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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|4 : CATGGTGTAAT-AC------TACA--TAA-TT-G-A--TTGAAG---CGG-----TAA---AAA-----GCAA-AG-GA---------TCCGG-TACGAG--TG-TTC-CGC-ACG-CGCAGAGCT--GAT-TGGA-TTT-GCA-G-GG--C--TG--A-T-----AC---------GGTTA--TC-A--GC-CCTAGG-G-CT--GA-T-A-C--GGC-TATT----GT--GA---TG-TAAT--T-G-T-ATCG--A-CA--TGCAAA------A-AAC--CTG-TA-TTT----A-ATGCT-AA-G-----ATGTacaaacaggattatccacataaataattcaagctcactcaaatcttgttccttaaatggcgtcaacattttgttcacttcctcatttctcgtttatccaatgacaatgtttacgttcgtctgccatggtgtaatactacataattgattgaagcggtaaaaagcaaaggatccggtacgagtgttccgcacgcgcagagctgattggatttgcagggctgatacggttatcagccctagggctgatacggctattgtgatgtaattgtatcgacatgcaaaaaacctgtatttaatgctaagatgt
gi|5 : tactacttagcattaacatacaaaacaatcaattaaacaataaattttatcaactttaacaattaactgatatgattcatgtacatgatataacaaacaggattatccacataaataattcaagctcactcaaatcttgttccttaaatggcgtcaacattttgttcacttcctcatttctcgtttatccaatgacaatgtttacgttcgtctgcTATTAC-A-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA-TAT-TAAAACAATAAA---TTTT-AAT------CAA----CTTTAACA-A-TAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-T-AC------TA
gi|6 : tgttTATTAC-A-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA-T---TAAAACAATAA----TTTT-AAT------CAA----CTT-AACA-A-GAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-TTAC------AACA--TAA-AT-G-A--T-GAAG---CGG-----GTA---AAA-----GCAA-AG-GGG---T----TCCGGAAACGAGG-TG-TCCGCGC-ACG-CGGAGGGCT--GATATGGATTTT-GCA-G-GGC-C--TG--G-T-----AC--A------GGTTA--TC-A--CG-CCTAGG-G-CT--GA-T-ACC--GGC-TTTG----GT--GA---TGATCATCTT-G-T-ATCGC-A-CA--TGCAAA------ATAAC--CTG-TA-TTT----A-ATACT-AA-G--T--ATGTAATAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaagtatgtaataaatatgtatatacatgtaatagatgtcaatgtgccttggtatatagatctatgtttgtgt
gi|7 : TATTACCA-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA--ATATAAAACAATAAA---TTTTAAAT------CAA----CTTTAACA-A-T--------------------------ATTCATTGAT---ACATGATGTA-T-AC------TACA--TAA-AT-G-ATTT-GAAG---CGG-----T-A---AAA-----GCAA-AG-GGG---TC---TCCGG-GACGAGGCTG--TC-CGC-ACG-C-GAGGGCT--GATATGGA-TTT-GCA-G-GG--C--TG--ATT-----AC--A------GGTTA--TC-A--GC-CCTAGG-G-CT--GA-T-A-C--GGCTTATT-----T--GATATTG-TCATC-T-G-T-ATCGC-A-CATCTGCAAA------A-A----CTGTTATTTT----A-ATACT-AA-GT-T--ATGTAATAAATA
gi|8 : tTATTAC-A-TACTTA-GTATTA---CATACAAA----CAA-GTCA-TAT-TAAACAAATAAAAATTTTT-AAT------CAAA---CTTTAACA-A----------------------------ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-T-AC------TACAA-TAA-AT-G-AA-T-GAAG---CGG-----TAA---AAA-----GCAA-AG-GGG---T----TCCGG-A-CGAGG-TG-TTC-CGC-ACG-CGGAGG-CT--GATATGGA-TTTTGCAAG-GG--C--TGG-A-T-----AC--A------GGTT---TC-AATGC-CCTAGG-GGCT--GA-T-A-CAAGGC-TATT----GT--GA---TG-TCATC-TGG-T-AT-GC-A-CA--TGCAAA------A-AAC--CTG-TA-TTT----A-ATACT-AA-GTAT--ATGTAATAAATA
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . ATAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . ATAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . ATAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . ATAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
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originalCons : TATTAC-A-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA-TAT-TAAAACAATAAA---TTTT-AAT------CAA----CTTTAACA-A-TAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-T-AC------TACA--TAA-AT-G-A--T-GAAG---CGG-----TAA---AAA-----GCAA-AG-GGG---T----TCCGG-AACGAGG-TG-TTC-CGC-ACG-CGGAGGGCT--GATATGGA-TTT-GCA-G-GG--C--TG--A-T-----AC--A------GGTTA--TC-A--GC-CCTAGG-G-CT--GA-T-A-C--GGC-TATT----GT--GA---TG-TCATC-T-G-T-ATCGC-A-CA--TGCAAA------A-AAC--CTG-TA-TTT----A-ATACT-AA-G--T--ATGTAATAAATAATC-ATATATG-TATACATATATATTTATATGTATACTTTCCCATGTGATATCGTGTA-TATATTTTAT-GTATAT------------------ATCTTATGTAACTT--G--TTATTCATTTTCTATTCTTTCATTTATCTATCTGTAAATATGTTTTATA
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-6835 ) : TATTAC-A-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA-TAT-TAAAACAATAAA---TTTT-AAT------CAA----CTTTAACA-A-TAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-T-AC------TACA--TAA-AT-G-A--T-GAAG---CGG-----TAA---AAA-----GCAA-AG-GGG---T----TCCGG-AACGAGG-TG-TTC-CGC-ACG-CGGAGGGCT--GATATGGA-TTT-GCA-G-GG--C--TG--A-T-----AC--A------GGTTA--TC-A--GC-CCTAGG-G-CT--GA-T-A-C--GGC-TATT----GT--GA---TG-TCATC-T-G-T-ATCGC-A-CA--TGCAAA------A-AAC--CTG-TA-TTT----A-ATACT-AA-G--T--ATGTAATAAATAATC-ATATATG-TATACATATATATTTATATGTATACTTTCCCATGTGATATCGTGTA-TATATTTTAT-GTATAT------------------ATCTTATGTAAC----GTTA-----TTCATTTTCTATTCTTTCATTTATCTATCTGTAAATATGTTTTATA
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gi|10 : attacatacgtataataacatacaaaaacaaggtgtcatttatttaaaacaataaaattttaatcataatgggctgcgccgacttccaacaaaatcaactaatcaatcataagtgttcattaaatccacataaatattcaagcgcactcaattcttgtctcctaatgcgcgtcaaactttgtcccttccttcgatttctctgtattccaatgacatgcttacgttcgtcttttgcaATTAC-A-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA-TAT-TAAAACAATAAA---TTTT-AAT------CAA----CTTTAACA-A-TAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGT---------------A--TAA-AT-G-A--T-GAAGCCACGGAATTCCAA---AGACCATTGCAA-GC-GAGCTAC----TCCGG-AACGAGG-TG-TTC-CGC-ACG-CGGAGGGTG--GATATGGA-TTT--CA-GCGG--CG-TGTTA-T-----TC--ATTTATGGATTA--TC-A--GC-CC-AGG----T--GATT-ACC--GGA-CATTTATAGT--GA---TG-TCA-----------------------------------------TG-TA-TTT----A-ATACT-AA-G--T--ATGTAATAAActttg
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gi|15 : taagtaaT-AAT------CAA----CTCTAACA-A-TAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-T-ACATGTACTACA--TAA-AT-G-A--T-GAAG---CGG-----TAA---AAA-----GCAA-AG-GGT---T----TCCGG-AACGAGG-TG-TTC-CGC-ATG-CGG-----------------------A-G-GG--C--TG--A-T-----AC--A------GGTTA--TC-A--GC-CCTAGG-G-CT--TA-T-A-C--GGC-TATT----GT--GA---TG-TCATC-T-G-T-ATCGC-A-CA--TGCAAA------A-AAC--CTG-TA-TTT----A-ATACT-GA-G--T--ATGTA
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gi|20 : ATTTATATGTATACTTTCCCACGTGATATCATGTA-TATATTTTAT-GTATAT------------------ATC--------------TTA-----TTCATTTTCTATTCTTTCATTTATCTATCCGTAAATATGTTTTAT
gi|21 : ttgtgTACTTTTCCATGTGATATCGTGTT-TATATTTTAT-GTATGT--------------------CTTATGTAACTTAAGTCA-----TTCATTCTCTATTCTGTTATTCATCTATCTGTAAATATGTTTTATA
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gi|27 : ATTTATATGTATACATTCCCTTGTGATATCATGTA-TATATTTTAT-
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gi|4 : acgaaatggtcatagatagatagatttaagtattcagggtaaaaatcaatgatacaggctaggatgaTAC---TACTTA-GCATTA--ACATACAAAA---CAA--TCA--AT-T-AAACAATAAA---TTTT--AT------CAA----CTTTAACA-A-TTAA-------CTG--A-TA----TG-ATTCAT--GT---ACATG--ATA-T-Agta
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gi|5 : tactacttagcattaacatacaaaacaatcaattaaacaataaattttatcaactttaacaattaactgatatgattcatgtacatgatataacaaacaggattatccacataaataattcaagctcactcaaatcttgttccttaaatggcgtcaacattttgttcacttcctcatttctcgtttatccaatgacaatgtttacgttcgtctgcTATTAC-A-TACTTA-GTATTA--ACATACAAAA---CAA-GTCA-TAT-TAAAACAATAAA---TTTT-AAT------CAA----CTTTAACA-A-TAAA-------CTG--A-TAG---TG-ATTCAT--GT---ACATG-TGTA-T-AC------TA
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