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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6998 ) : ATATCT-AGA-CGCG-TTAGTTCAAAA--CA---AT---ATATT---C-CA--C---GGAAGGGANC----AATCACT--AAG-----CA-AC-CC-TC-------GGCTGTTAAA-ANTGGC--CTG-----CAA----G--A------------G--TG-CT-CCG---TTTT----C--TC-AA---ACACTCCT-CC-TC--A-C-------TT-TT--CGG--GG-TACT-GAA-GTT-T-TCAACTTGT---G-ACG-----C------GA--ATT-TC-A-GTA-TCA---AAA--TGGAC-CCTTA-GAGA-GTTTTT----CT--C-CTA-AT-ACA--------T--CG-AA-----TAG--TTATGA-A-GT---------AT-A-G-----CA------ATAG-AA--T---TTT---GCTT-CATT-G--GTA-CTT-T-G--------------TAA-G-T-T-CA----TT--TATG-CGA--CTA--ATT---AAG-ACAA-T-T--ATG-CT-TCAA--ACT--CGATGC-G-CCGTTCG---GGGT-GGCGG------TCT--A--TG--CGCCCC-AC-GGGG-TGGC-GG----A-TTGCT---TAAG--AAATAGGG--AT--T-AA-TTTTGCC--T-A--C-A-----GTTCT-CT-T-C-TGC-TTTAT-AT---TGGGG-ACAAAAAT
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gi|31 : acaccggctagaacggcacataaggggtgggacagcggacagtgcgccactgaatgggggtcggtggattttttggaatgcgcatacagaaagagcagacgagtggataacttaagattgtttgtttttatAA--CA---AT---ATATT---C-CA--C---GGAAGGGACC----AATTAgagcgcta
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gi|6 : C-TC-------GGCTGTTAAA-ACTGGT--CTG-----TAA----G--AATCCCGGTAAGAG--TG-CT-CAG---TTTT----C--TC-AA---ACACTCCT-CC-TC--A-C-------TA-TT--CGA--TG-TACT-GAA-GTT-T-TCAACTTGT---G-ACG-----C------GA--AAT-TC-T-GTA-TCA---AAA--TTTAC-CCTTA-TAGA-GTTTTC----CT--C-CTA-AT-ACA--------T--CG-AA-----TTG--TTATGA-A-GT---------AT-A-GTGCT-CA------ATAG-AA--T---TTT---GCTT-CATT-G--GTA-CTT-C-G--------------TAA-G-T-T-AA----TT--TATG-CGA--CTA--ATT---AAT-ACAA-T-T--AGG-CT-TCAA--ACT--CGATTC-G-CCGTT-----------------------------------------C-GGGG-TGGC-GG----A-TTGCT---GAAG--AAATAGGG--AT--T-AA-TTTTGCC--T-A--C-A-----GTTCT-CT-C-C-TGC-TTTAT-AT---TCGGG-ACAAAAagacttacgttgcgtgtcttaacttgaattattacgatttttgtgatggtgcgatgttattgcgatctgaattaaaacaaaatatgcgtaattttaaatatgtttactatgcagaaaga
gi|7 : ATATCT-AGA-CGCG-TTAGTTCAAAA--CA---AT---ATATT---C-CA--C---GGAAGGGACC----AATTACT--AAG-----CA-AC-CC-TC-------GGCTGTTAAA-ATTGGC--CTG-----CAA----G--A------------G--TG-CT-CCG---TTTC----C--TC-AA---ACACTCCT-CC-TC--A-C-------TT-TT--CGG--GG-TGCT-GAA-GTT-T-TCAACTTTT---G-ACG-----C------GA--ATT-TC-A-GCA-TCA---AAA--TGGAC-CCTTA-GAGA-GAGTTT----CT--C-CTA-AT-ACA--------T--CG-AA-----TAG--TTCTAA-A-GA---------AT-A-G-----CA------ATAT-AA--T---TTT---GCTT-CATT-G--TTA-CTT-T-G--------------TAA-G-T-T-CA----TT--TATG-CGA--CTA--ATT---AAG-ACAA-G-T--ATG-CT-TCAA--ACT--CGATGC-G-CCGTTCG---GGGT-GGCGG------TCT--A--TG--CGTCCC-AC-GGGG-TGGC-GG----A-TTGCT---TAAG--AAATAAGG--AT--T-AA-TTTTGCC--T-A--C-A-----GTTCT-TT-T-C-TGC-TTTAT-AT---TGGGG-ACAAAAATcgacctatatatatttgaattattacgattttgtgatggtgtgatgttacgatctgaagttaaacgtattaaatttaaaatg
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blockSeqs : . . . C . . . . . . T . A . . . . . . C . . AA . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . C . T . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TTTC . T C . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . A . . . . . . C . A . . . . . . G . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
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originalCons : ATATCT-AGA-CGCG-TTAGTTCAAAA--CA---AT---ATATT---C-CA--C---GGAAGGGANC----AATCACT--AAG-----CA-AC-CC-TC-------GGCTGTTAAA-ANTGGC--CTG-----CAA----G--A------------G--TG-CT-CCG---TTTT----C--TC-AA---ACACTCCT-CC-TC--A-C-------TT-TT--CGG--GG-TACT-GAA-GTT-T-TCAACTTGT---G-ACG-----C------GA--ATT-TC-A-GTA-TCA---AAA--TGGAC-CCTTA-GAGA-GTTTTT----CT--C-CTA-AT-ACA--------T--CG-AA-----TAG--TTATGA-A-GT---------AT-A-G-----CA------ATAG-AA--T---TTT---GCTT-CATT-G--GTA-CTT-T-G--------------TAA-G-T-T-CA----TT--TATG-CGA--CTA--ATT---AAG-ACAA-T-T--ATG-CT-TCAA--ACT--CGATGC-G-CCGTTCG---GGGT-GGCGG------TCT--A--TG--CGCCCC-AC-GGGG-TGGC-GG----A-TTGCT---TAAG--AAATAGGG--AT--T-AA-TTTTGCC--T-A--C-A-----GTTCT-CT-T-C-TGC-TTTAT-AT---TGGGG-ACAAAAAT
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-6998 ) : ATATCT-AGA-CGCG-TTAGTTCAAAA--CA---AT---ATATT---C-CA--C---GGAAGGGANC----AATCACT--AAG-----CA-AC-CC-TC-------GGCTGTTAAA-ANTGGC--CTG-----CAA----G--A------------G--TG-CT-CCG---TTTT----C--TC-AA---ACACTCCT-CC-TC--A-C-------TT-TT--CGG--GG-TACT-GAA-GTT-T-TCAACTTGT---G-ACG-----C------GA--ATT-TC-A-GTA-TCA---AAA--TGGAC-CCTTA-GAGA-GTTTTT----CT--C-CTA-AT-ACA--------T--CG-AA-----TAG--TTATGA-A-GT---------AT-A-G-----CA------ATAG-AA--T---TTT---GCTT-CATT-G--GTA-CTT-T-G--------------TAA-G-T-T-CA----TT--TATG-CGA--CTA--ATT---AAG-ACAA-T-T--ATG-CT-TCAA--ACT--CGATGC-G-CCGTTCG---GGGT-GGCGG------TCT--A--TG--CGCCCC-AC-GGGG-TGGC-GG----A-TTGCT---TAAG--AAATAGGG--AT--T-AA-TTTTGCC--T-A--C-A-----GTTCT-CT-T-C-TGC-TTTAT-AT---TGGGG-ACAAAAAT
gi|1 : T---C-CAGGC---GGAAGGGAATCTAGAGTTACTG-AAGTTGTTCA-AT-CC-TT-------GTCTGT-AAT-ATTGTCTTCTC-----CAA----G--A------------GCTTA-TC-CTG---TGTTGACGC--TCTAAGTGACAGTCTTGCC-AC--A-CCAGCACATT-TTGCTGG--GG-TGCT-GAA-GAT-TATCAACTTTTTTTG-ACA-----CTGAGTCGA--ATTGTC-A-GTA-T-----AAA--TGGACGCCTTAAGAGACGTTTTTTCTTCT--C-CTA-ATTACACTATATAGT--CGGAA-----TAAGTTTATGAGA-GT---------ATTA-G-----CA------ATAGCAA--T---TTTATTGCTT-CATT-GAGGTA-CTT-T-G--------------TAA-GTT-T-CAT---TT--TATG-TGAACTTA--ATA---AAC-A-AA-T-TCGATGTTT-TCAAGCACT--CGATGC-GACCGTTCGGGTGGGT-GGCGGTGGCTCTTT--ACTTGACCG-CCC-AC-GGGGTTGGG-AG----ATTTGCT---TTAGT-AAATAGGGGTAT--T-AATTTTTGCCG-T-A--C-AGTCT-GTTCT-CT-T-CGTGCTTTTATAAT---TGGGG--CAAAAAT
gi|10 : ccacgctgaagaggcacatagggggggtggcggcacattggcccacattggggattggtctggattttagagaaagcaccagataaaaagaatgactacccccaacaagtggattagcttagagattttttatatcagtcttagtgacccgataattattaaacacaaagtttactcTTTT----CT--C-CTA-AA-ACA--------T--TG-AAA----TAG--TTA-GA-A-GTGCTCTATTTAT-A-G-----CA------ATAG-AA--A---TTT---GCTTCCATT-G--GTA-CGT-T-G--------------TAA-G-T-T-TAAACTTT--TATGCCGA--CTA--ATT---AAG-ACAATT-T--ATG-AT-TCAA--ACTTGCAATGC-G-CCATTC------GT-G-----------------------------------G-TGGC-GG----A-TTGCTTTATAAGAAAAATAGGG--A---T-AA--TTTGCCTAT-A--C-A-----GGTCT-TTCC-C-TGC-TTTAT-AT---TCAGG-ACAAAAAtagctctatgttactgtattggtcttacttgaattattacgattttggatggtgtcgatatttattgacgagtctgaaaattaaaacaataaatatgccgtaattttataaagtttgtttatctatgcaaaaagagtaatcacagaataattgttagtaccccaactttccttaatattactgacttaaactttttcttctctaatttactcatttacctttgtgttgctgttagtgcatggggcgatgtagaagtgg
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gi|6 : C-TC-------GGCTGTTAAA-ACTGGT--CTG-----TAA----G--AATCCCGGTAAGAG--TG-CT-CAG---TTTT----C--TC-AA---ACACTCCT-CC-TC--A-C-------TA-TT--CGA--TG-TACT-GAA-GTT-T-TCAACTTGT---G-ACG-----C------GA--AAT-TC-T-GTA-TCA---AAA--TTTAC-CCTTA-TAGA-GTTTTC----CT--C-CTA-AT-ACA--------T--CG-AA-----TTG--TTATGA-A-GT---------AT-A-GTGCT-CA------ATAG-AA--T---TTT---GCTT-CATT-G--GTA-CTT-C-G--------------TAA-G-T-T-AA----TT--TATG-CGA--CTA--ATT---AAT-ACAA-T-T--AGG-CT-TCAA--ACT--CGATTC-G-CCGTT-----------------------------------------C-GGGG-TGGC-GG----A-TTGCT---GAAG--AAATAGGG--AT--T-AA-TTTTGCC--T-A--C-A-----GTTCT-CT-C-C-TGC-TTTAT-AT---TCGGG-ACAAAAagacttacgttgcgtgtcttaacttgaattattacgatttttgtgatggtgcgatgttattgcgatctgaattaaaacaaaatatgcgtaattttaaatatgtttactatgcagaaaga
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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