG--TCTCAAA-GTGcattgtgggcgtaacatttcatcaattt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAGACGGATA-G------------G-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCGGCGTTT----------CT-GA--TT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTTA-G-G---T-AA--A-T-C-C-TACA---T-C-GA--T-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----C-CT-ATAAC-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--CCGTTGCGCT-----GTGTTTT-AC--AAC-T-C-C-AT-T----TAAGCCA-T-A-CA---TCA-AG-CCTTA--AA--TGCT--A-C--GCT-C--CT----TAAA--CCTAACG----TGAC-T-GACAGC-ATGA----------------------GC--AGAGCGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTACTGCTTTTGTTACAAT---------------A--TTCAAA-GC--AAA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTCA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--A-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-ATTACACT-----GTGTTT--AC---------------------TAGCTA-TGA-CA---TCACAA-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACT----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAATT-GAC--AGAACGCG---GCAAGTA----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------at


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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttAAAGT--AGAGACGGATA-GTTATtaac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatgaaatcaacaaccttccaagtaaacacccttcaataatttccaatatagataaaaatgtgaagcttaagatttgatttttgtgtcattattgttcagtt--TCCAAA-GC--AAATTTGTCACGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAA-GTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    t-C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AAAAGT-----C-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-GTTGCACT-----ATGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCcattgtgagtaatagtttatcggttttgttgggttccattgatgtgtcaagcattagattatcgtt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGTG-AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GGTTT-GGCAATAA-TTCCCG-TG--A--T-CTGC-AC-CG-CGCTGCTTCT----------CT-GA-CTT-TATCAA---Aaaccggtcgcggtggcacagttggt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT---GAGACGGATACGTTATCACGT--GA-TT-GGC-ATAATTT--CG-TG-AA--T-CCGC-GATCG-CGCTGCTTTC----------CT-AG-CTT-CATTAA---AGTCT-ACCTCG--------A-TC-A--TCT-TTTA-C-G---T-AAACA-T-C-CGTACAG--T-C-GA--GTC-TCT-TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-GT-ATA-C-CT-TGT-GTCAA-CAA------------TC--C-GTTACGCT-----ATGTTTAAAC--AAC-C------A-T---ATTAGCTA-TGA--------ATAG-----A--AG--TGCT--A-CA-G------TT----AATA-A--TAACG----T-AC-T-G-CAGCAATGA-------CG-TACACCAATT-G-C--AG-GCG-G---GTAAATA----------A----T-AAAGCCAAAT------------ATAA----------A-------------------AGTTTTACA-GC-----TTTTGTA--CAATA-TTT-CAA--GC-CAAA-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttC-T-GACGGC-ATGA-------CG-T-CA-CAGTT-GTA--AAAGTGCG---GTAAATT----------A----A-AAAG-TG-AT------------TTttttaaggcaatttcttagttttttaatgtgcattttgcgtattagtttatggttttgttcggttcattgattgtcgaagcattaggttatcggttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agatAAGGT--AGAGACGGATA-GTTATCACTT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttCTGCATTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TA-A--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GT--AGAGACGTATA-GTTATCACGT--GA-TT-GGC-A-AA-T
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-G---ATAA-TTT-CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTTGTTTT----------CT-GATCTT-TATCAA---AA-GT-AC--CG--------A-TC----TCT-TTTAAC-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--TTC-GA--G-C-TC--TA-G---TTC-T-GTAATAGT-----C-A--ATA-C-AT-T-A-GT--A---A------------TC--CTGTTATGCT-----GTGTTT--AC--AAT-T-C-C-AA-T---A-TAGCTA-TG--CA---TCACAT-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-CGTTT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-GC-CAATT-GAC--AGAGGCCG---GTAAAT-----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------G--CT---A-GC-----TTTTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatcgatGCAAT--TTT-CAG--TCTCAAA-GTGttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcggcaattttcagtctcaaagtgcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|4                          : gatcgattcacgtggttgataatttcgtgaatccgcacgcgcttgttttctgatctttatcaaaagtaccgatctcttttaacgtaaatcctacagttcgagctctagttctgtaatagtcaatacattagtaatcctgttatgctgtgtttacaattccaatatagctatgcatcacatcctaagtgctacgtcgtttcaaaatctaacgtactgacagcatgacgtgccaattgacagaggccggtaaatataaagcgaatttacagctagcttttttttttttttttttttagcaatgttccaagcgcaaaaagttttgcgAAGT--AGAGACGGATA-GTTATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TGGAA--T-CCGC-AA-CG-CGCTGCTTTT----------CT-GG-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-ATTTTT-TTTA-C-GT--T-AA--A-T---C-GACAG--T-C-GA----C-TC--AG-G---T-T-TGG-AATAGT-----C-GT-AT------------T--A-C---------------------TTA----------TTTTT--A---AAC-T---C-AA-T---ATTAGGTA-TGA-CATTGTCACAG-CCC-ACCAT--TGCT--A-C--GTT-C--TT----CAAACATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATTA-------CGTT-CA-CAATT-GAC--AGAACGCGCTTTTACACA----------T----T------TG---------------TTACA---------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAAAATCTTACGCAATA-TTTCCAG---CTCAAATGTGcatgtgtgcgtaagtgctttatcggttttgtttggttcccacgttgattgtcaagcattagattt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATA-GTTATCACGT--GG-AT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CTGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCA-TTTA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG----C-GA--G-C-TC--TA-G---T-C-C-----------------T-ATA-C-CT-TGT-GT--A-C-A------------AC--C-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-A-------------A-TGA-CA---TCCAAG-C-------------------------C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-TGGACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAA-T-GACAAAAAACGCG---GTAAATA----------A----T-AAAG-CGAATTTTCAGCTTTCGTTAC----------AAT-----------------A--TTCAAA-GC--AAAATTTTTACGCAATCTTTT-CAAGTTCTCAAA-GTGccatttatacggaaagtttatcggttttgttgggttatccatgactgtccaagcattgattatcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aGAGACGGATA-GTTATCA-GT--GG-TT-G-C-ATGT-TT--CA-TG-AACAT-CCGC-A--CGGTGCTGCTTTTT---------CT-GG-CTT--ATCAA---AG-CTTAC------------A-TCGA--TCT-TTTA-C-G---T-AA--A-T-CGT-TACAGATT-C-GA--G-C-TC--TAGG---T-C-T-G-AAAAGT-----C-AT-ATA-C-CT-TCT-GT--A-C-A------------TC--A-GTAACGCT-----ATGTTT--AC--AACTT-C-T-AATT---ATTAGCTA-TG---------ACAG-CCT----AG--TGCTACA-C--G-T-A--TT----C--A-ATCTAACG----T-ACTT-GACAGC-AGGA-------T--T-CA-C-ATT-GAC--AGAACGCG---GTAAATA----------A----T-AATG-CGA--------------TTAC----------AGCTTTTGTTTTGTTCAACTA--TTCAAA-GC--AAA-TTTTTATGCAATC-TTT-CAG--TCTCAAT-GTGcattgtgcgctaacagtttatcggttttgttgggttccaattgattgtcaagcattagataatttagattatcg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGT--AGAGACGGATA-GATATCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGTTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTGA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--A-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-CT-AT--C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--G-GTTACGCT-----GTGTTT--AC--AAC-T-C-C-AA-T---ATTAGCTA-TGA-CA---TCACAG-CCT-A--AG--AGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACG----T-AC-T-GACAGC-ATGG-------TG-T-CA-TAATT-GAC--AGAGCGCG---GTAAATA----------ATAATT-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------A--TTCAAA-GC--AAATTTTTTACGCAATA-TTT-CAG--TCTCAAA-GTGcattgtgggcgtaacatttcatcaattt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACGT--GG-TT-GGC-ATAA-TT--CG-TG-AA--T-CCGC-A--CG-CGCTGCTTTT----------CT-GA-CTT-TATCAA---AG-CT-AC--CG--------A-TC-A--TCT-TTCA-C-G---T-AA--A-T-C-C-TACAG--T-C-GA--A-C-TC--TA-G---T-C-T-G-AATAGT-----T-GT-ATA-C-CT-T-T-GT--A-C-A------------TC--C-ATTACACT-----GTGTTT--AC---------------------TAGCTA-TGA-CA---TCACAA-CCT-A--AG--TGCT--A-C--G-T-C--TT----CAAA-ATCTAACT----T-AC-T-GACAGC-ATGA-------CG-T-CA-CAATT-GAC--AGAACGCG---GCAAGTA----------A----T-AAAG-CGAAT------------TTAC----------A-------------------at